CN106480096B - 表达载体及重组细胞 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种表达载体,其是IDS基因过表达慢病毒质粒表达载体,包括EF1α‑IDS序列。该表达载体以EF1α为启动子,能够保证真核基因高效表达,为研究IDS基因的功能提供了良好的工具。
Description
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体地,本发明涉及一种表达载体以及包括该表达载体的重组细胞,特别地,本发明尤其涉及IDS基因过表达慢病毒质粒表达载体。
背景技术
慢病毒载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达目的基因的效果。在感染能力方面可有效地感染神经元细胞、肝细胞、心肌细胞、肿瘤细胞、内皮细胞、干细胞等多种类型的细胞,从而达到良好的基因治疗效果。对于一些较难转染的细胞,如原代细胞、干细胞、不分化的细胞等,使用慢病毒载体,能大大提高目的基因的转导效率,且目的基因整合到宿主细胞基因组的几率大大增加,能够比较方便快捷地实现目的基因的长期、稳定表达。在体外实验及体内实验的研究中,慢病毒已经成为表达外源基因的常用载体形式之一,并且正在获得越来越广泛的应用。在美国已经开展了临床研究,效果非常理想,因此具有广阔的应用前景。
粘多糖贮积症II型(Mucopo1ysaccharidosis type II,MPS II,MIM309900),又称Hunter综合征,是一种X连锁隐性遗传病,在人群中的发病率极低,属于一种“罕见病”。由于基因突变导致溶酶体酶艾杜糖-2-硫酸酯酶(iduronate-2-sulfatase,IDS)缺乏,以致粘多糖(mucop01ysaccharides,MPS)在体内大量沉积,尿中大量排出硫酸皮肤素(dermatinsulfate B,DS)、硫酸已酰肝素(heparitin sulfate,HS)。患者出生时表现一般正常,但随着越来越多的粘多糖贮积在体内,MPS II病程进行性加重,症状典型,预后甚差。IDS基因定位于Xq27.3-Xq28,MPS II与IDS基因发生突变高度相关。因此,开发一种可携带IDS基因的慢病毒载体,对于研究IDS基因的功能提供了良好的工具,且为Hunter综合征的慢病毒基因治疗提供了一种较为理想的手段,具有重要的现实意义。
发明内容
针对现有技术中存在的缺陷,本发明提供了一种可携带IDS基因的慢病毒表达载体以及包括该表达载体的重组细胞。
一方面,本发明提供了一种表达载体,所述表达载体包括EF1α-IDS序列。
前述的表达载体,所述EF1α-IDS序列包括:强启动子EF1α或者其功能片段或序列变体;IDS基因;和增强子Kozak或者其功能片段或序列变体;
其中,增强子Kozak或者其功能片段或序列变体插入到强启动子EF1α或者其功能片段或序列变体与IDS基因之间。
前述的表达载体,所述EF1α-IDS序列包括:强启动子EF1α,IDS基因,和插入到强启动子EF1α与IDS基因之间的增强子Kozak。
前述的表达载体,所述增强子Kozak的序列是CGCCACC。
前述的表达载体,所述EF1α-IDS序列是SEQ ID No:1所示的序列。
前述的表达载体,所述表达载体以慢病毒载体pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE为骨架载体,将PGK-GFP序列替换为EF1α-IDS序列。
另一方面,本发明还提供了包括上述表达载体的重组细胞。
相比于现有技术,本发明的技术方案至少具有如下有益效果:
(1)本发明提供了一种IDS基因过表达慢病毒质粒表达载体,为研究IDS基因的功能提供了良好的工具。
(2)本发明所述的启动子EF1α,是一种强表达的启动子,可使外源基因在哺乳动物细胞中广泛表达,甚至可在原代细胞和干细胞内表达。
(3)本发明所述的增强子Kozak,是用来增强真核基因的翻译效率的,是最优化的ATG环境,避免核糖体出现leaky scan。
附图说明
图1是pRRLSIN.cPPT.EF1α-IDS.WPRE载体图谱。
图2是pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE载体酶切结果。
其中,1#:10kb Marker(条带自上而下依次为:10kb、8kb、6kb、5kb、4kb、3.5kb、3kb、2.5kb、2kb、1.5kb、1kb、750bp、500bp、250bp)
2#:载体酶切产物
3#:未酶切载体(从细菌中提取的质粒因可能存在超螺旋,开环,线性等不同的构象而具有不同的迁移速率,在琼脂糖凝胶电泳中呈现大小不同的条带,故此时质粒的电泳条带只能作为质粒分子量大小判断的参考,不可作为准确判断依据。质粒经单酶切消化后,会呈现均一的电泳条带,此时可与Marker对比判断其分子量大小)。
图3是EF1α片段胶回收电泳结果。
其中,Marker自上而下依次为:5kb,3kb,2kb,1.5kb,1Kb,750bp,500bp,250bp,100bp。
图4是IDS片段胶回收电泳结果。
其中,Marker自上而下依次为:5kb,3kb,2kb,1.5kb,1Kb,750bp,500bp,250bp,100bp。
