CN103484496A - 一种报告基因重组在染色体目的基因上的方法、位点及用途 - Google Patents
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Abstract
本发明提供了一种建立报告基因重组在染色体目的基因上的方法,重组位点是目的基因的最后一个外显子的终止密码子后,把IRES-报告基因重组在目的基因的最后一个外显子的终止密码子后。重组后,目的基因和报告基因一起转录成融合的mRNA,目的基因mRNA各外显子剪接正确,并分别翻译成报告基因蛋白和目的基因蛋白,报告基因蛋白可以定时检测,通过报告基因的表达变化反映目的基因表达调控。该重组方法为目的基因的表达调控研究提供完全天然染色体环境。
Description
技术领域
本发明涉及分子生物学领域,具体涉及一种报告基因插入染色体完整目的基因位点、构建方法和用途。
背景技术
基因打靶技术(gene targeting)是一项新兴的分子生物学技术,是利用外源DNA与受体细胞染色体DNA上的同源序列之间发生重组,将外源DNA定点整合入受体细胞基因组上某一确定的位点。基因打靶技术在研究基因的结构和功能、表达与调控、转基因及基因治疗等方面已经成为有力的工具。
利用报告基因可有效地研究目的基因的表达调控。目前多数转基因动物报告基因的表达是由目的基因启动子驱动,可以研究目的基因启动子的调控。由于基因增强子、位点控制区域(locus control region, LCR)及绝缘子(insulators)等调控元件对于基因的表达和调控十分重要,但这些元件常常距基因有约50 kb之遥,而且目的基因所包含的天然内含子可能带有影响mRNA剪接和调控蛋白表达的信号,目的基因所处的天然的染色体环境也是调控基因表达的重要因素。但目前,报告基因重组在“天然”染色体目的基因上的研究报道较少。因此,迫切需要建立报告基因重组在染色体目的基因上的报告基因转基因动物,为目的基因的表达调控研究提供基本完全天然的染色体环境。因此,本发明确定了报告基因重组在染色体目的基因上的位点,利用基因打靶技术构建报告基因重组在目的基因上的报告基因转基因动物,为在完全天然染色体背景下研究完整目的基因表达和调控建立了研究平台。
发明内容
本发明公开一种报告基因重组在染色体完整目的基因上的方法。
也就是说,本发明目的是提供一种建立报告基因重组在染色体完整目的基因上的方法,确定报告基因插入目的基因的位点,利用基因打靶技术构建报告基因重组在目的基因上的报告基因转基因动物,该位点报告基因的插入,为目的基因表达和调控研究提供了完全天然染色体环境。
一种建立报告基因重组在染色体目的基因上的方法,其特征在于重组位点是目的基因的最后一个外显子的终止密码子后,把IRES-报告基因重组在目的基因的最后一个外显子的终止密码子后。
重组后,目的基因和IRES-报告基因一起转录成融合的mRNA,目的基因mRNA各外显子剪接正确。
IRES-报告基因与目的基因融合的mRNA,分别翻译成报告基因蛋白和目的基因蛋白。报告基因蛋白可以定时检测。由于报告基因与目的基因一起转录成融合的mRNA,报告基因的表达能相对定量目的基因的表达。
重组方法中的IRES,报告基因可以从市售报告基因质粒获得。其中市售报告基因质粒可以是荧光素酶系列报告基因质粒,荧光蛋白系列报告基因质粒,分泌性碱性磷酸酶系列报告基因质粒。
在建立转基因动物前,需要先进行体外实验,确定报告基因重组在染色体完整目的基因上的位点,考察此位点的重组,是否会引起目的基因 mRNA剪接错误,影响目的基因 mRNA完整性,以及报告基因能否反映目的基因表达调控。
然而,目前由于完整目的基因为大片段DNA(>10 kb),在技术上,研究比较困难,长期限制了报告基因在完整目的基因的表达调控研究上的应用。细菌人工染色体(Bacterial Artificial
Chromosome, BAC)为目的基因研究提供了基本完整的染色体DNA背景。BAC同源重组,为报告基因与完整目的基因重组提供了简便、可行的实验工具。
本发明通过BAC同源重组,选择报告基因插入目的基因的位点,考察此位点的重组,是否会引起目的基因 mRNA剪接错误,影响目的基因 mRNA完整性,以及报告基因能否反映目的基因表达调控。体外实验确定报告基因插入目的基因的位点后,构建报告基因重组在染色体原位目的基因上的报告基因转基因动物,在整体水平,为在完全天然染色体背景下研究目的基因表达和调控提供了研究平台。
