CN104593395A

CN104593395A - 一种控制低温下水稻叶片颜色的基因ywl1及其应用

Info

Publication number: CN104593395A
Application number: CN201410823573.4A
Authority: CN
Inventors: 魏祥进; 胡培松; 唐绍清; 刘聪利; 邵高能; 圣忠华; 焦桂爱; 谢黎虹
Original assignee: China National Rice Research Institute
Current assignee: China National Rice Research Institute
Priority date: 2014-12-26
Filing date: 2014-12-26
Publication date: 2015-05-06

Abstract

本发明属于基因工程技术领域，涉及一种控制低温下水稻叶片颜色的基因YWL1及其应用。该基因编码一个假尿嘧啶核苷合酶蛋白，该基因显性等位基因序列如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列,在低温下使水稻叶片维持正常绿色。该基因的突变体基因的DNA序列如SEQ ID NO.4所示，该突变体基因使得低温下水稻叶片颜色显示为白条纹状。本发明所述的YWL1基因突变体表现出来的低温白条纹叶性状可以作为标记性状用于杂交育种和良种繁育，不但可以测定种子纯度，还可在苗期剔除假杂种。

Description

一种控制低温下水稻叶片颜色的基因YWL1及其应用

技术领域

本发明属于植物基因工程领域。具体地说，本发明涉及一种利用图位克隆技术克隆水稻YWL1基因，利用转基因实验鉴定该基因的功能，及其该基因在杂交育种和良种繁育中的应用。

背景技术

叶片是植物进行光合作用的主要器官，水稻籽粒中2/3以上的干物质是开花后通过光合作用获得的（王旭军，徐庆国，杨知建（2005）水稻叶片衰老生理的研究进展.中国农学通报21:187-190），光合作用的效率与叶绿体结构和功能是否完整、光合作用复合体的稳定性、叶绿素含量的高低都有着复杂的关系。近年来，叶色的应用价值备受关注，叶色变异可以作为标记性状，在水稻杂交育种和良种繁育发挥重要作用，不但可以用于苗期剔除受外源花粉污染的种子和假杂种，还可以用于测定种子纯度（章志兴，陈善福（2001）叶色标记技术在杂交水稻种子生产中的应用.种子科技19:33-34）。另外，叶色突变体的研究对有效利用基因工程提高水稻的光合能力，培育高光效水稻，增加水稻产量具有重要的理论意义和应用价值。

目前，利用水稻叶色突变体，已经克隆出多个参与或调控叶绿素代谢和叶绿体发育的基因，通过分析基因功能、表达模式、基因间互作以及核-质信号传导，初步了解了水稻叶色形成及调控机理。目前为止，在拟南芥叶绿素合成过程中的关键酶都已鉴定出来（Nagata N(2005)Identification of a Viny Reductase Gene for Chlorophyll Synthesis in Arabidopsis thaliana and Implications for the Evolution of Prochlorococcus Species. The Plant Cell Online 17:233-240），但在水稻中只有少数基因被鉴定出来，其他基因还有待进一步发现。此外，叶绿素降解的调控机制尚未明朗，核-质互作的机理尚不清晰，有待深入进一步研究。

发明内容

本发明要解决的问题是提供一种从水稻温度敏感突变体中克隆新基因YWL1,该基因编码假尿嘧啶核苷合酶家族蛋白，调控低温下水稻叶片颜色的正常形成。

为了解决上述技术问题，本发明提供一种调控叶绿体正常发育的基因YWL1，该基因基因显性等位基因序列如SEQ ID NO.1所示,其CDS序列如SEQ ID NO.2所示，其编码的的蛋白质为一个假尿嘧啶核苷合酶蛋白，其氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示。

所述YWL1突变体含有其突变基因，其基因序列如SEQ ID NO.4所示，其CDS序列如SEQ ID NO.5所示，编码氨基酸序列如SEQ ID NO.6所示。

作为本发明的基因的改进：核苷酸序列还包括在SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列中添加、取代、插入和缺失一个或多个核苷酸生成的突变体、等位基因和衍生物。

所述基因YWL1突变后，突变体在低温下水稻叶片颜色显示为白条纹状，高温或正常温度条件下为正常绿色，该突变体白条纹表型可以作为表型标记用于杂交育种和良种繁育，不但可以测定种子纯度，还可在苗期剔除假杂种。

本发明的具体实施步骤如下：

一、水稻白条纹叶突变体ywl1为温度敏感型突变体

在水稻品种93-11的EMS诱变的突变体库中，发现了一个苗期表现出白条纹叶的叶色突变体ywl1。温度处理发现该突变体叶色白条纹状对温度敏感，在23℃条件下，突变体苗期出现严重的白条纹叶，而在28℃环境下突变体与野生型叶色没有明显差异，在25℃环境下，相对野生型93-11突变体表现出轻微的白条纹叶性状(图1)。

二、不同温度环境下突变体ywl1叶片叶绿素含量、叶绿体发育和光合特性分析

为了明确ywl1叶色动态变化过程，我们分别测量了植株一叶期至五叶期叶片叶绿素含量（图2）。从测量结果可以看出，该突变体叶绿素含量随着植株的生长而逐渐增加。23℃条件下，野生型中叶绿素a、叶绿素b及叶绿素总量始终高于突变体；25℃条件下三叶期以前，野生型叶绿素a、叶绿素b及叶绿素总量高于突变体，三叶期以后二者叶绿素含量趋于一致；28℃条件下，二者叶绿素a、叶绿素b及叶绿素总量基本一致，与表型结果一致。

利用扫描电镜对23℃温度环境条件下，突变体ywl1和野生型93-11苗期植株第三片叶叶肉细胞中叶绿体观察表明，突变体叶片的白色部分中大部分细胞内部结构简单，仅有少量的片状结构，而且尚未分化出类囊体片层结构及基粒；个别细胞能观察到叶绿体，与野生型相比，突变体的叶绿体数目少，体积小，类囊体片层间距离变大，排列疏松，整个叶绿体表现发育不良；而突变体叶片绿色部分中叶绿体数目、体积及基粒片层垛叠数与野生型没有明显差异（图3）。

