BR112020012763A2 - Genes pesticidas e métodos de uso - Google Patents

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BR112020012763A2
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Kira Bulazel Roberts
Rebecca E. Thayer
Jessica Parks
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AgBiome, Inc.
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Abstract

são fornecidas composições com atividade pesticida e métodos para sua utilização. as composições incluem sequências de polipeptídeos isoladas e recombinantes com atividade pesticida, moléculas de ácido nucleico recombinantes e sintéticas que codificam os polipeptídeos pesticidas, construtos de dna compreendendo as moléculas de ácido nucleico, vetores compreendendo as moléculas de ácido nucleico, células hospedeiras compreendendo os vetores, além de anticorpos para os polipeptídeos pesticidas. as sequências de nucleotídeos que codificam os polipeptídeos aqui fornecidos podem ser utilizadas em construtos de dna ou em cassetes de expressão para a transformação e a expressão em organismos de interesse. as composições e métodos aqui fornecidos são úteis para a produção de organismos com maior resistência ou tolerância a pragas. também são fornecidas plantas e sementes transgênicas que compreendem uma sequência de nucleotídeos que codifica uma proteína pesticida da invenção. são fornecidos métodos para produzir os diversos polipeptídeos aqui descritos e para utilizar esses polipeptídeos para controlar ou matar uma praga. também são incluídos métodos e kits para detectar polipeptídeos da invenção em uma amostra.

Description

"GENES PESTICIDAS E MÉTODOS DE USO" CAMPO DA INVENÇÃO
[0001] A invenção se refere a métodos e composições para o controle de pragas, particularmente pragas de plantas.
ANTECEDENTES
[0002] Pragas, doenças de plantas e ervas daninhas podem representar graves ameaças aos cultivos. Os prejuízos causados por pragas e doenças foram estimados em 37% da produção agrícola mundial, e 13% se deve a insetos, bactérias e outros organismos.
[0003] As toxinas são determinantes de virulência que desempenham um papel importante na patogenicidade microbiana e/ou na evasão da resposta imune do hospedeiro. Toxinas da bactéria Gram-positiva Bacillus, em particular Bacillus thuringensis, foram utilizadas como proteínas inseticidas. As estratégias atuais utilizam os genes que expressam essas toxinas para produzir cultivos transgênicos. Os cultivos transgênicos que expressam toxinas de proteínas inseticidas são utilizados para proteger os cultivos dos danos causados por insetos.
[0004] Embora o uso de toxinas de Bacillus tenha sido eficaz para controlar insetos, algumas pragas-alvo desenvolveram resistência às toxinas Bt em diversas partes do mundo onde essas toxinas foram utilizadas intensivamente. Uma maneira de resolver esse problema é semeando cultivos Bt com fileiras alternadas de cultivos comuns que não sejam Bt (refúgio). Um método alternativo para evitar ou retardar o desenvolvimento de resistência nos insetos é o empilhamento de genes inseticidas com diferentes modos de ação contra insetos em plantas transgênicas. A estratégia atual de utilizar cultivos transgênicos que expressem toxinas de proteínas inseticidas coloca cada vez mais ênfase na descoberta de novas toxinas, além daquelas que já derivam da bactéria Bacillus thuringiensis. Novas toxinas podem ser úteis como alternativas àquelas derivadas da B. thuringiensis para serem aplicadas a plantas transgênicas resistentes a insetos e pragas. Portanto, são necessárias novas proteínas de toxina.
SUMÁRIO
[0005] São fornecidas composições com atividade pesticida e métodos para sua utilização. As composições incluem sequências de polipeptídeos isoladas e recombinantes com atividade pesticida, moléculas de ácido nucleico recombinantes e sintéticas que codificam os polipeptídeos pesticidas, construtos de DNA compreendendo as moléculas de ácido nucleico, vetores compreendendo as moléculas de ácido nucleico, células hospedeiras compreendendo os vetores, além de anticorpos para os polipeptídeos pesticidas. As sequências de nucleotídeos que codificam os polipeptídeos aqui fornecidos podem ser utilizadas em construtos de DNA ou em cassetes de expressão para a transformação e a expressão em organismos de interesse, incluindo micro-organismos e plantas.
[0006] As composições e métodos aqui fornecidos são úteis para a produção de organismos com maior resistência ou tolerância a pragas. Esses organismos e as composições que compreendem os organismos são desejáveis para fins agrícolas. Também são fornecidas plantas e sementes transgênicas que compreendem uma sequência de nucleotídeos que codifica uma proteína pesticida da invenção. Essas plantas são resistentes a insetos e a outras pragas.
[0007] São fornecidos métodos para produzir os diversos polipeptídeos aqui descritos e para utilizar esses polipeptídeos para controlar ou matar uma praga. Também são incluídos métodos e kits para detectar polipeptídeos da invenção em uma amostra.
DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO
[0008] As presentes invenções serão descritas mais completamente daqui em diante com referência às figuras associadas, nas quais algumas, mas não todas, as formas de realização das invenções são ilustradas. De fato, estas invenções podem ser configuradas de muitas formas diferentes e não devem entender-se como limitadas às formas de realização aqui apresentadas; na verdade, estas formas de realização são proporcionadas para que a presente divulgação satisfaça os requisitos legais aplicáveis. Números similares se referem a elementos similares ao longo deste documento.
[0009] Muitas modificações e outras formas de realização das invenções aqui apresentadas virão à mente dos especialistas na técnica à qual estas invenções pertencem, com o benefício dos ensinamentos apresentados nas descrições anteriores e em suas correspondentes figuras. Portanto, deve-se entender que as invenções não se limitam às formas de realização específicas descritas e que modificações e outras formas de realização supõem-se incluídas no escopo das reivindicações em anexo. Embora sejam empregados termos específicos, estes são utilizados em sentido meramente genérico e descritivo e não com fins de limitação. I. Polinucleotídeos e polipeptídeos
[0010] São fornecidos composições e método para conferir atividade pesticida a um organismo. O organismo modificado exibe resistência ou tolerância a pragas. São fornecidas proteínas pesticidas recombinantes, ou polipeptídeos e seus fragmentos e variantes que retenham atividade pesticida, incluindo os apresentados nas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265,
266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, e/ou 310. As proteínas pesticidas são biologicamente ativas (por exemplo, são pesticidas) contra pragas como insetos, fungos, nematoides e semelhantes.
Os nucleotídeos que codificam os polipeptídeos pesticidas, incluindo, por exemplo, SEQ ID NOS: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272,
273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312. ou seus fragmentos ou variantes ativas, podem ser utilizados para produzir organismos transgênicos, como plantas e micro-organismos.
As proteínas pesticidas são biologicamente ativas (por exemplo, são pesticidas) contra pragas como insetos, fungos, nematoides e semelhantes.
Em formas de realização específicas, os polipeptídeos pesticidas e a variante ativa e seus fragmentos têm uma atividade pesticida melhorada quando comparados com outros polipeptídeos na técnica.
Os polinucleotídeos que codificam os polipeptídeos pesticidas, incluindo, por exemplo, SEQ ID NOS: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209,
210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312, ou seus fragmentos ou variantes ativas, podem ser utilizados para produzir organismos transgênicos, como plantas e micro-organismos.
Os organismos transformados são caracterizados por genomas que compreendem pelo menos um construto de DNA incorporado de forma estável compreendendo uma sequência de codificação para uma proteína pesticida aqui descrita.
Em algumas configurações, a sequência de codificação está operacionalmente ligada a um promotor que conduz a expressão do polipeptídeo pesticida codificado.
Consequentemente, são fornecidos micro-organismos, células vegetais, tecidos vegetais, plantas, sementes e partes de plantas transformadas.
Um resumo de vários polipeptídeos, suas variantes e fragmentos ativos e polinucleotídeos que codificam os mesmos são apresentados a seguir no Quadro 1. Conforme observado no Quadro 1, são fornecidas várias formas de polipeptídeos.
São fornecidos polipeptídeos pesticidas de comprimento total, bem como versões modificadas da sequência de comprimento total original (chamadas de variantes). O Quadro 1 também indica as sequências “CryBP1”. Essas sequências (SEQ ID NOS: 22, 24, 84, e 236) compreendem polipeptídeos acessórios que podem ser associados a alguns dos genes da toxina.
Nesses casos, as sequências CryBP1 podem ser utilizadas sozinhas ou em combinação com qualquer um dos polipeptídeos pesticidas aqui fornecidos.
O Quadro 1 também fornece polipeptídeos C-terminal Split-Cry.
Essas sequências compreendem a sequência de uma proteína posterior que possui homologia com a extremidade C-terminal da classe Cry de genes de toxinas e geralmente são encontradas após um gene Cry que não é de comprimento total e que não exibe a região C-terminal esperada.
Quadro 1. Resumo das SEQ ID NOs, classe de genes e suas variantes APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00766.0 1 2 Vip4 60,65,70,75, 75,80,85,90,91, APG01474.0 (55.49% de identidade, 80,85,90,91, 92,93,94,95,96, 71.14% de similaridade) 92,93,94,95, 97,98,99,100 APG04069.0 (55.44% de identidade, 96,97,98,99, 71.36% de similaridade) 100 APG02585.0 (55.21% de identidade,
71.24% de similaridade) CA_2844913-129 (52.27% de identidade, 68.08% de similaridade) CA_2844913-130 (52.27% de identidade, 68.08% de similaridade) APG02031.0 (51.92% de identidade,
66.57% de similaridade) WP_087876282.1 (51.73% de identidade, 66.22% de similaridade) WP_016123960.1 (51.53% de identidade, 66.38% de similaridade) APG07032.0 (51.24% de identidade,
67.21% de similaridade) WP_088113050.1 (50.73% de identidade, 64.28% de similaridade) APG00963.0 3 MTX 45,50,55,60, 60,65,70,75,80, US_9328356_B2-50 (40.38% de 65,70,75,80, 85,90,91,92,93, identidade, 59.62% de similaridade) 85,90,91,92, 94,95,96,97,98, US_2003_0049243_A1-37 (36.08% 93,94,95,96, 99,100 de identidade, 56.96% de 97,98,99,100 similaridade) APG01017.0 4 5 MTX 94,95,96,97,98, WP_086390045.1 (94.5% de 99,100 identidade, 98.38% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00495.0 US_2017_0175134_A1-12 (91.1% de identidade, 93.25% de similaridade) APG05183.0 (79.29% de identidade,
87.06% de similaridade) WP_016099228.1 (78.96% de identidade, 86.73% de similaridade) APG02007.0 (76.45% de identidade, 92,93,94,95, 85.81% de similaridade) 96,97,98,99, WP_088114034.1 (72.49% de 100 identidade, 81.88% de similaridade) APG03898.0 (71.82% de identidade,
80.91% de similaridade) APG09869.0 (71.43% de identidade,
78.87% de similaridade) APG00765.0 (70.92% de identidade,
79.53% de similaridade) APG06727.0 (68.38% de identidade,
76.64% de similaridade) APG01146.0 6 7 Cry 30,35,40,45, 45,50,55,60,65, APG03045.0 (32.42% de identidade, 50,55,60,65, 70,75,80,85,90, 50.85% de similaridade) 70,75,80,85, 91,92,93,94,95, APG05915.0 (28.4% de identidade, 90,91,92,93, 96,97,98,99,100 45.71% de similaridade) 94,95,96,97, APG09947.0 (25.43% de identidade, 98,99,100 42.04% de similaridade) APG01148.0 8 9 MTX 40,45,50,55, 55,60,65,70,75, APG03638.0 (35.22% de identidade, 60,65,70,75, 80,85,90,91,92, 50.81% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 80,85,90,91, 93,94,95,96,97, OOR71217.1 (35.22% de identidade, 92,93,94,95, 98,99,100 50.81% de similaridade) 96,97,98,99, APG08605.0 (34.95% de identidade, 100 50.81% de similaridade) WP_075716873.1 (34.83% de identidade, 50.4% de similaridade) WP_075718639.1 (34.83% de identidade, 49.87% de similaridade) APG02951.0 (33.6% de identidade,
49.34% de similaridade) APG03848.0 (33.59% de identidade,
49.22% de similaridade) APG08547.0 (31.82% de identidade,
48.3% de similaridade) APG00414.0 US_2016_0355842_A1-81 (31.71% de identidade, 44.76% de similaridade) APG00995.0 US_2016_0355842_A1-200 (31.71% de identidade, 44.25% de similaridade) APG01212.0 10 Cry 45,50,55,60, 60,65,70,75,80, APG00626.0 65,70,75,80, 85,90,91,92,93, US_2016_0366881_A1-124 (43.81% 85,90,91,92, 94,95,96,97,98, de identidade, 57.12% de 93,94,95,96, 99,100 similaridade) 97,98,99,100 APG02807.0 (42.86% de identidade,
60.71% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG06997.0 (36.52% de identidade,
53.43% de similaridade) APG01679.0 (33.86% de identidade,
49.53% de similaridade) WP_048536362.1 (33.86% de identidade, 49.53% de similaridade) APG09007.0 (33.44% de identidade,
52.3% de similaridade) APG09140.0 (32.3% de identidade,
47.98% de similaridade) APG08681.0 (31.1% de identidade,
47.41% de similaridade) WP_048536324.1 (31.1% de identidade, 47.41% de similaridade) APG00285.0 US_2016_0311864_A1-118 (30.86% de identidade, 45.4% de similaridade) APG01267.0 11 MTX 65,70,75,80, 75,80,85,90,91, APG04345.0 (61.9% de identidade, 85,90,91,92, 92,93,94,95,96, 74.4% de similaridade) 93,94,95,96, 97,98,99,100 APG00686.0 97,98,99,100 US_2016_0355842_A1-159 (61.49% de identidade, 74.63% de similaridade) APG01488.0 (60.83% de identidade,
73.59% de similaridade) APG04812.0 (35.73% de identidade,
51.8% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG04990.0 (35.64% de identidade,
52.49% de similaridade) APG00860.0 US_2016_0355842_A1-180 (33.33% de identidade, 47.92% de similaridade) APG03101.0 (30.14% de identidade,
43.66% de similaridade) APG03324.0 (29.81% de identidade,
44.57% de similaridade) APG00323.0 US_2016_0355842_A1-60 (28.97% de identidade, 43.73% de similaridade) APG00586.0 US_2016_0355842_A1-135 (28.89% de identidade, 43.61% de similaridade) APG01290.0 12 13 Cry 80,85,90,91, 85,90,91,92,93, APG09877.0 (75.47% de identidade, 92,93,94,95, 94,95,96,97,98, 82.93% de similaridade) 96,97,98,99, 99,100 APG06421.0 (74.29% de identidade, 100 82.1% de similaridade) US_9567381_B2-383 (51.13% de identidade, 64.62% de similaridade) APG01992.0 (41.0% de identidade,
53.47% de similaridade) US_9567381_B2-419 (39.27% de identidade, 51.64% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03236.0 (39.25% de identidade,
52.25% de similaridade) US_9567381_B2-373 (39.22% de identidade, 50.0% de similaridade) AJW76683.1 (38.92% de identidade,
51.16% de similaridade) CA_2516349-26 (36.87% de identidade, 48.12% de similaridade) CA_2516349-27 (36.74% de identidade, 48.12% de similaridade) APG01483.0 14 15,16 MTX 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, WP_042642875.1 (93.54% de 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, identidade, 95.11% de similaridade) 97,98,99,100 100 AAC44637.1 (90.61% de identidade,
93.54% de similaridade) WP_025325471.1 (90.41% de identidade, 93.74% de similaridade) WP_043157658.1 (84.93% de identidade, 91.0% de similaridade) WP_043134936.1 (81.6% de identidade, 89.04% de similaridade) WP_011704412.1 (81.6% de identidade, 88.85% de similaridade) WP_024945663.1 (81.6% de identidade, 88.65% de similaridade) WP_085734331.1 (81.6% de identidade, 88.65% de similaridade) CA_2630559-4 (81.41% de identidade, 89.24% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_065401927.1 (81.41% de identidade, 89.04% de similaridade) APG01561.0 17 MTX 65,70,75,80, 80,85,90,91,92, US_8829279_B2-27 (63.11% de 85,90,91,92, 93,94,95,96,97, identidade, 76.37% de similaridade) 93,94,95,96, 98,99,100 APG02280.0 (59.71% de identidade, 97,98,99,100 71.88% de similaridade) US_8829279_B2-37 (58.29% de identidade, 70.17% de similaridade) US_8318900_B2-63 (58.19% de identidade, 72.32% de similaridade) APG00846.0 US_2016_0355842_A1-177 (58.17% de identidade, 73.07% de similaridade) APG00513.0 US_2017_0175134_A1-14 (57.55% de identidade, 70.66% de similaridade) APG05506.0 (56.15% de identidade,
70.95% de similaridade) APG03760.0 (54.15% de identidade,
69.05% de similaridade) APG05634.0 (53.09% de identidade,
67.13% de similaridade) APG00609.0 US_2017_0175134_A1-57 (52.71% de identidade, 66.67% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG01571.0 18 19 Cry 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, US_8759619_B2-19 (84.0% de 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, identidade, 88.13% de similaridade) 97,98,99,100 100 US_8461421_B2-98 (69.27% de identidade, 79.36% de similaridade) US_8318900_B2-82 (66.43% de identidade, 76.89% de similaridade) ADK66923.1 (66.33% de identidade,
77.19% de similaridade) US_8461421_B2-91 (65.62% de identidade, 76.09% de similaridade) APG00941.0 (65.15% de identidade,
75.23% de similaridade) APG05930.0 (64.76% de identidade,
74.9% de similaridade) APG00673.0 US_2017_0175134_A1-93 (64.04% de identidade, 73.8% de similaridade) APG00974.0 (63.18% de identidade,
74.81% de similaridade) APG00310.0 US_2016_0366881_A1-4 (61.5% de identidade, 72.22% de similaridade) APG01611.0 20 21, 299, 300 22 Bin 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, APG00722.0 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, US_2017_0175134_A1-136 (74.49% 95,96,97,98, 99,100 de identidade, 84.31% de 99, 100 similaridade) US_8461421_B2-69 (64.61% de identidade, 75.98% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene CA_2844913-40 (63.24% de identidade, 70.2% de similaridade) APG00151.0 US_2016_0304898_A1-174 (63.21% de identidade, 74.74% de similaridade) APG00340.0 US_2016_0311864_A1-141 (61.41% de identidade, 73.12% de similaridade) APG09805.0 (35.54% de identidade,
44.71% de similaridade) WP_087949412.1 (33.98% de identidade, 43.21% de similaridade) APG00222.0 US_2016_0304898_A1-203 (33.31% de identidade, 42.59% de similaridade) CA_2844913-48 (33.26% de identidade, 40.88% de similaridade) APG06942.0 (33.04% de identidade,
40.9% de similaridade) APG01634.0 23 24 Cry 50,55,60,65, 65,70,75,80,85, WP_016099738.1 (54.76% de 70,75,80,85, 90,91,92,93,94, identidade, 71.61% de similaridade) 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, US_8318900_B2-111 (46.79% de 94,95,96,97, 100 identidade, 60.34% de similaridade) 98,99,100 US_8318900_B2-80 (46.46% de identidade, 59.92% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG09227.0 (41.38% de identidade,
57.49% de similaridade) APG07799.0 (40.75% de identidade,
56.19% de similaridade) US_8461415_B2-28 (39.55% de identidade, 53.39% de similaridade) US_8461415_B2-1 (37.99% de identidade, 52.26% de similaridade) APG03124.0 (32.84% de identidade,
48.03% de similaridade) CA_2516349-7 (32.69% de identidade, 45.64% de similaridade) US_8318900_B2-83 (32.41% de identidade, 45.8% de similaridade) CA_2516349-9 (32.41% de identidade, 44.97% de similaridade) APG01652.0 25 Cry 50,55,60,65, 60,65,70,75,80, US_8461421_B2-168 (46.84% de 70,75,80,85, 85,90,91,92,93, identidade, 58.65% de similaridade) 90,91,92,93, 94,95,96,97,98, US_8318900_B2-141 (43.35% de 94,95,96,97, 99,100 identidade, 58.09% de similaridade) 98,99,100 US_8759619_B2-30 (42.43% de identidade, 57.0% de similaridade) EJR94750.1 (42.13% de identidade,
55.25% de similaridade) US_8318900_B2-143 (40.46% de identidade, 54.77% de similaridade) US_8759619_B2-20 (39.66% de identidade, 53.49% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_9695440_B2-14 (39.63% de identidade, 53.12% de similaridade) US_9695440_B2-13 (38.91% de identidade, 52.16% de similaridade) US_8759619_B2-28 (38.74% de identidade, 53.34% de similaridade) US_8461421_B2-214 (38.15% de identidade, 50.41% de similaridade) APG01682.0 26 Cry 65,70,75,80, 80,85,90,91,92, APG00179.0 85,90,91,92, 93,94,95,96,97, US_2016_0304898_A1-186 (63.22% 93,94,95,96, 98,99,100 de identidade, 75.43% de 97,98,99,100 similaridade) US_2016_0017363_A1-27 (63.07% de identidade, 75.29% de similaridade) US_2016_0017363_A1-28 (55.46% de identidade, 65.95% de similaridade) US_2016_0017363_A1-29 (54.89% de identidade, 65.37% de similaridade) US_2016_0017363_A1-30 (54.74% de identidade, 65.23% de similaridade) US_2016_0017363_A1-31 (53.88% de identidade, 64.37% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00504.0 US_2016_0366881_A1-99 (43.13% de identidade, 47.24% de similaridade) APG04415.0 (37.41% de identidade,
51.46% de similaridade) APG03498.0 (37.17% de identidade,
44.09% de similaridade) APG00189.0 US_2016_0311864_A1-59 (36.49% de identidade, 52.92% de similaridade) APG01761.0 27 MTX 95,96,97,98, 98,99,100 APG00450.0 99,100 US_2016_0366881_A1-72 (94.08% de identidade, 97.04% de similaridade) US_9567381_B2-446 (90.16% de identidade, 94.43% de similaridade) APG05804.0 (81.97% de identidade,
86.56% de similaridade) APG06492.0 (80.98% de identidade,
86.56% de similaridade) APG00501.0 US_2016_0366881_A1-96 (64.17% de identidade, 68.08% de similaridade) US_8461415_B2-57 (43.83% de identidade, 62.34% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00987.0 US_2016_0366881_A1-223 (43.41% de identidade, 63.67% de similaridade) APG00346.0 US_2016_0366881_A1-24 (42.02% de identidade, 57.65% de similaridade) APG00697.0 US_2016_0366881_A1-222 (41.69% de identidade, 57.98% de similaridade) APG00506.0 US_2016_0366881_A1-102 (41.32% de identidade, 62.15% de similaridade) APG01808.0 28 30,29 MTX 65,70,75,80, 70,75,80,85,90, APG08693.0 (62.95% de identidade, 85,90,91,92, 91,92,93,94,95, 69.92% de similaridade) 93,94,95,96, 96,97,98,99,100 WP_086410936.1 (62.95% de 97,98,99,100 identidade, 69.92% de similaridade) WP_086409311.1 (43.99% de identidade, 59.02% de similaridade) APG00364.0 US_2016_0366881_A1-35 (43.72% de identidade, 59.02% de similaridade) APG04781.0 (40.52% de identidade,
54.29% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8318900_B2-75 (40.27% de identidade, 53.33% de similaridade) APG02884.0 (39.21% de identidade,
55.0% de similaridade) US_8318900_B2-76 (38.1% de identidade, 51.32% de similaridade) APG00858.0 (37.78% de identidade,
53.89% de similaridade) APG03543.0 (37.5% de identidade,
53.53% de similaridade) APG01877.0 31 32 Cry 35,40,45,50, 50,55,60,65,70, APG00266.0 55,60,65,70, 75,80,85,90,91, US_2016_0311864_A1-105 (33.17% 75,80,85,90, 92,93,94,95,96, de identidade, 47.76% de 91,92,93,94, 97,98,99,100 similaridade) 95,96,97,98, APG00396.0 99,100 US_2016_0311864_A1-163 (29.7% de identidade, 43.86% de similaridade) APG09441.0 (28.83% de identidade,
43.54% de similaridade) APG00288.0 US_2016_0311864_A1-122 (28.59% de identidade, 42.16% de similaridade) APG09713.0 (28.15% de identidade,
42.92% de similaridade) APG03573.0 (27.99% de identidade,
40.54% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG08243.0 (27.64% de identidade,
44.55% de similaridade) APG00043.0 US_2016_0304898_A1-69 (27.46% de identidade, 40.55% de similaridade) APG07069.0 (27.44% de identidade,
40.24% de similaridade) US_8461415_B2-45 (27.34% de identidade, 41.72% de similaridade) APG01892.0 33 34 MTX 35,40,45,50, 55,60,65,70,75, APG00940.0 55,60,65,70, 80,85,90,91,92, US_2016_0355842_A1-191 (32.98% 75,80,85,90, 93,94,95,96,97, de identidade, 52.62% de 91,92,93,94, 98,99,100 similaridade) 95,96,97,98, APG03055.0 (32.12% de identidade, 99,100 52.33% de similaridade) APG09864.0 (27.11% de identidade,
44.19% de similaridade) APG01985.0 35 36 Cry 90,91,92,93, 92,93,94,95,96, APG04325.0 (97.42% de identidade, 94,95,96,97, 97,98,99,100 98.85% de similaridade) 98,99,100 APG04689.0 (86.94% de identidade,
91.97% de similaridade) WP_006919322.1 (86.94% de identidade, 91.97% de similaridade) APG00086.0 US_2016_0304898_A1-113 (69.58% de identidade, 82.07% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_006922195.1 (60.8% de identidade, 73.53% de similaridade) APG00122.0 US_2016_0304898_A1-143 (60.49% de identidade, 73.32% de similaridade) APG07751.0 (59.77% de identidade,
72.29% de similaridade) APG00057.0 US_2016_0304898_A1-88 (34.19% de identidade, 49.39% de similaridade) WP_006927245.1 (33.73% de identidade, 51.0% de similaridade) APG01135.0 (31.72% de identidade,
47.17% de similaridade) APG02088.0 37 38 MTX 35,40,45,50, 55,60,65,70,75, APG07824.0 (79.07% de identidade, 55,60,65,70, 80,85,90,91,92, 87.38% de similaridade) 75,80,85,90, 93,94,95,96,97, APG05918.0 (33.75% de identidade, 91,92,93,94, 98,99,100 53.0% de similaridade) 95,96,97,98, APG00598.0 99,100 US_2016_0355842_A1-140 (33.43% de identidade, 51.98% de similaridade) APG06880.0 (31.66% de identidade,
48.52% de similaridade) APG07983.0 (30.22% de identidade,
45.48% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02633.0 (28.99% de identidade,
50.16% de similaridade) APG00236.0 US_2016_0355842_A1-32 (27.74% de identidade, 46.95% de similaridade) APG02109.0 39 40 Cry 65,70,75,80, 75,80,85,90,91, US_8461421_B2-264 (63.63% de 85,90,91,92, 92,93,94,95,96, identidade, 74.13% de similaridade) 93,94,95,96, 97,98,99,100 WP_088125814.1 (63.63% de 97,98,99,100 identidade, 74.02% de similaridade) US_8461421_B2-140 (61.84% de identidade, 72.05% de similaridade) APG06056.0 (58.29% de identidade,
71.25% de similaridade) APG08350.0 (58.01% de identidade,
70.2% de similaridade) APG00534.0 US_2017_0175134_A1-22 (45.87% de identidade, 61.5% de similaridade) WP_002169796.1 (44.37% de identidade, 57.41% de similaridade) APG00120.0 US_2016_0177333_A1-68 (44.29% de identidade, 57.76% de similaridade) US_9567381_B2-376 (43.05% de identidade, 59.66% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8461421_B2-94 (42.77% de identidade, 57.63% de similaridade) APG02139.0 41 MAC 70,75,80,85, 85,90,91,92,93, APG05669.0 (69.16% de identidade, PF 90,91,92,93, 94,95,96,97,98, 81.58% de similaridade) 94,95,96,97, 99,100 WO_2017_023486-679 (34.17% de 98,99,100 identidade, 53.25% de similaridade) WO_2017_023486-575 (34.04% de identidade, 52.64% de similaridade) WO_2017_023486-72 (34.03% de identidade, 53.99% de similaridade) WO_2017_023486-74 (34.03% de identidade, 53.99% de similaridade) WO_2017_023486-2 (33.89% de identidade, 53.77% de similaridade) WO_2017_023486-90 (33.89% de identidade, 53.14% de similaridade) WO_2017_023486-92 (33.89% de identidade, 53.14% de similaridade) WO_2017_023486-533 (33.75% de identidade, 52.62% de similaridade) WO_2017_023486-588 (33.75% de identidade, 52.62% de similaridade) APG02346.0 42 43 MTX 97,98,99,100 98,99,100 APG07114.0 (96.67% de identidade,
97.58% de similaridade) APG02531.0 (95.58% de identidade,
95.87% de similaridade) APG06422.0 (90.61% de identidade,
91.21% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG04067.0 (69.67% de identidade,
83.18% de similaridade) APG05428.0 (33.25% de identidade,
48.57% de similaridade) APG01044.0 (33.05% de identidade,
49.43% de similaridade) APG00156.0 US_2016_0355842_A1-6 (32.28% de identidade, 50.13% de similaridade) APG05384.0 (32.04% de identidade,
50.55% de similaridade) APG02577.0 (31.17% de identidade,
49.87% de similaridade) APG06912.0 (30.85% de identidade,
51.52% de similaridade) APG02391.0 44 45 Cry 98,99,100 99,100 APG00070.0 US_2016_0177333_A1-37 (97.77% de identidade, 98.71% de similaridade) US_8759619_B2-13 (90.55% de identidade, 93.19% de similaridade) US_8759619_B2-14 (48.8% de identidade, 49.48% de similaridade) CA_2595901-4 (47.0% de identidade, 59.86% de similaridade) CA_2595901-2 (43.94% de identidade, 56.91% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00080.0 US_2016_0304898_A1-101 (42.6% de identidade, 49.06% de similaridade) US_8759619_B2-17 (34.95% de identidade, 48.36% de similaridade) US_8759619_B2-3 (34.95% de identidade, 48.36% de similaridade) US_8759619_B2-15 (34.1% de identidade, 49.77% de similaridade) APG00001.0 US_2016_0304898_A1-1 (33.1% de identidade, 49.14% de similaridade) APG02422.0 46 Bin 80,85,90,91, 85,90,91,92,93, APG00925.0 92,93,94,95, 94,95,96,97,98, US_2016_0311864_A1-227 (76.67% 96,97,98,99, 99,100 de identidade, 84.89% de 100 similaridade) APG00369.0 US_2016_0311864_A1-149 (73.89% de identidade, 83.41% de similaridade) APG00262.0 US_2016_0311864_A1-101 (66.96% de identidade, 77.01% de similaridade) OFC99037.1 (64.96% de identidade,
73.44% de similaridade) APG00336.0 US_2016_0366881_A1-19 (64.43%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 74.72% de similaridade) APG00282.0 US_2016_0311864_A1-116 (60.18% de identidade, 68.01% de similaridade) APG00308.0 US_2016_0311864_A1-135 (59.61% de identidade, 69.21% de similaridade) APG00913.0 US_2016_0311864_A1-226 (59.6% de identidade, 72.41% de similaridade) APG02761.0 (59.47% de identidade,
72.03% de similaridade) APG00320.0 US_2016_0311864_A1-140 (58.94% de identidade, 70.2% de similaridade) APG02533.0 47 48 Cry 60,65,70,75, 70,75,80,85,90, APG09282.0 (65.83% de identidade, 80,85,90,91, 91,92,93,94,95, 75.82% de similaridade) 92,93,94,95, 96,97,98,99,100 APG00787.0 96,97,98,99, US_2017_0175134_A1-156 (56.62% 100 de identidade, 66.06% de similaridade) APG00471.0 US_2016_0366881_A1-85 (52.37% de identidade, 65.7% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene KXH80331.1 (50.51% de identidade,
60.76% de similaridade) WP_082770008.1 (49.08% de identidade, 59.03% de similaridade) APG00232.0 US_2016_0311864_A1-87 (47.95% de identidade, 60.09% de similaridade) APG00723.0 US_2016_0311864_A1-209 (46.19% de identidade, 57.55% de similaridade) APG09630.0 (45.77% de identidade,
55.67% de similaridade) APG05689.0 (44.85% de identidade,
55.76% de similaridade) APG05439.0 (44.71% de identidade,
56.04% de similaridade) APG02548.0 49 MTX 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, APG05358.0 (87.46% de identidade, 94,95,96,97, 100 94.21% de similaridade) 98,99,100 APG00360.0 US_2016_0355842_A1-69 (44.11% de identidade, 58.61% de similaridade) US_9328356_B2-46 (42.07% de identidade, 57.01% de similaridade) US_9567381_B2-441 (42.07% de identidade, 56.71% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00332.0 US_2016_0355842_A1-64 (41.69% de identidade, 59.87% de similaridade) APG02068.0 (41.36% de identidade,
60.49% de similaridade) APG00907.0 US_2016_0311864_A1-225 (41.03% de identidade, 57.14% de similaridade) US_8318900_B2-191 (39.88% de identidade, 55.59% de similaridade) APG08689.0 (39.82% de identidade,
57.23% de similaridade) APG00112.0 US_2016_0311864_A1-23 (39.81% de identidade, 57.68% de similaridade) APG02568.0 50 51 MTX 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, WP_086424228.1 (100.0% de 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, identidade, 100.0% de similaridade) 97,98,99,100 100 WP_086423658.1 (81.31% de identidade, 89.1% de similaridade) APG02401.0 (80.67% de identidade,
89.88% de similaridade) WP_018673409.1 (80.67% de identidade, 89.88% de similaridade) APG02701.0 (80.67% de identidade,
87.42% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00851.0 US_2016_0311864_A1-222 (80.37% de identidade, 88.47% de similaridade) WP_061663532.1 (80.37% de identidade, 88.47% de similaridade) APG00585.0 US_2016_0366881_A1-116 (80.06% de identidade, 88.96% de similaridade) WP_094701865.1 (79.75% de identidade, 88.96% de similaridade) APG06560.0 (77.33% de identidade,
87.58% de similaridade) APG02667.0 52 53 Cry 30,35,40,45, 45,50,55,60,65, CA_2844913-183 (26.56% de 50,55,60,65, 70,75,80,85,90, identidade, 44.11% de similaridade) 70,75,80,85, 91,92,93,94,95, 90,91,92,93, 96,97,98,99,100 94,95,96,97, 98,99,100 APG02743.0 54 55 Bin 90,91,92,93, 94,95,96,97,98, APG00403.0 94,95,96,97, 99,100 US_2016_0355842_A1-78 (88.95% 98,99,100 de identidade, 93.06% de similaridade) APG03187.0 (86.63% de identidade,
92.29% de similaridade) US_8461421_B2-5 (50.76% de identidade, 65.23% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8461421_B2-65 (50.76% de identidade, 65.23% de similaridade) US_8461421_B2-146 (42.53% de identidade, 54.64% de similaridade) WP_088023748.1 (33.18% de identidade, 52.4% de similaridade) WP_065486893.1 (31.2% de identidade, 51.11% de similaridade) US_8461421_B2-67 (29.57% de identidade, 48.56% de similaridade) WP_088023751.1 (27.79% de identidade, 42.37% de similaridade) US_8461421_B2-4 (27.73% de identidade, 44.55% de similaridade) US_8461421_B2-64 (27.73% de identidade, 44.55% de similaridade) APG02790.0 56 57 Cyt 50,55,60,65, 65,70,75,80,85, AJW76686.1 (50.0% de identidade, 70,75,80,85, 90,91,92,93,94, 65.65% de similaridade) 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, US_5302387_A-2 (49.48% de 94,95,96,97, 100 identidade, 64.6% de similaridade) 98,99,100 WP_088071735.1 (46.88% de identidade, 63.19% de similaridade) US_9567381_B2-1427 (46.69% de identidade, 64.11% de similaridade) US_9567381_B2-1429 (46.69% de identidade, 64.11% de similaridade) US_9567381_B2-522 (46.69% de identidade, 63.76% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene AGT15589.1 (46.69% de identidade,
63.41% de similaridade) US_9567381_B2-1430 (46.53% de identidade, 63.19% de similaridade) AFA52539.1 (46.34% de identidade,
63.76% de similaridade) US_2016_0339078_A1-29846 (46.34% de identidade, 63.76% de similaridade) WP_043938803.1 (46.34% de identidade, 63.76% de similaridade) APG02807.0 58 59 Cry 50,55,60,65, 65,70,75,80,85, APG00626.0 70,75,80,85, 90,91,92,93,94, US_2016_0366881_A1-124 (45.38% 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, de identidade, 60.67% de 94,95,96,97, 100 similaridade) 98,99,100 APG01212.0 (42.86% de identidade,
60.55% de similaridade) APG06997.0 (41.07% de identidade,
58.44% de similaridade) US_8318900_B2-90 (37.16% de identidade, 51.37% de similaridade) APG05139.0 (37.14% de identidade,
51.29% de similaridade) APG05103.0 (36.55% de identidade,
51.11% de similaridade) APG01679.0 (36.05% de identidade,
50.16% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_048536362.1 (36.05% de identidade, 50.16% de similaridade) APG09007.0 (35.83% de identidade,
54.67% de similaridade) APG06587.0 (33.8% de identidade,
49.69% de similaridade) APG02835.0 60 61 MTX 30,35,40,45, 45,50,55,60,65, APG04347.0 (43.97% de identidade, 50,55,60,65, 70,75,80,85,90, 56.32% de similaridade) 70,75,80,85, 91,92,93,94,95, ADK08315.1 (36.96% de identidade, 90,91,92,93, 96,97,98,99,100 56.16% de similaridade) 94,95,96,97, APG08633.0 (34.63% de identidade, 98,99,100 49.86% de similaridade) AIK29697.1 (34.22% de identidade,
51.99% de similaridade) KOS27986.1 (33.14% de identidade,
51.87% de similaridade) WP_000052062.1 (32.85% de identidade, 51.87% de similaridade) WP_085783006.1 (32.56% de identidade, 52.45% de similaridade) WP_033647182.1 (32.56% de identidade, 51.59% de similaridade) WP_079230709.1 (30.43% de identidade, 48.7% de similaridade) APG00347.0 US_2016_0366881_A1-25 (27.69% de identidade, 42.47% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_086419993.1 (27.69% de identidade, 42.47% de similaridade) APG02841.0 62 63 Cry 55,60,65,70, 70,75,80,85,90, APG00162.0 75,80,85,90, 91,92,93,94,95, US_2016_0177333_A1-82 (54.32% 91,92,93,94, 96,97,98,99,100 de identidade, 65.96% de 95,96,97,98, similaridade) 99,100 APG08884.0 (44.86% de identidade,
59.49% de similaridade) CA_2516349-7 (41.94% de identidade, 48.93% de similaridade) CA_2516349-38 (41.44% de identidade, 60.22% de similaridade) US_6056953_A-28 (41.44% de identidade, 60.14% de similaridade) AND28677.1 (41.44% de identidade,
60.06% de similaridade) ASO64551.1 (41.42% de identidade,
59.84% de similaridade) US_8865428_B2-88 (41.28% de identidade, 60.06% de similaridade) APG00326.0 US_2017_0175134_A1-1 (41.19% de identidade, 56.97% de similaridade) ABM97547.1 (40.81% de identidade,
59.98% de similaridade) APG02871.0 64 Cry 30,35,40,45, 45,50,55,60,65, WP_061139983.1 (72.14% de 50,55,60,65, 70,75,80,85,90, identidade, 82.26% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 70,75,80,85, 91,92,93,94,95, APG05830.0 (44.91% de identidade, 90,91,92,93, 96,97,98,99,100 56.54% de similaridade) 94,95,96,97, WP_061139982.1 (40.91% de 98,99,100 identidade, 56.49% de similaridade) APG01772.0 (25.29% de identidade,
