WO2012133377A1 - 電気泳動ゲル形成モノマー溶液、溶液吐出方法、電気泳動ゲルの形成方法、電気泳動ゲルおよび電気泳動用反応器具 - Google Patents

電気泳動ゲル形成モノマー溶液、溶液吐出方法、電気泳動ゲルの形成方法、電気泳動ゲルおよび電気泳動用反応器具 Download PDF

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solution
monomer solution
forming
electrophoresis
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大木 博
博史 山木
豊 鵜沼
祐二 丸尾
田中 毅
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シャープ株式会社
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    • G01N27/26Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating electrochemical variables; by using electrolysis or electrophoresis
    • G01N27/416Systems
    • G01N27/447Systems using electrophoresis
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    • G01N27/447Systems using electrophoresis
    • G01N27/44704Details; Accessories
    • G01N27/44747Composition of gel or of carrier mixture

Definitions

  • the present invention relates to an electrophoresis gel-forming monomer solution, a solution discharge method, a method for forming an electrophoresis gel, an electrophoresis gel, and a reaction instrument for electrophoresis.
  • Electrophoresis is a phenomenon in which charged particles or molecules move an electric field, and is particularly important as a technique for separating DNA or proteins in the fields of molecular biology and biochemistry.
  • two-dimensional electrophoresis is widely used as one of methods for separating proteins in order to analyze proteosomes that are attracting attention as a post-genome.
  • Two-dimensional electrophoresis is a technique for two-dimensionally separating proteins by two-stage electrophoresis.
  • proteins are separated by isoelectric focusing (IEF) using an immobilized pH gradient gel (IPG gel).
  • IPG gel immobilized pH gradient gel
  • proteins are separated according to molecular weight by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE; sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis).
  • the present invention has been made in view of the above circumstances, and is an electrophoresis gel-forming monomer solution capable of controlling the timing for starting gelation, a solution discharge method thereof, an electrophoresis gel formation method, an electrophoresis gel, and an electricity It aims at providing the reaction instrument for electrophoresis.
  • the electrophoresis gel-forming monomer solution according to the first aspect of the present invention contains at least a monomer that forms a gel structure and a gel polymerization accelerator that activates a gel polymerization initiator.
  • the monomer is preferably a radical polymerizable substance.
  • the radical polymerizable substance is at least one selected from the group consisting of acrylamide, N, N′-methylenebisacrylamide and acrylamide derivatives. It is preferable that
  • the gel polymerization accelerator is preferably tetramethylethylenediamine.
  • the solution discharge method discharges an electrophoretic gel-forming monomer solution containing at least a monomer that forms a gel structure and a gel polymerization accelerator that activates a gel polymerization initiator. And a second discharge step of discharging a gel polymerization initiating solution containing a gel polymerization initiator to the electrophoretic gel-forming monomer solution.
  • the electrophoresis gel-forming monomer in the first discharge step, so as to show a concentration gradient along one direction of the discharge surface of the discharge object. It is preferable to discharge the solution.
  • the electrophoresis gel forming monomer solution is discharged a plurality of times in the first discharge step.
  • the monomer is preferably a radical polymerizable substance.
  • the radical polymerizable substance is at least one selected from the group consisting of acrylamide, N, N′-methylenebisacrylamide and acrylamide derivatives. Is preferred.
  • the solution discharge method according to the second aspect of the present invention preferably uses an inkjet method in the first discharge step.
  • the method for forming an electrophoresis gel according to the third aspect of the present invention is an electrophoresis gel-forming monomer containing at least a monomer that forms a gel structure and a gel polymerization accelerator that activates a gel polymerization initiator.
  • a solution discharge method comprising: a first discharge step of discharging a solution; and a second discharge step of discharging a gel polymerization initiator solution containing a gel polymerization initiator with respect to the electrophoresis gel-forming monomer solution. .
  • the electrophoresis gel according to the fourth aspect of the present invention ejects an electrophoresis gel-forming monomer solution containing at least a monomer that forms a gel structure and a gel polymerization accelerator that activates a gel polymerization initiator.
  • An electrophoretic gel having a solution ejection method comprising: a first ejection step to perform; and a second ejection step to eject a gel polymerization initiator solution containing a gel polymerization initiator with respect to the electrophoresis gel-forming monomer solution It is formed by the forming method.
  • the electrophoresis reaction device is an electrophoresis gel-forming monomer solution containing at least a monomer that forms a gel structure and a gel polymerization accelerator that activates a gel polymerization initiator. And a second discharging step of discharging a gel polymerization initiating solution containing a gel polymerization initiator with respect to the electrophoretic gel-forming monomer solution.
  • An electrophoresis gel formed by the method for forming an electrophoresis gel is provided.
  • the timing at which gelation of the electrophoresis gel-forming monomer solution starts can be controlled.
  • electrophoresis gel-forming monomer solution The electrophoresis gel forming monomer solution of the embodiment of the present invention will be described.
  • the electrophoresis gel-forming monomer solution of this embodiment contains at least a monomer that forms a gel structure and a gel polymerization accelerator that activates a gel polymerization initiator.
  • the monomer that forms the gel structure includes a radically polymerizable substance (a substance that polymerizes using radicals as a reaction center), an anionically polymerizable substance, a cationically polymerizable substance, a coordination polymerizable substance, or a ring-opening polymerizable substance Is used.
  • a substance capable of radical polymerization is preferable because an electrophoresis gel having a target specification can be formed at an arbitrary timing.
  • the material capable of radical polymerization at least one selected from the group consisting of acrylamide, N, N′-methylenebisacrylamide and acrylamide derivatives is used.
  • Acrylamide polymerizes to form the main skeleton of the electrophoresis gel.
  • N, N′-methylenebisacrylamide copolymerizes with acrylamide to crosslink the main skeleton of the electrophoresis gel.
  • the blending ratio (mass ratio) of acrylamide and N, N′-methylenebisacrylamide is appropriately adjusted according to the specifications of the target electrophoresis gel. 1 to 49: 1 is preferred.
  • the blending ratio (mass ratio) of acrylamide and N, N′-methylenebisacrylamide is, for example, 37.5: 1.
  • Acrylamide derivatives determine the charge distribution of the electrophoresis gel, ie the pH distribution of the electrophoresis gel.
  • the acrylamide derivatives are those in which one or more substituents acrylamide is introduced, which acid dissociation constant due to the substituent (pK a) is in the range of 1 to 12 is used.
  • one hydrogen of carboxylic acid amide of acrylamide is a cyclic compound containing at least one of a sulfo group (—SO 3 H), a carboxyl group (—COOH), oxygen, nitrogen, sulfur and the like, an amino group ( And derivatives substituted with —NH 2 , —NHR, —NR 2 ) and the like.
  • acid dissociation constant (pK a) is 1,3.1,3.6,4.6,6.2,7.0,8.5
  • Acrylamide derivatives such as 9.3, 10.3, and 12 are used in combination.
  • the electrophoresis gel-forming monomer solution of the present embodiment is an acidic electrophoresis gel-forming monomer solution (hereinafter referred to as “acid gel-forming monomer solution”) or a basic electrophoresis gel-forming monomer solution (hereinafter referred to as “ It is used as “basic gel-forming monomer solution”.
  • acidic gel-forming monomer solution acrylamide, N, N′-methylenebisacrylamide, and one containing one or more acrylamide derivatives having different acid dissociation constants are used.
  • the blending ratio (mass ratio) of each acrylamide derivative ie, [acrylamide derivative mass / acid gel-forming monomer solution (including acrylamide derivative) mass] is appropriately adjusted according to the specifications of the target electrophoresis gel.
  • As the basic gel-forming monomer solution acrylamide, N, N′-methylenebisacrylamide, and one containing one or more acrylamide derivatives having different acid dissociation constants are used.
  • the blending ratio (mass ratio) of each acrylamide derivative, that is, [acrylamide derivative mass / basic gel forming monomer solution (including acrylamide derivative) mass] is appropriately adjusted according to the specification of the target electrophoresis gel.
  • Tetramethylethylenediamine (TEMED) is used as the gel polymerization accelerator. Tetramethylethylenediamine, when mixed with a gel polymerization initiator, immediately forms radicals that are active species of gel polymerization, and without deactivating ammonium persulfate (Ammonium persulfate, APS) suitable as an initiator for radical polymerization of acrylamide. , Can exist stably.
  • Ammonium persulfate Ammonium persulfate
  • the blending ratio (mass ratio) of the gel polymerization accelerator in the electrophoresis gel-forming monomer solution that is, [gel polymerization accelerator mass / electrophoresis gel-forming monomer solution (including gel polymerization accelerator) mass] is not particularly limited.
