CN104138594A - D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备新德里金属-β-内酰胺酶1抑制剂中的用途 - Google Patents
D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备新德里金属-β-内酰胺酶1抑制剂中的用途 Download PDFInfo
- Publication number
- CN104138594A CN104138594A CN201310168921.4A CN201310168921A CN104138594A CN 104138594 A CN104138594 A CN 104138594A CN 201310168921 A CN201310168921 A CN 201310168921A CN 104138594 A CN104138594 A CN 104138594A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- group
- ndm
- alkyl
- compound
- alkyl group
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 101000740455 Klebsiella pneumoniae Metallo-beta-lactamase type 2 Proteins 0.000 title claims abstract description 56
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 title claims abstract description 10
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title abstract description 8
- 108010016626 Dipeptides Proteins 0.000 title abstract description 5
- 229960005190 phenylalanine Drugs 0.000 title abstract description 5
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 43
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 claims abstract description 10
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 9
- -1 phenoxy, naphthyl Chemical group 0.000 claims description 31
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 23
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims description 14
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 14
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 14
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims description 14
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 14
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 11
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 claims description 10
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 claims description 10
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 claims description 10
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 claims description 9
- 125000001041 indolyl group Chemical group 0.000 claims description 8
- 125000001584 benzyloxycarbonyl group Chemical group C(=O)(OCC1=CC=CC=C1)* 0.000 claims description 7
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims description 7
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 claims description 7
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 6
- 125000000904 isoindolyl group Chemical group C=1(NC=C2C=CC=CC12)* 0.000 claims description 5
- 125000002950 monocyclic group Chemical group 0.000 claims description 5
- 125000000051 benzyloxy group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])O* 0.000 claims description 4
- 125000002619 bicyclic group Chemical group 0.000 claims description 4
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 4
- 125000004191 (C1-C6) alkoxy group Chemical group 0.000 claims description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 2
- 125000004213 tert-butoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C(O*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 abstract description 4
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 23
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 14
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 10
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 8
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 7
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 5
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 5
- GSOSVVULSKVSLQ-JJVRHELESA-N imipenem hydrate Chemical compound O.C1C(SCCNC=N)=C(C(O)=O)N2C(=O)[C@H]([C@H](O)C)[C@H]21 GSOSVVULSKVSLQ-JJVRHELESA-N 0.000 description 5
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 5
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 4
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 4
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 4
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical group C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 3
- MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N Oxalic acid Chemical compound OC(=O)C(O)=O MUBZPKHOEPUJKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N Propanedioic acid Natural products OC(=O)CC(O)=O OFOBLEOULBTSOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 3
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000012154 double-distilled water Substances 0.000 description 3
- 238000007877 drug screening Methods 0.000 description 3
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 3
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 description 3
- 238000010998 test method Methods 0.000 description 3
