发明详述
i.)一般概述
本发明提供有效对抗疟疾的新的抑制剂,特别是对抗恶性疟原虫(P.falciparum)的二氢叶酸还原酶(DHFR)突变所产生的抗叶酸剂耐药性疟疾。已知的恶性疟原虫(P.falciparum)抗叶酸剂耐药性株在以下位置上具有突变:108(丝氨酸到天冬酰胺),51(天冬酰胺到异亮氨酸),59(半胱氨酸到精氨酸)和/或164(异亮氨酸到亮氨酸)。恶性疟原虫(P.falciparum)的另一个抗叶酸剂耐药株在位置16(丙氨酸到缬氨酸)和108(丝氨酸到苏氨酸)处带有突变。有可能它们不仅作用于二氢叶酸还原酶,而且作用于导致有效的寄生虫杀死的疟原虫或宿主响应中的其它靶。本发明的抗疟用化合物对哺乳动物宿主具有相对低的毒性,并且在药物组合物中给药时是有效的。本发明的一个主要优点在于,所述新化合物表现出很少或者没有抗菌活性,并因此极不可能引起细菌的耐药株。
ii.)定义
术语“抗叶酸剂”、“叶酸拮抗剂”和“DHFR抑制剂”用于本发明的目的是在本文中可互换使用,所述术语指可用于治疗或预防疟疾的化合物。这些化合物是恶性疟原虫(P.falciparum)的突变型和野生型二氢叶酸还原酶(DHFR)的有效抑制剂。
术语“恶性疟原虫”和“恶性疟原虫(P.falciparum)”在本文中可互换使用,是指被传播到人和动物宿主引起宿主表现出一种或多种疟疾症状的寄生虫。更具体地,恶性疟原虫(p.falciparum)是引起疟疾的原生动物。
本文中使用的术语“酰基”是指式R″C(=O)-的基团,其中R″为例如H,C1-6烷基,芳基,C1-6烷氧基,OH,NH2,NHR′,或N(R′)2,其中R′为C1-6烷基或芳基。
如本文中使用的,术语“烷基”、“烯基”和“炔基”包括直链、支链和环状的单价烃基原子团、这些原子团的组合,其在未被取代时仅包含C和H。实例包括甲基,乙基,异丁基,环己基,环戊基乙基,2-丙烯基,3-丁炔基等。每个这种基团中的碳原子总数有时如本文中所述的,例如在基团可以包含最多十个碳原子时,其可以表示为1-10C或表示为C1-C10或C1-10。在允许杂原子(典型地为N,O和S)代替碳原子时,如在杂烷基中,例如,描述基团的数目,尽管仍写作为例如C1-C6,但是其表示该基团中的碳原子数加上被包括在内的代替所述环中或链中碳原子的这种杂原子的数目的和。
典型地,本发明的烷基,烯基和炔基取代基包含1-10C(烷基)或2-10C(烯基或炔基)。优选它们包含1-8C(烷基)或2-8C(烯基或炔基)。有时包含1-4C(烷基)或2-4C(烯基或炔基)。单个基团可以包括一种以上类型的多重键,或一个以上的多重键;在这种基团包含至少一个碳-碳双键时,它们被包括在术语“烯基”的定义内;在包含至少一个碳-碳三键时,它们被包括在术语“炔基”内。
烷基、烯基和炔基基团经常被取代,取代程度使得这种取代在化学上有意义。典型的取代基包括但不限于卤素,=O,=N-CN,=N-OR,=NR,OR,NR2,SR,SO2R,SO2NR2,NRSO2R,NRCONR2,NRCOOR,NRCOR,CN,COOR,CONR2,OOCR,COR,和NO2,其中每个R独立地为H,C1-C8烷基,C2-C8杂烷基,C1-C8酰基,C2-C8杂酰基,C2-C8烯基,C2-C8杂烯基,C2-C8炔基,C2-C8杂炔基,C6-C10芳基,或C5-C10杂芳基,且每个R为任选被卤素,=O,=N-CN,=N-OR′,=NR′,OR′,NR′2,SR′,SO2R′,SO2NR′2,NR′SO2R′,NR′CONR′2,NR′COOR′,NR′COR′,CN,COOR′,CONR′2,OOCR′,COR′,和NO2取代,其中每个R′独立地为H,C1-C8烷基,C2-C8杂烷基,C1-C8酰基,C2-C8杂酰基,C6-C10芳基或C5-C10杂芳基。烷基,烯基和炔基基团还可以被C1-C8酰基,C2-C8杂酰基,C6-C10芳基或C5-C10杂芳基取代,所述每个取代基可以被适合于特定基团的取代基所取代。
尽管如本文中使用的“烷基”包括环烷基和环烷基烷基基团,但是本文中可以使用术语“环烷基”来描述通过环碳原子连接的碳环非芳香族基团,“环烷基烷基”可用来描述通过烷基连接基与分子连接的碳环非芳香族基团。类似地“杂环基”可用来描述包含至少一个杂原子作为环成员并通过环原子(所述环原子可以是C或N)与分子连接的非芳香族环状基团;“杂环基烷基”可用来描述通过连接基与另一个分子连接的这种基团。适合于环烷基、环烷基烷基、杂环基、和杂环基烷基的大小和取代基与上述适用于烷基基团的那些相同。如本文中使用的,这些术语还包括包含一个或两个双键的环,只要所述环不是芳香族的。
“芳香族”部分或“芳基”部分是指具有公知的芳香性特征的单环或稠环的双环部分,实例包括苯基和萘基。类似地,“杂芳香族”和“杂芳基”是指包含一个或多个选自O、S和N的杂原子作为环成员的这种单环或稠合双环系统。包含杂原子允许在5元环以及6元环中的芳香性。典型的杂芳香族系统包括单环的C5-C6芳香族基团,诸如吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、噻吩基、呋喃基、吡咯基、吡唑基、噻唑基、噁唑基、和咪唑基,和为了形成C8-C10双环基团通过这些单环基团之一与苯基环或与任何杂芳香族单环基团稠合所形成的稠合双环部分,诸如吲哚基、苯并咪唑基、吲唑基、苯并三唑基、异喹啉基、喹啉基、苯并噻唑基、苯并呋喃基、吡唑并吡啶基、喹唑啉基、喹喔啉基、1,2-二氮杂萘基等。在整个环系统中在电子分布方面具有芳香性特征的任何单环或稠环双环系统都被包括在此定义中。还包括其中至少直接连接于分子的其余部分的环具有芳香性特征的双环基团。典型地,所述环系统包含5-12个环成员原子。优选地,单环杂芳基包含5-6个环成员,并且双环杂芳基包含8-10个环成员。
芳基和杂芳基部分可以被多种取代基取代,取代基包括C1-C8烷基,C2-C8烯基,C2-C8炔基,C5-C12芳基,C1-C8酰基、和这些的含杂原子形式,其每个可以自身被进一步取代;芳基和杂芳基部分的其它取代基包括卤素,OR,NR2,SR,SO2R,SO2NR2,NRSO2R,NRCONR2,NRCOOR,NRCOR,CN,COOR,CONR2,OOCR,COR,和NO2,其中每个R独立地为H,C1-C8烷基,C2-C8杂烷基,C2-C8烯基,C2-C8杂烯基,C2-C8炔基,C2-C8杂炔基,C6-C10芳基,C5-C10杂芳基,C7-C12芳基烷基,或C6-C12杂芳基烷基,且每个R如上对于烷基基团所述那样任选被取代。芳基或杂芳基基团上的取代基团当然可以进一步被本文中所述的基团取代,如适合于这种取代基的每个类型或适合于取代基的每个组分那样。因此,例如,芳基烷基取代基可以在芳基部分上被本文中所述的如对于芳基基团典型的取代基取代,并且可以另外在烷基部分上被本文中所述的典型的或适合于烷基基团的取代基取代。
如本文中使用的“任选被取代的”表示所述的特定的基团或所描述的基团可以没有非氢取代基,或者所述一个或多个基团可以具有一个或多个非氢取代基。除非另有说明,可以存在的这种取代基的总数等于所述基团的未被取代形式上存在的H原子数。在可选的取代基通过双键连接时,诸如羰基氧(=O),所述基团占据了两个可用化合价,因此可以包括的取代基的总数对应于可用化合价数目减少。
术语“株(系)”是指特定的生物体的特定的遗传变体。在化疗中,根据微生物对特定的药物或治疗的敏感性,可以将它们描述为耐药株或非耐药株。经常,耐药株具有一个或多个遗传突变。非耐药株是通常完全响应于特定的药物或治疗的菌株。这种菌株可以具有或可以没有遗传突变。耐药株是对相同的药物或治疗表现出比非耐药株更少响应的菌株。
术语“非耐药型”和“野生型”在本文中可互换使用,是指通常对特定的药物或治疗完全响应的寄生虫株。
iii.)抗疟用化合物
在一个方面中,本发明提供有效对抗野生型疟疾和抗药型疟疾的一系列新的抗疟用化合物,包括由恶性疟原虫(P.falciparum)引起的抗叶酸剂耐药性疟疾。这些化合物属于二氢叶酸还原酶抑制剂类。所述新化合物基于以下所示的式I:
式(I)的化合物中的R为H或C1-C4烷基,并且在一些实施方案中为C1-4烷基。在某些实施方案中,R为乙基或甲基;有时优选为乙基。
W有时为O且有时为CH2。在一些优选实施方案中,W为O。
Y通常为CH2,O,S或NZ。
X为二到四个碳的亚烷基链,(CH2)2-4,其可以被羟基基团取代。
Ar有时优选为杂环基芳香族基团,诸如喹啉基、异喹啉基、喹唑啉基、或喹喔啉基。在一些优选实施方案中,Ar为喹啉基,在特定的实施方案中,Ar为4-喹啉基。
在Ar为芳香环而不是杂芳香族基团时,其必须被至少一个基团取代,而在一些实施方案中,它被选自以下的至少一个基团取代:酰基,苯并噁唑基,硝基,羧基,羧基烷基C(1-3),羧基烷基C(1-3)氧基,烷基C(1-3)氧基羰基烷基C(1-3),烷基C(1-3)氧基羰基烷基C(1-3)氧基,四唑基,四唑基烷基C(1-3)和四唑基烷基C(1-3)氧基;且Ar为任选被另外的取代基取代或其药学可接受的盐。在一些实施方案中,Ar被选自以下的至少一个基团取代:CO2R′,(CH2)1-3COOR′,O(CH2)1-3COOR′,四唑基,(CH2)1-3-四唑基,和O(CH2)1-3-四唑基,其中R′为H或C1-4烷基。在另一个实施方案中,Ar可以进一步在一个或多个可用位置被可选的取代基取代,所述取代基选自烷基,被取代的烷基,环烷基,被取代的环烷基,三氟甲基,芳基,被取代的芳基,卤素,氨基,被取代的氨基,烷氧基,芳基氧基,羟基,硝基等。用于Ar的优选的可选取代基包括卤素,CF3,甲氧基,和甲基,且Ar典型地包含0-2个、优选0或1个这种可选取代基。
在Ar为杂芳香环时,其可以在一个或多个可用位置被烷基,被取代的烷基,环烷基,被取代的环烷基,三氟甲基,芳基,被取代的芳基,卤素,氨基,被取代的氨基,烷氧基,芳基氧基,羟基,硝基等取代。在Ar为杂芳香环时,优选的取代基包括卤素,CF3,甲氧基,和甲基,且在一些实施方案中,Ar表示的杂芳香族基团是未被取代的。
本发明的抗疟用化合物包括它们的互变异构体和药学可接受的盐。本发明还包括包含与至少一种药学可接受的赋形剂混合的至少一种式(I)的化合物的药物组合物。在优选实施方案中,所述赋形剂不是水。在式(I)的化合物中存在有手性中心时,本发明包括该化合物的每种单独的对映异构体或非对映体以及对映异构体或非对映体的混合物,包括外消旋混合物。