体外BAC同源重组基因工程方法基于3个λRed-encoded 基因 (Red, recombination deficient mutant of phage 噬菌体重组缺陷型) exo,bet 和gam介导的同源重组。Exo 编码5’-3’核酸外切酶产生待插入双链DNA3’悬端,bet编码一对蛋白,该蛋白绑定在待插入双链DNA3’悬端,并介导退火以及与BAC上互补DNA发生同源重组。Gam 编码RecBCD核酸外切酶抑制蛋白,保护待重组的DNA不被RecBCD降解。Exo,bet和gam的表达由温度敏感的抑制物控制,细菌在32℃培养时,这三个基因不表达。细菌42℃,15分钟,exo,bet和gam被快速诱导至高表达水平,同源重组得以有效进行。
体外BAC同源重组基因工程方法选择系统为galK阳性选择和阴性选择。E.coli半乳糖操纵子由四个结构基因组成,四个结构基因依次排列:galE(编码半乳糖差向异构酶)、galT(编码半乳糖转移酶)和galK(编码半乳糖激酶)和galM。当半乳糖作为唯一碳源时,这些基因是细菌生长必须的。galK编码的半乳糖激酶催化半乳糖降解第一步,磷酸化半乳糖。半乳糖激酶也可以有效催化2-脱氧-半乳糖(DOG)――半乳糖类似物的磷酸化。磷酸化的DOG不能被代谢,导致毒性蓄积。这样就形成了以galK为基础的阳性选择和阴性选择。
附图说明
图1 BAC重组和galK阳性选择和阴性选择流程示意图。
图2 分段PCR初步证实3’mDAT-IRES-G-luc插入得到pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc重组子菌落。其中
泳道1:templte:
pBACe3.6-AC154547, primer: 1-F和2-R;
泳道2:templte:
pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc, primer: 1-F和2-R;
泳道3:templte:
pBACe3.6-AC154547, primer: 2-F和2-R;
泳道4:templte:
pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc , primer: 2-F和2-R;
泳道5:templte:
pBACe3.6-AC154547, primer: 3-F和3-R;
泳道6:templte:
pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc, primer: 3-F和3-R。
图3 SmaI酶切,证实pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc重组子正确。左图为0.25v/cm,12 h;右图为20 h。其中
泳道A:pBACe3.6-AC154547 SmaI
digestion;
泳道B:pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc SmaI
digestion。
图4 pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc转染HEK293细胞,测定培养液和细胞G-luc表达。其中
VAP:丙戊酸(终浓度5 μM);
BAC-9k:指pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc;
BAC-Pac:指pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc经PacI酶切,自连后,仍然包含mDAT全基因。
图5 pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc转染HEK293细胞,逆转录PCR证实G-luc与DAT一起转录成融合的mRNA。其中,泳道1~5:引物:mouse-DAT RT-F
881和mouse-DAT RT-R 1149扩增子为mDATc 881bp-1149 bp, 长度 269 bp;泳道6~10:引物:RT-BAC-luc-1-F
1710和RT-BAC-luc-1-R扩增子长度893 bp。
泳道1 HEK293(无转染)丙戊酸+,
