发明内容
本发明的目的在于针对上述问题与不足,获得具有抗菌活性的重组抗菌肽Misgurin及其制备方法。本发明对Misgurin进行了突变改造,获得的Misgurin突变体具有明显的抗菌活性。本发明还设计了可在酵母宿主细胞中高效分泌表达的新型抗菌肽Misgurin突变体基因,提供一种用酵母细胞表达新型Misgurin突变体的制备方法,以简化生产步骤,提高效率。
本发明的目的是通过以下技术方案实现的:
Misgurin属天蚕素族抗菌肽,天蚕素族抗菌肽的一级结构存在很多相似之处。它们的N端富含亲水性的氨基酸残基,特别是碱性氨基酸如Arg(精氨酸)和Lys(赖氨酸);而C端则含有较多的疏水性氨基酸残基,其末端都酰胺化,C末端酰胺化对抗菌肽的活性至关重要(肖业臣,温硕洋,黄亚东,杨婉莹,曹阳.昆虫抗菌肽和抗真菌肽结构与功能的关系及分子设计.昆虫学报.2004,47(5):659-669.窦非,谢维,董雪吟,徐贤秀.抗菌肽CMIV末端结构对其活性的影响.中国科学(C辑),2000,30(1):59-64.)。为了获得具有更高活性的抗菌肽Misgurin,本发明在参考文献报道的天然抗菌肽Misgurin的氨基酸序列的基础上,设计了含谷氨酰胺的新型抗菌肽Misgurin突变体。
根据宿主细胞毕赤酵母偏好的密码子,采用全人工合成的方法获得一种Misgurin突变体全基因。
通过基因工程的方法,以上述设计合成的Misgurin突变体DNA序列,构建重组毕赤酵母分泌型表达载体,载体电击法转化宿主细胞,筛选获得高效表达重组酵母菌株。在合适的培养条件下,特别是将诱导培养基的初始pH值调整为3.0~5.0,经甲醇诱导表达获得具有较高抗菌活性的重组Misgurin突变体。每毫升表达上清中,重组Misgurin突变体的表达量达100微克,相当于1000克泥鳅中提取的抗菌肽Misgurin。产物表达水平、抗菌活性,以及对细菌性疾病的临床防治研究均表明,本发明所述方法在重组Misgurin突变体的基因工程生产上取得了突破性的进展,为Misgurin突变体的大规模生产、临床应用和深入研究提供了充足的物质来源。
上述重组酵母菌株,为被重组毕赤酵母分泌型载体转化的毕赤酵母菌pPICZαA-M/SMD1168株,重组毕赤酵母分泌型载体,为含有新型抗菌肽Misgurin突变体成熟肽基因的酵母表达载体pPICZαA-M。
本发明制备新型抗菌肽Misgurin突变体的方法,与现有的从组织中提取抗菌肽Misgurin相比,具有如下优点:
A本发明所述的新型抗菌肽Misgurin突变体是在天然抗菌肽Misgurin的羟基端增加了一个谷氨酰胺,提高了其抗菌活性。
B本发明人工设计合成的Misgurin突变体基因选用毕赤酵母偏爱密码子,有利于密码子在毕赤酵母中的识别和表达,从而可达到高效表达的目的。
C本发明提供的Misgurin突变体重组细胞诱导培养基的初始pH值为3.0~5.0,实现了Misgurin突变体在毕赤酵母中的高效表达,且表达产物分泌在细胞外,简化了分离纯化步骤,提高了重组基因产物的生产效率。
D本发明制备的Misgurin突变体具有较好的抗菌活性,制备方法简单:诱导培养后即可获得具有抗菌活性的Misgurin突变体,而且适合大规模培养。
E本发明制备的Misgurin突变体具有广谱抗菌活性:对金黄色葡萄球菌、猪沙门氏菌等革兰氏阳性菌和猪致病性大肠杆菌K88、K99、987P等革兰氏阴性菌均具有良好的抗菌作用,对控制和防治细菌性疾病将发挥重要的作用。
