WO2018062889A1 - 생물학적 시료 처리장치 - Google Patents
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- G01N2035/1027—General features of the devices
- G01N2035/1048—General features of the devices using the transfer device for another function
- G01N2035/1058—General features of the devices using the transfer device for another function for mixing
- G01N2035/106—General features of the devices using the transfer device for another function for mixing by sucking and blowing
Definitions
- the present invention relates to a biological sample processing device, and more particularly, to a device for processing such as purifying, extracting a biological sample.
- bio-industry which increases or improves the organisms themselves or their inherent functions, to produce substances in extremely small amounts in nature or to produce useful organisms, is becoming increasingly important.
- Korean Patent No. 10-1025135 by the present applicant, there is disclosed an automatic purification device capable of separating a desired material from a plurality of biological samples using magnetic particles.
- Such an automatic purification device processes biological samples while pipettes are moved to a multiwell plate kit, in which reagents for analysis are sequentially injected, to inhale or discharge reagents or analytes.
- the automatic refining apparatus extracts the target material by attaching the magnetic particles to the target material, removing the remaining material, and separating the magnetic particles from the target material.
- the automatic refining device is configured to apply a magnet for applying a magnetic field by rotation at the side of the pipette, which is not easy to extract the target material.
- the pipette is lowered, the sealing portion of the multi-well plate is configured to open by the pipette there is a problem that can cause contamination in the punching moment.
- the problem to be solved by the present invention is to provide a biological sample processing apparatus that can facilitate the application and release of the magnetic field.
- Another problem to be solved by the present invention is to provide a biological sample processing apparatus that can prevent contamination that may occur when the seal of the multiwell plate is released.
- Biological sample processing apparatus for solving this problem, pipette block, pipette block before and after transfer unit, pipette block shanghai sending unit, magnetic field applying unit and heating unit.
- the pipette block is coupled so that a plurality of pipettes for detaching or discharging a biological sample in a multiwell plate in which wells are arranged in a matrix form along rows and columns are formed.
- the pipette block forward and backward transfer unit moves the pipette block along a front and rear direction that is a process processing direction.
- the pipette block shanghai conveying unit moves the pipette block along the vertical direction.
- the magnetic field applying unit is disposed under the multiwell plate and applies a magnetic field to some wells of the multiwell plate.
- the heating unit is disposed under the multiwell plate to be spaced apart from the magnetic field applying unit, and heats some wells of the multiwell plate.
- the magnetic field applying unit may be disposed in front of the heating unit based on the process processing direction.
- the biological sample processing device may further include a horizontal transfer unit for transferring at least one of the magnetic field applying unit and the heating unit.
- the horizontal transfer unit may transfer the magnetic field applying unit and the heating unit separately.
- the magnetic field applying unit may include a plurality of bar-shaped magnet bars arranged in two diagonal directions of the matrix.
- the magnetic field applying unit may further include a magnet moving unit for moving the magnet bars up and down.
- the biological sample processing device may further include a punching part for punching and opening a cover of the multiwell plate.
- the punching unit may be coupled to the pipette block to be detachable, and may be formed to be transported by the pipette block forward and backward transfer unit and the pipette block shanghai transport unit.
- the biological sample processing device may further include a pipette storage unit for storing the separated pipette used in the first step of the treatment, and a pipette buffer unit for storing the pipette to be used in the second step of the treatment.
- the biological sample processing device may further include a sensing unit for sensing whether the storage unit is mounted.
- the system may further include a notification unit for notifying the detection unit.
- a biological sample processing apparatus includes a pipette block, pipette block forward and backward transfer unit, pipette block shanghai sending unit and punching unit.
- the pipette block is coupled so that a plurality of pipettes for detaching or discharging a biological sample in a multiwell plate in which wells are arranged in a matrix form along rows and columns are formed.
- the pipette block forward / backward transfer unit moves the pipette block along the front-back direction, which is the process processing direction.
- the pipette block shanghai sending unit, the pipette block moves along the vertical direction.
- the punching part punches open the cover of the multiwell plate.
- the punching unit may be coupled to the pipette block to be detachable, and may be formed to be transported by the pipette block forward and backward transfer unit and the pipette block shanghai transport unit.
- the biological sample processing device may further include a pipette storage unit for storing the separated pipette used in the first step of the treatment, and a pipette buffer unit for storing the pipette to be used in the second step of the treatment.
- the biological sample processing device may further include a sensing unit for sensing whether the storage unit is mounted.
- the system may further include a notification unit for notifying the detection unit.
- the punching unit may be configured to punch only selected wells of the multiwell plate.
- the biological sample processing apparatus arranges the magnetic field applying unit and the heating unit under the multiwell plate and applies the magnetic field to the lower side, thereby attracting the target sample combined with the magnetic particles to the bottom, thereby separating the target sample. You can make it smoother.
- the magnetic field applying unit and the heating unit by separately disposing the magnetic field applying unit and the heating unit, by performing the additional process between the process of applying and separating the magnetic field, heating to remove the ethanol, it can respond to the process required for new biological sample processing have. Furthermore, when the magnetic field applying unit and the heating unit are separated and arranged in this way, the secondary processing operation can be performed immediately without waiting for the cooling time of the heating unit after the primary processing operation. The analysis time can be shortened.
- the biological sample processing apparatus when the biological sample processing apparatus includes a horizontal transfer unit for transferring at least one of the magnetic field applying unit and the heating unit, the biological sample processing apparatus may perform biological sample processing even if the multi-well plate is accommodated. Can be.
- the degree of freedom may be further increased to perform biological sample processing even when accommodating any multiwell plate.
- the magnetic field applying unit includes a plurality of rod-shaped magnet bars arranged in two diagonal directions of the matrix and a magnet moving unit moving the magnet bars up and down, it is easy to apply and release the magnetic field to the multiwell plate.
- the target material coupled to the magnetic particles in the upper part of the well may be more easily induced downward.
- the biological sample processing apparatus includes a punching portion for punching and opening the cover of the multiwell plate, it is possible to prevent contamination that may occur when releasing the sealing portion of the multiwell plate.
- the pipette block is formed to be transported by the front and rear conveying part and the pipette block shanghai conveying part, it is not to form a separate drive for transporting the punching part. It is possible to reduce the parts, thus reducing the manufacturing cost.
- the biological sample processing apparatus includes a pipette storage unit for storing the separated pipette used in the first step of the treatment, and a pipette buffer unit for storing the pipette to be used in the second step of the processing, the biological sample processing process In the meantime, the pipette can be replaced to prevent contamination.
- the biological sample processing apparatus includes a detection unit for detecting whether the storage unit is mounted and a notification unit for notifying when the storage unit is not mounted as a result of the detection of the detection unit, the storage unit is driven without mounting, the biological sample
- the contamination of the processing unit can be prevented to improve the accuracy of the analysis.
- the inspection may be performed on a few inspection objects.
- FIG. 1 is a perspective view of a biological sample processing device according to an exemplary embodiment of the present invention.
- FIG. 2 is a perspective view from another angle of the biological sample processing device shown in FIG. 1.
- FIG. 2 is a perspective view from another angle of the biological sample processing device shown in FIG. 1.
- FIG. 3 is a cross-sectional view of a portion of FIG. 2;
- FIG. 4 is a perspective view of a portion of FIG. 1;
- 5 is a perspective view of the punching portion.
- FIG. 6 is a conceptual diagram of a heating unit and a magnetic field applying unit of a biological sample processing device according to an exemplary embodiment of the present invention.
- FIG. 7 is a schematic plan view illustrating an arrangement of a bar magnet of the magnetic field applying unit illustrated in FIG. 6.
- FIG. 8 is a block diagram of a controller, a detector, and an alarm unit of the biological sample processing device of the present invention.
- first and second may be used to describe various components, but the components should not be limited by the terms. The terms are used only for the purpose of distinguishing one component from another.
- the first component may be referred to as the second component, and similarly, the second component may also be referred to as the first component.