40.12% de similaridade) APG00250.0 US_2016_0355842_A1-37 (25.26% de identidade, 38.65% de similaridade) WP_017762616.1 (25.15% de identidade, 40.12% de similaridade) APG02884.0 65 66 MTX 65,70,75,80, 75,80,85,90,91, APG04781.0 (61.73% de identidade, 85,90,91,92, 92,93,94,95,96, 73.74% de similaridade) 93,94,95,96, 97,98,99,100 US_8318900_B2-75 (60.89% de 97,98,99,100 identidade, 73.18% de similaridade) APG03543.0 (58.97% de identidade,
74.07% de similaridade) APG00505.0 US_2016_0366881_A1-101 (58.69% de identidade, 72.93% de similaridade) WP_086410939.1 (58.69% de identidade, 72.93% de similaridade) US_8318900_B2-76 (57.38% de identidade, 70.47% de similaridade) APG00339.0 US_2016_0355842_A1-65 (56.46%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 70.79% de similaridade) APG00858.0 (54.9% de identidade,
70.03% de similaridade) APG08693.0 (41.31% de identidade,
56.98% de similaridade) WP_086410936.1 (41.31% de identidade, 56.98% de similaridade) APG02951.0 67 68 MTX 90,91,92,93, 94,95,96,97,98, APG03638.0 (87.9% de identidade, 94,95,96,97, 99,100 93.66% de similaridade) 98,99,100 OOR71217.1 (87.9% de identidade,
93.66% de similaridade) APG08605.0 (87.61% de identidade,
93.66% de similaridade) APG03848.0 (76.37% de identidade,
83.0% de similaridade) WP_075718639.1 (74.64% de identidade, 83.0% de similaridade) WP_075716873.1 (73.78% de identidade, 82.13% de similaridade) WP_078187960.1 (70.77% de identidade, 75.41% de similaridade) WP_078187232.1 (60.61% de identidade, 68.54% de similaridade) APG09091.0 (48.16% de identidade,
53.28% de similaridade) APG03553.0 (47.95% de identidade,
53.07% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03045.0 69 70 Cry 30,35,40,45, 45,50,55,60,65, APG01146.0 (32.42% de identidade, 50,55,60,65, 70,75,80,85,90, 50.85% de similaridade) 70,75,80,85, 91,92,93,94,95, APG00288.0 90,91,92,93, 96,97,98,99,100 US_2016_0311864_A1-122 (27.29% 94,95,96,97, de identidade, 40.77% de 98,99,100 similaridade) APG05915.0 (26.71% de identidade,
44.46% de similaridade) APG00396.0 US_2016_0311864_A1-163 (26.64% de identidade, 40.79% de similaridade) KMQ22191.1 (25.67% de identidade,
39.62% de similaridade) APG09713.0 (25.61% de identidade,
39.18% de similaridade) APG01877.0 (25.24% de identidade,
40.54% de similaridade) APG03068.0 71 Vip3 60,65,70,75, 75,80,85,90,91, AIU39611.1 (79.51% de identidade, 80,85,90,91, 92,93,94,95,96, 88.17% de similaridade) 92,93,94,95, 97,98,99,100 AJA74458.1 (78.75% de identidade, 96,97,98,99, 88.16% de similaridade) 100 APG00875.0 US_2016_0366881_A1-133 (56.43% de identidade, 72.72% de similaridade) APG01003.0 US_2017_0175134_A1-198 (56.15%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 71.98% de similaridade) APG00358.0 US_2016_0366881_A1-31 (55.31% de identidade, 71.41% de similaridade) APG00173.0 US_2016_0311864_A1-46 (55.13% de identidade, 71.92% de similaridade) KEZ80024.1 (54.93% de identidade,
71.24% de similaridade) APG00278.0 US_2016_0311864_A1-112 (54.87% de identidade, 71.33% de similaridade) APG00273.0 US_2016_0311864_A1-109 (53.63% de identidade, 69.91% de similaridade) APG00104.0 US_2016_0177333_A1-59 (53.52% de identidade, 68.3% de similaridade) APG03126.0 72 MTX 50,55,60,65, 70,75,80,85,90, APG01996.0 (45.39% de identidade, 70,75,80,85, 91,92,93,94,95, 68.09% de similaridade) 90,91,92,93, 96,97,98,99,100 APG05485.0 (44.44% de identidade, 94,95,96,97, 69.18% de similaridade) 98,99,100 APG09620.0 (43.26% de identidade,
66.67% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02633.0 (30.34% de identidade,
51.72% de similaridade) APG03164.0 73 74,75 Cry 35,40,45,50, 50,55,60,65,70, APG00083.0 55,60,65,70, 75,80,85,90,91, US_2016_0304898_A1-111 (32.63% 75,80,85,90, 92,93,94,95,96, de identidade, 48.58% de 91,92,93,94, 97,98,99,100 similaridade) 95,96,97,98, AHI15916.1 (32.18% de identidade, 99,100 48.08% de similaridade) US_7923602_B2-6 (31.6% de identidade, 48.21% de similaridade) APG07654.0 (31.29% de identidade,
46.76% de similaridade) AHI15917.1 (31.0% de identidade,
47.36% de similaridade) APG00651.0 US_2017_0175134_A1-77 (30.91% de identidade, 46.25% de similaridade) CA_2595901-15 (30.72% de identidade, 45.42% de similaridade) US_8318900_B2-68 (30.29% de identidade, 45.71% de similaridade) APG00524.0 US_2017_0175134_A1-17 (30.22% de identidade, 45.33% de similaridade) US_7923602_B2-35 (30.01% de identidade, 46.61% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03178.0 76 MTX 97,98,99,100 99,100 WP_000586617.1 (98.42% de identidade, 99.21% de similaridade) WP_044585299.1 (97.63% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_089607844.1 (96.84% de identidade, 98.42% de similaridade) APG02756.0 (96.44% de identidade,
98.42% de similaridade) APG03148.0 (96.44% de identidade,
98.02% de similaridade) APG09842.0 (96.05% de identidade,
98.42% de similaridade) WP_078994697.1 (96.05% de identidade, 98.02% de similaridade) APG02429.0 (95.65% de identidade,
98.02% de similaridade) WP_000586615.1 (95.65% de identidade, 98.02% de similaridade) WP_000586616.1 (95.65% de identidade, 97.63% de similaridade) APG07042.0 (95.26% de identidade,
97.23% de similaridade) WP_048564006.1 (94.86% de identidade, 98.42% de similaridade) WP_065230018.1 (94.86% de identidade, 98.42% de similaridade) WP_088066742.1 (94.47% de identidade, 97.63% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_9403881_B2-6 (94.07% de identidade, 97.63% de similaridade) WP_016090629.1 (94.07% de identidade, 97.23% de similaridade) APG02768.0 (93.68% de identidade,
98.02% de similaridade) APG09857.0 (93.68% de identidade,
97.63% de similaridade) APG01103.0 (93.28% de identidade,
97.63% de similaridade) APG00737.0 (93.28% de identidade,
95.65% de similaridade) APG01577.0 (92.89% de identidade,
96.84% de similaridade) APG09892.0 (92.52% de identidade,
96.46% de similaridade) APG09256.0 (92.52% de identidade,
95.67% de similaridade) APG05399.0 (92.49% de identidade,
96.44% de similaridade) APG02248.0 (92.09% de identidade,
96.44% de similaridade) APG01269.0 (91.73% de identidade,
95.67% de similaridade) APG02245.0 (91.7% de identidade,
96.44% de similaridade) APG09446.0 (91.3% de identidade,
96.05% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03204.0 77 Bin 5,10,15,20,2 5,10,15,20,25,3 WP_088099782.1 (38.1% de 5,30,35,40,4 0,35,40,45,50,5 identidade, 39.88% de similaridade) 5,50,55,60,6 5,60,65,70,75,8 5,70,75,80,8 0,85,90,91,92,9 5,90,91,92,9 3,94,95,96,97,9 3,94,95,96,9 8,99,100 7,98,99,100 APG03235.0 78 79 Cry 95,96,97,98, 97,98,99,100 APG00463.0 99,100 US_2016_0366881_A1-76 (94.14% de identidade, 96.32% de similaridade) AGU13875.1 (44.99% de identidade,
58.33% de similaridade) AGU13875.1 (44.99% de identidade,
58.33% de similaridade) US_9695440_B2-12 (44.99% de identidade, 58.33% de similaridade) US_9695440_B2-12 (44.99% de identidade, 58.33% de similaridade) US_2016_0122399_A1-2 (43.28% de identidade, 58.83% de similaridade) US_2016_0122399_A1-2 (43.28% de identidade, 58.83% de similaridade) US_2016_0122399_A1-1 (43.2% de identidade, 58.75% de similaridade) US_2016_0122399_A1-1 (43.2% de identidade, 58.75% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_2016_0122399_A1-4 (43.15% de identidade, 58.66% de similaridade) US_2016_0122399_A1-4 (43.15% de identidade, 58.66% de similaridade) APG03236.0 80 81 82 Cry 70,75,80,85, 80,85,90,91,92, APG01992.0 (69.9% de identidade, 90,91,92,93, 93,94,95,96,97, 79.04% de similaridade) 94,95,96,97, 98,99,100 US_9567381_B2-419 (66.48% de 98,99,100 identidade, 75.77% de similaridade) US_9567381_B2-420 (65.26% de identidade, 73.98% de similaridade) AJW76683.1 (62.14% de identidade,
73.55% de similaridade) APG00802.0 US_2017_0175134_A1-162 (45.37% de identidade, 60.11% de similaridade) CA_2516349-45 (45.1% de identidade, 59.45% de similaridade) OUB51426.1 (45.1% de identidade,
59.45% de similaridade) WP_088114772.1 (44.76% de identidade, 58.91% de similaridade) AGV55021.1 (41.38% de identidade,
52.67% de similaridade) CA_2516349-44 (40.69% de identidade, 53.89% de similaridade) APG03264.0 83 84 Cry 55,60,65,70, APG04454.0 (54.21% de identidade, 75,80,85,90, 70.23% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 91,92,93,94, APG00296.0 95,96,97,98, US_2016_0355842_A1-52 (53.08% 99,100 de identidade, 67.93% de similaridade) APG07033.0 (52.2% de identidade,
66.98% de similaridade) APG00553.0 US_2016_0355842_A1-124 (50.41% de identidade, 67.21% de similaridade) APG09727.0 (50.24% de identidade,
67.05% de similaridade) APG00480.0 70,75,80,85,90, US_2016_0355842_A1-102 (48.3% 91,92,93,94,95, de identidade, 65.8% de similaridade) 96,97,98,99,100 APG00733.0 US_2016_0355842_A1-165 (47.6% de identidade, 64.58% de similaridade) APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (27.67% de identidade, 39.19% de similaridade) APG00401.0 US_2016_0311864_A1-168 (26.4% de identidade, 37.48% de similaridade) APG00255.0 US_2016_0311864_A1-98 (26.16%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 36.71% de similaridade) APG03555.0 85 86 Cry 97,98,99,100 99,100 APG08578.0 (97.59% de identidade,
98.32% de similaridade) APG00034.0 US_2016_0177333_A1-14 (96.99% de identidade, 98.32% de similaridade) APG05886.0 (84.3% de identidade,
88.08% de similaridade) APG00383.0 US_2017_0175134_A1-6 (62.82% de identidade, 75.41% de similaridade) APG00101.0 US_2016_0177333_A1-57 (62.19% de identidade, 74.21% de similaridade) APG00002.0 US_2016_0177333_A1-1 (59.56% de identidade, 70.55% de similaridade) OPA06342.1 (57.04% de identidade,
71.48% de similaridade) WP_078401734.1 (56.65% de identidade, 70.98% de similaridade) APG00048.0 US_2016_0177333_A1-22 (50.51% de identidade, 64.42% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00608.0 US_2017_0175134_A1-55 (49.72% de identidade, 62.54% de similaridade) APG03565.0 87 MTX 40,45,50,55, 60,65,70,75,80, APG06065.0 (90.66% de identidade, 60,65,70,75, 85,90,91,92,93, 95.16% de similaridade) 80,85,90,91, 94,95,96,97,98, US_2003_0049243_A1-38 (36.79% 92,93,94,95, 99,100 de identidade, 58.53% de 96,97,98,99, similaridade) 100 WP_042595209.1 (36.79% de identidade, 58.53% de similaridade) US_9328356_B2-54 (34.38% de identidade, 53.12% de similaridade) WP_002193629.1 (29.17% de identidade, 49.36% de similaridade) US_2003_0049243_A1-45 (29.1% de identidade, 46.3% de similaridade) APG01051.0 (29.07% de identidade,
48.88% de similaridade) APG00755.0 US_2016_0355842_A1-166 (27.86% de identidade, 44.58% de similaridade) APG00402.0 US_2016_0355842_A1-77 (27.36% de identidade, 47.23% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00871.0 (26.36% de identidade,
44.55% de similaridade) APG03573.0 88 89,90 Cry 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, APG00329.0 94,95,96,97, 100 US_2016_0355842_A1-62 (89.74% 98,99,100 de identidade, 94.43% de similaridade) WP_017762581.1 (83.64% de identidade, 87.6% de similaridade) APG07069.0 (82.09% de identidade,
89.04% de similaridade) US_8461415_B2-45 (81.22% de identidade, 87.83% de similaridade) WP_044306759.1 (81.04% de identidade, 87.65% de similaridade) APG00424.0 US_2016_0366881_A1-52 (78.99% de identidade, 84.55% de similaridade) WP_060852738.1 (78.99% de identidade, 84.55% de similaridade) APG05278.0 (51.58% de identidade,
64.56% de similaridade) APG05402.0 (48.2% de identidade,
61.11% de similaridade) APG04280.0 (43.56% de identidade,
55.78% de similaridade) APG03623.0 91 92 MTX 75,80,85,90, APG00411.0 91,92,93,94, US_2016_0355842_A1-80 (70.25%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 95,96,97,98, 85,90,91,92,93, de identidade, 80.44% de 99, 100 94,95,96,97,98, similaridade) 99,100 APG00479.0 US_2016_0355842_A1-101 (64.57% de identidade, 73.43% de similaridade) APG00283.0 US_2016_0355842_A1-50 (59.94% de identidade, 71.76% de similaridade) APG00966.0 US_2016_0355842_A1-195 (57.1% de identidade, 70.14% de similaridade) WP_078401253.1 (46.43% de identidade, 61.9% de similaridade) WP_065486138.1 (43.75% de identidade, 61.36% de similaridade) WP_065487080.1 (43.75% de identidade, 61.36% de similaridade) AGS78124.1 (38.84% de identidade,
54.27% de similaridade) APG00228.0 US_2016_0355842_A1-31 (38.34% de identidade, 54.4% de similaridade) APG03864.0 (37.3% de identidade,
52.43% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03655.0 93 Bin 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, APG00314.0 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, US_2016_0311864_A1-136 (72.54% 95,96,97,98, 99,100 de identidade, 81.87% de 99, 100 similaridade) APG00415.0 US_2016_0311864_A1-175 (58.22% de identidade, 74.37% de similaridade) APG00591.0 US_2016_0311864_A1-194 (39.18% de identidade, 54.25% de similaridade) APG00440.0 US_2016_0366881_A1-65 (35.94% de identidade, 51.04% de similaridade) APG00674.0 US_2017_0175134_A1-96 (35.26% de identidade, 50.96% de similaridade) APG00550.0 US_2016_0311864_A1-190 (34.79% de identidade, 53.42% de similaridade) APG05284.0 (34.66% de identidade,
48.94% de similaridade) APG09977.0 (34.53% de identidade,
49.62% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00642.0 US_2016_0311864_A1-202 (34.52% de identidade, 48.77% de similaridade) WP_002166959.1 (34.01% de identidade, 51.78% de similaridade) WP_002191947.1 (34.01% de identidade, 51.78% de similaridade) APG03730.0 94 95 MTX 30,35,40,45, 50,55,60,65,70, US_8829279_B2-11 (28.17% de 50,55,60,65, 75,80,85,90,91, identidade, 45.18% de similaridade) 70,75,80,85, 92,93,94,95,96, WP_000844424.1 (27.99% de 90,91,92,93, 97,98,99,100 identidade, 47.55% de similaridade) 94,95,96,97, WP_078204211.1 (27.99% de 98,99,100 identidade, 47.28% de similaridade) WP_000844425.1 (27.72% de identidade, 47.28% de similaridade) APG05615.0 (27.64% de identidade,
47.15% de similaridade) APG03741.0 96 97 Cry 35,40,45,50, 50,55,60,65,70, APG04175.0 (40.67% de identidade, 55,60,65,70, 75,80,85,90,91, 54.5% de similaridade) 75,80,85,90, 92,93,94,95,96, WP_044306759.1 (31.68% de 91,92,93,94, 97,98,99,100 identidade, 45.96% de similaridade) 95,96,97,98, US_8461415_B2-45 (31.68% de 99,100 identidade, 45.65% de similaridade) APG07069.0 (31.13% de identidade,
43.71% de similaridade) WP_017762581.1 (30.1% de identidade, 42.14% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG05402.0 (30.08% de identidade,
43.05% de similaridade) APG00329.0 US_2016_0355842_A1-62 (29.91% de identidade, 42.41% de similaridade) APG03573.0 (29.88% de identidade,
42.46% de similaridade) APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (29.4% de identidade, 43.49% de similaridade) APG00424.0 US_2016_0366881_A1-52 (28.42% de identidade, 43.48% de similaridade) WP_060852738.1 (28.42% de identidade, 43.48% de similaridade) APG03859.0 98 Bin 91,92,93,94, 93,94,95,96,97, CA_2844913-50 (90.11% de 95,96,97,98, 98,99, 100 identidade, 92.25% de similaridade) 99,100 APG07930.0 (71.39% de identidade,
82.29% de similaridade) WP_095022149.1 (70.75% de identidade, 84.12% de similaridade) APG00532.0 US_2016_0311864_A1-189 (68.28% de identidade, 80.65% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00499.0 US_2016_0311864_A1-185 (61.17% de identidade, 73.18% de similaridade) APG00413.0 US_2016_0311864_A1-174 (54.57% de identidade, 68.28% de similaridade) APG09069.0 (54.55% de identidade,
68.45% de similaridade) APG06920.0 (53.99% de identidade,
69.41% de similaridade) US_9321814_B2-5 (53.8% de identidade, 67.66% de similaridade) US_9321814_B2-4 (53.66% de identidade, 67.48% de similaridade) APG03864.0 99 100,101 MTX 40,45,50,55, 55,60,65,70,75, AGS78124.1 (96.64% de identidade, 60,65,70,75, 80,85,90,91,92, 97.2% de similaridade) 80,85,90,91, 93,94,95,96,97, WP_065486138.1 (40.93% de 92,93,94,95, 98,99,100 identidade, 55.49% de similaridade) 96,97,98,99, WP_065487080.1 (40.93% de 100 identidade, 55.49% de similaridade) APG03623.0 (37.3% de identidade,
52.43% de similaridade) APG00228.0 US_2016_0355842_A1-31 (36.5% de identidade, 54.24% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00283.0 US_2016_0355842_A1-50 (36.1% de identidade, 54.55% de similaridade) APG00479.0 US_2016_0355842_A1-101 (35.88% de identidade, 52.51% de similaridade) APG00411.0 US_2016_0355842_A1-80 (35.13% de identidade, 51.54% de similaridade) APG00966.0 US_2016_0355842_A1-195 (34.07% de identidade, 53.46% de similaridade) US_8461415_B2-37 (33.01% de identidade, 48.06% de similaridade) APG03869.0 102 103 Bin 45,50,55,60, 60,65,70,75,80, US_8461421_B2-64 (41.24% de 65,70,75,80, 85,90,91,92,93, identidade, 57.83% de similaridade) 85,90,91,92, 94,95,96,97,98, US_8461421_B2-4 (39.82% de 93,94,95,96, 99,100 identidade, 57.21% de similaridade) 97,98,99,100 WP_088023751.1 (36.7% de identidade, 52.29% de similaridade) US_8461421_B2-144 (32.85% de identidade, 45.8% de similaridade) WP_065486894.1 (29.2% de identidade, 46.44% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8461421_B2-6 (28.7% de identidade, 46.47% de similaridade) US_8461421_B2-66 (28.7% de identidade, 46.47% de similaridade) APG04004.0 (28.61% de identidade,
44.21% de similaridade) APG00729.0 US_2017_0175134_A1-142 (28.51% de identidade, 41.87% de similaridade) WP_088023748.1 (28.44% de identidade, 46.89% de similaridade) APG03974.0 104 Cry 85,90,91,92, 92,93,94,95,96, APG00500.0 93,94,95,96, 97,98,99,100 US_2016_0311864_A1-186 (84.78% 97,98,99,100 de identidade, 91.94% de similaridade) APG00496.0 US_2016_0355842_A1-110 (69.38% de identidade, 74.95% de similaridade) APG00496.0 US_2016_0355842_A1-110 (69.38% de identidade, 74.95% de similaridade) US_8461415_B2-43 (60.05% de identidade, 72.26% de similaridade) APG01313.0 (56.33% de identidade,
64.84% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00030.0 US_2016_0304898_A1-50 (56.1% de identidade, 65.79% de similaridade) APG00113.0 US_2016_0311864_A1-24 (55.22% de identidade, 64.53% de similaridade) APG00012.0 US_2016_0304898_A1-19 (52.88% de identidade, 56.59% de similaridade) APG00196.0 US_2016_0311864_A1-66 (51.98% de identidade, 61.95% de similaridade) WP_089149092.1 (51.39% de identidade, 63.05% de similaridade) US_8461415_B2-14 (51.39% de identidade, 62.75% de similaridade) US_8461415_B2-42 (51.39% de identidade, 62.75% de similaridade) APG03986.0 105 106,107 Cry 50,55,60,65, 65,70,75,80,85, APG00702.0 70,75,80,85, 90,91,92,93,94, US_2017_0175134_A1-115 (46.17% 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, de identidade, 63.3% de similaridade) 94,95,96,97, 100 APG00401.0 98,99,100 US_2016_0311864_A1-168 (46.09% de identidade, 61.89% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00255.0 US_2016_0311864_A1-98 (45.37% de identidade, 61.79% de similaridade) APG00404.0 US_2016_0311864_A1-169 (39.97% de identidade, 52.87% de similaridade) APG06995.0 (39.41% de identidade,
52.96% de similaridade) APG00232.0 US_2016_0311864_A1-87 (37.05% de identidade, 50.21% de similaridade) APG01679.0 (36.97% de identidade,
53.08% de similaridade) WP_048536362.1 (36.97% de identidade, 53.08% de similaridade) CA_2844913-200 (36.12% de identidade, 50.4% de similaridade) APG07866.0 (35.68% de identidade,
51.0% de similaridade) APG04108.0 108 109 Cry 80,85,90,91, 85,90,91,92,93, APG00235.0 92,93,94,95, 94,95,96,97,98, US_2016_0311864_A1-89 (76.42% 96,97,98,99, 99,100 de identidade, 83.3% de similaridade) 100 WP_050845493.1 (66.2% de identidade, 76.23% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG08681.0 (58.37% de identidade,
69.27% de similaridade) WP_048536324.1 (58.37% de identidade, 69.27% de similaridade) APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (37.99% de identidade, 51.18% de similaridade) APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (37.99% de identidade, 51.18% de similaridade) APG00401.0 US_2016_0311864_A1-168 (37.4% de identidade, 49.13% de similaridade) APG00401.0 US_2016_0311864_A1-168 (37.4% de identidade, 49.13% de similaridade) APG00255.0 US_2016_0311864_A1-98 (37.08% de identidade, 48.97% de similaridade) APG06997.0 (36.03% de identidade,
50.0% de similaridade) APG04127.0 110 MTX 80,85,90,91, APG02577.0 (76.8% de identidade, 92,93,94,95, 82.67% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 96,97,98,99, APG05428.0 (51.55% de identidade, 100 64.18% de similaridade) APG00156.0 US_2016_0355842_A1-6 (46.94% de identidade, 61.99% de similaridade) APG00148.0 US_2016_0304898_A1-170 (33.77% de identidade, 51.05% de similaridade) 85,90,91,92,93, APG01044.0 (31.56% de identidade, 94,95,96,97,98, 46.15% de similaridade) 99,100 CA_2844913-114 (31.52% de identidade, 47.8% de similaridade) CA_2844913-112 (30.2% de identidade, 47.46% de similaridade) APG04067.0 (30.16% de identidade,
46.74% de similaridade) APG02225.0 (29.98% de identidade,
41.2% de similaridade) APG02346.0 (29.87% de identidade,
47.2% de similaridade) APG04144.0 111 112 Bin 90,91,92,93, 92,93,94,95,96, CA_2844913-10 (88.66% de 94,95,96,97, 97,98,99,100 identidade, 91.44% de similaridade) 98,99,100 WP_001258160.1 (88.16% de identidade, 90.93% de similaridade) WP_001258161.1 (88.16% de identidade, 90.93% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene EEL19841.1 (87.41% de identidade,
89.92% de similaridade) WP_078212086.1 (84.89% de identidade, 89.42% de similaridade) EJV43967.1 (82.87% de identidade,
84.38% de similaridade) WP_002187944.1 (81.5% de identidade, 88.5% de similaridade) APG07247.0 (79.0% de identidade,
86.0% de similaridade) WP_088084719.1 (78.33% de identidade, 84.73% de similaridade) SCV23895.1 (77.81% de identidade,
83.29% de similaridade) APG04175.0 113 114 Cry 40,45,50,55, 50,55,60,65,70, APG03741.0 (40.67% de identidade, 60,65,70,75, 75,80,85,90,91, 54.5% de similaridade) 80,85,90,91, 92,93,94,95,96, APG03573.0 (35.35% de identidade, 92,93,94,95, 97,98,99,100 49.75% de similaridade) 96,97,98,99, US_8461415_B2-45 (35.0% de 100 identidade, 49.17% de similaridade) WP_044306759.1 (35.0% de identidade, 49.17% de similaridade) APG07069.0 (34.48% de identidade,
48.77% de similaridade) WP_017762581.1 (34.44% de identidade, 48.41% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00329.0 US_2016_0355842_A1-62 (33.6% de identidade, 47.84% de similaridade) APG05402.0 (32.24% de identidade,
47.37% de similaridade) APG05278.0 (31.95% de identidade,
47.09% de similaridade) APG00424.0 US_2016_0366881_A1-52 (31.27% de identidade, 46.74% de similaridade) WP_060852738.1 (31.27% de identidade, 46.74% de similaridade) APG04182.0 115 116 MTX 35,40,45,50, 50,55,60,65,70, APG05787.0 (30.77% de identidade, 55,60,65,70, 75,80,85,90,91, 48.46% de similaridade) 75,80,85,90, 92,93,94,95,96, APG01148.0 (30.65% de identidade, 91,92,93,94, 97,98,99,100 42.46% de similaridade) 95,96,97,98, APG06273.0 (30.58% de identidade, 99,100 45.36% de similaridade) US_8829279_B2-11 (30.17% de identidade, 46.38% de similaridade) WP_075718639.1 (29.6% de identidade, 42.04% de similaridade) WP_075716873.1 (29.35% de identidade, 41.79% de similaridade) APG08547.0 (29.31% de identidade,
48.33% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00371.0 US_2016_0355842_A1-72 (29.31% de identidade, 45.5% de similaridade) WP_086387329.1 (29.03% de identidade, 42.4% de similaridade) US_8461415_B2-37 (28.84% de identidade, 44.68% de similaridade) APG04280.0 117 Cry 45,50,55,60, 60,65,70,75,80, APG05278.0 (86.11% de identidade, 65,70,75,80, 85,90,91,92,93, 88.12% de similaridade) 85,90,91,92, 94,95,96,97,98, APG05402.0 (84.75% de identidade, 93,94,95,96, 99,100 86.57% de similaridade) 97,98,99,100 US_8461415_B2-45 (43.68% de identidade, 55.01% de similaridade) WP_044306759.1 (43.68% de identidade, 55.01% de similaridade) APG00424.0 US_2016_0366881_A1-52 (43.62% de identidade, 55.37% de similaridade) WP_060852738.1 (43.62% de identidade, 55.37% de similaridade) APG03573.0 (43.56% de identidade,
55.78% de similaridade) APG07069.0 (43.19% de identidade,
55.17% de similaridade) APG00329.0 US_2016_0355842_A1-62 (42.38%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 54.09% de similaridade) WP_017762581.1 (42.07% de identidade, 53.53% de similaridade) APG04296.0 118 119 MTX 50,55,60,65, 65,70,75,80,85, APG05943.0 (52.35% de identidade, 70,75,80,85, 90,91,92,93,94, 66.46% de similaridade) 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, APG07780.0 (49.84% de identidade, 94,95,96,97, 100 62.7% de similaridade) 98,99,100 APG05984.0 (49.84% de identidade,
62.46% de similaridade) APG01273.0 (47.15% de identidade,
61.39% de similaridade) APG01093.0 (45.62% de identidade,
58.44% de similaridade) APG08917.0 (40.63% de identidade,
55.56% de similaridade) APG01706.0 (37.85% de identidade,
53.31% de similaridade) WP_073006286.1 (26.33% de identidade, 44.08% de similaridade) APG04305.0 120 121,122 MTX 55,60,65,70, 75,80,85,90,91, APG08802.0 (98.37% de identidade, 75,80,85,90, 92,93,94,95,96, 99.73% de similaridade) 91,92,93,94, 97,98,99,100 APG00154.0 95,96,97,98, US_2016_0355842_A1-5 (54.59% de 99,100 identidade, 71.62% de similaridade) WP_090920591.1 (54.05% de identidade, 71.89% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00594.0 US_2016_0355842_A1-137 (54.05% de identidade, 71.08% de similaridade) APG00486.0 US_2016_0355842_A1-107 (53.21% de identidade, 71.39% de similaridade) APG06851.0 (51.8% de identidade,
67.27% de similaridade) APG00483.0 US_2016_0355842_A1-104 (50.52% de identidade, 65.03% de similaridade) APG00475.0 US_2016_0366881_A1-90 (49.61% de identidade, 69.09% de similaridade) APG00421.0 US_2016_0355842_A1-86 (49.48% de identidade, 66.24% de similaridade) WP_063226258.1 (49.23% de identidade, 63.4% de similaridade) APG04325.0 123 124 Cry 90,91,92,93, 93,94,95,96,97, APG01985.0 (97.42% de identidade, 94,95,96,97, 98,99, 100 98.85% de similaridade) 98,99,100 APG04689.0 (86.94% de identidade,
92.11% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_006919322.1 (86.8% de identidade, 92.11% de similaridade) APG00086.0 US_2016_0304898_A1-113 (69.73% de identidade, 82.21% de similaridade) WP_006922195.1 (60.94% de identidade, 73.53% de similaridade) APG00122.0 US_2016_0304898_A1-143 (60.34% de identidade, 72.75% de similaridade) APG07751.0 (60.06% de identidade,
72.29% de similaridade) APG00057.0 US_2016_0304898_A1-88 (34.6% de identidade, 50.14% de similaridade) WP_006927245.1 (34.09% de identidade, 52.27% de similaridade) APG01135.0 (31.54% de identidade,
48.13% de similaridade) APG04347.0 125 126,127 MTX 35,40,45,50, 50,55,60,65,70, ADK08315.1 (45.56% de identidade, 55,60,65,70, 75,80,85,90,91, 63.32% de similaridade) 75,80,85,90, 92,93,94,95,96, APG02835.0 (43.97% de identidade, 91,92,93,94, 97,98,99,100 56.32% de similaridade) 95,96,97,98, AIK29697.1 (43.01% de identidade, 99,100 59.68% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene KOS27986.1 (41.79% de identidade,
58.79% de similaridade) WP_000052062.1 (41.5% de identidade, 58.79% de similaridade) WP_033647182.1 (41.21% de identidade, 58.5% de similaridade) WP_085783006.1 (40.63% de identidade, 59.08% de similaridade) WP_079230709.1 (39.19% de identidade, 56.48% de similaridade) APG08633.0 (36.1% de identidade,
52.72% de similaridade) WP_010891444.1 (32.08% de identidade, 46.53% de similaridade) APG04379.0 128 129 Cry 45,50,55,60, 60,65,70,75,80, ABB51653.1 (43.11% de identidade, 65,70,75,80, 85,90,91,92,93, 59.75% de similaridade) 85,90,91,92, 94,95,96,97,98, US_9567381_B2-248 (43.11% de 93,94,95,96, 99,100 identidade, 59.75% de similaridade) 97,98,99,100 WP_000357586.1 (43.03% de identidade, 59.75% de similaridade) WP_000357587.1 (42.95% de identidade, 59.56% de similaridade) US_9567381_B2-247 (42.28% de identidade, 59.08% de similaridade) APG02841.0 (34.14% de identidade,
49.77% de similaridade) APG00190.0 US_2016_0311864_A1-62 (33.49%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 49.96% de similaridade) US_6056953_A-28 (33.15% de identidade, 50.84% de similaridade) CA_2516349-38 (32.75% de identidade, 50.36% de similaridade) US_9567381_B2-489 (32.71% de identidade, 49.96% de similaridade) APG04448.0 130 131 MTX 92,93,94,95, 96,97,98,99,100 CA_2844913-108 (91.36% de 96,97,98,99, identidade, 94.02% de similaridade) 100 WP_002204230.1 (90.7% de identidade, 93.69% de similaridade) WP_063218405.1 (90.7% de identidade, 93.69% de similaridade) AFU17215.1 (90.37% de identidade,
94.68% de similaridade) WP_002166571.1 (90.03% de identidade, 93.36% de similaridade) WP_016093764.1 (90.03% de identidade, 93.36% de similaridade) US_7919272_B2-21 (89.7% de identidade, 93.36% de similaridade) WP_016362156.1 (89.7% de identidade, 93.02% de similaridade) APG00337.0 US_2016_0366881_A1-20 (89.37% de identidade, 95.02% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_000735751.1 (89.04% de identidade, 93.02% de similaridade) APG04454.0 132 Cry 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, APG00553.0 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, US_2016_0355842_A1-124 (81.71% 97,98,99,100 100 de identidade, 89.77% de similaridade) APG09727.0 (81.54% de identidade,
89.93% de similaridade) APG00480.0 US_2016_0355842_A1-102 (68.78% de identidade, 83.64% de similaridade) APG00733.0 US_2016_0355842_A1-165 (59.17% de identidade, 75.04% de similaridade) APG03264.0 (54.21% de identidade,
70.23% de similaridade) APG07033.0 (49.12% de identidade,
64.43% de similaridade) APG00296.0 US_2016_0355842_A1-52 (47.99% de identidade, 62.54% de similaridade) APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (27.04% de identidade, 40.2% de similaridade) APG00255.0 US_2016_0311864_A1-98 (26.21%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 39.25% de similaridade) APG00401.0 US_2016_0311864_A1-168 (25.77% de identidade, 38.44% de similaridade) APG04455.0 133 134 MTX 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, CA_2844913-110 (83.57% de 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, identidade, 88.58% de similaridade) 97,98,99,100 100 WP_063226258.1 (68.92% de identidade, 80.54% de similaridade) APG00421.0 US_2016_0355842_A1-86 (67.12% de identidade, 77.63% de similaridade) APG00483.0 US_2016_0355842_A1-104 (65.77% de identidade, 77.09% de similaridade) APG06851.0 (65.68% de identidade,
77.48% de similaridade) APG00995.0 US_2016_0355842_A1-200 (57.22% de identidade, 70.87% de similaridade) APG00593.0 US_2016_0355842_A1-136 (57.22% de identidade, 70.6% de similaridade) APG00414.0 US_2016_0355842_A1-81 (56.32%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 70.26% de similaridade) APG00560.0 US_2016_0355842_A1-125 (55.17% de identidade, 69.76% de similaridade) APG00475.0 US_2016_0366881_A1-90 (54.05% de identidade, 68.93% de similaridade) APG00269.0 US_2016_0355842_A1-46 (54.05% de identidade, 68.67% de similaridade) APG04685.0 135 136,137 Bin 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, APG00261.0 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, US_2016_0311864_A1-100 (72.68% 95,96,97,98, 99,100 de identidade, 83.71% de 99, 100 similaridade) WP_000839920.1 (70.93% de identidade, 79.45% de similaridade) WP_002114997.1 (70.07% de identidade, 79.05% de similaridade) WP_078212086.1 (69.67% de identidade, 81.45% de similaridade) CA_2844913-10 (68.67% de identidade, 81.7% de similaridade) WP_001258160.1 (68.42% de identidade, 81.45% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_001258161.1 (68.42% de identidade, 81.45% de similaridade) WP_070128649.1 (68.33% de identidade, 77.31% de similaridade) APG00648.0 US_2017_0175134_A1-73 (68.06% de identidade, 76.9% de similaridade) WP_002187944.1 (68.0% de identidade, 81.0% de similaridade) APG04767.0 138 139 MTX 99,100 100 APG01508.0 (98.04% de identidade,
99.16% de similaridade) APG00020.0 US_2016_0304898_A1-33 (96.65% de identidade, 98.32% de similaridade) APG00253.0 US_2016_0355842_A1-39 (88.27% de identidade, 93.58% de similaridade) APG04342.0 (88.02% de identidade,
93.31% de similaridade) APG00418.0 US_2016_0355842_A1-84 (85.47% de identidade, 90.22% de similaridade) APG00764.0 US_2016_0355842_A1-168 (83.51% de identidade, 87.77% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03995.0 (83.24% de identidade,
87.77% de similaridade) APG00448.0 US_2016_0366881_A1-70 (83.1% de identidade, 87.26% de similaridade) APG08278.0 (82.71% de identidade,
89.36% de similaridade) APG00268.0 US_2016_0355842_A1-45 (82.71% de identidade, 87.5% de similaridade) APG00646.0 US_2016_0355842_A1-201 (82.71% de identidade, 87.5% de similaridade) APG04825.0 140 141 Cry 65,70,75,80, 75,80,85,90,91, APG00469.0 85,90,91,92, 92,93,94,95,96, US_2016_0366881_A1-82 (61.97% 93,94,95,96, 97,98,99,100 de identidade, 74.06% de 97,98,99,100 similaridade) APG06739.0 (58.07% de identidade,
71.0% de similaridade) APG05370.0 (58.06% de identidade,
68.15% de similaridade) US_9567381_B2-324 (55.9% de identidade, 67.33% de similaridade) ADO32759.1 (55.9% de identidade,
67.25% de similaridade) ADO32760.1 (55.9% de identidade,
67.17% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene ADK66923.1 (55.1% de identidade,
66.97% de similaridade) APG01571.0 (55.01% de identidade,
66.87% de similaridade) US_8318900_B2-82 (54.59% de identidade, 66.9% de similaridade) US_8461421_B2-70 (54.48% de identidade, 65.65% de similaridade) APG04838.0 142 PI- 40,45,50,55, 45,50,55,60,65, WO_2017_015233-1 (35.04% de PLC 60,65,70,75, 70,75,80,85,90, identidade, 44.0% de similaridade) 80,85,90,91, 91,92,93,94,95, WP_058844594.1 (33.75% de 92,93,94,95, 96,97,98,99,100 identidade, 43.06% de similaridade) 96,97,98,99, WP_089932909.1 (33.75% de 100 identidade, 43.06% de similaridade) WP_010858191.1 (33.59% de identidade, 42.33% de similaridade) SCY31704.1 (32.82% de identidade,
41.87% de similaridade) WP_051891736.1 (32.71% de identidade, 41.55% de similaridade) WP_086405655.1 (32.41% de identidade, 40.86% de similaridade) WP_000933815.1 (32.41% de identidade, 40.71% de similaridade) WP_088059020.1 (32.07% de identidade, 43.13% de similaridade) WP_016078926.1 (30.39% de identidade, 38.47% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG04849.0 143 144,145 MTX 35,40,45,50, 50,55,60,65,70, APG07682.0 (31.99% de identidade, 55,60,65,70, 75,80,85,90,91, 45.16% de similaridade) 75,80,85,90, 92,93,94,95,96, APG00441.0 91,92,93,94, 97,98,99,100 US_2016_0355842_A1-91 (30.89% 95,96,97,98, de identidade, 44.99% de 99,100 similaridade) APG06784.0 (30.87% de identidade,
46.44% de similaridade) APG04196.0 (30.83% de identidade,
46.11% de similaridade) APG00143.0 US_2016_0355842_A1-4 (30.83% de identidade, 45.58% de similaridade) APG09602.0 (30.35% de identidade,
42.28% de similaridade) WP_065845806.1 (30.35% de identidade, 42.28% de similaridade) APG00833.0 US_2016_0355842_A1-175 (30.29% de identidade, 45.31% de similaridade) APG00444.0 US_2016_0355842_A1-93 (29.89% de identidade, 43.75% de similaridade) APG03867.0 (28.95% de identidade,
42.63% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG05091.0 146 147 Cry 40,45,50,55, 55,60,65,70,75, APG03986.0 (35.67% de identidade, 60,65,70,75, 80,85,90,91,92, 50.16% de similaridade) 80,85,90,91, 93,94,95,96,97, APG00457.0 92,93,94,95, 98,99,100 US_2016_0355842_A1-98 (35.52% 96,97,98,99, de identidade, 49.92% de 100 similaridade) WP_044307385.1 (35.52% de identidade, 49.92% de similaridade) APG00401.0 US_2016_0311864_A1-168 (35.16% de identidade, 50.31% de similaridade) APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (34.73% de identidade, 47.44% de similaridade) APG00255.0 US_2016_0311864_A1-98 (34.01% de identidade, 49.69% de similaridade) APG00471.0 US_2016_0366881_A1-85 (33.97% de identidade, 45.04% de similaridade) APG07866.0 (32.01% de identidade,
46.76% de similaridade) CA_2844913-200 (31.92% de identidade, 44.48% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG08681.0 (31.43% de identidade,
47.0% de similaridade) WP_048536324.1 (31.43% de identidade, 47.0% de similaridade) APG05103.0 148 149 Cry 60,65,70,75, 70,75,80,85,90, APG07224.0 (59.05% de identidade, 80,85,90,91, 91,92,93,94,95, 69.24% de similaridade) 92,93,94,95, 96,97,98,99,100 APG07866.0 (53.31% de identidade, 96,97,98,99, 63.48% de similaridade) 100 APG00404.0 US_2016_0311864_A1-169 (37.87% de identidade, 51.33% de similaridade) APG01679.0 (37.13% de identidade,
49.3% de similaridade) WP_048536362.1 (37.13% de identidade, 49.3% de similaridade) APG02807.0 (36.55% de identidade,
51.11% de similaridade) APG00457.0 US_2016_0355842_A1-98 (35.48% de identidade, 48.35% de similaridade) WP_044307385.1 (35.48% de identidade, 48.35% de similaridade) APG09007.0 (34.1% de identidade,
