TWI828625B - 引導及導航控制蛋白質以及彼之製造及使用方法 - Google Patents

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Abstract

本申請案提供引導及導航控制(GNC)蛋白質。在一個實施例中,該GNC蛋白質包含T細胞結合部分及癌症靶向部分,其中該T細胞結合部分具有對T細胞受體之結合特異性,該T細胞受體包含CD3、CD28、PDL1、PD1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40、VISTA、ICOS、BTLA、Light、NKp30、CD28H、CD27、CD226、CD96、CD112R、A2AR、CD160、CD244、CECAM1、CD200R、TNFRSF25 (DR3)、或其組合,且其中該癌症靶向部分具有對癌細胞受體之結合特異性。

Description

引導及導航控制蛋白質以及彼之製造及使用方法
本申請案主張以下各項之權益:2018年3月27日申請之美國臨時專利申請案第62/648880號、2018年3月27日申請之美國臨時專利申請案第62/648888號、2017年8月28日申請之美國臨時專利申請案第62/551032號、2017年6月25日申請之美國臨時專利申請案第62/524553號、2017年8月15日申請之美國臨時專利申請案第62/545603號、2017年8月28日申請之美國臨時專利申請案第62551035號、2017年8月28日申請之美國臨時專利申請案第62/551065號、2017年6月25日申請之美國臨時專利申請案第62/524554號、2017年6月25日申請之美國臨時專利申請案第62/524557號、及2017年6月25日申請之美國臨時專利申請案第62/524558號,該等申請案之全部揭示內容係明確地以引用方式併入本文。
本申請案大體上係關於引導及導航控制(Guidance and Navigation Control;GNC)蛋白質之技術領域,該等蛋白質具有針對免疫細胞及腫瘤細胞 上的表面分子之多特異性結合活性,且更特定而言本申請案係關於製造及使用GNC蛋白質。
癌細胞發展各種策略來逃避免疫系統。用於免疫逃脫的隱伏機制之一係減少癌細胞藉由免疫系統之識別。癌症特異性抗原之缺陷性呈現或其缺乏造成免疫耐受性及癌症進程。在存在有效免疫識別的情況下,腫瘤使用其他機制來避免藉由免疫系統消除。免疫活性腫瘤產生抑制性微環境來下調免疫反應。在成形抑制性腫瘤微環境方面涉及多個參與者,包括腫瘤細胞、調節T細胞、骨髓源性抑制性細胞、基質細胞、及其他細胞類型。免疫反應之抑制可以細胞接觸依賴性格式以及以接觸獨立性方式,經由免疫抑制細胞介素之分泌或消除來自局部環境的必要存活因子來執行。細胞接觸依賴性抑制依賴於細胞表面上表現的分子,例如程序性死亡配位體1(Programmed Death Ligand 1;PD-L1)、T-淋巴細胞相關聯蛋白質4(CTLA-4)及其他[Dunn等人,2004,Immunity,21(2):137-48;Adachi & Tamada,2015,Cancer Sci.,106(8):945-50]。
由於腫瘤逃避藉由免疫系統識別的機制持續得以更好地理解,最近已出現靶向該等機制之新治療模態。在2011年3月25日,美國食品藥物管理局(Food and Drug Administration;FDA)批准依匹單抗注射 (Yervoy,Bristol-Myers Myers Squibb)用於治療不可切除的或轉移性黑素瘤。Yervoy結合至活化T細胞上表現的細胞毒性T-淋巴細胞相關聯蛋白質4(CTLA-4)且阻斷CTLA-4與抗原呈遞細胞上之CD80/86之相互作用,進而阻斷負或抑制信號透過CTLA-4遞送至T細胞中,引起抗原特異性T細胞之重新活化,從而在許多患者中導致腫瘤之根除。幾年後,在2014年,FDA批准的Keytruda(派姆單抗,Merck)及Opdivo(納武單抗,Bristol-Myers Squibb)用於治療晚期黑素瘤。該等單株抗體結合至在活化及/或耗盡的T細胞上表現的PD-1且阻斷PD-1與腫瘤上表現的PD-L1之相互作用,進而消除抑制信號透過PD-1進入T細胞中,引起抗原特異性T細胞之重新活化,又在許多患者中導致腫瘤之根除。自那時起,已執行另外的臨床試驗來在晚期黑素瘤之治療中比較單一單株抗體Yervoy與單株抗體Yervoy及Opdivo之組合,從而證實在利用抗體之組合治療的患者中在總體存活及無進展存活方面的改良。(Hodi等人,2016,Lancet Oncol.17(11):1558-1568,Hellman等人,2018,Cancer Cell 33(5):853-861)。然而,由於許多臨床試驗已證實利用對一或多個免疫查核點分子為特異性的單株抗體治療癌症患者之巨大益處,資料已顯露僅具有高突變負荷之彼等患者才展示臨床反應,該高突變負荷產生藉由抗原特異性T細胞識別的新型T細胞表位(Snyder等人, 2014,NEJM 371:2189-2199)。具有低腫瘤突變負荷之彼等患者幾乎不展示目標臨床反應(Snyder等人,2014,NEJM 371:2189-2199,Hellman等人,2018,Cancer Cell 33(5):853-861)。
近年來,其他團體已開發替代方法,該方法不需要藉由抗原呈現細胞向活化T細胞的新生表位呈現之存在。一個實例係雙特異性抗體之開發,其中抗體的對例如CD19之腫瘤相關聯抗原為特異性的結合結構域係連接至對T細胞上之CD3為特異性的抗體結合結構域,因而產生雙特異性T細胞銜接子(engager)或BiTe分子。在2014年,FDA批准稱為博納吐單抗之雙特異性抗體用於治療前驅B細胞急性淋巴母細胞性白血病。博納吐單抗將對白血病細胞上表現的CD19為特異性的scFv與對T細胞上表現的CD3為特異性的scFv連接(Bejnjamin及Stein 2016,Ther Adv Hematol 7(3):142-146)。然而,儘管在患有復發或難治性ALL的患者中有>50%之初始反應速率,但許多患者在利用博納吐單抗成功治療之後對博納吐單抗療法有抵抗力或復發。正在出現的證據是,對博納吐單抗有抵抗力或在博納吐單抗治療之後復發的患者可歸因於在腫瘤細胞上表現的免疫查核點抑制分子之表現,該等免疫查核點抑制分子諸如PD-L1,其驅動抑制信號透過活化T細胞上表現的PD-1(Feucht等人,2016,Oncotarget 7(47):76902-76919)。在對利用博納吐單抗之療法有 抵抗力的患者之病例研究中,執行第二輪博納吐單抗療法但添加單株抗體派姆單抗(Keytruda,Merck),其特異地結合至PD-1且阻斷表現T細胞之PD-1與腫瘤細胞表現之PD-L1之相互作用,在此一位患者中引起顯著的反應及在骨髓中腫瘤細胞自45%至小於5%之減少(Feucht等人,2016,Oncotarget 7(47):76902-76919)。該些結果證實,將雙特異性BiTe分子與一或多個單株抗體組合可相較於任一藥劑單獨而言顯著地增加臨床活性。儘管存在有前景的結果,但進行組合療法之成本必定是高的,此歸因於在招募的代表性群體中的多次臨床試驗及困難度。
利用嵌合抗原受體T細胞(chimeric antigen receptor T cell;CAR-T)之授受性細胞療法係用於治療癌症的另一有前景免疫療法。CAR-T療法之臨床成功已揭露患有CD19陽性、治療難治性B細胞惡性腫瘤之患者的耐久完全緩解及延長的存活(Gill & June.2015.Immunol Rev,263:68-89)。然而,與個別化及遺傳修飾CAR-T免疫療法之製造相關聯的成本及複雜性已將其產生及使用限制於用於治療相對小數量的患者之專業中心。亦稱為細胞介素風暴的細胞介素釋放症候群(cytokine release syndrome;CRS)係在工程化CAR-T細胞之輸注之後的最顯著不利效應(Bonifant等人,201,Mol Ther Oncolytics.3:16011)。
