CN101801175A - 鉴定大豆中的大豆蚜虫抗性数量性状基因座的方法及其组合物 - Google Patents

Abstract

本发明属于植物育种和蚜虫抗性的领域。更具体地说，本发明包括用于培育含有与蚜虫-大豆蚜-抗性相关的数量性状基因座的大豆植物的方法。本发明进一步包括在育种计划中监测赋予蚜虫抗性的数量性状基因座(QTL)向优良种质内的渗入的方法。

Description

鉴定大豆中的大豆蚜虫抗性数量性状基因座的方法及其组合物

相关申请的交叉引用

本申请根据35U.S.C.§119(e)要求于2007年8月8日提交的美国临时申请60/963936的优先权。该申请的全部内容在此引入作为参考。

序列表的引入

序列表包含在2008年8月7日创建的、80,088个字节(在MicrosoftWindows中计数)的名为“53776seqlisting.txt”的文件中。该电子序列表以电子方式提交，并且引入本文作为参考。

技术领域

本发明属于植物育种领域。更具体地说，本发明包括使用与涉及大豆植物中的蚜虫抗性的数量性状基因座相关的标记筛选大豆属植物的方法和组合物。本发明进一步包括用于筛选与蚜虫抗性相关的大豆属植物的方法和基因组区域组合物。

背景技术

大豆，Glycine max(L.)Merril，是世界上的一种重要的经济作物，并且是植物油和蛋白质的主要来源(Sinclair和Backman，Compendium ofSoybean Diseases，3^rd Ed.APS Press，St.Paul，MN，p.106.(1989)。对低胆固醇和高纤维饮食的越来越多的需求也提高了大豆作为健康食物的重要性。

在美国种植的大豆品种具有很窄的遗传基础。六个引入种，‘Mandarin’、‘Manchu’、‘Mandarin’(Ottawa)、“Richland’、‘AK’(Harrow)和‘Mukden’，贡献了136个栽培种形式中代表的几乎70％的种质。迄今为止，现代栽培种可以回溯到这6个来自中国的大豆株。在Cox等人，Crop Sci.25：529-532(1988)进行的研究中，大豆种质包含90％的适应化的材料、9％的未适应的材料，只有1％来自外来物种。外来物种可以加宽栽培的大豆的遗传基础。另外，外来物种可以具有关键的性状，如抗病性、应激抗性和昆虫抗性。

大豆蚜虫，Aphis glycines Matsumura，在2001年被确定为大豆的新的昆虫害虫，并且到2003年在美国和加拿大的3个省扩大到超过21个状态(Vennette等人Ann Entomol Soc Am 97：217-226(2004))。高产量对于农民的利润率是关键的。大豆蚜虫可以引起超过50％的产量损失(Wang等人，Plant Protect 20：12-13(1994))。除了产量降低之外，杀虫剂使用的增多也可能降低农民的利润率。在2003年，美国中北部有超过700万英亩大豆喷洒杀虫剂以控制大豆蚜虫；2003年仅在中北部地区，估计杀虫剂处理费用即达8400-10500万美元(Landis等人NCR-125Arthropod biological control：state reports for 2003；Li等人，Mol Breeding19：25-34(2007))。

大豆蚜虫可以通过除去明显量的水和营养物，导致叶子变黄和萎蔫，而直接损害植物。另外，蚜虫向叶子和植物上排出蜜露—一种富含糖的粘性物质。蜜露通常导致烟霉的发展，烟霉影响光合作用，引起显著的产量损失(Gomez等人，Environ Exp Bot 55：77-86(2006))。大豆蚜虫携带大量的病毒，这些病毒可以阻碍植物生长、使叶子变形、引起叶子和茎的斑纹化、减少豆荚数和引起种子褪色。通过大豆蚜虫传播的病毒包括：大豆花叶病毒、黄花叶病毒、烟草蚀纹病毒和烟草叶脉斑点病毒(Wang等人Plant Dis 90：920-926(2006))。

宿主植物对昆虫的抗性通常是数量遗传的性状，并且不是主要的抗性基因。堆积的数量抗性比主要的抗性基因更持久，但是难以鉴定多个数量抗性和将其引入一个大豆品种中。与昆虫抗性相关的分子标记给育种者提供了更有效的用于数量性状和昆虫抗性的方法。大豆中的蚜虫抗性基因和QTL是已知的。它们的实例，包括Rag1，在大豆品种Dowling中鉴定，并且定位于连锁群M上(美国专利申请11/158,307)。另外，与蚜虫抗性相关的数量性状基因座在植物引入种(PI)567598B中鉴定，并且定位于连锁群B2、D1b、J和K(PCT/US2006/019200)。

植物育种领域需要鉴定大豆中与蚜虫抗性相关的另外的数量性状基因座。另外，需要快速、经济的测定大豆中是否存在蚜虫抗性基因座的方法。本发明提供一种使用单核苷酸多态性(SNP)技术筛查和选择包含与蚜虫抗性相关的数量性状基因座的大豆植物的方法。

发明内容

本发明提供在大豆植物中产生蚜虫抗性的方法。本发明涉及确定大豆植物(包括但不限于外来种质、群体、品系、优良品系、栽培种和品种)中是否存在提供蚜虫抗性的数量性状基因座的方法。本发明不限于任一种类型的蚜虫抗性性状，如蚜虫的抗生作用、排拒作用或驱性。更具体地说，本发明涉及关于鉴定与蚜虫抗性数量性状基因座(QTL)相关的分子标记的方法。本发明涉及分子标记用来筛选和选择大豆植物(包括但不限于外来种质、群体、品系、优良品系、栽培种和品种)内的蚜虫抗性的应用。

在一个优选实施方案中，本发明进一步提供与对一种或多种节肢动物的抗性相关的数量性状基因座，所述节肢动物包括但不限于鞘翅目(Coleoptera)，例如Cerotoma的种，如大豆叶甲(Cerotomatrifurcata)，Diabrotica的种，如黄瓜十一星叶甲(Diabroticaundecimpunctata howardi)，豆芫菁属(Epicauta)的种，如原野豆芫菁(Epicauta pestifera)，弧丽金龟属(Popilli)的种，如日本弧丽金龟(Popilliajaponica)，卧毛天牛属(Dectes)的种，如大豆茎天牛(Dectes texanustexanus)和Colaspis的种，如葡萄肖叶甲(Colaspis brunnea)，等等；直翅目(Orthoptera)，例如黑蝗属(Melanoplus)的种，如红足黑蝗(Melanoplus femurrubrum)，和沙漠蝗属(Shistocerca)的种，如美洲沙漠蝗(Shistocerca Americana)，等等；鳞翅目(Lepidoptera)，例如Plathypen的种，如绿夜蛾(Plathypena scabra)，Pseudoplusia的种，如大豆夜蛾(Pseudoplusia includens)，Anticarsia的种，如黎豆夜蛾(Anticarsia gemmatalis)，Epargyreus的种，如银星弄蝶(Epargyreusclarus)，顶灯蛾属(Estigmene)的种，如盐泽顶灯蛾(Estigmene acrea)，灰翅夜蛾属(Spodoptera)的种，如甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)，实夜蛾属(Heliothis)的种，如玉米夜蛾(Heliothis zea)和豆小卷蛾属(Matsumuraeses)的种，如豆小卷蛾(Matsumuraeses phaseoli)；半翅目(Hemiptera)，例如Acrosternum的种，如拟绿蝽(Acrosternum hilare)，美洲蝽属(Euschistus)的种，如褐美洲蝽(Euschistus servus)，绿蝽属(Nezara)的种，如稻绿蝽(Nezara viridula)；同翅目(Homoptera)，例如Spissistilus的种，如三角苜蓿跳虫(Spissistilus festinus)和蚜属(Aphis)的种，如大豆蚜(Aphis glycines)；缨翅目(Thysanoptera)，例如Sericothrips的种，如大豆蓟马(Sericothrips variabilis)。

在一个优选实施方案中，本发明进一步提供与线虫抗性相关的基因座，所述线虫包括但不限于异皮线虫属(Heterodera)的种，如大豆囊泡线虫(Heterodera glycines)，刺线虫属(Belonolaimus)的种，如刺线虫(Belonolaimus longicaudatus)，肾状线虫属(Rotylenchulus)的种，如肾形线虫(Rotylenchulus reniformis)，根结线虫属(Meloidogyne)的种，如南方根结线虫(Meloidogyne incognita)、花生根结线虫(Meloidogyne arenaria)和日本根结线虫(Meloidogyne javanica)。

本发明涉及产生蚜虫抗性植物、群体、品系、优良品系和品种。更特别地，本发明包括将蚜虫抗性等位基因渗入大豆植物中的方法，包括(A)使至少一个包含选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120的核酸序列的第一大豆植物与至少一个第二大豆植物杂交，以形成分离群体，(B)用一种或多种核酸标记筛查该分离群体，以确定一个或多个来自该分离群体的大豆植物是否含有该核酸序列，和(C)从该分离群体中选择一个或多个包含选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120的核酸序列的大豆植物。

本发明包括一种将等位基因渗入大豆植物中的方法，包括：(A)使至少一个蚜虫抗性大豆植物与至少一个蚜虫敏感性大豆植物杂交，以形成分离群体，(B)用一种或多种核酸标记筛查该分离群体，以确定一个或多个来自所述分离群体的大豆植物是否含有蚜虫抗性等位基因，其中所述蚜虫抗性等位基因是选自以下的等位基因：蚜虫抗性等位基因1、蚜虫抗性等位基因2、蚜虫抗性等位基因3、蚜虫抗性等位基因4、蚜虫抗性等位基因5、蚜虫抗性等位基因6、蚜虫抗性等位基因7、蚜虫抗性等位基因8、蚜虫抗性等位基因9、蚜虫抗性等位基因10、蚜虫抗性等位基因11、蚜虫抗性等位基因12、蚜虫抗性等位基因13、蚜虫抗性等位基因14、蚜虫抗性等位基因15、蚜虫抗性等位基因16、蚜虫抗性等位基因17、蚜虫抗性等位基因18、蚜虫抗性等位基因19、蚜虫抗性等位基因20、蚜虫抗性等位基因21、蚜虫抗性等位基因22、蚜虫抗性等位基因23、蚜虫抗性等位基因24、蚜虫抗性等位基因25、蚜虫抗性等位基因26、蚜虫抗性等位基因27、蚜虫抗性等位基因28、蚜虫抗性等位基因29、蚜虫抗性等位基因30、蚜虫抗性等位基因31、蚜虫抗性等位基因32、蚜虫抗性等位基因33、蚜虫抗性等位基因34、蚜虫抗性等位基因35、蚜虫抗性等位基因36、蚜虫抗性等位基因37and蚜虫抗性等位基因38、蚜虫抗性等位基因39和蚜虫抗性等位基因40。

