WO2000054789A1 - Fractions membranaires bacteriennes a effet adjuvant - Google Patents

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Christine Libon
Nathalie Corvaia
Thien Ngoc N'guyen
Alain Beck
Jean-Yves Bonnefoy
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    • C12N2760/18534—Use of virus or viral component as vaccine, e.g. live-attenuated or inactivated virus, VLP, viral protein

Definitions

  • the present invention relates to the use of a membrane fraction of gram negative bacteria, in particular of Klebsiella pneumoniae, associated with an antigen or hapten for the preparation of a pharmaceutical composition intended to orient the immune response towards a Thl type response and / or of the mixed Thl / Th2 type directed against said antigen or hapten.
  • the invention further comprises methods for preparing said membrane fractions and the pharmaceutical compositions containing them and their applications to the prevention and treatment of infectious diseases, in particular paramyxovirus infections such as RSV, and cancers, in particular those of which tumors are associated with tumor antigens.
  • Vaccination is an effective way to prevent or reduce infections, in particular.
  • the success of vaccination campaigns in this area has made it possible to extend the concept of vaccines to the fields of autoimmune diseases, cancer and fertility.
  • vaccinating antigens are not always capable of inducing a rapid and sustained antibody response on their own, which requires the presence of adjuvants, that is to say of compounds which help them (from the Latin word adjuvare: to help) to induce such responses.
  • the adjuvants constitute a group of various compounds as for their structure and their origin.
  • water-in-oil emulsions incomplete Freund's adjuvant
  • oil-in-water compounds of bacterial origin such as lipopolysaccharide derivatives of Gram negative bacteria, as well as salts aluminum.
  • aluminum salts are used in humans as an adjuvant for vaccine preparations.
  • Th lymphocytes Two types of Th lymphocytes can be distinguished according to the profile of cytokines produced: type 1 Th lymphocytes producing IFN- ⁇ and 1TL-2 and promoting the formation of IgG2a in mice, and type 2 Th lymphocytes producing 1TL-4, IL-5 and IL-10 with formation of IgGl in mice (Mosmann, TR and Sad S. Immunol. Today 1996, 17: 138).
  • Thl / Th2 a mixed Thl / Th2 response for which the Thl response is close to or greater than Th2 response.
  • the authors of the present invention have demonstrated specific properties of the membrane fraction of a gram-negative bacterium Klebsiella pneumoniae (called FMKp), in particular membrane fractions obtained by the methods as described below in the examples.
  • FMKp membrane fraction associated with an antigen not only had the capacity to increase the antibody response directed against said antigen but also to redirect the cytokinic response towards a Th1 / Th2 profile, thus corresponding to the activity particular adjuvant sought, regardless of the mode of administration of said membrane fractions.
  • the subject of the present invention is the use of a membrane fraction of gram-negative bacteria, in particular of Klebsiella pneumoniae, associated with an antigen or hapten to orient the immune response towards a Thl type and / or mixed type response.
  • Thl / Th2 directed against said antigen or hapten, or for the preparation of a pharmaceutical composition intended to orient the immune response to a Thl and / or mixed Thl / Th2 type response directed against said antigen or hapten.
  • Thl / Th2 in particular an orientation of the immune response is preferred which promotes the induction of a Thl response compared to the Thl / Th2 response obtained with the alum adjuvant.
  • Thl / Th2 more particularly preferred is an orientation of the immune response which increases the titer of IgG2a antibodies directed against the associated antigen by a factor of at least 10, preferably at least 25, 50 and 100 relative to the titer in IgG2a obtained with the alum adjuvant.
  • the immune response is oriented towards a Th1 and / or mixed Thl / Th2 type response in which the Th1 response is close to or greater than the Th2 response.
  • neighbor is intended to denote a response which, expressed as the IgG2a antibody directed against the associated antigen, is at least equal to 0.5 times, preferably at least equal to 0.75 times, the titer in IgG1 antibody directed against said antigen, with a titer of IgG antibody directed against the associated antigen neighboring or greater than the titer of IgG antibody directed against the associated antigen obtained with the adjuvant alum or Freund.
  • the invention also relates to the use according to the invention, characterized in that the membrane fraction comprises at least membrane fractions of two different strains of bacteria.
  • bacterial membrane fraction is intended to denote in the present invention any purified or partially purified membrane fraction or extract obtained from a culture of said bacteria and the preparation process of which comprises at least one step of lysis of the bacteria obtained after culture. and a step of separating the fraction containing the membranes of said bacteria from the total lysate obtained after the lysis step, in particular by centrifugation or filtration.
  • membrane fraction of bacteria when said bacterium is Klebsiella pneumoniae is also meant in the present invention protein P40, active fraction of the membrane fraction of Klebsiella pneumoniae, of amino acid sequence SEQ ID No. 2, or one of its fragments.
  • the membrane fractions can be prepared according to methods known to those skilled in the art such as for example the method described by by Haeuw J.F. et al. (Eur. J. Biochem, 255, 446-454, 1998).
  • the invention relates to a use according to the invention, characterized in that the membrane fraction is prepared by a process comprising the following stages: a) the culture of said bacteria in a culture medium allowing their growth followed by centrifugation of said culture; b) if necessary, deactivation of the lyric enzymes from the pellet of bacteria obtained in step a), then centrifugation of the suspension obtained; c) extraction and elimination of non-membrane proteins and nucleic acids from the pellet obtained in step a) or b) by at least one washing cycle of the pellet in an extraction solution; d) digestion of the membrane pellet obtained in step c) in the presence of proteolytic enzymes followed by centrifugation; e) at least one washing cycle of the pellet obtained in step d) in a physiological solution and / or in distilled water; and f) ultrasonication of the pellet obtained in step e).
  • Step b) of deactivation of the lytic enzymes from the pellet of bacteria obtained in step a) can be carried out by any known methods of deactivation of enzymes, such as in particular by heating the bacterial pellet resuspended at a temperature preferably close to 100 ° C., or by addition of inhibitor of the activity of these enzymes.
  • Step c) of extraction and elimination of the non-membrane proteins and of the nucleic acids from the pellet obtained in step a) or b) can be carried out for example by at least one washing cycle of the pellet in a solution d extraction corresponding to the addition of a hypertonic solution (extraction solution), preferably a saline solution of molarity close to 1 M, followed after a contact time sufficient for the desired effect of a centrifugation of the suspension obtained and the elimination of supernatant obtained after said centrifugation, this washing cycle can be repeated several times.
  • a hypertonic solution extraction solution
  • this washing cycle can be repeated several times.
  • Step d) of digestion of the membrane pellet obtained in step c) can be carried out in the presence of a solution of proteolytic enzymes such as for example trypsin, chymotrypsin or any enzyme with known proteolytic activity, the conditions of the reaction, pH of the solution, temperature and duration of the reaction, preferably being adjusted to optimal conditions for the activity of the chosen enzyme (s), followed by centrifugation, this digestion cycle being able to be reproduced several times with the same enzyme, the same combination of enzymes or with a different enzyme for each digestion cycle performed.
  • proteolytic enzymes such as for example trypsin, chymotrypsin or any enzyme with known proteolytic activity
  • Step e) of washing the pellet obtained in step d) is carried out by taking up the pellet in a physiological solution or in distilled water followed, after sufficient contact time, by centrifugation, this cycle of washing can be repeated several times.
  • step f) of ultrasonication of the pellet has the objective in particular of disintegrating and homogenizing the membrane fraction obtained at the end of step e).
  • the ultrasonication conditions (duration and power) will be determined by a person skilled in the art depending for example on the amount of membrane fraction to be treated.
  • the invention relates to a use according to the invention, characterized in that the membrane fraction is prepared by a process comprising the following steps: a) the culture of said bacteria in a culture medium allowing their growth followed, where appropriate, by centrifugation; b) freezing the culture medium or the pellet obtained in step a) followed by thawing and drying of the cells; c) elimination, by means of a DNase, of the nucleic acids from the dry cells obtained in step b) resuspended; d) grinding the cells obtained in step c) and clarifying the suspension obtained; e) precipitation in an acid medium of the suspension obtained in step d) and elimination of the pellet; f) neutralization of the supernatant obtained in step e) containing the membrane suspension, followed by dialysis and concentration of the membrane suspension; and g) sterilization of the concentrated membrane suspension obtained in step f).
  • the thawing conditions in step b) of the process below will of course be determined by those skilled in the art depending on the amount
  • step c) the removal of the nucleic acids is carried out for example by the addition of a DNase, at a final concentration of 5 mg / ml of a suspension of cells at a concentration equivalent to 5% dry cells.
  • the grinding of the cells obtained in step c) can be carried out using any system or apparatus known to those skilled in the art for grinding cells such as presses or preferably such as grinding in a Manton loop Gaulinet for 30 minutes.
