CN104593485A - 一种用于检测肺孢子虫的引物、探针和试剂盒 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种用于检测肺孢子虫的引物、探针和试剂盒,属于生物技术领域。所述引物和探针包括:用于检测肺孢子虫的正向引物、用于检测肺孢子虫的反向引物和用于检测肺孢子虫的探针。所述试剂盒包括所述的引物和探针。本发明实施例提供的用于检测肺孢子虫的引物和探针,具有灵敏度高的特性,使得本发明实施例提供的用于检测肺孢子虫的试剂盒,针对检测肺孢子虫具有灵敏度高的特性;检测速度快,整个检测过程共仅需2~3小时。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,特别涉及一种用于检测肺孢子虫的引物、探针和试剂盒。
背景技术
肺孢子虫(Pneumocystis)是一种呈世界性分布的机会致病性病原体,肺孢子虫最早发现于豚鼠体内。肺孢子虫作为致病性病原体,可以引起严重的肺部疾患称肺孢子虫肺炎(Pnuemocystis Pneumonia,PCP)。
现有技术中常采用环介导恒温扩增法(Loop-mediated isothermalamplification,LAMP)检测肺孢子虫,环介导恒温扩增是一种新的核酸扩增方法,采用环介导恒温扩增法检测肺孢子虫的过程,试剂容易被污染,因此,在操作时需要非常规范,即便规范操作有时也可能会引起污染,大大降低了检测的成功率。
发明内容
为了解决现有技术中检测肺孢子虫成功率低的问题,本发明实施例提供了一种用于检测肺孢子虫的引物、探针和试剂盒。所述技术方案如下:
一方面,本发明实施例提供了一种用于检测肺孢子虫的引物和探针,所述引物和探针包括:用于检测肺孢子虫的正向引物、用于检测肺孢子虫的反向引物和用于检测肺孢子虫的探针,其中,
所述用于检测肺孢子虫的正向引物如序列表中SEQ ID NO.1所示;
所述用于检测肺孢子虫的反向引物如序列表中SEQ ID NO.2所示;
所述用于检测肺孢子虫的探针如序列表中SEQ ID NO.3所示;
所述探针的5’端连接有荧光基团FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3或Cy5,所述探针的3’端连接有淬灭基团TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3或DABCYL。
另一方面,本发明实施例提供了一种用于检测肺孢子虫的试剂盒,所述试剂盒包括上述的引物和探针。
具体地,所述试剂盒还包括:核酸释放剂、PCR反应液、临界阳性质控品、阳性质控品、阴性质控品和工作标准品。
具体地,所述核酸释放剂包括无菌水、终浓度为0.03-0.3%的聚乙二醇辛基苯基醚、终浓度为0.04-0.4%的壬基酚聚氧乙烯(40)醚和pH值为8.3的终浓度为0.01-0.1M的三(羟甲基)氨基甲烷。
具体地,所述PCR反应液各组分在PCR扩增反应体系中包括:终浓度为0.01U/μL~0.05U/μL的Taq酶、终浓度为0.2~0.6mM的dNTPs、10×PCR缓冲液和终浓度为1.5~5.0mM的含Mg离子的溶液。
具体地,所述临界阳性质控品包括含浓度为1.0×104拷贝/mL的肺孢子虫基因片段的溶液。
具体地,所述引物的终浓度为0.05-0.9μM,所述探针的终浓度为0.05-0.9μM。
具体地,所述工作标准品包括:工作标准品1、工作标准品2、工作标准品3和工作标准品4,其中,
所述工作标准品1为含有1.0×107拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品2为含有1.0×106拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品3为含有1.0×105拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品4为含有1.0×104拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段。
具体地,,所述阳性质控品包括含浓度为1.0×106拷贝/mL的肺孢子虫基因片段的溶液。
具体地,所述阴性质控品为浓度0.8%生理盐水。