本发明还包括在体内容易地转化为式(I)的化合物的前体药物。这些前体药物的实例包括被取代的衍生物,其中胺氮被酰基基团(典型地为可以被取代的C1-C6酰基基团)取代,以及其中羧基基团被酯化为C1-C6烷氧基羰基基团的化合物。被N酰基取代的前体药物经常是优选的,因为它们容易地被内源性酰胺酶和酯酶脱酰基化,所述N酰基为C1-C4酰基基团或者衍生自氨基酸(诸如甘氨酸、丙氨酸、丝氨酸、谷氨酰胺、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、谷氨酸盐、天冬氨酸等)或这些氨基酸的二肽或三肽的酰基基团。
另外包括制备上述化合物的合成方法。在某些实施方案中,制备5-烷氧基-6-取代的-2,4-二氨基嘧啶的合成方法涉及在碱的存在下用卤代烷或烷基甲磺酸酯对5-羟基-6-取代的-2,4-二氨基嘧啶进行O-烷基化。
在另一个方面,本发明提供使用所述化合物治疗疟疾的方法,所述疟疾包括疟疾的非耐药株和耐药株。在优选实施方案中,所公开的化合物是针对野生型和耐药性恶性疟原虫二氢叶酸还原酶(pf DHFR)的有效的抑制剂。另外考虑了所公开的化合物或其药物组合物或盐用于治疗衍生自恶性疟原虫带有的野生型或突变型二氢叶酸还原酶(pfDHFR)的耐药性疟疾的用途,诸如本文中所述的在DHFR蛋白质序列中具有至少一个突变的突变株,或本文中所述的包含至少一个点突变的其它株,且更优选本文中所述的包含至少两个突变的突变株。
iv.)抗疟用化合物的合成
其中Ar为杂芳香族基团的化合物的柔性侧链部分优选通过Ar或ArOH与烷化剂的烷基化反应来构建,如以下方案1中举例说明的。
产生可用于合成式(I)的化合物的烷基化化合物的适合的烷化剂是公知的。例如,可以在上述举例说明的反应中使用1,3-二溴丙烷或1-溴-3-氯丙烷来生产式Ar-(CH2)3-Br或Ar-O-(CH2)3-Br的化合物。这些中间体可容易地用于将2,4-二氨基嘧啶上的5-羟基基团烷基化,以得到式(I)的化合物。适合的离去基团(LG)包括但不限于化学试剂诸如氯化物、溴化物、碘化物、甲磺酸酯、苯磺酸酯、甲苯磺酸酯和三氟甲磺酸酯。这类反应的变化对于本领域技术人员来说是显而易见的。适合的亲核试剂包括但不限于酚类、其它芳基和杂芳基醇、芳基和杂芳基硫醇、苯硫酚、芳基和杂芳基胺、和容易地在环原子上进行烷基化的杂芳香族化合物诸如吲哚、三唑、咪唑、和它们的被取代的衍生物和共轭碱。
在更难以实现选择性的单烷基化时,还有可能从ω-卤化的醇诸如2-溴乙醇、3-溴丙醇或3-氯丙醇开始,来代替双亲电子试剂。在那种情况下,中间体醇中的OH基团应该被转化为更具反应性的离去基团,条件是其与分子的其它部分的结构相容。例如,溴化可以通过PBr3,aq HBr,Ph3PBr2,CBr4/Ph3P,NBS/Ph3P来进行,而甲磺酸酯化可以通过MsCl/Et3N来进行。作为选择,卤代醇和亲核试剂(ArYH)之间的Mitsunobu反应(DEAD/Ph3P或DIAD/Ph3P)允许直接合成所需的具有与Ar连接的反应性侧链的中间体。
在合成了包含反应性侧链的Ar之后,进一步在碱的存在下用5-羟基-6-取代的-2,4-二氨基嘧啶使Ar-(CH2)1-4-LG物质烷基化,得到本发明的化合物。5-羟基-6-取代的-2,4-二氨基嘧啶容易地得自商业来源。所述碱可以选自LiH,LiOH,KOH,NaH和K2C03,其中最优选的碱为LiOH。所述碱可以以相对于羟基嘧啶为1-10当量添加。反应优选在惰性溶剂中进行,其中优选的溶剂是N,N-二甲基甲酰胺。反应可以在约25-80℃进行,优选在25-30℃进行。关于反应的更详细说明,参见被全文并入本文作为参考的以下专利和出版物(即,美国专利4,179,562和4,374,136;GB 2086386)。制备这种一般结构的化合物的其它方法是本领域中公知的,并且容易地由熟练的专业人员改造适用于这些化合物的制备。
最终产物可以通过常规方法分离和纯化,诸如蒸发、提取、结晶化和/或柱色谱法。可以通过将式(I)的化合物与适当的与期望的盐相对应的酸混合容易地制备的盐酸盐和其它药学可接受的盐,如本领域中公知的。通常是将酸添加到式(I)的化合物在包含水、甲醇和/或乙醇的溶剂中的溶液或悬浮液中,随后进行蒸发以除去任何不希望的溶剂。二氨基嘧啶经常被转化为二盐,诸如二盐酸盐。
v.)抗疟用化合物的药物组合物和制剂
抗疟用化合物或抗叶酸剂可以配制为在本发明方法中使用的药物。可以刺激与抗疟化合物对耐药性和非耐药性疟疾中的恶性疟原虫(P.falciparum)野生型和突变型(例如,单突变型、多重突变型)二氢叶酸还原酶(DHFR)的结合有关的生物响应的组合物或化合物可以在本发明中用作药物。关于制剂和给药技术的这种一般详述的实例在科学文献中有充分描述(参见Remington′s Pharmaceutical Sciences,Maack Publishing Co.,Easton Pa.)。抗叶酸剂药物制剂可以根据本领域中已知用于生产药物的任何方法来制备。用于本发明方法的抗叶酸剂可以配制为用于以任何通常可接受的方式给药,包括通过口服给药和通过非肠道途径。对于非重症的疟疾的治疗优选口服给药,对于重症的(严重的)疟疾的治疗优选非肠道给药。说明的例子如以下所述。
表1:三嗪类相对于嘧啶类的抗疟活性和口服生物利用度。
上述表1示出了常规的二氢三嗪类相对于常规的嘧啶类的抗疟活性和口服生物利用度。尽管WR99210在对感染P.chabaudi AS的小鼠皮下给药后在体外和体内对于非耐药性和乙胺嘧啶耐药性恶性疟原虫(P.falciparum)寄生虫株是有活性的,但是如果将该化合物通过口服途径给药,则其效力显著降低(即,高的ED90数值)。这种降低被发现是由于与环氯胍和乙胺嘧啶相比WR99210具有差的口服生物利用度。
表2:与甲氧苄啶和乙胺嘧啶相比较的新的2,4-二氨基嘧啶衍生物化合物的抗菌活性
比较起来,上述表2示出了本发明的新的2,4-二氨基嘧啶衍生物化合物的抗菌活性。这些所选择的化合物对于金黄色葡萄球菌和大肠杆菌是无活性的,需要非常高的微摩尔浓度来完全抑制琼脂板上的细菌生长,而其它2,4-二氨基嘧啶衍生物诸如甲氧苄啶是临床上有效的抗生素类。
用于口服给药的药物制剂和制备物可以以适合于口服给药的剂量使用本领域中公知的药学可接受的载体来制备。这种载体使得药物制剂可被配制为适合于由患者摄取的单位剂型,如片剂、丸剂、粉剂、胶囊、液体、锭剂、凝胶剂、糖浆、浆液、悬浮液等。用于口服应用的药物制备物可以如下生产:将抗叶酸剂化合物与固体赋形剂合并,任选地研磨得到的混合物,并在需要的情况下加入其它适合的另外的化合物,之后加工颗粒混合物,用于获得片剂或丸剂。适合的固体赋形剂是碳水化合物或蛋白质填料,包括但不限于糖,包括乳糖、蔗糖、甘露醇、或山梨醇,得自玉米、小麦、稻、马铃薯、或其它植物的淀粉,诸如甲基纤维素、羟丙基甲基纤维素、或羧甲纤维素钠的纤维素,和包括阿拉伯胶和黄蓍胶的树胶,以及诸如明胶和胶原蛋白的蛋白质。如果需要,可以添加崩解剂或增溶剂,诸如交联的聚乙烯基吡咯烷酮、琼脂、海藻酸、或其盐,诸如海藻酸钠。
也可以经口使用的本发明的药物制剂是例如由明胶制成的推入配合式胶囊,以及由明胶和诸如甘油或山梨醇的涂覆层制成的软的密封胶囊。推入配合式胶囊可以包含与填料或粘合剂、润滑剂、和任选的稳定剂混合的抗叶酸剂,所述粘合剂诸如乳糖或淀粉,所述润滑剂诸如滑石或硬脂酸镁。在软胶囊中,可以在有或没有稳定剂的情况下将抗叶酸剂化合物溶解或悬浮在适合的液体中,例如脂肪油、液状石蜡、或液体聚乙二醇。
本发明的含水悬浮液包含与适合于生产含水悬浮液的赋形剂相混合的抗叶酸剂。这种赋形剂包括助悬剂,例如羧甲基纤维素钠、甲基纤维素、羟丙基甲基纤维素、海藻酸钠、聚乙烯基吡咯烷酮、黄蓍胶和阿拉伯胶;和分散剂或润湿剂,诸如天然存在的磷脂(例如,卵磷脂)、氧化烯与脂肪酸的缩合产物(例如,聚氧乙烯硬脂酸酯)、氧化乙烯与长链脂族醇的缩合产物(例如,十七氧化乙烯十六烷醇)、氧化乙烯与衍生自脂肪酸和己糖醇的偏酯的缩合产物(例如,聚氧乙烯单油酸山梨醇酯)、或氧化乙烯与衍生自脂肪酸和己糖醇酐的偏酯的缩合产物(例如,聚氧乙烯单油酸山梨醇酐酯)。含水悬浮液还可以包含一种或多种防腐剂(诸如对羟基苯甲酸乙酯或正丙酯)、一种或多种着色剂、一种或多种调味剂和一种或多种甜味剂(诸如,蔗糖、阿司帕坦或糖精)。可以调节制剂的渗透性。
可以通过将抗叶酸剂悬浮在植物油(例如,花生油、橄榄油、芝麻油或椰子油)或矿物油(例如,液状石蜡)中来配制油悬浮液。所述油悬浮液可以包含增稠剂,例如蜂蜡、硬石蜡或鲸蜡醇。可以添加甜味剂以提供适口的口服制备物。这些制剂可以通过加入抗氧化剂例如抗坏血酸来保存。
适合于通过加入水来制备含水悬浮液的本发明的可分散性粉末和颗粒可以从与分散剂、助悬剂和/或润湿剂、和一种或多种防腐剂相混合的抗叶酸剂来配制。适合的分散剂或润湿剂和助悬剂由本文中公开的那些来举例说明。还可以存在有另外的赋形剂,例如甜味剂、调味剂和着色剂。
本发明的药物制剂还可以为水包油型乳剂的形式。油相可以是植物油(诸如,橄榄油或花生油)、矿物油(诸如,液状石蜡)、或这些油的混合物。适合的乳化剂包括天然存在的树胶,例如阿拉伯胶和黄蓍胶;天然存在的磷脂,例如大豆卵磷脂,衍生自脂肪酸和己糖醇酐的酯或偏酯,诸如单油酸山梨醇酐酯;以及这些偏酯与氧化乙烯的缩合产物,诸如聚氧乙烯单油酸山梨醇酐酯。乳液还可以包含甜味剂和调味剂。糖浆和酏剂还可以使用甜味剂来配制,例如甘油、山梨醇或蔗糖。这种制剂还可以包含缓和剂、防腐剂、调味剂或着色剂。
在药物通过注射经静脉内或其它非肠道途径递送时,本发明的抗叶酸剂药物制剂可为灭菌的可注射制备物的形式,诸如灭菌的可注射水溶液。所述灭菌的可注射制备物还可以是在无毒的非肠道可接受的稀释剂或溶剂中的灭菌的可注射溶液。另外,通常可以将无菌的不挥发油类用作溶剂或悬浮介质。为此,可以使用任何温和的不挥发油,包括合成的甘油单酯或甘油二酯。另外,同样可以将诸如油酸的脂肪酸用于可注射制备物中。
vi.)实施例
提供以下实施例用于说明本发明而非用于限制它的范围。本发明的其它变体对于本领域技术人员来说是显而易见的,并且被包括在权利要求范围内。本文中引用的所有出版物、专利、和专利申请都被全文并入本文作为参考。
实施例1:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(P113)(参见图1)。
以下提供用于制备2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶二盐酸盐的代表性方法:
a)3-(喹啉-4-基氧基)丙烷-1-醇:
将喹啉-4-醇(1.35g,9.30mmol),无水碳酸钾(3.73g,26mmol)和碘化钾((4.23g)在无水DMF(8mL)中的悬浮液在25℃搅拌30分钟。添加3-氯丙醇(2.93g,31mmol)并搅拌反应直到起始原料耗尽。反应用二氯甲烷稀释并用水提取。在蒸发二氯甲烷层之后得到产物,为浅黄色固体(0.5298g,28%),其不经进一步纯化用于下一步。1H NMR(400MHz,CDCl3):2.09(2H,m),3.93(2H,t,J=5.6Hz),4.10(2H,t,J=5.6Hz),4.51(1H,s),6.25(1H,d,J=5.5Hz),7.32(1H,t,J=7.4Hz),7.56(1H,t,J=8.2Hz),7.90(1H,d,J=8.4Hz),7.93(1H,d,J=8.4Hz),8.36(1H,d,J=5.3Hz)。
b)3-(喹啉-4-基氧基)丙基甲磺酸酯:
将在步骤a)中得到的3-(喹啉-4-基氧基)丙烷-1-醇(0.5298g,2.6mmol)的溶液用含三乙胺(0.60mL)和甲烷磺酰氯(0.55g,4.8mmol)的二氯甲烷(5mL)处理。在起始原料耗尽之后,反应用二氯甲烷稀释,用水、NaHCO3水溶液洗涤并蒸发。残余物通过SiO2上的柱色谱法纯化并用乙酸乙酯洗脱。得到产物,为浅黄色固体(0.3868g,53%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):2.43(2H,m),3.00(3H,s),4.38(2H,t,J=5.8Hz),4.55(2H,t,J=5.8Hz),6.80(1H,d,J=5.5Hz),7.55(1H,t,J=8.0Hz),7.75(1H,ddd,J=1.2,7.0,8.2Hz),8.20(1H,d,J=8.4Hz),8.13(1H,d,J=8.4Hz),8.77(1H,d,J=5.3Hz)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(0.3963g,2.6mmol)添加到搅拌的氢氧化锂一水合物(497.2mg,11.8mmol)的DMF(2mL)溶液中并将反应混合物搅拌1小时。缓慢加入3-(喹啉-4-基氧基)-丙基甲磺酸酯(0.3868g,1.37mmol)的DMF(1mL)溶液并且反应混合物于25℃搅拌过夜。反应用二氯甲烷稀释并用水提取。蒸发二氯甲烷层,随后使残余物从甲醇水溶液结晶。得到产物,为浅黄色固体(0.4677g,53%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.87(3H,t,J=7.0Hz),2.24(2H,q,J=7.0Hz),2.30(2H,m),3.85(2H,t,J=5.5Hz),4.43(2H,t,J=5.5Hz),5.53(2H,s),6.11(2H,s),7.06(1H,d,J=5.2Hz),7.54(1H,t,J=8.0Hz),7.72(1H,ddd,J=1.4,6.9,8.3Hz),7.93(1H,d,J=8.3Hz),8.15(1H,d,J=8.5Hz),8.72(1H,d,J=5.2Hz)。
d)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶二盐酸盐:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(0.1740g,0.51mmol)悬浮在甲醇(1mL)中并加入2当量的浓盐酸。在蒸发并将残余物与乙腈一起研磨之后得到标题化合物,为灰白色结晶固体(0.2004g,95%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.04(3H,t,J=7.6Hz),2.42(2H,m),2.45(2H,t,J=7.0Hz),3.97(2H,t,J=5.9Hz),4.72(2H,t,J=5.9Hz),7.56(2H,bs),7.61(1H,d,J=6.7Hz),7.87(1H,t,J=7.8Hz),7.97(1H,s),8.11(1H,ddd,J=1.0,7.3,8.2Hz),8.35-8.40(3H,m),9.18(1H,d,J=6.6Hz),12.86(1H,s)。
包括游离碱和盐酸盐在内的显示出体外和体内抗菌活性的其它化合物如下所示,并通过本文中对于P113的实施例1所述类似的方法来制备。这种化合物从适当的4-喹啉醇起始原料(是本领域中已知的)开始,并通过本领域技术人员显而易见的对这些方法的改造而转化为式(I)的化合物。示例性化合物如下所示。
实施例2:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-氯-喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(P149)(参见图2)。
a)6-氯喹啉-4-醇:
在氮气下将2,2-二甲基-1,3-二氧杂环己烷-4,6-二酮(梅尔德拉姆酸,21.62g,0.15mol)和原甲酸三甲酯(150mL)的混合物加热到温和回流1小时。将得到的红色溶液冷却(80℃)并分批添加4-氯苯胺(19.14g,0.15mol),形成黄色固体。将反应混合物加热到回流,剧烈搅拌另外的1小时,然后冷却到25℃(参见Ryan等人,(2006)Org.Lett.8:2779-2782.;Madrid等人,(2005)Bioorg.Med.Chem.Lett.15:1015-1018)。将得到的固体过滤并用冷的丙酮洗涤,得到烯-胺化合物(29.58g,70%,熔点214-214.5℃(dec.)),为黄色固体,通过1H NMR对其进行表征。向240℃二苯醚溶液(20ml)分多个小部分添加烯-胺化合物(5g,17.75mmol),产生剧烈的气体放出,使反应在氮气下达到回流30分钟。将反应混合物冷却到80℃并通过过滤分离沉淀物,用丙酮和己烷洗涤,直到滤液是无色的。通过用乙醚浸提纯化所述棕色固体,随后减压蒸馏,以55%收率得到6-氯喹啉-4-醇,为浅黄色固体(1.7533g,熔点281-282.5℃(参见Riegel等人,(1946)J.Am.Chem.Soc.68:1264-1266,熔点274-275℃)。1H NMR(400MHz,CDCl3):6.07(1H,d,J=7.4Hz),7.59(1H,d,J=8.8Hz),7.68(1H,dd,J=8.8,2.5Hz),7.95(1H,d,J=7.4Hz),8.01(1H,d,J=2.4Hz),11.92(1H,bs)。
b)3-(6-氯喹啉-4-基氧基)丙基溴:
在25℃在氮气下在20分钟内向6-氯喹啉-4-醇(2.16g,12mmol),三苯膦(3.78g,14.4mmol,1.2eq.),和3-溴-1-丙醇(1.30mL,14.4mmol,1.2eq.)在无水四氢呋喃(40mL)中的悬浮溶液添加偶氮二羧酸二乙酯(2.51g,14.4mmol,1.2eq.)并将反应混合物放置搅拌另外的1小时。加入氢溴酸(1.36mL,12mmol,48%水溶液,1.0eq.)产生白色固体,为相应的氢溴酸盐。将白色盐过滤并用乙醚浸提三次。将白色盐用碳酸钾水溶液中和,随后用二氯甲烷提取。蒸发二氯甲烷层得到粗产物,使其经过柱色谱法纯化(硅胶,含2%甲醇的CH2Cl2作为洗脱剂),得到溴化合物,为白色固体(2.52g,70%,熔点102-103.5℃(dec.))。1H NMR(500MHz,CDCl3):2.50(2H,m),3.70(2H,t,J=6.3Hz),4.36(2H,t,J=5.8Hz),6.79(1H,d,J=5.3Hz),7.64(1H,dd,J=9.0,2.4Hz),7.99(1H,d,J=9.0Hz),8.14(1H,d,J=2.4Hz),8.75(1H,d,J=5.2Hz)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-氯喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(1.39g,9mmol)添加到搅拌的氢氧化锂一水合物(1.32g,31.50mmol)在DMF(5mL)中的溶液中并将反应混合物在25℃搅拌1小时。添加3-(6-氯喹啉-4-基氧基)丙基溴(2.71g,9mmol)的DMF(3mL)溶液并将反应混合物在25℃放置搅拌过夜。在减压下部分除去DMF,得到残余物。将残余物用二氯甲烷浸提并过滤,得到白色固体。用甲醇水溶液和热水进行重结晶,得到期望的二氨基嘧啶,为白色固体(1.85g,55%,熔点230-231℃(dec.))。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):0.91(3H,t,J=7.6Hz),2.26(2H,q,J=7.6Hz),2.31(2H,m),3.86(2H,t,J=6Hz),4.45(2H,t,J=5.9Hz),5.59(2H,s),6.17,(2H,s),7.15(1H,d,J=5.3Hz),7.76(1H,dd,J=9.0,2.4Hz),7.98(1H,d,J=9.0Hz),8.14(1H,d,J=2.4Hz),8.77(1H,d,J=5.2Hz)。
d)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-氯喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶二盐酸盐:
向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-氯喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(0.5608g,1.5mmo l)在甲醇(1mL)中的悬浮液添加2当量的浓盐酸。在将反应混合物与乙醚研磨之后得到标题化合物,为灰白色结晶固体(0.6366g,95%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):1.09(3H,t,J=7.7Hz),2.43(2H,m),2.48(2H,m),3.99(2H,t,J=6.2Hz),4.70(2H,t,J=5.9Hz),7.55(2H,b s),7.64(1H,d,J=6.6Hz),7.95(1H,s),8.15(1H,dd,J=9.1,2.4Hz),8.37(2H,m),8.41(1H,d,J=9.1Hz),9.22(1H,d,J=6.5Hz),12.80(1H,s)。
实施例3:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-氟-喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(P153)(参见图3)。
a)3-(6-氟喹啉-4-基氧基)丙基溴氢溴酸盐:
在氮气下在25℃在30分钟内向6-氟喹啉-4-醇(3.67g,22.5mmol)(根据文献方法(参见Price等人,Organic Syntheses,Coll.Vol.3,p.272;Vol.28,p.38)从4-氟苯胺和乙氧基亚甲基丙二酸二乙酯开始以32%的总收率合成),三苯膦(6.56g,25mmol),和3-溴-1-丙醇(2.3mL,25mmol)在无水四氢呋喃(30mL)中的悬浮溶液添加偶氮二甲酸二异丙酯(4.9mL,25mmol)并将反应混合物搅拌1小时。添加氢溴酸(2.8mL,48%水溶液,25mmol),产生标题化合物的沉淀。通过抽吸过滤收集产物并用THF、丙酮和乙醚洗涤,得到浅黄色结晶固体(4.17g,51%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):2.45(2H,m),3.82(2H,t,J=6.5Hz),4.61(2H,t,J=5.7Hz),7.64(1H,d,J=6.6Hz),8.40(1H,dt,J=8.5,2.7Hz),7.90(m,1H),8.27(1H,dd,J=9.4,4.8Hz),9.24(1H,d,J=6.6Hz)。
b)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-氟喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(3.00g,19.5mmol)添加到搅拌的氢氧化锂一水合物(1.74g,41.50mmol)的DMF(5mL)溶液中并将反应混合物在25℃搅拌1小时。添加3-(6-氟喹啉-4-基氧基)丙基溴[通过用过量的饱和NaHCO3水溶液处理3-(6-氟喹啉-4-基氧基)丙基溴氢溴酸盐(4.17g,11.4mmol,步骤b),随后用二氯甲烷提取并蒸发以定量收率制备得到]的DMF(5mL)溶液并将反应混合物在25℃搅拌过夜。添加水引起产物沉淀,将其过滤收集。从MeOH-H2O重结晶,得到游离碱,为浅黄色结晶固体(3.23g,79%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.88(3H,t,J=7.6Hz),2.25(2H,q,J=7.6Hz),2.29(2H,m),3.84(2H,t,J=5.8Hz),4.43(2H,t,J=5.7Hz),5.54(2H,s),6.11(2H,s),7.10(1H,d,J=5.2Hz),7.63(1H,d t,J=8.7,2.6Hz),7.78(1H,dd,J=9.6,2.7Hz),8.01(1H,dd,J=9.2,5.4Hz),8.71(1H,d,J=5.2Hz)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-氟喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶二盐酸盐:
向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-氟喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(10.02g,28mmol)在甲醇(40mL)中的悬浮液添加5.3mL的浓盐酸。标题化合物几乎立即沉淀出来,在抽吸过滤并用丙酮洗涤和空气干燥之后得到白色结晶固体(11.81g,98%,熔点212-214℃)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.05(3H,t,J=7.4Hz),2.40(2H,m),2.48(2H,m),3.98(2H,t,J=5.8Hz),4.68(2H,t,J=5.5Hz),7.50(bs,2H),7.60(1H,d,J=6.5Hz),7.90(1H,s),8.04(1H,dt,J=9.0,2.6Hz),8.10(1H,dd,J=8.9,2.3Hz),8.33(1H,s),8.43(1H,dd,J=9.3,4.8Hz),9.17(1H,d,J=6.4Hz),12.70(1H,s)。
实施例4:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(P154)(参见图4)。
a)3-(2-甲基喹啉-4-基氧基)丙基溴:
使2-甲基喹啉-4-醇(1.59g,10mmol)(根据本领域中已知的方法从苯胺和乙酰乙酸酯合成,参见Leonard等人,(1946)J.Am.Chem.Soc.68:1279-1281),1,3-二溴丙烷(8.08g,40mmol)和碳酸钾(1.659g,12mmol)在丙酮(50mL)中的混合物回流,直到起始原料消失。将反应混合物过滤并在蒸发溶剂之后将残余物通过硅胶上的柱色谱法纯化(1%MeOH:99%CH2Cl2作为洗脱剂)。得到产物,为浅黄色固体(1.793g,64%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):2.48(2H,m),2,69(3H,s),3.69(2H,t,J=6.3Hz),4.33(2H,t,J=5.8Hz),6.6(1H,s),7.43(1H,t,J=7.5Hz),7.66(1H,t,J=7.8Hz),7.95(1H,d,J=8.5Hz),8.12(1H,d,J=8.3Hz)。
b)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(0.539g,3.5mmol)和氢氧化锂一水合物(0.294g,7.0mmol)在DMF(10mL)中的混合物在25℃搅拌1小时,之后向反应混合物添加3-(2-甲基喹啉-4-基氧基)丙基溴(0.980g,3.5mmol)并将反应混合物在25℃搅拌过夜。真空蒸发三分之二的DMF并将反应混合物倾倒在水中,通过过滤分离固体并在烘箱中在80℃干燥。粗产物通过硅胶上的柱色谱法纯化(4%MeOH:96%CH2Cl2作为洗脱剂),得到标题化合物,为浅黄色固体(0.5814g,47%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.90(3H,t,J=7.6Hz),2.30(4H,m),2.60(3H,s),3.86(2H,t,J=5.9Hz),4.41(2H,t,J=5.9Hz),5.59(2H,s),6.16(2H,s),6.97(1H,s),7.46(1H,t,J=7.7Hz),7.67(1H,t,J=7.7Hz),7.84(1H,d,J=8.4Hz),8.09(1H,d,J=8.2Hz)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶一盐酸盐:
在25℃向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(0.353g,1mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的悬浮液添加一当量的盐酸。在蒸发溶剂并与乙醚研磨之后,得到产物,为浅黄色固体(0.3587g,92%)。熔点:194-196℃(dec.)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.99(3H,t,J=7.5Hz),2.36(2H,m),2.44(2H,q,J=7.5Hz),2.65(3H,s),3.97(2H,t,J=6.0Hz),4.45(2H,t,J=5.6Hz),7.09(1H,s),7.40(2H,bs),7.54(2H,t,J=7.5Hz),7.75(1H,t,J=7.8Hz),7.93(2H,m),8.14(2H,m),12.55(1H,bs)。
实施例5:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(7-氟-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(P157)(参见图5)。
a)7-氟-2-甲基喹啉-4-醇:
在25℃向3-氟苯胺(4.44g,40mmol)和乙酰乙酸酯(5.20g,40mmol)的搅拌的溶液加入催化量(2滴)的稀盐酸,在10分钟内开始有水分离出来,并有少量的热生成。使反应混合物在25℃静置过夜;反应混合物用二氯甲烷(150mL)稀释连续地用0.5N HCl(2x50mL),0.5N NaOH(2x50mL)和水洗涤,用无水硫酸钠干燥。将二氯甲烷蒸发掉,并在5分钟内将油状残余物添加到回流的二苯醚(40mL)中,继续回流1小时,然后将反应混合物在25℃冷却,并通过过滤分离固体,用乙醚洗涤以除去一些带颜色的杂质。得到的产物为黄色固体(2.3388g,33%,基于3-氟苯胺),为5和7-氟-2-甲基喹啉-4-醇的异构体混合物,其不经进一步纯化用于下一步。
b)3-(7-氟-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙基溴:
将5-和7-氟-2-甲基喹啉-4-醇(2.12g,12mmol),1,3-二溴丙烷(9.70g,48mmol)和无水碳酸钾(1.99g,14.4mmol)在丙酮(60mL)中的混合物回流,直到起始原料消失。将反应混合物过滤并在蒸发溶剂之后将残余物通过硅胶上的柱色谱法纯化(1%MeOH:99%CH2Cl2作为洗脱剂)。分离得到3-(7-氟-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙基溴,为浅黄色固体(1.25g,35%),得到的其余化合物是异构体混合物(0.89g,25%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):2.47(2H,m),2.68(3H,s),3.67(2H,t,J=6.3Hz),4.33(2H,t,J=5.8Hz),6.62(1H,s),7.20(1H,d t,J=8.6,2.4Hz),7.57(1H,dd,J=10.5,2.4Hz),8.10(1H,dd,J=9.1,6.2Hz)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(7-氟-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(0.5395g,3.5mmol)和氢氧化锂一水合物(0.294g,7.0mmol)在DMF(10mL)中的混合物在25℃搅拌1小时,之后向反应混合物添加3-(7-氟-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙基溴(1.043g,3.5mmol)并将反应混合物在25℃搅拌过夜。真空蒸发三分之二的DMF并将反应混合物倾倒在水中,通过过滤分离固体并在烘箱中在80℃干燥。粗产物通过硅胶上的柱色谱法纯化(4%MeOH:96%CH2Cl2作为洗脱剂)。得到产物,为白色结晶固体(0.6629g,51%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.89(3H,t,J=7.5Hz),2.28(4H,m),2.60(3H,s),3.85(2H,t,J=5.9Hz),4.42(2H,t,J=5.9Hz),5.57(2H,s),6.15(2H,s),6.99(1H,s),7.39(1H,dt,J=8.8,2.5Hz),7.57(1H,dd,J=10.8,2.5Hz),8.15(1H,dd,J=9.1,6.4Hz)。
