TWI224286B - Transformation method of digital images - Google Patents

Transformation method of digital images Download PDF

Info

Publication number
TWI224286B
TWI224286B TW089109127A TW89109127A TWI224286B TW I224286 B TWI224286 B TW I224286B TW 089109127 A TW089109127 A TW 089109127A TW 89109127 A TW89109127 A TW 89109127A TW I224286 B TWI224286 B TW I224286B
Authority
TW
Taiwan
Prior art keywords
image
sample
dye
staining
color
Prior art date
Application number
TW089109127A
Other languages
English (en)
Inventor
Russell L Kerschmann
Andrew Hendrickson
Benn P Herrera
Original Assignee
Resolution Sciences Corp
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Resolution Sciences Corp filed Critical Resolution Sciences Corp
Application granted granted Critical
Publication of TWI224286B publication Critical patent/TWI224286B/zh

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G06COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06TIMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T5/00Image enhancement or restoration
    • G06T5/50Image enhancement or restoration using two or more images, e.g. averaging or subtraction

Landscapes

  • Physics & Mathematics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Sampling And Sample Adjustment (AREA)

Description

1224286 五、發明說明(1) 發明背景 本發明係有關於組織學之領域。 就目前的作法,製備光學及電子穿 二2機組織樣本及其他材料時,樣本通‘經:鏡 化干處理,這些處理會產生一個塊狀 連串的 狀物中。之後,將此塊狀物切片取得樣本樣^包埋在此塊 質):薄切片,並將薄切片置於坡埋: 後,包埋物質可能以化學方法移去,,並且組寺物上。而 不同種類的有色染料或螢光染料或免化::將染以 (_·. hybrfd;zat 5 ^ 在傳統的組織病理學上,應用在臨床 n處理。 上之最常見的亮野(brightfield) 織切片 ?-m〇Xylin)及曙紅(eosin)⑽"的=木= 从使核酸及其他所謂嗜鹼性物質在組織切片中匕方 ,白質及其他嗜酸性或嗜曙紅性組織成分呈粉==二 =法:世界通用,為一種檢查所有組織成分的二性= 法。在某些情況下,會再用特殊染料加以處理,=二 染料與特定的組織元素具親和性,例 ^寺殊 導方法,故可使這些特定組織元素在染色 清楚呈現。 』、、且纖切片中更 =(祕c )染色方法已介紹過,# 以浸泡法Γ。而後,從穿透二 法適用的塊狀物上,切下切片,或者以塊狀面(bi face)或表面顯像(surface imaging)顯微鏡法使塊
