CA3083147A1 - Milieu de culture anti-adhesion - Google Patents

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Abstract

La présente invention concerne un procédé culture de microorganismes, en particulier de protistes, réalisé de manière à prévenir l'adhésion des microorganismes sur les parois des réacteurs dans lesquels la culture est réalisée.

Description

MILIEU DE CULTURE ANTI-ADHÉSION
DOMAINE DE L'INVENTION
La présente invention concerne un procédé culture de microorganismes, en particulier de protistes, réalisé de manière à prévenir l'adhésion des microorganismes sur les parois des réacteurs dans lesquels la culture est réalisée.
ETAT DE LA TECHNIQUE
Les micro-organismes ont tendance à adhérer aux parois lors des cultures de longues durées (de plusieurs jours à plusieurs mois). Ce phénomène dit de fouling est bien connu. Il a des conséquences très néfastes tant sur la productivité des cultures que sur la longévité du matériel qui doit régulièrement être nettoyé. Les cellules qui adhérent aux parois des bioréacteurs réduisent la quantité de lumière pénétrant à l'intérieur, elles peuvent mourir par manque de ressources (nutriments, oxygène.. .etc) et provoquer ainsi le développement d'organismes nécrophages.
Certains matériaux génèrent moins d'adhérences que d'autres mais aucun ne permet de s'affranchir des inconvénients cités ci-dessus.
La salinité du milieu dans lequel circulent les microorganismes et la nature de la paroi qui le contient peuvent avoir une incidence sur l'adhésion des microorganismes à la paroi.
Ainsi, il a été montré que l'ajout de chlorure de fer favorise les phénomènes d'adhésion de microalgues du genre Chlorelle sur les parois de verre (Nordin J. & al., 1967).
Il existe des méthodes dites actives de travail en surface tel que les systèmes mécaniques de type grattoir (Wet Labs/Sea-Bird BioWiper), jet d'eau sous pression, ultrason, les biocides comme chlore ou brome (Alconox), les détergents anioniques pour le lavage manuel, les radiations UV.
Il est possible de construire une paroi anti-fouling intégrée (C-Spray YSI). Cela peut être une surface composée d'un biocide qui libère progressivement l'élément neutralisant du biofilm dans le milieu. Ces systèmes avec biocides sont généralement composés de sels de cuivre, il libère le Cu2+ qui interfère avec les enzymes sur les membranes empêchant leur division (YSI 6-Series Anti-Fouling Kits).
Ces méthodes sont difficiles à mettre en oeuvre car il est difficile de libérer les bonnes doses de produits en fonction de la croissance avec un risque de déploiement trop rapide du biofilm. Une fois le biofilm formé, le produit est moins efficace. Par ailleurs l'efficacité de ces techniques chimiques est basée sur la mort des microalgues, donc au détriment de leur croissance.
Il reste le besoin d'un moyen d'éviter l'agrégation des microorganismes cultivés dans des réacteurs tout en conservant voire en améliorant les propriétés de croissance et l'activité
2 biologique de ces microorganismes.
EXPOSE DE L'INVENTION
Pour résoudre ce problème technique, l'invention concerne l'utilisation d'un agent floculant dans le milieu de culture pendant la culture des microorganismes pour prévenir l'adhésion des microorganismes sur les parois des réacteurs dans lesquels la culture est réalisée.
L'invention concerne aussi un procédé de culture de microorganismes dans un milieu de culture approprié pour leur croissance, caractérisé en ce que le milieu de culture comprend une quantité appropriée d'un agent floculant pour prévenir l'adhésion des microorganismes sur les parois des réacteurs dans lesquels la culture est réalisée.
DESCRIPTION DES FIGURES
La figure 1 représente la viabilité des microalgues avec différentes concentrations de chlorure de fer.
La figure 2 représente la viabilité des microalgues avec différentes concentrations de chlorure de zinc.
La figure 3 représente la viabilité des microalgues avec différentes concentrations d'amidon La Figure 4 représente la production de biomasse de la même microalgue dans deux conditions, avec et sans agent floculant FeCl3. Les conditions de températures, pH, luminosités sont les mêmes.
La Figure 5 représente les points disposés sur la paroi de la colonne transparente employée comme réacteur pour la mesure de la capacité de passage de la lumière à travers la colonne.
La Figure 6 représente l'efficacité de 3 flocculants. Il s'agit de 2 éléments inorganiques dont le FeCl3, le ZnCl2 et un élément organique, l'amidon de pomme de terre.
DESCRIPTION DETAILLEE DE L'INVENTION
L'invention concerne la culture de microorganismes. Ces procédés de cultures de microorganismes et les microorganismes cultivés sont bien connus de l'homme du métier.
Il s'agit notamment de bactéries, de levures ou encore de protistes, plus particulièrement de microalgues. Selon un mode particulier et préféré de réalisation de l'invention, les microorganismes cultivés sont des protistes.
Par protistes , on entend tous les microorganismes unicellulaires eucaryotes. Les microalgues (Chlorophytes telles que Chlorella, Senedesmus, Tetraselmis, Haematococcus ;
Charophytes, chrysophytes dont les diatomées ; Nannochloropsis ; Euglenophytes telle que
3 Euglena, Phacus ; Rodophytes dont Galdieria...etc), les champignons unicellulaires (Thrautochytrides telle que Schizochytrium, Aurantiochytrium ...etc), les cyanobactéries (Anabaena, Nostoc, Microcistis, Arthrospira, Spirulina...) ou les flagellés hétérotrophes (Ctypthecodinium etc.) font partie du groupe des protistes.