在許多情況下,CRS之發病及嚴重程度似乎是專門的個人事件。緩和CRS之當前選擇主要地集中在快速反應及管理護理,因為在T細胞輸注之前控制CRS之選擇是有限的。
儘管現已建立對CD19陽性B細胞惡性腫瘤為特異性的CAR-T療法之功效,但CAR-T療法針對實體腫瘤之功效迄今為止尚未得到明確證明。當前,許多臨床試驗正在進行中以探究用於CAR-T療法之各種實體腫瘤相關聯抗原(tumor-associated antigen;TAA)。T細胞低效地轉運至腫瘤中、免疫抑制腫瘤微環境、次最佳抗原識別特異性、及缺乏對治療有關不利事件之控制當前係視為實體腫瘤CAR-T療法中之主要障礙(Li等人,2018,J Hematol Oncol.11(1):22-40)。管控治療效應以及CAR-T細胞輸注之前及之後的任何不利效應之選擇是有限的。
本申請案提供對T細胞及腫瘤細胞之表面分子具有多特異性抗原結合活性的引導及導航控制(GNC)蛋白質。
在一個實施例中,引導及導航控制(GNC)蛋白質包含細胞毒性細胞結合部分及癌症靶向部分。任何細胞毒性細胞可為所揭示GNC蛋白質之潛在結合標靶。細 胞毒性細胞之實例包括而不限於T細胞、NK細胞、巨噬細胞、及樹狀細胞。
在一個實施例中,GNC蛋白質包括T細胞結合部分。T細胞結合部分具有對T細胞受體之結合特異性。示例性T細胞受體包括而不限於CD3、CD28、PDL1、PD1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40L、VISTA、ICOS、BTLA、Light、CD30、NKp30、CD28H、CD27、CD226、CD96、CD112R、A2AR、CD160、CD244、CECAM1、CD200R、TNFRSF25(DR3)、或其組合。
在一個實施例中,GNC蛋白質包括NK細胞結合部分。NK細胞結合部分具有對NK細胞受體之結合特異性。示例性NK細胞受體包括而不限於用於活化NK細胞之受體,諸如CD16、NKG2D、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、NKG2C、NKG2E、NKG2H;促效劑受體,諸如NKp30a、NKp30b、NKp46、NKp80、DNAM-1、CD96、CD160、4-1BB、GITR、CD27、OX-40、CRTAM;及拮抗劑受體,諸如KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL3、NKG2A、NKp30c、TIGIT、SIGLEC7、SIGLEC9、LILR、LAIR-1、KLRG1、PD-1、CTLA-4、CD161。
在一個實施例中,GNC蛋白質包括巨噬細胞結合部分。巨噬細胞結合部分具有對巨噬細胞受體之結合 特異性。示例性巨噬細胞受體包括而不限於巨噬細胞上之促效劑受體,諸如TLR2、TLR4、CD16、CD64、CD40、CD80、CD86、TREM-1、TREM-2、ILT-1、ILT-6a、ILT-7、ILT-8、EMR2、Dectin-1、CD69;及拮抗劑受體,諸如CD32b、SIRPα、LAIR-1、VISTA、TIM-3、CD200R、CD300a、CD300f、SIGLEC1、SIGLEC3、SIGLEC5、SIGLEC7、SIGLEC9、ILT-2、ILT-3、ILT-4、ILT-5、LILRB3、LILRB4、DCIR;及其他表面受體,諸如CSF-1R、LOX-1、CCR2、FRβ、CD163、CR3、DC-SIGN、CD206、SR-A、CD36、MARCO。
在一個實施例中,GNC蛋白質包括樹狀細胞結合部分。樹狀細胞結合部分具有對樹狀細胞受體之結合特異性。示例性樹狀細胞受體包括而不限於樹狀細胞上之促效劑受體,諸如TLR、CD16、CD64、CD40、CD80、CD86、HVEM、CD70;拮抗劑受體,諸如VISTA、TIM-3、LAG-3、BTLA;及其他表面受體,諸如CSF-1R、LOX-1、CCR7、DC-SIGN、GM-CSF-R、IL-4R、IL-10R、CD36、CD206、DCIR、RIG-1、CLEC9A、CXCR4。
癌症靶向部分具有對癌細胞受體之結合特異性。示例性癌細胞受體包括而不限於BCMA、CD19、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30、ROR1、CEA、HER2、EGFR、EGFRvIII、LMP1、LMP2A、間皮 素、PSMA、EpCAM、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、gpA33、GD2、TROP2、或其組合。
在一個實施例中,GNC蛋白質包含至少一個T細胞結合部分及至少一個癌細胞結合部分,其中該T細胞結合部分對T細胞受體具有結合特異性,該T細胞受體包含CD3、CD28、PDL1、PD1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40、VISTA、ICOS、BTLA、Light、CD30、CD27、或其組合,且其中該癌細胞結合部分對癌細胞受體具有結合特異性。
在一個實施例中,該癌症受體包含以下各項上之受體:肺癌細胞、肝癌細胞、乳癌細胞、結腸直腸癌細胞、肛門癌細胞、胰腺癌細胞、膽囊癌細胞、膽管癌細胞、頭頸癌細胞、鼻咽癌細胞、皮膚癌細胞、黑素瘤細胞、卵巢癌細胞、前列腺癌細胞、尿道癌細胞、肺癌細胞、非小細胞肺癌細胞、小細胞肺癌細胞、腦腫瘤細胞、神經膠質瘤細胞、神經胚細胞瘤細胞、食道癌細胞、胃癌細胞、肝癌細胞、腎癌細胞、膀胱癌細胞、子宮頸癌細胞、子宮內膜癌細胞、甲狀腺癌細胞、眼癌細胞、肉瘤細胞、骨癌細胞、白血病細胞、骨髓瘤細胞、淋巴瘤細胞、或其組合。
在一個實施例中,GNC蛋白質能夠藉由將T細胞結合部分結合至T細胞上之T細胞受體而活化T細胞。在一個實施例中,GNC蛋白質包含雙特異性抗體或抗體單體、三特異性抗體或抗體單體、四特異性抗體或抗 體單體、其抗原結合片段、或其組合。在一個實施例中,GNC蛋白質包含具有與SEQ ID NO.49-52之同源性百分比的胺基酸序列,其中同源性百分比不小於70%、80%、90%、95%、98%、或99%。
在一個實施例中,GNC蛋白質可具有第一部分及第二部分。在一個實施例中,第一部分可包括T細胞結合部分、NK細胞結合部分、巨噬細胞結合部分、或樹狀細胞結合部分。第二部分包含癌症靶向部分。
在一個實施例中,第一部分及第二部分可具有對彼此的結合特異性。在此等實施例中,GNC蛋白質係藉由第一部分與第二部分之間的結合作用來形成。結合作用為非共價鍵結。在一個實施例中,GNC蛋白質包括經由高親和力非共價鍵結相互作用結合至第二部分的第一部分。高親和力非共價鍵結相互作用之實例包括而不限於抗體-抗原相互作用、生物素-鏈親和素相互作用、白胺酸-拉鍊、及來自雙雜合體篩選分析之任何成對蛋白質、非免疫球蛋白蛋白質支架(Hosse等人,2006,Protein Sci.15(1):14-27)、或適配體(Likhin等人,2013,Acta Naturae.2013.5(4):34-43)、或其組合。
在一個實施例中,GNC蛋白質可進一步包括連接子部分。在一個實施例中,第一部分及第二部分係經由連接子部分接合來提供GNC蛋白質。在一個實施例中,連接子部分可將第一部分及第二部分共價地連接在一起以提供GNC蛋白質。在一個實施例中,連接子部分可包 括兩個互補分子或穩定的蛋白質-蛋白質相互作用。互補分子之實例包括而不限於DNA及RNA之互補鏈。穩定的蛋白質-蛋白質相互作用之實例包括但不限於生物素-抗生物素蛋白、白胺酸-拉鍊、及來自雙雜合體篩選分析之任何成對蛋白質。
