WO2021206406A1 - 항암제 내성 진단 또는 치료용 조성물 - Google Patents

항암제 내성 진단 또는 치료용 조성물 Download PDF

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정재호
김정민
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    • G01N2800/44—Multiple drug resistance

Definitions

  • the present invention relates to a composition capable of diagnosing anticancer drug resistance and further treating resistance.
  • Cancer is one of the incurable diseases that civilization needs to solve, and huge capital is being invested in development to cure it worldwide. Diagnosed and more than 60,000 people have died.
  • gastric cancer was diagnosed as the 5th most frequently diagnosed worldwide in 2018, and although various anticancer therapies have been developed rapidly in cancer diagnosis and treatment over the past decade, the fatality rate due to cancer is still high.
  • side effects that accompany various anticancer drugs and various anticancer therapies still exist. Research to reduce these side effects is being actively conducted.
  • Drug resistance is a major factor that counteracts the effectiveness of successful chemotherapy, and worsens the prognosis of various carcinomas. Chemo-resistance in cancer cells is divided into pre-existing of resistance-mediating factor and newly acquired drug resistance due to drug administration (Cancer drug resistance). : an evolving paradigm. Nat Rev Cancer. 2013 Oct;13(10):714-26.). Factors causing acquired drug resistance include increased drug efflux, mutagenesis of drug targets, DNA damage repair, activation of alternative signaling pathways, or avoidance of cell death induced by drug resistance. Even if a patient with drug resistance is treated with the drug, the effect of the treatment cannot be guaranteed, so there is a possibility that the time and money of the clinician and the patient are wasted unnecessarily.
  • One object of the present invention is to provide a composition for diagnosing anticancer drug resistance.
  • Another object of the present invention is to provide a kit for diagnosing anticancer drug resistance.
  • Another object of the present invention is to provide a method for providing information on anticancer drug resistance.
  • Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for treating anticancer drug resistance.
  • Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition that enhances the anticancer drug sensitivity.
  • Another object of the present invention is to provide a pharmaceutical composition for preventing or treating anticancer drug-resistant cancer.
  • Another object of the present invention is to provide a screening method for a drug for overcoming anti-cancer drug resistance or therapeutic drug or anti-cancer drug sensitivity enhancement.
  • the present invention relates to a composition for diagnosing anticancer drug resistance.
  • the diagnostic composition may include an agent for measuring the expression level of a succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A (SDHA) protein or a gene encoding the same.
  • SDHA succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A
  • succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A encodes a major catalytic subunit of succinate-ubiquinone oxidoreductase, a complex of the mitochondrial respiratory chain.
  • the complex consists of four nuclear-encoded subunits located in the inner mitochondrial membrane.
  • the gene contains a FAD binding site, where it is known that succinic acid is converted to fumaric acid and deprotonated.
  • the gene mutation is related to a neurodegenerative disease caused by an abnormality in the energy production process due to a deficiency of the mitochondrial respiratory chain known as Leigh Syndrome.
  • the "SDHA protein or a gene encoding the same" is registered with the National Center for Biotechnology Information (NCBI), and the SDHA protein may consist of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, and the SDHA protein encoding
  • the gene may consist of the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 2, but is not limited thereto, and as a non-limiting example, 99% or more to less than 100%, 95% or more to less than 99%, 90% or more from the sequence of SDHA. to less than 95%, 85% to less than 90%, or 80% to less than 85% homology, it is apparent to those skilled in the art that the desired effect of the present invention is exerted. All within the scope may be included without limitation.
  • drug or “anticancer agent” and “anticancer agent” may be used interchangeably, and the agent corresponds to a drug having an anticancer effect by killing cancer stem cells as well as cancer cells, and more preferably gastric cancer treatment drugs that are effective.
  • the term "anticancer agent” is a drug having a mechanism to kill cancer cells, and includes OXPHOS inhibitors, nitrogen mustard, imatinib, oxaliplatin, rituximab, erlotinib, neratinib, lapatinib, gefitinib, vandetanib, ni rotinib, semasanib, bosutinib, axitinib, cediranib, restaurtinib, trastuzumab, gefitinib, bortezomib, sunitinib, carboplatin, bevacizumab, cisplatin, cetuximab, Viscum album, asparaginase, tretinoin, hydroxycarbamide, dasatinib, estramustine, gemtuzumab ozogamicin, ibritumomab tuxetane, heptaplatin, methylamin
  • the "anticancer agent” may correspond to an OXPHOS inhibitor, and the agent corresponds to an anticancer agent having a new mechanism to kill cancer cells by inhibiting mitochondrial oxidative phosphorylation. Since various types of immune cells utilize specific cellular metabolic processes to maintain cell survival, development and function, the drug can be used to enhance the effectiveness of cancer treatment by inhibiting ATP production.
  • the anticancer agent may include all without limitation, if it corresponds to one type of OXPHOS inhibitor.
  • the "OXPHOS inhibitor” is one selected from the group consisting of ubiquinone reduction activity inhibitor, mitochondrial electron transport chain I inhibitor, or iron chelator. It may include the above, and any drug having a mechanism to kill cancer cells by inhibiting oxidative phosphorylation of mitochondria may be included without being limited thereto.
  • the ubiquinone reducing activity inhibitor may be IACS-010759, but is not limited thereto as long as it corresponds to a drug that affects the activity of ubiquinone, a fat-soluble electron transporter present in the inner mitochondrial membrane.
  • the mitochondrial electron transport chain I inhibitor may be at least one selected from the group consisting of IM156, metformin, phenformin, and rotenone, more preferably IM156 or rotenone.
  • the present invention is not limited thereto.
  • the iron chelator may be VLX 600, but is not limited thereto as long as it is a compound having a function of inhibiting mitochondrial respiration.
  • the "IM156 drug” is a kind of a new biguanide derivative compound previously known as HL156A, and similarly to other biguanide drugs, a drug that blocks mitochondrial complex I corresponds to It is a small molecule oral drug derived from biguanide and is known as a potent oxidative phosphorylation (OXPHOS) inhibitor.
  • OXPHOS potent oxidative phosphorylation
  • the "rotenone drug” is a drug that functions to inhibit tumor growth dependent on oxidative metabolism by acting on mitochondrial respiratory chain complex I (Mitochondrial Complex I). It is a lipophilic, naturally occurring product obtained from the roots and stems of the legumes Lonchocarpus and Derris species. It has been widely used as an insecticide, but its toxic effect has limited its use in many countries. did.
  • rotenone is known to inhibit cell proliferation by causing apoptosis in various human cancer cell lines, and is being developed for use in cancer treatment. Examples of mitochondrial electron transport chain I inhibitors that act on mitochondrial respiratory chain complex I other than rotenone include IM156, metformin, and phenformin.
  • anticancer drug resistance refers to a decrease in the effect of the drug when the drug is used repeatedly in a quantitative manner, and in order to obtain the same effect previously experienced in patients with anticancer drug resistance, increase the amount of use or increase the frequency of use It is a condition in which the same effect as before is not obtained even if the dose must be increased or the same dose of the substance is administered.
  • drug resistance was diagnosed when the change in the expression level of the SDHA protein or the gene encoding it is increased compared to the control group, drug resistance was diagnosed.
  • the "diagnosis” refers to determining susceptibility to an anticancer agent, determining whether an onset disease currently has anticancer drug resistance, or prognosis of anticancer drug-resistant cancer (eg, cancer to the drug) It is defined as a broad concept that includes determining the reactivity of
  • the prognosis of the present invention refers to an act of predicting in advance the course of a disease and the outcome of death or survival.
  • the prognosis or prognostic diagnosis may be interpreted to mean any act of predicting the course of a disease before/after treatment by comprehensively considering the patient's condition, as the course of the disease may vary depending on the physiological or environmental condition of the patient.
  • the prognosis is an act of predicting in advance whether an anticancer agent treatment, preferably an OXPHOS inhibitor treatment, more preferably a treatment responsiveness or resistance to the anticancer agent occurs after IM156 treatment, or the use of the anticancer agent based on this It can be interpreted as an act of appropriately choosing whether or not to
  • tumor or “cancer” is a disease in which the cell cycle is not regulated and continues to divide, and is divided into Carcinoma and Sarcoma depending on the site of occurrence.
  • Carcinoma refers to a malignant tumor that arises from epithelial cells such as mucous membranes and skin
  • sarcoma refers to a malignant tumor that arises from non-epithelial cells such as muscle, connective tissue, bone, cartilage, and blood vessels.
  • the cancer is thyroid cancer, parathyroid cancer, stomach cancer, ovarian cancer, colorectal cancer, pancreatic cancer, liver cancer, breast cancer, cervical cancer, lung cancer, non-small cell lung cancer, prostate cancer, gallbladder cancer, biliary tract cancer, non-Hodgkin's lymphoma, Hodgkin's lymphoma, blood cancer , bladder cancer, kidney cancer, melanoma, colon cancer, bone cancer, skin cancer, head cancer, uterine cancer, rectal cancer, brain tumor, perianal cancer, fallopian tube carcinoma, endometrial carcinoma, vaginal cancer, vulvar carcinoma, esophageal cancer, small intestine cancer, endocrine adenocarcinoma, adrenal cancer , soft tissue sarcoma, urethral cancer, penile cancer, ureter cancer, renal cell carcinoma, renal pelvic carcinoma, CNS central nervoussystem tumor, primary CNS lymphoma, spinal cord tumor, brainstem glioma or pituitary ade
  • the agent for measuring the expression level of the protein is an antibody, oligopeptide, ligand, PNA (peptide nucleic acid) and an aptamer that specifically binds to the protein. It may include one or more selected from, but is not limited thereto.
  • the "antibody” refers to a substance that specifically binds to an antigen and causes an antigen-antibody reaction.
  • an antibody refers to an antibody that specifically binds to said protein.
  • Antibodies of the present invention include polyclonal antibodies, monoclonal antibodies and recombinant antibodies.
  • the antibody can be easily prepared using techniques well known in the art.
  • the polyclonal antibody can be produced by a method well known in the art, including the process of injecting an antigen of the protein into an animal and collecting blood from the animal to obtain a serum containing the antibody.
  • Such polyclonal antibodies can be prepared from any animal such as goat, rabbit, sheep, monkey, horse, pig, cow, dog, and the like.
  • monoclonal antibodies can be prepared using the hybridoma method well known in the art (see Kohler and Milstein (1976) European Journal of Immunology 6:511-519), or the phage antibody library technology (Clackson et al, Nature, 352). :624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991).
  • the antibody prepared by the above method may be separated and purified using methods such as gel electrophoresis, dialysis, salt precipitation, ion exchange chromatography, and affinity chromatography.
  • the antibodies of the present invention include functional fragments of antibody molecules as well as complete forms having two full-length light chains and two full-length heavy chains.
  • a functional fragment of an antibody molecule means a fragment having at least an antigen-binding function, and includes Fab, F(ab'), F(ab')2 and Fv.
  • the "oligopeptide” is a peptide consisting of 2 to 20 amino acids and may include a dipeptide, a tripeptide, a tetrapeptide, and a pentapeptide, but is not limited thereto.
  • PNA Peptide Nucleic Acid
  • DNA has a phosphate-ribose sugar backbone
  • PNA has a repeated N-(2-aminoethyl)-glycine backbone linked by peptide bonds, which greatly increases binding strength and stability to DNA or RNA, resulting in molecular biology , diagnostic assays and antisense therapy.
  • PNA is described in Nielsen PE, Egholm M, Berg RH, Buchardt O (December 1991). "Sequence-selective recognition of DNA by strand displacement with a thymine-substituted polyamide". Science 254 (5037): 1497-1500.
  • the "aptamer” is an oligonucleic acid or a peptide molecule, and the general description of the aptamer is described in Bock LC et al., Nature 355(6360):5646(1992); Hoppe-Seyler F, Butz K "Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine”. J Mol Med. 78(8):42630(2000); Cohen BA, Colas P, Brent R. "An artificial cell-cycle inhibitor isolated from a combinatorial library”. Proc Natl Acad Sci USA. 95(24): 142727 (1998).
  • the agent for measuring the expression level of the gene encoding the protein comprises at least one selected from the group consisting of primers, probes and antisense nucleotides that specifically bind to the gene encoding the protein. It may include, but is not limited to.
  • the "primer” is a fragment that recognizes a target gene sequence, and includes a pair of forward and reverse primers, but preferably, a primer pair that provides analysis results with specificity and sensitivity. High specificity can be conferred when the primer's nucleic acid sequence is a sequence that is inconsistent with the non-target sequence present in the sample, so that only the target gene sequence containing the complementary primer binding site is amplified and the primer does not cause non-specific amplification. .
  • the "probe” refers to a substance capable of specifically binding to a target substance to be detected in a sample, and refers to a substance capable of specifically confirming the presence of a target substance in a sample through the binding.
  • the type of probe is not limited as a material commonly used in the art, but preferably PNA (peptide nucleic acid), LNA (locked nucleic acid), peptide, polypeptide, protein, RNA or DNA, and most preferably It is PNA.
  • the probe includes a biomaterial derived from or similar thereto or manufactured in vitro, for example, enzymes, proteins, antibodies, microorganisms, animal and plant cells and organs, neurons, DNA, and It may be RNA, DNA includes cDNA, genomic DNA, and oligonucleotides, RNA includes genomic RNA, mRNA, and oligonucleotides, and examples of proteins include antibodies, antigens, enzymes, peptides, and the like.
  • RNA includes cDNA, genomic DNA, and oligonucleotides
  • RNA includes genomic RNA, mRNA, and oligonucleotides
  • proteins include antibodies, antigens, enzymes, peptides, and the like.
  • LNA Locked nucleic acids
  • LNA nucleosides include common nucleic acid bases in DNA and RNA, and can form base pairs according to Watson-Crick base pairing rules. However, due to the 'locking' of the molecule due to the methylene bridge, the LNA does not form an ideal shape in the Watson-Crick bond.
  • LNAs When LNAs are incorporated into DNA or RNA oligonucleotides, LNAs can pair with complementary nucleotide chains more rapidly, increasing the stability of the double helix.
  • the "antisense” means that the antisense oligomer is hybridized with a target sequence in RNA by Watson-Crick base pairing, and typically mRNA and RNA in the target sequence: A sequence of nucleotide bases allowing the formation of an oligomeric heteroduplex. and oligomers having an inter-subunit backbone. An oligomer may have exact sequence complementarity or approximate complementarity to a target sequence.
  • kits for diagnosing anticancer drug resistance comprising the composition for diagnosing anticancer drug resistance of the present invention.
  • the "kit” refers to a tool capable of evaluating the expression level of a biomarker by labeling a probe or antibody that specifically binds to a biomarker component with a detectable label.
  • a detectable substance with respect to a probe or antibody by reaction with a substrate
  • indirect labeling in which a color-generating label is conjugated by reactivity with another directly labeled reagent. It may include a chromogenic substrate solution, a washing solution, and other solutions to undergo a color reaction with the label, and may be prepared including reagent components used.
  • the kit may be a kit including essential elements necessary for performing RT-PCR, and in addition to each primer pair specific for a marker gene, a test tube, reaction buffer, deoxynucleotides (dNTPs), Taq-polymerization enzymes, reverse transcriptase, DNase, RNase inhibitors, sterile water, and the like.
  • the kit may be a kit for detecting a gene for anticancer drug resistance diagnosis including essential elements necessary for performing a DNA chip.
  • the DNA chip kit may include a substrate to which cDNA corresponding to a gene or fragment thereof is attached as a probe, and the substrate may include cDNA corresponding to a quantitative control gene or fragment thereof.
  • the kit of the present invention is not limited thereto, as long as it is known in the art.
  • the kit may be an RT-PCR kit, a DNA chip kit, an ELISA kit, a protein chip kit, a rapid kit, or a multiple reaction monitoring (MRM) kit.
  • MRM multiple reaction monitoring
  • the kit of the present invention may further include one or more other component compositions, solutions or devices suitable for the assay method.
  • the kit may further include essential elements necessary for performing the reverse transcription polymerase reaction.
  • the reverse transcription polymerase reaction kit includes a pair of primers specific for a gene encoding a marker protein.
  • the primer is a nucleotide having a sequence specific to the nucleic acid sequence of the gene, and may have a length of about 7 bp to 50 bp, more preferably, about 10 bp to 30 bp. It may also include primers specific for the nucleic acid sequence of the control gene.
  • reverse transcription polymerase reaction kits include test tubes or other suitable containers, reaction buffers (with varying pH and magnesium concentrations), deoxynucleotides (dNTPs), enzymes such as Taq-polymerase and reverse transcriptase, DNase, RNase inhibitor DEPC -Water (DEPC-water), sterile water, etc. may be included.
  • the anticancer drug resistance diagnostic kit of the present invention may include essential elements necessary for performing a DNA chip.
  • the DNA chip kit may include a substrate to which cDNA or oligonucleotide corresponding to a gene or fragment thereof is attached, and reagents, agents, enzymes, etc. for preparing a fluorescently-labeled probe.
  • the substrate may also contain cDNA or oligonucleotides corresponding to control genes or fragments thereof.
  • the anticancer drug resistance diagnostic kit of the present invention may include essential elements necessary for performing ELISA.
  • the ELISA kit contains an antibody specific for this protein.
  • Antibodies are antibodies with high specificity and affinity for a marker protein and little cross-reactivity with other proteins, and are monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, or recombinant antibodies.
  • the ELISA kit may also include an antibody specific for a control protein.
  • Other ELISA kits include reagents capable of detecting bound antibody, such as labeled secondary antibodies, chromophores, enzymes (eg, conjugated with an antibody) and substrates thereof or capable of binding the antibody. other materials and the like.
  • a nitrocellulose membrane, a PVDF membrane, a polyvinyl resin or a polystyrene resin, a well plate synthesized from a glass, A slide glass or the like may be used, but is not limited thereto.
  • the label of the secondary antibody is preferably a color developing agent that exhibits a color reaction, HRP (horseradish peroxidase), basic dephosphorylation enzyme (alkaline phosphatase), colloid gold (colloid gold), Labels such as fluorescein and dye such as FITC (poly L-lysine-fluorescein isothiocyanate) and RITC (rhodamine-B-isothiocyanate) may be used, but are limited thereto it is not
  • the chromogenic substrate for inducing color development in the anticancer drug resistance diagnostic kit of the present invention is preferably used according to a colorimetric marker, TMB (3,3',5,5'-tetramethyl bezidine), ABTS[2,2'-azino-bis(3-ethylbenzothiazoline-6-sulfonic acid)], OPD(o-phenylenediamine), etc. can be used.
  • the chromogenic substrate is more preferably provided in a dissolved state in a buffer solution (0.1 M NaAc, pH 5.5).
  • a chromogenic substrate such as TMB is decomposed by HRP used as a label of the secondary antibody conjugate to generate chromogenic deposits, and the presence or absence of the marker proteins is detected by visually confirming the degree of deposition of the chromogenic deposits.
  • the washing solution preferably includes a phosphate buffer solution, NaCl and Tween 20, and a buffer solution (PBST) composed of 0.02 M phosphate buffer solution, 0.13 M NaCl, and 0.05% Tween 20. ) is more preferable.
  • PBST buffer solution
  • the secondary antibody is reacted with the antigen-antibody conjugate, and an appropriate amount is added to the immobilizer and washed 3 to 6 times.
  • a sulfuric acid solution H 2 SO 4
  • H 2 SO 4 sulfuric acid solution
  • it relates to a method of providing information for diagnosing anticancer drug resistance.
