WO2023145788A1 - 菌体外膜画分を用いた、ヘリコバクター・スイス抗体の検出法 - Google Patents

菌体外膜画分を用いた、ヘリコバクター・スイス抗体の検出法 Download PDF

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WO2023145788A1
WO2023145788A1 PCT/JP2023/002329 JP2023002329W WO2023145788A1 WO 2023145788 A1 WO2023145788 A1 WO 2023145788A1 JP 2023002329 W JP2023002329 W JP 2023002329W WO 2023145788 A1 WO2023145788 A1 WO 2023145788A1
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outer membrane
membrane fraction
pylori
swiss
antibody
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PCT/JP2023/002329
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英則 松井
絵美子 林原
仁人 鈴木
崇道 高橋
明 石井
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学校法人北里研究所
国立感染症研究所長が代表する日本国
デンカ株式会社
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    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • GPHYSICS
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    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/569Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for microorganisms, e.g. protozoa, bacteria, viruses

Definitions

  • the present invention relates to a method for measuring Helicobacter suis antibodies using an outer membrane fraction of H. suis.
  • H. pylori a microscopic pathogen that parasitizes the human stomach. It is known that infection with temperamental Gram-negative Helix, hereinafter referred to as "H. pylori" is involved.
  • H. pylori infection test methods include the isolation culture method, urea breath test (UBT), and H. pylori in serum and urine.
  • pylori antibody titer ELISA and latex agglutination
  • H. pylori in stool pylori antigen measurement (immunochromatographic method) and gastric biopsy rapid urease test (RUT) are mainly employed.
  • H.I. H. pylori due to the spread of diagnosis and eradication of H. pylori.
  • H. NHPH Non-Helicobacter pylori hericobacters; Helicobacter other than H. pylori
  • H. NHPH includes Helicobacter suisse (hereinafter H. Switzerland), H. bizzozeronnii, H. felis, H. salmonis, H. ailurogastricus, H. cynogasticus, H. baculiformis, H. mustelae, H. acinonychls, H.; cetorum and H. heilmannii, of which the majority found in the human stomach are H. Switzerland.
  • H. pylori infects only primates, and infection from close relatives is assumed only in infancy, but H. pylori infects only primates. In Switzerland, people of all ages are infected by animals such as pigs and monkeys.
  • Non-Patent Document 1 Multi Locus Sequencing Typing
  • JP 2016-10331 A International publication WO2019/225639
  • the present invention is based on H.I.
  • the object of the present invention is to provide a method and a reagent for measuring antibodies against Helicobacter suis using Swiss outer membrane fractions.
  • Patent Document 1 H. It discloses immobilizing the Swiss F2R2 protein on a plate and measuring antibodies in the serum.
  • Patent Document 2 discloses that HsvA protein, which is said to have a higher antibody titer than F2R2 protein, is immobilized on a plate to measure antibodies in serum.
  • a method with higher sensitivity and specificity than conventional methods there is a need for a method with higher sensitivity and specificity than conventional methods.
  • the present invention relates to the following inventions: [1] At least H. H. spp. of a subject-derived specimen containing the Swiss outer membrane fraction, or proteins and anti-Ig antibodies contained in the outer membrane fraction. A reagent that detects antibodies that bind to the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction. [2] The reagent of [1], wherein the subject is a mammal. [3] The reagent of [1] or [2], wherein the specimen is derived from blood. [4] Furthermore, H. pylori cell component or H. pylori. H. pylori in a subject-derived specimen containing antibodies against H. pylori body components antibodies that bind to H.
  • anti-H A method characterized by detecting an antibody that binds to the Swiss outer membrane fraction or a protein contained in the outer membrane fraction: (a) A specimen derived from a subject is treated with H.I. (b) contacting with the Swiss outer membrane fraction or a protein contained in the outer membrane fraction; Detecting antibodies in said sample bound to the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction.
  • [7] The method of [6], wherein the subject is a mammal.
  • [8] The method of [6] or [7], wherein the sample is derived from blood.
  • the H.I. The method according to any one of [6] to [8], which also detects an antibody that binds to H. pylori: (a) A specimen derived from a subject is treated with H.I. and (b) H. pylori body components. A step of detecting antibodies in the specimen bound to H. pylori body components. [10] Furthermore, the H.I. The method according to any one of [6] to [8], characterized in that antigens of H.
  • pylori body components are also detected: (a) A specimen derived from a subject is treated with H.I. (b) contacting with antibodies against H. pylori body components; H. pylori in the sample bound to antibodies against H. pylori body components. A step of detecting an antigen of a H. pylori body component.
  • a subject whose antibody was detected by the measurement using the reagent of any one of [1] to [5] and/or by the method of any one of [6] to [10] is treated with H.I. determine infected with Switzerland, H. Swiss infection detection method.
  • This specification includes the disclosure content of Japanese Patent Application No. 2022-009302, which is the basis of priority of this application.
  • H By using the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction, anti-H. Swiss antibodies can be measured with high sensitivity.
  • the Swiss outer membrane fraction, or the proteins contained in the outer membrane fraction, are described in H. anti-H. It can be used to measure the presence or absence of Swiss antibodies or titers.
  • FIG. 2 is a diagram showing the results of ELISA using human serum (3600-fold dilution) as a specimen and H. suis whole cell or H. suis outer membrane fraction as an antigen.
  • FIG. 2 graphically shows the results of ELISA using human serum (3600-fold dilution) as the specimen and H. suis whole cells (FIG. 2A) or H. suis outer membrane fraction (FIG. 2B) as the antigen.
  • FIG. 2 is a diagram showing the results of ELISA using mouse serum (3600-fold dilution) as a sample and H. suis whole cell or H. suis outer membrane fraction as an antigen.
  • FIG. 4 graphically illustrates the results of ELISA using mouse serum (3600-fold dilution) as specimen and H. suis whole cells (FIG.
  • FIG. 4A is a diagram showing the results of ELISA using human serum (3600-fold dilution) as a sample and H. pylori outer membrane fraction or H. suis outer membrane fraction as an antigen.
  • FIG. 6 graphically shows the results of ELISA using human serum (3600-fold dilution) as the specimen and H. pylori outer membrane fraction (FIG. 6A) or H. suis outer membrane fraction (FIG. 6B) as the antigen.
  • FIG. 4 is a diagram showing the results of ELISA using human serum (3600-fold dilution) as a sample and H. suis outer membrane fractions or H.
  • FIG. 4 is a diagram showing the results of ELISA using human serum (3600-fold dilution) as a specimen and using H. suis outer membrane fractions or H. suis HsVA partial peptides (SEQ ID NOs: 6 to 11) as antigens, in terms of measured values. be.
  • the present invention provides a method for detecting H.
  • a method for detecting an antibody against the outer membrane fraction of Swiss fungal cells or a protein contained in the outer membrane fraction and a reagent for detecting the antibody.
  • the present invention provides a method for detecting H. pneumoniae in a subject.
  • a method for determining the presence of H.S.H. It is also the method of detecting infection in Switzerland.
  • the subject's H A method of obtaining ancillary data for diagnosing Swiss infections.
  • H. swiss means NHPH (Non-Helicobacter pylori helicobacters; Helicobacter other than H. pylori) or Helicobacter heilmannii sensu lato (in a broad sense) among the Helicobacter genus bacteria reported more than 50 kinds of Helicobacter hirmanii). It means the Swiss strain (Non-Patent Document 3). H. Switzerland is known to infect the stomachs of pigs, monkeys, wild boars, cats and dogs in addition to humans. H.I. The infected mammal from which Switzerland was isolated is not particularly limited and may be, for example, humans, monkeys, wild boars, or pigs.
  • H. swiss adventitial fraction refers to the H. Fraction prepared by collecting H. suis outer membrane fragments after sonication of H. suis. Sonication is performed according to H.I. It can be carried out by suspending the Swiss cells in a buffer solution and using an ultrasonicator. Examples of the ultrasonic crusher include a sample closed type ultrasonic disruption device Bioruptor (BM equipment) and a sample closed type ultrasonic disruption device Bioruptor (BM equipment). By sonication, H.I. Swiss cells are destroyed, leaving extracellular membrane fragments. Extracellular membrane fragments can be recovered by centrifugation or filtration. "Protein contained in H. Swiss outer membrane fraction” A protein derived from H. suis present in a fraction prepared by collecting H. suis outer membrane fragments after sonicating H. suis.
  • H. Antibodies to the Swiss outer membrane fraction were obtained from H. It refers to antibodies against antigens such as proteins and sugars contained in the Swiss outer membrane fraction, and may include multiple antibodies against various substances.
  • H. Antibodies against at least one of antigens such as proteins and sugars contained in the Swiss outer membrane fraction are isolated from H. It is called an antibody against the Swiss outer membrane fraction.
  • H.I. Antibodies against proteins contained in the Swiss outer membrane fraction were published by H. An antibody against a protein among the antigens contained in the Swiss outer membrane fraction.
  • the Swiss outer membrane fraction contains multiple proteins; Antibodies to proteins contained in the Swiss outer membrane fraction may contain multiple antibodies to different proteins.
  • H An antibody against at least one of the proteins contained in the Swiss outer membrane fraction was isolated from H. It is called an antibody against a protein contained in the Swiss outer membrane fraction.
  • H In swiss infected subjects, H .
  • H Antibodies to the Swiss outer membrane fraction or to proteins contained in the outer membrane fraction are produced.
  • the antibody is H.I.
  • An antibody is said to bind to the Swiss outer membrane fraction when it binds to an antigen contained in the Swiss outer membrane fraction.
  • a reagent for detecting the Swiss outer membrane fraction or an antibody against a protein contained in the outer membrane fraction can be prepared as a reagent applicable to known methods.
  • Known methods include, for example, an enzyme immunoassay method (EIA method), a simple EIA method, an enzyme-linked immunosorbent assay method (ELISA method), a radioimmunoassay method (RIA method), a fluorescence immunoassay method (FIA method), and the like.
  • turbidimetric method TIA method
  • NIA method nephelometric method
  • LIA method latex agglutination method
  • LIA method particle counting method
  • chemiluminescence measurement method CLIA method, CLEIA method
  • sedimentation reaction method surface plasmon resonance method (SPR method); resonant mirror detector method (RMD method); Whether or not the reagent of the present invention can be applied to the desired measurement method is described in H. et al.
  • H. Antibodies to the Swiss outer membrane fraction, or proteins contained in the outer membrane fraction, can be used as markers for H. suis infection.
  • H.I. A subject's own immune system-generated H. It can be determined by confirming the presence of antibodies against the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction. The presence of these antibodies has been documented by H. It can be detected and confirmed by an antigen-antibody reaction using the protein contained in the Swiss outer membrane fraction or the outer membrane fraction. H. H. elegans using the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction as assay reagents.
