BRPI0808732A2 - Conjugados complemento - peptídeo - Google Patents

Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para "CONJUGADOS COMPLEMENTO - PEPTÍDEO".

Antecedentes da Invenção

A infecção de células pelo vírus HIV é efetuada através de um processo, no qual a membrana das células a serem infectadas e a membrana viral são fundidas. Um esquema geral para este processo é proposto. O complexo de glicoproteína envelope viral (gp120/gp41) interage com um receptor de superfície de célula localizado sobre a membrana da célula a ser infectada A ligação de gp120 a, por exemplo, o receptor CD4 em combinação com um correceptor tal como CCR-5 ou CXCR-4, causa uma mudança na conformação do complexo gp120/gp41. Em conseqüência desta mudança conformacional a proteína gp41 é capaz de inserir na membrana da célula-alvo. Esta inserção é o início do processo de fusão de membranas.

É conhecido que a seqüência de aminoácidos da proteína gp41 difere entre as diferentes linhagens de HIV devido a polimorfismos ocorrendo naturalmente. Mas a mesma arquitetura de domínio pode ser reconhecida, precisamente, um sinal de fusão, dois domínios de repetição heptavalente (HR1, HR2) e um domínio de transmembrana (em direção de terminal Npara C). É sugerido que o domínio de fusão (ou fusogênico) seja participante na inserção em, e desintegração da, membrana de célula. As regiões HR são desenvolvidas por múltiplos estiramentos cada um compreendendo 7 aminoácidos ("heptavalente") (vide, por exemplo, Shu, W., et al., Biochemistry 38 (5378-5385). Além de heptavalentes um ou mais motivos similares a zíper Ieucina estão presentes. Esta composição responde pela formação de uma estrutura espiralada da proteína gp41 e justo também de peptídeo derivado destes domínios. Espirais espiraladas são em geral oligômeros consistindo em duas ou mais hélices interagindo.

Peptídeos com seqüências de aminoácidos deduzidas do domínio HR1 ou HR2 de gp41 são efetivos inibidores in vivo e in vitro de tomada de HIV em células (por exemplo, peptídeos, vide US 5.464.933, US 5.656.480, US 6.258.782, US 6.348.568, ou US 6.656.906). Por exemplo, T20 (também conhecido como DP178, Fuzeon®, um peptídeo HR2) e T651 (US 6.479.055) são inibidores muito potentes de infecção de HIV. Foi tentado o aperfeiçoamento de eficácia de peptídeos derivados de HR2, com, por exemplo, substituições de aminoácidos ou reticulação química (Sai, S.K., et al., Proc. Natl. Acad. Sei. USA 99 (2002) 14664-14669; Otaka, A., et al„ An5 gew. Chem. Int. Ed. 41 (2002) 2937-2940).

A imunidade inata de seres humanos compreende o caminho de complemento. Este caminho é ativado pela ligação de C1q, a subunidade de reconhecimento do fator de complemento C1, a um alvo imunológico. A inteira molécula C1q é uma molécula heteromérica compreendendo seis cópias 10 de cada um dos três blocos monoméricos de construção, que são representados como C1qA, C1qB, e C1qC. Cada uma das unidades monoméricas compreende uma região terminal-N (de 3 a 9 resíduos), um domínio similar a colágeno (estendendo-se aproximadamente por 81 resíduos), e um domínio globular (cabeça globular; estendendo-se por aproximadamente 135 resí15 duos) (Sellar, G.C. et al., Biochem. J. 274 (1991) 481-490).

Moir et al., reportam a infecção de HIV em células B via a ativação do caminho de complemento (Moir, S., et al., J. Exp. Méd. 192 (2000) 637-646). A ativação de caminho de complemento humano está emergindo de uma ligação da região imunodominante de gp41 (posição 590-620 de 20 gp160; numeração de acordo com Ratner, L., et al., Nature 313 (1985) 277- 284) com fator complemento C1q (Ebenbichler, C.F., J. Exp. Méd. 174 (1991) 1417-1424). Thielens et al. reportaram que o subcomponente C1q de C1 humano e a glicoproteína envelope de transmembrana gp41 de HIV-1 interagem na região de posições de aminoácidos 590-613 de gp160. Esta 25 interação pode ser inibida por um peptídeo compreendendo os aminoácidos 601-613 de gp160 com uma ligação de dissulfeto ligando Cys 605 e Cys 611 (Thielens, N.M., etal., J. Immunol. 151 (1993) 6583-6592).

Sumário da Invenção

A presente invenção compreende um conjugado polipeptídeo compreendendo um primeiro polipeptídeo selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0; 01 e fragmentos dos mesmos, e um segundo polipeptídeo selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos. Em uma concretização, o conjugado de acordo com a invenção compreende os primeiro e segundo polipeptídeos em uma ordem selecionada do seguinte grupo de ordens:

término-N - primeiro polipeptídeo - segundo polipeptídeo - tér

mino-C,

término-N - segundo polipeptídeo - primeiro polipeptídeo - tér

mino-C.

Em uma outra concretização, o conjugado de acordo com a invenção compreende entre os primeiro e segundo polipeptídeos, um polipep10 tídeo ligante.

A invenção ainda reporta um conjugado de polipeptídeo compreendendo

a) um primeiro polipeptídeo (1 st pp) selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 01 e fragmentos dos mesmos, 15 b) um segundo polipeptídeo (2nd pp) selecionado do grupo de

peptídeos antifusogênicos,

c) um opcional terceiro polipeptídeo (3rd pp) selecionado do grupo de cadeias de anticorpo anti-CCR5 de ligação de antígeno, cadeias de anticorpo anti-DC4 de ligação de antígeno, cadeias de anticorpo anti-HIV-1

neutralizantes, e fragmentos dos mesmos,

d) um opcional polipeptídeo ligante (link pp) ligando os ditos primeiro, segundo e/ou terceiro polipeptídeos.

Neste conjugado de polipeptídeos, os polipeptídeos constituintes têm uma ordem de terminal N para C de 25 [1 st pp]a - [link pp]m - [2nd pp]b - [link pp]n - [3rd pp]c - [link pp]0 [1 st pp]d - [link pp]p - [2nd pp]e - [link pp]q - [3rd pp]f - [link pp]r [1 st pp]g,

em que a, b, c, d, e, f, g, m, n, o, p, q, r são todos um inteiro de 0 ou 1, e com a + d + g = 1,

b + e = 1,

c + f = 0 ou 1,

m, n, o, p, q, r são independentemente uns dos outros tanto 0 ou 1. Um valor de 0 representa a ausência do correspondente polipeptídeo na correspondente posição, e um valor de 1 representa a presença do correspondente polipeptídeo na correspondente posição no conjugado de polipeptídeos.

Em uma concretização o terceiro polipeptídeo opcional é sele

cionado do grupo de cadeias de anticorpo anti-CCR5 de ligação de antígeno e fragmentos dos mesmos.

Em uma outra concretização o terceiro polipeptídeo opcional é selecionado de cadeias de anticorpo anti-CD4 de ligação de antígeno e 10 fragmentos dos mesmos.

Em uma outra concretização, o terceiro polipeptídeo opcional é selecionado de cadeias de anticorpo anti-HIV-1 de ligação de antígeno e fragmentos dos mesmos.

Em uma concretização o polipeptídeo ligante é selecionado do 15 grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 20 a SEQ ID N0: 48.

Em uma outra concretização o segundo polipeptídeo é selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos compreendendo da SEQ ID N0:

08 a SEQ ID N0: 19.

Outros aspectos da presente invenção são um ácido nucleico codificando um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção e uma célula eucariótica compreendendo o ácido nucleico de acordo com a invenção.

A invenção ainda compreende um processo para a produção de um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção compreendendo as seguintes etapas:

a) cultura de uma célula compreendendo um ácido nucleico codificando um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção sob condições apropriadas para a expressão do conjugado de polipeptídeos, e

b) recuperação de conjugado de polipeptídeos a partir da célula 30 ou do meio de cultura.

A invenção também compreende uma composição farmacêutica, contendo um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção ou um seu sal farmaceuticamente aceitável junto com um excipiente ou veículo farmaceuticamente aceitável.

É também abrangido pela presente invenção o uso de um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção para a fabricação de um 5 medicamento para o tratamento de infecções virais, preferivelmente de uma infecção de HIV.

Descrição Detalhada da Invenção

A presente invenção compreende um conjugado de polipeptídeos compreendendo um primeiro polipeptídeo selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 01 e fragmentos dos mesmos, e um segundo polipeptídeo selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos. A invenção ainda compreende um conjugado de polipeptídeos compreendendo um primeiro polipeptídeo (1st pp) selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 01 e fragmentos dos mesmos, e um segundo polipeptídeo (2nd pp) selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos, e um terceiro polipeptídeo opcional (3rd pp) selecionado do grupo compreendendo fragmentos de ligação de antígeno de anticorpos antiCCR5, fragmentos neutralizantes de anticorpos anti-HIV-1, e fragmentos de ligação de antígeno de anticorpos anti-CD4, e um opcional polipeptídeo Iigante (link pp) conectando os ditos primeiro, segundo, e/ou terceiro polipeptídeos, pelo que neste conjugado de polipeptídeos os polipeptídeos individuais têm uma ordem terminal N para C de

[1 st pp]a - [link pp]m - [2nd pp]b - [link pp]n - [3rd pp]c - [link pp]0 [1 st pp]d - [link pp]p - [2nd pp]e - [link pp]q - [3rd pp]f - [link pp]r [1 stpp]g

em que a, b, c, d, e, f, g, m, n, o, p, q, r são todos um inteiro de 0 a 1, e com a condição de que a + d + g = 1, b + e= 1,

c + f = 0 ou 1,

m, n, o, p, q, rsão independentemente um do outro 0 ou 1,

em que um valor de 0 representa a ausência do correspondente polipeptídeo na correspondente posição, e um valor de 1 representa a presença do correspondente polipeptídeo na correspondente posição no conjugado de polipeptídeos.

Métodos e técnicas úteis para concretização da presente invenção são conhecidos por aqueles versados na técnica e são descritos, por exemplo, em Thielens, N.M., et al., J. Immunol. 151 (1993) 6583-6592; Ausubel, F.M., ed., Current Protocols in Molecular Biology, Volumes I to Ill (1997), e Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989). Como conhecido por aqueles versados na técnica o uso de tecnologia de AND recombinante permite a produção de numerosos derivados de um ácido nucleico e/ou polipeptídeo. Tais derivados podem, por exemplo, ser modificados em uma ou várias posições através de substituição, alteração, troca, supressão, ou inserção. A modificação ou derivação pode, por exemplo, ser realizada por meio de mutagênese direcionada de sítio. Tais modificações podem ser facilmente realizadas por aqueles versados na técnica (vide, por exemplo, Sambrook, J., et al., Molecular Cloning; A Iaboratory manual (1999) Cold Spring Harboro Laboratory Press, New York, USA). O uso de tecnologia recombinante permite aqueles versados na técnica transformar várias células hospedeiras com um ou mais ácidos nucleicos heterologos. Embora a transcrição e tradução, isto é, expressão, maquinário de diferentes células usam os mesmos elementos, células pertencendo a diferentes espécies podem ter entre outras coisas uma diferente assim chamada utilização de códon. Pelo que polipeptídeos idênticos (com relação a sequência de aminoácidos) podem ser codificados por diferentes ácidos nucleicos. Também, devido à degenerescência do código genético, diferentes ácidos nucleicos podem codificar o mesmo polipeptídeo.

Um "ácido nucleico" como aqui usado, refere-se a uma molécula de polinucleotídeo consistindo em nucleotídeos individuais, por exemplo, para DNA, RNA, ou modificações dos mesmos. Esta molécula de polinucleotídeo pode ser uma molécula de polinucleotídeo ocorrendo naturalmente ou uma molécula de polinucleotídeo sintética ou uma combinação de uma ou mais moléculas de polinucleotídeo ocorrendo naturalmente com uma ou mais moléculas de polinucleotídeos sintéticas. Também abrangidas por esta definição são moléculas de polinucleotídeos ocorrendo naturalmente nas quais um ou mais nucleotídeos são alterados, por exemplo, através de mutagênese, suprimidos, ou adicionados. Um ácido nucleico pode ser isolado, ou integrado em um outro ácido nucleico, por exemplo, em um cassete de expressão, um plasmídeo, ou o genoma de uma célula hospedeira. Um ácido nucleico é caracterizado por sua seqüência de ácidos nucleicos consistindo em nucleotídeos individuais. Para aqueles versados na técnica procedimentos e processos são bem-conhecidos para conversão de uma seqüência de aminoácidos de, por exemplo, um polipeptídeo e uma correspondente seqüência de ácidos nucleicos codificando esta seqüência de aminoácidos. Por isso, um ácido nucleico é caracterizado por sua seqüência de ácidos nucleicos consistindo em nucleotídeos individuais e da mesma maneira pela seqüência de aminoácidos de um polipeptídeo codificado pela mesma.

Um "ácido nucleico" como aqui usado, refere-se a um ácido nucleico ocorrendo parcial ou inteiramente não-naturalmente ou ocorrendo naturalmente codificando um polipeptídeo que pode ser produzido recombinantemente. O ácido nucleico pode ser constituído por fragmentos de DNA que 20 são isolados ou sintetizados por meios químicos. O ácido nucleico pode ser integrado em um outro ácido nucleico, por exemplo, em um plasmídeo de expressão ou o genoma/cromossoma de uma célula hospedeira eucariótica. Plasmídeo inclui plasmídeos de expressão e lançador. Tipicamente, o plasmídeo também compreenderá uma unidade de propagação procariótica 25 compreendendo uma origem de replicação (por exemplo, a origem CoIEI de replicação) e um marcador selecionável (por exemplo, gene de resistência à ampicilina ou tetraciclina), para replicação e seleção, respectivamente, do plasmídeo em procariotes.

Um "cassete de expressão" refere-se a um ácido nucleico que contém os elementos necessários para expressão e secreção de pelo menos p gene estrutural contido em uma célula.

Um "gene" representa um segmento, por exemplo, sobre um cromossoma ou sobre um plasmídeo que é necessário para a expressão de um peptídeo, polipeptídeo, ou proteína. Além de região codificante o gene compreende outros elementos funcionais incluindo um promotor, íntrons, e terminadores.

5 Um "gene estrutural" representa a região codificante de um gene

sem uma seqüência de sinal.