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 3
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 2-Aminoethan-1-ol Chemical compound NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N Fumaric acid Chemical compound OC(=O)\C=C\C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-N 0.000 description 2
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Chemical compound OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N Iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 description 2
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N Phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N Pyruvic acid Chemical compound CC(=O)C(O)=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 2
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 101150059180 blaNDM-1 gene Proteins 0.000 description 2
- 125000004106 butoxy group Chemical group [*]OC([H])([H])C([H])([H])C(C([H])([H])[H])([H])[H] 0.000 description 2
- MYSWGUAQZAJSOK-UHFFFAOYSA-N ciprofloxacin Chemical compound C12=CC(N3CCNCC3)=C(F)C=C2C(=O)C(C(=O)O)=CN1C1CC1 MYSWGUAQZAJSOK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 2
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 2
- 125000001786 isothiazolyl group Chemical group 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 2
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 2
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 2
- 150000007530 organic bases Chemical class 0.000 description 2
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 2
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 2
- YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N salicylic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1O YGSDEFSMJLZEOE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N trans-butenedioic acid Natural products OC(=O)C=CC(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001425 triazolyl group Chemical group 0.000 description 2
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N (2R)-2-hydroxy-2-phenylacetic acid Chemical compound O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1.O[C@@H](C(O)=O)c1ccccc1 QBYIENPQHBMVBV-HFEGYEGKSA-N 0.000 description 1
- LITBAYYWXZOHAW-XDZRHBBOSA-N (2s,5r,6r)-6-[[(2r)-2-[(4-ethyl-2,3-dioxopiperazine-1-carbonyl)amino]-2-phenylacetyl]amino]-3,3-dimethyl-7-oxo-4-thia-1-azabicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylic acid;(2s,3s,5r)-3-methyl-4,4,7-trioxo-3-(triazol-1-ylmethyl)-4$l^{6}-thia-1-azabicyclo[3.2.0]hept Chemical compound C([C@]1(C)S([C@H]2N(C(C2)=O)[C@H]1C(O)=O)(=O)=O)N1C=CN=N1.O=C1C(=O)N(CC)CCN1C(=O)N[C@H](C=1C=CC=CC=1)C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S[C@@H]21 LITBAYYWXZOHAW-XDZRHBBOSA-N 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-M .beta-Phenylacrylic acid Natural products [O-]C(=O)\C=C\C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-VOTSOKGWSA-M 0.000 description 1
- WZPBZJONDBGPKJ-VEHQQRBSSA-L 2-[(z)-[1-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)-2-[[(2s,3s)-2-methyl-4-oxo-1-sulfonatoazetidin-3-yl]amino]-2-oxoethylidene]amino]oxy-2-methylpropanoate Chemical compound O=C1N(S([O-])(=O)=O)[C@@H](C)[C@@H]1NC(=O)C(=N/OC(C)(C)C([O-])=O)\C1=CSC(N)=N1 WZPBZJONDBGPKJ-VEHQQRBSSA-L 0.000 description 1
- 125000000094 2-phenylethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 3-azaniumyl-2-hydroxypropanoate Chemical compound NCC(O)C(O)=O BMYNFMYTOJXKLE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588626 Acinetobacter baumannii Species 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- WZPBZJONDBGPKJ-UHFFFAOYSA-N Antibiotic SQ 26917 Natural products O=C1N(S(O)(=O)=O)C(C)C1NC(=O)C(=NOC(C)(C)C(O)=O)C1=CSC(N)=N1 WZPBZJONDBGPKJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 1
- 239000005711 Benzoic acid Substances 0.000 description 1
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 1
- ZWZIHLRSOOMEKT-UHFFFAOYSA-N COC(NCc1ccccc1)=O Chemical compound COC(NCc1ccccc1)=O ZWZIHLRSOOMEKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N Calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-SREVYHEPSA-N Cinnamic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-SREVYHEPSA-N 0.000 description 1
- 241000588923 Citrobacter Species 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N Dextrotartaric acid Chemical compound OC(=O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O FEWJPZIEWOKRBE-JCYAYHJZSA-N 0.000 description 1
- 108090000204 Dipeptidase 1 Proteins 0.000 description 1
- 206010059866 Drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000588697 Enterobacter cloacae Species 0.000 description 1
