BRPI0609602A2 - polinucleotìdeos eg117 e eg307 e seus usos - Google Patents

polinucleotìdeos eg117 e eg307 e seus usos Download PDF

Info

Publication number
BRPI0609602A2
BRPI0609602A2 BRPI0609602-6A BRPI0609602A BRPI0609602A2 BR PI0609602 A2 BRPI0609602 A2 BR PI0609602A2 BR PI0609602 A BRPI0609602 A BR PI0609602A BR PI0609602 A2 BRPI0609602 A2 BR PI0609602A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
seq
lys
pro
polynucleotide
plant
Prior art date
Application number
BRPI0609602-6A
Other languages
English (en)
Inventor
Walter Messier
Original Assignee
Evolutionary Genomics Llc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Evolutionary Genomics Llc filed Critical Evolutionary Genomics Llc
Publication of BRPI0609602A2 publication Critical patent/BRPI0609602A2/pt

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8216—Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8241—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology
    • C12N15/8261—Phenotypically and genetically modified plants via recombinant DNA technology with agronomic (input) traits, e.g. crop yield
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/24—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405—Glucanases
    • C12N9/2408—Glucanases acting on alpha -1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2411—Amylases
    • C12N9/2414—Alpha-amylase (3.2.1.1.)
    • C12N9/2417—Alpha-amylase (3.2.1.1.) from microbiological source
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6869—Methods for sequencing
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A40/00—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production
    • Y02A40/10—Adaptation technologies in agriculture, forestry, livestock or agroalimentary production in agriculture
    • Y02A40/146—Genetically Modified [GMO] plants, e.g. transgenic plants

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

POLINUCLEOTìDEOS EG117 E EG307 E SEUS USOS. A presente invenção refere-se a métodos para identificar seqüências de polinucleotídeos e de polipeptídeos as quais podem ser associadas com uma peculiaridade comercialmente relevante em plantas, especificamente, os assim identificados polinucleotídeos e seqúências de polipeptideos para produzir os genes relacionados E3307 e EG1117 para milho, trigo, cevada, sorgo e cana-de-açúcar. As seqúências assim identificadas são úteis na intensificação dos traços comercialmente desejados em plantas domesticadas ou plantas de ancestral selvagem, na identificação de seqúências de polinucleotídeos relacionadas, na genotipagem da planta e na geração auxiliada por marcador. As seqúências assim identificadas também podem ser usadas para gerar DNA heterólogo, plantas transgênicas e células hospedeiras transfectadas.

