WO2006062131A1 - 細胞計測方法 - Google Patents

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WO2006062131A1
WO2006062131A1 PCT/JP2005/022465 JP2005022465W WO2006062131A1 WO 2006062131 A1 WO2006062131 A1 WO 2006062131A1 JP 2005022465 W JP2005022465 W JP 2005022465W WO 2006062131 A1 WO2006062131 A1 WO 2006062131A1
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cell
cells
liquid
image
measurement method
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PCT/JP2005/022465
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Nao Nitta
Original Assignee
Effector Cell Institute, Inc.
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Priority to EP05814552A priority patent/EP1821094A1/en
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    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
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    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
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    • G02B21/365Control or image processing arrangements for digital or video microscopes
    • G02B21/367Control or image processing arrangements for digital or video microscopes providing an output produced by processing a plurality of individual source images, e.g. image tiling, montage, composite images, depth sectioning, image comparison

Definitions

  • the present invention relates to a cell measurement method.
  • sites which are micro-compartments for accommodating cells and performing observations, are arranged two-dimensionally. Observation support equipment is used.
  • the observation support device When observing and measuring cells using this type of observation support device, the observation support device is placed on the XYZ stage of the microscope, and the stage is two-dimensional (XY
  • a good measurement result can be obtained by conducting an experiment at an appropriate concentration. For example, if you want to compare cell responsiveness to certain stimuli by cell type, or if you want to compare changes in cell responsiveness when changing cell conditions, or if the set concentration is too high or too low, The difference in each type is difficult to split The experimental results cannot be obtained.
  • An object of the present invention is to provide a technique capable of performing measurement in a wide concentration range at a time when measuring a reaction related to a cell.
  • a cell measurement that captures an image of a cell group with an imaging device, captures the image into an information processing device, and performs measurement based on the obtained image in the information processing device.
  • the cell group in the cell accommodation space is imaged by an imaging device and taken into an information processing device,
  • a cell measurement that captures an image of a cell group with an imaging device, captures the image into an information processing device, and performs measurement based on the obtained image in the information processing device.
  • the obtained image is partitioned into a plurality of regions along the density gradient, and feature amounts are extracted from the images in each region.
  • a cell measurement method characterized by generating information indicating a correspondence relationship between the extracted feature quantity and a concentration gradient.
  • a cell observation support device having a reservoir space and a second liquid reservoir space, and when used, an image of a cell group accommodated in the cell accommodation region is acquired, and information about the cell is obtained based on the acquired image. Using an information processing device to collect,
  • a process for generating information indicating a change over time with respect to a ratio of a specific number of cells in which the feature amount appears In accordance with an instruction, there is provided a cell measurement method characterized by performing a process of outputting information indicating the change over time.
  • FIG. 1 is an explanatory diagram showing the principle of a cell measurement system according to an embodiment of the present invention.
  • FIG. 2 is a block diagram showing an example of the configuration of a cell measurement system that can be used when performing cell measurement of the present invention.
  • FIG. 3 is a cross-sectional view showing a first example of an observation member that can be used in the practice of the present invention.
  • FIG. 4 is a cross-sectional view showing a second example of an observation member that can be used in the practice of the present invention.
  • FIG. 5 is a cross-sectional view showing a third example of an observation member that can be used in the practice of the present invention.
  • FIG. 6 is a cross-sectional view showing a fourth example of an observation member that can be used in the practice of the present invention.
  • FIG. 7 is a cross-sectional view showing a fifth example of an observation member that can be used in the practice of the present invention.
  • FIG. 8 is a graph showing the result of measuring the diffusion of FITC molecules after addition by fluorescence observation.
  • Fig. 9 is an explanatory diagram illustrating the case where the characteristics of the change in contrast by the degranulation of cells by the stimulating substance are captured.
  • FIG. 10 is an explanatory diagram showing a method of extracting a feature amount by dividing the screen into a plurality of regions along the density gradient for the obtained image.
  • FIG. 11 is a graph showing the percentage of degranulated cells calculated at each point (section).
  • Fig. 12 is a graph showing the results of measurement using the velocity in the concentration gradient direction of cell movement as an index of chemotaxis activity intensity, and measuring the value at each position on the channel. .
  • FIG. 13 is a graph showing some responsiveness to cell stimulation.
  • the present invention makes it possible to form a concentration gradient on a plane on which a large number of cells exist with good reproducibility, and to measure the response of cells at each position on the concentration gradient. Can be performed at once. As a result, according to the present invention, it is possible to reduce the experiment required to search for the optimum cell stimulation concentration, and to increase the efficiency of the experiment. In addition, the concentration of the chemical substance that stimulates the cells is continuously set according to the position, so that evaluation at the optimum concentration is possible.
  • the captured image is divided into strips, and the feature quantities of the cell population included in each region are obtained and then analyzed.
  • the present technique using a concentration gradient is used to measure each cell group continuously.
  • Reactivity data at drug concentration can be acquired in a batch. From the set of concentration conditions, the most appropriate concentration for evaluating the difference in the properties of each cell group can be selected, and the drug responsiveness of each cell group can be compared at that concentration. This method eliminates the need for a series of studies to evaluate cell responsiveness at a large number of drug concentrations, and enables easy and reliable acquisition of high-quality data.
  • the responsiveness of the cells to the drug can be continuously evaluated.
  • a function or value indicating the drug response characteristics of a cell based on the “series of concentration-response relationship data” obtained in step 1.
  • the data obtained in this study is fit to that function as appropriate, and the concentration dependence of the drug response in the tested cell population
  • a function that approximates sex can be obtained, and the specific function here is assumed to be a sigmoid function, but is not limited to this, and from the function, a maximum point, a minimum point, an inflection point, etc.
  • the concentration corresponding to the characteristic point is obtained, and the value is adopted as the characteristic amount of the reactivity of the cell group to the drug.
  • a concentration gradient for a specific substance for observing a cell reaction is formed in a space in which a plurality of cells are arranged. Therefore, the observation member 100 forms a cell accommodation space 110 as a space for accommodating cells.
  • the cell accommodation space 110 shown in FIG. 1 schematically shows the structure in order to explain the principle. A specific configuration will be described later.
  • the cell accommodating space 110 is filled with a liquid 120 that is harmless to cells, and a plurality (cell groups) of cells 200 to be observed are dispersed and arranged therein.
  • a substance hereinafter referred to as a stimulating substance 130 for observing the cell reaction is injected from one of the cell accommodating spaces 110 to form a concentration gradient 131 in the cell accommodating space 110.
  • a solution in which a stimulating substance 130 such as a compound is dissolved is injected, and a concentration gradient 131 of a specific stimulating substance 130 is formed in the cell accommodation space 110.
  • the image is taken by a digital camera (for example, a CCD camera) 320.
  • a plurality (eg, twelve) of cell accommodation spaces 110 are formed on a silicon wafer using a photolithographic technique. Then, the responsiveness of the cells at each position of the concentration gradient in each cell accommodation space 110 is measured. This method makes it possible to easily compare the effects of compounds on cells.
  • the responsiveness of cells to stimulating substances varies depending on the concentration.
  • Various cellular phenomena such as gene expression, morphological change, and release of physiologically active substances are considered as responses exhibited by cells. available.
  • the cell may exhibit some feature quantity that can be observed from the outside.
  • the characteristic amount indicated by the cell group is extracted by analyzing the image of the cell group, and information on the cell response regarding the stimulating substance is obtained.
  • a concentration gradient is formed in the same screen. For this reason, changing the concentration does not require the labor of trial and error such as repeating the experiment. Responses due to different concentrations can be observed in one experiment.
  • the cell accommodation space 110 can be realized by various forms of the observation member 100 as shown in FIGS.
  • the cell accommodation space 110 is for distributing and arranging cell groups on a plane so that they can be observed through an external force microscope or the like. Therefore, it has a flat structure.
  • the thickness is, for example, about the size of a cell.
  • the one shown in FIG. 3 is a flat engraving that becomes a cell accommodation space 110 and a stimulating substance that flows into the cell accommodation space 110 by using a photolithographic technique and is located on one end side of the silicon wafer 115.
  • a source region 111 and a carving that forms a drain space 112 that is located on the other end side of the cell storage space 110 and discharges the stimulating substance from the cell storage space 110 are formed.
