TWI772488B - 新穎DLBCL病患次族群之歐比托珠單抗(obinutuzumab)治療 - Google Patents

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Abstract

本發明係關於歐比托珠單抗(obinutuzumab) (或其功能等效物),其用於分別治療特定經生物標記定義之DLBCL病患及新穎DLBCL病患次族群。本發明進一步係關於一種歐比托珠單抗(或其功能等效物)治療有需要之病患之DLBCL的方法,其中該病患為特定的經生物標記定義之DLBCL病患或屬於新穎的經生物標記定義之DLBCL病患次族群。本發明進一步係關於歐比托珠單抗(或其功能等效物)的用途,其用於製備用於治療該特定經生物標記定義之DLBCL病患/新穎DLBCL病患次族群之DLBCL的醫藥組合物。本發明進一步係關於一種用於鑑別特定DLBCL病患/新穎DLBCL病患次族群的方法及一種用於分別診斷DLBCL之新穎形式及特定DLBCL病患/新穎DLBCL病患次族群的方法。

Description

新穎DLBCL病患次族群之歐比托珠單抗(obinutuzumab)治療
本發明係關於歐比托珠單抗(obinutuzumab)(或其功能等效物),其用於分別治療特定經生物標記定義之DLBCL病患及新穎DLBCL病患次族群。本發明進一步係關於一種用於用歐比托珠單抗(或其功能等效物)治療有需要之病患之DLBCL的方法,其中該病患為特定的經生物標記定義之DLBCL病患或屬於新穎的經生物標記定義之DLBCL病患次族群。本發明進一步係關於歐比托珠單抗(或其功能等效物)的用途,其用於製備用於治療該特定的經生物標記定義之DLBCL病患/新穎DLBCL病患次族群之DLBCL的醫藥組合物。本發明進一步係關於一種用於鑑別特定DLBCL病患/新穎DLBCL病患次族群的方法及一種用於分別診斷DLBCL之新穎形式及特定DLBCL病患/新穎DLBCL病患次族群的方法。
瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)為最常見類型之侵襲性非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin lymphoma;NHL)。用抗CD20單株抗體(mAb)利妥昔單抗(rituximab)(R)加環磷醯胺、小紅莓(doxorubicin)、長春新鹼(vincristine)及潑尼松(prednisone)(CHOP)進行的免疫化學療法為針對具有晚期疾病的先前未經治療之病患的標準護理治療(Coiffier,N. Engl.J.Med.346,2002,235-242;Tilly,Ann.Oncol.26,2015,v116-v125(增刊5);NCCN Clincal Practice Guidelines in Oncology:Non-Hodgkin's Lymphomas,型號3.2016;亦參見www.NCCN.org)。研究展示,完全及未確認完全反應(CR/CRu)速率為76%(GELA試驗)(Coiffier上述引文),且2年無故障存活率為77%(Habermann,J.Clin.Oncol.24,2006,3121-3127)。儘管DLBCL之一線(1L)治療對於許多病患而言為治癒性的(Maurer,J.Clin.Oncol.32,2014,1066-1073),仍然存在改善針對未能實現緩解或復發之20-40%病患的結果及補救療法仍較差的結果的需求(Sehn,Blood 125,2015,22-32)。
歐比托珠單抗(GazyvaTM/GazyvaroTM GA101;G)為經醣基工程改造之II型抗CD20 mAb,其比R具有更大的直接細胞死亡誘導及抗體依賴性細胞毒性及噬菌作用(Herter,Mol.Cancer Ther.12,2013,2031-2042;Mössner,Blood 115,2010,4393-4402;EP-B1 2380910;WO 2005/044859;亦參見Illidge,Expert Opin.Biol.Ther.12(5),2012,543-5)。在具有慢性淋巴球性白血病(CLL)及共存病況(CLL11)或濾泡性淋巴瘤(FL;GALLIUM)的先前未經治療之病患的階段3研究中,G經證明比R更有效(Goede,N.Engl.J.Med.370,2014,1101-1110;Marcus,N.Engl.J.Med.(2017年5月接受:出版中))。在更小研究中,G單藥療法及G-CHOP已證實在侵襲性形式之非霍奇金淋巴瘤(NHL)(包括DLBCL)中之前景(Morschhauser,J.Clin.Oncol.31,2013,2912-2919;Zelenetz,Blood 122,2013,1820)。此外,Owen(Expert Opin.Biol.Ther.12(3),2012,343-51)論述歐比托珠單抗用於治療淋巴增生病症之用途。多中心、開放標記、隨機分組、臨床階段3研究(GOYA;另外細節參見下文) 將G-CHOP與R-CHOP在具有DLBCL之先前未經治療之病患中之功效及安全性進行比較。然而,在GOYA中,在關於最初意欲在GOYA之情形中治療的未經治療之1L DLBCL病患族群的先前未經治療之DLBCL(1L DLBCL)中,G-CHOP相對於R-CHOP並不改善臨床結果(例如,無進展存活率(PFS))。
Scott(Blood 123(8),2014,1214-7;JCO 33(26),2015,284857;Am.Soc.Clin.Oncol.Educ.Book 2015,35:e458-66)及其他人(Nowakowski,Am.Soc.Clin.Oncol.Educ.Book 2015,35:e449-57)藉由使用NanoString Lymph2Cx分析對DLBCL之原始細胞(COO)亞型進行基於基因表現之測定(Scott 2014及2015上述引文)。特定言之,Scott(2014及2015上述引文)分別基於20個基因的基因表現分析及為約<1900、約1900-約2450及約>2450的線性預測值得分(LPS)來指定DLBCL、生發中心B細胞樣DLBCL(GCB DLBCL)、經活化B細胞樣DLBCL(ABC DLBCL)及類別不明DLBCL之COO亞型(參見Scott 2014上述引文,圖1)。Scott(2014及2015上述引文)亦評定R-CHOP對DLBCL之此等COO亞型的治療效果。
Punnoose(Blood 126,2015,3971;亦參見http://www.bloodjournal.org/content/126/23/3971)描述來自評估貝伐珠單抗加R-CHOP的MAIN、階段III試驗的具有先前未經治療之DLBCL的病患體內的ABC及GCB COO亞型內之BCL2及MYC蛋白質表現之流行及預後(NCT 00486759)。
Challa-Malladi(Cancer Cell 20,2011,728-40)揭示β2-微球蛋白及CD58之經組合基因失活揭露DLBCL中頻繁的逃脫免疫識別。
不管治療DLBCL之先前成效(例如,由於R,特定言之R-CHOP之發展),然而,對於一些DLBCL病患而言(參見,NCCN clinical practice guidelines in oncology;non-Hodgkin's lymphoma,v 2.2015)仍然存在對經改善治療之較高未滿足的醫療需求(參見Sehn上述引文)。
因此,下方本發明之技術問題為在某些病患中提供DLBCL之經改善治療。
該技術問題之解決方案為以下本文中所提供且其特徵在於所附申請專利範圍。
在本發明之上下文中出人意料地發現,在所有DLBCL病患之中,尤其與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,一些病患藉由經改善臨床結果而對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出反應。在本發明之上下文中亦出人意料地發現,尤其與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,可鑑別出/測定藉由經改善臨床結果而對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出反應的DLBCL病患之次族群。在本發明之上下文中亦出人意料地發現,尤其與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,存在藉由經改善臨床結果而對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出反應的DLBCL病患。本發明之主要要旨為此類特定DLBCL病患及DLBCL病患之次族群可實際上分別地經定義;在本文中亦被稱作「本文中所定義之病 患」。本發明之另一要旨為此病患可由生物標記(在本文中亦分別地被稱作「預測性生物標記」及「預測性經生物標記定義之病患」)定義。
特定言之,基於GOYA之探索性分析,在本發明之上下文中證實且藉由隨附實例說明,歐比托珠單抗為在GCB DLBCL病患之一或多個子組中(例如,在新分子濾泡性淋巴瘤(FL)樣GCB DLBCL病患次族群中)及/或在具有CD58突變及/或具有低CD58表現的DLBCL病患中優於利妥昔單抗(各自與CHOP化學療法組合)。此為首次針對某些病患,特定言之針對本文中所定義之病患鑑別出優於R之歐比托珠單抗益處。
舉例來說,在本發明之上下文中,已鑑別出/測定相對於用R(例如,R-CHOP)治療受益於用G(例如,G-CHOP)治療的以下經生物標記定義之DLBCL病患:˙BCL2易位的病患(參見例如圖4);˙BCL2蛋白質表現陽性病患(參見例如圖5);˙為BCL2蛋白質表現陽性的BCL2易位的病患(參見例如圖6);˙GCB DLBCL病患之一或多個子組。此等可例如經鑑別為:○藉由線性預測值得分(LPS)將GCB病患進行次族群(COO)分類,分類為次族群「較強GCB」病患(LPS<截止值之病患;例如與一般GCB DLBCL相比,LPS約1900之截止值)(參見例如圖7、圖10及圖12);○具有高BCL2基因表現之GCB病患;○為BCL2蛋白質表現陽性的GCB病患;○具有BCL2易位的GCB病患;○為BCL2蛋白質表現陽性的具有BCL2易位的GCB病患(參見例如圖8); ˙CD58突變型病患及/或具有低CD58表現的病患(參見例如圖9)。
更特定言之,基於GOYA之探索性分析,在本發明之上下文中證實且藉由隨附實例說明,對作為連續變量的LPS進行評定鑑別出相對於R(特定言之R-CHOP)受益於G(特定言之G-CHOP)的GCB病患次族群。甚至更特定言之,觀測到,在GOYA中之GCB病患中,基因表現(GE)陣列概況(藉由LPS量測)之加權表現與來自相對於R治療(例如,R-CHOP)之G治療(例如,G-CHOP)的結果益處有關。
在此基礎上,可測定新LPS截止值,其定義相對於R治療受益於G治療的較強GCB DLBCL病患次族群。此等新截止值實質上低於通常分配至GCB DLBCL(約<1900)之LPS截止值。舉例而言,在多變量模擬分析中測定
Figure 107127631-A0305-02-0008-66
749之新LPS截止值(參見圖10)。根據此實例,『較強GCB』病患(定義為LPS
Figure 107127631-A0305-02-0008-67
749之病患)在GOYA中表示25%(233/933)的可評估DLBCL病患及43%(233/540)的可評估GCB病患。作為一其他實例,在多變量模擬分析中測定
Figure 107127631-A0305-02-0008-68
725之新LPS截止值(參見圖10、圖12)。根據此實例,將『較強GCB』病患更嚴格地定義為LPS
Figure 107127631-A0305-02-0008-69
725之病患。此等病患在GOYA中表示25%(229/933)的可評估DLBCL病患及43%(229/540)的可評估GCB病患。大約725之LPS截止值經展示反映獨立群體(「本文中所定義之病患」)(亦即較強GCB DLBCL病患)的異常穩定性及結果之高度概化性。此藉由自助抽樣法模擬展示。
用G(G-CHOP)治療的較強GCB病患實現比用R(R-CHOP)治療的彼等明顯更佳地臨床結果,例如就無進展存活率(PFS)、無事件存活率(EFS)及總存活率(OS)而言(參見表4)。高水準安全性與任一治療方案類似。
在關於FoundationOne® Heme(FOH)資料的基因組增濃分析中,與其他GCB病患(被稱作「較弱GCB」病患)(例如,錯誤發現率,FDR,3.54e-9)相比,較強GCB病患進一步表徵為針對FL體細胞突變標誌明顯增濃。特定言之,與其他DLBCL病患相比,若干m7-FLIPI基因(BCL2BCL6CD70CDKN2ACREBBPEP300IGHMEF2BMYCMYD88PCLOTNFAIP3TNFRSF14)中之BCL2易位及突變/突變速率在較強GCB病患中及/或在具有BCL2易位及/或具有高BCL2表現之DLBCL病患中高度增濃(呈FDR<5%;圖11)。對於中央病理學檢查,較強GCB子組中不存在經轉化惰性NHL的跡象。
總之,已鑑別出新的臨床上及分子上不同亞型之DLBCL,特定言之GCB DLBCL,尤其被稱作『較強GCB』之亞型。經鑑別亞型表示新生DLBCL。此等展現FL之分子特徵,諸如FL典型突變(參見Morin,Nature 476(7360),2011,298-303),然而,其在臨床上不同於FL。用G(例如,G-CHOP)治療在(GCB)DLBCL病患(「本文中所定義之病患」),特定言之1L(GCB)DLBCL之此等新子組中賦予優於用R(例如,R-CHOP)治療的大量臨床益處。
因此,本發明提供用於鑑別/測定/診斷對歐比托珠單抗作出有利地反應,特定言之對歐比托珠單抗比對R更有利地反應之(GCB)DLBCL病患(「本文中所定義之病患」)之(a)子組的手段及方法。鑑別/測定/診斷可藉由若干方式進行,例如藉由測定是否存在BCL2易位及/或BCL2蛋白質過度表現,是否存在一或多個CD58基因突變及/或是否存在降低的CD58表現,或藉由基因表現譜/測定加權基因表現(例如,藉由採用NanoString COO分析)及使用LPS之新截止值(如本文中其他地方所描 述)。
更特定言之,本發明係關於一種用於鑑別DLBCL病患(具有/患有DLBCL之病患)的方法,與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,該病患藉由達成經改善臨床結果而對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出反應。該方法包含(以下步驟):測定病患(例如,藉由使用病患之(腫瘤)樣品)是否為本文中所定義之病患。
本發明進一步係關於一種用於診斷病患體內DLBCL之形式的方法,該DLBCL可用歐比托珠單抗治療(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)以使得與用利妥昔單抗治療(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)相比,達成經改善臨床結果。該方法包含(以下步驟):測定病患(例如,藉由使用病患之(腫瘤)樣品)是否為本文中所定義之病患。該方法(另外)包含(以下步驟):在病患為本文中所定義之病患時診斷該DLBCL之形式。
本發明亦係關於藉由歐比托珠單抗或藉由其功能等效物醫療干預/治療本文中所定義之病患。大體上,如本文中所使用之術語「歐比托珠單抗」亦涵蓋其功能等效物(另外解釋/定義參見下文)。
在一個態樣中,本發明係關於歐比托珠單抗,其用於治療本文中所定義之病患的DLBCL。
在此用途之情形中,例如設想:(i)已測定待治療之病患(例如,藉由使用病患之(腫瘤)樣品)是否為本文中所定義之病患;(ii)根據本發明之鑑別方法鑑別待治療之病患;或(iii)根據本發明之診斷方法診斷待治療之病患的DLBCL之形式。
在另一態樣中,本發明係關於歐比托珠單抗,其用於治療本文中所定義之病患之的DLBCL,其中例如設想該治療包含以下步驟:(i)測定待治療之(DLBCL)病患(例如,藉由使用病患之(腫瘤)樣品)是否為如本文中所定義之病患;(ii)根據本發明之鑑別方法鑑別DLBCL病患;或(iii)根據本發明之診斷方法診斷病患體內DLBCL之形式。
在測定/鑑別/診斷(步驟)之情形中,可採用(DLBCL)病患之樣品,例如(DLBCL)病患之腫瘤樣品。測定可在(DLBCL)病患之樣品中,例如在(DLBCL)病患之腫瘤樣品中。根據本發明採用之特定樣品之非限制性實例為腫瘤組織/腫瘤活檢體之樣品,更特定言之福馬林非揮發性、石蠟嵌入型腫瘤組織/腫瘤活檢體。此樣品可(例如)如Scott(2014及2015上述引文)中所描述經製備。其他適合樣品為在本文中其他地方描述。
在另一態樣中,本發明係關於一種用於治療有需要之病患之DLBCL的方法,其中該病患為本文中所定義之病患。方法可包含以下步驟:獲得涵蓋DLBCL療法的病患之一及/或測試病患之樣品以測定該病患是否為本文中所定義之病患。設想,用於本發明之治療的方法包含以下步驟:向待治療之病患投與醫藥學上有效量的歐比托珠單抗。在此等步驟,特定言之測試步驟之情形中,可採用(DLBCL)病患之(腫瘤)樣品。測試可在(DLBCL)病患之(腫瘤)樣品中。細節上作必要修改後,本文中上文及其他地方關於待採用之「樣品」的描述亦適用於此處。
在此等步驟之情形中,尤其在測試步驟之情形中(或代替該步驟),亦可採用根據本發明之鑑別或診斷方法。
在另一態樣中,本發明係關於歐比托珠單抗之用途,其用 於製備用於治療本文中所定義之病患之DLBCL的醫藥組合物。該治療可包含以下步驟:根據本發明測定/鑑別/診斷待治療之(DLBCL)病患是否為如本文中所定義之病患。在測定/鑑別/診斷之情形中,可採用(DLBCL)病患之樣品,例如(DLBCL)病患之腫瘤樣品。測定可在(DLBCL)病患之樣品中,例如在(DLBCL)病患之腫瘤樣品中。細節上作必要修改後,本文中其他地方關於待採用之「樣品」的描述亦適用於此處。同樣,細節上作必要修改後,上文關於用途及治療的描述適用於此處。
本發明現將參照以下圖及實例進行描述,該等圖及該等實例不應被理解為限制本發明之範圍。
諸圖展示:
圖1
GOYA中病患之處置。
*停止係指停止研究(抗體)治療的病患。
中位觀測時間在各族群中為29個月;已完成治療係指已完成研究(抗體)治療的病患。
在隨機分組時藉由IPI得分(低/低-中風險、高-中風險及高風險)、經規劃CHOP週期數目(8相較於6)及地理區(西歐、東歐、南美及中美、北美、亞洲及其他)對病患進行分層。
G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍。
圖2
GOYA中PFS及OS之卡本-麥爾(Kaplan-Meier)估計。
(A)研究者評定之意願治療群體的治療PFS(主要終點),(B)意願治療群體的治療OS,(C)研究者評定之具有原始細胞資料之病患中原始細胞亞型(無關於研究治療)之PFS。
ABC,經活化B細胞樣;CI,信賴區間;GCB,生發中心B細胞樣;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松;HR,風險比率;OS,總存活率;PFS,無進展存活率;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松。
圖3
GOYA病患次族群中研究者評定之PFS的未分層風險比率。
(A)隨機化分層因素及(B)基線特徵。
ABC,經活化B細胞樣;CI,信賴區間;DLBCL,瀰漫性大B細胞淋巴瘤;ECOG PS,東方協作腫瘤學組效能狀態(Eastern Cooperative Oncology Group performance statu);GCB,生發中心B細胞樣;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松;IPI,國際預後指數(International Prognostic Index);KM,卡本-麥爾;PFS,無進展存活率;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松。
*eCRF中勾選『是』之案例針對結外參與;結外位點為0之14位病患被誤勾。
圖4
GOYA中BCL2易位的病患中之Gazyva益處
圖5
GOYA中BCL2蛋白質表現陽性病患中之Gazyva益處
圖6
GOYA中為BCL2蛋白質表現陽性的BCL2易位的病患中之Gazyva益處
GOYA中由BCL2 IHC(正/負)及BCL2 FISH(正/負)定義之象限中的治療效果之評估。Gazyva優勢經展示為對BCL2 IHC+/FISH+病患具有特異性。
圖7
GOYA中由線性預測值得分之多個截止值定義之GCB次族群中的Gazyva益處
A:森林圖(FOREST Plot)25%-36%截止(%)
B:森林圖25%-50%截止(%)
C:LPS截止值<749處的主要終點(INV-PFS)之較強GCB次族群中的Gazyva益處。
Figure 107127631-A0305-02-0014-70
較強GCB GOYA病患中之HR*(95% CI)
- PFS:0.33[0.18-0.63],p值=0.0007
Figure 107127631-A0305-02-0014-72
較強GCB病患表示在LPS<749之情況下GOYA中所有DLBCL病患之25%(n=233/933)。
Figure 107127631-A0305-02-0014-71
較強GCB病患構成GOYA中GCB病患之43%(n=233/540)
圖8
GOYA中為BCL2易位及BCL2蛋白質表現陽性的GCB病患中的Gazyva益處。
圖9
GOYA中CD58突變型病患及/或具有低CD58基因表現之病患中的Gazyva益處。
圖10
基於COO分析的生物標記可評估病患之無進展存活率的G-CHOP益處優於R-CHOP的LPS截止值之多變量模擬最佳化(N=xx)。
GOYA原始資料中較強GCB治療效果之LPS截止值最佳化。
*針對治療、國際預後指數、化學療法週期數(6或8)及地理區域調整多變量HR。藍線,HR之點估計,黃線,95% CI;CI,信賴區間;COO,原始細胞;HR,風險比率;LPS,線性預測值得分。
圖11
GOYA中較強-GCB病患 # 之分子特徵。
較強GCB病患具有明顯更高的FL體細胞突變標誌之流行率。
(A)FL體細胞突變標誌*(任何突變類型)之流行率。