  • the gel polymerization accelerator is blended at a predetermined blending ratio (mass ratio) in each of the acidic gel-forming monomer solution and the basic gel-forming monomer solution.
  • the electrophoretic gel-forming monomer solution of this embodiment may contain a thickener in order to adjust the viscosity appropriately.
  • the thickener is not particularly limited, but glycerol is preferable because it does not affect electrophoresis.
  • the mixing ratio (mass ratio) of glycerol in the electrophoresis gel-forming monomer solution, ie, [glycerol mass / electrophoresis gel-forming monomer solution (including glycerol) mass] is not particularly limited. It adjusts suitably according to the method.
  • the electrophoretic gel-forming monomer solution is an acidic gel-forming monomer solution, and the inkjet method is used as a discharging method of this solution
  • the [glycerol mass / acid gel-forming monomer solution (including glycerol) mass] is, for example, 0. 47 is adjusted.
  • the electrophoresis gel-forming monomer solution is a basic gel-forming monomer solution and the inkjet method is used as a discharging method of this solution
  • [glycerol mass / basic gel-forming monomer solution (including glycerol) mass] is, for example, Adjusted to 0.40.
  • the electrophoresis gel-forming monomer solution of this embodiment since it does not contain a gel polymerization initiator, gelation starts by mixing with a gel polymerization initiator solution containing a gel polymerization initiator. Timing can be controlled. Therefore, when this electrophoretic gel-forming monomer solution is ejected by an inkjet head or the like, the electrophoretic gel-forming monomer solution is gelled in the inkjet head by ejecting the electrophoretic gel-forming monomer solution from an inkjet head different from the gel polymerization initiation solution. The nozzle of the head can be prevented from being clogged with the gel.
  • FIGS. 1A to 1C are perspective views showing an outline of a solution discharge method according to a first embodiment.
  • the discharge unit 3 applies the above-described gel formation region 2 provided on the discharge target surface (one surface) 1a of the base material 1 that is the discharge target.
  • the substrate 1 examples include a flat plate or a chip molded into an arbitrary shape.
  • the base material 1 is exemplified by a rectangular shape in plan view.
  • glass, resin, ceramics, etc. are mentioned, for example.
  • the glass include quartz glass and alkali-free glass.
  • the resin include polyethylene terephthalate (PET), polymethyl methacrylate resin (PMMA), and the like.
  • Specific examples of the ceramic include alumina and a low-temperature co-fired ceramic.
  • the gel-forming region 2 is formed by physically coating one surface 1a of the substrate 1 with an organic compound having a chemical structure similar to the monomer contained in the electrophoresis gel-forming monomer solution, or chemically. It is formed by performing surface modification of one surface 1a of the substrate 1 by covalent bonding. That is, the gel forming region 2 is composed of a thin film made of the organic compound.
  • the gel-forming region 2 is formed by plasma graft polymerization treatment of acrylic acid, acrylamide, acrylamide derivative or the like. It is preferable to form.
  • the obtained gel forming region 2 becomes hydrophilic, and an electrophoresis gel formed using the above-described electrophoresis gel forming monomer solution is formed into a gel formed on one surface 1a of the substrate 1.
  • the region 2 can be adhered with a strong adhesion force.
  • the gel forming region 2 is exemplified by a rectangular shape in plan view formed along the longitudinal direction of the substrate 1.
  • the discharge means 3 is not particularly limited as long as it can form fine droplets because it is necessary to mix a plurality of types of electrophoretic gel-forming monomer solutions directly on one surface 1a of the substrate 1.
  • Examples of the ejection unit 3 include an inkjet head and a spray nozzle. In the present embodiment, it is essential to be able to control the pitch between fine droplets in a direction perpendicular to the one surface 1a of the substrate 1.
  • the ejection unit 3 is preferably an inkjet head rather than a spray nozzle that sprays the electrophoretic gel-forming monomer solution in a spray form.
  • the ejection unit 3 is exemplified by an inkjet head.
  • the ejection unit 3 is referred to as an inkjet head 3.
  • the inkjet head 3 for example, eight inkjet heads 3A, 3B, 3C, 3D, 3E, 3F, 3G, in which a large number of nozzles 3a are provided at a predetermined pitch on a straight line. What consists of 3H is used.
  • the inkjet heads 3A, 3B, 3C, 3D, 3E, 3F, 3G, and 3H are arranged in parallel so that the directions in which the nozzles 3a extend are parallel to each other.
  • the inkjet heads 3A, 3B, 3C, 3D, 3E, 3F, 3G, and 3H are provided in order along the direction in which the inkjet head 3 scans the substrate 1 (the direction of the arrow in FIG. 1A).
  • the scanning direction of the inkjet head 3 is a direction along the longitudinal direction of the substrate 1.
  • the ink jet head 3 is not particularly limited, and a continuous discharge type (continuous ink jet) ink jet head, an on-demand type (drop on demand ink jet) ink jet head, or the like is used.
  • a continuous discharge type ink jet head a charge control method for controlling charged fine droplets with an electric field is used.
  • an on-demand type inkjet head a thermal (bubble) type, electrostatic actuator type or piezo type is used.
  • the scanning direction of the ink-jet head 3 is set to one direction along the longitudinal direction of the base material 1 and both directions (bases) according to the matters required in the formation of the electrophoresis gel using the above-described electrophoresis gel-forming monomer solution.
  • the scanning direction of the inkjet head 3 is set to one direction along the longitudinal direction of the substrate 1.
  • the scanning direction of the inkjet head 3 is set to both directions along the longitudinal direction of the base material 1 (direction to reciprocate along the longitudinal direction of the base material 1).
  • the gel forming region 2 is formed on one surface 1a of the substrate 1 (FIG. 1A).
  • a predetermined shape is patterned on an arbitrary region of one surface 1a of the base material 1 using a masking material such as a metal mask, a resist, or a Kapton tape, and surface treatment is performed only on the patterned region.
  • the gel formation region 2 is formed.
  • the surface treatment method is not particularly limited, but in the case of using the above-described electrophoresis gel-forming monomer solution, for example, plasma graft polymerization treatment such as acrylic acid, acrylamide, and acrylamide derivatives is used.
  • the masking material is removed, and one surface 1a of the substrate 1 is washed.
  • an acidic gel-forming monomer solution and a basic gel-forming monomer solution are used as the electrophoresis gel-forming monomer solution.
  • the acidic gel-forming monomer solution or the basic gel-forming monomer solution include those containing acrylamide, N, N′-methylenebisacrylamide as described above, and one or more acrylamide derivatives having different acid dissociation constants. Use.
  • the first discharge step one of the acidic gel-forming monomer solution and the basic gel-forming monomer solution is discharged so that the droplet exhibits a concentration gradient along one surface 1a of the substrate 1, and the opposite is true.
  • the other of the acidic gel-forming monomer solution or the basic gel-forming monomer solution is discharged so as to show a concentration gradient of. That is, in the first discharge step, for example, as shown in FIG. 1B, the density of the droplets 5 of the acidic gel-forming monomer solution is increased from one end 1b of the substrate 1 toward the other end 1c.
  • An acidic gel-forming monomer solution is discharged from the inkjet head 3 onto one surface 1a of the substrate 1.
  • the acidic gel-forming monomer solution is applied from the inkjet head 3 to one surface 1a of the substrate 1 so that the concentration gradient of the acidic gel-forming monomer solution increases from one end 1b of the substrate 1 toward the other end 1c. Discharged.
  • the density of the droplet 6 of the basic gel-forming monomer solution is increased from the inkjet head 3 to the substrate 1 so that the density of the droplet 1 increases from the other end 1c of the substrate 1 toward the one end 1b.
  • a basic gel-forming monomer solution is discharged onto one surface 1a.
  • the basic gel-forming monomer is applied from the inkjet head 3 to the one surface 1a of the base 1 so that the concentration gradient of the basic gel-forming monomer solution increases from the other end 1c of the base 1 toward the one end 1b.
  • the solution is discharged.
  • the acidic gel-forming monomer solution and the basic gel-forming monomer solution are separately discharged onto one surface 1a of the substrate 1, and a concentration gradient is formed at the time of discharging each monomer solution.
  • the electrophoresis gel-forming monomer solution can be discharged so as to show a pH gradient along the longitudinal direction of one surface 1a of the material 1.
  • the present invention is not limited to this.
  • the number of times of discharging the acidic gel-forming monomer solution and the basic gel-forming monomer solution is appropriately adjusted according to the electrophoresis gel having the target specification.
  • the acidic gel-forming monomer solution and the basic gel-forming monomer solution usually a mixture of acrylamide, N, N′-methylenebisacrylamide, and one or more acrylamide derivatives having different acid dissociation constants is used. It is done. Therefore, the respective acrylamide derivatives are not necessarily discharged to the gel forming region 2 at a preferable composition ratio. Therefore, in the first discharge step, various acrylamide derivatives may be discharged independently in order to more precisely control the density of droplets of the acidic gel-forming monomer solution and the basic gel-forming monomer solution. .
