WO2023138343A1 - 新型吡唑并嘧啶化合物及其组合物、制备方法和用途 - Google Patents

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WO2023138343A1
WO2023138343A1 PCT/CN2022/143770 CN2022143770W WO2023138343A1 WO 2023138343 A1 WO2023138343 A1 WO 2023138343A1 CN 2022143770 W CN2022143770 W CN 2022143770W WO 2023138343 A1 WO2023138343 A1 WO 2023138343A1
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cancer
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stereoisomer
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肖飞
翁亚丽
吴萌
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Definitions

  • the invention belongs to the field of medicine, and relates to a novel pyrazolopyrimidine compound, a composition thereof, a preparation method and an application for preparing anticancer drugs.
  • ATR The full name of ATR is ataxia telangiectasia and Rad3-related kinase (ataxia telangiectasia and Rad3-related kinase), which consists of 2644 amino acids. It is an important kinase that can activate cell responses after DNA damage, thereby arresting cell cycle progression, stabilizing replication forks and repairing DNA, thereby avoiding apoptosis.
  • ATR is recruited to the site of DNA damage, and a variety of proteins participate in the regulation of ATR activation.
  • ATR When ATR is activated, it can regulate cellular biological processes through a variety of signals, including cell cycle arrest, inhibition of replication origins, promotion of deoxynucleotide synthesis, initiation of replication forks, and repair of DNA double-strand breaks.
  • the present invention provides a compound represented by general formula (I), its stereoisomer or a pharmaceutically acceptable salt thereof:
  • R y is selected from H, halogen, NH 2 , C 1-4 alkyl or C 1-4 alkoxy.
  • R y is selected from H or C 1-4 alkyl.
  • R is selected from H, halogen, -CN, -NH 2 , C 1-4 alkyl, C 1-4 alkoxy or C 1-4 haloalkyl;
  • the present invention provides a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising a therapeutically effective amount of the compound of general formula (I) or (II), its stereoisomer or pharmaceutically acceptable salt thereof and pharmaceutically acceptable excipients.
  • the pharmaceutical composition further comprises other active agents useful in the treatment of cancer.
  • the pharmaceutical composition can be formulated as injections, such as sterile aqueous and non-aqueous solutions, dispersions, suspensions or emulsions; solid oral preparations such as tablets, capsules, powders, granules or pills; liquid oral preparations such as solutions, emulsions, suspensions or syrups.
  • injections such as sterile aqueous and non-aqueous solutions, dispersions, suspensions or emulsions
  • solid oral preparations such as tablets, capsules, powders, granules or pills
  • liquid oral preparations such as solutions, emulsions, suspensions or syrups.
  • halogen refers to fluorine, chlorine, bromine or iodine, preferably fluorine, chlorine, bromine.
  • Examples of 5-6 membered heteroaryl groups include, but are not limited to, thienyl, furyl, pyrrolyl, imidazolyl, pyrazolyl, thiazolyl, isothiazolyl, oxazolyl, isoxazolyl, 1,2,3-triazolyl, 1,2,4-triazolyl, 1,2,5-oxadiazole, 1,2,3-oxadiazole, 1,2,4-oxadiazole, 1,3,4-oxadiazole, 1,2,5-thiadiazole, 1,2,3-thiadiazole, 1,2,4-thiadiazole, 1,3,4-thiadiazole, pyridyl, pyrazinyl, triazinyl, pyrimidinyl and pyridazinyl, etc.
  • 5-6 membered heterocyclic groups include, but are not limited to, dihydrofuryl, dihydrothienyl, 3-pyrrolinyl, 2-pyrrolinyl, 2-imidazolinyl, 2-pyrazolidinyl, dihydrooxazolyl, dihydrothiazolyl, dihydroisoxazolyl, dihydroisothiazolyl, dihydro-1,2,3-triazolyl, dihydro-1,2,4-triazolyl, dihydro-1,2,5-oxadiazolyl, dihydro- 1,2,3-oxadiazolyl, dihydro-1,2,4-oxadiazolyl, dihydro-1,3,4-oxadiazolyl, dihydro-1,2,5-thiadiazolyl, dihydro-1,2,3-thiadiazolyl, dihydro-1,2,4-thiadiazolyl, dihydro-1,3,4-thiadiazolyl, tetrahydrofuranyl, t
  • the term "treat” and other similar synonyms include alleviating, alleviating or ameliorating the symptoms of a disease or disorder, inhibiting a disease or disorder, e.g., arresting the progression of a disease or disorder, ameliorating a disease or disorder, ameliorating a disease or disorder, relieving symptoms caused by a disease or disorder, or stopping the symptoms of a disease or disorder, preventing other symptoms, ameliorating or preventing the underlying metabolic cause of the symptoms, and in addition, the term includes prophylactic purposes. The term also includes obtaining a therapeutic and/or prophylactic effect. The therapeutic effect refers to curing or improving the underlying disease being treated.
  • R is selected from H, halogen, -CN, -NH 2 , C 1-4 alkyl, C 1-4 alkoxy or C 1-4 haloalkyl;
  • R y is selected from H, halogen, NH 2 , C 1-4 alkyl or C 1-4 alkoxy.
  • R x is 5-6 membered heteroaryl. In some embodiments, R x is a 5-6 membered heteroaryl containing 1 or 2 heteroatoms selected from nitrogen, oxygen, and sulfur. In some embodiments, R x is a 5-6 membered heteroaryl containing 1 or 2 heteroatoms selected from nitrogen and oxygen. In some embodiments, Rx is a 6-membered heteroaryl group containing 1 or 2 nitrogen atoms. In some embodiments, R x is selected from pyridyl, pyrimidinyl or isoxazolyl. In these embodiments, the heteroaryl is optionally substituted with Ra .
  • R is selected from the following groups:
  • Intermediate a1-1 (60.6mmol, 8.5g) and carbonyldiimidazole (CDI, 19.6g, 121.2mmol) were dissolved in 100mL of anhydrous tetrahydrofuran, reacted at room temperature for 2 hours, heated to 55°C and continued to stir for 4 hours, then cooled to room temperature.
  • Intermediate a1-2 (17.2 g, 121.2 mmol) was slowly added in batches to the reaction solution and the temperature was raised to 55° C. to continue the reaction for 40 hours.
  • Step 1 Dissolve intermediate a1 (43.3 mmol, 9.1 g) in 60 mL of pyridine, add 3-aminopyrazole a2-1 (34.0 mmol, 2.82 g), heat up to 110°C for 12 hours, and cool to room temperature. The solvent was distilled off under reduced pressure to obtain 9.0 g of crude intermediate a2-2, LC-MS: [M+H] + : 248.
  • Step 1 Under nitrogen protection, at -5°C, dissolve raw material b1-1 (5mmol, 1.05g) in 15mL of fluorobenzene, slowly add diethylzinc (2mmol/L in toluene, 12.5mL, 25mmol) and chloroiodomethane in fluorobenzene (4.4g/1.8mL, 25mmol), and react at room temperature for 12 hours.
  • the system was placed in an ice bath, 40 mL of saturated aqueous ammonium chloride was added to quench the reaction, extracted with ethyl acetate, dried over anhydrous sodium sulfate, and separated by flash column chromatography to obtain intermediate b1-2 (730 mg, yield: 65%).
  • the second step the compound 5-chloro-7-(2,2,2-trifluoroethoxy)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine c1-2 (31.4, 79.0g) and potassium fluoride (157.0mmol, 9.12g) were dissolved in 80mL of dry DMSO, heated to 140°C for 4 hours, cooled to room temperature, and stopped the reaction.
  • the third step the compound 5-fluoro-7-(2,2,2-trifluoroethoxy)pyrazolo[1,5-a]pyrimidine c1-3 (14.88mmol, 3.5g), N,N-diisopropylethylamine DIEA (44.65mmol, 5.77g) and 8-oxa-3-azabicyclo[3.2.1]octane hydrochloride (14.88mmol, 2.23g) were dissolved in In 80 mL of dry DMSO, after stirring for 5 minutes, the temperature was raised to 120°C and the reaction was continued for 2 hours, then cooled to room temperature to stop the reaction.
  • the first step under nitrogen protection, the intermediate 3-(7-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl)-8-oxa-3-azabicyclo[3.2.1]octane c5 (1.85mmol, 600.0mg) was dissolved in 10mL DMF, and N-bromosuccinimide NBS (2.22mmol, 39 5.1 mg), reacted at room temperature for 2 hours, and stopped the reaction.
  • Embodiment 3 the preparation of compound M16-M18
  • the first step under nitrogen protection, the intermediate (1S,4S)-5-(7-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl)-2-oxa-5-azabicyclo[2.2.1]heptane c6 (0.73mmol, 300.0mg) was dissolved in 5mL DMF, and N-bromosuccinimide NBS (0. 89mmol, 156.1mg), reacted at room temperature for 2 hours, and stopped the reaction.
  • the third step under the protection of nitrogen, the compound M16-2 (0.33mmol, 150mg), potassium phosphate (0.65mmol, 138mg), 3-bromopyridine M1-7 (0.65mmol, 103mg) and ligand N 1 , N 2 -dimethyl 1,2-cyclohexanediamine (0.65mmol, 142mg) were dissolved in 5mL DMF, and the catalyst CuI (0.33mmol , 62mg), the temperature was raised to 110°C and stirring was continued for 16 hours, then cooled to room temperature to stop the reaction.
  • Embodiment 4 the preparation of compound M1a and M1b
  • Embodiment 5 the preparation of compound M2a and M2b
  • the intermediate M2-1 (2.43mmol, 1.3g) and the raw material M1-4 (3.65mmol, 1.01g) were dissolved in 20mL of a mixture of 1,4-dioxane and water (v/v: 9/1), and potassium phosphate (4.86mmol, 1.03g) and Xphos-Pd-G3 (0.24mmol, 203mg) were added.
  • the reaction was heated under microwave at 95°C for 2 hours.
  • intermediate M2-3 (0.65mmol, 300mg), 3-bromo-5-fluoro-pyridine M2-4 (0.98mmol, 172mg), potassium phosphate (1.30mmol, 276mg) and CuI (0.06mmol, 12mg) were added into a microwave reaction vial, dissolved in 8mL DMF. After stirring for 5 minutes, N,N-dimethyl-1,2-cyclohexanediamine (0.12 mmol, 17 mg) was added slowly. The temperature was raised to 110° C. for 1.5 hours under microwave to stop the reaction and filtered.
  • the second step under the protection of nitrogen, the compound M19-2 (0.41mmol, 200mg), potassium phosphate (0.82mmol, 174mg), 3-bromo-pyridine M1-7 (0.82mmol, 130mg) and ligand N 1 , N 2 -dimethyl 1,2-cyclohexanediamine (0.41mmol, 58mg) were dissolved in 5mL DMF, and the catalyst CuI (0.20mmol , 39mg), the temperature was raised to 110°C and stirring was continued for 16 hours, then cooled to room temperature to stop the reaction.