  • the clarification of the suspension obtained after grinding can be carried out using any system or apparatus known to those skilled in the art for the clarification of bacterial cell shreds such as the Sharpless system.
  • Stage e) of precipitation in acid medium of the suspension obtained in stage d) can be carried out for example with acetic acid.
  • the precipitation is followed by the elimination of the pellet by means of a Sharpless type system and by the recovery of the supernatant.
  • Step f) consists of a step in which the supernatant, obtained after precipitation in an acid medium, is neutralized, diluted, dialysed and then concentrated.
  • the last step consists of a step of sterilizing the membrane fraction concentrate obtained in the previous step, for example by heating at 121 ° C for about 35 minutes.
  • the invention relates in particular to the use according to the invention, characterized in that the membrane fraction is the P40 protein of Klebsiella pneumoniae of sequence SEQ ID No. 2, or one of its fragments.
  • fragment of the P40 protein is intended to denote in particular any fragment of the amino acid sequence included in the amino acid sequence of the P40 protein capable of increasing a non-specific immune response and / or capable of inducing a response anti-tumor immune system, and comprising at least 5 amino acids, preferably at least 10 amino acids or more preferably at least 15 amino acids.
  • said P40 protein, or its fragments can be obtained by chemical synthesis or in the form of recombinant peptides.
  • the invention relates in particular to the use according to the invention, characterized in that said antigen or hapten is chosen from antigens or haptens specific for an infectious agent, such as a virus, a bacterium, a fungus or a parasite, or among antigens associated with tumor cells.
  • an infectious agent such as a virus, a bacterium, a fungus or a parasite
  • said antigens or haptens are preferably chosen from peptides, lipopeptides, polysaccharides, oligosaccharides, nucleic acids, lipids or any compound capable of specifically directing the immune response towards a Thl type response and / or of the mixed Thl / Th2 type against an antigen or hapten specific for an infectious agent or an antigen associated with a tumor cell.
  • said antigen or hapten when it is of peptide nature can be obtained by chemical or recombinant synthesis.
  • the invention further comprises the use according to the invention, characterized in that said antigen or hapten is coupled or mixed with said membrane fraction, in particular coupled by covalent bond with at least one of the compounds contained in the membrane fraction.
  • the invention comprises the use according to the invention, characterized in that said antigen or hapten is covalently coupled to a support peptide to form a complex capable of specifically binding to mammalian serum albumin , preferably said support peptide is a peptide fragment derived from the G protein of the streptococcus, in particular the C-terminal fragment called BB.
  • said complex can be prepared by genetic recombination.
  • the chimeric or hybrid complex can be produced by recombinant DNA techniques by insertion or addition to a DNA sequence coding for said peptide fragment of the streptococcus protein G of a sequence coding for said antigen or hapten of a protein nature.
  • the methods for synthesizing hybrid molecules include the methods used in genetic engineering to construct hybrid polynucleotides encoding the desired polypeptide sequences.
  • the coupling by covalent bond can be achieved by chemical synthesis.
  • one or more connecting elements may be introduced into at least one of the compounds contained in the membrane fraction and / or in said antigen or hapten to facilitate chemical coupling.
  • the said linking element introduced is an amino acid.
  • the covalent coupling between said compound of the membrane fraction and said antigen or hapten according to the invention can be carried out at the N- or C- terminal end of said compound of the membrane fraction or of said antigen or hapten, if these are by example of peptide nature.
  • the bifunctional reagents allowing the coupling will be determined according to the end chosen to effect the coupling and to the nature of the said antigen or hapten to be coupled.
  • the invention also includes the use according to the invention, characterized in that the coupling between said antigen, hapten or the complex and at least one of the compounds contained in the membrane fraction is carried out by genetic recombination when said antigen, hapten , or complex and said membrane compound are peptide in nature.
  • the coupling between said antigen, hapten or complex, and at least one of the compounds contained in the membrane fraction can in fact be achieved by genetic recombination. It is possible, for example, before extracting its membrane fraction therefrom, beforehand transforming said gram-negative bacteria with a vector containing a nucleic construct coding for an antigen of interest or said complex, so that the bacterium thus transformed expresses antigen of interest or said complex attached to the membrane or anchored in the membrane of said bacteria.
  • Such methods of expressing recombinant proteins attached to the membrane are well known and require, for example, the presence of a specific regulatory sequence such as a signal peptide type sequence.
  • a subject of the invention is also the use according to the invention, characterized in that the pharmaceutical composition also comprises an agent making it possible to convey said membrane fraction associated with said antigen, hapten or complex in a form making it possible to improve its stability and / or its immunogenicity, such as in the form of an oil-in-water or water-in-oil emulsion, or in the form of a particle of liposome, microsphere, nanosphere type or any type of structure allowing the encapsulation and the presentation in particulate form of said membrane fraction associated with said antigen, hapten or complex.
  • an agent making it possible to convey said membrane fraction associated with said antigen, hapten or complex in a form making it possible to improve its stability and / or its immunogenicity, such as in the form of an oil-in-water or water-in-oil emulsion, or in the form of a particle of liposome, microsphere, nanosphere type or any type of structure allowing the encapsulation and the presentation in particulate form of said membrane fraction associated
  • the invention also relates to the use according to the invention, characterized in that said agent is chosen from aluminum salts, calcium salts, compounds of plant origin such as Quil A or saponin, or compounds of bacterial origin such as cholera, pertussis, tetanus toxoid or heat-labile toxin derivatives of E. coli.
  • said agent is chosen from aluminum salts, calcium salts, compounds of plant origin such as Quil A or saponin, or compounds of bacterial origin such as cholera, pertussis, tetanus toxoid or heat-labile toxin derivatives of E. coli.
  • the pharmaceutical composition further comprises an agent making it possible to regulate the immune response induced by said membrane fraction associated with said antigen, hapten or complex.
  • an agent making it possible to regulate the immune response induced by said membrane fraction associated with said antigen, hapten or complex.
  • regulatory agents preference is given in particular to cytokines, growth factors, hormones or cellular components such as nucleic acids, a protein of the family of heat shock proteins or ribosomes.
  • a subject of the invention is also the use according to the invention, for the preparation of a pharmaceutical composition intended for the prevention or treatment of infectious diseases of viral, bacterial, fungal or parasitic origin, or for the prevention or treatment of cancers, in particular cancers whose tumors are associated with tumor antigens.
  • infectious diseases of viral origin particular preference is given to infectious diseases caused by the paramyxoviruses, in particular by the parainfluenzae virus and more preferably by the respiratory syncytial virus (RSV).
  • infectious diseases caused by the paramyxoviruses in particular by the parainfluenzae virus and more preferably by the respiratory syncytial virus (RSV).
  • RSV respiratory syncytial virus
  • the use according to the invention is characterized in that said antigen associated with the membrane fraction comprises the peptide G2Na, fragment of the protein G of the virus of amino acid sequence SEQ ID N ° 4, a peptide homologous to G2Na, the sequence of which has an identity rate of at least 80%, preferably 90%, 95% and 99%, after alignment with the sequence SEQ ID No. 4, or the peptide G2Na or the one of its counterparts, coupled by covalent bond to a C-terminal fragment (BB) of the streptococcal protein G to form a complex capable of binding to mammalian serum albumin, BB peptide as described in the documents Power et al.
  • BB C-terminal fragment
  • percentage, degree or level of identity between two nucleic acid or amino acid sequences within the meaning of the present invention is meant a percentage of identical nucleotides or amino acid residues between the two sequences to compare, obtained after the best alignment, this percentage being purely statistical and the differences between the two sequences being distributed randomly and over their entire length. Sequence comparisons between two nucleic acid or amino acid sequences are traditionally carried out by comparing these sequences after having optimally aligned them, said comparison being carried out by segment or by "comparison window" to identify and compare the regions. sequence similarity locale.
  • the optimal alignment of the sequences for comparison can be achieved, besides manually, by means of the local homology algorithm of Smith and Waterman (1981) [Ad. App. Math. 2: 482], using the local homology algorithm of Neddleman and Wunsch (1970) [J. Mol. Biol. 48: 443], using the similarity search method of Pearson and Lipman (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 2444], using computer software using these algorithms (GAP, BESTFIT, FASTA and TFASTA in the Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI, or by BLAST comparison software N or BLAST P).
  • the percentage of identity between two nucleic acid or amino acid sequences is determined by comparing these two optimally aligned sequences per comparison window in which the region of the nucleic acid or amino acid sequence to be compared. may include additions or deletions with respect to the reference sequence for optimal alignment between these two sequences.
  • the percentage of identity is calculated by determining the number of identical positions for which the nucleotide or the amino acid residue is identical between the two sequences, by dividing this number of identical positions by the total number of positions in the comparison window. and multiplying the result obtained by 100 to obtain the percentage of identity between these two sequences.
