CN106701931B

CN106701931B - 与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的snp标记及其应用

Info

Publication number: CN106701931B
Application number: CN201611155670.6A
Authority: CN
Inventors: 李胜杰; 樊佳佳; 姜鹏; 王俊杰; 胡婕
Original assignee: Pearl River Fisheries Research Institute CAFS
Current assignee: Pearl River Fisheries Research Institute CAFS
Priority date: 2016-12-14
Filing date: 2016-12-14
Publication date: 2020-09-18
Anticipated expiration: 2036-12-14
Also published as: CN106701931A

Abstract

本发明公开了与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示；所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A，CC个体的生长速度显著高于AA个体；所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G，AA个体的生长速度显著高于GG个体；所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G，AA个体的生长速度显著高于GG个体。本发明所发现的3个SNP标记的应用，可大大降低大口黑鲈“优鲈1号”亲本筛选的盲目性，可以快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈个体。

Description

与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，具体涉及一种与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。

背景技术

大口黑鲈(Micropterus salmoides L.)，俗名加州鲈，原产于北美洲，具有生长快、耐低温、肉质鲜美和易捕捞等特点，是重要的淡水养殖鱼类之一。1983年从台湾引种到广东省，现在全国大部分地区均有养殖。然而，目前我国养殖的大口黑鲈是由野生种家养驯化而成的，缺少定向选育，在亲本留种时经常选择个体小，性成熟早的个体作为亲本，致使我国大口黑鲈种质的下降，主要表现在生长速度下降、性成熟年龄普遍提前、饵料转化效率低、抗病力也大幅下降，其中，生长速度关系到大口黑鲈产量的高低，养殖效益的大小。养殖大口黑鲈生长速度慢、产量低直接影响大口黑鲈养殖业的健康稳定发展。因此，从分子遗传学角度加快改良大口黑鲈，提高其生长性能的工作势在必行。

大口黑鲈“优鲈1号”养殖新品种是以国内4个养殖群体为基础选育种群，采用传统的群体选育方法，以生长速度为主要指标，经连续5代选育获得的大口黑鲈选育品种。该新品种的生长速度比普通大口黑鲈快17.8%-25.3%，高背短尾的畸形率由5.2%降低到1.1%。该品种2010年通过全国水产原种和良种审定委员会审定，审定编号为GS01-004-2010。

挑选优质亲鱼是提高养殖鱼类生长速度的主要方法之一，其目的是为了改变养殖群体的遗传结构，使后代获得更快的生长速度、更好的抗病能力的遗传特点。在生产中，其传统方法是挑选个体较大、身体健壮的鱼作为留种亲本，即根据表型来决定亲鱼是否留种。这种方法方便、快捷、简单，但受人为因素影响很大，加上大口黑鲈属于肉食性为主的鱼类，掠食性强，饵料不足是会互相残食，致使其生长悬殊较大。如此可见，仅从表型判断大口黑鲈亲本质量往往达不到理想的效果。随着分子生物学和遗传学的发展，已涌现出很多种遗传标记，如AFLP、RAPD、SSR、SNP等标记，其中，SNP标记因分布广泛，适宜高通量自动化分析，遗传稳定，日益成为遗传育种研究中首选的遗传标记。若这些遗传标记能与生产性状相关联在一起，即可实现从DNA水平上进行选择育种，克服了传统方法受人为因素影响大的不利因素，提高了选择的准确性，并且可实现在早期鉴定出具有优良性状的个体，筛选出优良的后备亲本，从而缩短育种周期，加快育种进程。通过发现与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长有关的基因，提高快长亲本的筛选效率。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP位点标记及其应用。

本发明所采取的技术方案是：

与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记，所述SNP标记分别如SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.2 或SEQ ID NO.3所示；所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A；所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G；所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G。

其中：

序列为SEQ ID NO.1的SNP标记的CC基因型个体的生长速度显著高于AA基因型个体。

序列为SEQ ID NO.2的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。

序列为SEQ ID NO.3的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。

以上所述的SNP标记在检测大口黑鲈“优鲈1号”样本生长性状中的应用。

用于快速检测以上所述的SNP标记的引物对。

作为优选的，用于检测SEQ ID NO.1所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.4和SEQID NO.5所示；用于检测SEQ ID NO.2所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示；用于检测SEQ ID NO.3所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示。

一种用于筛选快速生长大口黑鲈样本的试剂盒，其包括用于检测SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示SNP标记的引物对。