  • the silicon wear 115 is placed on the glass substrate 117.
  • the engraved space between the silicon wafer 115 and the glass substrate 117 constitutes the cell accommodation space 110, the source region 111, and the drain region 112.
  • the cell accommodation space 110 is formed to be a flat space (channel) with a depth that does not allow cells to overlap.
  • the source region 111 and the drain region 112 are merely named for convenience of the stimulating substance injection side and the discharge side. In the case of a symmetric observation member, there is no problem even if there is a gap between the source region and the drain region.
  • a liquid reservoir constituting member 116 that constitutes a liquid reservoir is provided on the upper surface side of the silicon wafer 115.
  • the liquid reservoir constituting member 116 is made of a metal such as stainless steel, for example.
  • the liquid reservoir component 116 forms a first liquid reservoir space 113a and a third liquid reservoir space 113b, and a second liquid reservoir space 114a and a fourth liquid reservoir space 114b.
  • the first liquid storage space 113a and the third liquid storage space 113b communicate with the source region 111.
  • the second liquid reservoir space 112 and the fourth liquid reservoir space 114 communicate with the drain region 112.
  • the liquid 120 can go back and forth between the first liquid storage space 113a and the third liquid storage space 113b and the second liquid storage space 114a and the fourth liquid storage space 114b through the cell storage space 110.
  • the liquid itself is more convenient for observation if it does not create a flow, and therefore, above the liquid reservoir component 116, the first liquid reservoir space 113a and the third liquid reservoir space 113b, A communication portion 118 that communicates the second liquid reservoir space 114a and the fourth liquid reservoir space 114b is provided.
  • Cells, stimulating substances and the like are injected using a syringe or the like. At this time, the injection needle can be surely injected into the cell accommodating space 110 by setting the injection needle to reach the source region 111.
  • FIG. 4 shows an observation member 100 having a configuration substantially equivalent to the configuration shown in FIG.
  • the observation member 100 has the same structure as that shown in FIG. 3 described above except that there is a difference in the engraved structure formed in the silicon wafer 115, and functions in the same manner.
  • the observation member shown in FIG. 5 is provided in the observation member shown in FIG. 3 and FIG. 4 described above, and has a structure without the third liquid reservoir space 113b and the fourth liquid reservoir space 114b. RU That is, the first liquid storage space 113, the second liquid storage space 114, the source region 111, the cell storage space 110, and the drain region 112 are provided.
  • the third liquid reservoir space 113b and the fourth liquid reservoir space 114b are provided in order to absorb the shaking of the liquid injected. is there .
  • stimulating substance is injected using a syringe or the like at a position away from the source region 111, it serves to release part of the pressure generated when the stimulating substance is pushed out.
  • the observation member shown in FIGS. 6 and 7 is of a different type from that shown in FIGS. 3 to 5 described above. That is, the observation member shown in FIG. 6 and the observation member shown in FIG. 7 are different in the configuration of the liquid storage space and the configuration of the cell storage space 110.
  • the first liquid storage space 113 is open, and performs liquid injection, cell injection, stimulation substance injection, and the like.
  • the second liquid reservoir space 114 is not opened.
  • the member 119 constituting the cell accommodation space 110 stainless steel, which is not silicon, is directly used. To do this This simplifies the production of the observation member and has the effect of reducing the manufacturing cost.
  • FIG. 6 shows an example of a horizontal type, that is, a horizontal type.
  • FIG. 7 in the case of a sticky cell, the cell does not fall because it adheres to the glass substrate.
  • a communication pipe constituted by a cell storage space (channel) 110, a first liquid storage space 113 communicated therewith, and a second liquid storage space 114.
  • the structure is filled with a suitable liquid.
  • a solution containing a target substance for forming a concentration gradient is injected into one of the first liquid storage space 113 and the second liquid storage space 114.
  • the substance diffuses into the channel 110 from the source region 111 toward the drain region 112.
  • the liquid 120 between the upper communication portions 118 the disturbance of the concentration gradient due to the intense movement of the liquid in the channel 110 due to the influence of vibration or inclination can be greatly reduced. This makes it possible to maintain a stable concentration gradient.
  • the first liquid storage space 113a is provided with a third liquid storage space 113b as a branch path
  • the second liquid storage space 114a is set as a branch path with a fourth liquid storage space.
  • An observation member provided with 114b can also be used.
  • the liquid containing the target stimulating substance 130 is introduced from the first liquid reservoir space 113a or the second liquid reservoir space 114a, respectively.
  • the stimulating substance diffuses from the source region 111 to the drain region through the channel 110.
  • the drain region 112 shown in the figure is substantially the source region
  • the source region 111 on the opposite side is substantially the drain region. . Therefore, the source region and the drain region are names for convenience in the case of the observation member shown in FIGS.
  • a concentration gradient can also be formed using the observation member shown in FIG. 6 and FIG.
  • a liquid containing the stimulating substance 130 is introduced from the opened first liquid storage space 113, and a concentration gradient of the stimulating substance 130 is formed from the source region 111 to the drain through the channel 110. Is done.
  • FIG. 8 shows how diffusion occurs when the observation member shown in FIG. 4 is filled with a liquid and a specific stimulating substance 130 is added thereto.
  • FITC which is a fluorescent material, was added to the first liquid storage space 113a.
  • Figure 8 shows the results of fluorescence observation of the FITC molecule diffusion after addition.
  • the horizontal axis of the graph represents the position on the channel, and the vertical axis represents the fluorescence intensity.
  • concentration gradients of FITC molecules are shown at 1, 3, 6, 9, and 15 minutes after FITC molecule injection. It can be seen that an almost linear concentration gradient is formed and maintained after 3 minutes.
  • FIG. 2 shows an example of the configuration of the present cell measurement system.
  • the cell measurement system shown in FIG. 2 performs an image processing for obtaining an intended information by processing an imaged device for imaging a cell accommodated in the cell accommodating space 110 and the captured image. And an information processing device.
  • the imaging device includes a microscope 310, a CCD camera 320, a stage 316, a stage driving device 315, and an information processing device 350.
  • the information processing apparatus includes an input device 330, a display device 340, and a computer 350.
  • the computer 350 includes a central processing unit (CPU) 351, a memory 352, and an auxiliary storage device 353.
  • the auxiliary storage device 353 stores the operation program 360 of the CPU 351 and the data 370.
  • the program 360 includes an OS (not shown), an imaging sequence 361 for controlling the measurement operation in the cell measurement system, a stage control 352 for controlling the stage, an imaging control 363 for controlling imaging, and the obtained image.
  • Data analysis 364 that performs data analysis is included.
  • These programs are installed in the auxiliary storage device 353, such as a storage medium and a network.
  • the typical data is image data 371.
  • an observation cell group is prepared using the observation member described above, and measurement is performed under the control of the computer 350.
  • the measurement is performed according to a predetermined imaging sequence 361. That is, the computer 350 drives and controls the stage driving device 315 according to the stage control program 362 so that a plurality of positions, for example, 12 positions of the observation member are imaged at a constant timing such as every other minute. I do.
  • Imaging sequence 361 In addition to positioning by the XY stage 316, the CCD camera 320 is instructed to perform imaging of the cell group in the cell accommodating space 110 at a fixed timing by the imaging control program 363. Then, the image captured by the CCD camera 320 is taken into the memory 352 at a predetermined timing.
  • the captured image data is analyzed by the data analysis program 64.
  • the imaging data is stored in the auxiliary storage device 353 together with the imaging conditions.
  • the designated processing is performed on the obtained image.
  • Various methods can be used to extract the feature value from the captured image.
  • the screen is divided into a plurality of regions along the concentration gradient, and the feature amount indicated by the cell group included in each of the regions is extracted.
  • the section is defined in a rectangular shape.
  • the size of this section can be determined as appropriate.
  • there is a method of causing the computer 350 to recognize a section by specifying a frame on the screen displayed on the display device 340 using an input device.
  • by designating the number of partitions it is possible to divide the screen equally into the designated number of partitions to determine the partitions. In either case, a rectangular frame can be displayed on the display screen to indicate to the person the compartments that the computer 350 recognizes.
  • Figure 10 shows an example of display.
  • numerals 1 to 4 are appended to the left side of the frame indicating the section.