  • a mixture of acrylamide and N, N′-methylenebisacrylamide is discharged from one inkjet head 3A, and the acid dissociation constant (pK a ) is calculated from six inkjet heads 3B, 3C, 3D, 3E, 3F, and 3G.
  • six different acrylamide derivative e.g., acid dissociation constant (pK a) of those 3.6,4.6,6.2,7.0,8.5,9.3 ejects the separately.
  • acrylamide, N, N′-methylenebisacrylamide and an acrylamide derivative are mixed on one surface 1a of the substrate 1, and the above-mentioned electrophoresis gel-forming monomer solution is mixed on one surface 1a of the substrate 1.
  • a result equivalent to that of discharging is obtained.
  • the electrophoresis gel-forming monomer solution discharged onto one surface 1a of the substrate 1 exhibits a concentration gradient along the longitudinal direction of the one surface 1a of the substrate 1.
  • the discharge amount of the mixture of acrylamide and N, N′-methylenebisacrylamide and the discharge amount of the six acrylamide derivatives are controlled.
  • the gel polymerization start containing a gel polymerization initiator is performed on the electrophoretic gel-forming monomer solution discharged from one inkjet head 3H to one surface 1a of the substrate 1 in the first discharge step.
  • the solution is discharged (second discharge process).
  • a gel polymerization accelerator contained in the electrophoresis gel forming monomer solution is mixed.
  • the gel polymerization initiator When the gel polymerization initiator is mixed with a gel polymerization accelerator, it immediately generates radicals that are active species that trigger gel polymerization, but these radicals deactivate over time. In other words, in order to control the timing of gelation of the electrophoresis gel-forming monomer solution, the timing of mixing the gel polymerization initiator and the gel polymerization accelerator and the timing of mixing the monomer and the radical that form the gel structure are important. Become. Therefore, in this embodiment, by using an electrophoretic gel-forming monomer solution in which a monomer that forms a gel structure and a gel polymerization accelerator are mixed in advance, the gel polymerization initiator and the gel are used until immediately before gelation of the electrophoretic gel-forming monomer solution.
  • the gelation timing of the electrophoretic gel-forming monomer solution is controlled by the timing of discharging the gel polymerization initiating solution containing the gel polymerization initiator to the electrophoretic gel-forming monomer solution, that is, the timing of generating radicals. can do.
  • ammonium persulfate As a gel polymerization initiator, ammonium persulfate (Ammonium persulfate, APS) is used. Ammonium persulfate, when mixed with a gel polymerization accelerator such as tetramethylethylenediamine (TEMED), immediately forms a radical that is an active species of gel polymerization and is suitable as an initiator for radical polymerization of acrylamide.
  • a gel polymerization accelerator such as tetramethylethylenediamine (TEMED)
  • glycerol ethylene glycol, diethylene glycol, triethylene glycol, polyethylene glycol or the like is used as a solvent for dissolving the gel polymerization initiator.
  • the timing for starting gelation of the electrophoretic gel-forming monomer solution can be controlled, so that the electrophoretic gel-forming monomer solution gels in the ink-jet head 3 and the ink-jet head
  • the nozzle 3a of the third nozzle can be prevented from being clogged by the gel, and the gelation of the electrophoresis gel-forming monomer solution due to radical inactivation can be avoided. Therefore, it is possible to form an electrophoresis gel having an immobilized pH gradient (IPG; immobilized pH gradient).
  • IPG immobilized pH gradient
  • a gel-forming region 2 is formed in advance on one surface 1a of the substrate 1 to thereby gel the electrophoretic gel-forming monomer solution. Since the adhesiveness with respect to the one surface 1a of the material 1 is improved, the shape of the electrophoresis gel can be freely formed regardless of the material of the substrate 1.
  • an electrophoretic gel-forming monomer solution is discharged at a dot pitch of about several tens of ⁇ m by using an inkjet method in the first discharge step and the second discharge step.
  • an electrophoresis gel having a high-definition pH gradient can be formed.
  • FIG. 2 is a perspective view showing an outline of a solution discharge method according to a second embodiment.
  • the base material 11 for example, a flat plate is used, and the case where the gel forming region 12 is provided on one side surface 11a is illustrated.
  • the base material 11 For example, the acrylic board whose thickness is 2 mm is mentioned.
  • the inkjet head 13 for example, a configuration including five inkjet heads 13 ⁇ / b> A, 13 ⁇ / b> B, 13 ⁇ / b> C, 13 ⁇ / b> D, and 13 ⁇ / b> E provided with a large number of nozzles 13 a at a predetermined pitch on a straight line is used.
  • the inkjet heads 13A, 13B, 13C, 13D, and 13E are arranged in parallel so that the directions in which the nozzles 13a extend are parallel to each other.
  • the inkjet heads 13A, 13B, 13C, 13D, and 13E are provided in order along the direction in which the inkjet head 13 scans one side surface 11a of the substrate 11 (the direction of the arrow in FIG. 2).
  • the scanning direction of the inkjet head 13 is a direction along the longitudinal direction of the one side surface 11a of the substrate 11.
  • the gel forming region 12 is formed on the one side surface 11a of the substrate 11 in the same manner as in the first embodiment described above.
  • the electrophoresis gel-forming monomer solution is transferred from the inkjet head 13 to the gel formation region 12 on the one side surface 11 a of the substrate 11. Is discharged (first discharging step). Even in the present embodiment, the electrophoretic gel-forming monomer solution is discharged in the first discharge step in the same manner as in the first embodiment.
  • the gel polymerization initiating solution containing the gel polymerization initiator is discharged from the inkjet head 13 to the electrophoretic gel-forming monomer solution discharged to the one side surface 11a of the substrate 11 ( Second discharge step).
  • the gel polymerization initiating solution is discharged in the same manner as in the first embodiment described above.
  • the electrophoresis gel forming monomer solution can be discharged even in a narrow region or a region having a complicated shape. Therefore, a gel can be formed in a region where it has been difficult to form a gel.
  • Method of forming electrophoresis gel 3A to 3D are cross-sectional views schematically showing a method for forming an electrophoresis gel according to an embodiment of the present invention.
  • the method for forming an electrophoretic gel according to the present embodiment is a method having the solution ejection method according to the first embodiment or the solution ejection method according to the second embodiment.
  • a gel forming region 22 is formed on one surface 21a of the base material 21 (see FIG. 1A).
  • the same solution discharging method as that of the first embodiment described above is used.
  • a surface treatment method of the one surface 21a of the base material 21 for forming the gel forming region 22 the same method as the solution discharge method of the first embodiment described above is used.
  • a Kapton tape in which a polyethylene terephthalate film having a thickness of 200 ⁇ m is used as the base material 21 and a punching pattern having a length of 70 mm and a width of 3 mm is formed on one surface (surface) 21a of the base material 21.
  • Polyimide tape, thickness 80 ⁇ m was adhered, and plasma graft polymerization surface treatment of acrylic acid or acrylamide was performed. After the plasma graft polymerization surface treatment, the Kapton tape is peeled off and the surface is cleaned.
  • the contact angle of the gel formation region 22 was 20 degrees or less (water droplet), and the gel formation region 22 was stronger than the contact angle (60 degrees or more) of the one surface 21a of the substrate 21. It was confirmed that the surface was hydrophilic.
  • pure water or carrier ampholite (amphoteric carrier) is added to the gel forming region 22 on the one surface 21a of the base material 21 using a pipette, a dispenser, an ink jet, or the like.
  • a mixed aqueous solution or the like is dropped to form a liquid pool 23 in the gel formation region 22.
  • the liquid reservoir 23 is made to spread uniformly over the entire gel forming region 22.
  • a gel polymerization accelerator such as tetramethylethylenediamine may be added to the pure water or the aqueous solution forming the liquid pool 23.
  • the size of the liquid reservoir 23 (size (area) in plan view) is 70 mm long ⁇ 3 mm wide.
  • the liquid reservoir 23 plays an important role in mixing the above-mentioned electrophoresis gel-forming monomer solution and the above-mentioned gel polymerization initiating solution in a subsequent process in order to mix these solutions satisfactorily.
  • the liquid reservoir 23 also plays an important role in forming an electrophoresis gel having a desired thickness. That is, when there is no liquid reservoir 23, the production time of the electrophoresis gel is greatly increased.
  • a total amount of 140 ⁇ L of solution is discharged to the gel forming region 22 and the film thickness after gel polymerization is adjusted to 500 ⁇ m.
