BE1023841A1 - Cellules de mammiferes exprimant des antigenes du cytomegalovirus - Google Patents
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Abstract
Cette invention concerne des protéines du cytomégalovirus (CMV) appropriées pour des utilisations vaccinales. Sont fournies ici des cellules hôtes de mammifères, en particulier des cellules CHO, dans lesquelles la ou les séquences codant pour les protéines du CMV gH, gL, pUL128, pUL130, pUL131 (ou 5 l'un de leurs fragments formant un complexe) sont intégrées de façon stable dans le génome.
Description
CELLULES DE MAMMIFERES EXPRIMANT DES ANTIGENES DU
CYTOMEGALOVIRUS
Domaine de 1'invention [0001] Cette invention concerne des cellules hôtes exprimant des protéines du cytomégalovirus (CMV) appropriées pour des utilisations vaccinales.
Contexte de l'invention [0002] Le cytomégalovirus est un genre de virus qui appartient à la famille virale connue sous le nom de Herpèsviridés ou herpèsvirus. L'espèce qui infecte les êtres humains est couramment connue sous le nom de cytomégalovirus humain (HCMV) ou d'herpèsvirus-5 (HHV-5) humain. Parmi les Herpèsviridés, le HCMV appartient à la sous-famille des Bêta-herpesvirinés, qui comprend également les cytomégalovirus d'autres mammifères.
[0003] Bien qu'on puisse les trouver dans tout le corps, les infections à HCMV sont fréquemment associées aux glandes salivaires. Le hCMV infecte entre 50 % et 80 % des adultes aux Etats-Unis (40 % dans le monde), comme cela est indiqué par la présence d'anticorps chez une grande proportion de la population générale. Le HCMV passe généralement inaperçu chez les personnes en bonne santé, mais il peut menacer la vie des immunocompromis, comme les personnes infectées par le VIH, les receveurs de transplantation d'organe ou les nourrissons nouveau-nés. Le HCMV est le virus le plus fréquemment transmis aux fœtus en développement. Après une infection, le HCMV a la capacité de demeurer latent au sein du corps la vie durant de l'hôte, avec des réactivations occasionnelles depuis l'état latent. Etant donné la gravité et l'importance de cette maladie, l'obtention d'un vaccin efficace est considérée comme une priorité absolue pour la santé publique (Sung, H., et al., (2010) Expert review of vaccines 9, 1303-1314 ; Schleiss, Expert Opin Ther Pat. Apr 2010; 20(4): 597-602).
[0004] Les génomes de plus de 20 souches différentes du HCMV ont été séquencés, y compris ceux à la fois de souches de laboratoire et d'isolats. Par exemple, les souches suivantes du HCMV ont été séquencées : Towne (GL239909366), ADI 69 (GI: 219879600), Toledo (GL290564358 ) et Merlin (GI: 155573956). Les souches du HCMV AD169, Towne et Merlin peuvent être obtenues auprès de 1'American Type Culture Collection (ATCC VR538, ATCC VR977 et ATCC VR1590, respectivement).
[0005] Le CMV contient un nombre inconnu de complexes de protéines membranaires. Parmi les approximativement 30 glycoprotéines connues dans l'enveloppe virale, la gH et la gL sont apparues comme étant particulièrement intéressantes en raison de leur présence dans plusieurs complexes différents : le dimère gH/gL, le trimère gH/gL/gO (également connu comme le complexe gCIII), et le pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 (la pUL131 est également appelée « pUL131A », « pUL131a », ou « UL131A » ; les sous-unités pULl28, pULl30, et pUL131 sont parfois également appelées UL128, UL130, UL131). On pense que le CMV utilise les complexes pentamères pour pénétrer dans les cellules épithéliales et endothéliales par endocytose et fusion dépendante d'un pH bas mais on pense qu'il pénètre dans les fibroblastes par fusion directe à la membrane plasmatique dans un processus impliquant le complexe gH/gL ou éventuellement gH/gL/gO. Le (s) complexe(s) gH/gL et/ou gH/gL/gO est/sont suffisant(s) pour l'infection des fibroblastes, tandis que le complexe pentamère est requis pour infecter les cellules endothéliales et épithéliales.
[0006] Le complexe pentamère est considéré comme une cible majeure pour la vaccination contre le CMV. Les gènes viraux UL128, UL130 et UL131 sont nécessaires à la pénétration dans les cellules endothéliales (Hahn, Journal of Virology 2004; 78: 10023-33). Les souches à tropisme non endothélial adaptées aux fibroblastes contiennent des mutations dans au moins trois de ces gènes. La souche Towne, par exemple, contient une insertion de 2 paires de bases provoquant un décalage du cadre dans le gène UL130, tandis que AD169 contient une insertion de 1 paire de bases dans le gène UL131. A la fois Towne et AD169 ont pu être adaptées pour une croissance dans des cellules endothéliales, et dans les deux cas, les mutations de décalage du cadre dans les gènes UL130 ou UL131 ont été réparées.
[0007] Le brevet US 7 704 510 divulgue que la pUL131A est nécessaire pour un tropisme des cellules épithéliales. Le brevet US 7 704 510 divulgue également que la pUL128 et la pULl30 forment un complexe avec gH/gL, qui est incorporé dans les virions. Ce complexe est nécessaire pour infecter les cellules endothéliales et épithéliales mais pas les fibroblastes. Il a été découvert que des anticorps anti-CD46 inhibent l'infection par le HCMV des cellules épithéliales.
[0008] Des vaccins contre le CMV testés dans des essais cliniques comprennent le vaccin à base de Towne, des chimères Towne-Toledo, un réplicon d'alphavirus avec la gB comme antigène, un vaccin à base de gB/MF59, un vaccin à base de gB produit par GlaxoSmithKline, et un vaccin à base d'ADN utilisant la gB et la pp65. La pp65 est une protéine virale qui est un inducteur puissant des réponses CD8+ dirigées contre le CMV. Ces vaccins sont tous des inducteurs médiocres d'anticorps qui bloquent la pénétration du virus dans les cellules endothéliales/épithéliales (Adler, S. P. (2013), British Medical Bulletin, 107, 57-68. doi: 10.1093/bmb/ldt023) .
[0009] On pense de façon générale que des anticorps neutralisants dirigés contre le complexe pentamère (gH/gLpUL128/pUL130/pUL131) seront significativement plus puissants que des anticorps neutralisants dirigés contre la sous-unité gB, ou le complexe dimère gH/gL du CMV. Par conséquent, pour développer un vaccin efficace contre le CMV, il existe un besoin urgent de production de grandes quantités (par exemple, à des échelles commerciales) du complexe pentamère du CMV.
[0010] Toutefois, la production recombinante du complexe pentamère du CMV demeure un défi. Les cinq sous-unités doivent être exprimées (de préférence dans une quantité substantiellement égale, et de préférence pendant une période de temps prolongée), repliées correctement, et assemblées de façon correcte en un pentamère. En outre, il existe également un besoin d'éviter l'assemblage non souhaité de complexes contaminants (comme le dimère gH/gL, le tétramère gH/gL (deux copies de gH et deux copies de gL) , le tétramère gH/gLpUL128/pUL130, etc.).
[0011] L' expression recombinante d'un tel complexe de protéines eucaryotes nécessitera l'identification de constructions appropriées et d'hôtes appropriés, pour l'expression de quantités suffisantes de protéines repliées correctement pendant une période de temps prolongée, qui peuvent ensuite s'assembler correctement en complexes de protéines. En outre, la sélection d'un hôte d'expression approprié a un impact significatif sur le rendement et la qualité des protéines, ainsi que sur les coûts véritables du procédé de production. Résumé de l'invention [0012] Il est divulgué et exemplifié ici des cellules hôtes de mammifères, en particulier des cellules CHO, dans lesquelles la/les séquence(s) codant pour les protéines du CMV gH, gL, pUL128, pUL130, pUL131 (ou l'un de leurs fragments formant un complexe) est/sont intégrée (s) de façon stable dans le génome. De telles cellules hôtes fournissent une source fiable où le complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 peut être produit de façon recombinante.
[0013] Dans un aspect, l'invention propose une cellule de mammifère recombinante, comme une cellule de rongeur (par exemple, une cellule CHO) comprenant une ou plusieurs séquences polynucléotidiques codant pour le complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV), où ledit complexe pentamère comprend (i) la gH ou l'un de ses fragments formant un complexe, (ii) la gL ou l'un de ses fragments formant un complexe, (iii) la pUL128 ou l'un de ses fragments formant un complexe, (iv) la pUL130 ou l'un de ses fragments formant un complexe, et (v) la pUL131 ou l'un de ses fragments formant un complexe, où lesdites une ou plusieurs séquences polynucléotidiques sont intégrées dans l'ADN génomique de ladite cellule de mammifère. Parce que les séquences nucléotidiques sont intégrées de façon stable dans l'ADN génomique de la cellule, elles peuvent être transmises à la descendance comme faisant partie des séquences génomiques. De telles cellules sont souvent qualifiées dans l'art de lignées cellulaires stables. En particulier, la cellule ne comprend pas les séquences virales du CMV qui pourraient entraîner la production de virus CMV infectieux. Dans certains modes de réalisation, la cellule de mammifère est une cellule CHO. Lorsqu'elle est cultivée dans des conditions appropriées, ledit complexe pentamère du CMV est exprimé par ladite cellule hôte.
[0014] Les cellules CHO appropriées comprennent, par exemple, toutes les lignées cellulaires CHO disponibles à l'American Type Culture Collection (ATCC) ou à 1'European Collection of Cell Cultures (ECACC). Les exemples de lignées cellulaires CHO comprennent, par exemple, les cellules CHO-Kl, CH0-DUXB11, CHO-DG44, ou CHO-S. Pour faciliter la sélection des clones intégrés de façon stable, les cellules hôtes peuvent être déficientes pour la dihydrofolate réductase (DHFR). L'expression de protéines de recombinaison dans des lignées cellulaires déficientes pour la DHFR ou compétentes pour la DHFR peut être également criblée par une sélection au méthotrexate (MTX).
[0015] La cellule hôte peut comporter une ou plusieurs modifications supplémentaires pour encore amplifier la production du complexe pentamère du CMV. Dans certains modes de réalisation, le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 est réduit dans la cellule hôte, comparativement à un témoin. Dans certains modes de réalisation, le taux d'expression ou l'activité de la protéine FAM60A est réduit dans la cellule hôte, comparativement à un témoin. Dans certains modes de réalisation, le taux d'expression ou l'activité de la matriptase est réduit dans la cellule hôte, comparativement à un témoin. Les modifications décrites ici peuvent être utilisées seules ou dans n'importe quelle combinaison.
[0016] Le complexe pentamère du CMV produit de façon recombinante peut être soluble (par exemple, auquel il manque le domaine transmembranaire de la gH) . Pour faciliter la production, le complexe pentamère du CMV produit de façon recombinante peut être sécrété à partir de la cellule hôte dans le milieu de culture.
[0017] Les cellules hôtes de mammifères décrites ici sont particulièrement appropriées pour une production à grande échelle, comme des cultures qui ont une taille d'au moins 20 litres (par exemple, 50 litres, 100 litres, etc.). Dans certains modes de réalisation, le rendement du complexe pentamère du CMV est d'au moins 0,05 g/1, ou d'au moins 0,1 g/1.
Brève description des figures [0018] La figure 1 illustre diverses stratégies de conception pour la coexpression des cinq composants du pentamère.
[0019] La figure 2 représente les cartes plasmidiques des vecteurs d'expression utilisés pour la transfection de cellules CHO.
[0020] La figure 3 représente l'analyse SDS-PAGE du pentamère purifié produit avec les 12 principaux clones.
[0021] La figure 4 illustre les conceptions expérimentales utilisées pour étudier la stabilité des 12 principaux clones.
[0022] La figure 5 représente le rendement du pentamère produit par le clone principal VF7.
Description détaillée de l'invention 1. Généralités [0023] L'une des cibles principales pour une vaccination contre le CMV est le complexe pentamère (gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131). Pour produire un pentamère recombinant du CMV à une échelle commerciale, il existe le besoin d'identifier des constructions appropriées et des hôtes appropriés, de telle façon que les cinq sous-unités du pentamère peuvent être exprimées dans des quantités suffisantes pendant une période de temps prolongée, et peuvent s'assembler correctement en un complexe pentamère. Le pentamère du CMV est une cible primaire des anticorps neutralisants dirigés contre le CMV humain.
[0024] Le pentamère du CMV a été produit de façon recombinante en utilisant des cellules HEK293 en tant que cellules hôtes. Voir, le document WO 2014/005959. Toutefois, la lignée cellulaire HEK293 est généralement reconnue dans l'art comme l'une des meilleures lignées de cellules hôtes pour une expression transitoire de gènes. Voir, Meyer et al., PLoS One, 2013 Jul 17; 8 (7) : e68674 . doi: 10.1371/journal.pone.0068674 . Toutefois, il sera difficile de maintenir l’expression du pentamère pendant une période de temps prolongée dans des cellules HEK293 transfectées de façon transitoire. En outre, dans les exemples divulgués dans le document WO 2014/005959, les cinq sous-unités du pentamère ont été introduites dans des cellules HEK293 par l’intermédiaire de cinq plasmides différents. Dans cette configuration, il sera facile de maintenir l’expression de chaque sous-unité du pentamère à un taux substantiellement égal. Une quantité inégale des sous-unités peut réduire l’efficacité de l’assemblage du pentamère, d'autant plus que ces sous-unités ont déjà une tendance à former des complexes contaminants, comme le dimère gH/gL, le tétramère gH/gL (2 copies de gH et 2 copies de gL) , le tétramère gH/gLpUL128/pUL130. En outre, le plasmide codant pour la gH a été sélectionné par la néomycine, les quatre plasmides codant pour les gL, pUL128, pUL130, et pUL131, respectivement, ont tous été sélectionnés par la kanamycine. Par conséquent, parce que les quatre plasmides ont été sélectionnés par la kanamycine, la perte d’un seul plasmide dans une cellule hôte ne pourra pas être facilement détectée, mais la perte d’un seul plasmide empêchera l’assemblage du pentamère.
[0025] Comme cela est divulgué et exemplifié ici, les inventeurs ont surmonté les difficultés de la production recombinante du pentamère du CMV en utilisant des cellules d’ovaire de hamster de Chine (CHO) . Dans ces cellules CHO, les séquences codant pour les gH, gL, pUL128, pUL130, pUL131 (ou l’un de leurs fragments formant un complexe) sont intégrées de façon stable dans le génome des cellules CHO. En intégrant les séquences codant pour le pentamère dans le génome de la cellule CHO, les inventeurs ont obtenu une expression génomique stable du pentamère recombinant, avec une efficacité et une stabilité génomique élevées. Comme cela est exemplifié dans la section des exemples, il a été découvert que, comparativement aux cellules HEK293 transfectées de façon transitoire, les lignées CHO stables ont obtenu de façon régulière des rendements 100 fois supérieurs, rendant ces lignées cellulaires CHO particulièrement appropriées pour la production commerciale du pentamère du CMV. L'intégration stable permet également une manipulation aisée d'une culture cellulaire à grande échelle, comparativement aux cellules HEK transfectées de façon transitoire avec cinq plasmides exogènes. En fait, les clones principaux ont produit le pentamère avec un rendement aussi élevé que 0,1 g/1 à 0,5 g/1.
[0026] D'autres améliorations des cellules hôtes pour la production du pentamère du CMV sont également fournies ici. En particulier, trois cellules hôtes modifiées sont exemplifiées : (i) des cellules hôtes dans lesquelles le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 est réduit, comparativement à un témoin ; (ii) des cellules hôtes dans lesquelles le taux d'expression ou l'activité de la protéine FAM60A est réduit, comparativement à un témoin ; (iii) des cellules hôtes dans lesquelles le taux d'expression ou l'activité de la matriptase est réduit comparativement à un témoin. Il a été découvert que la réduction du taux d'expression ou de l'activité de la protéine C12orf35 ou de la protéine FAM60A entraîne une augmentation significative du taux d'expression d'une protéine recombinante. Il a été également découvert que la réduction du taux d'expression ou de l'activité de la matriptase diminue significativement la dégradation protéolytique (« coupure ») d'une protéine recombinante. Ces modifications peuvent être utilisées seules ou dans n'importe quelle combinaison.
[0027] Par conséquent, il est proposé ici des cellules hôtes de mammifères, en particulier des cellules CHO, dans lesquelles la/les séquence(s) polynucléotidique (s) codant pour le complexe pentamère du CMV comprenant les gH, gL, pUL128, pUL130, pUL131 (ou l'un de leurs fragments formant un complexe) sont intégrées de façon stable dans 1'ADN génomique. Lorsqu'elles sont cultivées dans des conditions appropriées, ledit complexe pentamère du CMV est exprimé par lesdites cellules hôtes.
[0028] Il est également proposé ici un complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV) produit par les cellules de mammifères décrites ici.
[0029] Il est également proposé ici un procédé de production du complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV), dans lequel ledit complexe pentamère comprend : la gH ou l'un de ses fragments formant un complexe, la gL ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL128 ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL130 ou l'un de ses fragments formant un complexe, et la pUL131 ou l'un de ses fragments formant un complexe, comprenant : (i) la culture de la cellule de mammifère telle que décrite ici dans des conditions appropriées, exprimant de cette façon ledit complexe pentamère ; et la récolte dudit complexe pentamère à partir de la culture. Le complexe pentamère peut être en outre purifié. Il est également proposé ici un complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV) produit par ce procédé.
[0030] Il est également proposé ici une composition comprenant le complexe pentamère décrit ici. La composition peut comprendre un complexe pentamère du CMV purifié qui est approprié pour une administration in vivo. Par exemple, le complexe pentamère dans une telle composition peut avoir une pureté d'au moins 85 %, d'au moins 86 %, d'au moins 87 %, d'au moins 88 %, d'au moins 89 %, d'au moins 90 %, d'au moins 91 %, d'au moins 92 %, d'au moins 93 %, d'au moins 94 %, d'au moins 95 %, d'au moins 96 %, d'au moins 97 %, d'au moins 98 %, ou d'au moins 99 %, en masse. La composition peut comprendre en outre un adjuvant, comme un sel d'aluminium, ou le MF59.
[0031] Il est également proposé ici une composition pour une utilisation dans l'induction d'une réponse immunitaire contre le CMV. L'utilisation de la composition décrite ici pour l'induction d'une réponse immunitaire contre le CMV et l'utilisation de la composition décrite ici dans la fabrication d'un médicament destiné à l'induction d'une réponse immunitaire contre le CMV sont également fournies.
2. Complexes pentamères du CMV et séquences codantes A. Complexes pentamères du CMV
[0032] Dans un aspect, l'invention propose une cellule hôte de mammifère qui exprime le complexe pentamère du CMV, où ledit complexe pentamère comprend (i) la gH ou l'un de ses fragments formant un complexe, (ii) la gL ou l'un de ses fragments formant un complexe, (iii) la pUL128 ou l'un de ses fragments formant un complexe, (iv) la pUL130 ou l'un de ses fragments formant un complexe, et (v) la pUL131 ou l'un de ses fragments formant un complexe. Les séquences polynucléotidiques codant pour le complexe pentamère du CMV sont intégrées dans 1'ADN génomique de la cellule hôte, et, lorsqu'elles sont cultivées dans des conditions appropriées, ledit complexe pentamère du CMV est exprimé par ladite cellule hôte.
[0033] Dans certains modes de réalisation, ledit complexe pentamère est soluble. Le complexe pentamère soluble peut être obtenu, par exemple, en utilisant un fragment de la gH dans lequel le domaine transmembranaire de la sous-unité gH est délété, comme cela est décrit en détail ci-dessous.
[0034] Dans certains modes de réalisation, ledit complexe pentamère est sécrété à partir de la cellule hôte. Il a été rapporté que la présence des cinq sous-unités, gH, gL, pUL128, pUL131, et pUL131, est suffisante pour l'assemblage du complexe pentamère dans le RE avant son exportation vers l'appareil de Golgi. Voir, Ryckman et al., J Virol. Jan 2008; 82(1): 60-70. En variante ou en outre, un peptide signal approprié peut être utilisé dans une ou plusieurs des cinq sous-unités (par exemple, en fabriquant une protéine de fusion avec un signal sécrétoire) . Les séquences signal (et la cassette d'expression) pour la production de protéine sécrétoire sont connues dans l'art. En général, les peptides de tête ont une longueur de 5 à 30 acides aminés, et ils sont généralement présents à l'extrémité N-terminale d'une protéine nouvellement synthétisée. Le cœur du peptide signal contient généralement une longue séquence d'acides aminés hydrophobes qui a tendance à former une seule hélice alpha. En outre, de nombreux peptides signal débutent par une séquence d'acides aminés chargés positivement, qui peut aider à l'application de la topologie correcte du polypeptide durant la translocation. A la fin du peptide signal, il y a généralement une séquence d'acides aminés qui est reconnue et clivée par une signal peptidase. La signal peptidase peut cliver soit durant soit après la complétion de la translocation pour produire un peptide signal libre et une protéine mature.
[0035] La glycoprotéine H (gH) du CMV humain, codée par le gène UL75, est une glycoprotéine de virion qui est essentielle à l'infectivité et qui est conservée parmi les membres des alpha-, bêta- et gamma-herpèsvirus. Elle peut former un complexe stable avec la gL, et la formation de ce complexe facilite l'expression à la surface cellulaire de la gH. En se basant sur les structures cristallines des complexes gH/gL du HSV-2 et de 1'EBV, la sous-unité gL et les résidus N-terminaux de la gH forment un domaine globulaire à une extrémité de la structure (la « tête ») , qui est impliqué dans les interactions avec la gB et l'activation de la fusion membranaire. Le domaine C-terminal de la gH, proximal à la membrane virale (la « queue »), est également impliqué dans la fusion membranaire. La gH affiche des déterminants qui sont reconnus par le facteur de l'hôte TLR2, et elle interagit directement avec un hétérodimère formé entre les facteurs de l'hôte TLR2 et TLR1. Le TLR2 médie l'activation du NF-κΒ et les réponses des cytokines inflammatoires à partir des cellules.
[0036] La gH provenant de la souche du CMV Merlin est représentée par SEQ ID NO : 1 (GI: 52139248, 742 résidus d'acides aminés). La gH provenant de la souche du CMV Towne est représentée par SEQ ID NO : 2 (GI:138314, également 742 résidus d'acides aminés) . La gH de Towne a été caractérisée comme comportant : (i) six sites de N-glycosylation (au niveau des résidus 55, 62, 67, 192, 641 et 700) ; (ii) une séquence signal hydrophobe à son extrémité N-terminale (résidus d'acides aminés 1 à 23) ; (iii) un ectodomaine (résidus 24 à 717) qui se projette hors de la cellule dans l'espace extracellulaire ; (iv) un domaine transmembranaire (TM) hydrophobe (résidus 718 à 736) ; et (v) un domaine cytoplasmique C-terminal (résidus 737 à 742). SEQ ID NO : 2 partage 99 % et 96 % d'identité de séquence d'acides aminés avec SEQ ID NO : 1, et la gH provenant de la souche du CMV AD169 (GI:138313, SEQ ID NO : 3) , respectivement.
[0037] Généralement, la séquence signal N-terminale de la protéine gH pleine longueur est clivée par une signal peptidase de la cellule hôte pour produire une protéine gH mature. En tant que telle, à la protéine gH exprimée par la cellule hôte décrite ici, il peut manquer la séquence signal N-terminale (par exemple, la gH est codée par une séquence nucléotidique à laquelle il manque la séquence codant pour la séquence signal N-terminale).
[0038] Sont également englobés dans l'invention, des fragments formant un complexe de la gH, comme un fragment de la gH auquel il manque le domaine transmembranaire (TM) (par exemple, les résidus 718 à 736 de SEQ ID NO : 2), le domaine C-terminal (par exemple, les résidus 737 à 742 de SEQ ID NO : 2), la séquence signal N-terminale (par exemple, les résidus 1 à 23 de SEQ ID NO : 2), ou l'une de leurs combinaisons. Un fragment formant un complexe de la gH peut être toute partie ou portion de la protéine gH qui conserve la capacité de former un complexe avec une autre protéine du CMV. Dans certains modes de réalisation, un fragment formant un complexe de la gH forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131. Par exemple, l'expression de la séquence de la gH pleine longueur peut gêner la purification du complexe pentamère soluble parce que le domaine TM de la gH est hydrophobe. A la place, le complexe pentamère peut comprendre un fragment de la gH avec au moins une portion du domaine TM de la gH délétée.
[0039] Par exemple, un fragment de la gH comprenant la séquence signal N-terminale et 1'ectodomaine de la gH, mais pas le domaine TM, peut être utilisé. Un fragment approprié de la gH peut également comprendre une portion de 1'ectodomaine de la gH (par exemple, au moins environ 70 %, au moins environ 80 %, au moins environ 85 %, au moins environ 90 %, au moins environ 95 %, au moins environ 96 %, au moins environ 97 %, au moins environ 98 %, ou au moins environ 99 % de la séquence de 1 ' ectodomaine de la gH) , mais aucune, ou seulement une petite portion du domaine TM. En variante, au fragment de la gH décrit ici, il peut manquer entre 1 et 20 résidus d'acides aminés (par exemple 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 ou 20 résidus d'acides aminés, ou il manque 1 à 20 résidus, 1 à 15 résidus, 1 à 10 résidus, 2 à 20 résidus, 2 à 15 résidus, 2 à 10 résidus, 5 à 20 résidus, 5 à 15 résidus, ou 5 à 10 résidus) à l'extrémité N-terminale et/ou à l'extrémité C-terminale de 1'ectodomaine pleine longueur. On pense que les résidus au niveau des domaines C-terminaux ne sont pas nécessaires à l'immunogénicité. Un exemple de fragment approprié de la gH décrit ici est représenté par SEQ ID NO : 4, qui correspond aux résidus d'acides aminés 1 à 715 de SEQ ID NO : 1. Un autre exemple de fragment de la gH décrit ici est représenté par SEQ ID NO : 5, auquel il manque la séquence signal N-terminale, le domaine TM et le domaine C-terminal de la gH, et correspond aux résidus d'acides aminés 24 à 715 de SEQ ID NO : 1. Un autre exemple de fragment de la gH décrit comprend la séquence signal N-terminale entière et 1'ectodomaine, mais auquel il manque le domaine C-terminal.