Lorsque les microalgues sont du genre Chlorella, elles pourront être choisies parmi les espèces C. acuminata, C. angustoellipsoidea, C. anitrata, C. antarctica, C. aureoviridis, C. autotrophica, C. bottyoides, C. caldaria, C. candida, C. capsulata, C.
chlorelloides, C.
cladoniae, C. coelastroides, C. colonialis, C. communis, C. conductrix, C. con glomerata, C.
desiccata, C. ellipsoidea, C. elongata, C. emersonii, C. faginea, C. fusca, C.
glucotropha, C.
homosphaera, C. infusionum, C. kessleri, C. koettlitzii, C. lacustris, C.
lewinii, C. lichina, C.
lobophora, C. luteo-viridis, C. marina, C. miniata, C. minor, C. minutissima, C. mirabilis, C.
mucosa, C. mutabilis, C. noctuma, C. nordstedtii, C. oblonga, C. oocystoides, C. ovalis, C.
paramecii, C. parasitica, C. parva, C. peruviana, C. photophila, C. pituita, C. pringsheimii, C.
protothecoides, C. pulchelloides, C. pyrenoidosa, C. regularis, C. reisiglii, C. reniformis, C.
rotunda, C. rubescens, C. rugosa, C. saccharophila, C. sauna, C. simplex, C.
singularis, C.
sorokiniana, C. spaerckii, C. sphaerica, C. stigmatophora, C. subsphaerica, C.
terricola, C.
trebouxioides, C. vannielii, C. variabilis, C. viscosa, C. vo/utis, C.
vulgaris, C. zopfingiensis.
Avantageusement selon l'invention les algues du genre Chlorella pourront être des algues choisies parmi les espèces C. sorokiniana ou C. vulgaris.
Lorsque les microalgues sont du genre Euglena, elles pourront être choisies entre autres parmi les espèces E. viridis, E. gracilis, E. limosa, E. globosa, E.
prowsei, E.
polomorpha.
Lorsque les microalgues sont du genre Scenedesmus, elles pourront être choisies parmi les espèces S. abundans, S. aciculatus, S. aculeolatus, S. aculeotatus, S. acuminatus, S. acutiformis, S. acutus, S. aldavei, S. altemans, S. ambuehlii, S.
anhuiensis, S. anomalus, S. antenna tus, S. antillarum, S. apicaudatus, S. apicula tus, S. arcua tus, S. arista tus, S.
armatus, S. arthrodesmiformis, S. arvemensis, S. asymmetricus, S. bacillaris, S.
baculiformis, S. bajacalifomicus, S. balatonicus, S. basiliensis, S. bemardii, S. bicaudatus, S.
bicellularis, S. bidentatus, S. bijuga, S. bijugatus, S. bilugus, S.
brasiliensis, S.
breviaculeatus, S. brevispina, S. caribeanus, S. carinatus, S. caudato-aculeolatus, S.
caudatus, S. chlorelloides, S. circumfusus, S. coalitus, S. costatogranulatus, S.
crassidentatus, S. curvatus, S. decorus, S. denticulatus, S. deserticola, S.
dia gonalis, S.
dileticus, S. dimorphus, S. disciformis, S. dispar, S. disten tus, S. ecomis, S. ellipsoideus, S.
ellipticus, S. falcatus, S. fenestra tus, S. flavescens, S. flexuosus, S.
furcosus, S. fuscus, S.
fusiformis, S. gracilis, S. graevenitzii, S. grahneisfi, S. granulatus, S.
gujaratensis, S.
gutwinskii, S. hanleyi, S. helveticus, S. heteracanthus, S. hindakii, S.
hirsutus, S. hortobagyi, S. houlensis, S. huangshanensis, S. hystrix, S. incrassatulus, S. indianensis, S. indicus, S.
4 inermis, S. insignis, S. intermedius, S. javanensis, S. jovais, S. jugalis, S.
kerguelensis, S.
kissii, S. komarekii, S. lefevrei, S. linearis, S. &tores, S. longispina, S.
Ion gus, S. luna, S.
luna tus, S. magnus, S. maximus, S. microspina, S. minutus, S. mirus, S.
morzinensis, S.
multicauda, S. multiformis, S. multispina, S. multistria tus, S. naegelii, S.
nanus, S. nota tus, S.
nygaardii, S. oahuensis, S. obliquus, S. obtusiusculus, S. obtusus, S.
olvaltemus, S.
oocystiformis, S. opoliensis, S. omatus, S. ovaltemus, S. pannonicus, S.
papillosum, S.
parisiensis, S. parvus, S. pecsensis, S. pectinatus, S. perforatus, S.
planctonicus, S.
plarydiscus, S. platydiscus, S. pleiomorphus, S. polessicus, S.
polydenticulatus, S.
polyglobulus, S. polyspinosus, S. praetervisus, S. prismaticus, S. producto-capitatus, S.
protuberans, S. pseudoarmatus, S. pseudobemardii, S. pseudodenticulatus, S.
pseudogranulatus, S. pseudohystrix, S. pyrus, S. quadrialatus, S. quadricauda, S.
quadricaudata, S. quadricaudus, S. quadrispina, S. raciborskii, S. ralfsii, S.
reginae, S.
regularis, S. reniformis, S. rostrato-spinosus, S. rotundus, S. rubescens, S.
scenedesmoides, S. schnepfii, S. schroeteri, S. securiformis, S. semicrista tus, S.
semipulcher, S.
sempervirens, S. senilis, S. serrato-perforatus, S. serratus, S. serrulatus, S. setiferus, S.
sihensis, S. smithii, S. soli, S. sooi, S. spica tus, S. spinoso-aculeolatus, S. spinosus, S.
spinulatus, S. striatus., S. subspicatus, S. tenuispina, S. terrestris, S.
tetradesmiformis, S.
transilvanicus, S. tricosta tus, S. tropicus, S. tschudyi, S. vacuola tus, S.
variabilis, S. velitaris, S. verrucosus, S. vesiculosus, S. westii, S. weberi, S. wisconsinensis, S.
wuhanensis, S.
wuhuensis. Avantageusement selon l'invention les algues du genre Scenedesmus pourront être des algues choisies parmi les espèces S. obliquus ou S. abundans.
Lorsque les microalgues sont des diatomées, elles pourront être choisies parmi les genres suivants : Nitzschia, Navicula, Gyrosigma, Phaeodactylum, Thalassiosira...etc.
