WO2009157204A1 - バイオマーカーとしてのマイクロｒｎａを用いた婦人科がんの診断・治療選択 - Google Patents

バイオマーカーとしてのマイクロｒｎａを用いた婦人科がんの診断・治療選択 Download PDF

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cancer
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座間猛
平沢晃
齋藤康一郎
赤羽智子
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Definitions

  • the present invention relates to an expression profile of microRNA (microRNA; miRNA) in gynecological cancer and its use. More specifically, the present invention relates to a method of using a specific microRNA as a biomarker for gynecological cancer, a gynecological cancer determination method, a gynecological cancer determination kit, and the like.
  • Gynecologic cancer is cancer that occurs in the cervix, uterine body, ovary, fallopian tube, sputum, and vulva, and accounts for more than a quarter of female malignant tumors.
  • Main examples include cervical cancer, endometrial cancer, and ovarian cancer (see Patent Document 1 and Non-Patent Document 1).
  • Diagnosis of gynecological cancer is generally performed by performing various imaging tests (ultrasound examination, CT, MRI, PET, etc.), and further evaluating progress through internal examinations and hysteroscopy.
  • imaging tests ultrasound examination, CT, MRI, PET, etc.
  • a histopathological diagnosis is made by preoperative biopsy.
  • Stage is determined by lesion progression and histopathological diagnosis. The stage of ovarian cancer cannot be determined until a histopathological diagnosis of the ovaries removed by laparotomy is obtained.
  • Non-Patent Document 4 there may be a difference between the development of a lesion caused by image inspection and a pathological diagnosis (see Non-Patent Document 4), and it is always necessary to keep in mind the possibility of malignancy in ovarian tumors.
  • pathological diagnosis by cytodiagnosis and histology used as a definitive diagnosis it is difficult to judge the degree of progress and progress even if various immunostainings are combined with basic hematoxylin-eosin (HE) staining. In some cases, it is impossible to predict the prognosis.
  • HE basic hematoxylin-eosin
  • the treatment policy for gynecological cancer is mainly determined by the stage and histopathological findings.
  • follow-up can be done if there is a definitive stage of resection or if there are no clinical symptoms.
  • surgery chemotherapy with anticancer drugs, and radiation therapy are performed alone or in combination.
  • the uterus may have to be removed by surgery, but this is a serious problem in young premature women because of the loss of fertility (non-patent literature). 5). Because ovarian cancer has few subjective symptoms and progresses quickly, it is often already advanced when it is discovered.
  • Non-Patent Document 6 Since an effective screening method has not been established (see Non-Patent Document 6) and cells cannot be collected, cancer screening cannot be performed, so early detection is extremely difficult. Furthermore, even if it is discovered at an early stage, it is a general rule to excise the uterus, which is an adjacent organ. Ovarian cancer develops at any age, and especially in the treatment of young people, fertility is lost, so it becomes a serious problem as with cervical cancer and endometrial cancer (see Non-Patent Document 7). In any type of cancer, chemotherapy is often performed after surgery for advanced cancer, but there are problems such as decreased immunity due to bone marrow suppression, dehydration due to digestive symptoms, and abnormal electrolytes. It has become. Furthermore, individual differences are observed in the therapeutic effect and prognosis, and these are considered to be caused by gene mutations and abnormal expression levels in cancer tissues (see Non-Patent Document 8).
  • microRNA is a single-stranded RNA having a length of about 22 bases that exists in cells and is not translated into protein (see Non-Patent Document 9). It was discovered in the worm C.elegans in 1993 and then in vertebrates in 2001, and is preserved across species. Currently, the presence of nearly 1000 types of microRNAs on the human genome is predicted, and more than 700 types of microRNAs have been cloned so far. In addition, it is estimated that microRNAs are gene-regulated in 30% of the protein translation region on the genome (see Non-Patent Document 10). Therefore, functional failure of microRNAs causes various diseases. there is a possibility. However, to date, only a few of its biological roles have been revealed, and further analysis is awaited.
  • Non-patent Document 13 compares the expression levels of mRNA and microRNA between various stages and grades of endometrial cancer tissues and normal endometrial tissues, and shows 90 types of mRNAs with significantly different expression levels. And 13 microRNAs have been identified.
  • microRNAs Among the 13 types of microRNAs, miR-185, miR-106a, miR-181a, miR-210, miR-423, miR-103, miR-107, and miR-let7c, 8 types of microRNAs are present in the uterine body. It is described that the expression of five microRNAs miR-let7i, miR-221, miR-30c, miR-152, and miR-193 decreased in endometrial cancer. However, it is not described in Non-Patent Document 13 that the 13 types of microRNAs described above can be used for diagnosis of endometrial cancer, and the 13 types of microRNAs identified in Non-Patent Document 13 are used. Is different from the present microRNA.
  • An object of the present invention is to provide a method for using a specific microRNA as a biomarker for gynecological cancer, a gynecological cancer determination method, a gynecological cancer determination kit, and the like.
  • Non-Patent Document 13 discloses 13 types of microRNAs that are suggested to be associated with endometrial cancer.
  • the 13 types of microRNAs identified in Non-Patent Document 13 are different from the present microRNAs, and it is possible to use the 13 types of microRNAs in the diagnosis of endometrial cancer. Is not listed.
  • 335 types of microRNAs that were analyzed in non-patent literature were not sufficient.
  • the present inventors contrasted 723 kinds of microRNAs between the endometrial cancer tissue and the endometrial polyp (endometrial benign tumor) tissue, and the specific microRNA was detected as the endometrial body. The present inventors have found that it is abnormally expressed in cancer tissues and have completed the present invention.
  • the present invention provides (1) miR-592, miR-629 *, miR-517a, miR-205, miR-184, miR-509-5p, miR-135a *, miR-137, miR-602, miR- 186 *, miR-181a-2 *, miR-193b *, miR-377 *, miR-449b, miR-449a, miR-369-3p, miR-323-3p, miR-329, miR-299-5p, miR-34b, miR-411, miR-34c-5p, miR-376b, miR-885-5p, miR-337-3p, miR-337-5p, miR-127-3p, miR-138, miR-203, miR-488, miR-489, miR-643, miR-888, miR-424, miR-432, miR-433, miR-450a, miR-503, miR-542-3p, miR-542-5p and miR- A method of using one or
  • the present invention also includes (3) a method for determining gynecological cancer comprising the following steps: (A) a step of extracting RNA in gynecological specimen tissue or blood of a subject: (B ) MiR-592, miR-629 *, miR-517a, miR-205, miR-184, miR-509-5p, miR-135a *, miR-137, miR-602, miR-186 in the extracted RNA *, MiR-181a-2 *, miR-193b *, miR-377 *, miR-449b, miR-449a, miR-369-3p, miR-323-3p, miR-329, miR-299-5p, miR -34b, miR-411, miR-34c-5p, miR-376b, miR-885-5p, miR-337-3p, miR-337-5p, miR-127-3p, miR-138, miR-203, miR -488, miR-489, mi
  • the present invention provides (7) miR-592, miR-629 *, miR-517a, miR-205, miR-184, miR-509-5p, miR-135a *, miR-137, miR-602, miR- 186 *, miR-181a-2 *, miR-193b *, miR-377 *, miR-449b, miR-449a, miR-369-3p, miR-323-3p, miR-329, miR-299-5p, miR-34b, miR-411, miR-34c-5p, miR-376b, miR-885-5p, miR-337-3p, miR-337-5p, miR-127-3p, miR-138, miR-203, miR-488, miR-489, miR-643, miR-888, miR-424, miR-432, miR-433, miR-450a, miR-503, miR-542-3p, miR-542-5p and miR- A microarray comprising
  • RNA Characterized in that it consists of RNA with nucleotides deleted, substituted, or added and whose expression is increased or decreased in the blood of gynecological cancer tissue or gynecologic cancer specimens compared to controls.
  • the present invention includes (10) a method for screening a therapeutic agent for gynecological cancer, comprising the following steps: (A) a step of administering a test substance to a non-human animal suffering from gynecological cancer : (B) miR-592, miR-629 *, miR-517a, miR-205, miR-184, miR-509-5p, miR-135a in gynecologic cancer tissue or blood in the non-human animal *, MiR-137, miR-602, miR-186 *, miR-181a-2 *, miR-193b *, miR-377 *, miR-449b, miR-449a, miR-369-3p, miR-323- 3p, miR-329, miR-299-5p, miR-34b, miR-411, miR-34c-5p, miR-376b, miR-885-5p, miR-337-3p, miR-337-5p, miR- 127-3p
  • gynecological cancer can be determined quickly and accurately.
  • the determination kit for gynecological cancer of the present invention and the method used for determination of gynecological cancer it is possible to quickly and accurately determine whether or not the cancer is gynecological.
  • a gynecological cancer therapeutic agent can be efficiently screened.
  • the microRNA when the subject suffers from gynecological cancer, the microRNA whose concentration in the blood of the subject also changes can use a blood sample that is extremely easy to collect.
  • the method is particularly excellent in rapidity and convenience in methods such as cancer biomarkers and gynecological cancer determination methods.
  • further research on this microRNA will enable the onset, progress, prognosis prediction and treatment of gynecological cancer, and will be a breakthrough in solving various problems in current gynecological cancer clinical practice. Can be expected.
  • microRNA expression is known to be tumor tissue-specific, and may be useful for identifying the primary site of gynecological unknown cancer.
  • MicroRNAs with increased expression in endometrial cancer tissues are diagrams showing the relative expression levels of their microRNAs in each sample.
  • the bar graph of each panel shows the relative expression level in each sample of polyp; cancer (1); cancer (2); cancer (3) from the left.
  • MicroRNAs with reduced expression in endometrial cancer tissues showing the relative expression levels of their microRNAs in each sample
  • FIG. the bar graph of each panel shows the relative expression level in each sample of polyp; cancer (1); cancer (2); cancer (3) from the left. It is a figure which shows the relative expression level of let-7 * family in the non-cancer tissue or cancer tissue of a uterine body.
  • the bar graph of each panel shows the relative expression level in each sample of polyp; cancer (1); cancer (2); cancer (3) from the left. It is a figure which shows the relative expression level of miR-17-92 (s) cluster in the non-cancer tissue or cancer tissue of a uterine body. In addition, the bar graph of each panel shows the relative expression level in each sample of polyp; cancer (1); cancer (2); cancer (3) from the left. It is a figure which shows the relative expression level of miR-15 and miR-16 in the non-cancer tissue or cancer tissue of a uterine body. In addition, the bar graph of each panel shows the relative expression level in each sample of polyp; cancer (1); cancer (2); cancer (3) from the left.
  • MicroRNAs with decreased expression in endometrial cancer tissues show the relative expression levels of their microRNAs in each sample.
  • the bar graphs on each panel are “42 (normal)” (normal endometrial tissue), “06-072 (G1Ib)”, “05-034 (G1Ib)”, “04-010 (G3IIIc) from the left, respectively.
  • MicroRNAs (miR-433, miR-450a, miR-503, miR-542-3p, miR-542-5p and miR-584) whose expression is reduced in endometrial cancer tissues, in each sample It is a figure which shows the relative expression level of.
  • the bar graphs on each panel are “42 (normal)” (normal endometrial tissue), “06-072 (G1Ib)”, “05-034 (G1Ib)”, “04-010 (G3IIIc) from the left, respectively. ", Relative expression level in each sample of" 06-082 (G3IIIc) ".