第4頁 IJ24286 五、發明說明(2) 狀物本身的切面呈現影像。在表面顯像顯微鏡法中,包括 已實施於美國專利第4,960,330號的方法,一樣本由結合 或非結合性螢光染料整體染色後,繼而被浸透及包埋在一 種質之中,通常是塑膠聚合物,此樣本經不透明化或其 他處理’不使塊狀物中超過幾微米深之處的組織顯出影 像’這形成一個薄的虛切面(virtual section ),與傳 統上用玻片裱製的組織切片極為相似。 、塊狀面顯微鏡法優於標準亮野顯微鏡法之處,在於塊 狀2顯微鏡法,可產生高品質的生物組織及其他物質之顯 微〜而不需製造組織玻片。免除此需求使組織病理學 之手’全自動’得以降低製造附加切片所增加之成本,因 而可從一個樣本中搜得更大量的資料。 在塊狀面顯微鏡法中’從塊狀面上補捉到未經變更的 數位虛切面是暗野影像,其來自於螢光染色樣本所發射出 的顏色。此樣本與黑色背景產生對比,而黑色背景為滲透 =f埋樣本的不透明聚合物。相對的,在大多數外科病理 ^驗室’及其他與醫學相關之以顯微鏡法為依據的診斷設 f上’其所使用傳統的穿透式光學顯微鏡法,是產生亮野 影像’因為組織與其他物質的薄切片以標準非螢光染料染 ^ ’而後用白光或近白光源照明,導致背景比組織的影像 党’並非較暗。 為了使塊狀面顯微鏡法產生的影像更有利於臨床診斷 、他目的’較佳是轉換從塊狀面補捉到的原始暗野影 像’並將之顯示成較熟悉的亮野顯微鏡法所產生的影像。
1224286 五 、發明説明(3) 發明楙述 ,般而言’本發明包括-種用螢光染料將樣 方法;一種產生螢光染色樣本的暗野影像之方法丨木色的 種將〆種或多種暗野染料染色所產生的樣本,’二= 種戒多種亮野染料染色所產生的樣本影像,以用 腦螢幕上檢驗之方法。此方法包括應用數位查閱夺]从 電腦化方法,使暗野數據轉換成亮野形式,二及2 =二3 轉換過的資訊顯示出的方法。較佳地,顯像工具e 一將忒 面的顯微鏡,以及轉換影像的工具是數位電腦。 鬼狀 因此’本發明的一種形態係以一種影像 色,此方法包括:⑷以-螢光染料將樣本染色总 光染料染色的樣本產生一第一影像· (b)、、里螢 染料染色的樣本所生丄f其相似於以非營光 在較佳具體實施例中,蔣筮 ^ ^ 像包括將-查閱表應用-影像轉換成為第二影 施例中,變更勺= 〜像上面。在較佳的具體實 的顏色範圍,以楔 ::t成調“-影像或第二影像 樣本可用—種:非螢先染料染色的樣本之顏色範圍。 生物樣本。 或—種以上的染料染色,較佳的樣本是 to ^ m ^ ^ ^ ^ : (b)妹第f第—螢光染料將樣本染色; 、-第-染料染色的樣本產生第一影像,經第二 1 第6頁 五、發明說明(4) 染料染色的樣本產生第二影像;以及 “)使用數位處理器將第一影像及第二影像 第三影像,八相似於以蘇木素及曙紅染色的樣 、成 影像。 4所生成的 本發明亦以一種影γ复座士、、上$ 裡〜像生成法為特徵,此方 U )用一螢光染料將樣本染色; 匕括·· (b) ‘此染料染色的樣本產生第一 染色的樣本產生第二影像;以及 %此染料 (C )使用數位處理器將第一影像及第二影 第二影像,其相似於以蘇木素及曙紅象轉換成 影像。 像本所生成的 ,發明也以一種影像生成法為特徵, U)用多種螢光染料將樣本染色; 女包括: 及⑷經其中一種染料染色的樣本產生第—影像;以 用数位處理器將第 其 相似於非螢光染料染色的樣本所生成之:像弟 在另一形態中,本發明亦以一 此方法包括: 種如像生成法為特徵, (a)用多種螢光染料將樣本染色; (b )產生第一影像,其相似於— 樣本所生成之影像;以及 # *先木料染色的 (c )用數位處理器將第一影像轉換办 相似於非螢光毕料汰 —衫像,复 忠木杆染色的樣本所生成之影像。 > 具
I224286
較佳地,本發明的第一及第二影像,是由使用含塊狀 面顯U鏡的裝置而產生。使用在本發明的染料可以包括變 色染料(matachromatic dye)(例如,吖啶橙(acridine °range) ) 〇 結合性染料” (con jugated dye )係指能與組織元素 有特定性的分子結合的染料。典型結合性染料,包括,但 並不限於螢光接合抗體(fluorescently — c〇Upled ant ibodies )及螢光性DNA探針。 ”非結合性染料’’ (unconjugated dye)是指本來就具 螢光性之染料。 ’〃 ’’浸透n (infiltration)是指用一種或一系列的液體 處理組織,此類液體穿透整個組織達分子層面,而後轉換 成固體以使樣本變硬。 、 ’’包埋” (embedding或embedment )是指將浸透的組織 置於一個模型中,並以一種物質(通常與滲透組織所用之 物質相同)包圍之,而後此種物質硬化而形成一個包裏住 的塊狀物。因此,包埋物質之作用為提供穩固支持並^ 切片方法順利。 π切片’’ (sectioning )是指由塊狀物切得薄片,之 後,或許將薄片裱製在玻面或其他支持物上。 ”染色” (staining )是指用有色或螢光物質處理材 料’此有色或瑩光物質在分子層次上可與材料結合。 ”勞光” (fluorescence)或”暗野” (darkfield)汰 色,是藉由非結合性染料(即受適當波長之光刺激時可1
1224286
