附图说明
图1、pGEX系列载体的图谱。
图2、实施例2所示目的蛋白诱导表达的10%SDS-PAGE实验结果。各泳道分别为:1:SpA(55KD);M:蛋白中蛋白质分子量标准(170、130、100、70、55、40、35、25、15)KD;2:SpA5wt(33KD);3:SpA5ref(KKAA,33KD);4:SpA5(KKAA,33KD);5:SpA5(KKVV,33KD);6:SpA5(RRAA,33KD);7:SpA5(RRVV,33KD)。
图3、SpA5工程菌在四种培养基中的生长曲线。
图4、SpA5在M9和TB培养基中的表达情况;其中,1:蛋白质分子量标准;2:M9培养基中表达情况;3:TB培养基中的表达情况。
图5、不同IPTG浓度对SpA5蛋白表达的影响;1:蛋白质分子量标准;2:0.1mM;3:0.2mM;4:0.5mM;5:1mM。
图6、不同接种量在诱导以前细菌生长曲线。
图7、SpA5基因工程菌不同接种量对蛋白表达的影响;1:蛋白质分子量标准;2:5%;3:10%;4:15%。
图8、不同氧浓度下SpA5工程菌生长曲线。
图9、PO2不同浓度时,SpA5蛋白的表达情况;1:蛋白质分子量标准;2:25%;3:45%;4:65%。
图10、不同浓度的甘油对SpA5蛋白表达的影响;1:蛋白质分子量标准;2:5ml/L;3:10ml/L;4:15ml/L。
图11、在不同诱导温度和时间时目的蛋白表达的情况;1:蛋白质分子量标准;2:诱导0h;3:诱导2h;4:诱导4h;5:诱导6h;6:诱导8h;7:诱导10h。
图12、25L SpA5工程菌发酵生长曲线。
图13、25L SpA5工程菌发酵时SpA5蛋白表达情况;1:蛋白质分子量标准;2:诱导0h;3:诱导1h;4:诱导2h;5:诱导3h;6:诱导4h;7:诱导5h。
图14、GST-琼脂糖凝胶4B纯化目的蛋白的结果:M:蛋白质分子量标准;1:结合于填料上的GST-SpA5融合蛋白;2:流穿;3:酶切洗脱后残存于填料上的SpA5及GST;4:酶切洗脱后的目的蛋白SpA5。
图15、SP HP层析纯化SpA5蛋白色谱图,出现两个洗脱峰:第一峰与第二峰。
图16、SP HP层析纯化SpA5蛋白电泳图;M:蛋白质分子量标准;1:样品;2:流穿;3:第一峰;4:第二峰(1M NaCl洗脱)。
图17、MMC层析纯化SpA5蛋白色谱图。
图18、MMC层析纯化SpA5蛋白电泳图;M:蛋白质分子量标准;1:进样样品;2:流穿样品;3:30%B液洗脱样品;4:100%B液洗脱样品。
图19、Phenyl HP层析纯化SpA5蛋白色谱图。
图20、Phenyl HP层析纯化SpA5蛋白电泳图;M:蛋白质分子量标准;1:洗脱管A1;2:洗脱管A2;3:洗脱管A3;4:洗脱管A4;5:流穿样品。
图21、SP HP层析(样品电导4.755ms/cm)纯化SpA5蛋白色谱图。
图22、SP HP层析(样品电导4.755ms/cm)纯化SpA5蛋白电泳图;M:蛋白质分子量标准;1:样品;2:流穿;3:洗脱管1;4:洗脱管2;5:洗脱管3;6:洗脱管4。
图23、SP HP层析(样品电导11.622ms/cm)纯化SpA5蛋白色谱图。
图24、SP HP层析(样品电导11.622ms/cm)纯化SpA5蛋白电泳图;M:蛋白质分子量标准;1:流穿;2:F2。
图25、硫酸铵沉淀SpA5条件的选择;1:2M(NH4)2SO4沉淀;2:2M(NH4)2SO4上清;3:1.6M(NH4)2SO4上清;4:1.6M(NH4)2SO4沉淀。
图26、SpA突变体精纯化结果;M:蛋白质分子量标准;1:SpA;2:SpA5ref(KKAA);3:SpA5(KKAA);4:SpA5(KKVV);5:SpA5(RRAA);6:SpA5(RRVV)。
图27、放大后SP HP层析(批次Ⅰ)纯化SpA5蛋白色谱图。
图28、放大后Q HP层析(批次Ⅰ)纯化SpA5蛋白色谱图。
图29、放大后(批次Ⅰ)纯化SpA5蛋白电泳图;M:蛋白质分子量标准;1:纯化前样品;2:流穿样品;3:SP HP洗脱样品;4:(NH4)2SO4沉淀复溶样品;5:G25洗脱样品;6:Q HP流穿样品。
图30、放大后SP HP(批次Ⅱ)纯化SpA5蛋白色谱图。
图31、放大后Q HP(批次Ⅱ)纯化SpA5蛋白色谱图。
图32、放大后(批次Ⅱ)纯化SpA5蛋白电泳图;M:蛋白质分子量标准;1:纯化前样品;2:SP HP洗脱样品;3:(NH4)2SO4沉淀复溶样品;4:G25洗脱样品;5:Q HP流穿样品。
图33、放大后SP HP(批次Ⅲ)纯化SpA5蛋白色谱图。
图34、放大后Q HP(批次Ⅲ)纯化SpA5蛋白色谱图。
图35、放大后(批次Ⅲ)纯化SpA5蛋白电泳图;M:蛋白质分子量标准;1:纯化前样品;2:流穿样品;3:SP HP洗脱样品;4:G25洗脱样品;5:Q HP流穿样品。
图36、SpA5(KKAA)突变体HPLC检测结果;主峰保留时间13.282分;主峰面积比率98.2%。
图37、ELISA检测SpA及各SpA5蛋白与人IgG的结合能力(平均值±stdev,n=12)。
图38、酶切纯化后的F(ab)2片段;1:F(ab)2;M:蛋白分子量标准;2:抗体。
图39、ELISA检测各SpA5蛋白免疫家兔后产生的抗体F(ab)2片段对SpA与人IgG结合能力的降低情况(平均值±stdev,n=5)。