50.25% de similaridade) APG00435.0 US_2016_0366881_A1-59 (33.49%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 49.84% de similaridade) WP_086420153.1 (33.49% de identidade, 49.84% de similaridade) APG05182.0 150 Cyt 90,91,92,93, 93,94,95,96,97, APG00431.0 94,95,96,97, 98,99, 100 US_2016_0366881_A1-56 (86.52% 98,99,100 de identidade, 92.55% de similaridade) APG00790.0 (81.91% de identidade,
91.49% de similaridade) APG01257.0 (81.21% de identidade,
90.43% de similaridade) APG00015.0 US_2016_0304898_A1-25 (61.21% de identidade, 78.65% de similaridade) APG00468.0 US_2016_0366881_A1-81 (60.5% de identidade, 77.94% de similaridade) APG01301.0 (59.72% de identidade,
77.43% de similaridade) APG01121.0 (58.72% de identidade,
76.51% de similaridade) US_2017_0058293_A1-4 (51.21% de identidade, 70.24% de similaridade) APG00168.0 US_2016_0311864_A1-44 (48.47% de identidade, 69.15% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_2017_0058293_A1-2 (46.58% de identidade, 64.29% de similaridade) APG05239.0 151 MTX 85,90,91,92, 93,94,95,96,97, APG02970.0 (83.94% de identidade, 93,94,95,96, 98,99, 100 92.73% de similaridade) 97,98,99,100 APG02808.0 (82.04% de identidade,
91.02% de similaridade) APG01367.0 (81.08% de identidade,
90.39% de similaridade) APG05140.0 (80.78% de identidade,
90.09% de similaridade) APG05040.0 (80.61% de identidade,
92.12% de similaridade) APG00793.0 US_2016_0355842_A1-170 (49.57% de identidade, 64.96% de similaridade) WP_072335847.1 (42.24% de identidade, 57.47% de similaridade) US_8829279_B2-11 (41.0% de identidade, 59.0% de similaridade) APG09460.0 (40.52% de identidade,
59.18% de similaridade) APG00416.0 US_2016_0355842_A1-82 (39.94% de identidade, 58.6% de similaridade) APG05278.0 152 153 Cry 55,60,65,70, 65,70,75,80,85, APG05402.0 (88.79% de identidade, 75,80,85,90, 90,91,92,93,94, 91.14% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 91,92,93,94, 95,96,97,98,99, APG04280.0 (86.11% de identidade, 95,96,97,98, 100 88.12% de similaridade) 99,100 APG03573.0 (51.58% de identidade,
64.56% de similaridade) US_8461415_B2-45 (51.16% de identidade, 62.79% de similaridade) WP_044306759.1 (51.0% de identidade, 62.62% de similaridade) APG07069.0 (50.66% de identidade,
63.29% de similaridade) APG00329.0 US_2016_0355842_A1-62 (50.0% de identidade, 61.81% de similaridade) WP_017762581.1 (49.53% de identidade, 61.08% de similaridade) APG00424.0 US_2016_0366881_A1-52 (44.67% de identidade, 57.33% de similaridade) WP_060852738.1 (44.67% de identidade, 57.33% de similaridade) APG05402.0 154 155 Cry 50,55,60,65, 65,70,75,80,85, APG05278.0 (88.79% de identidade, 70,75,80,85, 90,91,92,93,94, 91.14% de similaridade) 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, APG04280.0 (84.75% de identidade, 94,95,96,97, 100 86.57% de similaridade) 98,99,100 US_8461415_B2-45 (48.61% de identidade, 60.69% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_044306759.1 (48.61% de identidade, 60.69% de similaridade) APG07069.0 (48.45% de identidade,
61.01% de similaridade) APG03573.0 (48.2% de identidade,
61.11% de similaridade) APG00329.0 US_2016_0355842_A1-62 (46.9% de identidade, 59.14% de similaridade) WP_017762581.1 (46.5% de identidade, 58.48% de similaridade) APG00424.0 US_2016_0366881_A1-52 (42.86% de identidade, 55.83% de similaridade) WP_060852738.1 (42.86% de identidade, 55.83% de similaridade) APG05428.0 156 157,158 MTX 60,65,70,75, 70,75,80,85,90, APG02577.0 (55.05% de identidade, 80,85,90,91, 91,92,93,94,95, 68.69% de similaridade) 92,93,94,95, 96,97,98,99,100 APG04127.0 (51.55% de identidade, 96,97,98,99, 64.18% de similaridade) 100 APG00156.0 US_2016_0355842_A1-6 (44.39% de identidade, 58.16% de similaridade) APG05384.0 (33.42% de identidade,
55.1% de similaridade) APG02346.0 (33.25% de identidade,
48.57% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02531.0 (32.91% de identidade,
49.23% de similaridade) CA_2844913-114 (32.14% de identidade, 48.21% de similaridade) CA_2844913-112 (32.0% de identidade, 46.25% de similaridade) APG03732.0 (31.96% de identidade,
50.26% de similaridade) APG07114.0 (31.96% de identidade,
47.16% de similaridade) APG05451.0 159 160 MTX 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, APG00293.0 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, US_2016_0355842_A1-51 (83.69% 97,98,99,100 100 de identidade, 87.53% de similaridade) APG00170.0 US_2016_0355842_A1-13 (75.47% de identidade, 80.61% de similaridade) APG07055.0 (53.79% de identidade,
65.4% de similaridade) APG05372.0 (53.48% de identidade,
59.95% de similaridade) APG09211.0 (53.08% de identidade,
62.64% de similaridade) APG06231.0 (52.06% de identidade,
63.07% de similaridade) APG01858.0 (51.04% de identidade,
63.11% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG08882.0 (50.93% de identidade,
62.96% de similaridade) APG00051.0 US_2016_0304898_A1-81 (48.89% de identidade, 60.44% de similaridade) APG00911.0 US_2016_0355842_A1-189 (48.46% de identidade, 58.87% de similaridade) APG05485.0 161 MTX 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, APG09620.0 (86.55% de identidade, 94,95,96,97, 100 91.27% de similaridade) 98,99,100 APG01996.0 (86.23% de identidade,
94.57% de similaridade) APG03126.0 (44.44% de identidade,
69.18% de similaridade) APG02633.0 (33.57% de identidade,
50.53% de similaridade) APG00236.0 US_2016_0355842_A1-32 (27.74% de identidade, 52.4% de similaridade) APG05753.0 162 163 MTX 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, APG00484.0 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, US_2016_0355842_A1-105 (71.71% 95,96,97,98, 99,100 de identidade, 82.24% de 99, 100 similaridade) APG00382.0 US_2016_0355842_A1-74 (71.05% de identidade, 81.91% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00433.0 US_2016_0366881_A1-57 (57.64% de identidade, 74.52% de similaridade) WP_008180054.1 (49.68% de identidade, 64.84% de similaridade) APG00049.0 US_2016_0304898_A1-78 (48.9% de identidade, 62.78% de similaridade) APG05497.0 (48.72% de identidade,
63.78% de similaridade) APG03746.0 (48.58% de identidade,
63.41% de similaridade) WP_088114034.1 (48.24% de identidade, 65.18% de similaridade) WP_000790613.1 (47.02% de identidade, 61.76% de similaridade) WP_001036192.1 (46.69% de identidade, 60.57% de similaridade) APG05769.0 164 165 Bin 70,75,80,85, 80,85,90,91,92, APG09977.0 (68.37% de identidade, 90,91,92,93, 93,94,95,96,97, 78.06% de similaridade) 94,95,96,97, 98,99,100 APG00243.0 98,99,100 US_2016_0311864_A1-94 (67.6% de identidade, 76.02% de similaridade) APG00237.0 US_2016_0311864_A1-90 (66.16% de identidade, 77.27% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00701.0 US_2017_0175134_A1-113 (64.89% de identidade, 77.86% de similaridade) WP_002166959.1 (64.75% de identidade, 75.5% de similaridade) WP_002191947.1 (64.5% de identidade, 75.5% de similaridade) APG00065.0 US_2016_0177333_A1-31 (64.32% de identidade, 73.54% de similaridade) US_8318900_B2-72 (64.23% de identidade, 75.57% de similaridade) WP_000839920.1 (63.86% de identidade, 75.74% de similaridade) APG00301.0 US_2016_0311864_A1-131 (63.52% de identidade, 75.77% de similaridade) APG01059.0 (63.52% de identidade,
75.26% de similaridade) APG05830.0 166 Cry 30,35,40,45, 50,55,60,65,70, WP_061139982.1 (58.08% de 50,55,60,65, 75,80,85,90,91, identidade, 73.08% de similaridade) 70,75,80,85, 92,93,94,95,96, APG02871.0 (44.91% de identidade, 90,91,92,93, 97,98,99,100 56.54% de similaridade) 94,95,96,97, WP_061139983.1 (43.23% de 98,99,100 identidade, 57.43% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00363.0 US_2016_0366881_A1-34 (26.68% de identidade, 40.85% de similaridade) APG00053.0 US_2016_0304898_A1-83 (26.5% de identidade, 42.74% de similaridade) WP_044306828.1 (26.5% de identidade, 42.74% de similaridade) APG00435.0 US_2016_0366881_A1-59 (26.5% de identidade, 40.99% de similaridade) WP_086420153.1 (26.5% de identidade, 40.99% de similaridade) APG00250.0 US_2016_0355842_A1-37 (26.15% de identidade, 42.39% de similaridade) APG00404.0 US_2016_0311864_A1-169 (26.09% de identidade, 39.71% de similaridade) APG05865.0 167 168 Cry 40,45,50,55, 60,65,70,75,80, APG00102.0 60,65,70,75, 85,90,91,92,93, US_2016_0304898_A1-131 (39.7% 80,85,90,91, 94,95,96,97,98, de identidade, 55.36% de 92,93,94,95, 99,100 similaridade) 96,97,98,99, APG00478.0 100 US_2016_0366881_A1-92 (38.3% de identidade, 52.94% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene EP_2130839-1.01 (35.63% de identidade, 51.44% de similaridade) WP_033728958.1 (35.3% de identidade, 52.14% de similaridade) ETT84679.1 (35.18% de identidade,
51.88% de similaridade) CA_2844913-196 (33.7% de identidade, 48.77% de similaridade) US_8318900_B2-84 (33.33% de identidade, 46.08% de similaridade) US_8318900_B2-161 (33.21% de identidade, 45.33% de similaridade) WP_001063906.1 (32.17% de identidade, 49.56% de similaridade) APG00665.0 US_2016_0355842_A1-154 (31.14% de identidade, 47.77% de similaridade) APG05915.0 169 170 Cry 30,35,40,45, 45,50,55,60,65, APG01146.0 (28.4% de identidade, 50,55,60,65, 70,75,80,85,90, 45.71% de similaridade) 70,75,80,85, 91,92,93,94,95, CA_2844913-152 (27.23% de 90,91,92,93, 96,97,98,99,100 identidade, 43.89% de similaridade) 94,95,96,97, CA_2844913-151 (27.06% de 98,99,100 identidade, 43.89% de similaridade) APG03045.0 (26.71% de identidade,
44.46% de similaridade) APG05921.0 171 Cyt 5,10,15,20,2 5,10,15,20,25,3 APG08332.0 (33.02% de identidade, 5,30,35,40,4 0,35,40,45,50,5 47.35% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 5,50,55,60,6 5,60,65,70,75,8 5,70,75,80,8 0,85,90,91,92,9 5,90,91,92,9 3,94,95,96,97,9 3,94,95,96,9 8,99,100 7,98,99,100 APG05936.0 172 Bin 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, APG00669.0 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, US_2016_0355842_A1-156 (71.84% 95,96,97,98, 99,100 de identidade, 80.26% de 99, 100 similaridade) APG00377.0 US_2016_0311864_A1-154 (71.69% de identidade, 82.54% de similaridade) APG00568.0 US_2016_0311864_A1-391 (71.69% de identidade, 81.75% de similaridade) WP_050845516.1 (71.66% de identidade, 82.62% de similaridade) APG00157.0 US_2016_0355842_A1-7 (71.43% de identidade, 81.75% de similaridade) APG00356.0 US_2016_0311864_A1-147 (71.43% de identidade, 81.48% de similaridade) AEX56523.1 (71.39% de identidade,
82.35% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00231.0 US_2016_0311864_A1-86 (71.16% de identidade, 82.01% de similaridade) APG00287.0 US_2016_0311864_A1-121 (70.63% de identidade, 81.22% de similaridade) APG00494.0 US_2017_0175134_A1-10 (70.37% de identidade, 80.42% de similaridade) APG05943.0 173 174 MTX 80,85,90,91, 90,91,92,93,94, APG05984.0 (80.61% de identidade, 92,93,94,95, 95,96,97,98,99, 86.39% de similaridade) 96,97,98,99, 100 APG07780.0 (79.39% de identidade, 100 85.47% de similaridade) APG01093.0 (66.78% de identidade,
79.32% de similaridade) APG01273.0 (65.78% de identidade,
77.08% de similaridade) APG08917.0 (61.22% de identidade,
70.75% de similaridade) APG04296.0 (52.35% de identidade,
66.46% de similaridade) APG01706.0 (52.2% de identidade,
64.07% de similaridade) WP_073006286.1 (33.54% de identidade, 48.31% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG05984.0 175 MTX 96,97,98,99, 98,99,100 APG07780.0 (95.32% de identidade, 100 97.48% de similaridade) APG05943.0 (80.61% de identidade,
86.39% de similaridade) APG01093.0 (72.92% de identidade,
84.48% de similaridade) APG01273.0 (69.96% de identidade,
81.27% de similaridade) APG08917.0 (65.94% de identidade,
75.36% de similaridade) APG01706.0 (55.96% de identidade,
67.51% de similaridade) APG04296.0 (49.84% de identidade,
62.46% de similaridade) WP_073006286.1 (34.53% de identidade, 51.14% de similaridade) APG06031.0 176 177 MTX 93,94,95,96, 96,97,98,99,100 APG06501.0 (92.21% de identidade, 97,98,99,100 95.78% de similaridade) WP_090776461.1 (44.65% de identidade, 61.64% de similaridade) WP_075716647.1 (34.71% de identidade, 52.06% de similaridade) WP_080497298.1 (28.57% de identidade, 37.64% de similaridade) APG06059.0 178 179 MAC 50,55,60,65, 60,65,70,75,80, WP_077570323.1 (95.12% de PF 70,75,80,85, 85,90,91,92,93, identidade, 96.18% de similaridade) 90,91,92,93, 94,95,96,97,98, WP_095113965.1 (87.9% de 99,100 identidade, 90.45% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 94,95,96,97, WP_007909213.1 (87.47% de 98,99,100 identidade, 90.23% de similaridade) WP_095047163.1 (86.2% de identidade, 88.96% de similaridade) WP_093430033.1 (85.77% de identidade, 88.54% de similaridade) WP_095125300.1 (85.77% de identidade, 88.54% de similaridade) WP_073471566.1 (76.86% de identidade, 86.84% de similaridade) WP_016772120.1 (76.22% de identidade, 86.41% de similaridade) WP_024011223.1 (75.8% de identidade, 86.62% de similaridade) WP_095151740.1 (59.66% de identidade, 71.13% de similaridade) APG06065.0 180 MTX 40,45,50,55, 60,65,70,75,80, APG03565.0 (90.66% de identidade, 60,65,70,75, 85,90,91,92,93, 95.16% de similaridade) 80,85,90,91, 94,95,96,97,98, US_2003_0049243_A1-38 (37.0% de 92,93,94,95, 99,100 identidade, 57.33% de similaridade) 96,97,98,99, WP_042595209.1 (37.0% de 100 identidade, 57.33% de similaridade) US_9328356_B2-54 (34.07% de identidade, 53.31% de similaridade) US_2003_0049243_A1-45 (29.29% de identidade, 45.38% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_002193629.1 (28.76% de identidade, 49.35% de similaridade) APG01051.0 (28.66% de identidade,
48.86% de similaridade) APG00871.0 (27.59% de identidade,
45.14% de similaridade) APG00755.0 US_2016_0355842_A1-166 (27.47% de identidade, 43.52% de similaridade) APG02980.0 (25.07% de identidade,
42.07% de similaridade) APG06231.0 181 182 MTX 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, APG09211.0 (82.47% de identidade, 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, 88.15% de similaridade) 97,98,99,100 100 APG07055.0 (76.67% de identidade,
85.11% de similaridade) APG01858.0 (63.89% de identidade,
76.77% de similaridade) APG08882.0 (61.37% de identidade,
72.86% de similaridade) APG00293.0 US_2016_0355842_A1-51 (58.37% de identidade, 68.97% de similaridade) APG00170.0 US_2016_0355842_A1-13 (57.98% de identidade, 65.73% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00051.0 US_2016_0304898_A1-81 (54.29% de identidade, 69.29% de similaridade) APG00911.0 US_2016_0355842_A1-189 (53.57% de identidade, 65.56% de similaridade) APG06242.0 (52.9% de identidade,
63.53% de similaridade) APG09338.0 (52.42% de identidade,
65.46% de similaridade) APG06239.0 183 184 Cry 55,60,65,70, 65,70,75,80,85, APG00555.0 75,80,85,90, 90,91,92,93,94, US_2017_0175134_A1-33 (51.26% 91,92,93,94, 95,96,97,98,99, de identidade, 62.61% de 95,96,97,98, 100 similaridade) 99,100 US_9567381_B2-374 (50.64% de identidade, 63.38% de similaridade) APG00695.0 US_2017_0175134_A1-109 (50.57% de identidade, 63.94% de similaridade) AIN76756.1 (50.29% de identidade,
63.51% de similaridade) APG01883.0 (49.79% de identidade,
62.03% de similaridade) US_7919272_B2-5 (49.66% de identidade, 61.38% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8692066_B2-2 (49.65% de identidade, 61.85% de similaridade) CA_2844913-25 (49.65% de identidade, 61.68% de similaridade) US_7919272_B2-17 (49.52% de identidade, 61.38% de similaridade) CA_2844913-26 (49.51% de identidade, 61.68% de similaridade) APG06273.0 185 186 MTX 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, US_8829279_B2-11 (74.72% de 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, identidade, 83.71% de similaridade) 95,96,97,98, 99,100 APG06242.0 (54.81% de identidade, 99, 100 66.49% de similaridade) APG00911.0 US_2016_0355842_A1-189 (53.37% de identidade, 67.92% de similaridade) APG00854.0 US_2016_0355842_A1-179 (52.02% de identidade, 66.31% de similaridade) APG01858.0 (50.0% de identidade,
63.07% de similaridade) APG06231.0 (49.24% de identidade,
59.34% de similaridade) APG05372.0 (48.72% de identidade,
59.83% de similaridade) APG09338.0 (48.6% de identidade,
62.6% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG09211.0 (48.51% de identidade,
60.15% de similaridade) APG00051.0 US_2016_0304898_A1-81 (48.37% de identidade, 61.4% de similaridade) APG06294.0 187 188 Cry 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, APG00044.0 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, US_2016_0304898_A1-71 (71.5% de 95,96,97,98, 99,100 identidade, 81.0% de similaridade) 99, 100 WP_002169796.1 (46.28% de identidade, 58.87% de similaridade) APG01013.0 (43.52% de identidade,
57.7% de similaridade) US_9567381_B2-378 (41.75% de identidade, 57.18% de similaridade) APG02109.0 (40.48% de identidade,
52.15% de similaridade) US_8461421_B2-264 (39.98% de identidade, 52.73% de similaridade) WP_088125814.1 (39.75% de identidade, 52.51% de similaridade) US_8461421_B2-140 (39.46% de identidade, 52.06% de similaridade) APG06056.0 (39.22% de identidade,
50.89% de similaridade) APG00145.0 US_2016_0304898_A1-163 (37.84% de identidade, 52.29% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG06420.0 189 190,191 Cry 40,45,50,55, 55,60,65,70,75, APG00239.0 60,65,70,75, 80,85,90,91,92, US_2016_0311864_A1-91 (35.59% 80,85,90,91, 93,94,95,96,97, de identidade, 51.46% de 92,93,94,95, 98,99,100 similaridade) 96,97,98,99, APG08973.0 (33.58% de identidade, 100 47.36% de similaridade) APG03440.0 (32.48% de identidade,
46.37% de similaridade) APG04152.0 (28.24% de identidade,
42.21% de similaridade) APG00564.0 US_2016_0355842_A1-128 (28.04% de identidade, 41.91% de similaridade) APG09630.0 (27.57% de identidade,
41.15% de similaridade) APG00723.0 US_2016_0311864_A1-209 (27.4% de identidade, 39.68% de similaridade) APG07937.0 (27.36% de identidade,
38.91% de similaridade) APG00615.0 US_2016_0366881_A1-119 (26.93% de identidade, 38.12% de similaridade) APG05689.0 (26.85% de identidade,
38.35% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG06421.0 192 193 Cry 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, APG09877.0 (74.79% de identidade, 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, 84.3% de similaridade) 95,96,97,98, 99,100 APG01290.0 (74.29% de identidade, 99, 100 82.1% de similaridade) US_9567381_B2-383 (54.25% de identidade, 67.67% de similaridade) APG04671.0 (37.66% de identidade,
50.52% de similaridade) APG03236.0 (36.67% de identidade,
51.79% de similaridade) US_9567381_B2-420 (35.97% de identidade, 48.7% de similaridade) APG00695.0 US_2017_0175134_A1-109 (35.87% de identidade, 48.36% de similaridade) APG00204.0 US_2016_0177333_A1-89 (35.79% de identidade, 48.68% de similaridade) APG01992.0 (35.62% de identidade,
48.88% de similaridade) AJW76683.1 (35.46% de identidade,
49.11% de similaridade) APG06422.0 194 195 MTX 91,92,93,94, 93,94,95,96,97, APG07114.0 (90.91% de identidade, 95,96,97,98, 98,99, 100 92.12% de similaridade) 99,100 APG02346.0 (90.61% de identidade,
91.21% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02531.0 (88.79% de identidade,
89.09% de similaridade) APG04067.0 (64.86% de identidade,
78.08% de similaridade) APG05384.0 (31.49% de identidade,
47.24% de similaridade) APG03732.0 (30.23% de identidade,
51.16% de similaridade) APG06912.0 (29.08% de identidade,
45.92% de similaridade) APG01517.0 (28.99% de identidade,
50.72% de similaridade) APG01044.0 (28.49% de identidade,
43.59% de similaridade) CA_2844913-112 (28.0% de identidade, 43.73% de similaridade) APG06482.0 196 197 Cyt 30,35,40,45, 55,60,65,70,75, OUB82185.1 (33.8% de identidade, 50,55,60,65, 80,85,90,91,92, 58.8% de similaridade) 70,75,80,85, 93,94,95,96,97, WP_088071709.1 (32.16% de 90,91,92,93, 98,99,100 identidade, 55.95% de similaridade) 94,95,96,97, APG00194.0 98,99,100 US_2016_0311864_A1-65 (29.13% de identidade, 50.43% de similaridade) APG00017.0 US_2016_0304898_A1-28 (28.57% de identidade, 54.29% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00464.0 US_2016_0366881_A1-78 (28.57% de identidade, 54.29% de similaridade) APG01309.0 (28.57% de identidade,
53.81% de similaridade) APG01971.0 (27.63% de identidade,
50.88% de similaridade) APG06566.0 198 199 Cry 65,70,75,80, 80,85,90,91,92, APG00251.0 85,90,91,92, 93,94,95,96,97, US_2016_0311864_A1-97 (64.9% de 93,94,95,96, 98,99,100 identidade, 75.49% de similaridade) 97,98,99,100 APG00233.0 US_2016_0311864_A1-88 (60.5% de identidade, 71.87% de similaridade) APG05848.0 (46.37% de identidade,
56.68% de similaridade) WP_048536308.1 (46.37% de identidade, 56.68% de similaridade) OPA11477.1 (40.04% de identidade,
58.35% de similaridade) CA_2844913-200 (30.41% de identidade, 43.41% de similaridade) APG09282.0 (28.59% de identidade,
39.64% de similaridade) APG07866.0 (28.55% de identidade,
38.37% de similaridade) APG00348.0 US_2016_0366881_A1-26 (28.09%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 43.02% de similaridade) APG00446.0 US_2016_0366881_A1-68 (26.19% de identidade, 40.71% de similaridade) APG06802.0 200 201 MTX 97,98,99,100 99,100 APG00325.0 US_2016_0366881_A1-12 (96.82% de identidade, 98.84% de similaridade) APG03444.0 (82.52% de identidade,
87.97% de similaridade) WP_016099611.1 (59.54% de identidade, 72.65% de similaridade) APG01969.0 (48.21% de identidade,
64.19% de similaridade) APG00384.0 US_2016_0366881_A1-44 (46.34% de identidade, 61.79% de similaridade) WP_086413070.1 (44.32% de identidade, 60.94% de similaridade) APG03015.0 (43.09% de identidade,
61.33% de similaridade) WP_088065502.1 (41.67% de identidade, 59.44% de similaridade) APG00344.0 US_2016_0366881_A1-22 (41.6% de identidade, 60.06% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_016098287.1 (41.46% de identidade, 59.66% de similaridade) APG06851.0 202 203 MTX 96,97,98,99, 98,99,100 APG00421.0 100 US_2016_0355842_A1-86 (95.9% de identidade, 97.81% de similaridade) APG00483.0 US_2016_0355842_A1-104 (84.97% de identidade, 93.72% de similaridade) WP_063226258.1 (74.11% de identidade, 85.29% de similaridade) APG00995.0 US_2016_0355842_A1-200 (67.65% de identidade, 79.51% de similaridade) APG00414.0 US_2016_0355842_A1-81 (67.03% de identidade, 79.46% de similaridade) APG00593.0 US_2016_0355842_A1-136 (66.85% de identidade, 79.25% de similaridade) APG04455.0 (65.68% de identidade,
77.48% de similaridade) CA_2844913-110 (65.04% de identidade, 76.96% de similaridade) APG00594.0 US_2016_0355842_A1-137 (64.05%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 76.49% de similaridade) APG00154.0 US_2016_0355842_A1-5 (63.51% de identidade, 75.41% de similaridade) APG06988.0 204 205,206 MTX 50,55,60,65, 55,60,65,70,75, APG08288.0 (84.88% de identidade, 70,75,80,85, 80,85,90,91,92, 88.34% de similaridade) 90,91,92,93, 93,94,95,96,97, APG05252.0 (49.56% de identidade, 94,95,96,97, 98,99,100 53.32% de similaridade) 98,99,100 WP_065486138.1 (25.27% de identidade, 35.88% de similaridade) APG07033.0 207 Cry 90,91,92,93, 92,93,94,95,96, APG00296.0 94,95,96,97, 97,98,99,100 US_2016_0355842_A1-52 (85.9% de 98,99,100 identidade, 91.57% de similaridade) APG03264.0 (52.2% de identidade,
66.98% de similaridade) APG04454.0 (49.12% de identidade,
64.43% de similaridade) APG00553.0 US_2016_0355842_A1-124 (47.63% de identidade, 63.25% de similaridade) APG09727.0 (47.48% de identidade,
62.89% de similaridade) APG00480.0 US_2016_0355842_A1-102 (47.45% de identidade, 63.06% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00733.0 US_2016_0355842_A1-165 (42.43% de identidade, 60.37% de similaridade) APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (27.62% de identidade, 42.21% de similaridade) APG01679.0 (25.97% de identidade,
39.58% de similaridade) WP_048536362.1 (25.97% de identidade, 39.58% de similaridade) APG07042.0 208 MTX 95,96,97,98, 99,100 WP_088346608.1 (100.0% de 99,100 identidade, 100.0% de similaridade) WP_078994697.1 (98.42% de identidade, 99.21% de similaridade) WP_000586616.1 (98.02% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_063549995.1 (97.63% de identidade, 98.42% de similaridade) AST04996.1 (96.84% de identidade,
97.63% de similaridade) WP_000586617.1 (96.05% de identidade, 98.02% de similaridade) WP_065230018.1 (95.65% de identidade, 98.02% de similaridade) WP_000586614.1 (95.26% de identidade, 98.02% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_044585299.1 (95.26% de identidade, 97.63% de similaridade) APG03178.0 (95.26% de identidade,
97.23% de similaridade) WP_086398617.1 (94.86% de identidade, 97.63% de similaridade) APG02756.0 (94.86% de identidade,
97.23% de similaridade) APG03148.0 (94.86% de identidade,
96.84% de similaridade) APG09842.0 (94.47% de identidade,
98.02% de similaridade) APG09857.0 (94.47% de identidade,
97.23% de similaridade) APG09256.0 (94.09% de identidade,
96.85% de similaridade) APG05399.0 (94.07% de identidade,
96.84% de similaridade) APG02768.0 (93.68% de identidade,
97.63% de similaridade) APG01577.0 (93.68% de identidade,
97.23% de similaridade) APG02248.0 (93.68% de identidade,
96.84% de similaridade) APG02429.0 (93.68% de identidade,
96.84% de similaridade) US_9403881_B2-6 (93.28% de identidade, 97.23% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02245.0 (93.28% de identidade,
96.84% de similaridade) APG00737.0 (93.28% de identidade,
95.26% de similaridade) APG09446.0 (92.89% de identidade,
96.44% de similaridade) APG01103.0 (92.49% de identidade,
97.23% de similaridade) APG09892.0 (92.13% de identidade,
96.06% de similaridade) APG01269.0 (91.73% de identidade,
95.28% de similaridade) APG07055.0 209 210 MTX 75,80,85,90, 85,90,91,92,93, APG06231.0 (76.67% de identidade, 91,92,93,94, 94,95,96,97,98, 85.11% de similaridade) 95,96,97,98, 99,100 APG09211.0 (73.44% de identidade, 99, 100 82.3% de similaridade) APG01858.0 (61.69% de identidade,
72.53% de similaridade) APG08882.0 (56.78% de identidade,
68.22% de similaridade) APG00170.0 US_2016_0355842_A1-13 (54.69% de identidade, 64.51% de similaridade) APG05451.0 (53.79% de identidade,
65.4% de similaridade) APG00293.0 US_2016_0355842_A1-51 (53.07%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 66.98% de similaridade) APG00051.0 US_2016_0304898_A1-81 (52.89% de identidade, 66.97% de similaridade) APG06242.0 (52.86% de identidade,
61.9% de similaridade) APG00911.0 US_2016_0355842_A1-189 (52.71% de identidade, 64.04% de similaridade) APG07069.0 211 212 Cry 93,94,95,96, 96,97,98,99,100 US_8461415_B2-45 (92.31% de 97,98,99,100 identidade, 95.71% de similaridade) WP_044306759.1 (92.13% de identidade, 95.53% de similaridade) APG00329.0 US_2016_0355842_A1-62 (88.17% de identidade, 93.04% de similaridade) WP_017762581.1 (85.91% de identidade, 91.0% de similaridade) APG03573.0 (82.09% de identidade,
89.04% de similaridade) APG00424.0 US_2016_0366881_A1-52 (77.46% de identidade, 84.62% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_060852738.1 (77.46% de identidade, 84.62% de similaridade) APG05278.0 (50.66% de identidade,
63.29% de similaridade) APG05402.0 (48.45% de identidade,
61.01% de similaridade) APG04280.0 (43.19% de identidade,
55.17% de similaridade) APG07124.0 213 214,215,216 Cry 90,91,92,93, 94,95,96,97,98, US_8318900_B2-205 (88.26% de 94,95,96,97, 99,100 identidade, 93.72% de similaridade) 98,99,100 APG01742.0 (86.16% de identidade,
92.21% de similaridade) APG00672.0 US_2017_0175134_A1-91 (85.81% de identidade, 91.98% de similaridade) APG00045.0 US_2016_0304898_A1-73 (82.69% de identidade, 88.57% de similaridade) US_8318900_B2-69 (80.35% de identidade, 85.7% de similaridade) APG01644.0 (63.51% de identidade,
76.69% de similaridade) APG04374.0 (63.39% de identidade,
75.59% de similaridade) APG00110.0 US_2016_0177333_A1-60 (63.02%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 74.53% de similaridade) US_8318900_B2-207 (58.98% de identidade, 63.49% de similaridade) EOO24729.1 (49.61% de identidade,
61.83% de similaridade) APG07570.0 217 MTX 30,35,40,45, 35,40,45,50,55, US_2015_0218583_A1-6 (27.36% de 50,55,60,65, 60,65,70,75,80, identidade, 32.57% de similaridade) 70,75,80,85, 85,90,91,92,93, APG00146.0 90,91,92,93, 94,95,96,97,98, US_2016_0304898_A1-166 (25.15% 94,95,96,97, 99,100 de identidade, 30.67% de 98,99,100 similaridade) APG07719.0 218 Cry 55,60,65,70, 65,70,75,80,85, WP_061139797.1 (55.02% de 75,80,85,90, 90,91,92,93,94, identidade, 69.35% de similaridade) 91,92,93,94, 95,96,97,98,99, APG05228.0 (54.46% de identidade, 95,96,97,98, 100 61.43% de similaridade) 99,100 APG00787.0 US_2017_0175134_A1-156 (44.86% de identidade, 60.2% de similaridade) KXH80331.1 (38.99% de identidade,
54.89% de similaridade) APG02533.0 (37.93% de identidade,
52.82% de similaridade) WP_082770008.1 (37.83% de identidade, 53.26% de similaridade) APG00232.0 US_2016_0311864_A1-87 (37.72%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 49.57% de similaridade) APG00471.0 US_2016_0366881_A1-85 (37.41% de identidade, 48.47% de similaridade) APG09282.0 (36.35% de identidade,
51.28% de similaridade) APG09630.0 (35.83% de identidade,
48.75% de similaridade) APG07775.0 219 220 Cry 60,65,70,75, 70,75,80,85,90, WP_016098327.1 (57.71% de 80,85,90,91, 91,92,93,94,95, identidade, 70.18% de similaridade) 92,93,94,95, 96,97,98,99,100 US_9567381_B2-232 (57.23% de 96,97,98,99, identidade, 69.8% de similaridade) 100 APG07037.0 (55.46% de identidade,
69.42% de similaridade) OUB62847.1 (55.27% de identidade,
69.89% de similaridade) WO_2017_146899-26 (55.18% de identidade, 68.13% de similaridade) AGV55017.1 (54.66% de identidade,
68.13% de similaridade) WO_2017_146899-16 (54.41% de identidade, 69.65% de similaridade) US_9567381_B2-233 (54.38% de identidade, 69.12% de similaridade) US_8461415_B2-30 (54.31% de identidade, 68.66% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WO_2017_146899-21 (54.03% de identidade, 69.4% de similaridade) APG07824.0 221 MTX 35,40,45,50, 55,60,65,70,75, APG02088.0 (79.07% de identidade, 55,60,65,70, 80,85,90,91,92, 87.38% de similaridade) 75,80,85,90, 93,94,95,96,97, APG00598.0 91,92,93,94, 98,99,100 US_2016_0355842_A1-140 (34.91% 95,96,97,98, de identidade, 54.4% de similaridade) 99,100 APG05918.0 (34.19% de identidade,
53.35% de similaridade) APG06880.0 (32.93% de identidade,
50.0% de similaridade) APG02633.0 (28.99% de identidade,
48.21% de similaridade) APG07937.0 222 223 Cry 65,70,75,80, 65,70,75,80,85, APG07707.0 (61.04% de identidade, 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, 63.92% de similaridade) 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, APG00372.0 97,98,99,100 100 US_2016_0311864_A1-150 (48.7% de identidade, 59.11% de similaridade) APG00615.0 US_2016_0366881_A1-119 (48.24% de identidade, 58.81% de similaridade) APG05402.0 (40.7% de identidade,
51.59% de similaridade) APG00467.0 US_2016_0311864_A1-184 (39.57%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 51.85% de similaridade) APG03573.0 (39.09% de identidade,
51.27% de similaridade) APG00435.0 US_2016_0366881_A1-59 (38.94% de identidade, 51.16% de similaridade) WP_086420153.1 (38.94% de identidade, 51.16% de similaridade) US_8461415_B2-45 (38.14% de identidade, 50.08% de similaridade) WP_044306759.1 (38.14% de identidade, 50.08% de similaridade) APG07972.0 224 Cry 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, APG00677.0 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, US_2017_0175134_A1-98 (80.06% 97,98,99,100 100 de identidade, 88.04% de similaridade) APG00003.0 US_2016_0304898_A1-4 (65.34% de identidade, 78.99% de similaridade) BAE79727.1 (36.2% de identidade,
51.04% de similaridade) US_2016_0345590_A1-2 (36.0% de identidade, 50.76% de similaridade) KIQ78015.1 (35.34% de identidade,
49.67% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene CA_2844913-74 (34.89% de identidade, 49.2% de similaridade) CA_2844913-73 (34.85% de identidade, 49.13% de similaridade) 2C9K_A (34.81% de identidade,
49.57% de similaridade) APG00864.0 US_2017_0175134_A1-174 (33.47% de identidade, 47.54% de similaridade) US_8318900_B2-83 (33.06% de identidade, 45.93% de similaridade) APG08011.0 225 MTX 90,91,92,93, 93,94,95,96,97, APG00036.0 94,95,96,97, 98,99, 100 US_2016_0304898_A1-60 (86.96% 98,99,100 de identidade, 92.64% de similaridade) APG04720.0 (84.62% de identidade,
91.3% de similaridade) APG08088.0 (80.94% de identidade,
88.63% de similaridade) APG01506.0 (80.13% de identidade,
87.54% de similaridade) APG03379.0 (79.26% de identidade,
86.96% de similaridade) APG09682.0 (78.52% de identidade,
87.58% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00006.0 US_2016_0304898_A1-9 (78.43% de identidade, 85.62% de similaridade) APG00022.0 US_2016_0304898_A1-37 (78.15% de identidade, 85.76% de similaridade) APG08241.0 (77.78% de identidade,
87.21% de similaridade) APG07655.0 (77.52% de identidade,
84.9% de similaridade) APG08060.0 226 Cry 93,94,95,96, 97,98,99,100 APG00508.0 97,98,99,100 US_2016_0355842_A1-111 (92.74% de identidade, 96.37% de similaridade) APG00355.0 US_2016_0311864_A1-145 (84.51% de identidade, 91.35% de similaridade) APG00250.0 US_2016_0355842_A1-37 (29.57% de identidade, 45.7% de similaridade) APG00053.0 US_2016_0304898_A1-83 (29.39% de identidade, 45.52% de similaridade) WP_044306828.1 (29.39% de identidade, 45.52% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_061139982.1 (27.01% de identidade, 45.07% de similaridade) APG07719.0 (26.86% de identidade,
41.91% de similaridade) APG05830.0 (25.64% de identidade,
44.91% de similaridade) APG00313.0 US_2016_0366881_A1-8 (25.26% de identidade, 40.21% de similaridade) WP_086420177.1 (25.26% de identidade, 40.21% de similaridade) APG08114.0 227 228 Cry 90,91,92,93, 92,93,94,95,96, US_7919272_B2-5 (87.55% de 94,95,96,97, 97,98,99,100 identidade, 91.75% de similaridade) 98,99,100 US_7919272_B2-17 (87.41% de identidade, 91.75% de similaridade) US_7919272_B2-33 (87.26% de identidade, 91.46% de similaridade) US_8692066_B2-2 (86.55% de identidade, 91.52% de similaridade) APG01028.0 US_2017_0175134_A1-200 (85.84% de identidade, 91.04% de similaridade) APA45008.1 (78.18% de identidade,
85.36% de similaridade) APG00555.0 US_2017_0175134_A1-33 (68.37%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 77.99% de similaridade) APG01883.0 (68.27% de identidade,
78.31% de similaridade) CA_2516349-20 (65.46% de identidade, 75.72% de similaridade) CA_2516349-22 (64.02% de identidade, 74.13% de similaridade) APG08142.0 229 Cry 40,45,50,55, 55,60,65,70,75, WP_088435184.1 (95.92% de 60,65,70,75, 80,85,90,91,92, identidade, 96.12% de similaridade) 80,85,90,91, 93,94,95,96,97, WP_083491861.1 (43.37% de 92,93,94,95, 98,99,100 identidade, 57.23% de similaridade) 96,97,98,99, KRG77153.1 (39.8% de identidade, 100 52.04% de similaridade) APG00455.0 US_2016_0355842_A1-96 (37.86% de identidade, 51.96% de similaridade) WP_086071335.1 (37.86% de identidade, 51.96% de similaridade) WP_080335079.1 (29.73% de identidade, 42.42% de similaridade) APG01944.0 (28.35% de identidade,
37.49% de similaridade) WP_082090600.1 (26.36% de identidade, 38.91% de similaridade) WP_084635608.1 (26.17% de identidade, 41.31% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene AKB25582.1 (25.64% de identidade,
38.18% de similaridade) APG08243.0 230 231 Cry 65,70,75,80, 75,80,85,90,91, US_8318900_B2-91 (61.62% de 85,90,91,92, 92,93,94,95,96, identidade, 73.25% de similaridade) 93,94,95,96, 97,98,99,100 APG00375.0 97,98,99,100 US_2016_0311864_A1-152 (42.56% de identidade, 56.92% de similaridade) APG01679.0 (35.68% de identidade,
48.48% de similaridade) WP_048536362.1 (35.68% de identidade, 48.48% de similaridade) APG03986.0 (33.98% de identidade,
47.83% de similaridade) APG07937.0 (33.39% de identidade,
49.3% de similaridade) APG00435.0 US_2016_0366881_A1-59 (33.28% de identidade, 49.76% de similaridade) WP_086420153.1 (33.28% de identidade, 49.76% de similaridade) APG09140.0 (32.43% de identidade,
47.76% de similaridade) APG00285.0 US_2016_0311864_A1-118 (32.39% de identidade, 45.85% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG08288.0 232 233 MTX 50,55,60,65, 55,60,65,70,75, APG06988.0 (84.88% de identidade, 70,75,80,85, 80,85,90,91,92, 88.34% de similaridade) 90,91,92,93, 93,94,95,96,97, APG05252.0 (47.77% de identidade, 94,95,96,97, 98,99,100 52.23% de similaridade) 98,99,100 APG00228.0 US_2016_0355842_A1-31 (25.57% de identidade, 40.12% de similaridade) WP_065486138.1 (25.16% de identidade, 36.66% de similaridade) APG08332.0 234 Cyt 5,10,15,20,2 5,10,15,20,25,3 APG05921.0 (33.02% de identidade, 5,30,35,40,4 0,35,40,45,50,5 47.35% de similaridade) 5,50,55,60,6 5,60,65,70,75,8 5,70,75,80,8 0,85,90,91,92,9 5,90,91,92,9 3,94,95,96,97,9 3,94,95,96,9 8,99,100 7,98,99,100 APG08365.0 235 236 MTX 60,65,70,75, 75,80,85,90,91, APG00528.0 80,85,90,91, 92,93,94,95,96, US_2017_0175134_A1-20 (57.18% 92,93,94,95, 97,98,99,100 de identidade, 71.06% de 96,97,98,99, similaridade) 100 APG02038.0 (54.21% de identidade,
