WO2019244934A1 - 新規抗ｐａｄ２抗体 - Google Patents

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WO2019244934A1
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pad2
antibody
present
amino acid
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憲二 斉藤
知子 坂田
峻哲 川野邊
啓太 古賀
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株式会社ファーマフーズ
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    • C12Y305/03—Hydrolases acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds (3.5) in linear amidines (3.5.3)
    • C12Y305/03015—Protein-arginine deiminase (3.5.3.15)

Definitions

  • the present invention relates to a novel anti-PAD2 antibody.
  • PAD2 Peptidylarginine deiminase 2
  • PAD2 is known as an enzyme involved in citrullination of arginine in proteins. This citrullination is important for the structure and reaction of the protein, because arginine, which is the most basic of the amino acids constituting the protein, is converted to neutral citrulline.
  • Non-Patent Document 1 describes that PAD2 is involved in TNF ⁇ -induced citrullination and arthritis (Abstract).
  • Non-Patent Document 2 describes that citrullinated myelin basic protein represents a biochemical pathway for the development of multiple sclerosis (Abstract).
  • Non-Patent Document 3 describes the relationship between citrullinated histones and the onset of arthritis (Abstract).
  • Patent Document 1 discloses that a rabbit PAD2 was immunized to a mouse to prepare an anti-PAD2 antibody (Example 1), that the antibody bound to positions 1 to 165 of human PAD2 (Example 3), and that the antibody inhibited PAD2. It describes that the activity was examined (Example IV).
  • the anti-PAD2 antibody of Patent Document 1 does not have a sufficiently strong PAD2 inhibitory activity and has room for improvement. In addition, no antibody having excellent PAD2 inhibitory activity has been reported.
  • the present invention has been made in view of the above circumstances, and has as its object to provide an anti-PAD2 antibody having excellent PAD2 inhibitory activity.
  • the inventors of the present invention prepared an anti-PAD2 antibody using a peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 (positions 341 to 357 of PAD2) as an antigen, as described in Examples below.
  • SEQ ID NO: 1 positions 341 to 357 of PAD2
  • the antibody had an excellent inhibitory activity on PAD2.
  • this antibody unexpectedly exhibited significantly superior PAD2 inhibitory activity as compared to the anti-PAD2 antibodies (# 2 and # 34) prepared based on Patent Document 1.
  • an anti-PAD2 antibody which specifically binds to positions 341 to 357 of PAD2 (Peptidylarginine deiminase 2). Using this antibody, PAD2 can be detected. The use of this antibody can inhibit the function of PAD2.
  • an anti-PAD2 antibody that specifically binds to a peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. Using this antibody, PAD2 can be detected. The use of this antibody can inhibit the function of PAD2.
  • an anti-PAD2 antibody which specifically binds to positions 344 to 357 of PAD2.
  • PAD2 can be detected.
  • the use of this antibody can inhibit the function of PAD2.
  • a polynucleotide or a vector encoding the above-mentioned anti-PAD2 antibody there is provided a composition comprising the above anti-PAD2 antibody.
  • a PAD2 citrullination activity inhibitor comprising the above-mentioned anti-PAD2 antibody.
  • a method for producing an anti-PAD2 antibody comprising a step of growing a cell containing the polynucleotide or the vector.
  • the KD (M) for PAD2 may be 9.0 ⁇ 10 ⁇ 8 or less, and the binding site may be a binding site identified by an alanine scan with three amino acid substitutions.
  • the anti-PAD2 antibody may be a monoclonal antibody, and the anti-PAD2 antibody may be an antigen-binding fragment.
  • FIG. 1 is a diagram showing the results of measuring the affinity of the anti-PAD2 antibody used in the examples.
  • FIG. 2 is a diagram showing the results of measuring the citrullination activity of human PAD2 when the anti-PAD2 antibody used in the examples was added. * (p ⁇ 0.01) is shown in the results of the antibodies that showed a significant difference from the anti-DNP antibody (negative control) by t-test (two-sided).
  • FIG. 3 is a diagram showing the results of evaluating the epitope of the anti-PAD2 antibody used in the examples.
  • One embodiment of the present invention is a novel anti-PAD2 antibody.
  • This antibody is, for example, an anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 341 to 357 of PAD2.
  • it may be an anti-PAD2 antibody that specifically binds to a peptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • it may be an anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 344 to 357 of PAD2. If this antibody is used, for example, the function of PAD2 can be inhibited.
  • PAD2 is generally known as an enzyme involved in citrullination of arginine in proteins. Details of the amino acid sequence of PAD2 and the like can be found on a website such as NCBI (National Center for Biotechnology Information) or HGNC (HUGO Gene Nomenclature Corporation). The accession number of PAD2 described in NCBI is, for example, NP_031391.2. The amino acid sequence of PAD2 is, for example, SEQ ID NO: 2. PAD2 is not limited in its biological origin as long as it has PAD2 activity. PAD2 includes, for example, PAD2 from humans, monkeys, mice, rats, dogs, or cats. Positions 341 to 357 of PAD2 are typically Y, L, N, R, G, D, R, W, I, Q, D, E, I, E, F, G, Y (single amino acid) Notation) is located.
  • anti-PAD2 antibody includes an antibody having a binding property to PAD2.
  • the method for producing the anti-PAD2 antibody is not particularly limited.
  • the anti-PAD2 antibody may be produced by immunizing mammals or birds with PAD2.
  • An anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 341 to 357 of PAD2 may be produced, for example, by immunizing a mammal or bird with a peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1.
  • An anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 344 to 357 or 344 to 355 of PAD2 is, for example, a peptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, or a position 4 to 17 or 4 to 15 of SEQ ID NO: 1.
  • the peptide may be produced by immunizing a mammal or bird with a peptide consisting of the amino acid sequence of position 1.
  • An anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 344 to 357 or 344 to 355 of PAD2 shows, for example, binding to wild-type PAD2 and to Ala mutant PAD2 at positions 344 to 357 or 344 to 355. It may be obtained through a step of selecting an anti-PAD2 antibody that does not show binding property.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that inhibits the function of PAD2. Function inhibition includes, for example, inhibition of citrullination activity.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that binds to calcium-bound PAD2 or an antibody that inhibits the function of calcium-bound PAD2.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may have a function of inhibiting PAD2 activity.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may have an antibody that binds to calcium-bound PAD2 or a function of inhibiting calcium-bound PAD2 activity.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be a monoclonal antibody. If it is a monoclonal antibody, it can act on PAD2 more efficiently than a polyclonal antibody. From the viewpoint of efficiently producing an anti-PAD2 monoclonal antibody having a desired effect, it is preferable to immunize chickens with PAD2.
  • PAD2 used as an antigen includes PAD2 full length or PAD2 peptide fragment unless otherwise specified.
  • the antibody class of the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention is not particularly limited, and may be, for example, IgM, IgD, IgG, IgA, IgE, or IgY.
  • the antibody subclass is not particularly limited, but may be, for example, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, or IgA2.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody fragment having PAD2 binding activity (hereinafter, may be referred to as “antigen-binding fragment”).
  • antigen-binding fragment an antibody fragment having PAD2 binding activity
  • there are effects such as an increase in stability or an antibody production efficiency.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be a fusion protein.
  • This fusion protein may be one in which a polypeptide or oligopeptide is bound to the N or C terminus of PAD2.
  • the oligopeptide may be a His tag.
  • the fusion protein may be a fusion of a mouse, human, or chicken antibody partial sequence. Such fusion proteins are also included in one form of the anti-PAD2 antibody according to the present embodiment.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody obtained through a step of immunizing chickens with PAD2.
  • the anti-PAD2 antibody has a KD (M) of, for example, 9.0 ⁇ 10 ⁇ 8 , 7.0 ⁇ 10 ⁇ 8 , 5.0 ⁇ 10 ⁇ 8 , 3.0 ⁇ 10 ⁇ 8 , 1.0 ⁇ 10 ⁇ 8. , 9.0 ⁇ 10 ⁇ 9 , 7.0 ⁇ 10 ⁇ 9 , 5.0 ⁇ 10 ⁇ 9 , 3.0 ⁇ 10 ⁇ 9 or less, and may be in the range of any two of them.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that binds to PAD2 wild type or mutant type. Mutants include those resulting from DNA sequence differences between individuals, such as SNPs.
  • the amino acid sequence of the wild-type or mutant PAD2 is preferably at least 80%, more preferably at least 90%, more preferably at least 95%, particularly preferably at least 98%, the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2. Has the property.
  • the “anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 341 to 357 of PAD2” includes an antibody that binds within the amino acid region of positions 341 to 357 of PAD2. As long as this antibody has, for example, a binding property to the peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, the site recognized by the antibody within positions 341 to 357 of PAD2 is not limited.
  • This antibody includes, for example, an antibody that specifically binds to an epitope containing one or more amino acids at positions 341 to 357 of PAD2.
  • This antibody includes, for example, an antibody that specifically binds to positions 344 to 357 of PAD2.
  • anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 344 to 357 of PAD2 includes an antibody that binds within the amino acid region of positions 344 to 357 of PAD2.
  • This antibody includes, for example, an antibody that specifically binds to an epitope containing one or more amino acids at positions 344 to 357 of PAD2.
  • the antibodies include, for example, antibodies that specifically bind to PAD2 at positions 344-346, 347-349, 350-352, 353-355, or 356-357.
  • the antibodies also include, for example, antibodies that specifically bind to positions 344 to 355 of PAD2.
  • anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 344 to 355 of PAD2 includes an antibody that binds within the amino acid region of positions 344 to 355 of PAD2.
  • This antibody includes, for example, an antibody that specifically binds to an epitope containing one or more amino acids at positions 344 to 355 of PAD2.
  • Such antibodies include, for example, antibodies that specifically bind to positions 344-346, 347-349, 350-352, or 353-355 of PAD2.
  • the antibodies also include, for example, antibodies that specifically bind to positions 347 to 355 of PAD2.
  • anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 347 to 355 of PAD2 includes an antibody that binds within the amino acid region of positions 347 to 355 of PAD2.
  • This antibody includes, for example, an antibody that specifically binds to an epitope containing one or more amino acids at positions 347 to 355 of PAD2.
  • This antibody includes, for example, an antibody that specifically binds to positions 347 to 349, 350 to 352, or 353 to 355 of PAD2.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that has binding to wild-type PAD2 and does not have binding to Ala mutant PAD2 at positions 344 to 357.
  • “Ala mutant PAD2 at positions 344 to 357” is a PAD2 at positions 344 to 346, 347 to 349, 350 to 352, 353 to 355, 356 to 357, or 344 to Includes Ala variant antibody at position 355.
  • the Ala mutant PAD2 at positions 344 to 357 may not be substituted at positions other than positions 344 to 346, 347 to 349, 350 to 352, 353 to 355, or 356 to 357.
  • "having no binding” means that it does not substantially have binding. Or, it includes the case where it has no significant binding property. Or, in comparison with the EC 50 for wild-type, EC 50 for evaluation may be evaluated as having no binding to the case of more than two times. At this time, if the EC 50 is Not determined, it may be evaluated that it has no binding property. Alternatively, when the binding to the evaluation target is 50% or less as compared with the binding to the wild type, the binding may be evaluated as having no binding.
  • Anti PAD2 antibody according to an embodiment of the present invention the EC 50 for 344 to 357 positions of Ala mutant PAD2, compared to EC 50 for wild-type PAD2, may be an antibody is more than twice.
  • ⁇ double or more '' may be, for example, 2, 3, 4, 5 , 10, 100, 10 5 , 10 10 , or 10 15 , and any two of those values may be used. It may be within the range.
  • anti-PAD2 polyclonal antibody includes, for example, antiserum. Binding or reactivity includes affinity.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody having binding to Ala mutant PAD2 at positions 344 to 357 of 50% or less as compared to binding to wild-type PAD2.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention is an antibody whose binding to Ala mutant PAD2 at positions 344 to 357 is 50% or less as compared with the binding using an anti-PAD2 polyclonal antibody. You may.
  • “50% or less” may be, for example, 50, 45, 40, 35, 30, 25, 20, 15, 10, 5, 1, or 0%, and any of them. It may be between two values.
