CN105506155A - 检测长链非编码rna loc284454表达量的试剂的应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了检测胶质母细胞瘤组织中长链非编码RNA？LOC284454表达量的试剂的应用，主要是用于制备胶质母细胞瘤辅助诊断或者疗效预测的实时荧光定量检测试剂。通过研究证实LOC284454在胶质母细胞瘤组织中表达上调，LOC284454高表达LOC284454的胶质母细胞瘤患者比低表达LOC284454的胶质母细胞瘤患者预后差，因此，将LOC284454的表达用于胶质母细胞瘤患者的预后预测，可以为胶质母细胞瘤患者的预后提供强有力的分子生物学依据，具有深远的临床意义和重要的推广应用前景。

Description

检测长链非编码RNA LOC284454表达量的试剂的应用
技术领域
本发明属于肿瘤分子生物学领域，具体涉及检测胶质母细胞瘤组织中长链非编码RNALOC284454表达量的试剂用于制备胶质母细胞瘤癌辅助诊断或者疗效预测制剂的用途。
背景技术
人类基因组计划及其后续的DNA元件百科全书计划(TheEncyclopediaofDNAElementsProject,ENCODE)研究成果表明，蛋白编码基因序列仅占人类基因组序列的1-3％，而人基因组中绝大部分可转录的序列为长链非编码RNA(Longnon-codingRNA,lncRNA)。LncRNA广泛地存在于各种生物中，且随着生物复杂程度的升高，基因组中lncRNA序列的比例也相应地增大，提示lncRNA在生物进化过程中有重要意义。随着lncRNA不断被发现，它们的功能逐渐被诠释，科学家们发现lncRNA广泛而活跃地参与到生命活动不同层面的功能调控中，作为一个崭新的领域，已经成为国际生命科学研究领域新的前沿与热点。
LncRNA可作为功能蛋白质的信号(signal)、诱导(guide)、诱饵(decoy)或支架(scaffold)分子等多种方式，在染色质重构、基因转录、翻译及蛋白修饰等多重水平调控基因的表达，并在包括发育、免疫、生殖等基本生理过程中扮演了不可替代的角色，更重要的是，lncRNA的表达与功能失调已经与包括恶性肿瘤在内的人类多种疾病紧密联系在了一起。因此，深入研究lncRNA的功能，揭示由lncRNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络，不仅可以从蛋白编码基因以外的角度重新注释和阐明基因组的结构与功能，深入发现生命活动的本质和规律，还有望从一个新的视角认识包括肿瘤在内的多种人类常见疾病的发病机理，并为这些疾病的诊断与治疗提供新的分子标志物与治疗靶点。
胶质母细胞瘤是星形细胞肿瘤中恶性程度最高的胶质瘤，因肿瘤恶性程度高，术后易复发胶质母细胞瘤患者预后差95％未经治疗的患者生存期不超过3个月患者的预后与多因素有关，LncRNA在胶质母细胞瘤的发生发展过程中可能也起到了重要的作用。最近我们在胶质母细胞瘤中发现lncRNALOC284454(NCBIaccessionnumber:NR_036515)高表达的胶质母细胞瘤患者比低表达LOC284454的胶质母细胞瘤患者预后差，因此针对该lncRNA的检测制剂也可以用于胶质母细胞瘤的预后判断。
发明内容
本发明的目的是提供检测胶质母细胞瘤组织中长链非编码RNALOC284454表达量的试剂用于制备胶质母细胞瘤辅助诊断或者疗效预测制剂的用途。
检测胶质母细胞瘤组织中长链非编码RNALOC284454表达量的试剂的应用，所述的试剂用于制备胶质母细胞瘤辅助诊断或者疗效预测制剂；该长链非编码RNALOC284454的序列如SEQNO:1所示。
所述的胶质母细胞瘤辅助诊断或者疗效预测制剂为实时荧光定量检测试剂。
所述的实时荧光定量检测试剂中包含用于实时荧光定量检测LOC284454表达的引物序列：
正向引物：5’-CCAATGCGCCGGAATTACAG-3’，
反向引物：5’-ATCCCAAGCTTCTGTCCACG-3’。
所述的实时荧光定量检测试剂中包含内参基因GAPDH特异性PCR引物：
正向引物5’-ACCACAGTCCATGCCATCAC-3’