Description

Relatório Descritivo da Patente de Invenção para "POLINU-CLEOTÍDEOS EG117 E EG307Í SEUS USOS".
CAMPO DA INVENÇÃO
A presente invenção refere-se às técnicas moleculares e evolu-cionárias para identificar seqüências de polinucleotídeo e de polipeptídeocorrespondendo a traços comercialmente relevantes, tais como rendimento,em plantas ancestrais e domesticadas, as seqüências de polipeptídeo e depolinucleotídeo identificadas e métodos de uso das seqüências de polinucle-otídeo e de polipeptídeo identificadas.
ANTECEDENTES DA INVENÇÃO
Seres humanos têm criado plantas e animais por milhares deanos, selecionando por certos aspectos comercialmente valiosos e/ou estéti-cos. Plantas domesticadas diferem de seus ancestrais selvagens ou mem-bros da família com traços tais como rendimento, florescência de duração dedia curta, conteúdo de proteína e/ou óleo, facilidade de colheita, sabor, resis-tência à doença e resistência à secura. Animais domesticados diferem deseus ancestrais selvagens ou membros da família com traços tais como con-teúdo de conteúdo de gordura e/ou proteína, produção de leite, docilidade,fecundidade e tempo de maturação. No momento, a maioria dos genes sub-jacentes às diferenças acima não são conhecidos, nem tão importantemen-te, são as alterações específicas que evoluíram nesses genes para propor-cionar essas capacidades. Entendendo a base dessas diferenças entre plan-tas e animais domesticados e seus ancestrais selvagens ou membros dafamília irá se fornecer informação útil para manter e intensificar aqueles tra-ços. No caso de plantas de colheita, a identificação dos genes específicosque controlam traços desejados permitirá a melhoria direta e rápida de umaforma que anteriormente não era possível.
A identificação em espécies domesticadas de genes que evoluí-ram para conferir funções únicas, melhoradas ou alteradas em comparaçãocom genes ancestrais homólogos poderia ser usada para desenvolver agen-tes para modular essas funções. A identificação dos genes de espécies do-mesticadas subjacentes e das alterações de nucleotídeo específicas que sedesenvolveram, e a caracterização adicional das alterações físicas e bio-químicas nas proteínas codificadas por esses genes desenvolvidos poderi-am fornecer informação valiosa sobre os mecanismos subjacentes ao traçodesejado. Essa informação valiosa poderia ser aplicada na criação auxiliadapelo marcador de DNA na seleção auxiliada pelo marcador de DNA. Alterna-tivamente, essa informação poderia ser usada no desenvolvimento de agen-tes que intensificariam ainda mais a função das proteínas alvo. Alternativa-mente, a projeção adicional dos genes responsáveis poderia modificar ouaumentar o traço desejado. Adicionalmente, poderia ser descoberto que osgenes identificados desempenham um papel no controle de traços de inte-resse em outras plantas domesticadas.
Seres humanos, através de seleção artificial, estabeleceram in-tensas pressões de seleção em plantas de colheita. Essa pressão é refletidaem alterações evolutivamente significativas entre genes homólogos de orga-nismos domesticados e seu ancestral selvagem ou membros da família. Foidescoberto que somente alguns genes, por exemplo, 10-15 por espécie,controlam traços de interesse comercial em plantas de colheita domestica-das. Esses alguns genes foram excessivamente difíceis de identificar atra-vés de métodos padronizados de biologia molecular vegetal.
Métodos para identificar genes alterados devido à domesticaçãoestão descritos em patentes relacionadas e em pedidos de patente listadosacima. Métodos para a geração auxiliada por marcador de DNA (MAB) epara a seleção auxiliada por marcador de DNA (MAS) são bem-conhecidospelos indivíduos versados na técnica e foram descritos em muitas publica-ções (ver, por exemplo, Peleman e van der Voort, Breeding by Design,TRENDS in Plant Science 8(7):330-334). Tais métodos podem tornar a ge-ração de plantas mais eficiente pelo aumento da capacidade de selecionar eincorporar alelos específicos associados com um fenótipo desejado duranteo desenvolvimento de novas variedades vegetais. Um problema com marca-dores geralmente usados hoje é que eles podem se separar dos genes alvoou traços através de recombinação (ver Holland em Proceedings of the 4thInternational Crop Science Congress 26 Set-1 Out 2004, Brisbane, Austrá-lia). De fato, Holland cita exemplos onde o uso de marcadores foi melhor doque a geração convencional, e outros exemplos onde a geração convencio-nal produziu melhores resultados do que a geração auxiliada por marcador.Holland estabelece que "não é provável que marcadores vão ser logo úteispara manipular traços complexos como rendimento". O que é necessáriopara que marcadores sejam úteis para manipular traços complexos comorendimento são os genes específicos subjacentes a tais traços complexos aoinvés de marcadores que estejam somente algumas vezes associados comtais traços complexos.
DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO
Com a presente invenção, os inventores identificaram genes,polinucleotídeos e polipeptídios correspondentes ao EG1117 (para Z maysmays (milho), S. bicolor (sorgo), S. officinanim (cana-de-açúcar), T. aestivum(trigo), H. vulgare (cevada) e O. sativa (arroz domesticado)), EG307 (alelosde milho elite, alelos de milho não-elite, T. aeslivum, H. vulgare, S. bicolor, eO. sativa). Os polinucleotídeos e polipeptídeos da presente invenção sãoúteis em uma variedade de métodos, tais como no método de identificaçãode uma seqüência de polinucleotídeo que esteja associada com o rendimen-to em uma planta; um método para determinar se uma planta tem uma oumais de uma seqüência de polinucleotídeos compreendendo uma seqüênciaEG1117 ou EG307; e um método para a geração auxiliada por marcador deplantas para uma seqüência EG1117 ou EG307 particular. Os polinucleotí-deos e polipeptídeos da presente invenção também são úteis para criar célu-las vegetais, materiais de propagação, plantas transgênicas e células hos-pedeiras transfectadas.
Adicionalmente, os polinucleotídeos e polipeptídeos da presenteinvenção podem ser usados como marcadores para uma seleção auxiliadapor marcador ou para uma geração auxiliada por marcador melhorada. Alémdisso, tais polinucleotídeos e polipeptídeos podem ser usados para identifi-car genes homólogos em outras espécies que compartilham um ancestral oumembro da família comum, para uso como marcadores na geração de taisoutras espécies. Por exemplo, milho, arroz, trigo, painço, sorgo e outros ce-reais compartilham um ancestral ou membro de família comum, e genes i-dentificados no arroz podem levar diretamente a genes homólogos nessasoutras gramíneas. Da mesma forma, tomates e batatas compartilham umancestral ou membro de família comum, e se espera que genes identificadosem tomates pelo método em questão tenham homólogos em batatas e vice-versa.
A prática da presente invenção emprega, a não ser que seja in-dicado de outra forma, técnicas convencionais de biologia molecular, genéti-ca e evolução molecular, as quais estão dentro da habilidade da técnica.
Tais técnicas são explicadas completamente na literatura, tais como: "Mole-cular Cloning: A Laboratory Manual", segunda edição (Sambrook et al,1989); "Oligonucleotide Synthesis" (M. J. Gait, ed., 1984); "Current Protocolsin Molecular Biology" (F.M. Ausubel et al, eds., 1987); "PCR: The Polymera-se Chain Reaction", (Mullis et al, eds., 1994); "Molecular Evolution", (Li,1997).
Definições
É para ser notado que a existência do termo "um" ou "uma" serefere a um ou mais daqueles termos; por exemplo, um gene se refere a umou mais genes ou a pelo menos um gene. Como tais, os termos "um" (ou"uma"), "um ou mais" e "pelo menos um" podem ser usados aqui intercambi-avelmente. Também é para ser notado que os termos "compreendendo","incluindo" e "tendo" podem ser usados intercambiavelmente.
Conforme aqui utilizado, um "polinucleotídeo" se refere a umaforma polimérica de nucleotídeos de qualquer comprimento, sejam ribonu-cleotídeos ou desoxirribonucleotídeos, ou seus análogos. Esse termo se re-fere à estrutura primária da molécula, e dessa forma inclui DNA de filamentoúnico ou duplo, assim como RNA de filamento único ou duplo. Ele tambéminclui polinucleotídeos modificados tais como polinucleotídeos metilados e/oucobertos, polinucleotídeos contendo bases modificadas, modificações deestrutura e similars. Os termos "polinucleotídeo" e "seqüência de nucleotí-deos" são usados intercambiavelmente.
Conforme aqui utilizado, um "gene" se refere a um polinucleotí-deo ou a uma porção de um polinucleotídeo compreendendo uma seqüênciaque codifica uma proteína. É bem-entendido na técnica que um gene tam-bém compreende seqüências não-codificantes, tais como seqüências flan-queadoras 5' e 3' (tais como protômeros, intensificadores, repressores e ou-tras seqüências regulatórias), assim como íntrons.
Os termos "polipeptídeo", "peptídeo" e "proteína" são usadosaqui intercambiavelmente para se referir a polímeros de aminoácidos dequalquer comprimento. Esses termos também incluem proteínas que sãopós-traducionalmente modificadas através de reações que incluem glicosila-ção, acetilação e fosforilação.
O termo "organismo domesticado" se refere a um organismo vi-vo individual ou população do mesmo, uma espécie, subespécie, variedade,cultivar ou cepa que tenha sido submetida à pressão da seleção artificial etenha desenvolvido um traço comercial ou esteticamente relevante. Em al-gumas modalidades preferidas, o organismo domesticado é uma planta se-lecionada do grupo consistindo em milho, trigo, arroz, sorgo, tomate ou bata-ta, ou qualquer outra planta domesticada de interesse comercial, onde umancestral ou membro da família seja conhecido. Uma "planta" é qualquerplanta em qualquer estágio de desenvolvimento, particularmente uma plantade semente.
O termo "ancestral selvagem ou membro da família" ou "ances-tral ou membro da família" significa um organismo, espécie, subespécie, va-riedade, cultivar ou cepa precursora ou predecessora da qual um organismo,espécie, subespécie, variedade, cultivar ou cepa evoluiu. Um organismodomesticado pode ter um ou mais de um ancestral ou membro da família.Tipicamente, plantas domesticadas podem ter um ou uma pluralidade deancestrais ou membros de família, enquanto que animais domesticados ge-ralmente têm somente um único ancestral ou membro de família.
O termo "traço comercial ou esteticamente relevante" é aqui u-sado para se referir a traços que existem em animais domesticados tais co-mo em plantas ou animais cuja análise poderia fornecer informação (por e-xemplo, dados físicos ou bioquímicos) relevantes para o desenvolvimento deorganismos melhorados ou de agentes que possam modular o polipeptídeoresponsável pelo traço, ou o respectivo polinucleotídeo. O traço comercial ouesteticamente relevante pode ser único, intensificado ou alterado em relaçãoao ancestral ou membro da família. Por "alterado", se entende que o traçorelevante difere qualitativa ou quantitativamente dos traços observados noancestral ou membro da família. Um traço relevante comercial ou estetica-mente preferido é o rendimento.
O termo "métodos do tipo KA/Ks" significa métodos que avaliamdiferenças, freqüentemente (porém não sempre) mostradas como uma pro-porção, entre a quantidade de substituições não-sinônimas e de substitui-ções sinônimas em genes homólogos (incluindo os métodos mais rigorososque determinam sítios não-sinônimos ou sinônimos). Esses métodos sãoprojetados usando vários sistemas de nomenclatura incluindo, mas sem selimitar, a KA/KS, dN/ds, DN/DS.
Os termos "alteração evolutivamente significativa" e "alteraçãoadaptativa evolucionária" se referem a uma ou mais alteração/alterações naseqüência nucleotídica ou peptídica entre dois organismos, espécies, sub-espécies, variedades, cultivares e/ou cepas que pode ser atribuída ou aorelaxamento da pressão seletiva ou à pressão seletiva positiva. Um métodopara determinar a presença de uma alteração evolutivamente significativa éaplicar um método analítico do tipo KA/Ks, como por exemplo para mediruma proporção KA/KS. Tipicamente, uma proporção KA/KS de 1,0 ou mais éconsiderada como sendo uma alteração evolutivamente significativa.
Falando estritamente, proporções KA/KS de exatamente 1,0 sãoindicativas de relaxamento de pressão seletiva (evolução neutra) e propor-ções de KA/Ks maiores do que 1,0 são indicativas de seleção positiva. Entre-tanto, é comumente aceito que os ESTs no GenBank e em outros bancos dedados públicos geralmente sofrem de algum grau de erro de seqüenciamen-to, e mesmo alguns nucleotídeos incorretos podem influenciar proporções deKA/KS. Por essa razão, polinucleotídeos com proporções KA/Ks tão baixasquanto 0,75 podem ser cuidadosamente resseqüenciadas e reavaliadasquanto ao relaxamento da pressão seletiva (alteração evolutivamente signifi-cativa neutra), pressão de seleção positiva (alteração evolutivamente signifi-cativa positiva) ou pressão seletiva negativa (alteração evolutivamente con-servativa).
O termo "alteração evolutivamente significativa positiva" significauma alteração evolutivamente significativa em um organismo, espécie, sub-espécie, variedade, cultivar e/ou cepa particular que resulta em uma altera-ção adaptativa que é positiva em comparação com outros organismos rela-cionados. Um exemplo de uma alteração evolutivamente significativa positi-va é uma alteração que resultou em um rendimento aumentado em plantasde colheita. Conforme estabelecido acima, a seleção positiva é indicada poruma proporção KA/KS maior do que 1,0. Com preferência crescente, o valorKA/KS é maior do que 1,25, 1,5 e 2,0.
O termo "alteração evolutivamente significativa neutra" se referea uma alteração do polinucleotídeo ou do polipeptídeo que aparece em umorganismo domesticado em relação ao seu organismo ancestral, e a qual sedesenvolveu sob condições neutras. Uma alteração evolutivamente neutra éevidenciada por um valor de KA/KS entre cerca de 0,75-1,25, preferivelmenteentre cerca de 0,9 e 1,1, e mais preferivelmente igual a cerca de 1,0. Tam-bém, no caso de evolução neutra, não há "direcionalidade" para ser inferida.
O gene é livre para acumular alterações sem restrições, de forma que tantoas versões ancestrais quanto domesticadas se alteram uma em relação àoutra.
O termo "homólogos" ou "homólogo" ou "ortólogo" é conhecido ebem-entendido na técnica e se refere a seqüências relacionadas que com-partilham um ancestral ou membro da família comum e é determinado base-ando-se no grau de identidade de seqüência. Esses termos descrevem arelação entre um gene encontrado em uma espécie, subespécie, variedade,cultivar ou cepa e o gene correspondente ou equivalente em outra espécie,subespécie, variedade, cultivar ou cepa. Para propósitos dessa invenção,são comparadas seqüências homólogas. "Seqüências homólogas" ou "ho-mólogos" ou "ortologos" são considerados, acreditados ou conhecidos porserem funcionalmente relacionados. Uma relação funcional pode ser indica-da em qualquer uma de uma variedade de formas, incluindo, mas sem selimitar, a (a) um grau de identidade de seqüência"; (b) à mesma ou a umasimilar função biológica. Preferivelmente, tanto (a) quanto (b) são indicados.O grau de identidade de seqüência pode variar, mas é de preferivelmentepelo menos 50% (quando usando programas de alinhamento de seqüênciapadrão na técnica), mais preferivelmente pelo menos 60%, mais preferivel-mente pelo menos cerca de 75%, mais preferivelmente pelo menos cerca de85%. A homologia pode ser determinada usando programas de computadorprontamente disponíveis na técnica, tais como aqueles discutidos em Cur-rent Protocols in Molecular Biology (F.M. Ausubel et al, eds., 1987) Suple-mento 30, seção 7.718, Tabela 7.71. Programas de alinhamento preferidossão MacVector (Oxford Molecular Ltd, Oxford, RU.) e ALIGN Plus (Scientificand Educational Software, Pennsylvania). Outro programa de alinhamentopreferido é o Sequencher (Gene Codes, Ann Arbor, Michigan), usando pa-râmetros padrão.
O termo "alteração de nucleotídeo" se refere à substituição, anu-lação e/ou inserção de nucleotídeo, conforme é bem-entendido na técnica.
"Genes de manutenção" é um termo bem-entendido na técnica esignifica aqueles genes associados com a função celular geral, incluindo,mas sem se limitar, ao crescimento, divisão, estase, metabolismo e/ou mor-te. Genes manutenção geralmente efetuam funções encontradas em maisde um tipo celular. Ao contrário, genes específicos de células geralmenteefetuam funções em um tipo e/ou classe celular particular.
O termo "agente", conforme aqui utilizado, significa um compos-to biológico ou químico tal como uma molécula orgânica ou inorgânica sim-ples ou complexa, um peptídeo, uma proteína ou um oligonucleotídeo quemodula a função de um polinucleotídeo ou polipeptídeo. Uma vasta ordemde compostos pode ser sintetizado, por exemplo, oligômeros, tais como oli-gopeptídeos ou oligonucleotídeos, e compostos orgânicos e inorgânicos sin-téticos baseados em várias estruturas centrais, e estes também estão incluí-dos no termo "agente". Além disso, várias fontes naturais podem fornecercompostos para triagem, tais como extratos de plantas ou animais, e simi-lars. Compostos podem ser testados individual ou juntamente um com o ou-tro.
O termo "para modular a função" de um polinucleotídeo ou umpolipeptídeo significa que a função do polinucleotídeo ou do polipeptídeo éalterada em comparação com a não adição de um agente. A modulação po-de ocorrer em qualquer nível que afete a função. Uma função de polinucleo-tídeo ou polipeptídeo pode ser direta ou indireta, e medida direta ou indire-tamente.
Uma "função de um polinucleotídeo" inclui, mas não está limita-da, à replicação; tradução; padrão/padrões de expressão. Uma função poli-nucleotídeo também inclui funções associadas com um polipeptídeo codifi-cado no polinucleotídeo. Por exemplo, um agente o qual age em um polinu-cleotídeo e afeta a expressão, conformação, dobramento (ou outras caracte-rísticas físicas) da proteína, ligação às porções (tais como ligantes), ativida-de (ou outras características funcionais), regulação e/ou outros aspectos daestrutura ou função protéica é considerado como tendo função polinucleotí-dica modulada.
Uma "função de um polipeptídeo" inclui, mas não está limitada, àconformação, dobramento (ou outras características físicas), ligação a outrasporções (tais como ligantes), atividade (ou outras características funcionais),e/ou outros aspectos das funções ou estrutura protéica. Por exemplo, umagente que age em um polipeptídeo e afeta a sua conformação, dobramento(ou outras características físicas), ligação a outras porções (tais como ligan-tes), atividade (ou outras características funcionais), e/ou outros aspectosdas funções ou estrutura protéica é considerado como tendo uma funçãopolipeptídica modulada. As formas que um agente eficaz pode agir para mo-dular a função de um polipeptídeo incluem, mas não estão limitadas, a 1)alteração da conformação, dobramento ou outras características físicas; 2)alteração da força de ligação ao seu ligante natural ou alteração da especifi-cidade de ligação a ligantes; e 3) alteração da atividade do polipeptídeo.
O termo "sítio alvo" significa um local em um polipeptídeo o qualpode ser um único aminoacido e/ou uma parte de, uma porção estruturale/ou funcional, por exemplo, um sítio de ligação, um domínio de dimerizaçãoou um sítio ativo catalítico. Sítios ativos podem ser úteis para a interaçãodireta ou indireta com um agente, tal como com um agente terapêutico.
O termo "diferença molecular" inclui qualquer diferença estruturale/ou funcional. Métodos para detectar tais diferenças, assim como exemplosde tais diferenças, são aqui descritos.
Um "efeito funcional" é um termo bem-conhecido na técnica, esignifica qualquer efeito o qual é exibido em qualquer nível de atividade, sejadireto ou indireto.
O termo "facilidade de colheita" se refere às características ouaspectos vegetais que facilitam a coleta manual ou automatizada de estrutu-ras ou porções (por exemplo, frutas, folhas, raízes) para consumo ou outroprocessamento comercial.
O termo "rendimento" se refere à quantidade de tecido vegetalou animal ou material que é disponível para uso por seres humanos para osmercados alimentício, terapêutico, veterinário ou outros.
O termo "produtividade econômica aumentada" se refere à ca-pacidade de modular um traço comercialmente ou esteticamente relevantede forma a aumentar as características desejadas. O rendimento aumentadoe a resistência ao estresse aumentada são dois exemplos de produtividadeeconômica aumentada.Procedimentos Gerais Conhecidos na Técnica
Para os propósitos dessa invenção, a fonte do polinucleotídeoda planta domesticada ou de sua ancestral ou membro da família pode serqualquer fonte adequada, por exemplo, seqüências genômicas ou seqüên-cias de cDNA. Preferivelmente, seqüências de cDNA são comparadas. Se-qüências codificadoras de proteínas podem ser obtidas a partir de bancos dedados privados, públicos e/ou comerciais disponíveis, tais como aqueles a-qui descritos. Os bancos de dados servem como repositórios dos dados deseqüência molecular gerados por esforços de pesquisa contínuos. Alternati-vamente, seqüências codificadoras de proteínas podem ser obtidas a partir,por exemplo, do seqüenciamento de cDNA reverso transcrito a partir demRNA expresso nas células, ou após a amplificação por PRC, de acordocom métodos bem-conhecidos na técnica. Alternativamente, seqüências ge-nômicas podem ser usadas para comparação de seqüências. Seqüênciasgenômicas podem ser obtidas a partir de bancos de dados privados, públi-cos e/ou comerciais disponíveis, ou a partir do seqüenciamento de bibliote-cas de DNA genômico ou a partir de DNA genômico, após o PCR.
Em algumas modalidades, o cDNA é preparado a partir de mR-NA obtido a partir de um tecido em um estágio de desenvolvimento determi-nado, ou de um tecido obtido depois do organismo ter sido submetido a cer-tas condições ambientais. Bibliotecas de cDNA usadas para comparação deseqüências da presente invenção podem ser construídas usando técnicas deconstrução de bibliotecas de cDNA convencionais que são explicadas com-pletamente na literatura da técnica. mRNAs totais são usados como moldespara DNAcs transcritos reversos. DNAcs transcritos são subclonados emvetores apropriados para estabelecer uma biblioteca de cDNA. A bibliotecade cDNA estabelecida pode ser maximizada para conteúdos de cDNA decomprimento total, embora menos do que DNAcs de comprimento total pos-sam ser usados. Além disso, a freqüência da seqüência pode ser normaliza-da de acordo com, por exemplo, Bonaldo era/. (1996) Genome Research 6:791-806. Clones de cDNA aleatoriamente selecionados da biblioteca de cD-NA construída podem ser seqüenciados usando técnicas de seqüenciamen-to automatizado padronizadas. Preferivelmente, clones de cDNA de compri-mento completo são usados para o seqüenciamento. Ou os clones de cDNAinteiros ou uma grande porção deles de uma biblioteca de cDNA podem serseqüenciados, embora também seja possível praticar algumas modalidadesda invenção pelo seqüenciamento de tão pouco quanto um cDNA individual,ou vários clones de cDNA.
Numa modalidade preferida da presente invenção, clones decDNA a serem seqüenciados podem ser pré-selecionados de acordo com asua especificidade de expressão. Para selecionar DNAcs correspondentes agenes ativos que sejam especificamente expressos, os DNAcs podem sersubmetidos à hibridização por subtração usando mRNAs obtidos a partir deoutros órgãos, tecidos ou células do mesmo organismo. Sob certas condi-ções de hibridização com estringência e concentração apropriada, aquelesDNAcs que hibridizam com mRNAs que não são tecido-específicos e, con-seqüentemente, provavelmente representam genes manutenção serão ex-cluídos da reunião de cDNA. Concordantemente, DNAcs remanescentespara serem seqüenciados são mais propensos a serem associados com fun-ções tecido-específicas. Para o propósito da hibridização por subtração,mRNAs que não são tecido-específicos podem ser obtidos a partir de umtecido, ou preferivelmente a partir de uma combinação de tecidos e célulasdiferentes. A quantidade de mRNAs que não são tecido-específicos é maxi-mizada para saturar os DNAcs tecido-específicos.
Alternativamente, informação a partir de bancos de dados onlinepode ser usada para selecionar ou dar prioridade a DNAcs que são maisprováveis se associarem com funções específicas. Por exemplo, os candida-tos de cDNA ancestrais para o seqüenciamento podem ser selecionados porPCR usando primers projetados a partir de seqüências de cDNA de um or-ganismo domesticado candidato. As seqüências de cDNA de um organismodomesticado candidato são, por exemplo, aquelas que são somente encon-tradas em uma porção específica de uma planta, ou que correspondam agenes prováveis de serem importantes na função específica. Tais seqüên-cias de cDNA específicas podem ser obtidas pela busca de bancos de dadosde seqüências online nos quais informação a respeito do perfil de expressãoe/ou atividade biológica para as seqüências de cDNA pode ser especificada.
Seqüências de homólogo(s) ancestral/ancestrais para um genede um organismo domesticado conhecido podem ser obtidas usando méto-dos padrão na técnica, tais como métodos de PCR (usando, por exemplo, ostermociclizadores GeneAmp PCR System 9700 (Applied Biosystems, Inc.)).Por exemplo, candidatos de cDNA ancestrais para o seqüenciamento podemser selecionados por PCR usando primers projetados a partir de seqüênciasde cDNA de um organismo domesticado candidato. Para o PCR, os primerspodem ser feitos a partir das seqüências de organismo domesticado usandométodos padrão na técnica, incluindo programas de projeção de primers pu-blicamente disponíveis tais como PRIMER (Whitehead Institute). A seqüên-cia ancestral amplificada pode, a seguir, ser seqüenciada usando métodos eequipamentos padrão na técnica, tais como seqüenciadores automatizados(Applied Biosystems, Inc.). Da mesma forma, mímicos de genes ancestraisou de membros da família podem ser usados para obter genes correspon-dentes em organismos domesticados.
Identificação de polinucleotídeos positivamente selecionados em organismosdomesticados
Numa modalidade preferida, os métodos aqui descritos podemser aplicados para identificar os genes que controlam os traços de interesseem plantas domesticadas agriculturalmente importantes. Seres humanoscultivaram plantas domesticadas por vários milhares de anos sem conheci-mento dos genes que controlam esses traços. O conhecimento dos meca-nismos genéticos específicos envolvidos poderiam permitir uma intervençãomuito mais rápida e direta a nível molecular para cultivar vegetais com traçosdesejáveis ou intensificados.
Seres humanos, através da seleção artificial, proporcionaramsessões de seleção intensas em plantas de colheita. Essa pressão é refleti-da em alterações evolutivamente significativas entre genes homólogos deorganismos domesticados e em seus ancestrais selvagens ou membros dafamília. Foi descoberto que somente alguns genes, por exemplo, 10-15 porespécie, controlam traços de interesse comercial em plantas de colheita do-mesticadas. Esses alguns genes foram excessivamente difíceis de identificaratravés de métodos padronizados de biologia molecular vegetal. O KA/KS eas análises relacionadas aqui descritas podem identificar os genes que con-trolam traços de interesse.
Para qualquer planta de colheita de interesse, bibliotecas decDNA podem ser construídas a partir de espécies ou subespécies domesti-cadas e de seu ancestral selvagem ou de um membro da família. Conformeé descrito em USSN 09/240.915, requerido em 29 de janeiro de 1999, asbibliotecas de cDNA de cada um são "BLASTed" uma contra a outra paraidentificar polinucleotídeos homólogos. Alternativamente, o versado na técni-ca pode acessar bancos de dados de cDNA ou genômicos comercial e/oupublicamente disponíveis ao invés de construir bibliotecas de cDNA.
Depois, uma análise de KA/KS ou relacionada pode ser conduzi-da para identificar genes selecionados que rapidamente evoluíram sob pres-são seletiva. Esses genes são, a seguir, avaliados usando métodos de plan-tas transgênicos e moleculares padrão para determinar se eles desempe-nham um papel nos traços de interesse comercial ou estético. Usando osmétodos da invenção, os inventores identificaram polinucleotídeos e polipep-tídeos correspondendo aos genes EG1117 ou EG307, os quais são genesrelacionados com o rendimento. Os genes de interesse podem ser manipu-lados, por exemplo, por mutagênese aleatória ou direcionada a sítio, paradesenvolver novas variedades, espécies, cepas ou cultivares melhorados.
Geralmente, em uma modalidade da presente invenção, as se-qüências de nucleotídeos são obtidas a partir de um organismo domesticadoe de um ancestral selvagem ou de um membro da família. As seqüências denucleotídeos dos organismos domesticados e dos ancestrais ou membros dafamília são comparadas uma com a outra para identificar seqüências quesão homólogas. As seqüências homólogas são analisadas para identificaraquelas que têm diferenças na seqüência de ácido nucléico entre o orga-nismo domesticado e o ancestral ou membro da família. A análise de evolu-ção molecular é conduzida para avaliar quantitativa e qualitativamente a sig-nificância evolucionária das diferenças. Para genes que foram positivamenteselecionados, a análise de estranhos pode ser feita para identificar aquelesgenes que foram positivamente selecionados no organismo domesticado (ouno ancestral ou no membro da família). Depois, a seqüência é caracterizadaem termos de identidade molecular/genética e de função biológica. Final-mente, a informação pode ser usada para identificar agentes que possammodular a função biológica do polipeptídeo codificado pelo gene.
Os métodos gerais da invenção requerem a comparação de se-qüências de nucleotídeos codificadoras de proteínas de organismos ances-trais e domesticados. Bioinformática é aplicada para a comparação e as se-qüências são selecionadas que contêm uma alteração ou alterações de nu-cleotídeo que é/são alteração/alterações evolutivamente significativa(s). Ainvenção capacita a identificação dos genes que evoluíram para conferir al-guma vantagem evolucionária e a identificação das alterações evoluídas es-pecíficas. Por exemplo, o organismo domesticado pode ser Oryza sativa e oancestral selvagem ou membro da família Oryza rufipogon. No caso da pre-sente invenção, seqüências de nucleotídeos codificadoras de proteínas fo-ram obtidas a partir de clones vegetais por técnicas de seqüenciamento pa-dronizadas.
Seqüências codificadoras de proteína de um organismo domes-ticado e seu ancestral ou membro da família são comparadas para identificarseqüências homólogas. Qualquer mecanismo apropriado para completaressa comparação é contemplado por essa invenção. O alinhamento podeser efetuado manualmente ou por programas de computador (exemplos deprogramas de alinhamento adequados são conhecidos na técnica). Preferi-velmente, seqüências codificadoras de proteínas a partir de um ancestral oumembro da família ou membro da família são comparadas com as seqüên-cias de espécies domesticadas através de buscas em bancos de dados, porexemplo, buscas BLAST. Os "acertos" de alta pontuação, isto é, seqüênciasque mostram uma similaridade significativa depois da análise BLAST, serãorecuperados e analisados. Seqüências mostrando uma similaridade signifi-cativa podem ser aquelas com pelo menos cerca de 60%, pelo menos cercade 75%, pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 85% ou pelo me-nos cerca de 90% de identidade de seqüência. Preferivelmente, seqüênciasmostrando mais do que cerca de 80% de identidade são adicionalmenteanalisadas. As seqüências homólogas identificadas através de busca embanco de dados podem ser alinhadas na sua totalidade usando métodos dealinhamento de seqüência e programas que são conhecidos e disponíveis natécnica, tal como programa de alinhamento simples comumente usadoCLUSTAL V de Higgind et ai. (1992) CABIOS: 189-191.
Como um exemplo, seqüências de nucleosídeos obtidas a partirde O. rufipogon podem ser usadas como seqüências de consulta em umabusca de ESTs de O. sativa no GenBank para identificar seqüências homó-logas. Deve ser notado que uma seqüência de nucleotídeos que codificauma proteína completa não é necessária. Realmente, as seqüências de cD-NA parciais podem ser comparadas. Uma vez que as seqüências de interes-se são identificadas pelos métodos descritos abaixo, outros métodos de clo-nagem e/ou bioinformática podem ser usados para obter a seqüência codifi-cadora inteira para o gene ou proteína de interesse.
Alternativamente, a comparação de seqüenciamento e homolo-gia de seqüências codificadoras de proteína entre o organismo domesticadoe seu ancestral o membro da família ou de um membro da família pode serefetuada simultaneamente pelo uso da tecnologia de circuito integrado deseqüenciamento. Ver, por exemplo, RAva et ai, Patente U.S. 5.545.531.
As seqüências codificadoras de proteína alinhadas do organismodomesticado e do ancestral ou do membro da família ou de um membro dafamília são analisadas para identificar diferenças na seqüência de nucleotí-deos em sítios particulares. Novamente, qualquer método adequado paraconseguir essa análise é contemplado por essa invenção. Se não há dife-renças na seqüência de nucleotídeos, a seqüência codificadora de proteínasdo membro da família, do ancestral ou membro da família não é geralmenteadicionalmente analisada. As alterações da seqüência detectadas são ge-ralmente, e preferivelmente, inicialmente verificadas quanto à exatidão. Pre-ferivelmente, a verificação inicial compreende efetuar um ou mais dos se-guintes etapas, qualquer e todos os quais são conhecidos na técnica: (a)encontrar os pontos onde há alterações entre as seqüências do organismoancestral e domesticado; (b) verificação do fluorograma da seqüência (cro-matograma) para determinar se as bases que aparecem únicas para o an-cestral ou membro da família ou organismo domesticado correspondem asinais fortes e claros específicos para a base chamada; (c) verificação dosacertos do organismo domesticado para ver se há mais do que uma seqüên-cia de organismo modificado que corresponda a uma alteração de seqüên-cia. Múltiplas entradas de seqüência de organismo domesticado para omesmo gene que têm o mesmo nucleotídeo em uma posição onde há umdiferente nucleotídeo em uma seqüência ancestral ou membro da famíliaproporciona uma base independente de que a seqüência domesticada éprecisa, e que a alteração é significativa. Tais alterações são examinadasusando informação de banco de dados e o código genético para determinarse essas alterações da seqüência de nucleotídeos resultam em uma altera-ção na seqüência de aminoácidos da proteína codificada. Conforme a defini-ção de "alteração de nucleotídeo" torna claro, a presente invenção englobapelo menos uma alteração de nucleotídeo, seja uma substituição, uma anu-lação ou uma inserção, em uma seqüência de polinucleotídeos codificadorade proteína de um organismo domesticado em comparação com uma se-qüência correspondente do ancestral ou membro da família. Preferivelmente,a alteração é uma substituição nucleotídica. Mais preferivelmente, mais deuma substituição está presente na seqüência identificada e é sujeita a análi-se de evolução molecular.
Numa modalidade, a presente invenção inclui um método paraidentificar uma seqüência de polinucleotídeos que está associada com orendimento na planta. Esse método inclui a etapa de comparar pelo menosuma porção da seqüência de nucleotídeos da planta com pelo menos umaseqüência de polinucleotídeo EG1117 e/ou uma seqüência de polinucleotí-deos EG307. Esse método também inclui a etapa de identificar pelo menosuma seqüência de polinucleotídeos na planta que contenha pelo menos umaalteração de nucleotídeo em comparação com um polinucleotídeo selecio-nado do grupo consistindo em uma seqüência de polinucleotídeo EG1117 euma seqüência de polinucleotídeo EG307, em que a referida seqüência depolinucleotídeo identificada está associada com o rendimento em uma plan-ta. Seqüência de polinucleotídeo EG307 e EG1117 incluem SEQ ID NO: 71 ;SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ IDNO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48;SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ IDNO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62;SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ IDNO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO:78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82; SEQID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO:95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101;SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO:88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92; SEQID NO: 93; e um polinucleotídeo com pelo menos cerca de 70% de identida-de de seqüência com as SEQ ID Nos. precedentes.
Seqüência de polinucleotídeo vegetal inclui a seqüência vegetalque é derivada do DNA genômico ou derivada dos genes expressos de umaplanta, isto é, cDNA. Métodos para fazer isso são conhecidos na técnica esão discutidos em outros lugares no presente relatório descritivo.
Preferivelmente, a seqüência de polinucleotídeo EG307 ouEG1117 está associada com o rendimento aumentado em uma planta. Mé-todos para determinar e rendimentos quantitativos são conhecidos na técni-ca, e discutidos em outras partes no presente relatório descritivo. Mais prefe-rivelmente, o rendimento pode ser quantificado pela determinação se o ren-dimento está aumentado em relação a uma segunda planta de um ancestralcomum, gênero ou planta do membro da família, mais preferivelmente damesma espécie, ainda mais preferivelmente do mesmo cultivar, com umasegunda seqüência de polinucleotídeo EG307 ou EG1117 com pelo menosuma alteração de nucleotídeo em relação à seqüência de polinucleotídeoEG307 ou EG1117 da planta.
Em todas as modalidades da presente invenção, uma seqüênciade polinucleotídeo preferida inclui um polinucleotídeo com pelo menos cercade 60% de identidade de seqüência em relação a um polinucleotídeo EG307ou EG1117 da presente invenção e tem substancialmente o mesmo efeito norendimento que a SEQ ID NO nomeada aqui. Preferivelmente, um polinucle-otídeo da presente invenção terá pelo menos cerca de 65% de identidadepara, pelo menos cerca de 66% de identidade para, pelo menos cerca de67% de identidade para, pelo menos cerca de 68% de identidade para, pelomenos cerca de 69% de identidade para, pelo menos cerca de 70% de iden-tidade para, pelo menos cerca de 71% de identidade para, pelo menos cercade 72% de identidade para, pelo menos cerca de 73% de identidade para,pelo menos cerca de 74% de identidade para, pelo menos cerca de 75% deidentidade para, pelo menos cerca de 76% de identidade para, pelo menoscerca de 77% de identidade para, pelo menos cerca de 78% de identidadepara, pelo menos cerca de 79% de identidade para, pelo menos cerca de80% de identidade para, pelo menos cerca de 81% de identidade para, pelomenos cerca de 82% de identidade para, pelo menos cerca de 83% de iden-tidade para, pelo menos cerca de 84% de identidade para, pelo menos cercade 85% de identidade para, pelo menos cerca de 86% de identidade para,pelo menos cerca de 87% de identidade para, pelo menos cerca de 88% deidentidade para, pelo menos cerca de 89% de identidade para, pelo menoscerca de 90% de identidade para, pelo menos cerca de 91% de identidadepara, mais preferivelmente pelo menos cerca de pelo menos cerca de 92%de identidade para, pelo menos cerca de 93% de identidade para, pelo me-nos cerca de 94% de identidade para, pelo menos cerca de 95% de identi-dade para e ainda mais preferivelmente pelo menos cerca de 95,5% de iden-tidade para, pelo menos cerca de 96% de identidade para, pelo menos cercade 96,5% de identidade para, pelo menos cerca de 97% de identidade para,pelo menos cerca de 97,5% de identidade para, pelo menos cerca de 98%de identidade para, pelo menos cerca de 98,5% de identidade para, pelomenos cerca de 99% de identidade para, pelo menos cerca de 99,5% deidentidade para ou são idênticas para qualquer uma da SEQ ID NO: 71 ;SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ IDNO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48;SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ IDNO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62;SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ IDNO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO:78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82; SEQID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO:95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101;SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO:88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92; e SEQID NO: 93.
Em todas as modalidades da presente invenção, uma seqüênciade polipeptídeos preferida inclui um polipeptídeo com pelo menos cerca de60% de identidade de seqüência em relação a um polipeptídeo EG307 ouEG1117 da presente invenção e tem substancialmente o mesmo efeito norendimento que a SEQ ID NO nomeada aqui. Preferivelmente, um polipeptí-deo da presente invenção terá pelo menos cerca de 65% de identidade para,pelo menos cerca de 66% de identidade para, pelo menos cerca de 67% deidentidade para, pelo menos cerca de 68% de identidade para, pelo menoscerca de 69% de identidade para, pelo menos cerca de 70% de identidadepara, pelo menos cerca de 71% de identidade para, pelo menos cerca de72% de identidade para, pelo menos cerca de 73% de identidade para, pelomenos cerca de 74% de identidade para, pelo menos cerca de 75% de iden-tidade para, pelo menos cerca de 76% de identidade para, pelo menos cercade 77% de identidade para, pelo menos cerca de 78% de identidade para,pelo menos cerca de 79% de identidade para, pelo menos cerca de 80% deidentidade para, pelo menos cerca de 81% de identidade para, pelo menoscerca de 82% de identidade para, pelo menos cerca de 83% de identidadepara, pelo menos cerca de 84% de identidade para, pelo menos cerca de85% de identidade para, pelo menos cerca de 86% de identidade para, pelomenos cerca de 87% de identidade para, pelo menos cerca de 88% de iden-tidade para, pelo menos cerca de 89% de identidade para, pelo menos cercade 90% de identidade para, pelo menos cerca de 91% de identidade para,mais preferivelmente pelo menos cerca de pelo menos cerca de 92% de i-dentidade para, pelo menos cerca de 93% de identidade para, pelo menoscerca de 94% de identidade para, pelo menos cerca de 95% de identidadepara e ainda mais preferivelmente pelo menos cerca de 95,5% de identidadepara, pelo menos cerca de 96% de identidade para, pelo menos cerca de96,5% de identidade para, pelo menos cerca de 97% de identidade para,pelo menos cerca de 97,5% de identidade para, pelo menos cerca de 98%de identidade para, pelo menos cerca de 98,5% de identidade para, pelomenos cerca de 99% de identidade para, pelo menos cerca de 99,5% deidentidade para ou são idênticas para qualquer uma da SEQ ID NO: 73; SEQID NO: 76; SEQ ID NO: 43; SEQ ID NO: 46; SEQ ID NO: 49; SEQ ID NO:52; SEQ ID NO: 55; SEQ ID NO: 58; SEQ ID NO: 61; SEQ ID NO: 64; SEQID NO: 67; SEQ ID NO: 70; SEQ ID NO: 118; SEQ ID NO: 120; SEQ ID NO:116; SEQ ID NO: 96; SEQ ID NO: 99; SEQ ID NO: 102; SEQ ID NO: 104;SEQ ID NO: 106; SEQ ID NO: 108; SEQ ID NO: 110; SEQ ID NO: 112; eSEQ ID NO: 114.
Em todas as modalidades da presente invenção, as plantas do-mesticadas da presente invenção preferível mente incluem Zea mays mays,Oryza sativa, Triticum aestivum, Hordeum vulgare, Saccharum officinarum,Sorghum bicolor e Pennisetum typhoides. Em todas as modalidades da pre-sente invenção, o ancestral selvagem ou plantas membros da família prefe-rivelmente incluem um ancestral selvagem ou plantas membros da famíliapara uma planta domesticada selecionada do grupo consistindo em Zeamays mays, Oryza sativa, Triticum aestivum, Hordeum vulgare, Saccharumofficinarum, Sorghum bicolor e Pennisetum typhoides. Um ancestral selva-gem particularmente preferido ou planta membro da família é Oryza rufipo-gon. Qualquer polipeptídeo EG307 ou EG1117 da planta é um polipeptídeoadequado da presente invenção. Plantas adequadas para isolar a partir dasquais para isolar polipeptídeos EG307 ou EG1117 (incluindo o isolamento dopolipeptídeo natural ou a produção do polipeptídeo por técnicas recombinan-tes ou sintéticas) incluem milho, trigo, cevada, centeio, painço, grão-de-bico,lentilha, linho, oliva, figueira amendoeira, pistaceira, nogueira, beterraba,pastinaca frutas cítricas incluindo, mas sem se limitar, a laranja, limão, limão-galego, toronja, tangerina, tangerina minneola e a tangelo, batata doce, fei-jão, ervilha, chicória, alface, repolho, couve-flor, brócolis, nabo, rabanete,espinafre, aspargo, cebola, alho, pimenta, aipo, abóbora (squash), abóbora,cânhamo, abobrinha, maçã, pêra, marmelo, melão, ameixa, cereja, pêssego,nectarina, damasco, morango, uva, framboesa, amora-preta, abacaxi, aba-cate, mamão, manga, banana, soja, tomate, sorgo, cana-de-açúcar, açúcarde beterraba, girassol, colza, trevo, tabaco, cenoura, algodão, alfafa, arroz,batata, berinjela, pepino, Arabidopsis e plantas lenhosas tais como coníferase árvores decíduas, com milho, sorgo, cana-de-açúcar e trigo sendo especi-almente desejáveis.
Essa modalidade da presente invenção inclui métodos para i-dentificar variantes alélicas das seqüências da presente invenção. Conformeaqui utilizado, "marcador" inclui referência a um local em um cromossomoque serve para identificar uma única posição no cromossomo. Um "marcadorpolimórfico" inclui referência a um marcador o qual aparece em múltiplasformas (alelos) de forma que diferentes formas do marcador, quando elesestão presentes em um par homólogo, permitem a transmissão de cada umdos cromossomos naquele par a ser seguido. Um genótipo pode ser definidopelo uso de uma ou de uma pluralidade de marcadores.
A presente invenção também fornece ácidos nucléicos isoladoscompreendendo polinucieotídeos de comprimento e complementaridade su-ficiente em relação a um gene da presente invenção para usar como sondasou primers de amplificação na detecção, quantificação ou isolamento dostranscritos genéticos. Por exemplo, ácidos nucléicos isolados da presenteinvenção podem ser usados como sondas na detecção de deficiências nonível do mRNA em varreduras para plantas transgênicas desejadas, paradetectar mutações no gene (por exemplo, substituições, anulações ou adi-ções), para monitorar a supra-reguiação da expressão ou alterações na ati-vidade enzimática nos ensaios de varredura dos compostos, para a detec-ção de qualquer número de variantes alélicas (polimorfismos) do gene, oupara uso como marcadores moleculares em programas de cultivo de plantas.
Adicionalmente, a presente invenção fornece ainda ácidos nu-cléicos isolados compreendendo polinucieotídeos codificando uma ou maisvariantes polimórficas (alélicas) dos polipeptídeos/polinucleotídeos. Varian-tes polimórficas são freqüentemente usadas para seguir a segregação dasregiões cromossomais em, por exemplo, métodos de seleção auxiliados pormarcador para melhora da colheita.
A presente invenção fornece um método de genotipagem deuma planta utilizando polinucleotídeos da presente invenção. Genotipagemproporciona uma forma de distinguir homólogos de um par de cromossomose pode ser usada para diferenciar segregantes em uma população vegetal.Métodos de marcadores moleculares podem ser usados para estudos filoge-néticos, caracterizando relações genéticas entre as variedades de colheita,identificando cruzamentos ou híbridos somáticos, localizando segmentoscromossomais afetando traços monogenéticos, clonagem baseada em mapae o estudo da hereditariedade quantitativa. Ver, por exemplo, PELEMAN EVAN DER VOORT, (2003) TRENDS IN PLANT SCIENCE VOL 8(7): 330-334E HOLLAND (2004) PROCEEDINGS OF THE 4™ INTERNATIONAL CROPSCIENCE CONGRESS 26 SET-1 OUT 2004, BRISBANE, AUSTRÁLIA.
O método particular de genotipagem na presente invenção podeempregar qualquer variedade de técnicas analíticas de marcadores molecu-lares tais como, porém não limitados, a polimorfismos de comprimento dofragmento de restrição (RFLPs). RFLPs são o produto de diferenças alélicasentre os fragmentos de restrição de DNA causados pela variabilidade da se-qüência de nucleotídeos. Conforme é bem-conhecido para os indivíduosversados na técnica, RFLPs são tipicamente detectados por extração doDNA genômico e por digestão com uma enzima de restrição. Geralmente, osfragmentos resultantes são separados de acordo com o tamanho e hibridi-zados com uma sonda; sondas de cópias individuais são adequadas. Frag-mentos de restrição de cromossomos homólogos são descritos. Diferençasno tamanho do fragmento entre alelos representam um RFLP. Conseqüen-temente, a presente invenção fornece uma forma de seguir a segregação deum gene ou ácido nucléico da presente invenção, assim como seqüênciascromossomais geneticamente ligadas a esses genes ou ácidos nucleicosusando tais técnicas como análise de RFLP. Seqüências cromossomais li-gadas estão nos 50 centiMorgans (cM), geralmente em 40 ou 30 cM, emalguns casos em 20 ou 10 cM, e em alguns casos em 5, 3, 2 ou 1 cM de umgene da presente invenção.
Na presente invenção, as sondas de ácidos nucleicos emprega-das para mapeamento do marcador molecular de genomas nucleares vege-tais hibridizam seletivamente, sob condições de hibridização seletivas, comum gene que codifica um polinucleotídeo da presente invenção. Em algumasmodalidades, as sondas são selecionadas a partir de polinucleotídeos dapresente invenção. Tipicamente, essas sondas são sondas de cDNA ou clo-nes genômicos Pst I. A extensão das sondas é discutida em maiores deta-lhes, acima, mas são tipicamente 15 bases de comprimento, e em algunscasos, pelo menos 20, 25, 30, 35, 40 ou 50 bases de comprimento. Geral-mente, entretanto, as sondas são menores do que cerca de 1 quilobase decomprimento. Em algumas modalidades, as sondas são sondas de uma có-pia individual que hibridizam para um único local em um complemento decromossomo haplóide. Algumas enzimas de restrição exemplares emprega-das no mapeamento RFLP são EcoRI, EcoRV e Sstl. Conforme aqui utiliza-do, o termo "enzima de restrição" inclui referência a uma composição quereconhece e, sozinha ou juntamente com outra composição, diva em umaseqüência nucleotídica específica.
O método de detecção de RFLP compreende as etapas de (a)digerir DNA genômico de uma planta com uma enzima de restrição; (b) hi-bridizar uma sonda de ácido nucléico, sob condições de hibridização seleti-vas, em uma seqüência de um polinucleotídeo do presente do referido DNAgenômico; (c) detectar daí RFLP. Outros métodos de diferenciação de vari-antes polimórficas (alélicas) de polinucleotídeos da presente invenção podeser obtido pelo uso de técnicas de marcador molecular bem-conhecidas poraqueles indivíduos versados na técnica, incluindo tais técnicas como: 1) aná-lise conformacional de um único filamento (SSCP); 2) eletroforese em gelcom gradiente de desnaturação (DGGE); 3) ensaios de proteção de RNAse;4) oligonucleotídeos alelo-específicos (ASOs); 5) o uso de proteínas as quaisreconhecem mal emparelhamentos de nucleotídeos, tais como a proteína deE. coli mutS; e 6) PCR alelo específico. Outras tentativas baseadas na de-tecção de mal emparelhamentos entre os dois filamentos de DNA comple-mentares incluem eletroforese em gel de desnaturação seguro (CDGE); aná-lise heterodúplex (HA); e clivagem de mal emparelhamento químico (CMC).Variantes polimórficas exemplares são fornecidas na Tabela I, abaixo:Tabela 1: Variantes polimórficas de EG307 no milho
<table>table see original document page 26</column></row><table>
Conseqüentemente, a presente invenção fornece ainda um mé-todo de genotipagem compreendendo as etapas de colocar em contato, sobcondições de hibridização estringentes, uma amostra suspeita de compre-ender um polinucleotídeo da presente invenção com uma sonda de ácidonucléico. Geralmente, a amostra é uma amostra vegetal; uma amostra sus-peita de compreender um polinucleotídeo de milho da presente invenção(por exemplo, gene, mRNA). A sonda de ácido nucléico hibridiza seletiva-mente, sob condições estringentes, para uma subseqüência de um polinu-cleotídeo da presente invenção compreendendo um marcador polimórfico. Ahibridização seletiva da sonda de ácido nucléico para a seqüência de ácidonucléico do marcador polimórfico produz um complexo de hibridização. Adetecção do complexo de hibridização indica a presença daquele marcadorpolimórfico na amostra. Em algumas modalidades, a sonda de ácido nucléi-co compreende um polinucleotídeo da presente invenção.