d)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(7-氟-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶一盐酸盐:
在25℃向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(7-氟-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(0.3714g,1mmol)在甲醇(10mL)中的搅拌的悬浮液添加一当量的盐酸。在蒸发溶剂并与乙醚研磨之后,得到产物,为白色结晶固体(0.3834g,94%)。熔点>200℃,1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.99(3H,t,J=7.6Hz),2.35(2H,m),2.44(2H,q,J=7.6Hz),2.64(3H,s),3.97(2H,t,J=5.8Hz),4.45(2H,t,J=5.5Hz),7.07(1H,s),7.45(3H,m),7.64(1H,d,J=10.5Hz),7.90(1H,bs),8.19(1H,dd,J=8.9,6.3Hz),8.33(1H,bs),12.30(1H,bs)。
实施例6:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(1-吲哚基)丙氧基)嘧啶一盐酸盐。
以下提供用于制备2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(1-吲哚基)丙氧基)嘧啶一盐酸盐的代表性方法:
a)1-(3-溴丙基)吲哚:
在0℃将吲哚(1.17g,10mmol)的无水DMF(5mL)溶液添加到氢化钠(0.48g,11mmol,55%)在无水DMF(3mL)中的悬浮液。将反应混合物在25℃搅拌30分钟。在0℃添加1,3-二溴丙烷(2.04mL,20mmol)并将反应在0℃搅拌,直到起始原料耗尽。将反应用稀盐酸中和并用乙酸乙酯提取并蒸发。粗产物通过SiO2上的柱色谱法纯化,使用含10%乙酸乙酯的己烷作为洗脱剂。得到的产物为浅黄色油状物(0.9048g,38%)。1H NMR(400MHz,CDCl3),2.38(2H,m),3.34(2H,t,J=6.1Hz),4.37(2H,t,J=6.3Hz),6.57(1H,d,J=3.0Hz),7.19(2H,m),7.28(1H,m),7.43(1H,d,J=8.1Hz),7.69(1H,d,J=7.8Hz)。
b)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(1-吲哚基)丙氧基)嘧啶:
向搅拌的氢氧化锂一水合物(0.3147g,7.5mmol)的DMF(2mL)溶液添加2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(0.4625g,3mmol)并将反应混合物搅拌1小时。添加1-(3-溴丙基)吲哚(0.7144g,3mmol)的DMF(1mL)溶液并将反应混合物在25℃搅拌过夜。反应用二氯甲烷稀释并用水提取。将二氯甲烷层蒸发并将残余物从甲醇水溶液重结晶。得到的产物为浅黄色固体(0.4484g,48%)。1H NMR(DMSO-d6):1.02(3H,t,J=7.5Hz),2.20(2H,m),2.32(2H,q,J=7.5Hz),3.60(2H,t,J=6.3Hz),4.34(2H,t,J=7.2Hz),5.56(2H,s),6.07(2H,s),6.43(1H,d,J=3.1Hz),7.01(1H,m),7.13(1H,m),7.40(1H,d,J=3.1Hz),7.50(1H,d,J=8.3Hz),7.54(1H,d,J=7.8Hz)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(1-吲哚基)丙氧基)嘧啶一盐酸盐:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(1-吲哚基)丙氧基)嘧啶(0.1557g,0.5mmol)悬浮在甲醇(1mL)中并添加1当量的浓盐酸。在蒸发并将残余物与乙腈研磨之后得到标题化合物,为灰白色结晶固体(0.1670g,96%)。1H NMR(DMSO-d6):1.09(3H,t,J=7.5Hz),2.26(2H,m),2.44(2H,q,J=7.5Hz),3.71(2H,t,J=6.4Hz),4.33(2H,t,J=7.1Hz),6.45(1H,d,J=2.8Hz),7.02(1H,m),7.14(1H,m),7.40(2H,m),7.50(1H,d,J=8.1Hz),7.55(1H,d,J=7.8Hz),7.82(1H,s),8.32(1H,s),12.33(1H,s)。
实施例7:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(3-羧基丙氧基)苯氧基)丙氧基)嘧啶(P135)及其乙基酯(P217)(参见图6)。
a)4-(2-羟基苯氧基)丁酸乙酯:
在0℃向邻苯二酚(5.51g,50mmol)的无水DMF(30mL)溶液缓慢添加氢化钠(1.2g,50mmol)。在25℃搅拌4小时之后,将反应混合物在65-70℃加热1小时,随后添加4-溴丁酸乙酯(10.7mL,75mmol)。然后将反应混合物在这个温度搅拌6小时。在用水淬灭之后,用二氯甲烷提取并蒸发,得到粗产物,将其通过柱色谱法纯化,用87%己烷:10%CH2Cl2:3%EtOAc洗脱。用己烷结晶,以55%收率得到白色固体(6.17g,熔点37.2-38.4℃)。1H NMR(400MHz,CDCl3):1.26(3H,t,J=7.1Hz),2.17(2H,m),2.52(2H,t,J=7.0Hz),4.09(2H,t,J=6.0Hz),4.16(2H,q,J=7.1Hz),6.81-6.89(3H,m),6.92-6.94(1H,m)。
b)4-(2-(3-溴丙氧基)苯氧基)丁酸乙酯:
在0℃向4-(2-羟基苯氧基)丁酸乙酯(5.61g,25mmol)的DMF(25mL)的搅拌的溶液缓慢加入氢化钠(0.6g,25mmol),然后将溶液在0℃搅拌4小时。向在65-70℃搅拌的溶液添加1,3-二溴丙烷(3.80mL,37.5mmol)。将得到的溶液继续在65-70℃搅拌3小时。正常的后处理并通过硅胶柱色谱法纯化,以60%收率得到溴代-化合物,为白色固体(5.18g,熔点31-32.6℃,CH2Cl2/己烷)。1H NMR(400MHz,CDCl3):1.25(3H,t,J=7.1Hz),2.13(2H,m),2.34(2H,m),2.54(2H,t,J=7.3Hz),3.64(2H,t,J=6.4Hz),4.04(2H,t,J=6.2Hz),4.10-4.15(4H,m),6.99-6.93(4H,m)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(3-羧基丙氧基)苯氧基)丙氧基)嘧啶:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(0.4625g,3mmol)添加到氢氧化锂一水合物(0.4406g,10.5mmol)的DMF(4mL)溶液中并将反应混合物在25℃搅拌1小时。添加4-(2-(3-溴丙氧基)苯氧基)丁酸乙酯(1.0357g,3mmol)的DMF(1mL)溶液并将反应混合物在25℃搅拌过夜。在减压下部分除去DMF,得到残余物。将残余物用水稀释并用二氯甲烷提取。水层用稀盐酸中和,得到白色固体。用丙酮重结晶,得到期望的二氨基嘧啶,为白色固体(0.6911g,59%,熔点204-206℃)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.10(3H,t,J=7.5Hz),1.91(2H,m),2.14(2H,m),2.31-2.39(4H,m),3.78(2H,t,J=6.1Hz),3.96(2H,t,J=6.4Hz),4.13(2H,t,J=6.1Hz),5.60(2H,s),6.09(2H,s),6.86-6.90(2H,m),6.95-7.01(2H,m)。
d)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(3-羧基丙氧基)苯氧基)丙氧基)嘧啶盐酸盐:
向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(3-羧基丙氧基)苯氧基)丙氧基)嘧啶(0.3904g,1mmol)在水(1mL)中的悬浮液添加一当量浓盐酸。在将反应混合物与乙醚研磨之后,得到标题化合物,为白色结晶固体(0.4055g,95%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.09(3H,t,J=7.5Hz),1.90(2H,m),2.18(2H,m),2.38(2H,t,J=7.3Hz),2.48(2H,q,J=7.5Hz),3.89(2H,t,J=6.1Hz),3.95(2H,t,J=6.4Hz),4.12(2H,t,J=6.0Hz),6.86-6.90(2H,m),6.95-7.02(2H,m),7.81(1H,bs),8.14(1H,bs),8.18(1H,bs),12.34(1H,bs)。
