CN105420237A - 靶向抑制小鼠白细胞介素17A基因的序列siRNA-180 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一个靶向抑制小鼠白细胞介素17A的siRNA-180序列,siRNA-180的序列为SEQ.No.1。本发明的有益效果为:本发明提供的一个靶向抑制小鼠白细胞介素17A的siRNA-180序列,通过相关实验结果表明,其可以抑制小鼠细胞介素17A基因的表达,同时,相关实验结果提示,序列siRNA-180可用于抑制由小鼠细胞介素17A基因的表达引起的病理损伤,并能调节与之相关的细胞因子的表达,达到治愈疾病的目的。
Description
技术领域
本发明涉及一个靶向抑制小鼠白细胞介素17A的siRNA-180序列。
背景技术
白细胞介素17A(interleukin-17A,IL-17A)属于IL-17细胞因子家族,是近年来发现的重要的促炎性反应细胞因子。IL-17家族目前有6个成员,分别为:IL-17A~F,其中IL-17A是通常所说的IL-17,主要由Th17细胞分泌。IL-17受体识别相应的配体后,招募Act1/CIKS[NFκBactivator1,核因子NFκB激活剂1,又称TRAF3作用蛋白2(TRAF3IP2),也称CIKS(ConnectiontoIKK-complexandSAPK)],使其磷酸化,活化TRAF6向下游传递信号,调控炎症分子和趋化分子的表达,譬如:IL-4、IL-5、IL-6、IL-9、IL-13、TGF-β、CXCL1、CCL2、CCL7、CCL20和C-反应蛋白等的表达。IL-17A具有促炎性作用,诱导促炎性细胞因子(如IL-6,TNF-α)、趋化因子(如MCP-1和MIP-2)和基质金属蛋白酶的表达,引起组织细胞浸润和组织破坏。IL-17A也参与中性粒细胞的增殖、成熟和趋化,对T细胞的活化起协同刺激作用,并能促进树突状细胞的成熟。IL-17A可以诱导小鼠巨噬细胞和树突状细胞表面MHCI类分子的表达,继而促进抗感染细胞毒性T淋巴细胞(CTL)的增殖,使得机体能够更好的清除病原体。IL-17A也能够协同活化NK细胞,增强NK细胞杀伤活性,进而增强NK细胞杀伤性分子IFN-γ和颗粒酶B的分泌,杀伤周围肝细胞。研究表明,IL-17A在多种肝脏疾病的发生发展过程中发挥重要作用。酒精性肝病患者血清中IL-17A的水平要远远高于正常人。在慢性HBV相关肝病尤其是乙型肝炎肝硬化中IL-17A表达也明显升高。在巨型艾美耳球虫感染所诱导分泌的炎性细胞因子中,IL-17A可升高1650倍,并加重疾病。在克氏锥虫感染的急性阶段,IL-17A及TNF-α显著上调。曼氏血吸虫虫卵可溶性抗原可诱导小鼠产生高水平的IL-17A和IFN-γ,而在小鼠体内注入IL-17A特异性抗体后,肝虫卵肉芽肿炎症会受到明显抑制,表明IL-17A在曼氏血吸虫感染诱导的肝脏免疫病理损伤中发挥重要作用。综上所述,IL-17A在免疫反应中具有双重作用,即致病作用和炎性反应。对IL-17A基因进行RNA干扰(RNAinterference,RNAi),将会IL-17A的合成中断,影响其他相关因子的表达,从而达到机体调节的作用。根据小鼠IL-17A基因设计siRNA靶序列,合成siRNA正义链和反义链,并以loop相连,在细胞内转录出与siRNA相同干扰效果,但干扰时间更长的shRNA(shorthairpinRNA),发挥阻断小鼠IL-17A生成的作用。目前少有基于shRNA干扰技术靶向抑制小鼠IL-17A表达的报道,相关siRNA靶序列值得深入挖掘和应用。
发明内容
本发明的目的就是针对上述现有技术中的缺陷,提供了一个靶向抑制小鼠白细胞介素17A的siRNA-180序列,其在相关的实验中表现出对小鼠细胞介素17A基因的表达具有抑制作用。
为了实现上述目的,本发明提供的技术方案为:一个靶向抑制小鼠白细胞介素17A的siRNA-180序列,siRNA-180的序列为SEQ.No.1。
基因序列siRNA-180为:GGACTTCCTCCAGAATGTG(SEQ.No.1)。