=螢光之染料),ι结合性染料(即連結於樣本且直 例—包‘接Γ在螢光原上之分子)4理。結合性染料的實施 不限於:(1)連結於抗原的初級抗體及包 =先原連接於初級抗體之次級抗體;以&⑴)具有營 呈僮且與之共價鍵結之分子,螢光染色形成有黑色背景的 ^ *標準”或”亮野"染色通常藉由非營光染料處理並 2有明⑨或白色背景的影像。應、了解的是,相同的染料 可用於螢光及標準顯微鏡法。 、, 變色π染料構成一套組織化學的染料,豆中有呼多染 ,是螢光性的。如同大多數的螢光原,這些化合物吸收特 疋波長的光並且再放出波長較長之光。變色染料的光譜性 I強烈受到染料和標的分子的親近度所影響,因此其放射 出的波長會產生變化,故與某些類型的物質結合時,這些 染料會改變顏色,在某些情況下,變色染料可能僅在染料 與標的物結合時才發射出光,否則是無法看見的。一種典 型的變色染料是吖啶橙,其他的變色染料為熟悉於此技藝 者所知,且包括,但並不限於列在Conn,s Bi〇1〇gical
Stains,Williams & Wilkens 9th ED, 1 997 中的染料(此 處納入為參考文獻)’並可從MolecularProbes公司 (Eugene, OR )獲得。Molecular Probes公司之大多數的 染料是公告的美國專利之標的,這些染料在此處納入為參 考文獻。Molecular Probes的變色染料有助於標示蛋白 質,這些染料分為以下三類:苯並噁二唑 (benzoxadiazole )衍生物、萘(napthalene )衍生物及
第9頁 1224286
Pyrene )衍生物。 藉由這個方法,生物組織及其他 可猎塊狀面顯微鏡法有效地產生 頁 身料或許 熟悉的亮野影像形式。 ”、、員不成最有用及最 -裏ΐ :特色與優點可由下列較佳實施例之敘过、斑申 #專利乾圍中而變得更為明顯。 敘述與申 附件之簡單說明 一二件Ϊ本發明方法之計劃說日月,包括應用查閱表於第 〜以生第一影像,進而產生變更過的顏色。、 發明詳述 我們已經發現一個用一種或多種暗野染料使樣本(例 如組織樣本顯像,以及將樣本原像轉換成為第二影像的 方法,第二影像是相似於一種或多種亮野染料染色的樣本 所生成的影像。將第一影像轉換成為第二影像的方法涉及 應用查閱表於第一影像中。 查閱表 將第一影像轉換成所想要的第二影像,一般是使用稱 作查閱表的轉換值。查閱表是由一張描述一對/轉換的色 值關係所組成,並且通常是根據使用者電腦内顯像系統所 設的標準。轉換數位影像的方法包括一般的方法,例如, 將數學公式應用於每個資料元素的轉移功能。實例包括,
!224286
影像顏色轉化之轉換,此轉換可能是從每個次 一個常數值。 1固貝料元素減去 此外,在影像中的每個資料元素,可根 的計算結果來作改變,此計算結果是基於影像模 :白 特點之分析。例如,在一個影像中合計某一二1,其他 _ ^域中每個齡 據元素的值,並且這個總計值用來決定此區所顯示的♦ | 色。涉及此種高階計算的方法來模擬顏色,在明$ 作•’估算染料n ( computed stains )。 冉
一般而言,查閱表,例如RGB (紅色、綠色及藍色) 查閱表’是應用在暗野影像拥每個波段,(例如紅波段、 綠波段等)。在將暗野影像轉換成為亮野影像的過程中, 為了確定亮野影像的對應值,每個原暗野樣本值(例如每 個映像點(P i xe 1 ))作成參數值附註於查閱表。將每個波 段所獲得的顏色結合起來就產生RGB亮野影像。色彩定位 (color mapping)法說明於,例如:J.C. Russ (1995) 影像處理操作手冊,' 第二版,CRC press,Ann Arbor, MI, 此處納入為參考文獻。
間轉換(Additive colorspace conversion) 在一實例中,RGB色表是由每一個可能的暗野值細目 製成。例如,若來源(也就是,暗野影像)的範圍從〇到 225 (其中〇為黑色,255為白色),則可製成具256個細目 的表’在表中的每個細目可填入一個由下所述方法所得之 色彩。 Η =標的色的色彩
第11頁 1224286 五、發明說明(9) S =標的色的飽和度 B =標的色的亮度*I/max-sample-value(例如,8位元 = 255) 其中,I是目前計算出的查閱表值之參數,範圍從〇到 最大樣本值(max-sample-value)(例如,25 5 ),所得 之HSB值被轉換成RGB色彩空間,並且插入在查閱表中位置 I部分。 產生的結果是,每一個查閱表細目,是標的亮野影像 色彩的亮度範圍,在表中的色彩是從黑色開始排起,黑色 為未經變更的標的像色彩,進而提昇色彩亮度一直到最後 一個細目。 例如’若標的色彩是原紅色,而後查閱表應從黑色開 始’從暗紅逐漸增加至亮紅,一直到最後一個細目。則最 後一個細目應為原紅。 對每一組波段來源而言,將由查閱表獲得的多個rgb 色彩相加(例如,紅對紅,綠對綠,藍對藍),可取得一 個RGB色彩。色彩值是限定的所以不會超過最大樣本值 (例如,8位兀對255 )。而後,一個加亮值可加在每個 RGB值上,這個值由移去原始暗野影像之暗度而得,且將 之轉換如下:
,大樣本值一(波段來源1,波段來源2…)之最大值。 敢大樣本值減去最大來源樣本值可得一個暗度,此暗 度加在新的RGB值的每一個成分上可加亮色彩。產生的結 1224286 五、發明說明(ίο) 減色—空間轉換法(Subtractive c〇 1 or space conversion) 在第二種轉換暗野影像成為相似的亮野影像的方法 中,RGB色彩查閱表值可由上述之法製得,除了在表中的 每個細目填入一個由下述方法所得之色彩之外: H=標的色的色度 S二標的色的飽和度*I/max-sample-value(例如,8位元 = 255 ) B=標的色的亮度
所產生的HSB色彩,可轉換成RGB色彩空間,並插於查 閱表位置I之部分。 所產生的結果是,每一個查閱表細目,是標的亮野影 像色彩的飽和度範圍。在表中的色彩是從白色開始排起, 白色為未經變更的標的像色彩,進而提昇色彩飽和度一直 到最後一個細目。 例如,若標的色彩是原紅色,查閱表應由白色開始, 從淡紅色(粉紅色)開始增加成飽和度高的紅色直到最後 一個細目,原紅色。
因此,用前述的方法,每個波段來源可轉換成一個 RGB色彩。這些色彩以下述之法混合。 RGB色彩可轉換成CMY色彩(藍綠色、洋紅色及黃色
)。CMY 是減色空間(subtractive color space ),CMY 色彩可加成(例如,每一個波段來源的藍綠色值相加得到 一個藍綠色,,每一個波段來源的洋紅色值相加得到一個
第13頁 1224286 五、發明說明(11) 洋紅色值等)如此處所述’所想要的是這些色值以 的最大值為限(也就是,最大樣本值),合計之後 之CMY色彩再轉換成RGB色彩空間。 口 在轉換用ργ啶橙染色的暗野影像成為用h&e毕^ 野之情況下’色彩由黑色至標的色(在加色空間情 或由白色至標的色(在滅色空間之情況下)之增二 的。熟悉此技藝者將得知其他的查閱表,包括非線 甚至不連續的查閱表在本發明中都是有效的。^ 用暗野染料染f 可允許 ,所得 L的亮 況下) 是線性 性的或 使染 腦化生成 光染料( 不同的組 可產生一 換用一種 上亮野染料 影像的方法 相似於*一 在一 染色,其 染料與組 不同,用 菌體的存 準方法) 真菌體的 。單一的 色。在此 染料染色 野染料染 包含真菌 與真菌體 較高的親 色的樣本 亮野影像 不同的顏 或混合染 ,是用混 即一種變色染料)染 織結構結合 種以上的顏 或多種暗野 種或多種亮 實施例中, 中一種染料 織的成分有 這些染料染 在。轉換成 ’原始影像 亮野影像。 料(例如,H&E )的 合的螢光原染料或身 色。混合的螢光染米 螢光染料應用在一伯 所敘述的影像轉換沒 的樣本所生成的影谓 色的樣本所生成的景 體的樣本以混合的蜜 有較南的親和力,而 和力。真菌體與組鐵 所產生的暗野影像可 k (使用如同在此敛 色特徵被轉換成組織 良本電 一的螢 分別與 樣本時 ,可轉 ’使其 像。 光染料 另一種 的顏色 顯出真 述的標 中含有 1224286
(grayScau、二it '者分配T同的灰色範圍強度值 原始暗野影像中:有Υ:1:)給予不同的亮野色彩於 1*〜像中,3有真囷體且已染上單一、單色的 :樣本所產生的暗野影像’經轉換後產生多色的亮野: :。:如’若真菌體比組織和單色的染料有較強之親;: C::同的強度可用來產生一組亮染的樣本(即真菌體 、,且暗杂的樣本(即組織)之亮野色彩。其他不同 的性貝,例如大小,也可用電腦化來分配亮野色彩。 在一單一 中編碼多檨牵斜 一個樣本可用多種染料染色,而只有一種或一小組的 染料可被顯像。另一時間,其他的染料可用不同的濾鏡或 激發方法而顯像。因此,一個樣本含有的染料可多於所顯 像出的染料。 π 同k ’顯像出的染料可用濾鏡來互相區別,顯像可限 制發射光到達偵察器的波長。或者,每一個染料用光譜分 析或其他較高階的分析法來區別。這種使組織顯像的方法 4 明於下列文獻中:Levenson,R.M· and farkas,D.L· (1997) Proc. SPIE, 2983:123-135; Levenson, R.M. and Young, D.A. (1991) In: M.J. Dunn (Editor), Proc. International Meeting on Two-Dimensional Electrophoresis. Dept, of Cardiothoracic Surgery, National Heart and Lung Inst. (UK), London, UK; and Levenson, R.M., Brinckmann, U.G., Androphy,
