CN101792805A - 水稻胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及水稻胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记，属于分子遗传学领域。用两对特异扩增水稻胚乳低直链淀粉含量控制基因Wx-mq及其等位基因Wx-b的PCR分子标记引物，其中Wx-b和Wx-mq正向共用引物1Wx-b-F，Wx-b反向引物11Wx-b-R，Wx-mq反向引物11Wx-mq-R共同扩增粳稻品种或材料的DNA，可以准确区分Wx-mq基因及其等位基因的基因型。利用我们开发的等位基因特异PCR标记可以进行水稻胚乳低直链淀粉育种和稻米品质改良。
Description
技术领域
本发明提供了水稻胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记，属于分子遗传学领域，专用于水稻胚乳低直链淀粉含量控制基因Wx-mq的基因型鉴定。
背景技术
稻米品质作为水稻育种的重要目标之一，越来越受到育种工作者与消费者的关注。已有研究表明，淀粉中直链淀粉的相对含量是决定米饭质地和食味的重要因素之一。直链淀粉含量低，米饭黏软，外观油润，有光泽，冷不回生，适口性好；反之，则米饭质地硬，黏性小，蓬松干燥，光泽差。因此，直链淀粉含量已成为稻米食味品质改良的主要指标。低直链淀粉含量的稻米，是介于一般粘米和糯米之间的中间类型，其胚乳外观呈云雾状、乳白色，透明度略差，故又俗称为半糯米。其米饭表面光泽透亮，质地柔软，富有弹性，综合了糯米的柔软性和粳米的弹性，食味品质较佳，且冷不回生，膨化性好，特别适合加工方便调理米饭(如寿司、方便饭等)、膨化食品和各种米类点心。迄今已报道了14个低直链淀粉含量的水稻突变基因。根据它们与Waxy基因等位性关系的不同，可分为与Waxy等位和非等位两大类，其中暗胚乳突变基因Wx-mq属于与Waxy等位的低直链淀粉含量基因。日本水稻育种家已利用暗胚乳突变基因育成了食味品质优良、直链淀粉含量偏低的水稻品种，如Milk queen、关东194等。江苏省农业科学院利用暗胚乳突变基因的酶切扩增片段长度多态性分子标记(CAPS)，对含有该基因的分离世代进行辅助选择，将关东194的暗胚乳突变基因转育到武香粳14中，培育出了优质食味品种南粳46。南粳46被誉为江苏省最好吃的大米，主要由于Wx-mq基因的贡献，因此加速该基因的应用对于水稻品质改良具有重要意义。但CAPS标记涉及酶切反应，操作步骤多，费用较高，不适合于大规模育种和选择。
开发成本低廉且简便实用的基因功能标记是开展高效水稻分子标记辅助选择育种的基础和前提。半糯基因Wx-mq的功能已经初步明确，由于Waxy基因在第4外显子和第5外显子各发生了一个单碱基的突变，导致两个氨基酸的突变，可能导致直链淀粉合成效率降低，从而导致胚乳直链淀粉含量降低。本研究根据水稻复等位基因Wx-b、Wx-mq的DNA序列的差异设计了基于PCR的功能标记，利用该标记对水稻品种资源材料进行了分析验证。
发明内容
技术问题
本发明的目的是：开发水稻胚乳低直链淀粉含量控制基因Wx-mq的等位基因特异PCR功能标记，利用本研究开发的基于PCR的实用经济型标记，可以有效地对低直链淀粉含量控制基因Wx-mq进行基因型选择，主要用于Wx-mq基因的高效分子育种。
技术方案
水稻胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记方法，其特征在于：
用两对特异扩增水稻胚乳低直链淀粉含量控制基因Wx-mq及其等位基因Wx-b的PCR分子标记引物Wx-b和Wx-mq，其中
Wx-b和Wx-mq正向共用引物(1Wx-b-F)：GGCTGTAAGCACACACAAACTTC
Wx-b反向引物(11Wx-b-R)：GAACACACGGTCGACTCAAC
Wx-mq反向引物(11Wx-mq-R)：GAACACACGGTCGACTCAAT
共同扩增粳稻品种或材料的DNA，如用Wx-b引物对能扩增出377bp的片段，用Wx-mq引物对不能扩增出377bp片段，则该粳稻品种或材料含有Wx-b基因；如用Wx-b引物对不能扩增出377bp的片段，用Wx-mq引物对扩增出377bp片段，则该粳稻品种或材料含有Wx-mq基因。
有益效果
本研究所提供的分子标记方法，具有如下优点：
通过本发明获得了可对Wx-mq基因进行基因型鉴别的共显性分子标记。
本发明的分子标记可用于Wx-mq基因的分子标记选择育种，由于可以进行基因型选择，可以省去直链淀粉含量测定过程，降低育种成本，提高育种效率。
附图说明