- FIG. 1 is a perspective view of a biological sample processing device according to one exemplary embodiment of the present invention
- FIG. 2 is a perspective view from another angle of the biological sample processing device shown in FIG. 1, and FIG. One cross section.
- the biological sample processing apparatus 100 includes a pipette block 110, a pipette block before and after the transfer unit 120, a pipette block shanghai transport unit 130, The magnetic field applying unit 191 of FIG. 6 and the heating unit 192 of FIG. 6 are included.
- the pipette block 110 is detachably coupled to a plurality of pipettes P for suctioning or discharging the biological sample in the multiwell plate MWP in which the wells are arranged in a matrix shape along the row and column directions.
- the pipette block 110 is illustrated to be arranged in three columns in the drawing, for example, the pipette block 110 may be arranged in one or more columns to perform a plurality of analyzes simultaneously.
- the pipettes P may be formed of plastic, for example, in the form of a syringe, and after being analyzed as consumables, are replaced to prevent contamination during analysis of other samples.
- the pipette block forward and backward transfer unit 120 moves the pipette block 110 along the front and rear direction, which is the process processing direction (D).
- the pipette block shanghai sending unit 130 moves the pipette block 110 in the vertical direction in order to attach or detach the pipette (P).
- the pipette block before and after the transfer unit 120 may be installed in the frame 170
- the pipette block shanghai transport unit 130 may be installed in the pipette block before and after the transfer unit 120.
- the multi-well plate (MWP) is a variety of samples are added along the progress direction, the pipette block is transported to the lower portion by the shanghai sending unit 130, and then suction a row of samples of the multi-well plate (MWP), and again After the transfer to the upper, the pipette block is transferred to the next row of the multi-well plate (MWP) in the forward direction by the front and rear conveying unit 120, and again transferred to the lower by the pipette block shanghai conveying unit 130,
- the biological sample is processed while repeating an operation such as discharging to the well of the next row of the plate MWP, reacting it again, transferring it to the upper part, and the like. This process is performed by the control of the control unit 200, will be described in more detail with reference to FIG.
- the biological sample processing device 100 the pipette storage unit 150 for storing the separated pipette used in the first step of the treatment, and the pipette buffer unit 160 for storing the pipette to be used in the second step of the treatment ) May be further included. Therefore, the biological sample processing apparatus according to the present invention can replace the pipette P in order to prevent contamination in the middle of the sample processing process.
- the biological sample processing apparatus 100 may further include a detector 210 that detects whether the storage 150 is mounted.
- a detector 210 that detects whether the storage 150 is mounted.
- a magnet may be attached to a lower surface of the storage unit 150, and the sensing unit 210 may be configured as a sensor that senses such a magnetic field.
- the storage unit 150 when the storage unit 150 is not mounted, it may further include a notification unit 220 for notifying this.
- the controller 200 receives the detection signal from the detector 210 and drives the notification unit 220 when the storage unit 150 is not mounted.
- the notification unit 220 may inform the user that the storage unit 150 is not mounted through, for example, a siren or the like, and also notify the user of the storage unit 150 through a light such as a flashing light. It may also indicate that is not installed.
- the control unit 200 may control to stop the operation of the biological sample processing apparatus 100 when the storage unit 150 is not mounted.
- the biological sample processing device 100 may further include a punching unit 140 for punching and opening the cover of the multiwell plate (MWP).
- the punching part 140 may be formed by attaching the punch 141 to the lower portion of the rectangular frame, for example.
- the punching unit 140 is merely exemplary and may be formed in various forms.
- the punching unit 140 may be coupled to the pipette block 110 to be detachable, and may be formed to be transported by the pipette block before and after the transfer unit 120 and the pipette block Shanghai transport unit 130. . That is, when the multi-well plate MWP is mounted, the controller 200 drives the pipette block forward and backward transfer unit 120 to transfer the pipette block 110 toward the punching unit 140. Thereafter, the controller 200 drives the pipette block shanghai sending unit 130 to mount the punching unit 140 to the pipette block 110, and then drives the pipette block back and forth transfer unit 120 again to multi-well The punching part 140 is moved toward the plate MWP.
- the pipette block shanghai sending unit 130 is driven again to move the punching unit 130 up and down to punch the cover of the multiwell plate (MWP), and then the pipette block before and after the transfer unit 120 and the pipette block Shanghai
- the punching unit 140 is returned to its original position.
- biological sample analysis is performed while moving each row of the multiwell plate MWP as described above.
- the biological sample processing apparatus 100 includes the punching portion 140 for punching and opening the cover of the multiwell plate MWP, it may be generated when the sealing portion of the multiwell plate MWP is released. Contamination can be prevented.
- the punching unit 140 may be configured to punch only some selected wells of the multiwell plate. That is, in the punching part 140 illustrated in FIG. 5, eight punches 141 are fixed. When the punching part 140 is driven, all the wells of eight rows are opened, but the punches 141 When configured to move up and down individually, punching may be performed for only some selected wells and only open for some wells.
- the punching unit 140 may also inspect a few inspection objects.
- the punching part 140 having the fixed punch 141 of FIG. Only 12 (1 * 12) or 24 (2 * 12) wells will be needed, but the entire well will be opened, leaving the remaining wells unused.
- waste of multiwell plates is caused.
- the punching unit 140 is configured to punch only selected wells of the multiwell plate, the test may be immediately performed for a few patients while preventing the opening of the remaining wells so that the multiwell plate may be reused. .
- FIG. 4 is a perspective view of a portion of FIG. 1;
- a plurality of multiwell plates MWP may be disposed on the support plate 180.
- the multiwell plate (MWP) is composed of a plurality of wells. For example, eight wells in a column direction and twelve in a row direction may be arranged in 96 wells.
- the multiwell plate (MWP) is kitted according to an analysis or extraction function, and various samples may be added to the kited multiwell plate (MWP) according to the biological sample processing.
- the wells of the first set rows can be sealed by injecting protease, RNA degrading enzymes or buffers for sample preparation for cell lysis and proteolysis or RNA degradation.
- the cell lysis solution dissolving the biological sample is injected and sealed
- the binding solution is injected and sealed
- the wells of the fourth set row are injected and sealed with the magnetic solution dispersed therein.
- the washing solution is injected and sealed
- the eighth set well may be injected and sealed. That is, a solution for purifying a sample may be accommodated in the remaining unit wells except at least one of the unit wells, and the same solution may be accommodated in the same unit well.
- the magnetic particles dispersed in the aqueous dispersion may be spherical magnetic particles coated with silica.
- a specific multiwell plate MWP is placed on the support plate 180.
- the pipette block 130 is in the column direction of the multiwell plate according to the driving of the controller 200 described above. (I.e., moving along the process direction D), the sample is sucked or discharged into each well and biological sample processing is performed.
- FIG. 6 is a conceptual view of a heating unit and a magnetic field applying unit of a biological sample processing device according to an exemplary embodiment of the present invention
- FIG. 7 is a schematic plan view illustrating an arrangement of a bar magnet of the magnetic field applying unit illustrated in FIG. 6.
- the magnetic field applying unit and the heating unit are shown in a block diagram.
- the magnetic field applying unit 191 is disposed under the multiwell plate MWP and applies a magnetic field to some wells W of the multiwell plate MWP. As such, by applying a magnetic field to the well (W), the target material combined with the magnetic particles are induced to separate.
- the heating unit 192 is disposed below the multiwell plate MWP to be spaced apart from the magnetic field applying unit, and heats some wells W of the multiwell plate MWP. Thus ethanol is evaporated in the wells in which work was completed.
- the magnetic field applying unit 191 is preferably disposed in front of the heating unit 192 based on the process processing direction.
- the magnetic field applying unit 191 and the heating unit 192 are separated and disposed, an additional process may be performed between the process of applying and separating the magnetic field and heating to remove ethanol, thereby providing new biological properties. It can cope with the process required for sample processing.
