CN101090969B - 鼠李糖启动子表达系统及用途 - Google Patents
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Abstract
本发明的涉及可在宿主中表达的新载体,该载体含有操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域,该转录单元含有:a)对于所述宿主来说是异源的核酸序列,b)操作性连接于所述核酸序列的原核生物信号序列,该原核生物信号序列选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽,该核酸序列的表达由该启动子控制。还提供的是:所述新载体在原始生物宿主中核酸序列的受调节异源表达中的用途;可在宿主中表达的分离纯化的核酸序列,其含有L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域;和使用所述载体在宿主中生产多肽的方法。
Description
本发明涉及用于在原核生物宿主中异源表达编码如多肽(如重组蛋白)的核酸的载体。更具体而言,本发明涉及可在宿主中表达的新载体,它含有操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域,该转录单元含有:a)对于所述宿主来说是异源的核酸序列,b)操作性连接于所述核酸序列的原核生物信号序列,该原核生物信号序列选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽。本发明还涉及使用这些载体异源表达编码例如多肽的核酸。
发明背景
已描述了许多用于在原核生物宿主中异源表达编码如多肽(如重组蛋白)的核酸的系统。但是,原核生物宿主系统中的大多数异源基因表达系统全部依赖于有限的细菌启动子组。最常用的原核生物启动子包括乳糖[lac](Yanisch-Perron等,1985,Gene33,103-109)、和色氨酸[trp](Goeddel等,1980,Nature(伦敦)287,411-416)启动子,和衍生自这两种启动子的杂交启动子[tac和trc](Brosius,1984,Gene27:161-172;Amann和Brosius,1985,Gene40,183-190)。其它可诱导的启动子系统,如可由阿拉伯糖诱导的araB启动子(WO8604356)、由L-鼠李糖诱导的鼠李糖启动子rhaSB(WO03068956)或由L-鼠李糖诱导的鼠李糖启动子rhaBAD(WO2004/050877)也已被描述用于蛋白质的异源表达。WO2004/050877描述了使用rhaBAD启动子在大肠杆菌中异源表达腈水解酶。在用L-鼠李糖诱导后,可在静止细胞测试中获得腈水解酶活性。但是,尤其是在复杂多肽(如抗体或抗体片段)的表达中,有利的是使用信号肽将多肽从胞质转移到非胞质位置(分泌),因为胞质中异源蛋白质的过量生产通常伴随着错误折叠和隔离成不溶的聚集体(内涵体)。但是,由于信号序列可影响分泌的多肽的成熟区域中二级结构和三级结构的形成,适当的信号肽以及有用的启动子的选择对于功能性多肽的高产量而言是重要的。因此,仍需要提供替代的原核生物表达系统来异源表达核酸序列。
发明内容
通过提供新的载体将可实现依前述说明而显而易见的这些和其它目标,该载体可用于高水平表达所需的异源产物,它包含L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域、异源核酸序列和选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽的原核生物信号序列。在第一方面,本发明的目的是提供一种可在宿主中表达的新载体,该载体含有操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域,该转录单元含有:a)对于所述宿主来说是异源的核酸序列,b)操作性连接于所述核酸序列的原核生物信号序列,该原核生物信号序列选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽,该核酸序列的表达由该启动子控制。还提供的是:所述新载体在原始生物宿主中核酸序列的受调节异源表达中的用途;可在宿主中表达的分离纯化的核酸序列,其含有L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域、异源核酸序列和选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽的原核生物信号序列;用所述载体或所述分离纯化的核酸序列转化的原核生物宿主;使用所述载体在宿主中生产多肽的方法;和含有如下区域的载体:启动子区域、异源核酸序列和由序列AGGAGATATACAT构成的翻译起始区域。
本领域技术人员根据以下的详细描述将更易于了解其它目的和优点,下文的描述将结合以下的阐述性附图以及附带的权利要求进行。
附图简述
图1显示了质粒pBW22-Fab-H,其含有L-鼠李糖可诱导的启动子(PrhaBAD)、编码操作性连接于Fab片段的轻链(ompA-VL3-CL)和重链(phoA-VH-CH)的信号序列的序列和转录终止区域(rrnB)。
图2显示了质粒pBLL15,其含有蜜二糖可诱导的启动子(PmelAB2)、编码操作性连接Fab片段的轻链(ompA-VL3-CL)和重链(phoA-VH-CH)的信号序列的序列、和转录终止区域(rrnB)。
图3显示使用了不同表达质粒的未诱导的(—)和诱导的(+)W3110株的溶菌酶提取物的斑点印迹结果(用抗人轻链检测Fab,与碱性过氧化物酶偶联)。显 示了时间间隔。
图4显示了质粒pAKL14,其含有L-鼠李糖可诱导的启动子(PrhaBAD)和具有改变的信号序列的Fab-H基因。
图5显示未诱导的(—)和L-鼠李糖诱导的W3110(pAKL14)株的溶菌酶提取物的斑点印迹。显示了取样时间(用抗人轻链检测Fab,与碱性过氧化物酶偶联)。
图6显示了L-鼠李糖诱导的W3110(pAKL14)株的溶菌酶提取物的蛋白质印迹。显示了取样时的诱导后时间(用抗人轻链检测Fab,与碱性过氧化物酶偶联)。泳道1:标准品(1.28μg);泳道2:W3110(pAKL14),诱导,3h;泳道3:W3110(pAKL14),诱导,5h;泳道4:W3110(pAKL14),诱导,7h;泳道5:W3110(pAKL14),诱导,12h;泳道6:W3110(pAKL14),诱导,23h;泳道7:W3110(pAKL14),未诱导,23h。
图7显示具有高Fab-H抗体浓度的不同W3110株的溶菌酶提取物的SDS-PAGE。将产生没有信号序列的轻链和重链的菌株用作阴性参比(泳道1:标记物;泳道2:W3110(pMx9-HuCAL-Fab-H);泳道3:W3110(pBW22-Fab-H);泳道4:W3110(pBLL15);泳道5:W3110(pAKL14);泳道6:标准物(2μg))。
图8显示了质粒pAKL15E,其含有蜜二糖可诱导的启动子(PmelAB2)和具有改变的信号序列的Fab-H基因。
图9显示在诱导物蜜二糖的存在或缺乏的情况下,W3110(pAKL15E)株的溶菌酶提取物的SDS-PAGE。显示了轻链和重链的位置(泳道1:标记物;泳道2:W3110(pAKL15E),未诱导;泳道3:W3110(pAKL15E),诱导)。
图10显示质粒pBLL7-pelB-S1,其含有L-鼠李糖可诱导的rhaBAD启动子、操作性连接于编码单链抗体(scFv,S1)的序列的编码PelB信号肽的序列和转录终止区域(rrnB)。
图11显示未诱导的(—)和诱导的(+)W3110(pBW22-pelB-S1)株的粗提取物的SDS-PAGE。如所示在不同的时间间隔获取样品。分析溶菌酶处理后获得的可溶和不可溶的蛋白质级分。箭头表示scFv蛋白。M=标记12(Mark12),Invitrogen的分子量标准物。
图12显示了广宿主范围质粒pJOE4782,其含有L-鼠李糖可诱导的rhaBAD启动子与大肠杆菌L-鼠李糖操纵子的调节蛋白RhaS和RhaR的基因。质粒 pJOE4782还含有操作性连接编码GFP报道蛋白的序列的编码MalE信号肽的序列。
图13显示了质粒pAKLP2,其含有L-鼠李糖可诱导的rhaBAD启动子和编码腈水解酶蛋白的序列(nitA)。
图14显示诱导的恶臭假单胞菌KT2440(Pseudomonas putida strain KT2440)细胞(pAKLP2)的SDS-PAGE。如所示那样在不同的时间间隔后获取样品。箭头表示腈水解酶蛋白。M=标记12,Invitrogen的分子量标准物。
图15显示了质粒pAKLP1,其含有L-鼠李糖可诱导的rhaBAD启动子和分别操作性连接于编码OmpA信号肽的序列和编码PhoA信号肽的序列的编码Fab-M重链和轻链的序列。
图16显示诱导的恶臭假单胞菌KT2440(Pseudomonas putida strain KT2440)细胞(pAKLP1)的SDS-PAGE。如所示那样在不同的时间间隔后获取样品。箭头表示FabM轻链和重链。M=标记12,Invitrogen的分子量标准物。
图17显示大肠杆菌W3110株(pBW22-pelB-S1)的发酵样品的SDS-PAGE。如所示那样在不同的时间间隔后获取样品(以小时计)。箭头表示scFv蛋白。M=标记12,Invitrogen的分子量标准物。
发明详述
本文提供以下定义,以易于理解本发明。
“在宿主中可表达的载体”或“表达载体”指重组产生的或合成的多核酸构建物,其具有一系列的特定的多核酸元件,这些元件使得特定的核酸序列在宿主细胞中得以转录。一般而言,这种载体包括转录单元,该单元含有待转录的操作性连接于启动子的特定核酸。可在宿主中表达的载体可以是例如:自主复制或自复制质粒、粘粒、噬菌体、病毒或逆转录病毒。
术语“宿主”、“宿主细胞”或“重组宿主细胞”在本文中交换使用,指其中已引入了本发明的一种或多种载体或分离纯化的核酸序列的原核生物细胞。应理解,这些术语不仅指特定细胞对象,还指这些细胞的后代或潜在后代。因为随后的世代可能由于突变或环境影响而发生某些变动,因此这些后代实际上与亲本细胞可能是不同的,但它们仍包括在本文所用术语的范围之内。