泳道2 HEK 293T 转染pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc,
泳道3 HEK 293T转染
pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc,丙戊酸+,
泳道4 HEK 293T转染 BAC-Pac,
泳道5 HEK 293T转染 BAC-Pac,丙戊酸+,
泳道6 HEK 293 丙戊酸+,
泳道7 HEK 293 转染pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc,
泳道8 HEK 293 转染pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc,丙戊酸+,
泳道9 HEK 293 转染BAC-Pac,
泳道10 HEK 293 转染 BAC-Pac,丙戊酸+,
其中BAC-Pac:pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc经PacI酶切,自连后,仍然包含mDAT全基因。
图6 原位mDAT-IRES-G-luc
报告基因转基因小鼠构建流程示意图。
具体实施方式
以下通过实施例进一步描述本发明,应该理解的是,这些实施例仅用于例证的目的,不限制本发明的范围。
本发明实施例中所使用的限制性内切酶为商业产品。质粒载体、菌株均为商业产品,本实验室保存。
实施例
1
构建
pgalK
质粒
1、通过两步PCR,克隆galK开放阅读框ORF至pBluescript SK(-)的EcoRI 和BamHI位点。引物:
galK ORF 1 F:
5’-CCCAGGAGGCAGATCATGAGTCTGAAAGAAAAAACTGAAAGAAAAAACACAATCTCTGT-3’;
galK ORF 2 F: AAATAAGAATTCCTGTTGACAATTAATCATCGGCATAGTATATCGGCATAGTATAATACGACAAGGTGAGGAACTAAACCCAGGAGGCAGATCATG;(EcoRI site下划线 )
galK ORF R: AATAAAGGATCCTCAGCACTGTCCTGCTCCTT-3’(BamHI位点下划线)。
PCR反应体系:第一步模板为W3110细菌DNA,第二步PCR模板为第一步PCR产物。
H2O
42 μl
10×Pfu Buffer 5 μl
10mM dNTP
1 μl
Template
100 ng
Primers
0.2 μl
Pfu
1 μl
Total
50 μl
PCR 条件采用程序:
95℃ 5 min; 95℃ 30 sec,60℃ 30 sec,72℃ 30 sec,30循环;72℃ 2min延伸。
PCR产物取2 μl凝胶电泳,条带清晰单一。
2、纯化步骤1第二步PCR产物。PCR产物加5 M NH4Ac 5 μl,混合后,加125 μl 100%乙醇,-80℃ 4 h,14,000 rpm,4℃,30 min。弃上清,沉淀加70%乙醇0.3 ml,14,000 rpm,4℃,15 min。弃上清,沉淀溶解在ddH2O。
3、EcoRI和BamHI双酶切步骤2纯化的DNA片段。
酶切体系为:
步骤3纯化的DNA片段 0.4μg(1 μl)
BSA
0.5 μl
EcoRI
0.5 μl
BamHI
0.5 μl
10×NEBBuffer
2 5 μl
H2O
42.5 μl
37℃,2 h。
4、1.5%琼脂糖凝胶电泳,用QIAquick Gel Extraction
Kit,进行胶回收DNA片段。
5、EcoRI和BamHI双酶切pBluescript SK(-),酶切体系为:
pBluescript
SK(-) 0.4μg(1 μl)
BSA
0.5 μl
EcoRI
0.5 μl
BamHI
0.5 μl
10×NEBBuffer2
5 μl
H2O
42.5 μl
37℃,2 h。
6、回收步骤4得到的EcoRI或BamHI线性pBluescript SK(-)质粒。加5 M NH4Ac 5 μl,混合后,加125 μl 100%乙醇,-80℃,4 h;14,000 rpm,4℃,30 min。弃上清,沉淀加70%乙醇0.3 ml,14,000 rpm,4℃,15 min。弃上清,沉淀溶解在ddH2O。