  • Embodiment 7 the preparation of compound M20
  • Embodiment 8 the preparation of compound M21-M22
  • the first step under nitrogen protection, the compound 3-(7-(3,5-dimethyl-1H-pyrazol-4-yl)-3-(1-(tetrahydro-2H-pyran-2-yl)-1H-pyrazol-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-5-yl)-8-oxa-3-azabicyclo[3.2.1]octane M4-2 (0.32mmol, 150mg) was dissolved in 5 Add NaH (0.47mmol, 18.96mg) to mL anhydrous DMF, stir for 5 minutes, add raw material M21-1 (0.47mmol, 132.4mg), raise the temperature to 70°C and continue stirring for 16 hours, cool to room temperature, stop the reaction, and filter.
  • Embodiment 9 ATR kinase activity experiment
  • ATR kinase activity was tested by detecting the phosphorylation of downstream substrate p53 protein by ATR kinase.
  • GST-labeled full-length P53 protein was purchased from Sigma (Cat. No.: 14-865), Anti-phospho-p53(ser15)-K antibody and Anti-GST-d2 antibody were purchased from Cisbio (Cat. No.: 61GSTDLA; 61P08KAE).
  • the amount of phosphorylated p53 protein was determined using a time-resolved fluorescence system.
  • reaction buffer (20mM HEPES PH8.0, 1% glycerol, 0.01% Brij-35), dilution buffer (20mM HEPES PH8.0, 1% glycerol, 0.01% Brij-35, 5mM DTT and 1% BSA), stop solution (20mM HEPES PH8.0, 1% glycerol, 0. 01% Brij-35, 250mM EDTA), detection buffer (50mM HEPES PH7.0, 150mM NaCl, 267mM KF, 0.1% sodium cholate, 0.01% Tween-20, 0.0125% sodium azide).
  • a clinical research drug AZD6738 (purchased from Selleck) was used as a positive control.
  • a 4 ⁇ serial dilution compound solution was prepared with 1 ⁇ reaction buffer to obtain 9 different concentrations of the compound, and 2.5 ⁇ L of the 4 ⁇ serial dilution compound solution was added to a 384-well assay plate (784075, Greiner).
  • the compound of the present invention has excellent activity of inhibiting ATR kinase, which is equivalent to or even better than the drug AZD6738 in clinical research, indicating that the compound of the present invention can act as an ATR inhibitor and selectively act on tumor cells, and is expected to become an excellent potential drug for tumor treatment.
  • 22Rv1 cells were purchased from the American Type Culture Collection (ATCC).
  • 22Rv1 cells were cultured in RPMI 1640 medium (containing 10% FBS and 1% penicillin-streptomycin (ps)), and the cells were used for experiments when the degree of cell confluence reached more than 85%. About 2000 cells were inoculated in each well of a 96-well culture plate and cultured for 24 hours. The cells were treated with different concentrations of the test compound (0-50 ⁇ M), and three parallel wells were set up in each group. Set up blank wells (only containing medium) and control wells (inoculated with cells, no drug).
  • RPMI 1640 medium containing 10% FBS and 1% penicillin-streptomycin (ps)
  • CCK8 solution (Beyotime, #C0037) was added to each well, incubated in the dark for 4 hours, and the OD value was read with a Biotek Synergy H1 multifunctional microplate reader.
  • Inhibition rate (%) 100% ⁇ (control well-test well)/(control well-blank well)
  • the results of the proliferation inhibition experiment prove that the compound of the present invention has a good inhibitory effect on ATM-mutated human prostate cancer cell 22Rv1, and some IC 50 values can be lower than 1 ⁇ M, even lower than 0.3 ⁇ M.
  • TOV21G cells and Rec-1 cells were purchased from American Type Culture Collection (ATCC), and other cells were from Shanghai Medicilon Biopharmaceutical Co., Ltd.
  • Rec-1 cells were cultured in RPMI1640 medium (containing 10% FBS and 1% ps), about 6000 cells were inoculated in each well of a 96-well culture plate, and different concentrations of test compounds (0-10 ⁇ M) were added to treat the cells, and each group was set up with 3 parallel wells. Set up blank wells (containing medium only) and control wells (inoculated cells without drug treatment). After culturing for 120 hours, add 40 ⁇ L of Cell Titer-Glo solution to each well, incubate for 20 min with shaking in the dark, transfer 100 ⁇ L from each well to a 96-well white plate, and read the luminescence value with a Biotek Synergy H1 multifunctional microplate reader.
  • Inhibition rate (%) 100% ⁇ (control well-test well)/(control well-blank well)
  • IC50 values of compounds were calculated using parameter fitting standard software (GraphPad Prism 8.0). The results are shown in Table 3 and Table 4.
  • AsPC-1 pancreatic cancer 1.57 M14 melanoma 0.88 U2OS Osteosarcoma 0.69

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Abstract

本发明涉及新型吡唑并嘧啶化合物、其组合物、制备方法以及其具有抗肿瘤活性而作为抗癌药物的用途。所述新型吡唑并嘧啶化合物具有如下所示的结构通式(I),作为ATR抑制剂,其具有优异的肿瘤抑制活性,选择性强,水溶解性好,毒性低,可用于口服或静脉注射给药。

Description

新型吡唑并嘧啶化合物及其组合物、制备方法和用途 技术领域
本发明属于药物领域,涉及新型吡唑并嘧啶化合物和其组合物、制备方法及其制备抗癌药物的用途。
背景技术
癌症威胁着人类的健康和生命。近年来,抗癌药物的研究已经转向特异性的分子靶向治疗药物的研制。
ATR全称共济失调毛细血管扩张突变基因Rad3相关激酶(ataxia telangiectasia and Rad3-related kinase),由2644个氨基酸组成,是一种在DNA损伤后能够激活细胞应答,进而阻滞细胞周期进程并稳定复制叉及修复DNA,从而回避细胞凋亡的重要激酶。当细胞内DNA复制压力、DNA损伤产生时,ATR被募集至DNA损伤部位,多种蛋白参与调控ATR的激活。当ATR激活后,可通过多种信号调控细胞生物过程,包括细胞周期阻滞、抑制复制起点、促进脱氧核苷酸合成、启动复制叉以及修复DNA双链断裂。
由于肿瘤细胞的多种DNA修复通路存在缺陷,因此相对于正常细胞,肿瘤细胞更依赖ATR修复通路并对ATR抑制剂更加敏感。“合成致死”是指在肿瘤细胞中,由于一个通路发生突变导致的缺陷,使得肿瘤细胞比正常细胞更依赖另一个互补的通路,因此抑制互补通路就会对肿瘤细胞造成“合成致死”。而正常细胞由于还有一个通路是正常的,因此不会在药物抑制下死亡。研究发现,ATR是部分突变的合成致死靶点,如ATM缺失的肿瘤细胞对于ATR抑制剂更加敏感,而X线交错互补修复基因Ⅰ的缺失也会导致肿瘤细胞对ATR抑制作用更加敏感。因此,ATR抑制剂凭借选择性影响肿瘤细胞、而对正常细胞干扰较少的特点,有望成为肿瘤治疗的优异潜在药物。
作为继PARP抑制剂后最有前景的“合成致死”疗法,ATR抑制剂吸引了一批跨国巨头布局,包括默克、拜耳、阿斯利康等,其中默克公司的Berzosertib临床进展居前,目前处于临床Ⅱ期。国内布局ATR抑制剂的企业较少,英派药业的IMP9064于2021年10月29日获FDA的I/II期临床研究许可,获NMPA开展临床的ATR抑制剂包括默克的Berzosertib、拜耳的BAY1895344和石家庄智康弘仁新药的一款ATR抑制剂,均处于临床Ⅰ期。目前的一种临床在研药物是阿斯利康公司的AZD6738,其结构如下所示:
Figure PCTCN2022143770-appb-000001
在本发明实验部分中作为ATR激酶活性试验的阳性对照。然而, 截至目前,尚没有ATR抑制剂获得批准上市。因此,仍需要开发选择性更强、活性更好的新型ATR抑制剂。