  • BLAST program "BLAST 2 sequences" available on the website http: // www. ncbi. nlm. nih.
  • the invention relates to a process for the preparation of a membrane fraction of gram-negative bacteria, in particular Klebsiella pneumoniae, characterized in that it comprises the following steps: a) the culture of said bacteria in a medium culture allowing their growth followed by centrifugation of said culture; b) if necessary, deactivation of the lytic enzymes from the pellet of bacteria obtained in step a), then centrifugation of the suspension obtained; c) extraction and elimination of non-membrane proteins and nucleic acids from the pellet obtained in step a) or b) by at least one washing cycle of the pellet in an extraction solution; d) digestion of the membrane pellet obtained in step c) in the presence of protease enzymes followed by centrifugation; e) at least one washing cycle of the pellet obtained in step d) in a physiological solution and / or in distilled water; and f) ultrasonication of the pellet obtained in step e).
  • the invention also includes the process for the preparation of a membrane fraction of gram negative bacteria, in particular Klebsiella pneumoniae, characterized in that it comprises the following stages: a) the culture of said bacteria in a culture medium allowing their continued growth where appropriate, centrifugation; b) freezing the culture medium or the pellet obtained in step a) followed by thawing and drying of the cells; c) elimination, by means of a DNase, of the nucleic acids from the dry cells obtained in step b) resuspended; d) grinding the cells obtained in step c) and clarifying the suspension obtained; e) precipitation in an acid medium of the suspension obtained in step d) and elimination of the pellet; f) neutralization of the supernatant obtained in step e) containing the membrane suspension, followed by dialysis and concentration of the membrane suspension; and g) sterilization of the concentrated membrane suspension obtained in step f).
  • proteogly cane titer of the membrane fractions capable of being obtained by said methods active principle of FMKp, represented by the sum of the galactose and protein contents, is preferably understood:
  • this titer will be: - for galactose: between 1.6 g / 1 and 2.6 g / 1;
  • the invention further relates to the pharmaceutical compositions comprising a membrane fraction capable of being obtained by the methods according to the invention, preferably the said pharmaceutical compositions, further comprising an antigen, hapten or a complex, as defined above, associated to said membrane fraction, such as in particular the viral antigens or complexes specific to paramyxovirus, or the antigens associated with tumor cells.
  • compositions according to the invention may also comprise agents such as vehicles, regulatory agents defined above.
  • the pharmaceutical composition according to the invention is characterized in that said antigen associated with the membrane fraction comprises the peptide G2Na of sequence SEQ ID No. 4 of the respiratory syncytial virus, one of its counterparts as defined above , or said G2Na peptide, or one of its homologs, coupled by covalent bond to a C-terminal fragment (BB) of the Streptococcus G protein to form a complex capable of binding to mammalian serum albumin.
  • BB C-terminal fragment
  • FIG. 2 BBG2Na adjuvanted by FMKp -Titles IgGl and IgG2a anti-G2Na.
  • Figure 3 BBG2Na adjuvanted by FMKp - Study of protection.
  • Figure 4 Adjuvant effect of FMKp vis-à-vis Immugrip (influenza vaccine).
  • the extraction of the membranes of K. pneumoniae 1145 from the centrifugation pellet of the step is preferably preceded by a step of destruction of the lytic enzymes of the cellular components contained in the pellet, for example by heating to 100 ° C. of that -this, possibly after re-solution.
  • the actual extraction of the membranes from the centrifugation pellet is preferably carried out by treatment of the cellular components of the pellet, after a possible destruction of the lytic enzymes, using a saline solution, for example sodium chloride 1 M, one or more times, then centrifugation, preferably at 20,000 g, of the suspension obtained, the supernatant from this centrifugation, which is eliminated, contains the non-membrane impurities such as proteins and nucleic acids, while the pellet contains membranes.
  • a saline solution for example sodium chloride 1 M
  • the membranes are digested in the presence of proteolytic enzymes, preferably trypsin and chymotrypsin, in solution at pH 8 at 37 ° C for 4 hours. After digestion, the solution is homogenized by ultrasonication. The product thus obtained constitutes the membrane fraction called FMKp.
  • proteolytic enzymes preferably trypsin and chymotrypsin
  • This fraction is prepared from the pellet obtained by centrifugation at 40,000 g for 20 minutes. Said pellet is resuspended in physiological saline and this suspension is brought for 10 minutes to 100 ° C. in a boiling water bath to deactivate the lytic enzymes. After cooling, centrifugation is carried out for 30 min at 20,000 g. The pellet obtained is extracted twice with 1M NaCl to remove the proteins and the nucleic acids. The membranes are collected by centrifugation for 30 minutes at 20,000 g.
  • a constant volume dialysis is then carried out on PUF 100 up to 800 ⁇ cm, followed by a concentration of the membrane suspension (SM) thus obtained, at 11 1 / kg of dry cells.
  • the SM is then autoclaved at + 121 ° C for 35 min which can be stored at + 4 ° C for 6 weeks.
  • Characteristics of FMKp By definition, the titer in cane proteogly, active principle of FMKp, is equal to the sum of the galactose and protein contents. - Galactose: on average 2.2 g 11.
  • BBG2Na is a recombinant protein produced in E. coll. It consists of the peptide G2Na of sequence SEQ ID No. 4, the fragment of protein G of the Respiratory Syncytial Virus (RSV) type A ranging from residue 130 to residue 230, fused to BB, a fragment of the G protein of Streptococci , having the ability to bind to serum albumin.
  • RSV Respiratory Syncytial Virus
  • BBG2Na is an RSV vaccine (Power U. Virology 1997, 230: 155-166).
  • BALB / c mice receive 2 injections subcutaneously of 20 ⁇ g of
  • BBG2Na and different amounts of FMKp Blood samples are taken on D28 and the serum antibody titers are determined by ELISA with G2Na in solid phase. The results obtained are illustrated in FIG. 1. Surprisingly, they show that FMKp significantly increases the IgG anti-G2Na response; the anti-G2Na IgG titer achieved is similar to that induced by alum or Freund's adjuvant. The effect is dose-dependent: it is observed from 5 ⁇ g of FMKp, maximum from 50 ⁇ g of FMKp and remains stable with 100 ⁇ g of FMKp. FMKp is therefore a potential adjuvant for BBG2Na.
  • FMKp makes it possible to redirect the antibody response without affecting the ability to protect mice against a challenge to VRS-A.
  • Example 3 Adjuvant Effect of FMKp on an Inactivated Virus (Influenza Vaccine)
  • BALB / c mice receive a single injection of 0.01 ⁇ g of Immugrip TM (influenza vaccine marketed by INAVA Laboratories), and different amounts of FMKp. The products are co-administered. The injection is made subcutaneously on D0. Blood samples are taken on D7, D14 and D21.
  • the anti-Immugrip serum IgG antibody titer is by ELISA with Immugrip at 2 ⁇ g / ml in solid phase. The results presented (FIG.
  • FMKp significantly increases the anti-Immugrip antibody titer and this from the lowest dose of FMKp, namely 0.1 ⁇ g.
  • the adjuvant effect is dose-dependent. It is interesting to note that the presence of FMKp induces the generation of an earlier antibody response, observed from D7, compared to the non-adjuvanted Immugrip control. This effect is not obtained with the reference adjuvant, the complete Freund's adjuvant (CFA).
  • CFA complete Freund's adjuvant

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Abstract

La présente invention concerne l'utilisation d'une fraction membranaire de bactéries à gram négatif, notamment de Klebsiella pneumoniae, associée à un antigène ou haptène pour la préparation d'une composition pharmaceutique destinée à orienter la réponse immunitaire vers une réponse de type Th1 et/ou de type mixte Th1/Th2 dirigée contre ledit antigène ou haptène. L'invention comprend en outre des procédés de préparation desdites fractions membranaires et les compositions pharmaceutiques les contenant et leurs applications à la prévention et le traitement de maladies infectieuses, en particulier les infections à paramyxovirus telles que le VRS, et les cancers, notamment ceux dont les tumeurs sont associées à des antigènes tumoraux.

Description

FRACTIONS MEMBRANAIRES BACTERIENNES A EFFET ADJUVANT
La présente invention concerne l'utilisation d'une fraction membranaire de bactéries à gram négatif, notamment de Klebsiella pneumoniae, associée à un antigène ou haptène pour la préparation d'une composition pharmaceutique destinée à orienter la réponse immunitaire vers une réponse de type Thl et/ou de type mixte Thl/Th2 dirigée contre ledit antigène ou haptène. L'invention comprend en outre des procédés de préparation desdites fractions membranaires et les compositions pharmaceutiques les contenant et leurs applications à la prévention et au traitement de maladies infectieuses, en particulier les infections à paramyxovirus telles que le VRS, et les cancers, notamment ceux dont les tumeurs sont associées à des antigènes tumoraux.