术语“包含”通常以“含有”的含义使用,即允许存在一个或多个特征或组分。
“启动子”在本文中指调节转录单元的表达的核酸序列。“启动子区域”是能够结合细胞中的RNA聚合酶并启动下游(3’方向)编码序列的转录的调节区域。在启动子区域中将可存在转录起始位点(通常通过核酸酶S1的图谱来定义)以及对RNA聚合酶的结合负责的蛋白质结合区域(共有序列),如推定的-35区域和Pribnow框。
“L-鼠李糖操纵子”指Holcroft和Egan(2000,J.Bacteriol.182(23),6774-6782)所述的rhaSR-rhaBAD操纵子。RhaBAD操纵子是个阳性调节的分解代谢操纵子,它与另一rha操纵子rhaSR别异地转录RhaB、RhaA和RhaD,它们各自的转录起始位点之间具有大约240bp的DNA将它们隔开。rhaSR启动子编码两个L-鼠李糖特异性激活子RhaS和RhaR。RhaR调节rhaSR的转录,而RhaS结合-32到-81位(相对于rhaBAD的转录起始位点)的DNA上游。此外,rhaSR-rhaBAD基因间的操纵子含有位于-92,5(相对于rhaBAD的转录起始位点)的CRP结合位点(CRP1)、和位于-92,5(CRP2)、-115,5(CRP3)、116,5(CRP4)(相对于rhaSR的转录起始位点)的CRP结合位点,以及跨越-32到-82(相对于rhaSR的转录起始位点)的RhaR的结合位点。
“L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域”指基本上由rhaBAD转录起始位点、推定的-35区域、Pribnow框、CRP结合位点CRP1、相对于rhaBAD的转录起始位点的RhaS结合位点以及CRP结合位点CRP2-4,和相对于rhaSR的转录起始位点的RhaR结合位点构成的rhaBAD操纵子。“rhaBAD启动子”指基本上由rhaBAD转录起始位点、推定的-35区域、Pribnow框、相对于rhaBAD的转录起始位点的RhaS结合位点和CRP1结合位点区域、和相对于rhaSR的转录起始位点的CRP结合位点CRP4或其一部分构成的rhaBAD操纵子的启动子。
“CRP”指“分解代谢产物调节蛋白”。“CRP”在本领域中通常称作“环AMP受体蛋白”,它们具有相同的含义。CRP是由环AMP(cAMP)控制的调节蛋白,它介导分解代谢操纵子(如L-鼠李糖操纵子)的活化。
“增强子”是不依赖转录单元的同一性、其序列相对于转录单元的位置、 或其序列的取向而起到强化转录单元的转录的核酸序列。本发明的载体任选含有增强子。
“转录单元”在本文中指通常被转录成单一RNA分子的核酸序列。转录单元可含有编码功能上相关的多肽分子的一个基因(单顺反子)或两个(双顺反子)或多个基因(多顺反子)。
当核酸序列与另一核酸序列功能相关时,它是“操作性连接的”。例如,如果信号序列的DNA被表达为参与蛋白质的分泌的前体蛋白,则该信号序列的DNA操作性连接于该蛋白质的DNA;如果启动子影响到序列的转录,则该启动子与该序列操作性连接;或者如果翻译启动区域(如核糖体结合位点)的位置促进了多肽的翻译,则该翻译启动区域编码所述多肽的核酸序列操作性连接。可在常规的限制性位点通过连接反应来实现连接。如果不存在这类位点,则根据常规实践使用合成寡核苷酸连接物或接头。
“核酸”或“核酸序列”或“分离纯化的核酸或核酸序列”在本发明中可以是DNA、RNA、或DNA/RNA杂交体。在核酸或核酸序列位于载体中的情况中,核酸或核酸序列通常是DNA。DNA在本文中可以是任何聚脱氧核苷酸序列,包括例如:双链DNA、单链DNA、其中一条或两条由两个或多个片段组成的双链DNA、其中一条或两条链含有不间断的磷酸二酯骨架的双链DNA、含有一个或多个单链部分和一个或多个双链部分的DNA、其中DNA链完全互补的双链DNA、其中DNA链仅部分互补的双链DNA、环状DNA、共价封闭的DNA、线性DNA、共价交联的DNA、cDNA、化学合成的DNA、半合成的DNA、生物合成的DNA、自然分离的DNA、酶消化的DNA、剪切的DNA、标记的DNA(如放射性标记的DNA和荧光染料标记的DNA)、含一种或多种非天然存在的核酸种类的DNA。可采用标准的化学技术(例如磷酸三酯法)或通过自动合成方法和PCR方法合成DNA序列。还可采用酶技术生产纯化的和分离的DNA。
RNA在本文中可以是例如:单链RNA、cRNA、双链RNA、其中一条或两条由两个或多个片段组成的双链RNA、其中一条或两条链具有不间断的磷酸二酯骨架的双链RNA、含有一个或多个单链部分和一个或多个双链部分的RNA、其中RNA链完全互补的双链RNA、其中RNA链仅部分互补的双链RNA、 共价交联的RNA、酶消化的RNA、剪切的RNA、mRNA、化学合成的RNA、半合成的RNA、生物合成的RNA、自然分离的RNA、标记的RNA(如放射性标记的RNA和荧光染料标记的RNA)、含一种或多种非天然存在的核酸种类的RNA。
“变体”或“序列的变体”指与参比序列相比发生了保守核酸取代,从而使得一个或多个核酸被其它具有相同特性的核酸取代的核酸序列。变体也包括简并序列、具有缺失和插入的序列,只要这些修饰的序列具有与参比序列相同的功能(功能上等价)即可。
在本文中,术语“多肽”、“肽”、“蛋白质”、“多肽的(polypeptidic)”以及“肽(peptidic)”交换使用,指通过相邻残基的α-氨基和羧基之间的肽键连接到另外的氨基酸残基的一系列氨基酸残基。
术语“分离纯化的核酸序列”指根据本发明所述核酸序列将呈现的状态。核酸序列将不含有或基本上不含有:与它们天然结合的物质,如在它们的自然环境中或者当这种制品采用体外或体内的重组技术进行制备时在它们的制备环境(如细胞培养物)中所发现的与它们结合的其它核酸。
术语“转化”、“转化的”或“将核酸导入宿主细胞”指在具有或不具有伴随物质的情况下使胞外核酸(如载体)进入宿主细胞的任何过程。术语“细胞转化的”或“转化的细胞”指其中已导入胞外核酸从而包含有该胞外核酸的细胞或其后代。核酸可以被导入细胞中,从而使得该核酸可作为染色体的组成部分或作为额外的染色体元件被复制。可采用已知的方法如微注射、电穿孔、颗粒轰击或采用化学方法如磷酸钙介导的转化(Maniatis等,1982,“MolecularCloning,A laboratory Manual”《分子克隆实验指南》,Cold Spring HarborLaboratory,或者Ausubel等,1994,“Current Protocols in Molecular Biology”《分子生物学最新进展》,John Wiley和Sons),用如表达载体转化适当的宿主细胞。
“异源核酸序列”或“对于宿主而言是异源的核酸序列”指这样的核酸序列,其编码的表达产物如多肽对于宿主来说是外来的(“异源表达”或“异源产物”),即是源自不同于宿主的供体的核酸序列,或者指化学合成的核酸序列,它编码的表达产物如多肽对于宿主来说是外来的。在宿主是特定的原核生物物 种的情况下,异源的核酸序列较佳源自不同的属或科,更优选是源自不同的目或纲,尤其是源自不同的门(division),更特别是来自不同领域(empire)的有机体。
可在将源自不同于宿主的供体的异源核酸序列导入宿主细胞之前,通过突变、插入、缺失或取代单个核酸或一部分异源核酸序列,从而对其进行修饰,只要这种修饰的序列仍具有与参比序列相同的功能(功能性等价)。本文所指的异源核酸序列也包括源自不同领域(empire)的有机体的核酸序列,如来自真核生物(真核生物来源的),如人抗体,这些核酸序列已用于噬菌体展示文库并已根据原核生物宿主的“密码子选择”对单个核酸或一部分核酸序列进行了修饰。
“信号序列”或“信号肽序列”指编码在某些蛋白质的NH2-末端出现的通常被细胞转运到非胞质位置(如分泌)或成为膜组分的短氨基酸序列(即信号肽)的核酸序列。信号肽指导蛋白质从胞质转运到非胞质位置。
“翻译起始区域”指一个信号区域,此区域促进翻译启动,并作为核糖体结合位点,如Shine Dalgarno序列。
“转录终止区域”指引起RNA聚合酶终止转录的序列。转录终止序列通常是转录单元的一部分,它增加mRNA的稳定性。
“抗体”指由抗原刺激后的免疫系统的B细胞产生的一类血浆蛋白。哺乳动物(即人)抗体是IgG、M、A、E或D类免疫球蛋白。对于本发明的目的,术语“抗体”包括但不限于:多克隆抗体、单克隆抗体、自身免疫疾病(如糖尿病、多发性硬化和类风湿性关节炎)中存在的抗个体基因型抗体和自身抗体、以及嵌合抗体。基本的抗体结构单元已知包含四聚体。每个四聚体由两对相同的多肽链组成,各对具有一条“轻”链(约25kDa)和一条“重”链(约50-70kDa)。各链的氨基末端部分包括约100-110或更多个氨基酸的可变区,主要负责抗原识别。各链的羧基末端定义了一个恒定区,主要负责效应物的功能。
轻链分为K和λ。重链分为γ、μ、α、δ或ε,将抗体的同种型分别定义为IgG、IgM、IgA、IgD和IgE。在轻链和重链内,可变区和恒定区通过约12或更多的氨基酸的“J”区域连接,重链还包括约10个以上氨基酸的“D”区域。
术语“抗体”指整个抗体或其结合片段。结合片段包括单链片段、Fv片段和Fab片段。
术语“单链抗体”包括非天然的抗体形式,这些形式仅将抗体的抗原结合区域组合在单一的稳定折叠的多肽链上。这样,单链抗体的大小比典型的免疫球蛋白要小得多,但是它们仍然保留了抗体的抗原特异性结合特性。单链抗体被广泛使用在在大量不同的应用中,包括例如治疗、诊断、研究工具等。
术语Fab片段在本领域中有时指由完整抗体经木瓜蛋白酶解离而得到的结合片段。术语Fab’和F(ab’)2在本领域中有时指用胃蛋白酶解离完整的抗体产生的结合片段。在本发明的上下文中,Fab一般指完整抗体的双链结合片段,其具有足以用于抗原特异性结合的至少基本上完整的轻链和重链可变区、和足以维持轻链和重链的结合的部分轻链和重链恒定区。这种Fab的一个例子例如描述于如Skerra等(1988,Science240(4855),1038-41)中。诸如IgG独特型的Fab片段可含有或可不含有形成完整免疫球蛋白中的两条重链之间的两个链间二硫键的两个半胱氨酸残基中的至少一个。通常,通过将全长或基本上全长的轻链与含有可变区和恒定区的至少CH1区域的重链复合而形成Fab片段。此外,可用丝氨酸或其它氨基酸替换轻链上的C末端半胱氨酸,以消除本发明轻链和重链之间的链间二硫键。