F本发明制备的Misgurin突变体抗菌作用强:对金黄色葡萄球菌、猪沙门氏菌、猪致病性大肠杆菌K88、K99、987P的最小抑菌浓度分别为1.56、6.25、6.25、6.25、6.25μg/mL,显示出较强的抗菌作用。
G本发明制备的新型抗菌肽Misgurin突变体临床使用效果好:临床试验表明,Misgurin突变体作为预防应用,可明显提高雏鸡保护率,其中中高剂量组可达到100%保护,和卡那霉素对照组效果相当,但雏鸡平均体重高于卡那霉素对照组。
具体实施方式
1.设计含有谷氨酰胺的Misgurin突变体,并人工合成Misgurin突变体基因
本发明人经过深入而广泛的研究,在参照GenBank中misgurin(Gene Bank P81474)的氨基酸序列的基础上,设计成了含有谷氨酞胺的Misgurin突变体,以增强其抗菌活性。同时选用酵母偏爱密码子设计Misgurin突变体基因,并在其N端加上α信号肽Kex2裂解位点,以保证所分泌表达的抗菌肽具有天然N端,同时两端引入XhoI和XbaI酶切位点,以便于克隆入载体pPICZα-A中。
2.构建分泌型的酵母表达载体(如图1所示)
将经XhoI和XbaI酶切的含有Misgurin突变体基因的回收产物与经同样酶切回收的表达载体pPICZαA按一定的比例混匀,连接,转化,筛选,获得含有Misgurin突变体基因的重组克隆,扩增后提取质粒,以Misgurin突变体特异性引物M1和M2进行PCR鉴定(如图2所示),鉴定正确的阳性质粒pPICZαA-M送大连Takara公司测序。
3.筛选获得高表达抗菌肽Misgurin突变体酵母工程菌株
(1)PICZαA-M质粒的线性化与回收
大量提取pPICZαA-M质粒,用SacI单酶切使其线性化,反应体系为:
ddH2O 160μL
10×Buffer 20μL
pPICZαA-M质粒 15μL
SacI 5μL
总体积200μL,充分混匀后37℃温浴2h,然后取2μL酶切产物在1%琼脂糖上电泳,观察是否完全线性化。向上述线形化pPICZαA-M质粒中补加240μL水后加入等体积的酚、酚:氯仿、氯仿各抽提一次。每次均以12000r/min离心5min,后取上清加入1/10体积3M pH5.2NaAC和2.5倍体积的预冻无水乙醇,混匀后-20℃放置1h,12000r/min离心5min,用80%乙醇洗涤2次,在超净台中吹干,用灭菌双蒸水溶解后稀释为终浓度为2μg/μL,-20℃保存。
(2)酵母感受态细胞的制备
无菌操作,用接种环迅速蘸取冻存的巴斯德毕赤酵母菌SMD1168少许,划线接种于不含Zeocin的固体YPD平板上,倒置于温箱中,30℃培养。
待平板上长出单个菌落,挑取形态均一的单个菌落,接种于含5mL液体YPD的50mL锥形瓶中,30℃,200r/min振摇培养过夜。
取0.5mL振摇培养过夜的菌液接种于含50mL液体YPD的200mL锥形瓶中,30℃振摇培养过夜。
取菌液于50mL离心管中,2500r/min离心4℃5min后收集细胞。
用50mL预冷灭菌的双蒸水轻轻吹打开细胞,1500r/min 4℃离心5min后收集细胞。
用25mL灭菌冰冷双蒸水轻轻重悬细胞,1500r/min 4℃离心5min后收集细胞。
再用10mL灭菌冰冷1M D-山梨糖醇轻轻重悬细胞,1500r/min 4℃离心5min后收集细胞。
用灭菌冰冷1M D-山梨糖醇轻轻重悬细胞,并使细胞终浓度OD600=1.0,即得感受态细胞。
(3)酵母菌株的电转化与筛选
取5μL约10μg经SacI单酶切线性化的表达质粒pPICZαA-M加入80μL感受态细胞悬液中。充分混匀后加入到预冷的0.2cm的石英电转杯中,将该石英电转杯放于冰上5min。
