CN104284680A - 使用对受体的亲和力增加的突变型light分子用于癌症治疗的方法和组合物 - Google Patents

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Abstract

公开了使用与靶向试剂连接、融合或缀合的LIGHT蛋白质的具体形式靶向肿瘤细胞的方法和组合物。这些组合物与人和小鼠受体两者结合，其亲和力足以进行临床前和临床试验，并且与野生型人LIGHT蛋白质相比较具有增加的亲和力。LIGHT的具体形式对肿瘤细胞的靶向减少肿瘤生长并减少转移。

Description

使用对受体的亲和力增加的突变型LIGHT分子用于癌症治疗的方法和组合物
相关申请的交叉引用
本申请根据35U.S.C.§119(e)要求于2011年12月15日提交的美国临时专利申请号61/576,222的优先权利益。引用的申请中所述的公开内容，包括如最初提交给美国专利与商标局的所有信息，整体通过引用并入本文作。
序列表
本专利申请含有已经由EFS-Web以ASCII形式提交并在此整体引入作为参考的序列表。所述ASCII拷贝于2012年12月5日创建，命名为700286_SEQ_ST25.txt并且大小为54,899字节。
背景技术
公开了使用与靶向试剂连接、融合或缀合的LIGHT蛋白质的具体形式靶向肿瘤细胞的方法和组合物。这些组合物与人和小鼠受体两者结合，其亲和力足以进行临床前和临床试验，并且与野生型人LIGHT蛋白质相比较具有增加的亲和力。LIGHT的具体形式对肿瘤细胞的靶向减少肿瘤生长并减少转移。
在免疫活性宿主中浸润已建立的肿瘤的少量活化T细胞帮助解释宿主处置肿瘤的无能。在动物模型中的实验以及临床研究指示免疫系统可以识别并杀死个别肿瘤细胞，但宿主一般不能根除已建立的实体瘤。存在可能是宿主有效响应已建立的肿瘤的失败的几种解释：1)由于转移至淋巴样组织的肿瘤细胞(尤其是非造血起源的那些)数目的不足够，由于在淋巴样组织中的弱直接或间接呈递，缺乏早期T细胞引发(priming)；2)由于在肿瘤组织周围的生物学障碍，迁移至肿瘤位点的免疫细胞的数目不足够；3)由于储库有限，耗尽或短命的活化抗原特异性T细胞未能对抗肿瘤生长；4)T细胞对肿瘤的无应答性或忽略；5)抑制性微环境或在肿瘤内缺乏活化免疫系统的刺激。
在临床上，增加T细胞对肿瘤部位的浸润与更佳的预后紧密相关。存在预防性疫苗接种在诱导接种的肿瘤细胞排斥中有效的报道。然而，在肿瘤生长已建立后，治疗疫苗通常未能排斥肿瘤。肿瘤的手术减少不增强对肿瘤的免疫应答。此外，据报道即使在肿瘤细胞上的强抗原的表达也不足以促进已建立的肿瘤的排斥，尽管在淋巴样组织中存在过量数目的抗原特异性T细胞。引发和/或浸润已建立的肿瘤的T细胞缺乏是针对抗原性癌症的天然或治疗方法的主要障碍之一。另外，在肿瘤组织内部的共刺激分子的表达不充分可能未能活化浸润T细胞，并且导致肿瘤反应性T细胞的无能。
早期T细胞引发的缺乏可能由于仅少数肿瘤细胞从实体组织迁移到淋巴样组织用于直接呈递。使用骨髓嵌合体的遗传分析已揭示用于引发MHC-1限制性CD8+T细胞的两种抗原呈递模式。直接引发由T细胞与合成具有抗原表位的蛋白质的细胞的接合介导，而交叉引发由吸收通过其他细胞合成的抗原的宿主抗原呈递细胞介导。肿瘤特异性T细胞被引发的机制已进行热烈讨论，并且至今仍然没有定论。理解肿瘤抗原如何并在哪里呈递给T细胞将帮助找到针对肿瘤的治疗作用。
LIGHT(与淋巴毒素同源，显示出可诱导的表达，并且与HSV糖蛋白D竞争疱疹病毒进入介质，由T淋巴细胞表达的受体)是TNF配体超家族的II型跨膜糖蛋白。LIGHT(TNFSF14)是与淋巴毒素β受体(LTβR)和疱疹病毒进入介质相互作用的肿瘤坏死因子(TNF)家族成员，其主要分别在基质细胞和T细胞上表达。LTβR发信号是组构的淋巴样结构形成所需的，这可以至少部分由于其诱导趋化因子和粘附分子表达的能力，所述趋化因子和粘附分子吸引淋巴样器官中的幼稚T细胞和树突状细胞(DC)。在体内通过LIGHT刺激基质细胞上的LTβR导致CCL21的表达，所述CCL21在不存在LTaB(LTβR的另一种配体)的情况下吸引脾脏的T细胞区域中的幼稚T细胞。这些结果证实LIGHT能够与LTβR相互作用，以调节CCL21趋化因子表达。另外，LIGHT显示出用于T细胞引发和扩增的有力的CD28不依赖性共刺激活性，导致针对肿瘤增强的T细胞免疫和/或增加的自身免疫。经由LTβR发信号是组构的淋巴样组织形成所需的。淋巴毒素B受体(LTβR)在淋巴样结构形成中起重要作用。LTβR通过TNF家族的两个成员：膜淋巴毒素B和LIGHT活化。LTβR在淋巴结(LN)的形成以及次级淋巴样器官中的T、B区带的不同组构中起关键作用。经由LTβR发信号调节次级淋巴样器官的趋化因子和粘附分子表达。趋化因子和粘附分子控制脾脏中DC和淋巴细胞的迁移和定位。在非淋巴样组织中可溶性LT或TNF的过表达足以促进肝内淋巴样新生。
LIGHT也已被称为HVEM-L和LT-γ。在新TNF命名法下，它被称为TNFSF14。LIGHT是240个氨基酸(aa)的蛋白质，其含有37aa的细胞质结构域、22aa的跨膜区和181aa的细胞外结构域。类似于其他TNF配体家族成员，LIGHT预测装配为同三聚体。LIGHT由活化T细胞产生，并且首先通过其与HSV糖蛋白D竞争HVEM结合的能力得到鉴定。LIGHT也已显示与淋巴毒素B受体(LTβR)和诱饵受体(DcR3TR6)结合。
LIGHT在T细胞活化和淋巴样组织形成中起独特作用。LIGHT和LTβR之间的相互作用恢复LTα-/-小鼠的脾脏中的淋巴样结构。另外，LIGHT的上调引起T细胞活化并迁移到非淋巴样组织，提供淋巴样结构的形成。相反，LIGHT-/-小鼠显示受损的T细胞活化和延迟的心脏排斥。因此，LIGHT是有力的共刺激分子，其也促进淋巴样组织的形成，以增强局部免疫应答。在引流淋巴样组织中幼稚T细胞的有效引发的缺乏和在肿瘤内扩增肿瘤特异性T细胞的无能阻止癌症的根除。
微小转移灶(显微镜可见的癌细胞的小聚集体)可以在异质原发性肿瘤发育中的极早期变得建立，并且在其临床检测到之前种植远侧组织部位。例如，当原发性肿瘤大小极小时，可以观察到在乳腺癌中的可检测转移灶。因此，在诊断时，许多癌症患者已经具有微观转移灶，该观察已导致用于具有实体瘤的患者的手术后佐剂治疗的发展。尽管这些进展，成功仍是有限的，并且转移性疾病的最佳治疗仍在癌症治疗中构成显著挑战。
多种人和鼠癌症已证明为抗原性的，并且能够由T细胞识别。肿瘤反应性T细胞理论上可以找出并破坏肿瘤抗原阳性癌细胞，并且放过周围健康组织。然而，针对人中的恶性肿瘤的天然存在的T细胞应答通常不足以引起肿瘤，原发性肿瘤或转移灶的消退。已报道散发性自发性、但免疫原性肿瘤，通过诱导T细胞耐受而避免破坏。然而，肿瘤抗原特异性T细胞的活化可完全阻止自发性肿瘤的发展。因此，在原发性肿瘤治疗时破坏耐受并生成能够拒绝肿瘤的此类T细胞代表清除转移性肿瘤细胞的潜在方法。因为抗原丧失的变体可以在免疫压力下逃避，所以不依赖于特异性肿瘤抗原的了解，免疫治疗应是可应用的。
从免疫学角度来看，目前的临床策略妨碍针对恶性肿瘤的免疫防御，并且进一步减小免疫治疗的有效性。尽管肿瘤的去除可以逆转肿瘤诱导的免疫抑制，但在免疫治疗之前原发性肿瘤的手术切除还去除抗原的主要来源，这可以导致细胞毒性T淋巴细胞(CTL)活化的减少，因为引发的效率与肿瘤抗原负荷关联。另外，意欲杀死残留肿瘤细胞的，包括化学治疗和放射治疗的目前辅助治疗，实际上可以通过破坏或抑制T细胞而损害抗肿瘤免疫应答。
转移性疾病是癌症中的发病率和死亡率的主要原因。虽然手术、化学疗法或辐射通常可以控制原发性肿瘤生长，但弥散性转移灶的成功根除仍是罕见的。一个未解决的问题是此类应答是否允许新来的CTL被教育，并且随后离开肿瘤部位。另一个未解决的问题是这些CTL随后是否可以巡察并有效消除在周围的自发性转移的肿瘤细胞。肿瘤用LIGHT的局部治疗生成很多肿瘤特异性CTL，其离开原发性肿瘤并浸润远侧肿瘤，以完全根除先前存在的自发性转移灶。
如上所述，针对人中的恶性肿瘤的天然存在的T细胞应答通常不足以引起肿瘤、原发性肿瘤或转移细胞的消退。免疫疗法将有可能引发肿瘤反应性T细胞，其可以寻找并破坏弥散性肿瘤抗原阳性癌细胞，同时放过周围健康组织，但荷瘤宿主的主动疫苗接种仅显示有限的利益。大多数肿瘤中充分确定的抗原的缺乏限制主动疫苗接种或过继转移治疗。即使不测定特异性肿瘤抗原也有效的免疫疗法将是更可应用的以及在治疗上更可行的。然而，仍不明确何时和如何增强针对肿瘤组织的主动免疫应答。
幼稚或效应记忆T细胞可以通过主动过程离开周围并进入引流淋巴结内。尚未知召募至原发性肿瘤的足够数目的肿瘤特异性CTL是否可以存活并离开微环境，以巡察周围组织并根除弥散性转移灶。另外，开发有效免疫治疗中的挑战是设计增加循环肿瘤特异性T细胞的数目或增强循环肿瘤特异性T细胞的功能的方法，所述循环肿瘤特异性T细胞可以在微观转移细胞变得临床上有意义之前检测并破坏它们。LIGHT递送到原发性肿瘤内可以帮助生成CTL，所述CTL随后可以离开局部肿瘤并且巡察周围组织，以在转移灶在临床上有意义之前根除它们。
批准的乳腺癌治疗包括手术、辐射、化学疗法(例如多柔比星、紫杉醇)、发信号抑制剂(例如拉帕替尼、奈拉替尼)和单克隆抗体(例如曲妥珠单抗、帕妥珠单抗)。赫赛汀(曲妥珠单抗)是批准的用于乳腺癌的抗Her2抗体疗法。Her2(人表皮生长因子受体2(c-erbB2或neu)在25-30％的人乳腺癌中是扩增的。Her2的过表达与预后不良相关。
采用在人IgG构架上的鼠抗原结合残基的靶向Her2的人源化单克隆抗体在1998年由FDA批准用于单一疗法。总体应答率对于单一疗法在11.6-35％之间。
然而，存在关于抗Her2抗体疗法的问题。对于抗Her2/neu疗法，存在低于所需的治疗成功和大量无应答率。抗Her2/neu疗法需要连同化学疗法一起的延长治疗才有效。大多数患者发展抗性并且在一年内复发，并且治疗可以花费超过$100,000USD。
几种策略可以改善治疗抗体功效：
a.细胞毒性或免疫调节性免疫细胞因子(IL-2、LIGHT等)；
b.药物缀合物(化学药物)；
c.修改Fc介导的效应，例如改变抗体同种型；
修饰亲和力或改变Fc受体结合；和增加半衰期。
对抗原-抗体结合或设计的改善可通过下述寻求：
a.更高的亲和力
b.增加或降低的内在化
c.增加的抗体稳定性
d.双特异性、三特异性抗体。
在本公开内容中，与使用野生型LIGHT的先前结果相比较，不只用野生型LIGHT还用LIGHT的多种具体形式靶向肿瘤生成针对原发性肿瘤和转移灶的强免疫。
发明内容
用与针对肿瘤的靶向试剂连接、融合或缀合的LIGHT的具体形式例如突变型LIGHT蛋白质、肽或其片段靶向肿瘤细胞减少肿瘤的生长，并且还减少转移包括微小转移。靶向试剂包括抗体。进一步地，与针对肿瘤抗原的抗体连接的细胞因子可针对微小转移使用。
LIGHT，TNF家族成员，是复杂分子网络的部分，并且是用作免疫细胞因子的极佳候选物。(图8)
LIGHT(TNFSF14)在淋巴样组织、未成熟DC和活化T细胞上作为三聚体表达。
LIGHT结合靶细胞上的LTbR和HVEM。
LIGHT还结合由许多肿瘤分泌的在人中的可溶性诱饵受体3。
TNF家族成员的相互影响控制免疫调节。LIGHT的三管齐下活性使得其成为用作免疫细胞因子的极佳候选物：LIGHT结合LTβR和HVEM两者用于免疫调节；与LTβR相互作用以增加趋化因子和粘附分子；并且吸引T细胞。它通过HVEM活化T细胞和NK细胞用于增加的免疫功能和肿瘤免疫；并且指导LTβR或HVEM表达肿瘤的细胞凋亡。(图9)
使用腺病毒方法和以融合蛋白形式的LIGHT对肿瘤的递送在减少肿瘤大小和控制转移方面是有效的。(图10，11)(表1)然而，使用LIGHT的融合构建体的产生已经是有问题的。存在关于scFV(neu)-mLIGHT融合物的聚集和低生产问题。另外，在鼠模型中难以显示有效性，因为与野生型LIGHT或小鼠LIGHT相比较，人LIGHT构建体，例如抗neu(Fab)-hLIGHT对小鼠受体具有减少的结合亲和力。
因此，改造了具有增加的稳定性和亲和力的LIGHT分子，其可以用于生成scFV(neu)-LIGHT融合蛋白或其他融合蛋白，所述融合蛋白可以在体外和体内在疾病的小鼠模型和人中进行测试。
此外，公开了新突变型人LIGHT分子，其以比野生型人LIGHT(hLIGHT)更大的亲和力与LIGHT的小鼠受体结合，并且与野生型人LIGHT相比较，与LIGHT的人受体具有相等或更大的结合。公开了对抗体介导的癌症治疗和用于癌症治疗的免疫疗法的改善。如本文使用的“野生型”指表征来源哺乳动物例如人、小鼠中的序列的氨基酸或核酸序列。
对产生改善的LIGHT和改善的LIGHT靶向试剂融合构建体的解决方案部分通过下述步骤实现：人LIGHT(hLIGHT)(“野生型”)用作改造的平台，因为它比小鼠LIGHT更稳定。将hLIGHT改造为具有与鼠LTbR和HVEM(mLTbR和mHVEM)以及人LTbR和HVEM(hLTbR和hHVEM)相等或更大的结合，以及改善的表达和稳定性，以易于生产并增加治疗效果(图17，18)。在这个意义上，经改造的LIGHT分子“衍生”自LIGHT。
hLIGHT进行改造，并且鉴定了具有增加的小鼠LTβR和小鼠HVEM结合(图21)以及与人LTβR和人HVEM的有利结合的克隆(图23)。与小鼠和人受体的结合的证实在CHO细胞中产生的scFV-LIGHT融合物中进行(图23)。人突变型LIGHT构建体在体外作为融合蛋白进行测试。如通过细胞计数和MTS测量的，与单独的7164抗体或单独的人LIGHT相比较，7164-m4-14LIGHT(其为新的与scFV(neu)融合的更高亲和力的人突变型LIGHT分子之一)明显更佳地减慢TUBO细胞的生长。(图25，26)