还包括的是嵌合抗体,通常采用遗传工程技术从例如不同物种的免疫球蛋白基因片段(如编码可变区的片段和编码恒定区的片段)构建这种抗体中的轻链和重链基因。例如,可将小鼠单克隆抗体基因的可变区(V)节段连接到人的恒定区(C)节段(如IgG1和IgG4)。因此,典型的嵌合抗体是杂合蛋白,由小鼠抗体的V或抗原结合结构域和人抗体的C或效应物结构域构成。嵌合抗体的结合特异性和亲合力与小鼠抗体或其它提供抗体可变区的非人抗体的结合特异性和亲合力相同或类似。
术语“人抗体”包括具有衍生自包括自然或人工的、工程处理的亲合力成熟的人种系(germline)免疫球蛋白序列的可变区和恒定区(如果存在的话)。本发明的人抗体可包括不由人种系免疫球蛋白序列编码的氨基酸残基(如由体外随机或定点诱变或体内体细胞突变引入的突变)。但是,术语“人抗体”确实包括衍生自其它哺乳动物种系如小鼠的CDR序列,且已被移植到人框架序列上的抗体(即人源化抗体)。此术语也包括这些“人抗体”的功能性变体,如其截短形式,或其中例如单个脯氨酸或半胱氨酸残基已经本领域已知的遗传工程技术 工程加工的工程加工变体。这些例子在WO98/02462中有描述。但是,该术语仅涉及这些抗体的氨基酸序列,而不考虑肽骨架的任何糖基化或其它化学修饰。
一个方面,本发明提供可在宿主中表达的载体,该载体包含操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域,该转录单元包含
a)对所述宿主来说异源的核酸序列,
b)操作性连接于所述核酸序列的原核生物信号序列,该原核生物信号序列选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽,且所述核酸序列的表达收到所述启动子区域的控制。
本发明的载体优选是自主复制或自复制质粒、粘粒、噬菌体、病毒或逆转录病毒。大范围的宿主/载体组合可用于表达本发明的核酸序列。有用的表达载体可由例如染色体、非染色体和/或合成核酸序列的节段构成。合适的载体包括具有特定宿主范围的载体,例如对如大肠杆菌特异的载体,以及具有广泛的宿主范围的载体,如用于革兰氏阴性菌的载体。可使用“低拷贝”、“中等拷贝”以及“高拷贝”质粒。
用于如大肠杆菌中表达的有用载体是:pQE70、pQE60和pQE-9(QIAGEN,Inc.);pBluescript Vektoren、Phagescript Vektoren、pNH8A、pNH16a、pNH18A、pNH46A(Stratagene Cloning Systems,Inc.);ptrc99a、pKK223-3、pKK233-3、pDR540、pRIT5(Pharmacia Bio-tech,Inc.);pLG338、pACYC184、pBR322、pUC18、pUC19、pKC30、pRep4、pACYC177、pACYC184、pRSF1010和pBW22[Wilms等,2001,Biotechnology and Bioengineering,73(2)95-103]或其衍生物,如质粒pBW-22-Fab-H或pAKL14。其它有用的质粒是本领域技术人员周知的,描述于如“Cloning Vectors”(《克隆载体》Pouwels P.H.等编辑,Elsevier,Amsterdam-New York-Oxford,1985)中。
本发明的优选载体是自主复制或自复制质粒,更优选是具有特定宿主范围的载体,例如对如大肠杆菌特异的载体。最优选的是pBR322、pUC18、pACYC177、pACYC184、pRSF1010和pBW22或其衍生物,如pBW22-Fab-H或pAKL14,尤其优选的是pBW22-Fab-H或pAKL14,最优选的是pAKL14。
在优选的实施方式中,L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域是rhaBAD 启动子。在特别优选的实施方式中,rhaBAD启动子由SEQ ID NO:1、其互补序列或变体构成。优选的,L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域、rhaBAD启动子和由SEQ ID NO:1、其互补序列或变体构成的rhaBAD启动子得自大肠杆菌的L-鼠李糖操纵子。
在本发明另一优选实施方式中,可在原核生物宿主中表达的宿主除操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域外,还含有编码L-鼠李糖特异性激活子RhaS和RhaR的序列(包括它们各自的天然启动子序列)。在表达后,RhaS和RhaR蛋白控制着rhaBAD启动子的活性。
对于选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽的原核生物信号序列,可使用诸如:PelB(菊欧文氏菌(Erwinia chrysantemi),果胶酸盐裂解酶前体)、PelB(胡萝卜软腐欧文氏菌(Erwinia carotovora),果胶酸盐裂解酶前体)、PelB(野油菜黄单胞菌(Xanthomonas campestris),果胶酸盐裂解酶前体)、LamB(大肠杆菌,麦芽糖孔蛋白前体)、MalE(大肠杆菌,麦芽糖结合蛋白前体)、Bla(大肠杆菌,β-内酰胺酶)、OppA(大肠杆菌,周质寡肽结合蛋白)、TreA(大肠杆菌,周质海藻糖酶前体)、MppA(大肠杆菌,周质胞壁质肽结合蛋白前体)、BglX(大肠杆菌,周质β-葡糖苷酶前体)、ArgT(大肠杆菌,赖氨酸-精氨酸-鸟氨酸结合的周质蛋白前体)、MalS(大肠杆菌,α-淀粉酶前体)、HisJ(大肠杆菌,组氨酸结合的周质蛋白前体)、XylF(大肠杆菌,D-木糖结合的周质蛋白前体)、FecB(大肠杆菌,二柠檬酸结合的周质蛋白前体)、OmpA(大肠杆菌,外膜蛋白A前体)和PhoA(大肠杆菌,碱性磷酸酶前体)。
在优选的实施方式中,信号序列选自大肠杆菌信号肽LamB(麦芽糖孔蛋白前体)、MalE(麦芽糖结合蛋白前体)、Bla(β-内酰胺酶)、OppA(周质寡肽结合蛋白)、TreA(周质海藻糖酶前体)、MppA(周质胞壁质肽结合蛋白前体)、BglX(周质β-葡糖苷酶前体)、ArgT(赖氨酸-精氨酸-鸟氨酸结合的周质蛋白前体)、MalS(α-淀粉酶前体)、HisJ(组氨酸结合的周质蛋白前体)、XylF(D-木糖结合的周质蛋白前体)、FecB(二柠檬酸结合的周质蛋白前体)、OmpA(外膜蛋白A前体)和PhoA(碱性磷酸酶前体)。这些信号序列尤其可用于大肠杆菌中的异源表达。更优选的是大肠杆菌信号肽LamB(麦芽糖孔蛋白前体)、MalE(麦芽糖结合蛋白前体)、Bla(β-内酰胺酶)、TreA(周质海藻糖酶前体)、ArgT(赖氨酸-精氨酸-鸟氨 酸结合的周质蛋白前体)、FecB(二柠檬酸结合的周质蛋白前体)。最特别优选的是大肠杆菌信号序列LamB(麦芽糖孔蛋白前体)和MalE(麦芽糖结合蛋白前体)。在使用双顺反子或多顺反子转录单元的情况下,可将不同的或相同的信号序列操作性连接于各顺反子。优选的是,在这种情况下使用不同的信号序列。可从商业途径或通过化学合成获得用于本发明表达载体的信号序列。例如,可根据如Beaucage & Caruthers(Tetrahedron Lettts.22:1859-1862,1981)所述的固相亚磷酰胺三酯法,采用自动合成仪如Van Devanter等(Nucleic Acids Res.12:6159-6168,1984)所述合成信号序列。可如Pearson & Reanier(J.Chrom.255:137-149,1983)所述通过天然丙烯酰胺凝胶电泳或阴离子交换HPLC纯化寡核苷酸。
本发明的转录单元通常还包含所述转录单元的翻译起始位点上游的翻译起始区域,所述翻译起始区域由序列AGGAGATATACAT(SEQ ID NO:2)构成,而翻译起始区域操作性连接于该核酸序列。序列AGGAGATATACAT(SEQ IDNO:2)通常位于转录单元的翻译起始位点(通常为ATG、GTG或TTG)的上游,且直接邻接该位点。
通常,所述转录单元还含有选自rrnB、RNA I、T7Te、rrnB T1、trp a L126、trp a、tR2、T3Te、P14、tonB t和trp a L153的转录终止区域。优选使用rrnB转录终止序列。
本发明的异源核酸序列编码对于宿主来说是异源的表达产物。在宿主是原核生物物种(如大肠杆菌)的情况下,感兴趣的核酸序列更优选得自另一类别,如γ变形细菌(gammaproteobacteria),如得自伯克霍尔德氏菌属(Burkholderiasp.),尤其是得自不同的门(如古细菌),更优选是得自真核生物(如哺乳动物),尤其是人。但是,可根据宿主的“密码子选择”对异源核酸序列进行修饰。本发明的异源序列通常是感兴趣的基因。感兴趣的基因优选编码异源多肽,如结构性的、调节性的或治疗性的蛋白质,或结构性的、调节性的或治疗性的蛋白质与其它蛋白质(“标签蛋白”)如绿荧光蛋白的N-或C-末端融合蛋白或其它融合蛋白。异源核酸序列也可编码可以RNA形式使用的转录子,如反义RNA。
可以存在于宿主细胞的胞质或周质空间、和/或存在于细胞外基质中的不溶聚集体或溶解的蛋白质的形式生产蛋白质。优选的,以存在于宿主细胞的周质 空间和/或存在于胞外基质中的溶解蛋白的形式生产蛋白质。蛋白质的例子包括:激素(如生长激素)、生长因子(如表皮生长因子)、止痛物质(如脑啡肽)、酶(如胰凝乳蛋白酶)、抗体、激素受体,也包括通常用作可视标记物(如绿荧光蛋白)的蛋白质。
