CN101880674A - 枣树水通道蛋白基因及在提高植物耐旱性和耐盐性中的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及基因工程技术领域,具体为一种枣树水通道蛋白基因及在提高植物耐旱性和耐盐性中的应用,该基因的核苷酸序列以及氨基酸序列如序列表中所示SEQ ID NO:1和SEQID NO:2,本发明构建植物表达载体,获得转基因拟南芥植株,对其进行耐盐性评价及耐旱性性评价,证明其可用在提高植物耐旱性和耐盐性中。本发明首次发现并从枣树中克隆出枣树水通道蛋白基因ZjPIP2,该基因可作为目的基因导入植物,提高植物耐盐性和耐旱性,以进行植物品种改良,明确了具有优良抗性的枣树的抗逆机制,逆境相关基因的分子结构、表达、功能及调控,为进一步充分利用这些优良抗性基因提高植物的抗逆性提供了一定的实验数据,奠定了一定的理论基础。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,具体为一种枣树水通道蛋白基因及在提高植物耐旱性和耐盐性中的应用。
背景技术
公知,水通道蛋白(aquaporin,AQP)大量存在于植物、动物、微生物等多种生物体内。植物水通道蛋白是一类在植物体内形成水选择性运输通道的蛋白质,它在植物种子萌发、细胞伸长、气孔运动等过程中调节水分的快速跨膜运输,它使植物能快速灵敏地调节细胞内与细胞间的水分流动。有些水通道蛋白是组成型表达的,而多数水通道蛋白则受环境因子,如干旱、盐害、激素、光质等诱导表达,因此研究水通道蛋白与植物抗逆性的关系备受人们关注。
第一个植物水通道蛋白γ-TIP是从模式植物拟南芥中分离出来的,它位于液泡膜上,因此被命名为TIP(tonoplast intrinsic protein)。通过爪蟾卵母细胞表达系统分析确认了γ-TIP蛋白运输水的专一性功能。到目前为止,科学家已经在拟南芥、豌豆、烟草、玉米、水稻等多种植物中都发现了AQP。另外,从蛋白数据库中也发现了大量AQP的同源物,它们广泛存在于单子叶和双子叶植物以及C3和C4代谢植物中,通过氨基酸序列同源性分析推测它们可能也是AQP。越来越多的研究表明,大多数植物中都存在着多个AQP及其同源物且含量丰富。如拟南芥中,PIP1蛋白占叶与根质膜蛋白的1%以上;菠菜叶肉细胞中含丰富的质膜AQP,占其质膜总蛋白的20%;菜豆子叶中含丰富的a-TIP同源物,约占细胞可抽提总蛋白的2%。根据水通道蛋白氨基酸序列同源性及结构特征,可将其分为4类:质膜内在蛋白(plasma membrane intrinsic protein,PIPs)、液泡膜内在蛋白(tonoplast intrinsic protein,TIPs)、类nodulin26膜内蛋白(nodulin26-like intrinsic protein,NIPs)和小分子碱性内在蛋白(small and basic intrinsic protein,SIPs)。
植物水通道蛋白的发现是植物水分生理学研究的重大进展,将水分代谢的研究引入了一个全新的阶段。目前,科学家们已经在拟南芥、豌豆、玉米、烟草、向日葵、含羞草等多种植物中发现了AQP,并对它们中的某些蛋白进行了分类、功能、亚细胞定位等方面的研究。但是对于中国古老的、重要的经济树种——枣树的水通道蛋白的研究还没有相关的报道,到目前为止,还未见有从枣树中分离出AQP基因并用于提高植物耐旱性和耐盐性方面的报道。枣树原产于我国黄河流域,是我国特有的经济林树种之一,枣树耐寒,抗旱,抵御各种外界不良因子的能力强,尤其是对土壤瘠薄、干旱有很强的忍耐力,在晋西北、太行山、陕北等黄土高原地区,枣树一般生长在土壤相当贫瘠、少雨干旱的丘陵山坡、高崖边等不良环境下,且都能正常生长结果。这种极其耐旱、耐瘠薄的特点显著优于其它农作物,因此枣树的抗逆性基因是非常宝贵的遗传资源,了解具有优良抗性的枣树的抗逆机制,逆境相关基因的分子结构、表达、功能及调控,可充分利用这些优良抗性基因提高植物的抗逆性提供一定的实验数据和奠定理论基础。
发明内容
本发明的目的在于提供一种枣树水通道蛋白基因,该基因来自于枣树,可作为目的基因导入植物,提高植物耐旱性和耐盐性,进行植物品种改良。