图5是EF1α-IDS片段胶回收电泳结果。
其中,Marker自上而下依次为:5kb,3kb,2kb,1.5kb,1Kb,750bp,500bp,250bp,100bp
图6是转化子PCR产物电泳图。
其中,1#:阴性对照(ddH2O);2#:阴性对照(空载自连对照组);3#:阳性对照(GAPDH);4#:Marker自上而下依次为5kb,3kb,2kb,1.5kb,1Kb,750bp,500bp,250bp,100bp;5#-12#:IDS 1-8号转化子。
图7是阳性克隆测序结果。
图8是质粒表达检测流程图。
图9是Real-time PCR实验数据统计结果。
具体实施方式
为充分了解本发明之目的、特征及功效,借由下述具体的实施方式,对本发明做详细说明,但本发明并不仅仅限于此。下述具体实施方式中未注明具体条件的实验方法,按照常规方法和条件,或按照商品说明书选择。下述具体实施方式中所涉及的物质均为常规市购得到。
在此应当说明的是,除非另有说明,否则本发明中所涉及的术语具有本领域技术人通常理解的含义。
I.表达载体
本发明的一个方面提供了一种表达载体,该表达载体是IDS基因过表达慢病毒质粒表达载体,该表达载体包括EF1α-IDS序列。其中,EF1α-IDS序列包括:强启动子EF1α或者其功能片段或序列变体;IDS基因;和增强子Kozak或者其功能片段或序列变体;其中,增强子Kozak或者其功能片段或序列变体插入到强启动子EF1α或者其功能片段或序列变体与IDS基因之间。
在一种具体实施方式中,EF1α-IDS序列包括强启动子EF1α,IDS基因,和插入到强启动子EF1α与IDS基因之间的增强子Kozak。其中增强子Kozak的序列是CGCCACC。
在另一种具体实施方式中,EF1α-IDS序列是序列表中SEQ ID No:1所示的序列:
在一种特别优选的具体实施方式中,本发明的表达载体是IDS基因过表达慢病毒质粒表达载体pRRLSIN.cPPT.EF1α-IDS.WPRE,如图1所示,其是以慢病毒载体pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE为骨架载体,将PGK-GFP序列替换为EF1α-IDS序列(序列表中SEQ ID No:1所示的序列),即pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE中原有的PGK启动子替换为强启动子EF1α,将原有的GFP基因替换为IDS基因,并在强启动子EF1α和目的基因IDS之间插入增强子Kozak(CGCCACC)。
II.表达载体的构建
本发明表达载体的构建方法主要包括骨架载体线性化、EF1α-IDS的获取和重组载体的构建。具体如下:
1.pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE载体线性化
使用限制性核酸内切酶EcoRV和SalI,对pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE载体进行双酶切,随后胶回收约6Kb的酶切产物。
2.EF1α-IDS片段的获取
EF1α片段的获取:设计一对引物,以pMD18-EF1α载体为模板,PCR扩增EF1α片段并胶回收。
IDS片段的获取:设计一对引物,以pMD18-IDS载体为模板,PCR扩增IDS片段并胶回收。
EF1α-IDS片段的拼接:以胶回收的EF1α片段和IDS片段为模板,设计一对引物,进行两个片段的重叠PCR,拼接获得EF1α-IDS片段。
3.pRRLSIN.cPPT.EF1α-IDS.WPRE重组质粒的构建
EF1α-IDS片段通过同源重组构建到线性化骨架载体。
在一种具体实施方式中,本发明的IDS基因过表达慢病毒质粒表达载体pRRLSIN.cPPT.EF1α-IDS.WPRE的构建方法如下:
1.pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE载体线性化
将慢病毒载体pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE(购自美国Addgege公司)进行EcoRV和SalI双酶切,并胶回收约6Kb酶切产物,酶切体系(ThermoScientific公司)如下:
将上述混合液于37℃,反应30min。酶切结果如图2所示。
2.EF1α-IDS片段的获取
A、EF1α片段的获取
以pMD18-EF1α(序列是SEQ ID No:2所示的序列)为模板,PCR扩增EF1α片段,胶回收约1301bp片段。采用IDS-P1和IDS-P2引物对,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,序列如下表:
ID | 序列 |
IDS-P1 | GCCTCGAGAAGCTTGATATCAAGCTTTGCAAAGATGGATAAAG |
IDS-P2 | TGGCGGCATGGTGGCGTCACGACACCTGAAATGGAAG |
PCR反应体系如下:
PCR反应体系50μL(PCR反应相关试剂购自天根生化科技(北京)有限公司)。反应条件:95℃预变性5min;(95℃变性30s,55℃退火45s,72℃延伸45s),30个循环;72℃延伸10min;产物在4℃保存。扩增片段大小1301bp。用PCR纯化试剂盒(购自天根生化科技(北京)有限公司)纯化PCR产物。PCR琼脂糖电泳结果如图3所示。