感兴趣的其它蛋白质是生长因子受体(如FGFR、PDGFR、EFG、NGFR和VEGF)以及它们的配体。其它蛋白质是G-蛋白受体,包括物质K受体、血管紧缩素受体、[α]-和[β]-肾上腺素受体、5-羟色胺受体和PAF受体(如见Gilman,Ann.Rev.Biochem.56,625-649,1987)。其它蛋白质包括离子通道(如钙、钠、钾通道)、毒蕈碱性受体、乙酰胆碱受体、GABA受体、谷氨酸盐受体和多巴胺受体(见Harpold,美国专利5401629和5436128)。感兴趣的其它蛋白质是黏着蛋白,如整联蛋白、选择蛋白(selecting)、免疫球蛋白超家族成员(见Springer,Nature346,425-433(1990);Osborn,Cell62,3(1990);Hynes,Cell69,11(1992))。其它蛋白质是细胞因子,如白介素IL-1到IL-3,肿瘤坏死因子[α]和[β]、干扰素[α]、[β]和[γ]、肿瘤生长因子β(TGF-β)、集落刺激因子(CSF)和粒细胞单核细胞集落刺激因子(GM-CSF)(见Human Cytokines:Handbook for Basic &Clinical Research,“人细胞因子:基础和临床研究手册”,Aggrawal等编辑,Blackwell Scientific,Boston,Mass.,1991)。感兴趣的其它蛋白质是胞外或胞内信使,如腺苷酸环化酶、鸟苷酸环化酶和磷脂酶C。药物也是感兴趣的蛋白质。感兴趣的异源蛋白质可以是人源的、哺乳动物来源的或原核动物来源的。其它蛋白质是抗原,如从微生物致病原(包括病毒和细菌)以及从肿瘤得到的糖蛋白和碳水化合物。其它蛋白质是酶,如凝乳酶、蛋白酶、聚合酶、脱氢酶、核酸酶、葡聚糖酶、氧化酶、α-淀粉酶、氧化还原酶、脂酶、酰胺酶、腈水合酶、酯酶或腈水解酶。
优选的,本发明的异源核酸序列编码多肽,更优选的是抗体,最优选的是Fab片段。尤其是,该核酸序列编码人抗体或人源化抗体,更特别是人Fab片段。由该核酸序列编码的人Fab片段优选是人抗体片段或嫁接有至少一个得自另一哺乳动物物种的CDR的人抗体片段。在一个特别优选的实施方式中,人Fab片段是完整的人HuCAL-Fab,得自人工的基于共有框架序列的人抗体噬菌体文库,其中CDR是人工随机排列的,如Knappik等(2000,J.Mol.Biol.,296(1), 57-86)所述。
在另一更优选的任选实施方式中,任选嵌合的嫁接了CDR的人Fab片段是与前述HuCAL Fab定义相反的非-HuCAL-Fab,在完整的人Fab片段的情况下,该非-HuCAL-Fab优选不含有HuCAL共有框架序列,但它的非CDR序列部分至少有70%、更佳至少85%、最佳至少95%与相对应的可变和恒定轻链和重链种系的编码序列的氨基酸序列相同,此外且更佳地,它的CDR直接得自包括基因组亲合力熟化事件的淋巴细胞的天然存在的基因组序列。
Fab片段优选得自IgG抗体,且不含有在完整的免疫球蛋白的两条重链之间形成两个链间二硫键的半胱氨酸残基。具体而言,抗体的重链和轻链或优选的Fab片段由双顺反子转录单元编码,而各链操作性连接于选自糖类、氨基酸、维生素和例子的周质结合蛋白的原核生物的信号序列和该转录单元翻译起始位点上游的相同的翻译起始区域。该翻译起始区域优选由序列AGGAGATATACAT(SEQ ID NO:2)构成。
在本发明中,信号序列和异源核酸序列在表达载体中的顺序和距离是可以改变的。在优选的实施方式中,信号序列在编码如感兴趣多肽的核酸序列的5’端(上游)。该信号肽序列和编码如感兴趣多肽的核酸序列可由0到约1000个氨基酸隔开。在优选的实施方式中,信号肽序列和编码如感兴趣多肽的核酸序列直接相互邻接,即被0个氨基酸隔开。
优选的,本发明载体rhaBAD的启动子区域和操作性连接的转录单位由SEQ ID NO:3、其互补序列和变体构成。
更佳的,本发明载体的rhaBAD启动子区域和操作性连接的转录单元由SEQ ID NO:4、其互补序列和变体构成。
本发明还包括本发明载体在核酸序列在原核生物宿主中的受调节异源表达中的应用。表达可由原核生物宿主可获得的L-鼠李糖的量来调节。通常,培养的原核生物宿主的培养基中L-鼠李糖的量为0.01-100g/l,优选0.1-10g/l,更优选1-5g/l。
优选地,异源核酸序列编码多肽,更优选地编码抗体,最优选地编码Fab片段,而抗体的重链和轻链或Fab片段以相等的量表达,从而产生高浓度的功能性抗体或Fab片段。尤其是,该异源核酸序列编码上述的人抗体或人源化抗 体、更优选是上述人Fab抗体、最优选是上述人Fab片段。
为了获得高浓度的功能性抗体或Fab片段,需要表达等量的重链和轻链。在两条链中的一条与另一条相比被过量生产时,可能或产生不可还原的高分子量免疫反应性聚集体,这是不利的。令人惊讶的是,已发现使用本发明的载体可获得高滴度的功能性抗体,而仅产生非常少量的过生产轻链或重链或高分子量免疫反应性聚集体。通常,低于20%、优选低于10%的表达量的抗体或Fab片段表达为过生产的轻链或重链或高分子量免疫反应性聚集体。过生产的轻链、重链和高分子量免疫反应性聚集体的量可通过SDS-PAGE或蛋白质印迹分析宿主表达的抗体或Fab片段的提取物如培养的宿主细胞的溶菌酶提取物而测定。
在另一方面,本发明提供在宿主中表达的分离纯化的核酸序列,该序列包含操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaDAB启动子区域,该转录单元包含
a)对所述宿主来说异源的核酸序列,
b)操作性连接于所述核酸序列的原核生物信号序列,该原核生物信号序列选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽,所述核酸序列的表达由所述启动子区域控制。
所述rhaBAD启动子是优选的启动子区域。更优选的,所述分离纯化的核酸序列由SEQ ID NO:1、其互补序列和变体构成,尤其是由SEQ ID NO:3、其互补序列和变体构成的分离纯化的核酸序列,最优选的是由SEQ ID NO:4、其互补序列和变体构成的分离纯化的核酸序列。
可采用本领域熟知的标准PCR方案和方法分离本发明所述分离纯化的核酸序列。如本领域熟知的,所述分离纯化的DNA序列还可含有一个或多个通常用于所述核酸序列编码的产物表达中的调节序列,如增强子。
为了选择成功地、稳定地转化了本发明的载体或所述分离纯化的核酸序列的宿主细胞,可将编码可选择性标记物(如对抗生素有抗性的)的基因与所述感兴趣的核酸序列一同引入宿主细胞中。编码可选择性标记物的基因可位于载体之上,或者位于分离纯化的核酸序列之上,或者可任选地以如位于分离载体上的分离形式共引入。可使用各种可选择性标记物,包括赋予抗生素(如潮霉素、 氨苄青霉素和四环素)抗性的标记物。抗生素的量可根据需要来调整,以产生选择性的条件。通常,使用一种可选择性标记物。也可将报道基因(如荧光蛋白)与所述感兴趣的核酸序列一同导入宿主细胞中,以测定转化效率。
本发明的另一方面提供经本发明的载体转化的原核生物宿主。在本发明的一个特定实施方式中,用质粒pBW22-Fab-H或pAKL14转化原核生物宿主,优选用质粒pAKL14转化原核生物宿主,该质粒的双顺反子表达盒中含有两个不同编码区域以用于在该宿主细胞中表达分泌的异二聚体蛋白(如Fab)。优选的,这种在异二聚体蛋白是Fab。在本发明的另一实施方式中,用本发明分离纯化的核酸序列转化原核生物宿主。
可使用广泛的原核生物宿主细胞表达本发明的异源核酸序列。这些宿主可包括革兰氏阴性细胞株,如大肠杆菌和假单胞杆菌属(Pseudomonas);或革兰氏阳性细胞株,如芽胞杆菌属(Bacillus)和链霉菌属(Streptomyces)。优选地,宿主细胞是革兰氏阴性细胞,更优选的是大肠杆菌细胞。可使用的大肠杆菌是如TG1、W3110、DH1、XL1-Blue和Origami株,这些株可从商业途径获得,或者可通过DSMZ(Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und ZellkulturenGmbH,Braunschweig,德国)获得。最佳的是使用W3110。宿主细胞可代谢或可不代谢L-鼠李糖。可修饰通常能够摄取和代谢L-鼠李糖的宿主细胞(如大肠杆菌),以使其缺少一种或多种与摄取和/或代谢L-鼠李糖有关的功能。与摄取和/或代谢L-鼠李糖有关的一种或多种功能的缺陷可通过如抑制或阻断编码与摄取和/或代谢L-鼠李糖相关的蛋白的基因(如编码L-鼠李糖激酶的rhaB基因)而实现。这可采用已知的技术(如转座子支持的诱变或敲除突变)来实现。通常,原核生物宿主对应于所选择的信号序列,如在使用大肠杆菌的信号序列的情况中,宿主细胞通常是相同的肠杆菌科家族成员,更优选宿主是大肠杆菌菌株。
本发明还提供的是一种在宿主细胞中生产多肽的方法,该方法包括以下步骤:
a)构建载体;
b)用该载体转化原核生物宿主;
c)在适当条件下,使所述多肽在细胞培养系统中表达;
d)从细胞培养系统中回收所述多肽。
所使用的载体、以及其构建和原核生物宿主的转化如上所定义,而该载体含有的异源核酸序列则编码多肽。较佳的,所产生的多肽是抗体,最佳的是Fab片段,而该抗体或Fab片段的重链和轻链以相同的量在细胞培养系统中表达,从而产生高浓度的功能性抗体或Fab片段。
对于细胞培养系统,可在培养管、摇瓶或细菌发酵罐中使用连续或不连续的培养如批次培养或分批进料培养。通常在本领域已知的常规培养基中培养宿主细胞,例如复合培养基,如“营养酵母肉汤培养基”或在Kortz等(1995,J.Biotechnol.39,59-65)所述的含有甘油的培养基中进行培养,或者在Kulla等(1983,Arch.Microbiol,135,1)所述的矿物盐培养基中进行培养。用于实施所述多肽的表达的优选培养基是含有甘油的培养基,更优选是Kortz等(1995,J.Biotechnol.39,59-65)所述的培养基。