- 241000588921 Enterobacteriaceae Species 0.000 description 1
- 241000194031 Enterococcus faecium Species 0.000 description 1
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 1
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 241000588749 Klebsiella oxytoca Species 0.000 description 1
- WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N Lithium Chemical compound [Li] WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N Magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588772 Morganella morganii Species 0.000 description 1
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000588769 Proteus <enterobacteria> Species 0.000 description 1
- 241000588768 Providencia Species 0.000 description 1
- IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N R-2-phenyl-2-hydroxyacetic acid Natural products OC(=O)C(O)C1=CC=CC=C1 IWYDHOAUDWTVEP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N Succinic acid Natural products OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N Tartaric acid Natural products [H+].[H+].[O-]C(=O)C(O)C(O)C([O-])=O FEWJPZIEWOKRBE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WKDDRNSBRWANNC-UHFFFAOYSA-N Thienamycin Natural products C1C(SCCN)=C(C(O)=O)N2C(=O)C(C(O)C)C21 WKDDRNSBRWANNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 125000000641 acridinyl group Chemical group C1(=CC=CC2=NC3=CC=CC=C3C=C12)* 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960004821 amikacin Drugs 0.000 description 1
- LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N amikacin Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](N)C[C@H]([C@@H]([C@H]1O)O[C@@H]1[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)NC(=O)[C@@H](O)CCN)[C@H]1O[C@H](CN)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O LKCWBDHBTVXHDL-RMDFUYIESA-N 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 125000006615 aromatic heterocyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 229960003644 aztreonam Drugs 0.000 description 1
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 125000003785 benzimidazolyl group Chemical group N1=C(NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000004603 benzisoxazolyl group Chemical group O1N=C(C2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- 125000001164 benzothiazolyl group Chemical group S1C(=NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000004541 benzoxazolyl group Chemical group O1C(=NC2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 102000006635 beta-lactamase Human genes 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N butanedioic acid Chemical compound O[14C](=O)CC[14C](O)=O KDYFGRWQOYBRFD-NUQCWPJISA-N 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 244000309466 calf Species 0.000 description 1
- 125000000609 carbazolyl group Chemical group C1(=CC=CC=2C3=CC=CC=C3NC12)* 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 229960004261 cefotaxime Drugs 0.000 description 1
- AZZMGZXNTDTSME-JUZDKLSSSA-M cefotaxime sodium Chemical compound [Na+].N([C@@H]1C(N2C(=C(COC(C)=O)CS[C@@H]21)C([O-])=O)=O)C(=O)\C(=N/OC)C1=CSC(N)=N1 AZZMGZXNTDTSME-JUZDKLSSSA-M 0.000 description 1
- 229960000484 ceftazidime Drugs 0.000 description 1
- NMVPEQXCMGEDNH-TZVUEUGBSA-N ceftazidime pentahydrate Chemical compound O.O.O.O.O.S([C@@H]1[C@@H](C(N1C=1C([O-])=O)=O)NC(=O)\C(=N/OC(C)(C)C(O)=O)C=2N=C(N)SC=2)CC=1C[N+]1=CC=CC=C1 NMVPEQXCMGEDNH-TZVUEUGBSA-N 0.000 description 1
- QHTOIDKCEPKVCM-ZCFIWIBFSA-N cepham Chemical compound S1CCCN2C(=O)C[C@H]21 QHTOIDKCEPKVCM-ZCFIWIBFSA-N 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 235000013985 cinnamic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229930016911 cinnamic acid Natural products 0.000 description 1
- 229960003405 ciprofloxacin Drugs 0.000 description 1
- 235000015165 citric acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- HPNMFZURTQLUMO-UHFFFAOYSA-N diethylamine Chemical compound CCNCC HPNMFZURTQLUMO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000007884 disintegrant Substances 0.000 description 1
- CETRZFQIITUQQL-UHFFFAOYSA-N dmso dimethylsulfoxide Chemical compound CS(C)=O.CS(C)=O CETRZFQIITUQQL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M ethanesulfonate Chemical compound CCS([O-])(=O)=O CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- DBLXOVFQHHSKRC-UHFFFAOYSA-N ethanesulfonic acid;2-piperazin-1-ylethanol Chemical compound CCS(O)(=O)=O.OCCN1CCNCC1 DBLXOVFQHHSKRC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 239000001530 fumaric acid Substances 0.000 description 1
- 235000011087 fumaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 229940083124 ganglion-blocking antiadrenergic secondary and tertiary amines Drugs 0.000 description 1