Um "marcador selecionável" é um gene que permite células transportando o gene serem especificamente selecionadas para ou contra, na presença de um correspondente "agente de seleção". Um marcador sele10 cionável positivo útil é um gene de resistência a antibiótico. Este marcador selecionável permite a célula hospedeira transformada com o gene ser positivamente selecionada na presença do correspondente antibiótico, por exemplo, agente de seleção; uma célula hospedeira não-transformada não será capaz de crescer ou sobreviver sob as condições de cultura seletiva na 15 presença do agente de seleção. Marcadores selecionáveis podem ser positivos, negativos, ou bifuncionais. Marcadores selecionáveis positivos permitem seleção de células veiculando o marcador, enquanto marcadores selecionáveis negativos permitem células transportando o marcador serem seletivamente eliminadas. Tipicamente, um marcador selecionável conferirá re20 sistência a um fármaco ou compensará um defeito metabólico ou catabólico na célula hospedeira. Marcadores selecionáveis úteis com células eucarióticas incluem, por exemplo, os genes para aminoglicosídeo fosfotransferase (APH), tal como a higromicina fosfotransferase (hyg), neomicina e G418 APH, di-hidrofolato redutase (DHFR), timidina cinase (tk), glutamina sinteta25 se (GS), asparagina sintetase, triptofano sintetase (indol), histidinol desidrogenase (histidinol D), e genes provendo resistência a puromicina, bleomicina, fleomicina, cloranfenicol, zeocina, e ácido micofenólico. Ainda genes marcadores selecionáveis são descritos no WO 92/08796 e WO 94/28143.

"Elementos reguladores" como aqui usado, refere-se a sequências de nucleotídeos presentes em cis, necessárias para transcrição e/ou tradução do gene compreendendo o ácido nucleico codificando um polipeptídeo de interesse. Os elementos reguladores transcricionais normalmente compreendem um promotor a montante do gene estrutural a ser expresso, sítios de iniciação e terminação transcricional, e uma seqüência de sinal de poliadenilação. O termo "sítio de iniciação transcricional" refere-se ao nucleotídeo, ou mais precisamente à base de ácido nucleico, no gene correspon5 dendo ao primeiro nucleotídeo incorporado no transcrito primário, isto é, o precursor de RNAm; o sítio de iniciação transcricional pode sobrepor-se com a seqüência promotora. O termo "sítio de terminação transcricional" referese a uma seqüência de nucleotídeos normalmente presente na extremidade 3’ de um gene de interesse a ser transcrito, que faz com que RNA polimera10 se termine transcrição. A seqüência de nucleotídeos de sinal de poliadenilação, ou sinal de adição poli-A provê o sinal para a clivagem em um específico sítio na extremidade 3’ de RNAm eucariótico e a adição pós-transcricional no núcleo de uma seqüência de cerca de 100 a 200 nucleotídeos adenina (cauda poliA) à extremidade 3’ clivada. A seqüência sinal de poliadenilação 15 pode incluir a seqüência consenso AATAAA localizada em cerca de 10 a 30 nucleotídeos a montante a partir do sítio de clivagem.

Para produzir um polipeptídeo secretado, o gene estrutural de interesse inclui um segmento de DNA que codifica uma "seqüência sinal" ou "peptídeo líder". A seqüência sinal dirige o polipeptídeo recentemente sinte20 tizado para e através de membrana do retículo endoplasmático (ER) em que o polipeptídeo pode ser encaminhado para secreção. A seqüência sinal é clivada por uma peptidase sinal durante enquanto a proteína cruza a membrana ER. Para a função da seqüência de sinal o reconhecimento pelo maquinário de secreção de célula hospedeira é essencial. Por isso a seqüência 25 sinal usada tem de ser reconhecida pelas proteínas de células hospedeiras e enzimas do maquinário de secreção.

Elementos reguladores traducionais incluem um códon de iniciação traducional (AUG) e de interrupção traducional (TAA, TAG ou TGA). Um sítio de entrada de ribossoma interno (IRES) pode ser incluído em algumas construções.

Um "promotor" refere-se a uma seqüência de polinucleotídeos que controla transcrição de um gene/gene estrutural ou uma seqüência de ácidos nucleicos à qual ela está operavelmente ligada. Um promotor inclui sinais para ligação de RNA polimerase e iniciação de transcrição. Os promotores usados serão funcionais no tipo de célula da célula hospedeira na qual expressão da selecionada seqüência de ácido nucleico é contemplada. Um 5 grande número de promotores incluindo promotores constitutivos, induzíveis, e repressores a partir de uma variedade de diferentes fontes, são bemconhecidos na técnica (e identificados em bases de dados como GenBank) e são disponíveis como ou dentro de polinucleotídeos clonados (de, por exemplo, depositários como ATCC assim como outras fontes comerciais ou 10 individuais). Um "promotor" compreende uma seqüência de nucleotídeos que dirige a transcrição de um gene estrutural. Tipicamente, um promotor está localizado na região não-traduzida ou não-codificante 5’ de um gene, próximo ao sítio de início transcricional de um gene estrutural. Elementos de seqüência dentro de promotores que funcionam na iniciação de transcrição 15 são frequentemente caracterizados por seqüências de nucleotídeos de consenso. Estes elementos promotores incluem sítios de ligação de RNA polimerase, seqüências TATA, seqüências CAAT, elementos específicos de diferenciação (DSEs; McGehee, R.E., et al., Mol. Endocrinol. 7 (1993) 551- 560), elementos de resposta AMP cíclica (CREs), elementos de resposta de 20 soro (SREs; Treisman, R., Seminars in Cancer Biol. 1 (1990) 47-58), elementos de resposta de glicocorticoide (GREs), e sítios de ligação para outros fatores de transcrição, como CRE/ATF (0’Reilly, M.A., et al., J. Biol. Chem. 267 (1992) 19938-19943), AP2 (Ye, J., et al„ J. Biol. Chem. 269 (1994) 25728), SP1, proteína de ligação de elemento resposta cAMP 25 (CREB; Loeken, M.R., Gene Expr. 3 (1993) 253-264), e fatores octâmero (vide, em geral, Watson et al., eds., Molecular Biology of the Gene, 4th ed. (The Benjamin/Cummings Publishing Company, Inc. 1987), e Lemaigre, F.P. and Rousseau, G.G., Biochem. J. 303 (1994) 1-14). Se um promotor é um promotor induzível, então a taxa de transcrição aumenta em resposta a um 30 agente de indução. Em contraste, a taxa de transcrição não é regulada através de um agente de indução se o promotor for um promotor constitutivo. Promotores repressíveis também são conhecidos. Por exemplo, o promotor c-fos é especificamente ativado com ligação de hormônio de crescimento a seu receptor sobre a superfície de célula. Expressão regulada com tetraciclina (tet) pode ser obtida através de promotores híbridos artificiais que consistem em, por exemplo, um promotor CMV seguido por dois sítios operadores 5 Tet. O repressor - Tet se liga aos dois sítios operadores Tet e bloqueia transcrição. Com adição da tetraciclina indutora, repressor - Tet é liberado a partir de sítios operadores - Tet e transcrição procede (Gossen, M. e Bujard, H. PNAS 89 (1992) 5547-5551). Para outros promotores induzíveis incluindo metalotioneína e promotores de choque térmico, vide, por exemplo, Sam10 brook et al. (supra) e Gossen, M., et al., Curr. Opin. Biotech. 5 (1994) 516- 520. Entre os promotores eucarióticos que foram identificados como fortes promotores para expressão em alto nível estão o promotor inicial SV40, promotor posterior principal adenovírus, promotor metalotioneína-l de camundongo, repetição terminal longa de vírus de sarcoma de Rous, fator alfa 15 1 de elongação de hamster Chinês (CHEF-1, vide, por exemplo, US 5.888.809), EF-1 alfa humano, ubiquitina, e promotor inicial imediato citomegalovírus humano (CMV IE). O "promotor" pode ser constitutivo ou induzível. Um aperfeiçoador (isto é, um elemento DNA atuando-cis que atua sobre um promotor para aumentar transcrição) pode ser necessário para funcionar em 20 conjunção com o promotor para aumentar o nível de expressão obtido com um promotor sozinho, e pode ser incluído como um elemento regulador transcricional. Frequentemente, o segmento de polinucleotídeo contendo o promotor também incluirá seqüências aperfeiçoadoras (por exemplo, CMV ou SV40).

Um "aperfeiçoador", como aqui usado, refere-se a uma seqüên

cia de polinucleotídeos que aperfeiçoa transcrição de um gene ou seqüência codificante ao qual ela está operavelmente ligada. Diferente de promotores, aperfeiçoadores são relativamente independentes de orientação e posição e foram verificados 5’ ou 3’ (Lusky, M., et al., Mol. Cell Bio., 3(1983) 1108- 30 1122) para a unidade de transcrição, dentro de um íntron (Banerji, J., et al., Cell, 33 (1983) 729-740) assim como dentro da própria seqüência codificante (Osborne, T.F., et al., Mol. Cell Bio., 4 (1984) 1293-1305). Por isso, aperfeiçoadores podem ser colocados a jusante ou a montante do sítio de iniciação de transcrição ou em distâncias consideráveis do promotor, embora na prática aperfeiçoadores possam sobrepor fisicamente e funcionalmente com promotores. Um grande número de aperfeiçoadores, a partir de uma varie5 dade de diferentes fontes são bem-conhecidos na técnica (e identificados em bases de dados como GenBank) e disponíveis como ou dentro de seqüências de polinucleotídeos clonadas (de, por exemplo, depositários tais como ATCC assim como outras fontes comerciais ou individuais). Um grande número de polinucleotídeos compreendendo seqüências promotoras (tal 10 como o promotor CMV usado comumente) também compreende seqüências aperfeiçoadoras. Por exemplo, todos os promotores fortes listados acima também podem conter aperfeiçoadores fortes (vide, por exemplo, Bendig, M.M., Genetic Engineering, 7 (Academic Press, 1988) 91-127).

Um "sítio de entrada de ribossoma interno" ou "IRES" descreve uma seqüência que promove funcionalmente iniciação de tradução independente do gene 5’ do IRES e permite dois cistrons (quadros de leitura abertos) serem traduzidos a partir de um transcrito simples em uma célula animal. O IRES provê um sítio de entrada de ribossoma independente para tradução do quadro de leitura aberto imediatamente a jusante (jusante é aqui usado intercambiavelmente com 3’) do mesmo. Diferente de RNAm bacteriano que pode ser policistrônico, isto é, codificar vários diferentes polipeptídeos que são traduzidos seqüencialmente a partir dos RNAms, maioria de RNAnVs de células animais são monocistrônicos e codificam a síntese de somente um polipeptídeo ou proteína. Com um transcrito policistrônico em uma célula eucariótica, tradução pode iniciar-se a partir do sítio de iniciação de tradução 5’, terminar no primeiro códon de interrupção, e o transcrito pode ser liberado do ribossoma, resultando na tradução de somente o primeiro polipeptídeo codificado no RNAm. Em uma célula eucariótica, um transcrito policistrônico tendo um IRES ligado operavelmente ao segundo ou subsequente quadro de leitura aberto no transcrito permite a tradução seqüencial daquele quadro de leitura aberto a jusante para produzir os dois ou mais polipeptídeos codificados pelo mesmo transcrito. O uso de elementos IRES em construção de vetor foi previamente descrito, vide, por exemplo, Pelletier, J., et al., Nature 334 (1988) 320-325; Jang, S.K., et al., J. Virol. 63 (1989) 1651- 1660; Davies, M.V., et al., J. Virol. 66 (1992) 1924-1932; Adam, M.A., et al. J. Virol. 65 (1991) 4985- 4990; Morgan, R.A., et al. Nucl. Acids Res. 20 (1992) 5 1293-1299; Sugimoto, Y, et al. Biotechnology 12 (1994) 694-698; Ramesh, N., et al. Nucl. Acids Res. 24 (1996) 2697-2700; e Mosser, D.D. et al, BioTechniques 22 (1997) 150-161).

Operavelmente ligado" refere-se a uma justaposição de dois ou mais componentes, em que os componentes assim descritos estão em uma relação permitindo os mesmos funcionarem em sua maneira pretendida. Por exemplo, um promotor e/ou aperfeiçoador estão operavelmente ligados a uma seqüência codificante, se ele atua em cis para controlar ou modular a transcrição da seqüência ligada. Geralmente, mas não necessariamente, as seqüências de DNA que são "ligadas operavelmente" são contíguas e, em que necessário ligar duas regiões codificando proteína como um líder secretor e um polipeptídeo, ou dois polipeptídeos, contíguos e em quadro de leitura. Entretanto, embora um promotor operavelmente ligado esteja geralmente localizado a montante da seqüência codificante, ele não é necessariamente contíguo com a mesma. Aperfeiçoadores não têm de ser contíguos. Um aperfeiçoador está operavelmente ligado a uma seqüência codificante se o aperfeiçoador aumenta transcrição da seqüência codificante. Aperfeiçoadores operavelmente ligados podem estar localizados a montante, dentro, ou a jusante de seqüências codificantes e em considerável distância do promotor. Um sítio de poliadenilação está operavelmente ligado a uma seqüência codificante se ele estiver localizado na extremidade a jusante (extremidade 3’) da seqüência codificante de modo que a transcrição proceda através de seqüência codificante na seqüência de poliadenilação. A ligação é realizada através de processos recombinantes conhecidos na técnica, por exemplo, usando metodologia PCR e/ou através de ligação em convenientes sítios de restrição. Se convenientes sítios de restrição não existirem, então adaptadores ou Iigantes oligonucleotídeos sintéticos serão usados de acordo com prática convencional. O termo "expressão" como aqui usado refere-se à transcrição e/ou tradução ocorrendo dentro de uma célula, por exemplo, uma célula hospedeira produzindo um polipeptídeo recombinante. O nível de transcrição de um desejado produto em uma célula hospedeira pode ser determinado 5 nas bases da quantidade de correspondente RNAm que está presente na célula. Por exemplo, RNAm transcrito de uma seqüência pode ser quantificado por PCR ou por hibridização Northern (vide Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)). Proteína codificada por um ácido nucleico ou gene estrutural pode ser quan10 tificada através de vários processos, por exemplo, através de ELISA, através de ensaio para a atividade biológica da proteína, ou através de emprego de ensaios que são independentes de tal atividade, tal como Western blotting ou ensaio radioimuno, usando anticorpos que reconhecem e se ligam à proteína (vide Sambrooket al., 1989, supra).

