WO2018199341A1 - アレルギーの抗原およびそのエピトープ - Google Patents

アレルギーの抗原およびそのエピトープ Download PDF

Info

Publication number
WO2018199341A1
WO2018199341A1 PCT/JP2018/017472 JP2018017472W WO2018199341A1 WO 2018199341 A1 WO2018199341 A1 WO 2018199341A1 JP 2018017472 W JP2018017472 W JP 2018017472W WO 2018199341 A1 WO2018199341 A1 WO 2018199341A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
amino acid
seq
polypeptide
acid sequence
nos
Prior art date
Application number
PCT/JP2018/017472
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
佳世子 松永
晶子 矢上
政志 中村
尚志 下條
奈由 佐藤
祐治 青木
智美 酒井
Original Assignee
学校法人藤田学園
ホーユー株式会社
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 学校法人藤田学園, ホーユー株式会社 filed Critical 学校法人藤田学園
Priority to CN201880043071.6A priority Critical patent/CN110799646B/zh
Priority to KR1020197032673A priority patent/KR20200002888A/ko
Priority to JP2019514694A priority patent/JP7184259B2/ja
Priority to EP18792322.2A priority patent/EP3617312A4/en
Priority to US16/608,239 priority patent/US20200188510A1/en
Publication of WO2018199341A1 publication Critical patent/WO2018199341A1/ja
Priority to JP2022181605A priority patent/JP2023027061A/ja
Priority to US18/471,906 priority patent/US20240108719A1/en
Priority to JP2023200039A priority patent/JP2024026181A/ja

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6854Immunoglobulins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23LFOODS, FOODSTUFFS, OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES, NOT COVERED BY SUBCLASSES A21D OR A23B-A23J; THEIR PREPARATION OR TREATMENT, e.g. COOKING, MODIFICATION OF NUTRITIVE QUALITIES, PHYSICAL TREATMENT; PRESERVATION OF FOODS OR FOODSTUFFS, IN GENERAL
    • A23L5/00Preparation or treatment of foods or foodstuffs, in general; Food or foodstuffs obtained thereby; Materials therefor
    • A23L5/20Removal of unwanted matter, e.g. deodorisation or detoxification
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/35Allergens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/08Antiallergic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/43504Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates
    • C07K14/43509Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from invertebrates from crustaceans
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/564Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for pre-existing immune complex or autoimmune disease, i.e. systemic lupus erythematosus, rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, rheumatoid factors or complement components C1-C9
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23VINDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
    • A23V2002/00Food compositions, function of food ingredients or processes for food or foodstuffs
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A23FOODS OR FOODSTUFFS; TREATMENT THEREOF, NOT COVERED BY OTHER CLASSES
    • A23VINDEXING SCHEME RELATING TO FOODS, FOODSTUFFS OR NON-ALCOHOLIC BEVERAGES AND LACTIC OR PROPIONIC ACID BACTERIA USED IN FOODSTUFFS OR FOOD PREPARATION
    • A23V2200/00Function of food ingredients
    • A23V2200/30Foods, ingredients or supplements having a functional effect on health
    • A23V2200/304Foods, ingredients or supplements having a functional effect on health having a modulation effect on allergy and risk of allergy
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/24Immunology or allergic disorders

