WO2023033457A1 - Snp marker for predicting high water temperature tolerance of flatfish, and use thereof - Google Patents
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Definitions
- the present disclosure relates to a SNP marker composition for predicting High Water Temperature Tolerance (HWTT) of flounder and a method for predicting high temperature tolerance of flounder using the same.
- HWTT High Water Temperature Tolerance
- seawater temperature is an important variable in aquaculture production in onland farms or cage farms using natural seawater. It is known that it can cause various problems. Therefore, a new breed that can withstand the high temperature period is needed, and in order to develop the breed, genetic selective breeding based on a method for selecting high temperature resistant halibut is required.
- An object of the present disclosure is to provide a SNP marker composition for predicting high temperature resistance of flounder, a composition comprising an agent capable of detecting or amplifying it, a kit for predicting high temperature resistance of flounder including the composition, and a method for predicting high temperature resistance of flounder will be.
- the present disclosure provides that the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is G or A, and the polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base.
- a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 wherein the 36
- the present disclosure is a composition for predicting high temperature resistance of flounder, including an agent capable of detecting or amplifying a SNP marker for predicting high temperature resistance of flounder, wherein the SNP marker is a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1
- the 36th base of is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto;
- the agent may be a primer or probe capable of detecting or amplifying the SNP marker.
- the present disclosure provides a kit for predicting high-temperature resistance of flatfish, including the composition for predicting high-temperature resistance of flounder.
- the present disclosure provides (a) amplifying or detecting a polymorphic site of a SNP marker for predicting high temperature resistance of flounder from DNA of a sample isolated from flounder; and (b) determining the base of the polymorphic site amplified or detected in step (a), wherein the SNP marker in step (a) is 36 nucleotides of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1.
- the present disclosure is a kit for predicting high temperature tolerance of halibut; And in a method for predicting high-temperature tolerance of flatfish, it provides the use of the above-described SNP marker composition for predicting high-temperature tolerance of flatfish.
- the SNP marker composition of the present disclosure can be used for genetic selection of halibut with high temperature tolerance.
- Figure 1 is a graph showing the cumulative mortality according to the water temperature change in the high temperature tolerance experiment.
- Figure 2 shows the GWAS analysis by type (survival status, survival days, survival time) for high temperature tolerance.
- 3 to 32 show the phenotypic distribution of genotypes of 30 SNPs for prediction of high temperature tolerance.
- the present disclosure is a single nucleotide polymorphism that can predict high-temperature tolerance through genotypic analysis and genome-wide association study (GWAS) using a 70K SNP chip for halibut for individuals selected from high-temperature exposure experiments ( SNP) was confirmed.
- GWAS genotypic analysis and genome-wide association study
- the present disclosure relates to a SNP marker composition for predicting high temperature tolerance of halibut.
- the present disclosure discloses that the 36th base of a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto polynucleotide;
- a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto
- high water temperature resistance refers to the property of enduring an increase in water temperature, and specifically, when a high water temperature of 29.0 ° C to a maximum of 33.7 ° C is maintained, resistance to growth slowdown or disease occurrence due to water temperature shock, weakening of immunity, decline in physiological function, etc. means to have
- SNP marker in the present disclosure refers to a single base polymorphic allele base pair on a DNA sequence used to identify an individual or species. Since SNPs have a relatively high frequency, are stable, and are distributed throughout the genome, resulting in genetic diversity of individuals, SNP markers can serve as indicators of genetic proximity between individuals. SNP markers usually include phenotypic changes accompanying single nucleotide polymorphisms, but may not in some cases. In the case of the SNP marker of the present disclosure, it may represent a difference in phenotype of an individual such as amino acid sequence variation or high temperature tolerance of halibut.
- the term "individual” of the present disclosure means a halibut (flatfish), which is a target for confirming high-temperature resistance, and by analyzing the genotype of the SNP marker using a sample obtained from the flounder (flatfish), the high-temperature resistant flatfish (flatfish) can be identified.
- a 70K SNP chip prepared after searching for SNPs in the mother genome by whole genome re-sequencing of the flounder mother generation was used.
- the search was conducted by narrowing the scope to SNPs associated with high temperature tolerance.
- effective SNPs highly related to high temperature tolerance were found on chromosomes 18 and 19.
- the phenotypic distribution of the genotypes of the SNPs was analyzed to determine 30 SNP information, and the reliability and accuracy of the SNP markers of the present disclosure were confirmed to confirm that high-temperature tolerance of flounder could be predicted.
- a polynucleotide consisting of 10 to 100 contiguous bases comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 of the present disclosure or a polynucleotide complementary thereto to 10 to 100 contiguous bases comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 It suggests that halibut containing at least one selected from the group consisting of a polynucleotide consisting of or a polynucleotide complementary thereto may exhibit high-temperature resistance traits, and such a base sequence was identified for the first time by the present inventors.
- the present disclosure provides a composition for predicting high-temperature tolerance of flounder, including an agent capable of detecting or amplifying a SNP marker for predicting high-temperature resistance of flounder.
- agent capable of detecting or amplifying a SNP marker refers to a composition capable of predicting high-temperature resistant flounder by confirming the polymorphic region of the gene as described above through detection or amplification, preferably the SNP A primer set or probe capable of specifically detecting or amplifying a polynucleotide of a marker.
- the primers used to amplify the SNP markers are prepared in the form of template-directed DNA under suitable conditions (eg, four different nucleoside triphosphates and a polymerizing agent such as DNA, RNA polymerase or reverse transcriptase) in an appropriate buffer and at an appropriate temperature. It can be a single-stranded oligopolynucleotide that can serve as a starting point for synthesis.
- the appropriate length of the primer may vary depending on the purpose of use, but is usually 15 to 30 polynucleotides. Short primer molecules generally require lower temperatures to form stable hybrids with the template.
- the primer sequence need not be perfectly complementary to the SNP marker, but must be sufficiently complementary to hybridize with the SNP marker.
- primer in the present disclosure is a base sequence having a short free 3' terminal hydroxyl group, capable of forming a base pair with a complementary template, and starting for copying the template strand. It refers to a short sequence that functions as a point, and is mainly used in the form of a primer set that amplifies a specific section.
- a primer can initiate DNA synthesis in the presence of a reagent for polymerization (i.e., DNA polymerase or reverse transcriptase) and four different nucleoside triphosphates in an appropriate buffer and temperature. At this time, PCR conditions and lengths of sense and antisense primers may be modified based on those known in the art.
- the term "probe” is DNA or RNA nucleotide sequences of various lengths labeled with radioactive or fluorescent labels, and is composed of single-stranded nucleotide sequences and is specific for single-stranded DNA or RNA having complementary sequences. It is characterized in that it binds and hybridizes with the target, and the target can be detected through a method of detecting the label signal of the hybridized probe.
- the primers or probes of this disclosure can be chemically synthesized using the phosphoramidite solid support method, or other well-known methods.
- Such nucleic acid sequences can also be modified using a number of means known in the art. Non-limiting examples of such modifications include methylation, capping, substitution of one or more homologs of a natural nucleotide, and modifications between nucleotides, such as uncharged linkages such as methyl phosphonates, phosphotriesters, phosphoro amidates, carbamates, etc.) or to charged linkages (eg phosphorothioates, phosphorodithioates, etc.).
- the present disclosure provides a kit for predicting high temperature resistance of flounder, including the composition for predicting high temperature resistance of flounder.
- the kit of the present disclosure may be a DNA chip kit, but is not limited thereto.
- the DNA chip kit uses a chip attached with a polynucleotide sequence containing a SNP marker, which is a marker for predicting high temperature resistance of flounder, or an oligopolynucleotide containing a complementary nucleotide sequence thereof, to specifically hybridize and bind to target DNA Characterized in that, it is possible to predict high-temperature tolerant halibut using the change in hybridization level according to the base variation of the SNP.
- a SNP marker which is a marker for predicting high temperature resistance of flounder
- an oligopolynucleotide containing a complementary nucleotide sequence thereof to specifically hybridize and bind to target DNA Characterized in that, it is possible to predict high-temperature tolerant halibut using the change in hybridization level according to the base variation of the SNP.
- the DNA chip kit for predicting high temperature resistance of flounder is selected from the group consisting of a polynucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 to a polynucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 At least one polynucleotide or a polynucleotide consisting of 10 to 100 bases including its 36th base and an oligopolynucleotide complementary to a marker are attached to a chip, and target DNA is reacted with the chip to determine the genotype through hybridization. It may be a kit for predicting high temperature tolerance of halibut, which is a kit for determining.
- step (a) amplifying or detecting a polymorphic site of the SNP marker for predicting high temperature resistance of claim 1 from the DNA of a flounder sample; and (b) determining the base of the polymorphic site amplified or detected in step (a).
- any method known to those skilled in the art may be used for amplifying the polynucleotide from the DNA sample in step (a). For example, it can be obtained by amplifying a target nucleic acid through PCR and purifying it. Other techniques such as ligase chain reaction (LCR), transcription amplification, and self-maintained sequence replication and nucleic acid-based sequence amplification (NASBA) may be used.
- LCR ligase chain reaction
- NASBA self-maintained sequence replication and nucleic acid-based sequence amplification
- Step (a) may be amplifying or detecting a base using a primer or a probe.
- the method for determining the base of the amplified SNP marker region in step (b) includes sequencing analysis, microarray hybridization, allele specific PCR, and dynamic allele hybridization technique.
- allele-specific hybridization DASH
- PCR extension analysis PCR-SSCP
- PCR-RFLP analysis HRM analysis or TaqMan techniques
- SNPlex platform Applied Biosystems
- mass spectrometry eg Sequenom's MassARRAY system
- mini-sequencing mini-sequencing
- Bio-Plex systems BioRad
- CEQ and SNPstream systems Beckman
- Molecular Inversion Probe array technology eg, Affymetrix GeneChip
- BeadArray Technologies eg, Illumina GoldenGate and Infinium assays).
- One or more alleles in the SNP marker can be identified by the above methods or other methods available to those skilled in the art.
- Example 1 High-density SNP 70K chip for halibut
- MS loci loci Individuals selected from 1,291 flounder populations prepared based on the allele and correlation analysis results of 11 microsatellite (MS) loci loci were selected based on QC results for genomic DNA, group, mating status, Considering gender, 100 fish were finally selected from the flounder population for whole genome re-sequencing analysis.
- MS microsatellite
- the Axiom TM my Design TM SNP chip (50 to 90K) platform was selected.
- the secured high-quality SNPs are classified into tiers according to their importance, and 154,964 SNPs are classified according to 1) genotype rate for 100 animals, 2) LD block, 3) repeat, and 4) MAF range.
- the population structure of 100 halibut was analyzed based on the selected 155K SNPs, a pattern similar to the results of the analysis with the 11 MS markers used previously was found, indicating that the collected flounder population was different according to the collection area (group). It is assumed that the specificity is strong and genetic fixation within the population is judged to be high.
- 71,364 SNPs were finally determined considering the SNP chip (50 to 90K) platform. have been selected The selected SNPs were evenly distributed across 24 chromosomes, and 70% of the distances between SNPs were within 5,000 bp, and most of them were identified as less than 10,000 bp.
- a 70K SNP chip for halibut in the form of a total of 384 wells/plate was manufactured so that 71,364 SNPs were planted in one chip.
- the flounder used as the experimental fish was a flounder group produced according to the breeding guidelines of Jeju National University from a flounder mother group collected at the Jeju Maritime and Fisheries Research Institute. Specifically, the nF0 generation was mass-produced from 354 sexually mature mother candidates (126 females, 288 males) through natural spawning and natural fertilization, and reared to a size of 20 to 30 cm. 400 animals per tank were stocked in 2 m-sized tanks and allowed to acclimate for 3 days at 19.4°C water temperature. At this time, the water tank used a circulating filter system that can control the water temperature with a boiler. A total of 769 animals were used in the high-temperature exposure experiment by removing objects showing abnormal symptoms during the acclimatization period. Feed was fed twice a day until the water temperature was 30°C, and feeding was stopped after the first death.
- the water temperature was adjusted so that it could rise by about 1 ° C per day from the temperature of the fish to 30 ° C, and it was adjusted so that it could rise by about 0.5 ° C per day to 32.5 ° C, which is known as the critical temperature of halibut.
- Water temperature and dissolved oxygen were measured at regular intervals to ensure that oxygen saturation was maintained at 90% or more.
- the dead individuals were collected at regular intervals from the time of the first death, and the size, weight, and external symptoms were checked, and the tail fins were collected and stored frozen.
- Genomic DNA was extracted from 50 mg of the caudal fin of the experimental fish using the QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit (Qiagen, Germany).
- a microarray was performed on 763 samples that passed gDNA quality control (QC) using a 70K SNP chip designed and manufactured for halibut in Example 1.
- the average total length of 769 experimental fish was 25.42 ⁇ 1.63 cm, the average width was 8.84 ⁇ 0.65 cm, and the average body weight was 159.1 ⁇ 29.9 g.
- the water temperature at which the first death occurred after the temperature increase was 30.7 ° C, and the water temperature was raised and maintained from 30.7 ° C to a maximum of 32.7 ° C for 4 days from the first death.
- the water temperature was lowered from dawn on the 4th day after the first death, and the surviving individuals were classified as survivors.
- the total number of dead fish was 538, which was calculated as a cumulative mortality rate of 69.96%, and the number of surviving fish was confirmed as 231 (Table 2).
- the survival analysis according to high temperature exposure was 1) survival (survival), 2) number of survival days (DPC_Day), which is how many days have elapsed since the first death, and 3) survival time (DPC_Time, which is how many hours have passed since the first death) ), the score was given and applied to the analysis.
- GWAS Genome-Wide Association Study
- the heritability ( h 2 ) according to survival was estimated to be 0.620, and specific SNPs related thereto were identified on chromosomes 18 and 19.
- the heritability according to DPC_Day was estimated to be 0.753, and specific SNPs related thereto were identified on chromosomes 18 and 19, similar to the results of survival GWAS.
- SNPs were selected for prediction of high temperature resistant individuals, and the nucleotide sequence of the selected SNPs and the genes related to each SNP were selected. Information is as shown in Table 6.
- the 30 SNPs were determined as high temperature resistant genotypes based on the following analysis results.
- Table 7 and FIGS. 3 to 32 show information on each SNP associated with high temperature resistance and average and standard deviation of survival days and survival time for each genotype and graphs.
- the number of survival days (DPC_Day) was assigned a value of 1 to 8 as many as the number of survival days for each individual, and the survival time (DPC_Time) was the date of occurrence of the first dead individual after converting the death date of each individual into a serial number using Excel. 1 was performed.
- DPC_Day The number of survival days (DPC_Day) was assigned a value of 1 to 8 as many as the number of survival days for each individual
- the survival time (DPC_Time) was the date of occurrence of the first dead individual after converting the death date of each individual into a serial number using Excel. 1 was performed.
- the survival and genotype of each individual the number of surviving or dead individuals for each genotype was confirmed, and based on this, it was shown in
- G. (215) mean ⁇ standard deviation number of days to live 6.71 ⁇ 2.36 3.85 ⁇ 2.63 2.18 ⁇ 1.84 survival time 10.38 ⁇ 4.42 5.14 ⁇ 4.72 2.60 ⁇ 2.98 14 19 4476416 AX-419310954 C Variation (Number of Populations) CC (139) CT (376) TT (207) mean ⁇ standard deviation number of days to live 6.61 ⁇ 2.42 4.03 ⁇ 2.68 2.05 ⁇ 1.71 survival time 10.18 ⁇ 4.53 5.44 ⁇ 4.83 2.44 ⁇ 2.76 15 19 4230401 AX-419194853 G Variation (Number of Populations) AA (27) AG (334) G. G.
- G. (39) mean ⁇ standard deviation number of days to live 4.97 ⁇ 2.88 3.02 ⁇ 2.46 2.03 ⁇ 1.77 survival time 7.18 ⁇ 5.25 3.91 ⁇ 4.21 2.37 ⁇ 2.83 21 18 11576382 AX-419304244 T Variation (Number of Populations) G. G.
- G. (282) mean ⁇ standard deviation number of days to live 2.68 ⁇ 2.30 3.04 ⁇ 2.45 5.45 ⁇ 2.81 survival time 3.43 ⁇ 3.91 3.92 ⁇ 4.20 8.02 ⁇ 5.19 30 19 4781952 AX-419194922 T Variation (Number of Populations)
- G. G. (334) TG (338) TT (48) mean ⁇ standard deviation number of days to live 2.42 ⁇ 2.03 5.09 ⁇ 2.80 6.42 ⁇ 2.53 survival time 2.94 ⁇ 3.33 7.34 ⁇ 5.20 9.80 ⁇ 4.75
- Table 8 shows the heritability estimated from the GWAS analysis for high temperature tolerance through genetic parameter analysis.