图40、免疫SpA及各SpA5蛋白后,小鼠脾B淋巴细胞凋亡诱导情况。
图41、磷酸铝吸附SpA5前后10%SDS-PAGE结果;1:吸附磷酸铝后离心上清:SpA5ref(KKAA);2:吸附磷酸铝后离心上清SpA5(KKAA);3:吸附磷酸铝后离心上清SpA5(RRVV);4:蛋白原液(以SpA5(KKAA)作对照)。
实施例
本部分实施例所使用的试剂、菌株等如下所示;中未明确标注生产商的化学试剂等为本领域常规化学或生物学商店均可以购买的。
1.菌株
金黄色葡萄球菌ATCC国际标准株MRSA-252由美国ATCC提供;
宿主菌株XL1-blue大肠杆菌为美国安捷伦公司产品。
2.质粒
质粒pGEX-6p-2为美国GE Healthcare公司产品。
3.试剂
primeSTAR HS DNA聚合酶、DNA分子量标准、限制性内切酶BamH I和Not I、蛋白分子量标准、DNA连接酶为大连TakaRa公司产品;
质粒提取试剂盒和凝胶回收试剂盒为美国Omega公司产品;
琼脂粉、吐温-20等其余试剂均为国内市场购买;
MH培养基:购自北京奥博星生物技术有限责任公司(牛肉粉2.0g 可溶性淀粉1.5g 酸水解酪蛋白17.5g),加水至1L,pH值7.4±0.2;
MH平板:MH培养基加入琼脂糖至终浓度为1.5g/100mL;
PBS(磷酸二氢钾(KH2PO4)0.2g(国产分析纯),磷酸氢二钠(Na2HPO4·12H2O)2.9g(国产分析纯),氯化钠(NaCl)8.0g(国产分析纯),氯化钾(KCl)0.2g,加水至1000mL,pH7.4);
20mM PB缓冲液:磷酸二氢钾(KH2PO4)0.2g,磷酸氢二钠(Na2HPO4·12H2O)2.9g,氯化钾(KCl)0.2g,加水至1000mL,pH7.0;
氨苄西林、卡那霉素(华北制药);
5×蛋白质上样缓冲液(250mM Tris-HCl(pH6.8)10%(W/V)SDS 0.5%(W/V)溴酚蓝50%(V/V)甘油5%(W/V)β-巯基乙醇);
谷胱甘肽琼脂糖凝胶4B(美国GE Healthcare公司);
磷酸铝佐剂:美国GENERAL CHEMICAL公司(20mg/ml);
疫苗蛋白稀释液(组氨酸(美国Merck公司,药用级)10mM、NaCl 0.9%(四川科伦,注射用生理盐水)、泊洛沙姆188(美国Merck公司,药用级)0.01%、pH6.0),无热原。
实施例1:序列合成
以MRSA252基因组(GI:49240382)为模板获得SpA碱基序列及氨基酸序列(SpA(252),SEQ ID NO.5),将其中的EDABC五个结构域(即SEQ ID NO.5的37aa-327aa,命名为SpA5(252))的碱基依据大肠杆菌偏好性在网站http://people.mbi.ucla.edu/sumchan/caltor.html上进行稀有密码子分析并优化,对每个结构域内的4个氨基酸进行点突变,合成编码SpA5(KKAA)、SpA5(RRAA)、SpA5(KKVV)、SpA5(RRVV)四种蛋白第6-296位氨基酸的核苷酸序列,以BamHI和NotI作为双酶切位点装载到表达载体pGEX-6P-2上,然后转化宿主菌XL-1Blue(由上海捷瑞生物技术有限公司直接完成)。四种SpA5蛋白对应的核苷酸序列分别见SEQ ID NO.9-12,其中核苷酸序列中第16-891位核苷酸为基于SpA5(252)的编码序列进行密码子优化的核苷酸序列。
以同样的方法,合成SpA5(252)的核苷酸序列,装载至表达载体并转化宿主菌。
为了便于与文献报道的SpA突变体比较,也按文献报道(Nontoxigenic protein A vaccine formethicillin-resistant Staphylococcus aureus infections in mice.Kim HK,Cheng AG,Kim HY,Missiakas DM,Schneewind O.J Exp Med.2010 Aug30;207(9):1863-70)的氨基酸序列SpA5ref合成了编码SpA5ref(KKAA)(SEQ ID NO.6)的第6-301位氨基酸的核苷酸序列,并用上述方法将核苷酸序列装载至表达载体pGEX-6P-2中,转化宿主菌。
在本实施例中,所有合成基因在插入BamHI位点后,转化至宿主菌,通过这些重组工程菌表达并用PP酶(美国GE公司)酶切(切后在其N端保留了载体的五个氨基酸GPLGS(SEQID NO.8)),将得到用于下列实验的蛋白:本发明的SpA5(KKAA)、SpA5(RRAA)、SpA5(RRVV)、SpA5(KKVV),对比蛋白SpA5wt(序列为SEQ ID NO.7,即SpA5(252)核苷酸序列在装载至pGEX-6P-2载体、转化至XL-1Blue菌表达并经PP酶酶切后的产物,比SpA5(252)的N端多了GPLGS五个氨基酸,)和SpA5ref(KKAA)。
实施例2:各蛋白在大肠杆菌中诱导表达、纯化及表达形式的鉴定
1)目的蛋白诱导表达
