CN105177000A - 一种抑制Survivin基因表达的siRNA及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种抑制survivin基因表达的双链siRNA分子,其由正义链和反义链组成,其中,所述正义链的序列为:5’-GGACCACCGCAUCUCUACAdTdT-3’;所述反义链的序列为:5’-UGUAGAGAUGCGGUGGUCCdTdT-3’。由于survivin是一种凋亡抑制蛋白,与肿瘤细胞的凋亡有关,当该siRNA双链序列进入到生物体内时,能够高效抑制survivin基因的表达,诱导癌细胞的凋亡,达到治疗癌症的目的。双链siRNA分子能够用于制备治疗肺癌和乳腺癌的药物。
Description
技术领域
本发明属于基因工程领域,具体涉及一种抑制Survivin基因表达的双链siRNA分子及其应用。
背景技术
RNA干扰(RNAinterference,RNAi)现象最初发现于植物和线虫当中是指内源或外源性的双链RNA分子导致细胞内特定基因表达的沉默。通过导入外源siRNA分子(即siRNA递送)可以对细胞内目的蛋白的表达水平进行调控。当被下调的蛋白为疾病相关蛋白时,RNAi就有可能成为一种新的治疗策略。在肿瘤、感染和糖尿病等疾病的治疗中,RNAi已经成为国际上的研究热点之一。
Survivin是凋亡抑制蛋白家族的新成员,Survivin具有肿瘤特异性,只表达于肿瘤和胚胎组织,特别是在肺癌细胞和乳腺癌上高度表达,且与肿瘤细胞的凋亡密切相关。Survivin主要通过两条途径来抑制细胞凋亡:①直接抑制凋亡终末效应酶Caspase-3和Caspase-7的活性来阻断各种刺激诱导的细胞凋亡过程;②Survivin与周期蛋白激酶相互作用阻断凋亡信号转导通路。
在肿瘤治疗过程中,耐药性是困扰医生的一大难题,因此,设计一种双链siRNA分子,导入生物体内后,既能特异高效地沉默相应的Survivin基因,又能改善机体的耐药状态,对肺癌和乳腺癌的治疗提供了指导意义。
发明内容
为了解决目前癌症治疗的不足,本发明人进行了广泛深入的研究,并最终完成本发明。
因此,本发明的一个目的是提供一种抑制survivin基因表达的双链siRNA分子,该双链siRNA分子既可以特异高效地抑制Survivin基因的表达,又能改善机体的耐药状态本发明的另一个目的是提供上述双链siRNA分子在制备治疗肿瘤的药物中的应用。
本发明是通过以下技术方案实现的:
在本发明的一个方面,提供了一种抑制Survivin基因表达的siRNA,其由正义链和反义链组成,其中,
所述正义链的序列为:5’-GGACCACCGCAUCUCUACAdTdT-3’(SEQIDNO.1);
所述反义链的序列为:5’-UGUAGAGAUGCGGUGGUCCdTdT-3’(SEQIDNO.2)。
在本发明的siRNA的序列中的A、G、C、U分别表示腺嘌呤核糖核苷酸、鸟嘌呤核糖核苷酸、胞嘧啶核糖核苷酸和尿嘧啶核糖核苷酸,dT(或表示为t)表示胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸。
在本发明的另一个方面,提供了上述双链siRNA分子在制备治疗肿瘤的药物中的应用。
本发明中,优选地,所述肿瘤为肺癌或乳腺癌。
上述双链siRNA分子能够用于制备治疗肿瘤(特别是,肺癌和乳腺癌)的药物。
由于survivin是一种凋亡抑制蛋白,与肿瘤细胞的凋亡有关,当该siRNA双链序列进入到生物体内时,能够高效抑制survivin基因的表达,诱导癌细胞的凋亡,达到治疗癌症的目的。双链siRNA分子能够用于制备治疗肺癌和乳腺癌的药物。本发明的积极效果在于:提供了一种新的高效靶向survivin基因的双链siRNA分子,同时还能改善机体的耐药状态,对肺癌和乳腺癌的治疗提供了指导意义。
附图说明
图1是显示WesternBlot检测肿瘤细胞中转染双链siRNA分子后survivin蛋白表达水平的图;
图2是显示荧光定量PCR检测肿瘤细胞中转染双链siRNA分子后survivinmRNA表达水平的图;
图3是实施例10中的显影结果。
具体实施方式
为使本发明更加容易理解,下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。然而,这些实施例只用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。