  • the method of the present invention may include measuring the expression level of the SDHA protein or a gene encoding the protein in a biological sample isolated from the subject of interest.
  • the method of the present invention may be for screening the presence or absence of anticancer drug resistance in a biological sample isolated from a target individual.
  • the "target subject” refers to an individual having cancer or a high probability of developing cancer, and may be a mammal including a human, for example, a human, a rat, a mouse, a guinea pig, a hamster, a rabbit, a monkey, a dog. , may be selected from the group consisting of cats, cows, horses, pigs, sheep and goats, preferably humans, but is not limited thereto.
  • the biological sample refers to any material, biological fluid, tissue or cell obtained from or derived from an individual, whole blood, leukocytes, peripheral blood mononuclear cells ), buffy coat, plasma, serum, sputum, tears, mucus, nasal washes, nasal aspirate, respiration (breath), urine, semen, saliva, peritoneal washings, ascites, cystic fluid, meningeal fluid, amniotic fluid , glandular fluid, pancreatic fluid, lymph fluid, pleural fluid, nipple aspirate, bronchial aspirate, synovial fluid, joint aspirate (joint aspirate), organ secretions (organ secretions), cells (cell), cell extract (cell extract), and may be at least one selected from the group consisting of cerebrospinal fluid (cerebrospinal fluid), but is not limited thereto.
  • the agent for measuring the expression level of the SDHA protein is at least one selected from the group consisting of an antibody, oligopeptide, ligand, PNA (peptide nucleic acid) and aptamer that specifically binds to the SDHA protein. may include.
  • the measurement of the expression level of the SDHA protein is a protein chip analysis, immunoassay, ligand binding assay, MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) analysis, SELDI-TOF (Sulface Enhanced Laser Desorption) /Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) analysis, radioimmunoassay, radioimmunodiffusion method, octeroni immunodiffusion method, rocket immunoelectrophoresis, tissue immunostaining, complement fixation assay, 2D electrophoresis analysis, liquid chromatography-mass spectrometry (liquid chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS), LC-MS/MS (liquid chromatography-Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry), Western blotting, or ELISA (enzyme linked immunosorbent assay) may be performed.
  • MALDI-TOF Microx Assisted Laser Desorption/Ionization Time
  • the measurement of the expression level of the SDHA protein may be performed by a multiple reaction monitoring (MRM) method.
  • MRM multiple reaction monitoring
  • a synthetic peptide in which a specific amino acid constituting a target peptide is substituted with an isotope or E. coli beta galactosidase may be used as the internal standard material.
  • the SDHA protein may consist of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, but is not limited thereto.
  • the agent for measuring the expression level of the gene encoding the SDHA protein may include one or more selected from the group consisting of primers, probes and antisense nucleotides that specifically bind to the gene encoding the SDHA protein. .
  • the measurement of the expression level of the gene encoding the SDHA protein is reverse transcription polymerase reaction (RT-PCR), competitive reverse transcription polymerase reaction (Competitive RT-PCR), real-time reverse transcription polymerase reaction (Real-time RT-PCR) ), RNase protection assay (RPA), Northern blotting or DNA chip.
  • RT-PCR reverse transcription polymerase reaction
  • Competitive RT-PCR competitive reverse transcription polymerase reaction
  • Real-time RT-PCR real-time reverse transcription polymerase reaction
  • RNase protection assay RPA
  • Northern blotting or DNA chip.
  • the expression level of the SDHA protein or a gene encoding it measured with respect to the biological sample of the target individual is higher than that of the control group, it is predicted that anticancer drug resistance has occurred or is highly likely to occur in the target individual, It can be predicted that the treatment responsiveness to anticancer drugs is low or, furthermore, the prognosis of cancer treatment is poor.
  • control group may be a normal control in which anticancer drug resistance does not occur, or an average to median value of the expression level of SDHA protein or a gene encoding the same in anticancer drug sensitive cells.
  • the expression level of the marker protein or nucleic acid molecule encoding it in the control group can be compared with the expression level of the marker protein or the nucleic acid molecule encoding the same in a biological sample derived from a cancer patient to be analyzed, and whether there is a significant change in the expression level can be used to diagnose anticancer drug resistance.
  • the anticancer agent is an OXPHOS inhibitor, nitrogen mustard, imatinib, oxaliplatin, rituximab, erlotinib, neratinib, lapatinib, gefitinib, vandetanib, nirotinib, semasanib, bosutinib, axiplatin nib, cediranib, restaurtinib, trastuzumab, gefitinib, bortezomib, sunitinib, carboplatin, bevacizumab, cisplatin, cetuximab, viscumalbum, asparaginase, tretinoin, hydroxy Carbamide, Dasatinib, Estramustine, Gemtuzumab Ozogamycin, Ibritumomab Tucetan, Heptaplatin, Methylaminolevulinic Acid, Amsacrine, Alemtuzumab, Procarbazine
  • the cancer is thyroid cancer, parathyroid cancer, stomach cancer, ovarian cancer, colorectal cancer, pancreatic cancer, liver cancer, breast cancer, cervical cancer, lung cancer, non-small cell lung cancer, prostate cancer, gallbladder cancer, biliary tract cancer, non-Hodgkin's lymphoma, Hodgkin's lymphoma , blood cancer, bladder cancer, kidney cancer, melanoma, colon cancer, bone cancer, skin cancer, head cancer, uterine cancer, rectal cancer, brain tumor, perianal cancer, fallopian tube carcinoma, endometrial carcinoma, vaginal cancer, vulvar carcinoma, esophageal cancer, small intestine cancer, endocrine adenocarcinoma , adrenal cancer, soft tissue sarcoma, urethral cancer, penile cancer, ureter cancer, renal cell carcinoma, renal pelvic carcinoma, CNS central nervoussystem tumor, primary CNS lymphoma, spinal cord tumor, brainstem glioma or pituit
  • it relates to a pharmaceutical composition for treating anticancer drug resistance or enhancing anticancer drug sensitivity.
  • composition of the present invention comprises an agent for reducing the activity or expression level of SDHA protein; Alternatively, it may include an agent that reduces the expression level of the gene encoding the protein as an active ingredient.
  • the agent for reducing the activity or expression level of the protein of the present invention is any one selected from the group consisting of compounds, peptides, peptide mimetics, aptamers, antibodies, and natural products that specifically bind to the protein or a portion thereof. It may include, but is not limited to, a method known as a method commonly used in the art that corresponds to a means for deriving an effect of inhibiting its activity or expression by acting directly or indirectly on the target SDHA protein. As long as it can be easily derived by technology, the present invention is not limited thereto, and all of them may be included.
  • the "peptide mimetics (Peptide Minetics)" is a peptide or non-peptide that inhibits the binding domain of the SDHA protein leading to the inhibition of SDHA activity.
  • Major residues of non-hydrolyzable peptide analogs include the ⁇ -turn dipeptide core (Nagai et al. Tetrahedron Lett 26:647, 1985), keto-methylene pseudopeptides (Ewenson et al. J Med chem 29:295, 1986; and Ewenson et al. in Peptides: Structure and Function (Proceedings of the 9th AmeriCan Peptide Symposium) Pierce chemiCal co.
  • the "aptamer (Aptamer)” is a single-stranded nucleic acid (DNA, RNA or modified nucleic acid) having a stable tertiary structure by itself and having high affinity and specificity to bind to a target molecule.
  • SELEX Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment
  • Many aptamers capable of binding to various target molecules have been continuously discovered. Aptamers are comparable to single antibodies because of their inherent high affinity (usually at pM level) and specificity to bind to a target molecule, and have high potential as an alternative antibody, especially as a “chemical antibody”.
  • the "antibody” can be used either prepared through the protein injection or purchased commercially.
  • the antibody includes polyclonal antibodies, monoclonal antibodies, and fragments capable of binding to an epitope.
  • the polyclonal antibody can be produced by a conventional method of injecting the protein into an animal and collecting blood from the animal to obtain a serum containing the antibody.
  • Such polyclonal antibodies can be purified by any method known in the art and can be made from any animal species host, such as goat, rabbit, sheep, monkey, horse, pig, cow, dog, and the like.
  • the monoclonal antibody can be prepared using any technique that provides for the production of the antibody molecule through culture of a continuous cell line.
  • Such techniques include, but are not limited to, hybridoma technology, human B-cell line hybridoma technology, and EBV-hybridoma technology.
  • antibody fragments containing specific binding sites for the above proteins can be prepared.
  • the F(ab')2 fragment may be prepared by digesting an antibody molecule with pepsin, and the Fab fragment may be prepared by reducing the disulfide bridge of the F(ab')2 fragment.
  • the Fab expression library small, monoclonal Fab fragments having a desired specificity can be quickly and conveniently identified.
  • the antibody may be bound to a solid substrate to facilitate subsequent steps such as washing or separation of the complex.
  • Solid substrates include, for example, synthetic resins, nitrocellulose, glass substrates, metal substrates, glass fibers, microspheres and microbeads.
  • the synthetic resin includes polyester, polyvinyl chloride, polystyrene, polypropylene, PVDF and nylon.
  • the agent for reducing the activity or expression level of the protein may be one that specifically binds to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 1 of the SDHA protein, and preferably, the composition of the present invention is an antibody specific for the SDHA protein. may include, wherein the antibody may specifically bind to the polypeptide represented by SEQ ID NO: 1, but is not limited thereto.
  • the agent for reducing the expression level of the gene encoding the protein of the present invention is a gene encoding the protein, preferably antisense nucleotides complementary to the gene or a portion thereof, small interfering RNA (short interfering RNA; siRNA), short hairpin RNA (short hairpin RNA), and may include any one or more selected from the group consisting of ribozyme (ribozyme), but is not limited thereto, and acts directly or indirectly on the gene encoding the target SDHA protein. Therefore, as long as it corresponds to a means for deriving the effect that its expression is inhibited and can be easily derived by a method known in the art as a method commonly used in the art, it is not limited thereto and may include all.
  • the "antisense nucleotide” binds (hybridizes) to the complementary base sequence of DNA, immature-mRNA, or mature mRNA as defined in Watson-Click base pairing to disrupt the flow of genetic information from DNA to protein.
  • the nature of antisense nucleotides specific to a target sequence makes them exceptionally versatile. Since antisense nucleotides are long chains of monomeric units, they can be readily synthesized for the target RNA sequence. Many recent studies have demonstrated the utility of antisense nucleotides as biochemical means for studying target proteins.
  • antisense nucleotides Due to recent advances in oligonucleotide chemistry and nucleotide synthesis with improved cell line adsorption, target binding affinity and nuclease resistance, the use of antisense nucleotides can be considered as a new type of inhibitor.
  • the shRNA and “siRNA” are nucleic acid molecules capable of mediating RNA interference or gene silencing, and since they can inhibit the expression of a target gene, an efficient gene knockdown method or gene therapy used in a way
  • the shRNA forms a hairpin structure by bonding between complementary sequences within a single-stranded oligonucleotide.
  • siRNA which is a double-stranded oligonucleotide, and can inhibit expression by specifically binding to mRNA having a complementary sequence.
  • siRNA refers to a small double-stranded RNA fragment of 21 to 25 nucleotides in size that modifies the target mRNA by double-stranded RNA (dsRNA) to induce RNA interference (RNAi).
  • siRNA can be synthesized chemically or enzymatically.
  • the method for preparing siRNA is not particularly limited, and methods known in the art may be used.
  • a method of directly chemically synthesizing siRNA a method of synthesizing siRNA using in vitro transcription, a method of cleaving a long double-stranded RNA synthesized by in vitro transcription using an enzyme
  • Expression method through intracellular delivery of an shRNA expression plasmid or viral vector and expression method through intracellular delivery of a PCR (polymerase chain reaction)-induced siRNA expression cassette (cassette), but are not limited thereto.
  • the "ribozyme” refers to an RNA molecule having catalytic activity. Ribozymes having a variety of activities are known, and ribozymes of the SDHA gene include known or artificially generated ribozymes, and selectively ribozymes having target-specific RNA cleavage activity are prepared by known standard techniques. can be
  • the agent that reduces the expression level of the gene encoding the protein may be an agent that targets the FAD binding site of SDHA or an agent that acts by targeting the ubiquinone binding site of SDHB or SDHC/D, For example, 3-nitropropionic acid (3NPA), atpenin A5 (atpenin A5); Alternatively, it may include an SDHA protein activity or expression inhibitor or an SDHA protein-coding gene expression inhibitor, but is not limited thereto, as long as it performs a function of inhibiting cellular respiration.
  • 3NPA 3-nitropropionic acid
  • atpenin A5 atpenin A5
  • it may include an SDHA protein activity or expression inhibitor or an SDHA protein-coding gene expression inhibitor, but is not limited thereto, as long as it performs a function of inhibiting cellular respiration.
  • the "3-nitropropionic acid (3NPA)" is a compound composed of 5 hydrogen atoms, 3 carbon atoms, 1 nitrogen atom, and 4 oxygen atoms, and a total of 13 atoms as a compound composed of mitochondrial electron transport It is known as an inhibitor of succinate dehydrogenase acting on the chain complex ⁇ .
  • the "atpenin A5 is an inhibitor of mitochondrial complex II, which is a ubiquinone binding site, and stimulates the ATP-sensitive potassium channel (KATP channel) of mitochondria, and also functions as a respiratory inhibitor.
  • KATP channel ATP-sensitive potassium channel
  • the agent for reducing the expression level of the gene encoding the SDHA protein is an antisense nucleotide complementary to the gene encoding the SDHA protein, short interfering RNA (siRNA), short hairpin RNA (short). hairpin RNA) and ribozyme (ribozyme), but may include any one or more selected from the group consisting of, but is not limited thereto.
  • an agent for reducing the expression level of the gene encoding the SDHA protein it may be an siRNA comprising the nucleotide sequence shown in SEQ ID NO: 3 and SEQ ID NO: 4, but is not limited thereto.
  • composition of the present invention may further include one of 3-nitropropionic acid (3-nitropropionic acid; 3NPA) or atpenin A5 (atpenin A5) in order to treat anticancer drug resistance or increase the anticancer drug sensitivity enhancement effect.
  • 3NPA 3-nitropropionic acid
  • atpenin A5 atpenin A5
  • composition of the present invention may further include an anticancer agent, wherein the anticancer agent includes nitrogen mustard, imatinib, oxaliplatin, rituximab, erlotinib, neratinib, lapatinib, gefitinib, vandetanib, nirotinib, semasanib, bosutinib, axitinib, cediranib, restaurtinib, trastuzumab, gefitinib, bortezomib, sunitinib, carboplatin, bevacizumab, cisplatin, cetuximab , viscum albumen, asparaginase, tretinoin, hydroxycarbamide, dasatinib, estramustine, gemtuzumab ozogamicin, ibritumomab tusetan, heptaplatin, methylaminolevulinic acid, amsa
  • anticancer drug resistance refers to a decrease in the effect of an anticancer drug when the anticancer drug is used quantitatively and repeatedly. It is a condition in which the same effect as before is not obtained even if the dose must be increased or the same dose of the substance is administered.
  • the term "resistance treatment” means that when an anticancer agent is quantitatively and repeatedly used, the effect of the drug is reduced, or in order to obtain the same effect previously experienced in patients with anticancer drug resistance, the amount of use or frequency of use must be increased. It refers to the action of restoring a state in which the same effect as before is not obtained even after administration of the same amount of substance as before. More specifically, the same anticancer effect can be obtained even if the anticancer agent is applied fewer times or a smaller dose, or the same effect can be obtained even when the same dose or a smaller dose of the substance is administered by returning to the state before the occurrence of anticancer drug resistance. action that makes it exist.
  • the description of SDHA protein or a gene encoding it, various anticancer drugs, etc. is the same as described in the previous diagnostic composition, in order to avoid excessive complexity of the present specification. omit
  • it relates to a pharmaceutical composition for preventing or treating anticancer drug-resistant cancer.
  • composition of the present invention comprises an agent for reducing the activity or expression level of SDHA protein; Alternatively, it may include an agent that reduces the expression level of the gene encoding the protein as an active ingredient.
  • an agent for reducing the activity or expression of the protein of the SDHA (succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) in the present invention may act by targeting the FAD binding site of the SDHA protein or acting by targeting the ubiquinone binding site of SDHB or SDHC/D, for example For example, 3-nitropropionic acid (3NPA), atpenin A5 (atpenin A5); Alternatively, it may include an SDHA protein activity or expression inhibitor or an SDHA protein-coding gene expression inhibitor, but is not limited thereto, as long as it performs a function of inhibiting cellular respiration.
  • 3NPA 3-nitropropionic acid
  • atpenin A5 atpenin A5
  • it may include an SDHA protein activity or expression inhibitor or an SDHA protein-coding gene expression inhibitor, but is not limited thereto, as long as it performs a function of inhibiting cellular respiration.
  • composition of the present invention may further include at least one of 3-nitropropionic acid (3NPA) or atpenin A5 (atpenin A5) to treat anticancer drug resistance or increase the anticancer drug sensitivity enhancement effect.
  • 3NPA 3-nitropropionic acid
  • atpenin A5 atpenin A5
  • composition of the present invention may further include an anticancer agent, wherein the anticancer agent includes nitrogen mustard, imatinib, oxaliplatin, rituximab, erlotinib, neratinib, lapatinib, gefitinib, vandetanib, nirotinib, semasanib, bosutinib, axitinib, cediranib, restaurtinib, trastuzumab, gefitinib, bortezomib, sunitinib, carboplatin, bevacizumab, cisplatin, cetuximab , viscum albumen, asparaginase, tretinoin, hydroxycarbamide, dasatinib, estramustine, gemtuzumab ozogamicin, ibritumomab tusetan, heptaplatin, methylaminolevulinic acid, amsa
  • the "prevention" of the present invention may be included without limitation as long as it blocks symptoms caused by uncontrolled growth of cancer cells, etc., or suppresses or delays the symptoms using the composition of the present invention.
  • treatment of the present invention may be included without limitation as long as the symptoms caused by the uncontrolled growth of cancer cells are improved or beneficial by using the composition of the present invention.
  • each protein or a gene encoding the same an agent for reducing the activity or expression level of the protein;
  • the description of the agent for reducing the expression level of the gene encoding the protein is the same as described in the composition for anticancer drug resistance treatment and anticancer drug sensitivity enhancement composition, and is omitted in order to avoid excessive complexity of the present specification.
  • the pharmaceutical composition may be characterized in the form of capsules, tablets, granules, injections, ointments, powders or beverages, and the pharmaceutical composition may be characterized in that it is targeted to humans.
  • the pharmaceutical composition of the present invention is not limited thereto, but each is formulated in the form of oral dosage forms such as powders, granules, capsules, tablets, aqueous suspensions, external preparations, suppositories, and sterile injection solutions according to conventional methods.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may include a pharmaceutically acceptable carrier.
  • Pharmaceutically acceptable carriers may include binders, lubricants, disintegrants, excipients, solubilizers, dispersants, stabilizers, suspending agents, dyes, fragrances, etc., for oral administration, and in the case of injections, buffers, preservatives, pain-free agents Agents, solubilizers, isotonic agents, stabilizers, etc.
  • the dosage form of the pharmaceutical composition of the present invention can be prepared in various ways by mixing with a pharmaceutically acceptable carrier as described above.
  • a pharmaceutically acceptable carrier as described above.
  • it can be prepared in the form of tablets, troches, capsules, elixirs, suspensions, syrups, wafers, etc., and in the case of injections, it can be prepared in the form of unit dose ampoules or multiple doses. have.