- Heritability associated with high temperature tolerance phenotypic trait heritability Heritability ( h 2 ) P-value Significant to select major related chromosomes Survival 0.620 8.47 x 10 -7 Significant 18 and 19 Days to surviveDPC_Day 0.753 8.47 x 10 -7 Significant 18 and 19 survival timeDPC_Time 0.710 8.47 x 10 -7 Significant 18 and 19
- the single nucleotide polymorphism (SNP) marker composition for predicting high temperature resistance can induce the development and continuous production of high temperature resistant varieties, which can be of great help to flounder farming.
Landscapes
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Abstract
The present disclosure relates to a SNP marker composition for predicting high water temperature tolerance of flatfish and a method for predicting high water temperature tolerance of flatfish using same. The SNP marker composition of the present disclosure can be used for genetic selection of flatfish tolerant of high water temperature, and can induce the development and continuous production of high water temperature tolerance varieties.
Description
관련 출원에 대한 상호 참조CROSS REFERENCES TO RELATED APPLICATIONS
본 출원은 2021년 8월 31일에 출원된 한국 특허출원 제2021-0116084호에 대한 우선권 이익을 주장하며, 상기 특허출원의 내용은 그 전문이 본 명세서에 참조로 통합된다.This application claims the benefit of priority to Korean Patent Application No. 2021-0116084 filed on August 31, 2021, the contents of which are incorporated herein by reference in their entirety.
본 개시는 넙치의 고수온 내성(High Water Temperature Tolerance; HWTT) 예측용 SNP 마커 조성물 및 이를 이용한 넙치의 고수온 내성 예측 방법에 관한 것이다.The present disclosure relates to a SNP marker composition for predicting High Water Temperature Tolerance (HWTT) of flounder and a method for predicting high temperature tolerance of flounder using the same.
대한민국의 경우, 양식 넙치는 제주특별자치도와 전라남도에서 대부분 생산하고 있으며 매년 4만톤 이상의 양식 넙치가 생산 및 유통되고 있다. 지하 해수를 사용하는 양식장 외에 자연 해수를 사용하는 육상 양식장 또는 가두리 양식장에서는 해수 온도가 양식 생산의 중요한 변수로 작용하고 있으며 기후변화에 따른 여름철 고수온기가 오래 유지될 수록 양식 넙치에 질병 유발 및 면역력 약화 등 다양한 문제를 야기할 수 있다고 알려져 있다. 이에 고수온기를 견딜 수 있는 새로운 품종이 필요하며 해당 품종을 개발하기 위해서는 고수온 내성 넙치를 선별할 수 있는 방법을 기반으로 하는 유전적 선별육종이 필요하다.In the case of Korea, farmed flounder is mostly produced in Jeju Special Self-Governing Province and Jeollanam-do, and more than 40,000 tons of farmed flounder are produced and distributed annually. In addition to farms using underground seawater, seawater temperature is an important variable in aquaculture production in onland farms or cage farms using natural seawater. It is known that it can cause various problems. Therefore, a new breed that can withstand the high temperature period is needed, and in order to develop the breed, genetic selective breeding based on a method for selecting high temperature resistant halibut is required.
[선행기술문헌][Prior art literature]
[특허문헌][Patent Literature]
1. 대한민국 등록특허 제10-2080120호1. Republic of Korea Patent No. 10-2080120
본 개시의 목적은 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커 조성물, 이를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는 조성물, 상기 조성물을 포함하는 넙치의 고수온 내성 예측용 키트 및 넙치의 고수온 내성 예측 방법을 제공하는 것이다.An object of the present disclosure is to provide a SNP marker composition for predicting high temperature resistance of flounder, a composition comprising an agent capable of detecting or amplifying it, a kit for predicting high temperature resistance of flounder including the composition, and a method for predicting high temperature resistance of flounder will be.
상기 목적을 달성하기 위하여, 본 개시는 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 및 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 그룹에서 선택되는 1종 이상을 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP(Single nucleotide polymorphism) 마커 조성물을 제공한다.In order to achieve the above object, the present disclosure provides that the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is G or A, and the polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base. or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, wherein the 36th base is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C or A, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7, wherein the 36th base is T or G, and 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10, wherein the 36th base of the polynucleotide is G or A, and is composed of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21, wherein the 36th base is G or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23, wherein the 36th base is C or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; and SEQ ID NO: 36 base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of 30 is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36 base, or a group consisting of a polynucleotide complementary thereto. Provides a SNP (Single nucleotide polymorphism) marker composition for predicting high temperature resistance of flatfish, including one or more selected from.
상기 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A인 경우; 상기 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 또는 상기 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우, 고수온 내성 넙치인 것으로 예측할 수 있다.When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29 is G; Alternatively, when the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 is T, it can be predicted that the flounder is resistant to high temperatures.
또한, 본 개시는 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 조성물로서, 상기 SNP 마커는 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 및 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 그룹에서 선택되는 1종 이상을 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 조성물을 제공한다.In addition, the present disclosure is a composition for predicting high temperature resistance of flounder, including an agent capable of detecting or amplifying a SNP marker for predicting high temperature resistance of flounder, wherein the SNP marker is a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 The 36th base of is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, wherein the 36th base is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C or A, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7, wherein the 36th base is T or G, and 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10, wherein the 36th base of the polynucleotide is G or A, and is composed of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21, wherein the 36th base is G or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23, wherein the 36th base is C or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; and SEQ ID NO: 36 base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of 30 is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36 base, or a group consisting of a polynucleotide complementary thereto. Provides a composition for predicting high temperature resistance of flatfish, including at least one selected from.
상기 제제는 상기 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 프라이머 또는 프로브일 수 있다.The agent may be a primer or probe capable of detecting or amplifying the SNP marker.
또한, 본 개시는 상기 넙치의 고수온 내성 예측용 조성물을 포함하는 넙치의 고수온 내성 예측용 키트를 제공한다.In addition, the present disclosure provides a kit for predicting high-temperature resistance of flatfish, including the composition for predicting high-temperature resistance of flounder.
또한, 본 개시는 (a) 넙치로부터 분리된 시료의 DNA로부터 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커의 다형성 부위를 증폭하거나 검출하는 단계; 및 (b) 상기 (a) 단계에서 증폭 또는 검출된 다형성 부위의 염기를 결정하는 단계를 포함하며, 상기 (a)단계의 SNP 마커는, 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 및 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 그룹에서 선택되는 1종 이상을 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측 방법을 제공한다.In addition, the present disclosure provides (a) amplifying or detecting a polymorphic site of a SNP marker for predicting high temperature resistance of flounder from DNA of a sample isolated from flounder; and (b) determining the base of the polymorphic site amplified or detected in step (a), wherein the SNP marker in step (a) is 36 nucleotides of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1. a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base is G or A, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, wherein the 36th base is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C or A, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7, wherein the 36th base is T or G, and 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10, wherein the 36th base of the polynucleotide is G or A, and is composed of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21, wherein the 36th base is G or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23, wherein the 36th base is C or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; and SEQ ID NO: 36 base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of 30 is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36 base, or a group consisting of a polynucleotide complementary thereto. Provides a method for predicting high temperature resistance of flatfish, including one or more selected from.
상기 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A인 경우; 상기 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 또는 상기 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우, 고수온 내성 넙치인 것으로 예측할 수 있다.When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29 is G; Alternatively, when the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 is T, it can be predicted that the flounder is resistant to high temperatures.
또한, 본 개시는 넙치의 고수온 내성 예측용 키트; 및 넙치의 고수온 내성 예측 방법에 있어서, 전술한 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커 조성물의 용도를 제공한다.In addition, the present disclosure is a kit for predicting high temperature tolerance of halibut; And in a method for predicting high-temperature tolerance of flatfish, it provides the use of the above-described SNP marker composition for predicting high-temperature tolerance of flatfish.
본 개시의 SNP 마커 조성물은 고수온 내성을 가진 넙치의 유전적 선별(genomic selection)에 활용할 수 있다.The SNP marker composition of the present disclosure can be used for genetic selection of halibut with high temperature tolerance.
도 1은 고수온 내성 실험의 수온변화에 따른 누적폐사율을 그래프로 나타낸 것이다.Figure 1 is a graph showing the cumulative mortality according to the water temperature change in the high temperature tolerance experiment.
도 2는 고수온 내성에 대한 유형별(생존 여부, 생존 일수, 생존 시간) GWAS 분석을 나타낸 것이다.Figure 2 shows the GWAS analysis by type (survival status, survival days, survival time) for high temperature tolerance.
도 3 내지 도 32는 고수온 내성 예측에 대한 30개 SNP의 유전자형에 대한 표현형 분포를 나타내는 것이다. 3 to 32 show the phenotypic distribution of genotypes of 30 SNPs for prediction of high temperature tolerance.
본 발명자들은 “넙치의 바이러스성 출혈성 패혈증 바이러스 저항성 예측용 SNP 마커”에 대하여 특허를 출원한 바 있으며(한국등록특허 제10-2281658호), 상기 등록특허에 기재된 내용들은 모두 본 개시에서 참고가 될 수 있다.The present inventors have applied for a patent for "SNP marker for predicting viral hemorrhagic sepsis virus resistance in halibut" (Korean Patent Registration No. 10-2281658), and all the contents described in the registered patent will be referenced in the present disclosure. can
본 개시는 고수온 노출 실험에서 선발된 개체들을 대상으로 넙치용 70K SNP 칩을 활용한 유전형질 분석 및 전장유전체 연관성 분석(genome-wide association study, GWAS)을 통해 고수온 내성을 예측할 수 있는 단일염기다형성(SNP)을 확인하였다.The present disclosure is a single nucleotide polymorphism that can predict high-temperature tolerance through genotypic analysis and genome-wide association study (GWAS) using a 70K SNP chip for halibut for individuals selected from high-temperature exposure experiments ( SNP) was confirmed.
본 개시는 일 관점에서, 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커 조성물에 관한 것이다.In one aspect, the present disclosure relates to a SNP marker composition for predicting high temperature tolerance of halibut.
구체적으로, 본 개시는 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 및 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 그룹에서 선택되는 1종 이상을 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커 조성물을 제공한다.Specifically, the present disclosure discloses that the 36th base of a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto polynucleotide; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, wherein the 36th base is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C or A, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7, wherein the 36th base is T or G, and 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10, wherein the 36th base of the polynucleotide is G or A, and is composed of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21, wherein the 36th base is G or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23, wherein the 36th base is C or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; and SEQ ID NO: 36 base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of 30 is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36 base, or a group consisting of a polynucleotide complementary thereto. It provides a SNP marker composition for predicting high temperature resistance of flatfish, including one or more selected from.
본 개시의 용어, "고수온 내성"은 수온 상승에 견디는 성질을 의미하며, 구체적으로 29.0℃에서 최대 33.7℃ 고수온이 지속될 경우 수온 쇼크, 면역력 약화, 생리기능 저하 등으로 인한 성장 둔화 또는 질병 발생에 내성을 가지는 것을 의미한다. As used herein, the term "high water temperature resistance" refers to the property of enduring an increase in water temperature, and specifically, when a high water temperature of 29.0 ° C to a maximum of 33.7 ° C is maintained, resistance to growth slowdown or disease occurrence due to water temperature shock, weakening of immunity, decline in physiological function, etc. means to have
본 개시의 용어 "SNP 마커"란, 개체 또는 종을 식별하기 위해 이용되는 DNA 서열 상의 단일 염기 다형성 대립유전자 염기쌍을 의미한다. SNP는 비교적 그 빈도가 높고 안정하며 유전체 전체에 분포되어 있고 이에 의하여 개체의 유전적 다양성이 발생하므로, SNP 마커는 개체 간의 유전적 근접성을 알려주는 지표의 역할을 할 수 있다. SNP 마커는 일반적으로 단일 염기 다형성에 수반되는 표현형의 변화를 포함하지만 경우에 따라 그렇지 않을 수도 있다. 본 개시의 SNP 마커의 경우 아미노산 서열의 변이 또는 넙치의 고수온 내성과 같은 개체의 표현형의 차이를 나타낼 수 있다.The term "SNP marker" in the present disclosure refers to a single base polymorphic allele base pair on a DNA sequence used to identify an individual or species. Since SNPs have a relatively high frequency, are stable, and are distributed throughout the genome, resulting in genetic diversity of individuals, SNP markers can serve as indicators of genetic proximity between individuals. SNP markers usually include phenotypic changes accompanying single nucleotide polymorphisms, but may not in some cases. In the case of the SNP marker of the present disclosure, it may represent a difference in phenotype of an individual such as amino acid sequence variation or high temperature tolerance of halibut.
본 개시의 용어 "개체"란, 고수온 내성을 확인하고자 하는 대상인 넙치(광어)를 의미하며, 상기 넙치(광어)로부터 얻어진 검체를 이용하여, 상기 SNP 마커의 유전자형을 분석함으로써 상기 고수온 내성이 있는 넙치(광어)를 판별할 수 있다. The term "individual" of the present disclosure means a halibut (flatfish), which is a target for confirming high-temperature resistance, and by analyzing the genotype of the SNP marker using a sample obtained from the flounder (flatfish), the high-temperature resistant flatfish (flatfish) can be identified.
본 개시의 일 실시예에 의하면, 고수온 내성 예측 SNP를 선발하기 위해, 넙치 어미세대의 전장유전체 시퀀싱 (whole genome re-sequencing)으로 어미유전체의 SNP를 탐색한 후 제작된 70K SNP 칩을 활용하여. 고수온 노출 실험에서 선발된 개체에 대하여 고수온 내성과 연관된 SNP로 범위를 좁혀 탐색을 진행하였다. 그 결과, 18 및 19번 염색체에서 고수온 내성과 관련성이 높은 유효한 SNP를 발견하였다. 상기 SNP의 유전자형에 대한 표현형 분포를 분석하여 30개의 SNP 정보를 확정하였고, 본 개시의 SNP 마커의 신뢰성 및 정확성을 확인하여 넙치의 고수온 내성을 예측할 수 있음을 확인하였다.According to an embodiment of the present disclosure, in order to select high-temperature resistance prediction SNPs, a 70K SNP chip prepared after searching for SNPs in the mother genome by whole genome re-sequencing of the flounder mother generation was used. For the individuals selected from the high temperature exposure experiment, the search was conducted by narrowing the scope to SNPs associated with high temperature tolerance. As a result, effective SNPs highly related to high temperature tolerance were found on chromosomes 18 and 19. The phenotypic distribution of the genotypes of the SNPs was analyzed to determine 30 SNP information, and the reliability and accuracy of the SNP markers of the present disclosure were confirmed to confirm that high-temperature tolerance of flounder could be predicted.
따라서, 본 개시의 서열번호: 1의 염기서열을 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드 내지 서열번호: 30의 염기서열을 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오티드로 이루어진 그룹에서 선택되는 1종 이상을 포함하는 넙치는 고수온 내성 형질을 나타낼 수 있음을 시사하며, 이러한 염기서열은 본 발명자들에 의하여 최초로 규명되었다.Therefore, a polynucleotide consisting of 10 to 100 contiguous bases comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 of the present disclosure or a polynucleotide complementary thereto to 10 to 100 contiguous bases comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 It suggests that halibut containing at least one selected from the group consisting of a polynucleotide consisting of or a polynucleotide complementary thereto may exhibit high-temperature resistance traits, and such a base sequence was identified for the first time by the present inventors.
바람직하게는 상기 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A인 경우; 상기 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 또는 상기 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우, 고수온 내성 넙치인 것으로 예측할 수 있다.Preferably, when the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29 is G; Alternatively, when the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 is T, it can be predicted that the flounder is resistant to high temperatures.
본 개시는 다른 관점에서, 상기 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 조성물을 제공한다.In another aspect, the present disclosure provides a composition for predicting high-temperature tolerance of flounder, including an agent capable of detecting or amplifying a SNP marker for predicting high-temperature resistance of flounder.
본 개시의 용어 "SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제"란, 상기와 같은 유전자의 다형성 부위를 검출 또는 증폭을 통해 확인하여 고수온 내성 넙치를 예측할 수 있는 조성물을 의미하며, 바람직하게는 상기 SNP 마커의 폴리뉴클레오티드를 특이적으로 검출 또는 증폭할 수 있는 프라이머 세트 또는 프로브를 의미한다. The term "agent capable of detecting or amplifying a SNP marker" of the present disclosure refers to a composition capable of predicting high-temperature resistant flounder by confirming the polymorphic region of the gene as described above through detection or amplification, preferably the SNP A primer set or probe capable of specifically detecting or amplifying a polynucleotide of a marker.