7、T4DNA连接酶连接步骤4 EcoRI单酶切DNA片段和步骤6 DNA片段,连接反应体系20 μl,T4DNA连接酶1 μl,16℃过夜。
8、连接产物1μl和10 μl电转感受态(One Shot® TOP10
Electrocomp E. coli,Cat# C404050, Invitrogen,
CA,USA)混合,混合物转到冰冷的2 mm电转杯(Cat# 4307 000.593,
Eppendorf, Hamburg, Germany)。电转装置Gibco BRL Cell Porator Electroporation System (cat# 71600-050
和 11609-039, Gibco BRL)。设置:4 k欧,330 μF,fast charge 400 kV电击。电击后,混合物转入LB培养液0.3 ml中,225 rpm,37℃,1 h。取适量,接种氨苄抗性培养皿,37℃,12-16h。
9、鉴定。菌落PCR粗步鉴定含正确插入子菌落,得到含pgalK质粒转化子菌落。细菌扩增,提取质粒,测序验证。保存转化pgalK菌种。
实施例 2-4以小鼠多巴胺转运体DAT基因(mDAT)为例,应用BAC重组技术,把IRES-G-luc重组在小鼠染色体DAT基因的第15个外显子的终止密码子后。构建mDAT完整基因和IRES-G-luc BAC重组体。BAC重组和galK阳性选择和阴性选择流程示意图见图1。
实施例 2 构建pBACe3.6-AC154547-galK
1)pBACe3.6-AC154547转化SW102。
①抽提pBACe3.6-AC154547
QIAGEN Large-Construct Kit(Cat# 12462 QIAGEN 德国)试剂盒,按操作步骤进行。
② 制备SW102电转感受态
a. 用枪头挑新鲜单克隆SW102菌落,接种至盛有1 ml LB(含12.5 μg/ml四环素)液体培养基的15 ml离心管中。
b. 32℃,220 rpm,培养14-16h。
c. 第二天,以1:100的比例,将取0.5 ml菌液至50 ml LB(含12.5 μg/ml四环素)液体培养基中,32℃,220 rpm,振摇2-3h,当OD值达到0.5-0.6时,停止培养。
d. 将菌液在冰上预冷10min,随后将菌液分装到25 ml 预冷的离心杯中,4℃,5000 rpm离心10min。
e. 弃上清,离心管中加入少量冰ddH2O,冰上,使沉淀悬浮后,再将水注满离心杯,4℃,4000 rpm离心5min。重复一次。
f. 弃上清,每个离心管中加入冰50 μl ddH2O。
③ 电转化 25μl感受态加5 μl(2μg) pBACe3.6-AC154547,温和混匀,混合物转到冰冷的2 mm电转杯。电转装置和设置同实施例 1步骤8。电击后,混合物转入300μl的LB液体培养基,32℃,220-250 rpm复苏1h。接种在含32 μg/ml氯霉素和12.5 μg/ml四环素的培养皿上,32℃培养,18-24h。保存转化pBACe3.6-AC154547的 SW102。
2)PCR 扩增含同源臂galK双链DNA。
以实施例 1得到的pgalK为模板,根据NCBI genebank数据库所示目的基因序列设计拟插入位点,设计含同源臂hF(50 bp)和hR(50 bp),用于扩增galK的引物,PCR获得含目的基因DAT同源臂hF和载体同源臂hR的galKDNA片段。
设计含同源臂hF和hR,用于扩增galK的引物:
homology arm F-F: CTC AAG GCT CAG
CCC AAC TCT GCA ACT GTT CTC TTC TGC TCT GTC CTG CAC CTG TTG ACA ATT AAT CAT
CGG CA(同源臂hF,下划线)
homology arm R-R: TGC TGC TGT TTA
GGG ATC TGC AGC ATA TCA TGG CGT GTA ATA TGA GAG ACT CAG CAC TGT CCT GCT CCT
T(同源臂hR,下划线)
PCR 反应体系:
Fermentals fast PCR
mix 10 μl
Primers (50 mM)
0.2 μl
pgalK 100
ng
0.1 μl
H2O
9.7 μl
Total
20 μl
PCR 反应程序:
95℃ 5 min,95℃ 1 sec,60℃ 5sec,72℃ 20 sec,40 cycle。 72℃ 3min。