人突变型LIGHT构建体在体外和体内在腺病毒构建体中就其刺激宿主免疫应答的潜在功能进行测试(图29)。人LIGHT突变体m4-14细胞外结构域连同编码抗neu抗体片段的单链片段(scFv)一起递送(ad-neu-突变型LIGHT)。与含有未经修饰的人LIGHT细胞外结构域的构建体(ad-neu-人LIGHT)相比较，ad-neu-突变型LIGHT在体内和体内改善针对neu的CD8+CTL应答(图30-32，35)。与含有ad-neu-人LIGHT的构建体相比较，ad-neu-突变型LIGHT也刺激增加数目的抗neu抗体的产生(图33)。当作为抗癌疫苗进行测试时，ad-neu-突变型LIGHT在预防肿瘤方面比仅含neu的疫苗更有效(图34)，并且具有增加的neu特异性细胞杀死(图36)。LIGHT可以经由HVEM受体刺激NK细胞产生IFN，同时经由LTbR刺激MEF以产生IL-6。图37证实突变型LIGHT在Rag-l-脾细胞中诱导比Wt LIGHT高得多的IFN-γ生产。图38证实突变型LIGHT在MEF细胞中诱导比Wt人LIGHT更高的IL-6生产。因此，突变型LIGHT是比Wt LIGHT更强的刺激物。
在手术前经由抗体-人-突变型LIGHT融合物、人突变型LIGHT的腺病毒递送或缀合组合物在肿瘤组织中诱导免疫应答，生成足够的引发抗原特异性效应T细胞，其离开肿瘤并根除转移灶。对癌症抗原特异性的抗体和对蛋白酶消化抗性的LIGHT(例如在LIGHT的位置81-84区域中的突变型LIGHT形式)也可以分开施用。在手术切除前用TNFSF14(LIGHT)靶向原发性肿瘤是引发用于根除自发转移灶的更佳免疫应答的新策略。用人突变型LIGHT治疗的处理减慢侵袭性肿瘤的生长。
适合于癌症治疗的组合物包括与人LIGHT蛋白质的片段连接、融合或缀合的肿瘤特异性抗体，其中LIGHT片段对肿瘤环境中的蛋白酶消化是抗性的，并且足以诱导针对肿瘤细胞的细胞毒性T淋巴细胞。
合适的组合物包括肿瘤特异性靶向试剂和相对于人野生型序列具有突变的突变型LIGHT氨基酸序列(图6和7)，或与人突变型LIGHT蛋白质的片段连接的肿瘤特异性靶向试剂。靶向试剂和人突变型LIGHT蛋白质的片段可以形成融合蛋白，或LIGHT蛋白质的片段可以与靶向试剂或靶向试剂的片段化学缀合或以其他方式连接。
组合物包括通过合适的方法例如直接注射、腺病毒载体、微球体或纳米颗粒递送至肿瘤的能力。
衍生自LIGHT蛋白质的任何肽片段包括重组肽、合成肽、重组LIGHT蛋白质、突变型LIGHT蛋白质、截短的LIGHT蛋白质、LIGHT的细胞外结构域、LIGHT的保守结构域、类似LIGHT结构域的肽模拟物、具有经修饰的氨基酸的LIGHT蛋白质或其肽，通过使其与肿瘤特异性试剂例如抗体或其片段连接、融合或缀合而适用于诱导免疫应答，条件是LIGHT片段能够稳定存在于肿瘤细胞表面上，并且对于LIGHT的小鼠和人受体具有增加的亲和力。
合适的组合物包括人源化单克隆抗体或嵌合抗体或异微型抗体(heterominibody)或单链抗体。
与LIGHT结合使用的抗体片段足以识别肿瘤抗原。片段足以刺激细胞毒性T淋巴细胞。
LIGHT的片段可以包括LIGHT的约100-150个氨基酸。
LIGHT的片段可以具有对应于LIGHT的位置约85-240的氨基酸序列。LIGHT的片段还可以包括LIGHT的约100-150个氨基酸。LIGHT的片段可以包括来自LIGHT的位置约90-240的氨基酸序列。LIGHT的片段可以包括来自LIGHT的位置约84-240或83-240或82-240的氨基酸序列。
LIGHT的片段还可以包括LIGHT的约100-150个氨基酸，条件是该片段能够诱导针对肿瘤细胞的免疫应答。LIGHT的片段可以包括来自LIGHT的位置约90-235的氨基酸序列。
LIGHT的片段诱导蛋白酶抗性片段。LIGHT的片段可以包括在蛋白酶识别序列EQLI(SEQ ID NO:1)中的突变。
包括新型人突变型LIGHT细胞外结构域的组合物适合于癌症治疗。公开了这样的组合物，其中LIGHT片段包括具有下述氨基酸序列中的至少一种的细胞外结构域：
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与人和小鼠受体结合的新型人LIGHT细胞外结构域在图6、7和28中列出。本文公开的LIGHT突变体在其生物学特性及其功效方面是出乎意料的。如图21中所示(“hLIGHT突变体具有增加的与mLTbR和mHVEM的结合亲和力”)，这些新突变体不仅具有增加的对于小鼠LIGHT受体的结合亲和力，与野生型人LIGHT相比较，还具有显著增加的对于人LIGHT受体的结合亲和力。另外，与野生型人LIGHT相比较，这些突变体具有增加的稳定性。除了其显著改善的交叉物种亲和力之外，这些突变体在细胞杀死方面还基本上比野生型人LIGHT更有效，如图31和32中所示(超级LIGHT可以改善对neu的CD8CTL应答－－体内杀死”)。在本发明时本领域技术人员无法预测，可以生成会具有这些特性的LIGHT突变体。图6和7显示许多突变体具有在214处突变为E的K，这也是小鼠序列中的情况。特别有利的是突变体m4-14、m4-7和m4-16。
减少原发性肿瘤的生长和/或癌症转移的方法包括下述步骤：
施用包含与LIGHT的具体化中的至少一种例如片段连接的肿瘤特异性抗体的药物组合物；和
通过刺激针对肿瘤特异性T细胞的活化，减少原发性肿瘤的生长和/或癌症转移。
该抗体识别表面肿瘤抗原，并且该抗体可以与LIGHT片段化学缀合或者与LIGHT片段重组融合或以其他方式连接。
包括抗体-LIGHT的药物组合物可以通过技术人员已知或本文公开的其他方法静脉内施用。
减少原发性肿瘤的生长和/或癌症转移的方法包括下述步骤：
(a)施用包含与LIGHT的至少一种具体形式连接的肿瘤特异性抗体的药物组合物；
(b)在肿瘤部位处将编码其LIGHT具体形式的核酸分子引入个体内，其中LIGHT是蛋白酶抗性的；和
(c)通过刺激针对肿瘤的肿瘤特异性T细胞的活化，减少原发性肿瘤的生长癌症转移。
核酸可以递送至先前存在的肿瘤部位或相对于先前存在的肿瘤部位远侧的部位。
化学治疗剂还可以在抗体-LIGHT治疗过程中或之前或之后施用。
放射疗法还可以在LIGHT治疗过程中或之前或之后施用。
对肿瘤抗原特异性的抗体的具体形式可以选自HER2、HER4、HERB、STEAP、c-MET、EGFR、甲胎蛋白(AFP)、癌胚抗原(CEA)、CA-125、MUC-1、上皮肿瘤抗原(ETA)、酪氨酸酶、黑色素瘤相关抗原(MAGE)、ras或p53的异常产物、DcR3及任何其他抗癌抗原。
减少原发性肿瘤的生长和/或癌症转移的方法包括下述步骤：
(a)施用包含肿瘤特异性抗体的药物组合物；
(b)在肿瘤部位处引入编码LIGHT蛋白质或其片段的核酸分子，其中LIGHT是蛋白酶抗性的；
(c)在肿瘤细胞的表面上表达LIGHT蛋白质或其片段；和
(d)通过刺激针对肿瘤的肿瘤特异性T细胞的活化，减少肿瘤的生长和/或癌症转移。
公开了包括识别肿瘤抗原的肽区域和LIGHT蛋白质的片段的嵌合蛋白。试剂可以是结合肿瘤表面受体的配体。
描述了包括LIGHT蛋白质的片段和特异性识别肿瘤细胞的试剂的组合物。
药物组合物包括与肿瘤特异性组分偶联的LIGHT肽片段。肿瘤特异性组分可以包括针对肿瘤细胞表面中的受体的配体或识别肿瘤细胞表面上的配体的受体。
治疗肿瘤(特别是实体瘤)的新型方法是通过使用突变型LIGHT分子产生淋巴样微环境，其表达引发幼稚T细胞和扩增活化T细胞所需的趋化因子、粘附分子和共刺激分子。生成针对肿瘤的更广泛的T细胞。抗体-LIGHT融合物或缀合物的直接递送针对肿瘤和转移灶是有效的。与用对照治疗的肿瘤相比较，当抗体-LIGHT缀合物或融合产物靶向肿瘤时，肿瘤体积在体内减少。
在多种实施方案中，突变型人LIGHT具有在蛋白酶解位点中的氨基酸变化，所述蛋白酶解位点包括来自天然LIGHT蛋白质的位置81-84的氨基酸序列EQLI(SEQ ID NO:1)。在一个实施方案中，突变型LIGHT不具有蛋白酶解位点，来自天然LIGHT蛋白质的位置81-84的氨基酸序列EQLI(SEQID NO:1)。
在多种实施方案中，突变型人LIGHT具有在位置214处的氨基酸变化，其中在位置214处的赖氨酸变成谷氨酸。
公开的核酸分子编码包括细胞外结构域的重组LIGHT：
QLHWRLGEMVTRLPDGPAGSWEQLIQERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALVVTKAGYYYIYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEKVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV(SEQ ID NO:26)。
癌症转移通过细胞毒性T淋巴细胞的刺激和/或通过用于引发幼稚T细胞的趋化因子、粘附分子和共刺激分子的刺激得到减少。T细胞在肿瘤部位内活化，并且可以在血液中循环。循环T细胞优选是癌症特异性的。T细胞生成可以是CD8+依赖性的。
分离的重组核酸包括编码蛋白酶消化抗性突变型LIGHT的核苷酸序列。核苷酸序列的实施方案是：
ATGGAGGAGAGTGTCGTACGGCCCTCAGTGTTTGTGGTGGATGGACAGACCGACATCCCATTCACGAGGCTGGGACGAAGCCACCGGAGACAGTCGTGCAGTGTGGCCCGGGTGGGTCTGGGTCTCTTGCTGTTGCTGATGGGGGCTGGGCTGGCCGTCCAAGGCTGGTTCCTCCTGCAGCTGCACTGGCGTCTAGGAGAGATGGTCACCCGCCTGCCTGACGGACCTGCAGGCTCCTGGGAGCAGCTGATACAAGAGCGAAGGTCTCACGAGGTCAACCCAGCAGCGCATCTCACAGGGGCCAACTCCAGCTTGACCGGCAGCGGGGGGCCGCTGTTATGGGAGACTCAGCTGGGCCTGGCCTTCCTGAGGGGCCTCAGCTACCACGATGGGGCCCTTGTGGTCACCAAAGCTGGCTACTACTACATCTACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGTGTGGGCTGCCCGCTGGGCCTGGCCAGCACCATCACCCACGGCCTCTACAAGCGCACACCCCGCTACCCCGAGGAGCTGGAGCTGTTGGTCAGCCAGCAGTCACCCTGCGGACGGGCCACCAGCAGCTCCCGGGTCTGGTGGGACAGCAGCTTCCTGGGTGGTGTGGTACACCTGGAGGCTGGGGAGAAGGTGGTCGTCCGTGTGCTGGATGAACGCCTGGTTCGACTGCGTGATGGTACCCGGTCTTACTTCGGGGCTTTCATGGTGTGA(SEQ ID NO:27)，
其中编码蛋白酶消化位点的序列GAGCAGCTGATA(SEQ ID NO:28)是突变的。
野生型人LIGHT DNA序列(编码蛋白酶位点EQLI(SEQ ID NO:1)的序列以粗体显示)：
ATGGAGGAGAGTGTCGTACGGCCCTCAGTGTTTGTGGTGGATGGACAGACCGACATCCCATTCACGAGGCTGGGACGAAGCCACCGGAGACAGTCGTGCAGTGTGGCCCGGGTGGGTCTGGGTCTCTTGCTGTTGCTGATGGGGGCTGGGCTGGCCGTCCAAGGCTGGTTCCTCCTGCAGCTGCACTGGCGTCTAGGAGAGATGGTCACCCGCCTGCCTGACGGACCTGCAGGCTCCTGGGAGCAGCTGATACAAGAGCGAAGGTCTCACGAGGTCAACCCAGCAGCGCATCTCACAGGGGCCAACTCCAGCTTGACCGGCAGCGGGGGGCCGCTGTTATGGGAGACTCAGCTGGGCCTGGCCTTCCTGAGGGGCCTCAGCTACCACGATGGGGCCCTTGTGGTCACCAAAGCTGGCTACTACTACATCTACTCCAAGGTGCAGCTGGGCGGTGTGGGCTGCCCGCTGGGCCTGGCCAGCACCATCACCCACGGCCTCTACAAGCGCACACCCCGCTACCCCGAGGAGCTGGAGCTGTTGGTCAGCCAGCAGTCACCCTGCGGACGGGCCACCAGCAGCTCCCGGGTCTGGTGGGACAGCAGCTTCCTGGGTGGTGTGGTACACCTGGAGGCTGGGGAGAAGGTGGTCGTCCGTGTGCTGGATGAACGCCTGGTTCGACTGCGTGATGGTACCCGGTCTTACTTCGGGGCTTTCATGGTGTGA-3'(SEQ ID NO:29)。
天然人LIGHT氨基酸序列(蛋白酶消化位点以粗体下划线显示)：
MEESVVRPSVFVVDGQTDIPFTRLGRSHRRQSCSVARVGLGLLLLLMGAGLAVOGWFLLOLHWRLGEMVTRLPDGPAGSWEOLIQERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALVVTKAGYYYIYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEKVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV(SEQ ID NO:30)
突变型人LIGHT氨基酸序列(EQLI(SEQ ID NO:1)不存在，由点指示)的一个方面：