상기 SNP 마커 증폭에 사용되는 프라이머는, 적절한 버퍼 중의 적절한 조건(예를 들면, 4개의 다른 뉴클레오시드 트리포스페이트 및 DNA, RNA 폴리머라제 또는 역전사 효소와 같은 중합제) 및 적당한 온도 하에서 주형-지시 DNA 합성의 시작점으로서 작용할 수 있는 단일가닥 올리고폴리뉴클레오티드가 될 수 있는데, 상기 프라이머의 적절한 길이는 사용 목적에 따라 달라질 수 있으나, 통상 15 내지 30 폴리뉴클레오티드다. 짧은 프라이머 분자는 일반적으로 주형과 안정한 혼성체를 형성하기 위해서는 더 낮은 온도를 필요로 한다. 상기 프라이머 서열은 상기 SNP 마커와 완전하게 상보적일 필요는 없으나, 상기 SNP 마커와 혼성화 할 정도로 충분히 상보적이어야 한다.The primers used to amplify the SNP markers are prepared in the form of template-directed DNA under suitable conditions (eg, four different nucleoside triphosphates and a polymerizing agent such as DNA, RNA polymerase or reverse transcriptase) in an appropriate buffer and at an appropriate temperature. It can be a single-stranded oligopolynucleotide that can serve as a starting point for synthesis. The appropriate length of the primer may vary depending on the purpose of use, but is usually 15 to 30 polynucleotides. Short primer molecules generally require lower temperatures to form stable hybrids with the template. The primer sequence need not be perfectly complementary to the SNP marker, but must be sufficiently complementary to hybridize with the SNP marker.
본 개시의 용어 "프라이머"란, 짧은 자유 3' 말단 수산화기(free 3' hydroxyl group)를 가지는 염기 서열로 상보적인 템플레이트(template)와 염기쌍(base pair)을 형성할 수 있고 주형 가닥 복사를 위한 시작 지점으로 기능을 하는 짧은 서열을 의미하며, 주로 특정 구간을 증폭하는 프라이머 세트의 형태로 사용된다. 프라이머는 적절한 완충용액 및 온도에서 중합반응(즉, DNA 폴리머레이즈 또는 역전사효소)을 위한 시약 및 상이한 4가지 뉴클레오사이드 트리포스페이트의 존재하에서 DNA 합성을 개시할 수 있다. 이때, PCR 조건, 센스 및 안티센스 프라이머의 길이는 당업계에 공지된 것을 기초로 변형할 수 있다. The term "primer" in the present disclosure is a base sequence having a short free 3' terminal hydroxyl group, capable of forming a base pair with a complementary template, and starting for copying the template strand. It refers to a short sequence that functions as a point, and is mainly used in the form of a primer set that amplifies a specific section. A primer can initiate DNA synthesis in the presence of a reagent for polymerization (i.e., DNA polymerase or reverse transcriptase) and four different nucleoside triphosphates in an appropriate buffer and temperature. At this time, PCR conditions and lengths of sense and antisense primers may be modified based on those known in the art.
본 개시의 용어, "프로브"는 다양한 길이의 DNA 또는 RNA 염기서열로 방사성 표지 또는 형광 표지 등을 통해 표지되어 있으며, 단일가닥의 염기서열로 구성되어 상보적인 서열을 가진 단일가닥 DNA 또는 RNA에 특이적으로 결합하여 혼성화하는 것이 특징이며, 혼성화한 프로브의 표지 신호를 탐지하는 방식을 통해 타겟을 검출할 수 있다.As used herein, the term "probe" is DNA or RNA nucleotide sequences of various lengths labeled with radioactive or fluorescent labels, and is composed of single-stranded nucleotide sequences and is specific for single-stranded DNA or RNA having complementary sequences. It is characterized in that it binds and hybridizes with the target, and the target can be detected through a method of detecting the label signal of the hybridized probe.
본 개시의 프라이머 또는 프로브는 포스포아미다이트 고체 지지체 방법, 또는 기타 널리 공지된 방법을 사용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 이러한 핵산 서열은 또한 당해 분야에 공지된 많은 수단을 이용하여 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 비-제한적인 예로는 메틸화, 캡화, 천연 뉴클레오타이드 하나 이상의 동족체로의 치환, 및 뉴클레오타이드 간의 변형, 예를 들면, 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스테르, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로티오에이트, 포스포로디티오에이트 등)로의 변형이 있다.The primers or probes of this disclosure can be chemically synthesized using the phosphoramidite solid support method, or other well-known methods. Such nucleic acid sequences can also be modified using a number of means known in the art. Non-limiting examples of such modifications include methylation, capping, substitution of one or more homologs of a natural nucleotide, and modifications between nucleotides, such as uncharged linkages such as methyl phosphonates, phosphotriesters, phosphoro amidates, carbamates, etc.) or to charged linkages (eg phosphorothioates, phosphorodithioates, etc.).
본 개시는 또 다른 관점에서, 상기 넙치의 고수온 내성 예측용 조성물을 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 키트를 제공한다.In another aspect, the present disclosure provides a kit for predicting high temperature resistance of flounder, including the composition for predicting high temperature resistance of flounder.
본 개시의 키트는 DNA 칩 키트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 DNA 칩 키트는 넙치의 고수온 내성 예측용 마커인 SNP 마커를 포함하는 폴리뉴클레오티드의 서열 또는 이의 상보적인 염기서열을 포함하는 올리고폴리뉴클레오티드가 부착된 칩을 이용하여 특이적으로 타겟 DNA와 혼성화하여 결합하는 것을 특징으로 하며, SNP의 염기 변이에 따라 혼성화 수준의 변화가 나타나는 것을 이용하여 고수온 내성 넙치를 예측할 수 있다. 구체적으로, 본 개시에서 제공하는 넙치의 고수온 내성 예측용 DNA 칩 키트는 서열번호: 1의 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드 내지 서열번호: 30의 염기서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드로 구성되는 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 염기로 구성되는 폴리뉴클레오티드와 상보적인 올리고폴리뉴클레오티드를 표지자와 함께 칩에 부착하고 타겟 DNA를 칩에 반응시켜 혼성화 수준을 통해 유전자형을 판단하는 키트인 것인, 넙치의 고수온 내성 예측용 키트일 수 있다.The kit of the present disclosure may be a DNA chip kit, but is not limited thereto. The DNA chip kit uses a chip attached with a polynucleotide sequence containing a SNP marker, which is a marker for predicting high temperature resistance of flounder, or an oligopolynucleotide containing a complementary nucleotide sequence thereof, to specifically hybridize and bind to target DNA Characterized in that, it is possible to predict high-temperature tolerant halibut using the change in hybridization level according to the base variation of the SNP. Specifically, the DNA chip kit for predicting high temperature resistance of flounder provided by the present disclosure is selected from the group consisting of a polynucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 to a polynucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 At least one polynucleotide or a polynucleotide consisting of 10 to 100 bases including its 36th base and an oligopolynucleotide complementary to a marker are attached to a chip, and target DNA is reacted with the chip to determine the genotype through hybridization. It may be a kit for predicting high temperature tolerance of halibut, which is a kit for determining.
본 개시는 또 다른 관점에서, (a) 넙치 시료의 DNA로부터 제1항의 고수온 내성 예측용 SNP 마커의 다형성 부위를 증폭하거나 검출하는 단계; 및 (b) 상기 (a) 단계의 증폭 또는 검출된 다형성 부위의 염기를 결정하는 단계를 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측 방법을 제공한다. In another aspect of the present disclosure, (a) amplifying or detecting a polymorphic site of the SNP marker for predicting high temperature resistance of claim 1 from the DNA of a flounder sample; and (b) determining the base of the polymorphic site amplified or detected in step (a).
상기 (a) 단계의 DNA 시료로부터 폴리뉴클레오티드를 증폭하는 단계는 당업자에게 알려진 어떠한 방법이든 사용 가능하다. 예를 들면, 표적 핵산을 PCR을 통하여 증폭하고 이를 정제하여 얻을 수 있다. 그 외 리가아제 연쇄 반응(LCR), 전사증폭(transcription amplification) 및 자가유지 서열 복제 및 핵산에 근거한 서열 증폭(NASBA)이 사용될 수 있다.Any method known to those skilled in the art may be used for amplifying the polynucleotide from the DNA sample in step (a). For example, it can be obtained by amplifying a target nucleic acid through PCR and purifying it. Other techniques such as ligase chain reaction (LCR), transcription amplification, and self-maintained sequence replication and nucleic acid-based sequence amplification (NASBA) may be used.
상기 (a) 단계는 프라이머 또는 프로브를 이용하여 염기를 증폭 또는 검출하는 것일 수 있다.Step (a) may be amplifying or detecting a base using a primer or a probe.
상기 방법 중 (b) 단계의 증폭된 SNP 마커 부위의 염기를 결정하는 방법은 시퀀싱 분석, 마이크로어레이(microarray)에 의한 혼성화, 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 다이나믹 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization, DASH), PCR 연장 분석, PCR-SSCP, PCR-RFLP 분석, HRM 분석 또는 TaqMan 기법, SNPlex 플랫폼(Applied Biosystems), 질량 분석법(예를 들면, Sequenom의 MassARRAY 시스템), 미니-시퀀싱(mini-sequencing) 방법, Bio-Plex 시스템(BioRad), CEQ and SNPstream 시스템(Beckman), Molecular Inversion Probe 어레이 기술(예를 들면, Affymetrix GeneChip), 및 BeadArray Technologies(예를 들면, Illumina GoldenGate 및 Infinium 분석법) 등을 이용하여 수행될 수 있으나, 특별히 이에 제한되지는 않는다. 상기 방법들 또는 본 개시가 속하는 기술분야의 당업자에게 이용 가능한 다른 방법에 의해, 상기 SNP 마커에서 하나 이상의 대립유전자를 확인할 수 있다.Among the above methods, the method for determining the base of the amplified SNP marker region in step (b) includes sequencing analysis, microarray hybridization, allele specific PCR, and dynamic allele hybridization technique. allele-specific hybridization (DASH), PCR extension analysis, PCR-SSCP, PCR-RFLP analysis, HRM analysis or TaqMan techniques, SNPlex platform (Applied Biosystems), mass spectrometry (eg Sequenom's MassARRAY system), mini-sequencing (mini-sequencing) methods, Bio-Plex systems (BioRad), CEQ and SNPstream systems (Beckman), Molecular Inversion Probe array technology (eg, Affymetrix GeneChip), and BeadArray Technologies (eg, Illumina GoldenGate and Infinium assays). ), etc., but is not particularly limited thereto. One or more alleles in the SNP marker can be identified by the above methods or other methods available to those skilled in the art.
이하, 본 개시의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 개시를 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 하기 실시예에 의해 본 개시의 내용이 한정되는 것은 아니다. Hereinafter, preferred embodiments are presented to aid understanding of the present disclosure. However, the following examples are only provided to more easily understand the present disclosure, and the content of the present disclosure is not limited by the following examples.
실시예 1 : 넙치용 고밀도 SNP 70K 칩 Example 1: High-density SNP 70K chip for halibut
1-1. 분석용 어미 선발 및 고밀도 SNP 확보1-1. Parent selection for analysis and high-density SNP acquisition
준비된 넙치집단 1,291마리로부터 11개의 초위성체 마커(microsatellite,MS) 좌위(loci)의 대립유전자형(allele)과 연관관계 분석 결과를 기반으로 선발한 개체를 genomic DNA에 대한 QC 결과와 집단, 교배여부, 성별 등을 고려하여 whole genome re-sequencing 분석용으로 넙치 집단에서 100마리를 최종적으로 선별하였다.Individuals selected from 1,291 flounder populations prepared based on the allele and correlation analysis results of 11 microsatellite (MS) loci loci were selected based on QC results for genomic DNA, group, mating status, Considering gender, 100 fish were finally selected from the flounder population for whole genome re-sequencing analysis.
선별된 넙치 100마리의 유전자 분석은 Illumina NovaSeq으로 진행하였고 중국에서 발표한 넙치 전장유전체 서열을 참조서열(reference sequence)로 하여 분석하였다. 도 1에서 나타나는 바와 같이, trimming, read mapping, sorting 등의 단계를 거쳐 각 샘플별로 약 36.69 Gb의 시퀀싱 데이터를 구축하고 개체 별 대용량 변이 정보 중 약 80%의 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism, SNP)를 확인하였다. 변이 정보에 의한 hyper-variable 서열은 4가지 필터링 방법을 거쳐 고품질(high-quality) SNP를 선별하고 SNP 칩을 제작하기 위한 후보 SNP를 다시 선별하였다.Genetic analysis of 100 selected halibut was performed with Illumina NovaSeq, and the whole genome sequence of halibut published in China was analyzed as a reference sequence. As shown in Figure 1, about 36.69 Gb of sequencing data was constructed for each sample through steps such as trimming, read mapping, and sorting, and about 80% of the large-capacity mutation information for each individual was single nucleotide polymorphism (SNP) confirmed. High-quality SNPs were selected for the hyper-variable sequence by mutation information through four filtering methods, and candidate SNPs for constructing the SNP chip were selected again.
1-2. 최종 SNP 선별 및 SNP 칩 제작1-2. Final SNP screening and SNP chip fabrication
고밀도(high-density) SNP 칩을 제작하기 위하여 AxiomTM my DesignTM SNP 칩 (50 내지 90K) 플랫폼을 선정하였다. 도 2에 나타나는 바와 같이, 확보된 고품질 SNP는 중요도에 따라 tier를 구분하여 1) 100마리에 대한 genotype rate, 2) LD block, 3) repeat, 4) MAF 범위에 따른 등급화를 거쳐 SNP 154,964개를 얻었다. 선별된 155K SNP를 기반으로 100마리의 넙치에 대한 집단구조를 분석하였을 때, 앞서 사용한 11개의 MS 마커로 분석한 결과와 유사한 패턴을 보였으며, 이는 수집된 광어 집단이 수집지역(집단)에 따른 특이성이 강한 것으로 추측되며 집단 내 유전적 고정이 높을 것으로 판단된다. 155K SNP에서 호모폴리머 영역 및 대립유전자형인 A/T 또는 C/G인 SNP를 제거한 후 추천(recommendation)으로 분류된 88,065개 중 상기 SNP 칩 (50 내지 90K) 플랫폼을 고려하여 최종적으로 71,364개의 SNP가 선별되었다. 선별된 SNP는 24개 염색체에 골고루 분포하였고 SNP간의 거리도 70%가 5,000 bp 안쪽이며, 대부분 10,000 bp 이하로 확인되었다. 1개의 chip에 SNP 71,364개가 심어지도록 제작하여 총 384 well/plate 형태의 넙치용 70K SNP 칩을 제작하였다.To fabricate a high-density SNP chip, the Axiom TM my Design TM SNP chip (50 to 90K) platform was selected. As shown in Figure 2, the secured high-quality SNPs are classified into tiers according to their importance, and 154,964 SNPs are classified according to 1) genotype rate for 100 animals, 2) LD block, 3) repeat, and 4) MAF range. got When the population structure of 100 halibut was analyzed based on the selected 155K SNPs, a pattern similar to the results of the analysis with the 11 MS markers used previously was found, indicating that the collected flounder population was different according to the collection area (group). It is assumed that the specificity is strong and genetic fixation within the population is judged to be high. Among the 88,065 SNPs classified as recommendations after removing the homopolymer region and the allelic A/T or C/G SNPs from the 155K SNPs, 71,364 SNPs were finally determined considering the SNP chip (50 to 90K) platform. have been selected The selected SNPs were evenly distributed across 24 chromosomes, and 70% of the distances between SNPs were within 5,000 bp, and most of them were identified as less than 10,000 bp. A 70K SNP chip for halibut in the form of a total of 384 wells/plate was manufactured so that 71,364 SNPs were planted in one chip.
