CN105492458B - 一种棉花海藻糖合成酶tps-2及其编码基因与应用 - Google Patents

一种棉花海藻糖合成酶tps-2及其编码基因与应用 Download PDF

Info

Publication number
CN105492458B
CN105492458B CN201380078631.9A CN201380078631A CN105492458B CN 105492458 B CN105492458 B CN 105492458B CN 201380078631 A CN201380078631 A CN 201380078631A CN 105492458 B CN105492458 B CN 105492458B
Authority
CN
China
Prior art keywords
plant
seq
gene
arabidopsis
cotton
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Fee Related
Application number
CN201380078631.9A
Other languages
English (en)
Other versions
CN105492458A (zh
Inventor
孙超
陈文华
崔洪志
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Biocentury Seed Industry Co Ltd
Original Assignee
Biocentury Seed Industry Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Biocentury Seed Industry Co Ltd filed Critical Biocentury Seed Industry Co Ltd
Publication of CN105492458A publication Critical patent/CN105492458A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN105492458B publication Critical patent/CN105492458B/zh
Expired - Fee Related legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C12N15/8271Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance
    • C12N15/8273Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield for stress resistance, e.g. heavy metal resistance for drought, cold, salt resistance
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/10Transferases (2.)
    • C12N9/1048Glycosyltransferases (2.4)
    • C12N9/1051Hexosyltransferases (2.4.1)

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种来源于棉花的海藻糖合成酶TPS‑2及其编码基因,以及其在培育耐旱性提高的转基因植物中的应用。