Lorsque les microalgues sont du genre Nitzschia, elles pourront être choisies parmi les espèces N. abbreviata, N. abonuensis, N. abridia, N. accedens, N.
accommodata, N.
aciculariformis, N. acicularioides, N. acicularis (comprenant toutes ces variétés), N.
acidoclinata, N. actinastroides, N. actydrophila, N. acula, N. acuminata (comprenant toutes ces variétés), N. acuta, N. adamata, N. adamatoides, N. adapta, N. adducta, N.
adductoides, N. admissa, N. admissoides, N. aequalis, N. aequatorialis, N. aequora, N.
aequorea, N.
aerophila, N. aerophiloides, N. aestuari, N. affinis, N. africana, N. agnewii, N. agnita, N. alba, N. albicostalis, N. alexandrina, N. alicae, N. allanssonii, N. alpina, N.
alpinobacillum, N.
amabilis, N. ambigua, N. americana, N. amisaensis, N. amphibia, N. amphibia (comprenant toutes ces variétés), N. amphibioides, N. amphicephala, N. amphilepta, N.
amphioxoides, N.
amphioxys (comprenant toutes ces variétés), N. amphiplectans, N. amphiprora, N.
amplectens, N. amundonii, N. anassae, N. andicola, N. angularis (comprenant toutes ces variétés), N. angulata, N. angustata (comprenant toutes ces variétés), N.
angustatula, N.
angustiforaminata, N. aniae, N. antarctica, N. antillarum, N. apiceconica, N.
apiculata, N.

archibaldii, N. arcuata, N. arcula, N. arcus, N. ardua, N. aremonica, N.
arenosa, N. areolata, N. armoricana, N. asperula, N. astridiae, N. atomus, N. attenuata, N. aura ntiaca, N. aura riae, N. aurica, N. auricula, N. australis, N. austriaca, N. bacata (comprenant toutes ces variétés), N. bacillariaeformis, N. bacilliformis, N. bacillum, N. balatonis, N.
balcanica, N. baltica, N.
5 barbieri (comprenant toutes ces variétés), N. barkleyi, N. barronii, N.
barrowiana, N.
bartholomei, N. bathurstensis, N. bavarica, N. behrei, N. bergii, N. beyeri, N. biacrula, N.
bicapitata (comprenant toutes ces variétés), . bicuneata, N. bifurcata, N.
bilobata (comprenant toutes ces variétés), N. birostrata, N. bisculpta, N. bita, N.
bizertensis, N.
blankaartensis, N. bombiformis, N. borealis, N. bosumtwiensis, N. braarudii, N. brebissonii (comprenant toutes ces variétés), N. bremensis (comprenant toutes ces variétés), N. brevior, N. brevirostris, N. brevissima (comprenant toutes ces variétés), N.
brevistriata, N. brightwellii, N. brittonii, N. brunoi, N. bryophila, N. buceros, N. bukensis, N.
bulnheimiana, N.
buschbeckii, N. calcicola, N. caledonensis, N. calida (comprenant toutes ces variétés), N.
califomica, N. campechiana, N. capensis, N. capitata, N. capitellata (comprenant toutes ces variétés), N. capuluspalae, N. camicobarica, N. camico-barica, N. challengeri, N. chalonii, N.
chandolensis, N. chardezii, N. chasei, N. chauhanii, N. chun gara, N.
chutteri, N. circumsuta, N. clarissima, N. clausii, N. clementei, N. clementia, N. clevei, N.
closterium (comprenant toutes ces variétés), N. coarctata, N. cocconeiformis, N. communis (comprenant toutes ces variétés), N. commutata, N. commutatoides, N. compacta, N. compressa (comprenant toutes ces variétés), N. concordia, N. con finis, N. con formata, N. con fusa, N. con golensis, N.
constricta (comprenant toutes ces variétés), N. consummata, N. corpulenta, N.
costei, N.
coutei, N. creticola, N. cucumis, N. cursoria, N. curta, N. curvata, N.
curvilineata, N.
curvipunctata, N. curvirostris (comprenant toutes ces variétés), N. curvula (comprenant toutes ces variétés), N. cuspidata, N. cylindriformis, N. cylindrus, N.
dakariensis, N.
davidsonii, N. dealpina, N. debilis, N. decipiens, N. delauneyi, N.
delicatissima, N. delicatula, N. delognei, N. denticula (comprenant toutes ces variétés), N. denticuloides, N. desertorum, N. dianae, N. dia phana, N. diducta, N. didyma, N. dietrichii, N.
dilatata, N. diluviana, N.
dippelii, N. dire cta, N. diserta, N. disputata, N. dissipata (comprenant toutes ces variétés), N.
dissipatoides, N. distans (comprenant toutes ces variétés), N. distantoides, N. divaricata, N.
divergens, N. diversa, N. diversecostata, N. doljensis, N. draveillensis, N.
droebakensis, N.
dubia (comprenant toutes ces variétés), N. dubiformis, N. dubioides, N.
ebroicensis, N. eglei, N. elegans, N. elegantula, N. ele gens, N. elliptica, N. elongata, N. entomon, N. epiphytica, N.
epiphyticoides, N. epithemiformis, N. epithemioides, N. epithemoides (comprenant toutes ces variétés), N. epsilon, N. erlandssonii, N. erosa, N. etoshensis, N.
examinanda, N. eximia, N.
famelica, N. fasciculata, N. febigeri, N. ferox, N. ferrazae, N. fibula-fissa, N. filiformis (comprenant toutes ces variétés), N. flexa, N. flexoides, N. fluminensis, N.
fluorescens, N.
fluvialis, N. fogedii, N. fonticola (comprenant toutes ces variétés), N.
fonticoloides, N.
6 fonticula, N. fontifuga, N. forfica, N. formosa, N. fossalis, N. fossilis, N.
fragilariiformis, N.
franconica, N. fraudulenta, N. frauenfeldii, N. frequens, N. frickei, N.
frigida (comprenant toutes ces variétés), N. frustuloides, N. frustulum (comprenant toutes ces variétés), N.
fruticosa, N. fundi, N. fusiformis, N. gaarderi, N. gaertnerae, N.
gandersheimiensis, N.
garrensis, N. gazellae, N. geitleri, N. geitlerii, N. gelida (comprenant toutes ces variétés), N.
geniculata, N. gessneri, N. gieskesii, N. gigantea, N. gisela, N. glabra, N.
glacialis (comprenant toutes ces variétés), N. glandiformis, N. goetzeana (comprenant toutes ces variétés), N. gotlandica, N. graciliformis, N. gracilis (comprenant toutes ces variétés), N.
gracillima, N. graciloides, N. gradifera, N. graeffii, N. grana, N. grandis, N. granii (comprenant toutes ces variétés), N. granulata (comprenant toutes ces variétés), N.
granulosa, N.