  • Detection of antibodies against proteins contained in the Swiss outer membrane fraction or the outer membrane fraction can be performed by enzyme immunoassay (EIA method), simple EIA method, enzyme-linked immunosorbent assay method (ELISA method), radioimmunoassay method (RIA method), fluorescent immunoassay method (FIA method) and other labeled immunoassay methods; immunoblotting methods such as Western blotting; immunochromatographic methods such as gold colloid agglutination methods; ion-exchange chromatography methods, affinity chromatography methods and other chromatographic methods; Nephelometric method (TIA method); nephelometric method (NIA method); colorimetric method; latex agglutination method (LIA method); particle counting method (CIA method); method; surface plasmon resonance method (SPR method); resonant mirror detector method (RMD method);
  • EIA method enzyme immunoassay
  • simple EIA method enzyme-linked immunosorbent assay method
  • RIA method radioimmuno
  • the present invention provides a method for producing H. Concerning the method of determining Swiss infection: (a) A sample derived from a subject is treated with the H.364 of the present invention. contacting with the Swiss outer membrane fraction or a protein contained in the outer membrane fraction; (b) H.I. (c) detecting antibodies in said sample bound to the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction; Subjects in whom the Swiss outer membrane fraction or antibodies bound to proteins contained in the outer membrane fraction were detected were treated with H. determined to be infected with Switzerland, while H. Subjects in whom no antibodies bound to the Swiss outer membrane fraction or to proteins contained in the outer membrane fraction were detected were tested by H. The process of determining that Switzerland is not infected.
  • the present invention provides a method for producing an H.I. Concerning the method of determining Swiss infection: (a) A sample from a subject is treated with H.I. contacting with the Swiss outer membrane fraction or a protein contained in the outer membrane fraction; (b) H.I. measuring the level of antibodies in said specimen bound to the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction; If higher than the level of antibody measured, the subject is treated with H.I. If determined to be infected with H. switzerland and the level of antibody measured is equal to or lower than the level of antibody measured for the negative control by a similar method, the subject is tested for H. pneumoniae. The process of determining that Switzerland is not infected.
  • a negative subject refers to a specimen from a subject not infected with H. suis.
  • the level of antibody refers to the quantitative value of antibody, ie, antibody titer, and is expressed, for example, as the concentration in the sample. Also included in the detection of antibodies is the measurement of levels of antibodies.
  • H Whether or not the Swiss outer membrane fraction or the protein contained in the outer membrane fraction binds to the antibody in the specimen derived from the subject can be confirmed by the methods exemplified below.
  • H The Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction are bound to an immobilized carrier, and a specimen derived from a subject is treated with H. After contact with the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction, the reaction system is washed to remove unbound antibodies.
  • H.I There is a Swiss outer membrane fraction, or a complex in which a protein contained in the outer membrane fraction binds to an antibody in a subject-derived specimen. After that, contact with a labeled anti-Ig antibody, the H.
  • the reaction system After binding the subject-derived antibody bound to the protein contained in the Swiss outer membrane fraction or the outer membrane fraction with the labeled anti-Ig antibody, the reaction system is washed to remove the unbound labeled anti-Ig antibody. removing and detecting the label of the remaining labeled anti-Ig antibody; It can be determined that the protein contained in the Swiss outer membrane fraction or the outer membrane fraction bound to the antibody in the specimen derived from the subject. By measuring the level of the labeled anti-Ig antibody, H. The level of binding between the Swiss outer membrane fraction, or proteins contained in the outer membrane fraction, and antibodies in a specimen derived from a subject can also be measured.
  • the anti-Ig antibody may be an anti-IgG antibody, an anti-IgM antibody, or the like, but is preferably an anti-IgG antibody.
  • anti-IgG antibodies are preferably monoclonal antibodies.
  • Fab, Fab', F (ab') 2 single chain antibody (scFv), VHH single domain antibody (nanobody) dsFv, dibody, fragment having specific antigen binding such as minibody (antigen-binding fragment ) can also be used. Representative examples of such methods include ELISA and immunochromatography.
  • Enzymes such as alkaline phosphatase and horseradish peroxidase, metal colloids such as gold colloids, silica particles, cellulose particles, magnetic particles, fluorescent particles, colored polystyrene particles, colored latex particles, and the like are used for labeling anti-Ig antibodies.
  • metal colloids such as gold colloids, silica particles, cellulose particles, magnetic particles, fluorescent particles, colored polystyrene particles, colored latex particles, and the like are used for labeling anti-Ig antibodies.
  • colored particles such as metal colloid particles, colored polystyrene particles, colored latex particles, etc.
  • the amount of antibody can be calculated from the measured values by creating a standard curve using a standard solution whose abundance is known in advance.
  • a surface plasmon resonance sensor H. Binding of the Swiss outer membrane fraction, or proteins contained in the outer membrane fraction, to antibodies in a specimen derived from a subject can also be detected or measured.
  • the sandwich method is preferred.
  • the sandwich method itself is well known in the field of immunoassay, and can be performed, for example, by an immunochromatography method or an ELISA method in which lateral flow immunoassay is performed.
  • sandwich methods per se are all well-known, and the method of the present invention can be carried out by the well-known sandwich method.
  • the ELISA method will be described below.
  • the Swiss outer membrane fraction or a protein (antigen) contained in the outer membrane fraction is immobilized, and H. elegans is added to the immobilized carrier.
  • a Swiss outer membrane fraction or a specimen that may contain an antibody against a protein contained in the outer membrane fraction is added and contacted to form a complex of the antigen and the antibody on the immobilized carrier.
  • an enzyme-labeled antibody that is specific to a human antibody is added and brought into contact, and the anti-Ig antibody is bound to the antigen-antibody complex on the immobilized carrier.
  • a substrate for the enzyme is added, an enzymatic reaction is allowed to occur, color development is measured by absorbance measurement, and a sandwich complex of the antigen and antibody on the plate can be detected.
  • the antigen-antibody reaction can be carried out at 4° C. to 45° C., preferably 20° C. to 40° C., more preferably 25° C. to 38° C., and the reaction time for each binding reaction is 10 minutes to 18 hours. It is preferably 10 minutes to 3 hours, more preferably 30 minutes to 2 hours.
  • H. Binding of the Swiss outer membrane fraction or proteins (antigens) contained in the outer membrane fraction to the carrier can be performed by known methods such as physical adsorption and covalent bonding using functional groups.
  • the immobilized amount is not particularly limited, but when the carrier is a 96-well microtiter plate, it is preferably several ng to several tens of ⁇ g per well.
  • the solid-phased H.I. It can be carried out by contacting the Swiss outer membrane fraction or the protein (antigen) solution contained in the outer membrane fraction with the carrier. For example, H.
  • a Swiss outer membrane fraction or a solution of proteins (antigens) contained in the outer membrane fraction can be dispensed into wells of a microtiter plate and allowed to stand for a certain period of time to solidify.
  • H After immobilizing the Swiss outer membrane fraction or proteins (antigens) contained in the outer membrane fraction, use bovine serum albumin, human serum albumin, rabbit serum albumin, ovalbumin to prevent non-specific binding during the assay. Blocking is preferably performed using a blocking solution containing such as.
  • the subject in the method of determining Swiss infection can be mammals such as humans, monkeys, pigs, cats, wild boars, dogs, rabbits, mice and sheep, and is preferably a human. More preferably, gastritis, chronic gastritis, goose bump gastritis, type A gastritis, gastric MALT lymphoma, diffuse large B-cell lymphoma, gastric cancer, gastric/duodenal ulcer, idiopathic thrombocytopenic purpura, functional dyspepsia, or a human patient suffering from Parkinson's disease.
  • the method of the present invention can be performed qualitatively, quantitatively or semi-quantitatively (Non-Patent Document 4).
  • a tissue sample taken from a subject as a biopsy or a liquid sample taken from a subject can be used as a specimen for the method of the present invention.
  • the specimen is not particularly limited as long as it can be used as a target for the method of the present invention. Fluid, saliva, or fractions or processed products thereof can be mentioned.
  • the H.I. Preferred specimens are blood, plasma, serum, lymph, and urine when antibodies are to be detected in the method for determining the presence of Swiss.
  • kits for measuring antibodies against the Swiss outer membrane fraction or a protein contained in the outer membrane fraction comprising at least H. It contains a Swiss outer membrane fraction or a carrier on which a protein contained in the outer membrane fraction is immobilized, and further contains a labeled anti-Ig antibody.
  • the Swiss outer membrane fraction or proteins contained in the outer membrane fraction can be appropriately prepared by methods well known to those skilled in the art with reference to the disclosure of the present specification. Moreover, the reagent of the present invention can be produced as appropriate by a method well known in the art.
  • the present invention provides a method for detecting H. H . It relates to a method for determining the presence of Switzerland.
  • the present invention relates to H.I. detection of H . It relates to a method for determining Swiss infection.
  • H. Subjects who collected the Swiss outer membrane fraction or samples in which antibodies against proteins contained in the outer membrane fraction were detected were tested for H. pneumoniae, respectively. Switzerland exists, or H. Determined to be infected with Switzerland.
  • the method of the present invention is performed by measuring the binding between the antibody in the specimen and the test reagent, whether or not it is "detected” in the determination does not necessarily mean the presence or absence of absolute detection. Instead, it may be determined in comparison with other specimens. That is, the presence/absence of detection may be determined based on the measured value instead of based on the ⁇ detection result. That is, in the method of the present invention, the step of "detecting" can be replaced with "measuring” as necessary, and whether or not it is “detected” is determined based on the measured value of the target substance and the negative target. It may be determined in comparison. For example, negative subjects, ie, H. Specimens not containing Switzerland or H.
  • the target substance When the target substance is detected in a specimen derived from a subject who is clearly not infected with Switzerland, if the measured value of the subject is equivalent to that of the negative subject, it is detected in a small amount.
  • H.I. Switzerland does not exist or H. Determined not to have infected Switzerland.
  • the subject's measurement is high compared to the negative subject's measurement, it will be labeled as "detected.” Switzerland exists, or H. Determined to be infected with Switzerland. Therefore, it is within the pre-accepted range of the present invention that the method of the present invention accepts a small measured value for subjects that are negative.
  • H. Swiss infected and H. It is possible to measure antibody titers in specimens from uninfected Swiss subjects and set a cut-off value. If it is equal to or greater than the cutoff value, the H.I. Switzerland exists, or H. It is possible to determine that Switzerland is infected.
  • the cutoff value can be determined, for example, by ROC (receiver operating characteristic curve) analysis.
  • the diagnostic accuracy (sensitivity and specificity) of the method of the present invention can be determined by ROC analysis.
  • ROC analysis was carried out according to H. Specimens collected from Swiss infected persons and H. Anti-H. The Swiss antibody is measured, the sensitivity and false positive rate (1-specificity) at each cutoff value are calculated, and plotted on a coordinate system with (1-specificity) on the horizontal axis and sensitivity on the vertical axis.
  • the diagnostic accuracy is analyzed by ROC analysis, the sensitivity is 80% or higher, preferably 85% or higher, more preferably 90% or higher, and the specificity is 75% or higher, preferably 80% or higher.
  • H.I. Antibodies to H. pylori are available from H. pylori.
  • Helicobacter pylori refers to an antibody against any of the constituents of the whole cell of H. pylori, ie, the cell component. For example, H.I. If the test for H. pylori is negative but shows symptoms of gastric disease, H.