É aparente para os indivíduos versados na técnica que variantespolimórficas podem ser identificadas para EG307 e EG1117 pelo seqüenci-amento desses genes.
É claro para uma pessoa versada na técnica que variantes poli-mórficas adicionais ou alelos de EG307 e EG1117 podem ser identificadospelo seqüenciamento de mais linhagens de milho e híbridos, de mais linha-gens de arroz e híbridos, de mais sorgo, cevada, linhagens de trigo, painçoou linhagens de cana-de-açúcar e testes de associação podem ser efetua-dos para encontrar os alelos de cada um desses dois genes que estão asso-ciados com o melhor fenótipo para os traços de rendimento (tais como ren-dimento total, peso do grão, comprimento do grão ou outros traços relacio-nados com o rendimento) ou traços de qualidade (tais como ASV, adubo ououtros traços de qualidade). Testes de associação com esses alelos adicio-nais poderiam indicar quais alelos estão associados com fenótipos deseja-dos para traços específicos. Linhagens congênitas de ancestrais prospecti-vos poderiam, então, ser testados ou para a presença dos alelos (ou por-ções dos alelos desejados que seja diagnósticos) associados com um me-lhor desempenho para um traço de rendimento (tais como rendimento total,peso do grão, comprimento do grão, grãos por planta, etc.) ou um melhordesempenho para um traço de qualidade (tal como ASV ou adubo, etc). Ale-los associados com um melhor desempenho para um traço de rendimentoou para um traço de qualidade poderiam ser os "alelos desejados" para al-cançar o fenótipo desejado.
Em modalidades preferidas, a presente invenção fornece méto-dos para identificar alelos do EG307 ou EG1117 em um espécie de colheita;métodos para determinar se uma planta contém um alelo preferido ouEG307 ou EG1117, e métodos para testar plantas para alelos preferidos deEG307 ou EG1117. Alelos do EG307 e do EG1117 incluem, por exemplo,SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ IDNO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47;SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ IDNO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60;SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ IDNO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO:115; SEQ ID NO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQID NO: 82; SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO:94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ IDNO: 109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO:87; SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQID NO: 92; SEQ ID NO: 93; e um polinucleotídeo com pelo menos cerca de70% de identidade de seqüência com um polinucleotídeo eem umerado acima.
Para métodos para identificar outros alelos de EG307 ouEG1117, os métodos incluem em um etapa, usando pelo menos uma porçãode qualquer seqüência das seqüências de polinucleotídeo da presente in-venção para amplificar a seqüência do EG307 ou EG1117 correspondenteem uma ou mais plantas de uma espécie de colheita. Em outra etapa, essesmétodos incluem a determinação da seqüência de nucleotídeos das seqüên-cias amplificadas. Em outra etapa, esses métodos incluem a comparaçãodas seqüências amplificadas com seqüências de polinucleotídeos da presen-te invenção para identificar quaisquer alelos do EG307 ou do EG1117 nasplantas testadas das espécies de colheita.
Geralmente, esses métodos também incluem métodos para i-dentificar ou determinar alelos preferidos (por exemplo, alelos que estão as-sociados com um traço desejado). Em uma etapa, usando pelo menos umaporção de qualquer seqüência das seqüências de polinucleotídeo da presen-te invenção para amplificar a seqüência EG307 ou EG1117 correspondenteem pelo menos duas plantas para as quais um parâmetro particular para umtraço foi ou pode ser medido. Tal traço inclui rendimento, por exemplo. Emoutra etapa, esses métodos incluem a determinação da seqüência do EG307ou do EG1117 em cada planta. Em outra etapa, esses métodos incluem aidentificação de alelos preferidos ou de seqüências de polinucleotídeos doEG307 ou do EG1117. Alelos preferidos podem ser identificados pela análi-se de genotipagem pela determinação da associação do alelo com o traçodesejado. Exemplos de tal análise de genotipagem podem ser encontradosaqui nos Exemplos.
Geralmente, esses métodos também incluem métodos para tes-tar plantas para alelos preferidos ou seqüências de polinucleotídeos. Taismétodos incluem o uso de pelo menos uma porção de um alelo preferido(por exemplo, alelos associados com um traço desejado) para amplificar aseqüência do EG307 ou do EG1117 correspondente em uma planta, e sele-cionar aquelas plantas que contêm o alelo desejado (ou seqüência de poli-nucleotídeo). A presente invenção também fornece um método de produçãode um polipeptídeo EG307 ou EG1117 compreendendo: a) fornecer umacélula transfectada com um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeoEG307 ou EG1117 posicionado para a expressão na célula; b) o cultivo dacélula transfectada sob condições para expressar o polinucleotídeo; e c) oisolamento do polipeptídeo EG307 ou EG1117.
A presente invenção também fornece um método para isolar umgene relacionado com o rendimento a partir de uma biblioteca de célulasvegetais recombinantes. O método inclui fornecer uma preparação de umDNA de uma célula vegetal ou de uma biblioteca de célula vegetal recombi-nante; o contato da preparo ou da biblioteca de célula vegetal oligonucleotí-deos EG307 ou EG1117 conservados detectavelmente marcados (geradosde uma seqüência de polinucleotídeos EG307 ou EG1117 da presente in-venção, conforme descrito em outros lugares aqui) sob condições de hibridi-zação que proporcionam a detecção dos genes com 50% ou mais de identi-dade de seqüência; e o isolamento de um gene relacionado com o rendi-mento por sua associação com o marcador detectável.
A presente invenção também fornece um método para isolar umgene relacionado com o rendimento do DNA de uma célula vegetal. O méto-do inclui o fornecimento de uma amostra de DNA de célula vegetal; o forne-cimento de um par de oligonucleotídeos com homologia de seqüência emrelação a uma região conservada de oligonucleotídeos do gene EG307 ouEG1117 (gerados a partir de uma seqüência de polinucleotídeo EG307 ouEG1117, conforme descrito em outras partes aqui); a combinação do par deoligonucleotídeos com a amostra de DNA da célula vegetal sob condiçõesadequadas para a amplificação de DNA medida pela reação em cadeia dapolimerase; e o isolamento do gene relacionado com rendimento amplificadoou seu fragmento.
As seqüências identificadas pelos métodos aqui descritos podemser usadas para identificar agentes que são úteis na modulação de capaci-dades funcionais únicas, intensificadas ou alteradas de organismos domesti-cados e/ou corrigir defeitos nessas capacidades usando essas seqüências.Esses métodos empregam, por exemplo, técnicas de varredura conhecidasna técnica, tais como sistemas in vitro, sistemas de expressão baseados emcélulas e animais e plantas transgênicas. A tentativa fornecida pela presenteinvenção não somente identifica rapidamente genes evoluídos, mas indicamodulações que podem ser feitas para a proteína que podem não ser tãotóxicas porque elas existem em outras espécies.
A presente invenção também fornece um método de produçãode um polipeptídeo EG307 ou EG1117. Passos incluem o fornecimento deuma célula transfectada com um polinucleotídeo que codifica um polipeptí-deo EG307 ou EG1117 posicionado par a expressão na célula; e o cultivo dacélula transfectada sob condições para expressar o polinucleotídeo; e c) oisolamento do polipeptídeo EG307 ou EG1117.
A presente invenção também fornece um método de detecçãode um gene crescente de rendimento ou uma variante alélica de crescimentode rendimento de um gene em uma célula vegetal a qual inclui as seguintesetapas. As etapas incluem o contato do gene EG307 ou EG1117 ou umaporção sua maior do que 12 nucleotídeos, em alguns casos, maior do que 30nucleotídeos de comprimento com uma preparação do DNA genômico dacélula vegetal sob condições de hibridização proporcionando a detecção dasseqüências de moléculas de ácido nucléico com cerca de 50% ou mais deidentidade de seqüência em relação a um polinucleotídeo EG307 ouEG1117 da presente invenção, tal como, por exemplo, um polinucleotídeoselecionado do grupo consistindo em SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO:44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO:57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO:117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 78; SEQ ID NO: 79;SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82; SEQ ID NO: 83; SEQ IDNO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97;SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111; SEQ IDNO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89;SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92; SEQ ID NO: 93; e um poli-nucleotídeo com pelo menos cerca de 70% de identidade de seqüência comum polinucleotídeo eem umerado acima; e a detecção da hibridização, pormeio da qual um gene crescente de rendimento pode ser identificado.
A presente invenção também fornece um método de detecçãode um gene crescente de rendimento ou uma variante alélica crescente derendimento de um gene em uma célula vegetal. Esse método inclui o contatodos genes crescentes de rendimento EG307 ou EG1117 ou uma porção dequalquer um desse genes maior do que 12 nucleotídeos, em alguns casos,maior do que 30 nucleotídeos de comprimento com uma preparação do DNAgenômico da célula vegetal sob condições de hibridização proporcionando adetecção das seqüências de moléculas de ácido nucléico com cerca de 50%ou mais de identidade de seqüência em relação aos polinucleotídeos da pre-sente invenção conforme descritos em outros lugares aqui; e a detecção dahibridização, por meio da qual um gene crescente de rendimento ou umavariante alélica crescente de rendimento específica de um gene pode seridentificada.
As seqüências identificadas pelos métodos aqui descritos podemser usadas para identificar agentes que são úteis na modulação das capaci-dades funcionais únicas, aumentadas ou alteradas do organismo domestica-do e/ou para corrigir defeitos nessas capacidades usando essas seqüências.Esses métodos empregam, por exemplo, técnicas de varredura conhecidasna técnica, tais como sistemas in vitro, sistemas de expressão baseados emcélulas e animais e plantas transgênicas. A tentativa feita pela presente in-venção não somente identifica rapidamente os genes evoluídos, mas indicamodulações que podem ser feitas para a proteína que podem não ser tãotóxicas porque elas existem em outra espécie.
Numa modalidade, a presente invenção inclui um método dedeterminação se uma planta tem uma seqüência de polinucleotídeo particu-lar compreendendo uma seqüência EG307. Esse método inclui as seguintesetapas. Uma etapa inclui a comparação de pelo menos cerca de uma porçãoda seqüência de nucleotídeos codificadora de polipeptídeo da referida plantacom uma seqüência de polinucleotídeo de um polinucleotídeo EG307 dapresente invenção, tais como, por exemplo, aqueles selecionados do grupoconsistindo em (i) um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo naSEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ IDNO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47;SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ IDNO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60;SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ IDNO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO:115; SEQ ID NO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQID NO: 82; SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; e SEQ ID NO 85; e (ii) um poli-nucleotídeo com pelo menos cerca de 70% de seqüência de identidade paraum polinucleotídeo de (i) e o qual confere substancialmente o mesmo rendi-mento que o polinucleotídeo de (i). Um dos polinucleotídeos eem umeradosacima pode ser selecionado como o polinucleotídeo particular (isto é, o poli-nucleotídeo de interesse para a determinação se a planta contém aquelepolinucleotídeo ou um relacionado). Em outra etapa, o método inclui a identi-ficação se a planta contém o polinucleotídeo particular. Preferivelmente, aseqüência de polinucleotídeo vegetal é DNA ou cDNA genômico.
Em outra modalidade, a presente invenção inclui um métodopara determinar se uma planta tem uma seqüência de polinucleotídeo parti-cular compreendendo uma seqüência EG1117. Esse método inclui a etapade comparar pelo menos cerca de uma porção da seqüência de polinucleotí-deo da referida planta com uma seqüência de polinucleotídeo EG1117 dapresente invenção, tal como, por exemplo, um polinucleotídeo selecionadodo grupo consistindo em (i) um polinucleotídeo selecionado do grupo consis-tindo em SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98;SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ IDNO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90;SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92 e SEQ ID NO: 93 e (ii) um polinucleotídeocom pelo menos cerca de 70% de identidade de seqüência com um polinu-cleotídeo de (i) e o qual confere substancialmente o mesmo rendimento queum polinucleotídeo de (i). Um dos polinucleotídeos eem umerados acimapode ser selecionado como o polinucleotídeo particular (isto é, o polinucleo-tídeo de interesse, para a determinação se a planta contém aquele polinu-cleotídeo ou um relacionado). Em outra etapa, o método inclui a identificaçãose a planta contém o polinucleotídeo particular.
Preferivelmente, a seqüência de polinucleotídeo vegetal é DNAou cDNA genômico. Preferivelmente, a seqüência de polinucleotídeo vegetalestá associada com o rendimento aumentado em uma planta. Métodos paradeterminar e rendimentos quantitativos são conhecidos na técnica, e discuti-dos em outras partes no presente relatório descritivo. Por exemplo, o rendi-mento aumentado pode ser um rendimento aumentado em relação a umasegunda planta de uma planta de um ancestral, gênero ou membro da famí-lia comum com uma segunda seqüência de polinucleotídeo EG307 com pelomenos uma alteração de nucleotídeo em relação à seqüência de polinucleo-tídeo EG307 da planta.
A presente invenção também fornece métodos de modificaçãoda freqüência de um gene de rendimento de grão em uma população vege-tal, e métodos para a criação auxiliada por marcador ou para a seleção auxi-liada por marcador, os quais incluem as seguintes etapas. Uma etapa incluia varredura de uma pluralidade de plantas usando um oligonucleotídeo co-mo marcador para determinar a presença ou ausência de um gene de en-chimento de grão em uma planta individual, o oligonucleotídeo consistindoem não mais do que 300 bases de uma seqüência de nucleotídeo selecio-nada do grupo consistindo em SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO:74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO:51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO:65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO:80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82; SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO:98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105;SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO:90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92; SEQ ID NO: 93, e um polinucleotídeocom pelo menos cerca de 70% de identidade com uma SEQ ID NO. prece-dente. Outra etapa inclui a seleção de pelo menos uma planta individual paracriação baseando-se na presença ou ausência do gene de rendimento degrão; e outra etapa inclui a criação de pelo menos uma planta selecionadadessa forma para produzir uma população de plantas com uma freqüênciamodificada do gene de rendimento de grão.
Numa modalidade, métodos para a criação auxiliada por marca-dor incluem um método de criação auxiliada por marcador para uma se-qüência de polinucleotídeo EG1117 particular. Essa modalidade inclui asseguintes etapas. Uma etapa inclui a comparação, para pelo menos umaplanta, de pelo menos uma porção da seqüência de nucleotídeos das referi-das plantas com a seqüência de polinucleotídeo EG1117 particular da pre-sente invenção, tal como, por exemplo, aquelas selecionadas do grupo con-sistindo em (i) um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo em SEQID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO:41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO:54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO:68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115;SEQ ID NO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ IDNO: 82; SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 94;SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ IDNO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO:109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87;SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQ IDNO: 92; SEQ ID NO: 93; e um polinucleotídeo com pelo menos cerca de70% de identidade de seqüência com uma SEQ ID Ne precedente. Outraetapa inclui a seleção de pelo menos uma planta individual para criação ba-seando-se na presença ou ausência de gene de rendimento de grão; e outraetapa inclui a criação de pelo menos uma planta selecionada dessa formapara produzir uma população de plantas com uma freqüência modificada dogene de rendimento de grão.
Numa modalidade, métodos para a criação auxiliada por marca-dor incluem um método de cultivo auxiliado por marcador de plantas parauma seqüência de polinucleotídeo EG1117 particular. Essa modalidade in-clui as seguintes etapas. Uma etapa inclui a comparação, para pelo menosuma planta, de pelo menos uma porção da seqüência de nucleotídeo dasreferidas plantas com a seqüência de polinucleotídeo EG1117 particular dapresente invenção, tais como, por exemplo, aquelas selecionadas do grupoconsistindo em (i) um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo emSEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ IDNO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO:107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86;SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ IDNO: 91; SEQ ID NO: 92; SEQ ID NO: 93; e (ii) um polinucleotídeo com pelomenos cerca de 70% de identidade de seqüência com um polinucleotídeo de(i) e o qual confere substancialmente o mesmo rendimento que o polipeptí-deo de (i). Esse método também inclui a etapa de identificar se a plantacompreende a seqüência de polinucleotídeo particular; e a etapa de cultivaruma planta compreendendo a seqüência de polinucleotídeo particular paraproduzir progenia.
Métodos para o cultivo auxiliado por marcador também inclui ummétodo de cultivo auxiliado por marcador de plantas para uma seqüência depolinucleotídeo EG307 particular. Passos incluem a comparação, para pelomenos uma planta, de pelo menos uma porção da seqüência de nucleotí-deos das referidas plantas com um EG307 particular da presente invenção,tal como, por exemplo, uma seqüência de polinucleotídeo selecionada dogrupo consistindo em (i) um polinucleotídeo selecionado do grupo consistin-do da SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75;SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ IDNO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53;SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ IDNO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66;SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ IDNO: 115; SEQ ID NO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81;SEQ ID NO: 82; SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; e SEQ ID NO: 85; e (ii) umpolinucleotídeo com pelo menos cerca de 70% de identidade de seqüênciacom um polinucleotídeo de (i) e o qual confere substancialmente o mesmorendimento que um polipeptídeo de (i), identificando se a planta compreendea seqüência de polinucleotídeo particular; e o cultivo de uma planta compre-endendo a seqüência de polinucleotídeo particular para produzir progenia.
Esses métodos de cultivo auxiliado por marcador incluem ummétodo para selecionar plantas, por exemplo cereais (incluindo, mas sem selimitar, ao milho, trigo, cevada e outros membros da família das gramíneas)ou legumes (por exemplo, soja) com um rendimento alterado compreenden-do a obtenção de moléculas de ácido nucléico das plantas a serem selecio-nadas, contendo as moléculas de ácido nucléico com uma ou mais sondasque hibridizam seletivamente sob condições estringentes ou altamente es-tringentes para uma seqüência de ácido nucléico compreendendo os polinu-cleotídeos EG307 e EG1117 da presente invenção; a detecção da hibridiza-ção de uma ou mais sondas com as seqüências de ácido nucléico, em que apresença da hibridização indica a presença de um gene associado com orendimento alterado; e a seleção de plantas com base na presença ou au-sência de tal hibridização. Numa modalidade, a seleção auxiliada por mar-cador é efetuada no arroz. Em outra modalidade, a seleção auxiliada pormarcador é efetuada em trigo usando uma ou mais sondas as quais hibridi-zam seletivamente sob condições estringentes ou altamente estringentespara as seqüências compreendendo os polinucleotídeos EG307 e EG1117da presente invenção. Em ainda outra modalidade, a seleção auxiliada pormarcador é efetuada no milho (maize) ou milho (com) usando uma ou maissondas as quais hibridizam seletivamente sob condições estringentes oualtamente estringentes para polinucleotídeos compreendendo os polinucleo-tídeos EG307 e EG1117 da presente invenção. Em ainda outra modalidade,a seleção auxiliada por marcador é efetuada no sorgo usando uma ou maissondas as quais hibridizam seletivamente sob condições estringentes oualtamente estringentes para seqüências compreendendo os polinucleotídeosEG307 e EG1117 da presente invenção. Em ainda outra modalidade, a sele-ção auxiliada por marcador é efetuada na cevada usando uma ou mais son-das as quais hibridizam seletivamente sob condições estringentes ou alta-mente estringentes para seqüências compreendendo os polinucleotídeosEG307 e EG1117 da presente invenção. Em cada caso, a seleção auxiliadapor marcador pode ser efetuada usando uma sonda ou sondas para umaseqüência individual ou seqüências múltiplas. Se seqüências múltiplas foremusadas, elas podem ser usadas simultânea ou seqüencialmente.
Marcadores moleculares também podem ser usados durante oprocesso de cultivo para a seleção de traços qualitativos. Por exemplo, mar-cadores intimamente ligados a alelos ou marcadores contendo seqüênciasnos alelos eficazes de interesse podem ser usados para selecionar plantasque contêm os alelos de interesse durante um programa de cultivo de cru-zamento reverso. Os marcadores também podem ser usados para selecio-nar para o genoma do ancestral recorrente e contra os marcadores do an-cestral doador. O uso de procedimento pode minimizar a quantidade do ge-noma do ancestral doador que permanece nas plantas selecionadas. Eletambém pode ser usado para reduzir a quantidade de cruzamentos de voltapara o ancestral recorrente necessário em um programa de cruzamento re-verso, o uso de marcadores moleculares no processo de seleção é geral-mente chamado de Seleção Intensificada de Marcador Genético.
Em outra modalidade, a presente invenção inclui um polinucleo-tídeo isolado o qual inclui um ou mais dos seguintes nucleotídeos: SEQ IDNO: 71; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41;SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ IDNO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54;SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ IDNO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68;SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQID NO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO:82; SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO:101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109;SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ IDNO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92;SEQ ID NO: 93; e uma seqüência de polinucleotídeo com pelo menos cercade 70% de identidade de seqüência com uma (isto é, alguma) seqüência depolinucleotídeo eem umerada acima e confere substancialmente o mesmorendimento que qualquer seqüência de polinucleotídeo eem umerada acima.
Uma modalidade da presente invenção é um polinucleotídeo deplanta isolada que hibridiza sob condições de hibridização estringentes compelo menos um dos seguintes genes: um gene EG307 ou EG1117. As carac-terísticas identificadoras de tais genes são, antes, descritas. Um polinucleo-tídeo da presente invenção pode incluir um gene EG307 ou EG1117 da plan-ta natural isolada ou um homólogo seu, o último dos quais é descrito emmaiores detalhes abaixo. Um polinucleotídeo da presente invenção podeincluir uma ou mais regiões regulatórias, regiões codificadoras de compri-mento total ou parcial, ou combinações suas. O tamanho mínimo de um po-linucleotídeo da presente invenção é o tamanho mínimo que pode formar umhíbrido estável com um dos genes anteriormente mencionados sob condi-ções de hibridização estringentes. Plantas adequadas são descritas acima.
De acordo com a presente invenção, um polinucleotídeo isoladoé um polinucleotídeo que foi removido de seu ambiente natural (isto é, quetenha sido submetido à manipulação humana). Como tal, "isolado" não refle-te a extensão para a qual o polinucleotídeo foi purificado. Um polinucleotídeoisolado pode incluir DNA, RNA ou qualquer um dentre derivados de DNA ouRNA.
Um polinucleotídeo EG307 ou EG1117 vegetal isolado da pre-sente invenção pode ser obtido a partir de sua fonte natural ou como um ge-ne inteiro (isto é, completo) ou como uma porção sua capaz de formar umhíbrido estável com aquele gene. Um polinucleotídeo EG307 ou EG1117vegetal isolado também pode ser produzido usando a tecnologia de DNArecombinante (por exemplo, amplificação por reação em cadeia da polimera-se (PCR), clonagem) ou síntese química. Polinucleotídeos EG307 ouEG1117 vegetais isolados incluem polinucleotídeos naturais e homólogosseus, incluindo, mas sem se limitar, a variantes alélicos naturais e polinucle-otídeos modificados, nos quais os nucleotídeos foram inseridos, anulados,substituídos e/ou invertidos de tal forma que tais modificações não interfiramsubstancialmente com a capacidade do polinucleotídeo de codificar um poli-peptídeo EG307 ou EG1117 da presente invenção ou para formar híbridosestáveis sob condições estringentes com isolados de genes naturais.
Uma vez que o DNA desejado tenha sido isolado, ele pode serseqüenciado ou métodos conhecidos. É reconhecido na técnica que tais mé-todos são sujeitos a erros, tal como o múltiplo seqüenciamento da mesmaregião é rotina e será esperado que leve a taxas mensuráveis de erros naseqüência deduzida resultante, ou composições de bases não comuns, taiscomo regiões com alto conteúdo de base GC. Quando aparecem discrepân-cias, o resseqüenciamento pode ser feito e pode empregar métodos especi-ais. Métodos especiais podem incluir alterações das condições de seqüenci-amento pelo uso: de diferentes temperaturas; de diferentes enzimas; de pro-teínas as quais alteram a capacidade dos oligonucleotídeos formarem estru-turas de ordem; nucleotídeos alterados tais como ITP ou dGTP metilado;composições de gel diferentes, por exemplo adicionando formamida; diferen-tes primers ou primers localizados em diferentes distâncias da região doproblema; ou diferentes moldes tais como DNAs de filamento único. O se-qüenciamento de mRNA também pode ser empregados. Os inventores nota-ram que a SEQ ID NO: 97, um polinucleotídeo EG1117 da S. bicolor, origi-nalmente descrito na USSN 60/666.551 como SEQ ID NO: 3, foi descobertocomo tendo um erro e foi corrigido, de forma que a SEQ ID NO: 97 é a ver-são correta para o melhor do conhecimento atual do inventor.
Um homólogo de polinucleotídeo EG307 ou EG1117 vegetal po-de ser produzido usando uma quantidade de métodos conhecidos pelos in-divíduos versados na técnica (ver, por exemplo, Sambrook et ai, ibid). Porexemplo, polinucleotídeos podem ser modificados usando uma variedade detécnicas incluindo, mas sem se limitar, a técnicas de mutagênese clássica etécnicas de DNA recombinante, tais como mutagênese direcionada a sítio,tratamento químico de um polinucleotídeo para induzir mutações, clivagemde enzima de restrição de um fragmento de ácido nucléico, ligação dosfragmentos de ácido nucléico, amplificação da reação em cadeia da polime-rase (PCR) e/ou mutagênese de regiões selecionadas de uma seqüência deácido nucléico, síntese de misturas de oligonucleotídeo e ligação de gruposde mistura para "construir" uma mistura de polinucleotídeos e suas combina-ções. Homólogos de polinucleotídeo podem ser selecionados a partir de umamistura de ácidos nucléicos modificados pela varredura para a função dopolipeptídeo codificado pelo ácido nucléico (por exemplo, capacidade de eli-ciar uma resposta imune contra pelo menos um epitopo de um polipeptídeoEG307 ou EG1117, capacidade de aumentar o rendimento em uma plantatransgênica contendo um gene EG307 ou EG1117) e/ou por hibridizaçãocom um gene EG307 ou EG1117.
Um polinucleotídeo isolado da presente invenção pode incluiruma seqüência de ácido nucléico que codifica pelo menos um polipeptídeode planta EG307 ou EG1117 da presente invenção, exemplos de tais poli-peptídeos sendo aqui descritos. Embora a frase "polinucleotídeo" se refiraprimariamente ao polinucleotídeo físico e a frase "seqüência de ácido nucléi-co" se refira primariamente à seqüência de nucleotídeos em um polinucleotí-deo, as duas frases podem ser usadas intercambiavelmente, especialmenteem relação a um polinucleotídeo, ou a uma seqüência de ácido nucléico,sendo capaz de codificar um polipeptídeo EG307 ou EG1117. Conforme an-tes descrito, os polipeptídeos EG307 ou EG1117 da presente invenção in-cluem, mas não estão limitados, a polipeptídeos com regiões codificadorasEG307 ou EG1117 vegetais de comprimento completo, polipeptídeos comregiões codificadoras EG307 ou EG1117 vegetais parciais, polipeptídeos defusão, polipeptídeos protetores multivalentes e suas combinações.Pelo menos certos polinucleotídeos da presente invenção codifi-cam polipeptídeos que se ligam seletivamente ao soro imune derivado deum animal que tenha sido imunizado com um polipeptídeo EG307 ouEG1117 a partir do qual o polinucleotídeo foi isolado.
Um polinucleotídeo da presente invenção, quando expresso emuma planta adequada, é capaz de aumentar o rendimento da planta. Con-forme será descrito em maiores detalhes abaixo, tal polinucleotídeo podeser, ou codifica, um RNA anti-sentido, uma molécula capaz de formar umahélice tripla, uma ribozima ou outro composto baseado em ácido nucléico.
Uma modalidade da presente invenção é um polinucleotídeoEG307 ou EG1117 que hibridiza sob condições de hibridização estringentesem um polinucleotídeo EG307 ou EG1117 da presente invenção, ou a umhomólogo de tal polinucleotídeo EG307 ou EG1117, ou ao complemento detal polinucleotídeo. Um complemento de polinucleotídeo de qualquer se-qüência de ácido nucléico da presente invenção se refere à seqüência deácido nucléico do polinucleotídeo que é complementar a (isto é, pode formaruma dupla hélice completa com) o filamento para o qual a seqüência é cita-da. É para ser notado que uma molécula de ácido nucléico de duplo filamen-to da presente invenção para a qual uma seqüência de ácido nucléico foideterminada para um filamento, que é representado por uma SEQ ID NO,também compreende um filamento complementar co uma seqüência que éum complemento daquela SEQ ID NO. Como tal, polinucleotídeos da pre-sente invenção, os quais podem ser ou de duplo filamento ou de filamentoúnico, incluem aqueles polinucleotídeos que formam híbridos estáveis sobcondições de hibridização estringentes ou com uma dada SEQ ID NO deno-tada aqui e/ou com o complemento daquela SEQ ID NO, o qual pode ou nãoser aqui denotado. Métodos para deduzir uma seqüência complementar sãoconhecidos pelos indivíduos versados na técnica. Em algumas modalidades,um polinucleotídeo EG307 ou EG1117 é capaz de codificar pelo menos umaporção de um polipeptídeo EG307 ou EG1117 que está naturalmente pre-sente nas plantas.
Em algumas modalidades, os polinucleotídeos EG307 ouEG1117 da presente invenção hibridizam sob condições de hibridização es-tringentes com pelo menos um dos seguintes polinucleotídeos: SEQ ID NO:71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO:48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO:62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ IDNO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82;SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQ IDNO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101;SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO:88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92; SEQID NO: 93; ou a um homólogo ou complemento de tal polinucleotídeo.
O conhecimento das seqüências de ácido nucléico de certospolinucleotídeos EG307 ou EG1117 vegetais da presente invenção permite aum indivíduo versado na técnica, por exemplo, (a) a fazer cópias daquelespolinucleotídeos, (b) a obter polinucleotídeos incluindo pelo menos uma por-ção de tais polinucleotídeos (por exemplo, polinucleotídeos incluindo genesde comprimento completo, regiões codificadoras de comprimento completo,seqüências de controle regulatórias, regiões de codificação cortadas), e (c) aobter polinucleotídeos EG307 ou EG1117 para outras plantas. Tais polinu-cleotídeos podem ser obtidos de uma variedade de formas, incluindo a var-redura de bibliotecas de expressão apropriadas com anticorpos da presenteinvenção; técnicas de clonagem tradicionais usando sondas de oligonucleo-tídeo da presente invenção para testar bibliotecas apropriadas de DNA; eamplificação por PCR de bibliotecas apropriadas de DNA usando primers deoligonucleotídeo da presente invenção. Bibliotecas adequadas para testar oua partir das quais para amplificar polinucleotídeos incluindo bibliotecas taiscomo bibliotecas de DNA genômico, bibliotecas BAC, bibliotecas YAC, bi-bliotecas de cDNA preparadas a partir de tecidos vegetais isolados, incluin-do, mas sem se limitar, a troncos, estruturas/tecidos reprodutores, folhas,raízes e brotos; e bibliotecas construídas a partir de DNAcs reunidos a partirde qualquer ou de todos os tecidos listados acima. No caso de arroz e milho,bibliotecas BAC, disponíveis da Clemson University, podem ser usadas.Semelhantemente, fontes de DNA para varredura ou a partir das quais paraamplificar polinucleotídeos incluem DNA genômico vegetal. Técnicas paraclonar e amplificar genes são descritas, por exemplo, em Sambrook et al,ibid. e em Galun & Breiman, TRANSGENIC PLANTS, Imperial CollegePress, 1997.
A presente invenção também inclui polinucleotídeos que sãooligonucleotídeos capazes de hibridizar, sob condições de hibridização es-tringentes, com regiões complementares de outros polinucleotídeos, algu-mas vezes mais longos, da presente invenção, tais como aquelas compre-endendo os gentes EG307 ou EG1117 vegetais ou outros polinucleotídeosEG307 ou EG1117 vegetais. Oligonucleotídeos da presente invenção podemser RNA, DNA ou derivados de um ou outro. O tamanho mínimo de tais oli-gonucleotídeos é o tamanho necessário para formar um híbrido estável entreum dado oligonucleotídeo e a seqüência complementar em outro polinucleo-tídeo da presente invenção. Características de tamanho mínimo são aquidescritas. O tamanho do oligonucleotídeo também deve ser suficiente para ouso do oligonucleotídeo de acordo com a presente invenção. Oligonucleotí-deos da presente invenção podem ser usados em uma variedade de aplica-ções incluindo, mas sem se limitar, a sondas para identificar polinucleotídeosadicionais, como primers para amplificar ou estender polinucleotídeos, comoalvos para análise de expressão, como candidatos para mutagênese e/ourecuperação alvejada, ou em aplicações de agricultura para alterar a produ-ção ou atividade do polipeptídeo EG307 ou EG1117. Tais aplicações de a-gricultura incluem o uso de tais oligonucleotídeos em, por exemplo, tecnolo-gias baseadas em anti-sentido, formação de triplex, ribozima e/ou fármacode RNA. A presente invenção, conseqüentemente, inclui tais oligonucleotí-deos e métodos para aumentar a produtividade econômica em uma plantapelo uso de uma ou mais tais tecnologias.A presente invenção também inclui um polipeptídeo isolado oqual inclui um ou mais de um polipeptídeo codificado pelos polinucleotídeosSEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ IDNO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47;SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ IDNO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60;SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ IDNO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO:115; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ IDNO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; e um polinu-cleotídeo codificado por um polinucleotídeo com pelo menos cerca de 70%de identidade de seqüência em relação a um polinucleotídeo eem umeradoacima e confere substancialmente o mesmo rendimento que um polinucleo-tídeo eem umerado acima. Polipeptídeos isolados da presente invençãotambém incluem SEQ ID NO: 73; SEQ ID NO: 76; SEQ ID NO: 43; SEQ IDNO: 46; SEQ ID NO: 49; SEQ ID NO: 52; SEQ ID NO: 55; SEQ ID NO: 58;SEQ ID NO: 61; SEQ ID NO: 64; SEQ ID NO: 67; SEQ ID NO: 70; SEQ IDNO: 118; SEQ ID NO: 120; SEQ ID NO: 116; SEQ ID NO: 96; SEQ ID NO:99; SEQ ID NO: 102; SEQ ID NO: 104; SEQ ID NO: 106; SEQ ID NO: 108;SEQ ID NO: 110; SEQ ID NO: 112; SEQ ID NO: 114; e um polipeptídeo compelo menos cerca de 75% de identidade de seqüência com qualquer polipep-tídeo eem umerado acima e confere substancialmente o mesmo rendimentoque qualquer dos polipeptídeos eem umerados acima.
De acordo com a presente invenção, um polipeptídeo isolado oubiologicamente puro é um polipeptídeo que foi removido a partir de seu am-biente natural. Como tal, "isolado" e "biologicamente puro" não necessaria-mente refletem a extensão para a qual o polipeptídeo foi purificado. Um poli-peptídeo EG307 ou EG1117 isolado da presente invenção pode ser obtido apartir de sua fonte natural, pode ser produzido usando tecnologia do DNArecombinante ou pode ser produzido por síntese química. Um polipeptídeoEG307 ou EG1117 da presente invenção pode ser identificado por sua ca-pacidade de efetuar a função do EG307 ou EG1117 natural em um ensaiofuncional. Por "polipeptídeo EG307 ou EG1117 natural" se entende o poli-peptídeo EG307 ou EG1117 de comprimento total. A frase "capaz de efetuara função de um EG307 ou EG1117 natural em um ensaio funcional" significaque o polipeptídeo tem pelo menos cerca de 10% da atividade do polipeptí-deo natural no ensaio funcional. Em outras modalidades, o polipeptídeoEG307 ou EG1117 tem pelo menos cerca de 20% da atividade do polipeptí-deo natural no ensaio funcional. Em outras modalidades, o polipeptídeoEG307 ou EG1117 tem pelo menos cerca de 30% da atividade do polipeptí-deo natural no ensaio funcional. Em outras modalidades, o polipeptídeoEG307 ou EG1117 tem pelo menos cerca de 40% da atividade do polipeptí-deo natural no ensaio funcional. Em outras modalidades, o polipeptídeoEG307 ou EG1117 tem pelo menos cerca de 50% da atividade do polipeptí-deo natural no ensaio funcional. Em outras modalidades, o polipeptídeo tempelo menos cerca de 60% da atividade do polipeptídeo natural no ensaiofuncional. Em outras modalidades, o polipeptídeo tem pelo menos cerca de70% da atividade do polipeptídeo natural no ensaio funcional. Em outrasmodalidades, o polipeptídeo tem pelo menos cerca de 80% da atividade dopolipeptídeo natural no ensaio funcional. Em outras modalidades, o polipep-tídeo tem pelo menos cerca de 90% da atividade do polipeptídeo natural noensaio funcional. Exemplos de ensaios funcionais incluem tanto ensaios deligação a antígeno quanto ensaios de aumento de rendimento, conforme de-talhado em outros lugares nesse relatório descritivo.
Conforme usado aqui, um polipeptídeo EG307 ou EG1117 vege-tal isolado pode ser um polipeptídeo de comprimento completo ou qualquerhomólogo de tal polipeptídeo. Exemplos de homólogos de EG307 ouEG1117 incluem polipeptídeos EG307 ou EG1117 nos quais aminoácidosforam anulados (por exemplo, uma versão cortada do polipeptídeo, tal comoum peptídeo), inseridos, invertidos, substituídos e/ou derivados (por exem-pio, por glicosilação, fosforilação, acetilação, miristilação, prenilação, palmi-toilação, amidação e/ou adição de glicerofosfatidil inositol) de forma que ohomólogo tenha atividade EG307 ou EG1117 natural.Numa modalidade, quando o homólogo é administrado a um a-nimal como um imunógeno, usando técnicas conhecidas pelos indivíduosversados na técnica, o animal produzirá uma resposta imune humoral e/oucelular contra pelo menos um epitopo de um polipeptídeo EG307 ouEG1117. Homólogos de EG307 ou EG1117 também podem ser seleciona-dos por sua capacidade de efetuar a função do EG307 ou do EG1117 emum ensaio funcional.
Homólogos de polipeptídeo EG307 e EG1117 vegetais podemser o resultado da variação alélica natural ou de mutação natural. Homólo-gos de polipeptídeo EG307 ou EG1117 da presente invenção também po-dem ser produzidos usando técnicas conhecidas na técnica incluindo, massem se limitar, a modificações diretas ao polipeptídeo ou modificações nogene que codifica o polipeptídeo usando, por exemplo, técnicas de DNAclássicas ou recombinantes para efetuar a mutagênese aleatória ou alveja-da.
De acordo com a presente invenção, mimétopo se refere a qual-quer composto que é capaz de mimetizar a capacidade de um polipeptídeoEG307 ou EG1117 vegetal isolado da presente invenção de efetuar a funçãodo polipeptídeo EG307 ou EG1117 da presente invenção em um ensaio fun-cional. Exemplos de mimetopos incluem, mas não estão limitados, a anticor-pos antiidiotípicos ou a fragmentos seus, que incluem pelo menos um sítiode ligação que mimetiza um ou mais epitopos de um polipeptídeo isolado dapresente invenção; porções imunogênicas não-polipeptidáceas de um poli-peptídeo isolado (por exemplo, estruturas de carboidrato); e moléculas orgâ-nicas sintéticas ou naturais, incluindo ácidos nucléicos, que têm uma estrutu-ra similar a pelo menos um epitopo de um polipeptídeo isolado da presenteinvenção. Tais mimetopos podem ser projetados usando estruturas geradaspor computador de polipeptídeos da presente invenção. Mimetopos podemtambém ser obtidos pela geração de amostras aleatórias de moléculas, taiscomo oligonucleotídeos, peptídeos ou outras moléculas orgânicas, e pelavarredura de tais amostras por técnicas de cromatografia de afinidade usan-do o parceiro de ligação correspondente.O tamanho mínimo de um homólogo de polipeptídeo EG307 ouEG1117 da presente invenção é um tamanho suficiente para ser codificadopor um polinucleotídeo capaz de formar um híbrido estável com a seqüênciacomplementar de um polinucleotídeo que codifica o polipeptídeo natural cor-respondente. Como tal, o tamanho do polinucleotídeo que codifica tal homó-logo de polipeptídeo é dependente da composição do ácido nucléico e dahomologia porcentual entre o polinucleotídeo e a seqüência complementar,assim como das condições de hibridização per se (por exemplo, temperatu-ra, concentração salina e concentração de formamida). Também deve sernotado que a extensão da homologia necessária para formar um híbrido es-tável pode variar dependendo se as seqüências homólogas são interespa-çadas através dos polinucleotídeos ou estão agrupadas (isto é, localizadas)em regiões distintas dos polinucleotídeos. O tamanho mínimo de tais polinu-cleotídeos é de tipicamente pelo menos cerca de 12 até cerca de 15 nucleo-tídeos em extensão se os polinucleotídeos são ricos em GC e pelo menos15 até pelo menos 17 bases de comprimento se eles forem ricos em AT. Emalgumas modalidades, o polinucleotídeo é de pelo menos 12 bases de com-primento. Um polipeptídeo EG1117 ou EG307 vegetal da presente invençãoé um composto que quando expresso ou modulado em uma planta, é capazde aumentar o rendimento da planta.
Uma modalidade da presente invenção é um polipeptídeo defusão que inclui o domínio contendo o polipeptídeo EG307 ou EG1117 ligadoao segmento de fusão. A inclusão de um segmento de fusão como parte deum polipeptídeo EG307 ou EG1117 da presente invenção pode aumentar aestabilidade do polipeptídeo durante a produção, estocagem e/ou uso. De-pendendo das características do segmento, um segmento de fusão podetambém agir como um imunopotencializador para intensificar a resposta i-mune preparada por um animal imunizado com um polipeptídeo EG307 ouEG1117 contendo tal segmento de fusão. Além disso, um segmento de fu-são pode funcionar também como uma ferramenta para simplificar a purifi-cação de um polipeptídeo EG307 ou EG1117, de forma a capacitar a purifi-cação do polipeptídeo de fusão resultante usando cromatografia de afinida-de. Um segmento de fusão adequado pode ser um domínio de qualquer ta-manho que tenha a função desejada (por exemplo, conceder estabilidadeaumentada, conceder imunogenicidade aumentada a um polipeptídeo e/ousimplificar a purificação de um polipeptídeo). Está dentro do escopo da pre-sente invenção o uso de um ou mais segmentos de fusão. Segmentos defusão podem ser juntos com amino- ou carbóxi-terminais dos domínios dopolipeptídeo contendo EG307 ou EG1117. Ligações entre segmentos defusão e domínios contendo EG307 ou EG1117 de polipeptídeos de fusãopodem ser suscetíveis à clivagem para capacitar a recuperação direta dosdomínios contendo EG307 ou EG1117 de tais polipeptídeos. Polipeptídeosde fusão são produzidos em algumas modalidades pelo cultivo de uma célu-la recombinante transformada com um polinucleotídeo de fusão que codificaum polipeptídeo incluindo o segmento de fusão ligado ou à extremidade car-bóxi e/ou amino terminal de um domínio contendo EG307 ou EG1117.
Alguns segmentos de fusão para uso na presente invenção in-cluem um domínio de ligação à glutationa; um domínio de ligação a metal, talcomo um segmento de poliistidina capaz de se ligar a um íon de metal diva-lente; um domínio de ligação de imunoglobulina, tal como polipeptídeo A,polipeptídeo G, célula T, célula B, receptor Fc ou domínios de ligação a anti-corpo de polipeptídeo de complemento; um domínio de ligação a açúcar talcomo um domínio de ligação a maltose a partir de um polipeptídeo de liga-ção a maltose; e/ou um domínio "de identificação" (por exemplo, pelo menosuma porção da p-galactosidase, um peptídeo de identificação "strep", outrosdomínios que podem ser purificados usando compostos que se ligam aodomínio, tais como anticorpos monoclonais). Outros segmentos de fusãoincluem domínios de ligação a metal, tais como um segmento de poliistidina;um domínio de ligação à maltose; um peptídeo de identificação "strep".
Conforme aqui utilizado, "pelo menos uma porção" de um poli-nucleotídeo ou polipeptídeo significa uma porção com as características detamanho mínimas de tais seqüências, conforme descrito acima, ou qualquerfragmento maior da molécula de comprimento completo, até e incluindo amolécula de comprimento total. Por exemplo, uma porção de um polinucleo-tídeo pode ser 12 nucleotídeos, 13 nucleotídeos, 14 nucleotídeos, 15 nucleo-tídeos e assim por diante, indo até o polinucleotídeo de comprimento total.Similarmente, uma porção de um polipeptídeo pode ser de 4 aminoácidos, 5aminoácidos, 6 aminoácidos, 7 aminoácidos e assim por diante, indo até opolipeptídeo de comprimento total. O comprimento da porção a ser usadadependerá da aplicação particular. Conforme discutido acima, uma porçãode um polinucleotídeo útil como sonda de hibridização pode ser tão curtaquanto 12 nucleotídeos. Uma porção de um polipeptídeo útil como um epito-po pode ser tão curta quanto 4 aminoácidos. Uma porção de um polipeptí-deo que efetua a função do polipeptídeo de comprimento total poderia ge-ralmente ser mais longa do que 4 aminoácidos.
Outros polipeptídeos EG307 ou EG1117 vegetais da presenteinvenção são polipeptídeos que incluem, mas não estão limitados, aos poli-peptídeos codificados, polipeptídeos de comprimento completo, polipeptí-deos processados, polipeptídeos de fusão e polipeptídeos multivalentesseus, assim como polipeptídeos que são homólogos cortados de polipeptí-deos que incluem pelo menos porções das SEQ ID NOs anteriormente men-cionadas.
As seqüências nomeadas da presente invenção estão discutidasna Tabela II. Tabela II mostra o número de identificação da seqüência, o ge-ne, a espécie da qual ele foi isolado, uma descrição da seqüência, o pedidode patente de prioridade a partir do qual ele se originou e seu número deidentificação de seqüência original no pedido de patente de prioridade. To-das as seqüências nomeadas no presente pedido de patente são genes re-lacionados com o rendimento e são capazes de alterar o rendimento de umaplanta, por exemplo, as seqüências nomeadas são capazes de aumentar orendimento de uma planta e/ou diminuir o rendimento de uma planta. Méto-dos de avaliação de rendimento estão descritos em outros lugares aqui.Tabela II
<table>table see original document page 50</column></row><table><table>table see original document page 51</column></row><table><table>table see original document page 52</column></row><table><table>table see original document page 53</column></row><table>
Em consideração ao EG307 ou EG1117, algumas células re-combinantes são células vegetais. Por "célula vegetal" se entende qualquercélula autopropagavel ligada por uma membrana semipermeável e contendoum plastídeo. Tal célula também requer uma parede celular, se for desejadapropagação adicional. Célula vegetal, conforme aqui utilizada, inclui, semlimitação, algas, cianobactérias, sementes, culturas de suspensão, embri-ões, regiões meristemáticas, tecidos calosos, folhas, raízes, brotos, gametó-fitos, esporófitos, pólen e microsporos. Características de células recombi-nantes e de plantas transgênicas e métodos adequados estão descritos emWO 03/062382, assim como na Patente U.S. N9 6.040.497, ambas as quaissão incorporadas por referência nas suas totalidades. Por exemplo, a ex-pressão dos genes no milho é conhecida na técnica e promotores apropria-dos são conhecidos e podem ser selecionados pelo artesão instruído. Porexemplo, vetores de expressão vegetais podem ser construídos usando ve-tores de expressão de milho, tais como aqueles os quais podem ser obtidosa partir da Rhone Poulenc Agrochimie. Métodos para construir os construc-tos de expressão e vetores de transformação incluem recombinação e mani-pulação genética in vitro padrão. Ver, ou exemplo, as técnicas descritas emWeissbach and Weissbach, 1988, Methods For Plant Molecular Biology, A-cademic Press, Capítulos 26-28. Os vetores de transformação da invençãopodem ser desenvolvidos a partir de qualquer vetor de transformação vege-tal conhecido na técnica incluindo, mas sem se limitar, à família bem-conhecida de plasmídeos Ti de Agrobacterium e de seus derivados, incluin-do tanto vetores integrativos quanto binários, e incluindo, mas sem se limitar,a pBIB-KAN, pGA471, pEND4K, pGV38SOe pMONSOS. Também incluídossão os vírus vegetais de DNA e RNA, incluindo mas sem se limitar a CaMV,geminivírus, vírus mosaico do tabaco e derivados projetados destes, qual-quer um dos quais podendo eficaz servir como vetores para transferir umaseqüência codificadora, ou um equivalente funcional seu, com elementosregulatórios associados, em células vegetais e/ou manter autonomicamentea seqüência transferida. Além disso, elementos transponíveis podem serutilizados juntamente com qualquer vetor para transferir a seqüência codifi-cadora e a seqüência regulatória em uma célula vegetal.
Para ajudar na seleção de transformantes e de transfectantes,os vetores de transformação podem ser preferivelmente modificados paracompreender uma seqüência codificante para um produto de gene repórterou marcador selecionável. Tal seqüência codificadora para um marcadorrepórter ou selecionável deve preferivelmente estar em associação operativacom a seqüência codificadora do elemento regulatório descrita acima.
Genes repórteres, os quais podem ser úteis na invenção, inclu-em, mas não estão limitados, ao gene 3'-glicuronidase (GUS) (Jefferson etal., Proc. Natl. Acad. Sei. USA, 83:8447 (1986)), e o gene luciferase (Ow etal., Science 234:856 (1986)). Seqüências codificadoras que codificam mar-cadores selecionáveis os quais podem ser úteis na invenção incluem, masnão estão limitados, àquelas seqüências que codificam produtos de geneque conferem resistência a antibióticos, antimetabolitos ou herbicidas inclu-indo, mas sem se limitar, a canamicina, higromicina, estreptomicina, fosfino-tricina, gentamicina, metotrexato, glifosato e herbicidas de sulfoniluréia, eincluem, mas não estão limitados, a seqüências codificantes que codificamenzimas tais como neomicina fosfotransferase II (NPTII), cloranfenicol acetil-transferase (CAT) e higromicina fosfotransferase I (HPT, HYG).
