CN110891650A - 制导和导航控制蛋白及其制造和使用方法 - Google Patents

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欧勒·奥尔森
夏冬
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比尔·布雷迪
布莱尔·伦肖
布莱恩·科瓦切维奇
梁玉
王宇燕
高泽人
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Abstract

本申请提供了制导和导航控制(GNC)蛋白。在一个实施方案中,所述GNC蛋白包含T细胞结合部分和癌症靶向部分,其中所述T细胞结合部分对T细胞受体具有结合特异性,所述T细胞受体包含CD3、CD28、PDL1、PD1、OX40、4‑1BB、GITR、TIGIT、TIM‑3、LAG‑3、CTLA4、CD40、VISTA、ICOS、BTLA、Light、NKp30、CD28H、CD27、CD226、CD96、CD112R、A2AR、CD160、CD244、CECAM1、CD200R、TNFRSF25(DR3)或其组合,并且其中所述癌症靶向部分对癌细胞受体具有结合特异性。

Description

制导和导航控制蛋白及其制造和使用方法
相关申请的交叉引用
本申请要求2018年3月27日提交的美国临时专利申请62/6488880,2018年3月27日提交的美国临时专利申请62/648888、2017年8月28日提交的美国临时专利申请62/551032、2017年6月25日提交的美国临时专利申请62/524553、2017年8月15日提交的美国临时专利申请NO.62/545603、2017年8月28日提交的美国临时专利申请NO.62551035、2017年8月28日提交的美国临时专利申请号62/551065、2017年6月25日提交的美国临时专利申请号62/524554、2017年6月25日提交的美国临时专利申请号62/524557、和2017年6月25日提交的美国临时专利申请62/524558的权益,其全部公开内容通过引用明确地并入本文。
技术领域
本申请总体上涉及具有针对免疫细胞和肿瘤细胞两者上的表面分子的多特异性结合活性的制导和导航控制(Guidance and Navigation Control,GNC)蛋白的技术领域,并且更具体地涉及GNC蛋白的制备和使用。
背景技术
癌细胞发展各种策略以逃避免疫系统。免疫逃逸的潜在机制之一是免疫系统对癌细胞的识别降低。癌症特异性抗原的缺陷呈递或其缺乏导致免疫耐受和癌症进展。在有效的免疫识别的存在下,肿瘤使用其它机制以避免被免疫系统消除。免疫活性肿瘤产生抑制性微环境以下调免疫应答。多个参与者参与形成抑制性肿瘤微环境,包括肿瘤细胞、调节性T细胞、髓样衍生的抑制性细胞、基质细胞和其它细胞类型。通过从局部环境中分泌免疫抑制性细胞因子或消除必需的存活因子,免疫应答的抑制可以以细胞接触依赖性形式以及以接触非依赖性方式进行。细胞接触依赖性抑制依赖于细胞表面上表达的分子,例如,程序性死亡配体1(PD-L1)、T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA-4)等[Dunn等,2004,免疫(Immunity),21(2):137-48;Adachi&Tamada,2015,癌症科学(Cancer Sci.),106(8):945-50]。
随着肿瘤逃避免疫系统识别的机制继续被更好地了解,最近出现了靶向这些机制的新治疗方式。2011年3月25日美国食品和药品管理局(FDA)批准了用于治疗不可切除或转移性黑素瘤的易普利姆玛单抗(ipilimumab)注射剂(Yervoy,Bristol-Myers Squibb)。Yrevoy与活化T细胞上表达的细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA-4)结合并阻断抗原呈递细胞上CTLA-4与CD80/86的相互作用,从而阻断通过CTLA-4递送到T细胞中的阴性或抑制性信号,导致抗原特异性T细胞的再活化,这在许多患者中导致肿瘤的根除。2014年几年后,FDA批准Keytruda(派姆单抗(Pembrolizumab),默克公司)和Opdivo(纳武单抗(Nivolumab),百时美施贵宝)用于治疗晚期黑素瘤。这些单克隆抗体结合在活化和/或耗尽的T细胞上表达的PD-1,并阻断PD-1与在肿瘤上表达的PD-L1的相互作用,从而消除通过PD-1进入T细胞的抑制信号,导致抗原特异性T细胞的再活化,这在许多患者中再次导致肿瘤的根除。从那时起,已经进行了另外的临床试验,将单一单克隆抗体Yervoy与单克隆抗体Yervoy和Opdivo的组合在晚期黑素瘤的治疗中进行比较,结果显示,在接受抗体组合治疗的患者中,其总生存期和无进展生存期均有改善。(Hodi等人,2016,柳叶刀·肿瘤学(Lancet Oncol).17(11):1558-1568,Hellman等人,2018,肿瘤细胞(Cancer Cell)33(5):853-861)。然而,由于许多临床试验已经显示出使用对一种或多种免疫检查点分子具有特异性的单克隆抗体治疗癌症患者的极大益处,数据已经显示出只有那些具有产生被抗原特异性T细胞识别的新T细胞表位的高突变负荷的患者显示出临床应答(Snyder等人,2014,NEJM371:2189-2199)。具有低肿瘤突变负荷的那些患者大部分不显示客观的临床反应(Snyder等人,2014,NEJM371:2189-2199,Hellman等人,2018,肿瘤细胞(Cancer Cell)33(5):853-861)。
近年来,其它团队已经开发了不需要存在通过抗原呈递细胞的新表位呈递来活化T细胞的替代方法。一个实例是双特异性抗体的开发,其中对肿瘤相关抗原如CD19特异的抗体的结合结构域与T细胞上CD3特异的抗体结合结构域连接,从而产生双特异性T细胞结合剂或咬合分子。在2014年,FDA批准了称为Blinatumumab的双特异性抗体用于治疗前体B细胞急性成淋巴细胞白血病。Blinatumumab将对白血病细胞上表达的CD19有特异性的scFv与对T细胞上表达的CD3有特异性的scFv连接起来(Bejnijamin和Stein 2016,Ther AdvHematol7(3):142-146)。然而,尽管复发或顽固性急性淋巴细胞白血病(ALL)患者的初始应答率>50%,但许多患者在用Blinatumumab成功治疗后对Blinatumumab治疗有耐药性或复发。有证据表明,对Blinatumumab的耐药性或Blinatumumab治疗后的复发归因于在肿瘤细胞上表达的免疫检查点抑制分子的表达,如PD-L1,其通过在活化的T细胞上表达的PD-1驱动抑制信号(Feucht等人,2016,肿瘤标靶(Oncotarget7)(47):76902-76919)。在对耐受Blinatumumab治疗的患者的病例研究中,进行第二轮Blinatumumab治疗,但加入特异性地结合到PD-1并阻断T细胞表达的PD-1与肿瘤细胞表达的PD-L1的相互作用的单克隆抗体Pembrolizumab(Keytruda,默克公司),导致在这位患者中骨髓中肿瘤细胞的显著应答和从45%减少到小于5%(Feucht等人,2016,Oncotarget(肿瘤标靶)7(47):76902-76919)。这些结果表明,与任一单独的试剂相比,将双特异性咬合分子与一种或多种单克隆抗体组合可显著增加临床活性。尽管有希望的结果,但由于多次临床试验和招募代表性群体的困难性,导致联合治疗的成本必然很高。
嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)的过继细胞疗法是治疗癌症的另一种有前途的免疫疗法。CAR-T治疗的临床成功表明,CD19阳性治疗-难治性B细胞恶性肿瘤患者可实现持久的完全缓解和延长的生存期(Gill&June.2015.ImmuNO.l Rev,263:68-89)。但是,与个性化和基因改造的CAR-T免疫疗法的制造相关的成本和复杂性已将其生产和使用限制在专门的中心以治疗相对少量的患者。细胞因子释放综合征(CRS),也称为细胞因子风暴,是输注工程化CAR-T细胞后最显著的副作用(Bonifant等,201,Mol Ther Oncolytics.3:16011)。在许多情况下,CRS的发作和严重程度似乎是专门的个人事件。目前缓解CRS的选择主要集中于快速反应和管理护理,因为在T细胞输注之前控制CRS的选择是有限的。
尽管现在已经确定了对CD19阳性B细胞恶性肿瘤有特异性的CAR-T治疗的功效,但是迄今为止还没有明确地证明CAR-T治疗对实体瘤的功效。目前,许多临床试验正在进行,以探索用于CAR-T治疗的多种实体瘤相关抗原(TAA)。目前认为,进入肿瘤的低效T细胞运输,免疫抑制性肿瘤微环境,次优抗原识别特异性和缺乏对治疗相关不良事件的控制是实体肿瘤CAR-T治疗中的主要障碍(Li等人,2018,J Hematol Oncol.11(1):22-40)。管理治疗效果以及CAR-T细胞输注前后的任何副作用的选择是有限的。
发明内容
本申请提供了对T细胞和肿瘤细胞的表面分子具有多特异性抗原结合活性的制导和导航控制(GNC)蛋白。
在一个实施方案中,制导和导航控制(GNC)蛋白包含细胞毒性细胞结合部分和癌症靶向部分。任何细胞毒性细胞可能是所公开的GNC蛋白潜在的结合靶标。细胞毒性细胞的实例包括但不限于T细胞、NK细胞、巨噬细胞和树突细胞。
在一个实施方案中,GNC蛋白包括T细胞结合部分。T细胞结合部分对T细胞受体具有结合特异性。T细胞受体的实例包括但不限于CD3、CD28、PDL1、PD1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40L、VISTA、ICOS、BTLA、Light、CD30、NKp30、CD28H、CD27、CD226、CD96、CD112R、A2AR、CD160、CD244、CECAM1、CD200R、TNFRSF25(DR3)或其组合。
在一个实施方案中,GNC蛋白包括NK细胞结合部分。NK细胞结合部分对NK细胞受体具有结合特异性。NK细胞受体的实例包括但不限于活化NK细胞的受体,例如CD16、NKG2D、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、NKG2C、NKG2E、NKG2H;激动剂受体,如NKp30a、NKp30b、NKp46、NKp80、DNAM-1、CD96、CD160、4-1BB、GITR、CD27、OX-40、CRTAM;和拮抗剂受体,例如KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL3、NKG2A、NKp30c、TIGIT、SIGLEC7、SIGLEC9、LILR、LAIR-1、KLRG1、PD-1、CTLA-4、CD161。
在一个实施方案中,GNC蛋白包括巨噬细胞结合部分。巨噬细胞结合部分对巨噬细胞受体具有结合特异性。巨噬细胞受体的实例包括但不限于,巨噬细胞上的激动剂受体,例如TLR2、TLR4、CD16、CD64、CD40、CD80、CD86、TREM-1、TREM-2、ILT-1、ILT-6a、ILT-7、ILT-8、EMR2、Dectin-1、CD69;拮抗剂受体,例如CD32b、SIRPα、LAIR-1、VISTA、TIM-3、CD200R、CD300a、CD300f、SIGLEC1、SIGLEC3、SIGLEC5,SIGLEC7、SIGLEC9、ILT-2、ILT-3、ILT-4、ILT-5、LILRB3、LILRB4、DCIR;和其它表面受体,例如CSF-1R、LOX-1、CCR2、FRβ、CD163、CR3、DC-SIGN、CD206、SR-A、CD36、MARCO。
