CN100460515C - 一种改进的重叠延伸pcr方法及其所获得的突变基因 - Google Patents

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CN100460515C CNB2005100464149A CN200510046414A CN100460515C CN 100460515 C CN100460515 C CN 100460515C CN B2005100464149 A CNB2005100464149 A CN B2005100464149A CN 200510046414 A CN200510046414 A CN 200510046414A CN 100460515 C CN100460515 C CN 100460515C
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Abstract

本发明涉及基因定点突变的方法,具体的说是一种改进的重叠延伸PCR方法及其所获得的突变基因,本方法分为如下步骤:片段合成;双混合;预延伸;全长DNA合成;后延伸。以来自于酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)的腺苷蛋氨酸(SAM)合成酶基因sam1为起始基因验证了该方法的有效性,并获得了经稀有密码子改造的突变基因,该基因编码的SAM合成酶能在酿酒酵母中高效表达,并且能提高胞内SAM的积累量。本发明在原有重叠延伸PCR的基础上,进行了一系列重要的改进,使得在一个反应过程中实现多点定位突变。

Description

一种改进的重叠延伸PCR方法及其所获得的突变基因
技术领域
本发明涉及基因定点突变的方法,具体的说是一种改进的重叠延伸PCR方法及其所获得的突变基因,是一种能在一个反应过程中实现多点定位突变的基因改造方法。
背景技术
定点突变(site-directed mutagenesis,SDM)就是指在基因的特定位点引入突变,即在已知的DNA序列中插入、缺失或取代一定长度的核苷酸序列。该方法已经被广泛的应用于基因表达调控、基因结构与功能及蛋白质性质等方面的研究。
产生SDM的方法最常见是采用Overlap extension PCR(OE-PCR)介导定点突变,又称重叠延伸PCR。该技术是将两个或多个基因片段通过末端互补、重叠延伸的方法进行体外基因拼接的简单、快速的基因重组技术(Russell,Higuchi.protocols:A guide to methods and applications[A].Recombinant PCR[M].Academic Press,1990.177-183.)。该方法要求两条侧翼的通用引物和两个反向部分重叠的突变引物。首先引物两两配对分别进行PCR反应,产生两个部分重叠的PCR片段,两者的重叠区都通过引物的错配引入相同的突变。序列的重叠允许两个片段在混合、变性、复性后在DNA聚合酶作用下延伸产生全长的DNA片段;该片段可作为第二次延伸的模板,以两个侧翼引物进行全长DNA扩增。1987年,该技术问世一年后,Mullis KB等人便首先运用引物的错配引导(mis-priming),通过对基因进行体外定点突变,成功地将突变序列引入产物末端(Mullis KB,Faloona FA.Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction.Methods Enzymol.1987;155:335-50.);1988年,Higuchi R等在此基础上,运用重叠延伸方法将突变序列引入产物中的中间部位(Higuchi R,Krummel B,Saiki RK.A general method of in vitro preparation and specific mutagenesis ofDNA fragments:study of protein and DNA interactions.Nucleic Acids Res.1988Aug 11;16(15):7351-67.);此后Ho和Horton尝试用重叠延伸方法进行基因重组和嵌合基因的构建并获成功(Ho SN,Hunt HD,Horton RM,Pullen JK,Pease LR.Site-directed mutagenesis by overlap extension using thepolymerase chain reaction.Gene.1989 Apr15;77(1):51-9.;Horton RM,HuntHD,Ho SN,Pullen JK,Pease LR.Engineering hybrid genes without the use ofrestriction enzymes:gene splicing by overlap extension.Gene.1989 Apr15;77(1):61-8.)