Definitions

  • the present invention relates to a novel antigen that is allergic to shrimp.
  • the present invention also relates to a diagnostic kit, diagnostic composition, and diagnostic method for allergy to shrimp.
  • the present invention also relates to a pharmaceutical composition containing the antigen, and a shrimp or processed shrimp product from which the antigen has been removed or reduced.
  • the present invention further relates to a tester composition for determining the presence or absence of shrimp antigens in an object.
  • the present invention also relates to a polypeptide containing an epitope of an antigen.
  • the present invention also relates to an allergy diagnostic kit, a diagnostic composition, and a diagnostic method comprising the polypeptide.
  • the present invention also relates to a pharmaceutical composition containing the polypeptide, and a raw material or processed product from which the polypeptide has been removed or reduced.
  • the present invention further relates to a method for producing a processed product from which the polypeptide is removed or reduced.
  • the present invention further relates to a tester composition for determining the presence or absence of an antigen containing the polypeptide in an object.
  • IgE antibodies specific for specific antigens are produced in the serum and tissues of allergic patients. Allergic reactions are triggered by the physiological results produced by the interaction of this IgE antibody with a specific antigen.
  • antigen refers to foods / foods that cause allergic symptoms in a broad sense, and refers to proteins (hereinafter also referred to as allergen components) contained in foods / foods to which specific IgE antibodies bind in a narrow sense.
  • allergen reagents are often prepared simply by grinding foods / food ingredients, etc., of allergen candidates (Patent Document 1). For this reason, a positive reaction in an allergy test is detected only when the content of the allergen components contained in a conventional antigen reagent exceeds the threshold that allows a positive reaction to be determined for binding to an IgE antibody. The diagnostic efficiency was not high enough.
  • allergen candidate foods and ingredients some allergen components are suggested and commercialized as test kits.
  • test kits In order to increase the reliability of the allergy test, it is necessary to comprehensively identify allergen components, but the patient detection rate by measuring the allergen components is still insufficient. Identification of new shrimp allergens is not only important for improving the accuracy of diagnostics, but also very important as a target for low-allergen foods, low-allergen foods and therapeutics.
  • the allergen-specific IgE antibody recognizes and binds to an epitope that is a specific amino acid sequence in the allergen component.
  • Non-Patent Document 1 Non-Patent Document 1
  • allergen components have been analyzed up to the epitope
  • allergy diagnostic kit using a polypeptide containing an epitope on the market at present there is no allergy diagnostic kit using a polypeptide containing an epitope on the market at present.
  • JP 2002-286716 A JP2011-33544 JP2011-33546A JP2011-33547 JP2011-33548
  • the present invention provides a novel antigen that is allergic to shrimp.
  • the present invention also provides a diagnostic method and diagnostic kit for allergy to shrimp.
  • the present invention also provides a pharmaceutical composition containing the antigen, and a shrimp or processed shrimp product from which the antigen has been removed or reduced.
  • the present invention further provides a tester composition for determining the presence or absence of shrimp antigens in an object.
  • the present invention also provides a polypeptide containing an epitope of an antigen.
  • the present invention also provides an allergy diagnostic kit, a diagnostic composition, and a diagnostic method comprising the polypeptide.
  • the present invention also provides a pharmaceutical composition containing the polypeptide and a raw material or processed product from which the antigen containing the polypeptide has been removed or reduced.
  • the present invention further relates to a method for producing a processed product from which the antigen has been removed or reduced.
  • the present invention further provides a tester composition for determining the presence or absence of an antigen containing the polypeptide in a subject.
  • the present inventors conducted intensive research on the identification of causative antigens for allergies to shrimp. As a result, the inventors succeeded in identifying a novel antigen that specifically binds to an IgE antibody in the serum of a patient having shrimp allergy. Based on this finding, the present invention has been completed.
  • the present invention may be as follows.
  • a shrimp allergy diagnostic kit comprising at least one of the following proteins (1) to (11): (1) (1A) a protein containing a C-terminal part of myosin heavy chain type 1 or a C-terminal part of myosin heavy chain type a or a variant thereof, Any of the following proteins (1A-a) to (1A-e), which is an allergic antigen against shrimp: (1A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 2, 45 or 87; (1A-b) a protein comprising an amino acid sequence having 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 45 or 87; (1A-c) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 1, 44 or 86; (1A-d) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence having 70% or more identity
  • 3A a protein containing a C-terminal part of myosin heavy chain type 2 or a C-terminal part of myosin heavy chain type b or a variant thereof, Any of the following proteins (3A-a) to (3A-e), which is an antigen of allergy to shrimp: (3A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 161, 179 or 230; (3A-b) a protein comprising an amino acid sequence having 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 161, 179 or 230; (3A-c) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 160, 178 or 229; (3A-d) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in
  • 5A Any one of the following proteins (5A-a) to (5A-e), which is a protein containing glycogen phosphorylase or a variant thereof, and is an antigen of allergy to shrimp: (5A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 362; (5A-b) a protein comprising an amino acid sequence having 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 362; (5A-c) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 361; (5A-d) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence having 70% or more identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 361; or (5A-e) complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO:
  • a composition for diagnosing shrimp allergy comprising at least one of the proteins specified as (1) to (11) in [1] as an antigen.
  • a method for providing an index for diagnosing shrimp allergy in a subject comprising the following steps: (I) contacting a sample obtained from a subject with an antigen, wherein the sample is a solution containing IgE antibodies; (Ii) detecting binding between the IgE antibody and the antigen in a sample obtained from the subject; (Iii) if binding of the subject IgE antibody to the antigen is detected, an indication is provided that the subject is allergic to shrimp; Wherein the antigen is at least one of the proteins identified as (1) to (11) in [1] above.
  • a pharmaceutical composition comprising at least one of the proteins specified as (1) to (11) in [1] above.
  • the shrimp or shrimp processed product is characterized in that the antigen is removed or reduced, and the antigen is at least one of the proteins specified as (1) to (11) in [1] above.
  • a tester composition for determining the presence or absence of a shrimp antigen in an object comprising an antibody that binds to at least one of the proteins specified as (1) to (11) in [1] above .
  • the present inventors have also succeeded in finding an epitope for a shrimp-derived antigen containing the above antigen.
  • the IgE antibody can bind to a plurality of allergen components if the same amino acid sequence is present in different allergen components.
  • the allergic patient's IgE antibody binds to both, so the antigen is cross-linked. Therefore, the epitope specified by the present application enables diagnosis and treatment of allergy including cross-ability and detection of a plurality of allergen components including the epitope.
  • the present invention has been completed. That is, in another aspect, the present invention may be as follows.
  • An allergy diagnostic kit comprising at least one of the following polypeptides: (E1) (i) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 558-565; (ii) in SEQ ID NOs: 558 to 565, one or more amino acid residues corresponding to the 4, 5, 7, 8, 10, 11, 12, 13, 14, 15th amino acid residues of SEQ ID NO: 558 are A polypeptide comprising an amino acid sequence, substituted with any amino acid residue; (E2) (i) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 566-581, 949; (Ii) one or more amino acid residues corresponding to the first, third, fourth, fifth, sixth, seventh, eighth, ninth, eleventh, and twelfth amino acid residues of SEQ ID NO: 566 in SEQ ID NOS: 566-581,949 A polypeptide comprising an amino acid sequence, wherein the group is substituted with any amino acid residue; (E3) (i) a polypeptide
  • E32 (i) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 793-809, 974, 975;
  • (Ii) corresponds to amino acid residues at positions 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 of SEQ ID NO: 793 in SEQ ID NOs: 793-809, 974, 975
  • E33 (i) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 810-816;
  • Ii) in SEQ ID NO: 810-816, one or more amino acid residues corresponding to the 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 14th amino acid residues of SEQ ID NO: 810 are A polypeptide comprising an amino acid sequence, substituted with any amino acid residue;
  • E34 (i) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID
  • a polypeptide comprising an amino acid sequence substituted with an amino acid residue of (E36) (i) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 833-846, 976; (Ii) corresponds to amino acid residues at positions 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 of SEQ ID NO: 833 in SEQ ID NO: 833-846,976 A polypeptide comprising an amino acid sequence, wherein one or more amino acid residues are substituted with any amino acid residue; (E37) (i) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 847-857, 977; (Ii) one or more amino acid residues corresponding to the fifth, sixth, seventh, ninth, tenth, eleventh, twelfth, thirteenth and fourteenth amino acid residues of SEQ ID NO: 847 in SEQ ID NOS: 847-857, 977 A polypeptide comprising an amino acid sequence, substituted with any amino acid residue; (E38) (i)
  • a diagnostic composition for allergy which comprises at least one of the polypeptides according to aspect 1.
  • a method for providing an index for diagnosing a subject's allergy comprising the following steps: (I) contacting a sample obtained from a subject with an antigen, wherein the sample is a solution containing IgE antibodies; (Ii) detecting binding between the IgE antibody and the antigen in a sample obtained from the subject; (Iii) if binding of the subject IgE antibody to the antigen is detected, an indication is provided that the subject is allergic; Wherein said antigen is at least one of the polypeptides of embodiment 3.
  • a pharmaceutical composition comprising at least one of the polypeptides according to aspect 3.
  • a tester composition for determining the presence or absence of an antigen in a subject comprising an antibody that binds to at least one of the polypeptides according to aspect 3.
  • any of the following primers (A) a primer comprising a part of the base sequence of the nucleic acid encoding the polypeptide of embodiment 3 and / or part of its complementary strand; or (b) SEQ ID NOs: 1, 44, 86, 116, 140, 145 , 160, 178, 229, 275, 299, 305, 361, 380, 398, 413, 420, 454, 480, 485, 519, 540 or a primer that is part of at least one of the base sequences shown in FIG.
  • a primer that is part of a sequence that is complementary to at least one of the selected base sequences comprising:
  • a method for determining the presence or absence of a polypeptide according to aspect 3 in a raw material / processed product comprising detecting the polypeptide according to aspect 3 in the raw material / processed product.
  • a method for producing a processed product from which an antigen has been removed or reduced comprising the step of confirming that the antigen has been removed or reduced in the process of producing the processed product, wherein the antigen is described in Aspect 3.
  • the production method which is at least one of the polypeptides.
  • a novel antigen of allergy against shrimp can be provided. Since a novel allergen component causing shrimp allergy is identified in the present invention, a highly sensitive diagnostic method and diagnostic kit for allergy to shrimp, a pharmaceutical composition containing the antigen, shrimp or shrimp from which the antigen has been removed or reduced A processed product and a tester composition for determining the presence or absence of a shrimp antigen in an object can be provided.
  • a novel polypeptide containing an epitope of an antigen can be provided.
  • allergy-sensitive diagnostic kit, diagnostic composition, and diagnostic method pharmaceutical composition containing the polypeptide, and the presence or absence of an antigen containing the polypeptide in the target are determined.
  • the tester composition for carrying out, the raw material or processed product from which the said polypeptide was removed or reduced, and the manufacturing method of the processed product can be provided.
  • FIG. 1 is a photograph of a gel showing the migration pattern of proteins by two-dimensional electrophoresis for proteins contained in vaname shrimp.
  • the band on the left side of the photograph is the molecular weight marker band, and the value on the left side of the photograph is the molecular weight (KDa) of each molecular weight marker.
  • the numerical value at the top of the photo represents the isoelectric point.
  • FIG. 2 is a photograph of an immunoblot using the serum of a shrimp allergic patient against a two-dimensional electrophoresis pattern of a protein contained in vaname shrimp. Spots 1 to 11 where the IgE antibody in the serum of shrimp allergic patients specifically reacted are shown in white frames, respectively.
  • FIG. 1 is a photograph of a gel showing the migration pattern of proteins by two-dimensional electrophoresis for proteins contained in vaname shrimp.
  • the band on the left side of the photograph is the molecular weight marker band
  • KDa molecular weight (KDa) of each molecular weight marker.
  • FIG. 3 is a photograph of a gel showing a protein migration pattern by two-dimensional electrophoresis for proteins contained in black tiger.
  • the band on the left side of the photograph is the molecular weight marker band, and the value on the left side of the photograph is the molecular weight (KDa) of each molecular weight marker.
  • the numerical value at the top of the photo represents the isoelectric point.
  • FIG. 4 is a photograph of an immunoblot using the serum of a shrimp allergic patient against a two-dimensional electrophoresis pattern of a protein contained in a black tiger. Spots 1 to 11 where the IgE antibody in the serum of shrimp allergic patients specifically reacted are shown in white frames, respectively.
  • FIG. 5 is a photograph of a gel showing a protein migration pattern by two-dimensional electrophoresis for proteins contained in the prawn.
  • the band on the left side of the photograph is the molecular weight marker band, and the value on the left side of the photograph is the molecular weight (KDa) of each molecular weight marker.
  • the numerical value at the top of the photo represents the isoelectric point.
  • FIG. 6 is a photograph of an immunoblot using sera from shrimp allergic patients with respect to the two-dimensional electrophoresis pattern of the protein contained in the prawn. Spots 1 to 6 and 8 to 11 where the IgE antibody in the serum of shrimp allergic patients specifically reacted are shown in white boxes, respectively.
  • FIG. 7 shows the results of examining the cross-reactivity of the peptides having the amino acid sequences of the respective epitopes by ELISA using sera from patients who are allergic to shrimp and wheat or crabs.
  • FIG. 8 shows the results of examining the cross-reactivity of the peptides having the amino acid sequences of the respective epitopes by ELISA using sera from patients who are allergic to shrimp and wheat or crabs.
  • FIG. 9 shows the results of examining the cross-reactivity of the peptides having the amino acid sequences of the respective epitopes by ELISA using sera from patients who are allergic to shrimp and wheat or crabs.
  • FIG. 8 shows the results of examining the cross-reactivity of the peptides having the amino acid sequences of the respective epitopes by ELISA using sera from patients who are allergic to shrimp and wheat or crabs.
  • FIG. 9 shows the results of examining the cross-reactivity of the peptides having the amino acid sequences of the respective epitopes by ELISA using
  • FIG. 10 shows the results of examining the cross-reactivity of the peptides having the amino acid sequence of each epitope by ELISA using the serum of a patient who has allergies to shrimp and wheat or crabs.
  • FIG. 11 shows the results of examining cross-reactivity of a peptide having an amino acid sequence of each epitope by ELISA using sera from patients who are allergic to shrimp and wheat or crabs.
  • FIG. 12 shows the results of examining the cross-reactivity of the peptides having the amino acid sequences of the respective epitopes by ELISA using the serum of a patient who has allergies to shrimp and wheat or crabs.
  • allergy refers to a state in which a hypersensitivity reaction unfavorable to the living body, which occurs when the antigen enters the living body sensitized to a certain antigen again.
  • Allergic reactions can occur when in contact with an antigen or when ingested.
  • contact refers to touching an object, and particularly refers to adhesion to the skin, mucous membranes (eye, lips, etc.) and the like for the human body.
  • Ingestion means taking into the body, and taking by inhalation or oral means.
  • an allergic reaction that occurs when food is ingested is called food allergy.
  • the allergy may be a food allergy.
  • IgE antibodies specific for antigens are produced in blood and tissues.
  • IgE antibodies bind to mast cells or basophils.
  • the antigen specific to the IgE antibody enters the body of the allergic disease patient again, the antigen combines with the IgE antibody bound to mast cells or basophils, resulting in the physiological effect of the IgE antibody-antigen interaction.
  • physiological effects include the release of histamine, serotonin, heparin, eosinophil migration factor or various leukotrienes.
  • These released substances elicit allergic reactions caused by the combination of IgE antibodies and specific antigens.
  • an IgE antibody recognizes and binds to an epitope that is a specific amino acid sequence in a specific antigen, and an allergic reaction due to the antigen appears through the above-described pathway.
  • the allergy targeted by the present invention is not particularly limited as long as it is an allergy to the allergen containing the epitope to be used.
  • the allergen is a seafood, fruit, vegetable, nuts (seed and seeds), edible grass, cereal, livestock meat, milk, dairy product, etc., or a living body (particularly human) ingested by a living body (particularly human).
  • Parasites that parasitize are included.
  • Non-limiting examples of seafood include shrimp and crab belonging to the Decapoda (shrimp). What is generally recognized as “crustacea” is mostly included in the decapod (shrimp). Decapods (shrimps) include decapodal short tails (aka: crab bottoms) and decapodic tails (hermit crabs). Of the decapods (shrimps), all the names except for the decapods, short tails (aka: crab bottoms) and decapodic tails (hermit crabs) are “shrimp”. Shrimp will be described later.
  • the decapodic short tail (aka crab lower) is a crab family (eg, Erimacrus isenbeckii), crabs (eg, Chionoecetescetopilio), Portunus trituberculatus)).
  • crabs eg, Chionoecetescetopilio
  • Portunus trituberculatus e.g., the Decapoda Coleoptera (hermit crab) include the king crab family (eg, Paralithodes camtschaticus).
  • Non-limiting, seafood is also a squid belonging to the order of tsutsui and octopus. Including octopus.
  • Seafood further includes fish belonging to the mackerel family and the cod family.
  • Seafood further includes marsdalae shellfish.
  • Non-limiting examples of the cuttle squid include Todarodes pacificus. The squid is also called “true squid”.
  • Octopus octopus includes octopus (Octopus vulgaris).
  • Mackerel fish include tuna (Thunnus orientalis) and cassava (Scomber japonicas).
  • Cod fish include the cod (Gadus macrocephalus).
  • Marsdalegaid shellfish include clams, clams and swordfish. In one embodiment, it includes clams (Ruditapes philippinarum).
  • Non-limiting examples of the fruit include fruits belonging to the family Matabidae, Pineapple, Ursi, Cucurbitaceae, Citrus, Citrus, and Rosaceae.
  • examples of vegetables include fruits belonging to the eggplant family, the cucurbitaceae family, and the camphor family.
  • Examples of nuts (seed and seeds) include nuts (seed and seeds) belonging to Ursiaceae, Rosaceae and Walnuts.
  • Examples of edible grass include edible grass belonging to the family Asteraceae.
  • Examples of cereals include cereals belonging to the family Gramineae and Capaceae.
  • Non-limiting, fruit of the family Tabidae includes kiwi (Actinidia deliciosa). Pineapple fruits include pineapple (Ananas comosus).
  • the Urushi family includes nuts (seed and seeds) such as cashew nuts (Anacardium occidentale) in addition to fruits such as mango (Mangifera indica).
  • Cucurbitaceae includes vegetables such as cucumber (Cucumis sativus) in addition to fruits such as melon (Cucumis melo).
  • the fruit of the family Paceae contains banana (Musa acuminate). Citrus fruits include orange (Citrus sinensis).
  • the Rosaceae include nuts (seed and berries) such as almonds in addition to fruits such as peach, strawberry, apple, pear and loquat.
  • the Rosaceae includes apples (Malus domestica), almonds (Prunus dulcis).
  • Non-limiting examples of solanaceous vegetables include eggplant (Solanum melongena) and tomato (Solanum lycopersicum).
  • a camphoraceae vegetable includes avocado (Persea americana).
  • Non-limiting examples of nuts (seed and seeds) include Urushiaceae cashew nuts (Anacardium occidentale), Rosaceae almonds (Prunus dulcis). Nuts of the walnut family (seed and seeds) include shinaguru (Juglans regia).
  • Non-limiting examples of asteraceae edible grass include mugwort (Artemisia indica var. Maximowiczii or Artemisia indica). Gramineous grains include bread wheat (Triticum aestivum). The cereal family includes, for example, Fagopyrum esculentum.
  • the type of livestock meat is not particularly limited. In one embodiment, it includes avian (chicken, duck, etc.) meat, pork, beef, lamb and the like. In one embodiment, it is avian meat. In one embodiment, chicken (Gallus gallus) meat.
  • the origin of milk is not particularly limited. In one embodiment, it includes milk from cows, goats, sheep and the like. In one embodiment, it is milk (Bos Taurus). Dairy products are processed milk products. Non-limiting examples include butter, whipped cream, cheese, yogurt and ice cream.
  • Parasites are, but are not limited to, for example, Anisakisae parasites. Parasites of the family Anisakis include Anisakis) simplex.
  • the allergen is any of the following: Shrimp, crayfish (Erimacrus isenbeckii), snow crab (Chionoecetes opilio), blue crab (Portunus trituberculatus), king crab (Paralithodes camtschaticus), common squid (Todarodes pacificus), octopus (cientus berulshun) Madara (Gadus macrocephalus), clams (Ruditapes philippinarum), kiwi (Actinidia deliciosa), pineapple (Ananas comosus), mango (Mangifera indica), cashew nut (Anacardium occidentale), melon (Cucumis melo), banana (inate) Citrus sinensis), apples (Malus domestica), almonds (Prunusuldulcis), eggplants (Solanum melongena), tomatoes (Solanum lycopersicum), cucumbers (Cucumis sativus), avocados (
  • maxim owiczii or Artemisia indica bread wheat (Triticum aestivum), buckwheat (Fagopyrum esculentum), chicken (Gallus gallus) meat, milk (Bos Taurus), anisakis (Anisakis simplex).
  • the term “shrimp” refers to a shrimp belonging to the Eucarida.
  • the shrimp belonging to the upper shrimp may be, for example, a shrimp belonging to the family Shrimp, Vietnamese tiger, Kurma shrimp
  • the shrimp belonging to the lobster family may be, for example, lobster or prickly shrimp
  • the shrimp belonging to the Shrimp family is, for example, Omar shrimp (lobster) It may be.
  • the shrimp belonging to the familyshrimp can be, for example, a cherry shrimp, the shrimp belonging to the familyshrimp can be, for example, a white shrimp, and the shrimp belonging to the family Shrimp can be, for example, a sweet shrimp, a button shrimp, a shrimp Well, the shrimp belonging to the krill family may be, for example, krill.
  • the shrimp targeted by the present invention may be any of the above shrimp.
  • the shrimp targeted by the present invention is a shrimp belonging to the familyshrimp family (family Panaeidae).
  • allergy to shrimp refers to a state having an allergic reaction that occurs using proteins contained in shrimp as antigens. Allergy to shrimp can cause an allergic reaction when contacted with an antigen contained in shrimp or when the antigen is ingested. In general, an allergic reaction that occurs when food is ingested is called food allergy.
  • the allergy to shrimp may be food allergy.
  • an antigen is a substance that induces an allergic reaction.
  • it is a protein contained in raw materials such as foods, it is also called an allergen component.
  • the antigen is preferably a protein.
  • a protein is a molecule having a structure in which natural amino acids are linked by peptide bonds.
  • the number of amino acids contained in the protein is not particularly limited.
  • the term “polypeptide” also means a molecule having a structure in which natural amino acids are linked by peptide bonds.
  • the number of amino acids contained in the polypeptide is not particularly limited.
  • Polypeptide is a concept that includes “protein”. A polypeptide in which about 2 to 50 amino acids are linked by peptide bonds may be particularly referred to as a peptide.
  • L form is shown unless otherwise specified.
  • the notation of the amino acid sequence of a protein, polypeptide or peptide used in the present specification is represented by a single letter of amino acid based on standard usage and notation commonly used in the art, and the left direction is the amino terminal direction. Yes, and the right direction is the carboxy-terminal direction.
  • X may be any substance having an amino group and a carboxyl group capable of binding to amino acids at both ends, and particularly represents any of 20 kinds of natural amino acids.
  • the alanine scan method creates mutants in which residues in a protein are mutated one by one to alanine (glycine if the original amino acid is alanine). It is a method for site-specific identification of residues important for function. If the binding to the patient's IgE antibody remains even after mutation to alanine (glycine if the original amino acid is alanine), the residue is not important for binding to the IgE antibody, and other amino acids Even if it is changed to, binding properties remain.
  • the binding property of IgE antibody means that the binding and reaction of the target epitope and IgE antibody are detected.
  • binding and maintenance of IgE and antigen is important for the subsequent allergic reaction, and this binding and maintenance is responsible for epitope charge, hydrophobic bond, hydrogen bond, and aromatic interaction.
  • the ability to bind and maintain them by losing them by changing to alanine or glycine means that the amino acid is not important.
  • the protein contained in the shrimp specific shrimp was subjected to two-dimensional electrophoresis under the following conditions to identify the allergic antigen to shrimp.
  • the first dimension electrophoresis is an isoelectric focusing gel
  • the gel length is in the range of 5-10 cm
  • the gel pH range is 3-10
  • the pH gradient of the gel with respect to the migration direction is
  • a gel length up to pH 5 is a
  • a gel length of pH 5-7 is b
  • a gel length of pH 7 or higher is c
  • a is in the range of 0.15-0.3
  • b Is a gel having a range of 0.4 to 0.7
  • c is in a range of 0.15 to 0.3.
  • Isoelectric focusing was carried out using an IPG gel Immobiline® Drystrip® (pH 3-10NL).
  • IPGphor manufactured by GE was used as the electrophoresis apparatus.
  • the upper limit of the current value of the electrophoresis apparatus is set to 75 ⁇ A per gel, and the voltage program is (1) a constant voltage process is performed at a constant voltage of 300 V up to 750 Vhr (the current change width for 30 minutes before the end of the process is (2) Gradually increase the voltage to 1000V over 300Vhr, (3) Gradually increase the voltage to 5000V over 4500Vhr, and (4) then the total Vhr to 12000 at 5000V constant voltage Until then, isoelectric focusing of the first dimension was performed.
  • the gel concentration at the base end of the migration direction is set to 3 to 6%, and the gel concentration at the tip end in the migration direction is set higher than the gel concentration at the base end of the migration direction.
  • SDS-PAGE was performed using NuPAGE 4-12% Bris-Tris Gels IPG well mini 1 mm manufactured by Life Technologies.
  • As an electrophoresis instrument XCell SureLock Mini-Cell manufactured by life Technologies was used.
  • electrophoresis was performed at 200 V constant voltage for about 45 minutes.
  • spot 1 As a result of mass identification of antigen spot 1 of antigen (1) spot 1 , the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 3 to 43 for vaname shrimp, SEQ ID NOs: 46 to 85 for black tiger, and SEQ ID NOs: 88 to 115 for prawns were obtained. was detected.
  • SEQ ID NOs: 3 to 43 were identified to be the C-terminal portion of myosin heavy chain type 1 derived from vaname shrimp (amino acid sequence: SEQ ID NO: 2, nucleotide sequence encoding it: SEQ ID NO: 1).
  • ⁇ 85 is identified to be the C-terminal portion of myosin heavy chain type ⁇ ⁇ 1 from the black tiger (amino acid sequence: SEQ ID NO: 45, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 44), and SEQ ID NO: 88-115
  • the amino acid sequence was identified to be the C-terminal part of myosin heavy chain type a from amino acid prawn (amino acid sequence: SEQ ID NO: 87, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 86).
  • the antigen of spot 1 may be any of (1A-a) to (1A-e) and (1B) below.
  • (1A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 2, 45 or 87.
  • (1A-b) 70% or more, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 45 or 87 , A protein comprising 98% or more, 99% or more amino acid sequence.
  • a protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleotide sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 1, 44 or 86.
  • (1A-d) 70% or more, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1, 44 or 86 ,
  • a protein comprising an amino acid sequence encoded by 98% or more and 99% or more of a base sequence.
  • a protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid consisting of a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 1, 44 or 86.
  • a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 2 to 43, the group consisting of SEQ ID NOs: 45 to 85, or the group consisting of SEQ ID NOs: 87 to 115, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 45, 50 or all of the sequences.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 2 to 43, SEQ ID NOs: 45 to 85, and SEQ ID NOs: 87 to 115 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted or added. .
  • the proteins (1A-a) to (1A-e) and (1B) have a molecular weight of 80 to 260 kDa, when gels are subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned section “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 90 to 230 kDa, more preferably 100 to 200 kDa, and an isoelectric point of 3.0 to 7.0, preferably 4.0 to 6.5, more preferably 5.0 to 6.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • SEQ ID NOs: 118 to 139 are the N-terminal portion of myosin heavy chain ⁇ type 1 derived from vannamei (amino acid sequence: SEQ ID NO: 117, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 116).
  • ⁇ 144 was identified to be the N-terminal part of myosin heavy chain type 1 from the black tiger (amino acid sequence: SEQ ID NO: 141, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 140), and SEQ ID NOs: 147 to 159
  • the amino acid sequence was identified to be the N-terminal part (amino acid sequence: SEQ ID NO: 146, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 145) of myosin heavy chain type a derived from prawns.
  • the antigen of spot 2 may be any of (2A-a) to (2A-e) and (2B) below.
  • (2A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 117, 141 or 146.
  • (2A-b) 70% or more, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 117, 141 or 146 , A protein comprising 98% or more, 99% or more amino acid sequence.
  • (2A-c) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 116, 140 or 145.
  • (2A-d) 70% or more, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, with the base sequence represented by SEQ ID NO: 116, 140 or 145 ,
  • a protein comprising an amino acid sequence encoded by 98% or more and 99% or more of a base sequence.
  • (2A-e) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 116, 140 or 145.
  • (2B) a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 117 to 139, the group consisting of SEQ ID NOs: 141 to 144, or the group consisting of SEQ ID NOs: 146 to 159, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 or all of the sequences.
  • a protein comprising one, preferably a protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15 or all sequences of the amino acid sequence.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 117 to 139, SEQ ID NOs: 141 to 144, and SEQ ID NOs: 146 to 159 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted, or added. .
  • the proteins (2A-a) to (2A-e) and (2B) have a molecular weight of 50 to 160 kDa in a gel subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned section “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 55 to 150 kDa, more preferably 60 to 130 kDa, and an isoelectric point of 4.5 to 10.0, preferably 5.0 to 9.5, more preferably 5.5 to 9.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • SEQ ID NOs: 162 to 177 were the C-terminal portion of myosin heavy chain type 2 derived from vaname shrimp (amino acid sequence: SEQ ID NO: 161, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 160).
  • ⁇ 228 is identified to be the C-terminal part of myosin : heavy chain type ⁇ 2 derived from black tiger (amino acid sequence: SEQ ID NO: 179, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 178), and SEQ ID NOs: 231 to 274
  • the amino acid sequence was identified to be the C-terminal part of myosin heavy chain type b derived from prawns (amino acid sequence: SEQ ID NO: 230, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 229).
  • the antigen of spot 3 may be any one of (3A-a) to (3A-e) and (3B) below.
  • (3A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 161, 179 or 230.
  • (3A-b) 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 161, 179 or 230, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more , A protein comprising 98% or more, 99% or more amino acid sequence.
  • (3A-d) 70% or more identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 160, 178 or 229, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more ,
  • a protein comprising an amino acid sequence encoded by 98% or more and 99% or more of a base sequence.
  • (3A-e) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 160, 178 or 229.
  • (3B) a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 161 to 177, the group consisting of SEQ ID NOs: 179 to 228, or the group consisting of SEQ ID NOs: 230 to 274, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45 or all of the sequences.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NO: 161 to 177, SEQ ID NO: 179 to 228, and SEQ ID NO: 230 to 274 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted or added. .
  • the proteins (3A-a) to (3A-e) and (3B) have a molecular weight of 80 to 260 kDa in a gel subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned section “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 90 to 230 kDa, more preferably 100 to 200 kDa, and an isoelectric point of 3.0 to 7.0, preferably 4.0 to 6.5, more preferably 5.0 to 6.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • SEQ ID NO: 277-298 is the N-terminal part of myosin ⁇ heavy chain type 2 derived from vannamei shrimp (amino acid sequence: SEQ ID NO: 276, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 275).
  • ⁇ 304 is identified as the N-terminal part of myosin ⁇ ⁇ heavy chain type 2 derived from black tiger (amino acid sequence: SEQ ID NO: 300, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 299), and SEQ ID NO: 307-320
  • the amino acid sequence was identified to be the N-terminal portion (amino acid sequence: SEQ ID NO: 306, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 305) of myosin heavy chain type b derived from prawns.
  • the antigen of spot 4 may be any of the following (4A-a) to (4A-e) and (4B).
  • (4A-c) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 275, 299 or 305.
  • (4A-d) 70% or more, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, the identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 275, 299 or 305 ,
  • a protein comprising an amino acid sequence encoded by 98% or more and 99% or more of a base sequence.
  • (4A-e) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 275, 299 or 305.
  • (4B) a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 276 to 298, the group consisting of SEQ ID NOs: 300 to 304, or the group consisting of SEQ ID NOs: 306 to 320, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 or all of the sequences.
  • At least an amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 276-293 and 295-298, the group consisting of SEQ ID NOs: 300-304, or the group consisting of SEQ ID NOs: 306, 307, and 309-319 A protein comprising one, preferably a protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 or all sequences of the amino acid sequence.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 276 to 298, SEQ ID NOs: 300 to 304, and SEQ ID NOs: 306 to 320 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted, or added. .
  • the proteins (4A-a) to (4A-e) and (4B) have a molecular weight of 50 to 160 kDa, when gels are subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above item “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 55 to 150 kDa, more preferably 60 to 130 kDa, and an isoelectric point of 4.5 to 10.0, preferably 5.0 to 9.5, more preferably 5.5 to 9.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • SEQ ID NOS: 363 to 379 are glycogen phosphorylases derived from prawns (amino acid sequence: SEQ ID NO: 362, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 361).
  • SEQ ID NOs: 321 to 336 and SEQ ID NOs: 337 to 360 glycogen-derived phosphorylase derived from prawns was hit. That is, since a protein with high homology was detected in vaname shrimp and black tiger, glycogen phosphorylase and its homologue were judged to be shrimp antigens.
  • the antigen of spot 5 may be any of (5A-a) to (5A-e) and (5B) below.
  • (5A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 362.
  • (5A-b) 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 362, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98% or more , A protein comprising 99% or more amino acid sequence.
  • (5A-c) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 361.
  • (5A-d) 70% or more identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 361, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98% or more , A protein comprising an amino acid sequence encoded by 99% or more of the base sequence.
  • (5A-e) a protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 361.
  • a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 321 to 336, the group consisting of SEQ ID NOs: 337 to 360, or the group consisting of SEQ ID NOs: 362 to 379, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 or all of the sequences.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 321 to 336, SEQ ID NOs: 337 to 360, and SEQ ID NOs: 362 to 379 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted, or added. .
  • the proteins (5A-a) to (5A-e) and (5B) have a molecular weight of 70 to 160 kDa in a gel subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned section “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 75 to 140 kDa, more preferably 80 to 130 kDa, and an isoelectric point of 5.0 to 9.0, preferably 5.5 to 8.5, more preferably 6.0 to 8.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • SEQ ID NOs: 382 to 397 are a part of the hemocyanin subunit L1 derived from lobster shrimp (amino acid sequence: SEQ ID NO: 381, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 380), and SEQ ID NOs: 400 to 412 Is identified as a hemocyanin derived from black tiger (amino acid sequence: SEQ ID NO: 399, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 398), and the amino acid sequence of SEQ ID NOs: 415 to 419 is a hemocyanin subunit L derived from prawn (Amino acid sequence: SEQ ID NO: 414, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 413) was identified.
  • the antigen of spot 6 may be any of the following (6A-a) to (6A-e) and (6B).
  • (6A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 381, 399 or 414.
  • (6A-b) 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 381, 399 or 414, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more , A protein comprising 98% or more, 99% or more amino acid sequence.
  • (6A-c) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 380, 398 or 413.
  • (6A-d) 70% or more, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, the identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 380, 398 or 413 , A protein comprising an amino acid sequence encoded by 98% or more and 99% or more of a base sequence.
  • a protein comprising at least one of the amino acid sequences, preferably a protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or all sequences of said amino acid sequence.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 381 to 397, SEQ ID NOs: 399 to 412 and SEQ ID NOs: 414 to 419 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted or added. .
  • the proteins (6A-a) to (6A-e) and (6B) have a molecular weight of 50 to 110 kDa, when gels are subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned section “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 55 to 100 kDa, more preferably 60 to 90 kDa
  • the isoelectric point is 4.0 to 7.0, preferably 4.5 to 6.5, more preferably 5.0 to 6.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • the spot 7 was analyzed by comparing the mass data obtained from the mass spectrometer with the protein data of NCBI. As a result, it was identified that SEQ ID NOs: 422 to 435 were pyruvate kinase 3 (amino acid sequence: SEQ ID NO: 421, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 420) derived from lobster shrimp. In addition, as for SEQ ID NOs: 436 to 441, pyruvate kinase ⁇ 3 derived from vaname shrimp was hit. That is, since a protein with high homology was detected in Black Tiger, it was determined that pyruvate kinase 3 and its homologue are shrimp antigens.
  • the antigen of spot 7 may be any of (7A-a) to (7A-e) and (7B) below.
  • (7A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 421.
  • (7A-b) 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 421, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98% or more , A protein comprising 99% or more amino acid sequence.
  • (7A-c) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 420.
  • (7A-d) 70% or more identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 420, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98% or more , A protein comprising an amino acid sequence encoded by 99% or more of the base sequence.
  • (7A-e) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 420.
  • a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 421 to 435 or the group consisting of SEQ ID NOs: 436 to 441, preferably at least 2, 3, 4, 5, A protein comprising 6, 7, 8, 9, 10 or all sequences.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 421 to 435 and SEQ ID NOs: 436 to 441 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted or added.
  • the proteins (7A-a) to (7A-e) and (7B) are those having a molecular weight of 45 to 80 kDa in gels subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned “Identification of antigen”, Preferably, the molecular weight is around 50 to 75 kDa, more preferably 55 to 70 kDa, and an isoelectric point of 4.5 to 9.0, preferably 5.0 to 8.5, more preferably 5.5 to 8.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • the spot 8 was analyzed by comparing the mass data obtained from the mass spectrometer with the protein data of NCBI. As a result, it was identified that SEQ ID NOs: 456 to 479 were phosphopyruvate hydratase derived from black tiger (amino acid sequence: SEQ ID NO: 455, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 454). In addition, as for SEQ ID NOs: 442 to 453, phosphopyruvate hydratase derived from black tiger was hit. That is, since a protein with high homology was detected in vaname shrimp, it was determined that phosphopyruvate hydratase and its homolog are the shrimp antigens.
  • SEQ ID NOs: 482 to 484 are phosphopyruvate hydratase derived from tiger prawn (amino acid sequence: SEQ ID NO: 481, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 480).
  • the antigen of spot 8 may be any of the following (8A-a) to (8A-e) and (8B).
  • a protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 454 or 480.
  • (8A-d) 70% or more of identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 454 or 480, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98 % Or more, a protein comprising an amino acid sequence encoded by 99% or more of a base sequence.
  • a protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 454 or 480.
  • 8B a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 442 to 453, the group consisting of SEQ ID NOs: 455 to 479, or the group consisting of SEQ ID NOs: 481 to 484, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 or all of the sequences.
  • a protein comprising at least one of the amino acid sequences preferably a protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15 or all of the amino acid sequences.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 442 to 453, SEQ ID NOs: 455 to 479, and SEQ ID NOs: 481 to 484 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted or added. .
  • the proteins (8A-a) to (8A-e) and (8B) have a molecular weight of 35 to 80 kDa in a gel subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned section “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 40 to 75 kDa, more preferably 45 to 70 kDa, and an isoelectric point of 4.0 to 8.0, preferably 4.5 to 7.5, more preferably 5.0 to 7.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • the spot 9 was analyzed by comparing the mass data obtained from the mass spectrometer with the protein data of NCBI.
  • SEQ ID NOs: 487 to 490 were mitochondrial ATP synthase subunit alpha precursor (amino acid sequence: SEQ ID NO: 486, nucleotide sequence encoding the same: SEQ ID NO: 485) derived from lobster shrimp.
  • SEQ ID NOs: 491 to 497 and SEQ ID NOs: 498 to 518 mitochondrial ATP synthase subunit alpha precursor derived from lobster shrimp was hit.
  • the antigen of spot 9 may be any of (9A-a) to (9A-e) and (9B) below.
  • (9A-a) a protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 486.
  • (9A-b) 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 486, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98% or more , A protein comprising 99% or more amino acid sequence.
  • (9A-c) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 485.
  • (9A-d) 70% or more identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 485, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98% or more , A protein comprising an amino acid sequence encoded by 99% or more of the base sequence.
  • (9A-e) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 485.
  • a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 486 to 490, the group consisting of SEQ ID NOs: 491 to 497, or the group consisting of SEQ ID NOs: 498 to 518, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20 or all of the sequences.
  • a protein comprising one, preferably a protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15 or all sequences of the amino acid sequence.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 486 to 490, SEQ ID NOs: 491 to 497 and SEQ ID NOs: 498 to 518 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted or added. .
  • the proteins (9A-a) to (9A-e) and (9B) are those having a molecular weight of 40 to 70 kDa, when gels are subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above item “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 45 to 65 kDa, more preferably 50 to 60 kDa
  • the isoelectric point is 5.0 to 10.0, preferably 5.5 to 9.5, more preferably 6.0 to 9.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • the spot 10 was analyzed by comparing the mass data obtained from the mass spectrometer with the protein data of NCBI. As a result, it was identified that SEQ ID NOs: 521 to 527 were troponin I derived from the lobster shrimp (amino acid sequence: SEQ ID NO: 520, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 519). In addition, with regard to SEQ ID NOs: 528 to 532 and SEQ ID NOs: 533 to 539, troponin I derived from the lobster shrimp was hit. That is, since proteins with high homology were detected in black tiger and car prawns, it was determined that troponin I and its homologues are shrimp antigens.
  • the antigen of the spot 10 may be any of the following (10A-a) to (10A-e) and (10B).
  • (10A-c) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 519.
  • (10A-d) 70% or more identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 519, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98% or more , A protein comprising an amino acid sequence encoded by 99% or more of the base sequence.
  • (10A-e) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 519.
  • a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 520 to 527, the group consisting of SEQ ID NOs: 528 to 532, or the group consisting of SEQ ID NOs: 533 to 539, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5, 6 or all of the sequences. More preferably, it comprises at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 520 to 525 and 527, the group consisting of SEQ ID NOs: 528 to 530 and 532, or the group consisting of SEQ ID NOs: 533 to 537 and 539.
  • a protein preferably a protein comprising at least 2, 3, 4, 5 or all sequences of the amino acid sequence.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 520 to 527, SEQ ID NOs: 528 to 532, and SEQ ID NOs: 533 to 539 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted, or added. .
  • the proteins of the above (10A-a) to (10A-e) and (10B) have a molecular weight of 10 to 50 kDa, when gel is subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is around 15-40 kDa, more preferably 20-40 kDa, and an isoelectric point of 7.0-11.0, preferably 7.5-10.5, more preferably 8.0-10.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • SEQ ID NOs: 542 to 547 are cyclophilin A derived from the tiger shrimp (amino acid sequence: SEQ ID NO: 541, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 540).
  • SEQ ID NOs: 554 to 557 cyclophilin A derived from vannamei shrimp was hit. That is, since a protein with high homology was detected in the prawn, it was determined that cyclophilin A and its homologue were the shrimp antigens.
  • SEQ ID NOs: 550 to 553 are black tiger-derived cyclophilin A (amino acid sequence: SEQ ID NO: 549, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 548).
  • the antigen of the spot 11 may be any of the following (11A-a) to (11A-e) and (11B).
  • (11A-a) A protein comprising an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 541 or 549.
  • (11A-b) 70% or more identity with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 541 or 549, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98 % Or more, protein containing 99% or more amino acid sequence.
  • (11A-c) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a base sequence in which one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added in SEQ ID NO: 540 or 548. (11A-d) 70% or more of identity with the base sequence represented by SEQ ID NO: 540 or 548, preferably 75% or more, 80% or more, 85% or more, 90% or more, 95% or more, 97% or more, 98 % Or more, a protein comprising an amino acid sequence encoded by 99% or more of a base sequence.
  • (11A-e) A protein comprising an amino acid sequence encoded by a nucleic acid that hybridizes under stringent conditions with a nucleic acid comprising a base sequence complementary to the base sequence represented by SEQ ID NO: 540 or 548.
  • (11B) a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 541 to 547, the group consisting of SEQ ID NOs: 549 to 553, or the group consisting of SEQ ID NOs: 554 to 557, preferably the amino acid sequence A protein comprising at least 2, 3, 4, 5 or all of the sequences.
  • a protein comprising at least one amino acid sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 541 to 543, 545, and 546, the group consisting of SEQ ID NOs: 549 to 553, or the group consisting of SEQ ID NOs: 554 to 556, Preferably a protein comprising at least two, three or all of the amino acid sequences.
  • amino acid sequence represented by any of SEQ ID NOs: 541 to 547, SEQ ID NOs: 549 to 553, and SEQ ID NOs: 554 to 557 one or several amino acids may be deleted, substituted, inserted or added. .
  • the proteins (11A-a) to (11A-e) and (11B) have a molecular weight of 10 to 30 kDa in a gel subjected to two-dimensional electrophoresis under the conditions described in the above-mentioned section “Identification of antigen”.
  • the molecular weight is in the vicinity of 13 to 25 kDa, more preferably 15 to 20 kDa, and the isoelectric point is 7.0 to 11.0, preferably 7.5 to 10.5, more preferably 8.0 to 10.0. It may be a protein that appears as a spot.
  • the above proteins (1) to (11), which are antigens and the polypeptides (E1) to (E50) described later, are subjected to phosphorylation, sugar chain modification, aminoacylation, ring opening, deamination, etc. Alternatively, embodiments in which the amino acid residue of the polypeptide is modified are also included.
  • the proteins (1) to (11) described above and the polypeptides (E1) to (E50) described later are allergic antigens.
  • amino acids when “one or several amino acids are deleted, substituted, inserted or added” in the amino acid sequence, one or several amino acids are deleted in the target amino acid sequence. Or an amino acid sequence in which other amino acids are substituted, other amino acids are inserted, and / or other amino acids are added.
  • Several amino acids means, but not limited to, 200 or less, 100 or less, 50 or less, 30 or less, 20 or less, 15 or less, 12 or less, 10 or less, 8 or less, Means 6 amino acids, 4 amino acids, 3 amino acids or less.
  • several amino acids mean 30%, preferably 25%, 20%, 15%, 10%, 5%, 3%, 2% or 1% of amino acids relative to the total length of the amino acid sequence.
  • substitution is preferably a conservative substitution.
  • a conservative substitution is the replacement of a particular amino acid residue with a residue having similar physicochemical characteristics, but any substitution that does not substantially change the structural characteristics of the original sequence. For example, any substitution may be made so long as the substituted amino acid does not destroy the helix present in the original sequence or other types of secondary structures characterizing the original sequence.
  • conservative substitution of amino acid residues is exemplified for each substitutable residue, but the substitutable amino acid residues are not limited to those described below.
  • Group A leucine, isoleucine, valine, alanine, methionine
  • B group aspartic acid
  • glutamic acid glutamic acid
  • C group asparagine
  • glutamine D group: lysine
  • arginine arginine
  • Group E Serine
  • Threonine Group F: Phenylalanine, Tyrosine
  • one member of the above types can be exchanged for another type of member.
  • the amino acids of the above groups B, D, and E may be substituted with amino acids of other groups.
  • cysteines may be deleted or substituted with other amino acids to prevent folding in the protein with tertiary structure.
  • the hydropathic index of amino acids J.P.
  • J.P. which is a measure of hydrophobicity / hydrophilicity for amino acids, so that the hydrophilic / hydrophobic balance is maintained or the hydrophilicity is increased to facilitate synthesis.
  • Kyte and R. Doolittle, J. Mol. Biol., Vol.157, p.105-132, 1982), amino acids may be substituted.
  • substitution with an amino acid having less steric hindrance than the original amino acid for example, substitution from the F group to the A, B, C, D, E group; substitution from a charged amino acid to an uncharged amino acid
  • substitution from group B to group C may be performed.
  • the percent identity between two amino acid sequences can be determined by visual inspection and mathematical calculation.
  • the percent identity can also be determined using a computer program. Examples of such computer programs include BLAST and ClustalW. In particular, various conditions (parameters) for identity search by the BLAST program are described in Altschul et al. (Nucl. Acids. Res., 25, p. 3389-3402, 1997), NCBI and DNA Data Bank of Japan. (BDB manual, Altschul et al. NCB / NLM / NIH Bethesda, MD 20894; Altschul et al.). It can also be determined by using programs such as genetic information processing software GENETYX Ver.7 (Genetics), DNASIS Pro (Hitachi Software), Vector NTI (Infomax).
  • nucleotides when “one or several nucleotides are deleted, substituted, inserted or added” in the base sequence, one or several nucleotides are deleted in the target base sequence. Or a base sequence in which another nucleotide is substituted, another nucleotide is inserted, and / or another nucleotide is added. “Several nucleotides” means, but not limited to, within 600, within 300, within 150, within 100, within 50, within 30, within 20, within 15, within 12, It means no more than 10, no more than 8, no more than 6, no more than 4, no more than 3 nucleotide acids.
  • nucleotides mean 30%, preferably 25%, 20%, 15%, 10%, 5%, 3%, 2% or 1% nucleotides relative to the entire length of the base sequence. It is preferable that no frame shift occurs in the sequence encoding the amino acid due to the deletion, substitution, insertion or addition of the nucleotide.
  • the percent identity of two base sequences can be determined by visual inspection and mathematical calculation.
  • the percent identity can also be determined using a computer program.
  • sequence comparison computer program examples include the BLASTN program (Altschul et al. (1990) available from the website of the National Library of Medicine: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi. ) J. Mol. Biol. 215: 403-10: Version 2.2.7, WU-BLAST 2.0 algorithm or the like. Standard default parameter settings for WU-BLAST 2.0 can be those described in the following Internet site: http://blast.wustl.edu.
  • under stringent conditions means to hybridize under moderately or highly stringent conditions.
  • moderately stringent conditions can be easily determined by those skilled in the art having general techniques based on, for example, the length of DNA. The basic conditions are shown in Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd Edition, Chapters 6-7, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.
  • moderately stringent conditions are as hybridization conditions: 1 ⁇ SSC to 6 ⁇ SSC, 42 ° C. to 55 ° C., more preferably 1 ⁇ SSC to 3 ⁇ SSC, 45 ° C. to 50 ° C.
  • the most preferable conditions are 2 ⁇ SSC and 50 ° C.
  • the hybridization solution contains, for example, about 50% formamide
  • a temperature 5 to 15 ° C. lower than the above temperature is adopted.
  • Cleaning conditions include 0.5 ⁇ SSC to 6 ⁇ SSC, 40 ° C. to 60 ° C.
  • 0.05% to 0.2%, preferably about 0.1% SDS may generally be added.
  • Highly stringent conditions can also be readily determined by one skilled in the art based on, for example, the length of the DNA.
  • highly stringent conditions include hybridization and / or washing at higher temperatures and / or lower salt concentrations than moderately stringent conditions.
  • the hybridization conditions are 0.1 ⁇ SSC to 2 ⁇ SSC, 55 ° C.
  • Washing conditions include 0.2 ⁇ SSC to 2 ⁇ SSC, 50 ° C. to 68 ° C., more preferably 0.2 ⁇ SSC, 60 to 65 ° C.
  • the antigen may be obtained from shrimp by separating and purifying by a combination of protein purification methods well known to those skilled in the art.
  • the antigen may be obtained by expressing the antigen as a recombinant protein by a gene recombination technique well known to those skilled in the art, and separating and purifying it by a protein purification method well known to those skilled in the art.
  • Protein purification methods include, for example, methods using solubility such as salting out, solvent precipitation, methods using molecular weight differences such as dialysis, ultrafiltration, gel filtration, and SDS-PAGE, ion exchange chromatography and hydroxylation. Methods that use charge such as apatite chromatography, methods that use specific affinity such as affinity chromatography, methods that use the difference in hydrophobicity such as reversed-phase high-performance liquid chromatography, isoelectric focusing, etc. For example, a method using the difference in electric points can be used.
  • an expression vector containing a nucleic acid encoding an antigen is prepared, the expression vector is introduced into an appropriate host cell by gene transfer or transformation, and the host cell is transformed into a recombinant protein. Culturing under conditions suitable for expression and recovering the recombinant protein expressed in the host cell.
  • a “vector” is a nucleic acid that can be used to introduce a nucleic acid linked thereto into a host cell, and an “expression vector” can direct the expression of a protein encoded by the nucleic acid introduced by the vector. It is a vector. Vectors include plasmid vectors, viral vectors and the like. One skilled in the art can select an appropriate expression vector for expression of the recombinant protein depending on the type of host cell used.
  • a “host cell” is a cell that is subjected to gene transfer or transformation with a vector.
  • the host cell can be appropriately selected by those skilled in the art depending on the vector to be used.
  • the host cell can be derived from a prokaryote such as, for example, E. coli.
  • the antigen of the present invention may contain an N-terminal methionine residue to facilitate expression of the recombinant protein in the prokaryotic cell. This N-terminal methionine can also be cleaved from the recombinant protein after expression.
  • cells or silkworms derived from eukaryotes such as unicellular eukaryotes such as yeast, plant cells, animal cells (eg, human cells, monkey cells, hamster cells, rat cells, mouse cells or insect cells).
  • eukaryotes such as yeast, plant cells, animal cells (eg, human cells, monkey cells, hamster cells, rat cells, mouse cells or insect cells).
  • Gene transfer or transformation of an expression vector into a host cell can be appropriately performed by a method known to those skilled in the art.
  • those skilled in the art can express the recombinant protein by appropriately selecting conditions suitable for the expression of the recombinant protein according to the type of the host cell and culturing the host cell.
  • the host cell which expressed the recombinant protein is homogenized
  • the antigen expressed as a recombinant protein can be isolate