可通过如进一步加入其它成分,如缓冲液、盐、维生素或氨基酸,来适当改变培养基。在培养细胞期间还可使用不同的培养基或培养基的组合。优选的,为了实现L-鼠李糖启动子区域的严密调节,作为基础培养基使用的培养基不应含有L-鼠李糖。通常在培养基达到适当的OD600(视培养系统而定)后加入L-鼠李糖。通常,培养的原核生物宿主的培养基中L-鼠李糖的量是0.01-100g/l,优选是0.1-10g/l,更优选是1-5g/l。对于批次培养,通常的OD600通常是0.4或更高。适当的pH范围是如6-8,优选是7-7.5,适当的培养温度是10-40℃,优选是20-37℃。通常,尽可能长时间地培养细胞,直到积累了最大量的表达产物,该时间优选是1小时到20天,更优选是5小时到3天。表达产物的量依赖于所使用的培养系统。在摇瓶培养中,用本发明载体转化的宿主通常可产生0.5g表达产物/升培养基。在批次和/或分批进料模式的发酵罐培养中,每升发酵肉汤通常可产生高于0.5g、优选高于1g、更优选高于1.3g的表达产物。
在宿主细胞表达后,可从宿主细胞培养物中回收表达产物如感兴趣的多肽。当感兴趣的多肽是免疫球蛋白链时,重链和轻链通常各自在宿主细胞中表达,并被分泌到细胞的周质中。然后,从免疫球蛋白链加工表达载体中信号序列编码的信号肽。然后成熟的重链和轻链装配成完整的抗体或Fab片段。为了获得最大产量的表达产物,通常在培养结束时收集细胞,并进行裂解,例如通过溶菌酶处理、超声波或French Press进行裂解。因此,通常首先以宿主细胞 的粗裂解物形式获得多肽。然后可采用本领域已知的标准的蛋白质纯化方法纯化它们,该方法可包括示差沉淀、分子筛色谱、离子交换色谱、等电点聚焦、凝胶电泳、亲合以及免疫亲合层析。这些周知的和常规实践的方法在如Ausuble等(同上)和Wu等(编辑)Academic Press Inc.,N.Y.;Immunochemical Methods InCell And Molecular Biology(《细胞和分子生物学中的免疫化学方法》)中有描述。例如,为了纯化重组产生的免疫球蛋白或Fab片段,可采用免疫亲和层析使它们通过含有树脂的柱而纯化,其中该树脂上结合有靶分子,所表达的免疫球蛋白可特异性结合于该靶分子。
本发明另一方面是可在宿主中表达的载体,该载体操作性连接与转录单元的启动子区域,该转录单元包含:
a)对于所述宿主来说是异源的核酸序列,
b)所述转录单元的翻译起始位点上游的翻译起始区域,该翻译起始区域由序列AGGAGATATACAT(SEQ ID NO:2)构成,
所述翻译起始区域操作性连接于所述核酸序列,所述核酸序列的表达由所述启动子区域控制。启动子区域可以是可诱导的或不可诱导的启动子区域。通常使用分解代谢操纵子的可诱导的启动子区域。可使用分解代谢操纵子负性调节的启动子系统的可诱导启动子区域,如乳糖[lac](Yanisch-Perron等,1985,Gene33,103-109)、和色氨酸[trp](Goeddel等,1980,Nature(伦敦)287,411-416)启动子,和衍生自这两种启动子的杂交启动子[tac和trc](Brosius,1984,Gene27:161-172;Amann和Brosius,1985,Gene40,183-190),以及正性调节的启动子系统,如由阿拉伯糖诱导的araB启动子(WO8604356)、由鼠李糖诱导的鼠李糖启动子rhaSB(WO03068956)或本发明所述的“鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域”。优选使用正性调节分解代谢启动子,更优选使用本发明的“L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域”。也可使用这些启动子的功能性等价物,这些等价物可能得自各种原核生物。功能性等价物在正性调节分解代谢操纵子等价物的情况中是这样的等价物,即与不存在诱导物时它们所具有的活性相比,其在诱导物的存在下显示出提高的表达活性。存在诱导物时的表达活性通常比不存在诱导物时的表达活性高2倍、优选至少高5倍,更优选至少高10倍。
通常,载体还含有操作性连接于所述核酸序列的信号序列。信号序列可以是原核生物的或真核生物的。优选使用原核生物的信号序列。如上所述,原核生物信号序列优选选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽,或者选自本领域技术人员已知的其它原核生物信号序列。更佳的是,原核生物信号序列选自上述糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白质的信号肽。通常,如上所述,核酸序列编码多肽,优选抗体,更优选是Fab片段。
在一个具体实施方式中,在核酸序列编码抗体的情况下,优选是Fab片段、抗体的重链和轻链,优选Fab片段由双顺反子转录单元编码,各链操作性连接于信号序列和由序列AGGAGATATACAT(SEQ ID NO:2)构成的翻译起始区域。
本发明的再一方面提供一种在宿主细胞中生产多肽的方法,该方法包括以下步骤:
a)构建一载体;
b)用该载体转化原核生物宿主;
c)在适当条件下,使所述多肽在细胞培养系统中表达;
d)从细胞培养系统中回收所述多肽。
所使用的载体和宿主如上所定义。载体的构建、原核生物宿主的转化和细胞培养可根据以上描述进行,载体所含的异源核酸序列编码多肽。在所产生的多肽是Fab片段的情况下,该Fab片段的重链和轻链在所述细胞培养系统中以相同的量表达。
本发明还涉及用于原核生物宿主胞内异源表达编码如多肽的核酸的方法和工具。具体而言,本发明涉及在原核生物宿主中胞内表达异源多肽的载体,其中该载体在原核生物宿主中表达,含有操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子区域,该转录单元含有对于所述宿主来说是异源的核酸序列。由于在本发明的载体实施方式中该核酸序列不连接于原核生物信号序列,在用载体转化原核生物宿主细胞和由该异源核酸编码的多肽表达后,该多肽将不被从胞质中转移到非胞质位置。取而代之的是,该多肽将以内涵体的形式或可溶的形式表达在胞质中。因此,在表达后,可采用熟知的方法从细胞尤其是从细胞提取物中分离和纯化该多肽。本发明还提供所述载体在异源核酸序 列在原核生物宿主中的受调节胞内表达的应用;用所述载体转化的原核生物宿主或原核生物宿主细胞;使用所述载体在原核生物宿主中胞内生产异源多肽的方法;和用于胞内生产用于多肽的载体,其中该载体含有启动子区域、编码异源多肽的异源核酸序列和由序列AGGAGATATACAT构成的翻译起始区域。
在一个载体可用于胞内表达的优选实施方式中,rhaBAD启动子由SEQ IDNO:1所示序列、其互补序列和其变体构成。优选的是,所述rhaBAD启动子区域和所述操作性连接的转录单元由SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4、其互补序列或其变体序列构成。根据本发明,用于胞内表达的载体可能含有双顺反子转录单元。在本发明的另一优选实施方式中,载体的转录单元还含有位于所示转录单元的翻译起始位点上游的翻译起始区域,而该翻译起始区域由序列AGGAGATATACAT(SEQ ID NO:2)构成。在另一优选的实施方式中,用于胞内表达的所述载体含有转录终止区域,如rrnB转录终止序列。根据本发明,该异源核酸序列可编码多肽,如抗体、抗体片段等。
本领域技术人员将理解到,可对本文所述的发明做出除本文具体描述的那些内容之外的修改和变动。应理解,本发明包括不偏离本发明精神和实质特征的所有这些修改和变动。本发明还包括本说明书中涉及的或指出的所有步骤、特征、组合物和化合物,不论是单独的还是共同的,以及任何和所有组合或任何两个或多个所述步骤或特征。本文公开内容因此被视为在所有各方面都已有阐述,且不是限制性的,本发明的范围由附带的权利要求所限定,落入等价形式的含义和范围之内的所有变化都包括在本文之中。在整篇说明书引用了各文献,本文将各文献纳入作为参考。
结合下述实施例将能更完全地理解前述描述。但是,这些实施例是实施本发明的示例性方法,它们并不限制本发明的范围。
实施例
实施例1
具有正性调节启动子的表达质粒的构建
搜索大肠杆菌W3110的基因组,找出正性调节的操纵子。基于可从KEGG数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,http://www.genome. adjp/kegg/kegg2.html)中获得的基因组数据,鉴定并分析正性调节的分解代谢启动子,以将它们用于表达质粒。启动子应当是以便宜和无毒性的方式被严密调节和诱导,并因此是工业上有用的化合物。选择以下不同正性调节分解代谢操纵子的启动子:
——prp启动子(丙酸盐诱导的)
——gutA启动子(葡萄糖醇诱导的)
——melAB2启动子(蜜二糖诱导的)
基于相应的调节结合位点上可获得的信息选择含有所述启动子元件的精确DNA片段。采用Pitcher等(1989,Letters in Applied Microbiology8,151-156)所述的方法分离大肠杆菌的染色体DNA。采用PCR和以下引物从W3110株的染色体DNA扩增启动子片段。ClaI和AflII的限制性位点以下划线标出。这些片段的序列如下所示:
Pprp Pprp-5 5′aaa atc gat aaa tga aac gca tat ttg3’
Pprp-3 5′aaa ctt aag ttg ttatca acttgttat3’
AAAATCGATAACTGAAACGCATATTTGCGGATTAGTTCATGACTTTATCTCTAACAAA
TTGAAATTAAACATTTAATTTTATTAAGGCAATTGTGGCACACCCCTTGCTTTGTCTTT
ATCAACGCAAATAACAAGTTGATAACAACTTAAGTTT
PgutA PgutA-5 5’aaa atc gat gca tca cgc ccc gca caa3’
PgutA-3 5’aaa ctt aag tca gga ttt att gtt tta3’
AAAATCGATGCATCACGCCCCGCACAAGGAAGCGGTAGTCACTGCCCGATACGGAC
TTTACATAACTCAACTCATTCCCCTCGCTATCCTTTTATTCAAACTTTCAAATTAAAATA
TTTATCTTTCATTTTGCGATCAAAATAACACTTTTAAATCTTTCAATCTGATTAGATTAG