Description

一种棉花海藻糖合成酶TPS-2及其编码基因与应用
技术领域
本发明涉及植物蛋白及其编码基因与应用,特别是涉及一种来源于棉花的海藻糖合成酶TPS-2及其编码基因,以及其在培育耐旱性提高的转基因植物中的应用。
背景技术
温度、盐渍和干旱等逆境胁迫会对高等植物的生长发育造成严重危害,导致作物产量降低,品质下降,严重威胁农业生产和自然环境。其中干旱对作物产量的影响,在诸多自然逆境中占首位,其危害相当于其它灾害之和,是许多地区是农业发展的瓶颈。据统计,世界干旱、半干旱地区占陆地面积的34%;我国干旱、半干旱地区约占国土面积的52%,年受旱面积达200-270万公顷,全国灌溉区每年缺水约30亿立方米,因缺水而少收粮食350-400亿公斤;特别是我国主要产粮区如华北、东北和西北,是我国缺水最严重的地区,春旱频繁达到十年九遇。
植物耐旱性大多属于多基因控制的数量性状,利用常规育种方法改良作物的抗旱性受到周期长、优异种质资源缺乏的限制。近年来的转录组学、蛋白组学和基因表达调控的研究初步揭示了植物干旱胁迫的作用分子机理。目前,利用干旱胁迫相关基因提高植物的抗旱能力,已经成为植物抗逆分子生物学的研究热点和植物抗逆基因工程重要的研究方向。
植物受到逆境胁迫时会产生相应的应答反应,以降低或消除逆境胁迫给植物带来的危害。植物的这种应答反应是一个涉及多基因、多信号途径及多基因产物的复杂过程。但就目前的研究状况而言,由于其机制十分复杂,许多植物对逆境下的生物化学和生理学上的响应机制仍有待深入研究。在抗逆应答基因的功能及表达调控方面的研究将对植物抗逆相关的信号传递途径之间的联系以及整个信号传递网络系统的研究提供重要的基础。
发明内容
本发明人利用SSH(抑制差减杂交)与RACE(cDNA末端快速扩增)相结合的方法克隆出了一种棉花海藻糖合成酶(本文命名为TPS-2)的编码基因,并测定了其DNA序列。并且发现将其导入植物过量表达后,可明显改善转基因植株的耐旱性,而且这些性状可稳定遗传。
本发明第一方面提供棉花的一种海藻糖合成酶GhTPS-2的编码基因(本文命名为GhTPS-2),其序列为SEQ ID NO:2。
本发明第二方面提供一种重组表达载体,其含有本发明第一方面所述的基因并且所述基因的核苷酸序列与所述表达载体的表达控制序列可操作地连接;优选地,所述载体为附图2所示的35S-GhTPS-2-2300载体。
本发明第三方面提供一种重组细胞,其含有本发明第一方面所述的基因或者本发明第二方面所述的重组表达载体;优选地,所述重组细胞为重组农杆菌细胞。
本发明第四方面提供一种改善植物耐旱性的方法,包括:将本发明第一方面所述的基因或者本发明第二方面所述的重组表达载体导入植物或植物组织并使所述基因表达;优选地,所述植物是拟南芥。
本发明第五方面提供一种制备转基因植物的方法,包括:在有效产生植物的条件下培养含有本发明第一方面所述的基因或者本发明第二方面所述的重组表达载体的植物或植物组织;优选地,所述植物是拟南芥。
本发明第六方面提供本发明第一方面所述的基因、本发明第二方面所述的重组表达载体或者本发明第三方面所述的重组细胞用于改善植物耐旱性以及用于植物育种的用途;优选地,所述植物是拟南芥。
本发明第七方面提供本发明第一方面所述的基因编码的蛋白质,其氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
附图说明
图1是GhTPS-2的植物表达载体(35S-GhTPS-2-2300)的构建流程(a-b)。
图2是GhTPS-2的植物表达载体(35S-GhTPS-2-2300)的质粒图。
图3是GhTPS-2 T1代转基因拟南芥植株(T1H2)和作为对照的非转基因拟南芥植株(CK)的耐旱模拟实验结果。(a为正常生长20天的拟南芥植株;b为正常生长20天后干旱处理14天的拟南芥植株)。
图4是转基因T1代拟南芥植株和非转基因对照植株在转录水平上的蛋白表达验证结果。M为DNA Ladder Marker(DL2000,TakaRa),1-4为非转基因拟南芥对照,5-11为耐旱转基因拟南芥T1代植株(依次为:T1H1、T1H2、T1H3、T1H4、T1H5、T1H6、T1H7),12-15为不耐旱转基因拟南芥T1代植株。
具体实施方式
下面结合非限制性实施例对本发明进行进一步说明。所述实施例仅出于示例性目的,并非意在限制本发明的范围。
下面实施例中提到的未注明来源的限制性内切酶均购自New England Biolabs公司。
在本发明中,如果没有注明并且在上下文中没有歧义,比例和百分比是基于重量计算的。
实施例1、干旱胁迫下棉花SSH文库构建。
具体方法为:
利用Clontech公司的PCR-selectTM cDNA Subtraction Kit所示的方法通过抑制差减杂交方法构建差减文库。在实验过程中以干旱处理的棉花幼苗的叶片的mRNA作为样本(Tester),以未处理的棉花幼苗的叶片的mRNA作为对照(Driver)。具体步骤简述如下:
(1)供试材料:
冀棉14(国家棉花中期库,获取单位中国棉花研究所,统一编号:ZM-30270)播种到灭过菌的蛭石上,在25℃、光周期16小时光照/8小时黑暗(光强2000-3000Lx)条件下培养,每周浇1/2MS液体培养基(含9.39mM KNO3,0.625mM KH2PO4,10.3mM NH4NO3,0.75mM MgSO4,1.5mM CaCl2,50μM KI,100μM H3BO3,100μM MnSO4,30μM ZnSO4,1μM Na2MoO4,0.1μM CoCl2,100μM Na2EDTA,100μM FeSO4)一次。当苗株培养1个月左右时用于实验。
(2)材料处理:
将上述供试幼苗分为2组,每组4盆,每盆1株。第一组为对照组,在25℃、光周期16小时光照/8小时黑暗条件下培养,正常浇灌。第二组为干旱处理组,25℃、光周期16小时光照/8小时黑暗条件下培养,停止浇灌,处理10天,处理完毕后及时剪取两组幼苗顶端1/3的叶片,用液氮迅速冷冻后,于-70℃冰箱中保存。
(3)总RNA提取:
分别取对照组和干旱处理组的棉花叶片各0.1g,用植物RNA提取试剂盒(购自Invitrogen)提取棉花叶片的总RNA。用HITACHI公司的紫外分光光度计U-2001测定所得总RNA在260nm和280nm的吸光度值,OD260/OD280比值为1.8-2.0,表明总RNA纯度较高;用1.0%的琼脂糖凝胶电泳检测总RNA的完整性,28S条带的亮度约为18S条带的2倍,表明RNA的完整性良好。使用Qiagen公司的Oligotex mRNA纯化试剂盒(purification of polyA+RNA fromtotal RNA)分离mRNA。
(4)抑制差减杂交:
按Clontech公司的PCR-selectTM cDNA Subtraction Kit试剂盒所示的方法进行抑制差减杂交。先将Driver mRNA和Tester mRNA分别反转录,得到双链cDNA,再以2μgTester cDNA和2μg Driver cDNA作为起始材料进行差减杂交。在37℃水浴下分别将TestercDNA和Driver cDNA用Rsa I酶切1.5小时,然后将酶切后的Tester cDNA分成两等份,连接上不同的接头,而Driver cDNA不连接头。两种连有不同接头的Tester cDNA分别与过量的Driver cDNA混合,进行第一次正向差减杂交。将两种第一次差减杂交的产物混合,再与新变性的Driver cDNA进行第二次正向差减杂交,然后通过两次抑制性PCR扩增差异表达的片段,使其得到富集。
为了增加获得表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)(Unigene)的有效性,避免基因无酶切位点及所获得序列在非翻译区,本实验同时用内切酶HaeIII按上述步骤对Tester cDNA和Driver cDNA进行酶切并先后进行两次正向差减杂交和两次抑制性PCR扩增,最后合并两组正向差减杂交cDNA片段的第二次抑制性PCR产物。
(5)cDNA差减文库的构建与初步筛选、克隆、鉴定
依照pGEM-T Easy试剂盒(购自Promega)的产品说明书所示方法,将上述合并的正向差减杂交cDNA片段的第二次PCR产物(使用QIAquick PCR Purification Kit纯化,购自Qiagen)与pGEM-T Easy载体连接,其具体步骤如下:向200μl PCR管中依次加入下列成分:纯化的合并后的正向差减杂交cDNA片段的第二次抑制性PCR产物3μl,2×T4DNA连接酶缓冲液5μl,pGEM-T Easy载体1μl,T4 DNA连接酶1μl,于4℃连接过夜。取10μL连接反应产物,加入到100μL感受态大肠杆菌JM109(购自TAKARA)中并混匀,冰浴30分钟、42℃热休克60秒、冰浴2分钟,另加250μL LB培养液(含1%Tryptone购自OXOID,0.5%Yeast Extract购自OXOID,1%NaCl购自国药)后置于37℃摇床中,以225转/分钟振荡培养30分钟,所得菌液即为差减文库菌液。加甘油至终浓度20%(V/V),于-80℃保存备用。
取200μL所述差减文库菌液涂布于含50μg/mL氨苄青霉素(购自北京拜尔迪)、40μg/mL X-gal(5-溴-4氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷)、24μg/mL IPTG(异丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷)(X-gal和IPTG均购自TAKARA)的LB(同上)固体培养平板(1.5%琼脂,下同)上,37℃培育18小时。计数培养板中直径>1mm的清晰白色及蓝色菌落数,随机挑取198个白色菌落(编号:Gh-B001至Gh-B198)。将所有白色菌落分别接种于含有50μg/mL氨苄青霉素的LB液体培养基的96孔细胞培养板(CORNING)中,37℃培养过夜后加甘油至终浓度20%,于-80℃保存备用。以巢式PCR引物Primer 1和Primer 2R(Clontech公司的PCR-selectTM cDNASubtraction Kit试剂盒自带)进行菌液PCR扩增验证,得到190个阳性克隆,然后将所有阳性克隆在送英潍捷基(上海)贸易有限公司测序。
(6)差异克隆的cDNA测序分析:
将DNA测序结果去除载体和不明确序列及冗余的cDNA后,共得到135条EST(Unigene)。经分析有21个重叠群,有114个单一的序列。经BlastN发现其中48条EST(Unigene)在GenBank中有同源序列,32条EST功能未知或者为假定蛋白,另有34条未获得同源匹配,推测可能是处于3’或5’末端非翻译区的较短序列。
实施例2、棉花海藻糖合成酶编码基因GhTPS-2的克隆。
克隆子Gh-B129去掉冗余DNA后,序列为SEQ ID No:3,序列分析表明该序列的编码的蛋白质属于海藻糖合成酶,本文将克隆子GH-129对应的全长编码基因命名为GhTPS-2,其对应的蛋白命名为TPS-2。
SEQ ID No:3
TPS-2全长编码基因的克隆
根据已经获得的SEQ ID No:3序列分析:SEQ ID No:3为编码基因TPS-2的3端序列。
根据已经获得的SEQ ID NO:3序列,设计如下三条特异性引物,作为反转录引物及5’RACE的特异性引物。
GH-129GSP1:SEQ ID NO:4:
CGAGGGAGCCTTTTTCTCAG
GH-129GSP2:SEQ ID NO:5:
CGATTGGCTTGCATTTTGCC
GH-129GSP3:SEQ ID NO:6:
ATGACAACCATGCCAGAACA
试剂盒自带通用引物:
AAP:SEQ ID NO:7:
GGCCACGCGTCGACTAGTACGGGIIGGGIIGGGIIG
AUAP:SEQ ID NO:8:
GGCCACGCGTCGACTAGTAC
实验步骤按试剂盒说明书操作(5’RACE System for Rapid Amplification ofcDNA Ends试剂盒购自Invitrogen公司)。
以GH-129GSP1(SEQ ID NO:4)为反转录引物,以棉花mRNA为模板进行反转录,获得cDNA模板,然后按照上述5’RACE试剂盒说明书中的步骤加Poly C尾,以加尾后的产物为模板进行第一轮PCR扩增,所用引物为SEQ ID NO:4与通用引物SEQ ID NO:7(试剂盒自带,I为次黄嘌呤修饰的a、c、g或t),具体步骤如下:
50μl PCR反应体系:5μl 10×Ex Buffer,3μl 2.5mM的dNTP,2.0μl mRNA反转录的cDNA,1.0μl Ex Taq(购自TAKARA)、10μM的引物SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:7各2.0μl,以及35μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,33个循环(94℃变性45秒,58℃退火45秒,72℃延伸90秒),72℃延伸10分钟。
所得的PCR产物用双蒸水稀释50倍后取2.0μl作为模板,用SEQ ID NO:5与通用引物SEQ ID NO:8进行第二轮PCR扩增,具体步骤如下:
50μl PCR反应体系:5μl 10×Ex Buffer,3μl 2.5mM的dNTP,2.0μl稀释的第一轮PCR产物,1.0μl Ex Taq、10μM的引物SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:8各2.0μl,以及35μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,33个循环(94℃变性45秒,58℃退火45秒,72℃延伸90秒)),72℃延伸10分钟。回收第二次PCR产物中约为1.5Kbp大小的条带(Gel ExtractionKit购自OMEGA),并将其连接到pGEM-T Easy Vector,然后转化到JM109(具体方法同上),随机挑取6个白色菌落分别接种于含有50μg/mL氨苄青霉素的LB液体培养基中培养,37℃培养过夜后加甘油至终浓度20%(v/v),-80℃保存备用。用引物SEQ ID NO:5与3’端引物SEQ IDNO:6进行菌液PCR扩增(反应体系及反应条件同上),得到6个阳性克隆,送英潍捷基(上海)贸易有限公司测序,获得该基因的cDNA的一段5’端序列。
所得的5’RACE产物克隆子02测序获得序列为SEQ ID NO:9:
将5’RACE获得的序列SEQ ID NO:9,与获得的序列SEQ ID NO:3拼接,获得SEQ IDNO:10:
根据SEQ ID NO:10序列检索分析,SEQ ID NO:10不是GhTPS-2的全长序列。需进一步进行5’RACE,从而获取基因全长。根据SEQ ID NO:10序列,设计如下三条特异性引物,作为反转录引物及5’RACE的特异性引物。
GH-12902GSP1:SEQ ID NO:11:
CTGCAGTCAGTGATCCAAATC
GH-12902GSP2:SEQ ID NO:12:
CAACAATTTCATGAACTTGGC
GH-12902GSP3:SEQ ID NO:13:
AGGATCAAGGGAGGCTGACC
实验步骤按试剂盒说明书操作(5’RACE System for Rapid Amplification ofcDNA Ends试剂盒购自Invitrogen公司)。
以GH-12902GSP1(SEQ ID NO:11)为反转录引物,以棉花mRNA为模板进行反转录,获得cDNA模板,然后按照上述5’RACE试剂盒说明书中的步骤加Poly C尾,以加尾后的产物为模板进行第一轮PCR扩增,所用引物为SEQ ID NO:11与通用引物SEQ ID NO:7(试剂盒自带,I为次黄嘌呤修饰的a、c、g或t),具体步骤如下:
50μl PCR反应体系:5μl 10×Ex Buffer,3μl 2.5mM的dNTP,2.0μl mRNA反转录的cDNA,1.0μl Ex Taq(购自TAKARA)、10μM的引物SEQ ID NO:11和SEQ ID NO:7各2.0μl,以及35μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,33个循环(94℃变性45秒,58℃退火45秒,72℃延伸90秒),72℃延伸10分钟。
所得的PCR产物用双蒸水稀释50倍后取2.0μl作为模板,用SEQ ID NO:12与通用引物SEQ ID NO:8进行第二轮PCR扩增,具体步骤如下:
50μl PCR反应体系:5μl 10×Ex Buffer,3μl 2.5mM的dNTP,2.0μl稀释的第一轮PCR产物,1.0μl Ex Taq、10μM的引物SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:8各2.0μl,以及35μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,33个循环(94℃变性45秒,58℃退火45秒,72℃延伸90秒)),72℃延伸10分钟。回收第二次PCR产物中约为1.3Kbp大小的条带(Gel ExtractionKit购自OMEGA),并将其连接到pGEM-T Easy Vector,然后转化到JM109(具体方法同上),随机挑取6个白色菌落分别接种于含有50μg/mL氨苄青霉素的LB液体培养基中培养,37℃培养过夜后加甘油至终浓度20%(v/v),-80℃保存备用。用引物SEQ ID NO:12与3’端引物SEQID NO:13进行菌液PCR扩增(反应体系及反应条件同上),得到6个阳性克隆,送英潍捷基(上海)贸易有限公司测序,获得该基因的cDNA的一段5’端序列。
所得的5’RACE产物克隆子4测序获得序列为SEQ ID NO:14:
将第2轮5’RACE获得的序列SEQ ID NO:14,与拼接序列SEQ ID NO:10拼接,获得SEQ ID NO:15:
根据SEQ ID NO:15序列检索分析,SEQ ID NO:15为GhTPS-2的全长序列。根据SEQID NO:15序列设计一对引物如下:
GhTPS-2F:SEQ ID NO:16:
ATGCCTGGAAACAAGTACAAC
GhTPS-2R:SEQ ID NO:17:
TCAAGTGCCT TTTGCTAGTC
AP:SEQ ID NO:18:
GGCCACGCGTCGACTAGTACTTTTTTTTTTTTTTTTT
通过SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17来克隆GhTPS-2全长编码序列。
提取棉花RNA,以引物SEQ ID NO:18为反转录引物,获取棉花cDNA。采用Stratagene的PfuUltra II Fusion HS DNA Polymerase,以棉花的cDNA为模板进行PCR反应。50μl PCR反应体系:5μl 10×PfuUltra II reaction Buffer,0.5μl 25mM的dNTP,2.0μl cDNA,1.0μl PfuUltra II Fusion HS DNA Polymerase、10μM的引物SEQ ID NO:16和SEQID NO:17各2.0μl,以及37.5μl的双蒸水。PCR反应条件:95℃预变性2分钟,35个循环(95℃变性25秒,53℃退火25秒,72℃延伸2分钟),72℃延伸5分钟。
PCR扩增产物加A尾:PCR产物补水至400μl,先用氯仿抽一遍去除蛋白,吸取上清加入3M醋酸钠溶液40μl,加2倍的无水乙醇,-20℃放置10分钟,离心,去上清,晾干,用21μl双蒸水溶解。加入2.5μl 10×Ex Buffer,0.5μl 5mM的dATP,1.0μl Ex Taq。反应条件:70℃反应30分钟。将得到约2.8Kbp的DNA片段回收(Omega回收试剂盒),连接至pGEM T-easy载体上(得到GhTPS-2-pGEM质粒),然后转化JM109,随机挑取6个白色菌落分别接种于含有50μg/mL氨苄青霉素的LB液体培养基中培养,37℃培养过夜后加甘油至终浓度20%,-80℃保存备用。用引物SEQ ID NO:16与SEQ ID NO:17进行菌液PCR扩增(反应体系及反应条件同上),得到6个阳性克隆,送至英潍捷基(上海)贸易有限公司测序,序列为SEQ ID NO:2,其编码的蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:1
TPS-2蛋白的氨基酸序列:SEQ ID NO:1
GhTPS-2编码基因的核苷酸序列:SEQ ID NO:2
实施例3、GhTPS-2基因植物表达载体构建。