图1不同引物组合PCR扩增产物在1％的琼脂糖胶电泳结果；(M为DNA ladder，a为100bp，b为250bp，c为500bp，d为750bp，e为1kb，f为2kb；图1A：1、3、5、7、9、11为南粳41DNA，引物组合为扩增Wx-b基因，2、4、6、8、10、12为南粳46DNA，引物组合为扩增Wx-mq基因；图1B：1、3、5、7、9、11为日本晴DNA，引物组合为扩增Wx-mq基因，2、4、6、8、10、12为南粳46DNA，引物组合为扩增Wx-b基因)
图2筛选到的4对引物PCR扩增产物在1％的琼脂糖胶电泳结果(M为DNA ladder，a为100bp，b为250bp，c为500bp，d为750bp，e为1kb，f为2kb；1、3、5、7以日本晴DNA为模板，2、4、6、8以南粳46DNA为模板；1和2引物是，3和4的引物是1Wx-b-F和11Wx-mq-R，5和6的引物是1Wx-b-F和12Wx-b-R，7和8的引物是1Wx-b-F和12Wx-mq-R)
图3筛选到的4对引物提高退火温度后的PCR扩增产物在1％的琼脂糖胶电泳结果。(M为DNA ladder，a为100bp，b为250bp，c为500bp，d为750bp，e为1kb，f为2kb；除提高退火温度条件不同外，其它同图2)
图4筛选到的2对引物对品种材料的验证结果。PCR扩增产物在1％的琼脂糖胶电泳结果(M为DNA ladder，a为100bp，b为250bp，c为500bp，d为750bp，e为1kb，f为2kb；图4A：1-8道为南粳41、南粳44、苏沪香粳、南粳43、镇稻88、徐稻3号、南粳46、关东194，引物为Wx-b基因的特异引物；图4B：1-8同图A，引物为Wx-mq基因的特异引物)
具体实施方式
下面实施例中所用方法如无特别说明均为常规方法。
(一)鉴别胚乳低直链淀粉含量Wx-mq基因型分子标记的获得
1供试材料
均为水稻生产推广品种南粳41、南粳44、苏沪香粳、南粳43、镇稻88、徐稻3号，低直链淀粉含量品种南粳46、关东194。
2 DNA提取
在水稻分蘖期或孕穗期取1克左右水稻叶片，利用SDS方法提取DNA。
DNA提取参照Dellapporta等(1983)的方法，略有修改，具体步骤如下：
①取200-300mg新鲜水稻叶片(-20℃保存的叶片)，在-20℃预冷研钵中用液氮研磨成粉末。
②转移到1.5ml离心管中。
③加入600μl SDS提取液摇匀，65℃，温浴30min，振荡3-4次。
④加入1/4体积(约100μl)KAc，摇匀。
⑤加入1/2体积(约300-400μl)的氯仿∶异戊醇(体积比24∶1)，振荡器上充分摇匀(120rpm，30min)。
⑥室温下6000-8000rpm离心15min，取上清。
⑦加入2倍体积(700μl左右)-20℃预冷的无水乙醇、摇匀，-20℃自由沉淀20min。
⑧室温下12000rpm离心6min，弃上清，沉淀用等体积(400μl左右)70％乙醇洗涤10min。
⑨弃70％乙醇，DNA沉淀风干后，溶解于200μl TE(1/10)，4℃保存备用。
用0.8％的琼脂糖电泳检测DNA样品质量。
3引物设计及PCR反应
江苏省农业科学院选育的南粳46具有胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq，该基因为Waxy基因的突变(Breeding Science，2002，105(32)：131-135)。Wx-mq是由于Waxy基因在第4外显子1996bp处发生了G-A突变，密码子由CGT突变为CAT，氨基酸由(Arg)突变为(His)，第5外显子2190bp发生了T-C突变，密码子由TAC突变为CAC，氨基酸由(Tyr)突变为(His)。这两个单碱基的突变导致胚乳直链淀粉含量降低。选取G-A突变两侧300~500bp范围内的序列，用Primer Premier 5软件设计引物。为了在不同材料检测SNP，采用等位基因特异PCR(Allele-specific PCR，AS-PCR)方法。其基本原理是，针对突变性和野生型之间存在的SNP，以该位点为引物的3‘端，设计引物。一个与野生型完全匹配，一个与突变型完全匹配。而另一条引物为相同引物。这样，两对引物为互补的等位基因特异引物，可以分别与野生型和突变型结合，进行特异扩增。
1)在引物设计过程中，为增强PCR扩增的特异性，在引物的3’端另外加入1到2个错配碱基。有报道认为G/A，C/T为强错配类型，C/A、C/T为弱错配类型，A/A、C/C、G/G、T/T为中等错配类型。本研究主要在3’端的第2和第3加入弱或强错配的碱基。本研究所合成引物见表1。引物由Invitrogen中国公司合成。
表1 基于SNP位点设计的等位基因特异引物
