CN102559938B - Pcr结合核酸探针斑点杂交技术检测病料中i型马立克氏病病毒感染 - Google Patents

Pcr结合核酸探针斑点杂交技术检测病料中i型马立克氏病病毒感染 Download PDF

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Abstract

本发明涉及一种PCR结合核酸探针斑点杂交检测病料中I型马立克氏病病毒感染的方法。本发明将疑是I型马立克氏病病毒感染的动物(已死亡动物)组织样品DNA用针对I型马立克氏病病毒的特异性引物PCR扩增后,对PCR产物再用该病毒特异性核酸探针做斑点杂交,不仅能显示PCR产物的特异性,也大大提高了检出率。本发明试验结果表明,PCR结合核酸探针斑点杂交技术检测病料中I型马立克氏病病毒感染,可显著提高病毒感染检测的灵敏度和特异性。

Description

PCR结合核酸探针斑点杂交技术检测病料中I型马立克氏病病毒感染
本申请是申请日为2010年04月09日、申请号为201010142266.1、发明创造名称为“PCR结合核酸探针斑点杂交技术检测病料中病毒感染”申请的分案申请。
技术领域
本发明涉及一种PCR结合核酸探针斑点杂交技术检测病料中I型马立克氏病病毒感染,属于兽医微生物学领域分子生物技术。
背景技术
目前,在规模化养禽业和养猪业,病毒的多重感染是普遍性的问题,也是临床发病的真正原因。但是,对多种病毒的病原学检测对养殖场来说是一个困难问题。这是因为,很难对多个个体的不同病料同时做不同病毒的分离培养。现代分子生物学技术PCR和核酸探针斑点分子杂交技术有助于解决这一问题。在一切条件完美时,PCR的灵敏度非常高。但在实际应用时,常常出现假阳性和假阴性问题。如,有时PCR产生的DNA条带虽染大小与预期的一样,但测序结果表明,却是一种无关核酸。此外,由于技术性原因,PCR的可重复性也较差,特别是其灵敏度的可重复性较差,常常PCR产物在电泳时看不到核酸条带。这是因为,PCR产物电泳时,如果加入的DNA量小于50pg,则很难看到条带。用特异性核酸探针做斑点分子杂交,其特异性较稳定,其检测灵敏度可达1pg的同源核酸。但如果病毒感染量小时,在1μg病料样品的总DNA中,特异性病毒的核酸可能不足1pg,因而也检测不出来。如过将PCR和斑点杂交结合起来,则既能确定PCR产物的特异性,也能提高PCR产物的检出灵敏度。但如果再结合斑点杂交,则只要1pg就可显现阳性了。而且,电泳显示的条带,并不代表是特异的。
发明内容
本发明的目的是为克服PCR在实际应用时,常常出现假阳性和假阴性问题;用特异性核酸探针做斑点分子杂交,但如果病毒感染量小时,在1μg病料样品的总DNA中,特异性病毒的核酸可能不足1pg,因而也检测不出来这些不足,而将PCR和斑点杂交结合起来,则既能确定PCR产物的特异性,也能提高PCR产物的检出灵敏度。但如果再结合斑点杂交,则只要1pg就可显现阳性了。先将疑是病毒感染的肉鸡样品DNA用针对可疑病毒的特异性引物PCR扩增后,再对PCR的产物用该病毒的特异性核酸探针做斑点杂交,不仅能显示PCR产物的特异性,也大大提高了检出率。
A发明的详细描述
1本发明主要步骤
(1)病料的收集及样品DNA的制备
取因患病引起不同临床表现的动物、病死动物的肝脏、脾脏、心脏、肾脏、胸腺、骨髓等。按常规方法提取组织DNA,溶解于适量TE缓冲液制备成为样品DNA。
(2)扩增样品中可疑病毒的特异性核酸片段
设计可疑病毒特异性引物(F2/R2)扩增出样品DNA可疑病毒特异性核酸片段(样品PCR扩增的片段大小长于探针),如图1所示。用于扩增样品的引物(F2/R2)序列必须在探针标记用引物(F1/R1)序列之外,即被标记探针DNA序列之外;其扩增的产物长于标记探针DNA序列。