  • the antigen can also be prepared by introducing the expression vector or the synthesized double-stranded DNA, or mRNA transcribed therefrom, into a cell-free protein synthesis system and expressing it, and separating and purifying the expressed protein.
  • the present invention is a method for providing an index for diagnosing shrimp allergy in a subject, comprising the following steps: (I) contacting a sample obtained from a subject with an antigen, wherein the sample is a solution containing IgE antibodies; (Ii) detecting binding between the IgE antibody and the antigen in a sample obtained from the subject; (Iii) if binding of the subject IgE antibody to the antigen is detected, an indication is provided that the subject is allergic to shrimp; Wherein the antigen is at least one of the proteins identified as the antigens (1) to (11) above.
  • diagnosis generally includes simple “detection” including possibility in addition to (deterministic) diagnosis by a doctor.
  • the sample obtained from the subject is a solution containing IgE antibody collected from the subject.
  • solutions include, for example, blood, saliva, sputum, runny nose, urine, sweat, tears.
  • the sample obtained from the subject may be subjected to a pretreatment for increasing the IgE antibody concentration in the sample before contacting with the antigen.
  • Sample pretreatment may include, for example, obtaining serum or plasma from blood.
  • the Fab portion that is a binding portion with an antigen may be purified.
  • the step (i) is performed by contacting an antigen with IgE antibody in serum obtained from the subject.
  • the IgE antibody may be an IgE antibody itself or a mast cell to which the IgE antibody is bound.
  • the contact between the sample obtained from the subject and the antigen and the detection of the binding can be performed by a known method.
  • a known method for example, detection by ELISA (Enzyme-Linked Immunosorvent Assay), sandwich immunoassay, immunoblotting, immunoprecipitation, or immunochromatography can be used.
  • the target IgE antibody is brought into contact with and bound to the antigen, and an enzyme-labeled secondary antibody is allowed to act on the IgE antibody specifically bound to the antigen, whereby the enzyme substrate (usually color development or luminescence).
  • This is a technique for detecting the binding between an antigen and a target IgE antibody by adding a reagent) and detecting the product of the enzyme reaction.
  • a fluorescently labeled secondary antibody it is a method for detecting a fluorescently labeled secondary antibody.
  • detection by a measuring method capable of evaluating the binding between an antigen and an IgE antibody, such as surface plasmon resonance (SPR), can also be used.
  • SPR surface plasmon resonance
  • Plural types of antigen-specific IgE antibodies may be mixed.
  • the antigen may be in a state where the isolated antigen is immobilized on a carrier.
  • ELISA sandwich immunoassay
  • immunochromatography immunochromatography
  • surface plasmon resonance etc.
  • the sample obtained from the subject is treated with the antigen. This is done by bringing it into contact with a fixed surface.
  • An isolated antigen may be obtained from shrimp by separating and purifying by a combination of protein purification methods well known to those skilled in the art, or by preparing by genetic recombination techniques. Alternatively, an antibody may be attached.
  • the antigen may not be fixed to the carrier.
  • flow cytometry or the like can be used in the above steps (i) and (ii), and the presence of the antigen bound by the antibody can be confirmed by laser light.
  • BAT basophil activation test
  • HRT histamine release test
  • the antigen may be transferred from a state separated by two-dimensional electrophoresis and detected by immunoblotting.
  • Two-dimensional electrophoresis is a technique for separating protein samples by performing isoelectric focusing in the first dimension and SDS-PAGE in the second dimension.
  • the conditions for two-dimensional electrophoresis are not particularly limited as long as the antigens of the present invention can be separated.
  • the two-dimensional electrophoresis conditions described in the item “Identification of antigen” can be used.
  • electrophoresis conditions can be determined with reference to the descriptions in Patent Documents 1 to 4 described above, for example:
  • (A) As a first-dimension isoelectric focusing gel, the gel length is in the range of 5 to 10 cm, the pH range of the gel is 3 to 10, and the gel pH gradient with respect to the migration direction is up to pH 5. Satisfying the relationship of “a ⁇ b” and “b> c”, where a is the gel length of b, the gel length of pH 5-7 is b, and the gel length of pH 7 or higher is c;
  • (B) In the case of (A), when the total length of the gel is 1, a is in the range of 0.15 to 0.3, b is in the range of 0.4 to 0.7, and c is 0.
  • a constant voltage step is performed by applying a constant voltage having a value in the range of 100 V to 600 V for each gel containing a specimen, and the change width of electrophoresis per 30 minutes of electrophoresis is Start the voltage increasing process to increase the voltage from the constant voltage after being in the range of 5 ⁇ A;
  • the final voltage in the voltage raising step is within the range of 3000V to 6000V;
  • the gel length in the longitudinal direction of the first-dimension isoelectric focusing gel is 5 to 10 cm, and the gel concentration at the proximal end in the migration direction of the second-dimensional electrophoresis gel is 3 to 6%;
  • the gel concentration at the front end portion in the migration direction of the second-dimensional electrophoresis gel is set higher than the gel concentration at the base end portion in the migration direction;
  • Two-dimensional electrophoresis can be performed under
  • the antigens (1) to (11) above are antigens that specifically bind to IgE antibodies of patients who are allergic to shrimp. Thus, when binding of the subject IgE antibody to the antigen is detected, an indication that the subject is allergic to shrimp is provided.
  • the present invention also provides a diagnostic kit for allergy to shrimp, comprising at least one of the antigens (1) to (11).
  • the diagnostic kit of the present invention may be used in a method for providing an index for diagnosing the above-mentioned allergy to shrimp or the following diagnostic method.
  • the diagnostic kit of the present invention may contain an enzyme-labeled anti-IgE antibody and a chromogenic or luminescent substrate as a substrate of the enzyme, in addition to containing at least one of the antigens (1) to (11) above. .
  • a fluorescently labeled anti-IgE antibody may be used.
  • the antigen may be provided in a state immobilized on a carrier.
  • the diagnostic kit of the present invention may also be provided together with instructions for a procedure for diagnosis and a package containing the instructions.
  • the diagnostic kit includes a companion diagnostic agent for allergy to shrimp.
  • Companion diagnostic agents are used to identify patients who are expected to benefit from the drug, to identify patients who are at risk of serious side effects of the drug, or to examine the reactivity of the drug to optimize treatment with the drug. It is used for this purpose.
  • the optimization of treatment includes, for example, determination of dosage volume, determination of discontinuation of administration, confirmation of which allergen component is used for immune tolerance, and the like.
  • the present invention also provides a composition for diagnosing allergies to shrimp, comprising at least one of the antigens (1) to (11).
  • the diagnostic composition of the present invention can be used in the following diagnostic methods.
  • the diagnostic composition of the present invention may contain a pharmaceutically acceptable carrier or additive generally used with the antigen of the present invention, if necessary.
  • the present invention is a method for diagnosing allergy to shrimp in a subject comprising the following steps: (I) contacting a sample obtained from a subject with an antigen; (Ii) detecting binding between the IgE antibody and the antigen in a sample obtained from the subject; (Iii) If binding between the subject IgE antibody and the antigen is detected, it is determined that the subject is allergic to shrimp; Wherein the antigen is at least one of the proteins specified as the antigens (1) to (11) above.
  • steps (i) and (ii) are performed as described for each step of the method for providing an index for diagnosing allergy to shrimp.
  • the present invention provides a method for diagnosing allergy to shrimp in a subject, comprising administering to the subject at least one of the antigens (1) to (11) above.
  • the method may be performed in the form of a skin test characterized by applying an antigen to the skin.
  • the skin test after applying the diagnostic composition on the skin, the prick test and diagnostic composition were applied to observe the skin reaction by infiltrating the skin with the antigen by making a minute wound so as not to bleed. Scratch test to observe reaction by scratching skin a little, patch test to observe reaction by applying diagnostic composition such as cream or ointment to skin, and observe reaction by administering antigen intradermally Includes forms such as an intradermal test. If a skin reaction such as swelling occurs in the skin to which the antigen is applied, the subject is diagnosed as having an allergy to shrimp.
  • the amount of the antigen applied to the skin may be, for example, a dose of 100 ⁇ g or less per one time.
  • the antigen protein used for the load test may be a protein that has been expressed and purified, such as pollen rice in which rice is transformed with a cedar pollen antigen gene and the antigen protein is expressed in rice. It may be expressed in raw materials and processed products.
  • the above-described diagnostic composition and diagnostic kit can be used for prick tests, scratch tests, patch tests, intradermal tests, and the like.
  • the present invention provides at least one of the antigens (1) to (11) described above for use in diagnosis of allergy to shrimp.
  • it also includes providing at least one of the antigens (1) to (11) above mixed with a known antigen.
  • the present invention provides use of at least one of the antigens (1) to (11) in the manufacture of a composition for diagnosing allergies to shrimp.
  • composition / treatment method (1) The present invention provides a pharmaceutical composition comprising at least one of the antigens (1) to (11).
  • the pharmaceutical composition is used to treat allergies to shrimp.
  • treatment of allergy is to increase the limit amount of antigen that does not develop even if it is taken into the body, and ultimately aims at a state (remission) that does not develop with normal antigen intake. is there.
  • the present invention also provides a method for treating allergy to shrimp, comprising administering at least one of the antigens (1) to (11) to a patient in need of treatment for allergy to shrimp. .
  • the present invention provides at least one of the above antigens (1) to (11) for use in the treatment of allergy to shrimp. In still another aspect, the present invention provides use of at least one of the antigens (1) to (11) above for the manufacture of a therapeutic agent for allergy to shrimp.
  • desensitization therapy is often performed with the goal of inducing immune tolerance by administering an antigen to a patient.
  • At least one of the above antigens (1) to (11) can be used as an active ingredient for desensitization therapy against allergy to shrimp.
  • the antigen protein used for the desensitization therapy may be an expression-purified protein.
  • a pollen rice obtained by transforming a rice cedar pollen antigen gene into rice and expressing the antigen protein in rice. Thus, it may be expressed in the raw material / processed product.
  • the pharmaceutical composition of the present invention can be administered by a usual administration route.
  • Common routes of administration include, for example, oral, sublingual, transdermal, intradermal, subcutaneous, intravascular, intranasal, intramuscular, intraperitoneal, and rectal administration.
  • the pharmaceutical composition of the present invention comprises a pharmaceutically acceptable adjuvant, excipient, or various additives (for example, a stabilizer, a solubilizing agent, milk, etc.) that are generally used together with the antigen of the present invention as necessary.
  • a suspending agent, a buffering agent, a preservative, a coloring agent, etc. can be used as a pharmaceutical composition added by a conventional method.
  • the dosage form of the pharmaceutical composition can be appropriately selected by those skilled in the art depending on the administration route. For example, it may be in the form of tablets, capsules, troches, sublingual tablets, injections, intranasal sprays, poultices, solutions, creams, lotions, suppositories, and the like.
  • the dosage, frequency and / or administration period of the pharmaceutical composition of the present invention can be appropriately selected by a doctor according to the administration route, symptoms, patient characteristics such as age and weight, and the like. For example, in the case of an adult, it may be administered at a dose of 100 ⁇ g or less per dose.
  • the dosing interval may be, for example, about once a week, once a week, twice a month, or about once every three months.
  • the administration period can be, for example, several weeks to several years. It may be an administration method in which the dosage is increased stepwise within the administration period.
  • Tester composition (1) The present invention provides a tester composition comprising an antibody against at least one of the antigens (1) to (11).
  • the antibody can be prepared by a conventional method. For example, it may be prepared by immunizing a mammal such as a rabbit with the antigens (1) to (11).
  • the antibody may be an Ig antibody, a polyclonal antibody, a monoclonal antibody, or an antigen-binding fragment thereof (eg, Fab, F (ab ′) 2 , Fab ′).
  • the antibody may be provided in a form bound to a carrier.
  • the carrier is not particularly limited as long as it is a carrier that can be used for detecting the binding between the antibody and the antigen. Any carrier known to those skilled in the art can be utilized.
  • Examples of the method for examining the presence or absence of an antigen include the following methods. -The tester composition containing the prepared Ig antibody is brought into contact with the sample obtained from the raw material / processed product, etc., and the binding between the Ig antibody and the antigen in the sample is detected using, for example, ELISA, and the Ig antibody A method for determining that a target raw material / processed product contains the antigen when binding between the antigen and the antigen is detected. -A method in which raw materials and processed products are soaked in filter paper and the antibody solution is reacted so as to detect the antigen contained therein.
  • a tester composition for determining the presence or absence of an allergic antigen to shrimp in an object comprising a primer having a base sequence complementary to at least a part of the base sequence represented by 519, 540 or 548 Including things.
  • Non-limiting examples of the primer include, for example, SEQ ID NOs: 1, 44, 86, 116, 140, 145, 160, 178, 229, 275, 299, 305, 361, 380, 398, 413, 420, 454, 480, Preferably complementary to 12 residues, 15 bases, 20 bases, 25 bases of the sequence at the 3 ′ end part or the central part of at least one part of the base sequence represented by 485, 519, 540 or 548 It has a typical base sequence. In particular, when targeting mRNA, it has a complementary primer of poly A tail.
  • the tester composition comprising the above primer further comprises SEQ ID NOs: 1, 44, 86, 116, 140, 145, 160, 178, 229, 275, 299, 305, 361, 380, 398, 413, 420. 454, 480, 485, 519, 540 or a base sequence of at least one sequence of the base sequence represented by 548, preferably a base sequence consisting of 12 bases, 15 bases, 20 bases, 25 bases An included primer may be included.
  • cDNA was amplified by PCR (PolymerasemerChain Reaction) including RT-PCR (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)
  • the sequence of the cDNA is SEQ ID NO: 1, 44, 86, 116, 140, 145, 160, 178, 229, 275, 299, 305, 361, 380, 398, 413, 420, 454, 480, 485, 519, 540 or By comparing with 548, the presence or absence of the antigen is determined.
  • the method of amplification by PCR include the RACE (Rapid Amplification of cDNA End) method.
  • the amino acid sequence encoded by the cDNA is SEQ ID NO: 2, 45, 87, 117, 141, 146, 161.
  • 179, 230, 276, 300, 306, 362, 381, 399, 414, 421, 455, 481, 486, 520, 541 or 549 have an identity of 70% or more, preferably 80, 90, When it is 95, 98, 99% or more, it is determined that the antigen is present.
  • the above tester composition is used for examining the presence or absence of an antigen in an object such as a food (shrimp) or a food production line.
  • the tester composition may be used for quality inspection of production lines and pre-shipment products by the manufacturer, or for checking the presence or absence of antigens in the target raw material / processed product by the eater himself.
  • the present invention relates to the antigen of (1) to (11) above, which comprises contacting an antibody against at least one of the antigens (1) to (11) with a raw material / processed product (including a liquid). Includes a method for determining the presence or absence of a target substance.
  • the raw material may be a food material, a cosmetic raw material, a pharmaceutical raw material, or the like.
  • the processed product may be an edible processed product, and may be a cosmetic product, a pharmaceutical product, or the like.
  • the antibody a method for producing the antibody, a method for bringing the antibody into contact with the raw material / processed product, a binding between the antibody and the antigen, and the like are as described above in “Tester composition (1)”.
  • the present invention provides a shrimp or a shrimp processed product, wherein at least one of the antigens (1) to (11) is removed or reduced.
  • the method for removing or reducing the antigen of the present invention in shrimp or shrimp processed products is not limited.
  • the removal or reduction of the antigen may be performed by any method as long as the antigen of the present invention is removed or reduced.
  • shrimp in which the expression of the antigen of the present invention has been modified may be prepared using a gene modification technique.
  • any technique known to those skilled in the art can be used.
  • Oishi, et al. (Scientific Reports, Vol.6, Article number: 23980, 2016, doi: 10.1038 / srep23980) applies CRISPER / Cas9, a genome editing technology, to primordial germ cells in chickens. It describes obtaining genetically deleted individuals.
  • Shrimp from which the antigen of the present invention has been removed may be obtained using a similar technique.
  • shrimp with reduced antigens of the present invention may be obtained by mating by artificial insemination with shrimp that does not contain or contain little antigen.
  • Artificial mating of shrimp is carried out by the National Fisheries Research and Education Agency, National Institute of Fisheries Science and Technology (“Maturation of Eggs, Oviposition and Egg Collection Technology” (Takuji Okumura and Katsuki Mito), Aichi Prefectural Fisheries Promotion Fund, 2014) Etc., and can be carried out by conventional methods.
  • the processed shrimp from which the antigen of the present invention has been removed or reduced may be a processed product made from shrimp from which the antigen of the present invention has been removed or reduced.
  • a treatment for removing or reducing the antigen of the present invention is performed before or after the preparation of a shrimp processed product.
  • protein components in raw materials and processed products such as high-pressure treatment and elution with a neutral salt solution, and high-temperature steam are removed.
  • the present invention relates to a method for producing shrimp or a shrimp processed product from which antigen has been removed or reduced, comprising the step of confirming that the antigen has been removed or reduced in the process of manufacturing the processed product, wherein Provided is the production method, wherein the antigen is at least one of the antigens (1) to (11).
  • the step of confirming that the antigen has been removed or reduced during the production of the shrimp or processed shrimp product from which the antigen has been removed or reduced is carried out by the method described in the above item “Tester (1)”. You may carry out by checking the presence or absence.
  • Antigen Epitope For the antigen and arginine kinase specified as shown in Example 1-3, as shown in Example 4, the epitope and amino acids important for binding to IgE antibodies of allergic patients within the epitope Identified.
  • the present invention includes, or consists of, each amino acid sequence of SEQ ID NOs: 558 to 984 shown in Table 3 below as a polypeptide containing an amino acid sequence that specifically binds to an IgE antibody of an allergic patient.
  • SEQ ID NOs: 558 to 984 shown in Table 3 below as a polypeptide containing an amino acid sequence that specifically binds to an IgE antibody of an allergic patient.
  • To (E50) are provided.
  • Each of (E1) to (E50) is an amino acid sequence that binds to an IgE antibody derived from the protein described in “Derivation” in Table 3 (hereinafter sometimes referred to as “epitope”).
  • the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) may be prepared by a chemical synthesis method such as solid phase synthesis of the peptide.
  • a polypeptide containing an epitope may be obtained by expressing it as a recombinant polypeptide by a gene recombination technique well known to those skilled in the art, and separating and producing it by a protein production method well known to those skilled in the art.
  • Polypeptides may be linked in combination of two or more, or may be those in which one epitope is linked repeatedly. In that case, generally, the binding property with the Ig antibody is improved.
  • the length of the polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) is not particularly limited.
  • the length of the polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) is 500 amino acids or less, 300 amino acids or less, 200 amino acids or less, 100 amino acids or less, 50 amino acids or less, 30 amino acids or less, 20 amino acids.
  • it may be 15 amino acids or less, 10 amino acids or less, or 5 amino acids or less.
  • the length of the amino acid sequence portion is 1000 amino acids or less, It may be 750 amino acids or less, 500 amino acids or less, 250 amino acids or less, 100 amino acids or less, 75 amino acids or less, 50 amino acids or less, 30 amino acids or less, 15 amino acids or less, 10 amino acids or less, or 5 amino acids or less.
  • the number of amino acid residues described in a preferred embodiment as the length of the polypeptide is the total length of the sequences before and after the spacer (excluding the spacer).
  • SEQ ID NOs: 558 to 984 described in Table 3 SEQ ID NOs: 558, 566, 582, 586, 594, 599, 614, 624, 634, 640, 654 described in “Common 15 residue sequences” in Table 3 , 671, 672, 678, 681, 686, 691, 697, 704, 705, 708, 717, 725, 729, 741, 750, 752, 765, 770, 778, 788, 793, 810, 817, 826, 833 , 847, 858, 865, 879, 881, 892, 908, 912, 915, 917, 928, 935, 939, and 943, (E1)-(E50 ) Common 15 amino acids identified as epitopes that bind to IgE antibodies at each epitope It is a residue sequence.
  • the present invention is a polypeptide comprising or consisting of these amino acid sequences.
  • the epitope sequence contained in the polypeptide of the present invention can be the entire common epitope 15 amino acid residues or a part thereof.
  • Epitope sequence is 4 amino acid residues or more, 5 amino acid residues or more, 6 amino acid residues or more, 7 amino acid residues or more, 8 amino acid residues or more, 9 amino acid residues or more, 10 amino acid residues or more, 11 amino acid residues These are 12 amino acid residues or more, 13 amino acid residues or more, or 14 amino acid residues or more.
  • a polypeptide consisting of 4 amino acid residues for example, SEQ ID NOs: 587, 593, 595, 636, 655, 662, 663, 679, 707, 726, 727, 794, 880, etc.
  • SEQ ID NOs: 587, 593, 595, 636, 655, 662, 663, 679, 707, 726, 727, 794, 880, etc. was confirmed. Furthermore, epitope cross-reactivity was confirmed in many cases of 5 amino acid residues or more. Therefore, if at least 4 amino acid residues are present, it is useful as an epitope sequence for detecting cross-reactivity with various antigens.
  • SEQ ID NOs: 558 to 984 “a common 15 residue sequence”, ie, SEQ ID NOs: 558, 566, 582, 586, 594, 599, 614, 624, 634, 640, 654, 671, 672, 678, 681 , 686, 691, 697, 704, 705, 708, 717, 725, 729, 741, 750, 752, 765, 770, 778, 788, 793, 810, 817, 826, 833, 847, 858, 865, 879 , 881, 892, 908, 912, 915, 917, 928, 935, 939 and 943, polypeptides comprising these amino acid sequences or consisting of these amino acid sequences are also included in the present invention.
  • the “preferred” sequence is a shorter partial sequence that can function as an epitope in the “common 15-residue sequence”.
  • a “key” sequence refers to a sequence that appears to be particularly important among “common 15 residue sequences” or “key” sequences.
  • the amino acid sequence indicated by “X” is binding to IgE antibody even if it is changed to any alanine (glycine when the original amino acid residue is alanine) by alanine glycine scanning. Is an amino acid residue that has been confirmed to remain.
  • X is any amino acid residue, preferably alanine (or glycine).
  • an amino acid residue that was confirmed to remain binding to IgE antibody by alanine glycine scan was not found. Is the case.
  • amino acid residue represented by X in SEQ ID NOs: 560, 562, 564, and 565 was confirmed to remain binding to IgE antibody even if it was changed It is. Therefore, in SEQ ID NOs: 558 to 565, one or more amino acid residues corresponding to the 4, 5, 7, 8, 10, 11, 12, 13, 14, 15th amino acid residues of SEQ ID NO: 558 are arbitrary.
  • the amino acid residue may be substituted.
  • one or a plurality of amino acid residues represented by X in the “key sequence” corresponding to each “preferred sequence” may be substituted with any amino acid residue. .
  • the corresponding key sequence in SEQ ID NO: 559 which is a preferred sequence, is SEQ ID NO: 560.
  • the 2, 6, 7, 8, 9th amino acid residues which are X in SEQ ID NO: 560 (the 8, 12, 13, 14, 15th amino acid residues of SEQ ID NO: 558) Is an amino acid residue that can be optionally substituted.
  • the corresponding key sequence in SEQ ID NO: 563 is a preferred sequence is SEQ ID NO: 564.
  • amino acid residues 1, 2, 4, 5, 7, and 8 that are X in SEQ ID NO: 564 are amino acid residues that can be optionally substituted.
  • amino acid residues 1, 2, 4, 5, 7, and 8 that are X in SEQ ID NO: 564 are amino acid residues that can be optionally substituted.
  • the number of amino acid residues that may be substituted is not limited, and is preferably 6 or less, 5 or less, 4 or less, 3 or less, 2 or less, or 1 or less.
  • Table 1 summarizes information on the epitopes (E1)-(E50).
  • the polypeptide of the present invention includes a polypeptide comprising or consisting of these amino acid sequences.
  • the IgE antibody in the serum of each allergic patient is 1.05 times or more, 1.10 times or more, 1.15 times higher than the IgE antibody in the serum of non-allergic subjects against the polypeptide of the present invention. It exhibits a binding property that is twice or more, 1.20 times or more, or 1.25 times or more.
  • polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1) to (E50) includes a polypeptide comprising or consisting of each amino acid sequence of SEQ ID NOs: 558 to 984, as described above. Any embodiment in which amino acid residues are substituted is included. “Including each amino acid sequence of SEQ ID NO: 558-984” means binding of each amino acid sequence of SEQ ID NO: 558-984 (including the above-mentioned substituted embodiments) to an IgE antibody (ie, as these epitopes) It means that any other amino acid sequence may be included as long as it does not affect the function).
  • the present invention provides a method for providing an index for diagnosing an allergy in a subject, comprising the following steps: (I) contacting a sample obtained from a subject with an antigen, wherein the sample is a solution containing IgE antibodies; (Ii) detecting binding between the IgE antibody and the antigen in a sample obtained from the subject; (Iii) if binding of the subject IgE antibody to the antigen is detected, an indication is provided that the subject is allergic; Wherein the antigen is a polypeptide that is at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50), or a polypeptide comprising two or more amino acid sequences of (E1)-(E50). The above method is provided wherein the peptide is a polypeptide linked via or without a spacer.
  • polypeptide that is at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) above, or a polypeptide comprising two or more amino acid sequences of (E1)-(E50) described above via a spacer
  • the polypeptide linked without intervention may be referred to as “antigen containing (E1)-(E50)” in the present specification.
  • the type of spacer is not particularly limited, and spacers commonly used by those skilled in the art for linking a plurality of peptides can be used.
  • the spacer may be, for example, a polypeptide such as a hydrocarbon chain such as Acp (6) -OH or an amino acid chain.
  • the number of polypeptides to be linked is not particularly limited. In one embodiment, the number is 2 or more, 3 or more, 4 or more, 5 or more, 6 or more, 8 or more, 10 or more, 15 or more. In one aspect, 30 or less, 20 or less. 15 or less. 10 or less, 8 or less, 6 or less, 5 or less, 3 or less, 2 or less.
  • polypeptides containing the amino acid sequences (E1) to (E50) above the same one may be repeated or a plurality of different ones may be linked. Thus, even when a plurality of polypeptides containing the amino acid sequences (E1) to (E50) are linked, the polypeptide of the present invention can be applied to the method, kit, and composition of the present invention.
  • the sample obtained from the subject is as described in the above item “Diagnostic kit / diagnostic method (1)”.
  • Detection of the contact between the sample obtained from the subject and the polypeptide and the binding thereof can be performed by a known method described in the above item “Diagnostic Kit / Diagnostic Method (1)”, for example, ELISA (Enzyme-Linked Immunosorvent Assay). , Sandwich immunoassay, immunoblotting, immunoprecipitation, immunochromatography, and the like.
  • the polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) may be in a state of being immobilized on a carrier.
  • ELISA sandwich immunoassay, immunochromatography, surface plasmon resonance, etc.
  • the sample obtained from the subject is subjected to the above (E1).
  • -It is carried out by bringing the polypeptide comprising the amino acid sequence of (E50) into contact with the fixed surface.
  • the target IgE antibody may be immobilized on a carrier, and the binding to the polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) may be detected by the above-described method.
  • a tag such as a spacer or biotin may be attached to the N-terminus or C-terminus of the polypeptide for binding to the carrier, for providing a space with the carrier, or for facilitating contact of the antibody with the polypeptide.
  • the carrier preferably has avidin.
  • the polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) may not be immobilized on a carrier.
  • flow cytometry or the like can be used in the above steps (i) and (ii), and the presence of the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) to which the IgE antibody is bound by laser light is confirmed. it can.
  • This method is, for example, a method for detecting a surface antigen CD203c that appears when a basophil is activated by contact with a polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) described above. BAT). Further, there is a histamine release test (HRT) for examining whether or not histamine is released by further contacting a polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) with a blood cell in a sample.
  • HRT histamine release test
  • the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) is an antigen that specifically binds to an IgE antibody of an allergic patient. Therefore, when the binding between the subject IgE antibody and the antigen is detected, an indication that the subject is allergic is provided, including cross-linking.
  • sequences may be added before and after the epitope to increase the sequence length. In such a case, if the binding between the IgE antibody of interest and the amino acid sequence of (E1)-(E50) is detected, an indication that the subject is allergic, including crossover properties, is provided. Therefore, anything may be added before and after the amino acid sequence of the above (E1)-(E50) which is an epitope.
  • the present invention also provides an allergy diagnostic kit comprising at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequences (E1) to (E50).
  • the diagnostic kit of the present invention may be used in a method for providing an index for diagnosing the above-mentioned allergy or the following diagnostic method.
  • the diagnostic kit of the present invention comprises at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequences (E1) to (E50) above, an enzyme-labeled anti-IgE antibody, and a chromogenic substrate or luminescent substrate serving as a substrate for the enzyme. May be included. Alternatively, a fluorescently labeled anti-IgE antibody may be used.
  • the polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) may be provided in a state immobilized on a carrier.
  • the diagnostic kit of the present invention may also be provided together with instructions for a procedure for diagnosis and a package containing the instructions.
  • the diagnostic kit includes a companion diagnostic for allergies.
  • Companion diagnostic agents are used to identify patients who are expected to benefit from the drug, to identify patients who are at risk of serious side effects of the drug, or to examine the reactivity of the drug to optimize treatment with the drug. It is used for this purpose.
  • the optimization of treatment includes, for example, determination of dosage volume, determination of discontinuation of administration, confirmation of which allergen component is used for immune tolerance, and the like.
  • the present invention also provides a composition for diagnosing allergy comprising at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequences (E1) to (E50).
  • the diagnostic composition of the present invention can be used in the following diagnostic methods.
  • the diagnostic composition of the present invention may contain a pharmaceutically acceptable carrier or additive generally used with the polypeptide of the present invention, if necessary.
  • the invention is a method of diagnosing an allergy in a subject comprising the following steps: (I) contacting a sample obtained from a subject with an antigen; (Ii) detecting binding between the IgE antibody and the antigen in a sample obtained from the subject; (Iii) If binding between the subject IgE antibody and the antigen is detected, it is determined that the subject is allergic; Wherein the antigen is at least one polypeptide identified as a polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) above.
  • steps (i) and (ii) are performed as described for each step of the method for providing an index for diagnosing allergy.
  • the present invention relates to a method for diagnosing allergy in a subject, which comprises administering to the subject at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) above.
  • the method may be performed in the form of a skin test characterized by applying a polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) to the skin.
  • the skin containing the amino acid sequence (E1)-(E50) is penetrated into the skin by making a slight scratch so as not to bleed.
  • a prick test for observing the reaction a scratch test for observing the reaction by scratching the skin a little after applying the diagnostic composition
  • examples include a test, an intradermal test in which a polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) is administered intradermally and the reaction is observed, and the like.
  • the amount of the polypeptide applied to the skin may be, for example, a dose of 100 ⁇ g or less per one time.
  • the polypeptide used for the oral challenge test may be an expression-purified polypeptide, for example, a pollen rice obtained by transforming a rice cedar pollen antigen gene into rice and expressing the polypeptide in rice. Thus, it may be expressed in the raw material / processed product.
  • the above-described diagnostic composition and diagnostic kit can be used for prick tests, scratch tests, patch tests, intradermal tests, and the like.
  • the present invention provides at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequences (E1) to (E50) described above for use in diagnosis of allergy.
  • the present invention provides the use of at least one polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) above in the manufacture of a diagnostic agent for allergy.
  • the allergy to be diagnosed may be an allergy to a polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) above. That is, the diagnosis of allergy including detection of allergy and provision of a diagnostic index diagnoses allergy including not only allergy to a polypeptide containing the single amino acid sequence of (E1)-(E50) but also cross-ability. Can be a thing.
  • composition / treatment method (2) The present invention provides a pharmaceutical composition comprising at least one polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50).
  • the above pharmaceutical composition is used to treat allergies.
  • the treatment of allergy is to increase the limit amount of a polypeptide that does not develop even if it is taken into the body, and ultimately aims at a state (remission) that does not develop with a normal polypeptide intake.
  • the present invention also provides a method for treating allergy, comprising administering at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequences (E1) to (E50) to a patient in need of treatment for allergy. To do.
  • the present invention provides at least one polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) above for use in the treatment of allergy. In yet another aspect, the present invention provides at least one use of a polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) above for the manufacture of a therapeutic agent for allergy.
  • desensitization therapy is often performed with the goal of inducing immune tolerance by administering an antigen to a patient.
  • At least one of the polypeptides containing the amino acid sequences (E1) to (E50) can be used as an active ingredient for desensitization therapy for allergy.
  • the antigen used for the desensitization therapy may be an expression-purified polypeptide, for example, an antigen expressed in a raw material / processed product such as pollen rice.
  • the above-mentioned “Pharmaceutical composition / treatment method (1)” is used. It may be as described in the item.
  • the dose in the case of using the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) may be, for example, 100 ⁇ g or less per dose in the case of an adult.
  • the allergy to be treated may be an allergy to a polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) above. That is, the treatment of allergy can treat not only allergy to a polypeptide containing a single amino acid sequence of the above (E1)-(E50), but also allergy including crossing.
  • Tester composition (2) The present invention provides a tester composition comprising an antibody against at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequences (E1) to (E50).
  • the antibody can be prepared by a conventional method. For example, it may be produced by immunizing a mammal such as a rabbit with a polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50).
  • the antibody may be an Ig antibody, a polyclonal antibody, a monoclonal antibody, or an antigen-binding fragment thereof (eg, Fab, F (ab ′) 2 , Fab ′).
  • the antibody may be provided in a form bound to a carrier.
  • the carrier is not particularly limited as long as it is a carrier that can be used for detecting the binding between the antibody and the polypeptide comprising the amino acid sequence (E1)-(E50). Any carrier known to those skilled in the art can be utilized.
  • an antibody against a polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) is an antibody against a polypeptide having the same amino acid sequence as the epitope described in the item “Epitope of antigen” and the important amino acid. Preferably there is. Thereby, it can be set as the tester composition which can be detected including a crossing property.
  • Examples of the method for examining the presence or absence of the polypeptide containing the amino acid sequence (E1) to (E50) include the following methods.
  • -A tester composition containing the prepared antibody is brought into contact with a sample obtained from a raw material / processed product, etc., and the amino acid sequence containing the antibody and the above (E1)-(E50) in the sample using, for example, ELISA
  • the amino acid sequence of the target raw material / processed product is detected.
  • the method of judging that the polypeptide containing is contained. (In the “method for examining the presence or absence of polypeptide”, the polypeptide is removed or reduced when the binding between the antibody and the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) is decreased.
  • the amino acid sequence of (E1)-(E50) above for allergy in a subject comprising a primer corresponding to a polypeptide whose epitope and important amino acid have the same amino acid sequence
  • the primer may be designed to include, for example, a part of the base sequence of the nucleic acid encoding the amino acid sequence specified in (E1) to (E50) or a complementary strand thereof. .
  • the primer is a nucleic acid encoding a protein comprising a polypeptide having the same amino acid sequence as the epitope that is the amino acid sequence specified in (E1) to (E50) above, and the epitope and the important amino acid.
  • Examples of such a primer include SEQ ID NOs: 1, 44, 86, 116, 140, 145, 160, 178, 229, 275, 299, 305, 361, 380, 398, 413, 420, 454, 480, 485, 519.
  • the position of the epitope in the full length sequence of the antigen is as specified in Table 3 of Example 4 below.
  • DNA or mRNA obtained from a sample is used as a template, the primer is used, DNA is amplified by PCR (Polymerase Chain Reaction) including RT-PCR, and the amplified DNA sequence (E1)-( By determining whether or not the nucleic acid encoding the amino acid sequence specified in E50) is included, the presence or absence of the antigen including (E1) to (E50) is determined.
  • PCR Polymerase Chain Reaction
  • E1-(E50) By determining whether or not the nucleic acid encoding the amino acid sequence specified in E50) is included, the presence or absence of the antigen including (E1) to (E50) is determined.
  • Examples of a method for amplifying mRNA by PCR include the RACE method. When one of the amino acid sequences encoded by the three possible open reading frames in the amplified DNA contains the amino acid sequence specified in the above (E1)-(E50), it is determined that it has an antigen. If the DNA is not amplified, it is determined that
  • the above tester composition is used for examining the presence or absence of a polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) in an object such as a raw material or a processed product production line.
  • the raw materials may be food materials, cosmetic raw materials, pharmaceutical raw materials and the like.
  • the processed product may be an edible processed product, and may be a cosmetic product, a pharmaceutical product, or the like.
  • the tester composition may be used for searching for biological species contained as a raw material, or may be used for quality inspection of a production line by a manufacturer and a product before shipment. It may be used for checking whether the processed product contains an antigen.
  • the present invention includes a method for determining the presence or absence of a polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) in a raw material / processed product.
  • the method includes detecting a polypeptide having the whole or part of the amino acid sequence of the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) in the raw material / processed product.
  • the method of the present invention comprises contacting an antibody against at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) with a raw material / processed product (including a liquid). Determining the presence or absence of the polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1) to (E50) in the target substance.
  • the method for determining the presence or absence of the antigen includes an embodiment in which an epitope portion of a polypeptide containing the amino acid sequence (E1)-(E50) contained in the antigen is detected.
  • the “epept portion” is preferably 4 amino acid residues or more, 6 amino acid residues or more, or 8 amino acid residues or more.
  • the detection of the part of the epitope can be performed by a known method for detecting a specific amino acid sequence of a part of the polypeptide. For example, whether or not the peak of any epitope peptide has been reduced by the antigen removal treatment by cleaving the protein of the target raw material / processed product (eg food) with a digestive enzyme for antigen removal treatment and separating it with HPLC etc.
  • the method etc. which measure can be considered.
  • an antibody that recognizes a portion of the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) in the target substance of the antigen containing the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) The presence or absence may be determined.
  • Allergen removal raw materials (2) The present invention provides a raw material or processed product in which at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequences (E1) to (E50) is removed or reduced.
  • the method for removing or reducing the antigen of the present invention in the raw material or processed product is not limited.
  • the removal or reduction of the antigen may be performed by any method as long as the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) is removed or reduced.
  • the described technique may be used.
  • the removal or reduction of at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) above may be achieved by removing or reducing the entire amino acid sequence, or from the antigen protein.
  • the amino acid sequence portion of (E1)-(E50) may be cleaved or removed. “Removed” includes deletion and modification of all or part of the sequence portion specified in (E1)-(E50) above.
  • the raw material from which the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) is removed or reduced is expressed using the gene modification technique to express the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50). You may prepare the raw material which is no longer damaged.
  • the genetic modification knockout technique any technique known to those skilled in the art can be used.
  • the processed product from which the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) is removed or reduced has the amino acid sequence of (E1)-(E50) as in the case of powdered milk using a protein digest as a raw material. It may be a processed product using a raw material from which the polypeptide contained is removed or reduced. When ordinary raw materials are used, a treatment for removing or reducing the polypeptide containing the amino acid sequence (E1) to (E50) is performed before, during or after the preparation of the processed product. “Preparation of processed product” means preparation of a processed food product (eg, shrimp processed product such as fried shrimp) from, for example, a food raw material (eg shrimp).
  • a processed food product eg, shrimp processed product such as fried shrimp
  • the method described in the above item “Allergen-removed foods” may be used.
  • the method for cleaving the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) include a method of cleaving with a specific digestive enzyme.
  • the present invention relates to a method for producing a processed product from which at least one of the polypeptides comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50) has been removed or reduced, wherein the antigen is removed or reduced in the process of producing the processed product.
  • the manufacturing method including the step of confirming that
  • the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) is removed or reduced means that the polypeptide containing the amino acid sequence of (E1)-(E50) (E1)-(E50) It means that at least one of the peptides has been removed or reduced, or the sequence portion specified by (E1)-(E50) above has been cleaved or removed from the antigen.
  • the method for confirming that the polypeptide is removed or reduced during the manufacturing process of the processed product is not particularly limited, and at least one of the polypeptides containing the amino acid sequences (E1) to (E50) can be detected. Any method may be used. For example, due to the binding between a sample containing a material produced during the manufacturing process of the processed product and an antibody against at least one of the polypeptides containing the amino acid sequences (E1) to (E50), the poly The presence or absence of the peptide may be confirmed. Details of such a method are as described in the above item “Diagnostic Kit / Diagnostic Method (2)”.
  • the “target IgE antibody” in the item “diagnostic kit / diagnostic method (2)” is defined as “at least one polypeptide comprising the amino acid sequence of (E1)-(E50)”.
  • “Antibody” and “antigen” and “polypeptide” in the above item “diagnostic kit / diagnostic method (2)” are replaced with “sample containing materials generated during the manufacturing process of processed products” and “diagnosis kit / diagnostic”
  • the method described in the item “Method (2)” can be used to confirm that the antigen is removed or reduced in the process of manufacturing the processed product.
  • the tester composition described in the item “Tester composition (2)” can also be used.
  • Example 1 Confirmation of protein pattern Using the following two-dimensional electrophoresis method, proteins contained in shrimp (Banamei shrimp, black tiger shrimp and prawn) were examined.
  • precipitation was performed twice using a 2D-CleanUP kit (manufactured by GE).
  • TCA trichloroacetic acid
  • TCA precipitation was recovered.
  • acetone was added to the recovered TCA precipitate to perform precipitation, and the precipitate (specimen) obtained by the operation was recovered.
  • GE DeStreak Rehydration Solution
  • GE DeStreak Rehydration Solution
  • a specimen solution for second-order isoelectric focusing (swelling specimen solution) was used.
  • DeStreak Rehyd The composition of ration Solution is as follows. 7M thiourea 2M urea 4% (w / v) CHAPS 0.5% (v / v) IPG buffer; appropriate amount of BPB (bromophenol blue) manufactured by GE
  • First-order isoelectric focusing of the first-dimension isoelectric focusing gel The first-dimension isoelectric focusing gel (GE: IPG gel Immobiline Drystrip (pH 3-10NL)) described above
  • the sample solution for electrophoresis was immersed in 140 ⁇ l and allowed to permeate overnight at room temperature.
  • IPGphor manufactured by GE was used as an electrophoresis apparatus.
  • the electrophoresis tray was filled with silicon oil.
  • a filter paper moistened with water was provided at both ends of the gel infiltrated with the specimen, and the gel was set on an electrophoresis tray so as to be covered with silicone oil, and an electrode was set with the filter paper sandwiched between the gel and the gel.
  • the upper limit of the current value of the isoelectric focusing device is set to 75 ⁇ A per gel, and the voltage program is set to (1) a constant voltage step to 750 Vhr at a constant voltage of 300 V (current for 30 minutes before the end of the step) (2) The voltage was gradually increased to 1000V over 300Vhr), (3) the voltage was gradually increased to 5000V over 4500Vhr, and (4) the total Vhr at a constant voltage of 5000V. The first-dimension isoelectric focusing was performed until the value reached 12000.
  • the composition of the equilibration buffer containing the alkylating agent is as follows. 100 mM Tris-HCl (pH 8.0) 6M urea 30% (v / v) glycerol 2% (w / v) SDS 2.5% (w / v) iodoacetamide
  • Second dimension SDS-PAGE In this example, XCell SureLock Mini-Cell manufactured by life technologies was used as an electrophoresis apparatus. As the gel for the second dimension electrophoresis, NuPAGE 4-12% Bis-Tris Gels manufactured by life technologies was used. In addition, an electrophoresis buffer having the following composition was prepared and used. 50 mM MOPS 50 mM Tris base 0.1% (w / v) SDS 1 mM EDTA
  • an agarose solution for adhesion in which 0.5% (w / v) agarose S (manufactured by Nippon Gene) and an appropriate amount of BPB (bromophenol blue) were dissolved in the electrophoresis buffer was used.
  • the sealed container to be used was thoroughly washed with 98% (v / v) ethanol in advance.
  • Remove the gel for the second dimensional electrophoresis after electrophoresis from the SDS-PAGE instrument, place it in a washed sealed container, and immerse it in an aqueous solution containing 50% (v / v) methanol and 7% (v / v) acetic acid for 30 minutes was performed twice. Thereafter, the aqueous solution was replaced with water and immersed for 10 minutes.
  • the 2D gel was immersed in 40 ml of SYPRO Ruby and shaken overnight at room temperature.
  • Example 2 Confirmation of antigen by immunoblot Antigen confirmation by immunoblot was carried out by performing the procedure described in Example 1 for “Baname shrimp”, “Black tiger” and “Kuruma shrimp” until “second-dimensional SDS-PAGE”. Were performed by performing the operations of “transfer to membrane”, “immunoblot” and “analysis”.
  • Transfer to the membrane Transfer to the membrane was performed using the following transfer device and transfer buffer.
  • Transcriptor XCell SureLock Mini-Cell and XCell II Blot Module (life technologies)
  • Transfer buffer NuPAGE transfer buffer (x20) (life technologies) was diluted 20 times with milliQ water and used.
  • the protein in the two-dimensional electrophoresis gel was transferred to a membrane (PVDF membrane) according to the following procedure.
  • the PVDF membrane was dipped in 100% methanol, then dipped in milliQ water, then transferred to a transfer buffer solution, and the PVDF membrane was hydrophilized.
  • Immunoblotting of the immunoblot membrane was performed using sera from patients with allergy to shrimp or sera from non-shrimp allergic subjects as the primary antibody.
  • the immunoblotting of the membrane was performed according to the following procedure.
  • (1) The transferred membrane was shaken in a 5% skim milk / PBST solution (PBS buffer containing 0.1% of the nonionic surfactant Tween 20) at room temperature for 1 hour.
  • (2) The primary antibody was allowed to stand at room temperature for 1 hour in a 5% serum / 5% skim milk / PBST solution.
  • Anti-human IgE-HRP horsedish peroxidase
  • (6) The mixture was allowed to stand for 5 minutes with Pierce Western Blotting Substrate Plus (manufactured by Thermo).
  • the molecular weight and isoelectric point of the 11 spots are as follows (FIGS. 2, 4, and 6).
  • Spot 1 molecular weight 100-200 kDa
  • Spot 2 molecular weight 60-130 kDa
  • Spot 3 molecular weight 100-200 kDa
  • Spot 4 molecular weight 60-130 kDa, pI 5.5-9.0
  • Spot 5 molecular weight 80-130 kDa
  • Spot 6 molecular weight 60-90 kDa
  • Spot 7 molecular weight 55-70 kDa
  • Spot 8 molecular weight 45-70 kDa
  • 9 molecular weight 50-60 kDa
  • Spot 10 molecular weight 20-40
  • Example 3 Mass Spectrometry and Identification of Antigen The amino acid sequence was identified by mass spectrometry for the antigen that produced the above three spots.
  • each spot mass data obtained from the mass spectrometer was analyzed by NCBI, and each spot was identified as the following protein.
  • troponin I (NCBI protein accession number AFW99839.1, GenBank DNA accession number JX683730.1) (amino acid sequence: SEQ ID NO: 520, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 519)
  • NCBI protein accession number AFW99839.1 was a hit. From this, it was shown that a homolog of troponin I exists in black tiger and tiger shrimp, and it becomes an antigen of shrimp allergy.
  • NCBI protein accession AEP83534.1 GenBank DNA accession number JN546074.1 (amino acid sequence: SEQ ID NO: 541, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 540)
  • cyclophilin A derived from black tiger NCBI protein accession AGS46493.1, GenBank DNA accession number KF214635.1
  • amino acid sequence: SEQ ID NO: 549, base sequence encoding it: SEQ ID NO: 548
  • NCBI protein accession AEP83534.1 was a hit. From this, it was shown that a homologue of cyclophilin A exists in the prawn, which is an antigen of shrimp allergy.
  • Example 4 Epitope identification Epitope of shrimp allergen component The epitope was identified for the shrimp allergen component by the following procedure.
  • Epitope mapping was performed using a library of overlapping peptides (length: 15 amino acids) corresponding to the amino acid sequence identified as the allergic component of shrimp and the amino acid sequence of arginine kinase. Specifically, SEQ ID NOs: 117, 141, 146, 2, 45, 87, 276, 161, 230, 179, 362, 381, 399, 421, 455, 481, 486, 520, 541, 300, 306 and arginine A library of overlapping peptides was prepared based on the amino acid sequence of the kinase.
  • Each peptide to be synthesized was shifted by 10 amino acids. That is, each peptide has a 5 amino acid overlap with the previous and subsequent peptides.
  • Intavis® CelluSpots TM technology was used for peptide array preparation. That is, the following procedure: (1) The target peptide is synthesized on an amino-modified cellulose disk using an automated synthesizer (Intavis® MultiPep® RS), and (2) the amino-modified cellulose disk is dissolved to obtain a cellulose-binding peptide solution. (3) A peptide array was prepared by spotting the cellulose-binding peptide on a glass slide coated. Details of each procedure are as follows.
  • Peptide synthesis was performed stepwise using 9-fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) chemical reaction on an amino-modified cellulose disk in a 384-well synthesis plate. That is, an amino acid in which an Fmoc group is bonded to an amino group is activated with a solution of N, N′-diisopropylcarbodiimide (DIC) and 1-hydroxybenzotriazole (HOBt) in dimethylformamide (DMF) and added dropwise to the cellulose disk.
  • Fmoc 9-fluorenylmethoxycarbonyl
  • the Fmoc group-bound amino acid is coupled to the amino group on the cellulose disk (coupling), the unreacted amino group is capped with acetic anhydride, washed with DMF, further treated with piperidine and washed with DMF, The Fmoc group was removed from the amino group of the amino acid bonded to the amino group on the cellulose disk.
  • Peptide synthesis was performed by extending the amino terminus of the amino acid bound to the amino group on the cellulose disk by repeating the above coupling, capping, and removal of the Fmoc group.
  • Anti-human IgE antibody-HRP (1: 20,000, Pierce Protein-Free (PBS) Blocking Buffer (manufactured by Thermo) was added and shaken at room temperature for 1 hour.
  • the amount of chemiluminescence was quantified using ImageQuant TM TL (GE Healthcare). Obtained from the results of using the serum of 37 patients, with the second highest value among the values obtained from the images obtained from the results of using the serum of 5 non-shrimp allergic subjects. A peptide having a value of 35,000 or more in the value obtained by taking the difference between the N2nd values of the peptides from the values quantified from the obtained images was judged to be a peptide specifically bound to the IgE antibody.
  • Each peptide to be synthesized was shifted by one amino acid. That is, each peptide has a 9 amino acid overlap with the previous and subsequent peptides.
  • the library was prepared by the same procedure as in the above (A), and whether or not IgE antibody in the patient's serum was bound was measured for each peptide fragment by the same method as described above. (3)
  • Each of the values obtained from the results obtained by performing only (1) and (4) to (6) described in the column of the spot of the cellulose-binding peptide solution is used as a control value.
  • one amino acid at a time Peptides that lost or markedly reduced the patient's binding to IgE antibody due to the shifted peptide were judged to be peptides without IgE antibody binding.
  • the amount of chemiluminescence was quantified with respect to the image obtained by measurement. It was digitized from the image obtained from the results (secondary antibody measurement values) when only (1), (4) to (6) described in the column of (3) cellulose-binding peptide solution were performed.
  • the sequence (SEQ ID NO: 558, 566, 582, 586, 594, 599, 614, 624, 634, 640, 654, 671, 672, 678, 681, 686, 691, 697, 704, 705, 708, 717, 725, 729, 741, 750, 752, 765, 770, 778, 788, 793, 810, 817, 826, 833, 847, 858, 865, 879, 881, 8 2, 908, 912, 915, 917, 928, 935, 939 and 943), when the value obtained is 100%, less than 30% has no binding with IgE antibody, and 30% or more but less than 50% is IgE.
  • the binding property with an antibody is inferior, the binding property with an IgE antibody is 50% or more and less than 70%, the binding property with an IgE antibody is somewhat inferior, but the binding property with an IgE antibody is 70% or more. As a result, it was determined that the peptide remained binding to IgE antibody.
  • alanine the original amino acid is changed from the amino terminal side
  • alanine glycine scan a technique called alanine glycine scan
  • a library of peptide fragments substituted with glycine in the case of alanine is prepared by the same method as described above, and whether or not IgE antibody in the patient's serum binds by the same method as described above is measured for each peptide fragment did.
  • amino acid at the position where the binding to the IgE antibody of the patient is lost or markedly reduced by alanine glycine substitution is determined to be an amino acid important for the original antigenic expression or an amino acid affecting the original antigenic expression.
  • Amino acids whose patient's binding to IgE antibody was not lost or significantly decreased were not important for the original antigenic expression and were considered as replaceable amino acids.
  • the control value is the value quantified from the image obtained from the secondary antibody measurement value, and the difference between the control value of the peptide from the value quantified from the image obtained from the results of using the serum of 37 patients.
  • each patient has obtained interview information indicating that he / she is allergic to the food shown in Table 4 below.
  • IgE antibodies of patients shown in Table 5 below showed binding to the common 15-residue sequence of (E1)-(E50).
  • Example 5 Confirmation of cross-reactivity of epitopes Each epitope sequence (SEQ ID NOs: 559, 561, 563, 567, 569, 571, 573, 576, 578, 580, etc.) found in each of the shrimp proteins in Table 3 above.
  • the ELISA was specifically performed according to the following procedure.
  • Peptides having these amino acid sequences were prepared by the same procedure as in Example 4 (A), and it was measured whether IgE antibodies in the serum of allergic patients and the serum of non-allergic subjects were bound. For the serum of non-allergic subjects, the value obtained by measuring two patients and dividing by the average value was shown.