MEESVVRPSVFVVDGQTDIPFTRLGRSHRRQSCSVARVGLGLLLLLMGAGLAVQGWFLLQLHWRLGEMVTRLPDGPAGSW...QERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALVVTKAGYYYIYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEKVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV(SEQ ID NO:31)。
以ATG开始的小鼠突变型LIGHT的密码子最佳化的核苷酸序列以粗体突出显示：
GGGCGAATTGGGTACCGGATCCGCCACCATGGAGAGCGTGGTGCAGCCC
AGCGTGTTCGT1---------+---------+---------+---------+---------+---------+
GGTGGACGGCCAGACCGACATCCCCTTCAGGAGGCTGGAGCAGAACCAC
AGGCGGAGGAG61---------+---------+---------+---------+---------+---------+
ATGTGGCACCGTGCAGGTGTCCCTGGCCCTGGTGCTGCTGCTGGGCGCTG
GCCTGGCCAC121---------+---------+---------+---------+---------+---------+
CCAGGGCTGGTTTCTGCTGAGGCTGCACCAGAGGCTGGGCGACATCGTGG
CCCACCTGCC181---------+---------+---------+---------+---------+---------+
CGATGGCGGCAAGGGCAGCTGGCAGGACCAGAGGAGCCACCAGGCCAAC
CCTGCCGCCCA241---------+---------+---------+---------+---------+---------+
CCTGACAGGCGCCAACGCCAGCCTGATCGGCATCGGCGGACCCCTGCTGT
GGGAGACCAG301---------+---------+---------+---------+---------+---------+
GCTGGGCCTGGCTTTCCTGAGGGGCCTGACCTACCACGACGGCGCCCTGG
TGACCATGGA361---------+---------+---------+---------+---------+---------+
GCCCGGCTACTACTACGTGTACAGCAAGGTGCAGCTGTCCGGAGTGGGCT
GCCCTCAGGG421---------+---------+---------+---------+---------+---------+
CCTGGCCAACGGCCTGCCCATCACCCACGGCCTGTACAAGAGGACCAGCA
GATACCCCAA481---------+---------+---------+---------+---------+---------+
GGAGCTGGAGCTGCTGGTCTCCAGGCGGAGCCCCTGTGGCAGGGCCAACA
GCAGCCGAGT591---------+---------+---------+---------+---------+---------+
GTGGTGGGACAGCAGCTTCCTGGGCGGCGTGGTGCACCTGGAGGCCGGCG
AGGAGGTGGT601---------+---------+---------+---------+---------+---------+
GGTGAGGGTGCCCGGCAACAGGCTGGTGAGGCCCAGGGACGGCACCAGG
AGCTACTTCGG661---------+---------+---------+---------+---------+---------+
CGCCTTCATGGTGTGATGAGCGGCCGCGAGCTCCAGCTTTTGTTCCC721---
------+---------+---------+---------+-------
GCGGAAGTACCACACTACTCGCCGGCGCTCGAGGTCGAAAACAAGGG
(SEQ ID NO：32)
以ATG开始的人突变型LIGHT的密码子最佳化的核苷酸序列以粗体突出显示。
GAATTCGAGCTCGGTACCCGACACGGTACCGGATCCGCCACCATGGAGGAGAGCGTTGTGAGGCCCAGCGTGTTCGTGGTGGACGGCCAGACCGACATCCCCTTCACCCGGCTGGGCCGGAGCCACCGGAGGCAGAGCTGCTCCGTGGCCAGAGTGGGGCTGGGCCTGCTGCTCCTGCTGATGGGAGCCGGCCTGGCCGTGCAGGGCTGGTTCCTGCTGCAGCTGCACTGGCGGCTGGGCGAGATGGTGACCCGGCTGCCCGATGGCCCTGCCGGCAGCTGGCAGGAGCGGCGGAGCCACGAGGTGAACCCTGCCGCCCACCTGACCGGCGCCAACAGCAGCCTGACCGGCAGCGGCGGACCCCTGCTGTGGGAGACCCAGCTGGGCCTGGCCTTCCTGAGGGGCCTGAGCTACCACGACGGCGCCCTGGTGGTGACCAAGGCCGGCTACTACTACATCTACAGCAAGGTGCAGCTGGGCGGAGTGGGCTGCCCTCTGGGGCTGGCCAGCACCATCACCCACGGCCTGTACAAGCGGACCCCCAGATACCCCGAGGAGCTGGAGCTGCTGGTGTCCCAGCAGAGCCCCTGTGGCAGGGCCACCTCCAGCAGCCGGGTGTGGTGGGACAGCAGCTTCCTGGGCGGCGTGGTGCACCTGGAGGCCGGCGAGAAAGTGGTTGTGAGGGTGCTGGACGAGCGGCTTGTGAGGCTGAGGGACGGCACCCGGAGCTACTTCGGCGCCTTCATGGTGTGATGAGCGGCCGCGAGCTCGTCTCGGGGATCCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTG(SEQID NO:33)
附图说明
图1显示了AG 104A肿瘤特异性异二聚(heterodireic)构建体的示意性举例说明。人C.κ经由人IgG3的弹性上铰链区与衍生自癌症抗原的scFv-片段的C末端融合。
图2证实了Adv-mmlit抑制neu+N202肿瘤生长。注射(i.c.)约8x105N2021A细胞。在第18天和第20天时进行约2x1010vp adv-lacz或adv-mmlit的瘤内注射。每周两次监控肿瘤大小。
图3显示了scFv-LIGHT融合蛋白结构设计。图3分别公开了作为SEQID NO 41和42的“SL：短接头”和“LL：长接头”序列。
图4显示了将106TUBO肿瘤细胞s.c.接种至BABL/c小鼠，在抗Her2和Ad-LIGHT处理后的肿瘤生长抑制。在肿瘤接种后的第18天时，瘤内注射1010VP Ad-LIGHT或Ad-LacZ。在肿瘤接种后的第18和25天时，i.p.注射50μg抗Her 2抗体或同种型IgG。肿瘤生长在所示时间点进行监控。在第21天后，与同种型IgG组相比较，所有处理组均具有显著差异。在第25天后，与单独的Ad-LIGHT或单独的抗Her2组相比较，Ad-LIGHT和抗Her2组合处理组具有显著的协同作用差异。用双尾斯氏t检验进行统计分析。显示的数据是平均值+SEM。p<0.05视为显著差异。
图5显示了在抗Her2处理后的肿瘤生长抑制。将106TUBO肿瘤细胞s.c.接种至BALB/c小鼠。在肿瘤接种后的第10和17天时i.p.注射100μg抗Her 2抗体或同种型IgG。肿瘤生长在所示时间点进行监控。肿瘤在用抗Her 2处理的五只小鼠中的三只中再生长。
图6显示了新的人light突变体的蛋白质序列。突变的氨基酸以粗体、斜体和下划线注明。许多突变体相对于人野生型LIGHT具有在位置214处突变为E的K－类似于小鼠序列。图6以出现次序分别公开了SEQ ID NO43-44、6-8、8-10、10、4、3、5、5、11-13、12、14-17、20、19-23、45、20和25。
图7列出了新型人LIGHT突变体的氨基酸序列。特别有利的是m4-14、m4-7和m4-16。图7以出现次序分别公开了SEQ ID NO 6-8、8-10、10、4、3、5、5、11-13、12、14-17、20、19-23、45、20和25。
图8举例说明了在人中的LIGHT网络。LIGHT(TNFSF14)在淋巴样组织、未成熟DC和活化T细胞上作为三聚体表达，并且与靶细胞上的LTbR和HVEM结合。LIGHT还结合由许多癌症分泌的在人中的可溶性诱饵受体3，所述癌症包括胃肠、骨、肺和软组织肿瘤。TNF家族成员的相互影响如所示的控制免疫调节。
图9举例说明了LIGHT的3管齐下活性。LIGHT结合LTβR和HVEM两者用于免疫调节，并且与LTβR的相互作用增加趋化因子和粘附分子并吸引T细胞。LIGHT通过HVEM活化T细胞和NK细胞用于增加的免疫功能和肿瘤免疫。最后，LIGHT可以指导LTβR或HVEM表达肿瘤的细胞凋亡。
图10显示了接近哺乳动物肿瘤的LIGHT表达在体内控制转移。(C)4T1，通常弱免疫原性的乳癌细胞系，当注射到小鼠的乳房脂肪垫内时，模拟乳腺癌。它可以转移至多种器官，包括肺。体外培养的4T1乳癌(1X105细胞)用Ad-LIGHT或Ad-对照(2X108PFU/ml)注射24小时，并且随后将1X108细胞s.c.注射到BALB/c小鼠的胁腹内。监控肿瘤生长(A)直至小鼠在肿瘤接种后第35天时处死，用于由克隆生成(colonogenic)测定法分析(B)肺转移。
图11显示了Ad-LIGHT处理根除已建立的转移灶。A，在肿瘤接种后第14和17天时，s.c.注射到BALB/c小鼠的胁腹内的4T1乳癌细胞用1X109PFU Ad-LIGHT(黑色)或Ad对照(白色)进行瘤内处理。一组小鼠在肿瘤攻击后第14天时用单独的手术进行处理。其他荷有4T1肿瘤的小鼠以相同方式用Ad-LIGHT进行处理，伴随在原发性肿瘤接种(灰色)后第14天开始的，通过抗CD8Ab(YTS.169.4.2)的CD8耗尽的添加。抗CD8Ab i.p.给予小鼠，每周一次125μg/小鼠，直至小鼠处死用于分析。超过90％的CD8+T细胞通过该方案耗尽，如通过外周血的FACS染色证实的。除用单独的手术处理的小鼠之外，在其他小鼠上的原发性肿瘤(约150mm3)在第24天时进行手术切除，并且将小鼠处死用于在第35天时用克隆生成测定法分析肺转移。数据是多个独立实验的合并。
图12显示了T细胞受体的模型，其中CDR1、CDR2和CDR3区突出显示。图12公开了SEQ ID NO:35。
图13显示了CDR突变体的肽特异性，多种CDR突变体的QL9/Ld结合和肽-Ld特异性。酵母展示的2C突变体的肽选择性在QL9/Ld上加以选择。(A)CDR3a、(B)CDR3b、(C)CDRlb和(D)CDR2a中的突变体用(0.4mM)所示肽/Ld/Ig二聚体或单独的第二试剂(PE)进行测定。MCMV，YPHFMPTNL(SEQ ID NO:34)；QL9，QLSPFPFDL(SEQ ID NO:35)；QL9变体含有在位置5处的单个氨基酸置换(野生型，F)。酵母细胞通过流式细胞术就pep-Ld复合物结合进行测定(MFU，平均荧光单位)。
图14是突变型Ly49C-H-2Kb复合物的带状图，其中结晶Ly49C二聚体(箭头)交联两个MHC I类分子。
图15举例说明了肽对pepMHC结合和特异性的“多米诺”作用。存在与Ly49C恒定区串联的氢键合相互作用的网络。不同肽可以改变MHC构象并且改变Ly49C结合。
图16举例说明了2B4-CD48的结晶和小鼠NK细胞免疫突触。Ly49C-H-2Kb复合物(1P4L)的结构不包括70残基茎区，其使Ly49C同二聚体与NK细胞膜连接。
图17和18举例说明了使用酵母展示(YD)改造新的人LIGHT突变体。人LIGHT与交配粘附受体Aga2融合。荧光附加表位用于标准化，并且通过流式细胞术评价平衡、动力学和热稳定性分析。
图19显示了如何生成人LIGHT文库用于YD中。对人LIGHT实施可变错误率易错PCR，其生成4.5x107个克隆。分别使用小鼠和人LIGHT受体mLTβR、mHVEM和hLTβR、hHVEM进行选择。
图20显示了当针对小鼠和人LTβR和HVEM进行测试时，分离的突变体(构建体)的结合特性。
图21显示了人LIGHT突变体与mLTβR和mHVEM的结合亲和力增加。
图22举例说明了scFV(neu)-LIGHT融合蛋白。融合蛋白用C末端链霉抗生物素蛋白标签II生成，用于通过蛋白质印迹、流式细胞术和ELISA的增强检测，以及用于高特异性、一步纯化。
图23(A-D)显示了4种突变型人LIGHT克隆对于mLTβR、mHVEM和hLTβR、hHVEM的有利结合。
图24显示了当作为scFV-LIGHT融合蛋白产生时，scFV和LIGHT结合其各自的配体。
图25和26显示了scFV(neu)-LIGHT融合蛋白降低培养中的TUBO细胞生长。TUBO是由来自BALB-neuT小鼠的自发性乳腺肿瘤生成的克隆细胞系，并在细胞膜上高度表达HER-2蛋白质。(A)TUBO细胞进行培养并且用5ug/mL蛋白质进行处理，并且在四天后评价生长。(B)与抗体处理或未处理的细胞相比较，由抗neu单链抗体和突变型人LIGHT m4-14生成的融合蛋白7164m4-14LIGHT，显著降低TUBO细胞的生长。