Uma variedade de sistemas de expressão vegetais pode ser uti-lizada para expressar a seqüência codificante ou seu equivalente funcional.Espécies vegetais particulares podem ser selecionadas a partir de qualquerespécie dicotiledônea, monocotiledônea, gimnosperma, planta vascular ounão-vascular inferior, incluindo qualquer colheita de cereal ou outra colheitaimportante sob um aspecto de agricultura. Tais plantas incluem, mas nãoestão limitadas, a alfafa, Arabidopsis, aspargo, trigo, cana-de-açúcar, painçopérola, sorgo, cevada, repolho, cenoura, milho, algodão, pepino, linho, alfa-ce, óleo de semente de colza, pêra, ervilhas, petúnia, álamo, batata, arroz,beterraba, girassol, tabaco, tomate, trigo e trevo branco. Métodos pelosquais plantas podem ser transformadas ou transfectadas são bem-conhecidos pelos indivíduos versados na técnica. Ver, por exemplo, PlantBiotechnology, 1989, Kung & Arntzen, eds., Butterworth Publishers, cap. 1,2. Exemplos de métodos de transformação os quais podem ser eficazes u-sados na invenção incluem, mas não estão limitados, à transformação dosdiscos de folha ou outros tecidos vegetais mediada por Agrobacterium, mi-croinjeção de DNA diretamente nas células vegetais, eletroporação de DNAem protoplastos de células vegetais, lipossoma ou fusão de esferoplasto,bombardeamento por microprojéteis e a transfecção de células ou tecidosvegetais com vírus vegetais apropriadamente projetados. Os procedimentosde cultura de tecido vegetal necessários para a prática da invenção sãobem-conhecidos pelos indivíduos versados na técnica. Ver, por exemplo,Dixon, 1985, Plant Cell Culture: A Practical Approach, IRL Press. Aquelesprocedimentos de cultura tecidual que podem ser usados eficaz para praticara invenção incluem a produção e cultivo de protoplastos vegetais e suspen-soes celulares, propagação de cultura estéril de discos de folha ou outrostecidos vegetais em meio contendo cepas projetadas de agentes transfor-mantes tais como, por exemplo, Agrobacterium ou cepas de vírus vegetais ea regeneração de plantas inteiras transformadas a partir de protoplastos,suspensões celulares e tecidos calosos. A invenção pode ser praticada pelatransformação ou transfecção de uma planta ou tecido vegetal com um vetorde transformação contendo um constructo de expressão compreendendouma seqüência codificadora para a seqüência e a seleção para transforman-tes ou transfectantes que expressem a seqüência. Células e tecidos vegetaistransformadas ou transfectadas podem ser selecionados por técnicas bem-conhecidas pelos indivíduos versados na técnica incluindo, mas sem se limi-tar, à detecção de produtos do gene repórter ou à seleção baseada na pre-sença de um dos marcadores selecionáveis descritos acima. As células outecidos vegetais transformados ou transfectados são, a seguir, crescidos eplantas inteiras são regeneradas a partir disto. A integração e manutençãoda seqüência codificadora no genoma vegetal pode ser confirmada por téc-nicas padrão, por exemplo, por análise de hibridização Southern, análise porPCR, incluindo PCR-transcriptase reversa (RT-PCR) ou ensaios imunológi-cos para os produtos de proteína esperados. Uma vez que tal transformanteou transfectante vegetal é identificado, uma modalidade não-limitativa dainvenção envolve a expansão clonal e o uso daquele transformante ou trans-fectante na produção de uma seqüência.
Elementos regulatórios que podem ser usados nos constructosde expressão incluem promotores os quais podem ou ser heterologos ouhomólogos à célula vegetal. O protômero pode ser um protômero vegetal ouum protômero não-vegetal o qual é capaz de direcionar altos níveis de trans-crição de uma seqüência ligada em células vegetais e plantas. Exemplosnão-limitantes de promotores vegetais que podem ser usados eficientementena prática da invenção incluem o vírus mosaico de couve-flor (CaMV) 19Sou 35S. rbcS, o promotor para a proteína de ligação para a clorofila a/b, A-dhl, NOS e HMG2, ou modificações ou derivados seus. O promotor pode serou constitutivo ou induzível. Por exemplo, e não a título de limitação, umpromotor induzível pode ser um promotor que promova a expressão ou aexpressão aumentada de polinucleotídeos da presente invenção após a ati-vação de gene mecânica (MGA) da planta, tecido vegetal ou célula vegetal.Um exemplo não-limitante de tal promotor vegetal induzível por MGA é oMeGA.
Os constructos de expressão podem ser adicionalmente modifi-cados de acordo com os métodos conhecidos pelos indivíduos versados natécnica para aumentar ou otimizar a expressão de genes heteróloga emplantas e em células vegetais. Tais modificações incluem, mas não estãolimitadas, a elementos regulatórios de DNA para aumentar a força do promo-tor ou para alterar a própria seqüência codificadora. Outras modificaçõesincluem a anulação de seqüências de íntron ou excesso de seqüências não-codificadoras das extremidades 5' e/ou 3' da seqüência codificadora paraminimizar os efeitos negativos associados com a seqüência ou distância naexpressão de proteínas, por exemplo, minimizando ou eliminando seqüên-cias desestabilizadoras de mensagens.
Os constructos de expressão podem ser ainda modificados deacordo com os métodos conhecidos pelos indivíduos versados na técnicapara adicionar, remover ou, de outra forma, modificar seqüências de sinal depeptídeos para alterar a clivagem do peptídeo de sinal ou para aumentar oualterar o alvejamento dos polipeptídeos expressos através do sistema deendomembrana vegetal. Por exemplo, mas não a título de limitação, o cons-tructo de expressão pode ser especificamente projetado para alvejar o poli-peptídeo para secreção, ou localização vacuolar, ou retenção no retículoendoplasmático (ER).
A presente invenção também inclui anticorpos isolados capazesde se ligar seletivamente a um polipeptídeo EG307 ou EG1117 da presenteinvenção ou a um mimétopo seu. Características de células recombinantes ede plantas transgênicas, e métodos adequados são descritos em WO03/062382.
A presente invenção também inclui células vegetais, as quaiscompreendem DNA heterólogo que codifica um polipeptídeo EG1117 ouEG307. Tais polipeptídeos são capazes de alterar o rendimento de umaplanta. Por exemplo, mais preferivelmente o polipeptídeo é capaz de aumen-tar o rendimento de uma planta, e menos preferivelmente o polipeptídeo écapaz de reduzir o rendimento de uma planta. As células vegetais incluemos polipeptídeos da presente invenção conforme descritos aqui em outroslugares. Adicionalmente, a presente invenção inclui um material de propaga-ção de uma planta transgênica compreendendo a célula vegetal transgênicaacima descrita.
A presente invenção também inclui plantas transgênicas conten-do DNA heterólogo, o qual codifica um polipeptídeo EG1117 ou EG307 queé expresso no tecido vegetal. Tais polipeptídeos são capazes de alterar orendimento da planta. As plantas transgênicas incluem os polipeptídeos dapresente invenção conforme descritos em outros lugares por aqui.
A presente invenção também inclui um polinucleotídeo isolado oqual inclui um promotor operativamente ligado a um polinucleotídeo que co-difica um polipeptídeo EG1117 ou EG307 no tecido vegetal. Tais polipeptí-deos são capazes de alterar o rendimento da planta. As plantas transgênicasincluem os polipeptídeos da presente invenção conforme descritos aqui emoutros lugares. O polinucleotídeo pode ser um polinucleotídeo recombinante,e pode incluir qualquer promotor, incluindo um promotor natural para um gene EG1117ou EG307.
A presente invenção também inclui uma célula hospedeira trans-fectada compreendendo uma célula hospedeira transfectada com um cons-tructo compreendendo um polinucleotídeo promotor, intensificador ou íntronde um polinucleotídeo EG1117 ou EG307 ou qualquer combinação destes,operativamente ligado a um polinucleotídeo que codifica uma proteína repór-ter. Tais constructos são capazes de alterar o rendimento de uma planta. Ascélulas hospedeiras transfectadas compreendem os polipeptídeos da pre-sente invenção conforme descritos aqui em outros lugares.
A presente invenção também inclui um vetor recombinante, oqual inclui pelo menos um polinucleotídeo EG307 ou EG1117 vegetal dapresente invenção, inserido em qualquer vetor capaz de distribuir o polinu-cleotídeo em uma célula hospedeira. Características de moléculas recombi-nantes e métodos adequados estão descritos em WO 03/062382. Polinucle-otídeos adequados para incluir em vetores recombinantes da presente in-venção são como descritos aqui para polinucleotídeos EG307 ou EG1117vegetais per se. Polinucleotídeos para incluir em vetores recombinantes, eparticularmente em moléculas recombinantes da presente invenção incluemos polinucleotídeos EG307 e EG1117 da presente invenção.
Conforme aqui utilizado, condições de hibridização estringentesse referem a condições de hibridização padronizadas sob as quais polinu-cleotídeos, incluindo oligonucleotídeos, são usados para identificar molécu-Ias com seqüências de ácido nucléico similares. Tais condições padroniza-das são descritas, por exemplo, em Sambrook et al, MOLECULAR CLO-NING: A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Labs Press, 1989.
Exemplos de tais condições são fornecidos na seção de exemplos do pre-sente pedido de patente.
Conforme aqui utilizado, um gene EG307 ou EG1117 de milhoinclui todas as seqüências de ácido nucléico relacionadas com um geneEG307 ou EG1117 de milho natural, tais como regiões regulatórias que con-trolam a produção do polipeptídeo EG307 ou EG1117 de milho codificadopor aquele, gene (tal como, porém sem se limitar, a regiões de controle de transcrição, tradução ou pós-tradução) assim como a própria região codifi-cadora. Numa modalidade, um gene EG307 ou EG1117 de milho inclui aseqüência de ácido nucléico SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO:74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO:51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO:65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO:80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82; SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO:98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105;SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO:90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92; SEQ ID NO: 93 (assim como outrasseqüências aqui apresentadas).
Em outra modalidade, um gene EG307 ou EG1117 de milho po-de ser uma variante alélica que inclui uma seqüência semelhante, porémnão idêntica, a um EG307 ou EG1117 da presente invenção, ser um local(ou locais) no genoma cuja atividade diz respeito com os mesmos processosbioquímicos ou de desenvolvimento, e/ou um gene que ocorre essencial-mente no mesmo local que os genes incluindo um gene EG307 ou EG1117da presente invenção, mas o qual, devido a variações naturais causadas,por exemplo, por mutação ou recombinação, tem uma seqüência similar,porém não idêntica. Devido aos genomas poderem sofrer rearranjo, o arran-jo físico dos alelos não é sempre o mesmo. Variantes alélicas tipicamentecodificam polipeptídeos com atividade similar àqueles do polipeptídeo codifi-cado pelo gene ao qual elas estão sendo comparadas. Variantes alélicastambém compreendem alterações nas regiões 5' ou 3' não-traduzidas dogene (por exemplo, em regiões de controle regulatórias). Variantes alélicassão bem-conhecidas pelos indivíduos versados na técnica e poderia se es-perar encontrá-las em um dado cultivar ou cepa, uma vez que o genoma émultiplóide e/ou dentro de uma população compreendendo dois ou mais cul-tivares ou cepas. Um alelo pode ser definido como uma seqüência de poli-nucleotídeo EG1117 ou EG307 com pelo menos uma alteração de nucleotí-deo em comparação com uma segunda seqüência de polinucleotídeoEG1117ou EG307.
Como tal, o tamanho mínimo de um polinucleotídeo usado paracodificar um homólogo de polipeptídeo EG307 ou EG1117 da presente in-venção é de cerca de 12 até cerca de 18 nucleotídeos em comprimento. Nãohá limites, além do que um limite prático, no tamanho máximo de tal polinu-cleotídeo no fato de que o polinucleotídeo pode incluir uma porção de umgene, um gene inteiro ou genes múltiplos, ou porções destes. Similarmente,o tamanho mínimo de um homólogo de polipeptídeo EG307 ou EG1117 dapresente invenção é de cerca de 4 até cerca de 6 aminoácidos em compri-mento, com os tamanhos desejados dependendo se porções de comprimen-to inteiro, fusão, multivalente ou funcionais de tais polipeptídeos são deseja-das. Em algumas modalidades, o polipetídeo é de pelo menos 30 aminoáci-dos de comprimento.
Conforme aqui utilizado, um gene EG307 ou EG1117 inclui to-das as seqüências de ácido nucléico relacionadas com um gene EG307 ouEG1117 natural, tais como regiões regulatórias que controlam a produção dopolipeptídeo EG307 ou EG1117 codificado por aquele gene (tais como, po-rém sem se limitar, a regiões de controle de transcrição, tradução ou pós-tradução) assim como a própria região codificadora. Numa modalidade, umgene EG307 ou EG1117 inclui os polinucleotídeos EG307 ou EG1117 dapresente invenção. Em outra modalidade, um gene EG307 ou EG1117 demilho pode ser uma variante alélica que inclui uma seqüência similar, porémnão idêntica aos polinucleotídeos EG307 ou EG1117 da presente invenção.
Conforme aqui utilizado, um gene EG307 ou EG1117 inclui to-das as seqüências de ácido nucléico relacionadas com um gene EG307 ouEG1117, tais como regiões regulatórias que controlam a produção do poli-peptídeo EG307 ou EG1117 codificado por aquele gene (tal como, porémsem se limitar, às regiões de controle de transcrição, tradução ou pós-tradução), assim como a própria região codificadora. Um gene EG307 ouEG1117 preferivelmente inclui os polinucleotídeos EG307 ou EG1117 dapresente invenção. Objetos, vantagens e novas características adicionaisdessa invenção serão aparentes para os indivíduos versados na técnica noexame dos seus seguintes exemplos, os quais não são tencionados paraserem limitantes.
EXEMPLO 1
Conformando a validação dos genes candidatos a rendimento: Análise deAssociação.
Conforme descrito no Exemplo 17 de WO 03/062382, a análisede associação envolve o seqüenciamento de cada gene candidato em umagrande quantidade de cepas de arroz bem-caracterizadas para aprender seos genes estão associados com traços conhecidos. Além das linhagens dearroz analisadas conforme descrito no Exemplo 17, 44 cepas de arroz bem-caracterizadas (ver Tabela 1) foram analisadas para o alelo EG307 ouEG1117. Conforme foi encontrado anteriormente, o alelo derivados, positi-vamente selecionado de cada um de EG307 ou EG1117 se correlacionamcom um peso de grão maior nessas 44 linhagens de arroz. Usando um testequi-quadrado para associação, nós descobriu-se a associação entre o alelo(genótipo) e o fenótipo foi significativa com 2 graus de liberdade, P < 0,0001.O modelo que é observado a partir da tabela a seguir mostra que o EG307influencia no rendimento, isto é, é um gene relacionado com o rendimentocapaz de aumentar o rendimento em uma planta.
Tabela III
Genotipagem de acessos de arroz classificador por peso do grão
<table>table see original document page 62</column></row><table><table>table see original document page 63</column></row><table>
307A = Alelo ancestral EG307; 307D = alelo derivado EG307 (adaptado)1117A = Alelo ancestral EG1117; 1117D = alelo derivado EG1117 (adapta-do)
A figura 1 é um gráfico mostrando os dados na Tabela III mos-trando a faixa de pesos de grão correlacionada ou com o alelo ancestral(quadrado) ou derivado (triângulo) ou para o EG307 ou para o EG1117. Nafigura 2, dados fenotípicos foram convertidos em índices Z, valores expres-sando para que a extensão um traço é afetada por um genótipo particular. Oíndice Z indica o quão distante e em que direção um traço se desvia da mé-dia de distribuição de traços, expressa em unidades do desvio padrão (SD)de distribuição dos traços. Contagens Z maiores do que 1 SD indicam umefeito do alelo e do traço. Quanto maior O índice Z, maior é o efeito. O índiceZ para o rendimento foi de 4 SD, um efeito muito pronunciado.104 linhagens de arroz adicionais bem-caracterizadas e híbridos foram ge-notipados usando um método de produção mais elevada. O alelo ancestralpara cada EG307 e EG1117 pode ser distinguido do alelo derivado (adapta-do) pelo exame dos nucleotídeos em algumas posições chave. Conseqüen-temente, ao invés de genotipar pelo seqüenciamento da seqüência codifi-cante inteira, nós genotipamos pela análise do nucleotídeo presente em al-gumas posições chave. Os primers foram projetados de forma que pudes-sem produzir um pequeno produto de PCR (não mais do que um produto de200 pb, preferivelmente de 100-150 pb) ao redor da posição a ser analisada.Depois, uma sonda foi projetada de forma que pudesse se estender sobre aposição, com a posição a ser analisada o mais próximo do centro da sondaquanto possível. A sonda foi tão curta quanto possível sem ser mais curta doque 12 pbs. Adicionalmente, as sondas forma projetadas de forma que elastinham uma temperatura de fusão (Tf) na faixa de 65 a 67°C. Duas sondasforma projetadas para cada grupo de primers, um para cada posição a seranalisada. Usando a tecnologia de supressão ABI MGB, Tfs mais elevadaspodem ser usadas para as sondas que são usadas para o próprio produto dePCR eficaz. Cada sonda foi sintetizada incorporando um diferente identifica-dor fluorescente (seja VIC ou FAM).
Uma mistura de primer/sonda feita que incluiu um grupo de pri-mers "forward" e reversos e ambas as sondas (ver Tabela 2). Um sistemaBiotage Rotor-Gene 2000 RT PCR foi usado de acordo com os protocolos dofabricante para genotipagem. Para linhagens de híbridos que são homozigó-ticas ou para o alelo ancestral ou derivado, somente a sonda que é específi-ca para o nucleotídeo correspondente para qualquer um do alelo ancestralou derivado irá se ligar ao produto tal como ele é feito na reação de termoci-clização e, conseqüentemente, fluorescer. Quando ambos estão presentes(como em um heterozigoto), ambos os corantes fluorescentes são vistos nareação de PCR.
Tabela IV.
<table>table see original document page 65</column></row><table>
Usando um modelo estatístico aditivo de fator individual corrigidopara efeitos de linhagem, analisou-se o efeito do genótipo (alelos derivadosde homozigoto ou de ancestral homozigótico para cada um de EG307 ouEG1117). Seis estimativas foram maiores do que um desvio padrão (um efei-to de gene principal) com os efeitos mais pronunciados na ordem decrescen-te em: rendimento, altura da planta, peso do grão bruto (sdwt 1000-bruto),peso de grão descascado (sdwt 1000-descascado), largura e ASV (ver figura2). Efeitos de adição estimados menos pronunciados foram no alojamento,amilase e no comprimento. Houve um efeito negativo estimado principal paraos alelos derivados de ambos os genes no traço de "chalk". "Chalk" é geral-mente uma característica indesejável no arroz, embora ela possa ser dese-jável em certos tipos especializados de arroz. "Chalk" resulta da formação degrânulos de amido deformados que se empilham diferentemente do que grâ-nulos de amido propriamente formados deixando espaços de ar entre eles.Os alelos domesticados (derivados) de EG307 e EG1117 se correlacionamcom menos "chalk".
A seguir, calculou-se R2, a proporção de variação explicada pelomodelo aditivo de fator individual corrigido para os efeitos de linhagem. Paraos efeitos aditivos principais, R2 variou de 47% para o rendimento, 35% paraa altura, 35% para o peso de grão descascado, 18% para a largura, 15%para ASV (valor de difusão alcalina), quando combinado com % de amilase,produz o índice de amido), 11% para o peso de grão bruto e 19% para"chalk".
Exemplo 2
Identificação do EG307 e EG1117 no Trigo, Cevada, Sorgo e Cana-de-açúcar
Procurando as seqüências genômicas de trigo, cevada, sorgo ecana-de-açúcar no GenBank por BLAST usando seqüências EG1117 de ar-roz identificou pelo menos quatro ESTs de trigo (incluindo os números deacesso CK203588, CK203242, BE444456 e BJ481258), vários ESTs de ce-vada (incluindo os números de acesso BJ478960 e BJ481259), 4 ESTs desorgo (incluindo os números de acesso CA200440, BG948036, BG947743 eBM327663), e 5 ESTs de cana-de-açúcar (números de acesso CA284889,CA102585, CA200440, CA218123 e CA106550), os quais aparentam seremhomólogos. Iniciadores foram projetados por métodos padronizados quepermitiram a amplificação bem-sucedida dos homólogos de trigo, cevada,sorgo e cana-de-açúcar. Seqüências de homólogos de trigo, cevada, sorgo ecana-de-açúcar são aqui fornecidas. Trigo de pão moderno é um hexaplóide,consistindo em três genomas, de forma que espera-se ver três cópias deEG1117 e de EG307. No caso de EG1117, sabe-se que existem pelo menostrês cópias expressas.
A busca das seqüências de genoma de cevada no GenBank porBLAST usando as seqüências EG307 de arroz identificou uma quantidadede ESTs de trigo (incluindo os números de acesso CD898159, BE496848,BF484251, CA595746, CA730688 e CV772418) e nove ESTs de cevada(incluindo os números de acesso BI958390, CA026456, BQ467189,CA002341, BE558500, BQ466901, BU996029, CA014071, CB867549) osquais aparentam serem homólogos. Os primers foram projetados por méto-dos padronizados que permitiram uma amplificação bem-sucedida dos ho-mólogos de trigo e cevada. As seqüências são aqui fornecidas.
Exemplo 3
Análise de associação no milho
Usando dados de seqüência dos primers ESTs de milho e Oryzaforam projetados primers e EG307 e EG1117 foram amplificados por PCRem milho ancestral (teosinto), três milhos adaptados à terra e 6 híbridos deelite comercialmente disponíveis. Os alelos do EG307 foram encontradosagrupados em dois grupos. Um grupo de alelos intimamente relacionados,incluindo o alelo A (SEQ ID NO: 71) e o alelo B (SEQ ID NO: 74), foram des-cobertos somente nos seus híbridos de elite. O outro grupo de alelos inti-mamente relacionados, incluindo o alelo I (SEQ ID NO: 41), alelo II (SEQ IDNO: 44), alelo III (SEQ ID NO: 47), alelo IV (SEQ ID NO: 50), alelo V (SEQID NO: 53), alelo VI (SEQ ID NO: 56), alelo VII (SEQ ID NO: 59), alelo VIII(SEQ ID NO: 62), alelo IX (SEQ ID NO: 65) e alelo X (SEQ ID NO: 68) foramencontrados somente no milho ancestral de baixo rendimento ou no adaptado à terra.
É notado que uma variedade de seqüências, tais como ESTs,existem no domínio público. Alguns ESTs podem ter áreas de alta identidadecom os polinucleotídeos aqui descritos em áreas de sobreposição com ospolinucleotídeos da presente invenção. Em outras palavras, essas podemser potencialmente regiões de identidade menor entre um polinucleotídeo dapresente invenção e uma seqüência no domínio público, tal como um EST,onde a seqüência ou EST não sobrepõe com o polinucleotídeo da presenteinvenção, e regiões de identidade mais elevadas onde aquele EST se so-brepõe com um polinucleotídeo da presente invenção. Regiões de identida-de mais baixas podem ser especificadas pelos inventores, essas regiõescompreenderão áreas da SEQ ID NO: nomeada que não têm uma sobrepo-sição com uma seqüência ou EST no domínio público, e essas regiões deidentidade mais baixa terão uma identidade porcentual de pelo menos cercade 50%, pelo menos cerca de 55%, pelo menos cerca de 58%, pelo menoscerca de 60%, pelo menos cerca de 61%, pelo menos cerca de 62%, pelomenos cerca de 63%, pelo menos cerca de 64%, pelo menos cerca de 65%,pelo menos cerca de 66%, pelo menos cerca de 67%, pelo menos cerca de68%, pelo menos cerca de 70%, pelo menos cerca de 75%, pelo menos cer-ca de 80%, pelo menos cerca de 85% ou de pelo menos cerca de 90% emrelação a uma SEQ ID NO: aqui. Essas regiões podem ser reivindicadas se-paradamente pela exclamação de suas posições na SEQ ID NO:, por exem-plo, uma região pode ser identificada como se segue: nucleotídeos 1 a 144da SEQ IDNO: 105.
Exemplo 4
Usando o Genótipo como Marcadores para a Seleção Auxiliada por Marca-dor ou Cultivo Auxiliado por Marcador
Em cruzamentos usando linhagens adaptadas à terra para tentartrazer uma melhor resistência à secura ou resistência à peste em um híbridode elite, nas sem perder rendimento, mudas de tais cruzamentos são testa-das e somente aquelas mudas que contêm o melhor alelo de EG307 eEG1117 são selecionadas. Em cruzamentos de um rendimento mais baixo ede mudas de alta produção inata de tais cruzamentos são testadas e somen-te aquelas mudas que contêm o melhor alelo de EG307 ou EG1117 são se-lecionadas.
A discussão precedente da invenção foi apresentada para ospropósitos de ilustração e descrição. O precedente não é tencionado paralimitar a invenção na forma ou formas aqui descritas. Embora a descrição dainvenção tenha incluído a descrição de uma ou mais modalidades e de cer-tas variações e modificações, outras variações e modificações estão dentrodo escopo da invenção, por exemplo, como pode estar dentro da habilidadee conhecimento dos indivíduos versados na técnica, depois de entender apresente descrição. É tencionado obter direitos os quais incluem as modali-dades alternativas até a extensão permitida, incluindo funções, faixas, eta-pas ou estruturas alternadas, intercambiáveis e/ou equivalentes em relaçãoàquelas reivindicadas, quer sejam tais funções, faixas, etapas ou estruturasalternadas, intercambiáveis e/ou equivalentes aqui descritas ou não, e semtencionar dedicar publicamente qualquer material do assunto patenteável.Listagem de Seqüência
<110> Evolutionary Genomics LLCMessier, Walter
<120> Poiinucleotídeos e Polipetideos relacionados às safras de Planta-ções
<130> GENO200.1.8/PCT<160> 80
<170> Patentln Versão
<210> 41
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<400> 1
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aagccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaagc tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacattc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccaa aagagtaccc 240
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacgtga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360
gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag atccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 480
gtccaacaaa tgggatcagg ttcatccctg tctggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540
atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcaatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc gggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780
tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 840
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900
cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt cttcaaaaac ccaaggactt gcctgctatc 960
aagcagcagg agatcaggac ctcttcctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagcag ttcaagtgca ggatactaag ctctcccggt cagacatgaa gaaaatccgc 1080
aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac 1320
cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 42<211> 1347
<212> DNA<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> <1) .. (1347)
<400> 2
atg tcg agg tgc ttc ccc tac ccg cca ccg ggg tac gtg cgg aac cca 48
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
gtg gcc gtg gcc gag ccg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag 96Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
gaa aaa gcc gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gct ccc 144Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
aag cag tgt gag acg tec aaa cat tca aag cac age cat aag aag aga 192Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
aag ctt gaa gat gtc ate aaa gct gag cag ggt ccc aaa aga gta ccc 240Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
aaa gaa tca gtt gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser- Glu Glu His85 90 95
gga gct cet tet ttt gta cat acg ata cgt gac tet cet gag age tca 336Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
cag gac age ggc aag aga cga aag gtt gtc ctg tec agt cet age caa 384Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
cet aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gatPro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
432
ccc caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg
480Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu
145 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggt tca tcc ctg tct ggc aag caa aat tca 528
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tct acc tct ggt cag cgg agg gtc 57 6
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
aat ggt gac tcc caa gea gta caa aaa tgt ttg att aca gaa tcc ceg 624
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
gea aag acc atg cag aga ctt gtc cec cag cet gea gct aag gtc aca 672
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
cat cet gtt gat cec cag tca gct gtt aag gtg cca gtt gga aga tcg 720
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser
225 230 235 240
ggc cta cet ctg aag tct tcg gga agt gtg gac cet tcg cet gct aga 7 68
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
gtt atg aga aga ttt gat cet cca cet gtt aag atg atg tca cag aga 816
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
gtt cac cat cca gct tcc atg gtg tcg cag aaa gtt gat cet ceg ttt 864
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
ceg aag gta tta cat aag gaa acc gga tct gtt gtt cgc cta cca gaa 912
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
gct acc cgg cet act gtt ctt caa aaa. cec aag gac ttg cet gct ate 960
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie
305 310 315 320
aag cag cag gag ate agg acc tct tcc tca aaa gaa gag cec tgc ttc 1008
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe325 330 335
tct ggt agg aat gea gaa gea gtt caa gtg cag gat act aag etc tcc 1056
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
cgg tca gac atg aag aaa ate cgc aaa gct gag aaa aaa gat aag aag 1104
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365
ttc aga gat ctg ttt gtt acc tgg aat ceg gta ttg ata gag aat gaa 1152
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu370 375 380
ggt tca gat ctt ggt gat gaa gac tgg ctg ttc age agt aaa agg aac 1200 Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn 385 390 395 400
tec gat gct ate atg gtt caa age aga gct act gat agt tca gtg ceg 1248 Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro 405 410 415
ate cat cca atg gtg cag cag aag cet tet tta caa cec agg gea aca 1296 lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr 420 425 430
ttt ttg ceg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt 1344 Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe 435 440 445
taa 1347
<210> 43
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 3
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro 15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys 20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro 35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg 50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro 65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His 85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser 100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115
120
125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp 130 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu 145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser 165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai 180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro 195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr 210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser 225 230 235 240
Gly Leu Pro Leu- Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg 245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg 260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe 275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu 290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie 305 310 315 320
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe 325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser 340 345 350Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys 355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu 370 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn 385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro 405 410 415
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
<210> 44 <2U> 1347 <212> DNA <213> Milho
<400> 4
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aagccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaagc tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacattc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccaa aagagtaccc 240
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacgtga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360
gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag atccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 480
gtccaacaaa tgggatcagg ttcatccctg tctggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540
atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcaatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc gggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 84 0
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900
cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt cttcaaaaac ccaaggactt gcctgctatc 960
aagcagcagg agatcaggac ctctttctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagcag ttcaagtgca ggatactaag ctctcccggt cagacatgaa gaaaatccgc 1080
aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140
atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac . 1320
cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 45
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1).. .(1347)
<400> 5
atg tcg agg tgc ttc ccc tac ccg cca ccg 999 tac gtg cgg aac cca
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro
1 5 10 15
gtg gcc gtg gcc gag ccg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys
20 25 30
48
96
gaa aaa gcc gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gct ccc 144
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro
35 40 45
aag cag tgt gag acg tec aaa cat tca aag cac age cat aag aag aga 192
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg 50 55 60
aag ctt gaa gat gtc ate aaa gct gag cag ggt ccc aaa aga gta ccc 240
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro
65 70 75 80
aaa gaa tca gtt gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His
85 90 95gga gct cct tct ttt gta cat acg ata cgt gac tct cct gag age tca 336
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser
100 105 110
cag gac age ggc aag aga cga aag gtt gtc ctg tec agt cct age caa 384
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln
115 120 125
cct aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gat 432
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp
130 135 140
cec caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg 480
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu
145 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggt tca tec ctg tct ggc aag caa aat tca 528
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser 165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tct acc tct ggt cag cgg agg gtc 576
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai
180 185 190
aat ggt gac tec caa gea gta caa aaa tgt ttg att aca gaa tec ceg 624
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro
195 200 205
gea aag acc atg cag aga ctt gtc cec cag cct gea gct aag gtc aca 672
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr
210 215 220
cat cct gtt gat cec cag tca gct gtt aag gtg cca gtt gga aga tcg 720
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser
225 230 235 240
ggc cta cct ctg aag tct tcg gga agt gtg gac cct tcg cct gct aga 7 68
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg 245 250 255
gtt atg aga aga ttt gat cct cca cct gtt aag atg atg tca cag aga 816
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg
260 265 270
gtt cac cat cca gct tec atg gtg tcg cag aaa gtt gat cct ceg ttt 864
Vai His His'Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe
275 280 285
ceg aag gta tta cat aag gaa acc gga tct gtt gtt cgc cta cca gaa 912
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu
290 295 300
gct acc cgg cct act gtt ctt caa aaa cec aag gac ttg cct gct ate 960
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie
305 310 315 320
aag cag cag gag ate agg acc tct ttc tca aaa gaa gag cec tgc ttc 1008Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Phe Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe 325 330 335
tct ggt agg aat gca gaa gca gtt caa gtg cag gat act aag etc tec 1056
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser
340 345 350
cgg tca gac atg aag aaa ate cgc aaa gct gag aaa aaa gat aag aag 1104
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys
355 360 365
ttc aga gat ctg ttt gtt acc tgg aat ceg gta ttg ata gag aat gaa 1152
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu
370 375 380
ggt tca gat ctt ggt gat gaa gac tgg ctg ttc age agt aaa agg aac 1200
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
tec gat gct ate atg gtt caa age aga gct act gat agt tca gtg ceg 1248
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln- Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro 405 410 415
ate cat cca atg gtg cag cag aag cet tct tta caa cec agg gca aca 1296
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
ttt ttg ceg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt 1344
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
435 440 445
taa 1347
<210> 46
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 6
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro 1 5 10 . 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys 20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro 35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg 50 55 60Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro 65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His 85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser 100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln 115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp 130 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu 145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser 165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai 180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro 195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr 210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser 225 230 235 240
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg 245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg 260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe 275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie 305 310 315 320
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Phe Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe 325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser 340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys 355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu 370 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn 385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro 405 410 415
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr 420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe 435 440 445
<210> 47
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<400> 7
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aggccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaaga tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacactc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccáa aagagtaccc 240
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacggga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag atccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 480
gtccaacaaa tgggatcagg ttcatccctg tcgggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540
atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcaatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc aggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780
tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 840
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900
cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt cttcaaaaac ccaaggactt gccttctatc 960
aagcagcagg agatcaggac ctcttcctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagctg ttcaagtgca ggatactaag ctctcccggt cagatatgaa gaaaatccgc 1080
aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140
atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac 1320
cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 48
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1).,(1347)
<400> 8
atg tcg agg tgc ttc ccc tac ccg cca ccg ggg tac gtg cgg aac cca 48
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro 15 10 15
gtg gcc gtg gcc gag ccg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag 96 Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys 20 25 30
gaa aag gcc gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gat ccc 144 Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Asp Pro 35 40 45aag cag tgt gag acg tcc aaa cac tca aag cac age cat aag aag aga
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg 50 55 60
aag ctt gaa gat gtc ate aaa gct gag cag ggt cec aaa aga gta cec
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro
65 70 75 80
aaa gaa tca gtt gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His
85 90 95
gga gct cet tet ttt gta cat acg ata cgg gac tet cet gag age tca
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser
100 105 110
cag gac age ggc aag aga cga aag gtt gtc ctg tcc agt cet age caa
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln 115 120 125
cet aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gat
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp 130 135 140
cec caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg
Pro Gln.Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu
145 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggt tca tcc ctg tcg ggc aag caa aat tca
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser
165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tet acc tet ggt cag cgg agg gtc
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai
180 185 190
aat ggt gac tcc caa gea gta caa aaa tgt ttg att aca gaa tcc ceg
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro 195 200 205
gea aag acc atg cag aga ctt gtc cec cag cet gea gct aag gtc aca
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr 210 215 220
cat cet gtt gat cec cag tca gct gtt aag gtg cca gtt gga aga tcg
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser
225 230 235 240
ggc cta cet ctg aag tet tca gga agt gtg gac cet tcg cet gct aga
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg
245 250 255
gtt atg aga aga ttt gat cet cca cet gtt aag atg atg tca cag aga
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg
260 265 270gtt cac cat cca gct tcc atg gtg tcg cag aaa gtt gat cct ccg ttt 8 64
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe
275 280 285
ccg aag gta tta cat aag gaa acc gga tct gtt gtt cgc cta cca gaa 912
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu
290 295 300
gct acc cgg cct act gtt ctt caa aaa ccc aag gac ttg cct tct ate 960
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ser lie
305 310 315 320
aag cag cag gag ate agg acc tct tcc tca aaa gaa gag ccc tgc ttc 1008
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe
325 330 335
tct ggt agg aat gea gaa gct gtt caa gtg cag gat act aag etc tcc 1056
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser
340 345 350
cgg tca gat atg aag aaa ate cgc aaa gct gag aaa aaa gat aag aag 1104
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys
355 360 365
ttc aga gat ctg ttt gtt acc tgg aat ccg gta ttg ata gag aat gaa 1152
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu
370 375 380
ggt tca gat ctt ggt gat gaa gac tgg ctg ttc age agt aaa agg aac 1200
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
tcc gat gct ate atg gtt caa age aga gct act gat agt tca gtg ccg 1248
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro
405 410 415
ate cat cca atg gtg cag cag aag cct tct- tta caa ccc agg gea aca 1296
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
ttt ttg ccg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt 1344
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
435 440 445
taa 1347
<210> 49
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 9
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro 1 5 10 15Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys 20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Asp Pro 35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg 50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro 65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His 85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser 100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln 115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp 130 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu 145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser 165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai 180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro 195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr 210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser 225 230 235 240Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg 245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg 260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe 275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu 290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ser lie 305 310 315 320
Lys Gln Gln Glu ile Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe 325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser 340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys Ile Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys 355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu Ile Glu Asn Glu 370 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn 385 390 395 400
Ser Asp Ala Ile Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro 405 410 415
Ile His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr 420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe 435 440 445
<210> 50
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho<400> 10 atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aggccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaagc tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacattc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccaa aagagtaccc 240
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacgtga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360
gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag acccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 480
gtccaàcaaa tgggatcagg ttcatccctg tcgggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540
atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcgatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc gggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780
tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 840
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900
cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt cttcaaaaac ccaaggactt gcctgctatc 960
aagcagcagg atatcaggac ctcttcctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagcag ttcaagtgca agatactaag ctctcccggt cagacatgaa gaaaatccgc 1080
aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140
atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac 1320
cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 51
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1).. (1347)<400> 11
atg tcg agg tgc ttc ccc tac ccg cca ccg ggg tac gtg cgg aac cca 48
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro
15 10 15
gtg gcc gtg gcc gag ccg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag 96
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys
20 25 30
gaa aag gcc gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gct ccc 144
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro 35 40 45
aag cag tgt gag acg tec aaa cat tca aag cac age cat aag aag aga 192
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg
50 55 60
aag ctt gaa gat gtc ate aaa gct gag cag ggt ccc aaa aga gta ccc 240
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro
65 70 75 80
aaa gaa tca gtt gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His
85 90 95
gga gct cet tet ttt gta cat acg ata cgt gac tet cet gag age tca 336
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser
100 105 110
cag gac age ggc aag aga cga aag gtt gtc ctg tec agt cet age caa 384
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln 115 120 125
cet aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gac 432
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp
130 135 140
ccc caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg 4 80
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu
145 150 155 160
gtc caa caa at.g gga tca ggt tca tec ctg tcg ggc aag caa aat tca 528
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser
165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tet acc tet ggt cag cgg agg gtc 576
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai
180 185 190
gat ggt gac tec caa gca gta caa aaa tgt ttg att aca gaa tec ccg 624
Asp Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln-Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro 195 .200 205
gca aag acc atg cag aga ctt gtc ccc cag cet gca gct aag gtc aca 672
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr
210 215 220cat cct gtt His Pro Vai 225
ggc cta cct Gly Leu Pro
gtt atg aga Vai Met Arg
gtt cac cat Vai His His 275
ccg aag gta Pro Lys Vai 290
gct acc cgg Ala Thr Arg 305
aag cag cag Lys Gln Gln
tct ggt agg Ser Gly Arg
cgg tca gac Arg Ser Asp 355
ttc aga gat Phe Arg Asp 370
ggt tca gat Gly Ser Asp 385
tcc gat gct Ser Asp Ala
ate cat cca lie His Pro
ttt ttg ccg Phe Leu Pro 435
gat cec cag Asp Pro Gln 230
ctg aag tct Leu Lys Ser 245
aga ttt gat Arg Phe Asp 260
cca gct tcc Pro Ala Ser
tta cat aag Leu His Lys
cct act gtt Pro Thr Vai 310
gat ate agg Asp lie Arg 325
aat gea gaa Asn Ala Glu 340
atg aag aaa Met Lys Lys
ctg ttt gtt Leu Phe Vai
ctt ggt gat Leu Gly Asp 390
ate atg gtt lie Met Vai 405
atg gtg cag Met Vai Gln 420
gac ctt aat Asp Leu Asn
tca gct gtt Ser Ala Vai
tcg gga agt Ser Gly Ser
cct cca cct Pro Pro Pro 265
atg gtg tcg Met Vai Ser 280
gaa acc gga Glu Thr Gly 295
ctt caa aaa Leu Gln Lys
acc tct tcc Thr Ser Ser
gea gtt caa Ala Vai Gln 345
ate cgc aaa lie Arg Lys 360
acc tgg aat Thr Trp Asn 375
gaa gac tgg Glu Asp Trp
caa age aga Gln Ser Arg
cag aag cct Gln Lys Pro 425
atg tac cag Met Tyr Gln 440
aag gtg cca Lys Vai Pro 235
gtg gac cct Vai Asp Pro 250
gtt aag atg Vai Lys Met
cag aaa gtt Gln Lys Vai
tct gtt gtt Ser Vai Vai 300
cec aag gac Pro Lys Asp 315
tca aaa gaa Ser Lys Glu 330
gtg caa gat Vai Gln Asp
gct gag aaa Ala Glu Lys
ccg gta ttg Pro Vai Leu 380
ctg ttc age Leu Phe Ser 395
gct act gat Ala Thr Asp 410
tct tta caa Ser Leu Gln
ctg cca tat Leu Pro Tyr
gtt gga aga Vai Gly Arg
tcg cct gct Ser Pro Ala 255
atg tca cag Met Ser Gln 270
gat cct ccg Asp Pro Pro 285
cgc cta cca Arg Leu Pro
ttg cct gct Leu Pro Ala
gag cec tgc Glu Pro Cys 335
act aag etc Thr Lys Leu 350
aaa gat aag Lys Asp Lys 365
ata gag aat lie Glu Asn
agt aaa agg Ser Lys Arg
agt tca gtg Ser Ser Vai 415
cec agg gea Pro Arg Ala 430
gtc gta cca Vai Vai Pro 445
tcg 720
Ser
240
aga 7 68
Arg
aga 816 Arg
ttt 864 Phe
gaa 912 Glu
ate 960
lie
320
ttc 1008 Phe
tcc 1056 Ser
aag 1104 Lys
gaa 1152 Glu
aac 1200
Asn
400
ccg 1248 Pro
aca 1296 Thr
ttt 1344 Phetaa
1347
<210> 52
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 12
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro 15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys 20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro 35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg 50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro 65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His 85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser 100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln 115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp 130 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu 145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser 165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai 180 185 190Asp Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie305 310 315 320