B、IDS片段的获取
以pMD18-IDS(序列是SEQ ID No:3所示的序列)为模板,PCR扩增IDS片段,胶回收约1697bp片段。采用IDS-P3和IDS-P4引物对,引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,序列如下表:
ID | 序列 |
IDS-P3 | CTTCCATTTCAGGTGTCGTGACGCCACCATGCCGCCA |
IDS-P4 | TCCAGAGGTTGATTGTCGACGCGGCCGCTTTAAGGCATCAACAACTGGAAAAGATC |
PCR反应体系如下:
PCR反应体系50μL(PCR反应相关试剂购自天根生化科技(北京)有限公司)。反应条件:95℃预变性5min;(95℃变性30s,55℃退火60s,72℃延伸60s),30个循环;72℃延伸10min;产物在4℃保存。扩增片段大小1697bp。用PCR纯化试剂盒(购自天根生化科技(北京)有限公司)纯化PCR产物。PCR琼脂糖电泳结果如图4所示。
C、EF1α-IDS片段的拼接
以胶回收的EF1α片段和IDS片段为模板,以IDS-P1和IDS-P4为引物进行两个片段的重叠PCR,PCR反应体系如下:
PCR反应体系50μL(PCR反应相关试剂购自天根生化科技(北京)有限公司)。反应条件:95℃预变性5min;(95℃变性30s,55℃退火60s,72℃延伸60s),30个循环;72℃延伸10min;产物在4℃保存。扩增片段大小2947bp。用PCR纯化试剂盒(购自天根生化科技(北京)有限公司)纯化PCR产物。PCR琼脂糖电泳结果如图5所示。
3.pRRLSIN.cPPT.EF1α-IDS.WPRE重组质粒的构建
EF1α-IDS片段通过同源重组构建到线性化载体,重组反应体系(购自天根生化科技(北京)有限公司)如下:
EF1α-IDS片段 | 2ul |
线性化载体 | 2ul |
2×EasyGeno Assembly Mix | 5ul |
H<sub>2</sub>O | 1ul |
将上述混合液于50℃,反应15min。然后42℃热击转化入DH5α感受态细胞,涂布含氨苄青霉素的LB平板,筛选阳性转化子,对阳性转化子进行PCR鉴定(结果如图6所示),鉴定引物如下:
ID | 序列 |
IDS-P5 | CTTGAGTGCTTTGGACGAT |
IDS-P6 | AGCGTAAAAGGAGCAACATAG |
阳性转化子PCR产物大小约为798bp,将阳性克隆进行测序(测序结果如图7所示),通过阳性克隆测序结果及结果分析,证明获得pRRLSIN.cPPT.EF1α-IDS.WPRE重组质粒(质粒图谱如图1所示)。
III.表达检测
以293T为目的细胞(293细胞是转染腺病毒E1A基因的人肾上皮细胞系,293T细胞由293细胞派生,同时表达SV40大T抗原,含有SV40复制起始点与启动子区的质粒可以复制),以DMEM培养基(含10%胎牛血清)为培养基,具体操作过程参考《质粒转染细胞操作手册》和《Real time PCR操作手册》(上海吉凯基因生物科技有限公司),其流程如图8所示。引物序列如下:
Real-time PCR实验数据如下:
实验分组 | 内参基因Ct值 | 目的基因Ct值 | ΔCt | -ΔΔCt | 2-ΔΔCt |
CON | 14.26 | 20.53 | 6.27 | 0.083 | 1.059 |
CON | 14.18 | 20.51 | 6.33 | 0.023 | 1.016 |
CON | 14.12 | 20.58 | 6.46 | -0.107 | 0.929 |
OE | 14.14 | 10.88 | -3.26 | 9.613 | 783.252 |
OE | 13.99 | 10.91 | -3.08 | 9.433 | 691.379 |
OE | 14.01 | 10.85 | -3.16 | 9.513 | 730.800 |
Real-time PCR实验数据统计结果如下(如图9所示):
注:
1、CON:为293T细胞样品(对照组)OE:为目的基因质粒转染293T后样品
2、2-ΔΔCt法计算说明:ΔCt=目的基因Ct值-内参基因Ct值,-ΔΔCt=NC组ΔCt平均值-各样品ΔCt值。2-ΔΔCt反映各样品相对对照组样品目的基因的相对表达水平
结论:
经Real time PCR检测,结果说明:从定量PCR结果可以看出,293T细胞中,OE组IDS表达丰度是CON组的735.144倍(p<0.05)。
Claims (2)
1.一种表达载体,其特征在于,所述表达载体包括EF1α-IDS序列;
其中,所述表达载体以慢病毒载体pRRLSIN.cPPT.PGK-GFP.WPRE为骨架载体,将PGK-GFP序列替换为EF1α-IDS序列;
其中,所述EF1α-IDS序列是SEQ ID No:1所示的序列。
2.一种重组细胞,其特征在于,包括权利要求1所述的表达载体。
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