  • the anti-PAD2 antibody comprises a step of selecting an antibody showing significant binding to wild-type PAD2, or an antibody showing no binding to Ala mutant PAD2 at positions 344 to 357. And a step of selecting.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may have binding to other amino acid residues within the epitope as long as it has specific binding to positions 341 to 357 of PAD2.
  • An antibody that specifically binds to a specific site may be an antibody that recognizes a specific site.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that specifically binds to an epitope within positions 341 to 357 of PAD2.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that specifically binds to an epitope including positions 341 to 357 of PAD2.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may have binding to amino acid residues other than positions 341 to 357 of PAD2 in the epitope.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention has a binding property to the peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1, and has at least one kind of the peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3 to 8. An antibody having no binding property may be used.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody having no binding to the deleted PAD2 that does not include positions 341 to 357 of PAD2.
  • Anti PAD2 antibody according to an embodiment of the present invention the EC 50 s against one or more peptides of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 3-8, as compared to the EC 50 for wild-type PAD2, is more than twice antibody It may be.
  • Anti PAD2 antibody according to an embodiment of the present invention SEQ ID NO: 3 ⁇ EC 50 against one or more peptides of the amino acid sequence represented by 8, as compared to the EC 50 for the case of using the anti PAD2 polyclonal antibodies, 2 The antibody may be more than twice as many.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention is an antibody whose binding to one or more of the peptides having the amino acid sequences represented by SEQ ID NOs: 3 to 8 is 50% or less as compared to the binding to wild-type PAD2. It may be.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention has a binding property to one or more of the peptides having the amino acid sequences represented by SEQ ID NOS: 3 to 8 compared to the binding property using the anti-PAD2 polyclonal antibody. % Or less.
  • the anti-PAD2 antibody may be an antibody that specifically binds to positions 4 to 17 or 4 to 15 of the peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • This antibody has binding to other amino acid residues within the epitope as long as it has binding at positions 4 to 17 or 4 to 15 of the peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. Is also good.
  • an antibody that specifically binds to a peptide includes an antibody having specific binding property to a peptide.
  • An antibody that specifically binds to a peptide is one in which one of the binding properties of the antibody is specified.
  • the antibody may have binding property to a peptide and may have binding property to another compound.
  • An antibody that specifically binds to the peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 includes an antibody having specific binding to the peptide and binding to full-length PAD2. The same applies to an antibody that specifically binds to positions 4 to 17 or 4 to 15 of the peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • the site to which the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention binds may be evaluated by, for example, alanine scanning.
  • the “alanine scan” is a technique of, for example, substituting a certain amino acid in a protein with alanine and examining the properties of an antibody binding to the protein.
  • Evaluation by alanine scan for example, (i) a step of preparing an Ala mutant by replacing 3 amino acid residues of the antigen with Ala, (ii) a step of measuring the affinity of the Ala mutant and the test antibody, Alternatively, a binding site that can be evaluated through (iii) a step of evaluating an amino acid residue before Ala substitution as a binding site in an Ala mutant in which the test antibody did not show significant reactivity.
  • the above step (i) may include a step of substituting 3 amino acid residues of a plurality of antigens with Ala to produce a plurality of Ala mutants.
  • This evaluation method may include the step of (iv) measuring the affinity of the test antibody to wild-type PAD2, or measuring the affinity between the Ala mutant and the anti-PAD2 polyclonal antibody.
  • This evaluation method is based on (v) the EC 50 value of the test antibody when measuring the affinity between the test antibody and the Ala mutant, the test value when measuring the affinity between the test antibody and the wild type.
  • the method may include a step of evaluating that the compound did not show any reactivity.
  • Alanine scanning may be performed by three amino acid substitutions. At this time, if the number of amino acids contained in the antigen is not divisible by 3, one end of the antigen may be substituted with 2 amino acids.
  • the antigen used for the alanine scan may be PAD2 or a peptide fragment thereof. Affinity may be assessed, for example, by ELISA or surface plasmon resonance analysis.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that specifically binds to an epitope including positions 347 to 354 of PAD2.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that specifically binds to an epitope including positions 351, 352, 353, or 354 of PAD2. This antibody may have binding to other amino acid residues within the epitope as long as it has binding at positions 351, 352, 353 or 354 of PAD2.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be an antibody that specifically binds to positions 8, 9, 10, or 11 of the peptide having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 1.
  • the anti-PAD2 antibody may be an antibody that does not have specific binding to a mutant PAD2 having an Ala mutation at positions 351, 352, 353, or 354 of PAD2. . From the viewpoint of the ability to inhibit citrullination, these antibodies are particularly preferably antibodies that recognize positions 351, 352, 353 or 354 of PAD2. At this time, the binding may be evaluated by an alanine scan in which one amino acid residue is substituted with Ala.
  • an "antibody” comprises a molecule or a population thereof capable of specifically binding to a particular epitope on an antigen.
  • the antibody may be a polyclonal antibody or a monoclonal antibody.
  • the antibody can exist in various forms, for example, a full-length antibody (an antibody having a Fab region and an Fc region), an Fv antibody, a Fab antibody, an F (ab ') 2 antibody, a Fab' antibody, a diabody, and a single antibody.
  • Antibodies include modified or unmodified antibodies.
  • the modified antibody may be a combination of an antibody and various molecules such as polyethylene glycol.
  • the modified antibody can be obtained by chemically modifying the antibody using a known technique.
  • the amino acid sequence, class, or subclass of the antibody may be derived, for example, from a human, a non-human mammal (eg, rat, mouse, rabbit, cow, monkey, etc.), or a bird (eg, chicken).
  • Antibodies also include, for example, isolated, purified, or recombinant antibodies. Antibodies can be used, for example, in vitro or in vivo.
  • a “polyclonal antibody” is used to administer an immunogen containing an antigen of interest to mammals (eg, rats, mice, rabbits, cows, monkeys, etc.) or birds (eg, chickens). It can be generated by Administration of the immunogen may be infused with one or more immunizing agents or adjuvants. Adjuvants are sometimes used to increase the immune response and may include Freund's adjuvant (complete or incomplete), mineral gels (such as aluminum hydroxide), or surfactants (such as lysolecithin) and the like. . Immunization protocols are known in the art and may be performed by any method that elicits an immune response, depending on the host organism selected (Protein Experiment Handbook, @Yodosha (2003): 86-91). .).
  • “monoclonal antibody” includes an antibody in which individual antibodies constituting a population react to substantially the same epitope. Alternatively, the antibodies may be those in which the individual antibodies constituting the population are substantially the same (naturally occurring mutations are allowed). Monoclonal antibodies are highly specific, differing from ordinary polyclonal antibodies, which typically include different antibodies corresponding to different epitopes.
  • the method for producing the monoclonal antibody is not particularly limited. For example, a method similar to the hybridoma method described in “Kohler G, Milstein C., Nature. 1975 Aug 7; 256 (5517): 495-497.” May be produced.
  • monoclonal antibodies may be made by methods similar to recombinant methods as described in US Pat. No. 4,816,567.
  • the monoclonal antibody is "Clackson et al., Nature. 1991 Aug 15; 352 (6336): 624-628.”
  • it may be prepared by the method described in "Protein Experiment Handbook, @Yodosha (2003): 92-96.”
  • the “Fv antibody” is an antibody including an antigen recognition site.
  • This region contains a non-covalently linked dimer of one heavy and one light chain variable domain.
  • the three CDRs of each variable domain can interact to form an antigen binding site on the surface of the VH-VL dimer.
  • the ⁇ Fab antibody '' is, for example, a fragment obtained by treating an antibody containing a Fab region and an Fc region with the protease papain, and the N-terminal half of the H chain and the entire L chain. Is an antibody bound via some disulfide bonds.
  • Fab can be obtained, for example, by treating the above-described anti-PAD2 antibody containing an Fab region and an Fc region according to the embodiment of the present invention with the protease papain.
  • the ⁇ F (ab ') 2 antibody'' for example, of the fragment obtained by treating the antibody containing the Fab region and the Fc region with the protease pepsin, the site corresponding to the Fab 2 Antibodies.
  • F (ab ′) 2 can be obtained, for example, by treating the above-mentioned anti-PAD2 antibody containing an Fab region and an Fc region according to the embodiment of the present invention with the protease pepsin. Further, for example, it can be produced by making the following Fab ′ a thioether bond or a disulfide bond.
  • the “Fab ′ antibody” is, for example, an antibody obtained by cleaving a disulfide bond in the hinge region of F (ab ′) 2 .
  • it can be obtained by treating F (ab ') 2 with a reducing agent dithiothreitol.
  • the “scFv antibody” is an antibody in which VH and VL are linked via an appropriate peptide linker.
  • the scFv antibody for example, to obtain a cDNA encoding the VH and VL of the anti-PAD2 antibody according to the embodiment of the present invention, construct a polynucleotide encoding a VH-peptide linker-VL, and vector the polynucleotide And can be produced using cells for expression.
  • diabody is an antibody having a bivalent antigen-binding activity.
  • the divalent antigen-binding activities can be the same, or one can be a different antigen-binding activity.
  • a diabody is constructed, for example, by constructing a polynucleotide encoding scFv such that the amino acid sequence of the peptide linker has a length of 8 residues or less, incorporating the resulting polynucleotide into a vector, and using cells for expression. it can.
  • dsFv is an antibody in which a polypeptide having a cysteine residue introduced into VH and VL is bound via a disulfide bond between the cysteine residues.
  • the position to be introduced into the cysteine residue should be selected based on the three-dimensional structure prediction of the antibody according to the method shown by Reiter et al. (Reiter et al., Protein Eng. 1994 May; 7 (5): 697-704.) Can be.
  • the "peptide or polypeptide having antigen-binding property" is an antibody comprising VH or VL of an antibody, or CDR1, 2, or 3 thereof. Peptides containing multiple CDRs can be linked directly or via a suitable peptide linker.
  • the above Fv antibody, Fab antibody, F (ab ') 2 antibody, Fab' antibody, scFv antibody, diabody, dsFv antibody, peptide or polypeptide having antigen-binding property (hereinafter, also referred to as "Fv antibody etc.”
  • the production method is not particularly limited. For example, it can be produced using expression cells by incorporating a DNA encoding a region such as an Fv antibody in the anti-PAD2 antibody according to the embodiment of the present invention into an expression vector. Alternatively, it may be produced by a chemical synthesis method such as the Fmoc method (fluorenylmethyloxycarbonyl method) and the tBOC method (t-butyloxycarbonyl method).
  • the antigen-binding fragment according to the embodiment of the present invention may be one or more of the Fv antibodies and the like.
  • a “chimeric antibody” is one in which the variable region of an antibody between heterologous organisms and the constant region of the antibody are linked, and can be constructed by genetic recombination technology.
  • a mouse-human chimeric antibody, a chicken-human chimeric antibody, a chicken-mouse chimeric antibody and the like can be mentioned.
  • a mouse-human chimeric antibody can be prepared, for example, by the method described in "Roguska et al., Proc Natl Acad Sci U U S A.
  • Basic methods for producing mouse-human chimeric antibodies include, for example, encoding mouse leader and variable region sequences present in cloned cDNAs, encoding human antibody constant regions already present in mammalian cell expression vectors. Ligated to the sequence. Alternatively, a mouse leader sequence and a variable region sequence present in the cloned cDNA may be ligated to a sequence encoding a human antibody constant region, and then ligated to a mammalian cell expression vector.
  • Fragments of the human antibody constant region can be those of the H chain constant region of any human antibody and the L chain constant region of the human antibody, such as C ⁇ 1, C ⁇ 2, C ⁇ 3 or C ⁇ 4 for those of the human H chain, For the L chain, C ⁇ or C ⁇ can be mentioned, respectively.
  • a ⁇ humanized antibody '' has, for example, one or more CDRs from a non-human species, and a framework region from a human immunoglobulin, and a constant region from a human immunoglobulin. Is an antibody that binds to the antigen.
  • the "human antibody” is, for example, a region comprising the variable region and the constant region of the heavy chain, the variable region and the constant region of the light chain constituting the antibody is derived from a gene encoding human immunoglobulin.
  • Antibody Various techniques known in the art may be used for producing human antibodies.
  • the anti-PAD2 antibody according to one embodiment of the present invention may be in the form of scFv, and in that case, may have a linker between the heavy chain and the light chain.