对光合作用相关指标分析发现， 23℃环境下的ywl1突变体在苗期净光合速率（Pn）、气孔导度（Gs）和蒸腾速率（Tr）比野生型显著下降，表现出较严重的光合能力下降特征，抽穗期恢复与野生型一致；25℃环境下的ywl1突变体，苗期除净光合速率（Pn）比野生型显著下降外，气孔导度（Gs）和蒸腾速率（Tr）与野生型没有显著差异，抽穗期时三项指标均与野生型一致；28℃环境下的ywl1突变体无论苗期或是抽穗期，净光合速率（Pn）、气孔导度（Gs）和蒸腾速率（Tr）均与野生型一致（图4）。

三、图位克隆YWL1基因

1.突变体ywl1表型的遗传分析

本研究对突变体ywl1表型进行了相应的遗传分析。突变体ywl1与野生型93-11杂交，以及突变体ywl1与粳稻02428杂交得到的F1植株均表现为正常表型。突变体ywl1与粳稻02428杂交得到的F2群体中，正常表型与白条纹状表型单株出现分离，正常表型和突变表型单株的分离比符合分离比3:1（见表1）。因此遗传分析结果表明突变体ywl1的表型符合单隐性核基因的遗传分离规律。

表1 F2群体中白条纹叶植株和正常叶色植株的分离情况

组合cross	ywl1/02428
		野生型Wild type	1902
突变体表型Mutant type	619
		总计Total	2521
卡平方χ²（3:1）	0.24
		P值P-Value	0.62

2.YWL1基因的图位克隆与功能互补

利用本实验室保存的SSR标记和突变体ywl1与粳稻02428杂交衍生的F2群体的184株极端个体进行初定位，将ywl1基因定位在第3条染色体短臂上RM14327和RM5474之间（图5A）。随后通过扩大定位群体，根据已经公布的SSR和自行开发的Indel标记，构建了ywl1基因位点区域高密度连锁图谱，最终将突变基因精细定位在37.1kb区间内（图5B, C）。利用基因分析与预测软件对定位区域进行预测，发现共有5个候选基因，其中ORF5（LOC_Os03g05806）编码假尿嘧啶核苷合酶家族蛋白，该基因编码的蛋白序列与拟南芥SVR1编码的假尿嘧啶合酶家族蛋白序列有59%的相似性。测序结果发现ORF5第三外显子区存在18bp碱基的缺失，造成该基因蛋白质序列中Asp214-Ser219位 6个氨基酸的缺失（图5D, E）。因此，确定YWL1基因为ywl1突变基因的候选基因。野生型品种扩增的基因序列为SEQ ID NO.1,命名为YWL1基因，其对应的cDNA编码区序列为SEQ ID NO.2，YWL1基因的候选基因LOC_Os03g05806编码的假尿嘧啶合酶蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO.3。另外，突变体ywl1扩增出来的在第三外显子区缺失了18个碱基后的ORF5（LOC_Os03g05806）的核苷酸序列为SEQ ID NO.4,其对应的编码区核苷酸序列记为SEQ ID NO.5，同时相对野生型少了6个氨基酸的突变体该基因编码的氨基酸序列为SEQ ID NO.6.

利用PCR方法将水稻野生型93-11中的YWL1候选基因（LOC_Os03g05806）基因组序列和cDNA序列克隆到双元表达载体中1390Ubi中，并通过农杆菌介导法转化ywl1突变体，获得转基因阳性植株，观察T1代转基因植株家系表型，发现表型恢复成功（图6）。结果证明编码假尿嘧啶合酶的LOC_Os03g05806确实就是的目的基因。

3. YWL1的组织表达分析及编码蛋白的亚细胞定位

利用RT-PCR方法检测YWL1在水稻根、茎、叶、叶鞘、幼穗等部分的表达量，结果表明：YWL1在检测的所有组织中都有表达，在植株绿色组织叶片、幼穗和叶鞘的表达量比较高，茎和根中表达量稍微偏低（图7）。为了观察YWL1基因编码蛋白的亚细胞定位功能，将YWL1基因的CDS序列（SEQ ID NO.1）构建到PAN580-GFP 表达载体内，得到YWL1-GFP融合表达载体，然后利用PEG介导法将融合蛋白表达载体及GFP空载体导入水稻原生质体中，暗环境下培养16小时后，激光共聚焦显微镜下观察。结果表明，GFP非融合载体的绿色荧光均匀地表达于整个水稻原生质体细胞，而融合蛋白则特异性地分布于叶绿体内（图7），该实验表明YWL1编码蛋白特异性的定位与叶绿体中。

本发明利用水稻苗期温度敏感型突变体，通过图位克隆法克隆到了YWL1基因，该基因编码定位于叶绿体的假尿嘧啶合酶家族蛋白蛋白。通过转基因互补实验鉴定了YWL1基因的功能。因此本发明克隆的YWL1基因能在低温下调控水稻的叶色，维持期正常的叶绿体发育及光合作用；同时突变体ywl1表现出来的低温白条纹叶性状作为标记性状在杂交育种和良种繁育中的应用。

本发明的有益效果为：

1.本发明发现的YWL1基因编码假尿嘧啶核苷合酶家族蛋白，调控低温下水稻叶片颜色的正常形成，同时YWL1还保证了水稻的叶绿体正常发育、叶绿素的正常合成及维持正常的光合速率，为研究水稻叶绿体的发育、叶绿素的正常合成等提供了新的材料与思路。

2. 该基因突变后突变体在低温下幼苗叶片颜色为白条纹状，将改突变体基因导入常规水稻品种中，这种白色条纹状表型可以作为一种表型标记，可用来鉴定种子纯度；将突变体基因导入杂交水稻不育系或恢复系中可以在苗期鉴定与剔除假杂种。

附图说明

图1为野生型93-11与苗期温度敏感突变体ywl1各温度下的表型。

图2为不同温度条件下不同发育时期ywl1突变体与野生型叶绿素含量。

图3为野生型和突变体的透射电镜观察图，A，D 野生型93-11的叶肉细胞和叶绿体结构；B，E突变体ywl1白条纹叶白叶部分的叶肉细胞核叶绿体结构；C，F突变体ywl1白条纹叶绿叶部分的叶肉细胞核叶绿体结构。

图4为不同温度条件下突变体ywl1与野生型叶片的光合特性。

图5为YWL1基因在水稻第3染色体上的精细定位与候选基因分析； A，ywl1在染色体上的位置；B，ywl1的遗传连锁图谱；C，ywl1基因的物理图谱；D，ORF预测；E，ywl1基因组结构及碱基缺失位置示意图。