  • it can be formulated as a solution, suspension, tablet, capsule, sustained release formulation, and the like.
  • examples of carriers, excipients and diluents suitable for formulation include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, xylitol, erythritol, malditol, starch, acacia gum, alginate, gelatin, calcium phosphate, calcium silicate, Cellulose, methyl cellulose, microcrystalline cellulose, polyvinylpyrrolidone, water, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate or mineral oil may be used.
  • fillers, anti-agglomeration agents, lubricants, wetting agents, fragrances, emulsifiers, preservatives and the like may be further included.
  • the route of administration of the pharmaceutical composition of the present invention is not limited thereto, but oral, intravenous, intramuscular, intraarterial, intramedullary, intrathecal, intracardiac, transdermal, subcutaneous, intraperitoneal, intranasal, intestinal, topical , sublingual or rectal. Oral or parenteral administration is preferred.
  • the "parenteral" of the present invention includes subcutaneous, intradermal, intravenous, intramuscular, intraarticular, intrasynovial, intrasternal, intrathecal, intralesional and intracranial injection or infusion techniques.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may also be administered in the form of a suppository for rectal administration, but is not limited thereto.
  • the pharmaceutical composition of the present invention depends on several factors including the activity of the specific compound used, age, weight, general health, sex, formula, administration time, administration route, excretion rate, drug formulation, and the severity of the specific disease to be prevented or treated.
  • the dosage of the pharmaceutical composition may vary depending on the patient's condition, weight, degree of disease, drug form, administration route and period, but may be appropriately selected by those skilled in the art, and 0.0001 to 50 mg per day It may be administered at /kg or 0.001 to 50 mg/kg. Administration may be administered once a day, or may be administered in several divided doses. The above dosage does not limit the scope of the present invention in any way.
  • the pharmaceutical composition according to the present invention may be formulated as pills, dragees, capsules, solutions, gels, syrups, slurries, and suspensions.
  • it relates to a method of treating anticancer drug resistance or enhancing anticancer drug sensitivity.
  • the method of the present invention includes an agent for reducing the activity or expression level of a succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A (SDHA) protein to a subject in need of administration; Or it may include the step of administering an effective amount of an agent that reduces the expression level of the gene encoding the protein.
  • SDHA succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A
  • it relates to a method for preventing or treating anticancer drug-resistant cancer.
  • the method of the present invention includes an agent for reducing the activity or expression level of a succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A (SDHA) protein to a subject in need of administration; Or it may include the step of administering an effective amount of an agent that reduces the expression level of the gene encoding the protein.
  • SDHA succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A
  • the anticancer drug resistance treatment method of the present invention a method for enhancing anticancer drug sensitivity; And in the method of preventing or treating anticancer drug-resistant cancer, each protein or a gene encoding the same, an agent for reducing the activity or expression level of the protein; Or the description of the agent for reducing the expression level of the gene encoding the protein overlaps with that described above, and is omitted in order to avoid excessive complexity of the present specification.
  • administration means providing a predetermined composition of the present invention to a subject by any suitable method.
  • the "subject" in need of the administration may include both mammals and non-mammals.
  • mammals include humans, non-human primates such as chimpanzees, other apes or monkey species; livestock animals such as cattle, horses, sheep, goats, pigs; domestic animals such as rabbits, dogs or cats; laboratory animals such as rodents such as rats, mice or guinea pigs, but are not limited thereto.
  • non-mammal in the present invention may include, but are not limited to, birds or fish.
  • the formulation of the composition administered as described above in the present invention is not particularly limited, and may be administered as a solid formulation, a liquid formulation, or an aerosol formulation for inhalation, and a liquid formulation for oral or parenteral administration immediately before use. It can be administered in a solid form preparation intended to be converted into However, the present invention is not limited thereto.
  • a pharmaceutically acceptable carrier may be additionally administered together with the composition of the present invention.
  • the pharmaceutically acceptable carrier may include a binder, a lubricant, a disintegrant, an excipient, a solubilizer, a dispersing agent, a stabilizer, a suspending agent, a dye, a fragrance, etc.
  • a buffer Preservatives, analgesics, solubilizers, isotonic agents, stabilizers, etc. can be mixed and used.
  • bases, excipients, lubricants, preservatives, etc. can be used for topical administration.
  • the formulation of the compound of the present invention can be prepared in various ways by mixing with the pharmaceutically acceptable carrier as described above.
  • the pharmaceutically acceptable carrier for example, in the case of oral administration, it can be prepared in the form of tablets, troches, capsules, elixirs, suspensions, syrups, wafers, etc., and in the case of injections, it can be prepared in the form of unit dose ampoules or multiple doses. have.
  • it can be formulated as a solution, suspension, tablet, capsule, sustained release formulation, and the like.
  • suitable carriers, excipients and diluents for formulation include lactose, dextrose, sucrose, sorbitol, mannitol, xylitol, erythritol, maltitol, starch, acacia gum, alginate, gelatin, calcium phosphate, calcium silicate, cellulose , methyl cellulose, microcrystalline cellulose, polyvinylpyrrolidone, water, methylhydroxybenzoate, propylhydroxybenzoate, talc, magnesium stearate, or mineral oil may be used.
  • fillers, anti-agglomeration agents, lubricants, wetting agents, fragrances, emulsifiers, preservatives and the like may be further included.
  • the route of administration of the composition according to the present invention is, but not limited to, oral, intravenous, intramuscular, intraarterial, intramedullary, intrathecal, intracardiac, transdermal, subcutaneous, intraperitoneal, intranasal, intestinal, topical, sublingual or work. Oral or parenteral administration is preferred.
  • parenteral includes subcutaneous, intradermal, intravenous, intramuscular, intraarticular, intrasynovial, intrasternal, intrathecal, intralesional and intracranial injection or infusion techniques.
  • the pharmaceutical composition of the present invention may also be administered in the form of a suppository for rectal administration.
  • a "pharmaceutically effective amount” refers to an amount sufficient of an agent to provide a desired biological result. The result may be reduction and/or alleviation of the signs, symptoms or causes of a disease, or any other desirable change in the biological system.
  • an “effective amount” for therapeutic use is the amount of a composition disclosed herein required to provide a clinically significant reduction in disease.
  • An appropriate “effective” amount in any individual case can be determined by one of ordinary skill in the art using routine experimentation. Accordingly, the expression “effective amount” generally refers to the amount in which the active substance has a therapeutic effect.
  • the active substance is a prophylactic, ameliorating or therapeutic agent for cancer, and a prophylactic, ameliorating or therapeutic agent for anticancer drug-resistant cancer.
  • composition of the present invention may vary depending on various factors including the activity of the active substance used, age, weight, general health, sex, diet, administration time, administration route, excretion rate, drug formulation, and the severity of the specific disease to be prevented or treated.
  • the dosage of the active substance may vary depending on the patient's condition, weight, disease severity, drug form, administration route and period, but may be appropriately selected by those skilled in the art, and may be 0.0001 to 100 mg/kg or 0.001 per day. to 100 mg/kg may be administered. Administration may be administered once a day, or may be administered in several divided doses. The above dosage does not limit the scope of the present invention in any way.
  • the compounds according to the present invention can be formulated as pills, dragees, capsules, solutions, gels, syrups, slurries, and suspensions.
  • the active substances of the present invention can be used alone or in combination with methods using surgery, radiation therapy, hormone therapy, chemotherapy, and biological response modifiers.
  • composition of the present invention may be used in combination with other anticancer agents, wherein the anticancer agents include nitrogen mustard, imatinib, oxaliplatin, rituximab, erlotinib, neratinib, lapatinib, gefitinib, vande tanib, nirotinib, semasanib, bosutinib, axitinib, cediranib, restaurtinib, trastuzumab, gefitinib, bortezomib, sunitinib, carboplatin, sorafenib, bevacizumab, cisplatin, cetuximab, viscumalbum, asparaginase, tretinoin, hydroxycarbamide, dasatinib, estramustine, gemtuzumab ozogamicin, ibritumomab tucetan, heptaplatin, methylamin
  • it relates to a screening method for a drug for overcoming anticancer drug resistance or a drug for treatment or anticancer drug sensitivity enhancement.
  • the screening method of the present invention comprises the steps of treating a candidate substance with respect to a cancer cell or cancer tissue expressing the SDHA protein or a gene encoding the same in vitro; and measuring the activity or expression level of the SDHA protein or measuring the expression level of a gene encoding the protein in the cancer cells or cancer tissue after treatment with the candidate substance.
  • the "screening” refers to selecting a substance having a specific target property from a candidate group consisting of several substances by a specific manipulation or evaluation method.
  • the cancer cell may be a target individual, preferably one isolated from an individual resistant to or highly likely to have an anticancer agent, or engineered to overexpress SDHA protein or a gene encoding the same, preferably A recombinant vector containing a gene encoding the SDHA protein may be introduced into and transfected into cancer cells.
  • the "vector” refers to a means for expressing a target gene in a host cell.
  • the vector includes elements for expression of a target gene, and may include an origin of replication, a promoter, an operator, a transcription termination sequence, and the like, into the genome of a host cell. Appropriate enzymatic sites (eg, restriction enzyme sites) for introduction of and/or ribosome binding sites (RBS) for translation into selectable markers and/or proteins to confirm successful introduction into host cells, IRES (Internal Ribosome Entry Site) and the like may be additionally included.
  • the vector may be engineered by a conventional genetic engineering method to have the above-described fusion polynucleotide (fusion promoter) as a promoter.
  • the vector may further include a transcriptional control sequence (eg, enhancer, etc.) other than the promoter.
  • the recombinant vector may be a viral or non-viral vector
  • the viral vector may be an adenoviral vector, a retroviral vector including a lentivirus, an adeno-associated viral vector, or a herpes simplex virus vector.
  • the non-viral vector may be a plasmid vector, a bacteriophage vector, a liposome, a bacterial artificial chromosome, an artificial yeast chromosome, and the like, but is not limited thereto.
  • the target gene in the recombinant vector may be operably linked to the fusion polynucleotide.
  • operatively linked refers to a functional linkage between a gene expression control sequence and another nucleotide sequence.
  • the gene expression control sequences may be "operatively linked" to control the transcription and/or translation of other nucleotide sequences.
  • the fusion polynucleotide in order for the fusion polynucleotide to be operably linked to the target gene, the fusion polynucleotide may be linked to the 5' end of the target gene.
  • the recombinant vector of the present invention can be used as an expression vector for a target protein capable of expressing the target protein with high efficiency in an appropriate host cell when the gene encoding the target protein to be expressed is operably linked.
  • the recombinant vector of the present invention may further include a transcriptional control sequence.
  • the transcriptional regulatory sequence may include a transcription termination sequence such as a polyadenylation sequence (pA); It may be one or more selected from the group consisting of replication origins such as f1 replication origin, SV40 replication origin, pMB1 replication origin, adeno replication origin, AAV replication origin, BBV replication origin, etc., but is not limited thereto.
  • the recombinant vector may further include a selection marker.
  • the selection marker is a gene for confirming whether the recombinant vector has been successfully introduced into the host cell or for constructing a stable cell line, for example, one selected from the group consisting of drug resistance genes such as antibiotics, metabolism-related genes, gene amplification genes, and the like. may be more than
  • a delivery method well known in the art may be used for the delivery (introduction) of the recombinant vector into cancer cells.
  • the delivery method includes, for example, microinjection, calcium phosphate precipitation, electroporation, sonoporation, magnetofection using a magnetic field, liposome-mediated transfection, gene bambadment (gene). bombardment), dendrimers, and the use of inorganic nanoparticles, but is not limited thereto.
  • the candidate material may be at least one selected from the group consisting of natural compounds, synthetic compounds, RNA, DNA, polypeptides, enzymes, proteins, ligands, antibodies, antigens, bacterial or fungal metabolites and bioactive molecules. , but is not limited thereto.
  • the agent for measuring the activity or expression level of the protein is not particularly limited, but for example, an antibody, oligopeptide, ligand, PNA (peptide nucleic acid) and aptamer that specifically binds to the protein. ) may include one or more selected from the group consisting of.
  • a method for measuring or comparing the activity or expression level of the protein protein chip analysis, immunoassay, ligand binding assay, MALDI-TOF (Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) analysis, SELDI- TOF (Sulface Enhanced Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) analysis, radioimmunoassay, radioimmunodiffusion method, Oukteroni immunodiffusion method, rocket immunoelectrophoresis, tissue immunostaining, complement fixation assay, two-dimensional electrophoresis analysis, Liquid chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS), LC-MS/MS (liquid chromatography-Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry), Western blotting or ELISA (enzyme linked immunosorbent assay), etc., but are limited thereto it's not going to be
  • the agent for measuring the expression level of the gene encoding the protein may include one or more selected from the group consisting of primers, probes, and antisense nucleotides that specifically bind to the gene.
  • RT-PCR reverse transcription polymerase reaction
  • Competitive RT-PCR competitive reverse transcription polymerase reaction
  • Real-time RT-PCR real-time reverse transcription polymerase reaction
  • RPA RNase protection assay
  • the candidate substance when the activity or expression level of the SDHA protein measured in the cancer cells or cancer tissue is decreased after the treatment of the candidate substance in the present invention, or the expression level of the gene encoding the protein is decreased, the candidate substance is used for resistance to anticancer drugs It may further comprise the step of determining a drug for overcoming or therapeutic or anticancer drug sensitivity enhancement.
  • anticancer agents and cancer are the same as those described in the anticancer agent resistance diagnostic composition, and thus are omitted to avoid excessive complexity of the present specification.
  • the present invention when used, by diagnosing resistance to anticancer drugs, it is possible to provide accurate basic information on the suitability of anticancer drugs for each cancer patient in future treatment plans. In addition, when the present invention is used, it is possible to overcome resistance to anticancer drugs and further effectively prevent, improve or treat anticancer drug-resistant cancer.
  • FIGS. 1A and 1B are diagrams illustrating the results of measuring cell viability after administration of IM156 drug in various cell lines, according to an embodiment of the present invention.
  • Figure 2a is a diagram confirming the expression level of SDHA gene expression in various cell lines through Western blot analysis according to an embodiment of the present invention.
  • 2b is a Western blot showing the expression level of SDHA by classifying a breast cancer cell line (MDA-MB-231 or MCF7) and a gastric cancer cell line (SK4, MKN45 or AGS) into P cells and S cells according to an embodiment of the present invention. It is a diagram confirmed by comparison.
  • MDA-MB-231 or MCF7 breast cancer cell line
  • SK4, MKN45 or AGS gastric cancer cell line
  • FIGS 3a and 3b according to an embodiment of the present invention, IM156 resistant cell line (Hs746T) and IM156 sensitive cell line (SNU638) Rotenone (Rotenone) or a diagram confirming the degree of SDHA expression change according to the administration of the IM156 drug am.
  • 4a to 4c are results of measuring the oxygen consumption rate (OCR) in the cellular respiration process after administration of rotenone or IM156 drug in the IM156 resistant cell line (Hs746T) according to an embodiment of the present invention; is a confirmation of
  • OCR Oxygen Consumption Rate
  • FIGS. 6a and 6b according to an embodiment of the present invention, 3-nitropropionic acid (3-nitropropionic acid; 3NPA) or atpenin A5 (atpenin A5) when the drug administration oxygen consumption rate (OCR) through the measurement of the anticancer drug sensitivity change
  • 3NPA 3-nitropropionic acid
  • OCR drug administration oxygen consumption rate
  • FIGS. 7A and 7B are diagrams comparing and confirming changes in anticancer drug sensitivity through oxygen consumption rate (OCR) measurement during SDHA inhibitor drug administration or SDHA gene knockdown, according to an embodiment of the present invention.
  • OCR oxygen consumption rate
  • One embodiment of the present invention relates to a composition for diagnosing anticancer drug resistance, comprising an agent for measuring the expression level of a succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A (SDHA) protein or a gene encoding the same.
  • SDHA succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A
  • Another embodiment of the present invention relates to a kit for diagnosing anticancer drug resistance comprising the composition for diagnosing anticancer drug resistance of the present invention.
  • Another embodiment of the present invention relates to a method for providing information for diagnosing anticancer drug resistance, comprising measuring the expression level of the SDHA protein or a gene encoding the protein in a biological sample isolated from a target individual. .
  • an agent for reducing the activity or expression level of the SDHA protein or a pharmaceutical for treating anticancer drug resistance or enhancing anticancer drug sensitivity comprising an agent for reducing the expression level of a gene encoding the protein as an active ingredient It relates to the enemy composition.
  • an agent for reducing the activity or expression level of SDHA protein to a subject in need of administration relates to a method for treating anticancer drug resistance or enhancing anticancer drug sensitivity, comprising administering an effective amount of an agent that reduces the expression level of the gene encoding the protein.
  • a pharmaceutical composition for preventing or treating anticancer drug-resistant cancer comprising an agent for reducing the activity or expression level of SDHA protein or an agent for reducing the expression level of a gene encoding the protein as an active ingredient is about
  • an agent for reducing the activity or expression level of SDHA protein to a subject in need of administration relates to a method for preventing or treating anticancer drug-resistant cancer comprising administering an effective amount of an agent for reducing the expression level of the gene encoding the protein.
  • in vitro treating the candidate substance with respect to the SDHA protein or cancer cells or cancer tissue expressing the gene encoding the same; and measuring the activity or expression level of the SDHA protein or measuring the expression level of a gene encoding the protein with respect to the cancer cells or cancer tissue after treatment with the candidate substance. It relates to a screening method for a drug for enhancing sensitivity.
  • the inventors of the present invention performed all experiments with the approval of the Yonsei University School of Medicine Evaluation Committee (Institutional Review Board, IRB).
  • Human gastric cancer cell lines, Hs 746T, MKN-45, YCC-11, and YCC-16, were obtained from the American Type Culture Collection (ATCC) for the experiment, and human gastric cancer from the Korean Cell Line Bank.
  • ATCC American Type Culture Collection
  • Cell lines SK4, MKN-1, NCC-59, SNU-1750, SNU-1967, SNU-484, SNU-601, SNU-638, SNU-668 and SNU-719 were obtained, and a guide from the US or Korean cell line bank 1% penicillin in RPMI 1640 medium containing 10% FBS according to the - by adding streptomycin (Gibco) in the experiment and incubated at 37 °C, 5% CO 2 incubator (HERAcell 150i, Thermo Scientific, Waltham, MA, USA) was used.
  • each of the various gastric cancer cell lines obtained and cultured in Example 1.1 was treated with the IM156 drug, a type of OXPHOS inhibitor, at each concentration.
  • the values measured for cell viability through the MTT assay for each concentration of the drug are shown in the graph of FIG. 1 .
  • the cell viability rapidly changed within the concentration range of 6.33 uM to 63.29 uM (see FIG. 1a ).
  • Hs746T having the highest cell viability as a resistant cell line and SNU638 having the lowest cell viability as a sensitive cell line were selected (see FIG. 1b ).
  • cell lines of other carcinomas (breast cancer cell lines MDA-MB-231 and MCF7, colon cancer cell lines HCT116 and SW480, lung cancer cell lines A549, gastric cancer cell lines Hs746T, YCC9 and SK4) were separately obtained and carried out. It was cultured in the same manner as in Example 1.1. Western blot was performed to measure the expression level of the SDHA biomarker from them (see FIG. 2a ). In general, it was confirmed that SDHA expression was observed in cancer cells.