本发明是采用如下技术方案实现的:一种枣树水通道蛋白基因,该基因的核苷酸序列具有如SEQ ID NO:1所示的序列。
由所述一种枣树水通道蛋白基因的核苷酸序列编码的氨基酸序列,该氨基酸序列具有如SEQ ID NO:2所示的序列。
一种枣树水通道蛋白基因在提高植物耐旱性和耐盐性中的应用。
本发明从壶瓶枣树(Ziziphus jujuba Mill.HUPING)的结果枝(枣吊),利用CTAB法提取总RNA,根据mRNA纯化试剂盒方法从提取到的总RNA中分离纯化mRNA,构建cDNA文库,然后通过Blast分析与比对,从中克隆到一个cDNA序列为枣树中的水通道蛋白基因全序列,将其命名为ZjPIP2(Zizyphus jujuba Mill plasma membrane intrinsic protein)。根据该基因的核苷酸序列,设计并合成引物,上游引物WP3序列为:
5′--ATACCCGGG AACATGAGGGTT-3′,包含Sam I限制性酶切位点(即有下划线部分),三个保护碱基ATA,及水通道蛋白ZjPIP2基因的终止密码子TGA(反向序列)。引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。然后使用PCR技术成功扩增出ZjPIP2的目的基因片段,电泳分析ZjPIP2基因的cDNA序列全长为846bp,编码281氨基酸,其中包含有16个酸性氨基酸,19个碱性氨基酸,蛋白质的相对分子量为29.87KD,理论等电点为8.77。多重比对表明ZjPIP2与其他水通道蛋白有非常高的同源性,特别是与菜豆PIP2的同源性达到88%。而且,ZjPIP2蛋白序列当中含有MIP家族典型的保守氨基酸序列“HINPAVTFG”和两个“NPA”保守肽段。进化树分析表明枣树ZjPIP2和茄科烟草属的粉蓝烟草亲缘关系最近。特别是三级结构的分析暗示着ZjPIP2跟菠菜水通道蛋白相似,推测其功能有着类似性。上述同源性分析、氨基酸序列特性分析以及氨基酸序列的进化树分析、三级结构预测等分析手段是本领域普通技术人员所熟知的常规验证手段,通过上述多重对比分析,即可证明本发明克隆得到的核苷酸序列及其编码的氨基酸序列即为本发明所述的枣树水通道蛋白基因的序列,而且其蛋白功能也被唯一确定。
本发明在PCR克隆得到ZjPIP2基因后,经限制性内切酶修饰后连接到植物表达载体pBI121上,经含卡纳霉素的LB平板筛选、PCR、酶切、测序等方法证明植物表达载体pBII21-ZjPIP2构建成功。通过冻融法将植物表达载体pBI121-ZjPIP2转入根癌农杆菌LBA4404的感受态细胞中,经含卡纳霉素的YEB平板筛选、PCR鉴定等方法证明工程菌pBI121-ZjPIP2-L构建成功。农杆菌介导ZjPIP2基因转化拟南芥,经含卡纳霉素的1/2MS培养基筛选获得含有目的基因ZjPIP2的转基因拟南芥植株,然后对转基因植物及其T1代进行耐盐性评价及耐旱性性评价,经在0.1M NaCl溶液连续处理3天(盐处理)或是不浇任何液体(干旱处理),观察其生长表现,均能够在正常生长条件下恢复。
此外,本发明为了进一步研究ZjPIP2基因在枣树体内的表达,分别对盆栽壶瓶枣树苗进行干旱、NaCl胁迫处理,并以未作任何处理的正常壶瓶枣树苗为对照,研究逆境因素对ZjPIP2基因表达的影响,当处理过的树苗出现严重卷叶、枯黄现象时,立即采样并速冻保存于-80℃冰箱。用CTAB法提取所采集到的对照及胁迫处理过的植物材料的总RNA,经OD260值的测定、甲醛变性胶电泳等方法检测证明所提RNA纯度高、无降解,质量合格。反转录所提总RNA,RT-PCR分析得ZjPIP2基因在植物茎、叶中的表达比较稳定,同时证实ZjPIP2可受干旱、NaCl胁迫等逆境因素诱导表达。
与现有技术相比,本发明首次发现并从枣树中克隆出枣树水通道蛋白基因ZjPIP2,该基因可作为目的基因导入植物,提高植物耐盐性和耐旱性,以进行植物品种改良,明确了具有优良抗性的枣树的抗逆机制,逆境相关基因的分子结构、表达、功能及调控,为进一步充分利用这些优良抗性基因提高植物的抗逆性提供了一定的实验数据,奠定了一定的理论基础。
附图说明
图1为目的基因ZjPIP2的PCR扩增结果图;