실시예 2 : 넙치의 고수온 노출 실험Example 2: Halibut high temperature exposure experiment
2-1. 실험어 준비2-1. Preparation of experimental fish
실험어로 사용한 넙치는 제주특별자치도 해양수산연구원에서 수집된 넙치 어미 집단으로부터 제주대학교 교배지침에 따라 생산한 넙치 집단을 이용하였다. 구체적으로 성성숙 어미후보 354마리(암컷 126마리, 수컷 288마리)로부터 자연산란 및 자연수정을 통해 nF0세대를 대량으로 생산하여 20 내지 30 cm 크기로 사육하고 이 중에서 800마리를 무작위 선별하여, 직경 2.5 m짜리 수조 2개에 수조당 400 마리씩 입식하고 수온 19.4℃에서 3일간 순치시켰다. 이때 수조는 보일러로 수온을 조절할 수 있는 순환여과조 시스템을 사용하였다. 순치 기간 동안 이상 증상을 보이는 개체는 제거하여 고수온 노출 실험에 사용된 개체는 총 769마리이다. 수온 30℃까지는 하루 2회 사료를 급이하였으며 첫 폐사 후에는 급이를 중지하였다.The flounder used as the experimental fish was a flounder group produced according to the breeding guidelines of Jeju National University from a flounder mother group collected at the Jeju Maritime and Fisheries Research Institute. Specifically, the nF0 generation was mass-produced from 354 sexually mature mother candidates (126 females, 288 males) through natural spawning and natural fertilization, and reared to a size of 20 to 30 cm. 400 animals per tank were stocked in 2 m-sized tanks and allowed to acclimate for 3 days at 19.4℃ water temperature. At this time, the water tank used a circulating filter system that can control the water temperature with a boiler. A total of 769 animals were used in the high-temperature exposure experiment by removing objects showing abnormal symptoms during the acclimatization period. Feed was fed twice a day until the water temperature was 30℃, and feeding was stopped after the first death.
수온은 순치 온도부터 30℃까지 하루에 1℃ 가량 상승될 수 있도록 조절하였으며 넙치의 임계온도로 알려진 32.5℃까지는 하루에 0.5℃ 가량 상승될 수 있도록 조절하였다. 일정한 시간마다 수온과 용존 산소를 측정하여 산소포화도가 90% 이상 유지되도록 하였다. 첫 폐사가 일어나는 시점부터 일정 시간 마다 폐사 개체를 수거하여 크기와 무게, 외형적 증상을 확인하였고 꼬리 지느러미를 채취하여 냉동보관 하였다.The water temperature was adjusted so that it could rise by about 1 ° C per day from the temperature of the fish to 30 ° C, and it was adjusted so that it could rise by about 0.5 ° C per day to 32.5 ° C, which is known as the critical temperature of halibut. Water temperature and dissolved oxygen were measured at regular intervals to ensure that oxygen saturation was maintained at 90% or more. The dead individuals were collected at regular intervals from the time of the first death, and the size, weight, and external symptoms were checked, and the tail fins were collected and stored frozen.
2-2. 고수온 내성 비교를 위한 마이크로어레이2-2. Microarray for High Temperature Tolerance Comparison
실험어의 꼬리지느러미 50 mg으로부터 genomic DNA (gDNA)를 QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit(Qiagen, 독일)를 이용하여 추출하였다. 실시예1의 넙치용으로 설계 및 제작한 70K SNP칩을 이용하여 gDNA QC(quality control)를 통과한 763개의 샘플을 대상으로 마이크로어레이(microarray)를 수행하였다. Genomic DNA (gDNA) was extracted from 50 mg of the caudal fin of the experimental fish using the QIAamp 96 DNA QIAcube HT Kit (Qiagen, Germany). A microarray was performed on 763 samples that passed gDNA quality control (QC) using a 70K SNP chip designed and manufactured for halibut in Example 1.
마이크로어레이 원데이터(raw data)는 Axiom Analysis Suite 5.1.1 소프트웨어(Thermo Fisher)로 sample QC를 통과한 726개의 SNP QC를 분석하여 고해상도폴리 등급의 59,128개 SNP data를 추출하였다. For microarray raw data, 726 SNP QCs that passed the sample QC were analyzed with Axiom Analysis Suite 5.1.1 software (Thermo Fisher), and 59,128 SNP data of the high-resolution poly class were extracted.
실시예 3 : 통계분석Example 3: Statistical analysis
3-1. 표현형 데이터 분석3-1. Phenotypic data analysis
표 1에서 보는 바와 같이, 실험어 769마리의 평균 전장(Total length)은 평균 25.42±1.63 cm, 체폭(Width)은 평균 8.84±0.65 cm, 체중(Body weight)은 평균 159.1±29.9 g으로 집계되었다 As shown in Table 1, the average total length of 769 experimental fish was 25.42±1.63 cm, the average width was 8.84±0.65 cm, and the average body weight was 159.1±29.9 g.
| 구분division | 최소값minimum | 제1사분위수1st quartile | 중간값median | 평균average | 제3사분위수3rd quartile | 최고값highest value |
| 전장 (cm)Overall length (cm) | 20.020.0 | 24.424.4 | 25.525.5 | 25.42±1.6325.42±1.63 | 26.526.5 | 29.829.8 |
| 체폭 (cm)body width (cm) | 7.07.0 | 8.48.4 | 8.98.9 | 8.84±0.658.84±0.65 | 9.29.2 | 10.510.5 |
| 체중 (g)weight (g) | 7878 | 140140 | 158158 | 159.1±29.9159.1±29.9 | 178178 | 244244 |
도 1을 참고하면, 수온 상승을 시작하여 첫 폐사가 일어난 수온은 30.7℃이며 첫 폐사부터 4일간 수온은 30.7℃에서 최대 32.7℃로 상승 및 유지되었다. 첫 폐사 이후 4일째 새벽부터 수온을 하강하였고 이 후로 살아남는 개체는 생존어로 분류하였다. 총 폐사개체수는 538마리로 누적폐사율 69.96%로 집계되었고 생존어는 231마리로 확인되었다(표 2). Referring to FIG. 1, the water temperature at which the first death occurred after the temperature increase was 30.7 ° C, and the water temperature was raised and maintained from 30.7 ° C to a maximum of 32.7 ° C for 4 days from the first death. The water temperature was lowered from dawn on the 4th day after the first death, and the surviving individuals were classified as survivors. The total number of dead fish was 538, which was calculated as a cumulative mortality rate of 69.96%, and the number of surviving fish was confirmed as 231 (Table 2).
| 첫폐사후일수Number of days after first lung death | 수온 변화 범위Water temperature change range | 폐사개체수dead population |
누적 폐사개체수accumulate dead population |
생존개체수number of survivors | 누적폐사율cumulative mortality |
| 순치(3일) ~수온상승기간(12일)Sunchi (3 days) ~ water temperature rise period (12 days) |
19.4℃ 내지 30.7℃19.4°C to 30.7° |
00 | 00 | 769769 | 0%0% |
| D+1D+1 |
30.7℃ 내지 30.9℃30.7°C to 30.9° |
158158 | 158158 | 611611 | 20.55%20.55% |
| D+2D+2 | 30.8℃ 내지 32.2℃30.8°C to 32.2°C | 251251 | 409409 | 360360 | 53.19%53.19% |
| D+3D+3 | 32.2℃ 내지 32.6℃32.2°C to 32.6°C | 8888 | 497497 | 272272 | 64.63%64.63% |
| D+4D+4 |
32.6℃ 내지 31.2℃32.6°C to 31.2° |
3434 | 531531 | 238238 | 69.05%69.05% |
| D+5D+5 | 19.7℃19.7℃ | 44 | 535535 | 234234 | 69.57%69.57% |
| D+9D+9 | 19.9℃19.9℃ | 22 | 537537 | 232232 | 69.83%69.83% |
| D+10D+10 | 19.9℃19.9℃ | 1One | 538538 | 231231 | 69.96%69.96% |
| D+13D+13 | 19.9℃19.9℃ | 00 | 538538 | 231231 | 69.96%69.96% |
| 합계Sum | 538538 | 231231 | 69.96%69.96% | ||
고수온 노출에 따른 생존 분석은 1) 생존 여부(survival), 2) 첫 폐사를 기준으로 며칠이 경과되었는지의 생존 일수(DPC_Day), 3) 첫 폐사를 기준으로 몇시간이 경과되었는지의 생존 시간(DPC_Time)으로 나누어 점수를 부여하여 분석에 적용하였다.The survival analysis according to high temperature exposure was 1) survival (survival), 2) number of survival days (DPC_Day), which is how many days have elapsed since the first death, and 3) survival time (DPC_Time, which is how many hours have passed since the first death) ), the score was given and applied to the analysis.
3-2. 전장유전체연관분석(GWAS)3-2. Full-length genomic association analysis (GWAS)
각 실험 개체의 유전자형 데이터는 PLINK 1.9 소프트웨어를 통해 Quality control(QC)를 진행하였고, 다음 분석을 위해 SNP 값을 2진(binary) 형태의 bfile 형식으로 전환하였다. 이 후 R 패키지의 가스톤(Gaston)을 사용하여 선형혼합모형(Linear Mixed Model, LMM)을 기반으로 SNP 군집을 추정하였고, 2진 및 양적(quantitative) 형질에 대한 분석을 진행하였다. Quality control (QC) was performed on the genotype data of each experimental subject through PLINK 1.9 software, and SNP values were converted to binary bfile format for the next analysis. Afterwards, the SNP cluster was estimated based on the Linear Mixed Model (LMM) using Gaston of the R package, and analysis of binary and quantitative traits was performed.
표현형질 분산(phenotypic variation)의 비율(proportion)은 다음과 같은 식을 적용하여 추정하였다.The proportion of phenotypic variation was estimated by applying the following equation.
생존 여부에 따른 전장유전체연관분석(Genome-Wide Association Study; GWAS)에 있어서 생존 개체는 1로, 폐사 개체는 0으로 값을 부여하였고, 유의 수준은 본페로니 보정 방법을 이용하여 0.05 / 58,920 = 8.47 x 10-7 으로 진행하였다. 표 3 및 도 2a를 참고하면, 생존 여부에 따른 유전력(heritability, h
2)은 0.620으로 추정되었고 이와 관련된 특이적 SNP이 18 및 19번 염색체에서 확인되었다.In the Genome-Wide Association Study (GWAS) according to survival, surviving individuals were given a value of 1 and dead individuals were given a value of 0, and the significance level was 0.05 / 58,920 = 0.05 using the Bonferroni correction method. It proceeded to 8.47 x 10 -7 . Referring to Table 3 and FIG. 2a, the heritability ( h 2 ) according to survival was estimated to be 0.620, and specific SNPs related thereto were identified on chromosomes 18 and 19.
| 생존 여부에 따른 GWAS 분석에서 확인된 주요 SNP 정보Key SNP information identified in GWAS analysis based on survival | |||||||||||
| ChrChr | PosPos | IdId | A1A1 | A2A2 | freqA2freqA2 | tautau | betabeta | sdsd | pp | PVEPVE | Y (%)Y (%) |
| 1919 | 43443154344315 | AX-419312236AX-419312236 | GG | AA | 0.4860.486 | 1.1411.141 | -4.370-4.370 | 0.3380.338 | 3.49E-383.49E-38 | 0.1870.187 | 0.2500.250 |
| 1919 | 46873134687313 | AX-419197087AX-419197087 | AA | GG | 0.4630.463 | 1.7631.763 | 3.5353.535 | 0.2830.283 | 8.37E-368.37E-36 | 0.1770.177 | 0.2370.237 |
| 1919 | 43303724330372 | AX-419312234AX-419312234 | TT | CC | 0.4900.490 | 0.2210.221 | 4.6574.657 | 0.3740.374 | 1.52E-351.52E-35 | 0.1760.176 | 0.2350.235 |
| 1818 | 1263157812631578 | AX-419305596AX-419305596 | AA | GG | 0.4900.490 | 2.0082.008 | 3.6323.632 | 0.2920.292 | 1.69E-351.69E-35 | 0.1760.176 | 0.2350.235 |
| 1919 | 44611594461159 | AX-419194887AX-419194887 | TT | GG | 0.4590.459 | 1.5141.514 | -3.489-3.489 | 0.2890.289 | 1.22E-331.22E-33 | 0.1680.168 | 0.2240.224 |
| 1919 | 42483584248358 | AX-419194856AX-419194856 | CC | AA | 0.4800.480 | 1.5771.577 | 3.6103.610 | 0.3010.301 | 3.18E-333.18E-33 | 0.1660.166 | 0.2220.222 |
| 1919 | 27521902752190 | AX-419194727AX-419194727 | TT | GG | 0.3960.396 | 1.5831.583 | 2.0612.061 | 0.1770.177 | 1.76E-311.76E-31 | 0.1580.158 | 0.2120.212 |
| 1818 | 1254677812546778 | AX-419238898AX-419238898 | AA | GG | 0.4560.456 | 2.0302.030 | 3.2093.209 | 0.2780.278 | 8.13E-318.13E-31 | 0.1550.155 | 0.2080.208 |
| 1919 | 27936842793684 | AX-419311974AX-419311974 | TT | CC | 0.3220.322 | 2.1112.111 | -3.096-3.096 | 0.2830.283 | 7.29E-287.29E-28 | 0.1420.142 | 0.1900.190 |
| 1919 | 44097084409708 | AX-419310944AX-419310944 | GG | AA | 0.4610.461 | 2.2602.260 | -2.960-2.960 | 0.2710.271 | 9.63E-289.63E-28 | 0.1410.141 | 0.1890.189 |
| 1919 | 43523564352356 | AX-419312238AX-419312238 | TT | CC | 0.3120.312 | 2.1672.167 | 3.0693.069 | 0.2860.286 | 8.01E-278.01E-27 | 0.1370.137 | 0.1830.183 |
| 1919 | 51196035119603 | AX-419197131AX-419197131 | TT | CC | 0.4960.496 | 1.8741.874 | 2.4052.405 | 0.2260.226 | 2.20E-262.20E-26 | 0.1350.135 | 0.1800.180 |
| 1919 | 49958164995816 | AX-419311016AX-419311016 | AA | GG | 0.4550.455 | 2.1322.132 | 2.3722.372 | 0.2310.231 | 9.07E-259.07E-25 | 0.1270.127 | 0.1700.170 |
| 1919 | 44764164476416 | AX-419310954AX-419310954 | CC | TT | 0.4530.453 | 1.8501.850 | 2.2722.272 | 0.2260.226 | 8.43E-248.43E-24 | 0.1220.122 | 0.1640.164 |
| 1919 | 42304014230401 | AX-419194853AX-419194853 | AA | GG | 0.2670.267 | 3.8533.853 | -3.079-3.079 | 0.3100.310 | 3.48E-233.48E-23 | 0.1190.119 | 0.1600.160 |
| 1818 | 1282322412823224 | AX-419236852AX-419236852 | AA | CC | 0.3340.334 | 2.4532.453 | 2.8092.809 | 0.2840.284 | 5.04E-235.04E-23 | 0.1190.119 | 0.1590.159 |
| 1919 | 42613844261384 | AX-419194860AX-419194860 | AA | CC | 0.2880.288 | 2.1892.189 | 2.7162.716 | 0.2760.276 | 8.22E-238.22E-23 | 0.1180.118 | 0.1570.157 |
| 1919 | 41333624133362 | AX-419312202AX-419312202 | TT | CC | 0.3360.336 | 3.4893.489 | -3.063-3.063 | 0.3140.314 | 1.54E-221.54E-22 | 0.1160.116 | 0.1560.156 |
| 1919 | 47312944731294 | AX-419312293AX-419312293 | AA | CC | 0.4770.477 | 2.4442.444 | 2.3032.303 | 0.2370.237 | 2.46E-222.46E-22 | 0.1150.115 | 0.1540.154 |
| 1919 | 45930314593031 | AX-419197072AX-419197072 | GG | AA | 0.2750.275 | 3.9163.916 | -3.246-3.246 | 0.3340.334 | 2.82E-222.82E-22 | 0.1150.115 | 0.1540.154 |
| 1818 | 1157638211576382 | AX-419304244AX-419304244 | GG | TT | 0.4470.447 | 1.9311.931 | -2.241-2.241 | 0.2330.233 | 7.02E-227.02E-22 | 0.1130.113 | 0.1510.151 |
| 1919 | 28227052822705 | AX-419310690AX-419310690 | TT | CC | 0.2730.273 | 3.5123.512 | 2.8232.823 | 0.2950.295 | 9.97E-229.97E-22 | 0.1120.112 | 0.1500.150 |
| 1919 | 26944432694443 | AX-419194721AX-419194721 | CC | AA | 0.3110.311 | 3.2633.263 | -2.734-2.734 | 0.2880.288 | 2.47E-212.47E-21 | 0.1100.110 | 0.1480.148 |
| 1919 | 49973834997383 | AX-419194938AX-419194938 | AA | CC | 0.4170.417 | 2.9902.990 | 2.8892.889 | 0.3070.307 | 5.58E-215.58E-21 | 0.1090.109 | 0.1450.145 |
| 1919 | 43442794344279 | AX-419194866AX-419194866 | TT | CC | 0.3570.357 | 2.6342.634 | -2.457-2.457 | 0.2640.264 | 1.34E-201.34E-20 | 0.1070.107 | 0.1430.143 |
| 1919 | 44822724482272 | AX-419310955AX-419310955 | TT | CC | 0.2460.246 | 3.6353.635 | 2.8302.830 | 0.3050.305 | 1.47E-201.47E-20 | 0.1060.106 | 0.1420.142 |
| 1919 | 68011076801107 | AX-419311218AX-419311218 | TT | CC | 0.3710.371 | 1.4441.444 | 2.0512.051 | 0.2210.221 | 1.53E-201.53E-20 | 0.1060.106 | 0.1420.142 |
| 1818 | 1289038012890380 | AX-419238893AX-419238893 | CC | TT | 0.2600.260 | 3.5833.583 | 2.6502.650 | 0.2860.286 | 2.21E-202.21E-20 | 0.1060.106 | 0.1410.141 |
| 1818 | 1289095612890956 | AX-419305592AX-419305592 | AA | GG | 0.3490.349 | 3.6933.693 | -2.398-2.398 | 0.2610.261 | 4.09E-204.09E-20 | 0.1040.104 | 0.1390.139 |
| 1919 | 47819524781952 | AX-419194922AX-419194922 | TT | GG | 0.3010.301 | 2.1482.148 | 2.2722.272 | 0.2490.249 | 8.60E-208.60E-20 | 0.1030.103 | 0.1370.137 |
|
*Chr = 염색체, Pos = 염색체상의 SNP 위치, ID = SNP ID, A1 = 주요 대립유전자, A2 = 부 대립유전자, freqA2 = 부 대립유전자 빈도, beta = the SNP effect, sd = 표준에러, p = p-value, Y = SNP에 의한 표현형 값의 비율*Chr = chromosome, Pos = SNP location on chromosome, ID = SNP ID, A1 = major allele, A2 = minor allele, freqA2 = minor allele frequency, beta = the SNP effect, sd = standard error, p = p-value, Y = ratio of phenotypic values by SNP |
|||||||||||
생존 일수(DPC_Day)에 따른 GWAS 분석은 각 개체 별로 생존 일수만큼 1 내지 8의 값을 지정하였고, 유의 수준은 본페로니 보정 방법을 이용하여 0.05 / 58,920 = 8.47 x 10-7 으로 진행하였다. 표 4 및 도 2b를 참고하면, DPC_Day에 따른 유전력은 0.753으로 추정되었고 이와 관련된 특이적 SNP이 생존여부 GWAS 결과와 유사하게 18 및 19번 염색체에서 확인되었다.In the GWAS analysis according to the number of days of survival (DPC_Day), a value of 1 to 8 was designated as the number of days of survival for each individual, and the significance level was 0.05 / 58,920 = 8.47 x 10 -7 using the Bonferroni correction method. Referring to Table 4 and FIG. 2b, the heritability according to DPC_Day was estimated to be 0.753, and specific SNPs related thereto were identified on chromosomes 18 and 19, similar to the results of survival GWAS.