图6 YWL1的功能互补研究； A为野生型93-11苗期照片，B为突变体ywl1苗期照片，C为突变体ywl1转YWL1基因组DNA的1个T1家系苗期照片，D为突变体ywl1转YWL1 cDNA的1个T1家系苗期照片。

图7 YWL1的组织表达及编码蛋白的亚细胞定位； A荧光定量PCR分析YWL1在叶（L）、叶鞘（S）、茎（C）、幼穗（P）和根（R）中的表达，B-D为35S::GFP空载体的绿色荧光信号，E为35S::YWL1:GFP融合蛋白的绿色荧光信号，F为叶绿体自发荧光信号，G为融合蛋白叶色荧光与叶绿体自发荧光及明场照片的重叠。

具体实施方式

为了理解本发明，下面以实施例进一步说明本发明，但不限制本发明。

实施例1：YWL1基因的图位克隆

a) 水稻材料

水稻（Oryza sativa L）突变体ywl1, 原始野生型材料为籼稻品种93-11.

b) 叶绿素含量及光合特性的测定

选饱满的突变体和野生型种子浸种催芽，把已发芽的突变体和93-11的种子播种与钵子中，放置于23℃、25℃和28℃，光照12h，暗处理12h的人工气候箱中培养。观察并记录突变体表型。分别于一叶期、二叶期、三叶期、四叶期及五叶期取叶片测定叶绿素含量。

叶绿素含量的测定：取待测样品0.1g-0.2g浸泡于10ml 95%的乙醇，放置于4℃的冰箱中浸提色素48h左右。以型分光光度计测定665nm、649nm、470nm波光下的OD值。利用Lichtenthaler法进行修正的公式计算叶绿素a(Chla)、叶绿素b(Chlb)、类胡萝卜素（Caro）的含量。

Chla含量（mg/g）=（13.95O.D665-6.88O.D649）V/1000W

Chlb含量（mg/g）=（24.96O.D649-7.32O.D665）V/1000W

Caro含量（mg/g）=（1000O.D470+811.74O.D665-2851.32O.D649）/245

注：O.D：测定波长下的光密度值。

V：叶绿素提取液总体积（mL）。若测定用的是稀释液，应乘以稀释倍数。

W：材料鲜重（g）。

光合特性的测定：采用美国Li-COR公司生产的Li-6400型便携式光合测定仪，开放系统，使用红蓝光源，光量子密度1 200μmol m-2 s-1，流速500μmol s-1，在晴天上9:00~11:00 时分别测定三个环境条件下各材料的净光合速率。每处理测定3片具代表性的剑叶，每叶重复测定3次(取其平均值作为1次重复)。测定指标包括叶片净光合速率(Pn)、气孔导度(Gs)、蒸腾速率(Tr)和胞间CO2浓度(Ci)。

c) 叶绿体结构电镜观察

利用透射电镜（TEM）观察23℃条件下野生型和突变体ywl1第三片叶的叶绿体超微结构，结果发现突变体ywl1叶片白色部分大部分细胞内部尚未分化出类囊体片层结构及基粒，只有个别细胞能观察到成熟的叶绿体，整个叶绿体表现发育不良，但随着叶片的发育，基粒片层垛叠数目增加。（图3）。

d) 遗传分析和定位群体

利用正反杂交确定ywl1为隐性突变体，选取突变体和02428进行杂交，F1代自交后衍生F2群体，F2群体正常叶色与白条纹叶单株发生分离，共调选出4391个白条纹叶分离单株作为定位群体。在三叶期每株取1克左右的嫩叶，用来提取总DNA进行基因定位。

e) WLP1基因的精细定位

采用SDS法（Dellaporta SL, Wood J, Hicks JB(1983) A plant DNA minipreparation:version Ⅱ. Plant Mol Biol Rep 1:19-21）提取水稻样品基因组DNA。取大约100mg水稻叶片剪碎后放入2ml 离心管，加入钢珠经液氮冷冻后，在磨样机上粉碎，然后提取DNA，获得的DNA沉淀溶解于400μL超纯水中，每一个PCR反应用1μLDNA样品。

在YWL1基因的初步定位中，用由30个具有突变表型的F2个体进行SSR分析。首先根据公布的粳稻和籼稻创建的分子遗传图谱，选取近似均匀分布于各染色体上的SSR引物进行PCR扩增（反应体系如下）。通过8%的聚丙烯酰胺凝胶（凝胶配置方法如下）电泳分离，通过检测条带的多态性，将基因初步定位到第3染色体的短臂上，并介于RM14327和RM5474两SSR标记之间。

PCR反应体系：

DNA模板	1μL
		10╳PCR Buffer	1μL
dNTP(10mM)	0.1μL
		上游引物（10μm）	0.5μL
下游引物(10μm)	0.5μL
		Taq酶（5U/μL）	0.2μL
ddH₂O	6.7μL 至10μL

8%聚丙烯酰胺凝胶配方:

5╳TBE	6ml
		40% Arc-Bis	6
10%AP(μL)	240
		TEMED(μL)	30
ddH₂O	18 至30ml

聚丙烯酰胺凝胶显色液配方：

Na₃(BO₄)₄	0.152
		NaOH	12g
甲醛	3.2ml
		ddH₂O	至800ml

注：甲醛是临用前现加，其他三个按相应量提前配好。

然后通过对RM14327和RM5474两标记之间的BAC序列进行分析，发展了新的SSR和Indel标记，并将F2定位群体扩大到4291个进行精细定位，最终将YWL1基因精细定位于BAC克隆OSJNBa0016I15上的标记RM6829和RM14400间37.1kb的范围之内（图3），通过分析此区段开放阅读框（ORF）推测候选基因并基因测序分析，寻找突变位点。根据精细定位的结果，在37.1kb范围内根据RiceGAAS(Rice Automat ed Systrm,http://ricegaas.dna.affrc.go.jp/)和TIGR（http://rice.plantbiology.msu.edu/）的预测，发现在此区间内共有5个候选基因，我们设计了各基因的测序引物，采用PCR的方法分别从ywl1突变体和野生型品种基因组中扩增出所有候选基因进行测序分析。发现其中1029-1046位18bp碱基的缺失，进而造成该基因蛋白质序列中Asp214-Ser219位 6个氨基酸的缺失。野生型品种扩增的基因序列为SEQ ID NO.1,命名为YWL1基因，其编码的蛋白质测序得到的核苷酸序列为SEQ ID NO.2.