图2为pBI121载体及目的基因ZjPIP2的双酶切图谱;
图3为重组质粒pBI121-ZjPIP2的酶切图谱;
图4为植物表达载体pBI121-ZjPIP2的构建过程示意图;
图5为工程菌pBI121-ZjPIP2-L的PCR鉴定图谱;
图6(a)为枣树不同环境、组织器官中内参基因ZjH3的差异性表达图谱一;
图6(b)为枣树不同环境、组织器官中内参基因ZjH3的差异性表达图谱二;
图7为ZjPIP2基因在不同环境、组织器官的差异性表达图谱。
具体实施方式
一、枣树水通道蛋白基因ZjPIP2的获得
春天采集壶瓶枣树(Ziziphus jujuba Mill.HUPING)长度约2mm的结果枝(枣吊),利用CTAB法提取总RNA,根据mRNA纯化试剂盒(货号:Z5200)购自Promega(美国)方法从提取到的总RNA中分离纯化mRNA。利用cDNA文库构建试剂盒(货号:18248-039)购自Invitrogen(美国)构建cDNA文库。将获得的文库中的cDNA与克隆载体pSPORT1连接,连接产物转化至E.coli DH5α感受态细胞,涂布于含有氨苄青霉素抗性的平皿37℃培养过夜,蓝白斑筛选重组质粒,并随机挑选部分质粒委托上海生工测序。
将测序结果利用NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov/)在线分析软件进行Blast分析,结果表明其中的一个cDNA序列为枣树中的水通道蛋白同源基因全序列。将其命名为ZjPIP2(Zizyphus jujuba Mill plasma membrane intrinsic protein)。
根据上述已经获得的枣树水通道蛋白基因的精确核苷酸序列设计并委托上海生工生物工程技术服务有限公司合成如下引物,用于ZjPIP2基因的克隆。上游引物WP3序列为:5′-ATGGATCCATGGCAAAAGACCCTG-3′,包含BamH I限制性酶切位点(即有下划线部分),两个保护碱基AT,及水通道蛋白ZjPIP2基因的起始密码子ATG。下游引物WP6序列为:5′-ATACCCGGGTCAAACATGAGGGTT-3′,包含Sam I限制性酶切位点(即有下划线部分),三个保护碱基ATA,及水通道蛋白ZjPIP2基因的终止密码子TGA。引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。
以克隆载体pSPORT1-ZjPIP2为模板,以WP3和WP6为引物,扩增获得含完整开放阅读框的枣树水通道蛋白基因。PCR反应体系组成为:5μL 10×PCR buffer,1μL 2.5MmdNTPs,10pmol WP3,10pmol WP6,1.5U Taq DNA聚合酶,50ng的模板,去离子水补充体积至50μL。PCR扩增条件为:95℃预变性5min,94℃30s、54℃30s、72℃1min 35个循环,最后72℃延伸5min。
取5μL PCR产物,1.2%琼脂糖凝胶电泳分析确认片段大小。按照DNA纯化试剂盒说明操作,纯化PCR产物。
二、ZjPIP2基因植物表达载体的构建
1、材料、试剂与仪器
1.1载体和菌株
植物表达载体pBI121均由山西省农业科学院生物技术研究中心园艺作物研究室保存,大肠杆菌(E.coli)DH5a、含ZjPIP2基因的重组质粒pSPORT1-ZjPIP2。
1.2酶与试剂盒
限制性内切酶BamH I、Sma I、Xba I、Sac I、DNA Ligation Kit、RNA酶、PrimeScriptTMRT reagent Kit、Taq酶、dNTP Mixture、DNA Marker(15000bp、2000bp ladder)均购自大连TaKaRa(宝生物)工程有限公司;琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒购自QIAGEN公司。
1.3常用试剂及培养基
卡那青霉素(100mg/mL),
酚∶氯仿∶异戊醇(V∶V∶V=25∶24∶1)
葡萄糖溶液(1M)
EDTA(0.5M,pH8.0)
10×TBE电泳缓冲液:
硼酸 55.2g/L
Tris 108g/L