  • 67.65 ⁇ L of pure water forming the liquid pool 23 is dropped onto the gel forming region 22 using a pipette.
  • an electrophoresis gel is applied from the inkjet head 24 to the liquid reservoir 23 on the one surface 21a of the base material 21 in the same manner as the solution discharge methods of the first and second embodiments described above.
  • the forming monomer solution is discharged (first discharging step).
  • the density of the droplets 25 (discharge density) is the base material 21.
  • the acidic gel-forming monomer solution is discharged from the inkjet head 24 onto the one surface 21a of the substrate 21 so as to increase from one end 21b to the other end 21c.
  • the acidic gel-forming monomer solution is applied from the inkjet head 24 to the one surface 21a of the base material 21 so that the concentration gradient of the acidic gel-forming monomer solution increases from the one end 21b of the base material 21 toward the other end 21c.
  • the discharge amount of the acidic gel-forming monomer solution is 39.45 ⁇ L.
  • the electrophoretic gel-forming monomer solution is a basic gel-forming monomer solution
  • the density (discharge density) of the droplets 25 changes from the other end 21c of the substrate 21 to one end 21b.
  • the basic gel-forming monomer solution is discharged from the inkjet head 24 onto the one surface 21a of the base material 21 so as to be higher.
  • the basic gel-forming monomer solution is applied from the inkjet head 24 to the one surface 21a of the base material 21 so that the concentration gradient of the basic gel-forming monomer solution increases from the other end 21c of the base material 21 toward the one end 21b.
  • the solution is discharged.
  • the discharge amount of the basic gel-forming monomer solution is 26.90 ⁇ L.
  • the present invention is not limited to this.
  • the number of times of discharging the acidic gel-forming monomer solution and the basic gel-forming monomer solution is appropriately adjusted according to the electrophoresis gel having the target specification. That is, in the same manner as the solution discharge method of the first embodiment described above, in the first discharge step, in order to more precisely control the density of droplets of the acidic gel-forming monomer solution and the basic gel-forming monomer solution.
  • various acrylamide derivatives may be discharged independently.
  • a gel polymerization initiating solution containing a gel polymerization initiator is discharged to the electrophoresis gel forming monomer solution (second discharging step).
  • a gel polymerization initiator solution in which 20% ammonium persulfate is used as a gel polymerization initiator and 20% ammonium persulfate and glycerol are mixed at a volume ratio of 1: 1 is used.
  • the discharge amount of the gel polymerization initiator solution is 7 ⁇ L.
  • the electrophoretic gel-forming mixed solution 26 is discharged onto the gel-forming region 22 formed on the one surface 21a of the base material 21.
  • the electrophoretic gel-forming mixed solution 26 is left for about 30 minutes to 1 hour, gelation starts and the target electrophoretic gel 27 (FIG. 3D) is formed.
  • the electrophoresis gel forming step including the first discharge step and the second discharge step is performed in a nitrogen atmosphere in order to avoid the influence of oxygen that suppresses the gel polymerization reaction. It is preferable to carry out by crystallization.
  • the electrophoresis gel 27 is washed with a washing solution.
  • a washing solution pure water or an aqueous solution in which pure water is mixed with a small amount of carrier ampholite is used.
  • the substrate 21 on which the electrophoresis gel 27 is formed is immersed in pure water or an aqueous solution, and these are shaken by a shaker or the like.
  • the process of immersing the base material 21 on which the electrophoresis gel 27 is formed in pure water and shaking for 20 minutes at a cycle of 40 rpm was repeated three times.
  • pure water was exchanged every time one washing was completed.
  • the substrate 21 on which the electrophoresis gel 27 is formed is dried in a desiccator.
  • the timing for starting gelation of the electrophoretic gel-forming monomer solution can be controlled, so that the electrophoretic gel-forming monomer solution gels in the inkjet head 24.
  • the nozzle of the inkjet head 24 can be prevented from being clogged by the gel, and the inhibition of gelation of the electrophoretic gel-forming monomer solution due to radical inactivation can be avoided. Therefore, it is possible to form an electrophoresis gel having an immobilized pH gradient (IPG; immobilized pH gradient).
  • IPG immobilized pH gradient
  • the electrophoresis gel manufactured by the method for manufacturing an electrophoresis gel of the present embodiment has a high-definition pH gradient and a low impurity content.
  • an electrophoretic reaction instrument equipped with the electrophoretic gel can be obtained.