在一个实施方案中,GNC蛋白包括树突细胞结合部分。树突细胞结合部分对树突细胞受体具有结合特异性。树突细胞受体的实例包括但不限于树突细胞上的激动剂受体,例如TLR、CD16、CD64、CD40、CD80、CD86、HVEM、CD70;拮抗剂受体,例如VISTA、TIM-3、LAG-3、BTLA;和其它表面受体,例如CSF-1R、LOX-1、CCR7、DC-SIGN、GM-CSF-R、IL-4R、IL-10R、CD36、CD206、DCIR、RIG-1、CLEC9A、CXCR4。
癌症靶向部分对癌细胞受体具有结合特异性。癌细胞受体的实例包括但不限于BCMA、CD19、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30、ROR1、CEA、HER2、EGFR、EGFRvIII、LMP1、LMP2A、间皮素、PSMA、EpCAM、磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3、gpA33、GD2、TROP2或它们的组合。
在一个实施方案中,GNC蛋白包含至少一个T细胞结合部分和至少一个癌细胞结合部分,其中所述T细胞结合部分对T细胞受体具有结合特异性,所述T细胞受体包含CD3、CD28、PDL1、PD1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40、VISTA、ICOS、BTLA、Light、CD30、CD27或其组合,并且其中癌细胞结合部分对癌细胞受体具有结合特异性。
在一个实施方案中,所述癌症受体包括癌症细胞上的受体:肺癌细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞、结肠直肠癌细胞、肛门癌细胞、胰腺癌细胞、胆囊癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、鼻咽癌细胞、皮肤癌细胞、黑素瘤细胞、卵巢癌细胞、前列腺癌细胞、尿道癌细胞、肺癌细胞;非小细胞肺癌细胞、小细胞肺癌细胞、脑肿瘤细胞、神经胶质瘤细胞、成神经细胞瘤细胞、食管癌细胞、胃癌细胞、肝癌细胞、肾癌细胞、膀胱癌细胞、宫颈癌细胞、子宫内膜癌细胞、甲状腺癌细胞、眼癌细胞、肉瘤细胞;骨癌细胞、白血病细胞、骨髓瘤细胞、淋巴瘤细胞或其组合。
在一个实施方案中,GNC蛋白能够通过将T细胞结合部分与T细胞上的T细胞受体结合而活化T细胞。在一个实施方案中,GNC蛋白包含双特异性抗体或抗体单体、三特异性抗体或抗体单体、四特异性抗体或抗体单体、其抗原结合片段或其组合。在一个实施方案中,GNC蛋白包含与SEQ ID NO.49-52具有百分比同源性的氨基酸序列,其中同源性百分比不小于70%、80%、90%、95%、98%或99%。
在一个实施方案中,GNC蛋白可以具有第一部分和第二部分。在一个实施方案中,第一部分可包括T细胞结合部分、NK细胞结合部分,巨噬细胞结合部分或树突细胞结合部分。第二部分包含癌症靶向部分。
在一个实施方案中,第一部分和第二部分可以具有彼此结合的特异性。在这些实施方案中,GNC蛋白通过第一部分和第二部分之间的结合作用形成。结合作用是非共价键合。在一个实施方案中,GNC蛋白包括通过高亲和力非共价键相互作用与第二部分结合的第一部分。高亲和力非共价键合相互作用的实例包括但不限于抗体-抗原相互作用,生物素-链霉亲和素相互作用,亮氨酸-拉链和来自双杂交筛选测定的任何蛋白质对,非免疫球蛋白蛋白质支架(Hosse等人,2006,Protein Sci.15(1):14-27)或aptamers(适体)(Likhin等人,2013,Acta Naturae.2013.5(4):34-43)或其组合。
在一个实施方案中,GNC蛋白可以进一步包括接头部分。在一个实施方案中,第一部分和第一部分通过接头部分连接以提供GNC蛋白。在一个实施方案中,接头部分可以将第一和第二部分共价连接在一起,以提供GNC蛋白。在一个实施方案中,接头部分可以包括两个互补分子或稳定的蛋白质-蛋白质相互作用。互补分子的实例包括但不限于DNA和RNA的互补链。稳定的蛋白质-蛋白质相互作用的实例包括但不限于生物素-抗生物素蛋白,亮氨酸-拉链和来自双杂交筛选测定的任何蛋白质对。
在一个实施方案中,接头部分可以包括免疫球蛋白G(IgG)的主链,其中GNC蛋白可以包括具有两条重链和两条轻链的免疫球蛋白G(IgG)部分,并且至少两个scFv部分共价连接到重链或轻链的C或N末端。IgG部分可以为scFv部分提供稳定性,且三特异性GNC蛋白可以具有两个部分用于结合T细胞上的表面分子。
在一个实施方案中,第一部分包含抗体或其片段、可溶性受体或其组合。在一个实施方案中,第二部分包含抗体或片段、可溶性受体或其组合。
本申请还提供了掺入本文公开的GNC蛋白的治疗复合物。在一个实施方案中,治疗复合物包括GNC蛋白和细胞毒性细胞。细胞毒性细胞可以是T细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突细胞或其组合。在一个实施方案中,T细胞可以是自体T细胞、同种T细胞或通用供体T细胞。
在一个实施方案中,治疗复合物包括GNC蛋白和癌细胞。在一个实施方案中,治疗复合物可以包括本文公开的GNC蛋白,其具有与T细胞结合部分结合的T细胞和与癌症靶向部分结合的癌细胞。
本申请还提供了一种药物组合物。在一个实施方案中,该药物组合物包括本文公开的治疗复合物和药学上可接受的载体。在一个实施方案中,药物组合物包括本文公开的GNC蛋白和药学上可接受的载体。
在另一方面,本申请提供了制备和使用所公开的GNC蛋白的方法。
通过下面结合附图对优选实施例的详细描述,本申请的目的和优点将变得显而易见。
附图说明
结合附图,根据以下描述和所附权利要求书,本发明的前述和其它特征将变得更加完全显而易见。应理解,这些附图仅描绘了根据本公开安排的多个实施例,并且因此不应被认为是对其范围的限制,将通过使用附图以附加的特性和细节来描述本公开,在附图中:
图1显示了GNC蛋白的实施例,其特征在于其由多个抗原结合结构域(AgBD)和接头组成。
图2显示作为实施方案的四特异性GNC抗体的示例形式。
图3显示示例性四特异性GNC抗体通过多个AgBD结合T细胞和肿瘤细胞。
图4显示了与人ROR1转染的CHO细胞结合的四特异性GNC抗体实例。
图5显示了与人41BB转染的CHO细胞结合的四特异性GNC抗体的实例。
图6显示了与人PD-L1转染的CHO细胞结合的四特异性GNC抗体实例。
图7显示了以PBMC作为效应物、由具有对ROR1的Ig结构域有特异性的结合结构域323H7的四特异性GNC抗体介导的B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC。
图8显示了以CD8+、CD45RO+记忆T细胞作为效应物、由具有对ROR1的Ig结构域有特异性的结合结构域323H7的四特异性GNC抗体介导的B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC。
图9显示了以CD8+、CD45RA+初始T细胞(naive T cells)作为效应物、由具有对ROR1的Ig结构域有特异性的结合结构域323H7的四特异性GNC抗体介导的B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC。
图10显示了以PBMC作为效应物、由具有对ROR1的卷曲结构域有特异性的结合结构域338H4的四特异性GNC抗体介导的B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC。
图12显示了以CD8+、CD45RA+初始T细胞作为效应物、由具有对ROR1的卷曲结构域有特异性的结合结构域338H4的四特异性GNC抗体介导的B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC。
具体实施方式
在以下详细描述中,参考了构成本文一部分的附图。在附图中,除非上下文另有说明,否则类似的符号通常标识类似的成分。在具体实施方式、附图和权利要求中描述的说明性实施方式并不意味着是限制性的。可利用其他实施方案,且可作出其他改变,而不背离本文所呈现的标的物的精神或范围。将容易理解的是,如在此总体描述的并且在附图中示出的本公开的这些方面可以被安排、替代、组合、分开,并且被设计成多种不同的构型,所有这些在此明确地预期。
在一个实施方案中,指导导航对照(GNC)蛋白的特征在于它们的多个抗原特异性结合结构域(AgBD)的组成和它们通过T细胞和肿瘤细胞上的多个表面分子的结合将T细胞(或其它效应细胞)导向癌细胞(或其它靶细胞)的能力(图1)。根据该定义,GNC蛋白由用于结合T细胞上的至少一种表面分子的部分(Moiety)1和用于结合癌细胞上的至少一种表面抗原的部分2组成(表1A)。在T细胞治疗中,细胞毒性T细胞由T细胞增殖信号以及通过其表面上的激动剂受体或拮抗剂受体的共刺激信号调节。为了调节这些信号以及T细胞和癌症之间的相互作用,部分1(Moiety 1)和部分2(Moiety 2)可能分别需要多个AgBD。GNC蛋白必须具有至少一个连接部分1和部分2的接头。在概念GNC蛋白中,通过使用DNA/RNA或蛋白-蛋白相互作用的互补接头,包括但不限于生物素-抗生物素蛋白、亮氨酸-拉链和任何双杂交阳性蛋白的互补接头,任何接头分子可用于在体外或体内将两个或多个AgBD连接在一起。然而,在本申请中,所有接头或者是抗体骨架结构或者是抗体片段,从而GNC蛋白和GNC抗体可以具有相同的含义,例如图2中的四特异性GNC抗体结构的实施例。GNC蛋白或抗体能够在体内或离体指导T细胞与癌细胞的结合,由多个AgBD介导(图3)。T细胞可以来自相同患者或不同个体,并且癌细胞可以在体内、体外或离体存在。本申请中提供的实施例使得GNC蛋白能够作为T细胞疗法,即:GNC-T疗法,中的主要试剂,用于在过继转移之前先离体激活和控制细胞毒性T细胞。
表1A.在具有T细胞结合结构域的示例性GNC蛋白中,功能性部分(部分1和部分2)和抗原结合结构域的组成
Figure BDA0002316151150000071
除T细胞外,GNC蛋白也可利用其它细胞毒性细胞来杀死或预防癌症。表1B显示了GNC蛋白中具有NK细胞结合结构域的功能性部分(部分1和部分2)和抗原结合结构域的示例性组成。表1C显示了具有巨噬细胞结合结构域的GNC蛋白中的功能部分(部分1和部分2)和抗原结合结构域的示例性组成。表1D显示了具有树突细胞结合结构域的GNC蛋白中的功能部分(部分1和部分2)和抗原结合结构域的示例性组成。
表1b
Figure BDA0002316151150000072
表1c
Figure BDA0002316151150000081
表1d
Figure BDA0002316151150000082