  • the upper side of the screen is displayed as the source side, and the lower side is displayed as the drain side. Therefore, in the case of the example shown in Fig. 10, it can be said that the numerical value in which the upward force is also reduced in order represents the order of density.
  • examples of the feature amount indicated by the cell group include the following. Of course, it is not limited to these.
  • the feature amount is extracted by examining whether the cell has expanded or ruptured using the contrast of the cell image included in the section.
  • the size for example, the average diameter, the area, and the like can be determined by comparing whether or not the threshold has been exceeded compared to a predetermined threshold.
  • FIG. 9 a case will be described in which the characteristic that the contrast is changed due to degranulation of cells by stimulating substances is explained.
  • the number of cell groups is counted. That is, it is divided into the one having a large contrast (for example, the cell 212 shown in FIG. 9) and the one having a small contrast (the cell 211 shown in FIG. 9), respectively, and the number is counted.
  • the contour is obtained and the closed shape is counted as one.
  • the contrast is examined based on the brightness difference between the contour line and the surrounding area.
  • the contrast of the image is separated using a filter, the contour line is obtained for each of the separated images, and the number of cells is counted. In any case, the number of cells with high contrast and the number of cells with low contrast are counted.
  • the number of cells it is also possible to measure the area on the screen occupied by the cell region. For example, in the case of identifying a cell using contrast as an index, an effect equivalent to that of counting the number of cells can be obtained by counting the area of a region on the screen included in a specific contrast range. For example, when evaluating the ratio of cells having a specific contrast, the ratio of the area of the cell having the property to the total area of the cells occupying the screen is used to determine the ratio of the cell having the property to the total number of cells. It can be used as a percentage.
  • the counting result can be grasped as, for example, the degranulation rate with respect to the stimulating substance by determining the ratio of the number of low contrast cells to the total number of cells for each section. Furthermore, when imaging is performed a plurality of times at different timings, information indicating the responsiveness of the cells to the stimulating substance can be generated over time at each concentration of the concentration gradient. Based on the information generated in this way, Fig. 10 shows the feature quantity of the cell group (here, the percentage of degranulated cells, i.e. Quality activity intensity) for each concentration as a function of time. According to the information shown in FIG. 10, it can be read that the activity varies depending on the concentration, and that the responsiveness changes with time.
  • the mast cell In response to a certain compound stimulus, the mast cell causes a reaction called degranulation that releases granules held in the cell to the outside of the cell. Since the morphology and contrast of cells change during degranulation, it is possible to distinguish degranulated cells using an optical device.
  • a concentration gradient of a mast cell stimulating substance was formed in an environment in which mast cells were dispersed, and the ratio of cells that caused degranulation at each position was calculated.
  • TAXIScan (KK chamber), an instrument for measuring cell chemotaxis, was used (see Kanegasaki S et al, (2003) J. Immunol. Methods 282, 1-11).
  • Mast cells collected from the rat abdominal cavity are introduced into the gap (cell accommodation space 110) between the microchannel and the glass substrate formed of silicon ueno, and stimulated from the source region 111 connected to one end of the microchannel.
  • Mast cell stimulant was added as a substance.
  • a stimulant 1 microliter of a buffer solution containing 100 ⁇ lysoPS and 2000,1000,200,80 ⁇ g / ml concanapalin ⁇ was introduced.
  • Mast cell degranulation was monitored by direct observation of the cells in the channel under a microscope. Mast cell degranulation can be monitored by using changes in morphology and contrast as indicators as shown in FIG. In addition, degranulation can be automatically detected by image analysis using contrast change as an index.
  • the concentration varies depending on the position on the screen.
  • the activity intensity at the concentration at each site can be determined ( Figure 10).
  • the four graphs on the right of Fig. 10 show the percentage of degranulated cells measured over time in the four areas in the photograph (the horizontal axis is time (min) and the vertical axis is ratio). .
  • the concentration gradient is formed by diffusion, and the percentage of degranulated cells stabilizes after some time. As described above, in the example shown in FIG. 10, the density decreases in the order of the section (2), the section (3), and the section (4) in which the section (1) has the highest concentration. It has such a concentration gradient.
  • FIG. 10 a photograph in which mast cells are arranged in the cell accommodation space 110 and a stimulant is introduced from the top of the screen (left: before stimulation, right: after stimulation). It is confirmed that the cells in the upper part of the screen are degranulated, the contrast is lowered, and the color is white. In addition, 211 indicates cells that have degranulated and 212 cells that have not degranulated.
  • Fig. 11 shows a graph in which the proportion of degranulated cells is calculated at each point (section).
  • the vertical axis is the proportion of cells that have disintegrated, and the horizontal axis is the concentration of stimulant (g / ml).
  • the numbers on the horizontal axis represent compartments on channels (cell storage spaces) that form a concentration gradient. 1 is the highest concentration point, and the concentration gradient is formed as the concentration decreases in the order of 1 to 4!
  • the numbers from 1 to 4 correspond to the section numbers (1) to (4) given in FIG.
  • the concentration of Concananoline A used as the stimulant is black square: 2000 g / ml, white square: 1000 ⁇ g / ml, X mark: 200 / ⁇ ⁇ / ⁇ 1, white circle: 80 g / ml. From the graph, at points 2 and 3, there is a difference in the proportion of degranulated cells depending on the concentration of the stimulant, and the value correlates with the concentration of the stimulant.
  • Cell chemotaxis is a function in which a cell senses a concentration gradient of a specific factor and moves in the direction of increasing concentration. This chemotaxis activity is known to show a Belshave-type activity that is maximized at a specific concentration and decreases at high and low concentrations. In the conventional method, activity is Belshave to concentration. The mold can be confirmed by conducting experiments at a number of concentrations. By utilizing the fact that the concentration is different at each position in the concentration gradient environment, it is possible to easily know the concentration characteristics of the activity. In this experiment, TAXIScan (KK chamber), an instrument for measuring cell chemotaxis, was used (for methods and materials, see Kanegasaki S et al, (2003) J. Immunol. Methods 282, (See 1-11).
  • Jurkat cells were introduced into the cell accommodation space 110, and the movement of the cells when a concentration gradient of SDF-la was formed therein was measured.
  • the concentration of SDF-la used to create the concentration gradient was 10 and 1 nM, and 1 microliter was injected into each. Since Jurkat cells showed chemotaxis in the concentration gradient direction of SDF-la, the velocity in the concentration gradient direction of cell motility was used as an index of the activity intensity of the cell movement, and the value was used as a channel (cell accommodation space 110). Measured at each position above. The result is shown in FIG.
  • the horizontal axis of the graph represents the position on the channel, and the vertical axis represents the chemotaxis activity (concentration gradient component of the cell migration rate).
  • the concentration gradient is formed from the right side of the graph, the concentration increases as it goes to the right.
  • the vertical axis represents the velocity of the cell movement in the gradient direction (m / sec).
  • the cell movement is measured by dividing the screen shown in FIG. 10 into a plurality of meshes, focusing on a part of the cell outline in each mesh, and the position force of the outline.
  • the average speed can be obtained from the average displacement direction and imaging timing.
  • a cell group is introduced into the cell accommodation space, a stimulating substance is injected into the cell group, a concentration gradient of the stimulating substance is formed, and imaging is performed.
  • the obtained image is provided with a section along the density gradient, and the feature amount indicated by the cell group in each section is extracted based on the image processing.
  • FIG. 13 (a) horizontal axis: concentration, vertical axis: activity
  • Fig. 13 (b) horizontal axis: position, vertical axis: concentration
  • Fig. 13 (c) Horizontal axis: position, vertical axis: activity
  • concentration gradients it is possible to confirm the cellular response at each concentration in a continuous concentration range in one independent test. This reduces the number of independent tests and simplifies the experiment.

