TW202142565A

TW202142565A - 抑制scube2，一新穎vegfr2輔受體，遏止腫瘤血管新生

Info

Publication number: TW202142565A
Application number: TW110115917A
Authority: TW
Inventors: 楊瑞彬; 林育嬋
Original assignee: 中央研究院
Priority date: 2016-04-14
Filing date: 2017-04-14
Publication date: 2021-11-16
Also published as: US20210292401A1; US11066466B2; JP6938536B2; TWI786619B; CN109069602A; TWI669312B; US11866489B2; EP3442566A1; JP2019511545A; EP3442566A4; TWI729393B; US20190127454A1; TW201802118A; CN115873110A; TW201932492A; CN109069602B; WO2017180530A1; TW202306987A

Abstract

本發明揭示分離之SCUBE2抗體或其結合片段。該SCUBE2抗體包含一個抗原結合區域，能專一性的結合於SCUBE2 (SEQ ID NO：66)之標靶域且有能力抑制VEGF誘導之血管新生。該標靶域選自以下結構區域：SCUBE2 (SEQ ID NO：66)之EGF-like結構模組(EGF-like motifs)4至6 (a.a.175至323)、間隔區域 (spacer region) (a.a.441至659)，或第一個富含半胱胺酸結構模組 (cys-rich motif) (a.a.668至725)。該SCUBE2抗體或其結合片段可應用於治療在有需要的個體中與VEGF誘發血管新生之相關疾病，例如藉由遏止腫瘤血管新生而達成降低癌細胞生長之目的。

Description

抑制SCUBE2，一新穎VEGFR2輔受體，遏止腫瘤血管新生

本發明整體上係關於抗血管新生療法，更特定言之係關於應用SCUBE2抗體達成抗血管新生療法。

血管內皮生長因子(VEGF)係血管新生之主要調節者；其結合至內皮細胞(EC)表面之VEGFR2 (受體酪胺酸激酶，RTK)且觸發二聚合及轉磷酸化，以活化下游訊號，包括p44/42促分裂原活化之蛋白激酶(MAPK)及AKT調節EC遷移、增殖及管腔化(tubulogenesis)。這些VEGF反應可進一步受到少數VEGFR2輔受體 (co-receptor) (諸如神經氈蛋白、硫酸乙醯肝素蛋白多糖、CD44及CD146)促進。然而，其他可能存在之調控VEGF誘發之血管新生的VEGFR2輔受體仍待發現。 SCUBE2為最初由人類EC鑑別出之三個演化保守基因家族(SCUBE1、2及3)的第二個成員。該基因約由1,000個胺基酸組成，包含5個蛋白質區域：NH₂ 端信號胜肽 (signal peptide)、9個連續重複之EGF-like結構模組、間隔區域 (spacer region)、3個富含半胱胺酸(cysteine-rich; CR)之重複區域及1個COOH端之CUB區域。這些SCUBE蛋白可藉由兩個不同的機制 [靜電及凝集素-聚糖相互作用(electrostatic and lectin-glycan interactions))經由其間隔區域及CR重複區域結合於細胞表面上作為周邊膜蛋白質 (peripheral membrane protein)，且為多種生長因子之輔受體。除在正常內皮中表現以外，SCUBE2亦在低氧腫瘤微血管中高度表現。然而，SCUBE2是否可作為VEGFR2之輔受體及其在VEGF誘導之血管新生中扮演之角色仍待探究。