- the secondary processing operation may be performed immediately after the first processing operation, without having to wait for the cooling time of the heating unit 192. In this case, when a plurality of analyzes are performed, the analysis time can be shortened.
- the magnetic field applying unit 191 and the heating unit 192 are disposed at the same position, the magnetic field is applied in the first processing operation to separate the magnetic particles, and then the heating unit 192 is driven to cause problems in biological sample processing.
- the heating unit 192 is heated in the magnetic particle separation step, the ethanol is evaporated, so that the heating unit 192 is to be cooled, but must wait until the magnetic field
- the secondary processing operation may proceed immediately without waiting for the heating unit 192 to cool down.
- the biological sample processing device 100 may further include a horizontal transfer unit 193 for transferring at least one of the magnetic field applying unit 191 and the heating unit 192.
- the biological sample processing apparatus 100 may be any type.
- the biological sample treatment can also be performed by accommodating the multiwell plate (MWP).
- the wells (ethanol evaporation) where the operation is completed, and the wells (W) for separation of the target material to which magnetic particles are attached may be different (for example, a third party Multiwell plate), and in this case as well, by changing the positions of the magnetic field applying unit 191 and the heating unit 192.
- the horizontal transfer unit 193 may individually transfer the magnetic field applying unit 191 and the heating unit 191.
- the degree of freedom is further increased to accommodate biological multiwell plates. Sample processing can be performed.
- the magnetic field applying unit 191 may include a plurality of bar-shaped magnet bars 191a arranged in two diagonal directions of the matrix.
- the magnetic field applying unit 191 may further include a magnet moving unit 191b for moving the magnet bars 191a up and down.
- the magnet moving part 191b raises the magnetic rods 191a from the four directions of the unit well of the multiwell plate MWP to between the unit wells W, and then lowers the particles of the upper layer of the well. To the bottom.
- the magnetic field applying unit 191 includes a plurality of rod-shaped magnet bars 191a arranged in two diagonal directions of the matrix and a magnet moving unit 191b for moving the magnet bars 191a up and down.
- MTP multiwell plate
- Table 1 is a standard product required for performance comparison experiments of Exiprep TM Dx (Bioneer), which is an existing product, of the present invention.
- each internal positive control [internal positive control (IPC)]
- the sample loading tube which is then dried into the (sample loading tube) (Bioneer, KA-3011) present the Exiprep TM Dx
- the nucleic acid separation proceeds with the equipment of the invention.
- the volume of the sample for driving the Exiprep TM Dx equipment is 0.4 ml
- the volume of the sample for driving the equipment of the present invention is 0.8 ml
- the prep kit for extracting nucleic acids is Viral DNA / RNA Kit (Bioneer, K-4471, Korea), and both equipments used a program for extracting nucleic acids from plasma.
- the final volume (elution volume) is equal to 80 ul
- AccuPower ® HIV Quantitative RT -PCR Kit (Bioneer, HIV-1111, Korea) to be used for real-time nucleic acid amplification is 50 ul.
- Real-Time RT-PCR is performed to confirm nucleic acid separation and purification using nucleic acids of HIV-1 isolated from biological samples using Exiprep TM Dx and biological sample processing devices.
- AccuPower ® HIV Quantitative RT-PCR Kit completely seals the upper surface diagnostic kit using the adhesive sealing film of the (sealing) and ExiSpin TM (Bioneer, Korea), and then fully mix the diagnostic kit composition using a voltex, again ExiSpin Spin down the sample with the TM .
- the reaction conditions of Real-Time RT-PCR were performed in the same manner as Table 3 below, and ExiCycler TM 96 (Bioneer, Korea) was used for the real-time nucleic acid amplification reaction.
- Figure 10 shows a schematic diagram showing the time required for the nucleic acid separation and purification step when using a conventional nucleic acid extraction equipment Exiprep TM Dx and biological sample processing apparatus of the present invention.
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Abstract
자기장의 인가 및 해제를 용이하게 할 수 있는 생물학적 시료 처리장치가 개시된다. 이러한 생물학적 시료 처리장치는 피펫블럭, 피펫블럭 전후이송부, 피펫블럭 상하이송부, 자기장 인가부 및 히팅부를 포함한다. 상기 피펫블럭은, 웰들이 행 및 열방향을 따라 매트릭스 형상으로 배열된 멀티웰 플레이트 내의 생체시료를 흡입 또는 토출시키기 위한 다수의 피펫이 분리가능하도록 결합된다. 상기 피펫블럭 전후이송부는 프로세스 처리방향인 전후 방향을 따라서, 상기 피펫블럭을 이동시킨다. 상기 피펫블럭 상하이송부는 상기 피펫블럭을 상하방향을 따라서, 이동시킨다. 상기 자기장 인가부는, 상기 멀티웰 플레이트 하부에 배치되고, 상기 멀티웰 플레이트의 일부 웰에 자기장을 인가한다. 상기 히팅부는, 상기 자기장 인가부와 이격되도록 상기 멀티웰 플레이트 하부에 배치되고, 상기 멀티웰 플레이트의 일부 웰을 히팅시킨다.
Description
본 발명은 생물학적 시료 처리장치에 관한 것으로, 보다 상세히, 생물학적 시료를 정제하거나, 추출하는 등의 처리를 위한 장치에 관한 것이다.
생물 자체 또는 그들이 가지는 고유의 기능을 높이거나 개량하여 자연에는 극히 미량으로 존재하는 물질을 대량으로 생산하거나 유용한 생물을 만들어내는 바이오 산업의 중요성은 점점 더 커지고 있다.
바이오 산업의 기본이 되는 기술을 4가지로 살펴보면, 첫째로 생물체에서 특정한 유전 정보만을 꺼내어 생육이 빠른 미생물(예를 들어 대장균)의 유전자에 집어넣는 유전자 재조합 기술이 있다. 그 밖에 세포 융합 기술, 대량 배양 기술, 바이오리액터(bioreactor) 기술 등이 있다. 의약품ㆍ화학ㆍ식품ㆍ섬유 등에서 그러한 연구가 활발히 진행되고 있다.
한편, 이러한 바이오 산업 기술을 자동화하여 수행하기 위한 생물학적 시료 처리장치의 개발 또한 활발하게 진행되고 있다. 본 출원인에 의한 대한민국 등록특허 10-1025135에서는, 다수의 생물학적 시료로부터 원하는 물질을 자성입자를 이용하여 분리할 수 있는 자동정제장치가 개시되어 있다.
이러한 자동정제장치는, 분석을 위한 시약들이 순차적으로 주입된, 멀티웰 플레이트 키트에 피펫들이 이동해가며 시약 또는 분석시료를 흡입 또는 토출해가면서, 생물학적 시료들을 처리한다.
이러한, 자동정제장치는 자성입자를 타겟 물질에 부착시킨 후, 나머지 물질을 제거하고, 자성입자와 타겟 물질을 분리함으로써 타겟 물질을 추출하게 된다. 이를 위하여, 상기 자동정제장치는 자기장을 인가하기 위한 자석이 피펫의 측부에서 회전에 의해 인가하도록 구성되어 있어 타겟 물질 추출에 용이하지 않다.
또한, 멀티웰 플레이트의 밀봉부를 피펫이 하강하며, 피펫에 의해 개방하도록 구성되어 펀칭순간 오염이 발생될 수 있는 문제가 있다.
그에 따라서, 본 발명이 해결하고자 하는 과제는, 자기장의 인가 및 해제를 용이하게 할 수 있는 생물학적 시료 처리장치를 제공하는 것이다.
또한, 본 발명이 해결하고자 하는 다른 과제는, 멀티웰 플레이트의 밀봉부를 해제할 때, 발생될 수 있는 오염을 방지할 수 있는 생물학적 시료 처리장치를 제공하는 것이다.