EDTA(0.5M,pH8.0) 40mL
10%SDS(pH7.2)
NaOH(2M)
Tris-HCl(1M,pH8.0)
醋酸钠(3M,pH5.2)
TE溶液(10mM Tris-Hcl,1Mm EDTA,pH8.0)
LB培养基:(固体培养基加琼脂0.15g/L)
蛋白胨 0.1g/L
酵母提取物 0.05g/L
NaCl 0.05g/L
2实验方法
2.1大肠杆菌DH5α感受态细胞的制作
用CaCl2法制备大肠杆菌(E.coli)DH5α感受态细胞,具体方法见精编分子生物学实验指南。
2.2PCR引物的设计与合成
根据枣树水通道蛋白基因cDNA编码的序列,设计带有BamH I和Sam I酶切位点的特异性引物,并委托上海生工生物工程技术服务有限公司合成,用于ZjPIP2基因及组蛋白基因的克隆。
ZjPIP2基因的上游引物WP3序列为:5′-ATGGATCCATGGCAAAAGACCCTG-3′,包含BamH I限制性酶切位点(即有下划线部分),两个保护碱基AT,及水通道蛋白ZjPIP2基因的起始密码子ATG。
下游引物WP6的序列为:5′-ATACCCGGGTCAAACATGAGGGTT-3′,包含Sam I限制性酶切位点(即有下划线部分),三个保护碱基ATA,及水通道蛋白ZjPIP2基因的终止密码子TGA。
2.3质粒pBI121和pSPORT1-ZjPIP2的少量制备及目的基因ZjPIP2的扩增
2.3.1载体pBI121、pSPORT1-ZjPIP2的少量制备
pSPORT1-ZjPIP2质粒的DH5α菌液用2mL的LB液体培养基加1μl氨苄青霉素(100mg/mL)接菌后37℃过夜培养所得。含pBI121质粒的DH5α菌液则用2mL的LB液体培养基加1μL卡那青霉素(100mg/mL)接菌后37℃过夜培养所得。
碱裂解法快速提取质粒pBI121、pSPORT1-ZjPIP2的具体步骤见精编分子生物学实验指南。
最后将干燥的质粒溶于20μl TE中,-20℃保存备用。
2.3.2目的基因序列的扩增
以克隆载体pSPORT1(携带目的片段)为模板,用设计的特异性引物进行PCR扩增以获得含完整开放阅读框的枣水通道蛋白基因。先利用梯度PCR技术设置不同的退火温度,找出最佳退火温度为54℃。
PCR扩增ZjPIP2基因的反应体系:10×PCRbuffer 5μl(含Mg离子),dNTP 1μl,上下游引物各1μl(20pmol/L),rTaq聚合酶0.3μl,模板DNA 1μl(2.3μg/μl),灭菌超纯水加40.7μl至总体积为50μl。扩增条件为:95℃预变性5min,94℃变性1min,54℃退火1min,72℃延伸2min,共40个循环,最后72℃延伸5min。
2.4目的基因ZjPIP2和载体pBI121的准备
因为PCR扩增获得的目的基因片段两端及pBI121载体的多克隆位点都具有BamH I和Sma I限制性酶切位点,利用BamH I和Sma I分别双酶切目的基因ZjPIP2的PCR产物及载体pBI121,使它们都具有相同的粘性末端,为连接载体做准备。
PCR产物的酶切反应体系:
注:PCR产物的体积依据其浓度而定,最少酶切1~2μg目的基因片段。最后加超纯水至总体积为50μl。
载体pGEX-4T-1的酶切反应体系:
酶切后分别取5μl双酶切产物,1.0%琼脂糖凝胶电泳进行分析,确认片段大小都与预期相吻合。
2.5酶切产物的纯化及连接
按照琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒里的说明书进行操作,纯化双酶切后的目的基因片段和载体。
用T4DNA连接酶将纯化后的pBI121载体与ZjPIP2基因片段进行连接。将载体pBI121的DNA与欲插入的目的基因ZjPIP2的DNA片段混合制备成体积为5μL左右的DNA溶液(载体DNA和插入DNA的摩尔数比一般为:0.03pmol:0.1~0.3pmol),向上述DNA溶液中加入等体积的DNA Ligation Kit中的Solution I,充分混匀。连接反应体系总体积为10μl左右,16℃反应过夜。采用设计构建植物表达载体pBI121-ZjPIP2。
2.6连接产物的转化