| 생존 일수에 따른 GWAS 분석에서 확인된 주요 SNP 정보Key SNP information identified in GWAS analysis by number of days to live | |||||||||||
| ChrChr | PosPos | IDID | A1A1 | A2A2 | freqA2freqA2 | tautau | betabeta | sdsd | pp | PVEPVE | Y (%)Y (%) |
| 1919 | 43303724330372 | AX-419312234AX-419312234 | TT | CC | 0.4900.490 | 0.0390.039 | 3.1743.174 | 0.0940.094 | 1.96E-2471.96E-247 | 0.6090.609 | 0.7930.793 |
| 1919 | 43443154344315 | AX-419312236AX-419312236 | GG | AA | 0.4860.486 | 0.1680.168 | -3.164-3.164 | 0.1090.109 | 1.80E-1861.80E-186 | 0.5390.539 | 0.7020.702 |
| 1818 | 1263157812631578 | AX-419305596AX-419305596 | AA | GG | 0.4900.490 | 0.3560.356 | 2.9212.921 | 0.1270.127 | 1.01E-1161.01E-116 | 0.4210.421 | 0.5480.548 |
| 1919 | 46873134687313 | AX-419197087AX-419197087 | AA | GG | 0.4630.463 | 0.3140.314 | 3.1113.111 | 0.1370.137 | 1.75E-1131.75E-113 | 0.4140.414 | 0.5390.539 |
| 1919 | 42483584248358 | AX-419194856AX-419194856 | CC | AA | 0.4800.480 | 0.3320.332 | 2.9312.931 | 0.1300.130 | 4.23E-1124.23E-112 | 0.4110.411 | 0.5350.535 |
| 1919 | 44611594461159 | AX-419194887AX-419194887 | TT | GG | 0.4590.459 | 0.3770.377 | -3.081-3.081 | 0.1560.156 | 2.29E-862.29E-86 | 0.3480.348 | 0.4540.454 |
| 1818 | 1254677812546778 | AX-419238898AX-419238898 | AA | GG | 0.4560.456 | 0.4240.424 | 2.9712.971 | 0.1570.157 | 1.02E-791.02E-79 | 0.3300.330 | 0.4300.430 |
| 1919 | 27521902752190 | AX-419194727AX-419194727 | TT | GG | 0.3960.396 | 0.4740.474 | 2.0182.018 | 0.1160.116 | 1.03E-671.03E-67 | 0.2940.294 | 0.3830.383 |
| 1919 | 44097084409708 | AX-419310944AX-419310944 | GG | AA | 0.4610.461 | 0.5220.522 | -2.832-2.832 | 0.1740.174 | 2.84E-592.84E-59 | 0.2660.266 | 0.3470.347 |
| 1919 | 42304014230401 | AX-419194853AX-419194853 | AA | GG | 0.2670.267 | 0.6310.631 | -3.058-3.058 | 0.1900.190 | 3.46E-583.46E-58 | 0.2630.263 | 0.3420.342 |
| 1919 | 42941254294125 | AX-419194862AX-419194862 | GG | AA | 0.3240.324 | 0.6440.644 | -2.849-2.849 | 0.1780.178 | 1.64E-571.64E-57 | 0.2600.260 | 0.3390.339 |
| 1919 | 27936842793684 | AX-419311974AX-419311974 | TT | CC | 0.3220.322 | 0.4240.424 | -3.034-3.034 | 0.1940.194 | 3.99E-553.99E-55 | 0.2520.252 | 0.3280.328 |
| 1919 | 43523564352356 | AX-419312238AX-419312238 | TT | CC | 0.3120.312 | 0.4480.448 | 3.0363.036 | 0.1960.196 | 6.29E-546.29E-54 | 0.2480.248 | 0.3230.323 |
| 1919 | 41333624133362 | AX-419312202AX-419312202 | TT | CC | 0.3360.336 | 0.6100.610 | -3.098-3.098 | 0.2020.202 | 5.21E-535.21E-53 | 0.2440.244 | 0.3180.318 |
| 1919 | 45930314593031 | AX-419197072AX-419197072 | GG | AA | 0.2750.275 | 0.6170.617 | -3.117-3.117 | 0.2070.207 | 2.25E-512.25E-51 | 0.2380.238 | 0.3110.311 |
| 1919 | 28227052822705 | AX-419310690AX-419310690 | TT | CC | 0.2730.273 | 0.6240.624 | 2.9192.919 | 0.1990.199 | 1.01E-481.01E-48 | 0.2290.229 | 0.2980.298 |
| 1919 | 51196035119603 | AX-419197131AX-419197131 | TT | CC | 0.4960.496 | 0.5080.508 | 2.4522.452 | 0.1740.174 | 6.46E-456.46E-45 | 0.2140.214 | 0.2790.279 |
| 1919 | 26944432694443 | AX-419194721AX-419194721 | CC | AA | 0.3110.311 | 0.6100.610 | -2.671-2.671 | 0.1910.191 | 1.54E-441.54E-44 | 0.2130.213 | 0.2770.277 |
| 1919 | 44822724482272 | AX-419310955AX-419310955 | TT | CC | 0.2460.246 | 0.6550.655 | 3.1113.111 | 0.2260.226 | 2.71E-432.71E-43 | 0.2080.208 | 0.2710.271 |
| 1818 | 1289038012890380 | AX-419238893AX-419238893 | CC | TT | 0.2600.260 | 0.6430.643 | 2.8312.831 | 0.2060.206 | 5.05E-435.05E-43 | 0.2070.207 | 0.2690.269 |
| 1919 | 49973834997383 | AX-419194938AX-419194938 | AA | CC | 0.4170.417 | 0.5740.574 | 2.8492.849 | 0.2090.209 | 2.97E-422.97E-42 | 0.2040.204 | 0.2650.265 |
| 1919 | 49958164995816 | AX-419311016AX-419311016 | AA | GG | 0.4550.455 | 0.5590.559 | 2.4852.485 | 0.1840.184 | 9.48E-429.48E-42 | 0.2020.202 | 0.2630.263 |
| 1919 | 43013354301335 | AX-419310932AX-419310932 | GG | AA | 0.3510.351 | 0.6770.677 | -2.640-2.640 | 0.1960.196 | 1.90E-411.90E-41 | 0.2000.200 | 0.2610.261 |
| 1818 | 1282322412823224 | AX-419236852AX-419236852 | AA | CC | 0.3340.334 | 0.4900.490 | 2.8762.876 | 0.2130.213 | 2.28E-412.28E-41 | 0.2000.200 | 0.2610.261 |
| 1818 | 1289095612890956 | AX-419305592AX-419305592 | AA | GG | 0.3490.349 | 0.6550.655 | -2.484-2.484 | 0.1840.184 | 2.29E-412.29E-41 | 0.2000.200 | 0.2610.261 |
| 1919 | 44764164476416 | AX-419310954AX-419310954 | CC | TT | 0.4530.453 | 0.5640.564 | 2.3562.356 | 0.1780.178 | 3.62E-403.62E-40 | 0.1950.195 | 0.2540.254 |
| 1919 | 42613844261384 | AX-419194860AX-419194860 | AA | CC | 0.2880.288 | 0.5210.521 | 2.8612.861 | 0.2200.220 | 1.54E-381.54E-38 | 0.1880.188 | 0.2450.245 |
| 1919 | 47312944731294 | AX-419312293AX-419312293 | AA | CC | 0.4770.477 | 0.6010.601 | 2.4492.449 | 0.1910.191 | 1.29E-371.29E-37 | 0.1850.185 | 0.2400.240 |
| 1919 | 49994844999484 | AX-419312322AX-419312322 | GG | TT | 0.3410.341 | 0.6090.609 | 2.9132.913 | 0.2300.230 | 1.08E-361.08E-36 | 0.1810.181 | 0.2350.235 |
| 1919 | 47461514746151 | AX-419194919AX-419194919 | TT | CC | 0.3250.325 | 0.6580.658 | 2.4332.433 | 0.1990.199 | 1.80E-341.80E-34 | 0.1710.171 | 0.2230.223 |
|
*Chr = 염색체, Pos = 염색체상의 SNP 위치, ID = SNP ID, A1 = 주요 대립유전자, A2 = 부 대립유전자, freqA2 = 부 대립유전자 빈도, beta = the SNP effect, sd = 표준에러, p = p-value, Y = SNP에 의한 표현형 값의 비율*Chr = chromosome, Pos = SNP location on chromosome, ID = SNP ID, A1 = major allele, A2 = minor allele, freqA2 = minor allele frequency, beta = the SNP effect, sd = standard error, p = p-value, Y = ratio of phenotypic values by SNP |
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생존 시간(DPC_Time)에 따른 GWAS 분석은 각 개체별 폐사 날짜를 Excel을 이용하여 일련번호로 변환한 후에 첫 번째 폐사 개체 발생일을 1로 두고 실시하였으며, 유의 수준은 본페로니 보정 방법을 이용하여 0.05 / 58,920 = 8.47 x 10-7 으로 진행하였다. 표 5 및 도 2c를 참고하면, 생존 시간에 따른 유전력은 0.710으로 추정되었고 이와 관련된 특이적 SNP이 생존여부 GWAS 결과와 유사하게 18 및 19번 염색체에서 확인되었다.GWAS analysis according to survival time (DPC_Time) was performed by setting the first mortality date to 1 after converting the mortality date of each individual into a serial number using Excel, and the significance level was determined using the Bonferroni correction method. 0.05 / 58,920 = 8.47 x 10 -7 . Referring to Table 5 and FIG. 2c, the heritability according to survival time was estimated to be 0.710, and specific SNPs related thereto were identified on chromosomes 18 and 19, similar to the results of survival GWAS.