GTTGCCGTTTGGTAATAAAACAATAAATCCTGACTTAAGTTT
PmeIAB2 PmeIAB-5-1 5’aaa atc gat gac tgc gag tgg gag cac3’
PmeIAB-3 5’aaa ctt aag ggc ttg ctt gaa taa ctt3’
MeIR CRP
GATTCGCCTGCCATGATGAAGTTATTCAAGCAAGCCCTTAAGTTT
+1
(CRP2的结合位点以浅灰色显著标出,而MelR的结合位点以黑色标出)
以琼脂糖凝胶电泳分离各片段,并采用Qiagen(Hilden,德国)的凝胶提取试剂盒QiaexII进行分离。用ClaI和AflII切割分离的片段,并连接到CalI/AflII切割的pBW22(Wilms等,2001,Biotechnology and Bioengineering,73(2), 95-103)。除所连接的启动子区域外,所得的含prp启动子的质粒(pBLL5)、含gutA启动子的质粒(pBLL6)和含melAB2启动子的质粒(pBLL7)是相同的。通过测序(Microsynth GmbH,Balgach,Switzerland)确定插入的启动子的序列。
实施例2
Fab片段表达质粒的构建
作为IPTG诱导的lac启动子(质粒pMx9-HuCAL-Fab-H,Knappik等,1985,Gene33,103-119)的替换物,分析不同正性调节表达系统生产Fab-H抗体片段的能力。采用PCR,以引物Fab-5(5’-aaa cat atg aaa aag aca gct atc-3’)和Fab-3(5’-aaa aag ctt tta tca gct ttt cgg ttc-3’)从质粒pMx9-HuCAL-Fab-H扩增出Fab-H片段。用NdeI和HindIII切割PCR片段,将其插入NdeI/HindIII切割的pBW22(Volff等,1996,Mol.Microbiol.22,1037-1047)中,产生含有鼠李糖可诱导的rhaBAD启动子(SEQ ID NO:1)的质粒pBW22-Fab-H(图1)。将相同的PCR片段插入具有可诱导的启动子的不同表达质粒中。所得的(推定的)含有Fab-H的表达质粒是含prp启动子的pBLL13、含gutA启动子的pBLL14和含melAB2启动子的pBLL15(图2)。通过测序确定质粒pBW22-Fab-H中插入的Fab-H的序列。
实施例3
Fab片段的表达
用不同的表达载体转化W3110株(Deutsche Sammlung vonMikroorganismen und Zellkulturen GmbH,Braunschweig,德国)。从产生自不同的转化的克隆中分离出质粒,并经限制性酶切分析进行核对。除了质粒pBLL14外,其余所有质粒都具有预期的限制性图谱。再次分离的质粒pBLL14显示改变的大小和限制性图谱,这表明是重组事件导致。因此,在接下来的实验中没有测试W3110株(pBLL14)。测试余下菌株分泌主动折叠的Fab-H抗体片段的能力。如实施例4所述实施此产率试验。以0.2%的浓度加入以下诱导物:
pBW22-Fab-H L(+)-鼠李糖一水合物
pBLL13 丙酸钠
pBLL15 D(+)-蜜二糖一水合物
D(+)-棉子糖一水合物
D(+)-半乳糖
斑点印迹试验的结果显示在图3中。
鼠李糖和蜜二糖诱导的W3110(pBW22-Fab-H)株和W3110(pBLL15)株显示出期望的斑点印迹结果:信号随着时间的推移而增加,且几乎没有背景活性。用ELISA定量测定主动折叠的抗体片段部分。结果归纳在下表1中。
表1:具有不同表达质粒的W3110衍生物的ELISA结果。显示了诱导后的时间。测试22小时或25小时后的未诱导培养物,作为未诱导对照,将得自W3110(pMx9-HuCAL-Fab-H)株和TGlF’-(pMx9-HuCAL-Fab-H)株的结果作为参比。Fab-H的浓度以mg/100OD600/L计(nd指未测定)。
所有的菌株在存在或不存在相应的诱导物的情况下很好地生长,没有任何生长抑制,OD600达到4-6之间。在过夜诱导后,表达质粒pBW22-Fab-H(含SEQID NO:3)和pBLL15产生了最高的抗体片段滴度。蜜二糖诱导的W3110(pBLL15)株与鼠李糖(pBW22-Fab-H)诱导系统相比,在形成活性抗体片 段方面显示出延迟的增加。
在呼吸活性监测系统(RAMOS,ACBiotec,Julich,德国)中测试鼠李糖可诱导的W3110(pBW22-Fab-H)株,该系统是一种新颖的用于实时测定摇瓶中的呼吸活性的测量系统。与正常的摇瓶实验相比,抗体滴度(由ELISA测量)加倍(诱导23小时后为703.64mg/L/100OD600)。使用RAMOS装备的最佳生长有利于活性抗体片段的生产。
实施例4
摇瓶中的蜜二糖诱导
测试带有质粒pBLL15的大肠杆菌W3110生产主动折叠的Fab-H抗体片段的能力。在20ml新鲜的甘油培养基(如Kortz等,1995,J.Biotechnol.39,59-65所述,其中维生素溶液根据Kulla等,1983,Arch.Microbiol,135,1所述使用)中稀释(1:50)过夜培养物[在NYB培养基(10g/l胰蛋白胨、5g/l酵母抽提物,5g/l氯化钠)中,该培养基补充有100μg/ml氨苄青霉素,37℃],在30℃培育。当培养物达到约0.4的OD600时加入蜜二糖(0.2%)。在不同的时间间隔获取样品(1ml),离心,在-20℃保存沉淀物。根据上述溶菌酶处理裂解冷冻的细胞,在斑点印迹和ELISA检测中分析上清液。获得了504.28mg/L/100OD600的功能性Fab-H抗体片段。
实施例5
高分子量聚集体的出现
为了查明是否产生了高分子量聚集体,使用抗人Fab-H+AP接合物对显示最高的抗体滴度(表1)的W3110(pBLL15)株的提取物进行蛋白质印迹。如实施例4所述进行培育。在蜜二糖诱导后第9、12和23小时获取样品。较低浓度的高分子量聚集体对应于较高滴度的功能性抗体片段。对表达系统的选择看起来影响到抗体形成的方式:功能性还是成聚集体形式。
实施例6
信号肽的影响
使用大肠杆菌的基因组数据库寻找可与Fab-H片段VL3-CL和VH-CH—起使用的有用信号肽。选用从糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白得到的信号肽。这些周质蛋白代表的是与其它周质蛋白相比被更广泛地研究的相对相同种(homogeneous)的组。由于它们通常很丰富,它们的信号序列不得不确保有效地转运过内膜并转运到胞质中。使用SignalP网站服务器(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-2.0/#submission)检查所有可能的信号肽Fab组合的序列肽和解离位点可能性,如下表2所示。
选用以下6个组合:
——LamB-VL3-CL(麦芽糖孔蛋白前体)
——MalE-VH-CH(麦芽糖结合蛋白前体)
——Bla-VL3-CL(β-内酰胺酶)
——TreA-VH-CH(周质海藻糖酶前体)
——ArgT-VL3-CL(赖氨酸-精氨酸-鸟氨酸结合周质蛋白前体)
——FecB-VH-CH(二柠檬酸铁(III)结合周质蛋白前体)
使用重叠的PCR引物进行产生信号肽(SP)与VL3-CL和VH-CH的融合物的基因融合,该融合显示在以下扩增表3中。
如别处所述进行信号肽序列与VL3-CL和VH-CH序列的融合((Horton,R.M.,Hunt,H.D.,Ho,S.N.,Pullen,J.K.和Pease,L.R.(1989)Engineering hybridgenes without the use of restriction enzymes:gene splicing by overlap extension. 《不使用限制性内切酶的工程化杂交基因:通过重叠延伸获得的基因接合》Gene77,61-68)。用限制内切酶NdeI和PstI剪切SP-VL3-CL基因,并连入NdeI/PstI剪切的pBW22中,以及连入pBLL7中。用PstI和HindIII剪切所得的质粒,连接到PstI/HindIII剪切的SP-VH-CH基因。由于bla-VL3-CL和fecB-VH-CH基因不可能整合,因此仅检测到含有lamB-VL3-CL和malE-VH-CH基因的Fab-H表达质粒。获得含有鼠李糖可诱导的启动子的lamB-VL3-CL/male-VH-CH表达质粒(pAKL14)。将作为AflII/HindIII片段从pAKL15(实施例7)分离的lamB-VL3-CL/malE-VH-CH基因连接到AflII/HindIII剪切的pBLL7,获得pAKL15E。图4和8阐述了lamB-VL3-CL/malE-VH-CH表达质粒pAKL14和pAKL15E。
实施例7
翻译起始区域对Fab表达的影响
质粒pAKL14(含有SEQ ID NO:4)和质粒pAKL15E的Fab-H基因含有起始密码子的相同DNA序列5’端(翻译起始区域),而在原始质粒pMx9-HcCAL-Fab-H中,两个Fab-H基因的翻译起始区域是不同的。质粒pMx9-HuCAL-Fab-H和pAKL14/pAKL15E的翻译起始区域序列的比较显示在下表4中:
pMx9-HuCAL-Fab-H ompA-VL3-CL gagggcaaaaa atg
phoA-VH-CH aggagaaaataaa atg
pAKL14/pAKL15E lamB-VL3-CL aggagatatacat atg
malE-VH-CH aggagatatacat atg
如实施例4所述在摇瓶中测试W3110(pAKL14)的产率。菌株在存在和缺乏L-鼠李糖的情况下都能很好地生长。这意味着Fab-H的生产不影响细胞的生存能力。如图5所示,斑点印迹的结果看起来很理想。