第15頁 1224286 五、發明說明(13) E·, Schiller, J·, Turek, L·, Chin, M·, Broker, T. R. , Chow, L.T. and Young, D. A. ( 1 987) In: B.M. Steinberg, J.L. Brandsma and L.B. Taichman (Editors), Cancer cells V· Papillomaviruses. Cold Spring Harbor Press, N,ew York, pp· 137-144。以上所 有文獻資料在此納入為參考文獻。 下列的實施例用以說明本發明。這些實施例並非以任 何的方式限定本發明。 實施例 實施例I ·· H&E單一染料法 變色染料吖啶橙是一種螢光染料,在將組織及其他物 質染色時,組織元素與吖啶橙結合,其所產生的螢光色與 組織元素的化學組成有關。例如,以吖啶橙染色時,核酸 散放出黃色,而細胞質中的蛋白質以同法染色時,同步地 放出綠色。因此用吖啶橙染組織及其他物質所產生的組 凡素之顏色的區別,與用H&E染法所產生的顏色區別相、、 似。除了產生不同的特定顏色之外,螢光染料吖啶橙 暗野影像而非亮野影像。 生 黑 像 像 是 一個用來產生顯示數據的特定運算法則敘述如下: 輸入的影像被照像機數位化以產生映像點,映里 色或僅具有紅色及綠色值,輸出的映像點代表Mb a 1GB影像會出現如同以蘇木素及曙紅染色的亮野ς 1224286 五、發明說明(14) "一~
Sr,Sg=紅色及綠色的來源映像點值。
Dr,Dg,Db=紅色、綠色及藍色的目標映像點值。
Pmax=映像點的最大值(例如8位元=28 = 256,1〇位元 =210 = 1 0 24 等)。
Hr,Hg,Hb=蘇木素亮野色彩的RGb參數 Er,EG,Eb=曙紅亮野色彩的RGB參數
Dr- Pmax-max(Sr,Sg) + (Sr/Pmax)*Hr+(Sg/Pmax)*Er Dg= Pmaxiax(Sr,Sg) + (Sr/Pmax)/Hr+(Sg/Pmax)*Eg Db二 Pmax-max(Sr,Sg) + (Sr/Pmax)/Hr+(Sg/Pmax)*Eb
因此,本發明藉著將顏色查閱表及其他顏色轉換法應 用在染有吖啶橙的組織所產生的影像上,讓染有吖啶撥的 組織影像可以轉換’使其相似於經染色的組織所產生 的影像。 熟悉H&E染色法者會覺察到由於染液的生成與儲藏之 變異,組織的色彩及飽和度是可變的,因此一種以上的查 閱表可用來轉換經吖啶橙染色的樣本所產生的暗野影像, 以使模仿經H&E染色所產生的亮野影像。 實施例II : H&E多種染料法
螢光染料混合物或許可代替d丫咬燈及用來轉換η丫唆撥 暗野影像成為相似的Η&Ε標準亮野影像的查閱表及其他方 法。此類螢光染料混合物在組織中使嗜鹼性及嗜酸性的物 質呈現不同的顏色,prop i d i um i od i de (染核酸)及曙紅 Y (染蛋白質)的結合是一個可用的賦形。在一實施例
第17頁 1224286 五、發明說明(15) ---- 中,活體組織檢查的癌化組織以propidium iodide處理, propidium 1〇dide是一種黃色的榮光染料,其可與核酸鈇 合,在腫瘤細胞核酸含量的流體細胞計量研究上,此 也常用來做DNA定量,此癌化組織亦用曙紅γ處理以二 内的組織成分呈綠&,根據此發明,從這個組織樣本: 到的是暗野影像,經轉換可成為亮野影像,在亮野影= 背景呈白t,組織的非核内部分呈粉紅色,核呈藍色 者,定量測量每個核的營光強度以求得核内DNA含量的近 似值’這個量藉由顏色查閱表或其他方法使之與每個 凴野影像顏色有關,因此根據核内所含的DNA總量,每 ,會呈現不同的顏色,故造成一種”估算染料π ,其與 量相關。 ‘ 實施例III :從單色染料產生多色影像之方法。 在本發明的第三實施例中,單色染料的影像可轉換 色影像’乡色影像與經由-種多色染料染色或多種單 料染色的樣本所產生的影像相似。一實施例是藍-白染料 Flu〇rescence Brightener 28在含真菌體組織樣本上的應 用。FlU0rescence Brightener 28可堅固地連結於直 體’並使真菌體在暗野影像中呈現比i ^ & ^ ^ ^ „ a. G,、他構造更明顯的顏 ^例如被感染的生物之細胞。因此,一影 個灰影的映像點(黑色的映像點值為〇, β 為2 55 ),代表真菌體的映像點有彳艮高的映像點值像點值 在一個實施例中,真菌體的映像點值大於χ,而每一
第18頁 1224286
五、發明說明(16) 個非真菌體構造的映像點值+ > ^ 換染得比較亮的真菌體(即峨;X °製造顏色查閱法是轉 野色,如深紫灰色;其他部分^點值大於X )成第一個亮 介於X到0之間)則轉換成第二、組」織構造(即映像點值在 的,黑色的背景(所有的映i 3亮野色,如灰綠色。同樣 形成亮野。此種色彩組合造成點,為0 )變成白色,因而 胺-銀染色非常相像,此染色、、去的&像與Grocott六亞曱四 室來染組織切片中的真菌體。/ 一般用在外科病理學實驗 甚他具體實施例 本發明已參考較佳的具體每 、,, 述,而為熟悉於此技藝者所知二:?,二2詳:顯示及敘 =圍所定義的發明精神與範嘴外,可對 :『 的改變,熟悉於此技藝者僅使用例行的實驗法: 見或可以發現到許多與本發明特別的具體實施例同類& 例子。這些同類型的具體實施例包括在申請專利範圍之