精细定位YWL1所用的SSR及Indel标记引物序列：

RM14327-F	GATGCAGTAGGAACACCAAACAGC	(SEQ ID NO.7)
			RM14327-R	ATCGAGTACCAAGTGCCTGTGC	(SEQ ID NO.8)
RM5474-F	AAAGTGTTGGTGAGCATAGC	(SEQ ID NO.9)
			RM5474-R	TTTGTGTTTGGAGAGACGAG	(SEQ ID NO.10)
RM14388-F	GCGAACCAGTCCACTTTGATCC	(SEQ ID NO.11)
			RM14388-R	GAGGAAGGGAAGAAGGAAATAGAAGG	(SEQ ID NO.12)
RM6883-F	CCCTGTTGATGGTTGATTTCTCC	(SEQ ID NO.13)
			RM6883-R	CAAGATCAAAGCACATGAGTCTGC	(SEQ ID NO.14)
RM14394-F	GCAGATGAGCTTCAGTGCTAGGC	(SEQ ID NO.15)
			RM14394-R	TCAGCACAGCATATTGCAGACC	(SEQ ID NO.16)
RM14395-F	AATATCCGCAGCCGAAACATAGC	(SEQ ID NO.17)
			RM14395-R	ACCGACCAAACCAACACAATCG	(SEQ ID NO.18)
RM14402-F	ACATGTCATCTTCTCTCTCGCTACC	(SEQ ID NO.19)
			RM14402-R	GGAGACCACTCGTCACTTCG	(SEQ ID NO.20)
Ind3-9 F	ATGTGTTTTTGCCTTTTTTTTTGGG	(SEQ ID NO.21)
			Ind3-9 R	CTTATCCGTGAGGGGCTTGTTGTAG	(SEQ ID NO.22)
RM6829-F	CGATGAAGAGCCAATCCTTCAGC	(SEQ ID NO.23)
			RM6829-R	TGCTCGTCCCTTCTACAAACAGG	(SEQ ID NO.24)
RM14400-F	GGCAGCGAGTAAGTGTAGATTGG	(SEQ ID NO.25)
			RM14400-R	TGTTGGTATAAGACAGGTGCATGG	(SEQ ID NO.26)

实施例2：转基因实验

植物转化：

1. 载体构建

设计一对完全覆盖整个YWL1基因ORF的引物，并在引物上各加上载体pCUbi1390酶切位点BamHI两侧15个碱基，PCR扩增野生型基因组DNA,电泳检测切胶回收，利用重组试剂盒（Clontech, In-Fusion HD Enzyme）连接至茎BamHI酶切线性化的pCUbi1390载体上，经测序确认后，转化至农杆菌（A grobacterium tumefaciens）EHA105菌株中。

扩增ORF序列的引物序列为：

RGg5F: GCAGGTCGACGGATCCTATCCGATAACCGATAAAC（SEQ ID NO.27）

RGg5R: GAATTCCCGGGGATCCCATAAGCAGGTTTGAGAAG（SEQ ID NO.28）

2. 遗传转化：

（1）转化受体的选择

将突变体ywl1种子成熟胚诱导愈伤组织，经过诱导培养基培养2周后将胚芽剪下，继续培养1周，挑选生长旺盛的愈伤用作转化的受体。

（2）遗传转化

采用农杆菌介导的遗传转化方法（Hiei Y, OhtaS, Komari T, Kumashiro T(1994)Efficient transformation of rice (Oryza sativa L.)mediated by Agrobacterium and sequence analysis of the boundaries of the T-DNA. The Plant Journal6:271-282）,将pCUbi1390空载体和pCUbi1390-YWL1载体的EHA105菌株侵染水稻愈伤，在黑暗、25℃条件下共培养3天后，在含有120mg/L 潮霉素的筛选培养基上培养。筛选抗性愈伤在含有120mg/L潮霉素的预分化培养基上培养10天左右。将预分化的愈伤转至分化培养基上在光照条件下培养。一个月左右得到抗性转基因植株。对抗性植株进行PCR鉴定后后，选择阳性植株自交后在低温下继续种植T1家系，观察T1代幼苗叶色分离情况，发现多个家系发生正常叶色与白条纹叶发生分离，同时通过PCR方法调查表型分离与转基因的共分离情况，进而证明YWL1基因功能互补实验成功。

实施例3：YWL1（SEQ ID NO.2）的叶绿体定位实验

根据YWL1的CDS序列（SEQ ID NO.2）设计含XholI、SalI酶切位点的引物，其序列为：

PGXhF: TTTctcgagATAAACCCCCTCCCACACTCTCCAC（SEQ ID NO.29）

PGSalR: TTTgtcgagCCAAATTTGATATTGCACAATGGGA（SEQ ID NO.30）

以野生型cDNA为模板，用高保真酶扩增出YWL1基因的CDS序列（去除终止密码子），扩增产物经测序验证序列正确后，与PAN580-GFP载体连接，得到融合表达载体35S::YWL1:GFP。

提取构建好融合表达载体35S::YWL1:GFP的质粒及无基因融合的35S::GFP利用PEG介导法转化水稻原生质体细胞。轰击后的水稻原生质体细胞至于高渗培养基中暗培养16小时，然后置于荧光显微镜观察，YWL1:GFP融合蛋白定位在叶绿体内，而空载体GFP在整个细胞表达（图7）。该结果表明YWL1编码蛋白质(SEQ ID NO.3)是一个叶绿体定位蛋白。

最后，还需要注意的是，以上列举的仅是本发明的若干个具体实施例。显然，本发明不限于以上实施例，还可以有许多变形。本领域的普通技术人员能从本发明公开的内容直接导出或联想到的所有变形，均应认为是本发明的保护范围。