groenlandica, N. grossestriata, N. grovei, N. gruendleri, N. grunowii, N.
guadalupensis, N.
guineensis, N. guttula, N. gyrosigma, N. habirshawii, N. habishawii, N.
hadriatica, N.
halteriformis, N. hamburgiensis, N. hantzschiana (comprenant toutes ces variétés), N.
harder!, N. harrissonii, N. hassiaca, N. heidenii, N. heimii, N. hemistriata, N. heteropolica, N.
heuflerania, N. heufleriana (comprenant toutes ces variétés), N. hiemalis, N.
hiengheneana, N. hierosolymitana, N. hoehnkii, N. holastica, N. hollerupensis, N. holsatica, N.
homburgiensis, N. hudsonii, N. hummii, N. hungarica (comprenant toutes ces variétés), N.
hustedti, N. hustedtiana, N. hyalina, N. hybrida (comprenant toutes ces variétés), N.
hybridaeformis, N. ignorata (comprenant toutes ces variétés), N. iltisii, N.
impressa, N.
improvisa, N. incerta, N. incognita, N. inconspicua, N. incrustans, N. incurva (comprenant toutes ces variétés), N. indica, N. indistincta, N. inducta, N. inflatula, N.
ingenua, N. inimasta, N. innominata, N. insecta, N. insignis (comprenant toutes ces variétés), N.
intermedia (comprenant toutes ces variétés), N. intermissa, N. interrupta, N.
interruptestriata, N. invicta (comprenant toutes ces variétés), N. in visa, N. invisitata, N. iranica, N.
irregularis, N.
irremissa, N. irrepta, N. irresoluta, N. irritans, N. italica, N. janischii, N. jelineckii, N.
johnmartinii, N. juba, N. jucunda, N. jugata (comprenant toutes ces variétés), N. jugiformis, N. kahlii, N. kanakarum, N. kanayae, N. kavirondoensis, N. kerguelensis, N.
kimberliensis, N.
kittlii, N. kittonii, N. knysnensis, N. kolaczeckii, N. kotschyi, N.
kowiensis, N. krachiensis, N.
krenicola, N. kuetzingiana (comprenant toutes ces variétés), N. kuetzingii, N.
kuetzingioides, N. kurzeana, N. kurzii, N. kützingiana (comprenant toutes ces variétés), N.
labella, N.
labuensis, N. lacrima, N. lacunarum, N. lacunicola, N. lacus-karluki, N.
lacustris, N. lacuum, N. laevis, N. laevissima, N. lagunae, N. lagunensis, N. lamprocampa (comprenant toutes ces variétés), N. lanceola (comprenant toutes ces variétés), N. lanceolata (comprenant toutes ces variétés), N. lancettula, N. lancettuloides, N. lange-bertalotii, N.
latens, N. latestriata, N.
latiuscula, N. lauenbergiana, N. lauenburgiana, N. lecointei, N. leehyi, N.
legleri, N. lehyi, N.
leistikowii, N. lesbia, N. lesinensis, N. lesothensis, N. leucosigma, N.
levidensis (comprenant toutes ces variétés), N. liebetruthii (comprenant toutes ces variétés), N.
ligowskii, N. limicola,
7 N. limulus, N. linearis (comprenant toutes ces variétés), N. lineata, N.
lineola, N. linkei, N.
lionella, N. &tores (comprenant toutes ces variétés), N. littorea, N. longa, N. longicollum, N.
longirostris, N. longissima (comprenant toutes ces variétés), N. lorenziana (comprenant toutes ces variétés), N. lucisensibilis, N. lunaris, N. lunata, N. lurida, N.
luzonensis, N.
macaronesica, N. macedonica, N. macera, N. machardyae, N. macilenta (comprenant toutes ces variétés), N. magnacarina, N. mahihaensis, N. mahoodii, N. maillardii, N.
major, N.
majuscula (comprenant toutes ces variétés), N. makarovae, N. manca, N.
mancoides, N.
manguini, N. marginata, N. marginulata (comprenant toutes ces variétés), N.
marina, N.
martiana, N. maxima, N. media, N. medioconstricta, N. mediocris, N.
mediterranea, N.
metzeltinii, N. microcephala (comprenant toutes ces variétés), N. migrans, N.
minuta, N.
min utissima, N. min utula, N. miramarensis, N. miserabilis, N. mitchelliana, N. modesta, N.
moissacensis (comprenant toutes ces variétés), N. mollis, N. monachorum, N.
monoensis, N.
montanestris, N. morosa, N. multistriata, N. nana, N. natalensis, N. na tans, N. nathorsti, N.
navicularis, N. navis-varingica, N. navrongensis, N. neglecta, N. nelsonii, N.
neocaledonica, N. neoconstricta, N. neofrigida, N. neogena, N. neotropica, N. nereidis, N.
nicobarica, N.
nienhuisii, N. normannii, N. notabilis, N. nova, N. novae-guineaensis, N.
novae-guineensis, N. novaehollandiae, N. nova-zealandia, N. nyassensis, N. oberheimiana, N.
obesa, N.
obliquecostata, N. obscura, N. obscurepunctata, N. obsidialis, N. obsoleta, N.
obsoletiformis, N. obtusa (comprenant toutes ces variétés), N. obtusangula, N. oceanica, N.
ocellata, N.
oliffi, N. omega, N. osmophila, N. ossiformis, N. ostenfeldii, N. ovalis, N.
paaschei, N.
pacifica, N. palacea, N. palea (comprenant toutes ces variétés), N. paleacea, N.
paleaeformis, N. paleoides, N. palustris, N. pamirensis, N. panduriformis (comprenant toutes ces variétés), N. pantocsekii, N. paradoxa (comprenant toutes ces variétés), N. parallela, N.
pararostrata, N. partita, N. parvula (comprenant toutes ces variétés), N.
parvuloides, N.
paxillifer, N. peisonis, N. pelagica, N. pellucida, N. pennata, N. peragallii, N. perindistincta, N.
perminuta, N. perpusilla (comprenant toutes ces variétés), N. perspicua, N.
persuadens, N.
pertica, N. perversa, N. petitiana, N. philippinarum, N. pilum, N. pin guescens, N. piscinarum, N. plana (comprenant toutes ces variétés), N. planctonica, N. plicatula, N.