  • the detection of antibodies against H. pylori may be performed simultaneously using the same specimen, or may be performed separately using different specimens collected at different times. H. Detection of antibodies to H. pylori is described in H. pylori. Detection of antibodies against proteins contained in the Swiss outer membrane fraction or the outer membrane fraction may be performed in the same manner.
  • H. Whether or not H. pylori is "detected” does not have to be the absolute presence or absence of detection, and may be determined in comparison with other specimens. That is, the presence/absence of detection may be determined based on the measured value instead of based on the ⁇ detection result. That is, in the method of the present invention, the step of "detecting" can be replaced with “measuring” as necessary, and whether or not it is “detected” is determined based on the measured value of the target substance and the negative target. It may be determined in comparison. For example, negative subjects, ie, H. pylori-free specimen or H.
  • the target substance is detected in a specimen derived from a subject who is clearly not infected with Helicobacter pylori, if the measured value of the subject is equivalent to that of the negative subject, it is detected in a small amount.
  • H.I. pylori is absent or H. pylori infection is determined.
  • the subject's measurement is high compared to the negative subject's measurement, it will be labeled as "detected.”
  • pylori is present, or H. pylori infection is determined. Therefore, it is within the pre-accepted range of the present invention that the method of the present invention accepts a small measured value for subjects that are negative.
  • H. antibodies to the Swiss outer membrane fraction, or proteins contained in the outer membrane fraction In the present invention, H. antibodies to the Swiss outer membrane fraction, or proteins contained in the outer membrane fraction; A kit for measuring antibodies to H. pylori is included, the kit comprising at least H. pylori. Swiss outer membrane fraction or a carrier on which proteins contained in the outer membrane fraction are immobilized, and H. It contains a carrier on which any constituent component of the whole H. pylori cell is immobilized, and further contains a labeled anti-human Ig antibody.
  • H. pylori antigen may be detected.
  • H. Detection of H. pylori antigen also results in detection of H. pylori infection can be detected.
  • H. A preferred sample for detecting H. pylori antigens is stool.
  • the present invention is a method for detecting H. antibodies to the Swiss outer membrane fraction, or proteins contained in the outer membrane fraction;
  • a kit for measuring H. pylori antigen is included, the kit comprising at least H. pylori antigen.
  • Example 1 Measurement of human specimen Measurement of anti-H. swiss antibody titer of infected person (human) using ELISA (Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay; enzyme immunoassay).
  • Swiss medium composition Brucella Broth (BD BBL) 2.8 g Agar powder (BD BBL) 1.5 g Pyruvic acid (Sigma) 0.1 g added when preparing agar medium Skirrow Supplement (2 mL/vial, Oxoid) 0.4 mL Vitox Supplement (10 mL/vial, Oxoid) 2 mL Amphotericin B (0.25 mg/mL) 2 mL Adjust pH to 5 with 0.135 mL of concentrated hydrochloric acid 20 mL of inactivated fetal bovine serum (FBS) Distilled water was added to bring the total volume to 100 mL.
  • BD BBL Swiss medium composition Brucella Broth
  • BD BBL 2.8 g
  • Non-Patent Document 2 9 mL of agar medium was added to a 75 cm 2 flask to prepare a slant medium, and H. spp. Swiss SNTW101c strain (Non-Patent Document 2) was inoculated, 12 mL of liquid medium was added, temperature was 37°C, humidity was 100%, and microaerobic conditions (5% O 2 , 12% CO 2 , 83% N 2 ) were used. Shaking culture was performed for 1 week. After that, the culture medium was centrifuged (13,420 G x 10 minutes) to collect the cells.
  • the cells were washed twice with PBS (phosphate buffered saline, pH 7.4), suspended in distilled water, and subjected to sonication for 5 minutes under ice-cold conditions (Bioruptor II ultrasonic cell disruption). 30 seconds of sonication and 5 repetitions of 30 seconds rest on the device (setting High)).
  • the disruption solution was "H. swiss whole cell suspension", the sediment was taken as "H. swiss cell outer membrane fraction" by centrifugation (30,190 G x 10 minutes), and suspended in distilled water.
  • a Bio-Rad Protein Assay kit was used with BSA as a standard protein.
  • H. pylori-infected persons determined by existing test methods (urea breath test, antibody test, antigen test, etc.), and H. pylori Sera were collected from Swiss-infected subjects (H. suis infection was determined by the real-time PCR method described in Patent Document 2 or culture from the stomach biopsy by preparing DNA from the subject's stomach biopsy).
  • Figures 1 and 2 show the results of ELISA using human serum (3600-fold dilution).
  • the H. suis positive subject had an absorbance against both the H. suis whole cell and the H. suis solubilized fraction antigens. Higher absorbance was obtained with the Swiss solubilized fraction.
  • H.I. H . pylori-infected and non-infected individuals had low absorbance for all antigens. For this reason, H. In human blood infected with Swiss H. that antibodies have been produced against the Swiss solubilized fraction; It was shown for the first time that antibodies can be captured with high sensitivity by using the Swiss solubilized fraction as an antigen. This suggests that H. suis solubilized fractions may be used in humans.
  • H. pylori infection as distinct from H. pylori infection. It became clear that highly sensitive diagnosis of Swiss infection was possible.
  • Example 2 Measurement of mammalian specimen
  • the cultured H. suisse SNTW101c strain was centrifuged to collect cells. The cells were suspended in PBS, and 4-week-old female C57BL/6 mice were orally infected with 1 ⁇ 10 8 colony forming units (CFU) once.
  • the H.C. pylori strain SS1 was inoculated on a Nissui plate Helicobacter agar medium and cultured for 3 days under microaerobic conditions (5% O 2 , 12% CO 2 , 83% N 2 ) at a temperature of 37° C. and a humidity of 100%.
  • Colonies were grown in 100 mL of brucella broth (containing 10 mL of inactivated FBS and 0.4 mL of SR0147 Helicobacter pylori Selective Supplement (Dent)) at 37° C., 100% humidity, microaerophilic conditions (5% O 2 , 12%). After culturing with shaking for 3 days in CO 2 , 83% N 2 ), the cells were collected by centrifugation. The cells were suspended in PBS, and 2 ⁇ 10 8 CFU was orally administered to 4-week-old female C57BL/6 mice three times every other day. H. DNA was extracted from the gastric mucosa of Swiss-infected mice, and infection was confirmed by PCR. Also, H.I.
  • H. pylori-infected mouse gastric mucosa suspended in a buffer solution was spread on a Nissui Helicobacter agar medium (Nissui Pharmaceutical Co., Ltd.) and cultured to confirm infection.
  • Sera from H. pylori-infected mice and H. suis-infected mice 4 weeks after the last infection day were collected, respectively.
  • sera were collected from healthy mice that were not infected with any of these (non-infected).
  • H. suis whole cell suspension (4 ⁇ g/mL) or H. suis solubilized fraction (4 ⁇ g/mL) 100 ⁇ L/well dissolved in 0.1 M carbonate-bicarbonate buffer (pH 9.4) was added to 96- Dropped onto a well NUNC ImmunoPlate #439454 and left at 4° C. overnight. The next day, the cell solution was discarded, and the cells were washed with 200 ⁇ L/well of PBS-T three times. 200 ⁇ L/well of a blocking solution (1% BSA, PBS system pH 7.4) prepared from Blocker BSA 10X in PBS (Thermo Scientific) was dropped and left at 37° C. for 1 hour.
  • a blocking solution 1% BSA, PBS system pH 7.4
  • Blocker BSA 10X in PBS (Thermo Scientific) was dropped and left at 37° C. for 1 hour.
  • the blocking solution was discarded, and the cells were washed with 200 ⁇ L/well of PBS-T three times.
  • 50 ⁇ L/well of mouse serum diluted with a blocking solution was dropped and left at 37° C. for 1 hour.
  • the serum solution was discarded and washed with 200 ⁇ L/well of PBS-T three times.
  • Horseradish peroxidase-labeled secondary antibody (Goat Anti-Mouse Ig, Human ads-HRP, SouthernBiotech, Inc.) diluted 100,000-fold with blocking solution was added dropwise at 50 ⁇ L/well and left at 37° C. for 1 hour.
  • the secondary antibody solution was discarded, and washed with 200 ⁇ L/well of PBS-T three times.
  • FIGS 3 and 4 show the results of ELISA using mouse serum (3600-fold dilution).
  • the H. suis positive subject had absorbance for both the H. suis whole cell and H. suis outer membrane fraction antigens. Higher absorbance was obtained with the Swiss outer membrane fraction.
  • H.I. H . H. pylori-infected mice and non-infected mice had low absorbance for both antigens. For this reason, H. H . that antibodies against the Swiss outer membrane fraction have been produced; It was shown for the first time that antibodies can be captured with high sensitivity by using the Swiss outer membrane fraction as an antigen. This demonstrated that H. suis outer membrane fractions could be used to generate H. suis in mice. H. pylori infection as distinct from H. pylori infection. It became clear that highly sensitive diagnosis of Swiss infection was possible.
  • Example 3 Measurement of human specimen Measurement of anti-H. pylori antibody titer and anti-H. swiss antibody titer of infected person (human) using ELISA (EnzymeLinked ImmunoSorbent Assay; enzyme immunoassay) (1) H for ELISA . Preparation of H. pylori antigen (H. pylori extracorporeal membrane fraction) H.
  • ELISA EnzymeLinked ImmunoSorbent Assay; enzyme immunoassay
  • Non-Patent Document 2 pylori TN2GF4 strain was prepared in brucella broth containing 10% (V/V) fetal calf serum (FCS) at a temperature of 37°C, humidity of 100%, microaerobic conditions (5% O 2 , 10% CO 2 , 85% N 2 ) for 48 hours, and then the culture medium was centrifuged (13,420 G x 10 minutes) to collect the cells. The cells were washed twice with PBS phosphate-buffered saline (pH 7.4), suspended in distilled water, and subjected to sonication for 5 minutes under ice-cold conditions (Bioruptor II ultrasonic cell disruptor).
  • FCS fetal calf serum
  • the cells were washed twice with PBS phosphate-buffered saline (pH 7.4), suspended in distilled water, and subjected to sonication for 5 minutes under ice-cold conditions (Bioruptor II ultrasonic cell disruptor). (setting High), sonication for 30 seconds, rest for 30 seconds, repeated 5 times).
  • the disruption solution was "H. swiss whole cell suspension", the sediment was taken as "H. swiss cell outer membrane fraction" by centrifugation (30,190 G x 10 minutes), and suspended in distilled water.
  • a Bio-Rad Protein Assay kit was used with BSA as a standard protein.
  • H. H. pylori extracellular membrane fraction and H. suis extracellular membrane fraction (4 ⁇ g/mL) (100 ⁇ L/well) were dropped onto a 96-well NUNC ImmunoPlate #468667 and left at 4° C. overnight. The next day, the cell solution was discarded, and the cells were washed three times with 250 ⁇ L/well of PBS-T (PBS containing 0.05% (V/V) Tween 20). 200 ⁇ L/well of a blocking solution (1% (V/V) BSA, PBS pH 7.0) was added dropwise and left at 37° C. for 1 hour. The blocking solution was discarded, and the cells were washed with 250 ⁇ L/well of PBS-T three times. H.