  • the linker include, but are not limited to, a sequence of 0 to 5 amino acids typically consisting of G and P. A linker is not required and may not be present.
  • amino acid is a generic term for organic compounds having an amino group and a carboxyl group.
  • any of the amino acids in the amino acid sequence may be chemically modified. Further, any of the amino acids in the amino acid sequence may form a salt or a solvate. Further, any of the amino acids in the amino acid sequence may be L-type or D-type. Even in such cases, it can be said that the antibody according to the embodiment of the present invention includes the above “specific amino acid sequence”.
  • Examples of the chemical modification of amino acids contained in proteins in vivo include N-terminal modification (eg, acetylation, myristoylation, etc.), C-terminal modification (eg, amidation, glycosylphosphatidylinositol addition, etc.), or side chain Modifications (eg, phosphorylation, sugar chain addition, etc.) are known.
  • N-terminal modification eg, acetylation, myristoylation, etc.
  • C-terminal modification eg, amidation, glycosylphosphatidylinositol addition, etc.
  • side chain Modifications eg, phosphorylation, sugar chain addition, etc.
  • One embodiment of the present invention is a polynucleotide or a vector encoding the anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention.
  • a transformant can be prepared by introducing this polynucleotide or vector into a cell.
  • the transformant may be a cell of a human or a non-human mammal (eg, rat, mouse, guinea pig, rabbit, cow, monkey, etc.).
  • Examples of the mammalian cells include Chinese hamster ovary cells (CHO cells), monkey cells COS-7, human embryo-derived kidney cells (eg, HEK293 cells), and the like.
  • the transformant may be a genus Escherichia, yeast, or the like.
  • the polynucleotide or the vector may be constructed so that an anti-PAD2 antibody can be expressed.
  • the polynucleotide or vector may include components necessary for protein expression, such as, for example, a promoter, an enhancer, an origin of replication, or an antibiotic resistance gene.
  • the polynucleotide or vector may have a heterologous base sequence.
  • the heterologous nucleotide sequence is, for example, two or more organisms selected from the group consisting of humans and non-human organisms (eg, bacteria, archaea, yeast, insects, birds, viruses, mammals other than humans, and the like) It may contain a base sequence derived from it.
  • Examples of the above vectors include Escherichia coli-derived plasmids (eg, pET-Blue), Bacillus subtilis-derived plasmids (eg, pUB110), yeast-derived plasmids (eg, pSH19), and animal cell expression plasmids (eg, pA1-11, pcDNA3.1- V5 / His-TOPO), bacteriophage such as ⁇ phage, virus-derived vectors, and the like.
  • the vector may be an expression vector or may be circular.
  • a calcium phosphate method, a lipofection method, an electroporation method, a method using an adenovirus, a method using a retrovirus, or microinjection can be used (revised 4th edition) Niigata Genetic Engineering Handbook, Yodosha (2003): 152-179.).
  • a method for producing an antibody using cells for example, the method described in "Protein Experiment Handbook, Yodosha (2003): 128-142.” Can be used.
  • One embodiment of the present invention is a method for producing an anti-PAD2 antibody, comprising a step of growing cells containing the polynucleotide or the vector according to the above-described embodiment of the present invention.
  • the step of growing includes a step of culturing.
  • the production method may include a step of recovering the anti-PAD2 antibody.
  • the production method may include a step of preparing a cell culture solution.
  • the production method may include a step of purifying the anti-PAD2 antibody.
  • the purification of the antibody comprises, for example, ammonium sulfate, ethanol precipitation, protein A, protein G, gel filtration chromatography, anion, cation exchange chromatography, phosphocellulose chromatography, hydrophobic interaction chromatography. Chromatography, affinity chromatography, hydroxylapatite chromatography, or lectin chromatography can be used (Protein Experiment Handbook, @Yodosha (2003): 27-52.).
  • One embodiment of the present invention is a composition comprising the anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention.
  • PAD2 can be detected efficiently.
  • it can efficiently inhibit citrullination of PAD2.
  • the components contained in the composition are not particularly limited, and may include, for example, a buffer.
  • one or more of the various embodiments of the inhibitor and pharmaceutical composition described below may be applied.
  • One embodiment of the present invention is a PAD2 citrullination activity inhibitor comprising the anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention.
  • Use of this inhibitor can efficiently inhibit citrullination by PAD2.
  • the rate of decrease in citrullination activity by the inhibitor may be 20, 30, 40, 60, 80% or more, or may be in the range of any two of them. This reduction rate may be represented by, for example, a relative rate when the reduction rate when using PBS is 0%.
  • “agent” includes a composition used for research or treatment, for example.
  • the inhibitors include, for example, therapeutic agents.
  • the inhibitors can be used, for example, in vitro or inovo.
  • the inhibitor may include the composition according to the embodiment of the present invention described above.
  • One embodiment of the present invention is a method for inhibiting PAD2 citrullination activity, which comprises a step of contacting the anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention with PAD2.
  • One embodiment of the present invention is a method of inhibiting PAD2 citrullination activity, comprising the step of administering the above-mentioned anti-PAD2 antibody according to the embodiment of the present invention to a patient.
  • the above-mentioned inhibition method includes an inhibition method performed for research or treatment.
  • One embodiment of the present invention is the use of an anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention for producing an inhibitor of citrullination activity of PAD2.
  • the protein to be citrullinated is not particularly limited, and includes, for example, a protein having arginine. This protein includes, for example, histone and myelin basic proteins.
  • One embodiment of the present invention is a pharmaceutical composition comprising the anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention.
  • the pharmaceutical composition may include one or more pharmacologically acceptable carriers.
  • Pharmaceutical compositions include, for example, pharmaceutical compositions for the treatment of arthritis, rheumatoid arthritis, or multiple sclerosis.
  • the pharmaceutical composition may include the composition according to the embodiment of the present invention described above.
  • One embodiment of the present invention is a method for treating a disease, comprising a step of administering the above-mentioned anti-PAD2 antibody (or a pharmaceutical composition containing the anti-PAD2 antibody) according to the above-mentioned embodiment of the present invention to a patient.
  • Treatment includes, for example, treatment of arthritis, rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, or Sjogren's syndrome.
  • Anti-PAD2 antibodies such as S4 described in Examples below are particularly effective in treating arthritis or rheumatoid arthritis because they strongly inhibit histone citrullination.
  • anti-PAD2 antibodies such as S4 strongly inhibit citrullination of myelin basic protein, and are therefore particularly effective for treating multiple sclerosis.
  • One embodiment of the present invention is the use of an anti-PAD2 antibody according to the above embodiments of the present invention for producing a pharmaceutical composition.
  • One embodiment of the present invention is a PAD2 detection reagent containing the anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention. If this reagent is used, PAD can be detected efficiently.
  • One embodiment of the present invention is a method for detecting PAD2, comprising a step of bringing a test sample into contact with the anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention.
  • One embodiment of the present invention is a kit including the anti-PAD2 antibody according to the above embodiment of the present invention. Using this kit, for example, treatment, diagnosis, or detection of PAD2 can be performed.
  • This kit may include, for example, the composition according to the above-described embodiment of the present invention, an inhibitor, a pharmaceutical composition, a diagnostic agent, or a detection reagent, and may include an instruction manual, a buffer solution, a container, or a package. May be included.
  • “treatment” includes the ability to exert a symptom-ameliorating effect, a suppressing effect, or a prophylactic effect of a patient's disease or one or more symptoms associated with the disease.
  • the “therapeutic agent” may be a pharmaceutical composition comprising the active ingredient and one or more pharmacologically acceptable carriers.
  • the “pharmaceutical composition” may be produced, for example, by mixing an active ingredient and the above-mentioned carrier and by any method known in the technical field of pharmaceuticals. The form of use of the pharmaceutical composition is not limited as long as it is used for treatment, and the active ingredient may be a single active ingredient or a mixture of the active ingredient and an optional ingredient.
  • the shape of the carrier is not particularly limited, and may be, for example, a solid or a liquid (for example, a buffer).
  • the content of the carrier may be, for example, a pharmaceutically effective amount.
  • An effective amount can be, for example, an amount sufficient for pharmaceutically stability or delivery of the active ingredient.
  • buffers are effective in stabilizing the active ingredients in vials.
  • the dose, administration interval, and administration method are not particularly limited, and may be appropriately selected depending on the patient's age, body weight, symptoms, target organ, and the like.
  • the pharmaceutical composition preferably contains a therapeutically effective amount, or an effective amount of an active ingredient that exhibits a desired effect.
  • One embodiment of the present invention provides a method for promoting the ability of a composition to inhibit citrullination activity, comprising increasing the proportion of an anti-PAD2 antibody that specifically binds to positions 341 to 357 of PAD2 in the composition. is there.
  • One embodiment of the present invention is a composition comprising an anti-PAD2 antibody, wherein 90% or more of the anti-PAD2 antibody molecules in the composition are anti-PAD2 antibodies that specifically bind to positions 341-357 of PAD2.
  • One embodiment of the invention is an antibody population comprising an anti-PAD2 antibody, wherein 90% or more of the anti-PAD2 antibody molecules in the antibody population are anti-PAD2 antibodies that specifically bind to positions 341-357 of PAD2.
  • There is an antibody population The above 90% or more may be, for example, 90%, 95, 96, 97, 98, 99% or more, or 100%, or may be in the range of any two values.
  • One embodiment of the present invention is a peptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • an antibody that binds to PAD2 can be produced. Further, an antibody that binds to PAD2 can be detected.
  • the peptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 may have undergone chemical modification (for example, KLH modification), and such a chemically modified peptide is also a form of the peptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1. included.
  • the peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 may be an isolated, purified, or concentrated peptide.
  • One embodiment of the present invention is an antigen composition comprising a peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • the antigen composition may include, for example, a buffer or an adjuvant.
  • One embodiment of the present invention is a method for producing an anti-PAD2 antibody, comprising a step of immunizing a mammal or bird with a peptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • One embodiment of the present invention is a method for producing an anti-PAD2 antibody, comprising a step of bringing an antibody or an antibody library into contact with a peptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • One embodiment of the present invention is a method for detecting an antibody that binds to PAD2, comprising a step of contacting a peptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1 with a test sample containing an anti-PAD2 antibody.
  • One embodiment of the present invention is a composition for detecting an antibody that binds to active PAD2, comprising a peptide having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
  • bond may be a covalent bond or a non-covalent bond, and may be, for example, an ionic bond, a hydrogen bond, a hydrophobic interaction, or a hydrophilic interaction.
  • "significantly” means that, for example, a statistically significant difference is evaluated using a Student's t-test (one-sided or two-sided), and p ⁇ 0.05 or p ⁇ 0.01 is satisfied. Is also good. Alternatively, a state in which a difference is substantially generated may be employed.
  • Example 1 Preparation of Anti-PAD2 Antibody 333 ⁇ g of a KLH-modified peptide antigen (SEQ ID NO: 1, positions 341 to 357 of PAD2) was immunized intraperitoneally to three 3-month-old Boris Brown birds. Antigen was immunized with complete Freund's adjuvant (014-09541, Wako) for primary immunization and incomplete Freund's adjuvant (011-09551, Wako) for secondary and tertiary immunization. For the fourth immunization, an antigen diluted in PBS (phosphate buffered saline) was injected intravenously. Blood was collected from the subwing vein every other week, and the antibody titer was confirmed by ELISA.
  • PBS phosphate buffered saline
  • the fourth immunization was defined as the final immunization.
  • chicken spleens were collected, lymphocytes were isolated by density gradient centrifugation using Ficoll paque PLUS (17-1440-03, GE Healthcare), and RNA was isolated using TRIzole Reagent (15596026, Life Technologies). Was extracted.
  • CDNA was synthesized from the extracted RNA by RT-PCR using PrimeScript II 1st Strand cDNA Synthesis Kit (6210A, TAKARA) to prepare a scFv phage library.
  • An expression vector of a type in which a chicken ⁇ chain was inserted instead of the mouse ⁇ chain of pPDS was used.
  • the scFv phage library was prepared according to the method described in the reference: "Nakamura et al., J Vet Med Sci. 2004 Ju; 66 (7): 807-814".