La vaccination est un moyen efficace de prévenir ou de réduire notamment les infections. Le succès des campagnes de vaccination dans ce domaine a permis d'étendre le concept des vaccins aux domaines des maladies auto-immunes, du cancer et de la fertilité. En revanche, les antigènes vaccinants ne sont pas toujours capables d'induire seuls une réponse anticorps rapide et soutenue, ce qui requiert la présence d'adjuvants, c'est-à-dire de composés qui les aident (du latin adjuvare : aider) à induire de telles réponses.
Les adjuvants constituent un groupe de composés variés quant à leur structure et leur origine. Ainsi l'on trouve, entre autres, dans cette catégorie aussi bien des émulsions eau dans huile (adjuvant incomplet de Freund) ou huile dans eau, des composés d'origine bactérienne comme des dérivés du lipopolysaccharide des bactéries à Gram négatif, que des sels d'aluminium. A l'heure actuelle, seuls les sels d'aluminium sont employés chez l' homme comme adjuvant de préparations vaccinales.
La mise en place d'une réponse anticorps dirigée contre un antigène nécessite une série d'événements complexes. Elle met en jeu des cellules présentant l'antigène, des lymphocytes T régulateurs (Th pour T "helper") et des lymphocytes B producteurs d'anticorps. Deux types de lymphocytes Th peuvent être distingués selon le profil de cytokines produites : lymphocytes Th de type 1 produisant de l'IFN-γ et de 1TL-2 et favorisant la formation d'IgG2a chez la souris, et lymphocytes Th de type 2 produisant de 1TL-4, IL-5 et IL-10 avec formation d'IgGl chez la souris (Mosmann, T.R. and Sad S. Immunol. Today 1996, 17:138). Par ailleurs, il a été montré que, pour un même antigène donné, c'est l'adjuvant qui oriente vers l'isotype majoritaire lors de la réponse anticorps (Toellner K.-M. et al. J. Exp. Med. 1998, 187: 1193). Ainsi, il est connu que les sels d'aluminium, comme l'Alhydrogel, induisent chez la souris une réponse essentiellement de type Th2 et favorisent la formation d'IgGl voire d'IgE (Allison A.C. In Vaccine design - The rôle of cytokine networks Vol. 293, 1-9 Plénum Press 1997), ce qui peut poser des problèmes chez des sujets à terrain allergique. De plus, en fonction de la cible thérapeutique visée, une réponse de type Thl ou mixte (Thl/Th2) peut être désirée.
Ainsi, il existe aujourd'hui un besoin de disposer de nouveaux adjuvants capables d'induire une réponse immune de type Thl ou mixte (Thl/Th2), de préférence une réponse mixte Thl/Th2 pour laquelle la réponse Thl est voisine ou supérieure à la réponse Th2.
De manière surprenante, les auteurs de la présente invention ont mis en évidence des propriétés particulières de la fraction membranaire d'une bactérie à gram négatif Klebsiella pneumoniae (dénommée FMKp), notamment des fractions membranaires obtenues par les procédés tels que décrits ci-après dans les exemples. Les auteurs ont en effet découvert que ladite fraction membranaire FMKp associée à un antigène avait non seulement la capacité d'augmenter la réponse anticorps dirigée contre ledit antigène mais également de réorienter la réponse cytokinique vers un profil Thl/Th2, correspondant ainsi à l'activité adjuvante particulière recherchée, et ce quel que soit le mode d'administration desdites fractions membranaires.
Ainsi, la présente invention a pour objet l'utilisation d'une fraction membranaire de bactéries à gram négatif, notamment de Klebsiella pneumoniae, associée à un antigène ou haptène pour orienter la réponse immunitaire vers une réponse de type Thl et/ou de type mixte Thl/Th2 dirigée contre ledit antigène ou haptène, ou pour la préparation d'une composition pharmaceutique destinée à orienter la réponse immunitaire vers une réponse de type Thl et/ou de type mixte Thl/Th2 dirigée contre ledit antigène ou haptène.
Par orientation de la réponse immune vers une réponse Thl et/ou de type mixte
Thl/Th2, on préfère notamment une orientation de la réponse immune qui favorise l'induction d'une réponse Thl par rapport à la réponse Thl/Th2 obtenue avec l'adjuvant alum.
Par orientation de la réponse immune vers une réponse Thl et/ou de type mixte
Thl/Th2, on préfère plus particulièrement une orientation de la réponse immune qui augmente le titre en anticorps IgG2a dirigés contre l'antigène associé par un facteur d'au moins 10, de préférence d'au moins 25, 50 et 100 par rapport au titre en IgG2a obtenu avec l'adjuvant alum.
De manière particulièrement préférée, la réponse immune est orientée vers une réponse Thl et/ou mixte de type Thl/Th2 dans laquelle la réponse Thl est voisine ou supérieure à la réponse Th2. Par "voisine", on entendra désigner une réponse qui, exprimée en titre d'anticorps IgG2a dirigés contre l'antigène associé, est au moins égale à 0,5 fois, de préférence au moins égale à 0,75 fois, le titre en anticorps IgGl dirigé contre ledit antigène, avec un titre d'anticorps IgG dirigé contre l'antigène associé voisin ou supérieur au titre d'anticorps IgG dirigé contre l'antigène associé obtenu avec l'adjuvant alum ou de Freund. L'invention concerne également l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que la fraction membranaire comprend au moins des fractions membranaires de deux souches différentes de bactéries.
Par fraction membranaire de bactérie, on entend désigner dans la présente invention toute fraction ou extrait membranaire purifié ou partiellement purifié obtenu à partir d'une culture de ladite bactérie et dont le procédé de préparation comprend au moins une étape de lyse des bactéries obtenues après culture et une étape de séparation de la fraction contenant les membranes desdites bactéries du lysat total obtenu après l'étape de lyse, notamment par centrifugation ou filtration.
Par fraction membranaire de bactérie lorsque ladite bactérie est Klebsiella pneumoniae, on entend désigner également dans la présente invention la protéine P40, fraction active de la fraction membranaire de Klebsiella pneumoniae, de séquence d'acides aminés SEQ ID N° 2, ou l'un de ses fragments.
Selon l'invention, les fractions membranaires pourront être préparées selon les méthodes connues de l'homme de l'art telles que par exemple la méthode décrite par par Haeuw J.F. et al. (Eur. J. Biochem, 255, 446-454, 1998).
Selon un mode de réalisation particulier, l'invention est relative à une utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que la fraction membranaire est préparée par un procédé comprenant les étapes suivantes : a) la culture desdites bactéries dans un milieu de culture permettant leur croissance suivie d'une centrifugation de ladite culture ; b) le cas échéant, désactivation des enzymes lyriques du culot de bactéries obtenu à l'étape a), puis centrifugation de la suspension obtenue ; c) extraction et élimination des protéines non membranaires et des acides nucléiques du culot obtenu à l'étape a) ou b) par au moins un cycle de lavage du culot dans une solution d'extraction ; d) digestion du culot de membranes obtenu à l'étape c) en présence d'enzymes protéolytiques suivie d'une centrifugation ; e) au moins un cycle de lavage du culot obtenu à l'étape d) dans une solution physiologique et/ou dans de l'eau distillée ; et f) ultrasonication du culot obtenu à l'étape e).
L'étape b) de désactivation des enzymes ly tiques du culot de bactéries obtenu à l'étape a) peut être réalisée par toutes méthodes connues de désactivation d'enzymes, telles qu'en particulier par chauffage du culot bactérien remis en suspension à une température de préférence voisine de 100 °C, ou par addition d'inhibiteur de l'activité de ces enzymes.
L'étape c) d'extraction et d'élimination des protéines non membranaires et des acides nucléiques du culot obtenu à l'étape a) ou b) peut être réalisée par exemple par au moins un cycle de lavage du culot dans une solution d'extraction correspondant à l'addition d'une solution hypertonique (solution d'extraction), de préférence une solution saline de molarité voisine de 1 M, suivie après un temps de contact suffisant pour l'effet désiré d'une centrifugation de la suspension obtenue et de l'élimination du surnageant obtenu après ladite centrifugation, ce cycle de lavage pouvant être reproduit plusieurs fois.
L'étape d) de digestion du culot de membranes obtenu à l'étape c) peut être réalisée en présence d'une solution d'enzymes protéolytiques telles que par exemple la trypsine, la chymotrypsine ou toute enzyme à activité proteolytique connue, les conditions de la réaction, pH de la solution, température et durée de la réaction, étant de préférence ajustées aux conditions optimales pour l'activité de ou des enzymes choisies, suivie d'une centrifugation, ce cycle de digestion pouvant être reproduit plusieurs fois avec la même enzyme, la même combinaison d'enzymes ou avec une enzyme différente pour chaque cycle de digestion effectué.