选择植物双元表达载体pCAMBIA2300(购自北京鼎国昌盛生物技术有限责任公司)作为植物表达载体,用Pnos启动子替换NPTH基因含双增强子的35S启动子,以降低NPTII蛋白在植物中的表达。选择含双增强子的35S启动子及终止子Tnos分别作为GhTPS-2基因的启动子和终止子。
用引物SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:20以植物表达载体pBI121(购自北京华夏远洋科技有限公司)为模板扩增Pnos,采用TaKaRa的PrimeSTAR HS DNA聚合酶。50μl PCR反应体系:10μl 5×PS Buffer,3μl 2.5mM的dNTP,1.0μl pBI121,1.0μl P rimeSTAR、10μM的引物SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:20各2.0μl,以及31μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,33个循环(94℃变性30秒,56℃退火30秒,72℃延伸30秒),72℃延伸10分钟。通过EcoRI、BglII酶切后将所得PCR产物连接到pCAMBIA2300(Promega,T4连接酶盒)获得pCAMBIA2300-1。
SEQ ID NO:19:
GCACGAATTCATACAAATGGACGAACGGAT
SEQ ID NO:20:
ATCCAGATCTAGATCCGGTGCAGATTATTTG
SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22以pBI121为模板扩增Tnos,采用TaKaRa的PrimeSTAR HS DNA聚合酶。50μl PCR反应体系:10μl 5×PS Buffer,3μl 2.5mM的dNTP,1.0μl pBI121,1.0μl PrimeSTAR、10μM的引物SEQ ID NO:21和SEQ ID NO:22各2.0μl,以及31μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,33个循环(94℃变性30秒,58℃退火30秒,72℃延伸30秒),72℃延伸10分钟。通过KpnI、EcoRI酶切后将所得PCR产物连接到pCAMBIA2300-1(Promega T4连接酶盒)获得pCAMBIA2300-2。
SEQ ID NO:21:
CGGGGTACCGAATTTCCCCGATCGTTCAAA
SEQ ID NO:22:
TCAGAATTCCCAGTGAATTCCCGATCTAGTA
SEQ ID NO:23和SEQ ID NO:24以pCAMBIA2300质粒为模板扩增拟南芥35S启动子。采用TaKaRa的PrimeSTAR HS DNA聚合酶。50μl PCR反应体系:10μl 5×PS Buffer,3μl2.5mM的dNTP,1.0μl稀释50倍的pCAMBIA2300质粒,1.0μl PrimeSTAR、10μM的引物SEQ IDNO:23和SEQ ID NO:24各2.0μl,以及31μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,33个循环(94℃变性30秒,50℃退火30秒,72℃延伸30秒),72℃延伸10分钟。通过HindIII、XbaI酶切后将所得PCR产物连接到(连接方法同上)pCAMBIA2300-2获得pCAMBIA2300-3
SEQ ID NO:23:
ACTAAGCTTATGGTGGAGCACGACACTCT
SEQ ID NO:24:
GCTCTAGAAGAGATAGATTTGTAGAGAGAGAC
SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26扩增GhTPS-2(模板是实施例2所获得的阳性GhTPS-2-pGEM质粒),采用Stratagene的PfuUltra II Fusion HS DNA Polymerase。50μl PCR反应体系:5μl 10×PfuUltra II reaction Buffer,0.5μl 25mM的dNTP,2.0μl GhTPS-2-pGEM质粒,1.0μl PfuUltra II Fusion HS DNA Polymerase、10μM的引物SEQ ID NO:25和SEQID NO:26各2.0μl,以及37.5μl的双蒸水。PCR反应条件:95℃预变性2分钟,35个循环(95℃变性25秒,53℃退火25秒,72℃延伸2分钟,72℃延伸5分钟。通过XbaI、KpnI酶切后将所得PCR产物连接(连接方法同上)到pCAMBIA2300-3,获得植物表达载体35S-GhTPS-2-2300。
SEQ ID NO:25:
AATCTAGAATGCCTGGAAACAAGTACAAC
SEQ ID NO:26:
GCGGTACCTCAAGTGCCTTTTGCTAGTC
实施例4、35S-GhTPS-2-2300表达载体转化农杆菌。
农杆菌LBA4404(购自Biovector Science Lab,Inc)感受态细胞的制备:提前1-2天将农杆菌LBA4404在含50μg/ml利福平和50μg/ml链霉素的LB固体培养基上划单斑接种,28℃培养1至2天。挑取单菌落接种于5ml含50μg/ml利福平和50μg/ml链霉素的LB液体培养基中,28℃下摇动培养过夜(约12-16小时)至OD600值为0.4,形成种子菌液。取5ml活化后的菌液(1∶20的比例)接种于100ml同样浓度抗生素的LB液体培养基中,28℃摇动培养2-2.5小时至OD600=0.8。冰浴菌液10分钟,每隔3分钟摇匀一次,使细菌均匀进入休眠状态。于4℃下4000g离心10分钟,弃上清液;加入1ml冰预冷的10%(v/v)甘油重悬浮菌体,4℃下4000g离心10分钟,收集沉淀;用冰预冷的10%(v/v)甘油重复洗3-4次;加入适量冰浴预冷的10%(v/v)甘油重新悬浮细菌沉淀,以40μl/管将其分装,于-70℃保存备用。
转化农杆菌:在冰上融化感受态细胞,往40μl的感受态细胞中加入1μl实施例3中所得的阳性35S-GhTPS-2-2300质粒,混匀后冰浴约10分钟。将所述感受态细胞和质粒DNA的混合物用移液枪转移到冰预冷的电击杯中,轻敲使悬浮液到达底部,注意不要有气泡。将电击杯(购自Bio-Rad)放到电击室的滑道上,推动滑道将电击杯放至电击室基座电极处。使用0.1cm规格的电击杯,MicroPuMUer(购自Bio-Rad)的程序设置为“Agr”,电击一次。立即取出电击杯,加入28℃预热的200μl LB培养基。快速而轻柔的用移液枪将细胞打匀。将悬浮液转入1.5ml的离心管,在28℃下,225rpm培养1小时。取100-200μl的菌液涂布于相应的抗性筛选培养基平板上(LB固体培养基,含50μg/ml利福平、50μg/ml链霉素、50μg/ml卡那霉素),28℃培养。筛选阳性转化克隆,并将其菌液于-70℃保存备用。