在一個實施例中,連接子部分可包括免疫球蛋白G(IgG)之主鏈,其中GNC蛋白質可包括具有兩個重鏈及兩個輕鏈之免疫球蛋白G(IgG)部分及至少兩個scFv部分,該等scFv部分共價地連接至重鏈或輕鏈之C末端或N末端。IgG部分可提供對scFv部分的穩定性,且三特異性GNC蛋白質可具有用於結合T細胞上之表面分子的兩個部分。
在一個實施例中,第一部分包含抗體或其片段、可溶受體或其組合。在一個實施例中,第二部分包含抗體或其片段、可溶受體或其組合。
本申請案進一步提供併入有本文所揭示的GNC蛋白質之治療複合物。在一個實施例中,治療複合物包括GNC蛋白質及細胞毒性細胞。細胞毒性細胞可為T細胞、NK細胞、巨噬細胞、樹狀細胞、或其組合。在一個實施例中,T細胞可為自體T細胞、異體T細胞、或適用供體(universal donor)T細胞。
在一個實施例中,治療複合物可包括GNC蛋白質及癌細胞。在一個實施例中,治療複合物可包括本文 揭示的GNC蛋白質,其具有結合至T細胞結合部分之T細胞及結合至癌症靶向部分之癌細胞。
本申請案進一步提供醫藥組合物。在一個實施例中,醫藥組合物包括本文揭示的治療複合物及醫藥學上可接受的載劑。在一個實施例中,醫藥組合物包括本文揭示的GNC蛋白質及醫藥學上可接受的載劑。
在另一態樣中,本申請案提供用於製造及使用所揭示GNC蛋白質之方法。
本申請案之目標及優點將自以下本申請案之較佳實施例之詳細說明結合隨附圖式而變得明顯。
本揭示內容之前述及其他特徵將自以下描述及隨附申請專利範圍結合隨附圖式而變得更全面明顯的。應理解,該等圖式僅描繪根據本揭示內容佈置之若干實施例,且因此不視為其範疇之限制,本揭示內容將經由使用隨附圖式而描述為具有另外的特性及細節,圖式中:第1圖展示示例性GNC蛋白質,其藉由其多個抗原結合結構域(AgBd)及連接子之組合物來表徵。
第2圖展示作為實施例的四特異性GNC抗體之示例性格式。
第3圖展示示例性四特異性GNC抗體經由多個AgBd結合至T細胞及腫瘤細胞兩者。
第4圖展示結合至人類ROR1轉染CHO細胞之示例性四特異性GNC抗體。
第5圖展示結合至人類41BB轉染CHO細胞之示例性四特異性GNC抗體。
第6圖展示結合至人類PD-L1轉染CHO細胞之示例性四特異性GNC抗體。
第7圖展示示例性四特異性GNC抗體,其具有結合結構域323H7,該結合結構域323H7對B-ALL細胞系Kasumi2之ROR1介導RTCC之Ig結構域為特異性的,其中PBMC係作為效應物。
第8圖展示示例性四特異性GNC抗體,其具有結合結構域323H7,該結合結構域323H7對B-ALL細胞系Kasumi2之ROR1介導RTCC之Ig結構域為特異性的,其中CD8+、CD45RO+記憶T細胞係作為效應物。
第9圖展示示例性四特異性GNC抗體,其具有結合結構域323H7,該結合結構域323H7對B-ALL細胞系Kasumi2之ROR1介導RTCC之Ig結構域為特異性的,其中CD8+、CD45RA+初始T細胞係作為效應物。
第10圖展示示例性四特異性GNC抗體,其具有結合結構域338H4,該結合結構域338H4對B-ALL細胞系Kasumi2之ROR1介導RTCC之捲曲蛋白結構域為特異性的,其中PBMC係作為效應物。
第11圖展示示例性四特異性GNC抗體,其具有結合結構域338H4,該結合結構域338H4對B-ALL細胞系Kasumi2之ROR1介導RTCC之捲曲蛋白結構域為特異性的,其中CD8+、CD45RO+記憶T細胞係作為效應物。
第12圖展示示例性四特異性GNC抗體,其具有結合結構域338H4,該結合結構域338H4對B-ALL細胞系Kasumi2之ROR1介導RTCC之捲曲蛋白結構域為特異性的,其中CD8+、CD45RA+初始T細胞係作為效應物。
在以下詳細說明中,參考隨附圖式,其形成本文之一部分。在圖式中,除非上下文另外指定,否則類似符號典型地標示類似的組分。描述在詳細說明、圖式、及申請專利範圍中的說明性實施例不意謂為限制性的。可使用其他實施例,且可做出其他改變,而不脫離本文提出的標的之精神或範疇。易於理解的是,如本文大體上描述及圖式中說明的本揭示內容之態樣可以多種不同的配置來佈置、替代、組合、分離、及設計,其全部明確地涵蓋在本文中。
在一個實施例中,引導導航控制(GNC)蛋白質係藉由其多個抗原特異性結合結構域(AgBD)之組合物及藉由其經由結合T細胞及腫瘤細胞上之多個表面分 子而導引T細胞(或其他效應細胞)至癌細胞(或其他靶細胞)之能力來表徵(第1圖)。藉由此定義,GNC蛋白質由部分1及部分2構成,該部分1用於結合T細胞上之至少一個表面分子,且該部分2用於結合癌細胞上之至少一個表面抗原(表1A)。在T細胞療法中,細胞毒性T細胞係藉由T細胞增殖傳訊,以及經由其表面上之促效劑受體或拮抗劑受體的共刺激傳訊來調節。為調節該些傳訊,以及T細胞與癌症之間的相互作用,多個AgBD可分別對部分1及部分2為必需的。GNC蛋白質必須具有至少一個連接子以連接部分1及部分2。在概念GNC蛋白質中,任何連接子分子可用於在活體外或活體內藉由使用DNA/RNA之互補連接子或蛋白質-蛋白質相互作用將兩個或更多個AgBD連接在一起,該等相互作用包括但不限於生物素-抗生物素蛋白、白胺酸-拉鍊、及任何雙雜合體陽性蛋白質之彼相互作用。然而,在本申請案中,所有連接子為抗體主鏈結構或抗體片段,使得GNC蛋白質及GNC抗體可具有相同含義,例如第2圖中的四特異性GNC抗體結構之實例。GNC蛋白質或抗體能夠導引活體內或離體的藉由多個AgBD介導的T細胞對癌細胞之結合(第3圖)。T細胞可來源於相同患者或不同個體,且癌細胞可在活體內、活體外、或離體存在。提供於本申請案中之實例賦能GNC蛋白質作為T細胞療法,亦即,GNC-T療法中之啟始劑(prime agent)以用於在授受性轉移之前離體活化及控制細胞毒性T細胞。
Figure 107121548-A0305-02-0018-1
除T細胞之外,其他細胞毒性細胞亦可藉由GNC蛋白質用於癌症殺死或預防目的。表1B展示具有NK細胞結合結構域之GNC蛋白質中的功能部分(部分1及部分2)及抗原結合結構域之示例性組合物。表1C展示具有巨噬細胞結合結構域之GNC蛋白質中的功能部分(部分1及部分2)及抗原結合結構域之示例性組合物。表1D展示具有樹狀細胞結合結構域之GNC蛋白質中的功能部分(部分1及部分2)及抗原結合結構域之示例性組合物。
表1B
Figure 107121548-A0305-02-0019-2
Figure 107121548-A0305-02-0019-3
Figure 107121548-A0305-02-0019-4
本申請案係關於製造及使用重組GNC蛋白質之方法。多個AgBD可歸因於其分別與諸如T細胞及癌細胞之細胞毒性細胞的界面而分為部分1及部分2(表1A)。然而,多個AgBD之重排可為隨機的且以不等數量重排(表2)。具有兩個AgBD之GNC蛋白質可同時結合至諸如T細胞上之CD3的表面分子及諸如腫瘤細胞上之ROR1的腫瘤抗原,以用於將T細胞重導引或引導至腫瘤細胞。例如特異地結合至41BB的第三AgBD之添加可幫助增強抗CD3誘導之T細胞活化,因為41BB為共刺激因子且結合刺激其對活化T細胞之促效劑活性。例如特異地結合至腫瘤細胞上之PD-L1的第四AgBD向GNC蛋白質之添加可阻斷腫瘤細胞上的PD-L1之抑制路徑,該抑制路徑係經由其結合至T細胞上之PD-1介導。利用該些基本原理,GNC蛋白質可經設計及構造來獲得多個AgBD以特定地用於結合不等數量之T細胞拮抗劑及促效劑,不僅將活化T細胞重導引至腫瘤細胞而且控制其活體內活性(表2)。因此,GNC蛋白質之設計可為任何多特異性蛋白質。
在一個實施例中,GNC蛋白質可為雙特異性、三特異性、四特異性、五特異性、六特異性、七特異性、或八特異性蛋白質。在一個實施例中,GNC蛋白質可為單株抗體。在一個實施例中,GNC蛋白質可為雙特異性、三特異性、四特異性、五特異性、六特異性、七特異性、或八特異性抗體單體。在一個實施例中,GNC蛋白質可 為雙特異性、三特異性、四特異性、五特異性、六特異性、七特異性、或八特異性抗體。表3提供具有抗體結合結構域之特異性的一些示例性GNC蛋白質及抗體。