  • Examples of the method used as a biomarker for gynecological cancer of the present invention include miR-592 (microRNA-592), miR-629 * (microRNA-629 *), miR-517a (microRNA-517a), miR -205 (microRNA-205), miR-184 (microRNA-184), miR-509-5p (microRNA-509-5p), miR-135a * (microRNA-135a *), miR-137 (micro RNA-137), miR-602 (microRNA-602), miR-186 * (microRNA-186 *), miR-181a-2 * (microRNA-181a-2 *), miR-193b * (microRNA) -193b *), miR-377 * (microRNA-377 *), miR-449b (microRNA-449b), miR-449a (microRNA-449a), miR-369-3p (microRNA-369-3p) , MiR-323-3p (microRNA-323-3p), miR-329 (microRNA-329), miR-299-5
  • a biomarker for gynecological cancer such as endometrial cancer
  • gynecological cancer such as endometrial cancer
  • the method for determining gynecological cancer of the present invention and the woman of the present invention The method used for determination of gynecological cancer and the screening method of the gynecological cancer therapeutic agent of this invention can be illustrated.
  • the above gynecological cancer means cancer that occurs in the cervix, uterine body, ovary, vagina, and vulva.
  • cancers of the cervix and uterine body can be preferably exemplified, and cancers of the uterine body can be exemplified more suitably.
  • limit especially as the kind of said cancer even if it is the first time and recurrence the first time cancer can be illustrated more suitably.
  • Preferred examples of the organism from which the present microRNA is derived include mammals such as humans, mice, rats, hamsters, guinea pigs, monkeys, cows, pigs, horses, rabbits, sheep, goats, cats and dogs. Of these, humans and mice can be exemplified more preferably, and humans can be particularly exemplified.
  • This human-derived microRNA miR-592 (SEQ ID NO: 1), miR-629 * (SEQ ID NO: 2), miR-517a (SEQ ID NO: 3), miR-205 (SEQ ID NO: 4), miR-184 (sequence) No.
  • the sequence of the microRNA is particularly highly conserved among mammals, and the present microRNA is considered to exhibit an expression profile similar to that of humans in mammals other than humans.
  • miR-592 SEQ ID NO: 45
  • miR-449b SEQ ID NO: 46
  • miR-369-3p SEQ ID NO: 47
  • miR-329 SEQ ID NO: 48
  • miR that are the present microRNAs derived from mice The nucleotide sequences of -411 (SEQ ID NO: 49) are shown in SEQ ID NOs: 45 to 49, respectively.
  • the present microRNA is composed of RNA in which one or more nucleotides are deleted, substituted, or added in the nucleotide sequences shown in SEQ ID NOs: 1-27, 50-63, and gynecological cancer
  • RNA whose expression is increased or decreased in the blood of a tissue or gynecological cancer subject compared to a control is included.
  • the above “1 or 2 or more” is preferably 1 to 5, more preferably 1 to 3, particularly preferably 1 to 2, and further preferably 1.
  • RNA comprising the nucleotide sequence deleted as described above increases or decreases in the blood of a gynecological cancer tissue or gynecological cancer subject compared to the control is, for example, a microarray described below. It can be easily confirmed by a method or a quantitative PCR method. In addition, the arrangement
  • a step of extracting RNA in a gynecological specimen tissue or blood of a subject a step of extracting RNA in a gynecological specimen tissue or blood of a subject: (B) the amount of the present microRNA in the extracted RNA is measured.
  • a control there is no particular limitation as long as it comprises a step of comparing and evaluating the expression level of microRNA in the blood of a non-cancer tissue of the same type as the sample tissue or a normal sample of the same type as the sample MiR-592, miR-629 *, miR-517a, miR-205, miR-184, miR-509-5p, miR-135a *, miR-137, miR-602, miR- From a microRNA group consisting of 186 *, miR-181a-2 *, miR-193b *, miR-138, miR-203, miR-488, miR-489, miR-643, miR-885-5p and miR-888 If the expression level of one or more microRNAs selected is increased compared to the control, it is evaluated as gynecological cancer such as endometrial cancer, and / or MiR-377 *, miR-449b, miR-449a, miR-369-3p, miR-3
  • a normal tissue of the same type as the sample tissue was used as a control in the step (C)
  • the blood of the subject was used in the step (A).
  • blood of a normal subject of the same type as the subject is used as a control in the above step (C).
  • the expression level of microRNA in the present specification it is preferable to use a relative expression level corrected with an appropriate internal standard gene in order to correct variations between samples from the viewpoint of more accurate determination.
  • the internal standard gene is not particularly limited, but one or more genes selected from the group consisting of RNU48, RNU6b, snRNA (nuclear small RNA), and snoRNA (nuclear small RNA) are exemplified. can do.
  • the method for extracting RNA in the step (A) is not particularly limited as long as it is a method for extracting RNA containing microRNA from gynecological specimen tissue or subject blood.
  • a method for extracting total RNA including microRNA can be suitably exemplified.
  • the gynecological specimen tissue is not particularly limited as long as it is a tissue selected from the cervix, uterine body, ovary, vagina, vulva, derived from the organism to be determined for gynecological cancer, Preferred examples of the organism include mammals such as humans, mice, rats, hamsters, guinea pigs, monkeys, cows, pigs, horses, rabbits, sheep, goats, cats and dogs. It can be illustrated more preferably, and a human can be particularly preferably illustrated.
  • the method for measuring the expression level of the present microRNA in the step (B) is not particularly limited as long as it is a method capable of identifying the present microRNA amount in RNA containing microRNA.
  • Gynecological cancer determination kit such as a microarray comprising a polynucleotide comprising a nucleic acid sequence complementary to the sequence of the present microRNA, or a part thereof, capable of measuring the expression level of the present microRNA Gynecological cancer determination kit, gynecological cancer determination kit equipped with a primer set that can amplify the microRNA sequence, primer set that can amplify the microRNA sequence, and the micro A woman comprising a polynucleotide comprising a nucleic acid sequence complementary to the RNA sequence or a fluorescent probe comprising a part thereof
  • a microarray method using a microarray comprising a polynucleotide consisting of a nucleic acid sequence complementary to the sequence or a part thereof for gynecological cancer determination, and a primer set that can amplify the microRNA sequence for gynecological cancer A quantitative PCR method used for determination, a primer set capable of amplifying the sequence of the present microRNA, and a fluorescent probe comprising a polynucleotide comprising a nucleic acid sequence complementary to the sequence of the present microRNA or a part thereof,
  • a quantitative PCR method (fluorescent probe method) used for determination of cancer can be preferably exemplified.
  • the microarray method is not particularly limited as long as the expression level of the present microRNA can be measured, but the RNA extracted from the tissue is labeled with a label (preferably a fluorescent label), and the RNA is identified.
  • a label preferably a fluorescent label
  • the microarray is washed and A method for measuring the expression level of the remaining microRNA can be exemplified.
  • the nucleotide type of the nucleic acid sequence is not particularly limited as long as it can specifically hybridize to the predetermined microRNA in the present invention, but is preferably DNA because of its high stability.
  • the length of a part of the above-mentioned polynucleotide is not particularly limited as long as it can specifically hybridize to the predetermined microRNA in the present invention, but from the viewpoint of ensuring the stability of hybridization, 10 to 100 mer. Preferably, it is 10 to 40 mer.
  • said polynucleotide or its one part can be obtained by chemically synthesizing using a well-known method in the said technical field.
  • the array for immobilizing the polynucleotide or a part thereof is not particularly limited, but a glass substrate, a silicon substrate, and the like can be preferably exemplified, and a glass substrate can be more suitably exemplified.
  • the method for immobilizing the above polynucleotide or a part thereof on the array is not particularly limited, and a known method can be used.
  • the gynecological cancer determination kit containing the microarray of the present invention includes, for example, a reagent used for RNA labeling reaction, a reagent used for hybridization reaction, a reagent used for washing, and a tissue.
  • a reagent used for RNA labeling reaction for example, a reagent used for hybridization reaction, a reagent used for washing, and a tissue.
  • An optional element such as a reagent used in a microarray method, such as a reagent used for RNA extraction from, may further be included.
  • Agilent Human miRNA V2 ⁇ (manufactured by Agilent n Technologies) is used according to the method described in miRNA Microarray protocol Version 1.5 of Agilent ⁇ Technologies, and the expression level of microRNA is measured by DNA Microarray Scanner (manufactured by Agilent Technologies).
  • the measuring method can be illustrated more specifically.
  • a microarray to which a probe comprising the above polynucleotide or a part thereof is immobilized is prepared by synthesizing a polynucleotide based on the sequence information of the subject microRNA to be measured and immobilizing it on a commercially available array. be able to.
  • the quantitative PCR method is a method using a primer set capable of amplifying the sequence of the present microRNA, and is not particularly limited as long as the expression level of the present microRNA can be measured.
  • Agarose electrophoresis Conventional quantitative PCR methods such as the SYBR Green method and the fluorescent probe method can be used, but the fluorescent probe method is most preferable from the viewpoint of accuracy and reliability of quantification.
  • the primer set in the quantitative PCR method means a combination of primers (polynucleotides) that can amplify the sequence of the present microRNA.
  • the primer is not particularly limited as long as the sequence of the present microRNA can be amplified.
  • a primer (forward primer) consisting of a partial sequence on the 5 ′ side of the predetermined microRNA sequence in the present invention, and the microRNA
  • the primer set which consists of a primer (reverse primer) which consists of a sequence
  • the 5 ′ side means that it is 5 ′ side of the sequence corresponding to the reverse primer when compared in the sequence of the mature microRNA
  • the 3 ′ side means the mature microRNA.
  • the 5 ′ sequence of the microRNA is preferably exemplified by a sequence 5 ′ from the central nucleic acid of the microRNA sequence, and preferably the 3 ′ sequence of the microRNA is preferably the sequence thereof. Examples of the sequence 3 ′ from the central nucleic acid of the microRNA sequence can be given.
  • the length of each primer is not particularly limited as long as microRNA can be amplified, but a 7 to 10-mer polynucleotide is preferable.
  • the nucleotide type of the polynucleotide that is the primer is preferably DNA because of its high stability.
  • the fluorescent probe is not particularly limited as long as it contains a polynucleotide consisting of a nucleic acid sequence complementary to the sequence of the present microRNA or a part thereof.
  • the TaqMan (registered trademark) probe method using the FRET principle
  • fluorescent probes that can be used in the cycling probe method can be preferably exemplified, and in particular, fluorescent probes that can be used in the TaqMan (registered trademark) probe method (including those using the FRET principle) are more preferably exemplified. can do.
  • Fluorescent probes that can be used in the TaqMan (registered trademark) probe method (excluding those using the FRET principle) or the cycling probe method are labeled with a fluorescent dye on the 5 ′ side and a quencher on the 3 ′ side.
  • fluorescent probe using the FRET principle include fluorescent probes in which a donor dye and an acceptor dye are labeled on the 5 ′ side and the 3 ′ side, respectively.
  • Commercially available fluorescent dyes, quenching substances, donor dyes, acceptor dyes and the like can be used as appropriate.
  • the nucleotide type of the nucleic acid sequence in the fluorescent probe is not particularly limited as long as it can specifically hybridize to the present microRNA, but is preferably DNA because of its high stability.
  • the length of a part of the above-mentioned polynucleotide is not particularly limited as long as it can specifically hybridize to the predetermined microRNA in the present invention, but from the viewpoint of ensuring the stability of hybridization, it is 10 mer or more. It is preferably 15 mer or more, more preferably 1 to 3 mer less than the total number of nucleotides of the target microRNA.
  • the primer set and the fluorescent probe can be obtained by chemical synthesis or the like using a method well known in the art based on the sequence information.
  • a method of quantitative PCR using the above primer set and fluorescent probe a method of using TaqMan (registered trademark) microRNA Assays (Applied Biosystems) according to the attached protocol is preferably exemplified. Can do.
  • the gynecologic cancer determination kit of the present invention provided with a primer set and a fluorescent probe further includes an optional element such as a reagent used in a quantitative PCR reaction such as a polymerase in addition to the primer set described above. You may go out.