Lys Gln Gln Asp lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu370 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro405 410 415lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
<210> 53<211> 1347<212> DNA<213> Milho
<400> 13
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aggccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaagc tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacattc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccaa aagagtaccc 240
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacgtga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360
gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag atccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 480
gtccaacaaa tgggatcagg ttcatccccg tcgggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540
atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcgatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc gggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780
tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 840
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900
cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt cttcaaaaac ccaaggactt gcctgctatc 960
aagcagcagg atatcaggac ctcttcctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagcag ttcaagtgca agatactaag ctctcccggt cagacatgaa gaaaatccgc 1080
aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140
atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac 1320cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 54<211> 1347
<212> DNA<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1) .. (1347)
<400> 14
atg tcg agg tgc ttc ccc tac ccg cca ccg ggg tac gtg cgg aac cca 48
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
gtg gcc gtg gcc gag ccg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag 96Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
gaa aag gcc gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gct ccc 144Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
aag cag tgt gag acg tcc aaa cat tca aag cac age cat aag aag aga 192Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
aag ctt gaa gat gtc ate aaa gct gag cag ggt ccc aaa aga gta cccLys Leu Glu Asp Vai Ile Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
240
aaa gaa tca gtt gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
gga gct cet tet ttt gta cat acg ata cgt gac tet cet gag age tca 336
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr Ile Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser
100 105 110
cag gac age ggc aag aga cga aag gtt gtc ctg tcc agt cet age caa 384
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
cet aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gat 432
Pro Lys Asn Gly Asn Ile Leu Arg Phe Lys Ile Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
ccc caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg 480
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggtVai Gln Gln Met Gly Ser Gly
tcaSer
tcc ccg tcg ggc aag caa aat tcaSer Pro Ser Gly Lys Gln Asn Ser
528165
170
175
ate cat catlie His His
gat ggt gacAsp Gly Asp195
gea aag accAla Lys Thr210
cat cet gttHis Pro Vai225
ggc cta cetGly Leu Pro
gtt atg agaVai Met Arg
gtt cac catVai His His275
ceg aag gtaPro Lys Vai290
gct acc cggAla Thr Arg305
aag cag cagLys Gln Gln
tet ggt aggSer Gly Arg
cgg tca gacArg Ser Asp355
ttc aga gatPhe Arg Asp370
ggt tca gatGly Ser Asp.385
aag atg aatLys Met Asn180
tec caa geaSer Gln Ala
atg cag agaMet Gln Arg
gat cec cagAsp Pro Gln230
ctg aag tetLeu Lys Ser245
aga ttt gatArg Phe Asp260
cca gct tecPro Ala Ser
tta cat aagLeu His Lys
cet act gttPro Thr Vai310
gat ate aggAsp lie Arg325
aat gea gaaAsn Ala Glu340
atg aag aaaMet Lys Lys
ctg ttt gttLeu Phe Vai
ctt ggt gatLeu Gly Asp390
gtg aga tetVai Arg Ser185
gta caa aaaVai Gln Lys200
ctt gtc cecLeu Vai Pro215
tca gct gttSer Ala Vai
tcg gga agtSer Gly Ser
cet cca cetPro Pro Pro265
atg gtg tcgMet Vai Ser280
gaa acc ggaGlu Thr Gly295
ctt caa.aaaLeu Gln Lys
acc tet tecThr Ser Ser
gea gtt caaAla Vai Gln345
ate cgc aaalie Arg Lys360
acc tgg aatThr Trp Asn375
gaa gac tggGlu Asp Trp
acc tet ggtThr Ser Gly
tgt ttg attCys Leu lie
cag cet geaGln Pro Ala220
aag gtg ccaLys Vai Pro235
gtg gac cetVai Asp Pro250
gtt aag atgVai Lys Met
cag aaa gttGln Lys Vai
tet gtt gttSer Vai Vai300
cec aag gacPro Lys Asp315
tca aaa gaaSer Lys Glu330
gtg caa gatVai Gln Asp
gct gag aaaAla Glu Lys
ceg gta ttgPro Vai Leu380
ctg ttc ageLeu Phe Ser395
cag cgg aggGln Arg Arg190
aca gaa tecThr Glu Ser205
gct aag gtcAla Lys Vai
gtt gga agaVai Gly Arg
tcg cet gctSer Pro Ala255
atg tca cagMet Ser Gln270
gat cet cegAsp Pro Pro285
cgc cta ccaArg Leu Pro
ttg cet gctLeu Pro Ala
gag cec tgcGlu Pro Cys335
act aag etcThr Lys Leu350
aaa gat aagLys Asp Lys365
ata gag aatlie Glu Asn-
agt aaa aggSer Lys Arg
gtc 576Vai
ceg 624Pro
aca 672Thr
tcg 720
Ser
240
aga 7 68
Arg
aga 816Arg
ttt 864Phe
gaa 912Glu
ate 960
lie
320
ttc 1008Phe
tec 1056Ser
aag 1104Lys
gaa 1152Glu
aac 1200
Asn
400tcc gat gct ate atg gtt caa age aga gct act gat agt tca gtg ceg 1248Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro405 410 415
ate cat cca atg gtg cag cag aag cet tet tta caa cec agg gea aca 1296lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr420 425 430
ttt ttg ceg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt 1344Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe435 440 445
taa 1347
<210> 55
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 15
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser. Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Pro Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
Asp Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 . 235 240
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie305 310 315 320
Lys Gln Gln Asp lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu
370 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro
405 410 415
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
<210> 56<211> 1347<212> DNA<213> Milho
<400> 16
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aggccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaagc tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacattc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccaa aagagtaccc 240
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacgtga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360
gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag acccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 480
gtccaacaaa tgggatcagg ttcatccccg tcgggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540
atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcgatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc gggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780
tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 840
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt cttcaaaaac ccaaggactt gcctgctatc 960
aagcagcagg atatcaggac ctcttcctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagcag ttcaagtgca agatactaag ctctcccggt cagacatgaa gaaaatccgc 1080
aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140
atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac 1320
cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 57
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS<222> (1)..(13
<400> 17
atg tcg agg tgc
Met Ser Arg Cys
1
gtg gcc gtg gccVai Ala Vai Ala20
gaa aag gcc gaaGlu Lys Ala Glu35
aag cag tgt gagLys Gln Cys Glu50
aag ctt gaa gatLys Leu Glu Asp. 65
aaa gaa tca gttLys Glu Ser Vai
gga gct cct tctGly Ala Pro Ser100
cag gac age ggc
47)
ttc cec tac ceg cca ceg ggg tac gtg cgg aac cca 48Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro5 10 15
gag ceg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag 96Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys25 30
aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gct cec 144Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro40 45
acg tec aaa cat tca aag cac age cat aag aag aga 192Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg55 60
gtc ate aaa gct gag cag ggt cec aaa aga gta cec 240Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro70 75 80
gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
ttt gta cat acg ata cgt gac tct cct gag age tca 336Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser105 110
aag aga cga aag gtt gtc ctg tec agt cct age caa 384Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
cct aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gac 432
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
ccc caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg 4 80
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu
145 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggt tca tcc ccg tcg ggc aag caa aat tca 528
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Pro Ser Gly Lys Gln Asn Ser
165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tet acc tet ggt cag cgg agg gtc 576
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai
180 185 190 *
gat ggt gac tcc caa gea gta caa aaa tgt ttg att aca gaa tcc ccg 624
Asp Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
gea aag acc atg cag aga ctt gtc ccc cag cct gea gct aag gtc aca 672
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
cat cct gtt gat ccc cag tca gct gtt aag gtg cca gtt gga aga tcg 720
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser
225 230 235 240
ggc cta cct ctg aag tet tcg gga agt gtg gac cct tcg cct gct aga 768
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg
245 250 255
gtt atg aga aga ttt gat cct cca cct gtt aag atg atg tca cag aga 816
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg
260 265 270
gtt cac cat cca gct tcc atg gtg tcg cag aaa gtt gat cct ccg ttt 864
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
ccg aag gta tta cat aag gaa acc gga tet gtt gtt cgc cta cca gaa 912
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
gct acc cgg cct act gtt ctt caa aaa ccc aag gac ttg cct gct ate 960
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie
305 310 315 320
aag cag cag gat ate agg acc tet tcc tca aaa gaa gag ccc tgc ttc 1008
Lys Gln Gln Asp lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe
325 330 335
tet ggt agg aat gea gaa gea gtt caa gtg caa gat act aag etc tcc 1056
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
cgg tca gac atg aag aaa ate cgc aaa gct gag aaa aaa gat aag aag 1104
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys
355 360 365
ttc aga gat ctg ttt gtt acc tgg aat ceg gta ttg ata gag aat gaa 1152
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu
370 375 380
ggt tca gat ctt ggt gat gaa gac tgg ctg ttc age agt aaa agg aac 1200
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
tec gat gct ate atg gtt caa age aga gct act gat agt tca gtg ceg 1248
Ser Asp Ala IIe Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro
405 410 415
ate cat cca atg gtg cag cag aag cet tet tta caa cec agg gea aca 1296
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
ttt ttg ceg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt 1344
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
435 440 445
taa 1347
<210> 58
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 18
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
Lys Glu Ser .Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85
90
95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Pro Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
Asp Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
•Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie305 310 315 320Lys Gln Gln Asp lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe
325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser
340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys
355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu
370 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro
405 410 415
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
<210> 59<211> 1347<212> DNA<213> Milho
<400> 19
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aagccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaagc tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacattc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccaa aagagtaccc 240
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacgtga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360
gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag atccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 4 80
gtccaacaaa tgggatcagg ttcatccctg tctggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcaatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc gggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780
tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 840
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900
cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt cttcaaaaac ccaaggactt gcctgctatc 960
aagcagcagg agatcaggac ctctttctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagcag ttcaagtgca ggatactaag ctctcccggt cagacatgaa gaaaatccgc 1080
aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140
atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac 1320
cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 60
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1) .. (1347)
<400> 20
atg tcg agg tgc ttc ccc tac ccg cca ccg ggg tac gtg cgg aac cca 48
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro
15 10 15
gtg gcc gtg gcc gag ccg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag 96Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
gaa aaa gcc gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gct ccc 144Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
aag cag tgt gag acg tec aaa cat tca aag cac age cat aag aag aga 192Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60aag ctt gaa gat gtc ate aaa gct gag cag ggt cec aaa aga gta cecLys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
aaa gaa tca gtt gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag catLys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
gga gct cet tet ttt gta cat acg ata cgt gac tet cet gag age tcaGly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
cag gac age ggc aag aga cga aag gtt gtc ctg tec agt cet age caaGln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
cet aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gatPro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
cec caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttgPro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 . 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggt tca tec ctg tet ggc aag caa aat tcaVai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tet acc tet ggt cag cgg agg gtclie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
aat ggt gac tec caa gea gta caa aaa tgt ttg att aca gaa tec cegAsn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
gea aag acc atg cag aga ctt gtc cec cag cet gea gct aag gtc acaAla Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
cat cet gtt gat cec cag tca gct gtt aag gtg cca gtt gga aga tcgHis Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
ggc cta cet ctg aag tet tcg gga agt gtg gac cet tcg cet gct agaGly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
gtt atg aga aga ttt gat cet cca cet gtt aag atg atg tca cag agaVai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
gtt cac cat cca gct tec atg gtg tcg cag aaa gtt gat cet ceg tttVai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
ceg aag gta tta cat aag gaa acc gga tet gtt gtt cgc cta cca gaaPro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu
290 295 300
gct acc cgg cct act gtt ctt caa aaa ccc aag gac ttg cct gct ate 960
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie
305 310 315 320
aag cag cag gag ate agg acc tet ttc tca aaa gaa gag ccc tgc ttc 1008
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Phe Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe
325 330 335
tet ggt agg aat gea gaa gea gtt caa gtg cag gat act aag etc tec 1056
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser
340 345 350
cgg tca gac atg aag aaa ate cgc aaa gct gag aaa aaa gat aag aag 1104
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365
ttc aga gat ctg ttt gtt acc tgg aat ceg gta ttg ata gag aat gaa 1152
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu
370 375 380
ggt tca gat ctt ggt gat gaa gac tgg ctg ttc age agt aaa agg aac 1200
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
tec gat gct ate atg gtt caa age aga gct act gat agt tca gtg ceg 1248
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro
405 410 415
ate cat cca atg gtg cag cag aag cct tet tta caa ccc agg gea aca 1296
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
ttt ttg ceg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt 1344
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe435 440 445
taa 1347
<210> 61
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 21
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie305 310 315 320
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Phe Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu370 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro405 410 415
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe435 440 445
<210> 62
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<400> 22
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aagccgaaaa gaagaaagaggtg gcc gtg gcc gag ccg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag 96
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
gaa aaa gcc gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gct cec 144
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
aag cag tgt gag acg tec aaa cat tca aag cac age cat aag aag aga 192
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
aag ctt gaa gat gtc ate aaa gct gag cag ggt cec aaa aga gta cec 240
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro
65 70 75 80
aaa gaa tca gtt gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
gga gct cet tet ttt gta cat acg ata cgt gac tet cet gag age tca 336
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
cag gac age ggc aag aga cga aag gtt gtc ctg tec agt cet age caa 384
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
cet aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gat 432
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
cec caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg 480
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu
145 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggt tca tec ctg tet ggc aag caa aat tca 528
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tet acc tet ggt cag cgg agg gtc 576
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
aat ggt gac tec caa gea gta caa aaa tgt ttg att aca gaa tec ccg 624
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
gea aag acc atg cag aga ctt gtc cec cag cet gea gct aag gtc aca 672
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
cat cet gtt gat cec cag tca gct gtt aag gtg cca gtt gga aga tcgHis Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
720ggc cta cct ctg aag tct tcg gga agt gtg gac cct tcg cct gct aga
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg
245 250 255
gtt atg aga aga ttt gat cct cca cct gtt aag atg atg tca cag aga
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg
260 265 270
gtt cac cat cca gct tcc atg gtg tcg cag aaa gtt gat cct ccg ttt
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe
275 280 285
ccg aag gta tta cat aag gaa acc gga tct gtt gtt cgc cta cca gaa
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
gct acc cgg cct act gtt ctt caa aaa ccc aag gac ttg cct gct ate
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie
305 310 315 320
aag cag cag gag ate agg acc tct ttc tca aaa gaa gag ccc tgc ttc
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Phe Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe
325 330 335
tct ggt agg aat gea gaa gea gtt caa gtg cag gat act aag etc tcc
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser
340 345 350
cgg tca gac atg aag aaa ate cgc aaa gct gag aaa aaa gat aag aag
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys
355 360 365
ttc aga gat ctg ttt gtt acc tgg aat ccg gta ttg ata gag aat gaa
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu370 375 380
ggt tca gat ctt ggt gat gaa gac tgg ctg ttc age agt aaa agg aac
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
tcc gat gct ate atg gtt caa age aga gct act gat agt tca gtg ccg
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro
405 410 415
ate cat cca atg gtg cag cag aag cct tct tta caa ccc agg gea aca
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
ttt ttg ccg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
435 440 445
taa
<210> 64<211> 448<212> PRT<213> Milho
<400> 24
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro1 5 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie305 310 315 ' 320
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Phe Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu370. 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro405 410 415
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu
Pro Tyr Vai
Vai Pro Phe435 440 445
<210> 65
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<400> 25
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aggccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaaga tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacactc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccaa aagagtaccc 240
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacggga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360
gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag atccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 480
gtccaacaaa tgggatcagg ttcatccctg tcgggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540
atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcaatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc aggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780
tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 840
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900
cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt .cttcaaaaac ccaaggactt gccttctatc 960
aagcagcagg agatcaggac ctcttcctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagctg ttcaagtgca ggatactaag ctctcccggt cagatatgaa gaaaatccgc 1080
aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140
atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac 1320
cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 66<211> 1347<212> DNA<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1) . . (1347)
<400> 26
atg tcg agg tgc ttc ccc tac ccg cca ccg ggg tac gtg cgg aac cca 48
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
gtg gcc gtg gcc gag ccg gag tcg acc gct aag etc ctg aaa gaa aag 96
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
gaa aag gcc gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg aaa gat ccc 144
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Asp Pro
35 40 45
aag cag tgt gag acg tcc aaa cac tca aag cac age cat aag aag aga 192
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
aag ctt gaa gat gtc ate aaa gct gag cag ggt ccc aaa aga gta ccc 240
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
aaa gaa tca gtt gag cag ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
gga gct cet tet ttt gta cat acg ata cgg gac tet cet gag age tca 336
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
cag gac age ggc aag aga cga aag gtt gtc ctg tcc agt cet age caa 384
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln
115 120 125
cet aag aat gga aac att ctt cgc ttc aag att aaa agt agt caa gat 432
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
ccc caa tca gct gtt ctg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg 480
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggt tca tcc ctg tcg ggc aag caa aat tca 528
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tet acc tet ggt cag cgg agg gtc 576
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190aat ggt gacAsn Gly Asp195
gca aag accAla Lys Thr210
cat cct gttHis Pro Vai225
ggc cta cctGly Leu Pro
gtt atg agaVai Met Arg
gtt cac catVai His His275
ccg aag gtaPro Lys Vai290
gct acc cggAla Thr Arg305
aag cag cagLys Gln Gln
tct ggt aggSer Gly Arg
cgg tca gatArg Ser Asp355
ttc aga gatPhe Arg Asp370
ggt tca gatGly Ser Asp385
tcc gat gctSer Asp Ala
tcc caa gcaSer Gln Ala
atg cag agaMet Gln Arg
gat ccc cagAsp Pro Gln230
ctg aag tctLeu Lys Ser245
aga ttt gatArg Phe Asp260
cca gct tccPro Ala Ser
tta cat aagLeu His Lys
cct act gttPro Thr Vai310
gag ate aggGlu lie Arg325
aat gca gaaAsn Ala Glu340
atg aag aaaMet Lys Lys
ctg ttt gttLeu Phe Vai
ctt ggt gatLeu Gly Asp390
ate atg gttlie Met Vai405
gta caa aaaVai Gln Lys200
ctt gtc cccLeu Vai Pro215
tca gct gttSer Ala Vai
tca gga agtSer Gly Ser
cct cca cctPro Pro Pro2 65
atg gtg tcgMet Vai Ser280
gaa acc ggaGlu Thr Gly295
ctt caa aaaLeu Gln Lys
acc tct tccThr Ser Ser
gct gtt caaAla Vai Gln345
ate cgc aaalie Arg Lys360
acc tgg aatThr Trp Asn375
gaa gac tggGlu Asp Trp
caa age agaGln Ser Arg
tgt ttg attCys Leu lie
cag cct gcaGln Pro Ala220
aag gtg ccaLys Vai Pro235
gtg gac cctVai Asp Pro250
gtt aag atgVai Lys Met
cag aaa gttGln Lys Vai
tct gtt gttSer Vai Vai300
ccc aag gacPro Lys Asp315
tca aaa gaaSer Lys Glu330
gtg cag gatVai Gln Asp
gct gag aaaAla Glu Lys
ccg gta ttgPro Vai Leu380
ctg ttc ageLeu Phe Ser395
gct act gatAla Thr Asp410
aca gaa tccThr Glu Ser205
gct aag gtcAla Lys Vai
gtt gga agaVai Gly Arg
tcg cct gctSer Pro Ala255
atg tca cagMet Ser Gln270
gat cct ccgAsp Pro Pro285
cgc cta ccaArg Leu Pro
ttg cct tctLeu Pro Ser
gag ccc tgcGlu Pro Cys335
act aag etcThr Lys Leu350
aaa gat aagLys Asp Lys365
ata gag aatlie Glu Asn
agt aaa aggSer Lys Arg
agt tca gtgSer Ser Vai415
ccg 624Pro
aca 672Thr
tcg 720
Ser
240
aga 7 68
Arg
aga 816Arg
ttt 864Phe
gaa 912Glu
ate 960
lie
320
ttc 1008Phe
tcc 1056Ser
aag 1104Lys
gaa 1152Glu
aac 1200
Asn
400
ccg 1248Proate cat cca atg gtg cag cag aag cet tet tta caa cec agg gea aca 1296lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr420 425 430
ttt ttg ceg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt 1344Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe435 440 445
taa 1347
<210> 67
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 27
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Asp Pro35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 ■ 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ser lie305 310 315 320
Lys Gln Gln Glu lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe325 330 335
Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu370 375 380Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro
405 410 415
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
<210> 68<211> 1347<212> DNA<213> Milho
<400> 28
atgtcgaggt gcttccccta cccgccaccg gggtacgtgc ggaacccagt ggccgtggcc 60
gagccggagt cgaccgctaa gctcctgaaa gaaaaggaaa aggccgaaaa gaagaaagag 120
aaaaggagtg acaggaaagc tcccaagcag tgtgagacgt ccaaacattc aaagcacagc 180
cataagaaga gaaagcttga agatgtcatc aaagctgagc agggtcccaa aagagtaccc 24 0
aaagaatcag ttgagcagtt ggagaagagt ggactctcag aagagcatgg agctccttct 300
tttgtacata cgatacgtga ctctcctgag agctcacagg acagcggcaa gagacgaaag 360
gttgtcctgt ccagtcctag ccaacctaag aatggaaaca ttcttcgctt caagattaaa 420
agtagtcaag atccccaatc agctgttctg gagaaaccaa gggttcttga gcaaccattg 4 80
gtccaacaaa tgggatcagg ttcatccctg tcgggcaagc aaaattcaat ccatcataag 540
atgaatgtga gatctacctc tggtcagcgg agggtcaatg gtgactccca agcagtacaa 600
aaatgtttga ttacagaatc cccggcaaag accatgcaga gacttgtccc ccagcctgca 660
gctaaggtca cacatcctgt tgatccccag tcagctgtta aggtgccagt tggaagatcg 720
ggcctacctc tgaagtcttc aggaagtgtg gacccttcgc ctgctagagt tatgagaaga 780
tttgatcctc cacctgttaa gatgatgtca cagagagttc accatccagc ttccatggtg 840
tcgcagaaag ttgatcctcc gtttccgaag gtattacata aggaaaccgg atctgttgtt 900
cgcctaccag aagctacccg gcctactgtt cttcaaaaac ccaaggactt gcctgctatc 960
aagcagcagg atatcaggac ctcttcctca aaagaagagc cctgcttctc tggtaggaat 1020
gcagaagcag ttcaagtgca agatactaag ctctcccggt cagacatgaa gaaaatccgc 1080aaagctgaga aaaaagataa gaagttcaga gatctgtttg ttacctggaa tccggtattg 1140
atagagaatg aaggttcaga tcttggtgat gaagactggc tgttcagcag taaaaggaac 1200
tccgatgcta tcatggttca aagcagagct actgatagtt cagtgccgat ccatccaatg 1260
gtgcagcaga agccttcttt acaacccagg gcaacatttt tgccggacct taatatgtac 1320
cagctgccat atgtcgtacc attttaa 1347
<210> 69
<211> 1347
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1) (1347)
<400> 29
atg tcg agg tgc ttc cccMet Ser Arg Cys Phe Pro1 5
gtg gcc gtg gcc gag ccgVai Ala Vai Ala Glu Pro20
gaa aag gcc gaa aag aagGlu Lys Ala Glu Lys Lys35
aag cag tgt gag acg tccLys Gln Cys Glu Thr Ser50
aag ctt gaa gat gtc ateLys Leu Glu Asp Vai lie65 70
aaa gaa tca gtt gag cagLys Glu Ser Vai Glu Gln85
gga gct cet tet ttt gtaGly Ala Pro Ser Phe Vai100
cag gac age ggc aag agaGln Asp Ser Gly Lys Arg115
cet aag aat gga aac attPro Lys Asn Gly Asn lie
tac ccg cca ccgTyr Pro Pro Pro10
gag tcg acc gctGlu Ser Thr Ala25
aaa gag aaa aggLys Glu Lys Arg40
aaa cat tca aagLys His Ser Lys55.
aaa gct gag cagLys Ala Glu Gln
ttg gag aag agtLeu Glu Lys Ser90
cat acg ata cgtHis Thr lie Arg105
cga aag gtt gtcArg Lys Vai Vai120
ctt cgc ttc aagLeu Arg Phe Lys
ggg tac gtg cggGly Tyr Vai Arg
aag etc ctg aaaLys Leu Leu Lys30
agt gac agg aaaSer Asp Arg Lys45
cac age cat aagHis Ser His Lys60
ggt ccc aaa agaGly Pro Lys Arg75
gga etc tca gaaGly Leu Ser Glu
gac tet cet gagAsp Ser Pro Glu110
ctg tcc agt cetLeu Ser Ser Pro125
att aaa agt agtlie Lys Ser Ser
aac cca 4 8
Asn Pro
15
gaa aag 96Glu Lys
gct ccc 144Ala Pro
aag aga 192Lys Arg
gta ccc 240Vai Pro80
gag cat 288
Glu His
95
age tca 336Ser Ser
age caa 384Ser Gln
caa gat 432Gln Asp130 135 140
ccc caa tca gct gtt çtg gag aaa cca agg gtt ctt gag caa cca ttg 480Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
gtc caa caa atg gga tca ggt tca tcc ctg tcg ggc aag caa aat tca 528Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
ate cat cat aag atg aat gtg aga tet acc tet ggt cag cgg agg gtc 576lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
aat ggt gac tcc caa gea gta caa aaa tgt ttg att aca gaa tcc ceg 624Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
gea aag acc atg cag aga ctt gtc ccc cag cet gea gct aag gtc aca 672Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
cat cet gtt gat ccc cag tca gct gtt aag gtg cca gtt gga aga tcg 720His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
ggc cta cet ctg aag tet tca gga agt gtg gac cet tcg cet gct aga 768Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
gtt atg aga aga ttt gat cet cca cet gtt aag atg atg tca cag aga 816Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
gtt cac cat cca gct tcc atg gtg tcg cag aaa gtt gat cet ceg ttt 864Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
ceg aag gta tta cat aag gaa acc gga tet gtt gtt cgc cta cca gaa 912Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
gct acc cgg cet act gtt ctt caa aaa ccc. aag gac ttg cet gct ate 960Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie305 310 315 320
aag cag cag gat ate agg acc tet tcc tca aaa gaa gag ccc tgc ttc 1008Lys Gln Gln Asp lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe325 330 335
tet ggt agg aat gea gaa gea gtt caa gtg caa gat act aag etc tcc 1056Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
cgg tca gac atg aag aaa ate cgc aaa gct gag aaa aaa gat aag aag 1104Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365ttc aga gat ctg ttt gtt acc tgg aat ccg gta ttg ata gag aat gaa 1152
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu
370 375 380
ggt tca gat ctt ggt gat gaa gac tgg ctg ttc age agt aaa agg aac 1200
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn
385 390 395 400
tec gat gct ate atg gtt caa age aga gct act gat agt tca gtg ccg 1248
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro
405 410 415
ate cat cca atg gtg cag cag aag cet tet tta caa cec agg gea aca 1296
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr
420 425 430
ttt ttg ccg gac ctt aat atg tac cag ctg cca tat gtc gta cca ttt 1344
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
435 440 445
taa 1347
<210> 70
<211> 448
<212> PRT
<213> Milho
<400> 30
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Pro Glu Ser Thr Ala Lys Leu Leu Lys Glu Lys20 25 30
Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg Lys Ala Pro35 40 45
Lys Gln Cys Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys Lys Arg50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Ala Glu Gln Gly Pro Lys Arg Vai Pro65 70 75 80
Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
Gly Ala Pro Ser Phe Vai His Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110Gln Asp Ser Gly Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Ser Ser Pro Ser Gln115 120 125
Pro Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg Phe Lys lie Lys Ser Ser Gln Asp130 135 140
Pro Gln Ser Ala Vai Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Ser Gly Lys Gln Asn Ser165 170 175
lie His His Lys Met Asn Vai Arg Ser Thr Ser Gly Gln Arg Arg Vai180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys Leu lie Thr Glu Ser Pro195 200 205
Ala Lys Thr Met Gln Arg Leu Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys Vai Thr210 215 220
His Pro Vai Asp Pro Gln Ser Ala Vai Lys Vai Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
Gly Leu Pro Leu Lys Ser Ser Gly Ser Vai Asp Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Met Arg Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Met Ser Gln Arg260 265 270
Vai His His Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro Pro Phe275 280 285
Pro Lys Vai Leu His Lys Glu Thr Gly Ser Vai Vai Arg Leu Pro Glu290 295 300
Ala Thr Arg Pro Thr Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Ala lie305 310 315 320
Lys Gln Gln Asp lie Arg Thr Ser Ser Ser Lys Glu Glu Pro Cys Phe325 330 335Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys Leu Ser340 345 350
Arg Ser Asp Met Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Asp Lys Lys355 360 365
Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro Vai Leu lie Glu Asn Glu370 375 380
Gly Ser Asp Leu Gly Asp Glu Asp Trp Leu Phe Ser Ser Lys Arg Asn385 390 395 400
Ser Asp Ala lie Met Vai Gln Ser Arg Ala Thr Asp Ser Ser Vai Pro405 410 415
lie His Pro Met Vai Gln Gln Lys Pro Ser Leu Gln Pro Arg Ala Thr420 425 430
Phe Leu Pro Asp Leu Asn Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
<210> 71<211> 1078<212> DNA<213> Milho
<400> 31
cgagcgattc ggttgatttg atcgatttcg ggtgcttcgc gattgattag gccggcaaag 60
ccgccaatcc ttgtgatctc tcgaaggggt agagcgcggt cgaccgtcgg tcatgtcgag 120
gtgcttcccc tacccgccgc ctgtgtactt gggaaaccca gtggccgtgg ccgaggcgga 180
gtcgaccgct aagcttcaga aagaaaggga aagggctcac aagaagaaag ataaaaggag 240
tgacaagaaa gctccccaac tgggtgagac gtccaaacat tcaaagcaca accataagaa 300
gagaaagctc gaagatgtca gcacaggtga tcaggagccc aaaaaagtat tcaaagaatc 360
agctgagcta ttggagaaga gtggactctc agaagagcat ggagctcctt gttttgtaca 420
gatgtttcgt gactctcctg agagctcgca ggacagcagc aagagaagaa aggctgtcct 480
gcccagtccc agccaagcta agaatggtaa catcattcgc atcaagctaa aaagtaacca 540
agatccccaa tcagttcttt tggagaaacc aagggttctg gagcaaccac tggtccaaca 600
aatgagttcg gtttcatccc tgtcgagcaa acaaaattca atcaatcgta aggtgaatgt 660gagatctaca gctggccagc agtgggtcaa tggtgactcc caagcagtac aaaaatcttt 720
ggttacagaa accctgtcaa gggcaatgca gagaactgtc ccccagcctg cagtgaaggt 780
cacacgtcgg gctgatcccc agctatctgt taaggcgccg gttggaagat ctgacctacc 840
tccaaagttt tcgggaagtg tgggcccttc acctgctaga gtgaccggaa gattttgtcc ■ 900
tgcacctgtt aagacgcaac agagaattga gcatccacct tccatggtgt cacagagagt 960
tgatcctcag gcgaaggtgt cacagaagga aatgggatct gctgtttgcc tgccacaagc 1020
tccacatcct cctgttttgc agaaacccaa ggacttgcct gttcctaaac agcgggag 1078
<210> 72
<211> 966
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS<222> (1)..(96
<400> 32
atg tcg agg tgc
Met Ser Arg Cys
1
gtg gcc gtg gccVai Ala Vai Ala20
gaa agg gct cacGlu Arg Ala His35
caa ctg ggt gagGln Leu Gly Glu50
aag etc gaa gatLys Leu Glu Asp65
aaa gaa tca gctLys Glu Ser Ala
gga gct cet tgtGly Ala Pro Cys100
cag gac age ageGln Asp Ser Ser115
ttc cec tac ceg ceg cet gtg tac ttg gga aac cca 48Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Vai Tyr Leu Gly Asn Pro5 10 15
gag gcg gag tcg acc gct aag ctt cag aaa gaa agg 96Glu Ala Glu Ser Thr Ala Lys Leu Gln Lys Glu Arg25 30
aag aag aaa gat aaa agg agt gac aag aaa gct cec 144Lys Lys Lys Asp Lys Arg Ser Asp Lys Lys Ala Pro40 45
acg tcc aaa cat tca aag cac aac cat aag aag aga 192Thr Ser Lys His Ser Lys His Asn His Lys Lys Arg55 60
gtc age aca ggt gat cag gag cec aaa aaa gta ttc 240Vai Ser Thr Gly Asp Gln Glu Pro Lys Lys Vai Phe70 75 80
gag cta ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288Glu Leu Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
ttt gta cag atg ttt cgt gac tet cet gag age tcg 336Phe Vai Gln Met Phe Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser105 110
aag aga aga aag gct gtc ctg cec agt cec age caa 384Lys Arg Arg Lys Ala Vai Leu Pro Ser Pro Ser Gln120 125gct aag aat ggt aac ate att cgc ate aag cta aaa agt aac caa gat 432
Ala Lys Asn Gly Asn lie lie Arg lie Lys Leu Lys Ser Asn Gln Asp130 135- 140
cec caa tca gtt ctt ttg gag aaa cca agg gtt ctg gag caa cca ctg 480
Pro Gln Ser Vai Leu Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
gtc caa caa atg agt tcg gtt tca tec ctg tcg age aaa caa aat tca 528
Vai Gln Gln Met Ser Ser Vai Ser Ser Leu Ser Ser Lys Gln Asn Ser165 170 175
ate aat cgt aag gtg aat gtg aga tet aca gct ggc cag cag tgg gtc 576
lie Asn Arg Lys Vai Asn Vai Arg Ser Thr Ala Gly Gln Gln Trp Vai180 185 190
aat ggt gac tec caa gea gta caa aaa tet ttg gtt aca gaa acc ctg 624
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Ser Leu Vai Thr Glu Thr Leu195 200 205
tca agg gea atg cag aga act gtc cec cag cet gea gtg aag gtc aca 672
Ser Arg Ala Met Gln Arg Thr Vai Pro Gln Pro Ala Vai Lys Vai Thr210 215 220
cgt cgg gct gat cec cag cta tet gtt aag gcg ceg gtt gga aga tet 720
Arg Arg Ala Asp Pro Gln Leu Ser Vai Lys Ala Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
gac cta cet cca aag ttt tcg gga agt gtg ggc cet tca cet gct aga 768
Asp Leu Pro Pro Lys Phe Ser Gly Ser Vai Gly Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
gtg acc gga aga ttt tgt cet gea cet gtt aag acg caa cag aga att 816
Vai Thr Gly Arg Phe Cys Pro Ala Pro Vai Lys Thr Gln Gln Arg lie260 265 270
gag cat cca cet tec atg gtg tca cag aga gtt gat cet cag gcg aag 8 64
Glu His Pro Pro Ser Met Vai Ser Gln Arg Vai Asp Pro Gln Ala Lys275 280 285
gtg tca cag aag gaa atg gga tet gct gtt tgc ctg cca caa gct cca 912
Vai Ser Gln Lys Glu Met Gly Ser Ala Vai Cys Leu Pro Gln Ala Pro290 295 300
cat cet cet gtt ttg cag aaa cec aag gac ttg cet gtt cet aaa cag 960
His Pro Pro Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Vai Pro Lys Gln305 310 315 320
cgg gag 966Arg Glu
<210> 73<211> 322<212> PRT<213> Milho<400> 33
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Vai Tyr Leu Gly Asn Pro15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Ala Glu Ser Thr Ala Lys Leu Gln Lys Glu Arg20 25 30
Glu Arg Ala His Lys Lys Lys Asp Lys Arg Ser Asp Lys Lys Ala Pro35 40 45
Gln Leu Gly Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Asn His Lys Lys Arg50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai Ser Thr Gly Asp Gln Glu Pro Lys Lys Vai Phe65 70 75 80
Lys Glu Ser Ala Glu Leu Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
Gly Ala Pro Cys Phe Vai Gln Met Phe Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
Gln Asp Ser Ser Lys Arg Arg Lys Ala Vai Leu Pro Ser Pro Ser Gln115 120 125
Ala Lys Asn Gly Asn lie lie Arg lie Lys Leu Lys Ser Asn Gln Asp130 135 140
Pro Gln Ser Vai Leu Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Ser Ser Vai Ser Ser Leu Ser Ser Lys Gln Asn Ser165 170 175
lie Asn Arg Lys Vai Asn Vai Arg Ser Thr Ala Gly Gln Gln Trp Vai180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Ser Leu Vai Thr Glu Thr Leu195 200 205
Ser Arg Ala Met Gln Arg Thr Vai Pro Gln Pro Ala Vai Lys Vai Thr210 215 220
Arg Arg Ala Asp Pro Gln Leu Ser Vai Lys Ala Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
Asp Leu Pro Pro Lys Phe Ser Gly Ser Vai Gly Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Thr Gly Arg Phe Cys Pro Ala Pro Vai Lys Thr Gln Gln Arg lie260 265 270
Glu His Pro Pro Ser Met Vai Ser Gln Arg Vai Asp Pro Gln Ala Lys275 280 285
Vai Ser Gln Lys Glu Met Gly Ser Ala Vai Cys Leu Pro Gln Ala Pro290 295 300 •
His Pro Pro Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Vai Pro Lys Gln305 310 315 320
Arg Glu
<210> 74<211> 1054<212> DNA<213> Milho
<400> 34
gatttcgggt gcttcgcgat tgattaggcc ggcaaagccg ccaatccttg tgatctctcg 60
aaggggtaga gcgcggtcga ccgtcggtca tgtcgaggtg cttcccctac ccgccgccgg 120
tgtacttggg aaacccagtg gccgtggccg aggcggagtc gaccgctaag cttcagaaag 180
aaagggaaag ggctcacaag aagaaagata aaaggagtga caagaaagct' ccccaactgg 240-
gtgagacgtc caaacattca aagcacaacc ataagaagag aaagcttgaa gatgtcagca 300
caggtgatca ggagcccaaa aaagtattca aagaatcagc tgagctattg gagaagagtg 360
gactctcaga agagcatgga gctccttgtt ttgtacagat gtttcgtgac tctcctgaga 420
gctcgcagga cagcagcaag agaagaaagg ctgtcctgcc cagtcccagc caakytaaga 480
atggtaacat cattcgcatc aagctaaaaa gtaaccaaga tccccaatca gttcttttgg 540
agaaaccaag ggttctggag caaccactgg tccaacaaat gagttcggyt tcatccctgt 600cgagcaaaca aarttcaatc aatcgtaagg tgaatgkkag atctacagct ggccagcagt 660
gggtcaatgg tgactcccaa gcagtacaaa aatctttggt tacagaaacc cygtcaaggg 720
caatgcagag aactgtcccc cagcctgcag tgaaggtcac acgtcgggct gatccccagc 780
tatctgttaa ggcgccggtt ggaagatctg acctacctcc aaagttttcg ggaagtgtgg 840
gcccttcacc tgctagagtg accsgaagat tttgtcctsc acctgttaag acgcaacaga 900
gaattsagca tccaccttcc atggtgtcac agagagttga tcctcaggcg aaggtgtcac 960
agaaggaaat gggatctgct gtttgcctgc cacaagctcc acatcctcct gttttgcaga 1020
aacccaagga cttgcctgtt cctaaacagc ggga 1054
<210> 75
<211> 965
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(963)
<400> 35
atg tcg agg tgc ttc
Met Ser Arg Cys Phe
1 5
gtg gcc gtg gcc gagVai Ala Vai Ala Glu20
gaa agg gct cac aagGlu Arg Ala His Lys35
caa ctg ggt gag acgGln Leu Gly Glu Thr50
aag ctt gaa gat gtcLys Leu Glu Asp Vai65.
aaa gaa tca gct gagLys Glu Ser Ala Glu85
gga gct cct tgt tttGly Ala Pro Cys Phe100
ccc tac ccg ccg ccg gtg tac ttg gga aac cca 48Pro Tyr Pro Pro Pro Vai Tyr Leu Gly Asn Pro■10 15
gcg gag tcg acc gct aag ctt cag aaa gaa agg 96Ala Glu Ser Thr Ala Lys Leu Gln Lys Glu Arg25 30
aag aaa gat aaa agg agt gac aag aaa gct ccc 144Lys Lys Asp Lys Arg Ser Asp Lys Lys Ala Pro40 45
tcc aaa cat tca aag cac aac cat aag aag aga 192Ser Lys His Ser Lys His Asn His Lys Lys Arg55 60
age aca ggt gat cag gag ccc aaa aaa gta ttc 240Ser Thr Gly Asp Gln Glu Pro Lys Lys Vai Phe70 75 80
cta ttg gag aag agt gga etc tca gaa gag cat 288Leu Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His90 95
gta cag atg ttt cgt gac tet cct gag age tcg 336Vai Gln Met Phe Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser105 110
cag gac age age aag aga aga aag gct gtc ctg ccc agt ccc age caa
384Gln Asp Ser Ser Lys Arg Arg Lys Ala Vai Leu Pro Ser Pro Ser Gln115 120 125
kyt aag aat ggt aac ate att cgc ate aag cta aaa agt aac caa gatXaa Lys Asn Gly Asn lie lie Arg lie Lys Leu Lys Ser Asn Gln Asp130 135 140
cec caa tca gtt ctt ttg gag aaa cca agg gtt ctg gag caa cca ctgPro Gln Ser Vai Leu Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
gtc caa caa atg agt tcg gyt tca tec ctg tcg age aaa caa art tcaVai Gln Gln Met Ser Ser Xaa Ser Ser Leu Ser Ser Lys Gln Xaa Ser165 170 175
ate aat cgt aag gtg aat gkk aga tet aca gct ggc cag cag tgg gtclie Asn Arg Lys Vai Asn Xaa Arg Ser Thr Ala Gly Gln Gln Trp Vai180 185 190
aat ggt gac tec caa gea gta caa aaa tet ttg gtt aca gaa acc cygAsn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Ser Leu Vai Thr Glu Thr Xaa195 200 205
tca agg gea atg cag aga act gtc cec cag cet gea gtg aag gtc acaSer Arg Ala Met Gln Arg Thr Vai Pro Gln Pro Ala Vai Lys Vai Thr210 215 220
cgt cgg gct gat cec cag cta tet gtt aag gcg ceg gtt gga aga tetArg Arg Ala Asp Pro Gln Leu Ser Vai Lys Ala Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
gac cta cet cca aag ttt tcg gga agt gtg ggc cet tca cet gct agaAsp Leu Pro Pro Lys Phe Ser Gly Ser Vai Gly Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
gtg acc sga aga ttt tgt cet sca cet gtt aag acg caa cag aga attVai Thr Xaa Arg Phe Cys Pro Xaa Pro Vai Lys Thr Gln Gln Arg lie260 265 270
sag cat cca cet tec atg gtg tca cag aga gtt gat cet cag gcg aagXaa His Pro Pro Ser Met Vai Ser Gln Arg Vai Asp Pro Gln Ala Lys275 280 285
gtg tca cag aag gaa atg gga tet gct gtt tgc ctg cca caa gct ccaVai Ser Gln Lys Glu Met Gly Ser Ala Vai Cys Leu Pro Gln Ala Pro290 295 300
cat cet cet gtt ttg cag aaa cec aag gac ttg cet gtt cet aaa cagHis Pro Pro Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Vai Pro Lys Gln305 310 315 320
cgg gaArg
<210> 76<211> 321<212> PRT<213> Milho
<220><221><222><223>
Caracter! stica__misc
(1297..(129)O "Xaa" na locação
12 9permanece para Ala, Vai/ Ser, or Phe
<220><221><222><223>
Caracter!stica_misc
(167T..(167)0 "Xaa" na locação
167permanece para Ala, or Vai
<220>
<221> Característica_misc
<222> (1757..(175)
<223> O "Xaa" na locação
17 5permanece para Ser, or Asn
<220><221><222><223>
Caracter!stica_misc
(1837.•(183)O "Xaa" na locação
183 permanece para Gly, ou Vai
<220><221><222><223>
Caracter!stica_misc(208)..(208)O "Xaa" na locação
208 PerTnanece Para Pro, ou Leu
<220><221><222><223>
Caracter!stica_misc(259)..(259)O "Xaa" na locação
25gpermanece para Gly, ou Arg.
<220><221><222><223>
Caracter!stica_misc
(2647..(264)O "Xaa" na locação
2 64 Permanece Para Ala / ou Pro
<220><221><222><223>
Característica_misc(273)..(273)O "Xaa" na locação
27 3 Permanece para Glu, ou Gln
<400> 36
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Vai Tyr Leu Gly Asn Pro15 10 15
Vai Ala Vai Ala Glu Ala Glu Ser Thr Ala Lys Leu Gln Lys Glu Arg20 25 30
Glu Arg Ala His Lys Lys Lys Asp Lys Arg Ser Asp Lys Lys Ala Pro35 40 45Gln Leu Gly Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Asn His Lys Lys Arg50 55 60
Lys Leu Glu Asp Vai Ser Thr Gly Asp Gln Glu Pro Lys Lys Vai Phe65 70 75 80
Lys Glu Ser Ala Glu Leu Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu Glu His85 90 95
Gly Ala Pro Cys Phe Vai Gln Met Phe Arg Asp Ser Pro Glu Ser Ser100 105 110
Gln Asp Ser Ser Lys Arg Arg Lys Ala Vai Leu Pro Ser Pro Ser Gln115 120 125
Xaa Lys Asn Gly Asn lie lie Arg lie Lys Leu Lys Ser Asn Gln Asp130 135 140
Pro Gln Ser Vai Leu Leu Glu Lys Pro Arg Vai Leu Glu Gln Pro Leu145 150 155 160
Vai Gln Gln Met Ser Ser Xaa Ser Ser Leu Ser Ser Lys Gln Xaa Ser165 170 175
lie Asn Arg Lys Vai Asn Xaa Arg Ser Thr Ala Gly Gln Gln Trp Vai180 185 190
Asn Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Ser Leu Vai Thr Glu Thr Xaa195 200 205
Ser Arg Ala Met Gln Arg Thr Vai Pro Gln Pro Ala Vai Lys Vai Thr210 215 220
Arg Arg Ala Asp Pro Gln Leu Ser Vai Lys Ala Pro Vai Gly Arg Ser225 230 235 240
Asp Leu Pro Pro Lys Phe Ser Gly Ser Vai Gly Pro Ser Pro Ala Arg245 250 255
Vai Thr Xaa Arg Phe Cys Pro Xaa Pro Vai Lys Thr Gln Gln Arg lie260 265 270Xaa His Pro Pro Ser Met Vai Ser Gln Arg Vai Asp Pro Gln Ala Lys275 280 285
Vai Ser Gln Lys Glu Met Gly Ser Ala Vai Cys Leu Pro Gln Ala Pro290 295 300
His Pro Pro Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Pro Vai Pro Lys Gln305 310 315 320
Arg
<210> 77
<211> 446
<212> DNA
<213> Milho
<400> 37
cagtttcagc atcaaattcc ccagacatgc aaaatcccga gacacctgaa aatggtctta 60
agagtgtgct attggaaaat cccgctgcta aaaaagatca ggtgtcatta tgtccttcag 120
ttgaggatgc actggttttt actagcttag gtggaaggaa atctgaaccc aaacggaatg 180
ctgataatga aacagagata aaattggatg ctcgcagtaa aggtaaatct gtcatgtcct 240
ctgtgctgcc tgcttccacc acatctcatg gtgcttctca taacgacctg ttcatgtgcc 300
atcaatgcgc gaaaacaaac taatatatgg aacaacccct acctatactt cctgtgaatc 360
caatgggaca gctcatggta gtttgcagtc gatattccct cttccacatg tagtcttccc 420
tccttgctca ccagtttccc cccctt 446
<210> 78<211> 23<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 38
cgaaatgatg gtgagaacag cat 23
<210> 79<211> 22<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 39
tcgactcttg gcatgacttt tg 22<210> 80
<211> 14
<212> DNA
<213> Arroz vermelho
<400> 40cagtaccgaa acaa
<210> 81
<211> 16
<212> DNA
< 213 > Arro z vermelho
<400> 41cagtactgaa acaagg
<210> 82<211> 20<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 42
ggaacctggt gagcaattgg
<210> 83<211> 24<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 43
ggactgggta acacaacctt tctt
<210> 84
<211> 15
<212> DNA
<213> Arroz vermelho
<400> 44cagacagtgc atggc
<210> 85
<211> 15
<212> DNA
<213> Arroz vermelho
<400> 45cagacagagc atggc
<210> 86<211> 25<212> DNA<213> Arroz vermelho<400> 46tgtcatcagt gtcatcatct ggatt
<210> 87<211> 26<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 47cccttccagt gaactttcta gctatt
<210> 88<211> 18<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 48
ccgttttatg accgtgtg
<210> 89<211> 18<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 49
ccgttttatg gccgtgtg
<210> 90<211> 21<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 50
ccatttgggc cactactatt a
<210> 91<211> 20<212> DNA
<213> Arroz vermelho<400> 51
tcattgtccc tcctgcatcc
<210> 92
<211> 14
<212> DNA
<213> Arroz vermelho
<400> 52atgctcacaa ctct 14
<210> 93
<211> 15
<212> DNA
<213> Arroz vermelho
<400> 53
atgctcagaa ctctt 15
<210> 94 <211> 2086 <212> DNA <213> Milho
<400> 54 ccattccgtc tgaagaccct cctcctacct aattattttt ctctgtcgtg acgtgaaatg 60
ccagcgcgca gcttcttgat ccgttccggc tgatcccgtg gaccggactt ggggttgggg 120
gaggccctct gtctccatgg atgaggcagc agggctgctg ttgcaagaag agggtggagg 180
tggggaccaa gaagctctcc tccttccact tccacaggat gttggccttt acacaggtga 240
tggatctgtt gatgtcaaag ggcgccctgc gttaaagggc actacaggca attggaaagc 300
atgctttttc atcctaggga atgaatgttg tgaaaggctg gcctactacg gaattgcaaa 360
aaacctagtt acttatttga aagtgaagct tcatctaggc aacctcgagg ctgcaagaca 420
tgttaccact tggcaaggga catgctatct cactcccctt gttggaggca tcttagcaga 480
ctctcgttgg gggaaatact ggactattgc tgttttctca tcggtttact ttattggcct 540
ggctatttta acgctttctg catcagtccc agcgttgcaa ccaccttcat gtttaaggac 600
agtttgtcca gaagcaagct tacttcagta tggcatattt tttggtggcc tctatatgat 660
tgccctaggg actggaggta tcaaaccttg tgtctcctcc tttggagctg atcaatttga 720
tgacactgac caagcagaga gagctaagaa gggttcattc ttcaattggt tctacttctg 780
tataaatata ggttcattca tatcaggcac tatgatagtg tggatacaag ataacactgg 840
ttggggaata ggctttgcga ttcctactat attcatggca ttagctattt cattcttctt 900
ctcagcttca aataagtaca gattccaaaa acctggtggg agtccactca caagagtgtg 960
ccaggtggtt atagcagcat ttcgtaagtg gcacattgaa gtgccacatg atacatctct 1020
cctatatgaa gttgatggcc aaacttcagc aattgaagga agccggaagc tggagcacac 1080
aaatgagctc gagttccttg atagagctgc tgttatctca tctgctgatc tgaagagtga 1140
atcctttacc gacccatgga agctttgcac agttacccag gtggaagaat tgaagatcct 1200aataagaatg tttcccattt gggctactac tatcatattc agtgctgttt atgcccaaaa 1260
ctcttccatg ttcatagagc agggcatggt tcttgacaag cgcattgggt ctttcaacat 1320
tcctcctgca tctctctcca cttttgatgt aatcagcgtc atcatgtggg tcccactcta 1380
tgaccgcatc ctggtgccac tagctagaaa attcactgga agggagaagg gtttttctga 1440
gctacagcgg atgggaattg gattagtcct gtccattctc gcgatggtat ctgcagctct 1500
agttgagttg aagcgtttag agattgccag gtctgaaggt ctcattcatg agaaggctgc 1560
tgttccaatg agcattcttt ggcaaatacc acaatatttc ttggtgggcg ctgctgaggt 1620
gtttacttgt attggtcaag ttgagttctt ttacgatcag gccccagatg ccatgaggag 1680
tttatgtagt gcacttgcac ttattacagt ctcactggga aactatataa gctccatcat 1740
actgacattg gtgtcgtaca ttacaactca gggaggagat cctggatgga tccctgacaa 1800
tctgaatgaa ggccatctcg accggttctt ttggttaatt gcagggataa gctttgtaaa 1860
tttgatagtt tatatgggtt gtgctgtcag atacagatat aagaaagcct cttgattata 1920
tttatgtgaa ctcttgtaat gtgatttccc attcccgata tcatacttat caaatacaat 1980
gcactgtaca gatttctgaa atcctgcgat tcatctgact gctttctatt gcaaaaccta 2040
ctgtagttta ttaaaaaaaa aaaaaaaaaa ctcgaggggg ggcccg 2086
<210> 95
<211> 1779
<212> DNA
<213> Milho
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(1779)
<400> 55
atg gat gag gca gca ggg ctg ctg ttg caa gaa gag ggt gga ggt ggg 48
Met Asp Glu Ala Ala Gly Leu Leu Leu Gln Glu Glu Gly Gly Gly Gly
1 5 10 15
gac caa gaa gct etc etc ctt cca ctt cca cag gat gtt ggc ctt tac 96
Asp Gln Glu Ala Leu Leu Leu Pro Leu Pro Gln Asp Vai Gly Leu Tyr20 25 30
aca ggt gat gga tet gtt gat gtc aaa ggg cgc cet gcg tta aag ggc 144
Thr Gly Asp Gly Ser Vai Asp Vai Lys Gly Arg Pro Ala Leu Lys Gly35 40 45
act aca ggc aat tgg aaa gca tgc ttt ttc ate cta ggg aat gaa tgt 192
Thr Thr Gly Asn Trp Lys Ala Cys Phe Phe lie Leu Gly Asn Glu Cys50 55 60
tgt gaa agg ctg gcc tac tac gga att gca aaa aac cta gtt act tat 240
Cys Glu Arg Leu Ala Tyr Tyr Gly lie Ala Lys Asn Leu Vai Thr Tyr
65 70 75 80
ttg aaa gtg aag ctt cat cta ggc aac etc gag gct gca aga cat gtt 288
Leu Lys Vai Lys Leu His Leu Gly Asn Leu Glu Ala Ala Arg His Vai