整體而言，本發明係關於分離之SCUBE2抗體或其結合片段，其包含一個抗原結合區域能專一性的結合於SCUBE2 (SEQ ID NO：66)之標靶域且有能力抑制VEGF誘導之血管新生。該標靶域選自以下結構區域：SCUBE2 (SEQ ID NO：66)之EGF-like結構模組(EGF-like motifs)4至6 (a.a.175至323)、間隔區域 (spacer region) (a.a.441至659)，或第一個富含半胱胺酸結構模組 (cys-rich motif) (a.a.668至725)。在一個實例中，本發明分離之SCUBE2抗體或其結合片段具有抑制腫瘤血管新生及降低VEGF誘發之內皮細胞增生及管腔形成之特性。在另一實例中，本發明分離之SCUBE2抗體或其結合片段包含重鏈可變域(V_H )及輕鏈可變域(V_L )，其中： (a) V_H 包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列，且V_L 包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列；或 (b) V_H 包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列，且V_L 包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列；或 (c) V_H 包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列，且V_L 包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列；或 (d) V_H 包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列，且V_L 包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列。在另一實例中，SCUBE2抗體之V_H 及V_L 各自包含如下之互補決定區(CDR)1、CDR2、CDR3： (i) V_H 包含有包含SEQ ID NO：19之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：20之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的CDR3；且V_L 包含有包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：23之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的CDR3；或 (ii) V_H 包含有包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的CDR3；且V_L 包含有包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：7之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：8之胺基酸序列的CDR3；或 (iii) V_H 包含有包含SEQ ID NO：35之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：36之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的CDR3；且V_L 包含有包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：39之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的CDR3；或 (iv) V_H 包含有包含SEQ ID NO：51之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：52之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的CDR3；且V_L 包含有包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：55之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的CDR3。在另一實例中，本發明分離之SCUBE2抗體或其結合片段係單株抗體，係人類化的，係融合蛋白質，或選自由以下組成之群：Fv片段、片段抗原結合(Fab)片段、F(ab')₂ 片段、Fab'片段、Fd'片段、及Fd片段及單鏈抗體可變片段(scFv)。在另一實例中，本發明分離之SCUBE2抗體或結合片段囊封於脂質體內。在另一態樣中，本發明係關於一種醫藥組合物，其包含：(i)治療有效量之本發明分離之SCUBE2抗體或其結合片段；及(ii)治療有效量之特異性抗VEGF之VEGF抗體。在一個實例中，醫藥組合物中之SCUBE2抗體其V_H 及V_L 包含如下之胺基酸序列：(i) V_H 包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列，且V_L 包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列，或(ii) V_H 包含有包含SEQ ID NO：19之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：20之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的CDR3；且V_L 包含有包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：23之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的CDR3。在另一實例中，醫藥組合物中之SCUBE2抗體可為單株抗體、嵌合抗體或人類化抗體。在另一實例中，本發明分離之SCUBE2抗體或其結合片段對由人類或小鼠血管內皮細胞上表現之SCUBE2皆有專一性結合能力。在另一態樣中，本發明係關於分離之SCUBE2抗體或其結合片段之用途，其能應用於製造用於在有需要之個體中治療與VEGF誘發血管新生相關疾病之藥物。在一個實例中，與VEGF誘發血管新生之相關疾病係選自以下組成群的至少一者：腫瘤、新生血管性眼部病變、持續增生性玻璃體症候群、糖尿病性視網膜病、早產兒視網膜病、脈絡膜新生血管、子宮內膜異位、子宮出血、卵巢囊腫及卵巢功能亢進。在另一實例中，本發明之用途與特異性抗VEGF之VEGF抗體之用途組合，能應用於製造用於在有需要之個體中治療與VEGF誘發血管新生相關疾病之藥物。另外在另一態樣中，本發明係關於分離之SCUBE2抗體或其結合片段之用途，用於製造用於在有需要之個體中治療腫瘤或抑制腫瘤血管新生及癌細胞生長的藥物。或者，本發明係關於分離之SCUBE2抗體或其結合片段，其用於在有需要之個體中治療與VEGF誘發血管新生之相關疾病，包括治療腫瘤、抑制腫瘤血管新生及癌細胞生長。本發明之SCUBE2抗體或其結合片段可與VEGF抗體(諸如貝伐單抗(bevacizumab))組合使用，用於在有需要之個體中治療與VEGF誘發血管新生之相關疾病，或用於治療腫瘤、抑制腫瘤血管新生及癌細胞生長。本發明亦係關於用於在有需要之個體中治療與VEGF誘發血管新生之相關疾病、治療腫瘤或抑制腫瘤血管新生及癌細胞生長的方法。該方法包含向有需要之個體投與治療有效量之本發明之SCUBE2抗體或其結合片段。該方法可進一步包含向有需要之個體投與治療有效量之VEGF抗體。這些結果將由以下實例描述結合圖表詳細說明，但可在不背離本發明新穎概念之精神及範疇情況下，進行修改。附圖說明本發明之一或多個實例，且與書面描述一併解釋本發明之原理。在任何可能之處，將貫穿各圖式使用相同參考編號來取代實例之相同或相似元件。