Abstract

 細胞に関する反応を計測する際に、幅広い濃度範囲での計測を一度に行うことができる技術を提供する。液体120を満たした細胞収容空間110に細胞群200を配置する。細胞収容空間110の液体に特定の物質を供給して、当該細胞収容空間110の一端111から他端112に向かって液体中120に特定物質130の濃度勾配131を形成させる。細胞収容空間110内の細胞群を撮像装置320により撮像して、情報処理装置に取り込み、情報処理装置により、得られた画像について、前記濃度勾配に沿って複数の領域に区画し、各領域における画像から特徴量を抽出し、抽出された特徴量と濃度勾配との対応関係を示す情報を生成する。

Description

明 細 書
細胞計測方法
技術分野
[0001] 本発明は、細胞計測方法に関するものである。
背景技術
[0002] 医薬の開発、検査技術の開発等のために、細胞について顕微鏡等を用いて観察し 、種々の計測を行って、例えば、医薬の細胞への影響に関する情報等の各種情報を 収集することが行われている。この種の観察、測定等を行う場合、効率を上げるため 、細胞を収容して観察等を行うための微小区画である観察サイト(以下単にサイトとい う)が、複数、二次元的に配置された観察支援機器が用いられる。
[0003] この種の観察支援機器を用いて細胞の観察、測定等を行う場合には、観察支援機 器を顕微鏡の XYZステージ上に載せ、ステージを対物レンズ系に対して二次元 (XY
)方向に相対移動させて、複数のサイトを、順次、顕微鏡の視野内に位置させ、一定 時間間隔で同じ対象を撮影する経時的撮影 (タイムラブス撮影)が行われる。このた め、この種の顕微鏡を用いた光学測定器では、各サイトを顕微鏡の視野内に正確に 位置させるように、ステージの相対移動を精密に制御している。このようなタイムラブ ス観察については、例えば、非特許文献としては、 "Shiro Kanegasaki et al. , A novel optical assay system for the quantitative measurement of chemotaxis. Journal of Im munological Methods 282 (2003) 1 11"に記載されている。また、特許文献としては、 " 特開 2002— 277754号公報"に記載されて!、る。
[0004] ところで、化合物に対する細胞の反応、応答性等を観察する場合においては、細 胞の種類ごとの、反応性の差異を測定したり、細胞の条件を変えた場合での応答性 の変異を測定したりすることが求められる。
[0005] このような場合には、適切な濃度で実験をすることによって良好な測定結果を得る ことができる。例えば、ある刺激に対する細胞の応答性を細胞の種類ごとに比較した い場合、細胞の条件を変えた際の細胞応答性の変化を比較したい場合、設定した 濃度が高すぎたり低すぎたりすると細胞の種類ごとでの差異が分力りづらぐ良好な 実験結果が得られない。
[0006] そのため、化合物に対する細胞の応答性を試験するにあたっては、化合物刺激の 適切な濃度を設定する必要がある。その適切な濃度条件を設定するにあたり、濃度 条件を複数設定して各々の濃度について個別に細胞反応の計測を行う必要がある。 しかし、従来の技術では、そこまで配慮されていな力つた。
発明の開示
[0007] 本発明は、細胞に関する反応を計測する際に、幅広い濃度範囲での計測を一度に 行うことができる技術を提供することを目的とする。
[0008] 本発明の第 1の態様によれば、
撮像装置により細胞群の画像を撮像して画像を情報処理装置に取り込み、情報処 理装置にお!、て、得られた画像に基づ!、て細胞にっ 、ての計測を行う細胞計測方 法において、
細胞群を収容する細胞収容空間に液体を満たして、
前記細胞収容空間に細胞群を配置し、
前記細胞収容空間の液体に特定の物質を供給して、当該細胞収容空間の一端か ら他端に向力つて液体中に特定物質の濃度勾配を形成させ、
前記細胞収容空間内の細胞群を撮像装置により撮像して、情報処理装置に取り込 み、
得られた画像から細胞特徴量と特定物質の濃度との対応関係を示す情報を生成 すること
を特徴とする細胞計測方法が提供される。
[0009] 本発明の第 2の態様によれば、
撮像装置により細胞群の画像を撮像して画像を情報処理装置に取り込み、情報処 理装置にお!、て、得られた画像に基づ!、て細胞にっ 、ての計測を行う細胞計測方 法において、
細胞群を収容する細胞収容空間に液体を満たして、
前記細胞収容空間に細胞群を配置し、
前記細胞収容空間の液体に特定の物質を供給して、当該細胞収容空間の一端か ら他端に向力つて液体中に特定物質の濃度勾配を形成させ、 前記細胞収容空間内の細胞群を撮像装置により撮像して、情報処理装置に取り込 み、
情報処理装置において、
得られた画像について、前記濃度勾配に沿って複数の領域に区画し、各領域にお ける画像から特徴量を抽出し、
前記抽出された特徴量と濃度勾配との対応関係を示す情報を生成すること を特徴とする細胞計測方法が提供される。
本発明の第 3の態様によれば、
細胞計測方法において、
観察時に、観察すべき細胞群を収容する細胞収容領域と、前記細胞収容領域を挟 んで連通し、使用時に、それぞれに液体が入れられ、前記細胞収容領域を液体で満 たす、第 1液溜空間および第 2液溜空間と、を有する細胞観察支援装置と、使用時に 、前記細胞収容領域に収容されている細胞群の画像を取得し、取得した画像に基づ いて、細胞に関する情報を収集する情報処理装置と、を用い、
前記観察すべき細胞群を配置し、
第 1液溜空間および第 2液溜空間と、前記細胞収容領域とに液体を満たし、かつ、 前記第 1液溜空間の液体中に、前記細胞を刺激する細胞刺激物を添加した後、 前記撮像装置により、異なるタイミングで複数回、細胞群の画像を取得する処理と、 各回に取得した前記画像について、前記画像に表れる細胞収容領域を、前記第 1 の液溜空間側力 前記第 2の液溜空間側に沿って複数の区画に分け、それぞれの 区画に含まれる細胞の総個数を計数すると共に、予め定めた特徴量が表れている特 定の細胞を識別して、その個数を計数する処理と、
前記計数結果に基づいて、それぞれの区画について、それぞれの区画内で計数さ れた総個数に対する、特徴量が表れている特定の細胞個数の割合を算出する処理 と、
前記特徴量が表れている特定の細胞個数の割合に関する経時的変化を示す情報 を生成する処理と、 指示に応じて、前記経時的変化を示す情報を出力する処理と、を行うことを特徴と する細胞計測方法が提供される。
図面の簡単な説明
[0011] [図 1]図 1は、本発明の一実施形態に係る細胞計測システムの原理を示す説明図で ある。
[0012] [図 2]図 2は、本発明の細胞計測を行う際に用いることができる細胞計測システムの構 成の一例を示すブロック図である。
[0013] [図 3]図 3は、本発明の実施に用いることができる観察部材の第 1の例を示す断面図 である。
[0014] [図 4]図 4は、本発明の実施に用いることができる観察部材の第 2の例を示す断面図 である。
[0015] [図 5]図 5は、本発明の実施に用いることができる観察部材の第 3の例を示す断面図 である。
[0016] [図 6]図 6は、本発明の実施に用いることができる観察部材の第 4の例を示す断面図 である。
[0017] [図 7]図 7は、本発明の実施に用いることができる観察部材の第 5の例を示す断面図 である。
[0018] [図 8]図 8は、添加後における FITC分子の拡散のようすを、蛍光観察により測定した 結果を示すグラフである。
[0019] [図 9]図 9は、刺激物質により細胞が脱顆粒して、コントラストが変化するという特徴を 捉える場合にっ ヽて示す説明図である。
[0020] [図 10]図 10は、得られた画像について、濃度勾配に沿って、画面を複数の領域に区 画して、特徴量を抽出する方法を示す説明図である。
[0021] [図 11]図 11は、各地点(区画)で脱顆粒細胞の割合を計算したグラフである。
[0022] [図 12]図 12は、走化活性強度の指標として細胞運動の濃度勾配方向の速度を採用 し、その値をチャネル上の各位置にぉ 、て計測した結果を示すグラフである。
[0023] [図 13]図 13は細胞の刺激に対する何らかの応答性を示すグラフである。