  • Examples of the electrophoresis reaction tool of the present embodiment include those in which the above-described electrophoresis gel is directly provided on one surface of the substrate 11 shown in FIG.
  • Examples of the base material 11 include a plate-like injection-molded product formed of polymethyl methacrylate (PMMA) or the like.
  • the electrophoresis reaction instrument of this embodiment is applied to, for example, an automated two-dimensional electrophoresis apparatus.
  • the automated two-dimensional electrophoresis apparatus is, for example, a fixing means for fixing a second separation unit (sample separation instrument) that performs second-dimensional separation of a sample, and a support with a gel that supports a first medium that performs first-dimensional separation.
  • a holding means having an arm for holding the holding means, a fixing means and / or a driving means for moving the holding means to change the relative positions of both.
  • the electrophoresis reaction instrument of the present embodiment is used as the first medium for performing the first-dimensional separation.
  • the present invention can be used for polyacrylamide gel electrophoresis or agarose gel electrophoresis for separating biopolymers such as protein, DNA or RNA, and particularly includes isoelectric focusing and SDS-PAGE electrophoresis. It can be suitably used for two-dimensional electrophoresis.

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Abstract

 溶液吐出方法は、ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する。

Description

電気泳動ゲル形成モノマー溶液、溶液吐出方法、電気泳動ゲルの形成方法、電気泳動ゲルおよび電気泳動用反応器具
 本発明は、電気泳動ゲル形成モノマー溶液、溶液吐出方法、電気泳動ゲルの形成方法、電気泳動ゲルおよび電気泳動用反応器具に関する。
 本願は、2011年3月29日に、日本に出願された特願2011-072885号に基づき優先権を主張し、その内容をここに援用する。
 電気泳動は、荷電粒子または分子が電界を移動する現象であり、特に、分子生物学および生化学の分野において、DNAまたはタンパク質を分離する手法として重要である。
 また、ポストゲノムとして注目されているプロテオソームを解析するために、タンパク質を分離するための手法の1つとして、二次元電気泳動が広く用いられている。
 二次元電気泳動とは、二段階の電気泳動によってタンパク質を二次元的に分離する手法である。
 例えば、一次元目では、固定化pH勾配ゲル(IPGゲル)を用いた等電点電気泳動(IEF;isoelctric focusing)によってタンパク質を分離する。二次元目では、ドデシル硫酸ナトリウム・ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE;sodium dodecyl sulfate-polyacrylamidegel electrophoresis)によって分子量ごとにタンパク質を分離する。
 近年、動植物ゲノム解析などにおけるゲル電気泳動法の利用頻度が飛躍的に増大しており、均質かつ生産性に優れた電気泳動用ゲルプレートを作製する技術が望まれている。
 このような電気泳動用ゲルプレートの作製方法としては、インクジェット方式を用いた方法が知られている(例えば、特許文献1参照)。
特開2004-77393号公報
 しかしながら、特許文献1で用いられている電気泳動用ゲル形成用の溶液は、ゲル粒子を含有しているため、インクジェットヘッドに設けられた微細な口径のノズルが詰まるという問題があった。
 本発明は、上記事情に鑑みてなされたものであって、ゲル化を開始するタイミングを制御可能な電気泳動ゲル形成モノマー溶液、その溶液吐出方法、電気泳動ゲルの形成方法、電気泳動ゲルおよび電気泳動用反応器具を提供することを目的とする。
(1) 本発明の第1の態様による電気泳動ゲル形成モノマー溶液は、ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する。
(2) 本発明の第1の態様による電気泳動ゲル形成モノマー溶液において、前記モノマーは、ラジカル重合可能な物質であることが好ましい。
(3) 本発明の第1の態様による電気泳動ゲル形成モノマー溶液において、前記ラジカル重合可能な物質は、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミドおよびアクリルアミド誘導体からなる群から選択される少なくとも1種であることが好ましい。
(4) 本発明の第1の態様による電気泳動ゲル形成モノマー溶液において、前記ゲル重合促進剤は、テトラメチルエチレンジアミンであることが好ましい。
(5) 本発明の第2の態様による溶液吐出方法は、ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する。
(6) 本発明の第2の態様による溶液吐出方法は、前記第一の吐出工程において、被吐出物の被吐出面の一方向に沿って濃度勾配を示すように、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出することが好ましい。
(7) 本発明の第2の態様による溶液吐出方法は、前記第一の吐出工程において、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液を複数回吐出することが好ましい。
(8) 本発明の第2の態様による溶液吐出方法において、前記モノマーは、ラジカル重合可能な物質であることが好ましい。
(9) 本発明の第2の態様による溶液吐出方法において、前記ラジカル重合可能な物質は、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミドおよびアクリルアミド誘導体からなる群から選択される少なくとも1種であることが好ましい。
(10) 本発明の第2の態様による溶液吐出方法は、前記第一の吐出工程において、インクジェット法を用いることが好ましい。
(11) 本発明の第2の態様による溶液吐出方法は、前記第二の吐出工程において、インクジェット法を用いることが好ましい。
(12) 本発明の第3の態様による電気泳動ゲルの形成方法は、ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する溶液吐出方法を有する。
(13) 本発明の第4の態様による電気泳動ゲルは、ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する溶液吐出方法を有する電気泳動ゲルの形成方法によって形成される。
(14) 本発明の第5の態様による電気泳動用反応器具は、ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する溶液吐出方法を有する電気泳動ゲルの形成方法によって形成された電気泳動ゲルを備える。
 本発明によれば、電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化が開始するタイミングを制御することができる。
第1実施形態の溶液吐出方法の概要を示す第1の斜視図である。 第1実施形態の溶液吐出方法の概要を示す第2の斜視図である。 第1実施形態の溶液吐出方法の概要を示す第3の斜視図である。 第2実施形態の溶液吐出方法の概要を示す斜視図である。 本発明の一実施形態に係る電気泳動ゲルの形成方法の概略を示す第1の断面図である。 本発明の一実施形態に係る電気泳動ゲルの形成方法の概略を示す第2の断面図である。 本発明の一実施形態に係る電気泳動ゲルの形成方法の概略を示す第3の断面図である。 本発明の一実施形態に係る電気泳動ゲルの形成方法の概略を示す第4の断面図である。
「電気泳動ゲル形成モノマー溶液」
 本発明の実施形態の電気泳動ゲル形成モノマー溶液について説明する。
 本実施形態の電気泳動ゲル形成モノマー溶液は、ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する。
 ゲル構造を形成するモノマーとしては、ラジカル重合可能な物質(ラジカルを反応中心として重合する物質)、アニオン重合可能な物質、カチオン重合可能な物質、配位重合可能な物質または開環重合可能な物質が用いられる。これらの中でも、目的とする仕様の電気泳動ゲルを、任意のタイミングで形成可能であることから、ラジカル重合可能な物質が好ましい。
 ラジカル重合可能な物質としては、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミドおよびアクリルアミド誘導体からなる群から選択される少なくとも1種が用いられる。
 アクリルアミドは、重合して電気泳動ゲルの主骨格を形成する。
 N,N’-メチレンビスアクリルアミドは、アクリルアミドと共重合して、電気泳動ゲルの主骨格を架橋する。
 本実施形態の電気泳動ゲル形成モノマー溶液において、アクリルアミドとN,N’-メチレンビスアクリルアミドの配合比(質量比)は、目的とする電気泳動ゲルの仕様に応じて適宜調整されるが、19:1~49:1が好ましい。本実施形態では、アクリルアミドとN,N’-メチレンビスアクリルアミドの配合比(質量比)を、例えば、37.5:1とする。
 アクリルアミド誘導体は、電気泳動ゲルの電荷分布、すなわち、電気泳動ゲルのpH分布を決定する。