发明内容
本发明的一个目的是提供一种新型ATR抑制剂,其具有优异的肿瘤抑制活性,选择性强,水溶解性好,毒性低,可用于口服或静脉注射给药。
在一个方面,本发明提供了通式(I)所示的化合物、其立体异构体或其可药用盐:
Figure PCTCN2022143770-appb-000002
其中:
R 1选自
Figure PCTCN2022143770-appb-000003
Figure PCTCN2022143770-appb-000004
R x选自H、5-6元杂芳基或5-6元杂环基,其中所述5-6元杂芳基或5-6元杂环基任选地被R a取代;
R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基;且
R y选自H、卤素、NH 2、C 1-4烷基或C 1-4烷氧基。
在一个实施方式中,在通式(I)中,R 1选自以下基团:
Figure PCTCN2022143770-appb-000005
在一个实施方式中,在通式(I)中,R x选自H、6元杂芳基或6元杂环基,其中所述6元杂芳基或6元杂环基任选地被R a取代;且R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基。
在一个实施方式中,在通式(I)中,R y选自H或C 1-4烷基。
在一个实施方式中,所述化合物具有通式(II)的结构:
Figure PCTCN2022143770-appb-000006
其中:
R 1选自以下基团:
Figure PCTCN2022143770-appb-000007
R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基;且
R y选自H或甲基。
在一个实施方式中,本发明所述化合物选自如下化合物:
Figure PCTCN2022143770-appb-000008
Figure PCTCN2022143770-appb-000009
在另一方面,本发明提供了一种药物组合物,其包含治疗有效量的本发明所述的通式(I)或(II)的化合物、其立体异构体或其可药用盐以及可药用辅料。
在一个实施方式中,所述药物组合物还包含其他可用于治疗癌症的活性剂。
在一个实施方式中,所述药物组合物可配制为注射剂,例如无菌水性及非水性溶液、分散液、悬浮液或乳剂;固体口服制剂例如片剂、胶囊剂、散剂、颗粒剂或丸剂;液体口 服制剂例如溶液、乳剂、悬浮液或糖浆剂。
在又一方面,本发明提供了本发明所述的通式(I)或(II)的化合物、其立体异构体或其可药用盐在制备用于治疗癌症的药物中的用途。本发明还提供了本发明所述的药物组合物在制备用于治疗癌症的药物中的用途。
在一个实施方式中,所述癌症选自乳腺癌、肾癌、肺癌、卵巢癌、膀胱癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、白血病、淋巴瘤、黑色素瘤、骨髓瘤和骨肉瘤。
本发明的技术方案具有以下有益效果:
1.本发明提供了一种新型的吡唑并嘧啶化合物。
2.本发明提供的吡唑并嘧啶化合物具有优异的抑制ATR激酶的活性,与临床在研药物AZD6738活性相当,甚至更好,表明本发明化合物可作为ATR抑制剂,用于治疗ATR介导的疾病。
3.本发明提供的吡唑并嘧啶化合物具有优异的抑制多种癌细胞增殖的作用,可用于治疗或预防多种癌症。
4.本发明提供的吡唑并嘧啶化合物在小鼠和人的肝微粒体中具有非常高的稳定性,预示体内代谢较慢。
5.本发明提供的吡唑并嘧啶化合物在小鼠口服给药后具有非常高的体内暴露量,临床上有望以更低的剂量带来优异的抗肿瘤效果。
6.本发明提供的吡唑并嘧啶化合物对于ATR具有高度选择性,对于家族内其他激酶抑制活性较低,从而带来更高的安全性获益。
具体实施方式
除非另有定义,否则本文所有科技术语具有的涵义与本发明所属领域技术人员通常理解的涵义相同。
应理解,上文的概述和下文的详述为示例性的,仅用于举例说明,而不对本发明主题作任何限制。
定义
本文所用的术语“C 1-4烷基”是指具有1至4个碳原子的直链或支链烷基。其实例包括但不限于甲基、乙基、丙基、异丙基、正丁基、异丁基和叔丁基,优选甲基。
本文所用的术语“卤素”是指氟、氯、溴或碘,优选氟、氯、溴。
本文所用的术语“C 1-4烷氧基”是指具有式-O-C 1-4烷基基团,其中C 1-4烷基如上所定 义。C 1-4烷氧基的实例包括但不限于甲氧基、乙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基、叔丁氧基等,优选甲氧基、乙氧基。
本文所用的术语“C 1-4卤代烷基”是指是指被一个或多个卤素原子取代的C 1-4烷基。其实例包括但不限于氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、氟乙基、1,1-二氟乙基、氯甲基、氯乙基、二氯甲基、1,2-二氯乙基等,优选二氟甲基、三氟甲基。
本文所用的术语“5-6元杂芳基”是指包含1至3个、优选1至2个选自氮、氧和硫的杂原子的稳定5元至6元芳香性单环基团。与杂芳基的结合可以在杂原子的位置或通过杂环的碳原子。5-6元杂芳基的实例包括但不限于噻吩基、呋喃基、吡咯基、咪唑基、吡唑基、噻唑基、异噻唑基、噁唑基、异噁唑基、1,2,3-三唑基、1,2,4-三唑基、1,2,5-噁二唑、1,2,3-噁二唑、1,2,4-噁二唑、1,3,4-噁二唑、1,2,5-噻二唑、1,2,3-噻二唑、1,2,4-噻二唑、1,3,4-噻二唑、吡啶基、吡嗪基、三嗪基、嘧啶基和哒嗪基等。
本文所用的术语“5-6元杂环基”是指包含1至3个、优选1至2个选自氮、氧和硫的杂原子的稳定的5元至6元非芳香性单环基团。杂环基可为部分或完全饱和。与杂环基的结合可以在杂原子的位置或通过杂环的碳原子。5-6元杂环基的实例包括但不限于二氢呋喃基、二氢噻吩基、3-吡咯啉基、2-吡咯啉基、2-咪唑啉基、2-吡唑烷基、二氢噁唑基、二氢噻唑基、二氢异噁唑基、二氢异噻唑基、二氢-1,2,3-三唑基、二氢-1,2,4-三唑基、二氢-1,2,5-噁二唑基、二氢-1,2,3-噁二唑基、二氢-1,2,4-噁二唑基、二氢-1,3,4-噁二唑基、二氢-1,2,5-噻二唑基、二氢-1,2,3-噻二唑基、二氢-1,2,4-噻二唑基、二氢-1,3,4-噻二唑基、四氢呋喃基、四氢噻吩基、吡咯烷基、咪唑烷基、吡唑烷基、噁唑烷基、噻唑烷基、异噁唑烷基、异噻唑烷基、1,2,3-三唑烷基、1,2,4-三唑烷基、1,2,5-噁二唑烷基、1,2,3-噁二唑烷基、1,3,4-噁二唑烷基、1,2,5-噻二唑烷基、1,2,3-噻二唑烷基、1,3,4-噻二唑烷基、1,2-氧杂硫杂环戊烷基、1,3-氧杂硫杂环戊烷基、四氢吡喃基、四氢噻喃基、哌啶基、1,4-二噁烷基、吗啉基、硫代吗啉基和哌嗪基等。
“立体异构体”是指由相同原子组成,通过相同的键键合,但具有不同三维结构的化合物。本发明将涵盖各种立体异构体及其混合物。
本文所用的术语“受试者”包括哺乳动物和非哺乳动物。哺乳动物的实例包括但不限于哺乳动物纲的任何成员:人,非人的灵长类动物(例如黑猩猩和其它猿类和猴);家畜,例如牛、马、绵羊、山羊、猪;家养动物,例如兔、狗和猫;实验室动物,包括啮齿类动物,例如大鼠、小鼠和豚鼠等。在一些实施方式中,所述受试者为人。
本文所用的术语“治疗”和其它类似的同义词包括缓解、减轻或改善疾病或病症症状, 抑制疾病或病症,例如阻止疾病或病症的发展,缓解疾病或病症,使疾病或病症好转,缓解由疾病或病症导致的症状,或者中止疾病或病症的症状,预防其它症状,改善或预防导致症状的潜在代谢原因,此外,该术语包含预防的目的。该术语还包括获得治疗效果和/或预防效果。所述治疗效果是指治愈或改善所治疗的潜在疾病。此外,对与潜在疾病相关的一种或多种生理症状的治愈或改善也是治疗效果,例如尽管受试者可能仍然受到潜在疾病的影响,但观察到受试者情况改善。就预防效果而言,可向具有患特定疾病风险的受试者施用本发明所述化合物或组合物,或者即便尚未做出疾病诊断,但向出现该疾病的一个或多个生理症状的受试者施用本发明所述化合物或组合物。
本文所用的术语“治疗有效量”是指服用后足以在某种程度上缓解所治疗的疾病或病症的一个或多个症状的至少一种活性物质(如本发明所述的化合物)的量。其结果可以为迹象、症状或病因的消减和/或缓解,或生物系统的任何其它所需变化。例如,“治疗有效量”是在临床上提供显著的病症缓解效果所需的包含本文公开化合物的组合物的量。可使用诸如剂量递增试验的技术测定适合于任意个体病例中的治疗有效量。
本文所用术语“施用”、“给药”等是指能够将化合物或组合物递送到进行生物作用的所需位点的方法。这些方法包括但不限于口服途径、经十二指肠途径、胃肠外注射(包括静脉内、皮下、腹膜内、肌内、动脉内注射或输注)、外用和经直肠给药。本领域技术人员熟知可用于本文所述化合物和方法的施用技术。
本文所用术语“可药用辅料”是指不影响本发明化合物的生物活性或性质的物质,并且相对无毒,即该物质可施用于个体而不造成不良的生物反应或以不良方式与组合物中包含的任意组分相互作用。所述可药用辅料包括但不限于载体、稳定剂、稀释剂、分散剂、悬浮剂、增稠剂和/或赋形剂。
本文所用的术语“任选”、“任选的”或“任选地”表示随后描述的事件或状况可能发生也可能不发生,且该描述同时包括该事件或状况发生和不发生的情况。例如,“任选地被R a取代”表示未被取代或被R a取代,且该描述同时包括未被取代以及被R a取代的情况。
通式(I)的化合物、其立体异构体或其可药用盐
本发明提供了用于治疗、改善或预防癌症的化合物。如本文所述,抑制ATR激酶能够选择性影响肿瘤细胞而对正常细胞干扰较少。本发明的化合物能够有效地抑制ATR激酶的活性,与临床在研药物AZD6738活性相当甚至更好,有望成为肿瘤治疗的优异潜在药物。
一方面,本发明提供了一种通式(I)的化合物、其立体异构体或其可药用盐:
Figure PCTCN2022143770-appb-000010
其中:
R 1选自
Figure PCTCN2022143770-appb-000011
Figure PCTCN2022143770-appb-000012
R x选自H、5-6元杂芳基或5-6元杂环基,其中所述5-6元杂芳基或5-6元杂环基任选地被R a取代;
R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基;且
R y选自H、卤素、NH 2、C 1-4烷基或C 1-4烷氧基。
在一个实施方式中,所述R 1选自以下基团:
Figure PCTCN2022143770-appb-000013
Figure PCTCN2022143770-appb-000014
在一个实施方式中,所述R 1选自以下基团或其立体异构形式(适用时):
Figure PCTCN2022143770-appb-000015
在一个实施方式中,所述R 1选自以下基团或其立体异构形式(适用时):
Figure PCTCN2022143770-appb-000016
在一个实施方式中,R 1选自
Figure PCTCN2022143770-appb-000017
在一个实施方式中,R 1
Figure PCTCN2022143770-appb-000018
在一个实施方式中,R x选自H、5-6元杂芳基或5-6元杂环基,其中所述5-6元杂芳基或5-6元杂环基任选地被R a取代。
在一些实施方式中,R x为H。
在一些实施方式中,R x为5-6元杂芳基。在一些实施方式中,R x为含有1或2个选自氮、氧和硫的杂原子的5-6元杂芳基。在一些实施方式中,R x为含有1或2个选自氮和氧的杂原子的5-6元杂芳基。在一些实施方式中,R x为含有1或2个氮原子的6元杂芳基。 在一些实施方式中,R x选自吡啶基、嘧啶基或异噁唑基。在这些实施方式中,所述杂芳基任选地被R a取代。
在一些实施方式中,R x为5-6元杂环基。在一些实施方式中,R x为含有1或2个选自氮、氧和硫的杂原子的5-6元杂环基。在一些实施方式中,R x为含有1或2个选自氮和氧的杂原子的6元杂环基。在一些实施方式中,R x为含有1或2个氮原子的6元杂环基。在一些实施方式中,R x为含有1个氮原子的6元杂环基。在一些实施方式中,R x为哌啶基。在这些实施方式中,所述杂环基任选地被R a取代。
在一些实施方式中,R x选自H、
Figure PCTCN2022143770-appb-000019
Figure PCTCN2022143770-appb-000020
任选地被R a取代,其中
Figure PCTCN2022143770-appb-000021
表示与吡唑环相连接的位置。
在一些实施方式中,R x
Figure PCTCN2022143770-appb-000022
其任选地被R a取代,其中
Figure PCTCN2022143770-appb-000023
表示与吡唑环相连接的位置。
在前述实施方式中,R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基。
在前述实施方式中,R a选自H、F、Cl、Br、-CN、-NH 2、甲基、甲氧基、乙氧基、二氟甲基或二氟乙基。
在一些实施方式中,R y选自H、卤素、NH 2、C 1-4烷基或C 1-4烷氧基。
在一些实施方式中,R y选自H或C 1-4烷基。
在一些实施方式中,R y选自H或甲基。