[0040] L'ectodomaine de la gH correspond au domaine extracellulaire de la gH. La localisation et la longueur de 1 ' ectodomaine d'une gH (ou de l'un de ses homologues ou de ses variants) peuvent être prédites en se basant sur un alignement par paires de sa séquence avec les SEQ ID NO : 1, 2, 3, 4, ou 5, par exemple en alignant la séquence d'acides aminés d'une gH avec SEQ ID NO : 1, et en identifiant la séquence qui s'aligne avec les résidus 24 à 717 de SEQ ID NO : 1. De façon similaire, les localisations de la séquence signal, du domaine TM, et du domaine C-terminal peuvent être prédites en alignant la séquence d'acides aminés d'une gH avec les SEQ ID NO : 1, 2, 3, 4, ou 5, et en identifiant les séquences qui s'alignent avec les régions correspondantes (par exemple, les résidus 1 à 23 (séquence signal), 718 à 736 (TM) et 737 à 742 (domaine C-terminal) de SEQ ID NO : 1, respectivement). En variante, la localisation et la longueur de 1'ectodomaine, de la séquence signal, du domaine TM, et du domaine C-terminal peuvent être prédites en se basant sur une analyse informatique de l'hydrophobicité tout le long d'une séquence de gH donnée. La séquence signal et le domaine TM présentent les taux les plus élevés d'hydrophobicité et ces deux régions flanquent 1'ectodomaine, qui est moins hydrophobe.
[0041] Un fragment formant un complexe approprié de la gH peut être également obtenu ou déterminé par des tests classiques connus dans l'art, comme un test de coimmunoprécipitation, la réticulation, ou la co-localisation par coloration fluorescente, etc. Une SDS-PAGE ou une analyse Western blot peut être également utilisée (par exemple, en montrant que les cinq sous-unités sont présentes dans une électrophorèse sur gel). Dans certains modes de réalisation, le fragment formant un complexe de la gH (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, ou SEQ ID NO : 5 ; et/ou (iii) peut déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0042] D'autres protéines gH appropriées peuvent être des variants de la gH qui présentent divers degrés d'identité avec SEQ ID NO : 1, 2, 3, 4, ou 5, comme au moins identiques à 60 %, 70 %, 80 %, 85 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % ou 99 % avec la séquence citée dans SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, ou SEQ ID NO : 5. Dans certains modes de réalisation, les protéines variantes de la gH : (i) forment une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; (ii) comprennent au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, ou SEQ ID NO : 5 ; et/ou (iii) peuvent déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0043] La glycoprotéine L (gL) du CMV humain est codée par le gène UL115. On pense que la gL est essentielle à la réplication virale et toutes les propriétés fonctionnelles connues de la gL sont directement associées à sa dimérisation avec la gH. Le complexe gL/gH est nécessaire pour la fusion des membranes virale et plasmatique menant à la pénétration du virus dans les cellules hôtes. Il a été rapporté que la gL provenant de la souche du CMV Merlin (GI: 39842115, SEQ ID NO : 6) et de la souche du CMV Towne (GI: 239909463, SEQ ID NO : 7) a une longueur de 278 acides aminés. Il a été rapporté que la gL provenant de la souche du HCMV AD169 (GI: 2506510, SEQ ID NO : 8) a une longueur de 278 acides aminés, avec une séquence signal à son extrémité N-terminale (résidus d'acides aminés 1 à 35), deux sites de N-glycosylation (au niveau des résidus 74 et 114), et à laquelle il manque un domaine TM. La séquence signal N-terminale dans SEQ ID NO : 6 est prédite pour comprendre les résidus d'acides aminés 1 à 30. SEQ ID NO : 7 partage 98 % d'identité de séquence d'acides aminés avec SEQ ID NO : 6. Le séquençage du gène de la gL pleine longueur provenant de 22 à 39 isolats cliniques, ainsi que de souches de laboratoire AD169, Towne et Toledo a révélé moins de 2 % de variation dans les séquences d'acides aminés parmi les isolats.
[0044] Généralement, la séquence signal N-terminale de la protéine gL pleine longueur est clivée par un signal peptidase de la cellule hôte pour produire une protéine gL mature. En tant que telle, à la protéine gL exprimée par la cellule hôte décrite ici, il peut manquer la séquence signal N-terminale (par exemple, la gL est codée par une séquence nucléotidique à laquelle il manque la séquence codant pour la séquence signal N-terminale). Un exemple d'une gL à laquelle il manque la séquence signal est SEQ ID NO : 9, qui comprend les résidus d'acides aminés 31 à 278 de SEQ ID NO : 6, et à laquelle il manque une séquence signal N-terminale de SEQ ID NO : 6. La séquence signal d'autres protéines gL peut être déterminée par alignement des séquences ou des outils d'analyse des séquences tels que décrits ci-dessus.
[0045] Sont également englobés dans l'invention des fragments formant un complexe de la gL. Un fragment formant un complexe de la gL peut être toute partie ou portion de la protéine gL qui conserve la capacité de former un complexe avec une autre protéine du CMV. Dans certains modes de réalisation, un fragment formant un complexe de la gL forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131.
[0046] Un fragment formant un complexe approprié de la gL peut être obtenu ou déterminé par des tests classiques connus dans l'art, comme un test de co-immunoprécipitation, la réticulation, ou la co-localisation par coloration fluorescente, etc. Une SDS-PAGE ou une analyse Western blot peut être également utilisée (par exemple, en montrant que les cinq sous-unités sont présentes dans une électrophorèse sur gel) . Dans certains modes de réalisation, le fragment formant un complexe de la gL (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, ou SEQ ID NO : 9 ; et/ou (iii) peut déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0047] D'autres protéines gL appropriées peuvent être des variants de la gL (et des fragments de variants) qui présentent divers degrés d'identité avec SEQ ID NO : 6, 7, 8, ou 9, comme au moins identiques à 60 %, 70 %, 80 %, 85 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % ou 99 % avec la séquence citée par SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, ou SEQ ID NO : 9. Dans certains modes de réalisation, les protéines variantes de la gL : (i) forment une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; (ii) comprennent au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, ou SEQ ID NO : 9 ; et/ou (iii) peuvent déclencher des anticorps in vivo présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0048] Il a été rapporté que la pUL128 provenant de la souche du CMV humain Merlin (GI: 39842124, SEQ ID NO : 10) comporte 130 résidus d'acides aminés, et avec 1 substitution de nucléotide provoquant une terminaison prématurée. Il a été rapporté que la pUL128 provenant des souches du CMV humain Towne (GI: 39841882, SEQ ID NO : 11) et AD169 (GI: 59803078, SEQ ID NO : 12) comporte 171 résidus d'acides aminés. SEQ ID NO : 10 et 12 partagent plus de 99 % d'identité de séquence sur la pleine longueur de SEQ ID NO : 10 ; toutefois, à cause de la terminaison prématurée de la traduction, SEQ ID NO : 10 ne comporte pas les 41 résidus d'acides aminés C-terminaux de SEQ ID NO : 12 (environ 75 % d'identité de séquence sur la pleine longueur de SEQ ID NO : 12).
[0049] Il est prédit que la pULl28 comporte une séquence signal N-terminale, qui est localisée au niveau des résidus 1 à 27 de SEQ ID NO : 10, mais il est prédit qu'il lui manque un domaine TM. La séquence signal N-terminale de la protéine pULl28 pleine longueur peut être clivée par une signal peptidase de la cellule hôte pour produire une protéine pUL128 mature. En tant que telle, à la protéine pUL128 exprimée par la cellule hôte décrite ici, il peut manquer la séquence signal N-terminale (par exemple, la pUL128 est codée par une séquence nucléotidique à laquelle il manque la séquence codant pour la séquence signal N-terminale). Un exemple d'une protéine pULl28 mature est SEQ ID NO : 13, à laquelle il manque une séquence signal N-terminale et qui correspond aux résidus d'acides aminés 28 à 171 de SEQ ID NO : 11. SEQ ID NO : 13 correspond également aux acides aminés 28 à 171 de SEQ ID NO : 12.
[0050] Sont également englobés dans l'invention des fragments formant un complexe de la pUL128. Un fragment formant un complexe de la pUL128 peut être toute partie ou portion de la protéine pUL128 qui conserve la capacité de former un complexe avec une autre protéine du CMV. Dans certains modes de réalisation, un fragment formant un complexe de la pUL128 forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131.
[0051] Un fragment formant un complexe approprié de la pUL128 peut être obtenu ou déterminé par des tests classiques connus dans l'art, comme un test de co-immunoprécipitation, la réticulation, ou la co-localisation par coloration fluorescente, etc. Une SDS-PAGE ou une analyse Western blot peut être également utilisée (par exemple, en montrant que les cinq sous-unités sont présentes dans une électrophorèse sur gel) . Dans certains modes de réalisation, le fragment formant un complexe de la pUL128 (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pULl30/pUL131 ; (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, ou SEQ ID NO : 13 ; et/ou (iii) peut déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0052] D'autres protéines pUL128 appropriées peuvent être des variants de la pUL128 (et des fragments de variants) qui présentent divers degrés d'identité avec SEQ ID NO : 10, 11, 12, ou 13, comme au moins identiques à 60 %, 70 %, 80 %, 85 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % ou 99 % avec la séquence citée par SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, ou SEQ ID NO : 13. Dans certains modes de réalisation, les protéines variantes de la pUL128 : (i) forment une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; (ii) comprennent au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, ou SEQ ID NO : 13 ; et/ou (iii) peuvent déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0053] UL130 est le gène central et le plus grand (214 codons) du locus UL131A-128. La traduction conceptuelle du gène prédit une longue séquence signal N-terminale (25 acides aminés) qui précède une protéine hydrophile, avec deux sites potentiels de N-glycosylation (Asn85 et Asnll8) au sein d'un domaine de chimiokine putatif (acides aminés 46 à 120), et un site supplémentaire de N-glycosylation (Asn201) proche de l'extrémité d'une région C-terminale unique. Il est prédit qu'à la pUL130 il manque un domaine TM. Il a été rapporté qu'il s'agit d'une glycoprotéine luminale qui est sécrétée de façon inefficace à partir de cellules infectées mais qui est incorporée dans l'enveloppe du virion sous une forme mature après passage dans l'appareil de Golgi. Les séquences de la pUL130 provenant des souches du CMV humain Merlin et Towne sont disponibles au public (GI: 39842125, SEQ ID NO : 14, 214 résidus d'acides aminés ; et GI : 239909473, SEQ ID NO : 15, 229 résidus d'acides aminés, respectivement) . Il a été rapporté que SEQ ID NO : 15 contient une mutation de décalage du cadre dans la région C-terminale de la pUL130, et elle partage 94 % d'identité avec la SEQ ID NO : 14 du HCMV sur la pleine longueur de SEQ ID NO : 14.
[0054] La séquence signal N-terminale de la protéine pUL130 pleine longueur peut être clivée par une signal peptidase de la cellule hôte pour produire une protéine pUL130 mature. En tant que telle, à la protéine pUL130 exprimée par la cellule hôte décrite ici, il peut manquer la séquence signal N-terminale (par exemple, la pUL130 est codée par une séquence nucléotidique à laquelle il manque la séquence codant pour la séquence signal N-terminale). Un exemple d'une protéine pULl30 mature est SEQ ID NO : 16, à laquelle il manque une séquence signal N-terminale, et qui correspond aux résidus d'acides aminés 26 à 214 de SEQ ID NO : 14.
[0055] Sont également englobés dans l'invention des fragments formant un complexe de la pUL130. Un fragment formant un complexe de la pUL130 peut être toute partie ou portion de la protéine pUL130 qui conserve la capacité de former un complexe avec une autre protéine du CMV. Dans certains modes de réalisation, un fragment formant un complexe de la pUL130 forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131.
[0056] Un fragment formant un complexe approprié de la pUL30 peut être obtenu ou déterminé par des tests classiques connus dans l'art, comme un test de co-immunoprécipitation, la réticulation, ou la co-localisation par coloration fluorescente, etc. Une SDS-PAGE ou une analyse Western blot peut être également utilisée (par exemple, en montrant que les cinq sous-unités sont présentes dans une électrophorèse sur gel) . Dans certains modes de réalisation, le fragment formant un complexe de la pUL130 (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pULl28/pUL130/pUL131 ; (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, ou SEQ ID NO : 16 ; et/ou (iii) peut déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0057] D'autres protéines pUL130 appropriées peuvent être des variants de la pUL130 (et des fragments de variants) qui présentent divers degrés d'identité avec SEQ ID NO : 14, 15, ou 16, comme au moins identiques à 60 %, 70 %, 80 %, 85 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % ou 99 % avec la séquence citée dans SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, ou SEQ ID NO : 16. Dans certains modes de réalisation, les protéines variantes de la pUL130 : (i) forment une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; (ii) comprennent au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, ou SEQ ID NO : 16 ; et/ou (iii) peuvent déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0058] La fonction de la pUL131A est requise pour la réplication du CMV humain non seulement dans les cellules endothéliales mais également dans les cellules épithéliales. Il a été rapporté la pUL131A provenant des souches du CMV humain Merlin (GI: 39842126, SEQ ID NO : 17, 129 acides aminés) et Towne (GI: 239909474, SEQ ID NO : 18, 129 acides aminés) et AD169 (GI: 219879712, SEQ ID NO : 19, 76 acides aminés). Il est prédit que la PUL131A contienne une séquence signal N-terminale, qui est localisée au niveau des résidus 1 à 18 de SEQ ID NO : 18, et à laquelle il manque un domaine TM. Il a été rapporté que la pUL131A provenant de la souche AD169 contient une insertion de 1 paire de bases, qui provoque un décalage du cadre. SEQ ID NO : 17 est identique à 96 % avec SEQ ID NO : 19 sur les 28 acides aminés N-terminaux, mais elle est seulement identique à 36 % avec SEQ ID NO : 19 sur la pleine longueur de SEQ ID NO : 17, à cause du décalage du cadre dans le gène UL131A de AD169.
[0059] La séquence signal N-terminale de la protéine pUL131 pleine longueur peut être clivée par une signal peptidase de la cellule hôte pour produire une protéine pUL131 mature. En tant que telle, à la protéine pUL131 exprimée par la cellule hôte décrite ici il peut manquer la séquence signal N-terminale (par exemple, la pUL131 est codée par une séquence nucléotidique à laquelle il manque la séquence codant pour la séquence signal N-terminale) . Un exemple de protéine pUL130 mature est SEQ ID NO : 20, à laquelle il manque une séquence signal N-terminale et qui correspond aux résidus d'acides aminés 19 à 129 de SEQ ID NO : 17. SEQ ID NO : 35 correspond également aux résidus d'acides aminés 19 à 129 de SEQ ID NO : 18.
[0060] Sont également englobés dans l'invention des fragments formant un complexe de la pUL131. Un fragment formant un complexe de la pUL131 peut être toute partie ou portion de la protéine pUL131 qui conserve la capacité de former un complexe avec une autre protéine du CMV. Dans certains modes de réalisation, un fragment formant un complexe de la pUL131 forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131.
[0061] Un fragment formant un complexe approprié de la pUL31 peut être obtenu ou déterminé par des tests classiques connus dans l'art, comme un test de co-immunoprécipitation, la réticulation, ou la co-localisation par coloration fluorescente, etc. Une SDS-PAGE ou une analyse Western blot peut être également utilisée (par exemple, en montrant que les cinq sous-unités sont présentes dans une électrophorèse sur gel) . Dans certains modes de réalisation, le fragment formant un complexe de la pUL131 (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pULl28/pUL130/pUL131 ; (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, ou SEQ ID NO : 20 ; et/ou (iii) peut déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0062] D'autres protéines pUL131 appropriées peuvent être des variants de la pUL131 (et des fragments de variants) qui présentent divers degrés d'identité avec SEQ ID NO : 17, 18, 19, ou 20, comme au moins identiques à 60 %, 70 %, 80 %, 85 %, 90 %, 91 %, 92 %, 93 %, 94 %, 95 %, 96 %, 97 %, 98 % ou 99 % avec la séquence citée dans SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, ou SEQ ID NO : 20. Dans certains modes de réalisation, les protéines variantes de la pUL131 : (i) forment une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; (ii) comprennent au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, ou SEQ ID NO : 20 ; et/ou (iii) peuvent déclencher des anticorps in vivo qui présentent une réactivité croisée immunologique avec un virion du CMV.
[0063] Dans certains modes de réalisation, les gH, gL, pUL128, pUL130, pUL131 (ou l'un de leurs fragments) décrites ici peuvent contenir des résidus d'acides aminés supplémentaires, comme des extensions N-terminales ou C-terminales. De telles extensions peuvent comprendre un ou plusieurs marqueurs, qui peuvent faciliter la détection (par exemple, un marqueur épitopique pour la détection par des anticorps monoclonaux) et/ou la purification (par exemple, un marqueur polyhistidine pour permettre la purification sur une résine chélatrice de nickel) des protéines. Les exemples de marqueurs pour la purification par affinité comprennent, par exemple, le marqueur His (hexahistidine (SEQ ID NO : 36), se lie aux ions métalliques), la protéine de liaison du maltose (MBP) (se lie à l'amylose), la glutathion-S-transférase (GST) (se lie au glutathion), le marqueur FLAG (Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys (SEQ ID NO : 37), se lie à un anticorps anti-flag), le marqueur Strep (Ala-Trp-Arg-His-Pro-Gln-Phe-Gly-Gly (SEQ ID NO : 38), ou Trp-Ser- His-Pro-Gln-Phe-Glu-Lys (SEQ ID NO : 39), se lient à la streptavidine ou l'un de ses dérivés).
[0064] Dans un certain mode de réalisation, des lieurs clivables peuvent être utilisés. Ceci permet de séparer le marqueur du complexe purifié, par exemple par l'addition d'un agent capable de cliver le lieur. Un certain nombre de lieurs clivables différents sont connus de l'homme du métier. De tels lieurs peuvent être clivés, par exemple, par irradiation d'une liaison photolabile ou hydrolyse catalysée par un acide. Il existe également des lieurs polypeptidiques qui incorporent un site de reconnaissance de protéase et qui peuvent être clivés par l'addition d'une enzyme protéase appropriée.
[0065] Dans d'autres modes de réalisation, il peut être souhaitable d’avoir les protéines gH, gL, pULl28, pUL130, pULl31 (ou l’un de leurs fragments) qui ne comprennent pas de séquence marqueur exogène, par exemple, pour des raisons de sécurité clinique ou d’efficacité.
[0066] Bien qu’il soit parfois fait référence aux protéines gH, gL, pUL130 comme à des glycoprotéines, cette nomenclature ne devra pas être prise comme signifiant que ces protéines doivent être glycosylées lorsqu'elles sont utilisées avec l’invention. Alors qu'il a été fait référence ci-dessus à des souches spécifiques, il faudra comprendre que les protéines du CMV gH, gL, pUL128, pUL130, pUL131 (ou leurs fragments) de souches différentes du CMV peuvent être utilisées. A titre d’exemple non limitatif, les autres souches du CMV peuvent comprendre les souches Towne, Toledo, AD169, Merlin, TB20, et VR1814.
B. Acide nucléique codant pour les protéines et les complexes du CMV
[0067] Sont également proposés ici des acides nucléiques codant pour les protéines et les complexes du CMV pour une intégration génomique, et l’expression subséquente du pentamère du CMV.
[0068] Une ou plusieurs constructions d’acide nucléique codant pour les protéines et les complexes du CMV décrits ici peuvent être utilisées pour une intégration génomique. Par exemple, une seule construction d’acide nucléique codant pour les cinq sous-unités, gH, gL, pUL128, pUL130, pUL131 (ou leurs fragments), peut être introduit dans une cellule hôte. En variante, les séquences codant pour les cinq sous-unités (ou leurs fragments) peuvent être portées par deux constructions d’acide nucléique ou plus, qui sont ensuite introduites dans la cellule hôte simultanément ou séquentiellement.
[0069] Par exemple, dans un exemple de mode de réalisation, l'invention propose une seule construction d'acide nucléique codant pour : 1'ectodomaine des gH, gL, pUL128, pUL130, et pUL131. Dans un autre exemple de mode de réalisation, l'invention propose deux constructions d'acide nucléique codant pour : 1'ectodomaine des gH, gL, pUL128, pUL130, et pUL131. Voir, figure 1. Dans les deux exemples, il a été obtenu une intégration génomique couronnée de succès.
[0070] La construction d'acide nucléique peut comprendre de l'ADN génomique qui comprend un ou plusieurs introns, ou de l'ADNc. Certains gènes sont exprimés plus efficacement lorsque des introns sont présents. La séquence génomique native codant pour la pUL128 comprend deux introns, la séquence génomique native codant pour la pUL131 comprend un exon, tandis que la séquence génomique native codant pour la pUL130 ne comprend aucun intron. La séquence génomique native codant pour la pUL128 comprend trois exons, la séquence génomique native codant pour la pUL131 comprend deux exons, et la séquence génomique native codant pour la pUL130 comprend un exon. En particulier, la séquence d'acide nucléique est appropriée pour l'expression de polypeptides exogènes dans ladite cellule de mammifère.
[0071] Sont également proposés ici, des vecteurs qui comprennent des séquences codant pour les gH, gL, pULl28, pUL130, et/ou pUL131 (ou l'un de leurs fragments). Les exemples de vecteurs comprennent des plasmides qui sont capables de se répliquer de façon autonome ou d'être répliqués dans une cellule de mammifère. Les vecteurs d'expression types contiennent des promoteurs, des amplificateurs, et des terminateurs appropriés qui sont utiles pour la régulation de l'expression de la ou des séquences codantes dans la construction d'expression. Les vecteurs peuvent également comprendre des marqueurs de sélection pour fournir un trait phénotypique pour la sélection des cellules hôtes transformées (comme la transmission d'une résistance à des antibiotiques tels que l'ampicilline ou la néomycine).
[0072] Les promoteurs appropriés comprennent, par exemple, le promoteur du CMV, un adénovirus, EFla, le promoteur de la GAPDH métallothionéine, le promoteur précoce du SV-40, le promoteur tardif du SV-40, le promoteur du virus de la tumeur mammaire de la souris, le promoteur du virus du sarcome de Rous, le promoteur de la polyhédrine, etc. Les promoteurs peuvent être constitutifs ou inductibles. Un ou plusieurs vecteurs peuvent être utilisés (par exemple, un vecteur codant pour les cinq sous-unités ou des fragments de celles-ci, ou deux vecteurs ou plus ensemble codant pour les cinq sous-unités ou des fragments de celles-ci) ; voir, par exemple, la figure 1.
[0073] Lorsque la cellule hôte est une cellule CHO, le promoteur, l'amplificateur, ou le terminateur est actif dans les cellules CHO. Un promoteur fréquemment utilisé est le promoteur pour le gène immédiat précoce (IE) du cytomégalovirus humain (hCMV). Le promoteur de ce gène dirige des taux élevés d'expression de transgène dans une large diversité de types cellulaires. L'activité de ce promoteur dépend d'une série de répétitions imparfaites de 17, 18, 19, et 21 pb, dont certaines lient des facteurs de transcription des familles de la protéine de liaison sensible à l'AMPc (CREB) NF-κΒ et du facteur nucléaire 1.
[0074] Un promoteur fort est un promoteur qui provoque l'initiation des ARNm à une fréquence élevée égale ou supérieure à celle du fragment promoteur/amplificateur central du hCMV (décrit dans le brevet US No. 5 168 062) dans une cellule CHO. Un tel promoteur peut être un promoteur fort dépendant du type cellulaire, comme ceux décrits dans le brevet US No. 5 589 392, ou un promoteur fort actif de façon ubiquitaire. Les exemples de promoteurs viraux actifs de façon constitutive comprennent, par exemple, les promoteurs précoce et tardif du virus SV40, le promoteur immédiat précoce du cytomégalovirus humain (hCMV) ou du cytomégalovirus murin (mCMV), le promoteur de la thymidine kinase (TK) ou le virus Herpes Simplex, ou le promoteur des longues répétitions terminales du virus du sarcome de Rous (RS-LTR). D'autres exemples comprennent, par exemple, le promoteur MIE du hCMV tel que défini par le fragment Pst I de 2,1 kb décrit dans le brevet US No. 5 385 839 et/ou dans le document EP-323 997-A1 ou une partie fonctionnelle de celui-ci possédant une activité de promoteur.
[0075] Des séquences de sites internes d'entrée du ribosome (1RES) et de peptide 2A peuvent être également utilisées. Les 1RES et peptide 2A fournissent des variantes d'approches pour la coexpression de séquences multiples. 1RES est une séquence nucléotidique qui permet l'initiation de la traduction dans le milieu de la séquence d'un ARN messager (ARNm) faisant partie du plus grand processus de synthèse des protéines. Habituellement, chez les eucaryotes, la traduction peut être initiée uniquement à l'extrémité 5' de la molécule d'ARNm. Les éléments 1RES permettent l'expression de gènes multiples dans un transcrit. Des vecteurs polycistroniques à base d'IRES, qui expriment des protéines multiples à partir d'un transcrit, peuvent réduire l'échappement des clones non exprimant de la sélection.
[0076] Le peptide 2A permet la traduction de protéines multiples dans un seul cadre de lecture ouvert dans une polyprotéine qui est ensuite clivée en protéines individuelles par l'intermédiaire d'un mécanisme de saut ribosomique. Le peptide 2A peut fournir une expression plus équilibrée de multiples produits protéiniques.
[0077] Les exemples de séquences d'IRES comprennent, par exemple, les 1RES de l'EV71, les 1RES de 1'EMCV, les 1RES DU VHC .