Figure 107121548-A0305-02-0021-5
Figure 107121548-A0305-02-0021-6
在一個實施例中,本申請案提供製造及使用重組GNC蛋白質之方法。GNC蛋白質由多特異性抗原結 合部分構成,該等部分藉由兩個官能團表徵:部分1包含多個抗原結合結構域(AgBD),其特異性涉及T細胞活化、促效劑共刺激、及/或抑制拮抗劑活性;且部分2包含至少一種癌細胞結合特異性。GNC蛋白質可同時結合至諸如T細胞之CD3的表面分子及諸如腫瘤細胞之ROR1的腫瘤抗原,進而將T細胞之重導引或引導至腫瘤細胞。在GNC蛋白質中添加第三結合結構域可經由其直接結合41BB而幫助增強CD3-誘導之T細胞活化,該41BB為發揮促效劑活性之共刺激因子。此外,第四結合結構域在GNC蛋白質中之添加可結合至腫瘤細胞上之PD-L1以阻斷腫瘤細胞上的PD-L1之抑制路徑,該抑制路徑係經由其結合至T細胞上之PD-1介導。以此方式,GNC蛋白質獲得將活化T細胞重導引至腫瘤細胞的多重結合能力,且多重結合可幫助經由調節促效劑活性或拮抗劑活性或兩者來調節T細胞活化。一些結合能力可類似於CAR-T細胞上之嵌合抗原受體或諸如BiTe抗體之雙特異性抗體之彼能力。儘管GNC蛋白質為獨特的,但其引導及導航控制活化T細胞與腫瘤細胞之間的相互作用之能力有待證明。
在一個實施例中,揭示具有4個不同結合結構域之示例性GNC蛋白質。此GNC蛋白質為「四特異性抗體」,因為其連接子及主鏈包含抗體片段。在4個不同的抗原結合結構域中,一個抗原結合結構域特異地結合至T細胞上之CD3,第二結合結構域針對腫瘤相關聯抗 原為特異性的,該腫瘤相關聯抗原包括但不限於其他腫瘤抗原,諸如ROR1、CEA、HER2、EGFR、EGFRvIII、LMP1、LMP2A、間皮素、PSMA、EpCAM、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、gpA33、GD2、TROP2、BCMA、CD19、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30,且第三結合結構域及第四結合結構域針對兩個相異免疫查核點調節劑為特異性的,該等相異免疫查核點調節劑即為PD-L1、PD-1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40、VISTA、ICOS、BTLA、Light、HVEM、CD73、CD39等等。由於其在組合物中的功能及變化方面定義,GNC蛋白質可分類為新類別的用於治療癌症的免疫調節劑。表4展示示例性四特異性GNC抗體之列表。
Figure 107121548-A0305-02-0024-7
在一個實施例中,GNC介導之免疫療法可包括抗體療法及細胞療法之類型。本文中,優點可包括但不限於,IgG Fc結構域之包括可相較於雙特異性BiTe分子賦予在血清中較長半衰期之特性;其次,對免疫查核點調節劑為特異性的兩個結合結構域之包括可抑制抑制路徑且同時接合共刺激路徑;第三,將T細胞上之CD3與腫瘤相關聯抗原交聯重導引及引導T細胞來殺死腫瘤細胞而無需自患者移除T細胞且將其遺傳修飾為對腫瘤細胞為特異性的,之後將其重引入回患者中,此亦稱為嵌合抗原受體T細胞(CAR-T)療法;且第四,GNC蛋白質介導的抗體療法或T細胞療法不涉及T細胞之遺傳修飾,後者可帶來轉變經修飾T細胞至純系擴張,亦即,T細胞白血病之風險。
利用結合能力之一或多個添加,GNC蛋白質介導之免疫療法優於習知免疫療法之優點包括但不限於,首先,IgG Fc結構域之包括可相較於雙特異性BiTe分子賦予在血清中較長半衰期之特性;其次,對免疫查核點調節劑為特異性的兩個結合結構域之包括可抑制抑制路徑且同時接合共刺激路徑;第三,將T細胞上之CD3與腫瘤相關聯抗原交聯重導引及引導T細胞來殺死腫瘤細胞而無需自患者移除T細胞且將其遺傳修飾為對腫瘤細胞為特異性的,之後將其重引入回患者中,此亦稱為嵌合抗原受體T細胞(CAR-T)療法;且第四,GNC蛋白質介導的抗體療法或T細胞療法不涉及T細胞之遺傳修飾, 後者可帶來轉變經修飾T細胞至純系擴張,亦即,T細胞白血病之風險。
本揭示內容可參考本文包括的特定實施例及實例之以下詳細說明得以更容易地理解。儘管本揭示內容已參考其某些實施例之特定細節來描述,但此等細節不意欲視為對本揭示內容之範疇的限制。
實例
儘管以下實例係僅以說明方式而非限制方式來提供。熟習此項技術者將容易地認識到可改變或修改來產生基本上相同或類似結果的各種非臨界參數。
實例1:結合至人類ROR1經轉染CHO細胞的四特異性特異抗體之FACS分析
針對結合至穩定地表現全長人類ROR1之中國倉鼠卵巢(Chinese hamster ovary;CHO)細胞來測試表3及4中列出的四特異性GNC抗體。以2X最終濃度製備抗體且在50ul之PBS/2% FBS中跨於96孔板之3個孔滴定1:5,且隨後添加於50ul PBS/2%FBS中之5,000個ROR1-CHO細胞。將此混合物在冰上培養30分鐘,利用200ul PBS/2%FBS洗滌一次,且隨後以儲備液之1:1000稀釋來添加二級抗體PE山羊抗人類IgG Fc,且將此混合物在冰上培養30分鐘。將細胞洗滌2 x 200ul PBS/2%FBS,再懸浮於50ul PBS/2%FBS中且在BD LSRFORTESSA上分析且在第4圖中展示結合分佈。具有對ROR1之Ig 結構域為特異性的323H7結合結構域的四特異性抗體SI-35E18、19、及20比具有對ROR1之捲曲蛋白結構域為特異性的338H4結合結構域的四特異性GNC抗體SI-3521、22、及23展示更高的結合,且具有對ROR1之kringle結構域為特異性的330F11結合結構域的四特異性GNC抗體SI-3524、25、及26不結合。
實例2:結合至人類41BB經轉染CHO細胞的四特異性GNC抗體之FACS分析
針對結合至穩定地表現全長人類ROR1之中國倉鼠卵巢(Chinese hamster ovary;CHO)細胞來測試表3及4中列出的四特異性GNC抗體。以2X最終濃度製備抗體且在50ul之PBS/2% FBS中跨於96孔板之3個孔滴定1:5,且隨後添加於50ul PBS/2%FBS中之5,000個ROR1-CHO細胞。將此混合物在冰上培養30分鐘,利用200ul PBS/2%FBS洗滌一次,且隨後以儲備液之1:1000稀釋來添加二級抗體PE山羊抗人類IgG Fc,且將此混合物在冰上培養30分鐘。將細胞洗滌2 x 200ul PBS/2%FBS,再懸浮於50ul PBS/2%FBS中且在BD LSRFORTESSA上分析且在第5圖中展示結合分佈。除對照SI-27E12外,所有四特異性GNC抗體含有41BB結合結構域460C3、420H5、或466F6,且以變化的強度結合至表現41BB之CHO細胞。
實例3:結合至人類PDL1經轉染CHO細胞的四特異 性GNC抗體之FACS分析
針對結合至穩定地表現全長人類ROR1之中國倉鼠卵巢(Chinese hamster ovary;CHO)細胞來測試表3及4中列出的四特異性GNC抗體。以2X最終濃度製備抗體且在50ul之PBS/2% FBS中跨於96孔板之3個孔滴定1:5,且隨後添加於50ul PBS/2%FBS中之5,000個ROR1-CHO細胞。將此混合物在冰上培養30分鐘,利用200ul PBS/2%FBS洗滌一次,且隨後以儲備液之1:1000稀釋來添加二級抗體PE山羊抗人類IgG Fc,且將此混合物在冰上培養30分鐘。將細胞洗滌2 x 200ul PBS/2%FBS,再懸浮於50ul PBS/2%FBS中且在BD LSRFORTESSA上分析且在第6圖中展示結合分佈。除對照SI-27E15外,所有四特異性GNC抗體含有相同的PDL1結合結構域PL230C6,且展示對表現PDL1之CHO細胞的極類似的結合強度。