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 1
- 125000004051 hexyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 description 1
- 150000004679 hydroxides Chemical class 0.000 description 1
- 125000002883 imidazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229960002182 imipenem Drugs 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 125000003453 indazolyl group Chemical group N1N=C(C2=C1C=CC=C2)* 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N isopropylamine Chemical compound CC(C)N JJWLVOIRVHMVIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002183 isoquinolinyl group Chemical group C1(=NC=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 125000000842 isoxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229910052744 lithium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000314 lubricant Substances 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N maleic acid Chemical compound OC(=O)\C=C/C(O)=O VZCYOOQTPOCHFL-UPHRSURJSA-N 0.000 description 1
- 239000011976 maleic acid Substances 0.000 description 1
- 229960002510 mandelic acid Drugs 0.000 description 1
- WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L manganese(2+);methyl n-[[2-(methoxycarbonylcarbamothioylamino)phenyl]carbamothioyl]carbamate;n-[2-(sulfidocarbothioylamino)ethyl]carbamodithioate Chemical compound [Mn+2].[S-]C(=S)NCCNC([S-])=S.COC(=O)NC(=S)NC1=CC=CC=C1NC(=S)NC(=O)OC WPBNNNQJVZRUHP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- DMJNNHOOLUXYBV-PQTSNVLCSA-N meropenem Chemical compound C=1([C@H](C)[C@@H]2[C@H](C(N2C=1C(O)=O)=O)[C@H](O)C)S[C@@H]1CN[C@H](C(=O)N(C)C)C1 DMJNNHOOLUXYBV-PQTSNVLCSA-N 0.000 description 1
- 229960002260 meropenem Drugs 0.000 description 1
- 229940098779 methanesulfonic acid Drugs 0.000 description 1
- 238000000034 method Methods 0.000 description 1
- WBYWAXJHAXSJNI-UHFFFAOYSA-N methyl p-hydroxycinnamate Natural products OC(=O)C=CC1=CC=CC=C1 WBYWAXJHAXSJNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960004023 minocycline Drugs 0.000 description 1
- DYKFCLLONBREIL-KVUCHLLUSA-N minocycline Chemical compound C([C@H]1C2)C3=C(N(C)C)C=CC(O)=C3C(=O)C1=C(O)[C@@]1(O)[C@@H]2[C@H](N(C)C)C(O)=C(C(N)=O)C1=O DYKFCLLONBREIL-KVUCHLLUSA-N 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 229940076266 morganella morganii Drugs 0.000 description 1
- 125000004108 n-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000004123 n-propyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000001715 oxadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 235000006408 oxalic acid Nutrition 0.000 description 1
- 125000002971 oxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 description 1
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N papa-hydroxy-benzoic acid Natural products OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001147 pentyl group Chemical group C(CCCC)* 0.000 description 1
- 229940104641 piperacillin / tazobactam Drugs 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000003141 primary amines Chemical class 0.000 description 1
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 description 1
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 125000000561 purinyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1)* 0.000 description 1
- 125000003373 pyrazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003226 pyrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002098 pyridazinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004076 pyridyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000168 pyrrolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229940107700 pyruvic acid Drugs 0.000 description 1
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 1
- 125000002943 quinolinyl group Chemical group N1=C(C=CC2=CC=CC=C12)* 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 229960004889 salicylic acid Drugs 0.000 description 1
- 125000002914 sec-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 1
- 235000002906 tartaric acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011975 tartaric acid Substances 0.000 description 1
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 125000003831 tetrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001113 thiadiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229960000707 tobramycin Drugs 0.000 description 1
- NLVFBUXFDBBNBW-PBSUHMDJSA-N tobramycin Chemical compound N[C@@H]1C[C@H](O)[C@@H](CN)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](N)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N NLVFBUXFDBBNBW-PBSUHMDJSA-N 0.000 description 1