(3)地高辛PCR法标记病毒核酸探针制备及特异性及敏感性的测定
利用已知病毒基因组DNA克隆用于标记病毒核酸探针。设计引物(F1/R1)采用地高辛PCR法标记技术,进行地高辛标记制备探针,将纯化的病毒的特异性DNA片段作为标记DNA探针的模板,探针标记方法按以上试剂盒操作说明书进行。
(4)各样品及其相应PCR产物用标记的病毒核酸探针进行斑点杂交检测。
2本发明的具体描述(以鸡贫血病病毒为例)
(1)病料的收集及样品DNA的制备
取疑似鸡贫血病病毒(CAV)感染引起不同鸡群临床表现的鸡、死鸡的肝脏、脾脏、心脏、肾脏、胸腺、骨髓等。对组织样品,各取0.02g研磨,加入0.5mL DNA抽提缓冲液(100mmol/L NaCl,10mmol/L Tris-Cl,pH 8.0,0.25mmol/L EDTA,pH 8.0,0.5%SDS)和终浓度为100μg/mL的蛋白酶K,55℃消化过夜。次日,按常规方法(J.萨姆布鲁克、E.F.弗里奇、T.曼尼阿蒂斯著.金冬雁,黎孟枫等译.分子克隆实验指南第二版.科学出版社,1996)提取组织DNA,溶解于适量TE缓冲液(加适量核糖核酸酶)中,即为样品DNA。同时提取无特异性病原(SPF)鸡相应组织的DNA作阴性对照。
(2)样品DNA针对CAV的特异性核酸片段的扩增
利用提取的样品DNA分别用设计的一对引物CAV-vp1-F2和CAV-vp1-R2扩增出样品DNA的特异性核酸片段(样品1-12),片段长度及引物序列如表1所示,样品PCR扩增的片段大小长于探针,如图1所示。
表1:样品PCR所用的引物序列
Figure BDA0000146908290000031
(3)地高辛PCR法标记病毒核酸探针
1)病毒核酸探针的标记
利用本发明人保存的鸡贫血病毒CAV-vp1基因(李延鹏,崔治中.一株鸡传染性贫血病毒野毒株致病性及全基因组序列比较.微生物学报,2007年47卷5期)作为CAV特异性探针模板DNA用于标记CAV-vp1探针。用Primer5.0软件设计一对引物见表1(由上海生物工程公司合成)。采用地高辛PCR法标记技术,用罗氏公司的试剂盒(PCR DIG ProbeSynthesis Kit,Cat.No.11636090910,Version December 2005)进行地高辛标记制备探针,探针标记方法按以上试剂盒操作说明书进行。
表2:CAV病毒制备核酸探针所用的引物序列
Figure BDA0000146908290000032
2)标记探针特异性和敏感性的测定
取适当大小的尼龙膜(罗氏公司),将上述PCR扩增的探针模板(CAV-vp1基因)DNA片段稀释成500、50、5、0.5、0.05pg/μL系列浓度,分别取2μL在处理过的尼龙膜上点样。按照核酸探针标记及检测试剂盒(PCR DIG Probe Synthesis Kit,Cat.No.11636090910,Version December 2005;DIG Nucleic Acid Detection Kit,Cat.No.11175041910,VersionOctober 2008)操作说明进行预杂交、杂交和显色等步骤,以检测所制备探针的敏感性。
分别取2μL MDV-pp38基因、REV-pol基因和CAV-vp1基因(病毒特异性的DNA)作阴性对照和阳性对照,点于取适当大小的尼龙膜上,与变性的核酸探针杂交,加底物显色,以检测所制备探针的特异性。