实施例5、利用农杆菌介导的转化法获得转基因拟南芥。
待转化植株培养:拟南芥种子(哥伦比亚型,来自美国俄亥俄州立大学的拟南芥生物资源中心)播种在泥炭土中,经4℃低温处理3天后,置于23℃、16小时光照/8小时黑暗的培养箱中发芽。7-10天后移栽到装有泥炭土和蛭石(体积比3∶1)的口径为7.5cm的塑料钵中,每钵栽种6株,置于23℃,16小时光照/8小时黑暗的培养箱中生长。移栽前每钵浇营养液40ml,移栽后视土壤湿度及时补充水分。在生长期间适当浇灌营养液。按需要每3-4周一次(或者时间更长)。为了在每个植株上得到较多的花芽,当大多数植株第一个花序形成后剪去第一个花序,解除顶端优势,促使多个次生花序的同步出现。当大多数花序约1-10cm高(剪去第一个花序后4-8天)时准备浸染。
农杆菌的培养:取出实施例4中保种的农杆菌阳性转化克隆的菌液活化后,挑取农杆菌单菌落接种到10mL无菌LB液体培养基中(含75mg/L利福平、100mg/L链霉素和100mg/L卡那霉素),28℃恒温下250转/分钟振摇过夜培养。再将所得到的菌液按1%-2%的体积比接种到200mL同样含上述抗生素的LB液体培养基中,28℃恒温振摇使农杆菌的浓度达到OD600=1.8,然后在4℃下3000转/分钟离心15分钟,弃去上清液后用浸染培养基(该浸染培养基含有5.0%的蔗糖和0.05%(500μL/L)的Silwet L-77)重新悬浮农杆菌,悬浮至OD600约0.80。
花序的浸染:将上述含农杆菌的浸染培养基加入大口容器中,每个口径9cm的容器中加入200-300mL所述含农杆菌的浸染培养基用于浸染。将植株倒置,使地上组织全部浸没在农杆菌悬浮液中3-5秒,并要轻轻搅动。浸润后植株上应该有一层液体膜。浸染过的植株放在塑料盘中,用干净的塑料或保鲜膜覆盖以保湿,然后放置在弱光或暗处过夜,注意小心防止阳光直射植株。处理后约12-24小时去掉覆盖。正常培养植株,植株进一步生长3-5周,直至角果变褐变干。收获种子,并将种子用离心管在4℃下干燥贮存。
转基因种子筛选:配制含1/4MS大量元素(4.695mM KNO3,0.3125mM KH2PO4,5.15mMNH4NO3,0.375mM MgSO4,0.75mM CaCl2,25μM KI,50μM H3BO3,50μM MnSO4,15μM ZnSO4,0.5μMNa2MoO4,0.05μM CoCl2,50μM Na2EDTA,50μM FeSO4)的水溶液,加入0.8%琼脂粉,用微波炉加热至琼脂完全溶化,待冷却到50℃左右,加入所需量的终浓度为50mg·L-1的卡那霉素,摇匀后每培养皿中倒入25mL,置实验台冷却凝固后即可播种。把称量好的种子倒在一张复印纸上,用手指轻敲复印纸,将种子均匀地播种在琼脂胶上,盖上培养皿盖,置4℃冰箱冷处理72小时后,移至23℃、16小时光照/8小时黑暗的培养箱中发芽,定期统计种子发芽和幼苗生长情况,将抗性幼苗及时移栽到营养土中。移栽后视土壤湿度及时补充水分。在生长期间适当浇灌营养液。取生长20天的拟南芥叶片0.1g,提取DNA,用SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17扩增GhTPS-2:(50μl PCR反应体系:5μl 10×Ex Buffer,3μl 2.5mM的dNTP,2.0μl DNA,1.0μl Ex Taq、10μM的引物SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17各2.0μl,以及35μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,33个循环(94℃变性45秒,53℃退火45秒,72℃延伸2分钟),72℃延伸7分钟),将PCR鉴定为阳性的植株进行编号(T1H1-T1H12),并保存。
实施例6、过表达GhTPS-2的转基因拟南芥T1代植株的耐旱模拟实验及功能鉴定。
灭过菌的蛭石用1/2MS培养基浸透。T1H1-T1H6及对照拟南芥种子分别播种在蛭石上,每盆播种10颗种子,25℃、10小时光培养/14小时暗培养循环,每7天浇一次1/2MS,培养20天之后,每盆保留大小较一致的4棵苗,用于干旱实验。转基因拟南芥、对照拟南芥干旱14天(不浇水),25℃、10小时光培养/14小时暗培养循环。T1代转基因植株(T0代转基因植株的种子长成的植株)的抗旱性鉴定表明,对照植株都萎蔫严重,而T1H1、T1H2、T1H3、T1H4、T1H5、T1H6六个株系共28棵(每株系各4-5)拟南芥中25棵能够存活并继续生长显现出明显的耐旱性(参见图3a和3b,以T1H2为例,T1H1、T1H3、T1H4、T1H5、T1H6的结果与T1H2类似,在此未示出)。
实施例7、在转录水平上验证GhTPS-2蛋白表达。
分别取对照拟南芥植株、耐旱转基因拟南芥T1代植株(分别属于T1H1、T1H2、T1H3、T1H4、T1H5、T1H6六个株系)和不耐旱转基因拟南芥T1代植株的干旱10天的叶片各0.05g,用植物RNA提取试剂盒(Invitrogen)提取的总RNA。用HITACHI公司的紫外分光光度计U-2001测定总RNA在260nm和280nm的吸光度值,计算各个RNA浓度。依照Invitrogen反转录试剂盒SuperScript III Reverse Transcriptase所示方法进行反转录(2μg总RNA作为模板,反转录引物SEQ ID NO:18)。通过SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17扩增GhTPS-2,检测TPS-2蛋白相对表达情况。
采用TaKaRa的PrimeSTAR HS DNA聚合酶,以反转录的cDNA为模板进行PCR反应。50μl PCR反应体系:10μl 5×PS Buffer,3μl 2.5mM的dNTP,2.0μl cDNA,1.0μl PrimeSTAR、10μM的引物SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17各2.0μl,以及30μl的双蒸水。PCR反应条件:94℃预变性5分钟,29个循环(94℃变性45秒,53℃退火45秒,72℃延伸2分钟),72℃延伸10分钟。
产物电泳结果如图4所示:M为DNA Ladder Marker(DL2000,TakaRa),1-4为非转基因拟南芥对照,5-11为耐旱转基因拟南芥T1代植株(依次为:T1H1、T1H2、T1H3、T1H4、T1H5、T1H6、T1H7),12-15为不耐旱转基因拟南芥T1代植株。图中所示PCR产物电泳条带大小与GhTPS-2的大小一致(约2.8Kbp)。结果表明,对照拟南芥没有GhTPS-2转录,耐旱转基因拟南芥T1代植株中GhTPS-2的转录较强,不耐旱转基因拟南芥T1代植株转录很弱或者没有转录。