이러한 과제를 해결하기 위한 본 발명의 예시적인 일 실시예에 의한 생물학적 시료 처리장치는, 피펫블럭, 피펫블럭 전후이송부, 피펫블럭 상하이송부, 자기장 인가부 및 히팅부를 포함한다. 상기 피펫블럭은, 웰들이 행 및 열방향을 따라 매트릭스 형상으로 배열된 멀티웰 플레이트 내의 생체시료를 흡입 또는 토출시키기 위한 다수의 피펫이 분리 가능하도록 결합된다. 상기 피펫블럭 전후이송부는 프로세스 처리방향인 전후 방향을 따라서, 상기 피펫블럭을 이동시킨다. 상기 피펫블럭 상하이송부는 상기 피펫블럭을 상하방향을 따라서 이동시킨다. 상기 자기장 인가부는, 상기 멀티웰 플레이트 하부에 배치되고, 상기 멀티웰 플레이트의 일부 웰에 자기장을 인가한다. 상기 히팅부는, 상기 자기장 인가부와 이격되도록 상기 멀티웰 플레이트 하부에 배치되고, 상기 멀티웰 플레이트의 일부 웰을 히팅시킨다.
예컨대, 상기 프로세스 처리방향을 기준으로, 상기 자기장 인가부는 상기 히팅부 전방에 배치될 수 있다.
한편, 이러한 생물학적 시료 처리장치는, 상기 자기장 인가부 및 상기 히팅부 중 적어도 하나를 이송시키기 위한 수평 이송부를 더 포함할 수 있다.
이때, 상기 수평 이송부는 상기 자기장 인가부 및 상기 히팅부를 개별적으로 이송시킬 수 있다.
한편, 상기 자기장 인가부는, 메트릭스의 두 대각선 방향으로 배열된 다수의 막대형상의 자석 막대들을 포함할 수 있다.
또한, 상기 자기장 인가부는, 상기 자석 막대들을 상하로 움직이는 자석 이동부를 더 포함할 수 있다.
한편, 이러한 생물학적 시료 처리장치는, 멀티웰 플레이트의 커버를 펀칭하여 개방시키는 펀칭부를 더 포함할 수 있다.
이때, 상기 펀칭부는, 상기 피펫블럭에 탈착 가능하도록 결합되어, 상기 피펫블럭 전후이송부 및 상기 피펫블럭 상하이송부에 의해 이송될 수 있도록 형성될 수 있다.
한편, 이러한 생물학적 시료 처리장치는, 처리의 제1 단계에서 사용되어 분리된 피펫을 저장하는 피펫 저장부, 및 처리의 제2 단계에서 사용될 피펫을 저장하는 피펫 버퍼부를 더 포함할 수 있다.
또한, 이러한 생물학적 시료 처리장치는, 상기 저장부가 장착되었는지 감지하는 감지부를 더 포함할 수 있다.
더욱이, 상기 감지부의 감지 결과, 상기 저장부가 장착되지 않은 경우, 이를 알리기 위한 알림부를 더 포함할 수 있다.
이러한 과제를 해결하기 위한 본 발명의 예시적인 다른 실시예에 의한 생물학적 시료 처리장치는, 피펫블럭, 피펫블럭 전후이송부, 피펫블럭 상하이송부 및 펀칭부를 포함한다. 상기 피펫블럭은, 웰들이 행 및 열방향을 따라 매트릭스 형상으로 배열된 멀티웰 플레이트 내의 생체시료를 흡입 또는 토출시키기 위한 다수의 피펫이 분리 가능하도록 결합된다. 상기 피펫블럭 전후이송부는, 프로세스 처리방향인 전후 방향을 따라서, 상기 피펫블럭을 이동시킨다. 상기 피펫블럭 상하이송부는, 상기 피펫블럭을 상하방향을 따라서 이동시킨다. 상기 펀칭부는 멀티웰 플레이트의 커버를 펀칭하여 개방시킨다.
이때, 상기 펀칭부는, 상기 피펫블럭에 탈착 가능하도록 결합되어, 상기 피펫블럭 전후이송부 및 상기 피펫블럭 상하이송부에 의해 이송될 수 있도록 형성될 수 있다.
한편, 이러한 생물학적 시료 처리장치는, 처리의 제1 단계에서 사용되어 분리된 피펫을 저장하는 피펫 저장부, 및 처리의 제2 단계에서 사용될 피펫을 저장하는 피펫 버퍼부를 더 포함할 수 있다.
또한, 이러한 생물학적 시료 처리장치는, 상기 저장부가 장착되었는지 감지하는 감지부를 더 포함할 수 있다.
더욱이, 상기 감지부의 감지 결과, 상기 저장부가 장착되지 않은 경우, 이를 알리기 위한 알림부를 더 포함할 수 있다.
한편, 상기 펀칭부는 멀티웰 플레이트의 선택된 일부 웰만 펀칭할 수 있도록 구성될 수 있다.
이와 같이 본 발명에 의한 생물학적 시료 처리장치는, 자기장 인가부 및 히팅부를 멀티웰 플레이트의 하부에 배치하고 자기장을 하부로 인가하여, 자성입자와 결합된 타겟 시료를 하부로 유인함으로써, 타겟 시료의 분리를 보다 원할하게 할 수 있다.
또한, 자기장 인가부와 히팅부를 분리하여 배치함으로써, 자기장을 인가하여 분리하고, 히팅하여 에탄올을 제거하는 과정 사이에 추가적인 과정을 더 수행할 수 있도록 함으로써, 새로운 생물학적 시료처리에 요구되는 과정에 대응할 수 있다. 더욱이, 이와 같이 자기장 인가부와 히팅부를 분리하여 배치하면, 1차 처리 작업 이후, 히팅부의 냉각시간을 기다릴 필요 없이, 곧바로 2차 처리 작업을 수행할 수 있게 되어, 다수의 분석을 진행하는 경우, 분석시간을 단축시킬 수 있다.
또한, 이러한 생물학적 시료 처리장치가 상기 자기장 인가부 및 상기 히팅부 중 적어도 하나를 이송시키기 위한 수평 이송부를 포함하는 경우, 생물학적 시료 처리장치는 임의의 멀티웰 플레이트를 수용하여도 생물학적 시료처리를 수행할 수 있다.
또한, 상기 수평 이송부가 상기 자기장 인가부 및 상기 히팅부를 개별적으로 이송시킬 수 있도록 구성되는 경우, 자유도가 더욱 증가하여 임의의 멀티웰 플레이트를 수용하여도 생물학적 시료처리를 수행할 수 있다.
또한, 자기장 인가부가 메트릭스의 두 대각선 방향으로 배열된 다수의 막대형상의 자석 막대들 및 상기 자석 막대들을 상하로 움직이는 자석 이동부를 포함하는 경우, 멀티웰 플레이트에 자기장의 인가 및 해제가 용이할 뿐만 아니라, 웰 상부에 있는 자성입자와 결합된 타겟물질을 하부로 보다 용이하게 유도할 수 있다.
또한, 생물학적 시료 처리장치가 멀티웰 플레이트의 커버를 펀칭하여 개방시키는 펀칭부를 포함하는 경우, 멀티웰 플레이트의 밀봉부를 해제할 때, 발생될 수 있는 오염을 방지할 수 있다.
또한, 상기 펀칭부가 상기 피펫블럭에 탈착 가능하도록 결합되어, 상기 피펫블럭 전후이송부 및 상기 피펫블럭 상하이송부에 의해 이송될 수 있도록 형성되는 경우, 상기 펀칭부를 이송시키기 위한 별도의 구동부를 형성하지 않게 되어 부품을 감소시킬 수 있으며, 그에 따라서, 제조비용을 절감시킬 수 있다.
또한, 생물학적 시료 처리장치가, 처리의 제1 단계에서 사용되어 분리된 피펫을 저장하는 피펫 저장부, 및 처리의 제2 단계에서 사용될 피펫을 저장하는 피펫 버퍼부를 포함하는 경우, 생물학적 시료 처리의 공정 중간에, 오염방지를 위해서 피펫을 교체할 수 있다.