(B)BCL2易位之流行率
#經評估以表徵較強-較弱GCB的其他生物標記,其中未鑑別出流行率之明顯差異,係:藉由基因表現、基質-1/2基因標籤、免疫-反應1/2基因標籤、CD20及PTEN;藉由蛋白質表現、BCL2、MYC及BCL2/MYC雙表現者;以及藉由基因易位、MYC易位及BCL2/MYC雙衝擊。ABC,經活化B細胞;DLBCL,瀰漫性大B細胞淋巴瘤;FDR,錯誤發現率;FISH,螢光原位雜交;FL,濾泡性淋巴瘤;GCB,生發中心B細胞;NGS,下一代定序。
圖12
自助抽樣樣品上最佳LPS截止值之分佈
Figure 107127631-A0305-02-0016-73
自助抽樣法多變量模擬進一步測試使用「最小HR規則」鑑別出最佳LPS之穩定性及概化性。
Figure 107127631-A0305-02-0016-74
自助抽樣樣品上之極端峰值在LPS=725處
Figure 107127631-A0305-02-0016-75
LPS分佈以其獨特峰值支持治療效果信號之穩定性
Figure 107127631-A0305-02-0016-76
針對新潛在驗證研究建議的最佳LPS截止值為LPS725
- 病史上所有GOYA生物標記分析將較強GCB定義為<749(GOYA中25%之病患),包括呈現於此OBRF中之生物標記分析
- n=4位病患,其中725<LPS<749,所有G-CHOP(1個事件)
圖13
在意願治療群體中達至下一抗淋巴瘤治療(次要終點)之時間的卡本-麥爾估計。
CI,信賴區間;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍;HR,風險比率;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍。
圖14
由COO亞型進行次分群的具有COO資料之病患中研究者評定之治療隊組PFS的卡本-麥爾估計
(A)GCB;(B)ABC;(C)類別不明。
ABC,經活化B細胞樣;CI,信賴區間;COO,原始細胞;GCB,生發中心B細胞樣;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍;HR,風險比率;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍。
根據本發明的待治療之病患(「本文中所定義之病患」為病患,特定言之為具有/患有DLBCL之病患,與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,該病患藉由達成經改善臨床結果而對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出反應。
在本發明之一個態樣/實施例(態樣/實施例A)中,本文中所定義之病患(其將用歐比托珠單抗治療)為預測性經生物標記定義之病患。
若生物標記可用於鑑別本文中所定義之病患(視情況與一或多個其他(預測性)生物標記組合),亦即對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療比對用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出更有利地反應的病患,則生物標記根據本發明為「預測性的」。更特定言之,若治療效果(亦即與R治療相比的G治療)在生物標記定義之病患(次族群)之間不同,則生物標記為預測性的。在此上下文中,較佳的為預測性生物標記為如本文中其他地方所定義之生物標記。在本發明之上下文中待評定的預測性生物標記之特定實例為CD58(例如,其於其中之一或多個基因突變及/或低表現)、BCL2(例如,其之易位及/或高表現)及以下一或多個(較佳所有)基因:TNFRSF13BLIMD1IRF4CREB3L2PIM2CYB5R2RAB7L1CCDC50;以及MMESERPINA9ASB13MAML3ITPKBMYBL1S1PR2(例如,其之加權表現產生實質上低於約1900的LPS)。在此上下文中,亦參考本文中下文所揭示之內容,特定言之在態樣/實施例B至G之上下文中,見下文。
在本發明之一個態樣/實施例(態樣/實施例B)中,本文中所 定義之病患(其將用歐比托珠單抗治療)為具有/患有分子濾泡性淋巴瘤(FL)樣生發中心B細胞(GCB)DLBCL的病患。
「分子」在此上下文中意謂,在分子層級上,病患類似於FL病患(參見Morin上述引文)。然而,設想在臨床層級/臨床上,病患不類似於FL病患。
根據本發明,根據此態樣/實施例的分子FL樣GCB DLBCL較佳地表徵為根據本發明的較強GCB DLBCL及/或表徵為具有BCL2易位及/或高BCL2表現的病患之DLBCL(參見態樣/實施例D及E,見下文)。
根據本發明的患有分子FL樣GCB DLBCL之病患亦可表徵為具有選自由以下組成之族群的一個或(較佳)多個基因之一個或(較佳)多個突變的病患:BCL2、BCL6、CD70、CDKN2A、CREBBP、EP300、IGH、MEF2B、MYC、MYD88、PCLO、TNFAIP3TNFRSF14。儘管較不佳,根據本發明的患有分子FL樣GCB DLBCL之病患亦可表徵為具有選自由以下組成之族群的一個或(較佳)多個基因之一個或(較佳)多個突變的病患:BCL2CREBBPEP300EZH2MEF2BPCLOTNFRSF14,具有選自由以下組成之族群的一個或(較佳)多個基因之一個或(較佳)多個突變的病患:CREBBP、EP300EZH2MEF2BTNFRSF14,或具有選自由以下組成之族群的一個或(較佳)多個基因之一個或(較佳)多個突變的病患:EZH2、MEF2BTNFRSF14
然而並非為限制性的,適用突變之一個特定實例在此方面為BCL2突變,特定言之BCL2易位(細節參見下文)。
突變可例如藉由依賴於隨附實例來鑑別。基礎藥品下一代定序分析FoundationOne® Heme可例如用於此方面(根據經銷商之手冊)。
在本發明之一個態樣/實施例(態樣/實施例C)中,本文中所定義之病患(其將用歐比托珠單抗治療)為具有一或多個CD58基因突變及/或具有低CD58表現的病患。
已知CD58(亦參見Challa-Malladi上述引文)涉及腫瘤細胞之免疫識別且在腫瘤細胞上表現。CD58在效應子CTL及NK細胞上與CD2結合(由此提供免疫效應細胞之活化信號)。CD58中基因畸變之存在與缺失或異常的CD58表面表現相關聯(例如,可藉由免疫組織化學(IHC)偵測)。67%之DLBCL病例展示異常CD58蛋白質表現;其中在GCB及ABC COO次族群中之比例相同。
編碼CD58之核苷酸序列及CD58之胺基酸序列(特定言之智人(人類)CD58)在此項技術中已熟知。其可例如藉由遵照以下統一資源定位符(Uniform Resource Locator;URL)下載:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/search/?term=Homo+sapiens+CD58&utm_expid=.fAeHyO5JTBGxnObh2WlrCA.0&utm_referrer=https%3A%2F%2Fwww.ncbi.nlm.nih.gov%2Fsearch%2F%3Fterm%3DHomo%2Bsapiens%2BCD58。編碼CD58之核苷酸序列(特定言之智人(人類)CD58)例如可經由以下NCBI寄存編號獲得:XM_017002869.2(變體X1);NR_026665.1(變體3);NM_001779.2(變體1);NM_001144822.1(變體2)。CD58之胺基酸序列(特定言之智人(人類)CD58)例如可經由以下NCBI寄存編號獲得:XP_016858358.1(同工型X1);NP_001138294.1(同工型2);NP_001770.1(同工型1)。編碼智人(人類)CD58之核苷酸序列之一實例描繪於SEQ ID NO:11中。智人(人類)CD58之胺基酸序列之一實例描繪於SEQ ID NO:12中。
大體上,在本發明之上下文中將「表現」設想為意謂基因表現(亦即(初級)mRNA(轉錄層級)之外觀)及蛋白質表現(亦即蛋白質(轉譯層級)之外觀)兩者。
(初級)mRNA之外觀可例如藉由原位雜交(ISH)技術,例如藉由螢光ISH(FISH)來量測/偵測。相應手段及方法為此項技術中已知的且例如描述於Zhang中(Chin.J.Cancer.Res.23(2),2011,160-4;亦參見https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3587538/)。
(初級)mRNA之基因表現/外觀,尤其(初級)CD58 mRNA之CD58基因表現/外觀亦可藉由使用TruSeq® RNA定序來評估(根據經銷商(Illumina®,Inc.)之手冊)。
蛋白質之外觀可例如藉由IHC來量測/偵測。相應手段及方法為此項技術中已知的且例如描述於Punnoose中(上述引文;亦參見http://www.bloodjournal.org/content/126/23/3971)。
蛋白質之蛋白質表現/外觀,尤其CD58蛋白質表現亦可如Challa-Malladi上述引文中所描述來量測/偵測。
一般而言,用於評定CD58表現及CD58突變的手段及方法為此項技術中已知的(參見例如Challa-Malladi上述引文)。熟習此項技術者可易於分析給定CD58表現根據本發明是否為「低」的或根據本發明是否存在一或多個CD58突變。此外,相較於根據本發明給定CD58表現被視為「較低」或相較於根據本發明認為存在一或多個CD58突變,熟習此項技術者可易於選擇適合對照。在此上下文中,熟習此項技術者可例如亦依賴於Challa-Malladi(上述引文)。
在本發明之上下文中,「低CD58表現」意謂尤其與適合對 照相比,CD58以實質上更低水準表現。一般而言,根據本發明的「低CD58表現」意謂,CD58表現與在根據本發明之反應者(亦即,與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,藉由達成經改善臨床結果對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出反應的病患;「本文中所定義之病患」)中之CD58表現一樣低(例如,±10%或更小、±7.5%或更小、±5%或更小、±3%或更小、±2%或更小、±1%或更小、或甚至±0%),及/或低於根據本發明之無反應者(亦即,與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,藉由不達成經改善臨床結果對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療起反應的病患;非「本文中所定義之病患」)中之CD58表現。熟練者易於能夠分析就此而言CD58表現何時為「低」的並施加適合對照。舉例而言,對照在此方面可為常見DLBCL群體,更特定言之未分類為屬於根據本發明分類之病患次族群的DLBCL病患(非「本文中所定義之病患」)。
「低CD58表現」可為在對照族群中(例如在此類上文所提及之對照族群中)低於中位CD58表現的CD58表現。舉例而言,「低CD58表現」及「更低水準」之CD58表現根據本發明可分別為在經觀測GOYA病患中低於中位CD58表現的CD58表現。
作為CD58(基因)表現之單位,可使用單位log2(nRPKM),其為每千基百萬的標準化讀數。在GOYA病患中使用此單位的中位CD58表現為大約5.3。因此,「低CD58表現」及「更低水準」之CD58表現根據本發明可分別為低於對應於單位log2(nRPKM)5.3的對照 (族群)病患中之CD58表現(參見上文)的CD58表現(對照(族群)病患中之中位CD58表現)。換言之,根據本發明的待治療之病患中之CD58表現可實質上低於對應於單位log2(nRPKM)5.3的對照(族群)病患中之CD58表現。亦即,根據本發明的待治療之病患中之CD58表現可為對應於單位log2(nRPKM)
Figure 107127631-A0305-02-0022-77
5.2、
Figure 107127631-A0305-02-0022-78
5.1、
Figure 107127631-A0305-02-0022-79
5.0、
Figure 107127631-A0305-02-0022-80
4.5、
Figure 107127631-A0305-02-0022-81
4.0、
Figure 107127631-A0305-02-0022-82
3.5、
Figure 107127631-A0305-02-0022-83
3.0、
Figure 107127631-A0305-02-0022-84
2.5或
Figure 107127631-A0305-02-0022-85
2.0的CD58表現。
如上文所提及,CD58在腫瘤細胞上及B細胞之表面上表現。因此,在一個特定態樣中,「低CD58表現」及「更低水準」之CD58表現根據本發明分別意謂CD58以實質上低於常見DLBCL腫瘤細胞及/或常見DLBCLB細胞上之CD58表現的含量在腫瘤細胞及/或B細胞上表現。舉例而言,「常見DLBCL」在此上下文中意謂腫瘤細胞及B細胞分別來源於根據本發明之無反應者,較佳地來源於DLBCL腫瘤細胞及DLBCLB細胞分別來源於未分類為本文中所定義之病患的DLBCL病患。
舉例而言,「低CD58表現」及(實質上)「更低水準」之CD58表現根據本發明分別地意謂尤其與適合對照(例如,常見DLBCL病患/群體;非「本文中所定義之病患」)中之CD58表現相比,CD58以至少低10%、至少低20%、至少低30%、至少低40%、至少低50%、至少低75%或至少低100%的含量表現。此適用於基因表現及蛋白質表現兩者。
突變(特定言之CD58突變)可例如藉由使用FoundationOne® Heme(FOH)組來鑑別(參見例如He,Blood 127(24),2017,3004-14;亦參見隨附實例)。
可在本文中所定義之病患中存在(及偵測)的CD58基因突變之實例為短變體突變及/或複本數變體。
熟習此項技術者易於能夠在根據本發明評定/偵測CD58表現或一或多個CD58突變時選擇待使用之合適樣品(作為測試樣品或作為對照樣品)。
用於評定/偵測是否存在低CD58表現的待在本發明之上下文中採用之樣品(作為測試樣品或作為對照樣品)的特定實例為(CD58表現)腫瘤之樣品(例如,活檢體)及/或含有(CD58-表現)B細胞之樣品(例如,活檢體)。
用於評定/偵測是否存在一或多個CD58突變的待在本發明之上下文中採用之樣品(作為測試樣品或作為對照樣品)的特定實例為DNA樣品。
在本發明之一個態樣/實施例(態樣/實施例D)中,本文中所定義之病患(其將用歐比托珠單抗治療)為具有/患有較強GCB DLBCL的病患。
根據本發明,具有/患有較強GCB DLBCL的病患可藉由測定以下一或多個(較佳所有)基因(包含該一或多個(較佳所有)基因的一組基因)的(加權)表現來鑑別:TNFRSF13BLIMD1IRF4CREB3L2PIM2CYB5R2RAB7L1CCDC50(ABC DLBCL中之基因過度表現);以及MMESERPINA9ASB13MAML3ITPKBMYBL1S1PR2(GCB DLBCL中之基因過度表現)。
更特定言之,可將具有/患有較強GCB DLBCL的病患定義為具有腫瘤之病患,該腫瘤具有以下一或多個(較佳所有)基因(包含該一或多個(較佳所有)基因的一組基因)之某一(加權)表現:TNFRSF13BLIMD1IRF4CREB3L2PIM2CYB5R2RAB7L1CCDC50;以及 MMESERPINA9ASB13MAML3ITPKBMYBL1S1PR2;且視情況,具有以下一或多個(較佳所有)基因之某一(加權)表現:R3HDM1WDR55ISY1UBXN4TRIM56(管家基因)。
在本發明之此態樣/實施例之情形下,特定地設想對加權基因表現進行評定。
特定言之,當由本文揭示之一組基因之加權表現產生的線性預測值得分(LPS)低於某一截止值,亦即實質上低於通常分配至GCBDLBCL之LPS截止值(約<1900)時,GCB DLBCL被視為「較強GCB DLBCL」。同樣,當本文揭示之一組基因之加權表現對應於其中LPS低於某一截止值結果的本文揭示之一組基因之加權表現,亦即LPS實質上低於通常分配至GCB DLBCL之LPS截止值(約<1900)時,GCB DLBCL被視為「較強GCB DLBCL」。根據本發明,可應用(亦即定義「較強GCB DLBCL」)之特定截止值(亦即所得LPS)之實例為以下截止值:(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-86
1200、(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-88
1141、(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-89
1100、(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-90
756、(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-91
750、(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-87
749、(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-95
745、(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-94
725或(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-93
699。較佳截止值為(為)
Figure 107127631-A0305-02-0024-92
750、(為)
Figure 107127631-A0305-02-0024-96
749及(為)
Figure 107127631-A0305-02-0024-97
725。尤佳截止值為(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-98
750及(約)
Figure 107127631-A0305-02-0024-99
725。
根據本發明的待採用(亦即根據較強GCB DLBCL之測定/鑑別/診斷)的該組基因可進一步包含一或多個管家基因,例如以下一或多個(較佳所有)管家基因:R3HDM1WDR55ISY1UBXN4TRIM56
待採用之一或多個其他基因之表現可標準化為一或多個管家基因(例如,如本文中所定義管家基因)之表現。熟習此項技術者易於能夠基於一或多個管家基因(例如,基於以上提及之一或多個管家基因)標準化一或多個此等其他基因(及可包含於根據本發明的待採用之該組基因中 的一個或多個其他基因)之表現。舉例而言,在此方面可採用至少1、2、3、4或5個(此等)管家基因。對於相應指南,熟習此項技術者可依賴於Scott(2014及2015上述引文)。
大體上,根據本發明亦可採用僅包含上文所提及之該組基因之子組的一組基因。舉例而言,此子組可包含至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18或19個上文所提及之全部組基因。然而,越多此等基因經評定,越多基因為較佳的。
根據本發明可採用之基因之此類子組之實例為包含以下基因之子組:至少1、2、3、4、5、6或7個基因TNFRSF13B、LIMD1、IRF4、CREB3L2、PIM2、CYB5R2、RAB7L1CCDC50;至少1、2、3、4、5或6個基因MME、SERPINA9、ASB13、MAML3、ITPKB、MYBL1S1PR2;或至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14個此等兩個基因之子組之基因。大體上,更高數目之基因為較佳的。
在本發明之上下文中,亦設想不僅如本文所提及之基因之特定組或基因之子組可根據本發明評定;且亦評定包含一或多個其他基因(例如,2個或更多個、3個或更多個、4個或更多個、5個或更多個、6個或更多個、7個或更多個、8個或更多個、9個或更多個、10個或更多個、20個或更多個、30個或更多個、40個或更多個、50個或更多個、60個或更多個、70個或更多個、80個或更多個、90個或更多個、100個或更多個、150個或更多個、170個或更多個或180個或更多個其他基因)的基因之組(子組)。此/此等其他基因可例如為已知基於其(加權)表現分離/區分GCB及ABC(及類別不明)DLBCL的(約180個)基因中之一或多者(參見,尤其Lenz(N.Engl.J.Med.359(2),2008,2313-23)且亦Geiss(Nature Biotechnology 26(3),2008,317-25))。
舉例而言,根據本發明的待評定之一組基因可包含(至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18或19個)上文提及之基因之特定組或基因之子組中之任一者之基因及例如已知基於其(加權)表現分離/區分GCB及ABC(及類別不明)DLBCL的(約180個)基因之一或多個其他基因(例如,2個或更多個、3個或更多個、4個或更多個、5個或更多個、6個或更多個、7個或更多個、8個或更多個、9個或更多個、10個或更多個、20個或更多個、30個或更多個、40個或更多個、50個或更多個、60個或更多個、70個或更多個、80個或更多個、90個或更多個、100個或更多個、150個或更多個、170個或更多個或180個或更多個其他基因)(參見Lenz及Geiss上述引文)。
舉例而言,一個(或多個)其他基因可添加至上文所描述之基因之組或基因之子組中之一者,例如添加至上文提及之20、15、8或7個基因之組中之一者,或上文所描述之基因之組或基因之子組中之一者的一個(或多個)基因(例如上文提及之20、15、8或7個基因之組)可由一個(或多個)其他基因替換。
根據態樣/實施例D待採用之另一個基因之非限制性但較佳實例為BLC2基因。
可用於測定根據本發明的上文所提及之表現,特定言之加權表現的手段及方法之一實例由NanoString(NanoString技術股份有限公司,西雅圖,華盛頓州,美國;亦參見Lenz(上述引文)及Geiss(上述引文))提供。可測定上文所提及之基因之(加權)表現的非限制性特定實例為NanoString研究僅使用LST分析。另一實例為TruSeq® RNA工具 (Illumina®,Inc.)。另外的實例描述於Wright(PNAS 100(17),2003,9991-6)中。亦描述於Wright(上述引文)中的為用於(加權)基因表現分析的任何適合組之通用適用性。