  • Non-cancerous tissue of the same type as the sample tissue for example, a non-cancerous gynecological tissue if the sample tissue is a gynecological sample tissue
  • a normal sample of the same type as the subject as a control in the step (C)
  • the non-cancerous tissue (non-cancerous part) of the same individual as the sample tissue is preferable.
  • non-cancer tissue of the same type as the sample tissue it is not necessary to collect the blood of a non-cancer tissue of the same type as the sample tissue as a control or the normal sample of the same type as the sample.
  • a calibration curve may be prepared in advance for the expression level of the present microRNA in the blood of a medium or normal subject, and comparison / evaluation with it may be performed.
  • benign tumor tissues such as polyps and normal tissues can be preferably exemplified.
  • RNA in the sample tissue or the blood of the subject based on the expression level of microRNA contained in RNA in the sample tissue or the blood of the subject, whether the sample tissue or the subject is gynecological cancer (the sample tissue is gynecological cancer). Or whether the subject is suffering from gynecological cancer).
  • miR-592, miR-629 *, miR-517a, miR-205, miR-184, miR-509-5p, miR-135a *, miR-137, miR-602 , MiR-186 *, miR-181a-2 *, miR-193b *, miR-138, miR-203, miR-488, miR-489, miR-643, miR-885-5p and miR-888 It can be determined to be gynecological cancer when its expression level is increased compared to control, miR-377 *, miR-449b, miR-449a, miR-369-3p, miR-323- 3p, miR-329, miR-299-5p, miR-34b, miR-411, miR-34c-5p, miR-376b, miR-337-3p, miR-337-5p, miR-127-3p, miR- When 424, miR-432, miR-433, miR
  • miR-137, miR-138, miR-203, miR-205, miR-488, miR-489, miR-643, miR-885-5p, miR-888 are the average in cancer tissues Since the expression level is 5 times or more of the expression level in the non-cancerous tissue and the difference in the expression level is large, it is preferable in that it is possible to more accurately determine whether or not it is gynecological cancer. In addition, it is possible to more accurately determine whether or not gynecological cancers such as endometrial cancer by measuring the expression levels of two or more of the present microRNAs and comparing and evaluating them with controls. Is preferable.
  • the microRNA whose concentration in the subject's blood also changes can use a blood sample that is extremely easy to collect, This method is extremely preferable because it is particularly excellent in rapidity and simplicity in a method for use as a biomarker for gynecological cancer and a method for determining gynecological cancer. If the subject is affected with gynecological cancer, the concentration in the blood of the subject will also change. It can be easily found by comparing the present microRNA concentration in the blood of this subject with the present microRNA concentration in the blood of a normal subject not suffering from gynecological cancer.
  • the degree of increase in the expression level of the present microRNA when determining gynecological cancer is, for example, preferably 100% or more, more preferably 150% or more, and still more preferably 200% or more as a percentage of the control.
  • the degree of decrease in the expression level of the present microRNA when determining that it is gynecological cancer is, for example, preferably 50% or more, more preferably 75% or more as a ratio to the control. Further, it can be mentioned that the reduction is more preferably 90% or more.
  • the gynecological cancer determination method of the present invention further includes (D) let-7 family, miR-17-92 cluster, miR- 15 and the expression level of one or more microRNAs selected from the microRNA group consisting of miR-16, and the expression level of the microRNA in a non-cancer tissue of the same type as the sample tissue as a control
  • the step of comparing and evaluating can be included.
  • the let-7 family can be preferably exemplified by let-7a, let-7b, let-7c, let-7d, let-7e, let-7f, let-7g, let-7i, and the miR
  • miR-17, miR-18a, miR-19a, miR-19b, miR-20a, miR-92a can be preferably exemplified
  • miR-15, miR-15a MiR-15b can be preferably exemplified.
  • Each human-derived microRNA (let-7a (SEQ ID NO: 28), let-7b (SEQ ID NO: 29), let-7c (SEQ ID NO: 30), let-7d (SEQ ID NO: 31), let-7e (SEQ ID NO: 32), let-7f (SEQ ID NO: 33), let-7g (SEQ ID NO: 34), let-7i (SEQ ID NO: 35), miR-17 (SEQ ID NO: 36), miR-18a (SEQ ID NO: 37), miR- 19a (SEQ ID NO: 38, miR-19b ((SEQ ID NO: 39), miR-20a (SEQ ID NO: 40), miR-92a (SEQ ID NO: 41), miR-15a (SEQ ID NO: 42), miR-15b (SEQ ID NO: 43) )
  • miR-16 (SEQ ID NO: 44) can be particularly preferably exemplified by RNAs each having the nucleotide sequence shown in SEQ ID NOs: 28 to 44, respectively.
  • each microRNA (let-7 family, miR-17-92 cluster, miR-15, and miR-16) in this step (D) is abnormally observed in cancers other than gynecological cancers.
  • ( B) If it is determined that the sample tissue is gynecological cancer as a result of the identification and evaluation of the process, and if abnormal expression of microRNA in the process (D) is further observed, cancer other than gynecological cancer It can be determined that a nest exists.
  • MicroRNAlet-7 family is known to decrease in lung cancer tissue
  • miR-15 and miR-16 are known to decrease in chronic lymphocytic leukemia or pancreatic cancer tissue
  • miR-17-92 cluster is a B cell. It is known that expression increases in lymphoma or lung cancer tissue.
  • the screening method for a gynecological cancer therapeutic agent of the present invention includes (a) a step of administering a test substance to a non-human animal afflicted with gynecological cancer: (b) a gynecological cancer tissue in the non-human animal
  • Non-human mammals such as mice, rats, hamsters, guinea pigs, monkeys, cows, pigs, horses, rabbits, sheep, goats, cats and dogs are preferably exemplified as the types of non-human animals.
  • mice and rats can be exemplified more preferably.
  • the non-human animal afflicted with gynecological cancer may be a non-human animal naturally afflicted with gynecological cancer, or a non-human animal that has induced gynecological cancer with a carcinogen. Also good.
  • the method for measuring the expression level of the present microRNA may be used, and as a method for comparing and evaluating in the step (c).
  • the test substance is likely to be a gynecological cancer drug, miR-377 *, miR-449b, miR-449a, miR-369- 3p, miR-323-3p, miR-329, miR-299-5p, miR-34b, miR-411, miR-34c-5p,
  • microRNAs have been reported to have properties such as binding to mRNA and suppressing the expression of the gene, the abnormal expression of microRNAs in gynecological cancer tissues is shifted in the direction of normalization.
  • the test substance is considered likely to be used as a gynecological cancer therapeutic agent.
  • step (d) a step of comparing and evaluating the expression level of microRNA in the blood of a non-cancerous tissue or gynecologic cancer sample of the same type as a gynecological cancer tissue : Can be adopted.
  • step D As a method for comparison / evaluation in the step, when the expression level of the present microRNA is not significantly different from that of the control, the test substance is likely to be a gynecological cancer therapeutic agent. Can be determined.
  • miR-137, miR-138, miR-203, miR-205, miR-488, miR-489, miR-643, miR-885-5p, miR-888 are the average in cancer tissues Since the expression level is 5 times or more of the expression level in the non-cancerous tissue and the difference in the expression level is large, it is preferable in that the possibility of being a gynecological cancer therapeutic agent can be determined more accurately. In addition, it is preferable to use two or more kinds of the above-mentioned microRNAs as a biomarker for gynecological cancer in that the possibility of being a gynecological cancer therapeutic agent can be determined more accurately.
  • sample collection 1 Under the approval of the ethics committee of Keio University School of Medicine, patients who visited the gynecology outpatient department of Keio University Hospital were selected and requested as samples. After obtaining informed consent from the subjects, four types of sample tissues (“sample ID 1-4” in FIG. 1) were collected from each of the four subjects. There are two types of tissues in these four types of sample tissues (items of “tissues” in FIG. 1): endometrial polyp and endometrial cancer. The “samples” item in FIG. 1 includes two types, polyp and cancer.
  • RNAlater registered trademark (Applied Biosystems) (Applied Biosystems) was dispensed and stored frozen to stabilize RNA in the tissue.
  • tissue state cancer, polyp, etc.
  • the concentration of the obtained RNA is adjusted to about 30 ng / ⁇ L with distilled water, and OD260 / 280 (a value obtained by dividing the measured value of OD260 by the measured value of OD280) is measured with a spectrophotometer. And calculated. The result is shown in FIG. As shown in FIG. 2, both OD260 / 280 were within the range of about 1.6 to 2.0, and it was found that the RNA was a high-quality RNA with less protein and phenol contamination. .
  • RNA Integrity Number RNA Integrity Number of the extracted total RNA was measured with Bio-Analyzer RNA 6000 (manufactured by Agilent Technologies) to examine the degree of RNA degradation. The result is shown in FIG. As shown in FIG. 3, the RIN of each sample maintained a sufficiently high level, and it was found that the RNA was of good quality.
  • Agilent Human miRNA V2 [Expression analysis 1 of microRNA in each tissue] Exhaustive analysis was performed on 723 human microRNAs using Agilent Human miRNA V2 (Agilent Technologies).
  • the aforementioned Agilent Human miRNA V2 microarrays are miR-592, miR-629 *, miR-517a, miR-205, miR-184, miR-509-5p, miR-135a *, miR-137, miR-602, miR-186 *, miR-181a-2 *, miR-193b *, miR-377 *, miR-449b, miR-449a, miR-369-3p, miR-323-3p, miR-329, miR-299- As probes for 5p, miR-34b, miR-411, miR-34c-5p, miR-376b, miR-337-3p, miR-337-5p and miR-127-3p, SEQ ID NOs: 1 to 23 and 25, respectively It has a DNA sequence complementary to
  • the total RNA obtained in Example 2 was diluted with DNase / RNase-free water so that the total RNA was about 25 ng / ⁇ L, and the RNA concentration of the diluted solution was measured.
  • 1.4 ⁇ L of CIP master mix obtained by mixing 0.7 ⁇ L of 10 ⁇ CIP Buffer (manufactured by GE Healthcare) and 0.7 ⁇ L of 16 U / ⁇ L CIP (manufactured by GE Healthcare) was prepared. .
  • RNA from the above-mentioned RNA dilution was taken into a 1.5 mL tube, 1.4 ⁇ L of the above-mentioned CIP master mix was added, and the volume was further increased to 7 ⁇ L with DNase / RNase-free water. . Thereafter, incubation was carried out at 37 ° C. for 30 minutes to perform dephosphorylation of total RNA.
  • DMSO manufactured by Sigma
  • ligation was performed. Specifically, 2 ⁇ L of 10 ⁇ T4 RNA ligase buffer (GE Healthcare), 2 ⁇ L of 0.1% BSA (GE Healthcare), 1 ⁇ L of T4 RNA ligase (GE Health adjusted to 15 U / ⁇ L) 3 ⁇ L of Cyanine ⁇ ⁇ 3-Cytidine (Agilent Technologies) was mixed in another 1.5 mL tube to prepare a ligation master mix. 8 ⁇ L of this ligation master mix was added to the aforementioned sample that had been heat-denatured and then cooled, and incubated at 16 ° C. for 2 minutes.
  • sample RNA fluorescently labeled with Cyanine 3-Cytidine was purified from the aforementioned sample.
  • RNA profile analysis of the above-mentioned sample RNA was performed using an Agilent® Human® miRNA® V2® (manufactured by Agilent Technologies) oligo DNA microarray.
  • the RNA sample was subjected to a hybridization reaction at 55 ° C. for 20 hours or more.
  • the microarray after hybridization was washed with washing buffer 1 at room temperature for 5 minutes and washing buffer 2 at 37 ° C. for 5 minutes in accordance with the protocol of Agilent Technologies.