Uma "célula hospedeira" refere-se a uma célula na qual um áci

do nucleico a ser expresso ou a ser amplificado é introduzido. O termo "célula hospedeira" inclui ambas células procarióticas, que são usadas para propagação de plasmídeos, e células eucarióticas, que são usadas para a expressão de um ácido nucleico. Preferivelmente, as células procarióticas são 20 células de E. coli. Preferivelmente, as células eucarióticas são células mamíferas. Preferivelmente a célula mamífera é selecionada do grupo de células mamíferas compreendendo células CHO (por exemplo, CHO K1, CHO DG44), células BHK, células NSO, células SP2/0, células HEK 293, células HEK 293 EBNA, células PER.C6, e células COS. Como aqui usada, a ex25 pressão "célula" inclui a célula objeto e sua progênie. Assim, as palavras "transformante", "célula transformada", "transfectante", e "célula transfectada" incluem a célula sujeito primária e culturas dali derivadas sem relação ao número de transferências. Também é entendido que toda progênie pode não ser precisamente idêntica em teor de DNA, devido a mutações deliberadas 30 ou inadvertidas. Progênie variante que tem a mesma função ou atividade biológica como selecionada para, na célula originalmente transformada é incluída. Um "polipeptídeo" é um polímero de resíduos de aminoácidos ligados por ligações peptídicas, se produzido naturalmente ou sinteticamente. Polipeptídeos de menos que cerca de 20 resíduos de aminoácidos podem ser referidos como "peptídeos". Uma "proteína" é um polipeptídeo com5 preendendo uma ou mais cadeias de polipeptídeos pelo que pelo menos uma cadeia tem um comprimento de 100 aminoácidos ou mais. Uma proteína também pode compreender componentes não-peptídicos, tais como grupos carboidratos. Carboidratos e outros substituintes não-peptídicos podem ser adicionados a uma proteína pela célula na qual a proteína é produzida, e 10 pode variar com o tipo de célula. Proteínas são aqui definidas em termos de suas estruturas de cadeia principal de aminoácido; adições tais como grupos carboidratos geralmente não são especificadas, mas não obstante podem estar presentes.

"DNA heterólogo" ou "polipeptídeo heterólogo" refere-se a uma molécula de DNA ou um polipeptídeo, ou uma população de moléculas de DNA ou uma população de polipeptídeos, que não existe naturalmente dentro de uma dada célula hospedeira. Moléculas de DNA heterólogo para uma particular célula hospedeira podem conter DNA derivado das espécies de células hospedeiras (isto é, DNA endógeno) tanto quanto aquele DNA hospedeiro esteja combinado com DNA não-hospedeiro (isto é, DNA exógeno). Por exemplo, uma molécula de DNA contendo um segmento de DNA nãohospedeiro codificando um polipeptídeo operavelmente ligado a um segmento de DNA hospedeiro compreendendo um promotor é considerada ser uma molécula de DNA heteróloga. Ao contrário, uma molécula de DNA heteróloga pode compreender um gene estrutural endógeno ligado operavelmente com um promotor exógeno. Um polipeptídeo codificado por uma molécula de DNA não-hospedeiro é um polipeptídeo "heterólogo".

Um "plasmídeo de clonagem" é um ácido nucleico, tal como um plasmídeo, cosmídeo, fageimídeo, ou cromossoma artificial bacteriano (BAC), que tem a capacidade de replicar autonomamente em uma célula hospedeira. Plasmideos de clonagem tipicamente contêm um ou um pequeno número de sítios de reconhecimento de endonuclease de restrição que permitem inserção de um ácido nucleico em uma maneira determinável sem perda de uma essencial função biológica do plasmídeo, assim como seqüências de nucleotídeos codificando um marcador selecionável que é apropriado para uso na identificação e seleção de células transformadas com o 5 plasmídeo de clonagem. Genes de resistência tipicamente incluem genes que proveem resistência à tetraciclina, ampicilina, ou neomicina.

Um "plasmídeo de expressão" é um ácido nucleico codificando um polipeptídeo a ser expresso em uma célula hospedeira. Tipicamente, um plasmídeo de expressão compreende uma unidade de propagação de plas10 mídeo procariótico, por exemplo, para E.coli, compreendendo uma origem de replicação, e um marcador de seleção, um marcador de seleção eucariótico, e um ou mais cassetes de expressão para a expressão do gene(s) estrutural de interesse cada compreendendo um promotor, um gene estrutural, e um terminador de transcrição incluindo um sinal de poliadenilação. Expressão de gene 15 é usualmente colocada sob o controle de um promotor, e um tal gene estrutural é dito estar "operavelmente ligado" ao promotor. Similarmente, um elemento regulador e um promotor de núcleo são operavelmente ligados, se o elemento regulador modula a atividade do promotor de núcleo.

Um "polipeptídeo isolado" é um polipeptídeo que é essencialmente livre de componentes celulares contaminantes, tais como carboidrato, lipídeo, ou outras impurezas proteicas associadas com o polipeptídeo em natureza. Tipicamente, uma preparação de polipeptídeo isolado contém o polipeptídeo em uma forma altamente purificada, isto é, pelo menos cerca de 80% puro, pelo menos cerca de 90% puro, pelo menos cerca de 95% puro, maior que 95% puro, ou maior que 99% puro. Uma maneira de mostrar que uma particular preparação de proteína contém um polipeptídeo isolado é através de aparecimento de uma banda simples seguindo eletroforese em gel de dodecil sulfato de sódio (SDS) - poliacrilamida da preparação de proteína e manchamento com azul brilhante Coomassie do gel. Entretanto, o termo "isolado" não exclui a presença do mesmo polipeptídeo em formas físicas alternativas, como dímeros ou alternativamente formas glicosiladas ou derivadas. O termo "imunoglobulina" refere-se a uma proteína consistindo em um ou mais polipeptídeos substancialmente codificados por um gene imunoglobulina. Os diferentes polipeptídeos dos quais uma imunoglobulina é composta são referidos dependendo de seu peso como polipeptídeo de ca5 deia leve e como polipeptídeo de cadeia pesada. O genes de imunoglobulina reconhecidos incluem os diferentes genes de região constante assim como a miríade de genes de região variável de imunoglobulina. Imunoglobulinas podem existir em uma variedade de formatos, incluindo, por exemplo, cadeias leves e pesadas simples, Fv, Fab, e F(ab)2 assim como cadeias simples 10 (scFv) (por exemplo, Huston, J.S., et al., Proc. Natl. Acad. Sei. USA 85 (1988) 5879-5883; Bird, R.E., et al., Science 242 (1988) 423-426; e, em geral, Hood et al., Immunology, Benjamin N.Y., 2nd edition (1984) e HunkapilIerl T. and Hood1 L., Nature 323 (1986) 15-16).

Uma imunoglobulina em geral compreende duas cadeias de polipeptídeos leves e duas cadeias de polipeptídeos pesadas. Cada uma das cadeias de polipeptídeos pesada e leve contém uma região variável (a porção terminal amino da cadeia de polipeptídeo) que contém um domínio ligante que é capaz de interagir com um antígeno. Cada uma das cadeias de polipeptídeos pesada e leve compreende uma região constante (a porção terminai carboxila da cadeia de polipeptídeo). A região constante da cadeia pesada media a ligação do anticorpo i) a células transportando um receptor Fc gama (FcyR), tais como células fagocíticas, ou ii) a células transportando o receptor Fe neonatal (FcRn) também conhecido como receptor Brambell. O domínio variável de uma cadeia leve ou pesada de imunoglobulina por sua vez compreende diferentes segmentos, isto é, quatro regiões de estrutura (FR) e três regiões hipervariáveis (CDR).

Um "fragmento de imunoglobulina" representa um fragmento de uma imunoglobulina completa que reteve a habilidade para se ligar ao mesmo antígeno como a imunoglobulina completa. Uma "imunoglobulina com30 pleta" é uma imunoglobulina consistindo em duas cadeias leves de polipeptídeos e duas cadeias pesadas de polipeptídeos, cada uma delas compreendendo uma região variável e uma região constante. Um "conjugado imunoglobulina" representa um conjugado de uma imunoglobulina com ainda um polipeptídeo de não-imunoglobulina. A ligação do antígeno não é diminuída pela conjugação ainda ao polipeptídeo.

"Terminador de transcrição" como representado neste pedido de 5 patente é uma seqüência de DNA de 50 a 750 pares de bases em comprimento que rende ao RNA polimerase o sinal para terminação da síntese de RNAm. Terminadores muito eficientes (fortes) na extremidade 3’ de um cassete de expressão são aconselháveis para prevenção de RNA polimerase leia através, particularmente quando usando promotores fortes. Ineficientes 10 terminadores de transcrição podem conduzir à formação de um RNAm similar a óperon que pode ser a razão de uma indesejada expressão de gene, por exemplo, codificado por plasmídeo.

O termo "polipeptídeo ligante" como usado dentro deste pedido de patente representa polipeptídeos Iigantes peptídicos de origem natural e/ou sintética. Eles compreendem uma cadeia de aminoácido linear em que os 20 aminoácidos ocorrendo naturalmente são os blocos monoméricos de construção. A cadeia tem um comprimento de 1 a 50 aminoácidos, preferido entre 3 e 25 aminoácidos. O polipeptídeo ligante pode conter seqüências de aminoácidos repetitivos ou seqüências de polipeptídeos ocorrendo naturalmente, tais como polipeptídeos com uma função de articulação. O polipeptídeo ligante tem a função de assegurar que um polipeptídeo conjugado a um outro polipeptídeo pode reter suas propriedades de ligação permitindo o peptídeo dobrar corretamente e ser propriamente apresentado. Preferivelmente o polipeptídeo ligante é um polipeptídeo designado ser rico em resíduos glicina, glutamina, e/ou serina. Estes resíduos são dispostos, por exemplo, em pequenas unidades repetitivas de até cinco aminoácidos, como GGGGS, QQQQG, ou SSSSG. Esta pequena unidade repetitiva pode ser repetida por duas ou cinco vezes para formação de uma unidade multimérica. Nas extremidades terminais amino e/ou carbóxi da unidade multimérica até seis adicionais aminoácidos arbitrários, ocorrendo naturalmente, podem ser adicionados. Outros Iigantes peptídicos sintéticos são compostos por um aminoácido simples, que é repetido entre 10 a 20 vezes, tal como, por exemplo, serina no ligante SSSSSSSSSSSSSSS. Em cada uma extremidade terminal amino e/ou carbóxi até seis adicionais aminoácidos arbitrários, ocorrendo naturalmente podem estar presentes.

O termo "aminoácido" como usado neste pedido de patente re5 presenta um grupo de carbóxi alfa aminoácidos que pode ser codificado por um ácido nucleico compreendendo alanina (código de três letras: ala, código de uma letra: A), arginina (arg, R), asparagina (asn, N), ácido aspártico (asp, D), cisteína (cys, C), glutamina (gin, Q), ácido glutâmico (glu, E), glicina (gly, G), histidina (his, H), isoleucina (ile, I), Ieucina (leu, L), Iisina (lys, K), metio10 nina (met, M), fenil alanina (ph, F), prolina (pro, P), serina (ser, S), treonina (thr, T), triptofano (trp, W), tirosina (tyr, Y), e valina (vai, V).

Um "peptídeo antifusogênico" é um peptídeo que inibe eventos associados com fusão de membrana ou o próprio evento de fusão de membrana, incluindo, entre outras coisas, a inibição de infecção de células não15 infectadas por um vírus devido a fusão de membrana. Estes peptídeos antifusogênicos são preferivelmente peptídeos lineares. Por exemplo, eles podem ser derivados do ecto domínio de gp41, por exemplo, tais como DP107, ou DP178. Exemplos de tais peptídeos podem ser encontrados em US 5.464.933, US 5.656.480, US 6.013.263, US 6.017.536, US 6.020.459, 20 US 6.093.794, US 6.060.065, US 6.258.782, US 6.348.568, US 6.479.055, US 6.656.906, WO 1996/19495, WO 1996/40191, WO 1999/59615, WO 2000/69902, e WO 2005/067960. Por exemplo, as seqüências de aminoácidos de tais peptídeos compreendem SEQ ID N0: de 1 a 10 de US 5.464.933; SEQ ID N0: de 1 a 15 de US 5.656.480; SEQ ID N0: de 1 a 10 e 25 de 16 a 83 de US 6.013.263; SEQ ID N0: de 1 a 10, de 20 a 83 e de 139 a 149 de US 6.017.536; SEQ ID N0: de 1 a 10, de 17 a 83 e de 210 a 214 de US 6.093.794; SEQ ID N0: de 1 a 10, de 16 a 83 e de 210 a 211 de US 6.060.065; SEQ ID N0: de 1286 e 1310 de US 6.258.782; SEQ ID N0: 1129, de 1278 a 1309, 1311 e 1433 de US 6.348.568; SEQ ID N0: de 1 a 10 e de 30 210 a 238 de US 6.479.055; SEQ ID N0: de 1 a 171, de 173 a 216, de 218 a 219, de 222 a 228, 231, de 233 a 366, de 372 a 398, de 400 a 456, de 458 a 498, de 500 a 570, de 572 a 620, de 622 a 651, de 653 a 736, de 739 a 785, 787 a 811, de 813 a 815, de 816 a 823, 825, de 827 a 863, de 865 a 875, de 877 a 883, 885, de 887 a 890, de 892 a 981, de 986 a 999, de 1001 a 1003, de 1006 a 1018, de 1022 a 1024, de 1026 a 1028, de 1030 a 1032, de 1037 a 1076, de 1078 a 1079, de 1082 a 1117, de 1120 a 1176, de 1179 a 1213, 5 de 1218 a 1223, de 1227 a 1237, de 1244 a 1245, de 1256 a 1268, de 1271 a 1275, 1277, de 1345 a 1348, de 1350 a 1362, 1364, 1366, 1368, 1370, 1372, de 1374 a 1376, de 1378 a 1379, de 1381 a 1385, de 1412 a 1417, de 1421 a 1426, de 1428 a 1430, 1432, de 1439 a 1542, de 1670 a 1682, de 1684 a 1709, de 1712 a 1719, de 1721 a 1753, de 1755 a 1757 de US 10 6.656.906; ou SEQ ID N0: 5 a 95 de W02005/067960. O peptídeo antifusogênico tem uma seqüência de aminoácidos compreendendo de 5 a 100 aminoácidos, preferivelmente de 10 a 75 aminoácidos e mais preferido de 15 a 50 aminoácidos.