将100μl的新鲜或保存于-70℃的大肠杆菌感受态细胞DH5α加入到上面的连接产物中,轻轻混匀,冰上放置30min。放入预加温到42℃的循环水浴中热休克90s,快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却3~5min。加400μL的LB培养基,将管转移到37℃的摇床上,温浴40min使细菌复苏,复苏期应温和的摇动细胞(转速低于225转/min)。将适当体积的已转化感受态细胞转移到LB平板(含氨苄青霉素),涂匀。将平板置于室温直至液体被吸收,倒置平板,37℃静置培养过夜。
2.7转化产物的鉴定
2.7.1PCR鉴定
待转化菌在含有卡那霉素抗性的LB平板上长出菌落后,用无菌牙签挑取转化单菌落至50μL超纯水中,沸水浴5min使菌裂解。取1μl作为模板进行PCR阳性鉴定,反应体系为:10×PCR buffer 1.5μl(含Mg离子),dNTP 0.2μl,上下游引物各0.5μl(20pmol/L),rTaq聚合酶0.1μl,模板DNA 1μl(2.3μg/μl),灭菌超纯水加11.2μl至总体积为15μl。扩增条件同前,将鉴定为阳性的转化体划线培养。
2.7.2酶切鉴定
将PCR鉴定为阳性的克隆子用碱裂减法提取质粒DNA后,质粒pBI121-ZjPIP2用XbaI和Sac I进行双酶切鉴定,再用Sma I和Sac I进行双酶切鉴定。
载体pBI121-ZjPIP2的Xba I和Sac I双酶切反应体系:
载体pBI121-ZjPIP2的Sma I和Sac I双酶切反应体系:
S.D.W 6μl
琼脂糖凝胶电泳酶切液,验证片段的大小,保存有目的片段的阳性菌落。并将阳性菌株送往上海生工生物工程技术服务有限公司测序,验证重组质粒读码框的正确性。
3、ZjPIP2基因植物表达载体构建的结果与分析
3.1ZjPIP2cDNA的扩增
利用设计的特异性上下游引物进行PCR扩增后,产物在1.0%琼脂糖中电泳,经EB染色后在紫外灯下观测到一条约850bp的条带,如图1所示,图中M:DL2000Marker;1、2:PCR产物,与所设计的扩增目的片段大小吻合。
3.2目的基因片段及载体片段的制备
将PCR产物和pBI121质粒用BamH I和Sma I双酶切,酶切产物经琼脂糖电泳,结果如图2所示,图中,M1:DL15000Marker;1:pBI121酶切产物;M2:DL2000Marker;2:目的基因酶切产物,PCR产物大小约为850bp,pBI121载体片段分别约为14.7Kb,与预期结果相符。分别用试剂盒纯化目的片段与载体片段,用于连接。
3.3重组质粒的鉴定
从含有卡那霉素的培养基上挑取阳性单菌落进行PCR鉴定,如图3所示,图中,M:DL2000Marker;1、2:阳性克隆,与预期结果相符;初步推断重组质粒构建成功,且重组质粒的大小约为15.6Kb。测序结果表明该转化菌的质粒中确实含有目的片段,且读码框正确,重组质粒构建成功。
3.4构建ZjPIP2基因植物表达载体小结
通过PCR技术克隆得到目的基因ZjPIP2的cDNA片段,经限制性内切酶BamH I和Sma I修饰并纯化后连接到植物表达载体pBI121中;用热激法将连接产物转入E.coli DH5α感受态细胞中;用含有卡那霉素的LB平板筛选转化子,最后经PCR鉴定、酶切鉴定及测序证明植物表达载体pBI121-ZjPIP2构建成功,如图4所示,为载体的构建图谱,为探讨ZjPIP2基因在植物体内的功能奠定了基础。
三、农杆菌介导ZjPIP2基因转化拟南芥
1、材料、试剂及仪器
1.1植物材料
野生型拟南芥种子来源于山西省农业科学院生物技术研究中心园艺作物研究室,培养基质购自山西省农科院园艺作物研究所。
1.2载体和菌株
根癌农杆菌LBA4404、植物表达载体PBI121均由山西省农业科学院生物技术研究中心园艺作物研究室保存。
1-3试剂
卡那霉素购自上海生工生物工程服务有限公司;YEB、1/2MS培养基中所用试剂均购自天津天大化工。
1.4培养基及试剂配方
1.4.1YEB培养基:
蛋白胨0.05g/L,酵母膏0.01g/L,蔗糖0.05g/L,硫酸镁0.005g/L。
注:固体培养基需加终浓度为1.0%的琼脂粉。