- YFTHZRPMJXBUME-UHFFFAOYSA-N tripropylamine Chemical compound CCCN(CCC)CCC YFTHZRPMJXBUME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003313 weakening effect Effects 0.000 description 1
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
Landscapes
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
本发明涉及D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备新德里金属-β-内酰胺酶1(NDM-1)抑制剂中的用途。具体地,本发明涉及通式I的化合物在制备用于预防和/或治疗感染性疾病的药物和制备NDM-1抑制剂中的用途。
Description
技术领域
本发明涉及D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备用于预防和/或治疗感染性疾病的药物中的用途。本发明进一步涉及D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备NDM-1抑制剂中的用途。
背景技术
2010年8月11日,医学杂志《柳叶刀》报导,南亚出现了一种特殊的肠杆菌科细菌,对几乎对所有抗生素都有耐药性[1],被称为“超级细菌”。该细菌的质粒上携带有blaNDM-1基因,其能够表达一种β-内酰胺酶,几乎可以水解所有临床应用的抗生素。因为首个病例在印度新德里被发现,所以这种内酰胺酶称为新德里金属-β-内酰胺酶1(New Delhi metallo-β-lactamase1,NDM-1)。实际上,还有人报道了一些表达NDM-1的细菌或由其导致的病例。例如,2010年3月,在印度孟买发现了22株NDM-1细菌[3];2010年5月,英国发现NDM-1大肠埃希氏菌的感染病例[4];2010年8月,在美国安大略州发现首例NDM-1肺炎克雷伯氏菌的感染病例[5];以及在2010年10月,澳大利亚也发现NDM-1大肠埃希氏菌的感染病例[6]。目前,世界上已有近三百例NDM-1病菌感染,广泛分布在世界各地,并且新感染的病例数目正在不断上升[1,7-13]。
blaNDM-1基因位于质粒上,可以在不同菌种之间转移,从而会使得其他菌种也具有耐药性。携带这样的NDM-1基因的菌株主要有大肠埃希氏菌、肺炎克雷伯氏菌和阴沟肠杆菌,但在变形杆菌、鲍曼不动杆菌、产酸克雷伯菌、普罗威登菌、弗劳地枸橼酸杆菌、屎肠球菌和摩根摩根菌等细菌中也检出过NDM-1的表达[1-3,9-12]。表达NMD-1的细菌对临床上常用的绝大多数抗生素均有耐药性,例如亚胺培南、美罗培南、哌拉西林/他唑巴坦、头孢噻肟、头孢他啶、头孢吡咯、氨曲南、环丙沙星、庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星、米诺环素等[1,2,9]。
目前尚无针对NDM-1的有效药物的报道,因此亟需能够针对NDM-1活性的抑制剂或药物以预防或治疗由表达这种酶的病原体如细菌引起的感染性疾病。
发明内容
在第一方面,本发明涉及通式I的化合物或其药学可接受的盐在制备用于预防和/或治疗感染性疾病的药物中的用途,
其中,
R1选自以下组中:C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、-C1-C6烷基苯基、-C1-C6烷氧基苯基、苯氧基、萘基、含有1、2或3个独立地选自N、O或S的杂原子的单环或二环杂芳基、以及含有1、2或3个独立地选自N、O或S的杂原子的5元或6元杂环基,所述烷基、烷氧基、苯氧基、萘基、苯基、杂芳基和杂环基各自任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代;并且
R2选自以下组中:H和C1-C6烷基。
在优选的实施方案中,本发明通式I的化合物的R1选自以下组中:
和
在优选的实施方案中,R2选自以下组中:H和-CH3。
在优选的实施方案中,R1为含有1个独立地选自N、O或S的杂原子的二环杂芳基,例如吲哚基(如,1H-吲哚基)或异吲哚基;并且R2为H或C1-C6烷基。
在优选的实施方案中,R1为-C1-C6烷氧基苯基,例如苄氧基;并且R2为H或C1-C6烷基。
在优选的实施方案中,R1为C1-C6烷氧基,例如丁氧基(如,叔丁氧基);并且R2为H或C1-C6烷基。
在一优选实施方案中,所述通式I的化合物为(R)-2-((S)-2-(1H-吲哚-2-甲酰胺)-4-巯基丁酰胺)-3-苯基丙酸。
在另一优选实施方案中,所述通式I的化合物为(R)-2-((S)-2-((苄氧基)羰基)氨基)丁酰胺-4-巯基)-3-苯基丙酸。
在另一优选实施方案中,所述通式I的化合物为(R)-2-((S)-2-((叔丁氧基羰基氨基)-4-巯基丁酰胺)-3-苯丙酸甲酯。
在另一实施方案中,所述感染性疾病由表达NDM-1的病原体如细菌引起。
在第二方面,本发明涉及通式I的化合物或其药学可接受的盐在制备用作NDM-1抑制剂的药物中的用途,
其中,
R1选自以下组中:C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、-C1-C6烷基苯基、-C1-C6烷氧基苯基、苯氧基、萘基、含有1、2或3个独立地选自N、O或S的杂原子的单环或二环杂芳基、以及含有1、2或3个独立地选自N、O或S的杂原子的5元或6元杂环基,所述烷基、烷氧基、苯氧基、萘基、苯基、杂芳基和杂环基各自任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代;并且
R2选自以下组中:H和C1-C6烷基。
在优选的实施方案中,本发明通式I的化合物的R1选自以下组中:
和
在优选的实施方案中,R2选自以下组中:H和-CH3。
在优选的实施方案中,R1为含有1个独立地选自N、O或S的杂原子的二环杂芳基,例如吲哚基(如,1H-吲哚基)或异吲哚基;并且R2为H或C1-C6烷基。
在优选的实施方案中,R1为-C1-C6烷氧基苯基,例如苄氧基;并且R2为H或C1-C6烷基。
在优选的实施方案中,R1为C1-C6烷氧基,例如丁氧基(如,叔丁氧基);并且R2为H或C1-C6烷基。
在一优选实施方案中,所述通式I的化合物为(R)-2-((S)-2-(1H-吲哚-2-甲酰胺)-4-巯基丁酰胺)-3-苯基丙酸。
在另一优选实施方案中,所述通式I的化合物为(R)-2-((S)-2-((苄氧基)羰基)氨基)丁酰胺-4-巯基)-3-苯基丙酸。
在另一优选实施方案中,所述通式I的化合物为(R)-2-((S)-2-((叔丁氧基羰基氨基)-4-巯基丁酰胺)-3-苯丙酸甲酯。
在第三方面,本发明还涉及一种药物组合物,其包含本发明的通式I的化合物和/或其药学可接受的盐,和/或本发明的抑制剂作为活性成分,以及和药学可接受的赋形剂。
在第四方面,本发明涉及一种预防和/或治疗预防和/或治疗感染性疾病的方法,所述方法包括向有需要的个体给予本发明的通式I的化合物或其药学可接受的盐、本发明的NDM-1抑制剂或本发明的药物组合物。在一实施方案中,所述感染性疾病由表达NDM-1的病原体如细菌引起。
附图说明
图1为(R)-2-((S)-2-(1H-吲哚-2-甲酰胺)-4-巯基丁酰胺)-3-苯基丙酸抑制NDM-1的IC50曲线图。
图2为(R)-2-((S)-2-((苄氧基)羰基)氨基)丁酰胺-4-巯基)-3-苯基丙酸抑制NDM-1的IC50曲线图。
图3为(R)-2-((S)-2-((叔丁氧基羰基氨基)-4-巯基丁酰胺)-3-苯丙酸甲酯抑制NDM-1的IC50曲线图。
具体实施方式
下面对本发明的各个方面和特点作进一步的描述。
本发明使用的各种术语和短语具有本领域技术人员公知的一般含义,当提及的术语和短语如有与公知含义不一致时,以本文中所列的含义为准。本文所用的缩略语通常为本领域技术人员所熟知的,或者可以是根据基础知识易于理解的。
本文所用的缩略语及其含义如下所示:
NDM-1 新德里金属β-内酰胺酶-1
HEPES 4-羟乙基哌嗪乙磺酸
DMSO 二甲基亚砜
ddH2O 双蒸水
EP管 Eppendorf微量离心管
BSA 小牛血清蛋白
IC50 半数抑制浓度
除非另外指明,本发明中所用的比例、百分比或浓度均为重量比或基于重量比。
本文所用的术语“C1-C6烷基”指具有1-6个(包括1、2、3、4、5或6个)、优选1-4个碳原子(C1-C4烷基)、更优选1-3个碳原子(C1-C3烷基)碳原子的直链或支化的饱和烷基,其实例包括但不限于甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基和己基等。所述“C1-C6烷基”可以任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代。
本文所用的术语“C1-C6烷氧基”指“C1-C6烷基-O-”基团,其通过氧原子连接至分子的其他部分,并且其中“C1-C6烷基”如上文所述。其实例包括但不限于甲氧基、乙氧基、丙氧基、异丙氧基、丁氧基、异丁氧基、叔丁氧基、己氧基等。所述“C1-C6烷氧基”可以任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代。
本文所用的术语“-C1-C6烷氧基苯基”指与苯环连接的上文所述的“C1-C6烷氧基”,并且通过所述烷氧基部分(经由-O-)连接至分子的其他部分。其实例包括但不限于苄氧基、苯乙基氧基等。所述“-C1-C6烷氧基苯基”可以任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代,所述取代基可以位于其中的“C1-C6烷氧基”上,也可以位于“苯基”上。
本文所用的术语“-C1-C6烷基苯基”指与苯环连接的上文所述的“C1-C6烷基”,并且通过所述烷基部分连接至分子的其他部分。其实例包括但不限于苯甲基和苯乙基等。所述“-C1-C6烷基苯基”可以任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代,所述取代基可以位于其中的“C1-C6烷基”上,也可以位于“苯基”上。