85 90 95
acc act tgg caa ggg aca tgc tat etc act cec ctt gtt gga ggc ate 336
Thr Thr Trp Gln Gly Thr Cys Tyr Leu Thr Pro Leu Vai Gly Gly lie
100 105 110
tta gca gac tet cgt tgg ggg aaa tac tgg act att gct gtt ttc tca 384
Leu Ala Asp Ser Arg Trp Gly Lys Tyr Trp Thr lie Ala Vai Phe Ser115 120 ' 125
tcg gtt tac ttt att ggc ctg gct att tta acg ctt tet gca tca gtc 432
Ser Vai Tyr Phe lie Gly Leu Ala lie Leu Thr Leu Ser Ala Ser Vai130 135 140
cca gcg ttg caa cca cet tca tgt tta agg aca gtt tgt cca gaa gca 4 80
Pro Ala Leu Gln Pro Pro Ser Cys Leu Arg Thr Vai Cys Pro Glu Ala
145 150 155 160
age tta ctt cag tat ggc ata ttt ttt ggt ggc etc tat atg att gcc 528
Ser Leu Leu Gln Tyr Gly lie Phe Phe Gly Gly Leu Tyr Met lie Ala
165 170 175
cta ggg act gga ggt ate aaa cet tgt gtc tec tec ttt gga gct gat 576
Leu Gly Thr Gly Gly lie Lys Pro Cys Vai Ser Ser Phe Gly Ala Asp
180 185 190
caa ttt gat gac act gac caa gca gag aga gct aag aag ggt tca ttc 624
Gln Phe Asp Asp Thr Asp Gln Ala Glu Arg Ala Lys Lys Gly Ser Phe195 200 205
ttc aat tgg ttc tac ttc tgt ata aat ata ggt tca ttc ata tca ggc 672
Phe Asn Trp Phe Tyr Phe Cys lie Asn lie Gly Ser Phe lie Ser Gly210 215 220
act atg ata gtg tgg ata caa gat aac act ggt tgg gga ata ggc ttt 720
Thr Met lie Vai Trp lie Gln Asp Asn Thr Gly Trp Gly lie Gly Phe
225 230 235 240
gcg att cet act ata ttc atg gca tta gct att tca ttc ttc ttc tca 768
Ala lie Pro Thr lie Phe Met Ala Leu Ala lie Ser Phe Phe Phe Ser
245 250 255
gct tca aat aag tac aga ttc caa aaa cet ggt ggg agt cca etc aca 816
Ala Ser Asn Lys Tyr Arg Phe Gln Lys Pro Gly Gly Ser Pro Leu Thr
260 265 270
aga gtg tgc cag gtg gtt ata gca gca ttt cgt aag tgg cac att gaa 864
Arg Vai Cys Gln Vai Vai lie Ala Ala Phe Arg Lys Trp His lie Glu275 280 285gtg cca catVai Pro His290
gca att gaaAla lie Glu305
ctt gat agaLeu Asp Arg
ttt acc gacPhe Thr Asp
aag ate ctaLys lie Leu355
agt gct gttSer Ala Vai370
gtt ctt gacVai Leu Asp385
tec act tttSer Thr Phe
cgc ate ctgArg lie Leu
ttt tet gagPhe Ser Glu435
gcg atg gtaAla Met Vai450
agg tet gaaArg Ser Glu465
ctt tgg caaLeu Trp Gln
act tgt attThr Cys lie
gat aca tetAsp Thr Ser
gga age cggGly Ser Arg310
gct gct gttAla Ala Vai325
cca tgg aagPro Trp Lys340
ata aga atglie Arg Met
tat gcc caaTyr Ala Gln
aag cgc attLys Arg IIe390
gat gta ateAsp Vai Ile405
gtg cca ctaVai Pro Leu420
cta cag cggLeu Gln Arg
tet gca gctSer Ala Ala
ggt etc attGly Leu Ile470
ata cca caaIle Pro Gln485
ggt caa gttGly Gln Vai500
etc cta tatLeu Leu Tyr295
aag ctg gagLys Leu Glu
ate tca tetIle Ser Ser
ctt tgc acaLeu Cys Thr345
ttt cec attPhe Pro Ile360
aac tet tecAsn Ser Ser375
ggg tet ttcGly Ser Phe
age gtc ateSer Vai Ile
gct aga aaaAla Arg Lys425
atg gga attMet Gly Ile440
cta gtt gagLeu Vai Glu455
cat gag aagHis Glu Lys
tat ttc ttgTyr Phe Leu
gag ttc tttGlu Phe Phe505
gaa gtt gatGlu Vai Asp300
cac aca aatHis Thr Asn315
gct gat ctgAla Asp Leu330
gtt acc cagVai Thr Gln
tgg gct actTrp Ala Thr
atg ttc ataMet Phe Ile380
aac att cetAsn Ile Pro395
atg tgg gtcMet Trp Vai410
ttc act ggaPhe Thr Gly
gga tta gtcGly Leu Vai
ttg aag cgtLeu Lys Arg460
gct gct gttAla Ala Vai475
gtg ggc gctVai Gly Ala490
tac gat cagTyr Asp Gln
ggc caa actGly Gln Thr
gag etc gagGlu Leu Glu
aag agt gaaLys Ser Glu335
gtg gaa gaaVai Glu Glu350
act ate ataThr Ile Ile365
gag cag ggcGlu Gln Gly
cet gca tetPro Ala Ser
cca etc tatPro Leu Tyr415
agg gag aagArg Glu Lys430
ctg tec attLeu Ser Ile445
tta gag attLeu Glu Ile
cca atg agePro Met Ser
gct gag gtgAla Glu Vai495
gcc cca gatAla Pro Asp510
tca 912Ser
ttc 960
Phe
320
tec 1008Ser
ttg 1056Leu
ttc 1104Phe
atg 1152Met
etc 1200
Leu
400
gac 1248Asp
ggt 1296Gly
etc 1344Leu
gcc 1392Ala
att 1440
Ile
480
ttt 1488Phe
gcc 1536Alaatg agg agt tta tgt agt gca ctt gca ctt att aca gtc tca ctg gga 1584
Met Arg Ser Leu Cys Ser Ala Leu Ala Leu lie Thr Vai Ser Leu Gly
515 520 525
aac tat ata age tec ate ata ctg aca ttg gtg tcg tac att aca act 1632
Asn Tyr lie Ser Ser lie lie Leu Thr Leu Vai Ser Tyr lie Thr Thr
530 535 540
cag gga gga gat cet gga tgg ate cet gac aat ctg aat gaa ggc cat 1680
Gln Gly Gly Asp Pro Gly Trp lie Pro Asp Asn Leu Asn Glu Gly His
545 550 555 560
etc gac cgg ttc ttt tgg tta att gca ggg ata age ttt gta aat ttg 1728
Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie Ala Gly lie Ser Phe Vai Asn Leu
565 570 575
ata gtt tat atg ggt tgt gct gtc aga tac aga tat aag aaa gcc tet 1776
lie Vai Tyr Met Gly Cys Ala Vai Arg Tyr Arg Tyr Lys Lys Ala Ser
580 585 590
tga 1779
<210> 96
<211> 592
<212> PRT
<213> Milho
<400> 56
Met Asp Glu Ala Ala Gly Leu Leu Leu Gln Glu Glu Gly Gly Gly Gly1 5 10 15
Asp Gln Glu Ala Leu Leu Leu Pro Leu Pro Gln Asp Vai Gly Leu Tyr20 25 30
Thr Gly Asp Gly Ser Vai Asp Vai Lys Gly Arg Pro Ala Leu Lys Gly35 40 45
Thr Thr Gly Asn Trp Lys Ala Cys Phe Phe lie Leu Gly Asn Glu Cys50 55 60
Cys Glu Arg Leu Ala Tyr Tyr Gly lie Ala Lys Asn Leu Vai Thr Tyr65 70 75 80
Leu Lys Vai Lys Leu His Leu Gly Asn Leu Glu Ala Ala Arg His Vai85 90 95
Thr Thr Trp Gln Gly Thr Cys Tyr Leu Thr Pro Leu Vai Gly Gly lie100 105 110Leu Ala Asp Ser Arg Trp Gly Lys Tyr Trp Thr lie Ala Vai Phe Ser115 120 125
Ser Vai Tyr Phe lie Gly Leu Ala lie Leu Thr Leu Ser Ala Ser Vai130 135 140
Pro Ala Leu Gln Pro Pro Ser Cys Leu Arg Thr Vai Cys Pro Glu Ala145 150 155 160
Ser Leu Leu Gln Tyr Gly lie Phe Phe Gly Gly Leu Tyr Met lie Ala165 170 175
Leu Gly Thr Gly Gly Ile.Lys Pro Cys Vai Ser Ser Phe Gly Ala Asp180 185 190
Gln Phe Asp Asp Thr Asp Gln Ala Glu Arg Ala Lys Lys Gly Ser Phe195 200 ' 205
Phe Asn Trp Phe Tyr Phe Cys lie Asn lie Gly Ser Phe lie Ser Gly210 215 220
Thr Met lie Vai Trp lie Gln Asp Asn Thr Gly Trp Gly lie Gly Phe225 230 235 240
Ala lie Pro Thr lie Phe Met Ala Leu Ala lie Ser Phe Phe Phe Ser245 250 255
Ala Ser Asn Lys Tyr Arg Phe Gln Lys Pro Gly Gly Ser Pro Leu Thr260 265 270
Arg Vai Cys Gln Vai Vai lie Ala Ala Phe Arg Lys Trp His lie Glu275 280 285
Vai Pro His Asp Thr Ser Leu Leu Tyr Glu Vai Asp Gly Gln Thr Ser290 295 300
Ala lie Glu Gly Ser Arg Lys Leu Glu His Thr Asn Glu Leu Glu Phe305 310 315 320
Leu Asp Arg Ala Ala Vai lie Ser Ser Ala Asp Leu Lys Ser Glu Ser325 330 335Phe Thr Asp Pro Trp Lys Leu Cys Thr Vai Thr Gln Vai Glu Glu Leu340 345 350
Lys lie Leu lie Arg Met Phe Pro lie Trp Ala Thr Thr lie lie Phe355 360 365
Ser Ala Vai Tyr Ala Gln Asn Ser Ser Met Phe lie Glu Gln Gly Met370 375 380
Vai Leu Asp Lys Arg lie Gly Ser Phe Asn lie Pro Pro Ala Ser Leu385 390 395 400
Ser Thr Phe Asp Vai lie Ser Vai lie Met Trp Vai Pro Leu Tyr Asp405 410 415
Arg lie Leu Vai Pro Leu Ala Arg Lys Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly420 425 430
Phe Ser Glu Leu Gln Arg Met Gly lie Gly Leu Vai Leu Ser lie Leu435 440 445
Ala Met Vai Ser Ala Ala Leu Vai Glu Leu Lys Arg Leu Glu lie Ala450 455 460
Arg Ser Glu Gly Leu lie His Glu Lys Ala Ala Vai Pro Met Ser lie465 470 475 480
Leu Trp Gln lie Pro Gln Tyr Phe Leu Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe485 490 495
Thr Cys lie Gly Gln Vai Glu Phe Phe Tyr Asp Gln Ala Pro Asp Ala500 505 510
Met Arg Ser Leu Cys Ser Ala Leu Ala Leu lie Thr Vai Ser Leu Gly515 520 525
Asn Tyr lie Ser Ser lie lie Leu Thr Leu Vai Ser Tyr lie Thr Thr530 535 540
Gln Gly Gly Asp Pro Gly Trp lie Pro Asp Asn Leu Asn Glu Gly His545 550 555 560
Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie Ala Gly lie Ser Phe Vai Asn Leu565 570 575
lie Vai Tyr Met Gly Cys Ala Vai Arg Tyr Arg Tyr Lys Lys Ala Ser580 585 590
<210> 97
<211> 499
<212> DNA
<213> Sorgo bicolor
<400> 57
ttgcagaaga gggtggaggg tagggaccac gaaccgctcc tccttccact tccacaggat 60
gctggccttt acacaggtga tggatctgtt gatgtcaaag ggtgtcctgc attaaagggc 120
actacaggca attggaaagc atgttttttc atcctaggga atgagtgttg tgaaaggctg 180
gcctactacg gaattgcaaa aaacctagtt acttatttga aagtgaagct tcatctaggc 240
aaccttgagg ctgcaagaca tgttaccact tggcaaggga catgctatct tactcccctt 300
gttggagcca tcttagcaga ttctcattgg gggaaatact ggacaattgc tgttttctca 360
tcagtttact ttattggcct ggctattttg acgctgtcag catcagtccc agcattgcag 420
ccaccttcat gtttaagaac agtttgtcca gaagcaagct tacttcagta tggcgtattt 480
tttgttggtc tctatatga 4 99
<210> 98
<211> 604
<212> DNA
<213> Sorgo bicolor
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(525)
<400> 58
att ctg gtg cca gta gct aga aaa ttc act gga agg gag aag ggt ttt 48
lie Leu Vai Pro Vai Ala Arg Lys Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly Phe
15 10 15
tct gag etc cag cgg atg gga att gga tta gcc ctg tca att ctt gcg 96Ser Glu Leu Gln Arg Met Gly lie Gly Leu Ala Leu Ser lie Leu Ala20 25 30
atg gta tct gea gct ctt gtt gag ttg aag cgt tta gag att gcc agg 144Met Vai Ser Ala Ala Leu Vai Glu Leu Lys Arg Leu Glu lie Ala Arg35 40 45
tct gaa ggt ctt att cat gag aag gct gct gtt cca atg age att ctt 192Ser Glu Gly Leu lie His Glu Lys Ala Ala Vai Pro Met Ser lie Leu50 55 60
tgg caa ata cca caa tat ttc ttg gtg ggt gct gct gag gtg ttt act 240
Trp Gln lie Pro Gln Tyr Phe Leu Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe Thr
65 70 "75 80
tgt ata ggt caa gtc gag ttc ttt tac gat gag gcc cca gat gcc atg 288
Cys lie Gly Gln Vai Glu Phe Phe Tyr Asp Glu Ala Pro Asp Ala Met
85 90 95
agg agt tta tgt agt gca ttt gca ctt att aca gtc tca ctg gga age 336
Arg Ser Leu Cys Ser Ala Phe Ala Leu lie Thr Vai Ser Leu Gly Ser
100 105 110
tat ata age tec ate ata ctg acg ttg gtg tcg tgc att aca act cag 384
Tyr lie Ser Ser lie lie Leu Thr Leu Vai Ser Cys lie Thr Thr Gln
115 120 125
gga gga gat cet gga tgg ate cet gac aat ctg aat gaa ggc cat etc 432
Gly Gly Asp Pro Gly Trp IlePro Asp Asn Leu Asn Glu Gly His Leu
130 135 140
gac cgg ttc ttt tgg tta att gct ggg ata age ttt gtg aat ttg ata 480
Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie Ala Gly lie Ser Phe Vai Asn Leu lie
145 150 155 160
gtt tac atg ggc tgt gct gtg aga tac aga tat aag aaa gcc tet 525
Vai Tyr Met Gly Cys Ala Vai Arg Tyr Arg Tyr Lys Lys Ala Ser
165 170 * 175
tgattatatt tatgtgaact cttgtaatgt gattccaggt gccatactta tcaaatacat 585
tgcattgtmc agacttctg 604
<210> 99
<211> 175
<212> PRT
<213> Sorgo bicolor
<400> 59
lie Leu Vai Pro Vai Ala Arg Lys Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly Phe1 5 10 15
Ser Glu Leu Gln Arg Met Gly lie Gly Leu Ala Leu Ser lie Leu Ala20 25 30
Met Vai Ser Ala Ala Leu Vai Glu Leu Lys Arg Leu Glu lie Ala Arg35 40 45
Ser Glu Gly Leu lie His Glu Lys Ala Ala Vai Pro Met Ser lie Leu50 55 60Trp Gln Ile Pro Gln Tyr Phe Leu Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe Thr65 70 75 80
Cys Ile Gly Gln Vai Glu Phe Phe Tyr Asp Glu Ala Pro Asp Ala Met85 90 95
Arg Ser Leu Cys Ser Ala Phe Ala Leu Ile Thr Vai Ser Leu Gly Ser100 105 110
Tyr Ile Ser Ser Ile Ile Leu Thr Leu Vai Ser Cys Ile Thr Thr Gln
115 120 125
Gly Gly Asp Pro Gly Trp Ile Pro Asp Asn Leu Asn Glu Gly His Leu130 135 140
Asp Arg Phe Phe Trp Leu Ile Ala Gly Ile Ser Phe Vai Asn Leu Ile145 150 155 160
Vai Tyr Met Gly Cys Ala Vai Arg Tyr Arg Tyr Lys Lys Ala Ser
<210> 100<211> 1130<212> DNA
<213> Cana-de-açúcar<400> 60
ccgtggaccg tggactggac taggggttgg gggaggccct ctgtctccaa ctctccatgg 60
atgaggcagc aggactgctg ttgcaagaag agggtggagg tgaggaccac gaaccgctcc 120
tccttccact tccacaggac gctggccttt acacaggtga tggatctgtt gatgtcaaag 180
ggcgccctgc attaaagcgc actacaggca attggaaagc atgttttttc atcctaggga 240
atgagtgttg tgaaaggttg gcctactacg gaattgcgaa aaacctagtt acttatttga 300
aagtgaagct tcatctaggc aacctcgagg ctgcaagaca tgtcaccact tggcaaggga 360
catgctatct cactcccctt gttggagcca tcttagcaga ttctcattgg gggaaatact 420
ggacaattgc tgttttctca tcagtttact ttattggcct ggctattttg acgctgtcag 480
catcagtccc agcattgcag ccaccttcat gtttaagaac agtttgtcca gaagcaagca 540
tacttcagta tggcatattt tttgttggtc tctatatgat agccctaggg actggaggta 600
tcaaaccttg tgtctcctcc tttggagctg atcaatttga tgacactgac ccagcagaga 660gagctaagaa gggttccttc ttcaattggt tctacttctg tataaatatt ggttcattca 720
tatcaggcac tatcatagtg tggatacaag ataacactgg ttggggaata ggatttgcga 780
ttcctactat attcatggca ttagctattt cattcttctt acaagcttca aataagtaca 840
gattccaaaa acctggtggg agttcactca taagagtgtg tcaggtagtt atagcagcat 900
ttcgtaagtg gcatatagaa gtgccacatg atacatcttt cctttatgaa gttgatggcc 960
aaacttcaac aattgaggga agcccgaagc tggaacacac aaatgagctc gagttcctgg 1020
atagagctgg cgttatttta tttggtgatc tgaagagcga attccttaca acccattgaa 1080
actttgcaca attccccagt tggaagaatt gaagattcta ataagaatgt 1130
<210> 101<211> 595<212> DNA
<213> Cana-de-açúcar
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(594)
<400> 61
atg gat gag gca gca gga ctg ctg ttg caa gaa gag ggt gga ggt gag 48
Met Asp Glu Ala Ala Gly Leu Leu Leu Gln Glu Glu Gly Gly Gly Glu15 10 15
gac cac gaa ccg etc etc ctt cca ctt cca cag gac gct ggc ctt tac 96Asp His Glu Pro Leu Leu Leu Pro Leu Pro Gln Asp Ala Gly Leu Tyr20 25 30
aca ggt gat gga tet gtt gat gtc aaa ggg cgc cet gca tta aag cgc 144Thr Gly Asp Gly Ser Vai Asp Vai Lys Gly Arg Pro Ala Leu Lys Arg35 40 45
act aca ggc aat tgg aaa gca tgt ttt ttc ate cta ggg aat gag tgt 192Thr Thr Gly Asn Trp Lys Ala Cys Phe Phe Ile Leu Gly Asn Glu Cys50 55 60
tgt gaa agg ttg gcc tac tac gga att gcg aaa aac cta gtt act tat 240Cys Glu Arg Leu Ala Tyr Tyr Gly Ile Ala Lys Asn Leu Vai Thr Tyr65 70 75 80
ttg aaa gtg aag ctt cat cta ggc aac etc gag gct gca aga cat gtc 288Leu Lys Vai Lys Leu His Leu Gly Asn Leu Glu Ala Ala Arg His Vai85 90 95
acc act tgg caa ggg aca tgc tat etc act cec ctt gtt gga gcc ate 336Thr Thr Trp Gln Gly Thr Cys Tyr Leu Thr Pro Leu Vai Gly Ala Ile100 105 110
tta gca gat tet cat tgg ggg aaa tac tgg aca att gct gtt ttc tca
384Leu Ala Asp Ser His Trp Gly Lys Tyr Trp Thr lie Ala Vai Phe Ser115 120 125
tca gtt tac ttt att ggc ctg gct att ttg acg ctg tca gca tca gtc 432
Ser Vai Tyr Phe lie Gly Leu Ala lie Leu Thr Leu Ser Ala Ser Vai130 135 140
cca gca ttg cag cca cct tca tgt tta aga aca gtt tgt cca gaa gca 4 80
Pro Ala Leu Gln Pro Pro Ser Cys Leu Arg Thr Vai Cys Pro Glu Ala
145 150 155 160
age ata ctt cag tat ggc ata ttt ttt gtt ggt etc tat atg ata gcc 528
Ser lie Leu Gln Tyr Gly lie Phe Phe Vai Gly Leu Tyr Met lie Ala165 170 175
cta ggg act gga ggt ate aàa cct tgt gtc tec tec ttt gga gct gat 576
Leu Gly Thr Gly Gly lie Lys Pro Cys Vai Ser Ser Phe Gly Ala Asp180 185 190
caa ttt gat gac act gac c 595
Gln Phe Asp Asp Thr Asp195
<210> 102<211> 198<212> PRT
<213> Cana-de-açúcar<400> 62
Met Asp Glu Ala Ala Gly Leu Leu Leu Gln Glu Glu Gly Gly Gly Glu15 10 15
Asp His Glu Pro Leu Leu Leu Pro Leu Pro Gln Asp Ala Gly Leu Tyr20 25 30
Thr Gly Asp Gly Ser Vai Asp Vai Lys Gly Arg Pro Ala Leu Lys Arg35 40 45
Thr Thr Gly Asn Trp Lys Ala Cys Phe Phe lie Leu Gly Asn Glu Cys50 55 60
Cys Glu Arg Leu Ala Tyr Tyr Gly lie Ala Lys Asn Leu Vai Thr Tyr65 70 75 80
Leu Lys Vai Lys Leu His Leu Gly Asn Leu Glu Ala Ala Arg His Vai85 90 95
Thr Thr Trp Gln Gly Thr Cys Tyr Leu Thr Pro Leu Vai Gly Ala lie100 105 110Leu Ala Asp Ser His Trp Gly Lys Tyr Trp Thr lie Ala Vai Phe Ser115 120 125
Ser Vai Tyr Phe lie Gly Leu Ala lie Leu Thr Leu Ser Ala Ser Vai130 135 140
Pro Ala Leu Gln Pro Pro Ser Cys Leu Arg Thr Vai Cys Pro Glu Ala145 150 155 160
Ser lie Leu Gln Tyr Gly lie Phe Phe Vai Gly Leu Tyr Met lie Ala165 170 175
Leu Gly Thr Gly Gly lie Lys Pro Cys Vai Ser Ser Phe Gly Ala Asp180 185 190
Gln Phe Asp Asp Thr Asp195
<210> 103
<211> 817
<212> DNA
<213> Cana-de-açúcar
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(816)
<400> 63
gat ggc caa act tca gca att gag gga age cgg aag ctg gag cac aca 48
Asp Gly Gln Thr Ser Ala lie Glu Gly Ser Arg Lys Leu Glu His Thr15 10 15
aat gag etc gag ttc ctt gat aga gct gcc gtt ate tca tet gct gat 96Asn Glu Leu Glu Phe Leu Asp Arg Ala Ala Vai lie Ser Ser Ala Asp20 25 30
ctg aag age gaa tec ttt aca gac cca tgg aag ctt tgc tca gtt acc 144Leu Lys Ser Glu Ser Phe Thr Asp Pro Trp Lys Leu Cys Ser Vai Thr35 40 45
cag gtg gaa gaa ttg aag ate cta ata aga atg ttt cec att tgg gct 192Gln Vai Glu Glu Leu Lys lie Leu lie Arg Met Phe Pro lie Trp Ala50 55 60
act act ate ata ttc agt gct gtt tre gcc caa aac tet tec atg ttc 240Thr Thr lie lie Phe Ser Ala Vai Xaa Ala Gln Asn Ser Ser Met Phe65 70 75 80ata gag cag ggc atg gtt ctt gac aag cgc att gga tct ttc aac att
lie Glu Gln Gly Met Vai Leu Asp Lys Arg lie Gly Ser Phe Asn lie
85 90 95
cct cct gca tct etc tca act ttt gat gta ate age gtc ate ata ttg
Pro Pro Ala Ser Leu Ser Thr Phe Asp Vai lie Ser Vai lie lie Leu
100 105 110
gtt cca ctt tat gac cgc att ctg gtg cca ata gct aga aaa ttc acc
Vai Pro Leu Tyr Asp Arg lie Leu Vai Pro lie Ala Arg Lys Phe Thr
115 120 125
gga agg gag aag ggt ttt tcg gag cta cag cgg atg gga att gga tta
Gly Arg Glu Lys Gly Phe Ser Glu Leu Gln Arg Met Gly lie Gly Leu
130 135 140
gtc ctg tca att att gcg atg gta tct gca gct ctt gtt gag ttg aag
Vai Leu Ser lie lie Ala Met Vai Ser Ala Ala Leu Vai Glu Leu Lys
145 150 155 160
cgt tta gag att gcc agg tct gaa ggt ctt att cat gag aag gct gct
Arg Leu Glu lie Ala Arg Ser Glu Gly Leu lie His Glu Lys Ala Ala
165 170 175
gtt cca atg age att ctt tgg caa ata cca caa tat ttc ttg gtg ggt
Vai Pro Met Ser lie Leu Trp Gln lie Pro Gln Tyr Phe Leu Vai Gly
180 185 190
gct gct gag gtg ttt act tgt ata ggc caa gct gag ttc ttt tac gat
Ala Ala Glu Vai Phe Thr Cys lie Gly Gln Ala Glu Phe Phe Tyr Asp
195 200 205
cag gcc cca gat gcc atg agg agt tta tgt agt gca ttt gca ctt att
Gln Ala Pro Asp Ala Met Arg Ser Leu Cys Ser Ala Phe Ala Leu lie
210 215 220
aca gtc tca ctg gga age tat ata age tec ate ata ctg acg ttg gtg
Thr Vai Ser Leu Gly Ser Tyr lie Ser Ser lie lie Leu Thr Leu Vai
225 230 235 240
gcg tac att aca gct caa gga gga gat cct gga tgg ate cct gac aat
Ala Tyr lie Thr Ala Gln Gly Gly Asp Pro Gly Trp lie Pro Asp Asn
245 250 255
ctg aat gaa ggc cat etc gac cgg ttc ttt tgg tta att gca agg ata
Leu Asn Glu Gly His Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie Ala Arg lie
260 265 270
<210> 104
<211> 272
<212> PRT
<213> Cana-de-açúcar<220>
<221> Característica_mix
<222> (73)..(73)<223> The 'Xaa' at location 73 stands for Cys, or Tyr.<400> 64
Asp Gly Gln Thr Ser Ala lie Glu Gly Ser Arg Lys Leu Glu His Thr1 5 10 15
Asn Glu Leu Glu Phe Leu Asp Arg Ala Ala Vai lie Ser Ser Ala Asp20 25 30
Leu Lys Ser Glu Ser Phe Thr Asp Pro Trp Lys Leu Cys Ser Vai Thr35 40 45
Gln Vai Glu Glu Leu Lys lie Leu lie Arg Met Phe Pro lie Trp Ala50 55 60
Thr Thr lie lie Phe Ser Ala Vai Xaa Ala Gln Asn Ser Ser Met Phe65 70 75 80
lie Glu Gln Gly Met Vai Leu Asp Lys Arg lie Gly Ser Phe Asn lie85 90 95
Pro Pro Ala Ser Leu Ser Thr Phe Asp Vai lie Ser Vai lie lie Leu100 105 110
Vai Pro Leu Tyr Asp Arg lie Leu Vai Pro IIe Ala Arg Lys Phe Thr115 120 125
Gly Arg Glu Lys Gly Phe Ser Glu Leu Gln Arg Met Gly lie Gly Leu130 135 140
Vai Leu Ser lie lie Ala Met Vai Ser Ala Ala Leu Vai Glu Leu Lys145 150 155 160
Arg Leu Glu lie Ala Arg Ser Glu Gly Leu lie His Glu Lys Ala Ala165 170 175
Vai Pro Met Ser lie Leu Trp Gln lie Pro Gln Tyr Phe Leu Vai Gly180 . 185 190
Ala Ala Glu Vai Phe Thr Cys lie Gly Gln Ala Glu Phe Phe Tyr Asp195 200 205
Gln Ala Pro Asp Ala Met Arg Ser Leu Cys Ser Ala Phe Ala Leu lie210 215 220
Thr Vai Ser Leu Gly Ser Tyr Ile Ser Ser Ile Ile Leu Thr Leu Vai225 230 235 240
Ala Tyr Ile Thr Ala Gln Gly Gly Asp Pro Gly Trp Ile Pro Asp Asn245 250 255
Leu Asn Glu Gly His Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu Ile Ala Arg Ile260 265 270
<210> 105
<211> 675
<212> DNA
<213> Trigo
<220>
<221> CDS
<222> (3)..(596)
<400> 65
tc agt gtt cct cct gcg tcc etc tcg age ttt gac gta ate agt gtc 47
Ser Vai Pro Pro Ala Ser Leu Ser Ser Phe Asp Vai Ile Ser Vai15 10 15
atg ate tgg gtt ceg ctt tat gac cgt gtt etc ata cct ata gcc aga 95Met Ile Trp Vai Pro Leu Tyr Asp Arg Vai Leu Ile Pro Ile Ala Arg20 25 30
aag ttc act gga agg gaa aag ggt ttc tca gaa cta caa cgg att ggc 143Lys Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly Phe Ser Glu Leu Gln Arg Ile Gly35 40 45
att gga ttg gtg ctg tcc att att gca atg gtg tct gca gct ttt gtt 191Ile Gly Leu Vai Leu Ser Ile Ile Ala Met Vai Ser Ala Ala Phe Vai50 55 60
gag ttg aag cgc ttg gag att gcc aca tct gaa ggt ctt ate cat gag 239Glu Leu Lys Arg Leu Glu Ile Ala Thr Ser Glu Gly Leu Ile His Glu65 70 75
aag tct gcg gtt cca atg age att ctt-tgg caa ata cca cag tat ttc 287Lys Ser Ala Vai Pro Met Ser Ile Leu Trp Gln Ile Pro Gln Tyr Phe80 85 90 95
ctt gtt ggc gct gcc gag gtt ttc act aat ata ggt cta ctt gag ttt 335Leu Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe Thr Asn Ile Gly Leu Leu Glu Phe100 105 110
tcg tac gat cag gca cca gat gcc atg agg agt tta tgt act gca ttt 383Ser Tyr Asp Gln Ala Pro Asp Ala Met Arg Ser Leu Cys Thr Ala Phe115 120 125gcg etc gtc atg gtc tca gcg ggg age tat tta age tca ttc ata ttg 4 31
Ala Leu Vai Met Vai Ser Ala Gly Ser Tyr Leu Ser Ser Phe lie Leu130 135 140
acc ctg gtg tcg tat gtt aca act cga ggt gga gat cet gga tgg ate 479
Thr Leu Vai Ser Tyr Vai Thr Thr Arg Gly Gly Asp Pro Gly Trp lie
145 150 155
ceg gat aac atg aat gaa ggc cat ctt gac cgg ttc ttt tgg ttg att 527
Pro Asp Asn Met Asn Glu Gly His Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie160 165 170 175
gea ggg ate age ttt gtg aat ttg ctg gtt tac ate agt tgt gcg atg 575
Ala Gly lie Ser Phe Vai Asn Leu Leu Vai Tyr lie Ser Cys Ala Met180 185 190
aaa tac aaa tat aag aat gtg tgatggtttc tccaaaaaat tgtgtgatgg 626
Lys Tyr Lys Tyr Lys Asn Vai195
tcatacctac tgtggaataa gttcttgtaa tttcagattc catatteat 675
<210> 106
<211> 198
<212> PRT
<213> Trigo
<400> 66
Ser Vai Pro Pro Ala Ser Leu Ser Ser Phe Asp Vai lie Ser Vai Met15 10 15
lie Trp Vai Pro Leu Tyr Asp Arg Vai Leu lie Pro lie Ala Arg Lys20 25 30
Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly Phe Ser Glu Leu Gln Arg lie Gly lie35 40 45
Gly Leu Vai Leu Ser lie lie Ala Met Vai Ser Ala Ala Phe Vai Glu50 55 60
Leu Lys Arg Leu Glu lie Ala Thr Ser Glu Gly Leu lie His Glu Lys65 70 75 80
Ser Ala Vai Pro Met Ser lie Leu Trp Gln lie Pro Gln Tyr Phe Leu85 90 95
Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe Thr Asn lie Gly Leu Leu Glu Phe Ser100 105 110Tyr Asp Gln Ala Pro Asp Ala Met Arg Ser Leu Cys Thr Ala Phe Ala115 120 125
Leu Vai Met Vai Ser Ala Gly Ser Tyr Leu Ser Ser Phe lie Leu Thr130 135 140
Leu Vai Ser Tyr Vai Thr Thr Arg Gly Gly Asp Pro Gly Trp lie Pro145 150 155 160
Asp Asn Met Asn Glu Gly His Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie Ala165 170 175
Gly lie Ser Phe Vai Asn Leu Leu Vai Tyr lie Ser Cys Ala Met Lys180 185 190
Tyr Lys Tyr Lys Asn Vai195
<210> 107
<211> 675
<212> DNA
<213> Trigo
<220>
<221> CDS
<222> (3)..(596)
<400> 67
tc agt gtt cct cct gcg tcc etc tcg age ttt gac gtg ate agt gtc 47
Ser Vai Pro Pro Ala Ser Leu Ser Ser Phe Asp Vai lie Ser Vai15 10 15
atg ate tgg gtt cca ctt tat gac cgt gtt etc ata cct ata gcc aga 95Met lie Trp Vai Pro Leu Tyr Asp Arg Vai Leu lie Pro lie Ala Arg20 25 30
aag ttc act gga aga gaa aag ggt ytc tcg gaa cta caa cgg att ggc 143Lys Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly Xaa Ser Glu Leu Gln Arg lie Gly35 40 45
att gga ttg gtg ctg tcc att att gea atg gtg tet gea gct ttt gtt 191lie Gly Leu Vai Leu Ser lie lie Ala Met Vai Ser Ala Ala Phe Vai50 55 60
gag ttg aag cgc ttg gag att gcc gcg tet gaa ggt ctt ate cat gag 239Glu Leu Lys Arg Leu Glu lie Ala Ala Ser Glu Gly Leu lie His Glu65 70 75aag gct gtg gtt ccg atg age att ctt tgg caa ata ceg cag tat ttc 287
Lys Ala Vai Vai Pro Met Ser Ile Leu Trp Gln Ile Pro Gln Tyr Phe80 85 90 95
ttt gtt ggt gct gcc gag gtt ttc act aat ata ggt cag ctt gag ttc 335
Phe Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe Thr Asn Ile Gly Gln Leu Glu Phe100 105 110
ttc tat gat cag gcc cca gat gcc atg agg agt tta tgt gct gea ttt 383
Phe Tyr Asp Gln Ala Pro Asp Ala Met Arg Ser Leu Cys Ala Ala Phe115 120 125
gcg etc gtc acg gtc tca gcg ggg age tat tta age tcg ttc ata ctg 431
Ala Leu Vai Thr Vai Ser Ala Gly Ser Tyr Leu Ser Ser Phe Ile Leu
130 135 140
acc atg gtg tcg tat gtt aca act cga ggt gga grt cet gga tgg ate 479
Thr Met Vai Ser Tyr Vai Thr Thr Arg Gly Gly Xaa Pro Gly Trp Ile
145 150 155
ccg gat aac ctg aat gaa ggc cat ctt gac cgg ttc ttc tgg ttg att 527
Pro Asp Asn Leu Asn Glu Gly His Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu Ile160 165 170 175
gea ggg ate age ttt gtg aat ttg ctg gtt tac ate agt tgt gcg atg 575
Ala Gly Ile Ser Phe Vai Asn Leu Leu Vai Tyr Ile Ser Cys Ala Met180 185 190
aaa tac aaa tat aag aat gtg tgatggtttc tccaaaaaaa tgtgtgatgg 626Lys Tyr Lys Tyr Lys Asn Vai195
gcatacctac tgtggaataa gttcttgtga tttcagattc catatteat 675
<210> 108
<211> 198
<212> PRT
<213> Trigo
<220>
<221> Característica_mix
<222> (40).. (40)
<22 3> 0 "Xaa" na locação 40 permanece para Leu, ou Phe.<220>
<221> Característica_mix
<222> (155)..(155)
<223> O "Xaa" na locação 155 permanece para Gly, ou Asp.
<400> 68
Ser Vai Pro Pro Ala Ser Leu Ser Ser Phe Asp Vai Ile Ser Vai Met15 10 15
Ile Trp Vai Pro Leu Tyr Asp Arg Vai Leu Ile Pro Ile Ala Arg Lys20 25 30
Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly Xaa Ser Glu Leu Gln Arg lie Gly lie35 40 45
Gly Leu Vai Leu Ser lie lie Ala Met Vai Ser Ala Ala Phe Vai Glu50 55 60
Leu Lys Arg Leu Glu lie Ala Ala Ser Glu Gly Leu lie His Glu Lys65 70 75 80
Ala Vai Vai Pro Met Ser lie Leu Trp Gln lie Pro Gln Tyr Phe Phe85 90 95
Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe Thr Asn lie Gly Gln Leu Glu Phe Phe100 105 110
Tyr Asp Gln Ala Pro Asp Ala Met Arg Ser Leu Cys Ala Ala Phe Ala115 120 125
Leu Vai Thr Vai Ser Ala Gly Ser Tyr Leu Ser Ser Phe lie Leu Thr130 135 140
Met Vai Ser Tyr Vai Thr Thr Arg Gly Gly Xaa Pro Gly Trp lie Pro145 150 155 160
Asp Asn Leu Asn Glu Gly His Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie Ala165 170 175
Gly lie Ser Phe Vai Asn Leu Leu Vai Tyr lie Ser Cys Ala Met Lys180 185 190
Tyr Lys Tyr Lys Asn Vai195
<210> 109
<211> 675
<212> DNA
<213> Trigo
<220>
<221> CDS
<222> (3)..(596)<400> 69
tc agt gtt cct cct gcg tcc etc tcg agt ttt gac gta ate agt gtc 47
Ser Vai Pro Pro Ala Ser Leu Ser Ser Phe Asp Vai lie Ser Vai
15 10 15
atg ate tgg gtt cca ctt tat gac cgt gtt etc ata cct ata gcc aga 95
Met lie Trp Vai Pro Leu Tyr Asp Arg Vai Leu lie Pro lie Ala Arg
20 25 30
aag ttc act gga agg gaa aag ggt ttc tcg gaa cta caa cgg att ggc 143
Lys Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly Phe Ser Glu Leu Gln Arg lie Gly
35 40 45
att gga ttg gtg ctg tcc att att gea atg gtg tet gea gct ttt gtt 191
lie Gly Leu Vai Leu Ser lie lie Ala Met Vai Ser Ala Ala Phe Vai
50 55 60
gag ttg aag cgc ttg gag att gcc gcg tet gaa ggt ctt ate cat gag 239
Glu Leu Lys Arg Leu Glu lie Ala Ala Ser Glu Gly Leu lie His Glu
65 70 75
aag gct gtg gtt ceg atg age att ctt tgg caa ata ceg cag tat ttc 287
Lys Ala Vai Vai Pro Met Ser lie Leu Trp Gln lie Pro Gln Tyr Phe
80 85 90 95
ttt gtt ggt gct gcc gag gtt ttc act aat ata ggt cag ctt gag ttc 335
Phe Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe Thr Asn lie Gly Gln Leu Glu Phe
100 105 110
ttc tat gat cag gcc cca gat gcc atg agg agt tta tgt gct gea ttt 383
Phe Tyr Asp Gln Ala Pro Asp Ala Met Arg Ser Leu Cys Ala Ala Phe
115 120 125
gcg etc gtc acg gtc tca gcg ggg age tat tta age tcg ttc ata ctg 431
Ala Leu Vai Thr Vai Ser Ala Gly Ser Tyr Leu Ser Ser Phe lie Leu
130 135 140
acc atg gtg tcg tat gtt aca act cga ggt gga gat cct gga tgg ate 479
Thr Met Vai Ser Tyr Vai Thr Thr Arg Gly Gly Asp Pro Gly Trp lie
145 150 155
ceg gat aac ctg aat gaa ggc cat ctt gac cgg ttc ttc tgg ttg att 527
Pro Asp Asn Leu Asn Glu Gly His Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie
160 165 170 175
gea ggg ate age ttt gtg aat ttg ctg gtt tac ate agt tgt gcg atg 575
Ala Gly lie Ser Phe Vai Asn Leu Leu Vai Tyr lie Ser Cys Ala Met
180 185 190
aaa tac aaa tat aag aat gtg tgatggtttc tccaaaaaaa tgtgtgatgg 626Lys Tyr Lys Tyr Lys Asn Vai195
gcatacctac tgtggaataa gttcttgtga tttcagattc catatteat 675
<210> 110<211> 198<212> PRT<213> Trigo
<400> 70
Ser Vai Pro Pro Ala Ser Leu Ser Ser Phe Asp Vai lie Ser Vai Met15 10 15
lie Trp Vai Pro Leu Tyr Asp Arg Vai Leu lie Pro lie Ala Arg Lys20 25 30
Phe Thr Gly Arg Glu Lys Gly Phe Ser Glu Leu Gln Arg lie Gly lie35 40 .45
Gly Leu Vai Leu Ser lie lie Ala Met Vai Ser Ala Ala Phe Vai Glu50 55 60
Leu Lys Arg Leu Glu lie Ala Ala Ser Glu Gly Leu lie His Glu Lys65 70 75 80
Ala Vai Vai Pro Met Ser lie Leu Trp Gln lie Pro Gln Tyr Phe Phe85 90 95
Vai Gly Ala Ala Glu Vai Phe Thr Asn lie Gly Gln Leu Glu Phe Phe100 105 110
Tyr Asp Gln Ala Pro Asp Ala Met Arg Ser Leu Cys Ala Ala Phe Ala115 120 125
Leu Vai Thr Vai Ser Ala Gly Ser Tyr Leu Ser Ser Phe lie Leu Thr130 135 140
Met Vai Ser Tyr Vai Thr Thr Arg Gly Gly Asp Pro Gly Trp lie Pro145 150 155 160
Asp Asn Leu Asn Glu Gly His Leu Asp Arg Phe Phe Trp Leu lie Ala165 170 175
Gly lie Ser Phe Vai Asn Leu Leu Vai Tyr lie Ser Cys Ala Met Lys180 185 190
Tyr Lys Tyr Lys Asn Vai195<210> 111
<211> 1522
<212> DNA
<213> Cevada
<220>
<221> CDS
<222> (3)..(932)
<220>
<221> Característica_mix
<222> (1498)..(1498)
<223> n é a, c, g, ou t
<400> 71
at ctt gaa gct gca aga aat gtt ate act tgg caa ggg aca tgc tat 47
Leu Glu Ala Ala Arg Asn Vai Ile Thr Trp Gln Gly Thr Cys Tyr15 10 15
ctg act tec etc gtt gga gcc ate cta gca gat tet tat tgg gga aag 95Leu Thr Ser Leu Vai Gly Ala Ile Leu Ala Asp Ser Tyr Trp Gly Lys20 25 30
tac tgg act att gtt gtt ttc tcg tcg att tat ttc att ggt ctg gct 143
Tyr Trp Thr Ile Vai Vai Phe Ser Ser Ile Tyr Phe Ile Gly Leu Ala
35 40 45
ggt tta acg ctt tca gca tca ctt cca gca ctt caa cca cct tca tgt 191
Gly Leu Thr Leu Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Gln Pro Pro Ser Cys
50 55 60
tca gga tet gtt tgc cca gaa cca age cta ctt cag aat ggc aca ttt 239
Ser Gly Ser Vai Cys Pro Glu Pro Ser Leu Leu Gln Asn Gly Thr Phe65 70 75
ttc ctg ggc etc tat atg att gcc cta gga acc gga ggc att aaa cct 287
Phe Leu Gly Leu Tyr Met Ile Ala Leu Gly Thr Gly Gly Ile Lys Pro80 85 90 95
tgt gtg tca tec ttt gga gct gac caa ttt gat gtc agt gat ceg aca 335
Cys Vai Ser Ser Phe Gly Ala Asp Gln Phe Asp Vai Ser Asp Pro Thr
100 105 110
gag aga gta aag cag ggt tec ttc ttc aat tgg ttc tat ttc tgc ata 383
Glu Arg Vai Lys Gln Gly Ser Phe Phe Asn Trp Phe Tyr Phe Cys Ile
115 120 125
aat gtc ggt gca etc tta tca ggc act gtt att gtt tgg ata caa gat 431
Asn Vai Gly Ala Leu Leu Ser Gly Thr Vai Ile Vai Trp Ile Gln Asp
130 135 140
aac tca ggt tgg gga ata gga ttt gcc att cct act gta ttt atg gca 479Asn Ser Gly Trp Gly Ile Gly Phe Ala Ile Pro Thr Vai Phe Met Ala145 150 155ctg gct ate gea age ttc ttt tca gcc tca aat atg tat aga ttt cag 527
Leu Ala lie Ala Ser Phe Phe Ser Ala Ser Asn Met .Tyr Arg Phe Gln
160 165 170 175
aaa cec ggt ggg agt cca att aca aga gtg tgc cag gtt gtt gtc gea 575
Lys Pro Gly Gly Ser Pro lie Thr Arg Vai Cys Gln Vai Vai Vai Ala180 185 190
gea ttc cgt aag tgg cat ate gag ttg cca cty gac gct tet ctt ctg 623
Ala Phe Arg Lys Trp His lie Glu Leu Pro Xaa Asp Ala Ser Leu Leu195 200 205
tat gaa gtt gat ggt cga aag tca gea ata gag gga age cga aag ctg 671
Tyr Glu Vai Asp Gly Arg Lys Ser Ala lie Glu Gly Ser Arg Lys Leu210 215 220
gag cac aca agt gaa ctt gaa ttc ctt gac aag gct gct ate ate tca 719
Glu Hís Thr Ser Glu Leu Glu Phe Leu Asp Lys Ala Ala lie lie Ser225 230 235
tet act gat gcc aag agt gac ttt tet gea aac cca tgg agg cta tgc 7 67
Ser Thr Asp Ala Lys Ser Asp Phe Ser Ala Asn Pro Trp Arg Leu Cys
240 245 250 255
act gtc acc caa gtg gaa gaa ctg aag ate cta gta aga atg ttc cca 815
Thr Vai Thr Gln Vai Glu Glu Leu Lys lie Leu Vai Arg Met Phe Pro260 265 270
gtt tgg gcg act acw ate ata ttc age ggg gta ttt gct cag aac tec 863
Vai Trp Ala Thr Xaa lie He Phe Ser Gly Vai Phe Ala Gln Asn Ser275 280 285
gta ttc gtg gag cag gga atg gtt ctt gac aaa cgg gtt gga tet ttc 911
Vai Phe Vai Glu Gln Gly Met Vai Leu Asp Lys Arg Vai Gly Ser Phe290 295 300
gat att cet ctg cat cec tat taactttcga cgtaatcagt gtcatgatct 962Asp lie Pro Leu His Pro Tyr
305 310
ggattccaat ttatgaccgt atacteatac ceatagetag aaagttcact ggaagggaaa 1022
agggtttctc tgagctacag cgaatgggca ttggattagt cctatccatt atgacaatgg 1082
tatctgcagc tcttgttgag ttgaagcgct tagagattgc caggactgag ggtcttgttc 1142
atgagaatgt tgctgttccg atgagcattc tttggcaaat accacagtat tgctttgctg 1202
gtgctgccga ggttttcacc gctataggtc aagtcgagtt cttctatggt caggccccag 1262
atgccatgag gagcttatgt gctgcattgg cacttgttac ggtcacggtg ggaagctatt 1322
taagctcaat catattgacc ttggtgtcat accttacaac tcaaggagga gatgcaggat 1382
ggateccaga taacttgaat gaaggccatc tcgaccggtt tttttggttg ctggcaggga 1442
tcagctttgt aaatttgctg gtttacattg gttgcgcaat gagatacaaa tataanaatg 1502tgtgatggtt atagttactg 1522
<210> 112
<211> 310
<212> PRT
<213> Cevada
<220>
<221> Característica_mix
<222> (202)..(202)
<223> 0 "Xaa" na locação 2 02 permanece para Leu.<220>
<221> Característica_mix
<222> (276)..(276)
<223> O "Xaa" na locação 276 permanece para Thr.
<400> 72
Leu Glu Ala Ala Arg Asn Vai lie Thr Trp Gln Gly Thr Cys Tyr Leu15 10 15
Thr Ser Leu Vai Gly Ala lie Leu Ala Asp Ser Tyr Trp Gly Lys Tyr20 25 30
Trp Thr lie Vai Vai Phe Ser Ser lie Tyr Phe lie Gly Leu Ala Gly35 40 45
Leu Thr Leu Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Gln Pro Pro Ser Cys Ser50 55 60
Gly Ser Vai Cys Pro Glu Pro Ser Leu Leu Gln Asn Gly Thr Phe Phe65 70 75 80
Leu Gly Leu Tyr Met lie Ala Leu Gly Thr Gly Gly lie Lys Pro Cys85 90 95
Vai Ser Ser Phe Gly Ala Asp Gln Phe Asp Vai Ser Asp Pro Thr Glu100 105 110
Arg Vai Lys Gln Gly Ser Phe Phe Asn Trp Phe Tyr Phe Cys lie Asn115 120 125
Vai Gly Ala Leu Leu Ser Gly Thr Vai lie Vai Trp lie Gln Asp Asn130 135 140Ser Gly Trp Gly lie Gly Phe Ala lie Pro Thr Vai Phe Met Ala Leu145 150 155 160
Ala lie Ala Ser Phe Phe Ser Ala Ser Asn Met Tyr Arg Phe Gln Lys165 170 175
Pro Gly Gly Ser Pro lie Thr Arg Vai Cys Gln Vai Vai Vai Ala Ala180 185 190
Phe Arg Lys Trp His lie Glu Leu Pro Xaa Asp Ala Ser Leu Leu Tyr195 200 205
Glu Vai Asp Gly Arg Lys Ser Ala lie Glu Gly Ser Arg Lys Leu Glu210 215 220
His Thr Ser Glu Leu Glu Phe Leu Asp Lys Ala Ala lie lie Ser Ser225 230 235 240
Thr Asp Ala Lys Ser Asp Phe Ser Ala Asn Pro Trp Arg Leu Cys Thr245 250 255
Vai Thr Gln Vai Glu Glu Leu Lys lie Leu Vai Arg Met Phe Pro Vai260 265 270
Trp Ala Thr Xaa lie lie Phe Ser Gly Vai Phe Ala Gln Asn Ser Vai275 280 285
Phe Vai Glu Gln Gly Met Vai Leu Asp Lys Arg Vai Gly Ser Phe Asp290 295 300
lie Pro Leu His Pro Tyr305 310
<210> 113
<211> 1661
<212> DNA
<213> Cevada
<220>
<221> CDS
<222> (3)..(932)
<400> 73
at ctt gaa gct gca aga aat gtt acc act tgg caa ggg aca tgc tatLeu Glu Ala Ala Arg Asn Vai Thr Thr Trp Gln Gly Thr Cys Tyr15 10 15
ctg tct ccc etc att gga gcc ate cta gea gat tet tat tgg gga aag 95Leu Ser Pro Leu lie Gly Ala lie Leu Ala Asp Ser Tyr Trp Gly Lys20 25 30
tac tgg act att gct gtt ttc tca tca att tat ttc ate ggc ctg tct 143Tyr Trp Thr lie Ala Vai Phe Ser Ser lie Tyr Phe lie Gly Leu Ser35 40 45
gtt tta act ctt tca gea tcg ctt cca gea ctt cag cca cet tca tgt 191Vai Leu Thr Leu Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Gln Pro Pro Ser Cys50 55 60
tta gga acc gtt tgt cca gaa gea age tta ctt caa aat ggc aca ttt 239Leu Gly Thr Vai Cys Pro Glu Ala Ser Leu Leu Gln Asn Gly Thr Phe65 70 75
ttc cta ggt etc tat atg att gcc cta ggg acc gga ggt att aaa cca 287Phe Leu Gly Leu Tyr Met lie Ala Leu Gly Thr Gly Gly lie Lys Pro80 85 90 95
tgt gtg tca tec ttt ggg gct gat caa ttt gat gac agt gat ceg aca 335Cys Vai Ser Ser Phe Gly Ala Asp Gln Phe Asp Asp Ser Asp Pro Thr100 105 110
gag aga gta aag cag ggt tec ttc ttc aac tgg ttc tat ttc tgc ata 383Glu Arg Vai Lys Gln Gly Ser Phe Phe Asn Trp Phe Tyr Phe Cys lie115 120 125
aat ate ggt gea ttc ata tca ggc act gtt att gtt tgg ata caa gat 431Asn lie Gly Ala Phe lie Ser Gly Thr Vai lie Vai Trp lie Gln Asp130 135 140
aac tcg ggt tgg gga ata gga ttt gcc att cet act gta ttt atg gea 479Asn Ser Gly Trp Gly lie Gly Phe Ala lie Pro Thr Vai Phe Met Ala145 150 155
ttg gct att gea age ttc ttt tca gct tca gat atg tat aga ttt cag 527Leu Ala lie Ala Ser Phe Phe Ser Ala Ser Asp Met Tyr Arg Phe Gln160 165 170 175
aaa cet ggt ggg agt cca ctt aca aga gtg tgc cag gtc gtt gtc gea 575Lys Pro Gly Gly Ser Pro Leu Thr Arg Vai Cys Gln Vai Vai Vai Ala180 185 190
gcg ttc cgt aag tgg cat gtt gaa ctg cca cat gac act gct ctt tta 623Ala Phe Arg Lys Trp His Vai Glu Leu Pro His Asp Thr Ala Leu Leu195 200 205
tat gaa gtt gat aat caa aat tca gea ata gat gga age aga aag cta 671Tyr Glu Vai Asp Asn Gln Asn Ser Ala lie Asp Gly Ser Arg Lys Leu210 215 220
gag cac aca agt gaa ctt gaa ttc ctt gac aag gct gcc ate ate tcaGlu His Thr Ser Glu Leu Glu Phe Leu Asp Lys Ala Ala lie lie Ser225 230 235
719tct act gat gcc aag agt gac etc ctt aca aac cca tgg agg ctt tgc 7 67
Ser Thr Asp Ala Lys Ser Asp Leu Leu Thr Asn Pro Trp Arg Leu Cys
240 245 250 255
acg gtc acc cag gtg gaa gaa cta aag ate cta gta aga atg ttc ceg 815
Thr Vai Thr Gln Vai Glu Glu Leu Lys lie Leu Vai Arg Met Phe Pro
260 265 270
gtc tgg gct act act ate ata ttc aat gcg gtg tac gct cag aac tct 863
Vai Trp Ala Thr Thr lie lie Phe Asn Ala Vai Tyr Ala Gln Asn Ser
275 280 285
tec atg ttc tta gag cag gga atg gtt etc gac aag cgg gtt ggg tct 911
Ser Met Phe Leu Glu Gln Gly Met Vai Leu Asp Lys Arg Vai Gly Ser
290 295 300
ttc aat gtt cet cet gcg tec ctctcgagct ttgacgtaat cagtgtcatg 962Phe Asn Vai Pro Pro Ala Ser305 310
atctgggttc cactttatga ccgtgttctc atacetatag ctaggaagtt cactggaagg 1022
gaaaagggtt tetcagaget acaacggatt" ggcattggac tagtgctttc catttttgca 1082
atggtgtctg cagcttttgt cgaggtgaag cgcttggaga ttgccaggtc cgaaggtctt 1142
atccatgaga aggctgcggt tccgatgagc attctttggc aaataccgca gtatttcttt 1202
gttggcgctg ccgaggtttt cactaatata ggtcagcttg agttcttcta tgatcaggcc 1262
ccagatgcca tgagaagttt atgtgctgca tttgcactcg tcacggtctc agcagggagc 1322
tatttaagct catteatatt gaccttggtg tcttacgtta caactcgagg tggagatcct 1382
ggatggatcc cggataacct gaacgaaggc catcttgacc ggttcttttg gttgattgca 1442
ggggtcagct ttgtgaattt gctggtttac atcagttgtg caatgaaata caaatataag 1502
aatgtgtgat ggtttatctc cacaaaaatg tgtgatggtc atacctgctg tggaatcagt 1562
ccttgtaatc teagatteca atatccatga aagctgtgca t.tttatagac taagacatca 1622
catgagcygg ccctcctcaa caggtgcctc aagaaaaag 1661
<210> 114
<211> 310
<212> PRT
<213> Cevada
<400> 74
Leu Glu Ala Ala Arg Asn Vai Thr Thr Trp Gln Gly Thr Cys Tyr Leu15 10 15Ser Pro Leu lie Gly Ala lie Leu Ala Asp Ser Tyr Trp Gly Lys Tyr20 25 30
Trp Thr lie Ala Vai Phe Ser Ser lie Tyr Phe lie Gly Leu Ser Vai35 40 45
Leu Thr Leu Ser Ala Ser Leu Pro Ala Leu Gln Pro Pro Ser Cys Leu50 55 60
Gly Thr Vai Cys Pro Glu Ala Ser Leu Leu Gln Asn Gly Thr Phe Phe65 70 75 80
Leu Gly Leu Tyr Met lie Ala Leu Gly Thr Gly Gly lie Lys Pro Cys85 90 95
Vai Ser Ser Phe Gly Ala Asp Gln Phe Asp Asp Ser Asp Pro Thr Glu100 105 110
Arg Vai Lys Gln Gly Ser Phe Phe Asn Trp Phe Tyr Phe Cys lie Asn115 120 125
lie Gly Ala Phe lie Ser Gly Thr Vai lie Vai Trp lie Gln Asp Asn130 135 140
Ser Gly Trp Gly lie Gly Phe Ala lie Pro Thr Vai Phe Met Ala Leu145 150 155 160
Ala lie Ala Ser Phe Phe Ser Ala Ser Asp Met Tyr Arg Phe Gln Lys165 170 175
Pro Gly Gly Ser Pro Leu Thr Arg Vai Cys Gln Vai Vai Vai Ala Ala180 185 190
Phe Arg Lys Trp His Vai Glu Leu Pro His Asp Thr Ala Leu Leu Tyr195 200 205
Glu Vai Asp Asn Gln Asn Ser Ala lie Asp Gly Ser Arg Lys Leu Glu210 215 220
His Thr Ser Glu Leu Glu Phe Leu Asp Lys Ala Ala lie lie Ser Ser225 230 235 240
Thr Asp Ala Lys Ser Asp Leu Leu Thr Asn Pro Trp Arg Leu Cys Thr245 250 255
Vai Thr Gln Vai Glu Glu Leu Lys Ile Leu Vai Arg Met Phe Pro Vai260 265 270
Trp Ala Thr Thr Ile Ile Phe Asn Ala Vai Tyr Ala Gln Asn Ser Ser275 280 285
Met Phe Leu Glu Gln Gly Met Vai Leu Asp Lys Arg Vai Gly Ser Phe290 295 300
Asn Vai Pro Pro Ala Ser305 310
<210> 115
<211> 1344
<212> DNA
<213> Cevada
<220>
<221> GDS
<222> (1)..(1344)
<400> 75
atg tcg agg tgc ttc ccc tac ccg ccg ccg ggg tac gtg cga aac cca 48
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
gtg gtg gcc gtg gcc gcg gcc gaa gcg cag gcg acc act aag etc cag 96Vai Vai Ala Vai Ala Ala Ala Glu Ala Gln Ala Thr Thr Lys Leu Gln20 25 30
aaa gaa agg gaa aag gct gaa aag aag aaa gag aaa agg agt gac agg 144Lys Glu Arg Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg35 40 45
aaa gct ctt cca cat ggt gag ata tcc aag. cat tca aag cga acc cac 192Lys Ala Leu Pro His Gly Glu Ile Ser Lys His Ser Lys Arg Thr His50 55 60
cac aag aag aga aaa cat gaa gac ate aat aat gct gat cag aag tcc 240His Lys Lys Arg Lys His Glu Asp Ile Asn Asn Ala Asp Gln Lys Ser65 70 75 80
cgg aag gtt tcc tcc atg gaa cct ggt gag caa ttg gag aag agt gga 288Arg Lys Vai Ser Ser Met Glu Pro Gly Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly85 90 95
etc tca gaa gag cat gga gct cct tgc ttt act cag aca gag cat ggc 336Leu Ser Glu Glu His Gly Ala Pro Cys Phe Thr Gln Thr Glu His Gly100 105 110tct cca gagSer Pro Glu115
ccc agt cctPro Ser Pro130
aga aga gatArg Arg Asp145
gta caa acaVai Gln Thr
aag aaa aacLys Lys Asn
gca tca accAla Ser Thr195
aaa caa ggtLys Gln Gly210
cct cca tctPro Pro Ser225
gag atg ttgGlu Met Leu
gtc aat cctVai Asn Pro
gcc aag gcaAla Lys Ala275
ata gat gctlie Asp Ala290
ccg gaa gtaPro Glu Vai305
ate aat cgtlie Asn Arg
agt tca cagSer Ser Gln
age caa gctSer Gln Ala
caa gat tctGln Asp Ser150
cca gtt catPro Vai His165
tca atg caaSer Met Gln180
cag cag caaGln Gln Gln
atg cca accMet Pro Thr
atg agg gcaMet Arg Ala230
gcc aat gttAla Asn Vai245
gca gct gctAla Ala Ala260
tct cag agaSer Gln Arg
act cga tctthr Arg Ser
cag ccc ccaGln Pro Pro310
cag cag attGln Gln lie325
gac age ageAsp Ser Ser120
aag aat ggtLys Asn Gly135
tca gct tecSer Ala Ser
caa atg ggaGln Met Gly
cca cac aacPro His Asn185
age ate aaaSer lie Lys200
cca gca aaaPro Ala Lys215
tca aag gaaSer Lys Glu
ggt cct tcaGly Pro Ser
aag gtt acaLys Vai Thr265
att gat cctlie Asp Pro280
ttt acg aagPhe Thr Lys295
att ctg aaglie Leu Lys
gac acc tcgAsp Thr Ser
aag aga agaLys Arg Arg
aac ate cttAsn lie Leu140
ctt tcg gagLeu Ser Glu155
tca gtt tcaSer Vai Ser170
acc gaa atgThr Glu Met
ggt gat tttGly Asp Phe
gtc atg ccaVai Met Pro220
agg att ggcArg lie Gly235
ccc tec aagPro Ser Lys250
caa aga gttGln Arg Vai
ctg ttg ccaLeu Leu Pro
gtc tec cagVai Ser Gln300
gtg cct gtgVai Pro Vai315
cag ccc aaaGln Pro Lys330
aag gtt gtgLys Vai Vai125
cga ata aagArg lie Lys
aaa tct aatLys Ser Asn
tct ctg ccaSer Leu Pro175
atg gtg agaMet Vai Arg190
caa gca gtaGln Ala Vai205
aga gtc gatArg Vai Asp
ctt cgt cctLeu Arg Pro
gca aaa cagAla Lys Gln255
gat cct ccaAsp Pro Pro270
tec aag gttSer Lys Vai285
aca gag ateThr Glu lie
gct atg cctAla Met Pro
gaa gag cctGlu Glu Pro335
tta 384Leu
ata 432lie
gtt 480
Vai
160
agt 528Ser
aca 57 6
Thr
ccg 624Pro
gtt 672Vai
gca 720
Ala
240
att 768lie
cct 816Pro
cat 864His
aag 912Lys
acc 960
Thr
320
tgc 1008Cystcc tct ggc agg aat gct gaa gct gct tca gta tca gta gag aag cag 1056
Ser Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Ala Ser Vai Ser Vai Glu Lys Gln
340 345 350
tcc aag tca gat cgc aaa aag age cgc aag gct gag aag aaa gag aag 1104
Ser Lys Ser Asp Arg Lys Lys Ser Arg Lys Ala Glu Lys Lys Glu Lys
355 360 365
aag ttc aaa gat tta ttt gtt acc tgg gat cet ceg tct atg gaa atg 1152
Lys Phe Lys Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asp Pro Pro Ser Met Glu Met
370 375 380
gat gat atg gat etc ggg gac cag gat tgg ctg ctt gat agt acg agg 1200
Asp Asp Met Asp Leu Gly Asp Gln Asp Trp Leu Leu Asp Ser Thr Arg
385 390 395 400
aaa cet gat gct ggc att ggc aac tgc aga gaa att gtt gat cca ctt 1248
Lys Pro Asp Ala Gly lie Gly Asn Cys Arg Glu lie Vai Asp Pro Leu
405 410 415
act tct caa tca gea gag cag ttc tca ttg cag cet agg gcg att cat 1296
Thr Ser Gln Ser Ala Glu Gln Phe Ser Leu Gln Pro Arg Ala lie His
420 425 430
tta cca gac ctt cat gtc tat cag ttg cca tat gtg gtt cca ttc tag 1344
Leu Pro Asp Leu His Vai Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe
- 435 440 445
<210> 116
<211> 447
<212> PRT
<213> cevada
<400> 76
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
Vai Vai Ala Vai Ala Ala Ala Glu Ala Gln Ala Thr Thr Lys Leu Gln20 25 30
Lys Glu Arg Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Arg35 40 45
Lys Ala Leu Pro His Gly Glu lie Ser Lys His Ser Lys Arg Thr His50 55 60
His Lys Lys Arg Lys His Glu Asp lie Asn Asn Ala Asp Gln Lys Ser65 70 75 80
Arg Lys Vai Ser Ser Met Glu Pro Gly Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly85
90
95
Leu Ser Glu Glu His Gly Ala Pro Cys Phe Thr Gln Thr Glu His Gly100 105 110
Ser Pro Glu Ser Ser Gln Asp Ser Ser Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu115 120 125
Pro Ser Pro Ser Gln Ala Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg lie Lys lie130 135 140
Arg Arg Asp Gln Asp Ser Ser Ala Ser Leu Ser Glu Lys Ser Asn Vai145 150 155 160
Vai Gln Thr Pro Vai His Gln Met Gly Ser Vai Ser Ser Leu Pro Ser165 170 175
Lys Lys Asn Ser Met Gln Pro His Asn Thr Glu Met Met Vai Arg Thr180 185 190
Ala Ser Thr Gln Gln Gln Ser lie Lys Gly Asp Phe Gln Ala Vai Pro195 200 205
Lys Gln Gly Met Pro Thr Pro Ala Lys Vai Met Pro Arg Vai Asp Vai210 215 220
Pro Pro Ser Met Arg Ala Ser Lys Glu Arg lie Gly Leu Arg Pro Ala225 230 235 240
Glu Met Leu Ala Asn Vai Gly Pro Ser Pro Ser Lys Ala Lys Gln lie245 250 255
Vai Asn Pro Ala Ala Ala Lys Vai Thr Gln Arg Vai Asp Pro Pro Pro260 265 270
Ala Lys Ala Ser Gln Arg lie Asp Pro Leu Leu Pro Ser Lys Vai His275 280 285
lie Asp Ala Thr Arg Ser Phe Thr Lys Vai Ser Gln Thr Glu lie Lys290 295 300
Pro Glu Vai Gln Pro Pro lie Leu Lys Vai Pro Vai Ala Met Pro Thr305 310 315 320Ile Asn Arg Gln Gln Ile Asp Thr Ser Gln Pro Lys Glu Glu Pro Cys325 330 335
Ser Ser Gly Arg Asn Ala Glu Ala Ala Ser Vai Ser Vai Glu Lys Gln340 345 350
Ser Lys Ser Asp Arg Lys Lys Ser Arg Lys Ala Glu Lys Lys Glu Lys355 360 365
Lys Phe Lys Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asp Pro Pro Ser Met Glu Met370 375 380
Asp Asp Met Asp Leu Gly Asp Gln Asp Trp Leu Leu Asp Ser Thr Arg385 390 395 400
Lys Pro Asp Ala Gly Ile Gly Asn Cys Arg Glu Ile Vai Asp Pro Leu405 410 415
Thr Ser Gln Ser Ala Glu Gln Phe Ser Leu Gln Pro Arg, Ala Ile His420 425 430
Leu Pro Asp Leu His Vai Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai Pro Phe435 440 445
<210> 117
<211> 329
<212> DNA
<213> Trigo
<220>
<221> CDS
<222> (1)..(177)
<220>
<221> Característica_mix
<222> (18) .. (18)
<223> n é a, c, g, ou" t
<400> 77
acc gca ccg gat tgg ttn tcg gcg gtc aag aaa cct gat gcc tca aca 48
Thr Ala Pro Asp Trp Xaa Ser Ala Vai Lys Lys Pro Asp "Ala Ser Thr15 10 15
gca gct gca agg caa gtg atg gtt tgg cgc cca tgg age tgg agt ttt 96Ala Ala Ala Arg Gln Vai Met Vai Trp Arg Pro Trp Ser Trp Ser Phe20 25 30cat ggc aac caa ggg cta ttc att tgc ctg acc ttc ata tgt ate agt 144His Gly Asn Gln Gly Leu Phe lie Cys Leu Thr Phe lie Cys lie Ser35 40 45
tgc cat atg ttg ttc cet ttt agg ttt gtg tag gaagactgag gttagatgag 197Cys His Met Leu Phe Pro Phe Arg Phe Vai50 55
aagtagaaga gatgttggga gatagctgtg ccggtgtggg agatagtgtt cccccacggc 257
agttttccag ctttgtttcc tagtttttct tttccaggac gatggatttg gcaaccttct 317
gtagtgttgt ta 329
<210> 118
<211> 58
<212> PRT
<213> Trigo
<220>
<221> Característica_mix<222> (6)..(6)
<223> O 'Xaa' na locação 6 permanece para Leu, ou Phe.<400> 78
Thr Ala Pro Asp Trp Xaa Ser Ala Vai Lys Lys Pro Asp Ala Ser Thr15 10 15
Ala Ala Ala Arg Gln Vai Met Vai Trp Arg Pro Trp Ser Trp Ser Phe20 25 30
His Gly Asn Gln Gly Leu Phe lie Cys Leu Thr Phe lie Cys lie Ser35 40 45
Cys His Met Leu Phe Pro Phe Arg Phe Vai50 55
<210> 119
<211> 1353
<212> DNA
<213> Sorgo bicolor
<220>
<221> CDS
<222> (1) .. (1353)
<400> 79
atg tcg agg tgc ttc cec tac ceg ceg ceg ggg tac gtg cga aac cca 48
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15gtg gcc gtgVai Ala Vai
gaa agg gaaGlu Arg Glu35
gct ccc cagAla Pro Gln50
aag aga aagLys Arg Lys65
gaa tcc aaaGlu Ser Lys
gag cat ggaGlu His Gly
agt tca cagSer Ser Gln. 115
age caa gctSer Gln Ala130
caa gat tccGln Asp Ser145
cca ttg gtcPro Leu Vai
aat tet ateAsn Ser lie
agg gta actArg Vai Thr195
agt ctg geaSer Leu Ala210
gtc aca catVai Thr His225
gcc gtg gccAla Vai Ala20
aag gcc gaaLys Ala Glu
aag ggt gagLys Gly Glu
ctt gaa gatLeu Glu Asp70
gaa tca gttGlu Ser Vai85
gct cet tgtAla Pro Cys100
gac age ageAsp Ser Ser
aag aat gggLys Asn Gly
caa tca gctGln Ser Ala150
cga caa atgArg Gln Met165
cat cat aagHis His Lys180
ggt gac tccGly Asp Ser
aag acc atgLys Thr Met
ceg gtt catPro Vai His230
gag gcg gagGlu Ala Glu25
aag aag aaaLys Lys Lys40
acg tet aaaThr Ser Lys55
gtc ate aaaVai lie Lys
gag cag ttgGlu Gln Leu
ttt gta cagPhe Vai Gln105
aag agg cgaLys Arg Arg120
aac ate cttAsn lie Leu135
ctt tcg gagLeu Ser Glu
gga tca ggcGly Ser Gly
gtg aat gtgVai Asn Vai185
caa gea gtaGln Ala Vai200
cag aga gttGln Arg Vai215
ccc ceg ttgPro Pro Leu
tcg acc gctSer Thr Ala
gag aaa aggGlu Lys Arg
cat tca aagHis Ser Lys60
gtt ggg cagVai Gly Gln75
gag aag agtGlu Lys Ser90
acg ate cgcThr lie Arg
aag gtt gtcLys Vai Vai
cgc ate aagArg lie Lys140
aaa cca atgLys Pro Met155
tcg tcc ctgSer Ser Leu170
aga tet acaArg Ser Thr
caa aaa tgtGln Lys Cys
gtt ccc cagVai Pro Gln220
tet gtt aagSer Vai Lys235
aag etc cagLys Leu -Gln30
agt gac aagSer Asp Lys45
cac age catHis Ser His
gat ccc aaaAsp Pro Lys
gga etc tcaGly Leu Ser95
gac tet cetAsp Ser Pro110
ctg ccc agtLeu Pro Ser125
att aaa agtlie Lys Ser
gtt cet gagVai Pro Glu
ttg ggc aagLeu Gly Lys175
tet gct cagSer Ala Gln190
att att acalie lie Thr205
cet gea gcgPro Ala Ala
gcg cca gttAla Pro Vai
aaa 96Lys
aaa 144Lys
aag 192Lys
agg 240
Arg
80
gaa 288Glu
gag 336Glu
cet 384Pro
aat 432Asn
cag 480
Gln
160
caa 528Gln
cag 576Gln
gaa 624Glu
aag 672Lys
gga 720
Gly
240aga tct gac cta cct cca aag ttt tcg gga agt gtg gcg tct tca cct 7 68
Arg Ser Asp Leu Pro Pro Lys Phe Ser Gly Ser Vai Ala Ser Ser Pro245 250 255
gct gga gtg atg gga aga ttt gat cct cca cct gtt aag atg gtg tca 816Ala Gly Vai Met Gly Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Vai Ser260 265 270
cag gga gtt cag cgt cca gct tcc atg gtg tca cag aaa gtt gat cct 864Gln Gly Vai Gln Arg Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro275 280 285
cag tta gcg aag gtg tta cag aaa gaa acg aga tct gct gtt tgc cta 912Gln Leu Ala Lys Vai Leu Gln Lys Glu Thr Arg Ser Ala Vai Cys Leu290 295 300
cca gac gcc ccg cag cct cct gtt ctg caa aaa ccc aag gac ttg act 960Pro Asp Ala Pro Gln Pro Pro Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Thr305 310 315 320
gtt etc aag cag cag gat etc ate acc tct ttg cca aaa gaa gag cct 1008Vai Leu Lys Gln Gln Asp Leu lie Thr Ser Leu Pro Lys Glu Glu Pro325 330 335
tgc ttc tct ggt aga agt gea gaa aca gtt caa gtg cag gat act aag 1056Cys Phe Ser Gly Arg Ser Ala Glu Thr Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys340 345 350
etc tcc cgg tca gat cgg aag aaa ate cgc aaa gct gag aag aaa gaa 1104Leu Ser Arg Ser Asp Arg Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Glu355 360 365
aag aag ttc aga gat ctg ttt gtt acc tgg aat ccg ata tcg cta gag 1152Lys Lys Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro lie Ser Leu Glu370 375 380
aat gaa ggt tca gat ctt ggt gat caa gat tgg ctg ttg age agt aca 1200Asn Glu Gly Ser Asp Leu Gly Asp Gln Asp Trp Leu Leu Ser Ser Thr385 390 395 400
agg aac tct gat gct age atg gct caa tgc aaa tca act ggt ggt gta 1248Arg Asn Ser Asp Ala Ser Met Ala Gln Cys Lys Ser Thr Gly Gly Vai405 410 415
ggg ccg ate cat cca atg gtg cag cag cag cct tct ttg caa ccc agg 1296Gly Pro lie His Pro Met Vai Gln Gln Gln Pro Ser Leu Gln Pro Arg420 425 430
gcc act ttt ctg ccg gac ctt cat atg tac cag ctg cca tat gtc gta 1344Ala Thr Phe Leu Pro Asp Leu His Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai435 440 445
cca ttt taa 1353Pro Phe450<210> 120
<211> 450
<212> PRT
<213> Sorgo bicolor
<400> 80
Met Ser Arg Cys Phe Pro Tyr Pro Pro Pro Gly Tyr Vai Arg Asn Pro15 10 15
Vai Ala Vai Ala Vai Ala Glu Ala Glu Ser Thr Ala Lys Leu Gln Lys20 25 30
Glu Arg Glu Lys Ala Glu Lys Lys Lys Glu Lys Arg Ser Asp Lys Lys35 40 45
Ala Pro Gln Lys Gly Glu Thr Ser Lys His Ser Lys His Ser His Lys50 55 60
Lys Arg Lys Leu Glu Asp Vai lie Lys Vai Gly Gln Asp Pro Lys Arg65 70 75 80
Glu Ser Lys Glu Ser Vai Glu Gln Leu Glu Lys Ser Gly Leu Ser Glu85 90 95
Glu His Gly Ala Pro Cys Phe Vai Gln Thr lie Arg Asp Ser Pro Glu100 105 110
Ser Ser Gln Asp Ser Ser Lys Arg Arg Lys Vai Vai Leu Pro Ser Pro115 120 125
Ser Gln Ala Lys Asn Gly Asn lie Leu Arg lie Lys lie Lys Ser Asn130 135 140
Gln Asp Ser Gln Ser Ala Leu Ser Glu Lys Pro Met Vai Pro Glu Gln145 150 155 160
Pro Leu Vai Arg Gln Met Gly Ser Gly Ser Ser Leu Leu Gly Lys Gln165 170 175
Asn Ser lie His His Lys Vai Asn Vai Arg Ser Thr Ser Ala Gln Gln180 185 190
Arg Vai Thr Gly Asp Ser Gln Ala Vai Gln Lys Cys lie lie Thr Glu195 200 205Ser Leu Ala Lys Thr Met Gln Arg Vai Vai Pro Gln Pro Ala Ala Lys210 215 220
Vai Thr His Pro Vai His Pro Pro Leu Ser Vai Lys Ala Pro Vai Gly225 230 235 240
Arg Ser Asp Leu Pro Pro Lys Phe Ser Gly Ser Vai Ala Ser Ser Pro245 250 255
Ala Gly Vai Met Gly Arg Phe Asp Pro Pro Pro Vai Lys Met Vai Ser260 265 270
Gln Gly Vai Gln Arg Pro Ala Ser Met Vai Ser Gln Lys Vai Asp Pro275 280 285
Gln Leu Ala Lys Vai Leu Gln Lys Glu Thr Arg Ser Ala Vai Cys Leu290 295 300
Pro Asp Ala Pro Gln Pro Pro Vai Leu Gln Lys Pro Lys Asp Leu Thr305 310 315 320
Vai Leu Lys Gln Gln Asp Leu lie Thr Ser Leu Pro Lys Glu Glu Pro325 330 335
Cys Phe Ser Gly Arg Ser Ala Glu Thr Vai Gln Vai Gln Asp Thr Lys340 345 350
Leu Ser Arg Ser Asp Arg Lys Lys lie Arg Lys Ala Glu Lys Lys Glu355 360 365
Lys Lys Phe Arg Asp Leu Phe Vai Thr Trp Asn Pro lie Ser Leu Glu370 375 380
Asn Glu Gly Ser Asp Leu Gly Asp Gln Asp Trp Leu Leu Ser Ser Thr385 390 395 400
Arg Asn Ser Asp Ala Ser Met Ala Gln Cys Lys Ser Thr Gly Gly Vai' 405 410 415
Gly Pro lie His Pro Met Vai Gln Gln Gln Pro Ser Leu Gln Pro Arg420 425 430Ala Thr Phe Leu Pro Asp Leu His Met Tyr Gln Leu Pro Tyr Vai Vai435 440 445
Pro Phe450

