CN102422158A - 基于免疫的重靶向内肽酶活性测定 - Google Patents
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Abstract
本发明公开SNAP-25免疫响应诱导组合物;制备α-SNAP-25抗体的方法,所述α-SNAP-25抗体选择性结合包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的表位;α-SNAP-25抗体,所述α-SNAP-25抗体选择性结合包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的表位;检测重靶向内肽酶活性的方法;以及检测中和α-重靶向内肽酶抗体的方法。
Description
本专利申请依照美国法典第35篇第119条(e)款要求2009年3月13日提交的美国临时专利申请第61/160,217号的优先权,该申请的全部内容据此以引用的方式并入本文。
本说明书中公开的序列包含在序列表中,其与本说明书一起呈递,其全部内容据此以引用的方式并入本文。
梭菌毒素(例如,肉毒杆菌神经毒素(Botulinum neurotoxin,BoNT),BoNT/A、BoNT/B、BoNT/C1、BoNT/D、BoNT/E、BoNT/F和BoNT/G;以及破伤风神经毒素(Tetanus neurotoxin,TeNT))抑制神经信号传递的能力被使用在很多治疗和美容应用中,参见例如William J.Lipham,Cosmetic and Clinical Applications ofBotulinum Toxin(Slack,Inc.,2004)。可以药物组合物形式商购的梭菌毒素包括BoNT/A制剂,例如BOTOX(Allergan,Inc.,Irvine,CA)、DYSPORT/RELOXIN(Ipsen Ltd.,Slough,England)、PURTOX(Mentor Corp.,Santa Barbara,CA)、XEOMIN(MerzPharmaceuticals,GmbH.,Frankfurt,Germany)、NEURONOX(Medy-Tox,Inc.,Ochang-myeon,South Korea)、BTX-A(Biogen-tech Ltd.,University,Yantai,Shandong,China);和BoNT/B制剂,例如MYOBLOC/NEUROBLOC(SolsticeNeurosciences,Inc.,South San Francisco,CA)。例如,BOTOX目前在一个或多个国家被批准用于以下适应症:弛缓不能、成人痉挛、肛裂、背痛、眼睑痉挛、夜间磨牙、颈肌张力障碍、原发性震颤、眉间纹或面部动力性皱纹、头痛、面肌痉挛、膀胱机能亢进、多汗症、小儿脑性瘫痪、多发性硬化症、肌阵挛性病症、鼻唇线、痉挛性发音障碍、斜视和颜面神经病症(VII nerve disorder)。
梭菌毒素治疗法通过中断用于将神经递质和神经肽分泌到突触间隙中的胞吐过程来抑制神经递质和神经肽的释放。医药工业迫切需要扩展除了当前的肌松药应用以外梭菌毒素疗法的其它用途,以治疗感觉神经疾病,例如各种类型的慢性疼痛、神经源性炎症和泌尿生殖器病症,以及其它病症,例如胰腺炎。当前用于扩展基于梭菌毒素的疗法的一种方法涉及修饰梭菌毒素,以使经过修饰的毒素对相关神经元或非神经元细胞具有改变的细胞靶向能力。这些称为重靶向内肽酶或靶向囊泡胞吐调节蛋白(Targeted Vesicular Exocytosis Modulator Protein,TVEMP)的分子通过使用存在于相关神经元或非神经元靶细胞上的靶受体来实现其胞吐抑制作用。该重靶向的能力通过用对存在于相关神经元或非神经元靶细胞中的非梭菌毒素受体显示选择性结合活性的靶向域替代梭菌毒素的天然结合域来实现。该对结合域的修饰产生能够选择性结合靶细胞上存在的非梭菌毒素受体的分子。重靶向内肽酶可结合靶受体,转位到细胞质中,并对相关神经元或非神经元靶细胞的SNARE复合物发挥其蛋白水解作用。
一组重靶向内肽酶包含具有阿片靶向域的分子。这些阿片重靶向内肽酶包含阿片靶向域、梭菌毒素转位域和梭菌毒素酶域。阿片重靶向内肽酶或阿片-TVEMP的非限制性实例描述于以下专利文献中:例如Keith A.Foster等,Clostridial Toxin DerivativesAble To Modify Peripheral Sensory Afferent Functions,美国专利5,989,545;J.Oliver Dolly等,Activatable Recombinant Neurotoxins,美国专利7,132,259;Stephan Donovan,Clostridial ToxinDerivatives and Methods For Treating Pain,美国专利7,244,437;Stephan Donovan,Clostridial Toxin Derivatives and Methods ForTreating Pain,美国专利7,413,742;Stephan Donovan,ClostridialToxin Derivatives and Methods For Treating Pain,美国专利7,415,338;Lance E.Steward等,Multivalent Clostridial ToxinDerivatives and Methods of Their Use,美国专利7,514,088;KeithA.Foster,Fusion Proteins,美国专利公开2008/0064092;Keith A.Foster,Fusion Proteins,美国专利公开2009/0035822;Lance E.Steward等,Multivalent Clos tridial Toxin Derivatives and Methodsof Their Use,美国专利公开2009/0048431;Keith A.Foster,Non-Cytotoxic Protein Conjugates,美国专利公开2009/0162341;Keith A.Foster等,Re-targeted Toxin Conjugates,国际专利公开WO 2005/023309;和Lance E.Steward,Modified Clostridial Toxinswith Enhanced Translocation Capabilities and Altered TargetingCapabilities for Non-Clostridial Toxin Target Cells,国际专利申请WO 2008/008805;各专利的全部内容据此以引用的方式并入本文。
重靶向内肽酶与梭菌毒素之间的一个主要差异是,由于重靶向内肽酶通常不靶向运动神经元,故如果过量服用不能完全避免,将在很大程度上使与哺乳动物过量服用重靶向内肽酶有关的死亡减到最少。例如,以治疗有效剂量的10,000倍的量施用阿片重靶向内肽酶时,才能观察到致死的迹象,并且该致死迹象是由分子的被动扩散而非中毒过程引起。因此,出于所有实用的目的,重靶向内肽酶是非致死性分子。尽管该非致死特性具有重要的治疗意义,但因为用于制造基于梭菌毒素的生物制剂的标准活性测定是小鼠LD50生物测定(一种致死试验),所以会引起制造方面的问题。S.S.Arnon等,JAMA 285:1059-1070(2001)。目前,所有医药制造商都使用小鼠LD50生物测定来表示其梭菌毒素制剂的效力。事实上,梭菌毒素的活性单位是小鼠LD50单位。然而,由于重靶向内肽酶基本上无致死性,故无法使用小鼠LD50生物测定来评估这些分子的效力。因此,一种可以评估重靶向内肽酶摄取过程中所有必要步骤的完整性的简单、可靠、经过验证且政府机构可接受的活性测定将具有重要价值。
本说明书提供用于测定适用于多种工业(例如制药工业和食品工业)的重靶向内肽酶的活性的新型组合物、细胞和方法,并且还提供相关益处。这些组合物、细胞和方法不使用活体动物或从活体动物上获取的组织,但能评估重靶向内肽酶起作用必需的所有步骤。
附图说明
图1示出中枢和外周神经元中神经递质释放和梭菌毒素中毒的范例的现行示意图。图1A示出中枢和外周神经元中神经递质释放机制的示意图。释放过程可描述为包括两个步骤:1)囊泡停靠,其中含有神经递质分子的囊泡的囊泡结合SNARE蛋白与位于质膜处的膜结合SNARE蛋白缔合;和2)神经递质释放,其中囊泡与质膜融合,并且神经递质分子被胞吐。图1B示出中枢和外周神经元中破伤风毒素和肉毒毒素活性的中毒机制的示意图。该中毒过程可描述为包括四个步骤:1)受体结合,其中梭菌毒素结合梭菌受体复合物,并开始中毒过程;2)复合物内化,其中在毒素结合之后,含有毒素/受体系统复合物的囊泡通过胞吞作用进入细胞中;3)轻链转位,其中认为发生了多个事件,包括囊泡内部pH值改变、形成包含梭菌毒素重链HN域的通道孔、梭菌毒素的轻链与重链分离和轻链释放;以及4)酶促靶修饰,其中梭菌毒素的轻链通过蛋白水解裂解其靶SNARE底物,例如SNAP-25、VAMP或突触融合蛋白(Syntaxin),由此阻止囊泡停靠和神经递质释放。
图2示出对过表达ORL-1的ORL-1克隆#6无性细胞系中重靶向内肽酶Noc/A的全剂量响应。Noc/A的特异性摄取可在过表达ORL-1的ORL-1克隆#6无性细胞系中观察到。在裂解的SNAP-25197的ECL ELISA中,利用Noc/A(LHN/A加结合配体痛敏肽(nociceptin)变体)和LHN/A(LC/A和不含任何结合域的HN)对ORL-1稳定细胞系克隆#6进行的处理证实:Noc/A摄取对该无性细胞系是特异的。该无性细胞系也对Noc/A显示出较强敏感性,其中EC50为1.2nM。
图3示出对SK-N-DZ单细胞源性克隆#3和#22中的Noc/A的全剂量响应。与LHN/A相比较,SK-N-DZ克隆#3和#22特异性摄取Noc/A(n=4个独立进行的实验)。在RPMI SFM+N2+B27+NGF中将细胞接种到聚D-赖氨酸96孔板上。用配混物处理22小时。裂解的SNAP-25197的ECL ELISA证实Noc/A摄取对该无性细胞系是特异的。这些无性细胞系还对Noc/A显示出较强敏感性,其中克隆#3的EC50为0.3nM,而克隆#22的EC50为0.9nM。
图4示出用重靶向内肽酶Noc/A处理的ORL1 ND7克隆1C11、4B7和4C9得到的ECL夹心ELISA测定结果。用Noc/A处理亲本ND7和ORL1 ND7克隆24小时,随后孵育2天。由于亲本ND7仅达到约50%SNAP-25197裂解,故无法计算出其EC50值。克隆4B7和1C11中有超过80%SNAP-25197裂解。计算得到三个克隆的EC50值分别为5.7±0.5、6.7±1和8.6±2nM。
图5示出抗痛敏肽多克隆抗体可阻止SK-N-DZ克隆#3、克隆#22和AGN P33 ORL-1克隆#6细胞系中重靶向内肽酶Noc/A的摄取。在RPMI SFM+N2+B27+NGF中将细胞接种到聚D-赖氨酸96孔板上,并在含有抗痛敏肽多克隆抗体的无血清培养基中处理22小时,这些抗痛敏肽多克隆抗体在1nM Noc/A稀释达到不同浓度(0-3μg/mL)。
图6示出如蛋白印迹(Western blot)图像所描述的用浓度为0.017nM到1μM的重靶向内肽酶Dyn/A处理来自SiMa克隆AF4和确立细胞系PC-12的细胞。这两种细胞系都观察到剂量依赖性摄取。
图7示出7.8nM抗体2E2A6、1D3B8、3C1A5和2C9B10以及市售MC-6050和MC-6053的归一化BIAcore SPR曲线。图7A示出每种抗体的缔合速率(on-rate)的归一化数据。图7B示出每种抗体的解离速率(off-rate)的归一化数据。
详细描述
本说明书提供用于确定样本中活性重靶向内肽酶的存在与否以及用于确定重靶向内肽酶的活性/效力的新型测定法。本说明书中公开的基于细胞的新型测定法取决于使本测定法能够检测样本中纳摩尔量的重靶向内肽酶的细胞、试剂和检测方法。本说明书中公开的基于细胞的测定法用于分析重靶向内肽酶的多种功能,即,重靶向内肽酶与细胞表面受体的结合、内肽酶-受体复合物的内化、酶域向细胞质中的转位、底物的酶域裂解。如下文的进一步论述,这些新型方法和组合物可用于分析粗制样本和大块样本以及高度纯化的双链重靶向内肽酶和配制的重靶向内肽酶产物,而且还可按照自动高通量测定形式来测定。
因此,本说明书中公开的一方面提供用于产生α-SNAP-25抗体的免疫响应诱导组合物,这些α-SNAP-25抗体可选择性结合包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物的表位。免疫响应诱导组合物可包含佐剂以及免疫响应诱导组合物,该免疫响应诱导组合物包括SNAP-25抗原、连接到SNAP-25抗原的载体、或与连接到SNAP-25抗原的柔性间隔子连接的载体,其中柔性连接子插入SNAP-25抗原与载体之间。预期引发免疫响应从而产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的任何和所有SNAP-25抗原可用作SNAP-25抗原,包括但不限于,源自天然SNAP-25的SNAP-25抗原、源自非天然SNAP-25的SNAP-25抗原以及包含SNAP-25(即,来自天然SNAP-25或非天然SNAP-25的SNAP-25)的免疫响应性片段的SNAP-25抗原。适用于产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的SNAP-25抗原包括但不限于,包含具有连接到载体肽的羧基化C-末端谷氨酰胺的SNAP-25肽的SNAP-25抗原,包括但不限于SEQ ID NO:38。适用于制备可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的其它免疫响应诱导组合物包括但不限于,包含与连接到SNAP-25抗原羧基化C-末端谷氨酰胺的柔性连接子连接的载体的免疫响应诱导组合物,其中柔性连接子插入SNAP-25抗原与载体之间。预期任任何和所有佐剂均可适用于此类免疫响应诱导组合物中,包括但不限于,聚乙二醇(PEG)、单甲氧基聚乙二醇(mPEG)、聚乙烯醇(PVA)、完全和不完全弗氏佐剂(Freund’s adjuvant)。
本说明书中公开的另一方面提供用于产生α-SNAP-25抗体的方法,这种α-SNAP-25抗体可选择性结合包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物的表位。该方法的方面包括以下步骤:(a)对动物施用本说明书中公开的SNAP-25免疫响应诱导组合物;(b)从动物收集含有α-SNAP-25抗体或α-SNAP-25抗体产生细胞的样本;和(c)从样本中分离出α-SNAP-25抗体。所公开的方法适用于制备可选择性结合包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物的表位的α-SNAP-25单克隆抗体,或可选择性结合包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物的表位的α-SNAP-25多克隆抗体。
本说明书中公开的另一方面提供α-SNAP-25抗体,其可选择性结合包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的表位。此类α-SNAP-25抗体包括天然抗体和非天然抗体,以及单克隆α-SNAP-25抗体或多克隆α-SNAP-25抗体。适用作选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的α-SNAP-25抗体的单克隆α-SNAP-25抗体包括但不限于,由杂交瘤细胞系1D3B8、2C9B10、2E2A6、3C1A5和3C3E2产生的单克隆α-SNAP-25抗体。
本说明书中公开的另一方面提供用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法。该方法的方面包括以下步骤:(a)用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感;(b)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;(c)使SNAP-25组分与本说明书中公开的α-SNAP-25抗体接触;和(d)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;其中抗体-抗原复合物的检测将指示重靶向内肽酶活性。步骤(c)中的α-SNAP-25抗体可任选连接到固相载体。
本说明书中公开的又一方面提供用于检测阿片-TVEMP活性的基于免疫的方法。该方法的方面包括以下步骤:(a)用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞可摄取重靶向内肽酶;(b)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25;(c)使SNAP-25组分与本说明书中公开的α-SNAP-25抗体接触;和(d)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25;其中抗体-抗原复合物的检测将指示重靶向内肽酶活性。步骤(c)中的α-SNAP-25抗体可任选连接到固相载体。
本说明书中公开的另一方面提供用于测定哺乳动物体内的重靶向内肽酶免疫抗性的方法。该方法的方面包括以下步骤:(a)将重靶向内肽酶加入从哺乳动物获得的用于测试α-重靶向内肽酶中和抗体的存在与否的测试样本中;(b)用测试样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性敏感;(c)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;(d)使SNAP-25组分与本说明书中公开的α-SNAP-25抗体接触;(e)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;(f)用阴性对照样本代替测试样本,重复步骤a-e;和(g)将步骤(e)中检测到的抗体-抗原复合物的量与步骤(f)中检测到的抗体-抗原复合物的量相比较,其中如果检测出步骤(e)中检测到的抗体-抗原复合物的量少于步骤(f)中检测到的抗体-抗原复合物的量,就指示存在α-重靶向内肽酶中和抗体。步骤(d)中的α-SNAP-25抗体可任选连接到固相载体。步骤(f)中的对照样本除包括阴性对照样本外,还可包括阳性对照样本。
由肉毒梭菌(Clostridium botulinum)、破伤风梭菌(Clostridiumtetani)、巴氏梭菌(Clostridium baratii)和丁酸梭菌(Clostridiumbutyricum)产生的梭菌毒素被广泛用于人类和其它哺乳动物的治疗和美容中。肉毒梭菌菌株产生7种抗原性不同的肉毒毒素(BoNT)血清型,这些血清型是通过研究肉毒中毒在人类(BoNT/A、BoNT/B、BoNT/E和BoNT/F)、动物(BoNT/C1和BoNT/D)中的发作而鉴别的,或是从土壤(BoNT/G)中分离得到。尽管所有七种肉毒毒素血清型具有类似的结构和生物特性,但其各自也呈现异质特征,例如不同的药理学特性。相比之下,破伤风毒素(TeNT)是由均一的破伤风梭菌组产生。其它两种梭菌属,即巴氏梭菌和丁酸梭菌,也分别产生类似于BoNT/F和BoNT/E的毒素。
每种梭菌毒素被翻译为约150kDa的单链多肽,该单链多肽的二硫环随后被天然蛋白酶(例如内源性梭菌毒素蛋白酶或环境中产生的天然蛋白酶)通过蛋白水解切割作用而裂解。这种翻译后加工产生双链分子,其包含约50kDa轻链(LC)和约100kDa重链(HC),二者通过单个二硫键和非共价相互作用结合在一起。每个成熟的双链分子包含三个功能上不同的域:1)酶域,位于包括金属蛋白酶区的LC中,该金属蛋白酶区含有特异性靶向神经递质释放器官的核心部分的锌依赖性内肽酶活性;2)转位域,包含在HC(HN)的氨基末端半部分之内,其促进细胞内囊泡将LC释放到靶细胞的细胞质中;和3)结合域,发现于HC(HC)的羧基末端半部分之内,其决定梭菌毒素与位于靶细胞表面的受体复合物的结合活性和结合特异性。
这三个功能域的结合、转位和酶活性均是产生毒性所必需的。虽然该过程的所有细节尚未精确获知,但梭菌毒素进入神经元并抑制神经递质释放的整个细胞中毒机制都是相似的,而不管是何种血清型或亚型。虽然申请人不希望受以下描述的限制,但是中毒机制可描述为包括至少4个步骤:1)受体结合、2)复合物内化、3)轻链转位,和4)酶促靶修饰(图1)。当梭菌毒素的HC域结合位于靶细胞质膜表面上的毒素特异性受体系统时,开始该过程。受体复合物的结合特异性被认为是部分地通过似乎明显包含各梭菌毒素受体复合物的神经节苷脂与蛋白受体的特定组合来实现。一旦结合,毒素/受体复合物就通过胞吞作用内化,且内化的囊泡被归类为特定细胞内途径。转位步骤看起来是由囊泡隔室的酸化所引发。该过程似乎会开始重要的pH依赖性结构重排,从而使疏水性增加、促进孔形成、并促使毒素重链与轻链分离。一旦重链与轻链分离,毒素的轻链内肽酶就会从胞内囊泡释放到细胞溶质中,在细胞溶质中,其似乎会特异性靶向神经递质释放器官的核心部分。这些核心蛋白,即囊泡相关膜蛋白(VAMP)/小突触囊泡蛋白、25kDa的突触体相关蛋白(SNAP-25)和突触融合蛋白,对于突触囊泡在神经末梢停靠和融合必需的,并构成可溶性N-乙基马来酰亚胺敏感因子附着蛋白受体(SNARE)家族的成员。BoNT/A和BoNT/E裂解SNAP-25的羧基末端区,分别释放出具有9个或26个氨基酸的片段,且BoNT/C1也在羧基末端附近裂解SNAP-25,释放出含8个氨基酸的片段。肉毒血清型BoNT/B、BoNT/D、BoNT/F和BoNT/G以及破伤风毒素作用于VAMP的保守中心部分,并将VAMP的氨基末端部分释放到细胞溶质中。BoNT/C1在细胞质膜表面附近的单一位点处裂解突触融合蛋白。突触SNARE的选择性蛋白水解将导致封闭体内由梭菌毒素引起的神经递质释放。梭菌毒素的SNARE蛋白质靶是多种非神经元类型中发生胞吐作用所共有的;在这些细胞中,如在神经元中,轻链肽酶活性将抑制胞吐作用,参见例如Yann Humeau等,How Botulinum and Tetanus Neurotoxins BlockNeurotransmitter Release,82(5)Biochimie.427-446(2000);Kathryn Turton等,Botulinum and Tetanus Neurotoxins:Structure,Function and Therapeutic Utility,27(11)Trends Biochem.Sci.552-558.(2002);Giovanna Lalli等,The Journey of Tetanus andBotulinum Neurotoxins in Neurons,11(9)Trends Microbiol.431-437,(2003)。
重靶向内肽酶一般用外源性蛋白酶裂解位点取代天然双链环蛋白酶裂解位点。参见例如,Dolly,J.O.等,ActivatableClostridial Toxins,美国专利7,419,676,该专利以引用的方式并入本文。尽管重靶向内肽酶的总分子量因靶向性部分的大小而不同,但活化过程和其依赖于在外源性裂解位点裂解来产生双链分子方面与梭菌毒素基本上是相同的。参见例如,Steward,L.E.等,Activatable Clostridial Toxins,美国专利公布2009/0005313;Steward,L.E.等,Modified Clostridial Toxins with EnhancedTranslocation Capabilities and Altered Targeting Activity ForNon-Clostridial Toxin Target Cells,美国专利申请11/776,075;Steward,L.E.等,Modified Clostridial Toxins with EnhancedTranslocation Capabilities and Altered Targeting Activity forClostridial Toxin Target Cells,美国专利公布2008/0241881,各专利以引用的方式并入本文。
本公开的方面部分包括用于产生α-SNAP-25抗体的免疫响应诱导组合物,所述α-SNAP-25抗体可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25。本文中使用的术语“免疫响应诱导组合物”是指包含SNAP-25抗原的组合物,当将其施用于动物时,将刺激对SNAP-25抗原的免疫响应,由此产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体。术语“免疫响应”是指动物的免疫系统对免疫响应诱导组合物的任何响应。示例性免疫响应包括但不限于:细胞以及局部和全身性体液免疫,例如CTL响应,包括CD8+CTL的抗原特异性诱导响应、辅助性T细胞响应(包括T细胞增殖响应和细胞因子释放)和B细胞响应(包括例如产生抗体的响应)。术语“诱导免疫响应”是指施用免疫响应诱导组合物或编码免疫响应诱导组合物的多核苷酸,在此过程中,免疫响应受到影响,即被刺激、引发或诱导。
SNAP-25免疫响应诱导组合物包含SNAP-25抗原。本文中使用的术语“抗原”是指引发免疫响应的分子,并且包括但不限于肽、多糖以及例如脂蛋白和糖脂等脂质的缀合物。本文中使用的术语“SNAP-25抗原”是指在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的任何抗原,其可引发免疫响应。免疫响应诱导组合物中所用的SNAP-25抗原须大到足以具有显著独特的序列,由此降低产生与除SNAP-25外的抗原发生交叉反应的抗体的可能性。此外,免疫响应诱导组合物中所用的SNAP-25抗原还必须小到足以只引发大致上针对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的免疫响应,由此增加产生可区别在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25与在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处没有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体的可能性。而且,还迫切需要产生具有单一氨基酸序列的α-SNAP-25抗体,这些抗体具有良好的产率,可再现选择性并以可接受的亲合力结合,由此允许设计出高灵敏度的测定法。
出现在SNAP-25中的BoNT/A裂解位点周围的序列表示为P5-P4-P3-P2-P1-P1’-P2’-P3’-P4’-P5’,其中P1-P1’表示易分裂键。在重靶向内肽酶裂解后,由此产生的裂解产物包含包括P5-P4-P3-P2-P1序列的片段和包括P1’-P2’-P3’-P4’-P5’的片段。因此,本文中使用的术语“在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25”是指具有作为其羧基末端氨基酸的P1残基的任何SNAP-25。例如,人SNAP-25(SEQ ID NO:5)中的Q197-R198代表BoNT/A裂解位点的P1-P1’易分裂键。因此,“具有BoNT/A裂解位点易分裂键的羧基末端谷氨酰胺的SNAP-25”就是在其羧基末端氨基酸具有谷氨酰胺的任何SNAP-25裂解产物,其中谷氨酰胺代表易分裂键中的Q197。再例如,石纹电鳐(Torpedo marmorata)SNAP-25(SEQ ID NO:16)中的K204-H205代表BoNT/A裂解位点的P1-P1’易分裂键。因此,“具有BoNT/A裂解位点易分裂键的羧基末端赖氨酸的SNAP-25”就是在其羧基末端氨基酸具有赖氨酸的任何SNAP-25裂解产物,其中赖氨酸代表易分裂键中的K204。
在BoNT/A裂解位点中BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原经过修饰,可增强未结合修饰的SNAP-25抗原、半抗原或任何其它免疫原性、非免疫原性或弱免疫原性的抗原性化合物的免疫原性。在该实施方案的一方面,可羧基化来自SNAP-25抗原的易分裂键的羧基末端P1残基。羧基化将从两个方面增加SNAP-25抗原的所需免疫原性。第一,由于带电氨基酸可增强免疫原性,故将COO-基团加入羧基末端残基将增加SNAP-25抗原的整体免疫原性。第二,由于BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基在裂解时处于带电状态,故将COO-基团加入羧基末端残基将更好地模拟本说明书中公开的α-SNAP-25抗体被设计来选择性结合的实际抗原。
在该实施方案的一方面,可通过加入适于连接SNAP-25抗原与载体蛋白的氨基酸来修饰SNAP-25抗原的氨基末端残基,该载体蛋白为例如匙孔血蓝蛋白(keyhole limpet hemacyanin,KLH)、卵清蛋白(ovalbumin,OVA)、甲状腺球蛋白(thyroglobulin,THY)、牛血清白蛋白(bovine serum albumin,BSA)、大豆胰蛋白酶抑制剂(soybean trypsin inhibitor,STI)或多连接肽(multipleattachment peptide,MAP)。例如,半胱氨酸残基可位于氨基末端,以便缀合载体蛋白KLH。
因此,在一个实施方案中,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的长度可以是例如至少5个、至少6个、至少7个、至少8个、至少9个、至少10个、至少11个、至少12个、至少13个、至少14个、至少15个、至少16个、至少17个、至少18个、至少19个、至少20个、至少25个或至少30个氨基酸。在另一实施方案中,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的长度可以是例如最多5个、最多6个、最多7个、最多8个、最多9个、最多10个、最多11个、最多12个、最多13个、最多14个、最多15个、最多16个、最多17个、最多18个、最多19个、最多20个、最多25个或最多30个氨基酸。在又一实施方案中,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的氨基酸数量可以例如介于7到12个之间、介于10到15个之间或介于13到18个之间。
在另一实施方案中,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:33。在该实施方案的方面,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:39。在另一实施方案中,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原包含SEQ IDNO:40。
在又一实施方案中,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:41。在该实施方案的方面,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46。在另一实施方案中,在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:47。
预期引发免疫响应,从而产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体的任何和所有SNAP-25抗原都可用作SNAP-25抗原。因此,包含SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45或SEQ ID NO:46的氨基酸序列变体可用作SNAP-25抗原,以引发免疫响应,从而产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体。由此,在一个实施方案中,SNAP-25抗原可通过至少1个、至少2个、至少3个、至少4个或至少5个氨基酸的取代、缺失或添加而取代成包含SEQ IDNO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45或SEQ ID NO:46的SNAP-25抗原。在另一实施方案中,SNAP-25抗原与包含SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45或SEQ ID NO:46的SNAP-25抗原可具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%的氨基酸同一性。
预期一个或多个载体可连接到SNAP-25抗原,以便增强未结合载体的免疫原性、非免疫原性或弱免疫原性SNAP-25抗原的免疫原性。非限制性实例包括例如匙孔血蓝蛋白(KLH)、卵清蛋白(OVA)、甲状腺球蛋白(THY)、牛血清白蛋白(BSA)、大豆胰蛋白酶抑制剂(STI)或多连接肽(MAP)。如本领域中众所周知的,通过将抗原与载体偶联,可使非抗原性或弱抗原性抗原具有抗原性。用于将抗原与载体偶联的各种其它载体和方法是本领域中众所周知的。参见例如,Harlow和Lane,同上文,1998a;Harlow和Lane,同上文,1998b;以及David W.Waggoner,Jr.等,Immunogenicity-enhancing carriers and compositions thereof andmethods of using the same,美国专利公布第20040057958号(2004年3月25日)。也可通过将表位表达成融合蛋白来产生表位。本领域的技术人员熟知用于表达多肽融合物的方法,如例如以下文献中所述:Ausubel等,Current Protocols in Molecular Biology(增刊47),John Wiley & Sons,New York(1999)。由于SNAP-25抗原的羧基末端必须是BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基,故载体须连接到SNAP-25抗原的氨基末端。
预期一个或多个柔性间隔子可连接到SNAP-25抗原,以便增强未结合柔性连接子的免疫原性、非免疫原性或弱免疫原性SNAP-25抗原的免疫原性。柔性间隔子可增加SNAP-25抗原的总体肽长度,并提供柔性,从而有助于将SNAP-25抗原适当地呈递到免疫细胞。如非限制性实例,SNAP-25免疫响应诱导组合物可包含与一个或多个柔性间隔子串联连接的SNAP-25抗原,以更好地将SNAP-25抗原呈递到免疫细胞,由此促进免疫响应。
包含肽的柔性间隔子的长度为至少一个氨基酸,并且包含带有小侧链R基团的不带电氨基酸,例如甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸或丝氨酸。因此,在一个实施方案中,柔性间隔子的长度可以是例如至少1个、至少2个、至少3个、至少4个、至少5个、至少6个、至少7个、至少8个、至少9个或至少10个氨基酸。在另一实施方案中,柔性间隔子的长度可以是例如至少1个、最多2个、最多3个、最多4个、最多5个、最多6个、最多7个、最多8个、最多9个或最多10个氨基酸。在另一实施方案中,柔性间隔子的氨基酸数量可例如介于1到3个之间、介于2到4个之间、介于3到5个之间、介于4到6个之间或介于5到7个之间。柔性间隔子的非限制性实例包括例如G间隔子,例如GGG、GGGG(SEQ ID NO:57)和GGGGS(SEQ ID NO:58);或A间隔子,例如AAA、AAAA(SEQ ID NO:59)和AAAAV(SEQID NO:60)。柔性间隔子框内连接到SNAP-25抗原,成为融合蛋白。
如上文所论述,使用柔性间隔子将部分增加SNAP-25抗原的总体肽长度。举例来说,具有5到10个氨基酸的SNAP-25抗原可通过将具有3到5个氨基酸的柔性间隔子连接至SNAP-25抗原的氨基末端来增加其总长度。再例如,具有5到10个氨基酸的SNAP-25抗原可通过将具有4到6个氨基酸的柔性间隔子连接至SNAP-25抗原的氨基末端来增加其总长度。再例如,具有5到10个氨基酸的SNAP-25抗原可通过将具有7到10个氨基酸的柔性间隔子连接至SNAP-25抗原的氨基末端来增加其总长度。再例如,具有7到12个氨基酸的SNAP-25抗原可通过将具有1到3个氨基酸的柔性间隔子连接至SNAP-25抗原的氨基末端来增加其总长度。再例如,具有7到12个氨基酸的SNAP-25抗原可通过将具有4到6个氨基酸的柔性间隔子连接至SNAP-25抗原的氨基末端来增加其总长度。利用柔性间隔子增加长度将允许选择尺寸较小的SNAP-25抗原,进而增加使SNAP-25抗原只引发大致上针对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的免疫响应的可能性,由此增加了产生可区别在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25与在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处没有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体的可能性。
预期本说明书中公开的SNAP-25免疫响应诱导组合物可任选包含本说明书中公开的SNAP-25抗原以及一种或多种佐剂。当结合SNAP-25免疫响应诱导组合物使用时,本文中使用的术语“佐剂”是指使针对SNAP-25抗原的免疫响应增加或多样化的任何物质或物质混合物。免疫响应诱导佐剂可例如用于减少保护性免疫所需的免疫次数或抗原量。在免疫响应诱导组合物中使用免疫响应诱导佐剂是众所周知的。使用这些佐剂的主要目的是使免疫响应增强。非限制性佐剂包括例如脂质体、油相,包括但不限于,弗氏佐剂,例如弗氏完全佐剂(FCA);弗氏不完全佐剂(FIA);皂苷元糖苷(sapogenin glycoside),例如皂苷;聚羧乙烯(carbopol);N-乙酰基胞壁酰基-L-丙氨酰基-D-异谷氨酰胺(常称为胞壁酰二肽或“MDP”);以及脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)。这样的佐剂一般是以与水相形成的乳液的形式使用,或者更常见的是,其可由不溶于水的无机盐组成。这些无机盐可由例如氢氧化铝、硫酸锌、胶状氢氧化铁、磷酸钙或氯化钙组成。氢氧化铝(Al(OH)3)是一种常用佐剂。目前,FDA批准用于人类的唯一佐剂是铝盐(Alum),其可通过使抗原沉淀来“储积”抗原。上文提供的佐剂只是示例性的。事实上,任何免疫响应诱导佐剂都可用于本说明书中公开的免疫响应诱导组合物中,只要这种佐剂能满足诱导免疫响应所需要的特征。
本说明书中公开的载体也可充当佐剂。特定佐剂以及其制备和使用方法描述于例如以下文献中:Gupta等,Vaccine,11:993-306,1993;Arnon,R.(编辑)Synthetic Vaccines 1:83-92,CRCPress,Inc.,Boca Raton,Fla.,1987;和David W.Waggoner,Jr.等,Immunogenicity-Enhancing Carriers and Compositions Thereof andMethods of Using the Same,美国专利公布第20040057958号(2004年3月25日)。其它佐剂包括Plenum Press(New York)出版的Pharmaceutical Biotechnology的″Vaccine Design,TheSubunit and Adjuvant Approach″(Powell,M.F.和Newman,M.J.编辑),第6卷,第7章(第141-227页)中所述的任何化合物。这本书中的实例包括胞壁酰二肽(MDP)和Montanide 720。如聚肌苷:胞嘧啶(Poly I:C)或含有CpG基元的质粒DNA等分子也可作为佐剂与抗原一起封装在微粒中施用。在另一实例中,佐剂是有助于使抗原性化合物进入细胞的细胞质中的试剂,例如李斯特菌素(listeriolysin)、链球菌溶血素(streptolysin)或其混合物。
因此,在一个实施方案中,SNAP-25免疫响应诱导组合物包含具有连接到载体肽的羧基化羧基末端谷氨酰胺的SNAP-25抗原。在该实施方案的方面,具有羧基化羧基末端谷氨酰胺的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:39。在该实施方案的另一方面,SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:40。在该实施方案的方面,载体肽是匙孔血蓝蛋白(KLH)、卵清蛋白(OVA)、甲状腺球蛋白(THY)、牛血清白蛋白(BSA)、大豆胰蛋白酶抑制剂(STI)或多连接肽(MAP)。
在另一实施方案中,SNAP-25免疫响应诱导组合物包含具有连接到载体肽的羧基化羧基末端赖氨酸的SNAP-25抗原。在该实施方案的方面,具有羧基化羧基末端赖氨酸的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ IDNO:44、SEQ ID NO:45或SEQ ID NO:46。在该实施方案的另一方面,SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:47。在该实施方案的方面,载体肽是匙孔血蓝蛋白(KLH)、卵清蛋白(OVA)、甲状腺球蛋白(THY)、牛血清白蛋白(BSA)、大豆胰蛋白酶抑制剂(STI)或多连接肽(MAP)。
在另一实施方案中,SNAP-25免疫响应诱导组合物包含具有连接到一个或多个柔性连接子和载体肽的羧基化C末端谷氨酰胺的SNAP-25抗原,其中柔性连接子插入SNAP-25抗原与载体肽之间。在该实施方案的方面,具有羧基化羧基末端谷氨酰胺的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38或SEQ ID NO:39。在另一实施方案中,SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:46。在该实施方案的方面,载体肽是匙孔血蓝蛋白(KLH)、卵清蛋白(OVA)、甲状腺球蛋白(THY)、牛血清白蛋白(BSA)、大豆胰蛋白酶抑制剂(STI)或多连接肽(MAP)。在该实施方案的方面,柔性连接子是G-间隔子或A-间隔子。
在又一实施方案中,SNAP-25免疫响应诱导组合物包含具有连接到柔性连接子和载体肽的羧基化C末端赖氨酸的SNAP-25抗原,其中柔性连接子插入SNAP-25抗原与载体肽之间。在该实施方案的方面,具有羧基化羧基末端赖氨酸的SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ IDNO:44、SEQ ID NO:45或SEQ ID NO:46。在该实施方案的另一方面,SNAP-25抗原包含SEQ ID NO:47。在该实施方案的方面,载体肽是匙孔血蓝蛋白(KLH)、卵清蛋白(OVA)、甲状腺球蛋白(THY)、牛血清白蛋白(BSA)、大豆胰蛋白酶抑制剂(STI)或多连接肽(MAP)。在该实施方案的方面,柔性连接子是G-间隔子或A-间隔子。
本公开的方面部分包括用于产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体的方法。可利用本领域中众所周知的多种方法来产生选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体。本领域中已知用于制备和使用抗体以及检测和测量抗体结合特异性、结合亲和力和结合亲合力的特定方案。参见例如,ANTIBODIES:ALABORATORY MANUAL(Edward Harlow & David Lane,编辑,ColdSpring Harbor Laboratory Press,第2版,1998a);和USINGANTIBODIES:A LABORATORY MANUAL:PORTABLE PROTOCOL No.I(Edward Harlow & David Lane,Cold Spring Harbor LaboratoryPress,1998b);Molecular Cloning,A Laboratory Manual,2001;以及Current Protocols in Molecular Biology,2004;David Anderson等,Therapeutic Polypeptides,Nucleic Acids Encoding Same,andMethods of Use,美国专利7,034,132(2005年4月25日);和Beatriz M.Carreno等,Antibodies Against CTLA4,美国专利7,034,121(2006年4月25日)。
在非限制性实例中,可通过对动物(例如兔、山羊、小鼠或其它哺乳动物)注射本说明书中公开的免疫响应诱导组合物的一种或多种注射剂,来产生选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25多克隆抗体。在另一非限制性实例中,可通过对卵(例如鸡蛋)注射本说明书中公开的免疫响应诱导组合物的一种或多种注射剂,来产生选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25多克隆抗体。可利用标准技术(例如使用固定抗原的酶联免疫吸附测定法(ELISA)或基于细胞的活性测定法)随时间监测免疫动物体内的抗体滴度。必要时,可从哺乳动物体内(例如血液)分离出选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的多克隆抗体,并利用众所周知的技术(例如用于获得IgG部分的蛋白质A亲和色谱法,或对用于产生抗体的肽的亲和纯化法)进行进一步纯化。
在另一非限制性实例中,可以使用杂交瘤方法产生选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体。参见例如,第6章Monoclonal Antibodies,第196-244页,Harlow和Lane,同上文,1998a;和第7章Growing Hybridomas,第245-282页,Harlow和Lane,同上文,1998a;和Goding,第59-103页,MonoclonalAntibodies:Principles and Practice,Academic Press,(1986)。在该方法中,通常将宿主动物(例如小鼠、仓鼠或另一适合的宿主动物)暴露于本说明书中公开的SNAP-25抗原的一种或一种以上注射剂下,以引出产生或能够产生α-SNAP-25抗体的淋巴细胞,所述α-SNAP-25抗体将特异性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25。可利用标准技术(例如使用固定抗原的酶联免疫吸附测定(ELISA)或基于细胞的活性测定法)随时间监测免疫动物体内的抗体滴度。或者,可以在体外使用适合的细胞培养系使淋巴细胞免疫。在免疫后一段合适时间的时候,例如当抗体滴度达到最大时,从动物体内分离出产生抗体的细胞。一般说来,如果需要人类来源的细胞,则使用外周血淋巴细胞;而如果需要非人类哺乳动物来源的细胞,则使用脾细胞或淋巴结细胞。使用适合的融合剂(例如聚乙二醇)将分离出的产生抗体的细胞与永生细胞系融合,以形成杂交瘤细胞。永生化细胞系通常是经过转化的哺乳动物细胞,尤其是啮齿动物、牛和人类来源的骨髓瘤细胞。通常,将鼠类骨髓瘤细胞系与从经过适当免疫的小鼠收获的脾细胞融合,以产生杂交瘤。优选永生细胞系为对含有次黄嘌呤(hypoxanthine)、氨基蝶呤(aminopterin)和胸苷(thymidine)(HAT)的培养基敏感的小鼠骨髓瘤细胞系。根据标准技术,多种骨髓瘤细胞系中的任一种都可用作融合配偶体,例如P3-NS1/1-Ag4-1、P3-x63-Ag8.653或Sp2/O-Ag14骨髓瘤细胞系。然后使用HAT培养基选择通过融合得到的杂交瘤细胞,这种培养基会杀死未融合和无效融合的骨髓瘤细胞(未融合的脾细胞在孵育数天后死亡,因为其没有经过转化)。然后可测定杂交瘤细胞所生长的培养基中选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体的存在。例如,在免疫沉淀测定、体外结合测定(例如放射免疫测定(RIA)或酶联免疫吸附测定(ELISA))或基于细胞的活性测定中,可以使用α-SNAP-25阳性培养基来筛选杂交瘤上清液。这些技术和测定是本领域中已知的。参见例如,第11章,Immunoprecipitation,第421-470页,Harlow和Lane,同上文,1998a;第12章,Immunoblotting,第471-510页,Harlow与Lane,同上文,1998a;第14章,Immunoassays,第553-612页,Harlow和Lane,同上文,1998a。然后可以进行其它研究来确定这种抗体是否也对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处没有羧基末端的SNAP-25不具反应性。α-SNAP-25单克隆抗体的结合亲合力也可例如通过Scatchard分析法(Scatchard analysis)来确定。参见例如,Peter J.Munson和David Rodbard,Ligand:A VersatileComputerized Approach For Characterization of Ligand-BindingSystems,107(1)Anal.Biochem.220-239(1980)。在鉴别出所需杂交瘤细胞后,使用限制性稀释程序分离来源于单个细胞的克隆,直到获得表达所需单克隆抗体的无性细胞系。选择对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25具有足够选择性且结合亲合力足够高的那些抗体进行进一步表征和研究。