 アクリルアミド誘導体としては、アクリルアミドに1つ以上の置換基が導入されたものであり、その置換基に起因する酸解離定数(pK)が1~12の範囲にあるものが用いられる。
 アクリルアミド誘導体としては、アクリルアミドのカルボン酸アミドの1つの水素をスルホ基(-SOH)、カルボキシル基(-COOH)、酸素、窒素、硫黄などを少なくとも1つ含有する環式化合物、アミノ基(-NH、-NHR、-NR)などで置換した誘導体が挙げられる。
 本実施形態では、目的とする電気泳動ゲルを得るために、酸解離定数(pK)が1、3.1、3.6、4.6、6.2、7.0、8.5、9.3、10.3、12などのアクリルアミド誘導体が組み合わされて用いられる。
 本実施形態の電気泳動ゲル形成モノマー溶液は、酸性の電気泳動ゲル形成モノマー溶液(以下、「酸性ゲル形成モノマー溶液」と言う。)、または、塩基性の電気泳動ゲル形成モノマー溶液(以下、「塩基性ゲル形成モノマー溶液」と言う。)として用いられる。
 酸性ゲル形成モノマー溶液としては、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミド、および、酸解離定数が異なる1種または2種以上のアクリルアミド誘導体を含むものが用いられる。各アクリルアミド誘導体の配合比(質量比)、すなわち、[アクリルアミド誘導体質量/酸性ゲル形成モノマー溶液(アクリルアミド誘導体を含む)質量]は、目的とする電気泳動ゲルの仕様に応じて適宜調整される。
 塩基性ゲル形成モノマー溶液としては、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミド、および、酸解離定数が異なる1種または2種以上のアクリルアミド誘導体を含むものが用いられる。各アクリルアミド誘導体の配合比(質量比)、すなわち、[アクリルアミド誘導体質量/塩基性ゲル形成モノマー溶液(アクリルアミド誘導体を含む)質量]は、目的とする電気泳動ゲルの仕様に応じて適宜調整される。
 ゲル重合促進剤としては、テトラメチルエチレンジアミン(Tetramethyethylenediamine、TEMED)が用いられる。テトラメチルエチレンジアミンは、ゲル重合開始剤と混合すると、直ちにゲル重合の活性種であるラジカルを形成し、アクリルアミドのラジカル重合の開始剤として好適な過硫酸アンモニウム(Ammonium persulfate、APS)を失活させることなく、安定に存在させることができる。
 電気泳動ゲル形成モノマー溶液におけるゲル重合促進剤の配合比(質量比)、すなわち、[ゲル重合促進剤質量/電気泳動ゲル形成モノマー溶液(ゲル重合促進剤を含む)質量]は、特に限定されない。ゲル重合促進剤は、酸性ゲル形成モノマー溶液と塩基性ゲル形成モノマー溶液のそれぞれに、所定の配合比(質量比)で配合される。
 本実施形態の電気泳動ゲル形成モノマー溶液は、粘度を適切に調整するために、増粘剤が含まれていてもよい。
 増粘剤としては、特に限定されないが、電気泳動に影響を与えないことから、グリセロールが好ましい。
 電気泳動ゲル形成モノマー溶液におけるグリセロールの配合比(質量比)、すなわち、[グリセロール質量/電気泳動ゲル形成モノマー溶液(グリセロールを含む)質量]は、特に限定されないが、電気泳動ゲル形成モノマー溶液の吐出方法に応じて適宜調整される。
 電気泳動ゲル形成モノマー溶液が酸性ゲル形成モノマー溶液であり、この溶液の吐出方法としてインクジェット法が用いられる場合、[グリセロール質量/酸性ゲル形成モノマー溶液(グリセロールを含む)質量]は、例えば、0.47に調整される。
 電気泳動ゲル形成モノマー溶液が塩基性ゲル形成モノマー溶液であり、この溶液の吐出方法としてインクジェット法が用いられる場合、[グリセロール質量/塩基性ゲル形成モノマー溶液(グリセロールを含む)質量]は、例えば、0.40に調整される。
 本実施形態の電気泳動ゲル形成モノマー溶液によれば、ゲル重合開始剤を含まないので、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液と混合することによりゲル化が開始するので、ゲル化を開始するタイミングを制御することができる。したがって、この電気泳動ゲル形成モノマー溶液をインクジェットヘッドなどで吐出する場合、ゲル重合開始溶液とは別のインクジェットヘッドで吐出することにより、インクジェットヘッド内で電気泳動ゲル形成モノマー溶液がゲル化して、インクジェットヘッドのノズルがそのゲルによって目詰まりすることを防止できる。
「溶液吐出方法」
(1)第1実施形態
 図1A~図1Cは、第1実施形態の溶液吐出方法の概要を示す斜視図である。
 本実施形態の溶液吐出方法は、被吐出物である基材1の被吐出面(一方の面)1aに設けられた任意の形状のゲル形成領域2に対して、吐出手段3により、上述の電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、第一の吐出工程により基材1の被吐出面(一方の面)1aに吐出した電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、吐出手段3により、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する。
 基材1としては、例えば、平板プレートまたは任意の形状に成型したチップなどが挙げられる。本実施形態では、基材1としては、平面視長方形状のものを例示する。
 基材1の原料としては、例えば、ガラス、樹脂またはセラミックスなどが挙げられる。
 ガラスとしては、具体的には、石英ガラス、無アルカリガラスなどが挙げられる。
 樹脂としては、具体的には、ポリエチレンテレフタレート(polyethylene terephthalate、PET)、ポリメタクリル酸メチル樹脂(polymethyl methacrylate、PMMA)などが挙げられる。
 セラミックスとしては、具体的には、アルミナ、低温同時焼成セラミックなどが挙げられる。
 ゲル形成領域2は、例えば、基材1の一方の面1aに、電気泳動ゲル形成モノマー溶液に含まれるモノマーに類似する化学構造の有機化合物を、物理的にコーティングするか、あるいは、化学的に共有結合させることにより、基材1の一方の面1aの表面改質を行って形成される。すなわち、ゲル形成領域2は、前記の有機化合物からなる薄膜から構成される。
 上述のように、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミドおよびアクリルアミド誘導体を含む電気泳動ゲル形成モノマー溶液を用いる場合、アクリル酸、アクリルアミド、アクリルアミド誘導体などのプラズマグラフト重合処理により、ゲル形成領域2を形成することが好ましい。このようにすれば、得られたゲル形成領域2は親水性となり、上述の電気泳動ゲル形成モノマー溶液を用いて形成した電気泳動ゲルを、基材1の一方の面1aに設けられたゲル形成領域2に対して、強い付着力で付着させることができる。
 本実施形態では、ゲル形成領域2としては、基材1の長手方向に沿って形成された平面視長方形状のものを例示する。
 吐出手段3としては、基材1の一方の面1aで直接、複数種類の電気泳動ゲル形成モノマー溶液を混合する必要があることから、微細な液滴を形成可能なものであれば特に限定されない。吐出手段3としては、例えば、インクジェットヘッド、スプレーノズルなどが挙げられる。
 本実施形態では、基材1の一方の面1aに対して垂直方向に、微細な液滴間のピッチを制御できることも必須である。このような点を考慮すると、吐出手段3としては、電気泳動ゲル形成モノマー溶液をスプレー状に噴霧するスプレーノズルよりも、インクジェットヘッドが好ましい。
 本実施形態では、吐出手段3としては、インクジェットヘッドを例示する。以下、吐出手段3を、インクジェットヘッド3と言う。
 インクジェットヘッド3としては、図1Aに示すように、例えば、一直線上に、所定のピッチで多数のノズル3aが設けられた、8つのインクジェットヘッド3A,3B,3C,3D,3E,3F,3G,3Hから構成されるものが用いられる。
 インクジェットヘッド3A,3B,3C,3D,3E,3F,3G,3Hは、それぞれのノズル3aが延在する方向が互いに平行になるように、並列に配設される。また、インクジェットヘッド3A,3B,3C,3D,3E,3F,3G,3Hは、インクジェットヘッド3が基材1をスキャンする方向(図1Aにおける矢印の方向)に沿って順に設けられている。本実施形態では、インクジェットヘッド3のスキャン方向は、基材1の長手方向に沿った方向である。
 インクジェットヘッド3としては、特に限定されないが、連続吐出型(コンティニュアスインクジェット)のインクジェットヘッド、オンデマンド型(ドロップオンデマンドインクジェット)のインクジェットヘッドなどが用いられる。
 連続吐出型インクジェットヘッドとしては、帯電させた微小液滴を電界で制御する荷電制御方式などが用いられる。
 オンデマンド型インクジェットヘッドとしては、サーマル(バブル)方式、静電アクチュエータ方式またはピエゾ方式のものが用いられる。
 インクジェットヘッド3のスキャン方向は、上述の電気泳動ゲル形成モノマー溶液を用いた電気泳動ゲルの形成において要求される事項に応じて、基材1の長手方向に沿った一方向、および、両方向(基材1の長手方向に沿って往復する方向)から選択される。
 基材1に対する電気泳動ゲルのアライメント精度を優先する場合、インクジェットヘッド3のスキャン方向は、基材1の長手方向に沿った一方向とされる。
 一方、タクトタイムを優先する場合、インクジェットヘッド3のスキャン方向は、基材1の長手方向に沿った両方向(基材1の長手方向に沿って往復する方向)とされる。
 本実施形態の溶液吐出方法では、まず、基材1の一方の面1aにゲル形成領域2を形成する(図1A)。
 この工程では、基材1の一方の面1aの任意の領域に、メタルマスク、レジスト、カプトンテープなどのマスキング材により、所定の形状をパターニングし、そのパターニングされた領域のみに表面処理を施して、ゲル形成領域2を形成する。
 表面処理方法としては、特に限定されないが、上述の電気泳動ゲル形成モノマー溶液を用いる場合、例えば、アクリル酸、アクリルアミド、アクリルアミド誘導体などのプラズマグラフト重合処理が用いられる。
 次いで、プラズマグラフト重合処理が終了した後、マスキング材を除去して、基材1の一方の面1aを洗浄する。
 次いで、基材1の長手方向に沿ってインクジェットヘッド3をスキャン(移動)させながら、インクジェットヘッド3から基材1の一方の面1aにおけるゲル形成領域2に、電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する(第一の吐出工程)。
 第一の吐出工程では、電気泳動ゲル形成モノマー溶液として、酸性ゲル形成モノマー溶液と塩基性ゲル形成モノマー溶液を用いる。
 酸性ゲル形成モノマー溶液または塩基性ゲル形成モノマー溶液としては、上述のようなアクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミド、および、酸解離定数が異なる1種または2種以上のアクリルアミド誘導体を含むものを用いる。
 第一の吐出工程では、酸性ゲル形成モノマー溶液または塩基性ゲル形成モノマー溶液の一方を、その液滴が基材1の一方の面1aに沿って濃度勾配を示すように吐出し、それとは反対の濃度勾配を示すように、酸性ゲル形成モノマー溶液または塩基性ゲル形成モノマー溶液の他方を吐出する。