本文所用的术语“杂芳基”指包含5-14个环原子、优选5-10个(例如5、6、7、8、9、10个)环原子的单环或双环芳香基团,其包含1、2或3个选自O、S和N的杂原子。其实例包括但不限于吡啶基、咪唑基、苯基吡咯基、噻唑基、异噻唑基、噁二唑基、噻二唑基、吲唑基、吡嗪基、嘧啶基、哒嗪基、噁唑基、异噁唑基、三唑基、四唑基、吲哚基(如1H-吲哚基、异吲哚基)、苯并咪唑基、苯并噁唑基、苯并异噁唑基、苯并噻唑基、喹啉基、异喹啉基、吡咯基、嘌呤基、咔唑基、吖啶基、嘧啶基和吡唑基等,并包括这些基团的所有异构形式。所述“杂芳基”可以任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代。
本文所用的术语“杂环基”指包含5个或6个环原子的非芳香杂环基团,其可以包含1、2或3个、优选1或2个选自N、O、S的杂原子。所述“杂环基”可以任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代。
本文所用的术语“药学上可接受的盐”是指保持化合物的生物学有效性和性质的盐,且其不是生物学或其它方面上不利的。药学上可接受的酸加成盐可以通过无机酸和有机酸来形成。可以衍生得到盐的无机酸包括如盐酸、氢溴酸、硫酸、硝酸、磷酸等。可以衍生得到盐的有机酸包括如乙酸、丙酸、乙醇酸、丙酮酸、草酸、马来酸、丙二酸、琥珀酸、富马酸、酒石酸、柠檬酸、苯甲酸、肉桂酸、扁桃酸、甲烷磺酸、乙烷磺酸、对甲苯磺酸、水杨酸等。药学上可接受的碱加成盐可以通过无机和有机碱来形成。可以衍生得到盐的无机碱包括如钠、钾、锂、铵、钙、镁、铁、锌、铜、锰、铝的氢氧化物等。可以衍生得到盐的有机碱包括如伯、仲和叔胺、取代的胺(其包括天然存在的取代的胺)、环胺等,如异丙基胺、三甲基胺、二乙基胺、三乙基胺、三丙基胺和乙醇胺等。
本文所用的术语“药学可接受的赋形剂”涵盖各种药学可接受辅料,如填充剂、崩解剂、粘合剂、润湿剂、润滑剂、助流剂、致孔剂、骨架材料和包衣剂等。
本文所用的术语“任选(地)”指可以存在或不存在。例如,当指某基团可以任选地被取代时,其可以是未取代的,也可以被指定的取代基以任何合适的方式取代。
活性测试方法
本发明的活性测试方法以亚胺培南一水合物(Imipenem monohydrate)作为NDM-1的底物进行活性检测。
底物亚胺培南一水合物的母核部分具有O=C-N-C=C共轭结构,从而可以产生紫外吸收。由于NDM-1可以水解β-内酰胺环酰胺键,因此NDM-1与底物反应时可以水解底物的酰胺键,从而破坏共轭结构,使紫外吸收减弱或消失。通过对比NDM-1与底物反应前后的全波长扫描紫外吸收光谱图,发现底物在300nm处有最强紫外吸收。如果化合物对NDM-1具有抑制作用,其会阻止NDM-1对底物的水解,从而导致底物的紫外吸收值降低减慢。
本发明的活性测试方法包括以下6个步骤:
步骤1:NDM-1底物储备液的制备
将亚胺培南一水合物(购自Sigma公司)溶于50mM HEPES(购自BioBasic公司),配制成10mM的底物储备液备用。
步骤2:化合物的处理
将化合物溶于95%DMSO+5%ddH2O,配制成100mM浓度的溶液,然后将配制好的化合物溶液放置在1.5mL EP管中,于4℃下保存备用。
步骤3:NDM-1蛋白缓冲液的配制
将NDM-1(由本实验室MDC蛋白纯化组提供,制备方法参见Yu Guo,Jing Wang等,A structural view of the antibiotic degradation enzyme NDM-1form a superbug.Protein&Cell,2011,2(5):384-394)溶于蛋白缓冲液(pH=6.8,含有50mM HEPES、5μM ZnCl2(购于BioBasic公司)、10μg/mLBSA(购自上海生工工程有限公司)),配制成50nM的NDM-1蛋白缓冲液。步骤4:NDM-1药筛酶活体系的建立
NDM-1药筛酶活体系中包含的成分见表1。
表1NDM-1的药筛酶活体系
体系 | 体积 | 浓度 |
NDM-1 | 100μL | 50nM |
底物 | 50μL | 600μM |
化合物 | 2μL | 100mM |
总计 | 152μL |
在检测体系的阴性对照体系中加入2μL95%DMSO代替化合物,用于检测NDM-1的活性。
步骤5:化合物的初步筛选
向96微孔板中的每孔中加入100μL50nM的NDM-1蛋白缓冲液。然后向每孔中加入2μL100mM的相应化合物溶液。振荡,室温下孵育1分钟后,向每孔加入50μL600μM的底物进行反应。每隔8秒用光谱扫描多功能读数仪(Varioskan Flash,Thermo scientific)检测一次,共测20次。
绘制曲线:取阴性对照曲线斜率的最大处值为V0,化合物曲线斜率的最大处值为Vi,则NDM-1的剩余活性分数=Vi/V0。剩余活性越低,表示化合物对NDM-1的活性抑制越强。当NDM-1的剩余活性分数在0.2以内时,将进一步测定该化合物的IC50值。
步骤6:化合物的IC50值的测定
将原始浓度为100mM的化合物溶液用95%DMSO按1:2(体积比)的比例进行等比稀释,共稀释11个浓度梯度。最终浓度依次为1316、658、329、164.5、82.2、41.1、20.6、10.3、5.1、2.6和1.3μM。接着进行化合物的IC50值检测,向96微孔板中的每孔中加入100μL50nM的NDM-1蛋白缓冲液。然后向每孔中加入2μL如上配制11个浓度的各化合物溶液。振荡,室温下孵育1分钟后,向每孔加入50μL600μM的底物进行反应。每隔8秒用光谱扫描多功能读数仪(Varioskan Flash,Thermo scientific)检测一次,共测20次。然后以化合物浓度对数为横坐标,NDM-1的剩余活性为纵坐标绘制曲线。根据曲线,采用GraphPad Prism version5.0软件计算IC50值。
实施例1:(R)-2-((S)-2-(1H-吲哚-2-甲酰胺)-4-巯基丁酰胺)-3-苯基丙酸抑制NDM-1活性的测定
将上述结构表示的(R)-2-((S)-2-(1H-吲哚-2-甲酰胺)-4-巯基丁酰胺)-3-苯基丙酸(3mg,得自于天津国际生物医药联合研究院)溶于95%DMSO(70.6μL),配制成50mM的溶液,然后将该溶液放置在1.5mL EP管中,于4℃下保存。
然后按照上面活性测试方法步骤5(化合物的初步筛选)和步骤6(化合物的IC50值的测定)中所述的内容进行操作。以化合物的浓度对数为横坐标,NDM-1的剩余活性为纵坐标绘制曲线(见图1),根据曲线,采用GraphPadPrism version5.0软件计算,得到的IC50值为262.50±4.12μM。
实施例2:(R)-2-((S)-2-((苄氧基)羰基)氨基)丁酰胺-4-巯基)-3-苯基丙酸抑制NDM-1活性的测定
将上述结构表示的(R)-2-((S)-2-((苄氧基)羰基)氨基)丁酰胺-4-巯基)-3-苯基丙酸(3mg,得自于天津国际生物医药联合研究院)溶于95%DMSO(72.1μL),配制成100mM浓度的溶液,然后将该溶液放置在1.5mL EP管中,于4℃下保存。
然后按照上面活性测试方法步骤5(化合物的初步筛选)和步骤6(化合物的IC50值的测定)中所述的内容进行操作。以化合物的浓度对数为横坐标,NDM-1的剩余活性为纵坐标绘制曲线(见图2)。根据该曲线,采用GraphPadPrism version5.0软件计算,得到的IC50值为126.50±9.57μM。
实施例3:(R)-2-((S)-2-((叔丁氧基羰基氨基)-4-巯基丁酰胺)-3-苯丙酸甲酯抑制NDM-1活性的测定
将上述结构表示的(R)-2-((S)-2-((叔丁氧基羰基氨基)-4-巯基丁酰胺)-3-苯丙酸甲酯(3mg,得自于天津国际生物医药联合研究院)溶于95%DMSO(75.7μL),配制成100mM浓度的溶液,然后将该溶液放置在1.5mL EP管中,于4℃下保存。
然后按照上面活性测试方法步骤5(化合物的初步筛选)和步骤6(化合物的IC50值的测定)中所述的内容进行操作。以化合物的浓度对数为横坐标,NDM-1的剩余活性为纵坐标绘制曲线(见图3)。根据该曲线,采用GraphPadPrism version5.0软件计算,得到的IC50值为9.14±0.86μM。
以上实验证实,本发明通式I的化合物对NDM-1具有显著抑制活性,从而可以减少甚至消除NDM-1对底物的水解,因此可以用于抑制NDM-1,并且可以用于预防和/或治疗由表达NDM-1的病原体如细菌引起的感染性疾病。
此外,本领域普通技术人员应当理解,将本发明化合物与其他抗生素药物联合应用,可以进一步地可以提高抗生素疗效,从而治疗由NDM-1引起的多药耐药细菌感染。
上文描述了本发明的一些优选实施方案。应该理解,尽管本文为了说明的目的已经描述了本发明的具体实施方案,但在不背离本发明精神和范围的情况下可以进行各种修改。因此,本发明只受所附权利要求书的限制。可以根据本公开进行和执行本文公开和要求保护的所有实施方案而无需进行过度的实验。
参考文献
[1]Kumarasamy KK,Toleman MA,Walsh TR,et al.Emergence of anew antibiotic resistance mechanism in India,Pakistan,and the UK:amolecular,biological and epidemiological study[J].Lancet Infect Dis,2010,10(9):597-602.
[2]Yong D,Toleman MA,Giske CG,et al.Characterization of a newmetallo-β-lactamase gene,blaNDM-1,and a novel erythromycin esterase genecarried on a unique genetic structure in Klebsiella pneumonia sequence type14from India[J].Antimicrob Agents Chemother,2009,53(12):5046-5054.
[3]Deshpande P,Rodrigues C,Shetty A,et al.New DelhiMetallo-beta-lactamase(NDM-1)in Enterobacteriaceae:treatment options withcarbapenems compromised[J].J Assoc Physicians India,2010,58:147-149.
[4]Muir A,Weinbren MJ.New Delhi metallo-β-lactamase:a cautionarytale[J].J Hosp Infect,2010,75(3):239-240.
[5]Tijet N,Alexander DC,Richardson D,et al.New Delhimetallo-beta-lactamase,Ontario,Canada[J].Emerg Infect Dis,2011,17(2):306-307.