本申请涉及制备和使用重组GNC蛋白的方法。由于多个AgBD分别与诸如T细胞的细胞毒性细胞和癌细胞的界面,它们可以分成部分1和部分2(表1A)。然而,多个AgBD的重排可以是随机的并且数量不相等(表2)。具有两个AgBD的GNC蛋白可以同时结合表面分子(例如T细胞上的CD3),和肿瘤抗原(例如肿瘤细胞上的ROR1),用于将T细胞重新定向或引导至肿瘤细胞。添加第三AgBD,例如特异性结合41BB,可以帮助增强抗CD3诱导的T细胞活化,因为41BB是共刺激因子并且该结合刺激其对活化T细胞的激动剂活性。向GNC蛋白添加第四AgBD,例如特异性结合肿瘤细胞上的PD-L1,可以阻断PD-L1对肿瘤细胞的抑制途径,所述抑制途径是通过PD-L1与T细胞上的PD-1的结合介导的。根据这些基本原理,可以设计和构建GNC蛋白以获得特异性结合不等数量的T细胞拮抗剂和激动剂的多个AgBD,不仅将活化的T细胞重定向至肿瘤细胞,而且控制其体内活性(表2)。因此,GNC蛋白的设计可以是任何多特异性蛋白。
在一个实施方案中,GNC蛋白可以是双特异性、三特异性、四特异性、五特异性、六特异性、七特异性或八特异性蛋白。在一个实施方案中,GNC蛋白可以是单克隆抗体。在一个实施方案中,GNC蛋白可以是双特异性、三特异性、四特异性、五特异性、六特异性、七特异性或八特异性抗体单体。在一个实施方案中,GNC蛋白可以是双特异性、三特异性、四特异性、五特异性、六特异性、七特异性或八特异性抗体。表3提供了具有对抗体结合结构域有特异性的GNC蛋白和抗体的一些实例。
表2.单个GNC蛋白中T细胞活化、T细胞激动剂、T细胞拮抗剂和肿瘤抗原结合结构域的可能组合的实例。
Figure BDA0002316151150000091
表3.用于GNC蛋白的抗体结合结构域的特异性。
Figure BDA0002316151150000092
Figure BDA0002316151150000101
在另一方面,本申请提供了制备和使用所重组的GNC蛋白的方法。GNC蛋白由特征在于以下两个官能团的多特异性抗原结合部分组成:部分1,包含多个抗原结合结构域(AgBD),其特异性涉及T细胞活化,激动剂共刺激和/或抑制性拮抗剂活性;以及部分2,其包含至少一种癌细胞结合特异性。GNC蛋白可以同时结合诸如T细胞的CD3的表面分子,和诸如肿瘤细胞的ROR1的肿瘤抗原,从而将T细胞重新定向或引导至肿瘤细胞。在GNC蛋白中添加第三结合结构域可以通过其41BB的直接结合帮助增强CD3诱导的T细胞活化,即发挥激动剂活性的共刺激因子。此外,在GNC蛋白中添加第四结合结构域可以与肿瘤细胞上的PD-L1结合以阻断PD-L1对肿瘤细胞的抑制途径,所述抑制途径是通过其与T细胞上的PD-1的结合介导的。这样,GNC蛋白获得多种结合能力以将活化的T细胞重定向至肿瘤细胞,并且多种结合可以通过调节激动剂或拮抗剂活性或两者来帮助调节T细胞活化。一些结合能力可以类似于CAR-T细胞上的嵌合抗原受体或双特异性抗体(例如咬合抗体)的结合能力。尽管GNC蛋白是独特的,但它们引导和导航控制活化T细胞和肿瘤细胞之间相互作用的能力仍有待证实。
在一个实施方案中,公开了具有4个不同结合结构域的示例性GNC蛋白。该GNC蛋白是“四特异性抗体”,因为其接头和骨架包含抗体片段。在4种不同的抗原结合结构域中,一种特异性结合T细胞上的CD3;第二种结合针对肿瘤相关抗原有特异性的结构域,包括但不限于其它肿瘤抗原,诸如ROR1、CEA、HER2、EGFR、EGFRvIII、LMP1、LMP2A、Mesothelin、PSMA、EpCAM、磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3、gpA33、GD2、TROP2、BCMA、CD19、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30;并且第三和第四结合结构域针对两种不同的下述免疫检查点调节剂有特异性,即PD-L1、PD-1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40、VISTA、ICOS、BTLA、Light、HVEM、CD73、CD39等。因为它们在功能和组成上的定义,GNC蛋白可被分类为用于治疗癌症的一类新的免疫调节剂。表4显示了示例性四特异性GNC抗体的列表。
表4.四特异性GNC抗体列表。
Figure BDA0002316151150000102
在一个实施方案中,GNC介导的免疫治疗可包括抗体疗法和细胞疗法的类型。在此,优点可以包括但不限于,包含IgG Fc结构域可以赋予与双特异性咬合分子相比在血清中更长半衰期的特征;第二,包含对免疫检查点调节剂特异性的两个结合结构域可以抑制抑制性途径并且同时参与共刺激途径;第三,T细胞上的CD3与肿瘤相关抗原的交联重新定向和引导T细胞杀死肿瘤细胞,而不需要从患者体内除去T细胞,并且在将它们重新引入患者体内之前将它们基因修饰为对肿瘤细胞具有特异性,这也称为嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)疗法;第四,GNC蛋白介导的抗体疗法或T细胞疗法不涉及T细胞的基因修饰,后者可能具有将修饰的T细胞转化为克隆扩增的风险,即T细胞白血病。
通过结合能力的一个或多个增加,GNC蛋白介导的免疫治疗优于常规免疫治疗的优点包括,但不限于,首先,包含IgG Fc结构域可以赋予与双特异性咬合分子相比在血清中更长半衰期的特征;第二,包含对免疫检查点调节剂特异性的两个结合结构域可以抑制抑制性途径并且同时参与共刺激途径;第三,T细胞上的CD3与肿瘤相关抗原的交联重新定向和引导T细胞杀死肿瘤细胞,而不需要从患者体内除去T细胞,并且在将它们重新引入患者体内之前将它们基因修饰为对肿瘤细胞具有特异性,这也称为嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)疗法;第四,GNC蛋白介导的抗体疗法或T细胞疗法不涉及T细胞的基因修饰,后者可能具有将修饰的T细胞转化为克隆扩增的风险,即T细胞白血病。
通过参考本文包括的特定实施方案和实施例的以下详细描述,可以更容易地理解本公开。尽管已经参考本发明的某些实施例的具体细节描述了本发明,但是并不意味着这些细节应当被认为是对本发明范围的限制。
实施例
尽管以下实施例仅作为说明而非限制提供。本领域技术人员将容易地认识到,可以改变或修改各种非关键参数以产生基本相同或相似的结果。
实施例1:与人ROR1转染的CHO细胞结合的四特异性抗体的FACS分析
测试表3和表4中所列的四特异性GNC抗体与稳定表达全长人ROR1的中国仓鼠卵巢细胞(CHO)细胞的结合。制备2X终浓度的抗体,在50μl PBS/2%FBS中的96孔板的3个孔中按1:5滴定,然后加入在50μl PBS/2%FBS中的5,000个ROR1-CHO细胞。将该混合物在冰上温育30分钟,用200μl PBS/2%FBS洗涤一次,然后加入储备液1:1000稀释度的第二抗体PE山羊抗人IgG Fc,并将该混合物在冰上温育30分钟。将细胞用2×200μl PBS/2%FBS洗涤,再悬浮于50μl PBS/2%FBS中,并在BD LSRFORTESSA上分析,结合谱如图4所示。具有对ROR1的Ig结构域有特异性的323H7结合结构域的四特异性抗体SI-35E18、19和20显示出比具有对ROR1的卷曲结构域有特异性的338H4结合结构域的四特异性GNC抗体SI-3521、22和23更高的结合,且四特异性GNC抗体SI-3524、25和26与对ROR1的卷曲结构域有特异性的330F11结合结构域不结合。
实施例2:与人41BB转染的CHO细胞结合的四特异性抗体的FACS分析
测试表3和表4中所列的四特异性GNC抗体与稳定表达全长人ROR1的中国仓鼠卵巢细胞(CHO)细胞的结合。制备2X终浓度的抗体,在50μl PBS/2%FBS中的96孔板的3个孔中按1:5滴定,然后加入在50μl PBS/2%FBS中的5,000个ROR1-CHO细胞。将该混合物在冰上温育30分钟,用200μl PBS/2%FBS洗涤一次,然后加入储备液1:1000稀释度的第二抗体PE山羊抗人IgG Fc,并将该混合物在冰上温育30分钟。将细胞用2×200μl PBS/2%FBS洗涤,再悬浮于50μl PBS/2%FBS中,并在BD LSRFORTESSA上分析,结合谱如图5所示。除对照SI-27E12外,所有四特异性GNC抗体都含有41BB结合结构域,460C3、420H5或466F6,并以不同强度与表达41BB的CHO细胞结合。
实施例3:与人PDL1转染的CHO细胞结合的四特异性抗体的FACS分析
测试表3和表4中所列的四特异性GNC抗体与稳定表达全长人ROR1的中国仓鼠卵巢细胞(CHO)细胞的结合。制备2X终浓度的抗体,在50μl PBS/2%FBS中的96孔板的3个孔中按1:5滴定,然后加入在50μl PBS/2%FBS中的5,000个ROR1-CHO细胞。将该混合物在冰上温育30分钟,用200μl PBS/2%FBS洗涤一次,然后加入储备液1:1000稀释度的第二抗体PE山羊抗人IgG Fc,并将该混合物在冰上温育30分钟。将细胞用2×200μl PBS/2%FBS洗涤,再悬浮于50μl PBS/2%FBS中,并在BD LSRFORTESSA上分析,结合谱如图6所示。除对照SI-27E15外的所有四特异性GNC抗体都含有相同的PDL1结合结构域PL230C6,并且显示出与表达PDL1的CHO细胞非常相似的结合强度。
实施例4:以外周血单核细胞为效应物和B-急性淋巴细胞白血病(B-ALL)细胞系 Kasumi-2为靶标的重定向T细胞细胞毒性(RTCC)测定
使用人外周血单核细胞(PBMC)作为效应物,测试表3和表4中所列的四特异性GNC抗体针对B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC活性。Kasumi2靶细胞,5×106个,用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5μM在10ml培养基中于37℃标记20分钟。将细胞用50ml培养基洗涤3次,然后重悬浮于10ml中,然后再次计数。以2X终浓度制备抗体,并在200μl RPMI+10%FBS中在96孔板的10个孔中按1:3滴定。通过标准Ficoll密度梯度从“leukopak”纯化人PBMC,所述“leukopak”是从正常人外周血收集的富集白细胞单采产物。在最终目标96孔板中,通过向测定的各孔中加入100μl靶细胞(5,000)、50μl PBMC(25,000)和100μl每种抗体稀释液,合并靶细胞、PBMC和连续滴定的抗体。将测定板在37℃温育约72小时,然后收集每个测定孔的内容物并分析残留的CFSE标记的靶细胞的数目。如图7所示,四特异性GNC抗体均含有相同的PDL1结合结构域PL230C6,相同的ROR1结合结构域323H7和相同的CD3结合结构域284A10,但具有41BB结合结构域460C3、420H5和466F6之一;且与除SI-27E12之外的对照相比显示出更高的RTCC活性,对照SI-27E12不具有41BB结合结构域但似乎具有与四特异性GNC抗体SI-35E18、19和20类似的效力。
实施例5:以CD8+、CD45RO+记忆T细胞为效应物,B-急性淋巴细胞白血病(B-ALL)细 胞系Kasumi-2为靶标的重定向T细胞毒性(RTCC)测定