本发明实施例提供的技术方案带来的有益效果是:本发明实施例提供的用于检测肺孢子虫的引物和探针,具有灵敏度高的特性,使得本发明实施例提供的用于检测肺孢子虫的试剂盒,具有灵敏度高的特性,采用仪器收集荧光信号,避免了肉眼判断的主观性,其检测结果可靠,提高了检测的灵敏度,即使仅存在单拷贝的目的片段该试剂盒也可以进行有效的检测;检测速度快,整个检测过程共仅需2~3小时。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例中的技术方案,下面将对实施例描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1是本发明实施例2提供的荧光扩增曲线图;
图2是本发明实施例3提供的荧光扩增曲线图;
图3是本发明实施例4提供的荧光扩增曲线图;
图4是本发明实施例5提供的标准曲线的荧光扩增曲线图;
图5是本发明实施例5提供的荧光扩增曲线图;
图6是本发明实施例5提供的由图4得到的标准曲线图,图6横坐标为LogStarting Quantity copy number,纵坐标为Threshold Cycle。
图中:Cycles为循环数,RFU为荧光值,Log Starting Quantity copy number为肺孢子虫起始浓度的对数值,Ct(Threshold Cycle)值为循环数;1a-实施例2中样品1,4a-实施例2中样品4,5a-实施例2中样品5,6a-实施例2中样品6,7a-实施例2中样品7。
具体实施方式
为使本发明的目的、技术方案和优点更加清楚,下面结合附图对本发明实施方式作进一步地详细描述。以下实施例中所用试剂和探针主要购自宝生物工程(大连)有限公司。
实施例1.一种用于肺孢子虫核酸定量检测的引物和荧光探针
本发明实施例提供了一种用于检测肺孢子虫的引物和探针,引物和探针包括:用于检测肺孢子虫的正向引物、用于检测肺孢子虫的反向引物和用于检测肺孢子虫的探针,其中,
用于检测肺孢子虫的正向引物如序列表中SEQ ID NO.1所示;
用于检测肺孢子虫的反向引物如序列表中SEQ ID NO.2所示
用于检测肺孢子虫的探针如序列表中SEQ ID NO.3所示;
探针的5’端连接有荧光基团FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3或Cy5,探针的3’端连接有淬灭基团TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3或DABCYL。在本发明实施例中,探针的荧光报告基团为FAM,FAM的激发波长为485nm,接收波长为527nm;淬灭基团为Eclipse。纯化方式可选自:HAP、PAGE和HPLC纯化方式,具体地引物和探针如下表:
表1.肺孢子虫引物和探针
表1中:F:forward,正向;肺孢子虫-F表示肺孢子虫的正向引物。R:reverse,反向;肺孢子虫-R表示肺孢子虫的反向引物。P:probe,荧光探针(探针);肺孢子虫-P表示肺孢子虫荧光探针,荧光探针可以为TaqMan-MGB荧光探针、LNA荧光探针或MGB荧光探针。表1的设计的引物和探针均委托宝生物工程(大连)有限公司合成。
本发明实施例提供的引物和探针具有灵敏度高的特性,且能够准确检测出待测样品中的肺孢子虫的含量。
实施例2.一种用于检测肺孢子虫的试剂盒
本发明实施例提供了一种用于检测肺孢子虫核酸定量的试剂盒,该试剂盒包括本发明实施例1提供的引物和探针,该试剂盒还包括:核酸释放剂、PCR反应液、临界阳性质控品、阳性质控品、阴性质控品和工作标准品。
具体地,PCR反应液包括:终浓度为0.01U/μL~0.05U/μL的Taq酶、终浓度为0.2~0.6mM的dNTPs、10×PCR缓冲液和终浓度为1.5~5.0mM的含Mg离子的溶液。具体PCR反应液的各组分含量的配比为:浓度为5U/μL的Taq酶0.3μL、浓度为10mmol/L的dNTPs 2μL、10×PCR Buffer 5μL和浓度为25mmol/L的MgCl2溶液5μL。
具体地,正向引物和反向引物的终浓度均为0.05-0.9μM(正向引物和反向引物均为0.05-0.9μM),探针的终浓度为0.05-0.9μM。在本实施例中,浓度为10μmol/L引物加入2.5μL,浓度为10μmol/L探针加入2.5μL。
在实际应用过程中,可以将引物和探针一同加入PCR反应液中构成反应体系,再添加无菌水至体积为49.5μL。