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Insects & Arthropods (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)

Abstract

本発明は、エビに対するアレルギーの新規抗原、エビに対するアレルギーの診断方法および診断キット、当該抗原を含む医薬組成物、当該抗原が除去されたエビまたはエビ加工品、ならびに対象物におけるエビ抗原の有無を判定するためのテスター組成物を提供する。本発明はまた、抗原のエピトープを含むポリペプチド、当該ポリペプチドを含むアレルギーの診断キット、診断用組成物、及び診断方法、当該ポリペプチドを含む医薬組成物、ならびに、当該ポリペプチドを含む抗原が除去若しくは低減された原料又は加工品に関する。本発明はさらに、対象物における抗原の有無を判定するためのテスター組成物に関する。

Description

アレルギーの抗原およびそのエピトープ
 本発明は、エビに対するアレルギーの新規抗原に関する。本発明はまた、エビに対するアレルギーの診断キット、診断用組成物、及び診断方法に関する。本発明はまた、当該抗原を含む医薬組成物、及び当該抗原が除去又は低減されたエビまたはエビ加工品に関する。本発明はさらに、対象物におけるエビ抗原の有無を判定するためのテスター組成物に関する。
 本発明はまた、抗原のエピトープを含むポリペプチドに関する。本発明はまた、当該ポリペプチドを含むアレルギーの診断キット、診断用組成物、及び診断方法に関する。本発明はまた、当該ポリペプチドを含む医薬組成物、及び当該ポリペプチドが除去若しくは低減された原料又は加工品に関する。本発明はさらに、当該ポリペプチドが除去若しくは低減された加工品の製造方法に関する。本発明はさらにまた、対象物における当該ポリペプチドを含む抗原の有無を判定するためのテスター組成物に関する。
 アレルギー患者の血清及び組織中では、特定の抗原(以下、アレルゲンともいう)に特異的なIgE抗体が産生される。このIgE抗体と特定の抗原の相互作用により生じた生理学的結果によりアレルギー反応が惹起される。抗原とは、広義にはアレルギー症状を引き起こす食品・食材等を示し、狭義には特異的なIgE抗体が結合する、食品・食材等に含まれるタンパク質(以下、アレルゲンコンポーネントともいう)をいう。
 従来のアレルギー検査薬においては、単にアレルゲン候補の食品・食材等をすりつぶして抗原試薬を作成していることが多い(特許文献1)。このため、従来の抗原試薬中に含まれる多数のアレルゲンコンポーネントの中で、IgE抗体との結合について陽性反応が判定可能な閾値を超える含有量であった場合にのみ、アレルギー検査における陽性反応を検出することが可能であり、診断効率は十分に高いとはいえない状態であった。
 アレルゲン候補の食品・食材において、いくつかのアレルゲンコンポーネントが示唆され、検査キットとして商品化もされている。アレルギー検査の信頼度を高めるためには、アレルゲンコンポーネントを網羅的に特定する必要があるところ、上記アレルゲンコンポーネントの測定による患者検出率はまだまだ不十分である。エビの新規アレルゲンを同定することは、診断薬の精度を高めるだけでなく、低アレルゲン食品、低アレルゲン食材や治療薬のターゲットとしても非常に重要である。
 一方、タンパク質の分離・精製に関しては、近年、少量のサンプルから多様なタンパク質を分離精製する方法として、1次元目に等電点電気泳動を行い、2次元目にSDS-PAGE(ドデシル硫酸ナトリウム―ポリアクリルアミドゲル電気泳動)を行う2次元電気泳動法が用いられている。出願人らはこれまでに、分離能が高い2次元電気泳動法を開発してきた(特許文献2~5)。
 アレルゲン特異的IgE抗体はアレルゲンコンポーネント中の特定のアミノ酸配列であるエピトープを認識して結合する。しかしながら、アレルゲンコンポーネントについてエピトープまで解析されている例は若干数あるものの(非特許文献1)、極めて少ないのが現状である。また、エピトープを含むポリペプチドを利用したアレルギーの診断キットも現時点では市場に存在しない。
特開2002-286716 特開2011-33544 特開2011-33546 特開2011-33547 特開2011-33548
Matsuo, H., et al., J. Biol. Chem., (2004), Vol.279, No.13, pp.12135-12140
 本発明は、エビに対するアレルギーの新規抗原を提供する。本発明はまた、エビに対するアレルギーの診断方法及び診断キットを提供する。本発明はまた、当該抗原を含む医薬組成物、及び当該抗原が除去又は低減されたエビまたはエビ加工品を提供する。本発明はさらに、対象物におけるエビ抗原の有無を判定するためのテスター組成物を提供する。
 本発明はまた、抗原のエピトープを含むポリペプチドを提供する。本発明はまた、当該ポリペプチドを含むアレルギーの診断キット、診断用組成物、及び診断方法を提供する。本発明はまた、当該ポリペプチドを含む医薬組成物、及び当該ポリペプチドを含む抗原が除去若しくは低減された原料又は加工品を提供する。本発明はさらに、当該抗原が除去若しくは低減された加工品の製造方法に関する。本発明はさらにまた、対象物における当該ポリペプチドを含む抗原の有無を判定するためのテスター組成物を提供する。
 本発明者らは、上記課題を解決するためにエビに対するアレルギーの原因抗原特定について鋭意研究を行った。その結果、エビアレルギーを有する患者の血清中のIgE抗体が特異的に結合する新規な抗原を特定することに成功した。当該知見に基づいて、本発明は完成された。
 すなわち、一態様において、本発明は以下のとおりであってよい。
 [1] エビアレルギーの診断キットであって、以下の(1)~(11)のタンパク質の少なくとも一つ:
 (1)(1A)ミオシン ヘビー チェイン タイプ 1(myosin heavy chain type 1)のC末端部分またはミオシン ヘビー チェイン タイプ a(myosin heavy chain type a)のC末端部分を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(1A-a)~(1A-e)のいずれかのタンパク質:
(1A-a)配列番号2、45または87において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(1A-b)配列番号2、45または87で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(1A-c)配列番号1、44または86において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(1A-d)配列番号1、44または86で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(1A-e)配列番号1、44または86で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(1B)配列番号2~43からなる群、配列番号45~85からなる群、または配列番号87~115からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (2)(2A)ミオシン ヘビーチェイン タイプ 1のN末端部分またはミオシン ヘビー チェイン タイプ aのN末端部分を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(2A-a)~(2A-e)のいずれかのタンパク質:
(2A-a)配列番号117、141または146において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(2A-b)配列番号117、141または146で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(2A-c)配列番号116、140または145において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(2A-d)配列番号116、140または145で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(2A-e)配列番号116、140または145で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(2B)配列番号117~139からなる群、配列番号141~144からなる群、または配列番号146~159からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (3)(3A)ミオシン ヘビー チェイン タイプ 2(myosin heavy chain type 2)のC末端部分またはミオシン ヘビーチェイン タイプ b(myosin heavy chain type b)のC末端部分を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(3A-a)~(3A-e)のいずれかのタンパク質:
(3A-a)配列番号161、179または230において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(3A-b)配列番号161、179または230で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(3A-c)配列番号160、178または229において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(3A-d)配列番号160、178または229で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(3A-e)配列番号160、178または229で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(3B)配列番号161~177からなる群、配列番号179~228からなる群、または配列番号230~274からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (4)(4A)ミオシン ヘビーチェイン タイプ 2のN末端部分またはミオシン ヘビー チェイン タイプ bのN末端部分を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(4A-a)~(4A-e)のいずれかのタンパク質:
(4A-a)配列番号276、300または306において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(4A-b)配列番号276、300または306で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(4A-c)配列番号275、299または305において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(4A-d)配列番号275、299または305で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(4A-e)配列番号275、299または305で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(4B)配列番号276~298からなる群、配列番号300~304からなる群、または配列番号306~320からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (5)(5A)グリコーゲン ホスホリラーゼ(glycogen phosphorylase)を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(5A-a)~(5A-e)のいずれかのタンパク質:
(5A-a)配列番号362において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(5A-b)配列番号362で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(5A-c)配列番号361において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(5A-d)配列番号361で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(5A-e)配列番号361で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(5B)配列番号321~336からなる群、配列番号337~360からなる群、または配列番号362~379からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (6)(6A)ヘモシアニン サブユニット L1(hemocyanin subunit L1)の一部、ヘモシアニン(hemocyanin)またはヘモシアニン サブユニット L(hemocyanin subunit L)を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(6A-a)~(6A-e)のいずれかのタンパク質:
(6A-a)配列番号381、399または414において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(6A-b)配列番号381、399または414で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(6A-c)配列番号380、398または413において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(6A-d)配列番号380、398または413で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(6A-e)配列番号380、398または413で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(6B)配列番号381~397からなる群、配列番号399~412からなる群、または配列番号414~419からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (7)(7A)ピルベート キナーゼ 3(pyruvate kinase 3)を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(7A-a)~(7A-e)のいずれかのタンパク質:
(7A-a)配列番号421において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(7A-b)配列番号421で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(7A-c)配列番号420において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(7A-d)配列番号420で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(7A-e)配列番号420で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(7B)配列番号421~435からなる群、または配列番号436~441からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (8)(8A)ホスホピルベート ヒドラターゼ(phosphopyruvate hydratase)を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(8A-a)~(8A-e)のいずれかのタンパク質:
(8A-a)配列番号455または481において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(8A-b)配列番号455または481で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(8A-c)配列番号454または480において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(8A-d)配列番号454または480で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(8A-e)配列番号454または480で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(8B)配列番号442~453からなる群、配列番号455~479からなる群、または配列番号481~484からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (9)(9A)ミトコンドリアル ATP シンターゼ サブユニット アルファ プレカーサー(mitochondrial ATP synthase subunit alpha precursor)を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(9A-a)~(9A-e)のいずれかのタンパク質:
(9A-a)配列番号486において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(9A-b)配列番号486で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(9A-c)配列番号485において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(9A-d)配列番号485で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(9A-e)配列番号485で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(9B)配列番号486~490からなる群、配列番号491~497からなる群、または配列番号498~518からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (10)(10A)トロポニン I(troponin I)を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(10A-a)~(10A-e)のいずれかのタンパク質:
(10A-a)配列番号520において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(10A-b)配列番号520で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(10A-c)配列番号519において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(10A-d)配列番号519で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(10A-e)配列番号519で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(10B)配列番号520~527からなる群、配列番号528~532からなる群、または配列番号533~539からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
 (11)(11A)シクロフィリン A(cyclophilin A)を含むタンパク質またはその変異体であって、エビに対するアレルギーの抗原である、以下の(11A-a)~(11A-e)のいずれかのタンパク質:
(11A-a)配列番号541または549において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質;
(11A-b)配列番号541または549で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質;
(11A-c)配列番号540または548において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;
(11A-d)配列番号540または548で示される塩基配列と同一性が70%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;もしくは
(11A-e)配列番号540または548で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質;又は
(11B)配列番号541~547からなる群、配列番号549~553からなる群、または配列番号554~557からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質;
を抗原として含む、前記診断キット。
 [2] エビアレルギーの診断用組成物であって、上記[1]において(1)~(11)として特定されるタンパク質の少なくとも一つを抗原として含む、前記診断用組成物。
 [3] 対象のエビアレルギーを診断するための指標を提供する方法であって、以下の工程:
(i)対象から得られた試料を抗原に接触させる、ここで当該試料はIgE抗体が含まれる溶液である;
(ii)対象から得られた試料中のIgE抗体と当該抗原との結合を検出する;
(iii)対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、対象がエビアレルギーであることの指標が提供される;
を含み、ここで当該抗原は、上記[1]において(1)~(11)として特定されるタンパク質の少なくとも一つである、前記方法。
 [4] 上記[1]において(1)~(11)として特定されるタンパク質の少なくとも一つを含む医薬組成物。
 [5] エビアレルギーを治療するための、上記[4]に記載の医薬組成物。
 [6] 抗原が除去又は低減されていることを特徴とするエビまたはエビ加工品であって、当該抗原は上記[1]において(1)~(11)として特定されるタンパク質の少なくとも一つである、前記エビまたはエビ加工品。
 [7] 上記[1]において(1)~(11)として特定されるタンパク質の少なくとも一つと結合する抗体を含むことを特徴とする、対象物におけるエビ抗原の有無を判定するためのテスター組成物。
 [8] 配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540、および548からなる群より選択される少なくとも一つの塩基配列の一部と相補的な塩基配列を有するプライマーを含むことを特徴とする、対象物におけるエビに対するアレルギーの原因となる抗原の有無を判定するためのテスター組成物。
 本発明者らはまた、上記抗原を含むエビ由来の抗原についてのエピトープを見出すことにも成功した。
 エピトープは比較的短いアミノ酸配列を有するものであるため、異なるアレルゲンコンポーネントにも同一のアミノ酸配列が存在すれば、当該IgE抗体は、複数のアレルゲンコンポーネントに結合可能である。異なるアレルゲンコンポーネントに共通するエピトープが存在する結果、両者にアレルギー患者のIgE抗体が結合するため、その抗原は交差性を有する。したがって、本願により特定されたエピトープは、交差性を含めたアレルギーの診断や治療、および当該エピトープを含む複数のアレルゲンコンポーネントの検出等を可能にするものである。
 当該知見に基づいて、本発明は完成された。すなわち、別の態様において、本発明は以下のとおりであってよい。
[態様1]
 以下のポリペプチドの少なくとも一つを含む、アレルギーの診断キット。
 (E1)(i)配列番号558-565のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号558-565において、配列番号558の4、5、7、8、10、11、12、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E2)(i)配列番号566-581、949のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号566-581、949において、配列番号566の1、3、4、5、6、7、8、9、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E3)(i)配列番号582-585、950のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号582-585、950において、配列番号582の9、10、11、12、13番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E4)(i)配列番号586-593、951のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号586-593、951において、配列番号586の2、4、5、6、7、10、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E5)(i)配列番号594-598、952のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号594-598、952において、配列番号594の9、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E6)(i)、配列番号599-613、953、954のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号599-613、953、954において、配列番号599の2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E7)(i)配列番号614-623、955のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)、配列番号614-623、955において、配列番号614の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E8)(i)配列番号624-633のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号624-633において、配列番号624の3、5、6、7、8、10、11、12、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E9)(i)配列番号634-639のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号634-639において、配列番号634の4、6、8、10、11番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E10)(i)配列番号640-653、956、957のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号640-653、956、957において、配列番号640の4、6、8、9、11、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E11)(i)配列番号654-670のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号654-670において、配列番号654の2、4、5、6、7、8、9、10、12、13、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E12)配列番号671のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E13)(i)配列番号672-677、958のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号672-677、958において、配列番号672の6、7、8、9、10、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基に相当する任意のアミノ酸残基に置換されていてもよい。
 (E14)配列番号678-680のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E15)(i)配列番号681-685のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号681-685において、配列番号681の10番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E16)(i)配列番号686-690、959,960のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号686-690、959,960において、配列番号686の4、5、6、7、9、10、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E17)(i)配列番号691-696、961のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号691-696、961において、配列番号691の7、10、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E18)(i)配列番号697-703のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号697-703において、配列番号697の1、3、5番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E19)配列番号704のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E20)配列番号705-707のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E21)(i)配列番号708-716、962、963のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号708-716、962、963において、配列番号708の1、2、4、5、7、8、9、10、12、13、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E22)(i)配列番号717-724、964のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号717-724、964において、配列番号717の2、4、5、6、8、9、10、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E23)配列番号725-728のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E24)(i)配列番号729-740、965、966のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号729-740、965、966において、配列番号729の4、5、6、7、8、9、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E25)(i)配列番号741-749、967、968のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号741-749、967、968において、配列番号741の3、5、6、8、9、10、11、13番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E26)配列番号750-751のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E27)(i)配列番号752-764、969、970のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号752-764、969、970において、配列番号752の3、4、5、7、8、9、10、11番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E28)(i)配列番号765-769のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号765-769において、配列番号765の3、5、6番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E29)(i)配列番号770-777、971、972のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号770-777、971、972において、配列番号770の1、2、5、6、7、8、9、10、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E30)(i)配列番号778-787、973のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号778-787、973において、配列番号778の2、3、4、6、7、8、9、10、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E31)(i)配列番号788-792のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号788-792において、配列番号788の4、7、8、9、10、11、13番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E32)(i)配列番号793-809、974、975のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号793-809、974、975において、配列番号793の3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E33)(i)配列番号810-816のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号810-816において、配列番号810の2、4、5、6、7、8、9、10、12、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E34)(i)配列番号817-825のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号817-825において、配列番号817の2、4、5、7、8、9、11、12、13,14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E35)(i)配列番号826-832のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号826-832おいて、配列番号826の2、3、5、8、9、10、11、12、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E36)(i)配列番号833-846、976のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号833-846、976において、配列番号833の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E37)(i)配列番号847-857、977のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号847-857、977において、配列番号847の5、6、7、9、10、11、12、13、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E38)(i)配列番号858-864のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号858-864において、配列番号858の6、7、8、9、13、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E39)(i)配列番号865-878、984、978のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号865-878、984、978において、配列番号865の1、2、4、5、6、8、9、10、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E40)配列番号879-880のアミノ酸配列を含むポリペプチド;;
 (E41)(i)配列番号881-891、979のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号881-891、979において、配列番号881の2、3、4、6,9、10、11、12、13、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E42)(i)配列番号892-907、980のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号892-907、980において、配列番号892の1、2、3、4、5、8、9、10、11、12、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E43)(i)配列番号908-911、981のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号908-911、981において、配列番号908の7番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E44)配列番号912-914のアミノ酸配列を含むポリペプチド;;
 (E45)配列番号915-916のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E46)(i)配列番号917-927、982、983のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号917-927、982、983において、配列番号917の4、7、8、9、10、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E47)(i)配列番号928-934のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号928-934において、配列番号928の6、7、8、10、12、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E48)(i)配列番号935-938のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号935-938において、配列番号935の5、6番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E49)(i)配列番号939-942のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号939-942において、配列番号939の3、6、7、10、11番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (E50)(i)配列番号943-948のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
 (ii)配列番号943-948において、配列番号943の1、2、3,4,5、8、10、11番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド。 
[態様2]
 アレルギーの診断用組成物であって、態様1に記載のポリペプチドの少なくとも一つを含む、前記診断用組成物。
[態様3]
 アレルギー患者のIgE抗体に特異的に結合するポリペプチドであって、態様1に記載のポリペプチドのいずれか一つである、前記ポリペプチド。
[態様4]
 対象のアレルギーを診断するための指標を提供する方法であって、以下の工程:
(i)対象から得られた試料を抗原に接触させる、ここで当該試料はIgE抗体が含まれる溶液である;
(ii)対象から得られた試料中のIgE抗体と当該抗原との結合を検出する;
(iii)対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、対象がアレルギーであることの指標が提供される;
を含み、ここで当該抗原は、態様3に記載のポリペプチドの少なくとも一つである、前記方法。
[態様5]
 態様3に記載のポリペプチドの少なくとも一つを含む医薬組成物。
[態様6]
 アレルギーを治療するための、態様5に記載の医薬組成物。
[態様7]
 態様3に記載のポリペプチドの少なくとも一つと結合する抗体を含むことを特徴とする、対象物における抗原の有無を判定するためのテスター組成物。
[態様8]
 以下のいずれかのプライマー:
(a)態様3に記載のポリペプチドをコードする核酸の塩基配列の一部及び/またはその相補鎖の一部を含むプライマー;または
(b)配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つの一部であるプライマーおよび/または配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つと相補的な配列の一部であるプライマー;
を含むことを特徴とする、対象物における抗原の有無を判定するためのテスター組成物。
[態様9]
 態様3に記載のポリペプチドの原料・加工品中の有無を判定する方法であって、前記原料・加工品中に態様3に記載のポリペプチドを検出する、ことを含む、前記方法。
[態様10]
 抗原が除去若しくは低減されていることを特徴とする原料又は加工品であって、当該抗原は態様3に記載のポリペプチドの少なくとも一つである、前記原料又は加工品。
[態様11]
 抗原が除去若しくは低減されている加工品の製造方法であって、当該加工品の製造過程で抗原が除去若しくは低減されていることを確認するステップを有し、ここで当該抗原は態様3に記載のポリペプチドの少なくとも一つである、前記製造方法。
 本発明により、エビに対するアレルギーの新規抗原を提供することができる。本発明においてエビアレルギーを引き起こす新規なアレルゲンコンポーネントが同定されたことから、エビに対するアレルギーの高感度な診断方法及び診断キット、当該抗原を含む医薬組成物、当該抗原が除去又は低減されたエビまたはエビ加工品、および対象物におけるエビ抗原の有無を判定するためのテスター組成物を提供することができる。
 また、本発明により、抗原のエピトープを含む新規ポリペプチドを提供することができる。本発明のポリペプチドを利用することにより、アレルギーの高感度な診断キット、診断用組成物、及び診断方法、当該ポリペプチドを含む医薬組成物、対象物における当該ポリペプチドを含む抗原の有無を判定するためのテスター組成物、並びに当該ポリペプチドが除去若しくは低減された原料又は加工品、及びその加工品の製造方法を提供することができる。
図1は、バナメイエビに含まれるタンパク質について、2次元電気泳動によるタンパク質の泳動パターンを示すゲルの写真である。写真の左側のバンドは分子量マーカーのバンドであり、写真の左側の数値は各分子量マーカーの分子量(KDa)である。写真上部の数値は、等電点を表す。 図2は、バナメイエビに含まれるタンパク質の二次元電気泳動パターンに対して、エビアレルギー患者の血清を用いたイムノブロットの写真である。エビアレルギー患者の血清中のIgE抗体が特異的に反応したスポット1~11を、それぞれ白枠で囲って示した。 図3は、ブラックタイガーに含まれるタンパク質について、2次元電気泳動によるタンパク質の泳動パターンを示すゲルの写真である。写真の左側のバンドは分子量マーカーのバンドであり、写真の左側の数値は各分子量マーカーの分子量(KDa)である。写真上部の数値は、等電点を表す。 図4は、ブラックタイガーに含まれるタンパク質の二次元電気泳動パターンに対して、エビアレルギー患者の血清を用いたイムノブロットの写真である。エビアレルギー患者の血清中のIgE抗体が特異的に反応したスポット1~11を、それぞれ白枠で囲って示した。 図5は、クルマエビに含まれるタンパク質について、2次元電気泳動によるタンパク質の泳動パターンを示すゲルの写真である。写真の左側のバンドは分子量マーカーのバンドであり、写真の左側の数値は各分子量マーカーの分子量(KDa)である。写真上部の数値は、等電点を表す。 図6は、クルマエビに含まれるタンパク質の二次元電気泳動パターンに対して、エビアレルギー患者の血清を用いたイムノブロットの写真である。エビアレルギー患者の血清中のIgE抗体が特異的に反応したスポット1~6および8~11を、それぞれ白枠で囲って示した。 図7は、各エピトープのアミノ酸配列を有するペプチドに対して、エビと小麦若しくはカニに対するアレルギーを併発している患者の血清を用いて、ELISAにより交差反応性を調べた結果である。 図8は、各エピトープのアミノ酸配列を有するペプチドに対して、エビと小麦若しくはカニに対するアレルギーを併発している患者の血清を用いて、ELISAにより交差反応性を調べた結果である。 図9は、各エピトープのアミノ酸配列を有するペプチドに対して、エビと小麦若しくはカニに対するアレルギーを併発している患者の血清を用いて、ELISAにより交差反応性を調べた結果である。 図10は、各エピトープのアミノ酸配列を有するペプチドに対して、エビと小麦若しくはカニに対するアレルギーを併発している患者の血清を用いて、ELISAにより交差反応性を調べた結果である。 図11は、各エピトープのアミノ酸配列を有するペプチドに対して、エビと小麦若しくはカニに対するアレルギーを併発している患者の血清を用いて、ELISAにより交差反応性を調べた結果である。 図12は、各エピトープのアミノ酸配列を有するペプチドに対して、エビと小麦若しくはカニに対するアレルギーを併発している患者の血清を用いて、ELISAにより交差反応性を調べた結果である。
 以下に本発明を具体的に説明するが、本発明はこれらに限定されるものではない。
 本明細書で特段に定義されない限り、本発明に関連して用いられる科学用語及び技術用語は、当業者によって一般に理解される意味を有するものとする。
 本明細書においてアレルギーとは、ある抗原に感作されている生体に、再びその抗原が入った場合に起こる、生体に不都合な過敏反応を示す状態をいう。抗原と接触した場合、あるいは当該抗原を摂取した場合に、アレルギー反応を生じ得る。ここで接触は物体に触れることをいい、特に人体に対しては皮膚、粘膜(眼、口唇等)等に付着することをいう。また、摂取は体内に取り込むことをいい、吸入、経口等の手段で取り込むことをいう。一般的に食物を摂取した場合に生じるアレルギー反応を特に食物アレルギーという。好ましい態様においてアレルギーは食物アレルギーであってもよい。食物におけるアレルギー疾患の多くにおいて、血液および組織で抗原に特異的なIgE抗体が産生される。IgE抗体は、肥満細胞または好塩基球と結合する。当該IgE抗体に特異的な抗原が再びアレルギー疾患患者の体内に入ると、当該抗原は肥満細胞または好塩基球と結合したIgE抗体と組み合わさり、IgE抗体-抗原相互作用の生理学的効果を生ずる。これらの生理学的効果として、ヒスタミン、セロトニン、ヘパリン、好酸球遊走因子または各種ロイコトリエン等の放出が挙げられる。これらの放出物質は、IgE抗体と特定の抗原の組み合わせにより起こるアレルギー反応を惹起する。詳しくはIgE抗体は、特定の抗原中の特定のアミノ酸配列であるエピトープを認識して結合し、当該抗原によるアレルギー反応は、上記の経路を通じて現れる。
 本発明が対象とするアレルギーは、使用するエピトープを含むアレルゲンに対するアレルギーである限り、特に限定されない。一態様として、アレルゲンは、生体(特にヒト)が摂取する、魚介類、フルーツ、野菜、ナッツ類(種実類)、食用草、穀物、畜肉、乳汁、乳製品など、あるいは、生体(特にヒト)に寄生する寄生虫等などが含まれる。
 非限定的に、魚介類としては、十脚目(エビ目)に属するエビ、カニ等が含まれる。一般に「甲殻類」として認識されているものは、ほとんど十脚目(エビ目)に含まれる。十脚目(エビ目)には、十脚目短尾下目(別名:カニ下目)、十脚目異尾下目(ヤドカリ下目)が含まれる。十脚目(エビ目)のうち、十脚目短尾下目(別名:カニ下目)、十脚目異尾下目(ヤドカリ下目)以外の全ての総称が「エビ」である。エビについては後述する。非限定的に、十脚目短尾下目(別名:カニ下目)は、クリガニ科(例えば、ケガニ(Erimacrus isenbeckii))、ケセンガニ科(例えば、ズワイガニ(Chionoecetes opilio))、ワタリガニ科(ワタリガニ(Portunus trituberculatus))を含む。非限定的に、十脚目異尾下目(ヤドカリ下目)は、タラバガニ科(例えば、タラバガニ(Paralithodes camtschaticus))を含む。
 非限定的に、魚介類はまた、ツツイカ目、タコ目に属するイカ。タコを含む。魚介類はさらに、サバ科、タラ科、に属する魚を含む。魚介類はさらにまた、マルスダレガイ科の貝類を含む。非限定的に、ツツイカ目のイカはスルメイカ(Todarodes pacificus)を含む。スルメイカは「真イカ」とも呼称する。タコ目のタコは、マダコ(Octopus vulgaris)を含む。サバ科の魚は、マグロ(Thunnus orientalis)、マサバ(Scomber japonicas)を含む。タラ科の魚は、マダラ(Gadus macrocephalus)を含む。 マルスダレガイ科の貝は、アサリ、ハマグリ、シジミ等を含む。一態様において、アサリ(Ruditapes philippinarum)を含む。
 非限定的に、フルーツとしては、例えば、マタタビ科、パイナップル科、ウルシ科、ウリ科、バショウ科、ミカン科、バラ科に属するフルーツを含む。野菜としては、例えば、ナス科、ウリ科、クスノキ科に属するフルーツを含む。ナッツ類(種実類)としては、例えば、ウルシ科、バラ科、クルミ科に属するナッツ類(種実類)を含む。食用草としては、例えば、キク科に属する食用草を含む。穀物としては、例えば、イネ科、タデ科の属する穀物を含む。
 非限定的に、マタタビ科のフルーツはキウイ(Actinidia deliciosa)を含む。パイナップル科のフルーツは、パイナップル(Ananas comosus)を含む。ウルシ科は、マンゴー(Mangifera indica)等のフルーツの他、カシューナッツ(Anacardium occidentale)等のナッツ類(種実類)を含む。ウリ科は、メロン(Cucumis melo)等のフルーツの他に、きゅうり(Cucumis sativus)等の野菜を含む。バショウ科のフルーツは、バナナ(Musa acuminate)を含む。ミカン科のフルーツは、オレンジ(Citrus sinensis)を含む。バラ科は、モモ、イチゴ、リンゴ、ナシ、ビワ等のフルーツの他、アーモンド等のナッツ類(種実類)を含む。一態様において、バラ科は、リンゴ(Malus domestica)、アーモンド(Prunus dulcis)を含む。
 非限定的に、ナス科の野菜は、なす(Solanum melongena)、トマト(Solanum lycopersicum)を含む。クスノキ科の野菜は、アボカド(Persea americana)を含む。非限定的に、ナッツ類(種実類)は、ウルシ科のカシューナッツ(Anacardium occidentale)、バラ科のアーモンド(Prunus dulcis)を含む。クルミ科のナッツ類(種実類)は、シナノグルミ(Juglans regia)を含む。
 非限定的に、キク科の食用草は、ヨモギ(Artemisia indica var. maximowiczii又はArtemisia indica)を含む。イネ科の穀物は、パンコムギ(Triticum aestivum)を含む。タデ科の穀物は、例えば、タデ科ソバ属のソバ(Fagopyrum esculentum)を含む。
 畜肉の種類は特に限定されない。一態様において、鳥類(鶏肉、鴨肉、等)の肉、豚肉、牛肉、羊肉等を含む。一態様において、鳥類の肉である。一態様においてニワトリ(Gallus gallus)の肉である。
 乳汁(ミルク)の由来は特に限定されない。一態様においてウシ、ヤギ、ヒツジ等由来の乳汁を含む。一態様において、牛乳(Bos Taurus)である。乳製品は、乳汁の加工品である。非限定的に、バター、生クリーム、チーズ、ヨーグルト、アイスクリームを含む。
 寄生虫は、非限定的に、例えば、アニサキス科の寄生虫である。アニサキス科の寄生虫は、アニサキス(Anisakis simplex)を含む。
 一態様において、アレルゲンは以下のいずれかである。エビ、ケガニ(Erimacrus isenbeckii)、ズワイガニ(Chionoecetes opilio)、ワタリガニ(Portunus trituberculatus)、タラバガニ(Paralithodes camtschaticus)、スルメイカ(Todarodes pacificus)、マダコ(Octopus vulgaris)、マグロ(Thunnus orientalis)、マサバ(Scomber japonicas)、マダラ(Gadus macrocephalus )、アサリ(Ruditapes philippinarum)、キウイ(Actinidia deliciosa)、パイナップル(Ananas comosus)、マンゴー(Mangifera indica)、カシューナッツ(Anacardium occidentale)、メロン(Cucumis melo)、バナナ(Musa acuminate)、オレンジ(Citrus sinensis)、リンゴ(Malus domestica)、アーモンド(Prunus dulcis)、なす(Solanum melongena)、トマト(Solanum lycopersicum)、きゅうり(Cucumis sativus)、アボカド(Persea americana)、シナノグルミ(Juglans regia)、ヨモギ(Artemisia indica var. maximowiczii又はArtemisia indica)、パンコムギ(Triticum aestivum)、ソバ(Fagopyrum esculentum)、ニワトリ(Gallus gallus)の肉、牛乳(Bos Taurus)、アニサキス(Anisakis simplex)。