用于制备选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体的另一替代性方法是用SNAP-25肽筛选重组组合免疫球蛋白文库(例如抗体噬菌体展示文库),并分离免疫球蛋白文库中结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的成员。用于产生和筛选噬菌体展示文库的试剂盒可以商购获得,例如重组噬菌体抗体系统(Recombinant Phage AntibodySystem)(Amersham GE Healthcare,Piscataway,NJ);和SurfZAPTM噬菌体展示试剂盒(Stratagene,La Jolla,CA)。此外,适用于产生和筛选抗体展示文库的方法和试剂的实例可见于例如Ladner等,美国专利5,223,409;Borrebaeck等,美国专利5,712,089;Griffiths等,美国专利5,885,793;Griffiths等,美国专利5,962,255;McCafferty等,美国专利5,969,108;Griffiths等,美国专利6,010,884;Jespers等,美国专利6,017,732;Borrebaeck等,美国专利6,027,930;Johnson等,美国专利6,140,471;McCafferty等,美国专利6,172,197,各专利的全部内容据此以引用的方式并入本文。
本公开的方面部分包括收集含有α-SNAP-25抗体或产生α-SNAP-25抗体的细胞的样本。本文中使用的术语“含有α-SNAP-25抗体或产生α-SNAP-25抗体的细胞的样本”是指含有或可能含有至少一种选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的任何生物物质。预期本方法中可以使用可含有选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的任何和所有样本,包括但不限于,血液、血浆、血清和淋巴液。还预期本方法中可以使用能够产生选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的任何细胞,包括但不限于,CD8细胞、CTL细胞、辅助性T细胞和B细胞。多种众所周知的方法可用于从个体收集含有α-SNAP-25抗体或产生α-SNAP-25抗体的细胞的样本,参见例如,Harlow和Lane,同上文,1998a;以及Harlow和Lane,同上文,1998b。类似地,也可以使用多种众所周知的方法处理样本,以分离出选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体。可以根据欲分离的抗体的类型选择用于收集样本的程序。在非限制性实例中,当分离选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25多克隆抗体时,适合的样本可以是含有此类α-SNAP-25抗体的血液样本,而当分离选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体时,适合的样本可以是产生α-SNAP-25抗体的细胞,例如脾细胞或杂交瘤。
本公开的方面部分包括从样本中分离出选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体。本领域中的技术人员众所周知用于分离此类α-SNAP-25抗体的方法,这些抗体例如为选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25多克隆抗体或选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体。参见例如,Harlow和Lane,同上文,1998a;以及Harlow和Lane,同上文,1998b。例如,可以利用众所周知的技术(例如使用蛋白质A或蛋白质G的亲和色谱法(该方法主要提供免疫血清中的IgG部分))从样本中分离出此类α-SNAP-25多克隆抗体。随后或可选地,可将特定SNAP-25抗原固定于柱或磁珠上,以通过免疫亲和层法纯化选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25多克隆抗体。可通过例如蛋白质A-琼脂糖凝胶(Sepharose)法、羟磷灰石色谱法、凝胶电泳法、透析法或亲和色谱法等常规免疫球蛋白纯化程序将选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体从培养基或腹水液中分离。
因此,在一个实施方案中,用于产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体的方法包括以下步骤:(a)对动物施用SNAP-25免疫响应诱导组合物,这种组合物包含具有连接到载体肽的羧基化C末端谷氨酰胺的SNAP-25抗原;(b)从动物收集含有α-SNAP-25抗体或产生α-SNAP-25抗体的细胞的样本;以及(c)从样本中分离出α-SNAP-25抗体组分。在该实施方案的一方面,可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体为多克隆抗体。在该实施方案的另一方面,可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体为单克隆抗体。在该实施方案的又一方面,产生的可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体为IgG亚型。在该实施方案的其它方面,SNAP-25免疫响应诱导组合物还包含佐剂,例如聚乙二醇(PEG)、单甲氧基聚乙二醇(mPEG)或聚乙烯醇(PVA)。
在另一实施方案中,用于产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体的方法包括以下步骤:(a)对动物施用SNAP-25免疫响应诱导组合物,这种组合物包含具有连接到柔性连接子和载体肽的羧基化C末端谷氨酰胺的SNAP-25肽,其中柔性连接子插入SNAP-25肽与载体肽之间;(b)从动物收集含有α-SNAP-25抗体或产生α-SNAP-25抗体的细胞的样本;以及(c)从样本中分离出α-SNAP-25抗体。在该实施方案的一方面,可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体为多克隆抗体。在该实施方案的另一方面,可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体为单克隆抗体。在该实施方案的又一方面,产生的可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体为IgG亚型。在该实施方案的其它方面,SNAP-25免疫响应诱导组合物还包含佐剂,例如聚乙二醇(PEG)、单甲氧基聚乙二醇(mPEG)或聚乙烯醇(PVA)。
本公开发明的方面部分包括分离的α-SNAP-25抗体,所述分离的α-SNAP-25抗体选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位。本文中使用的术语“抗体”是指免疫系统对特定抗原起反应而产生的特异性结合该抗原的分子,且其包括天然抗体和非天然抗体。本文中使用的术语“分离的”是指利用人类的介入使分子脱离其天然环境。例如,抗体可以为多克隆抗体、单克隆抗体、二聚体、多聚体、多特异性抗体、人源化抗体、嵌合抗体、双功能抗体、缔合细胞的抗体(如Ig受体)、线性抗体、微型双功能抗体(diabody)或微抗体,只要片段呈现所需的生物活性,还可以是这些抗体的单链衍生物。抗体可以是包含VH域和VL域以及轻链恒定域(CL)和重链恒定域CH1、CH2和CH3的全长免疫球蛋白分子,或全长免疫球蛋白分子的免疫活性片段,例如Fab片段、F(ab′)2片段、Fc片段、Fd片段、Fv片段。抗体可源自于任何脊椎动物物种(例如,人类、山羊、马、驴、鼠类、大鼠、兔或鸡),且可以属于任何类型(例如,IgG、IgE、IgM、IgD和IgA)、类别(例如,IgA、IgD、IgE、IgG和IgM)或亚类(IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)。有关天然抗体、非天然抗体和其抗原性化合物结合片段的结构的总的公开内容,参见例如,Pluckthun in The Pharmacology ofMonoclonal Antibodies,第113卷,Rosenburg和Moore编辑,Springer-Verlag,New York,第269-315页(1994);Borrabeck,Antibody Engineering,第2版(Oxford University Press 1995),各文献的全部内容据此以引用的方式并入本文。
天然抗体常常是约150,000道尔顿的异四聚体糖蛋白,由两个相同的轻(L)链和两个相同的重(H)链构成。每一轻链都借助一个共价二硫键连接到一个重链,但不同免疫球蛋白同种型的重链中二硫键的数量不同。每一重链和轻链还具有规则间隔的链内二硫键。每一重链的一端具有一个可变域(VH),随后是多个恒定域。每一轻链的一端具有一个可变域(VL),且在其另一端具有一个恒定域。轻链的恒定域与重链的第一个恒定域对准,且轻链可变域与重链可变域对准。据悉,特定的氨基酸残基形成了轻链可变域与重链可变域之间的界面。
完整的抗原识别和抗原结合位点包含在抗体可变域内,即Fv片段。该片段包括由一个重链可变域(VH)与一个轻链可变域(VL)紧密、非共价缔合形成的二聚体。每一域包含由三个高变区连接的四个框架区(framework region,FR),主要采用β折叠构型,三个高变区形成环连接,且在一些情况下形成β折叠结构的一部分。每一高变区包含对应于互补决定区(complementaritydetermining region,CDR)的氨基酸序列。总的说来,6个CDR区的三维构型界定了VH-VL二聚体表面上的抗原结合位点,从而赋予抗原结合特异性。参见例如,Cyrus Chothia,等,Conformations of Immunoglobulin Hypervariable Regions,Nature342(6252):877-883(1989);Elvin A.Kabat等,Sequences ofProteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service,National Institutes of Health,Bethesda,MD.(1991),各文献的全部内容以引用的方式并入本文。抗体的恒定域不直接参与抗体与抗原的结合,但呈现各种效应功能,例如抗体参与抗体依赖性细胞毒性过程。
靶抗原一般具有一个或多个结合位点,又称表位,可由CDR形成的抗原结合位点识别。本文中使用的“表位”与“抗原决定簇”同义,意思指例如肽、多糖或含脂质分子等靶抗原上能够特异性结合免疫球蛋白或T细胞受体,或者以其它方式与分子相互作用的位点。特异性结合不同表位的每一抗体具有不同结构。因此,一个抗原可具有一种以上的对应抗体。
多克隆抗体是指含有至少两种能够结合特定抗原的抗体的异质抗体分子群。根据定义,多克隆抗体包括结合至少两个不同表位的两种不同的抗体。本文中使用的术语“单克隆抗体”是指只含有一种能够结合特定抗原的抗体的大致上均一的抗体分子群,即,包含所述群体的个体抗体除可能少量存在的天然突变外其余都相同。根据定义,单克隆抗体结合单一表位。单克隆抗体针对单一抗原位点具有高度特异性。此外,相比多克隆抗体,每一单克隆抗体都针对抗原上的单一决定簇。除特异性外,单克隆抗体的优势还在于,其合成不会受到其它抗体的污染。修饰语“单克隆的”表示从大致上均一的抗体群获得的抗体的性质,且不应解释为需要通过任何特定方法产生抗体。例如,根据本公开使用的单克隆抗体可通过杂交瘤方法(最先由Kohler等(1975)在Nature 256:495中描述)制备;或者可通过重组DNA方法(参见例如,美国专利第4,816,567号;美国专利第5,807,715号)制备。还可以使用例如Clackson等(1991)Nature,352:624-628和Marks等(1991)J.Mol.Biol.,222:581-597中所描述的技术从噬菌体抗体文库中分离单克隆抗体。
因此,在一个实施方案中,α-SNAP-25抗体包含重链可变域(VH)和轻链可变域(VL),其选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25。在该实施方案的一方面,重链可变域(VH)为SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQID NO:76、SEQ ID NO:80、SEQ ID NO:82或SEQ ID NO:133。在该实施方案的另一方面,轻链可变域(VL)为SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:88、SEQ ID NO:90或SEQ ID NO:92。
在另一实施方案中,核酸序列编码包含重链可变域(VH)和轻链可变域(VL)且选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体。在该实施方案的一方面,重链可变域(VH)由核酸序列SEQ ID NO:71、SEQID NO:73、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81或SEQ ID NO:132编码。在该实施方案的另一方面,重链可变域(VH)由与SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:73、SEQID NO:75、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:79、SEQ ID NO:81或SEQ ID NO:132具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%的同一性的核酸序列编码。在该实施方案的另一方面,轻链可变域(VL)由SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:87、SEQ ID NO:89或SEQ ID NO:91编码。在该实施方案的又一方面,轻链可变域(VL)由与SEQ ID NO:83、SEQ ID NO:85、SEQID NO:87、SEQ ID NO:89或SEQ ID NO:91具有至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%的同一性的核酸序列编码。
在另一实施方案中,α-SNAP-25抗体包含重链可变域(VH)的CDR1区、CDR2区、CDR3区或其任何组合,该抗体选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25。在该实施方案的一方面,重链可变域(VH)的CDR1区为SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:94、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:118、SEQ ID NO:119或SEQ ID NO:120。在该实施方案的另一方面,重链可变域(VH)的CDR2区为SEQ ID NO:96、SEQ ID NO:97、SEQ ID NO:98、SEQ ID NO:99、SEQ ID NO:121、SEQ IDNO:122或SEQ ID NO:123。在该实施方案的又一方面,重链可变域(VH)的CDR3区为SEQ ID NO:100、SEQ ID NO:101、SEQID NO:102、SEQ ID NO:124、SEQ ID NO:134或SEQ ID NO:135。
在另一实施方案中,α-SNAP-25抗体包含轻链可变域(VL)的CDR1区、CDR2区、CDR3区或其任何组合,该抗体选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25。在该实施方案的一方面,轻链可变域(VL)的CDR1区为SEQ ID NO:103、SEQ ID NO:104、SEQ ID NO:105、SEQ IDNO:106、SEQ ID NO:107、SEQ ID NO:125、SEQ ID NO:126、SEQ ID NO:127、SEQ ID NO:128或SEQ ID NO:129。在该实施方案的另一方面,轻链可变域(VL)的CDR2区为SEQ ID NO:108、SEQ ID NO:109、SEQ ID NO:110、SEQ ID NO:111或SEQID NO:112。在该实施方案的又一方面,轻链可变域(VL)的CDR3区为SEQ ID NO:113、SEQ ID NO:114、SEQ ID NO:115、SEQID NO:116或SEQ ID NO:117。
在另一实施方案中,α-SNAP-25抗体特异性结合表位,该表位包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25。在该实施方案的一方面,表位包含SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36或SEQ ID NO:37。在该实施方案的一方面,表位包含SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44。
如上文所论述,存在于SNAP-25中的BoNT/A裂解位点周围的序列表示为P5-P4-P3-P2-P1-P1’-P2’-P3’-P4’-P5’,其中P1-P1’表示易分裂键。在BoNT/A裂解后,由此产生的裂解产物包含包括P5-P4-P3-P2-P1序列的片段和包括P1’-P2’-P3’-P4’-P5’的片段。本文中使用的术语“选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体”是指选择性结合包含P5-P4-P3-P2-P1序列的任何SNAP-25裂解产物片段,但不结合包含P1’-P2’-P3’-P4’-P5’序列的任何SNAP-25裂解产物片段或具有完整BoNT/A裂解位点的P1-P1’易分裂键的任何SNAP-25的α-SNAP-25抗体。本文中使用的术语“α-SNAP-25197抗体”是指选择性结合羧基末端P1残基对应于SEQ ID NO:5中的谷氨酰胺197的SNAP-25的抗体。本文中使用的术语“α-SNAP-25204抗体”是指选择性结合羧基末端P1残基对应于SEQ ID NO:16中的赖氨酸204的SNAP-25的抗体。
本文中使用的术语“选择性”是指具有独特作用或影响,或者只按一种方式或只与一种物质反应。当用于抗体时,本文中使用的术语“选择性结合”是指抗体与指定靶表位有差别地结合,以致抗体大致上不与非靶表位交叉反应。本文中定义的肽表位的最小尺寸为约5个氨基酸,且肽表位通常包含至少5个、至少6个、至少7个、至少8个、至少9个、至少10个、至少15个或至少20个氨基酸。肽表位可以是非连续的,即,其包含的氨基酸残基在肽的一级结构中不相邻,但借助于肽的二级结构、三级结构或四级结构连在一起成为表位。此外,还应注意,表位可能包含除氨基酸序列外的分子的一部分,例如碳水化合物部分、如脂蛋白或糖脂等脂质部分,或如磷酸化氨基酸等经过化学修饰的氨基酸部分。在该实施方案的方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位,该表位包含至少5个、至少6个、至少7个、至少8个、至少9个、至少10个、至少15个或至少20个氨基酸。在该实施方案其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位,该表位包含最多5个、最多6个、最多7个、最多8个、最多9个、最多10个、最多15个或最多20个氨基酸。
选择性结合包括例如结合亲和力、结合特异性和结合亲合力等结合特性。参见David J.King,Applications and Engineering ofMonoclonal Antibodies,第240页(1998)。结合亲和力是指抗体在其表位结合位点停留的时间长度,并且可以视为抗体结合其表位的强度。结合亲和力可以用抗体的平衡解离常数(dissociationconstant,KD)来描述,平衡解离常数定义为平衡时Kd/Ka的比。其中Ka是抗体的缔合速率常数,kd是抗体的解离速率常数。结合亲和力是由缔合作用和解离作用一起决定,且仅有高缔合作用或低解离作用都无法确保高亲和力。缔合速率常数(associationrate constant,Ka),或结合速率常数(on-rate constant,Kon)是单位时间内结合事件的数量,或抗体与抗原可逆缔合形成其抗体-抗原复合物的倾向的量度。缔合速率常数是以M-1s-1为单位表示,且用符号表示如下:[Ab]×[Ag]×Kon。缔合速率常数越大,则抗体与其抗原的结合就越快,或者抗体与抗原之间的结合亲和力越高。解离速率常数(dissociation rate constant,Kd)或分解速率常数(off-rate constant,Koff)是单位时间内解离事件的数量,或抗体-抗原复合物可逆分离(解离)成其组分分子(即抗体和抗原)的倾向的量度。解离速率常数是以s-1为单位表示,且用符号表示如下:[Ab+Ag]×Koff。解离速率常数越小,抗体与其抗原的结合就越紧密,或者抗体与抗原之间的结合亲和力越高。平衡解离常数(KD)是平衡时形成新抗体-抗原复合物的速率等于抗体-抗原复合物解离的速率的量度。平衡解离常数是以M为单位表示,且定义为Koff/Kon=[Ab]×[Ag]/[Ab+Ag],其中[Ab]是抗体的摩尔浓度,[Ag]是抗原的摩尔浓度,且[Ab+Ag]是抗体-抗原复合物的摩尔浓度,其中所有浓度都是当系统达到平衡时这些组分的浓度。平衡解离常数越小,则抗体与其抗原的结合就越紧密,或抗体与抗原之间的结合亲和力越高。
因此,在一个实施方案中,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如小于1×105M-1s-1、小于1×106M-1s-1、小于1×107M-1s-1或小于1×108M-1s-1的缔合速率常数。在另一实施方案中,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如大于1×105M-1s-1、大于1×106M-1s-1、大于1×107M-1s-1或大于1×108M-1s-1的缔合速率常数。在其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有介于1×105M-1s-1至1×108M-1s-1、1×106M-1s-1至1×108M-1s-1、1×105M-1s-1至1×107M-1s-1或1×106M-1s-1至1×107M-1s-1之间的缔合速率常数。
在另一实施方案中,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有小于1×10-3s-1、小于1×10-4s-1或小于1×10-5s-1的解离速率常数。在该实施方案的其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如小于1.0x 10-4s-1、小于2.0x 10-4s-1、小于3.0x 10-4s-1、小于4.0x 10-4s-1、小于5.0x 10-4s-1、小于6.0x 10-4s-1、小于7.0x 10-4s-1、小于8.0x 10-4s-1或小于9.0x 10-4s-1的解离速率常数。在另一实施方案中,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如大于1×10-3s-1、大于1×10-4s-1或大于1×10-5s-1的解离速率常数。在该实施方案其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如大于1.0x 10-4s-1、大于2.0x 10-4s-1、大于3.0x 10-4s-1、大于4.0x 10-4s-1、大于5.0x10-4s-1、大于6.0x 10-4s-1、大于7.0x 10-4s-1、大于8.0x 10-4s-1或大于9.0x 10-4s-1的解离速率常数。
在另一实施方案中,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有小于0.500nM的平衡解离常数。在该实施方案的方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如小于0.500nM、小于0.450nM、小于0.400nM、小于0.350nM、小于0.300nM、小于0.250nM、小于0.200nM、小于0.150nM、小于0.100nM或小于0.050nM的平衡解离常数。在另一实施方案中,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有大于0.500nM的平衡解离常数。在该实施方案的方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如大于0.500nM、大于0.450nM、大于0.400nM、大于0.350nM、大于0.300nM、大于0.250nM、大于0.200nM、大于0.150nM、大于0.100nM或大于0.050nM的平衡解离常数。
在另一实施方案中,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如小于1×100M-1s-1、小于1×101M-1s-1、小于1×102M-1s-1、小于1×103M-1s-1或小于1×104M-1s-1的针对完整SNAP-25的缔合速率常数。在另一实施方案中,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合亲和力可具有例如最多1×100M-1s-1、最多1×101M-1s-1、最多1×102M-1s-1、最多1×103M-1s-1或最多1×104M-1s-1的针对完整SNAP-25的缔合速率常数。
结合特异性是抗体区分含其表位的分子与不含该表位的分子的能力。测量结合特异性的一种方式是将抗体对含其表位的分子的Kon缔合速率与抗体对不含该表位的分子的Kon缔合速率相比较。例如,比较α-SNAP-25抗体对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的缔合速率常数(Ka)与对不包含该表位的SNAP-25(例如在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处没有羧基末端的SNAP-25表位或具有BoNT/A裂解位点的完整P1-P1’易分裂键的SNAP-25表位)的缔合速率常数(Ka)。在该实施方案的方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对不包含其表位的SNAP-25的缔合速率常数(Ka)例如小于1×100M-1s-1、小于1×101M-1s-1、小于1×102M-1s-1、小于1×103M-1s-1或小于1×104M-1s-1。在该实施方案的其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对不包含其表位的SNAP-25缔合速率常数(Ka)为例如最多1×100M-1s-1、最多1×101M-1s-1、最多1×102M-1s-1、最多1×103M-1s-1或最多1×104M-1s-1。
在该实施方案的另一方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对其表位的缔合速率常数(Ka)是对不包含该表位的SNAP-25的Ka的例如至少2倍以上、至少3倍以上、至少4倍以上、至少5倍以上、至少6倍以上、至少7倍以上、至少8倍以上或至少9倍以上。在该实施方案的其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对其表位的缔合速率常数(Ka)是对不包含该表位的SNAP-25的Ka的例如至少10倍多、至少100倍多、至少1,000倍多或至少10,000倍多。在该实施方案的其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对其表位的缔合速率常数(Ka)是对不包含该表位的SNAP-25的Ka的例如最多1倍以上、最多2倍以上、最多3倍以上、最多4倍以上、最多5倍以上、最多6倍以上、最多7倍以上、最多8倍以上或最多9倍以上。在该实施方案的其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对其表位的缔合速率常数(Ka)是对不包含该表位的SNAP-25的Ka的例如最多10倍以上、最多100倍以上、最多1,000倍以上或最多10,000倍以上。
选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体的结合特异性也可以比率形式表征,致使此类α-SNAP-25抗体可区分其SNAP-25表位与不包含该表位的SNAP-25(例如在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处没有羧基末端的SNAP-25表位或具有BoNT/A裂解位点的完整P1-P1’易分裂键的SNAP-25表位)。在该实施方案的方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对其SNAP-25表位与对不包含该表位的SNAP-25的结合特异性比率为例如至少2∶1、至少3∶1、至少4∶1、至少5∶1、至少64∶1、至少7∶1、至少8∶1、至少9∶1、至少10∶1、至少15∶1、至少20∶1、至少25∶1、至少30∶1、至少35∶1或至少40∶1。在该实施方案的其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对其SNAP-25表位与对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处没有羧基末端的SNAP-25的结合特异性比率为例如至少2∶1、至少3∶1、至少4∶1、至少5∶1、至少6∶1、至少7∶1、至少8∶1、至少9∶1、至少10∶1、至少15∶1、至少20∶1、至少25∶1、至少30∶1、至少35∶1或至少40∶1。在该实施方案的其它方面,选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体对其SNAP-25表位与对具有BoNT/A裂解位点的完整P1-P1’易分裂键的SNAP-25的结合特异性比率为例如至少2∶1、至少3∶1、至少4∶1、至少5∶1、至少64∶1、至少7∶1、至少8∶1、至少9∶1、至少10∶1、至少15∶1、至少20∶1、至少25∶1、至少30∶1、至少35∶1或至少40∶1。
结合亲合力,又称功能性亲和力,是指多价抗体与其抗原之间功能性结合强度的总和。抗体分子可具有一个以上结合位点(例如,对于IgG是2个,对于IgM是10个),而且许多抗原含有一个以上抗原位点。尽管抗体的结合亲合力取决于个体抗体结合位点的结合亲和力,但由于所有抗体-抗原相互作用必须在抗体完全解离的同时破坏,故结合亲合力大于结合亲和力。预期选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体可选择性结合该抗体的任何和所有表位。
因此,在一个实施方案中,α-SNAP-25抗体为选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体。在该实施方案的方面,α-SNAP-25抗体为选择性结合具有羧基末端谷氨酰胺的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体,或选择性结合具有羧基末端赖氨酸的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体。在该实施方案的其它方面,α-SNAP-25抗体为选择性结合具有对应于SEQ ID NO:5中的谷氨酰胺197的羧基末端P1残基的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体,或选择性结合具有对应于SEQ ID NO:16中的赖氨酸204的羧基末端P1残基的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体。在该实施方案的其它方面,α-SNAP-25抗体为选择性结合具有SEQ ID NO:32、SEQID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45或SEQ ID NO:46的羧基末末端氨基酸序列的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体。
本公开的方面部分包括用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法。本说明书中公开的基于免疫的方法可以通过几个参数来评估,这些参数包括例如准确度、精确度、检测限(limit ofdetection,LOD)、定量限(limits of quantitation,LOQ)、范围、特异性、选择性、线性、重现性和系统适应性。方法的准确度是分析方法的正确性或测量值与作为公认的常规真值或公认参考值的值之间的一致接近度的量度。方法的精确度是当对同种样本的多次取样试样重复应用本程序时个别测试结果之间的一致程度。因此,精确度将评估1)测定法内可变性;2)日内可变性(可重复性);以及3)日间可变性(中间精确度);和4)实验室间可变性(可再现性)。变异系数(CV%)是相对于观察平均值或理论平均值所表达的精确度的定量度量。
本说明书中公开的基于免疫的方法须能够在背景上检测包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25抗体-抗原复合物的存在。方法的检测限(LOD)是指分析物产生与阴性对照物或空白明显不同的信号的浓度,并且表示可与背景相区别的分析物的最低浓度。
因此,在一个实施方案中,本说明书中公开的基于免疫的方法可检测重靶向内肽酶的LOD,其中重靶向内肽酶的量明显不同于阴性对照物或空白的量。在该实施方案的一方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如10ng或更少、9ng或更少、8ng或更少、7ng或更少、6ng或更少、5ng或更少、4ng或更少、3ng或更少、2ng或更少、1ng或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如900pg或更少、800pg或更少、700pg或更少、600pg或更少、500pg或更少、400pg或更少、300pg或更少、200pg或更少、100pg或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如90pg或更少、80pg或更少、70pg或更少、60pg或更少、50pg或更少、40pg或更少、30pg或更少、20pg或更少、10pg或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如9pg或更少、8pg或更少、7pg或更少、6pg或更少、5pg或更少、4pg或更少、3pg或更少、2pg或更少、1pg或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如0.9pg或更少、0.8pg或更少、0.7pg或更少、0.6pg或更少、0.5pg或更少、0.4pg或更少、0.3pg或更少、0.2pg或更少、0.1pg或更少的重靶向内肽酶。
在该实施方案的另一方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如100nM或更少、90nM或更少、80nM或更少、70nM或更少、60nM或更少、50nM或更少、40nM或更少、30nM或更少、20nM或更少、10nM或更少、9nM或更少、8nM或更少、7nM或更少、6nM或更少、5nM或更少、4nM或更少、3nM或更少、2nM或更少或1nM或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如900pM或更少、800pM或更少、700pM或更少、600pM或更少、500pM或更少、400pM或更少、300pM或更少、200pM或更少或100pM或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如100pM或更少、90pM或更少、80pM或更少、70pM或更少、60pM或更少、50pM或更少、40pM或更少、30pM或更少、20pM或更少或10pM或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOD为例如10pM或更少的重靶向内肽酶、9pM或更少、8pM或更少、7pM或更少、6pM或更少、5pM或更少、4pM或更少、3pM或更少、2pM或更少或1pM或更少的重靶向内肽酶。
定量限(LOQ)为可以可接受的准确度和精确度水平测量的样本或试样中分析物的最低浓度和最高浓度。定量下限是指检测方法始终能从背景中测量到的最低剂量。定量上限为在信号出现饱和前检测方法始终能检测到的最高浓度。方法的线性范围为定量下限与定量上限之间的区域。线性范围是通过用定量上限减去定量下限计算得到的。本文中使用的术语“下渐近线的信噪比”是指本方法在检测下限检测到的信号与背景信号的比率。本文中使用的术语“上渐近线的信噪比”是指本方法在检测上限检测到的信号与背景信号的比率。
因此,在一个实施方案中,本说明书中公开的基于免疫的方法可检测重靶向内肽酶的LOQ,其中重靶向内肽酶的量明显不同于阴性对照物或空白的量。在该实施方案的一方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如10ng或更少、9ng或更少、8ng或更少、7ng或更少、6ng或更少、5ng或更少、4ng或更少、3ng或更少、2ng或更少、1ng或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如900pg或更少、800pg或更少、700pg或更少、600pg或更少、500pg或更少、400pg或更少、300pg或更少、200pg或更少、100pg或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如90pg或更少、80pg或更少、70pg或更少、60pg或更少、50pg或更少、40pg或更少、30pg或更少、20pg或更少、10pg或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如9pg或更少、8pg或更少、7pg或更少、6pg或更少、5pg或更少、4pg或更少、3pg或更少、2pg或更少、1pg或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如0.9pg或更少、0.8pg或更少、0.7pg或更少、0.6pg或更少、0.5pg或更少、0.4pg或更少、0.3pg或更少、0.2pg或更少、0.1pg或更少的重靶向内肽酶。
在该实施方案的另一方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如100nM或更少、90nM或更少、80nM或更少、70nM或更少、60nM或更少、50nM或更少、40nM或更少、30nM或更少、20nM或更少、10nM或更少、9nM或更少、8nM或更少、7nM或更少、6nM或更少、5nM或更少、4nM或更少、3nM或更少、2nM或更少或1nM或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如900pM或更少、800pM或更少、700pM或更少、600pM或更少、500pM或更少、400pM或更少、300pM或更少、200pM或更少或100pM或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如100pM或更少、90pM或更少、80pM或更少、70pM或更少、60pM或更少、50pM或更少、40pM或更少、30pM或更少、20pM或更少或10pM或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,本说明书中公开的基于免疫的方法的LOQ为例如10pM或更少的重靶向内肽酶、9pM或更少、8pM或更少、7pM或更少、6pM或更少、5pM或更少、4pM或更少、3pM或更少、2pM或更少或1pM或更少的重靶向内肽酶。
适用于所公开的方法的实践方面的基于免疫的测定的精确度须不超过50%。在该实施方案的方面,基于免疫的测定的精确度不超过50%、不超过40%、不超过30%或不超过20%。在该实施方案的其它方面,基于免疫的测定的精确度不超过15%、不超过10%或不超过5%。在该实施方案的其它方面,基于免疫的测定的精确度不超过4%、不超过3%、不超过2%或不超过1%。
适用于所公开的方法的实践方面的基于免疫的测定的准确度须为至少50%。在该实施方案的方面,基于免疫的测定的准确度为至少50%、至少60%、至少70%或至少80%。在该实施方案的其它方面,基于免疫的测定的准确度为至少85%、至少90%或至少95%。在该实施方案的其它方面,基于免疫的测定的准确度为至少96%、至少97%、至少98%或至少99%。
本说明书中公开的基于免疫的方法须具有统计上显著的下渐近线的信噪比以及统计上显著的上渐近线的信噪比。在该实施方案的方面,本说明书中公开的基于免疫的方法在下渐近线的信噪比为例如至少3∶1、至少4∶1、至少5∶1、至少6∶1、至少7∶1、至少8∶1、至少9∶1、至少10∶1、至少15∶1或至少20∶1。在该实施方案的其它方面,基于免疫的方法在上渐近线的信噪比为例如至少10∶1、至少15∶1、至少20∶1、至少25∶1、至少30∶1、至少35∶1、至少40∶1、至少45∶1、至少50∶1、至少60∶1、至少70∶1、至少80∶1、至少90∶1或至少100∶1、至少150∶1、至少200∶1、至少250∶1、至少300∶1、至少350∶1、至少400∶1、至少450∶1、至少500∶1、至少550∶1或至少600∶1。
方法的特异性定义为这种方法排除其它相关组分(例如部分活性或无活性分析物)测量相关分析物的能力。方法的选择性将描述分析方法区别样本中各种物质的能力。方法的线性是其引起直接或通过明确确定的数学变换与样本中分析物的浓度成比例的结果的能力。因此,在一个实施方案中,本说明书中公开的基于免疫的方法可将具有完全活性的重靶向内肽酶与活性是具有完全活性的重靶向内肽酶的例如70%或更少、60%或更少、50%或更少、40%或更少、30%或更少、20%或更少或者10%或更少的具有部分活性的重靶向内肽酶区分开来。
方法的重现性为在正常(但可变化)的测试条件下由相同样本得到的测试结果的可再现性。一种程序的稳健性是其在方法参数较小但有意的变动下仍保持不受影响的能力的量度,并且提供了其在正常使用中的可靠性的指示。因此,重现性评估不能避免的变化,而稳健性则评估有意的变化。利用重现性和稳健性评估的典型参数包括冷冻/解冻、孵育时间、孵育温度、试剂使用期限、样本制备、样本储存、细胞传代数、重靶向内肽酶批次、纯化之间的变化性以及切口反应之间的变化性的影响。基于细胞的测定的稳健性参数包括细胞库(冷冻开始、期间和结束)、细胞传代水平、细胞接种密度、细胞储备液密度(在培养液中孵育多少天)、烧瓶中的胞龄(等待接种的时间)、孵育时间、不同的板、过量血清和试剂来源。方法的系统适应性是通过参照标准或参照分子的分析随时间进行的测定性能(包括试剂和仪器的性能)的测定,包括试剂和仪器的性能。系统适应性在FDA指南中提到设备、电子仪器、测定性能和欲分析的样本构成完整系统的事实时强调过。系统适应性可通过进行平行测试来评估,平行测试是指,当将对数剂量相对于响应作图时,参照物的连续稀释与样本的连续稀释应产生平行曲线。
本公开的方面部分包括来自确立细胞系的细胞。本文中使用的术语“细胞”是指对重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感的任何真核细胞,或可摄取重靶向内肽酶的任何真核细胞。术语细胞涵盖来自多种生物体的细胞,例如鼠类、大鼠、猪、牛、马、灵长类动物和人类的细胞;来自多种细胞类型的细胞,例如神经元和非神经元细胞;且这些细胞可从异质细胞群、组织或生物体分离,或者作为异质细胞群、组织或生物体的一部分。本文中使用的术语“确立细胞系”与“永生细胞系”或“转化的细胞系”同义,且是指为由源自于某一生物体、组织或器官来源的细胞群的无限繁殖而选择的细胞的细胞培养物。根据定义,确立细胞系不包括原代细胞的细胞培养物。本文中使用的术语“原代细胞”是直接从新鲜组织或器官收获的细胞,并且这些细胞没有发生无限繁殖的潜能。确立细胞系可以包含异质细胞群或均一细胞群。源自于单个细胞的确立细胞系称为无性细胞系。确立细胞系可以是所含细胞内源性表达使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解SNAP-25底物所需的所有组分的细胞系,所述细胞机制涵盖重靶向内肽酶与其受体的结合、内肽酶/受体复合物的内化、重靶向内肽酶轻链由细胞内囊泡转位到细胞质中以及SNAP-25的蛋白水解裂解。或者,确立细胞系可以是所含细胞从外源性来源引入至少一种使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解SNAP-25底物所需的组分的细胞系,所述细胞机制涵盖重靶向内肽酶与其受体的结合、内肽酶/受体复合物的内化、重靶向内肽酶轻链由细胞内囊泡转位到细胞质中以及SNAP-25的蛋白水解裂解。确立细胞系又称为遗传工程改造的细胞系,来自此类确立细胞系的细胞可例如表达外源性重靶向内肽酶,例如外源性ORL1、外源性DOR、外源性KOR、外源性MOR、外源性甘丙肽受体1、外源性甘丙肽受体2、外源性甘丙肽受体3或其任何组合。
本公开的方面部分包括来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞。本文中使用的术语“对重靶向内肽酶活性敏感的细胞”、“对重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感的细胞”或“来自确立细胞系的对重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感的细胞”是指可经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解SNAP-25底物,从而抑制胞吐作用的细胞,所述细胞机制涵盖重靶向内肽酶与其受体的结合、内肽酶/受体复合物的内化、重靶向内肽酶活性链由细胞内囊泡转位到细胞质中以及SNAP-25的蛋白水解裂解。根据定义,对重靶向内肽酶活性敏感的细胞必须表达,或被工程改造成表达至少一种重靶向内肽酶受体和至少一种SNAP-25底物。本文中使用的术语“可摄取重靶向内肽酶的细胞”或“构成确立细胞系的可摄取重靶向内肽酶的细胞”是指可经历经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解SNAP-25底物,从而抑制胞吐作用的细胞,所述细胞机制涵盖靶向内肽酶与其受体的结合、内肽酶/受体复合物的内化、重靶向内肽酶轻链由细胞内囊泡转位到细胞质中以及SNAP-25的蛋白水解裂解。根据定义,可摄取重靶向内肽酶的细胞必须表达,或被工程改造成表达至少一种重靶向内肽酶受体和至少一种SNAP-25底物。
因此,在一个实施方案中,来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性敏感。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的细胞对例如约100nM或更少、约90nM或更少、约80nM或更少、约70nM或更少、约60nM或更少、约50nM或更少、约40nM或更少、约30nM或更少、约20nM或更少、约10nM或更少的重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感。在其它方面,来自确立细胞系的细胞对例如约9nM或更少、约8nM或更少、约7nM或更少、约6nM或更少、约5nM或更少、约4nM或更少、约3nM或更少、约2nM或更少或者约1nM或更少的重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感。在其它方面,来自确立细胞系的细胞对例如约0.9nM或更少、约0.8nM或更少、约0.7nM或更少、约0.6nM或更少、约0.5nM或更少、约0.4nM或更少、约0.3nM或更少、约0.2nM或者约0.1nM或更少的重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感。当定量指定项目、数字、百分比或术语的值时,本文中使用的术语“约”是指该指定项目、百分比、参数或术语的值±10%的范围。