  • Hs746T a drug-resistant cell line selected in Example 1, and SNU638, a sensitive cell line
  • SNU638 a sensitive cell line
  • the SDHA expression level of the resistant cell line did not show change in the group administered with rotenone, whereas it was observed that the SDHA expression level increased in the group administered with IM156 compared to before drug administration (see FIG. 3a ).
  • each drug was administered to a drug-sensitive cell line and observed.
  • there was no change in SDHA expression level in the group administered with rotenone before and after drug administration. was confirmed (see FIG. 3b ).
  • FIG. 3b Taken together, these results suggest that SDHA can be used as a marker to confirm resistance to the IM156 drug through the change in SDHA expression level before and after drug administration.
  • the Hs746T and SNU638 cell lines selected in Example 1 were compared to determine whether resistance to the drug occurred.
  • rotenone and IM156 drugs were administered to the resistant cell line Hs746T, respectively, and the oxygen consumption rate (OCR) was measured and analyzed in the process of cellular respiration.
  • OCR oxygen consumption rate
  • FIGS. 5A to 5C Numerical values on the drawings according to all Examples below are expressed as mean ⁇ standard error of the mean (SEM), and * indicates statistical significance (*P ⁇ 0.05, **P ⁇ 0.005).
  • Oxygen consumption which is an indicator of oxidative phosphorylation, is a metabolic process of cancer cells and can be a measure of how actively the division of cancer cells occurs.
  • XF Calibrant buffer (Agilent Technologies) was added to the sensor cartridge (Agilent Technologies, Palo Alto, CA, USA), and overnight at 37 °C non-CO 2 incubator conditions.
  • A549 cells, a gastric cancer cell line were aliquoted at 7 ⁇ 10 4 cells/well in XF24 cell culture microplate (Agilent Technologies), and then, after 24 hours at 37 ° C, 5% CO 2 incubator, 50 nM of rotenone drug or 15 uM of IM156 drug After administration, 37 °C, 5% CO 2 It was overnight in an incubator.
  • XF base media pH 7.4, Agilent Technologies
  • XF base media pH 7.4, Agilent Technologies
  • P cells (PSK4) and S cells (SSK4) were prepared from the SK4 cell line, a gastric cancer cell line, and 3-nitropropionic acid (3 After administration of -nitropropionic acid; 3NPA) or atpenin A5 (atpenin A5), the results of measuring OCR are shown in FIGS. 6a and 6b. It was confirmed that the above two agents act on SSK4 cells with stem cell characteristics to have a cancer treatment effect. Confirmed.
  • siRNA manufactured by Bioneer
  • transfection reagent manufactured by mirus bio
  • the anticancer drug resistance is treated by treating the 3-nitropropionic acid drug or the artphenin A5 drug directly or indirectly related to the inhibition of SDHA expression, or by knocking down the SDHA expression using siRNA.
  • IM156 drug resistance is more specifically IM156 drug resistance. It is expected to lead to an improvement in the cancer treatment effect.
  • composition according to the present invention can be used not only to diagnose resistance to anticancer drugs, but also to overcome resistance to the anticancer drugs and further effectively prevent, improve or treat anticancer drug-resistant cancers.

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Abstract

본 발명은 신규한 항암제 내성 진단용 바이오 마커 조성물을 이용하여, 항암제 내성을 진단하고 이를 극복하는 항암제 내성 치료용 조성물에 관한 것이다. 투약 전에 환자별 항암제 적합성 여부를 미리 예측하여 정확한 기초 정보를 제공함으로써 환자의 비용 부담을 줄일 수 있으며, 아울러 항암제 내성을 치료하여 생존률을 높일 수 있을 것으로 기대된다.

Description

항암제 내성 진단 또는 치료용 조성물
본 발명은 항암제 내성을 진단하고, 더 나아가 내성을 치료할 수 있는 조성물에 관한 것이다.
암은 인류가 해결해야 할 난치병 중의 하나로, 전 세계적으로 이를 치유하기 위한 개발에 막대한 자본이 투자되고 있는 실정이며, 우리나라의 경우, 질병 사망 원인 중 제 1위의 질병으로서 연간 약 10만 명 이상이 진단되고, 약 6만 명 이상이 사망하고 있다. 특히 위암은 2018년 전 세계에서 5번째로 가장 빈번하게 진단되었으며 지난 10년간 암 진단과 치료에 있어 다양한 항암 요법이 비약적으로 발전하고 있지만, 암 발병으로 인한 치사율은 여전히 높다. 또한 다양한 항암제 및 여러 항암 요법을 시도할 때 수반되는 부작용도 여전히 존재한다. 이러한 부작용을 줄이기 위한 연구가 활발히 진행되고 있는 실정이다.
약물에 대한 저항성(drug resistance)은 성공적인 항암 치료 효과를 반감시키는 주된 요소로 다양한 암종의 예후를 나쁘게 한다. 암 세포에서의 약물 저항성(chemo-resistance)은 기존에 내재되어 있던 약물 저항성(pre-existing of resistance-mediating factor)과 약물 투여로 인하여 새롭게 획득된 약물 저항성(acquired drug resistance)으로 나뉜다(Cancer drug resistance: an evolving paradigm. Nat Rev Cancer. 2013 Oct;13(10):714-26.). 후천적으로 획득된 약물 저항성을 일으키는 요인으로는 약물 유출 증가, 약물 표적의 돌연변이 발생, DNA 손상 복구, 대체 신호 경로의 활성화 또는 약물 저항성에 의해 유도된 세포 사멸의 회피 등을 예로 들 수 있다. 이렇듯 약물 내성을 지닌 환자에게 해당 약물로 치료한다 할지라도 치료의 효과를 보장할 수 없어 임상 의사 및 환자들의 시간 및 비용이 불필요하게 소모되는 상황이 발생할 가능성이 존재하게 된다. 따라서 항암 치료를 시작할 시에는 치료에 따른 환자의 개개인별 특성을 고려하여 결정하여야 하며, 무작정 치료를 감행하기보다는 개개인에게 맞는 맞춤형 항암제를 선택적으로 사용할 수 있도록 특정 바이오 마커를 통해 미리 치료 효율을 가늠할 수 있는 척도가 현실적으로 필요한 상황이다. 이렇듯 약물에 대한 내성과 관련된 연구는 거의 없는 실정이기에 본 발명자들은 항암제 내성이 있는 환자를 미리 선별할 수 있는 신규한 마커를 발굴함으로써 본 발명을 완성하기에 이르렀다.
본 발명의 일 목적은 항암제 내성을 진단하기 위한 조성물을 제공하고자 한다.
본 발명의 다른 목적은 항암제 내성을 진단하는 키트를 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 항암제 내성에 관한 정보를 제공하는 방법을 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 항암제 내성을 치료하는 약학적 조성물을 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 항암제 감수성을 증진시키는 약학적 조성물을 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 항암제 내성 암을 예방 또는 치료하는 약학적 조성물을 제공하고자 한다.
본 발명의 또 다른 목적은 항암제 내성 극복 또는 치료용 약물이나 항암제 감수성 증진용 약물의 스크리닝 방법을 제공하고자 한다.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.
이하, 본원에 기재된 다양한 구체예가 도면을 참조로 기재된다. 하기 설명에서, 본 발명의 완전한 이해를 위해서, 다양한 특이적 상세 사항, 예컨대, 특이적 형태, 조성물 및 공정 등이 기재되어 있다. 그러나, 특정의 구체예는 이들 특이적 상세 사항 중 하나 이상 없이, 또는 다른 공지된 방법 및 형태와 함께 실행될 수 있다. 다른 예에서, 공지된 공정 및 제조 기술은 본 발명을 불필요하게 모호하게 하지 않게 하기 위해서, 특정의 상세사항으로 기재되지 않는다. "한 가지 구체예" 또는 "구체예"에 대한 본 명세서 전체를 통한 참조는 구체예와 결부되어 기재된 특별한 특징, 형태, 조성 또는 특성이 본 발명의 하나 이상의 구체예에 포함됨을 의미한다. 따라서, 본 명세서 전체에 걸친 다양한 위치에서 표현된 "한 가지 구체예에서" 또는 "구체예"의 상황은 반드시 본 발명의 동일한 구체예를 나타내지는 않는다. 추가로, 특별한 특징, 형태, 조성, 또는 특성은 하나 이상의 구체예에서 어떠한 적합한 방법으로 조합될 수 있다.
명세서 내에 특별한 정의가 없으면 본 명세서에 사용된 모든 과학적 및 기술적인 용어는 본 발명이 속하는 기술분야에서 당업자에 의하여 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 가진다.
1. 항암제 내성 진단의 용도
본 발명의 일 구현 예에 따르면, 항암제 내성 진단용 조성물에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 진단용 조성물은 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A)"란 미토콘드리아 호흡 사슬의 복합체인 숙신산-유비퀴논 산화환원효소(succinate-ubiquinone oxidoreductase)의 주요 촉매 서브 유닛을 암호화한다. 복합체는 4개의 핵으로 인코딩된 서브 유닛으로 구성되며 미토콘드리아 내막에 위치한다. 상기 유전자는 FAD 결합 부위를 포함하며 이 부위에서 숙신산이 푸마르산으로 전환되고 탈양성자화되는 것으로 알려져 있다. 상기 유전자 돌연변이는 리 증후군(Leigh Syndrome)으로 알려진 미토콘드리아 호흡 사슬 결핍으로 에너지 생산과정의 이상이 생겨 발생하는 신경변성질환과 관련이 있다.
본 발명에서 상기 "SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자"는 NCBI(National Center for Biotechnology Information)에 등록되어 있으며, 상기 SDHA 단백질은 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어질 수 있고, 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자는 서열번호 2로 표시되는 염기 서열로 이루어질 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니며, 비제한적인 예로서 상기 SDHA의 서열과 99% 이상 내지 100% 미만, 95% 이상 내지 99% 미만, 90% 이상 내지 95% 미만, 85% 이상 내지 90% 미만, 또는 80% 이상 내지 85% 미만의 상동성을 가지는 경우일 수 있으며, 당해 분야의 통상의 기술자에게 본 발명의 목적하는 효과를 발휘한다는 것이 자명한 범위 내에서 이에 제한 없이 모두 포함할 수 있다.
본 발명에서 "약제" 또는 "항암 치료제"와 "항암제"는 혼용하여 사용될 수 있으며, 상기 약제는 암 줄기세포뿐만 아니라 암 세포를 사멸시켜 항암 효과가 있는 약물에 해당하며, 보다 바람직하게는 위암 치료 효과가 있는 약물을 말한다.
본 발명에서 상기 "항암제"란 암 세포를 사멸시키는 기전을 가진 약물로서 OXPHOS 억제제, 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 5-플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는 것일 수 있으며, 바람직하게는 OXPHOS 억제제일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "항암제"는 OXPHOS 억제제에 해당할 수 있으며, 상기 약제는 미토콘드리아의 산화적 인산화를 억제하여 암 세포를 사멸시키는 새로운 기전을 갖는 항암제에 해당한다. 다양한 유형의 면역 세포는 세포 생존, 발달 및 기능을 유지하기 위해 특정한 세포 대사 과정을 이용하므로 상기 약제는 ATP 생성을 억제함으로써 암 치료 효과를 높이는 데에 사용될 수 있다. 상기 항암제는 OXPHOS 억제제의 일 유형에 해당한다면 이에 제한 없이 모두 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "OXPHOS 억제제"란 유비퀴논 환원 활성 억제제(ubiquinone reduction activity inhibitor), 미토콘드리아 전자 수송 사슬 I 억제제(mitochondrial electron transport chain I inhibitor) 또는 철 킬레이터(iron chelator)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있으며, 미토콘드리아의 산화적 인산화를 억제하여 암 세포를 사멸시키는 기전을 가진 약물이라면 이에 제한되지 않고 모두 포함될 수 있다.
본 발명에서 상기 유비퀴논 환원 활성 억제제는 IACS-010759일 수 있으나, 미토콘드리아 내막에 존재하는 지용성 전자운반체인 유비퀴논의 활성에 영향을 미치는 약물에 해당한다면 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 미토콘드리아 전자 수송 사슬 I 억제제는 IM156, 메트포민(Metformin), 펜포르민(Phenformin) 및 로테논(Rotenone)으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으며, 보다 바람직하게는 IM156 또는 로테논일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 철 킬레이터는 VLX 600일 수 있으나, 미토콘드리아 호흡을 억제하는 기능을 가진 화합물이라면 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "IM156 약물"은 이전에 HL156A로 알려진 새로운 비구아니드 유도체(biguanide derivative) 화합물의 일종으로 다른 비구아니드 약물과 유사하게 미토콘드리아 복합체 I(mitochondrial complex I)을 차단하는 작용을 하는 약물에 해당한다. 비구아니드에서 추출한 소분자 경구 약물로 강력한 산화성인산화(OXPHOS) 억제제로 알려져 있다. 최근 연구 결과에 따르면 IM156을 이용한 시험관내 배양된 쥐 복막 중피 세포 및 쥐 신장 근위관 세포의 치료 후, AMPK 활성은 메트포민과 같은 다른 AMPK (AMP-activated protein kinase)보다 효과가 더욱 좋다는 것이 밝혀져 있다(Am J Physiol Renal Physiol. 2016 Mar 1;310(5):F342-50.). 그러나 IM156 약물은 세포 유형에 따라 상이한 작용 방식으로 영향을 미치기 때문에 다양한 작용 기전에 관한 연구가 진행 중에 있다.
본 발명에서 상기 "로테논 약물"은 미토콘드리아 호흡 사슬 복합체 I(Mitochondrial Complex I)에 작용하여, 산화적 대사에 의존하는 종양 생장을 억제하는 기능을 하는 약물이다. 친유성을 띠며 콩과 식물인 론코카르푸스(Lonchocarpus) 및 데리스(Derris) 종의 뿌리와 줄기에서 자연적으로 발생하여 얻어지는 산물로 살충제로 널리 사용되었지만, 독성 효과가 있어 많은 국가에서 사용이 제한되기도 하였다. 또한, 로테논은 다양한 인간 암 세포주에서 세포 사멸을 일으켜 세포 증식을 억제하는 것으로 알려져 암 치료에 이용될 수 있도록 개발 중이다. 로테논 외 미토콘드리아 호흡 사슬 복합체 I에 작용하는 미토콘드리아 전자 수송 사슬 Ⅰ 억제제의 예로는 IM156, 메트포민(Metformin), 펜포르민(Phenformin) 등이 있다.
본 발명에서 상기 "항암제 내성"이란 약물을 정량 반복적으로 사용했을 때 해당 약물의 효과가 감소하는 것을 말하며, 항암제 내성이 있는 환자에게 이전에 경험한 동일한 효과를 얻기 위해서는 그 사용량을 늘리거나 사용 빈도를 증가시켜야 하거나 혹은 이전과 같은 용량의 물질을 투여해도 전과 똑같은 효과를 얻지 못하는 상태를 말한다. 본 발명에서 SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준의 변화를 대조군과 비교하여 증가하는 경우 약제 내성이 있는 것으로 진단하였다.
본 발명에서 상기 "진단"은 항암제에 대한 감수성(susceptibility)을 판정하는 것, 발병한 질환이 항암제 내성을 현재 가지고 있는지 여부를 판정하는 것, 또는 항암제 내성 암의 예후(예컨대, 해당 약물에 대한 암의 반응성 결정)를 판정하는 것, 또는 상기 진단에 대한 정보를 제공하는 것을 포함하는 넓은 개념으로 정의한다.
본 발명의 "예후"란, 질병의 경과 및 사망 또는 생존의 결과를 미리 예측하는 행위를 말한다. 상기 예후 또는 예후 진단이란 질환의 경과가 환자의 생리적 또는 환경적 상태에 따라 달라질 수 있으며, 이러한 환자의 상태를 종합적으로 고려하여 치료 전/후 질병의 경과를 예측하는 모든 행위를 의미하는 것으로 해석될 수 있다. 본 발명의 목적상 상기 예후는 항암제 치료, 바람직하게는 OXPHOS 억제제 치료, 보다 바람직하게는 IM156 치료 후 치료 반응성 또는 상기 항암제에 대해 내성이 발생하는 지 여부를 미리 예상하는 행위 또는 이를 토대로 상기 항암제의 사용 여부를 적절하게 선택하는 행위로 해석될 수 있다.
본 발명에서 "종양" 또는 "암"은 세포 주기가 조절되지 않아 세포 분열을 계속하는 질병으로서, 발생 부위에 따라 암종(Carcinoma)과 육종(Sarcoma)으로 나뉜다. 암종(Carcinoma)은 점막, 피부 같은 상피성 세포에서 발생한 악성 종양을 뜻하고, 육종(Sarcoma)은 근육, 결합 조직, 뼈, 연골, 혈관 등의 비상피성 세포에서 발생한 악성 종양을 뜻한다. 상기 암은 갑상선암, 부갑상선암, 위암, 난소암, 대장암, 췌장암, 간암, 유방암, 자궁경부암, 폐암, 비소세포성폐암, 전립선암, 담낭암, 담도암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 혈액암, 방광암, 신장암, 흑색종, 결장암, 골암, 피부암, 두부암, 자궁암, 직장암, 뇌종양, 항문부근암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 수뇨관암, 신장세포 암종, 신장골반 암종, 중추신경계(CNS central nervoussystem) 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 뇌간 신경교종 또는 뇌하수체 선종일 수 있으나, 종양의 분화 및/또는 증식 등 암의 진행이 본 발명에서 기술하는 암 세포 및/또는 암 줄기세포에 의존적인 암의 종류라면 이에 제한되지 않는다.
본 발명의 상기 항암제 내성 진단용 조성물에서 상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "항체"는 항원과 특이적으로 결합하여 항원-항체 반응을 일으키는 물질을 가리킨다. 본 발명의 목적상, 항체는 상기 단백질에 대해 특이적으로 결합하는 항체를 의미한다. 본 발명의 항체는 다클론 항체, 단클론 항체 및 재조합 항체를 모두 포함한다. 상기 항체는 당 업계에 널리 공지된 기술을 이용하여 용이하게 제조될 수 있다. 예를 들어, 다클론 항체는 상기 단백질의 항원을 동물에 주사하고 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 수득하는 과정을 포함하는 당 업계에 널리 공지된 방법에 의해 생산될 수 있다. 이러한 다클론 항체는 염소, 토끼, 양, 원숭이, 말, 돼지, 소, 개 등의 임의의 동물로부터 제조될 수 있다. 또한, 단클론 항체는 당 업계에 널리 공지된 하이브리도마 방법(hybridoma method; Kohler 및 Milstein (1976) European Journal of Immunology 6:511-519 참조), 또는 파지 항체 라이브러리 기술(Clackson et al, Nature, 352:624-628, 1991; Marks et al, J. Mol. Biol., 222:58, 1-597, 1991 참조)을 이용하여 제조될 수 있다. 상기 방법으로 제조된 항체는 겔 전기영동, 투석, 염 침전, 이온교환 크로마토그래피, 친화성 크로마토그래피 등의 방법을 이용하여 분리, 정제될 수 있다. 또한, 본 발명의 항체는 2개의 전장의 경쇄 및 2개의 전장의 중쇄를 갖는 완전한 형태뿐만 아니라, 항체 분자의 기능적인 단편을 포함한다. 항체 분자의 기능적인 단편이란, 적어도 항원 결합 기능을 보유하고 있는 단편을 의미하며, Fab, F(ab'), F(ab')2 및 Fv 등이 있다.
