AR085818A1 - Hipometilacion de line-1 como biomarcador del comienzo temprano de cancer colorrectal - Google Patents

Abstract

Método para detectar el comienzo temprano de cáncer colorrectal en un sujeto humano. El método comprende los pasos de: (i) identificar el sujeto humano sospechado de sufrir de cáncer colorrectal; (ii) obtener una o más muestras biológicas del sujeto humano; (iii) determinar el nivel de metilación de LINE-1 en una o más muestras biológicas; y (iv) comparar el nivel de metilación de LINE-1 con el nivel control de metilación de LINE-1, en donde un grado mayor de metilación de LINE-1 es indicativo del comienzo temprano de cáncer colorrectal.Reivindicación 2: El método de la reivindicación 1, caracterizado porque las muestras biológicas se seleccionan del grupo que consiste en una muestra de un tejido, una muestra de heces, un homogenato de células, una muestra de sangre, uno o más fluidos biológicos o cualquier combinación de los anteriores. Reivindicación 4: El método de la reivindicación 1, caracterizado porque el nivel de metilación de LINE-1 se determina mediante la amplificación de los sitios intermetilados, mediante la conversión de los bisulfitos, seguida por una captura y una secuenciación, a través de un análisis del perfil de metilación de los bisulfitos, a través de la secuenciación de los bisulfitos, con sondas que se unen a los bisulfitos, por medio de un análisis de alto desempeño de la metilación relativa, mediante un análisis de restricción de los bisulfitos, por medio de una hibridación diferencial en las metilaciones, con una PCR mediada por la unión a fragmentos cortos generados con HpalI, mediante la amplificación de los segmentos de CpG metilados, mediante una amplificación de los segmentos de CpG metilados combinada con una hibridación basada en microseries, por medio de la inmunoprecipitación del ADN metilado, mediante la inmunoprecipitación de los segmentos de CpG metilados, con un ensayo para recuperar los segmentos de CpG metilados, a través de una evaluación de la metilación basada en microseries, con una PCR con cebadores arbitrarios sensibles a la metilación, por medio de un conteo de los cortes sensible a la metilación, con una PCR con especificidad por la metilación, mediante la extensión de cebadores con nucleótidos individuales sensibles a la metilación, con una secuenciación de última generación, por medio de un análisis de las restricciones características del genoma, a través de una secuenciación basada en la representación reducida de los bisulfitos o a través de una secuenciación masiva de los bisulfitos en todo el genoma. Reivindicación 7: Un biomarcador para predecir, detectar, diagnosticar o monitorear un cáncer colorrectal de inicio temprano en un sujeto humano, caracterizado porque comprende un biomarcador con el que puede determinarse el nivel de metilación de LINE-1, donde un menor nivel de metilación de LINE-1 es indicativo de la presencia de un cáncer colorrectal de inicio temprano en el sujeto humano. Reivindicación 14: Un método para seleccionar la terapia apropiada para tratar un cáncer en un paciente al que se le ha diagnosticado un cáncer colorrectal de inicio temprano, caracterizado porque comprende los siguientes pasos: determinar el nivel de metilación de LINE-1 en una muestra biológica obtenida del sujeto, donde el nivel de mutilación de LINE-1 es indicativo de un cáncer colorrectal de inicio temprano; y seleccionar la terapia para el cáncer sobre la base de la determinación de la presencia del cáncer colorrectal de inicio temprano en el sujeto. Reivindicación 22: Un método para detectar un pre-cáncer o un cáncer en un sujeto humano, caracterizado porque comprende los siguientes pasos: obtener una o más muestras biológicas del sujeto humano, procesar las una o más muestras biológicas para determinar el nivel de metilación de LINE-1 y comparar el nivel de metilación de LINE-1 en las una o más muestras biológicas con el nivel de mutilación de LINE-1 en un tejido colorrectal normal, donde un menor nivel de mutilación de LINE-1 es indicativo de un cáncer colorrectal de inicio temprano.