在另一实施方案中,构成确立细胞系的细胞可摄取重靶向内肽酶。在该实施方案的方面,构成确立细胞系的细胞可摄取例如约100nM或更少、约90nM或更少、约80nM或更少、约70nM或更少、约60nM或更少、约50nM或更少、约40nM或更少、约30nM或更少、约20nM或更少、约10nM或更少的重靶向内肽酶。在其它方面,构成确立细胞系的细胞能够摄取约9nM或更少、约8nM或更少、约7nM或更少、约6nM或更少、约5nM或更少、约4nM或更少、约3nM或更少、约2nM或更少或者约1nM或更少的重靶向内肽酶。在其它方面,构成确立细胞系的细胞能够摄取约0.9nM或更少、约0.8nM或更少、约0.7nM或更少、约0.6nM或更少、约0.5nM或更少、约0.4nM或更少、约0.3nM或更少、约0.2nM或更少或者约0.1nM或更少的重靶向内肽酶。
本公开的方面部分包括来自确立细胞系的对本说明书中公开的重靶向内肽酶呈现选择性结合的细胞。当提到重靶向内肽酶时,本文中使用的术语“选择性结合”是指重靶向内肽酶与指定靶受体有差别地结合,以致重靶向内肽酶大致上不结合非靶受体。来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶呈现选择性结合的程度可通过这些细胞对不含重靶向内肽酶的靶向域的分子呈现非选择性摄取的程度来测量。评估对不含重靶向内肽酶的靶向域的分子的非选择性摄取的一种方式是:测量LHN片段的非选择性摄取。LHN片段是包含梭菌毒素转位域和梭菌毒素酶域,但完全缺乏任何靶向域的片段。LHN片段的非限制性实例包括LHN/A片段、LHN/B片段、LHN/C片段、LHN/D片段、LHN/E片段、LHN/F片段和LHN/G片段。示例性LHN/A片段为SEQ ID NO:146,该序列由多核苷酸分子SEQ ID NO:147编码。
因此,在一个实施方案中,来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶呈现选择性结合。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的细胞对表现出活性为例如活性是所测定的总活性的至少75%、所测定的总活性的至少80%、所测定的总活性的至少85%、所测定总活性的至少90%或所测定的总活性的至少95%的重靶向内肽酶呈现选择性结合。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞对表现出活性为例如所测定的总活性的约75%到约100%、所测定的总活性的约80%到约100%、所测定的总活性的约85%到约100%、所测定的总活性的约90%到约100%的重靶向内肽酶呈现选择性结合。
在另一实施方案中,来自确立细胞系的细胞呈现最少的对LHN片段的非选择性摄取。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的细胞呈现的对LHN片段的非选择性摄取量为例如所测量的总摄取量的最多25%、所测量的总摄取量的最多20%、所测量的总摄取量的最多15%、所测量的总摄取量的最多10%或所测量的总摄取量的最多5%。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞呈现的对LHN片段的非选择性摄取量为例如所测量的总摄取量的约0%到约25%、所测量的总摄取量的约0%到约20%、所测量的总摄取量的约0%到约15%、所测量的总摄取量的约0%到约10%或所测量的总摄取量的约0%到约5%。
在另一实施方案中,来自确立细胞系的细胞呈现最少的对LHN/A片段的非选择性摄取。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的细胞呈现的对LHN/A片段的非选择性摄取量为例如所测量的总摄取量的最多25%、所测量的总摄取量的最多20%、所测量的总摄取量的最多15%、所测量的总摄取量的最多10%或所测量的总摄取量的最多5%。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞呈现的对LHN/A片段的非选择性摄取量为例如所测量的总摄取量的约0%到约25%、所测量的总摄取量的约0%到约20%、所测量的总摄取量的约0%到约15%、所测量的总摄取量的约0%到约10%或所测量的总摄取量的约0%到约5%。
本公开的方面部分包括来自确立细胞系的细胞,这些细胞在质膜上呈现足量的受体结合位点,以赋予对重靶向内肽酶的敏感性和选择性结合。平衡饱和结合测定将测量各种浓度的配体的总的非特异性结合。针对配体的平衡解离常数(Kd)以及受体结合位点的最大数量Bmax可以使用非线性回归分析由特异性结合计算得到。特异性结合是通过用观察到的总结合减去配体的非特异性结合计算。Kd为达到半数最大结合所需的配体浓度,并且是以摩尔浓度来度量。Bmax为质膜上存在的结合位点的最大数量,并且是以pmol/mg、pmol/细胞、fmol/细胞或位点/细胞来度量。
因此,在一个实施方案中,来自确立细胞系的细胞在质膜上呈现足量的受体结合位点,以赋予对重靶向内肽酶的敏感性和选择性结合。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的细胞针对重靶向内肽酶的靶向配体呈现出的Bmax值为例如至少0.1fmol/细胞、至少0.2fmol/细胞、至少0.3fmol/细胞、至少0.4fmol/细胞、至少0.5fmol/细胞、至少0.6fmol/细胞、至少0.7fmol/细胞、至少0.8fmol/细胞、至少0.9fmol/细胞或至少1.0fmol/细胞。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞针对重靶向内肽酶的靶向配体呈现出的Bmax值为例如至少1fmol/细胞、至少2fmol/细胞、至少3fmol/细胞、至少4fmol/细胞、至少5fmol/细胞、至少6fmol/细胞、至少7fmol/细胞、至少8fmol/细胞、至少9fmol/细胞或至少10fmol/细胞。
本公开的方面部分包括来自确立无性细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞,这些细胞比来自衍生无性细胞系的亲本细胞系的细胞稳定。本文中使用的术语“稳定的”是指来自确立无性细胞系的细胞经过特定传代数所呈现的针对重靶向内肽酶活性的相对EC50、敏感性、功效、明确界定的上渐近线和/或明确界定的剂量-响应曲线类似于来自衍生无性细胞系的亲本细胞系的细胞经过相同或类似传代数所呈现的相对EC50、敏感性、功效、明确界定的上渐近线和/或明确界定的剂量-响应曲线值,其中两种测定中使用相同的测定条件和相同的重靶向内肽酶。
因此,在一个实施方案中,来自确立无性细胞系的细胞比来自衍生无性细胞系的亲本细胞系的细胞稳定。在该实施方案的一方面,来自确立无性细胞系的细胞比亲本SK-N-DZ细胞系稳定。在该实施方案的另一方面,来自确立无性细胞系的细胞比亲本SK-N-DZ细胞系ATCC CRL-2149稳定。在该实施方案的其它方面,来自确立无性细胞系的细胞经过例如至少5次以上传代、至少10次以上传代、至少15次以上传代、至少20次以上传代、至少25次以上传代或至少30次以上传代比来自获得无性细胞系的亲本细胞系的细胞稳定。在该实施方案的其它方面,来自确立无性细胞系的细胞经过例如至少5次以上传代、至少10次以上传代、至少15次以上传代、至少20次以上传代、至少25次以上传代或至少30次以上传代比来自衍生无性细胞系的亲本细胞系的细胞稳定。
本公开的方面部分包括来自确立无性细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞,这些细胞经过多次细胞传代仍保持稳定。本文中使用的术语“稳定”是指来自确立无性细胞系的细胞经过特定传代数所呈现的针对重靶向内肽酶活性的相对EC50、敏感性、功效、明确界定的上渐近线和/或明确界定的剂量-响应曲线类似于来自一次或多次传代前的同一种确立无性细胞系的细胞所呈现的相对EC50、敏感性、功效、明确界定的上渐近线和/或明确界定的剂量-响应曲线值,其中,两种测定中使用相同的测定条件和相同的重靶向内肽酶。
本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞经过多次细胞传代可对重靶向内肽酶活性呈现一致的敏感性。本文中使用的术语“对重靶向内肽酶活性的敏感性”是指测定中能始终测量到高于由未处理的对照检测的信号或背景信号的最低剂量。
因此,在一个实施方案中,经过任一指定传代数,来自确立无性细胞系的细胞对例如100nM或更少、约80nM或更少、约70nM或更少、约60nM或更少、约50nM或更少、约40nM或更少、约30nM或更少、约20nM或更少、约10nM或更少、约1nM或更少、约0.9nM或更少、约0.8nM或更少、约0.7nM或更少、约0.6nM或更少、约0.5nM或更少、约0.4nM或更少、约0.3nM或更少、约0.2nM或更少或者约0.1nM或更少的重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性呈现敏感性。在该实施方案的方面,经过任一指定传代数,来自确立无性细胞系的细胞对例如约0.01nM到约100nM、约0.01nM到约75nM、约0.01nM到约50nM、约0.01nM到约25nM、约0.01nM到约20nM、约0.01nM到约15nM、约0.01nM到约10nM、约0.01nM到约5nM、约0.001nM到约100nM、约0.001nM到约75nM、约0.001nM到约50nM、约0.001nM到约25nM、约0.001nM到约20nM、约0.001nM到约15nM、约0.001nM到约10nM或者约0.001nM到约5nM的重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性呈现敏感性。
在另一实施方案中,经过例如5次或多次细胞传代、10次或多次细胞传代、15次或多次细胞传代、20次或多次细胞传代、25次或多次细胞传代、30次或多次细胞传代、35次或多次细胞传代、40次或多次细胞传代、45次或多次细胞传代或者50次或多次细胞传代,来自确立无性细胞系的细胞对约100nM或更少、约75nM或更少、约50nM或更少、约25nM或更少、小于约20nM或更少、约15nM或更少、约10nM或更少或约1nM或更少的重靶向内肽酶活性呈现敏感性。在该实施方案的其它方面,经过例如约15到约60次传代、约20到约60次传代、约25到约60次传代、约30到约60次传代、约35到约60次传代、约40到约60次传代、约45到约60次传代、约50到约60次传代、约15到约50次传代、约20到约50次传代、约25到约50次传代、约30到约50次传代、约35到约50次传代、约40到约50次传代、约15到约40次传代、约20到约40次传代、约25到约40次传代或约30到约40次传代,来自确立无性细胞系的细胞对约100nM或更少、约75nM或更少、约50nM或更少、约25nM或更少、小于约20nM或更少、约15nM或更少、约10nM或更少或者约1nM或更少的重靶向内肽活性呈现敏感性。
本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞经过多次细胞传代可对重靶向内肽酶摄取或重靶向内肽酶活性呈现一致的相对功效。本文中使用的术语“相对功效”是指在执行本测定时检测到的重靶向内肽酶活性的上渐近线与在该测定中利用参照标准、参照分子或参照传代数检测到的重靶向内肽酶活性的上渐近线的对比程度。本文中使用的术语“上渐近线的信噪比”是指在测定中于检测上限检测到的信号与由未处理的对照检测的信号或背景信号的比率。检测上限是在信号出现饱和前测定始终能测量到的最大剂量。
因此,在一个实施方案中,本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞经过多次细胞传代可呈现明确界定的上渐近线,并在测定中保持一致且适宜的信噪比。在该实施方案的方面,经过例如5次或多次细胞传代、10次或多次细胞传代、15次或多次细胞传代、20次或多次细胞传代、25次或多次细胞传代、30次或多次细胞传代、35次或多次细胞传代、40次或多次细胞传代、45次或多次细胞传代或者50次或多次细胞传代,本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞针对重靶向内肽酶活性的上渐近线的明确界定的信噪比须为例如至少3∶1、至少4∶1、至少5∶1、至少6∶1、至少7∶1、至少8∶1、至少9∶1、至少10∶1、至少15∶1、至少20∶1、至少25∶1、至少30∶1、至少35∶1、至少40∶1、至少45∶1、至少50∶1、至少60∶1、至少70∶1、至少80∶1、至少90∶1或至少100∶1、至少150∶1、至少200∶1、至少250∶1、至少300∶1、至少350∶1、至少400∶1、至少450∶1、至少500∶1、至少550∶1或至少600∶1。在该实施方案的其它方面,经过例如约15到约60次传代、约20到约60次传代、约25到约60次传代、约30到约60次传代、约35到约60次传代、约40到约60次传代、约45到约60次传代、约50到约60次传代、约15到约50次传代、约20到约50次传代、约25到约50次传代、约30到约50次传代、约35到约50次传代、约40到约50次传代、约15到约40次传代、约20到约40次传代、约25到约40次传代或约30到约40次传代,本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞针对重靶向内肽酶活性的上渐近线的明确界定的信噪比须为例如至少3∶1、至少4∶1、至少5∶1、至少6∶1、至少7∶1、至少8∶1、至少9∶1、至少10∶1、至少15∶1、至少20∶1、至少25∶1、至少30∶1、至少35∶1、至少40∶1、至少45∶1、至少50∶1、至少60∶1、至少70∶1、至少80∶1、至少90∶1或至少100∶1、至少150∶1、至少200∶1、至少250∶1、至少300∶1、至少350∶1、至少400∶1、至少450∶1、至少500∶1、至少550∶1或至少600∶1。
本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞经过多次细胞传代可针对重靶向内肽酶活性呈现明确界定的剂量-响应曲线。本文中使用的术语“剂量-响应曲线”是指原始数据与所选用于本测定的统计模型的拟合程度。在非限制性实例中,利用四参数逻辑斯蒂拟合法(four parameter logistics fit)得到的S形曲线是用于例如效力测定等酶促活性测定的剂量-响应曲线。在另一非限制性实例中,利用单位点饱和拟合(one site saturation fit)的配体结合是配体/抗体结合测定的剂量-响应曲线。
因此,在一个实施方案中,本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞经过多次细胞传代仍针对重靶向内肽酶活性呈现明确界定的剂量-响应曲线。在该实施方案的方面,经过例如5次或多次细胞传代、10次或多次细胞传代、15次或多次细胞传代、20次或多次细胞传代、25次或多次细胞传代、30次或多次细胞传代、35次或多次细胞传代、40次或多次细胞传代、45次或多次细胞传代或者50次或多次细胞传代,本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性仍呈现明确界定的剂量-响应曲线。在该实施方案的其它方面,经过例如约15到约60次传代、约20到约60次传代、约25到约60次传代、约30到约60次传代、约35到约60次传代、约40到约60次传代、约45到约60次传代、约50到约60次传代、约15到约50次传代、约20到约50次传代、约25到约50次传代、约30到约50次传代、约35到约50次传代、约40到约50次传代、约15到约40次传代、约20到约40次传代、约25到约40次传代或约30到约40次传代,本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性仍呈现明确界定的剂量-响应曲线。
本说明书中公开的来自确立细胞系的细胞经过多次细胞传代可对重靶向内肽酶活性呈现一致的相对EC50值。本文中使用的术语“相对EC50”或“相对EC50值”是指针对经过计算的本测定中所用的参照标准、参照分子或参照传代数的EC50而归一化的重靶向内肽酶活性的EC50值。
因此,在一个实施方案中,来自确立无性细胞系的细胞经过多次细胞传代仍对重靶向内肽酶活性呈现一致的相对EC50值。在该实施方案的方面,经过例如5次或多次细胞传代、10次或多次细胞传代、15次或多次细胞传代、20次或多次细胞传代、25次或多次细胞传代、30次或多次细胞传代、35次或多次细胞传代、40次或多次细胞传代、45次或多次细胞传代或者50次或多次细胞传代,来自确立无性细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性呈现一致的相对EC50值,即例如为针对重靶向内肽酶活性的相对EC50值的约±10%、约±20%、约±30%、约±40%、约±50%、约±60%、约±70%或约±75%。在该实施方案的其它方面,经过例如5次或多次细胞传代、10次或多次细胞传代、15次或多次细胞传代、20次或多次细胞传代、25次或多次细胞传代、30次或多次细胞传代、35次或多次细胞传代、40次或多次细胞传代、45次或多次细胞传代或者50次或多次细胞传代,来自确立无性细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性呈现的相对EC50值是针对重靶向内肽酶活性的相对EC50值的例如约±10%到约75%、约±10%到约70%、约±10%到约60%、约±10%到约50%、约±10%到约40%、约±10%到约30%或者±10%到约20%。
本发明的方面部分包括重靶向内肽酶。本文中使用的术语“重靶向内肽酶”与“靶向囊泡胞吐调节蛋白”或者“TVEMP”同义。重靶向内肽酶的非限制性实例公开于例如以下文献中:Keith A.Foster等,Clostridial Toxin Derivatives Able To ModifyPeripheral Sensory Afferent Functions,美国专利5,989,545;Clifford C.Shone等,Recombinant Toxin Fragments,美国专利6,461,617;Conrad P.Quinn等,Methods and Compounds for theTreatment of Mucus Hypersecretion,美国专利6,632,440;Lance E.Steward等,Methods And Compositions For The Treatment OfPancreatitis,美国专利6,843,998;Stephan Donovan,ClostridialToxin Derivatives and Methods For Treating Pain,美国专利公布2002/0037833;Keith A.Foster等,Inhibition of Secretion fromNon-neural Cells,美国专利公布2003/0180289;J.Oliver Dolly等,Activatable Recombinant Neurotoxins,WO 2001/014570;KeithA.Foster等,Re-targeted Toxin Conjugates,国际专利公布WO2005/023309;Lance E.Steward等,Multivalent Clostridial ToxinDerivatives and Methods of Their Use,美国专利申请第11/376,696号;Steward,L.E.等,Modified Clostridial Toxins withEnhanced Translocation Capabilities and Altered TargetingActivity For Non-Clostridial Toxin Target Cells,美国专利申请第11/776,075号;Dolly,J.O.等,Activatable Clostridial Toxins,美国专利申请第11/829,475号;Foster,K.A.等,Fusion Proteins,国际专利公布WO 2006/059093;以及Foster,K.A.等,Non-CytotoxicProtein Conjugates,国际专利公布WO 2006/059105,各专利的全部内容以引用的方式并入本文。重靶向内肽酶的非限制性实例包括SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:130和SEQ ID NO:131。
因此,在一个实施方案中,所检测的重靶向内肽酶活性来自重靶向内肽酶。在该实施方案的方面,所检测的重靶向内肽酶活性是来自以下文献中公开的重靶向内肽酶:Keith A.Foster等,Clostridial Toxin Derivatives Able To Modify Peripheral SensoryAfferent Functions,美国专利5,989,545;Clifford C.Shone等,Recombinant Toxin Fragments,美国专利6,461,617;Conrad P.Quinn等,Methods and Compounds for the Treatment of MucusHypersecretion,美国专利6,632,440;Lance E.Steward等,Methods And Compositions For The Treatment Of Pancreatitis,美国专利6,843,998;Stephan Donovan,Clostridial Toxin Derivativesand Methods For Treating Pain,美国专利公布2002/0037833;Keith A.Foster等,Inhibition of Secretion from Non-neural Cells,美国专利公布2003/0180289;J.Oliver Dolly等,ActivatableRecombinant Neurotoxins,WO 2001/014570;Keith A.Foster等,Re-targeted Toxin Conjugates,国际专利公布WO 2005/023309;Lance E.Steward等,Multivalent Clostridial Toxin Derivatives andMethods of Their Use,美国专利申请第11/376,696号;Steward,L.E.等,Modified Clostridial Toxins with Enhanced TranslocationCapabilities and Altered Targeting Activity For Non-ClostridialToxin Target Cells,美国专利申请第11/776,075号;Dolly,J.O.等,Activatable Clostridial Toxins,美国专利申请第11/829,475号;Foster,K.A.等,Fusion Proteins,国际专利公布WO2006/059093;以及Foster,K.A.等,Non-Cytotoxic ProteinConjugates,国际专利公布WO 2006/059105,各专利的全部内容以引用的方式并入本文。在该实施方案的方面,重靶向内肽酶为SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:130或SEQ ID NO:131。
在另一实施方案中,所检测的重靶向内肽酶活性来自与以下文献中公开的重靶向内肽酶具有例如至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的重靶向内肽酶:Keith A.Foster等,Clostridial Toxin Derivatives Able ToModify Peripheral Sensory Afferent Functions,美国专利5,989,545;Clifford C.Shone等,Recombinant Toxin Fragments,美国专利6,461,617;Conrad P.Quinn等,Methods and Compoundsfor the Treatment of Mucus Hypersecretion,美国专利6,632,440;Lance E.Steward等,Methods And Compositions For TheTreatment Of Pancreatitis,美国专利6,843,998;Stephan Donovan,Clostridial Toxin Derivatives and Methods For Treating Pain,美国专利公布2002/0037833;Keith A.Foster等,Inhibition ofSecretion from Non-neural Cells,美国专利公布2003/0180289;J.Oliver Dolly 等,Activatable Recombinant Neurotoxins,WO2001/014570;Keith A.Foster等,Re-targeted Toxin Conjugates,国际专利公布WO 2005/023309;Lance E.Steward等,MultivalentClostridial Toxin Derivatives and Methods of Their Use,美国专利申请第11/376,696号;Steward,L.E.等,Modified Clostridial Toxinswith Enhanced Translocation Capabilities and Altered TargetingActivity For Non-Clostridial Toxin Target Cells,美国专利申请第11/776,075号;Dolly,J.O.等,Activatable Clostridial Toxins,美国专利申请第11/829,475号;Foster,K.A.等,Fusion Proteins,国际专利公布WO 2006/059093;以及Foster,K.A.等,Non-CytotoxicProtein Conjugates,国际专利公布WO 2006/059105,各专利的全部内容以引用的方式并入本文。在另一实施方案中,所检测的重靶向内肽酶活性来自与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ IDNO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:130或SEQ ID NO:131的重靶向内肽酶具有例如至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的重靶向内肽酶。
在该实施方案的其它方面,所检测的重靶向内肽酶活性来自相对于以下文献中公开的重靶向内肽酶具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个非连续氨基酸取代、缺失或添加的重靶向内肽酶:Keith A.Foster等,Clostridial Toxin Derivatives Able To Modify PeripheralSensory Afferent Functions,美国专利5,989,545;Clifford C.Shone等,Recombinant Toxin Fragments,美国专利6,461,617;Conrad P.Quinn等,Methods and Compounds for the Treatment of MucusHypersecretion,美国专利6,632,440;Lance E.Steward等,Methods And Compositions For The Treatment Of Pancreatitis,美国专利6,843,998;Stephan Donovan,Clostridial Toxin Derivativesand Methods For Treating Pain,美国专利公布2002/0037833;Keith A.Foster等,Inhibition of Secretion from Non-neural Cells,美国专利公布2003/0180289;J.Oliver Dolly等,ActivatableRecombinant Neurotoxins,WO 2001/014570;Keith A.Foster等,Re-targeted Toxin Conjugates,国际专利公布WO 2005/023309;Lance E.Steward等,Multivalent Clostridial Toxin Derivatives andMethods of Their Use,美国专利申请第11/376,696号;Steward,L.E.等,Modified Clostridial Toxins with Enhanced TranslocationCapabilities and Altered Targeting Activity For Non-ClostridialToxin Target Cells,美国专利申请第11/776,075号;Dolly,J.O.等,Activatable Clostridial Toxins,美国专利申请第11/829,475号;Foster,K.A.等,Fusion Proteins,国际专利公布WO2006/059093;以及Foster,K.A.等,Non-Cytotoxic ProteinConjugates,国际专利公布WO 2006/059105,各专利的全部内容以引用的方式并入本文。在该实施方案的其它方面,所检测的重靶向内肽酶活性来自相对于SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:130或SEQ ID NO:131的重靶向内肽酶具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个非连续氨基酸取代、缺失或添加的重靶向内肽酶。
在该实施方案的其它方面,所检测的重靶向内肽酶活性来自相对于以下文献中公开的重靶向内肽酶具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然重靶向内肽酶变体:KeithA.Foster等,Clostridial Toxin Derivatives Able To ModifyPeripheral Sensory Afferent Functions,美国专利5,989,545;Clifford C.Shone等,Recombinant Toxin Fragments,美国专利6,461,617;Conrad P.Quinn等,Methods and Compounds for theTreatment of Mucus Hypersecretion,美国专利6,632,440;Lance E.Steward等,Methods And Compositions For The Treatment OfPancreatitis,美国专利6,843,998;Stephan Donovan,ClostridialToxin Derivatives and Methods For Treating Pain,美国专利公布2002/0037833;Keith A.Foster等,Inhibition of Secretion fromNon-neural Cells,美国专利公布2003/0180289;J.Oliver Dolly等,Activatable Recombinant Neurotoxins,WO 2001/014570;KeithA.Foster等,Re-targeted Toxin Conjugates,国际专利公布WO2005/023309;Lance E.Steward等,Multivalent Clostridial ToxinDerivatives and Methods of Their Use,美国专利申请第11/376,696号;Steward,L.E.等,Modified Clostridial Toxins withEnhanced Translocation Capabilities and Altered TargetingActivity For Non-Clostridial Toxin Target Cells,美国专利申请第11/776,075号;Dolly,J.O.等,Activatable Clostridial Toxins,美国专利申请第11/829,475号;Foster,K.A.等,Fusion Proteins,国际专利公布WO 2006/059093;以及Foster,K.A.等,Non-CytotoxicProtein Conjugates,国际专利公布WO 2006/059105,各专利的全部内容以引用的方式并入本文。在该实施方案的其它方面,所检测的重靶向内肽酶活性来自相对于SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:130或SEQ ID NO:131的重靶向内肽酶具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然重靶向内肽酶变体。
在另一实施方案中,所检测的重靶向内肽酶活性来自阿片重靶向内肽酶。阿片重靶向内肽酶或阿片-TVEMP的非限制性实例描述于例如以下文献中:Keith A.Foster等,Clostridial ToxinDerivatives Able To Modify Peripheral Sensory Afferent Functions,美国专利5,989,545;J.Oliver Dolly等,Activatable RecombinantNeurotoxins,美国专利7,132,259;Stephan Donovan,ClostridialToxin Derivatives and Methods For Treating Pain,美国专利7,244,437;Stephan Donovan,Clostridial Toxin Derivatives andMethods For Treating Pain,美国专利7,413,742;Stephan Donovan,Clostridial Toxin Derivatives and Methods For Treating Pain,美国专利7,415,338;Lance E.Steward等,Multivalent ClostridialToxin Derivatives and Methods of Their Use,美国专利7,514,088;Keith A.Foster,Fusion Proteins,美国专利公布2008/0064092;Keith A.Foster,Fusion Proteins,美国专利公布2009/0035822;Lance E.Steward等,Multivalent Clostridial Toxin Derivatives andMethods of Their Use,美国专利公布2009/0048431;Keith A.Foster,Non-Cytotoxic Protein Conjugates,美国专利公布2009/0162341;Keith A.Foster等,Re-targeted Toxin Conjugates,国际专利公布WO 2005/023309;以及Lance E.Steward,ModifiedClostridial Toxins with Enhanced Translocation Capabilities andAltered Targeting Capabilities for Non-Clostridial Toxin TargetCells,国际专利公布WO 2008/008805;各专利的全部内容以引用的方式并入本文。
在另一实施方案中,所检测的重靶向内肽酶活性来自甘丙肽重靶向内肽酶。甘丙肽重靶向内肽酶或甘丙肽-TVEMP的非限制性实例描述于例如以下文献中:Steward,L.E.等,ModifiedClostridial Toxins with Enhanced Translocation Capability andEnhanced Targeting Activity,美国专利申请第11/776,043号(2007年7月11日);Steward,L.E.等,Modified Clostridial Toxins withEnhanced Translocation Capabilities and Altered Targeting ActivityFor Clostridial Toxin Target Cells,美国专利申请第11/776,052号(2007年7月11日);以及Steward,L.E.等,Modified ClostridialToxins with Enhanced Translocation Capabilities and AlteredTargeting Activity For Non-Clostridial Toxin Target Cells,美国专利申请第11/776,075号(2007年7月11日),各专利的全部内容以引用的方式并入本文。
本发明的方面部分包括SNAP-25。本文中使用的术语“SNAP-25”是指优先被重靶向内肽酶裂解的天然SNAP-25或非天然SNAP-25。本文中使用的术语“优先裂解”是指重靶向内肽酶裂解SNAP-25的速率比重靶向内肽酶裂解任何其它底物的速率高至少一个数量级。在该实施方案的方面,重靶向内肽酶裂解SNAP-25的速率比重靶向内肽酶裂解任何其它底物的速率高至少两个数量级、至少三个数量级、至少四个数量级或至少五个数量级。
本文中使用的术语“天然SNAP-25”是指由天然过程产生的任何SNAP-25,包括但不限于由翻译后修饰、替代剪接的转录物或自发突变产生的SNAP-25同种型以及SNAP-25亚型。天然SNAP-25包括但不限于SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24,或者SEQ ID NO:5、SEQ IDNO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸得到的SNAP-25。
本文中使用的术语“非天然SNAP-25”是指结构借助于人类操作进行修饰的任何SNAP-25,包括但不限于通过使用随机诱变或合理设计进行遗传工程改造而产生的SNAP-25,以及通过体外化学合成而产生的SNAP-25。非天然SNAP-25的非限制性实例描述于以下文献中:例如Steward,L.E.等,FRET Protease Assaysfor Clostridial Toxins,美国专利7,332,567;Fernandez-Salas等,Lipohilic Dye-based FRET Assays for Clostridial Toxin Activity,美国专利公布2008/0160561,各专利的全部内容以引用的方式并入本文。非天然SNAP-25可由SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸。
因此,在一个实施方案中,SNAP-25是天然SNAP-25。在该实施方案的方面,SNAP-25是SNAP-25同种型或SNAP-25亚型。在该实施方案的方面,天然SNAP-25是SEQ ID NO:5、SEQID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ IDNO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24的天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,SNAP-25是与SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24具有例如至少70%氨基酸同一性、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的天然SNAP-25。
在另一实施方案中,SNAP-25是非天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,SNAP-25是与SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4具有例如至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的非天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,SNAP-25是相对于SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个非连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,SNAP-25是相对于SEQID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然SNAP-25。
SNAP-25可以是内源性SNAP-25或外源性SNAP-25。本文中使用的术语“内源性SNAP-25”是指因为在细胞基因组内被自然编码而天然地存在于细胞中的SNAP-25,使得细胞固有地表达SNAP-25,无需外部来源的SNAP-25或外部来源的编码SNAP-25的遗传物质。内源性SNAP-25的表达可以利用或不利用环境刺激,例如细胞分化。根据定义,内源性SNAP-25只能是天然SNAP-25或其变体。例如,以下各确立细胞系将表达内源性SNAP-25:BE(2)-M17、Kelly、LA1-55n、N1E-115、N4TG3、N18、Neuro-2a、NG108-15、PC12、SH-SY5Y、SiMa、SK-N-DZ和SK-N-BE(2)-C。
本文中使用的术语“外源性SNAP-25”是指通过人类操作引入外部来源的SNAP-25或外部来源的编码SNAP-25的遗传物质而在细胞中表达的SNAP-25。外源性SNAP-25的表达可以利用或不利用环境刺激,例如细胞分化。在非限制性实例中,来自确立细胞系的细胞可通过SNAP-25的瞬时转染或稳定转染来表达外源性SNAP-25。作为另一非限制性实例中,来自确立细胞系的细胞可通过SNAP-25的蛋白质转染来表达外源性SNAP-25。外源性SNAP-25可以是天然SNAP-25或其变体,或是非天然SNAP-25或其变体。
因此,在一个实施方案中,来自确立细胞系的细胞表达内源性SNAP-25。在该实施方案的方面,由来自确立细胞系的细胞表达的内源性SNAP-25是天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,由来自确立细胞系的细胞表达的内源性SNAP-25是SEQ IDNO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24。在该实施方案的其它方面,由来自确立细胞系的细胞表达的内源性SNAP-25是天然SNAP-25,例如SNAP-25同种型或SNAP-25亚型。在该实施方案的其它方面,由来自确立细胞系的细胞表达的内源性SNAP-25是与SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24具有例如至少70%氨基酸同一性、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的天然SNAP-25。
在另一实施方案中,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达外源性SNAP-25。在该实施方案的一方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24的天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达天然SNAP-25,例如SNAP-25同种型或SNAP-25亚型。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达与SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ IDNO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ IDNO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24具有例如至少70%氨基酸同一性、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的天然SNAP-25。
在该实施方案另一方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达非天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达与SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24具有例如至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的非天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达相对于SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQID NO:8、SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQID NO:12、SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个非连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然SNAP-25。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达相对于SEQID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12、SEQ IDNO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然SNAP-25。
可以使用检测SNAP-25在暴露于重靶向内肽酶之后的裂解情况的测定来评估细胞是表达内源性SNAP-25还是外源性SNAP-25。在这些测定中,经过重靶向内肽酶处理之后,在表达SNAP-25的细胞中将检测到SNAP-25裂解产物的产生。特定蛋白印迹分析(Western blot analysis)的非限制性实例以及充分表征的试剂、条件和方案易于从供应商获得,这些供应商包括但不限于:Amersham Biosciences,Piscataway,NJ;Bio-Rad Laboratories,Hercules,CA;Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL;PromegaCorporation,Madison,WI,和Stratagene,Inc.,La Jolla,CA。应了解,这些以及类似的针对SNAP-25裂解的测定都可用于鉴别表达内源性SNAP-25或外源性SNAP-25的细胞。
在非限制性实例中,可以使用蛋白印迹分析来测定重靶向内肽酶的摄取,该分析方法是使用可识别SNAP-25裂解产物或者裂解和未裂解形式的SNAP-25的抗体进行。适用于这些测定的α-SNAP-25抗体的实例包括但不限于α-SNAP-25小鼠单克隆抗体SMI-81(Sternberger Monoclonals Inc.,Lutherville,MD)、小鼠α-SNAP-25单克隆抗体CI 71.1(Synaptic Systems,Goettingen,Germany)、α-SNAP-25小鼠单克隆抗体CI 71.2(Synaptic Systems,Goettingen,Germany)、α-SNAP-25小鼠单克隆抗体SP12(Abcam,Cambridge,MA)、α-SNAP-25兔多克隆抗血清(Synaptic Systems,Goettingen,Germany)、α-SNAP-25兔多克隆抗血清(Abcam,Cambridge,MA)和α-SNAP-25兔多克隆抗血清S9684(Sigma,StLouis,MO)。