plioveterana, N.
polaris, N. polymorpha, N. ponciensis, N. praecurta, N. praefossilis, N.
praereinholdii, N.
princeps, N. procera, N. prolongata (comprenant toutes ces variétés), N.
prolongatoides, N.
promare, N. propin qua, N. pseudepiphytica, N. pseudoamphioxoides, N.
pseudoamphioxys, N. pseudoamphyoxys, N. pseudoatomus, N. pseudobacata, N. pseudocapitata, N.
pseudocarinata, N. pseudocommunis, N. pseudocylindrica, N.
pseudodelicatissima, N.
pseudofonticola, N. pseudohungarica, N. pseudohybrida, N. pseudonana, N.
pseudoseriata, N. pseudosigma, N. pseudosinuata, N. pseudostagnorum, N. pubens, N.
pulcherrima, N.
pumila, N. punctata (comprenant toutes ces variétés), N. pun gens (comprenant toutes ces variétés), N. pungiformis, N. pura, N. puriformis, N. pusilla (comprenant toutes ces variétés),
8 N. putrida, N. quadrangula, N. quickiana, N. rabenhorstii, N. radicula (comprenant toutes ces variétés), N. rautenbachiae, N. recta (comprenant toutes ces variétés), N.
rectiformis, N.
rectilonga, N. rectirobusta, N. rectissima, N. regula, N. reimeri, N.
reimerii, N. reimersenii, N.
retusa, N. reversa, N. rhombica, N. rhombiformis, N. rhopalodioides, N.
richterae, N. rigida (comprenant toutes ces variétés), N. ritscheri, N. robusta, N. rochensis, N.
rolandii, N.
romana, N. romanoides, N. romanowiana, N. rorida, N. rosenstockii, N.
rostellata, N. rostrata, N. ruda, N. rugosa, N. rupestris, N. rusingae, N. ruttneri, N. salinarum, N.
salinicola, N.
salpaespinosae, N. salvadoriana, N. sansimoni, N. sarcophagum, N. scabra, N.
scalaris, N.
scaligera, N. scalpelliformis, N. schoenfeldii, N. schwabei, N. schweikertii, N. scutellum, N.
sellingii, N. semicostata, N. semirobusta, N. separanda, N. seriata (comprenant toutes ces variétés), N. serpenticola, N. serpentiraphe, N. serrata, N. sibula (comprenant toutes ces variétés), N. sigma (comprenant toutes ces variétés), N. sigma formis, N.
sigmatella, N.
sigmoidea (comprenant toutes ces variétés), N. silica, N. silicula (comprenant toutes ces variétés), N. siliqua, N. similis, N. simplex, N. simpliciformis, N. sinensis, N. sinuata (comprenant toutes ces variétés), N. smithii, N. sociabilis, N. socialis (comprenant toutes ces variétés), N. solgensis, N. solida, N. solita, N. soratensis, N. sp., N.
spathulata (comprenant toutes ces variétés), N. speciosa, N. spectabilis (comprenant toutes ces variétés), N.
sphaerophora, N. spiculoides, N. spiculum, N. spinarum, N. spinifera, N.
stagnorum, N.
steenbergensis, N. stellata, N. steynii, N. stimulus, N. stoliczkiana, N.
stompsii (comprenant toutes ces variétés), N. strelnikovae, N. stricta, N. strigillata, N.
striolata, N.
subaccommodata, N. subacicularis, N. subacuta, N. subamphioxioides, N.
subapiculata, N.
subbacata, N. subcapitata, N. subcapitellata, N. subcohaerens (comprenant toutes ces variétés), N. subcommunis, N. subconstricta, N. subcurvata, N. subdenticula, N. subfalcata, N. subfraudulenta, N. subfrequens, N. subfrustulum, N. subgraciloides, N.
subinflata, N.
subinvicta, N. sublaevis, N. sublanceolata, N. sublica, N. sublinearis, N.
sublongirostris, N.
submarina, N. submediocris, N. subodiosa, N. subpacifica, N. subpunctata, N.
subromana, N. subrostrata, N. subrostratoides, N. subrostroides, N. subsalsa, N.
subtilioides, N. subtilis (comprenant toutes ces variétés), N. subtubicola, N. subvitrea, N.
suchlandtii, N. sulcata, N.
sundaensis, N. supralitorea, N. tabellaria, N. taenia, N. taeniiformis, N. tan tata, N. tarda, N.
taylorii, N. temperei, N. tenella, N. tenerifa, N. tenuiarcuata, N.
tenuirostris, N. tenuis (comprenant toutes ces variétés), N. tenuissima, N. tergestina, N. terrestris, N. terricola, N.
thermalis (comprenant toutes ces variétés), N. thermaloides, N. tibetana, N.
tirstrupensis, N.
tonoensis, N. towutensis, N. translucida, N. tropica, N. ttyblionella (comprenant toutes ces variétés), N. tsarenkoi, N. tubicola, N. tumida, N. turgidula, N.
turgiduloides, N. umaoiensis, N. umbilicata, N. umbonata, N. vacillata, N. vacua, N. valdecostata, N.
valdestriata, N.
valens, N. valga, N. valida (comprenant toutes ces variétés), N. vanheurckii, N. vanoyei, N.
vasta, N. ventricosa, N. vermicularioides, N. vermicularis (comprenant toutes ces variétés),
9 PCT/EP2018/082318 N. vermicularoides, N. vexans, N. victoriae, N. vidovichii, N. vildaryana, N.
villarealii, N.
virgata, N. visurgis, N. vitrea (comprenant toutes ces variétés), N. vivax (comprenant toutes ces variétés), N. vixnegligenda, N. vonhauseniae, N. vulga, N. weaveri, N.
weissflogii, N.
westii, N. williamsiii, N. wipplingeri, N. witkowskii, N. wodensis, N.
woltereckii, N.
woltereckoides, N. wuellerstorfii, N. wunsamiae, N. yunchengensis, N. zebuana, N.
zululandica.
Avantageusement selon l'invention, les algues du genre Nitzschia pourront être des algues choisies parmi les espèces N. sp.
Lorsque les microalgues sont du genre Haematococcus, elles pourront être choisies parmi les espèces H. allmanii, H. buetschlii, H. capensis, H. carocellus, H.
droebakensis, H. grevilei, H. insignis, H. lacustris, H. murorum, H. pluvialis, H. salin us, H, sanguineis, H.
thermalis, H. zimbabwiensis.