。利用定点突变技术对天然酶蛋白的催化性质、底物特异性和热稳定性等进行改造已经有很多成功的例子(Ma YF,Evans DE,Logue SJ,Langridge P.Mutations of barley beta-amylase that improve substrate-bindingaffinity and thermostability.Mol Genet Genomics.2001 Nov;266(3):345-52.;Huang CY,Chang AK,Nixon PF,Duggleby RG.Site-directed mutagenesis ofthe ionizable groups in the active site of Zymomonas mobilis pyruvatedecarboxylase:effect on activity and pH dependence.Eur J Biochem.2001Jun;268(12):3558-65.;Wang SX,Dunphy WG.Activation of Xenopus Chklby mutagenesis of threonine-377.FEBS Lett.2000 Dec 29;487(2):277-81.)。
尽管OE-PCR作为一种常见的方法已经被广泛应用,但是一般情况下,每次只能引入一处突变,而当多个位点需要突变时,将需要烦琐的试验步骤和很大工作量,同时也增加了引入一些不必要点突变的可能性。
发明内容
本发明的目的在于提供一种快速高效的实现基因多点突变的—改进的重叠延伸PCR方法(modified overlap extension by PCR,MOE-PCR);本发明是一种快速、简单、无错的多点突变方法,应用本发明既可以实现在一轮反应过程中对多个位点进行定点突变,又没有引入其它突变位点,从而为DNA进行多点突变提供了新的选择;应用本发明,仅经过一轮反应就成功的实现了同时对sam1 8个稀有密码子进行定点突变。
为实现上述目的,本发明采用的技术方案为:
一种改进的重叠延伸PCR方法,反应过程分为以下几个步骤:
(1)片段合成:以所需突变的全长基因为模板,根据突变位点的个数设计一系列平行引物,引物中包含待突变的碱基,每相邻一对引物的末端设计一个重叠区段,长度为20-30bp;采用上述每相邻的一对引物分别进行平行的PCR,实现各个DNA小片段的扩增;
(2)双混合:分别纯化上述片段,分成不同组分,将等量相邻的每个组分的DNA片段分别两两混合,片段之间互为模板,以重叠延伸PCR方式扩增成长片段,反应为无引物PCR过程;
(3)预延伸:将上述多组反应后产物混合在一起,新形成的长片段之间互为模板,以重叠延伸PCR方式扩增成全长新模板,该步骤也是无引物PCR过程;
(4)全长DNA合成:在上述反应体系中加入全长基因的一对外侧引物,以上一步产生的重组全长DNA为模板,进行PCR,扩增全长基因;
(5)后延伸:将上述反应体系再经过10个循环的94℃变性30s,72℃退火和延伸1min;
(6)将突变基因连入载体并转入宿主菌株,进行序列分析。
以酿酒酵母总DNA为模板,扩增带有EcoRI和NotI的sam1基因,该基因具有序列表SEQ ID No:1中的核苷酸序列。将该基因作为起始基因,进行如下步骤的反应(如图1):
(1)片段合成:以酿酒酵母SAM合成酶基因sam1(如图2)作为模板,设计6对平行引物,引物中包含待突变的碱基,每相邻一对引物的末端设计一个重叠区段,长度为20-30bp;采用上述每相邻的一对引物分别进行平行的PCR,实现6个DNA小片段的扩增;
(2)双混合:纯化后的上述片段被分成5个组分,在每个组分中,等量的相邻的DNA片段两两混合(每一个片段约10ng)。片段1和2混合后命名为组分1,以下依次命名为组分2-5,片段之间互为模板,以重叠延伸PCR方式扩增成长片段,反应为无引物PCR过程;
(3)预延伸:随后,将5个组分混合在一起,新形成的长片段之间互为模板,以重叠延伸PCR方式扩增成全长新模板,该步骤也是无引物PCR过程;
(4)全长DNA合成:在反应体系中加入全长基因的一对外侧引物,以上一步产生的重组全长DNA为模板,进行PCR扩增全长基因;
(5)后延伸:经过10个循环的94℃变性30s,72℃退火和延伸1min;
(6)将突变基因连入表达载体并转入酿酒酵母,进行序列分析;并且进行诱导表达,检测蛋白质表达量和SAM的胞内积累量。所获得的突变基因具有序列表SEQ ID No:3中的核苷酸序列;该核酸序列来源于初始基因,与初始基因相比具有8个点突变:G126T,G138T,G462T,G483T,G603T,G621T,G936T和G975T。
本发明具有以下优点:
1.本发明通过独特的反应过程提供了一个新的基因定点突变方法,该方法通过简单的实验步骤,实现在一轮循环中对多个位点同时突变;并且整个反应过程具有良好的保真性,不引入其它点突变。
2.在本发明中,申请人运用该方法对来自酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)的腺苷蛋氨酸(SAM)合成酶基因sam1为起始基因进行了8个稀有密码子的改造,验证了该方法的有效性,并获得了一种突变基因,核酸序列与原有基因序列相比具有8点突变:G126T,G138T,G462T,G483T,G603T,G621T,G936T和G975T,将原有的稀有密码子变换成常见密码子;该基因编码的SAM合成酶可以在酿酒酵母中高效表达,并且能提高胞内SAM的积累量;引用本发明,可进一步提供直接用于生产高表达SAM合成酶的工程菌株。
总之,本发明首次将DNA shuffling技术的原理与定点突变相结合,提出并实践了一种新的定点突变方法。
附图说明
图1用MOE-PCR对sam1进行多点突变的示意图,反应步骤包括:(1)片段合成:用高保真的Pfu DNA聚合酶合成6条DNA片段,每相邻两条片段之间具有一个重叠区,长度为20-30bp,引物中包含有待突变的碱基,6条片段通过重叠连接在一起可以组成全长的DNA,白色空格位置代表待突变的位点;(2)双混合:将相邻的DNA片段两两混合,组成5个平行的组分,分别进行无引物的重叠延伸PCR(OE-PCR);(3)预延伸:将上述5个平行的组分混合在一个反应体系中,再通过无引物的重叠延伸PCR获得全长的重聚DNA模板;(4)全长DNA合成:在反应体系中加入一对相对于全长DNA末端的引物,以上一步反应产生的DNA为模板扩增出全长的经过突变的目的基因;(5)后延伸:经过10个循环的94℃变性,72℃退火和延伸。
图2为SAM合成酶基因sam1 PCR扩增产物的琼脂糖凝胶电泳分析,其中,LaneM:DNA Marker DL2000;Lane1:PCR目的条带;
图3用MOE-PCR方法对sam1的8个稀有密码子进行定点突变的琼脂糖凝胶电泳图(胶浓度1%),其中,Lane M:DNA sizemarker DL2000;Lane1-6:用PCR方法合成的片段1-6;Lane7:MOE-PCR的最终结果。
图4重组质粒pYES-sam1”酶切和PCR验证图谱,其中,LaneM1:Marker DL2000;Lane1:PCR验证结果;Lane2:空白质粒pYES2经BamHI和EcoRI双酶切;Lane3:重组质粒pYES-sam1”经BamHI和EcoRI双酶切;LaneM2:Marker λDNA\HindIII。
图5表达产物的SDS-PAGE电泳分析,其中,M为中分子量蛋白质Marker;Lane1-3分别代表包含有不同质粒的酿酒酵母的诱导表达蛋白:Lane1包含有pYES2;Lane2包含有pYES-sam1;Lane3包含有pYES-sam1”。
图6HPLC检测腺苷蛋氨酸的胞内积累量,其中,a,b,c分别代表包含有不同质粒的酿酒酵母经诱导表达和抽提后的产物:a包含有pYES2,b包含有pYES2+sam1,c包含有pYES2+sam1”;d为腺苷蛋氨酸标准样。
具体实施方式
实施例1
一种来源于酿酒酵母INVScI菌株的编码SAM合成酶(2.5.1.6)的基因sam1,具有序列表SEQ ID No:1中的碱基序列。
SEQ ID No:1:
ATGGCCGGTACATTTTTATTCACTTCTGAATCCGTTGGTGAAGGTCACCCAGA
TAAGATCTGTGACCAAGTTTCCGACGCCATCTTGGACGCTTGTTTAGCCGAGG
ACCCTCACTCCAAAGTTGCGTGTGAAACCGCGGCAAAGACTGGTATGATTATG
GTCTTTGGTGAAATTACTACCAAGGCACAGTTGGATTACCAAAAAATCGTCAG
AGACACCATCAAGAAGATTGGTTACGATGATTCCGCCAAGGGTTTCGACTATA
AGACCTGTAACGTCCTTGTCGCCATTGAGCAACAATCTCCAGATATCGCCCAA
GGTGTCCACGAGGAGAAGGATTTGGAAGACATCGGTGCCGGTGACCAAGGTAT
CATGTTTGGTTACGCCACAGATGAAACTCCAGAGGGTTTGCCTTTGACTATTC
TTTTGGCTCATAAACTAAACATGGCCATGGCTGACGCGAGAAGAGATGGCTCT
TTAGCGTGGTTGAGACCAGACACCAAGACTCAAGTCACCGTCGAATACAAGGA
TGACCACGGTAGATGGGTTCCACAAAGAATCGACACCGTCGTCGTCTCCGCTC
AACATGCTGACGAAATCACGACCGAGGACTTAAGAGCGCAACTAAAGTCCGAG
