WO2000012554A1 - Procede de synthese d'une chimiokine marquee, chimiokine marquee et trousse d'analyse - Google Patents

Procede de synthese d'une chimiokine marquee, chimiokine marquee et trousse d'analyse Download PDF

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WO2000012554A1
WO2000012554A1 PCT/FR1999/002055 FR9902055W WO0012554A1 WO 2000012554 A1 WO2000012554 A1 WO 2000012554A1 FR 9902055 W FR9902055 W FR 9902055W WO 0012554 A1 WO0012554 A1 WO 0012554A1
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chemokine
amino acid
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determined
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Claudio Vita
Jean Vizzavona
Jean Claude Gluckman
Abdelaziz Benjouard
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Commissariat A L'energie Atomique
Universite Pierre Et Marie Curie (Paris Vi)
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    • A61K47/6898—Pre-targeting systems with two or three steps using antibody conjugates; Ligand-antiligand therapies using avidin- or biotin-conjugated antibodies
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    • C07K14/521—Chemokines
    • C07K14/523—Beta-chemokines, e.g. RANTES, I-309/TCA-3, MIP-1alpha, MIP-1beta/ACT-2/LD78/SCIF, MCP-1/MCAF, MCP-2, MCP-3, LDCF-1, LDCF-2

Definitions

  • the present invention relates to a process for the synthesis of a chemokine, modified or unmodified, labeled at the level of at least one determined amino acid and at least one determined position of its sequence, to a chemokine obtained by said process, and a kit for analyzing receptors and molecules that interact with chemokines.
  • Chemokines are soluble factors or chemotactic cytokines essential for the recruitment of circulating cells at inflammatory sites and are involved in certain aspects of hematopoiesis in humans and animals. They also have many other activities in terms of the proliferation, differentiation and functional activation of their cell target.
  • the following table (I) shows examples of inflammatory conditions in humans where chemokines have been detected in certain tissues or bodily fluids by immunohistochemistry or by ELISA test.
  • low molecular weight polypeptides 8-10 kDa, with a strong affinity for heparin.
  • the mature forms are between 68 and 94 amino acids and have a sequence homology ranging from 20 to 80%.
  • RANTES (Regulated on Activation Normal T Cell Expressed and Secreted) is a polypeptide of 68 amino acids whose expression and secretion are regulated by activation of normal T cells.
  • the RANTES sequence is as follows: Ser-Pro-Tyr-
  • the receptors for these chemokines, and in particular for RANTES, are part of the sub-family of receptors with seven transmembrane passages coupled to G proteins
  • Chemokines also interact with proteoglycans which can immobilize them on the surface of cells, thus participating in the chemotactic gradient required for cell / cell adhesion and migration.
  • chemokine receptors such as CCR-5, a receptor for RANTES, have been identified as major cofactors for entry of the virus.
  • HIV Human immunodeficiency
  • target cells including RANTES has been shown to block the entry of HIV.
  • RANTES must combine with glycosaminoglycans to be active against HIV. Such an association is also observed in the secretory granules of cytotoxic T lymphocytes and can have a functional significance.
  • chemokines at a determined position in their amino acid sequence, are lacking.
  • Biotinylated derivatives of recombinant chemokines (MlP-1 ⁇ , MIP-1 ⁇ , MCP-1, 11-8) are available from the company R&D Systems, but these derivatives are obtained by chemical modification of a recombinant protein, and therefore, are not obtained in a homogeneous manner, are not specifically marked and may have altered functional properties in a non-controllable and non-reproducible manner.
  • the object of the present invention is precisely to provide a process for the synthesis of a chemokine, which makes it possible to obtain a chemokine, modified or not, labeled at the level of a determined amino acid and at a determined position in the sequence of the chemokine .
  • modified or unmodified chemokine is meant a chemokine whose amino acid sequence is modified or unmodified, at the level of one or more amino acids, and by labeled chemokine, is meant peptide sequence of the chemokine on which is ( are) fixed one or more labeling molecules.
  • the process of the invention can be characterized in that it comprises the following stages: a) a chemical peptide synthesis, preferably on a solid support, of the amino acid sequence of the chemokine, or of a modified sequence thereof, from the required amino acids, in which the reactive functions of the chains side of the required amino acids and the ⁇ -amino reactive function of the N-terminal amino acid of the synthesized sequence are protected by appropriate protective groups, and in which at least one protective group of a determined amino acid, at least a determined position of said sequence is orthogonal and chosen so that it can be removed from the reactive function of said determined amino acid at said determined position, independently of the group or groups which protect the reactive functions of the other amino acids of the sequence , b) removal of said orthogonal protective group from said amino acid determined at the determined position of the sequence uence of amino acids of the chemokine obtained in step a), so as to release said reactive function from said determined amino acid, c) coupling of said determined amino acid, by said reactive function released in step b),
  • the process of the invention can also be characterized in that it comprises the following stages: a) chemical peptide synthesis, preferably on a solid support, of the amino acid sequence of the chemokine, or a modified sequence thereof, from the required amino acids, in which the side chains of the required amino acids are protected by appropriate protecting groups; and in which at least one amino acid, at at least one determined position in said sequence is coupled to a labeling molecule, so as to obtain a sequence of chemokine labeled at said determined amino acid, ⁇ ) recovery of said sequence marked obtained in step ⁇ ).
  • the chemical peptide synthesis of the amino acid sequence of the chemokine, or of a modified sequence thereof can be any chemical synthesis suitable for synthesizing such an amino acid sequence.
  • this synthesis is carried out on a solid support, which can be any solid support suitable for a such synthesis, for example a resin such as that cited in the examples below.
  • This synthesis can be carried out, for example, in an automatic peptide synthesizer, for example of the Applied Biosystems Model 433 type, Foster City, California, USA.
  • the support can for example be a p-hydroxymethyl phenoxymethyl polystyrene resin or an equivalent resin.
  • the appropriate protective groups can be molecules which make it possible to protect the reactive functions of the side chains of certain amino acids and the reactive ⁇ -amino function of the N-terminal end of the sequence which will not be coupled to the labeling molecule, that is to say to block these reactive functions so that they do not react with the reagents used in a subsequent stage of the process of the invention.
  • these suitable protective groups can be molecules which form, with the reactive functions to protect, a stable chemical bond under the conditions of synthesis of the peptide sequence of the invention, and cleavable at the end of said synthesis.
  • reactive function is meant below the reactive functions of the side chains of amino acids which do not intervene in the peptide bonds and the reactive ⁇ -amino function of the N-terminal amino acid of the synthesized sequence.
  • the reactive functions of the amino acid side chains can be, for example, -NH 2 , -COOH, -SH, -OH functions of the amino acid side chains such as for example lysine, aspartic and glutamic acids, cysteine, serine and threonine respectively.
  • chemical synthesis in solid phase can for example be carried out using the protective group 9-fluorenyl ethyloxycarbonyl (Fmoc), for the ⁇ -amino function of the amino acids in the sequence (that is to say different of the N-terminal amino acid), and for example groups protecting the reactive functions of the side chains of amino acids forming with these functions bonds which are stable in basic material, but cleavable in an acid medium.
  • Fmoc the protective group 9-fluorenyl ethyloxycarbonyl
  • chemical synthesis in the solid phase can then be carried out using for example the protective tert-butyloxycarbonyl group (tBoc) for the ⁇ -amino function of the N-terminal amino acid, or any other stable protective group in a subsequent step in the process of the invention for this ⁇ -amino function, when it is desired to mark the side chain of an amino acid of the sequence.
  • the protective group tBoc has the characteristic of forming with the reactive functions to protect a stable bond in an acid medium.
  • a protective group having the same characteristic as tBoc can also be used.
  • the abovementioned chemical synthesis can also be carried out for example using the Fmoc for the ⁇ -amino function of the N-terminal amino acid, when it is desired to mark the ⁇ -amino function of the amino acid N -terminal of the sequence of the chemokine.
  • the orthogonal protective group is a molecule different from the other protective groups used in the process of the invention, which can be linked to the aforementioned reactive functions and be removed specifically from these functions by means of an appropriate reagent without removing the other protective groups from the other reactive functions.
  • This protective group can be one of those known to those skilled in the art.
  • Fmoc 1- (4, 4-dimethyl-2, 6-dioxocyclohexylidene) ethyl (Dde), 4-methyltrityl (Mtt), or allyloxycarbonyl (Alloc) to protect the reactive -NH 2 function of the side chain of an amino acid such as lysine, or of the ⁇ -amino function of the amino acid N-terminal of the sequence, for example of allyl or of 4 [N- [1- (4, 4-dimethyl-2, 6-dioxocyclohexylidene) -3-methylbutyl] -amino] benzyl (Dmab) to protect the -COOH function of the side chain of aspartic or glutamic acid, for example trityl to protect the -OH function of the side chain of serine or threonine, for example S-tertio-but
  • orthogonal protective groups can be removed from the reactive functions of the amino acids by means of an appropriate reagent: for example by means of hydrazine for example at 2% for example in an N-methyl pyrrolidone solvent to remove Dde from the side chain amino acid lysine or Dmab of the side chain of aspartic and glutamic acid amino acids, for example using a palladium catalyst for allyl of the side chain of aspartic and glutamic acid amino acids or for the Alloc of the side chain of the amino acid lysine, for example using 1% trifluoroacetic acid for the trityl of the side chain of the amino acids serine and threonine and for the Mtt of the side chain of the amino acid lysine, for example by means of thiols or of tributylphosphine for tButhio of the side chain of the acid amine cysteine, for example by means of piperidine for example at 20% for example in an N-methylpirrolidone solvent
  • the solid phase peptide chemical synthesis can be carried out in the presence of 2- (1H-benzotriazole-1- yl) hexafluorophosphate 1, 1, 3, 3-tetramethyluronium, or a mixture of N , N '-dicyclohexylcarbodiimide and N-hydroxyazabenzotriazole.
  • the reactive function of said determined amino acid can then be coupled, by a specific chemical reaction, to a labeling molecule or to a precursor thereof, so as to obtain a labeled amino acid sequence at the level of said determined amino acid.
  • the coupling is preferably carried out by means of a covalent bond between the function reagent of the determined amino acid and the labeling molecule.
  • the labeling molecule can be any one of the labeling molecules of proteins or peptides known to a person skilled in the art.
