CN106520932A - 一种检测nk/t细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法 - Google Patents

一种检测nk/t细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法 Download PDF

Info

Publication number
CN106520932A
CN106520932A CN201610904174.XA CN201610904174A CN106520932A CN 106520932 A CN106520932 A CN 106520932A CN 201610904174 A CN201610904174 A CN 201610904174A CN 106520932 A CN106520932 A CN 106520932A
Authority
CN
China
Prior art keywords
hybridization
detection
detection method
number variation
copy
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN201610904174.XA
Other languages
English (en)
Inventor
薛力泉
莫里斯
陈萍
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Shaoxing Jin Lu Biological Technology Co Ltd
Original Assignee
Shaoxing Jin Lu Biological Technology Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Shaoxing Jin Lu Biological Technology Co Ltd filed Critical Shaoxing Jin Lu Biological Technology Co Ltd
Priority to CN201610904174.XA priority Critical patent/CN106520932A/zh
Publication of CN106520932A publication Critical patent/CN106520932A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,包括如下步骤:(1)样本的制备与预处理;(2)样本DNA和无重复序列探针共变性和杂交;(3)杂交后洗涤、复染;(4)观察判读结果。本发明所述的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其准确性高,信号清晰,重复性好,检测成本低。

Description

一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法
技术领域
本发明涉及诊断NK/T细胞淋巴瘤,尤其涉及一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法。
背景技术
结外NK/T细胞淋巴瘤,是鼻型的一种少见类型,约占非霍奇金淋巴瘤的2%~10%,其恶性细胞大部分来源于成熟的NK细胞,少部分来源于NK样T细胞,因此称之为NK/T细胞淋巴瘤。多数病例原发于鼻腔和咽喉部以上部位,少数病例原发于鼻外,如皮肤、胃肠道、肺等,极少数病例发病初期即表现为全身播散, 而无明显鼻腔受累。其病理表现独特,具有以血管为中心的多形性淋巴细胞浸润, 瘤细胞浸润破坏血管继而引起坏死等特点,多数病例存在EB病毒感染证据。
结外 NK/T细胞淋巴瘤发病有地域或种族易感性,多发于亚洲以及南美洲,特别高发于中国、韩国、日本,西欧及北美少见。
现在,结外 NK/T细胞淋巴瘤发病率逐渐变高,临床症状常表现为鼻塞、流涕、血涕或鼻衄、耳鸣、声嘶、咽痛、吞咽不适及黏膜溃疡等严重侵害了患者的健康。其他结外病变部位如皮肤,可表现为结节、溃疡和黏膜红斑等;胃肠道受累可引起腹痛、肠梗阻或穿孔等;肺部受累可有咳嗽、咯血等。由于结外 NK/T细胞淋巴瘤的发病机制与EBV感染密切相关,因此该肿瘤一个重要的临床特点即容易发生噬血细胞综合征,表现为发热、肝脾肿大、血细胞减少、组织可见噬血细胞现象、肝功能异常、血乳酸脱氢酶升高、血清铁蛋白升高等。
各部位发生的结外 NK/T细胞淋巴瘤病理组织学形态及免疫表型基本相似。组织学方面,瘤细胞呈弥漫性浸润,常围绕并侵入、破坏血管壁,伴组织大片坏死。瘤细胞大小不等,以小到中等的淋巴细胞混合为主,常常可出现数量不等的大细胞,背景中可有大量混合性炎性细胞。虽然大细胞数量不一,但并不代表肿瘤的恶性度不同。