Claims (46)

1. Método para identificar uma seqüência de polinucleotídeosque está associada com o rendimento na planta, compreendendo as etapasde:a) comparar pelo menos uma porção de uma seqüência de poli-nucleotídeo da planta com pelo menos um polinucleotídeo selecionado dogrupo consistindo em uma seqüência de polinucleotídeos EG1117 e umaseqüência de polinucleotídeos EG307; eb) a identificação de pelo menos uma seqüência de polinucleotí-deo na planta que contenha pelo menos uma alteração de nucleotídeo emcomparação com um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo emuma seqüência de polinucleotídeo EG1117 e uma seqüência de polinucleo-tídeo EG307, em que a referida seqüência de polinucleotídeo identificadaestá associada com o rendimento em uma planta.
2. Método de acordo com a reivindicação 1, em que a seqüênciade polinucleotídeo é selecionada do grupo consistindo em a) SEQ ID NO: 71; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ IDNO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48;SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62;SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ IDNO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO:-78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82; SEQID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO:-95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101;SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO:-88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92; SEQID NO: 93; e b) por um polinucleotídeo com pelo menos cerca de 70% deidentidade de seqüência com um polinucleotídeo em a).
3. Método de acordo com a reivindicação 1, em que a seqüênciade polinucleotídeo da planta é um DNA genômico.
4. Método de acordo com a reivindicação 1, em que a seqüênciade polinucleotídeo da planta é cDNA.
5. Método de acordo com a reivindicação 1, em que a seqüênciade polinucleotídeo EG307 ou EHG1117 está associada com o rendimentoaumentado em uma planta.
6. Método de acordo com a reivindicação 5, em que o rendimen-to aumentado é um rendimento aumentado em relação a uma segunda plan-ta do mesmo gênero com uma segunda seqüência de polinucleotídeosEG307 ou EG1117 com pelo menos uma alteração de nucleotídeo em rela-ção à seqüência de polinucleotídeo EG307 ou EG1117 da planta.
7. Método de acordo com a reivindicação 1, em que a planta éselecionada do grupo consistindo em Zea mays mays, Oryza sativa, Triticumaestivum, Hordeum vulgare, Saccharum officinarum, Sorghum bicolor ePennisetum typhoides.
8. Método de acordo com a reivindicação 1, em que a planta éselecionada do grupo consistindo em uma planta ancestral selvagem parauma planta domesticada selecionada do grupo consistindo em Zea maysmays, Oryza sativa, Triticum aestivum, Hordeum vulgare, Saccharum offici-narum, Sorghum bicolor e Pennisetum typhoides.
9. Método de acordo com a reivindicação 8, em que a planta éOryza rufipogon ou teosinte.
10. Polinucleotídeo isolado selecionado do grupo consistindoem: a) um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo em SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO:62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ IDNO: 78; SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82;SEQ ID NO: 83; SEQ ID NO: 84; SEQ ID NO: 85; SEQ ID NO: 94; SEQ IDNO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101;SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO:-88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91; SEQ ID NO: 92; SEQID NO: 93; e b) um polinucleotídeo com pelo menos cerca de 70% de homo-logia com um polinucleotídeo de a), e confere substancialmente o mesmorendimento que um polinucleotídeo de a).
11. Polipeptídeo isolado selecionado do grupo consistindo em:a) um polipeptídeo codificado por um polinucleotídeo seleciona-do do grupo consistindo na SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO:-74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO:-51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO:-65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ-ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO:-97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103;SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111 eSEQ ID NO: 113;b) um polipeptídeo codificado por um polinucleotídeo com pelo-menos cerca de 70% de identidade de seqüência com um polinucleotídeoem a) e confere substancialmente o mesmo rendimento que o polinucleotí-deo de a);c) um polipeptídeo compreendendo a SEQ ID NO: 73; SEQ IDNO: 76; SEQ ID NO: 43; SEQ ID NO: 46; SEQ ID NO: 49; SEQ ID NO: 52;-SEQ ID NO: 55; SEQ ID NO: 58; SEQ ID NO: 61; SEQ ID NO: 64; SEQ IDNO: 67; SEQ ID NO: 70; SEQ ID NO: 118; SEQ ID NO: 120; SEQ ID NO:-116; SEQ ID NO: 96; SEQ ID NO: 99; SEQ ID NO: 102; SEQ ID NO: 104;SEQ ID NO: 106; SEQ ID NO: 108; SEQ ID NO: 110; SEQ ID NO: 112; eSEQ ID NO: 114; ed) um polipeptídeo com pelo menos cerca de 75% de identidadede seqüência com um polipeptídeo de c) e confere substancialmente omesmo rendimento que o polipeptídeo de c).
12. Células vegetais, compreendendo DNA heterólogo codifi-cando um polipeptídeo EG1117 ou EG307, em que o referido polipeptídeo écapaz de aumentar o rendimento de uma planta, em que o referido polipep-tídeo é selecionado do grupo consistindo em:a) um polipeptídeo codificado por um polinucleotídeo seleciona-do do grupo consistindo na SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO:74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103;SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111 eSEQ ID NO: 113;b) um polipeptídeo codificado por um polinucleotídeo com pelomenos cerca de 70% de identidade de seqüência com um polinucleotídeoem a) ec) um polipeptídeo compreendendo a SEQ ID NO: 73; SEQ IDNO: 76; SEQ ID NO: 43; SEQ ID NO: 46; SEQ ID NO: 49; SEQ ID NO: 52;SEQ ID NO: 55; SEQ ID NO: 58; SEQ ID NO: 61; SEQ ID NO: 64; SEQ IDNO: 67; SEQ ID NO: 70; SEQ ID NO: 118; SEQ ID NO: 120; SEQ ID NO: 116; SEQ ID NO: 96; SEQ ID NO: 99; SEQ ID NO: 102; SEQ ID NO: 104;SEQ ID NO: 106; SEQ ID NO: 108; SEQ ID NO: 110; SEQ ID NO: 112; eSEQ ID NO: 114; ed) um polipeptídeo com pelo menos cerca de 75% de identidadede seqüência com um polipeptídeo de c).
13. Material de propagação de uma planta transgênica, compre-endendo a célula vegetal transgênica como definida na reivindicação 12.
14. Planta transgênica contendo DNA heterólogo, o qual codificaum polipeptídeo EG1117 ou EG307 que é expresso no tecido vegetal, emque o referido polipeptídeo é capaz de aumentar o rendimento da planta, emque o referido polipeptídeo é selecionado do grupo consistindo em:a) um polipeptídeo codificado por um polinucleotídeo seleciona-do do grupo consistindo da SEQ ID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO:-74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ-ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO:-51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO:-65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO:-97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103;SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111 eSEQ ID NO: 113;b) um polipeptídeo codificado por um polinucleotídeo com pelomenos cerca de 70% de identidade de seqüência com um polinucleotídeo- ema);c) um polipeptídeo compreendendo a SEQ ID NO: 73; SEQ IDNO: 76; SEQ ID NO: 43; SEQ ID NO: 46; SEQ ID NO: 49; SEQ ID NO: 52;SEQ ID NO: 55; SEQ ID NO: 58; SEQ ID NO: 61; SEQ ID NO: 64; SEQ IDNO: 67; SEQ ID NO: 70; SEQ ID NO: 118; SEQ ID NO: 120; SEQ ID NO:-116; SEQ ID NO: 96; SEQ ID NO: 99; SEQ ID NO: 102; SEQ ID NO: 104;SEQ ID NO: 106; SEQ ID NO: 108; SEQ ID NO: 110; SEQ ID NO: 112; eSEQ ID NO: 114; ed) um polipeptídeo com pelo menos cerca de 75% de identidadede seqüência com um polipeptídeo de c).
15. Polinucleotídeo isolado, o qual inclui um promotor operavel-mente ligado a um polinucleotídeo que codifica um gene EG1117 ou EG307em um tecido vegetal, em que o referido polinucleotídeo é capaz de aumen-tar o rendimento de uma planta, em que o referido polinucleotídeo é selecio-nado do grupo consistindo em:a) um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo na SEQID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO:-41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO:-54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO:-68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115;-SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ IDNO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO:-107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111 e SEQ ID NO: 113; eb) um polinucleotídeo com pelo menos cerca de 70% de identi-dade de seqüência com um polinucleotídeo em a).
16. Polinucleotídeo isolado, de acordo com a reivindicação 15,em que o referido polinucleotídeo é um polinucleotídeo recombinante.
17. Polinucleotídeo, de acordo com a reivindicação 16, em que opromotor é o promotor natural para um gene EG1117 ou EG307.
18. Célula hospedeira transfectada, compreendendo uma célula hospedeira transfectada com um constructo compreendendo um promotor,um intensificador ou polinucleotídeo íntron de um polinucleotídeo EG1117 ouEG307 ou qualquer combinação destes, operativamente ligados a um poli-nucleotídeo codificando uma proteína repórter, em que o referido polinucleo-tídeo EG1117 ou EG307 é capaz de aumentar o rendimento de uma planta,em que o referido polinucleotídeo EG1117 ou EG307 é selecionado do grupoconsistindo em:a) um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo na SEQID NO: 71 ; SEQ ID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO:4-1; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ-ID NO: 48; SEQ ID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO:-54; SEQ ID NO: 56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQID NO: 62; SEQ ID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO:-68; SEQ ID NO: 69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115;SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID-NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO:-107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111 e SEQ ID NO: 113; eb) um polinucleotídeo com pelo menos cerca de 70% de identi-dade de seqüência com um polinucleotídeo em a).
19. Método para determinar se uma planta tem uma seqüênciade polinucleotídeo particular compreendendo uma seqüência EG1117, com-preendendo as etapas de:a) comparar pelo menos cerca de uma porção da seqüência depolinucleotídeo da referida planta com uma seqüência de polinucleotídeoselecionada do grupo consistindo em (i) um polinucleotídeo selecionado dogrupo consistindo em SEQ ID NO: 94; SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ ID NO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ IDNO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO: 109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87; SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQID NO: 90; SEQ ID NO: 91 ; SEQ ID NO: 92; e SEQ ID NO: 93; e (ii) um po-linucleotídeo com pelo menos cerca de 70% de identidade de seqüênciacom um polinucleotídeo de (i) e o qual confere substancialmente o mesmorendimento que um polinucleotídeo de (i), em que um ou mais dos polinucle-otídeos de a) é o polinucleotídeo particular; eb) a identificação se a planta contém o polinucleotídeo particular.
20. Método de acordo com a reivindicação 19, em que a seqüência de polinucleotídeo da planta é DNA genômico.
21. Método de acordo com a reivindicação 19, em que a seqüência de polinucleotídeo da planta é cDNA.
22. Método de acordo com a reivindicação 19, em que a se-qüência de polinucleotídeo EH1117 está associada com o rendimento aumentado em uma planta.
23. Método de acordo com a reivindicação 22, em que o rendi-mento aumentado é um rendimento aumentado em relação a uma segundaplanta do mesmo gênero com uma segunda seqüência de polinucleotídeoEG1117 com pelo menos uma alteração de nucleotídeo em relação à se-qüência de polinucleotídeo EG1117 da planta.
24. Método de acordo com a reivindicação 22, em que a planta éselecionada do grupo consistindo em Zea mays mays, Oryza sativa, Triticumaestivum, Hordeum vulgare, Saccharum officinarum, Sorghum bicolor ePennisetum typhoides.
25. Método de acordo com a reivindicação 23, em que a segun-da planta é selecionada do grupo consistindo em uma planta ancestral sel-vagem para uma planta domesticada selecionada do grupo consistindo emZea mays mays, Oryza sativa, Triticum aestivum, Hordeum vulgare,Saccharum officinarum, Sorghum bicolor e Pennisetum typhoides.
26. Método para determinar se uma planta tem uma seqüênciade polinucleotídeo particular compreendendo uma seqüência EG307, com-preendendo as etapas de:a) comparar pelo menos cerca de uma porção da seqüência denucleotídeo codificadora de polipeptídeo da referida planta com uma se-qüência de polinucleotídeo selecionada do grupo consistindo em (i) um poli-nucleotídeo selecionado do grupo consistindo em SEQ ID NO: 71 ; SEQ IDNO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42;SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQ IDNO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO: 56;SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQ IDNO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO: 69;SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 78; SEQID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82; SEQ ID NO:83; SEQ ID NO: 84 e SEQ ID NO: 85, e (ii) um polinucleotídeo com pelo me-nos cerca de 70% de identidade de seqüência com um polinucleotídeo de (i)e o qual confere substancialmente o mesmo rendimento que um polinucleo-tídeo de (i), em que um ou mais dos polinucleotídeos de a) é o polinucleotí-deo particular; eb) a identificação se a planta contém o polinucleotídeo particular.
27. Método de acordo com a reivindicação 26, em que a se-qüência de polinucleotídeo da planta é DNA genômico.
28. Método de acordo com a reivindicação 26, em que a se-qüência de polinucleotídeo da planta é cDNA.
29. Método de acordo com a reivindicação 26, em que a se-qüência de polinucleotídeo EH307 está associada com o rendimento aumen-tado em uma planta.
30. Método de acordo com a reivindicação 29, em que o rendi-mento aumentado é um rendimento aumentado em relação a uma segundaplanta do mesmo gênero com uma segunda seqüência de polinucleotídeoEG307 com pelo menos uma alteração de nucleotídeo em relação à se-qüência de polinucleotídeo EG307 da planta.
31. Método de acordo com a reivindicação 26, em que a planta éselecionada do grupo consistindo em Zea mays mays, Oryza sativa, TriticumPennisetum typhoides.
32. Método de acordo com a reivindicação 31, em que a segun-da planta é selecionada do grupo consistindo em uma planta ancestral sel-vagem para uma planta domesticada selecionada do grupo consistindo emZea mays mays, Oryza sativa, Triticum aestivum, Hordeum vulgare,Saccharum officinarum, Sorghum bicolor e Pennisetum typhoides.
33. Método de geração auxiliada por marcador de plantas parauma seqüência de polinucleotídeo EG1117 particular, compreendendo asetapas de:a) comparar, para pelo menos uma planta, pelo menos uma por-ção da seqüência de nucleotídeo das referidas plantas com a seqüência depolinucleotídeo EG1117 particular selecionada do grupo consistindo em (i)um polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo em SEQ ID NO: 94;SEQ ID NO: 95; SEQ ID NO: 97; SEQ ID NO: 98; SEQ ID NO: 100; SEQ IDNO: 101; SEQ ID NO: 103; SEQ ID NO: 105; SEQ ID NO: 107; SEQ ID NO:-109; SEQ ID NO: 111; SEQ ID NO: 113; SEQ ID NO: 86; SEQ ID NO: 87;SEQ ID NO: 88; SEQ ID NO: 89; SEQ ID NO: 90; SEQ ID NO: 91 ; SEQ IDNO: 92; e SEQ ID NO: 93; e (ii) um polinucleotídeo com pelo menos cercade 70% de identidade de seqüência com um polinucleotídeo de (i) e o qualconfere substancialmente o mesmo rendimento que um polinucleotídeo de-(i), eb) a identificação se a planta compreende a seqüência de poli-nucleotídeo particular; ec) a geração de uma planta compreendendo a seqüência de po-linucleotídeo particular para produzir progenia.
34. Método de acordo com a reivindicação 33, em que a se-qüência de polinucleotídeo vegetal é DNA genômico.
35. Método de acordo com a reivindicação 33, em que a se-qüência de polinucleotídeo vegetal é cDNA.
36. Método de acordo com a reivindicação 33, em que a se-qüência de polinucleotídeo EG1117 está associada com o rendimento au-mentado em uma planta.
37. Método de acordo com a reivindicação 36, em que o rendi-mento aumentado é um rendimento aumentado em relação a uma segundaplanta do mesmo gênero com uma segunda seqüência de polinucleotídeoEG1117 com pelo menos uma alteração de nucleotídeo em relação à se-qüência de polinucleotídeo EG1117 da planta.
38. Método de acordo com a reivindicação 33, em que a planta éselecionada do grupo consistindo em Zea mays mays, Oryza sativa, Triticumaestivum, Hordeum vulgare, Saccharum officinarum, Sorghum bicolor ePennisetum typhoides.
39. Método de acordo com a reivindicação 37, em que a segun-da planta é selecionada do grupo consistindo em uma planta ancestral sel-vagem para uma planta domesticada selecionada do grupo consistindo emZea mays mays, Oryza sativa, Triticum aestivum, Hordeum vulgare,Saccharum officinarum, Sorghum bicolor e Pennisetum typhoides.
40. Método de geração auxiliada por marcador de plantas parauma seqüência de polinucleotídeo EG307 particular, compreendendo as e-tapas de:a) comparar, para pelo menos uma planta, pelo menos uma por-ção da seqüência de nucleotídeo das referidas plantas com a seqüência depolinucleotídeo EG307 particular selecionada do grupo consistindo em (i) umpolinucleotídeo selecionado do grupo consistindo em SEQ ID NO: 71 ; SEQID NO: 72; SEQ ID NO: 74; SEQ ID NO: 75; SEQ ID NO: 41; SEQ ID NO: 42; SEQ ID NO: 44; SEQ ID NO: 45; SEQ ID NO: 47; SEQ ID NO: 48; SEQID NO: 50; SEQ ID NO: 51; SEQ ID NO: 53; SEQ ID NO: 54; SEQ ID NO:56; SEQ ID NO: 57; SEQ ID NO: 59; SEQ ID NO: 60; SEQ ID NO: 62; SEQID NO: 63; SEQ ID NO: 65; SEQ ID NO: 66; SEQ ID NO: 68; SEQ ID NO:-69; SEQ ID NO: 117; SEQ ID NO: 119; SEQ ID NO: 115; SEQ ID NO: 78;SEQ ID NO: 79; SEQ ID NO: 80; SEQ ID NO: 81; SEQ ID NO: 82; SEQ IDNO: 83; SEQ ID NO: 84 e SEQ ID NO: 85; e (ii) um polinucleotídeo com pelomenos cerca de 70% de identidade de seqüência com um polinucleotídeo de(i) e o qual confere substancialmente o mesmo rendimento que um polinu-cleotídeo de (i);b) a identificação se a planta compreende a seqüência de poli-nucleotídeo particular; ec) a geração de uma planta compreendendo a seqüência de po-linucleotídeo particular para produzir progenia.
41. Método de acordo com a reivindicação 38, em que a se-qüência de polinucleotídeo da planta é DNA genômico.
42. Método de acordo com a reivindicação 38, em que a se-qüência de polinucleotídeo da planta é cDNA.
43. Método de acordo com a reivindicação 38, em que a se-qüência de polinucleotídeo EG307 está associada com o rendimento aumen-tado em uma planta.
44. Método de acordo com a reivindicação 41, em que o rendi-mento aumentado é um rendimento aumentado em relação a uma segundaplanta do mesmo gênero com uma segunda seqüência de polinucleotídeoEG307 com pelo menos uma alteração de nucleotídeo em relação à se-qüência de polinucleotídeo EG307 da planta.
45. Método de acordo com a reivindicação 38, em que a planta éselecionada do grupo consistindo em Zea mays mays, Oryza sativa, Triticumaestivum, Hordeum vulgare, Saccharum officinarum, Sorghum bicolor ePennisetum typhoides.
46. Método de acordo com a reivindicação 44, em que a planta éselecionada do grupo consistindo em uma planta ancestral selvagem parauma planta domesticada selecionada do grupo consistindo em Zea maysmays, Oryza sativa, Triticum aestivum, Hordeum vulgare, Saccharum offici-narum, Sorghum bicolor e Pennisetum typhoides.
BRPI0609602-6A 2005-03-29 2006-03-29 polinucleotìdeos eg117 e eg307 e seus usos BRPI0609602A2 (pt)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US66651105P 2005-03-29 2005-03-29
US60/666,511 2005-03-29
US77493906P 2006-02-17 2006-02-17
US60/774,939 2006-02-17
PCT/US2006/011615 WO2006105277A2 (en) 2005-03-29 2006-03-29 Eg1117 and eg307 polynucleotides and uses thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BRPI0609602A2 true BRPI0609602A2 (pt) 2010-04-20