本发明包括一种优良大豆植物，其包含选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120的核酸序列。

核酸序列的简要说明

SEQ ID NO：1是用于扩增SEQ ID NO：81的正向PCR引物。

SEQ ID NO：2是用于扩增SEQ ID NO：81的反向PCR引物。

SEQ ID NO：3是用于扩增SEQ ID NO：82的正向PCR引物。

SEQ ID NO：4是用于扩增SEQ ID NO：82的反向PCR引物。

SEQ ID NO：5是用于扩增SEQ ID NO：83的正向PCR引物。

SEQ ID NO：6是用于扩增SEQ ID NO：83的反向PCR引物。

SEQ ID NO：7是用于扩增SEQ ID NO：84的正向PCR引物。

SEQ ID NO：8是用于扩增SEQ ID NO：84的反向PCR引物。

SEQ ID NO：9是用于扩增SEQ ID NO：85的正向PCR引物。

SEQ ID NO：1O是用于扩增SEQ ID NO：85的反向PCR引物。

SEQ ID NO：11是用于扩增SEQ ID NO：86的正向PCR引物。

SEQ ID NO：12是用于扩增SEQ ID NO：86的反向PCR引物。

SEQ ID NO：13是用于扩增SEQ ID NO：87的正向PCR引物。

SEQ ID NO：14是用于扩增SEQ ID NO：87的反向PCR引物。

SEQ ID NO：15是用于扩增SEQ ID NO：88的正向PCR引物。

SEQ ID NO：16是用于扩增SEQ ID NO：88的反向PCR引物。

SEQ ID NO：17是用于扩增SEQ ID NO：89的正向PCR引物。

SEQ ID NO：18是用于扩增SEQ ID NO：89的反向PCR引物。

SEQ ID NO：19是用于扩增SEQ ID NO：90的正向PCR引物。

SEQ ID NO：20是用于扩增SEQ ID NO：90的反向PCR引物。

SEQ ID NO：21是用于扩增SEQ ID NO：91的正向PCR引物。

SEQ ID NO：22是用于扩增SEQ ID NO：91的反向PCR引物。

SEQ ID NO：23是用于扩增SEQ ID NO：92的正向PCR引物。

SEQ ID NO：24是用于扩增SEQ ID NO：92的反向PCR引物。

SEQ ID NO：25是用于扩增SEQ ID NO：93的正向PCR引物。

SEQ ID NO：26是用于扩增SEQ ID NO：93的反向PCR引物。

SEQ ID NO：27是用于扩增SEQ ID NO：94的正向PCR引物。

SEQ ID NO：28是用于扩增SEQ ID NO：94的反向PCR引物。

SEQ ID NO：29是用于扩增SEQ ID NO：95的正向PCR引物。

SEQ ID NO：30是用于扩增SEQ ID NO：95的反向PCR引物。

SEQ ID NO：31是用于扩增SEQ ID NO：96的正向PCR引物。

SEQ ID NO：32是用于扩增SEQ ID NO：96的反向PCR引物。

SEQ ID NO：33是用于扩增SEQ ID NO：97的正向PCR引物。

SEQ ID NO：34是用于扩增SEQ ID NO：97的反向PCR引物。

SEQ ID NO：35是用于扩增SEQ ID NO：98的正向PCR引物。

SEQ ID NO：36是用于扩增SEQ ID NO：98的反向PCR引物。

SEQ ID NO：37是用于扩增SEQ ID NO：99的正向PCR引物。

SEQ ID NO：38是用于扩增SEQ ID NO：99的反向PCR引物。

SEQ ID NO：39是用于扩增SEQ ID NO：100的正向PCR引物。

SEQ ID NO：40是用于扩增SEQ ID NO：100的反向PCR引物。

SEQ ID NO：41是用于扩增SEQ ID NO：101的正向PCR引物。

SEQ ID NO：42是用于扩增SEQ ID NO：101的反向PCR引物。

SEQ ID NO：43是用于扩增SEQ ID NO：102的正向PCR引物。

SEQ ID NO：44是用于扩增SEQ ID NO：102的反向PCR引物。

SEQ ID NO：45是用于扩增SEQ ID NO：103的正向PCR引物。

SEQ ID NO：46是用于扩增SEQ ID NO：103的反向PCR引物。

SEQ ID NO：47是用于扩增SEQ ID NO：104的正向PCR引物。

SEQ ID NO：48是用于扩增SEQ ID NO：104的反向PCR引物。

SEQ ID NO：49是用于扩增SEQ ID NO：105的正向PCR引物。

SEQ ID NO：50是用于扩增SEQ ID NO：105的反向PCR引物。

SEQ ID NO：51是用于扩增SEQ ID NO：106的正向PCR引物。

SEQ ID NO：52是用于扩增SEQ ID NO：106的反向PCR引物。

SEQ ID NO：53是用于扩增SEQ ID NO：107的正向PCR引物。

SEQ ID NO：54是用于扩增SEQ ID NO：107的反向PCR引物。

SEQ ID NO：55是用于扩增SEQ ID NO：108的正向PCR引物。

SEQ ID NO：56是用于扩增SEQ ID NO：108的反向PCR引物。

SEQ ID NO：57是用于扩增SEQ ID NO：109的正向PCR引物。

SEQ ID NO：58是用于扩增SEQ ID NO：109的反向PCR引物。

SEQ ID NO：59是用于扩增SEQ ID NO：110的正向PCR引物。

SEQ ID NO：60是用于扩增SEQ ID NO：110的反向PCR引物。

SEQ ID NO：61是用于扩增SEQ ID NO：111的正向PCR引物。

SEQ ID NO：62是用于扩增SEQ ID NO：111的反向PCR引物。

SEQ ID NO：63是用于扩增SEQ ID NO：112的正向PCR引物。

SEQ ID NO：64是用于扩增SEQ ID NO：112的反向PCR引物。

SEQ ID NO：65是用于扩增SEQ ID NO：113的正向PCR引物。

SEQ ID NO：66是用于扩增SEQ ID NO：113的反向PCR引物。

SEQ ID NO：67是用于扩增SEQ ID NO：114的正向PCR引物。

SEQ ID NO：68是用于扩增SEQ ID NO：114的反向PCR引物。

SEQ ID NO：69是用于扩增SEQ ID NO：115的正向PCR引物。

SEQ ID NO：70是用于扩增SEQ ID NO：115的反向PCR引物。

SEQ ID NO：71是用于扩增SEQ ID NO：116的正向PCR引物。

SEQ ID NO：72是用于扩增SEQ ID NO：116的反向PCR引物。

SEQ ID NO：73是用于扩增SEQ ID NO：117的正向PCR引物。

SEQ ID NO：74是用于扩增SEQ ID NO：117的反向PCR引物。

SEQ ID NO：75是用于扩增SEQ ID NO：118的正向PCR引物。

SEQ ID NO：76是用于扩增SEQ ID NO：118的反向PCR引物。

SEQ ID NO：77是用于扩增SEQ ID NO：119的正向PCR引物。

SEQ ID NO：78是用于扩增SEQ ID NO：119的反向PCR引物。

SEQ ID NO：79是用于扩增SEQ ID NO：120的正向PCR引物。

SEQ ID NO：80是用于扩增SEQ ID NO：120的反向PCR引物。

SEQ ID NO：81是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座1的基因组序列。

SEQ ID NO：82是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座1的基因组序列。

SEQ ID NO：83是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座1的基因组序列。

SEQ ID NO：84是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座1的基因组序列。

SEQ ID NO：85是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座2的基因组序列。

SEQ ID NO：86是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座3的基因组序列。

SEQ ID NO：87是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座4的基因组序列。

SEQ ID NO：88是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座5的基因组序列。

SEQ ID NO：89是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座6的基因组序列。

SEQ ID NO：90是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座7的基因组序列。

SEQ ID NO：91是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座8的基因组序列。

SEQ ID NO：92是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座8的基因组序列。

SEQ ID NO：93是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座9的基因组序列。

SEQ ID NO：94是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座10的基因组序列。

SEQ ID NO：95是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座11的基因组序列。

SEQ ID NO：96是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座12的基因组序列。

SEQ ID NO：97是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座13的基因组序列。

SEQ ID NO：98是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座14的基因组序列。

SEQ ID NO：99是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座15的基因组序列。

SEQ ID NO：100是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座16的基因组序列。

SEQ ID NO：101是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座16的基因组序列。

SEQ ID NO：102是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座16的基因组序列。

SEQ ID NO：103是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座17的基因组序列。

SEQ ID NO：104是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座18的基因组序列。

SEQ ID NO：105是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座19的基因组序列。

SEQ ID NO：106是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座20的基因组序列。

SEQ ID NO：107是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座21的基因组序列。

SEQ ID NO：108是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座21的基因组序列。

SEQ ID NO：109是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座22的基因组序列。

SEQ ID NO：110是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座23的基因组序列。

SEQ ID NO：111是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座23的基因组序列。

SEQ ID NO：112是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座24的基因组序列。

SEQ ID NO：113是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座25的基因组序列。

SEQ ID NO：114是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座26的基因组序列。

SEQ ID NO：115是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座26的基因组序列。

SEQ ID NO：116是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座27的基因组序列。

SEQ ID NO：117是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座28的基因组序列。

SEQ ID NO：118是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座28的基因组序列。

SEQ ID NO：119是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座28的基因组序列。

SEQ ID NO：120是来源于大豆的对应于蚜虫抗性基因座28的基因组序列。

SEQ ID NO：121是用于检测SEQ ID NO：81的SNP的探针。

SEQ ID NO：122是用于检测SEQ ID NO：81的SNP的探针。

SEQ ID NO：123是用于检测SEQ ID NO：82的SNP的探针。

SEQ ID NO：124是用于检测SEQ ID NO：82的SNP的探针。

SEQ ID NO：125是用于检测SEQ ID NO：83的SNP的探针。

SEQ ID NO：126是用于检测SEQ ID NO：83的SNP的探针。

SEQ ID NO：127是用于检测SEQ ID NO：84的SNP的探针。

SEQ ID NO：128是用于检测SEQ ID NO：84的SNP的探针。

SEQ ID NO：129是用于检测SEQ ID NO：85的SNP的探针。

SEQ ID NO：130是用于检测SEQ ID NO：85的SNP的探针。

SEQ ID NO：131是用于检测SEQ ID NO：86的SNP的探针。

SEQ ID NO：132是用于检测SEQ ID NO：86的SNP的探针。

SEQ ID NO：133是用于检测SEQ ID NO：87的SNP的探针。

SEQ ID NO：134是用于检测SEQ ID NO：87的SNP的探针。

SEQ ID NO：135是用于检测SEQ ID NO：88的SNP的探针。

SEQ ID NO：136是用于检测SEQ ID NO：88的SNP的探针。

SEQ ID NO：137是用于检测SEQ ID NO：89的SNP的探针。

SEQ ID NO：138是用于检测SEQ ID NO：89的SNP的探针。

SEQ ID NO：139是用于检测SEQ ID NO：90的SNP的探针。

SEQ ID NO：140是用于检测SEQ ID NO：90的SNP的探针。

SEQ ID NO：141是用于检测SEQ ID NO：91的SNP的探针。

SEQ ID NO：142是用于检测SEQ ID NO：91的SNP的探针。

SEQ ID NO：143是用于检测SEQ ID NO：92的SNP的探针。

SEQ ID NO：144是用于检测SEQ ID NO：92的SNP的探针。

SEQ ID NO：145是用于检测SEQ ID NO：93的SNP的探针。

SEQ ID NO：146是用于检测SEQ ID NO：93的SNP的探针。

SEQ ID NO：147是用于检测SEQ ID NO：94的SNP的探针。

SEQ ID NO：148是用于检测SEQ ID NO：94的SNP的探针。

SEQ ID NO：149是用于检测SEQ ID NO：95的SNP的探针。

SEQ ID NO：150是用于检测SEQ ID NO：95的SNP的探针。

SEQ ID NO：151是用于检测SEQ ID NO：96的SNP的探针。

SEQ ID NO：152是用于检测SEQ ID NO：96的SNP的探针。

SEQ ID NO：153是用于检测SEQ ID NO：97的SNP的探针。

SEQ ID NO：154是用于检测SEQ ID NO：97的SNP的探针。

SEQ ID NO：155是用于检测SEQ ID NO：98的SNP的探针。

SEQ ID NO：156是用于检测SEQ ID NO：98的SNP的探针。

SEQ ID NO：157是用于检测SEQ ID NO：99的SNP的探针。

SEQ ID NO：158是用于检测SEQ ID NO：99的SNP的探针。

SEQ ID NO：159是用于检测SEQ ID NO：100的SNP的探针。

SEQ ID NO：160是用于检测SEQ ID NO：100的SNP的探针。

SEQ ID NO：161是用于检测SEQ ID NO：101的SNP的探针。

SEQ ID NO：162是用于检测SEQ ID NO：101的SNP的探针。

SEQ ID NO：163是用于检测SEQ ID NO：102的SNP的探针。

SEQ ID NO：164是用于检测SEQ ID NO：102的SNP的探针。

SEQ ID NO：165是用于检测SEQ ID NO：103的SNP的探针。

SEQ ID NO：166是用于检测SEQ ID NO：103的SNP的探针。

SEQ ID NO：167是用于检测SEQ ID NO：104的SNP的探针。

SEQ ID NO：168是用于检测SEQ ID NO：104的SNP的探针。

SEQ ID NO：169是用于检测SEQ ID NO：105的SNP的探针。

SEQ ID NO：170是用于检测SEQ ID NO：105的SNP的探针。

SEQ ID NO：171是用于检测SEQ ID NO：106的SNP的探针。

SEQ ID NO：172是用于检测SEQ ID NO：106的SNP的探针。

SEQ ID NO：173是用于检测SEQ ID NO：107的SNP的探针。

SEQ ID NO：174是用于检测SEQ ID NO：107的SNP的探针。

SEQ ID NO：175是用于检测SEQ ID NO：108的SNP的探针。

SEQ ID NO：176是用于检测SEQ ID NO：108的SNP的探针。

SEQ ID NO：177是用于检测SEQ ID NO：109的SNP的探针。

SEQ ID NO：178是用于检测SEQ ID NO：109的SNP的探针。

SEQ ID NO：179是用于检测SEQ ID NO：110的SNP的探针。

SEQ ID NO：180是用于检测SEQ ID NO：110的SNP的探针。

SEQ ID NO：181是用于检测SEQ ID NO：111的SNP的探针。

SEQ ID NO：182是用于检测SEQ ID NO：111的SNP的探针。

SEQ ID NO：183是用于检测SEQ ID NO：112的SNP的探针。

SEQ ID NO：184是用于检测SEQ ID NO：112的SNP的探针。

SEQ ID NO：185是用于检测SEQ ID NO：113的SNP的探针。

SEQ ID NO：186是用于检测SEQ ID NO：113的SNP的探针。

SEQ ID NO：187是用于检测SEQ ID NO：114的SNP的探针。

SEQ ID NO：188是用于检测SEQ ID NO：114的SNP的探针。

SEQ ID NO：189是用于检测SEQ ID NO：115的SNP的探针。

SEQ ID NO：190是用于检测SEQ ID NO：115的SNP的探针。

SEQ ID NO：191是用于检测SEQ ID NO：116的SNP的探针。

SEQ ID NO：192是用于检测SEQ ID NO：116的SNP的探针。

SEQ ID NO：193是用于检测SEQ ID NO：117的SNP的探针。

SEQ ID NO：194是用于检测SEQ ID NO：117的SNP的探针。

SEQ ID NO：195是用于检测SEQ ID NO：118的SNP的探针。

SEQ ID NO：196是用于检测SEQ ID NO：118的SNP的探针。

SEQ ID NO：197是用于检测SEQ ID NO：119的SNP的探针。

SEQ ID NO：198是用于检测SEQ ID NO：119的SNP的探针。

SEQ ID NO：199是用于检测SEQ ID NO：120的SNP的探针。

SEQ ID NO：200是用于检测SEQ ID NO：120的SNP的探针。

SEQ ID NO：201是用于检测SEQ ID NO：82的SNP的探针。

SEQ ID NO：202是用于检测SEQ ID NO：82的SNP的探针。

SEQ ID NO：203是用于检测SEQ ID NO：83的SNP的探针。

SEQ ID NO：204是用于检测SEQ ID NO：83的SNP的探针。

SEQ ID NO：205是用于检测SEQ ID NO：84的SNP的探针。

SEQ ID NO：206是用于检测SEQ ID NO：84的SNP的探针。

SEQ ID NO：207是用于检测SEQ ID NO：100的SNP的探针。

SEQ ID NO：208是用于检测SEQ ID NO：100的SNP的探针。

SEQ ID NO：209是用于检测SEQ ID NO：111的SNP的探针。

SEQ ID NO：210是用于检测SEQ ID NO：111的SNP的探针。

SEQ ID NO：211是用于检测SEQ ID NO：117的SNP的探针。

SEQ ID NO：212是用于检测SEQ ID NO：117的SNP的探针。

SEQ ID NO：213是用于检测SEQ ID NO：119的SNP的探针。

SEQ ID NO：214是用于检测SEQ ID NO：119的SNP的探针。

SEQ ID NO：215是用于检测SEQ ID NO：120的SNP的探针。

SEQ ID NO：216是用于检测SEQ ID NO：120的SNP的探针。

SEQ ID NO：217是用于检测SEQ ID NO：82的SNP的探针。

SEQ ID NO：218是用于检测SEQ ID NO：83的SNP的探针。

SEQ ID NO：219是用于检测SEQ ID NO：84的SNP的探针。

SEQ ID NO：220是用于检测SEQ ID NO：100的SNP的探针。

SEQ ID NO：221是用于检测SEQ ID NO：111的SNP的探针。

SEQ ID NO：222是用于检测SEQ ID NO：117的SNP的探针。

SEQ ID NO：223是用于检测SEQ ID NO：119的SNP的探针。

SEQ ID NO：224是用于检测SEQ ID NO：120的SNP的探针。

发明详述

本发明提供28个位于大豆基因组中的连锁群A1、B1、B2、C1、D1a、D1b、E、F、G、H、I和O上的蚜虫抗性基因座，它们以前没有与蚜虫抗性相关联(表1)。本发明还提供能够赋予大豆蚜虫抗性的数量性状基因座(QTL)等位基因。提供了位于蚜虫抗性基因座1、蚜虫抗性基因座2、蚜虫抗性基因座3、蚜虫抗性基因座4、蚜虫抗性基因座5、蚜虫抗性基因座6、蚜虫抗性基因座7、蚜虫抗性基因座8、蚜虫抗性基因座9、蚜虫抗性基因座10、蚜虫抗性基因座11、蚜虫抗性基因座12、蚜虫抗性基因座13、蚜虫抗性基因座14、蚜虫抗性基因座15、蚜虫抗性基因座16、蚜虫抗性基因座17、蚜虫抗性基因座18、蚜虫抗性基因座19、蚜虫抗性基因座20、蚜虫抗性基因座21、蚜虫抗性基因座22、蚜虫抗性基因座23、蚜虫抗性基因座24、蚜虫抗性基因座25、蚜虫抗性基因座26、蚜虫抗性基因座27和蚜虫抗性基因座28处的等位基因。

在本发明中，蚜虫抗性基因座1位于连锁群J上。用来监测蚜虫抗性基因座1的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：84。与蚜虫抗性基因座1相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：81至SEQID NO：84)可以使用如SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：8所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：121至SEQ ID NO：128、SEQ ID NO：201至SEQ IF NO：206和SEQ ID NO：217至SEQ ID NO：219所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座2位于连锁群E上。用来监测蚜虫抗性基因座2的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：85。与蚜虫抗性基因座2相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：85)可以使用如SEQ ID NO：9至SEQ ID NO：10所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：129至SEQ ID NO：130所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座3位于连锁群E上。用来监测蚜虫抗性基因座3的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：86。与蚜虫抗性基因座3相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：86)可以使用如SEQ ID NO：11至SEQ ID NO：12所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：131至SEQ ID NO：132所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座4位于连锁群E上。用来监测蚜虫抗性基因座4的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：87。与蚜虫抗性基因座4相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：87)可以使用如SEQ ID NO：13至SEQ ID NO：14所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：133至SEQ ID NO：134所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座5位于连锁群B1上。用来监测蚜虫抗性基因座5的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：88。与蚜虫抗性基因座5相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：88)可以使用如SEQ ID NO：15至SEQ ID NO：16所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：135至SEQ ID NO：136所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座6位于连锁群N上。用来监测蚜虫抗性基因座6的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：89。与蚜虫抗性基因座6相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：89)可以使用如SEQ ID NO：17至SEQ ID NO：18所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：137至SEQ ID NO：138所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座7位于连锁群G上。用来监测蚜虫抗性基因座7的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：90。与蚜虫抗性基因座7相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：90)可以使用如SEQ ID NO：19至SEQ ID NO：20所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：139至SEQ ID NO：140所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座8位于连锁群N上。用来监测蚜虫抗性基因座8的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：91至SEQ ID NO 92。与蚜虫抗性基因座8相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：91至SEQID NO 92)可以使用如SEQ ID NO：21至SEQ ID NO：24所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：141至SEQ ID NO：144所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座9位于连锁群N上。用来监测蚜虫抗性基因座9的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：93。与蚜虫抗性基因座9相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：93)可以使用如SEQ ID NO：25至SEQ ID NO：26所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：145至SEQ ID NO：146所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座10位于连锁群A1上。用来监测蚜虫抗性基因座10的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：94。与蚜虫抗性基因座10相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：94)可以使用如SEQ IDNO：27至SEQ ID NO：28所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：147至SEQ ID NO：148所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座11位于连锁群A1上。用来监测蚜虫抗性基因座11的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：95。与蚜虫抗性基因座11相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：95)可以使用如SEQ IDNO：29至SEQ ID NO：30所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：149至SEQ ID NO：150所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座12位于连锁群D1a上。用来监测蚜虫抗性基因座12的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：96。与蚜虫抗性基因座12相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：96)可以使用如SEQ IDNO：31至SEQ ID NO：32所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：151至SEQ ID NO：152所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座13位于连锁群C2上。用来监测蚜虫抗性基因座13的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：97。与蚜虫抗性基因座13相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：97)可以使用如SEQ IDNO：33至SEQ ID NO：34所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：153至SEQ ID NO：154所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座14位于连锁群H上。用来监测蚜虫抗性基因座14的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：98。与蚜虫抗性基因座14相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：98)可以使用如SEQ IDNO：35至SEQ ID NO：36所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：155至SEQ ID NO：156所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座15位于连锁群H上。用来监测蚜虫抗性基因座15的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：99。与蚜虫抗性基因座15相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：99)可以使用如SEQ IDNO：37至SEQ ID NO：38所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：157至SEQ ID NO：158所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座16位于连锁群D2上。用来监测蚜虫抗性基因座16的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：100至SEQ ID NO：102。与蚜虫抗性基因座16相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：100至SEQ ID NO：102)可以使用如SEQ ID NO：39至SEQ ID NO：44所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：159至SEQ ID NO：162、SEQID NO：207至SEQ ID NO：208和SEQ ID NO：220所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座17位于连锁群F上。用来监测蚜虫抗性基因座17的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：103。与蚜虫抗性基因座17相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：103)可以使用如SEQ IDNO：45至SEQ ID NO：46所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：165至SEQ ID NO：166所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座18位于连锁群F上。用来监测蚜虫抗性基因座18的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：104。与蚜虫抗性基因座18相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：104)可以使用如SEQ IDNO：47至SEQ ID NO：48所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：167至SEQ ID NO：168所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座19位于连锁群I上。用来监测蚜虫抗性基因座19的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：105。与蚜虫抗性基因座19相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：105)可以使用如SEQ IDNO：49至SEQ ID NO：50所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：169至SEQ ID NO：170所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座20位于连锁群D1b上。用来监测蚜虫抗性基因座20的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：106。与蚜虫抗性基因座20相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：106)可以使用如SEQID NO：51至SEQ ID NO：52所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：171至SEQ ID NO：172所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座21位于连锁群D1b上。用来监测蚜虫抗性基因座21的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：107至SEQ ID NO.108。与蚜虫抗性基因座21相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：107至SEQ ID NO.108)可以使用如SEQ ID NO：53至SEQ ID NO：56所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：173至SEQ ID NO：176所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座22位于连锁群O上。用来监测蚜虫抗性基因座22的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：109。与蚜虫抗性基因座22相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：109)可以使用如SEQ IDNO：57至SEQ ID NO：58所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：177至SEQ ID NO：178所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座23位于连锁群O上。用来监测蚜虫抗性基因座23的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：110至SEQ ID NO：111。与蚜虫抗性基因座23相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：110至SEQ ID NO：111)可以使用如SEQ ID NO：59至SEQ ID NO：62所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：179至SEQ ID NO：182、SEQID NO：209至SEQ ID NO：210和SEQ ID NO：221所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座24位于连锁群C1上。用来监测蚜虫抗性基因座24的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：112。与蚜虫抗性基因座24相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：112)可以使用如SEQID NO：63至SEQ ID NO：64所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：183至SEQ ID NO：184所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座25位于连锁群C1上。用来监测蚜虫抗性基因座25的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：113。与蚜虫抗性基因座25相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：113)可以使用如SEQID NO：65至SEQ ID NO：66所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：185至SEQ ID NO：186所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座26位于连锁群C1上。用来监测蚜虫抗性基因座26的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：114至SEQ ID NO：115。与蚜虫抗性基因座26相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：114至SEQ ID NO：115)可以使用如SEQ ID NO：67至SEQ ID NO：70所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：187至SEQ ID NO：190所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座27位于连锁群K上。用来监测蚜虫抗性基因座27的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：116。与蚜虫抗性基因座27相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：116)可以使用如SEQ IDNO：71至SEQ ID NO：72所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：191至SEQ ID NO：192所示的探针检测。

在本发明中，蚜虫抗性基因座28位于连锁群B2上。用来监测蚜虫抗性基因座28的渗入的SNP标记是SEQ ID NO：117至SEQ ID NO：120。与蚜虫抗性基因座28相关的SNP标记DNA序列(SEQ ID NO：117至SEQ ID NO：120)可以使用如SEQ ID NO：73至SEQ ID NO：80所示的引物扩增，并且使用如SEQ ID NO：193至SEQ ID NO：200、SEQID NO：211-216和SEQ ID NO：222-223所示的探针检测。

本发明还提供了一种包含选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120及其互补序列的核酸序列的大豆植物。在一方面，所述大豆植物包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27或28个选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120、其片段和其互补序列的核酸序列。

本发明还提供了一种包含1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27或28蚜虫抗性基因座的大豆植物，其中在其一个或多个基因座处的一个或多个等位基因选自蚜虫抗性等位基因1、蚜虫抗性等位基因2、蚜虫抗性等位基因3、蚜虫抗性等位基因4、蚜虫抗性等位基因5、蚜虫抗性等位基因6、蚜虫抗性等位基因7、蚜虫抗性等位基因8、蚜虫抗性等位基因9、蚜虫抗性等位基因10、蚜虫抗性等位基因11、蚜虫抗性等位基因12、蚜虫抗性等位基因13、蚜虫抗性等位基因14、蚜虫抗性等位基因15、蚜虫抗性等位基因16、蚜虫抗性等位基因17、蚜虫抗性等位基因18、蚜虫抗性等位基因19、蚜虫抗性等位基因20、蚜虫抗性等位基因21、蚜虫抗性等位基因22、蚜虫抗性等位基因23、蚜虫抗性等位基因24、蚜虫抗性等位基因25、蚜虫抗性等位基因26、蚜虫抗性等位基因27、蚜虫抗性等位基因28、蚜虫抗性等位基因29、蚜虫抗性等位基因30、蚜虫抗性等位基因31、蚜虫抗性等位基因32、蚜虫抗性等位基因33、蚜虫抗性等位基因34、蚜虫抗性等位基因35、蚜虫抗性等位基因36、蚜虫抗性等位基因37、蚜虫抗性等位基因38、蚜虫抗性等位基因39和蚜虫抗性等位基因40。这些等位基因可以是纯合的或杂合的。

本文使用的蚜虫是指同翅目(Homoptera)、进一步是指蚜科的各种吸吮植物的小的软体昆虫中的任何一种，其中蚜科的例子包括但不限于以下属：Acyrthosiphon、奇圆尾蚜属(Allocotaphis)、Amphorophora、短痣蚜属(Anoecia)、圆尾蚜属(Anuraphis)、爪棉蚜属(Aphidoounguis)、Aphidoura、蚜属(Aphis)、Asiphonaphis、舞蚜属(Astegopteryx)、粗额蚜属(Aulacorthum)、桦斑蚜属(Betacallis)、桦蚜属(Betulaphis)、Boernerina、短尾蚜属(Brachycaudus)、小管蚜属(Brachycorynella)、短棒蚜属(Brevicoryne)、长角斑蚜属(Calaphis)、带斑蚜属(Callipterinella)、Callipterus、二尾蚜属(Cavariella)、坚蚜属(Cerataphis)、粉角蚜属(Ceratovacuna)、Chaetomyzus、中瘤钉毛蚜属(Chaetosiphon)、毛蚜属(Chaitophorus)、毛角蚜属(Chaitoregma)、黑斑蚜属(Chromaphis)、长足大蚜属(Cinara)、刻斑蚜属(Clethrobius)、Clydesmithia、卡蚜属(Coloradoa)、Cornaphis、隐瘤蚜属(Cryptomyzus)、Crypturaphis、Doralis、一条角蚜属(Doraphis)、Drepanaphis、Drepanosiphoniella、长镰管蚜属(Drepanosiphum)、西圆尾蚜属(Dysaphis)、Eomacrosiphum、Epipemphigus、石冠蚜属(Ericolophium)、绵蚜属(Eriosoma)、Essigella、绵斑蚜属(Euceraphis)、长大蚜属(Eulachnus)、Eumyzus、真毛管蚜属(Eutrichosiphum)、缨蚜属(Fimbriaphis)、Fullawaya、Geopemphigus、雕蚜属(Glyphina)、Gootiella、毛管蚜属(Greenidea)、Grylloprociphilus、五节扁蚜属(Hamamelistes)、Hannabura、扁蚜属(Hormaphis)、明蚜属(Hyadaphis)、玻瘤蚜属(Hyalomyzus)、大尾蚜属(Hyalopterus)、Hyperomyza、超瘤蚜属(Hyperomyzus)、尾草蚜属(Hysteroneura)、伊州蚜属(Illinoia)、印蚜属(Indiaphis)、印马蚜属(Indomasonaphis)、卡基米蚜属(Kakimia)、大蚜属(Lachnus)、赖毛蚜属(Laingia)、Lambersaphis、Latgerina、长尾蚜属(Longicaudus)、长痣大蚜属(Longistigma)、长管瘤蚜属(Macromyzus)、小长管蚜属(Macrosiphoniella)等，甚至进一步以下属种中的任何一种或多种：蚜科，例如大豆蚜Aphis glycines、菜豆蚜Aphis fabae、棉蚜Aphis gossypii、玫瑰蚜Macrosiphun rosae(蔷薇长管蚜)、桃蚜Myzus persicae、玉米叶蚜Rhopalosiphum maidis、斑点紫花苜蓿蚜Therioaphis maculata、苹果棉蚜Eriosoma lanigerum等。

本文使用的大豆蚜Aphis glycines和Aphis glycines Matasamura是指以大豆为食的蚜虫。但是，任何在大豆植物上发现并且以此为食的蚜虫，如菜豆蚜Aphis fabae，是大豆中蚜虫抗性的目标，并且在本发明的范围内。本发明的大豆植物可以抵抗一种或多种侵袭大豆植物的蚜虫。一方面，本发明提供蚜虫抗性植物以及根据对蚜属引起的蚜虫的抗性或敏感性筛选大豆植物的方法和组合物。在一个优选方面，本发明提供根据对大豆蚜(Aphis glycines)的抗性或敏感性筛选大豆植物的方法和组合物。

一方面，植物选自大豆属(Glycine)。大豆植物，包括但不限于外来种质、群体、品系、优良品系、栽培种和品种。

如本文使用的大豆植物是指豆科(Fabaceae)的植物，在此以最广义的范围使用，包括但不限于大豆的任何种，例如大豆属的种。大豆植物可以是Glycine arenaria、Glycine argyrea、Glycine canescens、Glycine clandestine、Glycine curvata、Glycine cyrtoloba、Glycinefalcate、Glycine latifolia、Glycine latrobeana、Glycine max、Glycinemicrophylla、Glycine pescadrensis、Glycine pindanica、Glycinerubiginosa、野大豆(Glycine soja)、大豆属的种(Glycine sp.)、Glycinestenophita、Glycine tabacina和短绒野大豆(Glycine tomentella)。

本发明的植物可以是具有非常高的抗性、抗性、基本抗性、中度抗性、相当的抗性、部分抗性、中度敏感的或敏感的大豆植物。

如本文所用的术语抗性的、抗性和宿主植物抗性是指宿主植物预防或减少选自昆虫、线虫、病原体、真菌、病毒和病害的害虫侵扰和损害的能力。

如本文所用的术语排拒作用或非偏好抗性是指植物排斥昆虫、引起产卵和进食减少的能力。

如本文所用的术语抗生作用是指植物降低以该植物为食的昆虫的存活力、生长或繁殖的能力。

如本文所用的术语耐受性是指当给予相似数量的昆虫时，宿主植物比其它植物产生具有良好质量的更大产量的能力。

在一个优选方面，本发明提供一种大豆植物，将要通过任何方法测定该大豆植物的蚜虫抗性或敏感性，以确定该大豆植物是否具有非常高的抗性、抗性、中度抗性、中度敏感性或敏感性。

在该方面，通过目视估计植物上的蚜虫数测定植物的蚜虫抗性或敏感性(Mensah等人Crop Sci 25：2228-2233(2005))。

如本文所用的蚜虫抗性是指预防或抑制蚜虫引起宿主植物损害的能力，如减少进食、延迟生长和发育、降低繁殖力等。

在另一方面，大豆植物可以显示与非抗性对照大豆植物相当的抗性。在此方面，对照大豆植物除了所述一个或多个蚜虫抗性等位基因以外，优选地是遗传上相似的。这些植物可以在相同或接近相同的害虫暴露的类似条件下生长。在此方面，与已知的敏感植物相比，一个或多个抗性植物在每株植物上具有显著较少的蚜虫，或者每株抗性植物具有较少的损害，并且每株植物上具有与已知抗性植物相等的蚜虫数或损害。