  • the microarray was lifted from the washing buffer 2 and scanned using a DNA-Microarray Scanner (manufactured by Agilent Technologies).
  • FIGS. 4 shows microRNAs with increased expression in endometrial cancer tissues (miR-592, miR-629 *, miR-517a, miR-205, miR-184, miR-509-5p, miR-135a *, miR-137, miR-602, miR-186 *, miR-181a-2 *, and miR-193b *), and FIG.
  • microRNAs (miR-377 *) whose expression is decreased in endometrial cancer tissues , MiR-449b, miR-449a, miR-369-3p, miR-323-3p, miR-329, miR-299-5p, miR-34b, miR-411, miR-34c-5p, miR-376b, miR -337-3p, miR-337-5p and miR-127-3p). Since these microRNAs are expressed (abnormally expressed) in endometrial cancer tissues differently from non-cancerous tissues, these microRNAs are present in gynecological cancer tissues such as endometrial cancer tissues. It can be used as a marker.
  • let-7 family let-7a, let-7b, let-7c, let-7d, let-7e, let-7f, let-7g, let-7i known to be abnormally expressed in other cancers
  • MiR-17-92 cluster miR-17, miR-18a, miR-19a, miR-19b, miR-20a, miR-92a
  • miR-15 miR-15a, miR-15b
  • miR-16 miR-16
  • sample collection 2 Under the approval of the ethics committee of Keio University School of Medicine, patients who visited the gynecology outpatient department of Keio University Hospital were selected and requested as samples. In addition, after obtaining informed consent from the subject, five types of sample organizations (sample ID “42”, “06-072”, “05- 034 ”,“ 04-010 ”,“ 06-082 ”). There are two types of tissue in these five types of sample tissues (the item “samples” in FIG. 9): endometrium and endometrial cancer, and the grade of cancer (Fig. 9 “grade” items) and G1 and G3, and cancer progression stages (“advanced stage” items in FIG. 9) were Ib and IIIc.
  • RNAlater registered trademark
  • Applied Biosystems RNAlater
  • RNA Integrity Number RNA Integrity Number of the extracted total RNA was measured with Bio-Analyzer RNA 6000 (manufactured by Agilent Technologies) to examine the degree of RNA degradation. The result is shown in FIG. As shown in FIG. 10, the RIN of each sample was kept at a sufficiently high level, and it was found that the RNA was good quality.
  • Example 5 [Expression analysis 2 of microRNA in each tissue] Using each RNA extracted in Example 5 and TaqMan (registered trademark) MicroRNA Assays (Applied Biosystems), a comprehensive analysis was performed on human microRNAs by real-time PCR. The method of quantification was according to the method described in the attached protocol. The results of quantification of miR-135a *, miR-137, miR-138, miR-203, miR-205 and miR-488 for each RNA sample are shown in FIG. 11, miR-489, miR-629 *, miR-643 The results of quantification of miR-885-5p and miR-888 are shown in FIG.
  • miR-34c-5p, miR-127-3p, miR-299-5p, miR-323-3p, miR-337-5p, miR -376b, miR-411, miR-424 and miR-432 were quantified, and the results are shown in FIG. 13, miR-433, miR-450a, miR-503, miR-542-3p, miR-542-5p, The results of quantitative determination are shown in FIG. As shown in FIGS.
  • miR-127-3p, miR-299-5p, miR-323-3p, miR-337-5p, miR-376b, miR-411, miR-424, miR-432, miR-433, miR- 450a, miR-503, miR-542-3p, miR-542-5p, and miR-584 were confirmed to have decreased expression in endometrial cancer tissue compared to normal endometrial tissue did it.

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Abstract

本発明は、特定のマイクロＲＮＡを婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法、婦人科がんの判定方法、婦人科がんの判定キット等を提供するものである。miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡを婦人科がんのバイオマーカーとして使用することを特徴とする。

Description

バイオマーカーとしてのマイクロＲＮＡを用いた婦人科がんの診断・治療選択
　本発明は、婦人科がんにおけるマイクロＲＮＡ（ｍｉｃｒｏＲＮＡ；ｍｉＲＮＡ）の発現プロファイルとその用途に関する。より詳細には、特定のマイクロＲＮＡを婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法、婦人科がんの判定方法、婦人科がんの判定キット等に関する。
　婦人科がんとは、子宮頸部、子宮体部、卵巣、卵管、腟、外陰部に発生するがんであり、女性の悪性腫瘍の４分の１を超える割合を占める。主なものとして、子宮頸がん、子宮体がん、卵巣がんが挙げられる（特許文献１及び非特許文献１参照）。
　近年、がんに関する基礎および臨床的研究が飛躍的に進み、がんは遺伝子の異常に起因する疾患であることが明らかとなった。その結果、がんの病態に関連する様々な遺伝子や蛋白を分子標的にした治療が試みられている。また、子宮がんの早期発見を目的としたがん検診が普及し、早期治療により子宮頸がんの死亡率は低下している。しかし、一方では、初婚年齢の上昇や妊娠回数の減少による女性ホルモン刺激の増大、食事の欧米化といった生活様式の変化、あるいは、性活動の若年化によるパピローマウイルス感染の増大に伴い、子宮体がん、卵巣がんや若年者子宮頸がんについては、その罹患率及び死亡率が上昇している（非特許文献２参照）。特に子宮体がんはその罹患率や死亡率のみならず、疾患の若年齢化も進行している（非特許文献３参照）。
　婦人科がんの診断は、一般的に各種画像検査（超音波検査、ＣＴ、ＭＲＩ、ＰＥＴ等）を施行し、更に内診や子宮鏡などで進展を評価する。術前に細胞診及び組織診ができない卵巣がんを除く子宮頸がん及び子宮体がんでは、術前の生検で病理組織学的診断を付ける。病期は、病変の進展と病理組織学的診断により決定される。卵巣がんの病期は、開腹手術で摘出された卵巣の病理組織学的診断が得られるまで、決定できない。また、画像検査による病変の進展と病理学的診断が乖離していることがあり（非特許文献４参照）、卵巣腫瘍に際しては、常に悪性の可能性を念頭に置く必要がある。このように、婦人科がんの場合、画像診断では、がんの質的診断が不可能であり、良性疾患との鑑別が困難な場面も多々ある。また、確定診断として用いられる細胞診・組織診による病理学的診断については、基本的なヘマトキシリンエオジン（ＨＥ）染色に各種免疫染色を組み合わせて用いたとしても、進行度・進達度の判断に困難な場合がある上、予後の予測まではできないのが現状である。発症・予後の予測に関しては、いくつかの因子が報告されてはいるものの（特許文献４、５、６参照）、現在のところ感度と特異性の双方を十分に持つバイオマーカーは存在しない。
　一方、婦人科がんの治療方針は、主に病期と病理組織学的所見により決定される。良性腫瘍に対しては、根治可能な一期的摘出術か、小病変で臨床症状がなければ経過観察が行われる。一方、悪性腫瘍に対しては手術、抗がん剤による化学療法、放射線治療を単独もしくは併用して施行する。子宮頸がんと子宮体がんでは、手術で子宮を摘出せざるを得ないこともあるが、これは若年の未産婦においては妊孕力を喪失するため重大な問題となる（非特許文献５参照）。卵巣がんは自覚症状が乏しく、進行が早いため、発見される時にはすでに進行していることが多い。また、有効なスクリーニング法が確立しておらず（非特許文献６参照）、細胞の採取ができないためにがん検診もできないので、早期発見は極めて困難である。さらに、たとえ早期に発見された場合でも、隣接臓器である子宮を合併切除することが原則である。卵巣がんはあらゆる年齢で発症し、特に若年者の治療においては妊孕力を喪失するため、子宮頸がん・子宮体がんと同様に重大な問題となる（非特許文献７参照）。いずれのがんにおいても、進行がんでは術後に化学療法が施行される場合が多いが、骨髄抑制による免疫力の低下、消化器症状に　よる脱水、電解質異常など副作用が強いことが問題となっている。さらに、治療効果と予後に個人差が認められ、これらはがん組織における遺伝子変異とその発現量の異常に起因していると考えられている（非特許文献８参照）。
　前述のとおり、生活様式の変化により、婦人科がんの増加が予測されるため、それらの発症予測や発症診断についてのバイオマーカーの開発が期待されている。子宮頸がんの治療後の経過観察で用いられているバイオマーカーとして、Ｃａ１９－９やＣａ１２５などが知られているものの、その陽性率はおよそ３０％と低く、これまで、婦人科がんに関する有用なバイオマーカーの報告はなされていない（特許文献２及び３参照）。
　ところで、マイクロＲＮＡは、細胞内に存在し、タンパクへの翻訳がなされない、長さ２２塩基程度の１本鎖ＲＮＡである（非特許文献９参照）。１９９３年に線虫C.elegansにおいて、その後、２００１年には脊椎動物でも発見され、種を越えて保存されている。現在、ヒトゲノム上には１０００種類近くのマイクロＲＮＡの存在が予測され、これまでに７００種類以上のマイクロＲＮＡがクローニングされている。また、マイクロＲＮＡは、ゲノム上のタンパク翻訳領域の３０％に対し遺伝子制御を行っていると推測されており（非特許文献１０参照）、それ故、マイクロＲＮＡの機能破綻は各種の疾患を引き起こす可能性がある。しかしながら、現在までに、その生物学的役割が明らかになったものはごく僅かに過ぎず、今後の解析が待たれている。婦人科がんに関するマイクロＲＮＡの報告として、がん細胞株を用いたものは散見されるが（非特許文献１１、１２参照）、患者臨床検体を用いての報告は現在までわずかに存在するのみである（非特許文献１３参照）。非特許文献１３には、様々なステージとグレードの子宮体がん組織と、子宮内膜正常組織との間の、ｍＲＮＡとマイクロＲＮＡの発現を比較し、発現量が有意に異なる９０種のｍＲＮＡと１３種のマイクロＲＮＡを同定したと記載されている。１３種のマイクロＲＮＡのうち、miR-185、miR-106a、miR-181a、miR-210、miR-423、miR-103、miR-107、miR-let7cの８種のマイクロＲＮＡは、子宮体がんにおいて発現が増加し、miR-let7i、miR-221、miR-30c、miR-152、miR-193の５種のマイクロＲＮＡは、子宮体がんにおいて発現が低下したと記載されている。しかし、上記の１３種のマイクロＲＮＡを子宮体がんの診断に用い得ることは非特許文献１３には記載されておらず、また、非特許文献１３において同定された上記の１３種のマイクロＲＮＡは、本件マイクロＲＮＡとは異なる。