PCR法标记的核酸探针,均只与自身病毒核酸反应显示棕褐色斑点,而与其它病毒的核酸均不显颜色,特异性很强(见图2-1)。每种核酸探针可检测到1pg量的特异性核酸片段,具有很高的灵敏度(见图3-1)。
(3)针对CAV病毒样品的PCR-电泳检测
利用提取的样品DNA扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,结果见图5-1(样品1-12,并设分子量大小的标志M:2000DL)。
(4)各样品及其相应PCR产物用CAV-vp1探针,进行斑点杂交检测
将提取的样品DNA和各样品的PCR产物分别点在NC膜上,经变性、中和、烤膜、预杂交、杂交、洗膜、碱性磷酸酶标记的ELASA检测后,通过斑点的有无判断结果。具体步骤如下(本发明所用试剂购自罗氏公司PCR DIG Probe Synthesis Kit,Cat.No.11636090910和DIG Nucleic Acid Detection Kit,Cat.No.11175041910):
1)取一张适当大小的硝酸纤维素膜(NC膜,购自罗氏公司),划好格子(0.7cm×0.7cm),做好标记。
2)把每个提取的样品DNA分别点到NC膜上。
3)NC膜(点样面朝上)放于已用变性液(0.5mol/LNaOH,1.5mol/LNaCl)饱和的双层滤纸上变性10min,再放于已用中和液(0.5mol/LTris-Cl,3.0mol/LNaCl,pH7.4)饱和的双层滤纸上中和5min。
4)NC膜室温干燥30min,然后在80℃干烤2h固定DNA。
5)将NC膜放于预杂交液(5×SSC,0.2%SDS,2%Blocking Reagen,)于68℃反应2h,期间经常摇动NC膜。
6)将探针于沸水中变性10min,取出后立即置于冰浴中冷却5min。
7)将变性的探针倒入预杂交液中,充分混匀即成杂交液,使NC膜在其中68℃(温度可调整)杂交6h以上。
8)将NC膜放于洗液I(2×SSC,0.1%SDS)中室温洗涤15min,2次。
9)将NC膜放于洗液II(0.5×SSC,0.1%SDS)中68℃洗涤15min,2次。
10)置NC膜于缓冲液I(0.1mol/L Tris-Cl,0.15mol/LNaCl,pH7.5)中洗1min。
11)置NC膜于缓冲液II(Buffer I中加入2%Blocking Reagen)中反应30min,再用缓冲液I洗1min。
12)在20ml缓冲液II中加入4μl抗狄可辛抗体的碱性磷酸酶标记物,用之前经10000r/min离心5min,),将膜放于其中37℃浸泡30min。
13)用缓冲液I洗涤NC膜;5min×5次。
14)置NC膜于缓冲液III(0.1mol/LTris-Cl,0.1mol/LNaCl,0.05mol/LMgCl2,pH9.5)中反应浸泡2min。
15)在适当大小的容器中加入10ml缓冲液III和100μl显色液(NBT和BCIP混合物),将NC膜放入其中显色一定时间,加入蒸馏水终止显色反应。
探针片段的阳性PCR产物、阴性PCR产物和长于探针片段的阳性PCR产物,斑点杂交,尼龙膜上出现了明显的褐色斑点,斑点杂交呈现阳性结果。而长于探针片段的阴性PCR产物,尼龙膜上没有出现任何斑点,斑点杂交呈现阴性结果,如图4-1所示。
(6)样品PCR电泳、斑点杂交、PCR产物斑点杂交结果
分别用PCR-电泳、斑点杂交和PCR产物斑点杂交(PCR-斑点杂交)检测各样品,检测结果见表3。PCR-电泳、斑点杂交和PCR-斑点杂交的部分结果见图5-1,图6-1。经PCR-电泳检测为阴性的某些样品,样品DNA直接经斑点杂交检测却有阳性反应;相应样品的PCR产物经斑点杂交检测却有较强的信号;某些经PCR-电泳检测目的条带模糊的样品,相应PCR产物经斑点杂交检测却有很强的信号。这些现象说明,核酸探针斑点杂交方法比PCR-电泳灵敏,运用PCR产物斑点杂交方法会更灵敏,能有效地减少漏检,充分避免PCR中的假阴性现象。