Claims (1)

1224286 案號 89109127 修正本 93. 年 3· η • 2修正 六、申請專利範圍 ^------ 1. 一種影像生成法,包括: a) 以一種螢光染料將一樣本染色; b) 經螢光染料染色的樣本生成一第一影像;以及 c) 使用數位處理器將該第一影像轉換成為一第二影 像,其相似於以非螢光染料將該樣本染色所生成的影像。 2. 如申請專利範圍第1項所述之影像生成法,其中該 第一影像是使用塊狀面顯微鏡(b 1 〇 c k - f a c e m i c r 〇 s c 〇 p e )而產生。 3 .如申請專利範圍第1項所述之影像生成法,其中將 該第一影像轉換成為該第二影像,包括將查閱表應用在該 第一影像上。 4. 如申請專利範圍第1項所述之影像生成法,其中該 樣本至少以二種以上的螢光染料染色。 5. 如申請專利範圍第1項所述之影像生成法,其中該 樣本是一生物樣本。 6. —種影像生成法,包括: a) 以一第一或第二發光染料將一樣本染色; ·/-义 t b) 經該第一染料染色的該樣本生成一第一影像,經 該第二染料染色的樣本產生一第二影像;以及 c) 使用數位處理器將該第一影像及該第二影像轉換 成為一第三影像,其相似於以蘇木素及曙紅將該樣本染色 所生成的影像。 7. 如申請專利範圍第6項所述之影像生成法,其中該 第一及第二影像是使用塊狀面顯微鏡而產生。
1084-3191-pfl.ptc 第20頁 1224286 案號 89109127 年 月 曰 修正 六、申請專利範圍
8. —種影像生成法,包括: a) 以一種螢光染料將一樣本染色; b) 該染料染色的該樣本生成一第一影像及一第二影 像;以及 c) 使用數位處理器將該第一影像及該第二影像轉換 成為一第三影像,其相似於以蘇木素及曙紅將該樣本染色 所生成的影像。 9. 如申請專利範圍第8項所述之影像生成法,其中該 第一及第二影像是使用塊狀面顯微鏡而產生。 1 0.如申請專利範圍第8項所述之影像生成法,其中該 染料包括一變色染料。 1 1.如申請專利範圍第1 0項所述之影像生成法,其中 該變色染料包括吖啶橙。 1 2. —種影像生成法,包括: a) 以該多種螢光染料將一樣本染色; b) 在該樣本中,該染料的其中一種,生成一第一影 像;以及 c) 使用數位處理器將該第一影像轉換成為一第二影 像,其相似於以一種非螢光染料染該樣本所生成的影像。 1 3.如申請專利第1 2項所述之影像生成法,其中該第 一影像是使用塊狀面顯微鏡而產生。 1 4. 一種影像生成法,包括: a)以具有重疊激發及發射光譜的該多種螢光染料將 該樣本染色;
1084-3191-pfl.ptc 第21頁 1224286 _案號89109127_年 月 日__ 六、申請專利範圍 b ) 生成一第一影像,其相似於以一組該多種螢光染 料染色的该樣本,以及 c) 使用數位處理器將該第一影像轉換成為一第二影 像,其相似於以至少一種非螢光染料將該樣本染色所生成 的影像。 1 5.如申請專利第1 4項所述之影像生成法,其中該第 一影像是使用塊狀面顯微鏡而產生。
1084-3191-pf1.ptc 第22頁
TW089109127A 1999-05-13 2000-07-18 Transformation method of digital images TWI224286B (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US09/311,789 US6195451B1 (en) 1999-05-13 1999-05-13 Transformation of digital images