発明を実施するための最良の形態 [0024] 以下、発明を実施するための最良の形態について、図面を参照して説明する。先 ず、本発明の原理について説明し、ついで、具体的な適用について説明する。
[0025] 本発明は、細胞が多数存在する平面上に濃度勾配を再現性よく形成させ、その濃 度勾配上の各位置での細胞の応答を計測することにより、幅広 、濃度範囲での計測 を一度に行うことを可能とする。その結果、本発明により、最適な細胞刺激濃度を探 索することに必要となる実験を削減することができて、実験の効率を高める。また、細 胞を刺激する化学物質の濃度が位置によって連続的に設定されるため、最適な濃度 での評価が可能となる。
[0026] データの解析方法としては、次のような考え方が可能である。すなわち、後述するよ うに、撮像された画面を短冊状に領域を区切り、各々の領域に含まれる細胞集団の 特徴量を得た後、解析する。
(a)最適な濃度条件における細胞の薬剤応答性評価方法 (最適条件の選定方法) 細胞の薬剤に対する反応性を測定する場合、その細胞及び薬剤に対して、適当な 薬剤処理濃度を選定する必要がある。従来このような場合においては適当な濃度を いくつか選択して、その各々の濃度における細胞性質を独立に測定することにより、 適当な濃度を選定していた。この場合、より適当な濃度を選択するためには、多数の 濃度において実験を繰り返し、あるいは並行して行う必要があった。本技術では、細 胞に対する薬剤の処理濃度が連続的に変化した際の、細胞性質の変化についての 連続的なデータを取得することができる。
[0027] 例えば二種類以上の細胞群がある場合において、その各細胞群の薬剤に対する 反応性の差異を検討する場合、濃度勾配を用いる本技術により各々の細胞群につ V、て連続的な薬剤濃度での反応性データを一括して取得することができる。その一 連の濃度条件の中から、各細胞群の性質の差異を評価する最もふさわしい濃度を選 択し、その濃度において各細胞郡の薬剤応答性の比較を行うことができる。この手法 により、多数の薬剤濃度で細胞応答性を評価する一連の検討実験が不要となり、簡 便かつ確実に質の高いデータを取得することが可能となる。
(b)細胞の薬剤応答性の特性を表す、関数もしくは値の取得
本手法により、細胞の薬剤に対する応答性を連続的に評価することができる。ここ で取得される"一連の濃度-応答性関係デーダ 'をもとに、細胞の薬剤応答性の特性 を示す関数もしくは値を取得することが可能である。例えば、ある試験において、細 胞の薬剤に対する反応性が、その薬剤濃度に対する特定の関数の形でよく表される 場合、本試験で得られたデータをその関数に対して適宜フィッティングことにより、試 験した細胞群における薬剤応答の濃度依存性を近似する関数を得ることができる。こ こでいう特定の関数としては、シグモイド関数などが想定されるが、これに限らない。 また、その関数から、極大点、極小点、変極点などの特徴的な点に対応する濃度を 取得して、その値を当該細胞群の当該薬剤に対する反応性の特徴量として採用する ことちでさる。
[0028] 次に、本発明の実施形態について図 1を参照して説明する。図 1に示すように、本 実施形態では、複数の細胞が配置された空間に、細胞の反応を見るための特定の 物質についての濃度勾配を形成する。そのため、観察部材 100により、細胞を収容 する空間として細胞収容空間 110が形成される。図 1に示す細胞収容空間 110は、 原理の説明をするため、その構造を模式的に示す。具体的な構成については後述 する。
[0029] この細胞収容空間 110に、細胞に無害な液体 120を満たし、この中に、観察したい 細胞 200を、複数個(細胞群)、分散させて配置する。この状態で、細胞の反応を見 るための物質 (以下、刺激物質という) 130を、細胞収容空間 110の一方から注入し て、細胞収容空間 110内に濃度勾配 131を形成させる。この例では、化合物等の刺 激物質 130を溶解した溶液を注入し、細胞収容空間 110に特定の刺激物質 130の 濃度勾配 131が形成された状況において、各細胞 200の状態を、顕微鏡 310を介し て、ディジタルカメラ(例えば、 CCDカメラ) 320により撮像する。なお、本実施形態で は、細胞収容空間 110をシリコンウェハ上にフォトリソグラフ技術を用いて複数個(例 えば、 12個)形成する。そして、それぞれの細胞収容空間 110における濃度勾配の 各位置における細胞の応答性を計測する。この方法により、化合物の細胞に対する 作用の比較を容易に行うことが可能となる。
[0030] 刺激物質に対する細胞の応答性は、濃度に応じて異なる。細胞が示す応答として 、例えば、遺伝子発現、形態変化、生理活性物質の放出など、様々な細胞現象が考 えられる。こられの応答として、細胞は、外部から観察できる何らかの特徴量を示す 場合がある。本発明では、この性質を利用して、細胞群が示す特徴量を細胞群の画 像を解析することにより抽出して、刺激物質に関する細胞の応答に関する情報を、取 得する。本発明の場合、同じ画面内に、濃度勾配が形成される。このため、濃度を変 えては、実験を繰り返すといった試行錯誤による手間を要しない。 1回の実験で濃度 の違 、による応答を観察することができる。
[0031] 細胞収容空間 110は、具体的には、図 3から図 7に示すような、様々な形態の観察 部材 100により実現することができる。この細胞収容空間 110は、細胞群を平面上に 、分散配置させて、外部力 顕微鏡等を介して観察することができるようにするための ものである。そのため、扁平な構造となっている。厚さは、例えば、細胞の大きさ程度 である。
[0032] 図 3に示すものは、シリコンウェハ 115に、フォトリソグラフ技術を用いて、細胞収容 空間 110となる扁平な彫り込みと、その一端側に位置し、細胞収容空間 110に刺激 物質を流入させるソース領域 111、および、細胞収容空間 110の他端側に位置し、 細胞収容空間 110から刺激物質を排出させるドレイン空間 112となる彫り込みとが形 成される。シリコンウェア 115は、ガラス基盤 117上に載せられる。これにより、シリコン ウェハ 115とガラス基盤 117に挟まれる、彫り込まれた空間が、細胞収容空間 110、 ソース領域 111およびドレイン領域 112を構成する。細胞収容空間 110は、細胞が 重ならない程度の深さの扁平な空間(チャネル)となるように形成される。なお、ソース 領域 111およびドレイン領域 112は、あくまでも、刺激物質の注入側と排出側とを便 宜上名付けているにすぎない。対称的な観察部材の場合、ソース領域とドレイン領域 とカ^、ずれの佃 Jになっても差し支えな!/、。
[0033] シリコンウェハ 115の上面側には、液溜を構成する液溜構成部材 116が設けられる 。液溜構成部材 116は、例えば、ステンレススチール等の金属で構成される。この液 溜構成部材 116により、第 1液溜空間 113aおよび第 3液溜空間 113bと、第 2液溜空 間 114aおよび第 4液溜空間 114bとが形成される。第 1液溜空間 113aおよび第 3液 溜空間 113bは、ソース領域 111に連通している。一方、第 2液溜空間 112および第 4液溜空間 114は、ドレイン領域 112に連通している。このような構造であることにより 、液体 120は、細胞収容空間 110を通じて、第 1液溜空間 113aおよび第 3液溜空間 113bと、第 2液溜空間 114aおよび第 4液溜空間 114bとの間で行き来することがで きる。ただし、液体自体は、本実施形態では、流れを作らない方が観察には都合がよ いため、液溜構成部材 116の上方において、第 1液溜空間 113aおよび第 3液溜空 間 113bと、第 2液溜空間 114aおよび第 4液溜空間 114bとを連通させる連通部 118 が設けてある。液体 120を連通部 118まで達するように入れることによって、液体 120 に圧力差による流れができることを抑制することができる。
[0034] 細胞、刺激物質等は、注射器などを用いて注入する。この際、注射針を、ソース領 域 111に達する状態とすることによって、細胞収容空間 110に確実に注入することが できる。
[0035] 図 4に、図 3に示す構成とほぼ同等の構成を有する観察部材 100を示す。この観察 部材 100は、シリコンウェハ 115において形成される彫り込み構造に相違がある他は 、前述した図 3に示すものと同様の構造を有し、同様に機能する。