在一个实施方式中,在通式(I)中:
R 1选自以下基团:
Figure PCTCN2022143770-appb-000024
R x选自H、5-6元杂芳基或6元杂环基,其中所述5-6元杂芳基任选地被R a取代;
R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基;且
R y选自H或C 1-4烷基,例如甲基。
在一个实施方式中,本发明所述化合物具有通式(II)的结构:
Figure PCTCN2022143770-appb-000025
其中:
R 1选自以下基团:
Figure PCTCN2022143770-appb-000026
R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基;且
R y选自H或甲基。
在一个实施方式中,本发明所述通式(I)的化合物选自以下化合物:
Figure PCTCN2022143770-appb-000027
Figure PCTCN2022143770-appb-000028
Figure PCTCN2022143770-appb-000029
当本发明所述通式(I)或(II)的化合物含有一个或多个手性中心时,除非另外说明,否则提及这些化合物中的任一个将涵盖对映异构体纯的或非对映异构体纯的化合物以及呈任何比率的对映异构体或非对映异构体的混合物。
本发明所述通式(I)或(II)的化合物通常以游离物质形式或以其可药用盐形式利用。可药用盐是指无毒的,即生理上可接受的盐。在一个实施方式中,本发明所述通式(I)或(II)的化合物或其立体异构体的可药用盐包括但不限于:盐酸盐、氢溴酸盐、磷酸盐、甘油磷酸盐、亚硝酸盐、硫酸盐、硫酸氢盐、半硫酸盐、苯甲酸盐、柠檬酸盐、葡萄糖酸盐、乳酸盐、马来酸盐、琥珀酸盐、酒石酸盐、乙酸盐、丙酸盐、己酸盐、庚酸盐、葡庚酸盐、草酸盐、马来酸盐、富马酸盐、苹果酸盐、谷氨酸盐、焦谷氨酸盐、水杨酸盐、磺酸盐(例如甲磺酸盐、乙磺酸盐、甲苯磺酸盐和苯磺酸盐)等等。
药物组合物和药物制剂
在一方面,本发明还提供了一种药物组合物,其包含治疗有效量的如上所定义的通式(I)或(II)的化合物、其立体异构体或其可药用盐,以及可药用辅料。
在本发明中,术语“可药用辅料”是指不影响本发明化合物的生物活性或性质的物质,并且相对无毒,即该物质可施用于个体而不造成不良的生物反应或以不良方式与组合物中包含的任意组分相互作用。所述可药用辅料包括但不限于载体、稳定剂、稀释剂、分散剂、悬浮剂、增稠剂和/或赋形剂。
在一个实施方式中,本发明的药物组合物还可以包含其他用于治疗癌症的活性剂。所述活性剂的实例包括但不限于顺铂、卡铂、环磷酰胺、吉西他滨、Olaparib(奥拉帕利)、 拓扑替康、伊立替康、多柔比星、紫杉醇、多西他赛、阿霉素、PD-1或PD-L1单抗类药物(如纳武利尤单抗、阿提丽珠单抗等)。
在一个实施方式中,本发明的药物组合物可以被配制成通过任何合适途径给药的制剂。所述合适途径包括但不限于口服途径、经十二指肠途径、注射(包括静脉内、皮下、腹膜内、肌内、动脉内注射或输注)、外用和经直肠给药等。
用于口服给药的药物组合物包括固体口服剂型,诸如片剂、胶囊、粉剂和颗粒剂;以及液体口服剂型,诸如溶液、乳剂、悬浮液和糖浆剂以及待溶解或悬浮在适当液体中的粉剂和颗粒剂。
固体口服剂型可以离散单位(例如,片剂或者硬胶囊或软胶囊)的形式呈现,这些离散单位各自含有预定量的活性成分,并且优选地含有一种或多种合适的可药用辅料。适当时,根据本领域中熟知的方法,这些固体剂型可以被配制为具有包衣,诸如肠溶衣,或者它们可以被配制以提供活性成分的改进释放,诸如延迟或延长释放。
适于固体口服剂型的可药用辅料的实例包括但不限于微晶纤维素、玉米淀粉、乳糖、甘露醇、聚维酮、交联羧甲纤维素钠、蔗糖、环糊精、滑石、明胶、果胶、硬脂酸镁、硬脂酸和纤维素的低级烷基醚。类似地,固体制剂可以包括本领域已知的用于延迟或延长释放制剂的赋形剂,诸如单硬脂酸甘油酯或羟丙甲纤维素。
固体口服剂型可以例如通过以下方式来制备:将活性成分与固体赋形剂混合,并且随后在常规压片机中压缩该混合物;或可以例如将该制剂以例如粉剂、丸剂或微型片剂的形式置于硬胶囊中。
液体口服剂型可以呈现为例如溶液、乳剂、悬浮液、酏剂、糖浆剂、口服滴剂或充液胶囊。液体口服剂型还可以呈现为用于在使用前溶解在水性或非水性液体中形成溶液或悬浮液的粉剂。适于液体口服制剂的赋形剂的实例包括但不限于乙醇、丙二醇、甘油、聚乙二醇、泊洛沙姆、山梨醇、聚山梨醇酯、甘油单酯和甘油二酯、环糊精、椰子油、棕榈油和水。液体口服剂型可以例如通过将活性成分溶解或悬浮在水性或非水性液体中或通过将活性成分掺入水包油或油包水液体乳剂中来制备。
用于肠胃外施用的药物组合物也可以是无菌可注射制剂的形式,例如用于注射或输注的无菌水性及非水性溶液、分散液、悬浮液或乳剂,用于注射或输注的浓缩物以及待在使用之前在用于注射或输注的无菌溶液或分散液中重构的无菌粉剂。适于肠胃外制剂的可药用辅料的实例包括但不限于水、椰子油、棕榈油、环糊精溶液、林格氏溶液和等渗氯化钠溶液等。无菌可注射制剂可以根据已知技术采用合适的可药用辅料进行配制。
用于任何药物制剂的可药用辅料必须符合预期的给药途径并且与活性成分相容。
在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成注射剂,优选静脉内注射剂。在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成注射用无菌水性及非水性溶液、分散液、悬浮液或乳剂。
在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成固体口服制剂。在一个实施 方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成片剂。在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成胶囊剂,包括硬胶囊或软胶囊。在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成粉剂。在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成颗粒剂。在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成丸剂。
在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成液体口服制剂。在一个实施方式中,本发明所述药物组合物可以被配制成口服溶液、乳剂、悬浮液或糖浆剂。
用途
本发明所述的通式(I)或(II)的化合物、其立体异构体或其可药用盐或本发明所述的药物组合物可以有效抑制ATR激酶活性,其活性与临床在研药物AZD6738相当甚至更好,表明其可以用于治疗ATR激酶介导的疾病。
本发明所述的通式(I)或(II)的化合物、其立体异构体或其可药用盐或本发明所述的药物组合物可以有效抑制肿瘤细胞的增殖,因此可以用于治疗肿瘤或癌症。
在一个方面,本发明提供了本发明所述的通式(I)或(II)的化合物、其立体异构体或其可药用盐或本发明所述的药物组合物在制备用于治疗受试者的癌症的药物中的用途。
在一个实施方式中,所述癌症包括但不限于乳腺癌、肾癌、肺癌、卵巢癌、膀胱癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、白血病、淋巴瘤、黑色素瘤、骨髓瘤和骨肉瘤。
在一个实施方式中,所述癌症选自乳腺癌。在一个实施方式中,所述癌症选自肾癌。在一个实施方式中,所述癌症选自肺癌,例如非小细胞肺癌。在一个实施方式中,所述癌症选自卵巢癌。在一个实施方式中,所述癌症选自膀胱癌。在一个实施方式中,所述癌症选自胃癌。在一个实施方式中,所述癌症选自结直肠癌。在一个实施方式中,所述癌症选自肝癌。在一个实施方式中,所述癌症选自胰腺癌。在一个实施方式中,所述癌症选自前列腺癌。在一个实施方式中,所述癌症选自白血病。在一个实施方式中,所述癌症选自淋巴瘤,例如套细胞淋巴瘤。在一个实施方式中,所述癌症选自黑色素瘤。在一个实施方式中,所述癌症选自骨髓瘤。在一个实施方式中,所述癌症选自骨肉瘤。
制备方法
在一个方面,本发明提供了制备本发明所述的通式(I)的化合物的方法:
Figure PCTCN2022143770-appb-000030
具体地说,上述方法包括以下步骤:
第一步:使X1化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000031
与N-碘代琥珀酰亚胺NIS反应得到X2化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000032
第二步:使X2化合物与N6化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000033
进行Sukuzi反应得到X3化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000034
第三步:使X3化合物脱去Boc保护基得到X4化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000035
第四步:使X4化合物与X5化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000036
(或X7化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000037
)进行Ullmann反应(或取代反应)得到X6化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000038
第五步:使X6化合物脱去THP保护基得到本发明所述的通式(I)的化合物。
在一个实施方式中,提供了一种制备本发明的通式(I)的化合物的示例性反应方案:
Figure PCTCN2022143770-appb-000039
其中,R 1、R x和R y如通式(I)中所定义。
根据上述方案,以X1化合物为起始原料与N-碘代琥珀酰亚胺NIS在适当的溶剂例如 二氯甲烷中反应,得到X2化合物;X2化合物与1-(2-四氢吡喃基)-1H-吡唑-5-硼酸频哪酯类似物N6在适当的溶剂例如1,4-二氧六环/水混合溶液中与磷酸钾和Xphos-Pd-G3反应得到X3化合物;X3化合物在适当的溶剂例如四氢呋喃中与碱例如NaOH反应得到X4化合物;X4化合物与X5化合物在磷酸钾、CuI和N,N-二甲基-1,2-环己二胺的存在下反应得到X6化合物;X6化合物在酸性条件下脱保护得到通式(I)的化合物。
在一个实施方式中,提供了一种制备本发明的通式(II)的化合物的方法:
Figure PCTCN2022143770-appb-000040
第一步:使N1化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000041
与N-溴代琥珀酰亚胺NBS反应得到N2化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000042
第二步:使N2化合物与化合物N6
Figure PCTCN2022143770-appb-000043
在适当溶剂中进行Suzuki反应得到N3化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000044
第三步:使N3化合物与N5化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000045
进行Ullmann反应得到N4化合物
Figure PCTCN2022143770-appb-000046
第四步:使N4化合物脱去THP保护基得到本发明所述的通式(II)的化合物。
在一个实施方式中,提供了一种制备本发明的通式(II)的化合物的示例性反应方案:
Figure PCTCN2022143770-appb-000047
根据上述方案,以N1化合物为起始原料与N-溴代琥珀酰亚胺NBS在适当的溶剂例如DMF中反应,得到N2化合物;N2化合物与1H-吡唑-5-硼酸频哪酯类似物N6在适当的溶剂例如1,4-二氧六环/水混合溶液中与磷酸钾和Pd(dtbpf)Cl 2反应得到N3化合物;N3化合物与N5化合物在磷酸钾、CuI和N,N-二甲基-1,2-环己二胺的存在下反应得到N4化合物;N4化合物在酸性条件下脱保护得到通式(II)的化合物。
本发明的通式(I)或(II)的化合物的立体异构体可通过以下方式获得:将获得的外消旋混合物或其他混合物,基于它们不同的物理化学性质,采用众所周知的手段,例如,分步结晶或HPLC技术进行分离。也可以利用手性色谱柱分离获得对映异构体。还可以采用光学活性原料使其在不会引起外消旋化或差向异构化的条件下反应。
本发明的通式(I)或(II)的化合物或其立体异构体的可药用盐可通过本领域已知的方法使化合物或其立体异构体结构上的N原子与无机酸或有机酸形成。所述无机酸包括但不限于:盐酸、氢溴酸、磷酸、甘油磷酸、半硫酸、硫酸、硫酸氢、氢碘酸、亚硝酸等。所述有机酸包括但不限于:苯甲酸、柠檬酸、葡萄糖酸、乳酸、马来酸、琥珀酸、酒石酸、乙酸、丙酸、己酸、庚酸、葡庚酸、草酸、马来酸、富马酸、苹果酸、谷氨酸、焦谷氨酸、水杨酸、磺酸(例如甲磺酸、乙磺酸、甲苯磺酸和苯磺酸)等。