Lorsque les microalgues sont du genre Aura ntiochytrium , elles pourront être choisies parmi les espèces: A. limacinum, A. mangrovei Lorsque les microalgues sont du genre Schizochytrium , elles pourront être choisies parmi les espèces: S. aggregatum, S. limacinum, S. mangrovei, S. minutum, S.
octosporum.
Lorsque les microalgues sont du genre Ctypthecodinium , elles pourront être choisies parmi les espèces: C. cohnii, C. setense.
Lorsque les microalgues sont du genre Tetraselmis , elles pourront être choisies parmi les espèces: T. alacris, T. apiculata, T. amoldii, T. ascus, T.
astigmatica, T. bichlora, T.
bilobata, T. bolosiana, T. chui, T. contracta, T. con volutae, T. cordiformis, T. desikacharyi, T.
elliptica, T. fontiana, T. gracilis, T. hazenii, T. helgolandica, T.
impellucida, T. incisa, T.
inconspicua, T. indica, T. levis, T. maculata, T. marina, T. mediterranea, T.
micropapillata, T.
rubens, T. stria ta, T. subcordiformis, T. suecica, T. tetrabrachia, T.
tetrathele, T. verrucosa, T. viridis, T. wettsteinii.
Selon un mode particulier de réalisation de l'invention, les protistes sont choisis parmi celles des genres Chlorella, Galdieria, Euglena, cyanobacteria et diatomées.
Les méthodes de cultures de microorganismes sont également bien connues de l'homme du métier, qu'elles soient en mode auxotrophe, hétérotrophe ou mixotrophe (références). Les milieux de cultures employés pour ces différents modes de culture adaptés aux différents microorganismes précités sont également bien connus de l'homme du métier (référence).
L'invention est particulièrement adaptée pour des cultures dites de longues durées (de plusieurs jours à plusieurs mois), sujettes au phénomène d'adhésion des microorganismes aux parois des réacteurs dans lesquels ils sont cultivés.
Les réacteurs employés pour ces différents modes de culture sont également connus de l'homme du métier, tels que dans les colonnes à bulles, les airlifts (Lesson: Industrial Applications of Microbes, Dr. Parvinder Kaur, page 11-12), les fermenteurs (Tryton Tm), les photobioréacteurs tubulaires (Schott, Synoxis Algae) les raceways et les bioréacteurs.
Les parois des bioréacteurs sont en matériaux connus de l'homme du métier, notamment en plastique flexible, en acier inoxydable, en béton ou en brique.
5 L'invention est particulièrement adaptée aux cultures réalisées dans des réacteurs comprenant au moins une paroi transparente pour laisser passer la lumière, qu'il s'agisse de lumière naturelle ou de lumière artificielle, en mode autotrophe ou en mode mixotrophe.
Les parois transparentes à la lumière, bien connues de l'homme du métier, peuvent être en verre, en borosilicate, en plastique de type polyméthacrylate de méthyle (PMMA),
10 polychlorure de vinyle (PVC), polyéthylène (PE) en particulier polyéthylène basse densité
(PE-LD), polycarbonate, polystyrène (PS). De manière avantageuse, les parois transparentes sont en PMMA, en PVC, en PE ou en polycarbonate.
L'invention est en particulier adaptée pour des réacteurs à parois transparentes de type colonnes à bulles en mode autotrophe pour la culture de microalgues, comme des puits à
carbone. Ces puits à carbone sont des colonnes à bulles ou air lifts pour faire croitre des microalgues en mode auxotrophe et dans lequel on fait passer l'air ambiant dont le dioxyde de carbone est absorbé par les microorganismes comme source de carbone. En se multipliant elles dépolluent l'atmosphère en absorbant du dioxyde de carbone.
De tels systèmes sont notamment décrits dans WO 2014/063229 ou WO 2017/077061.
Pour se diviser la microalgue a besoin de lumière. La disponibilité en lumière dans le milieu est indispensable au développement des microalgues. Or, l'adhésion sur les parois du réacteur diminue la lumière disponible et les capacités de croissance, et donc d'absorption du carbone des microalgues.
Le puits de carbone correspond à une colonne de volume variable contenant des microalgues qui vont pouvoir capter entre 1 et 10000 tonnes de CO2 par an.
Dans certains cas, la lumière ne provient pas de l'extérieur du bioréacteur par des parois transparentes, mais la lumière est apportée à l'intérieur du bioréacteur en plongeant des sources de lumières étanches dans la cuve. Par exemple, un système de contre-pâles lumineuses peut être utilisé (W02014/174182). L'invention permet alors de réduire l'adhérence des cellules sur la source de lumière.
En limitant l'adhésion, on augmente la disponibilité en lumière dans le bioréacteur. Par conséquent les microalgues maintiennent leurs capacités de croissance et on réduit les coûts de nettoyage des colonnes.
Les microalgues employées dans ces puits de carbone sont généralement choisis parmi les microalgues chlorophylliennes ou non mais aussi d'autre microorganisme ayant généralement des membranes externes négatives. Ces microorganismes ayant généralement des membranes externes négatives et susceptibles d'être employés dans des
11 puits de carbone sont bien connus de l'homme du métier, en particulier parmi celles des genres Chlorella, Galdieria, Euglena, cyanobacteria et diatomées.
Le milieu de culture employé comprend le BG-11 growth media , décrit et commercialisé par UTEX (UTEX Culture Collection of Algae, 205 W. 24th St, Biological Labs 218, The University of Texas at Austin (F0402), Austin, TX 78712 USA). Pour une culture autotrophe, le milieu de culture ne comprend pas de source de carbone autre que le dioxyde de carbone contenu dans l'air qui passe dans le milieu de culture. Toutefois, pour amorcer la croissance des microalgues ou la relancer, on peut temporairement ajouter une source de carbone autre que le dioxyde de carbone, comme du glucose.
Le débit en air ambiant dans le milieu de culture correspond à un débit allant de 0,3 à
0,5 vvm. L'air extérieur contenant du CO2 passe à travers un bulleur pour être injecté dans la colonne. L'air injecté peut également provenir de fumée d'usine (par exemple des usines d'incinération) qui contiennent entre 1 et 20% de CO2.