2)以提取的DNA为模板，按下列反应体系进行PCR。PCR反应体系为20μL，分别为：10×PCR Buffer(Mg2+)2.0mL，dNTP(10mmol/L)0.5μL，Taq酶(5U/μL)1.0μL，正向引物(10pmol/L)0.5μL，反向引物(10pmol/L)0.5μL，DNA 1.0u L，ddH2O 14.5μL。PCR反应条件为94℃预变性5min，然后94℃变性1min、60℃退火1min、72℃延伸2min，35个循环，最后72℃延伸10min，结束反应。PCR反应在MJ PTC200热循环仪中进行，扩增产物加入指示剂(0.25％溴酚兰、0.25％二甲苯青FF、40％蔗糖水溶液)，将扩增产物利用1％琼脂糖电泳，EB染色，凝胶成相系统保存图象。
利用SDS方法提取关东194与南粳41的DNA，利用表1设计的引物进行PCR，扩增产物在1％琼脂糖电泳分析(图1)。图1-A为G-A突变设计的引物，采取两次重复进行PCR，第一道以南粳41的DNA为模板，引物对是1Wx-b-F和1Wx-b-R，第2道模版DNA为关东194，引物对是1Wx-b-F和1Wx-mq-R，第3、4道为重复。图1-A第5道引物组合为1Wx-b-F、11Wx-b-R；第6道引物组合为1Wx-b-F、11Wx-mq-R；第7、8道为重复。图1-A第9道引物组合为1Wx-b-F、12Wx-b-R，第10道引物组合为1Wx-b-F、12Wx-mq-R，第11、12道为重复。图1-B的1到12道引物组合一样，但模板DNA交换，即第一道为关东194，第2道模版DNA为南粳41，以此类推。从图1-B可以看出，引物组合1Wx-b-F和1Wx-b-R、1Wx-mq-R在交换DNA模板后仍然能扩增出产物，而引物组合1Wx-b-F和11Wx-b-R、11Wx-mq-R、12Wx-b-R、12Wx-mq-R在交换模版后扩不出产物，并且重复性好。因此对于G-A突变，如果不对SNP的第二位和第3位碱基进行错配，其扩增是非特异的，而在第2或第3位碱基进行错配，扩增就是特异的。
筛选到能进行特异扩增的引物有两组：
引物名称 引物序列
1Wx-b-F GGCTGTAAGCACACACAAACTTC
11Wx-b-R GAACACACGGTCGACTCAAC
11Wx-mq-R GAACACACGGTCGACTCAAT
12Wx-b-R GAACACACGGTCGACTCCGC
12Wx-mq-R GAACACACGGTCGACTCCGT
3)在退火温度为60℃时，仍可能出现一些暗淡带(图2)，为此我们升高退火温度到65℃，图3表明。引物组合11Wx-b-R和11Wx-mq-R与共用引物1Wx-b-F的PCR结果特异性更好(图3)。
引物名称 引物序列
1Wx-b-F GGCTGTAAGCACACACAAACTTC
11Wx-b-R GAACACACGGTCGACTCAAC
11Wx-mq-R GAACACACGGTCGACTCAAT
(二)对水稻品种资源的标记基因型分析
水稻生产推广品种南粳41、南粳44、苏沪香粳、南粳43、镇稻88、徐稻3号，携带Wx-b等位基因；低直链淀粉含量品种南粳46、关东194携带Wx-mq等位基因。提取这些材料的DNA，利用两对引物扩增结果见图4。可以看出：
引物为Wx-b和Wx-mq正向共用引物1Wx-b-F和Wx-b反向引物11Wx-b-R时，1-6道材料分别为含有Wx-b基因的粳稻品种，其基因型为Wx-bWx-b，能扩增到产物377bp片段；而7、8道为携带-mq基因的水稻品种，其基因型为Wx-mqWx-mq，不能获得产物(图4A)。
引物为Wx-b和Wx-mq正向共用引物1Wx-b-F和Wx-mq反向引物11Wx-mq-R时，1-6道材料分别为粳稻品种，其基因型为Wx-bWx-b，不能扩增到产物，而7、8道为携带Wx-mq基因的水稻品种，其基因型为Wx-mqWx-mq，能获得产物377bp片段(图4B)。
序列表
<110>江苏省农业科学院
<120>水稻胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记
<130>说明书
<160>3
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>23
<212>DNA
<213>人工
<220>
<221>Wx-b和Wx-mq正向共用引物1Wx-b-F
<222>(1)..(23)
<223>
<400>1
ggctgtaagc acacacaaac ttc 23
<210>2
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<221>Wx-b反向引物11Wx-b-R
