CN104388562B - 一种可鉴定绵羊产肉能力的分子标记及其应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种可鉴定绵羊产肉能力的分子标记及其应用。本发明的分子标记可用来预测或辅助预测具有不同产肉能力的绵羊,具体方法如下:以待测绵羊的基因组DNA为模板,采用由与SEQ ID No.1的第377位上游特异结合的单链DNA和与SEQ ID No.1的第379位下游特异结合的单链DNA组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR产物并测定其序列,根据PCR产物是否含有绵羊产肉能力分子标记鉴定绵羊产肉能力:PCR产物含有绵羊产肉能力分子标记的绵羊的产肉能力高于或候选高于PCR产物不含绵羊产肉能力分子标记的绵羊的产肉能力;绵羊产肉能力分子标记含有SEQ ID No.1的377‑379位的CCC。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域中一种可鉴定绵羊产肉能力的分子标记及其应用。
背景技术
产肉性能是绵羊三大重要经济性状(肉、毛和皮)中所占权重最大的经济性状,占绵羊总生产值的80%以上。羊肉肉质鲜嫩,蛋白质含量高,脂肪固醇含量低,属绿色、营养、健康食品,越来越受消费者的青睐。我国是世界养羊大国,养羊数量占世界总的17%,总产肉量和总存栏量虽居世界第一,但每年仍需花费大量的外汇从国外进口羊肉,年人均羊肉占有量不足2.0Kg,相当于我国猪肉年人均占有量的1/19,远远低于世界羊肉年人均占有水平。究其原因,良种覆盖率低是制约羊肉生产能力的重要因素。以欧、美、澳等发达的养羊国家为例,欧洲和美国的肉用羊良种的覆盖率达100%,以传统放牧为主的新西兰和澳大利亚良种覆盖率也达到65%以上,而我国的良种覆盖率不足30%,几乎没有自主优良肉羊品种。据统计我国绵羊胴体产肉量较美国和加拿大低10-15公斤/只,比澳大利亚和新西兰低6-8公斤/只。我国羊肉的生产能力已与我国养羊大国地位显得极不相称,因此我国羊肉的生产能力亟待提高。有鉴于此,研究绵羊肌肉生长与发育的相关调控机理,开发与挖掘出更多更精准的分子生物学标记方法,更好地服务于肉用品种绵羊的分子育种,加速选种选育的进程,培育出优良的肉羊品种,从而提高肉羊的胴体重,提升我国肉羊生产的整体水平,具有十分重要的理论研究意义。
传统的衡量绵羊产肉性能的指标有4月龄体重、6月龄体重、周岁重、屠宰率、净肉率、骨肉比和GR值等。但在肉羊选育过程一般很少使用屠宰率、净肉率、净肉率和GR值等指标,因为这四个指标均建立在宰杀羊只的基础上,宰杀高产肉能力的种羊进行产肉性能的测定无疑是一种损失。羔羊4-6月龄相对生长速度较快,优良的肉用品种绵羊4-6月龄的生长速度表现得异常突出,是衡量羊只产肉能力的一个重要指标。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是如何预测和鉴别绵羊的产肉能力。
为解决上述技术问题,本发明提供了预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的几种方法(即几种鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力的方法),这些方法均是基于发明人发现含有SEQ ID No.1的377-379位的CCC的绵羊产肉能力高于不含有SEQ ID No.1的377-379位的CCC的绵羊产肉能力作出的。
本发明首先提供了预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法1。
本发明所提供的预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法1(即一种鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力的方法),包括如下步骤:以待测绵羊的基因组DNA为模板,采用由与SEQ ID No.1的第377位上游特异结合的单链DNA和与SEQ ID No.1的第379位下游特异结合的单链DNA组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,测定所述PCR扩增产物的序列,根据所述PCR扩增产物是否含有绵羊产肉能力分子标记按照下述方法预测绵羊产肉能力:所述PCR扩增产物含有所述绵羊产肉能力分子标记的所述待测绵羊的产肉能力高于或候选高于所述PCR扩增产物不含所述绵羊产肉能力分子标记的所述待测绵羊的产肉能力;所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ ID No.1的377-379位的CCC。
上述预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法1中,所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ ID No.1的第374-382位核苷酸;进一步,所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQID No.1的第360-400位核苷酸;更进一步,所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ ID No.1的第300-450位核苷酸;再进一步,所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ ID No.1的第200-500位核苷酸。