结外 NK/T细胞淋巴瘤容易误诊,主要有以下原因:1)本病发病率低,早期临床表现不典型,造成对疾病的认识不足;2)病理取材不当。该疾病以坏死性病变为主,故病灶中心多为坏死组织,因此活检部位应在坏死灶与病变组织交界处取材,必要时反复多次并多点取材,组织块要足够大,并采用"咬切",避免挤压导致细胞变形,以提高活检的正确率;3)由于肿瘤细胞变异较大,可见大、中、小多样细胞,甚至有的病变并发感染,这都导致病理诊断相当困难,很容易与坏死组织伴炎性浸润混淆。
结外NK/T细胞淋巴瘤对放疗敏感,对于早期鼻腔结外 NK/T细胞淋巴瘤患者,给予单纯放疗效果较好,且较大剂量的放疗远期生存率较高。但考虑到患者治疗后远处转移率较高,提示采用合理的化疗仍有必要,目前对于早期结外NK/T细胞淋巴瘤提倡放化疗联合的治疗方案。
结外NK/T细胞淋巴瘤化学治疗。所以前期的体外分子诊断对NK/T细胞淋巴瘤的治疗有很好的指导意义。
但现有NK/T细胞淋巴瘤的检测存在检测准确性低,检测结果不清晰、重复性差,检测成本高等问题。
发明内容
本发明的目的在于提供一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其准确性高,信号清晰,重复性好,检测成本低。
为了达到上述目的,本发明的技术方案是:
一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,包括如下步骤:
(1)样本的制备与预处理;
(2)样本DNA和无重复序列探针共变性和杂交;
(3)杂交后洗涤、复染;
(4)观察判读结果。
所述样本为确诊为NK/T细胞淋巴瘤患者的石蜡包埋组织切片。
所述确诊为NK/T细胞淋巴瘤患者的石蜡包埋组织切片的制备与预处理包括如下步骤:首先将患者新鲜组织取下1小时内放入10%中性福尔马林溶液中固定,固定时间为6—48小时;接着用切片机将石蜡切成3—5um,然后将3—5um的石蜡放入温度为40℃的超纯水中漂浮展开,接着将展开的石蜡切片附在带正电荷的玻璃片上,然后将附着有石蜡切片的玻璃片风干后再在56℃的温度下烤片备用。
10%中性福尔马林溶液是一种使用广泛、简便的固定剂,同时又是一种良好别的标本保存液。经它固定的标本,可适应一些特殊染色。它的渗透性较强,固定均匀,能增加组织的韧性,组织 缩轻微,硬性大于酒精。
所述无重复序列探针是通过Genome Browser 搜索特异序列,经过合成,标记、纯化制得。
所述玻片上混合无重复序列探针混合液,盖上盖玻片,封胶;接着将无重复序列探针与样本DNA通过ThermoBrite杂交仪变性、杂交。
所述ThermoBrite杂交仪内变性的温度为75℃,变性时间为5分针;所述ThermoBrite杂交仪内杂交的温度为37℃,杂交的时间为18小时。
所述杂交后洗涤包括如下步骤:首先去除树胶,放入第一缸杂交后洗液中,室温,浸泡1-5分针后除去盖玻片;接着取出玻片,放入第二缸杂交后洗液中,温度为72—74℃,漂洗2分钟;然后取出玻片,吸取残留液体,暗处自然干燥玻片,备用。
所述杂交后复染包括如下步骤:首先将玻片完全干燥,接着将15µl DAPI复染剂滴加于杂交区域,盖上盖玻片,然后在暗处且-20℃避光储存。暗处且-20℃避光储存能防止荧光信号淬灭。
本发明的有益效果是:一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其准确性高,信号清晰,重复性好,检测成本低。
具体实施方式
实施例1
一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,包括如下步骤:
(1)样本的制备与预处理;
(2)样本DNA和无重复序列探针共变性和杂交;
(3)杂交后洗涤、复染;
(4)观察判读结果。
所述样本为确诊为NK/T细胞淋巴瘤患者的石蜡包埋组织切片。
所述确诊为NK/T细胞淋巴瘤患者的石蜡包埋组织切片的制备与预处理包括如下步骤:首先将患者新鲜组织取下1小时内放入10%中性福尔马林溶液中固定,固定时间为6—48小时;接着用切片机将石蜡切成3—5um,然后将3—5um的石蜡放入温度为40℃的超纯水中漂浮展开,接着将展开的石蜡切片附在带正电荷的玻璃片上,然后将附着有石蜡切片的玻璃片风干后再在56℃的温度下烤片备用。
所述无重复序列探针是通过Genome Browser 搜索特异序列,经过合成,标记、纯化制得。
所述玻片上混合无重复序列探针混合液,盖上盖玻片,封胶;接着将无重复序列探针与样本DNA通过ThermoBrite杂交仪变性、杂交。
所述ThermoBrite杂交仪内变性的温度为75℃,变性时间为5分针;所述ThermoBrite杂交仪内杂交的温度为37℃,杂交的时间为18小时。
所述杂交后洗涤包括如下步骤:首先去除树胶,放入第一缸杂交后洗液中,室温,浸泡1-5分针后除去盖玻片;接着取出玻片,放入第二缸杂交后洗液中,温度为72—74℃,漂洗2分钟;然后取出玻片,吸取残留液体,暗处自然干燥玻片,备用。
所述杂交后复染包括如下步骤:首先将玻片完全干燥,接着将15µl DAPI复染剂滴加于杂交区域,盖上盖玻片,然后在暗处且-20℃避光储存。
本实施例的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其准确性高,信号清晰,重复性好,检测成本低。