  • This molecule can be, for example, a molecule comprising or capable of incorporating a radioactive element for detection by a measurement of radioactivity, or a molecule suitable for detection by conventional methods, enzymatic, immunocytochemical or by flow cytometry (FACS (registered trademark). ) ( FACStar, Plus, Becton-Dickinson, Sans Jose, USA)), thanks to fluorescence or coloring.
  • the labeling molecule can also be a precursor capable of releasing the labeling function after a chemical or photochemical reaction.
  • this labeling molecule can be chosen from a set comprising biotin, a derivative of biotin, fluorescein, a derivative of fluorescein or another fluorochrome known to those skilled in the art.
  • the labeling molecule can for example be a molecule which can be activated or coupled to a detection molecule in order to be able to be detected or detectable.
  • the labeling molecule is for example biotin, or a derivative of biotin, it can be recognized through the use of its specific liqand, avidin or streptavidin.
  • the labeling molecule can also be another molecule than biotin, which can be recognized through avidin or streptavidin.
  • Avidin and streptavidin can be coupled to a fluorescent label or an enzyme so that they can detect biotin specifically through fluorescence or staining.
  • Biotin labeled chemokine can be detected by fluorescence microscope using for example streptavidin-Texas Red or streptavidin coupled to another fluorochrome; by optical microscope or by a colorimeter by examining the coloration after addition of streptavidin-peroxidase, then the suitable substrate for the peroxidase; or by flow cytometry, by fluorescence analysis after addition, for example, of streptavidin coupled to phycoerythrin or to any other fluorochrome.
  • a chemokine labeled with a labeling molecule at a determined position directly usable for detecting receptors and ligands for this chemokine on the surface of a cell, so very precise, and to prepare a molecule labeled with a marker precursor at a determined position which can be activated or coupled to a labeling molecule before being used to detect receptors and ligands for this chemokine on the surface of a cell.
  • the coupling of the reactive function of said amino acid with the labeling molecule or with a precursor thereof can be direct or indirect.
  • the coupling of the direct labeling molecule is a coupling carried out directly between the labeling molecule and the reactive function of the determined amino acid. This coupling carried out by any of the chemical reactions making it possible to form a covalent bond between the reactive function of the amino acid and the labeling molecule.
  • This coupling can be achieved, for example, through an amide or sulfonamide bond between the ⁇ -amino function of the side chain of a lysine amino acid, or between the ⁇ -amino function of the amino acid in the N-terminal position of the chemokine and the carboxylic or sulfonic function, respectively, of the labeling molecule, or between the carboxylic function of an aspartic or glutamic amino acid of the chemokine and an amine function of the labeling molecule.
  • This coupling can also be carried out through a thioether bond between the thiol function of an amino acid cysteine of the chemokine and a maleimide or iodoacetyl function of the labeling molecule.
  • This labeling can also be carried out using, during the synthesis of the chemokine sequence, an amino acid which is already linked to a marker such as those mentioned above, for example the amino acid biotinyl-L-lysine (biocytin) or a another biotin derivative.
  • a marker such as those mentioned above, for example the amino acid biotinyl-L-lysine (biocytin) or a another biotin derivative.
  • the coupling can also be indirect. Indeed, it is possible that the labeling molecule grafted directly onto the side chain of an amino acid has a steric gene for the folding of the chemokine and / or has a steric gene for the binding of the labeled chemokine with a receptor or a ligand. This is why, it may be necessary to "extend" the side chain of the amino acid by means of an arm, which can for example be an organic molecule having at a first end a chemical function of bond with the reactive function of the determined amino acid, and at a second end a chemical bonding function with the labeling molecule or a precursor thereof, for example 6-aminocaproic acid.
  • an arm can for example be an organic molecule having at a first end a chemical function of bond with the reactive function of the determined amino acid, and at a second end a chemical bonding function with the labeling molecule or a precursor thereof, for example 6-aminocaproic acid.
  • An “arm” can also be grafted onto the ⁇ -amino function of the amino acid of the N-terminal end of the chemokine sequence.
  • This "arm” can be grafted onto the reactive function of the side chain of the determined amino acid, or onto the ⁇ -amino function of the amino acid of the N-terminal end of the sequence of the synthesized chemokine, by any of the chemical reactions making it possible to form a covalent bond between the chemical bonding function of the arm with the reactive function of the side chain of the determined amino acid, and the marker can be coupled to the arm by any of the conventional chemical reactions making it possible to form a covalent bond between the chemical bonding function of the arm with the marker, or a precursor thereof, and the latter.
  • the "arm” can be present or fixed on the labeling molecule. This "arm” can be one of the above.
  • the amino acid which does not have a reactive function on its side chain can also be replaced by any molecule having at least one -NH 2 function, at least one -COOH function and at least one side chain having a reactive function useful for coupling to the labeling molecule.
  • the amino acid replacing the amino acid of the unmodified chemokine sequence, or original sequence can be labeled with a labeling molecule or a precursor thereof.
  • the labeled chemokine synthesized must be able to regain its original three-dimensional conformation in order to be able to bind to its receptors or to adhere to its ligands.
  • the labeling is carried out at the level of one or more amino acid (s).
  • the position determined in the amino acid sequence of the chemokine can be a position in the sequence which does not interfere not the biological activity of the chemokine.
  • the method of the present invention makes it possible to manufacture a modified, labeled chemokine, so as to modify its three-dimensional conformation and / or to modify its interaction (s) with its receptors and / or its ligands.
  • certain amino acids required for the synthesis of the chemokine are replaced by other amino acids. These amino acids will be chosen according to their role in the conformation of the peptide.
  • the labeled modified chemokine obtained can be useful for studying its interactions with its receptors and / or its ligands.
  • modified sequence of the chemokine it can therefore be understood: - either a sequence specially modified to fix a labeling molecule, or a precursor thereof, at a determined position of the sequence of the chemokine, where the acid original amino does not have a reactive function on its side chain, this modification being intended to replace the original amino acid with an amino acid having such a function,
  • RANTES is a peptide comprising 68 amino acids.
  • the method according to the invention makes it possible, for example, to manufacture RANTES marked in a determined position such as for example position 66 or 67 at the C-terminal end of this peptide, or alternatively position 1, 25, 33 or 45, by example with a biotin.
  • the amino acid sequence of RANTES is described above, and there is no need to rewrite it here. Simply, it should be noted that at position 67 of RANTES is a methionine.
  • This amino acid does not have a reactive function on its side chain, according to the process of the present invention, it can be replaced for example by a lysine which has a reactive function -NH 2 on its side chain, or by a cysteine which has a reactive function -SH on its side chain.
  • the recovery step of the process can be a conventional recovery step of a peptide, it can comprise a step of conventional processing of the polypeptide sequence obtained which allows the formation of possible disulfide bridges in the sequence peptide synthesized and purification of the labeled chemokine.
  • This recovery stage can for example comprise two stages of purification by high pressure liquid phase chromatography in reverse phase.
  • the process of the present invention has many advantages over the processes of the prior art. Indeed, it makes it possible to effectively manufacture, in a reproducible manner, a chemokine modified or not, homogeneously marked on one, or more, amino acid (s) determined (s) at one, or more, determined positions of the sequence of the chemokine. In addition, due to specific labeling at a determined position of the sequence, the synthesis yield of the method of the present invention is excellent compared to the methods of the prior art which use recombinant proteins labeled randomly. Indeed, the processes of art previous do not make it possible to obtain a chemokine, modified or not, labeled in one or more, position (s) determined in accordance with the present invention, and require numerous purification steps without obtaining the result of the present invention .
  • the method of the invention is economical compared to the methods of genetic recombination of the prior art, because it involves chemical reactions which are easily controllable and require fewer steps and operating precautions.
  • the process of the present invention is therefore particularly advantageous for mass production of a labeled chemokine, but also for manufacture in the laboratory.
  • the chemokine when it is RANTES, it can also be labeled at another position in the sequence which does not interfere with the biological properties of the chemokine, for example with a biotin.
  • the chemokine when it is RANTES, it can also be labeled at another position in the sequence which does not interfere with the biological properties of the chemokine, for example with a biotin.
  • the present invention also relates to a labeled chemokine characterized in that said chemokine is a modified or unmodified chemokine, the amino acid sequence of which is labeled at a determined amino acid at a determined position in said sequence, said chemokine being obtainable by the process of the present invention.
  • the chemokine can be one of those mentioned in the preceding table (II), for example RANTES, IL-8, etc.
  • the labeling molecule can be one of those mentioned above, or any other labeling molecule which can be coupled to a chemokine by the process of the present invention.
  • the chemokine when it is RANTES, it can be modified so as to comprise in position 67, next to the C-terminal end, for example a lysine or a cysteine or other amino acids suitable for coupling to the brand molecule, instead of methionine. In this case, it can be labeled by coupling with a biotin.
  • the chemokine when it is RANTES, it can also be labeled for example in position 66, next to the C-terminal end, in position 45, 33 or 25, or on the ⁇ -amino function of the amino acid of the N-terminal end of the RANTES sequence, that is to say in position 1 of the sequence, for example with a biotin.
  • the present invention also relates to a composition comprising a labeled chemokine, characterized in that said composition comprises, in a homogeneous manner and as desired, one or more labeled chemokines of the present invention.
  • said composition can homogeneously comprise a chemokine labeled in a single determined position of its amino acid sequence.
  • the composition according to the invention can homogeneously comprise RANTES marked as desired in one or more determined position (s) of its sequence, for example at position 67 of its sequence d 'acids amines, on the side of the C-terminal end.