表3:PCR-电泳、斑点杂交PCR-斑点杂交结果比较
Figure BDA0000146908290000051
附图说明
图1两对引物位置及扩增片段长度
图2-1CAV探针的灵敏性检测结果、2-2MDV-pp38探针的灵敏性检测结果、2-3REV-pol探针的灵敏性检测结果A1:SPF鸡胚组织DNA,B1:1ng量的探针模板DNA,C1:100pg量的1ng量的探针模板DNA,D1:10pg量的探针模板DNA,E1:1pg量的探针模板DNA,F1:0.1pg量的探针模板DNA。
图3-1CAV探针的特异性检测结果 B1:CAV探针模板DNA;C1:SPF鸡胚组织DNA;A2:MDV-pp38基因DNA;B2:REV-pol基因DNA。
图3-2MDV-pp38探针的特异性检测结果A1:MD-pp38探针DNA;B1:SPF鸡胚组织DNA;A2:CAV-vp3DNA;B2:REV-pol DNA。
图3-3REV-pol探针的特异性检测结果A1:SPF鸡胚组织DNA;B1:REV-pol探针模板DNA;C1:MD-pp38DNA;D1:CAV-vp3DNA。
图4-1CAV-vp3两段片段的斑点杂交结果A1:探针外片段阳性PCR产物;B1:探针外片段阴性PCR产物;C1:探针阳性PCR产物;D1:探针阴性PCR产物。
图4-2:MD-pp38两段片段的斑点杂交结果A1:探针阴性PCR产物,B1:探针阳性PCR产物,C1:探针外片段阴性PCR产物,D1:探针外片段阳性PCR产物。
图4-3:REV-pol两段片段的斑点杂交结果A1:SPF鸡胚组织DNA;B1:长于探针片段DNA;C1:长于探针片段阴性PCR产物;D1:探针片段DNA;E1:探针片段阴性PCR产物
图5-1:部分样品的CAV-vp1基因的PCR-电泳结果M:2000DL;1-12:样品PCR产物结果。
图5-2:部分样品的MDV1-pp38基因的PCR-电泳结果M:2000DL;A:阳性对照;1-7:样品PCR产物结果。
图5-3:部分样品的REV-pol基因的PCR-电泳结果M:2000DL;A:阴性对照;B:阳性对照;1-7:样品PCR产物结果。
图6-1:部分样品DNA和样品PCR产物斑点杂交结果A1:双蒸水;B1:SPF鸡胚组织DNA;C1:TE buffer;D1/F1:空白对照;E1:CAV探针模板DNA;A2-F2/A4-F4:样品DNA直接斑点杂交结果;A3-F3/A5-F5:相应样品PCR产物斑点杂交结果。
图6-2部分样品DNA和样品PCR产物斑点杂交结果A1:双蒸水;1:SPF鸡胚组织DNA;C1:马立克肿瘤组织DNA;D1:探针模板DNA;A2-D3:样品DNA直接斑点杂交结果;F3-I4:样品PCR产物斑点杂交结果。
图6-3部分样品DNA和样品PCR产物斑点杂交结果A1:双蒸水,B1:SPF鸡胚组织DNA,C1:REV探针模板DNA,D1/C4:空白对照,E1-B4:样品DNA直接斑点杂交结果,D4-H6:相应样品PCR产物斑点杂交结果。
本发明的积极意义在于本发明涉及一种PCR结合核酸探针斑点杂交检测病料中I型马立克氏病病毒感染的方法。本发明将疑是I型马立克氏病病毒感染的动物(已死亡动物)组织样品DNA用针对I型马立克氏病病毒的特异性引物PCR扩增后,对PCR产物再用该病毒特异性核酸探针做斑点杂交,不仅能显示PCR产物的特异性,也大大提高了检出率。本发明试验结果表明,PCR结合核酸探针斑点杂交技术检测病料中I型马立克氏病病毒感染,可显著提高病毒感染检测的灵敏度和特异性。