使用人CD8+、CD45RO+记忆T细胞作为效应物,测试表3和4中所列的四特异性GNC抗体针对B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC活性。Kasumi2靶细胞,5×106个,用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5μM在10ml培养基中于37℃标记20分钟。将细胞用50ml培养基洗涤3次,然后重悬浮于10ml培养基中,然后再次计数。以2X终浓度制备抗体,并在200μl RPMI+10%FBS中在96孔板的10个孔中按1:3滴定。根据制造商的方案,使用EasySepTM人记忆CD8+T细胞富集试剂盒(StemCell TechNO.logies,#19159),从来自正常供体的外周血单核细胞(PBMC)富集人CD8+、CD45RO+记忆T细胞。通过FACS分析确定最终细胞群为98%CD8+、CD45RO+T细胞。在最终的目标96孔板中,通过向测定的每个孔中加入100μl靶细胞(5,000个)、50μl CD8+、CD45RO+记忆T细胞(25,000个)和100μl每种抗体稀释液,合并靶细胞、T细胞和连续滴定的抗体。将测定板在37℃温育约72小时,然后收集每个测定孔的内容物并分析残留的CFSE标记的靶细胞的数目。如图8所示,四特异性抗体都含有相同的PDL1结合结构域PL230C6,相同的ROR1结合结构域323H7和相同的CD3结合结构域284A10,但是具有41BB结合结构域460C3、420H5和466F6之一,并且与不含有41BB、PDL1、ROR1或CD3结合结构域之一的对照相比显示出更高的RTCC活性。
实施例6:以CD8+、CD45RA+初始T细胞为效应物,B-急性淋巴细胞白血病(B-ALL)细 胞系Kasumi-2为靶标的重定向T细胞毒性(RTCC)测定
使用人CD8+、CD45RA+记忆T细胞作为效应物,测试表3和4中所列的四特异性-特异性-抗体针对B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC活性。Kasumi2靶细胞,5×10e6个,用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5μM在10ml培养基中于37℃标记20分钟。将细胞用50ml培养基洗涤3次,然后重悬浮于10ml培养基中,然后再次计数。以2X终浓度制备抗体,并在200μlRPMI+10%FBS中在96孔板的10个孔中按1:3滴定。根据制造商的方案,使用EasySepTM人初始CD8+T细胞分离试剂盒(干细胞技术(StemCell TechNO.logies),#19258),从来自正常供体的外周血单核细胞富集人CD8+、CD45RA+记忆T细胞。通过FACS分析确定最终细胞群为98%CD8+、CD45RA+T细胞(数据未显示)。在最终的目标96孔板中,通过向测定的各孔中加入100μl靶细胞(5,000个),50μl CD8+,CD45RO+T细胞(25,000个)和100μl每种抗体稀释液,合并靶细胞、T细胞和连续滴定的抗体。将测定板在37℃温育约72小时,然后收集每个测定孔的内容物并分析残留的CFSE标记的靶细胞的数目。如图9所示,四特异性抗体都含有相同的PDL1结合结构域PL230C6,相同的ROR1结合结构域323H7和相同的CD3结合结构域284A10,但具有41BB结合结构域460C3、420H5和466F6之一,并且与不含有41BB、PDL1、ROR1或CD3结合结构域之一的对照相比显示出更高的RTCC活性。
实施例7:以外周血单核细胞为效应物和B-急性淋巴细胞白血病(B-ALL)细胞系 Kasumi-2为靶标的重定向T细胞细胞毒性(RTCC)测定
使用人外周血单核细胞(PBMC)作为效应物,测试表3和表4中所列的四特异性-特异性抗体针对B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC活性。Kasumi2靶细胞,5×106个,用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5μM在10ml培养基中于37℃标记20分钟。将细胞用50ml培养基洗涤3次,然后重悬浮于10ml培养基中,然后再次计数。以2X终浓度制备抗体,并在200μlRPMI+10%FBS中在96孔板的10个孔中按1:3滴定。通过标准Ficoll密度梯度从“leukopak”纯化人PBMC,所述“leukopak”是从正常人外周血收集的富集白细胞单采产物。在最终目标96孔板中,通过向测定的各孔中加入100μl靶细胞(5,000个)、50μl PBMC(25,000个)和100μl每种抗体稀释液,合并靶细胞、PBMC和连续滴定的抗体。将测定板在37℃温育约72小时,然后收集每个测定孔的内容物并分析残留的CFSE标记的靶细胞的数目。如图10所示,四特异性GNC抗体都含有相同的PDL1结合结构域PL230C6,相同的ROR1结合结构域338H4和相同的CD3结合结构域284A10,但具有41BB结合结构域460C3、420H5和466F6之一,并且与除了对照SI-35E36之外的对照相比显示出更高的RTCC活性,对照SI-35E36不具有41BB结合结构域,但是似乎具有与四特异性抗体SI-35E18、19和20类似的效力。
实施例8:以CD8+、CD45RO+记忆T细胞为效应物,B-急性淋巴细胞白血病(B-ALL)细 胞系Kasumi-2为靶标的重定向T细胞毒性(RTCC)测定
使用人CD8+、CD45RO+记忆T细胞作为效应物,测试表3和4中所列的四特异性GNC抗体针对B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC活性。Kasumi2靶细胞,5×106个,用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5μM在10ml培养基中于37℃标记20分钟。将细胞用50ml培养基洗涤3次,然后重悬浮于10ml培养基中,然后再次计数。以2X终浓度制备抗体,并在200μl RPMI+10%FBS中在96孔板的10个孔中按1:3滴定。根据制造商的方案,使用EasySepTM人记忆CD8+T细胞富集试剂盒(StemCell TechNO.logies,#19159),从来自正常供体的外周血单核细胞(PBMC)富集人CD8+、CD45RO+记忆T细胞。通过FACS分析确定最终细胞群为98%CD8+、CD45RO+T细胞(数据未显示)。在最终的目标96孔板中,通过向测定的每个孔中加入100μl靶细胞(5,000个)、50μl CD8+、CD45RO+记忆T细胞(25,000个)和100μl每种抗体稀释液,合并靶细胞、T细胞和连续滴定的抗体。将测定板在37℃温育约72小时,然后收集每个测定孔的内容物并分析残留的CFSE标记的靶细胞的数目。如图11所示,四特异性GNC抗体都含有相同的PDL1结合结构域PL230C6,相同的ROR1结合结构域338H4和相同的CD3结合结构域284A10,但是具有41BB结合结构域460C3、420H5和466F6之一,并且与不含有41BB、PDL1、ROR1或CD3结合结构域之一的对照相比显示出更高的RTCC活性。
实施例9:以CD8+,CD45RA+初始T细胞为效应物,B-急性淋巴细胞白血病(B-ALL)细 胞系Kasumi-2为靶标的重定向T细胞毒性(RTCC)测定
使用人CD8+、CD45RA+记忆T细胞作为效应物,测试表3和4中所列的四特异性GNC抗体针对B-ALL细胞系Kasumi2的RTCC活性。Kasumi2靶细胞,5×106个,用CFSE(Invitrogen,#C34554)以0.5μM在10ml培养基中于37℃标记20分钟。将细胞用50ml培养基洗涤3次,然后重悬浮于10ml培养基中,然后再次计数。以2X终浓度制备抗体,并在200μl RPMI+10%FBS中在96孔板的10个孔中按1:3滴定。根据制造商的方案,使用EasySepTM人记忆CD8+T细胞分离试剂盒(StemCell TechNO.logies,#19258),从来自正常供体的外周血单核细胞(PBMC)富集人CD8+、CD45RA+初始T细胞。通过FACS分析确定最终细胞群为98%CD8+、CD45RA+T细胞。在最终的目标96孔板中,通过向测定的各孔中加入100μl靶细胞(5,000个),50μl CD8+,CD45RO+T细胞(25,000个)和100μl每种抗体稀释液,合并靶细胞、T细胞和连续滴定的抗体。将测定板在37℃温育约72小时,然后收集每个测定孔的内容物并分析残留的CFSE标记的靶细胞的数目。如图12所示,四特异性GNC抗体都含有相同的PDL1结合结构域PL230C6,相同的ROR1结合结构域338H4和相同的CD3结合结构域284A10,但是具有41BB结合结构域460C3、420H5和466F6之一,但是与不含有41BB、PDL1、ROR1或CD3结合结构域之一的对照相比,没有显示更大的RTCC活性。这与实施例6中描述的和图6中显示的对CD8+、CD45RA+初始T细胞确实显示RTCC活性的四特异性GNC抗体形成对比。
术语“抗体”以最广泛的意义使用,具体包括单一单克隆抗体(包括激动剂和拮抗剂抗体)、具有多表位特异性的抗体组合物、以及抗体片段(例如Fab、F(ab')2和Fv),只要它们表现出所需的生物活性。在一些实施方案中,抗体可以是单克隆抗体、多克隆抗体、嵌合抗体、单链抗体、双特异性抗体或双效抗体、猿抗体、人抗体和人源化抗体及其活性片段。与已知抗原结合的分子的活性片段的实例包括Fab、F(ab')2、scFv和Fv片段,以及Fab免疫球蛋白表达文库的产物和任何上述抗体和片段的表位结合片段。在一些实施方案中,抗体可以包括免疫球蛋白分子和免疫球蛋白分子的免疫活性部分,即含有免疫特异性结合抗原的结合位点的分子。免疫球蛋白可以是任何类型(IgG、IgM、IgD、IgE、IgA和IgY)或类(IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)或免疫球蛋白分子的亚类。在一个实施方案中,抗体可以是完整抗体和衍生自该完整抗体的任何抗原结合片段。典型抗体是指通常包含两条重(H)链和两条轻(L)链的异四聚体蛋白质。每条重链由重链可变区(缩写为VH)和重链恒定区组成。每条轻链由轻链可变区(缩写为VL)和轻链恒定区组成。VH和VL区可进一步细分为超变互补决定区(CDR)的结构域,和称为构架区(FR)的更保守区。每个可变区(VH或VL)通常由三个CDR和四个FR组成,按以下顺序排列:从氨基末端到羧基末端为FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。在轻链和重链的可变区内存在与抗原相互作用的结合区。
如本文所用,术语“单克隆抗体”是指从基本上同质的抗体群体获得的抗体,即除了可能以少量存在的天然存在的突变之外,包含该群体的单个抗体是相同的。单克隆抗体针对单个抗原位点具有高度特异性。此外,与通常包括针对不同决定簇(表位)的不同抗体的常规(多克隆)抗体制剂相反,每种单克隆抗体针对抗原上的单一决定簇。除了它们的特异性之外,单克隆抗体的优点在于它们由杂交瘤培养物合成,不被其它免疫球蛋白污染。修饰语“单克隆”表示从基本上同质的抗体群体获得的抗体的特征,并且不应被解释为需要通过任何特定方法生产抗体。例如,根据本公开内容使用的单克隆抗体可以通过首先由Kohler和Milstein,自然,256:495(1975)描述的杂交瘤方法制备,或者可以通过重组DNA方法制备(参见,例如,美国专利NO.4,816,567)。