图27显示了通过7164m4-14LIGHT引起的细胞死亡经由LIGHT和LTβR之间的相互作用介导。
图28显示了人LIGHT细胞外结构域的核酸序列(SEQ ID NO:46)和人LIGHT m4-14(SEQ ID NO:47)核酸序列。
图29是scFV-LIGHT(85-239)融合蛋白的图解。
图30显示了超级LIGHT，经由IRES连接neu序列与人突变型LIGHTm4-14的腺病毒构建体，改善对新ICS的CD8-CTL应答。WT B/C小鼠用5X108IFU ad-neu-人LIGHT或ad-neu突变型LIGHT进行免疫接种，并且在10天后，将脾细胞制备为单细胞，并且用neu-HIS蛋白质或肽RatP66进行刺激，或不进行刺激。进行ICS以检测IFN-γ阳性CD8细胞。
图31和32显示了超级LIGHT(m4-14突变体)改善对neu的CD8CTL应答，体内杀死。WT B/C小鼠用(B)5X108IFU ad-neu-人LIGHT或(C)ad-neu突变型LIGHT或(C)ad-neu突变型LIGHT进行免疫接种。在10天后，(A)首次用于实验的脾细胞用0.5uM和5uM CFSE进行标记，并且0.5uM细胞也装载有肽Ratp66，将相等数目的细胞混合在一起，并且尾静脉注射到首次用于实验的小鼠或免疫接种的小鼠内。在16小时后，就CFSE阳性细胞分析脾和引流淋巴结(LN)。
图33显示了超级LIGHT在NA疫苗后诱导更高的抗neu抗体。首次用于实验的小鼠(每个组中4只小鼠)通过高压注射以14天间隔用PcDNA-neu或PcDNA-neu-LIGHT(人或突变体)免疫接种两次。第二次免疫接种后七天，收集小鼠血清，并且使用细胞ELISA测试抗neu抗体。
图34显示了在10只无肿瘤小鼠(体内)中的新的超级LIGHT DNA疫苗的改善功效。首次用于实验的小鼠(每个组中4只小鼠)通过高压注射用PcDNA-neu或PcDNA-neu-LIGHT(突变体)进行免疫接种。四十四天后，免疫接种的小鼠用5*105TUBO细胞进行接种。在另外40天后将无肿瘤小鼠处死并进行分析。
图35和36显示了超级LIGHT改善对hLIGHT的neu特异性杀死化合物，首次用于实验的Balb/c小鼠用几个不同剂量的腺病毒进行皮下疫苗接种。在十一天后，如下进行ICS：首次用于实验的脾细胞用0.5uM或5uMCFSE进行标记，并且CFSE低细胞装载有her2/neu肽，随后将相等数目的CFSE低和高细胞通过尾静脉注射到免疫接种的小鼠内，20小时后，通过FACS分析接种疫苗的小鼠的脾中的CFSE阳性细胞。
图37证实LIGHT在Rag-1脾细胞中诱导IFN-γ。
图38证实LIGHT在MEF细胞中诱导IL-6。
具体实施方式
转移性疾病是癌症患者中的死亡率主因。转移灶或小原发性肿瘤的初始休眠可以造成可用于引发CD8+T细胞的抗原的不足够水平。利用LIGHT和人LIGHT的突变体的治疗方法可以有效靶向CD8+T细胞。在此类抗体-LIGHT通过静脉内(i.v.)注射全身引入后，使LIGHT或人突变型LIGHT与识别由肿瘤细胞表达的抗原的抗体组合(抗体-LIGHT)可以特异性并有效地靶向迁移肿瘤细胞。
例如，在小鼠模型中，针对肿瘤细胞的高亲和力单克隆抗体在静脉内注射后在体内在肿瘤内部以高浓度累积。异微型抗体LIGHT(通过缀合或遗传连锁)允许LIGHT在其全身引入后特异性递送到在多个远侧部位处的肿瘤组织内。
LIGHT融合蛋白(例如抗体-LIGHT偶)在肿瘤组织内部选择性累积，并且在体外与肿瘤特异性结合。
在抗体-LIGHT通过静脉内注射全身引入后，利用与LIGHT偶联的识别由肿瘤细胞表达的抗原的抗体(抗体-LIGHT)的治疗方法设计为特异性并有效地靶向迁移肿瘤细胞。在肿瘤细胞的表面上表达或能够由肿瘤特异性抗体识别的任何肿瘤抗原均适合于与LIGHT或其功能片段偶联。
蛋白酶抗性LIGHT(例如突变型LIGHT或LIGHT的细胞外结构域)的局部递送增强肿瘤抗原对抗原特异性T细胞的直接呈递，并且阻止在肿瘤微环境内的浸润T细胞的无能。另外，LIGHT可以在体内增强肿瘤细胞凋亡。
通过目前可用的癌症治疗成功根除转移灶仍是罕见的。在手术切除前，在原发性肿瘤组织中生成免疫应答产生足以根除远侧转移灶的肿瘤特异性效应T细胞。在原发性肿瘤中例如通过抗体-LIGHT递送引发肿瘤特异性CD8+T细胞促进细胞毒性T淋巴细胞(CTL)的后续离开，所述CTL归巢至远侧肿瘤。在手术切除前靶向原发性肿瘤引发免疫介导的自发性转移灶的根除。
转移通常是实体恶性肿瘤进展中的致命步骤。弥散性转移性肿瘤细胞可以在原发性肿瘤的手术切除后保持休眠和临床上无法检测数月或甚至数年，导致后续临床疾病复发。免疫治疗策略适合于根除这种微量转移疾病。例如，抗体-LIGHT递送到原发性肿瘤内减少转移灶的形成，并且排斥周围组织中已建立的转移灶。例如，以抗体-LIGHT融合蛋白形式的LIGHT对肿瘤(例如原发性肿瘤)的直接递送生成来自肿瘤组织的足够数目的效应/记忆T细胞，其移动至远侧部位，导致免疫应答强度中的总体增加、更大的免疫细胞因子产生和自发性转移灶的根除。在内源肿瘤抗原的存在下旨在引起并持续肿瘤特异性免疫应答的使用原发性肿瘤组织的免疫疗法生成必需CTL，以清除已经弥散的肿瘤细胞。
在肿瘤表面上的LIGHT的存在下，CTL被有效引发并且随后循环，以浸润LIGHT阴性远侧肿瘤。如果没有LIGHT存在于原发性肿瘤中的利益，则在次级肿瘤部位处预期少数活化T细胞。可能在LIGHT的存在下在局部肿瘤部位中生成的这些效应/记忆T细胞能够离开肿瘤，并且巡察周围并鉴定转移性肿瘤细胞。细胞因子受体(CCR7)近来已显示是T细胞离开周围组织包括炎症部位并运输至引流LN的关键分子。离开LIGHT表达肿瘤的2CT细胞可能受CCR7控制。
例如，LIGHT分子的细胞外结构域可以重组表达，从而使得任一重组形式均不具有全部在一起的蛋白酶解位点，或具有致使重组形式蛋白酶消化抗性的一种或多种氨基酸变化(突变型LIGHT)。另外，LIGHT的细胞外结构域或细胞外结构域的功能等价衍生物可以与系链或接头或间隔物序列连接，以将细胞外结构域锚定在肿瘤细胞的膜中。图2-3举例说明了抗体-LIGHT融合或缀合的一些方面。
LIGHT的细胞外结构域指LIGHT多肽的一种形式，其基本上不含跨膜和细胞质结构域。LIGHT的细胞外结构域具有小于1％的此类跨膜和/或细胞质结构域，并且优选地，将具有小于0.5％的此类结构域。应当理解依照本领域用于鉴定该类疏水结构域常规使用的标准，鉴定对于LIGHT多肽鉴定的任何跨膜结构域。跨膜结构域的确切边界可以改变，但最可能不超过在如本文最初鉴定的结构域的任一末端处的约2-5个氨基酸。LIGHT多肽的细胞外结构域可以含有在如本文鉴定的跨膜结构域/细胞外结构域边界的任一侧上的约5个或更少的氨基酸。
可溶性LIGHT蛋白质、其蛋白质和肽片段，包括例如LIGHT的氨基酸位置1-240，不含代表蛋白酶解位点EQLI(81-84)(SEQ ID NO:1)的一个或多个氨基酸；LIGHT的氨基酸位置1-240，其中代表蛋白酶解位点EQLI(81-84)(SEQ ID NO:1)的氨基酸中的一个或多个是突变的或另外失活的；LIGHT的82-240；LIGHT的83-240；LIGHT的84-240；LIGHT的85-240；LIGHT的90-240；LIGHT的95-240；LIGHT的100-240；LIGHT的85-235；LIGHT的85-230；LIGHT的85-225；LIGHT的85-220；LIGHT的85-215；LIGHT的85-200；不含细胞内和膜结构域的LIGHT片段；以及对蛋白酶消化抗性的LIGHT长度中的约100-150个氨基酸的任何片段。
“抗体-LIGHT”指特异性针对肿瘤抗原的抗体或其片段，其与LIGHT蛋白质的片段或融合或缀合，与天然LIGHT蛋白质相比较，所述LIGHT蛋白质的片段足以触发针对肿瘤细胞的免疫应答，并且通过对蛋白酶消化抗性能够稳定存在于肿瘤细胞表面上。
如本文使用的，在抗体-LIGHT偶中的术语“LIGHT”指不含蛋白酶识别序列的LIGHT的细胞外结构域，或突变型LIGHT，其中蛋白酶位点(EQLI)(SEQ ID NO:1)通过整个缺失或在一个或多个氨基酸处的突变失活，所述突变致使蛋白酶位点不敏感或无活性，或对蛋白酶消化抗性并能够刺激T细胞的截短形式的LIGHT。LIGHT还可以指图6和7中的新型序列。
“突变型LIGHT”指LIGHT蛋白质或LIGHT衍生的肽，其对蛋白酶解切割是抗性的，能够在肿瘤细胞的表面中稳定表达，并且与正常或天然LIGHT蛋白质相比较，显示出增加的肿瘤特异性T细胞活化。“突变型LIGHT”指LIGHT蛋白质或者LIGHT蛋白质衍生的肽或片段，其对蛋白酶解消化是抗性的，或另外能够在细胞包括肿瘤细胞的表面上稳定表达，由于致使蛋白酶解位点EQLI(SEQ ID NO:1)失活的突变。存在生成突变型LIGHT的几种方法。例如，通过改变(插入、缺失、置换)在蛋白酶位点处的一个或多个氨基酸，蛋白酶位点(例如EQLI)(SEQ ID NO:1)可以进行突变，以整个去除蛋白酶位点或致使该位点对蛋白酶消化抗性。
“截短的LIGHT”蛋白质指这样的LIGHT片段，当与天然LIGHT相比较时，其并非全长的，对蛋白酶解消化是抗性的，并且能够刺激针对肿瘤细胞的T细胞。例如，LIGHT的细胞外结构域(约85-240)是合适的截短的LIGHT。截短的LIGHT包括LIGHT蛋白质的片段/衍生物，其对蛋白酶解消化是抗性的，由此与天然LIGHT蛋白质相比较，显示出存在于细胞表面上延长时间段的能力。
为了生成蛋白酶抗性LIGHT蛋白质(例如突变型LIGHT)或片段或者其中蛋白酶位点失活的LIGHT蛋白质或LIGHT肽，例如，氨基酸谷氨酸(E)可以在蛋白酶识别序列EQLI(SEQ ID NO:1)内被缺失或置换。类似地，氨基酸谷氨酰胺(Q)在蛋白酶识别序列EQLI(SEQ ID NO:1)内被缺失或由另一种氨基酸置换。类似地，氨基酸L或I可以被缺失或由其他氨基酸置换。蛋白酶抗性氨基酸类似物也可以用于生成蛋白酶抗性的合成LIGHT片段。例如，使用β-氨基酸掺入肽内降低蛋白酶解，并且可以用于置换蛋白酶敏感位点EQLI(SEQ ID NO:1)。可以进行β-氨基酸在蛋白酶位点内或附近的合理掺入，并且所得的突变体就蛋白酶抗性进行测试。多种技术包括定点诱变可以用于生成对蛋白酶消化是抗性的LIGHT片段。
术语“失活的”意指LIGHT蛋白质或其片段在肿瘤环境中对蛋白酶消化是抗性的，因为蛋白酶识别位点已通过下述选择性沉默：在一个或多个氨基酸中的突变，或EQLI(SEQ ID NO:1)的缺失，或用α-或β-氨基酸置换一个或多个氨基酸或任何合适的方式。
术语“抗性”意指LIGHT蛋白质或其片段在肿瘤环境中对蛋白酶消化是不敏感的，因为蛋白酶识别位点已通过下述失活/突变：在一个或多个氨基酸中的突变，或EQLI(SEQ ID NO:1)的缺失，或用α-或β-氨基酸置换一个或多个氨基酸或任何合适的方式。
术语“肿瘤环境”指细胞蛋白酶的存在和表达和活性，所述细胞蛋白酶包括可以通过蛋白酶解级联协同影响基质降解和肿瘤细胞侵入的细胞外蛋白酶，其中个别蛋白酶在肿瘤生长、侵入、迁移、血管生成、肿瘤转移和扩增具有不同作用。
“Ad-LIGHT”或“Ad-突变型LIGHT”指腺病毒载体系统，其含有突变型LIGHT编码核酸，并且适合于将核酸序列递送至肿瘤部位或能够感染肿瘤细胞。“转移或转移灶”指癌症通过其从癌症在其处作为肿瘤起始的部位通过一种或多种癌性细胞的迁移而扩散到体内的一个或多个远侧位置的过程。这些术语还包括微量转移，其中在远侧位置处的肿瘤形成对应于显微镜可见的癌细胞的小聚集体。这些术语还指起因于原发性肿瘤从原始位置扩散的继发性癌性生长。
“减少或控制转移”指与对照相比较，转移性肿瘤部位数目的减少。
“过继转移”指T细胞转移到接受者内。
“肿瘤部位”意指含有或怀疑含有肿瘤细胞的体内或体外位置。肿瘤部位包括实体瘤以及邻近或直接接近肿瘤生长的位置。
“肿瘤特异性”指显示对肿瘤细胞的偏爱超过正常细胞的抗体或任何其他配体/受体。例如，靶向肿瘤细胞上存在的抗原的抗体视为肿瘤特异性的。如果存在靶抗原，则肿瘤特异性抗体也可以与正常细胞结合，尽管程度更低。
如本文使用的，术语“施用”指全身和/或局部施用。术语“全身施用”指非局限性施用，从而使得施用的物质可以影响遍及机体的几个器官或组织，或从而使得施用的物质可以在到达靶部位中穿越遍及机体的几个器官或组织。例如，施用于受试者的循环内可以导致在超过一个组织或器官中来自施用载体的治疗产物的表达，或可以导致在特定部位处来自施用载体的治疗产物的表达，例如由于天然向性或组织特异性启动子元件的可操作地连接。本领域技术人员应当理解多种形式的施用由全身施用包含，包括由肠胃外施用包含的那些施用形式，例如静脉内、肌内、腹膜内和皮下施用。在一些实施方案中，全身施用可以用于引发与局部或全身疾病或状况治疗相关的全身效应。全身效应对于局部疾病或状况可能是希望的，例如以预防所述疾病或状况的扩散。术语“局部施用”指在特异性部位处或附近的施用。本领域技术人员应当理解多种形式的施用由局部施用包含，例如直接注射到特异性部位内或附近。在一些实施方案中，局部施用与其中需要局部效应的疾病或状况治疗相关(例如施用于肺用于治疗肺癌)。局部效应与局部或全身疾病或状况相关可能是需要的。局部效应与全身疾病或状况相关可能是需要的，以治疗全身疾病或状况相关的局部方面。
LIGHT、LIGHT多肽或肽、或其片段、LIGHT融合产物或LIGHT缀合物等等的“有效量”指足以进行具体描述的目的的量。“有效量”可以凭经验和以与所述目的相关的常规方式进行测定。例如，用于抗体-LIGHT构建体的合适目的是减少肿瘤大小或生长和/或减少转移。
术语“治疗有效量”指有效治疗受试者或哺乳动物中的特异性疾病或病症的LIGHT、LIGHT多肽或肽或其片段、LIGHT融合产物或缀合物的量。在癌症的情况下，本文公开的组合物的治疗有效量可以减少癌细胞的数目；减少肿瘤大小；抑制(即减慢和/或停止)癌细胞浸润到周围器官内；抑制(即减慢和/或停止)肿瘤转移；抑制肿瘤生长；和/或减轻与癌症相关的一种或多种症状。