65.79% de similaridade) APG03662.0 (53.95% de identidade,
66.05% de similaridade) APG00661.0 US_2017_0175134_A1-83 (51.95% de identidade, 65.19% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG06508.0 US_2017_0175134_A1-217 (51.83% de identidade, 65.18% de similaridade) APG09801.0 US_2017_0175134_A1-218 (51.57% de identidade, 64.66% de similaridade) US_8829279_B2-35 (51.18% de identidade, 64.04% de similaridade) US_8318900_B2-62 (50.52% de identidade, 64.06% de similaridade) US_8829279_B2-25 (49.48% de identidade, 64.4% de similaridade) US_8318900_B2-64 (49.21% de identidade, 61.78% de similaridade) APG08425.0 237 238 Bin 35,40,45,50, 45,50,55,60,65, WP_078403805.1 (98.03% de 55,60,65,70, 70,75,80,85,90, identidade, 98.87% de similaridade) 75,80,85,90, 91,92,93,94,95, WP_071741307.1 (97.75% de 91,92,93,94, 96,97,98,99,100 identidade, 98.59% de similaridade) 95,96,97,98, SDL43004.1 (84.23% de identidade, 99,100 84.51% de similaridade) WP_051395691.1 (33.18% de identidade, 43.5% de similaridade) WP_078404250.1 (32.35% de identidade, 44.34% de similaridade) APG05563.0 (31.78% de identidade,
42.89% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_028398598.1 (28.06% de identidade, 38.89% de similaridade) WP_093780716.1 (25.76% de identidade, 31.3% de similaridade) WP_093780716.1 (25.76% de identidade, 31.3% de similaridade) APG08578.0 239 240 Cry 98,99,100 99,100 APG00034.0 US_2016_0177333_A1-14 (97.59% de identidade, 98.56% de similaridade) APG03555.0 (97.59% de identidade,
98.32% de similaridade) APG05886.0 (86.54% de identidade,
89.61% de similaridade) APG00383.0 US_2017_0175134_A1-6 (61.93% de identidade, 74.85% de similaridade) APG00101.0 US_2016_0177333_A1-57 (61.31% de identidade, 73.78% de similaridade) APG00002.0 US_2016_0177333_A1-1 (59.45% de identidade, 70.11% de similaridade) OPA06342.1 (56.86% de identidade,
71.28% de similaridade) WP_078401734.1 (56.47% de identidade, 70.79% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00048.0 US_2016_0177333_A1-22 (50.39% de identidade, 64.42% de similaridade) APG00608.0 US_2017_0175134_A1-55 (49.55% de identidade, 61.93% de similaridade) APG08608.0 241 242,243 MTX 5,10,15,20,2 5,10,15,20,25,3 EEM02132.1 (97.93% de identidade, 5,30,35,40,4 0,35,40,45,50,5 97.93% de similaridade) 5,50,55,60,6 5,60,65,70,75,8 SFQ92011.1 (94.25% de identidade, 5,70,75,80,8 0,85,90,91,92,9 97.01% de similaridade) 5,90,91,92,9 3,94,95,96,97,9 SDZ42740.1 (88.97% de identidade, 3,94,95,96,9 8,99,100 94.25% de similaridade) 7,98,99,100 WP_033794937.1 (26.21% de identidade, 26.44% de similaridade) KIV72254.1 (25.52% de identidade,
25.75% de similaridade) WP_044441224.1 (25.52% de identidade, 25.75% de similaridade) APG08610.0 244 245 Cry 95,96,97,98, 97,98,99,100 APG00452.0 99,100 US_2016_0366881_A1-73 (94.21% de identidade, 96.85% de similaridade) WP_081097654.1 (92.39% de identidade, 95.03% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00196.0 US_2016_0311864_A1-66 (79.9% de identidade, 88.63% de similaridade) APG00113.0 US_2016_0311864_A1-24 (79.7% de identidade, 88.93% de similaridade) APG00030.0 US_2016_0304898_A1-50 (66.26% de identidade, 79.64% de similaridade) APG01313.0 (64.91% de identidade,
79.31% de similaridade) APG00096.0 US_2016_0304898_A1-125 (63.42% de identidade, 78.09% de similaridade) US_8461415_B2-14 (63.33% de identidade, 78.69% de similaridade) US_8461415_B2-42 (63.23% de identidade, 78.69% de similaridade) WP_089149092.1 (62.36% de identidade, 76.89% de similaridade) APG08633.0 246 247 MTX 30,35,40,45, 45,50,55,60,65, APG04347.0 (36.57% de identidade, 50,55,60,65, 70,75,80,85,90, 52.57% de similaridade) 70,75,80,85, 91,92,93,94,95, ADK08315.1 (35.18% de identidade, 90,91,92,93, 96,97,98,99,100 48.75% de similaridade) 94,95,96,97, APG02835.0 (34.63% de identidade, 98,99,100 49.86% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene AIK29697.1 (33.16% de identidade,
46.74% de similaridade) WP_000052062.1 (32.41% de identidade, 44.88% de similaridade) KOS27986.1 (32.41% de identidade,
44.6% de similaridade) WP_085783006.1 (32.13% de identidade, 44.88% de similaridade) WP_033647182.1 (32.13% de identidade, 44.6% de similaridade) WP_079230709.1 (29.04% de identidade, 41.37% de similaridade) APG04127.0 (28.64% de identidade,
42.2% de similaridade) APG08645.0 248 Cry 35,40,45,50, 55,60,65,70,75, WP_050595421.1 (42.21% de 55,60,65,70, 80,85,90,91,92, identidade, 49.96% de similaridade) 75,80,85,90, 93,94,95,96,97, AHI15917.1 (38.31% de identidade, 91,92,93,94, 98,99,100 45.34% de similaridade) 95,96,97,98, CA_2840683-3 (31.18% de 99,100 identidade, 50.41% de similaridade) US_7923602_B2-7 (29.77% de identidade, 47.6% de similaridade) US_7923602_B2-8 (29.77% de identidade, 47.6% de similaridade) US_2011_0239334_A1-83 (29.31% de identidade, 46.68% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_7923602_B2-19 (29.13% de identidade, 46.71% de similaridade) US_7923602_B2-23 (29.1% de identidade, 46.9% de similaridade) US_8147856_B2-22 (29.1% de identidade, 46.9% de similaridade) US_2011_0239334_A1-81 (28.97% de identidade, 46.43% de similaridade) APG08689.0 249 250 MTX 75,80,85,90, 80,85,90,91,92, APG00112.0 91,92,93,94, 93,94,95,96,97, US_2016_0311864_A1-23 (73.29% 95,96,97,98, 98,99,100 de identidade, 79.53% de 99, 100 similaridade) US_8318900_B2-95 (69.05% de identidade, 78.87% de similaridade) US_8318900_B2-94 (64.29% de identidade, 78.57% de similaridade) US_8318900_B2-191 (60.71% de identidade, 73.81% de similaridade) APG00332.0 US_2016_0355842_A1-64 (54.46% de identidade, 67.26% de similaridade) APG00907.0 US_2016_0311864_A1-225 (53.73% de identidade, 67.46% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG07396.0 (50.72% de identidade,
67.72% de similaridade) APG09084.0 (45.0% de identidade,
60.59% de similaridade) APG00360.0 US_2016_0355842_A1-69 (42.15% de identidade, 57.27% de similaridade) APG02548.0 (39.82% de identidade,
57.23% de similaridade) APG08802.0 251 252,253 MTX 55,60,65,70, 75,80,85,90,91, APG04305.0 (98.37% de identidade, 75,80,85,90, 92,93,94,95,96, 99.73% de similaridade) 91,92,93,94, 97,98,99,100 APG00154.0 95,96,97,98, US_2016_0355842_A1-5 (54.59% de 99,100 identidade, 71.89% de similaridade) WP_090920591.1 (54.05% de identidade, 72.16% de similaridade) APG00594.0 US_2016_0355842_A1-137 (54.05% de identidade, 71.35% de similaridade) APG00486.0 US_2016_0355842_A1-107 (52.94% de identidade, 71.39% de similaridade) APG06851.0 (51.29% de identidade,
66.75% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00483.0 US_2016_0355842_A1-104 (51.04% de identidade, 65.54% de similaridade) APG00475.0 US_2016_0366881_A1-90 (50.13% de identidade, 69.09% de similaridade) APG00421.0 US_2016_0355842_A1-86 (49.74% de identidade, 66.24% de similaridade) APG00269.0 US_2016_0355842_A1-46 (49.61% de identidade, 68.83% de similaridade) APG08824.0 254 255 Cry 92,93,94,95, 95,96,97,98,99, WP_061685895.1 (91.6% de 96,97,98,99, 100 identidade, 95.1% de similaridade) 100 WP_087986441.1 (91.36% de identidade, 95.18% de similaridade) US_8318900_B2-18 (91.12% de identidade, 94.9% de similaridade) US_8318900_B2-67 (91.12% de identidade, 94.9% de similaridade) US_8318900_B2-151 (59.69% de identidade, 61.32% de similaridade) US_8759619_B2-21 (58.86% de identidade, 71.46% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8759619_B2-21 (58.86% de identidade, 71.46% de similaridade) AHI15915.1 (46.81% de identidade,
59.13% de similaridade) US_8318900_B2-68 (46.01% de identidade, 57.98% de similaridade) US_8461421_B2-81 (45.83% de identidade, 56.79% de similaridade) APG08828.0 256 257,258 MTX 60,65,70,75, 70,75,80,85,90, APG07235.0 (57.51% de identidade, 80,85,90,91, 91,92,93,94,95, 69.69% de similaridade) 92,93,94,95, 96,97,98,99,100 APG09329.0 (50.0% de identidade, 96,97,98,99, 64.81% de similaridade) 100 APG08330.0 (49.47% de identidade,
64.81% de similaridade) AGC39300.1 (39.35% de identidade,
52.63% de similaridade) WP_043924590.1 (38.96% de identidade, 52.99% de similaridade) US_8461415_B2-32 (38.27% de identidade, 55.8% de similaridade) WP_001267112.1 (38.27% de identidade, 55.26% de similaridade) WP_078401252.1 (37.63% de identidade, 55.79% de similaridade) WP_023524027.1 (36.6% de identidade, 52.06% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_2016_0017363_A1-59 (36.27% de identidade, 51.47% de similaridade) ANS51604.1 (36.27% de identidade,
51.2% de similaridade) APG08831.0 259 260,261 MTX 85,90,91,92, 92,93,94,95,96, WP_088023823.1 (91.69% de 93,94,95,96, 97,98,99,100 identidade, 94.38% de similaridade) 97,98,99,100 APG03484.0 (83.89% de identidade,
86.35% de similaridade) APG00366.0 US_2016_0366881_A1-37 (83.62% de identidade, 91.93% de similaridade) APG00923.0 (64.15% de identidade,
76.59% de similaridade) APG02362.0 (63.81% de identidade,
76.28% de similaridade) APG06372.0 (63.66% de identidade,
76.59% de similaridade) APG03337.0 (63.66% de identidade,
76.1% de similaridade) APG04650.0 (63.66% de identidade,
75.85% de similaridade) WP_078185377.1 (63.41% de identidade, 76.34% de similaridade) APG02194.0 (63.41% de identidade,
76.1% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene CDN39409.1 (63.41% de identidade,
76.1% de similaridade) KXY21848.1 (63.41% de identidade,
76.1% de similaridade) APG00129.0 US_2016_0304898_A1-158 (63.41% de identidade, 75.61% de similaridade) APG08907.0 262 263 MTX 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, APG00719.0 97,98,99,100 100 US_2016_0355842_A1-164 (92.43% de identidade, 94.95% de similaridade) WP_044797732.1 (50.79% de identidade, 67.3% de similaridade) APG00049.0 US_2016_0304898_A1-78 (49.68% de identidade, 64.97% de similaridade) WP_001036192.1 (49.52% de identidade, 66.35% de similaridade) APG03746.0 (49.04% de identidade,
65.61% de similaridade) APG05497.0 (48.72% de identidade,
66.35% de similaridade) WP_065211994.1 (48.25% de identidade, 65.71% de similaridade) WP_090978818.1 (48.1% de identidade, 65.51% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03297.0 (46.93% de identidade,
62.27% de similaridade) WP_003290257.1 (46.93% de identidade, 62.27% de similaridade) APG08935.0 264 MTX 5,10,15,20,2 5,10,15,20,25,3 5,30,35,40,4 0,35,40,45,50,5 5,50,55,60,6 5,60,65,70,75,8 5,70,75,80,8 0,85,90,91,92,9 5,90,91,92,9 3,94,95,96,97,9 3,94,95,96,9 8,99,100 7,98,99,100 APG08969.0 265 266 MTX 90,91,92,93, 95,96,97,98,99, APG02293.0 (89.88% de identidade, 94,95,96,97, 100 94.79% de similaridade) 98,99,100 APG05337.0 (88.96% de identidade,
94.17% de similaridade) WP_086397429.1 (88.65% de identidade, 94.48% de similaridade) WP_050845726.1 (88.65% de identidade, 94.17% de similaridade) WP_000823322.1 (88.34% de identidade, 93.87% de similaridade) WP_016084062.1 (88.04% de identidade, 92.94% de similaridade) APG07936.0 (87.73% de identidade,
93.87% de similaridade) APG01949.0 (87.73% de identidade,
93.56% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG04251.0 (87.73% de identidade,
92.64% de similaridade) WP_016085044.1 (87.73% de identidade, 92.64% de similaridade) APG09007.0 267 268 Cry 80,85,90,91, 85,90,91,92,93, APG06997.0 (75.52% de identidade, 92,93,94,95, 94,95,96,97,98, 83.97% de similaridade) 96,97,98,99, 99,100 APG09512.0 (51.56% de identidade, 100 60.9% de similaridade) APG04492.0 (51.38% de identidade,
60.73% de similaridade) APG00626.0 US_2016_0366881_A1-124 (39.17% de identidade, 55.06% de similaridade) APG02807.0 (35.95% de identidade,
55.02% de similaridade) APG05103.0 (34.1% de identidade,
50.25% de similaridade) APG01212.0 (33.44% de identidade,
52.3% de similaridade) APG00460.0 US_2016_0366881_A1-75 (33.06% de identidade, 48.03% de similaridade) WP_078205743.1 (32.89% de identidade, 48.03% de similaridade) US_8318900_B2-90 (32.62% de identidade, 51.8% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG09140.0 269 270 Cry 65,70,75,80, 80,85,90,91,92, APG00285.0 85,90,91,92, 93,94,95,96,97, US_2016_0311864_A1-118 (62.02% 93,94,95,96, 98,99,100 de identidade, 76.78% de 97,98,99,100 similaridade) APG00363.0 US_2016_0366881_A1-34 (61.69% de identidade, 76.45% de similaridade) APG00255.0 US_2016_0311864_A1-98 (50.96% de identidade, 63.54% de similaridade) APG00401.0 US_2016_0311864_A1-168 (50.56% de identidade, 63.04% de similaridade) APG01679.0 (46.1% de identidade,
61.21% de similaridade) WP_048536362.1 (46.1% de identidade, 61.21% de similaridade) APG00219.0 US_2016_0311864_A1-80 (44.74% de identidade, 59.65% de similaridade) APG00435.0 US_2016_0366881_A1-59 (41.82% de identidade, 57.7% de similaridade) WP_086420153.1 (41.82% de identidade, 57.7% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (38.04% de identidade, 50.52% de similaridade) APG09227.0 271 Cry 45,50,55,60, 65,70,75,80,85, US_8318900_B2-111 (43.5% de 65,70,75,80, 90,91,92,93,94, identidade, 60.88% de similaridade) 85,90,91,92, 95,96,97,98,99, US_8318900_B2-80 (43.2% de 93,94,95,96, 100 identidade, 60.45% de similaridade) 97,98,99,100 APG07799.0 (42.15% de identidade,
58.68% de similaridade) APG01634.0 (41.38% de identidade,
57.49% de similaridade) WP_016099738.1 (41.17% de identidade, 57.16% de similaridade) US_8461415_B2-28 (36.51% de identidade, 52.14% de similaridade) US_8461415_B2-1 (35.6% de identidade, 51.11% de similaridade) APG00864.0 US_2017_0175134_A1-174 (31.79% de identidade, 46.25% de similaridade) US_8318900_B2-83 (31.76% de identidade, 46.57% de similaridade) US_8461421_B2-120 (31.11% de identidade, 45.98% de similaridade) APG09282.0 272 273,274 Cry 60,65,70,75, APG02533.0 (65.83% de identidade, 80,85,90,91, 75.82% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 92,93,94,95, APG00787.0 96,97,98,99, US_2017_0175134_A1-156 (59.17% 100 de identidade, 68.5% de similaridade) KXH80331.1 (52.62% de identidade,
63.98% de similaridade) WP_082770008.1 (51.09% de identidade, 62.12% de similaridade) APG00471.0 US_2016_0366881_A1-85 (48.99% de identidade, 64.43% de similaridade) 70,75,80,85,90, APG00232.0 91,92,93,94,95, US_2016_0311864_A1-87 (47.08% 96,97,98,99,100 de identidade, 60.93% de similaridade) APG05689.0 (45.06% de identidade,
58.18% de similaridade) APG09630.0 (44.88% de identidade,
55.12% de similaridade) APG00723.0 US_2016_0311864_A1-209 (44.6% de identidade, 55.4% de similaridade) APG05439.0 (44.31% de identidade,
57.23% de similaridade) APG09313.0 275 276 MTX 45,50,55,60, 65,70,75,80,85, APG08794.0 (42.98% de identidade, 65,70,75,80, 90,91,92,93,94, 62.87% de similaridade) 85,90,91,92, 95,96,97,98,99, WP_093292902.1 (34.54% de 100 identidade, 52.37% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene 93,94,95,96, APG00854.0 97,98,99,100 US_2016_0355842_A1-179 (33.6% de identidade, 46.93% de similaridade) APG00911.0 US_2016_0355842_A1-189 (33.51% de identidade, 49.33% de similaridade) WP_065486138.1 (32.71% de identidade, 48.26% de similaridade) WP_065487080.1 (32.71% de identidade, 48.26% de similaridade) APG06273.0 (31.99% de identidade,
47.31% de similaridade) WP_000844424.1 (31.9% de identidade, 46.11% de similaridade) US_8829279_B2-11 (31.85% de identidade, 47.78% de similaridade) WP_000844425.1 (31.64% de identidade, 46.11% de similaridade) WP_078204211.1 (31.64% de identidade, 46.11% de similaridade) APG09426.0 277 278,279 MTX 85,90,91,92, 90,91,92,93,94, APG02187.0 (81.07% de identidade, 93,94,95,96, 95,96,97,98,99, 87.73% de similaridade) 97,98,99,100 100 WP_075716659.1 (77.87% de identidade, 83.73% de similaridade) US_8461415_B2-26 (77.84% de identidade, 84.96% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8461415_B2-60 (77.84% de identidade, 84.96% de similaridade) WP_078187999.1 (76.88% de identidade, 83.06% de similaridade) WP_075716648.1 (61.17% de identidade, 75.8% de similaridade) APG08817.0 (59.57% de identidade,
74.47% de similaridade) WP_078188005.1 (54.74% de identidade, 59.47% de similaridade) APG05653.0 (34.84% de identidade,
53.46% de similaridade) APG05385.0 (34.29% de identidade,
53.93% de similaridade) APG09496.0 280 281 Cry 70,75,80,85, 80,85,90,91,92, APG02776.0 (67.77% de identidade, 90,91,92,93, 93,94,95,96,97, 79.58% de similaridade) 94,95,96,97, 98,99,100 WP_016083794.1 (67.77% de 98,99,100 identidade, 79.58% de similaridade) APG00026.0 US_2016_0304898_A1-43 (66.79% de identidade, 78.93% de similaridade) APG00781.0 US_2017_0175134_A1-146 (65.52% de identidade, 78.57% de similaridade) US_7919272_B2-27 (64.91% de identidade, 79.34% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00109.0 US_2016_0304898_A1-135 (64.16% de identidade, 75.03% de similaridade) US_7919272_B2-14 (64.05% de identidade, 78.29% de similaridade) US_7919272_B2-2 (64.05% de identidade, 78.29% de similaridade) CA_2844913-30 (58.79% de identidade, 68.76% de similaridade) AFU17323.1 (56.64% de identidade,
68.31% de similaridade) APG09535.0 282 283 MTX 91,92,93,94, 92,93,94,95,96, WP_078187816.1 (100.0% de 95,96,97,98, 97,98,99,100 identidade, 100.0% de similaridade) 99,100 APG00681.0 US_2016_0355842_A1-158 (90.6% de identidade, 91.74% de similaridade) WP_075719043.1 (80.0% de identidade, 87.9% de similaridade) WP_075716758.1 (79.41% de identidade, 86.76% de similaridade) APG05777.0 (79.26% de identidade,
87.65% de similaridade) WP_078185377.1 (67.16% de identidade, 80.25% de similaridade) APG00129.0 US_2016_0304898_A1-158 (67.16%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 79.75% de similaridade) APG04650.0 (66.91% de identidade,
80.25% de similaridade) APG02362.0 (66.91% de identidade,
79.75% de similaridade) APG02421.0 (66.75% de identidade,
79.61% de similaridade) OQR53340.1 (66.75% de identidade,
79.06% de similaridade) APG09578.0 284 285 Cyt 90,91,92,93, 90,91,92,93,94, AJW76687.1 (95.77% de identidade, 94,95,96,97, 95,96,97,98,99, 97.5% de similaridade) 98,99,100 100 APG00624.0 US_2017_0175134_A1-60 (88.66% de identidade, 89.53% de similaridade) US_7919272_B2-24 (49.05% de identidade, 65.34% de similaridade) US_7919272_B2-24 (49.05% de identidade, 65.34% de similaridade) US_7919272_B2-12 (48.86% de identidade, 65.34% de similaridade) US_7919272_B2-12 (48.86% de identidade, 65.34% de similaridade) US_2016_0339078_A1-29248 (48.48% de identidade, 63.83% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_2016_0339078_A1-29248 (48.48% de identidade, 63.83% de similaridade) US_8829279_B2-43 (47.26% de identidade, 66.35% de similaridade) WP_088071701.1 (46.77% de identidade, 65.59% de similaridade) WP_088071701.1 (46.77% de identidade, 65.59% de similaridade) APG09594.0 286 287 MTX 5,10,15,20,2 5,10,15,20,25,3 WP_078403561.1 (86.08% de 5,30,35,40,4 0,35,40,45,50,5 identidade, 92.66% de similaridade) 5,50,55,60,6 5,60,65,70,75,8 WP_078796002.1 (85.82% de 5,70,75,80,8 0,85,90,91,92,9 identidade, 92.91% de similaridade) 5,90,91,92,9 3,94,95,96,97,9 WP_078724987.1 (85.82% de 3,94,95,96,9 8,99,100 identidade, 92.66% de similaridade) 7,98,99,100 WP_059343679.1 (85.57% de identidade, 92.91% de similaridade) WP_069148373.1 (85.57% de identidade, 92.66% de similaridade) WP_078780841.1 (85.57% de identidade, 92.41% de similaridade) WP_078703369.1 (85.32% de identidade, 92.41% de similaridade) WP_034868662.1 (85.06% de identidade, 92.41% de similaridade) WP_021348870.1 (77.56% de identidade, 86.28% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_093320930.1 (35.6% de identidade, 53.86% de similaridade) APG09641.0 288 MTX 40,45,50,55, 60,65,70,75,80, APG00609.0 60,65,70,75, 85,90,91,92,93, US_2017_0175134_A1-57 (39.78% 80,85,90,91, 94,95,96,97,98, de identidade, 55.8% de similaridade) 92,93,94,95, 99,100 APG00224.0 96,97,98,99, US_2016_0355842_A1-28 (39.39% 100 de identidade, 57.02% de similaridade) APG03760.0 (39.11% de identidade,
55.31% de similaridade) APG02280.0 (39.11% de identidade,
54.19% de similaridade) APG00846.0 US_2016_0355842_A1-177 (38.48% de identidade, 53.65% de similaridade) US_8318900_B2-65 (38.14% de identidade, 52.82% de similaridade) US_8829279_B2-37 (38.04% de identidade, 53.8% de similaridade) APG05634.0 (37.74% de identidade,
52.56% de similaridade) APG00513.0 US_2017_0175134_A1-14 (37.64% de identidade, 53.93% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8318900_B2-63 (36.54% de identidade, 51.92% de similaridade) APG09713.0 289 290 Cry 90,91,92,93, 91,92,93,94,95, APG00396.0 94,95,96,97, 96,97,98,99,100 US_2016_0311864_A1-163 (86.44% 98,99,100 de identidade, 90.49% de similaridade) APG00043.0 US_2016_0304898_A1-69 (31.85% de identidade, 45.87% de similaridade) APG00288.0 US_2016_0311864_A1-122 (31.6% de identidade, 44.79% de similaridade) APG01679.0 (30.21% de identidade,
43.66% de similaridade) WP_048536362.1 (30.21% de identidade, 43.66% de similaridade) APG00435.0 US_2016_0366881_A1-59 (29.32% de identidade, 43.01% de similaridade) WP_086420153.1 (29.32% de identidade, 43.01% de similaridade) APG00446.0 US_2016_0366881_A1-68 (29.14% de identidade, 44.27% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene US_8318900_B2-90 (29.09% de identidade, 44.99% de similaridade) APG00334.0 US_2016_0366881_A1-17 (29.04% de identidade, 43.33% de similaridade) APG09727.0 291 Cry 97,98,99,100 98,99,100 APG00553.0 US_2016_0355842_A1-124 (96.3% de identidade, 97.98% de similaridade) APG04454.0 (81.54% de identidade,
89.93% de similaridade) APG00480.0 US_2016_0355842_A1-102 (68.23% de identidade, 83.78% de similaridade) APG00733.0 US_2016_0355842_A1-165 (58.44% de identidade, 75.0% de similaridade) APG03264.0 (50.24% de identidade,
67.05% de similaridade) APG00296.0 US_2016_0355842_A1-52 (49.68% de identidade, 64.72% de similaridade) APG07033.0 (47.48% de identidade,
62.89% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG00702.0 US_2017_0175134_A1-115 (28.38% de identidade, 44.1% de similaridade) APG00255.0 US_2016_0311864_A1-98 (25.52% de identidade, 38.91% de similaridade) APG05091.0 (25.25% de identidade,
36.23% de similaridade) APG09856.0 292 293,294 MTX 40,45,50,55, 60,65,70,75,80, US_8461421_B2-111 (36.83% de 60,65,70,75, 85,90,91,92,93, identidade, 51.5% de similaridade) 80,85,90,91, 94,95,96,97,98, EP_3122882-24 (36.26% de 92,93,94,95, 99,100 identidade, 57.31% de similaridade) 96,97,98,99, EP_3122882-22 (35.99% de 100 identidade, 57.52% de similaridade) WP_090978779.1 (35.99% de identidade, 57.52% de similaridade) EP_3122882-10 (35.96% de identidade, 57.31% de similaridade) CA_2844913-66 (34.82% de identidade, 54.46% de similaridade) EP_3122882-8 (34.64% de identidade, 51.81% de similaridade) CA_2844913-65 (34.52% de identidade, 54.46% de similaridade) EP_3122882-59 (33.04% de identidade, 50.14% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene EP_3122882-4 (32.75% de identidade, 49.57% de similaridade) EP_3122882-14 (32.75% de identidade, 49.28% de similaridade) APG09889.0 295 5,10,15,20,2 5,10,15,20,25,3 WP_042711969.1 (97.28% de 5,30,35,40,4 0,35,40,45,50,5 identidade, 100.0% de similaridade) 5,50,55,60,6 5,60,65,70,75,8 5,70,75,80,8 0,85,90,91,92,9 5,90,91,92,9 3,94,95,96,97,9 3,94,95,96,9 8,99,100 7,98,99,100 APG09967.0 296 297 MTX 85,90,91,92, 91,92,93,94,95, WP_002193657.1 (99.37% de 93,94,95,96, 96,97,98,99,100 identidade, 100.0% de similaridade) 97,98,99,100 WP_033671297.1 (90.19% de identidade, 94.94% de similaridade) EOQ05487.1 (89.66% de identidade,
94.67% de similaridade) WP_006097189.1 (84.49% de identidade, 91.14% de similaridade) WP_040119245.1 (84.18% de identidade, 91.14% de similaridade) WP_040118692.1 (83.86% de identidade, 90.82% de similaridade) APG02123.0 (81.96% de identidade,
90.51% de similaridade) WP_018783466.1 (81.39% de identidade, 88.96% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_016113505.1 (77.78% de identidade, 83.95% de similaridade) WP_001079819.1 (76.0% de identidade, 83.08% de similaridade) APG00196.2 298 Cry 97,98,99,100 97,98,99,100 WP_098287095.1 (96.89% de identidade, 96.89% de similaridade) APG00196.0 US_2016_0311864_A1-66 (96.79% de identidade, 96.79% de similaridade) WP_098381619.1 (87.98% de identidade, 92.23% de similaridade) APG00113.0 US_2016_0311864_A1-24 (87.89% de identidade, 92.13% de similaridade) WP_081097654.1 (79.07% de identidade, 86.84% de similaridade) APG00452.0 US_2016_0366881_A1-73 (77.46% de identidade, 85.08% de similaridade) APG08610.0 (77.16% de identidade,
85.58% de similaridade) WP_098018669.1 (67.53% de identidade, 79.73% de similaridade) APG00030.0 US_2016_0304898_A1-50 (67.32%
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene de identidade, 79.48% de similaridade) APG01313.0 (66.08% de identidade,
79.52% de similaridade) APG01026.0 301 MTX 97,98,99,100 99,100 WP_098211574.1 (97.63% de identidade, 99.6% de similaridade) WP_000586614.1 (97.23% de identidade, 99.21% de similaridade) WP_098578362.1 (96.84% de identidade, 99.21% de similaridade) WP_098902598.1 (96.84% de identidade, 99.21% de similaridade) WP_086398617.1 (96.84% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_086407497.1 (96.84% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_086790671.1 (96.44% de identidade, 98.81% de similaridade) APG09857.0 (96.44% de identidade,
98.42% de similaridade) WP_098506596.1 (96.44% de identidade, 98.42% de similaridade) WP_097890689.1 (96.05% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_097996847.1 (96.05% de identidade, 98.81% de similaridade) APG05399.0 (96.05% de identidade,
98.02% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02245.0 (95.26% de identidade,
98.02% de similaridade) APG02248.0 (94.86% de identidade,
98.02% de similaridade) APG09446.0 (94.86% de identidade,
97.63% de similaridade) APG09256.0 (94.49% de identidade,
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97.24% de similaridade) APG07042.0 (94.07% de identidade,
98.02% de similaridade) APG02756.0 (93.68% de identidade,
98.42% de similaridade) APG01577.0 (93.68% de identidade,
98.02% de similaridade) APG09842.0 (93.28% de identidade,
98.42% de similaridade) APG03148.0 (93.28% de identidade,
98.02% de similaridade) APG03178.0 (93.28% de identidade,
97.63% de similaridade) APG01269.0 (92.91% de identidade,
96.46% de similaridade) APG01103.0 (92.89% de identidade,
98.42% de similaridade) APG06736.0 (92.89% de identidade,
98.42% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02768.0 (92.09% de identidade,
98.02% de similaridade) APG01187.0 (92.09% de identidade,
97.23% de similaridade) APG02474.0 (92.09% de identidade,
96.84% de similaridade) APG00737.0 (92.09% de identidade,
96.05% de similaridade) APG02429.0 (91.7% de identidade,
97.23% de similaridade) US_9403881_B2-6 (91.7% de identidade, 97.23% de similaridade) APG01187.0 302 MTX 96,97,98,99,10 98,99,100 WP_086389158.1 (95.65% de 0 identidade, 97.63% de similaridade) APG00737.0 (95.26% de identidade,
97.23% de similaridade) APG01269.0 (94.49% de identidade,
97.64% de similaridade) WP_098437640.1 (94.07% de identidade, 98.02% de similaridade) WP_061667036.1 (93.68% de identidade, 97.63% de similaridade) WP_098211574.1 (93.68% de identidade, 97.63% de similaridade) ADQ73630.1 (93.68% de identidade,
97.23% de similaridade) WP_043938562.1 (93.68% de identidade, 96.84% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_098451821.1 (93.68% de identidade, 96.84% de similaridade) WP_000586614.1 (93.28% de identidade, 97.23% de similaridade) APG01577.0 (93.28% de identidade,
96.84% de similaridade) WP_078994697.1 (93.28% de identidade, 96.44% de similaridade) WP_098902598.1 (92.89% de identidade, 97.23% de similaridade) APG07042.0 (92.89% de identidade,
96.44% de similaridade) APG01103.0 (92.49% de identidade,
97.63% de similaridade) APG02248.0 (92.49% de identidade,
96.84% de similaridade) APG09857.0 (92.49% de identidade,
96.44% de similaridade) US_9403881_B2-6 (92.49% de identidade, 96.05% de similaridade) APG02474.0 (92.49% de identidade,
95.65% de similaridade) APG01026.0 (92.09% de identidade,
97.23% de similaridade) APG09842.0 (92.09% de identidade,
96.84% de similaridade) APG02245.0 (92.09% de identidade,
96.05% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03178.0 (92.09% de identidade,
96.05% de similaridade) APG05399.0 (92.09% de identidade,
96.05% de similaridade) APG03148.0 (92.09% de identidade,
95.65% de similaridade) APG09892.0 (91.73% de identidade,
96.06% de similaridade) APG02768.0 (91.7% de identidade,
97.23% de similaridade) APG02429.0 (91.7% de identidade,
96.84% de similaridade) APG02756.0 (91.7% de identidade,
96.05% de similaridade) APG09446.0 (91.7% de identidade,
95.65% de similaridade) APG09256.0 (91.34% de identidade,
95.28% de similaridade) APG06736.0 (90.91% de identidade,
97.63% de similaridade) APG02037.0 303 304 MTX 5,10,15,20,25, 5,10,15,20,25,3 APG01146.0 (96.15% de identidade, 30,35,40,45,50 0,35,40,45,50,5 97.88% de similaridade) ,55,60,65,70,7 5,60,65,70,75,8 APG03045.0 (30.73% de identidade, 5,80,85,90,91, 0,85,90,91,92,9 49.07% de similaridade) 92,93,94,95,96 3,94,95,96,97,9 APG05915.0 (28.64% de identidade, ,97,98,99,100 8,99,100 46.23% de similaridade) WP_098783120.1 (26.83% de identidade, 44.72% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02474.0 305 MTX 98,99,100 99,100 WP_098451821.1 (98.02% de identidade, 98.81% de similaridade) APG01577.0 (97.63% de identidade,
98.81% de similaridade) WP_043938562.1 (97.23% de identidade, 98.81% de similaridade) APG02248.0 (95.65% de identidade,
98.81% de similaridade) WP_016082893.1 (95.65% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_098437640.1 (94.07% de identidade, 97.63% de similaridade) WP_086389158.1 (94.07% de identidade, 95.65% de similaridade) WP_061667036.1 (93.68% de identidade, 97.23% de similaridade) WP_098827964.1 (93.68% de identidade, 97.23% de similaridade) ADQ73630.1 (93.68% de identidade,
96.84% de similaridade) WP_098837125.1 (93.68% de identidade, 96.84% de similaridade) APG00737.0 (93.68% de identidade,
95.26% de similaridade) WP_088066742.1 (93.28% de identidade, 96.84% de similaridade) APG05399.0 (92.89% de identidade,
96.84% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG02245.0 (92.49% de identidade,
96.44% de similaridade) US_9403881_B2-6 (92.49% de identidade, 96.44% de similaridade) APG01187.0 (92.49% de identidade,
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96.44% de similaridade) APG01103.0 (91.3% de identidade,
96.84% de similaridade) APG02429.0 (91.3% de identidade,
96.05% de similaridade) APG02756.0 (91.3% de identidade,
95.65% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG03178.0 (91.3% de identidade,
95.65% de similaridade) APG03148.0 (90.91% de identidade,
95.26% de similaridade) APG09256.0 (90.16% de identidade,
94.88% de similaridade) APG06736.0 (90.12% de identidade,
96.84% de similaridade) APG04153.0 306 307,308 MTX 5,10,15,20,25, 5,10,15,20,25,3 APG08608.0 (95.17% de identidade, 30,35,40,45,50 0,35,40,45,50,5 99.08% de similaridade) ,55,60,65,70,7 5,60,65,70,75,8 SFQ92011.1 (94.71% de identidade, 5,80,85,90,91, 0,85,90,91,92,9 97.01% de similaridade) 92,93,94,95,96 3,94,95,96,97,9 EEM02132.1 (93.56% de identidade, ,97,98,99,100 8,99,100 97.24% de similaridade) SDZ42740.1 (88.05% de identidade,
93.79% de similaridade) WP_097796081.1 (76.09% de identidade, 79.54% de similaridade) WP_098639965.1 (73.79% de identidade, 77.24% de similaridade) PEI83594.1 (59.77% de identidade,
62.53% de similaridade) PFI43806.1 (58.62% de identidade,
58.62% de similaridade) PFY98179.1 (54.71% de identidade,
57.24% de similaridade) PFY99872.1 (54.48% de identidade,
58.16% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG06221.0 309 Cry 93,94,95,96,97 96,97,98,99,100 APG00553.0 ,98,99,100 US_2016_0355842_A1-124 (92.1% de identidade, 95.97% de similaridade) WP_098926212.1 (92.1% de identidade, 95.97% de similaridade) APG09727.0 (91.6% de identidade,
95.97% de similaridade) APG04454.0 (81.21% de identidade,
89.43% de similaridade) APG00480.0 US_2016_0355842_A1-102 (69.9% de identidade, 83.11% de similaridade) WP_098806846.1 (69.9% de identidade, 83.11% de similaridade) APG00733.0 US_2016_0355842_A1-165 (59.44% de identidade, 74.5% de similaridade) WP_098806848.1 (59.44% de identidade, 74.5% de similaridade) APG00296.0 US_2016_0355842_A1-52 (51.68% de identidade, 66.08% de similaridade) WP_098926211.1 (51.68% de identidade, 66.08% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG06736.0 310 MTX 98,99,100 WP_098300899.1 (98.02% de identidade, 100.0% de similaridade) APG01103.0 (97.63% de identidade,
100.0% de similaridade) APG02429.0 (94.07% de identidade,
98.81% de similaridade) WP_044585299.1 (94.07% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_048564006.1 (94.07% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_098033545.1 (94.07% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_000586617.1 (94.07% de identidade, 98.42% de similaridade) WP_088066742.1 (93.68% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_098827964.1 (93.68% de identidade, 98.81% de similaridade) WP_098613176.1 (93.68% de identidade, 98.02% de similaridade) WP_098437640.1 (93.28% de identidade, 99.21% de similaridade) APG09842.0 (93.28% de identidade,
98.42% de similaridade) WP_098211574.1 (92.89% de identidade, 98.81% de similaridade) APG01026.0 (92.89% de identidade,
98.42% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG01269.0 (92.52% de identidade,
97.64% de similaridade) APG01577.0 (92.49% de identidade,
98.02% de similaridade) APG03178.0 (92.49% de identidade,
97.63% de similaridade) APG00737.0 (92.49% de identidade,
97.23% de similaridade) APG03148.0 (92.49% de identidade,
97.23% de similaridade) APG09892.0 (92.13% de identidade,
97.24% de similaridade) APG09256.0 (92.13% de identidade,
96.46% de similaridade) APG02248.0 (92.09% de identidade,
98.02% de similaridade) US_9403881_B2-6 (92.09% de identidade, 98.02% de similaridade) APG02756.0 (92.09% de identidade,
97.63% de similaridade) APG09857.0 (91.7% de identidade,
97.63% de similaridade) APG05399.0 (91.3% de identidade,
97.23% de similaridade) APG01187.0 (90.91% de identidade,
97.63% de similaridade) APG02245.0 (90.91% de identidade,
97.23% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene APG07042.0 (90.91% de identidade,
97.23% de similaridade) APG02768.0 (90.51% de identidade,
98.02% de similaridade) APG09446.0 (90.51% de identidade,
96.84% de similaridade) APG02474.0 (90.12% de identidade,
96.84% de similaridade) APG01190.0 311 312 MTX 80,85,90,91,92 90,91,92,93,94, APG02568.0 (96.26% de identidade, ,93,94,95,96,9 95,96,97,98,99, 98.13% de similaridade) 7,98,99,100 100 WP_086424228.1 (96.26% de identidade, 98.13% de similaridade) WP_099327316.1 (80.12% de identidade, 89.44% de similaridade) APG02701.0 (79.45% de identidade,
85.89% de similaridade) APG02401.0 (79.14% de identidade,
88.34% de similaridade) WP_018673409.1 (79.14% de identidade, 88.34% de similaridade) WP_104030950.1 (79.14% de identidade, 88.34% de similaridade) WP_104064947.1 (79.14% de identidade, 88.34% de similaridade) APG00851.0 US_2016_0311864_A1-222 (79.13% de identidade, 87.23% de similaridade)
APG ID Seq Seq ID(s) CryBP1 Split-Cry Classe % Identidade % Homólgos ID modificadas Seq ID C-terminal de Similaridade Seq ID gene WP_061663532.1 (79.13% de identidade, 87.23% de similaridade)
i. Classes de proteínas pesticidas
[0011] As proteínas pesticidas aqui fornecidas e as sequências de nucleotídeos que as codificam são úteis em métodos para atingir pragas. Ou seja, as composições e os métodos da invenção encontram uso na agricultura para controlar ou matar pragas, incluindo pragas de muitas plantas de cultivo. As proteínas pesticidas aqui fornecidas são proteínas de toxinas de bactérias e exibem atividade contra certas pragas. As proteínas pesticidas são de várias classes de toxinas, incluindo toxinas Cry, Cyt, BIN, Mtx. Vide, por exemplo, o Quadro 1 para as classificações de proteínas específicas das diversas SEQ ID NOs aqui fornecidas. Além disso, ao longo deste documento faz-se referência a entradas de bancos de dados Pfam. O banco de dados Pfam é um banco de dados de famílias de proteínas, cada uma representada por múltiplos alinhamentos de sequências e por um modelo oculto de Markov de perfil. Finn et al. (2014) Nucl. Acid Res. Database Issue 42:D222-D230.