本公开的方面部分包括重靶向内肽酶受体。本文中使用的术语“重靶向内肽酶受体”是指以引起重靶向内肽酶活性响应的方式优先与重靶向内肽酶按相互作用的天然重靶向内肽酶受体或非天然重靶向内肽酶受体。本文中使用的术语“优先相互作用”是指重靶向内肽酶对重靶向内肽酶受体的平衡解离常数(KD)比重靶向内肽酶对细胞表面上的任何其它受体的KD低至少一个数量级。平衡解离常数,一种度量重靶向内肽酶重靶向的内肽酶受体复合物可逆分离(解离)成其组分分子(即重靶向内肽酶和重靶向内肽酶受体)的倾向的特定类型的平衡常数,定义为平衡时KD=Ka/Kd。缔合常数(Ka)定义为Ka=[C]/[L][R],且解离常数(Kd)定义为Kd=[L][R]/[C],其中[L]等于重靶向内肽酶的摩尔浓度,[R]是重靶向内肽酶受体的摩尔浓度,且[C]是内肽酶-受体复合物的摩尔浓度,且其中所有这些浓度都是当系统达到平衡时这些组分的浓度。解离常数越小,则重靶向内肽酶与其受体结合得越紧密,或者重靶向内肽酶与重靶向内肽酶受体之间的结合亲和力越高。在该实施方案的方面,重靶向内肽酶对其受体的解离常数比重靶向内肽酶对任何其它受体的解离常数低至少两个数量级、至少三个数量级、至少四个数量级或至少五个数量级。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶优先与其受体相互作用的结合亲和力的平衡解离常数(KD)可以是例如500nM或更少、400nM或更少、300nM或更少、200nM或更少、100nM或更少。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶优先与其受体相互作用的结合亲和力的平衡解离常数(KD)可以是例如90nM或更少、80nM或更少、70nM或更少、60nM、50nM或更少、40nM或更少、30nM或更少、20nM或更少、10nM或更少。本文中使用的术语“引起重靶向内肽酶活性响应”是指重靶向内肽酶受体与重靶向内肽酶相互作用形成内肽酶/受体复合物且随后该复合物内化到细胞的细胞质中的能力。
本文中使用的术语“天然重靶向内肽酶受体”是指由天然过程产生的任何重靶向内肽酶受体,包括但不限于由翻译后修饰、替代性剪接的转录物或自发突变产生的重靶向内肽酶受体同种型,以及重靶向内肽酶受体亚型。天然重靶向内肽酶受体包括但不限于:天然阿片受体,如阿片样受体(opiate-like receptor 1,ORL1)、δ-阿片受体(DOR)、κ-阿片受体(KOR)和μ-阿片受体(MOR),例如以下文献中描述的阿片受体:Christopher Evans等,Opioid Receptor Genes,美国专利6,265,563;Christopher Evans等,Methods of Screening Modulators of Opiod Receptor A ctivity,美国专利6,432,652;Christopher Evans等,Opioid Receptors andMethods of Use,美国专利7,282,563;以及Christopher Evans等,Delta Opioid Receptor Proteins,美国专利公布2008/0219925,各专利的全部内容据此以引用的方式并入本文。天然重靶向内肽酶受体的其它实例包括但不限于:甘丙肽受体1、甘丙肽受体2和甘丙肽受体3。本领域中已知来自其它脊椎动物物种,例如来自灵长类动物、母牛、狗、小鼠、大鼠、鸡和鱼等的天然阿片受体,并且其可用于本说明书的各方面。
天然ORL 1包括但不限于:SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26,或在SEQ ID NO:25或SEQ ID NO:26中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸得到的天然ORL1。天然DOR包括但不限于:SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:28,或在SEQ ID NO:27或SEQ ID NO:28中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸得到的天然DOR。天然KOR包括但不限于:SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:30,或在SEQ ID NO:29或SEQ ID NO:30中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸得到的天然KOR。天然MOR包括但不限于:SEQ ID NO:31,或在SEQ ID NO:31中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸得到的天然MOR。
天然甘丙肽受体1包括但不限于:SEQ ID NO:136、SEQ IDNO:137和SEQ ID NO:138,或在SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137或SEQ ID NO:138中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸得到的天然甘丙肽受体1。天然甘丙肽受体2包括但不限于:SEQ ID NO:139,或在SEQ ID NO:139中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸得到的天然甘丙肽受体2。天然甘丙肽受体3包括但不限于:SEQ ID NO:140,或在SEQ ID NO:140中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸得到的天然甘丙肽受体3。
本文中使用的术语“非天然靶向内肽酶受体变体”是指借助于人类操作或设计产生的任何重靶向内肽酶受体,包括但不限于:通过使用随机诱变或合理设计进行基因工程改造而产生的重靶向内肽酶受体,以及通过化学合成而产生的重靶向内肽酶受体。非天然重靶向内肽酶受体变体的非限制性实例包括例如保守重靶向内肽酶受体变体、非保守重靶向内肽酶受体变体、重靶向内肽酶受体嵌合变体和活性重靶向内肽酶受体片段。
本文中使用的术语“非天然重靶向内肽酶受体”是指结构借助于人类操作进行修饰的任何重靶向内肽酶受体,包括但不限于:通过使用随机诱变或合理设计通过基因工程改造而产生的重靶向内肽酶受体,以及通过体外化学合成而产生的重靶向内肽酶受体。非天然重靶向内肽酶受体可在SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ IDNO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140中取代、缺失或添加例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个氨基酸。
因此,在一个实施方案中,重靶向内肽酶受体是天然重靶向内肽酶受体,例如ORL1、DOR、KOR或MOR。在该实施方案的方面,重靶向内肽酶受体是重靶向内肽酶受体同种型或重靶向内肽酶受体亚型。在该实施方案的方面,天然重靶向内肽酶受体是SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31的天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶受体是与SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ IDNO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31具有例如至少70%氨基酸同一性、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的天然重靶向内肽酶受体。
在另一实施方案中,重靶向内肽酶受体是非天然重靶向内肽酶受体,例如经过基因工程改造的ORL1、经过遗传工程改造的DOR、经过遗传工程改造的KOR或经过遗传工程改造的MOR。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶受体是与SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31具有例如至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的非天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶受体是相对于SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30或SEQID NO:31具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个非连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶受体是相对于SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30或SEQ ID NO:31具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然重靶向内肽酶受体。
在另一实施方案中,重靶向内肽酶受体是天然重靶向内肽酶受体,例如甘丙肽受体1、甘丙肽受体2或甘丙肽受体3。在该实施方案的方面,重靶向内肽酶受体是重靶向内肽酶受体同种型或重靶向内肽酶受体亚型。在该实施方案的方面,天然重靶向内肽酶受体是SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140的天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶受体是与SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQID NO:140具有例如至少70%氨基酸同一性、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的天然重靶向内肽酶受体。
在另一实施方案中,重靶向内肽酶受体是非天然重靶向内肽酶受体,例如经过遗传工程改造的甘丙肽受体1、经过遗传工程改造的甘丙肽受体2或经过遗传工程改造的甘丙肽受体3。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶受体是与SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ IDNO:140具有例如至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的非天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶受体是相对于SEQ IDNO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个非连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,重靶向内肽酶受体是相对于SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然重靶向内肽酶受体。
重靶向内肽酶受体可以是内源性重靶向内肽酶受体或外源性重靶向内肽酶受体。本文中使用的术语“内源性重靶向内肽酶受体”是指因为在细胞基因组中被天然编码而存在于细胞中的天然重靶向内肽酶受体,使得细胞固有地表达重靶向内肽酶受体,而无需外部来源的重靶向内肽酶受体或外部来源的编码重靶向内肽酶受体的遗传物质。内源性重靶向内肽酶受体的表达可以利用或不利用环境刺激,例如细胞分化或启动子活化。例如,以下确立细胞系将表达至少一种内源性重靶向内肽酶受体:AGNP33、Neuro-2a、SiMa和SK-N-DZ。内源性重靶向内肽酶受体只能是天然重靶向内肽酶受体或其天然变体。
本文中使用的术语“外源性重靶向内肽酶受体”是指利用人类操作通过引入外部来源的重靶向内肽酶受体或外部来源的编码重靶向内肽酶受体的遗传物质而在细胞中表达的重靶向内肽酶受体。外源性重靶向内肽酶受体的表达可以利用或不利用环境刺激,例如细胞分化或启动子活化。在非限制性实例中,来自确立细胞系的细胞可通过编码例如ORL1、DOR、KOR、MOR、甘丙肽受体1、甘丙肽受体2或甘丙肽受体3等重靶向内肽酶受体的多核苷酸分子的瞬时或稳定转染来表达一种或多种外源性重靶向内肽酶受体。在另一非限制性实例中,来自确立细胞系的细胞可通过例如ORL1、DOR、KOR、MOR、甘丙肽受体1、甘丙肽受体2或甘丙肽受体3等重靶向内肽酶受体的蛋白质转染来表达一种或多种外源性重靶向内肽酶受体。外源性重靶向内肽酶受体可以是天然重靶向内肽酶受体或其天然变体,或者非天然重靶向内肽酶受体或其非天然变体。
因此,在一个实施方案中,来自确立细胞系的细胞表达内源性重靶向内肽酶受体。在该实施方案的方面,由来自确立细胞系的细胞表达的内源性重靶向内肽酶受体是天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,由来自确立细胞系的细胞表达的内源性重靶向内肽酶受体是SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140。在该实施方案的其它方面,由来自确立细胞系的细胞表达的内源性重靶向内肽酶受体是天然重靶向内肽酶受体,例如重靶向内肽酶受体同种型或重靶向内肽酶受体亚型。在该实施方案的其它方面,由来自确立细胞系的细胞表达的内源性重靶向内肽酶受体是与SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140具有例如至少70%氨基酸同一性、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的天然重靶向内肽酶受体。
在另一实施方案中,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达外源性重靶向内肽酶受体。在该实施方案的一方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140的天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达天然重靶向内肽酶受体,例如重靶向内肽酶受体同种型或重靶向内肽酶受体亚型。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时地或稳定地工程改造成表达与SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQID NO:31、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140具有例如至少70%氨基酸同一性、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的天然重靶向内肽酶受体。
在该实施方案另一方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达非天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定工程改造成表达与SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQID NO:140具有例如至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%或至少95%氨基酸同一性的非天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达相对于SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个非连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然重靶向内肽酶受体。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达相对于SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ IDNO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQID NO:31、SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137、SEQ ID NO:138、SEQ ID NO:139或SEQ ID NO:140具有例如1个或多个、2个或多个、3个或多个、4个或多个、5个或多个、6个或多个、7个或多个、8个或多个、9个或多个、10个或多个、20个或多个、30个或多个、40个或多个、50个或多个或者100个或多个连续氨基酸取代、缺失或添加的非天然重靶向内肽酶受体。
在另一实施方案中,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达外源性ORL1、外源性DOR、外源性KOR、外源性MOR或其任何组合。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达天然ORL1、天然DOR、天然KOR、天然MOR或其任何组合。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达非天然ORL1、非天然DOR、非天然KOR、非天然MOR或其任何组合。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达天然ORL1或非天然ORL1、天然DOR或非天然DOR、天然KOR或非天然KOR、天然MOR或非天然MOR,或其任何组合。
在另一实施方案中,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达外源性甘丙肽受体1、外源性甘丙肽受体2、外源性甘丙肽受体3或其任何组合。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达天然甘丙肽受体1、天然甘丙肽受体2、天然甘丙肽受体3或其任何组合。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达非天然甘丙肽受体1、非天然甘丙肽受体2、非天然甘丙肽受体3或其任何组合。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的细胞被瞬时或稳定地工程改造成表达天然甘丙肽受体1或非天然甘丙肽受体1、天然甘丙肽受体2或非天然甘丙肽受体2、天然甘丙肽受体3或非天然甘丙肽受体3或其任何组合。
表达一种或多种内源性重靶向内肽酶受体或外源性重靶向内肽酶受体的细胞可以借助常规方法来鉴别,所述常规方法包括针对重靶向内肽酶摄取的直接测定和间接测定。可以使用测定重靶向内肽酶的结合或摄取特性的测定来评估细胞是否表达重靶向内肽酶受体。这些测定包括但不限于:使用例如[125I]重靶向内肽酶等标记重靶向内肽酶进行的交联测定,参见例如,NorikoYokosawa等,Binding of Clostridium botulinum type C neurotoxinto different neuroblastoma cell lines,57(1)Infect.Immun.272-277(1989);Noriko Yokosawa等,Binding of botulinum type Cl,D and Eneurotoxins to neuronal cell lines and synaptosomes,29(2)Toxicon261-264(1991);以及Tei-ichi Nishiki等,Identification ofprotein receptor for Clostridium botulinum type B neurotoxin in ratbrain synaptosomes,269(14)J.Biol.Chem.10498-10503(1994)。其它非限制性测定包括免疫细胞化学测定,其使用经过标记或未标记过的抗体来检测重靶向内肽酶的结合,参见例如,AtsushiNishikawa等,The receptor and transporter for internalization ofClostridium botulinum type C progenitor toxin into HT-29 cells,319(2)Biochem.Biophys.Res.Commun.327-333(2004);以及免疫沉淀测定,参见例如,Yukako Fujinaga等,Molecularcharacterization of binding subcomponents of Clostridiumbotulinum type C progenitor toxin for intestinal epithelial cells anderythrocytes,150(Pt 5)Microbiology 1529-1538(2004),其使用经过标记或未标记过的抗体来检测结合的重靶向内肽酶。适用于这些测定的抗体包括但不限于:针对重靶向内肽酶选择的抗体和/或针对重靶向内肽酶受体选择的抗体,例如ORL1、DOR、KOR、MOR、甘丙肽受体1、甘丙肽受体2或甘丙肽受体3。如果抗体经过标记,那么可采用本领域技术人员众所周知的技术,通过各种方式来检测分子的结合,包括蛋白印迹分析、抗体细胞定位的直接显微镜观察、洗涤步骤后细胞或底物结合的抗体的测量、流式细胞计量术、电泳或毛细管电泳。如果抗体未标记过,那么可以采用标记二抗间接检测结合的分子,而且该检测可以参照标记抗体的方式进行。应了解,这些和类似的测定重靶向内肽酶摄取特性或特征的测定可用于鉴别表达内源性重靶向内肽酶受体或外源性或重靶向内肽酶受体的细胞。
还可以使用监测暴露于重靶向内肽酶之后的分子释放情况的测定来评估细胞是否表达一种或多种内源性重靶向内肽酶受体或外源性重靶向内肽酶受体。在这些测定中,在重靶向内肽酶处理之后,表达重靶向内肽酶受体的细胞中分子的释放将受到抑制。众所周知的测定包括测量神经元中放射标记的儿茶酚胺释放(例如[3H]去甲肾上腺素或[3H]多巴胺释放)的抑制的方法,参见例如,A Fassio等,Evidence for calcium-dependent vesiculartransmitter release insensitive to tetanus toxin and botulinum toxintype F,90(3)Neuroscience 893-902(1999);和Sara Stigliani等,The sensitivity of catecholamine release to botulinum toxin C1 andE suggests selective targeting of vesicles set into the readilyreleasable pool,85(2)J.Neurochem.409-421(2003);或使用荧光测定程序测量儿茶酚胺释放的方法,参见例如,Anton de Paiva等,A role for the interchain disulfide or its participating thiols inthe internalization of botulinum neurotoxin A revealed by a toxinderivative that binds to ecto-acceptors and inhibits transmitterrelease intracellularly,268(28)J.Biol.Chem.20838-20844(1993);Gary W.Lawrence等,Distinct exocytotic responses ofintact and permeabilised chromaffin cells after cleavage of the25-kDa synaptosomal-associated protein(SNAP-25)orsynaptobrevin by botulinum toxin A or B,236(3)Eur.J.Biochem.877-886(1996);和Patrick Foran等,Botulinum neurotoxin C1cleaves both syntaxin and SNAP-25 in intact and permeabilizedchromaffin cells:correlation with its blockade of catecholaminerelease,35(8)Biochemistry 2630-2636(1996)。其它非限制性实例包括测量如垂体前叶细胞或卵巢细胞等内分泌细胞中激素释放的抑制的测定。应了解,这些和类似的针对分子释放的测定都可用于鉴别表达内源性重靶向内肽酶受体或外源性重靶向内肽酶受体或重靶向内肽酶受体的细胞。
也可以使用检测SNAP-25底物暴露于重靶向内肽酶之后的裂解情况的测定来评估细胞是否表达一种或多种内源性重靶向内肽酶受体或外源性重靶向内肽酶受体。在这些测定中,经过重靶向内肽酶处理后,在表达重靶向内肽酶受体的细胞中将检测到SNAP-25裂解产物的产生或完整SNAP-25的消失。特定蛋白印迹分析的非限制性实例以及充分表征的试剂、条件和方案易于从供应商获得,包括但不限于:Amersham Biosciences,Piscataway,NJ;Bio-Rad Laboratories,Hercules,CA;Pierce Biotechnology,Inc.,Rockford,IL;Promega Corporation,Madison,WI;和Stratagene,Inc.,La Jolla,CA。应了解,这些和类似的针对SNAP-25裂解的测定都可用于鉴别表达内源性重靶向内肽酶受体或外源性重靶向内肽酶受体的细胞。
在非限制性实例中,可以使用蛋白印迹分析来测定重靶向内肽酶的摄取,该分析方法是使用可识别SNAP-25裂解产物或者SNAP-25的裂解和未裂解形式的抗体进行。适用于这些测定的α-SNAP-25抗体的实例包括但不限于:SMI-81 α-SNAP-25小鼠单克隆抗体(Sternberger Monoclonals Inc.,Lutherville,MD)、CI71.1小鼠α-SNAP-25单克隆抗体(Synaptic Systems,Goettingen,Germany)、CI 71.2α-SNAP-25小鼠单克隆抗体(Synaptic Systems,Goettingen,Germany)、SP12α-SNAP-25小鼠单克隆抗体(Abcam,Cambridge,MA)、α-SNAP-25兔多克隆抗血清(Synaptic Systems,Goettingen,Germany)、α-SNAP-25兔多克隆抗血清S9684(Sigma,St.Louis,MO)和α-SNAP-25兔多克隆抗血清(Abcam,Cambridge,MA)。
本公开的方面提供通过遗传操作或重组工程改造而表达外源性SNAP-25和/或一种或多种外源性重靶向内肽酶受体的细胞。适用于通过遗传操作或重组工程改造而表达外源性SNAP-25和/或一种或多种外源性重靶向内肽酶受体的细胞包括可能表达或不表达内源性SNAP-25和/或一种或多种内源性重靶向内肽酶受体的神经元细胞和非神经元细胞。还应了解,这些经过基因操作或重组工程改造的细胞可以在构成性、组织特异性、细胞特异性或可诱导的启动子元件、增强子元件或二者的控制下表达外源性SNAP-25以及一种或多种外源性重靶向内肽酶受体。应了解,任何细胞都可以使用,只要细胞经过遗传操作或重组工程改造,能够表达外源性SNAP-25和/或一种或多种外源性重靶向内肽酶受体,并且能够经受重靶向内肽酶活性。
适用于将某种外源性多核苷酸分子引入细胞中的方法包括但不限于:化学物质介导的递送方法,例如磷酸钙介导的递送方法、二乙基氨乙基(DEAE)葡聚糖介导的递送方法、脂质介导的递送方法、聚乙烯亚胺(PEI)介导的递送方法、聚赖氨酸介导的递送方法和聚凝胺介导的递送方法;物理方式介导的递送方法,例如基因枪递送、显微注射、原生质体融合和电穿孔;和病毒介导的递送方法,例如逆转录病毒介导的转染,参见例如,Introducing Cloned Genes into Cultured Mammalian Cells,第16.1-16.62页(Sambrook和Russell编,Molecular Cloning ALaboratory Manual,第3卷,第3版,2001年);Alessia Colosimo等,Transfer and Expression of Foreign Genes in Mammalian Cells,29(2)Biotechniques 314-318,320-322,324(2000);PhilipWashbourne和A.Kimberley McAllister,Techniques for GeneTransfer into Neurons,12(5)Curr.Opin.Neurobiol.566-573(2002);和Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley andSons,pp 9.16.4-9.16.11页(2000),各文献的全部内容以引用的方式并入本文;本方法中的外源性多核苷酸分子将编码使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解如SNAP-25、ORL1、DOR、KOR或MOR等SNAP-25底物所需的组分。本领域的技术人员应了解,将多核苷酸分子引入细胞中特定方法的选择将部分取决于细胞是暂时还是稳定地含有使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶通过蛋白水解裂解SNAP-25底物所需的组分。编码使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽通过酶蛋白水解裂解SNAP-25底物所需的组分的多核苷酸分子的非限制性实例如下:ORL1多核苷酸分子SEQ ID NO:61或SEQ ID NO:62;DOR多核苷酸分子SEQ ID NO:63或SEQ ID NO:64;KOR多核苷酸分子SEQ ID NO:65或SEQ ID NO:66;MOR多核苷酸分子SEQ ID NO:67;甘丙肽受体1多核苷酸分子SEQID NO:141、SEQ ID NO:142或SEQ ID NO:143;甘丙肽受体2多核苷酸分子SEQ ID NO:144或甘丙肽受体3多核苷酸分子SEQ ID NO:145;以及SNAP-25多核苷酸分子SEQ ID NO:68或SEQ ID NO:69。
本领域技术人员众所周知化学物质介导的递送方法,且这些方法描述于例如Martin Jordan和Florian Worm,Transfection ofAdherent and Suspended Cells by Calcium Phosphate,33(2)Methods 136-143(2004);Chun Zhang等,PolyethylenimineStrategies for Plasmid Delivery to Brain-Derived Cells,33(2)Methods 144-150(2004),各文献的全部内容据此以引用的方式并入本文。这些化学物质介导的递送方法可通过标准程序制备,并且可以商购获得,参见例如,CellPhect转染试剂盒(AmershamBiosciences,Piscataway,NJ);哺乳动物转染试剂盒、磷酸钙和DEAE葡聚糖(Stratagene,Inc.,La Jolla,CA);LipofectamineTM转染试剂(Invitrogen,Inc.,Carlsbad,CA);ExGen 500转染试剂盒(Fermentas,Inc.,Hanover,MD);和SuperFect和Effectene转染试剂盒(Qiagen,Inc.,Valencia,CA)。
本领域的普通技术人员众所周知物理方式介导的递送方法,且这些方法描述于例如Jeike E.Biewenga等,Plasmid-MediatedGene Transfer in Neurons using the Biolistics Technique,71(1)J.Neurosci.Methods.67-75(1997);John O’Brien和Sarah C.R.Lummis,Biolistic and Diolistic Transfection:Using the Gene Gunto Deliver DNA and Lipophilic Dyes into Mammalian Cells,33(2)Methods 121-125(2004);M.Golzio等,In Vitro and In VivoElectric Field-Mediated Permeabilization,Gene Transfer,andExpression,33(2)Methods,126-135(2004);和Oliver Gresch等,New Non-Viral Method for Gene Transfer into Primary Cells,33(2)Methods,151-163(2004),各文献的全部内容据此以引用的方式并入本文。
本领域的普通技术人员众所周知病毒介导的递送方法,且这些方法描述于例如Chooi M.Lai等,Adenovirus andAdeno-Associated Virus Vectors,21(12)DNA Cell Biol.895-913(2002);Ilya Frolov 等,Alphavirus-Based Expression Vectors:Strategies and Applications,93(21)Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.11371-11377(1996);Roland Wolkowicz等,Lentiviral Vectors forthe Delivery of DNA into Mammalian Cells,246,Methods Mol.Biol.391-411(2004);A.Huser和C.Hofmann,Baculovirus Vectors:Novel Mammalian Cell Gene-Delivery Vehicles and TheirApplications,3(1)Am.J.Pharmacogenomics 53-63(2003);TizianaTonini等,Transient Production of Retroviral-and Lentiviral-BasedVectors for the Transduction of Mammalian Cells,285,MethodsMol.Biol.141-148(2004);Manfred Gossen和Hermann Bujard,Tight Control of Gene Expression in Eukaryotic Cells byTetracycline-Responsive Promoters,美国专利第5,464,758号;Hermann Bujard和Manfred Gossen,Methods for Regulating GeneExpression,美国专利第5,814,618号;David S.Hogness,Polynucleotides Encoding Insect Steroid Hormone ReceptorPolypeptides and Cells Transformed With Same,美国专利第5,514,578号;David S.Hogness,Polynucleotides Encoding InsectEcdysone Receptor,美国专利6,245,531;Elisabetta Vegeto等,Progesterone Receptor Having C.Terminal Hormone BindingDomain Truncations,美国专利第5,364,791号;Elisabetta Vegeto等,Mutated Steroid Hormone Receptors,Methods for Their Useand Molecular Switch for Gene Therapy,美国专利第5,874,534号,各专利文献的全部内容据此以引用的方式并入本文。这些病毒介导的递送方法可通过标准程序制备,并且可以商购获得,参见例如ViraPowerTM腺病毒表达系统(Invitrogen,Inc.,Carlsbad,CA)和ViraPowerTM腺病毒表达系统使用说明25-0543 A版,Invitrogen Inc.,(2002年7月15日);以及AdEasyTM腺病毒载体系统(Stratagene,Inc.,La Jolla,CA)和AdEasyTM腺病毒载体系统使用说明064004f,Stratagene,Inc。此外,这些病毒递送系统也可以通过标准方法制备,并且可以商购获得,参见例如,BDTMTet-Off和Tet-On基因表达系统(BD Biosciences-Clonetech,PaloAlto,CA)和BDTM Tet-Off和Tet-On基因表达系统使用说明PT3001-1,BD Biosciences Clonetech(2003年3月14日)、GeneSwitchTM系统(Invitrogen,Inc.,Carlsbad,CA)和GeneSwitchTM系统A米非司酮调控的哺乳动物细胞表达系统D版,25-0313,InvitrogenInc.,(2002年11月4日);ViraPowerTM慢病毒表达系统(Invitrogen,Inc.,Carlsbad,CA)和ViraPowerTM慢病毒表达系统使用说明25-0501E版,Invitrogen Inc.,(2003年12月8日);以及Complete Control逆转录病毒诱导哺乳动物表达系统(Stratagene,La Jolla,CA)和Complete Control逆转录病毒诱导哺乳动物表达系统使用说明,064005e。
因此,在一个实施方案中,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解SNAP-25底物所需的组分的多核苷酸分子。在另一实施方案中,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解SNAP-25底物所需的多个组分的多核苷酸分子。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码ORL1、DOR、KOR、MOR或SNAP-25的多核苷酸分子。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码ORL1的多核苷酸分子SEQ ID NO:61或SEQ ID NO:62。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码DOR的多核苷酸分子SEQ ID NO:63或SEQ ID NO:64。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码KOR的多核苷酸分子SEQ ID NO:65或SEQ ID NO:66。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码MOR的多核苷酸分子SEQ ID NO:67。
在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码甘丙肽受体1的多核苷酸分子SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:142或SEQ ID NO:143。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码甘丙肽受体2的多核苷酸分子SEQ ID NO:144。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码甘丙肽受体3的多核苷酸分子SEQ ID NO:145。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞暂时含有编码SNAP-25的多核苷酸分子SEQ ID NO:68或SEQ ID NO:69。
在另一实施方案中,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解SNAP-25底物所需的组分的多核苷酸分子。在另一实施方案中,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶蛋白水解裂解SNAP-25底物所需的多个组分的多核苷酸分子。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码ORL1、DOR、KOR、MOR或SNAP-25的多核苷酸分子。在该实施方案的方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码ORL1的多核苷酸分子SEQ ID NO:61或SEQ ID NO:62。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码DOR的多核苷酸分子SEQ ID NO:63或SEQ ID NO:64。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码KOR的多核苷酸分子SEQ IDNO:65或SEQ ID NO:66。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码MOR的多核苷酸分子SEQ ID NO:67。
在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码甘丙肽受体1的多核苷酸分子SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:142或SEQ ID NO:143。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码甘丙肽受体2的多核苷酸分子SEQ ID NO:144。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码甘丙肽受体3的多核苷酸分子SEQ ID NO:145。在该实施方案的其它方面,来自确立细胞系的对重靶向内肽酶活性敏感的细胞稳定含有编码SNAP-25的多核苷酸分子SEQ ID NO:68或SEQ ID NO:69。
如上文所提到的,可以在细胞中引入本说明书中公开的使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶通过蛋白水解裂解如SNAP-25、ORL1、DOR、KOR、MOR、甘丙肽受体1、甘丙肽受体2或甘丙肽受体3等SNAP-25底物所需的外源性组分。可以使用任何和所有用于利用递送剂将此类外源性组分引入细胞群的方法,前提条件是此方法可暂时将本说明书中公开的外源性组分引入给定细胞群内至少50%的细胞中。因此,该实施方案的方面可包括细胞群,其中给定细胞群中例如至少50%、至少60%、至少70%、至少80%或至少90%暂时含有本说明书中公开的使细胞经历整个细胞机制,由此使重靶向内肽酶通过蛋白水解裂解如SNAP-25、ORL1、DOR、KOR、MOR、甘丙肽受体1、甘丙肽受体2或甘丙肽受体3等SNAP-25底物所需的外源性组分。本文中使用的术语“递送剂”是指使共价连接、非共价连接或以任何其它方式缔合的多肽内化到细胞中能够实现或增加的任何分子。因此,术语“递送剂”涵盖但不限于,(不限于)将共价或非共价连接的分子运输到细胞膜、细胞质或细胞核的蛋白质、肽、拟肽、小分子、多核苷酸分子、脂质体、脂质、病毒、逆转录病毒和细胞。还应了解,术语“递送剂”涵盖通过任何机制内化的分子,包括通过受体介导的胞吞作用起效的递送剂,以及不依靠受体介导的胞吞作用的递送剂。
递送剂还可以是例如通过化学缀合或通过基因方法产生的融合蛋白,使如SNAP-25、ORL1、DOR、KOR、MOR、甘丙肽受体1、甘丙肽受体2或甘丙肽受体3等共价连接的组分的细胞摄取能够实现或增加的试剂。共价连接递送剂的方法和这些试剂的使用方法描述于例如以下专利文献中:Steven F.Dowdy,Protein Transduction System and Methods of Use Thereof,国际公布第WO 00/34308号;Gérard Chassaing和Alain Prochiantz,Peptides which can be Used as Vectors for the IntracellularAddressing of Active Molecules,美国专利第6,080,724号;AlanFrankel等,Fusion Protein Comprising TAT-derived TransportMoiert,美国专利第5,674,980号;Alan Frankel等,TAT-derivedTransport Polypeptide Conjugates,美国专利第5,747,641号;AlanFrankel等,TAT-derived Transport Polypeptides and FusionProteins,美国专利第5,804,604号;Peter F.J.O’Hare等,Use ofTransport Proteins,美国专利第6,734,167号;Yao-Zhong Lin和Jack J.Hawiger,Method for Importing Biologically ActiveMolecules into Cells,美国专利第5,807,746号;Yao-Zhong Lin和Jack J.Hawiger,Method forImporting Biologically ActiveMolecules into Cells,美国专利第6,043,339号;Yao-Zhong Lin等,Sequence and Method for Genetic Engineering of Proteins withCell Membrane Translocating Activity,美国专利第6,248,558号;Yao-Zhong Lin等,Sequence and Method for Genetic Engineeringof Proteins with Cell Membrane Translocating Activity,美国专利第6,432,680号;Jack J.Hawiger等,Method for ImportingBiologically Active Molecules into Cells,美国专利第6,495,518号;Yao-Zhong Lin等,Sequence and Method for GeneticEngineering of Proteins with Cell Membrane Translocating Activity,美国专利第6,780,843号;Jonathan B.Rothbard和Paul A Wender,Method and Composition for Enhancing Transport AcrossBiological Membranes,美国专利第6,306,993号;Jonathan B.Rothbard和Paul A Wender,Method and Composition forEnhancing Transport Across Biological Membranes,美国专利第6,495,663号;以及Pamela B.Davis等,Fusion Proteins for ProteinDelivery,美国专利第6,287,817号,各专利的全部内容以引用的方式并入本文。
递送剂也可以是使如SNAP-25、ORL1、DOR、KOR、MOR、甘丙肽受体1、甘丙肽受体2或甘丙肽受体3等非共价缔合的组分的细胞摄取能够实现或增加的试剂。在不存在共价键的情况下起作用的方法以及这些试剂的使用方法描述于例如以下文献中:Gilles Divita等,Peptide-Mediated Transfection Agents andMethods of Use,美国专利第6,841,535号;Philip L Felgner和Olivier Zelphati,Intracellular Protein Delivery Compositions andMethods of Use,美国专利公布第2003/0008813号;以及MichaelKaras,Intracellular Delivery of Small Molecules,Proteins andNucleic Acids,美国专利公布2004/0209797,各专利的全部内容以引用的方式并入本文。这些肽递送剂可以通过标准方法制备和使用,并且可商购获得,参见例如CHARIOTTM试剂(Active Motif,Carlsbad,CA);BIO-PORTER试剂(Gene Therapy Systems,Inc.,San Diego,CA)、BIO TREKTM蛋白质递送剂(Stratagene,La Jolla,CA)和PRO-JECTTM蛋白质转染剂(Pierce Biotechnology Inc.,Rockford,IL)。