  • PBS-T PBS containing 0.05% (V/V) Tween 20
  • 200 ⁇ L/well of a blocking solution 1% (V/V) BSA, PBS pH 7.0
  • H. pylori-infected persons with symptoms of gastric disease determined by existing test methods (urea breath test, antibody test, antigen test, etc.) and H. pylori patients with symptoms of gastric disease.
  • Sera were collected from Swiss-infected subjects (H. suis infection was determined by the real-time PCR method described in Patent Document 2 or culture from the stomach biopsy by preparing DNA from the subject's stomach biopsy).
  • serum was collected from a healthy subject who had not been infected with any bacteria (non-infected).
  • 50 ⁇ L/well of human serum diluted with a specimen diluent (0.5% (V/V) BSA, PBS system pH 7.0) was added dropwise and left at 37° C. for 1 hour.
  • the serum solution was discarded and washed with 250 ⁇ L/well of PBS-T three times.
  • Horseradish peroxidase-labeled secondary antibody (Goat anti-Human IgG (H+L), Jackson ImmunoResearch, Inc.) was added dropwise at 50 ⁇ L/well and left at 37° C. for 1 hour. The secondary antibody solution was discarded, and washed with 250 ⁇ L/well of PBS-T three times.
  • 50 ⁇ L/well of TMB One Component HRP Microwell Substrate, (Surmodics, Inc.) was dropped to develop a blue color, and then 50 ⁇ L/well of 0.17 M sulfuric acid was dropped to change the color to yellow.
  • Absorbance at 450 nm reference wavelength: 620 nm to 630 nm
  • FIGS 5 and 6 show the results of ELISA using human serum (3,600-fold dilution).
  • H.I. In the Swiss outer membrane fraction, H. The absorbance of the swiss infected group (gastric disease - E, F, G, H) was H.C. Significantly higher results than the H. pylori infected group (stomach disease-A, B, C, D) or the non-infected group (healthy subjects-A, B, C, D) were obtained (H. Swiss infected group vs. H pylori-infected group or non-infected group: P 0.0209). This suggests that anti-H. pylori antibody and anti-H. By testing for both Swiss antibodies, H. pylori infection. H. pylori-negative and missed subjects were also tested. It became clear that a diagnosis of Swiss infection could be made.
  • Example 4 Measurement of human specimen Measurement of anti-H. swiss antibody titer of infected person (human) using ELISA (Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay; enzyme immunoassay).
  • Swiss medium composition Brucella Broth (BD BBL) 2.8 g Agar powder (BD BBL) 1.5 g Pyruvic acid (Sigma) 0.1 g added when preparing agar medium Skirrow Supplement (2 mL/vial, Oxoid) 0.4 mL Vitox Supplement (10 mL/vial, Oxoid) 2 mL Amphotericin B (0.25 mg/mL) 2 mL Adjust pH to 5 with 0.135 mL of concentrated hydrochloric acid 20 mL of inactivated fetal bovine serum (FBS) Distilled water was added to bring the total volume to 100 mL.
  • BD BBL Swiss medium composition Brucella Broth
  • BD BBL 2.8 g Agar powder (BD BBL) 1.5
  • Non-Patent Document 2 9 mL of agar medium was added to a 75 cm 2 flask to prepare a slant medium, and H. spp. Swiss SNTW101c strain (Non-Patent Document 2) was inoculated, 12 mL of liquid medium was added, temperature was 37°C, humidity was 100%, and microaerobic conditions (5% O 2 , 12% CO 2 , 83% N 2 ) were used. Shaking culture shaking was performed for one week. After that, the culture medium was centrifuged (13,420 G x 10 minutes) to collect the cells.
  • the cells were washed twice with PBS phosphate-buffered saline (pH 7.4), suspended in distilled water, and subjected to sonication for 5 minutes under ice-cold conditions (Bioruptor II ultrasonic cell disruptor). (setting High), sonication for 30 seconds, rest for 30 seconds, repeated 5 times).
  • the disruption liquid was used as "H. suis whole cell suspension", and the sediment was obtained by centrifugation (30, 190 G x 10 minutes) to obtain "H. suis cell outer membrane fraction", which was suspended in distilled water.
  • a Bio-Rad Protein Assay kit was used with BSA as a standard protein.
  • HsvA antigenic peptides are a part of HsvA (an outer membrane protein specifically present only in H. Switzerland, composed of about 3000 amino acid residues) disclosed in International Publication WO2019/225639. 14 amino acid residues are shown.
  • EKKAVQQMENSNPD Peptide No. 11: SEQ ID NO: 1
  • EKKAVEQMENSNPD Peptide No. 11 (TKY): SEQ ID NO: 2)
  • EKDAVTSLKNSNSG Peptide No. 11 (SH8): SEQ ID NO: 3
  • EKDAVTSLENSNSG Peptide No. 11 (SH10): SEQ ID NO: 4
  • NQGTLEFLSNDVST Peptide No.
  • TNGQEVSASIDYNK Peptide No. 16: SEQ ID NO: 6
  • AKLSNFASNDALPD Peptide No. 23: SEQ ID NO: 7
  • PTTSSGASPDSSNP Peptide No. 10: SEQ ID NO: 8
  • NVDNILNMPSTTSG Peptide No. 20: SEQ ID NO: 9
  • TLTLEGTETFAQNS Peptide No. 81: SEQ ID NO: 10
  • ADIQSSQTTFANSV Peptide No. 61: SEQ ID NO: 11).
  • H. H. pylori extracorporeal membrane fraction and HsvA antigen peptide were added dropwise to 96-well NUNC ImmunoPlate #468667 and left at 4° C. overnight. The next day, the cell solution was discarded, and the cells were washed three times with 250 ⁇ L/well of PBS-T (PBS containing 0.05% (V/V) Tween 20). 200 ⁇ L/well of a blocking solution (1% (V/V) BSA, PBS pH 7.0) was added dropwise and left at 37° C. for 1 hour.
  • PBS-T PBS containing 0.05% (V/V) Tween 20
  • 200 ⁇ L/well of a blocking solution 1% (V/V) BSA, PBS pH 7.0
  • H. pylori-infected persons determined by existing test methods (urea breath test, antibody test, antigen test, etc.), and H. pylori Sera were collected from Swiss-infected subjects (H. suis infection was determined by the real-time PCR method described in Patent Document 2 or culture from the stomach biopsy by preparing DNA from the subject's stomach biopsy). As a control, serum was collected from a healthy subject who had not been infected with any bacteria (non-infected).
  • H. H. pylori infection as distinct from H. pylori infection. Sensitive diagnosis of Swiss infection becomes possible. All publications, patents and patent applications cited herein are hereby incorporated by reference in their entirety.

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Abstract

H.スイスの外膜画分を用いたヘリコバクター・スイスの抗体の測定方法および測定試薬の提供。 少なくともH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質および抗Ig抗体を含む、被験体由来の検体のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合する抗体を検出する試薬。