为了分析不可诱导的高分子量聚集体的存在,进行了蛋白质印迹(图6)。虽然在诱导后5小时出现了高分子量聚集体,但是在23小时后它们的量仅轻微增加。未诱导的培养物显示出高分子量条带,这可能是弱的非特异性背景生 产所致。对应的ELISA值显示在下表5中(未诱导的和鼠李糖诱导的W3110(pAKL14)株的溶菌酶提取物中的Fab-H浓度(mg/L/100OD600))。
新的信号肽构建物(带有修饰的翻译起始信号)再次将抗体滴度从328.62mg/L/100OD600(含有得自pMx9-HuCAL-Fab-H质粒的MOR基因构建物的pBW22-Fab-H质粒)提高到596.14mg/L/100OD600(质粒pAKL14)和878.86mg/L/100OD600(质粒pAKL15E)。pAKL14中lamB-VL3-CL和malE-VH-CH基因的测序结果揭示了三个碱基互换,这可能是由于两个连续的PCR反应导致的融合基因的构建所致。碱基互换导致以下氨基酸变化(错误的氨基酸被着重指出):
VL3-CL(pAKL14)-pI=4.85
MMITLRKLPLAVAVAAGVMSAQAMADIELTQPPSVSVAPGQTARISCSGNALGDK
YASWYQQNPGQAPVLVIYDDSDRPSGIPERFSGSNSGNTATLTISGTQAEDEADYY
CQSYDSPQVVFGGGTKLTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPG
AVTVAWKADSSPVKAGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVT
HEGSTVEKTVAPTEA
VH-CH(pAKL14)-pI=9.52
MKIKTGARILALSALTTMMFSASALAQVQLKESGPALVKPTQTLTLTCTFSGFSLST
SGVGVGWIRQPPGKALEWLALIDWDDDKYYSTSLKTRLTISKDTSKNQVVLTMTN
MDPVDTATYYCARYPVTQRSYMDVWGQGTLVTVSSASTKGPSVLPLAPSSKSTS
GGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGAL TSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSS
LGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKS
Fab-H的轻链存在两个错误(D50N和K63N),重链有一个氨基酸交换(F156L)。为了恢复原始的Fab-H序列,针对质粒pBW22-Fab-H(带有未改变的 Fab-H基因序列)的同源片段交换了质粒pAKL14的两条片段(138bp的SexAI/BamHI和310bp的BssHII/HindIII片段)。所得的质粒pAKL15带有正确的Fab-H序列。三个氨基酸的交换对总的Fab-H特性没有产生明显的影响,因为pI并没有发生改变。因此,W3110(pAKL15)株生产功能性Fab-H抗体片段的能力被认为应该类似W3110(pAKL14)的生产能力,没有对其进行分析。
可通过使用不同的最佳策略提高Fab-H抗体片段的生产率。下表6总结了这些改进:
菌株 | 改进 | 功能性Fab-H抗体的浓度(mg/L/100OD600) | 活性增加 |
TG1F’-(pMx9-HuCAL-Fab-H) | MOR株 | 84.56 | |
W3110(pMx9-HuCAL-Fab-H) | 菌株背景 | 140.45 | 1.7 |
W3110(pBW22-Fab-H) | 表达系统(鼠李糖) | 328.62 | 3.9 |
W3110(pBLL15) | 表达系统(蜜二糖) | 504.28 | 6 |
W3110(pAKL14) | 信号肽翻译(鼠李糖) | 596.14 | 7 |
W3110(pAKL15E) | 信号肽翻译(蜜二糖) | 878.86 | 10.4 |
通过SDS-PAGE分析产生高Fab-H抗体滴度的菌株(图7)。在产生平衡量的轻链和重链(泳道4和5)的菌株中测量到最高的功能性Fab-H浓度。带有Fab-H片段的鼠李糖可诱导的菌株,如W3110(pBW22-Fab-H)(泳道3),强烈地过量生产轻链。
实施例8
摇瓶中蜜二糖的诱导
测试带有质粒pAKL15E的大肠杆菌W3110(图8)生产主动折叠的Fab-H抗体片段的能力。在20ml新鲜的甘油培养基(如Kortz等,1995,J.Biotechnol.39,59-65所述,其中维生素溶液根据Kulla等,1983,Arch.Microbiol,135,1所述使用)中稀释(1:50)过夜培养物[在NYB培养基(10g/l胰蛋白胨、5g/l酵母抽提物,5g/l氯化钠)中,该培养基补充有100μg/ml氨苄青霉素,37℃],在30℃培育。当培养物达到约0.4的OD600时加入蜜二糖(0.2%)。在不同的时间间隔获取样品(1ml),离心,在-20℃保存沉淀物。根据上述溶菌酶处理裂解冷冻的细胞,在SDS-PAGE和ELISA检测中分析上清液。携带有具有改变的信号肽 的Fab-H基因(lamB-VL3-CL/malE-VH-CH)的蜜二糖可诱导的菌株显示出最高的Fab-H抗体滴度(表6)。Fab-H的轻链和重链以相等的量生产(图9)。
实施例9
抗体片段的胞内生产
Origami宿主菌株在硫氧还蛋白还原酶(trxB)和谷胱甘肽还原酶(gor)基因中都提供突变,增强二硫键的形成,并允许蛋白质在细菌胞质中折叠。为了构建不含有信号肽区域的VL3-CL和VH-CH基因,使用以下引物:
5’-VL5’-aaa cat atg gat atc gaa ctg acc cag-3’(NdeI限制位点)
3’-CL5’-aaa ctg cag tta tca ggc ctc agt cgg-3’(PstI限制位点)
5’-VH5’-aaa ctg cag gag ata tac ata tgc agg tgc aat tga a-3’(PstI限制位点)
3’-CH5’-aaa aag ctt tta tca gct ttt cgg ttc-3’(HindIII限制位点)
扩增相应的VL3-CL和VH-CH基因,通过限制性酶切分析进行核对。将NdeI/PstI剪切的VL3-CH片段整合到NdeI/PstI剪切的质粒pBW22中。用PstI和HindIII剪切所得的质粒,然后连接到PstI/HindIII剪切的VH-CH片段,得到质粒pJKL6。将此质粒转化入Origami株和W3110株,用W3110株作为参比。如实施例4所述在摇瓶中测试W3110(pJKL6)株和Origami(pJKL6)株的产率。
为了分析功能性抗体片段和不可诱导的高分子量聚集体的存在,进行蛋白质印迹。两种菌株都很难产生任何功能性抗体片段。随着诱导时间的推移(W3110),W3110株积聚了高分子量聚集体,而Origami株没有产生任何抗体片段。下表7中给出了相应的ELISA值(未诱导的和鼠李糖诱导的Origami(pJKL6)株和W3110(pJKL6)株的溶菌酶提取物中的Fab-H浓度(mg/L/100OD600))。
实施例10
摇瓶中单链抗体(scFv,S1)的鼠李糖诱导
采用PCR,使用引物5-S(5’-aaa cat atg aaa tac cta ttg cct acg gc-3’)和3-S1(5’-aaa aag ctt act acg agg aga cgg-3’)分离scFv基因。对应的S1蛋白含有PelB信号序列,该序列负责将蛋白质转运到大肠杆菌周质中。用NdeI和HindIII切割PCR片段,并插入NdeI/HindIII切割的pBW22中,产生含有鼠李糖可诱导的rhaBAD启动子的质粒pBW22-pelB1-S1(图10)。通过测序确定了质粒pBW22-pelB-S1的S1插入序列。用质粒pBW22-pelB-S1转化W3110株(DSM5911,Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH,Braunschweig,德国)。从不同的克隆中分离质粒,采用限制性酶切分析进行验证。测试大肠杆菌W3110(pBW22-pelB-S1)生产可溶S1的能力。在20ml新鲜的甘油培养基(如Kortz等,1995,J.Biotechnol.39,59-65所述,其中维生素溶液根据Kulla等,1983,Arch.Microbiol,135,1所述使用)中稀释(1:50)过夜培养物[在NYB培养基(10g/l胰蛋白胨、5g/l酵母抽提物,5g/l氯化钠)中,该培养基补充有100μg/ml氨苄青霉素,37℃],在30℃培育。当培养物达到约0.4的OD600时加入鼠李糖(0.2%)。在不同的时间间隔获取样品(1ml),离心,在-20℃保存沉淀物。根据上述溶菌酶处理裂解冷冻的细胞,经SDS-PAGE(图11)和Bioanalyzer分析上清液和不溶的蛋白质沉淀物。大多数S1蛋白(mg/L/100OD600)以可溶性蛋白质级分的形式生产。
实施例11
假单胞菌(Pseudomonas)和相关细菌的广谱宿主范围鼠李糖表达质粒的构建
在大肠杆菌JM109中进行以下克隆实验。用AgeI/NsiI切割广谱宿主范围的克隆载体pBBR1MCS-2(NCBI登录号U23751)。使lacZα基因缺失,用寡核苷酸3802(5’-tgt taa ctg cag gat cca agc tta-3’)和3803(5’-ccg gta agc ttg gat cctgca gtt aac atg ca-3’)替代,得到质粒pJOE4776.1。用含有大肠杆菌JM109的基因组rhaRS片段(2kb)的质粒pJKS408(未发表)提供rhaRSP片段。用BamHI/HindIII切割质粒pJKS408,连接到BamHI/HindIII切割的质粒pTST101 的eGFP片段(0.7kb)[Stumpp,T.,Wilms,B.,Altenbuchner,J.(2000):Ein neues,L-Rhamnose-induzierbares Expressionssystem für Escherichia coli.Biospectrum6,33-36]。使用NsiI/HindIII从所得的质粒pJOE4030.2中分离出rhaRSPmalE-eGFP片段(4kb),将其整合到NsiI/HindIII切割的pJOE4776.1中。质粒pJOE4776.1(图12)含有rhaBAD启动子区域与广谱宿主范围质粒骨架中大肠杆菌的鼠李糖操纵子的调节蛋白RhaS和RhaR的基因的组合。