본 발명에서 상기 "올리고펩타이드"는 펩타이드로 2 내지 20 개의 아미노산으로 구성되며 디 펩티드, 트리 펩티드, 테트라 펩티드 및 펜타 펩티드를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에 상기 "PNA(Peptide Nucleic Acid)"는 인공적으로 합성된, DNA 또는 RNA와 비슷한 중합체를 가리키며, 1991년 덴마크 코펜하겐 대학교의 Nielsen, Egholm, Berg와 Buchardt 교수에 의해 처음으로 소개되었다. DNA는 인산-리보스당 골격을 갖는데 반해, PNA는 펩타이드 결합에 의해 연결된 반복된 N-(2-아미노에틸)-글리신 골격을 가지며, 이로 인해 DNA 또는 RNA에 대한 결합력과 안정성이 크게 증가되어 분자 생물학, 진단 분석 및 안티센스 치료법에 사용되고 있다. PNA는 문헌[Nielsen PE, Egholm M, Berg RH, Buchardt O (December 1991). "Sequence-selective recognition of DNA by strand displacement with a thymine-substituted polyamide". Science 254 (5037): 1497-1500]에 상세하게 개시되어 있다.
본 발명에서 상기 "앱타머"는 올리고핵산 또는 펩타이드 분자이며, 앱타머의 일반적인 내용은 문헌[Bock LC et al., Nature 355(6360):5646(1992); Hoppe-Seyler F, Butz K "Peptide aptamers: powerful new tools for molecular medicine". J Mol Med. 78(8):42630(2000); Cohen BA, Colas P, Brent R. "An artificial cell-cycle inhibitor isolated from a combinatorial library". Proc Natl Acad Sci USA. 95(24): 142727(1998)]에 상세하게 개시되어 있다.
본 발명의 상기 항암제 내성 진단용 조성물에서 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "프라이머"는 표적 유전자 서열을 인지하는 단편으로서, 정방향 및 역방향의 프라이머 쌍을 포함하나, 바람직하게는, 특이성 및 민감성을 가지는 분석 결과를 제공하는 프라이머 쌍이다. 프라이머의 핵산 서열이 시료 내 존재하는 비-표적 서열과 불일치하는 서열이어서, 상보적인 프라이머 결합 부위를 함유하는 표적 유전자 서열만 증폭하고 비특이적 증폭을 유발하지 않는 프라이머일 때, 높은 특이성이 부여될 수 있다.
본 발명에서 상기 "프로브"란 시료 내의 검출하고자 하는 표적 물질과 특이적으로 결합할 수 있는 물질을 의미하며, 상기 결합을 통하여 특이적으로 시료 내의 표적 물질의 존재를 확인할 수 있는 물질을 의미한다. 프로브의 종류는 당 업계에서 통상적으로 사용되는 물질로서 제한은 없으나, 바람직하게는 PNA(peptide nucleic acid), LNA(locked nucleic acid), 펩타이드, 폴리펩타이드, 단백질, RNA 또는 DNA일 수 있으며, 가장 바람직하게는 PNA이다. 보다 구체적으로, 상기 프로브는 바이오 물질로서 생물에서 유래되거나 이와 유사한 것 또는 생체 외에서 제조된 것을 포함하는 것으로, 예를 들어, 효소, 단백질, 항체, 미생물, 동식물 세포 및 기관, 신경세포, DNA, 및 RNA일 수 있으며, DNA는 cDNA, 게놈 DNA, 올리고뉴클레오타이드를 포함하며, RNA는 게놈 RNA, mRNA, 올리고뉴클레오타이드를 포함하며, 단백질의 예로는 항체, 항원, 효소, 펩타이드 등을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "LNA(Locked nucleic acids)"란, 2'-O, 4'-C 메틸렌 브릿지를 포함하는 핵산 아날로그를 의미한다 [J Weiler, J Hunziker and J Hall Gene Therapy (2006) 13, 496.502]. LNA 뉴클레오사이드는 DNA와 RNA의 일반적 핵산 염기를 포함하며, Watson-Crick 염기 쌍 규칙에 따라 염기 쌍을 형성할 수 있다. 하지만, 메틸렌 브릿지로 인한 분자의 'locking'으로 인해, LNA는 Watson-Crick 결합에서 이상적 형상을 형성하지 못하게 된다. LNA가 DNA 또는 RNA 올리고뉴클레오티드에 포함되면, LNA는 보다 빠르게 상보적 뉴클레오티드 사슬과 쌍을 이루어 이중 나선의 안정성을 높일 수 있다.
본 발명에서 상기 "안티센스"는 안티센스 올리고머가 왓슨-크릭 염기쌍 형성에 의해 RNA 내의 표적 서열과 혼성화되어, 표적서열 내에서 전형적으로 mRNA와 RNA: 올리고머 헤테로이중체의 형성을 허용하는, 뉴클레오티드 염기의 서열 및 서브유닛간 백본을 갖는 올리고머를 의미한다. 올리고머는 표적 서열에 대한 정확한 서열 상보성 또는 근사 상보성을 가질 수 있다.
본 발명에 따른 SDHA 단백질이나, 이를 코딩하는 유전자의 정보는 알려져 있으므로, 당 업자라면 이를 바탕으로 상기 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 또는 안티센스 뉴클레오티드를 용이하게 디자인할 수 있을 것이다.
본 발명의 다른 구현 예에 따르면, 본 발명의 상기 항암제 내성 진단용 조성물을 포함하는 항암제 내성 진단용 키트에 관한 것이다.
본 발명에서 상기 "키트"는 바이오 마커 성분에 특이적으로 결합하는 프로브 또는 항체를 검출 가능한 표지로 표지하여 바이오 마커의 발현 수준을 평가할 수 있는 도구를 말한다. 프로브 또는 항체 관련하여 검출 가능한 물질을 기질과의 반응에 의해서 직접적으로 표지하는 것뿐만 아니라, 직접적으로 표지된 다른 시약과의 반응성에 의한 발색하는 표지체가 접합된 간접적 표지도 포함한다. 상기 표지체와 발색 반응할 발색 기질 용액, 세척액 및 기타 다른 용액 등을 포함할 수 있으며, 사용되는 시약 성분을 포함하여 제작될 수 있다. 본 발명에서 키트는 RT-PCR을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 키트일 수 있으며, 마커 유전자에 대한 특이적인 각각의 프라이머 쌍 외에도 테스트 튜브, 반응 완충액, 데옥시뉴클레오티드(dNTPs), Taq-중합효소, 역전사효소, DNase, RNase 억제제, 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한, 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함하는 항암제 내성 진단용 유전자를 검출하기 위한 키트일 수 있다. DNA 칩 키트는 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA가 프로브로 부착되어 있는 기판을 포함하고 기판은 정량 대조군 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA를 포함할 수 있다. 본 발명의 키트는 당 업계에 공지되어 있는 것이라면, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서 상기 키트는 RT-PCR 키트, DNA 칩 키트, ELISA 키트, 단백질 칩 키트, 래피드(rapid) 키트 또는 MRM(Multiple reaction monitoring) 키트일 수 있다.
본 발명의 상기 키트는 분석 방법에 적합한 한 종류 또는 그 이상의 다른 구성 성분 조성물, 용액 또는 장치를 더 포함할 수 있다. 예를 들면, 본 발명에서 상기 키트는 역전사 중합효소반응을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 더 포함할 수 있다. 역전사 중합효소반응 키트는 마커 단백질을 코딩하는 유전자에 대해 특이적인 프라이머 쌍을 포함한다. 프라이머는 상기 유전자의 핵산 서열에 특이적인 서열을 가지는 뉴클레오티드로써, 약 7 bp 내지 50 bp의 길이, 보다 바람직하게는 약 10 bp 내지 30 bp의 길이를 가질 수 있다. 또한 대조군 유전자의 핵산 서열에 특이적인 프라이머를 포함할 수 있다. 그 외 역전사 중합효소반응 키트는 테스트 튜브 또는 다른 적절한 용기, 반응 완충액(pH 및 마그네슘 농도는 다양), 데옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-폴리머라아제 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNase 억제제 DEPC-수(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 항암제 내성 진단용 키트는 DNA 칩을 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함할 수 있다. DNA 칩 키트는 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA 또는 올리고뉴클레오티드(oligonucleotide)가 부착되어 있는 기판, 및 형광표지 프로브를 제작하기 위한 시약, 제제, 효소 등을 포함할 수 있다. 또한 기판은 대조군 유전자 또는 그의 단편에 해당하는 cDNA 또는 올리고뉴클레오티드를 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 항암제 내성 진단용 키트는 ELISA를 수행하기 위해 필요한 필수 요소를 포함할 수 있다. ELISA 키트는 상기 단백질에 대해 특이적인 항체를 포함한다. 항체는 마커 단백질에 대한 특이성 및 친화성이 높고 다른 단백질에 대한 교차 반응성이 거의 없는 항체로, 단클론 항체, 다클론 항체 또는 재조합 항체이다. 또한 ELISA 키트는 대조군 단백질에 특이적인 항체를 포함할 수 있다. 그 외 ELISA 키트는 결합된 항체를 검출할 수 있는 시약, 예를 들면, 표지된 2차 항체, 발색단(chromophores), 효소(예: 항체와 컨주게이트됨) 및 그의 기질 또는 항체와 결합할 수 있는 다른 물질 등을 포함할 수 있다.
본 발명의 항암제 내성 진단용 키트에서 항원-항체 결합반응을 위한 고정체로는 니트로셀룰로오즈 막, PVDF 막, 폴리비닐(polyvinyl) 수지 또는 폴리스티렌(polystyrene) 수지로 합성된 웰 플레이트(Well plate), 유리로 된 슬라이드 글래스 등이 사용될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 항암제 내성 진단용 키트에서 2차 항체의 표지체는 발색 반응을 하는 통상의 발색제가 바람직하며, HRP(horseradish peroxidase), 염기성 탈인산화효소(alkaline phosphatase), 콜로이드 골드(coloid gold), FITC(폴리 L-라이신-플루오르세인 아이소티오시아네이트), RITC(로다민-B-아이소티오시아네이트) 등의 형광물질(fluorescein) 및 색소(dye) 등의 표지체가 사용될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명의 항암제 내성 진단용 키트에서 발색을 유도하기 위한 발색 기질은 발색 반응을 하는 표지체에 따라 사용하는 것이 바람직하며, TMB(3,3',5,5'-테트라메틸 베지딘), ABTS[2,2'-아지노-비스(3-에틸벤조티아졸린-6-설폰산)], OPD(o-페닐렌다이아민) 등을 사용할 수 있다. 이때, 발색 기질은 완충 용액(0.1 M NaAc, pH 5.5)에 용해된 상태로 제공되는 것이 더욱 바람직하다. TMB와 같은 발색기질은 이차 항체 접합체의 표지체로 사용된 HRP에 의해 분해되어 발색 침적체를 생성하고, 이 발색 침적체의 침적 정도를 육안으로 확인함으로써 상기 마커 단백질들의 존재 유무를 검출한다.
본 발명의 항암제 내성 진단용 키트에서 세척액은 인산염 완충 용액, NaCl 및 트윈 20(Tween 20)을 포함하는 것이 바람직하며, 0.02 M 인산염 완충용액, 0.13 M NaCl, 및 0.05% 트윈 20으로 구성된 완충 용액(PBST)이 더욱 바람직하다. 세척액은 항원-항체 결합 반응 후 항원-항체 결합체에 2차 항체를 반응시킨 다음 적당량을 고정체에 첨가하여 3 내지 6회 세척한다. 반응 정지 용액은 황산 용액(H2SO4)이 바람직하게 사용될 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 항암제 내성 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다.
본 발명의 상기 방법은 상기 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 상기 SDHA 단백질 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명의 상기 방법은 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서, 항암제 내성 발생의 유무를 선별하기 위한 것일 수 있다.
본 발명에서 상기 "목적하는 개체"란 암이 발병하였거나 발병 가능성이 높은 개체로, 인간을 포함하는 포유 동물일 수 있고, 예를 들면, 인간, 래트, 마우스, 모르모트, 햄스터, 토끼, 원숭이, 개, 고양이, 소, 말, 돼지, 양 및 염소로 구성된 군으로부터 선택될 수 있고, 바람직하게는 인간일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 생물학적 시료는 개체로부터 얻어지거나 개체로부터 유래된 임의의 물질, 생물학적 체액, 조직 또는 세포를 의미하는 것으로, 전혈(whole blood), 백혈구(leukocytes), 말초혈액 단핵 세포(peripheral blood mononuclear cells), 백혈구 연층(buffy coat), 혈장(plasma), 혈청(serum), 객담(sputum), 눈물(tears), 점액(mucus), 세비액(nasal washes), 비강 흡인물(nasal aspirate), 호흡(breath), 소변(urine), 정액(semen), 침(saliva), 복강 세척액(peritoneal washings), 복수(ascites), 낭종액(cystic fluid), 뇌척수막 액(meningeal fluid), 양수(amniotic fluid), 선액(glandular fluid), 췌장액(pancreatic fluid), 림프액(lymph fluid), 흉수(pleural fluid), 유두 흡인물(nipple aspirate), 기관지 흡인물(bronchial aspirate), 활액(synovial fluid), 관절 흡인물(joint aspirate), 기관 분비물(organ secretions), 세포(cell), 세포 추출물(cell extract) 및 뇌척수액(cerebrospinal fluid) 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.
본 발명에서 상기 SDHA 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 SDHA 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 SDHA 단백질의 발현 수준의 측정은 단백질 칩 분석, 면역 측정법, 리간드 바인딩 어세이, MALDI-TOF(Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, SELDI-TOF(Sulface Enhanced Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, 방사선 면역 분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 조직면역 염색, 보체 고정 분석법, 2차원 전기영동 분석, 액상 크로마토그래피-질량분석(liquid chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS), LC-MS/MS(liquid chromatography-Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry), 웨스턴 블랏팅 또는 ELISA(enzyme linked immunosorbentassay)에 의해 수행될 수 있다.
또한, 본 발명에서 상기 SDHA 단백질의 발현 수준의 측정은 다중 반응 모니터링 (multiple reaction monitoring; MRM) 방법에 의할 수 있다.
본 발명에서 상기 다중 반응 모니터링 방법 시 내부 표준 물질은 타깃 펩타이드를 구성하는 특정 아미노산을 동위원소로 치환한 합성 펩타이드 또는 대장균 베타 갈락토시다아제를 사용할 수 있다.
본 발명에서 상기 SDHA 단백질은 서열번호 1로 표시되는 아미노산 서열로 이루어질 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준의 측정은 역전사 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 역전사 중합효소반응(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting) 또는 DNA 칩에 의할 수 있다.
본 발명의 정보 제공 방법에서 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid), 앱타머(aptamer) 등에 관한 기재와 프라이머, 프로브, 안티센스 뉴클레오티드 등에 관한 기재는 앞서 기재된 바와 중복되어 명세서의 과도한 복잡을 피하기 위하여 이하 그 자세한 기재를 생략한다.
본 발명에서 상기 목적하는 개체의 생물학적 시료에 대하여 측정된 SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준이 대조군에 비하여 높을 경우, 상기 목적하는 개체에 항암제 내성이 발생하였거나 발생할 가능성이 높은 것으로 예측되어, 상기 항암제에 대한 치료 반응성이 낮거나 더 나아가서는 암 치료 예후가 좋지 않을 것으로 예측할 수 있다.
본 발명에서 "대조군"이란 항암제 내성이 발생하지 아니한 정상 대조군이거나, 항암제 감수성 세포에서의 SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준의 평균 내지 중간 값일 수 있다. 대조군에서의 마커 단백질 또는 이를 코딩하는 핵산분자의 발현량과 분석 대상이 되는 암 환자 유래의 생물학적 시료에서의 마커 단백질 또는 이를 코딩하는 핵산분자의 발현량을 비교할 수 있으며, 상기 발현량의 유의한 변화 여부를 판단하여 항암제 내성 여부를 진단할 수 있다.
본 발명에서 상기 항암제는 OXPHOS 억제제, 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 5-플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는 약물을 이용한 것일 수 있으며, 보다 바람직하게는 OXPHOS 억제제일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 상기 약물들에 관한 기재는 앞서 기재된 바와 중복되어 명세서의 과도한 복잡을 피하기 위하여 이하 그 자세한 기재를 생략한다.
본 발명에서 상기 암은 갑상선암, 부갑상선암, 위암, 난소암, 대장암, 췌장암, 간암, 유방암, 자궁경부암, 폐암, 비소세포성폐암, 전립선암, 담낭암, 담도암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 혈액암, 방광암, 신장암, 흑색종, 결장암, 골암, 피부암, 두부암, 자궁암, 직장암, 뇌종양, 항문부근암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 수뇨관암, 신장세포 암종, 신장골반 암종, 중추신경계(CNS central nervoussystem) 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 뇌간 신경교종 또는 뇌하수체 선종일 수 있으나, 종양의 분화 및/또는 증식 등 암의 진행이 본 발명에서 기술하는 암 세포 및/또는 암 줄기세포에 의존적인 암의 종류라면 이에 제한되지 않는다.
2. 항암제 내성 치료 용도
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 항암제 내성을 치료하거나 항암제 감수성을 증진시키는 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 상기 조성물은 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효 성분으로 포함하는 것일 수 있다.
본 발명의 상기 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제는 상기 단백질 또는 그 일부 부위에 특이적으로 결합하는 화합물, 펩티드, 펩티드 미메틱스, 앱타머, 항체, 및 천연물로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상을 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니며, 표적 SDHA 단백질에 직간접적으로 작용하여 그의 활성 또는 발현이 저해되는 효과를 도출하는 수단에 해당하는 것으로 당업계에서 통상적으로 사용되는 방법으로 공지된 기술에 의하여 용이하게 도출 가능한 것이라면 이에 제한되지 아니하고 모두 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "펩티드 미메틱스 (Peptide Minetics)"는 SDHA의 활성 억제를 이끄는 SDHA 단백질의 결합 도메인을 억제하는 펩티드 또는 비펩티드이다. 비가수분해성 펩티드 유사체의 주요 잔기로는 β-턴 디펩티드 코어 (Nagai et al. Tetrahedron Lett 26:647, 1985), 케토-메틸렌 슈도펩티드류 (Ewenson et al. J Med chem 29:295, 1986; 및 Ewenson et al. in Peptides: Structure and Function (Proceedings of the 9th AmeriCan Peptide Symposium) Pierce chemiCal co. Rockland, IL, 1985), 아제핀 (Huffman et al. in Peptides: chemistry and Biology, G.R. Marshall ed., EScOM Publisher: Leiden, Netherlands, 1988), 벤조디아제핀 (Freidinger et al. in Peptides; chemistry and Biology, G.R. Marshall ed., EScOM Publisher: Leiden, Netherlands, 1988), β-아미노알콜 (Gordon et al. Biochem Biophys Res commun 126:419 1985) 및 치환 감마 락탐환 (Garvey et al. in Peptides: chemistry and Biology, G.R. Marshell ed., EScOM Publisher: Leiden, Netherlands, 1988)을 사용하여 생성할 수 있다.
본 발명에서 상기 "앱타머 (Aptamer)"는 그 자체로 안정된 삼차구조를 가지면서 표적분자에 높은 친화성과 특이성으로 결합할 수 있는 특징을 가진 단일가닥 핵산 (DNA, RNA 또는 변형핵산)이다. 앱타머는 SELEX (Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment)라는 앱타머 발굴 기술이 처음 개발된 이후(Ellington, AD and Szostak, JW., Nature 346:818-822, 1990), 저분자 유기물, 펩타이드, 막 단백질까지 다양한 표적분자에 결합할 수 있는 많은 앱타머들이 계속해서 발굴되었다. 앱타머는 고유의 높은 친화성(보통 pM 수준)과 특이성으로 표적분자에 결합할 수 있다는 특성 때문에 단일 항체와 비교가 되고, 특히 "화학 항체"라고 할 만큼 대체 항체로서의 높은 가능성이 있다.