[0078] Pour l'intégration génomique, l'intégration peut être spécifique du site ou aléatoire. Une recombinaison spécifique du site peut être obtenue par introduction d'une ou de plusieurs séquences homologues dans les constructions d'acide nucléique décrites ici. Une telle séquence homologue correspond potentiellement à la séquence endogène au niveau d'un site cible spécifique dans le génome de l'hôte. En variante, une intégration aléatoire peut être utilisée. Parfois, le taux d'expression d'une protéine peut varier selon le site d'intégration. Par conséquent, il peut être souhaitable de sélectionner un certain nombre de clones selon le taux d'expression de la protéine recombinante pour identifier un clone qui atteint le taux d'expression souhaité. 3. Cellules hôtes [0079] Dans un autre aspect, l'invention propose des cellules hôtes dans lesquelles les séquences codant pour le pentamère sont intégrées de façon stable dans le génome des cellules hôtes, et, lorsqu'elles sont cultivées dans des conditions appropriées, elles expriment le pentamère du CMV tel que divulgué ici. Dans certains modes de réalisation, la cellule hôte est une cellule de mammifère. Dans certains modes de réalisation, la cellule hôte est une cellule de rongeur.
[0080] Les exemples de lignées cellulaires de rongeurs comprennent par exemple, les lignées cellulaires de rein du hamster bébé (BHK) (par exemple, BHK21, BH TK), de Sertoli de souris (TM4), de foie du rat buffalo (BRL 3A) , de tumeur mammaire de la souris (MMT), d'hépatome du rat (HTC), de myélome de la souris (NSO), d'hybridome murin (Sp2/0), de thymome de la souris (EL4), d'ovaire du hamster de Chine (CHO) et des dérivés des cellules CHO, embryonnaires murines (NIH/3T3, 3T3 Li), myocardiques du rat (H9c2), de myoblastes de la souris (C2C12), et de rein de la souris (miMCD-3).
[0081] Dans un mode de réalisation, la cellule de rongeur est une cellule CHO. Les cellules CHO appropriées comprennent, par exemple, les lignées DUXB11 et DG44. Ces deux lignées cellulaires sont déficientes en activité dihydrofolate réductase (DHFR), et par conséquent dépendantes d'une source exogène de précurseurs nucléotidiques pour leur croissance. La déficience en DHFR est un phénotype facilement manipulé approprié pour sélectionner l'intégration génomique et l'expression stable d'ADN exogène. L'intégration génomique est accomplie par transfection des cellules avec des cassettes d'expression pour le gène d'intérêt et un gène DHFR. Après la transfection, les cellules sont placées dans un milieu de sélection auquel il manque les précurseurs nucléotidiques.
[0082] L' expression de protéines de recombinaison dans des lignées cellulaires déficientes en DHFR peut être en outre amplifiée par l'addition de méthotrexate (MTX) aux cultures, de telle façon qu'il est possible de sélectionner un nombre élevé de copies du vecteur d'expression introduit. Le MTX est un inhibiteur compétitif de l'enzyme DHFR. L'application de cette pression de sélection supplémentaire en plus de l'absence des précurseurs nucléotidiques permet la sélection et l'isolement de la population mineure de cellules qui ont subi une amplification spontanée du vecteur d'expression intégré contenant le marqueur sélectionnable DHFR et, dans la plupart des cas, le gène d'intérêt. La présence de copies multiples du gène permet d'obtenir un taux élevé d'expression des protéines exogènes. En variante, la sélection par le MTX peut être réalisée indépendamment de la déficience en DHFR (c'est-à-dire, l'utilisation de MTX pour sélectionner une cellule hôte qui est à l'origine compétente en DHFR), comme cela est exemplifié dans les exemples divulgués ici.
[0083] Une autre lignée cellulaire CHO appropriée est la lignée cellulaire CHO-K1 de type sauvage, et son dérivé CHO-K1SV.
[0084] Un procédé de sélection couramment utilisé pour les lignées cellulaires CHO-K1 consiste en la sélection par la glutamine synthétase (GS) . En l'absence d'une source exogène de glutamine, la survie cellulaire dépend de l'enzyme GS pour produire la glutamine. Avec des lignées de cellules hôtes telles que les cellules NS/0 dérivées de myélome murin et les cellules CHO, qui présentent une activité enzymatique GS endogène relativement basse, le procédé permet un schéma de sélection simple lors de l'utilisation d'un marqueur sélectionnable GS dans le vecteur d'expression et d'un milieu de sélection dépourvu de glutamine. Similaire au système DHFR/MTX, l'inhibiteur compétitif de la GS, le méthionine sulfoximine (MSX) peut être ajouté au milieu pour appliquer une pression supplémentaire et sélectionner les cellules CHO qui dirigent des taux élevés d'expression à partir du vecteur intégré.
[0085] Les cellules CHO-K1, ou toutes autres cellules CHO couramment utilisées, peuvent être également sélectionnées en se basant sur la déficience en DHFR comme il a été décrit ci-dessus. Par exemple, une cellule CH0-K1, ou tout autre type de cellule CHO, peut présenter une déficience en DHFR, comme une délétion dans laquelle au moins une copie de la séquence génomique du gène de la dihydrofdate réductase (DHFR) , ou au moins 30 % (par exemple, au moins 40 %, au moins 50 %, au moins 60 %, au moins 70 %, au moins 80 %, au moins 90 %, ou 100 %) de la séquence codante dudit gène DHFR, est délétée. D'autres moyens pour introduire une déficience en DHFR comprennent la création de mutations dans le gène DHFR endogène. Les lignées cellulaires peuvent être en outre amplifiées par l'addition de méthotrexate (MTX) aux cultures comme il a été décrit ci-dessus.
[0086] Les cellules CHO-K1, ou toutes autres cellules CHO couramment utilisées, peuvent être également sélectionnées en se basant sur le MTX, avec ou sans déficience en DHFR. Dans les exemples fournis ici, les cellules CHO ont été sélectionnées en se basant sur le MTX, sans déficience en DHFR (c'est-à-dire que la cellule CHO d'origine utilisée pour l'intégration génomique est compétente pour la DHFR). Dans un tel système, généralement, le nombre de copies des séquences exogènes (par exemple, les séquences codant pour les protéines du CMV) est généralement bas. Il est estimé que les lignées cellulaires dans les exemples décrits ici comportent environ 1 à 10 copies des séquences exogènes codant pour les protéines du CMV, au niveau d'un nombre très limité de sites d'intégration (par exemple, 1 ou 2 sites d'intégration). En général, lorsqu'une lignée cellulaire déficiente en DFHR est utilisée, le nombre de copies des séquences exogènes est généralement de beaucoup supérieur, parfois aussi élevé que quelques centaines de copies. On s'attend à ce que les deux procédés soient appropriés pour la production des lignées cellulaires CHO divulguées ici, bien que lorsque le nombre de copies est élevé, la cellule hôte puisse perdre une ou plusieurs copies des séquences exogènes durant le repiquage et/ou l'expansion de la lignée cellulaire.
[0087] D'autres souches des cellules CHO appropriées pour l'invention décrite ici comprennent, par exemple, des cellules CHO-ICAM-1, et des cellules CHO-hIFNy. Ces cellules génétiquement modifiées permettent une insertion stable d'ADN recombinant dans un gène spécifique ou une région d'expression des cellules, l'amplification de l'ADN inséré, et la sélection des cellules présentant un taux élevé d'expression de la protéine recombinante.
[0088] Les exemples de lignées cellulaires CHO disponibles à 1'European Collection of Cell Cultures (ECACC) sont énumérés dans le tableau 1. Toutes les cellules CHO énumérées dans le tableau 1 peuvent être utilisées.
Tableau 1
[0089] Diverses lignées cellulaires CHO sont également disponibles auprès de 1'American Type Culture Collection (ATCC), comme les lignées cellulaires CHO hCBEll (ATCC® PTA-3357™), E77.4 (ATCC® PTA-3765™), hLT-B : R-hGl CHO No. 14 (ATCC® CRL-11965™), MOR-CHO- MORAb-003-RCB (ATCC® PTA-7552™),
AQ.C2 clone 11B (ATCO® PTA-3274™) , AQ.C2 clone 11B (ATCO® PTA-327 4™) , hsAQC2 dans CHO-DG44 (ATCC® PTA-3356™) , xrs5 (ATCO® CRL-2348™), CH0-K1 (ATCC® CCL-61™), Lecl [nommée à l'origine Pro-5WgaRI3C] (ATCC® CRL-1735™), Pro-5 (ATCODCRL-1781™), ACY1-E (ATCC® 65421™), ACY1-E (ATCC® 65420™), pgsE-606 (ATCC® CRL-2 246™) , CHO-CD36 (ATCC® CRL-2092™), pgsC-605 (ATCC® CRL-2245™), MC2/3 (ATCC® CRL-2143™), CHO-ICAM-1 (ATCC® CRL-2093™), et pgsB-618 (ATCC® CRL-2241™). L’une quelconque de ces lignées cellulaires CHO peut être utilisée.
[0090] D'autres lignées cellulaires CHO disponibles dans le commerce comprennent, par exemple, les cellules FreeStyle™ CHO-S et la lignée cellulaire Flp-In™-CHO de Life Technologies.
[0091] Des procédés pour exprimer des protéines recombinantes dans des cellules CHO en général ont été divulgués. Voir, par exemple, dans les brevets US No. 4 816 567 et No. 5 981 214.
[0092] En plus des cellules CHO, d'autres cellules de mammifères peuvent être également utilisées en tant qu'hôtes. Les exemples de cellules de rongeurs comprennent des cellules BHK21, des cellules NSO, des cellules Sp2/0, des cellules EL4, des cellules NIH/3T3, des cellules 3T3-L1, des cellules ES-D3, des cellules H9c2, des cellules C2C12, YB2/0, des cellules mimcd 3, etc. Les exemples de cellules humaines comprennent : des cellules SH-SY5Y, des cellules IM 32, des cellules LAN, des cellules MCFIOA, des cellules 293T, des cellules SK-BR3, des cellules huvec, des cellules huasmc, des cellules HKB-1, des cellules hmsc, des cellules U293, des cellules HE 293, des cellules PERC6®, des cellules Jurkai, des cellules HT-29, des cellules Incap.FGC, des cellules A549, des cellules MDA MB453, des cellules hepg2, des cellules THP-1, des cellules bxpc-3, des cellules Capan-1, des cellules DU145, et des cellules PC-3.
[0093] Par exemple, la lignée cellulaire PERC6®, les cellules NSO de myélome de souris, les cellules de rat de hamster bébé (BHK), et la lignée cellulaire de rein embryonnaire humain (HEK293) ont reçu une approbation réglementaire pour la production de protéines recombinantes.
[0094] Les exemples de lignées cellulaires de primates non humains utiles dans des procédés fournis ici comprennent les lignées cellulaires de rein de singe (CVI-76), de rein de singe vert d'Afrique (VERO-76), de fibroblastes de singe vert (COS-1), et des cellules de rein de singe (CVI) transformées par le SV40 (COS-7). D'autres lignées cellulaires de mammifères sont connues d'une personne ayant des compétences moyennes dans le domaine et sont cataloguées à 1'American Type Culture Collection (Manassas, VA).
[0095] Dans certains modes de réalisation, les cellules hôtes sont appropriées pour une croissance dans des cultures en suspension. Les cellules hôtes compétentes en suspension sont généralement monodispersées ou se développent en agrégats lâches sans agrégation substantielle. Les cellules hôtes compétentes en suspension comprennent des cellules qui sont appropriées pour une culture en suspension sans adaptation ni manipulation (par exemple, des cellules hématopoïétiques, des cellules lymphoïdes) et des cellules qui ont été rendues compétentes en suspension par modification ou adaptation de cellules dépendantes de la fixation (par exemple, des cellules épithéliales, des fibroblastes).
[0096] Dans certains modes de réalisation, la cellule hôte est une cellule dépendante de la fixation qui est cultivée et maintenue dans une culture adhérente. Les exemples de lignées cellulaires adhérentes humaines utiles dans des procédés fournis ici comprennent les lignées cellulaires de neuroblastome humain (SH-SY5 Y, IMR32, et LANS), de carcinome du col de l'utérus humain (HeLa) , de l'épithélium de sein humain (MCFIOA), de rein embryonnaire humain (293T), et de carcinome du sein humain (SK-BR3). Gènes C12orf35 et protéines C12orf35 [0097] Dans certains modes de réalisation, la cellule hôte est une cellule dans laquelle le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 est réduit, comparativement à un témoin. Dans un certain mode de réalisation, une telle cellule est une cellule CHO. La demande de brevet US provisoire No. 61/919 313, déposée le 20 décembre 2013, et incorporée ici en référence, fournit une description détaillée de cellules de mammifères dans lesquelles le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 est réduit comparativement à un témoin.
[0098] Divers témoins peuvent être utilisés. Le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 à partir d'une cellule de type sauvage correspondante peut être utilisé en tant que témoin. En variante, un témoin peut être un taux prédéterminé ou un taux seuil qui peut être identifié dans la littérature ou une base de données.
[0099] Le gène C12orf35 humain se rapporte à la séquence nucléotidique codant pour le cadre de lecture ouvert 35 du chromosome 12. La protéine C12orf35 codée n'est pas caractérisée. On pense que l'homologue chez Cricetulus griseus (hamster de Chine) du gène C12orf35 humain, nommé Kiaal551, est localisé sur le chromosome 8. On pense que l'homologue chez Mus musculus du gène C12orf35 humain est localisé sur le chromosome 6. L'ID de gène pour le gène CHO C12orf35 est publié comme l'ID de gène GenBank No. 100762086 ; et pour le gène C12orf35 humain, il est publié comme l'ID de gène GenBank No. 55196. Les informations concernant le gène C12orf35 chez Cricetulus griseus, la séquence codante et la protéine C12orf35 prédite sont également disponibles à la GenBank par le numéro d'accession NCBI : XM_003512865.
[0100] Le gène C12orf35 est exprimé de façon endogène dans des cellules eucaryotes telles que, par exemple, d'espèces de mammifères comme l'être humain, la souris et le hamster. La protéine prédite codée par le gène C12orf35 est une grosse protéine dépassant 1500 résidus. La liste des séquences présente des exemples de séquences d'acides aminés ou de séquences d'acides aminés putatives de la protéine codée par le gène C12orf35 endogène de différentes espèces de mammifères comme le hamster (SEQ ID NO : 21 et 22), l'être humain (SEQ ID NO : 23 et 24), et la souris (SEQ ID NO : 35). La CDS (séquence d'ADN codante) de C12orf35 du hamster de Chine est représentée par SEQ ID NO : 25. En outre, une section de l'UTR en 5' (voir SEQ ID NO : 26) et de l'UTR en 3' (voir SEQ ID NO : 27) de l'ARNm de C12orf35 du hamster de Chine a été séquencée.
[0101] Chez l'être humain, le gène C12orf35 est également appelé KIAA1551. Le gène C12orf35 est également appelé de type C12orf35 ou homologue de C12orf35 chez le hamster ou 2810474O19Rik chez la souris. Différents noms peuvent être alloués dans différentes espèces pour la protéine ou le gène et des variantes non limitantes de noms (alias) sont également énumérées ci-dessus dans le tableau 2. Pour simplifier, dans cette divulgation, les homologues et les orthologues de différentes espèces sont tous appelés « gène C12orf35 » ou « protéine C12orf35 ».
[0102] A 1' encontre de ce contexte scientifique, il est surprenant et inattendu que lorsque le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 est réduit comparativement à un témoin (par exemple, par délétion du gène Cl2orf35, ou par introduction de mutations), le rendement de la protéine recombinante est significativement amélioré. En tant que telles, des cellules hôtes de mammifères (par exemple, des cellules CHO) avec un taux d'expression ou une activité réduit de la protéine C12orf35 sont particulièrement appropriées pour la production recombinante du complexe pentamère.
[0103] La réduction du taux d'expression ou de l'activité d'une protéine C12orf35 peut être obtenue par divers moyens. Par exemple, le taux d'expression ou l'activité d'une protéine C12orf35 peut être réduit par inactivation de gène, mutation de gène, délétion de gène, silençage de gène, ou une combinaison quelconque des précédents. L'inactivation de gène est une technique génétique par laquelle un gène est rendu inopérant par perturbation de sa fonction. Par exemple, un acide nucléique peut être inséré dans la séquence codante, perturbant de cette façon la fonction du gène. En outre, le gène C12orf35 pleine longueur (ou l'un de ses fragments) peut être délété, grâce à quoi l'expression de la protéine C12orf35 fonctionnelle est substantiellement éliminée. Par exemple, la délétion peut être d'au moins 30 %, d'au moins 40 %, d'au moins 50 %, d'au moins 55 %, d'au moins 60 %, d'au moins 65 %, d'au moins 70 %, d'au moins 75 %, d'au moins 80 %, d'au moins 85 %, d'au moins 90 %, d'au moins 95 %, ou de 100 % de la séquence codante du gène C12orf35. Une autre option est d'introduire une ou plusieurs mutations dans la séquence codante, ce qui rend une protéine C12orf35 non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. Par exemple, une ou plusieurs mutations de décalage du cadre peuvent être introduites, produisant une protéine C12orf35 non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. En variante ou en outre, un ou plusieurs codons d'arrêt peuvent être introduits dans la séquence codante si bien qu'il est obtenu une protéine tronquée, non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. D'autres options comprennent, mais n'y sont pas limitées, une ou plusieurs mutations dans le promoteur, dans l'UTR en 5' et/ou en 3' ou d'autres éléments régulateurs, par exemple par introduction d'une délétion du promoteur ou par introduction d'une construction entre le promoteur et le départ de la transcription. Les procédés pour la perturbation de gènes afin de supprimer ou d'éliminer l'expression du gène cible sont également bien connus de l'homme du métier.
[0104] Puisque chaque cellule comporte deux copies du gène C12orf35 dans son génome, dans certains modes de réalisation, au moins une copie de la séquence génomique du gène C12orf35, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène C12orf35, est délétée. Dans certains modes de réalisation, les deux copies des séquences génomiques du gène C12orf35 (ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène C12orf35 à partir de chaque copie) sont délétées.
[0105] Dans certains modes de réalisation, la séquence délétée comprend une portion de la région télomérique du chromosome 8 d'une cellule CHO. Une région télomérique est une région de séquences nucléotidiques répétitives à chaque extrémité d'une chromatide, qui protège l'extrémité du chromosome contre la détérioration ou contre la fusion avec des chromosomes voisins. Dans certains modes de réalisation, au moins 30 %, au moins 40 %, au moins 50 %, au moins 55 %, au moins 60 %, au moins 65 %, au moins 70 %, au moins 75 %, au moins 80 %, au moins 85 %, au moins 90 %, au moins 95 %, ou 100 % de la séquence nucléotidique de la région télomérique du chromosome 8 d'une cellule CHO est délétée.
[0106] Dans certains modes de réalisation, la séquence délétée comprend en outre la délétion d'un gène choisi dans le groupe constitué de : Bicdl, Amnl, protéine 20 de type méthyltransférase, Dennd5b, FAM60A, Caprin2, Ipo8, RPS4Y2, et l'une de leurs combinaisons.
[0107] Dans certains modes de réalisation, la délétion du gène C12orf35 (ou de l'un de ses fragments) est due à une cassure chromosomique. Une cassure chromosomique peut être induite par exemple en traitant les cellules eucaryotes avec un agent toxique qui favorise la cassure chromosomique, comme par exemple le MTX, 1'aphidicoline ou 1'hygromycine. D'autres options pour induire des cassures chromosomiques comprennent, mais n'y sont pas limitées, des radiations, des irradiations, des mutagènes, des substances cancérigènes et la bléomycine. Des cassures chromosomiques peuvent également se produire spontanément durant la transfection, par exemple, 1'électroporation. Des procédés pour induire une cassure chromosomique sont également connus de l'homme du métier et ainsi, n'ont pas besoin d'une description détaillée quelconque ici. Après l'induction d'une cassure chromosomique, les cellules eucaryotes comportant le point de rupture souhaité (qui produit une délétion du gène C12orf35, ou de l'un de ses fragments) peuvent être identifiées, par exemple, en analysant l'ADN ou en utilisant le procédé selon le cinquième aspect de la présente divulgation. Par exemple, le profil d'expression des cellules traitées peut être analysé pour déterminer si le gène Cl2orf35 ou les gènes localisés en position centromérique du gène C12orf35 sont exprimés, si l'expression est réduite ou si les gènes ne sont pas exprimés. Par exemple, dans le cas de cellules de souris ou de hamster, il peut être analysé si le gène C12orf35 est exprimé et en variante ou en outre à ceci, il peut être analysé si un ou plusieurs gènes choisis dans le groupe constitué de la protéine 20 de type méthyltransférase, Dennd5b, FAM60A, Caprin2, Ipo8, Tmtcl ou des gènes qui sont localisés en position télomérique des gènes susmentionnés (où télomérique a cet égard signifie dans la direction de l'extrémité télomérique) sont exprimés par la cellule et/ou si l'expression est réduite ou substantiellement éliminée.
[0108] La réduction du taux d'expression de la protéine C12orf35 peut être obtenue par un silençage du gène après la transcription, par exemple, par des molécules d'acide nucléique antisens, ou des molécules qui médient une interférence par ARN. Des exemples non limitants comprennent des ARNsi, des ARNsh, des miARN, des oligonucléotides antisens, etc., tous étant bien connus dans l'art.
[0109] Le taux d'expression de la protéine C12orf35 peut être estimé par des procédés connus dans l'art, par exemple, en mesurant le taux d'ARNm codant pour la protéine C12orf35, ou la protéine C12orf35 elle-même. De tels procédés comprennent, par exemple, les analyses Northern blot, FACS, ImageStream, Western blot, qPCR, RT-PCR, qRT-PCR, ELISA, Luminex, Multiplex, etc.
[0110] Dans certains modes de réalisation, le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 est réduit d'au moins 3 fois, d'au moins 5 fois, d'au moins 10 fois, d'au moins 20 fois, d'au moins 30 fois, d'au moins 40 fois, d'au moins 50 fois, d'au moins 60 fois, d'au moins 70 fois, d'au moins 75 fois, d'au moins 80 fois, d'au moins 90 fois, d'au moins 100 fois, comparativement à un témoin.
Gènes FAM60A et protéines FAM60A
[0111] Dans certains modes de réalisation, la cellule hôte est une cellule dans laquelle le taux d'expression ou l'activité de la protéine FAM60A est réduit, comparativement à un témoin. Dans un certain mode de réalisation, une telle cellule est une cellule CHO. La demande de brevet US provisoire No. 61/919 340, déposée le 20 décembre 2013, et incorporée ici en référence, fournit une description détaillée de cellules de mammifères dans lesquelles le taux d'expression ou l'activité de la protéine FAM60A est réduit.
[0112] Divers témoins peuvent être utilisés comme il a été discuté ci-dessus. Le taux d'expression ou l'activité de la protéine FAM60A à partir d'une cellule de type sauvage correspondante peut être utilisé en tant que témoin. En variante, un témoin peut être un taux prédéterminé ou un taux seuil qui peut être identifié dans la littérature ou une base de données.
[0113] La protéine FAM60A est une sous-unité du complexe SIN3-histone désacétylase (HDAC) (complexe SIN3/HDAC) qui fonctionne dans la répression de la transcription (Munoz et al., 2012, THE Journal of Biological Chemistry VOL. 287, NO. 39, pp. 32346-32353 ; Smith et ai., 2012, Mol Cell Proteomics 11 (12) : 1815-1828) . Les histone désacétylases (HDAC) catalysent l'élimination des groupes acétyle à partir des histones. L'acétylation des histones sur les lysines est un mécanisme majeur pour la modulation de la conformation de la chromatine. L'acétylation des histones favorise un état de la chromatine relâché, transcriptionnellement actif tandis que la désacétylation catalysée par les histone désacétylases (HDAC) favorise un état inactif silencieux. L'analyse de bases de données a révélé la présence d'au moins un orthologue de la FAM60A chez la plupart des métazoaires, mais pas chez les nématodes. Le gène FAM60A est conservé chez les métazoaires et peut être trouvé dans les génomes de tous les vertébrés et de la plupart des invertébrés qui ont été complètement séquencés. La recherche de similarité de séquence des homologues de la FAM60A indique que principalement, il n'existe qu'un seul membre représentatif de cette famille dans le génome. Il n'existe que quelques exceptions. Selon Smith et al., 2012, la protéine FAM60A a une séquence unique à laquelle il manque n'importe quel domaine connu de protéine. En outre, il a été décrit par Smith et al. 2012, qu'elle ne présente aucune homologie de séquence avec d'autres protéines connues dans le protéome humain. La comparaison des séquences entre les protéines FAM60A provenant de différentes espèces a montré que la protéine FAM60A comprend généralement trois régions : (1) une extrémité N-terminale comprenant des segments hautement conservés chez tous les métazoaires ; (2) une région moyenne qui est hautement conservée parmi les vertébrés tandis que chez les invertébrés elle est constituée d'un espaceur non conservé d'une longueur variable ; (3) une extrémité C-terminale comprenant des segments hautement conservés chez tous les métazoaires. Ainsi, la conservation la plus élevée a été observée dans les régions N- et C-terminales de la FAM60A.
[0114] Des études indiquent que la protéine FAM60A s'associe aux complexes SIN3/HDAC dans divers types de cellules eucaryotes comme en particulier des cellules de mammifères. Toutefois, jusqu'à ce jour, les informations fonctionnelles concernant la protéine FAM60A sont limitées. Des études fonctionnelles récentes (voir Smith et al., 2012) indiquent que la protéine FAM60A peut réprimer l'expression génique et régule un sous-ensemble spécifique de gènes. Smith et al. 2012 rapportent un rôle de la protéine FAM60A dans la régulation de la voie de signalisation du TGF-bêta, qui joue un rôle pivot dans des processus comme la progression d'un cancer, les métastases, la migration cellulaire et la surveillance immunitaire. Il existe des découvertes indiquant que la protéine FAM60A agit comme un répresseur de la transcription des composants de la voie de signalisation du TGF-bêta tandis que cette fonction de la protéine FAM60A semble être permise par l'intermédiaire de son rôle dans le complexe SIN3-HDAC. L'appauvrissement de la protéine FAM60A dans différentes lignées de cellules cancéreuses en utilisant des ARNsi contre la séquence codante de la FAM60A a produit un changement de la morphologie normale des cellules cancéreuses. En outre, il a été trouvé que les taux de protéine FAM60A changent périodiquement au cours du cycle cellulaire dans des cellules U20S (Munoz et al., 2012). Des expériences de répression de la FAM60A en utilisant des ARNsi dirigés contre la FAM60A dans des cellules d'ostéosarcome osseux humain U20S ont révélé que la protéine FAM60A restreint l'expression du gène de la cycline DI.