如本文所用的术语数量性状基因座和QTL是指影响连续变化的性状如产量或抗性的表型变化的基因组区域。QTL可以包括多个基因或其它遗传因素，甚至在连续基因组区域或连锁群内。

如本文所用的术语单核苷酸多态性和SNP是指两个DNA序列之间的单碱基差异。

如本文所用的术语寡核苷酸是指由两个或多个脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸组成的分子。

如本文所用的术语引物是指与给定核苷酸序列互补的并且是启动聚合酶的复制所需的寡核苷酸。

如本文所用的术语探针是指能够与另一目标寡核苷酸杂交的寡核苷酸。探针可以是单链或双链的寡核苷酸。探针可用于特定核苷酸序列的检测、鉴定或分离。

如本文所用的术语基因是指包含内含子、非翻译区和控制区和产生RNA、多肽或多肽的前体所需的编码序列的核酸序列。

如本文所用的术语标记、DNA标记和遗传标记是指性状，包括遗传性状，如DNA序列基因座等位基因染色体特征同工酶，和形态特征，它可以用来检测个体或群体中的基因或性状的存在或位置。

如本文所用的诊断标记是指可以检测或鉴定性状的遗传标记，例如蚜虫抗性、锈菌抗性和产量。

本发明的抗性QTL可以被引入到优良大豆品系中。在此，“品系”是指来自相似的谱系、具有相似的性状的一组个体植物。“优良品系”指通过对较好的农艺学表现进行育种和选择而产生的任何株系。另外，优良品系足够同源和纯合，能够用于商业生产。优良品系可以用于进一步的育种工作以开发新的优良品系。

本发明的蚜虫抗性QTL也可以被引入包含一种或多种转基因的大豆品系中，该转基因植物包含编码以下性状的一种或多种基因：除草剂耐受性、产量增加、昆虫控制、真菌病抗性、病毒抗性、线虫抗性、细菌病抗性、支原体病抗性、油产生改变、高产油量、高蛋白质产量、发芽和幼苗生长的控制、动物和人类营养增强、低棉子糖、环境应激抗性、可消化性提高、工业酶、药用蛋白质、肽和小分子、加工性状改善、风味改善、固氮、杂种种子的产生、变应原性降低、生物聚合物和生物燃料等。这些农艺学性状可通过植物生物技术方法在大豆中作为转基因提供。

一种或多种蚜虫抗性QTL等位基因可以从任何包含该等位基因的植物(供体)引入到任何接受体大豆植物中。一方面，接受体大豆植物可以包含另外的蚜虫抗性基因座。另一方面，接受体大豆植物可以包含转基因。另一方面，在保持引入的QTL的同时，可以通过回交或其它合适的方法来减少提供蚜虫抗性QTL的植物的遗传贡献。一方面，来自大豆植物中的供体材料的核遗传物质可能少于或是大约50％、少于或是大约25％、少于或是大约13％、少于或是大约5％、3％、2％或1％，但该遗传物质包含一种或多种感兴趣的蚜虫抗性基因座。

含有所述的一个或多个蚜虫抗性基因座的植物可以是供体植物。含有抗性基因座的蚜虫植物可以是，例如通过使用能够检测与抗性相关的标记多态性的核酸分子进行筛选。在一方面，供体植物是PI594427C。在优选的一方面，供体植物是蚜虫抗性基因座1、2、4、6、7、8、9、11、13、15、16、17、18、19、20、21、22、23、27和28的来源。在另一方面，供体植物是大豆品种MV0031。在另一优选的方面，供体植物是蚜虫抗性基因座2、5、8、10、25和26的来源。在另一方面，供体植物是大豆品种CNS(PI 548445)。在另一优选的方面，供体植物是蚜虫抗性基因座3、12、14和24的来源。供体植物是可以是敏感系。在一方面，供体植物也可以是接受体大豆植物。

如本文所用的成熟期组是指基于植物最佳适应和最大生产能力的纬度范围对品种组的工业划分。大豆品种被分类为13个认可的成熟期组，命名为成熟期组000、00、0和I至X，其中000表示最早熟的品种，X代表最晚熟的品种。成熟期组000至IV中的大豆植物具有不确定的植物习性，而成熟期组V至X中的大豆植物具有确定的生长习性。在本文中，确定的生长习性是指在主茎终止于一簇成熟豆荚后停止营养生长。在本文中，不确定的生长习性是指叶和花在其生殖期的一部分中同时发育，在顶端处具有1至3个豆荚。早熟品种(000至IV)适应具有较长日长的北方纬度，在具有较短日长的南方纬度成熟期代码增大。

在本文中，相对成熟期是指将成熟期组以十分之一为单位细分的大豆植物成熟期组，例如III.5。相对成熟期提供更精确的成熟期。小数点之后的数字是指成熟期组的相对早熟或晚熟，例如IV.2是早熟组IV品种，IV.9是晚熟组IV。

进一步理解，本发明的大豆植物可以显示任何相对成熟期组的特征。一方面，相对成熟期组选自组000.1-000.9、00.1-00.9、0.1-0.9、I.1-I.9、II.1-II.9、III.1-III.9、IV.1-IV.9、V.1-V.9、VI.1-VI.9、VII.1-VII.9、VIII.1-VIII.9、IX.1-IX.9和X.1-X.9。选择的大豆植物的花粉可以低温贮藏，并且用于与来自其它成熟期组的大豆品系杂交，以使蚜虫抗性基因座渗入到正常情况下无法用于自然杂交的品系中。花粉低温贮藏技术是本领域公知的(Tyagi和Hymowitz，Cryo letters 24：119-124(2003)，Liang等人Acta Botanica Sinica 35：733-738(1993))。

QTL的蚜虫抗性效果可能随亲本基因型和测定蚜虫抗性的环境因素而变化。植物育种领域的技术人员不需要过多的实验就可以使用此处所述的方法从植物群体或亲本基因型集合中选择那些当含有蚜虫抗性基因座时导致蚜虫抗性比亲本基因型增强的植物。在此，侵扰可以是由昆虫、真菌、病毒、细菌或无脊椎动物引起的。

已经报道了大豆的大量分子遗传图谱(Mansur等人，Crop Sci.36：1327-1336(1996)，Shoemaker等人，Genetics 144：329-338(1996)；Shoemaker等人，Crop Science 32：1091-1098(1992)，Shoemaker等人，Crop Science 35：436-446(1995)；Tinley和Rafalski，J.Cell Biochem.Suppl.14E：291(1990)，)；Cregan等人，Crop Science 39：1464-1490(1999)。大豆(Glycine max)、野大豆(Glycine soja)和Glycine max x.Glycine soja具有共同的连锁群(Shoemaker等人，Genetics 144：329-338(1996))。连锁群(LG)是倾向于从一代向另一代共同遗传的一组基因。此处使用的大豆的连锁群(LG)，J、E、B1、N、A1、Dla Q、H、D1、F、I D1b+W、O C1和B2是指对应于大豆遗传图谱的连锁群J、E、B1、N、A1、D1a_Q、H、D1、F、I D1b+W、O C1和B2的连锁群(Mansur等人，Crop Science 36：1327-1336(1996)；Cregan等人，CropScience 39：1464-1490(1999)和Soybase，Agricultural Research Service，United States Department of Agriculture)。

QTL的等位基因当然可以包含多个基因或其它遗传因素，甚至在连续基因组区域或连锁群如单元型内。连锁群是在同一染色体上携带的一组基因座。单元型是与一条染色体上的DNA区段紧密连锁并且倾向于作为单位遗传的一组遗传标记。如本文所用的，抗性基因座的等位基因可以包含一个以上的基因或其它遗传因素，其中，每个单独的基因或遗传组分也能够显示等位基因变异，并且其中每个基因或遗传因素也能够引发对所述数量性状的表型效应。在本发明的一方面，QTL的等位基因包含也能够显示等位基因变异的一个或多个基因或其它遗传因素。术语“QTL的等位基因”的使用并不排除包含一个以上的基因或其它遗传因素的QTL。特别是，本发明中的“QTL的等位基因”可以表示单元型窗口中的单元型，其中表型可以是害虫抗性。单元型窗口是可以用一组一个或多个多态性标记定义和示踪的连续的基因组区域，其中，多态性指示谱系同一性。该窗口中的单元型可以通过每个标记处的等位基因的独特指纹确定。如本文所用的，等位基因是占据染色体上给定基因座的基因的几种替代形式之一。当染色体上的给定基因座处存在的所有等位基因相同时，该植物在该基因座处是纯合的。如果染色体上的给定基因座处存在的等位基因不同，该植物在该基因座处是杂合的。本发明的植物在任何特定的蚜虫抗性基因座处或对于特定的多态性标记，可能是纯合或杂合的。

本发明也提供了本发明的植物的部分。植物部分包括但不限于，种子、胚乳、胚珠和花粉。在本发明的特别优选的方面，植物部分是种子。

本发明的植物或其部分可以在培养基中培养和再生。从各种组织类型再生大豆植物的方法和大豆的组织培养方法是本领域已知的(参见，例如，Widholm等人，In Vitro Selection and Culture-inducedVariation in Soybean，In Soybean：Genetics，Molecular Biology andBiotechnology，Verma和Shoemaker编，CAB International，Wallingford，Oxon，England(1996))。如大豆的植物的再生技术可以使用多种组织或细胞类型作为起始原料。尤其是对于大豆，已经开发了再生方法，其开始于某些分化的组织类型，如，分生组织(Cartha等人，Can.J.Bot.59：1671-1679(1981))、下胚轴节(Cameya等人，Plant Science Letters 21.：289-294(1981))和茎节点段(Saka等人，Plant Science Letters，19：193-201(1980)；Cheng等人，Plant Science Letters，19：91-99(1980))。已报道了由未成熟大豆胚的外植体产生的体细胞胚再生完整的性成熟的大豆植物(Ranch等人，In Vitro Cellular & Developmental Biology 21：653-658(1985))。也已报道了通过器官发生和胚发生从组织培养物再生成熟大豆植物(Barwale等人，Planta 167：473-481(1986)；Wright等人，PlantCell Reports 5：150-154(1986))。

本发明也提供一种通过针对大豆植物中的蚜虫抗性或敏感性进行筛查而选择的蚜虫抗性大豆植物，所述选择包括探询基因组核酸中是否存在与大豆植物中的蚜虫抗性相关的QTL的等位基因遗传连锁的标记分子，其中QTL的等位基因也位于与蚜虫抗性大豆相关的连锁群上。

本发明包括一种将蚜虫抗性等位基因渗入大豆植物中的方法，包括：(A)使至少一个包含选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120的核酸序列的第一大豆植物与至少一个第二大豆植物杂交，以形成分离群体，(B)用一种或多种核酸标记筛查该分离群体，以确定来自该分离群体的一个或多个大豆植物是否含有该核酸序列，和(C)从该分离群体中选择一个或多个包含选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120的核酸序列的大豆植物。

本发明包括一种将等位基因渗入大豆植物中的方法，包括：(A)使至少一个蚜虫抗性大豆植物与至少一个蚜虫敏感性大豆植物杂交，以形成分离群体，(B)用一种或多种核酸标记筛查所述分离群体，以确定来自所述分离群体的一个或多个大豆植物是否含有蚜虫抗性基因座，其中所述蚜虫抗性等位基因是选自蚜虫抗性等位基因1、蚜虫抗性等位基因2、蚜虫抗性等位基因3、蚜虫抗性等位基因4、蚜虫抗性等位基因5、蚜虫抗性等位基因6、蚜虫抗性等位基因7、蚜虫抗性等位基因8、蚜虫抗性等位基因9、蚜虫抗性等位基因10、蚜虫抗性等位基因11、蚜虫抗性等位基因12、蚜虫抗性等位基因13、蚜虫抗性等位基因14、蚜虫抗性等位基因15、蚜虫抗性等位基因16、蚜虫抗性等位基因17、蚜虫抗性等位基因18、蚜虫抗性等位基因19、蚜虫抗性等位基因20、蚜虫抗性等位基因21、蚜虫抗性等位基因22、蚜虫抗性等位基因23、蚜虫抗性等位基因24、蚜虫抗性等位基因25、蚜虫抗性等位基因26、蚜虫抗性等位基因27、蚜虫抗性等位基因28、蚜虫抗性等位基因29、蚜虫抗性等位基因30、蚜虫抗性等位基因31、蚜虫抗性等位基因32、蚜虫抗性等位基因33、蚜虫抗性等位基因34、蚜虫抗性等位基因35、蚜虫抗性等位基因36、蚜虫抗性等位基因37、蚜虫抗性等位基因38、蚜虫抗性等位基因39和蚜虫抗性等位基因40的等位基因。

本发明包括核酸分子。这些分子包括那些能够检测与蚜虫抗性基因座遗传或物理连锁的多态性的核酸分子。这些分子可以被称为标记。可以通过现有技术获得与蚜虫抗性基因座1、蚜虫抗性基因座2、蚜虫抗性基因座3、蚜虫抗性基因座4、蚜虫抗性基因座5、蚜虫抗性基因座6、蚜虫抗性基因座7、蚜虫抗性基因座8、蚜虫抗性基因座9、蚜虫抗性基因座10、蚜虫抗性基因座11、蚜虫抗性基因座12、蚜虫抗性基因座13、蚜虫抗性基因座14、蚜虫抗性基因座15、蚜虫抗性基因座16、蚜虫抗性基因座17、蚜虫抗性基因座18、蚜虫抗性基因座19、蚜虫抗性基因座20、蚜虫抗性基因座21、蚜虫抗性基因座22、蚜虫抗性基因座23、蚜虫抗性基因座24、蚜虫抗性基因座25、蚜虫抗性基因座26、蚜虫抗性基因座27和蚜虫抗性基因座28连锁的另外的标记。一方面，核酸分子能够检测是否存在位于距离蚜虫抗性基因座小于50、40、30、20、10、5、2或1厘摩(centimorgans)的标记。另一方面，使用Qgene Version 2.23(1996)和默认参数进行蚜虫抗性测定，标记显示2或更高、3或更高、4或更高的LOD得分。另一方面，核酸分子能够检测选自蚜虫抗性基因座1、蚜虫抗性基因座2、蚜虫抗性基因座3、蚜虫抗性基因座4、蚜虫抗性基因座5、蚜虫抗性基因座6、蚜虫抗性基因座7、蚜虫抗性基因座8、蚜虫抗性基因座9、蚜虫抗性基因座10、蚜虫抗性基因座11、蚜虫抗性基因座12、蚜虫抗性基因座13、蚜虫抗性基因座14、蚜虫抗性基因座15、蚜虫抗性基因座16、蚜虫抗性基因座17、蚜虫抗性基因座18、蚜虫抗性基因座19、蚜虫抗性基因座20、蚜虫抗性基因座21、蚜虫抗性基因座22、蚜虫抗性基因座23、蚜虫抗性基因座24、蚜虫抗性基因座25、蚜虫抗性基因座26、蚜虫抗性基因座27和蚜虫抗性基因座28的基因座中的标记。在进一步的方面，核酸分子选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120、其片段、其互补物和能够与这些核酸分子中的一种或多种特异性杂交的核酸分子。

在一个优选方面，本发明的核酸分子包括在中度严格条件下(例如在大约2.0xSSC和大约65℃下)与SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120所示的一种或多种核酸分子或其互补序列或其中任一个的片段特异性杂交的核酸分子。在特别优选的一方面，本发明的核酸分子在高严格条件下与SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120所示的一种或多种核酸分子或其中任一个的互补分子或片段特异性杂交。在本发明的一方面，本发明的优选的标记核酸分子具有SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120所示的核酸序列或其互补序列或其中任一个的片段。在本发明的另一方面，本发明的优选的标记核酸分子与SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120所示的核酸序列或其互补序列或其中任一个的片段共有80％-100％或90％-100％的序列同一性。在本发明的进一步的一方面，本发明的优选的标记核酸分子与SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120所示的核酸序列或其互补序列或其中任一个的片段共有95％-100％的序列同一性。在本发明的更优选的一方面，本发明的优选的标记核酸分子与SEQ IDNO：81至SEQ ID NO：120所示的核酸序列或其互补序列或其中任一个的片段共有98％-100％的序列同一性。

核酸分子或其片段在某些情况下能够与其它核酸分子特异性杂交。如本文所用，如果两个核酸分子能够形成反平行双链核酸结构，那么这两个分子能够彼此特异性杂交。如果它们表现出完全的互补性，则一核酸分子与另一核酸分子“互补”。如本文所用，当一个分子的每个核苷酸都与另一分子的核苷酸互补时，这两个分子显示“完全互补”。如果两个分子在至少常规的“低严格”的条件下能互相杂交，具有足够的稳定性，从而允许它们保持彼此退火，那么这两个分子是“最低限度互补的”。类似地，如果两个分子在常规的“高严格”的条件下能互相杂交，具有足够的稳定性，从而允许它们保持彼此退火，那么这两个分子是“互补的”。Sambrook等人，In：Molecular Cloning，A LaboratoryManual，2nd Edition，Cold Spring Harbor Press，Cold Spring Harbor，NewYork(1989)与Haymes等人，In：Nucleic Acid Hybridization，A PracticalApproach，IRL Press，Washington，DC(1985)描述了常规的严格条件。因而偏离完全互补性是允许的，只要这种偏离没有完全消除该分子形成双链结构的能力。为了使核酸分子作为引物或探针，只需要在序列上充分互补，以在所采用的特定的溶剂和盐浓度下能够形成稳定的双链结构。

如本文所用，基本上同源的序列是在高严格条件下与所比较的核酸序列的互补序列特异性杂交的核酸序列。本发明的核酸探针和引物可以在严格条件下与靶DNA序列杂交。术语“严格的杂交条件”定义为在该条件下，探针或引物特异性地与靶序列杂交而不与非靶序列杂交，这可以根据经验确定。术语“严格的条件”是功能上的定义，涉及通过Sambrook等人，1989，9.52-9.55所述的具体的杂交程序，核酸探针与靶核酸(即，与感兴趣的特定核酸序列)的杂交。也参见Sambrook等人，19899.47-9.52，9.56-9.58；Kanehisa 1984 Nucl.Acids Res.12：203-213；Wetmur等人1968 J.Mol.Biol.31：349-370。促进DNA杂交的合适的严格条件是，例如，大约45℃、6.0x氯化钠/柠檬酸钠(SSC)，接着50℃、2.0x SSC洗涤，这是本领域的技术人员已知的，或可以在Current Protocols in Molecular Biology，John Wiley & Sons，N.Y.，1989，6.3.1-6.3.6中找到。例如，洗涤步骤中的盐浓度可以从大约2.0x SSC、50℃的低严格条件到大约0.2xSSC、50℃的高严格条件中选择。另外，洗涤步骤中的温度可以从低严格条件的室温大约22℃增加到高严格条件的大约65℃。温度和盐都可以变化，或者，温度或盐浓度可以保持不变，而另一个变量发生变化。

对于高严格性，例如使用DNA或RNA探针或引物的杂交可以在65℃下在6xSSC，0.5％SDS，5xDenhardt’s，100μtg/mL非特异性DNA(例如，超声处理的鲑精DNA)中进行，于65℃用0.5xSSC，0.5％SDS洗涤。

本发明考虑，如果保持探针或引物与靶序列结合的特异性，可以使用如较低的杂交和/或洗涤温度的较低严格杂交条件，来确认具有较低的序列相似性的相关的序列。因此，本发明的核苷酸序列可用于选择性地与DNA、RNA或cDNA片段的互补延伸形成双链分子的能力。

核酸分子片段可以是任何大小的片段，且示例性的片段包括SEQID NO：81至SEQ ID NO：120所示的核酸序列及其互补序列的片段。一方面，片段可以是15-25、15-30、15-40、15-50、15-100、20-25、20-30、20-40、20-50、20-100、25-30、25-40、25-50、25-100、30-40、30-50及30-100。另一方面，片段可以是大于10、15、20、25、30、35、40、50、100或250个核苷酸。

另外的遗传标记可以用来选择具有与本发明大豆的蚜虫抗性相关的QTL的等位基因的植物。公共标记数据库的例子包括，例如：Soybase，Agricultural Research Service，United States Department ofAgriculture。

一种遗传标记是在染色体上具有已知位置并且与特定性状或基因相关的DNA序列。与蚜虫抗性相关的遗传标记可以用来确定个体植物是否是蚜虫抗性的。

本发明的遗传标记包括“显性”或“共显性”标记。“共显性标记”揭示两个或多个等位基因的存在(每个二倍体个体中有两个)。“显性标记”揭示只存在一个等位基因。显性标记表型(例如，DNA带)的存在表明在纯合或杂合条件下存在一个等位基因。不存在显性标记表型(例如，不存在DNA带)仅能证明存在“某些其它”不明确的等位基因。在群体中的个体主要是纯合的且基因座主要是二态性(dimorphic)的情况下，显性和共显性标记可能具有同样的价值。随着群体变得越来越杂合和多等位基因化(multiallelic)，共显性标记往往比显性标记提供更多的基因型信息。

可以使用与本发明的QTL的等位基因遗传连锁或相关的标记，如单序列重复标记(SSR)、AFLP标记、RFLP标记、RAPD标记、表型标记、SNP、同工酶标记、微阵列转录概况(Walton，1993；Burow等人1988)。分离这些标记的方法是本领域中已知的。

通过使用核酸扩增方法可有利于DNA、RNA或cDNA样品中的多态性位点的检测。这些方法特异性地增加了跨越多态性位点或包含该位点和位于其远端或近端的序列的多核苷酸的浓度。这些扩增的分子可以通过凝胶电泳、荧光检测方法或其它方法很容易地检测。

实现这种扩增的一种方法采用聚合酶链反应(PCR)(Mullis等人1986Cold Spring Harbor Symp.Quant.Biol.51：263-273；欧洲专利50,424；欧洲专利84,796；欧洲专利258,017；欧洲专利237,362；欧洲专利201,184；美国专利4,683,202；美国专利4,582,788；和美国专利4,683,194)，其中使用能够与以双链形式限定多态性的近端序列杂交的引物对。