ATCATTGAAAAAGTCATCCCAAGAGACATGTTGGACGAAAACACCAAATACTT
TATCCAACCTTCCGGTAGATTCGTCATCGGTGGTCCTCAAGGTGACGCTGGTT
TGACCGGTAGAAAGATCATCGTCGACGCTTACGGTGGTGCCTCATCCGTCGGT
GGTGGTGCCTTCTCCGGTAAGGACTACTCTAAGGTTGATCGTTCTGCCGCTTA
TGCCGCTAGATGGGTTGCCAAGTCCCTAGTTGCCGCTGGTTTATGTAAGAGAG
TTCAAGTTCAATTTTCTTATGCCATCGGTATTGCGGAACCATTGTCCTTGCAC
GTTGACACCTATGGTACTGCGACCAAGTCTGACGAAGAAATTATCGACATTAT
CAGCAAGAACTTTGACTTGAGACCTGGTGTATTGGTCAAGGAGTTGGACTTAG
CTAGACCAATCTACTTGCCAACCGCTTCTTATGGCCATTTCACAAACCAAGAA
TACCCATGGGAAAAGCCTAAGACTTTGAAGTTCTAA
(1)SEQ ID No:1的信息(参见序列表)
(a)序列特征
*长度:1149碱基对
*类型:核酸
*链型:双链
*拓扑结构:线性
(b)分子类型:DNA
(c)假设:否
(d)反义:否
(e)最初来源:酿酒酵母INVScI菌株的编码SAM合成酶(2.5.1.6)的基因sam1
(2)来源于酿酒酵母INVScI菌株的编码SAM合成酶(2.5.1.6)的基因sam1的制备:
上游引物1:5-ATTGGATCCCAACGATGGCACTAGACATA-3;
下游引物2:5-GCAGAATTCGAGGTTGAAGGCAGAAAA-3;
下划线序列分别为BamHI和EcoRI酶切位点。
扩增条件:以酿酒酵母INVScI菌株总DNA为模板,用pfu DNA聚合酶进行扩增。反应体系为:2.5U的pfu DNA聚合酶、1×pfu buffer、200μmolL-1dNTP、1mmol L-1各引物、100ng的DNA模板,总反应体积100μl;反应条件:94℃变性2min;30个循环的94℃ 30s,53℃ 30s,72℃ 3min;72℃延伸10min。PCR产物回收:按上海华舜试剂盒使用说明书。目的产物见琼脂糖凝胶电泳(如图2)。将目的基因经BamHI和EcoRI酶切后克隆入pYES2载体的相应酶切位点,构建pYES2-sam1重组质粒。
实施例2
采用新的综合的基因改组方法对sam1进行改组,获得编码酶活性提高的重组酶的基因sam1,具有序列表SEQ ID No:3的碱基序列。
ATGGCCGGTACATTTTTATTCACTTCTGAATCCGTTGGTGAAGGTCACCCAGA
TAAGCTCTGTGACCAAGTTTCCGACGCCATCTTGGACGCTTGTTTAGCCGAGG
ACCCTCACTCCAAAGTTGCTTGTGAAACCGCTGCAAAGACTGGTATGATTATG
GTCTTTGGTGAAATTACTACCAAGGCACAGTTGGATTACCAAAAAATCGTCAG
AGACACCATCAAGAAGATTGGTTACGATGATTCCGCCAAGGGATTCGACTATA
AGACCTGTAACGTCCTTGTCGCCATTGAGCAACAATCTCCAGACATCGCCCAA
GGTGTCCACGAGGAGAAGGATTTGGAAGACATCGGTGCCAGTGACCAAGGTAT
CATGTTTGGTTACGCCACAGATGAAACTCCAGAGGGTTTGCCTTTAACTATTC
TTTTGGCTCATAAACTAAACATGGCCATGGCTGACGCTAGAAGAGATGGCTCT
TTAGCTTGGTTGAGACCAGACACCAAGACTCAAGTCACCGTCGAATACAAGGA
TGACCACGGTAGATGGGTTCCGCAAAGAATCGACACCGTCGTCGTCTCCGCTC
AACATGCTGACGAAATCACTACCGAGGACTTAAGAGCTCAACTAAAGTCCGAG
TTCATTGAAAAAGTCATCCCAAGAGACATGTTGGACGAAAACACCAAATACTT
TATCCAACCTTCCGGTAGATTCGTCATCGGTGGTCCTCAAGGTGACGCTGGTT
TGACCGGTAGAAAGATCATCGTCGACGCTTACGGTGGTGCCTCATCCGTCGGT
GGTGGTGCCTTCTCCGGTAAGGACTACTCTAAGGTTGATCGTTCTGCCGCTTA
TGCCGCTAGATGGGTTGCCAAGTCCCTAGTTGCCGCTGGTTTATGTAAGAGAG