本發明更特定描述於以下實例中，該等實例意欲僅為說明性目的，因為熟習此項技術者將清楚其中的許多修改及變化。現詳細地描述本發明之各種實施例。參看圖式，在整個視圖中類似編號指示類似組件。如在本文之[實施方式]及之後的整個申請專利範圍中所用，除非上下文另外明確指示，否則「一(a/an)」及「該」之含義包括複數個參考物。另外，如在本文之[實施方式]及之後的整個申請專利範圍中所用，除非上下文另外明確指示，否則「在……中」之含義包括「在……中」及「在……上」。此外，為方便讀者閱讀，本說明書中可使用標題或子標題，其應不影響本發明之範疇。另外，本說明書中所用的一些術語更特定地定義於下文。定義除非另外定義，否則本文中所用之所有技術及科學術語具有與本發明所屬領域之一般熟習此項技術者通常所理解相同之含義。在有矛盾的情況下，將以本文件(包括定義)為準。出於說明書及申請專利範圍之目的，本文之術語「抗體片段」或「其片段」用以意謂完整抗體分子之部分或片段，其中片段保有抗原結合功能；亦即，F(ab')₂ 、Fab'、Fab、Fv、單鏈Fv (「scFv」)、Fd'及Fd片段。用於自mAb生成各種片段之方法為熟習此項技術者所熟知。術語「對由人類血管內皮細胞上表現之SCUBE2及鼠類血管內皮細胞上表現之SCUBE2共有之交叉反應性抗原決定基的特異性結合親和力或結合特異性」(或「對人類SCUBE2與鼠類SCUBE2之間的交叉反應性抗原決定基的結合特異性」)在本文中用以意謂抗SCUBE2抗體結合存在於人類SCUBE2與鼠類SCUBE2上之交叉反應性抗原決定基的特性，其中(a)該抗原決定基在表現SCUBE2之血管內皮細胞之表面上係可接近的；(b)與存在於鼠類內皮細胞上之SCUBE2抗原決定基的結合大於由同型對照免疫球蛋白呈現之結合，且「大於」可定量地量測，因為抗SCUBE2 mAb之結合減去一個標準差必須大於同型對照免疫球蛋白之結合加上1個標準差，如將在以下實例中更加顯而易見；且(c)抗SCUBE2抗體對鼠類內皮細胞上表現之SCUBE2之結合比抗SCUBE2抗體對人類內皮細胞上表現的SCUBE2的結合時低至少兩倍，如在免疫反應性之標準分析中所偵測。輔受體係除主要受體以外結合傳訊分子的細胞表面受體，以便促進配位體識別且起始生物過程。人類SCUBE2 cDNA之核苷酸序列(SEQ ID NO：65)；人類SCUBE2之胺基酸序列(SEQ ID NO：66)。縮寫：EC，內皮細胞；；EC-KO小鼠，EC特異性Scube2 基因剔除小鼠；LLC，路易斯肺癌瘤；AP ，鹼性磷酸酶；HIF ，低氧誘導性因子；HUVEC ，人類臍靜脈內皮細胞；KO ，基因剔除；MAPK ，促分裂原活化之蛋白激酶；MLEC ，小鼠肺內皮細胞；RTK ，受體酪胺酸激酶；SCUBE2 ，含信號肽(補體蛋白質C1r/C1s、Uegf及Bmp1(CUB))表皮生長因子(EGF)域之蛋白質2；shRNA ，短髮夾RNA；VEGF ，血管內皮生長因子；VEGFR2 ，血管內皮生長因子受體2。效用 / 適應症 (1)病理性腫瘤血管新生；及 (2)新生血管性眼部疾病 SCUBE2係在正常及腫瘤血管內皮細胞(EC)中表現之周邊膜蛋白質；然而，其在血管新生中之作用仍未充分被探究。吾等發現SCUBE2作為VEGFR2之輔受體及其在VEGF誘導之血管新生中的作用。SCUBE2藉由低氧誘導性因子(HIF-1α)對低氧條件起反應而表現量增加且與人類EC中之VEGFR2相互作用，在人類EC中SCUBE2為VEGFR2之輔受體而有助於VEGF結合且增強VEGF下游訊號傳遞，因此促進VEGF誘發之血管新生及腫瘤血管新生。此SCUBE2及VEGFR2相互作用及其增強的訊號傳遞可受到內皮細胞Scube2 基因去活化、SCUBE2 shRNA造成之基因表現下降以及活體外及活體內的SCUBE2 mAb抑制。內皮細胞Scube2 基因剔除(EC-KO小鼠)不影響血管發育，但在MATRIGEL™植入物中顯示VEGF誘發之血管生成減少，及在誘導後肢局部缺血後減弱的血液流動復原。SCUBE2係VEGFR2之新穎輔受體，其藉由調節VEGFR2相關之訊號傳遞 (尤其在藉由局部缺血或在低氧條件下誘導之產後血管新生期間)來影響VEGF誘發之管腔生成及EC增生。於腫瘤EC中標靶此SCUBE2功能作為抑制腫瘤血管新生之潛在抗腫瘤模式。