[0115] A l'encontre de ce contexte scientifique, il a été trouvé de façon surprenante que la réduction de l'expression ou de l'activité de la protéine FAM60A dans une cellule de mammifère augmente la stabilité de l'expression des protéines recombinantes, sans affecter négativement d'autres caractéristiques de la cellule qui sont importantes pour l'expression recombinante. Cette corrélation entre les effets de la protéine FAM60A et la stabilité de l'expression durant une culture prolongée des cellules était inattendue. En tant que telles, des cellules hôtes de mammifères (par exemple, des cellules CHO) avec un taux d'expression ou une activité réduit de la protéine FAM60A sont particulièrement appropriées pour la production recombinante du complexe pentamère.
[0116] Le gène FAM60A est exprimé de façon endogène chez les métazoaires et par conséquent dans des espèces de mammifères telles que l'être humain, la souris, le rat et le hamster, et la séquence d'acides aminés de la FAM60A est hautement conservée dans les espèces de mammifères ainsi que chez les vertébrés. Différents noms peuvent être alloués dans différentes espèces pour la protéine ou le gène et des variantes de noms non limitantes (alias) sont également énumérées dans le tableau 2 (ci-dessous). Pour simplifier, dans cette divulgation, les homologues et les orthologues de différentes espèces sont tous appelés « gène FAM60A » ou « protéine FAM60A ».
[0117] La liste des séquences présente des exemples de séquences d'acides aminés de protéines FAM60A connues et/ou prédites de différentes espèces de vertébrés, notamment Homo sapiens (SEQ ID NO : 28), Mus musculus (SEQ ID NO : 29), Cricetulus griseus (SEQ ID NO : 30). L'ADNc de FAM60A prédit de Cricetulus griseus est représenté par SEQ ID NO : 31 (séquence codante de 14 à 679 ; voir également la séquence de référence du NCBI : XM_003505482.1) . La protéine FAM60A n'a pas été décrite en détail dans la littérature. Ainsi, il était surprenant que la stabilité de l'expression d'une cellule hôte recombinante puisse être améliorée, si le génome de la cellule hôte est modifié de telle façon que le taux d'expression ou l'activité de la protéine endogène FAM60A est réduit, comparativement à un témoin. Il était inattendu que la protéine FAM60A influence la stabilité de l'expression d'un produit recombinant d'intérêt.
[0118] Les séquences du gène FAM60A codant pour la protéine FAM60A ont été rapportées chez Homo sapiens (ID du gène du NCBI : 58516) ; Rattus norvegicus (ID du gène du NCBI : 686611) ; Mus musculus (ID du gène du NCBI : 56306) ; Bos Taurus (ID du gène du NCBI : 538649) et d'autres. Des variants de transcrits peuvent exister d'une façon dépendante de l'espèce et dans des nombres différents (par exemple, le gène FAM60A humain exprime trois isoformes de transcrits putatifs qui diffèrent dans les UTR mais qui codent pour la même protéine).
[0119] La réduction du taux d'expression ou de l'activité d'une protéine FAM60A peut être obtenue par divers moyens. Par exemple, le taux d'expression ou l'activité d'une protéine FAM60A peut être réduit par inactivation de gène, mutation de gène, délétion de gène, silençage de gène ou une combinaison quelconque des précédents. L'inactivation de gène est une technique génétique qui rend un gène inopérant par perturbation de sa fonction. Par exemple, un acide nucléique peut être inséré dans la séquence codante, perturbant de cette façon la fonction du gène. En outre, le gène FAM60A pleine longueur (ou l'un de ses fragments) peut être délété, grâce à quoi l'expression de la protéine FAM60A fonctionnelle est substantiellement éliminée. Par exemple, la délétion peut être d'au moins 30 %, d'au moins 40 %, d'au moins 50 %, d'au moins 55 %, d'au moins 60 %, d'au moins 65 %, d'au moins 70 %, d'au moins 75 %, d'au moins 80 %, d'au moins 85 %, d'au moins 90 %, d'au moins 95 %, ou de 100 % de la séquence codante du gène FAM60A. Une autre option est d'introduire une ou plusieurs mutations dans la séquence codante, ce qui rend une protéine FAM60A non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. Par exemple, une ou plusieurs mutations de décalage du cadre peuvent être introduites, produisant une protéine FAM60A non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. En variante ou en outre, un ou plusieurs codons d'arrêt peuvent être introduits dans la séquence codante si bien qu'il est obtenu une protéine tronquée, non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. D'autres options comprennent, mais n'y sont pas limitées, une ou plusieurs mutations dans le promoteur, dans les UTR en 5' et/ou en 3' ou d'autres éléments régulateurs, par exemple par introduction d'une délétion du promoteur ou par introduction d'une construction entre le promoteur et le départ de la transcription. Des procédés de perturbation de gènes pour supprimer ou éliminer l'expression du gène cible sont également bien connus de l'homme du métier.
[0120] Puisque chaque cellule comporte deux copies du gène FAM60A dans son génome, dans certains modes de réalisation, au moins une copie de la séquence génomique du gène FAM60A, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène FAM60A, est délétée. Dans certains modes de réalisation, les deux copies des séquences génomiques du gène FAM60A (ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène FAM60A à partir de chaque copie) sont délétées.
[0121] Dans certains modes de réalisation, la séquence délétée comprend une portion de la région télomérique du chromosome 8 d'une cellule CHO. Une région télomérique est une région de séquences nucléotidiques répétitives à chaque extrémité d'une chromatide, qui protège l'extrémité du chromosome contre la détérioration ou contre la fusion avec des chromosomes voisins. Dans certains modes de réalisation, au moins 30 %, au moins 40 %, au moins 50 %, au moins 55 %, au moins 60 %, au moins 65 %, au moins 70 %, au moins 75 %, au moins 80 %, au moins 85 %, au moins 90 %, au moins 95 %, ou 100 % de la séquence nucléotidique de la région télomérique du chromosome 8 d'une cellule CHO est délétée.
[0122] Dans certains modes de réalisation, la séquence délétée comprend en outre une délétion d'un gène choisi dans le groupe constitué de : Caprin2 et Ipo8, et l'une de leurs combinaisons.
[0123] Dans certains modes de réalisation, la délétion du gène FAM60A est due à une cassure chromosomique. Une cassure chromosomique peut être induite par des procédés décrits ci-dessus. Après l'induction d'une cassure chromosomique, les cellules comportant le point de rupture souhaité (qui entraîne une délétion du gène FAM60A) peuvent être identifiées, par exemple, en analysant l'ADN ou en utilisant le procédé selon le cinquième aspect de la présente divulgation. Par exemple, le profil d'expression des cellules traitées peut être analysé pour déterminer si le gène FAM60A ou des gènes localisés en position centromérique du gène FAM60A sont exprimés, si l'expression est réduite ou si les gènes ne sont pas exprimés. Par exemple, dans le cas de cellules de souris ou de hamster, il peut être analysé si le gène FAM60A est exprimé et en variante ou en outre à ceci, il peut être analysé si un ou plusieurs gènes choisis dans le groupe constitué de Bicdl, C12orf35, protéine 20 de type méthyltransférase, Dennd5b, Caprin2, Ipo8, Tmtcl ou des gènes qui sont localisés en position télomérique des gènes susmentionnés (où télomérique a cet égard signifie dans la direction de l'extrémité télomérique) sont exprimés par la cellule et/ou si l'expression est réduite ou substantiellement éliminée.
[0124] La réduction du taux d'expression de la protéine FAM60A peut être obtenue par un silençage de gène après la transcription, par exemple, par des molécules d'acide nucléique antisens, ou des molécules qui médient une interférence par ARN. Des exemples non limitants comprennent des ARNsi, des ARNsh, des miARN, des oligonucléotides antisens, etc., tous étant bien connus dans l'art.
[0125] Le taux d'expression de la protéine FAM60A peut être estimé par des procédés bien connus, par exemple, en mesurant le taux d'ARNm codant pour la protéine FAM60A, ou la protéine FAM60A elle-même. De tels procédés comprennent, par exemple, les analyses Northern blot, FACS, ImageStream, Western blot, qPCR, RT-PCR, qRT-PCR, ELISA, Luminex, Multiplex, etc.
[0126] Dans certains modes de réalisation, le taux d'expression ou l'activité de la protéine FAM60A est réduit d'au moins 3 fois, d'au moins 5 fois, d'au moins 10 fois, d'au moins 20 fois, d'au moins 30 fois, d'au moins 40 fois, d'au moins 50 fois, d'au moins 60 fois, d'au moins 70 fois, d'au moins 75 fois, d'au moins 80 fois, d'au moins 90 fois, d'au moins 100 fois, comparativement à un témoin. Gènes de matriptases et matriptases [0127] Dans certains modes de réalisation, la cellule hôte est une cellule dans laquelle le taux d'expression ou l'activité de la matriptase est réduit, comparativement à un témoin. Dans un certain mode de réalisation, une telle cellule est une cellule CHO. La demande de brevet US provisoire
No. 61/985 589, déposée le 29 avril 2014 et incorporée ici en référence, et la demande de brevet US provisoire
No. 61/994 310, déposée le 16 mai 2014 et incorporée ici en référence, fournissent une description détaillée de cellules de mammifères dans lesquelles le taux d'expression ou l'activité de la matriptase est réduit.
[0128] Divers témoins peuvent être utilisés comme il a été discuté ci-dessus. Le taux d'expression ou l'activité de la matriptase provenant d'une cellule de type sauvage correspondante peut être utilisé en tant que témoin. En variante, un témoin peut être un taux prédéterminé ou un taux seuil qui peut être identifié dans la littérature ou une base de données.
[0129] La matriptase a été décrite pour la première fois en 1993 comme une nouvelle activité gélatinolytique dans des cellules cultivées de cancer du sein. La matriptase appartient à la famille des sérine protéases transmembranaires de type II (TTSP) . Des orthologues de la matriptase sont présents dans différentes espèces de vertébrés, y compris des espèces de mammifères, et ils ont été identifiés, par exemple, chez l'être humain, le chimpanzé, le chien, la souris, le rat, le poulet, le poisson zèbre, le poisson-globe à taches vertes et le poisson-globe tigre, ce qui suggère une fonction conservée dans l'évolution. La matriptase est énoncée dans la nomenclature des enzymes IÜBMB sous la référence EC 3.4.21.109. La matriptase est également connue comme une sérine protéase de type membranaire 1 (MT-SP1) et un suppresseur de la tumorigénicité-14 (ST14) (voir Chen et al., The Transmembrane Serine Protease Matriptase: Implications for Cellular Biology and Human Diseases J Med Sei 2012; 32 (3) : 097-108) . Il s'agit d'une protéine intégrale de la membrane avec un seul domaine transmembranaire proche de l'extrémité N-terminale cytoplasmatique. La partie extracellulaire est constituée d'une région de tige (comprenant un seul domaine SEA, 2 domaines CUB et 4 domaines LDLRA) et du domaine sérine protéase C-terminal qui est structuralement hautement similaire aux autres TTSP et comprend une triade catalytique conservée histidine/acide aspartique/sérine (HDS) essentielle à l'activité catalytique (voir, par exemple, List et al., Matriptase: Potent
Proteolysis on the cell Surface; Mol Med 12 (1-3) 1-7,
January-March 2006 et Chen et al., The Transmembrane Serine Protease Matriptase: Implications for Cellular Biology and Human Diseases J Med Sei 2012; 32 (3) : 097-108) . La matriptase est décrite comme étant exprimée dans les épithéliums dans de nombreux systèmes d'organes tels que la peau, le sein, le poumon, l'épiderme, la cornée, la glande salivaire, les cavités orales et nasales, la thyroïde, le thymus, l'œsophage, la trachée, les bronchioles, les alvéoles, l'estomac, le pancréas, la vésicule biliaire, le duodénum, l'intestin grêle, le côlon, le rectum, le rein, les surrénales, la vessie, l’uretère, les vésicules séminales, l’épididyme, la prostate, les ovaires, l'utérus et le vagin (voir, List et al., 2006 et Chen et al., 2012). La matriptase est synthétisée sous la forme d'un zymogène inactif et elle est convertie en sa forme active par l'intermédiaire d'un processus compliqué. Des détails concernant le processus d'activation qui implique des clivages endoprotéolytiques sont décrits pour la matriptase humaine dans List et al. 2006 et Chen et al. 2012. La matriptase est liée à la membrane en tant que protéine transmembranaire de type II avec le domaine catalytique orienté dans l'espace extracellulaire. En outre, il est décrit dans la littérature qu'une excrétion significative de la matriptase, respectivement sa partie extracellulaire, se produit in vivo (voir List et al., 2006 et Chen et al. 2012). Il est décrit dans la littérature que la matriptase est excrétée sous la forme d'un complexe, par exemple, complexée à l'inhibiteur de la sérine protéase de type Kunitz HAI-1. Différentes études suggèrent que dans des cellules humaines, l'inhibiteur spécifique HAI-1 facilite le transport de la matriptase vers la membrane cellulaire car il a été montré que l'élimination voire même des mutations ponctuelles simples dans HAI-1 mènent à une accumulation de la matriptase dans le compartiment de Golgi. Dans la littérature, plusieurs inhibiteurs endogènes différents de la matriptase en dehors de HAI-1 ont été décrits comme HAI-2, l'antithrombine, 1'alpha-l-antitrypsine et 1 'alpha-2-antiplasmine. En outre, également d'autres inhibiteurs de la matriptase ont été décrits (voir, par exemple, Chen et al., 2012). Il est décrit dans la littérature que la matriptase peut jouer de nombreux rôles dans la physiologie animale comme la fonction de barrière cutanée, l'intégrité épithéliale, le développement des follicules pileux, et l'homéostasie du thymus, et dans des pathologies humaines, comme l'arthrose, l'athérosclérose, et la progression, l'invasion et les métastases tumorales.
[0130] A l'encontre de ce contexte scientifique, qui n'est pas apparenté à la production recombinante d'une protéine, la présente découverte que la matriptase est une protéase impliquée dans la coupure des protéines produites de façon recombinante qui sont sécrétées par les cellules hôtes dans le milieu de culture cellulaire a été hautement surprenante. En prenant en considération le grand nombre et la diversité des protéases exprimées dans les cellules des vertébrés, comme en particulier les cellules de mammifères, il a été encore plus surprenant que la réduction du taux d'expression de l'activité de cette protéine puisse réduire significativement la coupure du polypeptide d'intérêt sécrété dans le milieu de culture cellulaire. Ces effets avantageux ne sont pas observés avec d'autres protéases, même des protéases étroitement apparentées. En tant que telles, des cellules hôtes de mammifères (par exemple, des cellules CHO) avec un taux d'expression ou une activité réduit de la matriptase sont particulièrement appropriées pour la production recombinante du complexe pentamère.
[0131] La liste des séquences présente des exemples de séquences d'acides aminés de la matriptase provenant de différentes espèces de vertébrés comme le hamster (SEQ ID NO : 32 - séquence de référence du NCBI : XP_003495890) , l'être humain (SEQ ID NO : 33 - séquence de référence du NCBI : NP_068813) , la souris (SEQ ID NO : 34 -séquence de référence du NCBI : NP_035306).
[0132] Les séquences nucléotidiques codant pour la matriptase provenant de différentes espèces de mammifères ont été également rapportées. Voir, par exemple, le hamster de Chine (ID du gène du NCBI : 100755225) ; Homo sapiens (ID du gène du NCBI : 6768) ; Mus musculus (ID du gène du NCBI : 19143) ; Rattus norvegicus (ID du gène du NCBI : 114093) ; Pan Troglodytes (ID du gène du NCBI : 100188950) et d'autres. Des synonymes pour certains du gène de la matriptase sont énumérés dans le tableau 3, parmi lesquels sont couramment utilisés « ST14 » ou « Stl4 ».
[0133] Comme cela est montré dans le tableau 3, la matriptase est également appelée « protéine suppresseur de la tumorigénicité 14 » (par exemple, pour l'être humain) et « homologue de la protéine suppresseur de la tumorigénicité 14 » (par exemple, chez la souris et le hamster de Chine) . Pour simplifier, dans cette divulgation, les homologues et les orthologues de différentes espèces sont tous appelés « gène de la matriptase » ou « matriptase » (protéine).
[0134] Sont également décrits ici des variants fonctionnels d'une matriptase (des variants qui possèdent substantiellement les mêmes activités catalytiques qu'une matriptase de type sauvage) . Par exemple, un variant de la matriptase peut comprendre une séquence qui est identique au moins à 50 %, au moins à 60 %, au moins à 70 %, au moins à 75 %, au moins à 80 %, au moins à 85 %, au moins à 90 %, au moins à 95 %, au moins à 96 %, au moins à 97 %, au moins à 98 % ou au moins à 99 % avec l'une quelconque des séquences de SEQ ID NO : 32 à 34, et qui possède les mêmes ou substantiellement les mêmes activités catalytiques qu'une protéine matriptase de type sauvage. L'activité catalytique d'un variant de la matriptase peut être estimée, par exemple, par la réaction chimique pour cliver divers substrats synthétiques avec Arg ou Lys en position PI et il est préféré des acides aminés à petite chaîne latérale, tels que Ala et Gly, en position P2 (voir, EC 3.4.21.109).
[0135] Sont également décrits ici des fragments fonctionnels d'une matriptase (des fragments qui possèdent substantiellement les mêmes activités catalytiques qu'une matriptase pleine longueur). Un fragment fonctionnel d'une matriptase peut être un sous-ensemble d'acides aminés consécutifs de la matriptase pleine longueur divulguée ici, et qui possède les mêmes ou substantiellement les mêmes activités catalytiques que la séquence de la protéine pleine longueur. L'activité catalytique d'un fragment de la matriptase peut être estimée, par exemple, par la réaction chimique pour cliver divers substrats synthétiques avec Arg ou Lys en position PI et il est préféré des acides aminés à petite chaîne latérale, tels que Ala et Gly, en position P2 (voir, EC 3.4.21.109).
[0136] La réduction du taux d'expression ou de l'activité d'une matriptase peut être obtenue par divers moyens. Par exemple, le taux d'expression ou l'activité d'une matriptase peut être réduit par inactivation de gène, mutation de gène, délétion de gène, silençage de gène, ou une combinaison quelconque des précédents. L'inactivation de gène est une technique génétique par laquelle un gène est rendu inopérant par perturbation de sa fonction. Par exemple, un acide nucléique peut être inséré dans la séquence codante, perturbant de cette façon la fonction du gène. En outre, le gène de la matriptase pleine longueur (ou l'un de ses fragments) peut être délété, grâce à quoi l'expression de la matriptase fonctionnelle est substantiellement éliminée. Par exemple, la délétion peut être d'au moins 30 %, d'au moins 40 %, d'au moins 50 %, d'au moins 55 %, d'au moins 60 %, d'au moins 65 %, d'au moins 70 %, d'au moins 75 %, d'au moins 80 %, d'au moins 85 %, d'au moins 90 %, d'au moins 95 %, ou de 100 % de la séquence codante du gène de la matriptase. Une autre option est d'introduire une ou plusieurs mutations dans la séquence codante, ce qui rend une matriptase non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. Par exemple, une ou plusieurs mutations de décalage du cadre peuvent être introduites, produisant une matriptase non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. En variante ou en outre, un ou plusieurs codons d'arrêt peuvent être introduits dans la séquence codante de telle façon qu'il est obtenu une protéine tronquée, non fonctionnelle ou moins fonctionnelle. D'autres options comprennent, mais n'y sont pas limitées, une ou plusieurs mutations dans le promoteur, dans les UTR en 5' et/ou en 3' ou d'autres éléments régulateurs, par exemple par introduction d'une délétion du promoteur ou par introduction d'une construction entre le promoteur et le départ de la transcription. Des procédés pour la perturbation de gènes pour supprimer ou éliminer l'expression du gène cible sont bien connus de l'homme du métier.
[0137] Puisque chaque cellule comporte deux copies du gène de la matriptase dans son génome, dans certains modes de réalisation, au moins une copie de la séquence génomique du gène de la matriptase, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène de la matriptase, ou d'un fragment fonctionnel gène de la matriptase, est délétée. Dans certains modes de réalisation, les deux copies des séquences génomiques du gène de la matriptase (ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène de la matriptase, ou d'un fragment fonctionnel dudit gène de la matriptase, à partir de chaque copie) sont délétées.
[0138] Dans certains modes de réalisation, la cellule hôte comprend une mutation dans l'exon 2 du gène de la matriptase. L'exon 2 est particulièrement approprié en tant que cible pour modifier l'activité matriptase parce qu'il existe plusieurs variants d'épissage fonctionnels différents. Ainsi, les exons proches de l'extrémité N-terminale de la matriptase comme par exemple l'exon 1, l'exon 2 et l'exon 3, sont avantageux pour introduire une ou plusieurs mutations, en particulier une ou plusieurs mutations de décalage du cadre. Une mutation de décalage du cadre dans l'un de ces exons mène le plus vraisemblablement à un codon d'arrêt précoce dans la séquence. Des mutations peuvent être également introduites dans l'un des exons subséquents, par exemple choisis parmi les exons 4 à 19.
[0139] Dans certains modes de réalisation, la matriptase comprend une mutation dans le domaine catalytique. Le domaine catalytique est la région d'une enzyme qui interagit avec son substrat pour provoquer la réaction enzymatique. Une ou plusieurs mutations peuvent être introduites dans ce domaine de telle façon que l'activité catalytique de la protéine est réduite comparativement à un témoin. Le domaine catalytique comprend des séquences codées par les exons 16, 17, 18 et 19. Les mutations peuvent être une délétion, une insertion, une substitution, ou l'une de leurs combinaisons. Les mutations peuvent provoquer une mutation de décalage du cadre, une mutation ponctuelle spécifique, une mutation de codon d'arrêt, ou l'une de leurs combinaisons, dans la séquence codant pour le domaine catalytique. Des mutants inactifs du point de vue catalytique de la matriptase comme par exemple la G827R-matriptase ou la S805A-matriptase ont été également décrits dans la littérature (voir Désilets et al., The Journal of Biological Chemistry Vol. 283, No. 16, pp. 10535-10542, 2008). En outre, la structure cristalline du domaine catalytique d'une matriptase recombinante est connue. D'après cette structure et les données sur la séquence, l'homme du métier peut dériver d'autres cibles spécifiques pour des mutations afin d'altérer la fonction catalytique de la matriptase.
[0140] La réduction du taux d'expression de la matriptase peut être obtenue par un silençage de gène après la transcription, par exemple par des molécules d'acide nucléique antisens, ou des molécules qui médient une interférence par ARN. Les exemples non limitants comprennent des ARNsi, des ARNsh, des miARN, des oligonucléotides antisens, etc., tous étant bien connus dans l’art.
[0141] Le taux d’expression de la matriptase peut être estimé par des procédés connus dans l’art, par exemple, en mesurant le taux d’ARNm codant pour la matriptase, ou la matriptase elle-même. De tels procédés comprennent, par exemple, les analyses Northern blot, FACS, ImageStream, Western blot, qPCR, RT-PCR, qRT-PCR, ELISA, Luminex, Multiplex, etc. L’activité de la matriptase peut être estimée, par exemple, selon son activité enzymatique.
[0142] Da ns certains modes de réalisation, le taux d’expression ou l’activité de la matriptase est réduit d’au moins 3 fois, d’au moins 5 fois, d’au moins 10 fois, d’au moins 20 fois, d’au moins 30 fois, d’au moins 40 fois, d’au moins 50 fois, d’au moins 60 fois, d’au moins 70 fois, d’au moins 75 fois, d’au moins 80 fois, d’au moins 90 fois, d’au moins 100 fois, comparativement à un témoin.
Tableau 2
Abréviations et variantes de noms (alias) de produits codés par des gènes localisés dans le chromosome 8 du hamster de Chine ou le chromosome 6 de la souris.
Tableau 3
Exemples de variantes de noms du gène de la matriptase et/ou du produit de la protéine codée de la matriptase utilisés dans la littérature (ordre alphabétique)
[0143] Une cellule hôte appropriée peut comporter des combinaisons quelconques des modifications décrites ici, par exemple, une cellule dans laquelle à la fois le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 est réduit dans ladite cellule, comparativement à un témoin, et le taux d'expression ou l'activité de la protéine FAM60A est réduit dans ladite cellule, comparativement à un témoin. D'autres combinaisons comprennent, par exemple, la réduction de du taux d'expression ou de l'activité de la protéine C12orf35, et la réduction du taux d'activité ou de l'activité de la matriptase ; la réduction du taux d'expression ou de l'activité de la protéine FAM60A, et la réduction du taux d'expression ou de l'activité de la matriptase ; la réduction du taux d'expression ou de l'activité de la protéine C12orf35, la réduction du taux d'expression ou de l'activité de la protéine FAM60A, et la réduction du taux d'expression ou de l'activité de la matriptase ; la réduction du taux d'expression ou de l'activité de la protéine C12orf35, et l'inclusion de la séquence de la dihydrofolate réductase (DHFR) en tant que marqueur de sélection, etc.