實例4:以末梢血液單核細胞作為效應物且以B-急性淋巴母細胞性白血病(B-Acute Lymphoblastic Leukemia;B-ALL)細胞系Kasumi-2作為標靶的重導引T細胞細胞毒性(Re-directed T cell cytotoxicity;RTCC)分析
就針對B-ALL細胞系Kasumi 2之RTCC活性,使用人類末梢血液單核細胞(peripheral blood mononuclear cell;PBMC)作為效應物來測試表3及 4中列出的四特異性GNC抗體。在37℃下,在10ml之培養基中將Kasumi 2靶細胞5 x 106用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5uM標記20分鐘。將細胞用50ml之培養基洗滌3次,之後再懸浮於10ml中,隨後再次計數。以2X最終濃度製備抗體且在200ul之RPMI+10%FBS中跨於96孔板之10個孔滴定1:3。藉由標準ficoll密度梯度自「leukopak」純化人類PBMC,該leukopak為自正常人類末梢血液收集的富集白細胞除去法(leukapheresis)產物。在最終目的地96孔板中,藉由將100ul之靶細胞(5,000)、50ul之PBMC(25,000)、及100ul之每一抗體稀釋液添加至分析之每一孔來組合靶細胞、PBMC、及連續滴定抗體。在37℃下將分析板培養大致72小時且隨後收穫每一分析孔之內容物且分析所剩餘的CFSE標記靶細胞之數量。如第7圖上所示,四特異性GNC抗體全部含有相同的PDL1結合結構域PL230C6、相同的ROR1結合結構域323H7、及相同的CD3結合結構域284A10,但是具有41BB結合結構域460C3、420H5、及466F6之一,且除不具有41BB結合結構域之對照SI-27E12外,展示相較於對照的較大RTCC活性,但似乎在四特異性GNC抗體SI-35E18、19、及20處為類似有效的。
實例5:以CD8+、CD45RO+記憶T細胞作為效應物且以B-急性淋巴母細胞性白血病(B-Acute Lymphoblastic Leukemia;B-ALL)細胞系 Kasumi-2作為標靶的重導引T細胞細胞毒性(Re-directed T cell cytotoxicity;RTCC)分析
就針對B-ALL細胞系Kasumi 2之RTCC活性,使用人類CD8+、CD45RO+記憶T細胞作為效應物來測試表3及4中列出的四特異性GNC抗體。在37℃下,在10ml之培養基中將Kasumi 2靶細胞5 x 106用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5uM標記20分鐘。將細胞用50ml之培養基洗滌3次,之後再懸浮於10ml中,隨後再次計數。以2X最終濃度製備抗體且在200ul之RPMI+10%FBS中跨於96孔板之10個孔滴定1:3。按照製造商之協定,使用EasySepTM人類記憶CD8+ T細胞富集套組(Stemcell Technologies,#19159)自來自正常供體之PBMC富集人類CD8+、CD45RO+記憶T細胞。最終細胞群體係藉由FACS分析判定為98% CD8+、CD45RO+ T細胞。在最終目的地96孔板中,藉由將100ul之靶細胞(5,000)、50ul之CD8+、CD45RO+記憶T細胞(25,000)、及100ul之每一抗體稀釋液添加至分析之每一孔來組合靶細胞、T細胞、及連續滴定抗體。在37℃下將分析板培養大致72小時且隨後收穫每一分析孔之內容物且分析所剩餘的CFSE標記靶細胞之數量。如第8圖上所示,四特異性抗體全部含有相同的PDL1結合結構域PL230C6、相同的ROR1結合結構域323H7、及相同的CD3結合結構域284A10,但具有41BB結合結 構域460C3、420H5、及466F6之一,且相較於不含有41BB、PDL1、ROR1、或CD3結合結構域之一的對照展示較大的RTCC活性。
實例6:以CD8+、CD45RA+初始T細胞作為效應物且以B-急性淋巴母細胞性白血病(B-Acute Lymphoblastic Leukemia;B-ALL)細胞系Kasumi-2作為標靶的重導引T細胞細胞毒性(Re-directed T cell cytotoxicity;RTCC)分析
就針對B-ALL細胞系Kasumi 2之RTCC活性,使用人類CD8+、CD45RA+記憶T細胞作為效應物來測試表3及4中列出的四特異性特異抗體。在37℃下,在10ml之培養基中將Kasumi 2靶細胞5 x 10e6用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5uM標記20分鐘。將細胞用50ml之培養基洗滌3次,之後再懸浮於10ml中,隨後再次計數。以2X最終濃度製備抗體且在200ul之RPMI+10%FBS中跨於96孔板之10個孔滴定1:3。按照製造商之協定,使用EasySepTM人類初始CD8+ T細胞分離套組(Stemcell Technologies,#19258)自來自正常供體之末梢血液單核細胞富集人類CD8+、CD45RA+記憶T細胞。最終細胞群體係藉由FACS分析判定為98% CD8+、CD45RA+ T細胞(資料未展示)。在最終目的地96孔板中,藉由將100ul之靶細胞(5,000)、50ul之CD8+、CD45RO+ T細胞(25,000)、及100ul之每一抗體稀 釋液添加至分析之每一孔來組合靶細胞、T細胞、及連續滴定抗體。在37℃下將分析板培養大致72小時且隨後收穫每一分析孔之內容物且分析所剩餘的CFSE標記靶細胞之數量。如第9圖上所示,四特異性抗體全部含有相同的PDL1結合結構域PL230C6、相同的ROR1結合結構域323H7、及相同的CD3結合結構域284A10,但具有41BB結合結構域460C3、420H5、及466F6之一,且相較於不含有41BB、PDL1、ROR1、或CD3結合結構域之一的對照展示較大的RTCC活性。
實例7:以末梢血液單核細胞作為效應物且以B-急性淋巴母細胞性白血病(B-Acute Lymphoblastic Leukemia;B-ALL)細胞系Kasumi-2作為標靶的重導引T細胞細胞毒性(Re-directed T cell cytotoxicity;RTCC)分析
就針對B-ALL細胞系Kasumi 2之RTCC活性,使用人類末梢血液單核細胞(peripheral blood mononuclear cell;PBMC)作為效應物來測試表3及4中列出的四特異性特異抗體。在37℃下,在10ml之培養基中將Kasumi 2靶細胞5 x 106用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5uM標記20分鐘。將細胞用50ml之培養基洗滌3次,之後再懸浮於10ml中,隨後再次計數。以2X最終濃度製備抗體且在200ul之RPMI+10%FBS中跨於96孔板之10個孔滴定1:3。藉由標準ficoll密度梯度自「leukopak」純化人類 PBMC,該leukopak為自正常人類末梢血液收集的富集白細胞除去法(leukapheresis)產物。在最終目的地96孔板中,藉由將100ul之靶細胞(5,000)、50ul之PBMC(25,000)、及100ul之每一抗體稀釋液添加至分析之每一孔來組合靶細胞、PBMC、及連續滴定抗體。在37℃下將分析板培養大致72小時且隨後收穫每一分析孔之內容物且分析所剩餘的CFSE標記靶細胞之數量。如第10圖上所示,四特異性GNC抗體全部含有相同的PDL1結合結構域PL230C6、相同的ROR1結合結構域338H4、及相同的CD3結合結構域284A10,但是具有41BB結合結構域460C3、420H5、及466F6之一,且除不具有41BB結合結構域之對照SI-35E36外,展示相較於對照的較大RTCC活性,但似乎在四特異性GNC抗體SI-35E18、19、及20處為類似有效的。