上述预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法1中,所述引物对为由SEQ IDNo.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA组成的引物对;所述绵羊产肉能力分子标记为SEQ ID No.1所示的DNA分子。
上述预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法1中,所述引物对为由SEQ IDNo.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA组成的引物对。
为解决上述技术问题,本发明还提供了预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法2。
本发明所提供的预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法2(即一种鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力的方法),包括如下步骤:以待测绵羊的基因组DNA为模板,采用由SEQ ID No.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,测定所述PCR扩增产物的序列,根据所述PCR扩增产物是否为SEQ ID No.1所示的DNA分子按照下述方法预测绵羊产肉能力:所述PCR扩增产物为SEQ ID No.1所示DNA分子的所述待测绵羊的产肉能力高于或候选高于所述PCR扩增产物不为SEQ ID No.1所示DNA分子的所述待测绵羊的产肉能力。
为解决上述技术问题,本发明还提供了预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的引物对。
本发明所提供的预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的引物对(即鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力的引物对),由正向引物和反向引物组成,所述正向引物为与SEQ IDNo.1的第377位上游特异结合的单链DNA,所述反向引物为与SEQ ID No.1的第379位下游特异结合的单链DNA。
上述引物对中,所述引物对为由SEQ ID No.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA组成的引物对。
为解决上述技术问题,本发明还提供了预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的试剂或试剂盒。
本发明所提供的预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的试剂或试剂盒(即鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力的试剂或试剂盒),包括上述引物对中所述引物对。
为解决上述技术问题,本发明还提供了DNA片段,所述DNA片段为下述H1-H5中的任一种:
H1、SEQ ID No.2的第374-379位核苷酸所示的DNA片段;
H2、SEQ ID No.2的第360-397位核苷酸所示的DNA片段;
H3、SEQ ID No.2的第300-447位核苷酸所示的DNA片段;
H4、SEQ ID No.2的第200-497位核苷酸所示的DNA片段;
H5、SEQ ID No.2的第1-507位核苷酸所示的DNA片段。
为解决上述技术问题,本发明还提供了下述任一应用:
P1、所述引物对在预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊中的应用(即在鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力中的应用);
P2、所述引物对在制备预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的试剂或试剂盒(即鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力的试剂或试剂盒)中的应用;
P3、所述引物对在选育具有不同产肉能力绵羊中的应用;
P4、所述试剂或试剂盒在预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊中的应用(即在鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力中的应用);
P5、所述试剂或试剂盒在选育具有不同产肉能力绵羊中的应用;
P6、所述绵羊产肉能力分子标记在预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊中的应用(即在鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力中的应用);
P7、所述绵羊产肉能力分子标记在选育具有不同产肉能力绵羊中的应用;