  • this chemokine can also be labeled at another position in the sequence, for example which does not interfere with the biological properties of the chemokine, for example with a biotin.
  • a chemokine labeled in a determined position is extremely useful in the studies of receptors and ligands of chemokines, for example for understanding the intimate mechanisms of recognition and binding of HIV with its target cells. These studies are necessary in particular for the development of new therapies and new drugs to fight against many diseases, for example against AIDS or other pathologies such as those mentioned in table I above.
  • the present invention also relates to a kit for analyzing a receptor and / or an adhesion molecule of a chemokine, characterized in that it comprises a composition according to the invention.
  • this kit can also comprise an adequate reagent making it possible to detect the labeled chemokine (s) of the composition.
  • the chemokine can for example be one of those mentioned in the preceding table (II), for example RANTES or IL-8.
  • the chemokine When the chemokine is RANTES, it can be labeled for example in position 66, or 67 for example with a biotin.
  • the reagent revealing the presence of the marker will depend on the labeling molecule used, or on the precursor thereof.
  • this reagent can be avidin or streptavidin when the chemokine labeling molecule is biotin.
  • FIGS. 1A and 1B are plots produced from results of mass analysis by electropulverization of biotinylated RANTES according to the invention
  • RANTES biotinylated according to the invention at different determined positions of its sequence (RANTES-bl, -b25, -b33, -b45 and -b67) and at different concentrations (10 n, 50 nM, 100 nM) to macrophages derived from monocytes
  • FIG. 3A and 3B represent two curves illustrating the effect of a specific enzymatic treatment of proteoglycans on the binding of RANTES-b67 to MDM-5d and MDM-MCSF
  • This example describes the preparation of a biotinylated derivative of RANTES specifically labeled, by synthesis in solid phase according to the method of the present invention.
  • position 67 next to the C-terminal end of RANTES has been chosen for marking as the determined position.
  • This labeling position allows good exposure to solvents and is far enough from the N-terminal end, which is presumed to be the region of binding with the RANTES receptor, so as not to interfere with the interaction of RANTES labeled with its receptor.
  • the labeling molecule chosen is biotin.
  • RANTES has in position 67, next to the C-terminal end, a methionine, (Met67) which has no reactive function on its side chain. Therefore, during the synthesis of RANTES, this methionine is replaced by a lysine which has an amino function on its side chain.
  • the protecting group for the ⁇ -amino function for the amino acids required to synthesize RANTES is 9-fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc), except for the amino acid of the N-terminal which contains the tert-butyloxycarbonyl group (tBoc).
  • the protective groups for the reactive functions of the side chains of the amino acids required to synthesize RANTES are the following: tert-butyl ether for the -OH function of the amino acids serine, threonine; tyrosine; tert-butyl ester for the -COOH function of the amino acids aspartic and glutamic acids; 2, 2, 5, 7, 8-pentamethylchroman-6-sulphonyl for the guanidinium function of the amino acid arginine; trityl for the amide function of the amino acids asparagine and glutamine, for the -SH function of the amino acids cysteine and the imidazolic nitrogen of the amino acid histidine; tert-butyloxycarbonyl for the -NH 2 function of amino acids lysine.
  • the orthogonal protective group for the determined lysine, at position 67 next to the C-terminal end (lys67) of RANTES chosen in this example is 1- (, 4-dimethyl-2, 6-dioxocyclohexylidene) ethyl (Dde) .
  • the active ester of each amino acid was formed using 1 mmol of N, N '-dicyclohexylcarbodiimide and 1 mmol of N-hydroxyazabenzotriazole in the solvent N-methylpyrrolidone.
  • the solvent used in the synthesis is N-methylpyrrolidone.
  • a peptide sequence modified in position 67 of RANTES is obtained, in which the ⁇ -amino function of the amino acid of the N-terminal end is protected by a tert-butyloxycarbonyl group (tBoc), the reactive functions of the side chains of the required amino acids are protected by appropriate protective groups and in which lysine 67 is protected by an orthogonal protective group, different from the other protective groups, so that it can be removed from the -NH 2 function of the side chain of lysine 67 independently of the other groups protecting the reactive functions of other amino acids, this modified peptide sequence of RANTES being fixed on the resin.
  • tBoc tert-butyloxycarbonyl group
  • the protective group of the lysine 67 side chain is then removed specifically by treating the peptide linked to the resin three times 2 minutes with a solution of methylpyrrolidone with 2% hydrazine and an "arm"("spacer") 6- aminocaproyl is then incorporated, by coupling Fmoc-6-aminocapro ⁇ que acid by a treatment of two times an hour in hexafluorophosphate medium of 2- (1H- benzotriazole-1-yl) -1,1,3,3-tetramethyluronium (HBTU ) with a 20-fold molar excess of the 6-aminocaproyl "arm".
  • HBTU 2- (1H- benzotriazole-1-yl) -1,1,3,3-tetramethyluronium
  • the Fmoc group was then cleaved by two 5-minute treatments with a solution comprising 20% of piperidine in N-methylpyrrolidone and the biotin was finally coupled to the resin-bound peptide, with a 20-fold molar excess of biotin, for one night, in an HBTU environment.
  • the peptide was detached from the resin and released from all these protective groups by an acid treatment of 90 minutes using a mixture containing 82.5% of trifluoroacetic acid, 5% of phenol, 5% water, 5% thioanisole and 2.5% ethane dithiol.
  • the peptide completely "deprotected” was precipitated from the acid solution by addition with isopropyl ether, the precipitate was washed twice with ether, then dissolved in a solution of acetic acid 30% in water and finally recovered under white powder form after lyophilization.
  • RANTES obtained biotinylated in position 67 on the C-terminal side of its peptide sequence (noted below RANTES b-67), was purified by high pressure liquid phase chromatography in reverse phase (“reverse-phase HPLC"), d 'first in reduced form, then after formation of the RANTES disulphide bridges.
  • reverse-phase HPLC reverse phase
  • FIG. 1A results of mass analysis by electrospray of biotinylated RANTES, according to the invention.
  • the masses 1020.5; 1166.0; 1360.2; and 1631.9 Da (Dalton) correspond to the biotinylated RANTES molecules having, respectively, 8, 7, 6 and 5 positive charges as a consequence of the addition of 8, 7, 6 and 5 protons in the ionization chamber,
  • MDM macrophages derived from monocytes
  • PBMC blood mononuclear cells
  • MDM-MCSF macrophages
  • MDM-5d and MDM-MCSF were characterized by immunofluorescent labeling with monoclonal antibodies FITC-I0T3 for CD3, FITC-I0B4a for CD19 and FITC-IOT4a for CD4, or a negative control monoclonal antibody FITC-IgGl (Immunotech Company , Marseille, France) .
  • Biotinylated RANTES binds with MDM-5d in a dose-dependent manner, ie depending on the amount of RANTES, more effectively than with MDM-MCSF.
  • biotinylated RANTES of the invention interacts, in addition with CCR-5, with the proteoglycans of macrophages.
  • the present invention has therefore allowed to provide a proof of the variation of the expression of proteoglycans according to the state of activation of macrophages.
  • Figure 2 in the appendix represents a series of curves illustrating the fixation of different forms of biotinylated RANTES according to the present invention, at different determined positions of its amino acid sequence (aa): aal, aa25, aa33, aa45 and aa67, noted RANTES-b1, -b25, -b33, -b45 and -b67 respectively, and at different concentrations (10 nM, 50 nM, 100 nM) to macrophages derived from MDM-5dd monocytes.
  • aa amino acid sequence
  • the macrophages derived from monocytes were obtained by 5 day adhesion (MDM-5d) and were incubated with variable concentrations (10 nM, 50 nM, 100 nM) of RANTES biotinylated at variable positions of its amino acid sequence, noted RANTES-b1, -b25, -b33, -b45 and -b67, for 30 min at 4 ° C. After washing, the cells were impregnated with streptavidin-phycoerythrin (SPE), then examined, after washing and fixation with PFA (paraformaldehyde), by analysis by FACS.
  • SPE streptavidin-phycoerythrin
  • the solid histograms represent the intensity of fluorescence of the cells not incubated with RANTES but impregnated with SPE.
  • the empty histograms correspond to the fluorescence intensity obtained when the cells were incubated with biotinylated RANTES and then SPE.
  • Figures 3A and 3B in the appendix represent two curves illustrating the effect of an enzymatic treatment specific for proteoglycans on the binding of RANTES-b67 to MDM-5d and MDM-MCSF respectively.
  • MDM-5d and MDM-MCSF were obtained as before. 5 ⁇ 10 5 cells (MDM-5d or MDM-MCSF) were treated with chondroitinase (histograms a) or
  • CD4 Hela / CD4
  • CD4 and CCR-5 Hela / CD4 / CCR-5
  • the cells were recovered by adding cold PBS to 1 mM EDTA, and sampling using a spatula.
  • the cells were suspended at the rate of 2 ⁇ 10 5 cells in 100 ⁇ l of PBS at 1 mg / ml of BSA, and incubated for 30 minutes at 4 ° C. with different concentrations of biotinylated RANTES in position 67 (b-67) obtained in Example 1. After that, the cells were washed, and brought into contact with SPE (1: 800 from the company Becton-Dickinson) and examined by analysis by flow cytometry such as in Example 2.
  • RANTES biotinylated B67 binds in a dose-dependent manner to both Hela cells (CD4 and Hela / CD4 / CCR-5 cells). However, the most effective binding was noted with Hela / CCR-5 cells).
  • RANTES can also bind to cells not expressing the RANTES CCR-5 receptor.
  • RANTES is known to bind to proteoglycans which are expressed by cell lines Hela, especially heparin sulfate.
  • the cells were washed and incubated for 30 minutes with RANTES biotinylated B67 according to the invention, in 100 ⁇ l of PBS-BSA at 4 ° C. After that, the cells were washed, contacted with SPE (1: 800, from the Becton-Dickinson Company), and examined by FACS analysis as above.
  • heparitinase which removes heparin sulfates from the surfaces of cells, inhibits the binding of RANTES to the surface of these cells, but no effect was noted with chondroitinase.
  • Figures 4 (1), 4 (11), 4 (111) and (IV) show four curves illustrating the fixing of
  • Hela / CD4 or Hela / CD4 / CCR-5 cells described above were incubated or not with variable concentrations of RANTES-b67: 0 nM (curves a), 10 nM (curves b), 50 nM (curves c) or 100 nM
  • SPE streptavidin-phycoerythrin
  • RANTES biotinylated in connection with the commercial availability of the avidin / streptavidin conjugates can be used for the detection and study of receptors and other ligands of chemokines, for example proteoglycans, on the surface of cells or in membrane preparations.
  • RANTES biotinylated in position 67 can be prepared by synthesis in solid phase according to the process of the present invention.
  • Synthetic peptide chemistry which uses, for example, the tert-butyloxycarbonyl (tBoc) protective group for the ⁇ -amino function of amino acids and the protective groups for the reactive side chains of amino acids which are stable in trifluooacetic acid medium and cleavable in hydrofluoric acid medium, known can be used by those skilled in the art. In this case, other orthogonal protective groups known to those skilled in the art must be used.
  • tBoc tert-butyloxycarbonyl
  • recombinant forms of RANTES can be specifically biotinylated.
  • the reactive thiol function of the side chain can be specifically labeled using commercially available biotinylation reagents such as 1- biotinamido-4- (4 '-maleimidomethyl) cyclohexane- carboximido) butane, N-iodoacetyl-N-biotinyl hexylene diamine, N- (6 (biotinamido) hexyl) -3 '- (2' - pyridyldithio) propionamide, etc.