吾等發現SCUBE2為VEGFR2之輔受體以強化VEGF與VEGFR2之結合且增強其訊號傳遞，包括VEGFR2磷酸化及p44/42促分裂原活化之蛋白激酶(MAPK)/Akt活化，因此促進EC中之細胞增生及管腔生成。在小鼠中內皮細胞去除Scube2 的情況下，生理性血管新生正常，實驗腫瘤中之病理性血管新生則發生改變，顯示抑制腫瘤及減少血管密度。為模擬腫瘤之血管新生環境，分離缺乏Scube2 之EC且藉由VEGF活體外繁殖。突變EC展示明顯減少的VEGF結合、增生及對VEGF的出芽反應以及下游訊號活化。此外，SCUBE2及VEGFmAb對異種移植肺腫瘤具有累加的抑制作用。總之，吾人之發現確定SCUBE2在腫瘤EC中是VEGF反應的關鍵調節因子，且表明抗SCUBE2策略在組合抗血管新生癌症療法中具有極大的潛力。實例不意欲限制本發明之範疇，在下文中提供根據本發明之實施例的例示性儀器、設備、方法及其相關結果。應注意，為方便讀者閱讀，實例中可使用標題或子標題，其決不應限制本發明之範疇。此外，在本文中提出且揭示某些理論；然而，不論其係正確或錯誤的，其絕不應限制本發明之範疇，只要本發明係根據本發明實施即可，而不需考慮任何特定理論或操作流程。材料及方法 抗體及試劑 . 抗SCUBE2、抗HIF-1α及抗磷酸基-酪胺酸多株抗體來自GeneTex (Irvine，CA)。抗磷酸基-VEGFR2 (Thr1059)、抗磷酸基-MAPK p44/p42 (Thr202/Tyr204)、抗MAPK p44/p42、抗磷酸基-AKT (Ser473)、抗AKT及抗EGFR抗體來自Cell Signaling Technology (Danvers，MA)。抗VEGFR2及抗VEGF抗體分別來自Thermo Scientific (Rockford，IL)及Santa Cruz Biotechnology (Santa Cruz，CA)。抗CD31、抗磷酸基-絲胺酸/蘇胺酸、抗VEGFR1及抗神經氈蛋白-1抗體來自Abcam (Cambridge，MA)。抗Ki67及抗β-肌動蛋白抗體分別來自DAKO Cytomatation (Glostrup, Denmark)及NOVUS Biologicals (Littleton，CO)。重組VEGF₁₆₅ 蛋白質來自R&D Systems (Minneapolis，MN)。生成抗 SCUBE2 單株抗體 . 如下生成抗SCUBE2特異性抗體。來自生產自HEK-293T細胞之經純化之重組SCUBE2間隔子區(胺基酸445至667)免疫接種的BALB/c小鼠的脾細胞與骨髓瘤細胞(SP2/O)融合以產生融合瘤。融合瘤細胞株如先前所描述進行製備及次選殖(Hadas等人「Production of monoclonal antibodies. The effect of hybridoma concentration on the yield of antibody-producing clones」J Immunol Methods 1987; 96:3-6)。對SCUBE2 (非SCUBE1及3)呈陽性之融合瘤細胞株如所描述進行鑑別(Tu等人「Localization and characterization of a novel protein SCUBE1 in human platelets」Cardiovasc Res. 2006;71:486-95；Cheng等人「SCUBE2 suppresses breast tumor cell proliferation and confers a favorable prognosis in invasive breast cancer」Cancer Res. 2009; 69:3634-41)。產生條件性 Scube2^Flox ^/ ^Flox 及內皮特異性 Scube2 基因剔除 ( EC - KO ) 小鼠 . 如所描述生成含有兩個被覆蓋外顯子2至21之65 kb基因組序列分開之lox P位點的條件性Scube2^Flox 對偶基因。為產生內皮特異性之條件性KO小鼠，在Tie2 啟動子² 控制下表現Cre重組酶且針對Scube2 異型接合(Tie2 - Cre ； Scube2 ^+/- )的轉殖基因小鼠與Scube2^Flox ^/ ^Flox 動物雜交以獲得實驗Tie2 - Cre ；Scube2^Flox ^/+ (對照)及Tie2 - Cre ；Scube2^Flox ^/- (EC-KO)小鼠。