①取各重组工程菌培养液100μL,加入至10mL的氨苄西林浓度为100μg/mL的LB培养基中,80rpm37℃过夜培养。分别取过夜培养的菌液400μL加入至20mL的氨苄西林浓度为100μg/mL的LB培养基中,37℃培养2~3h,转速220rpm;二次活化至OD600nm为0.8-1.0时,加入IPTG,使其终浓度为200μM,再置于摇床30℃诱导表达3h,然后16℃过夜诱导表达。
②将诱导表达后的菌液取出,以10000rpm离心5min,弃去上清,加入1mL PBS混匀,超声(功率300瓦)裂解10min(工作6秒,休息9秒),然后4℃14000×g离心15min,分离上清和沉淀。
2)处理上清
上清结合:取谷胱甘肽琼脂糖凝胶4B(美国GE Healthcare公司)20μl,用PBS洗涤3次后,将准备好的上清加入至谷胱甘肽琼脂糖凝胶4B中,室温结合1h。在4℃下以14000rpm离心3min后,使用PBS-0.25%吐温20洗涤2次,PBS洗涤一次。
用PP酶(Prescission蛋白酶,美国GE公司)进行酶切洗脱:PP酶的使用按厂家推荐的方法进行。由于所使用的PP酶带有GST标签,以利于去除PP酶。酶切完成后,离心收集上清。取上清16μl,加入4μl5×蛋白质上样缓冲液,煮沸5min,14000rpm离心3min。
3)10%SDS-PAGE
电泳结果如图2所示。其中泳道1的SpA(252)(1.5μg)蛋白购自Invitrogen公司(美国)(REC PROTEIN A10-1100)。由图可知,目的蛋白已被顺利纯化。
实施例3、工程菌的发酵
1、发酵条件的确定
1)检测培养基对工程菌生长与目的蛋白表达的影响
通过实施例2所述的培养方法在摇瓶中测试四种培养基:
植物源性改良TB(磷酸二氢钾2.3g、十二水磷酸氢二钠13g、甘油5ml、酵母提取物24g、大豆蛋白胨12g、硫酸镁1g,加水至1L);
动物源性改良TB(磷酸二氢钾2.3g、十二水磷酸氢二钠13g、甘油5ml、酵母提取物24g、动物源胰蛋白胨12g、硫酸镁1g,加水至1L);
植物源性M9-CAA(磷酸氢二钠15.6g、磷酸二氢钾4.3g、氯化铵1g、硫酸镁1g、氯化钠0.67g、葡萄糖5g、大豆蛋白胨3.6g、植物源酵母粉4g、酸水解酪蛋白6g,加水至1L);
动物源性M9-CAA(磷酸氢二钠15.6g、磷酸二氢钾4.3g、氯化铵1g、硫酸镁1g、氯化钠0.67g、葡萄糖5g、动物胰蛋白胨3.6g、动物源酵母粉4g、酸水解酪蛋白6g,加水至1L)。
SpA5(KKAA)工程菌,接种于Amp+(100μg/mL)LB平板上,37℃孵育16~20h,挑取单菌落接种于10ml的Amp+LB培养基中,置于摇床中,37℃、200rpm摇到OD600大约2左右时,按1:100分别接种于100ml四种培养基中,37℃、200rpm摇14小时,每2小时取样测OD600,其结果见图3。
由图可知:植物源性培养基均差于动物源性,工程菌都是大约8h时就生长减缓,而在动物源性培养基中就长势很好,一直处于对数期,且TB好于M9,故选用动物源培养基(动物源性改良TB和M9-CAA以下简称TB、M9)。
将新鲜SpA5工程菌菌液(OD600大约2)按1:100分别接种于100mlTB和M9培养基中,37℃、200rpm摇至OD600=0.8左右,加入1mM IPTG,25℃诱导12h。将100ml菌液离心,弃上清,称重TB:2.4g、M9:1.5g。以1g:10ml加PBS超声(功率300瓦)裂解10min(工作6秒,休息9秒)破菌,结合GST4B(具体描述见实施例4),进行10%SDS-PAGE,结果如图4所示:
如图4所示:考察单位目的蛋白表达量,TB培养基好于M9培养基,且单位菌湿重TB大于M9,故SpA5工程菌发酵用基础培养基选用TB培养基。
2)IPTG浓度对目的蛋白表达的影响
考察不同终浓度的IPTG对目的蛋白表达水平的影响。将IPTG的终浓度分别设为0.1mM、0.2mM、0.5mM、1mM,对其进行比较选出最佳浓度。将新鲜SpA5工程菌菌液(OD600大约2)按1:100分别接种于四个100ml TB培养基中,37℃、200rpm摇至OD6000.8左右,分别加入IPTG,使其浓度分别对应上述四个浓度(一瓶一个浓度),25℃诱导12h。将四瓶菌液分别离心,弃上清,以1g:10ml加入PBS,超声(功率300瓦)裂解10min(工作6秒,休息9秒)破菌,结合GST4B,进行10%SDS-PAGE,结果如图5所示。
如图5所示:IPTG终浓度为0.2mM时蛋白表达明显好于0.1mM,与0.5mM、1mM时的蛋白表达基本相同,所以选择0.2mM为发酵用IPTG终浓度。
3)种子菌的不同接种量对工程菌的生长和目的蛋白表达的影响
研究5%、10%、15%三种不同种子菌接种量对发酵的影响,通过细菌生长曲线、单位蛋白表达量来确定最佳接种量。当种子菌OD600在2左右时,倒入发酵罐内开始计时,每1小时取样测OD600,直到诱导前结束,绘制工程菌前期生长期曲线(图6),可判断细菌生长速度快慢。诱导结束后取样后,按照之前方法处理,进行10%SDS-PAGE,判断单位目的蛋白表达量(图7)。
由图6可见,5%接种量细菌生长最慢而且最高OD600较另两种接种量低很多,而10%与15%接种量则相差不大。
由图7可见,不同接种量单位目的蛋白表达量不同,表达最好的是5%接种量,其次是10%,但相差不大,15%最差。