实施例
本发明提供的实施例为进一步阐述本发明,但这些实施例不构成对本发明作出限制。
实施例1
PCR结合斑点杂交技术检测自然发病鸡群中MDV的感染(以I型鸡马立克氏病病毒为例)。
1病料的收集及样品DNA的制备
取疑似鸡I型马立克氏病病毒(MDV)感染引起不同鸡群临床表现的鸡、死鸡的肝脏、脾脏、心脏、肾脏、胸腺、骨髓等。对组织样品,各取0.02g研磨,加入0.5mLDNA抽提缓冲液(100mmol/L NaCl,10mmol/L Tris-Cl,pH 8.0,0.25mmol/L EDTA,pH 8.0,0.5%SDS)和终浓度为100μg/mL的蛋白酶K,55℃消化过夜。次日,按常规方法(J.萨姆布鲁克、E.F.弗里奇、T.曼尼阿蒂斯著.金冬雁,黎孟枫等译.分子克隆实验指南第二版.科学出版社,1996)提取组织DNA,溶解于适量TE缓冲液(加适量核糖核酸酶)中,即为样品DNA。同时提取无特异性病原(SPF)鸡相应组织的DNA作阴性对照。
2样品DNA针对MDV特异性核酸片段的扩增
利用提取的样品DNA分别用设计的一对引物MDV-pp38-F2和MDV-pp38-R2扩增出样品DNA特异性核酸片段(样品1-7),片段长度及引物序列如表4所示,样品PCR扩增的片段大小长于探针,如图1所示。
表4:样品PCR所用的引物序列(序列9,序列10)
Figure BDA0000146908290000071
3地高辛PCR法标记病毒核酸探针
(1)病毒核酸探针的标记利用MDV pp38基因克隆质粒(姜世金,丁家波,孟珊珊等.型马立克氏病病毒pp38和pp24基的真核表达.中国病毒学,2005年20卷4期),大小为981bp用于标记MDV-pp38探针。用Primer5.0软件设计一对引物见表5(由上海生物工程公司合成)。采用地高辛PCR法标记技术,用罗氏公司的试剂盒进行地高辛标记制备探针,探针标记方法按试剂盒操作说明进行。
表5:MD病毒制备核酸探针所用的引物序列(序列6,序列7)
Figure BDA0000146908290000081
(2)标记探针特异性和敏感性的测定
取适当大小的尼龙膜(罗氏公司),将上述PCR扩增的探针模板(MDV-pp38基因)DNA片段稀释成500、50、5、0.5、0.05pg/μL系列浓度,分别取2μL在处理过的尼龙膜上点样。按照核酸探针标记及检测试剂盒操作说明进行预杂交、杂交和显色等步骤,以检测所制备探针的敏感性。
分别取2μL CAV-vp基因1、REV-pol基因、和MDV-pp38基因(病毒特异性的DNA)点于取适当大小的尼龙膜上,与变性的核酸探针杂交,加底物显色,以检测所制备探针的特异性。
PCR法标记的核酸探针,均只与自身病毒核酸反应显示棕褐色斑点,而与其它病毒的核酸均不显颜色,特异性很强(见图2-2)。每种核酸探针可检测到1pg量的特异性核酸片段,具有很高的灵敏度(见图3-2)。
(3)针对MDV样品的PCR-电泳检测
利用提取的样品DNA扩增产物(样品1-7),并设M:2000DL和阳性对照(MDV-pp38基因DNA片段)进行琼脂糖凝胶电泳,结果见图5-2。
(4)各样品及其相应PCR产物用MD-pp38探针,进行斑点杂交检测
将提取的样品DNA和各样品的PCR产物分别点在NC膜上,经变性、中和、烤膜、预杂交、杂交、洗膜、免疫学检测后,通过斑点的有无判断结果。
探针片段的阳性PCR产物、阴性PCR产物和长于探针片段的阳性PCR产物,斑点杂交,尼龙膜上出现了明显的褐色斑点,斑点杂交呈现阳性结果。而长于探针片段的阴性PCR产物,尼龙膜上没有出现任何斑点,斑点杂交呈现阴性结果,如图4-2所示。