[0144] Les cellules hôtes décrites ici sont appropriées pour une culture à grande échelle. Par exemple, les cultures cellulaires peuvent être de 10 1, 30 1, 50 1, 100 1, 150 1, 200 1, 300 1, 500 1, 1000 1, 2000 1, 3000 1, 4000 1, 5000 1, 10,000 1 ou plus grandes. Dans certains modes de réalisation, la taille de la culture cellulaire peut se situer dans la plage de 10 1 à 5000 1, de 10 1 à 10,000 1, de 10 1 à 20 000 1, de 10 là 50 000 1, de 40 là 50 000 1, de 100 1 à 50 000 1, de 500 1 à 50 000 1, de 1000 1 à 50 000 1, de 2000 1 à 50 000 1, de 3000 1 à 50 000 1, de 4000 1 à 50 000 1, de 4500 1 à 50 000 1, de 1000 1 à 10 000 1, de 1000 1 à 20 000 1, de 1000 1 à 25 000 1, de 1000 1 à 30 000 1, de 15 1 à 2000 1, de 40 1 à 1000 1, de 100 1 à 500 1, de 200 1 à 400 1, ou tout nombre entier entre ces valeurs.
[0145] Les composants des milieux pour culture cellulaire sont connus dans l'art, et ils peuvent comprendre, par exemple, un tampon, une teneur en acides aminés, une teneur en vitamines, une teneur en sels, une teneur en minéraux, une teneur en sérum, une teneur en source de carbone, une teneur en lipides, une teneur en acides nucléiques, une teneur en hormones, une teneur en oligo-éléments, une teneur en ammoniac, une teneur en cofacteurs, une teneur en indicateurs, une teneur en petites molécules, une teneur en hydrolysats et une teneur en modulateurs enzymatiques. 4. Purification du complexe pentamère à partir de la culture cellulaire [0146] Le complexe pentamère produit conformément au procédé décrit ici peut être récolté à partir des cellules hôtes, et purifié en utilisant tout procédé approprié. Les procédés appropriés comprennent la précipitation et divers types de chromatographie, comme l'interaction hydrophobe, l'échange d'ions, l'affinité, la chélation, et l'exclusion par la taille, tous étant connus dans l'art. Des schémas de purification appropriés peuvent être créés en utilisant deux ou plus de ces procédés appropriés ou d'autres. Si c'est souhaité, une ou plusieurs des sous-unités du complexe pentamère peuvent comprendre un « marqueur » qui facilite la purification, comme un marqueur épitopique ou un marqueur HIS, un marqueur Strep. De tels polypeptides marqués peuvent être purifiés de façon pratique, par exemple à partir de milieux conditionnés, par chromatographie chélatrice ou chromatographie d'affinité. Eventuellement, la séquence du marqueur peut être clivée après la purification.
[0147] Par exemple, le document WO 2014/005959 divulgue des exemples de procédés de purification du complexe pentamère par chromatographie d'affinité.
[0148] Dans certains modes de réalisation, une ou plusieurs sous-unités du complexe pentamère comprennent un marqueur pour une purification par affinité. Les exemples de marqueurs pour une purification par affinité comprennent, par exemple, le marqueur His (se lie aux ions métalliques), un anticorps (se lie à la protéine A ou à la protéine G) , la protéine de liaison du maltose (MBP) (se lie à l'amylose), la glutathion-S-transférase (GST) (se lie au glutathion), le marqueur FLAG (Asp-Tyr-Lys-Asp-Asp-Asp-Asp-Lys (SEQ ID NO : 37)) (se lie à un anticorps anti-flag), le marqueur Strep (se lie à la streptavidine ou à l'un de ses dérivés).
[0149] La structure du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 est inconnue. Toutefois, si le marqueur pour la purification par affinité est fixé à un site qui interfère avec la formation du complexe pentamère, ou à un site qui est enterré au sein du complexe, la purification par affinité ne sera pas couronnée de succès. On pense que les sites suivants sont appropriés pour fixer un marqueur pour la purification par affinité, car le marqueur ne semble pas interférer avec la formation du complexe pentamère, et semble être exposé à la surface d'un pentamère assemblé : (i) la région C-terminale de la pUL130, (ii) la région N-terminale de la pUL130, (iii) la région C-terminale de la pUL131, (iv) la région N-terminale de la pUL131, (v) la région C-terminale de la pUL128, (vi) la région N-terminale de la pUL128, ou l'une de leurs combinaisons.
[0150] Dans certains modes de réalisation, le complexe pentamère ne comprend pas de marqueur pour la purification.
[0151] Un autre procédé approprié est la chromatographie par échange d'ions. Les exemples de matériaux utiles dans la chromatographie par échange d'ions comprennent la DEAE-cellulose, la QAE-cellulose, la DEAE-céphalose, la QAE-céphalose, DEAE-Toyopearl, QAE-Toyopearl, Mono Q, Mono S, Q sepharose, SP sepharose, etc. Dans un exemple de mode de réalisation, le procédé utilise une colonne de Mono S. Dans un autre exemple de mode de réalisation, le procédé utilise une colonne de Mono Q.
[0152] Dans certains modes de réalisation, le rendement du complexe pentamère du CMV est d'au moins environ 0,01 g/1, d'au moins environ 0,02 g/1, d'au moins environ 0,03 g/1, d'au moins environ 0,05 g/1, d'au moins environ 0,06 g/1, d'au moins environ 0,07 g/1, d'au moins environ 0,08 g/1, d'au moins environ 0,09 g/1, d'au moins environ 0,1 g/1, d'au moins environ 0,15 g/1, d'au moins environ 0,20 g/1, d'au moins environ 0,25 g/1, d'au moins environ 0,3 g/1, d'au moins environ 0,35 g/1, d'au moins environ 0,4 g/1, d'au moins environ 0,45 g/1, d'au moins environ 0,5 g/1, d'au moins environ 0,55 g/1, d'au moins environ 0,6 g/1, d'au moins environ 0,65 g/1, d'au moins environ 0,7 g/1, d'au moins environ 0,75 g/1, d'au moins environ 0,8 g/1, d'au moins environ 0,85 g/1, d'au moins environ 0,9 g/1, d'au moins environ 0,95 g/1, ou d'au moins environ 1,0 g/1. 5. Définitions [0153] Le terme « fragment formant un complexe » d'une protéine du CMV (comme gH, gL, pUL128, pUL130, ou pUL131) se rapporte à toute partie ou portion de la protéine qui conserve la capacité de former un complexe avec une autre protéine du CMV. De tels complexes comprennent, par exemple, le complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131. Les fragments qui conservent la capacité de former le complexe pentamère sont également appelés « fragments formant le pentamère ».
[0154] Une « culture à grande échelle » se rapporte à une culture qui a une taille d'au moins environ 10 litres (par exemple, un volume d'au moins environ 10 1, d'au moins environ 20 1, d'au moins environ 30 , d'au moins environ 40 1, d'au moins environ 50 1, d'au moins environ 60 1, d'au moins environ 70 1, d'au moins environ 80 1, d'au moins environ 90 1, d'au moins environ 100 1, d'au moins environ 150 1, d'au moins environ 200 1, d'au moins environ 250 1, d'au moins environ 300 1, d'au moins environ 400 1, d'au moins environ 500 1, d'au moins environ 600 1, d'au moins environ 700 1, d'au moins environ 800 1, d'au moins environ 900 1, d'au moins environ 1000 1, d'au moins environ 2000 1, d'au moins environ 3000 1, d'au moins environ 4000 1, d'au moins environ 5000 1, d'au moins environ 6000 1, d'au moins environ 10 000 1, d'au moins environ 15 000 1, d'au moins environ 20 000 1, d'au moins environ 25 000 1, d'au moins environ 30 000 1, d'au moins environ 35 000 1, d'au moins environ 40 000 1, d'au moins environ 45 000 1, d'au moins environ 50 000 1, d'au moins environ 55 000 1, d'au moins environ 60 000 1, d'au moins environ 65 000 1, d'au moins environ 70 000 1, d'au moins environ 75 000 1, d'au moins environ 80 000 1, d'au moins environ 85 000 1, d'au moins environ 90 000 1, d'au moins environ 95 000 1, d'au moins environ 100 000 1, etc.).
[0155] Un complexe pentamère « soluble » se rapporte au complexe gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 dans lequel la sous-unité gH ne comprend pas le domaine transmembranaire.
[0156] Dans tout le mémoire, y compris les revendications, où le contexte le permet, le terme « comprenant » et ses variantes comme « comprend » ou « comprenant » doivent être interprétés comme incluant le nombre entier ou les nombres entiers indiqués sans exclure nécessairement tout autre nombre entier.
[0157] L'identité de séquence est calculée selon le pourcentage de correspondances de résidus entre deux séquences polypeptidiques, ou de correspondances de nucléotides entre deux séquences polynucléotidiques, alignées en utilisant un algorithme normalisé. Un tel algorithme peut insérer, d'une façon normalisée et reproductible, des brèches dans les séquences comparées afin d'optimiser l'alignement entre deux séquences, et par conséquent, obtenir une comparaison plus significative des deux séquences. Le pourcentage d'identité peut être mesuré sur la longueur d'une séquence définie entière, ou il peut être mesuré sur une longueur plus courte, par exemple, sur la longueur d'un fragment pris à partir d'une séquence définie plus grande, par exemple, un fragment d'au moins 45, d'au moins 60, d'au moins 90, d'au moins 120, d'au moins 150, d'au moins 210 ou d'au moins 450 résidus ou nucléotides consécutifs. Si la longueur n'est pas spécifiée, l'identité de séquence est calculée sur la pleine longueur de la plus courte des deux séquences.
[0158] Cette invention est en outre illustrée par les exemples suivants qui ne devront pas être interprétés comme limitants.
Exemples [0159] Cet exemple concerne la production du complexe protéinique pentamère du CMV par des lignées cellulaires CHO dans lesquelles les séquences codantes des sous-unités du pentamère ont été intégrées de façon stable dans le chromosome. Les lignées cellulaires sont également qualifiées de lignées cellulaires CHO stables.
[0160] Comme cela est montré dans cet exemple, ces lignées cellulaires CHO stables ont produit un pentamère fonctionnel du CMV, avec les cinq sous-unités assemblées dans la conformation naturelle. Le rendement est élevé, permettant de cette façon la production du complexe pentamère à une grande échelle commerciale. Ces lignées cellulaires sont particulièrement appropriées pour la fabrication à grande échelle de vaccins contre le CMV utilisant le pentamère.
[0161] Comme cela est montré dans cet exemple, les séquences nucléotidiques codant pour 1'ectodomaine de la gH, la gL, la pUL128, la pUL130 et la pUL131 ont été clonées dans des vecteurs d'expression simples ou doubles, avec des promoteurs subgénomiques et des 1RES pour diriger l'expression du composant individuel (figure 1). De façon spécifique, les séquences codant pour 1'ectodomaine de la gH, les gL, pUL128, pUL130 et pUL131 pleine longueur ont été optimisées pour les codons pour une expression en culture de cellules de mammifères, synthétisées et clonées dans un vecteur d'expression simple (avec sélection par Neo et DHFR) dirigé par le promoteur du CMV (pour les gH et UL128) et 1'1RES de l'EV71 (pour les gL, UL130, UL131) pour l'expression ; ou des vecteurs d'expression doubles, un avec sélection par Neo et DHFR pour la gH dirigé par le promoteur du CMV, et pour la gL dirigé par le promoteur du CMV ou l'IRES de l'EV71, et un avec sélection par Hyg et Fra pour la UL128 dirigé par le promoteur du CMV, pour les UL130 et UL131 dirigé par l'IRES de l'EV71 (figure 1) . Les marqueurs pour la purification par affinité comme le marqueur His et/ou le marqueur Strep ont été introduits à l'extrémité C-terminale de 1 ' ectodomaine de la gH et/ou de UL130 pour faciliter la purification. Le codon d'arrêt et le domaine transmembranaire de la gH ont été également introduits à l'extrémité C-terminale de 1'ectodomaine de la gH pour faciliter le sous-clonage par FACS (figure 1).
[0162] Le plasmide ou les plasmides d'expression ont été transfectés dans un panel de cellules hôtes CHO, comprenant les lignées cellulaires KO pour la matriptase (i) CHOC8TD, (ii) CH0HPT3 et (iii) CHOC8TD.
[0163] CHOC8TD est dérivée d'une lignée cellulaire CHO Kl et elle est en outre modifiée par délétion de la région télomérique du chromosome, si bien que cette lignée cellulaire a les caractéristiques suivantes : (i) télomère du chromosome 8 délété ; (ii) productivité élevée et bonne croissance cellulaire ; et (iii) problèmes potentiels de dégradation protéolytique élevée. CH0HPT3 est une lignée cellulaire CHO Kl montrant une activité protéolytique réduite, si bien que cette lignée cellulaire a les caractéristiques suivantes : (i) dégradation protéolytique inférieure à CHOC8TD, et (ii) croissance, productivité et efficacité du clonage inférieures à CHOC8TD. CHOC8TD KO pour la matriptase a été dérivée de CHOC8TD, avec la matriptase inactivée, si bien que cette lignée cellulaire a les caractéristiques suivantes : (i) matriptase (sérine protéase) inactivée ; et (ii) dégradation protéolytique moindre.
[0164] Le plasmide ou les plasmides d'expression comprenant les séquences codant pour les gH, gL, UL128, UL130 et UL131 ont été transfectés dans les trois cellules hôtes avec Nucleofection ΑΜΑΧΑ. Pour la stratégie à vecteur simple, les cellules transfectées ont été sélectionnées par G418 et MTX séquentiellement. Pour la stratégie à vecteur double, les cellules transfectées ont été sélectionnées par Hyg puis MTX séquentiellement.
[0165] Les groupes de cellules survivantes ont été cultivés en culture fermée pour produire les protéines du pentamère jusqu'à l'évaluation des protéines pour le rendement avec un test ELISA indirect, la contamination par gH/gL et la dégradation de gL avec les analyses Western et SDS-PAGE. En se basant sur le rendement du pentamère et la croissance des cellules, le groupe des cellules CHO transfectées avec la stratégie de vecteur 2 (figure 1) , en utilisant des cellules hôtes CH0C8TD, a été sélectionné pour le clonage des cellules simples (plasmide d'expression représenté sur la figure 2). Les clones sélectionnés montrent un rendement élevé et moins de contamination par gH/gL.
[0166] Les clones simples ont été triés avec une analyse FACS en utilisant des Acm spécifiques du pentamère (~ 200). Les 30 clones principaux ont été d'abord sélectionnés en se basant sur le titre du pentamère évalué par un test ELISA indirect et ils ont été en outre sélectionnés pour les ramener à 12 clones principaux. Une culture fermée suivie d'une purification par affinité à l'aide de Strep a montré que les 12 principaux peuvent produire le pentamère avec un rendement > 300 mg/1 et une pureté élevée (figure 3) . En fait, les clones principaux ont produit le pentamère avec un rendement d'environ 0,3 g/1 à environ 0,5 g/1. Le complexe protéinique purifié a été évalué pour sa liaison avec un panel d'Acm dirigés contre le pentamère, et il a été montré qu'ils présentaient tous les épitopes clés.
[0167] Les 12 clones principaux ont été en outre évalués à l'aide d'études de stabilité sur 14 semaines (figure 4). Les lots contrôlés et non contrôlés ont été évalués pour la croissance cellulaire et le titre du pentamère et le clone VF7 a été sélectionné.
[01 68] La production en bioréacteur du pentamère avec le clone principal VF7 a été également estimée. Ce clone a produit > 100 mg/1 de pentamère purifié (figure 5).
[0169] Comme cela est exemplifié ici, les cellules CHO stables peuvent être utilisées pour exprimer le pentamère. Ceci est en contraste avec l'expression transitoire par les cellules HEK293. Les lignées cellulaires CHO stables de l'invention peuvent produire les protéines du pentamère de façon régulière avec un rendement 100 fois supérieur.
[0170] La capacité à produire des lignées cellulaires CHO stables dans lesquelles les séquences codant pour les cinq sous-unités du pentamère sont intégrées dans le chromosome, comme cela est exemplifié ici, est plutôt remarquable. Il existe toujours des incertitudes quant à si une lignée cellulaire stable peut être produite, même pour une seule protéine. Par exemple, lorsqu'une séquence codant pour l'IGF-1 humain a été introduite dans des cellules CHO pour produire une lignée stable, il a été découvert que les lignées cellulaires IGF-l/CHO résultantes présentaient une inhibition de la croissance cellulaire et des titres bas. La mesure du titre maximal a été d'environ 8 pg/ml ce qui correspond à 100 mg/1 d'un titre d'anticorps (en se basant sur la masse molaire). Comparativement, les mesures de titre moyen d'un anticorps recombinant dans un procédé en bioréacteur sont autour de 3 g/1. Une cause du titre bas d'IGF-1 a été la réduction de la croissance cellulaire et la faible viabilité cellulaire des cellules exprimant l'IGF-1. Durant un procédé d'expression d'anticorps, des cellules dérivées de CHO-K1 se sont développées jusqu'à 2 x 107 cellules/ml et la viabilité cellulaire est supérieure à 97 % durant les 230 à 260 premières heures du temps de culture. Au contraire, des cellules dérivées de CHO-Kl exprimant l'IGF-1 ne se sont développées que jusqu'à 0,5 x 107 cellules/ml et la viabilité cellulaire avait déjà chuté au-dessous de 97 % après deux jours. Pour d'autres détails, voir, la demande US provisoire No. 61/738466, déposée le 18 décembre 2012 et la publication de demande PCT No. WO/2014/097113, déposée le 16 décembre 2013 .
[0171] Par conséquent, les inventeurs ont fait face à des difficultés supplémentaires significatives parce que les séquences codant pour les cinq sous-unités du pentamère du CMV doivent être intégrées de façon stable dans le génome de la cellule CHO. Les inventeurs ont surmonté ces difficultés, comme cela est mis en évidence par les clones sélectionnés montrant des rendements élevés, avec le pentamère produit de façon recombinante dans sa conformation naturelle et avec tous les épitopes clés.
[0172] Les diverses caractéristiques et les divers modes de réalisation de la présente invention, auxquels il est fait référence dans des sections individuelles ci-dessus s'appliquent, comme il est approprié, aux autres sections, mutatis mutandis. Par conséquent, les caractéristiques précisées dans une section peuvent être combinées avec des caractéristiques spécifiées dans d'autres sections, comme il est approprié.
[0173] Le mémoire est au mieux compris à la lumière des enseignements des références citées au sein du mémoire. Les modes de réalisation au sein du mémoire fournissent une illustration de modes de réalisation de l'invention et ne devront pas être interprétés comme limitant l'étendue de l'invention. L'homme du métier comprend facilement que de nombreux autres modes de réalisation sont englobés par l'invention. La totalité des publications, des brevets, et des séquences de GenBank cités dans cette divulgation sont incorporés en référence dans leur intégralité. Dans la mesure où le matériau incorporé en référence contredit ou est incohérent avec ce mémoire, le mémoire supplantera tout matériau de ce type. La citation de l'une quelconque des références ici n'est pas une admission que de telles références sont de l'art antérieur à la présente invention.
[0174] L'homme du métier reconnaîtra, ou sera capable de déterminer en utilisant une expérimentation ne dépassant pas la routine, de nombreux équivalents aux modes de réalisation spécifiques de l'invention décrite ici. De tels équivalents sont censés être englobés par les modes de réalisation suivants.