"CCR5" significa CCR5 humano como descrito, por exemplo, em Oppermann, M., Cell Signal. 16 (2004) 1201-1210, e SwissProt P51681. O termo "anticorpo anti-CCR5" representa um anticorpo ligando-se especificamente a CCR5 e opcionalmente inibindo fusão de HIV com uma célulaalvo. A ligação pode ser testada em uma célula baseado em um ensaio ELISA in vitro (células CHO expressando CCR5). A ligação é verificada se o anticorpo causa uma razão S/N (sinal/ruído) de 5 ou mais, preferivelmente ou mais em uma concentração de anticorpo de 100 ng/ml. O termo "inibição de fusão de HIV com uma célula-alvo" refere-se à inibição de fusão de HIV com uma célula-alvo medida em um ensaio compreendendo contato da dita célula-alvo (por exemplo, PBMC) com o vírus na presença do anticorpo em uma concentração efetiva para inibir fusão de membrana entre o vírus e a dita célula e medindo, por exemplo, atividade de gene repórter Iuciferase ou a concentração de antígeno p24 de HIV. O termo "fusão de membrana" refere-se à fusão entre uma primeira célula coexpressando CCR5 e polipeptídeos CD4 e uma segunda célula ou vírus expressando uma proteína env de HIV. A fusão de membrana é determinada por células geneticamente engenheiradas e/ou vírus através de um ensaio de gene repórter (por exemplo, através de ensaio de gene repórter luciferase). Anticorpos anti-CCR5 preferidos são mencionados em US 2004/0043033, US 6.610.834, US 2003/0228306, US 2003/0195348, US 2003/0166870, US 2003/0166024, US 2003/0165988, US 2003/0152913, US 2003/0100058, US 2003/0099645, US 2003/0049251, US 2003/0044411, 5 US 2003/0003440, US 6.528.625, US 2002/0147147, US 2002/0146415, US 2002/0106374, US 2002/0061834, US 2002/0048786, US 2001/0000241, EP 1.322.332, EP 1.263.791, EP 1.207.202, EP 1.161.456, EP 1.144.006, WO 2003/072766, WO 2003/066830, WO 2003/033666, WO 2002/083172, WO 02/22077, WO 01/58916, WO 01/58915, WO 01/43779, WO 01/42308, e 10 WO 2006/103100. Anticorpos anti-CCR5 especialmente preferidos são descritos em W02006103/100.

"CD4" significa CD4 humana como descrito, por exemplo, em Brady, R.L. and Barclay, A.N., Curr. Top. Microbiol. Immunol. 205 (1996) 1- 18 e SwissProt P01730. O termo "anticorpo anti-CD4" representa um anticorpo específico ligando a CD4 e preferivelmente inibindo fusão de HIV a uma célula-alvo. A ligação pode ser testada em um ensaio ELISA in vitro baseado em célula (células CHO expressando CD4). A ligação é verificada se o anticorpo em questão causa uma razão S/N (sinal/ruído) de 5 ou mais, preferivelmente 10 ou mais em uma concentração de anticorpo de 100 ng/ml. O termo "inibição de fusão de HIV com uma célula-alvo" refere-se à inibição de fusão de HIV com uma célula-alvo medida em um ensaio compreendendo contato da dita célula-alvo (por exemplo, PBMC) com o vírus na presença do anticorpo em questão em uma concentração efetiva para inibir fusão de membrana entre o vírus e a dita célula e medindo, por exemplo, atividade de gene repórter Iuciferase ou a concentração de antígeno p24 de HIV. O termo "fusão de membrana" refere-se à fusão entre uma primeira célula expressando polipeptídeos CD4 e uma segunda célula ou vírus expressando uma proteína env de HIV. Fusão de membrana é determinada por células e/ou vírus engenheirados geneticamente através de um ensaio de gene repórter (por exemplo, através de ensaio de gene repórter luciferase).

Anticorpos anti-CD4 preferidos são mencionados em, por exemplo, Reimann, K.A., et al., Aids Res. Human Retrovir. 13 (1997) 933-943, EP 0.512.112, US 5.871.732, EP 0.840.618, EP 0.854.885, EP 1.266.965, US 2006/0051346, WO 97/46697, WO 01/43779, US 6.136.310, WO 91/009966. Anticorpos anti-CD4 especialmente preferidos são descritos em US 5.871.732 e Reiamnn, K.A., et al., Aids Res. Human Retrovir. 13 (1997) 933- 5 943, e WO 91/009966. Um anticorpo anti-CD4 especialmente preferido é caracterizado em que ele é um anticorpo não-imunossupressivo ou nãoesgotante quando administrado a humanos e também não bloqueia ligação de gp120 de HIV a CD4 humana.

"HIV-1" representa gp 120 de vírus tipo 1 de imunodeficiência humana. O termo "Anticorpo anti-HIV-1 neutralizante" representa um anticorpo ligando-se especificamente a gp120 de HIV-1 em mais de um epítopo conformacional e neutralizando habilidades Iigantes de gp120, assim como opcionalmente inibindo fusão de HIV com uma célula, "anticorpos anti-HIV-1 neutralizantes" são B12 e 4KG5. Estes anticorpos monoclonais são direcionados contra epítopos conformacionais localizados na gp120 de HIV. O epítopo anticorpo B12, por exemplo, é previsto consistir em quatro segmentos de peptídeos de gp120 (resíduos V254-T257, D368-F376, E381-Y384 e I420-I424), que estão localizados na periferia do sítio de ligação CD4 (Bublil, E. M., et al., FASEB J. 20 (2006) 1762-1774; Zwick, M.B., et al., J. Virol. 77 (2003) 6965-6978). O anticorpo B12 pode ser redesenhado para evitar reconhecimento de epítopos presentes em tecidos normais.

A presente invenção reporta um conjugado de polipeptídeos, em que o conjugado compreende

a) um primeiro polipeptídeo selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 01 e fragmentos dos mesmos,

b) um segundo polipeptídeo seleciondo do grupo de peptídeos antifusogênicos.

O primeiro polipeptídeo compreendido no conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção é selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0; 01 e fragmentos dos mesmos.

O primeiro polipeptídeo é a subunidade A de fator de complemento humano C1q ou um fragmento do mesmo. A seqüência de aminoácidos da subunidade A de fator de complemento humano C1q, que é daqui por diante representado como C1qA, é dada em SEQ ID N0: 01. Um fragmento de C 1qA representa uma seqüência de aminoácidos de pelo menos 12 resíduos de aminoácidos consecutivos de SEQ ID N0: 01, de pelo menos 15 re5 síduos de aminoácidos consecutivos de SEQ ID N0: 01, ou de pelo menos 18 resíduos de aminoácidos consecutivos de SEQ ID N0: 01. Fragmentos exemplares de SEQ ID N0: 01 compreendem

KGSPGNIKDQ PRPAFSA (SEQ ID N0: 02),

KGSPGNIKDQ PRPAFSAI (SEQ ID N0: 03),

GARGIPGIKG TKGSPGNIKD QPRPAFSAIR R (SEQ ID N0: 04),

GARGIPGIKG TKGSPGNIKD QPRPAFSAIR RNPPMGGNW IFDTVITNQE EPYQNHSGRF VCTVPGYYYF TFQVLSQWEI CLSIVSSSRG QVRRSLGFCD TTNKGLFQW SGGMVLQLQQ GDQVWVEKDP KKGHIYQGSE ADSVFSGFLI FPSA (SEQ ID N0: 05), ou

KGDQGEPGPS GNPGKVGYPG PSGPLGARGI PGIKGTKGSP GNIKDQPRPA FSAIRRNPPM GGNWIFDTV ITNQEEPYQN HSGRFVCTVP GYYYFTFQVL SQWEICLSIV SSSRGQVRRS LGFCDTTNKG LFQWSGGMV LQ LQQG DQVW VEKDPKKGHI YQGSEADSVF SGFLIFPSA (SEQ ID N0: 06).

Em uma concretização o primeiro polipeptídeo é selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 06, e fragmentos dos mesmos. SEQ ID N0: 06 representa a cabeça globular de C1qA. Um fragmento da cabeça globular de C1qA representa uma seqüência de aminoácidos de pelo menos 12 resíduos de aminoácidos consecutivos de SEQ ID N0:

06, de pelo menos 15 resíduos de aminoácidos consecutivos de SEQ ID N0: 06, ou de pelo menos 18 resíduos de aminoácidos consecutivos de SEQ ID N0: 06.

O segundo polipeptídeo é selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos. Por exemplo, peptídeos antifusogênicos são derivados da proteína gp41 de HIV-1 (SEQ ID N0: 07). Estes peptídeos antifusogênicos 30 são preferivelmente peptídeos lineares. Peptídeos antifusogênicos exemplares são DP107, DP178, C-34, N-36, T-20, T-651, T-1249, T-1357, variante T-1357, T-2635, mutante simples de variante de ectodomínio de gp41 de HIV-1: I568P, e mutante quádruplo de variante de ectodomínio de gp41 de HIV-1: I568P, L550E, L566E, I580E. As seqüências de aminoácidos de alguns peptídeos antifusogênicos são dadas na Tabela 1.

Tabela 1: Seqüências de aminoácidos de peptídeos antifusogênicos

Peptídeo antifusogênico Seqüência de aminoácidos SEQ ID N0: DP-107 NNLLRAIEAQ QHLLQLTVWG 08 IKQLQARILA VERYLKDQ DP-178 QQEKNEQDLL ALDKWASLWT 09 WFDISHWLWY IKIFIMIV C-34 WMEWDREINN YTSLIHSLIE 10 ESQNQQEKNE QELL N-36 SGIVQQQNNL LRAIEAQQHL 11 LQLTVWGIKQ LQARIL T-20 YTSLIHSLIE ESQNQQEKNE 12 QELLELDKWA SLWNWF T-651 MTWMEWDREI NNYTSLIHSL 13 IEESQNQQEK NEQELL T-1249 WQEWEQKITA LLEQAQIQQE 14 KNEYELQKLD KWASLWEWF T-1357 WQEWEQKITA LLEQAQIQQE 15 KNEYELQKLD KWASLWEWF variante T-1357 MRGSHHHHHH AIDVIEGRWQ 16 EWEQKITALL EQAQIQQEKN EYELQKLDKW AS LWEWFG T-2635 TTWEAWDRAI AEYAARIEAL 17 IRAAQEQQEK NEAALREL Peptídeo antifusogênico Seqüência de aminoácidos SEQ ID N0: Mutante simples de va¬ VQARQLLSGI VQQQNNLLRA 18 riante de ectodomínio de IEGQQHLLQL TVWGPKQLQA gp41 de HIV-1:1568P RILAVERYLK DQQLLGIWGC SGKLICTTAV PWNASWSNKS LEQIWNNMTW MEWDREINNY TSLIHSLIEE SQNQQEKNEQ ELL Mutante quádruplo vari¬ MGAASMTLTV QARQLLSGIV 19 ante de ectodomínio de QQQNNELRAI EGQQHLEQLT gp41 de HIV-1: I568P, VWGPKQLQAR ELAVERYLKD L550E, L566E, I580E QQLLGIWGCS GKLICTTAVP WNASWSNKSL EQIWNNMTWM EWDREINNYT SLIHSLIEES QNQQEKNEQE LL A seqüência de aminoácidos e a numeração das posições são

como na linhagem de referência BH8 (Locus HIVH3BH8; HIV-1 isolado de LAI/IIIB clone BH8 de France; Ratner, L. et al., Nature 313 (1985) 277-284). Ainda exemplos de tais peptídeos antifusogênicos podem ser encontrados em US 5.464.933, US 5.656.480, US 6.013.263, US 6.017.536, US 6.020.459, US 6.093.794, US 6.060.065, US 6.258.782, US 6.348.568, US 6.479.055, US 6.656.906, WO 1996/19495, WO 1996/40191, WO 1999/59615, WO 2000/69902, e WO 2005/067960 O peptídeo antifusogênico tem uma seqüência de aminoácidos compreendendo de 5 a 100 aminoácidos, de 10 a 75 aminoácidos, preferivelmente de 15 a 50 aminoácidos. Peptídeos antifusogênicos especialmente preferidos são C-34, T-20, T-1249, T-1357, T-651, T-2635, N-36, (Root, M.J., et al., Curr. Pharm. Des. 10 (2004) 1805-1825), DP-107 (Wild, C., et al., Proc. Natl. Acad. Sei. USA 91 (1994) 12676-12680), DP-178, mutante simples variante de ectodomínio de gp41 de HIV-1: I568P, e/ou mutante quádruplo variante de ectodomínio de gp41 de HIV-1: I568P, L550E, L566E, I580E. O conjugado de acordo com a invenção compreende mais de um polipeptídeo.

Assim, o polipeptídeo forma o términus-N do conjugado e um polipeptídeo forma o términus-C do conjugado. A ordem terminal N para C 5 destes polipeptídeos é arbitrária. Isto permite a qualquer um dos polipeptídeos conjugados estar no términus-N e a qualquer um dos polipeptídeos conjugados estar no términus-C com a condição de que cada um dos polipeptídeos esteja presente somente uma vez no conjugado.

Em uma concretização o conjugado de acordo com a invenção compreende os primeiro e segundo polipeptídeos em uma ordem selecionada a partir das seguintes ordens:

términus-N - primeiro polipeptídeo - segundo polipeptídeo términus-C, ou

términus-N - segundo polipeptídeo - primeiro polipeptídeo

términus-C.

O conjugado de acordo com a invenção pode compreender ainda um polipeptídeo adicional, um polipeptídeo ligante. Assim, em uma concretização o conjugado de acordo com a invenção compreende entre os primeiro e segundo polipeptídeos um polipeptídeo ligante. Polipeptídeos Iigantes preferidos são mostrados na Tabela 2.