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Abstract

La présente invention se rapporte à un procédé de synthèse d'une chimiokine marquée de manière homogène en une position déterminée. La présente invention se rapporte également à une chimiokine obtenue par ce procédé, à une composition et à une trousse comprenant ladite chimiokine. Selon l'invention, le procédé de synthèse de la chimiokine marquée comprend une étape de synthèse chimique en phase solide de la chimiokine, ou d'une séquence modifiée de celle-ci.

Description

PROCEDE DE SYNTHESE D'UNE CHIMIOKINE MARQUEE , CHIMIOKINE MARQUEE ET TROUSSE D'ANALYSE
DESCRIPTION
Domaine technique de 1 ' invention
La présente invention se rapporte à un procédé de synthèse d'une chimiokine, modifiée ou non modifiée, marquée au niveau d'au moins un acide aminé déterminé et à au moins une position déterminée de sa séquence, à une chimiokine obtenue par ledit procédé, et à une trousse d'analyse des récepteurs et des molécules qui interagissent avec les chimiokines.
Les chimiokines sont des facteurs solubles ou cytokines chimiotactiques indispensables au recrutement des cellules circulantes sur les sites inflammatoires et sont impliqués dans certains aspects de 1 ' hématopoïèse chez l'homme et les animaux. Elles possèdent également de nombreuses autres activités au niveau de la prolifération, de la différenciation et de l'activation fonctionnelle de leur cible cellulaire.
Le tableau (I) suivant montre des exemples de conditions inflammatoires chez l'homme où des chimiokines ont été détectées dans certains tissus ou fluides corporels par immunohistochimie ou par test ELISA.
Tableau (I) : Chimiokines détectées et maladies
Figure imgf000003_0001
(Suite Tableau I)
Figure imgf000004_0001
Il s'agit de polypeptides de faible masse moléculaire, de 8 à 10 kDa, ayant une forte affinité pour l'héparine. Les formes matures sont comprises entre 68 et 94 acides aminés et présentent une homologie de séquence allant de 20 à 80%.
Parmi elles, RANTES ("Regulated on Activation Normal T Cell Expressed and Secreted") est un polypeptide de 68 acides aminés dont l'expression et la sécrétion sont régulées par l'activation des lymphocytes T normaux.
La séquence RANTES est la suivante : Ser-Pro-Tyr-
Ser-Ser-Asp-Thr-Thr-Pro-Cys-Cys-Phe-Ala-Tyr-Ile-Ala- Arq-Pro-Leu-Pro-Arg-Ala-His-Ile-Lys-Glu-Tyr-Phe-Tyr-
Thr-Ser-Gly-Lys-Cys-Ser-Asn-Pro-Ala-Val-Val-Phe-Val-
Thr-Arg-Lys-Asn-Arg-Gln-Val-Cys-Ala-Asn-Pro-Glu-Lys-
Lys-Trp-Val-Arg-Glu-Tyr-Ile-Asn-Ser-Leu-Glu-Met-Ser.
Les récepteurs de ces chimiokines, et notamment de RANTES, font partie de la sous-famille des récepteurs à sept passages transmembranaires couplés aux protéines G
("Seven Transmembrane G-Protein-Coupled Receptor").
Les chimiokines interagissent aussi avec des proteoglycanes qui peuvent les immobiliser à la surface des cellules, participant ainsi au gradient chimiotactique requis pour l'adhésion et la migration cellule/cellule.
Plus récemment, des récepteurs de chimiokine tels que CCR-5, un récepteur pour RANTES, ont été identifiés comme cofacteurs majeurs pour l'entrée du virus de
1 ' immunodéficience humaine (VIH) dans les cellules cibles, et notamment RANTES a été montré comme bloquant l'entrée du VIH. Toutefois, RANTES doit s'associer avec des glycosaminoglycanes pour être actif contre le VIH. Une telle association est également observée dans les granules sécrétoires des lymphocytes T cytotoxiques et peut avoir une signification fonctionnelle.
La compréhension des interactions des chimiokines avec leur cellules cibles est donc très importante notamment pour le développement d'agent thérapeutiques tant pour les désordres inflammatoires que pour l'infection par le VIH.
Les recherches dans ce domaine nécessitent en conséquence l'utilisation de dérivés de chimiokines marquées spécifiquement et facilement détectables. Ces chimiokines marquées doivent permettre d'étudier les interactions des chimiokines avec leurs récepteurs et d'autres liqands, et de déterminer leur mécanismes d'action tant dans les désordres inflammatoires que pathogènes dus par exemple au VIH.
Art antérieur
Actuellement, des chimiokines marquées spécifiquement, en une position déterminée de leur séquence d'acides aminés, font défaut. Des dérivés biotinylés de chimiokines recombinantes (MlP-lα, MIP- lβ, MCP-1, 11-8) sont disponibles par la société R&D Systems, mais ces dérivés sont obtenus par modification chimique d'une protéine recombinante, et de ce fait, ne sont pas obtenus de manière homogène, ne sont pas marqués spécifiquement et peuvent présenter des propriétés fonctionnelles altérées d'une façon non contrôlable et non reproductible.
Exposé de l'invention
La présente invention a précisément pour but de fournir un procédé de synthèse d'une chimiokine, qui permet d'obtenir une chimiokine, modifiée ou non, marquée au niveau d'un acide aminé déterminé et à une position déterminée de la séquence de la chimiokine.
Par chimiokine modifiée ou non modifiée, on entend une chimiokine dont la séquence d'acides aminés est modifiée ou non modifiée, au niveau de un ou de plusieurs acides aminés, et par chimiokine marquée, on entend séquence peptidique de la chimiokine sur laquelle est (sont) fixée (s) une ou plusieurs molécules de marquage.
Le procédé de l'invention peut se caractériser en ce qu'il comprend les étapes suivantes : a) une synthèse chimique peptidique, de préférence sur un support solide, de la séquence d'acides aminés de la chimiokine, ou d'une séquence modifiée de celle-ci, à partir des acides aminés requis, dans laquelle les fonctions réactives des chaînes latérales des acides aminés requis et la fonction réactive α- aminique de 1 ' acide aminé N-terminal de la séquence synthétisée sont protégées par des groupements protecteurs appropriés, et dans laquelle au moins un groupement protecteur d'un acide aminé déterminé, à au moins une position déterminée de ladite séquence, est orthogonal et choisi de telle sorte qu'il puisse être retiré de la fonction réactive dudit acide aminé déterminé à ladite position déterminée, indépendamment du ou des autres groupements protecteurs des fonctions réactives des autres acides aminés de la séquence, b)un retrait dudit groupement protecteur orthogonal dudit acide aminé déterminé à la position déterminée de la séquence d'acides aminés de la chimiokine obtenue à l'étape a), de manière à libérer ladite fonction réactive dudit acide aminé déterminé, c)un couplage dudit acide aminé déterminé, par ladite fonction réactive libérée dans l'étape b) , soit directement, soit indirectement, avec une molécule de marquage ou un précurseur de celle-ci de manière à obtenir une séquence d'acides aminés de la chimiokine marquée au niveau dudit acide aminé déterminé, d)un retrait des autres groupements protecteurs, différents dudit groupement protecteur orthogonal, de la séquence de la chimiokine marquée obtenue à l'étape c) de manière à obtenir une séquence d'acides aminés marquée de la chimiokine, ou une séquence d'acides aminés modifiée marquée de celle-ci, au niveau d'un acide aminé déterminé à une position déterminée, et e)une récupération de ladite séquence marquée obtenue à l'étape d) .
Selon l'invention, le procédé de l'invention peut aussi se caractériser en ce qu'il comprend les étapes suivantes : α) une synthèse chimique peptidique, de préférence sur un support solide, de la séquence d'acides aminés de la chimiokine, ou d'une séquence modifiée de celle-ci, à partir des acides aminés requis, dans laquelle les chaînes latérales des acides aminés requis sont protégées par des groupements protecteurs appropriés ; et dans laquelle au moins un acide aminé, à au moins une position déterminée dans ladite séquence est couplé à une molécule de marquage, de manière à obtenir une séquence de la chimiokine marquée au niveau dudit acide aminé déterminé, β) une récupération de ladite séquence marquée obtenue à l'étape α) .
Selon l'invention, la synthèse chimique peptidique de la séquence d'acides aminés de la chimiokine, ou d'une séquence modifiée de celle-ci peut être une quelconque synthèse chimique adéquate pour synthétiser une telle séquence d'acides aminés. De préférence, cette synthèse est réalisée sur un support solide, qui peut être un quelconque support solide adéquat pour une telle synthèse, par exemple une résine telle que celle citée dans les exemples ci-après. Cette synthèse peut être réalisée par exemple dans un synthétiseur automatique de peptide, par exemple de type Applied Biosystems Model 433, Foster City, Californie, USA. Le support peut être par exemple une résine p- hydroxyméthyl phénoxyméthyl polystyrène ou une résine équivalente .
Selon l'invention, les groupements protecteurs appropriés peuvent être des molécules qui permettent de protéger les fonctions réactives des chaînes latérales de certains acides aminés et la fonction réactive α- aminique de 1 ' extrémité N-terminale de la séquence qui ne seront pas couplés à la molécule de marquage, c'est- à-dire de bloquer ces fonctions réactives pour qu'elles ne réaqissent pas avec les réactifs utilisés dans une étape ultérieure du procédé de l'invention.
Selon l'invention, ces groupements protecteurs appropriés peuvent être des molécules qui forment avec les fonctions réactives à protéger une liaison chimique stable dans les conditions de synthèse de la séquence peptidique de l'invention, et clivable à la fin de ladite synthèse.
Par fonction réactive, on entend ci-après les fonctions réactives des chaînes latérales des acides aminés qui n'interviennent pas dans les liaisons peptidiques et la fonction réactive α-aminique de l'acide aminé N-terminal de la séquence synthétisée. Les fonctions réactives des chaînes latérales des acides aminés peuvent être par exemple des fonctions -NH2, -COOH, -SH, -OH des chaînes latérales d'acides aminés tels que par exemple la lysine, les acides aspartique et glutamique, la cystéine, la serine et la thréonine respectivement. Selon l'invention, la synthèse chimique en phase solide peut être par exemple réalisée en utilisant le groupement protecteur 9- fluorényl éthyloxycarbonyle (Fmoc) , pour la fonction α- aminique des acides aminés dans la séquence (c'est-à- dire différents de l'acide aminé N-terminal) , et par exemple des groupements protecteurs des fonctions réactives des chaînes latérales des acides aminés formant avec ces fonctions des liaisons stables en matériau basique, mais clivables en milieu acide.
Selon l'invention, la synthèse chimique en phase solide peut alors être réalisée en utilisant par exemple le groupement protecteur tertio- butyloxycarbonyle (tBoc) pour la fonction α-aminique de l'acide aminé N-terminal, ou tout autre groupement protecteur stable dans une étape ultérieure du procédé de l'invention pour cette fonction α-aminique, lorsqu'on désire marquer la chaîne latérale d'un acide aminé de la séquence. Le groupement protecteur tBoc présente la caractéristique de former avec les fonctions réactives à protéger une liaison stable en milieu acide. Aussi, selon l'invention, un groupement protecteur présentant la même caractéristique que tBoc peut également être utilisé. Selon l'invention, la synthèse chimique précitée peut aussi être réalisée par exemple en utilisant le Fmoc pour la fonction α-aminique de l'acide aminé N- terminal, lorsqu'on désire marquer la fonction α- aminique de l'acide aminé N-terminal de la séquence de la chimiokine.
Selon l'invention, le groupement protecteur orthogonal est une molécule différente des autres groupements protecteurs utilisés dans le procédé de l'invention, qui peut être liée aux fonctions réactives précitées et être retirée spécifiquement de ces fonctions au moyen d'un réactif approprié sans que les autres groupements protecteurs des autres fonctions réactives soient retirés. Ce groupement protecteur peut être un de ceux connus de l'homme du métier. Il peut être choisi en fonction de la synthèse chimique utilisée et de la fonction réactive à protéqer : il s'agit, par exemple du Fmoc, du 1- (4, 4-diméthyl-2, 6- dioxocyclohexylidène) éthyle (Dde), du 4-méthyltrityle (Mtt) , ou de 1 ' allyloxycarbonyle (Alloc) pour protéger la fonction réactive -NH2 de la chaîne latérale d'un acide aminé tel que la lysine, ou de la fonction α- aminique de l'acide aminé N-terminal de la séquence, par exemple de l'allyle ou du 4[N-[1- (4, 4-diméthyl-2, 6- dioxocyclohexylidène) -3-méthylbutyl]-amino]benzyle (Dmab) pour protéger la fonction -COOH de la chaîne latérale de l'acide aspartique ou glutamique, par exemple le trityle pour protéger la fonction -OH de la chaîne latérale de la serine ou de la thréonine, par exemple le S-tertio-butylthio (tButhio) pour protéger la fonction -SH de la chaîne latérale de la cystéine, par exemple dans la chimie qui utilise le Fmoc pour la protection temporaire de la fonction α-aminique des acides aminés.