[0175] Les modes de réalisation particuliers de l'invention comprennent : 1. Une cellule recombinante de mammifère, comprenant : une ou plusieurs séquences polynucléotidiques codant pour le complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV), où ledit complexe pentamère comprend : la gH ou l'un de ses fragments formant un complexe, la gL ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL128 ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL130 ou l'un de ses fragments formant un complexe, et la pUL131 ou l'un de ses fragments formant un complexe ; où lesdites une ou plusieurs séquences polynucléotidiques sont intégrées dans l'ADN génomique de ladite cellule de mammifère. 2. La cellule de mammifère du mode de réalisation 1, où ladite cellule de mammifère est une cellule d'ovaire de hamster de Chine (CHO). 3. La cellule de mammifère du mode de réalisation 2, où ladite cellule CHO est une cellule CHO-K1, CHO-DUXB11, ou CHO-DG44. 4. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 3, où le taux d'expression ou l'activité de la protéine C12orf35 est réduit dans ladite cellule, comparativement à un témoin. 5. La cellule de mammifère du mode de réalisation 4, où au moins une copie de la séquence génomique du gène C12orf35, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène C12orf35, est délétée. 6. La cellule de mammifère du mode de réalisation 5, où les deux copies des séquences génomiques du gène C12orf35, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène C12orf35 à partir de chaque copie, sont délétées. 7. La cellule de mammifère du mode de réalisation 4 ou 5, où au moins une copie de la région télomérique du chromosome 8 d'une cellule CHO qui comprend le gène C12orf35 est délétée. 8. La cellule de mammifère du mode de réalisation 7, où ladite région télomérique comprend en outre un gène choisi dans le groupe constitué de : Bicdl, Amnl, protéine 20 de type méthyltransférase, Dennd5b, FAM60A, Caprin2, Ipo8, RPS4Y2, et l’une de leurs combinaisons. 9. La cellule de mammifère de l’un quelconque des modes de réalisation 4 à 8, où ladite protéine C12orf35 comprend une séquence qui est au moins identique à 80 % avec l'une quelconque des séquences choisies dans le groupe constitué des SEQ ID NO : 21, 22, 23, 24 et 35. 10. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 4 à 9, où ledit gène C12orf35 comprend une séquence qui est au moins identique à 80 % avec SEQ ID NO : 25. 11. La cellule de mammifère du mode de réalisation 4, où ladite cellule comprend une mutation dans le promoteur, l'UTR en 5', ou l'UTR en 3' dudit gène C12orf35. 12. La cellule de mammifère du mode de réalisation 4, où ladite protéine C12orf35 comprend une mutation qui réduit son activité, comparativement à un témoin. 13. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 12, où le taux d'expression ou l'activité de la protéine FAM60A est réduit dans ladite cellule, comparativement à un témoin. 14. La cellule de mammifère du mode de réalisation 13, où au moins une copie de la séquence génomique du gène FAM60A, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène FAM60A, est délétée. 15. La cellule de mammifère du mode de réalisation 14, où les deux copies des séquences génomiques du gène FAM60A, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène FAM60A à partir de chaque copie, sont délétées. 16. La cellule de mammifère du mode de réalisation 13 ou 14, où ladite séquence délétée comprend une portion de la région télomérique du chromosome 8 d'une cellule CHO. 17. La cellule de mammifère du mode de réalisation 16, où ladite séquence délétée comprend en outre un gène choisi dans le groupe constitué de : Caprin2 et Ipo8, et l’une de leurs combinaisons. 18. La cellule de mammifère de l’un quelconque des modes de réalisation 13 à 17, où ladite protéine FAM60A comprend une séquence qui est au moins identique à 80 % avec l'une quelconque des séquences choisies dans le groupe constitué des SEQ ID NO : 28, 29, et 30. 19. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 13 à 18, où ledit gène FAM60A comprend une séquence qui est au moins identique à 80 % avec SEQ ID NO : 31. 20. La cellule de mammifère du mode de réalisation 13, où ladite cellule comprend une mutation dans le promoteur, l'ÜTR en 5', ou l'UTR en 3' dudit gène FAM60A. 21. La cellule de mammifère du mode de réalisation 13, où ladite protéine FAM60A comprend une mutation qui réduit son activité, comparativement à un témoin. 22. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 21, où le taux d'expression ou l'activité de la matriptase est réduit dans ladite cellule, comparativement à un témoin. 23. La cellule de mammifère du mode de réalisation 22, où au moins une copie de la séquence génomique du gène de la matriptase, ou au moins 50 % de la séquence codante du gène de la matriptase, est délétée. 24. La cellule de mammifère du mode de réalisation 23, où les deux copies des séquences génomiques du gène de la matriptase, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène de la matriptase à partir de chaque copie, sont délétées. 25. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 22 à 25, où ladite matriptase comprend une séquence qui est au moins identique à 80 % avec l'une quelconque des séquences choisies dans le groupe constitué des SEQ ID NO : 32, 33, et 34. 26. La cellule de mammifère du mode de réalisation 22, où ladite cellule comprend une mutation dans 1'exon 2 du gène de la matriptase. 27. La cellule de mammifère du mode de réalisation 22, où ladite cellule comprend une mutation dans le promoteur, l'UTR en 5', ou l'UTR en 3' du gène de la matriptase. 28. La cellule de mammifère du mode de réalisation 22, où ladite matriptase comprend une mutation qui réduit son activité, comparativement à un témoin. 29. La cellule de mammifère du mode de réalisation 28, où ladite matriptase comprend une mutation dans le domaine catalytique. 30. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 29, où la dihydrofolate réductase (DHFR) endogène de ladite cellule de mammifère est déficiente. 31. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 29, où la dihydrofolate réductase (DHFR) endogène de ladite cellule de mammifère est compétente. 32. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 31, où ledit fragment formant un complexe de la gH ne comprend pas la séquence signal d'une protéine gH pleine longueur. 33. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 32, où ledit fragment formant un complexe de la gH ne comprend pas le domaine transmembranaire d'une protéine gH pleine longueur. 34. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 33, où ledit fragment formant un complexe de la gH comprend 1'ectodomaine d'une protéine gH pleine longueur. 35. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 34, où ladite gH comprend une séquence choisie dans le groupe constitué des SEQ ID NO : 1, 2, 3, 4, et 5. 36. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 35, où ledit fragment formant un complexe de la gH (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; et (i i) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 1, SEQ ID NO : 2, SEQ ID NO : 3, SEQ ID NO : 4, ou SEQ ID NO : 5. 37. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 36, où ledit fragment formant un complexe de la gL ne comprend pas la séquence signal d'une protéine gL pleine longueur. 38. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 37, où ladite gL comprend une séquence choisie dans le groupe constitué des SEQ ID NO : 6, 7, 8, et 9. 39. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 38, où ledit fragment formant un complexe de la gL (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; et (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 6, SEQ ID NO : 7, SEQ ID NO : 8, ou SEQ ID NO : 9. 40. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 39, où ledit fragment formant un complexe de la pUL128 ne comprend pas la séquence signal d'une protéine pUL128 pleine longueur. 41. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 40, où ladite pUL128 comprend une séquence choisie dans le groupe constitué des SEQ ID NO : 10, 11, 12 et 13. 42. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 41, où ledit fragment formant un complexe de la pULl28 (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; et (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 10, SEQ ID NO : 11, SEQ ID NO : 12, ou SEQ ID NO : 13. 43. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 42, où ledit fragment formant un complexe de la pUL130 ne comprend pas la séquence signal d'une protéine pULl30 pleine longueur. 44. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 43, où ladite pUL130 comprend une séquence choisie dans le groupe constitué des SEQ ID NO : 14, 15, et 16. 45. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 44, où ledit fragment formant un complexe de la pULl30 (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; et (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 14, SEQ ID NO : 15, ou SEQ ID NO : 16. 46. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 45, où ledit fragment formant un complexe de la pUL131 ne comprend pas la séquence signal d'une protéine pUL131 pleine longueur. 47. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 46, où ladite pUL131 comprend une séquence choisie dans le groupe constitué des SEQ ID NO : 17, 18, 19, et 20. 48. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 47, où ledit fragment formant un complexe de la pUL131 (i) forme une partie du complexe pentamère gH/gL/pUL128/pUL130/pUL131 ; et (ii) comprend au moins un épitope provenant de SEQ ID NO : 17, SEQ ID NO : 18, SEQ ID NO : 19, ou SEQ ID NO : 20. 49. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 48, où ledit complexe pentamère est soluble. 50. La cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 49, où ledit complexe pentamère est sécrété à partir de la cellule hôte. 51. Une culture à grande échelle comprenant la cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 50, où ladite culture a une taille d'au moins 20 litres. 52. Une culture à grande échelle comprenant la cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 51, où ladite culture a une taille d'au moins 50 litres. 53. La culture à grande échelle du mode de réalisation 51 ou 52, où le rendement du complexe pentamère du CMV est d'au moins 0,05 g/1. 54. La culture à grande échelle du mode de réalisation 51 ou 52, où le rendement du complexe pentamère du CMV est d'au moins 0,1 g/1. 55. Un complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV) produit par la cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 50, ou la culture à grande échelle de l'un quelconque des modes de réalisation 51 à 54. 56. Une composition comprenant le complexe pentamère du mode de réalisation 55. 57 . Un procédé de production du complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV), où ledit complexe pentamère comprend : la gH ou l'un de ses fragments formant un complexe, la gL ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL128 ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL130 ou l'un de ses fragments formant un complexe, et la pUL131 ou l'un de ses fragments formant un complexe, comprenant : (i) la culture de la cellule de mammifère de l'un quelconque des modes de réalisation 1 à 50 dans des conditions appropriées, exprimant de cette façon ledit complexe pentamère ; et (ii) la récolte dudit complexe pentamère à partir de la culture. 58. Le procédé du mode de réalisation 57, comprenant en outre la purification dudit complexe pentamère. 59. Un complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV) produit par le procédé du mode de réalisation 57 ou 58. 60. Une composition comprenant le complexe pentamère du mode de réalisation 59. 61. La composition du mode de réalisation 56 ou 60, où ledit complexe pentamère a une pureté d'au moins 95 %, en masse. 62. La composition du mode de réalisation 61, comprenant en outre un adjuvant, comme un sel d'aluminium, ou le MF59. 63. La composition du mode de réalisation 61 ou 62, pour une utilisation dans l’induction d’une réponse immunitaire contre le CMV. 64 . Le complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV) du mode de réalisation 55, où ledit complexe pentamère est immunogène. 65. Le complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV) du mode de réalisation 64, où les anticorps dirigés contre ledit complexe pentamère sont des anticorps neutralisants. Légendes des figures
Liste des séquences <110> GLAXOSMITHKLINE BIOLOGICALS sa
<120> CELLULES DE MAMMIFERES EXPRIMANT DES ANTIGENES DU CYTOMEGALOVIRUS <130> VN56323 <14 0> 14191385.5 <141> 31-10-2014 <160> 39 <170> Patentln version 3.5
<210> 1 <211> 742 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(742) <223> /note="Souche Merlin" <400> 1
Met Arg Pro Gly Leu Pro Ser Tyr Leu Ile Ile Leu Ala Val Cys Leu 15 10 15
Phe Ser His Leu Leu Ser Ser Arg Tyr Gly Ala Glu Ala Val Ser Glu 20 25 30
Pro Leu Asp Lys Ala Phe His Leu Leu Leu Asn Thr Tyr Gly Arg Pro 35 40 45
Ile Arg Phe Leu Arg Glu Asn Thr Thr Gin Cys Thr Tyr Asn Ser Ser 50 55 60
Leu Arg Asn Ser Thr Val Val Arg Glu Asn Ala Ile Ser Phe Asn Phe 65 70 75 80
Phe Gin Ser Tyr Asn Gin Tyr Tyr Val Phe His Met Pro Arg Cys Leu 85 90 95
Phe Ala Gly Pro Leu Ala Glu Gin Phe Leu Asn Gin Val Asp Leu Thr 100 105 110
Glu Thr Leu Glu Arg Tyr Gin Gin Arg Leu Asn Thr Tyr Ala Leu Val 115 120 125
Ser Lys Asp Leu Ala Ser Tyr Arg Ser Phe Ser Gin Gin Leu Lys Ala 130 135 140
Gin Asp Ser Leu Gly Glu Gin Pro Thr Thr Val Pro Pro Pro Ile Asp 145 150 155 160
Leu Ser Ile Pro His Val Trp Met Pro Pro Gin Thr Thr Pro His Gly 165 170 175
Trp Thr Glu Ser His Thr Thr Ser Gly Leu His Arg Pro His Phe Asn 180 185 190
Gin Thr Cys Ile Leu Phe Asp Gly His Asp Leu Leu Phe Ser Thr Val 195 200 205
Thr Pro Cys Leu His Gin Gly Phe Tyr Leu Ile Asp Glu Leu Arg Tyr 210 215 220
Val Lys Ile Thr Leu Thr Glu Asp Phe Phe Val Val Thr Val Ser Ile 225 230 235 240
Asp Asp Asp Thr Pro Met Leu Leu Ile Phe Gly His Leu Pro Arg Val 245 250 255
Leu Phe Lys Ala Pro Tyr Gin Arg Asp Asn Phe Ile Leu Arg Gin Thr 260 265 270
Glu Lys His Glu Leu Leu Val Leu Val Lys Lys Asp Gin Leu Asn Arg 275 280 285
His Ser Tyr Leu Lys Asp Pro Asp Phe Leu Asp Ala Ala Leu Asp Phe 290 295 300
Asn Tyr Leu Asp Leu Ser Ala Leu Leu Arg Asn Ser Phe His Arg Tyr 305 310 315 320
Ala Val Asp Val Leu Lys Ser Gly Arg Cys Gin Met Leu Asp Arg Arg 325 330 335
Thr Val Glu Met Ala Phe Ala Tyr Ala Leu Ala Leu Phe Ala Ala Ala 340 345 350
Arg Gin Glu Glu Ala Gly Ala Gin Val Ser Val Pro Arg Ala Leu Asp 355 360 365
Arg Gin Ala Ala Leu Leu Gin Ile Gin Glu Phe Met Ile Thr Cys Leu 370 375 380
Ser Gin Thr Pro Pro Arg Thr Thr Leu Leu Leu Tyr Pro Thr Ala Val 385 390 395 400
Asp Leu Ala Lys Arg Ala Leu Trp Thr Pro Asn Gin Ile Thr Asp Ile 405 410 415
Thr Ser Leu Val Arg Leu Val Tyr Ile Leu Ser Lys Gin Asn Gin Gin 420 425 430
His Leu Ile Pro Gin Trp Ala Leu Arg Gin Ile Ala Asp Phe Ala Leu 435 440 445
Lys Leu His Lys Thr His Leu Ala Ser Phe Leu Ser Ala Phe Ala Arg 450 455 460
Gin Glu Leu Tyr Leu Met Gly Ser Leu Val His Ser Met Leu Val His 465 470 475 480
Thr Thr Glu Arg Arg Glu Ile Phe Ile Val Glu Thr Gly Leu Cys Ser 485 490 495
Leu Ala Glu Leu Ser His Phe Thr Gin Leu Leu Ala His Pro His His 500 505 510
Glu Tyr Leu Ser Asp Leu Tyr Thr Pro Cys Ser Ser Ser Gly Arg Arg 515 520 525
Asp His Ser Leu Glu Arg Leu Thr Arg Leu Phe Pro Asp Ala Thr Val 530 535 540
Pro Ala Thr Val Pro Ala Ala Leu Ser Ile Leu Ser Thr Met Gin Pro 545 550 555 560
Ser Thr Leu Glu Thr Phe Pro Asp Leu Phe Cys Leu Pro Leu Gly Glu 565 570 575
Ser Phe Ser Ala Leu Thr Val Ser Glu His Val Ser Tyr Ile Val Thr 580 585 590
Asn Gin Tyr Leu Ile Lys Gly Ile Ser Tyr Pro Val Ser Thr Thr Val 595 600 605
Val Gly Gin Ser Leu Ile Ile Thr Gin Thr Asp Ser Gin Thr Lys Cys 610 615 620
Glu Leu Thr Arg Asn Met Hls Thr Thr Hls Ser Ile Thr Val Ala Leu 625 630 635 640
Asn Ile Ser Leu Glu Asn Cys Ala Phe Cys Gin Ser Ala Leu Leu Glu 645 650 655
Tyr Asp Asp Thr Gin Gly Val Ile Asn Ile Met Tyr Met His Asp Ser 660 665 670
Asp Asp Val Leu Phe Ala Leu Asp Pro Tyr Asn Glu Val Val Val Ser 675 680 685
Ser Pro Arg Thr His Tyr Leu Met Leu Leu Lys Asn Gly Thr Val Leu 690 695 700
Glu Val Thr Asp Val Val Val Asp Ala Thr Asp Ser Arg Leu Leu Met 705 710 715 720
Met Ser Val Tyr Ala Leu Ser Ala Ile Ile Gly Ile Tyr Leu Leu Tyr 725 730 735
Arg Met Leu Lys Thr Cys 740
<210> 2 <211> 742 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <220> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1) .. (742) <223> /note="Souche Towne" <400> 2
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<210> 3 <211> 743 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(743) <223> /note="Souche AD169" <400> 3
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<210> 4 <211> 715 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <220> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(715) <223> /note=”Souche Merlin" <400> 4
Met Arg Pro Gly Leu Pro Ser Tyr Leu Ile Ile Leu Ala Val Cys Leu 15 10 15
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<210> 5 <211> 692 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(692) <223> /note="Souche Merlin" <400> 5
Arg Tyr Gly Ala Glu Ala Val Ser Glu Pro Leu Asp Lys Ala Phe His 15 10 15
Leu Leu Leu Asn Thr Tyr Gly Arg Pro Ile Arg Phe Leu Arg Glu Asn 20 25 30
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Leu Leu Arg Asn Ser Phe His Arg Tyr Ala Val Asp Val Leu Lys Ser 290 295 300
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Ile Gin Glu Phe Met Ile Thr Cys Leu Ser Gin Thr Pro Pro Arg Thr 355 360 365
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<210> 7 <211> 278 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <220> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(278) <223> /note=”Souche Towne" <400> 7
Met Cys Arg Arg Pro Asp Cys Gly Phe Ser Phe Ser Pro Gly Pro Val 15 10 15
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<210> 8 <211> 278 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <220> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(278) <223> /note=”Souche ÄD169" <400> 8
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<210> 9 <211> 248 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(248) <223> /note=”Souche Merlin" <400> 9
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Asp Pro Pro Leu Leu Arg His Leu Asp Lys Tyr Tyr Ala Gly Leu Pro 210 215 220
Pro Glu Leu Lys Gin Thr Arg Val Asn Leu Pro Ala His Ser Arg Tyr 225 230 235 240
Gly Pro Gin Ala Val Asp Ala Arg 245
<210> 10 <211> 130 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(130) <223> /note="Souche Merlin" <400> 10
Met Ser Pro Lys Asp Leu Thr Pro Phe Leu Thr Ala Leu Trp Leu Leu 15 10 15
Leu Gly His Ser Arg Val Pro Arg Val Arg Ala Glu Glu Cys Cys Glu 20 25 30
Phe Ile Asn Val Asn His Pro Pro Glu Arg Cys Tyr Asp Phe Lys Met 35 40 45
Cys Asn Arg Phe Thr Val Ala Leu Arg Cys Pro Asp Gly Glu Val Cys 50 55 60
Tyr Ser Pro Glu Lys Thr Ala Glu Ile Arg Gly Ile Val Thr Thr Met 65 70 75 80
Thr His Ser Leu Thr Arg Gin Val Val His Asn Lys Leu Thr Ser Cys 85 90 95
Asn Tyr Asn Pro Leu Tyr Leu Glu Ala Asp Gly Arg Ile Arg Cys Gly 100 105 110
Lys Val Asn Asp Lys Ala Gin Tyr Leu Leu Gly Ala Ala Gly Ser Val 115 120 125
Pro Tyr 130
<210> 11 <211> 171 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1) . . (171) <223> /note="Souche Towne" <400> 11
Met Ser Pro Lys Asn Leu Thr Pro Phe Leu Thr Ala Leu Trp Leu Leu 15 10 15
Leu Gly His Ser Arg Val Pro Arg Val Arg Ala Glu Glu Cys Cys Glu 20 25 30
Phe Ile Asn Val Asn His Pro Pro Glu Arg Cys Tyr Asp Phe Lys Met 35 40 45
Cys Asn Arg Phe Thr Val Ala Leu Arg Cys Pro Asp Gly Glu Val Cys 50 55 60
Tyr Ser Pro Glu Lys Thr Ala Glu Ile Arg Gly Ile Val Thr Thr Met 65 70 75 80
Thr His Ser Leu Thr Arg Gin Val Val His Asn Lys Leu Thr Ser Cys 85 90 95
Asn Tyr Asn Pro Leu Tyr Leu Glu Ala Asp Gly Arg Ile Arg Cys Gly 100 105 110
Lys Val Asn Asp Lys Ala Gin Tyr Leu Leu Gly Ala Ala Gly Ser Val 115 120 125
Pro Tyr Arg Trp Ile Asn Leu Glu Tyr Asp Lys Ile Thr Arg Ile Val 130 135 140
Gly Leu Asp Gin Tyr Leu Glu Ser Val Lys Lys His Lys Arg Leu Asp 145 150 155 160
Val Cys Arg Ala Lys Met Gly Tyr Met Leu Gin 165 170
<210> 12 <211> 171 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1) . . (171) <223> /note="Souche ÄD169" <400> 12
Met Ser Pro Lys Asp Leu Thr Pro Phe Leu Thr Thr Leu Trp Leu Leu 15 10 15
Leu Gly His Ser Arg Val Pro Arg Val Arg Ala Glu Glu Cys Cys Glu 20 25 30
Phe Ile Asn Val Asn His Pro Pro Glu Arg Cys Tyr Asp Phe Lys Met 35 40 45
Cys Asn Arg Phe Thr Val Ala Leu Arg Cys Pro Asp Gly Glu Val Cys 50 55 60