为了QTL作图，包括的标记应当是来源特征性的，以对随后的群体作出推断。SNP标记对于作图是理想的，因为特定的SNP等位基因源自特定物种的现存群体中的独立来源的可能性较低。因此，SNP标记可用于示踪和辅助QTL的渗入，特别是在单元型的情况下。

可以通过基因作图模型建立另外的标记分子的遗传连锁，所述基因作图模型例如，但不限于，Lander等人(Lander等人，Genetics，121：185-199(1989))报道的侧翼标记模型，和区间作图(intervalmapping)，其基于其中所述的最大似然法，并用软件包MAPMAKER/QTL执行(Lincoln和Lander，Mapping Genes ControllingQuantitative Traits Using MAPMAKER/QTL，Whitehead Institute forBiomedical Research，Massachusetts，(1990))。另外的软件包括Qgene，Version 2.23(1996)，Department of Plant Breeding and Biometry，266Emerson Hall，Comell University，Ithaca，NY。使用Qgene软件是一种特别优选的方法。

对于标记的存在，计算最大似然估计值(MLE)，以及假设没有QTL效应的MLE，以避免假阳性。然后计算优势率的log₁₀(LOD)：LOD＝log₁₀(存在QTL的MLE/假定没有连锁QTL的MLE)。LOD得分基本上指示，假定存在QTL，相对于不存在QTL，数据增大的可能性有多大。对于给定的置信度，比如95％，为了避免假阳性的LOD阈值取决于标记的数量和基因组的长度。Lander等人(1989)说明了显示LOD阈值的曲线图，且Arús和Moreno-González，Plant Breeding，Hayward，Bosemark，Romagosa(编)Chapman & Hall，London，第314-331页(1993)进一步对其描述。

可以使用另外的模型。已经报导了对于区间作图的许多修改和可供选择的方法，包括使用非参数法(Kruglyak等人，1995 Genetics，139：1421-1428)。也可以使用多元回归方法或模型，其中，在大量标记上对性状进行回归(Jansen，Biometrics in Plant Breed，van Oijen，Jansen(编)Proceedings of the Ninth Meeting of the Eucarpia Section Biometrics inP1ant Breeding，The Netherlands，第116-124页(1994)；Weber和Wricke，Advances in Plant Breeding，Blackwell，Berlin，16(1994))。Jansen等人(Jansen等人，1994 Genetics，136：1447-1455)和Zeng(Zeng，1994 Genetics136：1457-1468)报道了组合了区间作图与回归分析的程序，由此将表型回归到给定的标记区间的单个假定的QTL上，且同时回归到作为′辅助因素′的标记数量上。一般来说，辅助因素的使用减少了估计的QTL位置的偏差和抽样误差(Utz和Melchinger，Biometrics in Plant Breeding，vanOijen，Jansen(编)Proceedings of the Ninth Meeting of the Eucarpia SectionBiometrics in Plant Breeding，The Netherlands，第195-204页(1994))，从而提高了QTL作图的精度和效率(Zeng 1994)。这些模型可以扩展到多环境实验，以分析基因型-环境的相互作用(Jansen等人，1995 Theor.Appl.Genet.91：33-3)。

合适的作图群体的选择对于图谱的构建是重要的。合适的作图群体的选择取决于所用的标记系统的类型(Tanksley等人，Molecularmapping in plant chromosomes.chromosome structure and function：Impactof new concepts J.P.Gustafson和R.Appels(编).P1enum Press，New York，第157-173页(1988))。必须考虑在作图群体中所用的亲本的来源(适应的相对于外来的)。染色体配对和重组率在远缘杂交(适应的×外来的)中会受到严重干扰(抑制)，且一般产生大大降低的连锁距离。与近缘杂交(适应的×适应的)的后代相比，远缘杂交通常会提供具有相对较大的多态性阵列的分离群体。

F₂群体是产生杂种种子之后的自交的第一代。通常一个F₁植物自交，产生所有基因都以孟德尔(1∶2∶1)方式分离的群体。使用共显性标记系统从完全分类的F₂群体中获得最大遗传信息(Mather，Measurement ofLinkage in Heredity：Methuen and Co.，(1938))。在显性标记的情况中，需要后代测试(例如F₃，BCF₂)来确定杂合子，从而使其等同于完全分类的F₂群体。但是由于后代测试的成本和时间原因，这一程序通常是不可行的。F₂个体的后代测试通常在其中表型不能一贯地反映基因型(例如害虫抗性)或性状表达受QTL控制的图谱构建中使用。来自后代测试群体(例如F₃或BCF₂)的分离数据可以在图谱构建中使用。然后可以基于标记-性状图谱关联(F₂，F₃)，对杂交后代进行标记辅助的选择，其中连锁群没有被重组事件完全分离(即最大不平衡)。

重组近交系(RIL)(遗传相关的系，通常是＞F₅，从继续自交的F₂系向纯合性发展)可以作为作图群体使用。通过使用RIL可以将从显性标记获得的信息最大化，因为所有的基因座都是纯合的或接近纯合。在紧密连锁的条件下(即，大约＜10％的重组)，对于每个个体，在RIL群体中评估的显性和共显性标记比在回交群体中的每个标记类型提供更多的信息(Reiter等人，1992 Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)89：1477-1481)。然而，由于标记之间的距离增大(即，基因座变得更加独立)，RIL群体中的信息明显减少。

回交群体(例如，通过成功的品种(轮回亲本)和携带前者不具有的性状的另一品种(供体亲本)之间杂交产生)可作为作图群体来使用。可以与轮回亲本进行一系列回交，以恢复大部分其需要的性状。因此，产生由几乎类似于轮回亲本的个体组成的群体，但每个个体携带不同量的或嵌合的来自供体亲本的基因组区域。如果轮回亲本中的所有基因座都是纯合的，且供体亲本和轮回亲本具有截然不同的多态性标记等位基因，回交群体可以用于对显性标记作图(Reiter等人1992)。使用共显性或显性标记从回交群体获得的信息少于从F₂群体获得的信息，因为从每株植物采集一个而不是两个重组配子。然而，与RIL相比，回交群体提供更多的信息(在低标记饱和度时)，因为RIL群体中的连锁的基因座之间的距离增加(即，大约0.15％的重组)。增加的重组对于紧密连锁的分析是有益的，但在构建具有低标记饱和度的图谱时可能是不需要的。

为了产生除了接受探询的性状或基因组区域之外在遗传组成上几乎相同的个体的阵列，通过多次回交产生的接近等基因的品系(NIL)可用作作图群体。在用NIL作图时，预计仅有一部分多态性基因座将定位于选定的区域。

集群分离分析法(BSA)是为快速鉴定标记与感兴趣的性状之间的连锁而开发的方法(Michelmore等人1991 Proc.Natl.Acad.Sci.(U.S.A.)88：9828-9832)。在BSA中，从一次杂交产生的分离群体中抽取两个集群DNA样品。这些集群包含特定性状(对特定病害具有抗性或易感性)或基因组区域相同但在非连锁的区域是任意的(即，杂合的)个体。与靶区域不连锁的区域在BSA中的许多个体的集群样品之间没有差异。

传统QTL作图的一种替代方法包括通过相对于各种标记对单元型作图以实现较高的分辨率(Fan等人2006 Genetics 172：663-686)。该方法追踪如由多态性标记限定的、被称为单元型的DNA组块，假定它们在作图群体中谱系相同。这种假设导致较大的有效样本大小，提供较高的QTL分辨率。确定表型与基因型(在此情况下为单元型)之间相关性的统计学显著性的方法可以通过任何本领域已知的统计学检验并且使用需要的任何公认的统计学显著性阈值来确定。特定方法和显著性阈值的应用在本领域普通技术人员的能力范围之内。

本发明的植物可以是育种计划的一部分或由育种计划产生。育种方法的选择取决于植物繁殖方式、待改善的性状的遗传性以及商业使用的栽培种的类型(例如，F₁杂种栽培种、纯系栽培种等)。栽培种是已经产生或有意挑选并通过栽培维持的植物种的生理小种或品种。

下文说明了用于培育本发明的植物的选择的、非限制性的方法。对任何杂交的后代使用标记辅助的选择(MAS)可以提高育种计划。可以理解：本发明核酸标记可以在MAS(育种)计划中使用。进一步可以理解：可以在育种计划中使用任何商业和非商业的栽培种。例如，如发芽活力、植物生长活力、应激抗性、抗病性、分枝、开花、结实、种子的大小、种子密度、直立性(standability)和脱粒性(threshability)等各种因素通常指导选择。

对于高度遗传的性状，在单一位置评估优良的单株植物的选择是有效的，而对于具有低遗传性的性状，选择应该基于通过相关植物的科的反复评估获得的平均值。流行的选择方法通常包括系谱选择、修改的系谱选择、混合选择(mass selection)和轮回选择。在优选的一方面，采取回交或轮回育种计划。

遗传的复杂性影响了育种方法的选择。可以利用回交育种将一个或少数高度遗传性状的有利基因转移到希望的栽培种中。这种方法已经广泛用于培育抗病性和昆虫抗性栽培种。利用各种轮回选择技术改善由大量基因控制的数量遗传的性状。

可以对育种系进行测试，且可以将其与代表商业目标区域的环境中合适的标准比较两代或更多代。最好的品系是新的商业栽培种的候选品系；那些仍然为性状缺陷的品系可用作亲本，以产生新的群体用于进一步选择。

新的优良大豆杂种的开发需要优良近交系的开发和选择、这些品系的杂交和优良杂种的选择。杂种种子可以通过选择的雄性能育亲本之间的人工杂交或者使用雄性不育系统来产生。关于亲本系的另外的数据以及杂种的表型影响育种者关于是否继续特定杂种杂交的决定。

系谱育种和轮回选择育种方法可用于从育种群体中开发栽培种。育种计划将来自两个或多个栽培种或各种广泛的来源的理想性状组合为育种池，从育种池中通过自交和所需的表型的选择开发栽培种。可以评估新栽培种以确定哪些具有商业潜力。

回交育种已被用来将简单遗传的、高度遗传的性状的基因转移到作为轮回亲本的需要的纯合栽培种或自交系中。待转移的性状的来源称为供体亲本。在初始杂交后，选择具有供体亲本的表型的个体，并与轮回亲本反复杂交(回交)。产生的植物预计具有轮回亲本(例如，栽培种)的大部分属性，此外，还有从供体亲本转移来的理想的性状。

严格意义上说，单种子遗传程序是指种植分离群体，每株植物收获一个种子的样品，并使用这一个种子样品种植下一代。当群体已从F₂提高到理想的近交水平时，作为该品系的来源的植物均回溯到不同的F₂个体。由于一些种子不能发芽或一些植物不能产生至少一个种子，种群中的植物数量每一代都在下降。结果，当完成了世代进步时，并非全部原先在群体中取样的F₂植物都有后代代表。

对于通常用于不同性状和农作物的其它育种方法的描述可在以下几种参考书中找到(Allard，Principles of Plant Breeding，John Wiley &Sons，NY，U.of CA，Davis，CA，50-98 1960；Simmonds，Principles of cropimprovement，Longman，Inc.，NY，369-399 1979；Sneep和Hendriksen，Plant breeding perspectives，Wageningen(编)，Center for AgriculturalPublishing and Documentation 1979；Fehr，In：Soybeans：Improvement，Production and Uses，2nd Edition，Manograph.，16：249 1987；Fehr，“Principles of variety development，”Theory and Technique，(Vol.1)和CropSpecies Soybean(Vol.2)，Iowa State Univ.，Macmillan Pub.Co.，NY，360-376，1987)。

进一步理解，本发明提供包含本发明的核酸分子的细菌、病毒、微生物、昆虫、哺乳动物和植物细胞。

如本文所用，“核酸分子”，无论是自然产生的分子还是在需要时以其它方式“基本上纯化的”分子，指的是从基本上全部其它通常与其天然状态相关的分子中分离的分子。更优选地，基本上纯化的分子是制剂中存在的主要的种类。基本上纯化的分子可以大于60％、优选75％、更优选90％且最优选95％地不含天然混合物中存在的其它分子(不包括溶剂)。术语“基本上纯化的”并非意在包括以其天然状态存在的分子。

本发明的材料优选是“生物活性的”，无论是在结构属性方面，如核酸与另一种核酸分子杂交的能力，还是在蛋白质被抗体结合(或与另一种分子竞争这种结合)的能力方面。或者，这种属性可以是催化性的，因此涉及该材料介导化学反应或应答的能力。

本发明的材料也可以是重组的。如本文所用的术语重组是指通过核酸分子的人工操作间接产生的任何材料(例如，DNA、肽等)。

本发明的材料可以用便于检测该材料的试剂标记(例如荧光标记(Prober等人，1987 Science 238：336-340；Albarella等人，欧洲专利144914)、化学标记(Sheldon等人，美国专利4,582,789；Albarella等人，美国专利4,563，417)、修饰的碱基(Miyoshi等人，欧洲专利119448)。

现已一般性地描述了本发明，通过参考以下的由举例的方式提供的，并且除非另外指定，不限制本发明的实施例，会更容易理解本发明。

实施例

实施例1：鉴定PI594427C中的排拒作用型蚜虫抗性

大豆育种者评价了大豆种质的赋予对蚜虫攻击和伤害的抗性的遗传性状。宿主植物抗性被分类为排拒作用、抗生作用或耐受性。排拒作用也被称为非偏好性，是植物排斥昆虫从而引起产卵或摄食减少的能力。Dowling，CNS(PI 548445)。评价了Jackson、PI 597727C、PI594403和Williams的排拒作用型抗性。排拒作用抗性是典型评价的选择实验，其中昆虫可以在至少两种宿主植物之间选择。

在密歇根州立大学经过三个季节进行的选择田间测试中，PI594427C被确定为具有蚜虫抗性。在选择田间测试中，种植Dowling、CNS、Jackson、PI 597727C、PI 594403和Williams，并且装在一个笼子中。每个植物上放置两个从野外采集的蚜虫。蚜虫能够从植物到植物自由移动，因此该研究评价蚜虫的植物偏好性。在侵扰后2、3、4或5周，根据何时第一次观察到症状对植物分别评分。给予植物从0到4的目测等级(表1)。

表1：用于蚜虫抗性表型分型的等级量表的描述

等级		症状
			0	非常高的抗性	没有蚜虫
1	抗性	少于100个蚜虫
			2	中度抗性	101-300个蚜虫
3	中度敏感	300-800个蚜虫
			4	敏感	＞800个蚜虫

每周，也确定植物的损害指数(DI)，损害指数是使用下式计算的：

较高的损害指数对应于较敏感的植物。

在三年的田间测试中，与已知的蚜虫抗性品种Jackson和Dowling相比，PI 594427C一贯地显示相等的或较低的蚜虫等级和损害指数(表2)。CNS和Williams对蚜虫侵扰敏感。

表2.在密歇根州立大学经过3年在田间笼中一式三份测试的蚜虫抗性和敏感性大豆基因型的平均大豆蚜虫等级和损害指数

实施例2：鉴定PI594427C中的抗生作用型蚜虫抗性

宿主植物抗性被分类为排拒作用、抗生作用或耐受性。抗生作用是植物降低以该植物为食的昆虫的存活力、生长或繁殖的能力。抗生作用通常是由植物产生毒性化学物质引起的。抗生作用型植物抗性通常在非选择研究中评价，其中给昆虫提供一种食物来源。在非选择实验中评价了Pana、PI 594403、PI 71506、Williams、PI594403、PI594427C、CNS、Jackson和Dowling的抗生作用抗性。

在伊利诺伊州大学进行的非选择实验中鉴定了PI 594427C中的抗生作用抗性。植物在选择情况下种植在分离的笼子中。每个植物上放置三个蚜虫蛹。接种后14、17和21天计数蚜虫数(表2)。每个项目进行4个重复。在排拒作用条件下，蚜虫能够容易地在CNS上繁殖(表2)，但是在抗生作用条件下不能。与在抗生作用评价时的蚜虫侵扰和年龄范围相比，在排拒作用评价时的蚜虫侵扰水平较高，并且蚜虫年龄范围较宽。蚜虫侵扰水平和蚜虫成熟度的差异可以说明在抗生作用和排拒作用评价时在CNS上观察到的差异。此外，来自伊利诺伊州和密歇根州的地理蚜虫生物型可以说明CNS上的反应的差异。

表3：在伊利诺伊州大学测试的蚜虫抗性和蚜虫敏感性大豆基因型的大豆蚜虫的平均数

*之后为不同字母的平均值在0.05水平上有显著性差异。

实施例3：蚜虫作图研究

为了将推断的QTL对蚜虫抗性作图，将抗性品系(PI 594427C)与CNS或MV0031杂交。为了对与蚜虫抗性连锁的推定QTL进行作图，开发了两个作图群体：PI594427C(蚜虫抗性)×MV0031和PI594427C(蚜虫抗性)×CNS.在East Lansing，MI评价封闭笼子中的F₃：PI594427C×MV0031和F₄：PI594427C×CNS群体的蚜虫抗性表型。每个植物上放置3个蚜虫蛹，接种后3、4、5周评定蚜虫密度。等级量表为0-5(表1)。鉴定了28个蚜虫抗性基因座(表6和表7)。

使用来自QTL作图研究的第4周评价的表型数据(表4和表5)。在第4周，蚜虫抗性亲本PI594427C被评定为1.5，而蚜虫敏感性亲本MV0031和CNS被评定为3.5。除了上述表型分型以外，用SNP标记对每个群体进行基因型分型：181个多态性SNP用于F₃：PI594427C×MV0031群体，164个多态性SNP用于F₄：PI594427C×CNS群体。进行单一标记和标记回归分析以确定调节蚜虫抗性的QTL区域。表6和表7列出了基因组区域和蚜虫抗性以及诊断标记之间的显著相关性。

表4：接种后第4周F₄：PI594427C×CNS的表型

蚜虫等级	植物数
		0.5	0
1	4
		1.5	8
2	32

蚜虫等级	植物数
		2.5	64
3	70
		3.5	6
4	0
		总数(n)	184

表5：接种后第4周F₃：PI594427C×MV0031的表型

蚜虫等级	植物数
		0.5	0
1	2
		1.5	5
2	29
		2.5	29
3	88
		3.5	30
4	0
		总数(n)	183

表7：用于蚜虫抗性基因座1-28的SNP标记的列表

蚜虫抗性基因座	标记	抗性等位基因	SEQID	SEQ ID正向引物	SEQ ID反向引物	SEQIDVIC探针	SEQIDFAM探针
								1	NS0115450	T	81	1	2	121	122
1	NS0122151	A	82	3	4	123	124
								1	NS0125096		83	5	6	125	126
1	NS0120948		84	7	8	127	128
								2	NS0126797	G	85	9	10	129	130
3	NS0098210	C	86	11	12	131	132
								4	NS0099483	C	87	13	14	133	134
5	NS0100200	A	88	15	16	135	136
								6	NS0137720	C	89	17	18	137	138
7	NS0118422	T	90	19	20	139	140
								8	NS0125467	T	91	21	22	141	142
8	NS0129030	C	92	23	24	143	144
								9	NS0098575	T	93	25	26	145	146
10	NS0129617	C	94	27	28	147	148
								11	NS0130304	A	95	29	30	149	150
12	NS0095317	I	96	31	32	151	152
								13	NS0115731	A	97	33	34	153	154
14	NS0120346	T	98	35	36	155	156
								15	NS0097165	A	99	37	38	157	158
16	NS0092748	T	100	39	40	159	160

蚜虫抗性基因座	标记	抗性等位基因	SEQID	SEQ ID正向引物	SEQ ID反向引物	SEQIDVIC探针	SEQIDFAM探针
								16	NS0096662		101	41	42	161	162
16	NS0118525	T	102	43	44	163	164
								17	NS0099503	T	103	45	46	165	166
18	NS0123719	A	104	47	48	167	168
								19	NS0130766	A	105	49	50	169	170
20	NS0121903	C	106	51	52	171	172
								21	NS0098438	A	107	53	54	173	174
21	NS0114263	C	108	55	56	175	176
								22	NS0124919	C	109	57	58	177	178
23	NS0124051	C	110	59	60	179	180
								23	NS0118907		111	61	62	181	182
24	NS0124300	G	112	63	64	183	184

表7：用于蚜虫抗性基因座1-28的SNP标记的列表(续)

蚜虫抗性基因座	标记	抗性等位基因	SEQID	SEQ ID正向引物	SEQ ID反向引物	SEQIDVIC探针	SEQIDFAM探针
								25	NS0093331	C	113	65	66	185	186
26	NS0097882	T	114	67	68	187	188
								27	NS0098803	T	116	71	72	191	192
28	NS0092589	G	117	73	74	193	194

蚜虫抗性基因座	标记	抗性等位基因	SEQID	SEQ ID正向引物	SEQ ID反向引物	SEQIDVIC探针	SEQIDFAM探针
								28	NS0103077	D	118	75	76	195	196
28	NS0100457		119	77	78	197	198
								28	NS0116259		120	79	80	199	200

确定与区域1相关的SNP标记是SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：84。用于区域1的SNP标记定位于连锁群J上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：8所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：121至SEQ ID NO：128所示的探针的序列。

确定与区域2相关的SNP标记是SEQ ID NO：85。用于区域2的SNP标记定位于连锁群E上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：9至SEQ ID NO：10所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：129至SEQ IDNO：130所示的探针的序列。

确定与区域3相关的SNP标记是SEQ ID NO：86。用于区域3的SNP标记定位于连锁群E上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：11至SEQ ID NO：12所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：131至SEQ IDNO：132所示的探针的序列。

确定与区域4相关的SNP标记是SEQ ID NO：87。用于区域4的SNP标记定位于连锁群E上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：13至SEQ ID NO：14所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：133至SEQ IDNO：134所示的探针的序列。

确定与区域5相关的SNP标记是SEQ ID NO：88。用于区域5的SNP标记定位于连锁群B1上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：15至SEQ ID NO：16所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：135至SEQ IDNO：136所示的探针的序列。

确定与区域6相关的SNP标记是SEQ ID NO：89。用于区域6的SNP标记定位于连锁群N上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：17至SEQ ID NO：18所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：137至SEQ IDNO：138所示的探针的序列。

确定与区域7相关的SNP标记是SEQ ID NO：90。用于区域7的SNP标记定位于连锁群G上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：19至SEQ ID NO：20所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：139至SEQ IDNO：140所示的探针的序列。

确定与区域8相关的SNP标记是SEQ ID NO：91至SEQ ID NO：92。用于区域8的SNP标记定位于连锁群N上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：21至SEQ ID NO：24所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：141至SEQ ID NO：144所示的探针的序列。