(5)样品PCR电泳、斑点杂交、PCR产物斑点杂交结果
分别用PCR-电泳、斑点杂交和PCR产物斑点杂交(PCR-斑点杂交)检测各样品,检测结果见表3。PCR-电泳、斑点杂交和PCR-斑点杂交的部分结果见图5-2,图6-2。经PCR-电泳检测为阴性的某些样品,样品DNA直接经斑点杂交检测却有阳性反应;相应样品的PCR产物经斑点杂交检测却有较强的信号;某些经PCR-电泳检测目的条带模糊的样品,相应PCR产物经斑点杂交检测却有很强的信号。这些现象说明,核酸探针斑点杂交方法比PCR-电泳灵敏,运用PCR产物斑点杂交方法会更灵敏,能有效地减少漏检,充分避免PCR中的假阴性现象。
PCR-电泳和斑点杂交和PCR-斑点杂交比较结果见表6。
表6MDV1PCR-电泳、斑点杂交PCR-斑点杂交结果比较
实施例2
PCR结合斑点杂交技术检测自然发病鸡群中REV病毒的感染
1病料的收集及样品DNA的制备
取疑似禽网状内皮增生病病毒(REV)感染引起不同鸡群临床表现的鸡、死鸡的肝脏、脾脏、心脏、肾脏、胸腺、骨髓等。对组织样品,各取0.02g研磨,加入0.5mLDNA抽提缓冲液(100mmol/L NaCl,10mmol/L Tris-Cl,pH 8.0,0.25mmol/L EDTA,pH 8.0,0.5%SDS)和终浓度为100μg/mL的蛋白酶K,55℃消化过夜。次日,按常规方法(J.萨姆布鲁克、E.F.弗里奇、T.曼尼阿蒂斯著.金冬雁,黎孟枫等译.分子克隆实验指南第二版.科学出版社,1996)提取组织DNA,溶解于适量TE缓冲液(加适量核糖核酸酶)中,即为样品DNA。同时提取无特异性病原(SPF)鸡相应组织的DNA作阴性对照。
2样品DNA针对REV特异性核酸片段的扩增
利用提取的样品DNA分别用设计的一对引物REV-pol-F2和REV-pol-R2扩增出样品DNA特异性核酸片段(样品1-7),片段长度及引物序列如表7所示,样品PCR扩增的片段大小长于探针,如图1所示。
表7:样品PCR所用的引物序列
Figure BDA0000146908290000092
3地高辛PCR法标记病毒核酸探针
(1)病毒核酸探针的标记利用本发明人保存的REV-pol(王玉,崔治中,姜世金.网状内皮组织增生症病毒中国分离株HA9901全基因组核苷酸序列的测定与分析,中国科学,C辑,2005,35:1-9),基因大小为3482bp,用于标记REV-pol探针。用Primer5.0软件设计一对引物见表8(由上海生工合成)。采用地高辛PCR法标记技术,用罗氏公司的试剂盒进行地高辛标记制备探针,作为标记DNA探针的模板,探针标记方法按试剂盒操作说明进行。
表8:REV病毒制备核酸探针所用的引物序列
Figure BDA0000146908290000101
(2)标记探针特异性和敏感性的测定
取适当大小的尼龙膜(罗氏公司),将上述PCR扩增的探针模板(REV-pol基因)DNA片段稀释成500、50、5、0.5、0.05pg/μL系列浓度,分别取2μL在处理过的尼龙膜上点样。按照核酸探针标记及检测试剂盒操作说明进行预杂交、杂交和显色等步骤,以检测所制备探针的敏感性。
分别取2μL CAV-vp1、MDV-pp38和REV-pol探针模板DNA点于取适当大小的尼龙膜上,与变性的核酸探针杂交,加底物显色,以检测所制备探针的特异性。
PCR法标记的核酸探针,均只与自身病毒核酸反应显示棕褐色斑点,而与其它病毒的核酸均不显颜色,特异性很强(见图2-3)。每种核酸探针可检测到1pg量的特异性核酸片段,具有很高的灵敏度(见图3-3)。