L'étape e) de lavage du culot obtenu à l'étape d) est réalisée par reprise du culot dans une solution physiologique ou dans de l'eau distillée suivie, après un temps de contact suffisant, d'une centrifugation, ce cycle de lavage pouvant être reproduit plusieurs fois. Enfin, l'étape f) d'ultrasonication, du culot a pour objectif en particulier de désintégrer et d'homogénéiser la fraction membranaire obtenue en fin d'étape e). Les conditions d'ultrasonication (durée et puissance) seront déterminées par l'homme de l'art en fonction par exemple de la quantité de fraction membranaire à traiter.
Selon un autre mode de réalisation particulier, l'invention est relative à une utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que la fraction membranaire est préparée par un procédé comprenant les étapes suivantes : a) la culture desdites bactéries dans un milieu de culture permettant leur croissance suivie le cas échéant d'une centrifugation ; b) la congélation du milieu de culture ou du culot obtenu à l'étape a) suivie d'une décongélation et du séchage des cellules ; c) élimination au moyen d'une DNase des acides nucléiques des cellules sèches obtenues à l'étape b) remises en suspension ; d) broyage des cellules obtenues à l'étape c) et clarification de la suspension obtenue ; e) précipitation en milieu acide de la suspension obtenue à l'étape d) et élimination du culot ; f) neutralisation du surnageant obtenu à l'étape e) contenant la suspension membranaire, suivie d'une dialyse et d'une concentration de la suspension membranaire ; et g) stérilisation de la suspension membranaire concentrée obtenue à l'étape f). Les conditions de décongélation à l'étape b) du procédé ci-dessous seront bien entendu déterminées par l'homme de l'art en fonction de la quantité de culot initiale à traiter, de préférence réalisée à 4°C pendant au moins 48 heures pour l'équivalent de 1 Kg de cellules sèches.
A l'étape c), l'él-mination des acides nucléiques est réalisée par exemple par l'addition d'une DNase, à une concentration finale de 5 mg/ml d'une suspension de cellules à une concentration équivalente à 5 % de cellules sèches.
Le broyage des cellules obtenues à l'étape c) peut être réalisé au moyen de tout système ou appareillage connu par l'homme de l'art pour le broyage de cellules tel que les presses ou de préférence tel que le broyage en boucle de Manton Gaulinet pendant 30 minutes.
La clarification de la suspension obtenue après broyage pourra être réalisée au moyen de tout système ou appareillage connu par l'homme de l'art pour la clarification de broyats cellulaires bactériens tel que le système Sharpless.
L'étape e) de précipitation en milieu acide de la suspension obtenue à l'étape d) peut être réalisée par exemple avec l'acide acétique. La précipitation est suivie par l'élimination du culot au moyen d'un système de type Sharpless et par la récupération du surnageant.
L'étape f) consiste en une étape dans laquelle le surnageant, obtenu après précipitation en milieu acide, est neutralisé, dilué, dialyse puis concentré. Enfin, la dernière étape consiste en une étape de stérilisation du concentré de fraction membranaire obtenu à l'étape précédente comme par exemple par chauffage à 121 °C pendant environ 35 minutes.
L'invention concerne de manière particulière l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que la fraction membranaire est la protéine P40 de Klebsiella pneumoniae de séquence SEQ ID N° 2, ou l'un de ses fragments. Par fragment de la protéine P40, on entend désigner en particulier tout fragment de séquence d'acides aminés compris dans la séquence d'acides aminés de la protéine P40 capable d'augmenter une réponse immune non spécifique et/ou capable d'induire une réponse immunitaire antitumorale, et comprenant au moins 5 acides aminés, de préférence au moins 10 acides aminés ou de manière plus préférée au moins 15 acides aminés.
Bien entendu, ladite protéine P40, ou ses fragments, pourra être obtenue par synthèse chimique ou sous forme de peptides recombinants.
L'invention concerne de manière particulière l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que ledit antigène ou haptène est choisi parmi les antigènes ou haptènes spécifiques d'un agent infectieux, tel qu'un virus, une bactérie, un champignon ou un parasite, ou parmi les antigènes associés à des cellules tumorales.
Selon l'invention, lesdits antigènes ou haptènes sont de préférence choisis parmi les peptides, les lipopeptides, les polysaccharides, les oligosaccharides, les acides nucléiques, les lipides ou tout composé capable de diriger spécifiquement la réponse immunitaire vers une réponse de type Thl et/ ou de type mixte Thl/Th2 contre un antigène ou haptène spécifique d'un agent infectieux ou d'un antigène associé à une cellule tumorale.
Bien entendu, ledit antigène ou haptène, lorsqu'il est de nature peptidique pourra être obtenu par synthèse chimique ou recombinante.
Les méthodes de préparation de peptides recombinants sont aujourd'hui bien connues de l'homme de l'art et ne seront pas développées dans la présente description. Parmi les cellules utilisables pour la production de ces peptides recombinants, il faut citer bien entendu les cellules bactériennes (Olins P.O. et Lee S.C. , 1993, Récent advances in heterologous gène expression in E. coli. Curr. Op. Biotechnology 4:520- 525), mais également les cellules de levure (Buckholz R.G., 1993, Yeast Systems for the Expression of Heterologous Gène Products. Curr. Op. Biotechnology 4:538-542), de même que les cellules animales, en particulier les cultures de cellules de mammifères (Edwards C.P. et Aruffo A. , 1993, Current applications of COS cell based transient expression Systems. Curr. Op. Biotechnology 4, 558-563) mais également les cellules d'insectes dans lesquelles on peut utiliser des procédés mettant en oeuvre par exemple des baculovirus (Luckow V.A., 1993, Baculo virus Systems for the expression of human gène products. Curr. Op. Biotechnology 4, 564-572).
L'invention comprend en outre l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que ledit antigène ou haptène est couplé ou mélangé avec ladite fraction membranaire, notamment couplé par liaison covalente avec l'un au moins des composés contenus dans la fraction membranaire.
Dans un mode préféré de réalisation, l'invention comprend l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que ledit antigène ou haptène est couplé de manière covalente à un peptide support pour former un complexe capable de se lier spécifiquement à la sérumalbumine de mammifère, de préférence ledit peptide support est un fragment peptidique issu de la protéine G du streptocoque, notamment le fragment C-terminal dénommé BB.
Bien entendu, ledit complexe pourra être préparé par recombinaison génétique. Le complexe chimérique ou hybride peut être produit par des techniques d'ADN recombinant par insertion ou addition à une séquence d'ADN codant pour ledit fragment peptidique de la protéine G de streptococcus d'une séquence codant pour ledit antigène ou haptène de nature protéique.
Les procédés de synthèse des molécules hybrides englobent les méthodes utilisées en génie génétique pour construire des polynucléotides hybrides codant pour les séquences polypeptidiques recherchées. On pourra, par exemple, se référer avantageusement à la technique d'obtention de gènes codant pour des protéines de fusion décrite par D.V. Goeddel (Gène expression technology, Methods in Enzymology, vol. 185, 3-187, 1990).
Selon la présente invention, le couplage par liaison covalente pourra être réalisé par synthèse chimique. Dans un mode de réalisation particulier de l'invention, il pourra être introduit un ou plusieurs éléments de liaison dans l'un au moins des composés contenus dans la fraction membranaire et/ou dans ledit antigène ou haptène pour faciliter le couplage chimique.
De préférence, ledit élément de liaison introduit est un acide aminé. Selon l'invention, il est possible d'introduire un ou plusieurs éléments de liaison, notamment des acides aminés pour faciliter les réactions de couplage entre un composé de la fraction membranaire, et ledit antigène ou haptène. Le couplage covalent entre ledit composé de la fraction membranaire et ledit antigène ou haptène selon l'invention peut être réalisé à l'extrémité N- ou C- terminale dudit composé de la fraction membranaire ou dudit antigène ou haptène, si ceux-ci sont par exemple de nature peptidique. Les réactifs bifonctionnels permettant le couplage seront déterminés en fonction de l'extrémité choisie pour effectuer le couplage et de la nature dudit antigène ou haptène à coupler.
L'invention comprend également l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que le couplage entre ledit antigène, haptène ou le complexe et l'un au moins des composés contenus dans la fraction membranaire est réalisé par recombinaison génétique lorsque ledit antigène, haptène, ou complexe et ledit composé membranaire sont de nature peptidique.