1.4.21/2MS培养基:
按配制MS培养基配制1/2MS培养基,大量元素、微量元素、有机元素、铁盐的量各减半,蔗糖30g/L,琼脂粉6g/L。
其他试剂配方与ZjPIP2基因植物表达载体的构建中所用到的试剂一样。
2实验方法
2.1拟南芥的培养
将拟南芥种子先在95%乙醇浸泡30~60s;再转入2.65%次氯酸钠灭菌5min,其间上下颠倒洗,5000rpm离心2min。灭菌水洗三次。然后将种子悬浮于0.1%的琼脂粉溶胶中。用枪头吸上悬浮液将种子点播于1/2MS固体培养基上,封口。4℃黑暗春化2d后,将拟南芥种子在22℃,16h/8h光周期条件下进行培养。当拟南芥长出2片真叶时,移栽到营养基质中继续培养。
2.2根癌农杆菌LBA4404感受态细胞的制作,为本领域公知技术。
2.3工程菌pBI121-ZjPIP2-L的构建及筛选
通过冻融法将构建成功的重组质粒载体转入农杆菌LBA4404,然后提取阳性克隆的质粒DNA,并通过PCR鉴定重组质粒载体是否转入农杆菌。
从28℃培养的转化有重组质粒pBI121-ZjPIP2的筛选平板上随机挑选生长良好的若干单菌落,各取二分之一菌落至50μl超纯水中,沸水浴5min使菌裂解,取1μl作为模板进行PCR鉴定,将鉴定出的阳性工程菌重新划线保存一份,备用。
2.4农杆菌介导转化拟南芥
2.4.1工程菌pBI121-ZjPIP2-L的培养
挑选鉴定的阳性克隆于10mLYEB液体培养基(含终浓度为50μg/mL的卡纳抗生素)过夜培养后。6000rpm离心5min收集菌体,用培养基悬浮菌体至OD600值为0.8左右,用于转化拟南芥植株。
2.4.2农杆菌侵染拟南芥
当拟南芥植株形成花蕾时,即可用于农杆菌转化。将含农杆菌的转化介质倒入烧杯,将拟南芥植株的花蕾部分浸入转化介质3~5S后,把浸染过的植株放到塑料盘中,用薄膜覆盖,暗处放置过夜。然后揭开薄膜,在正常条件下,继续培养转化后的拟南芥植株。当拟南芥的角果枯黄、欲开裂时,收获种子。
2.4.3转基因拟南芥的筛选
将消毒的转基因拟南芥植株的T0代种子播种于1/2MS筛选培养基(含终浓度为50μg/mL的卡那抗生素),4℃黑暗春化2d后在22℃,16h/8h光周期下培养。转化成功的拟南芥种子长出来的幼苗生长正常,未转化成功的幼苗叶子发黄,生长缓慢。生长正常的拟南芥长出2片真叶时,移栽到营养基质中继续培养。
3ZjPIP2基因转化拟南芥的结果与分析
3.1农杆菌的转化结果
将构建好的植物表达载体pBI121-ZjPIP2转人农杆菌LBA4404,在YEB固体培养基(含终浓度为50μg/mL的卡那霉素上筛选转化子,从筛选平板上随机挑选生长良好的若干单菌落,进行PCR检测,PCR扩增结果如图5所示,图中M:DL2000Marker:1、4、5、12、13:阳性克隆,产生一条大小约为850bp的特异条带,表明这些菌落为阳性转化子,重组植物表达载体已经成功转入农杆菌LBA4404。
3.2转基因拟南芥植株的获得
按上述方法侵染拟南芥后,将消毒的转基因拟南芥的T0代种子播种于1/2MS筛选培养基(含终浓度为50μg/mL的卡那霉素),4℃黑暗春化2d后在22℃,16h/8h光周期下培养。经观察,抗卡那霉素的拟南芥幼苗生长正常,且有真叶形成,而不抗卡那霉素的拟南芥幼苗比较小,叶子发黄,也没有真叶形成。
对转基因拟南芥植物及其T1代进行耐盐性评价及耐旱性性评价,选取对照、干旱处理、NaCl处理的转基因拟南芥植物及其T1代。每天下午给对照浇充足的水,NaCl处理的苗各浇0.1M NaCl溶液500ml,干旱处理的苗不浇任何液体。连续处理3天后,观察其生长表现,结果表明,经过两种胁迫处理的转基因拟南芥及其T1代均能够在正常生长条件下恢复,而对照则死亡。
3.3转ZjPIP2基因拟南芥小结
通过冻融法将构建好的植物表达载体pBI121-ZjPIP2转入农杆菌LBA4404感受态细胞中,经含卡纳霉素的YEB平板筛选、PCR鉴定成功构建工程菌pBI121-ZjPIP2-L;工程菌介导ZjPIP2基因侵染拟南芥,经含有卡纳霉素的1/2MS培养基筛选获得含有目的基因ZjPIP2的转基因拟南芥植株,并对转基因拟南芥植物进行耐盐性评价及耐旱性性评价,为研究ZjPIP2基因在植物体内的表达定位、功能及调控机制奠定了基础。