Tabela 2: Polipeotídeos Iia antes N0 de polipeptídeo Seqüência de aminoácidos de SEQ ID N0 ligante polipeptídeo ligante 1 LSLSPGK 20 2 LSPNRGEC 21 3 [GQ4J3 22 4 [GQ4J3G 23 [GQ4J3GNN 24 6 GGG[SG4]2SGG 25 7 GGG[SG4]2SGN 26 8 [SG4J3 27 9 [SG4J3G 28 N0 de polipeptídeo Seqüência de aminoácidos de SEQ ID N0: ligante polipeptídeo ligante GfSG4J3T 29 11 [SG4J3GG 30 12 [SG4J3GGT 31 13 [SG4J3GGN 32 14 [SG4J3GAS 33 [SG4J5 34 16 [SG4J5G 35 17 [SG4J5GG 36 18 [SG4J5GAS 37 19 G(S)15G 38 G(S)I5GAS 39 21 G _ 22 N 23 GST _ 24 [(G)4SJ3GAS 40 [(G)4SJ3G 41 26 [(G)4SJ5G 42 27 [(G)4SJ3GG 43 28 (G)4SJ5GG 44 29 LSLSGG 45 LSLSPGG 46 31 G3SJ5 47 32 [G3SJ5GGG 48 Especialmente preferidos são os polipeptídeos Iigantes [GQ4J3GNN (SEQ ID N0: 24), LSLSPGK (SEQ ID N0: 20), LSPNRGEC (SEQ ID N°: 21), LSLSGG (SEQ ID N0: 45), LSLSPGG (SEQ ID N0: 46), [G3SJ5, (SEQ ID N0: 47), e[G3SJ5GGG, (SEQ ID N0: 48). Todos os polipeptídeos Ii5 gantes podem ser codificados por uma molécula de ácido nucleico e por isso podem ser expressos recombinantemente. Na medida em que os polipeptídeos Iigantes são esses próprios peptídeos, o polipeptídeo, que está ligado ao ligante polipeptídeo, está ligado via uma ligação peptídica que é formada entre dois aminoácidos. Por isso, os conjugados de polipeptídeos de acordo com a invenção podem ser produzidos recombinantemente através de ex5 pressão de proteína.

A invenção em uma outra concretização compreende um conjugado de polipeptídeos em que além de primeiro e segundo polipeptídeos, um terceiro polipeptídeo adicional está conjugado.

O primeiro polipeptídeo é a subunidade A de fator de comple10 mento humano C1q ou um fragmento do mesmo, como descrito acima. O segundo polipeptídeo é um polipeptídeo selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos, como descrito acima. O terceiro polipeptídeo é um fragmento de ligação de antígeno de um anticorpo anti-CCR5 ou um anticorpo antiCD4, ou um anticorpo anti-HIV-1.

O termo "ligação de antígeno" como usado dentro deste pedido

de patente representa um anticorpo ou um fragmento do mesmo, que está se ligando a seu antígeno. No caso de um anticorpo anti-CCR5 a ligação é ao receptor de CCR5, no caso de um anticorpo anti-CD4 a ligação é ao receptor de CD4, e no caso de um anticorpo anti-HIV-1 a ligação é a gp120 de HIV. A afinidade de ligação dada com um valor Kd 10~5 mol/lou menor (por exemplo, 10'8 mol/l), com um valor Kd de 10'7 mol/l ou menor, ou com um valor Kd de 10'9 mol/l ou menor. A afinidade de ligação é determinada com um ensaio de ligação padrão, tal como técnica de ressonância plasmon de superfície (BIAcore). Este valor de afinidade de ligação não tem de ser tratado como um valor exato; ele é meramente um ponto de referência. Ele é usado para determinar e/ou selecionar, por exemplo, anticorpos anti-CCR5 ou seus fragmentos mostrando a ligação-alvo específica típica - imunoglobulina para o antígeno - receptor - CCR5 e, assim, tendo uma atividade terapêutica. Isto da mesma maneira se aplica também a anticorpos anti-CD4 e anticorpos anti-HIV-1.

O termo "grupo de fragmentos de ligação de antígeno de anticorpos anti-CCR5" como usado dentro deste pedido de patente representa qualquer fragmento de um anticorpo anti-CCR5, que tenha retido a habilidade de ligação de antígeno. Tais fragmentos geralmente compreendem pelo menos uma parte do domínio variável de uma cadeia leve ou pesada de anticorpo anti-CCR5. Tais fragmentos podem ser, por exemplo, cadeias pesa5 das ou leves simples, fragmentos Fv-, Fab-, e F(ab)2-, assim como anticorpos de cadeia simples (scFv).

Anticorpos anti-CCR5 preferidos, cujos fragmentos são úteis nos conjugados de acordo com a invenção, são expressos por linhas de células hibridoma listadas na Tabela 3, que foram depositadas com Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSMZ), Alemanha.

Linha de células N0 de Depósito Data de Depósito m<CCR5>Pz01.F3 DSM ACC 2681 18.08.2004 m<CCR5>Pz02.1C11 DSM ACC 2682 18.08.2004 m<CCR5>Pz03.1C5 DSM ACC 2683 18.08.2004 m<CCR5>Pz04.1F6 DSM ACC 2684 18.08.2004 Anticorpos anti-HIV-1 preferidos, cujos fragmentos são úteis nos conjugados de acordo com a invenção, são B12 e 4KG5.

Anticorpos anti-CD4 preferidos são descritos em US 5.871.732, Reimann, K.A., et al., Aids Res. Human Retrovir. 13 (1997) 933-943, e WO 91/009966.

No conjugado de polipeptídeos compreendendo um primeiro, segundo e terceiro polipeptídeos, seis diferentes ordens de terminal-N (términus-N representado como NH2) para terminal-C (términus-C representado como COOH) são possíveis. Este grupo de ordens compreende:

(1) NH2 - primeiro polipeptídeo - segundo polipeptídeo - terceiro polipeptídeo - COOH,

(2) NH2 - primeiro polipeptídeo - terceiro polipeptídeo - segundo polipeptídeo - COOH,

(3) NH2 - segundo polipeptídeo - primeiro polipeptídeo - terceiro

polipeptídeo - COOH,

(4) NH2 - segundo polipeptídeo - terceiro polipeptídeo - primeiro polipeptídeo - COOH,

(5) NH2 - terceiro polipeptídeo - primeiro polipeptídeo - segundo polipeptídeo - COOH,

(6) NH2 - terceiro polipeptídeo - segundo polipeptídeo - primeiro polipeptídeo - COOH.

É opcionalmente possível incluir polipeptídeos Iigantes entre cada um dos polipeptídeos conjugados. Neste caso, por exemplo, a ordem (1) incluindo um polipeptídeo ligante em adição compreende quatro ordens diferentes

(1) NH2 - primeiro poliopeptídeo - segundo polipeptídeo - tercei

ro polipeptídeo - COOH,

(1a) NH2 - primeiro polipeptídeo - polipeptídeo ligante - segundo polipeptídeo - terceiro polipeptídeo - COOH,

(1b) NH2 - primeiro polipeptídeo - segundo polipeptídeo - polipeptídeo ligante - terceiro polipeptídeo - COOH,

(1c) NH2 - primeiro polipeptídeo - polipeptídeo ligante - segundo polipeptídeo - polipeptídeo ligante - terceiro polipeptídeo - COOH.

Assim, na presença de todos os polipeptídeos Iigantes opcionais vinte e quatro diferentes ordens são possíveis.

Um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção com

preende cada polipeptídeo no máximo uma vez com a exceção do polipeptídeo ligante, que pode estar compreendido até três vezes.

Por isso, a presente invenção compreende um conjugado de polipeptídeos, que compreende a) um primeiro polipeptídeo (1 st pp) selecionado do grupo de

polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 01, e fragmentos dos mesmos,

b) um segundo polipeptídeo (2nd pp) selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos,

c) um terceiro polipeptídeo opcional (3 rd pp) selecionado do grupo de fragmentos de ligação de antígeno de anticorpos anti-CCR5, ou o

grupo de fragmentos de ligação de antígeno de anticorpos anti-CD4,

d) um polipeptídeo ligante opcional (link pp) ligando os ditos primeiro, segundo, e/ou terceiro polipeptídeos, pelo que os polipeptídeos têm uma ordem terminal N para C de [1 st pp]a - [link pp]m - [2nd pp]b - [link pp]n - [3rd pp]c - [link pp]0 [1 st pp]d - [link pp]p - [2nd pp]e - [link pp]q - [3rd pp]f - [link pp]r [1stpp]g

em que a, b, c, d, e, f, g, m, n, o, p, q, r são todos um inteiro de um valor de 0 ou 1,

com a + d + g = 1,

b + e = 1,

c + f = 0 ou 1,

m, n, o, p, q, r independentemente uns dos outros são O ou 1, com O representando a ausência e com 1 representando a presença do correspondente polipeptídeo na posição especificada do dito conjugado.

Em uma concretização preferida os polipeptídeos têm uma ordem de terminal N para C de

[3rd pp]c - [link pp]0 - [1st pp]d - [link pp]p - [2nd pp]e - [link pp]q - [1st pp]g, em que c, d, e, g, o, p, q são todos um inteiro de um valor de O ou 1, com c = 1

d + g = 1,

e = 1,

o, p, q são independentemente uns dos outros 0 ou 1, com 0 representando a ausência e com 1 representando a presença do correspondente polipeptídeo na correspondente posição do dito conjugado.

A presente invenção também compreende um ácido nucleico codificando um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção. Um outro aspecto da invenção é uma linha de células compreendendo um ácido nucleico codificando um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção.

A presente invenção também compreende um processo para a produção de um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção, compreendendo as etapas de

a) cultura de uma célula hospedeira compreendendo um ácido nucleico codificando um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção sob condições apropriadas para a expressão do conjugado de polipeptídeos, e

b) recuperação de conjugado de polipeptídeos da célula ou do meio de cultura.

O termo "sob condições apropriadas para a expressão do conjugado de polipeptídeos" representa condições que são usadas para a cultura de uma célula expressando um polipeptídeo heterólogo e que são conhecidas ou podem ser facilmente determinadas por aqueles versados na técnica.

É também conhecido por aqueles versados na técnica que estas condições podem variar dependendo do tipo de célula cultivada e o tipo de polipeptídeo expresso. Em geral a célula é cultivada em uma temperatura, por exemplo, entre 20°C e 40°C, e por um período de tempo suficiente para permitir efetiva produção do conjugado de polipeptídeos, por exemplo, por 4 a 28 dias.

Em uma concretização a célula hospedeira é uma célula mamífera.

A invenção ainda compreende uma composição farmacêutica, contendo um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção, ou um seu sal farmaceuticamente aceitável junto com um excipiente ou veículo farmaceuticamente aceitável.

Como aqui usado, "veículo farmaceuticamente aceitável" inclui

qualquer e todos os solventes, meios de dispersão, revestimentos, agentes antibacterianos e antifungos, agentes de retardo de ressorção/absorção e isotônicos, e similares que são fisiologicamente compatíveis. Preferivelmente, o veículo é apropriado para injeção ou infusão. Veículos farmaceutíca

mente aceitáveis incluem soluções ou dispersões aquosas estéreis e pulverizados estéreis para a preparação de soluções ou dispersões injetáveis estéreis. O uso de tais meios e agentes para substâncias farmaceuticamente ativas é conhecido na técnica. Em adição à água, o veículo pode ser, por exemplo, uma solução salina isotônica tamponada.

Independente da via de administração selecionada, os compos

tos da presente invenção, que podem ser usados em uma apropriada forma hidratada, e/ou as composições farmacêuticas da presente invenção, são formuladas em formas de dosagem farmaceuticamente aceitáveis através de processos convencionais conhecidos por aqueles versados na técnica.

Níveis de dosagem reais dos ingredientes ativos nas composições farmacêuticas da presente invenção podem ser variados de modo a obter-se uma quantidade do ingrediente ativo, que seja efetiva para obtenção de desejada resposta terapêutica para um particular paciente, composição, e modo de administração, sem ser tóxica para o paciente. O nível de dosagem selecionado dependerá de uma variedade de fatores fármaco cinéticos incluindo a atividade das particulares composições da presente invenção empregadas, a via de administração, o tempo de administração, a taxa de excreção do particular composto sendo empregado, outros fármacos, compostos e/ou materiais usados em combinação com as particulares composições empregadas, a idade, sexo, peso, condição, saúde geral e história médica anterior do paciente sendo tratado, e fatores similares bemconhecidos nas técnicas médicas.

A invenção ainda compreende o uso de um conjugado de polipeptídeos de acordo com a invenção para a fabricação de um medicamento para o tratamento de infecções virais. Preferivelmente a infecção viral é uma infecção de HIV. A invenção também compreende o uso de um conjugado 20 de polipeptídeos de acordo com a invenção para o tratamento de um paciente em necessidade de um tratamento antiviral. A invenção também compreende o uso de um conjugado de acordo com a invenção para o tratamento de um paciente sofrendo de síndromes de imunodeficiência como AIDS.

Os seguintes exemplos, listagem de seqüências e figuras são providos para auxílio no entendimento da presente invenção, o verdadeiro escopo da qual é mostrado nas reivindicações apostas. É entendido que modificações podem ser feitas nos procedimentos mostrados sem se fugir do espírito da invenção.

Descrição das Figuras Figura 1 mapa de plasmídeo anotado de pQE80_C1qA.

Figura 2 mapa de plasmídeo anotado de pQE80_Rob 1 (proteína de fusão T1357-C1qA). Figura 3 mapa de plasmídeo anotado de pQE80_Rob 2 (proteína de fusão C1qA-T1357).

Figura 4 16% tricina SDS-PAGE de proteína purificada a1) não-reduzida, a2) reduzida (Faixa 1 IB-Preparação Rob I, Faixa 2 IB-Preparação Rob II, 5 Faixa 3 Lavagem Rob I, Faixa 4 Lavagem Rob II, Faixa 5 biomassa Rob I, Faixa 6 Biomassa Robll); b) Faixas 7, 8 e 9 IB - Preparação de C1qA reduzida, Faixas 10 e 12 Biomassa C1qA reduzida, Faixas 13, 14 e 15 IBPreparação de C 1qA não-reduzida).

Figura 5 Western blot com um peptídeo abrangendo aminoácidos de g p41 pos ições 593-621.

Figura 6 Análise da atividade de ROB Il e T-1249 em ensaios de fusão inibição.

Exemplo 1

Materiais e Processos Informação geral com relação a seqüências de nucleotídeos de

cadeias leve e pesada de imunoglobulinas humanas é dada em: Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins og Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991). Aminoácidos de cadeias de anticorpos são numerados de acordo com numeração EU (E20 delman, G.M., et al., Proc. Natl. Acad. Sei. USA 63 (1969) 78-85; Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, (1991)).