Ces groupements protecteurs orthogonaux peuvent être retirés des fonctions réactives des acides aminés au moyen d'un réactif approprié : par exemple au moyen d'hydrazine par exemple à 2% par exemple dans un solvant N-méthyl pyrrolidone pour retirer le Dde de la chaîne latérale de l'acide aminé lysine ou le Dmab de la chaîne latérale des acides aminés acides aspartique et glutamique, par exemple au moyen d'un catalyseur palladium pour l'allyle de la chaîne latérale des acides aminés acides aspartique et glutamique ou pour 1 'Alloc de la chaîne latérale de l'acide aminé lysine, par exemple au moyen de l'acide trifluoroacetique à 1% pour le trityle de la chaîne latérale des acides aminés serine et thréonine et pour le Mtt de la chaîne latérale de l'acide .aminé lysine, par exemple au moyen des thiols ou de la tributylphosphine pour le tButhio de la chaîne latérale de l'acide aminé cystéine, par exemple au moyen de pipéridine par exemple à 20% par exemple dans un solvant N-méthylpirrolidone pour retirer le Fmoc de la fonction α-aminique de l'acide aminé N-terminal. Selon l'invention, la synthèse chimique peptidique en phase solide peut être réalisée en présence d' hexafluorophosphate de 2- (lH-benzotriazole-1- yl) 1, 1, 3, 3-tétraméthyluronium, ou d'un mélanqe de la N,N ' -dicyclohexylcarbodiimide et de N- hydroxyazabenzotriazole .
En protégeant d'une manière spécifique la fonction réactive de la chaîne latérale d'un acide aminé déterminé, à une position déterminée dans la séquence, et/ou la fonction α-aminique de l'acide aminé N- terminal, au moyen d'un groupement protecteur orthogonal, il est possible, selon le procédé de l'invention, de retirer spécifiquement ce groupement protecteur orthogonal pour libérer la fonction réactive de la chaîne latérale dudit acide aminé, et/ou de ladite fonction α-aminique de l'acide aminé de l'extrémité N-terminale de la séquence, sans libérer les autres fonctions réactives des autres acides aminés protégées par le ou les autres groupements protecteurs.
La fonction réactive dudit acide aminé déterminée peut alors être couplée, par une réaction chimique spécifique, à une molécule de marquage ou à un précurseur de celle-ci, de manière à obtenir une séquence d'acide aminé marquée au niveau dudit acide aminé déterminé. Le couplage est de préférence réalisé au moyen d'une liaison covalente entre la fonction réactive de l'acide aminé déterminé et la molécule de marquage .
La molécule de marquage peut être au choix l'une quelconque des molécules de marquage des protéines ou des peptides connues de l'homme du métier. Cette molécule peut être par exemple une molécule comprenant ou pouvant incorporer un élément radioactif pour une détection par une mesure de la radioactivité, ou une molécule adéquate pour une détection par les méthodes classiques i munoenzymatiques, immunocytochimiques ou par cytométrie de flux (FACS (marque déposée) (FACStar, Plus, Becton-Dickinson, Sans José, USA)), grâce à une fluorescence ou une coloration. La molécule de marquage peut aussi être un précurseur capable de libérer la fonction de marquage après une réaction chimique ou photochimique .
Selon l'invention, cette molécule de marquage peut être choisie dans un ensemble comprenant la biotine, un dérivé de la biotine, la fluorescéine, un dérivé de la fluorescéine ou un autre fluorochrome connu de l'homme du métier.
La molécule de marquage peut être par exemple une molécule qui peut être activée ou couplée à une molécule de détection pour pouvoir être détectée ou détectable. Lorsque la molécule de marquage est par exemple la biotine, ou un dérivé de la biotine, elle peut être reconnue à travers l'utilisation de son liqand spécifique, avidine ou streptavidine . La molécule de marquage peut aussi être une autre molécule que la biotine, qui peut être reconnue à travers l' avidine ou la streptavidine. L ' avidine et la streptavidine peuvent être couplées à un marqueur fluorescent ou à un enzyme de façon à pouvoir détecter la biotine spécifiquement à travers la fluorescence ou une coloration. La chimiokine marquée à la biotine peut être détectée par microscope à fluorescence en utilisant par exemple la streptavidine-Texas Red ou la streptavidine couplée à un autre fluorochrome ; par microscope optique ou par un colorimètre par examen de la coloration après addition de la streptavidine- peroxidase, puis le substrat adéquat de la peroxydase ; ou par cytométrie de flux, par analyse de la fluorescence après addition par exemple de streptavidine couplée à la phycoérythrine ou à tout autre fluorochrome.
Ainsi, selon le procédé de la présente invention, il est possible de préparer une chimiokine marquée par une molécule de marquage en une position déterminée, directement utilisable pour détecter des récepteurs et des ligands de cette chimiokine à la surface d'une cellule, de manière très précise, et de préparer une molécule marquée par un précurseur de marqueur en une position déterminée qui peut être activée ou couplée à une molécule de marquage avant d'être utilisée pour détecter des récepteurs et des ligands de cette chimiokine à la surface d'une cellule.
Le couplage de la fonction réactive dudit acide aminé avec la molécule de marquage ou avec un précurseur de celle-ci peut être directe ou indirecte. Le couplage de la molécule de marquage direct est un couplage réalisé directement entre la molécule de marquage et la fonction réactive de l'acide aminé déterminé. Ce couplage réalisé par l'une quelconque des réactions chimiques permettant de former une liaison covalente entre la fonction réactive de l'acide aminé et la molécule de marquage.
Ce couplage peut être réalisé, par exemple, à travers une liaison amide ou sulfonamide entre la fonction ε-aminique de la chaîne latérale d'un acide aminé lysine, ou entre la fonction α-aminique de l'acide aminé en position N-terminale, de la chimiokine et la fonction carboxylique ou sulfonique, respectivement, de la molécule de marquage, ou entre la fonction carboxylique d'un acide aminé aspartique ou glutamique de la chimiokine et une fonction aminique de la molécule de marquage. Ce couplaqe peut être réalisé aussi à travers une liaison thioether entre la fonction thiol d'un acide aminé cystéine de la chimiokine et une fonction maleimide ou iodoacétyl de la molécule de marquage.
Ce marquage peut être réalisé aussi en utilisant, pendant la synthèse de la séquence de la chimiokine, un acide aminé qui est déjà lié à un marqueur tel que ceux précités, par exemple l'acide aminé biotinyl-L-lysine (biocytine) ou un autre dérivé de la biotine. C'est le cas notamment du procédé de l'invention comprenant les étapes α et β précédemment citées.
Le couplage peut également être indirect. En effet, il est possible que la molécule de marquage greffée directement sur la chaîne latérale d'un acide aminé présente une gêne stérique pour le repliement de la chimiokine et/ou présente une gêne stérique pour la liaison de la chimiokine marquée avec un récepteur ou un ligand. C'est pourquoi, il peut être nécessaire de "prolonger" la chaîne latérale de l'acide aminé au moyen d'un bras, qui peut être par exemple une molécule organique comportant à une première extrémité une fonction chimique de liaison avec la fonction réactive de l'acide aminé déterminé, et à une deuxième extrémité une fonction chimique de liaison avec la molécule de marquage ou un précurseur de celui-ci, par exemple l'acide 6-aminocaproïque .
Un "bras" peut également être greffé sur la fonction α-aminique de l'acide aminé de l'extrémité N- terminale de la séquence de la chimiokine. Ce "bras" peut être greffé sur la fonction réactive de la chaîne latérale de l'acide aminé déterminé, ou sur la fonction α-aminique de l'acide aminé de l'extrémité N-terminale de la séquence de la chimiokine synthétisée, par l'une quelconque des réactions chimiques permettant de former une liaison covalente entre la fonction chimique de liaison du bras avec la fonction réactive de la chaîne latérale de l'acide aminé déterminé, et le marqueur peut être couplé au bras par l'une quelconque des réactions chimiques classiques permettant de former une liaison covalente entre la fonction chimique de liaison du bras avec le marqueur, ou un précurseur de celui-ci, et ce dernier . Dans une variante selon l'invention, le "bras" peut être présent ou fixé sur la molécule de marquage. Ce "bras" peut être un de ceux précités.
Selon l'invention, dans certains cas, c'est une séquence modifiée de la chimiokine qui peut être fabriquée.
En effet, si on désire marquer un acide aminé déterminé, à une position déterminée dans la séquence de la chimiokine, qui ne possède pas de fonction réactive sur sa chaîne latérale, tel que la glycine, l'alanine, la valine, la leucine, 1 ' isoleucine, on peut remplacer ledit acide aminé à ladite position déterminée par un autre acide aminé possédant une fonction chimique réactive sur sa chaîne latérale tel que la lysine, la cystéine, la serine, l'acide aspartique, l'acide glutamique, lors de la synthèse de la chimiokine.
Selon l'invention, l'acide aminé qui ne possède pas de fonction réactive sur sa chaîne latérale peut aussi être remplacé par toute molécule possédant au moins une fonction -NH2, au moins une fonction -COOH et au moins une chaîne latérale possédant une fonction réactive utile pour le couplage à la molécule de marquage .
Ainsi, à cette position déterminée, l'acide aminé remplaçant l'acide aminé de la séquence non modifiée de la chimiokine, ou séquence d'origine, peut être marqué par une molécule de marquage ou un précurseur de celle- ci .
Il sera aisément compris par l'homme du métier que plusieurs acides aminés de la séquence de la chimiokine peuvent ainsi être remplacés si nécessaire pour marquer la chimiokine en plusieurs positions déterminées.
De préférence, selon le procédé de l'invention, la chimiokine marquée synthétisée doit pouvoir retrouver sa conformation tridimensionnelle d'origine pour pouvoir se fixer sur ses récepteurs ou adhérer à ses ligands. Aussi, lorsqu'on désire obtenir une chimiokine marquée qui a le même comportement pour ses récepteurs et ses ligands que la chimiokine non marquée, il est préférable que le marquage soit effectué au niveau d'un, ou de plusieurs, acide(s) aminé(s) de telle sorte que ce marquage ne gêne pas le repliement de la chimiokine dans sa conformation tridimensionnelle d'origine, autrement dit la position déterminée dans la séquence d'acides aminés de la chimiokine peut être une position de la séquence qui ne gêne pas l'activité biologique de la chimiokine.
Toutefois, il peut aussi être décidé de gêner volontairement le repliement de la chimiokine, pour fabriquer une chimiokine marquée n'ayant pas la même conformation tridimensionnelle que la chimiokine non marquée correspondante. Une telle chimiokine peut en effet être utile pour l'étude des interactions de la chimiokine avec ses récepteurs et/ou ses ligands. De plus, le procédé da la présente invention permet de fabriquer une chimiokine modifiée, marquée, de manière à modifier sa conformation tridimensionnelle et/ou à modifier son ou ses interaction (s) avec ses récepteurs et/ou ses ligands. Dans ce cas, lors de la synthèse de la chimiokine, certains acides aminés requis pour la synthèse de la chimiokine sont remplacés par d'autres acides aminés. Ces acides aminés seront choisis en fonction de leur rôle dans la conformation du peptide. La chimiokine modifiée marquée obtenue peut être utile pour l'étude de ses interactions avec ses récepteurs et/ou ses ligands.
Par séquence modifiée de la chimiokine, il peut donc être compris : - soit une séquence modifiée spécialement pour fixer une molécule de marquage, ou un précurseur de celle-ci, à une position déterminée de la séquence de la chimiokine, là où l'acide aminé d'origine ne possède pas de fonction réactive sur sa chaîne latérale, cette modification étant destinée à remplacer l'acide aminé d'origine par un acide aminé possédant une telle fonction,
- soit une séquence modifiée spécialement pour modifier la conformation tridimensionnelle de la chimiokine et/ou à modifier son ou ses interactions avec ses récepteurs et/ou ses ligands,
- soit une combinaison de ses modifications.
Le tableau (II) suivant regroupe des exemples de chimiokines qui peuvent être synthétisées marquées, et éventuellement modifiées, selon le procédé de la présente invention, ainsi que leurs récepteurs cellulaires respectifs connus. Tableau (II)
Figure imgf000019_0001
Comme nous l'avons vu précédemment, RANTES est un peptide comprenant 68 acides aminés.
Le procédé selon l'invention permet par exemple de fabriquer RANTES marquée en une position déterminée telle que par exemple la position 66 ou 67 à l'extrémité C-terminale de ce peptide, ou encore la position 1, 25, 33 ou 45, par exemple avec une biotine. La séquence d'acides aminés de RANTES est décrite précédemment, et il n'est pas nécessaire ici de la réécrire. Simplement, il est à noter qu'à la position 67 de RANTES se trouve une méthionine. Cet acide aminé ne présentant pas de fonction réactive sur sa chaîne latérale, selon le procédé de la présente invention, il peut être remplacé par exemple par une lysine qui présente une fonction réactive -NH2 sur sa chaîne latérale, ou par une cystéine qui présente une fonction réactive -SH sur sa chaîne latérale.