Description

菌体外膜画分を用いた、ヘリコバクター・スイス抗体の検出法
 本発明は、H.スイスの外膜画分を用いたヘリコバクター・スイスの抗体の測定方法に関する。
 現在、慢性胃炎、胃潰瘍や十二指腸潰瘍、胃癌、胃Mucosa-Associated Lymphoid Tissue(MALT)リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞性リンパ腫などに、ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori、ヒトの胃に寄生する微好気性のグラム陰性螺旋菌、以下、「H.ピロリ」という)による感染が関与することが知られている。H.ピロリの感染検査方法として、分離培養法や尿素呼気試験(UBT)、血清や尿中のH.ピロリ抗体価の測定(ELISAとラッテクス凝集法)、便中のH.ピロリ抗原測定(イムノクロマト法)、胃生検体の迅速ウレアーゼ試験(RUT)が主に採用されている。
 しかし、近年、H.ピロリの診断や除菌の普及によるH.ピロリの感染率の低下に伴い、H.ピロリ以外のヒトに重篤な胃疾患を誘発するヘリコバクターとして、NHPH(Non-Helicobacter pylori hericobacters; H.ピロリ以外のヘリコバクター)が問題となってきた。NHPHには、ヘリコバクター・スイス(以下、H.スイス)、H.bizzozeronnii、H.felis、H.salmonis、H.ailurogastricus、H.cynogasticus、H.baculiformis、H.mustelae、H.acinonychls、H.cetorumおよびH.heilmanniiが含まれ、このうちヒトの胃から見つかる大部分は、H.スイスである。
 H.ピロリは霊長類にしか感染せず、乳幼児期においてのみ近親者からの感染が想定されるが、H.スイスは年齢に関係なく、豚、猿などの動物から感染する。
 H.スイスは約10万年前には、サルの胃に寄生していた。その後1.5万年前にブタにも感染するようになった。ブタの家畜化に伴い感染が爆発的に広まり、ヒトにも感染するようになった(非特許文献1)。世界各地から分離された181株のH.スイス遺伝子のMLST(Multi Locus Sequencing Typing)解析を行ったところ、感染宿主動物により独立のクラスターを形成したが、ヒトから分離した株は、独立のクラスターを形成せず、ブタのクラスターに含まれることから、ヒトへの感染源はブタと判定された(非特許文献2)。そこで、ブタとヒトにおいて感染診断と除菌剤が必要となる。
 H.スイスの感染検査方法として、血清中のH.スイス抗体価の測定(ELISAとラッテクス凝集法)が報告されている(特許文献1、2)。
特開2016-10331号公報 国際公開WO2019/225639号
Flahou et al.,ISM J.,Jan;12(1):77-86.doi:10.1038/ismej.2017.145 E.Rimbara et al.,Proc Natl Acad Sci USA 2021 Vol.118 Issue 13 e2026337118.doi:10.1073/pnas.2026337118. Haesebrouck F.et al.,Helicobacter,16(4),339-340,2011,doi:10.1111/j.1523-5378.2011.00849.x A.D.Augustin,et al.,Front.Med.,2019,6,188,doi:10.3389/fmed.2019.00188(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/31555648)
 本発明は、H.スイスの外膜画分を用いたヘリコバクター・スイスの抗体の測定方法および測定試薬の提供を目的とする。
 特許文献1にはH.スイスのF2R2蛋白をプレートに固相して血清中の抗体を測定することが開示されている。そして、特許文献2にはF2R2蛋白質より抗体価が高いとさされるHsvA蛋白をプレートに固相して血清中の抗体を測定することが開示されている。
 しかしながら、従来の方法より感度と特異性の高い方法が求められていた。
 今回、本発明者らは、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質を用いることで、感染者の体内の抗H.スイス抗体の測定感度と特異性を高めることを新規に発見し、新しい測定法を見出した。
 より具体的には、本発明は、以下の発明に関する:
[1] 少なくともH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質および抗Ig抗体を含む、被験体由来の検体のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合する抗体を検出する試薬。
[2] 被験体が哺乳動物であることを特徴とする、[1]の試薬。
[3] 検体が血液由来であることを特徴とする、[1]または[2]の試薬。
[4] さらに、H.ピロリの菌体成分またはH.ピロリ菌体成分に対する抗体を含む、被験体由来の検体のH.ピロリと結合する抗体またはH.ピロリ菌体成分の抗原も検出することを特徴とする、[1]~[3]のいずれかの試薬。
[5] ELISAまたはイムノクロマト用試薬である、[1]~[4]のいずれかの試薬。
[6] 以下の工程を含む、被験体由来の検体の抗H.スイス外膜画分または外膜画分に含まれる蛋白と結合する抗体を検出することを特徴とする方法:
(a)被験体由来の検体をH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と接触させる工程、および
(b)H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合した、前記検体中の抗体を検出する工程。
[7] 被験体が哺乳動物であることを特徴とする、[6]の方法。
[8] 検体が血液由来であることを特徴とする、[6]または[7]の方法。
[9] さらに、以下の工程を含む、被験体由来の検体のH.ピロリと結合する抗体も検出することを特徴とする、[6]~[8]のいずれかの方法:
(a)被験体由来の検体をH.ピロリ菌体成分と接触させる工程、および
(b)H.ピロリ菌体成分と結合した、前記検体中の抗体を検出する工程。
[10] さらに、以下の工程を含む、被験体由来の検体のH.ピロリ菌体成分の抗原も検出することを特徴とする、[6]~[8]のいずれかの方法:
(a)被験体由来の検体をH.ピロリ菌体成分に対する抗体と接触させる工程、および
(b)H.ピロリ菌体成分に対する抗体と結合した、前記検体中のH.ピロリ菌体成分の抗原を検出する工程。
[11] [1]~[5]のいずれかの試薬を用いた測定および/または[6]~[10]のいずれかの方法により抗体が検出された被験体をH.スイスに感染していると判定する、H.スイスの感染の検出方法。
 本明細書は本願の優先権の基礎となる日本国特許出願番号2022-009302号の開示内容を包含する。
 H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質を用いることで、感染者の体内の抗H.スイス抗体を高感度に測定することができる。H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質は、H.スイス感染診断対象体由来血液中の抗H.スイス抗体の有無または抗体価を測定するために使用することができる。
検体としてヒト血清(3600倍希釈)を用い、抗原としてH.スイス全菌体またはH.スイス外膜画分を用いたELISAの結果を測定値で示す図である。 検体としてヒト血清(3600倍希釈)を用い、抗原としてH.スイス全菌体(図2A)またはH.スイス外膜画分(図2B)を用いたELISAの結果をグラフで示す図である。 検体としてマウス血清(3600倍希釈)を用い、抗原としてH.スイス全菌体またはH.スイス外膜画分を用いたELISAの結果を測定値で示す図である。 検体としてマウス血清(3600倍希釈)を用い、抗原としてH.スイス全菌体(図4A)またはH.スイス外膜画分(図4B)を用いたELISAの結果をグラフで示す図である。 検体としてヒト血清(3600倍希釈)を用い、抗原としてH.ピロリ外膜画分またはH.スイス外膜画分を用いたELISAの結果を測定値で示す図である。 検体としてヒト血清(3600倍希釈)を用い、抗原としてH.ピロリ外膜画分(図6A)またはH.スイス外膜画分(図6B)を用いたELISAの結果をグラフで示す図である。 検体としてヒト血清(3600倍希釈)を用い、抗原としてH.スイス外膜画分またはH.スイスのHsVAの部分ペプチド(配列番号1~5)を用いたELISAの結果を測定値で示す図である。 検体としてヒト血清(3600倍希釈)を用い、抗原としてH.スイス外膜画分またはH.スイスのHsVAの部分ペプチド(配列番号6~11)を用いたELISAの結果を測定値で示す図である。
 以下、本発明の方法について説明する。
 本発明は、被験体の生体試料中のH.スイスの菌体の外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を検出する方法、および該抗体を検出する試薬である。本発明は、被験体におけるH.スイスの存在を判定する方法、または被験体のH.スイスの感染の検出方法でもある。あるいは、被験体のH.スイス感染症を診断するための補助的データを取得する方法である。
(H.スイス:Helicobacter suis)
 本明細書において、「H.スイス」とは、50種類以上報告されているヘリコバクター属細菌の中で、NHPH(Non-Helicobacter pylori helicobacters; H.ピロリ以外のヘリコバクター)あるいは、Helicobacter heilmannii sensu lato(広義のヘリコバクター・ハイルマニイ)に含まれるH.スイスの菌種を意味する(非特許文献3)。H.スイスは、ヒト以外にブタ、サル、イノシシ、ネコ、イヌなどの胃に感染することが知られている。本明細書におけるH.スイスが単離された感染哺乳動物は特に限定されるものではなく、例えば、ヒト、サル、イノシシ、またはブタであってよい。
(H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質)
 本明細書において、「H.スイス外膜画分」とは、H.スイスを超音波破砕後のH. スイス菌体外膜断片を集めることで調製した画分である。超音波破砕は、H.スイス菌体を緩衝液に懸濁させ超音波破砕機を用いて行うことができる。超音波破砕機としてサンプル密閉型超音波破壊装置 Bioruptor(ビーエム機器)サンプル密閉型超音波破壊装置 Bioruptor(ビーエム機器)が挙げられる。超音波破砕により、H.スイス菌体は破壊され、菌体外膜断片が残る。菌体外膜断片は、遠心分離やろ過により回収することができる。「H.スイス外膜画分に含まれる蛋白質」とは、H.スイスを超音波破砕後のH.スイス菌体外膜断片を集めることで調製した画分に存在するH. スイス由来の蛋白質をいう。
(H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を検出する方法および試薬)
 H.スイス外膜画分に対する抗体は、H.スイス外膜画分に含まれる蛋白質、糖等の抗原に対する抗体をいい、種々の物質に対する複数の抗体が含まれ得る。本発明において、H.スイス外膜画分に含まれる蛋白質、糖等の抗原のうち少なくともいずれかの抗原に対する抗体をH.スイス外膜画分に対する抗体という。また、H.スイス外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体は、H.スイス外膜画分に含まれる抗原のうち蛋白質に対する抗体をいう。H.スイス外膜画分には複数の蛋白質が含まれており、H.スイス外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体は、種々の蛋白質に対する複数の抗体が含まれ得る。本発明において、H.スイス外膜画分に含まれる蛋白質のいずれかの蛋白質のうち少なくともいずれかの蛋白質に対する抗体をH.スイス外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体という。実際には、H.スイスが感染した被験体において、体内でH.スイス菌体が分解された結果、被験体中でH.スイス外膜画分に対する抗体、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体が産生される。
 なお、抗体がH.スイス外膜画分に含まれる抗原と結合することを、抗体がスイス外膜画分と結合するという。
 H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を検出する試薬は、公知の方法に適用し得る試薬として作製することができる。公知の方法としては、例えば、酵素免疫測定法(EIA法)、簡易EIA法、酵素結合イムノソルベントアッセイ法(ELISA法)、ラジオイムノアッセイ法(RIA法)、蛍光免疫測定法(FIA法)等の標識化免疫測定法;イムノブロッティング法;イムノクロマト法;クロマトグラフィ法;比濁法(TIA法);比ろう法(NIA法);比色法;ラテックス凝集法(LIA法);粒子計数法(CIA法);化学発光測定法(CLIA法、CLEIA法);沈降反応法;表面プラズモン共鳴法(SPR法);レゾナントミラーディテクター法(RMD法);比較干渉法等を挙げることができる。本発明の試薬が、所望の測定法に適用することが可能であるか否かは、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を含む検体または該検体と同じ濃度のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を含むサンプルを用いて、各測定法を実施することにより、検出可能であるか否かを測定することで確認することができる。