综上所述:5%接种量表达最好,但生长速度慢,最终细菌得率少;15%接种量生长速度快,但表达量最差;10%接种量的表达量与5%相差不多,而且生长速度也与15%相差不多,所以选择10%接种量作为发酵接种量。
4)氧浓度对工程菌生长和目的蛋白表达的影响
此工程菌是兼性需氧菌,氧浓度的高低对细菌生长影响很大,所以在发酵过程中对溶氧的控制就显得特别重要。本实验分别考察溶氧在25%、45%、65%时细菌的生长情况(图8)和目的蛋白表达量(图9)。
从细菌生长情况可知:45%溶氧条件下,细菌是长得最好的;从单位蛋白表达量来看,45%溶氧条件下,表达也是最好的,所以溶氧浓度选择45%。
5)甘油用量的确定
在不同菌量时诱导,会影响SpA5的表达量;而发酵时培养基中甘油的量会直接影响菌量的多少。当罐内甘油消耗完,细菌停止生长,在短时间内pH值和溶氧值迅速上升,此时应马上加IPTG开始诱导。所以甘油的多少直接决定诱导时机。通过研究5ml/L、10ml/L、15ml/L的甘油量对目的蛋白表达的影响和最终湿重得率来确定最佳诱导时机。
图10是三个不同甘油量对应的单位目的蛋白表达量,由图可知:5ml/L甘油浓度时,表达量最高;10ml/L其次,但相差不多;而15ml/L相差较大。但是在甘油浓度为5ml/L时,最后菌体湿重低很多;10ml/L与15ml/L相差不多,所以最终确定甘油量加10ml/L。
6)不同的诱导温度和时间对目的蛋白表达的影响
考察30℃、25℃、16℃三个不同诱导温度对蛋白表达的影响,以及达到最大表达量时所用的时间。在诱导后每2h取样,诱导10h,处理样品,进行10%SDS-PAGE,其结果如图11所示:
由电泳图可知:30℃时,单位诱导表达量是最高的,且达到最大表达所用时间是最短的,4h-6h之间的表达差异不大。而25℃、16℃时单位表达量就不如30℃,且表达时间长。故诱导温度和时间选用30℃、5h。
根据上述研究,最终确定了本发明的SpA5工程菌的优选发酵工艺:
(1)基础培养基选用动物源性TB培养基,其中甘油量是10ml/L;
(2)发酵开始时,种子菌的接种量的比例是10%;
(3)在发酵过程中溶氧浓度始终保持在45%左右;
(4)诱导时,温度调为30℃,IPTG浓度为0.2mM、诱导5h。
2、工程菌发酵工艺放大
按照上述的优化条件对发酵规模进行扩大(25L),并得到SpA5工程菌生长曲线(图12)和单位蛋白表达电泳图(图13)。
由图12可知,工艺放大后,整个生长曲线比较标准,前期细菌生长较快,后期诱导时曲线较平稳,最终获得菌密度(OD600)达48,单位菌湿重50g/L。
由图13可知,从单位目的蛋白表达看:表达量随时间的延长有明显增加,5h表达量最高。
综上所述:SpA5工程菌发酵工艺放大成功,完全符合预期结果。本发明的发酵工艺可适用于大范围的工业生产应用。
本实施例中使用的工程菌是SpA5(KKAA),其它工程菌的发酵工艺与本菌一样。
实施例4:SpA5蛋白的制备和纯化
1、破菌制备上清
将实施例1中构建的各重组工程菌发酵,离心收集菌体。将菌体200-500g与20mmol/L PB,pH7.0缓冲液按重量:体积比1:10比例混匀悬浮,4℃预冷。
高压匀浆:使用蒸馏水冲洗高压匀浆机(高压匀质机APV-1000,丹麦An Invernsys Group)管道,低温循环系统开启预冷至1-4℃备用。将预冷的悬浮菌液加入高压匀浆机,压力维持在60-80Mpa破菌3-5次,取破菌液涂片进行结晶紫染色,油镜下每个视野下未破碎菌小于2个视为破菌完全(破菌率大于90%)。
高速离心:破菌后的液体装入离心桶(Beckman,美国),4℃,10,000-15,000g离心15-30min,收集上清。
2、GST-琼脂糖凝胶4B亲和层析纯化
向每升上清中加入200ml GST填料,20~25℃时结合4h以上,结合过程采用垂直旋转或搅拌的方法以促进目标蛋白与GST填料的结合。将上述结合目标蛋白的GST填料采用PBS洗涤5个体积以除去未与GST填料结合的杂蛋白。然后按每100ml GST填料加入20ml的Prescission protease酶(PP酶),在20~25℃条件下酶切6小时后抽滤并收集滤液,获得酶切除GST标签后的目的蛋白,进行10%SDS-PAGE分析,结果如图14所示。图14所示的是SpA5(KKAA)蛋白的纯化结果图,其它SpA5蛋白的纯化结果与SpA5(KKAA)相似。
3、阳离子交换层析纯化
重组SpA5各突变体蛋白的理论等电点大于8。因此,首先选用了GE公司常见的阳离子交换层析填料SP HP(强阳离子交换)、MMC及Phenyl HP进行精纯化,再使用Q HP对精纯化后的SpA5去内毒素。层析精纯工艺包括:
(1)层析填料的选择
比较采用SP HP、MMC及Phenyl HP对SpA5蛋白的纯化效果。使用的样品为上述获得的SpA5粗纯化样品。
仪器系统:AKTA-expolrer100/Avant25液相色谱系统(GE)
层析填料:SP HP、MMC、Phenyl HP
柱规格:①(Φ)1.6cm×(H)2.5cm,②(Φ)2.6cm×(H)20cm,③(Φ)1.6cm×(H)2.5cm;
装柱体积:①③5ml×2、②54ml;
SP HP缓冲液:缓冲液A:20mM PB,pH7.5;缓冲液B:20mM PB+1M NaCl,pH7.5;
MMC缓冲液:缓冲液A:20mM Tris,pH8.0;缓冲液B:20mM Tris-HCl+1M NaCl,pH8.0;