본 발명에서 상기 "항체"는 상기 단백질 주입을 통해 제조된 것 또는 시판되어 구입한 것이 모두 사용 가능하다. 또한, 상기 항체는 다클론 항체, 단클론 항체 및 에피토프와 결합할 수 있는 단편 등을 포함한다.
여기서, 상기 다클론 항체는 상기 단백질을 동물에 주사하고, 해당 동물로부터 채혈하여 항체를 포함하는 혈청을 수득하는 종래의 방법에 의해 생산할 수 있다. 이러한 다클론 항체는 당업계에 알려진 어떠한 방법에 의해서든 정제될 수 있고, 염소, 토끼, 양, 원숭이, 말, 돼지, 소, 개 등의 임의의 동물 종 숙주로부터 만들어질 수 있다.
또한, 상기 단클론 항체는 연속 세포주의 배양을 통한 항체 분자의 생성을 제공하는 어떠한 기술을 사용하여도 제조할 수 있다. 이러한 기술로는 이들로 한정되는 것은 아니지만 하이브리도마 기술, 사람 B-세포주 하이브리도마 기술 및 EBV-하이브리도마 기술이 포함된다.
또한, 상기 단백질에 대한 특정 결합 부위를 함유한 항체 단편이 제조될 수 있다. 예를 들면 이들로 한정되는 것은 아니지만 F(ab')2 단편은 항체 분자를 펩신으로 분해시켜 제조할 수 있으며, Fab 단편은 F(ab')2 단편의 디설파이드 브릿지를 환원시킴으로써 제조할 수 있다. 다른 방도로서, Fab 발현 라이브러리를 작게 하여 원하는 특이성을 갖는 단클론 Fab 단편을 신속하고 간편하게 동정할 수 있다.
본 발명에서 상기 항체는 세척이나 복합체의 분리 등 그 이후의 단계를 용이하게 하기 위해 고형 기질 (solid substrate)에 결합될 수 있다. 고형 기질은 예를 들어 합성수지, 니트로셀룰로오스, 유리기판, 금속기판, 유리섬유, 미세구체 및 미세비드 등이 있다. 또한, 상기 합성수지에는 폴리에스터, 폴리염화비닐, 폴리스티렌, 폴리프로필렌, PVDF 및 나일론 등이 있다.
본 발명에서 상기 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제는 SDHA 단백질의 서열번호 1로 표시되는 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 것일 수 있고, 바람직하게는 본 발명의 조성물은 상기 SDHA 단백질에 특이적인 항체를 포함할 수 있으며, 여기서, 상기 항체는 서열번호 1로 표시되는 폴리펩티드에 특이적으로 결합하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제는 상기 단백질을 코딩하는 유전자, 바람직하게는 상기 유전자 또는 그 일부 부위에 상보적으로 결합하는 안티센스 뉴클레오티드, 작은 간섭 RNA (short interfering RNA; siRNA), 짧은 헤어핀 RNA (short hairpin RNA) 및 리보자임 (ribozyme)으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상을 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니며, 표적 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자에 직간접적으로 작용하여 그 발현이 저해되는 효과를 도출하는 수단에 해당하는 것으로 당업계에서 통상적으로 사용되는 방법으로 공지된 기술에 의하여 용이하게 도출 가능한 것이라면 이에 제한되지 아니하고 모두 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "안티센스 뉴클레오티드"는 왓슨-클릭 염기쌍에 정의된 바에 따라, DNA, 미성숙-mRNA 또는 성숙된 mRNA의 상보적 염기서열에 결합(혼성화)하여 DNA에서 단백질로서 유전정보의 흐름을 방해하는 것이다. 표적 서열에 특이성이 있는 안티센스 뉴클레오티드의 성질은 그것들을 예외적으로 다기능이 되도록 한다. 안티센스 뉴클레오티드는 모노머 단위의 긴 사슬이기 때문에 이들은 표적 RNA 서열에 대해 쉽게 합성될 수 있다. 최근 많은 연구들은 표적 단백질을 연구하기 위한 생화학적 수단으로 안티센스 뉴클레오티드의 유용성을 증명하였다. 올리고뉴클레오티드 화학 및 향상된 세포주흡착, 표적결합 친화도 및 뉴클레아제 내성을 나타내는 뉴클레오티드 합성 분야에서 최근 많은 진보가 있었으므로 안티센스 뉴클레오티드의 사용은 새로운 형태의 억제제로 고려될 수 있다.
본 발명에서 상기 "shRNA" 및 "siRNA"는 RNA 방해 또는 유전자 사일런싱 (silencing)을 매개할 수 있는 핵산 분자로서, 표적 유전자의 발현을 억제할 수 있기 때문에 효율적인 유전자 넉다운 (knockdown) 방법 또는 유전자 치료 방법으로 사용된다. shRNA는 단일 가닥의 올리고 뉴클레오티드 내에서 상보적인 서열 간의 결합에 의해 헤어핀 (hairpin) 구조를 형성한 것이고, 생체 내에서 상기 shRNA는 다이서 (dicer)에 의해 절단되면서 21 내지 25 뉴클레오티드 크기의 작은 RNA 조각으로 이중 가닥의 올리고 뉴클레오티드인 siRNA가 되며, 상보적인 서열을 갖는 mRNA에 특이적으로 결합하여 발현을 억제할 수 있다. 또한, siRNA는 이중 가닥 RNA(dsRNA)에 의해 타깃이 되는 mRNA를 변형시켜 RNA 간섭 현상(RNA interference; RNAi)을 유도하게 되는 21 내지 25 뉴클레오티드 크기의 작은 이중 가닥의 RNA 단편에 해당하는 것을 말한다.
본 발명에서 상기 shRNA 및 siRNA 중 어느 수단을 이용할지는 당업자의 선택에 의해 결정될 수 있으며 이들이 표적으로 하는 mRNA 서열이 동일한 경우라면 유사한 발현 감소 효과를 기대할 수 있다. 본 발명의 목적상 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자에 특이적으로 작용하여 SDHA의 유전자(예; mRNA 분자)를 절단하여 RNA 간섭 (RNAi, RNA interference) 현상을 유도함으로써, 상기 SDHA의 발현을 억제할 수 있다. siRNA는 화학적으로 또는 효소학적으로 합성될 수 있다. siRNA의 제조방법으로는 특별히 한정되지 않으며, 당업계에 공지된 방법을 사용할 수 있다. 예를 들면, siRNA를 직접 화학적으로 합성하는 방법, 시험관 내 (in vitro) 전사를 이용한 siRNA의 합성법, 시험관 내 (in vitro) 전사에 의해 합성된 긴 이중 가닥 RNA를 효소를 이용하여 절단하는 방법, shRNA 발현 플라스미드나 바이러스성 벡터의 세포 내 전달을 통한 발현법 및 PCR (polymerase chain reaction) 유도 siRNA 발현 카세트 (cassette)의 세포 내 전달을 통한 발현법 등이 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "리보자임 (ribozyme)"은 촉매 활성을 갖는 RNA 분자를 말한다. 다양한 활성을 갖는 리보자임이 공지되어 있으며, SDHA 유전자의 리보자임은 공지된 또는 인공적으로 생성된 리보자임을 포함하며, 선택적으로 표적 특이적 RNA 절단 활성을 갖는 리보자임이 공지의 표준 기법에 의해 제조될 수 있다.
본 발명에서 상기 SDHA의 단백질의 활성 또는 발현을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제는 상기 SDHA의 FAD 결합 부위를 타깃으로 하여 작용하는 제제이거나 SDHB 또는 SDHC/D의 유비퀴논 결합 부위를 타깃으로 하여 작용하는 제제일 수 있고, 예를 들면, 3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA), 아트페닌 A5(atpenin A5); 또는 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 억제제 또는 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 억제제를 포함할 수 있으나, 세포 호흡 저해 기능을 수행하는 것이라면 이에 제한되지 아니하고 모두 포함될 수 있다.
본 발명에서 상기 "3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA)"은 5개의 수소 원자, 3개의 탄소 원자, 1개의 질소 원자 그리고 4개의 산소 원자로 구성되어 총 13개의 원자로 구성된 화합물로서 미토콘드리아 전자 수송 사슬 복합체 ±에 작용하는 숙신산 탈수소화효소 억제제(inhibitor of succinate dehydrogenase)로 알려져 있다.
본 발명에서 상기 "아트페닌 A5(atpenin A5)"는 유비퀴논 결합 부위인 미토콘드리아 복합체 Ⅱ의 억제제로 미토콘드리아의 ATP 민감성 칼륨 채널(ATP-sensitive potassium channel; KATP channel)을 자극하며, 호흡 저해제로도 기능을 한다. 생체 내에서 항허혈 작용 및 심장 보호 효과 기능 또한 수행하는 것으로 알려져 있는 물질 중 하나이다.
본 발명에서 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제는 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자에 상보적으로 결합하는 안티센스 뉴클레오티드, 작은 간섭 RNA (short interfering RNA; siRNA), 짧은 헤어핀 RNA (short hairpin RNA) 및 리보자임 (ribozyme)으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상을 포함하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 일 예시로 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제로서, 서열번호 3 및 서열번호 4로 표시되는 염기 서열로 이루어진 siRNA일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 조성물은 항암제 내성을 치료하거나 항암제 감수성 증진 효과를 높이기 위하여, 3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA) 또는 아트페닌 A5(atpenin A5) 중 적허도 하나를 추가로 더 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 조성물은 항암제를 추가로 더 포함할 수 있고, 여기서 상기 항암제로는 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 5-플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는 약물을 이용한 것일 수 있으며, 보다 바람직하게는 OXPHOS 억제제일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 "항암제 내성"이란 항암제를 정량 반복적으로 사용했을 때 해당 약물의 효과가 감소하는 것을 말하며, 항암제 내성이 있는 환자에게 이전에 경험한 동일한 효과를 얻기 위해서는 그 사용량을 늘리거나 사용 빈도를 증가시켜야 하거나 혹은 이전과 같은 용량의 물질을 투여해도 전과 똑같은 효과를 얻지 못하는 상태를 말한다.
본 발명에서 상기 "내성 치료"란 항암제를 정량 반복적으로 사용했을 때 해당 약물의 효과가 감소하거나, 항암제 내성이 있는 환자에게 이전에 경험한 동일한 효과를 얻기 위해서는 그 사용량을 늘리거나 사용 빈도를 증가시켜야 하거나 혹은 이전과 같은 용량의 물질을 투여해도 전과 똑같은 효과를 얻지 못하는 상태를 회복시키는 작용을 말한다. 보다 구체적으로 항암제를 보다 적은 횟수 또는 보다 적은 용량을 적용하여도 동일한 항암 효과가 나타나게 만들거나 항암제 내성이 발생하기 이전 상태로 되돌려 이전과 같은 용량 또는 이보다 적은 용량의 물질을 투여해도 같은 효과를 얻을 수 있는 상태로 만드는 작용을 말한다.
본 발명의 상기 항암제 내성 치료용 약학적 조성물 및 항암제 감수성 증진용 조성물에서 SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자, 다양한 항암제 등에 대한 기재는 앞선 진단용 조성물에서 기재한 바와 동일하여, 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 생략한다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 항암제 내성 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 상기 조성물은 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효 성분으로 포함하는 것일 수 있다.
본 발명에서 상기 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A)의 단백질의 활성 또는 발현을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제는 상기 SDHA 단백질의 FAD 결합 부위를 타깃으로 하여 작용하거나 SDHB 또는 SDHC/D의 유비퀴논 결합 부위를 타깃으로 하여 작용하는 것일 수 있고, 예를 들면, 3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA), 아트페닌 A5(atpenin A5); 또는 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 억제제 또는 상기 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 억제제를 포함할 수 있으나, 세포 호흡 저해 기능을 수행하는 것이라면 이에 제한되지 아니하고 모두 포함될 수 있다.
본 발명의 조성물은 항암제 내성을 치료하거나 항암제 감수성 증진 효과를 높이기 위하여, 3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA) 또는 아트페닌 A5(atpenin A5) 중 적어도 하나를 추가로 더 포함할 수 있다.
또한, 본 발명의 조성물은 항암제를 추가로 더 포함할 수 있고, 여기서 상기 항암제로는 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 5-플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는 약물을 이용한 것일 수 있으며, 보다 바람직하게는 OXPHOS 억제제일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 상기 "예방"이란, 본 발명의 상기 조성물을 이용하여 암 세포의 제어되지 않은 성장 등에 의해 발생되는 증상을 차단하거나, 그 증상을 억제 또는 지연시키는 행위라면 제한없이 포함될 수 있다.
본 발명의 상기 "치료"란, 본 발명의 상기 조성물을 이용하여 암 세포의 제어되지 않은 성장 등에 의해 발생된 증상이 호전되거나 이롭게 되는 행위라면 제한없이 포함될 수 있다.
본 발명의 상기 항암제 내성 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물에서 각 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자, 상기 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제 등에 대한 기재는 항암제 내성 치료용 및 항암제 감수성 증진용 조성물에서 기재한 바와 동일하여, 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 생략한다.
본 발명에서 상기 약학적 조성물은 캡슐, 정제, 과립, 주사제, 연고제, 분말 또는 음료 형태임을 특징으로 할 수 있으며, 상기 약학 조성물은 인간을 대상으로 하는 것을 특징으로 할 수 있다.
본 발명의 상기 약학적 조성물은 이들로 한정되는 것은 아니지만, 각각 통상의 방법에 따라 산제, 과립제, 캡슐, 정제, 수성 현탁액 등의 경구형 제형, 외용제, 좌제 및 멸균 주사 용액의 형태로 제형화되어 사용될 수 있다. 본 발명의 약학 조성물은 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함할 수 있다. 약학적으로 허용되는 담체는 경구 투여 시에는 결합제, 활탁제, 붕해제, 부형제, 가용화제, 분산제, 안정화제, 현탁화제, 색소, 향료 등이 사용될 수 있으며, 주사제의 경우에는 완충제, 보존제, 무통화제, 가용화제, 등장제, 안정화제 등이 혼합되어 사용될 수 있으며, 국소투여용의 경우에는 기제, 부형제, 윤활제, 보존제 등이 사용될 수 있다. 본 발명의 약학 조성물의 제형은 상술한 바와 같은 약제학적으로 허용되는 담체와 혼합하여 다양하게 제조될 수 있다. 예를 들어, 경구 투여시에는 정제, 트로키, 캡슐, 엘릭서 (Elixir), 서스펜션, 시럽, 웨이퍼 등의 형태로 제조할 수 있으며, 주사제의 경우에는 단위 투약 앰플 또는 다수회 투약 형태로 제조할 수 있다. 기타, 용액, 현탁액, 정제, 캡슐, 서방형 제제 등으로 제형화할 수 있다.
한편, 제제화에 적합한 담체, 부형제 및 희석제의 예로는, 락토즈, 덱스트로즈, 수크로즈, 솔비톨, 만니톨, 자일리톨, 에리스리톨, 말디톨, 전분, 아카시아 고무, 알지네이트, 젤라틴, 칼슘 포스페이트, 칼슘 실리케이트, 셀룰로즈, 메틸 셀룰로즈, 미정질 셀룰로즈, 폴리비닐피롤리돈, 물, 메틸하이드록시벤조에이트, 프로필하이드록시벤조에이트, 탈크, 마그네슘 스테아레이트 또는 광물유 등이 사용될 수 있다. 또한, 충진제, 항 응집제, 윤활제, 습윤제, 향료, 유화제, 방부제 등을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명의 상기 약학적 조성물의 투여 경로는 이들로 한정되는 것은 아니지만 구강, 정맥내, 근육내, 동맥내, 골수내, 경막내, 심장내, 경피, 피하, 복강내, 비강내, 장관, 국소, 설하 또는 직장이 포함된다. 경구 또는 비경구 투하가 바람직하다.
본 발명의 상기 "비경구"란, 피하, 피내, 정맥내, 근육내, 관절내, 활액낭내, 흉골내, 경막내, 병소내 및 두개골내 주사 또는 주입기술을 포함한다. 바람직하게는 본 발명의 상기 약학 조성물은 또한 직장 투여를 위한 좌제의 형태로 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명의 상기 약학적 조성물은 사용된 특정 화합물의 활성, 연령, 체중, 일반적인 건강, 성별, 정식, 투여 시간, 투여 경로, 배출율, 약물 배합 및 예방 또는 치료될 특정 질환의 중증을 포함한 여러 요인에 따라 다양하게 변할 수 있고, 상기 약학 조성물의 투여량은 환자의 상태, 체중, 질병의 정도, 약물 형태, 투여 경로 및 기간에 따라 다르지만 당업자에 의해 적절하게 선택될 수 있고, 1 일 0.0001 내지 50 mg/kg 또는 0.001 내지 50 mg/kg으로 투여할 수 있다. 투여는 하루에 한번 투여할 수도 있고, 수회 나누어 투여할 수도 있다. 상기 투여량은 어떠한 면으로든 본 발명의 범위를 한정하는 것은 아니다. 본 발명에 따른 약학적 조성물은 환제, 당의정, 캡슐, 액제, 겔, 시럽, 슬러리, 현탁제로 제형화될 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 항암제 내성을 치료하거나 항암제 감수성을 증진시키는 방법에 관한 것이다.
본 발명의 상기 방법은 투여가 필요한 대상체에게 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효한 양으로 투여하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 항암제 내성 암의 예방 또는 치료 방법에 관한 것이다.
본 발명의 상기 방법은 투여가 필요한 대상체에게 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효한 양으로 투여하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명의 항암제 내성 치료 방법; 항암제 감수성 증진 방법; 및 항암제 내성 암의 예방 또는 치료 방법에서, 각 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자, 상기 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제 등에 대한 기재는 앞서 기재한 바와 중복되어, 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 생략한다.
본 발명에서 상기 "투여"는 임의의 적절한 방법으로 대상체에 소정의 본 발명의 조성물을 제공하는 것을 의미한다.
본 발명에서 상기 투여가 필요한 "대상체"는 포유동물 및 비-포유동물을 모두 포함할 수 있다. 여기서, 상기 포유동물의 예로는 인간, 비-인간 영장류, 예컨대 침팬지, 다른 유인원 또는 원숭이 종; 축산 동물, 예컨대 소, 말, 양, 염소, 돼지; 사육 동물, 예컨대 토끼, 개 또는 고양이; 실험 동물, 예를 들어 설치류, 예컨대 래트, 마우스 또는 기니아 피그 등을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 또한, 본 발명에서 상기 비-포유동물의 예로는 조류 또는 어류 등을 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기와 같이 투여되는 조성물의 제제는 특별히 제한하지 않으며, 고체 형태의 제제, 액체 형태의 제제 또는 흡인용 에어로졸 제제로 투여될 수 있으며, 사용하기 바로 전에 경구 또는 비경구 투여용 액체 형태 제제로 전환되도록 의도되는 고체 형태 제제로 투여될 수 있고, 예를 들면, 산제, 과립제, 캡슐, 정제, 수성 현탁액 등의 경구형 제형, 외용제, 좌제 및 멸균 주사용액의 형태로 제형화하여 투여될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명에서 상기 투여 시 본 발명의 조성물과 함께 약학적으로 허용 가능한 담체를 추가로 투여할 수 있다. 여기서, 상기 약학적으로 허용되는 담체는 경구 투여 시에는 결합제, 활탁제, 붕해제, 부형제, 가용화제, 분산제, 안정화제, 현탁화제, 색소, 향료 등을 사용할 수 있으며, 주사제의 경우에는 완충제, 보존제, 무통화제, 가용화제, 등장제, 안정화제 등을 혼합하여 사용할 수 있으며, 국소투여용의 경우에는 기제, 부형제, 윤활제, 보존제 등을 사용할 수 있다. 본 발명의 화합물의 제형은 상술한 바와 같은 약학적으로 허용되는 담체와 혼합하여 다양하게 제조될 수 있다. 예를 들어, 경구 투여시에는 정제, 트로키, 캡슐, 엘릭서(elixir), 서스펜션, 시럽, 웨이퍼 등의 형태로 제조할 수 있으며, 주사제의 경우에는 단위 투약 앰플 또는 다수회 투약 형태로 제조할 수 있다. 기타, 용액, 현탁액, 정제, 캡슐, 서방형 제제 등으로 제형화할 수 있다.