一种快速生长大口黑鲈样本的筛选方法，通过对大口黑鲈样本SEQ ID NO.1、SEQID NO.2或SEQ ID NO.3 SNP标记的检测，选择SEQ ID NO.1 SNP标记为CC基因型和/或SEQID NO.2 SNP标记为AA基因型和/或SEQ ID NO.3 SNP标记为AA基因型的个体。具体包括如下步骤：

（1）提取待检样品基因组DNA；

（2）以提取得到的DNA为模板，利用特异性引物对进行PCR扩增，得到PCR产物；

（3）对PCR扩增产物进行测序，根据测序结果确定样品的SNP标记的基因型来筛选快速生长样本。

本发明的有益效果是：

本发明所发现的3个SNP标记的应用，可大大降低大口黑鲈“优鲈1号”亲本筛选的盲目性，可以快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈个体。

具体实施方式

下面结合实施例对本发明作进一步的说明，但并不局限于此。

实施例1 与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记的获得

一、SNP标记的获得

大口黑鲈“优鲈1号”养殖新品种是以国内4个养殖群体为基础选育种群，采用传统的群体选育方法，以生长速度为主要指标，经连续5代选育获得的大口黑鲈选育品种。该新品种的生长速度比普通大口黑鲈快17.8%-25.3%，高背短尾的畸形率由5.2%降低到1.1%。该品种2010年通过全国水产原种和良种审定委员会审定，审定编号为GS01-004-2010。在选育过程中我们比较了大口黑鲈选育群体与非选育群体的生产性能，采用金属线码标志分别标记接近时间繁殖的选育群体与非选育群体各800尾，然后同塘养殖，11月龄时从大口黑鲈“优鲈1号”快长群体中挑选10尾体重最大个体（快长群体）和非选育群体中挑选10尾体重最小个体（慢长群体），然后提取每尾鱼的总RNA，取等量的总RNA构建了快长群体和慢长群体的混合RNA池，并进行转录组测序，经生物信息软件分析获得了大量的潜在SNP位点，其中在phosphoenolpyruvate carboxykinase 1、FOXO3b和heat shock protein beta-1基因的3’非编码区存在各一个SNP位点。采用Snapshot方法对该位点进行验证，经实验证实了这3个位点的存在。

第一个SNP位点位于大口黑鲈phosphoenolpyruvate carboxykinase 1基因序列（SEQ ID NO.1）的第658个碱基处，该SNP位点的等位基因为C和A，有CC、CA和AA三种基因型。

第二个SNP位点位于大口黑鲈FOXO3b基因序列（SEQ ID NO.2）的第327个碱基处，该SNP位点的等位基因为G和A，有GG、GA和AA三种基因型。

第三个SNP位点位于大口黑鲈heat shock protein beta-1基因（SEQ ID NO.3）序列的第121个碱基处，该SNP位点的等位基因为G和A，有GG、GA和AA三种基因型。

二、大口黑鲈3个SNP位点不同基因型与生长性状的关联分析

11月龄时，从大口黑鲈“优鲈1号”选育群体中随机挑选340尾作为关联分析群体，并测量了每一尾的体质量、全长、头长、体高和尾柄长。由于该群体同一批繁殖、同池养殖，且采样时间一致，因此在建立分析模型时不考虑时间、环境及人工饲养条件的差异。利用Snapshot方法对phosphoenolpyruvate carboxykinase 1（PCK1）基因上突变位点在340尾大口黑鲈“优鲈1号”个体进行分型后，采用一般线性模型（GLM）分析不同基因型对体质量、全长、头长、体高和尾柄长进行关联分析。CC基因型个体在体质量、体宽、全长、头长、体高以及尾柄长上的平均值均高于AC型和AA型个体的均值，且CC基因型个体在体重、头长和体高上显著高于AA基因型个体(P<0.05)。

利用Snapshot方法对FOXO3b基因上突变位点在340尾大口黑鲈“优鲈1号”个体进行分型后，采用GLM分析不同基因型对体质量、全长、头长、体高和尾柄长进行关联分析。AA基因型个体在体质量、体宽、全长、头长以及尾柄长上的平均值均高于AG型和GG型个体的均值，且AA基因型个体在体重和头长上显著高于GG基因型个体(P<0.05)。

利用Snapshot方法对heat shock protein beta-1（HSPB1）基因上突变位点在340尾大口黑鲈“优鲈1号”个体进行分型后，采用GLM分析不同基因型对体质量、全长、头长、体高和尾柄长进行关联分析。AA基因型个体在体质量、体宽、全长、体高以及尾柄长上的平均值均高于AC型和AA型个体的均值，且AA基因型个体在体重、头长和体高上显著高于GG基因型个体(P<0.05)。