Phenyl HP缓冲液:缓冲液A:20mM PB+1.5M(NH4)2SO4,pH6.0;缓冲液B:20mM PB,pH6.0;
上样样品:SpA5各突变体粗纯化样品分别调节至与纯化填料相对应缓冲液A一致的pH备用。
SP HP:上样流速:8ml/min,洗脱流速:8ml/min;
洗脱程序:0-30%缓冲液B,10个柱体积(CV);
MMC:上样流速:12ml/min,洗脱流速:12ml/min;
洗脱程序:0-30%缓冲液B,7个柱体积(CV);
Phenyl HP:上样流速:8ml/min,洗脱流速:8ml/min;
洗脱程序:0-100%缓冲液B,10个柱体积(CV)。
各洗脱程序中其余份额的缓冲液是对应的缓冲液A。
收集:将目的蛋白各步洗脱样品进行SDS-PAGE纯度分析,评价纯化效果。
图15-20是SpA5(KKAA)的纯化结果图,其它各SpA5蛋白的纯化结果与该蛋白结果一致。
从图15-20可以看出,在不同层析填料条件下,SP HP比MMC及Phenyl HP洗脱目的蛋白的纯度更高,可以达到90%以上,具有很好的层析纯化效果。因此,综合上述考虑,确定选择使用SP HP作为第一步层析纯化的填料。
(2)层析纯化工艺的优化
在确立使用SP HP作为第一步填料的基础上,对此层析填料进行条件优化,主要优化的条件是上样样品电导及洗脱程序等,评价指标为SpA5的纯度及得率。
仪器系统:AKTA-explorer100液相色谱系统(GE Healthcare);
层析填料:SP HP;
柱规格:(Φ)1.6cm×(H)2.5cm;
装柱体积:5ml×2;
缓冲液A:20mM PB,pH7.5;缓冲液B:20mM PB+1M NaCl,pH7.5;
上样样品:SpA5粗纯化样品调节pH至8.0备用;
上样流速:8ml/min,洗脱流速:8ml/min;
洗脱程序:①0-100%B,10个柱体积(CV),②0-30%B,10个柱体积(CV);洗脱液中的其它份额为缓冲液A。
由图21-22可以看出,在低样品电导条件下,流穿中没有目的蛋白,且目的蛋白很早就出峰,而在图23-24中,提高样品中的电导,流穿中有明显的目的蛋白。为了提高蛋白的回收率,选用低样品电导作为上样条件。因此,综合上述考虑,确定上样样品电导为5ms/cm左右,洗脱程序为0-50%B,5CV。
4、硫酸铵沉淀纯化
通过SP HP层析纯化之后,SpA5纯度达到了90%以上,但依然需要进一步纯化以便去除目的蛋白下方紧挨着的一条带。采用硫酸铵沉淀进行纯化,使SpA5沉淀,而杂蛋白存在于上清中。
硫酸铵沉淀条件的确定:
分别尝试SpA5经SP HP纯化后的样品与硫酸铵按不同比例混合后搅拌,离心,收集上清与沉淀,SDS-PAGE观察纯化效果。
样品:经SP HP纯化后的SpA5样品。
硫酸铵:3M(NH4)2SO4;
沉淀条件:4℃条件下,样品与3M(NH4)2SO4按1:2、1.4:1.6比例(V/V)混合后搅拌10min,6000r/min,离心20min;
结果判定:分别收集离心后的上清与沉淀进行SDS-PAGE,评价不同浓度硫酸铵沉淀去除杂蛋白的效果(图25)。
图25是SpA5(KKAA)的硫酸铵沉淀效果图,其它SpA5蛋白的沉淀效果与该蛋白一致。从图25的蛋白纯度检测比较可以看出:4℃条件下,SP HP纯化后的SpA5(KKAA)样品与3M(NH4)2SO4以1.4:1.6(V/V)比例混合去除残留杂蛋白的效果最好,纯度达到95%以上。因此,本发明中优选的沉淀条件是:4℃条件下,SpA5样品与3M(NH4)2SO4按1.4:1.6混合,然后离心,收集SpA5蛋白沉淀。
5、脱盐
采用疫苗稀释液平衡脱盐G25柱,将上步纯化获得的样品通过脱盐柱置换缓冲液。
具体为:将上步获得的样品,用组氨酸缓冲液(组氨酸(Merck,美国,药用级)10mmol/L,泊洛沙姆188(Merck,美国,药用级),0.01%w/v,NaCl 9g/L(西南制药))溶解,平衡层析系统(AKTA Explorer 100,美国GE Healthcare)及层析柱XK50-60(美国GE Healthcare)(600mL Sephadex G 25),用流速20mL/min脱盐(脱去(NH4)2SO4及PB)。
6、去内毒素
仪器系统:AKTA-explorer 100液相色谱系统(GE Healthcare);
层析填料:Q HP;
柱规格:(Φ)2.6cm×(H)20cm;
装柱体积:50ml;
缓冲液:缓冲液A:10mM His+0.01%泊洛沙姆188+0.9%NaCl,pH6.0,无内毒素(疫苗稀释液);缓冲液B:1M NaOH;
上样样品:将上步脱盐后样品调节至与缓冲液A一致pH备用。
用缓冲液B(1mol/L NaOH)在位清洗消毒5个柱体积,放置半小时后,使用疫苗稀释液平衡系统至pH为6.0,然后上样。流速:8ml/min。收集穿透峰即目的蛋白峰。
穿透峰样品进行10%SDS-PAGE结果如图26。
7、工艺放大
按照以上确定的条件进行工艺放大:所采用的SP HP层析柱规模放大为(Φ)2.6cm×(H)20cm,装柱体积CV=50ml,Q HP层析柱规模放大为(Φ)2.6cm×(H)20cm,装柱体积CV=50ml。重复三批次实验,SDS-PAGE分析SpA5纯化后的效果及得率,评价此工艺放大后的稳定性和可重复性。