또한, 생물학적 시료 처리장치는, 상기 저장부가 장착되었는지 감지하는 감지부 및 상기 감지부의 감지 결과 상기 저장부가 장착되지 않으면 이를 알리기 위한 알림부를 포함하는 경우, 저장부가 장착되지 않은 상태로 구동되어, 생물학적 시료 처리장치가 오염되는 것을 방지할 수 있게되어 분석의 정확성을 향상시킬 수 있다.
또한, 상기 펀칭부는 멀티웰 플레이트의 선택된 일부 웰만 펀칭할 수 있도록 구성되는 경우, 소수의 검사대상물에 대해서도 검사를 진행할 수 있다.
도 1은 본 발명의 예시적인 일 실시예에 의한 생물학적 시료 처리장치의 사시도이다.
도 2는 도 1에서 도시된 생물학적 시료 처리장치의 다른 각도에서 본 사시도이다.
도 3은 도 2의 일부를 절단한 단면도이다.
도 4는 도 1의 일부를 도시한 사시도이다.
도 5는 펀칭부의 사시도이다.
도 6은 본 발명의 예시적인 일 실시예에 의한 생물학적 시료 처리장치의 히팅부 및 자기장 인가부의 개념도이다.
도 7은 도 6에서 도시된 자기장 인가부의 막대형상 자석의 배치를 도시한 개략적인 평면도이다.
도 8은 본 발명의 생물학적 시료 처리장치의 제어부, 감지부 및 알람부의 블럭도이다.
도 9은 본 발명의 생물학적 시료 처리장치를 이용하여 생물학적 시료로부터 핵산을 분리한 결과이다.
도 10은 본 발명의 생물학적 시료 처리장치의 구동시간을 기존 장비와 비교한 결과이다.
본 발명은 다양한 변경을 가할 수 있고 여러 가지 형태를 가질 수 있는 바, 특정 실시예들을 도면에 예시하고 본문에 상세하게 설명하고자 한다. 그러나, 이는 본 발명을 특정한 개시 형태에 대해 한정하려는 것이 아니며, 본 발명의 사상 및 기술 범위에 포함되는 모든 변경, 균등물 내지 대체물을 포함하는 것으로 이해되어야 한다. 각 도면을 설명하면서 유사한 참조 부호를 유사한 구성 요소에 대해 사용하였다. 첨부된 도면에 있어서, 구조물들의 치수는 본 발명의 명확성을 기하기 위하여 실제보다 과장하여 도시한 것일 수 있다.
제1, 제2 등의 용어는 다양한 구성 요소들을 설명하는데 사용될 수 있지만, 상기 구성 요소들은 상기 용어들에 의해 한정되어서는 안 된다. 상기 용어들은 하나의 구성 요소를 다른 구성 요소로부터 구별하는 목적으로만 사용된다. 예를 들어, 본 발명의 권리 범위를 벗어나지 않으면서 제1 구성 요소는 제2 구성 요소로 명명될 수 있고, 유사하게 제2 구성 요소도 제1 구성 요소로 명명될 수 있다.
본 출원에서 사용한 용어는 단지 특정한 실시예들을 설명하기 위해 사용된 것으로, 본 발명을 한정하려는 의도가 아니다. 단수의 표현은 문맥상 명백하게 다르게 뜻하지 않는 한, 복수의 표현을 포함한다. 본 출원에서, "포함하다" 또는 "가지다" 등의 용어는 명세서에 기재된 특징, 숫자, 단계, 동작, 구성 요소, 부분품 또는 이들을 조합한 것이 존재함을 지정하려는 것이지, 하나 또는 그 이상의 다른 특징들이나 숫자, 단계, 동작, 구성 요소, 부분품 또는 이들을 조합한 것들의 존재 또는 부가 가능성을 미리 배제하지 않는 것으로 이해되어야 한다. 또한, A와 B가'연결된다', '결합된다'라는 의미는 A와 B가 직접적으로 연결되거나 결합하는 것 이외에 다른 구성요소 C가 A와 B 사이에 포함되어 A와 B가 연결되거나 결합되는 것을 포함하는 것이다.
다르게 정의되지 않는 한, 기술적이거나 과학적인 용어를 포함해서 여기서 사용되는 모든 용어들은 본 발명이 속하는 기술 분야에서 통상의 지식을 가진 자에 의해 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 가지고 있다. 일반적으로 사용되는 사전에 정의되어 있는 것과 같은 용어들은 관련 기술의 문맥상 가지는 의미와 일치하는 의미를 가지는 것으로 해석되어야 하며, 본 출원에서 명백하게 정의하지 않는 한, 이상적이거나 과도하게 형식적인 의미로 해석되지 않는다. 또한, 방법 발명에 대한 특허청구범위에서, 각 단계가 명확하게 순서에 구속되지 않는 한, 각 단계들은 그 순서가 서로 바뀔 수도 있다.
이하, 첨부한 도면들을 참조하여, 본 발명의 바람직한 실시예들을 보다 상세하게 설명하고자 한다.
도 1은 본 발명의 예시적인 일 실시예에 의한 생물학적 시료 처리장치의 사시도이고, 도 2는 도 1에서 도시된 생물학적 시료 처리장치의 다른 각도에서 본 사시도이며, 도 3은 도 2의 일부를 절단한 단면도이다.
도 1 내지 도 3을 참조하면, 본 발명의 예시적인 일 실시예에 의한 생물학적 시료 처리장치(100)는, 피펫블럭(110), 피펫블럭 전후이송부(120), 피펫블럭 상하이송부(130), 자기장 인가부(도 6의 191) 및 히팅부(도 6의 192)를 포함한다.
상기 피펫블럭(110)은, 웰들이 행 및 열방향을 따라 매트릭스 형상으로 배열된 멀티웰 플레이트(MWP) 내의 생체시료를 흡입 또는 토출시키기 위한 다수의 피펫(P)이 분리가능 하도록 결합된다. 상기 피펫블럭(110)은 도면에서는 3열로 배열되어 있도록 도시되어 있으나, 예컨대 1열 이상으로 배치되어 다수의 분석을 동시에 진행할 수 있다. 상기 피펫(P)들은 예컨대 주사기 형상으로서 플라스틱으로 형성될 수 있으며, 소모품으로서 분석을 진행한 후, 타 시료 분석시 오염을 방지하기 위해서 교체된다.
상기 피펫블럭 전후이송부(120)는 프로세스 처리방향(D)인 전후 방향을 따라서, 상기 피펫블럭(110)을 이동시킨다. 또한, 상기 피펫블럭 상하이송부(130)는 상기 피펫(P)을 부착 또는 탈착시키기 위해서, 상기 피펫블럭(110)을 상하방향을 따라서 이동시킨다. 예컨대, 상기 피펫블럭 전후이송부(120)는 프레임(170)에 설치될 수 있으며, 상기 피펫블럭 상하이송부(130)는 상기 피펫블럭 전후이송부(120)에 설치될 수 있다.
상기 멀티웰 플레이트(MWP)는 진행방향을 따라 다양한 시료들이 첨가되어 있는데, 상기 피펫블럭 상하이송부(130)에 의해 하부로 이송된 후, 멀티웰 플레이트(MWP)의 일 열의 시료들을 흡입하고, 다시 상부로 이송된 후, 상기 피펫블럭 전후이송부(120)에 의해 진행방향을 따라서 멀티웰 플레이트(MWP)의 다음 열로 이송되고, 다시 피펫블럭 상하이송부(130)에 의해 하부로 이송된 후, 멀티웰 플레이트(MWP)의 다음 열의 웰에 토출시켜 반응시키고, 다시 흡입하고 다시 상부로 이송하는 등의 동작을 반복하면서 생물학적 시료를 처리하게 된다. 이러한 과정은 제어부(200)의 제어에 의해 수행되며, 도 4를 참조하여 보다 상세히 설명될 것이다.