确定与区域9相关的SNP标记是SEQ ID NO：93。用于区域9的SNP标记定位于连锁群N上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：25至SEQ ID NO：26所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：145至SEQ IDNO：146所示的探针的序列。

确定与区域10相关的SNP标记是SEQ ID NO：94。用于区域10的SNP标记定位于连锁群A1上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：27至SEQ ID NO：28所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：147至SEQ IDNO：148所示的探针的序列。

确定与区域11相关的SNP标记是SEQ ID NO：95。用于区域11的SNP标记定位于连锁群A1上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：29至SEQ ID NO：30所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：149至SEQ IDNO：150所示的探针的序列。

确定与区域12相关的SNP标记是SEQ ID NO：96。用于区域12的SNP标记定位于连锁群D1a上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：31至SEQ ID NO：32所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：151至SEQ IDNO：152所示的探针的序列。

确定与区域13相关的SNP标记是SEQ ID NO：97。用于区域13的SNP标记定位于连锁群C2上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：33至SEQ ID NO：34所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：153至SEQ IDNO：154所示的探针的序列。

确定与区域14相关的SNP标记是SEQ ID NO：98。用于区域14的SNP标记定位于连锁群H上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：35至SEQ ID NO：36所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：155至SEQ IDNO：156所示的探针的序列。

确定与区域15相关的SNP标记是SEQ ID NO：99。用于区域15的SNP标记定位于连锁群H上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：37至SEQ ID NO：38所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：157至SEQ IDNO：158所示的探针的序列。

确定与区域16相关的SNP标记是SEQ ID NO：100至SEQ ID NO：102。用于区域16的SNP标记定位于连锁群D2上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：39至SEQ ID NO：42所示的PCR扩增引物和如SEQ IDNO：159至SEQ ID NO：164所示的探针的序列。

确定与区域17相关的SNP标记是SEQ ID NO：103。用于区域17的SNP标记定位于连锁群F上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：45至SEQ ID NO：46所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：165至SEQID NO：166所示的探针的序列。

确定与区域18相关的SNP标记是SEQ ID NO：104。用于区域18的SNP标记定位于连锁群F上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：47至SEQ ID NO：48所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：167至SEQID NO：168所示的探针的序列。

确定与区域19相关的SNP标记是SEQ ID NO：105。用于区域19的SNP标记定位于连锁群I上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：49至SEQ ID NO：50所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：169至SEQ IDNO：170所示的探针的序列。

确定与区域20相关的SNP标记是SEQ ID NO：106。用于区域20的SNP标记定位于连锁群D1b上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：51至SEQ ID NO：52所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：171至SEQID NO：172所示的探针的序列。

确定与区域21相关的SNP标记是SEQ ID NO：107至SEQ ID NO：108。用于区域21的SNP标记定位于连锁群D1b上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：53至SEQ ID NO：56所示的PCR扩增引物和如SEQID NO：173至SEQ ID NO：176所示的探针的序列。

确定与区域22相关的SNP标记是SEQ ID NO：109。用于区域22的SNP标记定位于连锁群O上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：57至SEQ ID NO：58所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：177至SEQID NO：178所示的探针的序列。

确定与区域23相关的SNP标记是SEQ ID NO：110至SEQ ID NO：111。用于区域23的SNP标记定位于连锁群O上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：59至SEQ ID NO：62所示的PCR扩增引物和如SEQ IDNO：179至SEQ ID NO：180所示的探针的序列。

确定与区域23相关的SNP标记是SEQ ID NO：111。用于区域23的SNP标记定位于连锁群C1上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：61至SEQ ID NO：62所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：181至SEQID NO：182所示的探针的序列。

确定与区域24相关的SNP标记是SEQ ID NO：112。用于区域24的SNP标记定位于连锁群C1上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：63至SEQ ID NO：64所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：183至SEQID NO：184所示的探针的序列。

确定与区域25相关的SNP标记是SEQ ID NO：113。用于区域25的SNP标记定位于连锁群C1上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：65至SEQ ID NO：66所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：185至SEQID NO：186所示的探针的序列。

确定与区域26相关的SNP标记是SEQ ID NO：114至SEQ ID NO：116。用于区域26的SNP标记定位于连锁群C1上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：67至SEQ ID NO：70所示的PCR扩增引物和如SEQ IDNO：187至SEQ ID NO：190所示的探针的序列。

确定与区域27相关的SNP标记是SEQ ID NO：116。用于区域27的SNP标记定位于连锁群K上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：71至SEQ ID NO：72所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：191至SEQID NO：192所示的探针的序列。

确定与区域28相关的SNP标记是SEQ ID NO：117。用于区域28的SNP标记定位于连锁群B2上的区域。表7列出了如SEQ ID NO：73至SEQ ID NO：80所示的PCR扩增引物和如SEQ ID NO：193至SEQID NO：200所示的探针的序列。

实施例4.用于检测具有蚜虫抗性基因座的大豆植物的寡核苷酸杂交探针

通过基于杂交的SNP检测方法，寡核苷酸也可用于检测与本文所公开的蚜虫抗性相关的多态性或对其进行分型。本发明提供了能够与包含多态性的分离的核酸序列杂交的寡核苷酸。本领域的技术人员能够设计具有经实验确定的严格性的试验，以区别本文提出的多态性的等位基因状态。示例性的试验包括Southern印迹法、Northern印迹法、微阵列、原位杂交和其它基于杂交的多态性检测方法。表8提供了示例性的用于基于杂交的SNP检测的寡核苷酸。可以用放射性标记、荧光团或其它化学发光手段可检测地标记这些寡核苷酸，以有助于使用本领域已知的方法检测与源自一种或多种大豆植物的基因组或扩增核酸的样品的杂交。

表8.寡核苷酸杂交探针

标记	标记SEQID	SNP位置	杂交探针	SEQ ID
					NS0122151	82	62	CCTTGCAAGTCATGCT	201
NS0122151	82	62	CCTTGCATGTCATGCT	202
					NS0125096	83	139	AAGTTTATGATTTGAA	203

标记	标记SEQID	SNP位置	杂交探针	SEQ ID
					NS0125096	83	139	AAGTTTAAGATTTGAA	204
NS0120948	84	109	ATTCTTCAGCATGATC	205
					NS0120948	84	109	ATTCTTCTGCATGATC	206
NS0092748	100	289	TACCTCTAAAACTTGT	207
					NS0092748	100	289	TACCTCTTAAACTTGT	208
NS0118907	111	449	CTCCAACCTATGATTG	209
					NS0118907	111	449	CTCCAACATATGATTG	210
NS0092589	117	126	AGCCATCACAAGGAAA	211
					NS0092589	117	126	AGCCATCATAAGGAAA	212
NS0100457	119	34	TTGGTCCTGCCGGTAA	213
					NS0100457	119	34	TTGGTCCCGCCGGTAA	214
NS0116259	120	216	TGATAATGACTCCTGA	215
					NS0116259	120	216	TGATAATAACTCCTGA	216

实施例5.用于通过单碱基延伸方法检测具有蚜虫抗性基因座的大豆植物的寡核苷酸探针

通过基于单碱基延伸(SBE)的SNP检测方法，寡核苷酸也可用于检测与本文所公开的大豆蚜虫抗性相关的多态性或对其进行分型。表9提供了示例性的用于基于SBE的SNP检测的寡核苷酸。SBE方法基于与邻近多态性的序列杂交的核苷酸引物的延伸，以在引物延伸时掺入可检测的核苷酸残基。也预期SBE方法可以使用3种合成的寡核苷酸。其中两种寡核苷酸作为PCR引物发挥作用，并与位于包含待测多态性的区域两翼的基因座的序列互补。在表7的标注为“正向引物SEQ ID”和“反向引物SEQ ID”的栏中提供了可用于对本发明公开的多态性进行分型的示例性的PCR引物。在包含多态性的区域扩增之后，将PCR产物与延伸引物杂交，该延伸引物与邻近该多态性的扩增的DNA退火。然后提供DNA聚合酶和两种差别标记的双脱氧核苷三磷酸。如果模板上存在该多态性，可以在单碱基链延伸中将一种标记的双脱氧核苷三磷酸添加到引物中。然后通过确定两种差别标记中的哪一种添加到延伸引物中推断存在的等位基因。纯合的样品将导致两种标记的碱基中只有一种被掺入，因此两种标记中只有一种被检测到。杂合的样品存在两个等位基因，因此将直接掺入两种标记(进入延伸引物的不同的分子)，因此这两种标记都被检测到。

表9.用于单碱基延伸(SBE)分析的探针(延伸引物)

标记	标记SEQID	SNP位置	探针(SBE)	SEQ ID
					NS0122151	82	62	AGTAGTTACTCCCTTGC	217
NS0125096	83	139	TTCCAAAACTCAAGTTT	218
					NS0120948	84	109	GTCTGATTAATATTCTT	219
NS0092748	100	289	GCATTCCTCAATACCTC	220
					NS0118907	111	449	AAAGAGAAAAGCTCCAA	221
NS0092589	117	126	GGCCAATAAAAAGCCAT	222
					NS0100457	119	34	GGGAGCTAGATTTGGTC	223
NS0116259	120	216	TTTAATCAACATGATAA	224

实施例6：选择的蚜虫抗性等位基因的证实

在非选择田间研究中根据抗生作用筛查40个大豆育种系。将每个育种系10个植物种植在样地中。各个样地用一个小的昆虫笼子覆盖。当大豆植物达到V1期时向笼子中接种大豆蚜虫。每周如表1所述对植物进行等级评定。每周确定植物的损害指数(DI)。表8列出了具有各种蚜虫抗性等位基因的大豆系的平均DI等级。

另外，在非选择温室研究中针对抗生作用筛查40个品系。40个大豆育种系各有几个植物在温室中栽培。从每个植物上切下叶子，在封闭的容器中用2个大豆蚜虫接种。7天后计数每个叶子上的蚜虫数。表10列出了具有各种蚜虫抗性等位基因的大豆系上的蚜虫的平均数。

表10：蚜虫抗性等位基因1、16、23和28的证实。在非选择温室和田间实验中根据对大豆蚜虫的抗生作用筛查大豆系。

蚜虫抗性等位基因1在非选择田间和温室测试中都赋予蚜虫抗性。另外，蚜虫抗性基因座16在非选择田间测试中赋予抗性。而且，蚜虫抗性等位基因23提高了由蚜虫抗性等位基因1提供的蚜虫抗性。类似地，蚜虫抗性等位基因28提高了由蚜虫抗性等位基因1提供的蚜虫抗性。具有三个蚜虫抗性等位基因的大豆植物比具有一个或两个抗性等位基因的大豆植物具有更高水平的蚜虫抗性。此外，具有四个蚜虫抗性等位基因的大豆植物具有最高水平的蚜虫抗性。

宿主植物抗性控制方法可能属于以下三种类别：(1)顺序地部署单抗性等位基因，(2)通过种子混合物或轮作部署多个具有不同的单抗性等位基因的品种，(3)将不同的抗性等位基因堆积或组合到一个大豆系中。可以为了单独或组合的蚜虫抗性等位基因1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28培育大豆植物，这取决于地理区域的蚜虫压力和宿主植物抗性控制计划。

已经说明和描述了本发明的原理，本领域的技术人员应该明白，在不背离这些原理的情况下，可以在排列和细节上修改本发明。我们要求保护在所附的权利要求书的精神和范围之内的所有修改。

序列表

<110>Concibido，Vergel

Narvel，James

Yates，Jennifer

Boerma，Henry Roger

 

<120>鉴定大豆中的大豆蚜虫抗性数量性状基因座的方法及其组合物

 

<130>53776

 

<140>PCT/US08/72544

<141>2008-08-08

 

<150>60963936

<151>2007-08-08

 

<160>224

 

<210>1

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>1

 

gatggaggtc atgagttaga atctttt    27

 

<210>2

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>2

 

ggtcacttag tcaatgacaa cacaatt    27

 

<210>3

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>3

 

tgttcatgtc accactctcc aagta    25

<210>4

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>4

 

gcatgcaatc agctctccaa    20

 

<210>5

<211>29

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>5

 

agctttcaca taattaactt ttctttcca    29

 

<210>6

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>6

 

ggtcttataa agcatcaaag aggacat    27

 

<210>7

<211>31

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>7

 

tgtattgagt tacactattg aaaatgtctg a    31

 

<210>8

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

<400>8

 

gctaaatggc aaaagttcat cctt    24

 

<210>9

<211>29

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>9

 

ggcatactgg ttttaggttt ttagatttt    29

 

<210>10

<211>32

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>10

 

cgataaatca atagttatat caacccataa aa    32

 

<210>11

<211>28

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>11

 

gaccttcaat gtttattaca gctaaagc    28

 

<210>12

<211>28

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>12

 

aggaactgaa gcatattttt ggtatttc    28

 

<210>13

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>13

 

ccatctttga atgtggcttt gg    22

 

<210>14

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>14

 

gggcaatcct caccctataa gc    22

 

<210>15

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>15

 

tcagttgagg gaaaaaaggt aagaa    25

 

<210>16

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

<400>16

 

ggcatgatta aacactaaga acattca    27

 

<210>17

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

<400>17

 

acttctttgc ttcaacgaat ccat    24

 

<210>18

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>18

 

aagtcatggc aacggatgc    19

 

<210>19

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>19

 

tgcaccctcg tacatacatg tattg    25

 

<210>20

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>20

 

tcgtcaaaac ctcaaacaag gat    23

 

<210>21

<211>33

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>21

 

atgtattttt ttattccata gatgttatta gca    33

 

<210>22

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>22

 

gatgatgatg acaaaaattg tttgc    25

 

<210>23

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>23

 

cactcactta agttatcctt ccttcgt    27

 

<210>24

<211>31

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>     

<223>合成引物

 

<400>24

 

aattaataag agtacaatcc aggagatctt g    31

 

<210>25

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>25

 

caccagtgaa gcattggcaa t    21

 

<210>26

<211>28

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>26

tggcactacc tcacttttgt taaataaa    28

 

<210>27

<211>31

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>27

 

ttcagattta cacatgtaat agatttagcg t    31

 

<210>28

<211>26

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>28

 

ggcaattgac aaacaatgaa tagaat    26

 

<210>29

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>29

 

cccaagactt ttcccgaaca a    21

 

<210>30

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>30

 

gataccattg gcaccattaa tacgt    25

 

<210>31

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>31

 

actgccaaac taagccattt cc    22

 

<210>32

<211>26

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>32

 

atgtgcatat tcaagaaatg atgtca    26

 

<210>33

<211>26

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>33

 

gcattggtta cagtattttc ctgttg    26

 

<210>34

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>34

 

accagtggga aagaaatgtc atct    24

 

<210>35

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>35

acccctgcat gttctaaact tgtt    24

 

<210>36

<211>26

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>36

 

ctcacctttg taggcttgta ttctca    26

 

<210>37

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>37

 

gccggaagga ctccaaaatt    20

<210>38

<211>28

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>38

 

tctgtggtag aatcatgtcc tagatttt    28

 

<210>39

<211>26

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>39

 

cacctaagat cattcctagc attcct    26

 

<210>40

<211>30

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>合成引物

 

<400>40

 

gttaaacatt atttttttca attgaccaat    30

 

<210>41

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>41

 

cagtgaatga cacatcaaac aaaataa    27

 

<210>42

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>42

 

gcatcccagc tgcttgtttc    20

 

<210>43

<211>26

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>43

 

agcatgtcaa atgcacctaa gtacat    26

 

<210>44

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>44

 

ggaaagccca agtattaagt atcaaca        27

<210>45

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>45

 

ggtttcaacc atgaattatt tccat    25

 

<210>46

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>46

 

ggatgacttt ggtgggttta gg    22

 

<210>47

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>47

 

cgccggcgtg gttga    15

 

<210>48

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>48

 

gggcttccac cctgtgatc    19

 

<210>49

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>合成引物

 

<400>49

 

ccaggaatat caattgattt aacgc    25

 

<210>50

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>50

 

ttccgttgtc ttgtaatctg ttatctg    27

 

<210>51

<211>32

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>51

 

ctgtttttgg ctctatacta cagagattta tt    32

 

<210>52

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>52

 

atcttttggg ctgcaattat ttgt    24

 

<210>53

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>53

 

gggatacaag aaaattgtgg catag    25

<210>54

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>54

 

gctcaactca tcttctgctt cca    23

 

<210>55

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>55

 

gatggaggtc atgagttaga atctttt    27

 

<210>56

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>56

 

ggtcacttag tcaatgacaa cacaatt    27

 

<210>57

<211>28

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>57

 

gatagattga gaggtttgaa tttgatga    28

 

<210>58

<211>27

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>58

 

gagtatctta acaccccgtt tattctg    27

 

<210>59

<211>30

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>59

 

taattgttat tctgaaatat aatgcagcaa    30

 

<210>60

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>60

 

cccatcactt tattcaccaa atttt    25

 

<210>61

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>61

 

cctttcaaaa cctttaaggc atgta    25

 

<210>62

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>62

 

gttcctagcc aacaatgagt ttctc    25

<210>63

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>63

 

aaagcgtatc taaggcccat ca    22

 

<210>64

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>64

 

tttgcacccg atgatctaaa cat    23

 

<210>65

<211>26

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>65

 

accatgaggt aatttcactt tcagaa    26

 

<210>66

<211>22

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>66

 

acgcaccata tgctgaaatg ag    22

 

<210>67

<211>21

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

<400>67

 

gcattgaggg gaagtgtcgt a    21

 

<210>68

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>68

 

ttccttctgc aatttattct ccaaa    25

 

<210>69

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>69

 

aagagttctc gtttctcact tccg    24

 

<210>70

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>70

 

ggtgatggtg gaaatgaaat gtatt    25

 

<210>71

<211>30

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>71

 

ctttcatatc tgaaaattca atttcaaagt    30

 

<210>72

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>72

 

gcatgtggac ggttggaaac    20

 

<210>73

<211>23

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>73

 

attcagttcg atggccaata aaa    23

 

<210>74

<211>30

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>74

 

ttttgtttga ttctatgtta actttgcttt    30

 

<210>75

<211>30

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>75

 

ttaaacttgt tacggtacgt actgtacaaa    30

 

<210>76

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

<400>76

 

gaagcatgtg catgtgtagt gtaga    25

 

<210>77

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>77

 

tggagcgtta tggggagcta    20

 

<210>78

<211>24

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>78

 

ggagtggtat cactgaagca tcct    24

 

<210>79

<211>28

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>79

 

tctaacataa cgagaatcca aacatgat    28

 

<210>80

<211>25

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成引物

 

<400>80

 

ccatgaagct aatccaaaca cacta    25

 

<210>81

<211>890

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>81

 

attttaccct gaggttttgc catatggtga aactttcttc catgagccag ttggtagagc 60

ttctgatggt cgccttatca tagatttcat tggtatatac cttttcaata attctcatca 120

tttttttgct ttatttctta ttcatttatt tgtgaaacac gatcaaatga catgtttgct 180

ttttctatct actttgtttt ctttttcttt aatcatcatg tggtgtctca caacacaagc 240

taaatcttct tttctttgag ttttgttcca caaagattgg attccagttt gtgttgttat 300

tggagttata agatacatgt ggttgaaggg agaagaggga agggtgatgg aggtcatgag 360

ttagaatctt ttttattaac aaaaattaac aaattaacaa ctaatatata ttgactgata 420

aaaagaattg tgttgtcatt gactaagtga ccaacacaaa catctctacc caaatgaata 480

aagttgggat tcaataagaa tgagttgtga aattttttta cacaatatct ctgtctacca 540

ttatctattt agcagccata gaatcctatg atggtcatac ttacaaagtg gtacataaaa 600

aatataaagt tttcacgaag tgaaaattta atatgagaag atcataatat atatattaag 660

ggatctagtt caattagttg aagtgtatat aagtattgta aatttcctct tatcgtgttc 720

aatttctgca tatcaaaaaa tatatcataa tatatatagt tctattgcca agaaactatc 780

atactagtga tttggtgcca tttgtgtttg cagcccagca tctaggtttc ccattcttga 840

gtgcatacat aaattcaatt gggacaagtt ataggcacgg tgcaaacttt            890

 

<210>82

<211>1252

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>82

 

ggccagcttg catgcctgca ggagaagtat cgcaaaactt aagagtgaag gaaaaagcag  60

tgttgttcag tttttcacct tctcttattt taagcctagc tttcacataa ttaacttttc  120

tttccaaaac tcaagtttat gatttgaaaa actatgtcct ctttgatgct ttataagacc  180

atatagattt tcttgcctag aacagtggtc aataatttgg aactatagtg actttgctgc  240

tgtataaatt tatatttaat atagaattat caattttctt attgcatctc aaatctcaat  300

gcctacctat tcctcctcat gcaggacatg aagcggcaat gtgatgaaaa aaggtttgta  360

tttacacaac tgctattgtt ttttctcatc attatgtgat gtttcctgaa tctgttttat  420

tgccttcaga gatgtttatg aatacatgat tgcccaacag aaagagaaag gaaagtcaaa  480

aagtgctaaa ggtgaaagtt tcacgctaca gcagttgcaa gcagctcatg ctgaatatga 540

agacgaagca aaactttgtg cctttcggtt aaaatcgctg aagcaaggcc agtcacgcag 600

tctcctaaca caagcagcgc gtcaccatgc tgctcaggtt ttcttgaact atgacctttc 660

tcattcaaat cttttatcat ttcttcagcc tagtcttgat gcatctttgt tcttgttctt 720

ctttcaatat agttgaattt cttccggaaa ggacttaaat cactagaggc tgttgaccca 780

catgttagga tgattgctga acgacaacat attgattacc aattcagtgg cctggaggat 840

gatggaggtg aaaatgataa taatgatgat gggaatgatt ttgacgtcat tgaaggtggt 900

gagttgagtt ttgactacag ggcaaataag caagggccat atattgtttc cacatcaccg 960

aactcagcag aggtaggaaa tttgtattac tcaaaacttg aatggttttc aaagcctggg 1020

tgcatattga actttattct tattgctcat ttgctttttt atttaaaata ttaccaaact 1080

ttgtcacagt tgtcatttta tacttgttgc agtctatagc tcgctacaaa ttaaaaacat 1140

tccattgttg ttttcataat ctgaactata aattcatctt atcataatca ttggcaatgt 1200

tttgccaggt ggaagaatca ggccgttcat atattcgagc ttcaacccca ga         1252

 