四、ZjPIP2在枣树体内的表达
1材料、试剂及仪器
1.1植物材料
壶瓶枣(Ziziphus jujuba Mill hupingzao)树苗由山西省农业科学院生物技术研究中心园艺作物研究室提供。
1.2试剂及仪器设备
NaCl购自天津天大化工;饱和酚、DEPC及RNA提取过程中所用到的试剂均购自上海生工生物工程有限公司。
1.3试剂配方
与ZjPIP2基因植物表达载体的构建中所用到的试剂一样。
2实验方法
2.1材料的准备及采集
将壶瓶枣树苗移栽到直径为50厘米的大花盆中。放置户外正常培养,对照、干旱处理、NaCl处理的枣苗各三盆。每天下午给对照枣苗浇充足的水,NaCl处理的枣苗各交0.1M NaCl溶液500ml,干旱处理的枣苗不浇任何液体。连续处理3天后,经过胁迫处理的早树苗开始出现卷叶症状。两周后,两种胁迫处理的枣苗卷叶、枯黄现象严重,然后进行取样。取每盆植株的根、茎、叶、结果枝茎段到50mL离心管中,液氮速冻后保存于-80℃冰箱,用于RNA的提取。
2.2植物RNA的抽提和质量检测
2.2.1植物材料RNA的提取
CTAB法提取植物材料的总RNA。
2.2.2RNA质量检测
采用甲醛变性胶电泳法来检验RNA是否降解,同时用分光光度计检测其纯度和浓度。
(1)测所抽提RNA的OD260值
取1μl RNA加到99μl RNA-free water中,用分光光度计(eppendorf BioPhotometer)检测RNA质量,如果OD260/OD280=2.0那么RNA的质量非常好,纯度高,无降解,可以用于反转录。
(2)甲醛变性胶电泳
RNA甲醛变性电泳液:
1×MOPS 500~600ml:用DEPC处理过的水稀释20×MOPS 20倍。
1%琼脂糖变性胶配制方法如下:
水(经DEPC处理) 44mL
甲醛 3.0mL
20×MOPS 3.0mL
琼脂糖 0.6g
加热溶解后再加水至总体积为60ml,使溶液冷却。
注:制胶时先将水、MOPS、琼脂糖融化,室温放置至冷却到60℃,再加入甲醛,混匀并置通风橱中15分钟后倒入制胶器中。
RNA变性Buffer配制方法如下:
RNA样品分别加3倍体积的RNA变性Buffer,混匀后在65℃水浴中温浴10min,置于冰水混合物上使之冷却;点样,电泳,EB染色40min,S.D.W洗三次,每次15min,紫外检测照相,能看到较分明的两条带,且前后两条带亮度比接近2∶1,则RNA可用。
2.3RNA的反转录及RT-PCR
2.3.1反转录RNA
按试剂盒PrimeScripTM RT reagent Kit说明将2.6.2.2所提的RNA进行反转录,反转录体系如下:
5×Prime ScriptTM Buffer 8μl
Prime ScriptTM Enzyme MixI 1μl
Oligo dT Primer 1μl
Random 6mers 1μl
Total RNA 2μg
S.D.W up to 40μl
反转录的反应程序为:37℃15min(反转录反应),85℃5sec(反转录酶的失活反应)。
2.3.2内参基因ZjH3引物的设计与合成
孙海峰等[66]研究表明枣树ZjH3基因可作为内参基因对ZjPIP2基因进行mRNA表达水平的检测。由序列号EU916201获得ZjH3基因序列,根据所得序列设计内参基因ZjH3的特异性引物,并委托上海生工生物工程技术服务有限公司合成,用于ZjH3基因的克隆分析。
内参基因ZjH3的上游引物序列为Z1:5’-ATGGATCCATGGCACGGACAAAGCA-3’,包含BamHI限制性酶切位点(即有下划线部分),两个保护碱基AT,及组蛋白基因的起始密码子ATG。
下游引物序列为Z2:5’-TATACCCGGGCTAAGCCCTCTCGCC-3’,包含Sam I限制性酶切位点(即有下划线部分),四个保护碱基TATA,及组蛋白基因的终止密码子CTA。
2.3.3RT-PCR分析