3)1.5%琼脂糖凝胶电泳,用QIAquick Gel Extraction
Kit,进行胶回收DNA片段。
4)制备步骤1)得到的转化pBACe3.6-AC154547的 SW102电转感受态。方法步骤同1)②。
5)BAC重组和galK阳性选择。
步骤3)得到的DNA片段2 μl,电转化步骤4)得到的电转感受态,电转化操作同步骤1)③。电转化后,混合物转入LB培养液0.3 ml中,细菌42℃,15min,225 rpm,32℃ 1 h。M9盐溶液洗2次后,接种galK阳性选择培养皿,32℃,72h。
galK阳性选择培养皿制备:
6)galK阳性选择培养皿得到的克隆,MacConkey 培养板划线,再次选择取红色克隆1,2,3,4。鉴定。细菌扩增,提取质粒,PCR初步证实得到pBACe3.6-AC154547-galK重组子菌落。测序验证。保存含pBACe3.6-AC154547-galK重组子菌种。
实施例 3 构建打靶质粒pNEB193-HFR-3’mDAT-IRES-G-luc。
由于AC154547上mDAT缺少3’mDAT (8 kb)。AC158359.2含mDAT 3’8 kb。以AC158359.2为模板,克隆同源臂HR和3’mDAT (8 kb、同源臂HF位于mDAT,同源臂R位于载体)入pNEB193,并在mDAT第15外显子终止密码子(taa)后,克隆入IRES和G-luc。构建pNEB193-HFR-3’mDAT-IRES-G-luc质粒。
1)以AC158359.2为模板,克隆终止密码子taa前3’mDAT (2 kb,含同源臂HF 420 bp) 入pNEB193的AscI位点(引物F1, R1)。
引物F1:AAATAAGGCGCGCCTTTCACTATGTAATTCTGGC(AscI,
下划线)
引物R1:AAATAAGGCGCGCC GGATCCTTACACCAACAGCCAATGGC(AscI,
下划线;BamHI, 斜体)
2)以pBACe3.6-AC154547-galK为模板,克隆同源臂HR(420 bp)入步骤1)得到的质粒的PacI位点。
引物F2:ttttttTTAATTAA GCGGCCGCGAGCGACTCAAGCCTTCGCG(PacI, 下划线;NotI, 斜体)
引物R2:ttttttTTAATTAA
ATTCTTGCGTCTGATCTTTC(PacI, 下划线)。
3)以pIRES2-EGPF为模板,克隆IRES,入步骤2)得到的质粒的BamHI位点。
引物F3:ttttttGGATCCGCCCC
TCTCCCTCCC CCCCCCCTAA (BamHI, 斜体)
引物R3:ttttttGGATCC CCATGGATTATCATCGTGTTTTTCAAAGG
(BamHI, 斜体;NcoI, 下划线)
4)以AC158359.2为模板,克隆终止密码子taa后3’mDAT (7.4 kb) 入步骤3)得到的质粒的NcoI和NotI位点(引物F3, R3)。
引物F4:ttttttCCATGGAGTGGAAGGAGACAGCTGCC(NcoI, 下划线)
引物R4:ttttttGCGGCCGCGAAAACGAATTCGCCCTTGGCCG(NotI, 下划线)。
5)以pMCS-Gaussia-Luc载体(ThermoFisher)为模板,克隆G-luc入步骤4)得到质粒的NcoI位点,形成pNEB193-HFR-3’mDAT-IRES-G-luc打靶质粒(12 kb)。
引物F5:ttttttCCATGGGAGTCAAAGTTCTG
(NcoI, 下划线)
引物R5:ttttttCCATGGTTAGTCACCACCGGCCCCCT
(NcoI, 下划线)。
实施例 4 构建重组体pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc。
1)AscI/PacI 双酶切pNEB193-HFR-3’mDAT-IRES-G-luc打靶质粒(12 kb),得到含同源臂HFR-3’mDAT-IRES-G-luc片段(9 kb)。
2)制备实施例 2得到的含pBACe3.6-AC154547-galK重组子菌种SW102电转感受态。方法步骤同实施例 2 ,步骤1)②。