<222>(1)..(20)
<223>
<400>2
gaacacacgg tcgactcaac 20
<210>3
<211>20
<212>DNA
<213>人工
<220>
<221>Wx-mq反向引物11Wx-mq-R
<222>(1)..(20)
<223>
<400>3
gaacacacgg tcgactcaat 20
Claims (1)
1.水稻胚乳低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记方法，其特征在于：用两对特异扩增水稻胚乳低直链淀粉含量控制基因Wx-mq及其等位基因Wx-b的PCR分子标记引物，其中
Wx-b和Wx-mq正向共用引物1Wx-b-F：GGCTGTAAGCACACACAAACTTC
Wx-b反向引物11Wx-b-R：GAACACACGGTCGACTCAAC
Wx-mq反向引物11Wx-mq-R：GAACACACGGTCGACTCAAT
共同扩增粳稻品种或材料的DNA，如用Wx-b引物对能扩增出377bp的片段，而用Wx-mq引物对不能扩增出377bp片段，则该粳稻品种或材料含有Wx-b基因；如用Wx-b引物对不能扩增出377bp的片段，而用Wx-mq引物对扩增出377bp片段，则该粳稻品种或材料含有Wx-mq基因。
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Cited By (10)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN102199661A (zh) * | 2011-03-11 | 2011-09-28 | 山东省花生研究所 | 花生δ12-脂肪酸脱氢酶基因快速分型方法 |
| CN103725774A (zh) * | 2013-10-18 | 2014-04-16 | 湖北省农业科学院粮食作物研究所 | 快速检测水稻直链淀粉Wx基因型的分子标记Wx-YMZC及应用方法 |
| CN104131092A (zh) * | 2014-07-22 | 2014-11-05 | 华南农业大学 | 一种基于高分辨率熔解曲线的多snp鉴定方法 |
| CN106755408A (zh) * | 2016-12-22 | 2017-05-31 | 北京林业大学 | 一种植物等位基因不平衡表达检测方法 |
| CN108103228A (zh) * | 2018-01-17 | 2018-06-01 | 天津市农作物研究所 | 水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记特异性引物及其应用 |
| CN108841838A (zh) * | 2018-07-09 | 2018-11-20 | 江苏省农业科学院 | 一种控制水稻低直链淀粉含量的新等位基因及其应用 |
| CN109593879A (zh) * | 2019-01-31 | 2019-04-09 | 安徽省农业科学院水稻研究所 | 稻米中等直链淀粉含量基因Wxg1的SNP功能分子标记及其应用 |
| CN110004246A (zh) * | 2019-03-21 | 2019-07-12 | 江苏省农业科学院 | 一种筛选半糯水稻品种最适直链淀粉含量的分子标记辅助育种方法 |
| CN111154906A (zh) * | 2020-01-20 | 2020-05-15 | 安徽省农业科学院水稻研究所 | 适于米粉专用稻筛选的snp功能分子标记及其应用 |
| CN115125318A (zh) * | 2022-04-26 | 2022-09-30 | 浙江大学 | 与水稻籽粒暗胚乳性状相关的sscp分子标记、基因及其应用 |
Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2008072971A (ja) * | 2006-09-22 | 2008-04-03 | National Agriculture & Food Research Organization | 低アミロース性を支配する新規遺伝子及び低アミロース米品種の識別方法 |
| CN101265497A (zh) * | 2008-04-02 | 2008-09-17 | 江苏省农业科学院 | 一种鉴别水稻暗胚乳突变基因Wx-mq的分子标记方法 |
-
2010