根據可用於測定(加權)表現的手段及方法之所提及實例,亦可將具有/患有較強GCB DLBCL之病患定義為具有腫瘤之病患,該腫瘤具有產生低於通常分配至GCB DLBCL之LPS的LPS(約<1900;相應截止值之實例參見上文)的(加權)基因表現,其中LPS來源於NanoString LST,例如來自NanoString僅研究用途淋巴瘤分型測試(Lymphoma Subtyping Test;LST)(NanoString技術股份有限公司,西雅圖,華盛頓州,美國),作為Nanostring組中之基因之(加權)基因表現(或具有對應於此(加權)基因表現的(加權)基因表現的腫瘤)。舉例而言,上文提及之特定基因可在Nanostring組中。
亦可將具有/患有較強GCB DLBCL的病患定義為具有腫瘤之病患,該腫瘤具有具/產生低於通常分配至GCB DLBCL之LPS的LPS(約<1900;相應截止值之實例參見上文)的(加權)基因表現,其中LPS藉由(加權)基因表現圖(例如,如本文中所描述藉由使用NanoString LST)由COO分類產生(或具有對應於此(加權)基因表現的(加權)基因表現的腫瘤)。
大體上,COO分類(例如,分類為較強GCB DCBCL、類別不明GCB DCBCL及較弱GCB DCBCL)可基於基因表現圖,特定言之加權基因表現圖(例如,使用NanoString LST(如例如NanoString研究僅使用LST)(NanoString技術股份有限公司,西雅圖,華盛頓州,美國)。
大體上,「LPS」之含義為此項技術中已知的且因此在本發明之上下文中由熟習此項技術者理解。特定言之,根據本發明之LPS為連 續變量(基因表現之加權平均值;例如本文中提及之基因之基因表現,其可在Nanostring LST中)。
在GOYA中評定之病患之總和中,LPS範圍介於-1138至4504。通常,如上文所提及,LPS用於將病患分類為COO次族群GCB DLBCL、ABC DLBCL及類別不明DLBCL(參見上文及Scott 2014及2015上述引文)。預設COO算法使用貝葉斯方法(bayesian approach),其中基於可能性為GCB或ABC(類別不明作為緩衝起作用)的
Figure 107127631-A0305-02-0028-100
90%截止進行GCB/ABC分類。
更特定言之,設想根據本發明之LPS為待在基因表現圖中採用的基因(例如,包含於所提及基因之組(子組)中之以上所提及之基因)之表現之加權和。基因表現之加權和可根據以下公式(公式I)來計算:LPS(X)=Σ j a j X j ,其中X表示各樣品,X j 為基因j之基因表現且a j 為基因j之係數。(亦參見Wright上述引文;特定言之,章節「Gene Expression Data」及「Formulation of the DLBCL Subgroup Predictor」;以引用之方式併入本文中)
一般而言,根據本發明之教示,熟習此項技術者能夠測定基因之表現,特定言之基因之加權表現。相應手段及方法為此項技術中已知的且例如描述於Wright(上述引文),特定言之章節「Gene Expression Data」中及「Formulation of the DLBCL Subgroup Predictor」中;以引用之方式併入本文中。Wright(上述引文)例如亦概述可如何使用加權基因表現算法及其可如何在基因表現平台(如NanoString LST及其他)上轉移。類似指南亦提供於Lenz(上述引文)中。
在根據本發明及尤其如上文所描述的較強GCB DLBCL分類之情形下,可進一步考慮以下:多變量Cox回歸及(/或)彈性網懲罰回歸(elastic net penalized regression)(α=0.5)可用於評估生物標記治療效果。可使用交叉驗證及(/或)自助抽樣法來進行用於鑑別治療效果的最佳截止值的模擬,例如基於NanoString LST及相應LPS。多重測試調整可藉由估計錯誤發現率(FDR)來完成,例如使用Benjamini-Hochberg程式(例如,顯著性<5% FDR)。塗徑增濃分析可藉由基因組增濃來進行,例如藉由使用由MSigDB標誌定義之基因組及(/或)經驗證FL體細胞突變標誌基因組。
特定言之,LPS截止值(例如,如本文中其他地方所描述)可在一或多個模擬分析中,較佳在一或多個多變量模擬分析中來測定。
LPS截止值(例如,如本文中其他地方所描述)之穩定性可藉由自助抽樣法模擬展示。
此外,代替使用例如來自NanoString LST的LPS之特定加權算法,可應用例如來自另一表現分析組(例如,TruSeq® RNA工具(Illumina®,Inc.))的結果之主分量分析的第1主分量,藉由基因表現評估例如上文所提及之基因(例如,已知分離GCB及ABC的約180個基因中之一或多者)。根據本發明亦展示在(來源於NanoString LST之)LPS與第1主分量之間存在極高相關性。
在本發明之一個態樣/實施例(態樣/實施例E)中,本文中所定義之病患(其將用歐比托珠單抗治療)為具有/患有BCL2易位及/或高BCL2表現的病患。較佳地,在此態樣/實施例之情形下設想具有高BCL2表現之BCL2易位的病患。
通常已知BCL2(亦參見Zhang上述引文;Punnoose上述引文;Iqbal,Clin Cancer Res 17(24),2011,7785-95;Iqbal,JCO 24(6),2006,961-8;Hu,Blood 121(20),2013,4021-31;Johnson,JCO 30(28),2012,3452-67;Green,JCO 30(28),2012,3460-67)為抗凋亡蛋白質,其之過度表現對抗粒線體凋亡途徑。已知BCL2在DLBCL病患之腫瘤中表現。
編碼BCL2之核苷酸序列及BCL2之胺基酸序列(特定言之智人(人類)BCL2)在此項技術中已熟知。其可例如藉由遵照以下統一資源定位符(URL)下載:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/search/?term=Homo+sapiens+BCL2&utm_expid=.fAeHyO5JTBGxnObh2WlrCA.0&utm_referrer=https%3A%2F%2Fwww.ncbi.nlm.nih.gov%2Fsearch%2F%3Fterm%3DHomo%2Bsapiens%2BBCL2。編碼BCL2之核苷酸序列(特定言之智人(人類)BCL2)例如可經由以下NCBI寄存編號獲得:XM_017025917.2(變體X3);XM_011526135.3(變體X2);XR_935248.3(變體X1);NM_000657.2(變體β);NM_000633.2(變體α)。BCL2之胺基酸序列(特定言之智人(人類)BCL2)例如可經由以下NCBI寄存編號獲得:XP_016881406.1(同工型X2);XP_011524437.1(同工型X1);NP_000648.2(同工型β);NP_000624.2(同工型α)。編碼智人(人類)BCL2之核苷酸序列之一實例描繪於SEQ ID NO:13中。智人(人類)BCL2之胺基酸序列之一實例描繪於SEQ ID NO:14中。
以上關於「表現」已在本文中大體上描述,細節上作必要修改後,(初級)mRNA之量測/偵測及蛋白質之量測/偵測適用於此處。
一般而言,用於量測/偵測BCL2表現及BCL2易位的手段 及方法為此項技術中已知的且例如描述於Zhang(上述引文)及Puunoose(上述引文)中。此外,熟習此項技術者可易於分析給定BCL2表現根據本發明是否為「高」的或根據本發明是否存在一或多個BCL2易位。此外,相較於根據本發明給定BCL2表現被視為「較高」或相較於根據本發明認為存在一或多個BCL2易位,熟習此項技術者可易於選擇適合對照。在此上下文中,熟習此項技術者可例如亦依賴於Zhang(上述引文)及Puunoose(上述引文)。
BCL2表現可例如藉由Ventana免疫組織化學(IHC)分析,例如藉由Ventana試驗用用途IHC分析(BCL2抗體純系124)(藉由就讀供應商之手冊)來評定。舉例而言,高BCL2表現可在此上下文中定義為在
Figure 107127631-A0305-02-0031-101
50%腫瘤細胞中之中度或較強染色(另外細節參見下文)。
BCL2蛋白質表現/BCL2蛋白質之外觀亦可如Punnoose(上述引文)、Iqbal(2011及2006上述引文)、Hu(上述引文)、Johnson(上述引文)、Green(上述引文)中所描述來量測/偵測。
(初級)mRNA之基因表現/外觀,特定言之(初級)BCL2mRNA之BCL2基因表現/外觀可(例如)如Zhang(上述引文)中所描述或藉由使用TruSeq® RNA定序((Illumina®,Inc.)根據經銷商之手冊)來評估。
在本發明之上下文中,「高BCL2表現」意謂尤其與適合對照相比,BCL2以實質上更高水準表現。一般而言,根據本發明的「高BCL2表現」意謂,BCL2表現與在根據本發明之反應者(亦即,與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,藉由達成經改善臨床結果對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出反應的病患;「本文 中所定義之病患」)中之BCL2表現一樣高(例如,±10%或更小、±7.5%或更小、±5%或更小、±3%或更小、±2%或更小、±1%或更小、或甚至±0%),及/或高於根據本發明之無反應者(亦即,與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,藉由不達成經改善臨床結果對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療起反應的病患;非「本文中所定義之病患」)中之BCL2表現。熟練者易於能夠分析在此方面BCL2表現何時為「高」的並施加適合對照。舉例而言,對照在此方面可為常見DLBCL群體,更特定言之未分類為屬於根據本發明分類之病患次族群的DLBCL病患(非「本文中所定義之病患」)。「高BCL2表現」可為在對照族群中,例如在此類上文所提及之對照族群中高於中位BCL2表現的BCL2表現。舉例而言,「高BCL2表現」及「更高水準」之BCL2表現根據本發明可分別為在GOYA中評定之病患中高於中位BCL2表現的BCL2表現。
基於可在本發明之上下文中認為BCL2表現是否為「高」的,對照之一實例為正常的,亦即非腫瘤組織,更特定言之為正常的,亦即非腫瘤淋巴組織。組織可來自DLBCL病患。舉例而言,其可來自待治療之DLBCL病患。然而,大體上,組織亦可為正常/健康個體之組織。
基於可在本發明之上下文中認為BCL2表現是否為「高」的,對照之一較佳實例為腫瘤組織,更特定言之來自根據本發明之無反應者(非「本文中所定義之病患」)的淋巴腫瘤組織。較佳的為來自無反應DLBCL病患(為DLBCL病患的非「本文中所定義之病患」)的組織。
若例如
Figure 107127631-A0305-02-0032-102
30%、
Figure 107127631-A0305-02-0032-103
40%、
Figure 107127631-A0305-02-0032-104
50%或
Figure 107127631-A0305-02-0032-105
60%腫瘤細胞表現BCL2(例如,在IHC分析中展示BCL2染色),則將BCL2表現視為「較高」,特 定言之展示中度至較強BCL2表現(例如,在IHC分析中展示中度至較強BCL2染色)。
在本發明之上下文中較佳的為BCL2表現,特定言之「高」BCL2表現併有表現BCL2之腫瘤細胞之百分比及此等細胞中之BCL2表現之強度兩者。
當評定根據本發明的給定BCL2表現是否「較高」時,熟習此項技術者亦可依賴於Iqbal(2011及2006上述引文)、Hu(上述引文)、Johnson(上述引文)及Green(上述引文)。
更一般而言,「高BCL2表現」及(實質上)「更高水準」之BCL2表現根據本發明分別意謂尤其與適合對照(例如,常見DLBCL病患/群體;非「本文中所定義之病患」)中之BCL2表現相比,BCL2以至少高10%、至少高20%、至少高30%、至少高40%、至少高50%、至少高75%、或至少高100%的含量表現。此適用於基因表現及蛋白質表現兩者。
「一或多個BCL2易位」之含義在此項技術中熟知。通常,「BCL2易位」為BCL2與IgH之間的基因融合(涉及染色體14及18)。BCL2易位例如描述於Zhang(上述引文)中。
BCL2易位可例如藉由使用BCL2雙色分裂技術(Vysis,Abbott Molecular),特定言之藉由使用Vysis LSI雙色分裂FISH探針(例如,具有呈5%(通常使用)或50%的(FISH)截止值);藉由就讀供應商之手冊來評定/偵測。
BCL2易位亦可藉由基礎藥品下一代定序分析FoundationOne® Heme(藉由就讀供應商之手冊;亦參見He上述引文)來 評定/偵測。
用於評定/偵測BCL2易位的手段及方法為此項技術中已知的且例如描述於Zhang(上述引文)及He(上述引文)中。
熟習此項技術者易於能夠在評定/偵測根據本發明的一或多個BCL2易位或BCL2表現時選擇待使用之合適樣品(作為測試樣品或作為對照樣品)。
用於評定/偵測是否存在高BCL2表現的待在本發明之上下文中採用的樣品(作為測試樣品或作為對照樣品)之一特定實例為(BCL2表現)腫瘤之樣品(例如,活檢體)。
用於評定/偵測是否存在一或多個BCL2易位的待在本發明之上下文中採用之樣品(作為測試樣品或作為對照樣品)之一特定實例為DNA樣品。
在本發明之一個態樣/實施例(態樣/實施例F)中,本文中所定義之病患(其將用歐比托珠單抗治療)由前述態樣/實施例A、B、C、D及E中提及之任何2個、任何3個、任何4個或任何5個病患定義之組合/交叉點來定義。亦即,病患可由以下態樣/實施例中提及之病患定義之組合/交叉點來定義:A及B;A及C;A及D;A及E;B及C;B及D、B及E;C及D;C及E;A、B及C;A、C及D;A、D及E;A、B及D;A、B及E;A、C及E;B、C及D;B、C及E;B、D及E;C、D及E;A、B、C及D;A、C、D及E;B、C、D及E;以及A、B、D及E。較佳為包含根據態樣/實施例D及E之定義的組合/交叉點。
在本發明之一個態樣/實施例(態樣/實施例G)中,本文中所定義之病患(其將用歐比托珠單抗治療)由前述態樣/實施例D及E(或A、D 及E)中提及之病患定義之組合/交叉點來定義。亦即,根據此態樣/實施例的本文中所定義之病患為以下病患:(i)具有/患有較強GCB DLBCL;以及(ii)具有BCL2易位及/或高BCL2表現。病患定義之此組合/交叉點定義了本文中所定義之較佳病患。
一般而言,如在本發明之上下文中所使用,「對照」之一非限制性實例較佳為「無反應者」對照,例如,獲自不罹患如本文中所定義之特定DLBCL(非「本文中所定義之病患」)且根據本發明已知與利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)相比將不會對歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)作出有利地反應的一或多個病患之樣品/細胞/組織。「無反應者」對照之另一實例為在離體測試中與利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)相比,展示對歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)無經改善反應的細胞株/樣品/細胞/組織。「對照」之另一非限制性實例為「內標物」,例如經純化或以合成方式產生之蛋白質、肽、DNA及/或RNA或其混合物,其中各蛋白質/肽/DNA/RNA之量藉由使用本文中所描述之「無反應者」對照來衡量。
大體上,設想在本發明之上下文中待治療之病患為DLBCL病患。換言之,病患為具有/患有DLBCL之病患。因此,特定地設想同樣關於前述態樣/實施例A、B、C、D、E、F、G中之任一者定義的病患分別為DLBCL病患及具有/患有DLBCL之病患。然而,並非必需要求給定病患經診斷為DLBCL病患,例如在測定/鑑別/診斷為如本文中所定義之病患之前(或之後),特定言之如前述一個(或多個)態樣/實施例A至G中所定 義。然而,較佳的,根據本發明的待治療之病患在第一步驟中經診斷為DLBCL病患,或至少為淋巴瘤病患,且在第二步驟中經測定/鑑別/診斷為本文中所定義之病患,特定言之如前述一個(或多個)態樣/實施例A至G中所定義之病患。大體上,根據本發明,給定病患亦可在第一步驟中經測定/鑑別/診斷為本文中所定義之病患,且在第二步驟中診斷為DLBCL病患,或至少為淋巴瘤病患。然而,後者選項為較不佳的且如所提及,無論待治療之病患是否為(DLBC)L病患,亦可省略診斷之(前述或後續)步驟。
主治醫師將如何根據本發明選擇是否治療給定病患的方式之一非限制性實例將提供於以下中: 可自例如具有引起淋巴瘤(例如,增大淋巴結)之臨床懷疑之異常的病患獲取(腫瘤)樣品(例如,(腫瘤)活檢體)。(腫瘤)樣品可診斷為(DLBC)L陽性(例如,藉由病理學家)。此可為上文提及之兩個步驟中之一者。
如所提及,此步驟可省略。
可自(剩餘部分的)(腫瘤)樣品(例如,(腫瘤)組織/活檢體)或自相同或另一個病患之另一(腫瘤)樣品或自相同或另一個病患之另一腫瘤提取蛋白質、RNA(例如,(初級)mRNA)及/或DNA。本文中所定義之病患可接著經測定/鑑別/診斷,亦即可接著用經取樣蛋白質、RNA(例如,(初級)mRNA)及/或DNA進行根據本發明的一或多個生物標記分析。舉例而言,樣品可用加權基因表現分析(例如,藉由使用NanoString LST)分析以獲得LPS,針對一或多個CD58基因突變及/或針對低CD58表現進行測試及/或針對BCL2易位及/或針對高BCL2表現進行測試。一或多個分析之結果接著允許將病患分類為根據本發明定義之DLBCL次族群。換言之,一或多個分析之結果接著允許對病患是否為「本文中所定義之病患」進行分類。
此可為上文提及之兩個步驟之另一者(亦即,必須的步驟)。
可根據以下根據本發明採用一或多個生物標記分析之非限制性實例:腫瘤樣品,例如診斷腫瘤樣品(例如,組織活檢體),例如福馬林非揮發性及(/或)石蠟嵌入式樣品可獲自病患。RNA(或蛋白質或DNA)可經提取且基因表現可針對較強GCB分類、CD58易位/低表現及/或BCL2突變/低表現進行分析。可提取DNA以評估一或多個CD58突變。組織切片,特定言之腫瘤組織切片可經切割及嵌入,例如以用於IHC及/或(F)ISH分析。
如所提及,在本發明之上下文中設想使用歐比托珠單抗或歐比托珠單抗之功能等效物以用於治療本文中所定義之病患。
歐比托珠單抗自身為此項技術中熟知的且例如描述於EP-B1 2380910及WO 2005/044859中。關於歐比托珠單抗自身的另外細節參見下文。
同樣,「歐比托珠單抗之功能等效物」之含義對熟習此項技術者而言為顯而易見的。特定言之,術語「歐比托珠單抗之功能等效物」係指抗體,特定言之人類化II型抗CD20抗體,其比利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)更適用於治療(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)本文中所定義之病患。換言之,此術語係指抗體,特定言之人類II型抗CD20抗體,具有使得抗體能夠治療本文中所定義之病患以使得其與用利妥昔單抗治療相比藉由達成經改善臨床結果而作出反應的特徵及作用模式(MOA)。更特定言之,術語「歐比托珠單抗之功能等效物」係指抗體, 特定言之II型抗CD20抗體,其作為歐比托珠單抗自身之相同特徵及生物功能,特定言之作為使得抗體比利妥昔單抗更適用於治療本文中所定義之病患的歐比托珠單抗自身的相同生物功能。
根據本發明之歐比托珠單抗之等效物(及歐比托珠單抗自身)的大部分相關特徵及MOA之實例在本文中其他地方定義。其可易於藉由熟習此項技術者測定。
大體上,在本發明之上下文中,設想術語「歐比托珠單抗之功能等效物」亦涵蓋歐比托珠單抗之生物類似藥。特定言之,設想術語之含義亦涵蓋比利妥昔單抗更適用於治療本文中所定義之病患的歐比托珠單抗之任何生物類似物。換言之,「歐比托珠單抗之功能等效物」可為能夠治療本文中所定義之病患以使得其與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比藉由達成經改善臨床結果而作出反應的歐比托珠單抗之生物類似物。
一般而言,「生物類似物」之含義為此項技術中熟知的。在此上下文中,已知「生物類似物」為生物醫療產物,其幾乎為原始生物醫療產物之相同複本且亦稱為後續生物或後續進入生物。生物類似藥為原始「原創」產物的經官方批准之版本。在此上下文中,例如參考關於類似生物藥品產物之EMEA指南(CHMP/437/04 London,2005)。
在本發明之上下文中,設想歐比托珠單抗,特定言之歐比托珠單抗之功能等效物為抗體,特定言之人類化II型抗CD20抗體,其包含(a)如SEQ ID NO:1中所描繪之重鏈可變區及如SEQ ID NO:2中所描繪之輕鏈可變區(此輕鏈可變區亦稱為KV1輕鏈可變區;「KV1」表示 鼠類B-Lyl單株抗體之人類化輕鏈可變區;參見EP-B1 2380910);(b)重鏈可變區,其具有(a)之該重鏈可變區之特異性決定殘基,及輕鏈可變區,其具有(a)之該輕鏈可變區之特異性決定殘基;或(c)重鏈可變區,其由與SEQ ID NO:3至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致的核酸序列編碼,及輕鏈可變區,其由與SEQ ID NO:4至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%或至少99%一致(更高值為較佳)的核酸序列編碼。
較佳的,歐比托珠單抗,特定言之待在本發明之上下文中採用之歐比托珠單抗之功能等效物為單株抗體,特定言之單株人類化II型抗CD20抗體。
尤佳的,根據本發明的待採用之抗體為II型抗CD20抗體,特定言之人類化II型抗CD20單株抗體,或較佳地,及包含經醣基工程改造之Fc區,特定言之如本文以下所定義經醣基工程改造之Fc區的抗體。更佳的,根據本發明,此抗體或根據本發明的待採用之任何其他抗體展示實質上更高水準之ADCC活性,尤其與類似的I型抗CD20抗體相比及/或與未經醣基工程改造之抗體(例如,利妥昔單抗)相比。