从图27至图35可以看出,SpA5蛋白经SP HP层析工艺放大后,放大层析纯化模式和小量试验层析纯化色谱图无明显变化,经纯化后的SpA5纯度达到95%以上。
8、HPLC纯度检测
HPLC仪Agilent1260(美国Agilent公司),分析柱ZorBax SB-300-C34.6x150mm3.5micron(美国Agilent公司)。
流动相:A:0.1%三氟乙酸(Tedia,美国),水(18.2MΩ);B:0.1%三氟乙酸(Tedia,美国),乙腈(Tedia,美国)。
柱温60℃,流速0.5mL/min,上样10μl。
检测方法:0-30min:90%A,10%B;30-35min:100%B;35-40min:90%A,10%B;40-45min:90%A,10%B。
检测结果如图36和表1所示。
由图36和表1可以看出,纯化的SpA5(KKAA)突变体几乎无杂峰,主峰保留时间13.282分,主峰面积比率98.2%。其余各突变体结果类似。
表1:HPLC检测峰值
峰号 |
保留时间 |
类型 |
峰宽(min) |
峰面积 |
峰面积 |
|
(min) |
|
|
(mAU*s) |
|
1 |
11.158 |
|
0.0000 |
0.00000 |
0.0000 |
2 |
12.879 |
BV |
0.1387 |
26.23703 |
1.7774 |
3 |
13.282 |
VB |
0.1186 |
1449.93225 |
98.2226 |
4 |
32.252 |
|
0.0000 |
0.00000 |
0.0000 |
9、蛋白N端、C端测序、分子量测定及氨基酸组成分析
委托上海中科新生命生物科技有限公司对获得的各SpA5突变体(包括本发明的4种SpA5各突变体及SpA5ref(KKAA))进行测序分析,各突变体的测序序列与设计的序列完全一致。
实施例5:内毒素含量测定
1、将实施例4获得的样品用无热原水(湛江博康海洋生物有限公司)稀释至50μg/mL作为待测样品。根据内毒素检测试剂盒(湛江博康海洋生物有限公司)能检测到的最高范围0.25EU/mL,对待测样品进行稀释。即假定待测样品内毒素含量为5EU/mL,则用无热原水进一步稀释待测样品至2.5μg/mL(稀释20倍);
2、按照试剂盒说明书配制内毒素标准品阳性对照溶液、待测样品工作液、待测样品检测溶液;
3、鲎试剂的准备:根据各待测样品及对照品的数量,取鲎试剂,酒精棉球消毒瓶颈,晾干后开启,每支加入检查用水0.1ml,轻轻摇匀备用;
4、加样:向配制好的鲎试剂中分别加入待测样品检测溶液、内毒素标准品阳性对照液、检查用水各0.1ml,轻摇混匀,封口膜封口,37℃水浴60±2分钟,期间严禁移动;检查用水为阴性对照;
5、检测:取出样品,轻轻垂直旋转180°,观察瓶底,液体凝固不流动为阳性,流动不凝固为阴性;
6、测定结果:各突变体蛋白内毒素阴性,小于5EU/ml。
实施例6:各包被蛋白与人IgG的结合
将获得的各蛋白用0.1mol/L碳酸盐缓冲液(pH9.5)稀释至500ng/ml浓度,取100μl包被96孔ELISA板,4℃包被过夜。洗涤液(Tris2.42g,吐温200.5mL,用浓HCl调pH=7.4,加ddH2O至总体积1000ml)洗板4次。向各孔中加入200μl封闭液(5%(w/v)脱脂奶粉溶于100mmol/L TTBS(Tris(pH7.5),吐温200.1%(v/v),NaCl 0.9%(w/v))中,37℃封闭2小时。弃液体,用洗涤液洗板4次。加入人IgG-HRP(中杉金桥,北京)(1:5000)100μl,37℃温育60min。弃液体,用洗涤液洗板4次。加入100μl/孔新配制含OPD的显色液,室温避光显色15min。加入50μl12.5%H2SO4终止液终止反应,测定OD450nm。OD值越高表明与人IgG结合越强,越不适合做为候选抗原。结果如图37和表2所示,其中PBS为阴性对照。
表2:ELISA检测的SpA及其各突变体蛋白与人IgG结合能力
由结果可以看出,本发明的各SpA5蛋白与野生型SpA5wt及SpA(252)相比,与人IgG的结合能力都大下降,P<0.01;而SpA5(RRVV)已丧失与人IgG的结合能力。
实施例7:兔抗重组突变体抗体F(ab)2片段阻止SpA与人IgG结合
根据实施例6的结果,SpA5wt具有与SpA全蛋白一样的人IgG结合能力,因此这两个蛋白均不进行本次实验。
1)家兔免疫
分别取SpA5ref(KKAA)、SpA5(KKAA)、SpA5(KKVV)、SpA5(RRAA)及SpA5(RRVV)2mg(2mg/ml)加1ml完全弗氏佐剂(sigma,美国),充分乳化。2.0-2.5kg新西兰大耳兔(第三军医大学实验动物中心)25只,每组5只,于第0、14、28天皮下多点免疫乳化后的蛋白2ml(蛋白量2mg),末次免疫7天取血清。
2)抗体纯化
兔血清用硫酸胺沉淀后用PBS稀释,加至用PBS平衡的蛋白G预装柱(美国GE公司),PBS清洗柱子,用含有1mol/L甘氨酸、0.5mol/L NaCl的pH2.5的缓冲液洗脱,洗脱液立即用1mol/L Tris-HCl,pH8.5缓冲液中和,PBS透析。经Lowry法测定,抗体浓度为3mg/ml。经Westen实验验证,该抗体为SpA5特异抗体。