Claims (8)

1.一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)样本的制备与预处理;
(2)样本DNA和无重复序列探针共变性和杂交;
(3)杂交后洗涤、复染;
(4)观察判读结果。
2.根据权利要求1所述的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其特征在于:所述样本为确诊为NK/T细胞淋巴瘤患者的石蜡包埋组织切片。
3.根据权利要求2所述的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其特征在于:所述确诊为NK/T细胞淋巴瘤患者的石蜡包埋组织切片的制备与预处理包括如下步骤:首先将患者新鲜组织取下1小时内放入10%中性福尔马林溶液中固定,固定时间为6—48小时;接着用切片机将石蜡切成3—5um,然后将3—5um的石蜡放入温度为40℃的超纯水中漂浮展开,接着将展开的石蜡切片附在带正电荷的玻璃片上,然后将附着有石蜡切片的玻璃片风干后再在56℃的温度下烤片备用。
4.根据权利要求1所述的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其特征在于:所述无重复序列探针是通过Genome Browser 搜索特异序列,经过合成,标记、纯化制得。
5.根据权利要求1所述的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其特征在于:所述玻片上混合无重复序列探针混合液,盖上盖玻片,封胶;接着将无重复序列探针与样本DNA通过ThermoBrite杂交仪变性、杂交。
6.根据权利要求5所述的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其特征在于:所述ThermoBrite杂交仪内变性的温度为75℃,变性时间为5分针;所述ThermoBrite杂交仪内杂交的温度为37℃,杂交的时间为18小时。
7.根据权利要求1所述的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其特征在于:所述杂交后洗涤包括如下步骤:首先去除树胶,放入第一缸杂交后洗液中,室温,浸泡1-5分针后除去盖玻片;接着取出玻片,放入第二缸杂交后洗液中,温度为72—74℃,漂洗2分钟;然后取出玻片,吸取残留液体,暗处自然干燥玻片,备用。
8.根据权利要求1所述的一种检测NK/T细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法,其特征在于:所述杂交后复染包括如下步骤:首先将玻片完全干燥,接着将15µl DAPI复染剂滴加于杂交区域,盖上盖玻片,然后在暗处且-20℃避光储存。
CN201610904174.XA 2016-10-18 2016-10-18 一种检测nk/t细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法 Pending CN106520932A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610904174.XA CN106520932A (zh) 2016-10-18 2016-10-18 一种检测nk/t细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201610904174.XA CN106520932A (zh) 2016-10-18 2016-10-18 一种检测nk/t细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN106520932A true CN106520932A (zh) 2017-03-22

Family

ID=58332184

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201610904174.XA Pending CN106520932A (zh) 2016-10-18 2016-10-18 一种检测nk/t细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN106520932A (zh)