表1大口黑鲈3个SNP位点不同基因型与生长性状的关联分析

SNP site

Genotype

Number

BW/g

TL/cm

HL/cm

BH/cm

CPL/cm

PCK1

AA

152

507.54±10.36a

29.29±0.20

7.31±0.13a

8.39±0.08a

8.26±0.207a

AC

157

526.94±10.19

29.30±0.20

7.35±0.13

8.49±0.08

8.34±0.07b

CC

120

529.05±11.66b

29.52±0.23

7.70±0.14b

8.66±0.09b

8.36±0.11

FOXO3b

AA

61

545.64±16.30a

29.47±0.60

7.95±0.12ab

8.54±0.13

8.35±0.12

AG

220

530.36±8.59

29.54±0.19

7.42±0.11a

8.59±0.07a

8.34±0.06

GG

149

504.30±10.43b

29.05±0.31

7.24±0.19b

8.37±0.08b

8.28±0.08

HSPB1

AA

59

554.68±16.62a

29.66±0.33

7.35±0.20

8.67±0.08

8.42±0.12

AG

197

524.10±9.09

29.36±0.18

7.54±0.11

8.51±0.07

8.31±0.07

GG

173

512.07±9.70b

29.25±0.19

7.35±0.12

8.42±0.12

8.30±0.07

注：表中数值为平均值±标准误差，同一列不同上标字母表示差异显著( P<0.05)。

实施例2上述的SNP位点在筛选快速生长大口黑鲈亲本中的应用

利用上述的SNP位点对快速生长大口黑鲈亲本进行筛选，包括如下步骤：

1）从待测亲本中剪取鳍条样品，提取DNA；

2）以提取得到的DNA为模板，利用特异性引物进行初次PCR扩增，得到初次PCR产物，

3）使用Snapshot方法用初次获得PCR产物为模板，使用延伸引物延伸一个碱基在多态位点终止，在测序仪上检测，根据峰的颜色可知多肽位点的碱基类型，来确定待测亲本是否为纯合体。

初次PCR扩增的反应体系为：

DNA	1μl
		10×buffer	1.5μl
25mmol 的MgCl<sub>2</sub>	1.5μl
		dNTP	0.3μl
20P上下游引物	0.15μl
		Taq酶	0.3μl
H<sub>2</sub>O	补至15μl

扩增条件为：94℃预变性3min；94℃变性15s，55℃退火15s，72℃延伸30s，24个循环；72℃延伸3min。

引物延伸的反应体系为：

纯化PCR产物 2μl

Snapshot Mix试剂 1μl

延伸引物 2μl

水补至 6μl

延伸条件为：96℃预变性1min；96℃变性10s，52℃退火5s，60℃延伸30s，30个循环。

其中，用于检测PCK1分子标记SNP位点基因型的引物对为：

F1：3’-CTGAAAGAGGAGCAATTCTC-5’（SEQ ID NO.4），

R1：3’-TATTATTCATCTCAGCACCC-5’（SEQ ID NO.5），

延伸引物：3’-TTTTTTTTTTTTTTTTGAGCAATTCTCCTCTGATAATT-5’（SEQ ID NO.6）；

用于检测FOXO3b分子标记SNP位点基因型的引物对为：

F2：3’-GTACAGACATGTATGATGCAG-5’ （SEQ ID NO.7），

R2：3’-CATGGTGTAAATCTGATCCAGT-5’ （SEQ ID NO.8），

延伸引物：3’-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACAGAAAATCCAGTAAACAGAC-5（SEQ IDNO.9）；

用于检测HSPB1分子标记SNP位点基因型的引物对为：

F3：3’-GGAGGACAGCATTTATAATAG-5’ （SEQ ID NO.10），

R3：3’-GTTATGAGTGGTCTTATCAAAG-5’ （SEQ ID NO.11），

延伸引物：3’-AACACCTCAGGTTTTTAGTCTA-5’ （SEQ ID NO.12）。

以上实施例仅为介绍本发明的优选案例，对于本领域技术人员来说，在不背离本发明精神的范围内所进行的任何显而易见的变化和改进，都应被视为本发明的一部分。

SEQUENCE LISTING

<110> 中国水产科学研究院珠江水产研究所

<120> 与大口黑鲈"优鲈1号"快速生长相关的SNP标记及其应用

<130>

<160> 12

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 900

<212> DNA

<213> Micropterus salmoides L.