「II型」抗CD20抗體之含義在此項技術中熟知。一般而言,抗CD20單株抗體基於其在根除淋巴瘤細胞中之作用機制屬於兩個不同類別。I型抗CD20抗體主要利用補體來殺死靶細胞,而II型抗體藉由不同機制(主要地,細胞凋亡)來操作。利妥昔單抗及1F5為I型抗CD20抗體之實例,而B1為II型抗體之一實例。參見例如Cragg(Blood 103(7),2004,2738-2743);Teeling(Blood 104(6),2004,1793-1800),其全部內容以引用之方式併入本文中。同樣,歐比托珠單抗自身為II型抗體。參見 例如EP-B1 2380910及WO 2005/044859,其全部內容以引用之方式併入本文中。
熟習此項技術者已知(但至少易於能夠測定)歐比托珠單抗之重鏈及輕鏈可變區之相關特異性決定殘基。關於相應指南,熟習此項技術者可例如依賴於EP-B1 2380910及WO 2005/044859。
在一個態樣中,設想如在本發明之上下文中採用(特定言之如前述(b)及(c)中所定義)之歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物尤其具有以下特徵中之一或多者:(i)當相對於對照在相同條件下使用利妥昔單抗與CD20陽性人類細胞一起培育時誘導更高水準之細胞凋亡的能力;(ii)與利妥昔單抗相比造成增加的CD20+腫瘤B細胞殺死的能力;(iii)與利妥昔單抗相比造成增加的直接細胞死亡的能力(不受理論束縛,此係由於替代結合幾何構型(例如,彎頭鉸鏈修飾));(iv)與利妥昔單抗相比造成減少的補體依賴性細胞毒性(CDC)的能力(不受理論束縛,此係由於替代結合幾何構型(例如,彎頭鉸鏈修飾));(v)與利妥昔單抗相比造成增加的抗體依賴性細胞毒性(ADCC)的能力(不受理論束縛,此係由於經醣基工程改造之Fc區);(vi)與利妥昔單抗相比造成增加的抗體依賴性細胞噬菌作用(ADCP)的能力(不受理論束縛,此係由於經醣基工程改造之Fc區);(vii)與利妥昔單抗相比增加的對FcγRIII受體的親和力(不受理論束縛,此係由於經醣基工程改造之Fc區);(viii)在與CD20結合時,與利妥昔單抗相比觸發表面CD20之較少內化的能力。
在一個態樣中,設想如在本發明之上下文中採用(特定言之如前述(b)及(c)中所定義)之歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物尤其展示以下MOA中之一或多者:(i)當相對於對照在相同條件下,使用利妥昔單抗與CD20陽性人類細胞一起培育時誘導更高水準之細胞凋亡的能力;(iii)與利妥昔單抗相比,造成增加的直接細胞死亡的能力(不受理論束縛,此係由於替代結合幾何構型(例如,彎頭鉸鏈修飾));(iv)與利妥昔單抗相比,造成減少的補體依賴性細胞毒性(CDC)的能力(不受理論束縛,此係由於替代結合幾何構型(例如,彎頭鉸鏈修飾));(v)與利妥昔單抗相比,造成增加的抗體依賴性細胞毒性(ADCC)的能力(不受理論束縛,此係由於經醣基工程改造之Fc區);(vi)與利妥昔單抗相比,造成增加的抗體依賴性細胞噬菌作用(ADCP)的能力(不受理論束縛,此係由於經醣基工程改造之Fc區);(vii)與利妥昔單抗相比,對FcγRIII受體的親和力增加(不受理論束縛,此係由於經醣基工程改造之Fc區);(viii)在與CD20結合時,與利妥昔單抗相比,觸發表面CD20內化之能力較少。
可用於測定根據本發明的待採用之抗體之相關特徵(例如,生物功能、MOA)的手段及方法為此項技術中熟知的且可易於由熟習此項技術者應用。
可用於測定細胞凋亡之水準,特定言之當相對於對照在相同條件下,使用利妥昔單抗與CD20陽性人類細胞一起培育時,所給定抗 體是否能夠誘導更高水準之細胞凋亡的手段及方法為此項技術中已知的且例如描述於EP-B1 2380910及WO 2005/044859中。
根據本發明的「更高水準之細胞凋亡」意謂例如與由利妥昔單抗之類似應用造成的細胞凋亡之水準相比至少高1.2倍、至少高1.5倍、至少高2倍、至少高3倍、至少高4倍、至少高5倍或至少高10倍。
可用於測定CD20+腫瘤B細胞殺死,特定言之與利妥昔單抗相比,是否存在增加的CD20+腫瘤B細胞殺死的手段及方法為此項技術中已知的且例如揭示於EP-B1 2380910及WO 2005/044859中。
根據本發明,若CD20+腫瘤B細胞殺死例如與由利妥昔單抗之類似應用造成的CD20+腫瘤B細胞殺死相比至少高1.2倍、至少高1.5倍、至少高2倍、至少高3倍、至少高4倍、至少高5倍或至少高10倍,則其為「增加的」。
可用於測定直接細胞死亡,特定言之與利妥昔單抗相比,是否存在增加的直接細胞死亡的手段及方法為此項技術中已知的且例如揭示於EP-B1 2380910及WO 2005/044859中。
根據本發明,若直接細胞死亡與由利妥昔單抗之類似應用造成的直接細胞死亡相比至少高1.2倍、至少高1.5倍、至少高2倍、至少高3倍、至少高4倍、至少高5倍或至少高10倍,則其為「增加的」。
可用於測定CDC,特定言之與利妥昔單抗相比,是否存在減少的CDC的手段及方法為此項技術中已知的且例如揭示於Herter(上述引文)、Mössner(上述引文)、EP-B1 238090、WO 2005/044859、WO 2015/067586及WO 2016/207312中。
根據本發明,若CDC與例如由利妥昔單抗之類似應用造成 的CDC相比至少高1.2倍、至少高1.5倍、至少高2倍、至少高3倍、至少高4倍、至少高5倍或至少高10倍,則其為「減少的」。
術語「補體依賴性細胞毒性(CDC)」係指在補體存在下藉由根據本發明的待採用之抗體來裂解人類腫瘤靶細胞。CDC較佳地藉由在補體存在下用根據本發明的待採用之抗CD20抗體處理CD20表現細胞之製劑來量測。若抗體在例如4小時之後例如在100nM之濃度下誘導例如20%或更多腫瘤細胞之裂解(細胞死亡),則發現CDC。較佳用51Cr或Eu標記的腫瘤細胞進行分析且量測釋放的51Cr或Eu。對照包含將腫瘤靶細胞與補體一起培育,但與利妥昔單抗一起培育,且視情況,無需抗體。
熟習此項技術者易於能夠調整CDC分析之此特定實例以便能夠測試與施加利妥昔單抗相比CDC活性在施加根據本發明的待使用之抗體時是否減少,視具體情況而定。
可用於測定ADCC,特定言之與利妥昔單抗相比是否存在增加的ADCC的手段及方法為此項技術中已知的且例如揭示於Herter(上述引文)、Mössner(上述引文)、Tobinai(Adv.Ther.34,2017,324-56)、EP-B1 2380910、WO 2005/044859、WO 2015/067596及WO 2016/207312中。
根據本發明,更一般而言,若ADCC與由利妥昔單抗之類似應用造成的ADCC相比至少高1.2倍、至少高1.5倍、至少高2倍、至少高3倍、至少高4倍、至少高5倍或至少高10倍,則其為「增加的」。
一個非限制性公認的活體外ADCC分析係如下:1)該分析法使用已知表現抗體(CD20)之抗原結合區所識別之靶抗原的靶細胞; 2)該分析法使用自隨機選擇的健康供體之血液分離的人類外周血液單核細胞(PBMC)作為效應細胞;3)根據以下方案進行該分析:i)使用標準密度離心程序分離PBMC,且將其以5×106細胞/毫升懸浮於RPMI細胞培養基中;ii)靶細胞藉由標準組織培養方法生長,自具有高於90%之存活率之指數生長期採集,用RPMI細胞培養基洗滌,以100微居里(micro-Curies)之51Cr標記,用細胞培養基洗滌兩次,且以105個細胞/毫升之密度再懸浮於細胞培養基中;iii)將100微升上文之最終靶細胞懸浮液轉移至96孔微量滴定盤之各孔中;iv)在細胞培養基中將抗體自4000ng/ml連續稀釋至0.04ng/ml,且將50微升之所得抗體溶液添加至96孔微量滴定盤中之靶細胞中,重複三次測試涵蓋上文所有濃度範圍之各種抗體濃度;v)就最大釋放(MR)對照而言,在含有經標記的靶細胞之盤中之3個額外孔接納50微升之2%(VN)非離子清潔劑之水性溶液(Nonidet,Sigma,St.Louis),而不是抗體溶液(上文第iv點);vi)對於自發釋放(SR)對照,在含有經標記之靶細胞之盤中之3個額外孔接納50微升之RPMI細胞培養基,而非抗體溶液(上文第iv點);vii)接著在50×g下將96孔微量滴定盤離心1分鐘且在4℃下培育1小時;viii)將50微升之PBMC懸浮液(上文第i點)添加至各孔中以產生25:1之效應子:靶細胞比率且將盤置放於37℃下、5%之CO2氛圍下之培養箱中4 小時;ix)採集來自各孔之無細胞上清液且使用γ計數器量化實驗釋放的放射能(ER);x)對於各抗體濃度根據(ER-MR)/(MR-SR)×100計算特異性溶解百分比,其中ER為針對抗體濃度所量化之平均放射能(參見上文第ix點),MR為針對MR對照(參見上文第v點)所量化之平均放射能(參見上文第ix點),且SR為針對SR對照(參見上文第vi點)所量化之平均放射能(參見上文第ix點);4)將「增加的ADCC」定義為在上文測試之抗體濃度範圍內所觀測到的特異性溶解之最大百分比的增加及/或為實現在上文測試之抗體濃度範圍內所觀測到的特異性溶解最大百分比一半所需要之抗體濃度的降低。ADCC之增加係相對於使用熟習此項技術者已知之相同的標準產生、純化、調配及存儲方法、用以上分析法量測、藉由相同抗體介導、藉由相同類型之宿主細胞產生之ADCC而言,但該ADCC並非藉由經工程改造以過度表現GnTIII之宿主細胞產生。
熟習此項技術者易於能夠調整ADCC分析之此特定實例以便能夠測試與施加利妥昔單抗相比ADCC活性在施加根據本發明的待使用之抗體時是否減少,視具體情況而定。
可用於測定ADCP,特定言之與利妥昔單抗相比是否存在增加的ADCP的手段及方法為此項技術中已知的且例如揭示於Herter(上述引文)及Mössner(上述引文)中。
根據本發明,若ADCP與由利妥昔單抗之類似應用造成的ADCP相比至少高1.2倍、至少高1.5倍、至少高2倍、至少高3倍、至少高4 倍、至少高5倍或至少高10倍,則其為「增加的」。
可用於測定對FcγRIII受體之親和力,特定言之與利妥昔單抗相比是否存在增加的對FcγRIII受體之親和力的手段及方法為此項技術中已知的且例如揭示於Tobinai(上述引文)中。
根據本發明,若對FcγRIII受體之親和力例如與由利妥昔單抗之類似應用造成的對FcγRIII受體之親和力相比至少高1.2倍、至少高1.5倍、至少高2倍、至少高3倍、至少高4倍、至少高5倍或至少高10倍,則其為「增加的」。
可用於測定觸發表面CD20之內化的能力(在與抗CD20抗體結合時),特定言之與利妥昔單抗相比是否存在觸發表面CD20之較少內化的能力(當與歐比托珠單抗結合時)的手段及方法為此項技術中已知的且例如揭示於Lim(Blood 118(9),2011,2530-40)中。
根據本發明,若表面CD20之內化例如與由利妥昔單抗之類似應用造成的觸發表面CD20內化之能力相比至少高1.2倍、至少高1.5倍、至少高2倍、至少高3倍、至少高4倍、至少高5倍或至少高10倍,則其「較少」。
如所提及,在本發明之上下文中,較佳的為待在本發明之上下文中採用之歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物包含經醣基工程改造之Fc區。在此上下文中,亦參考EP-B1 2380910及WO 2005/044859;其之全部內容在此以引用之方式併入。
在本發明之上下文中,尤佳的為待採用之抗體之Fc區經醣基工程改造以使得抗體分別具有以上提及,更特定言之前述章節(v)、(vi)及(vii)中之特徵及MOA中之一或多者。章節(v)之特徵/MOA在此方面 (ADCC之增加)為最佳的。
待在本發明之上下文中採用之歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物可增加連接至該經醣基工程改造之Fc區的非岩藻醣基化寡糖之得分。
待在本發明之上下文中採用之歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物可增加連接至該經醣基工程改造之Fc區的經二等分非岩藻醣基化寡糖的得分。
待在本發明之上下文中採用之歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物相對於非經醣基工程改造之抗體及/或相對於利妥昔單抗可具有明顯更高水準的與人類FcγRIII受體之結合。
如所提及,在本發明之上下文中,較佳的為待在本發明之上下文中採用(特定言之如前述(b)及(c)中所定義)之歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物尤其相對於非經醣基工程改造之抗體及/或相對於利妥昔單抗展現明顯更高水準的ADCC活性。不受理論束縛,明顯更高水準的ADCC活性由經醣基工程改造之Fc區造成(參見上文)。
熟習此項技術者易於能夠醣基工程改造抗體之Fc區,以便獲得根據本發明的待採用(例如,如上文中所提及)之抗體,且以一方式擷取相關特徵/MOA。此外,熟習此項技術者易於能夠推斷根據本發明的非岩藻醣基化寡糖之得分增加了多少及經二等分非岩藻醣基化寡糖之得分增加了多少。在此上下文中,熟習此項技術者可尤其依賴於由EP-B1 2380910及WO 2005/044859提供之指南;其之內容在此以引用之方式併入。此類增加之非限制性實例為增加至少1.2倍、至少1.5倍、至少2倍、至少3倍、至少4倍、至少5倍或至少10倍(相對於非經醣基工程改造之抗 體)。
根據本發明,術語「一致性」或「一致」或「一致性百分比(percent identity/percentage identity)」或「序列一致性」在兩個(或更多)核酸序列之情形下係指當在比較窗口上或在如使用此項技術中已知之序列比較算法所量測之指定區域上或藉由手動比對及目視檢查針對最大對應進行比較及比對時,相同的兩個(或更多)序列或子序列,或具有指定百分比的相同核苷酸(較佳至少80%一致性、更佳地至少85%、90%、95%、96%、97%或98%一致性,最佳至少99%一致性)。可將具有例如80%至90%或更大序列一致性的序列視為實質上一致。定義亦適用於測試序列之補充。所描述之一致性可存在於長度為至少約15至25個核苷酸之區域上、長度為至少約50至100個核苷酸之區域上或長度為至少約800至1200個核苷酸之區域上(或序列之整個長度上)。熟習此項技術者將已知如何使用例如算法(諸如基於CLUSTALW電腦程式之彼等)來測定序列之間/中的一致性百分比(Thompson Nucl.Acids Res.2(1994),4673-4680)或FASTDB(Brutlag Comp.App.Biosci.6(1990),237-245),如此項技術中已知。
儘管FASTDB算法在其計算時通常不考慮序列中之內部非匹配缺失或添加,亦即間隙,但此可經人工校正以避免過高估計一致性%。然而,CLUSTALW在其一致性計算時未將序列間隙考慮在內。熟習此項技術者亦可用的為BLAST及BLAST 2.0算法(Altschul,(1997)Nucl.Acids Res.25:3389-3402;Altschul(1993)J.Mol.Evol.36:290-300;Altschul(1990)J.Mol.Biol.215:403-410)。BLASTN程式(對於核苷酸序列)使用以下作為預設參數:字長(W)為11,期望值(E)為10,M=5, N=4及兩股比較。BLOSUM62計分矩陣(Henikoff(1989)PNAS 89:10915)使用以下:比對(B)為50,預期(E)為10、M=5、N=4及兩股比較。
為測定核酸序列中之核苷酸殘基是否對應於給定核苷酸序列中之某一位置,熟習此項技術者可人工地或藉由使用電腦程式(諸如本文提及之彼等)使用此項技術中熟知的手段及方法,例如比對。舉例而言,表示鹼基局部比對檢索工具BLAST(Altschul(1997),上述引文;Altschul(1993),上述引文;Altschul(1990),上述引文)的BLAST 2.0可用於檢索局部序列比對。如上文所論述,BLAST產生核苷酸序列之比對以測定序列相似性。由於比對之局部性質,BLAST尤其適用於測定精確匹配或鑑別類似序列。BLAST算法輸出之基本單位為高得分區段配對(HSP)。HSP由任意但長度相等的兩個序列片段組成,其之比對為局部最大且比對得分符合或超過使用者設定之臨限值或截斷得分。BLAST方法係在查詢序列與資料庫序列之間尋找HSP,以評估所發現的任何匹配之統計顯著性,且僅報導滿足使用者選擇的重要臨限值的彼等匹配。參數E確定統計學上顯著之臨限值以用於報導資料庫序列匹配。將E解釋為在整個資料庫檢索之情形內HSP(或一組HSP)之預期可能出現頻率之上限。在程式輸出中報導匹配滿足E之任何資料庫序列。
使用BLAST的類似計算機技術(Altschul(1997),上述引文;Altschul(1993),上述引文;Altschul(1990),上述引文)用於在諸如GenBank或EMBL的核苷酸資料庫中檢索一致性或相關分子。此分析比多個基於薄膜之雜交更快。另外,電腦檢索之靈敏度可經修改以測定任何特定匹配是否分類為精確或類似。檢索之依據為定義為以下之產物得分:
Figure 107127631-A0305-02-0050-1
且其考慮兩個序列之間的類似度及序列匹配之長度兩者。舉例而言,在40之產物得分之情況下,匹配將精確在1-2%誤差內;且在70之產物得分下,匹配將為精確的。類似分子通常藉由選擇展示15與40之間的產物得分之彼等來鑑別,儘管更低得分可鑑別相關分子。能夠生成序列比對之程式的另一實例為CLUSTALW電腦程式(Thompson(1994)Nucl.Acids Res.2:4673-4680)或FASTDB(Brutlag(1990)Comp.App.Biosci.6:237-245),如此項技術中已知。
一般而言,如本文中所使用之術語「抗體(antibody/antibodies)」或「其功能等效物」為技術公認之術語且應理解為係指與已知抗原結合,尤其與免疫球蛋白分子及與免疫球蛋白分子之免疫活性部分結合的分子或分子之活性片段,亦即含有免疫特異性地結合抗原之結合位點的分子。大體上,免疫球蛋白可為免疫球蛋白分子之任何類型(IgG、IgM、IgD、IgE、IgA及IgY)或類別(IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1及IgA2)或子類別。
在本發明之範圍內預期「抗體」包括單株抗體、多株抗體、嵌合抗體、單鏈抗體、雙特異性抗體、猿化抗體、人類抗體及人類化抗體以及其活性片段。與已知抗原結合的分子之活性片段之實例包括Fab及F(ab')2片段,包括Fab免疫球蛋白表現庫及上文提及之抗體及片段中之任一者之抗原決定基結合片段的產物。
此等活性片段可藉由數個技術衍生自特定抗體(例如,歐比托珠單抗)。舉例而言,經純化單株抗體可用酶(諸如胃蛋白酶)裂解,且 進行HPLC凝膠過濾。接著可收集含有Fab片段之合適部分且藉由膜過濾以及類似技術濃縮。用於分離抗體之活性片段的通用技術之另外描述參見例如Khaw,B.A.等人,J.Nucl.Med.23:1011-1019(1982);Rousseaux等人,Methods Enzymology,121:663-69,Academic Press,1986。
「人類化抗體」係指一種類型的經工程改造之抗體,其CDR衍生自非人類供體免疫球蛋白,分子之剩餘免疫球蛋白衍生之部分係衍生自一個(或多個)人類免疫球蛋白。
人類化抗體可進一步係指具有可變區之抗體,在該可變區中其構架區中之一或多者具有人類(或靈長類)胺基酸。另外,構架支援殘基可經更改以保持結合親和力。獲得「人類化抗體」之方法為熟習此項技術者所熟知。(參見例如Queen等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,86:10029-10032(1989),Hodgson等人,Bio/Technoloy,9:421(1991))。
人類化抗體亦可藉由新穎基因工程改造方法獲得,該方法使得能夠在諸如家兔及大型動物中產生親和力成熟的類人多株抗體(http://www.rctech.com/bioventures/therapeutic.php)。
術語「單株抗體」亦在此項技術中眾所周知且係指抗體在實驗室中自單個純系量產且僅識別一個抗原。通常藉由將正常短生命期、抗體產生之B細胞融合至快速生長細胞(諸如癌細胞(有時稱為「永生」細胞)來製成單株抗體。所得雜交細胞或融合瘤快速增加,從而形成產生大量抗體之純系。
術語「抗原」係指可在生物,尤其動物,更特定言之包括人類之哺乳動物中誘導免疫反應的實體或其片段。術語包括負責抗原性或抗原決定子的免疫原及區域。
如本文中所使用,術語「可溶」意謂部分或完全溶解於水溶液中。
亦如本文中所使用,術語「免疫原性」係指針對免疫原性試劑誘發或加強抗體、T細胞及其他反應性免疫細胞之產生且有助於在人體或動物內之免疫反應的物質。
術語「融合瘤」為技術公認的且由一般熟習此項技術者理解為係指藉由融合抗體產生細胞及永生細胞(例如,多發性骨髓瘤細胞)而產生之細胞。此雜交細胞能夠產生抗體之連續供應。融合方法之更詳細描述參見上文「單株抗體」之定義。
在一個實施例中,設想歐比托珠單抗之功能等效物包含歐比托珠單抗自身之恆定重鏈區(例如,SEQ ID NO.5之胺基酸位置120至449),或歐比托珠單抗自身之恆定輕鏈區(例如,SEQ ID NO.6之胺基酸位置116至219),或歐比托珠單抗之恆定重鏈區及輕鏈區兩者。包含於歐比托珠單抗之功能等效物中之恆定重鏈區及/或輕鏈區之胺基酸序列可與歐比托珠單抗自身之恆定重鏈區及/或輕鏈區之胺基酸序列100%一致。然而,其亦可在一定程度上不同與此/此等胺基酸序列。舉例而言,其可與歐比托珠單抗自身之相應胺基酸序列至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少98%、至少99%一致。然而,設想此變體恆定重鏈區及/或輕鏈區仍分別促成歐比托珠單抗及歐比托珠單抗之功能等效物之相關特徵(細節參見上文),尤其如本文中所定義經醣基工程改造之特徵且分別促成如本文中所定義之明顯更高水準的ADCC活性。
最佳地,根據本發明使用之抗體為歐比托珠單抗自身(亦已知為GazyvaTM/GazyvaroTM及GA101;WHO Drug Information 27(1), 2013,90,Recommended INN:List 69)。如所提及,歐比托珠單抗為在此項技術中熟知且例如描述於EP-B1 2380910及WO 2005/044859中。歐比托珠單抗具有以下結構:
重鏈
Figure 107127631-A0305-02-0053-2
輕鏈
Figure 107127631-A0305-02-0053-3
二硫橋鍵位置
22-96 22"-96" 23'-93' 23'''-93''' 139'-199' 139'''-199''' 146-202 146"-202" 219'-222 219'''-222" 228-228" 231-231" 263-323 263"-323" 369-427 369"-427"
醣基化位點
H CH2 N84.4
299,299"(在經二等分非岩藻醣基化寡糖中增濃)
抗體利妥昔單抗(醫療產物名稱:MabThera®;亦稱為Rituxan®)亦在此項技術中已知。其例如描述於EP-B1 1005870中(例如,圖4及圖5)。利妥昔單抗之重鏈之胺基酸序列中為SEQ ID NO.9中所描繪。利妥昔單抗之輕鏈之胺基酸序列為SEQ ID NO.10中所描繪。
根據本發明,熟習此項技術者易於能夠分析與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,病患是否對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之 與CHOP化學療法組合)治療有利地作出反應。特定言之,可在此方面評定治療之臨床結果或臨床終點。可在此方面評定之臨床結果/臨床終點可供熟習此項技術者使用且例如描述於Goede(上述引文)、Owen(Expert Opin.Biol.Ther.12(3),2012,343-51)及Illidge(Expert Opin.Biol.Ther.12(5),2012,543-5)及隨附實例中。
根據本發明的待評定之臨床結果之較佳實例為無進展存活率(PFS)、總存活率(OS)及/或無事件存活率(EFS)。根據本發明的歐比托珠單抗優於利妥昔單抗之優勢亦可基於一或多個臨床終點來測定。大體上,根據本發明,設想術語臨床結果係指治療期間之時間且設想術語臨床終點係指治療結束(或之後)的時間。根據本發明,臨床終點可為主要臨床終點。特定(然而非限制性)臨床結果及臨床終點描述於隨附實例中。
熟習此項技術者易於能夠決定給定臨床結果根據本發明是否經改善,亦即與用利妥昔單抗治療相比是否經改善。舉例而言,「經改善」在此上下文中意謂與由用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)進行類似治療產生的臨床結果相比,臨床結果(由用歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療產生)至少高3%、至少高5%、至少高7%、至少高10%、至少高15%、至少高20%、至少高25%、至少高30%、至少高40%、至少高50%、至少高75%、至少高100%或至少高120%。
評定臨床結果/臨床終點的時間可易於藉由熟習此項技術者來測定。大體上,在兩個治療(歐比托珠單抗治療相較於利妥昔單抗治療)之間的臨床結果/臨床終點之差異變得(明顯)顯而易見時的時間點處進行測 定。在開始治療之後,此時間可例如為至少1個月、至少2個月、至少3個月、至少6個月、至少12個月、至少18個月、至少24個月、至少30個月、至少36個月、至少42個月或至少48個月。
較佳地,根據本發明的待治療之(DLBCL)病患為人類病患/人類。
最佳地,根據本發明的待治療之(DLBCL)病患為1L DLBCL人類病患。此意謂DLBCL病患為先前未經治療之DLBCL病患。
然而,大體上,亦可根據本發明治療其他病患,例如非人類病患,例如寵物(例如,狗、貓、家兔、大鼠或小鼠)、家牛(例如,母牛、豬、綿羊)、馬或小型馬或鳥(例如,雞、火雞、鸚鵡)。亦可根據本發明治療其他溫血動物。
如所提及,在本發明之上下文中,尤其設想與用利妥昔單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療相比,本文中所定義之病患藉由達成經改善臨床結果而對用歐比托珠單抗(特定言之與化學療法組合,更特定言之與CHOP化學療法組合)治療作出反應。
用於本發明之上下文中之抗體(亦即歐比托珠單抗或其功能等效物)可與另外的試劑組合投與。舉例而言,可共投與一或多種額外其他細胞毒性或化學治療劑或增強此類試劑之效果的電離輻射;相應實例參見例如EP-B1 2380910、WO 2005/044859、WO 2015/067586及WO 2016/207312。
術語「與...組合投與」或「共投與(co-administration/co-administering)」、「組合療法」或「組合治療」係指投與如本文中所描述 之抗體及如本文中所描述之其他試劑例如作為獨立調配物/應用(或作為一種單一調配物/應用)。共投與可為同步的或按任一次序依序的,其中較佳在兩種(或所有)活性劑同步發揮其生物活性時存在一時間段。該抗體及該(該等)另外的試劑例如經由連續輸注同時或依序(例如,靜脈內(i.v.))共投與。當兩種治療劑依序共投與時,以兩次獨立投與在同一天投與之劑量或可在第1天及第2天投與之試劑中之一者可在第2天至第7天,較佳在第2天至第4天共投與。因此在一個實施例中,術語「依序」」意謂在給藥第一組分後(約)7天內,較佳在給藥第一組分後(約)4天內;且術語「同時」意謂在相同時間。關於抗體及/或另外的試劑之維持劑量,術語「共投與」意謂若治療週期適合於兩種藥物,例如每週,則維持劑量可同時共投與,或另外的試劑例如每第一至第三天投與且該抗體每週投與。或在一天內或數天依次共投與維持劑量。
除抗體以外,視情況可與其他試劑組合,亦可投與一或多種化學治療劑或靶向療法。
可共投與之此類額外化學治療劑包括(但不限於):抗腫瘤劑,包括烷基化劑,包括氮芥(nitrogen mustard),諸如二氯甲二乙胺、環磷醯胺、異環磷醯胺、美法侖(melphalan)及苯丁酸氮芥;亞硝基脲,諸如卡莫司汀(carmustine)(BCNU)、洛莫司汀(lomustine)(CCNU)及司莫司汀(semustine)(甲基-CCNU);替莫達(Temodal)(TM)(替莫唑胺)、伸乙亞胺/甲基蜜胺(methylmelamine),諸如三乙基蜜胺(thriethylenemelamine)(TEM)、三伸乙基、噻替派(thiophosphoramide/thiotepa)、六甲蜜胺(HMM,hexamethylmelamine/altretamine);磺酸烷基酯,諸如白消安;三嗪,諸 如達卡巴嗪(dacarbazine)(DTIC);抗代謝物,包括葉酸類似物(諸如甲胺喋呤及曲美沙特(trimetrexate))、嘧啶類似物(諸如5-氟尿嘧啶(5FU)、氟去氧尿苷、吉西他濱(gemcitabine)、胞嘧啶阿拉伯糖苷(AraC,阿糖胞苷)、5-氮胞苷、2,2'-二氟去氧胞核)、嘌呤類似物(諸如6-巰基-ρ-嘌呤(6-merca.rho.topurine)、6-硫瓜因(6-thioguamne)、硫唑嘌呤、T-去氧助間型黴素(噴司他丁(pentostatin))、紅羥基壬基腺嘌呤(erythrohydroxynonyladenine)(EHNA)、氟達拉賓磷酸鹽及2-氯去氧腺苷(克拉屈濱(cladribine),2-CdA));天然產物,包括抗有絲分裂藥物(諸如太平洋紫杉醇(paclitaxel))、長春花生物鹼,包括長春鹼(vinblastine)(VLB)、長春新鹼及長春瑞濱(vinorelbine)、克癌易(taxotere)、雌莫司汀(estramustine)及雌莫司汀磷酸鹽;皮波多非諾毒素(pipodophylotoxin),諸如依託泊苷(etoposide)及替尼泊甙(teniposide);抗生素,諸如放線菌素D、柔紅黴素(daunomycin)(紅比黴素(rubidomycin))、小紅莓、米托蒽醌(mitoxantrone)、伊達比星(idarubicin)、博來黴素(bleomycins)、普卡黴素(plicamycin)(光神黴素(mithramycin))、絲裂黴素C及放射菌素;酶類,諸如L-天冬醯胺酶;生物反應改質劑,諸如干擾素-α、IL-2、G-CSF及GM-CSF;混雜試劑,包括鉑配位複合物,諸如奧賽力鉑(oxaliplatin)、順鉑(cisplatin)及卡鉑(carboplatin)、蒽二酮(諸如米托蒽醌)、經取代脲(諸如羥基尿素)、甲基肼衍生物(包括N-甲基肼(MIH)及丙卡巴肼(procarbazine)、腎上腺皮質抑制劑(諸如米托坦(鄰-DDD、對-DDD)及胺麩精(aminoglutethimide));激素及拮抗劑,包括腎上腺皮質類固醇拮抗劑(諸如潑尼松及等效物)、地塞米松及胺麩精;健擇(Gemzar)(TM)(吉西他濱)、孕激素(諸如羥基孕酮己酸鹽、乙酸甲羥助孕酮及乙酸 甲地孕酮);雌激素,諸如己烯雌酚及乙炔基雌二醇等效物;抗雌激素,諸如他莫昔芬(tamoxifen);雄激素,包括睪固酮丙酸鹽及氟甲睾酮/等效物;抗雄激素,諸如氟他胺、促性腺激素釋放荷爾蒙類似物及亮丙立德(leuprolide);以及非類固醇抗雄激素,諸如氟他胺。亦可使靶向表觀遺傳機構之療法與抗原結合蛋白組合,該療法包括(但不限於)組蛋白脫乙醯基酶抑制劑、去甲基劑(例如,維達紮(Vidaza))及轉錄抑制解除(ATRA)療法。在一個實施例中,化學治療劑選自由以下組成之族群:紫杉烷(taxane)(如太平洋紫杉醇(紫杉醇(Taxol))、多西他賽(docetaxel)(克癌易)、經改質太平洋紫杉醇(例如,阿布拉生(Abraxane)及歐帕西(Opaxio))、小紅莓、舒尼替尼(sunitinib)(舒癌特(Sutent))、索拉非尼(sorafenib)(雷沙瓦(Nexavar))及其他多重激酶抑制劑奧沙利鉑(oxaliplatin)、順鉑及卡鉑、依託泊苷、吉西他濱及長春鹼。在一個實施例中,化學治療劑選自由以下組成之族群:紫杉烷(如紫杉醇(太平洋紫杉醇)、多西他賽(克癌易)、經改質太平洋紫杉醇(例如,阿布拉生及歐帕西)。在一個實施例中,額外化學治療劑選自5-氟尿嘧啶(5-FU)、甲醯四氫葉酸(leucovorin)、伊立替康(irinotecan)或奧沙利鉑。在一個實施例中,化學治療劑為5-氟尿嘧啶、甲醯四氫葉酸及伊立替康(FOLFIRI)。在一個實施例中,化學治療劑為5-氟尿嘧啶及奧沙利鉑(FOLFOX)。
在一較佳實施例中,本文中所定義之抗體(亦即歐比托珠單抗及其功能等效物)可與化學療法,例如與CHOP化學療法(更佳)或與CHOP化學療法之變型(如CHOEP化學療法、CHOP-14化學療法或ACVBP化學療法)組合投與(參見例如下文之隨附實例以及EP-B1 2380910、WO 2005/044859及Scott,2014及2015,上述引文)。因此,在 一較佳實施例中,待共投與之額外化學治療劑係選自由以下組成之族群:環磷醯胺、羥基道諾黴素、昂寇維(Oncovein)、潑尼松或潑尼龍(Prednisolone)及視情況選用之依託泊苷。
用於本發明之上下文中之抗體可包含於組合物,特定言之醫藥組合物中。醫藥組合物可包含醫藥學上可接受之載劑。
適合醫藥組合物及醫藥學上可接受之載劑為此項技術中已知的且例如描述於EP-B1 2380910、WO/2005/044859、WO 2015/067586及WO 2016/207312中。
因此,在另一態樣中,設想根據本發明採用視情況與醫藥學上可接受之載劑一起調配的如本文中所定義含有抗體或其抗原結合部分的組合物,例如醫藥組合物。
如本文中所使用,「醫藥學上可接受之載劑」包括生理學上相容之任何及所有適合溶劑、分散介質、包衣、抗細菌劑及抗真菌劑、等張劑及吸收/再吸收延遲劑及類似物。較佳地,醫藥組合物及載劑分別適用於注射或輸注。
醫藥學上可接受之載劑包括用於製備無菌注射溶液或分散液之無菌水性溶液或分散液及無菌散劑。此類介質及藥劑用於醫藥活性物質之用途為此項技術中已知的。除水以外,載劑可為例如等張緩衝鹽水溶液。
設想可接受載劑、賦形劑或穩定劑在所採用之劑量及濃度下對接收者而言為無毒性的且包括緩衝液,諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸;抗氧化劑,包括抗壞血酸及甲硫胺酸;防腐劑(諸如十八烷基二甲基苯甲基氯化銨;氯化六羥季銨;苯紮氯銨、苄索氯銨;酚、丁基或苯 甲醇;對羥苯甲酸烷酯,諸如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯;兒茶酚;間苯二酚;環己醇;3-戊醇;以及間甲酚);低分子量(少於約10個殘基)多肽;蛋白質,諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白;親水性聚合物,諸如聚乙烯吡咯啶酮;胺基酸,諸如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、組胺酸、精胺酸或離胺酸;單醣、雙醣及其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合劑,諸如EDTA;糖,諸如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨糖醇;成鹽相對離子,諸如鈉;金屬錯合物(例如,Zn-蛋白質複合物);及/或非離子界面活性劑,諸如TWEENTM、PLURONICSTM或聚乙二醇(PEG)。
本發明之組合物/抗體可藉由此項技術中已知之多種方法投與。如熟習此項技術者所瞭解,投藥途徑及/或模式將視所要結果而變化。
不論所選擇之投藥途徑,可以適合水合形式及/或本發明之醫藥組合物來使用的本發明化合物係藉由熟習此項技術者已知之習知方法調配成醫藥學上可接受之劑型。
亦可根據本發明採用的經適當調適之例示性抗體調配物描述於WO98/56418中此公開案描述一種在2-8℃下具有最少兩年儲存存放期的液體多劑量調配物,其包含40mg/mL抗體、25mM乙酸鹽、150mM海藻糖、0.9%苯甲醇、0.02%聚山梨醇酯20,pH 5.0。另一種抗體調配物包含含10mg/mL抗體之9.0mg/mL氯化鈉、7.35mg/mL檸檬酸鈉二水合物、0.7mg/mL聚山梨醇酯80及無菌水,以用於注射,pH 6.5。
本發明之醫藥組合物中活性成分之實際劑量含量可變化,以獲得針對特定病患、組合物及投藥模式有效地達成所需治療反應而對病 患無毒性的活性成分之量。所選劑量含量將視多種藥物動力學因素而定,該等因素包括所採用之本發明之特定組合物、或其酯、鹽或醯胺之活性;投藥途徑;投藥時間;待採用之特定化合物之排泄速率;與所採用特定組合物組合之其他藥物、化合物及/或材料;待治療病患之年齡、性別、體重、病狀、一般健康狀況及先前病史;及醫學技術中熟知之類似因素。
當應用至例如DLBCL及本文中所定義之病患時,術語「一種治療...之方法」或其等效物分別係指例如經設計以減小或消除病患之DLBCL腫瘤細胞之數目或緩解DLBCL腫瘤之症狀的作用之程序或時程。然而,「一種治療DLBCL之方法」可能未必意謂DLBCL腫瘤細胞將實際上經消除,細胞之數目將實際上減少,或DLBCL腫瘤之症狀將實際上經緩解。通常,一種治療DLBCL之方法將即使在低成功可能性之情況下進行,但鑒於病患之病史及所估計存活預期,仍然將該方法視為誘導整體有益的作用時程,尤其與利妥昔單抗治療相比。
不言而喻,以「治療有效量」(或簡單地「有效量」)向病患投與抗體,該量為將引發研究人員、獸醫、醫學醫生或其他臨床醫生所探尋之組織、系統、動物或人類之生物或醫學反應的各別化合物或組合的量。
投與(共投與)之劑量及投與(共投與)之時機將視進行治療之病患之類型(種族、性別、年齡、體重等)及病況及進行治療之疾病或病況之嚴重度而定。抗體以及視情況選用之另一種試劑適合一次性或歷經一系列治療例如在同一天或之後一天投與(共投與)至病患。
視疾病之類型及嚴重度而定,約0.1mg/kg至50mg/kg(例如,0.1-20mg/kg)的本文中所定義之抗體為共投與至病患的初始候選劑 量。
歐比托珠單抗/歐比托珠單抗之功能等效物(更特定言之,G-CHOP)的投藥方案(包括投藥途徑及劑量)之特定然而非限制性實例描述於隨附實例中且由隨附實例提供(特定言之實例1及實例2,其詳細描述GOYA研究之情形下應用之研究設計及治療)。視需要,熟習此項技術者易於能夠將G投藥方案之此實例調整為根據本發明可為合適的任何其他G投藥方案。
根據本發明分別採用之抗體及醫藥組合物可與指令手冊或指令小冊一起提供。指令手冊/小冊可包含熟習此項技術者/主治醫師如何根據本發明治療本文中所定義之DLBCL及病患的指南。舉例而言,指令手冊/小冊可包含關於本文描述之投藥模式/投藥療程(例如,投藥途徑、給藥方案、投藥時間、投藥頻率)的指南。特定言之,指令手冊/小冊可包含關於待治療之病患,亦即本文中所定義之病患的資訊。大體上,本文中其他地方關於歐比托珠單抗、待治療之病患、投藥模式/投藥療程(包括劑量等)等描述的內容可包含於指令手冊/小冊中。
在本發明之上下文中待採用之一較佳樣品衍生自病患之腫瘤組織(例如,作為活檢體)。舉例而言,可採用福馬林非揮發性或較佳地及石蠟嵌入式腫瘤組織(例如,目標載玻片上之腫瘤組織切片)。然而,亦設想在本發明之上下文中待採用之其他樣品,例如其他組織之切片/活檢體、血液樣品、血清樣品或其他體液樣品,以及類似物。
在本說明書中,引用包括專利/專利申請案之數個文獻。儘管認為與本發明專利性不相關,此等文獻之揭示內容在此以全文引用的方式併入本文中。更特定而言,所有參考文獻均以引用方式併入,其併入程 度如同各個別文獻經特定且個別指示以引用方式併入一般。
本發明亦指下表。
Figure 107127631-A0305-02-0063-4
ABC,經活化B細胞樣(次族群);ECOG PS,東方協作腫瘤學組效能狀態;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍;GCB,生發中心B細胞樣(次族群);IPI,國際預後指數;LDH,乳酸脫氫酶;PET,正電子發射斷層攝影術;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍。
*除非另外規定,否則針對所有參數,對於G-CHOP,n=706,且對於R-CHOP,n=712。
eCRF中勾選『是』之案例針對結外參與;結外位點為0之14位病患被誤勾。
485位病患(G-CHOP,235;R-CHOP,250)之COO亞型分類缺失;包括由於缺乏出口許可可不進行分析的來自中國之樣品--在不久的將來計劃對此等樣品之進行分析。
Figure 107127631-A0305-02-0064-5
Figure 107127631-A0305-02-0065-6
CI,信賴區間;CR,完全反應;DFS,無疾病存活率;EFS,無事件存活率;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍;HR,風險比率;IRC,獨立審查委員會(Independent Review Committee);ORR,整體反應率;OS,總存活率;PET,正電子發射斷層攝影術;PFS,無進展存活率;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍。
*分層因素為國際預後指數得分及經規劃CHOP週期數(6或8)。
根據經修訂反應準則。13
Figure 107127631-A0305-02-0065-7
Figure 107127631-A0305-02-0066-8
AE,不良事件;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍。
*例舉作為較佳術語的在任一族群中之超過一位病患中報導之致命AE為:在G-CHOP族群中,敗血性休克(6[0.9%]病患)、肺炎(5[0.7%])、死亡(原因不明;3[0.4%])、肺栓塞(2[0.3%])及腦血管事故(2[0.3%]);及在R-CHOP族群中,肺炎(6[0.9%])、敗血症(3[0.4%])、腦血管事故(2[0.3%])及死亡(原因不明;2[0.3%])。
Figure 107127631-A0305-02-0066-65
*針對治療隊組、國際預後指數、化學療法週期數(6或8)及地理區域進行調整
CI,信賴區間;EFS,無事件存活率;GCB,生發中心B細胞;HR,風險比率;OS,總存活率;PFS,無進展存活率(研究者評定);yr,年
Figure 107127631-A0305-02-0067-14
G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松。
*包括對輸注之干擾及輸注速率之減緩。
Figure 107127631-A0305-02-0067-11
Figure 107127631-A0305-02-0068-13
AE,不良事件;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍;R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍。
Figure 107127631-A0305-02-0068-15
Figure 107127631-A0305-02-0069-16
AE,不良事件;G-CHOP,歐比托珠單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍;HBV,B型肝炎感染;MedDRA,調節活性之醫學詞典(Medical Dictionary for Regulatory Activities);R-CHOP,利妥昔單抗加環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松/潑尼龍。
*系統器官類別感染及傳染中之任何較佳術語。
標準化MedDRA查詢。
報導為AE之嗜中性白細胞減少症及相關聯併發症,不包括異常實驗值。
§與任何輸注治療相關且在24小時輸注期間/內發生。
系統器官類別心臟病症中之任何較佳術語。
**在第一研究藥物攝入後6個月開始的系統器官類別腫瘤良性、惡性及未指定(包括包囊及息肉)中之任何較佳術語。
††
Figure 107127631-A0305-02-0069-107
100IU/ml之HBV DNA水準之增加或B型肝炎再活化之AE中的至少一者。
‡‡標準化MedDRA查詢,包含穿孔事件(系統器官類別腸胃病症中之較佳術語)及膿腫及其他事件(其他系統器官類別中之較佳術語)。
§§標準化MedDRA查詢,包含出血性腦血管病況,及出血(實驗室及非實驗室術語)。
實例1-通用材料及方法 NanoString LST分析之描述