SEQUENCE LISTING

<110> 中国水稻研究所

<120> 一种控制低温下水稻叶片颜色的基因YWL1及其应用

<130> 1

<160> 30

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 3021

<212> DNA

<213> （水稻） Oryza sativa

<400> 1

atggccctcg ccgccgccgc cgccgccgcg gcagcggccg tctccttccc gcccttgctc 60

tcccgtcccg ccgcctgcgt gctcctccgc tgcggccgcc accgccgcct ccctcccctc 120

ctcctccgcg ccgcctcctc ctccacctcc agcgccccgg acttcaacat caccttcgcg 180

gagcccaccg cccccgcccc ctcgaaaccc aaaccctcat cccccgcccc gtccgcggag 240

caggtggtgc cgtggatcgt gcgtggggag gacggcaagc cgtccatgcg caccgcgccg 300

ccgccggacg tcctccaggc cattgcgctg gcggaggcgg aggccaagaa ggccaagaag 360

gacccccgca ggagccacaa gggcgccgcc gcccttgcca cccccgtcgc caatgccaag 420

gtgagggaga ggaaggccgc ccccgcgacg gcgccgccca agttctccaa ggccgcgagg 480

agattctaca atgagaatat caaggagcac gaaccgcagc ggctcgccaa ggtccttgcc 540

gcggcaggag gtagtcttcc tatcacgcat gattttattg aagtgcttga attggacaga 600

atcaattcaa tcaaagttat attacttagt tacagcaaca catcagttgt ctgaatgctg 660

gcctgattgc tccttccagt ggcctcacga aggacatgcg aggagctcat cttccaaggg 720

aaggtgaccg tcaatggttc tgtctgcact gcaccccagg tatgtttttt tttttagctt 780

tatgaatgat gaaatgctac ttctctaagt ttgttgcatg tctaagtaat gttttagctc 840

ttatcctcat ttatttggtg ctggtctgag accagctatc gtactattgc ggtaaaatat 900

aaattgtttt aatttagcta ggtcatttta ctatgaattt tgatccatgt gcttcaaatg 960

tattcataga caagtttgtt atttgttaca tatgattctt atacattctt ttttatgtag 1020

accaaagttg acatctcaaa ggattctatc tatgttaatg gaaaccgcat ttccaagaag 1080

cttcctccga agttatattt tgctgttaac aagccaaaag ggtcagctct tatattccat 1140

tccgctatct tgttccatca aagcattttt gaaatatata tggaggcagc agtccatatg 1200

agcaacatat ctaaatgtta tttccaatgt actgcaggta tatttgttcc tgtggtgaac 1260

caaagtccat tatctcctta tttgatgact atttgaaggg ttgggtatgt tctttttttt 1320

ttatagtgat ggtacttcct aatatttgtg aaatctttca cctcttatgc tttatagcta 1380

ggacttacaa ttttccattt tcaattaaca tttgcagaac aagattcaac caggagtacc 1440

aaaaccgcgc ttgtttactg tgggtcgtct tgatgttgct acaagtggtt tgataataat 1500

tacaaatgac ggtaatttca ttgtatttca taataaatac ttgggaatca atattttgac 1560

catccaatac ctaaagttag tttgtttctc tttcaggtga gtttgcccag aaactctcac 1620

acccttcgtc aaatataatg aaggagtaag ctcaacttct tgtgtccttc gaagtacagt 1680

aatacaaaat cacgtactag gaacactgta gacactatcc agatcttttg tagaagaaaa 1740

tttaacagtc tgttggtatc actctcattt atttggagaa acgcctaggg gtcttccggc 1800

tagctccaca aggtggtggg ctagccggcc tgggttcgaa gcctcacctt ttctatttat 1860

ttgatattag gccattccct aatattcaca tttttttact ctcatttatt cattatcaat 1920

atgcactggt aattgcgaaa agaaatatct gaaatatcat ttttatcaaa tttcaaatga 1980

aaccaacatt gactttgagt tgtttgatct tgcagatatg tggtaactat agatggacca 2040

gtgcacagaa atcaccttat agctatcagt gaaggcacaa aaattgatgg cgtcaaatgt 2100

atacctgatc tagtggaacc attggatgta caatccaata caaaaaggac ccggattaga 2160

atagcggtac ttatattttc tattatacct cattttatta gattccggat tgactttact 2220

gtctgtttca tgaattccaa attcttcata ggataatgta gaagataggc aacttggctc 2280

tttctgttca gtgaaaaata taccctagca atgaatctat cctatcattc ctttatggga 2340

tatacaacat gatacatgac acacgaaagg tctctttaga tagtatcttg cggtcaagat 2400

ttatttttaa atgtcatgac aagctaaagt ggttagtgat tatgtaaagt tcactttaaa 2460

tgtctaacag gcagttggtt ggatcgataa tttgcctcac ctgcttactt tttcaaatga 2520

ttgaaaccgt ggaaaccata agaaactggt aattctgcaa agcttaagca ataatatgtt 2580

tcgcattgtt caaaactagc taaataattt taacatgtta ccagctaatt tggaaccatt 2640

tcttgataat atttcagccc tgtgagtaaa aaccagtgta gaaggaaaag tcactactct 2700

gggcaacata cagtattttc aatgacatca atatgttatg gacttattgc tcaaaattct 2760

tgcatgtatt cttaactaaa gcaattctat agagatgtaa acttgcaaag gcatagcatt 2820

tggtcatcta ctcattggta tgctattttt tttaatgtct ggcaggttca tgaaggaaga 2880

aatcatgaag ttcgtgaact cgtgcagaat gcaggcctag aggtttgttt gtatgctcaa 2940

tatttttttt ctcaagtttt ccctttatgt tttattgatc atatcttaac atttcccatt 3000

gtgcaatatc aaatttggta a 3021

<210> 2

<211> 1248

<212> DNA

<213> （水稻）Oryza sativa