實例8:以CD8+、CD45RO+記憶T細胞作為效應物且以B-急性淋巴母細胞性白血病(B-Acute Lymphoblastic Leukemia;B-ALL)細胞系Kasumi-2作為標靶的重導引T細胞細胞毒性(Re-directed T cell cytotoxicity;RTCC)分析
就針對B-ALL細胞系Kasumi 2之RTCC活性,使用人類CD8+、CD45RO+記憶T細胞作為效應物來測試表3及4中列出的四特異性GNC抗體。在37℃下,在10ml之培養基中將Kasumi 2靶細胞5 x 106用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5uM標 記20分鐘。將細胞用50ml之培養基洗滌3次,之後再懸浮於10ml中,隨後再次計數。以2X最終濃度製備抗體且在200ul之RPMI+10%FBS中跨於96孔板之10個孔滴定1:3。按照製造商之協定,使用EasySepTM人類記憶CD8+ T細胞富集套組(Stemcell Technologies,#19159)自來自正常供體之PBMC富集人類CD8+、CD45RO+記憶T細胞。最終細胞群體係藉由FACS分析判定為98% CD8+、CD45RO+ T細胞(資料未展示)。在最終目的地96孔板中,藉由將100ul之靶細胞(5,000)、50ul之CD8+、CD45RO+記憶T細胞(25,000)、及100ul之每一抗體稀釋液添加至分析之每一孔來組合靶細胞、T細胞、及連續滴定抗體。在37℃下將分析板培養大致72小時且隨後收穫每一分析孔之內容物且分析所剩餘的CFSE標記靶細胞之數量。如第11圖上所示,四特異性GNC抗體全部含有相同的PDL1結合結構域PL230C6、相同的ROR1結合結構域338H4、及相同的CD3結合結構域284A10,但具有41BB結合結構域460C3、420H5、及466F6之一,且相較於不含有41BB、PDL1、ROR1、或CD3結合結構域之一的對照展示較大的RTCC活性。
實例9:以CD8+、CD45RA+初始T細胞作為效應物且以B-急性淋巴母細胞性白血病(B-Acute Lymphoblastic Leukemia;B-ALL)細胞系Kasumi-2作為標靶的重導引T細胞細胞毒性 (Re-directed T cell cytotoxicity;RTCC)分析
就針對B-ALL細胞系Kasumi 2之RTCC活性,使用人類CD8+、CD45RA+記憶T細胞作為效應物來測試表3及4中列出的四特異性GNC抗體。在37℃下,在10ml之培養基中將Kasumi 2靶細胞5 x 106用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5uM標記20分鐘。將細胞用50ml之培養基洗滌3次,之後再懸浮於10ml中,隨後再次計數。以2X最終濃度製備抗體且在200ul之RPMI+10%FBS中跨於96孔板之10個孔滴定1:3。按照製造商之協定,使用EasySepTM人類初始CD8+ T細胞分離套組(Stemcell Technologies,#19258)自來自正常供體之PBMC富集人類CD8+、CD45RA+記憶T細胞。最終細胞群體係藉由FACS分析判定為98% CD8+、CD45RA+ T細胞。在最終目的地96孔板中,藉由將100ul之靶細胞(5,000)、50ul之CD8+、CD45RO+ T細胞(25,000)、及100ul之每一抗體稀釋液添加至分析之每一孔來組合靶細胞、T細胞、及連續滴定抗體。在37℃下將分析板培養大致72小時且隨後收穫每一分析孔之內容物且分析所剩餘的CFSE標記靶細胞之數量。如第12圖上所示,四特異性GNC抗體全部含有相同的PDL1結合結構域PL230C6、相同的ROR1結合結構域338H4、及相同的CD3結合結構域284A10,但具有41BB結合結構域460C3、420H5、及466F6之一, 但相較於不含有41BB、PDL1、ROR1、或CD3結合結構域之一的對照不展示較大的RTCC活性。此與實例6中描述及第6圖中展示的四特異性GNC抗體形成對比,該等四特異性GNC抗體確實以CD8+、CD45RA+初始T細胞展示RTCC活性。
術語「抗體」係廣義使用,且特定而言,涵蓋單一單株抗體(包括促效劑及拮抗劑抗體)、具有多表位特異性之抗體組合物,以及抗體片段(例如,Fab、F(ab')2、及Fv),只要其展現所要生物活性即可。在一些實施例中,抗體可為單株、多株、嵌合、單鏈、雙特異性或雙有效性、模擬、人類及人源化抗體以及其活性片段。結合至已知抗原的分子之活性片段之實例包括Fab、F(ab')2、scFv及Fv片段,包括Fab免疫球蛋白表現庫之產物及上文提及的任何抗體及片段之表位結合片段。在一些實施例中,抗體可包括免疫球蛋白分子及免疫球蛋白分子之免疫活性部分,該等免疫球蛋白分子亦即為含有免疫特異性結合抗原之結合位點的分子。免疫球蛋白可具有免疫球蛋白分子之任何類型(IgG、IgM、IgD、IgE、IgA及IgY)或類別(IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2)或子類。在一個實施例中,抗體可為完整抗體及來源於完整抗體之任何抗原結合片段。典型抗體係指異源四聚蛋白質,其典型地包含兩個重(H)鏈及兩個輕(L)鏈。每一重鏈由重鏈可變結構域(縮寫為VH)及重鏈恆定結構域構成。每一輕鏈由輕鏈可變結構域(縮寫為VL)及輕鏈恆定 結構域構成。VH及VL區域可進一步再分成高度變異互補判定區(complementarity determining region;CDR),及稱為框架區(framework region;FR)之更保守區。每一可變結構域(VH或VL)典型地由三個CDR及四個FR構成,該等區係自胺基末端至羧基末端按以下順序佈置:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。在輕鏈及重鏈之可變區內,存在與抗原相互作用的結合區。
如本文所使用的術語「單株抗體」係指自實質上同源抗體之群體獲得的抗體,該等實質上同源抗體亦即為包含除可以微小量存在的可能天然存在的突變外皆為相同的群體之個別抗體。單株抗體為高度特異性,其係針對單一抗原位點。此外,與典型地包括針對不同決定位(表位)不同抗體之習知(多株)抗體製劑相對比,每一單株抗體係針對抗原上之單一決定位。除其特異性之外,單株抗體為有利的,原因在於其係藉由融合瘤培養合成,不受其他免疫球蛋白污染。修飾詞「單株」指示如自抗體之實質上同源群體獲得的抗體之特性,且不欲解釋為需要藉由任何特定方法來產生抗體。例如,根據本揭示內容使用的單株抗體可藉由首先由Kohler & Milstein,Nature,256:495(1975)描述的融合瘤方法來製造,或可藉由重組DNA方法(參見,例如,美國專利第4,816,567號)來製造。
單株抗體可包括「嵌合」抗體(免疫球蛋白),其中重鏈及/或輕鏈之一部分與來源於特定物種或屬於特定抗體類別或子類之抗體中的對應序列一致或同源,而鏈之剩餘部分係與來源於另一物種或屬於另一抗體類別或子類的抗體以及此種抗體之片段中之對應序列一致或同源,只要其展現所要生物活性即可(美國專利第4,816,567號;及Morrison等人Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851-6855[1984])。