<400> 1

acacaaaggc aaggtgatca tgcatgaccc cttcgccatg cgtcccttct ttggctacaa 60

ctttggacag tacctctctc actggctgag tatggccgac cgccccggcg ccaagctccc 120

caagatcttt cacgtcaact ggttccgcaa gagccccacc gccggatttc tgtggcccgg 180

tttcggcgac aacatccgcg tgcttgactg gatgttcagg cgggtgaatg gcgaggccgg 240

cgccgtgccc tctgctgtgg gctacctgcc tcactgtgac tctctaaacc tccagggcct 300

gcaggaggac gtggacctca acgagctgtt ctccctggat caggagttct ggcagaggga 360

ggtggatgag gtgaggaagt acttcaccac gcaggtgaac gacgacctgc ccagtgaggt 420

ggcccggcag ctggagctcc tgcagcagcg agtgaagcag atgtaaagag gaaaaacagg 480

aggggaagaa aagaagtgtg tccgaaattc tgagggaaca tgttggtaat ctagaaccaa 540

cttttagtaa ttgtagaata tctcgttctt gtgctgaaga acacatataa agaattcctt 600

tctttgaggt gaagccttac aacttcctga aagaggagca attctcctct gataattctt 660

gtttttttca ttagctagaa atcctccccc ttttcggatg attattctga aaatactact 720

gttaaaattc cgctgggggt gctgagatga ataatatgaa tttgtaggaa ttgttgagtt 780

tttcactgtg gtttaagtga aatgtcataa aaatgacagc cagagggcac cagtcacaaa 840

taaatcggaa atctttcttt tccatccctt cacatgctgt cgtagcagca ctatgttttc 900

<210> 2

<211> 1196

<212> DNA

<213> Micropterus salmoides L.

<400> 2

caacaacaac aacaacaaca aaaagaaagc tatgtcaaac tcacaaatcg tagaattatg 60

caattttcct ttgacaccca gtctgttgat atcaaagaga aactgcttat cagaaggggt 120

ttcaggtgga acacagggac taaatatcaa ggaaagattg aaggagtgca cggtgcagtt 180

gttcccgctg acgacaaaaa aagacaaagt gtaaagtgaa aaaaatcaag aagtgacatg 240

gtgtaaatct gatccagtgg tttcctggga tgtgttatgt taaaaaaaaa tccctctgtt 300

ctcactttgt gattttaaat gttcagtgtc tgtttactgg attttctgtt ttatcatatt 360

tgtttctgca tcatacatgt ctgtacaaaa acatttggtg tattgatgaa atgaaaagat 420

ggaaatgggg tatcttactc actgagtggc cacacataca gtacatgcaa acacacagac 480

aacctaacac tttgccccag tttgcaaaac ttcagaaccc tttgaagtta cgatttctta 540

tttttattgc catgcacttc catttttgtt tttttaaatt gcttgaatta aattaaatgc 600

tccacactga gggttatatt acaattagcc gaatattaca aaaatatttg ttatcttttg 660

tgtgtatcta actgtaaaaa aaaaaaatgg aaaaagacta agaggaggaa actctctgtc 720

atggatattt gtacagtgca gggcagtgaa aagttcaaga aggaggcggt cacatcttgt 780

ctgtcttttc gtagatttct taacttctgg tgagttctgt tgatgtagcc aaaatgaata 840

cctgtgtgct agagttgtga acatttccac accataacag gtgctatgta aacagtgttg 900

aatcctgccc tgagagcaag ccgtgcattt tgtgtgtttt tgtttctgtt tttacacatg 960

acctgcagaa gcccaaagct gcagccactt gtagcacagt gaggttgaac ctgtagacgg 1020

caggggtggg ggtgggaggg aggtgtgaag ggttttagcc tcattcctct agaagccatt 1080

tgtttctcga gtaaaacaat aagctatctc tgtatattgc caaattactt gaaacaaaca 1140

gtaggatatg ctggcagcca aatcacagca cagacacaca cacacacaca cagaca 1196

<210> 3

<211> 1694

<212> DNA

<213> Micropterus salmoides L.