实施例1:一种抑制Survivin基因表达的siRNA的化学合成
根据survivin基因的核苷酸序列,设计小分子干扰siRNA:
正义链:5′-GGACCACCGCAUCUCUACAdTdT-3′(SEQIDNO.1)
反义链:5′-UGUAGAGAUGCGGUGGUCCdTdT-3′(SEQIDNO.2)
将该序列在人类EST数据库中比对,确定没有与它相同的其它基因序列。siRNA由广州锐博生物科技有限公司合成。该siRNA序列中的A、G、C、U分别表示腺嘌呤核糖核苷酸、鸟嘌呤核糖核苷酸、胞嘧啶核糖核苷酸和尿嘧啶核糖核苷酸,t表示胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸。
实施例2:MCF-7乳腺癌细胞的活化与复苏
将MCF-7乳腺癌细胞(购自ACTT)冻存管从液氮中取出,迅速将冻存管投入到37℃的水浴锅中迅速解冻,并要不断的摇动,使管中的液体迅速融化。溶化后,用酒精棉球擦拭冻存管的外壁,再拿入超净台内。将MCF-7细胞转移至15ml离心筒中,将10mlDMEM完全培养基加入到装有MCF-7细胞的离心筒中,1000rpm,离心5min,弃上清,再次加入新鲜的完全培养基重悬细胞,将重悬后的细胞分装到细胞培养瓶中,置于37℃、5%CO2培养箱培养,次日更换新鲜培养基,待细胞长至占细胞培养瓶底部70%~80%,即可进行消化传代。
实施例3:MCF-7乳腺癌细胞的传代
当MCF-7乳腺癌细胞密度达到70%~80%时,在超净台中,将培养瓶中的培养基倒掉,用PBS溶液洗两次后,加入胰蛋白酶1ml,置于37℃培养箱中消化3~4min,待细胞变圆,敲打培养瓶底部,使贴壁细胞全部变成悬浮状态,加入1ml的完全培养基终止消化。吹打细胞使其成为悬浮单个细胞,取一定量的细胞悬液放回至细胞培养瓶中继续培养。
实施例4:MCF-7乳腺癌细胞的转染
将约2×105个的MCF-7细胞悬液接种到两个6孔板中,在37℃、5%CO2培养箱细胞培养24小时后,用lipofectame2000将siRNA-lipo2000混合液进行转染,使siRNA的最终浓度分别为10nM、20nM、30nM,同时设置一组空白对照组(Control)。对于每个转染样品,按如下步骤准备siRNA-lipo2000混合液:
a.稀释实施例1中合成的siRNA:用50μl不含血清培养基稀释5,10,15pmolsiRNA(加入细胞中的siRNA终浓度分别为10nM、20nM、30nM),轻轻混匀,室温孵育5min;
b.稀释lipo2000:用50μl不含血清培养基稀释1μllipo2000,轻轻混匀并室温孵育5min;
c.将步骤a与步骤b得到的液体轻轻混匀,室温孵育20min,得到siRNA-lipo2000混合液。
d.转染:将siRNA-lipo2000混合液加入含有MCF-7细胞以及培养液的培养板各孔中,轻轻混匀;
e将培养板置于37℃的CO2培养箱中培养48h,培养4h后,可以将孔里含有siRNA-lipo2000混合液的培养基移去,更换新鲜的生长培养基继续培养至48h,转染48h后,收集细胞,进行Survivin基因和蛋白的含量的检测。
实施例5:A549肺癌细胞的活化与复苏
将A549肺癌细胞(购自ACTT)冻存管从液氮中取出,迅速将冻存管投入到37℃的水浴锅中迅速解冻,并要不断的摇动,使管中的液体迅速融化。溶化后,用酒精棉球擦拭冻存管的外壁,再拿入超净台内。将A549细胞转移至15ml离心筒中,将10mlRPMI-1640完全培养基加入到装有A549细胞的离心筒中,1000rpm,离心5min,弃上清,再次加入新鲜的完全培养基重悬细胞,将重悬后的细胞分装到细胞培养瓶中,置于37℃、5%CO2培养箱培养,次日更换新鲜培养基,待细胞长至占细胞培养瓶底部70%~80%,即可进行消化传代。
实施例6:A549肺癌细胞的传代
当A549肺癌细胞密度达到70%~80%时,在超净台中,将培养瓶中的培养基倒掉,用PBS溶液洗两次后,加入胰蛋白酶1ml,置于37℃培养箱中消化3~4min,待细胞变圆,敲打培养瓶底部,使贴壁细胞全部变成悬浮状态,加入1ml的完全培养基终止消化。吹打细胞使其成为悬浮单个细胞,取一定量的细胞悬液放回至细胞培养瓶中继续培养。
实施例7:A549肺癌细胞的转染
将约2×105个的A549细胞悬液接种到两个6孔板中,在37℃、5%CO2培养箱细胞培养24小时后,用lipofectame2000将siRNA-lipo2000混合液进行转染,使siRNA的最终浓度分别为10nM、20nM、30nM,同时设置一组空白对照组(Control)。对于每个转染样品,按如下步骤准备siRNA-lipo2000混合液:
a.稀释实施例1中合成的siRNA:用50μl不含血清培养基稀释5,10,15pmolsiRNA(加入细胞中的siRNA终浓度分别为10nM、20nM、30nM),轻轻混匀,室温孵育5min;
b.稀释lipo2000:用50μl不含血清培养基稀释1μllipo2000,轻轻混匀并室温孵育5min;
c.将步骤a与步骤b得到的液体轻轻混匀,室温孵育20min,得到siRNA-lipo2000混合液。
d.转染:将siRNA-lipo2000混合液加入含有A549细胞以及培养液的培养板各孔中,轻轻混匀;将培养板置于37℃的CO2培养箱中培养48h,培养4h后,可以将孔里含有siRNA-lipo2000混合液的培养基移去,更换新鲜的生长培养基继续培养至48h,转染48h后,收集细胞,进行Survivin基因和蛋白的含量的检测。
实施例8:荧光定量PCR检测survivinmRNA表达水平
分别将实施例4和7中的细胞,用胰酶消化,收集到DEPC处理的1.5ml的EP管中,用mRNA提取试剂盒RNAisoPlus提取纯化总RNA,操作按试剂盒说明书进行,提取后的RNA,按照反转录试剂盒说明书进行,将RNA反转成cDNA备用。
将上述制备的cDNA作荧光定量PCR检测,荧光定量PCR采用SYBRGreen的方法,所用PCR试剂为SYBRPremixExTaqTM(宝生物工程大连有限公司生产),PCR程序设置按照该试剂盒提供的说明书进行,PCR检测中使用GAPDH基因作为内参基因,进行相对定量分析Survivin基因的表达水平。检测结果如图2所示,由图可见,survivin基因的表达水平明显受到siRNA的抑制而降低,且在siRNA为30nM时,survivin基因的沉默效率即可达到85%以上,特别是在MCF-7细胞系中,在siRNA为30nM时,survivin基因的沉默效率即可达到90%,所以本发明所述的siRNA可以用于乳腺癌和肺癌的治疗。
实施例9:WesternBlot检测siRNA对survivin蛋白表达的抑制情况
分别将实施例4和7中的细胞,去除培养基后,用PBS洗两遍,加入100μL细胞裂解液,在冰浴上裂解10min,用细胞刮将细胞刮下,转移至1.5ml离心管中,10000rpm离心5min后,取上清液测定蛋白浓度。每组取30μg蛋白进行SDS-PAGE,电泳完成后转至PVDF膜上,封闭后进行survivin一抗及羊抗兔二抗的处理,然后进行化学发光反应,显影。结果见图1,在MCF-7和A549细胞系中,siRNA都能显著的降低survivin蛋白的表达,所以本发明所述的siRNA可以用于乳腺癌和肺癌的治疗。
实施例10:WesternBlot检测siRNA对耐药基因MDR的蛋白表达的抑制情况
从上述实施例8和9可以看出,当SurvivinRNA的转染浓度在30nM时,能显著地降低survivin蛋白的表达,因此,我们在实施例7中考察30nMSurvivinRNA作用细胞时,对细胞的耐药性基因MDR表达的影响。分别将MCF-7和A549按照实施例4和7的方法进行转染,转染48h后,去除培养基,用PBS洗两遍,每孔加入100μL细胞裂解液,在冰浴上裂解10min,用细胞刮将细胞刮下,转移至1.5ml离心管中,10000rpm离心5min后,取上清液测定蛋白浓度。每组取30μg蛋白进行SDS-PAGE,电泳完成后转至PVDF膜上,封闭后进行MDR一抗及羊抗兔二抗的处理,然后进行化学发光反应,显影。结果见图3,在MCF-7和A549细胞系中,siRNA都能一定程度降低MDR蛋白的表达,所以本发明所述的siRNA可以改善细胞的耐药情况,对肿瘤的治疗提供了指导意义。
Claims (4)
1.一种抑制survivin基因表达的双链siRNA分子,其由正义链和反义链组成,其中,
所述正义链的序列为:5’-GGACCACCGCAUCUCUACAdTdT-3’;
所述反义链的序列为:5’-UGUAGAGAUGCGGUGGUCCdTdT-3’。
2.如权利要求1所述的双链siRNA分子在制备治疗肿瘤的药物中的应用。
3.如权利要求2所述的用途,其中,所述肿瘤为肺癌。
4.如权利要求2所述的用途,其中,所述肿瘤为乳腺癌。
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