Técnicas de DNA Recombinante

Processos padrão foram usados para manipular DNA como descrito em Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A Iaboratory manual; Cold spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989. Os reagentes de biologia molecular foram usados de acordo com as instruções dos fabricantes.

Síntese de Gene

Segmentos de gene desejados foram preparados a partir de oli

gonucleotídeos obtidos através de síntese química. Os segmentos de gene de comprimento de 100 a 600 pb, que são flanqueados por sítios de clivagem endonuclease de restrição singulares, foram montados por anelamento e ligação de oligonucleotídeos incluindo amplificação de PCR e subsequentemente clonados via os sítios de restrição Eco R1/Hindlll no vetor pQE80L (Qiagen, Hilden, Germany). A seqüência de DNA dos fragmentos de gene subclonados foi confirmada por sequenciamento de DNA.

Determinação de Proteína

A concentração de proteína do conjugado foi determinada através de determinação de densidade ótica (OD) em 280 nm, usando o coeficiente de extinção molar calculado nas bases da seqüência de aminoácidos.

Exemplo 2

Construção dos plasmídeos de expressão

O vetor de expressão pQE80 bacteriano baseado em RNA polimerase foi adquirido de Qiagen (Hilden, Germany).

Os sítios de restrição EcoRI e Hindlll foram usados para a inserção da seqüência de ácido nucleico codificando C1qA (SEQ ID N0: 6) para gerar plasmídeo de expressão pQE80_C1qA (para mapa de plasmídeo anotado vide Figura 1). Os sítios de restrição EcoRI e Hindlll foram usados para a inserção da seqüência codificando o conjugado compreendendo em direção de terminal N para C o peptídeo antifusogênico T-1357 e C1qA (SEQ ID N0: 49, 50) para gerar plasmídeo de expressão pQE80_Rob I (para mapa de plasmídeo anotado vide Figura 2). Os sítios de restrição EcoRI e Hindlll foram usados para a inserção da seqüência codificando o conjugado compreendendo em direção de terminal N para C o C1qA e T-1357 (SEQ ID N0: 51) para gerar plasmídeo de expressão pQE80_Rob 2 (para mapa de plasmídeo anotado vide figura 3).

Exemplo 3

Produção e purificação dos conjugados de polipeptídeos

Células de E.coli foram transformadas com os plasmídeos de expressão obtidos no Exemplo 2. As bactérias transformadas foram selecionadas através de resistência à ampicilina. Culturas de partida com OD de

0,1 OD/ml foram inoculadas. Culturas foram desenvolvidas em meio SB (32 g peptona, 20 g extrato de levedura, 5 g de NaCI e 5 ml de NaOH a 1 M ad 1 L de água) suplementado com 0,5 pg/ml de ampicilina a 37°C. A cultura foi terminada após atingir uma OD 600 nm maior que 0,8 a 1,0. O caldo de cultura foi centrifugado e as células no pélete foram rompidas com alta pressão em um tampão contendo 12,11 g/L de TRIS-hidróxi meti lamino metano 5 (TRIS), MgSO4 a 1 mM, pH ajustado com HCI 25% (peso/volume) para 7,0. Por 100 mg de biomassa, 500 ml de tampão foram usados. Após rompimento de células a suspensão foi centrifugada. O pélete foi lavado com uma solução contendo 200 ml/L de Brij 30% (peso/volume), NaCI a 1,5 M, e EDTA 60 mM, com o pH ajustado para 7,0. Após uma segunda etapa de centrifu10 gação IBs foram lavados com TRIS a 100 mM, EDTA a 20 mM, pH 6,5. Após a etapa de centrifugação final IBs foram centrifugados e estocados a -20°C. Homogeneidade da amostra foi confirmada com SDS-PAGE. Nenhuma etapa de purificação adicional foi necessária.

IBs foram solubilizados em KOH a 30 mM em pH 11, de 5 a 12,0 através de agitação, por 30 minutos à temperatura ambiente. Após completa solubilização das amostras, renaturação seguida por pulsação de solubilizado em uma solução tampão de borato a 50 mM, pH 8,5, para uma concentração máxima de 0,3 mg/ml.

Exemplo 4

Análise de expressão usando SDS PAGE

Os conjugados renaturados foram processados por eletroforese em gel de poliacrilamida - dodecil sulfato de sódio (SDS) (SDS-PAGE) de acordo com Schagger, H. e von Jagow, G., Anal Biochem. 166 (1997) 368- 379.

SDS-PAGE

Tampão amostra LDS, concentrado quatro vezes (4x): 4 g glicerol, 0,682 g TRIS-Base, 0,666 g TRIS-cloridrato, 0,8 g LDS (dodecil sulfato de lítio), 0,006 g de EDTA (ácido etileno diamino tetra-acético), 0,75 ml de uma solução 1% em peso (peso/peso) de Serva Blue G250 em água, 0,75 30 ml de uma solução 1% em peso (peso/peso) de vermelho fenol, adicionar água para obter um volume total de 10 ml.

O conjugado de polipeptídeo renaturado foi centrifugado para remoção de debris. Uma alíquota do sobrenadante clarificada foi misturada com 1X volume (v/v) de tampão amostra 4xLDS e 1/10 volume (v/v) de 1,4- ditiotreitol (DTT) a 0,5 M. Então as amostras foram incubadas por 10 minutos a 70°C e proteína separada por SDS-PAGE. O sistema de gel NuPAGE Pre5 Cast (Invitrogen) foi usado de acordo com as instruções do fabricante. Em particular, 10% NuPAGE Novex Bis-TRIS Pre-Cast géis (pH 6,4) e um tampão de corrida NuPAGE MOPS foram usados.

Exemplo 5

Construção do plasmídeo de expressão O vetor de expressão pQE80 bacteriano baseado em T5 RNA

polimerase foi adquirido de Qiagen (Hilden, Germany).

Os sítios de restrição EcoRI e Hindlll são usados para a inserção da seqüência de ácido nucleico codificando o conjugado de cadeia leve de anticorpo anti-CCR5 - C1qA-T-1249 para gerar plasmídeo de expressão pQE80_Rob 3.

Exemplo 6

Ensaio de fusão de célula - célula

É descrito um ensaio baseado em linha de célula para a avaliação de neutralização de vírus tipo 1 de imunodeficiência humana (HIV-1). O 20 ensaio é baseado em células CEM.NKR, transfectadas para expressarem o correceptor de HIV-1 CCR5 para suplemento de expressão endógena de CD4 e o correceptor CXCR4. As resultantes células CEM.NKR-CCR5 replicam eficientemente isolados de HIV-1 primários de ambos fenótipos R5 e X4. Uma comparação das células CEM.NKR-CCR5 com células mononucle25 ares de sangue periférico ativadas com mitógeno (PBMC) em ensaios de neutralização com soros de indivíduos infectados com HIV-1 ou anticorpos monoclonais anti-HIV-1 específicos mostra que a sensitividade de neutralização de HIV-1 é similar nos dois tipos de células.

No dia 1, células HeLa expressando gp160 (2x104 células/50 pL/cavidade) são semeadas em uma placa de microtitulação de 96 microlitros branca em meio DMEM suplementado com FCS 10% e 2 pg/ml de doxiciclina. No dia 2, 100 μL de amostra de sobrenadante ou controle anticorpo por cavidade são adicionados em uma placa de microtitulação de 96 cavidades clara. Então 100 pL contendo 8x104 CEM-NKr-Luccélulas em suspensão em meio são adicionados e incubados 30 minutos a 37°C. O meio de cultura de células HeLa é aspirado da placa de 96 cavidades, 100 μί de 200 pL de 5 mistura de anticorpo/CEM-NKr-Luc são adicionados e incubados por toda noite a 37°C. No dia 3, 100 pL/cavidade de substrato de ensaio Bright-Glo Luciferase (1,4-ditiotreitol e ditionito de sódio; Promega Corp., USA) são adicionados e luminescência é medida após um mínimo de 15 minutos de incubação à temperatura ambiente.

Materiais

Células HeLa-R5-16 (linha de células para expressão de gp160 de HIV com indução com doxiciclina) são cultivadas em meio DMEM contendo nutrientes e FCS 10% com 400 pg/ml de G418 e 200 pg/ml de Higromicina B. CEM.NKR-CCR5-Luc (Número de catálogo: 5198, uma linha de 15 célula-T disponível de NIH AIDS Research & Reference Reagent Program McKesson BioServices Corporation Germantown, MD 20874, USA). Célula tipo: CEM.NKR-CCR5 (Cat. #4376) é transfectada (eletroporação) para expressar o gene Iuciferase sob o controle transcricional de LTR de HIV-2 e propagada em RPMI 1640 contendo 10% de soro fetal bovino, glutamina a 4 20 mM, penicilina/streptomicina (100 U/ml penicilina, 100 pg/ml streptomicina), e 0,8 mg/ml de sulfato de geniticina (G418). Características de crescimento: células Iinfoides redondas, morfologia não muito variável. Células crescem em suspensão como células simples, que podem formar pequenos grumos. Dividir 1:10 duas vezes por semana. Características especiais: expressar 25 atividade Iuciferase após transativação da LTR de HIV-2. Apropriadas para infecção com isolados de HIV primários, para ensaios de sensitividade de fármaco e neutralização (Spenlehauer, C., et al., Virology 280 (2001) 292- 300; Trkola, A., et al., J. Virol. 73 (1999) 8966-8974). A linha de células foi obtida através de NIH AIDS Research and Reference Reagent Program, Nl30 AID, NIH de Drs. John Moore e Catherine Spenlehauer. Tampão de ensaio Bright-Glo Luciferase (Promega Corp. USA, Part N0 E2264B), Bright-GIo, substrato de ensaio de Luciferase (Promega Corp. USA, Part N0 EE26B). Exemplo 7

Determinação da afinidade de ligação de polipeptídeos

Afinidades de ligação de polipeptídeos baseada na interação de HR1-HR2 da proteína gp41 de HIV-1 (HR, região 1 e 2 de repetição heptavalente) foram medidas por ressonância de plasmons de superfície (SPR) usando um instrumento BIAcore 3000 (Pharmacia, Uppsala, Sweden) a 25°C.

O sistema BIAcore é bem estabelecido para o estudo de interações de moléculas. Ele permite um monitoramento de tempo real contínuo de ligações de ligante/analito e assim a determinação de constantes de taxa 10 de associação (Ka), constantes de taxa de dissociação (Kd)1 e constantes de equilíbrio (KD). Tecnologia SPR é baseada na medição do índice de refração próximo da superfície de um chip biossensor revestido com ouro. Mudanças no índice de refração indicam mudanças de massa sobre a superfície causadas pela interação de Iigante imobilizado com analito injetado em solução. 15 Se as moléculas ligam Iigante imobilizado sobre a superfície a massa aumenta, em caso de dissociação a massa diminui.

Ensaio de Ligação

O chip sensor SA (SA, streptavidina) foi pré-lavado através de três injeções de 1 minuto consecutivas de NaCI a 1 M em NaOH a 50 mM. 20 Então o peptídeo HR1 biotinilado Biotina-T-2324 (SEQ ID N°: 52) foi imobilizado sobre um chip sensor revestido com SA. Para evitar limitações de transferência de massa o valor mais baixo possível (aproximadamente 200 RU, unidades de ressonância) de peptídeo HR1 dissolvido em tampão HBSP (HEPES a 10 mM, pH 7,4, NaCI a 150 mM, 0,005% (v/v) tensoativo P20) 25 foi carregado sobre o chip-SA. Antes de medições serem iniciadas o chip foi regenerado uma primeira vez com um pulso de um minuto de dodecil sulfato de sódio (SDS) 0,5% (peso/volume) em uma taxa de fluxo de 50 pL/minuto.

Os conjugados de polipeptídeos a serem analisados foram primeiro dissolvidos em NaHCO3 a 50 mM, pH 9, em uma concentração de cerca de 1 mg/ml e então diluídos em tampão HPS-P para várias concentrações variando de 25 a 1,95 nM. O tempo de contato de amostra foi de 5 minutos (fase de associação). A seguir a superfície de chip foi lavada com HBS-P por 5 minutos (fase de dissociação). Todas as interações foram realizadas a exatamente 25°C (temperatura padrão). Durante um ciclo de medição as amostras foram estocadas a 12°C. Sinais foram detectados em uma taxa de detecção de um sinal por segundo. Amostras foram injetadas em concentra5 ções crescentes em uma taxa de fluxo de 50 pL/minuto sobre o elemento biossensor acoplado a HR1. A superfície foi regenerada por lavagem de 1 minuto com solução de SDS 0,5% (peso/volume) em uma taxa de fluxo de 50 ML/minuto.

As constantes de equilíbrio (KD), definidas como Ka/Kd foram de10 terminadas através de análise de curvas de sensorgrama obtidas com várias concentrações diferentes, usando o pacote de software BIAevaIuation 4.1. Ligação não-específica foi corrigida através de subtração de valor resposta de uma interação de polipeptídeo contendo HR2 com a superfície de Streptavidina livre a partir de valor da interação HR2-HR1. A adaptação dos dados 15 seguiu o modelo de ligação Langmuir 1:1.

Tabela 5: Análise BIAcore da ligação á região HR1

Nome de amostra ka [1/ms] kd [1/s] Ka [1/M] Kd [M] T-1249 6.4 x 105 8.45 x 10-4 7.56 x 108 1.32 x 10'9 Rob 1 8.8 x 104 4.76x10'4 1.85 x 108 5.41 x 10’9 Rob 2 3.5 x 104 3.11 x IO'5 1.13x109 8.88 x 10'10 Exemplo 8 Análise Western blot

As seguintes amostras (15 pL cada = 1-5 μς) foram transferidas para 10% Bis-TRIS NuPAGE-GeI sob condições redutoras.

Faixa 1 multimarcador Faixa 2 tampão borato Faixa 3 T-1249 (aprox. 5 kDa) Faixa 4 Rob I (26 kDa) Faixa 5 Rob Il (25 kDa) Faixa 6 C 1qA (28 kDa) Faixa 7 vazia Faixa 8 Mark mágica Tampão de transferência: glicina a 192 mM, TRIS a 25 mM, metanol 20% (v/v).

Após SDS-PAGE os conjugados separados foram transferidos eletroforeticamente (25 V, 1 hora) para uma membrana de filtro de PVDF (tamanho de poro: 0,45 pm, Invitrogen Corp.) de acordo com o processo de manchamento semisseco de Burnette (Burnette, W.N., Anal. Biochem. 112 (1981) 195-203).