Selon l'invention, l'étape de récupération du procédé peut être une étape de récupération classique d'un peptide, elle peut comprendre une étape de un traitement classique de la séquence polypeptidique obtenue qui permet la formation d'éventuels ponts disulfures dans la séquence peptidique synthétisée et la purification de la chimiokine marquée.
Cette étape de récupération peut par exemple comprendre deux étapes de purification par chromatographie en phase liquide haute pression en phase inversée.
Le procédé de la présente invention présente de nombreux avantages par rapport aux procédés de l'art antérieur. En effet, il permet de fabriquer effectivement, de manière reproductible, une chimiokine modifiée ou non, marquée de manière homogène sur un, ou plusieurs, acide (s) aminé (s) déterminé (s) à une, ou plusieurs, positions déterminées de la séquence de la chimiokine . De plus, du fait d'un marquage spécifique en une position déterminée de la séquence, le rendement de synthèse du procédé de la présente invention est excellent par rapport aux procédés de l'art antérieur qui utilisent des protéines recombinantes marquées de manière aléatoire. En effet, les procédés de l'art antérieur ne permettent pas d'obtenir une chimiokine, modifiée ou non, marquée en une, ou plusieurs, position (s) déterminée (s) conformément à la présente invention, et nécessitent de nombreuses étapes de purification sans obtenir le résultat de la présente invention .
De plus, le procédé de l'invention est économique par rapport aux procédés de recombinaison génétique de l'art antérieur, car il fait intervenir des réactions chimiques qui sont facilement contrôlables et nécessitent moins d'étapes et de précautions opératoires .
Le procédé de la présente invention est donc en particulier très intéressant pour une production en masse d'une chimiokine marquée, mais aussi pour une fabrication en laboratoire.
Selon l'invention, lorsque la chimiokine est RANTES, elle peut être également marquée à une autre position de la séquence qui ne gêne pas les propriétés biologiques de la chimiokine, par exemple avec une biotine .
Selon l'invention, lorsque la chimiokine est RANTES, elle peut être également marquée à une autre position de la séquence qui ne gêne pas les propriétés biologiques de la chimiokine, par exemple avec une biotine .
La présente invention se rapporte également à une chimiokine marquée caractérisée en ce que ladite chimiokine est une chimiokine modifiée ou non modifiée, dont la séquence d'acide aminé est marquée au niveau d'un acide aminé déterminé à une position déterminée de ladite séquence, ladite chimiokine étant susceptible d'être obtenue par le procédé de la présente invention. Selon l'invention, la chimiokine peut être une de celles citées dans le tableau (II) précédent, par exemple RANTES, IL-8, etc..
Selon l'invention, la molécule de marquage peut être une de celles précitées, ou toute autre molécule de marquage qui peut être couplée à une chimiokine par le procédé de la présente invention.
Selon l'invention, lorsque la chimiokine est RANTES, elle peut être modifiée de manière à comporter en position 67, à côté de l'extrémité C-terminale, par exemple une lysine ou une cystéine ou d'autres acides aminés adaptés pour un couplage à la molécule de marquaqe, à la place de la méthionine. Dans ce cas, elle peut être marquée par couplage avec une biotine. Selon l'invention, lorsque la chimiokine est RANTES, elle peut être également marquée par exemple en position 66, à côté de l'extrémité C-terminale, en position 45, 33 ou 25, ou sur la fonction α-aminique de l'acide aminé de l'extrémité N-terminale de la séquence de RANTES, c'est-à-dire en position 1 de la séquence, par exemple avec une biotine.
La présente invention se rapporte également à une composition comprenant une chimiokine marquée, caractérisée en ce que ladite composition comprend, de manière homogène et au choix, une ou plusieurs chimiokines marquées de la présente invention.
Selon l'invention, ladite composition peut comprendre de manière homogène une chimiokine marquée en une seule position déterminée de sa séquence d'acide aminé. Par exemple, lorsque la chimiokine est RANTES, la composition selon l'invention peut comprendre de manière homogène RANTES marqué au choix en une ou plusieurs position (s) déterminée (s) de sa séquence, par exemple à la position 67 de sa séquence d'acides aminés, du côté de l'extrémité C-terminale. Comme décrit précédemment, cette chimiokine peut être également marquée à une autre position de la séquence, par exemple qui ne gêne pas les propriétés biologiques de la chimiokine, par exemple avec une biotine.
Comme nous l'avons vu précédemment, une chimiokine marquée en une position déterminée, selon l'invention, c'est-à-dire de manière homogène et reproductible, est extrêmement utile dans les études des récepteurs et ligands des chimiokines, par exemple pour la compréhension des mécanismes intimes de reconnaissance et de liaison du VIH avec ses cellules cibles. Ces études sont nécessaires notamment pour le développement de nouvelles thérapies et de nouveaux médicaments pour lutter contre de nombreuses maladies, par exemple contre le SIDA ou d'autres pathologies telles que celles citées dans le tableau I précédent
Aussi, la présente invention se rapporte également à une trousse d'analyse d'un récepteur et/ou d'une molécule d'adhésion d'une chimiokine, caractérisé en ce qu'il comprend une composition selon l'invention.
Selon l'invention, cette trousse peut comprendre en outre un réactif adéquat permettant de détecter la ou les chimiokine (s) marquée (s) de la composition. Selon l'invention, la chimiokine peut être par exemple une de celles citées dans le tableau (II) précédent, par exemple RANTES ou IL-8.
Lorsque la chimiokine est RANTES, elle peut être marquée par exemple en position 66, ou 67 par exemple avec une biotine.
Selon l'invention, le réactif révélant la présence du marqueur sera fonction de la molécule de marquage utilisée, ou du précurseur de celle-ci. Par exemple, ce réactif peut être 1 ' avidine ou la streptavidine lorsque la molécule de marquage de la chimiokine est la biotine .
D'autres caractéristiques et avantaqes de la présente invention apparaîtront encore à la lecture des figures en annexe et des exemples qui suivent donnés, bien entendu, à titre illustratif et non limitatif.
Brève description des figures - les figures 1A et 1B sont des tracés réalisés à partir de résultats d'analyse de masse par électropulvérisation de RANTES biotinylé selon l'invention ;
- la figure 2 montre une série de courbes illustrant la fixation de différentes formes de
RANTES biotinylé selon l'invention à différentes positions déterminées de sa séquence (RANTES-bl, -b25, -b33, -b45 et -b67) et à différentes concentrations (10 n , 50 nM, 100 nM) à des macrophages dérivés de monocytes
(MDM) de type 5d ;
- les figures 3A et 3B représentent deux courbes illustrant l'effet d'un traitement enzymatique spécifique des proteoglycanes sur la fixation de RANTES-b67 aux MDM-5d et MDM-MCSF
("Macrophage Colony-Stimulating Factor") respectivement ;
- les figures 4(1), 4(11), 4(111) et 4 (IV) représentent quatre courbes illustrant la fixation de RANTES-b67 sur des cellules
Hela/CD4 (figures 4(1) et 4(11)) et sur des cellules Hela/CD4/CCR-5 (figures 4(111) et 4 (IV) . Exemple 1 : Synthèse d ' une chimiokine marquée selon 1 procédé de la présente invention
Cet exemple décrit la préparation d'un dérivé biotinylé de RANTES marqué spécifiquement, par synthèse en phase solide selon le procédé de la présente invention.
Dans cet exemple, la position 67 à côté de l'extrémité C-terminale de RANTES a été choisie pour le marquaqe comme étant la position déterminée. Cette position de marquage permet une bonne exposition aux solvants et est assez éloignée de l'extrémité N- terminale, qui est présumée être la région de liaison avec le récepteur de RANTES, pour ne pas gêner l'interaction de RANTES marqué avec son récepteur. La molécule de marquage choisie est la biotine.
Comme nous l'avons vu précédemment, RANTES possède en position 67, à côté de l'extrémité C-terminale, une méthionine, (Met67) qui n'a pas de fonction réactive sur sa chaîne latérale. De ce fait, lors de la synthèse de RANTES, cette méthionine est remplacée par une lysine qui présente une fonction aminé sur sa chaîne latérale .
Le groupement protecteur de la fonction α-aminique pour les acides aminés requis pour synthétiser RANTES est le 9-fluorenylméthyloxycarbonyle (Fmoc) , sauf pour l'acide aminé de l'extrémité N-terminale qui comporte le groupement tertio-butyloxycarbonyle (tBoc) . Les groupements protecteurs des fonctions réactives des chaînes latérales des acides aminés requis pour synthétiser RANTES sont les suivants : tertio-butyl éther pour la fonction -OH des acides aminés serine, thréonine ; tyrosine ; tertio-butyl ester pour la fonction -COOH des acides aminés acides aspartique et glutamique ; 2, 2, 5, 7 , 8-pentaméthylchromane-6-sulphonyl pour la fonction guanidinium de l'acide aminé arginine ; trityl pour la fonction amide des acides aminés asparagine et glutamine, pour la fonction -SH des acides aminés cystéine et l'azote imidazolique de l'acide aminé histidine ; tertio-butyloxycarbonyl pour la fonction -NH2 de acides aminés lysine.
Le qroupement protecteur orthogonal pour la lysine déterminée, à la position 67 à côté de l'extrémité C- terminale (lys67) de RANTES choisi dans cet exemple est 1- ( , 4-diméthyl-2, 6-dioxocyclohexylidène) éthyle (Dde).
La synthèse de RANTES modifiée à partir des acides aminés requis ayant leur fonction réactive protégée est réalisée dans un synthétiseur automatique de type
Applied Biosystems Model 433, Foster City, California, USA, en utilisant 100 mg de l'ester Fmoc- Serine (tertiobutyl) de la résine p- hydroxyméthylphénoxyméthyl polystyrène, avec une charge de 0,5 mmol/g, 200-400 mesh de la Société Novabiochem, France . L'assemblage de la chaîne polypeptidique de RANTES a été réalisé en utilisant 1 mmole de chaque acide aminé sous forme protégé et à travers un couplage à la résine pendant 30 minutes de chaque acide aminé, sous forme d'un ester actif de N-hydroxyazabenzotriazole (HOAt) . L'ester actif de chaque acide aminé a été formé en utilisant 1 mmole de N, N ' -dicyclohexylcarbodiimide et 1 mmole de N-hydroxyazabenzotriazole dans le solvant N-méthylpyrrolidone . Le solvant utilisé dans la synthèse est du N-méthylpyrrolidone. Après chaque cycle d'assemblage d'un acide aminé, le groupement protecteur Fmoc de la fonction α-aminique est retiré par deux traitements de 5 minutes avec une solution de pipéridine 20% dans le solvant N-méthylpyrrolidone.
Lorsque la synthèse est terminée, on obtient une séquence peptidique modifiée en position 67 de RANTES, dans laquelle la fonction α-aminique de l'acide aminé de l'extrémité N-terminale est protégée par un groupement tertio-butyloxycarbonyl (tBoc) , les fonctions réactives des chaînes latérales des acides aminés requis sont protégées par des groupements protecteurs appropriés et dans laquelle la lysine 67 est protégée par un groupement protecteur orthogonal, différent des autres groupements protecteurs, de telle sorte qu'il puisse être retiré de la fonction -NH2 de la chaîne latérale de la lysine 67 indépendamment des autres groupements protecteurs des fonctions réactives des autres acides aminés, cette séquence peptidique modifiée de RANTES étant fixée sur la résine.
Le groupement protecteur de la chaîne latérale de la lysine 67 est alors retiré spécifiquement en traitant le peptide lié à la résine trois fois 2 minutes avec une solution de méthylpyrrolidone à 2% d'hydrazine et un "bras" ("spacer") 6-aminocaproyl est alors incorporé, en couplant l'acide Fmoc- 6-aminocaproιque par un traitement de deux fois une heure en milieu hexafluorophosphate de 2-(lH- benzotriazole-1-yl) -1,1,3, 3-tétraméthyluronium (HBTU) avec un excès 20 fois molaire du "bras" 6-aminocaproyl . Le groupe Fmoc a ensuite été clivé par deux traitements de 5 minutes avec une solution comprenant 20% de pipéridine dans du N-méthylpyrrolidone et la biotine a été finalement couplée au peptide lié à la résine, avec un excès 20 fois molaire de biotine, pendant une nuit, en milieu HBTU. Après le marquage avec la biotine, le peptide a été détaché de la résine et libéré de tous ces groupements protecteurs par un traitement acide de 90 minutes en utilisant un mélange contenant 82,5% d'acide trifluoroacétique, 5% de phénol, 5% d'eau, 5% de thioanisole et 2,5% d'éthane dithiol. Le peptide complètement "déprotégé" a été précipité de la solution acide par addition avec de 1 ' isopropyléther, le précipitât a été lavé deux fois avec l'éther, puis dissous dans une solution d'acide acétique 30% dans l'eau et enfin récupéré sous forme de poudre blanche après lyophilisation.