e)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(3-乙氧基羰基丙氧基)苯氧基)丙氧基)嘧啶:
向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(3-羧基丙氧基)苯氧基)丙氧基)嘧啶(0.3904g,1mmol)和催化量的浓H2SO4在EtOH(4mL)中的溶液添加原甲酸三乙酯(2mL)并将溶液在25℃搅拌8小时。将反应混合物用K2CO3中和并蒸干。粗产物用水稀释并用CH2Cl2提取。蒸发到干燥,得到期望的酯,为白色半固体(0.2720g,65%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):0.99(3H,t,J=7.5Hz),1.15(3H,t,J=7.1Hz),1.93(2H,m),2.13(2H,m),2,33(2H,q,J=7.5Hz),2.45(2H,t,J=7.3Hz),3.78(2H,t,J=6.0Hz),3.95(2H,t,J=6.3Hz),4.03(2H,q,J=7.1Hz),4.13(2H,t,J=6.0Hz),5.54(2H,s),6.07(2H,s),6.87-6.90(2H,m),6.95-7.01(2H,m)。
f)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(3-乙氧基羰基丙氧基)苯氧基)丙氧基)嘧啶盐酸盐:
向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(3-乙氧基羰基丙氧基)苯氧基)丙氧基)嘧啶(0.4185g,1mmol)在EtOH(1mL)中的悬浮液添加一当量的浓盐酸。在将反应混合物与乙醚研磨之后得到标题化合物,为白色结晶固体(0.4322g,95%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):1.09(3H,t,J=7.6Hz),1.15(3H,t,J=7.1Hz),1.93(2H,m),2.18(2H,m),2.44(2H,t,J=7.4Hz),2.49(2H,q,J=7.7Hz),3.89(2H,t,J=6.1Hz),3.95(2H,t,J=6.3Hz),4.04(2H,q,J=7.1Hz),4.12(2H,t,J=5.7Hz),6.87-6.90(2H,m),6.95-7.01(2H,m),7.43(2H,bs),7.83(1H,s),8.33(1H,s),12.39(1H,s)。
实施例8:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(2-羧基乙基)苯氧基)丙氧基)嘧啶(P218)及其乙基酯(P195)(参见图7)。
a)3-(2-羟基苯基)丙酸甲酯:
向二氢香豆素(10mL,78.9mmol)溶液添加含催化量浓H2SO4的无水甲醇(300mL),然后将反应混合物在55℃加热8小时。将甲醇蒸干,得到粗产物,将其用K2CO3中和,残余物用水稀释并用二氯甲烷提取。通过柱色谱法纯化粗产物(20%CH2Cl2:3%EtOAc:77%己烷作为洗脱剂),得到期望的酯,为无色油状物(12.80g,90%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):2.71(3H,t,J=6.4Hz),2.89(2H,t,J=6.4Hz),3.67(3H,s),6.83-6.87(2H,m),7.06-7.12(2H,m)。
b)3-(2-(3-溴丙氧基)苯基)丙酸甲酯:
在氮气下在25℃在20分钟内向3-(2-羟基苯基)丙酸甲酯(1.80g,10mmol),三苯膦(3.15g,12mmol),和3-溴-1-丙醇(1.1mL,12mmol)在无水四氢呋喃(30mL)中的溶液添加偶氮二甲酸二异丙酯(2.4mL,12mmol)并将反应混合物搅拌另外的二小时。蒸发四氢呋喃层得到粗产物,将其通过硅胶柱色谱法纯化,用己烷:CH2Cl2:EtOAc(8:1.7:0.3)的混合物洗脱。得到溴代化合物,为黄色油状物(2.26g,75%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):2.33(2H,m),2.58(2H,t,J=7.8Hz),2.92(2H,t,J=7.8Hz),3.61(2H,t,J=6.4Hz),3.65(3H,s),4.10(2H,t,J=5.7Hz),6.84(1H,d,J=8.4Hz),6.88(1H,d,J=7.3Hz),7.13-7.19(2H,m)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(2-羧基乙基)苯氧基)丙氧基)嘧啶:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(0.4625g,3mmol)添加到氢氧化锂一水合物(0.4406g,10.5mmol)的DMF(4mL)的搅拌溶液中并将反应混合物在25℃搅拌1小时。添加3-(2-(3-溴丙氧基)苯基)丙酸甲酯(0.9035g,3mmol)的DMF(1mL)溶液并将反应混合物在25℃搅拌过夜。在减压下部分除去DMF,得到残余物。残余物用水稀释,随后用二氯甲烷提取。水层用稀盐酸中和,得到白色固体。从丙酮重结晶得到期望的二氨基嘧啶,为白色固体(0.6271g,58%,熔点155.5-157.5℃)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.04(3H,t,J=7.6Hz),2.19(2H,m),2.39(2H,q,J=7.5Hz),2.46(2H,t,J=7.5Hz),2.78(2H,t,J=7.7Hz),3.83(2H,t,J=6.1Hz),4.15(2H,t,J=5.9Hz),6.29(2H,bs),6.85(1H,t,J=7.4Hz),6.96(2H,bs),6.98(1H,d,J=8.1Hz),7.14-7.19(2H,m)。
d)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(2-羧基乙基)苯氧基)丙氧基)嘧啶盐酸盐:
向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(2-羧基乙基)苯氧基)丙氧基)嘧啶(0.3604g,1mmol)在水(1mL)中的悬浮液添加一当量的浓盐酸。在将反应混合物与乙醚研磨之后,得到标题化合物,为白色结晶固体(0.3770g,95%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.12(3H,t,J=7.5Hz),2.22(2H,t,J=5.8Hz),2.44-2.52(4H,m),2.78(2H,t,J=7.5Hz),3.89(2H,t,J=5.9Hz),4.14(2H,t,J=5.5Hz),6.85(1H,t,J=7.3Hz),6.98(1H,d,J=8.1Hz),7.14-7.19(2H,m)7.41(2H,s),7.85(1H,s),8.31(1H,s),12.11(1H,bs),12.54(1H,s)。
e)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(2-乙氧基羰基乙基)苯氧基)丙氧基)嘧啶
向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(2-羧基乙基)苯氧基)丙氧基)嘧啶(0.3604g,1mmol)和催化量的浓H2SO 4的EtOH(4mL)溶液添加原甲酸三乙酯(2mL)并将混合物在25℃搅拌8小时。将反应混合物用K2CO3中和并蒸干。粗产物用水稀释并用CH2Cl2提取。蒸发到干燥,得到期望的酯,为白色固体(0.3496g,90%,熔点124.5-1255.5℃)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6):1.24(3H,t,J=7.3Hz),1.26(3H,t,J=7.7Hz),2.26(2H,m),2.59(2H,q,J=7.7Hz),2.62(2H,t,J=7.7Hz),2.95(2H,t,J=7.7Hz),3.98(2H,t,J=6.0Hz),4.13(2H,q,J=7.1Hz),4.27(2H,t,J=5.7Hz),5.17(2H,bs),5.28(2H,bs),6.90(1H,d,J=8.2Hz),6.93(1H,t,J=7.5Hz),7.17(1H,dd,J=7.4,1.4Hz),7.22(1H,dt,J=7.8,1.5Hz)。
f)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(2-乙氧基羰基乙基)苯氧基)丙氧基)嘧啶盐酸盐:
向2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(2-(2-乙氧基羰基乙基)苯氧基)丙氧基)嘧啶(0.3885g,1mmol)在EtOH(1mL)中的悬浮液添加一当量的浓盐酸。在将反应混合物与乙醚研磨之后,得到标题化合物,为白色结晶固体(0.4037g,95%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.10(3H,t,J=7.8Hz),1.13(3H,t,J=7.1Hz),2.22(2H,m),2.47-2.55(m,4H),2.81(2H,t,J=7.6Hz),3.89(2H,t,J=6.2Hz),4.02(2H,q,J=7.1Hz),4.15(2H,t,J=5.8Hz),6.85(1H,t,J=7.4Hz),6.99(1H,d,J=8.1Hz),7.14(1H,d,J=8.2Hz),7.18(1H,t,J=7.5Hz),7.38(2H,s),7.85(1H,bs),8.14(1H,s),12.32(1H,s)。
实施例9:2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-(3-羧基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-基氧基)-丙氧基)嘧啶(P169)及其乙基酯(P219)(参见图8)。
a)6-(3-乙氧基羰基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-醇:
向4-(4-氨基苯氧基)丁酸乙酯(3.12g,14mmol)和乙酰乙酸酯(1.82g,14mmol)的搅拌的混合物添加催化量的盐酸并如实施例5a中所述在回流的二苯醚中环化。得到产物,为浅黄色固体(1.70g,42%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.32(3H,t,J=7.1Hz),2.15(2H,m),2.50(3H,s),2.62(2H,t,J=7.3Hz),4.21(4H,m),6.09(1H,s),7.42(1H,dd,J=9.0,2.7Hz),7.58(1H,d,J=2.7Hz),7.65(1H,d,J=9.0Hz),11.8(1H,s)。
b)3-(6-(3-乙氧基羰基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙基溴:
与实施例5b中所述类似地,使6-(3-乙氧基羰基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-醇(1.157g,4mmol),1,3-二溴丙烷(3.230g,16mmol)和无水碳酸钾(0.663g,4.8mmol)在丙酮中进行反应。得到预期的化合物,为白色固体(0.903g,55%)。1H NMR(400MHz,CDCl3):1.25(3H,t,J=7.2Hz),2.18(2H,m),2.56(4H,m),2.65(3H,s),3.67(2H,t,J=6.3Hz),4.14(4H,m),4.31(2H,t,J=5.8Hz),6.61(s,1H),7.29(1H,dd,J=9.1,2.6Hz),7.36(1H,d,J=2.6Hz),7.85(1H,d,J=9.1Hz)。
c)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-(3-乙氧基羰基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶:
将2,4-二氨基-6-乙基-5-羟基嘧啶(0.308g,2.0mmol),氢氧化钾(0.123g,2.2mmol)和3-(6-(3-乙氧基羰基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙基溴(0.821g,2.0mmol)在DMF中的混合物在25℃搅拌过夜。将DMF蒸干并通过硅胶上的柱色谱法纯化残余物(4%MeOH:96%CH2Cl2作为洗脱剂)。得到产物,为浅黄色固体(0.3578g,37%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.90(3H,t,J=7.5Hz),1.16(3H,t,J=7.1Hz),2.08(2H,m),2.28(4H,m),2.48(2H,t,J=7.0Hz),2.56(3H,s),3.86(2H,t,J=5.8Hz),4.06(4H,m),4.41(2H,t,J=5.8Hz),5.53(2H,s),6.11(2H,s)6.93(1H,s),7.31(1H,dd,J=9.1,2.6Hz),7.37(1H,d,J=2.6Hz),7.76(1H,d,J=9.1Hz)。
d)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-(3-羧基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶:
将在步骤(c)中得到的乙基酯(0.314g,0.65mmol)和在KOH水溶液(10当量)中的悬浮液在25℃搅拌过夜。通过添加稀盐酸将溶液中和。通过过滤分离形成的沉淀物,并在烘箱中在80℃干燥,得到浅黄色固体(0.2487g,84%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.91(3H,t,J=7.5Hz),1.98(2H,m),2.29(4H,m),2.41(2H,t,J=7.2Hz),2.56(3H,s),3.86(2H,t,J=5.5Hz),4.05(2H,t,J=5.9Hz),4.40(2H,t,J=5.3Hz),5.67(2H,s),6.24(2H,s)6.94(1H,s),7.33(2H,m),7.75(1H,d,J=9.1Hz)。
e)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-(3-乙氧基羰基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶一盐酸盐:
在25℃向步骤(c)中得到的2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-(3-乙氧基羰基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶(0.179g,0.37mmo l)在乙醇(0.5mL)中的搅拌的悬浮液添加一当量的盐酸。在蒸发溶剂并与丙酮研磨之后,得到产物,为白色结晶固体(0.117g,61%)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):0.90(3H,t,J=7.5Hz),1.15(3H,t,J=7.0Hz),2.00(2H,m),2.35(4H,m),2.40(2H,m),2.70(3H,s),3.85(2H,t,J=6.0Hz),4.02(2H,q,J=7.0Hz),4.10(2H,t,J=6.0Hz),4.52(2H,m),7.25(s,1H),7.42(3H,m),7.90(1H,bs),8.00(1H,d,J=10Hz),8.30(1H,bs)。
f)2,4-二氨基-6-乙基-5-(3-(6-(3-羧基丙氧基)-2-甲基喹啉-4-基氧基)丙氧基)嘧啶一盐酸盐
与(e)相似合成化合物。在蒸发溶剂并与丙酮研磨之后以定量的收率得到产物,为白色结晶固体。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):1.00(3H,t,J=7.5Hz),1.99(2H,m),2.37(2H,m),2.41(4H,m),2.63(3H,s),3.97(2H,t,J=6.0Hz),4.02(2H,q,J=7.0Hz),4.08(2H,t,J=6.0Hz),4.45(2H,t,J=5.3Hz),7.07(s,1H),7.40(3H,m),7.86(1H,d,J=9.0Hz),7.90(1H,bs),8.00(1H,d,J=10Hz),8.25(1H,bs)。
实施例10:化合物设计原理。
基于对以下化合物性质的考虑通过迭代法设计化合物:与使用用实验方法衍生的晶体结构模拟的目标酶的相互作用(即,疟原虫的DHFR)、体外和体内抗疟活性、代谢稳定性、口服生物利用度和药代动力学性质。通过已知方法进行的X射线衍射测定与野生型和四重突变型酶复合的特定化合物的结构(参见Yuvaniyama等人,(2003)Nat.Struct.Biol.10:357-365)。这种方法提供了关于DHFR活性部位的空间和电子信息,所述活性部位用于设计和优化对野生型和四重突变型恶性疟原虫(P.falciparum)DHFR为高亲合力和特异性的化合物。使用迭代循环,可以合成新设计的抑制剂,与DHFR酶共结晶化并使用X射线衍射进行研究以提供每个化合物如何准确地结合在DHFR活性部位的实验测定。基于这些数据,然后进行抑制剂的结构修饰,以便进一步增强对目标酶的结合。这导致对化合物有效结合酶(即,如以下实施例11中所述的野生型和耐药型酶)的活性部位所需要的基本要求的了解。化合物对野生型和突变型酶的亲合力测量为Ki值(参见实施例12)。通过体外方法测量针对恶性疟原虫的抑制活性(参见实施例13)。另外,测量化合物的细胞毒性并测定为最低的(参见实施例14)。在口服给药之后还测量了化合物针对P.chabaudi AS和ASP(即,分别为乙胺嘧啶敏感株和乙胺嘧啶耐药株)的体内活性(参见实施例15)。在实施例16中测量了化合物在大鼠和小鼠株的生物利用度。然后将得到的结果在一起考虑,以便优化化合物的性质:对野生型和突变型DHFR酶的高结合亲合力(低Ki值)、针对恶性疟原虫(P.falciparum)(特别是抗叶酸剂耐药性寄生虫)的有效的体外抗疟活性(低IC50值)和针对P.chabaudi的有效的体内抗疟活性(低的ED90值)、以及化合物的良好的口服生物利用度。
实施例11:有效化合物的基本要求。
设计化合物,使得它们为通式Het-X-R(I),其中-X-R为选自嘧啶,1,3,5-三嗪、喹唑啉、及其饱和或部分饱和的类似物的杂环的柔性侧链。所述柔性是需要的,使得可以避免侧链与突变型酶的位置108(丝氨酸到天冬酰胺)的突变残基之间的任何空间位阻。此外,其它突变引起活性部位的进一步变化,其需要侧链的进一步优化。具有对靶的良好亲合力的化合物(参见实施例3和8)被证明在体外和体内都是活性的,并且进一步证明是充分生物可利用的。
实施例12:酶抑制活性。
本发明提供了用于抑制恶性疟原虫(P.falciparum)的二氢叶酸还原酶(DHFR)酶的2,4-二氨基嘧啶衍生物化合物及其药学可接受的盐,所述酶包括野生型(WT)、双重突变型(C59R+S108N)、三重突变型(N51I+C59R+S108N,C59R+S108N+I164L)、和四重突变型(N51I+C59R+S108N+I164L)。在包含相应基因的大肠杆菌表达系统(E.coli BL21(DE3)pLysS)的帮助下制备WT、双重突变型、三重突变型、和四重突变型。在25℃通过分光光度法测定酶的活性。反应(1mL)包含1xDHFR缓冲液(50mM TES,pH 7.0,75mM β-巯基乙醇,1mg/mL牛血清白蛋白),100μM的每种底物二氢叶酸和辅助因子NADPH,以及用于引发反应的适量的亲合力纯化的酶(在包含50mM KC1的磷酸盐缓冲液中的0.001-0.005单位)。
在包含200μL上述混合物的96孔板中在抗叶酸剂的存在下研究化合物对各种酶(例如WT、双重突变型、三重突变型、和四重突变型,见上述)的抑制作用。在340nm跟踪动力学。使用以下方程测定抑制剂对野生型和突变型酶的Ki值:
IC50=Ki(1+([S]/Km)),其中IC50为在标准测定条件下抑制50%的酶活性的抑制剂浓度,Km为底物二氢叶酸的米氏常数。