Le couplage entre ledit antigène, haptène ou complexe, et l'un au moins des composés contenus dans la fraction membranaire peut être en effet réalisé par recombinaison génétique. On pourra par exemple, avant d'en extraire sa fraction membranaire, préalablement transformer ladite bactérie à gram négatif par un vecteur contenant une construction nucléique codant pour un antigène d'intérêt ou ledit complexe, de telle sorte que la bactérie ainsi transformée exprime l'antigène d'intérêt ou ledit complexe fixé à la membrane ou ancré dans la membrane de ladite bactérie. De telles méthodes d'expression de protéines recombinantes fixées à la membrane sont bien connues et nécessitent par exemple la présence de séquence régulatrice spécifique comme une séquence de type signal peptide.
L'invention a également pour objet l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que la composition pharmaceutique comprend en outre un agent permettant de véhiculer ladite fraction membranaire associée audit antigène, haptène ou complexe sous une forme permettant d'améliorer sa stabilité et/ou son immunogénicité, telle que sous la forme d'une émulsion de type huile dans eau ou eau dans huile, ou sous la forme d'une particule de type liposome, microsphère, nanosphère ou tout type de structure permettant l'encapsulation et la présentation sous forme particulaire de ladite fraction membranaire associée audit antigène, haptène ou complexe. L'invention concerne aussi l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que ledit agent est choisi parmi les sels d'aluminium, les sels de calcium, les composés d'origine végétale tels que le Quil A ou la saponine, ou les composés d'origine bactérienne tels que les dérivés d'anatoxine cholérique, pertussique, tétanique ou de la toxine thermolabile d'E. coli.
Est également comprise dans la présente invention, l'utilisation selon l'invention, caractérisée en ce que la composition pharmaceutique comprend en outre un agent permettant de réguler la réponse immune induite par ladite fraction membranaire associée audit antigène, haptène ou complexe. Parmi lesdits agents de régulation, on préfère notamment les cytokines, les facteurs de croissance, les hormones ou des composants cellulaires tels que des acides nucléiques, une protéine de la famille des protéines de choc thermique ou des ribosomes.
L'invention a également pour objet l'utilisation selon l'invention, pour la préparation d'une composition pharmaceutique destinée à la prévention ou au traitement des maladies infectieuses d'origine virale, bactérienne, fongique ou parasitaire, ou à la prévention ou au traitement des cancers, notamment les cancers dont les tumeurs sont associées à des antigènes tumoraux.
Parmi lesdites maladies infectieuses d'origine virale, on préfère en particulier les maladies infectieuses provoquées par les paramyxovirus, notamment par le virus parainfluenzae et de manière plus préférée par le virus respiratoire syncytial (VRS).
Dans un mode de réalisation particulier, l'utilisation selon l'invention est caractérisée en ce que ledit antigène associé à la fraction membranaire comprend le peptide G2Na, fragment de la protéine G du virus de séquence d'acides aminés SEQ ID N° 4, un peptide homologue à G2Na dont la séquence présente un taux d'identité d'au moins 80 %, de préférence 90 %, 95 % et 99 %, après alignement avec la séquence SEQ ID N° 4, ou le peptide G2Na ou l'un de ses homologues, couplé par liaison covalente à un fragment C-terminal (BB) de la protéine G de streptocoque pour former un complexe capable de se lier à la sérumalbumine de mammifère, peptide BB tel que décrit dans les documents Power et al., 1997 (Virology, 230,155-166) et WO 96/14416. Par « pourcentage, degré ou taux d'identité » entre deux séquences d'acide nucléique ou d'acides aminés au sens de la présente invention, on entend désigner un pourcentage de nucléotides ou de résidus d'acides aminés identiques entre les deux séquences à comparer, obtenu après le meilleur alignement, ce pourcentage étant purement statistique et les différences entre les deux séquences étant réparties au hasard et sur toute leur longueur. Les comparaisons de séquences entre deux séquences d'acide nucléique ou d'acides aminés sont traditionnellement réalisées en comparant ces séquences après les avoir alignées de manière optimale, ladite comparaison étant réalisée par segment ou par « fenêtre de comparaison » pour identifier et comparer les régions locales de similarité de séquence. L'alignement optimal des séquences pour la comparaison peut être réalisé, outre manuellement, au moyen de l'algorithme d'homologie locale de Smith et Waterman (1981) [Ad. App. Math. 2:482], au moyen de l'algorithme d'homologie locale de Neddleman et Wunsch (1970) [J. Mol. Biol. 48:443], au moyen de la méthode de recherche de similarité de Pearson et Lipman (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:2444], au moyen de logiciels informatiques utilisant ces algorithmes (GAP, BESTFIT, FASTA et TFASTA dans le Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, WI, ou encore par les logiciels de comparaison BLAST N ou BLAST P). Le pourcentage d'identité entre deux séquences d'acide nucléique ou d'acides aminés est déterminé en comparant ces deux séquences alignées de manière optimale par fenêtre de comparaison dans laquelle la région de la séquence d'acide nucléique ou d'acides aminés à comparer peut comprendre des additions ou des délétions par rapport à la séquence de référence pour un alignement optimal entre ces deux séquences. Le pourcentage d'identité est calculé en déterminant le nombre de positions identiques pour lesquelles le nucléotide ou le résidu d'acide aminé est identique entre les deux séquences, en divisant ce nombre de positions identiques par le nombre total de positions dans la fenêtre de comparaison et en multipliant le résultat obtenu par 100 pour obtenir le pourcentage d'identité entre ces deux séquences. Par exemple, on pourra utiliser le programme BLAST, « BLAST 2 séquences », disponible sur le site http : //www . ncbi . nlm . nih. gov/ gorf /b!2. html . les paramètres utilisés étant ceux donnés par défaut (en particulier pour les paramètres « open gap penaltie » : 5, et « extension gap penaltie » : 2 ; la matrice choisie étant par exemple la matrice « BLOSUM 62 » proposée par le programme), le pourcentage d'identité entre les deux séquences à comparer étant calculé directement par le programme.
Sous un autre aspect, l'invention est relative à un procédé de préparation d'une fraction membranaire de bactéries à gram négatif, notamment Klebsiella pneumoniae, caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes : a) la culture desdites bactéries dans un milieu de culture permettant leur croissance suivie d'une centrifugation de ladite culture ; b) le cas échéant, désactivation des enzymes ly tiques du culot de bactéries obtenu à l'étape a), puis centrifugation de la suspension obtenue ; c) extraction et élimination des protéines non membranaires et des acides nucléiques du culot obtenu à l'étape a) ou b) par au moins un cycle de lavage du culot dans une solution d'extraction ; d) digestion du culot de membranes obtenu à l'étape c) en présence d'enzymes protéasiques suivie d'une centrifugation ; e) au moins un cycle de lavage du culot obtenu à l'étape d) dans une solution physiologique et/ou dans de l'eau distillée ; et f) ultrasonication du culot obtenu à l'étape e).
L'invention comprend aussi le procédé de préparation d'une fraction membranaire de bactéries à gram négatif, notamment Klebsiella pneumoniae, caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes : a) la culture desdites bactéries dans un milieu de culture permettant leur croissance suivie le cas échéant d'une centrifugation ; b) la congélation du milieu de culture ou du culot obtenu à l'étape a) suivie d'une décongélation et du séchage des cellules ; c) élimination au moyen d'une DNase des acides nucléiques des cellules sèches obtenues à l'étape b) remises en suspension ; d) broyage des cellules obtenues à l'étape c) et clarification de la suspension obtenue ; e) précipitation en milieu acide de la suspension obtenue à l'étape d) et élimination du culot ; f) neutralisation du surnageant obtenu à l'étape e) contenant la suspension membranaire, suivie d'une dialyse et d'une concentration de la suspension membranaire ; et g) stérilisation de la suspension membranaire concentrée obtenue à l'étape f).
Les fractions membranaires susceptibles d'être obtenues par lesdits procédés font bien entendu partie de l'invention.
Le titre en protéogly canne des fractions membranaires susceptibles d'être obtenues par lesdits procédés, principe actif de la FMKp, représenté par la somme des teneurs en galactose et en protéine, est de préférence compris :
- pour le galactose : entre 1,2 g/1 et 3,4 g/1 ;
- pour les protéines : entre 7,5 g/1 et 14,9 g/1.
De manière plus préférée, ce titre sera : - pour le galactose : entre 1,6 g/1 et 2,6 g/1 ;
- pour les protéines : entre 9,3 g/1 et 11,7 g/1.
L'invention concerne en outre les compositions pharmaceutiques comprenant une fraction membranaire susceptible d'être obtenue par les procédés selon l'invention, de préférence, lesdites compositions pharmaceutiques, comprennent en outre un antigène, haptène ou un complexe, tels que définis précédemment, associés à ladite fraction membranaire, tels que notamment les antigènes viraux ou complexes spécifiques de paramyxovirus, ou les antigènes associés à des cellules tumorales.