  • scFv phage antibody library panning was performed on a plate on which full-length PAD2 was immobilized. Panning was performed according to the method described in the reference: "Nakamura et al., J Vet Med Sci. 2004 Ju; 66 (7): 807-814". After performing panning five times, the reactivity of the library was confirmed by ELISA using a plate on which the synthetic peptide was immobilized, and phage was screened from the library where the reactivity began to increase.
  • phage was infected with Escherichia coli, plated on 2 ⁇ YT Agar plate containing ampicillin (50 ⁇ g / ml, Nacalai), and the obtained colonies were cultured in 2 ⁇ YT liquid medium containing ampicillin. After infection with helper phage, phage induction was performed in 2X YT liquid medium containing ampicillin (50 ⁇ g / ml), kanamycin (25 ⁇ g / ml, Meiji Seika Co., Ltd.) and IPTG (100 ⁇ g / ml, nacalai). went.
  • the reactivity of the scFv phage antibody in the obtained culture supernatant was confirmed by ELISA using an antigen-immobilized plate.
  • the obtained positive clones were sequenced using a DNA sequencer (ABI PRISM 3100-Genetic Analyzer, Applied Biosystems) to determine the sequence.
  • Clones having different sequences were subjected to amplification of the chicken antibody gene H chain variable region and L chain variable region by PCR using the DNA chain encoding the scFv antibody as a template, and then treating the PCR product with SacII and NheI restriction enzymes ( R0157S, R0131S, BioLabs), and a mouse / chicken chimeric antibody (IgG1) expression vector (H chain expression vector: pcDNA4 / myc-His), which was similarly treated with restriction enzymes for the H chain variable region and the L chain variable region.
  • ELISA ELISA was performed under the following conditions to evaluate the reactivity of S4 and the like to human PAD2.
  • Material / antibody anti-PAD2 antibody (S4, S10, S24, S47, S108, S113, S170, S309), WO / 2014/086365 anti-PAD2 antibody (# 2, # 34), anti-PAD2 antibody Dinitrophenyl (DNP) antibody (negative control antibody).
  • # 2 and # 34 those prepared based on the amino acid sequence of the variable region described in the examples of WO / 2014/086365 were used (the same applies to the following examples).
  • -Antigen full-length human PAD2 antigen
  • Example 3 Evaluation of ability of anti-PAD2 antibody to inhibit citrullination activity Under the following conditions, the ability of anti-PAD2 antibody to inhibit citrullination activity of PAD2 was measured.
  • Table 4 shows the antibody concentration (EC 50 ) that inhibits human PAD2 by 50%. When the antibody concentration that gives 50% activity inhibition at 600 nM or less could not be calculated, it was expressed as ND (Not determined). It was shown that antibodies such as S4 have higher inhibitory activity than # 34.
  • Example 4 Evaluation of ability of anti-PAD2 antibody to inhibit citrullination activity Under the following conditions, the ability of anti-PAD2 antibody to inhibit the citrullination activity of calcium conjugate PAD2 was measured.
  • Table 5 shows antibody concentrations (EC 25 ) that give 25% inhibition of human PAD2 activity.
  • concentration of the antibody that gives 25% activity inhibition at 600 nM or less could not be calculated, it was expressed as ND (Not determined).
  • citrullination activity of the calcium conjugate PAD2 it was shown that antibodies such as S4 had a higher inhibitory activity than # 2.
  • Example 5 Evaluation of ability of anti-PAD2 antibody to inhibit citrullination activity Under the following conditions, the ability of anti-PAD2 antibody to inhibit citrullination activity of PAD2 was measured. At this time, calf thymus-derived histone was used as a substrate.
  • the total volume of the solution was 50 ⁇ L, final concentration 20 mM Tris-HCl (pH 7.6), 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1.8 mg / mL histone, 1 mM CaCl 2 , 5 nM human PAD2, and 0.1-600 nM Each antibody.
  • the solution was allowed to stand at 37 ° C. for 4 hours, and 12.5 ⁇ L of 5M perchloric acid was added to stop the reaction. Histones derived from calf thymus which were contained in this solution and were citrullinated were calorimetrically quantified.
  • Table 6 shows antibody concentrations (EC 50 ) that give 50% inhibition of human PAD2 activity. When the antibody concentration that gives 50% activity inhibition at 600 nM or less could not be calculated, it was expressed as ND (Not determined). It was shown that antibodies such as S4 have higher inhibitory activity than # 2 and # 34.
  • Example 6 Evaluation of ability of anti-PAD2 antibody to inhibit citrullination activity Under the following conditions, the ability of anti-PAD2 antibody to inhibit citrullination activity of PAD2 was measured. At this time, bovine myelin basic protein was used as a substrate.
  • the total volume of the solution was 50 ⁇ L, final concentration 20 mM Tris-HCl (pH 7.6), 150 mM NaCl, 1 mM DTT, 1.8 mg / mL bovine myelin basic protein, 1 mM CaCl 2 , 5 nM human PAD2, And 600 nM of each antibody.
  • the solution was allowed to stand at 37 ° C. for 4 hours, and 12.5 ⁇ L of 5M perchloric acid was added to stop the reaction.
  • the citrullinated bovine myelin basic protein contained in this solution was colorimetrically determined.
  • FIG. 2 shows the results of measuring the citrullination activity of human PAD2 upon addition of each antibody.
  • the values in FIG. 2 are the average value and the standard deviation when the TBS value is 100%.
  • the antibodies # 2 and # 34 did not show any inhibitory activity.
  • antibodies such as S4 showed high inhibitory activity.
  • * (P ⁇ 0.01) is shown for the antibody that showed a significant difference from the anti-DNP antibody (negative control).

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Abstract

優れたPAD2阻害活性を有する抗PAD2抗体を取得する。 PAD2の341～357位に特異的に結合する、抗PAD2抗体を用いる。又は、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドに特異的に結合する、抗PAD2抗体を用いる。

Description

新規抗ＰＡＤ２抗体
　本発明は、新規抗PAD2抗体に関する。
　PAD2（Peptidylarginine deiminase 2）は、蛋白質中のアルギニンのシトルリン化に関与する酵素として知られている。このシトルリン化は、蛋白質を構成するアミノ酸の中で最も塩基性の強いアルギニンが中性のシトルリンに変換される反応であるため、蛋白質の構造と反応にとって重要である。
　PAD2によるシトルリン化と疾患との関連性が種々報告されている。例えば、非特許文献1には、PAD2がTNFα誘導性シトルリン化及び関節炎に関与すると記載されている（Abstract）。非特許文献2には、シトルリン化ミエリン塩基性蛋白質が多発性硬化症の発症の生化学的経路を表すと記載されている（Abstract）。非特許文献3には、シトルリン化ヒストンと関節炎発症の関連性が記載されている（Abstract）。
　特許文献1には、ウサギPAD2をマウスに免疫して抗PAD2抗体を作製したこと（Example 1）、その抗体がヒトPAD2の1～165位に結合したこと（Example 3）、その抗体のPAD2阻害活性を検査したこと（Example 4）が記載されている。
　しかしながら、上記特許文献1の抗PAD2抗体は、十分に強いPAD2阻害活性を有しておらず、改善の余地を有していた。その他に、優れたPAD2阻害活性を有する抗体は報告されていなかった。
　本発明は上記事情に鑑みてなされたものであり、優れたPAD2阻害活性を有する抗PAD2抗体を提供すること等を目的とする。
　本願発明者らは、後述する実施例に記載の通り、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチド（PAD2の341～357位）を抗原として抗PAD2抗体を作製した。そして、得られた抗体のPAD2への反応性を調べたところ、驚くべきことに、PAD2に対する優れた阻害活性を示した。特にこの抗体は、上記特許文献1に基づいて作製した抗PAD2抗体（＃2及び＃34）に比べて、予想外に顕著に優れたPAD2阻害活性を示した。
　即ち本発明の一態様によれば、PAD2（Peptidylarginine deiminase 2）の341～357位に特異的に結合する、抗PAD2抗体が提供される。この抗体を用いれば、PAD2を検出することができる。この抗体を用いれば、PAD2の機能阻害をすることができる。