以反转录产物为模板,WP3、WP6;Z1,Z2为引物,PCR鉴定枣树水通道蛋白的表达位置及各种胁迫处理后的表达情况。反应体系为:10×PCR buffer 1.5μl(含Mg离子),dNTP0.2μl,上下游引物各0.5μl(20pmol/L),rTaq聚合酶0.1μl,模板cDNA 1μl(2.3μg/μl),灭菌超纯水加11.2μl至总体积为15μl。扩增条件同2.2.3.2,WP3、WP6的退火温度为54℃,Z1,Z2的退火温度为56℃。
3干旱、NaCI胁迫下ZjPIP2的表达分析结果
3.1RNA的质量检测结果
3.1.1测定所提RNA的OD260值
将所提RNA按1∶99与S.D.W配好后,分光光度计测得的RNA浓度见表1:
表1枣苗处理后分子数据
材料 总RNA 浓260/280 260/230 反转录 反转录产
度 用量 物浓度
(ug/ml) (ul) (ug/ml)
对照 根 1170.1 1.85 2.63 1 1116.5
茎 316.9 1.83 2.48 4 1343.8
叶 1637.3 1.82 2.69 1 1484.5
结 1082.5 1.79 2.66 1 1169.3
干旱胁迫根 31.9 1.99 1.77 20 1595.8
茎 2393.3 2.06 2.49 1 1796.1
叶 1977.6 2.04 2.53 1 1621.5
结 2840.4 2.04 2.55 1 1516.8
NaCl胁迫根 172.2 1.95 2.16 20 1078.2
茎 30.3 3.79 1.68 20 1433.4
叶 11894 1.99 2.26 0.5 1459.7
结 3863.6 2.00 2.52 1 1427.7
3.1.2甲醛变性胶电泳
将所提RNA样品处理后,进行甲醛变性胶电泳,凝胶成像分析仪下观察所提RNA质量,如果看到较分明的两条带,且前后两条带亮度比接近2∶1,表明所提RNA纯度高、无降解、可用于反转录。
3.2ZjPIP2在不同胁迫下的RT-PCR分析结果
按上述方法反转录所提RNA,反转录产物浓度见表1;然后再分别以Z1、Z2,WP3、WP6为引物对反转录产物进行RT-PCR分析,琼脂糖凝胶电泳RT-PCR产物,结果如图6(a)、图6(b)所示,如图7所示:
图6(a)中,M:DL2000Marker;1:质粒对照;.2-5:干旱处理植株的根、茎、叶、结果枝茎段;图6(b)中,2-5:对照植株的根、茎、叶、结果枝茎段;6-9:NaCl处理植株的根、茎、叶、结果枝茎段,表明ZjH3基因在对照和处理所有植株的不同组织均有表达,进一步表明所提RNA可用。图7中,M:DL2000Marker;1:质粒对照;2-5:对照植株的根、茎、叶、结果枝茎段6-9:干旱处理植株的根、茎、叶、结果枝茎段;10-13:NaCl处理植株的根、茎、叶、结果枝茎段.显示枣水通道蛋白在对照植株的茎和叶片中有表达,叶片中的表达量相对少一点儿;在干旱处理过的植株的茎、叶、结果枝茎段中均有表达,结果枝茎段经干旱胁迫表达了目的基因,叶中的表达量现相对对照有所增加;在NaCl处理过的植株中,茎、叶、结果枝茎段均有表达,而且茎、叶中的表达量比对照增加显著。实验结果表明ZjPIP2蛋白在茎、叶中的表达比较稳定,证实逆境因素可诱导目的基因在结果枝中的表达。
3.3ZjPIP2表达研究小结
分别对盆栽壶瓶枣树苗进行干旱、NaCl胁迫处理,并以未作任何处理的正常壶瓶枣树苗为对照,研究逆境因素对ZjPIP2基因表达的影响,当处理过的树苗出现严重卷叶、枯黄现象时,立即采样并速冻保存于-80℃冰箱。用CTAB法提取所采集到的对照及胁迫处理过的植物材料的总RNA,经OD260值的测定、甲醛变性胶电泳等方法检测证明所提RNA纯度高、无降解,质量合格。反转录所提RNA,RT-PCR分析得ZjPIP2基因在植物茎、叶中的表达比较稳定,并推测ZjPIP2可受干旱、NaCl胁迫等逆境因素诱导表达。
Claims (3)
1.一种枣树水通道蛋白基因,其特征是该基因的核苷酸序列具有如SEQ ID NO:1所示的序列。
2.由权利要求1所述一种枣树水通道蛋白基因的核苷酸序列编码的氨基酸序列,其特征是该氨基酸序列具有如SEQ ID NO:2所示的序列。
3.一种枣树水通道蛋白基因在提高植物耐旱性和耐盐性中的应用。
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