化合物对恶性疟原虫的二氢叶酸还原酶(DHFR)(Pf DHFR)的野生型和突变型酶的抑制常数(Ki)概述在以下表3中。低的Ki值表示热切的结合,这与显示出化合物与酶活性部位之间的最佳的相互作用的X射线共晶体结构一致,包括疏水性、范德华力、极性和电荷-电荷相互作用。例如,引入羧基侧链提供与活性部位中的R122的另外结合,因此得到与没有羧基侧链的比较物相比更低的Ki值。
表3:用于与野生型和突变型Pf DHFR结合的2,4-二氨基嘧啶衍生物化合物的抑制常数(Ki)
nd=未测定
实施例13:针对恶性疟原虫(P.falciparum)的体外活性。
本发明提供用于治疗疟疾的2,4-二氨基嘧啶衍生物化合物,所述疟疾包括非耐药性疟疾和耐药性疟疾。所述化合物可以单独使用或与作用于叶酸生物合成途径中的DHPS酶的磺胺类组合使用、和/或与可以通过非抗叶酸机制起作用的其它药物组合使用。在3%CO2下在37℃,在补充有25mM HEPES,pH 7.4,0.2%NaHCO3,40μg/mL庆大霉素和10%人血清的标准RPMI 1640培养基(Trager等人,(1976)Science 193:673-675)中,在人红细胞中连续地保持恶性疟原虫(P.falciparum)株。使用[3H]-次黄嘌呤结合方法(Desjardins等人,(1979)Antimicrob.Agents Chemother.16:710-718)测定体外抗疟活性,所述方法通过代谢性前体次黄嘌呤的累积来测量寄生虫生长。最初将化合物溶解于DMSO中并用相同的标准培养基稀释。将含不同浓度药物的等分样品(25μL)分配在96孔板中并添加200μL的包含1-2%寄生物血病的寄生感染的红细胞的1.5%细胞混悬液。DMSO的最终浓度(0.1%)不影响寄生虫生长。将混合物在3%CO2保温箱中在37℃保温。在保温24小时之后,向每个孔添加25μL(0.25μCi)的[3H]-次黄嘌呤。将寄生虫培养物在相同条件下进一步温育18-20小时。将寄生虫的DNA收获在玻璃滤纸上。将过滤器空气干燥并添加20μL的液体闪烁流体。然后使用微板闪烁计数器测量过滤器上的放射性活度。从通过将[3H]-次黄嘌呤结合的百分比对药物浓度绘图所得到的S形曲线,测定抑制50%寄生虫生长的抑制剂浓度(IC50)。这个系列中具有针对带有野生型DHFR以及特别是带有单突变型、双重突变型、三重突变型和四重突变型DHFR酶的寄生虫的抗疟活性的化合物的实例示在上述表3中。
以下表4示出了从以下突变株得到的结果:K1CB1(C59R+S108N),W2(N51I+C59R+S108N),Csl-2(C59R+S108N+I164L)和V1/S(N51I+C59R+S108N+I164L)。
表4:2,4-二氨基嘧啶衍生物化合物对带有以下各种DHFR类型的恶性疟原虫(P.falciparum)的抗疟原虫活性(IC50):TM4/8.2(野生型),K1CB1(C59R+S108N),W2(N51I+C59R+S108N),Csl-2(C59R+S108N+I164L),和V1/S(N51I+C59R+S108N+I164L)。
nd=未测定
上面的表4示出了各种2,4-二氨基嘧啶衍生物化合物。值得注意的是,这些化合物对于乙胺嘧啶耐药性寄生虫株非常有活性。这些实施例的IC50值远低于乙胺嘧啶针对该突变株的IC50值。
实施例14:测定在哺乳动物细胞中的细胞毒性(IC50)。
根据Skehan等人,(1990)J.Natl.Cancer Inst.82:1107-1112所述的规程在非洲绿猴肾脏成纤维细胞(Vero)细胞中进行化合物的细胞毒性试验。这些化合物具有针对疟疾寄生虫的选择性,对哺乳动物细胞系有不同的细胞毒性作用,如表5中概述的。具有酸和酯的化合物比具有其它官能团的化合物针对Vero细胞具有更好的选择性。
表5:2,4-二氨基嘧啶衍生物化合物在哺乳动物细胞中的细胞毒性
nd=未测定
实施例15:在啮齿动物疟疾模型中的体内活性。
使用夏氏鼠疟原虫(Plasmodium chabaudi)和柏氏鼠疟原虫(Plasmodium berghei)模型通过4天的Peters试验评价化合物的体内抗疟活性,在每个实验中都包括乙胺嘧啶作为对比药物。简而言之,将20gr的CD1雄性小鼠(Charles Rivers,UK)保持在无特定病原体的条件下并不限量进食。对于经口给药,将化合物溶解于标准的悬浮配制物(SSV)[0.5%羧甲纤维素钠,0.5%苯甲醇,0.4%Tween 80,0.9%NaCl(都得自Sigma)],对于腹膜内给药或皮下给药,将化合物溶解于[0.5%w/v羟丙基甲基纤维素,0.4%v/v Tween 80,0.5%v/v在去离子水中的苯甲醇]中。用4 x 106感染的红细胞静脉内感染小鼠并在感染后的二小时(第0天)和第1、2和3天用经口(p.o.)给予的0.2ml试验化合物溶液进行治疗。通过在第4天进行的对吉姆沙染色的血液膜的显微镜检查测定寄生虫血症。使用GraphPad Prism4(GraphPad Software,Inc.,CA,USA)处理得自每个小鼠的血液膜的显微镜计数并表示为相对于未经处理组的每个组的算术平均寄生虫血症的抑制百分比。在所述周期针对P.chabaudi AS(非耐药)以30mg/kg/天在最初筛选中试验化合物,并相对于未经处理的对照计算抑制百分比。然后在所述周期内在相同的模型中以一定范围的剂量试验显示80%或更高抑制作用的化合物,以便得到剂量反应曲线并计算它们的ED 50和ED90值。然后选择显示ED90等于或低于对比药物水平的化合物(表6)用于针对P.chabaudi ASP(乙胺嘧啶耐药株)的试验以及在致死性P.berghei ANKA(非耐药株)中的试验。针对P.chabaudi AS的体内试验结果概述在表7中。从ED90值明显可见,许多化合物在这个模型中具有强烈的活性,并且还在P.chabaudi ASP和P.berghei ANKA中进行了试验。
如表6中所示,针对P.chabaudi AS,这些化合物中有许多表现出比现有药物乙胺嘧啶低2-90倍的ED90值(ED90=0.01-0.36mg/kg),乙胺嘧啶表现出0.88mg/kg的ED90值。表7示出了这些化合物中的一些在包括P.chabaudi ASP和致死性P.berghei ANKA在内的三个不同的啮齿动物疟疾模型中的效力。与针对乙胺嘧啶耐药性P.chabaudiASP的效力(ED90=13.5mg/kg)小于15倍的乙胺嘧啶相比,化合物P113保持其针对这个株系的效力(ED90=0.01mg/kg)以及针对致死性P.berghei ANKA的效力(ED90=0.03mg/kg)。
表6:在标准的4天Peters试验中化合物针对P.chabaudi AS的口服抗疟活性。
*ED50/90:产生减少寄生虫血症50%/90%所需要的剂量。nd=未测定
表7:化合物针对不同的啮齿动物疟疾模型的口服抗疟活性的概述。
*ED50/90:产生减少寄生虫血症50%/90%所需要的剂量。nt=未试验
实施例16:生物利用度
为了评价口服生物利用度和药代动力学,对体重为270-300g的禁食雄性Sprague Dawley大鼠给予试验化合物(参见以下表8)。在剂量给药前和剂量给药后取样期间,大鼠自由饮水,并在剂量给药后4小时恢复供给食物。试验化合物作为5分钟的恒速输注静脉内给予(1.0mL/大鼠)和通过灌胃法经口给予(1.0mL/大鼠)。IV制剂典型地是包含共溶剂(如果溶解需要)的经过缓冲的水溶液。口服制剂制备为在羟丙基甲基纤维素或羧甲基纤维素中的悬浮液,各自添加Tween 80和苯甲醇。收集动脉血和总尿的样品,直到剂量给药后24小时。动脉血直接收集到包含肝素、蛋白酶抑制剂混合物、氟化钾、和EDTA的硼硅酸盐小瓶(4℃)中,以使血液/血浆样品中的试验化合物的离体降解可能性最小化。在收集后,将血样离心,取出上清血浆并储存在-20℃,通过LCMS测定试验化合物的血浆浓度。
表8.在对雄性Sprague Dawley大鼠i.v.和口服剂量给药后测定的所选化合物的药代动力学参数。
化合物 |
i.v.CL(血浆)(mL/min/kg) |
i.v.t1/2(h) |
VD(L/kg) |
口服BA(剂量的%) |
P111 |
51.4 |
1.7 |
7.4 |
18.5 |
P113 |
未确定 |
未确定 |
未确定 |
<2.0 |
P134 |
未确定 |
未确定 |
未确定 |
14.6 |
化合物 |
i.v.CL(血浆)(mL/min/kg) |
i.v.t1/2(h) |
VD(L/kg) |
口服BA(剂量的%) |
P135 |
49.1 |
未确定 |
1.6 |
7.0 |
P149 |
66.3 |
24.3 |
51.2 |
10 |
P153 |
69.6 |
15.7 |
17.3 |
26 |
P154 |
84.1 |
3.2 |
8.8 |
9.3 |
P157 |
74.7 |
17.6 |
15.2 |
25.5 |
P164 |
218.3 |
0.6 |
11.6 |
1.0 |
表8中的数据示出了各种化合物的不同的药代动力学特征和生物利用度性质。对于单独的化合物在口服生物利用度、清除率、t1/2和VD方面有许多数值。
在单独的研究中,在小鼠中研究了P195的口服生物利用度,P195是包含羧酸侧链的P218的酯前体药物。对雄性Swiss杂种小鼠通过推注尾静脉注射静脉内给予5mg/kg公称剂量的P218(游离酸)和通过灌胃法经口给予20mg/kg公称剂量的P195(酯前体药物)。剂量给药制剂与在上述大鼠研究中所使用的那些类似。通过心脏穿刺进行采血,每只小鼠进行一次取样,在剂量给药后的16小时内的每个时间点对2只小鼠进行采血。将血样分离并如上所述通过LCMS分析血浆。在P218的IV给药后和前体药物P195口服给药后的P218血浆浓度对时间曲线表示出在以下图9中。P218的血浆浓度保持高于定量的下限(LLQ=0.0014μM)达IV给药后7.5小时。在酯前体药物的口服给药后,酸P218的血浆浓度保持高于LLQ达剂量给药后16小时,且P218的生物利用度为约50%(通过将口服给药P195后的P218的剂量归一化的AUC数值相对IV给药P218后的P218的AUC相比较来测定)。在口服给药P195后在第一个血样(15min)中观察到P218的最大血浆浓度(Cmax),且前体药物P195的血浆浓度在所有时间点都低于定量下限(0.0014μM)。这些结果提示了酯前体药物在口服给药后的快速吸收和裂解,以释放酸P218。
本发明的各种改进和变化对于本领域技术人员来说是显而易见的,并不脱离本发明的范围和主旨。尽管已经在特定的优选实施方案方面描述了本发明,应该理解,所要求保护的本发明不应受到这种特定实施方案的过度限制。实际上,本领域技术人员可以理解的对用于实施本发明的所述方式的各种改进意旨在本发明范围内。