具体地,核酸释放剂:Triton-X100(聚乙二醇辛基苯基醚)的终浓度为0.03%、NP-40(壬基酚聚氧乙烯(40)醚)的终浓度为0.04%和pH值为8.3的终浓度为0.01M的Tris-HCL(三(羟甲基)氨基甲烷),溶剂为无菌水。
具体地,阴性质控品为浓度为0.8%生理盐水。称量0.008g氯化钠固体溶于1ml双蒸水,混匀,直接吸取0.5μL作阴性质控品。
具体地,阳性质控品包括含浓度为1.0×106拷贝/mL的肺孢子虫基因片段的溶液。取含肺孢子虫液,虫株由中国典型培养物保藏中心(China Center for TypeCultureCollection,CCTCC)提供,经培养后,取含肺孢子虫液100μL加入等体积的核酸释放剂充分混匀后,再离心5min,12000rpm,取上清液用分光光度计测A260定量,然后稀释至1.0×106拷贝/mL,即可作为阳性质控品模板。
具体地,临界阳性质控品包括含浓度为1.0×104拷贝/mL的肺孢子虫基因的DNA片段溶液。取含肺孢子虫液,虫株由中国典型培养物保藏中心(CCTCC)提供,经培养后,取含肺孢子虫液100μL加入等体积的核酸释放剂,充分混匀后,再离心5min,12000rpm,取上清液用分光光度计测A260定量,然后稀释至1.0×104拷贝/mL,即可作为临界阳性质控品。
具体地,工作标准品包括:工作标准品1、工作标准品2、工作标准品3和工作标准品4,其中,工作标准品1为含有1.0×107拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
工作标准品2为含有1.0×106拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
工作标准品3为含有1.0×105拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
工作标准品4为含有1.0×104拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段。
工作标准品,为含有肺孢子虫的高度保守基因的核苷酸片段的pUC57-T重组质粒,该重组质粒转化大肠杆菌DH5α增殖后用碱裂解法提取DNA,经DNA纯化试剂盒纯化,用分光光度计测A260定量,然后根据公式换算并稀释至1.0×108拷贝/mL,于-20℃保存。贮存浓度为1.0×108拷贝/mL,使用前用无菌生理盐水或0.1mol/L PBS缓冲液(pH值为7.6)进行10倍梯度的系列稀释。工作浓度依次为1.0×107拷贝/mL,1.0×106拷贝/mL,1.0×105拷贝/mL和1.0×104拷贝/mL,使用前,经10,000rmp离心30s,取上清液作为工作标准品。本实施例提供的试剂盒成分如下:
表2.试剂盒配置(24人份/盒):
该试剂盒可在在-10℃±5℃避光储存,避免反复冻融,该试剂盒适用的荧光定量PCR仪包括:Roche LightCycler480、ABI7500、ABI7300、Bio-Rad iQ5TM、Stratagene Mx3000P、Stratagene Mx3005P和达安7000等。
用本发明实施例2提供的试剂盒在Bio-Rad iQ5TM荧光定量PCR仪上检测肺孢子虫,具体方法如下:
(1)采集样品:样品均来源于武汉市传染病医院,其中5个为经检测已知的阳性样品,3个为经检测已知的阴性样品,样品可以为痰液或咽拭子,在5个经检测已知的阳性样品中有3个样品为痰液,其余2个为咽拭子,在3个经检测已知的阴性样品中有1个样品为痰液,其余2个为咽拭子。
①痰液的预处理:1)取0.5ml痰样品加入样品体积1-3倍的4%NaOH溶液,液化15min,其中NaOH溶液的加入量视痰液样品的粘稠度而定,粘稠度低的加1-2倍,高的加2-3倍体积,以液化完全为标准;2)吸出1ml液化后样品置于1.5ml离心管中,15000r/min离心5min,去上清。加800μL灭菌TE缓冲液,充分震荡混匀,再次15000r/min离心2min,去上清液,沉淀用TE缓冲液重复洗涤2次,样品管4℃保存备用。
②咽拭子标品处理:取出采集的样品,放入装有1mL PBS缓冲液(市售试剂,pH值为7.4)的玻璃管中,充分震荡摇匀后,用镊子在玻璃管边缘处挤干棉拭子,将玻璃管中液体转移至离心管中,12,000rpm离心5min,弃上清,加入500μl PBS缓冲液(pH值为7.4),12,000rpm离心5min,弃上清,再加入500μl PBS缓冲液(pH值为7.4),12,000rpm离心5min,弃上清,样品管4℃保存备用。