擦干石英电转杯外壁上的水分,放入BioRad GenePulse电转化仪的槽中以1.5kV,20μF,200Ω的条件电击,结束后,立即加入1mL 1mol/L冰浴的D-山梨醇,混匀。
将杯中的内含物转移到5mL灭菌离心管中,30℃温箱中静置1.5h。
取0.1mL转化物均匀涂布于含100μg/mL Zeocin的YPDS(1%yeast extraet,2%peptone,2%dextrose,1mol/L,sorbitol,2%agar)选择平板上,30℃孵育3~5天。
待YPDS平板上的阳性转化子生长较大,将各转化子依次点种至含Zeocin 200μg/mL,500μg/mL,1000ug/mL的YPDS选择平板,以在高浓度Zeocin平板上正常生长的菌落为高拷贝重组菌株。
另外,将pPICZαA载体酶切线性化后,同样电转化制备空载体重组菌株pPICZαA/SMD1168,作为后续工作的对照。
4.重组菌的PGR鉴定
酵母基因组DNA的提取
挑取10~20个单菌落于2mLYPD液体培养基中,30℃、250r/min振荡培养。
将1.5mL过夜培养液转到1.5mL Eppendorf管中,12000rpm室温离心1min,弃上清。
细胞重悬于50μL STES缓冲液中,向酵母悬液中加入50μL酸洗过的玻璃珠。每管加入20μLTE(pH 7.6),然后加入60μL苯酚∶氯仿(25∶24),盖紧盖子。
先振荡1min,使有机相和水相充分混合,然后每振荡30s就将Eppendorf管插在冰上,重复振荡6次。
12000rpm,室温离心8min,将上层的水相转移到一个新的1.5mL的Eppendorf管中。
依次加入1/10体积的3mol/L的NaAc(pH 5.2)、2.5倍体积的无水乙醇,-20℃沉淀20min。12000rpm 4℃离心10min,去上清,沉淀用75%的乙醇洗涤1次。12000rpm 4℃离心2min,去上清,空气干燥沉淀后,将沉淀溶解于40μL TE Buffer(pH 7.6),该溶液即为基因组样品。取5μL样品作琼脂糖电泳检测。使用前将基因组样品在沸水中煮5min,然后立即插在冰上或-20℃冻存备用。
以上述提取的酵母基因组DNA为模板,用Misgurin突变体特异性引物M1和3’AOX1通用引物进行PCR扩增鉴定,扩增体系如下:
混匀,瞬间离心。98℃预变性2min,98℃预变性1min,进入PCR循环:98℃15s,55℃20s,72℃1.5min,共30个。最后72℃延伸4min,取PCR产物,1.5%琼脂糖凝胶电泳,凝胶成像系统下观察并记录拍照。因为在构建pPICZαA-M时,双酶切除去87bp后又插入81bp的Misgurin突变体基因片段,理论上阳性重组子能扩增出特异的257bp DNA片段。而以宿主菌SMD1168和对照重组菌pPICZαA/SMD1168基因组作模板均不能扩增出DNA片段,鉴定结果显示阳性重组子pPICZαA-M/SMD1168基因组作模板扩增出257bp左右DNA片段(如图3所示),表明Misgurin突变体基因已经成功的整合到宿主菌SMD1168的基因组上。
5.毕赤酵母阳性转化子诱导表达抗菌肽Misgurin突变体