[6]Poirel L,Lagrutta E,Taylor P,et al.Emergence ofMetallo-β-lactamase NDM-1Producing Multidrug-Resistant Escherichia coli inAustralia[J].Antimicrob Agents Chemother,2010,54(11):4914-4916.
[7]Pfeifer Y,Witte W,Holfelder M,et al.NDM-1ProducingEscherichia coli in Germany[J].Antimicrob Agents Chemother,2011,55(3):1318-1319.
[8]Poirel L,Revathi G,Bernabeu S,et al.Detection ofNDM-1-producing Klebsiella pneumonia in Kenya[J].Antimicrob AgentsChemother,2011,55(2):934-936.
[9]Struelens MJ,Monnet DL,Magiorakos AP,et al.The EuropeanNDM-1Survey Participant.New Delhi metallo-beta-lactamase1-producingEnterobacteriaceae:emergence and response in Europe[J/OL].Euro Surveill,2010[2010-04-09]http://www.eurosurveillance.org/ViewArticle.aspx?ArticleId=19716.
[10]Zarfel G,Hoenigl M,Leiner E,et al.Emergence of new delhimetallo-β-lactamase,Austria[J].Emerg Infect Dis,2011,17(1):1699-1701.
[11]Rolain JM,Parola P,Cornaglia G.New Delhimetallo-β-lactamase(NDM-1):towards a new pandemia?[J].Clin MicrobiolInfect.2010,16(12):1699-1701.
[12]Karthikeyan K,thirunarayan MA,Krishnan P.Coexistence ofblaOXA-23with blaNDM-1and armA in clinical isolates of Acinetobacterbaumannii from India[J].J Antimicrob Chemother,2010,65(10):2253-2254.
[13]Poirel L,Ros A,Carricajo A,et al.Extremely Drug-ResistantCitrobacter freundii Isolate Producing NDM-1and Other CarbapenemasesIdentified in a Patient Returning from India[J].Antimicrob,Agents Chemother,2011,55(1):447-448.
Claims (11)
1.通式I的化合物或其药学可接受的盐在制备用于预防和/或治疗感染性疾病的药物中的用途,
其中,
R1选自以下组中:C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、-C1-C6烷基苯基、-C1-C6烷氧基苯基、苯氧基、萘基、含有1、2或3个独立地选自N、O或S的杂原子的单环或二环杂芳基、以及含有1、2或3个独立地选自N、O或S的杂原子的5元或6元杂环基,所述烷基、烷氧基、苯氧基、萘基、苯基、杂芳基和杂环基各自任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代;并且
R2选自以下组中:H和C1-C6烷基。
2.如权利要求1所述的用途,其中R1为含有1个独立地选自N、O或S的杂原子的二环杂芳基,例如1H-吲哚基或异吲哚基;并且R2为H或C1-C6烷基。
3.如权利要求1所述的用途,其中R1为-C1-C6烷氧基苯基,例如苄氧基;并且R2为H或C1-C6烷基。
4.如权利要求1所述的用途,其中R1为C1-C6烷氧基,例如叔丁氧基;并且R2为H或C1-C6烷基。
5.如权利要求1-4中任一项所述的用途,其中所述化合物选自(R)-2-((S)-2-(1H-吲哚-2-甲酰胺)-4-巯基丁酰胺)-3-苯基丙酸、(R)-2-((S)-2-((苄氧基)羰基)氨基)丁酰胺-4-巯基)-3-苯基丙酸和(R)-2-((S)-2-((叔丁氧基羰基氨基)-4-巯基丁酰胺)-3-苯丙酸甲酯。
6.如权利要求1-5中任一项所述的用途,其中所述感染性疾病由表达NDM-1的细菌引起。
7.通式I的化合物或其药学可接受的盐在制备用作NDM-1抑制剂的药物中的用途,
其中,
R1选自以下组中:C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、-C1-C6烷基苯基、-C1-C6烷氧基苯基、苯氧基、萘基、含有1、2或3个独立地选自N、O或S的杂原子的单环或二环杂芳基、以及含有1、2或3个独立地选自N、O或S的杂原子的5元或6元杂环基,所述烷基、烷氧基、苯氧基、萘基、苯基、杂芳基和杂环基各自任选地被选自羟基、氨基、羧基、硝基和C1-C6烷基的取代基取代;并且
R2选自以下组中:H和C1-C6烷基。
8.如权利要求7所述的用途,其中R1为含有1个独立地选自N、O或S的杂原子的二环杂芳基,例如1H-吲哚基或异吲哚基;并且R2为H或C1-C6烷基。
9.如权利要求7所述的用途,其中R1为-C1-C6烷氧基苯基,例如苄氧基;并且R2为H或C1-C6烷基。
10.如权利要求7所述的用途,其中R1为C1-C6烷氧基,例如叔丁氧基;并且R2为H或C1-C6烷基。
11.如权利要求7-10中任一项所述的用途,其中所述化合物选自(R)-2-((S)-2-(1H-吲哚-2-甲酰胺)-4-巯基丁酰胺)-3-苯基丙酸、(R)-2-((S)-2-((苄氧基)羰基)氨基)丁酰胺-4-巯基)-3-苯基丙酸和(R)-2-((S)-2-((叔丁氧基羰基氨基)-4-巯基丁酰胺)-3-苯丙酸甲酯。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201310168921.4A CN104138594B (zh) | 2013-05-06 | 2013-05-06 | D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备新德里金属-β-内酰胺酶1抑制剂中的用途 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201310168921.4A CN104138594B (zh) | 2013-05-06 | 2013-05-06 | D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备新德里金属-β-内酰胺酶1抑制剂中的用途 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN104138594A true CN104138594A (zh) | 2014-11-12 |
CN104138594B CN104138594B (zh) | 2020-08-14 |
Family
ID=51848044
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201310168921.4A Expired - Fee Related CN104138594B (zh) | 2013-05-06 | 2013-05-06 | D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备新德里金属-β-内酰胺酶1抑制剂中的用途 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN104138594B (zh) |
Cited By (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN107903302A (zh) * | 2017-11-22 | 2018-04-13 | 韶远科技(上海)有限公司 | 一种γ‑内酰胺桥联二肽类化合物的制备方法 |
JP2018535273A (ja) * | 2015-11-30 | 2018-11-29 | オックスフォード・ユニバーシティ・イノベイション・リミテッド | メタロ−ベータ−ラクタマーゼの阻害剤 |
CN112830884A (zh) * | 2019-11-22 | 2021-05-25 | 深圳市高盈医药科技开发有限公司 | 一种丹参素衍生物及其制备方法及其医药用途 |