标品保存和运输:如果标品不立即测试,应储存于-20℃,避免反复冻融。标品长途运送应采用0℃冰壶。
(2)样品处理:取待测样品和等量体积RNA提取液充分混匀后,即为处理后的样品。
(3)加样:向装有PCR反应液、引物和探针的PCR反应管中分别加入处理后的样品、阴性质控品、阳性质控品、临界阳性质控品和工作标准品各0.5μL,PCR反应液与处理后的样品、阴性质控品、阳性质控品、临界阳性质控品或工作标准品的体积比为99:1,经5,000rpm离心10s。
(4)PCR扩增:将各反应管放入荧光定量PCR仪器的反应槽内,设置标记荧光基团种类、样品名称及类型,定义样品孔:阴性质控品选NTC;待检样品、阳性质控品选及临界阳性质控品选Unknown。
按下面程序进行PCR扩增:
95℃3分钟;
95℃10秒,60℃1分钟(收集荧光信号),40个循环。
(5)分析判断:
Ct值小于28的为阳性;Ct值大于32的为阴性;Ct值大于等于28且小于等于32的为临界阳性。本发明实施例提供的扩增结果如图1所示(图1在Ct值为32时已经可以判断出样品结果),具体检测结果见下表3。
表3为实施例2提供的样品对应的Ct值
序号 | Ct值 |
1 | 24.63 |
2 | N/A |
3 | N/A |
4 | 19.38 |
5 | 26.32 |
6 | 25.78 |
7 | 24.08 |
8 | N/A |
其中,样品1,4,5,6,7在阳性范围内,为阳性样品;N/A表示阴性,样品2,3,8在阴性范围内,为阴性样品,结果与已知的一致,可见本发明实施例2提供的试剂盒特异性为100%,阳性检出率为100%,以图1为例,在图1中将阳性样品扩增结果标出,图2-图5中的排布规律参见图1。
实施例3.一种用于检测肺孢子虫的试剂盒
本发明实施例提供了一种检测样品中肺孢子虫核酸的试剂盒,该试剂盒的成分与实施例2中提供的试剂盒中的成分区别在于:
PCR反应液的各组分含量的配比为:浓度为5U/μL的Taq酶0.1μL、浓度为10mmol/L的dNTPs 1μL、10×PCR Buffer 5μL和浓度为25mmol/L的MgCl2溶液3μL。
浓度为10μmol/L的正向引物和反向引物各加入0.25μL,浓度为10μmol/L探针加入0.25μL。
在实际应用过程中,可以将引物和探针一同加入PCR反应液中,再添加无菌水至体积为10μL。
RNA提取液包括终浓度为0.15%的氯仿、终浓度为0.25%的异丙醇和终浓度为0.36%的乙醇。
表4.实施例3提供的试剂盒配置(24人份/盒):
采集样品:样品均来源于武汉市传染病医院,其中8个为经检测已知的阳性样品,2个为经检测已知的阴性样品。其他步骤参见实施例2,区别在于:
加样:向装有10μLPCR反应液的PCR反应管中分别加入处理后的样品、阴性质控品、阳性质控品和临界阳性质控品40μL,盖好管盖,5,000rpm离心10s。
将上述10个样品按照实施例2中的步骤进行操作,本发明实施例提供的扩增结果如图2所示,得到具体检测结果见表5。
表5为实施例3提供的样品对应的Ct值
序号 | Ct值 |
1 | 28.45 |
2 | 23.38 |
3 | 19.14 |
4 | N/A |
5 | 22.38 |
6 | 25.46 |
7 | N/A |
8 | 21.45 |
9 | 22.09 |
10 | 31.57 |
表5中,样品2、3、5、6、8和9在阳性范围内,为阳性样品;样品1和10在临界阳性范围内,为临界阳性样品,阳性样品共8个且与已知检测结果相符;样品4和7在阴性范围内,为阴性样品,与已知检测结果相符,可见本发明实施例3提供的试剂盒特异性为100%,阳性检出率为100%。
实施例4.一种用于肺孢子虫的试剂盒
本发明实施例提供了一种检测样品中肺孢子虫核酸的试剂盒,该试剂盒的成分与实施例2中提供的试剂盒中的成分区别在于:
PCR反应液的各组分含量的配比为:浓度为5U/μL的Taq酶0.5μL、浓度为10mmol/L的dNTPs 3μL、10×PCR Buffer 5μL和浓度为25mmol/L的MgCl2溶液10μL。
浓度为10μmol/L的正向引物和反向引物各加入4.5μL,浓度为10μmol/L探针加入4.5μL。
在实际应用过程中,可以将引物和探针一同加入PCR反应液中,再添加无菌水至体积为45μL。