单克隆抗体可包括“嵌合”抗体(免疫球蛋白),其中重链和/或轻链的一部分与衍生自特定种类或属于特定抗体类别或亚类的抗体中的相应序列相同或同源,而所述链的剩余部分与衍生自另一种类或属于另一抗体类别或亚类的抗体以及这些抗体的片段中的相应序列相同或同源,只要它们表现出所需的生物活性即可(美国专利NO.4,816,567;和Morrison等,Proc.Natl.Acad.Sci.美国,81:6851-6855[1984])。
单克隆抗体可以使用各种方法产生,包括小鼠杂交瘤或噬菌体展示(参见Siegel.Transfus.Clin.Biol.9:15-22(2002)综述)或直接来自原代B细胞的抗体的分子克隆(参见Tiller.新型生物技术(New BiotechNO.l).28:453-7(2011))。在本发明中通过用人PD-L1蛋白和在细胞表面瞬时表达人PD-L1的细胞免疫兔来产生抗体。已知兔产生高亲和力、多样性和特异性的抗体(Weber等人Exp.Mol.Med.49:E305)。体外培养来自免疫动物的B细胞并筛选抗PD-L1抗体的产生。使用重组DNA技术分离抗体可变基因,重组表达所得抗体,并进一步筛选所需特征,例如抑制PD-L1与PD-1结合的能力,与非人灵长类PD-L1结合的能力和增强人T细胞活化的能力。这种抗体发现的一般方法类似于Seeber等PLOS One.9:E86184(2014)描述的方法。
术语“抗原或表位结合部分或片段”是指能够结合抗原(在这种情况下是PD-L1)的抗体片段。这些片段可以具有完整抗体的抗原结合功能和附加功能。结合片段的实例包括但不限于单链Fv片段(scFv)或Fab片段,所述单链Fv片段(scFv)由通过合成接头连接在单多肽链中的抗体的单臂的VL和VH结构域组成,所述Fab片段是由VL、恒定轻链(CL)、VH和恒定重链1(CH1)结构域组成的单价片段。抗体片段可以是甚至更小的亚片段并且可以由与单个CDR结构域一样小的结构域组成,特别是来自VL和/或VH结构域的CDR3区(例如参见Beiboer等人,J.Mol.Biol.296:833-49(2000))。使用本领域技术人员已知的常规方法制备抗体片段。可以使用与完整抗体相同的技术筛选抗体片段的效用。
“抗原或表位结合片段”可以通过许多本领域已知的技术衍生自本公开的抗体。例如,可以用酶如胃蛋白酶切割纯化的单克隆抗体,并进行HPLC凝胶过滤。然后可收集含有Fab片段的适当级分并通过膜过滤等浓缩。关于分离抗体活性片段的一般技术的进一步描述,参见例如Khaw,B.A.等.J.nucl.Med.23:1011-1019(1982);Rousseaux等人,方法酶学(Methods Enzymology),121:663-69,学术出版社(Academic Press),1986。
抗体的木瓜蛋白酶消化产生两个相同的抗原结合片段,称为“Fab”片段,每个片段具有单个抗原结合位点,和残余的“Fc”片段,其名称反映其易于结晶的能力。胃蛋白酶处理产生具有两个抗原结合位点并且仍然能够交联抗原的F(ab')2片段。
Fab片段可含有轻链的恒定域和重链的第一恒定域(CH1)。Fab'片段与Fab片段的不同之处在于在重链CH1结构域的羧基末端添加了一些残基,包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。Fab’-SH在本文中是指Fab’,其中恒定结构域的半胱氨酸残基带有游离巯基。F(ab’)2抗体片段最初产生为Fab’片段对,它们之间具有铰链半胱氨酸。另外,抗体片段的化学偶联也是已知的。
“Fv”是含有完整抗原识别和结合位点的最小抗体片段。该区域由紧密非共价结合的一个重链可变域和一个轻链可变域的二聚体组成。在这种构型中,每个可变域的三个CDR相互作用以限定VH-VL二聚体表面上的抗原结合位点。总起来说,六个CDR赋予抗体抗原结合特异性。然而,即使单个可变结构域(或只包含对抗原特异的三个CDR的Fv的一半)也具有识别和结合抗原的能力,尽管亲和力低于整个结合位点。
基于其恒定结构域的氨基酸序列,来自任何脊椎动物物种的抗体(免疫球蛋白)的“轻链”可以归属于两种明显不同的类型之一,称为kappa(κ)和lambda(λ)。
根据其重链恒定域的氨基酸序列,免疫球蛋白可分为不同的类别。免疫球蛋白有五大类:IgA、IgD、IgE、IgG和IgM,其中一些可以进一步分为亚类(同种型),例如IgG-1、IgG-2、IgG-3和IgG-4;IgA-1和IgA-2。对应于不同类免疫球蛋白的重链恒定区分别称为α、δ、ε、γ和μ。不同类免疫球蛋白的亚基结构和三维构型是众所周知的。
“人源化抗体”是指一类工程化抗体,其CDR衍生自非人供体免疫球蛋白,分子的剩余免疫球蛋白衍生部分衍生自一种(或多种)人免疫球蛋白。此外,可以改变框架支持残基以保持结合亲和力。获得“人源化抗体”的方法是本领域技术人员熟知的。(参见例如Queen等,Proc.Natl Acad Sci USA,86:10029-10032(1989),Hodgson等,Bio/TechNO.logy,9:421(1991))。在一个实施方案中,“人源化抗体”可以通过基因工程方法获得,该基因工程方法能够在例如兔的大型动物中产生亲和力成熟的人样多克隆抗体(参见,例如,美国专利NO.NO.7,129,084)。
如本文所用,术语“多肽”、“肽”和“蛋白质”是可互换的,并且定义为意指由通过肽键连接的氨基酸组成的生物分子。
如本文所用的术语“一”、“一个”和“该”被定义为意指“一个或多个”并且包括复数,除非上下文不适当。
“分离的”是指不含其天然存在的至少一些组分的生物分子。“分离的”当用于描述本文公开的各种多肽时,是指已经从其表达的细胞或细胞培养物中鉴定和分离和/或回收的多肽。通常,通过至少一个纯化步骤制备分离的多肽。“分离的抗体”是指基本上不含具有不同抗原特异性的其他抗体的抗体。
“重组”是指使用重组核酸技术在外源宿主细胞中产生抗体。
术语“抗原”是指可以在生物体、特别是动物、更特别是包括人在内的哺乳动物中诱导免疫应答的实体或其片段。该术语包括免疫原及其负责抗原性或抗原决定簇的区域。
同样如本文所用,术语“免疫原性”是指引发或增强针对免疫原性剂的抗体,T细胞或其它反应性免疫细胞的产生并有助于人或动物中的免疫应答的物质。当个体针对本公开的施用的免疫原性组合物产生足够的抗体、T细胞和其它反应性免疫细胞以缓和或减轻待治疗的病症时,发生免疫应答。
“特异性结合”或“与…特异性结合”或“针对…有特异性”特定抗原或表位是指与非特异性相互作用可测量地不同的结合。特异性结合可以例如通过测定与对照分子的结合相比的分子的结合来测量,所述对照分子通常是不具有结合活性的类似结构的分子。例如,特异性结合可以通过与类似于靶的对照分子竞争来确定。
对特定抗原或表位的特异性结合可例如通过抗体对抗原或表位的KD来表示,所述KD至少约10-4M、至少约10-5M、至少约10-6M、至少约10-6M、至少约10-7M、至少约10-8M、至少约10-9M、或者至少约10-10M、至少约10-11M、至少约10-12M或更高,其中KD是指特定抗体-抗原相互作用的解离速率。在一些实施方案中,特异性结合抗原的抗体相对于抗原或表位对于对照分子可以具有20-、50-、100-、500-、1000-、5,000-、10,000-或更多倍的KD。
同样,对于特定抗原或表位的特异性结合可以例如通过抗体对于抗原或表位的KA或Ka来表示,该KA或Ka相对于对照对于所述表位的KA或Ka至少大20-、50-、100-、500-、1000-、5,000-、10,000-或更多倍,其中KA或Ka是指特定抗体-抗原相互作用的结合速率。
两个序列之间的“同源性”由序列同一性决定。如果待相互比较的两个序列长度不同,则序列同一性优选是指较短序列的核苷酸残基与较长序列的核苷酸残基相同的百分比。可以使用计算机程序常规地确定序列同一性。在给定序列与本公开的上述序列之间的比较中出现的偏差可以由例如添加、缺失、取代、插入或重组引起。
虽然已参考特定实施例或实例描述了本发明,但应了解,所述实施例是说明性的且本发明的范围不限于此。本公开的替代实施例对于本公开所属领域的普通技术人员来说是显而易见的。这些替代实施例被认为包含在本公开的范围内。因此,本发明的范围由所附权利要求书限定且由上文描述支持。本公开中引用或提及的所有参考文献在此全文引入作为参考。
序列表
Figure BDA0002316151150000191
Figure BDA0002316151150000201
氨基酸序列中CDR加下划线
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AYDMTQSPSSVSASVGDRVTIKCQASEDIYSFLAWYQQKPGKAPKLLIHSASSLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGYGKNNVDNAFGGGTKVEIK
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GCCCTTGTGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCAATTGCCAGGCCAGTGAGGACATTGATACCTATTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTTTTATGCATCCGATCTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAAGGCGGTTACTATACTAGTAGTGCTGATACGAGGGGTGCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAA
>SEQ ID 16抗-4-1BB 420H5 VLv3 aa
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>SEQ ID 20抗-4-1BB 466F6 VLv5 aa
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>SEQ ID 21抗-4-1BB 460C3 VHv1 nt
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>SEQ ID 22抗-4-1BB 460C3 VHv1 aa
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>SEQ ID 24抗-4-1BB 460C3 VLv1 aa
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>SEQ ID 25抗-ROR1 324C6 VHv2 nt
CAGTCGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTACTGCCTCTGGATTCTCCCTCAGTAGGTACTACATGACCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATCGGAACCATTTATACTAGTGGTAGTACATGGTACGCGAGCTGGACAAAAGGCAGATTCACCATCTCCAAAGACAATACCAAGAACACGGTGGATCTTCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCGAGATCCTATTATGGCGGTGATAAGACTGGTTTAGGCATCTGGGGCCAGGGAACTCTGGTTACCGTCTCTTCA