- 2010-03-18 CN CN2010101268349A patent/CN101792805B/zh not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2008072971A (ja) * | 2006-09-22 | 2008-04-03 | National Agriculture & Food Research Organization | 低アミロース性を支配する新規遺伝子及び低アミロース米品種の識別方法 |
| CN101265497A (zh) * | 2008-04-02 | 2008-09-17 | 江苏省农业科学院 | 一种鉴别水稻暗胚乳突变基因Wx-mq的分子标记方法 |
Non-Patent Citations (2)
| Title |
|---|
| 《Breeding Science》 20021231 Hiroyuki Sato et al Molecular characterization of Wx-mq，a novel mutant gene for low-amylose content in endosperm of rice（Oryza sativa L.） 131-135 1 第52卷, 2 * |
| 《作物学报》 20050430 张建勇等 利用分子标记鉴定水稻品种的Wx等位基因及其与直链淀粉含量的关系 420-424 1 第31卷, 第4期 2 * |
Cited By (15)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN102199661A (zh) * | 2011-03-11 | 2011-09-28 | 山东省花生研究所 | 花生δ12-脂肪酸脱氢酶基因快速分型方法 |
| CN103725774A (zh) * | 2013-10-18 | 2014-04-16 | 湖北省农业科学院粮食作物研究所 | 快速检测水稻直链淀粉Wx基因型的分子标记Wx-YMZC及应用方法 |
| CN103725774B (zh) * | 2013-10-18 | 2015-06-24 | 湖北省农业科学院粮食作物研究所 | 快速检测水稻直链淀粉Wx基因型的分子标记Wx-YMZC及应用方法 |
| CN104131092A (zh) * | 2014-07-22 | 2014-11-05 | 华南农业大学 | 一种基于高分辨率熔解曲线的多snp鉴定方法 |
| CN104131092B (zh) * | 2014-07-22 | 2016-08-17 | 华南农业大学 | 一种基于高分辨率熔解曲线的多snp鉴定方法 |
| CN106755408B (zh) * | 2016-12-22 | 2020-10-13 | 北京林业大学 | 一种植物等位基因不平衡表达检测方法 |
| CN106755408A (zh) * | 2016-12-22 | 2017-05-31 | 北京林业大学 | 一种植物等位基因不平衡表达检测方法 |
| CN108103228A (zh) * | 2018-01-17 | 2018-06-01 | 天津市农作物研究所 | 水稻低直链淀粉含量基因Wx-mq的分子标记特异性引物及其应用 |
| CN108841838A (zh) * | 2018-07-09 | 2018-11-20 | 江苏省农业科学院 | 一种控制水稻低直链淀粉含量的新等位基因及其应用 |
| CN108841838B (zh) * | 2018-07-09 | 2021-08-17 | 江苏省农业科学院 | 一种控制水稻低直链淀粉含量的新等位基因及其应用 |
| CN109593879A (zh) * | 2019-01-31 | 2019-04-09 | 安徽省农业科学院水稻研究所 | 稻米中等直链淀粉含量基因Wxg1的SNP功能分子标记及其应用 |
| CN110004246A (zh) * | 2019-03-21 | 2019-07-12 | 江苏省农业科学院 | 一种筛选半糯水稻品种最适直链淀粉含量的分子标记辅助育种方法 |
| CN111154906A (zh) * | 2020-01-20 | 2020-05-15 | 安徽省农业科学院水稻研究所 | 适于米粉专用稻筛选的snp功能分子标记及其应用 |
| CN115125318A (zh) * | 2022-04-26 | 2022-09-30 | 浙江大学 | 与水稻籽粒暗胚乳性状相关的sscp分子标记、基因及其应用 |
| CN115125318B (zh) * | 2022-04-26 | 2024-06-18 | 浙江大学 | 与水稻籽粒暗胚乳性状相关的sscp分子标记、基因及其应用 |
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