單株抗體可使用包括小鼠融合瘤或噬菌體呈現(參見Siegel.Transfus.Clin.Biol.9:15-22(2002)之綜述)的各種方法產生,或自直接來自初級B細胞之抗體之分子選殖(參見Tiller.New Biotechnol.28:453-7(2011))產生。在本揭示內容中,抗體係藉由用人類PD-L1蛋白質及在細胞表面上短暫表現人類PD-L1之細胞免疫兔子來產生。已知兔子產生高親和力、多樣性及特異性之抗體(Weber等人,Exp.Mol.Med.49:e305)。來自免疫動物之B細胞係活體外培養及篩選用於產生抗PD-L1抗體。抗體可變基因係使用重組DNA技術分離且所得抗體係重組表現且針對所要特徵來進一步篩選,該等所要特徵諸如抑制PD-L1與PD-1之結合的能力、結合至非人類靈長類動物PD-L1之能力及增強人類T細胞活化之能力。抗體發現之此一般方法係類似於Seeber等人,PLOS One.9:e86184(2014)中描述的彼方法。
術語「抗原或表位結合部分或片段」係指抗體的能夠結合至抗原(在此情況下為PD-L1)之片段。該些片段可能夠具有完整抗體之抗原結合功能及另外的功能。結合片段之實例包括但不限於單鏈Fv片段(scFv),其由藉由合成連接子或Fab片段連接在單一多肽鏈中的抗體之單臂之VL及VH結構域組成,該合成連接子或Fab片段為由VL、恆定輕鏈(CL)、VH及恆定重鏈1(CH1)結構域組成之一價片段。抗體片段可甚至為較小子片段且可由小達單一CDR結構域、尤其為來自VL及/或VH結構域之CDR3區的結構域組成(例如,參見Beiboer等人,J.Mol.Biol.296:833-49(2000))。使用熟習此項技術者已知的習知方法產生抗體片段。抗體片段可使用在完整抗體情況下使用的相同技術來針對實用性進行篩選。
「抗原或表位結合片段」可藉由多種此項技術中已知的技術自本揭示內容之抗體得到。例如,純化的單株抗體可利用諸如胃蛋白酶之酶來分解,且經受HPLC凝膠過濾。可隨後收集含有Fab片段之適當餾分且藉由膜過濾及類似物來濃縮適當餾分。對用於分離抗體之活性片段的一般技術之進一步描述,參見例如,Khaw,B.A.等人,J.Nucl.Med.23:1011-1019(1982);Rousseaux等人,Methods Enzymology,121:663-69,Academic Press,1986。
抗體之木瓜酶消化產生兩個一致的抗原結合片段,稱為「Fab」片段,每一片段具有單一抗原結合位點,及殘留「Fc」片段,該片段之名稱反映其容易結晶之能力。胃蛋白酶處理產生F(ab')2片段,其具有兩個抗原組合位點且仍能夠交聯抗原。
Fab片段可含有輕鏈之恆定結構域及重鏈之第一恆定結構域(CH1)。因在重鏈CH1結構域之羧基末端處添加包括來自抗體鉸鏈區之一或多個半胱胺酸的少數殘基,Fab'片段不同於Fab片段。Fab'-SH為在本文對Fab'之命名,其中恆定結構域之半胱胺酸殘基帶有游離的硫醇基。F(ab')2抗體片段原始地係產生為成對的Fab'片段,其之間具有鉸鏈半胱胺酸。亦已知抗體片段之其他、化學偶合。
「Fv」為最小抗體片段,其含有完全抗原識別及結合位點。此區由呈緊密、非共價締合的一個重鏈可變結構域及一個輕鏈可變結構域之二聚物組成。在此配置中,每一可變結構域之三個CDR相互作用以在VH-VL二聚物之表面上定義抗原結合位點。共同地,六個CDR將抗原結合特異性賦予抗體。然而,甚至單一可變結構域(或Fv之一半,其包含僅三個對抗原為特異性的CDR)具有辨別並結合抗原之能力,但以比完整結合位點低的親和力達成。
來自任何脊椎動物物種的抗體(免疫球蛋白)之「輕鏈」可基於其恆定結構域之胺基酸序列而指定為稱為κ及λ的兩個明顯相異類型之一。
取決於其重鏈之恆定結構域之胺基酸序列,免疫球蛋白可指定至不同類別。存在五個主要類別之免疫球蛋白:IgA、IgD、IgE、IgG及IgM,且該些免疫球蛋白中若干者可進一步分成子類(同型),例如,IgG-1、IgG-2、IgG-3、及IgG-4;IgA-1及IgA-2。對應於不同類別之免疫球蛋白的重鏈恆定結構域分別稱為α、δ、ε、γ、及μ。不同類別的免疫球蛋白之子單元結構及三維配置係熟知的。
「人源化抗體」係指一類工程化抗體,其具有其來源於非人類供體免疫球蛋白之CDR,分子之剩餘免疫球蛋白源性部分係來源於一種(或多種)人類免疫球蛋白。另外,框架支撐殘基可經改變以保存結合親和力。獲得「人源化抗體」之方法係熟習此項技術者熟知的。(參見,例如,Queen等人,Proc.Natl Acad Sci USA,86:10029-10032(1989),Hodgson等人,Bio/Technology,9:421(1991))。在一個實施例中,「人源化抗體」可藉由遺傳工程化方法來獲得,該遺傳工程化方法賦能親和力成熟類人類多株抗體於諸如例如兔子之大型動物中之產生(參見,例如美國專利第7,129,084號)。
如本文所使用的術語「多肽」、「肽」、及「蛋白質」係可互換的且經定義來意指由藉由肽鍵連接的胺基酸構成的生物分子。
如本文所使用術語「一(a/an)」及「該」係定義來意指「一或多個」且包括複數,除非情景係不適當的。
「分離的」意指生物分子,其不含至少一些與其天然存在的組分。當用於描述本文揭示的各種多肽時,「分離」意指已經鑑別且自表現其之細胞或細胞培養物分離及/或回收的多肽。通常,分離多肽將藉由至少一個純化步驟來製備。「分離抗體」係指實質上不含具有不同抗原特異性之其他抗體的抗體。
「重組」意指抗體係使用重組核酸技術在外來寄主細胞中產生。
術語「抗原」係指可在生物體、特定而言動物、更特定而言包括人類之哺乳動物中誘導免疫反應的實體或其片段。術語包括負責抗原性或抗原決定位之免疫原及其區域。
亦如本文所使用,術語「免疫原性」係指引發或增強抗體、T細胞或針對免疫原性劑的其他反應性免疫細胞之產生且貢獻於人類或動物中之免疫反應的物質。當個體產生充分的抗體、T細胞及抵抗所投與的本揭示內容之免疫原性組合物的其他反應性免疫細胞以緩和或減輕將要治療的病症時,免疫反應就發生。
「特異性結合特定抗原或表位」或「特異地結合至特定抗原或表位」或「對特定抗原或表位為特異性」意指適度地不同於非特異性相互作用之結合。特異性結合可例如藉由相較於對照分子之結合決定分子之結合來量測,該對照分子通常為不具有結合活性的具有類似結構之分子。例如,特異性結合可藉由與類似於標靶的對照分子競爭來決定。
用於特定抗原或表位之特異性結合可例如藉由具有至少約10-4M、至少約10-5M、至少約10-6M、至少約10-7M、至少約10-8M、至少約10-9、替代地至少約10-10M、至少約10-11M、至少約10-12M、或更大的對抗原或表位之KD的抗體來展現,其中KD係指特定抗體-抗原相互作用之解離速率。在一些實施例中,特異地結合抗原的抗體將具有比對照分子相對於抗原或表位大20倍、50倍、100倍、500倍、1000倍、5,000倍、10,000倍或更多倍的KD。
此外,對特定抗原或表位之特異性結合可例如藉由具有對抗原或表位比相對於對照對表位大至少20倍、50倍、100倍、500倍、1000倍、5,000倍、10,000倍或更多倍的KA或Ka之抗體來展現,其中KA或Ka係指特定抗體-抗原相互作用之締合速率。
兩個序列之間的「同源性」係藉由序列一致性來決定。若彼此比較的兩個序列在長度上有所不同,則序列一致性較佳地係關於較短序列中與較長序列之核苷酸 殘基一致的核苷酸殘基之百分比。序列一致性可按慣例使用電腦程式來決定。在給定序列與本揭示內容之上述序列之間的比較中出現的偏差可例如藉由添加、缺失、替代、插入或重組來引起。
儘管本揭示內容已參考特定實施例或實例描述,但可理解的是,實施例為說明性的且本揭示內容之範疇不因此受限。本揭示內容之替代實施例可對熟習本揭示內容所屬技術領域之一般技藝人士變得明顯。此種替代實施例係視為涵蓋在本揭示內容之範疇內。因此,本揭示內容之範疇係藉由隨附申請專利範圍界定且由前述描述來支援。本揭示內容中引用或參考的所有參考文獻之全部內容係在此以全文引用方式併入。
<110> 美商西雅圖免疫公司(SYSTIMMUNE,INC.) 大陸商四川百利藥業有限責任公司(SICHUAN BAILI PHARMACEUTICAL CO.LTD.)