| 생존 시간에 따른 GWAS 분석에서 확인된 주요 SNP 정보Key SNP information identified in GWAS analysis by survival time | |||||||||||
| ChrChr | PosPos | IdId | A1A1 | A2A2 | freqA2freqA2 | tautau | betabeta | sdsd | pp | PVEPVE | Y (%)Y (%) |
| 1919 | 43303724330372 | AX-419312234AX-419312234 | TT | CC | 0.4900.490 | 0.0280.028 | 5.3505.350 | 0.1760.176 | 5.32E-2035.32E-203 | 0.5600.560 | 0.7220.722 |
| 1919 | 43443154344315 | AX-419312236AX-419312236 | GG | AA | 0.4860.486 | 0.1490.149 | -5.333-5.333 | 0.2010.201 | 2.35E-1552.35E-155 | 0.4930.493 | 0.6350.635 |
| 1919 | 46873134687313 | AX-419197087AX-419197087 | AA | GG | 0.4630.463 | 0.2760.276 | 5.2635.263 | 0.2470.247 | 1.50E-1001.50E-100 | 0.3840.384 | 0.4950.495 |
| 1818 | 1263157812631578 | AX-419305596AX-419305596 | AA | GG | 0.4900.490 | 0.3160.316 | 4.9134.913 | 0.2320.232 | 1.32E-991.32E-99 | 0.3820.382 | 0.4920.492 |
| 1919 | 42483584248358 | AX-419194856AX-419194856 | CC | AA | 0.4800.480 | 0.2950.295 | 4.9144.914 | 0.2380.238 | 7.26E-957.26E-95 | 0.3700.370 | 0.4770.477 |
| 1919 | 44611594461159 | AX-419194887AX-419194887 | TT | GG | 0.4590.459 | 0.3170.317 | -5.196-5.196 | 0.2790.279 | 1.37E-771.37E-77 | 0.3240.324 | 0.4170.417 |
| 1818 | 1254677812546778 | AX-419238898AX-419238898 | AA | GG | 0.4560.456 | 0.3760.376 | 5.0115.011 | 0.2810.281 | 6.50E-716.50E-71 | 0.3040.304 | 0.3920.392 |
| 1919 | 27521902752190 | AX-419194727AX-419194727 | TT | GG | 0.3960.396 | 0.4230.423 | 3.6213.621 | 0.2060.206 | 6.92E-696.92E-69 | 0.2980.298 | 0.3840.384 |
| 1919 | 44097084409708 | AX-419310944AX-419310944 | GG | AA | 0.4610.461 | 0.4660.466 | -4.747-4.747 | 0.3110.311 | 1.47E-521.47E-52 | 0.2430.243 | 0.3130.313 |
| 1919 | 27936842793684 | AX-419311974AX-419311974 | TT | CC | 0.3220.322 | 0.3750.375 | -5.181-5.181 | 0.3420.342 | 6.90E-526.90E-52 | 0.2400.240 | 0.3100.310 |
| 1919 | 42304014230401 | AX-419194853AX-419194853 | AA | GG | 0.2670.267 | 0.5900.590 | -5.130-5.130 | 0.3450.345 | 5.91E-505.91E-50 | 0.2330.233 | 0.3010.301 |
| 1919 | 42941254294125 | AX-419194862AX-419194862 | GG | AA | 0.3240.324 | 0.6000.600 | -4.788-4.788 | 0.3230.323 | 1.23E-491.23E-49 | 0.2320.232 | 0.2990.299 |
| 1919 | 43523564352356 | AX-419312238AX-419312238 | TT | CC | 0.3120.312 | 0.3960.396 | 5.0915.091 | 0.3470.347 | 1.11E-481.11E-48 | 0.2280.228 | 0.2950.295 |
| 1919 | 41333624133362 | AX-419312202AX-419312202 | TT | CC | 0.3360.336 | 0.5680.568 | -5.230-5.230 | 0.3660.366 | 2.72E-462.72E-46 | 0.2190.219 | 0.2830.283 |
| 1919 | 45930314593031 | AX-419197072AX-419197072 | GG | AA | 0.2750.275 | 0.5820.582 | -5.294-5.294 | 0.3740.374 | 1.75E-451.75E-45 | 0.2160.216 | 0.2790.279 |
| 1919 | 28227052822705 | AX-419310690AX-419310690 | TT | CC | 0.2730.273 | 0.5820.582 | 4.9864.986 | 0.3590.359 | 8.48E-448.48E-44 | 0.2100.210 | 0.2700.270 |
| 1919 | 51196035119603 | AX-419197131AX-419197131 | TT | CC | 0.4960.496 | 0.4520.452 | 4.1544.154 | 0.3080.308 | 1.89E-411.89E-41 | 0.2000.200 | 0.2580.258 |
| 1919 | 26944432694443 | AX-419194721AX-419194721 | CC | AA | 0.3110.311 | 0.5660.566 | -4.609-4.609 | 0.3430.343 | 3.57E-413.57E-41 | 0.1990.199 | 0.2570.257 |
| 1818 | 1289038012890380 | AX-419238893AX-419238893 | CC | TT | 0.2600.260 | 0.6000.600 | 4.8644.864 | 0.3710.371 | 2.95E-392.95E-39 | 0.1910.191 | 0.2470.247 |
| 1919 | 49958164995816 | AX-419311016AX-419311016 | AA | GG | 0.4550.455 | 0.5020.502 | 4.2254.225 | 0.3240.324 | 5.67E-395.67E-39 | 0.1900.190 | 0.2450.245 |
| 1818 | 1282322412823224 | AX-419236852AX-419236852 | AA | CC | 0.3340.334 | 0.4440.444 | 4.8784.878 | 0.3760.376 | 2.05E-382.05E-38 | 0.1880.188 | 0.2420.242 |
| 1919 | 49973834997383 | AX-419194938AX-419194938 | AA | CC | 0.4170.417 | 0.5350.535 | 4.8604.860 | 0.3760.376 | 2.75E-382.75E-38 | 0.1870.187 | 0.2420.242 |
| 1919 | 44822724482272 | AX-419310955AX-419310955 | TT | CC | 0.2460.246 | 0.6110.611 | 5.2415.241 | 0.4060.406 | 4.46E-384.46E-38 | 0.1860.186 | 0.2400.240 |
| 1818 | 1289095612890956 | AX-419305592AX-419305592 | AA | GG | 0.3490.349 | 0.6120.612 | -4.220-4.220 | 0.3320.332 | 5.84E-375.84E-37 | 0.1820.182 | 0.2340.234 |
| 1919 | 44764164476416 | AX-419310954AX-419310954 | CC | TT | 0.4530.453 | 0.4930.493 | 3.9673.967 | 0.3140.314 | 1.27E-361.27E-36 | 0.1800.180 | 0.2330.233 |
| 1919 | 43013354301335 | AX-419310932AX-419310932 | GG | AA | 0.3510.351 | 0.6280.628 | -4.404-4.404 | 0.3530.353 | 9.36E-369.36E-36 | 0.1770.177 | 0.2280.228 |
| 1919 | 42613844261384 | AX-419194860AX-419194860 | AA | CC | 0.2880.288 | 0.4600.460 | 4.7974.797 | 0.3860.386 | 1.91E-351.91E-35 | 0.1750.175 | 0.2260.226 |
| 1919 | 47312944731294 | AX-419312293AX-419312293 | AA | CC | 0.4770.477 | 0.5450.545 | 4.1004.100 | 0.3390.339 | 1.02E-331.02E-33 | 0.1680.168 | 0.2160.216 |
| 1919 | 49994844999484 | AX-419312322AX-419312322 | GG | TT | 0.3410.341 | 0.5720.572 | 4.9814.981 | 0.4120.412 | 1.39E-331.39E-33 | 0.1670.167 | 0.2160.216 |
| 1919 | 47461514746151 | AX-419194919AX-419194919 | TT | CC | 0.3250.325 | 0.6180.618 | 4.1704.170 | 0.3560.356 | 1.12E-311.12E-31 | 0.1590.159 | 0.2050.205 |
|
*Chr = 염색체, Pos = 염색체상의 SNP 위치, ID = SNP ID, A1 = 주요 대립유전자, A2 = 부 대립유전자, freqA2 = 부 대립유전자 빈도, beta = the SNP effect, sd = 표준에러, p = p-value, Y = SNP에 의한 표현형 값의 비율*Chr = chromosome, Pos = SNP location on chromosome, ID = SNP ID, A1 = major allele, A2 = minor allele, freqA2 = minor allele frequency, beta = the SNP effect, sd = standard error, p = p-value, Y = ratio of phenotypic values by SNP |
|||||||||||
3-3. 고수온 내성 예측을 위한 SNP 선별3-3. SNP screening for prediction of high temperature tolerance
상기 생존 여부, 생존 일수, 생존 시간에 따른 GWAS 분석을 통해 확인된 주요 SNP 정보를 바탕으로 고수온 내성 개체 예측을 위한 30개의 SNP을 선별하였고, 선별된 SNP의 염기서열과 각 SNP과 관련된 유전자에 대한 정보는 표 6에 나타난 바와 같다.Based on the main SNP information identified through the GWAS analysis according to survival, survival days, and survival time, 30 SNPs were selected for prediction of high temperature resistant individuals, and the nucleotide sequence of the selected SNPs and the genes related to each SNP were selected. Information is as shown in Table 6.
| 고수온 내성 개체 예측을 위한 SNP 및 이와 관련된 유전자 정보SNPs and genetic information related to them for prediction of high-temperature tolerance individuals | |||||||||
| NoNo | ChrChr | PosPos | IdId | A1A1 | A2A2 | 염기서열base sequence |
고수온내성 유전자형high temperature resistance genotype |
관련 유전자related genes | RegionRegion |
| 1One | 1919 | 43443154344315 | AX-419312236AX-419312236 | GG | AA | GCAGGTTTATTTCTTTGCATATACACACAGTGACT[A/G]AGTTGAGCTCATCGTTAGCGAGGTGGCCTTACCAAGCAGGTTTATTTCTTTGCATATACACACAGTGACT[A/G]AGTTGAGCTCATCGTTAGCGAGGTGGCCTTACCAA | AA | (Upstream) myosin heavy chain, fast skeletal muscle-like(Downstream) NLR family CARD domain containing 5 (nlrc5)(Upstream) myosin heavy chain, fast skeletal muscle-like (Downstream) NLR family CARD domain containing 5 (nlrc5) | IntergenicIntergenic |
| 22 | 1919 | 46873134687313 | AX-419197087AX-419197087 | AA | GG | GGACGGCGCCTGCATGCGTATGGACGTGGAATCAG[A/G]ATCTGCCACCTCTGGTAAACAGTGTATTGTTTGTGGGACGGCGCCTGCATGCGTATGGACGTGGAATCAG[A/G]ATCTGCCACCTCTGGTAAACAGTGTATTGTTTGTG | AA | (Upstream) Unknown(Downstream) Unknown(Upstream) Unknown(Downstream) Unknown | IntergenicIntergenic |
| 33 | 1919 | 43303724330372 | AX-419312234AX-419312234 | TT | CC | TTAGGGGTAATGTTTTCTTCAGACTCAACAAGTAA[C/T]GACTTCAAAACACATATACTTTATAATAAAACACTTTAGGGGTAATGTTTTCTTCAGACTCAACAAGTAA[C/T]GACTTCAAAACACATATACTTTATAATAAAACACT | TT | (Upstream) myosin heavy chain, fast skeletal muscle-like(Downstream) myosin heavy chain, fast skeletal muscle-like(Upstream) myosin heavy chain, fast skeletal muscle-like (Downstream) myosin heavy chain, fast skeletal muscle-like | IntergenicIntergenic |
| 44 | 1818 | 1263157812631578 | AX-419305596AX-419305596 | AA | GG | AATTTAGAGTAAGCCCAGCACCCTCCTAACTCTTC[A/G]ATGACAAGACAACTTCTTTCACCTCCATACAGTAAAATTTAGAGTAAGCCCAGCACCCTCCTAACTCTTC[A/G]ATGACAAGACAACTTCTTTCACCTCCATACAGTAA | AA | (Upstream) glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1(Downstream) Unknown(Upstream) glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1 (Downstream) Unknown | IntergenicIntergenic |
| 55 | 1919 | 44611594461159 | AX-419194887AX-419194887 | TT | GG | TCAAGGTATTGTGTGTAAAACAGTTTGAGCAGTAT[G/T]AGGTCAGACTGCATGAGATCAGACTGCAGTAACTCTCAAGGTATTGTGTGTAAAACAGTTTGAGCAGTAT[G/T]AGGTCAGACTGCATGAGATCAGACTGCAGTAACTC | GG | (Upstream) Unknown(Downstream) Unknown(Upstream) Unknown(Downstream) Unknown | IntergenicIntergenic |
| 66 | 1919 | 42483584248358 | AX-419194856AX-419194856 | CC | AA | AATGCAAGATAATTGCATCCATTTAATTCATATCA[A/C]ATTCTTAACCACATCCTCTTCTCTGCTTCACCACAAATGCAAGATAATTGCATCCATTTAATTCATATCA[A/C]ATTCTTAACCACATCCTCTTCTTCTGCTTCACCACA | CC | HYDIN, axonemal central pair apparatus protein (hydin)HYDIN, axonemal central pair apparatus protein (hydin) | IntronIntron |
| 77 | 1919 | 27521902752190 | AX-419194727AX-419194727 | TT | GG | CACGCCACGATTTAATGGATGACTTGAAAATAATC[G/T]CTCATCAGGAAAGAAAGCCGGAGTCCAACTCAAGCCACGCCACGATTTAATGGATGACTTGAAAATAATC[G/T]CTCATCAGGAAAGAAAGCCGGAGTCCAACTCAAGC | TT | (Upstream) Unknown(Downstream) Unknown(Upstream) Unknown(Downstream) Unknown | IntergenicIntergenic |
| 88 | 1818 | 1254677812546778 | AX-419238898AX-419238898 | AA | GG | GTGTCGCCCCAGATTAGACTCATATGATGAGGTGA[A/G]AGAAACTCCCACTGGATCTGGGAACTCTTTAACTTGTGTCGCCCCAGATTAGACTCATATGATGAGGTGA[A/G]AGAAACTCCCACTGGATCTGGGAACTCTTTAACTT | AA | Rho GTPase activating protein 12 (arhgap12)Rho GTPase activating protein 12 (arhgap12) | IntronIntron |
| 99 | 1919 | 27936842793684 | AX-419311974AX-419311974 | TT | CC | TTAACTTTCTGAAATCTCTGCAGATTTTGAACCAG[C/T]GTTCTTCACCACTATCTCAACCCACTAGTTCTTGGTTAACTTTCTGAAATCTCTGCAGATTTTGAACCAG[C/T]GTTCTTCACCACTATCTCAACCCACTAGTTCTTGG | CC | (Upstream) Unknown(Downstream) protein serine kinase H1 (pskh1)(Upstream) Unknown(Downstream) protein serine kinase H1 (pskh1) | IntergenicIntergenic |
| 1010 | 1919 | 44097084409708 | AX-419310944AX-419310944 | GG | AA | AGACCAAAATCAGTCAACTGTATATTCAATTCTGA[A/G]GTTTGGGACACAGACAGGATTGAAATGCAGTTTCTAGACCAAAATCAGTCAACTGTATATTCAATTCTGA[A/G]GTTTGGGACACAGACAGGATTGAAATGCAGTTTCT | AA | (Upstream) exosome component 6 (exosc6)(Downstream) alanine--tRNA ligase, cytoplasmic-like(Upstream) exosome component 6 (exosc6) (Downstream) alanine--tRNA ligase, cytoplasmic-like | IntergenicIntergenic |
| 1111 | 1919 | 43523564352356 | AX-419312238AX-419312238 | TT | CC | CTCACTTGACAGAGATTTGTTTGCACCTGTGTTGT[C/T]CGATCTTTGCTTGTCACCACAATGAATATGGACAGCTCACTTGACAGAGATTTGTTTGCACCTGTGTTGT[C/T]CGATCTTTGCTTGTCACCACAATGAATATGGACAG | TT | NLR family CARD domain containing 5 (nlrc5)NLR family CARD domain containing 5 (nlrc5) | IntronIntron |
| 1212 | 1919 | 51196035119603 | AX-419197131AX-419197131 | TT | CC | ATGGAAGAAGATTGCCATTGAGCCACAAACAGTAA[C/T]CTCTTGTTCTGTGAATACTGAAATGATCCATGTCCATGGAAGAAGATTGCCATTGAGCCACAAACAGTAA[C/T]CTCTTGTTCTGTGAATACTGAAATGATCCATGTCC | TT | (Upstream) guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha(Downstream) guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha(Upstream) guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha (Downstream) guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha | IntergenicIntergenic |
| 1313 | 1919 | 49958164995816 | AX-419311016AX-419311016 | AA | GG | CATCGATGGTGTTGTTCAAAGAGACGAGATGAGGG[A/G]CCACAGTTTGATGAATTGTATTACAGATGATGATGCATCGATGGTGTTGTTCAAAGAGACGAGATGAGGG[A/G]CCACAGTTTGATGAATTGTATTACAGATGATGATG | AA | (Upstream) SET domain containing 6 (setd6)(Downstream) Bardet-Biedl syndrome 2 (bbs2)(Upstream) SET domain containing 6 (setd6) (Downstream) Bardet-Biedl syndrome 2 (bbs2) | IntergenicIntergenic |
| 1414 | 1919 | 44764164476416 | AX-419310954AX-419310954 | CC | TT | GGTTAATACTCAGACACATTATAATCTGTGAAAAC[C/T]GTGTCAGCGTGTATTACCGCTGGTTTTCTGTTTGCGGTTAATACTCAGACACATTATAATCTGTGAAAAC[C/T]GTGTCAGCGTGTATTACCGCTGGTTTTCTGTTTGC | CC | splicing factor 3b subunit 3 (sf3b3),splicing factor 3b subunit 3 (sf3b3); | IntronIntron |
| 1515 | 1919 | 42304014230401 | AX-419194853AX-419194853 | AA | GG | ATCCATAGGGGATTTATTTATGAAAGGCAGATCTT[A/G]GGTTTATTCACTCGGGCCTCCAAAGCACTGTGTTAATCCATAGGGGATTTATTTATGAAAGGCAGATCTT[A/G]GGTTTATTCACTCGGGCCTCCAAAGCACTGTGTTA | GG | HYDIN, axonemal central pair apparatus protein (hydin)HYDIN, axonemal central pair apparatus protein (hydin) | IntronIntron |
| 1616 | 1818 | 1282322412823224 | AX-419236852AX-419236852 | AA | CC | TTCTTCAGAGAGAAATGATCAAACCAATGATTTAC[A/C]TTCTGAATTCTGTGTCCCCAGGTTTATGAAAGAGGTTCTTCAGAGAGAAATGATCAAACCAATGATTTAC[A/C]TTCTGAATTCTGTGTCCCCAGGTTTTATGAAAGAGG | AA | (Upstream) Unknown(Downstream) Unknown(Upstream) Unknown(Downstream) Unknown | IntergenicIntergenic |
| 1717 | 1919 | 42613844261384 | AX-419194860AX-419194860 | AA | CC | GTGAGAACTGTACTCTGCCGCGGCTTTAACCACAC[A/C]TGACAATTACGACACGTGTCTGCAGCACCTTTAATGTGAGAACTGTACTCTGCCGCGGCTTTAACCACAC[A/C]TGACAATTACGACACGTGTCTGCAGCACCTTTAAT | AA | (Upstream) purine nucleoside phosphorylase-like(Downstream) calretinin-like(Upstream) purine nucleoside phosphorylase-like (Downstream) calretinin-like | IntergenicIntergenic |
| 1818 | 1919 | 41333624133362 | AX-419312202AX-419312202 | TT | CC | GGATGGATGCGGAGGATGTGAATGGATGTAGGCGA[C/T]CTTCTCTCCACACAAACATCTCTACCACCGACTGTGGATGGATGCGGAGGATGTGAATGGATGTAGGCGA[C/T]CTTCTCTCCACACAAACATCTCTACCACCGACTGT | CC | (Upstream) N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (necab2)(Downstream) N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (necab2)(Upstream) N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (necab2) (Downstream) N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (necab2) | IntergenicIntergenic |
| 1919 | 1919 | 47312944731294 | AX-419312293AX-419312293 | AA | CC | AAGCTCATAAAAGTAAGAGCTGTTGTTTGCTCTGT[A/C]AAATCAACTTCAGTAAGAGCCTGATGCTGGAGAGAAAGCTCATAAAAGTAAGAGCTGTTGTTTGCTCTGT[A/C]AAATCAACTTCAGTAAGAGCCTGATGCTGGAGAGA | AA | UnknownUnknown | IntronIntron |
| 2020 | 1919 | 45930314593031 | AX-419197072AX-419197072 | GG | AA | GACATTACATTTTGCAAAGAGAGTGGATTGAGGAG[A/G]ATGACATATTTAGAAGAGCATCAGTCAAACCTCAAGACATTACATTTTGCAAAGAGAGTGGATTGAGGAG[A/G]ATGACATATTTAGAAGAGCATCAGTCAAACCTCAA | AA | (Upstream) E3 ubiquitin-protein ligase Siah1(Downstream) NEDD4-binding protein 1 (n4bp1)(Upstream) E3 ubiquitin-protein ligase Siah1 (Downstream) NEDD4-binding protein 1 (n4bp1) | IntergenicIntergenic |
| 2121 | 1818 | 1157638211576382 | AX-419304244AX-419304244 | GG | TT | TGAAGTCGAGACACTTCCTTAAACAAACTGCCCTC[G/T]GGGGTTTGTTTCGGTCATACAGGCAGTAAGTGAGTTGAAGTCGAGACACTTCCTTAAACAAACTGCCCTC[G/T]GGGGTTTGTTTCGGTCATACAGGCAGTAAGTGAGT | TT | (Upstream) par-3 family cell polarity regulator (pard3)(Downstream) Unknown(Upstream) par-3 family cell polarity regulator (pard3) (Downstream) Unknown | IntergenicIntergenic |