实施例12
摇瓶中腈水解酶的鼠李糖诱导
用NdeI和BamHI从质粒pDC12(Kiziak等,2005)中切割腈水解酶基因,并将其插入NdeI/BamHI切割的pJOE4782.1中,得到含有L-鼠李糖可诱导的rhaBAD启动子的质粒pAKLP2(图13)。作为中间步骤,使用质粒pAKLP2转化大肠杆菌XL1-Blue株。从不同的克隆中分离质粒,采用限制性酶切分析进行验证。用从大肠杆菌XL1Blue(pAKLP2)得到的分离的质粒pALKP2转化恶臭假单胞菌KT-2440(Pseudomonas putida strain KT-2440,D SM6125,DeutscheSammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH,Braunschweig,德国)。测试恶臭假单胞菌KT-2440生产腈水解酶的能力。在20ml新鲜的甘油培养基(如Kortz等,1995,J.Biotechnol.39,59-65所述,但维生素溶液例外(如Kulla等,1983,Arch.Microbiol,135,1所述))中稀释过夜培养物[在NYB培养基(10g/l胰蛋白胨、5g/l酵母抽提物,5g/l氯化钠)中,该培养基补充有50μg/ml卡那霉素,30℃],使OD600约为0.1,并在30℃培育。当培养物达到约0.25的OD600时加入L-鼠李糖(1.0%)。在不同的时间间隔获取样品(1ml),离心,在-20℃保存沉淀物。将沉淀物再悬浮在Tris/HCl缓冲液(50mM,pH8.0)中,用SDS-PAGE分析细胞悬浮液(图14)。
实施例13
摇瓶中片段抗体(FabM)的L-鼠李糖诱导
用NdeI和BamHI从质粒pBW22-FabM切割Fab-M基因,将其插入NdeI/BamHI切割的pJOE4782.1中,产生含有L-鼠李糖可诱导的rhaBAD启动 子的质粒pAKLP1(图15)。作为中间步骤,使用质粒pAKLP1转化大肠杆菌XL1-Blue株。从不同的克隆中分离质粒,采用限制性酶切分析进行验证。用从大肠杆菌XL1Blue(pAKLP1)得到的分离的质粒pALKP1转化恶臭假单胞菌KT-2440(Pseudomonas putida strain KT-2440,DSM6125,Deutsche Sammlungvon Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH,Braunschweig,德国)。测试恶臭假单胞菌KT-2440(pAKLP1)生产Fab-M的能力。在20ml新鲜的甘油培养基(如Kortz等,1995,J.Biotechnol.39,59-65所述,但维生素溶液例外(如Kulla等,1983,Arch.Microbiol,135,1所述))中稀释过夜培养物[在NYB培养基(10g/l胰蛋白胨、5g/l酵母抽提物,5g/l氯化钠)中,该培养基补充有50μg/ml卡那霉素,30℃],使OD600约为0.1,并在30℃培育。当培养物达到约0.25的OD600时加入L-鼠李糖(1.0%)。在不同的时间间隔获取样品(1ml),离心,在-20℃保存沉淀物。将沉淀物再悬浮在Tris/HCl缓冲液(50mM,pH8.0)中,用SDS-PAGE分析细胞悬浮液(图16)。
实施例14
使用高细胞密度发酵中的大肠杆菌分泌系统进行的单链抗体表达
用质粒pBW22-pelB-S1转化大肠杆菌W3110。从不同的克隆中分离质粒,采用限制性酶切分析进行验证,将一个克隆用于进一步的实验。摇瓶中的预培养物由Lonza批式相培养基(Lonza’s batch phase medium)中的单个克隆接种得到。将此预培养物接种到20L的发酵桶中。根据Lonza的高细胞密度发酵方案使细胞生长。在鼠李糖诱导前和诱导后在不同的时间点获得培养物样品(10ml)。以10000g离心从发酵培养基中分离细胞。对从无细胞发酵培养基获得的样品进行SDS凝胶分析,结果显示在28.4kD具有蛋白质条带,其具有增加的密度。此蛋白质是从生长培养物释放到发酵培养基中的单链抗体S1。用Agilent2100Bioanalyser(Agilent,Palo Alto,USA)测定S1蛋白的含量,结果显示在鼠李糖诱导后,在发酵肉汤中积聚了达2g/L/100OD600的S1蛋白。对细胞沉淀物进行溶菌酶处理后,不溶的蛋白沉积物仅含有痕量的S1蛋白,而可溶蛋白级分(上清液)显示了强的S1蛋白条带,对应于约1g/L/100OD600(见图17)。
Claims (19)
1.一种可在原核宿主中表达的用于表达抗体的载体,它包含操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子,且所述rhaBAD启动子由SEQ ID NO:1构成,该转录单元含有
a)对于所述宿主来说是异源的编码抗体的核酸序列,
b)操作性连接于所述核酸序列的原核生物信号序列,该原核生物信号序列选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽,所述核酸序列的表达由所述启动子区域控制,和
c)翻译起始区域,所述翻译起始区域位于所述转录单元的翻译起始位点上游,该翻译起始区域由序列AGGAGATATACAT(SEQ ID NO:2)构成,其中所述翻译起始区域与所述核酸序列操作性连接。
2.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述信号肽选自来自下组物质的信号肽:LamB、MalE、Bla、OppA、TreA、MppA、BglX、ArgT、MalS、HisJ、XylF、FecB、OmpA和PhoA。
3.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述转录单元还含有转录终止区域,该转录终止区域是rrnB转录终止序列。
4.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述核酸序列编码Fab片段。
5.如权利要求4所述的载体,其特征在于,所述Fab片段的重链和轻链由双顺反子转录单元编码。
6.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述rhaBAD启动子和所述操作性连接的转录单元由SEQ ID NO:3构成。
7.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述rhaBAD启动子和所述操作性连接的转录单元由SEQ ID NO:4构成。
8.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述载体是自主复制或自复制的质粒、粘粒、噬菌体或病毒。
9.如权利要求8所述的载体,其特征在于,所述病毒是逆转录病毒。
10.权利要求1所述的载体在核酸序列的受调节异源表达中的用途,其中所述核酸序列是原核生物宿主中编码抗体的核酸序列。
11.如权利要求10所述的载体的用途,其特征在于,所述抗体是Fab片段,该Fab片段的重链和轻链以相等的量表达。
12.一种可用于在原核宿主中表达抗体的分离纯化的核酸序列,它含有操作性连接于转录单元的L-鼠李糖操纵子的rhaBAD启动子,其中所述rhaBAD启动子由SEQ ID NO:1构成,该转录单元含有
a)对于所述宿主来说是异源的编码抗体的核酸序列,
b)操作性连接于所述核酸序列的原核生物信号序列,该原核生物信号序列选自糖、氨基酸、维生素和离子的周质结合蛋白的信号肽,所述核酸序列的表达由所述启动子区域控制,和
c)所述转录单元在其翻译起始位点上游还含有翻译起始区域,该翻译起始区域由序列AGGAGATATACAT(SEQ ID NO:2)构成,其中所述翻译起始区域与所述核酸序列操作性连接。
13.如权利要求12所述的分离纯化的核酸序列,其特征在于,所述rhaBAD启动子和所述操作性连接的转录单元由SEQ ID NO:3构成。
14.如权利要求12所述的分离纯化的核酸序列,其特征在于,所述rhaBAD启动子和所述操作性连接的转录单元由SEQ ID NO:4构成。
15.转化了权利要求1所述的载体的原核生物宿主。
16.转化了权利要求12所述的分离纯化的核酸序列的原核生物宿主。
17.一种在宿主中生产抗体的方法,该方法包括步骤:
a)构建权利要求1所述的载体;
b)用所述载体转化原核生物宿主;
c)在适当条件下,使所述抗体在细胞培养系统中表达;
d)从该细胞培养系统中回收所述抗体。
18.如权利要求17所述的方法,其特征在于,所产生的多肽是Fab片段,该Fab片段的重链和轻链在所述细胞培养系统中以相同的量表达。
19.如权利要求17或18所述的方法,其特征在于,所述抗体的表达在含有甘油的培养基中进行。
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US5240831A (en) * | 1991-01-10 | 1993-08-31 | Board Of Regents, The University Of Texas | Methods and compositions for the expression of biologically active eukaryotic cytochrome p45os in bacteria |
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Cited By (2)
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