[0012] Bacillus thuringiensis (Bt) é uma bactéria gram- positiva que produz proteínas inseticidas como inclusões de cristal durante sua fase de crescimento em que ocorre esporulação. As inclusões proteináceas de Bacillus thuringiensis (Bt) são chamadas de proteínas de cristal ou δ-endotoxinas (ou proteínas Cry), que são tóxicas para membros da classe Insecta e outros invertebrados. Da mesma forma, as proteínas Cyt são proteínas de inclusão parasporal de Bt que exibem atividade hemolítica (citolítica) ou que possuem uma similaridade de sequência óbvia com uma proteína Cyt conhecida. Essas toxinas são altamente específicas para seu organismo-alvo e são inócuas para humanos, vertebrados e plantas.
[0013] A estrutura das toxinas Cry revela cinco blocos de aminoácidos conservados, concentrados principalmente no centro do domínio ou na união entre os domínios. A toxina Cry consiste em três domínios, cada um com uma função específica. O domínio I é um feixe de sete hélices α, no qual uma hélice central é completamente envolvida por seis hélices externas. Esse domínio intervém na formação de canais na membrana. O domínio II aparece como uma coluna triangular de três lâminas β antiparalelas, que são semelhantes às regiões de ligação de antígenos das imunoglobulinas. O domínio III contém cadeias β antiparalelas em forma de sanduíche β. A parte N-terminal da proteína da toxina é responsável por sua toxicidade e especificidade e contém cinco regiões conservadas. A parte C-terminal costuma ser altamente conservada e é provavelmente responsável pela formação de cristais. Vide, por exemplo, Patente dos EUA nº
8.878.007.
[0014] As cepas de B. thuringiensis mostram uma ampla gama de especificidade contra diferentes ordens de insetos (Lepidoptera, Diptera, Coleoptera, Hymenoptera, Homoptera, Phthiraptera ou Mallophaga e Acari) e outros invertebrados (Nemathelminthes, Platyhelminthes e Sarocomastebrates). As proteínas Cry foram classificadas em grupos com base na toxicidade contra vários grupos de insetos e invertebrados. De modo geral, as proteínas Cry I demonstram toxicidade contra lepidópteros, as proteínas Cry II contra lepidópteros e dípteros, as proteínas Cry III contra coleópteros, as proteínas Cry IV contra dípteros e as proteínas Cry V e Cry VI contra nematoides. Novas proteínas Cry podem ser identificadas e atribuídas a um grupo Cry com base na identidade de aminoácidos. Vide, por exemplo, Bravo, A. (1997) J. of Bacteriol. 179:2793-2801; Bravo et al. (2013) Microb. Biotechnol. 6:17-26, aqui incorporado como referência.
[0015] Mais de 750 sequências diferentes de genes cry foram classificadas em 73 grupos (Cry1 a Cry73), e novos membros dessa família de genes continuaram sendo descobertos (Crickmore et al. (2014) www.btnomenclature.info/). A família de genes cry consiste em várias famílias de proteínas filogeneticamente não-relacionadas que podem ter diferentes modos de ação: a família de toxinas Cry de três domínios, a família de toxinas Cry de mosquitocidade, a família das toxinas binárias e a família Cyt de toxinas (Bravo et al., 2005). Algumas cepas de Bt produzem toxinas inseticidas adicionais, as toxinas VIP. Vide, também, Cohen et al. (2011) J. Mol. Biol. 413:4-814; Crickmore et al. (2014) Toxina de Bacillus thuringiensis nomenclature, encontrado na internet em lifesci.sussex.ac.uk/home/Neil_Crickmore/Bt/; Crickmore et al. (1988) Microbiol. Mol. Biol. Rev. 62: 807-813; Gill et al. (1992) Ann. Rev. Entomol. 37: 807-636; Goldbert et al. (1997) Appl. Environ. Microbiol. 63:2716-2712; Knowles et al. (1992) Proc. R. Soc. Ser. B. 248: 1-7; Koni et al. (1994) Microbiology 140: 1869-1880; Lailak et al. (2013) Biochem. Biophys. Res. Commun. 435: 216-221; Lopez-Diaz et al. (2013) Environ. Microbiol. 15: 3030-3039; Perez et al. (2007) Cell. Microbiol. 9: 2931-2937; Promdonkoy et al.
(2003) Biochem. J. 374: 255-259; Rigden (2009) FEBS Lett. 583: 1555-1560; Schnepf et al. (1998) Microbiol. Mol. Biol. Rev. 62: 775-806; Soberon et al. (2013) Peptides 41: 87-93; Thiery et al. (1998) J. Am. Mosq. Control Assoc. 14: 472- 476; Thomas et al. (1983) FEBS Lett. 154: 362-368; Wirth et al. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 10536-10540; Wirth et al (2005) Appl. Environ. Microbiol. 71: 185-189; and, Zhang et al. (2006) Biosci. Biotechnol. Biochem. 70: 2199-2204; cada uma das quais é aqui incorporada como referência em sua totalidade.
[0016] Cyt designa uma proteína de inclusão de cristal parasporal de Bacillus thuringiensis com atividade citolítica, ou uma proteína que possua similaridade de sequência com uma proteína Cyt conhecida. (Crickmore et al. (1998) Microbiol. Mol. Biol. Rev. 62: 807-813). O gene é denominado cyt. Essas proteínas são diferentes em estrutura e atividade com respeito às proteínas Cry (Gill et al. (1992) Annu. Rev. Entomol. 37: 615-636). As toxinas Cyt foram descobertas pela primeira vez na subespécie israelensis de B. thuringiensis (Goldberg et al. (1977) Mosq. News. 37: 355-358). Existem 3 famílias de toxinas Cyt, incluindo 11 toxinas holótipo na nomenclatura atual (Crickmore et al. (2014) Toxina de Bacillus thuringiensis nomenclature, encontrada na internet em lifesci.sussex.ac.uk/home/Neil_Crickmore/Bt/). A maioria dos isolados de B. thuringiensis com genes cyt mostram atividade contra insetos dípteros (particularmente mosquitos e moscas negras), mas também existem genes cyt que foram descritos em cepas B. thuringiensis que visam insetos lepidópteros ou coleópteros (Guerchicoff et al. (1997) Appl. Environ. Microbiol. 63: 2716-2721).
[0017] A estrutura da Cyt2A, resolvida por cristalografia de raios X, mostra um único domínio em que duas camadas externas de hélice α se enrolam em torno de uma folha β mista. Outras estruturas de cristal disponíveis das toxinas Cyt apoiam um modelo estrutural α-β conservado, com dois grampos de hélice α flanqueando um núcleo de folha β contendo de sete a oito cadeias β. (Cohen et al. (2011) J. Mol. Biol. 413: 80 4-814). Estudos mutagênicos identificaram que os resíduos da folha β são críticos para a toxicidade, ao passo que as mutações nos domínios helicoidais não afetaram a toxicidade (Adang et al.; Diversity of Bacillus thuringiensis Crystal Toxins and Mechanism of Action. In: T. S. Dhadialla and S. S. Gill, eds, Advances in Insect Physiology, Vol. 47, Oxford: Academic Press, 2014, pág. 39-
87.) O domínio representativo da toxina Cyt é uma - endotoxina, Bac_thur_toxina (Pfam PF01338).
[0018] Existem numerosos modelos propostos para o modo de ação das toxinas Cyt, a qual ainda é uma área de investigação ativa. Algumas proteínas Cyt (Cyt1A) demonstraram que requerem a presença de proteínas acessórias para a cristalização. As protoxinas Cyt1A e Cyt2A são processadas por proteases digestivas nos mesmos locais nos terminais N e C para um núcleo de toxina estável. As toxinas Cyt então interagem com lipídios de membrana não-saturados, como fosfatidilcolina, fosfatidiletanolamina e esfingomielina. Para as toxinas Cyt, a formação de poros e a ruptura da membrana tipo detergente foram propostas como mecanismos não-exclusivos; além disso, é geralmente aceito que ambos podem ocorrer dependendo da concentração de toxina, com concentrações mais baixas favorecendo poros oligoméricos e concentrações mais altas provocando quebras da membrana (Butko (2003) Appl. Environ. Microbiol. 69: 2415-2422). No modelo de formação de poros, a toxina Cyt se liga à membrana celular, induzindo a formação de canais seletivos de cátions nas vesículas da membrana e provocando uma lise osmótica- coloide da célula (Knowles et al. (1989) FEBS Lett. 244: 259-262; Knowles et al. (1992) Proc. R. Soc. Ser. B. 248: 1- 7 e Promdonkoy et al. (2003) Biochem. J. 374: 255-259). No modelo de detergente, existe uma agregação inespecífica da toxina na superfície da bicamada lipídica, provocando a desmontagem da membrana e a morte celular (Butko (2003) supra; Manceva et al. (2005) Biochem. 44: 589-597).
[0019] Diversos estudos mostraram atividade sinérgica entre as toxinas Cyt e outras toxinas B. thuringiensis, particularmente as toxinas Cry, Bin e Mtx. Esse sinergismo já demonstrou inclusive ser capaz de superar a resistência de um inseto contra a outra toxina (Wirth 1997, Wirth 2005, Thiery 1998, Zhang 2006). O efeito sinérgico da Cyt com as toxinas Cry propõe envolver a Cyt1A que se liga ao domínio II das toxinas Cry em solução ou no plano da membrana para promover a formação de um oligômero pré-poro da toxina Cry. A formação desse oligômero é independente da oligomerização, ligação ou inserção da Cyt (Lailak 2013, Perez 2007, Lopez- Diaz 2013).
[0020] Uma série de proteínas pesticidas não-relacionadas às proteínas Cry são produzidas por algumas cepas de B.
thuringiensis e B. cereus durante o crescimento vegetativo (Estruch et al. (1996) Proc Natl Acad Sci USA 93:5389–5394; Warren et al. (1994) WO 94/21795). Essas proteínas inseticidas vegetativas, ou Vips, não formam proteínas de cristais parasporais e são aparentemente segregadas a partir da célula. As Vips se encontram atualmente excluídas da nomenclatura de proteínas Cry por não serem proteínas formadoras de cristais. O termo Vip é um termo errôneo no sentido de que algumas proteínas Cry B. thuringiensis também são produzidas durante o crescimento vegetativo, bem como durante as fases estacionárias e de esporulação, sobretudo a Cry3Aa. A localização dos genes Vip no genoma de B. thuringiensis demonstrou residir em grandes plasmídeos que também codificam genes cry (Mesrati et al. (2005) FEMS Microbiol. Lett. 244(2):353-8). Um site para a nomenclatura de toxinas Bt pode ser encontrado na internet em lifesci.sussex.ac.uk com o caminho “/home/Neil_Crickmore/Bt/” e em: “btnomenclature.info/”. Vide também Schnepf et al. (1998) Microbiol. Mol. Biol. Rev. 62(3):775-806. Essas menções são aqui incorporadas como referência.
[0021] Até à data, quatro categorias de Vips foram identificadas. Alguns genes Vip formam complexos proteicos binários de dois componentes: um componente “A”, que é normalmente a porção “ativa”, e um componente “B”, que é normalmente a porção “ligada” (Pfam pfam.xfam.org/family/PF03495). As proteínas Vip1 e Vip4 geralmente contêm domínios proteicos de toxina binária B. As proteínas Vip2 geralmente contêm domínios proteicos de toxina binária A.
[0022] As proteínas Vip1 e Vip2 são os dois componentes de uma toxina binária que exibe toxicidade contra coleópteros. A Vip1Aa1 e a Vip2Aa1 são muito ativas contra lagartas da raiz do milho, especialmente Diabrotica virgifera e Diabrotica longicornis (Han et al. (1999) Nat. Struct. Biol. 6:932–936; Warren GW (1997) “Vegetative insecticidal proteins: novel proteins for control of corn pests” In: Carozzi NB, Koziel M (eds) Advances in insect control, the role of transgenic plants; Taylor & Francis Ltd, London, págs. 109-21). O multímero Vip1 de 95 kDa de ligação à membrana fornece uma via para que a ADP-ribosilase Vip2 de 52 kDa entre no citoplasma das células-alvo da larva de lagarta da raiz do milho (Warren (1997) supra). A ADP- ribosiltransferase Vip2 dependente de NAD provavelmente modifica a actina monomérica em Arg177 para bloquear a polimerização, causando a perda do citoesqueleto da actina e a eventual morte celular devido à rápida troca de subunidades dentro dos filamentos da actina in vivo (Carlier M.F. (1990) Adv. Biophys. 26:51-73).
[0023] Como as toxinas Cry, as toxinas Vip3A ativadas são proteínas formadoras de poros capazes de criar canais iônicos estáveis na membrana (Lee et al. (2003) Appl. Environ. Microbiol. 69:4648–4657). As proteínas Vip3 são ativas contra várias das principais pragas de lepidópteros (Rang et al. (2005) Appl. Environ. Microbiol. 71(10):6276-6281; Bhalla et al. (2005) FEMS Microbiol. Lett. 243:467–472; Estruch et al. (1998) WO 9844137; Estruch et al. (1996) Proc
Natl Acad Sci USA 93:5389–5394; Selvapandiyan et al. (2001) Appl. Environ Microbiol. 67:5855–5858; Yu et al. (1997) Appl. Environ Microbiol. 63:532–536). A Vip3A é ativa contra Agrotis ipsilon, Spodoptera frugiperda, Spodoptera exigua, Heliothis virescens e Helicoverpa zea (Warren et al. (1996) WO 96/10083; Estruch et al. (1996) Proc Natl Acad Sci USA 93:5389–5394). Como as toxinas Cry, as proteínas Vip3A devem ser ativadas por proteases antes do reconhecimento na superfície do epitélio do intestino médio de proteínas de membrana específicas diferentes das reconhecidas pelas toxinas Cry.
[0024] A família MTX de proteínas da toxina é caracterizada pela presença de um domínio conservado, o ETX_MTX2 (pfam 03318). Os membros dessa família compartilham homologia de sequência com as toxinas mosquitocidas Mtx2 e Mtx3 de Bacillus sphaericus, bem como com a toxina epsilon ETX de Clostridium perfringens (Cole et al. (2004) Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 797-8; Thanabalu et al. (1996) Gene 170:85-9). As proteínas semelhantes a MTX são estruturalmente distintas das toxinas Cry de três domínios, pois possuem uma estrutura alongada e que se baseia predominantemente em folhas β. No entanto, como ocorre no caso das toxinas de três domínios, estima-se que as toxinas semelhantes a MTX formem poros nas membranas das células- alvo (Adang et al. (2014) supra). Diferentemente das proteínas Cry de três domínios, as proteínas semelhantes a MTX possuem um comprimento muito menor, que vai de 267 aminoácidos (Cry23) a 340 aminoácidos (Cry15A).
[0025] Até à data, apenas 15 proteínas pertencentes à família de toxinas semelhantes a MTX receberam nomes Cry, o que torna essa classe relativamente pequena em comparação com a família Cry de três domínios (Crickmore et al. (2014) supra; Adang et al. (2014) supra). Os membros da família de toxinas semelhantes a MTX incluem Cry15, Cry23, Cry33, Cry38, Cry45, Cry46, Cry51, Cry60A, Cry60B e Cry64. Essa família exibe uma série de atividades inseticidas, incluindo atividade contra pragas de insetos das ordens Lepidópteros e Coleópteros. Alguns membros dessa família podem formar parcerias binárias com outras proteínas, que podem ou não ser necessárias para a atividade inseticida.
[0026] A Cry15 é uma proteína de 34 kDA que foi identificada em Bacillus thuringiensis serovar thompsoni HD542. A Cry15 ocorre naturalmente em um cristal juntamente com uma proteína não-relacionada de aproximadamente 40 kDa. O gene que codifica a Cry15 e sua proteína parceira estão dispostos juntos em um operon. A Cry15 sozinha demonstrou possuir atividade contra pragas de insetos lepidópteros, incluindo Manduca sexta, Cydia pomonella e Pieris rapae, e a presença da proteína 40 kDA demonstrou aumentar a atividade da Cry15 somente contra C. pomonella (Brown K. and Whiteley H. (1992) J. Bacteriol. 174:549-557; Naimov et al. (2008) Appl. Environ. Microbiol. 74:7145–7151). São necessários mais estudos para elucidar a função da proteína parceira da Cry15. Da mesma forma, a Cry23 é uma proteína de 29 kDA que demonstrou ter atividade contra as pragas coleópteras Tribolium castaneum e Popillia japonica, juntamente com sua proteína parceira Cry37 (Donovan et al. (2000) Patente dos EUA nº 6.063.756).
[0027] Novos membros da família semelhante a MTX continuam sendo identificados. Um gene da toxina ETX_MTX foi recentemente identificado no genoma da cepa Na205-3 de Bacillus thuringiensis serovar tolworthi. Verificou-se que essa cepa era tóxica contra a praga lepidóptera Helicoverpa armigera e que também continha homólogos de Cry1, Cry11, Vip1, Vip2 e Vip3 (Palma et al. (2014) Genome Announc. 2(2): e00187-14. Publicado online em 13 de março de 2014 em doi:
10.1128/genomeA.00187-14; PMCID: PMC3953196). Como as proteínas semelhantes a MTX possuem uma estrutura de domínio única em relação às proteínas Cry de três domínios, acredita- se que possuem um modo de ação único, o que as torna uma ferramenta valiosa no controle de insetos e na luta contra a resistência dos insetos.
[0028] As células bacterianas produzem um grande número de toxinas com especificidade diversa contra organismos hospedeiros e não-hospedeiros. Grandes famílias de toxinas binárias foram identificadas em numerosas famílias bacterianas, incluindo toxinas que possuem atividade contra pragas de insetos. (Poopathi and Abidha (2010) J. Physiol. Path. 1(3): 22-38). A Lysinibacillus sphaericus (Ls), anteriormente denominada Bacillus sphaericus, (Ahmed et al. (2007) Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57:1117-1125) é bem conhecida como uma cepa de biocontrole de insetos. A Ls produz várias proteínas inseticidas, incluindo o complexo binário altamente potente BinA/BinB. Esse complexo binário forma um cristal parasporal nas células Ls e possui uma atividade forte e específica contra insetos dípteros, especificamente os mosquitos. Em algumas áreas, verificou-
se resistência dos insetos a cepas mosquitocidas de Ls existentes. A descoberta de novas toxinas binárias com diferentes especificidades-alvo ou com a capacidade de superar a resistência dos insetos desperta um interesse significativo.
[0029] O complexo de proteína inseticida binário Ls contém dois polipeptídeos principais, um polipeptídeo de 42 kDa e um polipeptídeo de 51 kDa, designados BinA e BinB, respectivamente (Ahmed et al. (2007), supra). Os dois polipeptídeos atuam sinergicamente para conferir toxicidade aos seus alvos. O modo de ação envolve a ligação das proteínas aos receptores no intestino médio larvário. Em alguns casos, as proteínas são modificadas por digestão com protease no intestino larvário para produzir formas ativadas. Considera-se que o componente BinB está envolvido na ligação, ao passo que o componente BinA confere toxicidade (Nielsen-LeRoux et al. (2001) Appl. Environ. Microbiol. 67(11):5049–5054). Quando clonado e expresso separadamente, o componente BinA é tóxico para larvas de mosquito, enquanto o componente BinB não é. No entanto, a coadministração das proteínas aumenta notoriamente a toxicidade (Nielsen-LeRoux et al. (2001) supra).
[0030] Um pequeno número de homólogos da proteína Bin foram descritos a partir de fontes bacterianas. Priest et al. (1997) Appl. Environ. Microbiol. 63(4):1195-1198 descreve uma tentativa de hibridização para identificar novas cepas de Ls, embora a maioria dos genes identificados codificassem proteínas idênticas às proteínas BinA/BinB conhecidas. A proteína BinA contém um domínio conservado definido conhecido como domínio da superfamília Toxina 10. Esse domínio de toxina foi originalmente definido por sua presença em BinA e BinB. Ambas as proteínas possuem o domínio, embora a similaridade de sequência entre BinA e BinB seja limitada nesta região (<40%). A proteína Cry49Aa, que também apresenta atividade inseticida, também possui esse domínio (descrito abaixo).
[0031] A toxina binária Cry48Aa/Cry49Aa da Ls possui a capacidade de matar larvas do mosquito Culex quinquefasciatus. Essas proteínas pertencem a uma classe estrutural de proteína que possui certa similaridade com o complexo proteico Cry da Bacillus thuringiensis (Bt), uma conhecida família de proteínas inseticidas. A toxina binária Cry34/Cry35 da Bt também é conhecida por matar insetos, incluindo a larva da lagarta da raiz do milho, uma praga significativa do milho. O Cry34, do qual diversas variantes foram identificadas, é um pequeno (14 kDa) polipeptídeo, enquanto o Cry35 (também codificado por diversas variantes) é um polipeptídeo de 44 kDa. Essas proteínas possuem certa homologia de sequência com o grupo proteico BinA/BinB e estima-se que estejam relacionadas evolutivamente (Ellis et al. (2002) Appl. Environ. Microbiol. 68(3):1137-1145).
[0032] As proteínas de fosfolipase C de fosfoinositídeos (PI-PLC ou, ainda, fosfotidilinositol fosfolipase C) pertencem ao grupo mais amplo de proteínas de fosfolipase C. Muitas dessas proteínas desempenham papéis importantes na transdução do sinal como parte da fisiologia celular normal. Várias toxinas bacterianas importantes também contêm domínios que possuem similaridade com essas proteínas
(Titball, RW (1993) Microbiological Reviews. 57(2):347-366). É importante notar que essas proteínas estão envolvidas na amplificação do sinal durante a intoxicação de células de insetos por proteínas Bt Cry (Valaitis, A.P. (2008) Insect Biochemistry and Molecular Biology. 38: 611-618).
[0033] A classe de toxina PI-PLC ocorre em isolados de Bacillus, normalmente vistos em concomitância com homólogos a outras classes de toxinas descritas, como as Toxinas Binárias. Essa classe de sequências possui homologia com fosfodiesterases de fosfatidilinositol (também chamada de fosfolipase C específica de fosfatidilinositol, PI-PLC). A estrutura de cristal e seu sítio ativo foram resolvidos para PI-PLC de B. cereus por Heinz et al (Heinz, et. al., (1995) The EMBO Journal. 14(16): 3855-3863). Os papéis dos resíduos de aminoácidos do sítio ativo PI-PLC de B. cereus em catálise e ligação ao substrato foram investigados por Gässler et al usando análises de mutagênese sítio-dirigida, cinética e estrutura de cristal (Gässler, et. al., (1997) Biochemistry. 36(42):12802-13).
[0034] Essas proteínas de toxinas PI-PLC contêm uma fosfodiesterase semelhante a PLC, domínio TIM beta/alfa- barril (IPR017946) e/ou uma fosfolipase C, específica do fosfatidilinositol, domínio X (IPR000909) (também chamado de domínio PI-PLC X-box). Também foram observadas proteínas com esses domínios em combinação com outros domínios de toxinas de proteínas típicos de Bacillus. Essa lista inclui mais comumente um domínio de lectina (IPR000772), um domínio de ligação de açúcar que pode estar presente em uma ou mais cópias e que parece ligar membranas celulares, bem como a toxina de cristal inseticida (IPR008872) (também chamada de Toxina10 ou P42), que é o domínio definidor da Toxina Binária.
[0035] Anteriormente, toxinas desta classe PI-PLC foram definidas na Patente dos EUA nº 8.318.900 B2 SEQ ID NOs 30 (DNA) e 79 (aminoácido), na Publicação de Patente dos EUA nº 20110263488 A1 SEQ ID NOs 8 (DNA) e 9 (aminoácido) e na Patente dos EUA nº 8.461.421 B2 SEQ ID NOs 3 (DNA) e 63 (aminoácido). O presente documento fornece proteínas pesticidas dessas classes de toxinas. As proteínas pesticidas são classificadas segundo sua estrutura, homologia com toxinas conhecidas e/ou sua especificidade pesticida. ii. Variantes e fragmentos de proteínas pesticidas e polinucleotídeos que os codificam
[0036] Proteínas ou polipeptídeos pesticidas da invenção incluem aqueles apresentados nas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168,
169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou
312. além de fragmentos e variantes destes. Por “toxina pesticida” ou “proteína pesticida” ou “polipeptídeo pesticida” entende-se uma toxina ou proteína ou polipeptídeo que possua atividade contra uma ou mais pragas, incluindo insetos, fungos, nematoides e semelhantes, de modo que a praga seja morta ou controlada.
[0037] Um polipeptídeo ou proteína “isolado” ou “purificado”, ou sua porção biologicamente ativa, está substancialmente ou essencialmente isento de componentes que normalmente acompanham ou interagem com o polipeptídeo ou com a proteína tal como se encontra em seu ambiente de ocorrência natural. Assim, um polipeptídeo ou proteína isolada ou purificada está substancialmente isento de outro material celular ou meio de cultura quando produzido mediante técnicas recombinantes, ou substancialmente isento de precursores químicos ou de outros químicos quando sintetizado quimicamente. Uma proteína que está substancialmente isenta de material celular inclui preparações de proteína com menos de cerca de 30%, 20%, 10%, 5% ou 1% (em peso seco) de proteína contaminante. Quando a proteína da invenção ou a sua porção biologicamente ativa é produzida de forma recombinante, o meio de cultura ideal representa menos do que cerca de 30%, 20%, 10%, 5% ou 1% (em peso seco) de precursores químicos ou químicos de proteínas que não sejam de interesse.
[0038] O termo “fragmento” se refere a uma porção de uma sequência polipeptídica da invenção. “Fragmentos” ou “porções biologicamente ativas” incluem polipeptídeos compreendendo um número de resíduos de aminoácidos contíguos suficientes para reter a atividade biológica, isto é, que possuem atividade pesticida. Os fragmentos das proteínas pesticidas incluem aqueles que são mais curtos do que as sequências de comprimento total, quer devido ao uso de um local de início posterior alternativo, quer devido ao processamento que produz uma proteína mais curta que possui atividade pesticida. O processamento pode ocorrer no organismo em que a proteína se expressa ou na praga após a ingestão da proteína. Exemplos de fragmentos das proteínas podem ser encontrados no Quadro 1. Uma porção biologicamente ativa de uma proteína pesticida pode ser um polipeptídeo que possui, por exemplo, 10, 25, 50, 100, 150, 200, 250 ou mais aminoácidos de comprimento de qualquer uma das SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63,
64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312. Essas porções biologicamente ativas podem ser preparadas mediante técnicas recombinantes e avaliadas quanto à atividade pesticida.
Conforme aqui utilizado, um fragmento compreende pelo menos 8 aminoácidos contíguos de SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74,
75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.
[0039] Os genes bacterianos, inclusive os que codificam as proteínas pesticidas aqui descritas, possuem muitas vezes vários códons de iniciação de metionina na proximidade com o começo do quadro aberto de leitura. Geralmente, a iniciação da tradução em um ou mais desses códons de início resulta na geração de uma proteína funcional. Esses códons de início podem incluir códons ATG. No entanto, bactérias como Bacillus sp. também reconhecem o códon GTG como um códon de início, e as proteínas que iniciam a tradução em códons GTG contêm uma metionina no primeiro aminoácido. Em raras ocasiões, a tradução em sistemas bacterianos pode ter início em um códon TTG, embora neste caso o TTG codifique uma metionina. Além disso, normalmente não é possível determinar a priori quais desses códons são usados naturalmente na bactéria. Portanto, deve-se entender que o uso de um dos códons de metionina alternativos também pode resultar na geração de proteínas pesticidas. Essas proteínas pesticidas são abrangidas pela presente invenção e podem ser utilizadas nos métodos aqui descritos. Deve-se entender que, caso expresso em plantas, será necessário alterar o códon de início alternativo para ATG de modo a obter uma tradução adequada.
[0040] Em várias formas de realização, as proteínas pesticidas aqui fornecidas incluem sequências de aminoácidos deduzidas das sequências de nucleotídeos de comprimento total, além de sequências de aminoácidos que são mais curtas do que as sequências de comprimento total devido à utilização de um local de início posterior alternativo. Assim, a sequência de nucleotídeos da invenção e/ou vetores, células hospedeiras e plantas que compreendem a sequência de nucleotídeos da invenção (além dos métodos de produção e utilização da sequência de nucleotídeos da invenção) podem compreender uma sequência de nucleotídeos que codifica um local de início alternativo.
[0041] Reconhece-se que modificações podem ser feitas aos polipeptídeos pesticidas aqui fornecidos, criando proteínas variantes. As mudanças concebidas pelo homem podem ser introduzidas através da aplicação de técnicas de mutagênese sítio-dirigidas. Alternativamente, também podem ser identificados polinucleotídeos nativos, ainda não conhecidos ou ainda não identificados, e/ou polipeptídeos estruturalmente e/ou funcionalmente relacionados com as sequências aqui descritas, os que se enquadram no escopo da presente invenção. As substituições conservadoras de aminoácidos podem ser feitas em regiões não-conservadas que não alteram a função das proteínas pesticidas. Alternativamente, podem ser feitas modificações que melhorem a atividade da toxina. A modificação das toxinas Cry por troca de domínio III resultou em alguns casos em toxinas híbridas com toxicidades melhoradas contra certas espécies de insetos. Portanto, a troca de domínio III pode ser uma estratégia eficaz para melhorar a toxicidade das toxinas Cry ou para criar novas toxinas híbridas com toxicidade contra pragas que não mostram suscetibilidade às toxinas Cry progenitoras. A mutagênese sítio-dirigida das sequências de alças de domínio II pode resultar em novas toxinas com maior atividade inseticida. As regiões de alças de domínio II são importantes regiões de ligação de toxinas iniciais Cry que são alvos adequados para a mutagênese e a seleção de toxinas Cry com melhores propriedades inseticidas. O domínio I da toxina Cry pode ser modificado para introduzir os locais de clivagem da protease e, assim, melhorar a atividade contra certas pragas. Estratégias para misturar os três domínios diferentes entre um grande número de genes cry e métodos de rastreamento de bioensaio de alta eficiência podem fornecer novas toxinas Cry com melhores ou novas toxicidades.
[0042] Conforme indicado, fragmentos e variantes dos polipeptídeos aqui descritos irão conservar sua atividade pesticida. Por atividade pesticida entende-se a capacidade da composição para alcançar um efeito observável diminuindo a ocorrência ou uma atividade da praga-alvo, incluindo, por exemplo, ocasionar a morte de pelo menos uma praga, ou uma redução notável no crescimento, alimentação ou desenvolvimento fisiológico normal da praga. Essas diminuições na quantidade ou no crescimento, alimentação ou desenvolvimento normal da praga podem significar qualquer redução estatisticamente significativa, incluindo, por exemplo, uma diminuição de cerca de 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 85%, 90%, 95% ou mais. A atividade pesticida contra uma ou mais das diversas pragas aqui fornecidas inclui, por exemplo, atividade pesticida contra Coleoptera, Diptera, Hymenoptera, Lepidoptera, Mallophaga, Homoptera, Hemiptera, Orthroptera, Nematodes, Thysanoptera, Dermaptera, Isoptera, Anoplura, Siphonaptera, Trichoptera, etc., ou qualquer outra praga aqui descrita. Reconhece-se que a atividade pesticida pode ser diferente ou melhorada em relação à atividade da proteína nativa, ou pode permanecer inalterada, desde que a atividade pesticida seja mantida. Métodos para medir a atividade pesticida são bem conhecidos na técnica. Vide também Czapla e Lang (1990) J. Econ. Entomol. 83:2480-2485; Andrews et al. (1988) Biochem. J. 252:199-206; Marrone et al. (1985) J. of Economic Entomology 78:290-293; e Pat. dos EUA nº 5.743.477, todos os quais são aqui incorporados como referência em sua totalidade.
[0043] Por "variantes" deve-se entender polipeptídeos que possuem uma sequência de aminoácidos que apresenta pelo menos cerca de 60%, cerca de 65%, cerca de 70%, cerca de 75%, cerca de 80%, cerca de 85%, cerca de 86%, cerca de 87%, Cerca de 88%, cerca de 89%, cerca de 90%, cerca de 91%, cerca de 92%, cerca de 93%, cerca de 94%, cerca de 95%, cerca de 96%, cerca de 97%, cerca de 98% ou cerca de 99% de identidade com a sequência de aminoácidos de qualquer uma das SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298,
299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312. e retêm atividade pesticida.
Nota, a Quadro 1 fornece exemplos não limitativos de polipeptídeos variantes (e polinucleotídeos que codificam o mesmo) para cada uma das SEQ ID NOS: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312. Uma variante biologicamente ativa de um polipeptídeo pesticida da invenção pode diferir por apenas cerca de 1 a 15 resíduos de aminoácido, apenas cerca de 1 a 10, como cerca de 6 a 10, apenas 5, apenas 4, apenas 3, apenas 2 ou apenas 1 resíduo de aminoácido. Em formas de realização específicas, os polipeptídeos podem compreender um truncamento N-terminal ou C-terminal, que pode conter pelo menos uma deleção de 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50 aminoácidos, ou mais, a partir da extremidade N ou C-terminal do polipeptídeo.
[0044] O Quadro 2 fornece os domínios de proteínas encontrados nas SEQ ID NOs: 1-312 com base nos dados de PFAM. Tanto a descrição do domínio como as posições dentro de uma SEQ ID NO são fornecidas no Quadro 2. Em formas de realização específicas, a variante ativa compreende qualquer uma das SEQ ID NOs: 1-312 pode compreender pelo menos 70%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, ou 99% de identidade com qualquer uma das SEQ ID NOs: 1-312 e compreende ainda pelo menos um dos domínios conservados apresentados no quadro 2. Por exemplo, em uma forma de realização, a variante ativa compreenderá pelo menos 70%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, ou 99% de identidade com a SEQ ID NO:1, e compreende ainda os aminoácidos nativos nas posições 270-345.