<120> 引導及導航控制蛋白質以及彼之製造及使用方法
<130> SIBA101PCT
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<210> 18
<211> 115
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 18
Figure 107121548-A0305-02-0056-33
Figure 107121548-A0305-02-0057-34
<210> 19
<211> 333
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 19
Figure 107121548-A0305-02-0057-35
Figure 107121548-A0305-02-0058-36
<210> 20
<211> 111
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 20
Figure 107121548-A0305-02-0058-37
<210> 21
<211> 345
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 21
Figure 107121548-A0305-02-0059-38
<210> 22
<211> 115
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 22
Figure 107121548-A0305-02-0059-39
Figure 107121548-A0305-02-0060-40
<210> 23
<211> 333
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 23
Figure 107121548-A0305-02-0060-41
<210> 24
<211> 111
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 24
Figure 107121548-A0305-02-0060-42
Figure 107121548-A0305-02-0061-43
<210> 25
<211> 357
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 25
Figure 107121548-A0305-02-0061-44
<210> 26
<211> 119
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 26
Figure 107121548-A0305-02-0062-45
<210> 27
<211> 339
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 27
Figure 107121548-A0305-02-0063-46
<210> 28
<211> 113
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 28
Figure 107121548-A0305-02-0063-47
Figure 107121548-A0305-02-0064-48
<210> 29
<211> 366
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 29
Figure 107121548-A0305-02-0064-49
<210> 30
<211> 122
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 30
Figure 107121548-A0305-02-0064-50
Figure 107121548-A0305-02-0065-51
<210> 31
<211> 339
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 31
Figure 107121548-A0305-02-0065-52
<210> 32
<211> 113
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 32
Figure 107121548-A0305-02-0066-53
<210> 33
<211> 345
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 33
Figure 107121548-A0305-02-0067-54
<210> 34
<211> 115
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 34
Figure 107121548-A0305-02-0067-55
Figure 107121548-A0305-02-0068-56
<210> 35
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 35
Figure 107121548-A0305-02-0068-57
<210> 36
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 36
Figure 107121548-A0305-02-0068-58
Figure 107121548-A0305-02-0069-59
<210> 37
<211> 360
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 37
Figure 107121548-A0305-02-0069-60
<210> 38
<211> 120
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 38
Figure 107121548-A0305-02-0070-61
<210> 39
<211> 324
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 39
Figure 107121548-A0305-02-0070-62
Figure 107121548-A0305-02-0071-63
<210> 40
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 40
Figure 107121548-A0305-02-0071-64
<210> 41
<211> 354
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 41
Figure 107121548-A0305-02-0072-65
<210> 42
<211> 118
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 42
Figure 107121548-A0305-02-0072-66
Figure 107121548-A0305-02-0073-67
<210> 43
<211> 336
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 43
Figure 107121548-A0305-02-0073-68
<210> 44
<211> 112
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 44
Figure 107121548-A0305-02-0074-69
<210> 45
<211> 987
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 45
Figure 107121548-A0305-02-0074-70
Figure 107121548-A0305-02-0075-71
<210> 46
<211> 329
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 46
Figure 107121548-A0305-02-0075-72
Figure 107121548-A0305-02-0076-73
Figure 107121548-A0305-02-0077-74
<210> 47
<211> 321
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 47
Figure 107121548-A0305-02-0077-75
<210> 48
<211> 107
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 48
Figure 107121548-A0305-02-0078-76
<210> 49
<211> 3681
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 49
Figure 107121548-A0305-02-0078-77
Figure 107121548-A0305-02-0079-78
Figure 107121548-A0305-02-0080-79
Figure 107121548-A0305-02-0081-80
<210> 50
<211> 1227
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 50
Figure 107121548-A0305-02-0081-81
Figure 107121548-A0305-02-0082-82
Figure 107121548-A0305-02-0083-83
Figure 107121548-A0305-02-0084-84
Figure 107121548-A0305-02-0085-85
Figure 107121548-A0305-02-0086-86
Figure 107121548-A0305-02-0087-87
Figure 107121548-A0305-02-0088-88
<210> 51
<211> 651
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 51
Figure 107121548-A0305-02-0088-89
<210> 52
<211> 217
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 合成
<400> 52
Figure 107121548-A0305-02-0089-90
Figure 107121548-A0305-02-0090-91

Claims (6)

  1. 一種引導及導航控制(GNC)蛋白質,該GNC蛋白質包含一細胞毒性細胞結合部分及一癌症靶向部分,其中該細胞毒性細胞結合部分具有對一T細胞受體之結合特異性,且其中該癌症靶向部分具有對一癌細胞受體之結合特異性,該T細胞受體包含CD3、PDL1和4-1BB,該癌症受體包含ROR1,其中該GNC蛋白質能夠藉由將該細胞毒性細胞結合部分結合至該T細胞受體而活化一T細胞,所述之GNC蛋白質,其為四特異抗體或抗體單體或彼等之組合,該四特異性抗體重鏈包含如下所示的CDR序列:QSSQSVYSNWFS;SASTLAS;AGGYNTVIDTFA;RYYMC;CIYTGSRDTPHYASSAKG;EGSL;TYDMI;IITYSGSRYYANWAKG;DYMSGSHL;RYHMT;HIYVNNDDTDYASSAKG; LDVGGGGAYIGDI;QSSQSVYNNNDLA;YASTLAS;AGGYDTDGLDTFA;TNAMS;VITGRDITYYASWAKG;DGGSSAITSNNI;QASESISSWLA;EASKLAS;及QGYFYFISRTYVNS;並且,其中該對稱四特異性抗體輕鏈包含如下所示的CDR序列:QASEDIYSFLA;SASSLAS;及QQGYGKNNVDNA。
  2. 如請求項1所述之GNC蛋白質,包含SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.24、SEQ ID NO.10、SEQ ID NO.12、SEQ ID NO.30、SEQ ID NO.32、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.4所示的重鏈可變區序列和輕鏈可變區序列。
  3. 如請求項1或2所述的GNC蛋白,包含SEQ ID NO.50所示的重鏈氨基酸序列和SEQ ID NO.52所示的輕鏈氨基酸序列。
  4. 一種治療複合物,包含如請求項1所述之GNC蛋白質及一細胞毒性細胞,其中該細胞毒性細胞包含一T細胞。
  5. 一種治療複合物,包含如請求項1所述之GNC蛋白質、結合至T細胞結合部分之一T細胞及結合至癌症靶向部分之一癌細胞。
  6. 一種醫藥組合物,包含如請求項4所述之治療複合物及一醫藥學上可接受的載劑。
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