P8、预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法1或2在预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊中的应用(即在鉴别或辅助鉴别绵羊产肉能力中的应用);
P9、预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法1或2在选育具有不同产肉能力绵羊中的应用。
为解决上述技术问题,本发明还提供了A或B的绵羊的育种方法:
A、绵羊的育种方法,包括将按照所述预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法1得到的PCR扩增产物含有所述绵羊产肉能力分子标记的待测绵羊作为亲本进行育种的步骤;
B、绵羊的育种方法,包括将按照所述预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法2得到的PCR扩增产物为所述绵羊产肉能力分子标记的待测绵羊作为亲本进行育种的步骤。
本申请中,所述绵羊具体可为萨福克羊、特克赛尔羊、阿勒泰羊、中国美利奴和湖羊这五种中的五种、四种、三种、两种或一种。
上文中,所述产肉能力具体可为体重。所述体重具体可为4月龄体重。
实验证明,本发明的引物对、绵羊产肉能力分子标记和预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法可用来预测绵羊的产肉能力:AA基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/+))的4月龄体重极显著性高于BB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(-/-))的4月龄体重;AB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/-))的4月龄体重显著高于BB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(-/-))的4月龄体重。
实验证明,本发明的含有SEQ ID No.1的377-379位CCC的绵羊产肉能力分子标记与绵羊的产肉性能(即产肉能力)相关:120份实践中产肉性能好的萨福克羊全部为AA基因型(PCR产物的基因型为CCC(+/+),即含有SEQ ID No.1的377-379位CCC的绵羊产肉能力分子标记),而实践中产肉性能较差的阿勒泰羊、中国美利奴羊和湖羊则以BB基因型(PCR产物的基因型为CCC(-/-),即不含SEQ ID No.1的377-379位CCC的绵羊产肉能力分子标记)为主。说明含有SEQ ID No.1的377-379位CCC的绵羊产肉能力分子标记可以用来预测绵羊的产肉能力。
本发明的绵羊产肉能力分子标记及预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法和相关产品不受待测绵羊的性别限制,可用于绵羊的早期选育。利用本发明的绵羊产肉能力分子标记及预测或辅助预测具有不同产肉能力绵羊的方法和相关产品选育具有不同产肉能力的绵羊具有诸多优点:(1)羔羊出生后即可检测加以判定其潜在产肉性能,节省育种时间,加速选种选育的进程;(2)传统的方法需要测定养只的体重与屠宰数据,需要花费大量人力去完成这些基础数据的采集,而分子标记的方法只需在羔羊初生时采集少量脐带血提取基因组DNA,无需花费大量的人力;(3)采用分子标记的方法无需宰杀大量后代进行屠宰率的测定,大大节省了育种成本。
附图说明
图1为部分绵羊DNA样品的PCR产物琼脂糖凝胶电泳图和不同非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳带型的测序峰图。其中,A为部分绵羊DNA样品的PCR产物琼脂糖凝胶电泳图,泳道1为100bp marker,泳道2-13为部分绵羊DNA样品的PCR产物;B为不同非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳带型的测序峰图,Ⅰ为基因型为CCC(+/+)的PCR产物的测序峰图,Ⅱ为基因型为CCC(-/-)的PCR产物的测序峰图,Ⅲ为基因型为CCC(+/-)的PCR产物的测序峰图。
具体实施方式
下面结合具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述,给出的实施例仅为了阐明本发明,而不是为了限制本发明的范围。
下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可从商业途径得到。
下述实施例中的阿勒泰羊公众可从阿勒泰地区农十师一八一团场获得,也可从阿勒泰的其它地方获得,该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的中国美利奴细毛羊公众可从新疆石河子市西部牧业集团获得(原紫泥泉种羊场)获得,该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的萨福克羊属于国外引进肉羊品种,公众可从全国各地获得,该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
下述实施例中的特克赛尔羊属于国外引进双肌肉羊品种,公众可从全国多地获得,该生物材料只为重复本发明的相关实验所用,不可作为其它用途使用。
实施例1、绵羊CCC插入与绵羊4月龄体重的关系
一、引物的制备