<400> 2

atggccctcg ccgccgccgc cgccgccgcg gcagcggccg tctccttccc gcccttgctc 60

tcccgtcccg ccgcctgcgt gctcctccgc tgcggccgcc accgccgcct ccctcccctc 120

ctcctccgcg ccgcctcctc ctccacctcc agcgccccgg acttcaacat caccttcgcg 180

gagcccaccg cccccgcccc ctcgaaaccc aaaccctcat cccccgcccc gtccgcggag 240

caggtggtgc cgtggatcgt gcgtggggag gacggcaagc cgtccatgcg caccgcgccg 300

ccgccggacg tcctccaggc cattgcgctg gcggaggcgg aggccaagaa ggccaagaag 360

gacccccgca ggagccacaa gggcgccgcc gcccttgcca cccccgtcgc caatgccaag 420

gtgagggaga ggaaggccgc ccccgcgacg gcgccgccca agttctccaa ggccgcgagg 480

agattctaca atgagaatat caaggagcac gaaccgcagc ggctcgccaa ggtccttgcc 540

gcggcaggag tggcctcacg aaggacatgc gaggagctca tcttccaagg gaaggtgacc 600

gtcaatggtt ctgtctgcac tgcaccccag accaaagttg acatctcaaa ggattctatc 660

tatgttaatg gaaaccgcat ttccaagaag cttcctccga agttatattt tgctgttaac 720

aagccaaaag ggtatatttg ttcctgtggt gaacgaaagt ccattatctc cttatttgat 780

gactatttga agggttggaa caagattcaa ccaggagtac caaaaccgcg cttgtttact 840

gtgggtcgtc ttgatgttgc tacaagtggt ttgataataa ttacaaatga cggtgagttt 900

gcccagaaac tctcacaccc ttcgtcaaat ataatgaagg aatatgtggt aactatagat 960

ggaccagtgc acagaaatca ccttatagct atcagtgaag gcacaaaaat tgatggcgtc 1020

aaatgtatac ctgatctagt ggaaccattg gatgtacaat ccaatacaaa aaggacccgg 1080

attagaatag cggttcatga aggaagaaat catgaagttc gtgaactcgt gcagaatgca 1140

ggcctagagg tttgtttgta tgctcaatat tttttttctc aagttttccc tttatgtttt 1200

attgatcata tcttaacatt tcccattgtg caatatcaaa tttggtaa 1248

<210> 3

<211> 415

<212> PRT

<213> （水稻）Oryza sativa

<400> 3

Met Ala Leu Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Val Ser Phe

1 5 10 15

Pro Pro Leu Leu Ser Arg Pro Ala Ala Cys Val Leu Leu Arg Cys Gly

20 25 30

Arg His Arg Arg Leu Pro Pro Leu Leu Leu Arg Ala Ala Ser Ser Ser

35 40 45

Thr Ser Ser Ala Pro Asp Phe Asn Ile Thr Phe Ala Glu Pro Thr Ala

50 55 60

Pro Ala Pro Ser Lys Pro Lys Pro Ser Ser Pro Ala Pro Ser Ala Glu

65 70 75 80

Gln Val Val Pro Trp Ile Val Arg Gly Glu Asp Gly Lys Pro Ser Met

85 90 95

Arg Thr Ala Pro Pro Pro Asp Val Leu Gln Ala Ile Ala Leu Ala Glu

100 105 110

Ala Glu Ala Lys Lys Ala Lys Lys Asp Pro Arg Arg Ser His Lys Gly

115 120 125

Ala Ala Ala Leu Ala Thr Pro Val Ala Asn Ala Lys Val Arg Glu Arg

130 135 140

Lys Ala Ala Pro Ala Thr Ala Pro Pro Lys Phe Ser Lys Ala Ala Arg

145 150 155 160

Arg Phe Tyr Asn Glu Asn Ile Lys Glu His Glu Pro Gln Arg Leu Ala

165 170 175

Lys Val Leu Ala Ala Ala Gly Val Ala Ser Arg Arg Thr Cys Glu Glu

180 185 190

Leu Ile Phe Gln Gly Lys Val Thr Val Asn Gly Ser Val Cys Thr Ala

195 200 205

Pro Gln Thr Lys Val Asp Ile Ser Lys Asp Ser Ile Tyr Val Asn Gly

210 215 220

Asn Arg Ile Ser Lys Lys Leu Pro Pro Lys Leu Tyr Phe Ala Val Asn

225 230 235 240

Lys Pro Lys Gly Tyr Ile Cys Ser Cys Gly Glu Arg Lys Ser Ile Ile

245 250 255

Ser Leu Phe Asp Asp Tyr Leu Lys Gly Trp Asn Lys Ile Gln Pro Gly

260 265 270

Val Pro Lys Pro Arg Leu Phe Thr Val Gly Arg Leu Asp Val Ala Thr

275 280 285

Ser Gly Leu Ile Ile Ile Thr Asn Asp Gly Glu Phe Ala Gln Lys Leu

290 295 300

Ser His Pro Ser Ser Asn Ile Met Lys Glu Tyr Val Val Thr Ile Asp

305 310 315 320

Gly Pro Val His Arg Asn His Leu Ile Ala Ile Ser Glu Gly Thr Lys

325 330 335

Ile Asp Gly Val Lys Cys Ile Pro Asp Leu Val Glu Pro Leu Asp Val

340 345 350

Gln Ser Asn Thr Lys Arg Thr Arg Ile Arg Ile Ala Val His Glu Gly

355 360 365

Arg Asn His Glu Val Arg Glu Leu Val Gln Asn Ala Gly Leu Glu Val

370 375 380

Cys Leu Tyr Ala Gln Tyr Phe Phe Ser Gln Val Phe Pro Leu Cys Phe

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Ile Asp His Ile Leu Thr Phe Pro Ile Val Gln Tyr Gln Ile Trp

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<211> 3003

<212> DNA

<213> （水稻） Oryza sativa

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tcccgtcccg ccgcctgcgt gctcctccgc tgcggccgcc accgccgcct ccctcccctc 120