 本明細書においてエビとは、エビ上目(Eucarida)に属するエビをいう。十脚目(エビ目)のうち、十脚目短尾下目(別名:カニ下目)、十脚目異尾下目(ヤドカリ下目)以外の全ての種がこれに該当する。エビ上目に属するエビは、例えば、クルマエビ科、イセエビ科、アカザエビ科、サクラエビ科、オキエビ科、タラバエビ科、オキアミ科に属するエビであってもよい。クルマエビ科に属するエビは、例えばバナメイエビ、ブラックタイガー、クルマエビであってもよく、イセエビ科に属するエビは、例えばイセエビ、ウチワエビであってもよく、アカザエビ科に属するエビは、例えばオマールエビ(ロブスター)であってもよい。サクラエビ科に属するエビは、例えばサクラエビであってもよく、オキエビ科に属するエビは、例えば白エビであってもよく、タラバエビ科に属するエビは、例えば甘エビ、ボタンエビ、シマエビであってもよく、オキアミ科に属するエビは、例えばオキアミであってもよい。本発明が対象とするエビは、上記のエビのいずれかであればよい。好ましくは、本発明が対象とするエビはクルマエビ科(family Panaeidae)に属するエビである。
 本明細書においてエビに対するアレルギーとは、エビに含まれるタンパク質等を抗原として生じるアレルギー反応を有する状態をいう。エビに対するアレルギーは、エビに含まれる抗原と接触した場合、あるいは当該抗原を摂取した場合に、アレルギー反応を生じ得る。一般的に食物を摂取した場合に生じるアレルギー反応を特に食物アレルギーという。エビに対するアレルギーは食物アレルギーであってもよい。
 本明細書において抗原とは、アレルギー反応を惹起させる物質である。食材等の原材料中に含まれるタンパク質である場合は、アレルゲンコンポーネントとも称される。抗原は好ましくはタンパク質である。
 本明細書において、タンパク質は、天然のアミノ酸がペプチド結合により連結された構造を有する分子である。タンパク質に含まれるアミノ酸の数は特に限定されない。本明細書において「ポリペプチド」の用語もまた、天然のアミノ酸がペプチド結合により連結された構造を有する分子を意味する。ポリペプチドに含まれるアミノ酸の数は特に限定されない。「ポリペプチド」は、「タンパク質」を含む概念である。また、2~50個程度のアミノ酸がペプチド結合により連結されたポリペプチドを、特にペプチドと呼ぶことがある。
 アミノ酸に関して光学異性体があり得る場合は、特に明示しなければL体を示す。本明細書で用いるタンパク質、ポリペプチドまたはペプチドのアミノ酸配列の表記法は、標準的用法及び当業界で慣用されている表記法に基づき、アミノ酸の一文字表記で表され、左方向はアミノ末端方向であり、そして右方向はカルボキシ末端方向である。なお、アミノ酸の一文字表記においてXは、両端のアミノ酸と結合できるアミノ基およびカルボキシル基を有する物質であればいずれでもよく、特に20種類の天然のアミノ酸のいずれかであってもよいことを表す。
 アラニンスキャン法(又は「アラニングリシンスキャン」法)は、タンパク質中の残基を1つ1つアラニン(元のアミノ酸がアラニンの場合はグリシン)に変異させた変異体を作製し、タンパク質の構造や機能にとって重要な残基を部位特異的に同定する方法である。アラニン(元のアミノ酸がアラニンの場合はグリシン)に変異しても患者のIgE抗体との結合性が残存する場合には、その残基がIgE抗体との結合性に重要でなく、他のアミノ酸に変更しても結合性は残存する。IgE抗体の結合性とは、対象のエピトープとIgE抗体が結合及び反応が検出されることをいう。本願の配列表において、Xで表される残基は、実施例4に示すアラニングリシンスキャンにより、アラニン(元のアミノ酸がアラニンの場合はグリシン)に置換してもアレルギー患者のIgE抗体への結合性が残存する部位のアミノ酸残基である。このような部位については、他のいずれかのアミノ酸に置換した場合も当該IgE抗体への結合性が残存する蓋然性が高いことは、当業者に周知である。即ち、アラニン、グリシンのみでなく、アラニン以外の任意のアミノ酸残基に置換可能である残基である。
IgEと抗原(エピトープ)の結合・維持がその後のアレルギー反応に重要であるが、この結合・維持は、エピトープの電荷、疎水結合、水素結合、芳香族性相互作用が担っている。アラニン、グリシンに変えることでこれらを失っても結合・維持できるということは、そのアミノ酸は重要ではないことを意味する。
 抗原の特定
 エビに含まれるタンパク質を下記の条件で2次元電気泳動に供し、エビに対するアレルギーの抗原の特定を行った。
 1次元目の電気泳動は、等電点電気泳動用ゲルとして、ゲル長が5~10cmの範囲内であって、ゲルのpH範囲が3~10であり、泳動方向に対するゲルのpH勾配が、ゲルの全長を1とし、pH5までのゲル長をa、pH5~7のゲル長をb、pH7以上のゲル長をcとした場合において、aが0.15~0.3の範囲内、bが0.4~0.7の範囲内、cが0.15~0.3の範囲内であるゲルを用いて、具体的には、GEヘルスケアバイオサイエンス株式会社(以下、GE社と省略する)製のIPGゲルImmobiline Drystrip (pH3-10NL)を用いて等電点泳動を行った。電気泳動機器は、GE社製のIPGphorを用いた。電気泳動機器の電流値の上限をゲル1本当たり75μAに設定し、電圧プログラムを、(1)300V定電圧で750Vhrまで定電圧工程を行い(当該工程終了前の泳動30分間の電流変化幅が5μAであった)、(2)300Vhrかけて1000Vまで徐々に電圧を上昇させ、(3)更に4500Vhrかけて5000Vまで徐々に電圧を上昇させ、(4)その後5000V定電圧で総Vhrが12000になるまで、1次元目の等電点電気泳動を行った。
 2次元目の電気泳動は、泳動方向基端部のゲル濃度が3~6%に設定され、泳動方向先端側の部分のゲル濃度が泳動方向基端部のゲル濃度よりも高く設定されたポリアクリルアミドゲルを用いて、具体的にはlife technologies社製のNuPAGE 4-12% Bris-Tris Gels IPG well mini 1mmを用いてSDS-PAGEを行った。電気泳動機器は、life technologies社製のXCell SureLock Mini-Cellを用いた。泳動緩衝液として50mM MOPS、50mM Tris塩基、0.1%(w/v)SDS、1mM EDTAを用い、200V定電圧で約45分間泳動を行った。
 その結果、エビ(バナメイエビ(リトペナエウス・バナメイ(Litopenaeus vannamei))、ブラックタイガー(ペナエウス・モノドン(Penaeus monodon))およびクルマエビ(マルスペナエウス・ジャポニカス(Marsupenaeus japonicas)))のタンパク質について上記の条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、以下のスポット1~11の抗原が、エビに対するアレルギー患者のIgE抗体に特異的に結合することを明らかにした(図2、4、6)。
 抗原
(1)スポット1の抗原
 スポット1について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号3~43、ブラックタイガーについて配列番号46~85、クルマエビについて配列番号88~115、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット1について、質量分析装置から得られた質量データを米国バイオテクノロジー情報センター(NCBI)のタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号3~43についてバナメイエビ由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ 1のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号2、それをコードする塩基配列:配列番号1)であることが同定され、配列番号46~85についてブラックタイガー由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ 1のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号45、それをコードする塩基配列:配列番号44)であることが同定され、そして、配列番号88~115のアミノ酸配列についてクルマエビ由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ aのC末端部分(アミノ酸配列:配列番号87、それをコードする塩基配列:配列番号86)であることが同定された。
 したがって、本願においてスポット1の抗原は、以下(1A-a)~(1A-e)および(1B)のいずれかであってよい。
(1A-a)配列番号2、45または87において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(1A-b)配列番号2、45または87で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(1A-c)配列番号1、44または86において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(1A-d)配列番号1、44または86で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(1A-e)配列番号1、44または86で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(1B)配列番号2~43からなる群、配列番号45~85からなる群、または配列番号87~115からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、45、50種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号2~5、7~13、16~24および26~43からなる群、配列番号45、46、48、49、51~55、58~66および68~85からなる群、または、配列番号87~90および92~115からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、45種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号2~43、配列番号45~85および配列番号87~115のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(1A-a)~(1A-e)および(1B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量80~260kDa、好ましくは分子量90~230kDa付近、さらに好ましくは100~200kDa、および、等電点3.0~7.0、好ましくは4.0~6.5、さらに好ましくは5.0~6.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (2)スポット2の抗原
 スポット2について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号118~139、ブラックタイガーについて配列番号142~144、クルマエビについて配列番号147~159、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット2について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号118~139についてバナメイエビ由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ 1のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号117、それをコードする塩基配列:配列番号116)であることが同定され、配列番号142~144についてブラックタイガー由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ 1のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号141、それをコードする塩基配列:配列番号140)であることが同定され、そして、配列番号147~159のアミノ酸配列についてクルマエビ由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ aのN末端部分(アミノ酸配列:配列番号146、それをコードする塩基配列:配列番号145)であることが同定された。
 したがって、本願においてスポット2の抗原は、以下(2A-a)~(2A-e)および(2B)のいずれかであってよい。
(2A-a)配列番号117、141または146において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(2A-b)配列番号117、141または146で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(2A-c)配列番号116、140または145において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(2A-d)配列番号116、140または145で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(2A-e)配列番号116、140または145で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(2B)配列番号117~139からなる群、配列番号141~144からなる群、または配列番号146~159からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号117~126、128~132、136、138および139からなる群、配列番号141~144からなる群、または配列番号146~159からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号117~139、配列番号141~144および配列番号146~159のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(2A-a)~(2A-e)および(2B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量50~160kDa、好ましくは分子量55~150kDa付近、さらに好ましくは60~130kDa、および、等電点4.5~10.0、好ましくは5.0~9.5、さらに好ましくは5.5~9.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (3)スポット3の抗原
 スポット3について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号162~177、ブラックタイガーについて配列番号180~228、クルマエビについて配列番号231~274、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット3について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号162~177についてバナメイエビ由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ 2のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号161、それをコードする塩基配列:配列番号160)であることが同定され、配列番号180~228についてブラックタイガー由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ 2のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号179、それをコードする塩基配列:配列番号178)であることが同定され、そして、配列番号231~274のアミノ酸配列についてクルマエビ由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ bのC末端部分(アミノ酸配列:配列番号230、それをコードする塩基配列:配列番号229)であることが同定された。
 したがって、本願においてスポット3の抗原は、以下(3A-a)~(3A-e)および(3B)のいずれかであってよい。
(3A-a)配列番号161、179または230において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(3A-b)配列番号161、179または230で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(3A-c)配列番号160、178または229において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(3A-d)配列番号160、178または229で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(3A-e)配列番号160、178または229で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(3B)配列番号161~177からなる群、配列番号179~228からなる群、または配列番号230~274からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号161、162および164~177からなる群、配列番号179~181、183~186、188~190、192~212、214~216および218~228からなる群、配列番号230~233、235~240、242、244~258、260~262および264~274からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号161~177、配列番号179~228および配列番号230~274のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(3A-a)~(3A-e)および(3B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量80~260kDa、好ましくは分子量90~230kDa付近、さらに好ましくは100~200kDa、および、等電点3.0~7.0、好ましくは4.0~6.5、さらに好ましくは5.0~6.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (4)スポット4の抗原
 スポット4について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号277~298、ブラックタイガーについて配列番号301~304、クルマエビについて配列番号307~320、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット4について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号277~298についてバナメイエビ由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ 2のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号276、それをコードする塩基配列:配列番号275)であることが同定され、配列番号301~304についてブラックタイガー由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ 2のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号300、それをコードする塩基配列:配列番号299)であることが同定され、そして、配列番号307~320のアミノ酸配列についてクルマエビ由来のミオシン ヘビー チェイン タイプ bのN末端部分(アミノ酸配列:配列番号306、それをコードする塩基配列:配列番号305)であることが同定された。
 したがって、本願においてスポット4の抗原は、以下(4A-a)~(4A-e)および(4B)のいずれかであってよい。
(4A-a)配列番号276、300または306において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(4A-b)配列番号276、300または306で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(4A-c)配列番号275、299または305において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(4A-d)配列番号275、299または305で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(4A-e)配列番号275、299または305で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(4B)配列番号276~298からなる群、配列番号300~304からなる群、または配列番号306~320からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号276~293および295~298かからなる群、配列番号300~304からなる群、または配列番号306、307、および309~319からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号276~298、配列番号300~304および配列番号306~320のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(4A-a)~(4A-e)および(4B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量50~160kDa、好ましくは分子量55~150kDa付近、さらに好ましくは60~130kDa、および、等電点4.5~10.0、好ましくは5.0~9.5、さらに好ましくは5.5~9.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (5)スポット5の抗原
 スポット5について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号321~336、ブラックタイガーについて配列番号337~360、クルマエビについて配列番号363~379、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット5について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号363~379についてクルマエビ由来のグリコーゲン ホスホリラーゼ(アミノ酸配列:配列番号362、それをコードする塩基配列:配列番号361)であることが同定された。また、配列番号321~336、および配列番号337~360についても、クルマエビ由来のグリコーゲン ホスホリラーゼがヒットした。すなわち、バナメイエビおよびブラックタイガーにおいてホモロジーの高いタンパク質が検出されたため、グリコーゲン ホスホリラーゼやそのホモログがエビの抗原であると判断された。
 したがって、本願においてスポット5の抗原は、以下(5A-a)~(5A-e)および(5B)のいずれかであってよい。
(5A-a)配列番号362において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(5A-b)配列番号362で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(5A-c)配列番号361において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(5A-d)配列番号361で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(5A-e)配列番号361で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(5B)配列番号321~336からなる群、配列番号337~360からなる群、または配列番号362~379からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号322~326、329~330および332~336からなる群、配列番号338~343、345、347~349および352~360からなる群、配列番号362~367、369、371および373~379からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号321~336、配列番号337~360および配列番号362~379のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(5A-a)~(5A-e)および(5B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量70~160kDa、好ましくは分子量75~140kDa付近、さらに好ましくは80~130kDa、および、等電点5.0~9.0、好ましくは5.5~8.5、さらに好ましくは6.0~8.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (6)スポット6の抗原
 スポット6について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号382~397、ブラックタイガーについて配列番号400~412、クルマエビについて配列番号415~419、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット6について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号382~397についてバナメイエビ由来のヘモシアニン サブユニット L1の一部(アミノ酸配列:配列番号381、それをコードする塩基配列:配列番号380)であることが同定され、配列番号400~412についてブラックタイガー由来のヘモシアニン(アミノ酸配列:配列番号399、それをコードする塩基配列:配列番号398)であることが同定され、そして、配列番号415~419のアミノ酸配列についてクルマエビ由来のヘモシアニン サブユニット L(アミノ酸配列:配列番号414、それをコードする塩基配列:配列番号413)であることが同定された。
 したがって、本願においてスポット6の抗原は、以下(6A-a)~(6A-e)および(6B)のいずれかであってよい。
(6A-a)配列番号381、399または414において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(6A-b)配列番号381、399または414で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(6A-c)配列番号380、398または413において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(6A-d)配列番号380、398または413で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(6A-e)配列番号380、398または413で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(6B)配列番号381~397からなる群、配列番号399~412からなる群、または配列番号414~419からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号381~384および386~397からなる群、配列番号399~402、404および407~412からなる群、または配列番号414~416、418および419から成る群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号381~397、配列番号399~412および配列番号414~419のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(6A-a)~(6A-e)および(6B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量50~110kDa、好ましくは分子量55~100kDa付近、さらに好ましくは60~90kDa、および、等電点4.0~7.0、好ましくは4.5~6.5、さらに好ましくは5.0~6.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (7)スポット7の抗原
 スポット7について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号422~435、ブラックタイガーについて配列番号436~441、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット7について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号422~435についてバナメイエビ由来のピルベート キナーゼ 3(アミノ酸配列:配列番号421、それをコードする塩基配列:配列番号420)であることが同定された。また、配列番号436~441についても、バナメイエビ由来のピルベート キナーゼ 3がヒットした。すなわち、ブラックタイガーにおいてホモロジーの高いタンパク質が検出されたため、ピルベート キナーゼ 3やそのホモログがエビの抗原であると判断された。
 したがって、本願においてスポット7の抗原は、以下(7A-a)~(7A-e)および(7B)のいずれかであってよい。
(7A-a)配列番号421において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(7A-b)配列番号421で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(7A-c)配列番号420において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(7A-d)配列番号420で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(7A-e)配列番号420で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(7B)配列番号421~435からなる群、または配列番号436~441からなる群より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号421~435および配列番号436~441のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(7A-a)~(7A-e)および(7B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量45~80kDa、好ましくは分子量50~75kDa付近、さらに好ましくは55~70kDa、および、等電点4.5~9.0、好ましくは5.0~8.5、さらに好ましくは5.5~8.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (8)スポット8の抗原
 スポット8について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号442~453、ブラックタイガーについて配列番号456~479、クルマエビについて配列番号482~484、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット8について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号456~479についてブラックタイガー由来のホスホピルベート ヒドラターゼ(アミノ酸配列:配列番号455、それをコードする塩基配列:配列番号454)であることが同定された。また、配列番号442~453についても、ブラックタイガー由来のホスホピルベート ヒドラターゼがヒットした。すなわち、バナメイエビにおいてホモロジーの高いタンパク質が検出されたため、ホスホピルベート ヒドラターゼやそのホモログがエビの抗原であると判断された。また、配列番号482~484については、クルマエビ由来のホスホピルベート ヒドラターゼ(アミノ酸配列:配列番号481、それをコードする塩基配列:配列番号480)であることが同定された。
 したがって、本願においてスポット8の抗原は、以下(8A-a)~(8A-e)および(8B)のいずれかであってよい。
(8A-a)配列番号455または481において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(8A-b)配列番号455または481で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(8A-c)配列番号454または480において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(8A-d)配列番号454または480で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(8A-e)配列番号454または480で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(8B)配列番号442~453からなる群、配列番号455~479からなる群、または配列番号481~484からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号442~450、452および453からなる群、配列番号455~459、463~469、471~473および476~479からなる群、または配列番号481~484からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号442~453、配列番号455~479および配列番号481~484のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(8A-a)~(8A-e)および(8B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量35~80kDa、好ましくは分子量40~75kDa付近、さらに好ましくは45~70kDa、および、等電点4.0~8.0、好ましくは4.5~7.5、さらに好ましくは5.0~7.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (9)スポット9の抗原
 スポット9について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号487~490、ブラックタイガーについて配列番号491~497、クルマエビについて配列番号498~518、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット9について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号487~490についてバナメイエビ由来のミトコンドリアル ATP シンターゼ サブユニット アルファ プレカーサー(アミノ酸配列:配列番号486、それをコードする塩基配列:配列番号485)であることが同定された。また、配列番号491~497、配列番号498~518についても、バナメイエビ由来のミトコンドリアル ATP シンターゼ サブユニット アルファ プレカーサーがヒットした。すなわち、ブラックタイガーおよびクルマエビにおいてホモロジーの高いタンパク質が検出されたため、ミトコンドリアル ATP シンターゼ サブユニット アルファ プレカーサーやそのホモログがエビの抗原であると判断された。
 したがって、本願においてスポット9の抗原は、以下(9A-a)~(9A-e)および(9B)のいずれかであってよい。
(9A-a)配列番号486において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(9A-b)配列番号486で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(9A-c)配列番号485において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(9A-d)配列番号485で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(9A-e)配列番号485で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(9B)配列番号486~490からなる群、配列番号491~497からなる群、または配列番号498~518からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号486~490からなる群、配列番号491~497からなる群、または配列番号498~501、503~507、509および512~518からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、15種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号486~490、配列番号491~497および配列番号498~518のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(9A-a)~(9A-e)および(9B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量40~70kDa、好ましくは分子量45~65kDa付近、さらに好ましくは50~60kDa、および、等電点5.0~10.0、好ましくは5.5~9.5、さらに好ましくは6.0~9.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (10)スポット10の抗原
 スポット10について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号521~527、ブラックタイガーについて配列番号528~532、クルマエビについて配列番号533~539、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット10について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号521~527についてバナメイエビ由来のトロポニン I(アミノ酸配列:配列番号520、それをコードする塩基配列:配列番号519)であることが同定された。また、配列番号528~532、および配列番号533~539についても、バナメイエビ由来のトロポニン Iがヒットした。すなわち、ブラックタイガーおよびクルマエビにおいてホモロジーの高いタンパク質が検出されたため、トロポニン Iやそのホモログがエビの抗原であると判断された。
 したがって、本願においてスポット10の抗原は、以下(10A-a)~(10A-e)および(10B)のいずれかであってよい。
(10A-a)配列番号520において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(10A-b)配列番号520で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(10A-c)配列番号519において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(10A-d)配列番号519で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(10A-e)配列番号519で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(10B)配列番号520~527からなる群、配列番号528~532からなる群、または配列番号533~539からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5、6種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号520~525および527からなる群、配列番号528~530および532からなる群、または配列番号533~537および539からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号520~527、配列番号528~532および配列番号533~539のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(10A-a)~(10A-e)および(10B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量10~50kDa、好ましくは分子量15~40kDa付近、さらに好ましくは20~40kDa、および、等電点7.0~11.0、好ましくは7.5~10.5、さらに好ましくは8.0~10.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 (11)スポット11の抗原
 スポット11について質量分析による配列同定を行った結果、バナメイエビについて配列番号542~547、ブラックタイガーについて配列番号550~553、クルマエビについて配列番号554~557、のアミノ酸配列が検出された。
 また、スポット11について、質量分析装置から得られた質量データをNCBIのタンパク質データと照合して解析した。その結果、配列番号542~547についてバナメイエビ由来のシクロフィリンA(アミノ酸配列:配列番号541、それをコードする塩基配列:配列番号540)であることが同定された。また、配列番号554~557についても、バナメイエビ由来のシクロフィリン Aがヒットした。すなわち、クルマエビにおいてホモロジーの高いタンパク質が検出されたため、シクロフィリン Aやそのホモログがエビの抗原であると判断された。また、配列番号550~553については、ブラックタイガー由来のシクロフィリン A(アミノ酸配列:配列番号549、それをコードする塩基配列:配列番号548)であることが同定された。
 したがって、本願においてスポット11の抗原は、以下(11A-a)~(11A-e)および(11B)のいずれかであってよい。
(11A-a)配列番号541または549において1又は数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入又は付加されたアミノ酸配列を含むタンパク質。
(11A-b)配列番号541または549で示されるアミノ酸配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上のアミノ酸配列を含むタンパク質。
(11A-c)配列番号540または548において1又は数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入又は付加された塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(11A-d)配列番号540または548で示される塩基配列と同一性が70%以上、好ましくは75%以上、80%以上、85%以上、90%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上の塩基配列によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(11A-e)配列番号540または548で示される塩基配列に対し相補的な塩基配列からなる核酸とストリンジェントな条件下でハイブリダイズする核酸によりコードされるアミノ酸配列を含むタンパク質。
(11B)配列番号541~547からなる群、配列番号549~553からなる群、または配列番号554~557からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3、4、5種またはすべての配列を含むタンパク質。さらに好ましくは、配列番号541~543、545および546からなる群、配列番号549~553からなる群、または配列番号554~556からなる群、より選択されるアミノ酸配列の少なくとも一つを含むタンパク質、好ましくは当該アミノ酸配列の少なくとも2、3種またはすべての配列を含むタンパク質。ここにおいて、配列番号541~547、配列番号549~553および配列番号554~557のいずれかで示されるアミノ酸配列は、1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加されていてもよい。
 上記(11A-a)~(11A-e)および(11B)のタンパク質は、上記「抗原の特定」の項目に記載した条件で2次元電気泳動を行った際のゲルにおいて、分子量10~30kDa、好ましくは分子量13~25kDa付近、さらに好ましくは15~20kDa、および、等電点7.0~11.0、好ましくは7.5~10.5、さらに好ましくは8.0~10.0、のスポットとして現れるタンパク質であってもよい。
 上記(1)~(11)の抗原であるタンパク質及び後述する(E1)-(E50)のポリペプチドには、リン酸化や糖鎖修飾、アミノアシル化、開環、脱アミノ化などにより、当該タンパク質またはポリペプチドのアミノ酸残基が修飾を受けている態様もまた含まれる。
 好ましくは、上記(1)~(11)の抗原であるタンパク質及び後述する(E1)-(E50)のポリペプチドは、アレルギーの抗原である。
 本明細書において、アミノ酸配列について「1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入もしくは付加された」という場合は、対象となるアミノ酸配列において、1個もしくは数個のアミノ酸が欠失しているか、他のアミノ酸に置換されているか、他のアミノ酸が挿入されているか、および/または他のアミノ酸が付加されているアミノ酸配列をいう。「数個のアミノ酸」とは、非限定的に、200個以内、100個以内、50個以内、30個以内、20個以内、15個以内、12個以内、10個以内、8個以内、6個以内、4個以内、3個以内のアミノ酸を意味する。あるいは、数個のアミノ酸とは、アミノ酸配列の全長に対して30%、好ましくは25%、20%、15%、10%、5%、3%、2%または1%のアミノ酸を意味する。
 上記のうち、置換は、好ましくは保存的置換である。保存的置換とは、特定のアミノ酸残基を類似の物理化学的特徴を有する残基で置き換えることであるが、もとの配列の構造に関する特徴を実質的に変化させなければいかなる置換であってもよく、例えば、置換アミノ酸が、もとの配列に存在するらせんを破壊したり、もとの配列を特徴付ける他の種類の二次構造を破壊したりしなければいかなる置換であってもよい。以下に、アミノ酸残基の保存的置換について置換可能な残基ごとに分類して例示するが、置換可能なアミノ酸残基は以下に記載されているものに限定されるものではない。
A群:ロイシン、イソロイシン、バリン、アラニン、メチオニン
B群:アスパラギン酸、グルタミン酸
C群:アスパラギン、グルタミン
D群:リジン、アルギニン、
E群:セリン、スレオニン
F群:フェニルアラニン、チロシン
 非保存的置換の場合は、上記種類のうち、ある1つのメンバーと他の種類のメンバーとを交換することができる。例えば、不用意な糖鎖修飾を排除するために上記のB、D、E群のアミノ酸をそれ以外の群のアミノ酸に置換してもよい。または、3次構造でタンパク質中に折りたたまれることを防ぐためにシステインを欠失させるか、他のアミノ酸に置換してもよい。あるいは、親水性/疎水性のバランスが保たれるように、または合成を容易にするために親水度を上げるように、アミノ酸に関する疎水性/親水性の指標であるアミノ酸のハイドロパシー指数(J. Kyte 及びR. Doolittle, J. Mol. Biol., Vol.157, p.105-132, 1982)を考慮して、アミノ酸を置換してもよい。
 別の態様として、元のアミノ酸よりも立体障害の少ないアミノ酸への置換、例えばF群からA、B、C、D、E群への置換;電荷を持つアミノ酸から電荷を持たないアミノ酸への置換、例えばB群からC群への置換、をしてもよい。そうすることで、IgE抗体との結合性が向上することがある。
 本明細書において、2つのアミノ酸配列の同一性%は、視覚的検査及び数学的計算によって決定することができる。また、コンピュータープログラムを用いて同一性%を決定することもできる。そのようなコンピュータープログラムとしては、例えば、BLAST及びClustalW等があげられる。特に、BLASTプログラムによる同一性検索の各種条件(パラメーター)は、Altschulら(Nucl. Acids. Res., 25, p.3389-3402, 1997)に記載されたもので、NCBIやDNA Data Bank of Japan(DDBJ)のウェブサイトから公的に入手することができる(BLASTマニュアル、Altschulら NCB/NLM/NIH Bethesda, MD 20894;Altschulら)。また、遺伝情報処理ソフトウエアGENETYX Ver.7(ゼネティックス)、DNASIS Pro(日立ソフト)、Vector NTI(Infomax)等のプログラムを用いて決定することもできる。
 本明細書において、塩基配列について「1もしくは数個のヌクレオチドが欠失、置換、挿入もしくは付加された」という場合は、対象となる塩基配列において、1個もしくは数個のヌクレオチドが欠失しているか、他のヌクレオチドに置換されているか、他のヌクレオチドが挿入されているか、および/または他のヌクレオチドが付加されている塩基配列をいう。「数個のヌクレオチド」とは、非限定的に、600個以内、300個以内、150個以内、100個以内、50個以内、30個以内、20個以内、15個以内、12個以内、10個以内、8個以内、6個以内、4個以内、3個以内のヌクレオチド酸を意味する。あるいは、数個のヌクレオチドとは、塩基配列の全長に対して30%、好ましくは25%、20%、15%、10%、5%、3%、2%または1%のヌクレオチドを意味する。上記ヌクレオチドの欠失、置換、挿入もしくは付加により、アミノ酸をコードする配列にフレームシフトを生じないことが好ましい。
 本明細書において、2つの塩基配列の同一性%は、視覚的検査及び数学的計算によって決定することができる。また、コンピュータープログラムを用いて同一性%を決定することもできる。そのような配列比較コンピュータープログラムとしては、例えば、米国国立医学ライブラリーのウェブサイト:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgiから利用できるBLASTNプログラム(Altschul et al. (1990) J. Mol. Biol. 215: 403-10):バージョン2.2.7、又はWU-BLAST2.0アルゴリズム等があげられる。WU-BLAST2.0についての標準的なデフォルトパラメーターの設定は、以下のインターネットサイト:http://blast.wustl.eduに記載されているものを用いることができる。
 本明細書における「ストリンジェントな条件下」とは、中程度又は高度にストリンジェントな条件においてハイブリダイズすることを意味する。具体的には、中程度にストリンジェントな条件としては、例えば、DNAの長さに基づき、一般の技術を有する当業者によって、容易に決定することが可能である。基本的な条件は、Sambrookら,Molecular Cloning: A Laboratory Manual,第3版,第6-7章,Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001に示されている。好ましくは、中程度にストリンジェントな条件は、ハイブリダイゼーション条件として、1×SSC~6×SSC、42℃~55℃の条件、より好ましくは、1×SSC~3×SSC、45℃~50℃の条件、最も好ましくは、2×SSC、50℃の条件があげられる。ハイブリダイゼーション溶液中に、例えば、約50%のホルムアミドを含む場合には、上記温度よりも5ないし15℃低い温度を採用する。洗浄条件としては、0.5×SSC~6×SSC、40℃~60℃があげられる。ハイブリダイゼーション及び洗浄時には、一般に、0.05%~0.2%、好ましくは約0.1%SDSを加えてもよい。高度にストリンジェントな条件もまた、例えばDNAの長さに基づき、当業者によって、容易に決定することが可能である。一般に、高度にストリンジェント(ハイストリンジェント)な条件としては、中程度にストリンジェントな条件よりも高い温度及び/又は低い塩濃度でのハイブリダイゼーション及び/又は洗浄を含む。例えば、ハイブリダイゼーション条件として、0.1×SSC~2×SSC、55℃~65℃の条件、より好ましくは、0.1×SSC~1×SSC、60℃~65℃の条件、最も好ましくは、0.2×SSC、63℃の条件があげられる。洗浄条件として、0.2×SSC~2×SSC、50℃~68℃、より好ましくは、0.2×SSC、60~65℃が挙げられる。
 抗原は、エビから当業者に周知のタンパク質精製方法を組み合わせて分離・精製することによって得てもよい。または、抗原は、当業者に周知の遺伝子組換え技術により抗原を組換えタンパク質として発現させ、そして当業者に周知のタンパク質精製方法により分離・精製することによって得てもよい。