RANTES obtenu, biotinylé en position 67 du côté C- terminal de sa séquence peptidique (noté ci-après RANTES b-67), a été purifié par chromatographie en phase liquide haute pression en phase inversée ("reverse-phase HPLC"), d'abord sous forme réduite, puis après formation des ponts disulfure de RANTES.
La pureté de RANTES biotinylé a été vérifiée par une analyse HPLC et une électrophorèse capillaire. L'identité du produit a été vérifiée par une analyse d'acides aminés et une spectrométrie de masse par électropulvérisation. Les figures 1A et 1B illustrent les résultats de cette analyse :
- figure 1A : résultats de l'analyse de masse par électropulvérisation de RANTES biotinylé, selon l'invention. Les masses 1020,5 ; 1166,0 ; 1360,2 ; et 1631,9 Da (Dalton) correspondent aux molécules de RANTES biotinylées présentant, respectivement 8, 7, 6 et 5 charges positives comme conséquence de l'addition de 8, 7, 6 et 5 protons dans la chambre d'ionisation,
- figure 1B : masse moyenne calculée sur les espèces multichargées observées dans le spectre A. La masse déterminée est de 8155.0 Da. La masse théorique est de 8155.1 Da .
Exemple 2 : Utilisation du composé selon 1 ' invention
Afin de tester la fixation de RANTES biotinylé synthétisé dans l'exemple 1 sur des cellules en culture primaire, nous avons utilisé des macrophages dérivés de monocytes (MDM) , qui ont été obtenus suivant un premier protocole qui correspond à une adhérence de 5 jours de cellules mononucléaires du sang (PBMC) de donneurs sains (MDM-5d) . Les cellules non-adhérentes ont été retirées et les MDM ont été cultivés pendant deux jours .
Une préparation différente de macrophages (MDM- MCSF) a été obtenue selon le second procédé suivant : adhérence d'une heure et culture pendant 7 jours en présence du facteur de croissance "macrophage colony- stimulating Factor" M-CSF recombinant exogène.
Les MDM-5d et les MDM-MCSF ont été caractérisés par un marquage immunofluorescent avec des anticorps monoclonaux FITC-I0T3 pour CD3, FITC-I0B4a pour CD19 et FITC-IOT4a pour CD4, ou un anticorps monoclonal témoin négatif FITC-IgGl (Société Immunotech, Marseille, France) .
Ces deux préparations contiennent des macrophages ayant différents états d ' activation . En fait, le métabolisme des proteoglycanes est hautement régulé dans les macrophages et dépend de l'état d' activation de ces derniers.
5xl05 MDM par cupule, préparés sous ces deux conditions ont été incubés en présence d'un anticorps anti-CCR-5 marqué à la fluorescéine (Société R&D) . L'expression de CCR-5 est similaire dans les deux conditions .
Nous avons ensuite examiné la fixation de RANTES biotinylé sur ces cellules. 5xl05 MDM par cupule, préparés sous les deux conditions ont été incubés avec différentes concentrations de RANTES biotinylé fabriqué dans l'exemple 1 dans 200 μl de PBS-BSA à 4°C pendant 30 minutes. Après cela, les cellules ont été lavées, imprégnés avec de la streptavidine-phycoerythrine (SPE) (1:800 ; de la société Becton-Dickinson) et examinées par analyse FACS (marque déposée) (FACStar, Plus, société Becton-Dickinson, San José, USA) . RANTES biotinylé se lie avec MDM-5d d'une manière dose-dépendante, c'est-à- dire en fonction de la quantité de RANTES, de manière plus efficace qu'avec MDM-MCSF.
Par ailleurs, nous avons testé les propriétés chimiotactiques de RANTES b-67 et nous avons observé que cette molécule a une activité chimiotactique similaire à RANTES non marqué.
Afin de tester si RANTES biotinylé peut interagir avec les proteoglycanes à côté de CCR-5, nous avons traité les MDM pendant 1 heure à 37°C avec 4 mU d' héparitinase (EC.4.2.2.8) ou de chondroïtinase (EC.4.2.2.4) (de la société Sigma, Saint-Louis, MO) dans 200 μl de PBS, 1 mg/ml d'albumine de sérum bovin (PBS-BSA) , qui élimine les sulfates d'héparine et de chondroïtine des proteoglycanes respectivement. Les cellules ont été ensuite lavées et incubées avec RANTES biotinylé fabriqué dans l'exemple 1, puis imprégnés avec la SPE et analysées par FACS comme indiqué ci- dessus . En traitant MDM-5d avec de la chondroïtinase, qui élimine de la surface des cellules le sulfate de chondroïtine, la liaison avec RANTES a été inhibée, mais aucun effet n'a été noté avec 1 ' héparitinase. En fait, les macrophages n'expriment pas l'héparine sulfate. L'effet de la chondroïtinase sur l'affaiblissement de la liaison de RANTES avec MDM-MCSF était moins évident qu'avec MDM-5d.
Ces résultats montrent que RANTES biotinylé de l'invention interagit, en plus d'avec CCR-5, avec les proteoglycanes des macrophages. La présente invention a donc permis de fournir une preuve de la variation de l'expression des proteoglycanes selon l'état d' activation des macrophages.
La figure 2 en annexe représente une série de courbes illustrant la fixation de différentes formes de RANTES biotinylé selon la présente invention, à différentes positions déterminées de sa séquence d'acides aminés (aa) : aal, aa25, aa33, aa45 et aa67, notés RANTES-bl, -b25, -b33, -b45 et -b67 respectivement, et à différentes concentrations (10 nM, 50 nM, 100 nM) à des macrophages dérivés de monocytes MDM-5dd.
Les macrophages dérivés de monocytes (5xl05 cellules) ont été obtenus par adhérence de 5 jours (MDM-5d) et ont été incubés avec des concentrations variables (10 nM, 50 nM, 100 nM) de RANTES biotinylé à des positions variables de sa séquence d'acides aminés, notés RANTES-bl, -b25, -b33, -b45 et -b67, pendant 30 mn à 4°C. Après lavage, les cellules ont été imprégnées avec de la streptavidine-phycoerythrine (SPE) , puis examinées, après lavage et fixation à la PFA (paraformaldéhyde) , par analyse par FACS. Les histogrammes pleins (témoins) représentent l'intensité de fluorescence des cellules non incubées avec RANTES mais imprégnées avec la SPE. Les histogrammes vides correspondent à l'intensité de fluorescence obtenue lorsque les cellules ont été incubées avec RANTES biotinylé puis la SPE.
Ces résultats montrent que les différentes formes de RANTES biotinylé à des positions diverses n'ont pas la même capacité de fixation aux cellules. La meilleure fixation est obtenue avec RANTES biotinylé à la position 67 (RANTES b-67).
Les figures 3A et 3B en annexe représentent deux courbes illustrant l'effet d'un traitement enzymatique spécifique des proteoglycanes sur la fixation de RANTES-b67 aux MDM-5d et MDM-MCSF respectivement.
Les MDM-5d et les MDM-MCSF ont été obtenus comme précédemment. 5xl05 cellules (MDM-5d ou MDM-MCSF) ont été traitées avec la chondroïtinase (histogrammes a) ou
1 ' héparitinase (histogrammes b) ou non traitées
(histogrammes c) comme décrit précédemment. Les cellules ont été ensuite incubées avec RANTES-b67
(50 nM) , puis imprégnées avec la SPE, et analysées par FACS. Les histogrammes pleins correspondent aux cellules non incubées avec RANTES mais traitées à la SPE.
Ces résultats montrent d'une part que RANTES b-67 se fixe plus efficacement aux MDM-5d qu'aux MDM-MCSF. Comme l'expression de CCR-5, récepteur de RANTES, est similaire sur les deux types cellulaires, cette différence dans la fixation serait due à une différence dans l'expression des proteoglycanes, en particulier les sulfates de chondroïtine dont l'enlèvement par la chondroïtinase ramène la fixation de RANTES à un niveau similaire à celui des MDM-MCSF. Ces dernières cellules ne semblent pas exprimer ce type de proteoglycanes.
Exemple 3 : Analyse par cytométrie de flux (FACS) de lignées cellulaires Hela liant RANTES
Des lignées cellulaires exprimant CD4 (Hela/CD4), ou CD4 et CCR-5 (Hela/CD4/CCR-5 ) ont été obtenues de l'Institut Pasteur, France. Elles ont été cultivées dans du DMEM comprenant 500 μg/ml de l'antibiotique généticine G418, 10% de sérum de foetus de veau, et 50 μg/ml de Penicilline-Streptomycine-Néomycine .
Les cellules ont été récupérées par adjonction de PBS froid à 1 mM EDTA, et prélèvement au moyen d'une spatule. Les cellules ont été mises en suspension à raison de 2xl05 cellules dans 100 μl de PBS à 1 mg/ml de BSA, et incubées pendant 30 minutes à 4°C avec différentes concentrations de RANTES biotinylé en position 67 (b-67) obtenu dans l'exemple 1. Après cela, les cellules ont été lavées, et mises en contact avec de la SPE (1:800 de la société Becton-Dickinson) et examinées par analyse par cytométrie de flux tel que dans l'exemple 2.
Comme indiqué, RANTES biotinylé B67 se lie d'une manière dose-dépendante à la fois aux cellules Hela (CD4 et aux cellules Hela/CD4/CCR-5) . Toutefois, la liaison la plus efficace a été notée avec les cellules Hela/CCR-5) .
Le fait que RANTES puisse aussi se lier à des cellules n'exprimant pas le récepteur CCR-5 de RANTES n'est pas surprenant car, comme décrit ci-dessus, RANTES est connu pour se lier aux proteoglycanes qui sont exprimées par les lignées cellulaires Hela, en particulier l'héparine sulfate.
Pour montrer que RANTES B67 interagit avec des proteoglycanes de surface cellulaire, 2xl05 cellules Hela/CD4 ou Hela/CD4/CCR-5 en suspension dans 100 μl de PBS comprenant 1 mg/ml d'albumine de sérum bovin (PBS- BSA) , ont été traitées ou non pendant une heure à 37 CC avec 2 mU d' héparitinase (EC.4.2.2.8) ou de la chondroïtine (EC.4.2.2.4) (Société Sigma, Saint-Louis) qui enlève les sulfates d'héparine et de chondroïtine respectivement de proteoglycanes.
Après une heure, les cellules ont été lavées et incubées pendant 30 minutes avec RANTES biotinylé B67 selon l'invention, dans 100 μl de PBS-BSA à 4°C. Après cela, les cellules ont été lavées, mises en contact avec de la SPE (1:800, de la Société Becton-Dickinson), et examinées par analyse FACS comme ci-dessus.
Le traitement des cellules avec 1 ' héparitinase, qui enlève les sulfates d'héparine des surfaces des cellules, inhibe la liaison de RANTES à la surface de ces cellules, mais aucun effet n'a été noté avec la chondroïtinase.
Il est important de noter que tandis que le traitement avec 1 ' héparitinase supprime les liaisons de RANTES avec les cellules Hela/CD4, un tel traitement réduit drastiquement mais ne supprime pas complètement les liaisons de RANTES avec Hela/CD4/CCR-5. Ces résultats montrent que RANTES B67 interagit, en plus de CCR-5, avec les proteoglycanes, en particulier avec le sulfate d'héparine sur les cellules.
Les figures 4(1), 4(11), 4(111) et (IV) représentent quatre courbes illustrant la fixation de
RANTES-b67 sur des cellules Hela/CD4 (figures 4(1) et 4(11)) et sur des cellules Hela/CD4/CCR-5 (figures
4 (III) et 4 (IV) ) .
Les cellules Hela/CD4 ou Hela/CD4/CCR-5 décrites précédemment ont été incubées ou non avec des concentrations variables de RANTES-b67 : 0 nM (courbes a) , 10 nM (courbes b) , 50 nM (courbes c) ou 100 nM
(courbes d) . Alternativement, les cellules ont été préalablement traitées avec de 1 ' héparitinase (courbes e) comme décrit précédemment. La fixation de RANTES est déterminée par FACS comme dans le cas des exemples illustrés par les figures 2, 3A et 3B.
Sur les figures 4(1), (II), (III) et (IV) : a-cellules + SPE (streptavidine-phycoerythrine) b-cellules + RANTES-b67 (10 nM) + SPE c-cellules + RANTES-b67 (50 nM) + SPE d-cellules + RANTES-b67 (100 nM) + SPE e-(cellules+héparitinase) + RANTES-b67 (50 nM) + SPE.
RANTES biotinylé, en relation avec la disponibilité commerciale des conjugués avidines/streptavidine peut être utilisé pour la détection et l'étude des récepteurs et d'autres ligands des chimiokines, par exemple des proteoglycanes, à la surface des cellules ou dans des préparations de membranes. RANTES biotinylé en position 67 peut être préparé par synthèse en phase solide selon le procédé de la présente invention.
Différents procédés chimiques peuvent être utilisés pour assembler RANTES par une méthode de synthèse en phase solide avec des résultats similaires à ceux de la présente invention. La chimie de synthèse peptidique qui utilise par exemple le groupement protecteur tertiobutyloxycarbonyl (tBoc) pour la fonction α-aminique des acides aminés et les groupements protecteurs pour les chaînes latérales réactives des acides aminés stables en milieu acide trifluooacétique et clivables en milieu acide fluorhydrique, connus par l'homme du métier, peuvent également être utilisés. Dans ce cas, d'autres groupements protecteurs orthogonaux connus par l'homme du métier doivent être utilisés.
De plus, des formes recombinantes de RANTES peuvent être spécifiquement biotinylées. Par exemple en incorporant une cystéine en position 67 ou 66, la fonction thiol réactive de la chaîne latérale peut être spécifiquement marquée en utilisant des réactifs de biotinylation disponible dans le commerce comme le 1- biotinamido-4- (4 ' -maleimidométhyl) cyclohexane- carboximido) butane, la N-iodoacétyl-N-biotinyl hexylène diamine, la N- (6 (biotinamido) hexyl) -3 ' - (2 ' - pyridyldithio) propionamide, etc..