| 2222 | 1919 | 28227052822705 | AX-419310690AX-419310690 | TT | CC | AACCATCTTTACCGCTACTCCAAGGTTCTGGAGGC[C/T]CACCTGGGAGACCCTAAGCCCCGCCCACTACCAGCAACCATCTTTACCGCTACTCCAAGGTTCTGGAGGC[C/T]CACCTGGGAGACCCTAAGCCCCGCCCACTACCAGC | TT | membrane bound transcription factor peptidase, site 1 (mbtps1)membrane bound transcription factor peptidase, site 1 (mbtps1) | ExonExon |
| 2323 | 1919 | 26944432694443 | AX-419194721AX-419194721 | CC | AA | CTAGCACCTGCGATGCTAATCTCGAGTTGAGTGAC[A/C]AGGAGCCAACGCGTTGTCATCGAACCGTCGTGTAACTAGCACCTGCGATGCTAATCTCGAGTTGAGTGAC[A/C]AGGAGCCAACGCGTTGTCATCGAACCGTCGTGTAA | AA | (Upstream) RAN binding protein 10 (ranbp10)(Downstream) translin associated factor X interacting protein 1 (tsnaxip1)(Upstream) RAN binding protein 10 (ranbp10) (Downstream) translin associated factor X interacting protein 1 (tsnaxip1) | IntergenicIntergenic |
| 2424 | 1919 | 49973834997383 | AX-419194938AX-419194938 | AA | CC | AACTACAATCACACAACATTTGCTAACGATACAAA[A/C]ACTATAATTTATGATGTTATACTACACATCATACTAACTACAATCACACAACATTTGCTAACGATACAAA[A/C]ACTATAATTTATGATGTTATACTACACATCATACT | AA | Bardet-Biedl syndrome 2 (bbs2)Bardet-Biedl syndrome 2 (bbs2) | IntronIntron |
| 2525 | 1919 | 43442794344279 | AX-419194866AX-419194866 | TT | CC | TTTACAGGCTTCAGTAAGAATCATTGTCTGAGCCA[C/T]GCAGGTTTATTTCTTTGCATATACACACAGTGACTTTTACAGGCTTCAGTAAGAATCATTGTCTGAGCCA[C/T]GCAGGTTTATTTCTTTGCATATACACACAGTGACT | CC | (Upstream) myosin heavy chain, fast skeletal muscle-like(Downstream) NLR family CARD domain containing 5 (nlrc5)(Upstream) myosin heavy chain, fast skeletal muscle-like (Downstream) NLR family CARD domain containing 5 (nlrc5) | IntergenicIntergenic |
| 2626 | 1919 | 44822724482272 | AX-419310955AX-419310955 | TT | CC | AATCAGGGGATGAATTGTAGTAACACTCTGTAAAA[C/T]ATTCTCTTGCTCAGGTGCTGGCAATGTCCAGTCGCAATCAGGGGATGAATTGTAGTAACACTCTGTAAAA[C/T]ATTCTCTTGCTCAGGTGCTGCAATGTCCAGTCGC | TT | splicing factor 3b subunit 3 (sf3b3)splicing factor 3b subunit 3 (sf3b3) | IntronIntron |
| 2727 | 1919 | 68011076801107 | AX-419311218AX-419311218 | TT | CC | GGTTCACTCTGCTCTGTGCAGAAATAGTACACAAA[C/T]TCCCAAACAGACACTACTGTTCTGTATTTCCCAGTGGTTCACTCTGCTCTGTGCAGAAATAGTACACAAA[C/T]TCCCAAACAGACACTACTGTTCTGTATTTCCCAGT | TT | SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 (srgap1)SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 (srgap1) | IntronIntron |
| 2828 | 1818 | 1289038012890380 | AX-419238893AX-419238893 | CC | TT | TTGGGCCTCCAGCACCCTTCGGTACACAGCATATA[C/T]AGAGCATCACACTATGTGATATTGGTAACCATCATTTGGGCCTCCAGCACCCTTCGGTACACAGCATATA[C/T]AGAGCATCACACTATGTGATATTGGTAACCATCAT | CC | (Upstream) Unknown(Downstream) potassium voltage-gated channel subfamily H member 2-like(Upstream) Unknown(Downstream) potassium voltage-gated channel subfamily H member 2-like | IntergenicIntergenic |
| 2929 | 1818 | 1289095612890956 | AX-419305592AX-419305592 | AA | GG | GGCATTGCAGGGTGCAGCAGGTTCAGATGCTATGG[A/G]GACAGTACATAAGCAGATGTGTTGGCAGCAGAGCTGGCATTGCAGGGTGCAGCAGGTTCAGATGCTATGG[A/G]GACAGTACATAAGCAGATGTGTTGGCAGCAGAGCT | GG | (Upstream) Unknown(Downstream) potassium voltage-gated channel subfamily H member 2-like(Upstream) Unknown(Downstream) potassium voltage-gated channel subfamily H member 2-like | IntergenicIntergenic |
| 3030 | 1919 | 47819524781952 | AX-419194922AX-419194922 | TT | GG | TTTATAGCCTAAACTGCAGTATTGTGTAGTGATAA[G/T]TTAATGCCAAAGAAATCAATTTTGAAATTTTGAAGTTTATAGCCTAAACTGCAGTATTGTGTAGTGATAA[G/T]TTAATGCCAAAGAAATCAATTTTGAAATTTTGAAG | TT | (Upstream) cerebellin 1 precursor 1 (cbln1)(Downstream) transmembrane protein 189-like(Upstream) cerebellin 1 precursor 1 (cbln1) (Downstream) transmembrane protein 189-like | IntergenicIntergenic |
상기 30개의 SNP에 대해 다음의 분석결과를 바탕으로 고수온 내성 유전자형으로 확정하였다. 고수온 내성과 연관된 각 SNP의 정보와 유전자형별 생존 일수 및 생존 시간의 평균 및 표준편차와 그래프를 하기 표 7, 도 3 내지 도 32에 나타냈다. 생존 일수(DPC_Day)은 각 개체 별로 생존 일수만큼 1 내지 8의 값을 지정하였고, 생존 시간(DPC_Time)은 각 개체별 폐사 날짜를 Excel을 이용하여 일련번호로 변환한 후에 첫 번째 폐사 개체 발생일을 1로 두고 실시하였다. 또한, 각 개체의 생존 여부와 유전자형을 서로 연관 분석하여 각 유전자형 별로 생존 또는 폐사한 개체 수를 확인하였고, 이를 바탕으로 막대 그래프에 나타내었다.The 30 SNPs were determined as high temperature resistant genotypes based on the following analysis results. Table 7 and FIGS. 3 to 32 show information on each SNP associated with high temperature resistance and average and standard deviation of survival days and survival time for each genotype and graphs. The number of survival days (DPC_Day) was assigned a value of 1 to 8 as many as the number of survival days for each individual, and the survival time (DPC_Time) was the date of occurrence of the first dead individual after converting the death date of each individual into a serial number using Excel. 1 was performed. In addition, by analyzing the survival and genotype of each individual, the number of surviving or dead individuals for each genotype was confirmed, and based on this, it was shown in a bar graph.
|
서열 번호order number |
염색체 번호chromosome number |
SNP 위치SNPs location |
SNP IDSNP ID |
고수온내성 관련 유전자형high temperature resistance related genotype |
항목item | 유전자형 -1Genotype -1 | 유전자형-2genotype-2 | 유전자형-3genotype-3 | |
| 1One | 1919 | 43443154344315 | AX-419312236AX-419312236 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (190)AA (190) | GA (365)GA (365) | GG (170)G. G. (170) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 7.49 ± 1.537.49 ± 1.53 | 3.26 ± 2.133.26 ± 2.13 | 1.47 ± 1.021.47 ± 1.02 | |||||
| 생존 시간survival time | 11.79 ± 3.0111.79 ± 3.01 | 3.96 ± 3.813.96 ± 3.81 | 1.66 ± 1.441.66 ± 1.44 | ||||||
| 22 | 1919 | 46873134687313 | AX-419197087AX-419197087 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (153)AA (153) | AG (358)AG (358) | GG (206)G. G. (206) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 7.44 ± 1.537.44 ± 1.53 | 3.66 ± 2.133.66 ± 2.13 | 1.92 ± 1.021.92 ± 1.02 | |||||
| 생존 시간survival time | 11.72 ± 3.1211.72 ± 3.12 | 4.71 ± 4.414.71 ± 4.41 | 2.28 ± 2.632.28 ± 2.63 | ||||||
| 33 | 1919 | 43303724330372 | AX-419312234AX-419312234 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (191)CC (191) | TC (359)T-C (359) | TT (176)TT (176) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 1.46 ± 0.981.46 ± 0.98 | 3.35 ± 2.113.35 ± 2.11 | 7.85 ± 0.747.85 ± 0.74 | |||||
| 생존 시간survival time | 1.64 ± 1.361.64 ± 1.36 | 4.07 ± 3.834.07 ± 3.83 | 12.47 ± 1.712.47 ± 1.7 | ||||||
| 44 | 1818 | 1263157812631578 | AX-419305596AX-419305596 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (172)AA (172) | AG (366)AG (366) | GG (187)G. G. (187) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 7.38 ± 1.767.38 ± 1.76 | 3.45 ± 2.233.45 ± 2.23 | 1.76 ± 1.661.76 ± 1.66 | |||||
| 생존 시간survival time | 11.63 ± 3.311.63 ± 3.3 | 4.28 ± 4.034.28 ± 4.03 | 2.14 ± 2.652.14 ± 2.65 | ||||||
| 55 | 1919 | 44611594461159 | AX-419194887AX-419194887 | GG | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | GG (186)G. G. (186) | GT (413)GT (413) | TT (126)TT (126) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 6.89 ± 2.196.89 ± 2.19 | 3.38 ± 2.403.38 ± 2.40 | 1.41 ± 0.671.41 ± 0.67 | |||||
| 생존 시간survival time | 10.67 ± 4.1510.67 ± 4.15 | 4.31 ± 4.244.31 ± 4.24 | 1.52 ± 0.481.52 ± 0.48 | ||||||
| 66 | 1919 | 42483584248358 | AX-419194856AX-419194856 | CC | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (186)AA (186) | CA (381)CA (381) | CC (157)CC (157) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 1.59 ± 1.291.59 ± 1.29 | 3.70 ± 2.393.70 ± 2.39 | 7.36 ± 1.787.36 ± 1.78 | |||||
| 생존 시간survival time | 1.85 ± 1.971.85 ± 1.97 | 4.73 ± 4.364.73 ± 4.36 | 11.59 ± 3.3411.59 ± 3.34 | ||||||
| 77 | 1919 | 27521902752190 | AX-419194727AX-419194727 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | GG (329)G. G. (329) | TG (207)TG (207) | TT (180)TT (180) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.60 ± 2.122.60 ± 2.12 | 3.29 ± 2.293.29 ± 2.29 | 7.23 ± 1.887.23 ± 1.88 | |||||
| 생존 시간survival time | 3.19 ± 3.563.19 ± 3.56 | 4.10 ± 4.044.10 ± 4.04 | 11.32 ± 3.5911.32 ± 3.59 | ||||||
| 88 | 1818 | 1254677812546778 | AX-419238898AX-419238898 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (149)AA (149) | AG (364)AG (364) | GG (213)G. G. (213) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 6.66 ± 2.406.66 ± 2.40 | 4.02 ± 2.644.02 ± 2.64 | 1.92 ± 1.571.92 ± 1.57 | |||||
| 생존 시간survival time | 10.27 ± 4.4810.27 ± 4.48 | 5.39 ± 4.785.39 ± 4.78 | 2.24 ± 2.482.24 ± 2.48 | ||||||
| 99 | 1919 | 27936842793684 | AX-419311974AX-419311974 | CC | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (293)CC (293) | TC (398)TC (398) | TT (35)TT (35) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 5.93 ± 2.665.93 ± 2.66 | 2.69 ± 2.122.69 ± 2.12 | 1.57 ± 1.241.57 ± 1.24 | |||||
| 생존 시간survival time | 8.87 ± 5.018.87 ± 5.01 | 3.28 ± 3.563.28 ± 3.56 | 1.78 ± 1.961.78 ± 1.96 | ||||||
| 1010 | 1919 | 44097084409708 | AX-419310944AX-419310944 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (190)AA (190) | GA (401)GA (401) | GG (134)G. G. (134) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 6.44 ± 2.556.44 ± 2.55 | 3.49 ± 2.433.49 ± 2.43 | 1.79 ± 1.691.79 ± 1.69 | |||||
| 생존 시간survival time | 9.90 ± 4.79.90 ± 4.7 | 4.48 ± 4.334.48 ± 4.33 | 2.18 ± 2.722.18 ± 2.72 | ||||||
| 1111 | 1919 | 43523564352356 | AX-419312238AX-419312238 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (322)CC (322) | TC (355)TC (355) | TT (49)TT (49) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.41 ± 2.042.41 ± 2.04 | 4.79 ± 2.784.79 ± 2.78 | 7.92 ± 0.577.92 ± 0.57 | |||||
| 생존 시간survival time | 2.93 ± 3.342.93 ± 3.34 | 6.78 ± 5.156.78 ± 5.15 | 12.62 ± 1.3212.62 ± 1.32 | ||||||
| 1212 | 1919 | 51196035119603 | AX-419197131AX-419197131 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (180)CC (180) | TC (371)TC (371) | TT (174)TT (174) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.14 ± 1.952.14 ± 1.95 | 3.50 ± 2.453.50 ± 2.45 | 6.78 ± 2.296.78 ± 2.29 | |||||
| 생존 시간survival time | 2.62 ± 3.152.62 ± 3.15 | 4.51 ± 4.364.51 ± 4.36 | 10.46 ± 4.3510.46 ± 4.35 | ||||||
| 1313 | 1919 | 49958164995816 | AX-419311016AX-419311016 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (150)AA (150) | AG (361)AG (361) | GG (215)G. G. (215) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 6.71 ± 2.366.71 ± 2.36 | 3.85 ± 2.633.85 ± 2.63 | 2.18 ± 1.842.18 ± 1.84 | |||||
| 생존 시간survival time | 10.38 ± 4.4210.38 ± 4.42 | 5.14 ± 4.725.14 ± 4.72 | 2.60 ± 2.982.60 ± 2.98 | ||||||
| 1414 | 1919 | 44764164476416 | AX-419310954AX-419310954 | CC | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (139)CC (139) | CT (376)CT (376) | TT (207)TT (207) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 6.61 ± 2.426.61 ± 2.42 | 4.03 ± 2.684.03 ± 2.68 | 2.05 ± 1.712.05 ± 1.71 | |||||
| 생존 시간survival time | 10.18 ± 4.5310.18 ± 4.53 | 5.44 ± 4.835.44 ± 4.83 | 2.44 ± 2.762.44 ± 2.76 | ||||||
| 1515 | 1919 | 42304014230401 | AX-419194853AX-419194853 | GG | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (27)AA (27) | AG (334)AG (334) | GG (365)G. G. (365) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.19 ± 2.502.19 ± 2.50 | 2.75 ± 2.202.75 ± 2.20 | 5.17 ± 2.875.17 ± 2.87 | |||||
| 생존 시간survival time | 3.03 ± 4.163.03 ± 4.16 | 3.41 ± 3.733.41 ± 3.73 | 7.53 ± 5.257.53 ± 5.25 | ||||||
| 1616 | 1818 | 1282322412823224 | AX-419236852AX-419236852 | GG | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (59)AA (59) | AC (366)AC (366) | CC (299)CC (299) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 1.50 ± 0.711.50 ± 0.71 | 6.63 ± 2.396.63 ± 2.39 | 4.71 ± 2.854.71 ± 2.85 | |||||
| 생존 시간survival time | 10.19 ± 4.5310.19 ± 4.53 | 6.70 ± 5.206.70 ± 5.20 | 3.05 ± 3.443.05 ± 3.44 | ||||||
| 1717 | 1919 | 42613844261384 | AX-419194860AX-419194860 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (30)AA (30) | AC (357)AC (357) | CC (337)CC (337) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 7.87 ± 0.737.87 ± 0.73 | 4.99 ± 2.804.99 ± 2.80 | 2.50 ± 2.112.50 ± 2.11 | |||||
| 생존 시간survival time | 12.5 ± 1.6812.5±1.68 | 7.16 ± 5.207.16 ± 5.20 | 3.07 ± 3.483.07 ± 3.48 | ||||||
| 1818 | 1919 | 41333624133362 | AX-419312202AX-419312202 | CC | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (277)CC (277) | TC (410)TC (410) | TT (39)TT (39) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 5.52 ± 2.775.52 ± 2.77 | 3.08 ± 2.473.08 ± 2.47 | 1.90 ± 1.571.90 ± 1.57 | |||||
| 생존 시간survival time | 8.10 ± 5.168.10 ± 5.16 | 4.00 ± 4.264.00 ± 4.26 | 2.18 ± 2.552.18 ± 2.55 | ||||||
| 1919 | 1919 | 47312944731294 | AX-419312293AX-419312293 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (165)AA (165) | AC (362)AC (362) | CC (198)CC (198) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 6.19 ± 2.706.19 ± 2.70 | 3.87 ± 2.603.87 ± 2.60 | 2.23 ± 2.022.23 ± 2.02 | |||||
| 생존 시간survival time | 9.46 ± 4.959.46 ± 4.95 | 5.13 ± 4.685.13 ± 4.68 | 2.76 ± 3.332.76 ± 3.33 | ||||||
| 2020 | 1919 | 45930314593031 | AX-419197072AX-419197072 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (365)AA (365) | GA (321)GA (321) | GG (39)G. G. (39) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 4.97 ± 2.884.97 ± 2.88 | 3.02 ± 2.463.02 ± 2.46 | 2.03 ± 1.772.03 ± 1.77 | |||||
| 생존 시간survival time | 7.18 ± 5.257.18 ± 5.25 | 3.91 ± 4.213.91 ± 4.21 | 2.37 ± 2.832.37 ± 2.83 | ||||||
| 2121 | 1818 | 1157638211576382 | AX-419304244AX-419304244 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | GG (130)G. G. (130) | GT (389)GT (389) | TT (207)TT (207) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 1.77 ± 1.481.77 ± 1.48 | 3.59 ± 2.523.59 ± 2.52 | 5.98 ± 2.795.98 ± 2.79 | |||||
| 생존 시간survival time | 2.05 ± 2.252.05 ± 2.25 | 4.68 ± 4.494.68 ± 4.49 | 9.09 ± 5.069.09 ± 5.06 | ||||||
| 2222 | 1919 | 28227052822705 | AX-419310690AX-419310690 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (339)CC (339) | TC (378)TC (378) | TT (9)TT (9) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.53 ± 2.052.53 ± 2.05 | 5.11 ± 2.875.11 ± 2.87 | 8.00 ± 0.008.00 ± 0.00 | |||||
| 생존 시간survival time | 3.09 ± 3.443.09 ± 3.44 | 7.43 ± 5.257.43 ± 5.25 | 12.81 ± 0.0012.81±0.00 | ||||||
| 2323 | 1919 | 26944432694443 | AX-419194721AX-419194721 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (305)AA (305) | CA (387)CA (387) | CC (31)CC (31) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 6.33 ± 2.896.33 ± 2.89 | 5.53 ± 2.835.53 ± 2.83 | 2.82 ± 2.262.82 ± 2.26 | |||||
| 생존 시간survival time | 8.18 ± 5.208.18 ± 5.20 | 3.53 ± 3.843.53 ± 3.84 | 2.55 ± 2.792.55 ± 2.79 | ||||||