 H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体をH.スイス感染のマーカーとして用いることができる。
 すなわち、被験体がH.スイスに感染しているか否かは、被験体自身の免疫系が生み出したH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体の存在を確認することにより決定することができる。これらの抗体の存在は、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質を利用した抗原抗体反応により検出し確認することができる。H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質を測定試薬として利用したH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体の検出は、酵素免疫測定法(EIA法)、簡易EIA法、酵素結合イムノソルベントアッセイ法(ELISA法)、ラジオイムノアッセイ法(RIA法)、蛍光免疫測定法(FIA法)等の標識化免疫測定法;ウェスタンブロッティング法等のイムノブロッティング法;金コロイド凝集法等のイムノクロマト法;イオン交換クロマトグラフィ法、アフィニティクロマトグラフィ法等のクロマトグラフィ法;比濁法(TIA法);比ろう法(NIA法);比色法;ラテックス凝集法(LIA法);粒子計数法(CIA法);化学発光測定法(CLIA法、CLEIA法);沈降反応法;表面プラズモン共鳴法(SPR法);レゾナントミラーディテクター法(RMD法);比較干渉法等の免疫学的測定法により行うことができる。
 一態様において、本発明は、以下の工程を含むH.スイス感染の判定方法に関する:
(a)被験者由来の検体を本発明のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と接触させること、
(b)H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合した、前記検体中の抗体を検出する工程、および
(c)H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合した抗体が検出された被験体をH.スイスに感染していると判定し、一方、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合した抗体が検出されなかった被験体を、H.スイスに感染していないと判定する工程。
 他の態様において、本発明は、以下工程を含むH.スイス感染の判定方法に関する:
(a)被験体由来の検体を、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と接触させる工程、
(b)H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合した、前記検体中の抗体のレベルを測定する工程、および
(c)測定された抗体のレベルが、同様の方法により陰性対照について測定された抗体のレベルよりも高い場合、該被験体をH.スイスに感染していると判定し、一方、測定された抗体のレベルが、同様の方法により陰性対照について測定された抗体のレベルと同等か低い場合、該被験体を、H.スイスに感染していないと判定する工程。ここで、陰性対象とは、H.スイスに感染していない被験体由来の検体をいう。抗体のレベルとは、抗体の定量値、すなわち抗体価をいい、例えば、検体中の濃度で表される。また、抗体のレベルの測定は、抗体の検出に含まれる。
 H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と被験体由来の検体中の抗体が結合したか否かは、以下に例示される方法で確認すればよい。例えば、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質を固相化担体に結合させ、被験体由来の検体を、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と接触させた後に、反応系を洗浄して非結合の抗体を除去する。この結果、反応系には、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と被験体由来の検体中の抗体が結合した複合体が存在する。その後、標識化した抗Ig抗体と接触させて、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合した被験体由来の抗体と該標識抗Ig抗体とを結合させた後に、反応系を洗浄して非結合の標識抗Ig抗体を除去して、残った標識抗Ig抗体の標識を検出し、該標識抗Ig抗体の標識が検出された場合にH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と被験体由来の検体中の抗体が結合したと判断することができる。該標識抗Ig抗体のレベルを測定することで、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と被験体由来の検体中の抗体との結合レベルを測定することもできる。抗Ig抗体は、抗IgG抗体でも、抗IgM抗体等でもよいが、好ましくは抗IgG抗体である。また、抗IgG抗体は好ましくはモノクローナル抗体を用いる。また、Fab、Fab’、F(ab’)、一本鎖抗体(scFv)、VHHシングルドメイン抗体(ナノボディ)dsFv、diabody、minibodyなどの特異的な抗原結合性を有する断片(抗原結合性断片)を用いることもできる。このような方法の代表例として、ELISA等やイムノクロマト法を挙げることができる。抗Ig抗体の標識には、アルカリフォスファターゼや西洋ワサビペルオキシダーゼのような酵素、金コロイドのような金属コロイド、シリカ粒子、セルロース粒子、磁性粒子、蛍光粒子、着色ポリスチレン粒子および着色ラテックス粒子等が用いられることが多い。金属コロイド粒子、着色ポリスチレン粒子や着色ラテックス粒子等の着色粒子を用いる場合には、これらの標識試薬が凝集することによって着色が生じるので、この着色を測定する。結合レベルを指標として利用する場合、予め存在量が判明している標準溶液を用いて標準曲線を作成することにより、測定値から抗体量を計算することができる。あるいは、表面プラズモン共鳴センサーを用いて、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と被験体由来の検体中の抗体の結合を検出または測定することもできる。
 上記の免疫測定法の中でも、サンドイッチ法が好ましい。サンドイッチ法自体は免疫測定の分野において周知であり、例えばラテラルフロー式に免疫測定を行うイムノクロマト法やELISA法により行うことができる。これらのサンドイッチ法自体はいずれも周知であり、本発明の方法は周知のサンドイッチ法により行うことができる。以下、ELISA法について説明する。
 ELISA用プレートに、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質(抗原)を固相化し、該固相化担体にH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を含む可能性がある検体を添加して接触させ、固相化担体上で抗原と抗体の複合体を形成させる。さらに、ヒト抗体に対する特異的抗体(抗Ig抗体)であって酵素で標識した抗体を添加して接触させ、固相化担体上の抗原と抗体の複合体に抗Ig抗体を結合させる。次いで、酵素に対する基質を添加し、酵素反応を行わせ、発色を吸光度の測定により測定しプレート上の抗原と抗体のサンドイッチ複合体を検出すればよい。
 抗原抗体反応は4℃~45℃、好ましくは20℃~40℃、さらに好ましくは25℃~38℃で行うことができ、また、それぞれの結合反応の反応時間は、10分~18時間、より好ましくは10分~3時間、さらに好ましくは30分~2時間程度である。
 H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質(抗原)の担体への結合は、物理的吸着、官能基を利用した共有結合等、公知の方法で行うことができる。固相化量は、特に限定されないが担体が96ウェルマイクロタイタープレートの場合、1ウエル当たり数ngから数十μgが望ましい。固相化は固相化すべきH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質(抗原)の溶液を担体と接触させることにより行うことができる。例えば、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質(抗原)の溶液をマイクロタイタープレートのウエルに分注し一定時間置くことにより固相化することができる。H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質(抗原)を固相化した後は、アッセイ中の非特異的結合を防ぐためにウシ血清アルブミン、ヒト血清アルブミン、ウサギ血清アルブミン、卵白アルブミン等を含んだブロッキング溶液を用いてブロッキングを行うことが好ましい。
 H.スイスは広く哺乳動物に感染することから、本発明のH.スイスの存在を判定する方法及びH.スイスへの感染を判定する方法における被験体は、ヒト、サル、ブタ、ネコ、イノシシ、イヌ、ウサギ、ネズミ及びヒツジ等の哺乳動物とすることができ、好ましくは、ヒトである。また、より好ましくは、胃炎、慢性胃炎、鳥肌胃炎、A型胃炎、胃MALTリンパ腫、びまん性大細胞型B細胞性リンパ腫、胃癌、胃・十二指腸潰瘍、特発性血小板減少紫斑病、機能性ディスペプシア、またはパーキンソン病に罹患しているヒト患者である。また、本発明の方法は、定性的、定量的または半定量的に行うことができる(非特許文献4)。
 本発明のH.スイスの存在を判定する方法において用いる検体としては、例えば、生検として被験体から採取した組織試料または被験体から採取した液体試料を使用することができる。検体は、本発明の方法の対象として用い得るものであれば特に限定はなく、例えば、組織、血液、血漿、血清、リンパ液、尿、便、漿液、髄液、関節液、眼房水、涙液、唾液またはそれらの分画物若しくは処理物を挙げることができる。本発明のH.スイスの存在を判定する方法において抗体を検出対象とする場合には、好ましい検体は、血液、血漿、血清、リンパ液、及び尿である。
 本発明は、検体中のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を測定するためのキットを包含し、該キットは少なくともH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質を固相化した担体を含み、さらに、標識した抗Ig抗体を含む。
 本発明のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質は、本明細書の開示を参照して当業者周知の方法により適宜調製することができる。また、本発明の試薬は、当該技術分野周知の方法により、適宜製造することができる。
 一態様において、本発明は、検体中の、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を検出する方法を含む、当該検体を採取して被験体におけるH.スイスの存在を判定する方法に関する。特に、本発明は、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体を検出することを含む、被験体におけるH.スイスの感染を判定する方法に関する。本方法において、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体が検出された検体を採取した被験体は、それぞれH.スイスが存在する、またはH.スイスに感染していると判定される。
 本発明の方法が、前記検体中の抗体と、被検試薬との結合を測定することにより行われる場合、判定において「検出された」か否かは、絶対的な検出の有無である必要はなく、他の検体との比較において決定してもよい。すなわち、±の検出結果に基づくものではなく、測定値から検出の有無を決定してもよい。すなわち、本発明の方法において、「検出する」工程は、必要に応じて「測定する」と置き換えることができ、「検出された」か否かは、対象物質の測定値に基づき陰性対象との比較において決定してもよい。例えば、陰性対象、即ち、H.スイスを含まない検体またはH.スイスに感染していないことが明らかな被験体由来の検体等において目的の物質が検出される場合、検被体の測定値が当該陰性対象の測定値と同等であれば、微量ながら検出されていても、本発明の方法においては「検出されなかった」としてH.スイスが存在しない、またはH.スイスに感染していないと判定される。一方で、陰性対象の測定値と比較して、被験体の測定値が高い場合には、「検出された」としてH.スイスが存在する、またはH.スイスに感染していると判定される。よって、本発明の方法において、陰性である対象についてわずかな測定値が認められることは、本発明が予め許容する範囲内である。
 本発明の方法においては、H.スイス感染者とH.スイス非感染者の検体中の抗体の抗体価を測定し、カットオフ値を設定することができる。カットオフ値以上であれば、H.スイスが存在する、またはH.スイスに感染していると判定することが可能である。
 カットオフ値は、例えば、ROC(receiver operating characteristic curve:受信者動作特性曲線)解析により定めることができる。また、ROC解析により本発明の方法による診断精度(感度及び特異度)を決定することができる。ROC解析は、H.スイス感染者から採取した検体とH.スイス非感染者から採取した検体について抗H.スイス抗体を測定し、各カットオフ値での感度及び偽陽性率(1-特異度)を算出し、横軸を(1-特異度)とし、縦軸を感度とした座標上にプロットする。ROC解析により診断精度を解析した場合の感度は80%以上、好ましくは85%以上、さらに好ましくは90%以上であり、特異度は75%以上、好ましくは80%以上であることが良い。