特表２００２－５２７７２３号公報 特表２００３－５１２０１０号公報 特開２００２－２２７４６号公報 特開２００５－５３２３１４号公報 米国特許第６８５５３５０号公報 米国特許第７０４５２９２号公報
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　本発明の課題は、特定のマイクロＲＮＡを婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法、婦人科がんの判定方法、婦人科がんの判定キット等を提供することにある。
　前述したように、非特許文献１３には、子宮体がんとの関連が示唆される１３種のマイクロＲＮＡが開示されている。しかし、非特許文献１３において同定された上記の１３種のマイクロＲＮＡは、本件マイクロＲＮＡとは異なる上、上記の１３種のマイクロＲＮＡを子宮体がんの診断に用い得ることは非特許文献１３には記載されていない。また、非特許文献で解析の対象となったマイクロＲＮＡは３３５種と十分ではなかった。このような状況下で、本発明者らは、子宮体がん組織と子宮体ポリープ（子宮体良性腫瘍）組織との間で、７２３種のマイクロＲＮＡを対比し、特定のマイクロＲＮＡが子宮体がん組織において異常発現していることを見出し、本発明を完成するに至った。
　すなわち本発明は、（１）miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡを婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法や、（２）miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584が、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡであることを特徴とする上記（１）に記載の方法に関する。
　また本発明は、（３）以下の工程を備えたことを特徴とする婦人科がんの判定方法：（Ａ）婦人科検体組織中又は被検体の血液中のＲＮＡを抽出する工程：（Ｂ）抽出したＲＮＡ中の、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584から選択される１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量を測定する工程：（Ｃ）コントロールとしての、検体組織と同種の非がん組織又は被検体と同種の正常被検体の血液におけるマイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する工程：や、（４）miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584が、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡであることを特徴とする上記（３）に記載の婦人科がんの判定方法や、（５）抽出したＲＮＡ中の、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、 miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-885-5p及びmiR-888からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量が、コントロールと比較して増加している場合に婦人科がんであると評価することを特徴とする上記（３）又は（４）に記載の婦人科がんの判定方法や、（６）抽出したＲＮＡ中の、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量が、コントロールと比較して低下している場合に婦人科がんであると評価することを特徴とする上記（３）又は（４）に記載の婦人科がんの判定方法に関する。
　さらに本発明は、（７）miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量を測定することができる、前記マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を備えたマイクロアレイを含んでいることを特徴とする婦人科がんの判定キットや、（８）miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの配列を増幅し得るプライマーセットと、前記マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を含む蛍光プローブを備えたことを特徴とする婦人科がんの判定キットや、（９）miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584が、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡであることを特徴とする上記（７）又は（８）に記載の判定キットに関する。
　さらにまた本発明は、（１０）以下の工程を含むことを特徴とする婦人科がん治療薬のスクリーニング方法：（Ａ）婦人科がんに罹患した非ヒト動物に被検物質を投与する工程：（Ｂ）前記非ヒト動物における婦人科がん組織中又は血液中の、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量を測定する工程：（Ｃ）コントロールとしての、被検物質を未投与の場合におけるマイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する工程：や、（１１）miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584が、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡであることを特徴とする上記（１０）に記載のスクリーニング方法に関する。
　本発明の婦人科がんの判定方法や、婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法によると、迅速かつ正確に婦人科がんを判定することができる。また、本発明の婦人科がんの判定キットや、婦人科がんの判定に使用する方法によると、婦人科がんであるかどうかを迅速かつ正確に判定することができる。さらに、本発明の婦人科がん治療薬のスクリーニング方法によると、婦人科がん治療薬を効率的にスクリーニングすることができる。特に、被検体が婦人科がんに罹患している場合に、被検体の血液中の濃度も変化するマイクロＲＮＡの場合は、採取が極めて容易な血液サンプルを利用することができるため、婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法や、婦人科がんの判定方法等における迅速性や簡便性が特に優れている。なお、本件マイクロＲＮＡ等についてさらに研究が進めば、婦人科がんの発症・進展・予後予測や治療が可能となることで、現在の婦人科がん臨床のさまざまな問題点を解決する突破口となることが期待できる。また、マイクロＲＮＡの発現は腫瘍組織特異的であることが知られており、婦人科原発不明がんの原発部位の特定にも有用となる可能性がある。さらに治療に際しては、薬剤や放射線治療への抵抗性が診断できれば、患者個人ごとに有効な治療法を選択する個別化治療にまで発展させ得る可能性を含んでいる。正確な診断や予後の予測は、余計な検査や患者の必要以上の通院を減らすことが期待でき、医療経済効果も大きいと予想される。
マイクロＲＮＡの発現プロファイル解析のサンプルの概要をまとめた図である。 サンプル由来のトータルＲＮＡについて行なった、ＵＶを用いた品質検査の結果を示す図である。 サンプル由来のトータルＲＮＡについて行なった、Bio-Analyzer RNA6000を用いた品質検査の結果を示す図である。 子宮体がん組織で発現が増加するマイクロＲＮＡ（miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*及びmiR-193b*）の、各サンプルにおけるそれらのマイクロＲＮＡの相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左からpolyp；cancer(1)；cancer(2)；cancer(3)の各サンプルにおける相対発現量を示す。 子宮体がん組織で発現が低下するマイクロＲＮＡ（miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-337-3p、miR-337-5p及びmiR-127-3p）の、各サンプルにおけるそれらのマイクロＲＮＡの相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左からpolyp；cancer(1)；cancer(2)；cancer(3)の各サンプルにおける相対発現量を示す。 子宮体の非がん組織あるいはがん組織における、let-7 familyの相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左からpolyp；cancer(1)；cancer(2)；cancer(3)の各サンプルにおける相対発現量を示す。 子宮体の非がん組織あるいはがん組織における、miR-17-92 clusterの相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左からpolyp；cancer(1)；cancer(2)；cancer(3)の各サンプルにおける相対発現量を示す。 子宮体の非がん組織あるいはがん組織における、miR-15及びmiR-16の相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左からpolyp；cancer(1)；cancer(2)；cancer(3)の各サンプルにおける相対発現量を示す。 マイクロＲＮＡの発現プロファイル解析のサンプルの概要をまとめた図である。 サンプル由来のトータルＲＮＡについて行なった、ＵＶおよびBio-Analyzer RNA6000を用いた品質検査の結果を示す図である。 子宮体がん組織で発現が増加するマイクロＲＮＡ（miR-135a*、miR-137、miR-138、miR-203、miR-205及びmiR-488）の、各サンプルにおけるそれらのマイクロＲＮＡの相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左から“42（normal）”（子宮内膜正常組織）、“06-072（Ｇ１Iｂ）”、“05-034（Ｇ１Iｂ）”、“04-010（Ｇ３IIIｃ）”、“06-082（Ｇ３IIIｃ）”の各サンプルにおける相対発現量を示す。 子宮体がん組織で発現が増加するマイクロＲＮＡ（miR-489、miR-629*、miR-643、miR-885-5p及びmiR-888）の、各サンプルにおけるそれらのマイクロＲＮＡの相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左から“42（normal）”（子宮内膜正常組織）、“06-072（Ｇ１Iｂ）”、“05-034（Ｇ１Iｂ）”、“04-010（Ｇ３IIIｃ）”、“06-082（Ｇ３IIIｃ）”の各サンプルにおける相対発現量を示す。 子宮体がん組織で発現が低下するマイクロＲＮＡ（miR-34c-5p、miR-127-3p、miR-299-5p、miR-323-3p、miR-337-5p、miR-376b、miR-411、miR-424及びmiR-432）の、各サンプルにおけるそれらのマイクロＲＮＡの相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左から“42（normal）”（子宮内膜正常組織）、“06-072（Ｇ１Iｂ）”、“05-034（Ｇ１Iｂ）”、“04-010（Ｇ３IIIｃ）”、“06-082（Ｇ３IIIｃ）”の各サンプルにおける相対発現量を示す。 子宮体がん組織で発現が低下するマイクロＲＮＡ（miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584）の、各サンプルにおけるそれらのマイクロＲＮＡの相対的発現量を示す図である。なお、各パネルの棒グラフは、それぞれ左から“42（normal）”（子宮内膜正常組織）、“06-072（Ｇ１Iｂ）”、“05-034（Ｇ１Iｂ）”、“04-010（Ｇ３IIIｃ）”、“06-082（Ｇ３IIIｃ）”の各サンプルにおける相対発現量を示す。
　本発明の婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法としては、miR-592（マイクロＲＮＡ-592）、miR-629*（マイクロＲＮＡ-629*）、miR-517a（マイクロＲＮＡ-517a）、miR-205（マイクロＲＮＡ-205）、miR-184（マイクロＲＮＡ-184）、miR-509-5p（マイクロＲＮＡ-509-5p）、miR-135a*（マイクロＲＮＡ-135a*）、miR-137（マイクロＲＮＡ-137）、miR-602（マイクロＲＮＡ-602）、miR-186*（マイクロＲＮＡ-186*）、miR-181a-2*（マイクロＲＮＡ-181a-2*）、miR-193b*（マイクロＲＮＡ-193b*）、miR-377*（マイクロＲＮＡ-377*）、miR-449b（マイクロＲＮＡ-449b）、miR-449a（マイクロＲＮＡ-449a）、miR-369-3p（マイクロＲＮＡ-369-3p）、miR-323-3p（マイクロＲＮＡ-323-3p）、miR-329（マイクロＲＮＡ-329）、miR-299-5p（マイクロＲＮＡ-299-5p）、miR-34b（マイクロＲＮＡ-34b）、miR-411（マイクロＲＮＡ-411）、miR-34c-5p（マイクロＲＮＡ-34c-5p）、miR-376b（マイクロＲＮＡ-376b）、miR-885-5p（マイクロＲＮＡ-885-5p）、miR-337-3p（マイクロＲＮＡ-337-3p）、miR-337-5p（マイクロＲＮＡ-337-5p）、miR-127-3p（マイクロＲＮＡ-127-3p）、miR-138（マイクロＲＮＡ-138）、miR-203（マイクロＲＮＡ-203）、miR-488（マイクロＲＮＡ-488）、miR-489（マイクロＲＮＡ-489）、miR-643（マイクロＲＮＡ-643）、miR-888（マイクロＲＮＡ-888）、miR-424（マイクロＲＮＡ-424）、miR-432（マイクロＲＮＡ-432）、miR-433（マイクロＲＮＡ-433）、miR-450a（マイクロＲＮＡ-450a）、miR-503（マイクロＲＮＡ-503）、miR-542-3p（マイクロＲＮＡ-542-3p）、miR-542-5p（マイクロＲＮＡ-542-5p）、及び、miR-584（マイクロＲＮＡ-584）からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡ（以下、「本件マイクロＲＮＡ」ともいう。）を、子宮体がん等の婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法である限り特に制限はされず、具体的には、本発明の婦人科がんの判定方法や、本発明の婦人科がんの判定に使用する方法や、本発明の婦人科がん治療薬のスクリーニング方法を例示することができる。