若沒有相反的說明,則根據經銷商之手冊(NanoString技術股份有限公司,西雅圖,華盛頓州,美國)在本發明之上下文中進行NanoString LST分析。分析之另外的指南係提供於Scott(2014及2015上述引文)中。
COO分析之綜述
NanoString LST基因表現分析經發展以使得能夠在nCounter®分析系統上鑑別COO亞型。nCounter®基因表現分析併與NanoString技術一起提供一種用於偵測mRNA之超靈敏及高度多工方法,該方法係利用稱為nCounter報導子探針之分子條碼且無需使用反轉錄或擴增(Geissloc引文)。mRNA之偵測係基於數位偵測及經由使用彩色編碼探針對的靶標分子之直接分子條碼。探針對係由報導子探針(其在其5'端上攜帶信號)及捕獲探針組成。彩色碼攜載六個位置且各位置可為四種顏色中之一者,因此允許可在單個孔中混合在一起以用於直接與靶標雜交,但在資料收集期間仍然係單獨地解析及鑑別的大量不同的標記。NanoString報導子及捕獲探針技術採用攜載彩色編碼條碼的報導子探針及允許複合物經固定以用於資料收集的捕獲探針。
將定製LST探針對與大量過量樣品RNA混合以靶向mRNA,以確保各靶標找到探針對。在雜交之後,洗滌掉過量未結合探針,且將靶標/探針複合物固定於料匣中以用於資料收集。資料收集在nCounter®數位分析器中進行。數位圖像經處理且條碼計數以逗號間隔開之值(CSV)格式列表,準備用於樣品標準化及資料分析。
在資料分析之前,將各樣品標準化為自合成RNA參考對照轉錄物及管家基因產生的參考計數。
病患樣品中COO狀態之測定
LST分析針對各病患產生20個基因之基因表現資料(參見表5)。五個此等基因為管家參考基因,而15個其他基因區分GCB與ABC,特定而言已知八個基因將在ABC樣DLBCL中過度表現,且已知七個基因將在GCB樣DLBCL中過度表現(基於Scott 2014上述引文)。
Figure 107127631-A0305-02-0071-64
基於基因表現資料針對各病患計算線性預測值得分(LPS)。LPS為LST分析中20個基因之基因表現之加權和:LPS(X)=Σ j a j X j ,其中X j 為基因j之基因表現且a j 為基因j之係數。
接著將各病患之LPS對照預定義臨限值進行比較以測定病患之DLBCL COO亞型。對於個別LPS得分,關於腫瘤是否有可能為ABC亞型或GCB亞型之部分來測定機率。將為ABC之機率大於90%的腫瘤視為ABC,而將為GCB之機率大於90%的彼等視為GCB。將為ABC或為GCB之機率小於90%的腫瘤視為類別不明(Scott 2014及2015上述引文)。
G-CHOP及R-CHOP療程
病患將接受用兩個免疫化學療法療程中之一者治療:
˙G-CHOP(研究性隊組):與歐比托珠單抗組合之CHOP化學療法
˙R-CHOP(對照隊組):與利妥昔單抗組合之CHOP化學療法
出於此方案之目的將歐比托珠單抗及利妥昔單抗視為研究性醫藥產物。
在研究性隊組中,歐比托珠單抗將藉由IV灌注以1000mg之絕對(平緩)劑量在8個週期之各21天週期之第1天投與。在第1週期期間,歐比托珠單抗將亦在第8天及第15天輸注。在給與歐比托珠單抗及CHOP兩者當日,應在化學療法投藥開始前至少30分鐘完成歐比托珠單抗之投藥。
若歐比托珠單抗輸注之持續時間使次日CHOP輸注之投藥成為必要,則可在歐比托珠單抗投藥後次日給與CHOP化學療法。CHOP化學療法將給與最大6或8個週期,如章節4.5.3.a及表5中所描述。若投藥僅6個週期之CHOP化學療法(參見表5),則週期7及8之歐比托珠單抗將在每21天時間表作為單藥療法給與。
在研究之對照隊組中,呈375mg/m2劑量之利妥昔單抗將藉由IV灌注在8個週期之各21天週期之第1天投與。利妥昔單抗將在CHOP之前投與,且應在開始CHOP前至少30分鐘完成輸注並觀測病患。若利妥昔單抗輸注之持續時間使次日CHOP輸注之投藥成為必要,則可在第2天給與CHOP。若投藥僅6個週期之CHOP化學療法(參見表5),則週期7及8之利妥昔單抗將在每21天時間表作為單藥療法給與。
應基於病患之體重在篩檢評定下計算利妥昔單抗及化學療法之劑量(第14天至第1天)。對於所有後續劑量根據篩檢體重>10%的變 化,應相應地修改利妥昔單抗及化學療法之劑量。將觸發劑量調節之重量視為未來劑量調節之新參考重量。
如章節3.6.1.c中所述,根據ASCO、EORTC及ESMO指南,對於
Figure 107127631-A0305-02-0073-108
60歲之病患及具有共同合併症之彼等推薦使用G-CSF。其對於用G-CHOP治療之所有病患在第1週期中經強烈推薦。
歐比托珠單抗(技術資料) a 調配
歐比托珠單抗以單個劑量、無菌液體調配物形式提供於含有額定1000mg歐比托珠單抗的50mL醫藥級玻璃瓶中(G3材料)。經調配藥物產物由組胺酸、海藻糖及泊洛沙姆188調配之25mg/mL原料藥(G3)組成。小瓶含有41mL(伴有2.5%超灌)。
對於另外細節,參見歐比托珠單抗研究者手冊。
b 操縱及儲存
歐比托珠單抗藥物產物之所推薦儲存條件為在2℃與8℃之間避光。含歐比托珠單抗稀釋液之0.9%氯化鈉(NaCl)的化學及物理使用穩定性在2℃-8℃下及在環境溫度及環境室內照明下證實24小時。應緊接著使用經製備稀釋產物。若未緊接著使用,則使用之前的使用儲存時間及條件為使用者的責任且正常將在2℃-8℃下不長於24小時。不應凍結或搖晃歐比托珠單抗。輕緩地混合。所有轉移程序需要嚴格遵守無菌技術。由於潛在吸收,不使用額外串聯過濾器。
對於另外細節,參見歐比托珠單抗研究者手冊。
c 歐比托珠單抗劑量及時間表
歐比托珠單抗將藉由IV灌注以1000mg之絕對(平緩)劑量在8個週期之各21天週期之第1天投與。歐比托珠單抗將在CHOP之前投與,且應在開始CHOP前30分鐘觀測病患。若由於歐比托珠單抗療法之長持續時間未在第1天完成CHOP,則可在第2天投藥CHOP化學療法。在第1週期期間,歐比托珠單抗將亦在第8天及第15天輸注。若未在週期7及8給與CHOP化學療法,則歐比托珠單抗將作為單藥療法投與。
d 歐比托珠單抗製備
意圖用於IV灌注的歐比托珠單抗藥物產物藉由將藥物產物稀釋至含有0.9% NaCl之輸液袋中至4mg/mL之最終藥物濃度來製備。使用含有0.9% NaCl之250mL輸液袋,撤回且捨棄40mL之氯化鈉。自單個玻璃瓶撤回40mL之歐比托珠單抗且注射至輸液袋中(捨棄靜置於小瓶中之歐比托珠單抗之任何未使用部分)。輕緩地倒置輸液袋以混合溶液;不振盪。
以聚氯乙烯(PVC)、聚氨酯(PUR)或聚乙烯作為產物接觸面的投藥設置及以聚烯烴、聚丙烯(PP)、PVC或聚乙烯作為產物接觸面的IV袋為相容的,且可使用。
不使用超過壓印於紙箱上之過期日期的歐比托珠單抗。
e 歐比托珠單抗投藥
歐比托珠單抗應在臨床配置(住院病人或門診)中投與至病患,其中完整緊急復蘇機構為緊接著可用的且病患始終應在研究者之緊密監督下。不 以IV推注或快速注射方式投藥。在第一次輸注結束之後,IV線或中樞靜脈導液管應原地保留
Figure 107127631-A0305-02-0075-109
2小時以便能夠視需要投與IV藥物。若2小時之後未出現不良事件,則可移除IV線或可去接入中樞靜脈導液管。對於後續輸注,接入(經由IV線或中樞靜脈導液管)應自輸注結束原地保留至少1小時,且若1小時之後未出現不利事件,則可移除IV接入。
在投與歐比托珠單抗之前,請參考章節4.3.5,通用注意事項(關於預先藥物治療之用途及腫瘤裂解症候群之防治的指南)。歐比托珠單抗之第一次及後續輸注之指令呈現於表1中。
Figure 107127631-A0305-02-0075-20
歐比托珠單抗應以緩慢IV灌注形式經由專用線路給與。應使用IV灌注泵以控制歐比托珠單抗之輸注速率。不以IV推注或快速注射形式投藥。
在給與歐比托珠單抗及CHOP兩者當日,歐比托珠單抗將在CHOP之前投與且應在開始CHOP前30分鐘觀測病患。若CHOP化學療法不可在與歐比托珠單抗投藥相同的一天給與,則可次日投與CHOP化學 療法。在與CHOP組合給與的各歐比托珠單抗輸注之前(週期1-6或週期1-8之第1天),病患應服用針對CHOP療程之各週期指定的第1天劑量之口服潑尼松(100mg)。若研究者認為合適,則亦可針對認為處於IRR之高風險下的病患考慮皮質類固醇(例如,100mg IV潑尼龍或等效物)之防治性用途,且應亦在歐比托珠單抗輸注之前投藥。
對於IRR及全身性過敏反應之處理,參見章節4.3.6.a及表3。
CHOP化學療法
將CHOP視為治療DLBCL的標準療法。藉由中心選擇,將在研究開始之前選取位點,無論其將投與8週期或6週期之CHOP化學療法。
a 劑量及投藥
CHOP化學療法由IV環磷醯胺、IV小紅莓、藉由IV推注投與之長春新鹼及口服潑尼松或潑尼龍組成。標準CHOP將投與六至八個21天週期。週期7及8之CHOP化學療法將根據針對6個相較於8個經規劃週期之中心預期選擇投藥。
˙在第1天經靜脈內投與之環磷醯胺750mg/m2
˙在第1天經靜脈內投與之小紅莓50mg/m2
˙在2.0mg之所推薦上限下在第1天藉由IV推注投與之長春新鹼1.4mg/m2
˙在第1-5天經口(PO)之潑尼松100mg/天
注意:潑尼松之劑量遵循國立綜合癌症網路之建議(National Comprehensive Cancer Network's recommendations)(2010),其基於Cruzman等人1999;Hiddemann等人2005。在潑尼松不可用或不為精選療法之國家中潑尼松可經潑尼龍置換(1:1轉換,100mg)或其在不能獲取潑尼松/潑尼龍之國家或場所中可經80mg甲基潑尼龍置換。
CHOP將根據標準製備及輸注程序在各研究性位點處且在利妥昔單抗或歐比托珠單抗輸注之後投藥。對於製備、投藥及儲存指南,參看特定的封裝插頁。由研究者酌情處理,長春新鹼之劑量可在2mg處封端。對於
Figure 107127631-A0305-02-0077-110
70歲之病患,長春新鹼之劑量可在1.5mg處封端。按照機構標準BSA可在2m2處封端。
當歐比托珠單抗或利妥昔單抗及CHOP計劃在同一天投與時,推薦在歐比托珠單抗或利妥昔單抗輸注之前給與潑尼松(100mg)。歐比托珠單抗或利妥昔單抗投藥應在投藥CHOP(環磷醯胺、長春新鹼及阿德力黴素)輸注前至少30分鐘完成。若其為研究者或位點之較強偏好(例如,出於邏輯原因),則在預先藥物治療之情況下投藥CHOP前一天允許利妥昔單抗或歐比托珠單抗之投藥(定義於章節4.3.5中)。若病患處於IRR之增加的風險下(高腫瘤負荷、高周邊淋巴細胞計數),則亦允許在2天內分流抗體(利妥昔單抗或歐比托珠單抗)輸注。同樣,在歐比托珠單抗或利妥昔單抗輸注期間經歷不良事件的病患中,視需要可在第二天繼續歐比托珠單抗之投藥。若歐比托珠單抗之週期1第1天劑量經分流,則兩個輸注必須在合適預先藥物治療之情況下且在第一次輸注速率下發生(請參見表2)。若CHOP比週期之第1天稍晚開始,則下一週期之經規劃第1天應自實際上開始CHOP之當日計算,以便維持21天之常規化學療法時間間隔。
實例2-先前未經治療DLBCL中之歐比托珠單抗或利妥昔單抗(加CHOP)(Roche GOYA(B021005)臨床階段3研究之描述) 病患
符合條件的病患年齡
Figure 107127631-A0305-02-0078-111
18歲,具有以下:先前未經治療、組織學記載之CD20陽性DLBCL(如藉由本地病理學實驗室所評定);
Figure 107127631-A0305-02-0078-112
1二維上可量測病變(在電腦斷層掃描[CT]掃描上>1.5cm之最大尺寸);0-2之東方協作腫瘤學組效能狀態;適當血液學、肝及腎功能;左心室射血分數
Figure 107127631-A0305-02-0078-113
50%;以及
Figure 107127631-A0305-02-0078-114
2之國際預後指數(IPI)得分(及年齡
Figure 107127631-A0305-02-0078-115
60歲IPI得分為1、有或無大型疾病之病患,及IPI得分為0及具有大型疾病(亦即一個病變
Figure 107127631-A0305-02-0078-116
7.5cm)之病患)。以下詳述完整納入/排除準則。所有病患提供書面知情同意書。
完整納入/排除準則
病患必須符合以下準則以用於研究登記:
1.書面知情同意書。
2.使用以下的組織學上記載之先前未經治療之CD20陽性瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL):
a.病理學報導必須可供審查且發送組織塊以供回溯性中央確認。
b.福馬林非揮發性石蠟嵌入式組織塊為較佳的;然而,在使用不同固定液之國家中,可用之任何組織塊將為認可的且包括固定液類型之標號。
c.若組織塊不可用,則15個未染色切片(厚度為3-5μm)將為認可的。
d.視情況選用之Roche臨床儲存庫樣品及所需探索性生物標記樣 品將獲自同一組織塊。若不能夠對所材料進行中央確認,則亦可需要用於診斷之經染色切片。
3.國際預後指數(IPI)疾病風險族群中之病患,該國際預後指數疾病風險族群為以下中之一者:高、高-中或低-中。
a.低風險族群中之病患為符合條件的但必須具有1之IPI得分,無關於大型疾病,或0之IPI得分,具有大型疾病,定義為一個病變
Figure 107127631-A0305-02-0079-117
7.5cm。
b.注意:無無大型疾病的僅由於年齡(亦即,病患>60歲,不具有其他風險因素)IPI為1之病患對於對於此試驗為不符合條件的。
4.在電腦斷層掃描掃描上至少一個二維上可量測病變定義為其最大尺寸>1.5cm。
5.遵守研究方案程序之能力及意願。
6.年齡
Figure 107127631-A0305-02-0079-118
18年。
7.東方協作腫瘤學組效能狀態為0、1或2。
8.在心肌多閘控採集掃描或心肌心動回聲圖上左心室射血分數
Figure 107127631-A0305-02-0079-119
50%。
9.定義如下之適當血液學功能(除非由於潛在的疾病,如受到大量骨髓波及所造成,或由於由研究者認為係受到繼發於DLBCL之脾波及的脾功能亢進症):a.血紅蛋白
Figure 107127631-A0305-02-0079-120
9g/dl;b.絕對嗜中性白血球計數
Figure 107127631-A0305-02-0079-121
1.5×109/l;c.血小板計數
Figure 107127631-A0305-02-0079-122
75×109/l。
10.對於不以手術方式不育的男性:同意在治療階段期間使用屏障 避孕方法且直至最後一劑歐比托珠單抗或利妥昔單抗後
Figure 107127631-A0305-02-0080-123
3個月,或根據CHOP化學療法之機構指南,以更長者為準,且同意要求其之伴侶使用額外避孕方法,諸如口服避孕藥、子宮內裝置、障壁方法或殺精果凍。
11.對於不以手術方式不育的生殖潛能之女性:同意在治療階段期間使用兩種適當的避孕方法,諸如口服避孕藥、子宮內裝置或與殺精果凍結合之屏障避孕方法,直至最後一劑歐比托珠單抗或利妥昔單抗後
Figure 107127631-A0305-02-0080-124
12個月,或根據CHOP化學療法之機構指南,以更長者為準。
滿足以下準則中之任一者的病患自研究登記排除:
1.對人類化或鼠類單株抗體的重度過敏性或過敏性反應的病史,或對鼠類產物或對CHOP或歐比托珠單抗之任何組分的已知敏感性或過敏的病史。
2.對CHOP之個別組分中之任一者的禁忌,包括預先接收蒽環黴素。
3.具有經轉化淋巴瘤之病患及具有3b期濾泡性淋巴瘤之病患。
4. DLBCL之先前療法,除結活檢體或局部照射之外。
5.對於另一病況(例如,類風濕性關節炎)用細胞毒性藥物或利妥昔單抗進行預先治療或預先使用抗CD20抗體。
6.在開始週期1之3個月之內預先使用任何單株抗體。
7.出於除淋巴瘤症狀控制以外的目的,皮質類固醇使用>30mg/天之潑尼松或等效物。
a.接收用
Figure 107127631-A0305-02-0080-125
30mg/天潑尼松或等效物進行皮質類固醇治療的病患必須在隨機分組之前記載為至少4週持續時間的穩定劑量(週期1,第1天)。
b.若糖皮質激素治療在開始研究治療之前為淋巴瘤症狀控制迫切 地所需,則可給與最多5天的潑尼松100mg或等效物,但必須在開始糖皮質激素治療之前完成所有腫瘤評定。
8.原發性中樞神經系統(CNS)淋巴瘤及繼發性CNS波及的淋巴瘤、套細胞淋巴瘤,或轉化為伯基特淋巴瘤、原發性縱隔DLBCL、原發性滲出性淋巴瘤、漿母細胞淋巴瘤及原發性皮膚DLBCL的組織學跡象。
9.在隨機分組之前28天內用活毒疫苗進行疫苗接種。
10.在開始週期1之前28天內的任何研究性療法。
11.可影響與方案之遵從性或結果解釋的其他惡性疾病之病史。
a.在研究之前的任何時間處具有治療性治療之基底或鱗狀細胞癌或皮膚黑素瘤或原位子宮頸癌之病史的病患為符合條件的。
b.在參與之前具有在治癒性意圖下已僅用手術治療之任何其他惡性疾病且惡性疾病已緩解且無需治療
Figure 107127631-A0305-02-0081-126
5年的病患為符合條件的。
12.可影響與方案之遵從性或結果解釋的明顯不受控伴隨疾病之跡象,包括明顯心血管疾病(諸如紐約心臟協會類別III或IV心肌疾病、最後6個月內之心肌梗塞、不穩定心律不劑或不穩定絞痛)或肺部疾病(包括阻塞性肺病及支氣管痙攣病史)。
13.最近大手術(在開始週期1之前4週內),除用於診斷以外。
14.以下異常實驗值中之任一者(除非此等異常中之任一者由潛在淋巴瘤所致):
a.肌酐>正常值上限之1.5倍(ULN;除非肌酐清除正常),或所計算肌酐清除<40ml/min(使用Cockcroft-Gault公式)。
b.天冬胺酸胺基轉移酶或丙胺酸胺基轉移酶>ULN之2.5×。
c.總膽紅素
Figure 107127631-A0305-02-0081-127
ULN之1.5×:若總膽紅素
Figure 107127631-A0305-02-0081-128
ULN之3.0×,則具有所 記載Gilbert疾病的病患可參與。
d.無治療性抗凝存在下,國際標準化比值>ULN之1.5×。
e.無狼瘡抗凝血劑存在下,部分凝血活酶時間或活化部分凝血活酶時間>ULN之1.5×。
15.在開始週期1之前4週內,已知活性細菌、病毒、真菌、分支桿菌、寄生或其他感染(不包括甲床之真菌感染)或需要用靜脈內抗生素或住院治療的任何重大發作事件(與抗生素療程之完成相關,除非腫瘤發熱)。
16.具有疑似活性或潛伏肺結核之病患。
a.潛伏肺結核需要藉由陽性干擾素-γ釋放分析來確認。
17.慢性B型肝炎感染之之陽性測試結果(定義為陽性HBsAg血清學)。
a.若HBV DNA為不可偵測的,則可包括具有隱性或先前B型肝炎感染(定義為陽性總B型肝炎核抗體及陰性HBsAg)之病患。此等病患必須願意每月經歷DNA測試。
18. C型肝炎之陽性測試結果(HCV抗體血清學測試)。
a.僅在聚合酶鏈反應對於HCV RNA為陰性時,HCV抗體陽性的病患為符合條件的。
19. HIV血清反應呈陽性狀態之已知病史。
a.對於具有未知HIV狀態之病患,在本地法規要求,將在篩選時進行HIV測試。
20.人類T-淋巴1病毒(HTLV)之陽性結果。
a.在流行病國家(日本及馬來西亞,及加勒比海盆地之國家、南美、中美及撒哈拉沙漠以南非洲)之場所處病患需要進行HTLV測試。
21.具有經確認進展型多病灶腦白質病之病史的病患。
22.懷孕或泌乳。
23.壽命預期<12個月。
研究設計及治療
GOYA為多中心、開放標記、隨機分組、階段3研究。將病患隨機分組(1:1比率)以接受八個21天週期之G(在週期1之第1天、第8天及第15天及在週期2-8之第1天,1000mg靜脈內[IV])或R(在上週期1-8之第1天,375mg/m2 IV)加6或8個週期的呈以下劑量之CHOP:環磷醯胺750mg/m2 IV(第1天);小紅莓50mg/m2 IV(第1天);長春新鹼1.4mg/m2 IV(第1天,最多2.0mg);以及潑尼松100mg/天經口(第1-5天)。兩個隊組之CHOP週期數提前與各研究場所商定;若僅投藥6個CHOP週期,則抗體在週期7-8期間作為單藥療法投藥。在最後抗體週期之第1天之8週內且在治療結束評定完成後,准許在大型或結外疾病之初始位點處進行預規劃放射治療。預先藥物治療之細節、准許之伴隨療法及劑量延遲/減少之准許原因在補充附錄中給出。隨機分組係經由交互式語音應答系統進行,其中根據所規劃化學療法週期數(6/8週期之CHOP)、IPI得分及地理區域(西歐、東歐、南美及中美、北美及亞洲及其他)進行分層。
GOYA根據歐洲臨床試驗指南(European Clinical Trial Directive)(針對歐洲中心)及優良臨床實驗規範協調指南國際會議(International Conference on Harmonization guidelines for Good Clinical Practice)來進行。方案經參與中心之倫理學委員會批准且登記在ClinicalTrials.gov處(NCT01287741)。
預先藥物治療、劑量更改及准許之療法
所有病患在投藥歐比托珠單抗(G)或利妥昔單抗(R)之前接受用口服乙醯胺苯酚及抗組胺劑進行預先藥物治療。推薦環磷醯胺、小紅莓、長春新鹼及潑尼松(CHOP)投藥在投藥G或R後至少30分鐘開始。在CHOP給與G或R時的各週期中,在抗體輸注之前投與口服潑尼松之第1天劑量。額外糖皮質激素療法亦可向認為處於輸注相關反應之高風險下之病患投與。對於具有高腫瘤負荷及認為處於腫瘤裂解風險下之病患推薦腫瘤裂解防治(適當水合作用及安樂普利諾(allopurinol))。在級別3或4血液學毒性或級別2-4非血液學毒性之情況下治療劑量延遲至多2週;若未分解毒性,則自研究治療撤回病患。劑量減少為化學療法所允許,但不為G或R所允許。
針對年齡
Figure 107127631-A0305-02-0084-129
60歲及/或具有共同合併症之病患且在週期1期間對於G-CHOP隊組中之所有病患推薦用G-CSF進行防治。針對嗜中性白細胞減少症之治療亦准許G-CSF。禁止使用意圖用於治療淋巴瘤的化學療法(除CHOP以外)、免疫療法、激素療法(除避孕藥、激素替代療法或乙酸甲地孕酮以外)及任何療法(對於放射療法,參見正文)。
研究終點及評定