其他未详细提及的中间体或反应物可以通过购买获得或者通过本领域通常已知的合成方法制备得到。
上述通用的合成路线仅代表大多数实施例的一般方法,对带有特殊取代基的化合物,可以在某步反应中进行本领域普通技术人员所知的变动或者改变反应顺序。
实施例
下面的实施例举例说明在本发明所述化合物的制备和生物活性评价。
提供下面的这些实施例以使本领域的技术人员能够更清楚地理解并且能够实践本发明。它们不应当被认为是限制本发明的范围,而仅仅是举例说明性的和代表性的。
本文所用的材料或试剂为可购买到的或由本领域通常已知的合成方法制备。以下反应路线例示了本发明化合物的具体合成方法。
具体如下:
关键中间体a1-a3的制备:
中间体a1的制备:
Figure PCTCN2022143770-appb-000048
将中间体a1-1(60.6mmol,8.5g)和羰基二咪唑(CDI,19.6g,121.2mmol)溶于100mL无水四氢呋喃中,室温反应2小时后,升温至55℃继续搅拌4小时,冷却至室温。向反应液中缓慢分批加入中间体a1-2(17.2g,121.2mmol)并升温至55℃下继续反应40小时。停止反应,过滤,减压蒸除溶剂,加水50mL,乙酸乙酯萃取,flash柱层析分离,得到中间体a1(9.1g,收率:72%),LC-MS:[M+H] +:211。
中间体a2的制备:
Figure PCTCN2022143770-appb-000049
第一步:将中间体a1(43.3mmol,9.1g)溶于60mL吡啶中,加入3-氨基吡唑a2-1(34.0mmol,2.82g),升温至110℃反应12小时,冷却至室温。减压蒸除溶剂,得到9.0g粗品中间体a2-2,LC-MS:[M+H] +:248。
第二步:将粗品中间体a2-2(9.0g)溶于80mL乙醇中,加入吡啶对甲苯磺酸盐PPTS(54.6mmol,13.7g),升温至90℃反应36小时,停止反应。减压蒸除溶剂,向体系中加水100mL,乙酸乙酯萃取,flash柱层析分离,得到中间体a2-3(7.5g,两步收率:76%),LC-MS: [M+H] +:230。
第三步:冰浴下,将中间体a2-3(19.6mmol,4.5g)溶于25mL三氯氧磷中,搅拌10分钟后,撤去冰浴,升温至110℃并继续搅拌2小时。停止反应,冷却至室温,向反应液中缓慢加入150mL冰水,饱和碳酸氢钠溶液调节pH-8左右,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥。粗品经flash柱层析分离,得中间体a2(3.5g,收率:72%)。LC-MS:[M+H] +:248。
中间体a3的制备:
Figure PCTCN2022143770-appb-000050
将中间体a2(6.01mmol,1.5g)和4-二甲氨基吡啶DMAP(0.6mmol,73mg)溶于20mL四氢呋喃中,缓慢加入二叔丁基二碳酸酯(9.01mmol,1.97g),室温反应2小时后,停止反应。向体系加入50mL水,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,得到中间体a3(1.9g,收率:91%),LC-MS:[M+H] +:348。
关键中间体b1的制备:
Figure PCTCN2022143770-appb-000051
第一步:氮气保护,-5℃下,将原料b1-1(5mmol,1.05g)溶于15mL氟代苯中,缓慢加入二乙基锌(2mmol/L的甲苯溶液,12.5mL,25mmol)和氯碘甲烷的氟苯溶液(4.4g/1.8mL,25mmol),室温下反应12小时。将体系置于冰浴中,加入饱和氯化铵水溶液40mL淬灭反应,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离,得到中间体b1-2(730mg,收率:65%)。
第二步:氮气保护下,将中间体b1-2(3.23mmol,730mg)溶于16mL甲醇/乙腈(1/1,v/v)的混合液中,缓慢加入氟化钾水溶液(749mg/3mL)。该混合物搅拌10分钟后,加入L-酒石酸(6.46mmol,968mg)和四氢呋喃(350μL),室温下继续反应1.5h。停止反应,过滤,滤液浓缩,得到中间体b1-3(600mg,粗品)。
第三步:氮气保护下,将中间体b1-3(7.9mmol,1.6g)、中间体a3(7.9mmol,2.75g)和碳酸铯(23.7mmol,7.7g)溶于30mL甲苯/水(6/1,v/v)的混合液中,加入Pd(dppf)Cl 2(0.8mmol,586mg)。升温至110℃下反应12小时,停止反应,过滤,向体系加水70mL,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离,得到中间体b1(1.3g,收率:41%), LC-MS:[M+H] +:410。
关键中间体c1-c8的制备:
中间体c1的制备:
Figure PCTCN2022143770-appb-000052
第一步:将原料5,7-二氯吡唑并[1,5-a]嘧啶c1-1(37.2mmol,7.0g)和碳酸钾(55.85mmol,7.72g)溶于50mL乙腈中,加入三氟乙醇(40.96mmol,4.1g),室温下反应16小时,停止反应。减压蒸除溶剂,向混合物中加入100mL水,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(PE/EA=6/1),得到化合物c1-2(7.90g,收率:84%),LC-MS:[M+H] +:252.0。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ8.28(d,J=2.0Hz,1H),7.01(s,1H),6.72-6.70(m,1H),5.36(q,J=8.4Hz,2H)。
第二步:将化合物5-氯-7-(2,2,2-三氟乙氧基)吡唑并[1,5-a]嘧啶c1-2(31.4,79.0g)和氟化钾(157.0mmol,9.12g)溶于80mL干燥DMSO中,升温至140℃反应4小时,冷却至室温,停止反应。向混合物中加水100mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(PE/EA=10/1),得到化合物c1-3(3.5g,收率:47%),LC-MS:[M+H] +:236.1。
第三步:将化合物5-氟-7-(2,2,2-三氟乙氧基)吡唑并[1,5-a]嘧啶c1-3(14.88mmol,3.5g)、N,N-二异丙基乙基胺DIEA(44.65mmol,5.77g)和8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷盐酸盐(14.88mmol,2.23g)溶于80mL干燥DMSO中,搅拌5分钟后,升温至120℃并继续反应2小时,冷却至室温,停止反应。向反应液中加水120mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(PE/EA=10/1),得到化合物c1(3.0g,收率:61%),LC-MS:[M+H] +:329.0。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ7.87(d,J=2.0Hz,1H),6.25(s,1H),6.05(d,J=2.0Hz,1H),5.21(q,J=8.8Hz,2H),4.45(d,J=2.4Hz,2H),4.02(d,J=12.4Hz,2H),3.08(dd,J=12.8Hz,2.0Hz,2H),1.87-1.81(m,2H),1.74-1.67(m,2H)。
参考中间体c1的合成,采用类似的原料,合成如下中间体c2至c4:
Figure PCTCN2022143770-appb-000053
中间体c5的制备:
Figure PCTCN2022143770-appb-000054
第一步:将中间体3-(7-(2,2,2-三氟乙氧基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷c1(9.14mmol,3.0g)和氢氧化钠(18.28mmol,0.73g)溶于20mL四氢呋喃中,升温至70℃反应16小时,冷却至室温,停止反应,过滤。减压蒸除溶剂,粗品经flash反向柱层析分离纯化(乙腈/水),得到化合物c5-1(2.0g,收率:89%),LC-MS:[M+H] +:247.2。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ7.48(d,J=2.0Hz,1H),5.65(d,J=1.6Hz,1H),4.89(s,1H),4.35(s,2H),3.71(d,J=12.4Hz,2H),2.83(dd,J=12.0Hz,1.6Hz,2H),1.81-1.68(m,4H)。
第二步:将化合物5-(8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-7-羟基c5-1(8.12mmol,2.00g)溶于10mL三氯氧磷中,升温至110℃反应4小时,冷却至室温,停止反应。将反应液缓慢倒入50mL冰水混合物中,加入饱和碳酸氢钠水溶液调节pH至9左右,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(PE/EA=6/1),得到化合物c5-2(1.3g,收率:61%),LC-MS:[M+H] +:265.1。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ7.98(d,J=2.4Hz,1H),7.03(s,1H),6.19(d,J=2.4Hz,1H),4.44(d,J=2.0Hz,2H),4.00(d,J=12.4Hz,2H),3.10(dd,J=12.4Hz,2.0Hz,2H),1.87-1.81(m,2H),1.74-1.66(m,2H)。
第三步:氮气保护下,将化合物3-(7-氯吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷c5-2(4.91mmol,1.30g)、碳酸钠(14.73mmol,1.56g)、原料c5-3(1.64g,7.37mmol)和催化剂Pd(dppf)Cl 2(0.49mmol,0.36g)溶于10mL 1,4-二氧六环中,加入2mL水,搅拌5分钟后,升温至90℃并继续反应16小时,冷却至室温,停止反应,过滤。向混合液中加水35mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(DCM/MeOH=10/1),得到化合物c5(0.7g,收率:44%),LC-MS:[M+H] +:325.3。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.63(s,1H),7.84(d,J=2.4Hz,1H),6.50(s,1H),6.09(d,J=2.0Hz,1H),4.43(s,2H),4.01(d,J=13.2Hz,2H),3.08(dd,J=12.4Hz,2.0Hz,2H),2.18(d,J=28.0Hz,6H),1.89-1.81(m,2H),1.77-1.69(m,2H)。
参考中间体c5的合成,采用类似的原料/中间体,合成如下中间体化合物c6至c8:
Figure PCTCN2022143770-appb-000055
实施例1:化合物M3的制备
Figure PCTCN2022143770-appb-000056
将中间体a3(1.29mmol,450mg)和原料M3-1(1.43mmol,161mg)溶于10mL N-甲基吡咯烷酮中,加入三乙胺(2.60mmol,263mg),180℃下微波加热反应2小时。停止反应,向体系加入水40mL,二氯甲烷萃取。将该混合物和4-二甲氨基吡啶DMAP(0.06mmol,8mg)溶解于12mL二氯甲烷中,加入三乙胺(1.29mmol,131mg)和二叔丁基二碳酸酯(1.29mmol,282mg),室温反应2小时后停止反应。向体系加水30mL,二氯甲烷萃取,无水硫酸钠干燥,得到粗品中间体M3-2。LC-MS:[M+H] +:425。
冰浴下,将上一步骤粗品中间体M3-2溶于12mL无水二氯甲烷中,分批缓慢加入N-碘代琥珀酰亚胺NIS(1.29mmol,290mg),并继续搅拌2小时。停止反应,加入30mL饱和氯化铵水溶液,二氯甲烷萃取。无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=2/1),得到化合物M3-3(450mg,两步收率:64%)。LC-MS:[M+H] +:551。
氮气保护下,将中间体M3-3(0.82mmol,450mg)和原料M1-4(1.23mmol,342mg)溶于10mL 1,4-二氧六环和水的混合液中(v/v:9/1),加入磷酸钾(1.64mmol,348mg)和Xphos-Pd-G3(0.08mmol,68mg)。微波95℃下加热反应2小时。停止反应,过滤,向体系加水30mL,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=2/1),得到化合物M3-4(260mg,收率:56%)。LC-MS:[M+H] +:575。