Publications (1)

Publication Number Publication Date
TWI224286B true TWI224286B (en) 2004-11-21

Family

ID=23208478

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
TW089109127A TWI224286B (en) 1999-05-13 2000-07-18 Transformation method of digital images

Country Status (7)

Country Link
US (2) US6195451B1 (zh)
EP (1) EP1200928A1 (zh)
JP (1) JP2002544531A (zh)
CN (1) CN1349633A (zh)
AU (1) AU4841800A (zh)
TW (1) TWI224286B (zh)
WO (1) WO2000070541A1 (zh)

Families Citing this family (29)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6650357B1 (en) * 1997-04-09 2003-11-18 Richardson Technologies, Inc. Color translating UV microscope
CA2243090A1 (en) * 1998-07-10 2000-01-10 Timothy M. Richardson Inverted darkfield contrast microscope and method
US6558623B1 (en) * 2000-07-06 2003-05-06 Robodesign International, Inc. Microarray dispensing with real-time verification and inspection
US7025933B2 (en) * 2000-07-06 2006-04-11 Robodesign International, Inc. Microarray dispensing with real-time verification and inspection
US6740530B1 (en) * 2000-11-22 2004-05-25 Xerox Corporation Testing method and configurations for multi-ejector system
FR2860320A1 (fr) * 2003-09-30 2005-04-01 Ct De Lutte Contre Le Cancer F Procede de mise en correspondance d'images d'echantillons tissulaires portes par des lames en materiau transparent
US20070016081A1 (en) * 2005-07-12 2007-01-18 Globalmedia Group, Llc Chroma-photon staining
JP2007206107A (ja) * 2006-01-31 2007-08-16 Olympus Corp 顕微鏡撮像装置、顕微鏡撮像方法、および情報記憶媒体
US20070250548A1 (en) * 2006-04-21 2007-10-25 Beckman Coulter, Inc. Systems and methods for displaying a cellular abnormality
US8131476B2 (en) * 2006-08-07 2012-03-06 General Electric Company System and method for co-registering multi-channel images of a tissue micro array
US8060348B2 (en) 2006-08-07 2011-11-15 General Electric Company Systems for analyzing tissue samples
CA2731956A1 (en) 2008-07-25 2010-01-28 Daniel S. Gareau Rapid confocal microscopy to support surgical procedures
BRPI0914499A2 (pt) 2008-10-23 2015-10-27 Konink Philips Eletronics N V método de determinação de uma transformação de cor para imagens de material biológico, método de gerenciamento de cor para ser utilizado em microbiologia, historiologia e patologia, e, carregador de dados que carrega um arquivo de imagem
US9002077B2 (en) * 2009-08-10 2015-04-07 Cambridge Research & Instrumentation, Inc. Visualization of stained samples
JP5278252B2 (ja) * 2009-08-31 2013-09-04 ソニー株式会社 組織切片像取得表示装置、組織切片像取得表示方法及び組織切片像取得表示プログラム
US8269827B2 (en) * 2009-09-29 2012-09-18 General Electric Company System and methods for mapping fluorescent images into a bright field color space
JP5540102B2 (ja) * 2009-10-12 2014-07-02 ベンタナ メディカル システムズ, インコーポレイテッド 高められた病理学的決定のための複数モダリティコントラストおよび明視野コンテキスト表現、および組織内の複数検体検出
WO2011144212A1 (en) 2010-05-21 2011-11-24 Chemometec A/S A compact dark field light source and dark field image analysis at low magnification
BR112012031688A2 (pt) * 2010-06-15 2016-08-16 Koninkl Philips Electronics Nv método para o processamento de uma primeira imagem digital e produto de programa de computador para o processamento de uma primeira imagem digital
JP5832537B2 (ja) * 2010-08-05 2015-12-16 ケンブリッジ・リサーチ・アンド・インストルメンテーション・インコーポレーテッド 試料の強調視覚評価
US8639013B2 (en) * 2011-08-17 2014-01-28 General Electric Company System and methods for generating a brightfield image using fluorescent images
EP2827772B1 (en) 2012-03-19 2023-10-04 Genetic Innovations Inc. Devices, systems, and methods for virtual staining
WO2014123844A1 (en) * 2013-02-05 2014-08-14 Tripath Imaging, Inc. Cytological staining compositions and uses thereof
US20150030215A1 (en) * 2013-07-26 2015-01-29 Abbott Point Of Care, Inc. Method and apparatus for producing an image of undiluted whole blood sample having wright stain coloration
JP2015169991A (ja) * 2014-03-05 2015-09-28 キヤノン株式会社 画像処理装置、画像処理方法
AU2016357478B2 (en) * 2015-11-22 2023-07-06 Ventana Medical Systems, Inc. Methods of identifying immune cells in PD-L1 positive tumor tissue
EP4235598A3 (en) * 2015-12-30 2023-09-13 Ventana Medical Systems, Inc. System and method for real time assay monitoring
JP6755975B2 (ja) * 2016-06-10 2020-09-16 エフ・ホフマン−ラ・ロシュ・アクチェンゲゼルシャフト 明視野像シミュレーションのためのシステム
US10580130B2 (en) * 2017-03-24 2020-03-03 Curadel, LLC Tissue identification by an imaging system using color information