设计扩增含有SEQ ID No.1的377-379位CCC的绵羊产肉能力分子标记(即绵羊体重性状分子标记)的引物,其中,正向引物为与SEQ ID No.1的第377位上游特异结合的单链DNA,反向引物为与SEQ ID No.1的第379位下游特异结合的单链DNA,具体序列如下:正向引物F:5’-TTGGTCACGTGACTGACCCTCAGAC-3’(序列表中SEQ ID No.3),反向引物R:5’-GTGATGCTGTGGTGTGCAGCAGACA-3’(序列表中SEQ ID No.4)。
制备SEQ ID No.3所示的单链DNA(F)与SEQ ID No.4所示的单链DNA(R)组成的引物对。
二、鉴别具有不同体重性状绵羊
按照如下方法鉴别绵羊体重性状:以待鉴别绵羊的基因组DNA为模板,采用SEQ IDNo.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,测定所述PCR扩增产物的序列,根据所述PCR扩增产物是否含有绵羊体重性状分子标记按照下述方法鉴别绵羊体重性状:所述PCR扩增产物含有所述绵羊体重性状分子标记的所述待鉴别绵羊的体重高于或候选高于所述PCR扩增产物不含所述绵羊体重性状分子标记的所述待鉴别绵羊的体重;所述绵羊体重性状分子标记含有SEQ ID No.1的377-379位的CCC。具体方法如下:
1、样品的制备
采集150只阿勒泰羊(阿勒泰富蕴县阿勒泰羊种群核心区)的血样(每只绵羊采用颈静脉采血10mL,1.5%的EDTANa2抗凝),并分别提取基因组,将每份样品的DNA浓度均调整为100ng/μL,共得到150份阿勒泰羊DNA样品。
2、PCR扩增
利用步骤一的引物对对步骤1的150份阿勒泰羊DNA样品进行PCR扩增。
每份DNA样品的PCR扩增均采用下述25μL体系:10×PCR buffer 2.5μL;含有dATP、dTTP、dCTP和dGTP各2.5mM的4种dNTP混合物2μL;步骤一的浓度均为10μmol/L的SEQ IDNo.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA各0.5μL;Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)0.5μL,DNA样品(100ng/μL)1μL,ddH2O 18μL。
每个PCR扩增的反应条件均为:94℃预变性5min;94℃30s,64℃30s,72℃30s,共35个循环;72℃延伸10min,4℃保存。
将PCR扩增得到的所有样品的PCR产物进行1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测,部分样品的结果如图1中A所示。
3、PCR产物测序
将PCR扩增得到的所有样品的PCR产物进行10%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。电泳条件:在4-15℃温度下,300V电泳5min,然后110V电泳16h。凝胶经固定、银染、显色并拍照,结果中共有三种不同的带型,将含有不同带型的PCR产物的基因型分别命名CCC(+/+)、CCC(+/-)和CCC(-/-)。挑选不同带型的PCR产物,经回收纯化后送北京六合华大基因科技股份有限公司测序,测序结果如图1中B所示。基因型为CCC(+/+)的PCR产物测序图谱为Ⅰ型图谱,该PCR产物的序列为序列表中SEQ ID No.1;基因型为CCC(+/-)的PCR产物的测序图谱为Ⅱ型图谱,该PCR产物的序列是两种,一种为序列表中SEQ ID No.1,另一种为序列表中SEQ IDNo.2;基因型为CCC(-/-)的PCR产物的测序图谱为Ⅲ型图谱,该PCR产物的序列为序列表中SEQ ID No.2。和SEQ ID No.2相比,SEQ ID No.1的377-379位核苷酸的CCC为插入序列,其它核苷酸完全相同。
对所有样品的PCR产物进行测序,将PCR产物的序列为SEQ ID No.1的纯合型绵羊(即PCR产物的序列只有一种,为SEQ ID No.1)命名为AA基因型绵羊,将PCR产物的序列为SEQ ID No.2的纯合型绵羊(即PCR产物的序列只有一种,为SEQ ID No.2)命名为BB基因型绵羊,将它们的杂合型绵羊(即PCR产物的序列有两种,为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2)命名为AB基因型绵羊。
结果显示,150只阿勒泰羊中,10只阿勒泰羊的基因型为AA基因型,24只阿勒泰羊的基因型为AB基因型,116只阿勒泰羊的基因型为BB基因型。
4、鉴别具有不同体重性状绵羊
在步骤3的三种基因型的阿勒泰羊中,选取初生体重基本相同的阿勒泰羊各10只(5公5母)(表1)。AA基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/+))初生平均体重为5.35±0.08Kg,AB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/-))初生平均体重为5.27±0.18Kg,BB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(-/-))初生平均体重为5.18±0.21Kg。
待这30只阿勒泰羊满四个月时,在它们满四个月的当天分别称取其体重(即4月龄体重),如表1所示。