将中间体M3-4(260mg)溶于10mL四氢呋喃中,加入1N NaOH水溶液5mL,升温至70℃反应1小时。停止反应,减压蒸除溶剂,加入40mL水,二氯甲烷萃取,flash柱层析分离(PE/EA=1/1),得到化合物M3-5(200mg,收率:94%),LC-MS:[M+H] +:475。
氮气保护下,在微波反应瓶中加入中间体M3-5(0.42mmol,200mg),3-溴吡啶M1-7 (0.63mmol,100mg),磷酸钾(1.26mmol,268mg)和CuI(0.08mmol,15mg),6mL DMF溶解。搅拌5分钟后,缓慢加入N,N-二甲基-1,2-环己二胺(0.08mmol,12mg)。微波下升温至110℃反应1.5小时,冷却至室温,向反应液加水30mL,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=2/1),得到化合物M3-6(100mg,收率:44%),LC-MS:[M+H] +:552。
将上步中间体M3-6(100mg)溶于4mL二氯甲烷中,加入2mL三氟乙酸,室温反应2小时。停止反应,减压蒸除溶剂,加入饱和碳酸氢钠水溶液调节pH-10,二氯甲烷萃取,HPLC制备色谱分离(0.1%三氟乙酸的水溶液),得到目标化合物M3(30mg,收率:37%),LC-MS:[M+H] +:468。
M3: 1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.71(s,1H),8.83(d,J=2.6Hz,1H),8.68(d,J=4.7Hz,1H),8.27(s,1H),8.09–8.02(m,1H),7.63(dd,J=8.2,4.8Hz,2H),6.72–6.76(m,2H),4.49(s,2H),4.17(s,2H),3.20(d,J=12.6Hz,2H),2.34(s,3H),2.24(s,3H),1.86–1.89(m,2H),1.76–1.81(m,2H)。
实施例2:化合物M4-M15的制备
Figure PCTCN2022143770-appb-000057
第一步:氮气保护下,将中间体3-(7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷c5(1.85mmol,600.0mg)溶于10mL DMF中,缓慢加入N-溴代琥珀酰亚胺NBS(2.22mmol,395.1mg),室温下反应2小时,停止反应。向反应液加入50mL水,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(DCM/MeOH=10/1),得到化合物3-(3-溴-7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷M4-1(600mg,收率:80%),LC-MS:[M+H] +:403.1。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.67(s,1H),7.95(s,1H),6.58(s,1H),4.46(s,2H),4.09(d,J=12.4Hz,2H),3.18-3.07(dd,J=12.4Hz,1.2Hz,2H),2.17(d,J=21.2Hz,7H),1.90-1.81(m,2H),1.77-1.67(m,2H)。
第二步:氮气保护下,将化合物M4-1(1.24mmol,500mg)、磷酸钾(3.72mmol,789.5 mg)、化合物M1-4(1.86mmol,571.3mg)和催化剂Pd(dtbpf)Cl 2(0.24mmol,155mg)溶于10mL 1,4-二氧六环中,加入2mL水,搅拌5分钟后,升温至90℃并继续反应16小时,冷却至室温,停止反应,过滤。向混合液中加水45mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(DCM/MeOH=10/1),得到化合物3-(7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-3-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷M4-2(420mg,收率:71%),LC-MS:[M+H] +:475.5。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ8.61(s,1H),7.89(d,J=8.0Hz,1H),4.23(q,J=7.2Hz,3H),1.29(t,J=6.8Hz,3H),1.20-1.14(m,2H),1.06-0.98(m,2H)。
第三步:氮气保护下,将化合物M4-2(0.32mmol,150mg)、磷酸钾(0.63mmol,131mg)、3-溴-5-氯吡啶M4-3(0.63mmol,122mg)和配体N 1,N 2-二甲基1,2-环己二胺(0.063mmol,8.99mg)溶于5mL DMF中,加入催化剂CuI(0.03mmol,6.02mg),升温至110℃并继续搅拌4小时,冷却至室温,停止反应。向混合液中加水40mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(DCM/MeOH=15/1),得到化合物3-(7-(1-(5-氯吡啶-3-基)-3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-3-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷M4-4(80mg,收率:44%),LC-MS:[M+H] +:586.3。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ8.61(s,1H),7.89(d,J=8.0Hz,1H),4.23(q,J=7.2Hz,3H),1.29(t,J=6.8Hz,3H),1.20-1.14(m,2H),1.06-0.98(m,2H)。
第三步:氮气保护下,将化合物M4-4(0.14mmol,80mg)溶于4mL二氯甲烷和三氟乙酸的混合溶剂中(v/v=3/1),室温下反应2小时。向混合液中加入饱和碳酸氢钠水溶液调节pH至9左右,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经制备色谱HPLC分离纯化,得到化合物M4(13.1mg),LC-MS:[M+H] +:502.2。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.79(br s,1H),8.83(d,J=2.4Hz,1H),8.75(d,J=2.0Hz,1H),8.27(t,J=2.4Hz,2H),7.59(br s,1H),6.75(br s,1H),6.69(s,1H),4.50(s,2H),4.15(s,2H),3.20(d,J=11.6Hz,2H),2.38(s,3H),2.24(s,3H),1.90-1.74(m,4H)。
参考化合物M4的合成,采用类似的原料/中间体,合成如下目标化合物M5至M15:
Figure PCTCN2022143770-appb-000058
Figure PCTCN2022143770-appb-000059
Figure PCTCN2022143770-appb-000060
实施例3:化合物M16-M18的制备
Figure PCTCN2022143770-appb-000061
第一步:氮气保护下,将中间体(1S,4S)-5-(7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷c6(0.73mmol,300.0mg)溶于5mL DMF中,缓慢加入N-溴代琥珀酰亚胺NBS(0.89mmol,156.1mg),室温下反应2小时,停止反应。向反应液加入30mL水,二氯甲烷萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经flash反向柱层析分离纯化(乙腈/水),得到化合物(1S,4S)-5-(3-溴-7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷M16-1(5.0mg,收率:6%),LC-MS:[M+H] +:309.9。重复放大该反应,得到M16-1(2.0g)。
第二步:氮气保护下,将化合物M16-1(0.59mmol,230mg)、磷酸钾(1.77mmol,376mg)、化合物M1-4(1.18mmol,329mg)和催化剂Pd(dtbpf)Cl 2(0.12mmol,76mg)溶于4mL 1,4-二氧六环中,加入0.8mL水,搅拌5分钟后,升温至90℃并继续搅拌16小时,冷却至室温,停止反应,过滤。向混合液中加水30mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(DCM/MeOH=50/1),得到化合物(1S,4S)-5-(7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-3-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.1]庚烷M16-2(150mg,收率:55%),LC-MS:[M+H] +:461.1。
第三步:氮气保护下,将化合物M16-2(0.33mmol,150mg)、磷酸钾(0.65mmol,138mg)、3-溴吡啶M1-7(0.65mmol,103mg)和配体N 1,N 2-二甲基1,2-环己二胺(0.65mmol,142mg)溶于5mL DMF中,加入催化剂CuI(0.33mmol,62mg),升温至110℃并继续搅拌16小时,冷却至室温,停止反应。向混合液中加水40mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,得到粗品化合物M16-3,LC-MS:[M+H] +:538.3。
第四步:氮气保护下,将第三步得到的粗品化合物M16-3溶于4mL二氯甲烷和三氟乙酸的混合溶剂中(v/v=3/1),室温下反应2小时。向混合液中加入饱和碳酸氢钠水溶液调节pH至9左右,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经制备色谱HPLC分离纯化,得到化合物M16(13.8mg),LC-MS:[M+H] +:454.2。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.64(s,1H),8.83(d,J=2.4Hz,1H),8.67(d,J=4.8Hz,1H),8.25(s,1H),8.08-8.02(m,1H),7.63(dd,J=8.0Hz,4.8Hz,2H),6.64(br s,2H),5.06(s,1H),4.75(s,1H),3.83(d,J=15.6Hz,2H),3.63(d,J=10.0Hz,2H),2.34(s,3H),2.24(s,3H),1.97(dd,J=25.2,9.2Hz,2H)。
参考化合物M16的合成,采用类似的原料/中间体,合成如下目标化合物M17至M18:
Figure PCTCN2022143770-appb-000062
实施例4:化合物M1a和M1b的制备
Figure PCTCN2022143770-appb-000063
氮气保护下,将中间体a3(3.75mmol,1.3g)和原料M1-1(5.63mmol,1.18g)溶于30mL 1,4-二氧六环和水的混合液中(v/v:9/1),加入碳酸钾(11.25mmol,1.55g)和Pd(dppf)Cl 2(0.4mmol,292mg),100℃下加热反应10小时。停止反应,过滤,向体系加水80mL,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=2/1),得到化合物M1-2(1.1g,收率:75%)。LC-MS:[M+H] +:396。
冰浴下,将中间体M1-2(2.78mmol,1.1g)溶于25mL无水二氯甲烷中,分批缓慢加入N-碘代琥珀酰亚胺NIS(3.06mmol,688mg),并继续搅拌2小时。停止反应,加入30mL饱和氯化铵水溶液,二氯甲烷萃取。无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=2/1),得到化合物M1-3(1.4g,收率:97%)。LC-MS:[M+H] +:522。
氮气保护下,将中间体M1-3(2.69mmol,1.4g)和原料M1-4(4.03mmol,1.1g)溶于20mL 1,4-二氧六环和水的混合液中(v/v:9/1),加入磷酸钾(5.38mmol,1.1g)和Xphos-Pd-G3(0.27mmol,229mg)。微波95℃下加热反应2小时。停止反应,过滤,向体系加水60mL,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=4/1),得到化合物M1-5(700mg,收率:48%)。LC-MS:[M+H] +:546。