术语“抗体”覆盖例如单克隆抗体、多克隆抗体、单链抗体、抗体片段(参见下文)，只要它们显示出所需生物或免疫活性。术语“免疫球蛋白”(Ig)在本文中与抗体可互换使用。抗体可以特异性靶向肿瘤抗原，例如表面肿瘤抗原，例如Her2/neu和CD20。
“分离的抗体”是已得到鉴定并且与其天然环境的组分分离和/或回收的抗体。抗体纯化至如通过Lowry方法测定的按抗体的重量计超过95％，和按重量计超过99％。
如本文使用的术语“单克隆抗体”指得自基本上同质性抗体的群体的抗体，即群体的个别抗体是相同的，除可能以少量存在的可能天然存在的突变之外。单克隆抗体是高度特异性的，针对单个抗原位点或表位。例如，单克隆抗体可以通过首先由Kohler等人，Nature，256:495(1975)描述的杂交瘤方法进行制备，或可以使用重组DNA方法在细菌、真核动物或植物细胞中进行制备(参见例如，美国专利号4,816,567)。还可以使用例如Clackson等人，Nature，352:624-628(1991)和Marks等人，J.Mol.Biol，222:581-597(1991)中所述的技术，从噬菌体抗体文库中分离“单克隆抗体”。
单克隆抗体在本文中包括“嵌合”抗体，其中重和/或轻链的部分与衍生自特定物种或者属于特定抗体种类或亚类的抗体中的相应序列相同或同源，而一条或多条链的剩余部分与衍生自另一个物种或者属于另一个抗体种类或亚类的抗体中的相应序列相同或同源，以及此类抗体的片段，只要它们显示出所需生物活性(参见美国专利号4,816,567；和Morrison等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，81:6851-6855(1984))。本文有利的嵌合抗体包括“灵长类化”抗体，其包含衍生自非人灵长类的可变结构域抗原结合序列和人恒定区序列。
“抗体片段”包括完整抗体的部分，例如完整抗体的抗原结合或可变区。抗体片段的例子包括Fab、Fab1、F(ab1)2、单链Fv和Fv片段；双抗体；线性抗体(参见美国专利号5,641,870；Zapata等人，Protein Eng.8(10):1057-1062[1995])；单链抗体分子；以及由抗体片段形成的多特异性抗体。
“人源化”形式的非人(例如啮齿类)抗体是含有衍生自非人抗体的最低限度序列的嵌合抗体。对于大部分，人源化抗体是人免疫球蛋白(受体抗体)，其中来自受体的高变区的残基替换为具有所需抗体特异性、亲和力和能力的来自非人物种(供体抗体)(例如小鼠、大鼠、兔或非人灵长类)的高变区的残基。在一些情况下，人免疫球蛋白的构架区(FR)残基替换为相应地非人残基。此外，人源化抗体可以包括在受体抗体或供体抗体中未发现的残基。制备这些修饰，以进一步精炼抗体性能。一般而言，人源化抗体包括至少一个且通常两个可变结构域的基本上全部，其中高变环的全部或基本上全部对应于非人免疫球蛋白的那些，并且FR的全部或基本上全部是人免疫球蛋白序列的那些。人源化抗体任选还包括免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少部分，通常为人免疫球蛋白的那种。
术语“癌症”和“癌性的”指或描述哺乳动物中的生理状况，其通常特征在于不受调节的细胞生长。癌症的例子包括癌、淋巴瘤、母细胞瘤、肉瘤和白血病或淋巴样恶性肿瘤。此类癌症的更具体例子包括鳞状细胞癌(例如上皮鳞状细胞癌)，肺癌包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺的腺癌和肺的鳞状癌，腹膜癌，肝细胞癌，胃的或胃癌包括胃肠癌，胰腺癌，成胶质细胞瘤，宫颈癌，卵巢癌，肝癌，膀胱癌，尿道癌，肝瘤，乳腺癌，结肠癌，直肠癌，结肠直肠癌，子宫内膜或子宫癌，唾液腺癌，肾的或肾癌，前列腺癌，外阴癌，甲状腺癌，肝癌，肝门癌，阴茎癌，黑素瘤，多发性骨髓瘤和B细胞淋巴瘤，脑以及头与颈癌，和相关转移。
可以使用抗体-LIGHT融合物或缀合物靶向的合适的表面肿瘤抗原包括表皮生长因子受体家族(EGFR)包括HER1、HER2、HER4和HER8(Nam，N.H.，&Parang，K.(2003)，Current targets for anti-cancer drug discovery.Current Drug Targets，4(2)，159-179)，STEAP(前列腺的六次跨膜上皮抗原；Hubert等人，STEAP:a prostate-specific cell-surface antigen highly expressedin human prostate tumors.，Proc Natl Acad Sci USA.1999；96(25):14523-8.)，CD55(Hsu等人，Generation and characterization of monoclonal antibodiesdirected against the surface antigens of cervical cancer cells.，HybridHybridomics.2004；23(2):121-5.)。其他合适的抗体包括利妥昔单抗(RituxanTM，嵌合抗CD20抗体)、Campath-IH(抗CD52抗体)以及任何癌症特异性细胞表面抗原。下述是批准的针对特异性癌症类型的单克隆抗体药物的示例性列表，所述癌症类型适合与LIGHT蛋白质一起使用：用于慢性淋巴细胞白血病的阿仑珠单抗(CampathTM)；用于结肠癌和肺癌的贝伐珠单抗(AvastinTM)；用于结肠癌和头与颈癌的西妥昔单抗(ErbituxTM)；用于急性髓性白血病的吉妥珠单抗(MylotargTM)；用于非何杰金淋巴瘤的替伊莫单抗(ZevalinTM)；用于结肠癌的帕木单抗(VectibixTM)；用于非何杰金淋巴瘤的利妥昔单抗(RituxanTM)；用于非何杰金淋巴瘤的托西莫单抗(BexxarTM)；以及用于乳腺癌的曲妥珠单抗(HerceptinTM)。
实施例
下述实施例仅用于举例说明性目的，并且不预期限制公开内容的范围。
实施例1-Light与肿瘤靶向试剂的偶联或缀合
为了允许突变型LIGHT递送系统或等价递送系统的递送，突变型LIGHT可以与肿瘤靶向试剂例如肿瘤特异性抗体偶联或缀合。例如，与LIGHT或突变型LIGHT缀合的肿瘤特异性抗体可以用于将融合蛋白选择性递送至肿瘤部位。另外，肿瘤特异性抗体可以设计为与病毒递送系统或脂质体媒介物递送系统偶联。表达突变型LIGHT且容纳肿瘤靶向试剂的递送媒介物将首先靶向特异性肿瘤细胞，并且随后转化肿瘤细胞，以在细胞的表面上表达突变型LIGHT。在肿瘤细胞的表面上的该靶向的突变型LIGHT表达将诱导在肿瘤周围的基质细胞上的趋化因子，以吸引并起始T细胞的引发。此类治疗适合于所有肿瘤，包括实体瘤。4T1、MC38、B16和肥大细胞瘤用Ad-LIGHT进行处理，并且显示原发性和/或继发性肿瘤的减少。因此，抗体-LIGHT可以用于靶向多种肿瘤，尤其是由于迁移至远侧部位的原发性肿瘤的细胞而形成的转移灶。例如，通过全身注射，具有LIGHT的抗her2/neu可以将LIGHT携带至表达her2/neu的转移性肿瘤，并且随后可以生成局部免疫应答以清除肿瘤。因此，融合蛋白可以通过任何全身和局部途径递送，并且由于抗体或另一种试剂对肿瘤抗原的特异性，融合蛋白将更局限于肿瘤。
实施例2-LIGHT缀合的抗体的功能活性
通过分别使用LTβR-Ig和HVEM-Ig的流式细胞术，测定抗体-LIGHT与LIGHT的受体LTβR和HVEM结合的能力。抗体-LIGHT的功能活性首先在体外就其在亚最佳剂量的平板结合的抗CD3的存在下共刺激T细胞的能力进行测试。抗体-LIGHT的功能性看起来与抗CD28的那种相当。
为了测试抗体-LIGHT融合蛋白是否在体内抑制肿瘤生长，小鼠用5x104肿瘤细胞s.c.注射十天，并且随后用10μg融合蛋白进行处理。肿瘤生长的抑制用小剂量的融合蛋白即10μg加以证实，所述小剂量允许针对肿瘤的强免疫。
该实施例通过分别使用LTβR-Ig和HVEM-Ig的流式细胞术，证实抗体-LIGHT与LIGHT的受体LTβR和HVEM结合的能力，并且与LIGHT偶联的肿瘤特异性抗体刺激免疫以减少肿瘤生长。
实施例3-抗体-LIGHT对的组合处理和表达LIGHT的腺病毒的局部递送。
抗体-LIGHT融合蛋白或缀合物的重要效用是此类靶向试剂可以非常有力地清除不有效刺激免疫系统的小数目的转移性肿瘤细胞或残留癌细胞。测试了包括抗体-LIGHT和表达LIGHT或Ad-LIGHT的腺病毒的组合疗法。
肿瘤细胞在两个部位进行接种，一个部位使用106，并且另一侧使用1x104。两周后，大肿瘤(106)用Ad-LIGHT进行处理，并且在处理后两周手术去除。小鼠用以本文描述剂量的抗体-LIGHT进行全身处理。该模型测定与Ad-LIGHT对原发性肿瘤的局部递送组合的抗体-LIGHT是否是用于处理远侧肿瘤的有力试剂。通过克隆型抗体(1B2)容易鉴定的2C T细胞可以过继转移至荷瘤小鼠，作为用于肿瘤抗原特异性CD8+T细胞的模型。监控过继转移的2C T细胞的运输、增殖和活化，并且与不同治疗策略相比较。
两种临床相关的递送系统，Ad-LIGHT和抗体-LIGHT，预期使LIGHT有效靶向肿瘤组织，并且随后不仅破坏原发性肿瘤还破坏远侧转移灶。长度足以制备LIGHT介导的淋巴样结构的LIGHT的持续表达诱导所需抗肿瘤CD8+T细胞应答。
实施例4-用于乳腺癌的抗Her2/neu抗体-LIGHT疗法
五分之一的乳腺癌和结肠癌患者表达Her2/neu。一般地，针对Her2的抗体减慢这些肿瘤的生长，但不根除它们。与LIGHT偶联的抗Her2/neu抗体将LIGHT靶向转移性肿瘤部位。抗Her2/neu抗体减慢肿瘤生长并诱导细胞凋亡，这允许偶联的LIGHT诱导LIGHT介导的T细胞召募和活化在肿瘤内部发生。另外，LIGHT还召募FcR+细胞，以增强抗neu抗体的疗效。在实验模型中，低至10μg的与LIGHT连接的肿瘤抗体剂量减慢小鼠中的肿瘤生长。考虑了其他更低或更高的剂量。抗Her2/neu抗体-LIGHT是用于乳腺癌转移灶的新型治疗。图2显示了Adv-mmlit抑制neu+N202肿瘤生长。
实施例5-与抗体-LIGHT融合物或缀合物组合的化学治疗药物的使用
肿瘤特异性抗体-LIGHT融合蛋白或缀合物进一步与抗肿瘤试剂偶联，所述抗肿瘤试剂例如多柔比星、紫杉醇、多西他赛、顺铂、氨甲蝶呤、环磷酰胺、5-氟尿苷、亚叶酸钙、伊立替康(CAMPTOSARTM或CPT-11或Camptothecin-11或Campto)、卡铂、氟尿嘧啶卡铂、依达曲沙、吉西他滨或长春瑞滨或其组合。这些药物可以分开施用或通过与抗体-LIGHT融合蛋白或缀合物缀合或偶联共施用。
该组合疗法还可以与基因疗法共施用，由此能够表达蛋白酶抗性LIGHT的核酸递送到肿瘤内部。容纳LIGHT核酸序列的腺病毒载体或Ad-LIGHT是合适的。
实施例6-通过抗Her2抗体和Ad-LIGHT处理的肿瘤协同抑制
抗neu抗体与LIGHT的协同作用。TUBO。TUBO是由来自BALB-neuT小鼠的自发性乳腺肿瘤生成的克隆细胞系，并在细胞膜上高度表达HER-2蛋白质。该肿瘤系在体内和体外对抗neu抗体处理敏感。然而，当肿瘤充分建立时，单独的抗体或LIGHT的效应减小。在抗neu抗体中断后，TUBO细胞可以在3-4周内恢复。为了测定在两者之间是否存在协同作用，使TUBO细胞建立18天，并且随后用ad-LIGHT和抗neu抗体两者每周处理一次，共三周。印象深刻的是，在该组合中无法检测到肿瘤，而用任一的单一处理则肿瘤进行性生长(图4-5)。每个组中的所有五只小鼠均具有肿瘤，除施用组合处理的那些之外。
因此，组合例如通过Ad-LIGHT表达载体或通过另一种对肿瘤细胞的稳定LIGHT呈递的LIGHT介导的治疗与任何其他抗癌治疗提供协同肿瘤抑制治疗剂。
实施例7-抗体-LIGHT融合蛋白的生成
为了表达sc-Fv-LIGHT，构建scFV-58LIGHT(具有氨基酸位置58-240的LIGHT片段)和scFV-85LIGHT(具有氨基酸位置85-240的LIGHT片段，绕过蛋白酶位点81-84)。在蛋白质印迹后使Flag标签附着至LIGHT片段，因为抗Flag抗体是非常特异和灵敏的。将此类质粒转染到293细胞系内。一周后收获细胞，并且制备裂解产物并且用抗flag抗体印迹。抗Flag蛋白质印迹的显现显示scFv-85LIGHT表达高于scFv-58LIGHT。
这证实抗体-LIGHT融合构建体生成融合蛋白，并且所得的融合蛋白可以进行分离、纯化并用于证实抗体-LIGHT融合蛋白特异性靶向肿瘤细胞，并刺激针对肿瘤细胞的T细胞产生。LIGHT的相似融合蛋白可以由任何其他抗体制备，所述任何其他抗体针对肿瘤细胞表面抗原，并且优选靶向肿瘤特异性细胞表面抗原。
实施例8-抗体-LIGHT融合构建体
为了生成肿瘤靶向抗体-LIGHT免疫细胞因子，采取下述步骤：
a.改造LIGHT用于增加的稳定性/亲和力；
b.生成scFV(neu)-LIGHT融合蛋白用于生产；和
c.在体外和体内测试scFV(neu)-LIGHT融合蛋白。
为了改造LIGHT：
人LIGHT用作改造的平台。
人LIGHT看起来比小鼠LIGHT更稳定(YD和先前表达)；和
人LIGHT与鼠受体交叉反应(弱)。
用于LIGHT改造的标准
a.与鼠和人LTbR和HVEM的相等结合，并且如果可能，减少的与DcR3的结合；和
b.改善的表达/稳定性以易于生产。
使用酵母展示改造的蛋白质包括下述：2C T细胞受体、Ly49C-c-型凝集素NKR、2B4(CD244)-Ig-样NKR、CD48-Ig样NKR以及鼠和人KLRG1-c-型凝集素NKR。在其他CDR中的更高亲和力克隆显示极佳的肽特异性。(图12-13.)