한편, 제제화에 적합한 담체, 부형제 및 희석제의 예로는, 락토즈, 덱스트로즈, 수크로즈, 솔비톨, 만니톨, 자일리톨, 에리스리톨, 말티톨, 전분, 아카시아 고무, 알지네이트, 젤라틴, 칼슘 포스페이트, 칼슘 실리케이트, 셀룰로즈, 메틸 셀룰로즈, 미정질 셀룰로즈, 폴리비닐피롤리돈, 물, 메틸하이드록시벤조에이트, 프로필하이드록시벤조에이트, 탈크, 마그네슘 스테아레이트 또는 광물유 등이 사용될 수 있다. 또한, 충진제, 항응집제, 윤활제, 습윤제, 향료, 유화제, 방부제 등을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명에 따른 조성물의 투여 경로는 이들로 한정되는 것은 아니지만 구강, 정맥 내, 근육 내, 동맥 내, 골수 내, 경막 내, 심장 내, 경피, 피하, 복강 내, 비강 내, 장관, 국소, 설하 또는 직장이 포함된다. 경구 또는 비경구 투하가 바람직하다.
본 발명에서, "비경구"는 피하, 피내, 정맥내, 근육내, 관절내, 활액낭내, 흉골내, 경막내, 병소내 및 두개골내 주사 또는 주입기술을 포함한다. 본 발명의 약학적 조성물은 또한 직장 투여를 위한 좌제의 형태로 투여될 수 있다.
본 발명에서, "약학적으로 유효한 양"은 바람직한 생물학적 결과를 제공하기 위한 작용제의 충분한 양을 지칭한다. 상기 결과는 질환의 징후, 증상 또는 원인의 감소 및/또는 완화, 또는 생물계의 임의의 다른 바람직한 변화일 수 있다. 예를 들어, 치료 용도를 위한 "유효량"은 질환에서 임상적으로 유의한 감소를 제공하는데 요구되는, 본 발명에 개시된 조성물의 양이다. 임의의 개별적인 경우에서 적절한 "효과적인" 양은 일상적인 실험을 사용하여 당업자에 의해 결정될 수 있다. 따라서, 표현 "유효량"은 일반적으로 활성 물질이 치료 효과를 갖는 양을 지칭한다. 본 발명의 경우에, 활성 물질은 암의 예방, 개선 또는 치료제이자, 항암제 내성 암의 예방, 개선 또는 치료제이다.
본 발명의 조성물은 사용된 활성 물질의 활성, 연령, 체중, 일반적인 건강, 성별, 정식, 투여 시간, 투여 경로, 배출율, 약물 배합 및 예방 또는 치료될 특정 질환의 중증을 포함한 여러 요인에 따라 다양하게 변할 수 있고, 상기 활성 물질의 투여량은 환자의 상태, 체중, 질병의 정도, 약물 형태, 투여 경로 및 기간에 따라 다르지만 당업자에 의해 적절하게 선택될 수 있고, 1일 0.0001 내지 100mg/kg 또는 0.001 내지 100mg/kg으로 투여할 수 있다. 투여는 하루에 한번 투여할 수도 있고, 수회 나누어 투여할 수도 있다. 상기 투여량은 어떠한 면으로든 본 발명의 범위를 한정하는 것은 아니다. 본 발명에 따른 화합물은 환제, 당의정, 캡슐, 액제, 겔, 시럽, 슬러리, 현탁제로 제형화될 수 있다.
본 발명의 활성 물질은 단독으로, 또는 수술, 방사선 치료, 호르몬 치료, 화학 치료 및 생물학적 반응 조절제를 사용하는 방법들과 병용하여 사용할 수 있다.
또한, 본 발명의 조성물은 다른 항암제와도 추가로 병용하여 사용될 수 있으며, 이때 상기 항암제로는 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 소라페닙, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 케페시타빈, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 올라파립, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴, 보리노스텟, 엔티노스텟, 펜포민, 메트포민, 탈라조파립 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 사용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
3. 항암제 내성 극복 또는 치료용 약물 또는 항암제 감수성 증진용 약물의 스크리닝 방법
본 발명의 또 다른 구현 예에 따르면, 항암제 내성 극복 또는 치료용 약물 또는 항암제 감수성 증진용 약물의 스크리닝 방법에 관한 것이다.
본 발명의 스크리닝 방법은, 인-비트로(in vitro)에서 SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자를 발현하는 암 세포 또는 암 조직에 대하여 후보 물질을 처리하는 단계; 및 상기 후보 물질의 처리 후 상기 암 세포 또는 암 조직에 대하여 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 측정하거나 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 "스크리닝"이란, 여러 물질로 이루어진 후보군으로부터 목적으로 하는 어떤 특정한 성질을 갖는 물질을 특정한 조작 또는 평가 방법으로 선별하는 것이다.
본 발명에서 상기 암 세포는 목적하는 개체, 바람직하게는 항암제에 대해 내성이 있거나 있을 가능성이 높은 개체로부터 분리된 것이거나, SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자가 과발현되도록 조작된 것일 수 있고, 바람직하게는 SDHA 단백질을 코딩하는 유전자를 포함하는 재조합 벡터가 암 세포 내로 도입되어 형질 감염된 것일 수 있다.
본 발명에서 상기 "벡터(vector)"는 숙주 세포에서 목적 유전자를 발현시키기 위한 수단을 의미한다. 상기 벡터는 목적 유전자 발현을 위한 요소 (elements)를 포함하는 것으로, 복제원점 (replication origin), 프로모터, 작동 유전자 (operator), 전사 종결 서열 (terminator) 등을 포함할 수 있고, 숙주 세포의 게놈 내로의 도입을 위한 적절한 효소 부위 (예컨대, 제한 효소 부위) 및/또는 숙주 세포 내로의 성공적인 도입을 확인하기 위한 선별 마커 및/또는 단백질로의 번역을 위한 리보좀 결합 부위 (ribosome binding site; RBS), IRES (Internal Ribosome Entry Site) 등을 추가로 포함할 수 있다. 상기 벡터는 프로모터로서 상기한 융합 폴리뉴클레오타이드 (융합 프로모터)를 갖도록 통상적인 유전공학적 방법으로 조작된 것일 수 있다. 상기 벡터는 상기 프로모터 이외의 전사 조절 서열 (예컨대 인핸서 등)을 추가로 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 재조합 벡터는 바이러스성 또는 비바이러스성 벡터일 수 있으며, 상기 바이러스성 벡터는 아데노바이러스 벡터, 렌티바이러스를 포함하는 레트로바이러스 벡터, 아데노-부속 바이러스 벡터 또는 헤르페스 심플렉스 바이러스 벡터 등일 수 있으나, 이에 한정되지 않는다. 또한, 상기 비바이러스성 벡터로는 플라스미드 벡터, 박테리오파지 벡터, 리포솜, 세균인공염색체, 효모인공염색체 등일 수 있으나, 이에 한정되지 않는다.
본 발명에서 상기 재조합 벡터에서 상기 목적 유전자는 상기 융합 폴리뉴클레오타이드에 작동가능하게 연결될 수 있다. 용어 "작동 가능하게 연결된(operatively linked)"은 유전자 발현 조절 서열과 다른 뉴클레오타이드 서열 사이의 기능적인 결합을 의미한다. 상기 유전자 발현 조절 서열은 "작동 가능하게 연결(operatively linked)"됨으로써 다른 뉴클레오타이드 서열의 전사 및/또는 해독을 조절할 수 있다. 상기 재조합 벡터에 있어서, 상기 융합 폴리뉴클레오타이드가 상기 목적 유전자에 작동 가능하게 연결되기 위해서, 상기 융합 폴리뉴클레오타이드는 상기 목적 유전자의 5' 말단에 연결된 것일 수 있다. 본 발명의 재조합 벡터는, 발현시키고자 하는 목적 단백질의 암호화 유전자가 작동 가능하게 연결될 경우, 적절한 숙주 세포에서 상기 목적 단백질을 높은 효율로 발현시킬 수 있는 목적 단백질의 발현 벡터로 사용될 수 있다.
본 발명의 상기 재조합 벡터는 전사 조절 서열을 추가로 포함할 수 있다. 상기 전사 조절 서열은 폴리아데닐화 서열(pA)과 같은 전사 종결 서열; f1 복제원점, SV40 복제원점, pMB1 복제원점, 아데노 복제원점, AAV 복제원점, BBV 복제원점 등의 복제 원점 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 본 발명에서 상기 재조합 벡터는 선별 마커를 추가로 포함할 수 있다. 상기 선별 마커는 재조합 벡터가 숙주 세포 내에 성공적으로 도입되었는지 여부를 확인하거나 안정적인 세포주 구축을 위한 유전자로서, 예컨대, 항생제와 같은 약물 저항 유전자, 대사 관련 유전자, 유전자 증폭 유전자 등으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상일 수 있다.
본 발명에서 상기 재조합 벡터의 암 세포 내로의 운반(도입)은, 당업계에 널리 알려진 운반 방법을 사용할 수 있다. 상기 운반 방법은 예컨대, 미세 주입법, 칼슘 포스페이트 침전법, 전기 천공법(electroporation), 초음파 천공법(sonoporation), 자기장을 이용한 자기주입법(magnetofection), 리포좀-매개 형질감염법, 유전자 밤바드먼트 (gene bombardment), 덴드리머 및 무기(inorganic) 나노 입자의 사용 등을 사용할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 후보 물질은 천연 화합물, 합성 화합물, RNA, DNA, 폴리펩티드, 효소, 단백질, 리간드, 항체, 항원, 박테리아 또는 진균의 대사 산물 및 생활성 분자로 이루어진 군으로부터 선택되는 1종 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기한 단백질의 활성 또는 발현 수준을 측정하는 제제는 특별히 제한하지는 않으나, 예를 들면 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA(peptide nucleic acid) 및 앱타머(aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에서 상기 단백질의 활성 또는 발현 수준을 측정 또는 비교 분석 방법으로는 단백질 칩 분석, 면역측정법, 리간드 바인딩 어세이, MALDI-TOF(Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, SELDI-TOF(Sulface Enhanced Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry) 분석, 방사선 면역 분석, 방사 면역 확산법, 오우크테로니 면역 확산법, 로케트 면역전기영동, 조직면역 염색, 보체 고정 분석법, 2차원 전기영동 분석, 액상 크로마토그래피-질량분석(liquid chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS), LC-MS/MS(liquid chromatography-Mass Spectrometry/ Mass Spectrometry), 웨스턴 블랏팅 또는 ELISA(enzyme linked immunosorbentassay) 등이 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함할 수 있다.
본 발명에 따른 단백질이나 이를 코딩하는 유전자의 정보는 알려져 있으므로, 당업자라면 이를 바탕으로 상기 단백질을 암호화하는 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 또는 안티센스 뉴클레오티드를 용이하게 디자인할 수 있을 것이다.
본 발명에서 상기 유전자의 존재 여부와 발현 정도를 확인하는 과정으로, 상기 유전자의 발현 수준을 측정하는 분석 방법으로는 역전사 중합효소반응(RT-PCR), 경쟁적 역전사 중합효소반응(Competitive RT-PCR), 실시간 역전사 중합효소반응(Real-time RT-PCR), RNase 보호 분석법(RPA; RNase protection assay), 노던 블랏팅(Northern blotting) 또는 DNA 칩 등이 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.
본 발명에서 상기 후보 물질의 처리 후 상기 암 세포 또는 암 조직에서 측정된 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준이 감소하거나, 혹은 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준이 감소한 경우, 상기 후보 물질을 항암제의 내성 극복 또는 치료용 약물 또는 항암제 감수성 증진용 약물로 판별하는 단계를 더 포함할 수 있다.
본 발명의 스크리닝 방법에서 항암제 및 암 등에 대한 기재는 항암제 내성 진단용 조성물에서 기재한 바와 동일하여, 본 명세서의 과도한 복잡성을 피하기 위하여 생략한다.
본 발명을 이용하는 경우 항암제에 대한 내성을 진단함으로써, 향후 치료 계획에 있어 암 환자별 항암제 적합성에 대한 정확한 기초 정보를 제공할 수 있다. 뿐만 아니라, 본 발명을 이용하는 경우 항암제에 대한 내성을 극복하고 더 나아가서는 항암제 내성 암을 효과적으로 예방, 개선 또는 치료할 수 있다.
도 1a 및 도 1b는 본 발명의 일 실시예에 따른, 다양한 세포주에서 IM156 약물 투여 후 세포 생존력(cell viability)을 측정한 결과를 나타낸 도이다.
도 2a는 본 발명의 일 실시예에 따른, 다양한 세포주에서의 SDHA 유전자의 발현을 웨스턴 블롯 분석을 통해 발현 정도를 확인한 도이다.
도 2b는 본 발명의 일 실시예에 따른, 유방암 세포주(MDA-MB-231 또는 MCF7)와 위암 세포주(SK4, MKN45 또는 AGS)를 P 세포와 S 세포로 분류하여 SDHA의 발현 정도를 웨스턴 블롯을 통해 비교 확인한 도이다.
도 3a 및 도 3b는 본 발명의 일 실시예에 따른, IM156 내성 세포주(Hs746T)와 IM156 감수성 세포주(SNU638)에서의 로테논(Rotenone) 또는 IM156 약물 투여에 따른 SDHA 발현 변화의 정도를 비교 확인한 도이다.
도 4a 내지 4c는 본 발명의 일 실시예에 따른, IM156 내성 세포주(Hs746T)에서의 로테논(Rotenone) 또는 IM156 약물 투여 후 세포 호흡 과정에서의 산소 소모율(Oxygen Consumption Rate; OCR)을 측정한 결과를 확인한 도이다.
도 5a 내지 5c는 본 발명의 일 실시예에 따른, IM156 감수성 세포주(SNU638)에서의 로테논(Rotenone) 또는 IM156 약물 투여 후 세포 호흡 과정에서의 산소 소모율(Oxygen Consumption Rate; OCR)을 측정한 결과를 확인한 도이다.
도 6a 및 도 6b는 본 발명의 일 실시예에 따른, 3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA) 또는 아트페닌 A5(atpenin A5) 약물 투여시 산소 소모율(OCR) 측정을 통하여 항암제 감수성 변화를 비교 확인한 도이다.
도 7a 및 도 7b는 본 발명의 일 실시예에 따른, SDHA 억제제 약물 투여 또는 SDHA 유전자의 넉다운시 산소 소모율(OCR) 측정을 통하여 항암제 감수성 변화를 비교 확인한 도이다.
본 발명의 일 구현 예에서는 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함를 포함하는 항암제 내성 진단용 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 다른 구현 예에서는 본 발명의 상기 항암제 내성 진단용 조성물을 포함하는 항암제 내성 진단용 키트에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 구현 예에서는 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 상기 SDHA 단백질 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 항암제 내성 진단을 위한 정보를 제공하는 방법에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 구현 예에서는 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효 성분으로 포함하는 항암제 내성을 치료하거나 항암제 감수성을 증진시키는 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 구현 예에서는 투여가 필요한 대상체에게 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효한 양으로 투여하는 단계를 포함하는 항암제 내성 치료하거나 항암제 감수성을 증진시키는 방법에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 구현 예에서는 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효 성분으로 포함하는 항암제 내성 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 구현 예에서는 투여가 필요한 대상체에게 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효한 양으로 투여하는 단계를 포함하는 항암제 내성 암의 예방 또는 치료 방법에 관한 것이다.
본 발명의 또 다른 구현 예에서는 인-비트로(in vitro)에서 SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자를 발현하는 암 세포 또는 암 조직에 대하여 후보 물질을 처리하는 단계; 및 상기 후보 물질의 처리 후 상기 암 세포 또는 암 조직에 대하여 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 측정하거나 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는 항암제 내성 극복 또는 치료용 약물 또는 항암제 감수성 증진용 약물의 스크리닝 방법에 관한 것이다.
이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 요지에 따라 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 자명할 것이다.
실시예 1: 항암제 내성 세포의 준비
1.1 세포의 배양
본 발명의 발명자들은 연세대학교 의과대학 평가위원회(Institutional Review Board, IRB)의 승인을 얻어 모든 실험을 수행하였다. 실험 진행을 위하여 미국 세포주 은행(American Type Culture Collection; ATCC)으로부터 인간 위암 세포주인 Hs 746T, MKN-45, YCC-11 및 YCC-16을 수득하였으며, 한국 세포주 은행(Korean Cell Line Bank)으로부터 인간 위암 세포주인 SK4, MKN-1, NCC-59, SNU-1750, SNU-1967, SNU-484, SNU-601, SNU-638, SNU-668 및 SNU-719를 수득하여, 미국 또는 한국 세포주 은행의 가이드에 따라 10 % FBS가 포함된 RPMI 1640 배지에 1% 페니실린-스트렙토마이신(Gibco)을 추가하여 37 ℃, 5 % CO2 incubator(HERAcell 150i, Thermo Scientific, Waltham, MA, USA)에서 배양하여 실험에 이용하였다.
1.2 IM156 약물 처리 후 내성 세포주 및 감수성 세포주의 선별
IM156 약물의 민감도 확인을 위하여 실시예 1.1에서 수득하여 배양한 다양한 위암 세포주 각각에 농도별로 OXPHOS 억제제의 일종인 IM156 약물을 처리하였다. 상기 약물의 농도 별로 MTT 어세이를 통하여 세포 생존 능력(cell viability)을 측정한 값을 도 1의 그래프에 나타내었다. 그 결과 6.33 uM 내지 63.29 uM 농도 범위 내에서 세포 생존력(cell viability)이 급격히 변화하는 모습을 확인할 수 있었다(도 1a 참조). IM156 약물의 농도가 약 20 uM 범위인 때 세포주간 민감도를 살펴본 결과 내성 세포주로서 가장 높은 세포 생존율을 가지는 Hs746T와 감수성 세포주로서 가장 낮은 세포 생존율을 가지는 SNU638을 선별하였다(도 1b 참조).