<210>83

<211>614

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>83

 

atggatgtta tcaataagtg cttctctaaa aaggctgttg aggaaatatt atcttctctc 60

gtaagttgta ttgagttaca ctattgaaaa tgtctgatta atattcttca gcatgatcaa 120

ggatgaactt ttgccattta gcaacctgaa ttttagcctg ctgttttagg aggtggaagc 180

tacgagaaag gctgatcctt ggatttctgc aactattcaa tccttaaaga aagcatctcc 240

aacaagcctt aaaatctttc ttagatcggt atgtgtccag aatgtattaa aagttctgtt 300

ttatgtacat tctaaaattc acttctcttc tgtgttcaac tgttgaagta tcatttttat 360

catcatcatc attttactat cattattgtg attataacaa ctgttttttt tttaaattta 420

ttttggcctt tttcagatta gacaaggaag gctccaaggt gttggacaat gccttgtttc 480

tgattataga gttgtttgtc atattctaaa aggacactac agcaaggatt tcttcgaggt 540

tatctgatga ttcctataca tagttatgct tttaattatt tttctttcat gccctatggt 600

taatgttacc cttt                                                   614

 

<210>84

<211>597

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>84

 

gtttttcctc actctctcca tcatgttcat gtcaccactc tccaagtagt tactcccttg  60

caagtcatgc taacttggag agctgattgc atgcttctct gtaacataat cctagtgtac  120

accttaatag gatgggtttc aattattcag ttgttgaaaa gtcattacta ctcagctagg  180

aaaggcaggc atggaatggc cattttctaa ataatttgtt ataacaattg aagagagtga  240

taacagggta agaagtgagt gaaagctaca gcctacacaa aagagagaac ttactttgaa  300

aggaatttat aaaattgaat caccaaatcc aggtcattct catataccgt actgagtttt  360

cccaggcatg agatgccaaa tcttgggtct gttgtataaa ttatattaat aacaatgttt  420

cagaataaaa tactatgaag tttggttata caaatacaat agaacagatt ctgcatgcaa  480

ccattccatg tatcaaaatg ctcaagttaa ccccacagct atcctagact atataatggg  540

aggaaaagaa atgtaaagta aaataaaagt taagaaaggt cattcctttc aaatgta     597

 

<210>85

<211>1209

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>85

 

tggcaatcca cacatacgac tgtttgatgt taactcaaat agtcctcaac cagtttgtct  60

ttctcacctg atacacttgc tgcaaaataa atcatttatt ttctggttcc caacaatttt  120

tgttcctgat tttgtggcag gtaatgagct atgattcaca taccaataat gtaatggctg  180

ttgggtttca atgtgatggt aattggatgt attctggctc agaggatggc acagttaaaa  240

tctgggattt gaggtgaagt agatatacag catgtagtgt aataagtttg tagtatgact  300

tatgccctta agttcattct tgataatcat tgcttatatg tgataacaaa aatgcagggc  360

acccggttgt caaagggaat atgaaagtcg tgcagctgta aacactgttg ttctacaccc  420

aaatcaggtt atgtttcacc atttttggtg gatatacaat ttattcctgg cttatgagta  480

cattaatcat taacatggta caacaagtta gaagatgtaa caattaataa caataattaa  540

tgcaagaatc agattagtag cttggactga attggcctta cggcatactg gttttaggtt  600

tttagatttt attttacttc atttaactgc ttaccacttt tatgggttga tataactatt  660

gatttatcga ttgatgttta tttagatctg gattatgaca tactttcaat tataagtgct  720

tatttgtttc atagcatttc agttgaagaa tgggtcattg gtgctctttc ttcattgatt  780

atggttcctt aatttttgca atatccagaa tactcagatt gcagttctta tagtttcttg  840

ctttgtggtt ctcattgatt ttttttctgg tgatcctaca gactgaacta atatctggtg  900

accaaaatgg caacattcgt gtgtgggatt tgacagcaaa ttcatgcagt tgcgaattgg  960

tattagttat gacctttttt tattgaatat ggatatcact gtaggatcaa gattcaaaat  1020

attttctatc caagaaaaaa atccaaaata atatttatta agaatgaact gtctaaatta  1080

taagtcttgt agttctaact ctataggcat acaccttgca aaagcacatg atgcttctct  1140

ttgacctccc acatgtactc taatatagta atatgcattc aattgtcatg cttcaccaaa  1200

gggttcttt                                                          1209

 

<210>86

<211>750

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>86

 

aaactatcta tctacgtgct ttgtatggat aggttacttg cctccattca tccatttctt 60

aaaccatttg aaaagtatct ctttagcata actagttttt cctaagagaa ggccacataa 120

ttacatatta atcaataggg gtaggggtga tgtcaaaatt aggactcagt ctcatttata 180

gcttgatttt caatagttca taacagaact taaaaatata aaggaccttc aatgtttatt 240

acagctaaag ccactaaatg gtaggcatca ataacagtat atatccaatc actgatataa 300

attaatgaaa taccaaaaat atgcttcagt tccttctgag cttctcggat aatataagct 360

aaagaaattc atattgaaga aaacaaaaat tacttcataa attttgttga agagaaggcc 420

agtgcaaaaa acatattttc ctaaaaaaga ttatgaacga gtatagatac cacctgatag 480

accatcttcc agtcccattc ggtatatgac gagaagctga gatgcagaag ctcataatgt 540

ccaatgtcag gagcatcttt ggttgacttt ttcttagaga acaatttatc cataaaaagt 600

gtgttcagat gggcaaaagt aaaaacagat gaagcactaa aagccattta tgctttaaca 660

ttgcttggat ttatttattt ttaatatttt tatgaaagaa cttgcactag ctgtcacaat 720

gttctttgga tgagattcta aagaactaaa                                  750

 

<210>87

<211>578

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>87

 

aaagggcaaa acatattgtt gatctgcatg ttccttttac gcagattctc ttttgtgggc    60

aatctgcccc tgcataatct ccaagcgaat accgcaattt tgctaggtat ctttgtcttc 120

catagttcca tactccaatg tggcctgttt aatggatcta agatttttga taccatcttt 180

gaatgtggct ttgggcttaa ctcaatcaaa agctagctta tagggtgagg attgcccccc 240

atttatatgc cttatcttga ccttgagatg atgtgagact tgggtttttc ctttttttat 300

tttattgtgt tgatgcgctt cttgaatatt tcacattaca aaagattagg aaactgatgg 360

tggcagtgca acaaaagatt agggaaccaa cccaattgtg acagttttgt caaacaaatg 420

ccaagaaaat ttgggccaaa acaagatcat tcccaaatca ataatgaagc aaatcaccaa 480

acacttggtg cacaaagata tgcaatctga tgtgatgagg cactaaccag ccgtcaggat 540

tgagaaccga tgaagaacat gaacatgtcc ccgagaac                         578

 

<210>88

<211>758

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>88

 

atgtacttag gtatgttagt tgtttgctga attagtttga accaatgttt gttgtttgag 60

taaattgtta tctcctcctt tgtattttgt gttactatgc ctacctccca tctattatgc 120

aaacctacaa aaagaactta ctgtatttgc aaaacaaaac tttacaacta actccaaaat 180

gctggcaaga ctagtagatt tgtcagatca aggaagtttg ttttatagtc aaatattatt 240

cctacactgt tcaacctttc agttgaggga aaaaaggtaa gaatacattc atctggcagt 300

gcagcagatt tgaatgttct tagtgtttaa tcatgcctct tgtccctttt tcttgttata 360

taagtctcgg aaagggtagg atttaatcat gagacattca tgataatgta ttagttaaac 420

aatctgttag acataatagt ttattggatt tagtttcagc attgctgtaa attcaatgga 480

ggtatttgcc tgctttcata ataaatggat gtctgtgtta ggaacccaat gaataactct 540

gttgattgaa tgaaattgaa cagaaacaaa gagaaagaat tctcctccaa gggttttccc 600

tttcttacga acttgctaat tgtctgcatc tccttcttcc ccctatttgt gtaattgatg 660

ccctttaatg aactaactgc tgtatttgtt gctaacaaat ttcccctccc attctgttcc 720

aactcctatc aatctatgca gctgatgctt ttgcactt                         758

 

<210>89

<211>776

<212>DNA

<213>大豆

<400>89

 

atgatggagt attcaattct atccaaagag gttgatatct taagtgacga aagtctcttc 60

gttattggca ttctttcctt aattttgtat ctttccacca ataaagcact tgaagagact 120

tccaaggcca ttctttttaa tacttgtata atctctatgg tcagcacacc gtagtctgtg 180

ctgcttcttc gaagggacct gctttggttg accatgacga gggaacatgc acaggagaaa 240

ctttaatatt tgttcttttg attcattact tcgccgttaa aaggtaagcc ggttcgaatc 300

agtaataaga aaccttttat attctagctt gcatgctatc ctaccagggt tcgtggattg 360

gcaaaacttc tttgcttcaa cgaatccatc ggagccgcta gctttcattg gcatccgttg 420

ccatgacttg tgcagacttc tgcattttgg ttctcctgta atcaagattg ctgcttctta 480

tagcctgtta gagttattta acagaatatc agatcaaata aacagtgatc atgaagagtt 540

gagatgtact attgggtact taatgcccat aaggattgga aggaatggtt ttctataatg 600

atctgagagt ggctaaaaat tgttccctct gtctgtcaat gattctggga tgggaaaagc 660

tgacaaagga aacaaaagtc ttagaagaga gtagctggtg tagattgatt atagaggaga 720

tgacagtatc tttggccgct cctgctttag catcacaatc attcacgaac aatcaa     776

 

<210>90

<211>597

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>90

 

tgacttcctt agcacatgtt caaagttcaa actaccttaa ctgtttcctt tcttgttctc 60

tttgataggt gtcacaccaa tatcttctca tatgcatccc atattttatc ctttcttata 120

tgtccacatc ttcatcttaa tgttttcttt tttactccta caactttttt ttttgtgttg 180

tccttttaaa gcccaatatt cttgctacca taaagtataa ctagttatat aaccatgcca 240

tgaaacttga ttttagtaag tagtttacag tcagaaataa tccttgatgt tttccctcgt 300

atttaaccac ccagcttgga ttccacgtgt ggcattgtga tggtgtaaac ctatccttgt 360

aagaaagtct tgagtttcac ttccaagagt tgcaccctcg tacatacatg tattgtatag 420

cttattaatg tcgcaatatg tcgtgagtga tccttgtttg aggttttgac gagttttcgt 480

tttcgttggc tatcaaggat ctaatacaat tttcctccat tatcagaatt taggatttgt 540

tactagacta taggcagagt tatctttgtt gattttgata ttctattaaa ataatat    597

 

<210>91

<211>1036

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>91

 

tctagagtcg acctgcagga aaaatactca ggagtatata atgctaacag gttttcccga  60

aggactccta caggcacagc ttgttagtgt aagtccacac tcactgtaga cttggctgtt  120

ctctccccta tctatttatt gaaacttagg atgataggat ccacttttgc tgaaggaaag  180

gtccatgtgt atacttaaag tcacagaatg tcatttggtg tttgaatata aattttcagt  240

gagttcgatg gcagctatgg aaagtaatca aaataaccaa gtagatgtca aatgcaagaa  300

atggtagtcc aaattacaga tttcagcagt ttgtacccta aaacgatagc atctggtata  360

taaccaatca gttaatctga tttactatca taaatgaata aaaaaaataa gtaaagagga  420

gtacaacaca ctttttaaaa catcctttta acatactctc tactattaat taaaaataaa  480

atttattaga aattgcaaaa tcacgaatga ggctcattat ataaggtgag acctgcccaa  540

ttttgtattt tctgataaat tccagccaat agagtactta aaaatgtgcg acaaagagtg  600

tgttgttagc atttctcaat aactaaacct gaagacttca attgcattct gactcatgct  660

tctaataaat gagactaaat aatacttcca tgtatttttt tattccatag atgttattag  720

cataacactc actccattct tgtcttatga attaggcaaa caatttttgt catcatcatc  780

atcatcaaga atgagtttaa ctccattatt cttaagagca ttcacaacag cccaaacctt  840

ggtttggttc ttaaatcctt tcttcccaac ttctttagtt atgtttgcat gaatccctct  900

tccttctcct tcattaagcc cctcaacttt cagccgcctg gccaatacct ctccaacaac  960

agctgctgct tttgcattgc aggatctgcc acactcaagt gactctttaa tggtgtgttc  1020

tgcaggtcga ctctag                                                  1036

 

<210>92

<211>1008

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>92

 

tgacactgct ttgtacttat tttcttcctt ctttctttgg tctatgaaag atattataat  60

tttaccttga tctcgatctt tccaattcaa ttgtactttc aatcaaatcg cgttttctat  120

gaaattaatt ctcaatattg tgatattata tatgctgagg tatgtgtgag atttttttta  180

tatttttttt tttgtaattt cagaaattct tgttagctca agaagtaccc agcagcaatt  240

cctagttatt ttgcaggaag taaaccactc acttaagtta tccttccttc gtcctctaac  300

aatgaaagta atatttttgg ggtatgcaca aagtctttca aaaacaaaca agatctcctg 360

gattgtactc ttattaatta atggagttct gtacatatac atggcatcac acttccaata 420

tagtccaaca aaatggcctt actcctcaat tgccctcttg taattaagat gaaagcacca 480

attgagaggt ggaagcatgg caaacttttt taggtatatg ttctttttga gaagaaattt 540

atgcatgaat atatgtcttt tatttttttt tttcctattt tcagactgcg aacaacatca 600

gtatatatga tggttttctc catacgatgt ttccagaagc tagagataca aatgaaaaaa 660

aggttcagga ctgcatatga agggataatt tgaaaagaag aataaaagag gaaaagatat 720

ttaagtaatt ttttttttct tgaagaaaaa gaaagaaagg aagatatata tatctttaga 780

taaatataat taagggacgt gtaaatatta ttaattgtca aaaaagtaaa gtagcagaga 840

actacatata gtattacatg caacaacaag cggagacaac taagggactc gcttaagtac 900

tagagtcctc atcgccctct ctttattttc attaatataa attttacaac attatgatat 960

atagtatcct gcgactgaaa aactgccctg caggcatgca agctggcg              1008

 

<210>93

<211>660

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>93

 

agtatggaat tttccatgac ctaatgtcca tcttgaaacg agttgagctc atattattat  60

gcaattggtt gcaaggaaaa ttaacatgat caaatgcatt tgtaactaaa ttgcaagcaa  120

catgcttttt taacatactt tctctgttgg aggatacttc tcatgttgat cttatttaat  180

aacctgggtc cattctttat tagtgggacc aatattaaat aaattcatca ataaaaaaag  240

gcagtatttc tagtatcatt ttcgtgactt taaggtggcc agtgaagcat ccaccgaccc  300

ccataatacc tgaactgaat gcagtaagca atgcactgtt tttcaccagt gaagcattgg  360

caatgttggt atttaattgt gcttgtgtta ttagtggtca atttatttaa caaaagtgag  420

gtagtgccag tagtttggtt ataaaatgcg gcaaatgtat taggaaaaca gggatcaatt  480

cattatgtgt gaagtagtga agcacaaaac ttgtttcaat aaaattgtta acctggttga  540

aatcatcaca agagatctgt gtattggcta taaaagctat gatacaatta aagggtaaca  600

taacataatg tagcaatggt taactaaact ccttcagtgt gtttttaaat ctttccaccc  660

 

<210>94

<211>1159

<212>DNA

<213>大豆

<400>94

 

atatacttca agtggtttca ctttgtggga agagtcgtcg gggaagaggg gaaagacagg  60

aaaggagaat aatgcgggcg agaaaccctc tctaggaggt aaaccataaa ttttctcttt  120

attgtgtaca ttgcatcagt agtattttgt aaaaattcgc cgaaatattt ttcaatttat  180

aaaaataata aatgaaattt ataattttat ttatatatat tcatataaaa attttgattt  240

tttcaaacaa acacttttca tcttaattca atgaatttca tagatgaatt tataacaaat  300

ttttgtatga taataattta ttgaataaat acttaactaa atatgcctta aatattagag  360

aaaagaggtt atgatataaa attattttat atttttattt aattacaaat tattatttat  420

gataaattta ttaattttta taaaaaaata atcttaaaaa ttatacaaat aataatttgt  480

gattaaacaa taatatttta taccaatgta tcgccacttt gttccaccaa tttcctacat  540

tgtcatggag ttttctgtaa cttttgttta tacgtgcatg aatctaaact taaatcaaaa  600

caaggatcaa acaaccactt ttccttcctt atttctcaat attgaagtct attggcaatt  660

tatatatgca aatcatctca attgttgcat agaaatttga tctcttccta aaaacaagta  720

gatggagaaa gtcatctatt tacaatagga aattatatct gtataatttt aaaaaatata  780

tttaataaga agaaaagaaa aaagatgata cctacaaata tatttgtaca aacatttgtt  840

tatataaaat tattaatgtg ataaaaaata aaaagtaaaa atagaaaatc ttgtattaca  900

tctataaata aatatatatg tcttgccaca atatatgtgt tgattccttt cagatttaca  960

catgtaatag atttagcgtg gcagtgcgct ggactagtta gccaaattct attcattgtt  1020

tgtcaattgc cagtattcag caataaaaaa cagtagaagt aataataata gtaattacaa  1080

tattaatgtt gtcaaatatc aactgcataa tgtgtctaac ggtaacagcg tttggccgcg  1140

cttgatactg tgacagagt                                               1159

 

<210>95

<211>973

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>95

 

acaataagca agctaattag tagttaccca agacttttcc cgaacaactg gtttgctcaa  60

gaatatttgt agcacgtatt aatggtgcca atggtatcaa ttcttaaatg aaatgttggt  120

cataccttcc aacgtatagg ttttcatcca aaaaatatgg aagcaaaaat agccactatc  180

acaagcgcga gagggttgaa aacacatgca tacaatggac ctttaatccg tacacaccat  240

gcagtaacaa taaccactaa tccagagtac acaattccct gccacaacat cttggtttct  300

tagtaattac taatttttag tatactagtt caccatccaa ttaatgcaaa ttttaactta  360

cagaaaatcc gcagttagaa gcctaatatc ccaacccaac ttccattggc tccaatcctt  420

cacaacacat agggctaaga ctgtggcttg tattgccccc attaaggtca tcagcgctgt  480

acttgagtaa tggcttggat attcgatctt tactcatctt agtctgtccc atttagtgat  540

tattcatcaa caacaacaac tacacttttt ttttttttgc caacaaatag aattataatt  600

agataaggcc ataagggtaa acccttaaca catcatatat ttcatcaaca ttttttttta  660

tcgctttctt ctaatcatgt tatttatctt attgcatgtt atacttatat tttttttttt  720

ctctctttct caattagcaa ctgagtgccc atgaaatata tatttctctt taagtactga  780

gatataacaa caggaagctt aattacctga atgatgagcc ataatgaaag actaaaaaca  840

cttccaagac aacataaaac acctagccat tttcttccag aaacagcatg cgatgatcca  900

aggtggccat tttgattttt gtgaaaaaat atttatgtgc aaagtcaaaa tgtcaatttc  960

taacccttta aaa                                                     973

 

<210>96

<211>1395

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>96

 

tcttgcatgc ctgcagaatt aatatcgtgt gtatgtatat acatgcaaga ctagctaatt 60

tttttttttt tttatattga aaggagcaag acaaaagcta gttgatggtg caattaatat 120

ttcaggtaat ttatactaca ataaaacttc agaatctcac tgaaaaggta gggcacacta 180

cagggtcatt aattttgatg acaagctaat taaacaacaa aaattcattt gattacactg 240

tagaaaaaag gcactgttcc attaatacaa gagaaaattg aggcatcgat ctcatattta 300

tacatttaac tagcaaacaa tcagataaat tttacctacg ctagatttaa attggatgca 360

gttttgtaga tgtttttagt attgtttttt aattagaatt ggatcgagtt tcgactcggt 420

aatctgctta atgaagattt ttattaaagg ttaatgtaaa ttagtaagat aaaactctaa 480

ttataggtag aggataatac caacaacact tgtaatcgtt ttaaattcat ttggcgctag 540

cacactcttt ttgcatggtt aaactttttg tttgtagtaa tcccaattca actgtagtat 600

atcataagac ataacccccc aaattaagtg ccaaacaccc ctccattcat cggctatcct 660

actacttaaa aaaaaaaggt ttttctgtta ttcccatgtc tcgattgtat cgaagatctt 720

caaacgctga accaacaggt caaatgcaaa ataacttaat gaaaaaacaa tggatatttc 780

aaaccggatt caaaccttaa ttatatgtat aggtacttta ggaaattcaa cgaacttacc 840

ttatgcttaa acggcacttg ccctacctaa tcctgatttt cgttataact tatctgacaa 900

taaagttctc cgtgtggcgg aaaattgcca aagggtaatc tctaggtaac ttctttcaca 960

ctgccaaact aagccatttc cctggtatat acatgtttcc catttggttt ctcaattcaa 1020

aaaaaaataa ttaaacctaa ttgaaaaaaa caataataat gatgacatca tttcttgaat 1080

atgcacatcc cctctgcacc tataaaacca aatatcacga gcaattaacc tatgctatac 1140

ggtcctagtt aacttagctt ttccccaaga gcatacactt gctaataact gctaactatt 1200

ctttgcctta gaaaatatat tcgctgtgcc actgcattat gggaaggtca ccatgctgtg 1260

aagagaatgt tggtgtaaag aaagggccat ggacgccaga agaagatgag aagctgattg 1320

attatatcag caaacacggc catggcagtt ggagaacact tccaaagcgt gcaggtctca 1380

ataggtgtgg taaga                                                  1395

 