| 2424 | 1919 | 49973834997383 | AX-419194938AX-419194938 | AA | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (116)AA (116) | AC (373)AC (373) | CC (236)CC (236) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 6.08 ± 2.706.08 ± 2.70 | 4.23 ± 2.834.23 ± 2.83 | 2.45 ± 2.022.45 ± 2.02 | |||||
| 생존 시간survival time | 9.19 ± 5.029.19 ± 5.02 | 5.90 ± 5.085.90 ± 5.08 | 2.97 ± 3.312.97 ± 3.31 | ||||||
| 2525 | 1919 | 43442794344279 | AX-419194866AX-419194866 | CC | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (270)CC (270) | TC (392)TC (392) | TT (63)TT (63) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 5.77 ± 2.715.77 ± 2.71 | 2.87 ± 2.292.87 ± 2.29 | 2.78 ± 2.532.78 ± 2.53 | |||||
| 생존 시간survival time | 8.57 ± 5.088.57 ± 5.08 | 3.60 ± 3.93.60 ± 3.9 | 3.70 ± 4.273.70 ± 4.27 | ||||||
| 2626 | 1919 | 44822724482272 | AX-419310955AX-419310955 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (397)CC (397) | TC (300)TC (300) | TT (28)TT (28) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.70 ± 2.192.70 ± 2.19 | 5.34 ± 2.845.34 ± 2.84 | 6.54 ± 2.46.54 ± 2.4 | |||||
| 생존 시간survival time | 3.35 ± 3.693.35 ± 3.69 | 7.82 ± 5.247.82 ± 5.24 | 9.95 ± 4.629.95 ± 4.62 | ||||||
| 2727 | 1919 | 68011076801107 | AX-419311218AX-419311218 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (287)CC (287) | TC (340)TC (340) | TT (99)TT (99) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.45 ± 2.062.45 ± 2.06 | 4.45 ± 2.814.45 ± 2.81 | 6.56 ± 2.436.56 ± 2.43 | |||||
| 생존 시간survival time | 3.01 ± 3.423.01 ± 3.42 | 6.20 ± 5.116.20 ± 5.11 | 10.07 ± 4.5610.07 ± 4.56 | ||||||
| 2828 | 1818 | 1289038012890380 | AX-419238893AX-419238893 | CC | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | CC (2)CC (2) | CT (373)CT (373) | TT (351)TT (351) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 5.00 ± 4.245.00 ± 4.24 | 5.14 ± 2.895.14 ± 2.89 | 2.66 ± 2.162.66 ± 2.16 | |||||
| 생존 시간survival time | 7.42 ± 7.627.42 ± 7.62 | 7.50 ± 5.277.50 ± 5.27 | 3.29 ± 3.643.29 ± 3.64 | ||||||
| 2929 | 1818 | 1289095612890956 | AX-419305592AX-419305592 | GG | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | AA (63)AA (63) | AG (381)AG (381) | GG (282)G. G. (282) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.68 ± 2.302.68 ± 2.30 | 3.04 ± 2.453.04 ± 2.45 | 5.45 ± 2.815.45 ± 2.81 | |||||
| 생존 시간survival time | 3.43 ± 3.913.43 ± 3.91 | 3.92 ± 4.203.92 ± 4.20 | 8.02 ± 5.198.02 ± 5.19 | ||||||
| 3030 | 1919 | 47819524781952 | AX-419194922AX-419194922 | TT | 변이 (개체수)Variation (Number of Populations) | GG (334)G. G. (334) | TG (338)TG (338) | TT (48)TT (48) | |
| 평균 ± 표준편차mean ± standard deviation | 생존 일수number of days to live | 2.42 ± 2.032.42 ± 2.03 | 5.09 ± 2.805.09 ± 2.80 | 6.42 ± 2.536.42 ± 2.53 | |||||
| 생존 시간survival time | 2.94 ± 3.332.94 ± 3.33 | 7.34 ± 5.207.34 ± 5.20 | 9.80 ± 4.759.80 ± 4.75 | ||||||
표 7, 도 3 내지 도 32를 참고하면, 고수온 내성 유전자형이 포함될 경우 DPC 평균이 높고, 생존 개체 수가 많아지는 것이 확인되었고, 상기 30개의 SNP을 포함하는 고수온 내성 유전자형을 가지는 개체를 선별할 경우 고수온에서 생존 확률이 높을 것으로 기대할 수 있다.Referring to Table 7 and FIGS. 3 to 32, it was confirmed that the DPC average was high and the number of surviving individuals increased when the high temperature resistance genotype was included, and when selecting individuals having the high temperature resistance genotype including the 30 SNPs, high temperature can be expected to have a high probability of survival.
3-4. 고수온 내성에 대한 유전력 분석3-4. Heritability analysis for high temperature tolerance
유전적 매개변수(Genetic parameter) 분석을 통해 고수온 내성에 대한 GWAS 분석에서 추정된 유전력은 표 8과 같다.Table 8 shows the heritability estimated from the GWAS analysis for high temperature tolerance through genetic parameter analysis.
| 고수온 내성 관련 유전력Heritability associated with high temperature tolerance | ||||
| 표현형 형질phenotypic trait |
유전력 Heritability (h 2)heritability Heritability ( h 2 ) |
P-valueP-value | Significant to selectionSignificant to select | 주요 관련 염색체major related chromosomes |
| 생존 여부SurvivalSurvival | 0.6200.620 | 8.47 x 10-7 8.47 x 10 -7 |
Significant |
18 and 1918 and 19 |
| 생존 일수DPC_DayDays to surviveDPC_Day | 0.7530.753 | 8.47 x 10-7 8.47 x 10 -7 |
Significant |
18 and 1918 and 19 |
| 생존 시간DPC_Timesurvival timeDPC_Time | 0.7100.710 | 8.47 x 10-7 8.47 x 10 -7 |
Significant |
18 and 1918 and 19 |
생존 여부, 생존 일수, 생존 시간 기반 분석에서 유전력이 0.620 - 0.753 정도로 유효한 값이 추정되어 유전체 선발을 통해 해당 형질의 개량을 충분히 기대할 수 있으며, 이와 관련된 SNP 마커를 고수온 내성 개체 선발을 위한 마커로 사용할 수 있을 것으로 기대할 수 있다.In the analysis based on survival, number of days of survival, and survival time, a valid value of 0.620 - 0.753 was estimated for heritability, so improvement of the trait can be sufficiently expected through genome selection, and related SNP markers can be used as markers for selection of high-temperature resistant individuals. can be expected to be able to.
본 개시에 따른 고수온 내성 예측용 SNP(Single nucleotide polymorphism) 마커 조성물은 고수온 내성 품종 개발 및 지속적인 생산을 유도할 수 있어, 넙치 양식에 큰 도움을 줄 수 있다.The single nucleotide polymorphism (SNP) marker composition for predicting high temperature resistance according to the present disclosure can induce the development and continuous production of high temperature resistant varieties, which can be of great help to flounder farming.
Claims (7)
- 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 is A or G, including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, wherein the 36th base is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C or A, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7, wherein the 36th base is T or G, and 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10, wherein the 36th base of the polynucleotide is G or A, and is composed of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21, wherein the 36th base is G or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23, wherein the 36th base is C or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 및A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; and서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;로 이루어진 그룹에서 선택되는 1종 이상을 포함하는, The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto; a group consisting of Including one or more selected from,넙치의 고수온 내성 예측용 SNP(Single nucleotide polymorphism) 마커 조성물.SNP (Single nucleotide polymorphism) marker composition for predicting high temperature tolerance of halibut.
- 제 1항에 있어서,According to claim 1,상기 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A인 경우; 상기 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 또는 상기 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우, 고수온 내성 넙치인 것으로 예측하는 것인, When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29 is G; Or, if the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 is T, predicting that it is a high temperature resistant flounder,넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커 조성물.SNP marker composition for predicting high-temperature tolerance of halibut.
- 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 제제를 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 조성물로서,A composition for predicting high temperature resistance of flounder, comprising an agent capable of detecting or amplifying a SNP marker for predicting high temperature resistance of flounder,상기 SNP 마커는,The SNP marker,서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, wherein the 36th base is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C or A, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7, wherein the 36th base is T or G, and 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10, wherein the 36th base of the polynucleotide is G or A, and is composed of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21, wherein the 36th base is G or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23, wherein the 36th base is C or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 및A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; and서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;로 이루어진 그룹에서 선택되는 1종 이상을 포함하는, The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto; a group consisting of Including one or more selected from,넙치의 고수온 내성 예측용 조성물.A composition for predicting high-temperature tolerance of halibut.
- 제 3항에 있어서,According to claim 3,상기 제제는 상기 SNP 마커를 검출 또는 증폭할 수 있는 프라이머 또는 프로브인 것을 특징으로 하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 조성물.The preparation is characterized in that the primer or probe capable of detecting or amplifying the SNP marker, a composition for predicting high temperature tolerance of halibut.
- 제 3항의 조성물을 포함하는, 넙치의 고수온 내성 예측용 키트.A kit for predicting high temperature tolerance of halibut, comprising the composition of claim 3.
- (a) 넙치로부터 분리된 시료의 DNA로부터 넙치의 고수온 내성 예측용 SNP 마커의 다형성 부위를 증폭하거나 검출하는 단계 및(a) amplifying or detecting a polymorphic site of a SNP marker for predicting high temperature resistance of flounder from DNA of a sample isolated from flounder and(b) 상기 (a) 단계에서 증폭 또는 검출된 다형성 부위의 염기를 결정하는 단계를 포함하며,(b) determining the base of the polymorphic site amplified or detected in step (a);상기 (a)단계의 상기 SNP 마커는,The SNP marker in step (a),서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5, wherein the 36th base is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases in which the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C or A, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7, wherein the 36th base is T or G, and 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;a polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10, wherein the 36th base of the polynucleotide is G or A, and is composed of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20, wherein the 36th base is G or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21, wherein the 36th base is G or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 A이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23, wherein the 36th base is C or A, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24, wherein the 36th base is A or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 C이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27, wherein the 36th base is T or C, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 또는 T이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28, wherein the 36th base is C or T, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto;서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드; 및A polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29, wherein the 36th base is A or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base, or a polynucleotide complementary thereto; and서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 또는 G이고, 상기 36번째 염기를 포함하는 10 내지 100개의 연속적인 염기로 구성된 폴리뉴클레오티드 또는 이에 상보적인 폴리뉴클레오티드;로 이루어진 그룹에서 선택되는 1종 이상을 포함하는, The 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 is T or G, and a polynucleotide consisting of 10 to 100 consecutive bases including the 36th base or a polynucleotide complementary thereto; a group consisting of Including one or more selected from,넙치의 고수온 내성 예측 방법.A method for predicting high-temperature tolerance of halibut.
- 제 6항에 있어서,According to claim 6,상기 서열번호: 1의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A인 경우; 상기 서열번호: 2의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 3의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 4의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 5의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 6의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 7의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 8의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 9의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 10의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 11의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 12의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 13의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 14의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 15의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 상기 서열번호: 16의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 17의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 18의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 19의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 20의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 21의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 22의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 23의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 24의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 A 인 경우; 상기 서열번호: 25의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 26의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 27의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우; 상기 서열번호: 28의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 C 인 경우; 상기 서열번호: 29의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 G 인 경우; 또는 상기 서열번호: 30의 염기서열로 구성되는 폴리뉴클레오티드의 36번째 염기가 T 인 경우, 고수온 내성 넙치인 것으로 예측하는 것인,When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 5 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 6 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 7 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 8 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 9 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 11 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 12 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 13 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 15 is G; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 16 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 17 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 19 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 20 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 21 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 22 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 23 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 24 is A; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 25 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 26 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 27 is T; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 28 is C; When the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 29 is G; Or, if the 36th base of the polynucleotide consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 30 is T, predicting that it is a high temperature resistant flounder,넙치의 고수온 내성 예측 방법.A method for predicting high-temperature tolerance of halibut.
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