 タンパク質の精製方法としては、例えば、塩析、溶媒沈澱法等の溶解度を利用する方法、透析、限外濾過、ゲル濾過、SDS-PAGEなど分子量の差を利用する方法、イオン交換クロマトグラフィーやヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィーなどの荷電を利用する方法、アフィニティークロマトグラフィーなどの特異的親和性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィーなどの疎水性の差を利用する方法、等電点電気泳動などの等電点の差を利用する方法などが挙げられる。
 遺伝子組換え技術によるタンパク質の調製は、抗原をコードする核酸を含む発現ベクターを調製し、当該発現ベクターを適切な宿主細胞中に遺伝子導入または形質転換により導入し、当該宿主細胞を組換えタンパク質の発現に適する条件下で培養し、そして当該宿主細胞中で発現された組換えタンパク質を回収することにより行う。
 「ベクター」は、それに連結させた核酸を宿主細胞内に導入するために用いることが可能な核酸であり、「発現ベクター」はベクターにより導入された核酸がコードするタンパク質の発現を導くことが可能なベクターである。ベクターには、プラスミドベクター、ウイルスベクター等が含まれる。当業者は、使用する宿主細胞の種類に応じて、組換えタンパク質の発現に適切な発現ベクターを選択することができる。
 「宿主細胞」は、ベクターにより遺伝子導入または形質転換を受ける細胞である。宿主細胞は、使用するベクターに応じて当業者が適切に選択することができる。宿主細胞は、例えば、大腸菌(E. coli)などの原核生物由来であることが可能である。大腸菌のような原核細胞を宿主として使用する場合、本発明の抗原は、原核細胞内での組換えタンパク質の発現を容易にするためにN末端メチオニン残基を含むようにしてもよい。このN末端メチオニンは、発現後に組換えタンパク質から切り離すこともできる。あるいは、酵母などの単細胞真核生物、植物細胞、動物細胞(例えば、ヒト細胞、サル細胞、ハムスター細胞、ラット細胞、マウス細胞または昆虫細胞)などの、真核生物由来の細胞やカイコであることが可能である。
 発現ベクターの宿主細胞への遺伝子導入または形質転換は、当業者に公知の手法により適宜行うことができる。また、当業者は、宿主細胞の種類に応じて組換えタンパク質の発現に適する条件を適宜選択し、宿主細胞を培養することにより組換えタンパク質を発現させることができる。そして、組換えタンパク質を発現した宿主細胞をホモジナイズし、得られたホモジネートから上述したタンパク質の精製方法を適宜組み合わせて行うことにより、組換えタンパク質として発現された抗原を分離・精製することができる。上記発現ベクター若しくは合成した二本鎖DNA、またはそれらから転写したmRNAを無細胞タンパク質合成系に導入して発現し、発現されたタンパク質を分離・精製することによっても抗原を調製することができる。
 診断キット・診断方法(1)
 本発明は、対象のエビアレルギーを診断するための指標を提供する方法であって、以下の工程:
 (i)対象から得られた試料を抗原に接触させる、ここで当該試料はIgE抗体が含まれる溶液である;
 (ii)対象から得られた試料中のIgE抗体と当該抗原との結合を検出する;
 (iii)対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、対象がエビアレルギーであることの指標が提供される;
を含み、ここで当該抗原は上記(1)~(11)の抗原として特定されるタンパク質の少なくとも一つである、前記方法を提供する。
 本明細書において「診断」とは、一般的に医師による(確定的な)診断以外に、可能性を含めた単なる「検出」も含む。
 対象から得られた試料とは、対象から採取されたIgE抗体、が含まれる溶液である。そのような溶液には、例えば、血液、唾液、痰、鼻水、尿、汗、涙が含まれる。対象から得られた試料は、抗原に接触させる前に、試料中のIgE抗体濃度を高めるための前処理が施されていてもよい。試料の前処理としては、例えば血液から血清、血しょうを得ることが含まれてもよい。またさらに、抗原との結合部分であるFab部分を精製してもよい。特に好ましい態様において、上記工程(i)は、対象から得られた血清中のIgE抗体と抗原を接触させることにより行われる。
 IgE抗体は、IgE抗体そのものであってもよく、IgE抗体が結合した肥満細胞等であってもよい。
 対象から得られた試料と抗原との接触およびその結合の検出は、既知の方法により行うことが可能である。そのような方法には、例えば、ELISA(Enzyme-Linked Immunosorvent Assay)、サンドイッチ免疫測定法、イムノブロット法、免疫沈降法、イムノクロマト法による検出を用いることができる。これらはいずれも、抗原に対象のIgE抗体を接触させて結合させ、抗原に特異的に結合したIgE抗体に対して酵素標識した二次抗体を作用させ、酵素の基質(通常は、発色あるいは発光試薬)を加えて酵素反応の生成物を検出することにより、抗原と対象のIgE抗体の結合を検出する手法である。もしくは、蛍光標識した二次抗体を検出する方法である。あるいは、表面プラズモン共鳴(SPR)等の、抗原とIgE抗体の結合を評価可能な測定方法による検出を用いることもできる。複数種の抗原特異的IgE抗体が混合されていてもよい。
 抗原は、単離された抗原が担体に固定されている状態であってもよい。この場合は上記工程(i)および(ii)においてELISA、サンドイッチ免疫測定法、イムノクロマト法、表面プラズモン共鳴等が利用でき、また、上記工程(i)では、対象から得られた試料を、抗原を固定した面に接触させることにより行う。単離された抗原は、エビから当業者に周知のタンパク質精製方法を組み合わせて分離・精製することによって、または遺伝子組換え技術により調製することによって得てもよい。また、抗体が貼り付けられたものであってもよい。
 抗原は担体に固定されていない状態であってもよい。この場合は、上記工程(i)および(ii)において、フローサイトメトリー等が利用でき、レーザー光により抗体が結合した抗原の存在を確認できる。例えば、好塩基球活性化試験(BAT)等が挙げられる。また、抗原を試料中の血球にさらに接触させることにより、ヒスタミンを遊離するかどうかを調べるヒスタミン遊離試験(HRT)も挙げられる。
 また、抗原は2次元電気泳動により分離した状態から転写してイムノブロット法による検出を行ってもよい。2次元電気泳動は、1次元目に等電点電気泳動、2次元目にSDS-PAGEを行うことで、タンパク質試料を分離する手法である。この場合、2次元電気泳動の条件は、本願発明の抗原が分離できる条件であれば特に限定されない。例えば、上記「抗原の特定」の項目において記載した2次元電気泳動の条件を利用できる。あるいは、上述の特許文献1~4の記載を参考にして電気泳動の条件を定めることもでき、例えば、以下:
 (A)1次元目の等電点電気泳動ゲルとして、ゲル長が5~10cmの範囲内であって、ゲルのpH範囲が3~10であり、泳動方向に対するゲルのpH勾配が、pH5までのゲル長をa、pH5~7のゲル長をb、pH7以上のゲル長をcとした場合において、「a<b]及び「b>c」の関係を満たす;
 (B)(A)の場合であって、ゲルの全長を1とした場合、aが0.15~0.3の範囲内、bが0.4~0.7の範囲内、cが0.15~0.3の範囲内である;
 (C)1次元目の等電点電気泳動において、検体を含むゲル1本につき100V~600Vの範囲内の値の定電圧の印加による定電圧工程を行い、泳動30分あたりの泳動変化幅が5μAの範囲内となった後に前記定電圧から電圧を上昇させる電圧上昇行程を始める;
 (D)(C)の場合に、電圧上昇工程の最終電圧を3000V~6000Vの範囲内とする;
 (E)1次元目の等電点電気泳動ゲルの長手方向のゲル長が5~10cmであって、2次元目電気泳動ゲルの泳動方向基端部のゲル濃度を3~6%とする;および
 (F)(E)の場合に、2次元目電気泳動ゲルの泳動方向先端側の部分のゲル濃度が、泳動方向基端部のゲル濃度よりも高く設定する;
からなる群より選択される少なくとも一つを満たす条件で2次元電気泳動を行うことができる。
 上記(1)~(11)の抗原は、エビに対するアレルギーの患者のIgE抗体と特異的に結合する抗原である。したがって、対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、対象がエビに対するアレルギーであることの指標が提供される。
 本発明はまた、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを含むエビに対するアレルギーの診断キットを提供する。本発明の診断キットは、上記のエビに対するアレルギーを診断するための指標を提供する方法、または下記の診断方法に用いてもよい。本発明の診断キットは、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを含むほか、酵素標識された抗IgE抗体および当該酵素の基質となる発色基質または発光基質を含んでいてもよい。また、蛍光標識された抗IgE抗体を用いてもよい。本発明の診断キットにおいて、抗原は担体に固定化された状態で提供されてもよい。本発明の診断キットはまた、診断のための手順についての説明書や当該説明を含むパッケージと共に提供されてもよい。
 別の態様において、上記の診断キットは、エビに対するアレルギーについてのコンパニオン診断薬を含む。コンパニオン診断薬とは、医薬品の効果が期待される患者の特定または医薬品の重篤な副作用リスクを有する患者の特定、あるいは医薬品を用いた治療の最適化のために当該医薬品の反応性を検討するために用いるものである。ここで治療の最適化とは、例えば、用法容量の決定や投与中止の判断、どのアレルゲンコンポーネントを使って免疫寛容するかの確認等が含まれる。
 本発明はまた、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを含むエビに対するアレルギーの診断用組成物を提供する。本発明の診断用組成物は、下記の診断方法に用いることができる。本発明の診断用組成物は、必要に応じて本発明の抗原とともに一般的に用いられる、薬学的に許容される担体や添加剤を含んでいてもよい。
 一態様において、本発明は、対象のエビに対するアレルギーを診断する方法であって、以下の工程:
 (i)対象から得られた試料を抗原に接触させる;
 (ii)対象から得られた試料中のIgE抗体と当該抗原との結合を検出する;
 (iii)対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、対象がエビに対するアレルギーであると判断する;
ことを含み、ここで当該抗原は上記(1)~(11)の抗原として特定されるタンパク質の少なくとも一つである、前記方法を提供する。ここにおいて(i)および(ii)の各工程は、エビに対するアレルギーを診断するための指標を提供する方法の各工程について説明したとおりに行われる。
 別の態様において、本発明は、対象のエビに対するアレルギーを診断する方法であって、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを対象に投与することを含む、前記方法を提供する。当該方法は、皮膚に抗原を適用することを特徴とする皮膚テストの形式で行ってもよい。皮膚テストには、皮膚上に診断用組成物を適用した後に、出血しない程度に微少な傷をつけることで皮膚に抗原を浸透させて皮膚反応を観察するプリックテスト、診断用組成物を適用した上に皮膚を少し引っ掻いて反応を観察するスクラッチテスト、クリームや軟膏などの形態の診断用組成物を皮膚に適用して反応を観察するパッチテスト、抗原を皮内に投与して反応を観察する皮内テスト、などの形態が含まれる。抗原を適用した部分の皮膚に腫れなどの皮膚反応が生じた場合、その対象はエビに対するアレルギーを有すると診断する。ここで、皮膚に適用する抗原の量は、例えば、1回あたり100μg以下の用量であってよい。
 アレルギーの診断においては、抗原の特定を目的とした負荷試験がしばしば行われている。上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つは、エビに対するアレルギーであることを診断するための負荷試験の有効成分として用いることができる。ここで、負荷試験に用いる抗原タンパク質としては、発現精製したタンパク質であってもよく、例えば、イネにスギ花粉抗原の遺伝子を形質転換し、その抗原タンパク質を米内に発現させた花粉米のように、原料・加工品において発現させたものであってもよい。
 一態様において、上記の診断用組成物、診断キットは、プリックテスト、スクラッチテスト、パッチテスト、皮内テスト等のために使用することが可能である。
 また別の態様において、本発明はエビに対するアレルギーの診断に使用するための上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを提供する。ここで、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを、既知の抗原と混合して提供することも含む。
 さらなる別の態様において、本発明はエビに対するアレルギーの診断用組成物の製造においての上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つの使用を提供する。
 医薬組成物・治療方法(1)
 本発明は、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを含む医薬組成物を提供する。
 一態様において、上記の医薬組成物は、エビに対するアレルギーを治療するために用いられる。本明細書において、「アレルギーの治療」とは、体内に取り込んでも発症しない抗原の限界量を増やすことであり、最終的には通常の抗原の摂取量では発症しない状態(寛解)を目指すものである。
 本発明はまた、エビに対するアレルギーの治療を必要とする患者に対して、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを投与することを含む、エビに対するアレルギーを治療する方法を提供する。
 別の態様において、本発明はエビに対するアレルギーの治療に使用するための上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つを提供する。さらに別の態様において本発明は、エビに対するアレルギーの治療薬の製造のための上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つの使用を提供する。
 アレルギーの治療においては、患者に抗原を投与することで免疫寛容へと誘導することを目標とした、減感作療法がしばしば行われている。上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つは、エビに対するアレルギーに対する減感作療法のための有効成分として用いることができる。ここで、減感作療法に用いる抗原タンパク質としては、発現精製したタンパク質であってもよく、例えば、イネにスギ花粉抗原の遺伝子を形質転換し、その抗原タンパク質を米内に発現させた花粉米のように、原料・加工品において発現させたものであってもよい。
 本発明の医薬組成物は、通常の投与経路により投与することができる。通常の投与経路には例えば、経口、舌下、経皮、皮内、皮下、血液内、鼻腔内、筋肉内、腹腔内、直腸内の投与が含まれる。
 本発明の医薬組成物は、必要に応じて本発明の抗原と共に、一般的に用いられる薬学的に許容されるアジュバント、賦形剤、または各種の添加剤(例えば安定剤、溶解補助剤、乳濁化剤、緩衝剤、保存剤、着色剤等)を常法により添加した医薬組成物として用いることができる。医薬組成物の剤型は、投与経路に応じて当業者が適宜選択することができる。例えば、錠剤、カプセル剤、トローチ、舌下錠、注射剤、鼻腔内噴霧剤、パップ剤、液剤、クリーム剤、ローション剤、坐剤等の形態であってよい。本発明の医薬組成物の投与量、投与回数および/または投与期間は、投与経路、症状、年齢や体重などの患者の特性等に応じて医師が適宜選択することができる。例えば、成人の場合、1回あたり100μg以下の用量で投与してもよい。投与間隔は、例えば、毎日、毎週1回、月に2回、又は3ヶ月に1回程度であってよい。投与期間は例えば、数週間から数年であってよい。投与期間内において、投与量を段階的に増加させる投与方法であってもよい。
 テスター組成物(1)
 本発明は、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つに対する抗体を含むテスター組成物を提供する。
 当該抗体は、常法により作製することができる。例えば、ウサギなどの哺乳動物を上記(1)~(11)の抗原で免疫することにより作製してもよい。当該抗体は、Ig抗体、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、またはそれらの抗原結合フラグメント(例えば、Fab、F(ab’)、Fab’)であってもよい。
 また、上記のテスター組成物において、当該抗体は担体に結合した形で提供されていてもよい。担体は、抗体と抗原の結合の検出に利用可能な担体であれば特に限定されない。当業者に公知の任意の担体が利用できる。
 抗原含有の有無を調べる方法としては、例えば、以下の方法が挙げられる。
・作製したIg抗体を含むテスター組成物を原料・加工品等から得られた試料に接触させて、例えばELISA等を用いて当該Ig抗体と試料中の抗原との結合を検出し、当該Ig抗体と抗原との結合が検出された場合に、対象原料・加工品等に当該抗原が含まれると判断する方法。
・ろ紙などに原料・加工品をしみこませ、そこに含まれる抗原を検出するように、抗体溶液を反応させる方法。
 本発明の別の態様において、配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つの一部と相補的な塩基配列を有するプライマーを含むことを特徴とする、対象物におけるエビに対するアレルギーの抗原の有無を判定するためのテスター組成物を含む。非限定的に、上記プライマーは例えば、配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つの配列の一部の3’末端の部分または中央部分の配列の、好ましくは、12残基、15塩基、20塩基、25塩基と相補的な塩基配列を有する。特にmRNAを対象とする場合は、ポリAテールの相補プライマーを有する。好ましい態様において、上記のプライマーを含むテスター組成物は、さらに配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つの配列の5’末端の部分の塩基配列、好ましくは12塩基、15塩基、20塩基、25塩基からなる塩基配列を含むプライマーを含んでもよい。
 例えば、エビから得られたDNAまたはmRNAを鋳型として、前記相補的なプライマーを用い、RT-PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)を含むPCR(Polymerase Chain Reaction)でcDNAを増幅し、増幅されたcDNAの配列を配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548と比較することで、抗原の有無を判断する。PCRで増幅する方法は、RACE(Rapid Amplification of cDNA End)法等が例示できる。この時、増幅されたcDNAと配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548との比較において、同じアミノ酸をコードする点変異が存在する場合、または、増幅されたcDNAの塩基配列において、配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548の塩基配列に対する塩基の挿入、欠失、置換もしくは付加が存在しても、当該cDNAコードするアミノ酸配列が配列番号2、45、87、117、141、146、161、179、230、276、300、306、362、381、399、414、421、455、481、486、520、541または549のアミノ酸配列に対して同一性が70%以上、好ましくは80、90、95、98、99%以上となる場合は、抗原が存在すると判断する。
 一態様において、上記のテスター組成物は、例えば、食材(エビ)または食品製造ライン中などの対象物中の抗原含有の有無を調べるために用いられる。上記テスター組成物は、製造業者による製造ラインおよび出荷前製品の品質検査用として用いてもよく、喫食者自身による対象原料・加工品の抗原含有の有無のチェック用として用いてもよい。
 抗原の有無の判定方法(1)
 本発明は、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つに対する抗体を、原料・加工品(液体を含む)とを接触させることを含む、上記(1)~(11)の抗原の対象物質中の有無を判定する方法を含む。
 原料は食材であってもよく、化粧品原料、医薬品原料等であってもよい。加工品は食用加工品であってもよく、化粧品、医薬品等であってもよい。
 当該抗体、抗体の作製方法、抗体と原料・加工品とを接触させる方法、抗体と抗原との結合等については、「テスター組成物(1)」で上述した通りである。
 アレルゲン除去食品等(1)
 本発明は、上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つが除去又は低減されていることを特徴とするエビまたはエビ加工品を提供する。
 エビまたはエビ加工品において、本発明の抗原を除去又は低減する方法は限定されない。抗原の除去又は低減は、本発明の抗原が除去又は低減される限り、いかなる方法によって行われてもよい。
 例えば、本発明の抗原が除去又は低減されたエビは、遺伝子改変技術を用いて、本発明の抗原の発現が改変されたエビを調製してもよい。
 遺伝子改変技術は、当業者に公知の手法のいずれかを用いることができる。例えば、 Oishi, et al.(Scientific Reports, Vol.6, Article number: 23980, 2016, doi:10.1038/srep23980)は、ゲノム編集技術であるCRISPER/Cas9をニワトリの始原生殖細胞に適用して、オボムコイド遺伝子欠失個体を得ることを記載している。同様の手法を利用して、本発明の抗原が除去されたエビを得てもよい。
 また、抗原を含有しないまたは含有量の少ないエビとの人工授精による交配により、本発明の抗原が低減されたエビを得てもよい。エビの人工交配は国立研究開発法人水産研究・教育機構 水産工学研究所(「クルマエビ類の成熟・産卵と採卵技術」(奥村卓二・水藤勝喜編)愛知県水産業振興基金、2014)の方法等、常法により行うことができる。
 本発明の抗原が除去又は低減されたエビ加工品は、本発明の抗原が除去又は低減されたエビを原料とした加工品であってもよい。通常のエビを原料とする場合は、エビ加工品の調製前または調製後に本発明の抗原を除去又は低減する処理を行う。通常のエビを原料としたエビ加工品において本発明の抗原を除去又は低減する方法として、高圧処理および中性塩溶液による溶出や、高温スチーム等の、原料・加工品中のタンパク質成分を除去する方法や、熱処理および酸処理による加水分解・変性・アミノ酸変化(側鎖の化学修飾・脱離等)する方法が挙げられる。
 アレルゲン除去加工品の製造方法(1)
 本発明は、抗原が除去または低減されているエビまたはエビ加工品の製造方法であって、当該加工品の製造過程で抗原が除去又は低減されていることを確認するステップを有する、ここで当該抗原は上記(1)~(11)の抗原の少なくとも一つである、前記製造方法を提供する。
 抗原が除去または低減されているエビまたはエビ加工品の製造過程で抗原が除去又は低減されていることを確認するステップは、上記「テスター(1)」の項目において記載した方法により抗原の含有の有無を確認することにより行ってもよい。
 また、抗原が除去または低減されているエビまたはエビ加工品の製造は、上記「アレルゲン除去食品等」の項目において記載した方法により行ってもよい。
 抗原のエピトープ
 実施例1-3に示すとおり特定した抗原ならびにアルギニンキナーゼ(arginine kinase)ついて、実施例4に示すとおり、エピトープおよびそのエピトープ内でアレルギー患者のIgE抗体との結合性に重要なアミノ酸を特定した。
 本発明は、アレルギー患者のIgE抗体に特異的に結合するアミノ酸配列を含むポリペプチドとして後述の表3に記載の配列番号558-984の各アミノ酸配列を含む、または各アミノ酸配列からなる、(E1)~(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを提供する。(E1)~(E50)は、各々表3の「由来」に記載したタンパク質に由来するIgE抗体と結合するアミノ酸配列である(以下、「エピトープ」と呼称する場合がある)。
 ミオシン ヘビー チェイン タイプ 1由来:(E1)-(E4)、(E26)-(E43)
 ミオシン ヘビー チェイン タイプ 2由来:(E5)-(E11)
 グリコーゲン ホスホリラーゼ由来:(E12)、(E13)
 ヘモシアニン サブユニット L1由来:(E14)、(E15)、(E44)
 ピルベート キナーゼ 3由来:(E16)、(E17)、(E45)
 ホスホピルベート ヒドラターゼ由来:(E18)、(E46)、(E47)
 ミトコンドリアル ATP シンターゼ サブユニット アルファ プレカーサー由来:(E19)、(E20)
 トロポニン I由来:(E21)、(E48)、(E49)
 シクロフィリンA由来:(E22)、(E23)、(E50)
 アルギニンキナーゼ由来:(E24)、(E25)
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドは、ペプチドの固相合成など化学合成の手法により調製してもよい。または、エピトープを含むポリペプチドは、当業者に周知の遺伝子組換え技術により組換えポリペプチドとして発現させ、そして当業者に周知のタンパク質生成方法により分離・生成することによって得てもよい。ポリペプチドは、2種以上を組み合わせて連結してもよく、1種のエピトープを繰り返し連結させたものであってもよい。その場合一般に、Ig抗体との結合性が向上する。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの長さは特に限定されない。好ましい態様において、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの長さは、500アミノ酸以下、300アミノ酸以下、200アミノ酸以下、100アミノ酸以下、50アミノ酸以下、30アミノ酸以下、20アミノ酸以下、15アミノ酸以下、10アミノ酸以下、または5アミノ酸以下であってもよい。ポリペプチドが1種以上の上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を1回または2回以上繰り返し連結させたものである場合、好ましい態様において当該アミノ酸配列部分の長さは、1000アミノ酸以下、750アミノ酸以下、500アミノ酸以下、250アミノ酸以下、100アミノ酸以下、75アミノ酸以下、50アミノ酸以下、30アミノ酸以下、15アミノ酸以下、10アミノ酸以下、または5アミノ酸以下であってもよい。上記ポリペプチドの長さとして好ましい態様に記載のアミノ酸残基の数は、スペーサーの前後の(スペーサを含まない)配列の長さの合計である。
 表3に記載の配列番号558-984のうち、表3の「共通15残基配列」に記載の、配列番号558,566、582、586、594、599、614、624、634、640、654、671、672、678、681、686、691、697、704、705、708、717、725、729、741、750、752、765、770、778、788、793、810、817、826、833、847、858、865、879、881、892、908、912、915、917、928、935、939及び943の50種類の各配列は、オーバーラッピングに基づくエピトープマッピングにより、(E1)-(E50)の各エピトープにおいてIgE抗体と結合するエピトープとして同定された共通15アミノ酸残基配列である。本発明は一態様において、これらのアミノ酸配列を含む、あるいはこれらのアミノ酸配列からなるポリペプチドである。本発明のポリペプチド中に含まれるエピトープ配列は、この共通エピトープ15アミノ酸残基全体、またはその一部でありうる。エピトープ配列は、4アミノ酸残基以上、5アミノ酸残基以上、6アミノ酸残基以上、7アミノ酸残基以上、8アミノ酸残基以上、9アミノ酸残基以上、10アミノ酸残基以上、11アミノ酸残基以上、12アミノ酸残基以上、13アミノ酸残基以上、14アミノ酸残基以上である。
 本明細書の実施例において、例えば、4アミノ酸残基からなるポリペプチド(例えば、配列番号587、593、595、636、655、662、663,679、707、726,727,794、880等)が多数において、エピトープの交差反応性が確認された。さらに、5アミノ酸残基、それ以上の場合も多数、エピトープの交差反応性が確認された。よって、少なくとも4アミノ酸残基存在すれば、各種抗原との交差反応性を検出するためのエピトープ配列として有用である。
 よって、配列番号558-984のうち「共通15残基配列」、即ち、配列番号558,566、582、586、594、599、614、624、634、640、654、671、672、678、681、686、691、697、704、705、708、717、725、729、741、750、752、765、770、778、788、793、810、817、826、833、847、858、865、879、881、892、908、912、915、917、928、935、939及び943以外の各アミノ酸配列を含む、あるいはこれらのアミノ酸配列からなるポリペプチドも本発明に含まれる。
 表3において、「好ましい」配列は、「共通15残基配列」のうちエピトープとして機能し得るより短い部分配列である。「鍵」配列は、「共通15残基配列」または「鍵」配列のうち、特に重要と思われる配列を示す。「鍵」の配列のうち、「X」で示されたアミノ酸配列はアラニングリシンスキャンにより任意のアラニン(元のアミノ酸残基がアラニンの場合にはグリシン)に変更してもIgE抗体への結合性が残存することが確認されたアミノ酸残基である。よって、Xは、任意のアミノ酸残基であり、好ましくはアラニン(又はグリシン)である。なお、「鍵」の配列において「X」で示された配列が含まれないものは、アラニングリシンスキャンでIgE抗体への結合性が残存することが確認されたアミノ酸残基が見出されなかった場合である。
 (E1)のエピトープに関し、配列番号560、562、564、565において、Xと示されているアミノ酸残基は、変化させてもIgE抗体への結合性が残存することが確認されたアミノ酸残基である。よって、配列番号558-565において、配列番号558の4、5、7、8、10、11、12、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されていてもよい。本発明は好ましくは、各「好ましい配列」に対応する「鍵配列」においてXと示されているアミノ酸残基の1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されていてもよい。例えば、一態様において、好ましい配列である配列番号559において対応する鍵配列は配列番号560である。好ましくは、配列番号559において、配列番号560でXとなっている2、6、7、8、9番目のアミノ酸残基(配列番号558の8、12、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当)が、任意の置換されうるアミノ酸残基である。あるいは、別の一態様において、好ましい配列である配列番号563において対応する鍵配列は配列番号564である。好ましくは、配列番号563において、配列番号564でXとなっている1,2,4,5,7,8番目のアミノ酸残基(配列番号558の4、5、7、8、10、11番目のアミノ酸残基に相当)が、任意の置換されうるアミノ酸残基である。以下、(E1)のその他の「好ましい配列、「鍵配列」、(E2)-(E50)において同様である。
 置換されていても良いアミノ酸残基の数は限定されない、好ましくは、6個以下、5個以下、4個以下、3個以下、2個以下、1個以下である。以下、(E2)-(E50)において同様である。
 (E1)-(E50)のエピトープに関する情報をまとめて表1に示す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
 表3のグラフNo.1-114の右の「合成配列」及び/又は「配列番号」の欄に記載の各配列は、実施例5においてエピトープ交差反応が確認された配列である。「エピトープ交差反応性が確認された」とは、各アレルギー患者の血清のIgE抗体が、非アレルギー被験者の血清中のIgE抗体よりもより高い結合性を示した(具体的には、図7-12において「1」より大きい)ことを意味する。よって、一態様において、本発明のポリペプチドは、これらのアミノ酸配列を含む、または、これらのアミノ酸配列からなるポリペプチドを含む。一態様において、本発明のポリペプチドに対し、各アレルギー患者の血清のIgE抗体は、、非アレルギー被験者の血清中のIgE抗体よりも、1.05倍以上、1.10倍以上、1.15倍以上、1.20倍以上、1.25倍以上高い結合性を示す。
 本明細書において、「(E1)~(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチド」は、配列番号558-984の各アミノ酸配列を含む、または各アミノ酸配列からなるポリペプチド、並びに、上述したようにアミノ酸残基が置換されている態様のいずれをも含む。「配列番号558-984の各アミノ酸配列を含む」とは、配列番号558-984の各アミノ酸配列(これらの上記置換された態様も含む)とIgE抗体との結合(即ち、これらのエピトープとしての機能)に影響を与えない範囲において、その他の任意のアミノ酸配列を含んで良いことを意味する。
 診断キット・診断方法(2)
 本発明は、対象のアレルギーを診断するための指標を提供する方法であって、以下の工程:
 (i)対象から得られた試料を抗原に接触させる、ここで当該試料はIgE抗体が含まれる溶液である;
 (ii)対象から得られた試料中のIgE抗体と当該抗原との結合を検出する;
 (iii)対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、対象がアレルギーであることの指標が提供される;
を含み、ここで当該抗原は上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つであるポリペプチド、または2以上の上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドがスペーサーを介してもしくは介さずに連結されたポリペプチドである、前記方法を提供する。
 以下、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つであるポリペプチド、または2以上の上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドがスペーサーを介してもしくは介さずに連結されたポリペプチドを、本明細書において「上記(E1)-(E50)を含む抗原」と記載する場合がある。スペーサーの種類は特に限定されず、複数のペプチドを連結するのに当業者が通常使用するものを利用できる。スペーサーは例えば、Acp(6)-OHなどの炭化水素鎖、アミノ酸鎖等のポリペプチドであってもよい。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドがスペーサーを介してもしくは介さずに連結される場合、連結されるポリペプチドの数は特に限定されない。一態様において、2個以上、3個以上、4個以上、5個以上、6個以上、8個以上、10個以上、15個以上である。一態様において、30個以下、20個以下。15個以下。10個以下、8個以下、6個以下、5個以下、3個以下、2個以下である。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドのうち、同じものが繰り返されるものであっても、別のものが複数連結されたものでもよい。このように複数の上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドが連結された場合でも、本願発明のポリペプチドとして、本発明の方法、キット、組成物に適用しうる。
 対象から得られた試料は、上記「診断キット・診断方法(1)」の項目において記載したとおりである。
 対象から得られた試料と当該ポリペプチドとの接触およびその結合の検出は、上記「診断キット・診断方法(1)」の項目において記載した既知の方法、例えば、ELISA(Enzyme-Linked Immunosorvent Assay)、サンドイッチ免疫測定法、イムノブロット、免疫沈降法、イムノクロマト法等により行うことが可能である。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドは、担体に固定されている状態であってもよい。この場合は上記工程(i)および(ii)においてELISA、サンドイッチ免疫測定法、イムノクロマト法、表面プラズモン共鳴等が利用でき、上記工程(i)は、対象から得られた試料を、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを固定した面に接触させることにより行う。また、対象のIgE抗体が担体に固定されている状態のものを利用し、上記の手法により上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドとの結合を検出してもよい。担体への結合のため若しくは担体とスペースを設けるため、またはポリペプチドに抗体が接触しやすくするため、ポリペプチドのN末端またはC末端にはスペーサーやビオチン等のタグを付してもよい。ビオチンとの結合の場合、担体にはアビシンを有することが好ましい。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドは担体に固定されていない状態であってもよい。この場合は、上記工程(i)および(ii)において、フローサイトメトリー等が利用でき、レーザー光によりIgE抗体が結合した上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの存在を確認できる。この方法は例えば、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの接触により好塩基球が活性化したときに現れる表面抗原CD203cを検出する方法である、好塩基球活性化試験(BAT)が挙げられる。また、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを試料中の血球にさらに接触させることにより、ヒスタミンを遊離するかどうかを調べるヒスタミン遊離試験(HRT)も挙げられる。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドは、アレルギー患者のIgE抗体と特異的に結合する抗原である。したがって、対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、交差性まで含めて、対象がアレルギーであることの指標が提供される。上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの合成においては、例えば大腸菌を用いた合成を容易にするため、エピトープの前後に配列を付加し、配列長を長くすることがある。そのような場合も、対象のIgE抗体と上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列との結合が検出されれば、交差性まで含めて、対象がアレルギーであることの指標が提供される。従って、エピトープである上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列の前後に如何なるものが付加されていてもよい。
 本発明はまた、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを含むアレルギーの診断キットを提供する。本発明の診断キットは、上記のアレルギーを診断するための指標を提供する方法、または下記の診断方法に用いてもよい。本発明の診断キットは、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを含むほか、酵素標識された抗IgE抗体および当該酵素の基質となる発色基質または発光基質を含んでいてもよい。また、蛍光標識された抗IgE抗体を用いてもよい。本発明の診断キットにおいて、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドは担体に固定化された状態で提供されてもよい。本発明の診断キットはまた、診断のための手順についての説明書や当該説明を含むパッケージと共に提供されてもよい。
 別の態様において、上記の診断キットは、アレルギーについてのコンパニオン診断薬を含む。コンパニオン診断薬とは、医薬品の効果が期待される患者の特定または医薬品の重篤な副作用リスクを有する患者の特定、あるいは医薬品を用いた治療の最適化のために当該医薬品の反応性を検討するために用いるものである。ここで治療の最適化とは、例えば、用法容量の決定や投与中止の判断、どのアレルゲンコンポーネントを使って免疫寛容するかの確認等が含まれる。
 本発明はまた、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを含むアレルギーの診断用組成物を提供する。本発明の診断用組成物は、下記の診断方法に用いることができる。本発明の診断用組成物は、必要に応じて本発明のポリペプチドとともに一般的に用いられる、薬学的に許容される担体や添加剤を含んでいてもよい。
 一態様において、本発明は、対象のアレルギーを診断する方法であって、以下の工程:
 (i)対象から得られた試料を抗原に接触させる;
 (ii)対象から得られた試料中のIgE抗体と当該抗原との結合を検出する;
 (iii)対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、対象がアレルギーであると判断する;
ことを含み、ここで当該抗原は上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドして特定されるポリペプチドの少なくとも一つである、前記方法を提供する。ここにおいて(i)および(ii)の各工程は、アレルギーを診断するための指標を提供する方法の各工程について説明したとおりに行われる。
 別の態様において、本発明は、対象のアレルギーを診断する方法であって、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを対象に投与することを含む、前記方法を提供する。当該方法は、皮膚に上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを適用することを特徴とする皮膚テストの形式で行ってもよい。皮膚テストには、皮膚上に診断用組成物を適用した後に、出血しない程度に微少な傷をつけることで皮膚に上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを浸透させて皮膚反応を観察するプリックテスト、診断用組成物を適用した上に皮膚を少し引っ掻いて反応を観察するスクラッチテスト、クリームや軟膏などの形態の診断用組成物を皮膚に適用して反応を観察するパッチテスト、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを皮内に投与して反応を観察する皮内テスト、などの形態が含まれる。上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを適用した部分の皮膚に腫れなどの皮膚反応が生じた場合、その対象はアレルギーを有すると診断する。ここで、皮膚に適用する上記ポリペプチドの量は、例えば、1回あたり100μg以下の用量であってよい。
 アレルギーの診断においては、抗原の特定と抗原摂取と症状の程度の検証を目的とした経口負荷試験がしばしば行われている。上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つは、アレルギーであることを診断するための経口負荷試験の有効成分として用いることができる。ここで、経口負荷試験に用いるポリペプチドとしては、発現精製したポリペプチドであってもよく、例えば、イネにスギ花粉抗原の遺伝子を形質転換し、そのポリペプチドを米内に発現させた花粉米のように、原料・加工品において発現させたものであってもよい。
 一態様において、上記の診断用組成物、診断キットは、プリックテスト、スクラッチテスト、パッチテスト、皮内テスト等のために使用することが可能である。
 また別の態様において、本発明はアレルギーの診断に使用するための上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを提供する。
 さらなる別の態様において、本発明はアレルギーの診断薬の製造においての上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つの使用を提供する。
 本項目において、診断対象となるアレルギーは、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドに対するアレルギーであってよい。すなわち、アレルギーの検出および診断指標の提供を含むアレルギーの診断は、単一の上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドに対するアレルギーのみならず、交差性を含めたアレルギーを診断するものであり得る。
 医薬組成物・治療方法(2)
 本発明は、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを含む医薬組成物を提供する。一態様において、上記の医薬組成物は、アレルギーを治療するために用いられる。アレルギーの治療とは、体内に取り込んでも発症しないポリペプチドの限界量を増やすことであり、最終的には通常のポリペプチドの摂取量では発症しない状態(寛解)を目指すものである。
 本発明はまた、アレルギーの治療を必要とする患者に対して、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを投与することを含む、アレルギーを治療する方法を提供する。
 別の態様において、本発明はアレルギーの治療に使用するための上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを提供する。さらに別の態様において本発明は、アレルギーの治療薬の製造のための上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つの使用を提供する。
 アレルギーの治療においては、患者に抗原を投与することで免疫寛容へと誘導することを目標とした、減感作療法がしばしば行われている。上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つは、アレルギーに対する減感作療法のための有効成分として用いることができる。ここで、減感作療法に用いる抗原としては、発現精製したポリペプチドであってもよく、例えば花粉米のように、原料・加工品において発現させたものであってもよい。
 本発明の医薬組成物の投与経路、投与量、投与回数および/または投与期間、医薬組成物に含まれる他の成分、ならびに剤型については、上記「医薬組成物・治療方法(1)」の項目において記載したものとすることができる。上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを用いる場合の用量は、例えば、成人の場合、1回あたり100μg以下の用量であってもよい。
 本項目において、治療対象となるアレルギーは、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドに対するアレルギーであってよい。すなわち、アレルギーの治療は、単一の上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドに対するアレルギーのみならず、交差性を含めたアレルギーを治療するものであり得る。
 テスター組成物(2)
 本発明は、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つに対する抗体を含むテスター組成物を提供する。
 当該抗体は、常法により作製することができる。例えば、ウサギなどの哺乳動物を、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドで免疫することにより作製してもよい。当該抗体は、Ig抗体、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、またはそれらの抗原結合フラグメント(例えば、Fab、F(ab’)、Fab’)であってもよい。
 また、上記のテスター組成物において、当該抗体は担体に結合した形で提供されていてもよい。担体は、抗体と上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの結合の検出に利用可能な担体であれば特に限定されない。当業者に公知の任意の担体が利用できる。また、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドに対する抗体が、上記「抗原のエピトープ」の項目に記載されたエピトープおよび重要なアミノ酸が同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドに対する抗体であることが好ましい。それにより、交差性を含めて検出できるテスター組成物とすることができる。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチド含有の有無を調べる方法としては、例えば、以下の方法が挙げられる。
 ・作製した抗体を含むテスター組成物を原料・加工品等から得られた試料に接触させて、例えばELISA等を用いて当該抗体と試料中の上記(E1)-(E50)を含むのアミノ酸配列を含むポリペプチドとの結合を検出し、当該抗体と上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドとの結合が検出された場合に、対象原料・加工品等に当該のアミノ酸配列を含むポリペプチドが含まれると判断する方法。(「ポリペプチド含有の有無を調べる方法」には、当該抗体と上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドとの結合が低下した場合に、ポリペプチドが除去又は低減されている、と判断することを含む。)
 ・ろ紙などに原料・加工品等をしみこませ、そこに含まれる上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを検出するように、抗体溶液を反応させる方法。
 本発明の別の態様において、エピトープおよび重要なアミノ酸が同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドに対応するプライマーを含むことを特徴とする、対象物におけるアレルギーの上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの有無を判定するためのテスター組成物を含む。非限定的に、上記プライマーは例えば、上記(E1)-(E50)で特定したアミノ酸配列をコードする核酸の塩基配列の一部またはその相補鎖を含むように設計されたものであってもよい。あるいは、上記プライマーは、上記(E1)-(E50)で特定したアミノ酸配列であるエピトープおよび重要なアミノ酸が同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドを含むタンパク質をコードする核酸において、当該エピトープおよび重要なアミノ酸が同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする部分の上流側の領域の塩基配列またはそのエピトープおよび重要なアミノ酸が同一のアミノ酸配列を有するポリペプチドをコードする部分の下流側の領域の相補鎖の塩基配列となるように設計されたものであってもよい。そのようなプライマーとして、例えば配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つの一部であるプライマーおよび/または配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つと相補的な配列の一部であるプライマーが挙げられる。ここで、抗原の全長配列におけるエピトープの位置は、下記実施例4の表3において特定した通りである。また、特にmRNAを対象とする場合は、ポリAテールの相補プライマーを有していてもよい。
 例えば、試料から得られたDNAまたはmRNAを鋳型として、前記プライマーを用い、RT-PCRを含むPCR(Polymerase Chain Reaction)でDNAを増幅し、増幅されたDNAの配列において、上記(E1)-(E50)で特定したアミノ酸配列をコードする核酸を含むか否かを判定することで、上記(E1)-(E50)を含む抗原の有無を判断する。mRNAを対象にPCRで増幅する方法は、RACE法等が例示できる。増幅されたDNAにおいて可能な3通りのオープンリーディングフレームがコードするアミノ酸配列の一つが、上記(E1)-(E50)で特定したアミノ酸配列を含む場合、抗原を有すると判断する。DNAが増幅されない場合は、抗原を有しないと判断する。
 一態様において、上記のテスター組成物は、原料または加工品製造ライン中などの対象物中の上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチド含有の有無を調べるために用いられる。原料は食材であってもよく、化粧品原料、医薬品原料等であってもよい。加工品は食用加工品であってもよく、化粧品、医薬品等であってもよい。上記テスター組成物は、原料として含まれる生物種の探索用として用いてもよく、製造業者による製造ラインおよび出荷前製品の品質検査用として用いてもよく、喫食者または使用者自身による対象原料・加工品の抗原含有の有無のチェック用として用いてもよい。