Quadro 2. Resumo dos domínios de PFAM em cada uma das SEQ ID NOs: 1-312 APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG00766.0 1 PF07691 Domínio PA14 99 224 PF03495 Toxina binária 270 345 Clostridial B/Toxina PA Domínio de ligação ao Ca PF17475 Toxina binária 348 540 Clostridial B/Toxina PA domínio 2 PF17476 Toxina binária 575 664 Clostridial B/Toxina PA domínio 3 APG00766.1 2 Início PF07691 Domínio PA14 54 179 alternativo PF03495 Toxina binária 225 300 Clostridial B/Toxina PA Domínio de ligação ao Ca PF17475 Toxina binária 303 495 Clostridial B/Toxina PA domínio 2 PF17476 Toxina binária 530 619 Clostridial B/Toxina PA domínio 3 APG00963.0 3 nenhum domínio
PFAM APG01017.0 4 PF03318 Toxina Clostridium 81 287 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01017.1 5 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 55 261 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01146.0 6 PF03945 endotoxina delta, 124 271 domínio terminal N APG01146.1 7 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 82 229 removido domínio terminal N APG01148.0 8 PF03318 Toxina Clostridium 102 226 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01148.1 9 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 64 188 removido épsilon ETX/Toxina
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01212.0 10 PF03945 endotoxina delta, 96 267 domínio terminal N APG01267.0 11 PF03318 Toxina Clostridium 92 255 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01290.0 12 PF03945 endotoxina delta, 102 315 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 323 562 PF03944 endotoxina delta 572 700 APG01290.1 13 Início PF03945 endotoxina delta, 99 312 alternativo e domínio terminal N 3’ PF00555 endotoxina delta 320 559 truncamento PF03944 endotoxina delta 569 697 APG01483.0 14 PF03440 Domínio toxina 42 123 Aerolisina/Pertussis (APT) PF01117 toxina Aerolisina 138 494 APG01483.1 15 Início PF03440 Domínio toxina 24 105 alternativo Aerolisina/Pertussis (APT) PF01117 toxina Aerolisina 120 476 APG01483.2 16 Peptídeo sinal PF03440 Domínio toxina 2 83 removido Aerolisina/Pertussis (APT) PF01117 toxina Aerolisina 98 454 APG01561.0 17 PF03318 Toxina Clostridium 92 313 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01571.0 18 PF03945 endotoxina delta, 77 302 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 310 527 PF03944 endotoxina delta 539 686 APG01571.1 19 3’ PF03945 endotoxina delta, 77 302 Truncamento domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 310 527 PF03944 endotoxina delta 539 686 APG01611.0 20 PF14200 Domínio de tipo lectina 5 75 beta-trifólio de tipo ricina
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação PF14200 Domínio de tipo lectina 89 147 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 180 341 inseticida P42 APG01611.1 21 3’ PF14200 Domínio de tipo lectina 42 119 Truncamento beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 180 341 inseticida P42 APG01611 22 PF07029 Proteína CryBP1 32 184 CryBP1 (APG06764.0 ) APG01634.0 23 PF03945 endotoxina delta, 147 300 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 323 517 PF03944 endotoxina delta 534 679 APG01634 24 PF07029 Proteína CryBP1 53 205 CryBP1 (APG03400.0 ) APG01652.0 25 PF03945 endotoxina delta, 89 299 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 307 516 PF03944 endotoxina delta 528 617 APG01682.0 26 PF03945 endotoxina delta, 108 289 domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 508 653 APG01761.0 27 PF03318 Toxina Clostridium 29 271 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01808.0 28 PF03318 Toxina Clostridium 118 268 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01808.1 29 Início PF03318 Toxina Clostridium 105 256 alternativo épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG01808.2 30 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 77 225 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG01877.0 31 PF03945 endotoxina delta, 140 342 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 457 469 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 506 520 parede celular putativa APG01877.1 32 Início PF03945 endotoxina delta, 114 316 alternativo domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 431 443 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 480 494 parede celular putativa APG01892.0 33 nenhum domínio
PFAM APG01892.1 34 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG01985.0 35 PF03945 endotoxina delta, 94 269 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 338 550 PF03944 endotoxina delta 560 690 APG01985.1 36 Início PF03945 endotoxina delta, 94 269 alternativo domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 338 550 PF03944 endotoxina delta 560 690 APG02088.0 37 PF03318 Toxina Clostridium 59 283 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG02088.1 38 Início PF03318 Toxina Clostridium 55 279 alternativo épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG02109.0 39 PF03945 endotoxina delta, 84 259 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 348 549 PF03944 endotoxina delta 559 696 APG02109.1 40 3’ PF03945 endotoxina delta, 84 259 Truncamento domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 348 549 PF03944 endotoxina delta 559 695 APG02139.0 41 PF01823 Domínio 108 301 MAC/Perforina
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG02346.0 42 nenhum domínio
PFAM APG02346.1 43 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG02391.0 44 PF03945 endotoxina delta, 80 283 domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 460 596 APG02391.1 45 3’ PF03945 endotoxina delta, 80 283 Truncamento domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 460 596 APG02422.0 46 PF14200 Domínio de tipo lectina 113 191 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 281 442 inseticida P42 APG02533.0 47 PF03945 endotoxina delta, 117 296 domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 475 542 beta-trifólio de tipo ricina APG02533.1 48 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 79 259 removido domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 473 566 beta-trifólio de tipo ricina APG02548.0 49 PF03318 Toxina Clostridium 40 261 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG02568.0 50 PF03318 Toxina Clostridium 90 311 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG02568.1 51 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 60 281 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG02667.0 52 PF03945 endotoxina delta, 83 280 domínio terminal N APG02667.1 53 Início PF03945 endotoxina delta, 83 280 alternativo domínio terminal N APG02743.0 54 PF05431 Toxina Crystal 183 337 inseticida P42
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG02743.1 55 Início PF05431 Toxina Crystal 183 337 alternativo inseticida P42 APG02790.0 56 PF01338 Toxina de Bacillus 59 280 thuringiensis APG02790.1 57 Início PF01338 Toxina de Bacillus 56 277 alternativo thuringiensis APG02807.0 58 PF03945 endotoxina delta, 121 314 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 438 450 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 465 477 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 539 553 parede celular putativa APG02807.1 59 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 83 276 removido domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 400 412 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 427 439 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 501 515 parede celular putativa APG02835.0 60 nenhum domínio
PFAM APG02835.1 61 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG02841.0 62 PF03945 endotoxina delta, 134 323 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 341 555 PF03944 endotoxina delta 565 711 APG02841.1 63 3’ PF03945 endotoxina delta, 133 323 Truncamento domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 341 555 PF03944 endotoxina delta 565 711 APG02871.0 64 PF03945 endotoxina delta, 72 140 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 321 334 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 369 383 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 544 555 parede celular putativa
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG02884.0 65 nenhum domínio
PFAM APG02884.1 66 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG02951.0 67 PF03318 Toxina Clostridium 106 236 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG02951.1 68 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 83 213 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03045.0 69 PF03945 endotoxina delta, 137 302 domínio terminal N APG03045.1 70 PF03945 endotoxina delta, 99 264 domínio terminal N APG03068.0 71 PF12495 Proteína inseticida 12 185 vegetal 3A N terminal APG03126.0 72 PF03318 Toxina Clostridium 38 251 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03164.0 73 PF03945 endotoxina delta, 101 318 domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 539 667 APG03164.1 74 Início PF03945 endotoxina delta, 82 299 alternativo domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 520 648 APG03164.2 75 Início PF03945 endotoxina delta, 82 299 alternativo e domínio terminal N 3’ PF03944 endotoxina delta 520 648 truncamento APG03178.0 76 nenhum domínio
PFAM APG03204.0 77 nenhum domínio
PFAM APG03235.0 78 PF03945 endotoxina delta, 68 306 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 314 537 PF03944 endotoxina delta 547 686 APG03235.1 79 3’ PF03945 endotoxina delta, 68 306 Truncamento domínio terminal N
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação PF00555 endotoxina delta 314 537 PF03944 endotoxina delta 547 685 APG03236.0 80 PF03945 endotoxina delta, 84 285 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 298 507 PF03944 endotoxina delta 517 644 APG03236.1 81 Início PF03945 endotoxina delta, 84 285 alternativo domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 298 507 PF03944 endotoxina delta 517 644 APG03236 82 nenhum SplitCry domínio (APG09442.0 PFAM ) APG03264.0 83 PF03945 endotoxina delta, 203 293 domínio terminal N APG03264 84 PF07029 Proteína CryBP1 28 188 CryBP1 (APG04181.0 ) APG03555.0 85 PF03945 endotoxina delta, 99 325 domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 555 708 APG03555.1 86 3’ PF03945 endotoxina delta, 99 325 Truncamento domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 555 708 APG03565.0 87 PF03318 Toxina Clostridium 77 274 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03573.0 88 PF03945 endotoxina delta, 134 323 domínio terminal N APG03573.1 89 Início PF03945 endotoxina delta, 118 307 alternativo domínio terminal N APG03573.2 90 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 82 271 removido domínio terminal N APG03623.0 91 PF03318 Toxina Clostridium 107 311 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03623.1 92 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 77 282 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03655.0 93 PF05431 Toxina Crystal 185 341 inseticida P42
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG03730.0 94 PF03318 Toxina Clostridium 115 304 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03730.1 95 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 89 279 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03741.0 96 PF03945 endotoxina delta, 103 289 domínio terminal N APG03741.1 97 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 62 248 removido domínio terminal N APG03859.0 98 PF00652 Domínio da lectina 29 150 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 194 355 inseticida P42 APG03864.0 99 PF03318 Toxina Clostridium 111 238 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03864.1 100 Início PF03318 Toxina Clostridium 109 236 alternativo épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03864.2 101 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 82 209 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG03869.0 102 PF05431 Toxina Crystal 209 335 inseticida P42 APG03869.1 103 Início PF05431 Toxina Crystal 209 335 alternativo inseticida P42 APG03974.0 104 PF03945 endotoxina delta, 64 294 domínio terminal N APG03986.0 105 PF03945 endotoxina delta, 122 294 domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 453 526 beta-trifólio de tipo ricina APG03986.1 106 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 84 256 removido domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 415 488 beta-trifólio de tipo ricina
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG03986.2 107 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 84 256 removido e 3’ domínio terminal N truncamento APG04108.0 108 PF03945 endotoxina delta, 118 292 domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 446 530 beta-trifólio de tipo ricina APG04108.1 109 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 80 254 removido domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 408 492 beta-trifólio de tipo ricina APG04127.0 110 PF03318 Toxina Clostridium 92 207 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04144.0 111 PF14200 Domínio de tipo lectina 38 107 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 231 384 inseticida P42 APG04144.1 112 Peptídeo sinal PF14200 Domínio de tipo lectina 5 73 removido beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 197 350 inseticida P42 APG04175.0 113 PF03945 endotoxina delta, 100 285 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 396 411 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 416 433 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 466 477 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 494 510 parede celular putativa APG04175.1 114 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 58 243 removido domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 354 369 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 374 391 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 424 435 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 452 468 parede celular putativa
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG04182.0 115 PF03318 Toxina Clostridium 163 318 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04182.1 116 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 129 284 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04280.0 117 PF03945 endotoxina delta, 81 273 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 404 419 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 423 437 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 468 481 parede celular putativa APG04296.0 118 nenhum domínio
PFAM APG04296.1 119 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG04305.0 120 PF03318 Toxina Clostridium 157 261 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04305.1 121 Início PF03318 Toxina Clostridium 143 247 alternativo épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04305.2 122 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 114 214 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04325.0 123 PF03945 endotoxina delta, 94 269 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 338 550 PF03944 endotoxina delta 560 690 APG04325.1 124 Início PF03945 endotoxina delta, 94 269 alternativo domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 338 550 PF03944 endotoxina delta 560 690 APG04347.0 125 nenhum domínio
PFAM
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG04347.1 126 Início PF03318 Toxina Clostridium 101 191 alternativo épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04347.2 127 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 65 155 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04379.0 128 PF03945 endotoxina delta, 99 280 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 288 505 PF03944 endotoxina delta 516 660 APG04379.1 129 Início PF03945 endotoxina delta, 89 271 alternativo e domínio terminal N 3’ PF00555 endotoxina delta 279 496 truncamento PF03944 endotoxina delta 507 650 APG04448.0 130 PF03318 Toxina Clostridium 75 271 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04448.1 131 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 46 241 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04454.0 132 nenhum domínio
PFAM APG04455.0 133 PF03318 Toxina Clostridium 134 273 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04455.1 134 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 105 244 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04685.0 135 PF14200 Domínio de tipo lectina 77 163 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 233 395 inseticida P42 APG04685.1 136 Início PF14200 Domínio de tipo lectina 72 158 alternativo beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 228 390 inseticida P42
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG04685.2 137 Peptídeo sinal PF14200 Domínio de tipo lectina 45 131 removido beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 201 363 inseticida P42 APG04767.0 138 PF03318 Toxina Clostridium 121 233 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04767.1 139 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 90 204 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG04825.0 140 PF03945 endotoxina delta, 91 302 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 310 529 PF03944 endotoxina delta 539 676 APG04825.1 141 3’ PF03945 endotoxina delta, 91 302 Truncamento domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 310 529 PF03944 endotoxina delta 539 676 APG04838.0 142 PF00388 Domínio da fosfolipasa 31 168 específico do fosfatidilinositol PF14200 Domínio de tipo lectina 341 426 beta-trifólio de tipo ricina PF14200 Domínio de tipo lectina 481 568 beta-trifólio de tipo ricina APG04849.0 143 nenhum domínio
PFAM APG04849.1 144 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG04849.2 145 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG05091.0 146 PF03945 endotoxina delta, 103 285 domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 486 575 beta-trifólio de tipo ricina APG05091.1 147 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 65 247 removido domínio terminal N
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação PF14200 Domínio de tipo lectina 448 537 beta-trifólio de tipo ricina APG05103.0 148 PF03945 endotoxina delta, 139 306 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 390 404 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 407 422 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 449 461 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 521 535 parede celular putativa APG05103.1 149 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 108 275 removido domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 359 373 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 376 391 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 418 430 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 490 504 parede celular putativa APG05182.0 150 PF01338 Toxina de Bacillus 27 242 thuringiensis APG05239.0 151 PF03318 Toxina Clostridium 114 303 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG05278.0 152 PF03945 endotoxina delta, 119 313 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 437 452 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 456 470 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 501 514 parede celular putativa APG05278.1 153 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 81 275 removido domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 399 414 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 418 432 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 463 476 parede celular putativa
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG05402.0 154 PF03945 endotoxina delta, 124 317 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 446 461 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 465 479 parede celular putativa APG05402.1 155 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 86 279 removido domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 408 423 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 427 441 parede celular putativa APG05428.0 156 nenhum domínio
PFAM APG05428.1 157 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG05428.2 158 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG05451.0 159 PF03318 Toxina Clostridium 177 305 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG05451.1 160 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 135 263 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG05485.0 161 PF03318 Toxina Clostridium 29 238 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG05753.0 162 PF03318 Toxina Clostridium 55 274 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG05753.1 163 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 31 250 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG05769.0 164 PF14200 Domínio de tipo lectina 38 105 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 220 380 inseticida P42
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG05769.1 165 Peptídeo sinal PF14200 Domínio de tipo lectina 5 71 removido beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 186 346 inseticida P42 APG05830.0 166 PF03945 endotoxina delta, 60 274 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 305 319 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 427 440 parede celular putativa APG05865.0 167 PF03945 endotoxina delta, 134 336 domínio terminal N APG05865.1 168 Início PF03945 endotoxina delta, 113 315 alternativo domínio terminal N APG05915.0 169 PF03945 endotoxina delta, 124 290 domínio terminal N APG05915.1 170 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 82 248 removido domínio terminal N APG05921.0 171 PF01338 Toxina de Bacillus 113 230 thuringiensis PF01338 Toxina de Bacillus 240 316 thuringiensis APG05936.0 172 PF14200 Domínio de tipo lectina 51 132 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 186 349 inseticida P42 APG05943.0 173 nenhum domínio
PFAM APG05943.1 174 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG05984.0 175 nenhum domínio
PFAM APG06031.0 176 nenhum domínio
PFAM APG06031.1 177 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG06059.0 178 PF06101 Proteína associada à 35 200 seleção da proteína vacuolar 62
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG06059.1 179 Início PF06101 Proteína associada à 23 187 alternativo seleção da proteína vacuolar 62 APG06065.0 180 PF03318 Toxina Clostridium 78 273 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06231.0 181 PF03318 Toxina Clostridium 158 285 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06231.1 182 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 131 258 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06239.0 183 PF03945 endotoxina delta, 65 291 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 299 506 PF03944 endotoxina delta 516 651 APG06239.1 184 Início PF03945 endotoxina delta, 62 288 alternativo domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 296 503 PF03944 endotoxina delta 513 648 APG06273.0 185 PF03318 Toxina Clostridium 117 222 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06273.1 186 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 88 193 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06294.0 187 PF03945 endotoxina delta, 55 269 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 278 460 PF03944 endotoxina delta 470 609 PF14200 Domínio de tipo lectina 651 736 beta-trifólio de tipo ricina APG06294.1 188 Início PF03945 endotoxina delta, 49 263 alternativo e domínio terminal N 3’ PF00555 endotoxina delta 272 454 truncamento PF03944 endotoxina delta 464 603 APG06420.0 189 PF03945 endotoxina delta, 147 353 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 525 540 parede celular putativa
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação PF01473 Repetição de ligação da 557 577 parede celular putativa APG06420.1 190 Início PF03945 endotoxina delta, 130 336 alternativo domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 508 523 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 540 560 parede celular putativa APG06420.2 191 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 91 297 removido domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 469 484 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 501 521 parede celular putativa APG06421.0 192 PF03945 endotoxina delta, 93 315 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 323 557 PF03944 endotoxina delta 567 700 APG06421.1 193 Início PF03945 endotoxina delta, 90 312 alternativo domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 320 554 PF03944 endotoxina delta 564 697 APG06422.0 194 nenhum domínio
PFAM APG06422.1 195 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG06482.0 196 PF01338 Toxina de Bacillus 10 198 thuringiensis APG06482.1 197 Início PF01338 Toxina de Bacillus 10 198 alternativo thuringiensis APG06566.0 198 PF03945 endotoxina delta, 68 246 domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 364 451 beta-trifólio de tipo ricina APG06566.1 199 Início PF03945 endotoxina delta, 58 236 alternativo domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 354 441 beta-trifólio de tipo ricina APG06802.0 200 PF03318 Toxina Clostridium 120 324 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG06802.1 201 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 86 290 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06851.0 202 PF03318 Toxina Clostridium 147 336 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06851.1 203 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 118 307 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06988.0 204 PF03318 Toxina Clostridium 128 250 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06988.1 205 Início PF03318 Toxina Clostridium 113 235 alternativo épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG06988.2 206 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 77 200 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG07033.0 207 PF03945 endotoxina delta, 198 266 domínio terminal N APG07042.0 208 nenhum domínio
PFAM APG07055.0 209 PF03318 Toxina Clostridium 137 264 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG07055.1 210 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 110 237 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG07069.0 211 PF03945 endotoxina delta, 118 307 domínio terminal N APG07069.1 212 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 80 269 removido domínio terminal N APG07124.0 213 PF03945 endotoxina delta, 133 332 domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 526 661 PF01473 Repetição de ligação da 686 702 parede celular putativa
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação PF01473 Repetição de ligação da 715 727 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 745 760 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 773 789 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 803 818 parede celular putativa APG07124.1 214 3’ PF03945 endotoxina delta, 134 332 Truncamento domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 526 661 APG07124.2 215 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 103 302 removido domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 496 631 PF01473 Repetição de ligação da 656 672 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 685 697 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 715 730 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 743 759 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 773 788 parede celular putativa APG07124.3 216 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 103 302 removido e 3’ domínio terminal N truncamento PF03944 endotoxina delta 496 631 APG07570.0 217 nenhum domínio
PFAM APG07719.0 218 PF03945 endotoxina delta, 71 242 domínio terminal N APG07775.0 219 PF03945 endotoxina delta, 90 277 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 285 482 PF03944 endotoxina delta 494 629 APG07775.1 220 3’ PF03945 endotoxina delta, 90 277 Truncamento domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 285 482 PF03944 endotoxina delta 494 629 APG07824.0 221 PF03318 Toxina Clostridium 54 279 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG07937.0 222 PF03945 endotoxina delta, 124 291 domínio terminal N
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG07937.1 223 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 88 255 removido domínio terminal N APG07972.0 224 PF03945 endotoxina delta, 93 290 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 299 499 PF03944 endotoxina delta 510 647 APG08011.0 225 PF03318 Toxina Clostridium 44 247 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08060.0 226 PF03945 endotoxina delta, 62 242 domínio terminal N APG08114.0 227 PF03945 endotoxina delta, 125 297 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 305 519 PF03944 endotoxina delta 529 662 APG08114.1 228 Início PF03945 endotoxina delta, 122 294 alternativo domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 302 516 PF03944 endotoxina delta 526 659 APG08142.0 229 PF03945 endotoxina delta, 74 257 domínio terminal N APG08243.0 230 PF03945 endotoxina delta, 144 322 domínio terminal N APG08243.1 231 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 106 284 removido domínio terminal N APG08288.0 232 PF03318 Toxina Clostridium 113 243 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08288.1 233 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 67 197 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08332.0 234 PF01338 Toxina de Bacillus 39 155 thuringiensis APG08365.0 235 nenhum domínio
PFAM APG08365 236 PF07029 Proteína CryBP1 58 214 CryBP1 (APG08503.0 ) APG08425.0 237 nenhum domínio
PFAM
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG08425.1 238 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG08578.0 239 PF03945 endotoxina delta, 99 325 domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 555 708 APG08578.1 240 3’ PF03945 endotoxina delta, 99 325 Truncamento domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 555 708 APG08608.0 241 nenhum domínio
PFAM APG08608.1 242 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG08608.2 243 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG08610.0 244 PF03945 endotoxina delta, 86 316 domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 910 961 beta-trifólio de tipo ricina APG08610.1 245 Início PF03945 endotoxina delta, 36 266 alternativo domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 860 911 beta-trifólio de tipo ricina APG08633.0 246 PF03318 Toxina Clostridium 84 213 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08633.1 247 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 40 169 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08645.0 248 PF03945 endotoxina delta, 91 310 domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 529 679 APG08689.0 249 PF03318 Toxina Clostridium 57 287 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08689.1 250 Início PF03318 Toxina Clostridium 36 266 alternativo épsilon ETX/Toxina
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08802.0 251 PF03318 Toxina Clostridium 157 263 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08802.1 252 Início PF03318 Toxina Clostridium 143 249 alternativo épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08802.2 253 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 114 220 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08824.0 254 PF03944 endotoxina delta 601 715 APG08824.1 255 Início PF03944 endotoxina delta 592 706 alternativo e 3’ truncamento APG08828.0 256 nenhum domínio
PFAM APG08828.1 257 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG08828.2 258 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG08831.0 259 PF03318 Toxina Clostridium 148 351 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08831.1 260 Alterate start PF03318 Toxina Clostridium 148 351 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08831.2 261 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 120 323 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08907.0 262 PF03318 Toxina Clostridium 94 301 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08907.1 263 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 68 275 removido épsilon ETX/Toxina
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação Bacillus do mosquitocida MTX2 APG08935.0 264 nenhum domínio
PFAM APG08969.0 265 nenhum domínio
PFAM APG08969.1 266 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG09007.0 267 PF03945 endotoxina delta, 102 273 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 393 411 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 434 446 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 467 481 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 501 521 parede celular putativa APG09007.1 268 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 75 246 removido domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 366 384 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 407 419 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 440 454 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 474 494 parede celular putativa APG09140.0 269 PF03945 endotoxina delta, 114 320 domínio terminal N APG09140.1 270 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 76 282 removido domínio terminal N APG09227.0 271 PF03945 endotoxina delta, 149 303 domínio terminal N PF03944 endotoxina delta 534 673 APG09282.0 272 PF03945 endotoxina delta, 116 290 domínio terminal N PF14200 Domínio de tipo lectina 514 596 beta-trifólio de tipo ricina APG09282.1 273 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 78 252 removido domínio terminal N
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação PF14200 Domínio de tipo lectina 476 558 beta-trifólio de tipo ricina APG09282.2 274 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 78 252 removido e 3’ domínio terminal N truncamento APG09313.0 275 PF03318 Toxina Clostridium 142 258 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09313.1 276 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 114 223 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09426.0 277 nenhum domínio
PFAM APG09426.1 278 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG09426.2 279 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG09496.0 280 PF03945 endotoxina delta, 98 291 domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 307 510 PF03944 endotoxina delta 521 651 PF14200 Domínio de tipo lectina 696 785 beta-trifólio de tipo ricina APG09496.1 281 3’ PF03945 endotoxina delta, 97 291 Truncamento domínio terminal N PF00555 endotoxina delta 307 510 PF03944 endotoxina delta 521 651 APG09535.0 282 PF03318 Toxina Clostridium 176 344 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09535.1 283 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 146 315 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09578.0 284 PF01338 Toxina de Bacillus 14 241 thuringiensis
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação PF14200 Domínio de tipo lectina 272 360 beta-trifólio de tipo ricina PF14200 Domínio de tipo lectina 414 503 beta-trifólio de tipo ricina APG09578.1 285 3’ PF01338 Toxina de Bacillus 14 230 Truncamento thuringiensis APG09594.0 286 PF03318 Toxina Clostridium 227 348 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09594.1 287 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 206 327 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09641.0 288 PF03318 Toxina Clostridium 107 305 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09713.0 289 PF03945 endotoxina delta, 126 306 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 402 416 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 422 440 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 476 489 parede celular putativa APG09713.1 290 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 88 268 removido domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 364 378 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 384 402 parede celular putativa PF01473 Repetição de ligação da 438 451 parede celular putativa APG09727.0 291 PF03945 endotoxina delta, 54 288 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 384 398 parede celular putativa APG09856.0 292 PF03318 Toxina Clostridium 113 322 épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09856.1 293 Início PF03318 Toxina Clostridium 101 310 alternativo épsilon ETX/Toxina
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09856.2 294 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium 76 285 removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 APG09889.0 295 nenhum domínio
PFAM APG09967.0 296 nenhum domínio
PFAM APG09967.1 297 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG00196.2 298 Início PF03945 Endotoxina delta, 36 265 alternativo domínio N-terminal PF00030 Beta/gama cristalina 623 699 PF14200 Domínio de tipo lectina 824 911 beta-trifólio de tipo ricina APG01611.2 299 Início PF14200 Domínio de tipo lectina 5 75 alternativo beta-trifólio de tipo ricina PF14200 Domínio de tipo lectina 89 147 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 180 341 inseticida P42 APG01611.3 300 Início PF14200 Domínio de tipo lectina 5 75 alternativo e beta-trifólio de tipo 3’ ricina truncamento PF14200 Domínio de tipo lectina 89 147 beta-trifólio de tipo ricina PF05431 Toxina Crystal 180 341 inseticida P42 APG01026.0 301 nenhum domínio
PFAM APG01187.0 302 nenhum domínio
PFAM APG02037.0 303 PF03945 endotoxina delta, 123 270 domínio terminal N APG02037.1 304 Peptídeo sinal PF03945 endotoxina delta, 81 228 removido domínio terminal N
APG ID Seq Tipo de Acesso Descrição Start Stop ID modificação APG02474.0 305 nenhum domínio
PFAM APG04153.0 306 nenhum domínio
PFAM APG04153.1 307 Início nenhum alternativo domínio
PFAM APG04153.2 308 Peptídeo sinal nenhum removido domínio
PFAM APG06221.0 309 PF03945 endotoxina delta, 54 288 domínio terminal N PF01473 Repetição de ligação da 384 398 parede celular putativa APG06736.0 310 nenhum domínio
PFAM APG01190.0 311 PF03318 Toxina Clostridium épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 86 307 APG01190.1 312 Peptídeo sinal PF03318 Toxina Clostridium removido épsilon ETX/Toxina Bacillus do mosquitocida MTX2 61 281
[0045] Também são fornecidos ácidos nucleicos recombinantes ou sintéticos que codificam os polipeptídeos pesticidas aqui descritos. Resultam de particular interesse as sequências de ácido nucleico que foram concebidas para expressão em uma planta de interesse. Por exemplo, a sequência de ácido nucleico pode ser otimizada para aumentar a expressão em uma planta hospedeira. Uma proteína pesticida da invenção pode ser traduzida de volta para produzir um ácido nucleico compreendendo códons otimizados para expressão em um hospedeiro em particular, por exemplo, uma planta de cultivo. Em outra realização, os polinucleotídeos que codificam os polipeptídeos aqui fornecidos podem ser otimizados para aumentar a expressão na planta transformada. Por exemplo, os polinucleotídeos podem ser sintetizados utilizando códons preferidos por plantas para obter uma melhor expressão. Vide, por exemplo, Campbell e Gowri (1990) Plant Physiol. 92:1-11 para uma discussão sobre a utilização do códon preferido pelo hospedeiro. A técnica dispõe de métodos para sintetizar genes preferidos por plantas. Vide, por exemplo, as Patentes dos EUA nº 5.380.831 e 5.436.391, e Murray et al. (1989) Nucleic Acids Res. 17:477-498, aqui incorporados como referência. A expressão dessa sequência de codificação pela planta transformada (por exemplo, dicotiledônea ou monocotiledônea) resultará na produção de um polipeptídeo pesticida e conferirá maior resistência na planta a uma praga. As moléculas de ácido nucleico recombinantes e sintéticas que codificam as proteínas pesticidas da invenção não incluem a sequência bacteriana natural que codifica a proteína.
[0046] Um “polinucleotídeo recombinante” ou “ácido nucleico recombinante” compreende uma combinação de dois ou mais segmentos de ácido nucleico ligados quimicamente que não se encontram diretamente unidos na natureza. Por “diretamente unidos” entende-se que os dois segmentos de ácido nucleico são imediatamente adjacentes e que estão unidos entre si por uma ligação química. Em formas de realização específicas, o polinucleotídeo recombinante compreende um polinucleotídeo de interesse ou uma variante ou fragmento do mesmo, de modo tal que um segmento adicional de ácido nucleico ligado quimicamente esteja localizado a
5’, 3’ ou seja interno ao polinucleotídeo de interesse. Alternativamente, o segmento de ácido nucleico ligado quimicamente do polinucleotídeo recombinante pode ser formado por deleção de uma sequência. O segmento adicional de ácido nucleico ligado quimicamente, ou a sequência eliminada para unir os segmentos de ácido nucleico ligados, pode ser de qualquer comprimento, incluindo, por exemplo, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 nucleotídeos ou mais. Os diversos métodos para produzir esses polinucleotídeos recombinantes incluem síntese química e a manipulação de segmentos isolados de polinucleotídeos mediante técnicas de engenharia genética. Em formas de realização específicas, o polinucleotídeo recombinante pode compreender uma sequência de DNA recombinante ou uma sequência de RNA recombinante. Um “fragmento de um polinucleotídeo ou ácido nucleico recombinante” compreende pelo menos uma de uma combinação de dois ou mais segmentos de aminoácidos ligados quimicamente que não se encontram diretamente unidos na natureza.
[0047] Os fragmentos de um polinucleotídeo (RNA ou DNA) podem codificar fragmentos de proteína que retêm atividade. Em formas de realização específicas, um fragmento de um polinucleotídeo recombinante ou um construto de polinucleotídeo recombinante compreende pelo menos uma junção dos dois ou mais segmentos de ácido nucleico ligados quimicamente ou operacionalmente, os quais não se encontram diretamente unidos na natureza. Um fragmento de um polinucleotídeo que codifica uma porção biologicamente ativa de um polipeptídeo que retém atividade pesticida irá codificar pelo menos 25, 30, 40, 50, 60, 70, 75, 80, 90,
100, 110, 120, 125, 130, 140, 150, 160, 170, 175 ou 180 aminoácidos contingentes, ou até o número total de aminoácidos presentes em um polipeptídeo de comprimento total conforme apresentado nas SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312. Em formas de realização específicas, esses fragmentos de polipeptídeos são fragmentos ativos, enquanto em outras formas de realização o fragmento de polipeptídeo compreende um fragmento de polipeptídeo recombinante. Conforme aqui utilizado, um fragmento de um polipeptídeo recombinante compreende pelo menos uma combinação de dois ou mais segmentos de aminoácidos ligados quimicamente, os quais não se encontram diretamente unidos na natureza.
[0048] O termo "variantes" pretende significar sequências substancialmente semelhantes. Para os polinucleotídeos, uma variante compreende uma deleção e/ou adição de um ou mais nucleotídeos em um ou mais locais internos dentro do polinucleotídeo nativo e/ou uma substituição de um ou mais nucleotídeos em um ou mais locais no polinucleotídeo nativo. Conforme aqui utilizado, um polinucleotídeo ou polipeptídeo “nativo” compreende uma sequência de nucleotídeos ou uma sequência de aminoácidos que ocorrem naturalmente, respectivamente.
[0049] As variantes de um polinucleotídeo em particular da invenção (isto é, o polinucleotídeo de referência) também podem ser avaliadas por comparação da porcentagem de identidade de sequência entre o polipeptídeo codificado por um polinucleotídeo variante e o polipeptídeo codificado pelo polinucleotídeo de referência. Assim, por exemplo, descreve- se um polinucleotídeo isolado que codifica um polipeptídeo que possui uma certa porcentagem de identidade de sequência com o polipeptídeo das SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54,
55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312. A porcentagem de identidade de sequência entre dois polipeptídeos quaisquer pode ser calculada utilizando programas de alinhamento de sequências e parâmetros descritos em outras partes deste documento.
Quando qualquer par de polinucleotídeos da invenção for avaliado mediante comparação da porcentagem de identidade de sequência compartilhada pelos dois polipeptídeos que codificam, a porcentagem de identidade de sequência entre os dois polipeptídeos codificados será de pelo menos cerca de 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais de identidade de sequência com as SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312. Em outras formas de realização, a variante do polinucleótido aqui proporcionado difere da sequência nativa em pelo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 ou mais nucleótidos.
[0050] Os polinucleotídeos e proteínas variantes também abrangem sequências e proteínas derivadas de um procedimento mutagênico e recombinogênico como o embaralhamento de DNA. Com esse procedimento, uma ou mais proteínas pesticidas diferentes aqui divulgadas (SEQ ID NO: 1-312) é manipulada para criar uma nova proteína pesticida que possua as propriedades desejadas. Desta forma, bibliotecas de polinucleotídeos recombinantes são geradas a partir de uma população de polinucleotídeos com sequências relacionadas, compreendendo regiões de sequência que possuem considerável identidade de sequência e que podem ser recombinadas homologamente in vitro ou in vivo. Por exemplo, usando esta abordagem, os motivos de sequência que codificam um domínio de interesse podem ser embaralhados entre as sequências pesticidas aqui fornecidas e outros genes pesticidas conhecidos para obter um novo gene que codifique uma proteína com uma propriedade de interesse melhorada, por exemplo, um aumento de Km no caso de uma enzima. Estratégias para o embaralhamento de DNA são conhecidas na técnica. Vide, por exemplo, Stemmer (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:10747- 10751; Stemmer (1994) Nature 370:389-391; Crameri et al. (1997) Nature Biotech. 15:436-438; Moore et al. (1997) J. Mol. Biol. 272:336-347; Zhang et al. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94:4504-4509; Crameri et al. (1998) Nature 391:288- 291; e as Patentes dos EUA nº 5.605.793 e 5.837.458. Um ácido nucleico “embaralhado” é um ácido nucleico produzido por um procedimento de embaralhamento como qualquer um dos procedimentos de embaralhamento aqui apresentados. Os ácidos nucleicos embaralhados são produzidos mediante recombinação (física ou virtual) de dois ou mais ácidos nucleicos (ou cadeia de caracteres), por exemplo, de forma artificial e opcionalmente recursiva. Geralmente, uma ou mais etapas de rastreamento são usadas nos processos de embaralhamento para identificar ácidos nucleicos de interesse; essa etapa de rastreamento pode ser realizada antes ou depois de qualquer etapa de recombinação. Em algumas formas de realização de embaralhamento (mas não em todas), é desejável realizar múltiplas rodadas de recombinação antes da seleção, de modo a aumentar a diversidade do grupo a ser rastreado. O processo geral de recombinação e seleção pode ser opcionalmente repetido de modo recursivo. Dependendo do contexto, o embaralhamento pode se referir a um processo geral de recombinação e seleção, ou, alternativamente, pode simplesmente se referir às porções recombinacionais do processo geral.
[0051] Em uma forma de realização, é fornecido um método para obter um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo melhorado contendo atividade pesticida, em que o polipeptídeo melhorado apresenta pelo menos uma propriedade melhorada com respeito a qualquer uma das SEQ ID NOS: 1-312. Tais métodos podem compreender: (a) recombinar vários polinucleotídeos progenitores para produzir uma biblioteca de polinucleotídeos recombinantes que codificam polipeptídeos pesticidas recombinantes; (b) rastrear a biblioteca para identificar um polinucleotídeo recombinante que codifique um polipeptídeo pesticida recombinante melhorado que apresente uma propriedade melhorada com respeito ao polinucleotídeo progenitor; (c) recuperar o polinucleotídeo recombinante que codifica o polipeptídeo pesticida recombinante melhorado identificado em (b); e (d) repetir as etapas (a), (b) e (c) usando o polinucleotídeo recombinante recuperado na etapa (c) como um dos vários polinucleotídeos progenitores da etapa repetida (a). iii. Comparações de sequências
[0052] Conforme aqui utilizado, o termo “identidade” ou “porcentagem de identidade”, quando utilizado em relação a um par em particular de sequências de aminoácidos alinhadas, se refere à porcentagem de identidade de sequência de aminoácidos obtida contando o número de correspondências idênticas no alinhamento e dividindo esse número de correspondências idênticas pelo comprimento das sequências alinhadas. Conforme aqui utilizado, o termo “similaridade” ou “porcentagem de similaridade”, quando utilizado em relação a um determinado par de sequências de aminoácidos alinhadas, se refere à soma das pontuações obtidas a partir de uma matriz de pontuação para cada par de aminoácidos no alinhamento dividido pelo comprimento das sequências alinhadas.
[0053] Salvo indicação em contrário, a identidade e a similaridade são calculadas pelos algoritmos de alinhamento e pontuação globais de Needleman-Wunsch (Needleman e Wunsch (1970) J. Mol. Biol. 48(3):443-453) conforme implementado pelo programa “agulha”, distribuído como parte do pacote de software EMBOSS (Rice, P. Longden, I. and Bleasby, A.,
EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite, 2000, Trends in Genetics 16, (6) págs. 276-277, versões 6.3.1 disponibilizadas pela EMBnet em embnet.org/resource/emboss e emboss.sourceforge.net, entre outras fontes) usando penalidades de intervalo e matrizes de pontuação padrão (EBLOSUM62 para proteínas e EDNAFULL para DNA). Programas equivalentes também podem ser usados. Por “programa equivalente” entende-se qualquer programa de comparação de sequências que, para duas sequências quaisquer em questão, gere um alinhamento que possua correspondências de resíduos de nucleotídeos idênticas e uma identidade de porcentagem de sequência idêntica com relação ao alinhamento correspondente gerado pela agulha do EMBOSS versão 6.3.1.
[0054] Algoritmos matemáticos adicionais são conhecidos na técnica e podem ser utilizados para a comparação de duas sequências. Vide, por exemplo, o algoritmo de Karlin and Altschul (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:2264, modificado como em Karlin and Altschul (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5877. Esse algoritmo é incorporado nos programas BLAST de Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215:403. As buscas de nucleotídeos BLAST podem ser realizadas com o programa BLASTN (pesquisa de nucleotídeos feita com respeito a sequências de nucleotídeos) para obter sequências de nucleotídeos homólogas a moléculas de ácido nucleico semelhantes a pesticidas da invenção, ou com o programa BLASTX (pesquisa de nucleotídeos traduzida feita com respeito a sequências de proteínas) para obter sequências de proteínas homólogas às moléculas de ácido nucleico pesticidas da invenção. As buscas de proteínas BLAST podem ser realizadas com o programa BLASTP (pesquisa de proteínas feita com respeito a sequências de proteínas) para obter sequências de aminoácidos homólogas às moléculas de proteína pesticidas da invenção, ou com o programa TBLASTN (pesquisa de proteínas feita com respeito a sequências de nucleotídeos traduzidas) para obter sequências de nucleotídeos homólogas às moléculas de proteína pesticidas da invenção. Para obter alinhamentos defasados para fins de comparação, o Gapped BLAST (em BLAST 2.0) pode ser utilizado conforme descrito em Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389. Alternativamente, o PSI-Blast pode ser usado para realizar uma pesquisa iterada que detecte relações distantes entre moléculas. Vide Altschul et al. (1997) supra. Ao utilizar programas BLAST, Gapped BLAST e PSI-Blast, podem ser utilizados os parâmetros padrão dos respectivos programas (por exemplo, BLASTX e BLASTN). O alinhamento também pode ser realizado manualmente por inspeção.
[0055] Duas sequências estão “alinhadas otimamente” quando estão alinhadas para a pontuação de similaridade usando uma matriz de substituição de aminoácidos definida (por exemplo, BLOSUM62), penalidade por existência de intervalo e penalidade por extensão de intervalo, de modo a chegar à pontuação mais alta possível para esse par de sequências. As matrizes de substituição de aminoácidos e a sua utilização na quantificação da similaridade entre duas sequências são bem conhecidas na técnica e descritas, por exemplo, em Dayhoff et al. (1978) "A model of evolutionary change in proteins." em "Atlas of Protein Sequence and Structure," Vol. 5, Suppl. 3 (ed. M. O. Dayhoff), pp. 345-
352. Natl. Biomed. Res. Found., Washington, D.C. e Henikoff et al. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915-10919. A matriz BLOSUM62 é frequentemente usada como uma matriz de substituição de pontuação padrão em protocolos de alinhamento de sequências. A penalidade por existência de intervalo é imposta para a introdução de um único intervalo de aminoácido em uma das sequências alinhadas, e a penalidade por extensão de intervalo é imposta para cada posição de aminoácido vazia adicional inserida em um intervalo já aberto. O alinhamento é definido pelas posições de aminoácidos de cada sequência em que o alinhamento começa e termina e, opcionalmente, pela inserção de um intervalo ou de intervalos múltiplos em uma ou ambas as sequências, de modo a chegar à pontuação mais alta possível. Embora o alinhamento e a pontuação ótimas possam ser obtidas manualmente, o processo é facilitado pelo uso de um algoritmo de alinhamento implementado por computador como, por exemplo, o gapped BLAST 2.0, descrito em Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402, e disponibilizado ao público no site do National Center for Biotechnology Information (www.ncbi.nlm.nih.gov). Alinhamentos ótimos, incluindo alinhamentos múltiplos, podem ser preparados usando, por exemplo, PSI-BLAST, disponível em www.ncbi.nlm.nih.gov e descrito por Altschul et al. (1997) Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
[0056] Em relação a uma sequência de aminoácidos que está otimamente alinhada com uma sequência de referência, um resíduo de aminoácido "corresponde a" a posição na sequência de referência com a qual o resíduo está emparelhado no alinhamento. A "posição" é denotada por um número que identifica sequencialmente cada aminoácido na sequência de referência com base na sua posição em relação ao terminal- N. Por exemplo, na SEQ ID NO: 1 posição 1 é M, posição 2 é A, posição 3 é I, etc. Quando uma sequência de teste é otimamente alinhada com a SEQ ID NO: 1, um resíduo na sequência de teste que alinha com o I na posição 3 diz-se "corresponde à posição 3" da SEQ ID NO: 1. Devido a deleções, inserções, truncamentos, fusões, etc., que devem ser levados em conta ao determinar um alinhamento ótimo, em geral, o número de resíduos de aminoácidos em uma sequência de teste determinada simplesmente contando a partir do terminal N não será necessariamente o mesmo que o número de sua posição correspondente na sequência de referência. Por exemplo, em um caso em que há uma deleção em uma sequência de teste alinhada, não haverá aminoácido que corresponda a uma posição na sequência de referência no local da deleção. Onde há uma inserção em uma sequência de referência alinhada, essa inserção não corresponderá a nenhuma posição de aminoácido na sequência de referência. No caso de truncamentos ou fusões, pode haver extensões de aminoácidos na sequência de referência ou alinhada que não correspondem a qualquer aminoácido na sequência correspondente. iv. Anticorpos
[0057] Anticorpos para os polipeptídeos da presente invenção, ou para suas variantes ou fragmentos, também são abrangidos. Os métodos para a produção de anticorpos são bem conhecidos na técnica (vide, por exemplo, Harlow e Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y.; e Pat. dos EUA nº
4.196.265). Esses anticorpos podem ser utilizados em kits para detecção e isolamento de polipeptídeos de toxinas. Assim, esta divulgação proporciona kits compreendendo anticorpos que se ligam especificamente aos polipeptídeos aqui descritos, incluindo, por exemplo, polipeptídeos que possuem as sequências SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291,
292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312. II. Pragas
[0058] As composições e os métodos aqui fornecidos são úteis contra uma variedade de pragas. O termo “pragas” inclui, mas não se limita a, insetos, fungos, bactérias, nematoides, acarídeos, patógenos protozoários, animais- parasitas da fasciolose hepática, entre outros. Pragas de particular interesse são as pragas de insetos, especialmente as pragas de insetos que causam danos significativos às plantas agrícolas. As pragas de insetos incluem insetos selecionados das ordens Coleoptera, Diptera, Hymenoptera, Lepidoptera, Mallophaga, Homoptera, Hemiptera, Orthroptera, Thysanoptera, Dermaptera, Isoptera, Anoplura, Siphonaptera, Trichoptera ou nematoides. Em formas de realização não- limitantes, a praga de insetos compreende larva da lagarta da raiz do milho, Diabrotica virgifera virgifera; lagarta do cartucho, Spodoptera frugiperda; besouro da batata, Leptinotarsa decemlineata; lagarta da espiga, Helicoverpa zea (na América no Norte a mesma espécie ataca o algodão e se denomina lagarta do algodão); broca europeia do milho, Ostrinia nubilalis; lagarta negra, Agrotis ipsilon; traça das crucíferas, Plutella xylostella; lagarta da soja, Anticarsia gemmatalis; broca do milho do sudoeste, Diatraea grandiosella; lagarta do algodão, Helicoverpa armigera (encontrada em todo o mundo, exceto nos EUA); percevejo verde da soja, Nezara viridula; percevejo barriga-verde, Chinavia halaris; percevejo marrom marmorizado, Halyomorpha halys; além de percevejo marrom norte-americano, Euschistus servus;
Euschistus heros (percevejo marrom neotropical OU percevejo da soja); Piezodorus guildinii (percevejo verde pequeno); Dichelops melacanthus (sem nome popular) e/ou Dichelops furcatus (sem nome popular); um pulgão, como o pulgão da soja. Em outras formas de realização, a praga compreende um nematoide incluindo, mas não se limitando a, Meloidogyne hapla (nematoide das galhas); Meloidogyne enterolobii, Meloidogyne arenaria (nematoide da goiabeira); e Meloidogyne javanica.
[0059] O termo “pragas de insetos”, conforme aqui utilizado, se refere a insetos e outras pragas semelhantes como, por exemplo, as da ordem Acari, incluindo, mas não se limitando a, ácaros e carrapatos. As pragas de insetos da presente invenção incluem, mas não se limitam a, insetos da ordem Lepidoptera, por ex., Achoroia grisella, Acleris gloverana, Acleris variana, Adoxophyes orana, Agrotis ipsilon, Alabama argillacea, Alsophila pometaria, Amyelois transitella, Anagasta kuehniella, Anarsia lineatella, Anisota senatoria, Antheraea pernyi, Anticarsia gemmatalis, Archips sp., Argyrotaenia sp., Athetis mindara, Bombyx mori, Bucculatrix thurberiella, Cadra cautella, Choristoneura sp., Cochylls hospes, Colias eurytheme, Corcyra cephalonica, Cydia latiferreanus, Cydia pomonella, Datana integerrima, Dendrolimus sibericus, Desmiafeneralis, Diaphania hyalinata, Diaphania nitidalis, Diatraea grandiosella, Diatraea saccharalis, Ennomos subsignaria, Eoreuma loftini, Esphestia elutella, Erannis tilaria, Estigmene acrea, Eulia salubricola, Eupocoellia ambiguella, Eupoecilia ambiguella, Euproctis chrysorrhoea, Euxoa messoria, Galleria mellonella,
Grapholita molesta, Harrisina americana, Helicoverpa subflexa, Helicoverpa zea, Heliothis virescens, Hemileuca oliviae, Homoeosoma electellum, Hyphantia cunea, Keiferia lycopersicella, Lambdina fiscellaria fiscellaria, Lambdina fiscellaria lugubrosa, Leucoma salicis, Lobesia botrana, Loxostege sticticalis, Lymantria dispar, Macalla thyrisalis, Malacosoma sp., Mamestra brassicae, Mamestra configurata, Manduca quinquemaculata, Manduca sexta, Maruca testulalis, Melanchra picta, Operophtera brumata, Orgyia sp., Ostrinia nubilalis, Paleacrita vernata, Papilio cresphontes, Pectinophora gossypiella, Phryganidia californica, Phyllonorycter blancardella, Pieris napi, Pieris rapae, Plathypena scabra, Platynota flouendana, Platynota stultana, Platyptilia carduidactyla, Plodia interpunctella, Plutella xylostella, Pontia protodice, Pseudaletia unipuncta, Pseudoplasia includens, Sabulodes aegrotata, Schizura concinna, Sitotroga cerealella, Spilonta ocellana, Spodoptera sp., Thaurnstopoea pityocampa, Tinsola bisselliella, Trichoplusia hi, Udea rubigalis, Xylomyges curiails, e Yponomeuta padella.