　上記の婦人科がんとは、子宮頸部、子宮体部、卵巣、膣、外陰部に発生するがんを意味する。これらの婦人科がんの中でも、子宮頸部や子宮体部のがんを好適に例示することができ、中でも子宮体部のがんをより好適に例示することができる。上記がんの種類としては、初発でも再発でも特に制限されないが、初発のがんをさらに好適に例示することができる。
　本件マイクロＲＮＡの由来となる生物としては、ヒト、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、サル、ウシ、ブタ、ウマ、ウサギ、ヒツジ、ヤギ、ネコ、イヌ等の哺乳動物を好適に例示することができ、中でもヒト、マウスをより好適に例示することができ、特にヒトを好適に例示することができる。ヒト由来の本件マイクロＲＮＡであるmiR-592（配列番号１）、miR-629*（配列番号２）、miR-517a（配列番号３）、miR-205（配列番号４）、miR-184（配列番号５）、miR-509-5p（配列番号６）、miR-135a*（配列番号７）、miR-137（配列番号８）、miR-602（配列番号９）、miR-186*（配列番号１０）、miR-181a-2*（配列番号１１）、miR-193b*（配列番号１２）、miR-377*（配列番号１３）、miR-449b（配列番号１４）、miR-449a（配列番号１５）、miR-369-3p（配列番号１６）、miR-323-3p（配列番号１７）、miR-329（配列番号１８）、miR-299-5p（配列番号１９）、miR-34b（配列番号２０）、miR-411（配列番号２１）、miR-34c-5p（配列番号２２）、miR-376b（配列番号２３）、miR-885-5p（配列番号２４）、miR-337-3p（配列番号２５）、miR-337-5p（配列番号２６）、miR-127-3p（配列番号２７）、miR-138（配列番号５０）、miR-203（配列番号５１）、miR-488（配列番号５２）、miR-489（配列番号５３）、miR-643（配列番号５４）、miR-888（配列番号５５）、miR-424（配列番号５６）、miR-432（配列番号５７）、miR-433（配列番号５８）、miR-450a（配列番号５９）、miR-503（配列番号６０）、miR-542-3p（配列番号６１）、miR-542-5p（配列番号６２）及びmiR-584（配列番号６３）の各ヌクレオチド配列は、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示される。マイクロＲＮＡの配列は特に哺乳動物間では保存性が高く、上記の本件マイクロＲＮＡはヒト以外の哺乳動物においてもヒトと同様の発現プロファイルを示すと考えられる。なお、例えばマウス由来の本件マイクロＲＮＡであるmiR-592（配列番号４５）、miR-449b（配列番号４６）、miR-369-3p（配列番号４７）、miR-329（配列番号４８）及びmiR-411（配列番号４９）の各ヌクレオチド配列は、それぞれ配列番号４５～４９に示される。
　また、本件マイクロＲＮＡには、配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡが便宜上含まれる。上記の「１又は２個以上」としては、１～５個が好ましく、１～３個がより好ましく、１～２個が特に好ましく、１個がさらに好ましい。なお、上記の欠失等されたヌクレオチド配列からなるＲＮＡが、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するかどうかは、例えば後述のマイクロアレイ法や定量ＰＣＲ法により容易に確認することができる。なお、ヒト以外の上記の各生物からの本件マイクロＲＮＡの配列は、ＧｅｎＢａｎｋ等のデータベースに登録されている情報に基づいて確認又は特定することができる。
　本発明の婦人科がんの判定方法としては、（Ａ）婦人科検体組織中又は被検体の血液中のＲＮＡを抽出する工程：（Ｂ）抽出したＲＮＡ中の、本件マイクロＲＮＡ量を測定する工程：（Ｃ）コントロールとしての、検体組織と同種の非がん組織又は被検体と同種の正常被検体の血液におけるマイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する工程：を備えている限り特に制限されないが、抽出したＲＮＡ中の、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-885-5p及びmiR-888からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量が、コントロールと比較して増加している場合に子宮体がん等の婦人科がんであると評価し、及び／又は、抽出したＲＮＡ中の、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量が、コントロールと比較して低下している場合に子宮体がん等の婦人科がんであると評価する方法を好適に例示することができる。なお、上記工程（Ａ）において婦人科検体組織を用いた場合は、上記工程（Ｃ）におけるコントロールとして、検体組織と同種の正常組織を用い、上記工程（Ａ）において被検体の血液を用いた場合は、上記工程（Ｃ）におけるコントロールとして、被検体と同種の正常被検体の血液を用いる。また、本明細書におけるマイクロＲＮＡの発現量としては、サンプル間のばらつきを補正するために適切な内部標準遺伝子で補正した相対発現量を用いることがより正確な判定を行なう観点から好ましい。内部標準遺伝子としては特に制限されないが、ＲＮＵ４８、ＲＮＵ６ｂ、ｓｎＲＮＡ（核内低分子ＲＮＡ）、及び、ｓｎｏＲＮＡ（核小体低分子ＲＮＡ）からなる群から選ばれる１種又は２種以上の遺伝子を例示することができる。
　上記（Ａ）工程におけるＲＮＡを抽出する方法としては、婦人科検体組織中又は被検体の血液中から、マイクロＲＮＡを含むＲＮＡを抽出する方法である限り特に制限されず、例えば、mirVana miRNA Isolation Kit（Applied Biosystems社製）を添付のプロトコールにしたがって用いることによって、マイクロＲＮＡを含むトータルＲＮＡを抽出する方法を好適に例示することができる。上記の婦人科検体組織としては、婦人科がんの判定の対象となる生物由来の、子宮頸部、子宮体部、卵巣、膣、外陰部から選択される組織である限り特に制限されず、上記生物としては、ヒト、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、サル、ウシ、ブタ、ウマ、ウサギ、ヒツジ、ヤギ、ネコ、イヌ等の哺乳動物を好適に例示することができ、中でもヒト、マウスをより好適に例示することができ、特にヒトを好適に例示することができる。
　上記（Ｂ）工程における本件マイクロＲＮＡの発現量を測定する方法としては、マイクロＲＮＡを含むＲＮＡ中の本件マイクロＲＮＡ量を同定し得る方法である限り特に制限されず、例えば本発明の子宮体がん等の婦人科がんの判定キット、すなわち、本件マイクロＲＮＡの発現量を測定することができる、本件マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を備えたマイクロアレイを含んでいる婦人科がんの判定キットや、本件マイクロＲＮＡの配列を増幅し得るプライマーセットを備えた婦人科がんの判定キットや、本件マイクロＲＮＡの配列を増幅し得るプライマーセットと、本件マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を含む蛍光プローブとを備えた婦人科がんの判定キットを用いる方法や；本発明の子宮体がん等の婦人科がんの判定に使用する方法、すなわち、本件マイクロＲＮＡの発現量を測定することができる、本件マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を備えたマイクロアレイを婦人科がんの判定に使用するマイクロアレイ法や、本件マイクロＲＮＡの配列を増幅し得るプライマーセットを婦人科がんの判定に使用する定量ＰＣＲ法や、本件マイクロＲＮＡの配列を増幅し得るプライマーセットと、本件マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を含む蛍光プローブとを、婦人科がんの判定に使用する定量ＰＣＲ法（蛍光プローブ法）；を好適に例示することができる。
　上記のマイクロアレイ法としては、本件マイクロＲＮＡの発現量を測定することが可能である限り特に制限されないが、組織から抽出したＲＮＡをラベル（好ましくは蛍光ラベル）で標識し、そのＲＮＡを、同定対象とするマイクロＲＮＡに相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド（好ましくはＤＮＡ）又はその一部からなるプローブが固定されたマイクロアレイに接触させてハイブリダイゼーションを行った後、マイクロアレイを洗浄して、マイクロアレイ上に残ったマイクロＲＮＡの発現量を測定する方法を例示することができる。
　上記の核酸配列のヌクレオチドの種類としては、本発明における所定のマイクロＲＮＡに特異的にハイブリダイズし得る限り特に制限されないが、安定性が高いことからＤＮＡであることが好ましい。また、上記のポリヌクレオチドの一部の長さとしては、本発明における所定のマイクロＲＮＡに特異的にハイブリダイズし得る限り特に制限されないが、ハイブリダイゼーションの安定性を確保する観点から、１０～１００ｍｅｒであることが好ましく、１０～４０ｍｅｒであることがより好ましい。なお、上記のポリヌクレオチド又はその一部は、当該技術分野において周知の方法を用いて化学合成等することにより得ることができる。
　上記のポリヌクレオチド又はその一部を固定するアレイとしては特に制限されないが、ガラス基板やシリコン基板等を好適に例示することができ、ガラス基板をより好適に例示することができる。上記のポリヌクレオチド又はその一部をアレイに固定する方法としては特に制限されず、公知の方法を用いることができる。
　また、本発明のマイクロアレイを含んでいる婦人科がんの判定キットには、前述のマイクロアレイの他に、例えばＲＮＡのラベル化反応に用いる試薬、ハイブリダイゼーション反応に用いる試薬、洗浄に用いる試薬、組織からのＲＮＡ抽出に用いる試薬等の、マイクロアレイ法に用いる試薬などの任意の要素をさらに含んでいてもよい。
　そして、マイクロアレイ法としては、Agilent Human miRNA V2 (Agilent Technologies社製)をAgilent Technologies社のmiRNA Microarray protocol Version 1.5に記載の方法に従って用い、DNA Microarray Scanner (Agilent Technologies社製)でマイクロＲＮＡの発現量を測定する方法をより具体的に例示することができる。上記のポリヌクレオチド又はその一部からなるプローブが固定されたマイクロアレイは、測定対象とする本件マイクロＲＮＡの配列情報に基づいてポリヌクレオチドを合成し、それを市販のアレイに固定するなどして作製することができる。
　上記の定量ＰＣＲ法としては、本件マイクロＲＮＡの配列を増幅し得るプライマーセットを用いる方法であり、かつ、本件マイクロＲＮＡの発現量を測定することが可能である限り特に制限されず、アガロース電気泳動法、ＳＹＢＲグリーン法、蛍光プローブ法等の通常の定量ＰＣＲ法を用いることができるが、定量の精度や信頼性の点で、蛍光プローブ法が最も好ましい。
　定量ＰＣＲ法におけるプライマーセットとは、本件マイクロＲＮＡの配列を増幅し得るプライマー（ポリヌクレオチド）の組合せを意味する。上記プライマーとしては、本件マイクロＲＮＡの配列を増幅し得る限り特に制限されないが、本発明における所定のマイクロＲＮＡの配列の５’側の一部の配列からなるプライマー（フォワードプライマー）と、そのマイクロＲＮＡの配列の３’側の一部の配列に相補的な配列からなるプライマー（リバースプライマー）とからなるプライマーセットを例示することができる。ここで、５’側とは、成熟型マイクロＲＮＡの配列において比較した場合に、リバースプライマーに対応する配列よりも、５’側であることを意味し、３’側とは、成熟型マイクロＲＮＡの配列において比較した場合に、フォワードプライマーに対応する配列よりも、３’側であることを意味する。
　マイクロＲＮＡの５’側の配列として、好ましくは、そのマイクロＲＮＡの配列の中央の核酸よりも５’側の配列を例示することができ、マイクロＲＮＡの３’側の配列として、好ましくは、そのマイクロＲＮＡの配列の中央の核酸よりも３’側の配列を例示することができる。また、それぞれのプライマーの長さとしては、マイクロＲＮＡを増幅し得る限り特に制限されないが、７～１０ｍｅｒのポリヌクレオチドであることが好ましい。なお、上記プライマーであるポリヌクレオチドのヌクレオチドの種類としては、安定性が高いことからＤＮＡであることが好ましい
　上記の蛍光プローブとしては、本件マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を含んでいる限り特に制限されず、TaqMan（登録商標）プローブ法（ＦＲＥＴ原理を利用したものも含む）や、サイクリングプローブ法に用いうる蛍光プローブを好適に例示することができ、特にTaqMan（登録商標）プローブ法（ＦＲＥＴ原理を利用したものも含む）に用いうる蛍光プローブをより好適に例示することができる。TaqMan（登録商標）プローブ法（ＦＲＥＴ原理を利用したものを除く）や、サイクリングプローブ法に用いうる蛍光プローブとしては、５’側に蛍光色素を標識し、３’側に消光物質を標識した蛍光プローブを例示することができ、ＦＲＥＴ原理を利用した蛍光プローブとしては、５’側と３’側に、それぞれドナー色素とアクセプター色素を標識した蛍光プローブを例示することができる。上記の蛍光色素、消光物質、ドナー色素、アクセプター色素等は、市販のものを適宜使用することができる。