将中间体M1-5(700mg)溶于15mL四氢呋喃中,加入1N NaOH水溶液6mL,升温至70℃反应1小时。停止反应,减压蒸除溶剂,加入30mL水,二氯甲烷萃取,flash柱 层析分离(PE/EA=1/1),得到化合物M1-6(530mg,收率:93%),LC-MS:[M+H] +:446。
氮气保护下,在微波反应瓶中加入中间体M1-6(1.19mmol,530mg),3-溴吡啶M1-7(1.78mmol,282mg),磷酸钾(2.38mmol,505mg)和CuI(0.12mmol,23mg),10mL DMF溶解。搅拌5分钟后,缓慢加入N,N-二甲基-1,2-环己二胺(0.24mmol,34mg)。微波下升温至110℃反应1.5小时,冷却至室温,过滤,向反应液加水50mL,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离,得到化合物M1-8(240mg,收率:39%),LC-MS:[M+H] +:523。
氮气保护下,将NaH(1.66mmol,60%,40mg)和三甲基氯化亚砜(1.0mmol,129mg)加入反应瓶中,缓慢向体系加入1mL无水DMSO并搅拌20分钟。将中间体M1-8(0.46mmol,240mg)溶于1mL DMSO中,并将该混合液缓慢注射到反应液中。升温至65℃反应4小时,停止反应。向反应液中加水20mL,乙酸乙酯萃取,得到200mg粗品中间体M1-9。LC-MS:[M+H] +:537。
将粗品中间体M1-9(200mg)溶于4mL二氯甲烷中,加入2mL三氟乙酸,室温反应2小时。停止反应,减压蒸除溶剂,加入饱和碳酸氢钠水溶液调节pH-10,二氯甲烷萃取,HPLC制备色谱分离,得到化合物M1(70mg,两步收率:34%),LC-MS:[M+H] +:453。
化合物M1经手性制备色谱分离,得到目标化合物M1a和M1b。
M1b: 1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.91(d,J=111.8Hz,1H),8.85(d,J=2.5Hz,1H),8.68(d,J=4.7Hz,1H),8.50(s,1H),8.10–8.03(m,1H),7.77(s,1H),7.64(dd,J=8.2,4.8Hz,1H),6.92(s,2H),3.90–3.97(m,2H),3.65–3.70(m,1H),3.38–3.41(m,1H),2.91–2.97(m,1H),2.34(s,3H),2.24(s,3H),1.99–2.01(m,1H),1.91(s,1H),1.55(dd,J=9.3,4.2Hz,1H),1.23(d,J=5.5Hz,1H)。
实施例5:化合物M2a和M2b的制备
Figure PCTCN2022143770-appb-000064
冰浴下,将中间体b1(3.18mmol,1.3g)溶于25mL无水二氯甲烷中,分批缓慢加入N-碘代琥珀酰亚胺NIS(3.50mmol,787mg)并继续搅拌2小时。停止反应,加入35mL饱和氯化铵水溶液,二氯甲烷萃取。无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=2/1),得到化合物M2-1(1.3g,收率:77%)。LC-MS:[M+H] +:536。
氮气保护下,将中间体M2-1(2.43mmol,1.3g)和原料M1-4(3.65mmol,1.01g)溶于20mL 1,4-二氧六环和水的混合液中(v/v:9/1),加入磷酸钾(4.86mmol,1.03g)和Xphos-Pd-G3(0.24mmol,203mg)。微波95℃下加热反应2小时。停止反应,过滤,向体系加水60mL,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=4/1),得到化合物M2-2(1.3g,收率:96%)。LC-MS:[M+H] +:560。
将中间体M2-2(1300mg)溶于20mL四氢呋喃中,加入1N NaOH水溶液8mL,升温至70℃反应1小时。停止反应,减压蒸除溶剂,加入40mL水,二氯甲烷萃取,flash柱层析分离(PE/EA=1/1),得到化合物M2-3(1.0g,收率:94%),LC-MS:[M+H] +:460。
氮气保护下,在微波反应瓶中加入中间体M2-3(0.65mmol,300mg),3-溴-5-氟-吡啶M2-4(0.98mmol,172mg),磷酸钾(1.30mmol,276mg)和CuI(0.06mmol,12mg),8mL DMF溶解。搅拌5分钟后,缓慢加入N,N-二甲基-1,2-环己二胺(0.12mmol,17mg)。微波下升温至110℃反应1.5小时后停止反应,过滤。向反应液加水30mL,乙酸乙酯萃取,无水硫酸钠干燥,flash柱层析分离(PE/EA=3/1),得到化合物M2-5(200mg,收率:56%),LC-MS:[M+H] +:555。
将中间体M2-5(0.36mmol,200mg)溶于4mL二氯甲烷中,加入2mL三氟乙酸,室 温反应2小时。停止反应,减压蒸除溶剂,加入饱和碳酸氢钠水溶液调节pH-10,二氯甲烷萃取,HPLC制备色谱分离,得到化合物M2(80mg,收率:48%),LC-MS:[M+H] +:471。
化合物M2经手性制备色谱分离,得到目标化合物M2a和M2b。
M2b: 1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.91(d,J=117.3Hz,1H),8.77(s,1H),8.73(d,J=2.6Hz,1H),8.49(s,1H),8.14(dd,J=9.6,2.7Hz,1H),7.69(d,J=79.0Hz,1H),6.90(s,2H),3.90–3.97(m,2H),3.65–3.70(m,1H),3.35–3.41(m,1H),2.94(dt,J=14.4,4.6Hz,1H),2.38(s,3H),2.24(s,3H),2.01–2.08(m,1H),1.91(s,1H),1.54(dd,J=9.2,4.2Hz,1H),1.22–1.26(m,1H)。
实施例6:化合物M19的制备
Figure PCTCN2022143770-appb-000065
第一步:氮气保护下,将化合物3-(3-溴-7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷M4-1(1.24mmol,500mg)、磷酸钾(3.72mmol,789.5mg)、化合物M19-1(1.49mmol,434.7mg)和催化剂Pd(dtbpf)Cl 2(0.12mmol,80mg)溶于10mL 1,4-二氧六环中,加入2mL水,搅拌5分钟后,升温至90℃并继续搅拌16小时,冷却至室温,停止反应,过滤。向混合液中加水40mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经柱层析分离纯化(DCM/MeOH=10/1),得到化合物3-(7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-3-(3-甲基-1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷M19-2(460mg,收率:76%),LC-MS:[M+H] +:489.3。
第二步:氮气保护下,将化合物M19-2(0.41mmol,200mg)、磷酸钾(0.82mmol,174mg)、3-溴-吡啶M1-7(0.82mmol,130mg)和配体N 1,N 2-二甲基1,2-环己二胺(0.41mmol,58mg)溶于5mL DMF中,加入催化剂CuI(0.20mmol,39mg),升温至110℃并继续搅拌16小时,冷却至室温,停止反应。向混合液中加水40mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,得到粗品化合物M19-3,LC-MS:[M+H] +:566.3。
第三步:氮气保护下,将第二步得到的粗品M19-3溶于6mL二氯甲烷和三氟乙酸的混合溶剂中(v/v=3/1),室温下反应2小时,停止反应。向混合液中加入饱和碳酸氢钠水 溶液调节pH至9左右,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经制备色谱HPLC分离纯化,得到化合物M19(79.5mg),LC-MS:[M+H] +:482.3。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.30(s,1H),8.83(d,J=2.4Hz,1H),8.67(dd,J=4.8Hz,1.2Hz,1H),8.23(s,1H),8.07-8.02(m,1H),7.65-7.60(m,1H),6.70(s,1H),6.51(s,1H),4.50(d,J=2.0Hz,2H),4.16(d,J=12.4Hz,2H),3.19(d,J=11.2Hz,2H),2.33(s,3H),2.23(s,6H),1.92-1.73(m,4H)。
实施例7:化合物M20的制备
Figure PCTCN2022143770-appb-000066
氮气保护下,将化合物3-(7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-3-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷M4-2(0.11mmol,50mg)溶于4mL二氯甲烷和三氟乙酸的混合溶剂中(v/v=3/1),室温下反应2小时,停止反应。向混合液中加入饱和碳酸氢钠水溶液调节pH至9左右,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经制备色谱HPLC分离纯化,得到化合物M20(18.0mg),LC-MS:[M+H] +:391.2。
1H NMR(400MHz,DMSO-d 6)δ12.67(s,2H),8.23(s,1H),7.58(s,1H),6.73(s,1H),6.56(s,1H),4.48(s,2H),4.14(s,2H),3.16(d,J=10.8Hz,2H),2.20(s,6H),1.90-1.73(m,4H)。
实施例8:化合物M21-M22的制备
Figure PCTCN2022143770-appb-000067
第一步:氮气保护下,将化合物3-(7-(3,5-二甲基-1H-吡唑-4-基)-3-(1-(四氢-2H-吡喃-2-基)-1H-吡唑-5-基)吡唑并[1,5-a]嘧啶-5-基)-8-氧杂-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷M4-2(0.32mmol,150mg)溶于5mL无水DMF中,加入NaH(0.47mmol,18.96mg),搅拌5分钟后,加入原料M21-1(0.47mmol,132.4mg),升温至70℃并继续搅拌16小时,冷却至室温,停止反应,过滤。向混合液中加水40mL,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,得到粗品化合物M21-2,LC-MS:[M+H] +:658.5。
第二步:氮气保护下,将第一步得到的粗品M21-2溶于4mL二氯甲烷和三氟乙酸的混合溶剂中(v/v=3/1),室温下反应2小时,停止反应。向混合液中加入饱和碳酸氢钠水溶液调节pH至9左右,乙酸乙酯萃取,饱和食盐水洗涤,无水硫酸钠干燥,浓缩,粗品经制备色谱HPLC分离纯化,得到化合物M21(38.89mg),LC-MS:[M+H] +:474.3。
1H NMR(400MHz,CDCl 3)δ8.34(s,1H),8.23(s,1H),7.59(s,1H),6.74(s,1H),6.57(s,1H),4.48(s,2H),4.44-4.35(m,1H),4.15(d,J=12.0Hz,2H),3.25(d,J=11.2Hz,2H),3.16(d,J=11.6Hz,2H),2.87(t,J=11.6Hz,2H),2.25(s,3H),2.15-2.03(m,5H),1.94-1.82(m,4H),1.80-1.72(m,2H)。
参考化合物M21的合成,采用类似的原料/中间体,合成如下目标化合物M22:
Figure PCTCN2022143770-appb-000068
实施例9:ATR激酶活性实验
通过检测ATR激酶磷酸化下游底物p53蛋白的情况,进行ATR激酶活性测试。GST标记的全长P53蛋白购自Sigma(货号:14-865),Anti-phospho-p53(ser15)-K抗体和Anti-GST-d2抗体均购自Cisbio(货号:61GSTDLA;61P08KAE)。采用时间分辨荧光系统测定磷酸化P53蛋白的量。实验开始前,根据需要进行如下工作液的配制:1×反应缓冲液(20mM HEPES PH8.0、1%甘油、0.01%Brij-35),稀释缓冲液(20mM HEPES PH8.0、1%甘油、0.01%Brij-35、5mM DTT和1%BSA),终止液(20mM HEPES PH8.0、1%甘油、0.01%Brij-35、250mM EDTA),检测缓冲液(50mM HEPES PH7.0、150mM NaCl、267mM KF、0.1%胆酸钠、0.01%Tween-20、0.0125%叠氮化钠)。使用临床在研药物AZD6738(购自selleck公司)作为阳性对照。