<210>97

<211>868

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>97

 

gatttgtcag cgagatacat agttgatagg tatctacctg ataaagctat tgacctcata  60

gatgaagcag gaagtagagc ttgtattgaa gcctttaaga agaaaaagga gcacgaaact  120

ggaatccttt ctaagtgccc agctgattac tggcaagaaa ttaaagatgt taagtccatg  180

catgaaatgg taatggcatt ggttacagta ttttcctgtt gcctgtatca attgcttaca  240

gtattagttt aagatgacat ttctttccca ctggttcagg agaacaagct taaatactat  300

ggcgcttcta gcattgacga taccaatgaa ctcatactgg actcatattt atcttctaca  360

accaccgata atgagtatgt tatttgaccc cataatcaga gggcattcat ttgtatgtat  420

ctggatttga tttctgagcg gctaacacat tatattttct ctttagacct atagaagttg  480

ggccagaaga tatagcagca gttgcttccc tctggtcagg aattcctgta cagaagctca  540

cagctgatca aagaattctt ctgttagatc ttgagaatca acttcggaag cgtgtgattg  600

gacaagagga ggctgttgct gccatttcta gagctgtgaa gagatcccgg gttggcctaa  660

aggatcctga tagacccata gctgctatgt tattctgtgg cccaaccggt gttgggaaaa  720

cagaactcgc aaaatctttg gcggcgtgtt actttggatc ggtaaggctt gacacactat  780

atgttttagc aatcatagtt agagatgatt ttgttgttgt ttttcttctt tttaatgatc  840

tgcaggccat gcaagatggc gtaataaa                                   868

 

<210>98

<211>480

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>98

 

aacttttacc aaatttttaa ttatgtcccg ggaacttttt tcccctttca attggataaa  60

agttcaagga cccaattgaa acaaaaaaag gttcagggac atatttgaaa atgacaaata  120

gttcaaggac ctaattaaaa aattgtgaat ctctccaagc tagtcttttc acccctgcat  180

gttctaaact tgttgaagaa cctaagaata cggagtttag aacctgcaaa agtgagaata  240

caagcctaca aaggtgagaa tacaagccta caaaggttgg taatttttaa ttaggtcctt  300

gaactttttc atttttaaat aaggccctga atattttttt tcaattaggt ccctgaactt  360

atttttttta attaggtcca acatggacct aattaataaa tacatacaag ttcagggaac  420

caattaaaga aaaaaaaagt tcaggggacc taattaaaaa atttagtaaa agttcaggaa  480

 

<210>99

<211>760

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>99

 

agtatcttgc cggaaggact ccaaaattct acggttttca ttatctacag aaggttgtag  60

ataaaatcta ggacatgatt ctaccacaga atcctttctt tcccgcactg tccttaatat  120

aagtgtcttc aagaagttca ttacttgaac tgcatacatc aatgcagata tagggtctgc  180

catctgcaat cagaaagacc aaatactttc attgactcga acctactatc agatggaaca  240

actatcacat tggcatcttt atttactctt ggaaaaacac agcatagtaa agacttcact  300

aaaggtaaaa atattgtcaa gacaagtagt gcagaaaaga tttcccgaga aaagaaaaca  360

attggatttc aaaagatttc catatgcaat ttagtaaagt agaaaatgaa aatatatagc  420

acttgtatgg tacatctttt cttccttgca gtcacttgag aatgaaaaaa tatggaaaca  480

cacctgagtc atgtttggtg caaaaaccat ggcaatgtta cgcgcattca tcttattaac  540

atgctcatgt aggacaacat cagccatcag attgatggtc cagtccaaga gtgaagcttc  600

agtatgaggt agatgtctca ctagttcaga acattcatcc tcagtctggc attgcattac  660

ctgctcgggt gataatgaat ctagaatgcc tgtaggaagt tccctaaacc aagccttgaa  720

aaatgcaaga ttatcaaaaa gtttctaata acatgcattt                        760

<210>100

<211>502

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>100

 

attcagaaaa ctcacttctt gctaaaagtt caacaacctg attccccaaa cctaccacat  60

cctgtaacgt agtgtaaaat tagtcccttg tgtatgtgca gaatgaatca agttatagag  120

ttttgatttt gaacaactgg ggtttcttta aaattgacct atcttgaaat gggattcttg  180

tattttcgcc ttaattcaac gcgagactag tgcttagagc cttaaatttt tcattacatc  240

tcaggttctt acccacctaa gatcattcct agcattcctc aatacctcta aaacttgttt  300

taaatattgg tcaattgaaa aaaataatgt ttaacagaat cctgggataa aatttttgag  360

gcaatgttta gtagcatgta tcaaatagct tagtgaaaga tgatttgagg tatatgatgc  420

ttaccaaaag aagatcctcc tcattaatgc caaatgcttt gcgagcctct tctaaagact  480

tcgaagaagt gctcttatgt tt                                           502

 

<210>101

<211>759

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>101

 

attttaagtt tgatcacaac acaagagaat tcaagtgaag gacaagaggc agaaatttta  60

atgtataaat aatataagga aaagaggatg gaaaagaaga atggagagaa agttaaccac  120

acataaaaga gaactcattc attgtaaatt gttgcagtga atgacacatc aaacaaaata  180

aaattatgat atacctctgt taatccaacc atgctaagtt caggatgagt gaaacaagca  240

gctgggatgc ttaaatgatt gagcacgtga tcttttccag tgacttgttc aaccactgtt  300

agacaatttt ttcatcaact gatattgctg cataaactaa attttggaaa agttacatca  360

gttaccactt acctgaaatt ccttgtgcac tggcagcatg agcaagcatc atcttgccat  420

ttgcatcacc aatacaatat aaatgaggca cctatcattc cacatcctat gtcagtaaca  480

ataagtcagg gagggataat tattgcatga gaaattgaga caaaccagct tgccattcgc  540

atcaattact cgcatgtgct catccactgg aacaaaacca cgctgtgtta ccacatcaat  600

ctgtaggtaa aagttaccaa aaatatacaa ttacttcctt tggagaaaat ctcctaatcc  660

taaagcacat ctctgtcgga attgcttaca ttctccaatc caagaccttg tgtgaacgga  720

gcccttccag ttgctattag tgcagcatcc acctgtaac                         759

 

<210>102

<211>457

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>102

 

gctctcaaga gagcaaatgt tgatccatca ctcgtgcaag aggtgttttt tgggaatgtt  60

cttagtgcca atttagggca ggctcctgcc agacaggctg cattaggtgc aggaattcct  120

acatctgtaa tctgcactac tattaacaag gtctgtgcat cagggatgaa aggtatgttc  180

tttttttgtt gttgttgatt tggaagggta ttccagtatt cccacttaaa tatatgaatt  240

ttaattggaa gggtcctttt cattgcagct accatgcttg cagcactcac catacaattc  300

ggtctcaatg atgttgttgt ggctggtggt atggaaagca tgtcaaatgc acctaagtac  360

attgcggagg ccaggttcgc ttttctttca tgaattgttg atacttaata cttgggcttt  420

ccgataaaag ataacgtttt ttaaatctga caaaatc                           457

 

<210>103

<211>659

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>103

 

aatcttgttt tttgcttcct tcacttcttc tgcatgcctt gaattttgat cttcaataca  60

actcctcagt ttgctggaca tattaagcaa gttttcaacc acttaaaaca agattatgaa  120

gacaacagag aaaaaagaaa gatatggata gagatgaaaa caataaacta acagcaaaat  180

acacgataaa acttttctaa ttggacttga aatacttact cagtaattaa agcttcatca  240

caaagaaaat tcagcagtgt gagcttttta gataaatcca aattgtaata tccaccaacg  300

ccttcttgaa gccaatccaa aggaaaatct tttaatatat gatcagatcc agcaattaaa  360

tcctccaatg gtttcaacca tgaattattt ccattgctag tagttaagga tggagaccta  420

aacccaccaa agtcatccat atgacaacct taatccaaga ttccaagtat atcatagaaa  480

aattatttcc cccaaaacta tacactaaca aataaataaa agctataagg gataactcac  540

tcatttcctg aatcagttag tatcaaggtc aacactctaa tttgaaactg aaccactaaa  600

gtgttttgtc ctcgacgcaa attttgttta cgcactaatt ctcgtaagat ggcttcagg   659

 

<210>104

<211>586

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>104

tggtgtcaaa agtcacatcc catttgaagg aatactacac tataaagtgg gcatccgcac  60

atgaagaggt gcttgtgttc ttctcgccgg cgtggttgag tcctctggag aatgcatatt  120

tgtggatcac agggtggaag ccctccatgg tgttcaagct tctggaaact ctcaagaagc  180

aagcgagtgg tggtgatttt gtgatgacgg aggagcaggt gaggaagatc gaggagctga  240

ggaagaggac gaggatggag gaggagaagg tggagaggga gatggagagg cagcaggtgg  300

ccatggctga ccgaaagatg gtggagttgg tcaagctcac cggcagagca aggaacaacg  360

gtagtggtgg tggtggtgat gcggtggatg cggtggtgga ggtggcctta aaaggggttc  420

ttgcggggtt ggagagggtc atgaaagctt cggattgcgt gaggctcaag acactcaaag  480

gggtgttgga tgtgcttagt ccaatgcagt gtgtcgattt cttggctgca aatattgcta  540

tgcagctaag actcaggcaa tgggggaaga agaagaggga cattgc                 586

 

<210>105

<211>294

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>105

 

agcttgcatg ctctgtagaa gaacatctac gacacaatac atgacccaag gaactatagt  60

tatatcaacc tctgaactca gacaaacccg acaaacccat gctgcttttg ctgtatcagc  120

ctcttttgtt gccttttcaa ccctttcctg tacaatgtat aatggtgatg tcattccaaa  180

cttatcataa agattaactc taccagatat atgcattaca aagcatcaag gaagctactt  240

caatcattac tcgtttctac actttaaaac tatccctaaa gccttaaaca actg        294

 

<210>106

<211>797

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>106

 

ttgcacgatt accctgtgtt gtggcatatc gtgcccatat tttgacagaa tggtatattt  60

ggtacaaagc gaagatacag tatatatcac ttaccaatat tcttttggac aaagccatta  120

ttcctgaagc actctttcaa tcttgcaaac cacttaactt agccttgttg ctcaagtaag  180

gctgaaattc aaattatttc gtctgtatta ctaatttgag aaagctgaga atttatcagt  240

tatagccagt atttttgttg gaatgtttga cacctgtttt tggctctata ctacagagat 300

ttattacatg atgatggttg tcgagaagaa caaataattg cagcccaaaa gattctcaag 360

cttctatggc cttcagagag aataaagctc aaccttctac aacaaaattt gaaaacttgt 420

gctgattaca ctccaagtgc agttgcagca ttgactatat taaaccatgg gaagccaatg 480

actagtatct aaggacatat ctttctgcaa gggctctggg attggatttt ttcactgcaa 540

agtttgaagg tttgaagctg gaggatattt tcatttcata tgtaactgag aaaaaaatag 600

ctttcaaaag tgtagaatca agttattgat aaacatggag atggaaaagc attgctccat 660

gttttgtttc agctaactca aaaattcccg accttgcatt ttttcttcta ttgcagcttg 720

tttgtctgca ttgatttact ggtgtataat attctttatg aatgatgatg attatgatca 780

tgatctgcag gtcgact                                                797

 

<210>107

<211>785

<212>DNA

<213>大豆

 

<220>

<221>不确定

<222>(1)..(785)

<223>在所有n位置处不确定

 

<400>107

 

aattgacgca acagtacctt acacacaaag gacatctcat gcaatcctcc aaaaaaactt  60

cactactacg tacatttatg agacagaata aggtaaaaaa aaaaactttg gaatgcaagt  120

tgaagacagg gacaaagaca agcaacttca cttggctatc cttattcctt ggtcaaattt  180

ctcaatctgt tgctcctcca tcaccaaaca gatgattgtg ggttggaaag aatagtggta  240

catcaacacc tcttttcatt ttaataaact aataataagc atctcaaatg tgtctttcct  300

gtttccacat taagtgatta agggatacaa gaaaattgtg gcatagtttt ttttttttta  360

caaatgatgt tagttctcac ctggaagcag aagatgagtt gagcaaaaca aaattgatta  420

gatcctcaat tttgcctcct tggtacttct aattctgtaa atttggaaat ttgaaagtgt  480

tgcattattt ttctttatta ttttctctta atatgaatat attcataaca ataattcaaa  540

atcactagag agcacctact ctaaattgat ttttatagct aaatcttcaa aggaggcaat  600

aagaattatg ctttaataaa tcgaagggct atacctctgt ctaatgccat ggatgctctc  660

aaggagttca attgggttgg tgcaccctaa aaattctttg gggctctttt tctttttccc  720

ggnaccaagg ttgggaacct ttcaaaccag gaactggtcg ggggtggact tgccctgggg  780

gtgtt                                                              785

 

<210>108

<211>890

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>108

 

attttaccct gaggttttgc catatggtga aactttcttc catgagccag ttggtagagc  60

ttctgatggt cgccttatca tagatttcat tggtatatac cttttcaata attctcatca  120

tttttttgct ttatttctta ttcatttatt tgtgaaacac gatcaaatga catgtttgct  180

ttttctatct actttgtttt ctttttcttt aatcatcatg tggtgtctca caacacaagc  240

taaatcttct tttctttgag ttttgttcca caaagattgg attccagttt gtgttgttat  300

tggagttata agatacatgt ggttgaaggg agaagaggga agggtgatgg aggtcatgag  360

ttagaatctt ttttattaac aaaaattaac aaattaacaa ctaatatata ttgactgata  420

aaaagaattg tgttgtcatt gactaagtga ccaacacaaa catctctacc caaatgaata  480

aagttgggat tcaataagaa tgagttgtga aattttttta cacaatatct ctgtctacca  540

ttatctattt agcagccata gaatcctatg atggtcatac ttacaaagtg gtacataaaa  600

aatataaagt tttcacgaag tgaaaattta atatgagaag atcataatat atatattaag  660

ggatctagtt caattagttg aagtgtatat aagtattgta aatttcctct tatcgtgttc  720

aatttctgca tatcaaaaaa tatatcataa tatatatagt tctattgcca agaaactatc  780

atactagtga tttggtgcca tttgtgtttg cagcccagca tctaggtttc ccattcttga  840

gtgcatacat aaattcaatt gggacaagtt ataggcacgg tgcaaacttt             890

 

<210>109

<211>1236

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>109

 

atccttgcta tatatatcgg aaagttgaaa agctggtggt ggctgatgat ggtgccaatt  60

actagtacat gactcgtcta ttatgaaacc tgtttctggt ttaataacct cagtgtagat  120

agattgagag gtttgaattt gatgattctg cgctgtgttg tttcccagaa taaacggggt  180

gttaagatac tcagaccatt ttagatcttc ttgttctgct tgtagaggca ctacttgagc  240

ctctttgtta atgttaacaa tcttcataga ctctgccacc ccccacgtgc tgtcaaggta  300

gtttgtgcta ctttgtaact gcatattccc attgtttttg tttgtgttgt tacttgtttc  360

ccagttttga accccatcag atgaaatgga agaagggttg ttgttattag attggagctt  420

cacatgttgt gttgggaaaa ttgaagggag catggaggag gaggttatga tggagttgtt  480

attattaatg tctgaagaag tggagggtag aatgaaacaa agagaggtgt tggggtttga  540

agagagggcc atgcttgttg ttgttccata gttcaagtgc tggaaggaga agtatgatcc  600

taccaaatca gaagtgttgt tgttgttgtt ttcgtggcag gtggtggtgg tggtgccaaa  660

cctatctagg aacagttcct gggtggaact agtagtggaa acttcaagag ggtatctctc  720

tgatgaagaa ttaggcatgg tttttggtgg ctgatgatga tcaaccaaat tactcactac  780

ttcattggat cccacagagg ctttctgagt gcttttgtcg gttgagggtg gcatcatatt  840

catgtccttg tcgttctcaa cctcagagag tggcttgtgt gtggttgggt caatgcctct  900

ttgcctcagc ttcttcttca ggcacgagtt ccataggttc ttaatctcat tgtctgttct  960

tcctggtaac tgtgctgcaa tctgagacca cctgataaag cacccaccaa gctaaaaatt  1020

aataaaaacc atacatcaag aacaaaagtc aaagtaataa ctgtacgctg aaaaaaaaaa  1080

aaaaaaaaat ggccttgtat gagatatata aatatataac tatataacta aaactacctg  1140

tttccaagaa ctgcatgaag ttcaacaatc atgttctctt cttgctgtga gaatgctcct  1200

ctcttcaaat caggccttag ataatttatc cacctc                            1236

 

<210>110

<211>1212

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>110

 

atctcgataa tttcggagaa atcaggtctc aatgtaggat cttgctgcca gacctctcaa  60

gaagctccac aaactttgga tgagtgttct tcgggatggt gggtcgcaaa ccctgaaatc  120

catttaaagt tatggtagga aaaaattact atttgtacga tacacatatt tccatttaat  180

catataaaaa ccgctttcct caaaatttga gtttattcta ccactgatgt ttaaggaaaa  240

aaataccttt tgaaccactc ctatagctgc ctgtaggggg gttaaatatt cgtatggaag  300

ctggcaagaa aaacacaata atttacatga gaggaaaact aatactgtaa gagtcataag  360

gtgttacaaa taagaaatac ctttccggtg agcaactccc ataaaacaat tccaaaacta  420

aatacatcag ccttgtgatc atacggcttg tgttctataa ccttcaatac aaaggaatca  480

tggtaagaaa gatgacaata tgagttatac ctctcatcta tcttagccac cagaaaatat  540

ttaaacaaga aaacaaaaac tattaaacag catattttag tgggctagta ctaacattca  600

gggcctgaga tttatcaaac cttcaaatct ttcagcaaga aaaacagcaa tgaacaattg  660

atttaccaca ctacatttcc ccagatatta aaaaagttaa tactattatt ttgcccgatg  720

tttgaactga acattttcta ccgataactc gaccttaatt gttattctga aatataatgc  780

agcaataatc ctttttctca tactaaatcc atcgtacaat ctaatctcat aaaatttggt  840

gaataaagtg atgggggaaa gacattatag aagggagaag gaaaagtcgt gggtttgatc  900

ccctctgcta atatatgacc acatgacagg acacttagct acagtaatgt catccatttc  960

atttattata aatttccaga acgacaggtt cacataattg atcaaacatc aaaataagat  1020

ttaacactag acatctattt aggttgaaaa aaccaattaa aaaagtgcaa actcctatgg  1080

taatataaca agaaaacaga caacaggtgt tgaaaagcta aacaatgtca tcaaaactat  1140

ttgaacaact tgatggcagt aacatgagaa gatcaaatac ctcaggagcc atccatcgat  1200

atgttccagt tt                                                      1212

 

<210>111

<211>774

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>111

 

ggaaaaactt tgagacaaaa actaaaacac ttatgaaatt agacaaaaga atgcaatatt  60

aacagaatgc tacaacattt caagaggacc caaacgtaga ttataaggag aataatgaat  120

cctcctattt aaaacagaaa gaaactccta tcctatctaa aacagaaaga acccaatgag  180

ccaaagtggc tcaaaaatgc aataaagtat tccaatattt tcgcatacaa atgattgatt  240

ctttgaagca gccattaacc aagaaccatc atagagacaa tcctatccta tgacgactgt  300

aaagggaaag aggtgctctt gaaaatacac gcatttcatt acaaccaaat gcactactag  360

ataactacat atactgcaca atgcgataaa atttaacact ctttgttcct ttcaaaacct  420

ttaaggcatg taaagagaaa agctccaacc tatgattgga gaaactcatt gttggctagg  480

aaccccaaaa caattcagca ggtgtaccac aaaagtggcc tacctatagt attatcagct  540

tattttagca tgtttatacc tagatgtctc tatttcttta tgaacttcaa tagttcaact  600

accatttgat gaatgtgtcc atgatcatat cataacttat atcacgcaaa cttcagaggt  660

tattatcttt tttgtttctc attgtattct acaccaatga ggtaaaacaa gcgagcccca  720

aacgcatgat gaaacataat catccattgt tgctacttgt cagatcacct cttg        774

 

<210>112

<211>1080

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>112

 

aacatcccag ccttttatta ttaactatat ctataaaaat attcttgcag caactttaag  60

tattataatg gagattatat atcattaact ataatggcac ataatttagt tactgcactc  120

aaaatagtag taaaaaatat acatgataag gggtttggct tgataaatag gagacaaaac  180

taaaagatca attgatccag catttatgct cttaaaaaat agcagtagta aacagttacc  240

actagttgtt ttcctatatt cagcattttt atgtttccta cctccagcag cgcgcataca  300

attgatccat tattatggca ggatgtgttg tataataaat aaaaataata attaagttaa  360

aaacaattga gatccattta acacaccttt gcaaacattt ccaagctctt aatgatttca  420

gaagcaaaca gatcccatgt ttcttgtata tataactcaa taaatctgaa agcgtatcta  480

aggcccatca tcgtcttgtt tgaatccata gttgatgttt agatcatcgg gtgcaaagct  540

tttaagaact atatacgtat taagaaatta attaaatata tatacttgcg cagatggtga  600

tccgatcgag gaaactagct agacaacaat atatgtgaac aaagagaaaa atatcttgaa  660

tatagacaaa aaataactag tggaaaatat taacctccta gggattaaaa cttatttaac  720

cacagagact aagtgaatgc ttaattagtt gataagagaa gtttttttaa aaccaaaaca  780

ttttggtttt ctattttctt ttcgctatcg cagtttcttc cctcacttct attgtctaac  840

aatcattttt tgaaatttgt tttatagaac atttttaaaa atgaaaaaca caatcaaaca  900

tggccttaat attttgtttc ttatcgccag aacttgttgc tccacagacc tctcttcagt  960

tgctgctctc cctcccaaaa aggcaagaca atgcataagc atttctgtac tttcagtttt  1020

accaacacca ctttctccac taaccaaaat agattggctt tcttcttcgt ttatcatctt  1080

 

<210>113

<211>969

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>113

 

tgttgaattg tccttgagct tgatgatgat gaccttagtc ctgctccaaa accttgcata  60

aatgatttct tcccaaccat tgtcttgaag gcagtatcaa tgttttcttg ttccgttgtt  120

tccaccactt cctgagaatc ttctatttga catctcttct cattagtttg ttcagcaact  180

ttgtcctaca atgaattggt acaacaattg gtcatttaga gaagacgggg aacatcaaat  240

caaatcatat ataagaaaat atagcagtaa tgtaaaatgc agttacattg atttccttag  300

atgctttgtc aatccattcc ccatttcccc ttttgtgtgt caactggcaa aatgtctgca 360

aatcaggctc ctttccggtc actgggtcac gctgttaaaa ttatgtttat taaacattat 420

acaaaaaatg tcataaaatt agatgagaca atcataagag caaacattga gttcaacaga 480

aatctcactg catcattgct gacagctaga aaggattttg agcctgcaga agtgtattaa 540

ttccttcaac aaaaagcagc gtctgcacca ccctcacttt atcatcctga atcattgtat 600

caatatttga aatatcaata tcaaatctct atataatagg acaatgcaaa gtaaaactaa 660

aaaagaccat gaggtaattt cactttcaga atcaacattt ttccttctct gtgggaccca 720

cacggctcat ttcagcatat ggtgcgtcaa aacaaaatat ataaaacaaa aaacaaaaaa 780

acaatgtaaa ggcaaaacaa aaagtttctc cattcctcct cagtagagag atttggcaat 840

atcaaacaat ttcatcatac ataataatat aaaacaaaat gaagaagcaa aacaaaagga 900

attgaagttg aagggaatga cttacatcac ttccacccat caaaggcaca agaaatgaag 960

gaatcatga                                                         969

 