本发明的方面部分包括含重靶向内肽酶的样本。本文中使用的术语“含重靶向内肽酶的样本”是指含有或可能含有活性重靶向内肽酶的任何生物物质。根据本说明书中公开的方法,可以测定多种样本,包括但不限于:纯化、部分纯化或未纯化的重靶向内肽酶;具有天然或非天然序列的重组单链或双链重靶向内肽酶;具有经修改的蛋白酶特异性的重组重靶向内肽酶;具有变化的细胞特异性的重组重靶向内肽酶;大量重靶向内肽酶;经过配制的重靶向内肽酶产物;以及例如细菌、酵母、昆虫或哺乳动物来源的细胞或粗制的、分级分离的或部分纯化的细胞裂解物;血液、血浆或血清;生食、半熟食、熟食或加工过的食物;饮料;动物饲料;土壤样本;水样本;塘底泥;洗剂;化妆品;和临床制剂。应了解,术语样本涵盖组织样本,包括但不限于:哺乳动物组织样本、家畜组织样本,例如绵羊、奶牛和猪的组织样本;灵长类动物的组织样本;和人类的组织样本。这些样本涵盖但不限于:肠样本,例如婴儿肠样本,以及从创口获得的组织样本。在非限制性实例中,可以使用检测皮摩尔量的重靶向内肽酶活性的方法来确定食物或饮料样本中重靶向内肽酶的存在或活性,测定例如暴露于重靶向内肽酶或出现一种或多种肉毒中毒症状的人或动物的样本,在大量重靶向内肽酶生产和纯化期间跟踪活性,测定医药或化妆品应用中使用的经过配制的重靶向内肽酶产物,或测定受试者血清中中和α-重靶向内肽酶抗体的存在与否。
因此,在一个实施方案中,含重靶向内肽酶的样本是包含任何量的重靶向内肽酶的样本。在该实施方案的方面,含重靶向内肽酶的样本包含约100ng或更少、约10ng或更少、约1ng或更少、约100pg或更少、约10pg或更少或约1pg或更少的重靶向内肽酶。在该实施方案的其它方面,含重靶向内肽酶的样本包含约1μM或更少、约100nM或更少、约10nM或更少、约1nM或更少、约100nM或更少、约10nM或更少、约1nM或更少的重靶向内肽酶。
本发明的方面部分包括从经过处理的细胞中分离出包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的SNAP-25组分。本文中使用的术语“包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的SNAP-25组分”是指含有SNAP-25裂解产物的细胞组分。预期适于富集或分离SNAP-25组分的任何方法都可以使用,包括但不限于:细胞裂解方案、旋转柱纯化方案、免疫沉淀法、亲和纯化法和蛋白质色谱法。
本公开的方面部分包括连接到固相载体的α-SNAP-25抗体。本文中使用的术语“固相载体”与“固相”同义,意思指可用于固定本说明书中公开的α-SNAP-25抗体的任何基质。固相载体的非限制性实例包括例如:试管;板;柱;针或“测验片(dipstick)”;磁性粒子、珠粒或者其它球形或纤维性色谱分离介质,例如琼脂糖、琼脂糖凝胶、二氧化硅和塑料;以及薄片或膜,例如硝基纤维素和聚偏二氟乙烯(polyvinylidene fluoride,PVDF)。可以使用如玻璃、碳、聚苯乙烯、聚氯乙烯、聚丙烯、聚乙烯、葡聚糖、尼龙(nylon)、重氮纤维素或淀粉等多种材料构造固相载体。所选固相载体的物理特性应使其易于与可溶性或未结合材料分开,且一般应使如过量试剂、反应副产物或溶剂等未结合材料能与结合固相载体的测定组分分开或以其它方式移除(例如通过洗涤、过滤、离心等)。制备和使用固相载体的方法的非限制性实例描述于例如:Molecular Cloning,A Laboratory Manual,同上文,(2001);和Current Protocols in Molecular Biology,同上文,(2004)中,各文献的全部内容据此以引用的方式并入本文。
本发明的方面部分包括检测抗体-抗原复合物的存在,这种抗体-抗原复合物包含选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体和在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物。预期任何检测系统都可以用来实行该公开的基于免疫的方法的方面,前提是信噪比可达到使来自抗体-抗原复合物的信号与背景信号相区分的统计上显著程度。基于免疫的检测系统的非限制性实例包括免疫分析法,如蛋白印迹和斑点印迹法(dot-blotting)、免疫沉淀分析法、酶联免疫吸附分析法(ELISA)和夹心ELISA。可以使用结合成像或光成像的放射自显影法(AU)、化学发光(chemiluminescense,CL)、电化学发光(electrochemiluminescence,ECL)、生物发光(bioluminescence,BL)、荧光、共振能量转移、平面极化、比色或流式细胞计量术(flow cytometry,FC)实现信号的检测。基于免疫的检测系统的描述公开于例如以下文献中:Michael M.Rauhut,Chemiluminescence,Kirk-Othmer Concise Encyclopedia ofChemical Technology(Grayson编,第3版,John Wiley and Sons,1985);A.W.Knight,A Review of Recent Trends in AnalyticalApplications of Electrogenerated Chemiluminescence,Trends Anal.Chem.18(1):47-62(1999);K.A.Fahnrich,等,Recent Applicationsof Electrogenerated Chemiluminescence in Chemical Analysis,Talanta 54(4):531-559(2001);Commonly Used Techniques inMolecular Cloning,第A8.1-A8-55页(Sambrook和Russell编,Molecular Cloning A Laboratory Manual,第3卷,第3版,2001);Detection Systems,第A9.1-A9-49页(Sambrook和Russell编,Molecular Cloning A Laboratory Manual,第3卷,第3版,2001);Electrogenerated Chemiluminescence(Allen J.Bard编,MarcelDekker Inc.,2004),各文献的全部内容据此以引用的方式并入本文。
夹心ELISA(或夹心免疫测定)是一种基于两种抗体的方法,这两种抗体将结合抗原上的不同表位。对相关抗原具有高结合特异性的捕捉抗体结合于固体表面。然后加入抗原,随后加入称为检测抗体的第二抗体。检测抗体结合抗原上与捕捉抗体所结合不同的表位。抗原因此“被夹在”两种抗体之间。抗体对抗原的结合亲合力通常是免疫测定灵敏度的主要决定因素。随着抗原浓度增加,检测抗体的量也增加,由此产生较高的测量响应。为定量结合程度,可以使用不同报告系统,例如连接第二抗体的酶,和在酶促响应中形成被视为检测信号的读数的报告子底物。产生的信号与样本中存在的靶抗原的量成比例。用于测量结合事件的报告子底物将决定检测模式。测量光谱光度的读板器用于比色检测。已经开发出了化学发光和电化学发光底物,其进一步扩大了信号,并且可以在发光读取器上读出。报告子还可以是荧光读出器,其中该测定的酶步骤被替换为荧光团,且随后使用荧光读取器测量读出信号。进行ECL夹心ELISA所需的试剂和方案可商购获得,包括但不限于:MSD夹心ELISA-ECL检测平台(MesoScale Discovery,Gaithersburg,MD)。
因此,在一个实施方案中,可以使用免疫印迹分析法、免疫沉淀分析法、ELISA或夹心ELISA来检测抗体-抗原复合物的存在,这种抗体-抗原复合物包含选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25抗体,以及在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物。在该实施方案的方面,该检测是使用AU、CL、ECL或BL免疫印迹分析法;AU、CL、ECL、BL或FC免疫沉淀分析法;AU、CL、ECL、BL或FC ELISA;或者AU、CL、ECL、BL或FC夹心ELISA进行的。
本公开的方面可以按单重或多重方式实行。按单重方式实行的用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法是一种只能检测包含α-SNAP-25抗体和在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物的抗体-抗原复合物的存在的方法。按多重方式实行的用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法是一种同时检测两种或两种以上抗体-抗原复合物的存在的方法;其中一种抗体-抗原复合物是包含α-SNAP-25抗体和在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物的抗体-抗原复合物;而另一种(其它)抗体-抗原复合物是针对第二、第三、第四等不同蛋白质的抗体-抗原复合物。第二蛋白质可以例如作为内对照,以通过针对所检测的针对第二种蛋白质的抗体-抗原复合物的量将所检测的α-SNAP-25/SNAP-25抗体-抗原复合物的量归一化,来使样本间的变化减到最少。因此,第二蛋白质通常是始终由细胞表达的蛋白质,例如管家蛋白(house-keeping protein)。适用的第二蛋白质的非限制性实例包括例如3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、突触融合蛋白、细胞因子。按多重方式进行基于免疫的测定的方法描述于例如以下文献中:U.B.Nielsen和B.H.Geierstanger,Multiplexed Sandwich Assays in Microarray Format,J.Immunol.Methods.290(1-2):107-120 2004);R.Barry和M,Soloviev,Quantitative Protein Profiling using Antibody Arrays,Proteomics,4(12):3717-3726(2004);M.M.Ling等,Multiplexing MolecularDiagnostics and Immunoassays using Emerging MicroarrayTechnologies,Expert Rev Mol Diagn.7(1):87-98(2007);S.X.Leng等,ELISA and Multiplex Technologies for CytokineMeasurement in Inflammation and Aging Research,J Gerontol ABiol Sci Med Sci.63(8):879-884(2008),各文献的全部内容据此以引用的方式并入本文。
因此,在一个实施方案中,按单重方式实行的用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法只检测包含α-SNAP-25抗体和在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物的抗体-抗原复合物的存在。在另一实施方案中,按多重方式实行的用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法同时检测包含α-SNAP-25抗体和在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物以及至少一种针对除SNAP-25外的蛋白质(例如GAPDH或突触融合蛋白)的其它抗体-抗原复合物的抗体-抗原复合物存在。
本公开的方面部分提供用于测定重靶向内肽酶免疫抗性的方法。本文中使用的术语“重靶向内肽酶免疫抗性”是指由于哺乳动物的免疫响应直接或间接降低了重靶向内肽酶疗法的功效,使得这种哺乳动物不对重靶向内肽酶疗法充分起反应,或显示出降低的重靶向内肽酶疗法的有益作用。功效降低的非限制性实例将出现在具有至少一种中和α-重靶向内肽酶抗体的哺乳动物中,这种抗体以降低或阻止重靶向内肽酶的特异性或活性的方式结合重靶向内肽酶。本文中使用的术语“重靶向内肽酶疗法”是指以治疗、改善、治愈、愈合、康复或任何其它方式对抗需要使用重靶向内肽酶进行的神经调节的哺乳动物发生的不合需要的事件,或者对哺乳动物施用一种或多种控制剂量的具有医疗、治疗、治愈、化妆、补救和任何其它有益作用的重靶向内肽酶的药物、制剂或混合物。重靶向内肽酶疗法涵盖但不限于:使用其任何天然存在或经过修饰的片段组合任何载体或活性成分的任何制剂,并通过任何施用途径施用。
本公开的方面部分提供从哺乳动物中获得的用于测试α-重靶向内肽酶中和抗体的存在与否的测试样本。本文中使用的术语“测试样本”是指含有或可能含有至少一种α-重靶向内肽酶抗体的任何生物物质。α-重靶向内肽酶抗体可以是中和α-重靶向内肽酶抗体或非中和α-重靶向内肽酶抗体。本文中使用的术语“中和α-重靶向内肽酶抗体”是指在生理条件下将以一定方式结合重靶向内肽酶某一区域,从而降低或阻止重靶向内肽酶发挥其在重靶向内肽酶疗法中的作用的任何α-重靶向内肽酶抗体。本文中使用的术语“非中和α-重靶向内肽酶抗体”是指在生理条件下将结合重靶向内肽酶某一区域,但不阻止重靶向内肽酶发挥其在重靶向内肽酶疗法中的作用的任何α-重靶向内肽酶抗体。预期可含有α-重靶向内肽酶抗体的任何和所有样本都可以用于本方法中,包括但不限于:血液、血浆、血清和淋巴液。此外,能够产生针对重靶向内肽酶的α-重靶向内肽酶抗体的任何和所有生物体都可用作样本来源,包括但不限于:鸟类和哺乳动物类,包括小鼠、大鼠、山羊、绵羊、马、驴、奶牛、灵长类动物和人类。有关血液采集和血清制备的具体方案的非限制性实例描述于例如以下文献中:Marjorie Schaub Di Lorenzo和Susan King Strasinger,BloodCollection in Healthcare(F.A.Davis Company,2001);以及DianaGarza和Kathleen Becan-McBride,Phlebotomy Handbook:BloodCollection Essentials(Prentice Hall,第6版,2002)。这些方案属于本领域技术人员技能范围且是本文中教导的常规程序。测试样本可以在生物体暴露于重靶向内肽酶之前、单次重靶向内肽酶治疗后、多次重靶向内肽酶治疗后、重靶向内肽酶疗法抗性发生前或重靶向内肽酶疗法抗性发生后获得。
本公开的方面部分提供对照样本。本文中使用的术语“对照样本”是指已知存在或不存在测试样本的任何样本,并且包括阴性对照样本和阳性对照样本。对于中和α-重靶向内肽酶抗体,阴性对照样本可以从未曾暴露于重靶向内肽酶的个体获得,且可包括但不限于:在经历重靶向内肽酶治疗前从提供测试样本的同一个体取得的样本;从未曾暴露于重靶向内肽酶的不同个体取得的样本;从未曾暴露于BoNT/A的多个不同个体取得的合并样本。对于中和α-重靶向内肽酶抗体,阳性对照样本可以从表现重靶向内肽酶免疫抗性的个体获得,且包括但不限于:在基于患者的测试测定中测试呈阳性的个体;在体内生物测定中测试呈阳性的个体;和显示高免疫性的个体,例如接种过重靶向内肽酶的个体。
还预期α-重靶向内肽酶抗体可以由样本纯化得到。α-重靶向内肽酶抗体可以使用多种程序由样本纯化得到,这些程序包括但不限于:蛋白质A/G色谱法和亲和色谱法。用于纯化样本中的抗体的具体方案的非限制性实例描述于例如以下文献中:ANTIBODIES:A LABORATORY MANUAL(Edward Harlow和DavidLane编,Cold Spring Harbor Laboratory Press,第2版,1998);USING ANTIBODIES:A LABORATORY MANUAL:PORTABLE PROTOCOLNo.I(Edward Harlow和David Lane,Cold Spring HarborLaboratory Press,1998);和MOLECULAR CLONING,A LABORATORYMANUAL,同上文,(2001),这些文献据此以引用的方式并入本文。此外,抗体纯化方法以及充分表征的试剂、条件和方案的非限制性实例易于从供应商获得,包括但不限于:Pierce BiotechnologyInc.,Rockford,IL);和Zymed Laboratories Inc.,South SanFrancisco,CA。这些方案是本领域技术人员技能范围内的常规程序。
因此,在一个实施方案中,样本包含血液。在该实施方案的一方面,样本包含小鼠血、大鼠血、山羊血、绵羊血、马血、驴血、奶牛血、灵长类动物血或人血。在另一实施方案中,样本包含血浆。在该实施方案的一方面,测试样本包含小鼠血浆、大鼠血浆、山羊血浆、绵羊血浆、马血浆、驴血浆、奶牛血浆、灵长类动物血浆或人血浆。在另一实施方案中,样本包含血清。在该实施方案的一方面,样本包含小鼠血清、大鼠血清、山羊血清、绵羊血清、马血清、驴血清、奶牛血清、灵长类动物血清或人血清。在另一实施方案中,样本包含淋巴液。在该实施方案的一方面,样本包含小鼠淋巴液、大鼠淋巴液、山羊淋巴液、绵羊淋巴液、马淋巴液、驴淋巴液、奶牛淋巴液、灵长类动物淋巴液或人淋巴液。在另一实施方案中,样本为测试样本。在另一实施方案中,样本为对照样本。在该实施方案的方面,对照样本为阴性对照样本或阳性对照样本,
本发明的方面部分提供在步骤(d)中检测到的在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的量与在步骤(e)中检测到的在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的量的比较。在一个实施方案中,测试样本中SNAP-25裂解产物的量高于对照样本中SNAP-25裂解产物的量。在该实施方案的一方面,测试样本中SNAP-25裂解产物的量高于阳性对照样本表明,哺乳动物具有较低重靶向内肽酶免疫抗性或缺乏重靶向内肽酶免疫抗性。在该实施方案的另一方面,测试样本中SNAP-25裂解产物的量与阴性对照样本相当表明,哺乳动物具有较低重靶向内肽酶免疫抗性或缺乏重靶向内肽酶免疫抗性。在另一实施方案中,测试样本中SNAP-25裂解产物的量低于对照样本中SNAP-25裂解产物的量。在该实施方案的一方面,测试样本中SNAP-25裂解产物的量比阳性对照样本低或与之相当将表明,哺乳动物具有增加的重靶向内肽酶免疫抗性或存在重靶向内肽酶免疫抗性。在该实施方案的另一方面,测试样本中SNAP-25裂解产物的量低于阴性对照样本表明,哺乳动物具有较高重靶向内肽酶免疫抗性或存在重靶向内肽酶免疫抗性。
预期适于检测样本中中和α-重靶向内肽酶抗体的存在的任何和所有测定条件都可用于本说明书中公开的方法,例如线性测定条件和非线性测定条件。在一个实施方案中,这些分析测定呈线性。在该实施方案的一方面,重靶向内肽酶的测定量是过量的。在该实施方案的另一方面,重靶向内肽酶的测定量是限速的。在该实施方案的另一方面,测试样本的测定量是限速的。
本公开的方面也可描述如下:
1.一种用于检测重靶向内肽酶活性的方法,所述方法包括以下步骤:a)用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感;b)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;c)使SNAP-25组分与α-SNAP-25抗体接触,其中α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;和d)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;其中抗体-抗原复合物的检测将指示重靶向内肽酶活性。
2.一种用于检测重靶向内肽酶活性的方法,所述方法包括以下步骤:a)用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感;b)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;c)使SNAP-25组分与连接到固相载体的α-SNAP-25抗体接触,其中α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;和d)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;其中抗体-抗原复合物的检测将指示重靶向内肽酶活性。
3.一种用于检测重靶向内肽酶活性的方法,所述方法包括以下步骤:a)用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感;b)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;c)将SNAP-25组分固定于固相载体;d)使SNAP-25组分与α-SNAP-25抗体接触,其中α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;和e)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;其中抗体-抗原复合物的检测将指示重靶向内肽酶活性。
4.一种用于检测重靶向内肽酶活性的方法,所述方法包括以下步骤:a)用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞可摄取重靶向内肽酶;b)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;c)使SNAP-25组分与α-SNAP-25抗体接触,其中α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;和d)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;其中抗体-抗原复合物的检测将指示重靶向内肽酶活性。
5.一种用于检测重靶向内肽酶活性的方法,所述方法包括以下步骤:a)用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞可摄取重靶向内肽酶;b)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;c)使SNAP-25组分与连接到固相载体的α-SNAP-25抗体接触,其中α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;和d)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;其中抗体-抗原复合物的检测将指示重靶向内肽酶活性。
6.一种用于检测重靶向内肽酶活性的方法,所述方法包括以下步骤:a)用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞可摄取重靶向内肽酶;b)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;c)将SNAP-25组分固定于固相载体;d)使SNAP-25组分与α-SNAP-25抗体接触,其中α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;和e)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;其中抗体-抗原复合物的检测将指示重靶向内肽酶活性。
7.一种用于测定哺乳动物的重靶向内肽酶免疫抗性的方法,其包括以下步骤:a)将重靶向内肽酶加入从哺乳动物中获得的用于测试α-重靶向内肽酶中和抗体的存在与否的测试样本中;b)用测试样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性敏感;c)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;d)使SNAP-25组分与α-SNAP-25抗体接触,其中所述α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;e)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;f)用阴性对照样本代替测试样本,重复步骤b-e,阴性对照样本包含重靶向内肽酶以及已知不含α-重靶向内肽酶中和抗体的血清;和g)将步骤e中检测到的抗体-抗原复合物的量与步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量相比较,其中检测出步骤e中检测到的抗体-抗原复合物的量少于步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量,就指示存在α-重靶向内肽酶中和抗体。
8.一种用于测定哺乳动物的重靶向内肽酶免疫抗性的方法,其包括以下步骤:a)将重靶向内肽酶加入从哺乳动物中获得的用于测试α-重靶向内肽酶中和抗体的存在与否的测试样本中;b)用测试样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性敏感;c)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;d)使SNAP-25组分与连接到固相载体的α-SNAP-25抗体接触,其中所述α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;e)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;f)用阴性对照样本代替测试样本,重复步骤b-e,阴性对照样本包含重靶向内肽酶以及已知不含α-重靶向内肽酶中和抗体的血清;和g)将步骤e中检测到的抗体-抗原复合物的量与步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量相比较,其中检测出步骤e中检测到的抗体-抗原复合物的量少于步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量,就指示存在α-重靶向内肽酶中和抗体。
9.一种用于测定哺乳动物的重靶向内肽酶免疫抗性的方法,其包括以下步骤:a)将重靶向内肽酶加入从哺乳动物中获得的用于测试α-重靶向内肽酶中和抗体的存在与否的测试样本中;b)用测试样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞对重靶向内肽酶活性敏感;c)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;d)将SNAP-25组分固定于固相载体;e)使SNAP-25组分与α-SNAP-25抗体接触,其中所述α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;f)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;g)用阴性对照样本代替测试样本,重复步骤b-f,阴性对照样本包含重靶向内肽酶以及已知不含α-重靶向内肽酶中和抗体的血清;和h)将步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量与步骤g中检测到的抗体-抗原复合物的量相比较,其中检测出步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量少于步骤g中检测到的抗体-抗原复合物的量,就指示存在α-重靶向内肽酶中和抗体。
10.一种用于测定哺乳动物的重靶向内肽酶免疫抗性的方法,其包括以下步骤:a)将重靶向内肽酶加入从哺乳动物中获得的用于测试α-重靶向内肽酶中和抗体的存在与否的测试样本中;b)用测试样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞可摄取重靶向内肽酶;c)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;d)使SNAP-25组分与α-SNAP-25抗体接触,其中所述α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;e)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;f)用阴性对照样本代替测试样本,重复步骤b-e,阴性对照样本包含重靶向内肽酶以及已知不含α-重靶向内肽酶中和抗体的血清;和g)将步骤e中检测到的抗体-抗原复合物的量与步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量相比较,其中检测出步骤e中检测到的抗体-抗原复合物的量少于步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量,就指示存在α-重靶向内肽酶中和抗体。
11.一种用于测定哺乳动物的重靶向内肽酶免疫抗性的方法,其包括以下步骤:a)将重靶向内肽酶加入从哺乳动物中获得的用于测试α-重靶向内肽酶中和抗体的存在与否的测试样本中;b)用测试样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞可摄取重靶向内肽酶;c)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述出SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;d)使SNAP-25组分与连接到固相载体的α-SNAP-25抗体接触,其中所述α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;e)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;f)用阴性对照样本代替测试样本,重复步骤b-e,阴性对照样本包含重靶向内肽酶以及已知不含α-重靶向内肽酶中和抗体的血清;和g)将步骤e中检测到的抗体-抗原复合物的量与步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量相比较,其中检测出步骤e中检测到的抗体-抗原复合物的量少于步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量,就指示存在α-重靶向内肽酶中和抗体。
12.一种用于测定哺乳动物的重靶向内肽酶免疫抗性的方法,其包括以下步骤:a)将重靶向内肽酶加入从哺乳动物获得的用于测试α-重靶向内肽酶中和抗体的存在与否的测试样本中;b)用测试样本处理来自确立细胞系的细胞,其中来自确立细胞系的细胞可摄取重靶向内肽酶;c)从经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物;d)将SNAP-25组分固定于固相载体;e)使SNAP-25组分与α-SNAP-25抗体接触,其中所述α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位;f)检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含α-SNAP-25抗体和SNAP-25裂解产物;g)用阴性对照样本代替测试样本,重复步骤b-f,阴性对照样本包含重靶向内肽酶以及已知不含α-重靶向内肽酶中和抗体的血清;和h)将步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量与步骤g中检测到的抗体-抗原复合物的量相比较,其中检测出步骤f中检测到的抗体-抗原复合物的量少于步骤g中检测到的抗体-抗原复合物的量,就指示存在α-重靶向内肽酶中和抗体。
13.根据1至3和7至9所述的方法,其中所述细胞对约500nM或更少、约400nM或更少、约300nM或更少、约200nM或更少、约100nM或更少的重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感。
14.根据4至6和10至12所述的方法,其中所述细胞可摄取约500nM或更少、约400nM或更少、约300nM或更少、约200nM或更少、约100nM或更少的重靶向内肽酶。
15.根据1至6所述的方法,其中所述样本包含约100ng或更少、约10ng或更少、约1ng或更少、100fg或更少、10fg或更少或者1fg或更少的重靶向内肽酶。
16.根据1至6所述的方法,其中所述样本包含约100nM或更少、约10nM或更少、约1nM或更少、约100nM或更少、约10nM或更少、约1nM或更少、约0.5nM或更少或者约0.1nM或更少的重靶向内肽酶。
17.根据1至12所述的方法,其中所述抗体-抗原复合物的存在是通过免疫印迹分析法、免疫沉淀分析法、ELISA或夹心ELISA检测。
18.根据1至12所述的方法,其中所述方法在下渐近线的信噪比为至少3∶1、至少5∶1、至少10∶1、至少20∶1、至少50∶1或至少100∶1。
19.根据1至12所述的方法,其中所述方法在上渐近线的信噪比为至少10∶1、至少20∶1、至少50∶1、至少100∶1、至少200∶1、至少300∶1、至少400∶1、至少500∶1或至少600∶1。
20.根据1至12所述的方法,其中所述方法可检测例如至少100ng、至少50ng、至少10ng、至少5ng、至少100pg、至少50pg、至少10pg、至少5pg、至少100fg、至少50fg、至少10fg或至少5fg的重靶向内肽酶的EC50活性。
21.根据1至12所述的方法,其中所述方法可检测例如至少10nM、至少5nM、至少100nM、至少50nM、至少10nM、至少5nM、至少1nM、至少0.5nM或至少0.1nM的重靶向内肽酶的EC50活性。
22.根据1至12所述的方法,其中所述方法的LOD为例如10pg或更少、9pg或更少、8pg或更少、7pg或更少、6pg或更少、5pg或更少、4pg或更少、3pg或更少、2pg或更少、1pg或更少的重靶向内肽酶。
23.根据1至12所述的方法,其中所述方法的LOD为例如100nM或更少、90nM或更少、80nM或更少、70nM或更少、60nM或更少、50nM或更少、40nM或更少、30nM或更少、20nM或更少或者10nM或更少的重靶向内肽酶。
24.根据1至12所述的方法,其中所述方法的LOQ为例如10pg或更少、9pg或更少、8pg或更少、7pg或更少、6pg或更少、5pg或更少、4pg或更少、3pg或更少、2pg或更少、1pg或更少的重靶向内肽酶。
25.根据1至12所述的方法,其中所述方法的LOQ为例如100nM或更少、90nM或更少、80nM或更少、70nM或更少、60nM或更少、50nM或更少、40nM或更少、30nM或更少、20nM或更少或者10nM或更少的重靶向内肽酶。
26.根据1至12所述的方法,其中所述方法可将具有完全活性的重靶向内肽酶与活性是具有完全活性的重靶向内肽酶A的70%或更少、60%或更少、50%或更少、40%或更少、30%或更少、20%或更少或者10%或更少的具有部分活性的重靶向内肽酶区分开来。
27.根据1至12所述的方法,其中所述α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处包含羧基末端的表位。
28.根据27所述的方法,其中所述α-SNAP-25抗体对SNAP-25裂解产物中不包含所述BoNT/A裂解位点易分裂键的羧基末端谷氨酰胺的表位的缔合速率常数小于1×101M-1s-1;且其中所述α-SNAP-25抗体对所述表位的平衡解离常数小于0.450nM。
29.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体具有包含选自由SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:80和SEQ ID NO:82组成的组的氨基酸序列的重链可变区;和包含选自由SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:86、SEQID NO:88、SEQ ID NO:90和SEQ ID NO:92组成的组的氨基酸序列的轻链可变区。
30.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体至少包含具有SEQ ID NO:93的VH CDR1、具有SEQ ID NO:94的VH CDR1、具有SEQ ID NO:95的VH CDR1、具有SEQ ID NO:118的VH CDR1、具有SEQ ID NO:119的VH CDR1或具有SEQID NO:120的VH CDR1。
32.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体至少包含具有SEQ ID NO:96的VH CDR2、具有SEQ ID NO:97的VH CDR2、具有SEQ ID NO:98的VH CDR2、具有SEQ ID NO:99的VH CDR2、具有SEQ ID NO:121的VH CDR2、具有SEQ IDNO:122的VH CDR2或具有SEQ ID NO:123的VH CDR2。
33.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体至少包含具有SEQ ID NO:100的VH CDR3、具有SEQ ID NO:101的VH CDR3、具有SEQ ID NO:102的VH CDR3或具有SEQID NO:124的VH CDR3。
34.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体至少包含具有SEQ ID NO:103的VL CDR1、具有SEQ ID NO:104的VL CDR1、具有SEQ ID NO:105的VL CDR1、具有SEQ ID NO:106的VL CDR1、具有SEQ ID NO:107的VL CDR1、具有SEQ IDNO:125的VL CDR1、具有SEQ ID NO:126的VL CDR1、具有SEQ ID NO:127的VL CDR1、具有SEQ ID NO:128的VL CDR1或具有SEQ ID NO:129的VL CDR1。
35.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体至少包含具有SEQ ID NO:108的VL CDR2、具有SEQ ID NO:109的VL CDR2、具有SEQ ID NO:110的VL CDR2、具有SEQ ID NO:111的VL CDR2或具有SEQ ID NO:112的VL CDR2。
36.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体至少包含具有SEQ ID NO:113的VL CDR3、具有SEQ ID NO:114的VL CDR3、具有SEQ ID NO:115的VL CDR3、具有SEQ ID NO:116的VL CDR3或具有SEQ ID NO:117的VL CDR3。
37.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体包含重链可变区,其包含SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:121和SEQID NO:100;和轻链可变区,其包含SEQ ID NO:105、SEQ ID NO:110和SEQ ID NO:115。
38.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体选择性结合具有SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:147或SEQ ID NO:148的SNAP-25表位。
39.根据27所述的方法,其中所述分离的α-SNAP-25抗体选择性结合具有SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44的SNAP-25表位。
实施例
实施例I
筛选用于表达内源性重靶向内肽酶受体的候选细胞系
以下实施例说明如何鉴别拥有开发基于细胞的效力测定所需的重靶向内肽酶摄取能力的确立细胞系。
1.候选细胞系储备培养物的生长.
为生长细胞系,将适合密度的来自所测试的细胞系的细胞接种于含有30mL适合的生长培养基(参见表1)的162cm2组织培养烧瓶中,并使其在37℃培养箱中于5%或10%二氧化碳下生长,直到细胞达到所需密度。
2.筛选在细胞表面上表达靶受体的细胞.
使用流式细胞计量术和/或配体结合测定筛选存在所需靶受体的细胞系。尽管以下实施例使用试剂来鉴别质膜中的阿片或阿片样受体,但也可以使用下文公开的方法来鉴别任何重靶向内肽酶的同源受体。
a.使用流式细胞计量术鉴别细胞系.
为鉴别包含在细胞表面上表达重靶向内肽酶靶受体的细胞的确立细胞系,进行流式细胞计量术分析。如第1部分中所述,使每一候选细胞系的细胞生长,用胰蛋白酶处理,在包含1×PBS、0.5%BSA的染色缓冲液中洗涤,并在1200rpm下离心3分钟。将球状细胞再悬浮于染色缓冲液中,并将约2.0×106个细胞转移到新试管中,每种测试的受体使用两个试管。为针对阿片或阿片样受体的存在进行筛选,将约2.0μL到5.0μL α-ORL-1RA14133(Neuromics,Edina,MN)、α-DOR兔多克隆抗体RA10101(Neuromics,Edina,MN)、α-KOR兔多克隆抗体RA10103(Neuromics,Edina,MN)或α-MOR兔多克隆抗体RA10104(Neuromics,Edina,MN)加入一个试管中,并在4℃下孵育混合物1小时。在无任何抗体的情况下,将第二个试管在4℃下孵育1小时,并用作阴性对照物。在抗体孵育后,将1.0mL染色缓冲液加入各试管中,并在1200rpm下离心3分钟。再用1.0mL染色缓冲液洗涤细胞小球1次。将细胞小球再悬浮于200μL染色缓冲液中,并将2.0μL山羊抗兔IgG FITC抗体加入各试管中,并在4℃下于暗处孵育1小时。在与二抗一起孵育后,将1.0mL染色缓冲液加入各试管中,并在1200rpm下离心3分钟。再用1.0mL染色缓冲液洗涤细胞小球1次,并将小球再悬浮于500μL染色缓冲液中。使用流式细胞计数器分析样本,且数据呈现为抗受体抗体染色覆盖在兔IgG FITC染色上的情形。
结果表明,在所测试的细胞系中,ORL-1在约50%的构成确立细胞系SiMa、SiMa P>33、克隆H10、ND7和SK-N-DZ的细胞的细胞表面上表达;在介于约25%到约50%之间的构成确立细胞系SH-SY5Y和ND15的细胞的细胞表面上表达;且在不到约25%的构成确立细胞系ND3、ND8、N18和Neuro-2a的细胞的细胞表面上表达(表2)。结果还表明,KOR在约50%的构成确立细胞系SH-SY5Y和ND7的细胞的细胞表面上表达;在介于约25%到约50%之间的构成确立细胞系SiMa克隆H10、SiMa P>33、ND15和Neuro-2a的细胞的细胞表面上表达;且在不到约25%的构成确立细胞系ND3、ND8和N18的细胞的细胞表面上表达(表2)。结果同时还揭露,MOR在约50%的构成确立细胞系ND7、ND15和SiMa P>33的细胞的细胞表面上表达;在介于约25%到约50%之间的构成确立细胞系SH-SY5Y、SiMa克隆H10、ND8和Neuro-2a的细胞的细胞表面上表达;且在不到约25%的构成确立细胞系ND3和N18的细胞的细胞表面上表达(表2)。α-DOR兔多克隆抗体RA10101无法适宜地工作,并且产生不可用的数据。
b.使用配体结合鉴别细胞系.
为鉴别包含在细胞表面上表达重靶向内肽酶靶受体的细胞的确立细胞系,进行配体结合分析。将来自欲测试的候选细胞系的细胞接种于黑色透明底的96孔板上,孵育约4小时以促进附着。为针对阿片或阿片样受体的存在进行筛选,随后从各孔中抽吸出培养基,并用含0(未处理的对照物)、0.001nM、0.01nM、0.1nM或1nM FAM-痛敏肽(Phoenix Pharmaceuticals,Inc.,Burlingame,CA),或含0(未处理的对照物)、0.001nM、0.01nM、0.1nM或1nM FAM-强啡肽A(dynorphin A)(PhoenixPharmaceuticals,Inc.,Burlingame,CA)的50μL配体溶液替换。在37℃培养箱中5%二氧化碳下将细胞与配体溶液一起孵育1小时。通过用100μL的1×PBS洗涤细胞3次来洗涤细胞,以除去未结合的配体。在Typhoon(Ex 488且Em 520nm)上扫描板,随后在M5读板器(Ex 495且Em 520nm)上读取板中的RFU信号。结果表明,构成确立细胞系SiMa克隆H10、SH-SY5Y和SK-N-DZ的细胞结合痛敏肽,而构成SiMa克隆H10的细胞还结合强啡肽(表2)。
使用类似方法,通过FAM标记这些内肽酶的靶向域,并如上文所述筛选细胞系,可鉴别出包含具有其它重靶向内肽酶的同源受体的细胞的细胞系。
3.使用重靶向内肽酶分子对候选细胞系进行单剂量筛选.
为确定细胞系是否能够摄取适合的重靶向内肽酶分子,将适合密度的来自测试细胞系的储备培养物的细胞接种于含有1mL适合的血清生长培养基的24孔组织培养板的各孔中(表1)。使细胞在37℃培养箱中5%二氧化碳下生长,直到细胞达到所需密度(约18到24小时)。为评估阿片重靶向内肽酶的摄取情况,从各孔中抽吸出生长培养基,并用1)不含阿片重靶向内肽酶(未处理的细胞系)的新鲜生长培养基;或2)含30nM痛敏肽重靶向内肽酶(Noc/A)或100nM强啡肽重靶向内肽酶(Dyn/A)(处理过的细胞系)的新鲜生长培养基替换。在过夜孵育后,通过抽吸生长培养基并用200μL的1×PBS冲洗各孔,来洗涤细胞。为收获细胞,抽吸出1×PBS,通过加入50μL的2×SDS上样缓冲液(LoadingBuffer)来裂解细胞,将裂解物转移到清洁的试管中,并将样本加热到95℃,保持5分钟。
为检测未裂解的SNAP-25底物和裂解的SNAP-25产物的存在,通过蛋白质印迹来分析每一收获样本的等分试样。在该分析中,在变性、还原条件下,借助MOPS聚丙烯酰胺凝胶电泳法,使用NuPAGENovex 12% Bis-Tris预制聚丙烯酰胺凝胶(Invitrogen Inc.,Carlsbad,CA)分离出12μL的收获样本的等分试样。借助蛋白质印迹,使用TRANS-BLOTSD半干电泳转印细胞仪(semi-dry electrophoretic transfer cell apparatus)(Bio-RadLaboratories,Hercules,CA)将分离出的肽从凝胶转印到聚偏二氟乙烯(PVDF)膜(Invitrogen Inc.,Carlsbad,CA)上。通过在室温下在溶液中孵育2小时来封闭PVDF膜,该溶液含有Tris缓冲生理盐水(Tris-Buffered Saline,TBS)(25mM 2-氨基-2-羟甲基-1,3-丙二醇盐酸(Tris-HCl)(pH 7.4)、137mM氯化钠、2.7mM氯化钾)、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)、2%牛血清白蛋白(BSA)、5%脱脂奶粉。4℃下,在TBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)、2%BSA和5%脱脂奶粉中将封闭的膜孵育过夜,该5%脱脂奶粉含有1)α-SNAP-25小鼠单克隆抗体的1∶5,000稀释液作为一抗(SMI-81;SternbergerMonoclonals Inc.,Lutherville,MD);或2)S9684 α-SNAP-25兔多克隆抗血清的1∶5,000稀释液作为一抗(Sigma,St Louis,MO)。α-SNAP-25小鼠单克隆抗体和兔多克隆抗体都可同时检测未裂解的SNAP-25底物和裂解的SNAP-25产物,从而能够评估各细胞系中SNAP-25的整体表达情况和重靶向内肽酶处理后裂解的SNAP-25百分比,以作为参数来评估重靶向内肽酶的摄取量。在TBS、TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)中洗涤用一抗探查的印迹3次,每次持续15分钟。室温下,在TBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)、2%BSA和5%脱脂奶粉中孵育经过洗涤的膜2小时,该5%脱脂奶粉含有1)缀合辣根过氧化物酶的山羊多克隆抗小鼠免疫球蛋白G重链和轻链(IgG,H+L)抗体(Zymed,South San Francisco,CA)的1∶10,000稀释液作为二抗;或2)缀合辣根过氧化物酶的山羊多克隆抗兔免疫球蛋白G重链和轻链(IgG,H+L)抗体(Zymed,SouthSan Francisco,CA)的1∶10,000稀释液作为二抗。在TBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)中洗涤用二抗探查的印迹3次,每次持续15分钟。使用ECL PlusTM蛋白印迹检测系统(GE Healthcare,Amersham Biosciences,Piscataway,NJ)观察标记SNAP-25产物的信号检测,并利用Typhoon 9410可变模式成像仪(Variable Mode Imager)和图像分析软件(ImagerAnalysis software)(GE Healthcare,Amersham Biosciences,Piscataway,NJ)获取膜图像并定量裂解产物的百分比。根据单个印迹,选择像素大小(100到200像素)和PMT电压设置(350到600,通常为400)。
根据对SNAP-25裂解产物的检测,以下细胞系展现摄取30nM Noc/A:BE(2)-C、N18TG2、Neuro-2a、SiMa、SK-N-BE(2)-C和SK-N-DZ(表3);而以下细胞系展现摄取100nM Dyn/A:N18TG2、Neuro-2a、PC12和SiMa。用较低剂量的化合物和/或用全剂量响应测试这些敏感细胞系中的一部分。
使用类似方法,可以评估包含具有其它重靶向内肽酶同源受体的细胞的细胞系的重靶向内肽酶摄取。
实施例II
筛选内源性重靶向内肽酶受体表达的候选无性细胞系
1.来自亲本SiMa细胞系的候选无性细胞系的单剂量重靶向内肽酶筛选.