ctcctccgcg ccgcctcctc ctccacctcc agcgccccgg acttcaacat caccttcgcg 180

gagcccaccg cccccgcccc ctcgaaaccc aaaccctcat cccccgcccc gtccgcggag 240

caggtggtgc cgtggatcgt gcgtggggag gacggcaagc cgtccatgcg caccgcgccg 300

ccgccggacg tcctccaggc cattgcgctg gcggaggcgg aggccaagaa ggccaagaag 360

gacccccgca ggagccacaa gggcgccgcc gcccttgcca cccccgtcgc caatgccaag 420

gtgagggaga ggaaggccgc ccccgcgacg gcgccgccca agttctccaa ggccgcgagg 480

agattctaca atgagaatat caaggagcac gaaccgcagc ggctcgccaa ggtccttgcc 540

gcggcaggag gtagtcttcc tatcacgcat gattttattg aagtgcttga attggacaga 600

atcaattcaa tcaaagttat attacttagt tacagcaaca catcagttgt ctgaatgctg 660

gcctgattgc tccttccagt ggcctcacga aggacatgcg aggagctcat cttccaaggg 720

aaggtgaccg tcaatggttc tgtctgcact gcaccccagg tatgtttttt tttttagctt 780

tatgaatgat gaaatgctac ttctctaagt ttgttgcatg tctaagtaat gttttagctc 840

ttatcctcat ttatttggtg ctggtctgag accagctatc gtactattgc ggtaaaatat 900

aaattgtttt aatttagcta ggtcatttta ctatgaattt tgatccatgt gcttcaaatg 960

tattcataga caagtttgtt atttgttaca tatgattctt atacattctt ttttatgtag 1020

accaaagtta tctatgttaa tggaaaccgc atttccaaga agcttcctcc gaagttatat 1080

tttgctgtta acaagccaaa agggtcagct cttatattcc attccgctat cttgttccat 1140

caaagcattt ttgaaatata tatggaggca gcagtccata tgagcaacat atctaaatgt 1200

tatttccaat gtactgcagg tatatttgtt cctgtggtga accaaagtcc attatctcct 1260

tatttgatga ctatttgaag ggttgggtat gttctttttt ttttatagtg atggtacttc 1320

ctaatatttg tgaaatcttt cacctcttat gctttatagc taggacttac aattttccat 1380

tttcaattaa catttgcaga acaagattca accaggagta ccaaaaccgc gcttgtttac 1440

tgtgggtcgt cttgatgttg ctacaagtgg tttgataata attacaaatg acggtaattt 1500

cattgtattt cataataaat acttgggaat caatattttg accatccaat acctaaagtt 1560

agtttgtttc tctttcaggt gagtttgccc agaaactctc acacccttcg tcaaatataa 1620

tgaaggagta agctcaactt cttgtgtcct tcgaagtaca gtaatacaaa atcacgtact 1680

aggaacactg tagacactat ccagatcttt tgtagaagaa aatttaacag tctgttggta 1740

tcactctcat ttatttggag aaacgcctag gggtcttccg gctagctcca caaggtggtg 1800

ggctagccgg cctgggttcg aagcctcacc ttttctattt atttgatatt aggccattcc 1860

ctaatattca cattttttta ctctcattta ttcattatca atatgcactg gtaattgcga 1920

aaagaaatat ctgaaatatc atttttatca aatttcaaat gaaaccaaca ttgactttga 1980

gttgtttgat cttgcagata tgtggtaact atagatggac cagtgcacag aaatcacctt 2040

atagctatca gtgaaggcac aaaaattgat ggcgtcaaat gtatacctga tctagtggaa 2100

ccattggatg tacaatccaa tacaaaaagg acccggatta gaatagcggt acttatattt 2160

tctattatac ctcattttat tagattccgg attgacttta ctgtctgttt catgaattcc 2220

aaattcttca taggataatg tagaagatag gcaacttggc tctttctgtt cagtgaaaaa 2280

tataccctag caatgaatct atcctatcat tcctttatgg gatatacaac atgatacatg 2340

acacacgaaa ggtctcttta gatagtatct tgcggtcaag atttattttt aaatgtcatg 2400

acaagctaaa gtggttagtg attatgtaaa gttcacttta aatgtctaac aggcagttgg 2460

ttggatcgat aatttgcctc acctgcttac tttttcaaat gattgaaacc gtggaaacca 2520

taagaaactg gtaattctgc aaagcttaag caataatatg tttcgcattg ttcaaaacta 2580

gctaaataat tttaacatgt taccagctaa tttggaacca tttcttgata atatttcagc 2640

cctgtgagta aaaaccagtg tagaaggaaa agtcactact ctgggcaaca tacagtattt 2700

tcaatgacat caatatgtta tggacttatt gctcaaaatt cttgcatgta ttcttaacta 2760

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tatgctattt tttttaatgt ctggcaggtt catgaaggaa gaaatcatga agttcgtgaa 2880

ctcgtgcaga atgcaggcct agaggtttgt ttgtatgctc aatatttttt ttctcaagtt 2940

ttccctttat gttttattga tcatatctta acatttccca ttgtgcaata tcaaatttgg 3000

taa 3003

<210> 5

<211> 1230

<212> DNA

<213> （水稻）Oryza sativa

<400> 5

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caggtggtgc cgtggatcgt gcgtggggag gacggcaagc cgtccatgcg caccgcgccg 300