Após a mancha a membrana foi imersa em agente de bloqueio de membrana 5% (Amersham Biosciences) em TBST (1 I tampão TRIS a 10 10 mM, suplementado com NaCI a 150 mM, Tween® 20 1 ml ajustado para pH 7,5) por aproximadamente 30 minutos à temperatura ambiente com agitação e a seguir a 4°C por toda noite. Após a etapa de bloqueio a membrana é lavada por três vezes com TBST.

Para detecção a membrana bloqueada foi incubada com o peptídeo biotinilado HIV-gp41P2(593-621)-Bi com agitação por 3 horas com 5 pg/ml de TBST, CaCI2 a 0,15 mM e MgCI2 a 12 mM,

Após a etapa de desenvolvimento a membrana foi lavada com TBST e incubada com substrato de Western blotting Lumi-Lightpujs e a seguir desenvolvida (vide Figura 4 para gel SDS e Figura 5 para Western blot). Seqüência de Listagem

<110> F. Hoffmann-La Roche AG

<120> Conjugados complemento - peptídeo

<130> 24171

<150> EP 07005096.8

<151> 2007-03-13

<160> 52

<170> Patentin version 3.2

<210> 1

<211> 223

<212> PRT

<213> Homo sapiens

<400> 1 Glu Asp Leu Cys Arg Ala Pro Asp Gly Lys Lys Gly Glu Ala Gly Arg 15 10 15

Pro Gly Arg Arg Gly Arg Pro Gly Leu Lys Gly Glu Gln Gly Glu Pro 20 25 30

Gly Ala Pro Gly Ile Arg Thr Gly Ile Gln Gly Leu Lys Gly Asp Gln 35 40 45

Gly Glu Pro Gly Pro Ser Gly Asn Pro Gly Lys Val Gly Tyr Pro Gly 50 55 60

Pro Ser Gly Pro Leu Gly Ala Arg Gly Ile Pro Gly Ile Lys Gly Thr 65 70 75 80

Lys Gly Ser Pro Gly Asn Ile Lys Asp Gln Pro Arg Pro Ala Phe Ser 85 90 95

Ala Ile Arg Arg Asn Pro Pro Met Gly Gly Asn Val Val Ile Phe Asp 100 105 110

Thr Val Ile Thr Asn Gln Glu Glu Pro Tyr Gln Asn His Ser Gly Arg 115 120 125

Phe Val Cys Thr vai Pro Gly Tyr Tyr Tyr Phe Thr Phe Gln vai Leu 130 135 140

ser Gln Trp Glu Ile Cys Leu Ser He Val Ser ser ser Arg Gly Gln 145 150 155 160

vai Arg Arg Ser Leu Gly Phe Cys Asp Thr Thr Asn Lys Gly Leu Phe 165 170 175

Gln Val Val Ser Gly Gly Met vai Leu Gln Leu Gln Gln Gly Asp Gln 180 185 190

vai Trp vai Glu Lys Asp Pro Lys Lys Gly His Ile Tyr Gln Gly Ser 195 200 205

Glu Ala Asp Ser Val Phe Ser Gly Phe Leu Ile Phe Pro Ser Ala 210 215 220

<210> 2 <211> 17

<212> PRT

<213> Homo sapiens <400> 2

Lys Gly Ser ργο Gly Asn ile Lys Asp Gln Pro Arg Pro Ala Phe ser 15 10 15

Ala

<210> 3 <211> 18 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 3

Lys Gly ser Pro Gly Asn Ile Lys Asp Gln Pro Arg Pro Ala Phe Ser 15 10 15

Ala Ile <210> 4 <211> 31 <212> PRT

<213> Homo sapiens <400> 4

Gly Ala Arg Gly Ile ργο Gly Ile Lys Gly Thr Lys Gly Ser Pro Gly 15 10 15

Asn ile Lys Asp Gln Pr ο Arg Pro Ala Phe ser Ala He Arg Arg 20 25 30

<210> 5 <211> 154 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 5

Gly Ala Arg Gly ile Pro Gly ile Lys Gly Thr Lys Gly Ser Pro Gly 15 10 15

Asn Ile Lys Asp Gln Pro Arg Pro Ala Phe Ser Ala Ile Arg Arg Asn 20 25 30

Pro Pro Met Gly Gly Asn Val Val Ile Phe Asp Thr Val ile Thr Asn 35 40 45 Gln Glu Glu Pro Tyr Gln Asn His Ser Gly Arg Phe Val Cys Thr vai 50 55 60

Pro Gly Tyr Tyr Tyr Phe Thr Phe Gln vai Leu ser Gln Trp Glu Ile 65 70 75 80

Cys Leu ser Ile Val Ser Ser Ser Arg Gly Gln Val Arg Arg Ser Leu

85 90 95

Gly Phe Cys Asp Thr Thr Asn Lys Gly Leu Phe Gln Val Val Ser Gly 100 105 110

Gly Met vai Leu Gln Leu Gln Gln Gly Asp Gln Val Trp Val Glu Lys 115 120 125

Asp Pro Lys Lys Gly His Ile Tyr Gln Gly Ser Glu Ala Asp ser vai 130 135 140

Phe ser Gly Phe Leu Ile Phe Pro ser Ala 145 150

<210> 6 <211> 179 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 6

Lys Gly Asp Gln Gly Glu Pro Gly Pro Ser Gly Asn Pro Gly Lys Val 15 10 15

Gly Tyr Pro Gly Pro Ser Gly Pro Leu Gly Ala Arg Gly Ile Pro Gly 20 25 30

Ile Lys Gly Thr Lys Gly Ser Pro Gly Asn Ile Lys Asp Gln Pro Arg 35 40 45

Pro Ala Phe ser Ala Ile Arg Arg Asn Pro Pro Met Gly Gly Asn Val 50 55 60

Val ile Phe Asp Thr vai Ile Thr Asn Gln Glu Glu Pro Tyr Gln Asn 65 70 75 80

His Ser Gly Arg Phe Val Cys Thr Val Pro Gly Tyr Tyr Tyr Phe Thr

85 90 95 Phe Gln Val Leu Ser Gln Trp Glu Ile Cys Leu Ser Ile Val Ser ser 100 105 110

Ser Arg Gly Gln vai Arg Arg ser Leu Gly Phe Cys Asp Thr Thr Asn 115 120 125

Lys Gly Leu Phe Gln vai vai ser Gly Gly Met vai Leu Gln Leu Gln 130 135 140

Gln Gly Asp Gln Val Trp Val Glu Lys Asp Pro Lys Lys Gly His Ile 145 150 155 160

Tyr Gln Gly ser Glu Ala Asp Ser vai Phe Ser Gly Phe Leu Ile Phe 165 170 175

Pro Ser Ala <210> 7 <211> 345 <212> PRT

<213> vírus de imunodeficiência humana tipo 1 <220>

<221> caracten'stica_misc

<223> gp41 de HIV-1 (posição 507-851 de gp 160 de bh8)

<400> 7

Ala vai Gly Ile Gly Ala Leu Phe Leu Gly Phe Leu Gly Ala Ala Gly 15 10 15

Ser Thr Met Gly Ala Ala Ser Met Thr Leu Thr vai Gln Ala Arg Gln 20 25 30

Leu Leu Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu Leu Arg Ala ile 35 40 45

Glu Gly Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp Gly ile Lys Gln 50 55 60

Leu Gln Ala Arg ile Leu Ala vai Glu Arg Tyr Leu Lys Asp Gln Gln 65 70 75 80

Leu Leu Gly Ile Trp Gly Cys Ser Gly Lys Leu Ile Cys Thr Thr Ala

85 90 95 Val Pro Trp Asn Ala Ser Trp Ser Asn Lys Ser Leu Glu Gln Ile Trp 100 105 110

Asn Asn Met Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr 115 120 125

Ser Leu He His ser Leu He Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys 130 135 140

Asn Glu Gln Glu Leu Leu Glu Leu Asp Lys Trp Ala Ser Leu Trp Asn 145 150 155 160

Trp Phe Asn Ile Thr Asn Trp Leu Trp Tyr Ile Lys Leu Phe Ile Met 165 170 175

ile Val Gly Gly Leu Val Gly Leu Arg Ile Val Phe Ala Val Leu Ser 180 185 190

Ile Val Asn Arg Val Arg Gln Gly Tyr Ser Pro Leu Ser Phe Gln Thr 195 200 205

His Leu Pro Asn Pro Arg Gly Pro Asp Arg Pro Glu Gly Ile Glu Glu 210 215 220

Glu Gly Gly Glu Arg Asp Arg Asp Arg ser Ile Arg Leu Val Asn Gly 225 230 235 240

Ser Leu Ala Leu Ile Trp Asp Asp Leu Arg Ser Leu Cys Leu Phe Ser 245 250 255

Tyr His Arg Leu Arg Asp Leu Leu Leu ile Val Thr Arg Ile vai Glu 260 265 270

Leu Leu Gly Arg Arg Gly Trp Glu Ala Leu Lys Tyr Trp Trp Asn Leu 275 280 285

Leu Gln Tyr Trp Ser Gln Glu Leu Lys Asn ser Ala Val Asn Leu Leu 290 295 300

Asn Ala Thr Ala Ile Ala vai Ala Glu Gly Thr Asp Arg vai Ile Glu 305 310 315 320

Leu Val Gln Ala Ala Tyr Arg Ala Ile Arg His Ile Pro Arg Arg ile 325 330 335

Arg Gln Gly Leu Glu Arg Ile Leu Leu 340 345 <210> 8 <211> 38 <212> PRT <213> Arti fi < <220> <22 3> DP-107 <400> 8 Asn Asn Leu Leu Arg Ala Ile Glu Ala Gln Gln His Leu Leu Gln Leu 15 10 15

Thr Val Trp Gly ile Lys Gln Leu Gln Ala Arg ile Leu Ala Val Glu 20 25 BO

Arg Tyr Leu Lys Asp Gln 35

<210> 9 <211> 38

<212> PRT <213> Artificial <220>

<223> dp-178 <400> 9

Gln Gln Glu Lys Asn Glu Gln Asp Leu Leu Ala Leu Asp Lys Trp Ala 15 10 15

Ser Leu Trp Thr Trp Phe Asp Ile Ser His Trp Leu Trp Tyr Ile Lys 20 25 30

Ile Phe ile Met ile Val 35

<210> 10 <211> 34 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> C-34 <400> 10

Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr Ser Leu Ile His 15 10 15

ser Leu ile Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys Asn Glu Gln Glu 20 25 30

Leu Leu <210> 11 <211> 36 <212> PRT 10 <213> Artificial <220>

<223> Ν-36 <400> 11

Ser Gly ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu Leu Arg Ala He Glu Ala 1 5 10 15

Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp Gly Ile Lys Gln Leu Gln 20 25 30

Ala Arg Ile Leu 35

<210> 12 <211> 36 <212> PRT <213> Artificial <220>

<22 3> Τ-20 <400> 12

Tyr Thr Ser Leu Ile His Ser Leu Ile Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln 15 10 15

Glu Lys Asn Glu Gln Glu Leu Leu Glu Leu Asp Lys Trp Ala Ser Leu 20 25 30

Trp Asn Trp Phe 35 <210> 13

<211> 36

<212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> Τ-651 <400> 13

Met Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr Ser Leu 15 10 15

Ile His Ser Leu Ile Glu Glu Ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys Asn Glu 20 25 30

Gln Glu Leu Leu 35

<210> 14 <211> 39 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> Τ-1249 <400> 14

Trp Gln Glu Trp Glu Gln Lys Ile Thr Ala Leu Leu Glu Gln Ala Gln 15 10 15

Ile Gln Gln Glu Lys Asn Glu Tyr Glu Leu Gln Lys Leu Asp Lys Trp 20 25 30

Ala ser Leu Trp Glu Trp Phe 35

<210> 15 <211> 39 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> τ-1357 <400> 15

Trp Gln Glu Trp Glu Gln Lys Ile Thr Ala Leu Leu Glu Gln Ala Gln 15 10 15

Ile Gln Gln Glu Lys Asn Glu Tyr Glu Leu Gln Lys Leu Asp Lys Trp 20 25 30

Ala Ser Leu Trp Glu Trp Phe 35

<210> 16 <211> 58 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> variante τ-1357 <400> 16

Met Arg Gly Ser His His His His His His Ala Ile Asp Val Ile Glu 15 10 15

Gly Arg Trp Gln Glu Trp Glu Gln Lys Ile Thr Ala Leu Leu Glu Gln 20 25 30

Ala Gln Ile Gln Gln Glu Lys Asn Glu Tyr Glu Leu Gln Lys Leu Asp 35 40 45

Lys Trp Ala ser Leu Trp Glu Trp Phe Gly 50 55

<210> 17 <211> 38 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> Τ-2635 <400> 17

Thr Thr Trp Glu Ala Trp Asp Arg Ala ile Ala Glu Tyr Ala Ala Arg 15 10 15 Ile Glu Ala Leu ile Arg Ala Ala Gln Glu Gln Gln Glu Lys Asn Glu 20 25 30

Ala Ala Leu Arg Glu Leu 35

<210> 18

<211> 123 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> mutante simples variante de ectodomínio de gp41 de Hiv-l: <400> 18

val Gln Ala Arg Gln Leu Leu Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn 15 10 15

Leu Leu Arg Ala ile Glu Gly Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr val 20 25 30

Trp Gly Pro Lys Gln Leu Gln Ala Arg ile Leu Ala val Glu Arg Tyr 35 40 45

Leu Lys Asp Gln Gln Leu Leu Gly Ile Trp Gly Cys ser Gly Lys Leu 50 55 60

Ile Cys Thr Thr Ala Val Pro Trp Asn Ala Ser Trp Ser Asn Lys ser 65 70 75 80

Leu Glu Gln Ile Trp Asn Asn Met Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu 85 90 95

Ile Asn Asn Tyr Thr Ser Leu ile His Ser Leu Ile Glu Glu Ser Gln 100 105 110

Asn Gln Gln Glu Lys Asn Glu Gln Glu Leu Leu 115 120

<210> 19 <211> 132 <212> PRT

<213> Artificial <220>

I568P <223> mutante quádruplo variante de ectodomínio de gp41 de mv-1: I568P, L550E, L566E, I580E <400> 19

Met Gly Ala Ala Ser Met Thr Leu Thr val Gln Ala Arg Gln Leu Leu 1 5 10 15

Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Glu Leu Arg Ala Ile Glu Gly 20 25 30