>SEQ ID 26抗-ROR1 324C6 VHv2 nt
QSLVESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLSRYYMTWVRQAPGKGLEWIGTIYTSGSTWYASWTKGRFTISKDNTKNTVDLQMNSLRAEDTAVYYCARSYYGGDKTGLGIWGQGTLVTVSS
>SEQ ID 27抗-ROR1 324C6 VLv1 nt
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGGCCAGTCAGAGCATTGATAGTTGGTTATCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATCAGGCATCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAGTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAATCTGCTTATGGTGTTAGTGGTACTAGTAGTTATTTATATACTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAA
>SEQ ID 28抗-ROR1 324C6 VLv1 aa
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQSIDSWLSWYQQKPGKAPKLLIYQASTLASGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQSAYGVSGTSSYLYTFGGGTKVEIK
>SEQ ID 29抗-ROR1 323H7 VHv4 nt
GAGGTGCAGCTGTTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCATCAGTCGCTACCACATGACTTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATCGGACATATTTATGTTAATAATGATGACACAGACTACGCGAGCTCCGCGAAAGGCCGGTTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCCACCTATTTCTGTGCGAGATTGGATGTTGGTGGTGGTGGTGCTTATATTGGGGACATCTGGGGCCAGGGAACTCTGGTTACCGTCTCTTCA
>SEQ ID 30抗-ROR1 323H7 VHv4 aa
EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTISRYHMTWVRQAPGKGLEWIGHIYVNNDDTDYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTATYFCARLDVGGGGAYIGDIWGQGTLVTVSS
>SEQ ID 31抗-ROR1 323H7 VLv1 nt
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGTCCAGTCAGAGTGTTTATAACAACAACGACTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGTTCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCTTCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCTCGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATGTTGCAACTTATTACTGTGCAGGCGGTTATGATACGGATGGTCTTGATACGTTTGCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAA
>SEQ ID 32抗-ROR1 323H7 VLv1 aa
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQSSQSVYNNNDLAWYQQKPGKVPKLLIYYASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCAGGYDTDGLDTFAFGGGTKVEIK
>SEQ ID 33抗-ROR1 338H4 VHv3 nt
GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTACTGCCTCTGGATTCTCCCTCAGTAGCTATGCAATGAGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAGGGGGCTGGAGTGGATCGGAATCATTTATGCTAGTGGTAGCACATACTACGCGAGCTCGGCGAAAGGCAGATTCACCATCTCCAAAGACAATACCAAGAACACGGTGGATCTTCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCGAGAATTTATGACGGCATGGACCTCTGGGGCCAGGGAACTCTGGTTACCGTCTCTTCA
>SEQ ID 34抗-ROR1 338H4 VHv3 aa
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCTASGFSLSSYAMSWVRQAPGRGLEWIGIIYASGSTYYASSAKGRFTISKDNTKNTVDLQMNSLRAEDTAVYYCARIYDGMDLWGQGTLVTVSS
>SEQ ID 35抗-ROR1 338H4 VLv4 nt
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCAATTGCCAGGCCAGTCAGAACATTTACAGCTACTTATCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGTTCCTAAGCGCCTGATCTATCTGGCATCTACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCTCGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTACACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATGTTGCAACTTATTACTGTCAAAGCAATTATAACGGTAATTATGGTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAA
>SEQ ID 36抗-ROR1 338H4 VLv4 aa
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTINCQASQNIYSYLSWYQQKPGKVPKRLIYLASTLASGVPSRFSGSGSGTDYTLTISSLQPEDVATYYCQSNYNGNYGFGGGTKVEIK
>SEQ ID 37抗-ROR1 330F11 VHv1 nt
GAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCTCCCTCAATAACTACTGGATGAGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATCGGAACCATTAGTAGTGGTGCGTATACATGGTTCGCCACCTGGGCGACAGGCAGATTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTATCTTCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCGAGATATTCTTCTACTACTGATTGGACCTACTTTAACATCTGGGGCCAGGGAACTCTGGTTACCGTCTCTTCA
>SEQ ID 38抗-ROR1 330F11 VHv1 aa
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSLNNYWMSWVRQAPGKGLEWIGTISSGAYTWFATWATGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARYSSTTDWTYFNIWGQGTLVTVSS
>SEQ ID 39抗-ROR1 330F11 VLv1 nt
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGGCCAGTCAGAGCATTAATAACTACTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATAGGGCATCCACTCTGGAATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAAAGCTATAATGGTGTTGGTAGGACTGCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAA
>SEQ ID 40抗-ROR1 330F11 VLv1 aa
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQASQSINNYLAWYQQKPGKAPKLLIYRASTLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQSYNGVGRTAFGGGTKVEIK
>SEQ ID 41抗-FITC 4-4-20 VH nt
GAGGTGAAGCTGGATGAGACTGGAGGAGGCTTGGTGCAACCTGGGAGGCCCATGAAACTCTCCTGTGTTGCCTCTGGATTCACTTTTAGTGACTACTGGATGAACTGGGTCCGCCAGTCTCCAGAGAAAGGACTGGAGTGGGTAGCACAAATTAGAAACAAACCTTATAATTATGAAACATATTATTCAGATTCTGTGAAAGGCAGATTCACCATCTCAAGAGATGATTCCAAAAGTAGTGTCTACCTGCAAATGAACAACTTAAGAGTTGAAGACATGGGTATCTATTACTGTACGGGTTCTTACTATGGTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCA
>SEQ ID 42抗-FITC 4-4-20 VH aa
EVKLDETGGGLVQPGRPMKLSCVASGFTFSDYWMNWVRQSPEKGLEWVAQIRNKPYNYETYYSDSVKGRFTISRDDSKSSVYLQMNNLRVEDMGIYYCTGSYYGMDYWGQGTSVTVSS