主要研究終點為研究者評定之無進展存活率(PFS),定義為自隨機分組之日期直至疾病進展之第一次出現、復發或任何原因之死亡的時間。為排除偏差且支援主要分析,亦藉由獨立檢查委員會(IRC)來評定PFS。次要終點包括總存活率(OS)、無事件存活率(EFS)、CR速率、整體反應率(ORR,包括CR及部分反應)、無病存活率(DFS)、反應持續時間、達至下 一抗淋巴瘤治療(TTNT)之時間及安全性。亦在DLBCL原始細胞(COO)次族群(生發中心B細胞樣[GCB],經活化B細胞樣[ABC]及類別不明;探索性分析)中分析PFS。COO分類係基於使用NanoString研究僅使用淋巴瘤分型測試的基因表現圖(NanoString技術股份有限公司,西雅圖,華盛頓州,美國)。
根據惡性淋巴瘤之經修訂反應準則,藉由研究者使用常規臨床及實驗室檢查及CT掃描來評定腫瘤反應及進展(Cheson,J Clin Oncol 25,2007,579-586)。對於具有18F氟脫氧葡糖正電子發射斷層攝影術(FDG-PET)掃描(必須在具有PET掃描器之場所處)的彼等病患,結合FDG-PET結果進行單獨的反應評定。主要端點分析係基於對使用習知CT掃描的所有病患之評定。反應在最後研究治療之後評估4-8週(CT)或6-8週(FDG-PET),或在更早停止之情況下,評估更快。
藉由監測及記錄所有不良事件(AE)及嚴重AE(SAE)來評定安全性,包括自實驗室評估、生命徵象量測及物理檢驗鑑別出之異常。AE使用國家癌症研究所不良事件常見術語準則v4.0進行分級。實驗室安全性評定包括常規血液學及血液化學,及免疫參數測試。獨立資料監測委員會(IDMC)進行週期安全性審查。
統計分析
樣品大小經計算以允許偵測G-CHOP相較於R-CHOP的疾病進展、復發或死亡之風險降低25%(亦即,G-CHOP優於R-CHOP之PFS風險比率[HR]為0.75),雙側α水準為0.05及80%檢驗效能。為實現此且允許5%之年度丟棄速率,405個PFS事件為主要分析所需,從而需要在3年內登記 1,400位病患。
對意願治療(ITT)群體(包含所有隨機分組之病患)進行功效評定。安全性分析群體包括接受任何研究藥物(抗體或CHOP)之所有病患。使用雙側水準0.05分層之對數秩測試來進行PFS之治療比較。卡本-麥爾方法用於估計各治療隊組之PFS分佈。使用分層Cox比例風險分析,包括95%信賴區間(CI),將治療效果之估計表述為HR。
IDMC評估三次正式中期分析下的功效及安全性;兩次無效且一次有效。預規劃次族群分析評定經選擇基線病患特徵(包括COO亞型)對PFS之影響。
結果 綜述
在29個月的中位觀測之後,研究者評定之PFS事件之數目與G(201,28.5%)及R(215,30.2%)類似,分層風險比率為0.92(95%信賴區間,0.76至1.11;P=0.39);3年PFS速率分別為70%及67%。獨立審查之PFS之次要終點、其他事件時間終點及腫瘤反應速率隊組之間類似。在探索性次族群分析中,無關於治療,具有生發中心B細胞樣亞型之病患具有比經活化B細胞樣更佳的PFS。級別3-5不良事件(AE;73.7%相較於64.7%)及嚴重AE(42.6%相較於37.6%)之頻率在G-CHOP之情況下更高。致命AE頻率對於G-CHOP為5.8%且對於R-CHOP為4.3%。最常見AE為嗜中性白細胞減少症(G-CHOP,48.3%;R-CHOP,40.7%)、輸注相關反應(36.1%;23.5%)、噁心(29.4%;28.3%)及便秘(23.4%;24.5%)。
病患特徵及治療
病患在29個國家的207個中心登記。總共1,418位病患在2011年7月與2014年6月之間隨機分組以接受G-CHOP(n=706)或R-CHOP(n=712),且1,188位病患(G-CHOP,587;R-CHOP,601)完成經規劃治療(圖1)。AE為兩個隊組中研究(抗體)治療停止的主要原因,且此在G-CHOP隊組中更頻繁報導。與G-CHOP隊組相比較,由進展型疾病所致的研究(抗體)治療停止在R-CHOP隊組中大約頻繁兩倍。
人口統計及基線疾病特徵在兩個隊組之間很均衡(表1)。COO次族群資訊可供933位病患用;亞型分佈很均衡且COO亞型內隊組之間不存在臨床上相關差異。缺失COO資訊之原因為:妨礙生物標記評定的受限中國樣品出口許可(n=252)、不由中央實驗室確認之CD20陽性之DLBCL(n=102;應注意此等病患在治療隊組之間均衡:G-CHOP,n=53;R-CHOP,n=49),以及缺失/不足的組織(n=131)。
暴露之中位持續時間對於G為25.3(範圍,1-32)週且對於R為25.3(0-32)週。G及R之劑量強度對於分別95.3%及99.1%之病患超過90%。兩個隊組中之大部分病患(>88%)接受超過90%之經規劃劑量的各CHOP組分。抗體劑量延遲在G-CHOP隊組中更常見:至少一次延遲
Figure 107127631-A0305-02-0087-130
7天(G-CHOP,34.9%;R-CHOP,30.0%)及>7天(G-CHOP,13.1%;R-CHOP,9.1%)(表5)。103位病患(G-CHOP,49;R-CHOP,54)在疾病進展之前接受新(未規劃)抗淋巴瘤治療,包括對研究治療完成之後具有殘餘疾病之徵象的23位病患(G-CHOP,9;R-CHOP,14)及疾病進展之後的227位病患(G-CHOP,102;R-CHOP,125)進行放射治療。
功效
截至2016年4月30日且在29個月的中位觀測之後,ITT群體中研究者評定之PFS事件之數目與G-CHOP(201,28.5%)及R-CHOP(215,30.2%)類似,分層HR為0.92(95%CI,0.76至1.11;P=0.3868)。所估計3年PFS速率分別為69.6%及66.9%(圖2A;表2)。
次要終點與主要終點一致,其中對於IRC評定之PFS或任何其他事件時間終點(OS、EFS、DFS及TTNT)在治療隊組之間無臨床上有意義的差異(圖2B,表2,圖13)。
次族群及探索性分析
G-CHOP相較於R-CHOP之功效(研究者評定PFS之未分層HR)在所選擇病患次族群中大體上類似,該等病患次族群包括接受6個週期相較於8週期CHOP的病患(圖3)。
具有不同COO亞型之病患中PFS之卡本-麥爾分析(無關於研究治療)表明GCB亞型與比ABC或類別不明亞型更佳的結果相關聯。PFS之HR對於ABC-GCB比較為1.71(95% CI,1.31至2.23)、對於類別不明GCB比較為1.57(95% CI,1.14至2.15)且對於ABC類別不明比較為1.08(95% CI,0.77至1.52)(圖2C);3年PFS速率對於GCB、ABC及類別不明亞型分別為75%、59%及63%。在研究者評定之PFS的探索性分析中,具有可用COO資料之933位病患的G-CHOP相對於R-CHOP之分層HR為0.82(95% CI,0.64至1.04),表明相較於ITT群體之潛在選擇偏差。GCB COO次族群中540位病患的分層HR為0.72(95%CI,0.51至1.03;3年PFS,79%[G-CHOP]相較於71%[R-CHOP]);治療族群之間的PFS中 無臨床上有意義的差異在具有ABC亞型之243位病患(HR,0.86[95% CI,0.57至1.29];3年PFS,61%相較於58%])或具有類別不明COO亞型之150位病患(HR,1.02[95% CI,0.60至1.75];3年PFS,62%相較於64%];圖14)中發現。
安全性
在安全性群體中,經歷任何級別之至少一個AE的病患之比例在G-CHOP及R-CHOP隊組(分別地,97.0%[683/704]及93.5%[657/703])中類似(表3)。兩個隊組中之最常見AE為嗜中性白細胞減少症(G-CHOP,48.3%;R-CHOP,40.7%)、輸注相關反應(IRR;36.1%;23.5%)、噁心(29.4%;28.3%)及便秘(23.4%;24.5%)(表6)。級別3-5 AE在G-CHOP隊組(73.7%[519/704]相較於64.7%[455/703])中更常見,SAE(42.6%[300/704]相較於37.6%[264/703])亦如此。兩個隊組中之最常見級別3-5 AE為嗜中性白細胞減少症(G-CHOP,46.2%;R-CHOP,38.1%)、感染(19.2%;15.5%)、發熱性嗜中性球減少症(17.5%;15.2%)及白細胞減少症(13.6%;10.1%)(表3)。
尤其受關注之AE分析展示任何級別(以及級別3-5 AE及SAE)之感染、嗜中性白細胞減少症、IRR、心肌事件、血小板減少及出血性事件與R-CHOP相比在G-CHOP之情況下更常見(表7)。值得注意的,B型肝炎再活化之速率與R-CHOP(0.9%)相比在G-CHOP(2.3%)之情況下更高,大部分事件為級別1或2,且級別3或4事件在兩個隊組之間很均衡(G-CHOP 0.3%相較於R-CHOP 0.3%)。尤其受關注之所有其他AE族群,亦即機會性感染、腫瘤裂解症候群、次級惡性病及腸胃穿孔(不包括膿腫) 在兩個隊組中以類似頻率發生(表7)。
各隊組中類似比例之病患在研究期間接受至少一個劑量之G-CSF(G-CHOP,611[86.5%];R-CHOP,586[82.3%])。
與R-CHOP隊組相比G-CHOP隊組中更高比例之病患由於AE(84[11.9%]相較於60[8.5%])停止
Figure 107127631-A0305-02-0090-131
1種組分之研究治療。71位病患經歷致命AE(G-CHOP,5.8%[41/704];R-CHOP,4.3%[30/703])且詳述於表3中。
論述
在具有先前未經治療之DLBCL的病患之當前研究中,G-CHOP及R-CHOP證實所有事件時間終點的類似功效,且不滿足研究者評定之PFS之主要研究終點。具有侵襲性NHL之群體中G-CHOP相對於R-CHOP之優勢缺乏與在CLL及FL中評估G之研究結果形成對比。在GALLIUM研究中,基於G之誘導及維持療法相對於基於R之療法在1,202位先前未經治療之FL病患中明顯改善了研究者評定之PFS(Marcus上述引文)。當兩者在階段3 CLL11研究中與苯丁酸氮芥組合時,G亦相對於R在未經治療之CLL病患(n=663)中延長PFS(Goede上述引文)。
給定基於G之療法在FL及CLL病患中之優點,在GOYA中,G-CHOP在DLBCL病患中之益處缺乏為出人意料的。其可能僅僅由惰性淋巴增生疾病(諸如FL及CLL)與侵襲性疾病(諸如DLBCL)之間的生物及臨床概況中之差異導致(Lenz,N.Engl.J.Med.362,2010,1417-1429;Lim上述引文)。實際上,歐比托珠單抗可能在較少侵襲性之淋巴瘤或如衍生自生發中心之FL中更有益。在GOYA中GCB亞型的G-CHOP優 於R-CHOP之益處的趨勢似乎支援此發現,該GCB亞型衍生自生發中心且已知與其他DLBCL亞型相比更像FL(Morin,Nature 476 2011,298-303;Shaffer,Nat.Rev.Immunol.2,2002,920-932),與ABC及類別不明亞型相比具有更好的預後及不同的免疫微環境。歐比托珠單抗及利妥昔單抗之不同作用模式亦可在FL及DLBCL中以此等試劑之差分益處起作用,然而,仍無資料可供使用以支援此表述。GOYA生物標記資料之持續分析將提供對此等差異之進一步理解。尤其,週期1中之劑量干擾及省略劑量在G-CHOP之情況下更頻繁,反映更高速率之AE(IRR及血球減少症);此可促成與R-CHOP相比較功效益處之缺乏。
由於利妥昔單抗之後結果之顯著改善首先添加至CHOP(Coiffier上述引文),在DLBCL病患之管理中未取得大進展。隨機分組試驗未能展示縮短週期之間的間隔之益處(Cunningham,Lancet 381,2013,1817-1826),或大劑量化學療法及自體幹細胞移植之鞏固(Stiff,N.Engl.J.Med.369,2013,1681-1690;Schmitz,Lancet Oncol 13,2012,1250-1259);將硼替佐米添加至R-CHOP亦未能改善具有非GCB DLBCL之病患之隨機分組試驗之結果(Leonard,Blood 126,2015,811),且用來那度胺(lenalidomide)維持並未改善OS(Thieblemont,Blood 128,2016,471)。假定DLBCL之侵襲性行為,以不同作用模式由新抗CD20抗體取代利妥昔單抗可能不足以克服對化學療法的不應性。藥物共軛抗體或抗BCL2試劑與R-CHOP之組合可保持更多前景,如最近階段1/2研究之初始結果所展示(Zelenetz,Blood 128,2016,3032;Tilly,Blood 128,2016,1853)。
使用基因表現譜測定COO狀態已鑑別出DLBCL之生物不 同亞型,包括GCB及ABC原始亞型(Lenz,Proc Natl Acad Sci USA 105,2008,13520-13525;Scott,J.Clin.Oncol.33,2015,2848-2856)。此等分子亞型對於瘤形成及治療結果具有重要影響,如由其包括於DLBCL之當前世界衛生組織分類中所反映(Swerdlow,Blood 127,2016,2375-2390)。具有GCB亞型之病患通常具有更良好結果,然而ABC亞型在化學療法或免疫化學療法(包括R-CHOP)後與較差結果相關聯,且可表示具有未滿足醫療需求的不良風險子組病患(如回溯性研究中所展示)(Lenz,Proc.Natl.Acad.Sci.USA上述引文;Scott 2015上述引文)。GOYA為分析COO對臨床結果之影響的最有希望的研究。COO亞型之PFS比較與GCB DLBCL中之較佳結果一致,其中HR指示相對於GCB亞型,具有ABC之病患之疾病進展風險之70%增加。類別不明次族群之結果類似於ABC次族群之結果,其與一些先前研究中報導之情況形成對比(Scott 2015上述引文)。有趣的是,COO分類在其他前瞻性地定義之研究中不與ORR及/或PFS之初始評定相關,該等研究諸如REMoDL-B(Davies,Blood 126,2015,812)或PYRAMID(Leonard上述引文),儘管此等研究使用不同COO分析。針對DLBCL之COO亞型的特定治療可提供替代策略以用於改進結果。選擇性地靶向B細胞受體或NF-κB途徑例如可證明在DLBCL亞型(ABC或非GCB)中有益,如由用R-CHOP評估來那度胺或依魯替尼(ibrutinib)之階段2研究的結果所表明(Nowakowski,J Clin Oncol 33,2015,251-257;Vitolo,Lancet Oncol.152014,730-737;Younes,Lancet Oncol 15,2014,1019-1026)。此等策略當前在隨機分組階段3研究中進行評估。
在G-CHOP治療之病患中報導的AE之概況及性質如所預期,無新的安全信號。級別3-5 AE、SAE及由於AE之治療中斷的發生率 在G-CHOP族群中比在R-CHOP族群中略微更高,與其他研究中報導之情況保持一致。此等差異可歸因於G及R之不同結構及生物特性。
總之,當前研究證實與R-CHOP相比較,G-CHOP並不改善具有先前未經治療之DLBCL的大群病患之PFS,其仍為此等病患之標準治療。未鑑別出新的安全信號。
實例3-在DLBCL之新次族群中歐比托珠單抗相比於利妥昔單抗之優勢(預測性生物標記定義;GOYA臨床階段3研究之探索性分析之描述及結果) 實例3.1-Gazyva TM -CHOP在生物標記定義之DLBCL子組中優於利妥昔單抗-CHOP-來自Roche GOYA(BO21005)階段3臨床試驗之結果 概述
利妥昔單抗(R)加CHOP化學療法為先前未經治療之瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)之標準護理。歐比托珠單抗(G)為經醣基工程改造之II型抗CD20單株抗體。GOYA為在先前未經治療之晚期DLBCL中將G-CHOP及R-CHOP進行比較的隨機分組階段3研究。
1L DLBCL中之GOYA試驗並不符合其主要終點:分層HR,PFS:0.92(95% CI 0.76-1.12),但GALLIUM試驗證實在1L FL中Gazyva相對於利妥昔單抗的優勢(HR 0.66,95% CI 0.51-0.85;當前正在申請)。
在GOYA之探索性分析中,GazyvaTM相對於利妥昔單抗之優勢在GCB DLBCL病患之子組中及/或亦在具有CD58突變及/或低CD58表現之病患中發現。此為首次在生物標記定義之DLBCL次族群中鑑別出 Gazyva益處。
結果表明可以若干方式鑑別對Gazyva作出反應之一或多個GCB DLBCL病患子組,該等方式例如藉由測定BCL2易位及BCL2蛋白質過度表現,且亦藉由量測基因表現譜,例如使用線性預測值得分(LPS)之新截止值的Nanostring原始細胞(COO)分析。
方法
將原始細胞(COO)分類為次族群生發中心B細胞(GCB)、經活化B細胞(ABC)及類別不明係基於使用僅用途淋巴瘤分型測試之NanoString研究(NanoString技術股份有限公司,西雅圖,華盛頓州,美國)的基因表現譜。
線性預測值得分(LPS)為在GOYA中範圍介於-1138至4504的連續變量(Nanostring淋巴瘤分型分析中的基因之基因表現之加權平均值)。通常,LPS用於將病患分類為COO次族群GCB、ABC、類別不明。預設COO算法使用貝葉斯方法,其中基於可能性為GCB或ABC(類別不明作為緩衝起作用)的
Figure 107127631-A0305-02-0094-132
90%截止進行GCB/ABC分類。
已首次針對臨床結果直接地分析LPS。將LPS視為用於在GOYA試驗中之探索性未指定分析中評定治療效果(G-CHOP相較於R-CHP之功效)之連續變量。
BCL-2易位使用Bcl-2雙色分裂(Vysis,Abbott Molecular)且亦基礎藥品下一代定序分析FoundationOne Heme來評定。BCL-2蛋白質表現使用Ventana研究用IHC分析(BCL2抗體純系,124)來評定。GOYA試驗中之整個轉錄組基因表現使用TruSeq® RNA存取庫製備型套組來評 估。CD58突變使用FoundationOne heme基因組來鑑別。
結果
經鑑別出相對於R(R-CHOP)受益於G(G-CHOP)的生物標記定義之DLBCL次族群:
˙BCL2易位的病患(參見圖4)
˙BCL2蛋白質表現陽性的病患(參見圖5)
˙為BCL2蛋白質表現陽性的BCL2易位的病患(參見圖6)
˙GCB DLBCL病患之子組。此等可鑑別為:
○藉由線性預測值得分之新截止值將GCB病患進行新次族群分類,分類為新次族群「較強GCB」(LPS<截止值之病患)(參見圖7)
○或具有高BCL2基因表現之GCB病患
○或為BCL2蛋白質表現陽性的GCB病患
○或具有BCL2易位之GCB病患
○或為BCL2蛋白質表現陽性的具有BCL2易位的病患(參見圖8)
˙一般而言,CD58突變型病患,及/或具有低CD58表現之病患(參見圖9)
實例3.2-在新分子FL樣DLBCL次族群中歐比托珠單抗優於利妥昔單抗的優勢-來自階段3 GOYA試驗之結果 方法
GOYA為在1418 DLBCL病患(pts)中將1L G-CHOP與R-CHOP進行比較的開放標記、隨機分組階段3研究。對在治療之前收集之福馬林非揮 發性、石蠟嵌入式腫瘤組織生物標記測試且在中央實驗室中進行回顧性地測試。在933病患中使用僅使用LST之NanoString研究(NanoString技術股份有限公司,西雅圖,華盛頓州,美國)來評定COO。用於分子表徵之額外生物標記分析包括使用FoundationOne® Heme(FOH)組(n=499位病患)進行467個基因之DNA靶向定序且整個轉錄組基因表現在552位病患中使用TruSeq® RNA定序來評估。Vysis LSI雙色分裂FISH探針用於鑑別BCL2易位(n=644位病患;FISH截止值,50%),且Ventana研究用IHC分析用於分析BCL2表現(BCL2抗體純系,124);BCL2+ IHC定義為在
Figure 107127631-A0305-02-0096-133
50%腫瘤細胞中之中度/較強染色。多變量Cox回歸及彈性網懲罰回歸(α=0.5)用於評估生物標記治療效果。另外,進行自助抽樣法模擬以鑑別最佳LPS(NanoString LST)以反映GOYA中觀測到之治療效果之穩定性及對獨立研究群體之治療效果之概化性。多個測試調整藉由使用Benjamini-Hochberg程序估計FDR來完成(有效性,<5% FDR)。路徑增濃分析一超幾何測試進行;藉由使用由MSigDB標誌定義之基因組的基因組增濃及基於最近公開之審查的經驗證FL體細胞突變標誌基因組。所有病患同意生物標記分析。
結果
LPS作為連續變量之評定鑑別出受益於G-CHOP的GCB病患次族群。特定言之,生發中心基因表現譜(藉由LPS)之較強表現與來自GOYA中之病患中相對於R-CHOP用G-CHOP治療的結果益處有關。自助抽樣法模擬鑑別出,預測G-CHOP益處之最佳LPS截止值(
Figure 107127631-A0305-02-0096-134
725)為25%(233/933)之GOYA病患具有最低LPS得分。此等病患被稱為特定『較強GCB』病患, 且在GOYA中包含43%(233/540)之可評估GCB病患。用G-CHOP治療之較強GCB病患就研究者評定之無進展存活率(HR=0.33,p=0.0007)、無事件存活率(HR=0.47,p=0.003)及總存活率(HR=0.41,p=0.019)而言比用R-CHOP治療之彼等實現明顯更佳的臨床結果(參看圖10、圖12;表4)。在多變量分析中,所觀測益處與基線人口資料及疾病特徵無關。安全性與任一療程類似。FOH、TruSeq RNA及BCL2 IHC/FISH GOYA資料用於較強GCB病患之分子表徵。在關於FOH資料之基因組分析中,與其他GCB病患相比較,較強GCB病患針對為FL病患之特徵的突變明顯增濃(『較弱GCB』:FDR,3.54e-9)。特定言之,若干m7-FLIPI基因中之BCL2易位及突變相較於其他DLBCL次族群在較強GCB病患中高度增濃(圖11)。對於中央病理學檢查,較強GCB子組中不存在經轉化惰性NHL的跡象。
結論
藉由分析來自GOYA試驗之資料,鑑別出包含至少大約25%所有DLBCL病患(被稱作『較強GCB』)的新臨床上及以分子形式不同的GCB DLBCL次族群。此不同次族群可藉由基因表現譜(使用例如關於Nanostring LST分析之
Figure 107127631-A0305-02-0097-135
725之LPS截止值)鑑別且其特徵在於亦通常在FL病患中鑑別出之突變(參看Morin上述引文)。用G-CHOP治療在1L DLBCL病患之此新子組中賦予優於R-CHOP的大量臨床益處。
本發明係指以下核苷酸及胺基酸序列:
SEQ ID NO:1:
歐比托珠單抗之重鏈可變區之胺基酸序列。
小鼠-人類嵌合多肽。