 すなわち、第一の吐出工程では、例えば、図1Bに示すように、酸性ゲル形成モノマー溶液の液滴5の濃淡密度が、基材1の一端1bから他端1cに向かって高くなるように、インクジェットヘッド3から基材1の一方の面1aに、酸性ゲル形成モノマー溶液を吐出する。これにより、酸性ゲル形成モノマー溶液の濃度勾配が、基材1の一端1bから他端1cに向かって高くなるよう、インクジェットヘッド3から基材1の一方の面1aに、酸性ゲル形成モノマー溶液が吐出される。
 一方、図1Cに示すように、塩基性ゲル形成モノマー溶液の液滴6の濃淡密度が、基材1の他端1cから一端1bに向かって高くなるように、インクジェットヘッド3から基材1の一方の面1aに、塩基性ゲル形成モノマー溶液を吐出する。これにより、塩基性ゲル形成モノマー溶液の濃度勾配が、基材1の他端1cから一端1bに向かって高くなるよう、インクジェットヘッド3から基材1の一方の面1aに、塩基性ゲル形成モノマー溶液が吐出される。
 このように、基材1の一方の面1aに、酸性ゲル形成モノマー溶液と塩基性ゲル形成モノマー溶液を別々に吐出するとともに、それぞれのモノマー溶液の吐出時に、濃度勾配を形成することにより、基材1の一方の面1aの長手方向に沿ってpH勾配を示すように、電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出することができる。
 また、本実施形態では、酸性ゲル形成モノマー溶液と塩基性ゲル形成モノマー溶液をそれぞれ1回ずつ吐出した場合を例示したが、本発明はこれに限定されない。本発明にあっては、目的とする仕様の電気泳動ゲルに応じて、酸性ゲル形成モノマー溶液と塩基性ゲル形成モノマー溶液を吐出する回数が適宜調整される。
 ところで、酸性ゲル形成モノマー溶液および塩基性ゲル形成モノマー溶液としては、通常、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミド、および、酸解離定数が異なる1種または2種以上のアクリルアミド誘導体の混合物が用いられる。したがって、必ずしも、それぞれのアクリルアミド誘導体が好ましい組成比でゲル形成領域2に吐出されるわけではない。
 そこで、第一の吐出工程では、酸性ゲル形成モノマー溶液および塩基性ゲル形成モノマー溶液の液滴の濃淡密度を、より精密に制御するために、種々のアクリルアミド誘導体を独立して吐出してもよい。
 例えば、1つのインクジェットヘッド3Aから、アクリルアミドとN,N’-メチレンビスアクリルアミドの混合物を吐出し、6つのインクジェットヘッド3B,3C,3D,3E,3F,3Gから、酸解離定数(pK)が異なる6種類のアクリルアミド誘導体(例えば、酸解離定数(pK)が3.6、4.6、6.2、7.0、8.5、9.3のもの)をそれぞれ別々に吐出する。これにより、基材1の一方の面1aにて、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミドおよびアクリルアミド誘導体が混合して、基材1の一方の面1aに、上述の電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出したことと同等の結果が得られる。
 また、この場合、最終的に、基材1の一方の面1aに吐出された電気泳動ゲル形成モノマー溶液が、基材1の一方の面1aの長手方向に沿って濃度勾配を示すように、アクリルアミドとN,N’-メチレンビスアクリルアミドの混合物の吐出量と、6種類のアクリルアミド誘導体の吐出量とを制御する。
 次いで、例えば、1つのインクジェットヘッド3Hから、第一の吐出工程において、基材1の一方の面1aに吐出された電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する(第二の吐出工程)。
 すなわち、第二の吐出工程では、インクジェットヘッド3内で電気泳動ゲル形成モノマー溶液がゲル化することを防止するために、電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化の直前に、ゲル重合開始剤と、電気泳動ゲル形成モノマー溶液に含まれるゲル重合促進剤とを混合する。
 ゲル重合開始剤は、ゲル重合促進剤と混合すると、直ちにゲル重合のトリガーとなる活性種であるラジカルを生成するが、このラジカルは時間とともに失活する。つまり、電気泳動ゲル形成モノマー溶液をゲル化するタイミングを制御するためには、ゲル重合開始剤とゲル重合促進剤を混合するタイミングや、ゲル構造を形成するモノマーとラジカルを混合するタイミングが重要となる。
 そこで、本実施形態では、ゲル構造を形成するモノマーとゲル重合促進剤を予め混合した電気泳動ゲル形成モノマー溶液を用いることにより、電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化直前まで、ゲル重合開始剤とゲル重合促進剤を混合しない。したがって、電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化のタイミングは、電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出するタイミング、すなわち、ラジカルを生成するタイミングによって制御することができる。
 ゲル重合開始剤としては、過硫酸アンモニウム(Ammonium persulfate、APS)が用いられる。過硫酸アンモニウムは、テトラメチルエチレンジアミン(TEMED)などのゲル重合促進剤と混合すると、直ちにゲル重合の活性種であるラジカルを形成し、アクリルアミドのラジカル重合の開始剤として好適である。
 ゲル重合開始剤を溶解するための溶媒としては、グリセロール、エチレングリコール、ジエチレングリコール、トリエチレングリコール、ポリエチレングリコールなどが用いられる。
 基材1のゲル形成領域2に吐出された電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始溶液を吐出した後、30分~1時間程度放置すると、電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化が始まり、目的とする電気泳動ゲルが形成される。
 本実施形態の溶液吐出方法によれば、電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化を開始するタイミングを制御することができるので、インクジェットヘッド3内で電気泳動ゲル形成モノマー溶液がゲル化して、インクジェットヘッド3のノズル3aがそのゲルによって目詰まりすることを防止できるとともに、ラジカルの不活性化による電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化の阻害を回避することができる。したがって、固定化pH勾配(IPG;immobilized pH gradient)を有する電気泳動ゲルを形成することができる。
 また、電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する前に、予め基材1の一方の面1aにゲル形成領域2を形成することにより、電気泳動ゲル形成モノマー溶液をゲル化してなる電気泳動ゲルの基材1の一方の面1aに対する密着性が向上するので、基材1の材質を問わず、電気泳動ゲルの形状を自由に形成可能となる。
 また、本実施形態の溶液吐出方法によれば、第一の吐出工程と第二の吐出工程において、インクジェット法を用いることにより、数十μm程度のドットピッチで、電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出することができ、結果として、高精細なpH勾配を有する電気泳動ゲルを形成することができる。
(2)第2実施形態
 図2は、第2実施形態の溶液吐出方法の概要を示す斜視図である。
 本実施形態では、基材11としては、例えば、平板プレートを用い、その一側面11aに、ゲル形成領域12を設けた場合について例示する。
 基材11としては、特に限定されないが、例えば、厚さが2mmのアクリル板が挙げられる。
 インクジェットヘッド13としては、例えば、一直線上に、所定のピッチで多数のノズル13aが設けられた、5つのインクジェットヘッド13A,13B,13C,13D,13Eから構成されるものが用いられる。
 インクジェットヘッド13A,13B,13C,13D,13Eは、それぞれのノズル13aが延在する方向が互いに平行になるように、並列に配設される。また、インクジェットヘッド13A,13B,13C,13D,13Eは、インクジェットヘッド13が基材11の一側面11aをスキャンする方向(図2における矢印の方向)に沿って順に設けられている。本実施形態では、インクジェットヘッド13のスキャン方向は、基材11の一側面11aの長手方向に沿った方向である。
 本実施形態の溶液吐出方法では、まず、上述の第1実施形態と同様にして、基材11の一側面11aにゲル形成領域12を形成する。
 次いで、基材11の一側面11aの長手方向に沿ってインクジェットヘッド13をスキャン(移動)させながら、インクジェットヘッド13から基材11の一側面11aにおけるゲル形成領域12に、電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する(第一の吐出工程)。
 本実施形態にあっても、第一の吐出工程において、上述の第1実施形態と同様にして、電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する。
 次いで、インクジェットヘッド13から、第一の吐出工程において、基材11の一側面11aに吐出された電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する(第二の吐出工程)。
 本実施形態にあっても、第二の吐出工程において、上述の第1実施形態と同様にして、ゲル重合開始溶液を吐出する。
 このように、本実施形態の溶液吐出方法によれば、狭い領域や複雑な形状の領域に対しても電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出することができる。したがって、従来、ゲルの形成が困難であった領域に対して、ゲルを形成することができる。
「電気泳動ゲルの形成方法」
 図3A~図3Dは、本発明の一実施形態に係る電気泳動ゲルの形成方法の概略を示す断面図である。
 本実施形態の電気泳動ゲルの形成方法は、上述の第1実施形態の溶液吐出方法または第2実施形態の溶液吐出方法を有する方法である。
 本実施形態の電気泳動ゲルの形成方法では、まず、図3Aに示すように、基材21の一方の面21aにゲル形成領域22を形成する(図1A参照)。
 基材21としては、上述の第1実施形態の溶液吐出方法と同様のものが用いられる。
 ゲル形成領域22を形成するための基材21の一方の面21aの表面処理方法としては、上述の第1実施形態の溶液吐出方法と同様の方法が用いられる。
 本実施形態では、例えば、基材21として、厚さ200μmのポリエチレンテレフタレートフィルムを用い、その基材21の一方の面(表面)21aに、長さ70mm×幅3mmの抜きパターンを形成したカプトンテープ(ポリイミドテープ、厚さ80μm)を接着し、アクリル酸またはアクリルアミドのプラズマグラフト重合表面処理を施した。
 プラズマグラフト重合表面処理後、カプトンテープを剥がして、表面洗浄を行う。