[0036] 図 5に示す観察部材は、前述した図 3および図 4に示す観察部材において設けら れて 、る第 3液溜空間 113bおよび第 4液溜空間 114bを持たな 、構造となって 、る。 すなわち、第 1液溜空間 113と、第 2液溜空間 114と、ソース領域 111と、細胞収容空 間 110と、ドレイン領域 112と、を有する構造となっている。
[0037] なお、図 3および図 4の観察部材 100において、第 3液溜空間 113bおよび第 4液 溜空間 114bを設けて 、る理由は、注入されて 、る液体の揺れを吸収するためである 。特に、ソース領域 111から離れた位置で、刺激物質を、注射器などを用いて注入す る場合に、刺激物質を押し出す際に生じる圧力の一部を逃がす働きを果たすためと 考えられる。
[0038] 図 6および図 7に示す観察部材は、前述した図 3から図 5に示すものと異なるタイプ のものである。すなわち、図 6に示す観察部材と図 7に示す観察部材とは、液溜空間 の構成と、細胞収容空間 110の構成の仕方において相違がある。第 1液溜空間 113 は、開放されていて、液体の注入、細胞の注入、刺激物質の注入等を行う。一方、第 2液溜空間 114は、開放されていない。また、細胞収容空間 110を構成する部材 11 9として、シリコンではなぐステンレススチールを直接用いている。このようにすること によって、観察部材の生産を簡単化して、製造原価を低下する効果がある。
[0039] 図 6は、横置き型、すなわち、水平に置くタイプの例である。一方、図 7に示す例は 、縦置き型である。図 7に示す例では、粘着性のある細胞の場合、ガラス基盤 117〖こ 付着してしまうため、細胞が落下することはない。
[0040] ここで、濃度勾配の形成方法につ!、て、説明する。
[0041] 前述した図 5に示す観察部材の場合には、細胞収容空間(チャネル) 110と、これ によって連通する第 1液溜空間 113と、第 2液溜空間 114とによって構成される連通 管構造について、内部に適当な液体を満たす。また、第 1液溜空間 113および第 2 液溜空間 114のいずれかの管中に、濃度勾配を形成させる目的の物質を含む溶液 を注入する。これにより、ソース領域 111からドレイン領域 112に向かって物質がチヤ ネル 110中に拡散する。なお、上部の連通部 118間で液体 120を満たすことによつ て、振動や傾きなどの影響でチャネル 110内を液体が激しく移動することによる濃度 勾配の乱れを大幅に軽減することができる。これによつて安定的な濃度勾配を維持 することが可能となる。
[0042] 図 3および図 4に示すように、第 1液溜空間 113aに分岐路として第 3液溜空間 113 bを設け、また、第 2液溜空間 114aに分岐路として第 4液溜空間 114bを設けた観察 部材を用いることもできる。これらの場合には、それぞれ、第 1液溜空間 113aまたは 第 2液溜空間 114aから、目的の刺激物質 130を含む液体を投入する。なお、第 1液 溜空間 113a側力 刺激物質 130の液体を注入した場合、ソース領域 111からチヤネ ル 110を経てドレイン領域に向けて刺激物質が拡散する。一方、第 2液溜空間 114a 側から刺激物質の液体を投入した場合、図に示すドレイン領域 112が、実質的にソ ース領域となり、反対側のソース領域 111が実質的にドレイン領域となる。従って、ソ ース領域とドレイン領域とは、図 3、図 4および図 5に示す観察部材の場合には、便宜 上の名称である。
[0043] なお、図 6および図 7に示す観察部材を用いて濃度勾配を形成することもできる。こ の場合には、開放されている第 1液溜空間 113から刺激物質 130を含む液体を投入 して、ソース領域 111からチャネル 110を経てドレインに向けて、刺激物質 130の濃 度勾配を形成される。 [0044] 濃度勾配がどのように形成されるかについて、図 8を参照して説明する。図 4に示す 観察部材に液体を満たし、これに、特定の刺激物質 130を投入した場合の、拡散が どのように起きているかについて、図 8に示す。この実験では、第 1液溜空間 113aに 、蛍光物質である FITCを添カ卩した。図 8に示すものは、添加後における FITC分子の 拡散のようすを、蛍光観察により測定した結果である。グラフ横軸はチャネル上の位 置を表し、縦軸は蛍光強度を示す。ここでは FITC分子投入後、 1分、 3分、 6分、 9分 および 15分後の FITC分子の濃度勾配を表している。 3分後から、ほぼ直線的な濃度 勾配が形成され、維持されていることがわかる。
[0045] 図 2に、本細胞計測システムの構成の一例を示す。図 2に示す細胞計測システムは 、細胞収容空間 110に収容されている細胞の撮像を行うための撮像装置と、撮像さ れた画像について処理し、目的とする情報を得るための画像処理を行う情報処理装 置とを備える。
[0046] 撮像装置は、本実施形態では、顕微鏡 310、 CCDカメラ 320、ステージ 316、ステ ージ駆動装置 315、および、情報処理装置 350により構成される。一方、情報処理 装置は、入力装置 330および表示装置 340と、コンピュータ 350とを有する。
[0047] コンピュータ 350は、中央演算ユニット(CPU) 351と、メモリ 352と、補助記憶装置 353とを有する。補助記憶装置 353には、当該 CPU351の動作プログラム 360と、デ ータ 370とが格納される。プログラム 360としては、図示していない OSの他、細胞計 測システムにおける計測動作を制御する撮像シーケンス 361と、ステージを制御する ステージ制御 352と、撮像を制御する撮像制御 363と、得られた画像データの解析 を行うデータ解析 364とが含まれる。これらのプログラムは、記憶媒体、ネットワークな ど力も補助記憶装置 353にインストールされたものである。データとしては、画像デー タ 371が代表的なものである。
[0048] 細胞についての撮像は、前述した観察部材により観察用細胞群を用意しておき、コ ンピュータ 350の制御により、測定を行う。測定は、予め定めた撮像シーケンス 361 に従って行う。すなわち、コンピュータ 350は、ステージ制御プログラム 362により、ス テージ駆動装置 315を駆動制御して、観察部材の複数箇所、例えば、 12箇所を、 1 分おき等の一定のタイミングで、撮像するように位置決めを行う。撮像シーケンス 361 は、 XYステージ 316による位置決めと共に、撮像制御プログラム 363により、一定タ イミングで、細胞収容空間 110における細胞群の撮像を行うよう CCDカメラ 320に指 示する。そして、予め定めたタイミングで、 CCDカメラ 320が撮像した画像をメモリ 35 2に取り込む。
[0049] 取り込んだ画像データについて、データ解析プログラム 64により解析処理を行う。
まず、撮像データを、撮像条件と共に、補助記憶装置 353に格納する。
[0050] この後、得られた画像につ!、て、指定された処理を行う。撮像された画像から特徴 量を抽出するには、種々の方法が可能である。例えば、得られた画像について、濃 度勾配に沿って、画面を複数の領域に区画し、区画毎に、それらに含まれる細胞群 が示す特徴量の抽出を行う。区画は、例えば、図 10に示すように、長方形状に定め られる。この区画の大きさは、適宜定めることができる。例えば、表示装置 340条に表 示されている画面上に、入力装置を用いて、枠指定を行うことにより、コンピュータ 35 0に区画を認識させる方法がある。また、区画数を指示することによって、画面を指示 された区画数に均等割して、区画を定める構成とすることも可能である。いずれの場 合でも、コンピュータ 350が認識している区画を人に示すため、長方形の枠を表示画 面上に表示することができる。図 10は、表示を行っている例である。
[0051] なお、図 10においては、説明の便宜上、区画を示す枠の左側に 1から 4の数字を 付記してある。図 10では、画面上方をソース側とし、下方側をドレイン側として表示し ている。従って、図 10に示す例の場合、上力も順に降られている数値は、濃度の濃 い順を表しているともいえる。
[0052] ここで、細胞群が示す特徴量としては、例えば、次のようなものが挙げられる。もちろ ん、これらに限定されるものではない。