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4202037A (en) * 1977-04-22 1980-05-06 Der Loos Hendrik Van Computer microscope apparatus and method for superimposing an electronically-produced image from the computer memory upon the image in the microscope's field of view
JPH065932B2 (ja) * 1986-05-28 1994-01-19 富士写真フイルム株式会社 画像記録装置
JPH0212060A (ja) * 1988-06-30 1990-01-17 Sumitomo Electric Ind Ltd 細胞の状態のモニター方法及びその装置
JPH03291567A (ja) * 1990-04-10 1991-12-20 Olympus Optical Co Ltd ウイルス感染検査装置およびウイルス感染検査方法
US5784162A (en) * 1993-08-18 1998-07-21 Applied Spectral Imaging Ltd. Spectral bio-imaging methods for biological research, medical diagnostics and therapy
ATE265676T1 (de) * 1996-05-29 2004-05-15 Walter Dr Schubert Automatisierte vorrichtung und verfahren zum messen und bestimmen von molekülen oder teilen davon
JPH1051639A (ja) * 1996-07-29 1998-02-20 Fuji Photo Film Co Ltd 画像処理装置
US5854710A (en) * 1996-09-09 1998-12-29 University Of Massachusetts Optical fourier processing
US5986271A (en) * 1997-07-03 1999-11-16 Lazarev; Victor Fluorescence imaging system

Also Published As

Publication number Publication date
JP2002544531A (ja) 2002-12-24
AU4841800A (en) 2000-12-05
US6195451B1 (en) 2001-02-27
US20010017938A1 (en) 2001-08-30
WO2000070541A1 (en) 2000-11-23
WO2000070541A9 (en) 2002-06-27
CN1349633A (zh) 2002-05-15
EP1200928A1 (en) 2002-05-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
TWI224286B (en) Transformation method of digital images
Fereidouni et al. Microscopy with ultraviolet surface excitation for rapid slide-free histology
Landini et al. Colour deconvolution: stain unmixing in histological imaging
JP6755975B2 (ja) 明視野像シミュレーションのためのシステム
Giacomelli et al. Virtual hematoxylin and eosin transillumination microscopy using epi-fluorescence imaging
Haug et al. Autofluorescence imaging, an excellent tool for comparative morphology
Paddock Principles and practices of laser scanning confocal microscopy
JP4376058B2 (ja) 定量的ビデオ顕微鏡法とそれに関連するシステム及びコンピューターソフトウェアプログラム製品
US9041792B2 (en) Generation of a multicolour image of an unstained biological specimen
Handschuh et al. Showing their true colors: a practical approach to volume rendering from serial sections
US20090103801A1 (en) Separation of Spectrally Overlaid or Color-Overlaid Image Contributions in a Multicolor Image, Especially Transmission Microscopic Multicolor Image
Gareau et al. Rapid screening of cancer margins in tissue with multimodal confocal microscopy
CN109923401A (zh) 高光谱成像系统
JP2016161417A (ja) 画像処理装置、画像処理方法、イメージングシステム
McGavin Factors affecting visibility of a target tissue in histologic sections
JP2021529951A (ja) 画像データを組み合わせることによる染色組織試料の合成画像の作成
Giacomelli et al. Comparison of nonlinear microscopy and frozen section histology for imaging of Mohs surgical margins
Villarreal et al. Ex vivo confocal microscopy performs real-time assessment of renal biopsy in non-neoplastic diseases
Zetina et al. Material study of the codex Colombino
Ortner et al. Exploring the utility of Deep Red Anthraquinone 5 for digital staining of ex vivo confocal micrographs of optically sectioned skin
CN112041655A (zh) 用于生物学表面的紫外激发显微术的方法
US10942122B2 (en) Microscopy method
Kizhakkoottu et al. Inking of gross specimens: a systematic review
Moustafa et al. A multi-analytical investigation of an ancient Egyptian painted wooden coffin from the late period
JPS63216549A (ja) 骨形態評価方法及び装置

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Annulment or lapse of patent due to non-payment of fees