伴随提交的专利申请Zhu Hong等,Cell Lines Useful inImmuno-Based Botulinum Toxin Serotype A Activity Assays,美国专利申请序列第61/160,199号公开了源自于亲本SiMa细胞系的无性细胞系,这些无性细胞系可用于BoNT/A效力测定中,如Ester Fernandez-Salas等,Immuno-Based Botulinum ToxinSerotype A Activity Assays,美国专利申请序列第12/403,531号中所述,各专利申请的全部内容据此以引用的方式并入本文。为确定这些无性细胞系是否能够摄取适当的重靶向内肽酶,使用ECL夹心ELISA测定来对各细胞系进行筛选。
为制备用重靶向内肽酶处理过的裂解物,将适合密度的来自所测试细胞系的储备培养物的细胞接种于含有100μL适合的血清生长培养基(表1)的96孔组织培养板的各孔中,培养过夜。从各孔中抽吸出接种的细胞中的培养基,并用含有30nM Noc/A重靶向内肽酶或80nM Dyn/A重靶向内肽酶的新鲜培养基替换。孵育24小时后,通过抽吸生长培养基并用200μL的1×PBS冲洗各孔来洗涤细胞。为收获细胞,抽吸出1×PBS,通过向各孔中加入30μL包含20mM Tris-HCl(pH 7,5)、150mM NaCl、1mMEDTA、1mM EGTA、1%Triton X-100的裂解缓冲液来裂解细胞,并在4℃下,在以500rpm旋转的振荡器上孵育板30分钟。在4℃下,以4000rpm离心板20分钟以使细胞碎片形成粒状沉淀,并将上清液转移到涂有捕捉抗体的96孔板中,以进行检测步骤。
为制备α-SNAP-25197捕捉抗体溶液,使用标准蛋白质A纯化方案纯化来自杂交瘤细胞系2E2A6(实施例XI)的腹水中所含的α-SNAP-25197小鼠单克隆抗体。
为制备α-SNAP-25检测抗体溶液,根据制造商说明书(MesoScale Discovery,Gaithersburg,MD),将α-SNAP-25兔多克隆抗体S9684(Sigma,St.Louis,MO)与钌(II)-三-二吡啶-(4-甲基磺酸酯)NHS酯标记试剂(Meso Scale Discovery,Gaithersburg,MD)缀合。按以下方式进行缀合反应:将30μL蒸馏水重悬的(reconstituted)MSD SULFO-TAGTM储备溶液加入200μL的2mg/mL α-SNAP-25多克隆抗体中,并在室温下于暗处孵育反应2小时。使用标准离心柱方案纯化标记抗体,并使用标准比色蛋白质测定来确定蛋白质浓度。使用分光光度计在455nm下测量α-SNAP-25抗体/MSD SULFO-TAGTM缀合物的吸光度,以确定浓度(以摩尔/升为单位)。在4℃下储存检测抗体溶液待用。不用的等分试样在-20℃下长期储存。
为制备包含α-SNAP-25197捕捉抗体的α-SNAP-25固相载体,将约5μL适当的α-SNAP-25197单克隆抗体溶液(在1×PBS中为20μg/mL)加入96孔MSD高结合力(MSD High Bind)板的各孔中,并使溶液在生物安全柜中风干2到3小时,以便液体蒸发该溶液。密封经过封闭的板,并在4℃下储存待用。
为通过ECL夹心ELISA检测裂解的SNAP-25产物的存在,然后通过加入150μL封闭缓冲液(Blocking Buffer)在室温下培养封闭结合捕捉抗体的孔2小时,该封闭缓冲液包含2%Amersham封闭试剂(GE Life Sciences,Piscataway,NJ)和10%山羊血清(VWR,West Chester,PA)。抽吸出封闭缓冲液,将25μL用重靶向内肽酶处理过的细胞的裂解物加入各孔中,并在4℃下将板孵育过夜。通过抽吸细胞裂解物,并用200μL 1×PBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)冲洗各孔3次,将板中各孔洗涤3次。在洗涤之后,向各孔中加入25μL包含1×PBS中2%Amersham封闭试剂、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)的5μg/mL α-SNAP-25检测抗体溶液,然后密封,并在室温下振荡孵育1小时。在孵育α-SNAP-25检测抗体之后,用200μL 1×PBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)洗涤各孔3次。洗涤后,将150μL 1×读取缓冲液(Read Buffer)(Meso Scale Discovery,Gaithersburg,MD)加入各孔中,并使用SECTORTM Imager 6000型图像读取器(Image Reader)(Meso Scale Discovery,Gaithersburg,MD)读取板。使用ECL成像仪收集原始数据。
结果表明,亲本SiMa细胞系以及无性细胞系H10都显示对Noc/A重靶向内肽酶的良好摄取(表4)。此外,这些结果还揭露,许多细胞系展现对Dyn/A重靶向内肽酶的摄取(表4)。三个无性细胞系(1E11、AF4和DC4)对Dyn/A重靶向内肽酶显示良好摄取;11个无性细胞系(1E3、2D2、2D6、3D8、5C10、5F3、BB10、BF8、CG8、CG10和DE7)展现对Dyn/A重靶向内肽酶的中等摄取;且(3B8、2B9、CE6、YB8、4C8、2F5、AC9、CD6、DD10、YF5)显示对Dyn/A重靶向内肽酶的最少摄取。在全剂量响应测定中,用相应的重靶向内肽酶测试这些候选细胞系中的一部分。
2.候选细胞系的全剂量响应筛选.
接下来,使用适当重靶向内肽酶的全剂量响应来评估上文所鉴别的确立细胞系。将来自不同细胞系的细胞接种于96孔板中,并暴露于各种浓度的Noc/A(0、0.14nM、0.4nM、1.23nM、3.7nM、11.1nM、33.3nM和100nM)或Dyn/A(0.017nM、0.05nM、0.15nM、0.45nM、1.4nM、4.1nM、12nM、37nM、111nM、333nM和1000nM),保持24小时。然后除去含重靶向内肽酶的培养基,并用新鲜的完全培养基替换。在37℃、5%CO2下再孵育孔板24小时,以使SNAP-25裂解。将细胞于裂解缓冲液(表5)中裂解,并对孔板进行离心,以去除碎片。裂解物用于蛋白印迹测定中或夹心ELISA中。
对于蛋白印迹分析,如实施例I中所述,测定样本中完整SNAP-25和SNAP-25裂解产物的存在。
对于夹心ELISA,在室温下,用150μL封闭缓冲液封闭涂有2E2A6单克隆抗体的ELISA板,保持2小时。在除去封闭缓冲液之后,将25μL细胞裂解物加入各孔中,并在4℃下孵育板2小时。用PBS-T将板洗涤3次,并将PBS-T中的2%封闭剂中浓度为5μg/mL的25μL标记SULFO-TAG NHS-酯的抗-SNAP25pAb检测抗体加入各孔的底角。密封板并在室温下振荡1小时,随后用PBS-T洗涤3次。洗涤完成后,每孔加入150μL 1×读取缓冲液,并在SI6000型图像读取器中读取板。为确定每一测试的细胞系的敏感性,计算各细胞系的EC50值。Noc/A重靶向内肽酶的值概括于表5中。仅在PC12和克隆AF4中进行重靶向内肽酶Dyn/A的全剂量响应。在这两种情况下,测定未达到上渐近线且不能计算出EC50值。对于两种细胞系来说,产生AF4克隆信号的剂量较低,为12nM。
使用类似方法,可针对重靶向内肽酶摄取筛选和评估包含具有其它重靶向内肽酶同源受体的细胞的无性细胞系。
实施例III
生长条件对候选细胞系中重靶向内肽酶摄取的影响的评估
以下实施例说明如何确定使确立细胞系中重靶向内肽酶摄取最多的培养条件(生长和分化)。
1.细胞分化和营养因子对候选细胞系重靶向内肽酶摄取的影响.
为确定细胞分化或生长培养基中营养因子的存在是否改进重靶向内肽酶摄取,利用不同培养基组成来测试展现良好Noc/A摄取的细胞系。将适合密度的来自所测试的SiMa P>30细胞系的储备培养物的细胞接种于96孔组织培养板的各孔中,该96孔组织培养板的孔中含有100μL含RPMI1640、1%青霉素-链霉素、2mM L-谷氨酰胺且补充有B27和N2的无血清培养基或者含有100μL含RPMI1640、1%青霉素-链霉素、2mM L-谷氨酰胺且补充有B27、N2和NGF(神经生长因子,100ng/mL)的无血清培养基。在37℃培养箱中5%二氧化碳下孵育这些细胞,直到借助标准和常规形态学标准(例如生长停滞和神经突延伸)评估发现细胞分化为止(约1到2天)。作为对照物,将适合密度的来自测试细胞系的储备培养物的细胞接种于含有100μL含或不含NGF(100ng/mL)的适宜生长培养基(表1)的96孔组织培养板的各孔中。在37℃培养箱中5%二氧化碳下使这些未分化的对照细胞生长,直到细胞达到所需密度(约18到24小时)。从各孔中抽吸出分化的对照培养物和未分化的对照培养物的培养基,并用含有0(未处理的样本)或各种浓度的Noc/A(0.14nM、0.4nM、1.23nM、3.7nM、11.1nM、33.3nM和100nM)的新鲜培养基替换。经过24小时的处理之后,洗涤细胞,并在不含重靶向内肽酶的培养基中孵育24小时,以增加产生的SNAP25197的量。然后洗涤并收获细胞用于如实施例II中所述的ECL夹心ELISA测定中。
还测试营养因子对SK-N-DZ细胞系的影响。将SK-N-DZ细胞按每孔25,000个细胞接种于涂有聚D-赖氨酸的96孔板上的8种不同SM培养基中(表6),保持72小时。在含有0、0.3nM、3nM和30nM剂量的Noc/A的同样的八种培养基中处理细胞。经过24小时的处理后,洗涤细胞并在不含重靶向内肽酶的培养基中孵育24小时,以便增加产生的SNAP25197裂解产物的量。然后洗涤并收获细胞用于如实施例I中所述的蛋白印迹测定中。
分化对SiMa>P30细胞系中的Noc/A摄取没有影响,但似乎会改进SK-N-DZ细胞系中的摄取。基础培养基对SK-N-DZ细胞系中的Noc/A摄取具有显著影响,其中包含营养因子N2和B27的RPMI1640是最佳组合。培养基中NGF的存在似乎不会改进所测试的两种细胞系中的摄取。
使用类似方法,可评估包含具有其它重靶向内肽酶同源受体的细胞的无性细胞系的生长条件和分化条件。
实施例IV
表达外源性重靶向内肽酶受体的确立细胞系的开发
以下实施例说明如何制备表达重靶向内肽酶外源性受体的确立细胞系。
1.将靶受体转染到构成候选细胞系的细胞中.
重靶向内肽酶Noc/A包含痛敏肽靶向域,其为类阿片受体-1(ORL-1)的天然配体。为获得包含ORL-1的开放阅读框的表达构建体,从GeneCopoeia(GeneCopoeia,Germantown,MD)中获得表达构建体pReceiver-M02/ORL-1。
或者,可以使用标准程序(BlueHeronBiotechnology,Bothell,WA),根据ORL-1的氨基酸序列(例如氨基酸序列SEQ ID NO:25或SEQ ID NO:26)合成多核苷酸分子。使用标准亚磷酰胺合成法合成20到50碱基长的寡核苷酸。使这些寡核苷酸杂交成双链的双链体,其连接在一起以组装全长多核苷酸分子。使用标准分子生物学方法将该多核苷酸分子克隆到pUCBHB1载体中的SmaI位点,以产生pUCBHB1/ORL-1。通过使用Big Dye TerminatorTMChemistry 3.1(Applied Biosystems,Foster City,CA)和ABI 3100型测序仪(Applied Biosystems,Foster City,CA)进行测序来验证合成的多核苷酸分子。必要时,可根据ORL-1氨基酸序列(例如氨基酸序列SEQ ID NO:25或SEQ ID NO:26)合成表达优化的多核苷酸分子,以便改进其在大肠杆菌菌株中的表达。可对编码ORL-1的多核苷酸分子进行修饰,以使其1)含有通常存在于大肠杆菌菌株的天然多核苷酸分子中的同义密码子;2)含有的G+C含量与大肠杆菌菌株中发现的天然多核苷酸分子的平均G+C含量极为匹配;3)减少在多核苷酸分子内所发现的聚单核苷酸区;和/或4)消除在多核苷酸分子内所发现的内部调控或结构位点,参见例如,Lance E.Steward等,Optimizing Expression of ActiveBotulinum Toxin Type A,美国专利公布2008/0057575(2008年3月6日);和Lance E.Steward等,Optimizing Expression of ActiveBotulinum Toxin Type E,美国专利公布2008/0138893(2008年6月12日)。一旦完成序列优化,就使用标准亚磷酰胺合成法合成20到50个碱基长的寡核苷酸。使这些寡核苷酸杂交成双链的双链体,其连接在一起以组装全长多核苷酸分子。使用标准分子生物学方法将该多核苷酸分子克隆到pUCBHB1载体中的SmaI位点,以产生pUCBHB1/ORL-1。通过DNA测序来验证合成的多核苷酸分子。必要时,可针对例如酵母菌株、昆虫细胞系或哺乳动物细胞系等不同生物体进行表达优化,参见例如,Steward,美国专利公布2008/0057575,同上文,(2008);和Steward,美国专利公布2008/0138893,同上文,(2008)。示例性编码ORL-1的多核苷酸分子包括SEQ ID NO:61和SEQ ID NO:62。
为构建编码ORL-1的表达构建体,用限制性内切核酸酶消化pUCBHB1/ORL-1构建体以1)切除编码ORL-1的开放阅读框的多核苷酸分子;并2)使该多核苷酸分子可操作地连接到pcDNA3载体(Invitrogen Inc.,Carlsbad,CA)。使用T4DNA连接酶程序将该插入物亚克隆到pcDNA3载体中,用适宜的限制性内切核酸酶消化,得到pcDNA3/ORL-1。使用电穿孔法,将连接混合物转化到电击转化感受态大肠杆菌BL21(DE3)细胞(Edge Biosystems,Gaitherburg,MD)中,并将细胞接种于含有50μg/mL氨比西林的1.5%Luria-Bertani琼脂平板(pH 7.0)上,并放入37℃培养箱中过夜生长。将含有表达构建体的细菌鉴别为氨比西林抗性集落。使用碱性溶解质粒小量制备程序分离出候选构建体,并通过限制性内切核酸酶消化图进行分析,以确定插入物的存在和方位。该克隆策略将得到包含编码ORL-1的多核苷酸分子的pcDNA3表达构建体。
重靶向内肽酶Dyn/A包含强啡肽靶向域,其为κ-阿片受体(KOR)的天然配体。为获得包含ORL-1的开放阅读框的表达构建体,从GeneCopoeia(GeneCopoeia,Germantown,MD)获得表达构建体pReceiver-M02/KOR-1。或者,可以使用与上文所述方法类似的方法合成并亚克隆编码KOR的表达构建体,以产生表达构建体pcDNA3.1/KOR。示例性KOR氨基酸序列包括SEQ ID NO:29和SEQ ID NO:30;示例性编码KOR的多核苷酸分子包括SEQID NO:65和SEQ ID NO:66。
可以使用类似克隆策略来制备编码其它重靶向内肽酶受体的表达构建体,例如pcDNA3.1/DOR或pcDNA3.1/MOR、pcDNA3.1/甘丙肽受体1、pcDNA3.1/甘丙肽受体2或pcDNA3.1/甘丙肽受体3。示例性DOR的氨基酸序列包括SEQ ID NO:27和SEQ ID NO:28;示例性MOR的氨基酸序列包括SEQ ID NO:31;示例性甘丙肽受体1的氨基酸序列包括SEQ ID NO:136、SEQ ID NO:137和SEQ ID NO:138;示例性甘丙肽受体2的氨基酸序列包括SEQ ID NO:139;且示例性甘丙肽受体3的氨基酸序列包括SEQ ID NO:140。示例性编码DOR的多核苷酸分子包括SEQ ID NO:63和SEQ ID NO:64;示例性编码MOR的多核苷酸分子包括SEQ ID NO:67;示例性编码甘丙肽受体1的多核苷酸分子包括SEQ ID NO:141、SEQ ID NO:142和SEQ ID NO:143;示例性编码甘丙肽受体2的多核苷酸分子包括SEQ ID NO:144;且示例性编码甘丙肽受体3的多核苷酸分子包括SEQ IDNO:145。
为引入编码重靶向内肽酶受体的表达构建体,用编码重靶向内肽酶受体的表达构建体转染细胞系。为能用阿片或阿片样受体转染细胞系,将来自候选细胞系的细胞按1×107个细胞的密度接种于涂有T175胶原蛋白IV(T175 Collagen IV)的烧瓶中,并在37℃培养箱中5%二氧化碳下生长,直到细胞达到所需密度。通过将4mL在室温下孵育了5分钟的含有200μL LipofectAmine2000(Invitrogen,Carlsbad,CA)的OPTI-MEM减血清培养基加入4mL含有20μg pReceiver-M02/ORL-1或20μgpReceiver-M02/KOR-1的OPTI-MEM减血清培养基中,制备4.2mL转染溶液。在室温下孵育该转染溶液约20分钟。将培养基用8mL无血清且无抗生素的新鲜培养基替换,并将转染溶液加入细胞中。然后在37℃培养箱中5%二氧化碳下孵育细胞约16-18小时。将转染培养基用新鲜的生长培养基替换,并在37℃培养箱在5%二氧化碳下孵育细胞。24小时后,用含有培养基(选择培养基)中的浓度为1mg/mL的抗生素G418的新鲜生长培养基替换生长培养基,并孵育细胞7天。每周更换选择培养基,总共持续4周(在每周更换培养基期间,约90%细胞死亡并将其除去)。
用ORL-1受体转染的候选细胞系包括SiMa>P30、ND15、ND7、NG108-T15和SK-N-DZ细胞系。用KOR-1受体转染的候选细胞系包括SiMa、SiMa>P30、ND15、ND7、NG108-T15和SK-N-DZ细胞系。转染的NG108-T15细胞在G418中选择时未能存活。
2.使用重靶向内肽酶分子对稳定转染的细胞系进行的单剂量和剂量响应筛选.
将来自在前一部分中经过转染和选择的候选细胞系的细胞按1×105个细胞/孔接种到涂有聚D-赖氨酸或胶原蛋白IV的96孔板上含有N2和B27添加物以及NGF(50-100ng/ml)的RPMI1640培养基中,持续20±4小时,随后用化合物处理。然后用同种培养基中的30nM的重靶向内肽酶Noc/A处理用ORL-1受体稳定转染的细胞,持续24±2小时,但SK-N-DZ细胞系除外,该细胞系是用10nM的重靶向内肽酶Noc/A处理。在120μL裂解缓冲液中裂解细胞,并将20μL裂解物与2×SDS缓冲液混合,以进行如实施例I中详述的蛋白印迹测定。当用ORL-1受体转染时,所有细胞系都呈现重靶向Noc/A化合物的摄取增加(表7)。
将来自在前一部分中经过转染和选择的候选细胞系的细胞按1×105个细胞/孔接种到涂有聚D-赖氨酸或胶原蛋白IV的96孔板上含有10%FBS以及N2和B27添加物的RPMI1640培养基中,持续20±4小时,随后用化合物处理。用同种培养基中的100nM的重靶向内肽酶Dyn/A处理用KOR-1受体稳定转染的细胞,持续24±2小时。在120μL裂解缓冲液中裂解细胞,并将20μL裂解物与2×SDS缓冲液混合,以进行如实施例I中详述的蛋白印迹测定。当用人KOR-1受体转染时,所有细胞系都呈现重靶向Dyn/A化合物的摄取增加。
3.通过连续稀释选择展现高敏感性的稳定转染的无性细胞系
以下实施例说明如何鉴别稳定转染的确立细胞系中对重靶向内肽酶作用影响或具有重靶向内肽酶摄取能力的无性系细胞。
对于上述所选细胞的单细胞克隆,采用有限稀释细胞系克隆法。用胰蛋白酶处理细胞,计数,稀释以实现每100μL 0.5-1个细胞,将细胞按每孔100μL接种于5个涂有聚D-赖氨酸的96孔板中的选择培养基中。将细胞孵育超过2周,直到在孔底部形成集落。对源自单一细胞的阳性集落进行标记。使用显微照相机获取单细胞源性克隆的照片。在克隆开始后约4周,使来自含单一克隆的孔中的细胞再生长1周,并将其转移到24孔板中。
对于克隆的选择,用于筛选阳性克隆的主要参数是使用蛋白印迹分析,用识别完整和裂解的SNAP-25的抗体测量的在Noc/A或Dyn/A处理后获得的SNAP-25裂解产物的最高量。一旦可获得足够的细胞,就用10nM和30nM的重靶向内肽酶Noc/A测试过表达ORL-1的克隆过夜(表8)。用100nM的重靶向内肽酶Dyn/A测试过表达KOR-1的克隆过夜(表9)。此外,根据实施例I中所述的强啡肽结合测定来测试过表达KOR-1的克隆。
4.使用重靶向内肽酶对稳定转染的无性细胞系进行的剂量响应筛选.
在全剂量响应实验中测试来自第3部分的显示出良好重靶向内肽酶Noc/A摄取的候选的稳定转染无性细胞系,以确定其对重靶向内肽酶Noc/A的敏感性和功效。将细胞按1×105个细胞/孔接种到涂有聚D-赖氨酸或胶原蛋白IV的96孔板上含有N2和B27添加物以及NGF(50-100ng/ml)的RPMI1640培养基中,持续20±4小时,随后用化合物处理。用同种培养基中的0、0.14nM、0.4nM、1.23nM、3.7nM、11.1nM、33.3nM和100nM的Noc/A处理来自亲本AGN P33细胞系和ND7无性细胞系的细胞24小时,并在不含重靶向内肽酶的培养基中孵育24小时,以使SNAP-25裂解。此外,用同种培养基中的0、0.03nM、0.08nM、0.24nM、0.74nM、2.22nM、6.67nM和20nM的Noc/A处理来自亲本AGN P33细胞系的细胞24小时,并在不含重靶向内肽酶的培养基中孵育24小时,以使SNAP-25裂解。除去培养基,并洗涤且裂解细胞,以进行如实施例II中所详述的ECL夹心ELISA测定。由用ORL-1受体稳定转染的AGN P33亲本和无性细胞系得到的数据概述于表10中。克隆#2和克隆#6对重靶向内肽酶Noc/A呈现的敏感性和功效优于亲本细胞系。此外,具有较高敏感性的新无性细胞系允许使用较低浓度来进行剂量响应,由此证实新无性细胞系更敏感。
由用ORL-1受体稳定转染的ND7亲本和无性细胞系得到的数据概述于表11中。测试的所有克隆对重靶向内肽酶Noc/A呈现的敏感性和功效都比亲本细胞系ND7有所改进。克隆4B7、克隆1E6和克隆1C11最敏感,且EC50值都低于10pM。
表12概述了在不同细胞背景中由过表达ORL-1受体的无性细胞系的产生和测试获得的结果。
实施例V
来自亲本SK-N-DZ细胞系的无性细胞系的开发.
以下实施例说明如何鉴别亲本确立细胞系中对重靶向内肽酶的胞吐抑制作用敏感或具有重靶向内肽酶摄取能力的无性系细胞。
1.无性细胞系的分离.
在表征SK-N-DZ细胞系期间,发现构成该确立细胞系的细胞包含至少5种不同的细胞表型。为确定这些表型不同的细胞类型中任一者是否使该细胞系对重靶向内肽酶胞吐抑制作用敏感,进行了两次不同的有限稀释筛选以获得每一表型不同的细胞类型的单集落分离株。
使适合密度的来自SK-N-DZ储备溶液的细胞在涂有胶原蛋白IV的T175烧瓶中所含的DMEM、10%胎牛血清(热灭活)、0.1mM非必需氨基酸、10mM HEPES、1mM丙酮酸钠、100U/ml青霉素、100μg/ml链霉素中生长。第二次传代后,用胰蛋白酶处理细胞以产生细胞悬浮液,并确定细胞浓度。将该细胞悬浮液中约4.0×106个细胞转移到50mL试管中,并通过使用10mL注射器经由18.5号针反复用力排出,将细胞解离成单个细胞。然后,通过加入15mL新鲜生长培养基,将来自该解离的单细胞悬浮液的细胞稀释到0.2×106个细胞/毫升的浓度,并将2.5μL的该稀释液加入50mL新鲜生长培养基中,以达到10个细胞/毫升的浓度。对于该最终稀释储备溶液,将100μL生长培养基加入涂有胶原蛋白IV的96孔板的各孔中,并使细胞在37℃培养箱中5%二氧化碳下安静生长4周。设置4个96孔板进行分析。4周后,用显微镜观察各孔,以鉴别正在生长的单一集落,且对于鉴别出来的每一集落,将100μL新鲜生长培养基加入各孔中,并使细胞在37℃培养箱中5%二氧化碳下安静生长2周。再生长2周后,用胰蛋白酶处理正在生长的单一集落,并将其转移到新的96孔板中继续生长。一旦根据目测观察,集落生长达到约1,000个细胞,就用胰蛋白酶处理细胞,并将每一细胞悬浮液转移到新的涂有胶原蛋白IV的24孔板的各孔中。使这些细胞在37℃培养箱中5%二氧化碳下生长,必要时每2到3天补充一次新鲜生长培养基。使细胞生长直到培养物达到约60%或更高程度汇合,此时,根据24孔板中细胞的汇合程度,用胰蛋白酶处理细胞,并将每一细胞悬浮液转移到涂有胶原蛋白IV的25cm2烧瓶中。使这些细胞在37℃培养箱中5%二氧化碳下生长,必要时每2到3天补充一次新鲜生长培养基。一旦烧瓶中的细胞达到70-80%的汇合时,就将其冷冻并储存于液氮中,直到进行无性细胞系测试,以确定其对Noc/A的胞吐抑制作用的敏感度。根据活力和生长标准,从最初由两次筛选确立的384个集落分离株中选出24个无性细胞系,并进行扩增,以供后续筛选程序使用。在这些细胞系中,鉴别出12个快速生长的细胞系。
2.使用重靶向内肽酶对来自无性细胞系的细胞的重靶向内肽酶活性敏感度的初步筛选.
为确定来自无性细胞系的细胞是否对重靶向内肽酶Noc/A活性敏感,使用供确定内肽酶活性的基于免疫的方法进行初步筛选。
将13个SK-N-DZ克隆(#3、#4、#5、#8、#9、#10、#13、#15、#16、#17、#18、#22和#23)加SK-N-DZ亲本细胞接种于96孔板(每孔的细胞数量未知)上的EMEM、10%FBS、1×B27和1×N2中,并孵育过夜。用1nM的Noc/A处理细胞24小时。用100μL的裂解缓冲液裂解细胞20分钟,并在4000rpm下离心20分钟。将50μL的2×SDS样本缓冲液加入50μL的细胞裂解物中,并在95℃下加热5分钟。将10μL的蛋白质样本装载到12%NuPage凝胶的每个泳道上,并进行如实施例I中所述的蛋白印迹测定。针对总SNAP-25和裂解的SNAP-25的评估证实,克隆#3、克隆#8、克隆#15和克隆#22在Noc/A摄取方面至少与亲本细胞一样良好。在将细胞按比例扩增后,进行全剂量响应处理和利用ECL夹心ELISA测定的分析。
3.使用重靶向内肽酶分子对无性细胞系进行二次响应筛选.
为确定来自无性细胞系的细胞是否对重靶向内肽酶Noc/A活性敏感,使用用于确定内肽酶活性的基于免疫的方法进行二次筛选。
为进一步比较这些SK-N-DZ克隆的细胞系,进行ECL夹心ELISA测定。将5个克隆(#3、#9、#15、#16、#22)加SK-N-DZ亲本细胞按每个细胞系25,000个细胞/孔接种于涂有聚D-赖氨酸的96孔板上的RPMI 1640、10%FBS、1×B27和1×N2培养基(无NGF)中过周末。用0到20nM(0nM、0.03nM、0.08nM、0.24nM、0.74nM、2.22nM、6.67nM、20nM)剂量的Noc/A处理细胞24小时。如实施例I中详述的用ECL ELISA测定定量裂解的SNAP-25197。
表13显示了5个克隆和其亲本细胞系的EC50值和信噪比。与亲本细胞系(约2nM)相比较,名为#3、#9和#15的3个克隆产生较低EC50值(<1nM)且克隆#16和克隆#22产生类似的EC50值。然而,来自裂解的SNAP25的总信号高于克隆#3、克隆#22和亲本细胞中的总信号。与其余细胞系相比较,克隆#9、克隆#16和克隆#15具有较低总信号。
优化针对SK-N-DZ克隆的Noc/A处理条件,并执行测定,以比较克隆#3、克隆#15和克隆#22与亲本异质SK-N-DZ细胞系。表14显示了比较结果,并证实测定优化极大地改进了测定的信噪比。选择克隆#3和克隆#22进行进一步测定开发,因为这两个克隆拥有优良的敏感性和功效。
实施例V
针对重靶向内肽酶摄取表征和比较无性细胞系
以下实施例说明如何表征和比较源自包含异质细胞群的确立细胞系或通过靶受体转染和随后的细胞系克隆得到的无性细胞系。
为评估重靶向内肽酶摄取的特异性或选择性,使用缺乏靶向域的重靶向内肽酶进行非特异性摄取测定。对于阿片重靶向内肽酶,将来自AGN P33克隆#6细胞系(包含用编码ORL-1受体的表达构建体稳定转化的细胞)和SK-N-DZ无性细胞系#3和#22(包含表达内源性ORL-1受体的细胞)的细胞按150,000个细胞/孔接种于涂有聚D-赖氨酸的96孔板上含有N2和B27添加物以及NGF(50ng/mL)的RPMI 1640无血清培养基中,并在5%CO2的培养箱中37℃下孵育20±4小时,随后用化合物处理。用同种培养基中的范围为0nM到20nM或0nM到40nM的8种剂量的Noc/A或范围为0nM到400nM或0nM到40nM的8种剂量的LHN/A处理细胞22小时。除去培养基,并洗涤、裂解和离心细胞,以去除制剂中的碎片以供夹心ELISA测定用。在室温下,用150μL封闭缓冲液封闭涂有2E2A6单克隆抗体的ELISA板,保持1小时。除去封闭缓冲液后,将30μL细胞裂解物加入各孔中,并在4℃下孵育板2小时。用PBS-T将板洗涤3次,并将PBS-T中的2%封闭剂中浓度为5μg/mL的30μL标记SULFO-TAG NHS-酯的检测α-SNAP25多克隆抗体加入各孔的底角。密封板并在室温下振荡1小时,随后用PBS-T洗涤3次。洗涤完成后,每孔加入150μL 1×读取缓冲液,并在SI6000型图像读取器中读取板。Noc/A摄取与阴性对照LHN/A的比较结果显示于表15和表16中。这些结果表明,两种细胞系中Noc/A与LHN/A摄取之间存在明显不同,这证实了Noc/A摄取的特异性。
表17概括了表征和比较3个细胞系的结果。SK-N-DZ无性细胞系#3和#22拥有与原代eDRG相同的敏感性,并具有优良的信噪比,由此可开发针对重靶向内肽酶Noc/A的稳健测定。AGNP33无性细胞系#6因低非特异性摄取和适宜的敏感性也成为优良的候选物。
为评估重靶向内肽酶摄取的敏感性,进行配体饱和结合测定。大部分配体与其结合位点的相互作用都可根据结合亲和力来表征(NIH测定指南)。一般说来,高亲和力结合涉及配体在其受体结合位点的停留时间比低亲和力结合的情形长。解离常数常被用来描述配体(L)(例如某种药物)与蛋白质(P)之间的亲和力,即,配体与特定蛋白质结合的紧密程度。平衡饱和结合实验可测量在各种放射性配体浓度下的总结合和非特异性结合(NSB)。平衡解离常数或针对放射性配体的亲和力Kd以及受体结合位点的最大数量Bmax都可使用非线性回归分析由特异性结合(总结合-NSB)计算出来。针对特异性结合的Kd可以使用如以下等式中所示的单位点结合双曲线非线性回归分析(即GraphPad Prism)计算得到,其中Bmax是结合位点的最大数量(pmol/mg或pmol/细胞或位点/细胞),且Kd(nM、pM等)是达到一半最大结合所需的放射性配体的浓度:
对于阿片重靶向内肽酶,将来自AGN P33克隆#6细胞系(包含用编码ORL-1受体的表达构建体稳定转化的细胞)、SK-N-DZ亲本细胞系以及SK-N-DZ无性细胞系#3、#15和#22(包含表达内源性ORL-1受体的细胞)的细胞按200,000个细胞/孔接种到涂有聚D-赖氨酸的48孔板上含有1×N2和1×B27添加物的RPMI1640无血清培养基中,并在5%CO2培养箱中37℃下孵育过夜。除去培养基,并将细胞和150μL Tris结合缓冲液加入各孔中以用以评估总结合,并将100μL Tris结合缓冲液加入各孔中以很好地用以评估非特异性结合。将约50μL 4×最终浓度的冷痛敏肽(2.5μM加入SK-N-DZ细胞系中,且1μM加入AGN P33无性细胞系#6中)加入非特异性结合孔中,并将50μL 4×最终浓度的3H-痛敏肽(0nM、0.05nM、0.1nM、0.2nM、0.4nM、0.8nM、1.6nM、3.1nM、6.3nM、12.5nM、25nM和50nM加入SK-N-DZ细胞系中,且0、0.01nM、0.02nM、0.039nM、0.078nM、0.156nM、0.313nM、0.625nM、1.25nM、2.5nM、5.0nM和10nM加入AGN P33无性细胞系#6中)加入总结合孔和非特异性结合孔中,达到最终体积200μL。在37℃下孵育30分钟后,用0.5mL冷洗涤缓冲液洗涤细胞2次。然后在200μL 2N NaOH中使细胞变性,并将其转移到含有5mL闪烁液的20mL闪烁瓶中。使用原始数据绘制剂量-响应曲线图,并计算每一样本的Kd值。将得到的原始数据传输到SigmaPlot v10.0中,并使用单点饱和拟合依据配体结合的等式类别来界定剂量-响应曲线。生成图形报告,并含有以下参数:R2(相关系数)、Bmax和Kd±SE(系数±标准误差)。根据针对SK-N-DZ无性细胞系#3、#15和#22以及AGNP33无性细胞系#6细胞进行的测定获得总结合、特异性结合和非特异性结合的曲线图。SK-N-DZ无性细胞系#3和#22对3H-痛敏肽产生浓度依赖性且可饱和的结合。在相同的实验条件下,SK-N-DZ无性细胞系#15对3H-痛敏肽产生剂量依赖性响应,但在50nM最高剂量下也未饱和。与表达内源性ORL-1的SK-N-DZ细胞系相比较,来自AGN P33无性细胞系#6的细胞以明显较高的亲和力结合3H-痛敏肽(最高剂量为10nM对SK-N-DZ中的50nM),且具有较低的非特异性结合。
使用SK-N-DZ无性细胞系#3、#22、#15以及AGN P33无性细胞系#6的饱和结合曲线,由在3个不同天针对每一细胞系进行的3次独立的结合实验,来估算Kd和Bmax值。这4个细胞系的等级次序为:AGN P33无性细胞系#6(Kd=1.86nM且Bmax=2.9fmol/细胞)>SK-N-DZ无性细胞系#3(Kd=14nM且Bmax=0.6fmol/细胞)≥SK-N-DZ无性细胞系#22(Kd=17nM且Bmax=0.6fmol/细胞)>>SK-N-DZ无性细胞系#15(Kd>50nM)。为实现SK-N-DZ无性细胞系#15的饱和剂量响应,需要使用较高剂量范围的3H-痛敏肽。表16概述了有关3个SK-N-DZ无性细胞系#3、#15和#22以及AGN P33无性细胞系#6稳定细胞系中特异性质膜痛敏肽结合位点的特征的数据。数据显示:1)在AGN P33无性细胞系#6中具有高亲和力位点和极低非特异性结合(Kd,1.8nM,Bmax 2.9fmol/细胞);2)痛敏肽结合可在表达内源性受体的SK-N-DZ天然细胞上进行;3)AGN P33无性细胞系#6对痛敏肽的亲和力比SK-N-DZ细胞系的高约10倍;4)如在基于细胞的效力测定中可以看出,SK-N-DZ无性细胞系#3和#22(Kd 14-17nM,Bmax 0.6fmol/细胞)中每个细胞的受体位点数多于SK-N-DZ无性细胞系#15(在相同剂量范围下不能达到饱和)。
为评估重靶向内肽酶摄取的敏感性,使用RT-PCR,在mRNA水平上评估表达的重靶向内肽酶受体的量。细胞中表达的受体量是表征用于测试的细胞系的一个重要方面,且其与对重靶向内肽酶的敏感性有关。表达的重靶向内肽酶受体的量还可以是用于筛选其它潜在细胞系并消除不表达靶受体的细胞系的工具。测量受体表达的一种方法是使用实时PCR(RT-PCR)定量重靶向内肽酶受体mRNA的量。
对于阿片重靶向内肽酶,从在无血清培养基或含血清培养基中生长的未转染的亲本SiMa细胞系的细胞、来自AGN P33无性细胞系#6的细胞、来自亲本SK-N-DZ细胞系的细胞以及来自SK-N-DZ无性细胞系#3和#22的细胞中分离出RNA。将mRNA转化为cDNA,并且使用ORL-1的以下寡核苷酸引物扩增ORL-1,同时进行实时测量,以确定各细胞系中存在的相对量:正向引物5′-CACTCGGCTGGTGCTGGTGG-3′(SEQ ID NO:148)和反向引物5′-AATGGCCACGGCAGTCTCGC-3′(SEQ ID NO:149)。通过使用SYBR绿色荧光染料定量DNA,该荧光染料将相对于反应中存在的双链DNA(PCR产物)的量发出荧光。对荧光量vs.循环数作图,得到每一反应的逻辑曲线(logistic curve)。反应越快到达曲线的线性阶段,反应中存在的ORL-1受体cDNA就越多。使用未加入酶的对照RT反应来确定是否存在污染。由于该反应中不存在RT酶,所以不会产生cDNA。使用RNA模板不能产生PCR产物,因此,如果在-RT反应中出现PCR曲线,只有一种可能是存在基因组DNA污染。在-RT反应中,如果没有出现PCR曲线,则可确定存在极少基因组DNA污染(未显示数据)。表18列出了细胞系及其CT值。CT是产生高于设置的阈值的信号所发生的相应PCR反应的PCR循环数。可以通过观察相应的CT值,来比较一个细胞系与另一细胞系中ORL-1受体mRNA的量。根据CT值,来自AGN P33无性细胞系#6的细胞在无血清培养基(平均CT:28.6vs.17.3)和含血清培养基(平均CT:26.1vs.16.5)中产生的ORL-1mRNA远高于亲本SiMa细胞系。由AGN P33无性细胞系#6中传代6次的细胞与传代16次的细胞获得的mRNA似乎具有极小差异。亲本SK-N-DZ细胞系与无性细胞系#3和#22的CT值和曲线似乎也具有极小差异。该结论符合生长于含血清培养基和无血清培养基中的细胞,并反映出在针对Noc/A的基于细胞的效力测定中所观察到的这些细胞系的相似性。
实施例VII
选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有游离羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25单克隆抗体的开发
以下实施例说明如何制备可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25单克隆抗体。
1.α-SNAP-25单克隆抗体的产生.