Claims (7)

1.一种编码棉花海藻糖合成酶的基因编码的蛋白,其氨基酸序列为SEQ ID NO:1。
2.编码权利要求1所述蛋白的基因,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
3.一种重组表达载体,其含有权利要求2所述的基因并且所述基因的核苷酸序列与所述重组表达载体的表达控制序列可操作地连接。
4.一种重组细胞,其含有权利要求2所述的基因或者权利要求3所述的重组表达载体;所述重组细胞为重组农杆菌细胞。
5.一种改善植物耐旱性的方法,包括:将权利要求2所述的基因或者权利要求3所述的重组表达载体导入植物或植物组织并使所述基因表达;所述植物是拟南芥。
6.一种制备转基因植物的方法,包括:在有效产生植物的条件下培养含有权利要求2所述的基因或者权利要求3所述的重组表达载体的植物或植物组织,其中所述植物是拟南芥。
7.权利要求2所述的基因、权利要求3所述的重组表达载体或者权利要求4所述的重组细胞用于改善植物耐旱性以及用于植物育种的用途,其中所述植物是拟南芥。
CN201380078631.9A 2013-09-17 2013-09-17 一种棉花海藻糖合成酶tps-2及其编码基因与应用 Expired - Fee Related CN105492458B (zh)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PCT/CN2013/083596 WO2015039272A1 (zh) 2013-09-17 2013-09-17 一种棉花海藻糖合成酶tps-2及其编码基因与应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN105492458A CN105492458A (zh) 2016-04-13
CN105492458B true CN105492458B (zh) 2019-04-16