3)抗体F(ab)2片段的制备
将胃蛋白酶(sigma,美国)用醋酸盐缓冲液(醋酸钠18g,加冰醋酸9.8ml,再加水稀释至1000ml,pH4.5)配制成60IU/ml,以1:11(v/v)加入至上步获得的抗体中,37℃作用30分钟,用1mol/L Tris-HCl,pH8.5缓冲液终止反应,用蛋白G预装柱进行如上步的亲和层析纯化。Lowry法测定浓度为1mg/ml。结果如图38所示。
4)重组突变体抗体F(ab)2片段阻止SpA与人IgG结合的验证
将各SpA5蛋白用0.1mol/L碳酸盐缓冲液pH9.5稀释至500ng/ml浓度包被96孔ELISA板,4℃包被过夜。洗涤液(Tris2.42g,吐温200.5mL,用浓HCl调pH=7.4,加ddH2O至总体积1000ml)洗板4次。向各孔加入200μl封闭液(5%(w/v)脱脂奶粉溶于100mmol/LTTBS(Tris(pH7.5),吐温200.1%(v/v),NaCl 0.9%(w/v)中),37℃封闭2小时。弃液体,用洗涤液洗板4次。加入人IgG-HRP(中杉金桥,北京)(1:5000)100μl,及稀释至100ng/ml的兔抗突变体蛋白抗体F(ab)2片段100μl与其反应,37℃温育60min。弃液体,用洗涤液洗板4次。加入100μl/孔新配制含OPD的显色液,室温避光显色15min。加入50μl12.5%H2SO4终止反应。测定OD450nm。OD值越高表明与人IgG结合越强,越不适合做为候选抗原。结果总结如表3及图39所示。
表3:重组突变体抗体F(ab)2片段阻止SpA与人IgG结合的ELISA结果(OD450nm)
由结果可知,本发明的各SpA5蛋白产生的抗体都能有效地与SpA结合,从而显著降低SpA与人IgG的结合能力,而抗SpA5(RRVV)抗体F(ab)2的降低能力最强。
实施例8:B细胞凋亡诱导实验
1)取6周龄BALB/c小鼠(北京华阜康),体重约为16g,共计64只,随机分为7组,每组8只,分别编号为PBS组、SpA组、SpA5wt组及SpA5各突变体组。
2)SpA组腹腔注射SpA纯化蛋白,每只剂量为150μg;SpA5wt组腹腔注射野生型的SpA5wt纯化蛋白,每只剂量为150μg;SpA5突变体组腹腔注射SpA5突变体纯化蛋白,每只剂量为150μg;PBS组注射相等体积的PBS。
3)4小时后断颈处死小鼠,取各组小鼠的脾脏,加入PBS,用200目的筛网制成单细胞悬液,1000r/pm离心5mins弃上清。
4)取4℃的红细胞裂解液(BD Biosciences,美国),按1:5的比例向细胞沉淀中加入红细胞裂解液(1ml细胞体积加入5ml裂解液),轻轻吹打混匀,室温静置5min;800-1000rpm离心5分钟,离心弃去上层红色清液;收集沉淀部分,加入Hank’s液(Hyclone,美国)或无血清培养基1640(Hyclone,美国)离心洗3次;加入完全培养基1640(Hyclone,美国)调整细胞的密度为2×106细胞/ml。
5)细胞收集:将细胞直接收集到96孔U型板。离心:U型板直接在U型板架上离心1800rpm5min,然后甩掉上清,用160μl着色缓冲液(PBS+1%胎牛血清(GIBCO,新西兰))重悬,然后离心同上;1.5ml Ep管在小型离心机上离心1800rpm5min,去上清后,用1ml着色缓冲液重悬,然后离心同上。
6)流式染色:离心时预先配制染色液重组藻红蛋白耦联的抗小鼠CD19抗体(eBioscience,美国),然后根据需要的2倍倍比配制后按50μl/孔加入到上述离心的细胞孔,4℃孵育30min。加入100μl着色缓冲液稍重悬,离心1800rpm5min。去上清,加入160μl着色缓冲液重悬,离心1800rpm5min。
7)上机检测:去上清,加入150μl1×PBS重悬入上样管,上机(BD FACSCantoⅡ)按BD FACSCantoⅡ操作程序进行检测。
CD19+白细胞百分比越接近阴性对照表明所试验蛋白诱导凋亡能力越少,所试验蛋白就更适合做为候选抗原。结果总结如表4和图40所示。
表4:CD19+B细胞百分率
由结果可知,SpA(252)及SpA5wt都能诱导小鼠脾B淋巴细胞凋亡,而各突变体都不引起B细胞凋亡(平均值±stdev,n=8)。
根据上述几个实施例,将本发明的各SpA5蛋白的表达量、与人IgG结合能力、抗SpA5突变体F(ab)2片段阻止SpA结合人IgG能力及诱导B细胞凋亡能力与SpA5ref(KKAA)的比较,结果见表5。
表5:SpA5各突变体性质总结
实施例9:SpA5疫苗的制备
磷酸铝为美国GENERAL CHEMICAL公司原装进口产品(20mg/ml)。
1、配制金黄色葡萄球菌重组SpA5疫苗
①准确量取磷酸铝佐剂80μl,将其加入到配制瓶中。量取疫苗稀释液(组氨酸10mM、NaCl 0.9%、泊洛沙姆1880.01%、pH6.0)220μl,总体积300μl,充分混匀;
②用疫苗稀释液将各SpA5蛋白稀释至30μg/300μl,充分混匀;
③将等体积的稀释后佐剂溶液与稀释后蛋白溶液加入至分装瓶中,温度范围4℃-32℃条件下,垂直混悬或水平搅拌吸附1小时后即得。
2、10%SDS-PAGE鉴定重组金黄色葡萄球菌疫苗抗原蛋白磷酸铝佐剂吸附均一性与完全性