3)步骤1)得到的DNA片段5 μl,电转化步骤2)得到的电转感受态,电转化操作同实施例 2,步骤 1)③。电转化后,混合物转入LB培养液0.3 ml中,细菌42℃,15min。225 rpm,32℃ 4 h。M9盐溶液洗2次后,接种galK阴性选择培养皿,32℃,72h。
galK阴性性选择培养皿制备:
galK阴性选择培养皿得到的克隆,细菌扩增,提取质粒,分段多步PCR初步证实得到pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc重组子菌落。见图2。
分段PCR引物如下:
第一对引物1-F 5’ -tgttgatgcaaaccccagag -3 ’ (位于HF前199 bp处) 和 1-R 5’-gcaacagcaatgaggacagc-3’ (位于插入子5’)。扩增子1227 bp。
第二对引物2-F 5’
tggaagatccagcaatacgg-3 ’ (位于插入子3’端) 和 2-R 5’-ccgttcgctaactcagcatc-3’ (位于载体HR后445 bp) ,扩增子1488 bp。
第三对引物3-F 5 ’ gggctgaactcaggttgtgg-3 ’ 3-R 5 ’ –aggccaggcatcattcttga-3 ’位于插入子,扩增子1926 bp。
SmaI酶切,证实重组正确。
pBACe3.6-AC154547和pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc SmaI酶切预测见下表。
与pBACe3.6-AC154547相比,pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc是由pBACe3.6-AC154547插入9021 bp构成(此插入子无SamI酶切位点),插入点在pBACe3.6-AC154547 SamI酶切的第 6 片段1143 bp 内,因此,pBACe3.6-AC154547 SamI酶切的第 6 片段1143 bp在pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc SamI酶切时不存在,而形成20454 (1143+9021)bp片段。其余酶切片段两者相同。见图3。
分段测序证实重组正确。保存含pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc细菌备用。
实施例 5 pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc转染HEK293细胞,考察重组子mDAT和G-luc表达。
考察重组在目的基因上的报告基因是否会引起DAT mRNA剪接错误,影响DAT mRNA完整性。证实G-luc与mDAT一起转录成融合的mRNA,分别翻译成G-luc和mDAT。可以认为在转录水平,G-luc的表达能反映mDAT基因的表达。
1)细胞系及细胞培养:HEK293细胞购于ATCC。培养条件:37℃,5% CO2,湿化培养箱,培养液Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM)添加10% (v/v) 胎牛血清, 青霉素(100 U/mL),链霉素 (100 U/mL) (均购于Invitrogen, Carlsbad, CA,
U.S.A.)。
2)瞬时转染
第1天,细胞传代至24孔板,每孔0.5ml培养液。
第2天,细胞至50%~70%融合。2μg质粒 DNA,5 μl Superfect
reagent(Qingen),19 μl DMED,温和混合,静置20 min,加入150 μl完全培养液。弃细胞培养液,将混合物加入细胞培养孔。同时设立Mork(不加DNA)对照。
质粒DNA包括2种:1. pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc,简称BAC-9k;2. pBACe3.6-AC154547-3’mDAT-IRES-G-luc经PacI酶切,自连后,仍然包含mDAT全基因,简称BAC-Pac。
第3天,加新鲜完全培养基500 μl。转染24 h后,转染细胞分组为对照组和丙戊酸5 μM刺激组。每次实验设置复孔。
第4天,荧光素酶活性分析。时间点:转染前(0h),转染后24h-96h,取细胞培养液50 μl。96 h同时取细胞,裂解后,进行荧光素酶活性分析。