　上記の蛍光プローブにおける核酸配列のヌクレオチドの種類としては、本件マイクロＲＮＡに特異的にハイブリダイズし得る限り、特に制限されないが、安定性が高いことからＤＮＡであることが好ましい。また、上記のポリヌクレオチドの一部の長さとしては、本発明における所定のマイクロＲＮＡに特異的にハイブリダイズし得る限り、特に制限されないが、ハイブリダイゼーションの安定性を確保する観点から、１０ｍｅｒ以上であることが好ましく、１５ｍｅｒ以上であることがより好ましく、対象とするマイクロＲＮＡの全長のヌクレオチド数から１～３ｍｅｒ少ないヌクレオチド数であることがさらに好ましい。
　上記プライマーセットや、上記の蛍光プローブは、その配列情報に基づき当該技術分野において周知の方法を用いて化学合成等することにより得ることができる。上記のプライマーセットや蛍光プローブを用いた定量ＰＣＲの具体的な方法としては、TaqMan（登録商標）マイクロＲＮＡ Assays（Applied Biosystems社製）を、添付のプロトコールにしたがって使用する方法を好適に例示することができる。また、プライマーセットと蛍光プローブとを備えた本発明の婦人科がんの判定キットには、前述のプライマーセットの他に、例えばポリメラーゼ等の定量ＰＣＲ反応に用いる試薬などの任意の要素をさらに含んでいてもよい。
　上記（Ｃ）工程のコントロールとしての、検体組織と同種の非がん組織（例えば検体組織が婦人科検体組織である場合は、非がんである婦人科組織）又は被検体と同種の正常被検体の血液（例えば被検体がヒトである場合は、婦人科がん患者ではないヒトの血液）におけるマイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する方法におけるコントロールとしては、より正確な評価が可能となることから、検体組織と同一個体の非がん組織（非がん部位）であることが好ましい。なお、コントロールとしての検体組織と同種の非がん組織又は被検体と同種の正常被検体の血液は、検体組織又は被検体の血液を採取する際にかならずしも採取する必要はなく、非がん組織中又は正常被検体の血液中の本件マイクロＲＮＡの発現量についてあらかじめ検量線を作成し、それとの比較・評価を行なってもよい。上記の非がん組織としては、ポリープ等の良性腫瘍組織や、正常組織を好適に例示することができる。
　このように検体組織中又は被検体の血液中のＲＮＡに含まれるマイクロＲＮＡの発現量に基づいて、その検体組織又はその被検体が婦人科がんであるかどうか（その検体組織が婦人科がんであるか、又は、その被検体が婦人科がんに罹患しているかどうか）を判定することができる。前記のように、本件マイクロＲＮＡのうち、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-885-5p及びmiR-888については、コントロールと比較してその発現量が増加している場合に婦人科がんであると判定することができ、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584については、コントロールと比較してその発現量が低下している場合に婦人科がんであると判定することができる。
　本件マイクロＲＮＡの中でも、miR-137、miR-138、miR-203、miR-205、miR-488、miR-489、miR-643、miR-885-5p、miR-888は、がん組織における平均発現量が非がん組織における発現量の５倍以上と、発現量の差が大きいため、婦人科がんであるかどうかをより正確に判定することが可能である点で好ましい。また、２種類以上の本件マイクロＲＮＡの発現量を測定してコントロールと比較・評価することにより、子宮体がん等の婦人科がんであるかどうかをより正確に判定することが可能となる点で好ましい。なお、本発明者らの別発明に関するＰＣＴ出願であるＰＣＴ／ＪＰ２００９／００２６２９（バイオマーカーとしてのマイクロＲＮＡを用いた頭頸部腫瘍の診断・治療選択）では、被検体が頭頸部腫瘍に罹患している場合に、被検体の血液中の濃度も変化するマイクロＲＮＡ（例えばmiR-196aなど）が実際に見い出された。婦人科がん組織において発現が増加又は低下する本件マイクロＲＮＡの中にも、被検体が婦人科がんに罹患している場合に被検体の血液中の濃度も変化するマイクロＲＮＡが存在する可能性はきわめて高いと考えられる。本件マイクロＲＮＡの中でも、被検体が婦人科がんに罹患している場合に、被検体の血液中の濃度も変化するマイクロＲＮＡは、採取が極めて容易な血液サンプルを利用することができるため、婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法や、婦人科がんの判定方法等における迅速性や簡便性が特に優れている点で、極めて好ましい。本件マイクロＲＮＡの中で、被検体が婦人科がんに罹患している場合に被検体の血液中の濃度も変化するものがいずれであるかは、婦人科がんに罹患している被検体の血液中の本件マイクロＲＮＡ濃度と、婦人科がんに罹患していない正常被検体の血液中の本件マイクロＲＮＡ濃度を比較することによって、容易に見い出すことができる。
　婦人科がんであると判定する場合の本件マイクロＲＮＡの発現量の増加の程度としては、例えば、コントロールに対する割合として好ましくは１００％以上、より好ましくは１５０％以上、さらに好ましくは２００％以上の増加であることを挙げることができ、婦人科がんであると判定する場合の本件マイクロＲＮＡの発現量の低下の程度としては、例えば、コントロールに対する割合として好ましくは５０％以上、より好ましくは７５％以上、さらに好ましくは９０％以上の低下であることを挙げることができる。
　また、本発明の婦人科がんの判定方法は、上記（Ａ）～（Ｃ）工程に加えて、さらに（Ｄ）抽出したＲＮＡ中のlet-7 family、miR-17-92 cluster、miR-15、及びmiR-16からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量を測定し、コントロールとしての、検体組織と同種の非がん組織における前記マイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する工程：を含むことができる。上記let-7 familyとしては、let-7a、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f、let-7g、let-7iを好適に例示することができ、上記miR-17-92 clusterとしては、miR-17、miR-18a、miR-19a、miR-19b、miR-20a、miR-92aを好適に例示することができ、上記miR-15としては、miR-15a、miR-15bを好適に例示することができる。ヒト由来の上記各マイクロＲＮＡ（let-7a（配列番号２８）、let-7b（配列番号２９）、let-7c（配列番号３０）、let-7d（配列番号３１）、let-7e（配列番号３２）、let-7f（配列番号３３）、let-7g（配列番号３４）、let-7i（配列番号３５）、miR-17（配列番号３６）、miR-18a（配列番号３７）、miR-19a（配列番号３８、miR-19b（（配列番号３９）、miR-20a（配列番号４０）、miR-92a（配列番号４１）、miR-15a（配列番号４２）、miR-15b（配列番号４３）、miR-16（配列番号４４）としては、それぞれ配列番号２８～４４に示されるヌクレオチド配列からなるＲＮＡを特に好適に例示することができる。
　この（Ｄ）工程における各マイクロＲＮＡ（let-7 family、miR-17-92 cluster、miR-15、及びmiR-16）は、婦人科がん以外のがんにおいて異常発現が認められるため、（Ｂ）工程の同定・評価の結果、検体組織が婦人科がんであると判定された場合に、さらに（Ｄ）工程におけるマイクロＲＮＡの異常発現が認められるときは、婦人科がん以外のがん巣が存在すると判定することができる。なお、マイクロＲＮＡlet-7 familyは肺がん組織で、miR-15及びmiR-16は慢性リンパ性白血病あるいは膵臓がん組織で発現が減少することが知られており、miR-17-92 clusterはＢ細胞リンパ腫あるいは肺がん組織で発現が増加することが知られている。
　本発明の婦人科がん治療薬のスクリーニング方法としては、（ａ）婦人科がんに罹患した非ヒト動物に被検物質を投与する工程：（ｂ）前記非ヒト動物における婦人科がん組織中又は血液中の、本件マイクロＲＮＡの発現量を測定する工程：（ｃ）コントロールとしての、被検物質を未投与の場合におけるマイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する工程：を含んでいる限り特に制限されず、上記非ヒト動物の種類としては、マウス、ラット、ハムスター、モルモット、サル、ウシ、ブタ、ウマ、ウサギ、ヒツジ、ヤギ、ネコ、イヌ等の非ヒト哺乳動物を好適に例示することができ、中でもマウス、ラットをより好適に例示することができる。また、婦人科がんに罹患した非ヒト動物としては、婦人科がんを自然に罹患した非ヒト動物であってもよいし、発がん物質で婦人科がんを誘導した非ヒト動物であってもよい。
　上記（ｂ）工程における本件マイクロＲＮＡの発現量を測定する方法としては、前述の本件マイクロＲＮＡの発現量を測定する方法を用いればよく、また、上記（ｃ）工程において比較・評価する方法としては、本件マイクロＲＮＡのうち、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-885-5p及びmiR-888については、コントロールと比較して低下している場合に、その被検物質が婦人科がん治療薬である可能性が高いと判定することができ、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584については、コントロールと比較して増加している場合に、その被検物質が婦人科がん治療薬である可能性が高いと判定することができる。マイクロＲＮＡは、ｍＲＮＡに結合するなどして、その遺伝子の発現を抑制するなどの性質が報告されているため、婦人科がん組織における上記マイクロＲＮＡの異常発現を正常化方向にシフトさせるような被検物質は、婦人科がん治療薬として用いうる可能性が高いと考えられる。
　なお、（ｃ）工程に代えて、（ｄ）コントロールとしての、婦人科がん組織と同種の非がん組織又は婦人科がん被検体の血液におけるマイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する工程：を採用することができる。（ｄ）工程において比較・評価する方法としては、本件マイクロＲＮＡの発現量が、コントロールと比較して有意差がない場合に、その被検物質が婦人科がん治療薬である可能性が高いと判定することができる。
　本件マイクロＲＮＡの中でも、miR-137、miR-138、miR-203、miR-205、miR-488、miR-489、miR-643、miR-885-5p、miR-888は、がん組織における平均発現量が非がん組織における発現量の５倍以上と、発現量の差が大きいため、婦人科がん治療薬である可能性をより正確に判定することが可能である点で好ましい。また、上述のマイクロＲＮＡを２種類以上、婦人科がんのバイオマーカーとして併用すると、婦人科がん治療薬である可能性をより正確に判定することが可能となる点で好ましい。
　以下、実施例により本発明をより具体的に説明するが、本発明の技術的範囲はこれらの例示に限定されるものではない。
［サンプル組織の採取１］
　慶應義塾大学医学部の倫理委員会の承認のもと、慶應義塾大学病院の婦人科外来を受診した患者を選定し、サンプル提供の依頼対象者とした。その上で、その対象者からインフォームド・コンセントを得た後、４人の各対象者から、４種類のサンプル組織（図１の“sample ID 1-4”）を採取した。これら４種類のサンプル組織における組織の種類（図１の“tissues”の項目）としては、子宮内膜ポリープ（endometrial polyp）と子宮体がん（endometrial cancer）の２種類であり、組織の状態（図１の“samples”の項目）としては、ポリープ（polyp）、がん（cancer）の２種類であった。
　採取したこれらの組織のそれぞれの一部を、RNAlater（登録商標）（Applied Biosystems社製）が分注されたチューブに入れて冷凍保存し、組織内のＲＮＡを安定化した。なお、各サンプルの組織の状態（がん、ポリープ等）は、採取した組織の他の一部について病理学検査を実施し、確定診断を行った。
［サンプル組織からのＲＮＡの抽出及びその質的評価１］
　後述のマイクロアレイに用いるため、実施例１で冷凍保存した各組織からＲＮＡを抽出した。具体的には、mirVana miRNA Isolation Kit（Applied Biosystems社製）を添付のプロトコールにしたがって用いて、前述の各組織から、マイクロＲＮＡを含むトータルＲＮＡを抽出した。
　次に、後述のマイクロアレイで十分な精度が得られることを確認するために、抽出したＲＮＡの質的評価を行った。具体的には、得られたＲＮＡの濃度を蒸留水にて約３０ｎｇ／μＬに調整し、分光光度計にてＯＤ２６０／２８０（ＯＤ２６０の計測値をＯＤ２８０の計測値で割った数値）等を計測及び算出した。その結果を図２に示す。図２に示されているように、ＯＤ２６０／２８０はいずれも約１．６～２．０の範囲内に入っており、タンパク質やフェノールの混入の少ない、質の良いＲＮＡであることが分かった。また、抽出したトータルＲＮＡのＲＩＮ（RNA Integrity Number）を、Bio-Analyzer RNA6000（Agilent Technologies社製）にて計測し、ＲＮＡの分解の程度を調べた。その結果を図３に示す。図３に示されているように、各サンプルのＲＩＮは十分に高いレベルを保持しており、質の良いＲＮＡであることが分かった。
［各組織におけるマイクロＲＮＡの発現解析１］