Bien entendu, lesdites compositions pharmaceutiques selon l'invention pourront comprendre en outre les agents tels que les véhicules, agents de régulation définis précédemment.
Dans un mode de réalisation préféré, la composition pharmaceutique selon l'invention est caractérisée en ce que ledit antigène associé à la fraction membranaire comprend le peptide G2Na de séquence SEQ ID N° 4 du virus respiratoire syncytial, un de ses homologues tels que définis précédemment, ou ledit peptide G2Na, ou l'un de ses homologues, couplé par liaison covalente à un fragment C-terminal (BB) de la protéine G de streptocoque pour former un complexe capable de se lier à la sérumalbumine de mammifère.
Les légendes des figures et exemples qui suivent sont destinés à illustrer l'invention sans aucunement en limiter la portée. Légendes des figures :
Figure 1 : BBG2Na adjuvé par la FMKp - Etude dose-réponse (titres IgG sériques anti-G2Na).
* p < 0,05 (par rapport au groupe PBS). Figure 2 : BBG2Na adjuvé par la FMKp -Titres IgGl et IgG2a anti-G2Na. Figure 3 : BBG2Na adjuvé par la FMKp - Etude de la protection. Figure 4 : Effet adjuvant de la FMKp vis-à-vis d'Immugrip (vaccin anti-grippal).
* p < 0,05 par comparaison au groupe non adjuvé (« 0 ») au même jour de prélèvement.
Exemple 1 : Obtention de la faction membranaire de K. pneumoniae (FMKp)
Procédé N° 1
L'extraction des membranes de K. pneumoniae 1145 à partir du culot de centrifugation de l'étape est précédée de préférence par une étape de destruction des enzymes lytiques des composants cellulaires contenus dans le culot, par exemple par chauffage à 100°C de celui-ci, éventuellement après remise en solution.
L'extraction proprement dite des membranes à partir du culot de centrifugation est réalisée de préférence par traitement des composants cellulaires du culot, après une éventuelle destruction des enzymes lytiques, à l'aide d'une solution saline, par exemple du chlorure de sodium 1 M, une ou plusieurs fois, puis centrifugation, de préférence, à 20 000 g, de la suspension obtenue, le surnageant de cette centrifugation, qui est éliminé, contient les impuretés non membranaires telles que protéines et acides nucléiques, tandis que le culot contient les membranes.
Après séparation de la solution saline contenant les impuretés, les membranes sont digérées en présence d'enzymes protéolytiques, de préférence la trypsine et la chymotrypsine, en solution à pH 8 à 37 °C pendant 4 heures. Après digestion, la solution est homogénéisée par ultrasonication. Le produit ainsi obtenu constitue la fraction membranaire nommée FMKp.
Le surnageant obtenu est à nouveau centrifugé dans les mêmes conditions, de préférence à 140 000 g. Préparation des glycopeptides membranaires
Cette fraction est préparée à partir du culot obtenu par centrifugation à 40 000 g pendant 20 minutes. Ledit culot est remis en suspension dans du sérum physiologique puis cette suspension est portée pendant 10 minutes à 100°C dans un bain-marie d'eau bouillante pour désactiver les enzymes lytiques. Après refroidissement, on centrifuge 30 mn à 20 000 g. Le culot obtenu est extrait deux fois avec du NaCl 1M pour éliminer les protéines et les acides nucléiques. Les membranes sont recueillies par centrifugation durant 30 minutes à 20 000 g.
Elles sont ensuite soumises à une digestion par de la trypsine à pH 8 et à 37 °C pendant 4 heures puis par de la chymotrypsine dans les mêmes conditions. Les membranes sont alors recueillies par centrifugation à 2 000 g pendant 30 minutes, lavées avec du sérum physiologique puis de l'eau distillée et sont soumises à une désintégration par les ultrasons de 15 minutes. Procédé N° 2
Après décongélation à + 4°C pendant 48 h minimum, 1 kg de cellules sèches de K. pneumoniae est remis en suspension à 5 % cellules sèches. La DNase est ajoutée à 5 mg/1. On procède ensuite au broyage en boucle au Manton Gaulin pendant 30 min puis à une clarification sur SHARPLES à 50 1/h, suivie d'une précipitation à l'acide acétique à pH = 4,2 + 0,1 pendant 30 min. Le culot est éliminé (SHARPLES à 25 1/h) et le surnageant est neutralisé, dilué à 2 fois le volume initial avec de l'eau osmosée. Une dialyse à volume constant est alors effectuée sur PUF 100 jusqu'à 800 Ωcm, suivie d'une concentration de la suspension membranaire (SM) ainsi obtenue, à 11 1/kg de cellules sèches. On procède alors à l'autoclavage de la SM à + 121 °C durant 35 min que l'on peut conserver à + 4°C pendant 6 semaines. Caractéristiques de la FMKp Par définition, le titre en protéogly canne, principe actif de la FMKp, est égal à la somme des teneurs en galactose et en protéines. - Galactose : en moyenne 2,2 g 11.
- Protéines : en moyenne 10,5 g/1.
Exemple 2 : Effet adjuvant de la FMKp sur une protéine recombinante, BBG2Na
BBG2Na est une protéine recombinante produite dans E. coll. Elle est constituée du peptide G2Na de séquence SEQ ID N° 4, le fragment de la protéine G du Virus Respiratoire Syncytial (VRS) de type A allant du résidu 130 au résidu 230, fusionnée à BB, un fragment de la protéine G des Streptocoques, ayant la capacité de se lier à l'albumine sérique. BBG2Na est un vaccin anti-VRS (Power U. Virology 1997, 230:155-166). Des souris BALB/c reçoivent 2 injections par voie sous-cutanée de 20 μg de
BBG2Na et différentes quantités de FMKp. Des prélèvements de sang sont effectués à J28 et les titres anticorps sériques sont déterminés par ELISA avec G2Na en phase solide. Les résultats obtenus sont illustrés par la figure 1. De manière surprenante, ils montrent que la FMKp augmente significativement la réponse IgG anti-G2Na ; le titre IgG anti-G2Na atteint est similaire à ceux induits par l'alum ou l'adjuvant de Freund. L'effet est dose-dépendant : il est observé à partir de 5 μg de FMKp, maximal à partir de 50 μg de FMKp et reste stable avec 100 μg de FMKp. La FMKp est donc un adjuvant potentiel pour BBG2Na.
Afin de connaître l'effet de la FMKp sur l'orientation de la réponse immunitaire, en terme de réponse Thl/Th2, les titres IgGl et IgG2a anti-G2Na ont été déterminés sur des sérums obtenus comme précisé ci-dessus. Les résultats (figure 2) montrent qu'étonnamment, la FMKp est capable de modifier le ratio IgGl/IgG2a anti- G2Na, à l'inverse de ce qui est observé avec l'alum, pour lequel l'isotype majoritaire est l'IgGl. Ce profil est proche de celui induit par l'adjuvant de Freund. Ceci indique que la FMKp peut être utilisée comme adjuvant de l'immunité pour induire une réponse de type mixte (Thl/Th2).
Les animaux immunisés comme décrit ci-dessus ont reçu une épreuve virale par voie nasale avec 105 TCID50 de VRS-A. Celle-ci a été effectuée 3 semaines après la dernière immunisation. Cinq jours après l'épreuve virale, les animaux ont été sacrifiés, et les poumons prélevés afin de déterminer les titres de VRS-A. Les résultats (figure 3) montrent que les animaux ayant reçu BBG2Na adjuvé par la FMKp sont protégés contre un challenge à RSV-A.
En conclusion, la FMKp permet de réorienter la réponse anticorps sans affecter la capacité de protection des souris contre un challenge à VRS-A. Exemple 3 : Effet adjuvant de la FMKp sur un virus inactivé (vaccin anti-grippal) Des souris BALB/c reçoivent 1 seule injection de 0,01 μg d 'Immugrip™ (vaccin anti-grippal commercialisé par les Laboratoires INAVA), et de différentes quantités de FMKp. Les produits sont coadministrés. L'injection se fait par voie sous- cutanée à J0. Des prélèvements sanguins sont effectués à J7, J14 et J21. Le titre anticorps IgG sériques anti-Immugrip se fait par ELISA avec Immugrip à 2 μg/ml en phase solide. Les résultats présentés (figure 4) montrent que la FMKp augmente significativement le titre anticorps anti-Immugrip et ceci dès la plus faible dose de FMKp, à savoir 0,1 μg. L'effet adjuvant est dose-dépendant. On remarque de manière intéressante, que la présence de la FMKp induit la génération d'une réponse anticorps plus précoce, observée dès J7, comparée au contrôle Immugrip non adjuvé. Cet effet n'est pas obtenu avec l'adjuvant de référence, l'adjuvant complet de Freund (CFA).