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1879892A (zh) * 2006-04-13 2006-12-20 四川大学华西医院 一种建立人结外鼻型nk/t细胞淋巴瘤动物模型的方法
CN102876632A (zh) * 2012-10-17 2013-01-16 浙江省肿瘤医院 人nk/t细胞系
CN103451287A (zh) * 2013-08-28 2013-12-18 曾艳 一种改良共变性荧光原位杂交方法
CN104450899A (zh) * 2014-11-27 2015-03-25 武昌理工学院 一种用于肺癌检测的rbm5fish探针的制备方法

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1879892A (zh) * 2006-04-13 2006-12-20 四川大学华西医院 一种建立人结外鼻型nk/t细胞淋巴瘤动物模型的方法
CN102876632A (zh) * 2012-10-17 2013-01-16 浙江省肿瘤医院 人nk/t细胞系
CN103451287A (zh) * 2013-08-28 2013-12-18 曾艳 一种改良共变性荧光原位杂交方法
CN104450899A (zh) * 2014-11-27 2015-03-25 武昌理工学院 一种用于肺癌检测的rbm5fish探针的制备方法

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
LI LIANG等: "The Genetic Deletion of 6q21 and PRDM1 and Clinical Implications in Extranodal NK/T Cell Lymphoma,Nasal Type", 《BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL》 *
吴蔚等: "荧光原位杂交技术在套细胞淋巴瘤石蜡切片的应用研究", 《实验与检验医学》 *
宋正尧等: "FISH技术在中国人膀胱尿路上皮癌诊断及复发检测中应用的研究", 《临床泌尿外科杂志》 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN104714026B (zh) 一种甲胎蛋白异质体的分离检测组合物、系统及其应用
Yamamoto-Fukuda et al. Effects of various decalcification protocols on detection of DNA strand breaks by terminal dUTP nick end labelling
CN204422547U (zh) 一种甲胎蛋白异质体的分离检测试剂盒及装置
CN106754874A (zh) 一种从人体粪便样本中提取dna的试剂盒及其使用方法
CN105483283B (zh) 丙型肝炎病毒hcv实时荧光核酸恒温扩增检测试剂盒
CN108796074B (zh) 检测环状RNA circRNF13的试剂在制备肿瘤辅助诊断制剂上的应用及试剂盒
EP4028410A1 (en) Bioreceptor molecules, the use of bioreceptor molecules, sensors containing electrodes modified with the said bioreceptor molecules and the detection method of sars-cov-2 virus
CN107541550A (zh) 人ros1融合基因检测方法
CN106520932A (zh) 一种检测nk/t细胞淋巴瘤拷贝数变异的检测方法
CN103543265B (zh) 一种检测乙肝肝癌前病变标志物elisa试剂盒及其应用
CN110006724B (zh) 采用巴氏和革兰氏染色方法检测滴虫用试剂
CN108660213B (zh) 检测三种非编码rna试剂的应用及试剂盒
CN106399549A (zh) Pcr检测多房棘球蚴的方法及检测试剂盒
CN106047864A (zh) 一种血液中提取rnc‑rna的rnc固定剂及其提取方法
CN108279307A (zh) 保护和稳定血清或血浆中胃泌素释放肽前体的采血管
CN101215604B (zh) 一种检测人乳腺球蛋白mRNA表达量的试剂盒及其应用
CN107663541A (zh) 一种用于诊断原发性肝癌的特异性生物标志物及其筛选方法与应用
CN106701742A (zh) 一种保护和稳定游离rna的采血管
CN109486954A (zh) 一种基于AFP mRNA检测的肝癌诊断试剂盒及其应用
CN108559775A (zh) 登革热和登革出血热诊断区分标志物
CN103983687A (zh) 人源hsf2作为溃疡性结肠炎特异性诊断分子标记物的应用
CN116659987A (zh) 一种细胞病理学检测用石蜡切片的制备方法和应用
CN105223358B (zh) 一种子宫内膜癌特异性检测的试剂盒
CN109439655A (zh) 适用于超微量细胞核酸提取的试剂盒及方法
JP2014512190A (ja) 核酸の液相抽出方法とその検出方法

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
RJ01 Rejection of invention patent application after publication
RJ01 Rejection of invention patent application after publication

Application publication date: 20170322