TTCAAGTTCAATTTTCTTATGCCATCGGTATTGCTGAACCATTGTCCTTGCAC
GTTGACACCTATGGTACTGCTACCAAGTCTGACGAAGAAATTATCGACATTAT
CAGCAAGAACTTTGACTTGAGACCTGGTGTATTGGTCAAGGAGTTGGACTTAT
CTAGACCAATCTACTTGCCAACCGCTTCTTATGGCCATTTCACAAACCAAGAA
TACCCATGGGAAAAGCCTAAGACTTTGAAGTTCTAA
(1)SEQ ID No:3的信息(参见序列表)
(A)序列特征
*长度:1149碱基对
*类型:核酸
*链型:双链
*拓扑结构:线性
(b)分子类型:DNA
(c)假设:否
(d)反义:否
(2)采用MOE-PCR对sam1进行多点突变。
(1)片段合成:采用6个平行的PCR反应实现对6条相邻DNA片段的扩增(如图3),每相邻两个PCR之间具有一个重叠区,长度一般20-30bp。DNA反应体系如下:dNTP 0.2mM,10×pfu buffer(with MgCl2)10μl,pfuDNA聚合酶5U,模板(总DNA)100ng,引物(见表1)各1mM,加ddH2O至反应总体积为100μl。对于片段1进行扩增,其反应程序为:94℃变性2min;30个循环的94℃30s,59.6℃30s,72℃55s;72℃延伸10min。
Figure C200510046414D00081
表1:用MOE-PCR进行sam1稀有密码子改造所用的各突变引物
已经突变的碱基用阴影标示;方框内所示为BamHI和EcoRI限制性识别序列
其它各片段的反应条件与片段1相似,除了退火温度和延伸时间不同。片段2-6的退火温度分别为62.5℃,58.8℃,59.5℃,55.1℃和53.3℃;而片段2-6的延伸时间分别为1min 25s,55s,1min 20s,50s和55s。扩增后的产物分别进行1%的琼脂糖凝胶电泳,然后以胶回收试剂盒进行回收纯化。
(2)双混合:纯化后的上述片段被分成5个组分,在每个组分中,等量的相邻的DNA片段两两混合(每一个片段约10ng)。片段1和2混合后命名为组分1,以下依次命名为组分2-5,片段之间互为模板,以重叠延伸PCR方式扩增成长片段,反应为无引物PCR过程。每组中反应体系如下:dNTP 0.2mM,10×pfu buffer(with MgCl2)2μl,pfuDNA聚合酶1U,相邻两条片段各10ng,加ddH2O至反应总体积为20μl。对于组分1(即片段1&2混合)进行无引物PCR,其反应程序如下:94℃变性2min;30个循环的94℃ 20s,59.6℃ 30s,72℃ 1min 25s;72℃延伸10min。其它组分的反应条件与组分1相似,除了退火温度和延伸时间不同。组分2-5的退火温度分别为58.8℃、58.8℃、55.1℃和53.3℃;组分2-5的延伸时间分别为1min 25s、1min 20s、1min 20s、55s;
(3)预延伸:随后,将5个组分混合在一起,新形成的长片段之间(新形成的长片段之间互为模板)经过20个循环的94℃ 20s变性和72℃ 30s退火、延伸,形成部分全长新模板,该步骤也是无引物PCR过程;
(4)全长DNA合成:在反应体系中加入40pmol的两种外测引物F0和R0,以上一步产生的重组全长DNA为模板,进行PCR扩增全长基因。PCR反应程序如下:94℃变性20s;30个循环的94℃ 20s,53.3℃ 30s,72℃ 2min;72℃延伸10min;
(5)后延伸:经过10个循环的94℃变性30s,72℃退火和延伸1min。反应产物进行琼脂糖凝胶电泳,切下目的大小的条带,用胶回收试剂盒进行纯化;
(6)将突变基因经BamHI和EcoRI酶切后克隆入同样经双酶切的pYES2载体上,构建pYES2+sam1”重组质粒(如图4),并转化酿酒酵母INVScI菌株。挑取基因工程菌单菌落接种到15ml修改的SC-U培养基(6.7g酵母氮源;5g蛋氨酸;0.1g的腺嘌呤,精氨酸,半胱氨酸,亮氨酸,赖氨酸,络氨酸,苏氨酸;0.05g的天冬氨酸,组氨酸,异亮氨酸,苯丙氨酸,脯氨酸,丝氨酸,色氨酸和缬氨酸;终体积1L),包括2%棉籽糖。30℃培养至OD600=0.4,然后4℃下1500×g离心5min,然后将细胞重悬于2ml诱导培养基(修改的SC-U培养基,包含2%的半乳糖),再接种到50ml的诱导培养基内,30℃条件下150rmin-1摇床内培养6h。然后4℃下1500×g离心5min,倒掉上清,将沉淀重悬于500μl的纯净水。4℃下1500×g离心5min,倒掉上清,细胞用于检测SAM积累。每1g菌体中加入5ml 1.5molL-1的高氯酸以120r min-1摇动1h进行抽提,生成的SAM水平用BioCAD700E型HPLC(Perseptive Biosystem,Inc.U.S.A.)进行检测。本试验选用弱阳离子交换柱Poros20CM(4.6mm×100mm),流动相为0.5mol L-1的HCOONH4,pH调整为4.0,流速为5ml min-1,在260nm波长下检测产物,室温22℃。作为对照,含有pYES2质粒和pYES2+sam1质粒的酿酒酵母也被用于检测SAM的胞内积累量。10μmol/L的标准品SAM被用于标定SAM的保留时间。