(H.ピロリ(H.pylori)に対する抗体またはH.ピロリ抗原の検出)
 本発明は同一の被験体においてH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合する抗体とH.ピロリに対する抗体を検出する方法および該方法に用いる試薬も包含する。ここで、H.ピロリに対する抗体は、H.ピロリの全菌体のいずれかの構成成分、すなわち菌体成分に対する抗体をいう。例えばH.ピロリの検査で陰性だが胃疾患の症状が示される場合は、H.スイスの感染が原因の可能性が考えられる。同一の被検体からH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合する抗体とH.ピロリに対する抗体を検出することで、H.ピロリの感染の有無だけではなく、これまでH.ピロリ陰性で見逃されていた被検体に対してもH.スイス感染の確認をすることができる。早期に感染を確認することで、適切な治療方針を定めることができる。同一の被験体由来の検体はH.ピロリとH.スイスで同じであっても、異なってもよい。すなわち、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合する抗体の検出とH.ピロリに対する抗体の検出は、同じ検体を用いて同時に行ってもよいし、別の時に採取された異なる検体を用いて別途行ってもよい。H.ピロリに対する抗体の検出は、H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体の検出と同様の方法で行えばよい。
 H.ピロリの判定においても「検出された」か否かは、絶対的な検出の有無である必要はなく、他の検体との比較において決定してもよい。すなわち、±の検出結果に基づくものではなく、測定値から検出の有無を決定してもよい。すなわち、本発明の方法において、「検出する」工程は、必要に応じて「測定する」と置き換えることができ、「検出された」か否かは、対象物質の測定値に基づき陰性対象との比較において決定してもよい。例えば、陰性対象、即ち、H.ピロリを含まない検体またはH.ピロリに感染していないことが明らかな被験体由来の検体等において目的の物質が検出される場合、検被体の測定値が当該陰性対象の測定値と同等であれば、微量ながら検出されていても、本発明の方法においては「検出されなかった」としてH.ピロリが存在しない、またはH.ピロリに感染していないと判定される。一方で、陰性対象の測定値と比較して、被験体の測定値が高い場合には、「検出された」としてH.ピロリが存在する、またはH.ピロリに感染していると判定される。よって、本発明の方法において、陰性である対象についてわずかな測定値が認められることは、本発明が予め許容する範囲内である。
 本発明は、検体中のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体、およびH.ピロリに対する抗体を測定するためのキットを包含し、該キットは少なくともH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質を固相化した担体およびH.ピロリ全菌体のいずれかの構成成分を固相化した担体を含み、さらに、標識した抗ヒトIg抗体を含む。
 さらに、被験体由来の試料中のH.ピロリ抗原を検出してもよい。H.ピロリ抗原の検出によってもH.ピロリの感染を検出することができる。H.ピロリ抗原を検出するための試料は糞便が好ましい。本発明は、検体中のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質に対する抗体、およびH.ピロリ抗原を測定するためのキットを包含し、該キットは少なくともH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質を固相化した担体およびH.ピロリに対する抗体を固相化した担体を含み、さらに、標識した抗ヒトIg抗体を含む。
 以下に実施例を挙げて本発明を具体的に説明するが、本発明はこれに限定されるものではない。なお、本願全体を通して引用される全文献は参照によりそのまま本願に組み込まれる。
(実施例1)ヒト検体の測定
ELISA(EnzymeLinked ImmunoSorbent Assay ;酵素免疫測定法)を用いた感染者(ヒト)の抗H.スイス抗体価の測定
H.スイス培地の組成
ブルセラブロス(BD BBL)        2.8 g
寒天粉末(BD BBL)           1.5 g 寒天培地作製の場合に加えるピルビン酸(Sigma)      0.1 g
Skirrow Supplement(2 mL/vial,Oxoid)            0.4 mL
Vitox Supplement(10 mL/vial,Oxoid)             2 mL
Amphotericin B(0.25 mg/mL)                2 mL
濃塩酸               0.135 mLによりpHを5に調整
非働化牛胎児血清(FBS)                20 mL
蒸留水を加えて、全量を100 mLとした。
 75cmのフラスコに、寒天培地を9mL加え斜面培地を作製し、-80℃保存の鳥肌胃炎の患者から分離したH.スイス SNTW101c株(非特許文献2)を植菌し、液体培地を12mL加え、温度37℃,湿度100%,微好気条件(5%O,12%CO,83%N)で、振とう培養を1週間行った。その後、培養液を遠心分離(13,420 G x 10分間)により菌体を集めた。菌体はPBS(リン酸緩衝生理食塩水、pH7.4)で2回洗浄後、蒸留水に懸濁し、氷冷条件下で5分間の超音波破砕処理を行った(Bioruptor II超音波細胞破壊装置(設定High)で、30秒間の音波処理と30秒間の休止を5回繰り返す)。破壊液を「H.スイス全菌体懸濁液」とし、遠心分離(30,190 G x 10分間)により沈渣を「H.スイス菌体外膜画分」とし、蒸留水に懸濁した。蛋白質の定量には、BSAを標準蛋白質としてBio-Rad Protein Assayキットを用いた。
 0.1M炭酸-重炭酸緩衝液(pH9.4)に溶解したH.スイス全菌体懸濁液またはH.スイス菌体外膜画分(4μg/mL)100μL/wellを96-well NUNC ImmunoPlate #439454へ滴下し、4℃に一晩置いた。翌日菌体溶液を廃棄し、PBS-T(0.05%(V/V)Tween20を含むPBS)200μL/wellで3回洗浄した。Blocker BSA(ウシ血清アルブミン)10X in PBS(Thermo Scientific)より調製したブロッキング溶液(1%(V/V)BSA、PBS系pH7.4)を200μL/well滴下し、37℃に1時間置いた。ブロッキング溶液を廃棄し、PBS-T 200μL/wellで3回洗浄した。H.ピロリ感染者(既存の検査法(尿素呼気試験や抗体検査、抗原検査など)で判定)、およびH.スイス感染者(被検者の胃生検体からDNAを調製し、特許文献2に記載のリアルタイムPCR法あるいは胃生検体からの培養によりH.スイス感染を判定)から血清をそれぞれ採取した。また対照として、いずれの菌にも感染していない健常人からの血清を採取した(非感染)。ブロッキング溶液を用いて希釈したヒト血清を50μL/well滴下し、37℃に1時間置いた。血清溶液を廃棄し、PBS-T 200μL/wellで3回洗浄した。ブロッキング溶液を用いて100,000倍希釈した西洋わさびペルオキシダーゼ標識二次抗体(Goat anti-Human IgA+IgG+IgM(H+L),Jackson ImmunoResearch, Inc.)を50μL/well滴下し、37℃で1時間置いた。二次抗体溶液を廃棄し、PBS-T 200μL/wellで3回洗浄した。SuperBlue TMB Microwell Peroxidase Substrate(1-Component),Kirkegaard&Perry Laboratories,Inc.(KPL)を50μL/well滴下し青く発色後に、1N塩酸を50μL/well滴下し黄色へ変色させた。プレートリーダーを用いて450nm(リファレンス波長:620nm~630nm)の吸光度を測定した。
 ヒト血清(3600倍希釈)を用いたELISAの結果を図1および図2に示す。H.スイス陽性の対象はH.スイス全菌体およびH.スイス可溶化画分のいずれの抗原に対しても吸光度が得られたが、H.スイス可溶化画分でより高い吸光度が得られた。また、H.スイスに感染していないH.ピロリ感染者および非感染者はいずれの抗原に対する吸光度も低かった。このことから、H.スイスに感染したヒト血液中にH.スイス可溶化画分に対する抗体が産生されていること、および、H.スイス可溶化画分を抗原として用いることで、高感度に抗体を捉えられることが初めて示された。これにより、H.スイス可溶化画分を用いることにより、ヒトにおいてH.ピロリ感染と区別してH.スイス感染の高感度な診断ができることが明らかとなった。
(実施例2)哺乳動物検体の測定
 培養したH.スイス SNTW101c株を遠心分離により菌体を集めた。菌体はPBSに懸濁し、4週齢のメスのC57BL/6マウスへ1x10Colony forming unit(CFU)を1回経口感染投与した。一方、-80℃保存のH.ピロリSS1株をニッスイプレートヘリコバクター寒天培地に植菌し、温度37℃,湿度100%,微好気条件(5%O,12%CO,83%N)で3日培養し、生じたコロニーを100 mLのブルセラブロス(10mLの非働化FBSと0.4mLのSR0147 Helicobacter pylori Selective Supplement(Dent)を含む)で温度37℃,湿度100%,微好気条件(5%O,12%CO,83%N)で3日間振とう培養を行った後に、遠心分離により菌体を集めた。菌体はPBSに懸濁し、4週齢のメスのC57BL/6マウスへ2x10CFUを1日置きに3回経口投与した。H.スイスを感染させたマウス胃粘膜からDNAを抽出し、PCRで感染を確認した。また、H.ピロリを感染させたマウス胃粘膜を緩衝液に懸濁した液をニッスイヘリコバクター寒天培地(日水製薬)に塗布し、培養して感染を確認した。最終感染日から4週間後のH.ピロリ感染マウス、およびH.スイス感染マウスからの血清をそれぞれ採取した。また対照として、いずれにも感染していない健常なマウスからの血清を採取した(非感染)。
 0.1M炭酸-重炭酸緩衝液(pH9.4)に溶解したH.スイス全菌体懸濁液(4μg/mL)またはH.スイス可溶化画分(4μg/mL)100μL/wellを96-well NUNC ImmunoPlate #439454へ滴下し、4℃に一晩置いた。翌日菌体溶液を廃棄し、PBS-T 200μL/wellで3回洗浄した。Blocker BSA 10X in PBS(Thermo Scientific)より調製したブロッキング溶液(1%BSA、PBS系pH7.4)を200μL/well滴下し、37℃に1時間置いた。ブロッキング溶液を廃棄し、PBS-T 200μL/wellで3回洗浄した。ブロッキング溶液を用いて希釈したマウス血清を50μL/well滴下し、37℃に1時間置いた。血清溶液を廃棄し、PBS-T 200μL/wellで3回洗浄した。ブロッキング溶液を用いて100,000倍希釈した西洋わさびペルオキシダーゼ標識二次抗体(Goat Anti-Mouse Ig, Human ads-HRP,SouternBiotech,Inc.)を50μL/well滴下し、37℃で1時間置いた。二次抗体溶液を廃棄し、PBS-T 200μL/wellで3回洗浄した。SuperBlue TMB Microwell Peroxidase Substrate(1-Component)を50μL/well滴下し青く発色後に、1N塩酸を50μL/well滴下し黄色へ変色させた。プレートリーダーを用いて450nm(リファレンス波長: 620nm~630nm)の吸光度を測定した。
 マウス血清(3600倍希釈)を用いたELISAの結果を図3および図4に示す。H.スイス陽性の対象はH.スイス全菌体及びH.スイス外膜画分のいずれの抗原に対しても吸光度が得られたが、H.スイス外膜画分でより高い吸光度が得られた。また、H.スイスに感染していないH.ピロリ感染マウス及び非感染マウスはいずれの抗原に対する吸光度も低かった。このことから、H.スイスに感染したマウス血液中にH.スイス外膜画分に対する抗体が産生されていること、及び、H.スイス外膜画分を抗原として用いることで、高感度に抗体を捉えられることが初めて示された。これにより、H.スイス外膜画分を用いることにより、マウスにおいてH.ピロリ感染と区別してH.スイス感染の高感度な診断ができることが明らかとなった。
(実施例3)ヒト検体の測定
 ELISA(EnzymeLinked ImmunoSorbent Assay ;酵素免疫測定法)を用いた感染者(ヒト)の抗H.ピロリ抗体価および抗H.スイス抗体価の測定
(1)ELISA用H.ピロリ抗原(H.ピロリ菌体外膜画分)の調製
 H.ピロリ TN2GF4株(非特許文献2)は、10%(V/V)牛胎児血清(FCS)を含むブルセラブロスで温度37℃、湿度100%、微好気条件(5%O、10%CO、85%N)で48時間振とう培養を行った後で、培養液を遠心分離(13,420 G x 10分間)により菌体を集めた。菌体はPBSリン酸緩衝生理食塩水、pH7.4)で2回洗浄後、蒸留水に懸濁し、氷冷条件下で5分間の超音波破砕処理を行った(Bioruptor II超音波細胞破壊装置(設定High)で、30秒間の音波処理と30秒間の休止を5回繰り返す)。破壊液を「H.ピロリ全菌体懸濁液」とし、遠心分離(30,190 G x 10分間)により沈渣を「H.ピロリ菌体外膜画分」とし、蒸留水に懸濁した。蛋白質の定量には、BSAを標準蛋白質としてBio-Rad Protein Assayキットを用いた。