Tyr Ser Pro Glu Lys Thr Ala Glu Ile Arg Gly Ile Val Thr Thr Met 65 70 75 80
Thr His Ser Leu Thr Arg Gin Val Val His Asn Lys Leu Thr Ser Cys 85 90 95
Asn Tyr Asn Pro Leu Tyr Leu Glu Ala Asp Gly Arg Ile Arg Cys Gly 100 105 110
Lys Val Asn Asp Lys Ala Gin Tyr Leu Leu Gly Ala Ala Gly Ser Val 115 120 125
Pro Tyr Arg Trp Ile Asn Leu Glu Tyr Asp Lys Ile Thr Arg Ile Val 130 135 140
Gly Leu Asp Gin Tyr Leu Glu Ser Val Lys Lys His Lys Arg Leu Asp 145 150 155 160
Val Cys Arg Ala Lys Met Gly Tyr Met Leu Gin 165 170
<210> 13 <211> 144 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <400> 13
Glu Glu Cys Cys Glu Phe Ile Asn Val Asn His Pro Pro Glu Arg Cys 15 10 15
Tyr Asp Phe Lys Met Cys Asn Arg Phe Thr Val Ala Leu Arg Cys Pro 20 25 30
Asp Gly Glu Val Cys Tyr Ser Pro Glu Lys Thr Ala Glu Ile Arg Gly 35 40 45
Ile Val Thr Thr Met Thr His Ser Leu Thr Arg Gin Val Val His Asn 50 55 60
Lys Leu Thr Ser Cys Asn Tyr Asn Pro Leu Tyr Leu Glu Ala Asp Gly 65 70 75 80
Arg Ile Arg Cys Gly Lys Val Asn Asp Lys Ala Gin Tyr Leu Leu Gly 85 90 95
Ala Ala Gly Ser Val Pro Tyr Arg Trp Ile Asn Leu Glu Tyr Asp Lys 100 105 110
Ile Thr Arg Ile Val Gly Leu Asp Gin Tyr Leu Glu Ser Val Lys Lys 115 120 125
His Lys Arg Leu Asp Val Cys Arg Ala Lys Met Gly Tyr Met Leu Gin 130 135 140
<210> 14 <211> 214 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(214) <223> /note="Souche Merlin" <400> 14
Met Leu Arg Leu Leu Leu Arg His His Phe His Cys Leu Leu Leu Cys 15 10 15
Ala Val Trp Ala Thr Pro Cys Leu Ala Ser Pro Trp Ser Thr Leu Thr 20 25 30
Ala Asn Gin Asn Pro Ser Pro Pro Trp Ser Lys Leu Thr Tyr Ser Lys 35 40 45
Pro His Asp Ala Ala Thr Phe Tyr Cys Pro Phe Leu Tyr Pro Ser Pro 50 55 60
Pro Arg Ser Pro Leu Gin Phe Ser Gly Phe Gin Arg Val Ser Thr Gly 65 70 75 80
Pro Glu Cys Arg Asn Glu Thr Leu Tyr Leu Leu Tyr Asn Arg Glu Gly 85 90 95
Gin Thr Leu Val Glu Arg Ser Ser Thr Trp Val Lys Lys Val Ile Trp 100 105 110
Tyr Leu Ser Gly Arg Asn Gin Thr Ile Leu Gin Arg Met Pro Arg Thr 115 120 125
Ala Ser Lys Pro Ser Asp Gly Asn Val Gin Ile Ser Val Glu Asp Ala 130 135 140
Lys Ile Phe Gly Ala His Met Val Pro Lys Gin Thr Lys Leu Leu Arg 145 150 155 160
Phe Val Val Asn Asp Gly Thr Arg Tyr Gin Met Cys Val Met Lys Leu 165 170 175
Glu Ser Trp Ala His Val Phe Arg Asp Tyr Ser Val Ser Phe Gin Val 180 185 190
Arg Leu Thr Phe Thr Glu Ala Asn Asn Gin Thr Tyr Thr Phe Cys Thr 195 200 205
His Pro Asn Leu Ile Val 210
<210> 15 <211> 229 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <220> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(229) <223> /note=”Souche Towne" <400> 15
Met Leu Arg Leu Leu Leu Arg His His Phe His Cys Leu Leu Leu Cys 15 10 15
Ala Val Trp Ala Thr Pro Cys Leu Ala Ser Pro Trp Ser Thr Leu Ihr 20 25 30
Ala Asn Gin Asn Pro Ser Pro Pro Trp Ser Lys Leu Thr Tyr Ser Lys 35 40 45
Pro His Asp Ala Ala Thr Phe Tyr Cys Pro Phe Leu Tyr Pro Ser Pro 50 55 60
Pro Arg Ser Pro Leu Gin Phe Ser Gly Phe Gin Arg Val Leu Thr Gly 65 70 75 80
Pro Glu Cys Arg Asn Glu Thr Leu Tyr Leu Leu Tyr Asn Arg Glu Gly 85 90 95
Gin Thr Leu Val Glu Arg Ser Ser Thr Trp Val Lys Lys Val Ile Trp 100 105 110
Tyr Leu Ser Gly Arg Asn Gin Thr Ile Leu Gin Arg Met Pro Arg Thr 115 120 125
Ala Ser Lys Pro Ser Asp Gly Asn Val Gin Ile Ser Val Glu Asp Ala 130 135 140
Lys Ile Phe Gly Ala His Met Val Pro Lys Gin Thr Lys Leu Leu Arg 145 150 155 160
Phe Val Val Asn Asp Gly Thr Arg Tyr Gin Met Cys Val Met Lys Leu 165 170 175
Glu Ser Trp Ala His Val Phe Arg Asp Tyr Ser Val Ser Phe Gin Val 180 185 190
Arg Leu Thr Phe Thr Glu Ala Asn Asn Gin Thr Phe Thr Pro Ser Ala 195 200 205
Pro Ile Pro Ile Ser Ser Phe Glu Pro Val Ala Arg Ala Gly Asn Phe 210 215 220
Glu Asn Arg Ala Ser 225
<210> 16 <211> 189 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(189) <223> /note="Souche Merlin" <400> 16
Ser Pro Trp Ser Thr Leu Thr Ala Asn Gin Asn Pro Ser Pro Pro Trp 15 10 15
Ser Lys Leu Thr Tyr Ser Lys Pro His Asp Ala Ala Thr Phe Tyr Cys 20 25 30
Pro Phe Leu Tyr Pro Ser Pro Pro Arg Ser Pro Leu Gin Phe Ser Gly 35 40 45
Phe Gin Arg Val Ser Thr Gly Pro Glu Cys Arg Asn Glu Thr Leu Tyr 50 55 60
Leu Leu Tyr Asn Arg Glu Gly Gin Thr Leu Val Glu Arg Ser Ser Thr 65 70 75 80
Trp Val Lys Lys Val Ile Trp Tyr Leu Ser Gly Arg Asn Gin Thr Ile 85 90 95
Leu Gin Arg Met Pro Arg Thr Ala Ser Lys Pro Ser Asp Gly Asn Val 100 105 110
Gin Ile Ser Val Glu Asp Ala Lys Ile Phe Gly Ala His Met Val Pro 115 120 125
Lys Gin Thr Lys Leu Leu Arg Phe Val Val Asn Asp Gly Thr Arg Tyr 130 135 140
Gin Met Cys Val Met Lys Leu Glu Ser Trp Ala His Val Phe Arg Asp 145 150 155 160
Tyr Ser Val Ser Phe Gin Val Arg Leu Thr Phe Thr Glu Ala Asn Asn 165 170 175
Gin Thr Tyr Thr Phe Cys Thr His Pro Asn Leu Ile Val 180 185
<210> 17 <211> 129 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <220> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(129) <223> /note=”Souche Merlin" <400> 17
Met Arg Leu Cys Arg Val Trp Leu Ser Val Cys Leu Cys Ala Val Val 15 10 15
Leu Gly Gin Cys Gin Arg Glu Thr Ala Glu Lys Asn Asp Tyr Tyr Arg 20 25 30
Val Pro His Tyr Trp Asp Ala Cys Ser Arg Ala Leu Pro Asp Gin Thr 35 40 45
Arg Tyr Lys Tyr Val Glu Gin Leu Val Asp Leu Thr Leu Asn Tyr His 50 55 60
Tyr Asp Ala Ser His Gly Leu Asp Asn Phe Asp Val Leu Lys Arg Ile 65 70 75 80
Asn Val Thr Glu Val Ser Leu Leu Ile Ser Asp Phe Arg Arg Gin Asn 85 90 95
Arg Arg Gly Gly Thr Asn Lys Arg Thr Thr Phe Asn Ala Ala Gly Ser 100 105 110
Leu Ala Pro His Ala Arg Ser Leu Glu Phe Ser Val Arg Leu Phe Ala 115 120 125
Asn
<210> 18 <211> 129 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <22 0> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(129) <223> /note="Souche Towne" <400> 18
Met Arg Leu Cys Arg Val Trp Leu Ser Val Cys Leu Cys Ala Val Val 15 10 15
Leu Gly Gin Cys Gin Arg Glu Thr Ala Glu Lys Asn Asp Tyr Tyr Arg 20 25 30
Val Pro His Tyr Trp Asp Ala Cys Ser Arg Ala Leu Pro Asp Gin Thr 35 40 45
Arg Tyr Lys Tyr Val Glu Gin Leu Val Asp Leu Thr Leu Asn Tyr His 50 55 60
Tyr Asp Ala Ser His Gly Leu Asp Asn Phe Asp Val Leu Lys Arg Ile 65 70 75 80
Asn Val Thr Glu Val Ser Leu Leu Ile Ser Asp Phe Arg Arg Gin Asn 85 90 95
Arg Arg Gly Gly Thr Asn Lys Arg Thr Thr Phe Asn Ala Ala Gly Ser 100 105 110
Leu Ala Pro His Ala Arg Ser Leu Glu Phe Ser Val Arg Leu Phe Ala 115 120 125
Asn
<210> 19 <211> 74 <212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <220> <221> AUTRE(S) CARACTERISTIQUE(S) <222> (1)..(74) <223> /note=”Souche AD169" <400> 19
Met Arg Leu Cys Arg Val Trp Leu Ser Val Cys Leu Cys Ala Val Val 15 10 15
Leu Gly Gin Cys Gin Arg Glu Thr Ala Glu Lys Lys Arg Leu Leu Pro 20 25 30
Ser Thr Ala Leu Leu Gly Arg Val Leu Ser Arg Ala Ala Arg Pro Asn 35 40 45
Pro Leu Gin Val Cys Gly Thr Ala Arg Gly Pro His Val Glu Leu Pro 50 55 60
Leu Arg Cys Glu Pro Arg Leu Gly Gin Leu 65 70 <210> 20 <211> 111
<212> PRT <213> Herpèsvirus 5 humain <400> 20
Gin Cys Gin Arg Glu Thr Ala Glu Lys Asn Asp Tyr Tyr Arg Val Pro 15 10 15
His Tyr Trp Asp Ala Cys Ser Arg Ala Leu Pro Asp Gin Thr Arg Tyr 20 25 30
Lys Tyr Val Glu Gin Leu Val Asp Leu Thr Leu Asn Tyr His Tyr Asp 35 40 45
Ala Ser His Gly Leu Asp Asn Phe Asp Val Leu Lys Arg Ile Asn Val 50 55 60
Thr Glu Val Ser Leu Leu Ile Ser Asp Phe Arg Arg Gin Asn Arg Arg 65 70 75 80
Gly Gly Thr Asn Lys Arg Thr Thr Phe Asn Ala Ala Gly Ser Leu Ala 85 90 95
Pro His Ala Arg Ser Leu Glu Phe Ser Val Arg Leu Phe Ala Asn 100 105 110
<210> 21 <211> 1547 <212> PRT <213> Cricetulus griseus <400> 21
Met Asn Trp Asn Ala Lys Pro Glu Asn Ala Ala Pro Asn Pro Pro Tyr 15 10 15
Ser Lys Ser Gin Ser Ser Leu Leu Gin Gin Phe Leu Met Pro Ser Thr 20 25 30
Thr Ser Gin Ser Ser Phe Ser Cys Leu Pro His Asn Gin Glu Ala Cys 35 40 45
Ile Tyr Pro Thr Asn Ser Asn Ser Val Ser Gin Pro Leu Leu Asn Val 50 55 60
Arg Ser Phe Ile Asn Pro Pro Ile Ser Val Ser Asn Val His Asn Arg 65 70 75 80
Thr Val Val Ala Ser Gin Thr Ser Val Glu Arg Val Thr Tyr Thr Asn 85 90 95
Val Lys Gly Ala Gin Gin Pro Asn His Asn Leu Gin Thr Val Ser Ser 100 105 110
Gly Val Val Gin Asn Ala Trp Met Asn Ser Thr Met Arg Asn Phe Met 115 120 125
Pro Ser Leu Thr Glu Ala Thr Ile Ser His Lys Pro Asp Gly Gly Pro 130 135 140
Ser Met Pro Tyr Met His Ala Pro Gin Ser His Leu Val Thr Ser Asp 145 150 155 160
Thr Tyr Ser Val Gin Leu Gin Met Thr Pro Ser Asn Ser Val Arg Gly 165 170 175
Pro Val Thr Tyr Gin Gly Asn Tyr Gin Gly Asn Pro Gly Leu Asn His 180 185 190
Ser Met Ala Gly Glu Leu Gly Trp Val Gin Cys Ala Ser Ser Glu Leu 195 200 205
Thr Tyr Pro Asp Tyr Arg Pro Pro Pro Lys Gin Tyr Pro Tyr Leu Pro 210 215 220
Gin Ser Phe Val Gin Asp Thr Ser Val Gin Lys Gin Asn Phe Val Ser 225 230 235 240
Ser Thr Ser Leu Gin Val Lys Asn Asn Gin Leu Pro Pro Ser Thr Gin 245 250 255
Thr Leu Pro Ser Lys Arg Pro Val Pro Val Ser Ser Tyr Gin Tyr Ala 260 265 270
Ala Glu Thr Ser Lys Arg Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Ser Cys Arg Tyr 275 280 285
Gly Ser Gin His Val Gin Asn Ser Gin Ser Val Ser Arg His Leu Pro 290 295 300
Val Glu Val Pro Gin Ser Ser Glu Met His Ser Ser Glu Lys Lys Lys 305 310 315 320
Asp Ala Tyr Lys Val Phe Gin Gin Gin Trp Gin Ser Thr Ser Lys Asn 325 330 335
Val Ser Thr Ile Gly Lys Phe Cys Glu Leu Lys Ile Asn Thr Lys Gin 340 345 350
Ser Tyr Asn Asp Ser Ala Gly Ser Ser Gly Asp Gly Val His Thr Leu 355 360 365
Val Gin Asn Asn Gin Glu Glu Arg Lys Tyr Ser Tyr Asn Pro Ser Thr 370 375 380
Asn Gin Ile Leu Asp Thr Asn Val Thr Lys Glu Lys Leu Val Arg Asp 385 390 395 400
Ile Lys Ser Leu Val Glu Ile Lys Lys Lys Phe Ser Glu Leu Ala Arg 405 410 415
Lys Ile Lys Ile Asn Lys Lys Leu Leu Met Ala Ala Gly Cys Ser Lys 420 425 430
Thr Ala Asn Thr Ser Tyr Thr Glu Pro Thr Arg His Ser Glu Phe Ser 435 440 445
Ala Lys Glu Met Ser Ala Lys Arg Asp Asn Gin Cys Ser Met Glu Leu 450 455 460
Leu Ala Thr Cys Leu Ser Leu Trp Lys Asn Gin Pro Pro Lys Thr Thr 465 470 475 480
Glu Glu Asn Val Ser Lys Pro Leu Glu Glu Lys Gin Tyr Asn Ala Ser 485 490 495
Arg Thr Ser Thr Thr Ala Val Gly Pro Ser Asn Pro Met Asn Glu Val 500 505 510
His Val Lys Asn Phe Cys Ser Gly Val Arg Asn Ser Gin Lys Ile Thr 515 520 525
Thr Ser Ser Gin Thr Val Leu Ser Val Leu Thr Pro Val Tyr Asp Ser 530 535 540
Ser Asp Val Ala Val Gly Lys Gly Thr Glu Leu Gin Ile Ala Val Val 545 550 555 560
Ser Pro Leu Ile Leu Ser Asp Val Ser Thr Val Pro Gly Lys Glu Leu 565 570 575
Ala Pro Glu Val Val Ser Glu Thr Val Tyr Pro Val Val Lys Glu Gly 580 585 590
Ser Val Cys Ser Leu Gin Asn Gin Gin Ala Glu Asn Ala Thr Val Thr 595 600 605
Ala Gly Leu Pro Phe Asp Val Ile Arg Ala Val Ala Ser Ala Thr Val 610 615 620
Ser Ala Glu Leu Ser Leu Pro Gly His Lys Glu Lys Gin His Lys Pro 625 630 635 640
Thr Gin Ser Asp Leu Asp Ile Ala Asp Gly Ser Leu Gly Lys His Ser 645 650 655
Pro Gin Gly Ala Glu Ala Leu Pro Asn Pro Arg Asp Ser Thr Ile Val 660 665 670
Ser Gly Pro Ile Leu Gin Ile Glu Ser Ile Cys Ser Leu Ala Glu Gly 675 680 685
Asp Val Ser Tyr Asn Ser Gin Ile Ala Glu Ile Phe Asn Ser Val Gin 690 695 700
Asn Glu Pro Gin Lys Pro Ser Pro Asp Gin Gin Val Ile Asn Ser Gin 705 710 715 720
Gin Glu Glu Gin Val Asp Lys Val Ala Glu Asn Lys Asp Leu Ser Phe 725 730 735
Leu Lys Asp Lys Cys Met Gin Cys Thr Asp Val Pro His Glu Val Thr 740 745 750
Glu Gin Pro Glu Pro Leu Gin Pro Leu Glu Thr Thr Ser Asp Glu Tyr 755 760 765
Val Glu Ala Asn Gly Glu Ile Leu Glu Glu Ser Ser Lys Glu Asn Pro 770 775 780
Gly Glu Lys Glu Met Thr Lys Asp Ile Leu Cys Ser Pro Ala Ala Val 785 790 795 800
Gin Gin Asp Pro Gin Pro Gin Glu Ile Asp Thr Ala Ser Ser Lys Ser 805 810 815
Gly His Ser Phe Ser Thr Val Asn Glu Ile Asn Asp Glu Asn Glu Pro 820 825 830
Val Ser Tyr Leu His Asp Gin Leu Leu Glu Leu Leu Lys Glu Phe Pro 835 840 845
Tyr Gly Ile Glu Thr Ile Ala Arg Pro Glu Val Tyr Val Gly Gin Gin 850 855 860
Lys Thr His Glu Ile Leu Glu Asn Gin Thr Gly Ser Lys Thr Gly Asn 865 870 875 880
Val Ser Gly Asp Asn Thr Asp Gin Ile Lys Ile Thr Val Leu Asn Ser 885 890 895
Glu Gin Ile Lys Glu Leu Phe Pro Glu Glu Asp Gin Pro Cys Asp Val 900 905 910
Asp Lys Leu Ala Glu Pro Glu Asn Thr Lys Ile Ile Ala Glu Val Lys 915 920 925
Ser Leu Cys Asp Ser Gin Val Pro Arg Glu Glu Ser His Asn Pro Gly 930 935 940
Met Leu Asp Leu Glu Lys Asp Lys Ile His Cys Cys Ala Leu Gly Trp 945 950 955 960
Leu Ser Met Val Tyr Glu Gly Val Pro Gin Cys Gin Cys Ser Ser Met 965 970 975
Glu Glu Lys Glu Lys Asp Gin Cys Ser Leu Glu Ile Ser Asn Cys Lys 980 985 990
Gin Gly Glu Gin Ala Cys Asn Ser Gly Ile Thr Ile Phe Glu Ile Asn 995 1000 1005
Pro Ile Ser Asn Asn Ser Lys Ser Pro Leu Ile Gin Glu Ser Glu 1010 1015 1020
Lys Gly His Phe Ser Asp Ile His Gly Glu Lys Ile Lys Thr Ser 1025 1030 1035
Glu Thr Lys Asn Ser Ser Ser Pro Arg Val Glu Gin Glu Leu Thr 1040 1045 1050
Gly His Phe Ser Met Lys Cys Tyr Gin Lys Asp Lys Ser Thr Thr 1055 1060 1065
Lys Gin Asp Ser Ser Leu Lys Thr Glu Gin Lys Ile Lys Asn Leu 1070 1075 1080
Ser Ser Lys Cys Asp Lys Pro Asn Pro Leu Lys Ser Ser Lys Ile 1085 1090 1095
Pro Thr Pro Glu Thr Phe Asn Val Val Thr Ser Asn Ser Asp Lys 1100 1105 1110
Asn Met Pro Ala Phe Ser Lys Gin Asp Ser Gin Gly Ser Leu Gin 1115 1120 1125
Lys Lys His Leu Phe Gin Asp Ser Asp Pro Val Lys Gly His Val 1130 1135 1140
Trp Leu Leu Pro Asn Lys Asp Pro Arg Arg Arg Asn Thr Phe Leu 1145 1150 1155
Val Gin Ser Val Ser Pro Glu Lys Lys Lys Leu Lys Phe Lys Ser 1160 1165 1170
Gly Ser Ser Lys Leu Lys Tyr Phe Glu Lys Arg Lys Met Asp His 1175 1180 1185
Leu Leu Ile Ser Asp Val Glu Ile Lys Lys Lys Lys Tyr Glu Lys 1190 1195 1200
Gin Glu Gin Asn Lys Asn Ala Gly Gly Thr Leu Lys Leu Cys Ser 1205 1210 1215
Thr Leu Thr Glu Pro Asn Glu Arg Ala Cys Ala Lys Glu Lys Ile 1220 1225 1230
Val Thr Asn Ser Glu Pro Ser Asp Ser Lys Gly Ser Ser Ser Lys 1235 1240 1245
Ser Thr Arg Val Ile Thr Val Gin Glu Tyr Leu Gin Arg Lys Lys 1250 1255 1260
Asp Lys His Val Ile Gly Asn Asn Ala Ser Lys Asn Ile Cys Val 1265 1270 1275
Glu Asn Val Pro Cys Asp Ser Glu Pro Met Lys Ser Ser Lys His 1280 1285 1290
Ser Ala Ser Pro Ser Leu Gly Lys Leu Ile Glu Gly Gin Gly Val 1295 1300 1305
Ser Ala Glu Thr Leu Lys Glu Val Glu His Asn Ser Thr Ser His 1310 1315 1320
Gly Lys Asn Leu Lys Thr His Arg Ser Glu Glu Thr Arg Pro Tyr 1325 1330 1335
Ser Val Ser Asn Ser Lys Glu Lys Phe Tyr Arg Thr His Pro Asp 1340 1345 1350
Lys Ser Tyr Ile Asp Lys Ala Lys Leu Glu Arg Leu Thr Ser Met 1355 1360 1365
Ser Ser Lys Ser Ser Gin Leu Gin Val Lys Glu Lys Arg Lys Gin 1370 1375 1380
Tyr Leu Asn Arg Val Ala Phe Lys Cys Thr Glu Gin Glu Ser Ile 1385 1390 1395
Cys Leu Thr Lys Leu Asp Ser Ala Ser Lys Lys Leu Ser Lys Glu 1400 1405 1410
Lys Glu Lys Ser Thr Ala Cys Ala Pro Met Thr Lys Asp Tyr Thr 1415 1420 1425
His Lys Pro Met Leu Glu Phe Lys Leu Cys Pro Asp Val Leu Leu 1430 1435 1440
Lys Asn Thr Ser Ser Ile Asp Lys Gly Asp Asp Pro Arg Pro Gly 1445 1450 1455
Pro Glu Lys Glu Arg Ala Pro Val Gin Val Ser Gly Ile Lys Thr 1460 1465 1470
Thr Lys Glu Asp Trp Leu Lys Cys Ile Pro Thr Arg Thr Lys Met 1475 1480 1485
Pro Glu Ser Ser Glu Gin Thr Asp Arg Ala Asp Ser Arg Leu Ser 1490 1495 1500
Lys Arg Ser Phe Ser Ala Asp Glu Phe Glu Thr Leu Gin Asn Pro 1505 1510 1515
Val Lys Asp Ser Asn Val Met Phe Arg Thr Phe Lys Lys Met Tyr 1520 1525 1530
Leu Glu Lys Arg Ser Arg Ser Leu Gly Ser Ser Pro Val Lys 1535 1540 1545
<210> 22 <211> 1515 <212> PRT <213> Cricetinae sp. <22 0> <221> RESIDU MODIFIE <222> (879)..(879) <223> Tout acide aminé <400> 22
Met Asn Trp Asn Ala Lys Pro Glu Asn Ala Ala Pro Asn Pro Pro Tyr 15 10 15
Ser Lys Ser Gin Ser Ser Leu Leu Gin Gin Phe Leu Met Pro Ser Thr 20 25 30
Thr Ser Gin Ser Ser Phe Ser Cys Leu Pro His Asn Gin Glu Ala Cys 35 40 45
Ile Tyr Pro Thr Asn Ser Asn Ser Val Ser Gin Pro Leu Leu Asn Val 50 55 60
Arg Ser Phe Ile Asn Pro Pro Ile Ser Val Ser Asn Val His Asn Arg 65 70 75 80
Thr Val Val Ala Ser Gin Thr Ser Val Glu Arg Val Thr Tyr Thr Asn 85 90 95
Val Lys Gly Ala Gin Gin Pro Asn His Asn Leu Gin Thr Val Ser Ser 100 105 110
Gly Val Val Gin Asn Ala Trp Met Asn Ser Thr Met Arg Asn Phe Met 115 120 125
Pro Ser Leu Thr Glu Ala Thr Ile Ser His Lys Pro Asp Gly Gly Pro 130 135 140
Ser Met Pro Tyr Met His Ala Pro Gin Ser His Leu Val Thr Ser Asp 145 150 155 160
Thr Tyr Ser Val Gin Leu Gin Met Thr Pro Ser Asn Ser Val Arg Gly 165 170 175
Pro Val Thr Tyr Gin Gly Asn Tyr Gin Gly Asn Pro Gly Leu Asn His 180 185 190
Ser Met Ala Gly Glu Leu Gly Trp Val Gin Cys Ala Ser Ser Glu Leu 195 200 205
Thr Tyr Pro Asp Tyr Arg Pro Pro Pro Lys Gin Tyr Pro Tyr Leu Pro 210 215 220
Gin Ser Phe Val Gin Asp Thr Ser Val Gin Lys Gin Asn Phe Val Ser 225 230 235 240
Ser Thr Ser Leu Gin Val Lys Asn Asn Gin Leu Pro Pro Ser Thr Gin 245 250 255
Thr Leu Pro Ser Lys Arg Pro Val Pro Val Ser Ser Tyr Gin Tyr Ala 260 265 270
Ala Glu Thr Ser Lys Arg Leu Pro Pro Pro Pro Tyr Ser Cys Arg Tyr 275 280 285
Gly Ser Gin His Val Gin Asn Ser Gin Ser Val Ser Arg His Leu Pro 290 295 300
Val Glu Val Pro Gin Ser Ser Glu Met His Ser Ser Glu Lys Lys Lys 305 310 315 320
Asp Ala Tyr Lys Val Phe Gin Gin Gin Trp Gin Ser Thr Ser Lys Asn 325 330 335
Val Ser Thr Ile Gly Lys Phe Cys Glu Leu Lys Ile Asn Thr Lys Gin 340 345 350
Ser Tyr Asn Asp Ser Ala Gly Ser Ser Gly Asp Gly Val His Thr Leu 355 360 365
Val Gin Asn Asn Gin Glu Glu Arg Lys Tyr Ser Tyr Asn Pro Ser Thr 370 375 380
Asn Gin Ile Leu Asp Thr Asn Val Thr Lys Glu Lys Leu Val Arg Asp 385 390 395 400
Ile Lys Ser Leu Val Glu Ile Ser Trp Ala Met Val Ala His Ser Glu 405 410 415
Phe Ser Ala Lys Glu Met Ser Ala Lys Arg Asp Asn Gin Cys Ser Met 420 425 430
Glu Leu Leu Ala Thr Cys Leu Ser Leu Trp Lys Asn Gin Pro Pro Lys 435 440 445
Thr Thr Glu Glu Asn Val Ser Lys Pro Leu Glu Glu Lys Gin Tyr Asn 450 455 460
Ala Ser Arg Thr Ser Thr Thr Ala Val Gly Pro Ser Asn Pro Met Asn 465 470 475 480
Glu Val His Val Lys Asn Phe Cys Ser Gly Val Arg Asn Ser Gin Lys 485 490 495
Ile Thr Thr Ser Ser Gin Thr Val Leu Ser Val Leu Thr Pro Val Tyr 500 505 510
Asp Ser Ser Asp Val Ala Val Gly Lys Gly Thr Glu Leu Gin Ile Ala 515 520 525
Val Val Ser Pro Leu Ile Leu Ser Asp Val Ser Thr Val Pro Gly Lys 530 535 540
Glu Leu Ala Pro Glu Val Val Ser Glu Thr Val Tyr Pro Val Val Lys 545 550 555 560
Glu Gly Ser Val Cys Ser Leu Gin Asn Gin Gin Ala Glu Asn Ala Thr 565 570 575
Val Thr Ala Gly Leu Pro Phe Asp Val Ile Arg Ala Val Ala Ser Ala 580 585 590
Thr Val Ser Ala Glu Leu Ser Leu Pro Gly His Lys Glu Lys Gin Hrs 595 600 605
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Ile Val Ser Gly Pro Ile Leu Gin Ile Glu Ser Ile Cys Ser Leu Ala 645 650 655
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Val Gin Asn Glu Pro Gin Lys Pro Ser Pro Asp Gin Gin Val Ile Asn 675 680 685
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Ser Phe Leu Lys Asp Lys Cys Met Gin Cys Thr Asp Val Pro His Glu 705 710 715 720
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Asn Leu Lys Thr His Arg Ser Glu Glu Thr Arg Pro Tyr Ser Val 1295 1300 1305
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<210> 23 <211> 1747 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 23
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<212> PRT <213> Homo sapiens <400> 24
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Pro Val Ala Tyr Gin Gly Asn Gin Gly Leu Asn Gin Ser Phe Ser Glu 180 185 190
Gin Gin Val Asp Trp Thr Gin Gin Cys Ile Ser Lys Gly Leu Thr Tyr 195 200 205
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Ser Leu Gin Val Lys Asn Ser Gin Leu Leu Asn Ser Val Leu Thr Leu 245 250 255
Pro Ser Arg Gin Thr Ser Ala Val Pro Ser Gin Gin Tyr Ala Thr Gin 260 265 270
Thr Asp Lys Arg Pro Pro Pro Pro Pro Tyr Asn Cys Arg Tyr Gly Ser 275 280 285
Gin Pro Leu Gin Ser Thr Gin His Ile Thr Lys His Leu Ser Met Glu 290 295 300
Val Pro Gin Ser Arg Glu Met Leu Ser Ser Glu Ile Arg Thr Ser Phe 305 310 315 320
Gin Gin Gin Trp Gin Asn Pro Asn Glu Asn Val Ser Thr Ile Gly Asn 325 330 335
Phe Thr Asn Leu Lys Val Asn Thr Asn Ser Lys Gin Pro Phe Asn Ser 340 345 350
Pro Ile Arg Ser Ser Val Asp Gly Val Gin Thr Leu Ala Gin Thr Asn 355 360 365
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Thr Lys Gly Thr Glu Leu Gin Ile Ala Val Val Ser Pro Leu Val Leu 755 760 765
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Thr Ser Glu Asp Gin Thr Ala Asp Lys Thr Ser Ser Asp Ser Lys 1085 1090 1095
Asp Pro Ala Asp Gin Ile Gin Ile Thr Ile Leu Ser Ser Glu Gin 1100 1105 1110
Met Lys Glu Ile Phe Pro Glu Gin Asp Asp Gin Pro Tyr Val Val 1115 1120 1125
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Lys Glu Gin Cys Ser Pro Leu Asp Thr Asn Ser Cys Lys Gin Gly 1205 1210 1215
Glu Arg Thr Ser Asp Arg Asp Val Thr Val Val Gin Phe Lys Ser 1220 1225 1230
Leu Val Asn Asn Pro Lys Thr Pro Pro Asp Gly Lys Ser His Phe 1235 1240 1245
Pro Glu Leu Gin Asp Asp Ser Arg Lys Asp Thr Pro Lys Thr Lys 1250 1255 1260
His Lys Ser Leu Pro Arg Thr Glu Gin Glu Leu Val Ala Gly Gin 1265 1270 1275
Phe Ser Ser Lys Cys Asp Lys Leu Asn Pro Leu Gin Asn His Lys 1280 1285 1290
Arg Lys Lys Leu Arg Phe His Glu Val Thr Phe His Ser Ser Asn 1295 1300 1305
Lys Met Thr Ala Ser Tyr Glu Gin Ala Ser Gin Glu Thr Arg Gin 1310 1315 1320
Lys Lys His Val Thr Gin Asn Ser Arg Pro Leu Lys Thr Lys Thr 1325 1330 1335