取1ml发酵液离心,菌体沉淀用1ml蒸馏水洗涤,离心后重悬于1倍的上样缓冲液中,沸水浴煮10min,12000×g离心2min。取10μl进行SDS-PAGE电泳,0.1%考马斯亮蓝染色,然后检测蛋白的表达。
结果:
1.测序结果表明,突变基因序列,即8个点突变与预测结果相符,没有其它突变位点引入;
2.运用本发明所述的基因定点突变方法,经过一轮反应即获得目的大小的突变DNA(如图3);
3.在工程菌的细胞全蛋白电泳中有一条明显的表达带,诱导蛋白如图5所示。分子量约为4.2K dalton;
4.通过HPLC检测,得到一株腺苷蛋氨酸胞内积累量提高的酿酒酵母菌株,胞内SAM积累量较对照提高了25.6%(如图6)。
            重叠延伸
     SEQUENCE LISTING
<110>中国科学院沈阳应用生态研究所
<120>一种改进的重叠延伸PCR方法及其所获得的突变基因
<130>
<160>4
<170>PatentIn version 3.1
<210>1
<211>1149
<212>DNA
<213>酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)
<220>
<221>CDS
<222>(1)..(1149)
<223>
<400>1
<210>2
<211>382
<212>PRT
<213>酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)
<400>2
Figure C200510046414D00141
<210>3
<211>1149
<212>DNA
<213>酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)
<220>
<221>CDS
<222>(1)..(1149)
<223>
<400>3
Figure C200510046414D00142
Figure C200510046414D00151
<210>4
<211>382
<212>PRT
<213>酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)
<400>4
Figure C200510046414D00161
Figure C200510046414D00171

Claims (2)

1.一种改进的重叠延伸PCR方法,其特征在于:
反应过程分为以下几个步骤:
(1)片段合成:以所需突变的全长基因为模板,根据突变位点的个数设计一系列平行引物,引物中包含待突变的碱基,每相邻一对引物的末端设计一个重叠区段,长度为20-30bp;采用上述每相邻的一对引物分别进行平行的PCR,实现各个DNA小片段的扩增;
(2)双混合:分别纯化上述片段,分成不同组分,将等量相邻的DNA片段分别两两混合,片段之间互为模板,以重叠延伸PCR方式扩增成长片段,反应为无引物PCR过程;
(3)预延伸:将上述多组反应后产物混合在一起,新形成的长片段之间互为模板,以重叠延伸PCR方式扩增成全长新模板,该步骤也是无引物PCR过程;
(4)全长DNA合成:在上述反应体系中加入全长基因的一对外侧引物,以上一步产生的重组全长DNA为模板,PCR扩增出全长基因;
(5)后延伸:将上述反应体系再经过10个循环的94℃变性30s,72℃退火和延伸1min。
2.按权利要求1所述方法所获得的突变基因,其特征在于:具有序列表SEQ ID No:3中的核苷酸序列。
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Site-directed mutagenesis by overlap extension usingpolymerase chain reaction. Steffan N. Ho et al.Gene,Vol.77 No.1. 1989
Site-directed mutagenesis by overlap extension usingpolymerase chain reaction. Steffan N. Ho et al.Gene,Vol.77 No.1. 1989 *
用改进的重叠PCR引入血管内皮生长因子基因突变. 白向阳等.生物化学与生物物理进展,第31卷第2期. 2004
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