为开发可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的单克隆α-SNAP-25抗体,将具有13个残基的肽CDSNKTRIDEANQCOOH(SEQ ID NO:38)设计为SNAP-25裂解产物抗原。该肽包含柔性连接子区和用于结合至KLH的N-末端半胱氨酸残基以及具有羧基化C-末端谷氨酰胺(SEQ ID NO:38)的人SNAP-25(SEQ ID NO:5)的氨基酸186-197。产生针对适当选择的唯一肽序列的单克隆抗体将控制表位特异性,从而允许从密切相关的同种型库中鉴别出特定的蛋白质亚群。Blast搜索显示,这种肽只与SNAP-25具有高同源性,并且几乎不可能与神经元细胞中的其它蛋白质发生交叉反应。同时,通过利用计算机算法小心地细查序列,以确定亲水性指数、蛋白质表面概率、柔性区和有利的二级结构,随后适当的定位和呈递所选肽序列。合成肽,并将其与匙孔血蓝蛋白(KLH)缀合,以增加免疫原性。用这种肽免疫6只Balb/c小鼠,并在约8周内进行3次免疫,之后抽取小鼠的血液进行测试。将血液在4℃下孵育60分钟,以使其凝块。在4℃下,以10,000xg离心凝块的血液10分钟,以使细胞碎片形成粒状沉淀。将所得血清样本分成50μl的等分试样,并储存于-20℃下待用。
使用基于本说明书中公开的其它SNAP-25抗原的类似策略来开发可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25单克隆抗体。例如,SNAP-25抗原SEQ ID NO:45可缀合至KLH,而不是SNAP-25抗原SEQ ID NO:38。再例如,来自SNAP-25抗原SEQ ID NO:38的人SNAP-25的氨基酸186-197可以替换为SEQ ID NO:32、SEQID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44。
2.针对α-SNAP-25单克隆抗体的存在的筛选.
为确定可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的α-SNAP-25单克隆抗体的存在,使用提取的小鼠血清进行比较性ELISA和基于细胞的裂解测定。对于比较性ELISA,构建两种融合蛋白:BirA-HisTag-SNAP-25134-197(SEQ ID NO:48)和BirA-HisTag-SNAP-25134-206(SEQ ID NO:49)。BirA-HisTag-SNAP-25134-197包含天然生物素化的16氨基酸BirA肽(SEQ ID NO:50),该SEQ ID NO:50氨基末端连接到包含氨基酸134-197(SEQ ID NO:5)的SNAP-25肽。BirA-HisTag-SNAP-25134-206包含天然生物素化的16氨基酸BirA肽(SEQ ID NO:50),该SEQ ID NO:50氨基末端连接到包含氨基酸134-206(SEQ ID NO:5)的SNAP-25肽。将这两种底物以10μg/mL BirA-HisTag-SNAP-25134-197和BirA-HisTag-SNAP-25134-206的浓度悬浮于1×PBS中。通过加入约100μl适宜的底物溶液并在室温下孵育板1小时,将BirA-HisTag-SNAP-25134-197和BirA-HisTag-SNAP-25134-206涂覆于分离的板上。在37℃下,在含有来源于6只免疫小鼠之一(小鼠1、小鼠2、小鼠3、小鼠4、小鼠5和小鼠6)的含抗体血清的1∶10到1∶100稀释液的1×TBS中的0.5%BSA中孵育经过洗涤的板1小时。在200μl TBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)中洗涤用一抗探查过的板4次,每次持续5分钟。在37℃下,在含有缀合辣根过氧化物酶的山羊多克隆抗小鼠IgG抗体(Pierce Biotechnology,Rockford,IL)的1∶10,000稀释液作为二抗的1×TBS中孵育经过洗涤的板1小时。在200μlTBS、0.1% TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)中洗涤用二抗探查的板4次。通过使用ImmunoPure TMB底物试剂盒(Pierce Biotechnology,Rockford,IL)进行的显色检测观察标记SNAP-25产物的显色检测结果。涂有BirA-HisTag-SNAP-25134-197的板中显出黄色,但涂有BirA-HisTag-SNAP-25134-206的板则没有显出黄色,这表明α-SNAP-25抗体优先识别SNAP-25197裂解产物。结果表明,在6只用于免疫的小鼠中,有3只小鼠(小鼠2、小鼠3和小鼠4)对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原具有较高滴度和较高特异性。
使用ELISA轻链活性测定来确定这些结果。通过加入约100μl以下底物溶液来准备涂有Reacti-Bind抗生蛋白链霉素的96孔板(Pierce Biotechnology,Rockford,IL):用100μL 12种不同浓度的BirA-HisTag-SNAP-25134-197涂覆A-C行;用100μL浓度为10μg/mL的BirA-HisTag-SNAP-25134-206涂覆D-H行。通过抽吸底物溶液,并用200μl TBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)冲洗各孔3次,来洗涤这些板。在37℃下,在BoNT/A孵育缓冲液(50mM HEPES,pH 7.4,1%胎牛血清、10μM ZnCl2、10mM二硫代苏糖醇)中预还原BoNT/A的稀释液20分钟,并将100μl预还原的BoNT/A加入涂有底物的板中,并在37℃下孵育90分钟。通过抽吸BoNT/A孵育缓冲液并用200μl TBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)冲洗各板3次,来洗涤经BoNT/A处理的板。在37℃下,在1×TBS中的0.5%BSA中孵育经过洗涤的板1小时,该1×TBS含有测试的含抗体血清的1∶10到1∶100稀释液。在200μlTBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)中洗涤用一抗探查过的板4次,每次持续5分钟。经过洗涤的板在1×TBS中37℃下孵育1小时,该1×TBS含有缀合辣根过氧化物酶的山羊多克隆抗小鼠IgG抗体(Pierce Biotechnology,Rockford,IL)的1∶10,000稀释液作为二抗。在200μl TBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)中洗涤用二抗探查的板4次。通过使用ImmunoPure TMB底物试剂盒(PierceBiotechnology,Rockford,IL)进行的显色检测观察标记SNAP-25产物的显色检测结果。使用源自于所有6只免疫小鼠(小鼠1、小鼠2、小鼠3、小鼠4、小鼠5和小鼠6)的含抗体血清,在用BoNT/A处理过的样本中检测到与SNAP-25197裂解产物的存在相关的黄色显影,但未处理的对照物中未观察到。因此,比较性ELISA分析表明,在6只用于免疫的小鼠中,有3只小鼠(小鼠2、小鼠3和小鼠4)对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原具有较高滴度和较高特异性。
对于基于细胞的裂解测定,将适合密度的PC12细胞接种于含有3mL适宜血清培养基(表1)的60mm2组织培养板中。使细胞在37℃培养箱中5%二氧化碳下生长,直到细胞达到适宜的密度。通过以下方式制备500μL转染溶液:将250μL在室温下孵育了5分钟的含有15μL LipofectAmine 2000(InvitrogenInc.,Carlsbad,CA)的OPTI-MEM减血清培养基加入250μL含有10μg pQBI-25/GFP-BoNT/A-LC表达构建体(SEQ ID NO:51)的OPTI-MEM减血清培养基。pQBI-25/GFP-BoNT/A-LC表达构建体包含pQBI-25表达载体(Qbiogene Inc.,Carlsbad,CA),该载体的启动子元件功能性连接编码GFP-BoNT/A轻链的多核苷酸(SEQ ID NO:52)。在室温下,将该转染混合物孵育约20分钟。将培养基用新鲜的未补充培养基替换,并将500μL转染溶液加入细胞。然后,在37℃培养箱中5%二氧化碳下孵育细胞约6到18小时。如实施例II中所述,洗涤并收获细胞。为检测裂解的SNAP-25197产物的存在,如实施例II中所述,借助蛋白质印迹来分析每一收获的样本的等分试样,但所用一抗为含抗体血清的1∶1,000稀释液,且所用二抗为小鼠α-IgG辣根过氧化物酶(PierceBiotechnology,Rockford,IL)的1∶20,000稀释液。使用源自于3只小鼠(小鼠2、小鼠3和小鼠4)的含抗体血清,在用BoNT/A处理过的样本中检测到对应于SNAP-25197裂解产物的单一带,但未处理的对照物中未检测到。因此,基于细胞的裂解测定表明,在用于免疫的小鼠中,有3只小鼠(小鼠2、小鼠3和小鼠4)对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原具有较高滴度和较高特异性。
3.杂交瘤的产生.
为制备产生可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的α-SNAP-25单克隆抗体的杂交瘤,在最后一次“增强”免疫后3天收获小鼠2的脾,并使用标准杂交瘤方案将脾细胞与骨髓瘤细胞P3-X63 Ag8.653融合。将这些细胞接种于5个96孔板中,并使用HAT培养基选择杂交物。在融合后的8到14天内,使用比较性ELISA,用涂覆在两个独立板中的BirA-HisTag-SNAP-25134-197肽和BirA-HisTag-SNAP-25134-206肽对约480个亲本克隆进行初次筛选。比较性ELISA是一种用于鉴别产生对裂解的SNAP-25197具特异性的抗体的杂交瘤的快速筛选方法。使用上述基于细胞的裂解测定以及LC/A转染的细胞的免疫染色对顶部的18个克隆进行进一步筛选(表20)。
通过有限稀释对克隆1D3、1G10、2E2、3C1、3C3和3E8进行进一步克隆,因为由这些克隆产生的条件培养基包含的α-SNAP-25抗体具有优先结合特异性,即,SNAP-25197裂解产物相对于SNAP-25206未裂解底物的比率197/206为至少4∶1,并使用基于细胞的裂解测定和用GFP-LC/A转染的PC12细胞的免疫染色来检测SNAP-25197裂解产物。类似地,通过有限稀释对克隆2C9、2F11、3G2、4D1和4G6进行进一步克隆,因为由这些克隆产生的条件培养基包含的α-SNAP-25抗体具有优先结合特异性,即,SNAP-25206未裂解底物相对于SNAP-25197裂解产物的比率206/197为至少1.5∶1,并使用基于细胞的裂解分析来检测SNAP-25206未裂解底物。使用比较性ELISA、基于细胞的裂解和免疫染色再次筛选这些单细胞衍生无性系,以确定其亲和力和特异性,并使用标准程序对抗体进行同种型分类。由克隆1D3B8(IgM.k)、1G10A12(IgG3.k)、2C9B10(IgG3.k)、2E2A6(IgG3.k)、2F11B6(IgM.k)、3C1A5(IgG2a.k)和3C3E2(IgG2a.k)产生腹水。在克隆过程中,克隆3E8停止产生抗体,并且无法进行进一步评估。
4.α-SNAP-25单克隆抗体的结合特异性的评估.
为评估可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的α-SNAP-25单克隆抗体的结合特异性,使用基于细胞的活性测定、免疫细胞化学和免疫沉淀法,使用由克隆1D3B8、1G10A12、2C9B10、2E2A6、2F11B6、3C1A5和3C3E2产生的腹水来检测SNAP-25裂解产物。
对于基于细胞的活性测定,通过用蛋白印迹分析法分析含α-SNAP-25抗体的腹水来检测未裂解的SNAP-25206底物和裂解的SNAP-25197产物的能力来确定结合特异性。如上文所述,将适合密度的PC12细胞接种于含3mL适宜的血清培养基的60mm2组织培养板中,使其在37℃培养箱中5%二氧化碳下生长,直到达到适宜的细胞密度,并用不含pQBI-25/GFP-BoNT/A-LC的表达构建体(未转染细胞)的转染溶液或含pQBI-25/GFP-BoNT/A-LC表达构建体(经过转染的细胞)的转染溶液进行转染。如实施例I中所述,洗涤并收获细胞。为检测未裂解的SNAP-25206底物和裂解的SNAP-25197产物的存在,如实施例I中所述,借助蛋白质印迹来分析每一收获的样本的等分试样,但所用的一抗为含α-SNAP-25单克隆抗体的腹水的1∶100稀释液,且所用的二抗为缀合辣根过氧化物酶的α-小鼠IgG(PierceBiotechnology,Rockford,IL)的1∶20,000稀释液。此外,还测试了3只可商购获得的小鼠α-SNAP-25单克隆抗体。SMI-81(Sternberger Monoclonals Inc.,Lutherville,MD),一种α-SNAP-25抗体,制造商指示用来检测未裂解的SNAP-25206底物和裂解的SNAP-25197产物,根据制造商的推荐,以15,000稀释液来使用。MC-6050(Research & Diagnostic Antibodies,Las Vegas,NV),一种α-SNAP-25抗体,制造商指示用来检测未裂解的SNAP-25206底物和裂解的SNAP-25197产物,根据制造商的推荐,以1∶100稀释液使用。MC-6053(Research & Diagnostic Antibodies,LasVegas,NV),一种α-SNAP-25抗体,制造商指示只用来检测裂解的SNAP-25197产物,根据制造商的推荐,以1∶100稀释液来使用。
表21指明含α-SNAP-25抗体的腹水只检测SNAP-25197裂解产物。基于细胞的裂解测定指明,由克隆1D3B8、2C9B10、2E2A6、3C1A5和3C3E2产生的腹水将合成对SNAP-25197裂解产物具有高结合特异性的α-SNAP-25单克隆抗体,由此允许相对于SNAP-25206未裂解底物选择性识别该裂解产物。商用抗体SMI-81检测SNAP-25206未裂解底物,但识别SNAP-25197裂解产物的能力较差(表21)。意外的是,商用抗体MC-6050只检测SNAP-25206未裂解底物,并且不能识别SNAP-25197裂解产物(表21)。更意外的是,商用抗体MC-6050只检测SNAP-25206未裂解底物,并且不能识别SNAP-25197裂解产物,即使制造商宣称这种抗体可选择性检测SNAP-25197裂解产物(表21)。因此,该分析表明,虽然1D3B8、2C9B10、2E2A6、3C1A5和3C3E2对SNAP-25197裂解产物展现适当的选择性,但是1G10A12和2F11B6却不具有该选择性。此外,商用抗体SMI-81、MC-6050和MC-6053都不适用于本申请案中公开的基于免疫的方法,因为它们都不能选择性检测SNAP-25197裂解产物。
对于免疫细胞化学分析,通过用免疫染色法分析含α-SNAP-25抗体的腹水检测未裂解的SNAP-25206底物和裂解的SNAP-25197产物的能力来测定结合特异性。参见例如,EsterFernandez-Salas等,Plasma Membrane Localization Signals in theLight Chain of Botulinum Neurotoxin,Proc.Natl.Acad.Sci.,U.S.A.101(9):3208-3213(2004)。如上文所述,将适合密度的PC12细胞接种,使其生长,并用不含pQBI-25/GFP-BoNT/A-LC表达构建体(未转染的细胞)的转染溶液或含pQBI-25/GFP-BoNT/A-LC表达构建体(经过转染的细胞)的转染溶液进行转染。用1×PBS洗涤细胞,并在室温下于5mL PAF中固定30分钟。在磷酸盐缓冲盐水中洗涤固定的细胞,于1×PBS中的5mL0.5%TritonX-100(聚乙二醇辛基苯醚)中孵育,用1×PBS洗涤,并在-20℃下5mL甲醇中透化6分钟。在室温下5mL 100mM甘氨酸中封闭透化的细胞30分钟,用1×PBS洗涤封闭细胞,并在室温下1×PBS中的5mL 0.5%BSA中封闭30分钟。于1×PBS中洗涤封闭细胞,并在室温下于1×PBS中的0.5%BSA中孵育2小时,该1×PBS含有由测试的克隆杂交瘤细胞系产生的腹水的1∶10稀释液。在1×PBS中洗涤用一抗探查的细胞3次,每次持续5分钟。在室温下于1×PBS中孵育经过洗涤的细胞2小时,该1×PBS含有缀合ALEXAFLUOR 568的山羊多克隆抗小鼠免疫球蛋白G重链和轻链(IgG,H+L)抗体(Invitrogen,Carlsbad,CA)的1∶200稀释液作为二抗。在1×PBS中洗涤用二抗探查的细胞3次,每次持续5分钟。将经过洗涤的细胞封片到VECTASHIELD封片剂(Vector Laboratories,Burlingame,CA)中并盖上盖玻片以为显微镜检查作准备。利用Leica共聚焦显微镜,使用适宜的激光设置来获得信号检测的图像。表21显示含α-SNAP-25抗体的腹水特异性检测SNAP-25197裂解产物。免疫细胞化学分析表面,由克隆1D3B8、2C9B10、2E2A6、3C1A5和3C3E2产生的腹水将合成对SNAP-25197裂解产物具有高结合特异性的α-SNAP-25单克隆抗体,从而允许相对于SNAP-25206未裂解底物优先识别该裂解产物。
对于免疫沉淀分析,通过分析蛋白质A(HiTrapTM Protein AHP Columns,GE Healthcare,Amersham,Piscataway,NJ),纯化的α-SNAP-25单克隆抗体使未裂解的SNAP-25206底物和裂解的SNAP-25197产物沉淀的能力来确定结合特异性。参见例如,第8章Storing and Purifying Antibodies,第309页-第311页,Harlow和Lane,同上文,1998a。如上文所述,接种适合密度的PC12细胞,使其生长,并用含有pQBI-25/GFP表达构建体(对照细胞;SEQ ID NO:53)的转染溶液或含有pQBI-25/GFP-BoNT/A-LC表达构建体(实验细胞)的转染溶液进行转染。pQBI-25/GFP表达构建体包含其启动子元件功能性连接到编码GFP的多核苷酸(SEQID NO:54)的表达载体。过夜孵育后,通过抽吸生长培养基并用200μL 1×PBS冲洗各孔来洗涤细胞。为收获细胞,抽吸出PBS,通过加入免疫沉淀裂解缓冲液,并在4℃下孵育1小时来裂解细胞,该免疫沉淀裂解缓冲液包含50mM HEPES、150mM NaCl、1.5mM MgCl2、1mM EGDT、10%甘油、1%TritonX-100(聚乙二醇辛基苯醚)和1×COMPLETETM蛋白酶抑制剂混合液(RocheApplied Biosciences,Indianapolis,IN)。在4℃下,以3,000×g离心裂解的细胞10分钟,以除去细胞碎片,并将上清液转移到清洁的试管中,并将其稀释到约1mg/mL的蛋白质浓度。将约5μg纯化的单克隆抗体加入0.5mL稀释过的上清液,并在4℃下孵育2小时。在一抗孵育后,将约50μL固定的蛋白质G(PierceBiotechnology,Rockford,IL)加入稀释的上清液中,并在4℃下孵育1小时。通过加入0.5mL免疫沉淀裂解缓冲液来洗涤经过孵育的上清液3次,每次持续30分钟,在4℃下以300×g离心1分钟,以使固定的蛋白质G形成粒状沉淀,并倾析出上清液。洗涤后,将颗粒再悬浮于30μl 1×SDS上样缓冲液中,并将样本加热到95℃,保持5分钟。为检测未裂解的SNAP-25206底物和裂解的SNAP-25197产物的存在,如实施例I中所述,借助蛋白质印迹来分析每一收获的样本的等分试样,但所用的一抗为α-SNAP-25多克隆抗体血清的1∶1,000稀释液(见实施例V),且所用的二抗为兔α-IgG辣根过氧化物酶(Pierce Biotechnology,Rockford,IL)的1∶20,000稀释液。表21显示通过免疫沉淀分析特异性沉淀SNAP-25197裂解产物的含α-SNAP-25抗体的腹水。免疫沉淀分析表明,由克隆2E2A6和3C1A5产生的腹水将合成对SNAP-25197裂解产物具有高结合特异性的α-SNAP-25单克隆抗体,其允许相对于SNAP-25206未裂解底物优先识别该裂解产物。
5.α-SNAP-25单克隆抗体结合亲和力评估.
为确定对SNAP-25197裂解产物或SNAP-25206未裂解底物显示高结合特异性的α-SNAP-25单克隆抗体的结合亲和力,使用羧甲基葡聚糖(CM5)传感器芯片(BIAcore,Piscataway,NJ),在BIAcore 3000仪器上进行结合亲和力测定。在25℃下,用包含10mM HEPES(pH 7.4)、150mM氯化钠、3mM EDTA、0.005%(v/v)表面活性剂P20的HBS-EP缓冲液,以10μL/min的流速进行流挂。使用标准氨基偶联,将包含氨基酸134-197(SEQ ID NO:5)(SNAP-25134-197)或氨基酸134-206(SEQ ID NO:5)(SNAP-25134-206)的SNAP-25肽共价连接到CM5传感器芯片表面。简言之,通过历时7分钟注入0.2M 1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳化二亚胺与0.05M N-羟基丁二酰亚胺的混合物,激活CM5芯片;然后以10μL/min的流速将SNAP-25肽注入10mM乙酸钠(pH 4.0)中,耗时20分钟;并通过历时7分钟注入1M乙醇胺盐酸盐(pH 8.5)来封闭未反应的丁二酰亚胺酯。以响应单位增加100-150(约0.10-0.15ng/mm2)来反映芯片上SNAP-25134-197或SNAP-25134-206的固定量。使包含由克隆1D3B8、2C9B10、2E2A6、3C1A5和3C3E2产生的腹水或纯化的单克隆抗体的抗体以及可商购获得的α-SNAP-25抗体的样本通过CM5芯片的表面上方,允许保持10分钟的缔合时间和20分钟的解离时间。在每轮分析之间,通过以15μL/min的流速历时1分钟注入10mM甘氨酸-HCl(pH 2.5)使表面在流挂之间再生。利用BIAevaluation3.0软件,将感应图曲线与1∶1动力学结合模型相拟合。
结果表明,2E2A6和3C1A5对裂解的SNAP-25197产物的特异性均高于SNAP-25未裂解的底物(表22)。当与MC-6050和MC-6053的结合亲和力相比较时,1D3B6对SNAP-25裂解产物的平衡解离常数是这些商用抗体的约10倍(表22)。有趣的是,2E2A6对SNAP-25裂解产物的平衡解离常数仅略低于这些商用抗体(0.405nM对0.497和0.508)(表22)。由于这些商用α-SNAP-25抗体都不能选择性识别SNAP-25裂解产物(表21),故低于约0.5nM的平衡解离常数看起来在某种程度上对实现这种选择很关键。类似地,当与MC-6050和MC-6053的结合亲和力相比较时,2E2A6的分解速率/解离常数慢约至少1倍(6.74×10-5对8.82×10-4s-1和1.18×10-3s-1)(表22)。这进一步表明,低于约8.82×10-4的分解速率/解离常数看起来在某种程度上对实现SNAP-25裂解产物的选择性结合很关键。该结果与1D3B8一致,其分解速率/解离常数为5.78×10-5s-1(表22)。
为比较6种不同的抗体,使用BIA评估4.1软件的程序将结合速率(ka)和分解速率(kd)分别归一化。为比较结合速率,首先通过删除再生部分和注射峰个别地整理数据,随后将数据归一化到0到100标度。对于分解速率的比较,将数据归一化到注射停止点/顶部点。该分析显示,2C9B10的结合速率比其它抗体慢很多(图7A),而且MC-6053的分解速率(解离)比其它抗体快很多(图7B)。MC-6053的分解速率较快表明,这种抗体不能很好地在本说明书中公开的方法中发挥作用,因为该抗体在洗涤步骤期间很难保持于底物抗原结合。
6.对分离的α-SNAP-25单克隆抗体的表位测序.
为确定可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的分离的α-SNAP-25单克隆抗体的表位,对编码由杂交瘤1D3B8、2C9B10、2E2A6、3C1A5和3C3E2产生的α-SNAP-25单克隆抗体的可变重链(VH)和可变轻链(VL)的多核苷酸分子进行测序。使用标准方案从各杂交瘤中提取出mRNA并加以纯化,并且使用寡聚dT反义引物或基因特异性(鼠类IgG1CH和κCL)反义引物将mRNA逆转录为cDNA。在产生cDNA后,使用特异性鼠类和人恒定域引物,通过PCR来扩增cDNA,以确定抗体的同种型。使用简并VH和VL引物扩增cDNA中的可变域。对于5’RACE,将同聚物dCTP尾部添加到cDNA的3’端。随后,用寡聚dG正义引物和基因特异性(CH/KC)反义引物扩增重链和轻链。PCR产物包括信号肽、可变域和恒定域至反义引物的序列。对PCR产物进行凝胶纯化,以除去小片段,并克隆到平端或TA载体中以供测序。对每条链的5个独立克隆进行测序,并确定VH和VL链和一致序列的比对。用于测定VH和VL氨基酸序列的方法描述于例如以下文献中:Roger A.Sabbadini等,Novel Bioactive Lipid Derivatives and Methods ofMaking and Using Same,美国专利公开2007/0281320;和PeterAmersdorfer,等,Molecular Characterization of Murine HumoralImmune Response to Botulinum Neurotoxin Type A Binding Domainas Assessed by Using Phage Antibody Libraries,65(9)Infect.Immun.3743-3752,各文献的全部内容以引用的方式并入本文。此外,商用服务可用于对抗体可变重链(VH)和可变轻链(VL)进行测序,并鉴别CDR区,参见例如,Fusion Antibodies Ltd.,NorthernIreland。在一种情况下,对于3C1A5的VL区,也可通过用高分辨率2DE电泳法分离经过亲和纯化的抗体,随后在用蛋白水解消化后,使用高分辨率纳米LC-MSMS对这种蛋白质进行肽段指纹分析(peptide fragmentation fingerprinting analysis),对氨基酸序列进行测定。
构成由本说明书中公开的杂交瘤产生的α-SNAP-25单克隆抗体的VH链和VL链的多核苷酸序列如下:1D3B8 VH(SEQ IDNO:71)、2C9B10 VH(SEQ ID NO:73)、2E2A6 VH(SEQ ID NO:75)、3C1A5 VH(SEQ ID NO:77)、3C3E2 VH变体1(SEQ ID NO:79)、3C3E2 VH变体2(SEQ ID NO:81)、3C3E2 VH变体3(SEQ IDNO:132)、1D3B8 VL(SEQ ID NO:83)、2C9B10 VL(SEQ ID NO:85)、2E2A6 VL(SEQ ID NO:87)、3C1A5 VL(SEQ ID NO:89)和3C3E2 VL(SEQ ID NO:91)。构成由本说明书中公开的杂交瘤产生的α-SNAP-25单克隆抗体的VH链和VL链的氨基酸序列如下:1D3B8 VH(SEQ ID NO:72)、2C9B10 VH(SEQ ID NO:74)、2E2A6VH(SEQ ID NO:76)、3C1A5 VH(SEQ ID NO:78)、3C3E2 VH变体1(SEQ ID NO:80)、3C3E2 VH variant 2(SEQ ID NO:82);3C3E2 VH变体2(SEQ ID NO:133)、1D3B8 VL(SEQ ID NO:84)、2C9B10 VL(SEQ ID NO:86)、2E2A6 VL(SEQ ID NO:88)、3C1A5VL(SEQ ID NO:90)和3C3E2 VL(SEQ ID NO:92)。包含由杂交瘤1D3B8、2C9B10、2E2A6、3C1A5和3C3E2产生的α-SNAP-25单克隆抗体的VH和VL CDR域的氨基酸序列提供于表23中。
包含由本说明书中公开的杂交瘤产生的α-SNAP-25单克隆抗体的VH CDR域变体的氨基酸序列的非限制性实例包括:1D3B8,的VH CDR1变体SEQ ID NO:118;2C9B10、2E2A6和3C 1A5VH的VH CDR1变体SEQ ID NO:119;3C1A5 VH和3C3E2变体3的VH CDR1变体SEQ ID NO:120;1D3B8和2E2A6的VH CDR2变体SEQ ID NO:121;2C9B10和3C1A5 VH的VH CDR2变体SEQ ID NO:122;3C1A5 VH和3C3E2变体3的VH CDR2变体SEQ ID NO:123;1D3B8和2C9B10的VH CDR3变体MDY;2E2A6和3C1A5 VH的VH CDR3变体MGY;以及3C1A5 VH和3C3E2变体3的VH CDR3变体SEQ ID NO:124。包含由本说明书中公开的杂交瘤产生的α-SNAP-25单克隆抗体的VL CDR域变体的氨基酸序列的非限制性实例包括:1D3B8的VL CDR1变体SEQ ID NO:125;2C9B10的VL CDR1变体SEQ ID NO:126;2E2A6的VL CDR1变体SEQ ID NO:127;3C1A5的VL CDR1变体SEQ ID NO:128;3C3E2的VL CDR1变体SEQ ID NO:129;1D3B8的VL CDR2变体KVS;2C9B10的VL CDR2变体NAK;2E2A6的VL CDR2变体LVS;3C1A5的VL CDR2变体YAT;以及3C3E2的VLCDR2变体YAS。
实施例VIII
选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有游离羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25多克隆抗体的开发
以下实施例说明如何制备可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25表位的α-SNAP-25多克隆抗体。
为开发可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25多克隆抗体,将具有10个残基的肽CGGGRIDEANQ(SEQ ID NO:46)设计为SNAP-25裂解产物抗原。这种肽包含与KLH缀合的N末端半胱氨酸残基、连接到人SNAP-25的氨基酸191-197(SEQ ID NO:5)的G-间隔子柔性间隔子(GGG),并具有羧基化C-末端谷氨酰胺。Blast搜索显示,这种肽只与SNAP-25具有高同源性,并且几乎不可能与神经元细胞中的其它蛋白质发生交叉反应。也可利用计算机算法小心地细查序列,以确定亲水性指数、蛋白质表面概率、柔性区和有利的二级结构,随后适当的定位和呈递所选肽序列。合成肽,并且将其与匙孔血蓝蛋白(KLH)缀合,以增加免疫原性。在对动物进行免疫之前,首先在蛋白印迹中针对来自候选细胞系的细胞裂解物筛选本地兔,以鉴别对细胞裂解物中存在的蛋白质不具免疫反应性的动物。用这种肽使两只预先筛选出来的兔免疫,并在约8周内进行3次免疫,之后抽取兔的血液进行测试。将血液在4℃下孵育60分钟,以使血液凝块。在4℃下以10,000xg离心凝块血10分钟,以使细胞碎片形成粒状沉淀。将所得血清样本分成50μl的等分试样,并储存于-20℃下待用。
使用基于本说明书中公开的其它SNAP-25抗原的类似策略来开发可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25的α-SNAP-25多克隆抗体。例如,SNAP-25抗原SEQ ID NO:47可以缀合到KLH,而不是SNAP-25抗原SEQ ID NO:46。再例如,来自SNAP-25抗原SEQ ID NO:38的人SNAP-25的氨基酸191-197可以替换为SEQ ID NO:33、SEQID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43或SEQ ID NO:44。
2.针对α-SNAP-25多克隆抗体的存在的筛选.
为确定可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的α-SNAP-25多克隆抗体的存在,如实施例III所述,使用提取的兔血清进行比较性ELISA和基于细胞的裂解分析。来自两只兔的血清含有可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的α-SNAP-25多克隆抗体。α-SNAP-25兔多克隆抗体命名为NTP 22和NTP 23。
3.α-SNAP-25多克隆抗体的纯化.
为纯化可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的α-SNAP-25多克隆抗体,使用含有SNAP-25抗原SEQ ID NO:46的亲和柱来纯化来自兔血清的NTP 22抗体和NTP 23抗体。
4.α-SNAP-25多克隆抗体结合特异性的评估.
为评估可选择性结合在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25抗原的α-SNAP-25多克隆抗体的结合特异性,如实施例III中所述,通过基于细胞的活性测定、免疫细胞化学和免疫沉淀法,使用纯化的NTP 22和NTP 23α-SNAP-25多克隆抗体来检测裂解产物。基于细胞的裂解测定、免疫细胞化学分析和免疫沉淀分析都表明,NTP 22和NTP 23α-SNAP-25多克隆抗体不与未裂解的SNAP-25交叉反应。因此,NTP 22和NTP 23均对裂解的SNAP-25197产物具有高结合特异性,从而允许相对于SNAP-25206未裂解底物来说优先识别这种裂解产物。如实施例III中所述,可使用BiAcore中的SPR测定抗原的亲和力。
实施例IX
夹心ELISA法的组分和条件准备
以下实施例说明如何鉴别和准备进行夹心ELISA所需的组分和条件,这种夹心ELISA是通过使用对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25具有特异性的α-SNAP-25单克隆抗体检测SNAP-25裂解产物,来进行用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法。
1.用重靶向内肽酶处理过的细胞的细胞裂解物的制备.
为获得用重靶向内肽酶处理过的细胞裂解物来进行分析,将适合密度的来自Neuro-2a的储备培养物的细胞接种于含有50mL无血清培养基的T175烧瓶中,所述无血清培养含有MEM培养基(Minimum Essential Medium)、含厄尔平衡盐(Earle’s salt)的2mM GlutaMAXTM I、1×B27添加物、1×N2添加物、0.1mM非必需氨基酸、10mM HEPES。在37℃培养箱中5%二氧化碳下孵育这些细胞,直到细胞分化,如通过标准和常规形态学标准评估,例如生长停滞和神经突延伸(约2到3天)。作为对照物,将适合密度的来自Neuro-2a的储备培养物的细胞接种于含有50mL适宜的生长培养基(表1)的T175烧瓶中。使这些未分化的对照细胞在37℃培养箱中5%二氧化碳下生长,直到达到50%汇合(约18小时)。从各孔中抽吸出分化培养物和未分化对照培养物的培养基,并用含有0(未处理的样本)或10nM的重靶向内肽酶的新鲜培养基替换。过夜培养后,洗涤细胞,并通过在恒定搅动下,在4℃下于新制的Triton X-100裂解缓冲液(50mM HEPES、150mM NaCl、1.5mM MgCl2、1mM EGTA、1%Triton X-100)中裂解细胞30分钟,来收获细胞。使用台式离心机,在4℃下以4000rpm离心裂解的细胞20分钟,以去除碎片。通过Bradford测定来测量细胞裂解物的蛋白质浓度。
2.夹心ELISA组分的制备和鉴别.