Claims

REVENDICATIONS
1. Procédé de synthèse d'une chimiokine marquée comprenant les étapes suivantes : α) une synthèse chimique peptidique, de préférence en phase solide, de la séquence d'acides aminés de la chimiokine, ou d'une séquence modifiée de celle-ci, à partir des acides aminés requis, dans laquelle les chaînes latérales des acides aminés requis sont protégées par des groupements protecteurs appropriés, et dans laquelle au moins un acide aminé, à au moins une position déterminée de ladite séquence est couplé à une molécule de marquage, de manière à obtenir une séquence de la chimiokine marquée au niveau dudit acide aminé déterminé, β) une récupération de ladite séquence marquée obtenue à 1 ' étape α) .
2. Procédé de synthèse d'une chimiokine marquée, comprenant les étapes suivantes : a) une synthèse chimique peptidique, de préférence en phase solide, de la séquence d'acides aminés de la chimiokine, ou d'une séquence modifiée de celle-ci, à partir des acides aminés requis, dans laquelle les fonctions réactives des chaînes latérales des acides aminés requis et la fonction réactive α-aminique de l'acide aminé N-terminal de la séquence synthétisée sont protégées par des groupements protecteurs appropriés, et dans laquelle au moins un groupement protecteur d'un acide aminé déterminé, à au moins une position déterminée de ladite séquence, est orthogonal et choisi de telle sorte qu'il puisse être retiré de la fonction réactive de la chaîne latérale dudit acide aminé déterminé à ladite position déterminée, indépendamment du ou des autres groupements protecteurs des fonctions réactives des autres acides aminés de la séquence, b)un retrait dudit groupement protecteur orthogonal dudit acide aminé déterminé à la position déterminée de la séquence de la chimiokine obtenue à l'étape a), de manière à libérer ladite fonction réactive dudit acide aminé déterminé, c)un couplage dudit acide aminé déterminé, par ladite fonction réactive libérée dans l'étape b) , soit directement, soit indirectement, avec une molécule de marquage de manière à obtenir une séquence de la chimiokine marquée au niveau dudit acide aminé déterminé, d)un retrait des autres groupements protecteurs, différents dudit groupement protecteur orthogonal, de la séquence de la chimiokine marquée obtenue à l'étape c) de manière à obtenir une séquence d'acides aminés marquée de la chimiokine, ou une séquence d'acides aminés modifiée marquée de celle-ci, au niveau d'un acide aminé déterminé à une position déterminée, et e)une récupération de ladite séquence marquée obtenue à l'étape d) .
3. Procédé selon la revendication 1 ou 2, dans lequel la synthèse chimique étant faite en phase solide, elle est réalisée dans un synthétiseur automatique de peptides.
4. Procédé selon la revendication 1 ou 2, dans lequel la synthèse chimique en phase solide est réalisée en utilisant le groupement protecteur 9- fluorenylméthyloxycarbonyle pour la fonction α-aminique des acides aminés, et/ou le groupement protecteur terio-butyloxycarbonyle pour la fonction α-aminique de l'acide aminé N-terminal.
5. Procédé selon la revendication 1 ou 2, dans lequel les groupements protecteurs différents du groupement protecteur orthogonal sont des molécules qui forment avec les fonctions réactives à protéger une liaison stable en milieu basique, mais clivable en position basique.
6. Procédé selon la revendication 1 ou 2, dans lequel la synthèse chimique peptidique en phase solide est réalisée en présence d' hexafluorophosphate de 2- (lH-benzotriazol-1-yl) 1, 1, 3, 3-tétraméthyluronium, ou d'un mélange de la N, N ' -dicyclohexylcarbodiimide et de N-hydroxyazabenzotriazole .
7. Procédé selon la revendication 2, dans lequel le, au moins un, groupement protecteur orthogonal est choisi en fonction de la synthèse chimique peptidique utilisée et de la fonction réactive à protéger dans un ensemble comprenant, le fluorénylméthoxylcarbonyle, le 1- (4, 4-diméthyl-2, 6-dioxocyclohexylidène) éthyle, le 4- méthyltrityle, 1 ' allyloxycarbonyle, l'allyle, le 4[N-[1- (4 , 4-diméthyl-2, 6-dioxocyclohexylidène) -3-méthylbutyl]- amino]benzyle, le trityle et le S-tertio-butylthio.
8. Procédé selon la revendication 2, dans lequel l'acide aminé déterminé ne possédant pas de fonction réactive sur sa chaîne latérale, il est remplacé lors de la synthèse de l'étape a) par un acide aminé possédant une fonction réactive sur sa chaîne latérale.
9. Procédé selon l'une quelconque des revendications 2 à 8 précédentes lorsqu'elles ne dépendent pas de la revendication 1, dans lequel le marquage étant indirect, la chaîne latérale de l'acide aminé déterminé, ou la fonction α-aminique de l'acide aminé N-terminal de la séquence de la chimiokine synthétisée, est prolongée au moyen d'un bras qui est une molécule organique comportant à une première extrémité une fonction de liaison avec la fonction réactive dudit acide aminé, et à une deuxième extrémité une fonction chimique de liaison avec la molécule de marquage.
10. Procédé selon la revendication 9, dans lequel le bras est l'acide 6-aminocaproïque .
11. Procédé selon la revendication 7, dans lequel le groupement protecteur orthogonal étant le l-(4,4- diméthyl-2, 6-dioxocyclohexylidène) éthyle, ou le 4[N-[1- (4 , 4-diméthyl-2, 6-dioxocyclohexylidène) -3-méthylbutyl]- amino]benzyle, il est retiré de la fonction réactive de l'acide aminé déterminé à la position déterminée au moyen d'un traitement chimique à l'hydrazine.
12. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 11, dans lequel la molécule de marquage est choisie dans un ensemble comprenant la biotine, un dérivé de la biotine, et la fluorescéine ou un autre fluorochrome.
13. Procédé selon l'une quelconque des revendications 2 et 3 à 12 précédentes lorsqu'elles ne dépendent pas de la revendication 1, dans lequel le couplage avec la molécule de marquage est un couplage chimique destiné à former une liaison covalente entre la fonction réactive de l'acide aminé déterminé et la molécule de marquage.
14. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 13, dans lequel la chimiokine synthétisée est choisie dans un ensemble comprenant IL- 8, GRO -α, -β, -γ, ENA-78, NAP-2, IP-10, MIG, SDF-1, MlP-lα, MIP -lβ, MCP-1, RANTES, MCP-3, Eotaxine, Lymphotactine et GRO.
15. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel la position déterminée dans la séquence d'acide aminé de la chimiokine est une position de la séquence qui ne gêne pas l'activité biologique de la chimiokine.
16. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 15, dans lequel la chimiokine est RANTES .
17. Procédé selon la revendication 16, dans lequel la position déterminée dans la séquence d'acide aminé de RANTES est la position 66 ou 67 à côté de l'extrémité C-terminale, ou les positions 1, 25, 33 ou
45, de la séquence.
18. Procédé selon la revendication 16, dans lequel RANTES ayant une méthionine en position 67, cette méthionine est remplacée par une lysine ou une cystéine lors de l'étape de synthèse chimique peptidique de la chimiokine .
19. Procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 18, dans lequel la molécule de marquage est la biotine ou d'autres molécules qui sont reconnues par 1 ' avidine ou la streptavidine.
20. Procédé selon la revendication 1 dans laquelle l'acide aminé couplé à une molécule de marquage est choisi dans un ensemble comprenant la biocytine, ou un autre dérivé de la biotine.
21. Procédé selon l'une quelconque des revendications précédentes, dans lequel l'étape de récupération de ladite séquence marquée comprend une étape de purification de ladite séquence par deux étapes de chromatographie en phase liquide haute pression en phase inversée.
22. Chimiokine marquée caractérisée en ce que ladite chimiokine est une chimiokine modifiée ou non modifiée, dont la séquence d'acide aminé est marquée par une molécule de marquage au niveau d'un acide aminé déterminé à une position déterminée de ladite séquence, ladite chimiokine étant susceptible d'être obtenue par un procédé selon l'une quelconque des revendications 1 à 21.
23. Chimiokine selon la revendication 22, dans laquelle ladite molécule de marquage est choisie parmi la biotine, les dérivés de la biotine, une fluorescéine, les dérivés de la fluorescéine et toute autre molécule de marquage qui peut être couplée à ladite chimiokine par ledit procédé.
24. Chimiokine selon la revendication 22 ou 23, ladite chimiokine étant choisie parmi IL-8, GRO -α, -β, -γ, ENA-78, NAP-2, IP-10, MIG, SDF-1, MIP -la, MIP -lβ, MCP-1, RANTES, MCP-3, Eotaxine, Lymphotactine, GRO.
25. Chimiokine selon la revendication 22 ou 23, ladite chimiokine étant RANTES.
26. Chimiokine selon la revendication 25 dans laquelle RANTES est marqué en position 1, 25, 33, 45, 66 ou 67.
27. Chimiokine selon la revendication 25, dans laquelle RANTES est modifiée de manière à comporter en position 67, une lysine, ou une cystéine ou d'autres acides aminés adaptés pour un couplage à la molécule de marquage.
28. Chimiokine selon l'une quelconque des revendications 22 à 27, dans laquelle la chimiokine est marquée avec une biotine.
29. Composition comprenant une chimiokine marquée, caractérisée en ce que ladite composition comprend, de manière homogène et au choix, une, ou plusieurs, chimiokine (s) marquée (s) selon l'une quelconque des revendications 22 à 28.
30. Composition comprenant une chimiokine marquée, caractérisée en ce que ladite composition comprend de manière homogène et au choix une chimiokine marquée, ladite chimiokine marquée étant RANTES dans lequel la méthionine 67 a été remplacée par une lysine, ladite lysine étant couplée à la biotine.
31. Trousse d'analyse d'un récepteur et/ou d'une molécule d'adhésion d'une chimiokine, caractérisée en ce qu'elle comprend une composition selon la revendication 29 ou 30.
32. Trousse selon la revendication 31, comprenant en outre un réactif adéquat permettant de détecter la chimiokine marquée de ladite composition, ledit réactif étant choisi en fonction de la molécule de marquage de la chimiokine.
33. Trousse selon la revendication 31, dans laquelle la chimiokine étant marquée par une biotine, ladite trousse comprend en outre de 1 ' avidine ou de la streptavidine.
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Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000050088A2 (fr) * 1999-02-22 2000-08-31 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Complexes constitues d'un anticorps et de chimiokines biotinylees
WO2004026893A2 (fr) * 2002-09-23 2004-04-01 Rmf Dictagene S.A. Chimiokines de synthese marquees a des positions choisies
US6869606B1 (en) 1999-02-22 2005-03-22 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Biotinylated-chemokine antibody complexes

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0310136A2 (fr) * 1987-10-02 1989-04-05 The Rockefeller University Médiateur inflammatoire dérivé des macrophages (MIP-1 alpha et MIP-1 bêta)
US5605671A (en) * 1992-10-05 1997-02-25 The Regents Of The University Of Michigan Radiolabeled neutrophil activating peptides for imaging
WO1997031655A2 (fr) * 1996-02-27 1997-09-04 Fondazione Centro San Raffaele Del Monte Tabor Cytokines modifiees pour usage therapeutique
WO1998001757A1 (fr) * 1996-07-08 1998-01-15 Cambridge Antibody Technology Limited Marquage et selection de molecules
WO1998009171A1 (fr) * 1996-08-28 1998-03-05 Smithkline Beecham Corporation Nouveau dosage d'inhibition du recepteur de chemokine
US5780268A (en) * 1995-12-06 1998-07-14 Incyte Pharmaceuticals Chemokine expressed in a mixed lymphocyte reaction

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0310136A2 (fr) * 1987-10-02 1989-04-05 The Rockefeller University Médiateur inflammatoire dérivé des macrophages (MIP-1 alpha et MIP-1 bêta)
US5605671A (en) * 1992-10-05 1997-02-25 The Regents Of The University Of Michigan Radiolabeled neutrophil activating peptides for imaging
US5780268A (en) * 1995-12-06 1998-07-14 Incyte Pharmaceuticals Chemokine expressed in a mixed lymphocyte reaction
WO1997031655A2 (fr) * 1996-02-27 1997-09-04 Fondazione Centro San Raffaele Del Monte Tabor Cytokines modifiees pour usage therapeutique
WO1998001757A1 (fr) * 1996-07-08 1998-01-15 Cambridge Antibody Technology Limited Marquage et selection de molecules
WO1998009171A1 (fr) * 1996-08-28 1998-03-05 Smithkline Beecham Corporation Nouveau dosage d'inhibition du recepteur de chemokine

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BIOCHIM. BIOPHYS. ACTA (1997), 1336(1), 83-88 CODEN: BBACAQ;ISSN: 0006-3002, 1997 *
CHEMICAL ABSTRACTS, vol. 127, no. 10, 8 September 1997, Columbus, Ohio, US; abstract no. 136059, CHERSI, ALBERTO ET AL: "Selective 'in synthesis' labeling of peptides by fluorochromes" XP002123712 *
LELIEVRE D ET AL: "On-Line Solid-Phase Synthesis of a Peptide Bi-Derivatized with Biotin and 4-Azido Salicylic Acid", TETRAHEDRON LETTERS, vol. 36, no. 51, 18 December 1995 (1995-12-18), pages 9317-9320, XP004026744 *
MAGAZINE H I ET AL: "EVALUATION OF ENDOTHELIN RECEPTOR POPULATIONS USING ENDOTHELIN-1 BIOTINYLATED AT LYSINE-9 SIDECHAIN", BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS, vol. 181, no. 3, 31 December 1991 (1991-12-31), pages 1245 - 1250, XP002029500 *
RIVERA BAEZA C ET AL: "ORTHOGONAL SOLID-PHASE SYNTHESIS OF A MONOBIOTINYLATED ANALOG OF NEUROPEPTIDE Y", INTERNATIONAL JOURNAL OF PEPTIDE AND PROTEIN RESEARCH, vol. 39, no. 3, 1 March 1992 (1992-03-01), pages 195 - 200, XP000264168 *

Cited By (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2000050088A2 (fr) * 1999-02-22 2000-08-31 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Complexes constitues d'un anticorps et de chimiokines biotinylees
WO2000050088A3 (fr) * 1999-02-22 2000-12-21 Millennium Pharm Inc Complexes constitues d'un anticorps et de chimiokines biotinylees
US6869606B1 (en) 1999-02-22 2005-03-22 Millennium Pharmaceuticals, Inc. Biotinylated-chemokine antibody complexes
WO2004026893A2 (fr) * 2002-09-23 2004-04-01 Rmf Dictagene S.A. Chimiokines de synthese marquees a des positions choisies
WO2004026893A3 (fr) * 2002-09-23 2004-05-27 Rmf Dictagene Sa Chimiokines de synthese marquees a des positions choisies

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