(a)各領域に存在する細胞全体の個数に対する、当該領域において特定の性質を 有する細胞の個数の割合
(al)特定の性質が、細胞の脱顆粒である場合
(a2) alで、さらに細胞がマスト細胞である場合
(b)細胞のある特徴量の平均値、中央値、分散、標準偏差など
(bl)細胞のある特徴量力 細胞の運動速度である場合 (b2)細胞のある特徴量力 細胞の運動方向特異性である場合
特徴量の抽出は、図 10に示すように、区画に含まれる細胞の画像のコントラストを 用いて、細胞が膨張ないし破裂したかを調べることにより行う。この他に、大きさ、例え ば、平均直径、面積等について、予め定めた閾値と比較して、閾値を超えたかを調 ベることにより、判断する構成とすることもできる。ここでは、図 9に示すように、刺激物 質により細胞が脱顆粒して、コントラストが変化するという特徴を捉える場合について 説明する。
[0053] まず、細胞群の個数の計数を行う。すなわち、コントラストが大きいもの(例えば、図 9に示す細胞 212)と、小さいもの(図 9に示す細胞 211)とに分けて、それぞれ識別 を行って、その個数を計数する。識別は、種々の手法があるが、例えば、輪郭を求め て、閉形状のものを 1個として計数する。この際、例えば、輪郭線と周囲との明度差に 基づいて、コントラストを調べる。または、画像について、コントラストの大小を、フィル タを使って分離し、分離された画像のそれぞれについて、輪郭線を求めて、細胞の 個数を計数する。いずれによっても、コントラストの高い細胞の個数と、低い細胞の個 数とを計数する。
[0054] また、細胞個数の計数の代替として、細胞の領域が占める画面上の面積を計測す ることも可能である。例えば、コントラストを指標として細胞を識別する場合では、特定 のコントラスト範囲に含まれる画面上の領域について面積を計数することにより、細胞 個数の計数と同等な効果を得ることができる。例えば、特定のコントラストを有する細 胞の割合を評価する場合、画面上を占める細胞の総面積に対する当該性質を有す る細胞の面積の割合をもってして、細胞の総数に対する当該性質を有する細胞の割 合として用いることができる。
[0055] 計数結果は、各区画について、全体の細胞個数に対する低コントラストの細胞の個 数についての割合を求めることによって、例えば、刺激物質に対する脱顆粒率として 把握することができる。さらに、異なるタイミングで複数回、撮像が行われる場合には 、時間の経過と共に、濃度勾配の各濃度において、刺激物質に対する細胞の応答 性を示す情報を生成することができる。図 10は、このようにして生成された情報に基 づいて、細胞群が示す特徴量 (ここでは脱顆粒した細胞の割合、すなわち、刺激物 質の活性強度)を、各濃度について、その時間変化として表したものである。図 10に 示す情報によれば、濃度に応じて活性度が異なること、および、応答性が時間の経 過とともに変わることが読みとれる。
<実施例 >
次に、実施例に基づいて、より具体的に説明する。
[0056] マスト細胞は、ある化合物刺激に対応して、細胞内に保有する顆粒を細胞外に放 出する脱顆粒と呼ばれる反応を起こす。脱顆粒に際しては細胞の形態やコントラスト が変化するため、光学的装置により脱顆粒した細胞を区別することが可能である。こ こではマスト細胞が分散した環境中に、マスト細胞刺激物質の濃度勾配を形成させ、 各位置で脱顆粒を弓 Iき起こした細胞の割合を計算した。
[0057] 実験にあたっては細胞走ィ匕性測定用の器具である TAXIScan (KK chamber)を用い た (参照: Kanegasaki S et al, (2003)J. Immunol. Methods 282, 1-11)。シリコンウエノ、 で形成されたマイクロチャネルとガラス基盤との間隙 (細胞収容空間 110)に、ラット腹 腔より採取したマスト細胞を導入し、マイクロチャネルの一方の端につながるソース領 域 111より、刺激物質としてマスト細胞刺激剤を投入した。ここで刺激剤としては、 100 μ Μの lysoPSと、 2000,1000,200,80 μ g/mlのコンカナパリン Αとを含む緩衝液を 1マイ クロリットル導入した。マスト細胞の脱顆粒は、チャネル中の細胞を顕微鏡で直接観 察することによりモニターした。マスト細胞の脱顆粒は、図 9に示すように形態の変化 やコントラストの変化などを指標とすることによってモニターすることが可能である。ま た、コントラスト変化などを指標とすることにより、画像解析で自動的に脱顆粒の検出 を行うことも可能である。
[0058] 刺激剤は、拡散により濃度勾配を形成するため、画面上の位置によって濃度が異 なる。その各々の地点において個別に脱顆粒活性の強度を測定することにより、各 地点の濃度での活性強度が分かる(図 10)。図 10の右に示した 4つのグラフは、写真 中の 4つのエリアにおいて、脱顆粒した細胞の割合を、時間を追って計測したもので ある (横軸は時間 (min)、縦軸は割合 )。濃度勾配は拡散により形成され、ある程度 時間を置くと脱顆粒細胞の割合が安定する。前述したように、図 10に示す例では、 区画(1)が最も濃度が高ぐ区画 (2)、区画 (3)、区画 (4)の順に、濃度が低くなるよ うな濃度勾配を有する。
[0059] 図 10において、細胞収容空間 110にマスト細胞を配置し、画面上方向より刺激剤 を導入した写真 (左:刺激前、右:刺激後)。画面上方の細胞が脱顆粒してコントラスト が下がり、白くなつていることが確認される。なお、 211が脱顆粒した細胞、 212脱顆 粒しなかった細胞を示す。
[0060] 各地点(区画)で脱顆粒細胞の割合を計算したグラフを図 11に示す。縦軸は脱顆 粒した細胞の割合 、横軸は横軸は刺激剤の濃度 ( g/ml)である。横軸における数 字は、濃度勾配を形成したチャネル (細胞収容空間)上の区画を表す。 1が最も濃度 の高 、点で、 1から 4の順で濃度が薄くなつて 、くように濃度勾配は形成されて!、る。 ここで、 1から 4の番号は、図 10において付した区画の番号(1)から(4)に対応してい る。なお、刺激剤に用いたコンカナノ リン A濃度は、黒四角: 2000 g/ml、白四角: 10 00 μ g/ml, X印: 200 /ζ §/πι1、白丸:80 g/mlである。グラフより、地点 2や 3において 、刺激剤の濃度によって脱顆粒細胞の割合に差異がみられ、かつその値は刺激剤 の濃度と相関している。
[0061] 図 11に示すグラフにおいて、区画(1)および (4)では刺激剤の濃度差がほとんど ないが、区画(2)および(3)では濃度によって反応の違いが明瞭である。例えば、こ の細胞の、刺激強度に対する活性のばらつきを調べたり、試薬が細胞活性に与える 阻害 Z促進活性を確認したりする実験にあたっては、区画 (2)および (3)の領域に 該当する刺激物濃度を採用することによって適切なデータを取ることができる。このよ うに、濃度勾配を利用することにより、一度の試験において連続的に変化した濃度で の細胞応答が観察できるため、最適な条件での比較が可能である。
[0062] 次に、他の実施例について説明する。ここでは、細胞の走ィ匕活性の濃度変化につ いて述べる。
[0063] 細胞の走化活性の濃度変化についても、濃度勾配上の細胞位置を考慮することに より検討が可能である。細胞の走ィ匕性は細胞が特定の因子の濃度勾配を感知して、 濃度の濃い方向へと移動する機能のことである。この走ィ匕活性は、特定の濃度で活 性が最大となり、高い濃度や低い濃度域では活性が減少していぐベルシェイブ型の 活性を示すことが知られている。従来の方法では、濃度に対して活性がベルシェイブ 型であることは、多数の濃度において実験を行うことにより確認することができる。濃 度勾配環境中の各位置で濃度が異なることを利用すれば、容易に活性の濃度特性 を知ることができる。このことを実験で示すにあたっては、細胞走ィ匕性測定用の器具 である TAXIScan (KK chamber)を用いた (方法と材料などについては Kanegasaki S et al, (2003)J. Immunol. Methods 282, 1-11を参照)。