Claims

REVENDICATIONS
1/ Utilisation d'une fraction membranaire de Klebsiella pneumoniae associée à un antigène ou haptène pour la préparation d'une composition pharmaceutique destinée à orienter la réponse immunitaire vers une réponse de type Thl et/ou de type mixte Thl/Th2 dirigée contre ledit antigène ou haptène.
2/ Utilisation selon la revendication 1, caractérisée en ce que la fraction membranaire comprend au moins des fractions membranaires de deux souches différentes de bactéries. 3/ Utilisation selon l'une des revendications 1 et 2, caractérisée en ce que la fraction membranaire est préparée par un procédé comprenant les étapes suivantes : a) la culture desdites bactéries dans un milieu de culture permettant leur croissance suivie d'une centrifugation de ladite culture ; b) le cas échéant, désactivation des enzymes lytiques du culot de bactéries obtenu à l'étape a), puis centrifugation de la suspension obtenue ; c) extraction et élimination des protéines non membranaires et des acides nucléiques du culot obtenu à l'étape a) ou b) par au moins un cycle de lavage du culot dans une solution d'extraction ; d) digestion du culot de membranes obtenu à l'étape c) en présence d'enzymes protéasiques suivie d'une centrifugation ; e) au moins un cycle de lavage du culot obtenu à l'étape d) dans une solution physiologique et/ou dans de l'eau distillée ; et f) ultrasonication du culot obtenu à l'étape e).
4/ Utilisation selon l'une des revendications 1 et 2, caractérisée en ce que la fraction membranaire est préparée par un procédé comprenant les étapes suivantes : a) la culture desdites bactéries dans un milieu de culture permettant leur croissance suivie le cas échéant d'une centrifugation ; b) la congélation du milieu de culture ou du culot obtenu à l'étape a) suivie d'une décongélation et du séchage des cellules ; c) élimination au moyen d'une DNase des acides nucléiques des cellules sèches obtenues à l'étape b) remises en suspension ; d) broyage des cellules obtenues à l'étape c) et clarification de la suspension obtenue ; e) précipitation en milieu acide de la suspension obtenue à l'étape d) et élimination du culot ; f) neutralisation du surnageant obtenu à l'étape e) contenant la suspension membranaire, suivie d'une dialyse et d'une concentration de la suspension membranaire ; et g) stérilisation de la suspension membranaire concentrée obtenue à l'étape f).
5/ Utilisation selon l'une des revendications 1 à 4, caractérisée en ce que ledit antigène ou haptène est choisi parmi les antigènes ou haptènes spécifiques d'un agent infectieux ou parmi les antigènes associés à des cellules tumorales.
6/ Utilisation selon la revendication 5, caractérisée en ce que ledit antigène ou haptène est choisi parmi les peptides, les lipopeptides, les polysaccharides, les oligosaccharides, les acides nucléiques, les lipides ou tout composé capable de diriger spécifiquement la réponse immune de type Thl et/ou de type mixte Thl/Th2 contre un antigène ou haptène spécifique d'un agent infectieux ou d'un antigène associé à une cellule tumorale.
7/ Utilisation selon l'une des revendications 1 à 6, caractérisée en ce que ledit antigène ou haptène est couplé ou mélangé avec ladite fraction membranaire.
8/ Utilisation selon l'une des revendications 1 à 7, caractérisée en ce que ledit antigène ou haptène est couplé de manière covalente à un peptide support pour former un complexe capable de se lier spécifiquement à la sérumalbumine de mammifère.
9/ Utilisation selon la revendication 8, caractérisée en ce que ledit peptide support est un fragment peptidique issu de la protéine G du streptocoque. 10/ Utilisation selon l'une des revendications 8 et 9, caractérisée en ce que ledit complexe est préparé par recombinaison génétique.
11/ Utilisation selon l'une des revendications 7 à 10, caractérisée en ce que ledit antigène, haptène ou complexe est couplé par liaison covalente avec l'un au moins des composés contenus dans la fraction membranaire. 12/ Utilisation selon la revendication 11, caractérisée en ce que le couplage par liaison covalente est un couplage réalisé par synthèse chimique. 13/ Utilisation selon la revendication 12, caractérisée en ce qu'il est introduit un ou plusieurs éléments de liaison dans l'un au moins des composés contenus dans la fraction membranaire et/ou dans ledit antigène, haptène ou complexe pour faciliter le couplage chimique. 14/ Utilisation selon la revendication 13, caractérisée en ce que ledit élément de liaison introduit est un acide aminé.
15/ Utilisation selon la revendication 11, caractérisée en ce que le couplage entre ledit antigène, haptène ou complexe et l'un au moins des composés contenus dans la fraction membranaire est réalisé par recombinaison génétique lorsque ledit antigène, haptène, ou complexe et ledit composé membranaire sont de nature peptidique.
16/ Utilisation selon l'une des revendications 1 à 15, caractérisée en ce que la composition pharmaceutique comprend en outre un agent permettant de véhiculer ladite fraction membranaire associée audit antigène, haptène ou complexe sous une forme permettant d'améliorer sa stabilité et/ou son immunogénicité.
17/ Utilisation selon la revendication 16, caractérisée en ce que ledit agent est une émulsion de type huile dans eau ou eau dans huile.
18/ Utilisation selon la revendication 16, caractérisée en ce que ledit agent est une particule de type liposome, microsphère, nanosphère ou tout type de structure permettant l'encapsulation et la présentation sous forme particulaire de ladite fraction membranaire associée audit antigène, haptène ou complexe.
19/ Utilisation selon la revendication 16, caractérisée en ce que ledit agent est choisi parmi les sels d'aluminium, les sels de calcium, les composés d'origine végétale tels que le Quil A ou la saponine, ou les composés d'origine bactérienne tels que les dérivés d' anatoxine cholérique, pertussique, tétanique ou de la toxine thermolabile d'E. coli.
20/ Utilisation selon l'une des revendications 1 à 19, caractérisée en ce que la composition pharmaceutique comprend en outre un agent permettant de réguler la réponse immune induite par ladite fraction membranaire associée audit antigène, haptène ou complexe. 21/ Utilisation selon la revendication 20, caractérisée en ce que ledit agent de régulation est choisi parmi les cytokines, les facteurs de croissance, les hormones ou des composants cellulaires tels que des acides nucléiques, une protéine de la famille des protéines de choc thermique ou des ribosomes. 22/ Utilisation selon l'une des revendications 1 à 21, pour la préparation d'une composition pharmaceutique destinée à la prévention ou au traitement des maladies infectieuses ou des cancers.
23/ Utilisation selon la revendication 22, caractérisée en ce que la maladie infectieuse est d'origine virale, bactérienne, fongique ou parasitaire. 24/ Utilisation selon la revendication 23, pour la préparation d'une composition pharmaceutique destinée à la prévention ou au traitement des infections par les paramyxovirus.
25/ Utilisation selon la revendication 24, caractérisée en ce que le paramyxovirus est un virus respiratoire syncytial. 26/ Utilisation selon la revendication 25, caractérisée en ce que ledit antigène associé à la fraction membranaire comprend le peptide G2Na de séquence
SEQ ID N° 4 ou l'un de ses homologues dont la séquence présente un degré d'identité d'au moins 80 % avec la séquence SEQ ID N° 4.
27/ Utilisation selon la revendication 26, caractérisée en ce que ledit peptide G2Na ou l'un de ses homologues est couplé par liaison covalente à un fragment C- terminal (BB) de la protéine G de streptocoque pour former un complexe capable de se lier à la sérumalbumine de mammifère.
28/ Utilisation selon la revendication 24, caractérisée en ce que le paramyxovirus est un virus parainfluenzae. 29/ Composition pharmaceutique, caractérisée en ce qu'elle comprend une fraction membranaire préparée par le procédé tel que défini dans l'une quelconque des revendications 3 ou 4, et un antigène ou haptène associé à ladite fraction membranaire.
30/ Composition pharmaceutique selon la revendication 29, caractérisée en ce que ledit antigène est choisi parmi des fragments peptidiques de paramyxovirus. 31/ Composition pharmaceutique selon la revendication 30, caractérisée en ce que le paramyxovirus est un virus respiratoire syncytial ou un virus parainfluenzae.
32/ Composition pharmaceutique selon la revendication 31, caractérisée en ce que ledit antigène associé à la fraction membranaire comprend le peptide G2Na de séquence SEQ ID N° 4 du virus respiratoire syncytial, ou un peptide dont la séquence présente un degré d'identité d'au moins 80 % avec la séquence SEQ ID N° 4.
33/ Composition pharmaceutique selon la revendication 32, caractérisée en ce que ledit peptide G2Na ou l'un de ses homologues est couplé par liaison covalente à un fragment C-terminal (BB) de la protéine G de streptocoque pour former un complexe capable de se lier à la sérumalbumine de mammifère.
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