WO2021255156A1 (fr) * | 2020-06-18 | 2021-12-23 | Universite Paris-Saclay | Nouveaux composés dipeptidiques, leur procédé de fabrication et une nouvelle application thérapeutique de composés dipeptidiques |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20100256092A1 (en) * | 2008-05-12 | 2010-10-07 | Anacor Pharmaceuticals, Inc. | Boron-containing small molecules |
CN101875704A (zh) * | 2010-06-25 | 2010-11-03 | 浙江工业大学 | 水溶性壳聚糖西弗碱衍生物及其制备和应用 |
-
2013
- 2013-05-06 CN CN201310168921.4A patent/CN104138594B/zh not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20100256092A1 (en) * | 2008-05-12 | 2010-10-07 | Anacor Pharmaceuticals, Inc. | Boron-containing small molecules |
CN101875704A (zh) * | 2010-06-25 | 2010-11-03 | 浙江工业大学 | 水溶性壳聚糖西弗碱衍生物及其制备和应用 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
高会洲等: "超级细菌耐药靶酶金属β-内酰胺酶的研究进展", 《中国药学杂志》 * |
Cited By (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2018535273A (ja) * | 2015-11-30 | 2018-11-29 | オックスフォード・ユニバーシティ・イノベイション・リミテッド | メタロ−ベータ−ラクタマーゼの阻害剤 |
US11439622B2 (en) | 2015-11-30 | 2022-09-13 | Oxford University Innovation Limited | Inhibitors of metallo-beta-lactamases |
JP7176953B2 (ja) | 2015-11-30 | 2022-11-22 | オックスフォード・ユニバーシティ・イノベイション・リミテッド | メタロ-ベータ-ラクタマーゼの阻害剤 |
CN107903302A (zh) * | 2017-11-22 | 2018-04-13 | 韶远科技(上海)有限公司 | 一种γ‑内酰胺桥联二肽类化合物的制备方法 |
CN107903302B (zh) * | 2017-11-22 | 2021-05-14 | 韶远科技(上海)有限公司 | 一种γ-内酰胺桥联二肽类化合物的制备方法 |
CN112830884A (zh) * | 2019-11-22 | 2021-05-25 | 深圳市高盈医药科技开发有限公司 | 一种丹参素衍生物及其制备方法及其医药用途 |
WO2021255156A1 (fr) * | 2020-06-18 | 2021-12-23 | Universite Paris-Saclay | Nouveaux composés dipeptidiques, leur procédé de fabrication et une nouvelle application thérapeutique de composés dipeptidiques |
FR3111544A1 (fr) * | 2020-06-18 | 2021-12-24 | Universite Paris-Saclay | Nouveaux composés dipeptidiques, leur procédé de fabrication et une nouvelle application thérapeutique de composés dipeptidiques. |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN104138594B (zh) | 2020-08-14 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN104138594B (zh) | D-同型半胱氨酰-L-苯丙氨酸类二肽衍生物在制备新德里金属-β-内酰胺酶1抑制剂中的用途 | |
JP6870029B2 (ja) | セフトロザン抗生物質組成物 | |
CN102762200B (zh) | 作为抗微生物剂的增强剂的查尔酮 | |
US10064858B2 (en) | Methods and compositions for treating bacterial infections with iron chelators | |
WO2006076009A2 (en) | Transcription factor modulating compounds and methods of use thereof | |
US9540389B2 (en) | Antimicrobial potentiators | |
JP2014504279A (ja) | 化合物及びその使用 | |
JP2018154654A (ja) | メタロβラクタマーゼの阻害剤 | |
JP2009541332A (ja) | 転写因子調節化合物およびその使用法 | |
WO2010124097A2 (en) | Transcription factor modulating compounds and methods of use thereof | |
EP2969003A1 (en) | Methods and compositions for bacteria infections | |
KR102135648B1 (ko) | 항독성 또는 항병원성 활성을 갖는 레오이딘 화합물 및 이의 용도 | |
US9282738B2 (en) | Antimicrobial compositions and methods of use thereof | |
JP2021525105A (ja) | 標的細菌を死滅させるための方法および組成物 | |
CA2954653C (en) | N-(hydrophobe-substituted)vancosaminyl [.psi.[c(=nh)nh]tpg4]vancomycin and [.psi.[ch2nh]tpg4]vancomycin | |
US20140323457A1 (en) | Beta-o/s/n fatty acid based compounds as antibacterial and antiprotozoal agents | |
US20150328198A1 (en) | Methods of treating methicillin-resistant staphylococcus aureus (mrsa) using ppar-gamma agonists | |
CN111808090B (zh) | 一种新德里金属-β-内酰胺酶-1抑制剂 | |
CN111808093B (zh) | 一种新德里金属-β-内酰胺酶-1抑制剂 | |
TW202233832A (zh) | 針對假單胞菌屬之包含crispr-cas系統的噬菌體組合物及其使用方法 | |
KR102168398B1 (ko) | 3',4'-디플루오로케르세틴 및 그 유도체에 의한 항생제 내성 억제 효능 | |
US20170348253A1 (en) | Treatment of Drug-Resistant Microbial Infections | |
AU2012227269A1 (en) | Transcription factor modulating compounds and methods of use thereof | |
US20240307369A1 (en) | Exo VII Inhibitor and Quinolone Antibiotic Combination Useful for Treating Bacterial Infection | |
CN115414342B (zh) | 芬布芬在制备杀灭革兰氏阴性菌药物中的应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee | ||
CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20200814 Termination date: 20210506 |