LY49C的改造允许LY49C-OVA/Kb复合物的高分辨率晶体结构。(图14.)。存在肽对pepMHC结合和特异性的影响的“多米诺”作用。氢键合网络与下至Ly49C恒定区的肽相互作用。(图15.)
经改造的CD48促进2B4-CD48复合物的结晶。(图16.)
hLIGHT使用酵母展示进行改造。使用附加表位使hLIGHT与交配粘附受体Aga2融合用于标准化。平衡、动力学和热稳定性分析通过流式细胞术。(图17-19)
当针对小鼠和人LTβR和HVEM测试时，人LIGHT的突变体具有改善的结合特性和亲和力。(图20-21.)
生成scFV(neu)-LIGHT融合蛋白。谷氨酰胺-合成酶载体允许对于MSX的基因扩增，并且腺Ela共转染用于转录增强。C末端Strep-Tag II序列提供通过蛋白质印迹、ELISA、流式细胞术和高特异性1步纯化的检测。(图22)
分离了对于所有4种所需受体具有有利结合的一组新克隆。scFV-LIGHT融合物在CHO细胞中产生。scGV和LIGHT两者均结合其各自配体。(图23-24)
scFV(neu)-融合蛋白降低在培养中的Tubo细胞生长。融合蛋白介导的细胞死亡是由于LIGHT对在肿瘤细胞上表达的LTβR的直接作用。(图25-27)
材料与方法
抗体-LIGHT的融合蛋白的生成。使用标准方案开发了命名为异微型抗体的重组抗体构建体，其允许LIGHT对抗体的特异性靶向，所述抗体以高亲和力与肿瘤抗原或肿瘤细胞结合。
小鼠、细胞系和试剂。雌性C3HXC57BL/6Fl(C3B6F1)小鼠，4-8周龄，购自美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)，Frederick CancerResearch Facility,(Frederick，Md.)。C57BL/6-RAG-1缺陷(RAG-1-/-)小鼠购自Jackson Laboratory(Bar Harbor，Me.)。在RAG-2-缺陷/B6背景上的H-Y TCR转基因小鼠(H—Y小鼠)购自Taconic Farms(Germantown，N.Y.)。在RAG-1缺陷背景上培育到B6内共10代的2C TCR转基因小鼠(2C小鼠)由J.Chen(Massachusetts Institute of Technology，Boston，Mass.)提供。OT-1TCR转基因小鼠(OT-1小鼠)由A.Ma(The University of Chicago)提供。将RAG-1-/-、H-Y、2C、OT-1小鼠培育，并且维持在University of Chicago的无特定病原体的设施处。动物护理和使用依照机构指南。
表达鼠U-2Ld的AG104A(AG 104-Ld)，AG104A细胞的转染子，先前已得到描述(Wick M，1997，JEM 186:229-38)。这些肿瘤细胞系维持在DMEM(Mediatech)中，所述DMEM补充有10％FCS(Sigma-Aldrich)、100U/ml青霉素和100μg/ml链霉素(BioWhittaker)。产生抗Ld(克隆30-5-7)的杂交瘤细胞系和抗2C TCR(1B2)抗体分别得自D.Sachs(National Institutes ofHealth，Bethesda，Md.)和T.Gajweski(The University of Chicago)。
通过本领域技术人员已知的操作，用蛋白G柱从培养上清液中纯化由杂交瘤产生的单克隆抗体。前述1B2抗体通过Monoclonal Antibody Facilityof The University of Chicago与FITC或生物素缀合。PE偶联的抗CD8抗体、Cy-铬(CyC)-偶联的链霉抗生物素蛋白、CyC偶联的抗CD44抗体、PE偶联的抗CD62L抗体和PE偶联的Thl.2抗体购自BD Biosciences。FITC缀合的山羊抗小鼠IgG购自Caltag。PE偶联的链霉抗生物素蛋白购自Immunotech。PE偶联的驴抗人IgG购自Jackson Immunological Research Lab(West grove，PA)。生物素化的山羊抗SLC抗体购自R&D systems Inc.(Minneapolis，Minn.)。AP缀合的兔抗山羊Ig抗体购自Vector Laboratories Inc.(Burlingame，Calif.)。纯化的山羊抗SLC抗体购自PeproTech(Rock hill，NJ)。胶原酶(4型)购自Sigma-Aldrich。CFSE购自Molecular Probes。
在体内的肿瘤生长。将肿瘤细胞皮下注射到腰部，即小鼠尾基部上0.5-1cm。肿瘤生长每3-4天用测径器进行测量。以立方厘米表示的大小通过πabc/6式进行计算，其中a、b和c是三个正交直径。
组织学。用于组织学检查的肿瘤组织在所示时间收集，并且在10％中和缓冲的福尔马林中固定，处理至石蜡包埋，并且用苏木精和伊红染色。对于SLC的免疫组织化学染色，将肿瘤组织收获，在OCT化合物(Miles-Yeda，Rehovot，Israel)中包埋，并且在-70℃下冷冻。冷冻切片(厚5-10μm)在PBS中的冷2％福尔马林中固定，并且用0.1％皂苷/PBS渗透化处理。切片用在0.1％皂苷/PBS中的5％山羊血清在室温下在增湿室中预封闭半小时。SLC的染色通过首先与以1/25稀释度的生物素化的山羊抗SLC抗体(R&Dsystems Inc.Minneapolis，Minn.)一起在封闭缓冲液中温育来完成。2小时后加入碱性磷酸酶缀合的兔抗山羊Ig抗体(Vector Laboratories Inc.Burlingame，Calif.)。对于免疫荧光染色，切片用在PBS中的2％正常小鼠血清、兔血清和山羊血清在室温下在增湿室中封闭半小时。将封闭溶液替换为50μl初级Ab。PE缀合的抗Thl.2(BD PharMingen)、或PE缀合的抗CD8(BD PharMingen)在封闭溶液中1/100稀释，并且切片在室温下在增湿室中封闭1小时。样品在含有10％1,4-二氮杂二环[2.2.2]辛烷的Mowiol4-88(BD Biosciences，La Jolla，Calif.)中固定。样品在48小时内进行分析，使用Zeiss Axioplan显微镜(Zeiss，Oberkochen，德国)和Photometries PXLCCD照相机(Photometries，Tucson，Ariz.)。使用Openlab v2.0.6(Impro vision，Lexington，Mass.)进行非邻域反卷积。
针对CCL21的ELISA。制备肿瘤匀浆物并且测定CCL21。收集可比较量的来自荷瘤小鼠的肿瘤组织并称重，在含有蛋白酶抑制剂的PBS中匀浆化，并且通过离心收集上清液。聚苯乙烯96孔微量滴定板(Immulon 4，Dynatech Laboratories，Chantilly，Va.)用山羊抗小鼠CCL21以在PBS中的2μg/ml包被，并且随后用在PBS中的0.1％牛血清白蛋白(BSA)在室温下封闭30分钟。在洗涤后，加入已知浓度的标准的系列稀释(重组CCL21，50ng/ml，R&D)和样品，并且在室温下温育2小时。在3次洗涤后，将生物素化的兔抗SLC Ab加入孔中。在2小时温育和洗涤后，加入50μl 1/1000稀释的碱性磷酸酶缀合的抗生物素蛋白(Dako)1小时，并且随后显色。显色在自动化平板阅读器(Spectra-Max 340，Molecular Devices，Sunnyvale，Calif.)上在405nm处进行测量，并且通过ELISA由标准曲线测定CCL21的量，并且根据组织重量进行标准化。数据为平均值+-.s.d。
T细胞共刺激测定。T细胞通过阴性选择方法在磁场中进行纯化，如通过制造商(Miltenyi Biotec，Auburn，Calif.)指示的。分离的T细胞的长度大于95％，如通过流式细胞术使用针对CD3的单克隆抗体评价的。包被有0.2g/ml针对CD3的单克隆抗体的平板进一步在37℃下用突变型LIGHT-flag包被4小时。在洗涤后，纯化的T细胞(1x106细胞/ml)在孔中进行培养。针对CD28的单克隆抗体(1μg/ml)以可溶形式使用。在所有测定法中，T细胞的增殖通过在3天培养的最后15小时过程中的1Ci/孔3H-胸苷添加进行评价。3H-胸苷掺入在TopCount微板闪烁计数器(Packard instrument，Meriden，Conn.)中进行测量。
来自肿瘤组织的细胞分离。小鼠首先放血以降低肿瘤组织的血液污染。收集肿瘤组织，在PBS中洗涤，切成小片，并且重悬浮于补充有2％FCS和1.25mg/ml胶原酶D(胶原酶D溶液)的DMEM中在37℃振荡温箱中40分钟。在40分钟后收集单细胞悬浮液，并且使细胞块在胶原酶D溶液中消化另外40分钟，直至所有肿瘤组织均已分解成单细胞悬浮液。
药物组合物。本文使用的治疗组合物可以配制成含有适合于所需递送方法的载体的药物组合物。合适的载体包括当与治疗组合物组合时，保留治疗组合物的抗肿瘤功能的材料。例子包括许多标准药学载体例如无菌磷酸盐缓冲盐水溶液、抑菌水等等。治疗制剂可以进行溶解，并且经由适合于将治疗组合物递送至肿瘤部位的任何途径施用。潜在有效的施用途径包括静脉内、肠胃外、腹膜内、肌内、瘤内、真皮内、器官内、常位等等。用于静脉内注射的制剂包括在防腐的抑菌水、无菌未防腐的水的溶液中，和/或在含有无菌注射用氯化钠的聚氯乙烯或聚乙烯袋中稀释的治疗组合物。治疗蛋白质制剂可以优选在真空下冻干并作为无菌粉末贮存，并且随后在注射前在抑菌水(含有例如苯甲醇防腐剂)或无菌水中重构。使用本文公开的方法用于治疗癌症的剂量和施用方案可以根据方法和靶癌症而改变，并且一般取决于本领域理解和了解的许多因素。
脾脏和肿瘤中的细胞因子测量。肿瘤和脾脏匀浆物如所述的(Yu等人，2003JEM197:985-995)进行制备。简言之，收集可比较量的肿瘤或脾脏组织，称重并在含有蛋白酶抑制剂的PBS中匀浆化，并且通过离心收集上清液。根据制造商的说明书，在配备CellQuestPro和CBA软件(Becton Dickinson)的FACS Caliber细胞计数器上，使用细胞计数珠阵列试剂盒(CBA)(BDBiosciences)，定量上清液中的细胞因子量。
肿瘤生长中的差异的统计分析。因为在相同小鼠上随着时间过去重复观察肿瘤生长，所以用于纵向数据的随机效应模型用于分析此类数据。对于每个实验，肿瘤生长假定依赖于处理并且随着时间过去遵循线性生长率。模型给出关于每个组的线性生长的截距和斜率的总体估计量。截距和斜率两者均允许在个别小鼠中改变。斜率(即比较的生长率)在不同处理组中是不同的。因为实际肿瘤生长经过整个随访期可能不遵循线性生长趋势。肿瘤生长的增加在早期缓慢，并且在一些实验中的以后阶段变得快速。将二次项加入在上述随机效应模型中的随访时间。
突变型LIGHT表达载体的生成和克隆pcDNA3.1-LIGHT用作模板，以通过PCR生成两个dsDNA片段A和B。对于片段A(约500b.p.)的生成，使用同义引物5'-CATGGATCCAAGACCATGGAGAGTGTGGTACA-3'(SEQID NO:36)(粗体文本指示BamHI位点)和反义引物5'-AGATCGTTGATCTTGCCAGGAGCCTTTGCC-3'(SEQ ID NO:37)。为了生成片段B(约200b.p.)，使用同义引物5'-GGCAAAGGCTCCTGGCAAGATCAACGATCT-3'(SEQ ID NO:38)和反义引物5'-ACCTCTAGATCAGACCATGAAAGCTCCGA-3'(SEQ ID NO:39)(加下划线的文本指示XbaI位点)。片段A的反义引物与片段B的同义引物互补，所述片段B的同义引物覆盖在其中缺失a.a.79-82的氨基酸(a.a.)73-87序列。将片段A和B混合，在94℃下变性，并且冷却至室温，以使两个DNA片段退火。退火的DNA产物用作PCR反应的模板，并且使用BamHI和XbaI将产物克隆到pcDNA3.1内。a.a.79-82的缺失通过测序加以验证。为了生成pMFG-突变型LIGHT，pcDNA3.1-突变型LIGHT用NcoI和BamHI进行消化，并且与NcoI和BamHI消化的pMFG-S-TPA质粒(Mulligan R C，Massachusetts Institute of Technology，Boston，Mass.)连接。