　また本発明の一態様によれば、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドに特異的に結合する、抗PAD2抗体が提供される。この抗体を用いれば、PAD2を検出することができる。この抗体を用いれば、PAD2の機能阻害をすることができる。
　また本発明の一態様によれば、PAD2の344～357位に特異的に結合する、抗PAD2抗体が提供される。この抗体を用いれば、PAD2を検出することができる。この抗体を用いれば、PAD2の機能阻害をすることができる。
　また本発明の一態様によれば、上記抗PAD2抗体をコードする、ポリヌクレオチド又はベクターが提供される。本発明の一態様によれば、上記抗PAD2抗体を含む、組成物が提供される。本発明の一態様によれば、上記抗PAD2抗体を含む、PAD2のシトルリン化活性阻害剤が提供される。本発明の一態様によれば、上記ポリヌクレオチド又はベクターを含有する細胞を増殖させる工程を含む、抗PAD2抗体の生産方法が提供される。
　また本発明の一態様によれば、上記PAD2に対するKD（M）が9.0×10-8以下であってもよく、上記結合部位が3アミノ酸置換のアラニンスキャンによって同定される結合部位であってもよく、上記抗PAD2抗体がモノクローナル抗体であってもよく、上記抗PAD2抗体が抗原結合性断片であってもよい。
図1は、実施例で用いた抗PAD2抗体の親和性測定の結果を示した図である。 図2は、実施例で用いた抗PAD2抗体を添加時の、ヒトPAD2のシトルリン化活性能の測定結果を示した図である。t検定（両側）により抗DNP抗体（ネガティブコントロール）に対して有意差がみられた抗体の結果には、*(p<0.01)と示している。 図3は、実施例で用いた抗PAD2抗体のエピトープの評価結果を示した図である。
　以下、本発明の実施の形態について詳細に説明する。なお、同様な内容については繰り返しの煩雑を避けるために、適宜説明を省略する。
　本発明の一実施形態は、新規の抗PAD2抗体である。この抗体は、例えば、PAD2の341～357位に特異的に結合する、抗PAD2抗体である。又は、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドに特異的に結合する、抗PAD2抗体であってもよい。又は、PAD2の344～357位に特異的に結合する、抗PAD2抗体であってもよい。この抗体を用いれば、例えば、PAD2の機能を阻害することができる。
　PAD2は、一般的に、蛋白質中のアルギニンのシトルリン化に関与する酵素として知られている。PAD2のアミノ酸配列等の詳細は、NCBI（National Center for Biotechnology Information）、又はHGNC（HUGO Gene Nomenclature Committee)等のWEBサイトから見ることができる。NCBIに記載されているPAD2のアクセッションナンバーは、例えば、NP_031391.2である。PAD2のアミノ酸配列は、例えば、配列番号2である。PAD2は、PAD2活性を有していれば、その生物由来は限定されない。PAD2は、例えば、ヒト、サル、マウス、ラット、イヌ、又はネコ由来のPAD2を含む。PAD2の341～357位には、典型的にはそれぞれY、L、N、R、G、D、R、W、I、Q、D、E、I、E、F、G、Y（アミノ酸一文字表記）が位置する。
　本発明の一実施形態において「抗PAD2抗体」は、PAD2に結合性を有する抗体を含む。この抗PAD2抗体の生産方法は特に限定されないが、例えば、PAD2を哺乳類又は鳥類に免疫することによって生産してもよい。PAD2の341～357位に特異的に結合する、抗PAD2抗体は、例えば、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドを哺乳類又は鳥類に免疫することによって生産してもよい。PAD2の344～357位又は344～355位に特異的に結合する、抗PAD2抗体は、例えば、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチド、又は配列番号1の4～17位又は4～15位のアミノ酸配列からなるペプチドを哺乳類又は鳥類に免疫することによって生産してもよい。PAD2の344～357位又は344～355位に特異的に結合する、抗PAD2抗体は、例えば、野生型のPAD2に結合性を示し、且つ344～357又は344～355位のAla変異型PAD2に対して結合性を示さない抗PAD2抗体を選抜する工程を経て得てもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の機能を阻害する抗体であってもよい。機能阻害は、例えば、シトルリン化の活性阻害を含む。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、カルシウム結合体PAD2に結合する抗体、又はカルシウム結合体PAD2の機能を阻害する抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2活性を阻害する機能を有していてもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、カルシウム結合体PAD2に結合する抗体、又はカルシウム結合体PAD2活性を阻害する機能を有していてもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、モノクローナル抗体であってもよい。モノクローナル抗体であれば、ポリクローナル抗体に比べて、効率的にPAD2に対して作用させることができる。所望の効果を有する抗PAD2モノクローナル抗体を効率的に生産する観点からは、PAD2をニワトリに免疫することが好ましい。抗原として使用するPAD2は、特に指定しない限り、PAD2全長又はPAD2ペプチド断片を含む。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体の抗体クラスは特に限定されないが、例えばIgM、IgD、IgG、IgA、IgE、又はIgYであってもよい。また、抗体サブクラスは特に限定されないが、例えばIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、又はIgA2であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2結合活性を有する抗体断片（以下、「抗原結合性断片」と称することもある）であっても良い。この場合、安定性又は抗体の生産効率が上昇する等の効果がある。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、融合蛋白質であってもよい。この融合蛋白質は、PAD2のN又はC末端に、ポリペプチド又はオリゴペプチドが結合したものであってもよい。ここで、オリゴペプチドは、Hisタグであってもよい。また融合蛋白質は、マウス、ヒト、又はニワトリの抗体部分配列を融合したものであってもよい。それらのような融合蛋白質も、本実施形態に係る抗PAD2抗体の一形態に含まれる。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2をニワトリに免疫する工程を経て得られる抗体であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、KD（M）が、例えば、9.0×10-8、7.0×10-8、5.0×10-8、3.0×10-8、1.0×10-8、9.0×10-9、7.0×10-9、5.0×10-9、3.0×10-9以下であってもよく、それらいずれか2つの値の範囲内であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の野生型又は変異型に結合する抗体であってもよい。変異型は、SNPsのように、個体間のDNA配列の差異に起因するものを含む。野生型又は変異型のPAD2のアミノ酸配列は、配列番号2に示すアミノ酸配列に対し、好ましくは80％以上、より好ましくは90％以上、より好ましくは95％以上、特に好ましくは98％以上の相同性を有する。
　本発明の一実施形態において「PAD2の341～357位に特異的に結合する抗PAD2抗体」は、PAD2の341～357位のアミノ酸領域内に結合する抗体を含む。この抗体は、例えば、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドに結合性を有する限り、PAD2の341～357位内において抗体が認識する部位は限定されない。この抗体は、例えば、PAD2の341～357位の1つ以上のアミノ酸を含むエピトープに特異的に結合する抗体を含む。この抗体は、例えば、PAD2の344～357位に特異的に結合する抗体を含む。本発明の一実施形態において「PAD2の344～357位に特異的に結合する抗PAD2抗体」は、PAD2の344～357位のアミノ酸領域内に結合する抗体を含む。この抗体は、例えば、PAD2の344～357位の1つ以上のアミノ酸を含むエピトープに特異的に結合する抗体を含む。この抗体は、例えば、PAD2の344～346位、347～349位、350～352位、353～355位、又は356～357位に特異的に結合する抗体を含む。またこの抗体は、例えば、PAD2の344～355位に特異的に結合する抗体を含む。本発明の一実施形態において「PAD2の344～355位に特異的に結合する抗PAD2抗体」は、PAD2の344～355位のアミノ酸領域内に結合する抗体を含む。この抗体は、例えば、PAD2の344～355位の1つ以上のアミノ酸を含むエピトープに特異的に結合する抗体を含む。この抗体は、例えば、PAD2の344～346位、347～349位、350～352位、又は353～355位に特異的に結合する抗体を含む。またこの抗体は、例えば、PAD2の347～355位に特異的に結合する抗体を含む。本発明の一実施形態ににおいて「PAD2の347～355位に特異的に結合する抗PAD2抗体」は、PAD2の347～355位のアミノ酸領域内に結合する抗体を含む。この抗体は、例えば、PAD2の347～355位の1つ以上のアミノ酸を含むエピトープに特異的に結合する抗体を含む。この抗体は、例えば、PAD2の347～349位、350～352位、又は353～355位に特異的に結合する抗体を含む。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、野生型PAD2に対して結合性を有し、且つ344～357位のAla変異型PAD2に対して結合性を有さない抗体であってもよい。本発明の一実施形態において「344～357位のAla変異型PAD2」は、PAD2の344～346位、347～349位、350～352位、353～355位、356～357位、又は344～355位のAla変異型抗体を含む。また344～357位のAla変異型PAD2は、344～346位、347～349位、350～352位、353～355位、又は356～357位以外は置換されていなくてもよい。本発明の一実施形態において「結合性を有さない」は、実質的に結合性を有さなければよい。又は、有意に結合性を有さない場合を含む。又は、野生型に対するEC50に比べて、評価対象に対するEC50が2倍以上の場合に結合性を有さないと評価してもよい。このとき、EC50がNot determinedの場合は結合性を有さないと評価してもよい。又は、野生型に対する結合性に比べて、評価対象に対する結合性が50％以下の場合に結合性を有さないと評価してもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、344～357位のAla変異型PAD2に対するEC50が、野生型PAD2に対するEC50に比べて、2倍以上である抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、344～357位のAla変異型PAD2に対するEC50が、抗PAD2ポリクローナル抗体を用いた場合のEC50に比べて、2倍以上である抗体であってもよい。本発明の一実施形態において「2倍以上」は、例えば、2、3、4、5、10、100、105、1010、又は1015であってもよく、それらいずれか2つの値の範囲内であってもよい。EC50がNot determinedの場合は2倍以上に含まれると評価してもよい。反応性は、例えば、ELISA又は表面プラズモン共鳴分析法で評価してもよい。本発明の一実施形態において「抗PAD2ポリクローナル抗体」は、例えば、抗血清を含む。結合性又は反応性は、親和性を含む。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、344～357位のAla変異型PAD2に対する結合性が、野生型PAD2に対する結合性に比べて、50％以下である抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、344～357位のAla変異型PAD2に対する結合性が、抗PAD2ポリクローナル抗体を用いた場合の結合性に比べて、50％以下である抗体であってもよい。本発明の一実施形態において「50％以下」は、例えば、50、45、40、35、30、25、20、15、10、5、1、又は0％であってもよく、それらいずれか2つの値の範囲内であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、野生型のPAD2に有意な結合性を示す抗体を選抜する工程、又は344～357位のAla変異型PAD2に対して結合性を示さない抗体を選抜する工程、を含む生産方法によって得られる抗体であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の341～357位に対する特異的な結合性がある限り、エピトープ内の他のアミノ酸残基に結合性を有していてもよい。特定の部位に特異的に結合する抗体は、特定の部位を認識する抗体であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の341～357位内のエピトープに特異的に結合する抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の341～357位を含むエピトープに特異的に結合する抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、エピトープ内のPAD2の341～357位以外のアミノ酸残基に結合性を有していてもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、配列番号1で示されるアミノ酸配列のペプチドに対して結合性を有し、且つ配列番号3～8で示されるアミノ酸配列のペプチドの1種以上に対して結合性を有さない、抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の341～357位を含まない欠失型PAD2に対して結合性を有さない、抗体であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、配列番号3～8で示されるアミノ酸配列のペプチドの1種以上に対するEC50が、野生型PAD2に対するEC50に比べて、2倍以上である抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、配列番号3～8で示されるアミノ酸配列のペプチドの1種以上に対するEC50が、抗PAD2ポリクローナル抗体を用いた場合のEC50に比べて、2倍以上である抗体であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、配列番号3～8で示されるアミノ酸配列のペプチドの1種以上に対する結合性が、野生型PAD2に対する結合性に比べて、50％以下である抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、配列番号3～8で示されるアミノ酸配列のペプチドの1種以上に対する結合性が、抗PAD2ポリクローナル抗体を用いた場合の結合性に比べて、50％以下である抗体であってもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、配列番号1で示されるアミノ酸配列のペプチドの4～17位又は4～15位に特異的に結合する抗体であってもよい。