Lorsque la quantité de biomasse maximum est atteinte, le puits de carbone est vidangé. Enfin, le puits est de nouveau rempli avec du milieu pour être inoculé avec des microalgues.
Les agents floculants sont bien connus de l'homme du métier. Ils sont généralement employés à la fin de la culture des microorganismes, ajoutés au mout de fermentation lorsque la culture est terminée pour faciliter la séparation de la biomasse du milieu de culture (Hanotu J. & al., 2012). Ces ajouts une fois la culture terminée ne sont généralement pas préjudiciable à l'usage des microalgues récupérées, par exemple pour des aliments destinés à l'aquaculture (US 2013/205850).
Ces agents floculants sont organiques ou inorganiques, tels que le chitosane, les arboxyméthylcelluloses, des amidons ou dérivés d'amidons comme l'amidon de riz, l'amidon de maïs, l'amidon de tapioca, la dextrine jaune, l'amidon de pomme de terre, l'amidon prégélatinisé ou l'amidon cationique pour les floculants organiques, ou le sulfate d'aluminium, le chlorure de calcium, chlorure de zinc ou chlorure de fer pour les floculants inorganiques.
Contrairement aux usages de l'état de la technique, l'utilisation des agents floculants selon l'invention se fait pendant la culture, dans le milieu de culture, non pas pour favoriser la séparation de la biomasse du milieu de culture, mais pour favoriser le maintien de cette biomasse dans le milieu de culture en prévenant son adhésion sur les parois des réacteurs.
Les agents floculants selon l'invention doivent pourvoir être employés sans affecter les capacités de croissance et l'activité biologique des microorganismes cultivés.
En effet les tests de viabilités ont révélé que les agents floculants et le chlorure de fer en particulier ne perturbent pas la croissance des microalgues. (Figures 1, 2 et 3) L'homme du métier saura sélectionner par de simples essais de laboratoire les agents
12 floculants les mieux adaptés aux microorganismes cultivés et à leurs conditions de culture.
De manière préférée, les agents floculants employés dans le milieu de culture selon l'invention sont choisis parmi le chlorure de zinc et le chlorure de fer, plus préférentiellement le chlorure de fer. Ces agents floculants sont disponibles sur le marché, notamment sous les noms iron(III) chloride, chlorure de fer(III), chlorure ferrique, perchlorure de fer chez des fournisseurs comme VWR et Sigma.
L'homme du métier saura déterminer par de simples essais de laboratoire la quantité
appropriée d'agent floculant nécessaire pour prévenir l'adhésion des microorganismes aux parois.
L'homme du métier saura déterminer la quantité de floculant à ajouter, en particulier pour obtenir une efficacité de floculation (pourcentage de biomasse sédimenté
par rapport à
la biomasse totale) d'au moins 10%, de manière avantageuse d'au moins 30%. En effet, l'efficacité de floculation change en fonction du floculant pour une même concentration. La composition de milieu de culture et la souche de microorganisme utilisée peut également avoir un impact sur l'efficacité de floculation. Ces ajustements font partie des travaux de mise au point de routine connus de l'homme du métier.
De manière avantageuse, la quantité d'agent floculant dans le milieu de culture va de 50 à 450 mg/L, plus particulièrement de 150 à 350 mg/L.
L'ajout d'agent floculants dans le milieu de culture peut conduire à la formation d'agrégats cellulaires en suspension. De manière à prévenir ou limiter cette formation d'agrégats, la culture sera faite dans des conditions usuelles d'agitation, comme une agitation mécanique ou bien passive telle que dans une colonne à bulle ou un réacteur air lift .
L'ajout d'agent floculant dans le milieu de culture peut être fait à tout moment pendant la culture de manière à prévenir ou limiter la formation d'adhésion sur les parois du réacteur.
De manière préférentielle, l'agent floculant est ajouté dans le milieu de culture dès le début du procédé de culture et maintenu dans ce milieu de culture jusqu'à la fin de la culture.
L'invention concerne également un milieu de culture approprié pour la culture de microorganismes, caractérisé en ce qu'il comprend de 50 à 450 mg/L, plus particulièrement de 150 à 350 mg/L d'agent floculant tel que défini précédemment, en particulier de chlorure de fer.
EXEMPLES
On effectue deux cultures de microalgues, un témoin sans agent floculent et une avec l'agent floculant FeCl3.
Matériels et Méthodes Microalgues
13 Les microalgues employées dans cet exemple viennent de l'espèce Chlorella soroki nia na.
Milieu de culture Un milieu de type BG-11 growth media (UTEX) a été utilisé.
Conditions de culture Les colonnes ont été inoculé à 0.5 g/L de microalgue. La température est restée constante à 30 C. La luminosité a été fixé à 500 pEinstein/m2/s. Le pH est stabilisé à 6.3 jusqu'à 160 heures (témoin) 189 heures (Fec13) puis n'est plus régulé, le pH
va monter à 8 pour se stabiliser à ce niveau jusqu'à la fin de l'expérience. Il a été choisi de ne plus réguler le pH car un pH élevé permet d'augmenter les capacités de collage des microalgues aux parois.
Récupération de la biomasse La biomasse est récupérée avec une pompe, on obtient la biomasse en suspension ainsi que celle resté au fond de la colonne. Ensuite on ajoute un volume d'eau à la colonne afin de décoller les microalgues restées sur les parois. Une mesure de masse sèche est effectuée sur chacun des lots.
Passage de la lumière L'analyse de la capacité de passage de la lumière à travers la colonne est mesurée sur 24 points disposés sur la paroi de la colonne comme représentés sur la Figure 5. Ces mesures exprimées en pEinstein/m2/s.
Résultats La Figure 4 permet montre la différence de production de biomasse avec et sans agent floculant. Pour l'expérience effectuée avec le floculant, on note que jusqu'à
1 g/L de biomasse supplémentaire dans le milieu de culture comparé à la même culture sans agent floculant. Cette biomasse supplémentaire est due aux non-collages des microalgues sur la paroi.
En fin d'expérience on fait la distinction entre la biomasse dans le milieu de culture et celle collée sur les parois.