3)荧光素酶活性分析。应用荧光素酶测定试剂盒(Cat# M1193, Markergene Inc.),检测系统Bio-Tek Synergy HT/KC4。荧光素报告基因活性计算:荧光素酶活性读值-背景读值。背景为Mork的荧光读值。
4)逆转录PCR。转染后96h,提取细胞RNA,逆转录PCR初步证实G-luc与DAT一起转录成融合的mRNA(见图5)。
第1~5泳道,引物:mouse-DAT RT-F 881:
tgcctggtgctggtcattgt (位于mDAT cDNA 881bp);mouse-DAT RT-R 1149:
aaggcaatcagcaccccaaa (位于mDAT cDNA 1149bp);扩增子为mDATc 881bp-1149 bp, 长度 269 bp。
第6~10泳道,引物:RT-BAC-luc-1-F 1710
actggcggctatgctggaag (位于mDAT cDNA 1710bp);RT-BAC-luc-1-R gttgttctcggtgggcttgg(位于G-luc);扩增子长度893 bp。
并经过分段测序验证,连接在目的基因上的报告基因不引起目的基因 mRNA剪接错误,不影响目的基因mRNA完整性。
与文献报道一致,HEK293对照不表达DAT,丙戊酸明显诱导DAT表达。丙戊酸刺激转染重组子HEK293,细胞培养液中G-luc测定,表示G-luc单独翻译,并被分泌到细胞培养液中。丙戊酸刺激转染重组子HEK293,细胞培养液中的G-luc表达变化反映丙戊酸对DAT表达的调控(见图4,图5)。表明IRES-报告基因重组在完整目的基因终止密码子后,报告基因与目的基因一起转录成融合的mRNA,分别翻译成报告基因蛋白和目的基因蛋白。连接在目的基因上的报告基因不引起目的基因 mRNA剪接错误,不影响目的基因mRNA完整性。融合的mRNA,分别翻译成报告基因蛋白和目的基因蛋白,可以通过测定报告基因研究目的基因表达调控。
实施例 6 建立原位mDAT-IRES-G-luc报告基因转基因小鼠,考察G-luc与mDAT是否一起转录成融合的mRNA,分别翻译成G-luc 和mDAT。
原位mDAT-IRES-G-luc报告基因转基因小鼠的建立是基于DNA同源重组和胚胎干细胞(ES细胞)发育全能性的原理,应用基因打靶技术,染色体定点重组IRES-报告基因,获得目的基因(mDAT)最后一个外显子(即第15个外显子)终止密码子后重组IRES-报告基因(G-luc)转基因小鼠。原位mDAT-IRES-G-luc报告基因转基因小鼠构建流程示意图见图6。
转基因小鼠黑质组织逆转录PCR,引物同实施例 5,步骤4),证实G-luc与mDAT一起转录成融合的mRNA,分别翻译成G-luc 和mDAT,而且G-luc分泌至脑脊液,通过脑脊液荧光素酶活性分析G-luc表达,G-luc分析方法同实施例 5,步骤3)。
本发明所述的把IRES-报告基因重组在目的基因的最后一个外显子的终止密码子后,在重组后,目的基因和报告基因一起转录成融合的mRNA,目的基因mRNA各外显子剪接正确。报告基因与目的基因分别翻译成报告基因蛋白和目的基因蛋白。报告基因蛋白可以定时检测。本发明为在整体水平,为目的基因在完全天然的染色质环境下的调控研究提供了有价值的研究平台。
Claims (5)
1.一种建立报告基因重组在染色体目的基因上的方法,其特征在于重组位点是目的基因的最后一个外显子的终止密码子后,把IRES-报告基因重组在目的基因的最后一个外显子的终止密码子后,该重组方法为目的基因的表达调控研究提供完全天然的染色体环境。
2.权利要求1 所述的一种建立报告基因重组在染色体目的基因上的方法,其特征在于重组后,目的基因和报告基因一起转录成融合的mRNA,目的基因mRNA各外显子剪接正确。
3.权利要求2所述的一种建立报告基因重组在染色体目的基因上的方法,其特征在于报告基因与目的基因融合的mRNA,分别翻译成报告基因蛋白和目的基因蛋白。
4.权利要求1所述的一种建立报告基因重组在染色体目的基因上的方法,其特征在于重组方法中的IRES,报告基因可以从市售报告基因质粒获得。
5.权利要求4所述的一种建立报告基因重组在染色体目的基因上的方法,其特征在于市售报告基因质粒可以是荧光素酶系列报告基因质粒,荧光蛋白系列报告基因质粒,分泌性碱性磷酸酶系列报告基因质粒。
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