この抗体は、配列番号1で示されるアミノ酸配列のペプチドの4～17位又は4～15位に結合性を有している限り、エピトープ内の他のアミノ酸残基に結合性を有していてもよい。なお、本発明の一実施形態において「ペプチドに特異的に結合する抗体」は、ペプチドに特異的な結合性を有する抗体を含む。ペプチドに特異的に結合する抗体は、抗体の有する結合性の一つが特定されたものであり、ペプチドへの結合性を有する一方で、他の化合物への結合性を有していてもよい。「配列番号1で示されるアミノ酸配列のペプチドに特異的に結合する抗体」は、そのペプチドに特異的な結合性を有する一方で、全長PAD2に結合性を有する抗体を含む。配列番号1で示されるアミノ酸配列のペプチドの4～17位又は4～15位に特異的に結合する抗体についても同様である。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体が結合する部位は、例えば、アラニンスキャンで評価してもよい。本発明の一実施形態において「アラニンスキャン」は、例えば、蛋白質のあるアミノ酸をアラニンに置換して、その蛋白質に結合する抗体の性質を調べる手法である。アラニンスキャンでの評価は、例えば、(i)抗原の3アミノ酸残基をAlaへ置換し、Ala変異体を作製する工程、(ii)Ala変異体と被検抗体の親和性を測定する工程、又は(iii)被検抗体が有意な反応性を示さなかったAla変異体の、Ala置換前のアミノ酸残基を結合部位として評価する工程、を経て評価可能な結合部位であってもよい。上記工程(i)は、複数の抗原の3アミノ酸残基をAlaに置換し、複数のAla変異体を作製する工程を含んでいてもよい。この評価方法は、(iv)野生型PAD2に対する被験抗体の親和性を測定する抗体、又はAla変異体と抗PAD2ポリクローナル抗体との親和性を測定する工程を含んでいてもよい。この評価方法は、(v)被検抗体とAla変異体との親和性を測定したときの被検抗体のEC50の値が、被験抗体と野生型との親和性を測定したときの被検抗体のEC50の値に比べて2倍以上のときに、被検抗体が有意な反応性を示さなかったと評価する工程、又は、被検抗体とAla変異体との親和性を測定したときの被検抗体のEC50の値が、抗PAD2ポリクローナル抗体とAla変異体との親和性を測定したときの被検抗体のEC50の値に比べて2倍以上のときに、被検抗体が有意な反応性を示さなかったと評価する工程を含んでいてもよい。アラニンスキャンは、3アミノ酸置換によって行なってもよい。このとき、抗原に含まれるアミノ酸数が3で割り切れない場合、抗原の片端は2アミノ酸置換であってもよい。アラニンスキャンに用いる抗原は、PAD2又はそのペプチド断片であってもよい。親和性は、例えば、ELISA又は表面プラズモン共鳴分析法で評価してもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の347～354位を含むエピトープに特異的に結合する抗体であってもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の351、352、353、又は354位を含むエピトープに特異的に結合する抗体であってもよい。この抗体は、PAD2の351、352、353、又は354位に結合性を有する限り、エピトープ内の他のアミノ酸残基に結合性を有していてもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、配列番号1で示されるアミノ酸配列のペプチドの8、9、10、又は11位に特異的に結合する抗体であってもよい。この抗体は、ペプチドの8、9、10、又は11位に結合性を有する限り、エピトープ内の他のアミノ酸残基に結合性を有していてもよい。本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、PAD2の351、352、353、又は354位にAla変異を有する変異型PAD2に対して特異的な結合性を有さない抗体であってもよい。これらの抗体は、シトルリン化阻害能の観点からは、特にPAD2の351、352、353、又は354位を認識する抗体が好ましい。このとき、結合性は1アミノ酸残基をAlaへ置換したアラニンスキャンで評価してもよい。
　本発明の一実施形態において「抗体」は、抗原上の特定のエピトープに特異的に結合することができる分子又はその集団を含む。また抗体は、ポリクローナル抗体又はモノクローナル抗体であってもよい。抗体は、様々な形態で存在することができ、例えば、全長抗体（Fab領域とFc領域を有する抗体）、Fv抗体、Fab抗体、F(ab')2抗体、Fab'抗体、diabody、一本鎖抗体（例えば、scFv）、dsFv、多価特異的抗体（例えば、二価特異的抗体）、抗原結合性を有するペプチド又はポリペプチド、キメラ抗体、マウス抗体、ニワトリ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、又はそれらの同等物（又は等価物）からなる群から選ばれる1種以上の形態であってもよい。また抗体は、抗体修飾物又は抗体非修飾物を含む。抗体修飾物は、抗体と、例えばポリエチレングリコール等の各種分子が結合していてもよい。抗体修飾物は、抗体に公知の手法を用いて化学的な修飾を施すことによって得ることができる。抗体のアミノ酸配列、クラス、又はサブクラスは、例えば、ヒト、ヒトを除く哺乳類（例えば、ラット、マウス、ウサギ、ウシ、サル等）、又は鳥類（例えば、ニワトリ）等由来であってもよい。また抗体は、例えば、単離抗体、精製抗体、又は組換抗体を含む。また抗体は、例えば、in vitro又はin vivoで使用できる。
　本発明の一実施形態において「ポリクローナル抗体」は、例えば、哺乳類（例えば、ラット、マウス、ウサギ、ウシ、サル等）又は鳥類（例えば、ニワトリ）等に、目的の抗原を含む免疫原を投与することによって生成することが可能である。免疫原の投与は、1つ以上の免疫剤、又はアジュバントを注入してもよい。アジュバントは、免疫応答を増加させるために使用されることもあり、フロイントアジュバント（完全又は不完全）、ミネラルゲル（水酸化アルミニウム等）、又は界面活性物質（リゾレシチン等）等を含んでいてもよい。免疫プロトコルは、当該技術分野で公知であり、選択する宿主生物に合わせて、免疫応答を誘発する任意の方法によって実施される場合がある（タンパク質実験ハンドブック, 羊土社(2003):86-91.）。
　本発明の一実施形態において「モノクローナル抗体」は、集団を構成する個々の抗体が、実質的に同じエピトープに反応する場合の抗体を含む。又は、集団を構成する個々の抗体が、実質的に同一（自然発生可能な突然変異は許容される）である場合の抗体であってもよい。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、異なるエピトープに対応する異なる抗体を典型的に含むような、通常のポリクローナル抗体とは異なる。モノクローナル抗体の作製方法は特に限定されないが、例えば、"Kohler G, Milstein C., Nature. 1975 Aug 7;256(5517):495-497."に掲載されているようなハイブリドーマ法と同様の方法によって作製してもよい。あるいは、モノクローナル抗体は、米国特許第4816567号に記載されているような組換え法と同様の方法によって作製してもよい。又は、モノクローナル抗体は、"Clackson et al., Nature. 1991 Aug 15;352(6336):624-628."、又は"Marks et al., J Mol Biol. 1991 Dec 5;222(3):581-597."に記載されているような技術と同様の方法を用いてファージ抗体ライブラリーから単離してもよい。又は、"タンパク質実験ハンドブック, 羊土社(2003):92-96."に掲載されている方法によって作製してもよい。
　本発明の一実施形態において「Fv抗体」は、抗原認識部位を含む抗体である。この領域は、非共有結合による1つの重鎖可変ドメイン及び1つの軽鎖可変ドメインの二量体を含む。この構成において、各可変ドメインの3つのCDRは相互に作用してVH-VL二量体の表面に抗原結合部位を形成することができる。
　本発明の一実施形態において「Fab抗体」は、例えば、Fab領域及びFc領域を含む抗体を蛋白質分解酵素パパインで処理して得られる断片のうち、H鎖のN末端側約半分とL鎖全体が一部のジスルフィド結合を介して結合した抗体である。Fabは、例えば、Fab領域及びFc領域を含む上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体を、蛋白質分解酵素パパインで処理して得ることができる。
　本発明の一実施形態において「F(ab')2抗体」は、例えば、Fab領域及びFc領域を含む抗体を蛋白質分解酵素ペプシンで処理して得られる断片のうち、Fabに相当する部位を2つ含む抗体である。F(ab')2は、例えば、Fab領域及びFc領域を含む上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体を、蛋白質分解酵素ペプシンで処理して得ることができる。また、例えば、下記のFab'をチオエーテル結合あるいはジスルフィド結合させることで、作製することができる。
　本発明の一実施形態において「Fab'抗体」は、例えば、F(ab')2のヒンジ領域のジスルフィド結合を切断して得られる抗体である。例えば、F(ab')2を還元剤ジチオスレイトール処理して得ることができる。
　本発明の一実施形態において「scFv抗体」は、VHとVLとが適当なペプチドリンカーを介して連結した抗体である。scFv抗体は、例えば、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体のVHおよびVLをコードするcDNAを取得し、VH-ペプチドリンカー-VLをコードするポリヌクレオチドを構築し、そのポリヌクレオチドをベクターに組み込み、発現用の細胞を用いて生産できる。
　本発明の一実施形態において「diabody」は、二価の抗原結合活性を有する抗体である。二価の抗原結合活性は、同一であることもできるし、一方を異なる抗原結合活性とすることもできる。diabodyは、例えば、scFvをコードするポリヌクレオチドをペプチドリンカーのアミノ酸配列の長さが8残基以下となるように構築し、得られたポリヌクレオチドをベクターに組み込み、発現用の細胞を用いて生産できる。
　　本発明の一実施形態において「dsFv」は、VH及びVL中にシステイン残基を導入したポリペプチドを、上記システイン残基間のジスルフィド結合を介して結合させた抗体である。システイン残基に導入する位置はReiterらにより示された方法(Reiter et al., Protein Eng. 1994 May;7(5):697-704.)に従って、抗体の立体構造予測に基づいて選択することができる。
　本発明の一実施形態において「抗原結合性を有するペプチド又はポリペプチド」は、抗体のVH、VL、又はそれらのCDR1、2、もしくは3を含んで構成される抗体である。複数のCDRを含むペプチドは、直接又は適当なペプチドリンカーを介して結合させることができる。
　上記のFv抗体、Fab抗体、F(ab')2抗体、Fab' 抗体、scFv抗体、diabody、dsFv抗体、抗原結合性を有するペプチド又はポリペプチド（以下、「Fv抗体等」と称することもある）の生産方法は特に限定しない。例えば、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体におけるFv抗体等の領域をコードするDNAを発現用ベクターに組み込み、発現用細胞を用いて生産できる。又は、Fmoc法（フルオレニルメチルオキシカルボニル法）、tBOC法（t-ブチルオキシカルボニル法）などの化学合成法によって生産してもよい。なお上記の本発明の実施形態に係る抗原結合性断片は、上記Fv抗体等の1種以上であってもよい。
　本発明の一実施形態において「キメラ抗体」は、例えば、異種生物間における抗体の可変領域と、抗体の定常領域とを連結したもので、遺伝子組換え技術によって構築できる。例えば、マウス-ヒトキメラ抗体、ニワトリ-ヒトキメラ抗体、ニワトリ-マウスキメラ抗体等が挙げられる。マウス-ヒトキメラ抗体は、例えば、"Roguska et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 1994 Feb 1;91(3):969-973."に記載の方法で作製できる。マウス-ヒトキメラ抗体を作製するための基本的な方法は、例えば、クローン化されたcDNAに存在するマウスリーダー配列及び可変領域配列を、哺乳類細胞の発現ベクター中にすでに存在するヒト抗体定常領域をコードする配列に連結する。又は、クローン化されたcDNAに存在するマウスリーダー配列及び可変領域配列をヒト抗体定常領域をコードする配列に連結した後、哺乳類細胞発現ベクターに連結してもよい。ヒト抗体定常領域の断片は、任意のヒト抗体のH鎖定常領域及びヒト抗体のL鎖定常領域のものとすることができ、例えばヒトH鎖のものについてはCγ1、Cγ2、Cγ3又はCγ4を、L鎖のものについてはCλ又はCκを各々挙げることができる。
　本発明の一実施形態において「ヒト化抗体」は、例えば、非ヒト種由来の1つ以上のCDR、及びヒト免疫グロブリン由来のフレームワーク領域、さらにヒト免疫グロブリン由来の定常領域を有し、所望の抗原に結合する抗体である。抗体のヒト化には、当該技術分野で既知の種々の手法を使用してもよい。本発明の一実施形態において「ヒト抗体」は、例えば、抗体を構成する重鎖の可変領域及び定常領域、軽鎖の可変領域及び定常領域を含む領域が、ヒトイムノグロブリンをコードする遺伝子に由来する抗体である。ヒト抗体の作製には、当該技術分野で既知の種々の手法を使用してもよい。
　本発明の一実施形態に係る抗PAD2抗体は、scFvの形態であってもよく、その場合、重鎖と軽鎖間にリンカーを有していてもよい。リンカーは、例えば、代表的には、GとPからなる0～5アミノ酸の配列が挙げられるがこれに限定されない。リンカーは必須ではなく、存在しなくてもよい。
　本発明の一実施形態において「アミノ酸」は、アミノ基とカルボキシル基を持つ有機化合物の総称である。本発明の実施形態に係る抗体が「特定のアミノ酸配列」を含むとき、そのアミノ酸配列中のいずれかのアミノ酸が化学修飾を受けていてもよい。また、そのアミノ酸配列中のいずれかのアミノ酸が塩、又は溶媒和物を形成していてもよい。また、そのアミノ酸配列中のいずれかのアミノ酸がL型、又はD型であってもよい。それらのような場合でも、本発明の実施形態に係る抗体は、上記「特定のアミノ酸配列」を含むといえる。蛋白質に含まれるアミノ酸が生体内で受ける化学修飾としては、例えば、N末端修飾（例えば、アセチル化、ミリストイル化等）、C末端修飾（例えば、アミド化、グリコシルホスファチジルイノシトール付加等）、又は側鎖修飾（例えば、リン酸化、糖鎖付加等）等が知られている。