AA基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/+))4月龄平均体重为42.49±1.39Kg,AB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/-))4月龄平均体重为40.89±2.31Kg,BB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(-/-))4月龄平均体重为37.68±1.97Kg。AA基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/+))的4月龄体重极显著性高于BB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(-/-))的4月龄体重;AA基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/+))的4月龄体重高于AB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/-))的4月龄体重,但两者不显著;AB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(+/-))的4月龄体重显著高于BB基因型的阿勒泰羊(PCR产物的基因型为CCC(-/-))的4月龄体重。
结果表明,SEQ ID No.1的377-379位的CCC与绵羊4月龄体重存在明显的相关性。
表1、阿勒泰羊各基因型与4月龄体重的关系
AA基因型(10只) | AB基因型(10只) | BB基因型(10只) | |
初生体重(Kg) | 5.35±0.08 | 5.27±0.18 | 5.18±0.21 |
4月龄体重(Kg) | 42.49±1.39** | 40.89±2.31* | 37.68±1.97 |
注:“**”、“*”分别为相对于CCC(-/-)基因型体重差异极显著与显著。
本发明的SEQ ID No.1的377-379位的CCC与绵羊的产肉性能具有相关性:120份实践中产肉性能好的萨福克羊全部为AA基因型(PCR产物的基因型为CCC(+/+)),而实践中产肉性能较差的阿勒泰羊、中国美利奴羊和湖羊则以BB基因型(PCR产物的基因型为CCC(-/-))为主。说明含有SEQ ID No.1的377-379位的CCC绵羊体重性状分子标记可以用来鉴别或预测绵羊的产肉性能。
实施例2、本发明的绵羊体重性状分子标记的发现
1、样品的制备
采集150只阿勒泰羊(阿勒泰富蕴县阿勒泰羊种群核心区)的血样、115只中国美利奴细毛羊(新疆生产建设兵团农八师150团紫泥泉种羊场)的血样、155只湖羊(江苏省泰州海伦羊业有限公司)的血样、120只萨福克羊(新疆玛纳斯新澳种羊场)的血样和100只特克赛尔羊(新疆玛纳斯新澳种羊场)的血样(每只绵羊采用颈静脉采血10mL,1.5%的EDTANa2抗凝),并分别提取基因组,将每份样品的DNA浓度均调整为100ng/μL,共得到150份阿勒泰羊DNA样品、115份中国美利奴细毛羊DNA样品、155份湖羊DNA样品、120份萨福克羊DNA样品和100份特克赛尔羊DNA样品。
2、PCR扩增
利用实施例1的引物对对步骤1的150份阿勒泰羊DNA样品、115份中国美利奴细毛羊DNA样品、155份湖羊DNA样品、120份萨福克羊DNA样品和100份特克赛尔羊DNA样品分别进行PCR扩增。
每份DNA样品的PCR扩增均采用下述25μL体系:10×PCR buffer 2.5μL;含有dATP、dTTP、dCTP和dGTP各2.5mM的4种dNTP混合物2μL;实施例1步骤一的浓度均为10μmol/L的SEQID No.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA各0.5μL;Taq DNA聚合酶(2.5U/μL)0.5μL,步骤1中的DNA样品(100ng/μL)1μL,ddH2O 18μL。
每个PCR扩增的反应条件均为:94℃预变性5min;94℃30s,64℃30s,72℃30s,共35个循环;72℃延伸10min,4℃保存。
将PCR扩增得到的所有样品的PCR产物进行1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测,部分样品的结果如图1中A所示。
3、PCR产物测序
将PCR扩增得到的所有样品的PCR产物进行10%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。电泳条件为:在4-15℃温度下,300V电泳5min,然后110V电泳16h。凝胶经固定、银染、显色并拍照,结果中共有三种不同的带型,将含有不同带型样品的基因型分别命名CCC(+/+)、CCC(+/-)和CCC(-/-)。挑选不同带型的PCR产物,经回收纯化后送北京六合华大基因科技股份有限公司测序,测序结果如图1中B所示。基因型为CCC(+/+)的PCR产物测序图谱为Ⅰ型图谱,该PCR产物的序列为序列表中SEQ ID No.1;基因型为CCC(+/-)的PCR产物的测序图谱为Ⅱ型图谱,该PCR产物的序列是两种,一种为序列表中SEQ ID No.1,另一种为序列表中SEQ IDNo.2;基因型为CCC(-/-)的PCR产物的测序图谱为Ⅲ型图谱,该PCR产物的序列为序列表中SEQ ID No.2。和SEQ ID No.2相比,SEQ ID No.1的377-379位核苷酸的CCC为插入序列,其它核苷酸完全相同,将SEQ ID No.1的377-379位核苷酸的CCC命名为绵羊产肉能力分子标记(即绵羊体重性状分子标记)。