Dans le cadre de l'expérience sans FeCl3, la biomasse totale en suspension dans le milieu représente 14,7 g et la biomasse restée au fond de la colonne s'élevé à
5,6 g. La biomasse collée aux parois est de 1,013 g ce qui représente 4.74 % de la biomasse totale.
Dans le cadre de l'expérience avec FeCl3, la biomasse totale en suspension dans le milieu représente 18 g et la biomasse restée au fond de la colonne s'élevé à
1,11 g. La biomasse collée aux parois est de 0,043 g ce qui représente 0.22 % de la biomasse totale.
On constate une plus grande quantité de biomasse en suspension avec l'utilisation du FeCl3 ou 94% de la biomasse en suspension contre 69% dans le témoin.
14 Tableau 1 Proportion de MS dans les 3 zones de la colonne Témoin Témoin FeCl3 FeCl3 (g) % Biomasse (g) % Biomasse MS Milieu 14,700 68,769 18,050 94,17 MS au fond 5,663 26,492 1,075 5,61 MS paroi 1,013 4,739 0,043 0,22 Total 21,376 100,000 19,168 100,00 Les résultats de l'analyse du passage de la lumière à travers les parois de la colonne sont donnés dans le Tableau 2 ci-dessous.
Les mesures de la lumière ont été effectué sur 24 points comme présenté sur la représentation schématique de la colonne en Figure 5. La lumière a été mesuré
sur une colonne propre sans microalgues, sur une colonne témoin avec microalgue et une colonne contenant du FeCl3 avec des microalgues.
Tableau 2: Mesure de 24 points sur la colonne mol par mol par mol par point Différence Différence Point point point colonne FeCl3 %
Témoin %
Témoin FeCl3 propre A 120 214 295 -27,46 -59,32 B 125 252 314 -19,75 -60,19 C 236 232 289 -19,72 -18,34 D 200 198 228 -13,16 -12,28 E 13 204 287 -28,92 -95,47 F 109 263 298 -11,74 -63,42 G 189 248 274 -9,49 -31,02 H 128 192 225 -14,67 -43,11 I 143 233 307 -24,10 -53,42 J 213 254 317 -19,87 -32,81 K 223 236 270 -12,59 -17,41 L 191 189 225 -16,00 -15,11 M 143 244 302 -19,21 -52,65 N 200 256 297 -13,80 -32,66 0 204 233 262 -11,07 -22,14 P 175 190 212 -10,38 -17,45 Q 156 246 291 -15,46 -46,39 R 199 257 299 -14,05 -33,44 S 198 235 268 -12,31 -26,12 T 175 186 223 -16,59 -21,52 U 123 196 293 -33,11 -58,02 V 199 242 302 -19,87 -34,11 W 222 226 280 -19,29 -20,71 X 193 185 228 -18,86 -15,35 Moyenne -17,56 -36,77 Sur les 12 points qui constituent la partie inférieure de la colonne, la pénétration de la lumière est 2.78 fois plus importante avec la présence de FeCl3.
Tableau 3: Mesure des 12 points de la moitié inférieure de la colonne Point mol par point Témoin mol par point FeCl3 FeCl3/Témoin A 120 214 1,78 B 125 252 2,02 E 13 204 15,69 F 109 263 2,41 I 143 233 1,63 J 213 254 1,19 M 143 244 1,71 Moyenne 3,78 L'ensemble des résultats montre une amélioration des cultures de microorganismes dues à la présence d'un agent floculant dans le milieu de culture, due à la prévention de l'adhésion des microorganismes sur les parois des réacteurs.
Des résultats similaires seront obtenus avec d'autres microorganismes dans d'autres 10 conditions de culture en mode hétérotrophe ou mixotrophe, en particulier dans le cas de cultures de longues durées, en particulier pour la culture de Chlorelle, Galdieria, Euglena, cyanobacteria, diatomées.

RÉFÉRENCES
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Claims (14)

REVENDICATIONS
1. Procédé de culture de microorganismes dans un milieu de culture approprié pour leur croissance, caractérisé en ce que le milieu de culture comprend une quantité appropriée d'un agent floculant pour prévenir l'adhésion des microorganismes sur les parois des réacteurs dans lesquels la culture est réalisée.
2. Procédé selon la revendication 1, caractérisés en ce que l'agent floculant est choisi parmi le chlorure de fer ou le chlorure de zinc.
3. Procédé selon l'une des revendication 1 ou 2, caractérisé en ce que le milieu de culture comprend de 50 à 450 mg/L d'agent floculant.
4. Procédé selon l'une des revendications 1 à 3, caractérisé en ce que l'agent floculant est ajouté au milieu de culture en début de culture et maintenu jusqu'à la fin de la culture.
5. Procédé selon l'une des revendications 1 à 4, caractérisé en ce que le réacteur est un puits de carbone.
6. Procédé selon l'une des revendications 1 à 5, caractérisé en ce que la culture est réalisée en mode autotrophe ou en mode mixotrophe et le réacteur comprend au moins une paroi transparente à la lumière.
7. Procédé selon la revendication 6, caractérisé en ce que la paroi transparente à la lumière est polyméthacrylate de méthyle (PMMA), en polychlorure de vinyle (PVC), polyéthylène (PE) ou en polycarbonate.
8. Procédé selon l'une des revendications 1 à 7, caractérisé en ce que les microorganismes sont choisis parmi les protistes.
9. Procédé selon la revendication 6, caractérisé en ce que les microorganismes sont des microalgues choisies parmi microalgues chlorophylliennes.
10. Utilisation d'un agent floculant dans le milieu de culture pendant la culture des microorganismes pour prévenir l'adhésion des microorganismes sur les parois des réacteurs dans lesquels la culture est réalisée.
11. Utilisation selon la revendication 10, caractérisé en ce que l'agent floculant est choisi parmi le chlorure de fer ou le chlorure de zinc.
12. Utilisation selon l'une des revendications 10 ou 11, caractérisée en ce que les microorganismes sont choisis parmi les protistes
13. Utilisation selon la revendication 12, caractérisée en ce que les microorganismes sont des microalgues choisies parmi microalgues chlorophylliennes.
14. Milieu de culture approprié pour la culture de microorganismes, caractérisé en ce qu'il comprend de 50 à 450 mg/L d'agent floculant choisi parmi le chlorure de fer ou le chlorure de zinc.
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