本发明的有益效果为:本发明提供的一个靶向抑制小鼠白细胞介素17A的siRNA-180序列,通过相关实验结果表明,其可以抑制小鼠细胞介素17A基因的表达,同时,相关实验结果提示,序列siRNA-180可用于抑制由小鼠细胞介素17A基因的表达引起的病理损伤,并能调节与之相关的细胞因子的表达,达到治愈疾病的目的。
附图说明
图1显示为pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰质粒BamHI和PstI酶切鉴定结果。
其中1-5为pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180的PstI酶切结果,6-10为pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180的BamHI酶切结果。阳性重组载体可以被BamHI切开,而不能被PstI切开。
图2显示为pcDNA3.1-mIL-17A过表达载体酶切鉴定结果。
其中1,2为pcDNA3.1-mIL-17A阳性质粒1,2的酶切结果。
图3显示为本发明的pcDNA3.1-mIL-17A过表达载体和pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰载体共转染24h后,RT-PCR检测GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)/mIL-17AmRNA转录水平的扩增曲线,结果显示PCR扩增特异性高。
图4显示为本发明的pcDNA3.1-mIL-17A过表达载体和pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰载体共转染48h后,RT-PCR检测GAPDH/mIL-17AmRNA转录水平的扩增曲线,结果显示PCR扩增特异性高。
图5显示为转染24h后,各试验组mIL-17AmRNA转录水平比较。
其中,24H-N为干扰阴性对照+过表达组,24H-N1为过表达阴性对照组,24H-N0为过表达组,24H-B为空白对照组,24H-2为过表达和干扰载体组。结果显示,pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰载体+pcDNA3.1-mIL-17A过表达载体组共转染24h后,mIL-17AmRNA转录水平远低于阴性干扰对照+过表达组(P=0.000<0.05)。
图6显示为转染48h后,各试验组mIL-17AmRNA转录水平比较。
其中,48H-N为阴性干扰对照+过表达组,48H-N1为过表达阴性对照组,48H-N0为过表达组,48H-B为空白对照组,48H-2为过表达和干扰载体组。结果显示,pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰载体+pcDNA3.1-mIL-17A过表达载体组共转染48h后,mIL-17AmRNA转录水平远低于阴性干扰对照+过表达组(P=0.000<0.05)。
图7显示为转染24h后,各试验组mIL-17A蛋白表达水平比较。
结果显示,pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰载体+pcDNA3.1-mIL-17A过表达载体共转染24h后,红色荧光量远低于阴性干扰对照+过表达组和过表达组,说明在干扰片段的作用下,mIL-17A蛋白表达水平较阴性干扰对照+过表达组和过表达组低。
图8显示为转染48h后,各试验组mIL-17A蛋白表达水平比较。
结果显示,pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰载体与pcDNA3.1-mIL-17A过表达载体共转染48h后,红色荧光量远低于阴性干扰对照+过表达组和过表达组,说明在干扰片段的作用下,mIL-17A蛋白表达水平较阴性干扰对照+过表达组和过表达组低。
具体实施方式
实施例1:
以下结合实施例对本发明进行说明。
1、序列设计:
针对mIL-17A基因设计siRNA干扰序列,用于合成shRNA,siRNA-180基因序列为SEQ.No.1。
2、mIL-17A干扰载体构建:
2.1OligoDNA设计合成:
shRNA模板中的loop结构选用了TTCAAGAGA以避免形成终止信号,shRNA的转录终止序列采用T6结构。正义链模板的5’端添加了CACC,与BbsI酶切后形成的粘端互补;反义链模板的5’端添加了GATCC,与BamHI酶切后形成的粘端互补;如果shRNA的第一个碱基不是G,则在CACC后补加一个G。小鼠IL-17A基因shRNA寡核苷酸序列(shRNA-180oligoDNA)如表1所示,设计与合成由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。
表1
名称 | 序列5’-3’ | |
shRNA-180 | 上游 | CACCGGACTTCCTCCAGAATGTGTTCAAGAGACACATTCTGGAGGAAGTCCTTTTTTG |
下游 | GATCCAAAAAAGGACTTCCTCCAGAATGTGTCTCTTGAACACATTCTGGAGGAAGTCC |
2.2shDNA模板的退火:
将oligoDNA分别用TE(pH8.0)溶解,浓度为100μmol/L。取相应的正义链和反义链oligoDNA溶液,正义链和反义链oligoDNA退火反应体系如表2所示,按照表2的配比配置退火反应体系。
表2
在PCR仪上按照如下程序进行退火处理:95℃5min;85℃5min;75℃5min;70℃5min;4℃保存。退火处理后得到浓度为10μmol/L的shRNA模板。将所得模板溶液稀释50倍,终浓度为200nmol/L,用于连接反应。
2.3pGPU6/GFP/Neo载体的线性化:
取10μgpGPU6/GFP/Neo载体,按照表3pGPU6/GFP/Neo载体酶切反应体系进行酶切处理,37℃酶切1h,琼脂糖凝胶电泳,使用AgaroseGelDNAPurificationKitVer2.0回收,电泳检测估算浓度,稀释浓度至50ng/μL。
表3
2.4pGPU6/GFP/Neo-shRNA-180载体的构建:
按照表4所示的pGPU6/GFP/Neo载体与shRNA-180干扰片段的连接反应体系进行载体和片段的连接,22℃连接1h,转化Top10感受态细胞。
表4
2.5阳性克隆的鉴定与测序:
从每块平板上挑取5个菌落,接种到含50μg/mlKanamycin的LB培养基中,37℃培养16h,使用碱裂解法抽提质粒。所得质粒用BamHI,PstI分别酶切鉴定,如图1所示。阳性重组载体应该可以被BamHI切开,而不能被PstI切开。挑选酶切结果正确的两个克隆进行序列测定。
3、mIL-17A过表达载体构建:
由TaKaRa公司合成mIL-17A基因序列,同时在序列两端分别加入BamHI和NotI两个酶切位点,并连接于pMD18-Tsimple载体。用BamHI和NotI酶对pMDl8-Tsimple质粒进行双酶切,胶回收目的片段。用T4DNA连接酶连接到经BamHI和NotI双酶切并纯化回收的pcDNA3.1载体,转化JM109感受态细胞,涂布于含有100mg/ml氨苄青霉素的LB培养基平板,置于37℃培养箱过夜培养。挑取菌落置于LB培养基摇菌增殖,小量质粒制备,BamHI和NotI双酶切鉴定,阳性质粒送公司进行序列测定,确定构建表达质粒pcDNA3.1-mIL-17A序列正确且插入阅读框无误。
4、mIL-17A过表达和干扰载体共转染:
将293T细胞在10cm2培养皿中培养至80%-90%融合时,接种6孔板。倾去培养液,用2mLPBS洗涤细胞两次。加入2mLTrypsin-EDTAsolution,混匀后,37℃放置3-5min。小心吸去胰酶溶液,在加入2mL含10%FBS的DMEM培养液,吹打使细胞形成单细胞悬液。血球计数板计数,将细胞稀释至1.5×106细胞/mL。按1.5×106细胞/孔的浓度接种6孔板,混匀后于37℃下5%CO2培养条件下培养24h。在1.5mLEP管中加入250μLOpti-MEMI,加入1μgpcDNA3.1-mIL-17A过表达质粒,并加入1μgpGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰质粒。取另一1.5mLEP管,加入250μLOpti-MEMI,加入6μLlipofectamin2000,混匀,室温放置5min后将两管混合,室温放置20min。实验设过表达阴性对照组,过表达组,阴性干扰对照+过表达组及空白组。吸去6孔板中的培养液,每孔加入1mL无血清的DMEM培养液。将转染混合物逐滴加入6孔板中,混匀后,在培养箱中温育4-6h。吸弃转染液,加入1.5mL含10%FBS的DMEM培养液。37℃5%CO2培养条件下继续培养24h和48h,收样。所得细胞用于Real-TimePCR检测。