为鉴别适宜的捕捉抗体-检测抗体对,对26种不同的捕捉抗体和检测抗体对的组合进行ECL夹心ELISA分析,这些组合中包含11种不同的α-SNAP-25捕捉抗体和7种不同的α-SNAP-25检测抗体(表12)。所用的α-SNAP-25抗体是本说明书中公开的2E2A6和3C1A5 α-SNAP-25小鼠单克隆抗体;本说明书中公开的SMI-81、MC-6050和MC-6053α-SNAP-25小鼠单克隆抗体;本说明书中公开的NTP 23α-SNAP-25兔多克隆抗体;S9684α-SNAP-25兔多克隆抗体(Sigma,St.Louis,MO);H-50α-SNAP-25兔多克隆抗体(Santa Cruz Biotechnology,Santa Cruz,CA);C-18α-SNAP-25山羊多克隆抗体(Santa CruzBiotechnology,Santa Cruz,CA);N-19α-SNAP-25山羊多克隆抗体(Santa Cruz Biotechnology,Santa Cruz,CA);以及SP12α-SNAP-25小鼠多克隆抗体(Santa Cruz Biotechnology,SantaCruz,CA)。
为制备捕捉抗体溶液,使用标准蛋白质A纯化方案,纯化来自杂交瘤细胞系2E2A6和3C1A5的腹水中所含的α-SNAP-25单克隆抗体,以及α-SNAP-25MC-6050和MC-6053单克隆抗体。所有其它α-SNAP-25抗体都是购买为纯化抗体。
为制备检测抗体溶液,根据制造商说明书(Meso ScaleDiscovery,Gaithersburg,MD),将适合的α-SNAP-25抗体与钌(II)-三-二吡啶-(4-甲基磺酸酯)NHS酯标记试剂(Meso ScaleDiscovery,Gaithersburg,MD)缀合。按以下方式进行缀合反应:将30μL蒸馏水重悬的MSD SULFO-TAGTM储备液加入200μL 2mg/mL α-SNAP-25多克隆抗体中,并在室温下于暗处孵育该反应2小时。使用标准离心柱纯化标记抗体,并使用标准比色蛋白分析来测定蛋白质浓度。使用分光光度计在455nm下测量α-SNAP-25抗体/MSD SULFO-TAGTM缀合物的吸光度,以确定浓度(以摩尔/升为单位)。在4℃下储存检测抗体溶液待用。
为制备包含对SNAP-25裂解产物具特异性的捕捉抗体的固相载体,将约5μL适当的α-SNAP-25单克隆抗体溶液(20μg/mL的1×PBS溶液)加入96孔MSD High Bind板的各孔中,并使溶液在生物安全柜中风干2到3小时,以便对溶液进行液体蒸发。随后,通过加入150μL包含2%Amersham封闭剂(GE LifeSciences,Piscataway,NJ)和10%山羊血清(VWR,West Chester,PA)的封闭缓冲液,在室温下封闭结合捕捉抗体的孔2小时。密封封闭的板并在4℃下储存待用。
为通过ECL夹心ELISA分析来检测裂解的SNAP-25裂解产物的存在,如上文所述,从储存板各孔中抽吸出封闭缓冲液,将25μL用重靶向内肽酶处理过的细胞的裂解物加入各孔中,并在4℃下孵育板过夜。通过抽吸细胞裂解物并用200μL 1×PBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)冲洗各孔3次,将板中各孔洗涤3次。洗涤之后,向各孔中加入25μL包含1×PBS中的2%Amersham封闭试剂、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)的5μg/mL检测抗体溶液,将板密封,并在室温下振荡孵育密封的板1小时。在孵育检测抗体之后,用200μL 1×PBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)洗涤各孔3次。洗涤之后,将150μL 1×读取缓冲液(Meso Scale Discovery,Gaithersburg,MD)加入各孔中,并使用SECTORTM Imager 6000型图像读取器(Meso ScaleDiscovery,Gaithersburg,MD)读取板。通过用由10nM剂量的各抗体对获得的信号除以由0nM剂量的各抗体对获得的信号来计算比率(表24)。这些结果表明,在测试的26种不同的抗体对的组合中,只有3个抗体对在所测试的较高剂量下具有高于10∶1的信噪比:第1号对(2E2A6小鼠单克隆抗体和S9684兔多克隆抗体)、第4号对(3C1A5小鼠单克隆抗体和S9684兔多克隆抗体)和第18号对(S9684兔多克隆抗体和2E2A6小鼠单克隆抗体)。选择抗体对1进行进一步测定开发。
实施例X
使用ECL夹心ELISA进行的用于检测具有BoNT/A轻链酶活性的重靶向内肽酶的基于免疫的方法
以下实施例说明用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法,该方法通过ECL夹心ELISA,使用对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25裂解产物具有特异性的α-SNAP-25单克隆抗体来检测SNAP-25裂解产物。
为制备用具有BoNT/A轻链酶活性的重靶向内肽酶处理过的细胞的裂解物,将适合密度的来自确立细胞系的细胞接种于含有100μL适宜培养基的96孔组织培养板的各孔中。在37℃培养箱中5%二氧化碳下孵育这些细胞约24小时。从各孔中抽吸出细胞的培养基,并用含有0(未处理的样本)或由对这种重靶向内肽酶的剂量响应实验测定的多种剂量中一种剂量的重靶向内肽酶的新鲜培养基替换。孵育24小时之后,洗涤并收获细胞。
为制备α-SNAP-25捕捉抗体溶液,使用标准蛋白质A纯化方案,纯化来自杂交瘤细胞系2E2A6的腹水中所含的α-SNAP-25单克隆抗体。为制备α-SNAP-25检测抗体溶液,根据制造商说明书(Meso Scale Discovery,Gaithersburg,MD),将α-SNAP-25兔多克隆抗体S9684(Sigma,St.Louis,MO)与钌(II)-三-二吡啶-(4-甲基磺酸酯)NHS酯标记试剂(Meso Scale Discovery,Gaithersburg,MD)缀合。缀合反应、标记的α-SNAP-25抗体的纯化、浓度测定和储存都如实施例VI中所述。
为制备包含对SNAP-25裂解产物具特异性的捕捉抗体的固相载体,将约5μL α-SNAP-25单克隆抗体2E2A6溶液(20μg/mL的1×PBS溶液)加入96孔MSD High Bind板的各孔中,并使溶液在生物安全柜中风干2到3小时,以便对溶液进行液体蒸发。随后封闭结合捕捉抗体的孔,并直接用于检测重靶向内肽酶活性。
为通过ECL夹心ELISA分析检测裂解的SNAP-25产物的存在,从储存板的各孔中抽吸出封闭缓冲液,将25μL用重靶向内肽酶处理的细胞的裂解物加入各孔中,并在4℃下孵育板过夜。通过抽吸细胞裂解物并用200μL 1×PBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)冲洗各孔3次,将板中各孔洗涤3次。洗涤之后,向各孔中加入25μL包含1×PBS中的2%Amersham封闭试剂、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)的5μg/mL检测抗体溶液,将板密封,并在室温下振荡孵育密封的板1小时。在孵育检测抗体之后,用200μL 1×PBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)洗涤各孔3次。洗涤之后,将150μL 1×读取缓冲液(Meso ScaleDiscovery,Gaithersburg,MD)加入各孔中,并使用SECTORTMImager 6000型图像读取器(Meso Scale Discovery,Gaithersburg,MD)读取板。如实施例VI中所述,分析收集到的数据,并计算EC50值。对于阿片重靶向内肽酶,这些结果表明,在EC50下检测到平均1.0nM的Noc/A(在约0.3nM到约2.0nM的范围内),其中下渐近线的信噪比为约15∶1到约20∶1;而上渐进线的信噪比为约180∶1到约300∶1。
实施例XI
使用CL夹心ELISA检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法
以下实施例说明用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法,该方法通过CL夹心ELISA,使用对在BoNT/A裂解位点易分裂键的P1残基处具有羧基末端的SNAP-25具有特异性的α-SNAP-25单克隆抗体,来检测SNAP-25裂解产物。
如实施例VII中所述进行制备用重靶向内肽酶处理过的细胞的裂解物和α-SNAP-25捕捉抗体溶液。
为制备α-SNAP-25检测抗体溶液,根据制造商说明书(PierceBiotechnology,Rockford,IL),将α-SNAP-25多克隆抗体S9684(Sigma,St.Louis,MO)与辣根过氧化物酶(HRP)缀合。按以下方式缀合反应:将500μL 1mg/mL α-SNAP-25多克隆抗体加入含有冻干的活性过氧化物酶的小瓶中,混合各组分,然后加入10μL氰基硼氢化钠。室温下,在通风橱中孵育该反应混合物1小时。淬灭反应之后,使用标准离心柱方案纯化标记抗体,并使用标准比色蛋白分析来测定蛋白质浓度。使用分光光度计,在455nm下测量α-SNAP-25多克隆抗体/HRP缀合物的吸光度,以确定浓度(以摩尔/升为单位)。在4℃下储存α-SNAP-25检测抗体溶液待用。
为制备包含对SNAP-25裂解的产物具有特异性的α-SNAP-25捕捉抗体的固相载体,将约100μL α-SNAP-25单克隆抗体2E2A6溶液(1mg/mL的1×PBS溶液)加入96孔Greiner白色板(Greiner white plate)各孔中,并在4℃下孵育板过夜,然后丢弃任何过量的抗体溶液。然后通过加入150μL包含2%Amersham封闭试剂(GE Life Sciences,Piscataway,NJ)和10%山羊血清(VWR,West Chester,PA)的封闭缓冲液,在室温下封闭结合捕捉抗体的孔1小时。丢弃封闭缓冲液,通过在纸巾上倒置板并轻叩,将其印迹在纸巾上。然后封闭结合捕捉抗体的孔,并直接用于检测重靶向内肽酶活性。
为通过CL夹心ELISA分析检测裂解的SNAP-25产物的存在,将50μL用重靶向内肽酶处理的细胞的裂解物加入各孔中,将板密封,并在4℃下,在以500rpm旋转的振荡器上孵育密封的板2-4小时到过夜。通过抽吸细胞裂解物,并用200μl 1×PBS、0.05%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)冲洗各孔3次,将板中各孔洗涤3次。洗涤之后,向各孔中加入100μL包含1×PBS中的2%Amersham封闭试剂、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)的1mg/mL α-SNAP-25多克隆抗体/HRP检测抗体溶液,密封板,并在室温下,在以650rpm旋转的振荡器上孵育密封的板1小时。在孵育检测抗体之后,用200μL 1×PBS、0.05%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)洗涤各孔3次。洗涤之后,将100μl SuperSignal ELISAPico 1∶1混合物(Pierce Biotechnology,Rockford,IL)加入各孔中,并使用光度计(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)在395nm下读取板。如实施例VI中所述,分析收集到的数据,并计算EC50值。
实施例XII
使用多重ECL夹心ELISA进行的用于检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法
以下实施例说明用于检测重靶向内肽酶活性的多重基于免疫的方法,该方法使用对SNAP-25裂解产物具有特异性的α-SNAP-25单克隆抗体和针对不同蛋白质的第二抗体对来检测SNAP-25裂解产物。
重靶向内肽酶效力分析可以使用多重ECL夹心ELISA来进行。该分析描述于伴随提交的专利申请Ester Fernandez-Salas等,Immuno-Based Botulinum Toxin Serotype A Activity Assays,美国专利申请第12/403,531号(该专利的全部内容以引用的方式并入本文)中,并且可以使用本说明书中公开的细胞系和重靶向内肽酶以及相应的细胞系进行。
实施例XIII
使用多重ECL夹心ELISA检测重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法
以下实施例说明用于检测重靶向内肽酶活性的多重基于免疫的方法,该方法使用对SNAP-25裂解产物具有特异性的α-SNAP-25单克隆抗体和针对不同蛋白质的第二抗体对来检测SNAP-25裂解产物。
可使用多重EC夹心ELISA来进行重靶向内肽酶效力测定。该测定描述于伴随提交的专利申请Ester Fernandez-Salas等,Immuno-Based Botulinum Toxin Serotype A Activity Assays,美国专利申请第12/403,531号,该专利申请的全部内容以引用的方式并入本文中,并且可以使用本说明书中公开的细胞系和重靶向内肽酶以及相应的细胞系来使用该测定。
实施例XIV
用于检测纳摩尔浓度量的重靶向内肽酶的基于免疫的方法
以下实施例说明如何进行用于检测纳摩尔浓度量的重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法。
1.使用ECL夹心ELISA检测重靶向内肽酶的基于免疫的方法.
为制备用重靶向内肽酶处理的细胞的裂解物,将约50,000到150,000个来自适于本测定的确立细胞系的细胞接种于含有100μL适宜培养基(参看实施例I和实施例II)的涂有聚D-赖氨酸的96孔组织培养板的各孔中。在37℃培养箱中5%二氧化碳下孵育这些细胞24小时。从各孔中抽吸出细胞的培养基,并用含有0(未处理的样本)和本申请中所述的适宜剂量响应的各重靶向内肽酶的新鲜培养基替换。孵育24小时之后,洗涤并收获细胞,或在收获前,在没有重靶向内肽酶的情况下再孵育2天。为收获细胞,抽吸出培养基,并用1×PBS洗涤,且通过向各孔中加入30μL包含50mM HEPES、150mM NaCl、1.5mM MgCl2、1mMEGTA、1%Triton X-100的裂解缓冲液裂解,在4℃下,在以500rpm旋转的振荡器上孵育板30分钟。在4℃下以4000rpm离心板20分钟,以使细胞碎片形成粒状沉淀,并将上清液转移到涂有捕捉抗体的96孔板中,以进行检测步骤。
如实施例VII中所述进行制备α-SNAP-25捕捉抗体溶液、α-SNAP-25检测抗体溶液以及包含对SNAP-25裂解的产物具有特异性的捕捉抗体的固相载体。
为通过ECL夹心ELISA分析检测SNAP-25裂解产物的存在,从储存板中抽吸出封闭缓冲液,将25μL-30μL的用重靶向内肽酶处理的细胞的裂解物加入各孔中,并在4℃下孵育板2小时或24小时。通过抽吸细胞裂解物并用200μL 1×PBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)冲洗各孔3次,而将板中各孔洗涤3次。洗涤之后,向各孔中加入25μL包含1×PBS中的2%Amersham封闭试剂、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)的5μg/mL α-SNAP-25检测抗体溶液,密封板,并在室温下振荡孵育密封的板1小时。在孵育α-SNAP-25检测抗体之后,用200μL 1×PBS、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)洗涤各孔3次。洗涤之后,处理板,分析收集到的数据,并如实施例VI中所述计算EC50值。这些结果表明,当使用SK-N-DZ无性细胞系#3细胞时,在EC50下检测到平均1.0nM的Noc/A(在约0.3nM到约2.0nM的范围内),其中上渐进线的信噪比为约20∶1到约300∶1。此外,当使用AGN P33无性细胞系#6细胞时,在EC50下检测到平均3.7nM的Noc/A(在约2.0nM到约5.5nM的范围内),其中上渐进线的信噪比为约20∶1到约500∶1。对于对含有强啡肽A配体的重靶向内肽酶具有特异性的SK12细胞,当使用SK12细胞时,在EC50下检测到平均8.4nM的Dyn/A(在约4.5nM到约10.0nM的范围内),其中上渐进线的信噪比为约10∶1到约20∶1。此外,当使用Neuro-2a无性细胞系#7细胞时,在EC50下检测到平均8.8nM的TVEMP-甘丙肽(在约5.0nM到约15.5nM的范围内),其中上渐进线的信噪比为约20∶1到约200∶1。本方法也可如实施例IX中所述按多重方式进行。
2.使用CL夹心ELISA进行的用于检测重靶向内肽酶的基于免疫的方法.
如实施例VII中所述进行制备用重靶向内肽酶处理的细胞的裂解物和α-SNAP-25捕捉抗体溶液。如实施例VIII中所述进行制备α-SNAP-25检测抗体溶液和包含对SNAP-25裂解产物具有特异性的捕捉抗体的固相载体。
为通过CL夹心ELISA分析检测SNAP-25裂解产物的存在,将100μL用重靶向内肽酶处理的细胞的裂解物加入各孔中,密封板,并在4℃下,在以500rpm旋转的振荡器上孵育密封的板2小时或24小时。通过抽吸细胞裂解物,并用200μl 1×PBS、0.05%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)冲洗各孔3次,将板中各孔洗涤3次。洗涤之后,向各孔中加入100μL1×PBS中的包含2%Amersham封闭试剂、0.1%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)的1mg/mL α-SNAP-25多克隆抗体/HRP检测抗体溶液,密封板,并在室温下,在以650rpm旋转的振荡器上孵育密封的板1小时。在孵育检测抗体之后,用200μL 1×PBS、0.05%TWEEN-20(聚氧化乙烯(20)山梨聚糖单月桂酸酯)洗涤各孔3次。洗涤之后,将100μl SuperSignalELISA Pico 1∶1混合物(Pierce Biotechnology,Rockford,IL)加入各孔中,并使用光度计(Molecular Devices,Sunnyvale,CA)在395nm下读取板。分析收集到的数据,并如实施例VI中所述计算EC50值。本方法也可如实施例IX中所述按多重方式进行。
实施例XV
用于检测中和α-重靶向-内肽酶抗体的基于免疫的方法
以下实施例说明如何进行可检测中和α-Noc/A抗体存在的基于免疫的方法。
Noc/A是目前正在评估的用于治疗疼痛病症(其中有一些为慢性的)的抗体。反复长期利用Noc/A进行治疗,患者会产生针对重靶向内肽酶的中和α-Noc/A抗体,从而产生免疫抗性。中和α-Noc/A抗体将通过结合重靶向内肽酶的靶配体和/或转位域(HN),阻止神经元和其它靶细胞中重靶向内肽酶的摄取,来抑制重靶向内肽酶活性。目前还没有用于测定患者血液中中和α-Noc/A抗体的存在的确立的测定。如果能够开发出一种检测用重靶向内肽酶治疗的患者体内的中和抗体的基于细胞的测定,就能节约成本和时间。
为检测中和α-Noc/A抗体的存在与否,可以使用本说明书中公开的用于测定重靶向内肽酶活性的基于免疫的方法。一种方式是使用蛋白印迹检测法测定用各种浓度的Noc/A治疗后存在的SNAP-25裂解产物的量,另一种方式是使用ECL夹心ELISA检测法。
为制备包含中和α-Noc/A抗体的样本,从用Noc/A免疫的猴的血液中分离出血清,并对抗体进行亲和纯化。也用痛敏肽变体肽(Noc/A分子中存在的靶配体)使兔免疫,收集其血清,并亲和纯化抗体(抗痛敏肽多克隆抗体)。
为制备用包含Noc/A的样本处理的细胞的裂解物,将SK-N-DZ无性细胞系#3细胞和AGN P33无性细胞系#6细胞接种于涂有聚D-赖氨酸的96孔板中,持续16-18小时。在含有1nM的Noc/A的RPMI SFM(有N2、B27和NGF添加物)中稀释0-3μg/mL的抗痛敏肽多克隆抗体,并在室温下预孵育混合物1小时。然后将溶液加入细胞中,并孵育24小时,然后进行ECL ELISA测定。这种抗痛敏肽变体抗体在1μg/mL下完全封闭两种细胞系上1nMNoc/A摄取(>90%抑制)。也在这些细胞系上测定抗Noc/A猴多克隆抗体。将细胞按100,000个细胞/孔接种于涂有聚D-赖氨酸的96孔板中的补充有N2、B27和NGF的RPMI生长培养基中,持续24小时。在含有1nM Noc/A的培养基中稀释0-20μg/mL的抗Noc/A多克隆抗体,并在室温下预孵育混合物1小时。然后将混合物加入细胞中,并孵育24小时,然后进行ECL ELISA测定。在抗Noc/A多克隆抗体的浓度较高(6-20μg/mL)的情况下,在SK-N-DZ细胞系上观察到高达60%抑制,且在AGN P33无性细胞系#6细胞系上观察到约30%抑制。这可能是由于抗Noc/A多克隆抗体对结合位点不具特异性,且含有结合该分子其它部分的其它抗体,从而导致在所测试的浓度下仅引起部分封闭。可能需要更高浓度来实现完全封闭。
为通过蛋白印迹分析检测SNAP-25裂解产物的存在,从各孔中抽吸出培养基,使细胞悬浮于50μL的SDS-PAGE上样缓冲液中,然后加热到95℃,保持5分钟。如实施例I中所述,通过蛋白质印迹分析每一收获的样本的等分试样,但通过SDS-PAGE,使用12%26孔Criterion凝胶(Bio-Rad Laboratories,Hercules,CA)分离收获的样本,并使用兔多克隆α-SNAP-25197抗体血清作为一抗(参看实施例V)。结果披露,最低浓度的重靶向内肽酶可在蛋白印迹中产生可检测的SNAP-25裂解产物带。
为通过ECL夹心ELISA检测SNAP-25裂解产物的存在,如实施例VI中所述,除去各孔中的培养基并裂解细胞。如实施例VIII中所述进行制备α-SNAP-25捕捉抗体溶液、α-SNAP-25检测抗体溶液和α-SNAP-25固相载体。将上清液转移到α-SNAP-25固相载体中,并如实施例VI中所述进行ECL夹心ELISA测定。如实施例VI中所述,分析收集得到的数据,并计算EC50值,但EC50是抑制重靶向内肽酶活性达到其最大抑制的1/2所需的血清稀释度,而最大信号(信号Max)与最小信号(信号Min)的比率是通过用在最大抗体稀释度下获得的SNAP-25裂解产物信号除以在最低抗体稀释度下获得的信号而获得。
结果表明,可检测出在猴血清中存在中和α-Noc/A抗体,且存在来自兔的α-痛敏肽变体抗体。随着抗体稀释度降低,在经过亲和纯化的来自免疫动物的抗体中孵育的Noc/A分子的活性也降低。利用对每一测试化合物具有特异性的细胞系,用Dyn/A和TVEMP-甘丙肽化合物进行相同的测定。
实施例XV
针对甘丙肽重靶向内肽酶的基于细胞的测定的开发
以下实施例说明如何鉴别具有开发基于细胞的效力测定所需的重靶向内肽酶摄取能力的确立细胞系。
1.候选细胞系的储备培养物的生长.
为生长细胞系,将适合密度的来自测试细胞系的细胞接种于含30mL适合的生长培养基(参见表25)的162cm2组织培养烧瓶中,并使其在37℃培养箱中5%或10%二氧化碳下生长,直到细胞达到所需密度。
2.针对对甘丙肽TVEMP-甘丙肽化合物的敏感性筛选商用细胞系
针对通过在用相应化合物处理后SNAP25的裂解情况所测量的细胞系对TVEMP-甘丙肽化合物的敏感性来筛选商用细胞系。使用各种TVEMP-甘丙肽化合物来筛选和测试。将PC-12、Neuro-2a、SiMa和P19细胞接种于无血清培养基中,持续3天,或接种于CM中,持续1天。用0和75nM浓度的TVEMP-甘丙肽批料A处理这些分化的细胞和天然的细胞18小时。观察到裂解的SNAP25的存在量增加,表明TVEMP-甘丙肽批料A在PC-12和Neuro-2a细胞中显示活性,且在分化状态下Neuro-2a细胞对带有甘丙肽配体的TVEMP化合物的敏感性高于天然细胞。细胞活性的等级次序显示PC-12细胞的活性最高,其次为Neuro-2a细胞,最后为SiMa细胞。必要时,需确定这种摄取是否对这些甘丙肽-重靶向化合物具有特异性,且因此用不含甘丙肽配体的其它化合物测试细胞很重要。Noc/A是一种含有痛敏肽变体配体的重靶向化合物,且LHN/A(阴性对照)是一种不含结合域的化合物。LHN/A的摄取不具特异性,而如果细胞系对重靶向化合物具有特异性摄取,那么LHN/A的活性应明显低于TVEMP-甘丙肽化合物。先前已经显示Noc/A化合物在SiMa细胞中具有特异性摄取,并用作测试细胞系的基线。有利的细胞系应对LHN/A化合物和Noc/A化合物具有低摄取,而对TVEMP-甘丙肽化合物具有高摄取。表26显示了由该实验的结果。
结果显示,对于测试的细胞系,TVEMP-甘丙肽批料A和TVEMP-甘丙肽批料B具有活性与阴性对照物类似或仅为阴性对照物的1到2倍的曲线或EC50值。该数据表明天然细胞不够敏感,且这些细胞须用编码甘丙肽受体蛋白GalR1或GalR2受体的质粒转染。
3.用GalR稳定转染PC-12、Neuro-2a和SiMa细胞.
在转染前一天,将细胞按0.5×106个细胞/孔的密度接种于涂有胶原蛋白IV的6孔板(Cat# 354554:BD Biosciences)(SiMa,PC-12)或6孔Costar板(Cat# 3516:Corning)(Neuro-2a)中。通过将12μl LipofectamineTM 2000(Cat# 52758,Invitrogen)稀释于250μl Opti-MEMI减血清培养基(Cat# 3195,Invitrogen)中,随后在室温下孵育5分钟,来进行转染。将4μg GalR质粒DNA与0.4μg pAdVantageTM载体(1mg/ml,Cat# E1711,Promega)混合于250μl Opti-MEMI减血清培养基中,保持5分钟。孵育5分钟之后,将稀释的LipofectamineTM 2000与稀释的质粒DNA混合,并在室温下再孵育20分钟,以形成复合物。同时,用OPTI-MEM洗涤细胞,并将0.5ml OPTI-MEM加入各孔中。孵育20分钟之后,将0.5ml含有稀释的LipofectamineTM 2000与稀释的质粒DNA的复合物小心地加入0.5ml OPTI-MEM中的含有细胞的孔中。在37℃下孵育板5小时,之后加入1mL完全培养基。次日,将培养基用生长培养基替换,孵育48小时。在第4天,回收转染的细胞,随后将生长培养基用含有0.5mg/ml(1∶100稀释)Geneticin(Cat# 10131:Invitrogen)的新鲜长培养基替换,并且再孵育3天。在转染后第7天,将细胞转移到含有生长培养基和遗传霉素(0.5mg/ml,1∶100稀释液)的75cm胶原蛋白IV烧瓶(Cat# 35423:BD Biosciences)中。进行此转移时,约90%的细胞死亡,并在更换培养基期间将其除去。每2天更换一次含有遗传霉素(0.5mg/ml,1∶100稀释)的生长培养基,直到第21天。
为选择能够吸收甘丙肽TVEMP化合物的稳定细胞,在使用用于捕获的涂有单克隆2E2A6的板和用于检测的磺基标记的多克隆SNAP25(Sigma,Cat# S9684)抗体的ECL夹心ELISA中,各参数应能筛选出用TVEMP-甘丙肽处理产生了最高百分数的SNAP25裂解产物的克隆。表27中的EC50值显示,在用GalR1和GalR2转染的SiMa和Neuro-2a细胞中,TVEMP-甘丙肽批料D展现的摄取是阴性对照物的至少10倍,而在经过转染的PC-12细胞中仅为2到4倍。由于经过转染的PC-12细胞的敏感性和特异性似乎低于SiMa和Neuro-2a细胞,故将不对其进行克隆。此外,由于TVEMP-甘丙肽化合物中的甘丙肽1到16单体配体结合GALR1受体的亲和力高于GALR2,故只克隆用GALR1转染的细胞。图中还显示,在Neuro-2a GalR1中,TVEMP-甘丙肽批料C和批料D展现的摄取是LHN/A和重靶向痛敏肽化合物TVEMP-痛敏肽的9到10倍。
根据常规,所选非无性系细胞群不是适合使用的良好细胞群,因为这些细胞群含有受体表达不同水平的细胞的混合物,而且其可随时间发生变化。为获得来源于单细胞的稳定细胞系,启用稀释克隆法。第21天,用胰蛋白酶处理转染的细胞,用针将其分开,并计数。剩余的转染的细胞系冷冻起来待用。在含有遗传霉素(0.5mg/ml,1∶100稀释)的生长培养基中将细胞连续稀释到10个细胞/孔。按100μl/孔将细胞接种到2个涂有胶原蛋白IV的96孔板(SiMa、PC-12)或2个96孔Costar板(Neuro-2a)中,以达到1个细胞/孔的密度。将板放回培养箱,并非接触孵育2周,以形成集落。2周后(第35天),小心地检查孔中形成于孔底部的单个集落的存在(对于多个集落,小心检查整个孔)。当鉴别出某一孔中具有单一细胞团时,小心地细查整个孔,以确保有且仅有一个细胞团存在。拍摄该细胞团的照片。如果怀疑还存在细胞团,就不选择这个孔。第36天,用TrypLE将所选克隆脱离,并加入0.5mL含有遗传霉素(0.5mg/ml,1∶100稀释)的完全培养基,以停止胰蛋白酶反应。将其整个体积转移到6孔板中,并用3.0ml含有遗传霉素(0.5mg/ml,1∶100稀释)的完全培养基进一步稀释。使克隆生长到90%汇合,然后再用胰蛋白酶处理,并转移到装有10.0ml含遗传霉素(0.5mg/ml,1∶100稀释)的完全培养基的75cm涂有胶原蛋白IV的烧瓶或Costar烧瓶中。一旦细胞再次达到90%汇合,就使用这些细胞填装3个冷冻小瓶进行冷冻储存,或用于ELISA测定中进行甘丙肽重靶向化合物的筛选。
使用参照化合物TVEMP-甘丙肽批料C来测试这些克隆,由两个操作人员进行独立测试。SiMa GalR1克隆生长缓慢,且此时不能用于测试。幸运的是,Neuro-2a克隆生长较快,并且很快12个克隆中就有8个达到足够量用于测试。用全剂量范围的TVEMP-甘丙肽化合物(0-300nM)测试这些Neuro-2a GalR1无性系细胞,且这些克隆中的9个克隆的结果显示于下文中。剩余4个克隆生长很慢,并未进行测试。所选非无性系亲本细胞连同这些克隆一起接种,以用作基准。表28显示了当用TVEMP-甘丙肽化合物测试时,8个克隆中每一者以及所选非无性系Neuro-2aGalR1细胞的活性。在所测试的8个克隆中,只有克隆#4、克隆#7和克隆#12显示对TVEMP-甘丙肽化合物的良好摄取,其中具有可接受的EC50值。Neuro-2a GalR1克隆#1、克隆#3和克隆#10不吸收TVEMP-甘丙肽化合物,而克隆#5、克隆#11和克隆#13以及非克隆细胞群产生极高EC50值,并且没有使用这些细胞进行进一步测试。
4.无性细胞系中GalR1表达情况的表征
针对克隆的筛选显示,只有克隆#4、克隆#7和克隆#12的敏感性高于非无性系细胞。从这3个克隆以及未转染的亲本Neuro-2a细胞和稳定转染的非无性系Neuro-2a细胞中提取出信使RNA(mRNA),通过RT-PCR,使用实施例V中所述的RT-PCR条件和表29中所述的引物进行表征。
表30中的结果显示,经过转染的非无性系细胞和无性系GALR1mRNA量远高于亲本细胞。在TVEMP-甘丙肽细胞筛选中,克隆#7对TVEMP-甘丙肽显示出最高敏感性。根据表30,还显示克隆#7具有最高的GALR1mRNA量。Neuro-2a GalR1克隆7(Neuro-2a#7)的CT值最低,其次是克隆4,接着是为克隆12。此时,所测试的非克隆细胞提供的CT值与克隆12很接近,但这些细胞含有一直变化的含有不同浓度的GalR1受体的细胞群,并因此不被认为是适于进一步研究的细胞群。在3个EC50较低的克隆中,Neuro-2a克隆GalR1克隆#12(Neuro-2a#12)生长最快,其次是Neuro-2a克隆#7,最后是Neuro-2a克隆#4。除了其生长速率较慢外,Neuro-2a克隆#4还因Neuro-2a克隆#4的敏感性远不如克隆#7而未进行测试。
5.利用TVEMP-甘丙肽化合物进行的Neuro-2a克隆#7与克隆#12的敏感性和特异性的比较
同时测试两个克隆,以尝试鉴别出二者中敏感性和选择性最强的一个,由此,可以肯定地从表现最好的克隆收集数据。表31显示了当用TVEMP-甘丙肽批料C和LHN/A处理时,这两个克隆各自的敏感性和选择性的结果。两个克隆都展现高信噪比。Neuro-2a克隆#7的EC50值为5.5nM,而Neuro-2a克隆#12的EC50值为68.4nM。Neuro-2a克隆#12须用0nM到300nM的剂量范围测试,而Neuro-2a克隆#7可用0nM到30nM的剂量范围测试,以在所用最高浓度下引起稳定状态。两个克隆都显示出LHN/A与TVEMP-甘丙肽批料C间的明显差异,Neuro-2a克隆#12在高浓度下显示某种程度的非特异性摄取,而Neuro-2a克隆#7则不然。从表中的结果可以看出,用Neuro-2a#7细胞测试的范围比Neuro-2a #12细胞的测试范围低10倍,致使Neuro-2a #7所用化合物的量比Neuro-2a #12的低10倍。当LHN/A用作比较时,Neuro-2a #7的选择性是Neuro-2a克隆#12的8倍。两个克隆的信噪比都超过100,但比率为10就足以进行基于细胞的效力测定。Neuro-2a#7克隆EC50值为5.5nM,比Neuro-2a#12的低约12倍,Neuro-2a#12的EC50值为68.4nM。较低的测试剂量范围、对于LHN/A为24倍的选择性、高信噪比、产生低EC50值的优良敏感性和每个测试所需的低蛋白质量都表明Neuro-2a克隆#7将是进行基于细胞的效力测定用于确定针对TVEMP-甘丙肽化合物的效力比的克隆。
实施例XVI
用于摄取强啡肽A重靶向内肽酶的过表达KOR-1受体的无性细胞系的产生
以下实施例说明如何表征和比较由被靶受体转染确立细胞系且随后进行细胞系克隆得到的数个无性细胞系。该具体实施例将提到最先在实施例III表9中描述的被hKOR-1转染的无性细胞系的鉴别和表征。
选出4个AGN P33-KOR克隆(实施例III表9中的克隆编号8、9、10和12),并利用Dyn/A通过0nM到150nM的全剂量响应加以测试。同时,选出2个SiMa-KOR克隆(实施例III表9中的克隆编号12和16),并利用Dyn/A通过0nM到150nM的全剂量响应加以测试。在本实验中,AGN P33-KOR克隆8、克隆9和克隆12产生极低摄取,并因此被丢弃;AGN P33-KOR克隆10呈现良好摄取,且其EC50值为30.3nM。所测试的两个SiMa-KOR克隆呈现良好摄取,并且克隆16的EC50值为26.6nM,且克隆12的EC50值为11.8nM。然后通过将靶Dyn/A化合物与缺乏靶配体的阴性对照LHN/A和Noc/A对照物的摄取相比较,来测试这三个克隆的敏感性和选择性。利用0nM到150nM的全剂量响应进行的三个克隆以及亲本SiMa细胞的比较概括于表32中。
用Dyn/A处理的经过KOR-1转染的克隆的Dyn/A摄取明显增加,而亲本SiMa细胞显示出化合物的极低摄取(摄取量类似于阴性对照LHN/A)。包括亲本SiMa细胞在内的所有细胞系中都存在一定量Noc/A。这也在意料之中,因为在针对该重靶向化合物的测定研究期间,观察到SiMa细胞摄取Noc/A。此外,Noc/A摄取在特别针对该重靶向内肽酶衍生得到的AGN P33细胞系中最高。在无性SiMa-KOR克隆12(SK12)细胞中存在明显的Noc/A摄取与Dyn/A化合物的摄取差异。在所有图表中,阴性对照LHN/A的活性最小,表明在不存在结合域的情况下,这些细胞系中不会发生特异性摄取,且SK12细胞中摄取最少,表明Dyn/A化合物的摄取具有高度特异性。从这些结果可知,应选择SK12克隆用于后续优化和表征。
利用SK12细胞进行优化研究,以便开发出一种具有特异性和敏感性的稳定测定。需测定的数个参数包括接种培养基和接种密度、处理培养基和处理时间。优化期间获得的数据的总结提供于表33中。
表B显示,按100,000个细胞/孔接种于CM中并用CM中的化合物处理过的细胞在各实验中的EC50值变化较大(4.6nM、1.2nM和13.72nM),而按100,000个细胞/孔接种于SFM中并用在SFM中稀释的化合物处理过的细胞提供优良的曲线和一致的EC50值(9.0nM和8.4nM)。今后,细胞也将按100,000个细胞/孔接种于SFM中,并也用SFM中的化合物处理。
将SK12按100,000个细胞/孔接种于PDL板上的SFM中,持续24小时,随后在SFM中处理16小时,得到最低EC50值8.4+/-1.1nM,且信噪比为12。这两个值是今后在CBPA中使用此细胞可接受的。
利用饱和结合测定表征SK12细胞
此处利用的饱和结合分析详细描述于实施例V中。使用KOR-1拮抗剂3H-二丙诺啡(diprenorphine)进行饱和结合研究,以评估结合。在几个实验中测量总结合、特异性结合和非特异性结合。由两次独立实验生成3H-二丙诺啡与受体的饱和结合曲线。可以看出,约25%结合是非特异性结合,且75%是分子与受体的特异性结合。分子对受体的亲和力是适宜的,为6.5nM。Bmax表明在SK12细胞上,每个细胞具有23fmol KOR-1受体。
除非另外指明,否则说明书和权利要求书中使用的表示成分、特性(如分子量)、反应条件等的量的所有数字都应理解为在所有情况下用术语“约”修饰。因此,除非有相反的说明,否则本说明书和所附权利要求书中陈述的数字参数都是近似值,都可视本发明设法获得的所需特性而变化。在最低限度上,且不打算将等效原则的应用局限于权利要求书的范围,各数字参数应至少依据所报告的有效数字的数目并应用一般舍入技术来解释。尽管提出本发明的较宽范围的数字范围和参数是近似值,但在具体实施例中尽可能精确地报告所列的数值。然而,任何数值固有地含有由其各自的测试测量值中所见的标准偏差必然引起的某些误差。
除非本文中另外指明或上下文明显矛盾,否则在描述本发明的上下文中(尤其是以上权利要求书的上下文中)使用的术语“一个(种)”、“所述”和指代词语应解释为涵盖单数和复数。本文中值的范围的列举仅旨在用作单独提及该范围内的各单独值的简写方法。除非本文中另外指明,否则各单独值都并入本说明书中,如同在本文中对其单独列举一样。除非本文中另外指明或上下文明显矛盾,否则描述的所有方法可按任何适合的次序进行。对本文中提供的任何和所有实施例或示例性语言(例如,“如”)的使用都仅旨在更好阐述本发明,而不是对本发明或权利要求的范围构成限制。本说明书中所用的任何语言都不应解释为指示对实施本发明所必需的任何非权利要求的要素。
本文中公开的替代性要素或实施方案的分组不应解释为限制。各个组成员都可单独地或与该组其它组成员或者本文中所见的其它要素的任何组合被提及和请求保护。出于便利和/或可专利性的原因,预期一个或多个成员可包含在一组中或从改组中删除。当任何此类包含或删除发生时,说明书在此被看作为含有经修改的组,从而满足所附权利要求书中所用的所有马库什组(Markush group)的书面陈述。
本文描述了本发明的某些实施方案,包括为本发明人所知用于实施本发明的最佳方式。当然,在阅读了上述描述后,这些所述实施方案的变化对本领域的技术人员将显而易见。本发明人预期本领域的熟练技术人员会适时采用此类变化,而且本发明人预期能以除了本文具体描述的方式之外的方式来实施。因此,在适用法律允许的情况下,本发明包括对本文所附权利要求书中陈述的主题进行的所有修改和等同物。此外,除非本文另外指明或上下文明显矛盾,否则其所有可能变化的任何上述要素组合都涵盖在本发明内。
本文公开的具体实施方案可进一步限制于使用“由...组成”或“基本上由...组成”的权利要求中。当在权利要求中使用时(无论每次修改进行提交或增加),连接词“由...组成”不包括权利要求中未具体说明的任何要素、步骤或成分。连接词“基本上由...组成”将权利要求的范围局限于具体说明的材料或步骤,以及实质上不会影响基本特征和新颖特征的材料或步骤。本文中固有地或明确地描述了如此要求的本发明的实施方案并使它们可以实施。
此外,整个本说明书对专利和印刷的出版物做了很多引用。上文引用的各参考文献和印刷的出版物的全部内容都单独以引用的方式并入本文。
最后,应了解,本文公开的本发明的实施方案是对本发明原理的说明。其它可采用的修改在本发明的范围内。因此,例如(但不限于),根据本文中的教导,可以利用本发明的替代性配置。因此,本发明不限于明确所示和描述的内容。
Claims (7)
1.一种检测重靶向内肽酶活性的方法,所述方法包括以下步骤:
a.用包含重靶向内肽酶的样本处理来自确立细胞系的细胞,其中所述来自确立细胞系的细胞对约500pM或更少的重靶向内肽酶的重靶向内肽酶活性敏感;
b.从所述经过处理的细胞中分离出SNAP-25组分,所述SNAP-25组分包含具有BoNT/A裂解位点易分裂键的羧基末端谷氨酰胺的SNAP-25裂解产物;
c.使所述SNAP-25组分与连接到固相载体的α-SNAP-25抗体接触,
其中所述α-SNAP-25抗体结合SNAP-25裂解产物中包含所述BoNT/A裂解位点易分裂键的羧基末端谷氨酰胺的表位,所述α-SNAP-25抗体对SNAP-25裂解产物中不包含所述BoNT/A裂解位点易分裂键的羧基末端谷氨酰胺的SNAP-25的表位的缔合速率常数小于1×101M-1s-1;且所述α-SNAP-25抗体对所述表位的平衡解离常数小于0.450nM;
d.检测抗体-抗原复合物的存在,所述抗体-抗原复合物包含所述α-SNAP-25抗体和具有来自所述BoNT/A裂解位点易分裂键的羧基末端谷氨酰胺的所述SNAP-25裂解产物;
其中通过所述抗体-抗原复合物的检测指示重靶向内肽酶活性。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述SNAP-25裂解产物为SNAP-25197。
3.根据权利要求1所述的方法,其中使用夹心ELISA检测抗体-抗原复合物的存在。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述方法在下渐近线的信噪比为至少3∶1且在上渐近线的信噪比为至少10∶1。
5.根据权利要求1所述的方法,其中所述样本包含最多100pM的重靶向内肽酶。
6.根据权利要求1所述的方法,其中所述来自确立细胞系的细胞对约100pM或更少的重靶向内肽酶对胞吐作用的重靶向内肽酶抑制作用敏感。
7.根据权利要求1所述的方法,其中按单重方式或多重方式进行所述方法。
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