<400> 3

gacggtgtgt tggaaatcac tggtgagtgc tcttttctcc ttcactattt gttctgtaca 60

gttacctgtt gcatgctgat tcgaggagga cagcatttat aatagttata taataaccgc 120

gtagactaaa aacctgaggt gttgaaggtc ctgtcaggaa gagccagtct ttgataagac 180

cactcataac acctaaaaat gtgctagtgt acaggacaga tgcattggca ggcagattat 240

agaatgtctc acttggtgta ttttatctct agtaggtttg tctcttccct gtagaagaga 300

aaccgctaca gtactgaaaa aaaaagacac aagataaaaa ggcaggaaac atttttgcta 360

ggtcaagctt aaggcagatg catagctgta gtgttacata atatcttgat acaatagtgt 420

gggcgggggc ttttggctgc acgcctgcga gatgcaaaac aacacacaat tcaacatgtg 480

ggagttgact tttacagctg ctctcagatg aacacagtgt tttctctcct tgccatgaaa 540

ggttttcatt gtccatccct gcctgtgaaa gaccaaagca aaatgggcag acctgaagaa 600

atgtgtgcgg aatggatccg atataatagc ttagctctct gagtcagtgt cagcctctgt 660

gtctgccatt tcacaaagag tcacgctctt ggagtagggg gtttagctgt gactcaccca 720

gtgagtctgc tactttaaaa ggactgctgg atcttggcca ggtccagggt ctagggcttg 780

actatggctt atatctctct gctgagagac tgggtataga taaacaaagc acgagatcca 840

aatcaacttt gccgcctgat gtattttatg tcaccagaga acaaggatga tattatgtta 900

catcatcggt tttagtaaag agttttgtat acacaccaaa gtgcaacctc tttatgccgc 960

agccctcttc tcattctttt catccatact ctgaactaat gacccttcat gagcttgttg 1020

aaaaagtgcc tgcttggccc ggcaacagga gtgttgtcct gttgaaacgg agggacagat 1080

ccctcaggac agcaacctat ttcagcttgt tgtcataaca aacagattat ttagagccag 1140

aatgacgggc aatgtttcca catcacagtc aggcatcttt gtgcctagga gagactgaca 1200

gaaactgatt aagactggtg agggtggtat ggctgataga caaaaatacc accacaaaac 1260

ctcaacaatc tcaaagtagc acagtaacta ttctgttcta ttctgcaact ccatgtgtta 1320

ctgttacaca tggtactaca cagtacacac ggtactagat aatgttgaga gtcctcaaaa 1380

tactggatct agtttagttt gcttctgaaa aaaaacttca gtcaaactta attttttcaa 1440

tatttgcatt aagtatgttt atgaattgta ggggataagt agaataaata caaagtcaac 1500

atgcattctg tctgccacat agtgcagtca ttccctcaag caccttcctt atcctttatt 1560

gcttttattt ccatttaata tccattttgc aaatacctac aagattggtg taccataata 1620

cattttttgt tataaactga atgaatcttt cagattagtg ccacatttat gtaagtatgt 1680

tgtctgcatc ttta 1694

<210> 4

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 4

ctgaaagagg agcaattctc 20

<210> 5

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 5

tattattcat ctcagcaccc 20

<210> 6

<211> 38

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 6

tttttttttt ttttttgagc aattctcctc tgataatt 38

<210> 7

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 7

gtacagacat gtatgatgca g 21

<210> 8

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 8

catggtgtaa atctgatcca gt 22

<210> 9

<211> 43

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 9

tttttttttt tttttttttt tacagaaaat ccagtaaaca gac 43

<210> 10

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 10

ggaggacagc atttataata g 21

<210> 11

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 11

gttatgagtg gtcttatcaa ag 22

<210> 12

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工序列

<400> 12

aacacctcag gtttttagtc ta 22

Claims

1.与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记，所述SNP标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示；所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A；所述SEQID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G；所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G。

2.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，序列为SEQ ID NO.1的SNP标记的CC基因型个体的生长速度显著高于AA基因型个体。

3.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，序列为SEQ ID NO.2的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。

4.根据权利要求1所述的SNP标记，其特征在于，序列为SEQ ID NO.3的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。

5.检测权利要求1-4任一项所述的SNP标记的特异性引物在检测大口黑鲈“优鲈1号”样本生长性状中的应用。

6.用于快速检测权利要求1-4任一项所述的SNP标记的引物对，其特征在于，用于检测SEQ ID NO.1所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示；用于检测SEQ IDNO.2所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示；用于检测SEQ ID NO.3所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示。

7.一种用于筛选快速生长大口黑鲈样本的试剂盒，其包括权利要求6所述的引物对。

8.一种快速生长大口黑鲈样本的筛选方法，其特征在于，对大口黑鲈样本SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3SNP标记进行检测，所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A，所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G，所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G，选择SEQ ID NO.1SNP标记为CC基因型和/或SEQ ID NO.2SNP标记为AA基因型和/或SEQ ID NO.3SNP标记为AA基因型的个体。

9.根据权利要求8所述的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：

(1)提取待检样品基因组DNA；

(2)以提取得到的DNA为模板，利用权利要求6所述的引物对进行PCR扩增，得到PCR产物；

(3)对PCR扩增产物进行测序，根据测序结果确定样品的SNP标记的基因型来筛选快速生长样本。