<210>114

<211>611

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>114

 

gcagtgagca agacattctt tgattttgct gaaagaaaaa taatcatggt gtctattttt  60

caaggaacta gtgccgtagt gggccttaag gtttacatgg agtctatttt tcaagtttat  120

aagcatactt taacatacat ttgaggaaat catacgatat tgaagcattg aggggaagtg  180

tcgtaatttg gaactacctg atccttgttt ggagaataaa ttgcagaagg aagctttttt  240

tgcaatttgg gatttgaact ctgatgaaac tatagctggt ttggaaattg caaggataga  300

cggtgatgaa ataatgtggt aggaaatgca aatgatagtg tgtcttgaca gtgggcacgc  360

cgaaacatga ttgttacgtc aaccaaaact actcaattag gggagagcta catctcatta  420

tacagttgga ttctcagcaa aatatttatg tggaaagctg agaactaatg gtttcatagg  480

atacttttgc ttaatttggg ggtgttttca tttggtcaat ttagtagtac gttcaatggt  540

taatatatat gccttgaaaa ataaatattg tgctcaacaa attcgcttct ccgctcttcc  600

tttccaagcg g                                                       611

 

<210>115

<211>751

<212>DNA

<213>大豆

<400>115

 

aaatttccct atccctaacc tcctctacag aatcaaaata accaacatct ttagtttctt  60

caacttcatt gcctctgacc acgtactttt catctttccc ttcctcattt cgaccagaac  120

ccatattcac tccatcattc ttttttcgct gattctgaaa cagatcaggc atgacagaaa  180

tgtcaccact ctgcaacaaa aaatcatcca ggtctcgcga tccaaatgcc acggaagaat  240

tcataaacaa agagttctcg tttctcactt ccggctcctc aaaataacct ttatttttcc  300

acaaatacat ttcatttcca ccatcaccat cactaccata gtcatacata gaatcatcac  360

cctccgataa ctcctcttct tcctcctcct ccttttcttc ctcctcctcc ttttcttctt  420

ccacttcttc ttcttctctt ttctcaattt ccaattcaaa accatttcca ccactcactt  480

caccgttccc tttcgactct tcgatccgat gattaagccc gataaactcc gacgaatcga  540

gcgctgtcat agagagctcc tcactgcaat caccgtacat ctccaatcca ctggaaccgt  600

accgcaaact ccgcctccgg tcgccgccgc cgccgcgatt cacctccgcg gctccttttc  660

ccaaactgaa attctcgaaa ccctcgccgc cggcagaagc gaaatcgcaa tcggagaatt  720

cgtggaagag cgtaacggcg ctgcaggcaa c                                 751

 

<210>116

<211>833

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>116

 

actggtgtac attttaaact cgattttata gttgaaaaat atagacaaac agatagaaga  60

cagtgaatat ctttcatatc tgaaaattca atttcaaagt ataatcatta ttagtttgtt  120

tggaatatta tctcaaagtt tccaaccgtc cacatgcact tttcaaggca ctaaacgaag  180

aaagaactcc aacgttagat tgagaatgac ttagagttaa agtatatcta aacatataat  240

aaatatattt aaataatatc tattaatttc agttaacagt ttcccctctt tactttaatc  300

tctacaaatt caaattcaaa gtataatcat tatagtttgt ttgagttatt gttttaaagc  360

ttcaaaatgc ctacatgcat tttttaagac actaaatgga aagaaaaaaa aaaggttata  420

aaattgatta gagagtaaaa gaagaaaaaa gggaaaaaaa gatcacaaat ttgattcact  480

agttaataaa aaattaacaa ttaatcacta atgaaataaa agtacattta aaattttaaa  540

tatataaaca ctatgagata ctaaaatatt atctattaat ttcaattaac agctatcatt  600

gaaagaaacg agaaaaaatg gagacaatgt ttttcgttta gtgtgtttga attgttttca  660

tggcactaaa cgaaaaaata aaataagaaa ctgtcatcga actgaatata acgtcgactt 720

gtgttggatg caaaaaaaat tccaacacac gaggttatga gtatgacatt ctgttaattg 780

gatatttatt ttccatggca aatatgaact tcgactgaac cacaatgaca caa        833

 

<210>117

<211>410

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>117

 

attcttgcta aatgaaacaa aacattattc tgcaaaggag tgcgaccccc accctagata 60

ccttcaactt tttttctttt gaaactttaa actcggattc agttcgatgg ccaataaaaa 120

gccatcataa ggaaactcta aagcaaagtt aacatagaat caaacaaaac tacagtttca 180

acattgtttt tcctccttat cctaaatcaa aacaatgtgt caaggtctaa cagaggatac 240

ataaaatttt acgtctaaag taagtaacac ttcctgagat gagaaaaaaa aaacaaaaat 300

gaaaacagaa ctaagattga gggcatagaa tgatctattg atgtgggaac tctttctgcc 360

tacttttgct tgacaacctg aattcctgag gcgattgtag tacccttcat            410

 

<210>118

<211>707

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>118

 

tactcccgaa gacactacaa cagaatttct ttttgttttt cttctccttt gtcgcattaa  60

acgtacaagc cttaattact ttcttttcaa taaggtaatc ataatcctat ttattttgcc  120

atgtcccatc aatctaaact tttttttctt ctttcattga atcccatcaa tctaaaccgc  180

ctctatagtt aaacttgtta cggtacgtac tgtacaaatt aactaactat ctgtttattg  240

attgaatgta tagttctctt ttttatatta aaaataaaaa atatgttaca aattgttggt  300

agttatctac actacacatg cacatgcttc accccaaaag cacaaaatgg ttttgacatt  360

cttccaattg atgttgaaaa taccttttac ttccagaagg catcttcaag taaatggcaa  420

ctatggaaca cgtggcttct gtacctgtaa ttctgtcaac acataaaaac aagaacgaat  480

ttttttttaa tctcagtatt ttctagtttt aaaccgtgac acatgatgac cactttggtg  540

caaattaaga aggtagattt atgtatttaa ttggactttt ttttttgcaa gttatctagc  600

tttgatttgc ggataattcc tattcaatag ttgaatctac tggaaaattt gtaccttcca  660

ctcttggtca gcataccttc atggtttctt tttatttctt taagcaa                707

<210>119

<211>856

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>119

 

gtcctggagc gttatgggga gctagatttg gtcctgccgg taatgggaga ggatgcttca   60

gtgataccac tccagatctc tcgtttgtaa tctcaggagg ctttatgcag cccccttccg  120

ggtggcatcc gttgtcaaat gttgtgttga acttgagtag ctgggaggtg ctgtgactcc  180

tagagtatga ataatctcat tagtaacgca gaaatgcgta atttggaatg acatgcactc  240

gcatttagtt atatagttgc caataatatg gtaacgcatt ggtgttttcg ttgttgtgtt  300

taagctctac cgtgtttagg acttatttta tcattgaaga actttgcaca atcattgtaa  360

gtagaccggt aggacagtag gatatataca tggatgtatg gttcgtgcct caattcatcc  420

agaacagtat atttatcata cggaactcat cgatggtgtg aagtttgctg ctcccgatga  480

ttggagttcc attgcaatcg aaagtgattc caaaaaggta ggtaacatta atagaaatgt  540

aacagattgg tctgaactag gtgttattta tgagaggcat aagattagca gtcattgttt  600

gatgaatgta tttccaactt tgttcctagg aaaggaacta aatttgccca ccaagttgac  660

aatgggcaca ttcctcggtt gaaagtttgg cttgggggtt taattccttg gtgatatact  720

ctgaatctgt tgctggttaa tgaatttgat ggatatttga aaaagaaaaa tatgtagaga  780

tagctaaact aacctaaaag gggtttaaga attttagctt attgatgatc ggatttatcc  840

aaaatatggc cttttt                                                  856

 

<210>120

<211>858

<212>DNA

<213>大豆

 

<400>120

 

aaaattaact tagtccgtgt ttgaatgaag ctaatttaga aagaaagaaa attaatttcg  60

gtcaaaaatt gattttaaaa tgaagtgatt tatgcttgat tgtttttata ttaaaacaaa  120

attagtagaa aaatccatta taaaatcgct tcactcaaaa ttgactttgg agccagaatc  180

aatcaattct tcaacacgca accaaaaaca tgaacagttt accttaaaaa atcaagttag  240

ctggtacagt ggtacctcaa catgatttta tctaacataa cgagaatcca aacatgattt  300

taatcaacat gataatgact cctgaatgat taatagtgtg tttggattag cttcatggcg  360

aaaaataatt aattattatt ttttccatgg tgaaggtaaa gcaacaaata gttccttcca  420

ttattgatgg tatcaccatg attttgtgag ttagaattga tttttgacac actgaagagt  480

ttggaaaagc aaacctgttg aaaacaagtg acaaggtatc aaaattgaga ggatcctcca  540

agaaaaactt caactgtgca gctctcttgg cagtggagaa tctaacaaca ggtgccctag  600

acatgcaatc cctcaaaacc acactgctgg ccccaccaga agcatagatg gccttgcacc  660

ctctgttggt actcgccaca aggcaccctt ccgtggtggc catcggcaca gtgtattcga  720

atccatccaa caacaacggc cccgccaccc ctaccggaat ctgcacatac cctaccggca  780

tttcgcagca ctgccctaaa atggagtcgt agtcgaaccc ctccagcggc aggccctcaa  840

gcgactgccc cgtcaggc                                                858

 

<210>121

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>121

 

atattgacag ataaaaag    18

 

<210>122

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>122

 

atattgactg ataaaaag    18

 

<210>123

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>123

 

cttgcaagtc atgcta    16

 

<210>124

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>124

 

tcccttgcat gtcat    15

 

<210>125

<211>20

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>125

 

actcaagttt aagatttgaa    20

 

<210>126

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>126

 

aactcaagtt tatgatttg    19

 

<210>127

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>127

 

attcttcagc atgatc    16

 

<210>128

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

<400>128

 

attcttctgc atgatc    16

 

<210>129

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>129

 

tggtaagtag ttaaatga    18

 

<210>130

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>130

 

tggtaagcag ttaaat    16

 

<210>131

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>131

 

tggtaggcat caataa    16

 

<210>132

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>132

 

atggtaggca ttaataa    17

 

<210>133

<211>13

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>133

 

ctcaaccaaa agc    13

 

<210>134

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>134

 

aactcaatca aaagc    15

 

<210>135

<211>14

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>135

 

ctggcagtgc agca    14

 

<210>136

<211>13

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>136

 

ctggcggtgc agc    13

 

<210>137

<211>13

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>137

ccgctagcct tca    13

 

<210>138

<211>13

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>138

 

ccgctagctt tca    13

<210>139

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>139

 

catattgcga cattaa    16

 

<210>140

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>140

 

ctcacgacat attac    15

 

<210>141

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>141

 

actccattct ggtctt    16

 

<210>142

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>142

 

ctccattctt gtcttat    17

 

<210>143

<211>13

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>143

 

ttgtgcatac ccc    13

 

<210>144

<211>13

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>144

 

ttgtgcagac ccc    13

 

<210>145

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>145

 

acacaagcgc aatta    15

 

<210>146

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>146

caagcacaat taaat    15

 

<210>147

<211>13

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>147

 

cagtgcgctg gac    13

 

<210>148

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>148

 

cagtgtgctg gacta    15

 

<210>149

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>149

 

tattcttgtg caaaccag    18

 

<210>150

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>150

 

attcttgagc aaaccag    17

 

<210>151

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>合成探针

 

<400>151

 

acatgtttcc atttgg    16

 

<210>152

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>152

 

atgtttccca tttggt    16

 

<210>153

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>153

 

caattgctta cagtattag    19

 

<210>154

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>154

 

aattgcttac agttttag    18

 

<210>155

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>155

 

aaactccgta ttcttag     17

<210>156

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>156

 

caggttctaa actcag    16

 

<210>157

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>157

 

ccttctgttg ataatga    17

 

<210>158

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>158

 

ccttctgtag ataatg    16

 

<210>159

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>159

 

caatacctct aaaactt    17

 

<210>160

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>合成探针

 

<400>160

 

caatacctct taaactt    17

 

<210>161

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>161

 

tcatcctgaa cttagc    16

 

<210>162

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>162

 

tcatcctgaa attag    15

 

<210>163

<211>14

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>163

 

aggttcgctt ttct    14

 

<210>164

<211>14

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>164

 

caggtttgct tttc    14

<210>165

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>165

 

ccatccttga ctactag    17

 

<210>166

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>166

 

tctccatcct taactac    17

 

<210>167

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>167

 

caaatatgca ttctc    15

 

<210>168

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>168

 

acaaataagc attctc    16

 

<210>169

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>169

 

tttcaacttt taattcca    18

 

<210>170

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>170

 

aactttcaat tccat    15

 

<210>171

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>171

 

atggttgtcg agaaga    16

 

<210>172

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>172

 

atggttgtgg agaaga    16

 

<210>173

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>173

 

tgagaactaa catcattt    18

<210>174

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>174

 

agaactaaca ccatttgt    18

 

<210>175

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>175

 

atattgacag ataaaaag    18

 

<210>176

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>176

 

atattgactg ataaaaag    18

 

<210>177

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>177

 

aacaacacag cgcag    15

 

<210>178

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

<400>178

 

aacaacacaa cgcag    15

 

<210>179

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>179

 

agattgtacg atggattta    19

 

<210>180

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>180

 

tagattgtac catggattt    19

 

<210>181

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>181

 

agctccaaca tatgat    16

 

<210>182

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>182

 

ctccaaccta tgattg    16

 

<210>183

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>183

 

tatggattca aacaaga    17

 

<210>184

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>184

 

aactatggat ccaaaca    17

 

<210>185

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>185

 

agagaaggga aaatg    15

 

<210>186

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>186

 

cacagagaag gaaaa    15

 

<210>187

<211>14

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

<400>187

 

actacccgat cctt    14

 

<210>188

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>188

 

aactacctga tccttg    16

 

<210>189

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>189

 

aataacctgt atttttc    17

 

<210>190

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>190

 

cctcaaaata acctttatt    19

 

<210>191

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>191

 

agtttgtttg gaatatt    17

 

<210>192

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>192

 

agtttgtttg gattattat    19

 

<210>193

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>193

 

agccatcata aggaaa    16

 

<210>194

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>194

 

ccatcgtaag gaaac    15

 

<210>195

<211>18

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>195

 

acaatttgta acattttt    18

 

<210>196

<211>19

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>196

caatttgtaa catattttt    19

 

<210>197

<211>14

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>197

 

tggtcccgcc ggta    14

 

<210>198

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>198

 

tggtcctgcc ggtaa    15

 

<210>199

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>199

 

caggagtcgt tatca    15

 

<210>200

<211>15

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>合成探针

 

<400>200

 

caggagtcat tatca    15

 

<210>201

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>201

 

ccttgcaagt catgct    16

 

<210>202

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>202

 

ccttgcatgt catgct    16

 

<210>203

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>203

 

aagtttatga tttgaa    16

 

<210>204

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>204

 

aagtttaaga tttgaa    16

 

<210>205

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>205

attcttcagc atgatc    16

 

<210>206

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>206

 

attcttctgc atgatc    16

 

<210>207

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>207

 

tacctctaaa acttgt    16

 

<210>208

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>208

 

tacctcttaa acttgt    16

 

<210>209

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>209

 

ctccaaccta tgattg    16

 

<210>210

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>210

 

ctccaacata tgattg    16

 

<210>211

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>211

 

agccatcaca aggaaa    16

 

<210>212

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>212

 

agccatcata aggaaa    16

 

<210>213

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>213

 

ttggtcctgc cggtaa    16

 

<210>214

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>214

 

ttggtcccgc cggtaa              16

<210>215

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>215

 

tgataatgac tcctga    16

 

<210>216

<211>16

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>216

 

tgataataac tcctga    16

 

<210>217

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>217

 

agtagttact cccttgc    17

 

<210>218

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>218

 

ttccaaaact caagttt    17

 

<210>219

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>219

 

gtctgattaa tattctt    17

 

<210>220

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>220

 

gcattcctca atacctc    17

 

<210>221

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>221

 

aaagagaaaa gctccaa    17

 

<210>222

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>222

 

ggccaataaa aagccat    17

 

<210>223

<211>17

<212>DNA

 

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>223

 

gggagctaga tttggtc    17

<210>224

<211>17

<212>DNA

<213>人工序列

 

<220>

<223>其它信息：人工序列说明：合成探针

 

<400>224

 

tttaatcaac atgataa            17

Claims (25)

1.一种将等位基因渗入大豆植物中的方法，包括：

A)提供大豆植物群体，

B)相对于选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120的大豆基因组核酸标记，对该群体中的至少一个大豆植物进行基因型分型，

C)从所述群体中选择至少一个包含至少一个与蚜虫抗性相关的等位基因的大豆植物。

2.如权利要求1所述的方法，其中，所述选择的大豆植物显示至少部分的蚜虫抗性。

3.如权利要求1所述的方法，其中，所述选择的大豆植物显示至少基本的蚜虫抗性。

4.如权利要求1所述的方法，其中所述基因型通过选自单碱基延伸(SBE)、等位基因特异性引物延伸测序(ASPE)、DNA测序、RNA测序、基于微阵列的分析、通用PCR、等位基因特异性延伸、杂交、质谱法、连接、延伸-连接和瓣核酸内切酶介导的测定的分析方法来确定。

5.如权利要求1所述的方法，其中，所述大豆基因组核酸标记选自SEQ ID NO：81-82。

6.通过权利要求1的方法获得的优良大豆植物。

7.一种将等位基因渗入大豆植物中的方法，包括：

A)使至少一个蚜虫抗性大豆植物与至少一个蚜虫敏感性大豆植物杂交，以形成分离群体，

B)用一种或多种核酸标记筛查所述分离群体，以确定来自所述分离群体的一个或多个大豆植物是否含有蚜虫抗性等位基因，其中所述蚜虫抗性等位基因是选自1、2、3、4、5、6、7、8、9、10，11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27和28蚜虫抗性基因座的等位基因，其中在其一个或多个基因座处的一个或多个等位基因选自蚜虫抗性等位基因1、蚜虫抗性等位基因2、蚜虫抗性等位基因3、蚜虫抗性等位基因4、蚜虫抗性等位基因5、蚜虫抗性等位基因6、蚜虫抗性等位基因7、蚜虫抗性等位基因8、蚜虫抗性等位基因9、蚜虫抗性等位基因10、蚜虫抗性等位基因11、蚜虫抗性等位基因12、蚜虫抗性等位基因13、蚜虫抗性等位基因14、蚜虫抗性等位基因15、蚜虫抗性等位基因16、蚜虫抗性等位基因17、蚜虫抗性等位基因18、蚜虫抗性等位基因19、蚜虫抗性等位基因20、蚜虫抗性等位基因21、蚜虫抗性等位基因22、蚜虫抗性等位基因23、蚜虫抗性等位基因24、蚜虫抗性等位基因25、蚜虫抗性等位基因26、蚜虫抗性等位基因27、蚜虫抗性等位基因28、蚜虫抗性等位基因29、蚜虫抗性等位基因30、蚜虫抗性等位基因31、蚜虫抗性等位基因32、蚜虫抗性等位基因33、蚜虫抗性等位基因34、蚜虫抗性等位基因35和蚜虫抗性等位基因36。

8.如权利要求7所述的方法，其中所述一种或多种标记中的至少一种位于所述抗性等位基因的30cM以内。

9.如权利要求7所述的方法，其中所述一种或多种标记中的至少一种位于所述抗性等位基因的20cM内

10.如权利要求7所述的方法，其中所述一种或多种标记中的至少一种位于所述抗性等位基因的2cM内。

11.如权利要求7所述的方法，其中所述一种或多种标记中的至少一种位于所述抗性等位基因的1cM内。

12.通过权利要求9的方法获得的优良大豆植物。

13.如权利要求12所述的优良大豆植物，其中，所述优良大豆植物显示转基因性状。

14.如权利要求12所述的优良大豆植物，其中，所述转基因性状选自除草剂耐受性、害虫抗性、油组成等。

15.如权利要求12所述的优良大豆植物，其中，所述除草剂耐受性选自草甘膦、麦草畏、草丁膦、磺脲、溴苯腈和达草灭除草剂的耐受性。

16.如权利要求12所述的优良大豆植物，其中，所述核酸序列在所述优良大豆植物中以单拷贝存在。

17.如权利要求12所述的优良大豆植物，其中，所述核酸序列在所述优良大豆植物中以两个拷贝存在。

18.如权利要求12所述的优良大豆植物，其中，所述优良大豆植物显示至少部分的蚜虫抗性。

19.如权利要求16所述的优良大豆植物，其中，所述优良大豆植物显示至少基本的蚜虫抗性。

20.一种用于检测与蚜虫抗性相关的基因座的基本纯化的核酸分子，其包含选自SEQ ID NO：1至SEQ ID NO：175及其互补序列的核酸序列。

21.包含权利要求20的核酸片段的载体。

22.在与权利要求21的载体相容的宿主中表达的权利要求21的载体的表达产物。

23.权利要求22的表达产物的抗体。

24.一种鉴定大豆植物中的蚜虫抗性等位基因的方法，包括检测与选自SEQ ID NO：81至SEQ ID NO：120的SNP标记相关的基因座。

25.一组寡核苷酸，包括：

A)一对寡核苷酸引物，其中所述引物中的每一个包含至少12个连续核苷酸，并且其中所述引物对允许PCR扩增包含与表6和表7中鉴定的蚜虫抗性基因座相关的大豆基因组DNA多态性的DNA区段；和

B)至少一个检测寡核苷酸，其允许检测所述扩增的区段中的多态性，其中所述检测寡核苷酸的序列与包括或直接邻近步骤(A)的所述多态性的玉米DNA区段任一条链中相同数目连续核苷酸的序列至少95％相同。