RNA提取液包括终浓度为0.3%的氯仿、终浓度为0.4%的异丙醇和终浓度为0.6%的乙醇。
其余试剂与实施例2中提供的试剂相同。
采集样品:样品均来源于武汉市传染病医院,其中6个为经检测已知的阳性样品,2个为经检测已知的阴性样品。其他步骤参见实施例2,区别在于:
加样:向装有10μLPCR反应液的PCR反应管中分别加入处理后的样品、阴性质控品、阳性质控品和临界阳性质控品各5μL,PCR反应液与处理后的样品、阴性质控品、阳性质控品或临界阳性质控品的体积比为9:1,盖好管盖,5,000rpm离心10s。
将上述10个样品按照实施例2中的步骤进行操作,本发明实施例提供的扩增结果如图3所示,得到具体检测结果见表6。
表6为实施例4提供的样品对应的Ct值
序号 | Ct值 |
1 | 25.08 |
2 | 30.45 |
3 | 26.64 |
4 | 31.47 |
5 | N/A |
6 | N/A |
7 | 22.53 |
8 | 31.04 |
表6中,样品1、3和7在阳性范围内,为阳性样品;样品2、4和8在临界阳性范围内,为临界阳性样品,阳性样品共6个且与已知检测结果相符;样品5和6在阴性范围内,为阴性样品,与已知检测结果相符,可见本发明实施例4提供的试剂盒特异性为100%,阳性检出率为100%。
实施例5.
在利用本发明实施例4提供的试剂盒进行定量检测时,需绘制标准曲线,除8个样品反应管外,另取3个反应管分别为阴性质控品、阳性质控品和临界阳性质控品,还有4个反应管,对应加入试剂盒中不同浓度梯度的工作标准品5μL,按照实施例4的方法配制PCR反应体系,5000rpm离心10s,然后放入仪器样品槽进行PCR扩增。工作标准品选Standard。对于Standard,需要在Quantity栏中分别输入1.0×107拷贝/ml、1.0×106拷贝/ml、1.0×105拷贝/ml、1.0×104拷贝/ml及1.0×103拷贝/ml。
采用使用仪器Bio-Rad iQ5TM进行检测。
参照结果:
a.如果扩增曲线不呈S型或Ct值>32,判定样品肺孢子虫DNA含量小于检测下限;
b.如果扩增曲线S型不明显或28≤Ct值≤32,则样品肺孢子虫DNA含量处于临界阳性范围;
c.如果扩增曲线呈S型且Ct值﹤28,则按以下方法进行定量:若样品的C(“C”表示样品浓度或含量)<5.0000E+01,则该样品的肺孢子虫DNA总含量<50基因拷贝;若样品的5.0000E+01≤C≤5.0000E+07,则该样品的肺孢子虫DNA总含量等于C基因拷贝;若样品的C>5.0000E+07,则该样品的肺孢子虫DNA总含量>5.0000E+07基因拷贝,将样品稀释至线性范围内再检测,具体检测结果见表7;
表7为Ct值及其对应的起始浓度
工作标准品 | Ct值 | C(起始浓度) |
1.0e+007 | 18.03 | 1.0e+007 |
1.0e+006 | 21.34 | 1.0e+006 |
1.0e+005 | 24.65 | 1.0e+005 |
1.0e+004 | 27.96 | 1.0e+004 |
Slope | -3.31 | - |
Intercept | 41.2 | - |
R2 | 1 | - |
标准方程 | y=-3.31x+41.2 | - |
本发明实施例5提供的样品的扩增曲线如图5所示,本发明实施例5提供的工作标准品和8个样品在一起检测,根据扩增后得到的Ct值,查图6的标准曲线,再经换算,最终得到8个样品的初始浓度如下表。
序号 | Ct值 | C(起始浓度) |
阳性质控品 | 19.86 | 2.800e+006 |
临界阳性质控品 | 29.67 | 3.044e+003 |
阴性质控品 | N/A | - |
1 | 26.08 | 3.700e+004 |
2 | 25.45 | 5.732e+004 |
3 | 34.64 | 0.959e+002 |
4 | 22.47 | 4.566e+005 |
5 | N/A | - |
6 | N/A | - |
7 | N/A | - |
8 | 26.04 | 3.802e+004 |
扩增曲线均呈光滑″S″型,标准曲线为一条直线,Ct值在14-28之间,每个浓度梯度的Ct值差约为3.31。检测下限可精确到5.000e+002,由此可见,该试剂盒具有高灵敏度。