한편, 이러한 생물학적 시료 처리장치(100)는, 처리의 제1 단계에서 사용되어 분리된 피펫을 저장하는 피펫 저장부(150), 및 처리의 제2 단계에서 사용될 피펫을 저장하는 피펫 버퍼부(160)를 더 포함할 수 있다. 따라서, 본 발명에 의한 생물학적 시료 처리장치는, 시료 처리의 공정 중간에, 오염방지를 위해서 피펫(P)을 교체할 수 있다.
한편, 이러한 생물학적 시료 처리장치(100)는, 도 8에서 도시된 바와 같이, 상기 저장부(150)가 장착되었는지 감지하는 감지부(210)를 더 포함할 수 있다. 예컨대, 상기 저장부(150)의 하면에는 자석이 부착될 수 있으며, 상기 감지부(210)는 이러한 자기장을 센싱하는 센서로 구성될 수 있다.
더욱이, 상기 감지부(210)의 감지 결과, 상기 저장부(150)가 장착되지 않은 경우, 이를 알리기 위한 알림부(220)를 더 포함할 수 있다. 상기 제어부(200)는 감지부(210)의 감지신호를 수신하여, 상기 저장부(150)가 장착되지 않은 경우 상기 알림부(220)를 구동하게 된다.
예컨대, 상기 알림부(220)는 예컨대, 사이렌 등의 소리를 통해서 사용자에게 저장부(150)가 장착되지 않았음을 알릴 수 있으며, 또한 깜박이는 조명 등의 빛을 통해서 사용자에게 저장부(150)가 장착되지 않았음을 알릴 수도 있다. 더욱이, 상기 제어부(200)는, 상기 저장부(150)가 장착되지 않은 경우, 상기 생물학적 시료 처리장치(100)의 동작을 중지하도록 제어할 수도 있다.
한편, 이러한 생물학적 시료 처리장치(100)는, 멀티웰 플레이트(MWP)의 커버를 펀칭하여 개방시키는 펀칭부(140)를 더 포함할 수 있다. 이러한 펀칭부(140)는 도 5에서 도시된 바와 같이, 예컨대, 사각의 프레임 하부에 펀치(141)를 부착함으로써 형성될 수 있다. 이러한 펀칭부(140)는 예시적인 것일 뿐, 다양한 형태로 형성될 수 있다.
또한, 상기 펀칭부(140)는, 상기 피펫블럭(110)에 탈착 가능하도록 결합되어, 상기 피펫블럭 전후이송부(120) 및 상기 피펫블럭 상하이송부(130)에 의해 이송될 수 있도록 형성될 수 있다. 즉, 상기 제어부(200)는, 멀티웰 플레이트(MWP)가 장착된 경우, 상기 피펫블럭 전후이송부(120)를 구동시켜 상기 피펫블럭(110)을 상기 펀칭부(140)를 향해 이송시킨다. 이후, 상기 제어부(200)는 상기 피펫블럭 상하이송부(130)를 구동시켜 상기 펀칭부(140)를 상기 피펫블럭(110)에 장착한 후, 다시 피펫블럭 전후이송부(120)을 구동시켜 멀티웰 플레이트(MWP)를 향해서 상기 펀칭부(140)를 이동시킨다. 이후, 다시 피펫블럭 상하이송부(130)를 구동시켜 상기 펀칭부(130)를 상하로 움직여 멀티웰 플레이트(MWP)의 커버를 펀칭한 후, 다시 상기 피펫블럭 전후이송부(120) 및 상기 피펫블럭 상하이송부(130)를 구동시켜 펀칭부(140)를 원위치에 돌려 놓은다. 이후, 상기 피펫블럭(110)이 피펫(P)을 장착한 후, 앞서 설명한 바와 같이 멀티웰 플레이트(MWP)의 각 열을 이동해가면서 생물학적 시료분석을 진행하게 된다.
이와 같이, 생물학적 시료 처리장치(100)가 멀티웰 플레이트(MWP)의 커버를 펀칭하여 개방시키는 펀칭부(140)를 포함하는 경우, 멀티웰 플레이트(MWP)의 밀봉부를 해제할 때, 발생될 수 있는 오염을 방지할 수 있다.
한편, 상기 펀칭부(140)는 멀티웰 플레이트의 선택된 일부 웰만 펀칭할 수 있도록 구성될 수 있다. 즉, 도 5에서 도시된 펀칭부(140)는 8개의 펀치(141)가 고정되어 있어, 하나의 펀칭부(140)를 구동하면 8개의 행의 모든 웰들이 개방되어 지지만, 펀치(141)들이 상하로 개별적으로 움직일 수 있도록 구성되는 경우, 선택된 일부 웰에 대해서만 펀칭을 진행하여 일부 웰에 대해서만 개방시킬 수 있다.
즉, 상기 펀칭부(140)는 멀티웰 플레이트의 선택된 일부 웰만 펀칭할 수 있도록 구성되는 경우, 소수의 검사대상물에 대해서도 검사를 진행할 수 있다. 보다 상세히, 예컨대, 1명 내지 2명의 환자에게서 채취한 시료에 대해서 검사를 진행하여여 하는 경우, 도 5의 고정된 펀치(141)를 갖는 펀칭부(140)를 구동하게 되면, 실제 필요한 웰의 수는 12개(1*12) 또는 24개(2*12)의 웰만 필요하게 되지만 전체의 웰을 모두 개방시키게 되어 나머지 웰을 사용되지 않은 상태로 소비되게 된다. 따라서, 멀티웰 플레이트의 낭비를 초래하게 된다. 이와 다르게, 환자가 8명이 모여질 때 구동하면, 멀티웰 플레이트의 낭비는 막을 수 있으나, 환자가 8명 모여질 때까지 대기하여야 하는 문제점이 발생된다. 따라서, 펀칭부(140)가 멀티웰 플레이트의 선택된 일부 웰만 펀칭할 수 있도록 구성되는 경우, 소수의 환자에 대해서도 검사를 곧바로 진행하면서도 나머지 웰들의 개방을 막을 수 있어 멀티웰 플레이트를 재사용할 수 있게 된다.
도 4는 도 1의 일부를 도시한 사시도이다.
도 4를 참조하면, 지지 플레이트(180) 상부에는 다수의 멀티웰 플레이트(MWP)가 배치될 수 있다. 상기 멀티웰 플레이트(MWP)는 다수의 웰들로 구성되어 있으며, 예컨대 열방향을 따라서 8개, 행방향을 따라서 12개가 나열되어 96개의 웰들로 구성될 수 있다. 이러한 멀티웰 플레이트(MWP)는 분석 또는 추출하는 기능에 따라서 키트화되어 있으며, 키트화된 멀티웰 플레이트(MWP)에는 처리하는 생물학적 시료처리에 따라서 다양한 시료들이 첨가될 수 있다.
예컨대, 첫번째 세트 열의 웰에는 세포 용해 및 단백질 분해 또는 RNA 분해를 위한 단백질 분해효소, RNA 분해효소 또는 시료 전처리에 필요한 완충액이 주입되어 밀봉될 수 있다. 두번째 세트 열의 웰에는 상기 생물학적 시료를 용해시키는 세포용해용액이 주입되어 밀봉되고, 세번째 세트 열의 웰에는 결합용액이 주입되어 밀봉되고, 네번째 세트 열의 웰에는 자성입자가 분산된 수분용액이 주입되어 밀봉되고, 다섯번째 내지 일곱 번째 세트 웰에는 세척용액이 주입되어 밀봉되고, 여덟 번째 세트 웰에는 용출 용액이 주입되어 밀봉될 수 있다. 즉, 단위 웰 중 적어도 하나를 제외한 나머지 단위 웰에는 시료를 정제하기 위한 용액이 수용되되, 동일한 단위웰에는 동일한 용액이 수용될 수 있다.
한편, 상기 밀봉된 하나의 단위 웰에 수용되는 용액이 자성입자가 분산된 수분산액인 경우 상기 수분산액에 분산된 자성입자는 실리카로 코팅된 구형의 자성입자일 수 있다.