　Agilent Human miRNA V2 (Agilent Technologies社製)を用いて、ヒトのマイクロＲＮＡ７２３種につき網羅的解析を行った。前述のAgilent Human miRNA V2のマイクロアレイは、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-337-3p、miR-337-5p及びmiR-127-3p用のプローブとして、それぞれ配列番号１～２３、２５～２７に示されるヌクレオチド配列に相補的なＤＮＡ配列を有している。解析の方法は、Agilent Technologies社のmiRNA Microarray protocol Version 1.5に記載の方法にしたがった。具体的には、以下のような方法で解析を行った。なお、試薬の量は１サンプル用の分量で記載する。
　まず、実施例２で得られたトータルＲＮＡを約２５ｎｇ／μＬになるように、ＤＮａｓｅ／ＲＮａｓｅフリーの水で希釈し、その希釈液のＲＮＡ濃度を測定した。次に、１０×ＣＩＰ Ｂｕｆｆｅｒ（ＧＥヘルスケア社製）０．７μＬと、１６Ｕ／μＬのＣＩＰ（ＧＥヘルスケア社製）０．７μＬを混合して得られたＣＩＰマスターミックス１．４μＬを調製した。前述のＲＮＡ希釈液から、トータルＲＮＡ量が１００ｎｇとなる量を１．５ｍＬチューブに分取し、前述のＣＩＰマスターミックス１．４μＬを添加し、さらにＤＮａｓｅ／ＲＮａｓｅフリーの水で７μＬにメスアップした。この後、３７℃で３０分間インキュベーションして、トータルＲＮＡの脱リン酸化反応を行った。
　脱リン酸化反応したサンプル溶液にＤＭＳＯ（Sigma社製）を５μＬ添加して混合し、１００℃で約５分間インキュベートしてトータルＲＮＡの熱変性を行った。その後、直ちに氷水にて２分間冷却した。
　次に、ライゲーションを行なった。具体的には、２μＬの10×T4 RNA Ligase Buffer（ＧＥヘルスケア社製）、２μＬの０．１％ＢＳＡ（ＧＥヘルスケア社製）、１５Ｕ／μＬに調整した１μＬのT4 RNA Ligase（ＧＥヘルスケア社製）、３μＬのCyanine 3-Cytidine（Agilent Technologies社製）を別の１．５ｍＬチューブ中で混合し、ライゲーションマスターミックスを調製した。このライゲーションマスターミックス８μＬを、熱変性を行なった後冷却した前述のサンプルに添加し、１６℃にて２分間インキュベーションした。
　次いで、サンプルの精製を行った。具体的には、MicroBioSpin6（BioRad社製）を添付のプロトコールにしたがって利用して、前述のサンプルから、Cyanine 3-Cytidineで蛍光標識したサンプルＲＮＡを精製した。
　Agilent Human miRNA V2 (Agilent Technologies社製)オリゴＤＮＡマイクロアレイを用いて前述のサンプルＲＮＡのマイクロＲＮＡプロファイル解析を行った。Agilent Technologies社のプロトコールに従って、５５℃で２０時間以上ＲＮＡサンプルのハイブリダイゼーション反応を行なった。次いで、ハイブリダイゼーション後のマイクロアレイを、Agilent Technologies社のプロトコールにしたがって、洗浄バッファー１で室温５分間、洗浄バッファー２で３７℃５分間洗浄した。マイクロアレイを洗浄バッファー２から引き上げて、DNA Microarray Scanner（Agilent Technologies社製）を用いてスキャニングを行なった。
　７２３種類のマイクロＲＮＡのうち、子宮体の非がん組織（ポリープ：polyp）と、子宮体がん組織（cancer 1-3）とを比較して、発現量（シグナル強度）に大きな差が見られる複数のマイクロＲＮＡを見出した。各サンプルにおけるそれらのマイクロＲＮＡのシグナル強度を図４及び５に示す。図４には、子宮体がん組織で発現が増加するマイクロＲＮＡ（miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、及びmiR-193b*）を示し、図５は、子宮体がん組織で発現が低下するマイクロＲＮＡ（miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-337-3p、miR-337-5p及びmiR-127-3p）を示す。これらのマイクロＲＮＡは、子宮体がん組織において、非がん組織とは異なる発現（異常発現）していることから、これらのマイクロＲＮＡは、子宮体がん組織等の婦人科がん組織のマーカーとして用いることができる。
　なお、他のがんにおいて異常発現することが知られるlet-7 family（let-7a、let-7b、let-7c、let-7d、let-7e、let-7f、let-7g、let-7i）、miR-17-92 cluster（miR-17、miR-18a、miR-19a、miR-19b、miR-20a、miR-92a）、miR-15（miR-15a、miR-15b）及びmiR-16についての発現を各サンプルにて確認したが、子宮体がんにおいては特に異常発現は見られなかった（図６、図７、図８）。
［サンプル組織の採取２］
　慶應義塾大学医学部の倫理委員会の承認のもと、慶應義塾大学病院の婦人科外来を受診した患者を選定し、サンプル提供の依頼対象者とした。その上で、その対象者からインフォームド・コンセントを得た後、５人の各対象者から、５種類のサンプル組織（図９のsample ID“42”、“06-072”、“05-034”、“04-010”、“06-082”）を採取した。これら５種類のサンプル組織における組織の種類（図９の“samples”の項目）としては、子宮内膜（endometrium）と子宮体がん（endometrial cancer）の２種類であり、がんのグレード（図９の“grade”の項目）としては、Ｇ１及びＧ３の２種類であり、がんの進行期（図９の“進行期”の項目）としては、Iｂ及びIIIｃの２種類であった。
　採取したこれらの組織のそれぞれの一部を、RNAlater（登録商標）（Applied Biosystems社製）が分注されたチューブに入れて冷凍保存し、組織内のＲＮＡを安定化した。なお、各サンプルの組織の状態（がん等）は、採取した組織の他の一部について病理学検査を実施し、確定診断を行った。
［サンプル組織からのＲＮＡの抽出及びその質的評価２］
　後述のリアルタイムＰＣＲに用いるため、実施例４で冷凍保存した各組織からＲＮＡを抽出した。具体的には、mirVana miRNA Isolation Kit（Applied Biosystems社製）を添付のプロトコールにしたがって用いて、前述の各組織から、マイクロＲＮＡを含むトータルＲＮＡを抽出した。
　次に、後述のリアルタイムＰＣＲで十分な精度が得られることを確認するために、抽出したＲＮＡの質的評価を行った。具体的には、得られたＲＮＡの濃度を蒸留水にて約３０ｎｇ／μＬに調整し、分光光度計にてＯＤ２６０／２８０（ＯＤ２６０の計測値をＯＤ２８０の計測値で割った数値）等を計測及び算出した。その結果を図１０に示す。図１０に示されているように、ＯＤ２６０／２８０はいずれも約１．６～２．２の範囲内に入っており、タンパク質やフェノールの混入の少ない、質の良いＲＮＡであることが分かった。また、抽出したトータルＲＮＡのＲＩＮ（RNA Integrity Number）を、Bio-Analyzer RNA6000（Agilent Technologies社製）にて計測し、ＲＮＡの分解の程度を調べた。その結果を図１０に示す。図１０に示されているように、各サンプルのＲＩＮは十分に高いレベルを保持しており、質の良いＲＮＡであることが分かった。
［各組織におけるマイクロＲＮＡの発現解析２］
　前述の実施例５で抽出した各ＲＮＡ及びTaqMan（登録商標）MicroRNA Assays（Applied Biosystems社製）を用いて、リアルタイムＰＣＲ法により、ヒトのマイクロＲＮＡにつき網羅的解析を行った。定量の方法は、添付のプロトコールに記載の方法にしたがった。各ＲＮＡサンプルについて、miR-135a*、miR-137、miR-138、miR-203、miR-205及びmiR-488を定量した結果を図１１に、miR-489、miR-629*、miR-643、miR-885-5p及びmiR-888を定量した結果を図１２に、miR-34c-5p、miR-127-3p、miR-299-5p、miR-323-3p、miR-337-5p、miR-376b、miR-411、miR-424及びmiR-432を定量した結果を図１３に、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584を定量した結果を図１４にそれぞれ示す。図１１～１２に示されるように、miR-135a*、miR-137、miR-138、miR-203、miR-205、miR-488、miR-489、miR-629*、miR-643、miR-885-5p及びmiR-888についてはそれぞれ、子宮内膜正常組織（normal）における発現と比較して子宮体がん組織における発現の増加が確認でき、図１３～１４に示されるように、miR-34c-5p、miR-127-3p、miR-299-5p、miR-323-3p、miR-337-5p、miR-376b、miR-411、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584についてはそれぞれ、子宮内膜正常組織（normal）における発現と比較して子宮体がん組織における発現の低下が確認できた。

Claims (11)

  1. miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡを婦人科がんのバイオマーカーとして使用する方法。
  2. miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584が、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡであることを特徴とする請求項１に記載の方法。
  3. 以下の工程を備えたことを特徴とする婦人科がんの判定方法：
    （Ａ）婦人科検体組織中又は被検体の血液中のＲＮＡを抽出する工程：
    （Ｂ）抽出したＲＮＡ中の、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584から選択される１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量を測定する工程：
    （Ｃ）コントロールとしての、検体組織と同種の非がん組織又は被検体と同種の正常被検体の血液におけるマイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する工程：
  4. miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584が、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡであることを特徴とする請求項３に記載の婦人科がんの判定方法。
  5. 抽出したＲＮＡ中の、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-885-5p及びmiR-888からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量が、コントロールと比較して増加している場合に婦人科がんであると評価することを特徴とする請求項３又は４に記載の婦人科がんの判定方法。
  6. 抽出したＲＮＡ中の、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量が、コントロールと比較して低下している場合に婦人科がんであると評価することを特徴とする請求項３又は４に記載の婦人科がんの判定方法。
  7. miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量を測定することができる、前記マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を備えたマイクロアレイを含んでいることを特徴とする婦人科がんの判定キット。
  8. miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの配列を増幅し得るプライマーセットと、前記マイクロＲＮＡの配列に相補的な核酸配列からなるポリヌクレオチド又はその一部を含む蛍光プローブを備えたことを特徴とする婦人科がんの判定キット。
  9. miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584が、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡであることを特徴とする請求項７又は８に記載の判定キット。
  10. 以下の工程を含むことを特徴とする婦人科がん治療薬のスクリーニング方法：
    （Ａ）婦人科がんに罹患した非ヒト動物に被検物質を投与する工程：
    （Ｂ）前記非ヒト動物における婦人科がん組織中又は血液中の、miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584からなるマイクロＲＮＡ群から選ばれる１又は２種以上のマイクロＲＮＡの発現量を測定する工程：
    （Ｃ）コントロールとしての、被検物質を未投与の場合におけるマイクロＲＮＡの発現量と比較・評価する工程：
  11. miR-592、miR-629*、miR-517a、miR-205、miR-184、miR-509-5p、miR-135a*、miR-137、miR-602、miR-186*、miR-181a-2*、miR-193b*、miR-377*、miR-449b、miR-449a、miR-369-3p、miR-323-3p、miR-329、miR-299-5p、miR-34b、miR-411、miR-34c-5p、miR-376b、miR-885-5p、miR-337-3p、miR-337-5p、miR-127-3p、miR-138、miR-203、miR-488、miR-489、miR-643、miR-888、miR-424、miR-432、miR-433、miR-450a、miR-503、miR-542-3p、miR-542-5p及びmiR-584が、それぞれ配列番号１～２７、５０～６３に示されるヌクレオチド配列において１又は２個以上のヌクレオチドが欠失、置換、若しくは付加されたＲＮＡからなり、かつ、婦人科がん組織又は婦人科がん被検体の血液においてコントロールと比較して発現が増加又は低下するＲＮＡであることを特徴とする請求項１０に記載のスクリーニング方法。
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