Family

ID=37054120

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BRPI0609602-6A BRPI0609602A2 (pt) 2005-03-29 2006-03-29 polinucleotìdeos eg117 e eg307 e seus usos

Country Status (9)

Country Link
US (2) US20060225153A1 (pt)
EP (1) EP1863335A4 (pt)
JP (1) JP2008537881A (pt)
KR (1) KR20080004538A (pt)
AU (1) AU2006230352A1 (pt)
BR (1) BRPI0609602A2 (pt)
CA (1) CA2602337A1 (pt)
IL (1) IL186135A0 (pt)
WO (1) WO2006105277A2 (pt)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20080047032A1 (en) * 1999-01-29 2008-02-21 Evolutionary Genomics Llc Eg307 nucleic acids and uses thereof
US20040009944A1 (en) * 2002-05-10 2004-01-15 Inex Pharmaceuticals Corporation Methylated immunostimulatory oligonucleotides and methods of using the same
CA2620897A1 (en) * 2005-09-02 2007-03-08 Evolutionary Genomics, Inc. Eg8798 and eg9703 polynucleotides and uses thereof
US20110173723A1 (en) * 2008-07-29 2011-07-14 Evolutionary Genomics, Inc. EG82013 and EG81345 Nucleic Acids and Uses Thereof

Family Cites Families (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5614395A (en) * 1988-03-08 1997-03-25 Ciba-Geigy Corporation Chemically regulatable and anti-pathogenic DNA sequences and uses thereof
US5451513A (en) * 1990-05-01 1995-09-19 The State University of New Jersey Rutgers Method for stably transforming plastids of multicellular plants
DE4035756A1 (de) * 1990-11-08 1992-05-14 Inst Genbiologische Forschung Neue plasmide zur herstellung von im habitus und ertrag veraenderten transgenen pflanzen
UA48104C2 (uk) * 1991-10-04 2002-08-15 Новартіс Аг Фрагмент днк, який містить послідовність,що кодує інсектицидний протеїн, оптимізовану для кукурудзи,фрагмент днк, який забезпечує направлену бажану для серцевини стебла експресію зв'язаного з нею структурного гена в рослині, фрагмент днк, який забезпечує специфічну для пилку експресію зв`язаного з нею структурного гена в рослині, рекомбінантна молекула днк, спосіб одержання оптимізованої для кукурудзи кодуючої послідовності інсектицидного протеїну, спосіб захисту рослин кукурудзи щонайменше від однієї комахи-шкідника
US5545818A (en) * 1994-03-11 1996-08-13 Calgene Inc. Expression of Bacillus thuringiensis cry proteins in plant plastids
US5545817A (en) * 1994-03-11 1996-08-13 Calgene, Inc. Enhanced expression in a plant plastid
US5545531A (en) * 1995-06-07 1996-08-13 Affymax Technologies N.V. Methods for making a device for concurrently processing multiple biological chip assays
US6245969B1 (en) * 1997-06-24 2001-06-12 Joanne Chory Receptor kinase, Bin1
AU769931B2 (en) * 1998-01-30 2004-02-12 Evolutionary Genomics Llc Methods to identify polynucleotide and polypeptide sequences which may be associated with physiological and medical conditions
US6280953B1 (en) * 1998-01-30 2001-08-28 Evolutionary Genomics, L.L.C. Methods to identify polynucleotide and polypeptide sequences which may be associated with physiological and medical conditions
US5965352A (en) * 1998-05-08 1999-10-12 Rosetta Inpharmatics, Inc. Methods for identifying pathways of drug action
US7439018B2 (en) * 1999-01-29 2008-10-21 Evolutionary Genomics, Inc. EG1117 Polynucleotides and uses thereof
US7252966B2 (en) * 1999-01-29 2007-08-07 Evolutionary Genomics Llc EG307 polynucleotides and uses thereof
US6274319B1 (en) * 1999-01-29 2001-08-14 Walter Messier Methods to identify evolutionarily significant changes in polynucleotide and polypeptide sequences in domesticated plants and animals
US20090087878A9 (en) * 1999-05-06 2009-04-02 La Rosa Thomas J Nucleic acid molecules associated with plants
US20040031072A1 (en) * 1999-05-06 2004-02-12 La Rosa Thomas J. Soy nucleic acid molecules and other molecules associated with transcription plants and uses thereof for plant improvement
US20100293669A2 (en) * 1999-05-06 2010-11-18 Jingdong Liu Nucleic Acid Molecules and Other Molecules Associated with Plants and Uses Thereof for Plant Improvement
US20110131679A2 (en) * 2000-04-19 2011-06-02 Thomas La Rosa Rice Nucleic Acid Molecules and Other Molecules Associated with Plants and Uses Thereof for Plant Improvement
US20070016976A1 (en) * 2000-06-23 2007-01-18 Fumiaki Katagiri Plant genes involved in defense against pathogens
WO2003062382A2 (en) * 2002-01-16 2003-07-31 Evolutionary Genomics Llc Methods to identify evolutionarily significant changes in polynucleotide and polypeptide sequences in domesticated plants and animals

Also Published As

Publication number Publication date
AU2006230352A1 (en) 2006-10-05
IL186135A0 (en) 2008-01-20
JP2008537881A (ja) 2008-10-02
EP1863335A4 (en) 2009-10-14
KR20080004538A (ko) 2008-01-09
WO2006105277A2 (en) 2006-10-05
CA2602337A1 (en) 2006-10-05
WO2006105277A3 (en) 2009-04-09
US20110083229A1 (en) 2011-04-07
US20060225153A1 (en) 2006-10-05
EP1863335A2 (en) 2007-12-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR101268896B1 (ko) 옥수수 이벤트 ｍｉｒ604
CN102057045B (zh) 转基因糖用甜菜植物
US20040025202A1 (en) Nucleic acid molecules associated with oil in plants
Wang et al. Fine mapping and candidate gene analysis of purple pericarp gene Pb in rice (Oryza sativa L.)
UA115768C2 (uk) Спосіб підвищення стійкості рослини до абіотичного стресу
AU2012242991B2 (en) Identification and the use of KRP mutants in plants
EP2514304A1 (en) Cucurbita plant resistant to potyvirus
BRPI0609602A2 (pt) polinucleotìdeos eg117 e eg307 e seus usos
CN110407922B (zh) 水稻耐冷基因qSCT11及其应用
CA3160843A1 (en) Puccinia resistance gene
Wang et al. Identification of an AFLP marker and conversion to a SCAR marker to identify cytoplasmic male-sterile or normal cytoplasm in Welsh onion (Allium fistulosum L.)
Effertz et al. Rpt5 encodes a receptor-like protein that provides broad and effective net form net blotch (Pyrenophora teres f. teres) resistance in barley
CN111499713B (zh) 水稻粒型基因qGL6-2及其应用
Sasaki et al. Where does the accurate rice genome sequence lead us?
BRPI0615429A2 (pt) polinucleotìdeos eg8798 e eg9703 e seus usos
CN116463358A (zh) 一个芝麻含油量调控基因SiNAC1及其检测引物对
CN118773209A (zh) 小麦籽粒蛋白质含量基因TaGPC-6A及其编码蛋白和应用
Alameldin et al. DEVELOPMENT OF A FUSARIUM HEAD BLIGHT (FHB) RESISTANT WHEAT VIA THE OVER-ACTIVATIONS OF TWO WHEAT NATIVE TRANSGENES
CN108409845A (zh) 蛋白质TaNRT2.5在调控植物对氮肥利用效率中的应用
US20110173723A1 (en) EG82013 and EG81345 Nucleic Acids and Uses Thereof
CN101501192A (zh) Eg8798和eg9703多核苷酸和其用途

Legal Events

Date Code Title Description
B08F Application dismissed because of non-payment of annual fees [chapter 8.6 patent gazette]

Free format text: REFERENTE A 7A ANUI DADE.

B08F Application dismissed because of non-payment of annual fees [chapter 8.6 patent gazette]

Free format text: REFERENTE A 7A ANUI DADE.

B08K Patent lapsed as no evidence of payment of the annual fee has been furnished to inpi [chapter 8.11 patent gazette]

Free format text: REFERENTE AO DESPACHO 8.6 PUBLICADO NA RPI 2213 DE 04/06/2013.