实验具体操作步骤如下:
用1×反应缓冲液制备4×梯度稀释化合物溶液,得到9个不同浓度的化合物,加2.5μL4×梯度稀释化合物溶液到384孔分析板(784075,Greiner)。用1×反应缓冲液制备4×p53底物工作液(40nM),加2.5μL 4×p53底物工作液到384孔分析板中。用稀释缓冲液制备4× ATR/ATRIP工作液(12.8ng/μL),加2.5μL 4×ATR/ATRIP工作液至384孔分析板。用去离子水制备4×ATP工作液(2mM),加2.5μL 4×ATP工作液到384孔分析板,在避光条件下室温培育30分钟。加5μL终止液到384分析板。最后加5μL检测混合物(0.09ng/μL的Anti-phospho-p53(ser15)-K和6ng/μL的Anti-GST-d2)到384孔分析板。室温孵育过夜,用M5e(Molecular Device)仪器检测荧光信号(激发波长为320nm,发射波长为620nm和665nm)。通过各孔荧光强度值计算出每个孔中的抑制率:ER(Emission Ratio,发射光比率)=(665nm处荧光强度/620nm处荧光强度);抑制率=(ER阳性-ER待测化合物)/(ER阳性-ER阴性)×100%,利用参数拟合标准软件(GraphPad Prism 8.0)计算化合物的IC 50数值(IC 50为在50%最大效力下的抑制浓度)。结果如表1中所示。
表1
化合物编号 ATR/IC 50/nM
M3 7
M7 9
M15 10
M16 445
M18 64
M1a 25
M1b 138
M2a 33
M2b 548
M19 15
M20 41
M21 22
AZD6738 15
根据表1的数据,本发明化合物具有优异的抑制ATR激酶的活性,活性与临床在研药物AZD6738相当,甚至更优,表明本发明化合物可以作为ATR抑制剂,选择性地作用于肿瘤细胞,有望成为肿瘤治疗的优异潜在药物。
实施例10:体外细胞增殖抑制实验1
22Rv1细胞购于美国典型培养物保藏中心(American Type Culture Collection,ATCC)。
实验具体操作步骤如下:
22Rv1细胞培养于RPMI 1640培养基(含10%FBS和1%青霉素链霉素(ps))中,细胞融合度达到85%以上时,用于试验。96-孔培养板每孔接种约2000个细胞,培养24小时, 加入不同浓度待测化合物(0-50μM)处理细胞,每组设置3个平行复孔。设置空白孔(只含有培养基)和对照孔(接种细胞,无药物)。培养120小时,每孔加入10μL CCK8溶液(Beyotime,#C0037),避光孵育4h,用Biotek Synergy H1多功能酶标仪读取OD值。
抑制率(%)=100%×(对照孔-测试孔)/(对照孔-空白孔)
利用参数拟合标准软件(GraphPad Prism 8.0)计算化合物的IC 50数值。结果如表2中所示。
表2
化合物编号 22Rv1/IC 50/μM 化合物编号 22Rv1/IC 50/μM
M3 0.21 M13 1.38
M4 0.65 M14 1.40
M5 0.44 M15 0.20
M6 1.33 M16 4.05
M7 0.22 M18 0.33
M8 2.40 M19 0.15
M9 0.97 M20 0.59
M10 0.37 M21 4.33
M11 0.50 M22 4.48
M12 1.71    
该增殖抑制实验结果证明本发明化合物对ATM突变的人前列腺癌细胞22Rv1具有良好的抑制效果,部分IC 50值可低于1μM,甚至低于0.3μM。
实施例11:体外细胞增殖抑制实验2
本实验通过检测本发明化合物在肿瘤细胞系TOV21G与SK-OV-3(卵巢癌)、Rec-1(淋巴瘤)、HCT-116(结肠癌)、MDA-MB-231(乳腺癌)、NCI-H23(非小细胞肺癌)、SNU216(胃癌)、OS-RC-2(肾癌)、T24(膀胱癌)、AsPC-1(胰腺癌)、M14(黑色素瘤)和U2OS(骨肉瘤)中对体外细胞增殖的影响,研究本发明化合物对肿瘤细胞增殖的抑制作用。
TOV21G细胞与Rec-1细胞均购于美国典型培养物保藏中心(American Type Culture Collection,ATCC),其他细胞来自上海美迪西生物医药有限公司。
TOV21G细胞培养于MCDB105/M199培养基(含15%FBS和1%ps)中,细胞融合度达到85%以上时,用于试验。96-孔培养板每孔接种约1000个细胞,培养24小时,加入不同浓度待测化合物(0-10μM)处理细胞,每组设置3个平行复孔。设置空白孔(只含有培养基)和对照孔(接种细胞,无药物)。培养120小时,每孔加入40μL Cell Titer-Glo溶液 (Promega,#G7573),避光震荡孵育25min,每孔取100μL转移至96-孔白板中(Corning,#3917),用Biotek Synergy H1多功能酶标仪读取发光值。
Rec-1细胞培养于RPMI1640培养基(含有10%FBS和1%ps)中,96-孔培养板每孔接种约6000个细胞,加入不同浓度待测化合物(0-10μM)处理细胞,每组设置3个平行复孔。设置空白孔(只含有培养基)和对照孔(接种细胞,不用药物处理)。培养120小时,每孔加入40μL Cell Titer-Glo溶液,避光震荡孵育20min,每孔取100μL转移至96-孔白板中,用Biotek Synergy H1多功能酶标仪读取发光值。
其余细胞培养与实验方案参照以上两种细胞系的实验方案,细胞培养基使用ATCC推荐的常规培养基。
抑制率(%)=100%×(对照孔-测试孔)/(对照孔-空白孔)
利用参数拟合标准软件(GraphPad Prism 8.0)计算化合物的IC 50数值。结果见表3、表4。
表3
Figure PCTCN2022143770-appb-000069
表4化合物M3对于多种肿瘤细胞的抗增殖效果。
细胞系名称 细胞所属肿瘤类型 IC 50/μM
TOV21G 卵巢癌 0.58
Rec-1 人套细胞淋巴瘤 1.16
SK-OV-3 卵巢癌 1.89
HCT-116 结肠癌 1.72
MDA-MB-231 乳腺癌 1.08
NCI-H23 非小细胞肺癌 1.54
SNU216 胃癌 1.24
OS-RC-2 肾癌 0.97
T24 膀胱癌 0.48
AsPC-1 胰腺癌 1.57
M14 黑色素瘤 0.88
U2OS 骨肉瘤 0.69
该增殖抑制实验结果证明本发明化合物在所研究的人肿瘤细胞中具有良好的抑制效果。
实施例12:化合物体外肝微粒体稳定性实验
对本发明化合物进行肝微粒体稳定性实验研究。将待测化合物(终浓度2.0nM)在加入或不加入NADPH情况下与人/小鼠的肝微粒体进行共孵育,检测60分钟内孵育上清中的化合物浓度。代表性化合物的结果如下表5所示。
表5
Figure PCTCN2022143770-appb-000070
以上结果表明本发明的分子在小鼠和人的肝微粒体中具有非常高的稳定性,预示体内代谢较慢。
实施例13:化合物体内药代动力学实验
对本发明化合物进行体内药代动力学研究。
实验方法:
雄性ICR小鼠(3只/组)口服灌胃给药,给药剂量为10mg/kg。收集给药前(0小时)和给药后(0.25,0.5,1,2,4,6,8,24小时)的血浆样品,对收集的样品进行LC/MS/分析并采集数据,采集的分析数据用Analyst v1.6.2(AB Applied Biosystems Company,USA)软件计算相关药代动力学参数。
代表性化合物的结果如下表6所示。
表6
Figure PCTCN2022143770-appb-000071
以上结果表明本发明的分子在小鼠口服给药后具有非常高的体内暴露量,临床上有望 以更低的剂量带来优异的抗肿瘤效果。
实施例14:化合物对于ATR激酶选择性研究
对本发明化合物进行同家族(ATM,DNA-PK)抑制实验测试:
根据文献报道的实验方法,将待测化合物以10μM为起点,3倍稀释至0.51nM(共计10个浓度),分别测定其对激酶ATM 1和DNA-PK 2的抑制活性,结果如下表7所示。
表7:
Figure PCTCN2022143770-appb-000072
以上结果表明本发明所述化合物对于ATR具有高度选择性,对于家族内其他激酶抑制活性较低,从而带来较高的安全性获益。
以上内容是结合具体的优选实施方式对本发明所作的进一步详细说明,不能认定本发明的具体实施只局限于这些说明。对于本发明所属技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干简单推演或替换,都应当视为属于本发明的保护范围。
参考文献:
[1]Discovery of Novel 3-Quinoline Carboxamides as Potent,Selective and Orally Bioavailable Inhibitors of Ataxia Telangiectasia Mutated(ATM)Kinase,J.Med.Chem.2016,56,6281-6292;
[2]The Discovery of 7-Methyl-2-[(7-methyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-6-yl)amino]-9-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-7,9-dihydro-8H-purin-8-one(AZD7648),a Potent and Selective DNA-Dependent Protein Kinase(DNA-PK)Inhibitor,J.Med.Chem.2020,63,3461-3471。

Claims (11)

  1. 通式(I)所示的化合物、其立体异构体或其可药用盐:
    Figure PCTCN2022143770-appb-100001
    其中:
    R 1选自
    Figure PCTCN2022143770-appb-100002
    Figure PCTCN2022143770-appb-100003
    R x选自H、5-6元杂芳基或5-6元杂环基,其中所述5-6元杂芳基或5-6元杂环基任选地被R a取代;
    R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基;且
    R y选自H、卤素、NH 2、C 1-4烷基或C 1-4烷氧基。
  2. 根据权利要求1所述的化合物、其立体异构体或其可药用盐,其中,R 1选自以下基团:
    Figure PCTCN2022143770-appb-100004
  3. 根据权利要求1或2所述的化合物、其立体异构体或其可药用盐,其中
    R x选自H、6元杂芳基或6元杂环基,其中所述6元杂芳基或6元杂环基任选地被R a取代;
    R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基。
  4. 根据权利要求1至3中任一项所述的化合物、其立体异构体或其可药用盐,其中R y选自H或C 1-4烷基。
  5. 根据权利要求1所述的化合物、其立体异构体或其可药用盐,具有通式(II)的结构:
    Figure PCTCN2022143770-appb-100005
    其中:
    R 1选自以下基团:
    Figure PCTCN2022143770-appb-100006
    R a选自H、卤素、-CN、-NH 2、C 1-4烷基、C 1-4烷氧基或C 1-4卤代烷基;且
    R y选自H或甲基。
  6. 根据权利要求1至4中任一项所述的化合物、其立体异构体或其可药用盐,其中,所述化合物选自如下化合物:
    Figure PCTCN2022143770-appb-100007
    Figure PCTCN2022143770-appb-100008
    Figure PCTCN2022143770-appb-100009
  7. 一种药物组合物,其包含治疗有效量的权利要求1至6中任一项所述的化合物、其立体异构体或其可药用盐以及可药用辅料。
  8. 根据权利要求7所述的药物组合物,其还包含其他用于治疗癌症的活性剂。
  9. 根据权利要求7或8所述的药物组合物,其中,所述药物组合物被配制为注射剂,例如无菌水性及非水性溶液、分散液、悬浮液或乳剂;固体口服制剂例如片剂、胶囊剂、粉剂、颗粒剂或丸剂;液体口服制剂例如溶液、乳剂、悬浮液或糖浆剂。
  10. 权利要求1至6中任一项所述的化合物、其立体异构体或其可药用盐或者权利要求7至9中任一项所述的药物组合物在制备用于治疗癌症的药物中的用途。
  11. 根据权利要求10所述的用途,其中所述癌症选自乳腺癌、肾癌、肺癌、卵巢癌、膀胱癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、胰腺癌、前列腺癌、白血病、淋巴瘤、黑色素瘤、骨髓瘤和骨肉瘤。
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