[0060] As pragas de insetos também incluem insetos selecionados das ordens Diptera, Hymenoptera, Lepidoptera, Mallophaga, Homoptera, Hemiptera, Orthroptera, Thysanoptera, Dermaptera, Isoptera, Anoplura, Siphonaptera, Trichoptera, Coleoptera. As pragas de insetos da invenção para os principais cultivos incluem, mas não se limitam a: Milho: Ostrinia nubilalis, broca europeia do milho; Agrotis ipsilon, lagarta negra; Helicoverpa zeae, lagarta da espiga; Spodoptera frugiperda, lagarta do cartucho do milho;
Diatraea grandiosella, broca do milho do sudoeste; Elasmopalpus lignosellus, lagarta-elasmo; Diatraea saccharalis, broca da cana-de-açúcar; lagarta da raiz do milho ocidental, por ex., Diabrotica virgifera virgifera; lagarta da raiz do milho do norte, por ex., Diabrotica longicornis barberi; lagarta da raiz do milho do sul, por ex., Diabrotica undecimpunctata howardi; Melanotus spp., pirilampos; Cyclocephala borealis, escaravelho mascarado do norte (larva branca); Cyclocephala immaculata, escaravelho mascarado do sul (larva branca); Popillia japonica, besouro japonês; Chaetocnema pulicaria, besouro da pulga do milho; Sphenophorus maidis, percevejo do milho; Rhopalosiphum maidis, pulgão da folha do milho; Anuraphis maidiradicis, pulgão da raiz do milho; Blissus leucopterus leucopterus, percevejo das gramíneas; Melanoplus femurrubrum, gafanhoto de perna vermelha; Melanoplus sanguinipes, gafanhoto migratório; Hylemya platura, verme da semente do milho; Agromyza parvicornis, larva da mancha do milho; Anaphothrips obscrurus, tripes da grama; Solenopsis milesta, formiga- ladra; Tetranychus urticae, ácaro-aranha de duas manchas; Sorgo: Chilo partellus, broca do sorgo; Spodoptera frugiperda, lagarta do cartucho; Helicoverpa zea, lagarta da espiga; Elasmopalpus lignosellus, lagarta-elasmo; Feltia subterranea, lagarta-rosca; Phyllophaga crinita, larva branca; Eleodes, Conoderus e Aeolus spp., pirilampos; Oulema melanopus, larva-lesma; Chaetocnema pulicaria, besouro da folha do milho; Sphenophorus maidis, percevejo do milho; Rhopalosiphum maidis; pulgão da folha do milho; Sipha flava, pulgão amarelo da cana-de-açúcar; percevejo das gramíneas,
por ex., Blissus leucopterus leucopterus; Contarinia sorghicola, mosca do sorgo; Tetranychus cinnabarinus, ácaro- aranha carmim; Tetranychus urticae, ácaro-aranha de duas manchas; Trigo: Pseudaletia unipunctata, lagarta do cartucho; Spodoptera frugiperda, lagarta do cartucho do milho; Elasmopalpus lignosellus, lagarta-elasmo; Agrotis orthogonia, agrotis ocidental; Elasmopalpus lignosellus, lagarta-elasmo; Oulema melanopus, larva-lesma; Hypera punctata, caruncho da folha do trevo; lagarta da raiz do milho do sul, por ex., Diabrotica undecimpunctata howardi; pulgão russo do trigo; Schizaphis graminum, pulgão verde dos cereais; Macrosiphum avenae, pulgão da espiga do trigo; Melanoplus femurrubrum, gafanhoto de perna vermelha; Melanoplus differentialis, gafanhoto diferencial; Melanoplus sanguinipes, gafanhoto migratório; Mayetiola destructor, mosca-de-hesse; Sitodiplosis mosellana, verme do trigo; Meromyza americana, verme do talo do trigo; Hylemya coarctata, mosca do bulbo do trigo; Frankliniella fusca, tripes do fumo; Cephus cinctus, mosca do talo do trigo; Aceria tulipae, eriofídeo do alho; Girassol: Cylindrocupturus adspersus, caruncho do talo do girassol; Smicronyx fulus, caruncho da semente do girassol vermelho; Smicronyx sordidus, caruncho da semente do girassol cinza; Suleima helianthana, traça do botão do girassol; Homoeosoma electellum, traça do girassol; Zygogramma exclamationis, besouro do girassol; Bothyrus gibbosus, besouro da cenoura; Neolasioptera murtfeldtiana, mosca da semente do girassol; Algodão: Heliothis virescens, lagarta das maçãs; Helicoverpa zea, lagarta do algodão; Spodoptera exigua, lagarta do cartucho da beterraba; Pectinophora gossypiella, lagarta rosada; bicudo do algodoeiro, por ex., Anthonomus grandis; Aphis gossypii, pulgão do algodoeiro; Pseudatomoscelis seriatus, pulga saltadora do algodoeiro; Trialeurodes abutilonea, mosca branca Bemisia tabaci; Lygus lineolaris, percevejo opaco da planta; Melanoplus femurrubrum, gafanhoto de perna vermelha; Melanoplus differentialis, gafanhoto diferencial; Thrips tabaci, tripes da cebola; Franklinkiella fusca, tripes do fumo; Tetranychus cinnabarinus, ácaro- aranha carmim; Tetranychus urticae, ácaro-aranha de duas manchas; Arroz: Diatraea saccharalis, broca da cana-de- açúcar; Spodoptera frugiperda, lagarta do cartucho; Helicoverpa zea, lagarta da espiga; Colaspis brunnea, vaquinha; Lissorhoptrus oryzophilus, caruncho da água do arroz; Sitophilus oryzae, caruncho do arroz; Nephotettix nigropictus, cigarrinha do arroz; percevejo das gramíneas, por ex., Blissus leucopterus leucopterus; Acrosternum hilare, percevejo-acrosterno; Soja: Pseudoplusia includens, lagarta falsa-medideira; Anticarsia gemmatalis, lagarta da soja; Plathypena scabra, lagarta verde do trevo; Ostrinia nubilalis, broca europeia do milho; Agrotis ipsilon, lagarta negra; Spodoptera exigua, lagarta do cartucho da beterraba; Heliothis virescens, lagarta das maçãs; Helicoverpa zea, lagarta do algodão; Epilachna varivestis, besouro mexicano do feijão; Myzus persicae, pulgão verde do pêssego; Empoasca fabae, cigarrinha da batata; Acrosternum hilare, percevejo- acrosterno; Melanoplus femurrubrum, gafanhoto de perna vermelha; Melanoplus differentialis, gafanhoto diferencial; Hylemya platura, verme da semente do milho; Sericothrips variabilis, tripes da soja; Thrips tabaci, tripes da cebola; Tetranychus turkestani, ácaro-aranha do morango; Tetranychus urticae, ácaro-aranha de duas manchas; Cevada: Ostrinia nubilalis, broca europeia do milho; Agrotis ipsilon, lagarta negra; Schizaphis graminum, pulgão verde dos cereais; percevejo das gramíneas, por ex., Blissus leucopterus leucopterus; Acrosternum hilare, percevejo-acrosterno; Euschistus servus, percevejo marrom norte-americano; Jylemya platura, verme da semente do milho; Mayetiola destructor, mosca-de-hesse; Petrobia latens, ácaro marrom do trigo; Colza: Vrevicoryne brassicae, pulgão da couve; Phyllotreta cruciferae, besouro-pulga; Phyllotreta striolata, besouro- pulga listrado; Phyllotreta nemorum, besouro-pulga listrado do nabo; Meligethes aeneus, besouro da colza; e os besouros do pólen Meligethes rufimanus, Meligethes nigrescens, Meligethes canadianus e Meligethes viridescens; Batata: Leptinotarsa decemlineata, besouro da batata.
[0061] Os métodos e composições aqui fornecidos podem ser eficazes contra Hemiptera como Lygus hesperus, Lygus lineolaris, Lygus pratensis, Lygus rugulipennis Popp, Lygus pabulinus, Calocoris norvegicus, Orthops compestris, Plesiocoris rugicollis, Cyrtopeltis modestus, Cyrtopeltis notatus, Spanagonicus albofasciatus, Diaphnocoris chlorinonis, Labopidicola allii, Pseudatomoscelis seriatus, Adelphocoris rapidus, Poecilocapsus lineatus, Blissus leucopterus, Nysius ericae, Nysius raphanus, Euschistus servus, Nezara viridula, Eurygaster, Coreidae, Pyrrhocoridae, Tinidae, Blostomatidae, Reduviidae, and Cimicidae. Pragas de interesse também incluem Araecerus fasciculatus, caruncho do café; Acanthoscelides obtectus, caruncho do feijão; Bruchus rufmanus, caruncho da fava; Bruchus pisorum, caruncho da ervilha; Zabrotes subfasciatus, caruncho do feijão mexicano; Diabrotica balteata, besouro do pepino; Cerotoma trifurcata, besouro das folhas de feijão; Diabrotica virgifera, lagarta do milho mexicana; Epitrix cucumeris, besouro-pulga da batata; Chaetocnema confinis, besouro-pulga da batata-doce; Hypera postica, caruncho da alfafa; Anthonomus quadrigibbus, gorgulho da maçã; Sternechus paludatus, caruncho da haste do feijão; Hypera brunnipennis, caruncho da alfafa egípcia; Sitophilus granaries, caruncho da tulha; Craponius inaequalis, gorgulho da uva; Sitophilus zeamais, caruncho do milho; Conotrachelus nenuphar, gorgulho da ameixa; Euscepes postfaciatus, caruncho da batata-doce das Índias Ocidentais; Maladera castanea, besouro de jardim asiático; Rhizotrogus majalis, escaravelho europeu; Macrodactylus subspinosus, escaravelho da rosa; Tribolium confusum, besouro de farinha confuso; Tenebrio obscurus, verme da farinha escuro; Tribolium castaneum, besouro da farinha vermelho; Tenebrio molitor, verme da farinha amarelo.
[0062] Os nematoides incluem nematoides parasitas, como os nematoides dos nódulos das raízes, dos cistos e de lesão, incluindo Heterodera spp., Meloidogyne spp. e Globodera spp.; particularmente os membros dos nematoides dos cistos, incluindo, mas não se limitando a, Heterodera glycines (nematoide do cisto da soja); Heterodera schachtii (nematoide do cisto da beterraba); Heterodera avenae (nematoide do cisto dos cereais); e Globodera rostochiensis e Globodera pailida (nematoides do cisto da batata). Os nematoides de lesão incluem Pratylenchus spp.
[0063] As pragas de insetos podem ser testadas quanto à atividade pesticida das composições da invenção em estágios precoces de desenvolvimento, por exemplo, como larvas ou outras formas imaturas. Os insetos podem ser criados na escuridão total, com cerca de 20℃ a cerca de 30℃ e cerca de 30% a cerca de 70% de umidade relativa. Os bioensaios podem ser realizados conforme descrito em Czapla e Lang (1990) J. Econ.Entomol. 83 (6): 2480-2485. Vide também a seção experimental do presente documento. III. Cassetes de expressão
[0064] Os polinucleotídeos que codificam as proteínas pesticidas aqui fornecidas podem ser fornecidos em cassetes de expressão para expressão em um organismo de interesse. O cassete incluirá sequências reguladoras 5’ e 3’ operacionalmente ligadas a um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo pesticida aqui fornecido que permite a expressão do polinucleotídeo. O cassete pode, ainda, conter pelo menos um gene ou elemento genético adicional a ser cotransformado dentro do organismo. Sempre que genes ou elementos adicionais sejam incluídos, os componentes estarão operacionalmente ligados. Alternativamente, o(s) gene(s) ou elemento(s) adicional(is) podem ser fornecidos em múltiplos cassetes de expressão. Um cassete de expressão desse tipo é fornecido com uma pluralidade de locais de restrição e/ou locais de recombinação para que a inserção dos polinucleotídeos esteja sob a regulação transcricional das regiões reguladoras. O cassete de expressão pode, adicionalmente, conter um gene marcador selecionável.
[0065] O cassete de expressão incluirá na direção de transcrição 5’-3’ uma região de iniciação da transcrição e da tradução (ou seja, um promotor), um polinucleotídeo pesticida da invenção e uma região de término da transcrição e da tradução (ou seja, região de término) funcional no organismo de interesse, ou seja, uma planta ou bactéria. Os promotores da invenção são capazes de direcionar ou conduzir a expressão de uma sequência de codificação em uma célula hospedeira. As regiões reguladoras (ou seja, promotores, regiões reguladoras da transcrição e regiões de término da tradução) podem ser endógenas ou heterólogas para a célula hospedeira ou entre si. Conforme aqui utilizado, “heterólogo” em referência a uma sequência é uma sequência que se origina a partir de uma espécie diferente, ou, caso se trate da mesma espécie, que é substancialmente modificada em relação à sua forma nativa na composição e/ou no locus genômico por intervenção humana deliberada. Conforme aqui utilizado, um gene quimérico compreende uma sequência de codificação operacionalmente ligada a uma região de iniciação da transcrição que é heteróloga à sequência de codificação.
[0066] Regiões de término convenientes estão disponíveis a partir do plasmídeo Ti do A. tumefaciens, como as regiões de término da octopina sintase e da nopalina sintase. Vide também Guerineau et al. (1991) Mol. Gen. Genet. 262:141-144; Proudfoot (1991) Cell 64:671-674; Sanfacon et al. (1991) Genes Dev. 5:141-149; Mogen et al. (1990) Plant Cell 2:1261-
1272; Munroe et al. (1990) Gene 91:151-158; Ballas et al. (1989) Nucleic Acids Res. 17:7891-7903; e Joshi et al. (1987) Nucleic Acids Res. 15:9627-9639.
[0067] Sinais reguladores adicionais incluem, mas não se limitam a, locais de começo da iniciação da transcrição, bem como operadores, ativadores, potenciadores, outros elementos reguladores, locais de ligação ribossômica, um códon de iniciação, sinais de término, entre outros. Vide, por exemplo, Patente dos EUA nº 5.039.523 e 4.853.331; EPO 0480762A2; Sambrook et al. (1992) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, ed. Maniatis et al. (Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.), hereinafter “Sambrook 11”; Davis et al., eds. (1980) Advanced Bacterial Genetics (Cold Spring Harbor Laboratory Press), Cold Spring Harbor, N.Y., e as referências nelas citadas.
[0068] Na preparação do cassete de expressão, os diversos fragmentos de DNA podem ser manipulados, de modo a fornecer as sequências de DNA na orientação adequada e, conforme apropriado, no quadro de leitura adequado. Para esse fim, podem ser utilizados adaptadores ou ligantes para unir os fragmentos de DNA ou outras manipulações podem estar envolvidas para proporcionar locais de restrição convenientes, remoção de DNA supérfluo, remoção de locais de restrição, entre outros. Com esse propósito, podem estar envolvidas mutagênese in vitro, bem como reparação, restrição, recozimento, substituições, por ex., transições e transversões de iniciadores.
[0069] Podem ser utilizados diversos promotores na prática da invenção. Os promotores podem ser selecionados com base no resultado desejado. Os ácidos nucleicos podem ser combinados com promotores constitutivos, induzíveis, preferidos por tecido ou outros para expressão no organismo de interesse. Vide, por exemplo, os promotores apresentados em WO 99/43838 e nas Patentes dos EUA nº: 8.575.425,
7.790.846, 8.147.856, 8.586.832, 7.772.369, 7.534.939,
6.072.050, 5.659.026, 5.608.149, 5.608.144, 5.604.121,
5.569.597, 5.466.785, 5.399.680, 5.268.463, 5.608.142 e
6.177.611, aqui incorporadas como referência.
[0070] Para expressão em plantas, os promotores constitutivos também incluem o promotor CaMV 35S (Odell et al. (1985) Nature 313:810-812); actina do arroz (McElroy et al. (1990) Plant Cell 2:163-171); ubiquitina (Christensen et al. (1989) Plant Mol. Biol. 12:619-632 e Christensen et al. (1992) Plant Mol. Biol. 18:675-689); pEMU (Last et al. (1991) Theor. Appl. Genet. 81:581-588); MAS (Velten et al. (1984) EMBO J. 3:2723-2730). Os promotores induzíveis incluem aqueles que conduzem a expressão de proteínas relacionadas à patogênese (proteínas PR), que são induzidas após a infecção por um patógeno. Vide, por exemplo, Redolfi et al. (1983) Neth. J. Plant Pathol. 89:245-254; Uknes et al. (1992) Plant Cell 4:645-656; e Van Loon (1985) Plant Mol. Virol. 4:111-116; e WO 99/43819, aqui incorporados como referência. Promotores que são expressos localmente ou perto do local de infecção patogênica também podem ser utilizados (Marineau et al. (1987) Plant Mol. Biol. 9:335-342; Matton et al. (1989) Molecular Plant-Microbe Interactions 2:325-331; Somsisch et al. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83:2427-2430; Somsisch et al. (1988) Mol. Gen. Genet. 2:93-98; and Yang (1996) Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 93:14972-14977; Chen et al. (1996) Plant J. 10:955-966; Zhang et al. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:2507-2511; Warner et al. (1993) Plant J. 3:191-201; Siebertz et al. (1989) Plant Cell 1:961-968; Cordero et al. (1992) Physiol. Mol. Plant Path. 41:189-200; Patente dos EUA nº 5.750.386 (induzível por nematoide); e as referências citadas nos mesmos).
[0071] Os promotores induzíveis de feridas podem ser utilizados nos construtos da invenção. Tais promotores induzíveis de feridas incluem o promotor pin II (Ryan (1990) Ann. Rev. Phytopath. 28:425-449; Duan et al. (1996) Nature Biotechnology 14:494-498); wun1 e wun2 (Patente dos EUA nº
5.428.148); win1 e win2 (Stanford et al. (1989) Mol. Gen. Genet. 215:200-208); systemin (McGurl et al. (1992) Science 225:1570-1573); WIP1 (Rohmeier et al. (1993) Plant Mol. Biol. 22:783-792; Eckelkamp et al. (1993) FEBS Letters 323:73-76); gene MPI (Corderok et al. (1994) Plant J. 6(2):141-150); e afins, aqui incorporados como referência.
[0072] Os promotores preferidos por tecidos para serem utilizados na invenção incluem os apresentados em Yamamoto et al. (1997) Plant J. 12(2):255-265; Kawamata et al. (1997) Plant Cell Physiol. 38(7):792-803; Hansen et al. (1997) Mol. Gen Genet. 254(3):337-343; Russell et al. (1997) Transgenic Res. 6(2):157-168; Rinehart et al. (1996) Plant Physiol. 112(3):1331-1341; Van Camp et al. (1996) Plant Physiol. 112(2):525-535; Canevascini et al. (1996) Plant Physiol. 112(2):513-524; Yamamoto et al. (1994) Plant Cell Physiol. 35(5):773-778; Lam (1994) Results Probl. Cell Differ. 20:181-196; Orozco et al. (1993) Plant Mol Biol. 23(6):1129-
1138; Matsuoka et al. (1993) Proc Natl. Acad. Sci. USA 90(20):9586-9590; e Guevara-Garcia et al. (1993) Plant J. 4(3):495-505.
[0073] Os promotores preferidos por folhas incluem os apresentados em Yamamoto et al. (1997) Plant J. 12(2):255- 265; Kwon et al. (1994) Plant Physiol. 105:357-67; Yamamoto et al. (1994) Plant Cell Physiol. 35(5):773-778; Gotor et al. (1993) Plant J. 3:509-18; Orozco et al. (1993) Plant Mol. Biol. 23(6):1129-1138; e Matsuoka et al. (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90(20):9586-9590.
[0074] Os promotores preferidos por raízes são conhecidos e incluem os apresentados em Hire et al. (1992) Plant Mol. Biol. 20(2):207-218 (gene da glutamina sintetase específico da raiz da soja); Keller e Baumgartner (1991) Plant Cell 3(10):1051-1061 (elemento de controle específico da raiz); Sanger et al. (1990) Plant Mol. Biol. 14(3):433-443 (gene manopina sintase (MAS) da Agrobacterium tumefaciens); e Miao et al. (1991) Plant Cell 3(1):11-22 (glutamina sintetase citosólica (GS)); Bogusz et al. (1990) Plant Cell 2(7):633- 641; Leach e Aoyagi (1991) Plant Science (Limerick) 79(1):69- 76 (rolC e rolD); Teeri et al. (1989) EMBO J. 8(2):343-350; Kuster et al. (1995) Plant Mol. Biol. 29(4):759-772 (o promotor do gene VfENOD-GRP3); e, Capana et al. (1994) Plant Mol. Biol. 25(4):681-691 (promotor rolB). Vide também as Patentes dos EUA nº 5.837.876, 5.750.386, 5.633.363,
5.459.252, 5.401.836, 5.110.732 e 5.023.179.
[0075] Os promotores “preferidos por sementes” incluem tanto os promotores “específicos de sementes” (promotores ativos durante o desenvolvimento de sementes, tais como os promotores de proteínas de armazenamento de sementes), bem como promotores de “germinação de sementes” (promotores ativos durante a germinação de sementes). Vide Thompson et al. (1989) BioEssays 10:108. Os promotores preferidos por sementes incluem, mas não se limitam a, Cim1 (mensagem induzida por citoquinina); CZ19B1 (zeína de milho 19 kDa); milps (mio-inositol-1-fosfato sintase) (vide WO 00/11177 e Patente dos EUA nº 6.225.529). A gama-zeína é um promotor específico de endospermas. A Globulina 1 (Glb-1) é um promotor específico de embriões representativo. Para as dicotiledôneas, os promotores específicos de sementes incluem, mas não se limitam a, β-faseolina de feijão, napina, β-conglicinina, lectina de soja, cruciferina, entre outros. Para as monocotiledôneas, os promotores específicos de sementes incluem, mas não se limitam a, zeína de milho 15 kDa, zeína de 22 kDa, zeína de 27 kDa, gama-zeína, cera, encolhida 1, encolhida 2, Globulina 1, etc. Vide também WO 00/12733, onde se descrevem os promotores preferidos por sementes dos genes end1 e end2.
[0076] Para a expressão em um hospedeiro bacteriano, promotores que funcionam em bactérias são bem conhecidos na técnica. Esses promotores incluem qualquer um dos promotores conhecidos do gene da proteína cristalina, incluindo os promotores de qualquer uma das proteínas pesticidas da invenção e os promotores específicos para fatores sigma de B. thuringiensis. Alternativamente, os promotores de genes que codificam a proteína cristalina mutagenizada ou recombinante podem ser manipulados de forma recombinante e utilizados para promover a expressão dos novos segmentos de genes aqui descritos.
[0077] O cassete de expressão também pode compreender um gene marcador selecionável para a seleção de células transformadas. Os genes marcadores selecionáveis são utilizados para a seleção de células ou tecidos transformados. Os genes marcadores incluem genes que codificam a resistência a antibióticos, tais como os que codificam a neomicina fosfotransferase II (NEO) e a higromicina fosfotransferase (HPT), bem como os genes que conferem resistência a compostos herbicidas, tais como glufosinato amônio, bromoxinilo, imidazolinonas e 2,4- diclorofenoxiacetato (2,4-D). Marcadores selecionáveis adicionais são conhecidos e qualquer um deles pode ser utilizado. Vide, por exemplo, Pedido de Patente Provisório dos EUA 62/094,697, depositado en Dezembro 19, 2014, e Pedido de Patente Provisório dos EUA 62/189,505, depositado em Julho 7, 2015, os quais são aqui incorporados por referência em sua totalidade, que descreve sequências de resistência ao glufosinato que podem ser utilizadas como marcadores selecionáveis. Vide, por exemplo, PCT/US2015/066648, depositado em 18 de dezembro de 2015 e aqui incorporado como referência em sua totalidade, que descreve sequências de resistência ao glufosinato que podem ser utilizadas como marcadores selecionáveis. IV. Métodos, células hospedeiras e células de plantas
[0078] Conforme indicado, construtos de DNA compreendendo sequências de nucleotídeos que codificam as proteínas pesticidas, ou suas variantes ou fragmentos ativos, podem ser utilizados para transformar plantas de interesse ou outros organismos de interesse. Os métodos de transformação envolvem a introdução de um construto de nucleotídeo em uma planta. Por “introdução” deve-se entender introduzir o construto de nucleotídeo na planta ou em outra célula hospedeira de tal maneira que o construto ganhe acesso ao interior da célula da planta ou célula hospedeira. Os métodos da invenção não requerem um método particular para a introdução de um construto de nucleotídeo em uma célula de planta ou hospedeira, apenas que o construto de nucleotídeo ganhe acesso ao interior de pelo menos uma célula da planta ou do organismo hospedeiro. Os métodos para a introdução de construtos de nucleotídeos em plantas e outras células hospedeiras são conhecidos na técnica incluindo, mas não se limitando a, métodos de transformação estáveis, métodos de transformação transitórios e métodos mediados por vírus.
[0079] Os métodos resultam em organismos transformados, tais como uma planta, incluindo plantas inteiras, bem como órgãos de plantas (por ex., folhas, hastes, raízes, etc.), sementes, células de plantas, propágulos, embriões e suas progênies. As células de plantas podem ser diferenciadas ou indiferenciadas (por ex., calos, células de cultura em suspensão, protoplastos, células de folhas, células de raízes, células do floema, pólen).
[0080] Os termos “plantas transgênicas” ou “plantas transformadas” ou plantas ou células ou tecidos “transformados de forma estável” se referem a plantas que incorporaram ou integraram um polinucleotídeo que codifica pelo menos um polipeptídeo pesticida da invenção. Reconhece- se que outras sequências de ácidos nucleicos ou fragmentos de DNA exógenos ou endógenos também podem ser incorporados na célula da planta. As transformações mediadas por Agrobacterium e por biolística continuam sendo as duas abordagens predominantemente utilizadas. Entretanto, a transformação pode ser realizada por infecção, transfecção, microinjeção, eletroporação, microprojeção, biolística ou bombardeamento de partículas, eletroporação, fibras de sílica/carbono, mediada por ultrassom, mediada por PEG, coprecipitação de fosfato de cálcio, técnica de policação DMSO, procedimento DEAE dextrano, mediada por Agro e vírus (Caulimorivírus, Geminivírus, vírus de plantas de RNA), mediada por lipossomas, entre outros.
[0081] Os protocolos de transformação, bem como os protocolos para a introdução de polipeptídeos ou sequências de polinucleotídeos em plantas, podem variar dependendo do tipo de planta ou célula de planta, isto é, monocotiledônea ou dicotiledônea, que será objeto da transformação. Os métodos de transformação são conhecidos na técnica e incluem os apresentados nas Patentes dos EUA nº 8.575.425, 7.692.068,
8.802.934 e 7.541.517, cada uma das quais é aqui incorporada como referência. Vide também Rakoczy-Trojanowska, M. (2002) Cell Mol Biol Lett. 7:849-858; Jones et al. (2005) Plant Methods 1:5; Rivera et al. (2012) Physics of Life Reviews 9:308-345; Bartlett et al. (2008) Plant Methods 4:1-12; Bates, G.W. (1999) Methods in Molecular Biology 111:359-366; Binns e Thomashow (1988) Annual Reviews in Microbiology 42:575-606; Christou, P. (1992) The Plant Journal 2:275-281; Christou, P. (1995) Euphytica 85:13-27; Tzfira et al. (2004) TRENDS in Genetics 20:375-383; Yao et al. (2006) Journal of
Experimental Botany 57:3737-3746; Zupan e Zambryski (1995) Plant Physiology 107:1041-1047; Jones et al. (2005) Plant Methods 1:5.
[0082] A transformação pode resultar na incorporação estável ou transitória do ácido nucleico na célula. Por “transformação estável” deve-se entender que o construto de nucleotídeos introduzido em uma célula hospedeira se integra ao genoma da célula hospedeira e é capaz de ser herdado por sua progênie. Por “transformação transitória” deve-se entender que um polinucleotídeo é introduzido na célula hospedeira e não se integra ao genoma da célula hospedeira.
[0083] Os métodos para a transformação dos cloroplastos são conhecidos na técnica. Vide, por exemplo, Svab et al. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:8526-8530; Svab e Maliga (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:913-917; Svab e Maliga (1993) EMBO J. 12:601-606. O método se baseia na entrega de DNA com armas de partículas contendo um marcador selecionável e direcionamento do DNA para o genoma do plastídeo mediante recombinação homóloga. Além disso, a transformação do plastídeo pode ser realizada através da transativação de um transgene silencioso transmitido por plastídeo mediante expressão preferida por tecidos de uma polimerase de RNA codificada por um núcleo e direcionada a um plastídeo. Esse sistema foi descrito em McBride et al. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:7301-7305.
[0084] As células que foram transformadas podem ser cultivadas em plantas de forma convencional. Vide, por exemplo, McCormick et al. (1986) Plant Cell Reports 5:81-84. Essas plantas podem então ser cultivadas e polinizadas com a mesma cepa transformada ou com diferentes cepas, em que o híbrido resultante possui uma expressão constitutiva da característica fenotípica desejada. Duas ou mais gerações podem ser cultivadas para garantir que a expressão da característica fenotípica desejada seja mantida e herdada de forma estável, e posteriormente as sementes podem ser colhidas para garantir que a expressão da característica fenotípica desejada seja obtida. Deste modo, a presente invenção fornece uma semente transformada (também denominada “semente transgênica”) que possui um construto de nucleotídeos da invenção, por exemplo, um cassete de expressão da invenção, incorporado de forma estável em seu genoma.
[0085] Em formas de realização específicas, as sequências aqui fornecidas podem ser direcionadas para um local específico dentro do genoma da célula hospedeira ou da célula da planta. Esses métodos incluem, mas não se limitam a, meganucleases projetadas contra a sequência genômica de interesse da planta (D'Halluin et al. 2013 Plant Biotechnol J); CRISPR-Cas9, TALENs e outras tecnologias para edição precisa de genomas (Feng, et al. Cell Research 23:1229-1232, 2013, Podevin, et al. Trends Biotechnology, publicação online, 2013, Wei et al., J Gen Genomics, 2013, Zhang et al (2013) WO 2013/026740); recombinação específica do local Cre-lox (Dale et al. (1995) Plant J 7:649-659; Lyznik, et al. (2007) Transgenic Plant J 1:1-9; recombinação FLP-FRT (Li et al. (2009) Plant Physiol 151:1087-1095); integração mediada por Bxb1 (Yau et al. Plant J (2011) 701: 147-166); integração mediada por zinco-dedo (Wright et al.(2005) Plant
J 44:693-705); Cai et al. (2009) Plant Mol Biol 69:699-709); e recombinação homóloga (Lieberman-Lazarovich e Levy (2011) Methods Mol Biol 701: 51-65); Puchta (2002) Plant Mol Biol 48:173-182).
[0086] A sequência aqui fornecida pode ser utilizada para a transformação de qualquer espécie de planta, incluindo, mas não se limitando a, monocotiledôneas e dicotiledôneas. Exemplos de plantas de interesse incluem, mas não se limitam a, milho, sorgo, trigo, girassol, tomate, crucíferas, pimentas, batata, algodão, arroz, soja, beterraba, cana-de- açúcar, tabaco, cevada e colza, Brassica sp., alfafa, centeio, milheto, cártamo, amendoim, batata-doce, mandioca, café, coco, abacaxi, cítricos, cacau, chá, banana, abacate, figo, goiaba, manga, azeitona, mamão, caju, macadâmia, amêndoa, aveia, verduras, plantas ornamentais e coníferas.
[0087] As verduras incluem, mas não se limitam a, tomates, alface, feijão-verde, feijão-de-lima, ervilhas e membros do gênero Curcumis, como pepino, melão cantaloupe e melão comum. As plantas ornamentais incluem, mas não se limitam a, azaleia, hortênsia, hibisco, rosas, tulipas, narcisos, petúnias, cravos, poinsétia e crisântemo. De preferência, as plantas da presente invenção são plantas de cultivo (por exemplo, milho, sorgo, trigo, girassol, tomate, crucíferas, pimentas, batata, algodão, arroz, soja, beterraba, cana-de- açúcar, tabaco, cevada, colza, etc.).
[0088] Conforme aqui utilizado, o termo “planta” inclui células vegetais, protoplastos vegetais, culturas de tecidos de células vegetais a partir dos quais as plantas podem ser regeneradas, calos vegetais, touceiras vegetais, além de células vegetais que estão intactas em plantas ou partes de plantas, como embriões, pólen, óvulos, sementes, folhas, flores, ramos, frutos, caroços, espigas, sabugos, cascas, caules, raízes, pontas de raízes, anteras, entre outras. O termo “grão” pretende designar a semente madura produzida por cultivadores comerciais para outros fins que não sejam os de plantar ou reproduzir a espécie. Progênie, variantes e mutantes das plantas regeneradas também estão incluídos no escopo da invenção, desde que essas partes compreendam os polinucleotídeos introduzidos. Além disso, também é fornecido um produto ou subproduto vegetal processado que retém as sequências aqui descritas, incluindo, por exemplo, farinha de soja.
[0089] Em outra forma de realização, os genes que codificam as proteínas pesticidas podem ser utilizados para transformar organismos patogênicos de insetos. Esses organismos incluem baculovírus, fungos, protozoários, bactérias e nematoides. Podem ser selecionados hospedeiros de micro-organismos que são conhecidos por ocupar a “fitosfera” (filoplano, filosfera, rizosfera e/ou rizoplana) de um ou mais cultivos de interesse. Esses micro-organismos são selecionados de modo a serem capazes de competir com êxito no ambiente particular com os micro-organismos de tipo selvagem, proporcionar uma manutenção e expressão estável do gene que expressa a proteína pesticida e, idealmente, proporcionar uma melhor proteção ao pesticida contra a degradação e inativação do meio-ambiente.
[0090] Esses micro-organismos incluem arca, bactérias, algas e fungos. Resultam de particular interesse microrganismos como bactérias, por ex., Bacillus, Pseudomonas, Erwinia, Serratia, Klebsiella, Xanthomonas, Streptomyces, Rhizobium, Rhodopseudomonas, Methylius, Agrobacterium, Acetobacter, Lactobacillus, Arthrobacter, Azotobacter, Leuconostoc e Alcaligenes. Os fungos incluem fermento, por ex., Saccharomyces, Cryptococcus, Kluyveromyces, Sporobolomyces, Rhodotorula e Aureobasidium. Resultam de particular interesse as espécies bacterianas da fitosfera, como Pseudomonas syringae, Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas fluorescens, Serratia marcescens, Acetobacter xylinum, Agrobacteria, Rhodopseudomonas spheroides, Xanthomonas campestris, Rhizobium melioti, Alcaligenes entrophus, Clavibacter xyli and Azotobacter vinlandir e espécies de levedura da fitosfera, como Rhodotorula rubra, R. glutinis, R. marina, R. aurantiaca, Cryptococcus albidus, C. diffluens, C. laurentii, Saccharomyces rosei, S. pretoriensis, S. cerevisiae, Sporobolomyces rosues, S. odorus, Kluyveromyces veronae, Aureobasidium pollulans, Bacillus thuringiensis, Escherichia coli, Bacillus subtilis, entre outras.
[0091] Procariotas ilustrativos, tanto Gram-negativos como Gram-positivos, incluem Enterobacteriaceae, como Escherichia, Erwinia, Shigella, Salmonella e Proteus; Bacillaceae; Rhizobiceae, como Rhizobium; Spirillaceae, como a fotobactéria, Zymomonas, Serratia, Aeromonas, Vibrio, Desulfovibrio, Spirillum; Lactobacillaceae; Pseudomonadaceae, como Pseudomonas e Acetobacter; Azotobacteraceae e Nitrobacteraceae. Os fungos incluem Phycomycetes e Ascomycetes, por ex., levedura, como
Saccharomyces e Schizosaccharomyces; e levedura Basidiomycetes, como Rhodotorula, Aureobasidium, Sporobolomyces, entre outros.
[0092] Os genes que codificam proteínas pesticidas podem ser introduzidos por meio de eletrotransformação, transformação induzida por PEG, choque térmico, transdução, conjugação, entre outros. Especificamente, os genes que codificam as proteínas pesticidas podem ser clonados em um vetor de transferência, por exemplo, o pHT3101 (Lerecius et al. (1989) FEMS Microbiol. Letts. 60: 211-218). O vetor de transferência pHT3101 que contém a sequência de codificação para o gene da proteína pesticida em particular pode, por exemplo, ser transformado no Bacilo de colonização da raiz mediante eletroporação (Lerecius et al. (1989) FEMS Microbiol. Letts. 60: 211-218).
[0093] Os sistemas de expressão podem ser concebidos de modo que as proteínas pesticidas sejam segregadas fora do citoplasma de bactérias Gram-negativas mediante a fusão de um peptídeo sinal apropriado à extremidade amino-terminal da proteína pesticida. Os peptídeos sinal reconhecidos por E. coli incluem a proteína OmpA (Ghrayeb et al. (1984) EMBO J, 3: 2437-2442).
[0094] As proteínas pesticidas e as suas variantes ativas podem ser fermentadas em um hospedeiro bacteriano e a bactéria resultante pode ser processada e utilizada como pulverização microbiana da mesma forma em que as cepas de Bacillus thuringiensis foram utilizadas como pulverizações inseticidas. No caso de proteína(s) pesticida(s) que são segregadas por Bacillus, o sinal de secreção é removido ou mutado usando procedimentos conhecidos na técnica. Essas mutações e/ou deleções impedem a secreção da(s) proteína(s) pesticida(s) no meio de crescimento durante o processo de fermentação. As proteínas pesticidas são retidas dentro da célula, e as células são posteriormente processadas para produzir as proteínas pesticidas encapsuladas.
[0095] Alternativamente, as proteínas pesticidas são produzidas pela introdução de genes heterólogos em um hospedeiro celular. A expressão do gene heterólogo resulta, direta ou indiretamente, na produção e manutenção intracelular do pesticida. Essas células são então tratadas em condições que contribuem para a atividade da toxina produzida na célula quando a célula é aplicada ao meio ambiente da(s) praga(s)-alvo. O produto resultante mantém a toxicidade da toxina. Essas proteínas pesticidas naturalmente encapsuladas podem então ser formuladas de acordo com técnicas convencionais para aplicação ao ambiente que hospeda uma praga-alvo, por ex., solo, água e folhagem de plantas. Vide, por exemplo, a Patente dos EUA n° 6.468.523 e a Publicação dos EUA nº 20050138685, bem como as referências nelas citadas. Na presente invenção, um micro- organismo transformado (que inclui organismos inteiros, células, esporo(s), proteína(s) pesticida(s), componente(s) pesticida(s), componente(s) que impacta(m) pragas, mutante(s), células ou componentes celulares vivos ou mortos, incluindo misturas de células e componentes celulares vivos ou mortos, e incluindo células ou componentes celulares vivos quebrados) ou uma proteína pesticida isolada podem ser formulados com um veículo aceitável em composição(ões) pesticida(s) ou agrícola(s), isto é, por exemplo, uma suspensão, uma solução, uma emulsão, um pó seco, um grânulo dispersável, um pó molhável e um concentrado emulsionável, um aerossol, um grânulo impregnado, um adjuvante, uma pasta revestida e também encapsulações em, por exemplo, substâncias de polímero.
[0096] As composições agrícolas podem compreender um polipeptídeo, um polipeptídeo recombinogênico ou uma variante ou fragmento dele, conforme aqui descrito. A composição agrícola aqui descrita é aplicada ao meio ambiente de uma planta ou área de cultivo, ou aplicada à planta, parte de planta, célula de planta ou semente.
[0097] As composições descritas acima podem ser obtidas pela adição de um agente tensioativo, um veículo inerte, um conservante, um umidificante, um estimulante de alimentação, um atrativo, um agente encapsulante, um aglutinante, um emulsionante, um corante, um protetor UV, um tampão, um agente de fluxo ou fertilizantes, doadores de micronutrientes ou outras preparações que influenciam o crescimento da planta. Um ou mais produtos agroquímicos, incluindo, mas não se limitando a, herbicidas, inseticidas, fungicidas, bactericidas, nematicidas, moluscicidas, acaricidas, reguladores do crescimento das plantas, auxiliares de colheita e fertilizantes, podem ser combinados com veículos, surfactantes ou adjuvantes habitualmente empregados na técnica de formulação ou outros componentes para facilitar o manuseio e a aplicação de produtos para pragas-alvo específicas. Os veículos e adjuvantes adequados podem ser sólidos ou líquidos e correspondem às substâncias normalmente utilizadas na tecnologia de formulação, por ex., substâncias minerais naturais ou regeneradas, solventes, dispersantes, agentes molhantes, agentes de adesividade, aglutinantes ou fertilizantes. Os ingredientes ativos da presente invenção são normalmente aplicados sob a forma de composições e podem ser aplicados na área de cultivo, planta ou semente a ser tratada. Por exemplo, as composições da presente invenção podem ser aplicadas a grãos em preparação para ou durante o armazenamento em um depósito de grãos ou silo, etc. As composições da presente invenção podem ser aplicadas simultaneamente ou em sucessão com outros compostos. Os métodos de aplicação de um ingrediente ativo da presente invenção ou de uma composição agroquímica da presente invenção que contém pelo menos uma das proteínas pesticidas produzidas pelas cepas bacterianas da presente invenção incluem, mas não se limitam a, aplicação foliar, revestimento de sementes e aplicação no solo. O número de aplicações e a taxa de aplicação dependem da intensidade da infestação pela praga correspondente.