ccgccggacg tcctccaggc cattgcgctg gcggaggcgg aggccaagaa ggccaagaag 360

gacccccgca ggagccacaa gggcgccgcc gcccttgcca cccccgtcgc caatgccaag 420

gtgagggaga ggaaggccgc ccccgcgacg gcgccgccca agttctccaa ggccgcgagg 480

agattctaca atgagaatat caaggagcac gaaccgcagc ggctcgccaa ggtccttgcc 540

gcggcaggag tggcctcacg aaggacatgc gaggagctca tcttccaagg gaaggtgacc 600

gtcaatggtt ctgtctgcac tgcaccccag accaaagtta tctatgttaa tggaaaccgc 660

atttccaaga agcttcctcc gaagttatat tttgctgtta acaagccaaa agggtatatt 720

tgttcctgtg gtgaacgaaa gtccattatc tccttatttg atgactattt gaagggttgg 780

aacaagattc aaccaggagt accaaaaccg cgcttgttta ctgtgggtcg tcttgatgtt 840

gctacaagtg gtttgataat aattacaaat gacggtgagt ttgcccagaa actctcacac 900

ccttcgtcaa atataatgaa ggaatatgtg gtaactatag atggaccagt gcacagaaat 960

caccttatag ctatcagtga aggcacaaaa attgatggcg tcaaatgtat acctgatcta 1020

gtggaaccat tggatgtaca atccaataca aaaaggaccc ggattagaat agcggttcat 1080

gaaggaagaa atcatgaagt tcgtgaactc gtgcagaatg caggcctaga ggtttgtttg 1140

tatgctcaat attttttttc tcaagttttc cctttatgtt ttattgatca tatcttaaca 1200

tttcccattg tgcaatatca aatttggtaa 1230

<210> 6

<211> 409

<212> PRT

<213> （水稻）Oryza sativa

<400> 6

Met Ala Leu Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Ala Val Ser Phe

1 5 10 15

Pro Pro Leu Leu Ser Arg Pro Ala Ala Cys Val Leu Leu Arg Cys Gly

20 25 30

Arg His Arg Arg Leu Pro Pro Leu Leu Leu Arg Ala Ala Ser Ser Ser

35 40 45

Thr Ser Ser Ala Pro Asp Phe Asn Ile Thr Phe Ala Glu Pro Thr Ala

50 55 60

Pro Ala Pro Ser Lys Pro Lys Pro Ser Ser Pro Ala Pro Ser Ala Glu

65 70 75 80

Gln Val Val Pro Trp Ile Val Arg Gly Glu Asp Gly Lys Pro Ser Met

85 90 95

Arg Thr Ala Pro Pro Pro Asp Val Leu Gln Ala Ile Ala Leu Ala Glu

100 105 110

Ala Glu Ala Lys Lys Ala Lys Lys Asp Pro Arg Arg Ser His Lys Gly

115 120 125

Ala Ala Ala Leu Ala Thr Pro Val Ala Asn Ala Lys Val Arg Glu Arg

130 135 140

Lys Ala Ala Pro Ala Thr Ala Pro Pro Lys Phe Ser Lys Ala Ala Arg

145 150 155 160

Arg Phe Tyr Asn Glu Asn Ile Lys Glu His Glu Pro Gln Arg Leu Ala

165 170 175

Lys Val Leu Ala Ala Ala Gly Val Ala Ser Arg Arg Thr Cys Glu Glu

180 185 190

Leu Ile Phe Gln Gly Lys Val Thr Val Asn Gly Ser Val Cys Thr Ala

195 200 205

Pro Gln Thr Lys Val Ile Tyr Val Asn Gly Asn Arg Ile Ser Lys Lys

210 215 220

Leu Pro Pro Lys Leu Tyr Phe Ala Val Asn Lys Pro Lys Gly Tyr Ile

225 230 235 240

Cys Ser Cys Gly Glu Arg Lys Ser Ile Ile Ser Leu Phe Asp Asp Tyr

245 250 255

Leu Lys Gly Trp Asn Lys Ile Gln Pro Gly Val Pro Lys Pro Arg Leu

260 265 270

Phe Thr Val Gly Arg Leu Asp Val Ala Thr Ser Gly Leu Ile Ile Ile

275 280 285

Thr Asn Asp Gly Glu Phe Ala Gln Lys Leu Ser His Pro Ser Ser Asn

290 295 300

Ile Met Lys Glu Tyr Val Val Thr Ile Asp Gly Pro Val His Arg Asn

305 310 315 320

His Leu Ile Ala Ile Ser Glu Gly Thr Lys Ile Asp Gly Val Lys Cys

325 330 335

Ile Pro Asp Leu Val Glu Pro Leu Asp Val Gln Ser Asn Thr Lys Arg

340 345 350

Thr Arg Ile Arg Ile Ala Val His Glu Gly Arg Asn His Glu Val Arg

355 360 365

Glu Leu Val Gln Asn Ala Gly Leu Glu Val Cys Leu Tyr Ala Gln Tyr

370 375 380

Phe Phe Ser Gln Val Phe Pro Leu Cys Phe Ile Asp His Ile Leu Thr

385 390 395 400

Phe Pro Ile Val Gln Tyr Gln Ile Trp

405

<210> 7

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 7

gatgcagtag gaacaccaaa cagc 24

<210> 8

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 8

atcgagtacc aagtgcctgt gc 22

<210> 9

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 9

aaagtgttgg tgagcatagc 20

<210> 10

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 10

tttgtgtttg gagagacgag 20

<210> 11

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 11

gcgaaccagt ccactttgat cc 22

<210> 12

<211> 26

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 12

gaggaaggga agaaggaaat agaagg 26

<210> 13

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 13

ccctgttgat ggttgatttc tcc 23

<210> 14

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 14

caagatcaaa gcacatgagt ctgc 24

<210> 15

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 15

gcagatgagc ttcagtgcta ggc 23

<210> 16

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 16

tcagcacagc atattgcaga cc 22

<210> 17

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 17

aatatccgca gccgaaacat agc 23

<210> 18

<211> 22

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 18

accgaccaaa ccaacacaat cg 22

<210> 19

<211> 25

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 19

acatgtcatc ttctctctcg ctacc 25

<210> 20

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 20

ggagaccact cgtcacttcg 20

<210> 21

<211> 25

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 21

atgtgttttt gccttttttt ttggg 25

<210> 22

<211> 25

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 22

cttatccgtg aggggcttgt tgtag 25

<210> 23

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 23

cgatgaagag ccaatccttc agc 23

<210> 24

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 24

tgctcgtccc ttctacaaac agg 23

<210> 25

<211> 23

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 25

ggcagcgagt aagtgtagat tgg 23

<210> 26

<211> 24

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 26

tgttggtata agacaggtgc atgg 24

<210> 27

<211> 35

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 27

gcaggtcgac ggatcctatc cgataaccga taaac 35

<210> 28

<211> 35

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 28

gaattcccgg ggatcccata agcaggtttg agaag 35

<210> 29

<211> 34

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 29

tttctcgaga taaaccccct cccacactct ccac 34

<210> 30

<211> 34

<212> DNA

<213> 人工合成

<400> 30

tttgtcgagc caaatttgat attgcacaat ggga 34

Claims

1.一种控制低温下水稻叶片颜色的基因YWL1，其特征在于该基因显性等位基因序列如SEQ ID NO.1所示,其CDS序列如SEQ ID NO.2所示。

2.一种如权利要求1所述的控制低温下水稻叶片颜色的基因YWL1编码的假尿嘧啶核苷合酶蛋白，其特征在于该假尿嘧啶核苷合酶蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示。

3.一种如权利要求1所述的控制低温下水稻叶片颜色的基因YWL1的突变体基因，其特征在于该突变体基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示，其CDS序列如SEQ ID NO.5所示。

4.如权利要求3所述的突变体基因编码的蛋白质，其特征在于该突变体基因编码蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID No.6 所示。

5.一种控制低温下水稻叶片颜色的基因YWL1在培育叶绿体发育状况变化的转基因植物中的应用。

6.含有如权利要求3所述的YWL1的突变体基因的水稻材料表现出来的低温白条纹叶性状作为标记性状在杂交育种和良种繁育中的应用。