(2)ELISA用H.スイス抗原(H.スイス菌体外膜画分)の調製
H.スイス培地の組成
ブルセラブロス(BD BBL)        2.8 g
寒天粉末(BD BBL)           1.5 g 寒天培地作製の場合に加えるピルビン酸(Sigma)       0.1 g
Skirrow Supplement(2 mL/vial, Oxoid)          0.4 mL
Vitox Supplement(10 mL/vial, Oxoid)             2 mL
Amphotericin B(0.25 mg/mL)                 2 mL
濃塩酸              0.135 mLによりpHを5に調整
非働化牛胎児血清(FBS)                  20 mL
蒸留水を加えて、全量を100 mLとした。
 75cmのフラスコに、寒天培地を9mL加え斜面培地を作製し、-80℃保存の鳥肌胃炎の患者から分離したH.スイス SNTW101c株(国際公開WO2019/225639号)を植菌し、液体培地を12mL加え、温度37℃,湿度100%,微好気条件(5%O,12%CO,83%N)で、振とう培養振を1週間行った。その後、培養液を遠心分離(13,420 G x 10分間)により菌体を集めた。菌体はPBSリン酸緩衝生理食塩水、pH7.4)で2回洗浄後、蒸留水に懸濁し、氷冷条件下で5分間の超音波破砕処理を行った(Bioruptor II超音波細胞破壊装置(設定High)で、30秒間の音波処理と30秒間の休止を5回繰り返す)。破壊液を「H.スイス全菌体懸濁液」とし、遠心分離(30,190 G x 10分間)により沈渣を「H.スイス菌体外膜画分」とし、蒸留水に懸濁した。蛋白質の定量には、BSAを標準蛋白質としてBio-Rad Protein Assayキットを用いた。
 0.05M炭酸-重炭酸緩衝液(pH9.6)に溶解したH.ピロリ菌体外膜画分およびH.スイス菌体外膜画分(4μg/mL)100μL/wellを96-well NUNC ImmunoPlate #468667へ滴下し、4℃に一晩置いた。翌日菌体溶液を廃棄し、PBS-T(0.05%(V/V) Tween20を含むPBS)250μL/wellで3回洗浄した。ブロッキング溶液(1%(V/V)BSA、PBS系pH7.0)を200μL/well滴下し、37℃に1時間置いた。ブロッキング溶液を廃棄し、PBS-T 250μL/wellで3回洗浄した。胃疾患の症状を有するH.ピロリ感染者(既存の検査法(尿素呼気試験や抗体検査、抗原検査など)で判定)、および胃疾患の症状を有するH.スイス感染者(被検者の胃生検体からDNAを調製し、特許文献2に記載のリアルタイムPCR法あるいは胃生検体からの培養によりH.スイス感染を判定)から血清をそれぞれ採取した。また対照として、いずれの菌にも感染していない健常人からの血清を採取した(非感染)。検体希釈液(0.5%(V/V)BSA、PBS系pH7.0)を用いて希釈したヒト血清を50μL/well滴下し、37℃に1時間置いた。血清溶液を廃棄し、PBS-T 250μL/wellで3回洗浄した。二次抗体希釈液(1.0%(V/V)BSA、PBS系pH7.0)を用いて20,000倍希釈した西洋わさびペルオキシダーゼ標識二次抗体(Goat anti-Human IgG(H+L),Jacson ImmunoResearch, Inc.)を50μL/well滴下し、37℃で1時間置いた。二次抗体溶液を廃棄し、PBS-T 250μL/wellで3回洗浄した。TMB One Component HRP Microwell Substrate,(Surmodics, Inc.)を50μL/well滴下し青く発色後に、0.17M硫酸を50μL/well滴下し黄色へ変色させた。プレートリーダーを用いて450nm(リファレンス波長:620nm~630nm)の吸光度を測定した。
 ヒト血清(3,600倍希釈)を用いたELISAの結果を図5および図6に示す。H.ピロリ菌体外膜画分では、H.ピロリ感染群(胃疾患‐A、B、C、D)の吸光度がH.スイス感染群(胃疾患‐E、F、G、H)または非感染群(健常人‐A、B、C、D)よりも優位に高い結果が得られた(H.ピロリ感染群 vs.H.スイス感染群:P=0.0209、H.ピロリ感染群 vs.非感染群:P=0.0202)。また、H.スイス菌体外膜画分では、H.スイス感染群(胃疾患‐E、F、G、H)の吸光度がH.ピロリ感染群(胃疾患‐A、B、C、D)または非感染群(健常人‐A、B、C、D)よりも優位に高い結果が得られた(H.スイス感染群 vs.H.ピロリ感染群 or 非感染群:P=0.0209)。このことより、同一の被検体に対し抗H.ピロリ抗体と抗H.スイス抗体の両方の検査をすることで、H.ピロリ感染の有無だけではなく、今までH.ピロリ陰性で見逃されていた対象についても、H.スイス感染と診断できることが明らかとなった。
(実施例4)ヒト検体の測定
 ELISA(EnzymeLinked ImmunoSorbent Assay ;酵素免疫測定法)を用いた感染者(ヒト)の抗H.スイス抗体価の測定
H.スイス培地の組成
ブルセラブロス(BD BBL)        2.8 g
寒天粉末(BD BBL)           1.5 g 寒天培地作製の場合に加えるピルビン酸(Sigma)       0.1 g
Skirrow Supplement(2 mL/vial, Oxoid)           0.4 mL
Vitox Supplement(10 mL/vial, Oxoid)            2 mL
Amphotericin B(0.25 mg/mL)                2 mL
濃塩酸               0.135 mLによりpHを5に調整
非働化牛胎児血清(FBS)                 20 mL
蒸留水を加えて、全量を100 mLとした。
 75cmのフラスコに、寒天培地を9mL加え斜面培地を作製し、-80℃保存の鳥肌胃炎の患者から分離したH.スイス SNTW101c株(非特許文献2)を植菌し、液体培地を12mL加え、温度37℃,湿度100%,微好気条件(5%O,12%CO,83%N)で、振とう培養振を1週間行った。その後、培養液を遠心分離(13,420 G x 10分間)により菌体を集めた。菌体はPBSリン酸緩衝生理食塩水、pH7.4)で2回洗浄後、蒸留水に懸濁し、氷冷条件下で5分間の超音波破砕処理を行った(Bioruptor II超音波細胞破壊装置(設定High)で、30秒間の音波処理と30秒間の休止を5回繰り返す)。破壊液を「H.スイス全菌体懸濁液」とし、遠心分離(30,190 G x 10分間)により沈渣を「H.スイス菌体外膜画分」とし、蒸留水に懸濁した。蛋白質の定量には、BSAを標準蛋白質としてBio-Rad Protein Assayキットを用いた。
 HsvA抗原ペプチド(11種)は、国際公開WO2019/225639号で開示されているHsvA(H.スイスにのみ特異的に存在する外膜蛋白質で、約3000アミノ酸残基で構成される)の一部である14アミノ酸残基を示す。
EKKAVQQMENSNPD(ペプチドNo.11:配列番号1)、
EKKAVEQMENSNPD(ペプチドNo.11(TKY):配列番号2)、
EKDAVTSLKNSNSG(ペプチドNo.11(SH8):配列番号3)、
EKDAVTSLENSNSG(ペプチドNo.11(SH10):配列番号4)、
NQGTLEFLSNDVST(ペプチドNo.19(TKY):配列番号5)、
TNGQEVSASIDYNK(ペプチドNo.16:配列番号6)、
AKLSNFASNDALPD(ペプチドNo.23:配列番号7)、
PTTSSGASPDSSNP(ペプチドNo.10:配列番号8)、
NVDNILNMPSTTSG(ペプチドNo.20:配列番号9)、
TLTLEGTETFAQNS(ペプチドNo.81:配列番号10)、及び
ADIQSSQTTFANSV(ペプチドNo.61:配列番号11)。
 0.05M炭酸-重炭酸緩衝液(pH9.6)に溶解したH.ピロリ菌体外膜画分およびHsvA抗原ペプチド(各4μg/mL)100μL/wellを96-well NUNC ImmunoPlate #468667へ滴下し、4℃に一晩置いた。翌日菌体溶液を廃棄し、PBS-T(0.05%(V/V) Tween20を含むPBS)250μL/wellで3回洗浄した。ブロッキング溶液(1%(V/V)BSA、PBS系pH7.0)を200μL/well滴下し、37℃に1時間置いた。ブロッキング溶液を廃棄し、PBS-T 250μL/wellで3回洗浄した。H.ピロリ感染者(既存の検査法(尿素呼気試験や抗体検査、抗原検査など)で判定)、およびH.スイス感染者(被検者の胃生検体からDNAを調製し、特許文献2に記載のリアルタイムPCR法あるいは胃生検体からの培養によりH.スイス感染を判定)から血清をそれぞれ採取した。また対照として、いずれの菌にも感染していない健常人からの血清を採取した(非感染)。検体希釈液(0.5%(V/V)BSA、PBS系pH7.0)を用いて希釈したヒト血清を50μL/well滴下し、37℃に1時間置いた。血清溶液を廃棄し、PBS-T 250μL/wellで3回洗浄した。二次抗体希釈液(1.0%(V/V)BSA、PBS系pH7.0)を用いて20,000倍希釈した西洋わさびペルオキシダーゼ標識二次抗体(Goat anti-Human IgG(H+L),Jacson ImmunoResearch, Inc.)を50μL/well滴下し、37℃で1時間置いた。二次抗体溶液を廃棄し、PBS-T 250μL/wellで3回洗浄した。TMB One Component HRP Microwell Substrate,(Surmodics, Inc.)を50μL/well滴下し青く発色後に、0.17M硫酸を50μL/well滴下し黄色へ変色させた。プレートリーダーを用いて450nm(リファレンス波長:620nm~630nm)の吸光度を測定した。
 ヒト血清(3,600倍希釈)を用いたELISAの結果を図7-1および7-2に示す。H.スイス菌体外膜画分ではH.スイス感染者に対して吸光度が最小であった検体でも0.658(Abs.450nm~630nm)と高い吸光度が得られ、H.スイスに感染していないH.ピロリ感染者および非感染者に対しては吸光度が最大であった検体でも0.461(Abs.450nm~630nm)に止まり、H.スイス感染者と非感染者とを明確に区別することができた。一方HsvA抗原ペプチドではいずれの配列ペプチドにおいてもH.スイス感染者に対して高い吸光度が得られず、H.スイスに感染していないH.ピロリ感染者や非感染者に対する吸光度と明確に区別することができなかった。このことから、H.スイス菌体外膜画分を用いることにより、HsvA抗原ペプチドを用いた検出系よりも、感度・特異度ともに優れたH.スイスの診断ができることが明らかとなった。
 本発明の方法により、H.ピロリ感染と区別してH.スイス感染の高感度な診断が可能となる。
 本明細書で引用した全ての刊行物、特許及び特許出願はそのまま引用により本明細書に組み入れられるものとする。
配列番号1~11:合成

Claims (11)

  1.  少なくともH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質および抗Ig抗体を含む、被験体由来の検体のH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合する抗体を検出する試薬。
  2.  被験体が哺乳動物であることを特徴とする、請求項1記載の試薬。
  3.  検体が血液由来であることを特徴とする、請求項1または2に記載の試薬。
  4.  さらに、H.ピロリの菌体成分またはH.ピロリ菌体成分に対する抗体を含む、被験体由来の検体のH.ピロリと結合する抗体またはH.ピロリ菌体成分の抗原も検出することを特徴とする、請求項1~3のいずれか1項に記載の試薬。
  5.  ELISAまたはイムノクロマト用試薬である、請求項1~4のいずれか1項に記載の試薬。
  6.  以下の工程を含む、被験体由来の検体の抗H.スイス外膜画分または外膜画分に含まれる蛋白質と結合する抗体を検出することを特徴とする方法:
    (a)被験体由来の検体をH.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と接触させる工程、および
    (b)H.スイス外膜画分、または外膜画分に含まれる蛋白質と結合した、前記検体中の抗体を検出する工程。
  7.  被験体が哺乳動物であることを特徴とする、請求項6記載の方法。
  8.  検体が血液由来であることを特徴とする、請求項6または7に記載の方法。
  9.  さらに、以下の工程を含む、被験体由来の検体のH.ピロリと結合する抗体も検出することを特徴とする、請求項6~8のいずれか1項に記載の方法:
    (a)被験体由来の検体をH.ピロリ菌体成分と接触させる工程、および
    (b)H.ピロリ菌体成分と結合した、前記検体中の抗体を検出する工程。
  10.  さらに、以下の工程を含む、被験体由来の検体のH.ピロリ菌体成分の抗原も検出することを特徴とする、請求項6~8のいずれか1項に記載の方法:
    (a)被験体由来の検体をH.ピロリ菌体成分に対する抗体と接触させる工程、および
    (b)H.ピロリ菌体成分に対する抗体と結合した、前記検体中のH.ピロリ菌体成分の抗原を検出する工程。
  11.  請求項1~5のいずれか1項に記載の試薬を用いた測定および/または請求項6~10のいずれか1項に記載の方法により抗体が検出された被験体をH.スイスに感染していると判定する、H.スイスの感染の検出方法。
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