[0098] Agentes tensioativos adequados incluem, mas não se limitam a, compostos aniônicos como um carboxilato de, por exemplo, um metal; um carboxilato de um ácido graxo de cadeia longa; um N-acilsarcosinato; mono ou di-ésteres de ácido fosfórico com etoxilatos de álcoois graxos ou sais desses ésteres; sulfatos de álcoois graxos como sulfato de dodecil de sódio, sulfato de octadecil de sódio ou sulfato de cetil de sódio; sulfatos de álcoois graxos etoxilados; sulfatos de alquilfenol etoxilados; sulfonatos de lignina; sulfonatos de petróleo; sulfonatos de aril-alquilo como sulfonatos de alquil-benzeno ou sulfonatos de alquilnaftaleno inferior, por ex., sulfonato de butil-naftaleno; sais de condensados de naftaleno-formaldeído sulfonados; sais de condensados sulfonados de fenol-formaldeído; sulfonatos mais complexos como sulfonatos de amida, por ex., o produto de condensação sulfonado de ácido oleico e taurina N-metil; ou os sulfossuccinatos de dialquilo, por ex., o sulfonato de sódio do succinato de dioctilo. Agentes não-iônicos incluem os produtos de condensação de ésteres de ácidos graxos, álcoois graxos, amidas de ácidos graxos ou fenóis substituídos por grupos alquil-graxos ou alquenilo com óxido de etileno, ésteres graxos de éteres de álcool poli-hídricos, por ex., ésteres de ácidos graxos de sorbitano, produtos de condensação desses ésteres com óxido de etileno, por ex., ésteres de ácidos graxos de polioxietileno sorbitar, copolímeros em bloco de óxido de etileno e óxido de propileno, glicóis acetilênicos como 2,4,7,9-tetraetil-5- decin-4,7-diol ou glicóis acetilênicos etoxilados. Exemplos de um agente tensioativo catiônico incluem, por exemplo, uma mono, di ou poliamina alifática como um acetato, naftenato ou oleato; ou uma amina contendo oxigênio como um óxido de amina de polioxietileno alquilamina; uma amina ligada a amida preparada pela condensação de um ácido carboxílico com uma di ou poliamina; ou um sal de amônio quaternário.
[0099] Exemplos de materiais inertes incluem, mas não se limitam a, minerais inorgânicos como caulino, filossilicatos, carbonatos, sulfatos, fosfatos, ou materiais botânicos como cortiça, grãos de milho em pó, cascas de amendoim, cascas de arroz e cascas de noz.
[0100] As composições da presente invenção podem estar em uma forma adequada para aplicação direta ou como um concentrado de composição primária que requer diluição com uma quantidade adequada de água ou outro diluente antes da aplicação. A concentração pesticida variará de acordo com a natureza da formulação em particular, especificamente, caso se trate de um concentrado ou caso seja de uso direto. A composição contém de 1 a 98% de um veículo inerte sólido ou líquido e de 0 a 50% ou 0,1 a 50% de um surfactante (p/p, v/v ou p/v, conforme apropriado ou desejado). Essas composições serão administradas à taxa marcada para o produto comercial, por exemplo, cerca de 0,01 lb a 5,0 lb por acre quando em forma seca e cerca de 0,01 pts a 10 pts por acre quando em forma líquida.
[0101] Em uma outra forma de realização, as composições, micro-organismos transformados e proteínas pesticidas aqui fornecidas podem ser tratadas antes da formulação para prolongar a atividade pesticida quando aplicada ao ambiente de uma praga-alvo, desde que o pré-tratamento não seja prejudicial para a atividade pesticida. Esse tratamento pode ser por meios químicos, meios físicos ou ambos, desde que o tratamento não afete de forma prejudicial as propriedades da(s) composição(ões). Exemplos de reagentes químicos incluem, mas não se limitam a, agentes halogenantes; aldeídos como formaldeído e glutaraldeído; anti-infecciosos, como cloreto de zefirano; álcoois, como isopropanol e etanol; e fixadores histológicos, como o fixador de Bouin e o fixador de Helly (vide, por exemplo, Humason (1967) Animal Tissue Techniques (W.H. Freeman and Co.).
[0102] Em um aspecto, as pragas podem ser mortas ou reduzidas em números em uma área determinada mediante a aplicação das proteínas pesticidas aqui fornecidas nessa área. Alternativamente, as proteínas pesticidas podem ser aplicadas de forma profilática em uma área ambiental para prevenir a infestação por uma praga suscetível. De preferência, a praga ingere, ou entra em contato com uma quantidade eficaz de pesticida do polipeptídeo. Por "quantidade eficaz de pesticida" deve-se entender uma quantidade de pesticida capaz de provocar a morte de pelo menos uma praga ou reduzir significativamente o crescimento, a alimentação ou o desenvolvimento fisiológico normal das pragas. Essa quantidade variará dependendo de fatores como, por exemplo, as pragas-alvo específicas a serem controladas, o ambiente específico, localização, planta, cultivo ou local agrícola a ser tratado, as condições ambientais e o método, taxa, concentração, estabilidade e quantidade de aplicação da composição de polipeptídeo com ação pesticida eficaz. As formulações ou composições também podem variar em relação a condições climáticas, considerações ambientais e/ou frequência de aplicação e/ou gravidade da infestação de pragas.
[0103] Os ingredientes ativos são normalmente aplicados na forma de composições e podem ser aplicados na área de cultivo, planta ou semente a ser tratada. Por conseguinte, são fornecidos métodos para proporcionar a uma planta, uma célula vegetal, uma semente, uma parte da planta ou uma área de cultivo, uma quantidade eficaz da composição agrícola compreendendo o polipeptídeo, o polipeptídeo recombinogênico, ou uma variante ou fragmento ativo dele. Por “quantidade eficaz” deve-se entender uma quantidade de uma proteína ou composição que tenha atividade pesticida suficiente para matar ou controlar a praga ou causar uma redução notável no crescimento, alimentação ou desenvolvimento fisiológico normal da praga. Essas diminuições no número de pragas, no crescimento das pragas, na alimentação das pragas ou no desenvolvimento normal das pragas podem compreender uma diminuição estatisticamente significativa, incluindo, por exemplo, uma diminuição de cerca de 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 35 %, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 85%, 90%, 95% ou superior.
[0104] Por exemplo, as composições podem ser aplicadas ao grão em preparação para ou durante o armazenamento em um depósito de grãos ou silo, etc. As composições podem ser aplicadas simultaneamente ou em sucessão com outros compostos. Os métodos de aplicação de um ingrediente ativo ou uma composição agroquímica compreendendo pelo menos um dos polipeptídeos, polipeptídeos recombinogênicos ou suas variantes ou fragmentos, conforme aqui descrito, incluem, mas não se limitam a, aplicação foliar, revestimento de semente e aplicação de solo.
[0105] Métodos para aumentar o rendimento da planta são fornecidos. Os métodos compreendem proporcionar uma planta ou célula vegetal que expressa um polinucleotídeo que codifica a sequência polipeptídica pesticida aqui descrita e cultivar a planta ou uma semente sua em um campo infestado com (ou suscetível de ser infestado por) uma praga contra a qual o referido polipeptídeo possui atividade pesticida. Em algumas formas de realização, o polipeptídeo tem atividade pesticida contra uma praga de lepidóptero, coleóptero, díptero, hemipterano ou nematoide, e esse campo está infestado com uma praga de lepidóptero, hemipterano, coleóptero, díptero ou nematoide. Conforme aqui definido, o “rendimento” da planta se refere à qualidade e/ou quantidade de biomassa produzida pela planta. Por “biomassa” deve-se entender qualquer produto vegetal medido. Um aumento na produção de biomassa é qualquer melhoria no rendimento do produto vegetal medido. Aumentar o rendimento da planta apresenta várias aplicações comerciais. Por exemplo, o aumento da biomassa das folhas da planta pode aumentar o rendimento de verduras foliares para consumo humano ou animal. Além disso, o aumento da biomassa foliar pode ser utilizado para aumentar a produção de produtos farmacêuticos ou industriais derivados de plantas. Um aumento no rendimento pode incluir qualquer aumento estatisticamente significativo, incluindo, mas não se limitando a, pelo menos um aumento de 1%, pelo menos um aumento de 3%, pelo menos um aumento de 5%, pelo menos um aumento de 10%, pelo menos um aumento de 20%, pelo menos 30%, pelo menos 50%, pelo menos 70%, pelo menos 100% ou mais de aumento no rendimento em comparação com uma planta que não expressa a sequência pesticida. Em métodos específicos, o rendimento da planta aumenta como resultado de uma maior resistência à praga de uma planta que expressa uma proteína pesticida aqui descrita. A expressão da proteína pesticida resulta em uma menor capacidade de uma praga para infestar ou alimentar.
[0106] As plantas também podem ser tratadas com uma ou mais composições químicas, incluindo um ou mais herbicidas, inseticidas ou fungicidas.
[0107] Formas de realização não-limitantes incluem:
1. Um polipeptídeo isolado com atividade inseticida, compreendendo: (a) um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277,
278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312; ou (b) um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 em relação a uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265,
266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.
2. O polipeptídeo da forma de realização 1, em que o referido polipeptídeo compreende a sequência de aminoácidos apresentada nas SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292,
293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.
3. Uma composição compreendendo o polipeptídeo das formas de realização 1 ou 2.
4. O polipéptideo da forma de realização 2, compreendendo ainda sequências de aminoácidos heterólogas.
5. Uma molécula de ácido nucleico recombinante que codifica o polipeptídeo da forma de realização 1, em que a referida molécula de ácido nucleico recombinante não é a sequência de ocorrência natural que codifica o referido polipeptídeo.
6. O ácido nucleico recombinante da forma de realização 5, em que a referida molécula de ácido nucleico é uma sequência sintética que foi concebida para sua expressão em uma planta.
7. A molécula de ácido nucleico recombinante da forma de realização 6, em que a referida molécula de ácido nucleico está operacionalmente ligada a um promotor capaz de conduzir a expressão em uma célula vegetal.
8. A molécula de ácido nucleico recombinante da forma de realização 5, em que a referida molécula de ácido nucleico está operacionalmente ligada a um promotor capaz de conduzir a expressão em uma bactéria.
9. Uma célula hospedeira que contém a molécula de ácido nucleico recombinante da forma de realização 8.
10. A célula hospedeira da forma de realização 9, em que a referida célula hospedeira é uma célula hospedeira bacteriana.
11. Um construto de DNA compreendendo um promotor que conduz a expressão em uma célula vegetal ligada operacionalmente a uma molécula de ácido nucleico recombinante, compreendendo: (a) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de qualquer uma das SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292,
293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.; ou, (b) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 para uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280,
281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.
12. O construto de DNA da forma de realização 11, em que a referida sequência de nucleotídeos é uma sequência de DNA sintética que foi concebida para expressão em uma planta.
13. Um vetor que compreende o construto de DNA da forma de realização 11.
14. Uma célula hospedeira que contém o construto de DNA da forma de realização 11 ou 13 ou o vector da forma de realização 13.
15. A célula hospedeira da forma de realização 14, em que a célula hospedeira é uma célula de planta.
16. Uma planta transgênica compreendendo a célula hospedeira da forma de realização 15.
17. Uma composição compreendendo a célula hospedeira da forma de realização 10.
18. A composição da forma de realização 17, em que a referida composição é selecionada do grupo constituído por um pó, poeira, pelota, grânulo, pulverizador, emulsão, coloide e solução.
19. A composição da forma de realização 17, em que a referida composição compreende de cerca de 1% a cerca de 99% em peso do referido polipeptídeo.
20. Um método para controlar uma população de pragas compreendendo o contato da referida população com uma quantidade pesticida eficaz da composição da forma de realização 17.
21. Um método para matar uma população de pragas compreendendo o contato da referida população com uma quantidade pesticida eficaz da composição da forma de realização 17.
22. Um método para produzir um polipeptídeo com atividade pesticida, compreendendo a cultura da célula hospedeira da forma de realização 9 sob condições em que a molécula de ácido nucleico que codifica o polipeptídeo seja expressa.
23. Uma planta que incorporou de forma estável em seu genoma um construto de DNA compreendendo uma sequência de nucleotídeos que codifica uma proteína com atividade pesticida, em que a referida sequência de nucleotídeos compreende: (a) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de qualquer uma das SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184,
185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.; ou, (b) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 para uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172,
173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.
24. Uma semente transgênica da planta da forma de realização 23.
25. Um método para proteger uma planta de uma praga de inseto, compreendendo expressar em uma planta ou célula desta uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo pesticida, em que a referida sequência de nucleotídeos compreende: (a) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de qualquer uma das SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112,
113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.; ou, (b) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 para uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100,
101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.
26. O método da forma de realização 25, em que a referida planta produz um polipeptídeo pesticida que possui atividade pesticida contra uma praga lepidóptera ou coleóptera.
27. Um método para aumentar o rendimento em uma planta, compreendendo plantar em um campo uma planta ou uma semente desta tendo incorporado de forma estável em seu genoma um construto de DNA compreendendo um promotor que conduz a expressão em uma planta operacionalmente ligada a uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo pesticida, em que a referida sequência de nucleotídeos compreende: (a) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de qualquer uma das SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.; ou,
(b) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 para uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304,
305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312.
28. Um método para obter um polinucleotídeo que codifica um polipeptídeo melhorado contendo atividade pesticida, em que o polipeptídeo melhorado apresenta pelo menos uma propriedade melhorada com respeito a qualquer uma das SEQ ID NOS: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306,
307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312, compreendendo: (a) recombinar vários polinucleotídeos progenitores contendo SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312. ou uma variante ativa ou fragmento dos mesmos, para produzir uma biblioteca de polinucleotídeos recombinantes que codificam polipeptídeos pesticidas recombinantes; (b) rastrear a biblioteca para identificar um polinucleotídeo recombinante que codifique um polipeptídeo pesticida recombinante melhorado que apresente uma propriedade melhorada com respeito ao polinucleotídeo progenitor; (c) recuperar o polinucleotídeo recombinante que codifica o polipeptídeo pesticida recombinante melhorado identificado em (b); e (d) repetir as etapas (a), (b) e (c) usando o polinucleotídeo recombinante recuperado na etapa (c) como um dos vários polinucleotídeos progenitores da etapa repetida (a).
[0108] Os exemplos a seguir são oferecidos a título de ilustração e não a título de limitação.
EXPERIMENTAL Exemplo 1. Descoberta de genes novos por sequenciamento e análise de DNA
[0109] Culturas microbianas foram cultivadas em cultura líquida em meios de laboratório padrão. As culturas foram cultivadas até a saturação (16 a 24 horas) antes da preparação do DNA. O DNA foi extraído de células bacterianas por lise detergente, seguido por ligação a uma matriz de sílica e lavagem com um tampão de etanol. O DNA purificado foi eluído a partir da matriz de sílica com um tampão aquoso ligeiramente alcalino.
[0110] O DNA para sequenciação foi testado quanto à pureza e concentração por espectrofotometria. As bibliotecas de sequenciação foram preparadas usando o kit de preparação de bibliotecas Nextera XT de acordo com o protocolo do fabricante. Os dados de sequência foram gerados em um HiSeq 2000 de acordo com o protocolo do Guia do Usuário do Sistema Illumina HiSeq 2000.
[0111] As leituras de sequenciação foram montadas em genomas de teste utilizando o pacote de software CLC Bio Assembly Cell. Após a montagem, as chamadas de genes foram feitas por vários métodos e as sequências de genes resultantes foram interrogadas para identificar novos homólogos de genes pesticidas. Novos genes foram identificados pelo BLAST, pela composição do domínio e pelo alinhamento em pares contra um conjunto-alvo de genes pesticidas. Um resumo dessas sequências é apresentado no Quadro 1.
[0112] Os genes identificados na pesquisa de homologia foram amplificados a partir de DNA bacteriano por PCR e clonados em vetores de expressão bacterianos contendo etiquetas de purificação em quadro fundidas. Os genes clonados foram expressos em E. coli e purificados por cromatografia em coluna. As proteínas purificadas foram avaliadas em estudos de bioensaio de dieta de insetos para identificar proteínas ativas. Exemplo 2. Expressão heteróloga em E. Coli
[0113] Cada quadro de leitura aberto de qualquer uma das SEQ ID NO: 1-312 foi clonado em um vetor de expressão de E. coli contendo uma proteína de ligação a maltose (pMBP). O vetor de expressão foi transformado em BL21*RIPL. Uma cultura de LB suplementada com carbenicilina foi inoculada com uma única colônia e cultivada durante a noite a 37°C utilizando 0,5% da cultura noturna, e uma cultura fresca foi inoculada e cultivada até a fase logarítmica a 37°C. A cultura foi induzida utilizando 250 mM de IPTG durante 18 horas a 16°C. As células foram sedimentadas e ressuspensas em 10mM de Tris pH7.4 e 150 mM de NaCl suplementado com inibidores de protease. A expressão da proteína foi avaliada por SDS-PAGE. Exemplo 3. Atividade pesticida contra coleópteros e lepidópteros Métodos
[0114] Expressão da proteína: A sequência apresentada na SEQ ID NO: 1-312 foi expressa em E. coli conforme descrito no Exemplo 2. Foram inoculados 400 mL de LB e cultivados até uma OD600 de 0,6. A cultura foi induzida com 250 mM de IPTG durante a noite a 16°C. As células foram centrifugadas e o sedimento celular foi ressuspenso em 5 mL de tampão. A ressuspensão foi sonicada durante 2 minutos em gelo.
[0115] Bioensaio: Ovos de lagarta do cartucho (fall army worm, FAW), lagarta da espiga (corn ear worm, CEW), broca europeia do milho (European corn borer, ECB), broca do milho do sudoeste (southwestern corn borer, SWCB) e traça das crucíferas (diamond backed moth, DBM) foram adquiridos de uma insetaria comercial (Benzon Research Inc., Carlisle, PA, EUA). Os ovos de FAW, CEW, ECB e BCW foram incubados até o ponto em que a eclosão ocorreria em até 12 horas após a realização do ensaio. A SWCB e a DBM foram introduzidas no ensaio como larvas de neonatos. Os ensaios foram realizados em bandejas de 24 poços contendo dieta de lepidópteros multiespécies (SOUTHLAND PRODUCTS INC., Lake Village, AR).
Amostras do lisado sonicado foram aplicadas na superfície da dieta (sobreposição de dieta) e foram deixadas se evaporar e se ensopar na dieta. Para as CEW, FAW, BCW, ECB e SWCB, 125 μl de lisado sonicado foram adicionados à superfície da dieta e logo foram secos. Para a DBM, 50 µl de uma diluição 1:2 de lisado sonicado foram adicionados à superfície da dieta. As placas de bioensaio foram vedadas com uma película de vedação de placa ventilada com orifícios de alfinete. As placas foram incubadas a 26°C a 65% de umidade relativa (UR) em um ciclo 16:8 dia:noite em Percival durante 5 dias. Os ensaios foram avaliados quanto ao nível de mortalidade, inibição do crescimento e inibição da alimentação.
[0116] Para o bioensaio da larva da lagarta da raiz do milho, o construto ou lisado da proteína foi avaliado em um bioensaio de insetos, dispensando 60 μl de uma diluição 1:6 de lisado sonicado na superfície superior da dieta no/s poço/s de uma placa de 24 poços (Cellstar, 24 poços, Greiner Bio One) e foi deixado secar. Cada poço continha dieta de 500 μl (Marrone et al., 1985). Quinze a vinte larvas neonatais foram introduzidas em cada poço usando um pincel de ponta fina e a placa foi coberta com membrana (Viewseal, Greiner Bio One). O bioensaio foi armazenado à temperatura ambiente e pontuado quanto à mortalidade e/ou inibição de crescimento/alimentação no dia 4.
[0117] Para o besouro da batata (Colorado potato beetle, CPB), um disco de folha foi excisado da folha da batata com um furador de rolha de tamanho nº 8 e mergulhado no lisado sonicado da proteína com 0,1% Tween80 até ficar completamente encharcado, sendo posteriormente colocado no topo do disco do filtro (Millipore, filtro de fibra de vidro, 13 mm). Foram adicionados 60 µl de dH2O a cada disco de filtro e colocados em cada poço da placa de 24 poços (Cellstar, 24 poços, Greiner Bio One). O disco de folha foi deixado secar e cinco a sete larvas do primeiro ínstar foram introduzidas em cada poço usando um pincel de ponta fina. A placa foi coberta com membrana (Viewseal, Greiner Bio One) e um pequeno orifício foi perfurado em cada poço da membrana. O construto foi avaliado com quatro repetições, mostrando pontuação para mortalidade e danos nas folhas no dia 3. Exemplo 4. Atividade pesticida contra hemipteranos
[0118] Expressão da proteína: Cada uma das sequências apresentadas na SEQ ID NOS: 1-312 foi expressa em E. coli conforme descrito no Exemplo 2. Foram inoculados 400 mL de LB e cultivados até uma OD600 de 0,6. A cultura foi induzida com 0,25 mM de IPTG durante a noite a 16°C. As células foram centrifugadas e o sedimento celular foi ressuspenso em 5 mL de tampão. A ressuspensão foi sonicada durante 2 minutos em gelo.
[0119] Foram obtidas SGSB de segundo ínstar a partir de uma insetaria comercial (Benzon Research Inc., Carlisle, PA, EUA). Uma proporção de 50% v/v de amostra de lisado sonicado para 20% de sacarose foi utilizada no bioensaio. Um parafilme esticado foi usado como membrana de alimentação para expor a SGSB à mistura de dieta/amostra. As placas foram incubadas a 25°C: 21°C, ciclo 16:8 dia:noite a 65% de UR durante 5 dias.
[0120] A mortalidade foi pontuada para cada amostra. Exemplo 5. Transformação da soja
[0121] Construtos de DNA compreendendo cada uma das SEQ ID NO: 1-312 ou uma variante ou fragmento ativo destas ligados operacionalmente a um promotor ativo em uma planta são clonados em vetores de transformação e introduzidos em Agrobacterium, conforme descrito no Pedido Provisório dos EUA nº 62/094,782, depositado em 19 de dezembro de 2015, aqui incorporado como referência em sua totalidade.
[0122] Quatro dias antes da inoculação, várias alças de Agrobacterium são estriadas em uma placa fresca de meio YEP* suplementado com os antibióticos apropriados** (espectinomicina, cloranfenicol e canamicina). As bactérias são cultivadas durante dois dias no escuro a 28°C. Após dois dias, várias alças de bactérias são transferidas a 3 ml de meio líquido YEP com antibióticos em um balão de Erlenmeyer de 125 ml. Os balões são colocados em um agitador rotativo a 250 RPM a 28°C durante a noite. Um dia antes da inoculação, foram transferidos de 2 a 3 ml da cultura noturna a 125 ml de YEP com antibióticos em um balão de Erlenmeyer de 500 ml. Os balões são colocados em um agitador rotativo a 250 RPM a 28°C durante a noite.
[0123] Antes da inoculação, a OD da cultura bacteriana é verificada em OD 620. Uma OD de 0,8 a 1,0 indica que a cultura está em fase logarítmica. A cultura é centrifugada a 4.000 RPM durante 10 minutos em tubos Oakridge. O sobrenadante é descartado e o sedimento é ressuspenso em um volume de meio de infecção de soja (SI) para atingir a OD desejada. As culturas são mantidas com mistura periódica até serem necessárias para a inoculação.
[0124] Dois ou três dias antes da inoculação, as sementes de soja são esterilizadas à superfície usando gás cloro. Em um exaustor, uma placa de Petri com sementes é colocada em uma campânula sem tampa. Adiciona-se lentamente 1,75 ml de HCl 12 N a 100 ml de água sanitária em um balão de Erlenmeyer de 250 ml no interior da campânula. A tampa é imediatamente colocada em cima da campânula. As sementes são deixadas esterilizar durante 14 a 16 horas (durante a noite). A parte superior é removida da campânula e a tampa da placa de Petri é substituída. A placa de Petri com a superfície esterilizada é então aberta em um fluxo laminar durante cerca de 30 minutos para dispersar qualquer gás de cloro restante.
[0125] As sementes são embebidas em água DI estéril ou em um meio de infecção de soja (SI) durante 1 a 2 dias. São revestidas 20 a 30 sementes com líquido em uma placa de Petri de 100 x 25 mm e incubadas no escuro a 24°C. Após a absorção, as sementes que não germinam são descartadas.
[0126] Os explantes de cotilédones são processados em uma placa de papel estéril com papel de filtro estéril umedecido usando meio SI, empregando os métodos da Patente dos EUA nº
7.473.822, aqui incorporados como referência.
[0127] Geralmente, 16 a 20 cotilédones são inoculados por tratamento. O meio SI utilizado para manter os explantes é descartado e substituído por 25 ml de cultura de Agrobacterium (OD 620 = 0,8 a 20). Uma vez que todos os explantes são submersos, a inoculação é realizada durante 30 minutos com turbulência periódica do prato. Após 30 minutos, a cultura de Agrobacterium é removida.
[0128] São preparadas placas de cocultivo por sobreposição de um pedaço de papel estéril sobre um meio de cocultivo de soja (SCC). Sem mancha, os cotilédones inoculados são cultivados com seu lado adaxial para baixo sobre o papel de filtro. Cerca de 20 explantes podem ser cultivados em cada placa. As placas são vedadas com Parafilm e cultivadas a 24ºC e cerca de 120 µmoles m-2s-1 (em uma incubadora Percival) durante 4 a 5 dias.
[0129] Após o cocultivo, os cotilédones são lavados 3 vezes em 25 ml de meio de lavagem de soja com 200 mg/l de cefotaxima e timentina. Os cotilédones são transferidos para um papel de filtro estéril e depois transferidos para um meio de indução de brotos de soja (SSI). A extremidade nodal do explante é ligeiramente deprimida no meio, ao passo que a extremidade distal é mantida acima da superfície a cerca de 45 graus. Não mais de 10 explantes são cultivados em cada placa. As placas são envolvidas em fita Micropore e cultivadas em Percival a 24°C e cerca de 120 µmoles m-2s-1.
[0130] Os explantes são transferidos para um meio SSI fresco após 14 dias. São retirados brotos emergentes do ápice do broto e do nó de cotilédones. A indução de brotos continua durante mais 14 dias nas mesmas condições.
[0131] Após 4 semanas de indução de brotos, o cotilédone é separado da extremidade nodal e um corte paralelo é feito abaixo da área da indução de brotos (almofada de brotos). A área do corte paralelo é colocada no meio de alongamento de brotos de soja (SSE), ao passo que os explantes são cultivados em Percival a 24ºC e cerca de 120 µmoles m-2s-1.
Esse passo é repetido de duas em duas semanas durante até 8 semanas, contanto que os brotos continuem se alongando.
[0132] Quando os brotos atingem um comprimento de 2 a 3 cm, são transferidos para um meio de enraizamento de soja (SR) em um recipiente Plantcon e são incubados nas mesmas condições durante 2 semanas ou até as raízes alcançarem um comprimento de cerca de 3 a 4 cm. Depois disso, as plantas são transferidas para o solo.
[0133] Note-se que todos os meios mencionados para a transformação da soja são encontrados em Paz et al. (2010) Agrobacterium-mediated transformation of soybean and recovery of transgenic soybean plants; Plant Transformation Facility of Iowa State University, a que é aqui incorporada como referência em sua totalidade. (Vide agron- ww.agron.iastate.edu/ptf/protocol/Soybean.pdf.). Exemplo 6. Transformação do milho
[0134] As espigas de milho são melhor colhidas 8 a 12 dias após a polinização. Os embriões são isolados das espigas, e aqueles cujo tamanho é de 0,8 a 1,5 mm são preferidos para serem utilizados na transformação. Os embriões são colocados em placas de scutellum com o lado para cima em um meio de incubação adequado, como o meio DN62A5S (3,98 g/L de sais N6; 1 mL/L (de 1000X de estoque) de vitaminas N6; 800 mg/L de L-asparagina; 100 mg/L de mio-inositol; 1,4 g/L L-prolina; 100 mg/L de ácidos casamino; 50 g/L de sacarose; 1 mL/L (de 1 mg/mL de estoque) de 2,4-D). No entanto, meios e sais diferentes de DN62A5S são adequados e são conhecidos na técnica. Os embriões são incubados durante a noite a 25°C no escuro. Porém, não é necessário em si incubar os embriões durante a noite.
[0135] Os explantes resultantes são transferidos para quadrados de malha (30 a 40 por placa), transferidos para meios osmóticos durante cerca de 30 a 45 minutos, depois transferidos para uma placa de irradiação (vide, por exemplo, Publicação PCT nº WO/0138514 e Patente dos EUA nº 5.240.842). Os construtos de DNA concebidos para expressar as proteínas GRG da presente invenção em células de plantas são acelerados no tecido vegetal utilizando um acelerador de feixe de aerossol, essencialmente utilizando condições descritas na Publicação PCT n° WO/0138514. Após a irradiação, os embriões são incubados durante cerca de 30 min. em meios osmóticos, e colocados em meios de incubação durante a noite a 25°C no escuro.
Para evitar danificar indevidamente os explantes irradiados, estes são incubados durante pelo menos 24 horas antes da transferência para meios de recuperação.
Em seguida, os embriões são espalhados em um meio de período de recuperação, por cerca de 5 dias, a 25°C no escuro, e posteriormente transferidos a um meio de seleção.
Os explantes são incubados em meios de seleção durante até oito semanas, dependendo da natureza e características da seleção em particular utilizada.
Após o período de seleção, o calo resultante é transferido para o meio de maturação do embrião, até que a formação de embriões somáticos maduros seja observada.
Os embriões somáticos maduros resultantes são então colocados sob luz fraca, e o processo de regeneração é iniciado por métodos conhecidos na técnica.
Os brotos resultantes são deixados enraizar em meio de enraizamento, e as plantas resultantes são transferidas para vasos de viveiro e propagadas como plantas transgênicas.
Exemplo 7. Atividade pesticida contra nematoides
Ensaio in vitro da Heterodera glycines (nematoide do cisto da soja)
[0136] Os nematoides do cisto da soja (Soybean Cyst Nematodes, SCN) são distribuídos em uma placa de ensaio de 96 poços com um volume total de 100 ul e 100 J2 por poço. A proteína de interesse, conforme apresentada nas SEQ ID NO: 1-312 é despejada nos poços e mantida à temperatura ambiente para avaliação. Finalmente, a placa de 96 poços que contém os SCN J2 é analisada quanto à motilidade. Os dados são anotados como % de inibição em comparação com os controles. Os acertos são definidos como maiores ou iguais a 70% de inibição Ensaio na planta da Heterodera glycines (nematoide do cisto da soja)
[0137] As plantas de soja que expressam uma ou mais das SEQ ID NO: 1-312 são geradas conforme descrito em outras partes deste documento. Um corte de soja de 3 semanas de idade é inoculado com 5000 ovos de SCN por planta. Essa infecção é mantida por 70 dias e depois colhida para contar os cistos de SCN que se desenvolveram na planta. Os dados são anotados como % de inibição em comparação com os controles. Os acertos são definidos como maiores ou iguais a 90% de inibição. Ensaio in vitro da Meloidogyne incognita (nematoide do nódulo da raiz)
[0138] Os nematoides do nódulo da raiz (Root-Knot Nematodes, RKN) são distribuídos em uma placa de ensaio de 96 poços com um volume total de 100 uls e 100 J2 por poço.
[0139] A proteína de interesse compreendendo qualquer uma das SEQ ID NO: 1-312 é despejada nos poços e mantida à temperatura ambiente para avaliação. Finalmente, a placa de 96 poços que contém os RKN J2 é analisada quanto à motilidade. Os dados são anotados como % de inibição em comparação com os controles. Os acertos são definidos como maiores ou iguais a 70% de inibição. Ensaio na planta da Meloidogyne incognita (nematoide do nódulo da raiz)
[0140] As plantas de soja que expressam uma ou mais das SEQ ID NO: 1-312 são geradas conforme descrito em outras partes deste documento. Uma soja de 3 semanas de idade é inoculada com 5000 ovos de RKN por planta. Essa infecção é mantida por 70 dias e depois colhida para contar os ovos de RKN que se desenvolveram na planta. Os dados são anotados como % de inibição em comparação com os controles. Os acertos são definidos como maiores ou iguais a 90% de inibição. Exemplo 8. Outros ensaios de atividade pesticida
[0141] Os diversos polipeptídeos apresentados nas SEQ ID NO: 1-312 podem ser testados para agir como um pesticida sobre uma praga de várias maneiras. Um desses métodos é realizar um ensaio de alimentação. Em um ensaio de alimentação desse tipo, a praga é exposta a uma amostra contendo compostos a serem testados ou amostras de controle. Muitas vezes, isso é realizado colocando o material a ser testado, ou uma diluição adequada desse material, sobre um material que a praga irá ingerir, como uma dieta artificial. O material a ser testado pode ser composto por um líquido, sólido ou pasta. O material a ser testado pode ser colocado sobre a superfície e depois deixado secar. Alternativamente,
o material a ser testado pode ser misturado com uma dieta artificial derretida e, em seguida, distribuído na câmara de ensaio. A câmara de ensaio pode ser, por exemplo, um copo, um prato ou um poço de uma placa de microtitulação.
[0142] Os ensaios para pragas sugadoras (por exemplo, pulgões) podem envolver a separação do material de teste do inseto mediante partição, idealmente uma porção que pode ser perfurada por partes da boca de sucção do inseto sugador, para permitir a ingestão do material de teste. Muitas vezes, o material de teste é misturado com um estimulante de alimentação, como a sacarose, para incentivar a ingestão do composto de teste.
[0143] Outros tipos de ensaios podem incluir microinjeção do material de teste na boca ou no intestino da praga, bem como o desenvolvimento de plantas transgênicas, seguido pelo teste da capacidade da praga de se alimentar sobre a planta transgênica. Os testes de plantas podem envolver o isolamento das partes de plantas normalmente consumidas, por exemplo, pequenas gaiolas anexadas a uma folha ou isolamento de plantas inteiras em gaiolas contendo insetos.
[0144] Outros métodos e abordagens para ensaios com pragas são conhecidos na técnica e podem ser encontrados, por exemplo, em Robertson e Preisler, eds. (1992) Pesticide bioassays with arthropods, CRC, Boca Raton, Fla. Alternativamente, os ensaios são comumente descritos nas publicações Arthropod Management Tests e Journal of Economic Entomology ou por discussão com membros da Entomological Society of America (ESA). Qualquer uma das SEQ ID NOS: 1-312 pode ser expressa e empregada em um ensaio, conforme os
Exemplos 3 e 4. Exemplo 9. Atividade pesticida contra percevejo verde do sul (SGSB)
[0145] Expressão da proteína: SEQ ID NO: 298 foi expressa em E. coli conforme descrito no Exemplo 2. Foram inoculados 400 mL de LB e cresceram até uma OD600 de 0,6. A cultura foi induzida com IPTG 0,25 mM durante a noite a 16ºC. As células foram centrifugadas e o sedimento celular foi ressuspenso em 5 mL de tampão. A ressuspensão foi sonicada por 2 min em gelo.
[0146] Foram obtidas SGSB de segundo ínstar a partir de uma insetaria comercial (Benzon Research Inc., Carlisle, PA, EUA). Uma proporção de 50% v/v de amostra de lisado sonicado para 20% de sacarose foi utilizada no bioensaio. Um parafilme esticado foi usado como membrana de alimentação para expor a SGSB à mistura de dieta/amostra. As placas foram incubadas a 25°C: 21°C, ciclo 16:8 dia:noite a 65% de UR durante 5 dias.
[0147] A mortalidade foi pontuada para cada amostra. A SEQ ID NO: 298 mostrou de cerca de 30% a cerca de 60% de mortalidade contra percevejo verde do sul após uma incubação de 5 dias e de cerca de 50% a cerca de 70% de mortalidade após uma incubação de 7 dias. Os resultados estão apresentados no Quadro 3. Os controles negativos (domínio de expressão do vector vazio e tampão somente) não mostraram mortalidade.
Quadro 3. Resumo da atividade pesticida contra o percevejo verde do sul APG SEQ 5 dias 7 dias ID (%) (%) APG00196.2 298 50 50 APG00196.2 298 60 70 APG00196.2 298 40 60 APG00196.2 298 30 60
[0148] Todas as publicações e pedidos de patente mencionados na especificação são indicativos do nível de perícia dos especialistas na técnica à qual esta invenção pertence. Todas as publicações e pedidos de patente são aqui incorporados como referência de igual maneira, como se cada publicação ou pedido de patente determinado fosse especificamente e individualmente indicado para ser incorporado como referência.
[0149] Embora a invenção anterior tenha sido descrita em algum detalhe por meio de ilustrações e exemplos para fins de clareza de compreensão, é elementar ressaltar que certas alterações e modificações podem ser praticadas dentro do escopo das reivindicações anexas.

Claims (24)

REIVINDICAÇÕES
1. Um polipeptídeo isolado com atividade pesticida, caracterizado por compreender: (a) um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos 90% de identidade de sequência com uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NO: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285,
286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311 e/ou 312; ou (b) um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 em relação a uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277,
278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312.
2. O polipeptídeo da reivindicação 1, caracterizado pelo referido polipeptídeo compreender a sequência de aminoácidos apresentada nas SEQ ID NO: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301,
302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312.
3. Uma composição caracterizada por compreender o polipeptídeo da reivindicação 1 ou 2.
4. O polipeptídeo da reivindicação 2, caracterizado por compreender ainda sequências de aminoácidos heterólogas.
5. Uma molécula de ácido nucleico recombinante que codifica o polipeptídeo da reivindicação 1, caracterizada pela referida molécula de ácido nucleico recombinante não ser uma sequência de ocorrência natural que codifica o referido polipeptídeo.
6. A molécula de ácido nucleico recombinante da reivindicação 5, caracterizada pela referida molécula de ácido nucleico ser uma sequência sintética concebida para a expressão em uma planta.
7. A molécula de ácido nucleico recombinante da reivindicação 6 ou da reivindicação 5, caracterizada pela referida molécula de ácido nucleico estar operacionalmente ligada a um promotor capaz de conduzir a expressão em uma célula vegetal.
8. A molécula de ácido nucleico recombinante da reivindicação 5, caracterizada pela referida molécula de ácido nucleico estar operacionalmente ligada a um promotor capaz de conduzir a expressão em uma bactéria.
9. Uma célula hospedeira caracterizada por compreender a molécula de ácido nucleico recombinante da reivindicação
8.
10. A célula hospedeira da reivindicação 9, caracterizada pela referida célula hospedeira ser uma célula hospedeira bacteriana.
11. Um construto de DNA caracterizado por compreender um promotor que conduz a expressão em uma célula vegetal operacionalmente ligada a uma molécula de ácido nucleico recombinante compreendendo: (a) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos apresentada qualquer uma das SEQ ID NOs: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289,
290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312; ou, (b) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 para uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268,
269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312.
12. O construto de DNA da reivindicação 11, caracterizado pela referida sequência de nucleotídeos ser uma sequência de DNA sintética concebida para a expressão em uma planta.
13. Um vetor caracterizado por compreender o construto de DNA da reivindicação 11.
14. Uma célula hospedeira caracterizada por compreender o vetor da reivindicação 11 ou 12 ou o vector da reivindicação 13.
15. A célula hospedeira da reivindicação 14, caracterizada pela célula hospedeira ser uma célula vegetal.
16. Uma planta transgênica caracterizada por compreender a célula hospedeira da reivindicação 15.
17. Uma composição caracterizada por compreender a célula hospedeira da reivindicação 10.
18. Um método para controlar uma população de pragas caracterizado por compreender o contato da referida população com uma quantidade pesticida eficaz da composição da reivindicação 17.
19. Um método para matar uma população de pragas caracterizado por compreender o contato da referida população com uma quantidade pesticida eficaz da composição da reivindicação 17.
20. Um método para produzir um polipeptídeo com atividade pesticida, caracterizado por compreender a cultura da célula hospedeira da reivindicação 9 sob condições em que a molécula de ácido nucleico que codifica o polipeptídeo seja expressa.
21. Uma planta que incorporou de forma estável em seu genoma um construto de DNA compreendendo uma sequência de nucleotídeos que codifica uma proteína com atividade pesticida, caracterizada pela referida sequência de nucleotídeos compreender: (a) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de qualquer uma das SEQ ID NOs: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244,
245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312;ou, (b) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 para uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231,
232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312.
22. Uma semente transgênica caracterizada por ser da planta da reivindicação 21.
23. Um método para proteger uma planta de uma praga de inseto, caracterizado por compreender a expressão em uma planta ou célula desta uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo pesticida, em que a referida sequência de nucleotídeos compreende: (a) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo a sequência de aminoácidos de qualquer uma das SEQ ID NOs: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171,
172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312; ou, (b) uma sequência de nucleotídeos que codifica um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos com pelo menos a porcentagem de identidade de sequência apresentada no Quadro 1 para uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo constituído pelas sequências apresentadas nas SEQ ID NOs: 235, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159,
160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, e/ou 312.
24. O método da reivindicação 23, caracterizado pela referida planta produzir um polipeptídeo pesticida que possui atividade pesticida contra uma praga lepidóptera ou coleóptera.
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