①取上述疫苗制剂1ml,4℃,6000rpm离心5分钟,小心吸取上清,并从上清取样40μl;
②补入与上清等体积的解离液(1M Na2CO3),室温条件下,垂直混悬1小时,取样40μl;
③按上述1的方法配制不含磷酸铝佐剂的蛋白溶液,磷酸铝所占体积以疫苗稀释液补足,充分混匀后取样40μl;
④将所取样品加入10μl5×蛋白上样缓冲液,100℃加热5分钟,冷却并瞬时离心后,取10μl上样;
⑤利用10%SDS-PAGE电泳,电压先80v电泳20分钟,再调至180v,电泳40分钟。然后将胶取出,置于考马斯亮蓝染色液中振荡染色,再置于脱色液中振荡脱色后,在呈像系统下观察结果,结果示于图41,说明磷酸铝佐剂能充分充分吸附蛋白。
实施例10:感染用金黄色葡萄球菌菌株(国际标准株MRSA-252)标准定量曲线的建立
将菌株接种于MH平板置于37℃孵育24小时;在平板上挑取单菌落,接种于MH液体培养基中,置于37℃恒温摇床中震荡培养6小时后6000rpm离心10min收集菌体,用生理盐水洗涤菌体2次;再将菌液进行10倍和1.25倍稀释,并在紫外分光系统下测定各菌液的在600nm处的吸光度(OD600),并取各个稀释度的菌液100μl涂布于MH平板,置于37℃孵育24小时后计数菌落;根据各个平板菌落数和菌液的OD600值绘制标准定量曲线。
结果:标准曲线公式为Y=2.3065X+0.0051(109CFU/ml),相关系数为0.9999。
实施例11:脓毒血症动物模型的构建
1、将MRSA-252菌株接种于MH平板置于37℃孵育24小时;在平板上挑取单菌落,接种于MH液体培养基中,置于37℃恒温摇床中震荡培养6小时后收集菌体,并利用标准曲线公式进行定量,再将菌液稀释(或浓缩)为2.0×1010CFU/mL、1.5×1010CFU/mL、1.25×1010CFU/mL、1.0×1010CFU/mL不同浓度组,再用各组菌液通过尾静脉注射6~8周龄、体重为18~20g的BALB/C小鼠(100μl/只)进行全身感染,同时设置生理盐水对照组,观察7天并统计各组小鼠的死亡率;
2、感染后计时每隔24小时(至感染后7天)采用菌落计数法对细菌定植量进行检测:从各感染组和对照组中随机选取3只小鼠,利用眼球摘除法,取小鼠血样0.5~1mL,取20μL血样用180μL肝素稀释10倍后用于细菌计数,取50μL涂于平板,置于37℃,24h后计数克隆数;取完血样后将小鼠处死放入75%酒精中浸泡消毒后,取出将其四肢固定,将其解剖,取出脾、肾、肝脏,置于2mL无菌的PBS中,于洁净的玻璃匀浆器中进行匀浆,取1mL均浆按照1:10、1:100、1:1000比例进行稀释;每稀释度各取100μL轻轻涂布于固体培养基上,置于37℃,培养24h,做菌落计数。结果显示于表6。
表6:MRSA-252最小致死剂量与亚致死剂量的确定
2.0×109CFU剂量组12小时(h)内小鼠死亡率为100%;1.5×109CFU剂量组48h内小鼠死亡率为90%,72h内死亡率为100%;1.25×109CFU剂量组48h内小鼠死亡率为80%,96h内死亡率为小鼠死亡率为90%,120h内死亡率为小鼠死亡率为100%;1.0×109CFU剂量组48h内小鼠死亡率为10%,72h内死亡率为小鼠死亡率为20%,7天(d)内死亡率为小鼠死亡率为70%;由此可见MRSA-252最小致死剂量约为1.25×109CFU,亚致死剂量为1.0~1.25×109CFU。
3、MRSA-252感染BALB/C小鼠后在血液和各脏器中的定植量:
感染后血液中细菌的在48h时达到峰值,最大定植量达到8.0×109CFU/ml,在72h时血液中细菌量开始减少,到96h时血液中未检测出细菌;感染后脾、肾、肝脏中定植的细菌均在72时达到峰值,最大定植量均达到8.0×109CFU/ml;对照组小鼠的血液、脾、肾、肝脏中的细菌定植检测结果均为零。
以上结果针对小鼠的生存率和血液、脾、肾、肝脏主要器官细菌定植量进行了动物模型的评价,为SA单个亚单位疫苗和SA多亚单位融合疫苗的成功研制及SA感染的发病机制的研究奠定了基础。
实施例12:通过动物免疫攻毒保护确定SpA5作为抗原的效果
1、将SpA5ref(KKAA)、SpA5(KKAA)及SpA5(RRVV)按实施例9制成疫苗。
2、实验动物及分组:
使用雌性6周龄BALB/C小鼠(北京华阜康)。设疫苗稀释液、磷酸铝佐剂对照组、SpA5ref(KKAA)、SpA5(KKAA)及SpA5(RRVV)五组,每组30只。
3、将各疫苗分别以30μg/100μl分三次股四头肌肌注(0、14、21天)免疫。
4、攻毒:末次免疫,在第14天采用致死剂量,尾静脉注射MRSA-252活菌进行攻毒实验,每只BALB/C小鼠注射菌液量为1.25×109CFU(根据表6确定的结果),观察10天,统计各组小鼠的存活率。
5、结果见表7。
表7:SpA5各突变体蛋白免疫小鼠后的攻毒保护能力
组别 |
10天后存活数(只) |
生存率 |
疫苗稀释液 |
4 |
13% |
AlPO4 |
6 |
20% |
SpA5(KKAA) |
11 |
37% |
SpA5(RRVV) |
12 |
40% |
SpA5ref(KKAA) |
10 |
33% |
由表可知,SpA5(KKAA)和SpA5(RRVV)都对动物有很好的保护效果。