反向引物5’-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3’。
本发明从胶质母细胞瘤样本中抽提RNA后逆转录，实时荧光定量法检测了LOC284454的表达，结果显示LOC284454在胶质母细胞瘤组织中表达上调，LOC284454高表达LOC284454的胶质母细胞瘤患者比低表达LOC284454的胶质母细胞瘤患者预后差，提示LOC284454可作为胶质母细胞瘤预后预测的分子标志。本发明为胶质母细胞瘤的辅助诊断和预后预测提供了强有力的分子生物学工具，具有深远的临床意义和重要的推广应用前景。
附图说明
图1为LOC284454在胶质母细胞瘤组织中表达上调情况；
实时荧光定量PCR技术检测lncRNALOC284454在胶质母细胞瘤(80例)和胶质母细胞瘤旁(6例)中的表达情况，P<0.001。
图2为胶质母细胞瘤中LOC284454的表达与胶质母细胞瘤患者预后的关系，
胶质母细胞瘤中LOC284454的高表达与胶质母细胞瘤患者的不良预后相关，即LOC284454高表达的患者总的生存时间(Over-allsurvival)要明显低于LOC284454低表达或不表达的患者，LOC284454表达高的患者更容易复发。
具体实施方式
以下结合具体实施方式进一步说明本发明，而非限制本发明。
实施例1，实时荧光定量PCR法检测证实LOC284454在胶质母细胞瘤中表达上调
1.材料与方法：
收集6例胶质母细胞瘤旁组织和80例胶质母细胞瘤组织，抽提总RNA，1μgRNA经逆转录成cDNA后，进行实时荧光定量PCR。LOC284454正向引物为CCAATGCGCCGGAATTACAG，如SEQNO:2所示，和反向引物ATCCCAAGCTTCTGTCCACG，如SEQNO:3所示。
用于对照的GAPDH正向引物为5’-ACCACAGTCCATGCCATCAC-3’如SEQNO:4所示，和反向引物5’-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3’，如SEQNO:5所示。
实时荧光定量PCR反应体系
实时荧光定量PCR反应步骤
反应结束后确认实时荧光定量PCR的扩增曲线和熔解曲线，各基因的表达强度根据CT值(thresholdcyclevalues)、内参基因(GAPDH)标化后，采用groupt-test检验计算P值。
2.结果
LOC284454在胶质母细胞瘤旁对照组织中不表达或者表达很低，而在胶质母细胞瘤组织中高表达P<0.001(图1)
对80例胶质母细胞瘤患者进行了电话随访，详细询问了他们的首发时间、治疗情况、有无复发、有无再患其他疾病、复发及死亡时间等，并登记了生存时间和状态，并对胶质母细胞瘤组织中LOC284454的表达与病人的生存时间和状态进行的生存分析，发现LOC284454高表达患者平均生存时间明显短于LOC284454低表达或不表达的患者(图2)。说明LOC284454是一个与胶质母细胞瘤预后相关的分子标记，该lncRNA表达高，病人预后差。

Claims (4)

1.检测胶质母细胞瘤组织中长链非编码RNALOC284454表达量的试剂的应用，其特征在于，所述的试剂用于制备胶质母细胞瘤辅助诊断或者疗效预测制剂；该长链非编码RNALOC284454的序列如SEQNO:1所示。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述的胶质母细胞瘤辅助诊断或者疗效预测制剂为实时荧光定量检测试剂。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述的实时荧光定量检测试剂中包含用于实时荧光定量检测LOC284454表达的引物序列：
正向引物：5’-CCAATGCGCCGGAATTACAG-3’，
反向引物：5’-ATCCCAAGCTTCTGTCCACG-3’。
4.根据权利要求2或3所述的应用，其特征在于，所述的实时荧光定量检测试剂中包含内参基因GAPDH特异性PCR引物：
正向引物5’-ACCACAGTCCATGCCATCAC-3’
反向引物5’-TCCACCACCCTGTTGCTGTA-3’。
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