Family

ID=52688067

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201380078631.9A Expired - Fee Related CN105492458B (zh) 2013-09-17 2013-09-17 一种棉花海藻糖合成酶tps-2及其编码基因与应用

Country Status (2)

Country Link
CN (1) CN105492458B (zh)
WO (1) WO2015039272A1 (zh)

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2001064850A1 (en) * 2000-02-29 2001-09-07 Auburn University Genetic engineering of drought tolerance via a plastid genome
CN101215569B (zh) * 2008-01-11 2011-12-21 未名兴旺系统作物设计前沿实验室(北京)有限公司 一个与耐逆相关的水稻海藻糖合酶基因的克隆及应用
CN101586107A (zh) * 2009-07-08 2009-11-25 四川农业大学 一种来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列及其克隆方法
CN102952786B (zh) * 2012-12-11 2014-03-26 中国热带农业科学院橡胶研究所 一种植物耐逆性相关蛋白及其编码基因的应用
CN103103168B (zh) * 2013-02-06 2014-09-03 中国热带农业科学院橡胶研究所 一种促进植物生长和开花的蛋白及其编码基因的应用

Also Published As

Publication number Publication date
WO2015039272A1 (zh) 2015-03-26
CN105492458A (zh) 2016-04-13

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN105452272A (zh) 一种棉花钙调磷酸酶b类似蛋白cbl-3及其编码基因与应用
CN105492458B (zh) 一种棉花海藻糖合成酶tps-2及其编码基因与应用
CN105452453A (zh) 一种小盐芥钙调磷酸酶b类似蛋白cbl-4及其编码基因与应用
CN105452452B (zh) 一种木榄液泡焦磷酸酶vp2及其编码基因与应用
CN105073773B (zh) 一种小盐芥液泡膜焦磷酸酶vp1及其编码基因与应用
CN105189537A (zh) 一种棉花亮氨酸拉链蛋白bZIP-3及其编码基因与应用
CN105008389B (zh) 一种小盐芥钼辅酶因子硫化酶mcsu-2及其编码基因与应用
CN105408350B (zh) 一种白骨壤单加氧酶cmo及其编码基因与应用
CN105073774B (zh) 一种棉花亮氨酸拉链蛋白bZIP-2及其编码基因与应用
CN105189535A (zh) 一种棉花高亲和钾离子转运蛋白hkt2及其编码基因与应用
CN105408349B (zh) 一种木榄钼辅酶因子硫化酶mcsu及其编码基因与应用
CN105026420A (zh) 一种棉花锌指蛋白zat10-1及其编码基因与应用
CN105008391A (zh) 一种棉花锌指蛋白azf2-1及其编码基因与应用
CN105008390B (zh) 一种棉花同源异型‑亮氨酸拉链蛋白HDbZIP‑2及其编码基因与应用
CN105102622B (zh) 一种棉花玉米黄素环氧化酶zep‑1及其编码基因与应用
CN105008386B (zh) 一种小盐芥液泡膜钠氢反向转运蛋白nhx2及其编码基因与应用
CN104884619B (zh) 一种棉花异戊烯基转移酶ipt2及其编码基因与应用
CN105073993B (zh) 一种棉花钼辅酶因子硫化酶mcsu‑1及其编码基因与应用
CN105452273A (zh) 一种小盐芥脱水素蛋白dh5及其编码基因与应用
CN104968787A (zh) 一种棉花同源异型-亮氨酸拉链蛋白HDbZIP-1及其编码基因与应用
CN105452278A (zh) 一种小盐芥同源异型-亮氨酸拉链蛋白HDbZIP-3及其编码基因与应用
CN105026421B (zh) 一种木榄蛋白激酶cipk1及其编码基因与应用
CN105452281A (zh) 一种棉花海藻糖合成酶tps-3及其编码基因与应用
CN104995204B (zh) 一种秋茄钠氢转运蛋白nha1及其编码基因与应用
CN105051059B (zh) 一种棉花脱水素蛋白及其编码基因与应用

Legal Events

Date Code Title Description
C06 Publication
PB01 Publication
C10 Entry into substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant
CP02 Change in the address of a patent holder
CP02 Change in the address of a patent holder

Address after: 518117 7th floor, Chuangshi seed industry building, A701, No.22, Puzi Road, Pingdi street, Longgang District, Shenzhen, Guangdong Province

Patentee after: BIOCENTURY TRANSGENE (CHINA) Co.,Ltd.

Address before: 518048, the 308 tower of Oriental Pearl science and technology building, Sha Mo Industrial Zone, Shenzhen, Guangdong, Futian District, 4

Patentee before: BIOCENTURY TRANSGENE (CHINA) Co.,Ltd.

CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee
CF01 Termination of patent right due to non-payment of annual fee

Granted publication date: 20190416