　本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体をコードするポリヌクレオチド又はベクターである。このポリヌクレオチド又はベクターを細胞に導入することによって、形質転換体を作製できる。形質転換体は、ヒト又はヒトを除く哺乳動物（例えば、ラット、マウス、モルモット、ウサギ、ウシ、サル等）の細胞であってもよい。哺乳動物細胞としては、例えば、チャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO細胞)、サル細胞COS-7、ヒト胎児由来腎臓細胞（例えば、HEK293細胞）などが挙げられる。又は、形質転換体はEscherichia属菌、酵母等であってもよい。上記ポリヌクレオチド又はベクターは、抗PAD2抗体を発現可能に構築されていてもよい。上記ポリヌクレオチド又はベクターは、例えば、プロモーター、エンハンサー、複製開始点、又は抗生物質耐性遺伝子など、蛋白質発現に必要な構成要素を含んでいてもよい。上記ポリヌクレオチド又はベクターは、異種由来の塩基配列を有していてもよい。異種由来の塩基配列は、例えば、ヒト及びヒトを除く生物（例えば、細菌、古細菌、酵母、昆虫、鳥類、ウイルス、又はヒトを除く哺乳動物等）からなる群から選ばれる2種以上の生物由来の塩基配列を含んでいてもよい。
　上記のベクターとしては、例えば大腸菌由来のプラスミド（例えばpET-Blue）、枯草菌由来のプラスミド（例えばpUB110）、酵母由来プラスミド（例えばpSH19）、動物細胞発現プラスミド（例えばpA1-11、pcDNA3.1-V5/His-TOPO）、λファージなどのバクテリオファージ、ウイルス由来のベクターなどを用いることができる。ベクターは発現ベクターであってもよく、環状であってもよい。
　上記のポリヌクレオチド又はベクターの細胞への導入方法としては、例えば、リン酸カルシウム法、リポフェクション法、エレクトロポレーション法、アデノウイルスによる方法、レトロウイルスによる方法、又はマイクロインジェクションなどを使用できる（改訂第4版 新 遺伝子工学ハンドブック, 羊土社(2003):152-179.）。細胞を用いた抗体の生産方法としては、例えば、"タンパク質実験ハンドブック,羊土社(2003):128-142."に記載の方法を使用できる。
　本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係るポリヌクレオチド又はベクターを含有する細胞を増殖させる工程を含む、抗PAD2抗体の生産方法である。上記増殖させる工程は、培養する工程を含む。またこの生産方法は、抗PAD2抗体を回収する工程を含んでいてもよい。またこの生産方法は、細胞培養液を調製する工程を含んでいてもよい。またこの生産方法は、抗PAD2抗体を精製する工程を含んでいてもよい。
　本発明の一実施形態において、抗体の精製は、例えば、硫酸アンモニウム、エタノール沈殿、プロテインA、プロテインG、ゲルろ過クロマトグラフィー、陰イオン、陽イオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、又はレクチンクロマトグラフィーなどを用いることができる（タンパク質実験ハンドブック, 羊土社(2003):27-52.）。
　本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体を含む、組成物である。この組成物を用いれば、PAD2を効率的に検出できる。また、PAD2のシトルリン化を効率的に阻害することができる。この組成物が含有する成分は特に限定されず、例えば、緩衝液を含んでいてもよい。この組成物に対して、後述の阻害剤及び医薬組成物に係る種々の実施形態（例えば、担体を含有可能なこと等）の1つ以上を適用してもよい。
　本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体を含む、PAD2のシトルリン化活性阻害剤である。この阻害剤を用いれば、PAD2によるシトルリン化を効率的に阻害することができる。上記阻害剤によるシトルリン化活性の低下率は、20、30、40、60、80％以上であってもよく、それらいずれか2つの値の範囲内であってもよい。この低下率は、例えば、PBSを用いたときの低下率を0％としたときの相対割合で表してもよい。本発明の一実施形態において「剤」は、例えば、研究又は治療に用いられる組成物を含む。上記阻害剤は、例えば、治療剤を含む。上記阻害剤は、例えば、in vitro又はin vovoで用いることができる。上記阻害剤は、上記の本発明の実施形態に係る組成物を含んでいてもよい。本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体と、PAD2とを接触させる工程を含む、PAD2のシトルリン化活性阻害方法である。本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体を患者に投与する工程を含む、PAD2のシトルリン化活性阻害方法である。上記阻害方法は、研究又は治療のために行われる阻害方法を含む。本発明の一実施形態は、PAD2のシトルリン化活性阻害剤を生産するための、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体の使用である。本発明の一実施形態においてシトルリン化する蛋白質は特に限定されないが、例えば、アルギニンを有する蛋白質を含む。この蛋白質は、例えば、ヒストン、ミエリン塩基性蛋白質を含む。
　本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体を含む、医薬組成物である。この医薬組成物は、薬理学的に許容される1つ以上の担体を含んでいてもよい。医薬組成物は、例えば、関節炎、関節リウマチ、又は多発性硬化症の治療用医薬組成物を含む。上記医薬組成物は、上記の本発明の実施形態に係る組成物を含んでいてもよい。本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体（又は抗PAD2抗体を含む医薬組成物）を患者に投与する工程を含む、疾患の治療方法である。治療は、例えば、関節炎、関節リウマチ、多発性硬化症、又はシェーグレン症候群の治療を含む。後述の実施例に記載のS4等の抗PAD2抗体は、ヒストンのシトルリン化を強く阻害することから、関節炎又は関節リウマチの治療に特に有効である。また、S4等の抗PAD2抗体は、ミエリン塩基性蛋白質のシトルリン化を強く阻害することから、多発性硬化症の治療に特に有効である。本発明の一実施形態は、医薬組成物を生産するための、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体の使用である。
　本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体を含む、PAD2の検出試薬である。この試薬を用いれば、効率的にPADを検出できる。本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体と、試験サンプルを接触させる工程を含む、PAD2の検出方法である。本発明の一実施形態は、上記の本発明の実施形態に係る抗PAD2抗体を含む、キットである。このキットを用いれば、例えば、疾患の治療、診断、又はPAD2の検出ができる。このキットは、例えば、上記の本発明の実施形態に係る組成物、阻害剤、医薬組成物、診断薬、又は検出試薬を含んでいてもよく、取扱説明書、緩衝液、容器、又は包装を含んでいてもよい。
　本発明の一実施形態において「治療」は、患者の疾患、もしくは疾患に伴う1つ以上の症状の、症状改善効果、抑制効果、又は予防効果を発揮しうることを含む。本発明の一実施形態において「治療薬」は、有効成分と、薬理学的に許容される1つ以上の担体とを含む医薬組成物であってもよい。本発明の一実施形態において「医薬組成物」は、例えば有効成分と上記担体とを混合し、製剤学の技術分野において知られる任意の方法により製造してもよい。また医薬組成物は、治療のために用いられる物であれば使用形態は限定されず、有効成分単独であってもよいし、有効成分と任意の成分との混合物であってもよい。また上記担体の形状は特に限定されず、例えば、固体又は液体（例えば、緩衝液）であってもよい。上記担体の含有量は、例えば、製剤学上有効量であってもよい。有効量は、例えば、有効成分の製剤学的な安定性又は送達のために十分量であってもよい。例えば、緩衝液は、バイアル中における有効成分の安定化に有効である。投与量、投与間隔、投与方法は、特に限定されず、患者の年齢や体重、症状、対象臓器等により、適宜選択してもよい。また医薬組成物は、治療有効量、又は所望の作用を発揮する有効量の有効成分を含むことが好ましい。
　本発明の一実施形態は、組成物中の、PAD2の341～357位に特異的に結合する抗PAD2抗体の割合を増加させる工程を含む、組成物のシトルリン化活性阻害能を促進させる方法である。本発明の一実施形態は、抗PAD2抗体を含有する組成物であって、組成物中の抗PAD2抗体分子の90％以上が、PAD2の341～357位に特異的に結合する抗PAD2抗体である、組成物である。本発明の一実施形態は、抗PAD2抗体を含有する抗体集団であって、抗体集団中の抗PAD2抗体分子の90％以上が、PAD2の341～357位に特異的に結合する抗PAD2抗体である、抗体集団である。上記90％以上は、例えば、90、95、96、97、98、99％以上、又は100％であってもよく、それらいずれか2つの値の範囲内であってもよい。
　本発明の一実施形態は、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドである。このペプチドを用いれば、PAD2に結合する抗体を生産することができる。また、PAD2に結合する抗体を検出することができる。配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドは、化学修飾（例えば、KLH修飾）を受けていてもよく、そのような化学修飾ペプチドも配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドの一形態に含まれる。配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドは、単離、精製、又は濃縮されたペプチドであってもよい。
　本発明の一実施形態は、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドを含む抗原組成物である。この抗原組成物は、例えば、緩衝液、又はアジュバンドを含んでいてもよい。本発明の一実施形態は、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドを哺乳類又は鳥類に免疫する工程を含む、抗PAD2抗体の生産方法である。本発明の一実施形態は、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドと、抗体又は抗体ライブラリーを接触させる工程を含む、抗PAD2抗体の生産方法である。本発明の一実施形態は、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドと、抗PAD2抗体を含む試験サンプルと、を接触させる工程を含む、PAD2に結合する抗体の検出方法である。本発明の一実施形態は、配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドを含む、活性型PAD2に結合する抗体の検出用組成物である。
　本発明の一実施形態において「結合」は、共有結合又は非共有結合のいずれであってもよく、例えば、イオン結合、水素結合、疎水性相互作用、又は親水性相互作用であってもよい。
　本発明の一実施形態において「有意に」は、例えば、統計学的有意差をスチューデントのt検定（片側又は両側）を使用して評価し、p＜0.05又はp＜0.01である状態であってもよい。又は、実質的に差異が生じている状態であってもよい。
　本明細書において引用しているあらゆる刊行物、公報類（特許、又は特許出願）は、その全体を参照により援用する。
　本明細書において「又は」は、文章中に列挙されている事項の「少なくとも1つ以上」を採用できるときに使用される。「もしくは」も同様である。本明細書において「2つの値の範囲内」と明記した場合、その範囲には2つの値自体も含む。本明細書において「A～B」は、A以上B以下を意味するものとする。
　以上、本発明の実施形態について述べたが、これらは本発明の例示であり、上記以外の様々な構成を採用することもできる。また、上記実施形態に記載の構成を組み合わせて採用することもできる。
　以下、本発明を実施例によりさらに説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
　＜実施例1＞抗PAD2抗体の作製
　3ヵ月齢のボリスブラウン3羽に対してKLH修飾されたペプチド抗原（配列番号1、PAD2の341～357位）を各333 μgずつ腹腔に免疫した。一次免疫には完全フロイントアジュバンド（014-09541、Wako）、二次および三次免疫には不完全フロイントアジュバンド（011-09551、Wako）を用いて抗原を免疫した。四次免疫はPBS（phosphate buffered saline）に希釈した抗原を静脈注射した。隔週で翼下静脈より採血を行い、ELISAによって抗体価の確認を行った。3次免疫まで実施し、4次免疫を最終免疫とした。最終免疫3日後、ニワトリの脾臓を回収し、 Ficoll paque PLUS（17-1440-03、GE Healthcare）を用いた密度勾配遠心によりリンパ球を単離し、TRIzole Reagent（15596026、Life Technologies）を用いてRNAを抽出した。抽出したRNAからPrimeScript II 1st Strand cDNA Synthesis Kit（6210A、TAKARA）を用いたRT-PCRによりcDNAの合成を行い、scFvファージライブラリーを作製した。発現ベクターはpPDSのマウスκ鎖の代わりにニワトリλ鎖を挿入したタイプの発現ベクターを使用した。scFvファージライブラリーの作製は、参考文献："Nakamura et al., J Vet Med Sci. 2004 Ju;66 (7): 807-814"に記載の方法に従って行った。
　scFvファージ抗体ライブラリーを用いて、完全長PAD2を固相化したプレートによるパニングを行った。パニングは参考文献："Nakamura et al., J Vet Med Sci. 2004 Ju;66 (7): 807-814"に記載の方法に従って行った。5回パニングを行った後、合成ペプチドを固相化したプレートを用いたELISAによってライブラリーの反応性を確認し、反応性が上昇し始めたライブラリーからファージのスクリーニングを行った。スクリーニングは、ファージを大腸菌に感染させ、アンピシリン（50 μg/ml、nacalai社）を含む2×YT Agar plateにプレーティングし、得られたコロニーをアンピシリン含有2×YT液体培地中で培養した。ヘルパーファージに感染させた後、アンピシリン（50 μg/ml）、カナマイシン（25 μg/ml、明治製菓株式会社）、IPTG（100 μg/ml、nacalai）含有2×YT液体培地中でファージの誘導を行った。得られた培養上清中のscFvファージ抗体の反応性を、抗原固相化プレートを用いたELISAによって確認した。得られた陽性クローンはDNAシークエンサー（ABI PRISM 3100-Genetic Analyzer、Applied Biosystems）を用いてシークエンスを行い配列を決定した。