다시 도 1 내지 도 4를 참조하면, 지지플레이트(180)를 슬라이딩하여 본 발명에 의한 생물학적 시료 처리장치(100) 외부로 빼낸 이후, 지지플레이트(180) 상부에 특정의 멀티웰 플레이트(MWP)를 장착하고, 생물학적 시료 처리장치(100) 내에 삽입한 후, 생물학적 시료 처리장치(100)를 구동하면, 앞서 설명된 제어부(200)의 구동에 따라서, 피펫블럭(130)이 멀티웰 플레이트의 열방향(즉, 프로세스 처리방향 D)를 따라서 이동해가며 각 웰들에 시료를 흡입 또는 토출을 하며 생물학적 시료처리 작업을 수행하게 된다.
도 6은 본 발명의 예시적인 일 실시예에 의한 생물학적 시료 처리장치의 히팅부 및 자기장 인가부의 개념도이고, 도 7은 도 6에서 도시된 자기장 인가부의 막대형상 자석의 배치를 도시한 개략적인 평면도이다. 설명의 편의상 자기장 인가부 및 히팅부는 블럭도로 표현한다.
도 6 및 도 7을 참조하면, 상기 자기장 인가부(191)는, 상기 멀티웰 플레이트(MWP) 하부에 배치되고, 상기 멀티웰 플레이트(MWP)의 일부 웰(W)에 자기장을 인가한다. 이와 같이 웰(W)에 자기장을 인가하여, 자성입자와 결합된 타겟 물질을 유도하여 분리하게 된다.
상기 히팅부(192)는, 상기 자기장 인가부와 이격되도록 상기 멀티웰 플레이트(MWP) 하부에 배치되고, 상기 멀티웰 플레이트(MWP)의 일부 웰(W)을 히팅시킨다. 따라서 작업이 완료된 웰에서의 에탄올을 증발시킨다.
히팅과정이 처리작업의 마지막에 배치되는 것이 일반적이므로, 상기 프로세스 처리방향을 기준으로, 상기 자기장 인가부(191)는 상기 히팅부(192) 전방에 배치되는 것이 바람직하다.
이와 같이, 자기장 인가부(191)와 히팅부(192)를 분리하여 배치하는 경우, 자기장을 인가하여 분리하고, 히팅하여 에탄올을 제거하는 과정 사이에 추가적인 과정을 더 수행할 수 있도록 함으로써, 새로운 생물학적 시료처리에 요구되는 과정에 대응할 수 있다. 더욱이, 이와 같이 자기장 인가부(191)와 히팅부(192)를 분리하여 배치하면, 1차 처리 작업 이후, 히팅부(192)의 냉각시간을 기다릴 필요 없이, 곧바로 2차 처리 작업을 수행할 수 있게 되어, 다수의 분석을 진행하는 경우, 분석시간을 단축시킬 수 있다. 즉, 자기장 인가부(191)와 히팅부(192)를 동일한 위치에 배치시키면, 1차 처리 작업에서는 자기장을 인가하여 자성입자를 분리한 이후, 히팅부(192)를 구동하여 생물학적 시료 처리에 문제가 되지 않으나, 곧바로 2차 처리 작업을 진행하게 되면, 자성입자 분리단계에서 히팅부(192)가 가열되어 있어, 에탄올이 증발하게 되므로, 히팅부(192)가 냉각될 때까지, 대기하여야 하지만 자기장 인가부(191)와 히팅부(192)를 분리하여 배치하면, 히팅부(192)가 냉각될 때까지의 대기하지 않고 곧바로 2차 처리 작업을 진행할 수 있다.
한편, 이러한 생물학적 시료 처리장치(100)는, 상기 자기장 인가부(191) 및 상기 히팅부(192) 중 적어도 하나를 이송시키기 위한 수평 이송부(193)를 더 포함할 수 있다. 이와같이, 생물학적 시료 처리장치(100)가 상기 자기장 인가부(191) 및 상기 히팅부(192) 중 적어도 하나를 이송시키기 위한 수평 이송부(193)를 포함하는 경우, 생물학적 시료 처리장치(100)는 임의의 멀티웰 플레이트(MWP)를 수용하여도 생물학적 시료처리를 수행할 수 있다.
즉, 멀티웰 플레이트(MWP)에 따라서, 작업이 종료되는 웰(에탄올증발), 및 자성입자가 부착된 타겟물질의 분리를 위한 웰(W) 등의 위치가 상이하게 될 수 있는데(예컨대, 타사 멀티웰 플레이트), 이 경우에도 자기장 인가부(191) 및 히팅부(192)의 위치를 변경함으로써 대응할 수 있게 된다.
한편, 상기 수평 이송부(193)는 상기 자기장 인가부(191) 및 상기 히팅부(191)를 개별적으로 이송시킬 수 있다. 이와 같이, 상기 수평 이송부(193)가 상기 자기장 인가부(191) 및 상기 히팅부(192)를 개별적으로 이송시킬 수 있도록 구성되는 경우, 자유도가 더욱 증가하여 임의의 멀티웰 플레이트를 수용하여도 생물학적 시료처리를 수행할 수 있다.
한편, 상기 자기장 인가부(191)는, 도 7에서 도시된 바와 같이, 메트릭스의 두 대각선 방향으로 배열된 다수의 막대형상의 자석 막대들(191a)을 포함할 수 있다. 또한, 상기 자기장 인가부(191)는, 상기 자석 막대들(191a)을 상하로 움직이는 자석 이동부(191b)를 더 포함할 수 있다. 상기 자석 이동부(191b)는 상기 멀티웰 플레이트(MWP)의 단위웰의 4 방향에서 단위웰(W)사이의 위에까지 상기 자석 막대들(191a)을 상승시킨 후, 하강시키면서 웰의 상층부의 입자들까지 하부로 유도하게 된다.
이와같이, 자기장 인가부(191)가 메트릭스의 두 대각선 방향으로 배열된 다수의 막대형상의 자석 막대들(191a) 및 상기 자석 막대들(191a)을 상하로 움직이는 자석 이동부(191b)를 포함하는 경우, 멀티웰 플레이트(MWP)에 자기장의 인가 및 해제가 용이할 뿐만 아니라, 웰 상부에 있는 자성입자와 결합된 타겟물질을 하부로 보다 용이하게 유도할 수 있다.
이하, 본 발명의 실시예를 활용예를 상세히 설명한다.
도9는 기존에 자사에서 개발한 핵산 추출 장비인 Exiprep TM Dx와 본 발명의 생물학적 시료처리 장치의 성능을 비교하기 위하여 사람의 혈장 속에서 HIV-1 을 검출하여 실시간(Real-Time) RT-PCR을 통하여 정량 분석한 결과이다. Ct 값 1 차이는 해당 핵산이 2배 차이남을 의미하는 것으로 Ct 값이 적을수록 더 많은 핵산을 가지고 있음을 의미한다.
본 발명의 실시 예에 사용된 재료 및 방법 등을 설명하면 다음과 같다.
먼저, 본 발명의 생물학적 시료 처리 장치와 Exiprep TM Dx 의 성능을 비교 및 확인하기 위하여, 생물학적 시료에서 핵산을 분리하는데 사용되는 재료에 대해서 설명한다.
생물학적 시료 준비
(1) 다음의 하기 표 1은 기존 제품인 Exiprep TM Dx (Bioneer) 와 본 발명의 성능 비교 실험에 필요한 표준품이다.