本发明涉及一种引起人类肺炎等疾病的病原体基因检测技术,适用于肺孢子虫定性定量检测。本发明实施例提供的实时TaqMan荧光定量PCR,其引物和荧光探针具有高特异性及高灵敏度,其试剂盒能够精确定量,其检测方法能够快速检测肺孢子虫。实时TaqMan荧光定量PCR通过序列特异性TaqMan荧光探针以闭管模式在扩增的同时检测目标基因,从而可以增加特异性和降低交叉污染的可能性。另外,本发明实施例不需要进一步的下游分析,节约了凝胶电泳观察结果的时间。在实时TaqMan荧光定量PCR中,PCR产物累积的每个循环都被实时监控和分析,分析达到荧光阈值的循环数(Ct值)就可以直接报告出DNA起始拷贝数。
以上所述仅为本发明的较佳实施例,并不用以限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。
Claims (10)
1.一种用于检测肺孢子虫的引物和探针,其特征在于,所述引物和探针包括:用于检测肺孢子虫的正向引物、用于检测肺孢子虫的反向引物和用于检测肺孢子虫的探针,其中,
所述用于检测肺孢子虫的正向引物如序列表中SEQ ID NO.1所示;
所述用于检测肺孢子虫的反向引物如序列表中SEQ ID NO.2所示;
所述用于检测肺孢子虫的探针如序列表中SEQ ID NO.3所示;
所述探针的5’端连接有荧光基团FAM、HEX、TET、JOE、VIC、ROX、Cy3或Cy5,所述探针的3’端连接有淬灭基团TAMRA、Eclipse、BHQ1、BHQ2、BHQ3或DABCYL。
2.一种用于检测肺孢子虫的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1所述的引物和探针。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括:核酸释放剂、PCR反应液、临界阳性质控品、阳性质控品、阴性质控品和工作标准品。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述核酸释放剂包括无菌水、终浓度为0.03-0.3%的聚乙二醇辛基苯基醚、终浓度为0.04-0.4%的壬基酚聚氧乙烯(40)醚和pH值为8.3的终浓度为0.01-0.1M的三(羟甲基)氨基甲烷。
5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR反应液各组分在PCR扩增反应体系中包括:终浓度为0.01U/μL~0.05U/μL的Taq酶、终浓度为0.2~0.6mM的dNTPs、10×PCR缓冲液和终浓度为1.5~5.0mM的含Mg离子的溶液。
6.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述临界阳性质控品包括含浓度为1.0×104拷贝/mL的肺孢子虫基因片段的溶液。
7.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述正向引物和所述反向引物的终浓度均为0.05-0.9μM,所述探针的终浓度为0.05-0.9μM。
8.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述工作标准品包括:工作标准品1、工作标准品2、工作标准品3和工作标准品4,其中,
所述工作标准品1为含有1.0×107拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品2为含有1.0×106拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品3为含有1.0×105拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段;
所述工作标准品4为含有1.0×104拷贝/mL的肺孢子虫基因的非传染性DNA片段。
9.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述阳性质控品包括含浓度为1.0×106拷贝/mL的肺孢子虫基因片段的溶液。
10.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述阴性质控品为浓度0.8%生理盐水。
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