Ala Phe Leu Pro Asn Lys Asp Val Tyr Lys Lys His Ser Ser Leu 1340 1345 1350
Gly Gin Ser Leu Ser Pro Glu Lys Ile Lys Leu Lys Leu Lys Ser 1355 1360 1365
Val Ser Phe Lys Gin Lys Arg Lys Leu Asp Gin Gly Asn Val Leu 1370 1375 1380
Asp Met Glu Val Lys Lys Lys Lys His Asp Lys Gin Glu Gin Lys 1385 1390 1395
Gly Ser Val Gly Ala Thr Phe Lys Leu Gly Asp Ser Leu Ser Asn 1400 1405 1410
Pro Asn Glu Arg Ala Ile Val Lys Glu Lys Met Val Ser Asn Thr 1415 1420 1425
Lys Ser Val Asp Thr Lys Ala Ser Ser Ser Lys Phe Ser Arg Ile 1430 1435 1440
Leu Thr Pro Lys Glu Tyr Leu Gin Arg Gin Lys His Lys Glu Ala 1445 1450 1455
Leu Ser Asn Lys Ala Ser Lys Lys Ile Cys Val Lys Asn Val Pro 1460 1465 1470
Cys Asp Ser Glu His Met Arg Pro Ser Lys Leu Ala Val Gin Val 1475 1480 1485
Glu Ser Cys Gly Lys Ser Asn Glu Lys His Ser Ser Gly Val Gin 1490 1495 1500
Thr Ser Lys Glu Ser Leu Asn Gly Leu Thr Ser His Gly Lys Asn 1505 1510 1515
Leu Lys Ile His His Ser Gin Glu Ser Lys Thr Tyr Asn Ile Leu 1520 1525 1530
Arg Asn Val Lys Glu Lys Val Gly Gly Lys Gin Pro Asp Lys Ile 1535 1540 1545
Trp Ile Asp Lys Thr Lys Leu Asp Lys Leu Thr Asn Ile Ser Asn 1550 1555 1560
Glu Ala Gin Phe Ser Gin Met Pro Pro Gin Val Lys Asp Gin Lys 1565 1570 1575
Lys Leu Tyr Leu Asn Arg Val Gly Phe Lys Cys Thr Glu Arg Glu 1580 1585 1590
Ser Ile Ser Leu Thr Lys Leu Glu Ser Ser Pro Arg Lys Leu Hrs 1595 1600 1605
Lys Asp Lys Arg Gin Glu Asn Lys His Lys Thr Phe Leu Pro Val 1610 1615 1620
Lys Gly Asn Thr Glu Lys Ser Asn Met Leu Glu Phe Lys Leu Cys 1625 1630 1635
Pro Asp Ile Leu Leu Lys Asn Thr Asn Ser Val Glu Glu Arg Lys 1640 1645 1650
Asp Val Lys Pro His Pro Arg Lys Glu Gin Ala Pro Leu Gin Val 1655 1660 1665
Ser Gly Ile Lys Ser Thr Lys Glu Asp Trp Leu Lys Phe Val Ala 1670 1675 1680
Thr Lys Lys Arg Thr Gin Lys Asp Ser Gin Glu Arg Asp Asn Val 1685 1690 1695
Asn Ser Arg Leu Ser Lys Arg Ser Phe Ser Ala Asp Gly Phe Glu 1700 1705 1710
Met Leu Gin Asn Pro Val Lys Asp Ser Lys Glu Met Phe Gin Thr 1715 1720 1725
Tyr Lys Gin Met Tyr Leu Glu Lys Arg Ser Arg Ser Leu Gly Ser 1730 1735 1740
Ser Pro Val Lys 1745 <210> 25 <211> 4644
<212> ADN <213> Cricetulus griseus <400> 25 atgaattgga atgcaaaacc agagaatgct gccccaaacc caccatattc taaaagccag 60 tcgtctcttt tgcagcagtt tttaatgcct tccacaactt ctcaaagttc tttcagctgt 120 ctcccacata accaagaagc atgcatatat cccactaatt caaattcagt ttcacagcca 180 cttctgaacg tcaggagttt cataaatcct ccgatctctg tttctaatgt gcataatagg 240 acagttgtgg cctcacagac ctcagtagaa agagtcacat atacaaatgt taaaggagcc 300 caacaaccaa accacaattt gcaaacagtg tcttctggag ttgtgcaaaa tgcctggatg 360 aattcaacaa tgaggaattt tatgccttct cttacagagg caaccatatc tcataaacct 420 gatggtgggc ctagtatgcc atatatgcat gcaccacaga gtcatcttgt cacatcagac 480 acctactctg tgcaactaca gatgactcct tcaaactctg taagaggccc tgtaacttac 540 caaggaaatt atcaaggaaa tccgggactt aaccactcga tggcaggtga gcttggctgg 600 gtacaatgtg catccagtga acttacttat ccagattaca gaccacctcc aaagcaatat 660 ccttatttac cacaaagctt tgtgcaagac acttctgttc agaaacaaaa ctttgtgtca 720 tctacatcat tacaagttaa aaataatcag cttccacctt ctacacagac cttaccatca 780 aagcgccctg tacctgtgtc gtcatatcag tatgctgcag aaaccagcaa aagactccct 840 cccccccctt acagctgtag atatggaagc caacatgtgc aaaattctca gtctgtttct 900 agacacttgc ctgtggaagt tcctcagagt tcagaaatgc actcgtctga aaaaaagaaa 960 gatgcttaca aagtctttca acagcagtgg cagagcacta gtaaaaatgt cagtacaata 1020 ggaaaattct gtgagttgaa aattaataca aaacagtctt acaatgactc tgctggctct 1080 tctggggatg gtgttcatac tcttgttcaa aataatcaag aagaaagaaa gtattcttat 1140 aatccaagta caaatcaaat actagacaca aatgtcacaa aagaaaagct ggtgagggat 1200 attaaatcac tagtagaaat taaaaagaaa ttttcagaac ttgcaagaaa aattaaaatc 1260 aacaaaaagc ttttgatggc agctggttgc agtaaaacag ctaatacttc ttatactgaa 1320 ccaactcggc attctgaatt ttcagcaaaa gaaatgtctg ctaaaaggga caatcagtgc 1380 tccatggaat tgctagcaac atgcctttct ctttggaaaa accaacctcc aaaaaccaca 1440 gaagaaaatg tttcaaaacc tttagaagaa aaacaatata atgcatcaag aactagtaca 1500 acagcggttg gcccttcaaa tcccatgaat gaagttcatg tgaagaattt ttgttcaggt 1560 gttagaaatt ctcagaaaat aaccacctcg tcacaaacag tcttgtcagt tctcacacca 1620 gtttacgatt cttcagatgt agctgttgga aaaggaacag agcttcagat tgctgtggtt 1680 tcacctttaa ttctttcaga tgtcagtact gtacctggga aagagttagc tcctgaagtc 1740 gtatctgaaa ctgtatatcc agttgtgaag gaaggcagtg tttgtagctt acaaaaccag 1800 caggcagaaa atgcaacagt aactgctggt ttgccctttg atgttatcag agcagtagca 1860 agtgctactg tatcagctga gctatcactg cctgggcata aagaaaagca gcacaaacca 1920 acacagagtg atctagacat cgctgatggc agcctaggga aacactctcc ccagggtgct 1980 gaagctttgc ctaaccctag ggacagcacc attgtgagtg ggcctatatt acagattgaa 2040 agtatctgtt ctcttgcaga aggtgatgta tcttacaatt cccaaatagc agagatattc 2100 aactctgtac aaaatgagcc ccagaaacct tcacctgatc agcaagtaat taatagtcaa 2160 caagaagaac aagtagataa ggttgctgaa aataaagact taagttttct gaaagacaag 2220 tgtatgcagt gtacagatgt tcctcatgaa gtcactgaac agccagagcc actgcagcct 2280 ttagagacaa catctgatga gtatgttgaa gcaaacggag aaatcctaga ggaaagcagt 2340 aaggagaatc ctggtgaaaa agagatgact aaggacatat tgtgttcacc agctgctgtt 2400 cagcaagatc ctcaacctca ggaaattgac acagccagca gtaagtcagg acacagtttt 2460 tctacagtaa atgagattaa tgatgaaaat gaacctgtct catacctaca tgaccagctg 2520 ttagaacttc taaaagagtt tccttatggc attgaaacta ttgccaggcc tgaagtttat 2580 gtgggccaac aaaagacaca tgaaatctta gaaaatcaaa ctggtagtaa aactggtaat 2640 gtgtctgggg ataacacaga ccaaataaaa attacagtat taaactcaga acaaatcaaa 2700 gaattatttc ctgaagagga tcagccatgt gatgtagaca aattggcaga acccgagaat 2760 acaaaaatca ttgcagaagt aaagagcctg tgtgattcac aggtccccag agaagaaagt 2820 cacaaccctg gaatgttgga tctggagaaa gataaaatcc attgctgtgc cttgggctgg 2880 ctctcaatgg tttatgaagg tgtgccacag tgtcagtgca gttccatgga agagaaagag 2940 aaagaccagt gttctttgga aatctctaat tgcaaacaag gagagcaggc ctgcaatagt 3000 ggaatcacta tttttgaaat taatcctatt tctaataact caaaaagtcc tctgatccaa 3060 gaatctgaga aaggccattt ttctgacata catggtgaaa agataaaaac atctgaaaca 3120 aaaaacagca gctcaccaag ggtagaacag gaattaactg gtcatttttc aatgaaatgt 3180 taccagaaag ataaatctac aacaaaacag gatagctcac tgaaaacaga gcaaaaaata 3240 aaaaatcttt cttctaaatg tgacaaacca aatcccttaa aaagcagtaa aataccaacc 3300 cctgaaacat ttaatgtggt aacttccaac tctgataaaa atatgccagc attttctaaa 3360 caagattctc agggaagcct gcagaagaaa cacctattcc aagactcaga tccagtaaaa 3420 ggacatgtat ggcttttgcc aaataaagat ccacgcagga ggaatacctt tttagtacag 3480 tcagtatcac cagaaaagaa aaagttaaaa ttcaaatcgg gtagctccaa actgaaatat 3540 tttgaaaaaa gaaaaatgga ccatttgctt atctcagatg tggaaataaa aaagaagaaa 3600 tacgaaaaac aagagcagaa caaaaatgct ggaggcacac tcaaattatg tagtactctg 3660 actgaaccaa atgaaagagc ctgtgctaaa gaaaagatag tgacaaattc tgagccctca 3720 gactcaaagg gaagctcctc taagagtact agagttataa ctgtgcagga atatttacag 3780 cggaaaaaag acaaacatgt aataggaaat aatgcctcca aaaacatctg tgtagaaaat 3840 gtgccatgtg actctgaacc catgaagtcc agtaaacatt ctgcatcacc tagtttggga 3900 aaattaattg agggccaggg tgtcagtgca gagactttaa aagaagtaga acataattcc 3960 accagccatg gcaaaaatct caagacccac cgttctgagg agactaggcc atacagtgtg 4020 tcaaatagta aagagaaatt ttataggaca catccagaca aatcttacat tgataaagct 4080 aaattagaaa gattgaccag tatgagtagt aagtccagcc agctccaggt aaaggaaaaa 4140 aggaaacagt acctgaatcg agttgcattc aaatgcacag aacaggaaag catttgtctc 4200 accaaattgg acagtgcatc caagaagctt agtaaagaga aagaaaagag tacagcatgt 4260 gcacccatga caaaagacta cacacacaag cccatgttgg agtttaaatt atgtccagat 4320 gtgctattga agaatacaag ctccattgac aaaggggatg atccaaggcc tgggcctgag 4380 aaggagcgag cacctgtgca agtttcagga ataaaaacta caaaagaaga ctggttaaaa 4440 tgtatcccaa caaggacaaa gatgcccgaa tcaagtgaac aaacagatcg ggctgactca 4500 agactctcta agagaagctt cagtgcagat gaatttgaaa ctctacaaaa cccagtaaaa 4560 gactcaaatg tcatgttccg gactttcaaa aagatgtacc tggagaagag aagcaggagc 4620 etggggagca gtccagtgaa gtag 4644
<210> 26 <211> 112 <212> ADN <213> Cricetulus griseus <400> 26 tgctgggatt taaggggaaa gctttaataa aagatcttta tttgtatttc ttgcagattt 60 gtgacattca aaaccacaga ctatgcaaca ctactactaa accaggtcaa at 112
<210> 27 <211> 36 <212> ADN <213> Cricetulus griseus <400> 27 cttcgggata gagtggtttt gcttttacca ccagga 36
<210> 28 <211> 221 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 28
Met Phe Gly Phe His Lys Pro Lys Met Tyr Arg Ser Ile Glu Gly Cys 15 10 15
Cys Ile Cys Arg Ala Lys Ser Ser Ser Ser Arg Phe Thr Asp Ser Lys 20 25 30
Arg Tyr Glu Lys Asp Phe Gin Ser Cys Phe Gly Leu His Glu Thr Arg 35 40 45
Ser Gly Asp Ile Cys Asn Ala Cys Val Leu Leu Val Lys Arg Trp Lys 50 55 60
Lys Leu Pro Ala Gly Ser Lys Lys Asn Trp Asn His Val Val Asp Ala 65 70 75 80
Arg Ala Gly Pro Ser Leu Lys Thr Thr Leu Lys Pro Lys Lys Val Lys 85 90 95
Thr Leu Ser Gly Asn Arg Ile Lys Ser Asn Gin Ile Ser Lys Leu Gin 100 105 110
Lys Glu Phe Lys Arg His Asn Ser Asp Ala His Ser Thr Thr Ser Ser 115 120 125
Ala Ser Pro Ala Gin Ser Pro Cys Tyr Ser Asn Gin Ser Asp Asp Gly 130 135 140
Ser Asp Thr Glu Met Ala Ser Gly Ser Asn Arg Thr Pro Val Phe Ser 145 150 155 160
Phe Leu Asp Leu Thr Tyr Trp Lys Arg Gin Lys Ile Cys Cys Gly Ile 165 170 175
Ile Tyr Lys Gly Arg Phe Gly Glu Val Leu Ile Asp Thr His Leu Phe 180 185 190
Lys Pro Cys Cys Ser Asn Lys Lys Ala Ala Ala Glu Lys Pro Glu Glu 195 200 205
Gin Gly Pro Glu Pro Leu Pro Ile Ser Thr Gin Glu Trp 210 215 220
<210> 29 <211> 221 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 29
Met Phe Gly Phe His Lys Pro Lys Met Tyr Arg Ser Ile Glu Gly Cys 15 10 15
Cys Ile Cys Arg Ala Lys Ser Ser Ser Ser Arg Phe Thr Asp Ser Lys 20 25 30
Arg Tyr Glu Lys Asp Phe Gin Ser Cys Phe Gly Leu His Glu Thr Arg 35 40 45
Ser Gly Asp Ile Cys Asn Ala Cys Val Leu Leu Val Lys Arg Trp Lys 50 55 60
Lys Leu Pro Ala Gly Ser Lys Lys Asn Trp Asn His Val Val Asp Ala 65 70 75 80
Arg Ala Gly Pro Ser Leu Lys Thr Thr Leu Lys Pro Lys Lys Val Lys 85 90 95
Thr Leu Ser Gly Asn Arg Met Lys Ser Asn Gin Ile Ser Lys Leu Gin 100 105 110
Lys Glu Phe Lys Arg His Asn Ser Asp Ala His Ser Thr Thr Ser Ser 115 120 125
Ala Ser Pro Ala Gin Ser Pro Cys Tyr Ser Asn Gin Ser Asp Glu Gly 130 135 140
Ser Asp Thr Glu Met Ala Ser Ser Ser Asn Arg Thr Pro Val Phe Ser 145 150 155 160
Phe Leu Asp Leu Thr Tyr Trp Lys Arg Gin Lys Ile Cys Cys Gly Ile 165 170 175
Ile Tyr Lys Gly Arg Phe Gly Glu Val Leu Ile Asp Thr His Leu Phe 180 185 190
Lys Pro Cys Cys Ser Ser Lys Lys Ala Ala Ala Glu Lys Pro Glu Glu 195 200 205
Gin Gly Pro Ala Pro Leu Pro Ile Ser Thr Gin Glu Trp 210 215 220
<210> 30 <211> 221 <212> PRT <213> Cricetulus griseus <400> 30
Met Phe Gly Phe His Lys Pro Lys Met Tyr Arg Ser Ile Glu Gly Cys 15 10 15
Cys Ile Cys Arg Ala Lys Ser Ser Ser Ser Arg Phe Thr Asp Ser Lys 20 25 30
Arg Tyr Glu Lys Asp Phe Gin Ser Cys Phe Gly Leu His Glu Thr Arg 35 40 45
Ser Gly Asp Ile Cys Asn Ala Cys Val Leu Leu Val Lys Arg Trp Lys 50 55 60
Lys Leu Pro Ala Gly Ser Lys Lys Asn Trp Asn His Val Ser His Ser 65 70 75 80
Arg Ala Gly Pro Ser Leu Lys Thr Thr Leu Lys Pro Lys Lys Val Lys 85 90 95
Thr Leu Ser Gly Asn Arg Met Lys Ser Asn Gin Ile Ser Lys Leu Gin 100 105 110
Lys Glu Phe Lys Arg His Asn Ser Asp Ala His Ser Thr Thr Ser Ser 115 120 125
Ala Ser Pro Ala Gin Ser Pro Cys Tyr Ser Asn Gin Ser Asp Asp Gly 130 135 140
Ser Asp Thr Glu Met Ala Ser Ser Ser Asn Arg Thr Pro Val Phe Ser 145 150 155 160
Phe Leu Asp Leu Thr Tyr Trp Lys Arg Gin Lys Ile Cys Cys Gly Ile 165 170 175
Ile Tyr Lys Gly Arg Phe Gly Glu Val Leu Ile Asp Thr His Leu Phe 180 185 190
Lys Pro Cys Cys Ser Ser Lys Lys Ala Ala Pro Glu Lys Pro Glu Glu 195 200 205
Gin Gly Pro Ala Pro Leu Pro Ile Ser Thr Gin Glu Trp 210 215 220
<210> 31 <211> 1236 <212> ADN <213> Cricetulus griseus <400> 31 ctcagaagaa aagatgtttg gttttcacaa gccaaagatg taccgaagta tagagggctg 60 ctgtatctgc agagccaagt cctccagctc tcggttcacg gacagtaaac gttatgaaaa 120 ggacttccag agctgttttg ggttgcacga gactcgctca ggagatatct gcaatgcctg 180 tgtgctgctt gtgaaaagat ggaagaagtt gccagcagga tcaaaaaaaa actggaatca 240 tgtgtcacac tcaagggcag gacccagtct aaagacaaca ttgaaaccaa agaaagtgaa 300 aactctatct ggaaacagga tgaaaagcaa ccagatcagt aaactgcaga aggagtttaa 360 acgccacaac tctgatgctc acagtaccac ctcaagtgcc tcgccagccc agtctccctg 420 ctacagtaac cagtcagatg atggctcaga cacagagatg gcttccagct ctaacagaac 480 tccagttttt tccttcttag atcttaccta ctggaaaaga cagaaaatat gttgtgggat 540 catctataag ggccgttttg gggaagtcct catcgacacg catctcttca agccttgctg 600 cagcagtaag aaggcagctc ctgagaagcc tgaggaacag ggaccagcgc ctctgcccat 660 ctctactcag gagtggtgac tgaggttcat gcagaaggga acaaagagca atttaaactt 720 tgaaaagacc acaaagcaac agactgaccc tcctattttt aacttggata cctgctattc 780 tgccaaaaga cattttctag aatagttttt aatgggttac ccatcccccc atccaacaaa 840 ctcggaagcc agttctagct tactgcaaga agagagtgta cataatattt aatatgctga 900 gtatttcata ggaaggctga atgctgctgt aaagtgctct ttaagtcttt tttttttttt 960 aatcccctct aatgaatgag attagggggg tttcagggga cagagatggg atttgttgtg 1020 tgataaacca tatgtagttt agtctttctg tggagaggca gtggttgggg cattttaaat 1080 ggctggctac acttgttttc ccctcatggt aatttgtcat aactcagtag cacgacctgc 1140 ccctagaagt agttaaagat ttttaaatgc taaggcgttg ccaaggttct gatgattcag 1200 acctgtacta ctgattatta agcaggacag actgag 1236
<210> 32 <211> 855 <212> PRT <213> Cricetulus griseus <400> 32
Met Gly Ser Asn Arg Gly Arg Lys Ala Gly Gly Ser Ser Lys Asp Phe 15 10 15
Gly Ala Arg Leu Lys Tyr Ser Ser Gly Leu Glu Asn Met Asn Gly Phe 20 25 30
Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Ala Lys Lys Val Glu 35 40 45
Lys Arg Gly Pro Arg Arg Cys Val Val Leu Val Val Leu Leu Val Ser 50 55 60
Phe Leu Phe Leu Ser Leu Val Ala Gly Phe Leu Val Trp His Phe Leu 65 70 75 80
Tyr Ser Asn Val Arg Ile Gin Lys Val Phe Asn Gly His Leu Arg Val 85 90 95
Thr Asn Glu Asn Phe Leu Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110
Phe Lys Asp Leu Ala Asn Gin Val Lys Glu Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125
Ser Glu Val Pro Val Leu Gly Pro Tyr His Lys Arg Ser Ala Val Thr 130 135 140
Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160
Ile Pro Pro His Leu Ala Glu Glu Val Asp Arg Ala Met Ala Val Glu 165 170 175
Arg Val Val Thr Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ala Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190
Leu Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Pro Arg Leu Leu Gly Arg 195 200 205
Thr Gin Asp Asn Ser Cys Asn Phe Ala Leu His Ala His Gly Gly Glu 210 215 220
Val Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asn Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240
His Ala Arg Cys Gin Trp Val Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255
Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Val Ala Pro Cys Asp Glu Leu Gly 260 265 270
Asn Asp Leu Val Thr Val Tyr Asp Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285
Ala Val Val Arg Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300
Phe Leu Ser Ser Gin Asn Val Phe Leu Val Thr Leu Ile Thr Asn Thr 305 310 315 320
Asp Arg Arg His Pro Gly Phe Glu Ala Thr Phe Phe Gin Leu Pro Lys 325 330 335
Met Arg Ser Cys Gly Gly Ser Leu Ser Glu Ala Gin Gly Leu Phe Ser 340 345 350
Ser Pro Tyr Tyr Pro Gly His Tyr Pro Pro Asn Ile Asp Cys Thr Trp 355 360 365
Asn Ile Lys Val Pro Asn Asn Arg Asn Val Lys Val Arg Phe Lys Leu 370 375 380
Phe Tyr Leu Val Asp Pro Asn Ile Pro Leu Gly Thr Cys Pro Lys Asp 385 390 395 400
Tyr Val Glu Ile Asn Gly Glu Arg Tyr Cys Gly Glu Lys Ser Gin Phe 405 410 415
Val Val Ser Ser Asn Ser Ser Lys Ile Thr Val Arg Phe His Ser Asp 420 425 430
His Ser Tyr Thr Asp Thr Gly Phe Leu Ala Glu Tyr Leu Ser Tyr Asp 435 440 445
Ser Asn Asp Pro Cys Pro Gly Met Phe Met Cys Asn Thr Gly Arg Cys 450 455 460
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Ser Asp Glu His Phe Cys Arg Cys Asn Thr Thr His Gin Phe Met Cys 485 490 495
Lys Asn Lys Leu Cys Lys Pro Leu Phe Trp Val Cys Asp Asn Ile Asn 500 505 510
Asp Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Glu Gly Cys Ser Cys Pro Ala Glu 515 520 525
Thr Phe Lys Cys Ser Asn Gly Lys Cys Leu Pro Gin Ser Gin Lys Cys 530 535 540
Asp Gly Lys Asp Asn Cys Gly Asp Gly Ser Asp Glu Ala Ser Cys Asp 545 550 555 560
Arg Val Lys Val Val Ser Cys Thr Lys Tyr Thr Tyr Arg Cys His Asn 565 570 575
Gly Leu Cys Leu Ser Lys Gly Asn Pro Glu Cys Asp Gly Lys Lys Asp 580 585 590
Cys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Lys Asn Cys Asp Cys Gly Leu Arg Ser 595 600 605
Phe Thr Lys Gin Ala Arg Val Val Gly Gly Thr Asn Ala Asp Glu Gly 610 615 620
Glu Trp Pro Trp Gin Val Ser Leu His Ala Leu Gly Gin Gly His Leu 625 630 635 640
Cys Gly Ala Ser Leu Ile Ser Pro Asn Trp Leu Val Ser Ala Ala His 645 650 655
Cys Phe Met Asp Asp Arg Asn Phe Lys Tyr Ser Asp His Thr Lys Trp 660 665 670
Thr Ala Phe Leu Gly Leu Leu Asp Gin Ser Lys Arg Ser Ser Thr Gly 675 680 685
Val Gin Glu His Lys Leu Lys Arg Ile Ile Thr His Pro Leu Phe Asn 690 695 700
Glu Ile Thr Phe Asp Tyr Asp Ile Ala Leu Leu Glu Leu Glu Lys Pro 705 710 715 720
Ala Glu Tyr Ser Thr Val Val Arg Pro Ile Cys Leu Pro Asp Thr Thr 725 730 735
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Cys Gin Gly Asp Ser Gly Gly Pro Leu Ser Ser Val Glu Thr Glu Gly 805 810 815
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<210> 33 <211> 855 <212> PRT <213> Homo sapiens <400> 33
Met Gly Ser Asp Arg Ala Arg Lys Gly Gly Gly Gly Pro Lys Asp Phe 15 10 15
Gly Ala Gly Leu Lys Tyr Asn Ser Arg His Glu Lys Val Asn Gly Leu 20 25 30
Glu Glu Gly Val Glu Phe Leu Pro Val Asn Asn Val Lys Lys Val Glu 35 40 45
Lys His Gly Pro Gly Arg Trp Val Val Leu Ala Ala Val Leu Ile Gly 50 55 60
Leu Leu Leu Val Leu Leu Gly Ile Gly Phe Leu Val Trp His Leu Gin 65 70 75 80
Tyr Arg Asp Val Arg Val Gin Lys Val Phe Asn Gly Tyr Met Arg Ile 85 90 95
Thr Asn Glu Asn Phe Val Asp Ala Tyr Glu Asn Ser Asn Ser Thr Glu 100 105 110
Phe Val Ser Leu Ala Ser Lys Val Lys Asp Ala Leu Lys Leu Leu Tyr 115 120 125
Ser Gly Val Pro Phe Leu Gly Pro Tyr His Lys Glu Ser Ala Val Thr 130 135 140
Ala Phe Ser Glu Gly Ser Val Ile Ala Tyr Tyr Trp Ser Glu Phe Ser 145 150 155 160
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Arg Val Val Met Leu Pro Pro Arg Ala Arg Ser Leu Lys Ser Phe Val 180 185 190
Val Thr Ser Val Val Ala Phe Pro Thr Asp Ser Lys Thr Val Gin Arg 195 200 205
Thr Gin Asp Asn Ser Cys Ser Phe Gly Leu His Ala Arg Gly Val Glu 210 215 220
Leu Met Arg Phe Thr Thr Pro Gly Phe Pro Asp Ser Pro Tyr Pro Ala 225 230 235 240
His Ala Arg Cys Gin Trp Ala Leu Arg Gly Asp Ala Asp Ser Val Leu 245 250 255
Ser Leu Thr Phe Arg Ser Phe Asp Leu Ala Ser Cys Asp Glu Arg Gly 260 265 270
Ser Asp Leu Val Thr Val Tyr Asn Thr Leu Ser Pro Met Glu Pro His 275 280 285
Ala Leu Val Gin Leu Cys Gly Thr Tyr Pro Pro Ser Tyr Asn Leu Thr 290 295 300
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Trp Ser His Pro Gin Phe Glu Lys 1 5
Claims (9)
- REVENDICATIONS1. Cellule CHO recombinante, comprenant : une ou plusieurs séquences polynucléotidiques codant pour le complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV), où ledit complexe pentamère comprend : la gH ou l'un de ses fragments formant un complexe, la gL ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL128 ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL130 ou l'un de ses fragments formant un complexe, et la pUL131 ou l'un de ses fragments formant un complexe ; où lesdites une ou plusieurs séquences polynucléotidiques sont intégrées dans l'ADN génomique de ladite cellule CHO et où l'expression ou l'activité de la protéine FAM60A est réduite dans ladite cellule, comparativement à un témoin.
- 2. Cellule CHO selon la revendication 1, où ladite cellule CHO est une cellule CH0-K1, CHO-DUXB11, CHO-DG44, ou CHO-S.
- 3. Cellule CHO selon la revendication 1 ou 2, où au moins une copie de la séquence génomique du gène FAM60A, ou au moins 50 % de la séquence codante dudit gène FAM60A, est délétée.
- 4. Cellule CHO selon l'une quelconque des revendications 1 à 3, où ledit fragment formant un complexe de la gH comprend 1'ectodomaine d'une protéine gH pleine longueur.
- 5. Cellule CHO selon l'une quelconque des revendications 1 à 4, où ledit complexe pentamère est soluble.
- 6. Cellule CHO selon l'une quelconque des revendications 1 à 5, où ledit complexe pentamère est sécrété à partir de la cellule hôte.
- 7. Culture à grande échelle comprenant la cellule CHO selon l'une quelconque des revendications 1 à 6, où ladite culture a une taille d'au moins 20 litres.
- 8. Culture à grande échelle selon la revendication T, où le rendement du complexe pentamère du CMV est d'au moins 0,05 g/1.
- 9. Composition comprenant le complexe pentamère du cytomégalovirus (CMV), où ledit complexe pentamère comprend : la gH ou l'un de ses fragments formant un complexe, la gL ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL128 ou l'un de ses fragments formant un complexe, la pUL130 ou l'un de ses fragments formant un complexe, et la pUL131 ou l'un de ses fragments formant un complexe, et où ledit complexe pentamère est produit par la cellule CHO selon l'une quelconque des revendications 1 à 6, ou la culture à grande échelle selon la revendication 7 ou 8.
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