CN104745462B - 一种高通量dna测序芯片 - Google Patents
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Abstract
本发明属于生物医学工程设备制造技术和相关器件领域，具体涉及一种高通量DNA测序芯片。芯片设置有反应池，反应池上方有上盖，芯片的材料为光纤或石英，芯片上有反应池68-72万个，反应池直径为28-30μm，芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm。芯片使用Infinium芯片制造技术制备。本发明提供了一种高通量的测序芯片，保证了测序的准确度和效率。
Description
技术领域
本发明属于生物医学工程设备制造技术和相关器件领域，具体涉及一种高通量DNA测序芯片。
背景技术
人类基因组计划的完成对当代的生物学研究和医学研究产生了巨大的影响。人们能够从基因水平上认识生命现象的差异，疾病发生、发展的规律，以及药物与生命体的相互作用。就基因序列分析而言，后基因组时代的重点已由单个物种的全基因组序列测定转移到了对某一物种在基因组DNA序列层次上个体遗传差异及物种间遗传差异的比较。在基础研究方面，研究疾病基因的遗传规律，克隆致病基因；在应用方面，直接寻找疾病的易感基因突变位点，通过对于某一特定疾病的大量基因组样本中突变基因型的大规模鉴定和检测，可以获得与该疾病相关基因型的信息，实现个体化医学。如何实现个体全基因组DNA序列的快速有效低成本测定，已是当今国际基因组科学及其应用所面临的重要挑战之一，也是我国生命科学和医学发展面临的又一次重大机遇。国家科技部在2006年启动的“十一五”863“生物芯片”重点项目中对低成本快速人类全基因组的测序技术和相关仪器的研究进行了重点支持。
与传统定量PCR（qPCR）技术不同，数字PCR采用绝对定量的方式，不依赖于标准曲线和参照样本，直接检测目标序列的拷贝数。由于这种检测方式具有比传统qPCR更加出色的灵敏度和特异性、精确性，dPCR迅速得到广泛的应用，这项技术在极微量核酸样本检测、复杂背景下稀有突变检测和表达量微小差异鉴定方面变现出的优势已被普遍认可，而其在基因表达研究、microRNA研究、基因组拷贝数鉴定、癌症标志物稀有突变检测、致病微生物鉴定、转基因成分鉴定、NGS测序文库精确定量和结果验证等诸多方面具有的广阔应用前景已经受到越来越多的关注。现有的微流控基因芯片仍存在测序通量小、精确度低的缺点，需要制备出一种新型的基因芯片以满足实际应用的需求。
发明内容
本发明的一个目的是一种高通量DNA测序芯片，所述芯片设置有反应池，反应池上方有上盖，所述芯片的材料为光纤或石英，优选为光纤，所述芯片的有效面积为27.6x27.6mm2。
所述芯片上有反应池68-72万个。
所述反应池直径为28-30um。
所述芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm。
所述芯片使用Infinium芯片制造方法制备。
制得芯片后，在芯片表面均匀喷涂碳化硼涂料。
本发明能够提供一种检测精度高，测序速度快、通量大的基因芯片。芯片的有效面积大，达到了27.6x27.6mm2，能够同时检测68-72万个基因样品。本发明采用了Infinium芯片制造方法制备，该制作方法能够满足本发明中芯片的制作需求。本发明还使用了光纤面板，对信号的探测简单、灵敏度高，能够适应实际应用的需求。
具体实施方式
实施例1
一种高通量DNA测序芯片，芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm，芯片设置有反应池68-69万个，反应池直径为30μm，反应池上方有上盖，所述芯片的材料为光纤，芯片的有效面积为27.6x27.6mm2。芯片使用Infinium芯片制造方法制备。
实施例2
一种高通量DNA测序芯片，芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm，芯片设置有反应池69-70万个，反应池直径为29μm，反应池上方有上盖，所述芯片的材料为石英，芯片的有效面积为27.6x27.6mm2。芯片使用Infinium芯片制造方法制备。
实施例3
一种高通量DNA测序芯片，芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm，芯片设置有反应池70-71万个，反应池直径为28.5μm，反应池上方有上盖，所述芯片的材料为光纤，芯片的有效面积为27.6x27.6mm2。芯片使用Infinium芯片制造方法制备。
实施例4
一种高通量DNA测序芯片，芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm，芯片设置有反应池71-72万个，反应池直径为28μm，反应池上方有上盖，芯片的材料为光纤，芯片的有效面积为27.6x27.6mm2。芯片使用Infinium芯片制造方法制备。
实施例5
一种高通量DNA测序芯片，芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm，芯片设置有反应池71-71.5万个，反应池直径为29.5μm，反应池上方有上盖，芯片的材料为光纤，芯片的有效面积为27.6x27.6mm2。
高通量DNA测序芯片的制备方法，包括以下步骤：
步骤1：取单面抛光的基片，材料为光纤；
步骤2：以异丙醇水浴25min，94℃；以体积比为4:1的乙醇和水的混合液水浴25min，以水冲洗，吹片烘干；
步骤3：在芯片抛光面上涂光刻胶，通过曝光在表面形成反应池图形；
步骤4：刻蚀芯片，形成反应池；
步骤5：以体积比为3:1的甲醇和水的混合液水浴20min，以硫酸双氧水混合液浸泡40min，以水冲洗；完成芯片的制备。
实施例6
一种高通量DNA测序芯片，芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm，芯片设置有反应池70-71万个，反应池直径为29μm，反应池上方有上盖，所述芯片的材料为光纤，芯片的有效面积为27.6x27.6mm2。
高通量DNA测序芯片的制备方法，包括以下步骤：
步骤1：取单面抛光的基片，材料为光纤；
步骤2：以体积比为1:2.5的异丙醇和正丁醇的混合液水浴35min，94℃；以体积比为3:1的乙醇和水的混合液水浴25min，以水冲洗，吹片烘干；
步骤3：在芯片抛光面上涂光刻胶，通过曝光在表面形成反应池图形，；
步骤4：刻蚀芯片，形成反应池；
步骤5：以体积比为6:1的甲醇和水的混合物水浴20min，以硫酸双氧水混合液浸泡40min，以水冲洗；完成芯片的制备。在芯片表面均匀喷涂碳化硼涂料。
上述详细说明是针对本发明其中之一可行实施例的具体说明，该实施例并非用以限制本发明的专利范围，凡未脱离本发明所为的等效实施或变更，均应包含于本发明技术方案的范围内。
Claims (5)
1.一种高通量DNA测序芯片，其特征在于，所述芯片设置有反应池，反应池上方有上盖，芯片的材料为光纤或石英，芯片表面具有碳化硼涂层，芯片的有效面积为27.6x27.6mm2。
2.如权利要求1所述的高通量DNA测序芯片，其特征在于，所述芯片上有反应池68-72万个。
3.如权利要求1所述的高通量DNA测序芯片，其特征在于，所述反应池直径为28-30μm。
4.如权利要求1所述的高通量DNA测序芯片，其特征在于，所述芯片长为49mm，宽为48mm，厚度为2mm。
5.如权利要求1所述的高通量DNA测序芯片，其特征在于，所述芯片使用Infinium芯片制造方法制备。
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| CN201510204428.2A CN104745462B (zh) | 2015-04-28 | 2015-04-28 | 一种高通量dna测序芯片 |
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Publications (2)
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| CN104745462A CN104745462A (zh) | 2015-07-01 |
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