将筛选到的阳性重组子单菌落接种(于含50μg/mL Zeocin的YPD培养液中,28℃、200rpm振摇培养18个小时。取此菌液按2%体积比转接于含BMGY培养基的250mL锥形瓶中,瓶口用三层灭菌医用纱布封口,以保证足够的通氧量,28℃200rpm摇振培养18~24h左右。4℃4000rpm离心5min,弃上清,收集沉淀。沉淀菌体用pH值为3.0~5.0的BMMY培养基重悬,28℃200rpm继续培养。为了维持诱导表达,每隔24h补加100%甲醇使终浓度达1%。于0,24h,48h,72h,96h和120h取样一次,4℃12000rpm离心10min,收集上清,按常规方法进行Tricine-SDS-PAGE电泳鉴定,并以金黄色葡萄球菌Cowanl为试验菌株,用标准琼脂孔穴扩散法测定其抗菌活性,筛选表达量高的重组子进行大规模诱导培养。
6.毕赤酵母表达的重组Misgurin突变体的最小抑菌浓度(MIC)测定
用液体生长抑制法测定重组Misgurin突变体对金黄色葡萄球菌、猪沙门氏菌、猪致病性大肠杆菌K88、K99、987P的MIC,将能完全抑制菌体生长的最低蛋白浓度确定为MIC。将活化培养的菌液用LB培养基稀释至106CFU/mL,分别取50μL加到96孔培养板上,然后分别加入稀释的新型抗菌肽Misgurin(浓度分别为100μg/mL,50μg/mL,25μg/mL,12.5μg/mL,6.25μg/mL,3.12μg/mL,1.56μg/mL,0.78μg/mL,0.39μg/mL,0.20μg/mL)的溶液50μL,37℃孵育24h后用自动酶标仪测定OD600确定结果。重组Misgurin突变体对金黄色葡萄球菌、猪沙门氏菌、猪致病性大肠杆菌K88、K99、987P的最小抑菌浓度分别为1.56、6.25、6.25、6.25、6.25μg/ml。
7.毕赤酵母表达的重组Misgurin突变体对致病性大肠杆菌感染雏鸡的防治效果
试验以AA肉仔鸡为对象,随机平均分为高、中、低剂量试验组、卡那霉素对照组、感染对照组和生理盐水对照组6组,每组10羽,分别于21日龄攻毒致病性大肠杆菌5×108个菌/羽,于攻毒同时口服相应剂量重组抗菌肽,连用3d,定期观察鸡生长性能、精神状态,统计死亡率、保护率。试验结果表明,重组Misgurin突变体作为预防应用,可明显提高雏鸡保护率,其中中高剂量组可达到100%保护,和卡那霉素对照组效果相当,但雏鸡平均体重高于卡那霉素对照组,而感染对照组的死亡率达80%。本试验针对自主研发的新型抗菌肽Misgurin突变体进行了初步的动物学保护试验,取得了较满意的结果,为下一步的大规模临床试验和应用提供了依据。
SEQUENCE LISTING
<110>上海市农业科学院畜牧兽医研究所
<120>新型抗菌肽Misgurin突变体的制备方法与应用
<130>说明书
<160>2
<170>Patentln version 3.3
<210>1
<211>93
<212>DNA
<213>人工设计
<220>
<221>CDS
<222>(16)..(84)
<220>
<221>mutation
<222>(79)..(81)
<400>1
gctctcgaga aaaga aga caa aga gtt gag gag ttg tcc aag ttc tcc aag 51
Arg Gln Arg Val Glu Glu Leu Ser Lys Phe Ser Lys
1 5 10
aag ggt gct gct gct aga aga aga aag caa tga tctagaagt 93
Lys Gly Ala Ala Ala Arg Arg Arg Lys Gln
15 20
<210>2
<211>22
<212>PRT
<213>人工设计
<400>2
Arg Gln Arg Val Glu Glu Leu Ser Lys Phe Ser Lys Lys Gly Ala Ala
1 5 10 15
Ala Arg Arg Arg Lys Gln
20