 ポリペプチドの有無の判定方法(2)
 本発明は、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの原料・加工品中の有無を判定する方法を含む。当該方法は、原料・加工品中に上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドのアミノ酸配列の全体又は部分を有するポリペプチドを検出することを含む。
 一態様において、本発明の方法は、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つに対する抗体を、原料・加工品(液体を含む)とを接触させることを含む、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの対象物質中の有無を判定する、工程を含む。
 当該抗体、原料・加工品の定義抗体の作製方法、抗体と原料・加工品とを接触させる方法、抗体と抗原との結合等については、「テスター組成物(2)」で上述した通りである。
 あるいは、上記抗原の有無を判定する方法は、抗原に含まれる上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドのエピトープの部分を検出する態様も含む。「エプトープの部分」とは、好ましくは、4アミノ酸残基以上、6アミノ酸残基以上、8アミノ酸残基以上である。エピートープの部分の検出は、ポリペプチドの一部分の特定のアミノ酸配列を検出するための公知の方法で行うことが可能である。例えば、対象原料・加工品等(例えば、食材)のタンパク質を抗原除去処理のための消化酵素で切断し、HPLC等で分離し、任意のエピトープペプチドのピークが、抗原除去処理により低下したかどうかを測定する方法等、などが考えられる。あるいは、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの部分を認識する抗体を用いて、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む抗原の対象物質中の有無を判定してもよい。
 アレルゲン除去原料等(2)
 本発明は、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つが除去又は低減されていることを特徴とする原料または加工品を提供する。
 原料または加工品において本発明の抗原を除去又は低減する方法は限定されない。抗原の除去又は低減は、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドが除去又は低減される限り、いかなる方法によって行われてもよく、例えば上記「アレルゲン除去食品等」の項目に記載した手法を用いてもよい。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つが除去又は低減されているとは、アミノ酸配列全体が除去または低減されていることにより達成されてもよく、あるいは抗原タンパク質から、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列部分が切断または取り除かれることにより達成されてもよい。「取り除かれる」には、上記(E1)-(E50)で特定する配列部分のすべてまたは一部の欠失および改変を含む。
 例えば、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドが除去又は低減された原料は、遺伝子改変技術を用いて、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの発現がしなくなった原料を調製してもよい。遺伝子改変ノックアウト技術は、当業者に公知の手法のいずれかを用いることができる。
 上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドが除去又は低減された加工品は、タンパク質消化物を原料として用いた粉ミルクのように、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドが除去又は低減された原料を用いた加工品であってもよい。通常の原料を用いる場合は、加工品の調製前、調製中または調製後に上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを除去又は低減する処理を行う。「加工品の調製」とは、例えば食品原料(例:エビ)から食品加工品(例:エビ加工品、例えばエビフライ)を調製することを意味する。
 通常の原料を用いた加工品において上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチド原を除去又は低減する方法として、上記「アレルゲン除去食品等」の項目に記載した手法を用いてもよい。上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドを切断する方法としては、特定の消化酵素で切断する処理をする方法が挙げられる。
 アレルゲン除去加工品の製造方法(2)
 本発明は、(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つがが除去又は低減されている加工品の製造方法であって、当該加工品の製造過程で抗原が除去又は低減されていることを確認するステップを有する、前記製造方法を提供する。
 当該製造方法において、(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドが除去又は低減されているとは、上記(E1)-(E50)(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つが除去又は低減されているか、前記抗原から、上記(E1)-(E50)で特定する配列部分が切断または取り除かれていることを意味する。
 加工品の製造過程でポリペプチドが除去又は低減されていることを確認する手法は、特に限定されず、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つを検出可能ないかなる手法を用いてもよい。例えば、当該加工品の製造過程で生じる材料を含む試料と、上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つに対する抗体との結合性により、当該加工品中の当該ポリペプチドの存在の有無を確認してもよい。そのような方法の詳細は、上記「診断キット・診断方法(2)」の項目において記載した通りである。すなわち、上記製造方法においては、上記「診断キット・診断方法(2)」の項目における「対象のIgE抗体」を「上記(E1)-(E50)のアミノ酸配列を含むポリペプチドの少なくとも一つに対する抗体」と置き換え、上記「診断キット・診断方法(2)」の項目における「抗原」「ポリペプチド」を「加工品の製造過程で生じる材料を含む試料」と置き換えて、上記「診断キット・診断方法(2)」の項目において記載した手法を加工品の製造過程で抗原が除去又は低減されていることを確認するために用いることができる。また、上記「テスター組成物(2)」の項目で記載したテスター組成物を使用することもできる。
 以下に本発明の実施例を説明する。本発明の技術的範囲は、これらの実施例によって限定されない。
 実施例1:タンパク質パターンの確認
 下記の二次元電気泳動方法を使用して、エビ(バナメイエビ、ブラックタイガーおよびクルマエビ)に含まれるタンパク質を調べた。
 タンパク質の抽出
 エビに含まれるタンパク質の抽出及び精製は次のように行った。エビの身に、尿素バッファーを加えてタンパク質を抽出した。尿素バッファーの組成は以下の通りである。
30mM Tris
2M チオ尿素
7M 尿素
4%(w/v)  CHAPS:
3-[(3-コラミドプロピル)ジメチルアンモニオ]プロパンスルホナート
適量の希塩酸
蒸留水を加えて全体を100mLに調整した。pHは8.5であった。
 その後、2D-CleanUPキット(GE社製)を使用して2回の沈殿操作を行った。第1回目の沈殿操作は、回収した上記蛋白質抽出液にTCA(トリクロロ酢酸)を加えて沈殿を行い、当該操作で生じた沈殿(TCA沈殿)を回収した。第2回目の沈殿操作は、回収した前記TCA沈殿にアセトンを加えて沈殿を行い、当該操作で得られた沈殿(検体)を回収した。
 検体溶液の調製
 得られた検体の一部(タンパク質重量として50μg)を、1次元目等電点電気泳動用ゲルの膨潤用緩衝液であるDeStreak Rehydration Solution(GE社製)150μlに溶解し、1次元目等電点電気泳動用の検体溶液(膨潤用検体溶液)とした。DeStreak Rehyd
ration Solutionの組成は以下の通りである。
7M チオ尿素
2M 尿素
4%(w/v) CHAPS
0.5%(v/v) IPGバッファー;GE社製
適量のBPB(ブロモフェノールブルー)
 1次元目等電点電気泳動用ゲルへの検体の浸透
 1次元目等電点電気泳動用ゲル(GE社製:IPGゲルImmobiline Drystrip (pH3-10NL))を前記した1次元目等電点電気泳動用の検体溶液(膨張用検体溶液)140μlに浸漬し、一晩室温にて浸透させた。
 本実施例においては、電気泳動機器としてGE社製のIPGphorを使用した。
 泳動トレーにシリコンオイルを満たした。検体を浸透させたゲルの両端に水で湿らせた濾紙を設け、ゲルをシリコンオイルに覆われるよう、泳動トレーにセットし、ゲルとの間に当該濾紙を挟んだ状態で電極をセットした。
 等電点電気泳動機器の電流値の上限をゲル1本当たり75μAに設定し、電圧プログラムを、(1)300V定電圧で750Vhrまで定電圧工程を行い(当該工程終了前の泳動30分間の電流変化幅が5μAであった)、(2)300Vhrかけて1000Vまで徐々に電圧を上昇させ、(3)更に4500Vhrかけて5000Vまで徐々に電圧を上昇させ、(4)その後5000V定電圧で総Vhrが12000になるまで、1次元目の等電点電気泳動を行った。
 等電点電気泳動ゲルのSDS平衡化
 上記の1次元目の等電点電気泳動を行った後、等電点電気泳動機器からゲルを取り外し、還元剤を含む平衡化緩衝液に当該ゲルを浸漬して、15分・室温にて振とうした。上記還元剤を含む平衡化緩衝液の組成は以下の通りである。
100mM Tris-HCl(pH8.0)
6M 尿素
30%(v/v) グリセロール
2%(w/v) SDS
1%(w/v) DTT
 次に、上記還元剤を含む平衡化緩衝液を除き、ゲルをアルキル化剤を含む平衡化緩衝液に浸漬して、15分・室温にて振とうし、SDS平衡化したゲルを得た。上記アルキル化剤を含む平衡化緩衝液の組成は以下の通りである。
100mM Tris-HCl(pH8.0)
6M 尿素
30%(v/v) グリセロール
2%(w/v) SDS
2.5%(w/v) ヨードアセトアミド
 2次元目のSDS-PAGE
 本実施例においては、電気泳動機器としてlife technologies社製のXCell SureLock Mini-Cellを使用した。2次元目泳動用ゲルはlife technologies社製NuPAGE 4-12% Bis-Tris Gelsを使用した。また、以下の組成の泳動用緩衝液を調製し、使用した。
50mM MOPS
50mM Tris塩基
0.1%(w/v) SDS
1mM EDTA
 また、本実施例においては泳動用緩衝液に0.5%(w/v)のアガロースS(ニッポンジーン社製)と適量のBPB(ブロモフェノールブルー)を溶解させた接着用アガロース溶液を使用した。
 SDS-PAGEのウェル中を十分に上記泳動用緩衝液で洗浄した後、当該洗浄に用いた緩衝液を取り除いた。次に、ウェルの中に充分に溶解させた接着用アガロース溶液を添加した。次に、SDS平衡化したゲルをアガロース中に浸漬させ、ピンセットでSDS平衡化したゲルと2次元目泳動用ゲルを密着させた。当該両ゲルが密着した状態でアガロースが充分に固まったのを確認し、200V定電圧で約45分間泳動を行った。
 ゲルの蛍光染色
 SYPRO Ruby(life technologies社製)を用いてゲルの蛍光染色を行った。
 まず、使用する密閉容器を事前に98%(v/v)のエタノールで十分に洗浄した。SDS-PAGE機器から泳動後の2次元目泳動用ゲルを取り外して、洗浄した密閉容器におき、50%(v/v)メタノール及び7%(v/v)酢酸含有水溶液に30分間浸漬する処理を2回行った。その後、当該水溶液を水に置換し、10分間浸漬した。次に、2次元目泳動用ゲルを40mlのSYPRO Rubyに浸漬し、室温で一晩振とうした。次に、SYPRO Rubyを除き、2次元目泳動用ゲルを水で洗浄した後、10%(v/v)メタノール及び7%(v/v)酢酸含有水溶液で30分間振とうした。更に当該水溶液を水に置換し、30分以上振とうした。
 解析
 上記一連の処理を施した2次元目泳動用ゲルをTyphoon9500(GE社製)を使用した蛍光イメージのスキャンに供した。エビの身に含まれるタンパク質について、2次元電気泳動の結果を図1(バナメイエビ)、図3(ブラックタイガー)および図5(クルマエビ)に示す。各図のゲルの写真の左側には、分子量マーカーのバンドが見られ、バンドの位置が特定の分子量(KDa)を示す。
 実施例2:イムノブロットでの抗原確認
 イムノブロットでの抗原確認は、バナメイエビ、ブラックタイガーおよびクルマエビについて、それぞれ実施例1に記載した手順を「2次元目のSDS-PAGE」まで行った後、以下の「メンブレンへの転写」「イムノブロット」「解析」の操作を行うことにより行った。
 メンブレンへの転写
 メンブレンへの転写は、以下の転写装置及び転写用緩衝液を用いて行った。
転写装置:XCell SureLock Mini-Cell およびXCell IIブロットモジュール(life technologies社製)
転写用緩衝液:NuPAGEトランスファーバッファー(×20)(life technologies社製)をmilliQ水で20倍希釈して使用した。
 具体的には以下の手順に従って二次元電気泳動ゲル中のタンパク質をメンブレン(PVDF膜)へ転写した。
 (1)PVDF膜を、100%メタノールに浸漬し、次にmilliQ水に浸漬し、その後、転写用緩衝液に移して、PVDF膜の親水化処理を行った。
 (2)スポンジ、ろ紙、2次元目のSDS-PAGEが終わったゲル、親水化処理済みPVDF膜、ろ紙、スポンジの順でセットし、転写装置中、30V定電圧で1時間通電した。
 イムノブロット
 メンブレンのイムノブロットを、1次抗体としてエビに対するアレルギーを有する患者の血清または非エビアレルギー被験者の血清を用いて行った。
 メンブレンのイムノブロットは、以下の手順に従って行った。
(1)転写したメンブレンを5%スキムミルク/PBST溶液(非イオン界面活性剤Tween 20を0.1%含むPBSバッファー)中、室温で1時間振とうした。
(2)1次抗体として、5%血清/5%スキムミルク/PBST溶液中、室温で1時間静置した。
(3)PBST溶液で洗浄した(5分×3回)。
(4)2次抗体として抗ヒトIgE-HRP(セイヨウワサビペルオキシダーゼ)を5%スキムミルク/PBST溶液で5000倍に希釈した溶液中、室温で1時間静置した。
(5)PBST溶液で洗浄した(5分×3回)。
(6)Pierce Western Blotting Substrate Plus(Thermo社製)で、5分間静置した。
 解析
 上記一連の処理を施したメンブレンをTyphoon9500(GE社製)を使用した蛍光イメージのスキャンに供した。
 エビアレルギー患者の血清を用いたイムノブロットを、対照である非エビアレルギー被験者の血清を用いたイムノブロットと比較した。エビに含まれるタンパク質についてエビアレルギー患者の血清を用いたイムノブロット(バナメイエビについて図2、ブラックタイガーについて図4、およびクルマエビについて図6)において、非エビアレルギー被験者の血清を用いた場合とは異なり、かつ公知のエビアレルゲンタンパク質とは異なる11のスポットが検出された。
 上記11のスポットの分子量および等電点はそれぞれ以下の通りである(図2、4、および6)。
スポット1:分子量100~200kDa、pI5.0~6.0
スポット2:分子量60~130kDa、pI5.5~9.0
スポット3:分子量100~200kDa、pI5.0~6.0
スポット4:分子量60~130kDa、pI5.5~9.0
スポット5:分子量80~130kDa、pI6.0~8.0
スポット6:分子量60~90kDa、pI5.0~6.0
スポット7:分子量55~70kDa、pI5.5~8.0
スポット8:分子量45~70kDa、pI5.0~7.0
スポット9:分子量50~60kDa、pI6.0~9.0
スポット10:分子量20~40kDa、pI8.0~10.0
スポット11:分子量15~20kDa、pI8.0~10.0
 実施例3:質量分析および抗原の同定
 上記の3つのスポットを生じる抗原について、質量分析によるアミノ酸配列の同定を行った。
 具体的には、以下の手順でタンパク質の抽出および質量分析を行った。
(1)エビ(バナメイエビ、ブラックタイガーおよびクルマエビ)について、実施例1及び2の手順に従ってタンパク質抽出、2次元電気泳動及びメンブレン転写を行い、0.008%Direct blue/40%エタノール・10%酢酸で振とうにより染色した。
(2)その後、40%エタノール・10%酢酸で5分間の処理を3回行って脱色し、水で5分間洗浄後、風乾した。
(3)目的のスポットをきれいなカッター刃で切り取り、遠心チューブに入れた。50μLのメタノールでメンブレン親水処理後、100μLの水で2回洗浄後遠心除去し、20μLの20mM NHHCO・50%アセトニトリルを加えた。
(4)1pmol/μLリシルエンドペプチダーゼ(WAKO)1μLを加え、37℃で60分間静置した後、溶液を新しい遠心チューブに回収した。20μLの20mM NHHCO・70%アセトニトリルをメンブレンに加え、室温にて10分間浸し、さらに回収した。0.1%ギ酸、4%アセトニトリル10μLで溶解し、チューブに移した。
(5)回収した溶液を減圧乾燥した後、A液(0.1%ギ酸、4%アセトニトリル溶液)15μlで溶解し、質量分析(ESI-TOF6600, AB Sciex社製)を行った。
(6)質量分析計から得られた質量データに基づくタンパク質の同定は、NCBIをサーチすることで行った。
 結果
 各スポットについて、質量分析を行ったところ、以下のアミノ酸配列が検出された。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
 さらに、各スポットについて、質量分析計から得られた質量データをNCBIで解析したところ、それぞれのスポットは以下のタンパク質であることが同定された。
 スポット1
・バナメイエビについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ 1(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAM65721.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB758443.1)のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号2、それをコードする塩基配列:配列番号1)
・ブラックタイガーについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ 1(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAM65719.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB758441.1)のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号45、それをコードする塩基配列:配列番号44)
・クルマエビについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ a(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAK61429.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB613205.1)のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号87、それをコードする塩基配列:配列番号86)
 スポット2
・バナメイエビについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ 1(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAM65721.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB758443.1)のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号117、それをコードする塩基配列:配列番号116)
・ブラックタイガーについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ 1(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAM65719.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB758441.1)のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号141、それをコードする塩基配列:配列番号140)
・クルマエビについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ a(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAK61429.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB613205.1)のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号146、それをコードする塩基配列:配列番号145)
 スポット3
・バナメイエビについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ 2(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAM65722.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB758444.1)のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号161、それをコードする塩基配列:配列番号160)
・ブラックタイガーについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ 2(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAM65720.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB758442.1)のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号179、それをコードする塩基配列:配列番号178)
・クルマエビについてミオシン ヘビー チェイン タイプ b(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAK61430.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB613206.1)のC末端部分(アミノ酸配列:配列番号230、それをコードする塩基配列:配列番号229)
 スポット4
・バナメイエビについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ 2(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAM65722.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB758444.1)のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号276、それをコードする塩基配列:配列番号275)
・ブラックタイガーについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ 2(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAM65720.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB758442.1)のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号300、それをコードする塩基配列:配列番号299)
・クルマエビについて、ミオシン ヘビー チェイン タイプ b(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAK61430.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB613206.1)のN末端部分(アミノ酸配列:配列番号306、それをコードする塩基配列:配列番号305)
 スポット5
・クルマエビについて、グリコーゲン ホスホリラーゼ(NCBIのタンパク質アクセッション番号BAJ23879.1、GenBank のDNAアクセッション番号AB596876.1)(アミノ酸配列:配列番号362、それをコードする塩基配列:配列番号361)
バナメイエビおよびブラックタイガーについては、NCBIのタンパク質アクセッション番号BAJ23879.1がヒットした。このことから、バナメイエビおよびブラックタイガーにグリコーゲン ホスホリラーゼのホモログが存在し、それがエビアレルギーの抗原となることが示された。
 スポット6
・バナメイエビについて、ヘモシアニン サブユニット L1の一部(NCBIのタンパク質アクセッション番号AHY86471.1、GenBank のDNAアクセッション番号KF193058.1)(アミノ酸配列:配列番号381、それをコードする塩基配列:配列番号380)
・ブラックタイガーについて、ヘモシアニン(NCBIのタンパク質アクセッション番号AEB77775.1、GenBank のDNAアクセッション番号JF357966.1)(アミノ酸配列:配列番号399、それをコードする塩基配列:配列番号398)
・クルマエビについて、ヘモシアニン サブユニット L(NCBIのタンパク質アクセッション番号ABR14693.1、GenBank のDNAアクセッション番号EF375711.1)(アミノ酸配列:配列番号414、それをコードする塩基配列:配列番号413)
 スポット7
・バナメイエビについて、ピルベート キナーゼ 3(NCBIのタンパク質アクセッション番号ABY66598.1、GenBank のDNAアクセッション番号EU216039.1)(アミノ酸配列:配列番号421、それをコードする塩基配列:配列番号420)
ブラックタイガーについては、NCBIのタンパク質アクセッション番号ABY66598.1がヒットした。このことから、ブラックタイガーにピルベート キナーゼ 3のホモログが存在し、それがエビアレルギーの抗原となることが示された。
 スポット8
・ブラックタイガーについて、ホスホピルベート ヒドラターゼ(NCBIのタンパク質アクセッション番号AAC78141.1、GenBank のDNAアクセッション番号AF100985.1)(アミノ酸配列:配列番号455、それをコードする塩基配列:配列番号454)
・クルマエビについてホスホピルベート ヒドラターゼ(NCBIのタンパク質アクセッション番号ALL27930.1、GenBank のDNAアクセッション番号KR184189.1)(アミノ酸配列:配列番号481、それをコードする塩基配列:配列番号480)
バナメイエビについては、NCBIのタンパク質アクセッション番号AAC78141.1がヒットした。このことから、バナメイエビにホスホピルベート ヒドラターゼのホモログが存在し、それがエビアレルギーの抗原となることが示された。
 スポット9
 ・バナメイエビについて、ミトコンドリアル ATP シンターゼ サブユニット アルファプレカーサー(NCBIのタンパク質アクセッション番号ADC55251.1、GenBank のDNAアクセッション番号GQ848643.3)(アミノ酸配列:配列番号486、それをコードする塩基配列:配列番号485)
ブラックタイガーおよびクルマエビについては、NCBIのタンパク質アクセッション番号ADC55251.1がヒットした。このことから、ブラックタイガーおよびクルマエビにミトコンドリアル ATP シンターゼ サブユニット アルファ プレカーサーのホモログが存在し、それがエビアレルギーの抗原となることが示された。
 スポット10
・バナメイエビについて、トロポニン I(NCBIのタンパク質アクセッション番号AFW99839.1、GenBank のDNAアクセッション番号JX683730.1)(アミノ酸配列:配列番号520、それをコードする塩基配列:配列番号519)
ブラックタイガーおよびクルマエビについては、NCBIのタンパク質アクセッション番号AFW99839.1がヒットした。このことから、ブラックタイガーおよびクルマエビにトロポニン Iのホモログが存在し、それがエビアレルギーの抗原となることが示された。
 スポット11
・バナメイエビについて、シクロフィリン A(NCBIのタンパク質アクセッションAEP83534.1、GenBank のDNAアクセッション番号JN546074.1)(アミノ酸配列:配列番号541、それをコードする塩基配列:配列番号540)
・ブラックタイガーについて、ブラックタイガー由来のシクロフィリン A(NCBIのタンパク質アクセッションAGS46493.1、GenBank のDNAアクセッション番号KF214635.1)(アミノ酸配列:配列番号549、それをコードする塩基配列:配列番号548)
・クルマエビについては、NCBIのタンパク質アクセッションAEP83534.1がヒットした。このことから、クルマエビにシクロフィリン Aのホモログが存在し、それがエビアレルギーの抗原となることが示された。
 実施例4:エピトープの同定
 エビのアレルゲンコンポーネントのエピトープ
 エビのアレルゲンコンポーネントについて、以下の手順によりエピトープの同定を行った。
 (A)エピトープマッピング(1)
 エビのアレルギーコンポーネントとして特定したアミノ酸配列ならびにアルギニンキナーゼ(arginine kinase)のアミノ酸配列に対応するオーバーラップペプチド(長さ:15アミノ酸)のライブラリーによって、エピトープマッピングを行った。具体的には、配列番号117、141、146、2、45、87、276、161、230、179、362、381、399、421、455、481、486、520、541、300、306およびアルギニンキナーゼのアミノ酸配列に基づいてオーバーラップペプチドのライブラリーを調製した。
 合成する各ペプチドは、10アミノ酸ずつシフトさせた。すなわち各ペプチドは、前のペプチドおよび後のペプチドと、それぞれ5アミノ酸の重複を有する。
 ペプチドアレイの調製のため、Intavis CelluSpots(商標)技術を使用した。すなわち次の手順、(1)アミノ修飾セルロースディスク上に自動化合成装置(Intavis MultiPep RS)を用いて目的のペプチドを合成し、(2)前記アミノ修飾セルロースディスクを溶解させてセルロース結合ペプチド溶液を得て、(3)コーティングを施したスライドガラス上に前記セルロース結合ペプチドをスポットすることにより、ペプチドアレイを調製した。各手順の詳細は以下のとおりである。
 (1)ペプチドの合成
 384ウェル合成プレート中のアミノ修飾セルロースディスク上で、9-フルオレニルメトキシカルボニル(Fmoc)化学反応を利用して、ペプチド合成を段階的に行った。すなわち、Fmoc基がアミノ基に結合したアミノ酸をジメチルホルムアミド(DMF)中のN,N’-ジイソプロピルカルボジイミド(DIC)および1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)の溶液で活性化し、前記セルロースディスクに滴下してセルロースディスク上のアミノ基へ前記Fmoc基結合アミノ酸を結合させ(カップリング)、未反応のアミノ基を無水酢酸によりキャッピングしてDMFにより洗浄し、さらにピペリジンで処理してDMFにより洗浄して、セルロースディスク上のアミノ基に結合したアミノ酸のアミノ基からFmoc基を除去した。前記セルロースディスク上のアミノ基に結合したアミノ酸に対して、上記カップリング、キャッピング、およびFmoc基の除去を反復して行うことにより、アミノ末端を伸長させてペプチド合成を行った。
(2)アミノ修飾セルロースディスクの溶解
 上記「(1)ペプチドの合成」で得られた目的のペプチドが結合したセルロースディスクを96ウェルプレートに移し、アミノ酸の側鎖の脱保護のため、トリフルオロ酢酸(TFA)、ジクロロメタン、トリイソプロピルシラン(TIPS)、および水の側鎖脱保護混合液で処理した。その後、脱保護されたセルロース結合ペプチドを、TFA、トリフルオロメタンスルホン酸(TFMSA)、TIPS、および水の混合液で溶解し、テトラブチルメチルエーテル(TBME)で沈殿させ、ジメチルスルホキシド(DMSO)中に再懸濁し、NaCl、クエン酸Na、および水の混合液と混合し、スライドスポット用ペプチド溶液を得た。
(3)セルロース結合ペプチド溶液のスポット
 上記「(2)アミノ修飾セルロースディスクの溶解」で得られたスライドスポット用ペプチド溶液を、Intavisスライドスポッティングロボットを用いて、Intavis CelluSpots(商標)スライド上にスポットし、これを乾燥させてペプチドアレイを調製した。
 前記ペプチドアレイを用いて、抗原抗体反応によりエビアレルギー患者の血清中のIgE抗体が結合するか否かを各ペプチド断片について測定した。測定は以下の手順に従って行った。
 (1)ペプチドを、Pierce Protein-Free(PBS)Blocking Buffer(Thermo社製)中で、室温で1時間振盪した。
 (2)2%血清/Pierce Protein-Free(PBS)Blocking Buffer(Thermo社製)中で、4℃で一晩振盪した。
 (3)PBST(非イオン界面活性剤Tween 20を3%含むPBSバッファー)で5分洗浄した(×3回)。
 (4)抗ヒトIgE抗体-HRP(1:20,000、Pierce Protein-Free(PBS)Blocking Buffer(Thermo社製))を添加し、室温で1時間振盪した。
 (5)PBSTで5分洗浄した(×3回)。
 (6)Pierce ECL Plus Western Blotting Substrate(Thermo社製)を添加し、室温で5分間振盪した。
 (7)Amersham Imager 600を使用して、上記(1)~(6)の処理を施したペプチドの化学発光を測定した。
 上記(7)において測定して得られた画像に対して、ImageQuant TL(GEヘルスケア社)を用いて化学発光量を数値化した。5名の非エビアレルギー被験者の血清を使用した結果から得られた画像からそれぞれ数値化された値の中で2番目に高い値をN2nd値とし、37名の患者の血清を使用した結果から得られた画像から数値化された値からそれぞれペプチドのN2nd値の差をとった値において35,000以上の値を有するペプチドを患者特異的にIgE抗体と結合したペプチドと判断した。
 (B)エピトープマッピング(2):オーバーラッピング
 上記(A)により患者特異的に血清中IgE抗体が結合したペプチドの配列(配列番号558、566、582、586、594、599、614、624、634、640、654、671、672、678、681、686、691、697、704、705、708、717、725、729、741、750、752、765、770、778、788、793、810、817、826、833、847、858、865、879、881、892、908、912、915、917、928、935、939および943)を基に、当該ペプチドの配列および当該ペプチドの配列を含むアレルゲンコンポーネントのアミノ酸配列における当該ペプチドの前後の配列を付加した配列において、オーバーラップペプチド断片(長さ:10アミノ酸)のライブラリーを作製し、エピトープマッピングを行った。
 合成する各ペプチドは、1アミノ酸ずつシフトさせた。すなわち各ペプチドは、前のペプチドおよび後のペプチドと、それぞれ9アミノ酸の重複を有する。
 ライブラリーは上記(A)と同様の手順で調製し、上記と同様の手法で患者の血清中のIgE抗体が結合するか否かを各ペプチド断片について測定した。前記(3)セルロース結合ペプチド溶液のスポットの欄に記載の(1)、(4)~(6)のみを行った際の結果から得られた画像からそれぞれ数値化された値をコントロール値とし、患者の血清を使用した結果から得られた画像から数値化された値からそれぞれペプチドのコントロール値の差をとった値においてオーバーラッピングの基礎としたペプチドから得られた値と比較し、1アミノ酸ずつシフトさせたペプチドにより患者のIgE抗体への結合性が喪失あるいは著しく減少したペプチドは、IgE抗体の結合性がないペプチドと判断した。
 上記(A)と同様に、測定して得られた画像に対して化学発光量を数値化した。前記(3)セルロース結合ペプチド溶液のスポットの欄に記載の(1)、(4)~(6)のみを行った際の結果(2次抗体測定値)から得られた画像から数値化された値をコントロール値とし、患者の血清を使用した結果から得られた画像から数値化された値からそれぞれペプチドのコントロール値の差をとった値において、オーバーラッピングの基礎とした配列(配列番号558、566、582、586、594、599、614、624、634、640、654、671、672、678、681、686、691、697、704、705、708、717、725、729、741、750、752、765、770、778、788、793、810、817、826、833、847、858、865、879、881、892、908、912、915、917、928、935、939および943)により得られた値を100%としたとき、30%未満はIgE抗体との結合性なし、30%以上50%未満はIgE抗体との結合性は劣るが、IgE抗体との結合性はあり、50%以上70%未満はIgE抗体との結合性は多少劣るが、IgE抗体との結合性あり、70%以上はIgE抗体との結合性に差がないまたはIgE抗体との結合性がよいとして、IgE抗体との結合性が残存したペプチドであると判断した。
 この解析により、オーバーラッピングの基礎とした配列において、患者のIgE抗体との結合に重要な領域を見出した。
 (C)エピトープマッピング(3):アラニングリシンスキャン
 上記(A)で同定したアミノ酸配列について、アラニングリシンスキャンと呼ばれる手法(非特許文献5)により、アミノ末端側から1アミノ酸ずつアラニン(元のアミノ酸がアラニンの場合はグリシン)に置換したペプチド断片のライブラリーを、上記と同様の手法で調製し、上記と同様の手法で患者の血清中のIgE抗体が結合するか否かを各ペプチド断片について測定した。アラニングリシン置換により患者のIgE抗体への結合性が喪失あるいは著しく減少した位置のアミノ酸は、本来の抗原性の発現のために重要なアミノ酸、または本来の抗原性の発現に影響するアミノ酸と判断し、患者のIgE抗体への結合性が喪失あるいは著しく減少しなかったアミノ酸は、本来の抗原性の発現のためには重要ではなく、置換が可能なアミノ酸と判断した。
 上記(A)と同様に、測定して得られた画像に対して、化学発光量を数値化した。2次抗体測定値から得られた画像から数値化された値をコントロール値とし、37名の患者の血清を使用した結果から得られた画像から数値化された値からそれぞれペプチドのコントロール値の差をとった値において、アラニングリシンススキャンの基礎とした配列(配列番号558、566、582、586、594、599、614、624、634、640、654、671、672、678、681、686、691、697、704、705、708、717、725、729、741、750、752、765、770、778、788、793、810、817、826、833、847、858、865、879、881、892、908、912、915、917、928、935、939および943)により得られた値を100%としたとき、30%未満はIgE抗体との結合性なし、30%以上50%未満はIgE抗体との結合性は劣るが、IgE抗体との結合性はあり、50%以上70%未満はIgE抗体との結合性は多少劣るが、IgE抗体との結合性あり、70%以上はIgE抗体との結合性に差がないまたはIgE抗体との結合性がよいとして、IgE抗体との結合性が残存したペプチドであると判断した。
 (A)~(C)の結果を解析したところ、アラニングリシンスキャンの基礎とした配列における患者のIgE抗体との結合に重要な領域において、本来の抗原性の発現のために重要な共通配列を見出した。50種類全てのエピトープについて配列を特定し、結果を以下の表3にまとめた。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000007
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000008
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000009
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000010
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000011
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000012
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000013
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000014
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000015
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000016
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000017
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000018
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000019
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000020
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000021
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000022
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000023
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000024
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000025
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000026
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000027
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000028
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000029
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000030
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000031
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000032
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000033
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000034
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000035
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000036
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000037
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000038
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000039
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000040
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000041
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000042
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000043
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000044
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000045
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000046
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000047
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000048
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000049
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000050
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000051
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000052
 なお、各患者は以下の表4に示す食物等に対し、アレルギーを示すとの問診情報を得ている。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000053
 また、(E1)-(E50)の共通15残基配列に対し、表3に示した患者も含め、下記の表5に示す患者のIgE抗体が結合性を示した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000054
 実施例5:エピトープの交差性の確認
 上記表3の、エビの各タンパク質について見出された各エピトープ配列(配列番号559、561、563、567、569、571、573、576、578、580、583、585、587、588、591、593、595、596、597、600、602、604、606、608、611、612、615、617、619、621、623、625、626、630、632、635、636、637、639、641、643、645、646、647、649、651、653、655、656、658、660、662、663、664、666、668、669、673、676、679、680、682、683、684、687、689、692、694、695、698、700、702、703、706、707、709、711、713、715、719、721、723、724、726、727、728、730、732、734、736、738、742、744、746、748、751、753、755、757、759、761、763、764、766、767、768、771、772、774、776、779、781、783、785、787、789、791、794、795、797、799、801、803、805、808、811、813、815、818、820、822、824、827、829、831、834、836、838、840、842、845、848、850、851、852、854、856、859、861、863、866、868、870、872、875、877、880、882、884、885、887、889、893、895、897、899、900、902、904、906、909、910、913、914、916、918、920、921、923、926、929、931、933、936、937、940、942、944、946および947)中におけるIgE抗体との結合維持に重要なアミノ酸以外のアミノ酸を、任意のアミノ酸(X)とした鍵配列(配列番号560、562、564、565、568、570、572、574、575、577、579、581、584、589、590、592、598、601、603、605、607、609、610、613、616、618、620、622、627、629、631、633、636、638、642、644、648、650、652、657、659、661、665、667、670、674、675、677、685、688、690、693、696、701、710、712、714、716、720、722、731、733、735、737、739、740、743、745、747、749、754、756、758、760、762、769、773、775、777、780、782、784、786、790、792、796、798、800、802、804、806、807、809、812、814、816、819、821、823、825、828、830、832、835、837、839、841、843、844、846、849、853、855、857、860、862、864、867、869、871、873、874、876、878、984、883、886、888、890、891、894、896、898、901、903、905、907、911、919、922、924、925、927、930、932、934、938、941、945および948)について、各患者が同時に有するアレルゲン食材に対して同配列を有するタンパク質をNCBIで検索した結果、一例として表3-1~表3-50の「交差性確認食物」の列に記載の各食物の配列に含まれるアミノ酸配列がヒットした。
 表3の「合成配列」、再右列の「配列番号」の列に記載ののアミノ酸配列を含むペプチドについて、表3-1~表3-50の「交差性確認食物」の列に記載の各食物に対してアレルギーを有する患者のIgE抗体との結合性をELISAにより確認した。ペプチドは、Fmoc法によりN末端側でビオチン化されるように合成した。
 ELISAは、具体的には以下の手順に従って行った。
 (1)ビオチン化ペプチドの濃度が10μg/mLとなるようにPBST(0.1%Tween20)で調製した。
 (2)各ペプチド溶液をストレプトアビジン被覆した384ウェルプレートの各ウェルに20μL添加して、室温で1時間振盪した。溶液を回収後、PBSで5回洗浄した。
 (3)40μLのPierce Protein-Free(PBS)Blocking Buffer(Thermo社製)を添加して、室温で1時間振盪した。溶液を除去後、PBSTで5回洗浄した。
  (4)20μLの2%血清/Canget SignalSolution I (TOYOBO社製)を添加し、室温で1時間振盪した。溶液を除去後、PBSTで5回洗浄した。
 (5)20μLの二次抗体希釈液(1:10000、Canget SignalSolution II (TOYOBO社製))を添加し、室温で1時間振盪した。溶液を除去後、PBSTで5回洗浄した。
 (6)20μLの1-Step Ultra TMB-ELISA(Thermo社製)を添加し、室温で15分間振盪した。
 (7)20μLの2M HSOを添加した。450nmの吸光度を測定した。
 これらのアミノ酸配列を有するペプチドを、実施例4の(A)と同様の手順で調製し、アレルギー患者の血清および非アレルギー被験者の血清中のIgE抗体が結合するか否かを測定した。非アレルギー被験者の血清は2名分を測定してその平均値で割った値を表記した。
 結果を図7-12に示す。各図の縦軸は、「アレルギー患者の吸光度/非アレルギー患者(健常者)の吸光度」である。同じ配列に対する棒グラフが2本ある場合、グラフの濃淡が異なることは患者が別個であることを意味する。例えば、図7のグラフNo.8とNo.10は同一配列のペプチドに対する異なる患者の結果である。各グラフに記載の食材名は、使用した各合成配列の基礎となるアミノ酸配列を含むポリペプチドを含む食材名である。
 図7-12から明らかであるように、グラフNo,1-114に記載のアミノ酸配列を有する全てのポリペプチドにおいて、非アレルギー被験者の血清中のIgE抗体よりも各アレルギー患者のIgE抗体に対しより高い結合性(「1」より大きい)が示され、これらのポリペプチドの交差性が確認された。このことは、これらのエピトープがエビ以外の抗原との交差性を検出するのに利用できることを示している。さらに、「X」部分が任意のアミノ酸残基をとりうることを裏付ける。