(3)针对REV样品的PCR-电泳检测
利用提取的样品DNA分别扩增REV特异性核酸片段(样品1-7),并设M:2000DL、阴性对照(SPF鸡相应组织的DNA作为模板的PCR产物)和阳性对照(用已知REV-pol基因为模板的PCR产物)进行琼脂糖凝胶电泳,结果见图5-3。
(4)各样品及其相应PCR产物用REV-pol探针,进行斑点杂交检测
将提取的样品DNA和各样品的PCR产物分别点在NC膜上,经变性、中和、烤膜、预杂交、杂交、洗膜、免疫学检测后,通过斑点的有无判断结果。
探针片段的阳性PCR产物、阴性PCR产物和长于探针片段的阳性PCR产物,斑点杂交,尼龙膜上出现了明显的褐色斑点,斑点杂交呈现阳性结果。而长于探针片段的阴性PCR产物,尼龙膜上没有出现任何斑点,斑点杂交呈现阴性结果,如图4-3所示。
(5)样品PCR电泳、斑点杂交、PCR产物斑点杂交结果
分别用PCR-电泳、斑点杂交和PCR产物斑点杂交(PCR-斑点杂交)检测各样品,检测结果见表9。PCR-电泳、斑点杂交和PCR-斑点杂交的部分结果见图5-3,图6-3。经PCR-电泳检测为阴性的某些样品,样品DNA直接经斑点杂交检测却有阳性反应;相应样品的PCR产物经斑点杂交检测却有较强的信号;某些经PCR-电泳检测目的条带模糊的样品,相应PCR产物经斑点杂交检测却有很强的信号。这些现象说明,核酸探针斑点杂交方法比PCR-电泳灵敏,运用PCR产物斑点杂交方法会更灵敏,能有效地减少漏检,充分避免PCR中的假阴性现象。
PCR-电泳和斑点杂交和PCR-斑点杂交比较结果见表9。
表9:REV PCR-电泳、斑点杂交PCR-斑点杂交结果比较
Figure BDA0000146908290000111
Figure IDA00003456652600011
Figure IDA00003456652600021
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Figure IDA00003456652600041
Figure IDA00003456652600051

Claims (2)

1.一种PCR结合核酸探针斑点杂交检测病料中I型马立克氏病病毒感染的方法,其特征在于所述病料取自病死动物的肝脏、脾脏、心脏、肾脏、胸腺、骨髓,使用针对可疑病毒的特异性引物对病料DNA进行PCR扩增后,再用该可疑病毒的特异性核酸探针对PCR扩增产物做斑点杂交; 
其中:扩增病料DNA的引物MDV-pp38-F2和MDV-pp38-R2,其序列如序列表中序列9和10所示;制备检测探针的引物MDV-pp38-F1和MDV-pp38-R1其序列如序列表中序列6和7所示。 
2.如权利要求1所述一种PCR结合核酸探针斑点杂交检测病料中I型马立克氏病病毒感染的方法,其特征在于在利用PCR结合核酸探针斑点杂交检测病料时,用于扩增病料DNA的引物MDV-pp38-F2和MDV-pp38-R2必须在探针标记用引物MDV-pp38-F1和MDV-pp38-R1之外,即MDV-pp38-F2在MDV-pp38-F1的5’-端上游而MDV-pp38-R2在MDV-pp38-R1的3’-端的下游。 
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用核酸探针和分子斑点杂交技术检测家禽病毒的核酸;王汉雷;《中国优秀硕士学位论文全文数据库 农业科技辑》;20080115;D050-205 *

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