对所有样品的PCR产物进行测序,将PCR产物的序列为SEQ ID No.1的纯合型绵羊(即PCR产物的序列只有一种,为SEQ ID No.1)命名为AA基因型绵羊,将PCR产物的序列为SEQ ID No.2的纯合型绵羊(即PCR产物的序列只有一种,为SEQ ID No.2)命名为BB基因型绵羊,将它们的杂合型绵羊(即PCR产物的序列有两种,为SEQ ID No.1和SEQ ID No.2)命名为AB基因型绵羊。
结果显示,120只萨福克羊的基因型全为AA基因型,AA基因型频率为1;100只特克赛尔羊中,32只特克赛尔羊的基因型为AA基因型,60只特克赛尔羊的基因型为AB基因型,8只特克赛尔羊的基因型为BB基因型,AA基因型频率为0.32,AB基因型频率为0.60,BB基因型频率为0.08;150只阿勒泰羊中,10只阿勒泰羊的基因型为AA基因型,24只阿勒泰羊的基因型为AB基因型,116只阿勒泰羊的基因型为BB基因型,AA基因型频率为0.07,AB基因型频率为0.16,BB基因型频率为0.77;115只中国美利奴细毛羊中,5只中国美利奴细毛羊的基因型为AA基因型,20只中国美利奴细毛羊的基因型为AB基因型,90只中国美利奴细毛羊的基因型为BB基因型,AA基因型频率为0.04,AB基因型频率为0.17,BB基因型频率为0.78;155只湖羊中,4只湖羊的基因型为AA基因型,25只湖羊的基因型为AB基因型,126只湖羊的基因型为BB基因型,AA基因型频率为0.03,AB基因型频率为0.16,BB基因型频率为0.81。
Claims (10)
1.预测或辅助预测绵羊产肉能力的方法,包括如下步骤:以待测绵羊的基因组DNA为模板,采用由与SEQ ID No.1的第377位上游特异结合的单链DNA和与SEQ ID No.1的第379位下游特异结合的单链DNA组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,测定所述PCR扩增产物的序列,根据所述PCR扩增产物是否含有绵羊产肉能力分子标记按照下述方法预测绵羊产肉能力:所述PCR扩增产物含有所述绵羊产肉能力分子标记的所述待测绵羊的产肉能力高于或候选高于所述PCR扩增产物不含所述绵羊产肉能力分子标记的所述待测绵羊的产肉能力;所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ ID No.1的377-379位的CCC;所述引物对为由SEQ ID No.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA组成的引物对。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ IDNo.1的第374-382位核苷酸。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:,所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ IDNo.1的第360-400位核苷酸。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ IDNo.1的第300-450位核苷酸。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述绵羊产肉能力分子标记含有SEQ IDNo.1的第200-500位核苷酸。
6.根据权利要求1-4任一所述的方法,其特征在于:所述绵羊产肉能力分子标记为SEQID No.1所示的DNA分子。
7.预测或辅助预测绵羊产肉能力的方法,包括如下步骤:以待测绵羊的基因组DNA为模板,采用由SEQ ID No.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA组成的引物对进行PCR扩增,得到PCR扩增产物,测定所述PCR扩增产物的序列,根据所述PCR扩增产物是否为SEQ ID No.1所示的DNA分子按照下述方法预测绵羊产肉能力:所述PCR扩增产物为SEQ IDNo.1所示DNA分子的所述待测绵羊的产肉能力高于或候选高于所述PCR扩增产物不为SEQID No.1所示DNA分子的所述待测绵羊的产肉能力。
8.预测或辅助预测绵羊产肉能力的引物对;所述引物对由SEQ ID No.3所示的单链DNA与SEQ ID No.4所示的单链DNA组成。
9.预测或辅助预测绵羊产肉能力的试剂或试剂盒,包括权利要求8所述引物对。
10.下述任一应用:
P1、权利要求8所述引物对在预测或辅助预测绵羊产肉能力中的应用;
P2、权利要求8所述引物对在制备预测或辅助预测绵羊产肉能力的试剂或试剂盒中的应用;
P3、权利要求8所述引物对在选育具有不同产肉能力绵羊中的应用;
P4、权利要求9所述的试剂或试剂盒在预测或辅助预测绵羊产肉能力中的应用;
P5、权利要求9所述的试剂或试剂盒在选育具有不同产肉能力绵羊中的应用;
P6、权利要求1-3任一所述方法中所述的绵羊产肉能力分子标记在预测或辅助预测绵羊产肉能力中的应用;
P7、权利要求1-3任一所述方法中所述的绵羊产肉能力分子标记在选育具有不同产肉能力绵羊中的应用;
P8、权利要求1-4任一所述的方法在预测或辅助预测绵羊产肉能力中的应用;
P9、权利要求1-4任一所述的方法在选育具有不同产肉能力绵羊中的应用。
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