编码突变型人LIGHT的核酸递送到患者内可以是直接的，在所述情况下患者直接暴露于核酸或携带核酸的载体，或间接的，在所述情况下，得自活组织检查的肿瘤细胞首先用核酸在体外转化，被照射并且随后移植到患者内。这些方法在基因治疗中常规实践用于抑制肿瘤或治疗其他病。
核酸的递送。核酸序列在体内直接施用，它们在其中表达以产生编码产物。这可以通过本领域已知的众多方法中的任一种实现，例如通过将它们构建为适当的核酸表达载体的部分，并且这样施用其，从而使得它们变成细胞内的，例如通过使用缺陷型或减弱的逆转录病毒或其他病毒载体感染(美国专利号4,980,286)，或通过裸露DNA的直接注射，或通过使用微粒轰击，或包被有脂质或细胞表面受体或转染试剂，封装在脂质体、微粒或微胶囊内，或通过将其与已知进入核的肽连接施用，通过将其与实施受体介导的胞吞作用的配体(其可以用于靶向特异性表达受体的细胞类型)连接施用。可替代地，核酸可以细胞内引入，并且通过同源重组掺入宿主细胞DNA内用于表达。
生物可降解的微球体也已用于封装核酸的基因递送中。微球体例如基质、薄膜、凝胶和水凝胶(其包括由二酰肼衍生的透明质酸(HA)并与核酸交联，形成缓慢释放微球体)，已用于递送核酸。美国专利号6,048,551公开了利用聚(丙交酯共乙交酯)(PLGA)、羟丙基甲基纤维素邻苯二甲酸酯、乙酸邻苯二甲酸纤维素和共聚物微球体的控制释放基因递送系统，以封装基因载体。
在前述方法的实践中使用的治疗组合物可以配制成包含适合于所需递送方法的载体的药物组合物。合适的载体包括当与治疗组合物组合时，保留治疗组合物的抗肿瘤功能的材料。例子包括但不限于许多标准药学载体中的任一种，例如无菌磷酸盐缓冲盐水溶液、抑菌水等等。治疗制剂可以进行溶解，并且经由能够将治疗组合物递送至肿瘤部位的任何途径施用。潜在有效的施用途径包括但不限于静脉内、肠胃外、腹膜内、肌内、瘤内、真皮内、器官内、常位等等。用于静脉内注射的优选制剂包含在防腐的抑菌水、无菌未防腐的水的溶液中，和/或在含有无菌注射用氯化钠的聚氯乙烯或聚乙烯袋中稀释的治疗组合物。治疗蛋白质制剂可以优选在真空下冻干并作为无菌粉末贮存，并且随后在注射前在抑菌水(含有例如苯甲醇防腐剂)或无菌水中重构。使用前述方法用于治疗癌症的剂量和施用方案根据方法和靶癌症而改变，并且一般取决于本领域理解的许多其他因素。
使用病毒载体的递送。含有编码本发明抗体的核酸序列的病毒载体用于递送特异性核酸。例如，可以使用逆转录病毒载体。这些逆转录病毒载体含有正确包装病毒基因组和整合到宿主细胞DNA内所需的组分。待用于基因治疗中的编码所需蛋白质的核酸序列克隆到一种或多种载体内，所述载体促进基因递送到患者内。腺病毒是可以用于基因治疗中的其他病毒载体。腺病毒是用于将基因递送至呼吸上皮的尤其有吸引力的媒介物，并且基于腺病毒的递送系统的其他靶是肝脏、中枢神经系统、上皮细胞和肌肉。腺病毒具有能够感染非分裂细胞的优点。腺伴随病毒(AAV)也已提议用于基因治疗中(美国专利号5,436,146)。慢病毒有希望用于基因治疗中。
组织培养中的转染细胞随后递送至患者。基因治疗的另一种方法涉及通过此类方法如电穿孔、脂转染、磷酸钙介导的转染或病毒感染，将基因转移至组织培养中的细胞。通常，转移方法包括将可选标记转移至细胞。细胞随后置于选择下，以分离已吸收并表达转移的基因的那些细胞。随后将那些细胞递送给患者。在该方法中，核酸在体内施用所得的重组细胞之前引入细胞内。此类引入可以通过本领域已知的任何方法进行，所述方法包括但不限于转染、电穿孔、显微注射、用含有核酸序列的病毒或细菌噬菌体载体感染、细胞融合、染色体介导的基因转移、微细胞介导的基因转移、原生质体融合等。技术应提供核酸对细胞的稳定转移，从而使得核酸由细胞表达并且优选可由其细胞后代遗传并表达。
所得的重组细胞可以被照射，并且通过本领域已知的多种方法递送给患者。重组细胞(例如造血干细胞或祖细胞)优选静脉内施用。设想使用的细胞量取决于所需效应、患者状态等，并且可以由本领域技术人员决定。核酸可以引入其内用于基因治疗目的的细胞包含任何所需、可用的细胞类型，并且包括但不限于上皮细胞、内皮细胞、角质形成细胞、成纤维细胞、肌细胞、肝细胞、血细胞，例如T淋巴细胞、B淋巴细胞、单核细胞、巨噬细胞、嗜中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、巨核细胞、粒细胞；例如如得自骨髓、脐带血、外周血、胎儿肝脏等的多种干细胞或祖细胞，特别是造血干细胞或祖细胞。
疫苗。如本文使用的，术语“疫苗”指引发肿瘤特异性免疫应答的组合物(例如突变型人LIGHT抗原和佐剂)。这些疫苗包括预防性的(预防新肿瘤)和治疗性的(根除亲本肿瘤)。疫苗载体例如编码突变型人LIGHT的DNA疫苗可以用于引发针对肿瘤的免疫应答。通过在部位(例如远离肿瘤的部位)处施用疫苗组合物，由受试者的自身免疫系统引发应答。免疫应答可以导致肿瘤细胞在体内的根除(例如原发性和转移性肿瘤细胞)。用于生成肿瘤疫苗的方法是本领域众所周知的(参见例如美国专利号5,994,523和6,207,147，所述专利各自引入本文作为参考)。
疫苗可以包含在药物组合物中的一种或多种肿瘤抗原。在一些情况下，肿瘤抗原在施用前进行灭活。在其他实施方案中，疫苗进一步包含一种或多种另外的治疗试剂(例如细胞因子或细胞因子表达细胞)。
在某些情况下，选自患者的细胞例如得自例如常规皮肤活组织检查的成纤维细胞进行遗传修饰，以表达所需蛋白质之一或。可替代地，可能通常充当免疫系统中的抗原呈递细胞的患者细胞，例如巨噬细胞、单核细胞和淋巴细胞也可以进行遗传修饰，以表达所需抗原中的一种或多种。抗原表达细胞随后与患者的肿瘤细胞(例如肿瘤抗原)混合，所述肿瘤细胞例如以被照射的肿瘤细胞的形式，或可替代地以纯化的天然或重组肿瘤抗原的形式，并且用于例如皮下免疫接种中，以诱导全身抗肿瘤免疫。疫苗可以使用任何合适方法包括但不限于上文描述的那些进行施用。
癌症转移可以通过刺激下述中的至少一种得到减少：包括用于引发幼稚T细胞的趋化因子、粘附分子和共刺激分子。癌症类型包括乳腺癌、肺癌、前列腺癌、结肠癌和皮肤癌。
用于使非人抗体人源化的方法是本领域众所周知的。一般地，人源化抗体具有从非人来源引入其内的一个或多个氨基酸残基。这些非人氨基酸残基通常被称为“输入”残基，其通常得自“输入”可变结构域。人源化可以遵循Winter和同事[Jones等人，Nature，321:522-525(1986)；Riechmann等人，Nature，332:323-327(1988)；Verhoeyen等人，Science，239:1534-1536(1988)]的方法，通过用啮齿类CDR或CDR序列置换人抗体的相应序列进行。相应地，此类“人源化”抗体是嵌合抗体(美国专利号4,816,567)，其中基本上小于完整的人可变结构域已由来自非人物种的相应序列置换。在实践中，人源化抗体通常是其中一些CDR残基和可能一些FR残基由来自啮齿类抗体的类似位点的残基置换的人抗体。
考虑了多种形式的人源化抗体-LIGHT融合物或缀合物。例如，人源化抗体可以是抗体片段，例如Fab，其与LIGHT或其细胞外片段缀合。可替代地，人源化抗体可以是完整抗体，例如完整IgG1抗体。
作为人源化的替代方案，可以生成人抗体。例如，能够产生转基因动物(例如小鼠)，在不存在内源免疫球蛋白产生的情况下，所述转基因动物在免疫接种后能够产生多种人抗体。参见例如Jakobovits等人，Proc.Natl.Acad.Sci.USA，90:2551(1993)；Jakobovits等人，Nature，362:255-258(1993)。
可替代地，噬菌体展示技术(McCafferty等人，Nature 348:552-553(1990))可以用于由来自未免疫接种的供体的免疫球蛋白可变(V)结构域基因储库，在体外产生人抗体和抗体片段。根据该技术，将抗体V结构域基因框内克隆到丝状噬菌体例如Ml 3或fd的主要或次要衣壳蛋白基因内，并且在噬菌体颗粒的表面上展示为功能抗体片段(参见例如Johnson，Kevin S和Chiswell，David J.，Current Opinion in Structural Biology 3:564-571(1993))。人抗体也可以通过体外活化的B细胞生成(参见美国专利号5,567,610和5,229,275)。
多种技术已开发用于产生抗体片段。传统上，这些片段经由完整抗体的蛋白酶解消化衍生。然而，这些片段还可以通过重组宿主细胞直接产生。Fab、Fv和ScFv抗体片段可以全部在大肠杆菌(E.coli)中表达并且由大肠杆菌分泌，因此允许大量这些片段的容易产生。抗体片段可以从抗体噬菌体文库中分离。抗体片段还可以是例如如美国专利号5,641,870中描述的“线性抗体”。此类线性抗体片段可以是单特异性或双特异性的。
抗体和共刺激分子例如LIGHT的缀合物可以使用多种双功能蛋白质偶联剂进行制备，所述双功能蛋白质偶联剂例如N-琥珀酰亚胺-3-(2-吡啶基二硫代)丙酸酯(SPDP)、琥珀酰亚胺基-4-(N-马来酰亚胺甲基)环己烷-羧酸酯、亚氨基硫烷(IT)、酰亚胺酯的双功能衍生物(例如二甲基己二酸HCL)、活性酯(例如二琥珀酰亚胺辛二酸酯)、醛(例如戊二醛(glutareldehyde))、双叠氮基化合物(例如双(对叠氮基苯甲酰)己二胺)、双叠氮鎓衍生物(例如双(对重氮鎓苯甲酰)-乙二胺(ethylenediaminc)、二异氰酸酯(例如甲苯2,6-二异氰酸酯)和双活性氟化合物(例如1,5二氟-2,4-二硝基苯)。LIGHT的细胞外结构域或其片段与抗体或抗体片段缀合，所述抗体或抗体片段对于肿瘤抗原优选表面肿瘤抗原是特异性的。
可替代地，包含抗肿瘤抗原抗体和LIGHT的融合蛋白可以例如通过重组技术或肽合成进行制备。DNA的长度可以包含编码缀合物的两个部分的各自区域，所述区域彼此相邻或由编码接头肽的区域分开，所述接头肽不破坏缀合物的所需特性。
本文公开的抗体-LIGHT复合物还可以配制为免疫脂质体。“脂质体”是由多类脂质、磷脂和/或表面活性剂组成的小媒介物，其可用于将药物递送至哺乳动物。脂质体的组分通常以双层形式排列，类似于生物膜的脂质排列。含有抗体的脂质体通过本领域已知的方法进行制备，例如美国专利号4,485,045和4,544,545；以及1997年10月23日公开的W097/38731中所述的。具有增强的循环时间的脂质体公开于美国专利号5,013,556中。
对于疾病的预防或治疗，施用剂量和方式将由医师根据已知标准进行选择。适当剂量的LIGHT、抗体-LIGHT缀合物或融合产物可以取决于待治疗的癌症类型、疾病的严重性和过程、肿瘤大小、转移程度、抗体施用是用于预防还是治疗目的、先前治疗、患者的临床史和对抗体的应答、以及主治医师的判断。LIGHT或抗体-LIGHT组合物适当地一次或经过一系列治疗施用于患者。优选地，组合物通过静脉内输注或通过皮下注射进行施用。取决于疾病的类型和严重性，约1μg/kg至约50mg/kg体重(例如约0.1-15mg/kg/剂量)的抗体可以是施用于患者的初始候选剂量，无论是例如通过一次或多次分开施用还是通过连续输注。给药方案可以包括施用约5mg/kg的初始装载剂量，随后为约2mg/kg抗TAT抗体的每周一次维持剂量。然而，其他剂量方案可以是有用的。通常的日剂量可以范围为约1μg/kg至100mg/kg或更多，取决于上述因素。对于经过几天或更久的重复施用，取决于状况，治疗持续直至疾病症状的所需抑制出现，例如肿瘤大小/体积中的减少和转移中的减少。可以通过常规方法和测定法并且基于医师或本领域其他技术人员已知的标准，来监控该治疗的进展。
表I.Ad-LIGHT根除转移并促进长期存活
a在原发性肿瘤接种后的天数。
b由几次独立实验合并。
c注射总共2.5×109PFU Ad-对照(LacZ)或Ad-LIGHT/小鼠。
d在第14天时和每周一次注射总共125mg耗尽的抗CD8Ab。
权利要求书(按照条约第19条的修改)
1.一种具有由核酸序列编码的氨基酸序列的突变型LIGHT分子，所述氨基酸序列赋予所述分子下述能力：
i)与野生型人LIGHT相比较，以增加的亲和力与LIGHT的鼠受体结合，和
ii)与野生型人LIGHT相比较，以至少相同的亲和力与LIGHT的人受体结合
其中所述能力是由于LIGHT的细胞外结构域的编码序列中的突变。
2.(已删除)
3.权利要求1的突变型LIGHT分子，其中所述细胞外结构域选自以出现的次序分别指定为SEQ ID NO 6-8、8-10、10、4、3、5、5、11-13、12、14-17、20、19-23、45、20和25的氨基酸序列。
4.(已删除)
5.权利要求1的突变型LIGHT分子，其选自突变型LIGHT蛋白质、肽、蛋白质或肽的片段、和编码突变型LIGHT的核酸分子的表达产物。