실시예 2: 줄기세포적 특성과 SDHA 발현량과의 상관 관계 확인
상기에서 수득한 위암 세포주 외에 다른 암종의 세포주(유방암 세포주인 MDA-MB-231 및 MCF7, 대장암 세포주인 HCT116 및 SW480, 폐암 세포주인 A549, 위암 세포주인 Hs746T, YCC9 및 SK4)를 별도로 수득하여 실시예 1.1과 같은 방법으로 배양하였다. 이들로부터 SDHA 바이오 마커의 발현 수준을 측정하고자 웨스턴 블롯을 수행하였다(도 2a 참조). 일반적으로 암 세포에서 SDHA의 발현이 관찰되는 것을 확인할 수 있었다. 이들 중에서 유방암 세포주와 위암 세포주만을 선택하여 추가적으로 모세포(parent cell; P cell) 및 모세포를 연속 배양하여 30일 이후에 생존한 세포(selected cell; S cell)로 나누어 SDHA 단백질의 발현 정도를 확인하기 위하여 웨스턴 블롯을 수행하였다. 그 결과 줄기세포성/난치암 아형에서의 SDHA의 발현이 높게 나타났으며 특히 위암 세포주에서 차이가 현저한 것으로 확인되었다. 다양한 위암 세포주 모두에서 줄기세포적 특성을 갖는 S 세포인 경우 상대적으로 상기 단백질의 발현량이 높은 것으로 나타났다(도 2b 참조). 이는 결국 SDHA의 발현량이 높은 것은 상대적으로 치료율이 낮을 수 있음을 시사한다.
실시예 3: IM156 약물 특이적인 SDHA 마커 발현량의 변화 확인
3.1. SDHA 마커의 발현량 변화 확인
IM156 약물에 대한 SDHA 마커 특이성이 인정되는지 확인을 위해 감수성 세포주와 내성 세포주에 같은 OXPHOS 억제제 중의 하나인 로테논 약물을 추가로 이용하여 비교 실험을 수행하였다. IM156 약물과 로테논 약물 투여 전 후의 SDHA 발현량 변화를 측정하기 위해 웨스턴 블롯을 수행하였으며 그에 따른 결과를 도 3a 및 도 3b에 나타내었다.
실시예 1에서 선별한 약물 내성 세포주인 Hs746T와 감수성 세포주인 SNU638을 배양하여 로테논과 IM156을 각각 투여하였다. 그 결과 로테논을 투여한 군에서 내성 세포주의 SDHA 발현량에 변화가 나타나지 않은 반면, IM156을 투여한 군에서 SDHA 발현량이 약물 투여 전에 비하여 증가한 모습을 관찰할 수 있었다(도 3a 참조). 이를 명확히 비교하기 위하여 약물 감수성 세포주에 각 약물을 투여하고 관찰한 결과 로테논을 투여한 군에는 약물 투여 전 후에 SDHA 발현량에 변화가 없었으나, IM156을 투여한 군에서 SDHA 발현량이 감소하는 결과를 확인할 수 있었다(도 3b 참조). 이러한 결과를 종합하면 약물 투여 전 후의 SDHA 발현량 변화를 통하여 IM156 약물에 대한 내성을 확인하기 위한 마커로서 SDHA가 사용될 수 있음을 시사한다.
3.2 각 약물 투여시 미토콘드리아 호흡률 비교
상기 약물에 대한 내성 발생 유무를 확인하고자 실시예 1에서 선별된 Hs746T와 SNU638 세포주를 비교하였다. 먼저, 내성 세포주인 Hs746T에 로테논과 IM156 약물을 각각 투여하여 세포 호흡 과정에서의 산소 소모율(Oxygen Consumption Rate; OCR)을 측정하여 분석한 결과를 도 4a 내지 4c에 나타내었으며, 감수성 세포주인 SNU638도 동일하게 측정하여 분석한 결과를 도 5a 내지 도 5c에 나타내었다. 이하 모든 실시예에 따른 도면 상의 수치는 평균±표준오차범위(standard error of the mean; SEM)로 나타내었으며, *는 통계적 유의성을 나타낸다(*P<0.05, **P<0.005). 산화적 인산화의 지표인 산소 소모량은 암 세포의 대사 과정으로서 암 세포의 분열이 얼마나 활발하게 일어나는지를 확인할 수 있는 척도가 될 수 있다.
센서 카트리지(Agilent Technologies, Palo Alto, CA, USA)에 XF Calibrant buffer(Agilent Technologies) 1 mL을 넣고 37 ℃ non-CO2 인큐베이터 조건에서 오버나이트하였다. 위암 세포주인 A549 세포를 XF24 세포배양 마이크로플레이트(Agilent Technologies)에 7Х104 cells/well로 분주한 후, 37 ℃, 5 % CO2 인큐베이터에서 24시간 후 로테논 약물을 50 nM 또는 IM156 약물을 15 uM을 투여한 후 37 ℃, 5 % CO2 인큐베이터에서 오버나이트시켰다. 약물 투여한 마이크로플레이트에 XF base media(pH 7.4, Agilent Technologies)를 각각 500 uL/well 넣은 후 37 ℃ non-CO2 인큐베이터에서 1 시간 동안 추가로 배양하였다. 센서 카트리지의 A port에 1.5 uM 올리고마이신(Agilent Technologies), B port에 2.0 uM FCCP(Agilent Technologies), C port 0.5 uM 로테논/안티마이신 A(Agilent Technologies)을 넣고 추가로 XF24 마이크로플레이트도 함께 Agilent seahorse XF24 (Agilent Technologies)기기에 넣어 OCR을 측정하여 비교하였다. 이때, 측정된 값은 1 분 당 피코몰 단위(pM/min)를 기준으로 하여 퍼센티지 값을 비교하였다.
IM156 약물에 대한 내성 세포주와 감수성 세포주에서의 결과를 살펴보면, 로테논 약물을 투여한 경우 시간에 따른 OCR 측정 정도의 값이 동일한 양상(도 4a 및 도 5a 참조)을 보이는 것을 확인할 수 있는 반면, IM156 약물을 투여한 경우 OCR 측정 정도의 값은 내성 세포주와 감수성 세포주에서 반대의 양상(도 4b 및 도 5b 참조)을 보이는 것을 확인하였다. 이를 더욱 명확하게 비교하기 위하여 기초 호흡량(basal respiration), 호흡용량(spare respiratory capacity) 및 ATP 생산량(ATP production)을 음성 대조군 기준으로 하여 환산한 그래프로 나타내었다. 도 4c 및 도 5c를 참조하면, 내성 세포주와 감수성 세포주에서 현저한 차이를 보이는 것은 IM156 약물에 해당하는 것을 확인할 수 있다. 따라서 상기 결과를 종합할 때, 동일한 OXPHOS 약물 중에서 IM156 약물 특이적인 내성 마커로서 SDHA가 활용될 수 있다는 것을 확인하였다.
실시예 4: SDHA 발현 조절을 통한 항암제 내성 치료 가능성 확인
4.1 줄기세포성/난치암의 치료 효과
위암 세포주인 SK4 세포주로부터 P 세포(PSK4)와 S 세포(SSK4)를 준비하였으며, P 세포군과 S 세포군에 SDHA의 단백질, 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제인 3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA) 또는 아트페닌 A5(atpenin A5)을 투여한 후 OCR을 측정한 결과를 도 6a 및 도 6b에 나타내었다. 줄기세포적 특성을 띠는 SSK4 세포에 상기 두 가지 제제가 작용하여 암 치료 효과가 있는 것을 확인하였으며, 아트페닌 A5에 비하여 3-니트로 프로피온산이 더욱 효과적으로 암 세포와 함께 암 줄기세포도 치료할 수 있음을 확인하였다.
4.2 IM156 약물 내성 치료 용도의 확인
내성 세포주인 Hs746T에도 같은 암 치료 효과가 나타나는지 확인하기 위하여 로테논 또는 IM156 약물 단독 투여한 경우를 100 %로 환산하여 3-니트로 프로피온산과 병용 투여 후의 ATP 생산량을 각각 측정하였다. 그 결과 줄기세포성 특성을 갖는 세포주에 효과가 있었던 것과 마찬가지로 두 약물과 병용 투여시 모두에서 암 치료 효과가 나타난 것을 확인하였다(도 7a 및 도 7b 참조). 또한, SDHA 발현 억제제의 효과를 확인하기 위하여 추가 실험을 수행하였다. 6 웰 플레이트에 세포를 60 % 컨플루언시(confluency)로 분주하고, 37 ℃, 5 % CO2 인큐베이터에서 오버나이트 시킨 후 2 % FBS(without antibiotics) RPMI-1650 배지로 교체하여 배양하였다. siRNA 50 nM(바이오니아 제품)과 트렌스펙션 시약(transfection reagent, mirus bio 제품)을 섞은 뒤 총 부피를 200 uL로 맞추어 20 분 동안 상온에서 인큐베이션시켰다. 6 웰 플레이트에 siRNA와 트렌스펙션 시약 혼합물을 천천히 넣어주어 37 ℃, 5 % CO2 인큐베이터에서 오버나이트 후 10 % FBS(with antibiotics) RPMI-1650 배지로 교체하여 72 시간 인큐베이션시켜 SDHA 발현 억제제를 제조하였다. 상기와 같은 실험을 반복 수행하였다. 하기 표 1을 참조하면, 로테논과 IM156 모두에서 효과가 나타났으며, 특히 IM156 약물에 내성을 갖는 세포주에서 IM156 약물의 내성이 극복되어 암 치료 효과가 나타난 것을 확인할 수 있었다(도 7b 하단 참조).
ATP production(%) 로테논 IM156
단독 100 100
병용(3NPA) 50.64 47.00
병용(siSDHA) 37.66 12.30
상기 결과를 종합하면, SDHA 발현 억제와 직간접적으로 관련이 있는 3-니트로 프로피온산 약물 또는 아트페닌 A5 약물을 처리하거나 SDHA의 발현을 siRNA를 이용해 넉다운 시킴으로써 항암제 내성이 치료되는 것을 확인할 수 있다.
상기 실시예 1 내지 4를 종합적으로 고려하면, 약물의 종류에 따른 항암제 내성 진단 방법은 약물 종류에 따라 달라질 수 있음을 시사하며, 상기 SDHA 발현 억제제를 투여할 경우 항암제 내성 보다 구체적으로 IM156 약물 내성을 극복하여 암 치료 효과의 향상을 유도할 수 있을 것으로 기대된다.
이상으로 본 발명의 특정한 부분을 상세히 기술하였는 바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서 이러한 구체적인 기술은 단지 바람직한 구현 예일 뿐이며, 이에 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백하다. 따라서 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항과 그의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.
본 발명에 따른 조성물은 항암제에 대한 내성을 진단할 수 있을 뿐만 아니라, 상기 항암제에 대한 내성을 극복하고 더 나아가서는 항암제 내성 암을 효과적으로 예방, 개선 또는 치료를 위해 매우 효과적으로 사용될 수 있다.

Claims (27)

  1. SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제를 포함하는, 항암제 내성 진단용 조성물.
  2. 제 1항에 있어서,
    상기 단백질의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 단백질에 특이적으로 결합하는 항체, 올리고펩타이드, 리간드, PNA (peptide nucleic acid) 및 앱타머 (aptamer)로 이루어진 군에서 선택된 1 종 이상을 포함하는, 조성물.
  3. 제 1항에 있어서,
    상기 유전자의 발현 수준을 측정하는 제제는 상기 유전자에 특이적으로 결합하는 프라이머, 프로브 및 안티센스 뉴클레오티드로 이루어진 군에서 선택된 1 종 이상을 포함하는, 조성물.
  4. 제 1항에 있어서,
    상기 항암제는 OXPHOS 억제제, 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 5-플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 조성물.
  5. 제 4항에 있어서,
    상기 항암제는 OXPHOS 억제제인, 조성물.
  6. 제 5항에 있어서,
    상기 OXPHOS 억제제는 유비퀴논 환원 활성 억제제(ubiquinone reduction activity inhibitor), 미토콘드리아 전자 수송 사슬 Ⅰ 억제제(mitochondrial electron transport chain I inhibitor) 또는 철 킬레이터(iron chelator)로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는 것인, 조성물.
  7. 제 5항에 있어서,
    상기 미토콘드리아 전자 수송 사슬 Ⅰ 억제제는 IM156인, 조성물.
  8. 제 1항에 있어서,
    상기 항암제는 갑상선암, 부갑상선암, 위암, 난소암, 대장암, 췌장암, 간암, 유방암, 자궁경부암, 폐암, 비소세포성폐암, 전립선암, 담낭암, 담도암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 혈액암, 방광암, 신장암, 흑색종, 결장암, 골암, 피부암, 두부암, 자궁암, 직장암, 뇌종양, 항문부근암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 수뇨관암, 신장세포 암종, 신장골반 암종, 중추신경계(CNS central nervoussystem) 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 뇌간 신경교종 또는 뇌하수체 선종인 암의 치료를 위한 것인, 조성물.
  9. 제 1항 내지 제 8항 중 어느 한 항의 조성물을 포함하는, 항암제 내성 진단용 키트.
  10. 목적하는 개체로부터 분리된 생물학적 시료에서 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 항암제 내성 진단을 위한 정보 제공 방법.
  11. 제 10항에 있어서,
    상기 생물학적 시료에서 측정된 SDHA 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자의 발현 수준이 대조군에 비하여 높을 경우, 상기 목적하는 개체에 항암제 내성이 발생하였거나 발생할 가능성이 높을 것으로 예측하는 것인, 방법.
  12. 제 10항에 있어서,
    상기 항암제는 OXPHOS 억제제, 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 5-플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 방법.
  13. SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효 성분으로 포함하는, 항암제 내성 치료용 약학적 조성물.
  14. 제 13항에 있어서,
    상기 단백질의 활성 또는 발현을 감소시키는 제제는 SDHA 단백질 또는 그 일부 부위에 특이적으로 결합하는 화합물, 펩티드, 펩티드 미메틱스, 앱타머, 항체, 및 천연물로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상인, 조성물.
  15. 제 13항에 있어서,
    상기 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제는 SDHA 유전자 또는 그 일부 부위에 상보적으로 결합하는 안티센스 뉴클레오티드, 작은 간섭 RNA(short interfering RNA; siRNA), 짧은 헤어핀 RNA(short hairpin RNA) 및 리보자임(ribozyme)으로 구성된 군으로부터 선택된 어느 하나 이상인, 조성물.
  16. 제 13항에 있어서,
    상기 조성물은 3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA) 또는 아트페닌 A5(atpenin A5) 중 적어도 하나를 추가로 더 포함하는, 조성물.
  17. 제 13항에 있어서,
    상기 항암제는 OXPHOS 억제제, 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 5-플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 조성물.
  18. 제 13항에 있어서,
    상기 항암제는 갑상선암, 부갑상선암, 위암, 난소암, 대장암, 췌장암, 간암, 유방암, 자궁경부암, 폐암, 비소세포성폐암, 전립선암, 담낭암, 담도암, 비호지킨 림프종, 호지킨 림프종, 혈액암, 방광암, 신장암, 흑색종, 결장암, 골암, 피부암, 두부암, 자궁암, 직장암, 뇌종양, 항문부근암, 나팔관암종, 자궁내막암종, 질암, 음문암종, 식도암, 소장암, 내분비선암, 부신암, 연조직 육종, 요도암, 음경암, 수뇨관암, 신장세포 암종, 신장골반 암종, 중추신경계(CNS central nervoussystem) 종양, 1차 CNS 림프종, 척수 종양, 뇌간 신경교종 또는 뇌하수체 선종인 암의 치료를 위한 것인, 조성물.
  19. SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효 성분으로 포함하는, 항암제 감수성 증진용 약학적 조성물.
  20. 제 19항에 있어서,
    상기 조성물은 3-니트로 프로피온산(3-nitropropionic acid; 3NPA) 또는 아트페닌 A5(atpenin A5) 중 적어도 하나를 추가로 더 포함하는, 조성물.
  21. 제 19항에 있어서,
    상기 항암제는 OXPHOS 억제제, 나이트로젠 머스타드, 이마티닙, 옥살리플라틴, 리툭시맙, 엘로티닙, 네라티닙, 라파티닙, 제피티닙, 반데타닙, 니로티닙, 세마사닙, 보수티닙, 악시티닙, 세디라닙, 레스타우르티닙, 트라스투주맙, 게피티니브, 보르테조밉, 수니티닙, 카보플라틴, 베바시주맙, 시스플라틴, 세툭시맙, 비스쿰알붐, 아스파라기나제, 트레티노인, 하이드록시카바마이드, 다사티닙, 에스트라머스틴, 겜투주맵오조가마이신, 이브리투모맙튜세탄, 헵타플라틴, 메칠아미노레불린산, 암사크린, 알렘투주맙, 프로카르바진, 알프로스타딜, 질산홀뮴 키토산, 젬시타빈, 독시플루리딘, 페메트렉세드, 테가푸르, 카페시타빈, 기메라신, 오테라실, 아자시티딘, 메토트렉세이트, 우라실, 시타라빈, 5-플루오로우라실, 플루다가빈, 에노시타빈, 플루타미드, 데시타빈, 머캅토푸린, 티오구아닌, 클라드리빈, 카르모퍼, 랄티트렉세드, 도세탁셀, 파클리탁셀, 이리노테칸, 벨로테칸, 토포테칸, 비노렐빈, 에토포시드, 빈크리스틴, 빈블라스틴, 테니포시드, 독소루비신, 이다루비신, 에피루비신, 미톡산트론, 미토마이신, 블레로마이신, 다우노루비신, 닥티노마이신, 피라루비신, 아클라루비신, 페프로마이신, 템시롤리무스, 테모졸로마이드, 부설판, 이포스파미드, 사이클로포스파미드, 멜파란, 알트레트민, 다카바진, 치오테파, 니무스틴, 클로람부실, 미토락톨, 레우코보린, 트레토닌, 엑스메스탄, 아미노글루테시미드, 아나그렐리드, 나벨빈, 파드라졸, 타목시펜, 토레미펜, 테스토락톤, 아나스트로졸, 레트로졸, 보로졸, 비칼루타미드, 로무스틴 및 카르무스틴으로 이루어진 군에서 선택된 1종 이상을 포함하는, 조성물.
  22. SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효 성분으로 포함하는, 항암제 내성 암의 예방 또는 치료용 약학적 조성물.
  23. 인-비트로(in vitro)에서 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질 또는 이를 코딩하는 유전자를 발현하는 암 세포 또는 암 조직에 대하여 후보 물질을 처리하는 단계; 및
    상기 후보 물질의 처리 후 상기 암 세포 또는 암 조직에 대하여 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준을 측정하거나 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하는, 항암제 내성 치료용 약물의 스크리닝 방법.
  24. 제 23항에 있어서,
    상기 후보 물질의 처리 후 측정된 SDHA 단백질의 활성 또는 발현 수준이 감소하거나, 혹은 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준이 감소한 경우, 상기 후보 물질을 항암제의 내성 치료용 약물로 판별하는 단계를 더 포함하는, 스크리닝 방법.
  25. 투여가 필요한 대상체에게 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효한 양으로 투여하는 단계를 포함하는 항암제 감수성 증진 방법.
  26. 투여가 필요한 대상체에게 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효한 양으로 투여하는 단계를 포함하는 항암제 내성 치료 방법.
  27. 투여가 필요한 대상체에게 SDHA(succinate dehydrogenase complex flavoprotein subunit A) 단백질의 활성 또는 발현 수준을 감소시키는 제제; 또는 상기 단백질을 코딩하는 유전자의 발현 수준을 감소시키는 제제를 유효한 양으로 투여하는 단계를 포함하는 항암제 내성 암의 예방 또는 치료 방법.
PCT/KR2021/004253 2020-04-06 2021-04-06 항암제 내성 진단 또는 치료용 조성물 WO2021206406A1 (ko)

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