Claims (11)

  1.  以下のポリペプチドの少なくとも一つを含む、アレルギーの診断キット。
     (E1)(i)配列番号558-565のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号558-565において、配列番号558の4、5、7、8、10、11、12、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E2)(i)配列番号566-581、949のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号566-581、949において、配列番号566の1、3、4、5、6、7、8、9、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E3)(i)配列番号582-585、950のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号582-585、950において、配列番号582の9、10、11、12、13番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E4)(i)配列番号586-593、951のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号586-593、951において、配列番号586の2、4、5、6、7、10、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E5)(i)配列番号594-598、952のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号594-598、952において、配列番号594の9、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E6)(i)、配列番号599-613、953、954のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号599-613、953、954において、配列番号599の2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E7)(i)配列番号614-623、955のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)、配列番号614-623、955において、配列番号614の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E8)(i)配列番号624-633のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号624-633において、配列番号624の3、5、6、7、8、10、11、12、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E9)(i)配列番号634-639のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号634-639において、配列番号634の4、6、8、10、11番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E10)(i)配列番号640-653、956、957のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号640-653、956、957において、配列番号640の4、6、8、9、11、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E11)(i)配列番号654-670のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号654-670において、配列番号654の2、4、5、6、7、8、9、10、12、13、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E12)配列番号671のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E13)(i)配列番号672-677、958のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号672-677、958において、配列番号672の6、7、8、9、10、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基に相当する任意のアミノ酸残基に置換されていてもよい。
     (E14)配列番号678-680のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E15)(i)配列番号681-685のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号681-685において、配列番号681の10番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E16)(i)配列番号686-690、959,960のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号686-690、959,960において、配列番号686の4、5、6、7、9、10、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E17)(i)配列番号691-696、961のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号691-696、961において、配列番号691の7、10、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E18)(i)配列番号697-703のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号697-703において、配列番号697の1、3、5番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E19)配列番号704のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E20)配列番号705-707のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E21)(i)配列番号708-716、962、963のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号708-716、962、963において、配列番号708の1、2、4、5、7、8、9、10、12、13、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E22)(i)配列番号717-724、964のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号717-724、964において、配列番号717の2、4、5、6、8、9、10、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E23)配列番号725-728のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E24)(i)配列番号729-740、965、966のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号729-740、965、966において、配列番号729の4、5、6、7、8、9、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E25)(i)配列番号741-749、967、968のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号741-749、967、968において、配列番号741の3、5、6、8、9、10、11、13番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E26)配列番号750-751のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E27)(i)配列番号752-764、969、970のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号752-764、969、970において、配列番号752の3、4、5、7、8、9、10、11番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E28)(i)配列番号765-769のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号765-769において、配列番号765の3、5、6番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E29)(i)配列番号770-777、971、972のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号770-777、971、972において、配列番号770の1、2、5、6、7、8、9、10、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E30)(i)配列番号778-787、973のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号778-787、973において、配列番号778の2、3、4、6、7、8、9、10、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E31)(i)配列番号788-792のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号788-792において、配列番号788の4、7、8、9、10、11、13番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E32)(i)配列番号793-809、974、975のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号793-809、974、975において、配列番号793の3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E33)(i)配列番号810-816のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号810-816において、配列番号810の2、4、5、6、7、8、9、10、12、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E34)(i)配列番号817-825のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号817-825において、配列番号817の2、4、5、7、8、9、11、12、13,14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E35)(i)配列番号826-832のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号826-832おいて、配列番号826の2、3、5、8、9、10、11、12、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E36)(i)配列番号833-846、976のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号833-846、976において、配列番号833の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E37)(i)配列番号847-857、977のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号847-857、977において、配列番号847の5、6、7、9、10、11、12、13、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E38)(i)配列番号858-864のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号858-864において、配列番号858の6、7、8、9、13、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E39)(i)配列番号865-878、984、978のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号865-878、984、978において、配列番号865の1、2、4、5、6、8、9、10、11、12番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E40)配列番号879-880のアミノ酸配列を含むポリペプチド;;
     (E41)(i)配列番号881-891、979のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号881-891、979において、配列番号881の2、3、4、6,9、10、11、12、13、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E42)(i)配列番号892-907、980のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号892-907、980において、配列番号892の1、2、3、4、5、8、9、10、11、12、13、14、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E43)(i)配列番号908-911、981のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号908-911、981において、配列番号908の7番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E44)配列番号912-914のアミノ酸配列を含むポリペプチド;;
     (E45)配列番号915-916のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E46)(i)配列番号917-927、982、983のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号917-927、982、983において、配列番号917の4、7、8、9、10、15番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E47)(i)配列番号928-934のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号928-934において、配列番号928の6、7、8、10、12、14番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E48)(i)配列番号935-938のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号935-938において、配列番号935の5、6番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E49)(i)配列番号939-942のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号939-942において、配列番号939の3、6、7、10、11番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (E50)(i)配列番号943-948のアミノ酸配列を含むポリペプチド;
     (ii)配列番号943-948において、配列番号943の1、2、3,4,5、8、10、11番目のアミノ酸残基に相当する1つないし複数のアミノ酸残基が任意のアミノ酸残基に置換されている、アミノ酸配列を含むポリペプチド。 
  2.  アレルギーの診断用組成物であって、請求項1に記載のポリペプチドの少なくとも一つを含む、前記診断用組成物。
  3.  アレルギー患者のIgE抗体に特異的に結合するポリペプチドであって、請求項1に記載のポリペプチドのいずれか一つである、前記ポリペプチド。
  4.  対象のアレルギーを診断するための指標を提供する方法であって、以下の工程:
    (i)対象から得られた試料を抗原に接触させる、ここで当該試料はIgE抗体が含まれる溶液である;
    (ii)対象から得られた試料中のIgE抗体と当該抗原との結合を検出する;
    (iii)対象のIgE抗体と当該抗原との結合が検出された場合、対象がアレルギーであることの指標が提供される;
    を含み、ここで当該抗原は、請求項3に記載のポリペプチドの少なくとも一つである、前記方法。
  5.  請求項3に記載のポリペプチドの少なくとも一つを含む医薬組成物。
  6.  アレルギーを治療するための、請求項5に記載の医薬組成物。
  7.  請求項3に記載のポリペプチドの少なくとも一つと結合する抗体を含むことを特徴とする、対象物における抗原の有無を判定するためのテスター組成物。
  8.  以下のいずれかのプライマー:
    (a)請求項3に記載のポリペプチドをコードする核酸の塩基配列の一部及び/またはその相補鎖の一部を含むプライマー;または
    (b)配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つの一部であるプライマーおよび/または配列番号1、44、86、116、140、145、160、178、229、275、299、305、361、380、398、413、420、454、480、485、519、540または548で示される塩基配列の少なくとも1つと相補的な配列の一部であるプライマー;
    を含むことを特徴とする、対象物における抗原の有無を判定するためのテスター組成物。
  9.  請求項3に記載のポリペプチドの原料・加工品中の有無を判定する方法であって、前記原料・加工品中に請求項3に記載のポリペプチドを検出する、ことを含む、前記方法。
  10.  抗原が除去若しくは低減されていることを特徴とする原料又は加工品であって、当該抗原は請求項3に記載のポリペプチドの少なくとも一つである、前記原料又は加工品。
  11.  抗原が除去若しくは低減されている加工品の製造方法であって、当該加工品の製造過程で抗原が除去若しくは低減されていることを確認するステップを有し、ここで当該抗原は請求項3に記載のポリペプチドの少なくとも一つである、前記製造方法。
     
     
     
     
     
     
PCT/JP2018/017472 2017-04-28 2018-05-01 アレルギーの抗原およびそのエピトープ WO2018199341A1 (ja)

Priority Applications (8)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201880043071.6A CN110799646B (zh) 2017-04-28 2018-05-01 变态反应的抗原及其表位
KR1020197032673A KR20200002888A (ko) 2017-04-28 2018-05-01 알레르기 항원 및 그 에피토프
JP2019514694A JP7184259B2 (ja) 2017-04-28 2018-05-01 アレルギーの抗原およびそのエピトープ
EP18792322.2A EP3617312A4 (en) 2017-04-28 2018-05-01 ALLERGY AGENTS AND EPITOPES FOR IT
US16/608,239 US20200188510A1 (en) 2017-04-28 2018-05-01 Allergy antigen and epitope thereof
JP2022181605A JP2023027061A (ja) 2017-04-28 2022-11-14 アレルギーの抗原およびそのエピトープ
US18/471,906 US20240108719A1 (en) 2017-04-28 2023-09-21 Allergy antigen and epitope thereof
JP2023200039A JP2024026181A (ja) 2017-04-28 2023-11-27 アレルギーの抗原およびそのエピトープ

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2017090438 2017-04-28
JP2017-090438 2017-04-28

Related Child Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
US16/608,239 A-371-Of-International US20200188510A1 (en) 2017-04-28 2018-05-01 Allergy antigen and epitope thereof
US18/471,906 Division US20240108719A1 (en) 2017-04-28 2023-09-21 Allergy antigen and epitope thereof

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2018199341A1 true WO2018199341A1 (ja) 2018-11-01

Family

ID=63919715

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2018/017472 WO2018199341A1 (ja) 2017-04-28 2018-05-01 アレルギーの抗原およびそのエピトープ

Country Status (5)

Country Link
US (2) US20200188510A1 (ja)
EP (1) EP3617312A4 (ja)
JP (3) JP7184259B2 (ja)
KR (1) KR20200002888A (ja)
WO (1) WO2018199341A1 (ja)

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114729015A (zh) * 2019-07-22 2022-07-08 第一美肤公司 具有抗衰老效果的多肽及其用途
WO2024128080A1 (ja) * 2022-12-16 2024-06-20 東亞合成株式会社 合成ペプチド及び構築物

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2022015934A2 (en) * 2020-07-15 2022-01-20 The Johns Hopkins Universtiy Comprehensive analysis of anti-allergen antibodies using phage display
CN115963273B (zh) * 2022-10-09 2024-04-12 中国海洋大学 一种三疣梭子蟹nSCP或rSCP的应用与试剂盒

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2002286716A (ja) 2001-03-28 2002-10-03 Iatron Lab Inc 複数項目同時分析可能なイムノクロマトグラフ法及びイムノクロマトグラフ用ストリップ
JP2011033544A (ja) 2009-08-04 2011-02-17 Hoyu Co Ltd 等電点電気泳動用ゲル及び等電点電気泳動方法
JP2011033548A (ja) 2009-08-04 2011-02-17 Hoyu Co Ltd 2次元電気泳動方法
JP2011033546A (ja) 2009-08-04 2011-02-17 Hoyu Co Ltd 等電点電気泳動方法及び粗雑物除去の判定方法
JP2011033547A (ja) 2009-08-04 2011-02-17 Hoyu Co Ltd 2次元電気泳動方法

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5449669A (en) * 1993-11-10 1995-09-12 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services IgE-binding epitopes of a major heat-stable crustacean allergen derived from shrimp
CA2503346C (en) * 2002-11-27 2014-03-18 Agensys, Inc. Nucleic acid and corresponding protein entitled 24p4c12 useful in treatment and detection of cancer
JP4444306B2 (ja) * 2007-04-05 2010-03-31 博 宮澤 エビアレルゲン及び抗エビアレルゲン抗体並びにその利用
US20120219545A1 (en) * 2009-07-31 2012-08-30 Mount Sinai School Of Medicine Materials and methods for diagnosing and treating shellfish allergy
MX2014009285A (es) * 2012-02-07 2015-02-04 Jolla Inst Allergy Immunolog Alergenos del fleo de los prados y metodos y usos para la modulacion de respuesta inmune.
WO2016183500A1 (en) * 2015-05-14 2016-11-17 La Jolla Institute For Allergy And Immunology Novel antigens and t cell epitopes from cockroach and methods of making and using same

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2002286716A (ja) 2001-03-28 2002-10-03 Iatron Lab Inc 複数項目同時分析可能なイムノクロマトグラフ法及びイムノクロマトグラフ用ストリップ
JP2011033544A (ja) 2009-08-04 2011-02-17 Hoyu Co Ltd 等電点電気泳動用ゲル及び等電点電気泳動方法
JP2011033548A (ja) 2009-08-04 2011-02-17 Hoyu Co Ltd 2次元電気泳動方法
JP2011033546A (ja) 2009-08-04 2011-02-17 Hoyu Co Ltd 等電点電気泳動方法及び粗雑物除去の判定方法
JP2011033547A (ja) 2009-08-04 2011-02-17 Hoyu Co Ltd 2次元電気泳動方法

Non-Patent Citations (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
"GenBank", Database accession no. KF214635.1
"Maturation and hatching of kuruma prawn Marsupenaeus japonicus", 2014, AICHI SEA-FARMING INSTITUTE
"NCBI", Database accession no. AGS46493.1
ALTSCHUL ET AL., J. MOL. BIOL., vol. 215, 1990, pages 403 - 10
ALTSCHUL ET AL., NUCL. ACIDS. RES., vol. 25, 1997, pages 3389 - 3402
AYUSO R. ET AL.: "Myosin light chain is a novel shrimp allergen, Lit v 3", JOURNAL OF ALLERGY AND CLINICAL IMMUNOLOGY, vol. 122, no. 4, October 2008 (2008-10-01), pages 795 - 802, XP025493926 *
GARCIA-OROZCO K.D. ET AL.: "Molecular characterization of arginine kinase, an allergen from the shrimp Litopenaeus vannamei", INT. ARCH. ALLERGY IMMUNOL., vol. 144, no. 1, August 2007 (2007-08-01), pages 23 - 28, XP009517535, ISSN: 1018-2438, DOI: 10.1159/000102610 *
J. KYTER. DOOLITTLE, J. MOL. BIOL., vol. 157, 1982, pages 105 - 132
KHANARUKSOMBAT S. ET AL.: "Identification of a novel allergen from muscle and various organs in banana shrimp (Fenneropenaeus merguiensis)", ANNALS OF ALLERGY, ASTHMA & IMMUNOLOGY, vol. 113, no. 3, 31 August 2014 (2014-08-31), pages 301 - 306, XP009517536, ISSN: 1081-1206, DOI: 10.1016/j.anai.2014.06.002 *
KOYAMA H. ET AL.: "Cloning, expression, and localization of two types of fast skeletal myosin heavy chain genes from black tiger and pacific white shrimps", JOURNAL OF EXPERIMENTAL ZOOLOGY PART A: ECOLOGICAL GENETICS AND PHYSIOLOGY, vol. 317, no. 10, December 2012 (2012-12-01), pages 608 - 621, XP055528407 *
LIN R. Y. ET AL.: "Identification and characterization of a 30 kd major allergen from Parapenaeus fissurus", JOURNAL OF ALLERGY AND CLINICAL IMMUNOLOGY, vol. 92, no. 6, December 1993 (1993-12-01), pages 837 - 845, XP000926734 *
MATSUO, H. ET AL., J. BIOL. CHEM., vol. 279, no. 13, 2004, pages 12135 - 12140
OISHI ET AL., SCIENTIFIC REPORTS, vol. 6, 2016
SAMBROOK ET AL.: "Molecular Cloning: A Laboratory Manual", 2001, COLD SPRING HARBOR LABORATORY PRESS
YU C. J. ET AL.: "Proteomics and immunological analysis of a novel shrimp allergen, Pen m 2", THE JOURNAL OF IMMUNOLOGY, vol. 170, no. 1, January 2003 (2003-01-01), pages 445 - 453, XP002487131 *

Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN114729015A (zh) * 2019-07-22 2022-07-08 第一美肤公司 具有抗衰老效果的多肽及其用途
CN114729015B (zh) * 2019-07-22 2024-01-12 第一美肤公司 具有抗衰老效果的多肽及其用途
WO2024128080A1 (ja) * 2022-12-16 2024-06-20 東亞合成株式会社 合成ペプチド及び構築物

Also Published As

Publication number Publication date
JP2024026181A (ja) 2024-02-28
JP2023027061A (ja) 2023-03-01
KR20200002888A (ko) 2020-01-08
US20240108719A1 (en) 2024-04-04
US20200188510A1 (en) 2020-06-18
JP7184259B2 (ja) 2022-12-06
EP3617312A1 (en) 2020-03-04
EP3617312A8 (en) 2020-04-29
CN110799646A (zh) 2020-02-14
JPWO2018199341A1 (ja) 2020-03-26
EP3617312A4 (en) 2021-04-07

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20240108719A1 (en) Allergy antigen and epitope thereof
JP7470934B2 (ja) アレルギーの抗原およびそのエピトープ
JP7420330B2 (ja) アレルギーの抗原およびそのエピトープ
WO2018220889A1 (ja) アレルギーの抗原およびそのエピトープ
CN110799646B (zh) 变态反应的抗原及其表位
US20210231678A1 (en) Allergy antigen and epitope thereof
CN111051336B (en) Allergy antigen and epitope thereof
US20220323575A1 (en) Novel milk allergy antigen

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 18792322

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2019514694

Country of ref document: JP

Kind code of ref document: A

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 20197032673

Country of ref document: KR

Kind code of ref document: A

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2018792322

Country of ref document: EP

ENP Entry into the national phase

Ref document number: 2018792322

Country of ref document: EP

Effective date: 20191128