5、总RNA的提取:
吸弃6孔板中的培养液,每孔加入1mLTrizolReagent,用枪头吹打使细胞完全裂解。将裂解液转移至1.5mLEP管中,室温放置10min。加入200μL三氯甲烷,剧烈震荡混匀,室温放置10min。12000×g4℃离心10min,吸取上层清液至新离心管中,加入等体积的异丙醇,室温沉淀10min。12000×g4℃离心15min,弃上清。沉淀用500μL75%乙醇洗涤一次。12000×g4℃离心5min,回收沉淀,弃上清。常温倒置晾干10min。用20μLDEPC-H2O溶解沉淀,测定OD260、OD280,计算RNA浓度。琼脂糖电泳检查RNA的完整性。
6、Real-timePCR分析:
逆转录反应体系如表5所示,反应程序为42℃30min;85℃10min。
表5
实时荧光定量PCR反应体系如表6所示。定量PCR反应程序为95℃3min变性;95℃,12S;62℃,40S;40循环。
表6
7、免疫荧光检测:
将293T细胞在10cm2培养皿中培养至80%-90%融合时,接种12孔板。倾去培养液,用2mLPBS洗涤细胞两次。加入2mLTrypsin-EDTAsolution,混匀后,37℃放置3-5min。小心吸去胰酶溶液,加入2mL含10%FBS的DMEM培养液,吹打使细胞形成单细胞悬液。血球计数板计数,将细胞稀释至1.5×106细胞/mL。按2×105细胞/孔的浓度接种12孔板,混匀后于37℃5%CO2培养条件下培养24h。在1.5mLEP管中加入250μLOpti-MEMI,加入0.4μgpcDNA3.1-mIL-17A过表达质粒,并加入0.4μgpGPU6/GFP/Neo-shRNA-180干扰质粒。取另一1.5mLEP管,加入250μLOpti-MEMI,加入3μLlipofectamin2000,混匀,室温放置5min后将两管混合,室温放置20min。实验设过表达阴性对照组,过表达组,阴性干扰对照+过表达组及空白组。吸去12孔板中的培养液,每孔加入1mL无血清的DMEM培养液。将转染混合物逐滴加入12孔板中,混匀后,在培养箱中温育5h。吸弃转染液,加入1.5mL含10%FBS的DMEM培养液。37℃5%CO2培养条件下继续培养24h和48h。取出12孔板,PBS清洗三次,每次10min。4%多聚甲醛,室温固定30min,去除固定液,PBS洗三次,每次10min。用含0.2%TritonX-100的PBS室温下通透处理15min,PBS漂洗三次,每次10min。一抗1:600稀释,二抗1:150稀释,并加入1%BSA,4℃孵育过夜。取出12孔板,PBS清洗未结合的抗体稀释液,显微镜下观察拍照。
最后应说明的是:以上所述仅为本发明的优选实施例而已,并不用于限制本发明,尽管参照前述实施例对本发明进行了详细的说明,对于本领域的技术人员来说,其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分技术特征进行等同替换。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
<110>中国农业科学院兰州兽医研究所
<120>靶向抑制小鼠白细胞介素17A基因的序列siRNA-180
<210>1
<211>19
<212>DNA
<213>人工序列(siRNA-180)
<400>1
ggacttcctccagaatgtg19
Claims (1)
1.一个靶向抑制小鼠白细胞介素17A的siRNA-180序列,其特征在于,siRNA-180的序列为SEQ.No.1。
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