[0064] ここでは、 Jurkat細胞を、細胞収容空間 110中に導入し、そこに SDF-laの濃度勾配 を形成した際の細胞の運動を測定した。濃度勾配を作成する際に用いた SDF-laの 濃度は 10及び 1 nMの 3種類で、各々にっき 1マイクロリットルを注入した。 Jurkat細胞 は SDF-laの濃度勾配方向に走ィ匕性を示したので、走ィ匕活性強度の指標として細胞 運動の濃度勾配方向の速度を採用し、その値をチャネル (細胞収容空間 110)上の 各位置において計測した。その結果を図 12に示す。グラフ横軸はチャネル上の位置 、縦軸は走化活性 (細胞移動速度の濃度勾配方向成分)を表す。濃度勾配はグラフ 右方向より形成したため、右に行くほど濃度が高いことになる。縦軸は細胞運動の濃 度勾配方向の速度 m/sec)を表す。加えた SDF-laの濃度が 1 nMの際には、図 12 (b)に示すように、濃度が高いほど走ィ匕活性も高くなつている。 ΙΟηΜとした場合の結 果をみると、図 12 (a)チャネル上の途中地点に活性のピークがあり、そこより濃度が 濃くなると走ィ匕活性は減少していくことが分かる。これにより確かに走ィ匕活性はべルシ イプであることが分かる。
[0065] 細胞の運動の計測は、例えば、図 10に示す画面を複数のメッシュに区画し、それ ぞれのメッシュ内での細胞の輪郭線の一部に注目し、その輪郭線の位置力 時間共 に、どのように変位するかについて計測し、それらの変位の X成分、 y成分を平均する ことにより、平均的な変位方向と、撮像タイミングとから、平均的な速度を求めることが できる。
[0066] 以上に述べたように、本発明では、細胞収容空間に細胞群を投入すると共に、細 胞群について刺激物質を注入して、その刺激物質の濃度勾配を形成して、撮像し、 得られた画像について、濃度勾配に沿った区画を設けて、画像処理に基づいて、各 区画における細胞群が示す特徴量を抽出するものである。これまでのように、濃度毎 に、時間経過毎に、何度も試行する必要があった計測を、一回の処理で行うことが可 能となる。
[0067] すなわち、細胞の種類ごとでの反応性の差異を測定したり、細胞の条件を変えた場 合での応答性の変異を測定したりする場合には、適切な濃度で実験をすることによつ て良好な測定結果を得ることができる。例えば、ある刺激に対する細胞の応答性を細 胞の種類ごとに比較したり、細胞の条件を変えた際の細胞応答性の変化を比較した りした 、場合、設定した濃度が高すぎたり低すぎたりすると細胞の種類ごとでの差異 が分力りづらぐ良好な実験結果が得られない。
[0068] ここで、細胞の刺激に対する何らかの応答性が、図 13(a)のように表されるとする (横 軸:濃度、縦軸:活性)。細胞が適当に分散した環境中に図 13(b)(横軸:位置、縦軸:濃 度)に示すような濃度勾配を形成した場合、濃度勾配中の各位置における細胞応答 性は図 13(c)(横軸:位置、縦軸:活性)のようになる。通常の実験では、多数の濃度を 試験する場合、濃度を段階的にふって、各々の濃度における反応をみるため、試験 される濃度が断続的となる。さらに、多数の濃度での反応を確認するためには、その 数だけの試験を独立に行なう必要がある。濃度勾配を利用すると、連続的な濃度範 囲の各濃度における細胞応答を、一つの独立な試験で確認することが可能となる。こ れにより独立な試験の個数が削減されて実験が簡便となる。
[0069] なお、細胞の活性評価につ!、ては、細胞の形態変化や運動性、ある!、は蛍光プロ ーブなどを用いた細胞内分子の局在変化、遺伝子発現など、顕微鏡上で評価可能 なあらゆる生命現象が対象となる。

Claims

請求の範囲
[1] 撮像装置により細胞群の画像を撮像して画像を情報処理装置に取り込み、情報処 理装置にお!、て、得られた画像に基づ!/、て細胞にっ 、ての計測を行う細胞計測方 法において、
細胞群を収容する細胞収容空間に液体を満たして、
前記細胞収容空間に細胞群を配置し、
前記細胞収容空間の液体に特定の物質を供給して、当該細胞収容空間の一端か ら他端に向力つて液体中に特定物質の濃度勾配を形成させ、
前記細胞収容空間内の細胞群を撮像装置により撮像して、情報処理装置に取り込 み、
得られた画像から細胞特徴量と特定物質の濃度との対応関係を示す情報を生成 すること
を特徴とする細胞計測方法。
[2] 請求項 1に記載の細胞計測方法であって、
濃度勾配は、蛍光物質が形成する濃度勾配を蛍光観察によって測定すること を特徴とする細胞計測方法。
[3] 請求項 1および 2の 、ずれか一項に記載の細胞計測方法であって、
細胞特徴量が、細胞の脱顆粒、運動速度、運動方向特異性、大きさ、平均直径、 面積、コントラスト、形態変化、細胞内分子の局在変化、および、遺伝子発現のいず れかであることを特徴とする細胞計測方法。
[4] 請求項 3に記載の細胞計測方法であって、
細胞特徴量は、画像より輪郭を求めて、閉形状のものを 1個の細胞として識別する ことによって、その識別された細胞力も得られる特徴量であることを特徴とする細胞計 測方法。
[5] 撮像装置により細胞群の画像を撮像して画像を情報処理装置に取り込み、情報処 理装置にお!、て、得られた画像に基づ!、て細胞にっ 、ての計測を行う細胞計測方 法において、
細胞群を収容する細胞収容空間に液体を満たして、 前記細胞収容空間に細胞群を配置し、
前記細胞収容空間の液体に特定の物質を供給して、当該細胞収容空間の一端か ら他端に向力つて液体中に特定物質の濃度勾配を形成させ、
前記細胞収容空間内の細胞群を撮像装置により撮像して、情報処理装置に取り込 み、
情報処理装置において、
得られた画像について、前記濃度勾配に沿って複数の領域に区画し、各領域にお ける画像から特徴量を抽出し、
前記抽出された特徴量と濃度勾配との対応関係を示す情報を生成すること を特徴とする細胞計測方法。
[6] 請求項 5に記載の細胞計測方法お!/、て、
前記特徴量は、細胞の画像が示すコントラストの違いによって抽出されるものである こと、を特徴とする細胞計測方法。
[7] 請求項 6に記載の細胞計測方法にお 、て、
前記各領域における画像から、各領域に存在する細胞全体の個数に対する、当該 領域にお 1、て特定の性質を有する細胞の個数の割合を、特徴量として抽出すること 、を特徴とする細胞計測方法。
[8] 請求項 7に記載の細胞計測方法にお 、て、
前記特定の性質が、細胞の脱顆粒である細胞計測方法。
[9] 請求項 8に記載の細胞計測方法にお 、て、
前記細胞がマスト細胞である細胞計測方法。
[10] 請求項 6に記載の細胞計測方法にお 、て、
前記各領域における画像から、各領域に存在する細胞全体の運動についての、平 均値、中央値、分散および標準偏差のいずれかの指標を、特徴量として抽出するこ と、を特徴とする細胞計測方法。
[11] 請求項 10に記載の細胞計測方法において、
前記特徴量として抽出されるものが細胞の運動速度についての指標である細胞計 測方法。
[12] 請求項 10に記載の細胞計測方法にお ヽて、
前記特徴量として抽出されるものが細胞の運動方向特異性についての指標である 細胞計測方法。
[13] 細胞計測方法において、
観察時に、観察すべき細胞群を収容する細胞収容領域と、前記細胞収容領域を挟 んで連通し、使用時に、それぞれに液体が入れられ、前記細胞収容領域を液体で満 たす、第 1液溜空間および第 2液溜空間と、を有する細胞観察支援装置と、使用時に 、前記細胞収容領域に収容されている細胞群の画像を取得し、取得した画像に基づ いて、細胞に関する情報を収集する情報処理装置と、を用い、
前記観察すべき細胞群を配置し、
第 1液溜空間および第 2液溜空間と、前記細胞収容領域とに液体を満たし、かつ、 前記第 1液溜空間の液体中に、前記細胞を刺激する細胞刺激物を添加した後、 前記撮像装置により、異なるタイミングで複数回、細胞群の画像を取得する処理と、 各回に取得した前記画像について、前記画像に表れる細胞収容領域を、前記第 1 の液溜空間側力 前記第 2の液溜空間側に沿って複数の区画に分け、それぞれの 区画に含まれる細胞の総個数を計数すると共に、予め定めた特徴量が表れている特 定の細胞を識別して、その個数を計数する処理と、
前記計数結果に基づいて、それぞれの区画について、それぞれの区画内で計数さ れた総個数に対する、特徴量が表れている特定の細胞個数の割合を算出する処理 と、
前記特徴量が表れている特定の細胞個数の割合に関する経時的変化を示す情報 を生成する処理と、
指示に応じて、前記経時的変化を示す情報を出力する処理と、を行うことを特徴と する細胞計測方法。
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