>SEQ ID 43抗-FITC 4-4-20 VL nt
GATGTCGTGATGACCCAAACTCCACTCTCCCTGCCTGTCAGTCTTGGAGATCAAGCCTCCATCTCTTGCAGATCTAGTCAGAGCCTTGTACACAGTAATGGAAACACCTATTTACGTTGGTACCTGCAGAAGCCAGGCCAGTCTCCAAAGGTCCTGATCTACAAAGTTTCCAACCGATTTTCTGGGGTCCCAGACAGGTTCAGTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTCACACTCAAGATCAGCAGAGTGGAGGCTGAGGATCTGGGAGTTTATTTCTGCTCTCAAAGTACACATGTTCCGTGGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAA
>SEQ ID 44抗-FITC 4-4-20 VL aa
DVVMTQTPLSLPVSLGDQASISCRSSQSLVHSNGNTYLRWYLQKPGQSPKVLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYFCSQSTHVPWTFGGGTKLEIK
>SEQ ID 45人IgG1无效(具有ADCC/CDC无效突变的G1m-fa)nt
GCTAGCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTT
GGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCCGCGGGGGCACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCGCGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTATAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGT
>SEQ ID 46人IgG1无效(具有ADCC/CDC无效突变的G1m-fa)aa
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCAVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
>SEQ ID 47人Igκnt
CGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
>SEQ ID 48人Igκaa
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
>SEQ ID 49 SI-35E18
(460C3-L1H1-scFv×PL230C6-Fab×323H7-H4L1-scFv×284A10-H1L1-scFv)重链nt
GACATCCAGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGTCCAGTCAGAGTGTTTATAGTAACTGGTTCTCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATTCTGCATCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAATTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCGCAGGCGGTTACAATACTGTTATTGATACTTTTGCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAAGGCGGTGGCGGTAGTGGGGGAGGCGGTTCTGGCGGCGGAGGGTCCGGCGGTGGAGGATCAGAGGTGCAGCTGTTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGAATCGACTTCAGTAGGAGATACTACATGTGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATCGCATGCATATATACTGGTAGCCGCGATACTCCTCACTACGCGAGCTCCGCGAAAGGCCGGTTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCCGTATATTACTGTGCGAGAGAAGGTAGCCTGTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCGAGCGGCGGTGGAGGGTCCGGCGGTGGTGGATCCCAGTCGGTGGAGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTACAGCCTCTGGAATCGACCTTAATACCTACGACATGATCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGCAAGGGGCTAGAGTGGGTTGGAATCATTACTTATAGTGGTAGTAGATACTACGCGAACTGGGCGAAAGGCCGATTCACCATCTCCAAAGACAATACCAAGAACACGGTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGAGCTGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCCAGAGATTATATGAGTGGTTCCCACTTGTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTCTCTAGTGCTAGCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCCGCGGGGGCACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCGCGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTATACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTATAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTGGCGGTGGAGGGTCCGGCGGTGGTGGATCCGAGGTGCAGCTGTTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTACAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCATCAGTCGCTACCACATGACTTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATCGGACATATTTATGTTAATAATGATGACACAGACTACGCGAGCTCCGCGAAAGGCCGGTTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTATCTGCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCCACCTATTTCTGTGCGAGATTGGATGTTGGTGGTGGTGGTGCTTATATTGGGGACATCTGGGGCCAGGGAACTCTGGTTACCGTCTCTTCAGGCGGTGGCGGTAGTGGGGGAGGCGGTTCTGGCGGCGGAGGGTCCGGCGGTGGAGGATCAGACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCCAGTCCAGTCAGAGTGTTTATAACAACAACGACTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGTTCCTAAGCTCCTGATCTATTATGCTTCCACTCTGGCATCTGGGGTCCCATCTCGGTTCAGTGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATGTTGCAACTTATTACTGTGCAGGCGGTTATGATACGGATGGTCTTGATACGTTTGCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAAGGCGGTGGAGGGTCCGGCGGTGGTGGATCCGAGGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTGGTCCAGCCTGGGGGGTCCCTGAGACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACCATCAGTACCAATGCAATGAGCTGGGTCCGCCAGGCTCCAGGGAAGGGGCTGGAGTGGATCGGAGTCATTACTGGTCGTGATATCACATACTACGCGAGCTGGGCGAAAGGCAGATTCACCATCTCCAGAGACAATTCCAAGAACACGCTGTATCTTCAAATGAACAGCCTGAGAGCCGAGGACACGGCTGTGTATTACTGTGCGCGCGACGGTGGATCATCTGCTATTACTAGTAACAACATTTGGGGCCAAGGAACTCTGGTCACCGTTTCTTCAGGCGGTGGCGGTAGTGGGGGAGGCGGTTCTGGCGGCGGAGGGTCCGGCGGTGGAGGATCAGACGTCGTGATGACCCAGTCTCCTTCCACCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCAATTGCCAAGCCAGTGAGAGCATTAGCAGTTGGTTAGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCTATGAAGCATCCAAACTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGAGTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGATGATTTTGCAACTTATTACTGCCAAGGCTATTTTTATTTTATTAGTCGTACTTATGTAAATTCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAA
>SEQ ID 50 SI-35E18
(460C3-L1H1-scFv×PL230C6-Fab×323H7-H4L1-scFv×284A10-H1L1-scFv)重链aa