　配列の異なるクローンは、scFv抗体をコードするDNA鎖を鋳型にして、ニワトリ由来抗体遺伝子H鎖可変領域およびL鎖可変領域の増幅をPCRで行った後、PCR産物をSacIIおよびNheI制限酵素処理（R0157S、R0131S、BioLabs）し、H鎖可変領域およびL鎖可変領域のそれぞれについて、同じように制限酵素処理したマウス／ニワトリキメラ抗体（IgG1）発現ベクター（H鎖用発現ベクター：pcDNA4/myc-His、L鎖用発現ベクター：pcDNA3/myc-His、Invitrogen）に組換えた。作製したH鎖およびL鎖のコンストラクトをCHO細胞にトランスフェクトした後、完全長PAD2を固相したELISAで反応性の確認を行った。使用したマウスキメラ発現ベクターはTateishi et al., J Vet Med Sci. 2008 Apr;70(4): 397-400に記載されているベクターを使用した。以上により得られた抗体クローンのうち、S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309を以下の実験で使用した。以下ではこれらの抗体を纏めて「S4等」と称することもある。
　＜実施例2＞抗PAD2抗体の反応性評価
　(2-1)ELISA
　以下の条件でELISAを行い、S4等のヒトPAD2に対する反応性を評価した。
　(2-1-1)材料
・抗体：抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309）、WO/2014/086365の抗PAD2抗体（#2、#34）、抗ジニトロフェニル（DNP）抗体（ネガティブコントロール抗体）。上記#2、#34は、WO/2014/086365の実施例に記載の可変領域のアミノ酸配列をもとに作製したものを使用した（以下の実施例も同じ）。
・抗原：完全長ヒトPAD2抗原
　(2-1-2)実験条件
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
　(2-1-3)結果
　抗PAD2抗体のELISAの結果から、50%効果濃度（EC50）の値を求めた。結果を表2に示す。値が小さいほど反応性が高いことを示す。いずれの抗体もPAD2に対する高い反応性を示した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
　(2-2)Biacore
　Biacore（GE Healthcare、Biacore T200）によって、S4等のヒトPAD2に対する親和性を評価した。
　(2-2-1)材料
・抗体：抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309）
・抗原：完全長ヒトPAD2抗原
　(2-2-2)方法
　Biacore（GE Healthcare、Biacore T200）によって、S4等のヒトPAD2に対する親和性を評価した。親和性の測定には、Mouse Antibody Capture Kit（GE Healthcare、BR-1008-38）を用いた。具体的には、メーカー提供の標準プロトコルに従い、NHS/EDCを使用し、CM5チップ表面のフリーカルボキシル基を利用したアミンカップリング法によって、ウサギ抗マウスポリクローナル抗体をCM5チップ表面に固定化した。次に、S4等をウサギ抗マウスポリクローナル抗体にキャプチャーした。Biacore T200に種々の濃度のヒトPAD2を供し、カイネティクスセンサーグラムを作成した。
　(2-2-3)結果
　親和性測定の結果を表3及び図1に示す。いずれの抗体もPAD2に対する高い親和性を示した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
　＜実施例3＞抗PAD2抗体のシトルリン化阻害活性能の評価
　以下の条件で、抗PAD2抗体がPAD2のシトルリン化活性を阻害する能力を測定した。
　(3-1)材料
・組換蛋白質：完全長組換えヒトPAD2を含む粗画分
・基質：BAEE（Nα-ベンゾニル-L-アルギニンエチルエステルヒドロクロリド）
・抗体：抗DNP抗体（ネガティブコントロール）、抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309)、WO/2014/086365の抗PAD2抗体（#34）
　(3-2)方法
　作製した抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309）、#34、抗DNP抗体（ネガティブコントロール）それぞれについて1-6000 nMの抗体溶液を5μL、3.75 ng/μL（50nM）ヒトPAD2を5μL調製し、Tris-HCl 緩衝液（pH 7.6）、NaCl、DTTを全量が44μLになるように混合した。この溶液を室温で30分静置させた後、5μLの100 mM BAEE（ベンゾイルアルギニンエチルエステル）、1μLの0.05 M CaCl2を同時に加えてよく攪拌した。このときの溶液は、全量50μL、終濃度20 mM Tris-HCl （pH 7.6）、150 mM NaCl、1 mM DTT、10 mM BAEE、1 mM CaCl2、5 nMヒトPAD2、及び0.1-600 nM各抗体である。この溶液を37℃で4時間静置させ、5Mの過塩素酸を12.5μLを加えて反応を停止させた。この溶液中に含まれるシトルリン化されたBAEEを比色定量した。
　(3-3)結果
　ヒトPAD2に50%活性阻害を与える抗体濃度（EC50）を表4に示す。600 nM以下で50%活性阻害を与える抗体濃度を算出できなかった場合はND(Not determined)と表記した。S4等の抗体が、#34に比べて高い阻害活性能を有していることが示された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
　＜実施例4＞抗PAD2抗体のシトルリン化阻害活性能の評価
　以下の条件で、抗PAD2抗体がカルシウム結合体PAD2のシトルリン化活性を阻害する能力を測定した。
　(4-1)材料
・組換蛋白質：完全長組換えヒトPAD2を含む粗画分
・基質：BAEE（Nα-ベンゾニル-L-アルギニンエチルエステルヒドロクロリド）
・抗体：抗DNP抗体（ネガティブコントロール）、抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309)、WO/2014/086365の抗PAD2抗体（#2）
　(4-2)方法
　3.75 ng/μL（50nM）ヒトPAD2を5μL調製し、Tris-HCl 緩衝液（pH 7.6）、NaCl、DTTを全量が29μLになるように混合した。この溶液に、CaCl2を5μL添加し室温で30分静置させた。この溶液に対して、作製した抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309)、#2、抗DNP抗体（ネガティブコントロール）それぞれについて0.5-3000 nMの抗体溶液を10μL、100 mM BAEE （ベンゾイルアルギニンエチルエステル）を5μL、水を1μLそれぞれ同時に加えてよく攪拌した。このときの溶液は、全量50μL、終濃度20 mM Tris-HCl （pH 7.6）、150 mM NaCl、1 mM DTT、10 mM BAEE、1 mM CaCl2、5 nMヒトPAD2、及び0.1-600 nM各抗体である。この溶液を37℃で4時間静置させ、5Mの過塩素酸を12.5μLを加えて反応を停止させた。この溶液中に含まれるシトルリン化されたBAEEを比色定量した。
　(4-3)結果
　ヒトPAD2に25%活性阻害を与える抗体濃度（EC25）を表5に示す。600 nM以下で25%活性阻害を与える抗体濃度を算出できなかった場合はND(Not determined)と表記した。カルシウム結合体PAD2のシトルリン化活性に関して、S4等の抗体が、#2に比べて高い阻害活性能を有していることが示された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
　＜実施例5＞抗PAD2抗体のシトルリン化阻害活性能の評価
　以下の条件で、抗PAD2抗体がPAD2のシトルリン化活性を阻害する能力を測定した。このとき、基質に子牛胸腺由来ヒストンを使用した。
　(5-1)材料
・組換蛋白質：完全長組換えヒトPAD2を含む粗画分
・基質：子牛胸腺由来ヒストン
・抗体：抗DNP抗体（ネガティブコントロール）、抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170)、WO/2014/086365の抗PAD2抗体（#2、#34）
　(5-2)方法
　作製した抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170)、#2、#34、抗DNP抗体（ネガティブコントロール）それぞれについて1-6000 nMの抗体溶液を5μL、3.75 ng/μL（50nM）ヒトPAD2を5μL調製し、Tris-HCl 緩衝液（pH 7.6）、NaCl、DTTを全量が44μLになるように混合した。この溶液を室温で30分静置させた後、5μLの子牛胸腺由来ヒストン、1μLの0.05 M CaCl2を同時に加えてよく攪拌した。このときの溶液は、全量50μL、終濃度20 mM Tris-HCl （pH 7.6）、150 mM NaCl、1 mM DTT、1.8 mg/mL ヒストン、1 mM CaCl2、5 nMヒトPAD2、及び0.1-600 nM各抗体である。この溶液を37℃で4時間静置させ、5Mの過塩素酸を12.5μLを加えて反応を停止させた。この溶液中に含まれるシトルリン化された子牛胸腺由来ヒストンを比色定量した。
　(5-3)結果
　ヒトPAD2に50%活性阻害を与える抗体濃度（EC50）を表6に示す。600 nM以下で50%活性阻害を与える抗体濃度を算出できなかった場合はND(Not determined)と表記した。S4等の抗体が、#2及び#34に比べて高い阻害活性能を有していることが示された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
　＜実施例6＞抗PAD2抗体のシトルリン化活性阻害能の評価
　以下の条件で、抗PAD2抗体がPAD2のシトルリン化活性を阻害する能力を測定した。このとき、基質に牛由来ミエリン塩基性蛋白質を使用した。
　(6-1)材料
・組換蛋白質：完全長組換えヒトPAD2を含む粗画分
・基質：牛由来ミエリン塩基性蛋白質
・抗体：抗DNP抗体（ネガティブコントロール）、抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309)、WO/2014/086365の抗PAD2抗体（#2、#34）
　(6-2)方法
　作製した抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S47、S108、S113、S170、S309)、#2、#34、抗DNP抗体（ネガティブコントロール）それぞれについて6000 nMの抗体溶液を5μL、3.75 ng/μL（50nM）ヒトPAD2を5μL調製し、Tris-HCl 緩衝液（pH 7.6）、NaCl、DTTを全量が44μLになるように混合した。この溶液を室温で30分静置させた後、5μLの牛由来ミエリン塩基性蛋白質、1μLの0.05 M CaCl2を同時に加えてよく攪拌した。このときの溶液は、全量50μL、終濃度20 mM Tris-HCl （pH 7.6）、150 mM NaCl、1 mM DTT、1.8 mg/mL 牛由来ミエリン塩基性蛋白質、1 mM CaCl2、5 nMヒトPAD2、及び600 nM各抗体である。この溶液を37℃で4時間静置させ、5Mの過塩素酸を12.5μLを加えて反応を停止させた。この溶液中に含まれるシトルリン化された牛由来ミエリン塩基性蛋白質を比色定量した。
　(6-3)結果
　各抗体添加時のヒトPAD2のシトルリン化活性能の測定結果を図2に示す。図2の値は、TBSの値を100%としたときの平均値および標準偏差である。#2及び#34の抗体には阻害活性が見られなかった。一方で、S4等の抗体は高い阻害活性能を示した。抗DNP抗体（ネガティブコントロール）に対して有意差がみられた抗体には、*(p<0.01)と示した。
　＜実施例7＞エピトープの評価
　(7-1)方法
　抗原配列（YLNRGDRWIQDEIEFGY、配列番号1）のアミノ酸残基を3アミノ酸ずつアラニンへ置換することで、6個のAla変異体（配列番号3～8）を合成した。各Ala変異体と作製した抗PAD2抗体（S4、S10、S24、S108、S170、S309）の反応性を評価（ELISA）した。S4等の抗体が有意な反応性を示さなかったAla変異体の、Ala置換前のアミノ酸残基をエピトープと評価した。
　(7-2)Ala変異体
　AAARGDRWIQDEIEFGY（配列番号3）
　YLNAAARWIQDEIEFGY（配列番号4）
　YLNRGDAAAQDEIEFGY（配列番号5）
　YLNRGDRWIAAAIEFGY（配列番号6）
　YLNRGDRWIQDEAAAGY（配列番号7）
　YLNRGDRWIQDEIEFAA（配列番号8）
　(7-3)実験条件
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000007
　(7-4)結果
　S4等の各Ala変異体およびオリジナル抗原配列に対する50%効果濃度（EC50）の値を図3に示す。この結果からわかるように、S4等はPAD2の344～357位に対応する位置に変異を有するAla変異体に有意な反応性を示さなかった。このことから、S4等は341～357位の中でも特にPAD2の344～357位内のアミノ酸を認識していることが明らかになった。
　以上の実施例により、PAD2の341～357位に結合する抗体が、PAD2によるシトルリン化に関して、優れた阻害活性を有することが明らかとなった。
　以上、本発明を実施例に基づいて説明した。この実施例はあくまで例示であり、種々の変形例が可能なこと、またそうした変形例も本発明の範囲にあることは当業者に理解されるところである。

Claims (16)

  1. 　PAD2（Peptidylarginine deiminase 2）の341～357位、又は配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチド、に特異的に結合する、抗PAD2抗体。
  2. 　配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチドに特異的に結合する抗体である、請求項1に記載の抗PAD2抗体。
  3. 　PAD2の344～357位に特異的に結合する抗体である、請求項1又は2に記載の抗PAD2抗体。
  4. 　PAD2のシトルリン化活性を阻害する、請求項1～3いずれかに記載の抗PAD2抗体。
  5. 　PAD2に対するKD（M）が9.0×10-8以下である、請求項1～4いずれかに記載の抗PAD2抗体。
  6. 　前記結合部位は、3アミノ酸置換のアラニンスキャンによって同定される結合部位である、請求項1～5いずれかに記載の抗PAD2抗体。
  7. 　モノクローナル抗体である、請求項1～6いずれかに記載の抗PAD2抗体。
  8. 　抗原結合性断片である、請求項1～7いずれかに記載の抗PAD2抗体。
  9. 　請求項1～8いずれかに記載の抗PAD2抗体をコードする、ポリヌクレオチド又はベクター。
  10. 　請求項1～8いずれかに記載の抗PAD2抗体を含む、組成物。
  11. 　請求項1～8いずれかに記載の抗PAD2抗体を含む、PAD2のシトルリン化活性阻害剤。
  12. 　請求項9に記載のポリヌクレオチド又はベクターを含有する細胞を増殖させる工程を含む、抗PAD2抗体の生産方法。
  13. 　配列番号1で示されるアミノ酸配列からなるペプチド。
  14. 　化学修飾ペプチドである、請求項13に記載のペプチド。
  15. 　請求項13又は14に記載のペプチドを含む抗原組成物。
  16. 　請求項13又は14に記載のペプチドで哺乳類又は鳥類を免疫する工程を含む、抗PAD2抗体の生産方法。
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