 その後、ゲル形成領域22の接触角を測定したところ、20度以下(水液滴)となり、基材21の一方の面21aの接触角(60度以上)と比較すると、ゲル形成領域22は強い親水性を有する面であることが確認された。
 次いで、図3Bに示すように、ピペット、ディスペンサー、インクジェットなどを用いて、基材21の一方の面21aにおけるゲル形成領域22に、純水、または、純水にキャリアアンフォライト(両性担体)を混合した水溶液などを滴下し、ゲル形成領域22に液溜まり23を形成する。このとき、液溜まり23がゲル形成領域22の全域に均一に濡れ拡がるようにする。
 液溜まり23を形成する純水または水溶液には、必要に応じて、テトラメチルエチレンジアミンなどのゲル重合促進剤を添加してもよい。
 本実施形態では、例えば、液溜まり23の大きさ(平面視した場合の大きさ(面積))を、長さ70mm×幅3mmとした。
 液溜まり23は、後段の工程にて、上述の電気泳動ゲル形成モノマー溶液と、上述のゲル重合開始溶液とを混合する際、これらの溶液を良好に混合するために重要な役割を果たす。
 また、液溜まり23は、所望の厚さの電気泳動ゲルを形成するためにも重要な役割を果たす。すなわち、液溜まり23がないと、電気泳動ゲルの製造時間が大幅に増加する。
 本実施形態では、例えば、ゲル形成領域22に総量で140μLの溶液を吐出し、ゲル重合後の膜厚を500μmに調整する。
 本実施形態では、例えば、ピペットを用いて、液溜まり23を形成する純水67.65μLを、ゲル形成領域22に滴下した。
 次いで、図3Cに示すように、上述の第1実施形態および第2実施形態の溶液吐出方法と同様にして、インクジェットヘッド24から基材21の一方の面21aにおける液溜まり23に、電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する(第一の吐出工程)。
 すなわち、第一の吐出工程では、例えば、図3Cに示すように、電気泳動ゲル形成モノマー溶液が酸性ゲル形成モノマー溶液である場合、その液滴25の濃淡密度(吐出密度)が、基材21の一端21bから他端21cに向かって高くなるように、インクジェットヘッド24から基材21の一方の面21aに、酸性ゲル形成モノマー溶液を吐出する。
 これにより、酸性ゲル形成モノマー溶液の濃度勾配が、基材21の一端21bから他端21cに向かって高くなるよう、インクジェットヘッド24から基材21の一方の面21aに、酸性ゲル形成モノマー溶液が吐出される。
 本実施形態では、例えば、酸性ゲル形成モノマー溶液の吐出量を、39.45μLとした。
 一方、図3Cに示すように、電気泳動ゲル形成モノマー溶液が塩基性ゲル形成モノマー溶液である場合、その液滴25の濃淡密度(吐出密度)が、基材21の他端21cから一端21bに向かって高くなるように、インクジェットヘッド24から基材21の一方の面21aに、塩基性ゲル形成モノマー溶液を吐出する。
 これにより、塩基性ゲル形成モノマー溶液の濃度勾配が、基材21の他端21cから一端21bに向かって高くなるよう、インクジェットヘッド24から基材21の一方の面21aに、塩基性ゲル形成モノマー溶液が吐出される。
 本実施形態では、例えば、塩基性ゲル形成モノマー溶液の吐出量を26.90μLとした。
 なお、本実施形態では、酸性ゲル形成モノマー溶液と塩基性ゲル形成モノマー溶液をそれぞれ1回ずつ吐出した場合を例示したが、本発明はこれに限定されない。本発明にあっては、目的とする仕様の電気泳動ゲルに応じて、酸性ゲル形成モノマー溶液と塩基性ゲル形成モノマー溶液を吐出する回数が適宜調整される。
 すなわち、上述の第1実施形態の溶液吐出方法と同様にして、第一の吐出工程では、酸性ゲル形成モノマー溶液および塩基性ゲル形成モノマー溶液の液滴の濃淡密度を、より精密に制御するために、種々のアクリルアミド誘導体を独立して吐出してもよい。
 次いで、図3Cに示すように、上述の第1実施形態および第2実施形態の溶液吐出方法と同様にして、インクジェットヘッド24から基材21の一方の面21aにおける液溜まり23に吐出された電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する(第二の吐出工程)。
 本実施形態では、例えば、ゲル重合開始剤として20%過硫酸アンモニウムを用い、20%過硫酸アンモニウムとグリセロールを体積比で1:1の割合で混合した、ゲル重合開始剤溶液を用いた。
 また、本実施形態では、例えば、ゲル重合開始剤溶液の吐出量を7μLとした。
 このようにして、基材21の一方の面21aに形成されたゲル形成領域22に、電気泳動ゲル形成混合溶液26を吐出する。
 この電気泳動ゲル形成混合溶液26は、30分~1時間程度放置すると、ゲル化が始まり、目的とする電気泳動ゲル27(図3D)が形成される。
 なお、本実施形態では、ラジカル反応を用いているため、第一の吐出工程および第二の吐出工程を含む電気泳動ゲル形成工程は、ゲル重合反応を抑制する酸素の影響を避けるため、窒素雰囲気化で行うことが好ましい。
 次いで、電気泳動ゲル27に含まれるナトリウムイオンなどの塩、ゲル未重合モノマーを除去するために、洗浄液で電気泳動ゲル27を洗浄する。
 洗浄液としては、純水、または、純水に少量のキャリアアンフォライトを混合した水溶液などが用いられる。
 電気泳動ゲル27を洗浄するには、純水または水溶液に電気泳動ゲル27が形成された基材21を浸漬し、これらを振盪機などにより振盪する。
 本実施形態では、純水中に電気泳動ゲル27が形成された基材21を浸漬し、周期40rpmで、20分間振盪する工程を3回繰り返した。なお、1回の洗浄が完了する毎に、純水を交換した。
 次いで、洗浄後、直ちに、デシケーター中で電気泳動ゲル27が形成された基材21を乾燥する。
 本実施形態の電気泳動ゲルの製造方法によれば、電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化を開始するタイミングを制御することができるので、インクジェットヘッド24内で電気泳動ゲル形成モノマー溶液がゲル化して、インクジェットヘッド24のノズルがそのゲルによって目詰まりすることを防止できるとともに、ラジカルの不活性化による電気泳動ゲル形成モノマー溶液のゲル化の阻害を回避することができる。したがって、固定化pH勾配(IPG;immobilized pH gradient)を有する電気泳動ゲルを形成することができる。
 また、本実施形態の電気泳動ゲルの製造方法によって製造された電気泳動ゲルは、高精細なpH勾配を有するとともに、不純物の含有量が少ない。
 さらに、本実施形態の電気泳動ゲルの製造方法を適用して、任意の基材上に電気泳動ゲルを形成することによって、その電気泳動ゲルを備えた電気泳動用反応器具が得られる。
 本実施形態の電気泳動用反応器具としては、例えば、図2に示した基材11の一面に、上述した電気泳動ゲルを直接設けたものなどが挙げられる。
 基材11としては、ポリメチルメタクリレート(PMMA)などで成形された板状の射出成形品などが挙げられる。
 本実施形態の電気泳動用反応器具は、例えば、自動化2次元電気泳動装置に適用される。
 自動化2次元電気泳動装置は、例えば、サンプルの2次元目分離を行う第2分離部(サンプル分離器具)を固定する固定手段、1次元目の分離を行う第1媒体を支持したゲル付支持体を保持するアームを備えた保持手段、固定手段および/または保持手段を移動して双方の相対位置を変更させる駆動手段を具備する。
 この自動化2次元電気泳動装置では、例えば、1次元目の分離を行う第1媒体として、本実施形態の電気泳動用反応器具が用いられる。
 本発明は、タンパク質、DNAまたはRNAなどの生体高分子を分離させるポリアクリルアミドゲル電気泳動またはアガロースゲル電気泳動に用いることが可能であり、特に、等電点電気泳動およびSDS-PAGE電気泳動を含む二次元電気泳動に好適に利用可能である。
1 基材
2 ゲル形成領域
3 吐出手段(インクジェットヘッド)
3A,3B,3C,3D,3E,3F,3G,3H インクジェットヘッド
4 酸性ゲル形成モノマー溶液の液滴
5 塩基性ゲル形成モノマー溶液の液滴
11 基材
12 ゲル形成領域
13 インクジェットヘッド
21 基材
22 ゲル形成領域
23 液溜まり
24 インクジェットヘッド
25 液滴
26 電気泳動ゲル形成混合溶液
27 電気泳動ゲル

Claims (14)

  1.  ゲル構造を形成するモノマーと、
     ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、
     を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液。
  2.  前記モノマーは、ラジカル重合可能な物質である請求項1に記載の電気泳動ゲル形成モノマー溶液。
  3.  前記ラジカル重合可能な物質は、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミドおよびアクリルアミド誘導体からなる群から選択される少なくとも1種である請求項2に記載の電気泳動ゲル形成モノマー溶液。
  4.  前記ゲル重合促進剤は、テトラメチルエチレンジアミンである請求項1に記載の電気泳動ゲル形成モノマー溶液。
  5.  ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、
     前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、
     を有する溶液吐出方法。
  6.  前記第一の吐出工程において、被吐出物の被吐出面の一方向に沿って濃度勾配を示すように、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する請求項5に記載の溶液吐出方法。
  7.  前記第一の吐出工程において、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液を複数回吐出する請求項5に記載の溶液吐出方法。
  8.  前記モノマーは、ラジカル重合可能な物質である請求項5に記載の溶液吐出方法。
  9.  前記ラジカル重合可能な物質は、アクリルアミド、N,N’-メチレンビスアクリルアミドおよびアクリルアミド誘導体からなる群から選択される少なくとも1種である請求項8に記載の溶液吐出方法。
  10.  前記第一の吐出工程において、インクジェット法を用いる請求項5に記載の溶液吐出方法。
  11.  前記第二の吐出工程において、インクジェット法を用いる請求項5に記載の溶液吐出方法。
  12.  ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する溶液吐出方法を有する電気泳動ゲルの形成方法。
  13.  ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する溶液吐出方法を有する電気泳動ゲルの形成方法によって形成される電気泳動ゲル。
  14.  ゲル構造を形成するモノマーと、ゲル重合開始剤を活性化するゲル重合促進剤と、を少なくとも含有する電気泳動ゲル形成モノマー溶液を吐出する第一の吐出工程と、前記電気泳動ゲル形成モノマー溶液に対して、ゲル重合開始剤を含有するゲル重合開始溶液を吐出する第二の吐出工程と、を有する溶液吐出方法を有する電気泳動ゲルの形成方法によって形成された電気泳動ゲルを備える電気泳動用反応器具。
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