표준품 명칭 | 제조사 | 비고 |
EDTA Human plasma (Cat. No. HB-100) | Seracare | Matrix |
WHO International Standard 3rd HIV-1 International Standard,NIBSC code: 10/152 | NIBSC | Genotype B |
AccuPower®HIV-1 Quantitative RT-PCR Kit | Bioneer | PCR kit |
검사 필요 수량 | Exiprep TM Dx 8ea (8 ea X 0.4 ml = 3.2 ml) 본 발명의 장비 8ea (8 ea X 0.8 ml = 6.4 ml) 총 필요량 3.2 ml + 6.4 ml= 9.6 ml |
처음농도 | 185000 IU/ml |
희석 단계 1 | EDTA Human Plasma 0.142 ml WHO HIV-1 panel 0.008 ml 혼합 (1차 희석 농도: 10000 IU/ml) |
희석 단계 2 | EDTA Human Plasma 11.88 ml 1차 희석액 0.12 ml 혼합 (최종 희석 농도: 100 IU/ml) |
핵산의 분리 및 정제
상기 표 2를 참고하여 만든 생물학적 시료를 각각 인터널 포지티브 컨트롤[internal positive control (IPC)]이 건조되어 있는 샘플로딩튜브(sample loading tube) (Bioneer, KA-3011)에 넣은 후 Exiprep TM Dx 와 본 발명의 장비로 핵산분리를 진행한다.
Exiprep TM Dx 장비 구동을 위한 샘플의 부피는 0.4 ml이며, 본 발명의 장비 구동을 위한 샘플의 부피는 0.8 ml이며, 핵산을 추출하기 위한 프렙키트(prep kit)는 Viral DNA/RNA Kit (Bioneer, K-4471, 한국)을 이용하였으며, 두 장비 모두 혈장에서 핵산을 추출하는 프로그램을 사용하였다.
최종 용적(elution volume)은 80 ul로 동일하며, 실시간 핵산증폭을 위해 사용하는 AccuPower
® HIV Quantitative RT-PCR Kit(Bioneer, HIV-1111, 한국)는 50 ul 이다.
Real-Time RT-PCR을 이용한 검사
Exiprep TM Dx 와 생물학적 시료처리 장치를 이용하여 생물학적 시료로부터 분리한 HIV-1의 핵산을 이용하여 핵산 분리 및 정제능을 확인하기 위하여 실시간(Real-Time) RT-PCR을 수행한다. AccuPower
® HIV Quantitative RT-PCR Kit의 adhesive sealing film을 이용하여 진단 키트 상단면을 완전히 밀봉(sealing)하고 ExiSpinTM(Bioneer, 한국)과 voltex를 이용하여 진단키트 조성물을 완벽하게 혼합한 후, 다시 ExiSpinTM으로 시료를 스핀다운(spin down) 해준다. 실시간(Real-Time) RT-PCR의 반응 조건은 하기 표 3과 동일하게 진행되었으며, 실시간 핵산 증폭 반응을 위해서는 ExiCyclerTM 96 (Bioneer, 한국)을 이용하였다.
Line | STEP | Temperature | Running Time |
1 | cDNA synthesis | 50 ℃ | 15 min |
2 | Pre Denaturation | 95 ℃ | 5min |
3 | Denaturation | 95 ℃ | 5 sec |
4 | Annealing & Extension | 55 ℃ | 5 sec |
5 | Scan | ||
6 | Go to line 3 Cycle 45 | ||
7 | End |
도 10은 기존에 자사에서 개발한 핵산 추출 장비인 Exiprep TM Dx와 본 발명의 장비인 생물학적 시료처리 장치를 이용하였을 때 핵산 분리 및 정제 단계에서 소요되는 시간을 모식도로 나타내 준 것이다.
도 10에서 볼 수 있는 바와 같이, 바인딩, 워싱, 드라이 공정에서 시간을 대폭 감축시켜, 전체 처리시간이 대폭적으로 감소됨을 확인할 수 있다.
위에서 본 발명의 실시예들은 하나의 예로써 표시하고 있으나, 본 발명의 특징적 구성은 개별적으로 별도의 발명으로서, 개별적인 특징만을 갖도록 형성될 수 있음은 당업자에게 자명한 사항이다. 또한, 앞서 설명한 본 발명의 상세한 설명에서는 본 발명의 바람직한 실시예들을 참조하여 설명하였지만, 해당 기술분야의 숙련된 당업자 또는 해당 기술분야에 통상의 지식을 갖는 자라면 후술될 특허청구범위에 기재된 본 발명의 사상 및 기술 영역으로부터 벗어나지 않는 범위 내에서 본 발명을 다양하게 수정 및 변경시킬 수 있음을 이해할 수 있을 것이다.
Claims (17)
- 웰들이 행 및 열방향을 따라 매트릭스 형상으로 배열된 멀티웰 플레이트 내의 생체시료를 흡입 또는 토출시키기 위한 다수의 피펫이 분리가능하도록 결합되는 피펫블럭;프로세스 처리방향인 전후 방향을 따라서, 상기 피펫블럭을 이동시키기 위한 피펫블럭 전후이송부;상기 피펫블럭을 상하방향을 따라서, 이동시키기 위한 피펫블럭 상하이송부;상기 멀티웰 플레이트 하부에 배치되고, 상기 멀티웰 플레이트의 일부 웰에 자기장을 인가하기 위한 자기장 인가부; 및상기 자기장 인가부와 이격되도록 상기 멀티웰 플레이트 하부에 배치되고, 상기 멀티웰 플레이트의 일부 웰을 히팅시키기 위한 히팅부;를 포함하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제1 항에 있어서,상기 프로세스 처리방향을 기준으로, 상기 자기장 인가부는 상기 히팅부 전방에 배치된 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제1 항에 있어서,상기 자기장 인가부 및 상기 히팅부 중 적어도 하나를 이송시키기 위한 수평 이송부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제3 항에 있어서,상기 수평 이송부는 상기 자기장 인가부 및 상기 히팅부를 개별적으로 이송시키는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제1 항에 있어서,상기 자기장 인가부는,메트릭스의 두 대각선 방향으로 배열된 다수의 막대형상의 자석 막대들을 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제5 항에 있어서,상기 자기장 인가부는,상기 자석 막대들을 상하로 움직이는 자석 이동부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제1 항에 있어서,멀티웰 플레이트의 커버를 펀칭하여 개방시키는 펀칭부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제7 항에 있어서,상기 펀칭부는,상기 피펫블럭에 탈착 가능하도록 결합되어, 상기 피펫블럭 전후이송부 및 상기 피펫블럭 상하이송부에 의해 이송될 수 있도록 형성된 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제1 항에 있어서,처리의 제1 단계에서 사용되어 분리된 피펫을 저장하는 피펫 저장부; 및처리의 제2 단계에서 사용될 피펫을 저장하는 피펫 버퍼부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제9 항에 있어서,상기 저장부가 장착되었는지 감지하는 감지부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제10 항에 있어서,상기 감지부의 감지 결과, 상기 저장부가 장착되지 않은 경우, 이를 알리기 위한 알림부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 웰들이 행 및 열방향을 따라 매트릭스 형상으로 배열된 멀티웰 플레이트 내의 생체시료를 흡입 또는 토출시키기 위한 다수의 피펫이 분리가능하도록 결합되는 피펫블럭;프로세스 처리방향인 전후 방향을 따라서, 상기 피펫블럭을 이동시키기 위한 피펫블럭 전후이송부;상기 피펫블럭을 상하방향을 따라서, 이동시키기 위한 피펫블럭 상하이송부; 및멀티웰 플레이트의 커버를 펀칭하여 개방시키는 펀칭부;를 포함하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제12 항에 있어서,상기 펀칭부는,상기 피펫블럭에 탈착 가능하도록 결합되어, 상기 피펫블럭 전후이송부 및 상기 피펫블럭 상하이송부에 의해 이송될 수 있도록 형성된 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제12 항에 있어서,처리의 제1 단계에서 사용되어 분리된 피펫을 저장하는 피펫 저장부; 및처리의 제2 단계에서 사용될 피펫을 저장하는 피펫 버퍼부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제14 항에 있어서,상기 저장부가 장착되었는지 감지하는 감지부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제15 항에 있어서,상기 감지부의 감지 결과, 상기 저장부가 장착되지 않은 경우, 이를 알리기 위한 알림부;를 더 포함하는 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
- 제12 항에 있어서,상기 펀칭부는 멀티웰 플레이트의 선택된 일부 웰만 펀칭할 수 있도록 구성된 것을 특징으로 하는 생물학적 시료 처리장치.
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