CN106244692A - 一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明公布了一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,包括用于对待侧样品中的对多个目标区域进行扩增的结直肠癌易感基因特异性引物,所述结肠癌易感基因包括rs10795668、MMP2、SMAD7、ADH2、ALDH2、CYP1A2、MMP‑1、MTHFR、TP53、VEGF、COX‑2、DNMT3B、hMLH1、LOC727677、MMP9、MTRR和TGF‑β1中的至少一个。本发明试剂盒能同时对结直肠癌易感基因的多个区域进行同时检测,提高检测效率,且降低检测成本,检测的准确性和灵敏度高。
Description
技术领域
本发明涉及分子生物学和医学领域,具体涉及一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒。
背景技术
结直肠癌(colorectal cancer,CRC),也称为大肠癌,为结肠癌和直肠癌的总称,指大肠粘膜上皮在环境或遗传等多种致癌因素作用下发生的癌变,是常见的恶性肿瘤之一,其死亡率较高。全球范围而言,结直肠癌是常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率在消化道的恶性肿瘤中仅次于胃癌,在所有恶性肿瘤中排名第四。结直肠癌容易被误诊,早期出现的大便次数增多、大便有粘液和脓血时,易误诊为痢疾、肠炎或痔疮等疾病,因而失去了早期 治疗的机会。
结直肠癌易感基因为初步研究可能与结直肠癌有关联的基因,其中各易感基因的关联度有高有低。目前,采用检测结直肠癌易感基因的常见方法是Sanger测序法,该方法只能对一个样品的某一段区域进行测序,检测效率低,成本高。
基于此,研究并开发设计一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒。
发明内容
本发明的目的在于提供一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,检测效率高,检测成本低。
本发明的通过下述技术方案实现:
一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,包括用于对待侧样品中的对多个目标区域进行扩增的结直肠癌易感基因特异性引物,所述结肠癌易感基因包括rs10795668、MMP2、SMAD7、ADH2、ALDH2、CYP1A2、MMP-1、MTHFR、TP53、VEGF、COX-2、DNMT3B、hMLH1、LOC727677、MMP9、MTRR和TGF-β1中的至少一个。
优选,所述每个目标区域对应的特异性引物中,至少有一条引物与目标区域部分互补,且该引物的C端带有第二标签序列,用于在扩增目标区域中,对不同待侧样品的目标区域扩增产物进行标记。
优选,所述试剂盒还包括用于与扩增产物结合构件测序文库的接头部。
优选,所述接头部采用分叉接头。
优选,所述分叉接头包含第一标签序列,用于对不同待测样品的测序文库进行标记。
本发明与现有技术相比,具有如下的优点和有益效果:
本发明试剂盒能同时对结直肠癌易感基因的多个区域进行同时检测,提高检测效率,且降低检测成本,检测的准确性和灵敏度高。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚明白,下面结合实施例,对本发明作进一步的详细说明,本发明的示意性实施方式及其说明仅用于解释本发明,并不作为对本发明的限定。
实施例1:
一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,操作方法,包括以下步骤,
1)利用结直肠癌易感基因特异性引物,对待测样品中的多个目标区域进行扩增,并基于扩增产物构件测序文库;
2)对测序文库进行单分子扩增,得到与多个目标区域对应的单分子扩增产物;
3)同时对多个单分子扩增产物进行高通量基因测序,得到所述多个目标区域的序列信息。
其中,目标区域为结直肠癌易感基因的任意序列,可根据需要进行选择,包括基因的内部序列,基因的外部调控区域,其中基因的内部序列包括结直肠癌易感基因的内含子区域、外显子区域,含有内含子的外显子区域。
本实施例1中采用高通量测序方法对结直肠癌易感基因的多个区域同时进行区域扫描,能够同时提高检测效率,降低检测成本;同时利用高通量基因测序方法与传统检测方法不同,可有效提高检测的准确性和灵敏度。
以上使用结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒获得的结直肠癌易感基因序列信息,可以结合分子生物学试验、临床试验、临床观察及综合数据的统计分析,建立结直肠癌疾病模型,实现早期评估结直肠癌的易感性。
以上所述的具体实施方式,对本发明的目的、技术方案和有益效果进行了进一步详细说明,所应理解的是,以上所述仅为本发明的具体实施方式而已,并不用于限定本发明的保护范围,凡在本发明的精神和原则之内,所做的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
Claims (5)
1.一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,其特征在于:包括用于对待侧样品中的对多个目标区域进行扩增的结直肠癌易感基因特异性引物,所述结肠癌易感基因包括rs10795668、MMP2、SMAD7、ADH2、ALDH2、CYP1A2、MMP-1、MTHFR、TP53、VEGF、COX-2、DNMT3B、hMLH1、LOC727677、MMP9、MTRR和TGF-β1中的至少一个。
2.根据权利要求1所述的一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,其特征在于:所述每个目标区域对应的特异性引物中,至少有一条引物与目标区域部分互补,且该引物的C端带有第二标签序列,用于在扩增目标区域中,对不同待侧样品的目标区域扩增产物进行标记。
3.根据权利要求1所述的一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括用于与扩增产物结合构件测序文库的接头部。
4.根据权利要求3所述的一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,其特征在于,所述接头部采用分叉接头。
5.根据权利要求4所述的一种结直肠癌遗传性易感基因筛查试剂盒,其特征在于,所述分叉接头包含第一标签序列,用于对不同待测样品的测序文库进行标记。
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