6.权利要求1的突变型LIGHT分子，其包含衍生自人LIGHT序列的氨基酸序列。
7.一种免疫组合物，其包含权利要求1的突变型LIGHT分子。
8.一种药物组合物，其包含与权利要求1的突变型LIGHT分子连接、缀合或融合的肿瘤特异性试剂，其中所述组合物刺激针对肿瘤细胞的细胞毒性T淋巴细胞。
9.权利要求8的组合物，其中所述试剂与所述突变型LIGHT分子化学缀合。
10.权利要求8的组合物，其中所述试剂是人源化单克隆抗体。
11.权利要求8的组合物，其中所述试剂是嵌合抗体。
12.权利要求8的组合物，其中所述试剂是异微型抗体。
13.权利要求8的组合物，其中所述试剂是单链抗体。
14.权利要求8的组合物，其中所述试剂是足以识别肿瘤抗原的抗体片段。
15.权利要求8的组合物，其中所述突变型LIGHT分子包含足以刺激细胞毒性T细胞的细胞外结构域区段。
16.根据权利要求15的组合物，其中所述区段包含以人LIGHT氨基酸次序的LIGHT的约100-150个氨基酸。
17.根据权利要求15的组合物，其中所述区段包含来自人LIGHT蛋白质的位置约85-240的氨基酸序列。
18.根据权利要求8的组合物，其中所述突变型LIGHT包含在蛋白酶识别序列EQLI(残基81-84)(SEQ ID NO:1)中的突变，由此使所述蛋白酶识别序列失活。
19.根据权利要求8的组合物，其中所述突变型LIGHT包含缺失。
20.根据权利要求8的组合物，其中所述突变型LIGHT包含在细胞外结构域中的突变，所述细胞外结构域包含下述氨基酸序列：
QLHWRLGEMVTRLPDGPAGSWEQLIQERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALVVTKAGYYYTYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEKVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV(SEQ ID NO:40)。
21.突变型LIGHT细胞外结构域序列，其命名为m4-14、m4-7和m4-16。
22.一种药物组合物，其包含与权利要求1的突变型LIGHT分子连接、缀合或融合的肿瘤特异性试剂，用于减少原发性肿瘤生长或用于治疗癌症转移。
23.人(hLIGHT)突变体分子，其选自以出现的次序分别命名为SEQ IDNO 6-8、8-10、10、4、3、5、5、11-13、12、14-17、20、19-23、45、20和25的氨基酸序列。
24.一种融合蛋白，其包含权利要求23的分子和针对Her-2的抗体。
25.一种组合物，其包含与特异性识别肿瘤细胞的试剂组合的蛋白酶抗性LIGHT蛋白质的片段。
26.权利要求25的组合物，其中所述试剂是针对肿瘤抗原的抗体。
27.权利要求25的组合物，其中所述试剂是结合肿瘤表面受体的配体。
28.一种嵌合蛋白，其包含识别与LIGHT分子连接、融合或缀合的肿瘤抗原的氨基酸区域，其中所述LIGHT分子对肿瘤环境中的蛋白酶消化是抗性的，或是突变型LIGHT分子。
29.一种将权利要求1的突变型LIGHT分子递送至患者中的肿瘤的方法，所述方法包括：(a)给有此需要的患者施用具有编码所述分子的核酸分子的腺病毒；或(b)给有此需要的患者施用具有所述分子的纳米颗粒；或(c)将所述分子直接转移到有此需要的患者内。
30.一种减少原发性肿瘤的生长或癌症转移的方法，所述方法包括：(a)施用包含与LIGHT多肽突变体或片段连接、缀合或融合的肿瘤特异性试剂的权利要求8的药物组合物，其中所述组合物足以刺激细胞毒性T淋巴细胞的产生；和(b)通过刺激针对所述肿瘤的肿瘤特异性T细胞的活化，减少原发性肿瘤的生长或癌症转移。
31.权利要求30的方法，其中所述试剂是识别表面肿瘤抗原的抗体。
32.权利要求30的方法，其中所述试剂是对选自下述的肿瘤抗原特异的抗体：HER2、HER4、HERB、EGFR、STEAP、c-Met、甲胎蛋白(AFP)、癌胚抗原(CEA)、CA-125、MUC-1、ras或p53的异常产物和DcR3。
33.权利要求30的方法，其中所述试剂是与所述LIGHT片段化学缀合或与所述LIGHT片段重组融合的抗体。
34.权利要求30的方法，其中所述LIGHT片段包含LIGHT的细胞外结构域，所述细胞外结构域包含人LIGHT蛋白质的氨基酸85-240。
35.权利要求30的方法，其中所述药物组合物静脉内施用。
36.权利要求30的方法，其中所述癌症转移通过刺激用于引发幼稚T细胞的下述中的至少一种的产生而得到减少：趋化因子、粘附分子和共刺激分子。
37.权利要求30的方法，其中所述癌症选自乳腺癌、肺癌、前列腺癌、结肠癌、肾癌、肝癌、白血病和皮肤癌。
38.权利要求30的方法，其进一步包括施用化学治疗剂或放射治疗。
39.一种减少肿瘤的生长和癌症转移的方法，所述方法包括：(a)施用权利要求8的组合物；或(b)在肿瘤部位处将编码LIGHT或其片段的核酸分子引入个体内，其中所述LIGHT包含在所述细胞外结构域中的突变或是蛋白酶抗性的，并且其中LIGHT稳定存在于所述肿瘤细胞表面上；和(c)通过刺激针对所述肿瘤的肿瘤特异性T细胞的活化，减少原发性肿瘤的生长和癌症转移。
40.权利要求39的方法，其中核酸递送至先前存在的肿瘤部位或对于先前存在的肿瘤部位远侧的部位。
41.一种减少原发性肿瘤的生长和癌症转移的方法，所述方法包括：(a)施用包含肿瘤特异性抗体的药物组合物；(b)在肿瘤部位处引入编码LIGHT蛋白质的核酸分子，其中所述LIGHT是人LIGHT蛋白质或其突变体或片段，或是蛋白酶抗性的；(c)在肿瘤细胞的表面上稳定表达所述LIGHT蛋白质或其片段；和(d)通过刺激针对所述肿瘤的肿瘤特异性T细胞的活化，减少所述肿瘤的生长和癌症转移。

Claims (41)

1.一种具有由核酸序列编码的氨基酸序列的突变型LIGHT分子，其中所述突变型LIGHT分子
i)与野生型人LIGHT相比较，以增加的亲和力与LIGHT的鼠受体结合，和
ii)与野生型人LIGHT相比较，以至少相同的亲和力与LIGHT的人受体结合。
2.权利要求1的突变型LIGHT分子，其中所述突变在LIGHT的细胞外结构域的编码序列中。
3.权利要求2的突变型LIGHT分子，其中所述细胞外结构域选自图6或7中列出的氨基酸序列(以出现的次序分别为SEQ ID NO 6-8、8-10、10、4、3、5、5、11-13、12、14-17、20、19-23、45、20和25)。
4.权利要求2的突变型LIGHT分子，其具有在野生型人LIGHT蛋白质的细胞外结构域的位置214处的赖氨酸至谷氨酸的氨基酸置换。
5.权利要求1的突变型LIGHT分子，其选自突变型LIGHT蛋白质、肽、蛋白质或肽的片段、和编码突变型LIGHT的核酸分子的表达产物。
6.权利要求1的突变型LIGHT分子，其包含衍生自人LIGHT序列的氨基酸序列。
7.一种免疫组合物，其包含权利要求1的突变型LIGHT分子。
8.一种药物组合物，其包含与权利要求1的突变型LIGHT分子连接、缀合或融合的肿瘤特异性试剂，其中所述组合物足以刺激针对肿瘤细胞的细胞毒性T淋巴细胞。
9.权利要求8的组合物，其中所述试剂与所述突变型LIGHT分子化学缀合。
10.权利要求8的组合物，其中所述试剂是人源化单克隆抗体。
11.权利要求8的组合物，其中所述试剂是嵌合抗体。
12.权利要求8的组合物，其中所述试剂是异微型抗体。
13.权利要求8的组合物，其中所述试剂是单链抗体。
14.权利要求8的组合物，其中所述试剂是足以识别肿瘤抗原的抗体片段。
15.权利要求8的组合物，其中所述突变型LIGHT分子包含足以刺激细胞毒性T细胞的细胞外结构域区段。
16.权利要求15的组合物，其中所述区段包含以人LIGHT氨基酸次序的LIGHT的约100-150个氨基酸。
17.权利要求15的组合物，其中所述区段包含来自人LIGHT蛋白质的位置约85-240的氨基酸序列。
18.权利要求8的组合物，其中突变型LIGHT包含在蛋白酶识别序列EQLI(残基81-84)(SEQ ID NO:1)中的突变，由此使所述蛋白酶识别序列失活。
19.权利要求8的组合物，其中突变型LIGHT包含缺失。
20.权利要求8的组合物，其中所述突变型LIGHT包含在细胞外结构域中的突变，所述细胞外结构域包含下述氨基酸序列：
QLHWRLGEMVTRLPDGPAGSWEQLIQERRSHEVNPAAHLTGANSSLTGSGGPLLWETQLGLAFLRGLSYHDGALVVTKAGYYYTYSKVQLGGVGCPLGLASTITHGLYKRTPRYPEELELLVSQQSPCGRATSSSRVWWDSSFLGGVVHLEAGEKVVVRVLDERLVRLRDGTRSYFGAFMV(SEQ ID NO:40)。
21.突变型LIGHT细胞外结构域序列，其命名为m4-14、m4-7和m4-16。
22.一种药物组合物，其包含与权利要求1的突变型LIGHT分子连接、缀合或融合的肿瘤特异性试剂，用于减少原发性肿瘤生长或用于治疗癌症转移。
23.人(hLIGHT)突变体分子，其如图6和7中所示(以出现的次序分别为SEQ ID NO 6-8、8-10、10、4、3、5、5、11-13、12、14-17、20、19-23、45、20和25)。
24.一种融合蛋白，其包含权利要求23的分子和针对Her-2的抗体。
25.一种组合物，其包含与特异性识别肿瘤细胞的试剂组合的蛋白酶抗性LIGHT蛋白质的片段。
26.权利要求25的组合物，其中所述试剂是针对肿瘤抗原的抗体。
27.权利要求25的组合物，其中所述试剂是结合肿瘤表面受体的配体。
28.一种嵌合蛋白，其包含识别与LIGHT分子连接、融合或缀合的肿瘤抗原的氨基酸区域，其中所述LIGHT分子对肿瘤环境中的蛋白酶消化是抗性的，或是突变型LIGHT分子。
29.一种将权利要求1的突变型LIGHT分子递送至肿瘤的方法，所述方法包括：(a)具有编码所述分子的核酸分子的腺病毒，或；(b)纳米颗粒；或(c)直接转移。
30.一种减少原发性肿瘤的生长或癌症转移的方法，所述方法包括：(a)施用包含与LIGHT多肽突变体或片段连接、缀合或融合的肿瘤特异性试剂的药物组合物，其中所述组合物足以刺激细胞毒性T淋巴细胞的产生；和(b)通过刺激针对所述肿瘤的肿瘤特异性T细胞的活化，减少原发性肿瘤的生长或癌症转移。
31.权利要求30的方法，其中所述试剂是识别表面肿瘤抗原的抗体。
32.权利要求30的方法，其中所述试剂是对选自下述的肿瘤抗原特异的抗体：HER2、HER4、HERB、EGFR、STEAP、c-Met、甲胎蛋白(AFP)、癌胚抗原(CEA)、CA-125、MUC-1、ras或p53的异常产物和DcR3。
33.权利要求30的方法，其中所述试剂是与所述LIGHT片段化学缀合或与所述LIGHT片段重组融合的抗体。
34.权利要求30的方法，其中所述LIGHT片段包含LIGHT的细胞外结构域，所述细胞外结构域包含人LIGHT蛋白质的氨基酸85-240。
35.权利要求30的方法，其中所述药物组合物静脉内施用。
36.权利要求30的方法，其中所述癌症转移通过刺激用于引发幼稚T细胞的下述中的至少一种的产生得到减少：趋化因子、粘附分子和共刺激分子。
37.权利要求30的方法，其中所述癌症选自乳腺癌、肺癌、前列腺癌、结肠癌、肾癌、肝癌、白血病和皮肤癌。
38.权利要求30的方法，其进一步包括施用化学治疗剂或放射治疗。
39.一种减少肿瘤的生长和癌症转移的方法，所述方法包括：(a)施用权利要求8的组合物；或(b)在肿瘤部位处将编码LIGHT或其片段的核酸分子引入个体内，其中所述LIGHT包含在所述细胞外结构域中的突变或是蛋白酶抗性的，并且其中LIGHT稳定存在于所述肿瘤细胞表面上；和(c)通过刺激针对所述肿瘤的肿瘤特异性T细胞的活化，减少原发性肿瘤的生长和癌症转移。
40.权利要求39的方法，其中核酸递送至先前存在的肿瘤部位或对于先前存在的肿瘤部位远侧的部位。
41.一种减少原发性肿瘤和的生长癌症转移的方法，所述方法包括：(a)施用包含肿瘤特异性抗体的药物组合物；(b)在肿瘤部位处引入编码LIGHT蛋白质的核酸分子，其中所述LIGHT是人LIGHT蛋白质或其突变体或片段，或是蛋白酶抗性的；(c)在肿瘤细胞的表面上稳定表达所述LIGHT蛋白质或其片段；和(d)通过刺激针对所述肿瘤的肿瘤特异性T细胞的活化，减少所述肿瘤的生长和癌症转移。
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