Figure 107127631-A0305-02-0098-21
SEQ ID NO:2:
歐比托珠單抗之KV1輕鏈可變區之胺基酸序列
小鼠-人類嵌合多肽
Figure 107127631-A0305-02-0098-22
SEQ ID NO:3:
編碼歐比托珠單抗之重鏈可變區的核酸序列
小鼠-人類嵌合DNA
Figure 107127631-A0305-02-0098-23
SEQ ID NO:4:
編碼歐比托珠單抗之KV1輕鏈可變區的核酸序列
小鼠-人類嵌合DNA。
Figure 107127631-A0305-02-0099-24
SEQ ID NO:5:
歐比托珠單抗之重鏈之胺基酸序列。可變區包含胺基酸位置1至119。
Figure 107127631-A0305-02-0099-25
SEQ ID NO:6:
歐比托珠單抗之KV1輕鏈之胺基酸序列。可變區包含胺基酸位置1至115。
Figure 107127631-A0305-02-0099-26
SEQ ID NO:7:
編碼歐比托珠單抗之重鏈可變區的核酸序列(B-HH6)。
Figure 107127631-A0305-02-0100-27
SEQ ID NO:8:
編碼歐比托珠單抗之KV1輕鏈可變區的核酸序列。
Figure 107127631-A0305-02-0100-28
SEQ ID NO:9:
利妥昔單抗之重鏈之胺基酸序列。
嵌合利妥昔單抗重鏈
Figure 107127631-A0305-02-0100-29
SEQ ID NO:10:
利妥昔單抗之輕鏈之胺基酸序列。
嵌合利妥昔單抗輕鏈
Figure 107127631-A0305-02-0101-30
SEQ ID NO:11:
編碼智人(人類)CD58(變體1)的核苷酸序列之實例。
Figure 107127631-A0305-02-0101-31
SEQ ID NO:12:
智人(人類)CD58(同工型1)之胺基酸序列之實例。
Figure 107127631-A0305-02-0101-32
SEQ ID NO:13:
編碼智人(人類)BCL2(變體α)的核苷酸序列之實例。
Figure 107127631-A0305-02-0101-33
Figure 107127631-A0305-02-0102-34
Figure 107127631-A0305-02-0103-35
SEQ ID NO:14:
智人(人類)BCL2(同工型α)之胺基酸序列之實例。
Figure 107127631-A0305-02-0103-36
<110> 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 美商納諾史特林科技公司
<120> 新穎DLBCL病患次族群之歐比托珠單抗(obinutuzumab)治療
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<151> 2017-08-08
<160> 14
<170> BiSSAP 1.3
<210> 1
<211> 119
<212> PRT
<213>人工序列
<220>
<223>歐比托珠單抗之重鏈可變區:小鼠-人類嵌合多肽
<400> 1
Figure 107127631-A0305-02-0104-37
<210> 2
<211> 115
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 歐比托珠單抗之KV1輕鏈可變區:小鼠-人類嵌合多肽
<400> 2
Figure 107127631-A0305-02-0104-38
Figure 107127631-A0305-02-0105-39
<210> 3
<211> 357
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 編碼歐比托珠單抗之重鏈可變區的核酸序列:小鼠-人類嵌合DNA
<400> 3
Figure 107127631-A0305-02-0105-41
<210> 4
<211> 345
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 編碼歐比托珠單抗之KV1輕鏈可變區的核酸序列:小鼠-人類嵌合DNA
<400> 4
Figure 107127631-A0305-02-0105-42
<210> 5
<211> 449
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 歐比托珠單抗之重鏈
<400> 5
Figure 107127631-A0305-02-0105-43
Figure 107127631-A0305-02-0106-44
<210> 6
<211> 219
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 歐比托珠單抗之KV1輕鏈
<400> 6
Figure 107127631-A0305-02-0106-45
Figure 107127631-A0305-02-0107-46
<210> 7
<211> 357
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 編碼歐比托珠單抗之重鏈可變區的核酸序列(B-HH6)
<400> 7
Figure 107127631-A0305-02-0107-48
<210> 8
<211> 345
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 編碼歐比托珠單抗之KV1輕鏈可變區的核酸序列
<400> 8
Figure 107127631-A0305-02-0107-49
<210> 9
<211> 451
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 利妥昔單抗之重鏈
<400> 9
Figure 107127631-A0305-02-0108-50
<210> 10
<211> 213
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 利妥昔單抗之輕鏈
<400> 10
Figure 107127631-A0305-02-0109-51
<210> 11
<211> 1153
<212> DNA
<213> 智人
<400> 11
Figure 107127631-A0305-02-0109-55
Figure 107127631-A0305-02-0110-56
<210> 12
<211> 250
<212> PRT
<213> 智人
<400> 12
Figure 107127631-A0305-02-0110-57
<210> 13
<211> 6492
<212> DNA
<213> 智人
<400> 13
Figure 107127631-A0305-02-0110-58
Figure 107127631-A0305-02-0111-59
Figure 107127631-A0305-02-0112-60
Figure 107127631-A0305-02-0113-61
Figure 107127631-A0305-02-0114-62
<210> 14
<211> 239
<212> PRT
<213> 智人
<400> 14
Figure 107127631-A0305-02-0114-63

Claims (26)

  1. 一種人類化II型抗CD20抗體的用途,其係用於製備用於治療病患之瀰漫性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的藥物,該病患相較於以利妥昔單抗(rituximab)治療,其以歐比托珠單抗(obinutuzumab)治療會達到經改善臨床結果的反應,其中該人類化II型抗CD20抗體包含:(a)重鏈可變區,其如SEQ ID NO:1中所示或如SEQ ID NO:5中所包含(胺基酸殘基1至119),及輕鏈可變區,其如SEQ ID NO:2中所示或如SEQ ID NO:6中所包含(胺基酸殘基1至115);或(b)重鏈可變區,其由SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:7之核酸序列編碼,及輕鏈可變區,其由SEQ ID NO:4或SEQ ID NO:8之核酸序列編碼,其中該抗體與利妥昔單抗相比,能夠造成增加的抗體依賴性細胞毒性(ADCC);與利妥昔單抗相比,能夠造成增加的抗體依賴性細胞噬菌作用(ADCP);及/或與利妥昔單抗相比,具有增加的對FcγRIII受體的親和力,其中該病患為:(i)具有選自由以下組成之族群的一個或多個基因之一個或多個突變的病患:CREBBP、EP300MEF2BMYCEZH2TNFRSF14;(ii)在CD58具有基因突變及/或具有低CD58表現的病患,該低CD58表現對應於log2(每千基百萬的標準化讀數(nRPKM))
    Figure 107127631-A0305-02-0115-136
    5.2,其中在CD58之該基因突變為(a)短變體突變及/或(b)複本數變體; (iii)具有DLBCL之原始細胞(cell-oi-origin,COO)亞型的病患,係由線性預測值得分(LPS)<1141(較強生發中心B細胞樣(GCB)DLBCL)所定義之GCB DLBCL;及/或(iv)BCL2易位的DLBCL病患及/或具有高BCL2表現的DLBCL病患其中
    Figure 107127631-A0305-02-0116-137
    50%之腫瘤細胞表現BCL2
  2. 如請求項1之用途,其中該臨床結果為無進展存活率(PFS)、總存活率(OS)及/或無事件存活率(EFS)。
  3. 如請求項1或2之用途,其中該病患為:(i)如請求項1(i)所定義的病患;及(ii)如請求項1(ii)所定義的病患。
  4. 如請求項3之用途,其中該病患為:(i)如請求項1(iii)所定義的病患;及(ii)如請求項1(iv)所定義的病患。
  5. 如請求項1或2之用途,其中該病患係藉由測定一組基因之表現來鑑別,該一組基因包含以下一或多個基因:TNFRSF13BLIMD1IRF4CREB3L2PIM2CYB5R2RAB7L1CCDC50;以及MMESERPINA9ASB13MAML3ITPKBMYBL1S1PR2
  6. 如請求項4之用途,其中具有較強GCB DLBCL之該病患為具有腫瘤 之病患,該腫瘤具有包含一組基因經加權表現所產生線性預測值得分(LPS)<1141,該一組基因包含以下一或多個基因:TNFRSF13BLIMD1IRF4CREB3L2PIM2CYB5R2RAB7L1CCDC50;以及MMESERPINA9ASB13MAML3ITPKBMYBL1S1PR2
  7. 如請求項5之用途,其中該組基因進一步包含以下一或多個基因:R3HDM1WDR55ISY1UBXN4TRIM56
  8. 如請求項5之用途,其中如請求項5中所定義之該一或多個基因之表現係經標準化成如請求項7中所定義之一或多個基因之表現。
  9. 如請求項1或2之用途,其中該LPS為根據以下公式計算之該等基因之表現之加權和:LPS(X)=Σ j a j X j ,其中X j 為基因j之基因表現且a j 為基因j之係數。
  10. 如請求項1或2之用途,其中該等基因之表現藉由NanoString僅研究用途淋巴瘤分型測試(Lymphoma Subtyping Test;LST)來測定。
  11. 如請求項1或2之用途,其中該LPS
    Figure 107127631-A0305-02-0117-138
    1100。
  12. 如請求項1或2之用途,其中該LPS
    Figure 107127631-A0305-02-0117-140
    749。
  13. 如請求項1或2之用途,其中該LPS
    Figure 107127631-A0305-02-0118-141
    725。
  14. 如請求項1或2之用途,其中該抗體包含經醣基工程改造之Fc區。
  15. 如請求項14之用途,其中該抗體增加連接至該經醣基工程改造之Fc區的非岩藻醣基化寡糖的得分(fraction)。
  16. 如請求項14之用途,其中該抗體增加連接至該經醣基工程改造之Fc區的經二等分非岩藻醣基化寡糖的得分(fraction)。
  17. 如請求項14之用途,其中該抗體相對於未經醣基工程改造之抗體及/或相對於利妥昔單抗具有明顯更高水準的與人類FcγRIII受體之結合。
  18. 如請求項14之用途,其中該抗體相對於該未經醣基工程改造之抗體及/或相對於利妥昔單抗具有明顯更高水準的ADCC活性。
  19. 如請求項1或2之用途,其中該抗體為歐比托珠單抗(GazyvaTM/GazyvaroTM)。
  20. 如請求項1或2之用途,其中投與一或多種額外其他細胞毒性或化學治療劑或增強該(等)試劑之效果的電離輻射。
  21. 如請求項1或2之用途,其中該抗體將與CHOP化學療法組合投與。
  22. 如請求項1或2之用途,其中該抗體包含於醫藥組合物中,該醫藥組合物包含醫藥學上可接受之載劑。
  23. 一種用於鑑別DLBCL病患的方法,相較於以利妥昔單抗治療,其以歐比托珠單抗治療會達到經改善臨床結果的反應,該方法包含測試該DLBCL病患之樣品,以確定該DLBCL病患是否為如請求項1至13中任一項中所定義之病患。
  24. 一種用於診斷病患體內DLBCL之形式的方法,該DLBCL用歐比托珠單抗治療因此可得到與以利妥昔單抗治療相比達到經改善臨床的結果,該方法包含測試該病患之樣品,以確定該病患是否為如請求項1至13中任一項中所定義之病患,且如果該病患為如請求項1至13中任一項中所定義之病患時,診斷出該DLBCL之形式。
  25. 如請求項1或2之用途,其中(i)已測定該病患是否為如請求項1至13中任一項中所定義之病患,其中(ii)已根據如請求項23之方法鑑別出該病患,或其中(iii)已根據如請求項24之方法診斷出該病患DLBCL之形式。
  26. 如請求項1或2之用途,其中該治療包含以下步驟:(i)測定待治療之該病患是否為如請求項1至13中任一項中所定義之病患;(ii)根據如請求項23之方法鑑別出DLBCL病患;或(iii)根據如請求項24之方法診斷出該病患DLBCL之形式。
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Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2933256T3 (es) 2017-08-08 2023-02-03 Hoffmann La Roche Tratamiento con obinutuzumab de un subgrupo de pacientes con LDLBG
EP3873942A4 (en) * 2018-10-29 2022-12-28 Tigatx, Inc. COMPOSITIONS AND METHODS WITH IGA ANTIBODY CONSTRUCTS

Family Cites Families (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3752017T2 (de) 1986-03-20 1997-08-28 Nippon Electric Co Mikrorechner mit Zugriffsfähigkeit auf einen internen Speicher mit gewünschter variabler Zugriffszeit
ATE196606T1 (de) 1992-11-13 2000-10-15 Idec Pharma Corp Therapeutische verwendung von chimerischen und markierten antikörpern, die gegen ein differenzierung-antigen gerichtet sind, dessen expression auf menschliche b lymphozyt beschränkt ist, für die behandlung von b-zell-lymphoma
ES2190087T3 (es) 1997-06-13 2003-07-16 Genentech Inc Formulacion estabilizada de un anticuerpo.
LT2348051T (lt) 2003-11-05 2019-02-25 Roche Glycart Ag Cd20 antikūnai su padidintu fc receptoriaus prisijungimo giminingumu ir efektorine funkcija
GB0718684D0 (en) * 2007-09-24 2007-10-31 Roche Products Ltd Treatment method
US20130195843A1 (en) * 2010-06-23 2013-08-01 British Columbia Cancer Agency Branch Biomarkers for Non-Hodgkin Lymphomas and Uses Thereof
KR102357699B1 (ko) * 2013-11-06 2022-02-04 더 유나이티드 스테이츠 오브 어메리카, 애즈 리프리젠티드 바이 더 세크러테리, 디파트먼트 오브 헬쓰 앤드 휴먼 서비씨즈 발현 프로파일링에 의한 림프종 유형의 하위유형 분류 방법
DE102013222576A1 (de) 2013-11-06 2015-05-07 BSH Bosch und Siemens Hausgeräte GmbH Haushaltsgerät
JP6478989B2 (ja) 2013-11-07 2019-03-06 エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft 抗cd20抗体とbtk阻害剤とを用いた併用療法
MA39776A (fr) * 2014-03-24 2017-02-01 Hoffmann La Roche Traitement du cancer avec des antagonistes de c-met et corrélation de ces derniers avec l'expression de hgf
MX2017003121A (es) * 2014-09-15 2017-08-02 Genentech Inc Formulaciones de anticuerpos.
PT3262071T (pt) * 2014-09-23 2020-06-16 H Hoffnabb La Roche Ag Métodos de utilização de imunoconjugados anti-cd79b
AU2016276158B2 (en) * 2015-06-08 2022-06-30 Debiopharm International, S.A. Anti-CD37 immunoconjugate and anti-CD20 antibody combinations
KR20180012873A (ko) 2015-06-24 2018-02-06 에프. 호프만-라 로슈 아게 림프종 또는 백혈병에서 림프구증가증의 유도에 사용하기 위한 인간 csf-1r에 대한 항체
IL313608A (en) * 2015-12-09 2024-08-01 Hoffmann La Roche Antibody against CD20 type II to reduce the formation of antibodies against drugs
EP3178848A1 (en) * 2015-12-09 2017-06-14 F. Hoffmann-La Roche AG Type ii anti-cd20 antibody for reducing formation of anti-drug antibodies
ES2933256T3 (es) 2017-08-08 2023-02-03 Hoffmann La Roche Tratamiento con obinutuzumab de un subgrupo de pacientes con LDLBG

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
期刊 Lenz G et al., "Molecular subtypes of diffuse large B-cell lymphoma arise by distinct genetic pathways" Proc Natl Acad Sci U S A. 105(36),The National Academy of Sciences of the USA2008 Sep 9; 13520-5 *
期刊 Umberto Vitolo et al., "Obinutuzumab or Rituximab Plus CHOP in Patients with Previously Untreated Diffuse Large B-Cell Lymphoma: Final Results from an Open-Label, Randomized Phase 3 Study (GOYA)" Blood, 128(22),the American Society of Hematology 2016, 470.; *

Also Published As

Publication number Publication date
WO2019030260A1 (en) 2019-02-14
US11597772B2 (en) 2023-03-07
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TW202323297A (zh) 2023-06-16
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JP7418322B2 (ja) 2024-01-19
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