DIQMTQSPSTLSASVGDRVTITCQSSQSVYSNWFSWYQQKPGKAPKLLIYSASTLASGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCAGGYNTVIDTFAFGGGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGIDFSRRYYMCWVRQAPGKGLEWIACIYTGSRDTPHYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAREGSLWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSQSVEESGGGLVQPGGSLRLSCTASGIDLNTYDMIWVRQAPGKGLEWVGIITYSGSRYYANWAKGRFTISKDNTKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCARDYMSGSHLWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGAPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCAVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTISRYHMTWVRQAPGKGLEWIGHIY VNNDDTDYASSAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTATYFCARLDVGGGGAYIGDIWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCQSSQSVYNNNDLAWYQQKPGKVPKLLIYYASTLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCAGGYDTDGLDTFAFGGGTKVEIKGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTISTNAMSWVRQAPGKGLEWIGVITGRDITYYASWAKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDGGSSAITSNNIWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDVVMTQSPSTLSASVGDRVTINCQASESISSW LAWYQQKPGKAPKLLIYEASKLASGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQGYFYFISRTYVNSFGGGTKVEIK
>SEQ ID 51 SI-35E18
(460C3-L1H1-scFv×PL230C6-Fab×323H7-H4L1-scFv×284A10-H1L1-scFv)轻链nt
GCCTATGATATGACCCAGTCTCCATCTTCCGTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCAAGTGTCAGGCCAGTGAGGACATTTATAGCTTCTTGGCCTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCCATTCTGCATCCTCTCTGGCATCTGGGGTCCCATCAAGGTTCAGCGGCAGTGGATCTGGGACAGATTTCACTCTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATTTTGCAACTTACTATTGTCAACAGGGTTATGGTAAAAATAATGTTGATAATGCTTTCGGCGGAGGGACCAAGGTGGAGATCAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGT
>SEQ ID 52 SI-35E18
(460C3-L1H1-scFv×PL230C6-Fab×323H7-H4L1-scFv×284A10-H1L1-scFv)轻链aa
AYDMTQSPSSVSASVGDRVTIKCQASEDIYSFLAWYQQKPGKAPKLLIHSASSLASGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGYGKNNVDNAFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

Claims (22)

1.一种制导和导航控制(GNC)蛋白,其包含细胞毒性细胞结合部分和癌症靶向部分,其中所述细胞毒性细胞结合部分对T细胞受体、NK细胞受体、巨噬细胞受体、树突细胞受体或其组合具有结合特异性,并且其中所述癌症靶向部分对癌细胞受体具有结合特异性。
2.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其中所述T细胞受体包括CD3、CD28、PDL1、PD1、OX40、4-1BB、GITR、TIGIT、TIM-3、LAG-3、CTLA4、CD40L、VISTA、ICOS、BTLA、Light、CD30、NKp30、CD28H、CD27、CD226、CD96、CD112R、A2AR、CD160、CD244、CECAM1、CD200R、TNFRSF25(DR3)或其组合。
3.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其中所述NK细胞受体包括CD16、NKG2D、KIR2DS1、KIR2DS2、KIR2DS4、KIR3DS1、NKG2C、NKG2E、NKG2H、NKp30a、NKp30b、NKp46、NKp80、DNAM-1、CD96、CD160、4-1BB、GITR、CD27、OX-40、CRTAM、KIR2DL1、KIR2DL2、KIR2DL3、KIR3DL1、KIR3DL2、KIR3DL3、NKG2A、NKp30c、TIGIT、SIGLEC7、SIGLEC9、LILR、LAIR-1、KLRG1、PD-1、CTLA-4或CD161。
4.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其中所述巨噬细胞受体包括TLR2、TLR4、CD16、CD64、CD40、CD80、CD86、TREM-1、TREM-2、ILT-1、ILT-6a、ILT-7、ILT-8、EMR2、Dectin-1、CD69、CD32b、SIRPα、LAIR-1、VISTA、TIM-3、CD200R、CD300a、CD300f、SIGLEC1、SIGLEC3、SIGLEC5,SIGLEC7、SIGLEC9、ILT-2、ILT-3、ILT-4、ILT-5、LILRB3、LILRB4、DCIR、CSF-1R、LOX-1、CCR2、FRβ、CD163、CR3、DC-SIGN、CD206、SR-A、CD36、MARCO。
5.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其中所述树突细胞受体包括TLR,CD16,CD64、CD40、CD80、CD86、HVEM,CD70、VISTA、TIM-3、LAG-3、BTLA、CSF-1R、LOX-1、CCR7、DC-SIGN、GM-CSF-R、IL-4R、IL-10R、CD36、CD206、DCIR、RIG-1、CLEC9A、CXCR4。
6.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其中所述癌症受体是如下癌细胞上的受体:肺癌细胞、肝癌细胞、乳腺癌细胞、结肠直肠癌细胞、肛门癌细胞、胰腺癌细胞、胆囊癌细胞、胆管癌细胞、头颈癌细胞、鼻咽癌细胞、皮肤癌细胞、黑素瘤细胞、卵巢癌细胞、前列腺癌细胞、尿道癌细胞、肺癌细胞;非小细胞肺癌细胞、小细胞肺癌细胞、脑肿瘤细胞、神经胶质瘤细胞、成神经细胞瘤细胞、食管癌细胞、胃癌细胞、肝癌细胞、肾癌细胞、膀胱癌细胞、宫颈癌细胞、子宫内膜癌细胞、甲状腺癌细胞、眼癌细胞、肉瘤细胞;骨癌细胞、白血病细胞、骨髓瘤细胞、淋巴瘤细胞或其组合。
7.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其中所述癌细胞受体包括BCMA、CD19、CD20、CD33、CD123、CD22、CD30、ROR1、CEA、HER2、EGFR、EGFRvIII、LMP1、LMP2A、间皮素、PSMA、EpCAM、磷脂酰肌醇蛋白聚糖-3、gpA33、GD2、TROP2或其组合。
8.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其中所述GNC蛋白能够通过将所述细胞毒性细胞结合部分与所述T细胞受体结合而活化T细胞。
9.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其包含双特异性抗体或抗体单体、三特异性抗体或抗体单体、四特异性抗体或抗体单体、或其组合。
10.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其包含与SEQ ID NO.49-52具有百分比同源性的氨基酸序列,其中所述百分比同源性不小于98%。
11.根据权利要求1所述的GNC蛋白,其包含第一部分、第二部分和接头部分,其中所述第一部分包含所述细胞毒性细胞结合部分,其中第二部分包含所述癌症靶向部分,并且其中所述第一分子和所述第二分子通过所述接头部分结合在一起。
12.根据权利要求11所述的GNC蛋白,其中所述第一或第二部分包含抗体或其片段、可溶性受体或其组合。
13.根据权利要求11所述的GNC蛋白,其中所述第一部分和所述第一部分通过接头部分连接以提供所述GNC蛋白。
14.根据权利要求11所述的GNC蛋白,其中所述接头部分共价连接所述第一和所述第二部分以提供所述GNC蛋白。
15.根据权利要求11所述的GNC蛋白,其中所述接头部分包含一对互补分子或稳定的蛋白-蛋白相互作用。
16.根据权利要求11所述的GNC蛋白,其中所述互补分子对包含DNA或RNA的互补链。
17.根据权利要求11所述的GNC蛋白,其中所述稳定的蛋白-蛋白相互作用包括生物素-抗生物素蛋白相互作用。
18.根据权利要求11所述的GNC蛋白,其中所述第一部分和所述第二部分具有彼此结合特异性,其中所述接头部分是所述第一部分与所述第二部分之间的键合亲和力相互作用,且其中所述第一部分和所述第二部分键合在一起以通过非共价键合相互作用提供所述GNC蛋白。
19.一种治疗复合物,其包含根据权利要求1所述的GNC蛋白和细胞毒性细胞,其中所述细胞毒性细胞包含T细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突细胞或其组合。
20.一种治疗复合物,其包含根据权利要求1所述的GNC蛋白和癌细胞。
21.一种治疗复合物,其包含根据权利要求1所述的GNC蛋白,与所述T细胞结合部分结合的T细胞和与所述癌症靶向部分结合的癌细胞。
22.一种药物组合物,其包含根据权利要求19所述的治疗复合物和药学上可接受的载体。
CN201880039397.1A 2017-06-25 2018-06-22 制导和导航控制蛋白及其制造和使用方法 Pending CN110891650A (zh)

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