Gln Gln His Leu Glu Gln Leu Thr Val Trp Gly Pro Lys Gln Leu Gln 35 40 45

Ala Arg Glu Leu Ala Val Glu Arg Tyr Leu Lys Asp Gln Gln Leu Leu 50 55 60

Gly Ile Trp Gly Cys ser Gly Lys Leu Ile Cys Thr Thr Ala val Pro 65 70 75 80

Trp Asn Ala Ser Trp ser Asn Lys ser Leu Glu Gln Ile Trp Asn Asn 85 90 95

Met Thr Trp Met Glu Trp Asp Arg Glu Ile Asn Asn Tyr Thr ser Leu 100 105 110

ile His ser Leu Ile Glu Glu ser Gln Asn Gln Gln Glu Lys Asn Glu 115 120 125

Gln Glu Leu Leu 130 <210> 20 <211> 7 <212> PRT 25 <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 1 <400> 20

Leu ser Leu Ser Pro Gly Lys

1 5

<210> 21 <211> 8 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 2

<400> 21

Leu Ser Pro Asn Arg Gly Glu Cys 1 5

<210> 22 <211> 15 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 3 <400> 22

Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Gln 15 10 15

<210> 23 <211> 16 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 4 <400> 23

Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Gln Gly 1 5 10 15

<210> 24 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial

<220>

<223> polipetideo Iigante 5 <400> 24 Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Gln Gly Gln Gln Gln Gln Gly 15 10 15

Asn Asn <210> 25

<211> 16

<212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 6 <400> 25

Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly 15 10 15

<210> 26 <211> 16 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 7 <400> 26

Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Asn 15 10 15

<210> 27 <211> 15 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 8 <400> 27

ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly 1 5 10 15

<210> 28 <211> 16 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 9 <400> 28

Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly 15 10 15

<210> 29 <211> 17 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 10 <400> 29

Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly 15 10 15

Thr

<210> 30 <211> 17 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> polipetideo Iigante 11 <400> 30

Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly ser Gly Gly Gly Gly Gly 15 10 15

Gly

<210> 31 <211> 18 <212> PRT

<213> Artificial <220> <223> polipetideo ligante 12 <400> 31

ser Gly Gly Gly Gly ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly 15 10 15

Gly Thr <210> 32 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial 10 <220>

<223> polipetideo ligante 13 <400> 32

Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly 15 10 15

Gly Asn <210> 33 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial 20 <220>

<223> polipetideo ligante 14 <400> 33

Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly 15 10 15

Ala ser <210> 34 <211> 25 <212> PRT <213> Artificial

<220>

<223> polipetideo ligante 15 <400> 34 Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 15 10 15

Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly 20 25

<210> 35 <211> 26 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 16 <400> 35

Ser Gly Gly Gly Gly ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 15 10 15

Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly

20 25

<210> 36 <211> 27 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 17 <400> 36

Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 15 10 15

Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly 20 25

<210> 37 <211> 28 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 18 <400> 37

ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser 15 10 15

Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Gly Ala Ser 5 20 25

<210> 38 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 19 <400> 38

Gly Ser Ser Ser Ser Ser Ser Ser Ser Ser Ser Ser ser Ser Ser ser 15 10 15

Gly

<210> 39 <211> 19 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 20 <400> 39

Gly ser ser ser Ser ser ser Ser Ser ser ser ser ser ser Ser ser 15 10 15

Gly Ala Ser <210> 40 <211> 18 <212> PRT <213> Artificial

<220>

<223> polipetideo ligante 24 <400> 40 Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 15 10 15

Ala Ser <210> 41

<211> 16

<212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 25 <400> 41

Gly Gly Gly Gly ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 15 10 15

<210> 42 <211> 26 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 26 <400> 42

Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 15 10 15

Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 20 25

<210> 43 <211> 17 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 27 <400> 43

Gly Gly Gly Gly ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 15 10 15 Gly

<210> 44 <211> 27 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 28 <400> 44

Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly 1 5 10 15

Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly ser Gly Gly 20 25

<210> 45 <211> 6 <212> PRT

<213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 29 <400> 45 Leu ser Leu ser Gly Gly I 5

<210> 46 <211> 7 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 30 <400> 46

Leu Ser Leu Ser Pro Gly Gly

ι 5

<210> 47 <211> 20 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> polipetideo ligante 31 <400> 47

Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 15 10 15

Gly Gly Gly Ser 20

<210> 48 <211> 23 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> Polipetideo ligante 32 <400> 48

Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 15 10 15

Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly 20 20 <210> 49 <211> 237 <212;· PRT <213> Artificial

<220>

<223> Τ-1357 - ClqA <400> 49

Met Arg Gly Ser His His His His His His Ala ile Asp Val ile Glu 15 10 15

Gly Arg Trp Gln Glu Trp Glu Gln Lys Ile Thr Ala Leu Leu Glu Gln 20 25 30 Ala Gln Xle Gln Gln Glu Lys Asn Glu Tyr Glu Leu Gln Lys Leu Asp 35 40 45

Lys Trp Ala Ser Leu Trp Glu Trp Phe Gly Lys Gly Asp Gln Gly Glu 50 55 60

Pro Gly Pro Ser Gly Asn Pro Gly Lys val Gly Tyr Pro Gly Pro Ser 65 70 75 80

Gly Pro Leu Gly Ala Arg Gly Ile Pro Gly Ile Lys Gly Thr Lys Gly 85 90 95

Ser Pro Gly Asn Ile Lys Asp Gln Pro Arg Pro Ala Phe Ser Ala Ile 100 105 110

Arg Arg Asn Pro Pro Met Gly Gly Asn Val Val Ile Phe Asp Thr val 115 120 125

Ile Thr Asn Gln Glu Glu Pro Tyr Gln Asn His ser Gly Arg Phe val 130 135 140

Cys Thr val Pro Gly Tyr Tyr Tyr Phe Thr Phe Gln Val Leu Ser Gln 145 150 155 160

Trp Glu ile cys Leu ser Ile val ser ser ser Arg Gly Gln val Arg 165 170 175

Arg Ser Leu Gly Phe Cys Asp Thr Thr Asn Lys Gly Leu Phe Gln Val 180 185 190

val Ser Gly Gly Met val Leu Gln Leu Gln Gln Gly Asp Gln Val Trp 195 200 205

val Glu Lys Asp Pro Lys Lys Gly His Ile Tyr Gln Gly Ser Glu Ala 210 215 220

Asp Ser Val Phe Ser Gly Phe Leu Ile Phe Pro Ser Ala 225 230 235

<210> 50 <211> 233 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> ROB I <400> 50

Met Arg Gly Ser His His His His His His Ile Glu Gly Arg Trp Gln 15 10 15

Glu Trp Glu Gln Lys ile Thr Ala Leu Leu Glu Gln Ala Gln ile Gln 20 25 30

Gln Glu Lys Asn Glu Tyr Glu Leu Gln Lys Leu Asp Lys Trp Ala Ser 35 40 45

Leu Trp Glu Trp Phe Gly Lys Gly Asp Gln Gly Glu Pro Gly Pro Ser 50 55 60

Gly Asn Pro Gly Lys Val Gly Tyr Pro Gly Pro Ser Gly Pro Leu Gly 65 70 75 80

Ala Arg Gly Ile Pro Gly Ile Lys Gly Thr Lys Gly Ser Pro Gly Asn 85 90 95

Ile Lys Asp Gln Pro Arg Pro Ala Phe Ser Ala Ile Arg Arg Asn Pro

100 105 110

Pro Met Gly Gly Asn Val Val Ile Phe Asp Thr Val Ile Thr Asn Gln 115 120 125

Glu Glu Pro Tyr Gln Asn His Ser Gly Arg Phe val Cys Thr Val Pro 130 135 140

Gly Tyr Tyr Tyr Phe Thr Phe Gln Val Leu Ser Gln Trp Glu Ile Cys 145 150 155 160

Leu Ser Ile Val Ser Ser Ser Arg Gly Gln Val Arg Arg Ser Leu Gly 165 170 175

Phe Cys Asp Thr Thr Asn Lys Gly Leu Phe Gln val val ser Gly Gly 180 185 190

Met val Leu Gln Leu Gln Gln Gly Asp Gln Val Trp val Glu Lys Asp 195 200 205

Pro Lys Lys Gly His Ile Tyr Gln Gly ser Glu Ala Asp ser val Phe 210 215 220

Ser Gly Phe Leu Ile Phe Pro ser Ala 225 230

<210> 51 <211> 231 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> ROB II <400> 51

Met Arg GTy Ser His His His His His His Ile Glu Gly Arg Gly Ala 15 10 15

Arg Gly Ile Pro Gly ile Lys Gly Thr Lys Gly ser Pro Gly Asn Ile 20 25 30

Lys Asp Gln Pro Arg Pro Ala Phe ser Ala Ile Arg Arg Asn Pro Pro 35 40 45

Met Gly Gly Asn val Val ile Phe Asp Thr Val Ile Thr Asn Gln Glu 50 55 60

Glu Pro Tyr Gln Asn His Ser Gly Arg Phe Val Cys Thr Val Pro Gly 65 70 75 80

Tyr Tyr Tyr Phe Thr Phe Gln Val Leu Ser Gln Trp Glu Ile Cys Leu 85 90 95

ser ile val Ser ser ser Arg Gly Gln val Arg Arg ser Leu Gly Phe 100 105 110

Cys Asp Thr Thr Asn Lys Gly Leu Phe Gln Val val Ser Gly Gly Met 115 120 125

val Leu Gln Leu Gln Gln Gly Asp Gln val Trp val Glu Lys Asp Pro 130 135 140

Lys Lys Gly His ile Tyr Gln Gly Ser Glu Ala Asp Ser val Phe ser 145 150 155 160

Gly Phe Leu ile Phe Pro ser Ala Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser 165 170 175

Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Ser Gly Gly Gly Trp 180 185 190

Gln Glu Trp Glu Gln Lys Ile Thr Ala Leu Leu Glu Gln Ala Gln Ile 195 200 205 Gln Gln Glu Lys Asn Glu Tyr Glu Leu Gln Lys Leu Asp Lys Trp Ala 210 215 220

Ser Leu Trp Glu Trp Phe Gly 225 230

<210> 52 <211> 51 <212> PRT <213> Artificial <220>

<223> Τ-2324 <400> 52

Gln Ala Arg Gln Leu Leu Ser Gly Ile Val Gln Gln Gln Asn Asn Leu 15 10 15

Leu Arg Ala Ile Glu Ala Gln Gln His Leu Leu Gln Leu Thr Val Trp 20 25 30

Gly lle Lys Gln Leu Gln Ala Arg Ile Leu Ala Val Glu Arg Tyr Leu 35 40 45

Lys Asp Gln

Claims (11)

1. Conjugado de polipeptídeos, caracterizado pelo fato de que o dito conjugado compreende a) um primeiro polipeptídeo selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 01 e fragmentos dos mesmos, b) um segundo polipeptídeo selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos.

2. Conjugado de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelo fato de que o dito primeiro e o dito segundo polipeptídeos têm uma ordem selecionada do seguinte grupo de ordens: términus-N - primeiro polipeptídeo - segundo polipeptídeo términus-C, ou términus-N - segundo polipeptídeo - primeiro polipeptídeo términus-C.

3. Conjugado de acordo com qualquer uma das reivindicações precedentes, caracterizado pelo fato de que o dito conjugado compreende entre os ditos primeiro e segundo polipeptídeos um polipeptídeo ligante.

4. Conjugado de polipeptídeos, caracterizado pelo fato de que o dito conjugado compreende a) um primeiro polipeptídeo (1 st pp) selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 01 e fragmentos dos mesmos, b) um segundo polipeptídeo (2nd pp) selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos, c) um terceiro polipeptídeo opcional (3rd pp) selecionado do grupo de fragmentos de ligação de antígeno de anticorpos anti-CCR5, ou fragmentos de ligação de antígeno de anticorpos anti-HIV-1, ou o grupo de fragmentos de ligação de antígeno de anticorpos anti-CD4, d) um opcional polipeptídeo ligante (link pp) ligando os ditos primeiro, segundo, e/ou terceiro polipeptídeos, pelo que os polipeptídeos do dito conjugado de polipeptídeos têm uma ordem de terminal N para C de [1 st pp]a - [link pp]m - [2nd pp]b - [link pp]n - [3rd pp]c - [link pp]0 [1st pp]d - [link pp]p - [2nd pp]e - [link pp]q - [3rd pp]f - [link pp]r [1st pp]g em que a, b, c, d, e, f, g, m, n, o, p, q, r são todos um inteiro de um valor de 0 ou 1, com a + d + g = 1, b + e = 1, c + f = 0 ou 1, m, n, o, p, q, r são independentemente uns dos outros O ou 1, com 0 representando a ausência e com 1 representando a presença do correspondente polipeptídeo na correspondente posição do dito conjugado.

5. Conjugado de acordo com as reivindicações 3 ou 4, caracterizado pelo fato de que o dito polipeptídeo ligante é selecionado do grupo de polipeptídeos compreendendo da SEQ ID N0: 20 a SEQ ID N0: 48.

6. Conjugado de acordo com qualquer uma das reivindicações precedentes, caracterizado pelo fato de que o dito segundo polipeptídeo é selecionado do grupo de peptídeos antifusogênicos compreendendo da SEQ ID N0: 08 a SEQ ID N0: 19 .

7. Processo para a produção de um conjugado de polipeptídeo como definido na reivindicação 1 ou 4, caracterizado pelo fato de que o processo compreende a) cultura de uma célula hospedeira compreendendo um ácido nucleico codificando um conjugado de polipeptídeos de acordo com a reivindicação 1 ou 4, sob condições apropriadas para a expressão do conjugado de polipeptídeos, e b) recuperação de conjugado de polipeptídeos da célula ou do meio de cultura.

8. Composição farmacêutica contendo um conjugado de polipeptídeos como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6, ou um sal farmaceuticamente aceitável do mesmo junto com um excipiente ou veículo farmaceuticamente aceitável.

9. Uso de um conjugado de polipeptídeos como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6, para a fabricação de um medicamento para o tratamento de uma infecção viral.

10. Uso de acordo com a reivindicação 9, caracterizado pelo fato de que a dita infecção viral é uma infecção de HIV.

11. Uso de um conjugado de polipeptídeos como definido em qualquer uma das reivindicações 1 a 6, para o tratamento de um paciente em necessidade de um tratamento antiviral.