雄性小鼠主要用於在各實驗組(n = 5或大於5)。所有動物實驗均經由中央研究院動物管理學會及使用委員會(Institute Animal Care and Utilization Committee, Academia Sinica)核准。腫瘤異種移植 . 藉由在對照組及EC-KO小鼠之側腹上皮下注射1 × 10⁶ 個黑素瘤細胞 (B16F10)或路易斯肺癌瘤細胞(LLC)而產生異種移植腫瘤。腫瘤大小是藉由使用數位測徑規一週兩次量測且藉由長度 × 寬度 × 高度 × 0.5236計算(以mm³ 為單位)。在腫瘤生長16天之後，將腫瘤固定且包埋於石蠟中用於組織切片。哌莫硝唑(Pimonidazole)及APO-BRDU™ (TUNEL)細胞凋亡試劑是根據製造商說明書使用。來自LLC及B16F10腫瘤之組織血管及增殖分別是藉由使用CD31及Ki-67抗體觀測。MATRIGEL™ 血管新生分析 . 血管新生模型係基於在對照或EC-KO小鼠中使用MARTIGEL™植入物。將0.5 ml量之生長因子減少之MARTIGEL™ (具有或不具有100 ng/ml VEGF)注入小鼠側腹。注射由26G針頭快速完成，以確保注射器之內容物呈單個塞遞送。一週之後，採集塞且在RIPA溶胞緩衝液中均質化。在藉由離心移除殘渣之後，藉由使用都氏試劑(Drabkin's regent) (Sigma-Aldrich)量測血紅素濃度。或者，將塞固定於4%多聚甲醛中隔夜、包埋於石蠟中、切片，且用抗CD31抗體染色。後肢局部缺血模型 . 如先前所描述³ 執行後肢局部缺血模型。簡言之，露出對照組及EC-KO小鼠(8週)之股動脈，與股神經及靜脈分離，且在兩個相隔5 mm之位置結紮，一個位置正好接近腹股溝韌帶，且第二個位置遠離第一位置且接近膕動脈。藉由間斷4-0縫合線閉合皮膚。小鼠在手術前後之不同時間予以麻醉，使用Moor紅外雷射都卜勒影像儀觀測雷射都卜勒流動成像，且。在近端股動脈結紮之後3週，使用麻醉小鼠採集小腿肌肉且以CD31 Ab染色。主動脈環出芽分析 . 基本上如標準程序來製備小鼠主動脈環出芽分析。主動脈採集自小鼠。用鑷子及解剖刀移除所有額外的脂肪、組織及分支血管。將主動脈移至含有OPTI-MEM培養基之培養皿，且主動脈切割大約0.5 mm厚的環狀。將主動脈環嵌入1 mg/ml I型膠原蛋白中且隨後使其在37℃/5% CO₂ 下培育1 h。添加補充有2.5% FBS及30 ng/ml VEGF之OPTI-MEM培養基且包圍主動脈環。在第5天計算微血管出芽之數目及長度。免疫組織化學 . 組織切片(5 μm厚)用二甲苯脫蠟、在梯度濃度之乙醇中復水、用3% H₂ O₂ 處理20 min、以PBS洗滌、阻斷溶液(補充有2% BSA及2%正常山羊血清之PBST)作用1 h，且在室溫下與一級抗體培育隔夜。藉由使用過氧化酶結合之抗體及穩定3,3'-二胺基聯苯胺(DAB)過氧化酶受質偵測抗體結合。使用蘇木精(Hematoxylin)進行對比染色。初代小鼠肺 EC ( MLEC ) 分離、鑑別 及培養 . 如所描述⁶ 由對照組及EC-KO小鼠之肺組織分離初代MLEC。各小鼠(6週齡)首先接受100 µl之肝素(140 U/ml)尾靜脈注射，隨後10 min之後，將小鼠麻醉，且使胸腔暴露。經由右心室注射低溫M199培養基以自肺沖洗掉血液。隨後將1 ml量之膠原蛋白酶A (1 mg/ml)經由血管快速滴注進入肺中。移除肺且與5 ml膠原蛋白酶A在37℃下一起培育30 min。細胞懸浮液藉由70 µm過濾器過濾，隨後在1000 rpm下離心5 min。使細胞再懸浮於生長培養基(補充有20%胎牛血清、50 μg/ml EC生長因子、100 μg/ml肝素、2 mM麩醯胺、100單位/毫升之青黴素及100 μg/ml鏈黴素之M199培養基)中且培養於塗佈明膠之組織培養皿中持續2天。使用胰蛋白酶移除細胞且細胞懸浮液用於CD31-PE抗體染色及FACS分選。HUVEC 中之 低氧處理及慢病毒 SCUBE2 過度表現 / 基因表現減量 . HUVEC購自生物資源收集及研究中心(Bioresource Collection and Research Center，臺灣)且根據供應商之建議進行培養。針對低氧處理，藉由在以95% N₂ /5% CO₂ 之混合物充氣之CO₂ 培育箱中培育而使HUVEC暴露於低氧(1% O₂ )。HUVEC藉由慢病毒轉導系統將SCUBE2表現於HUVEC中。吾等使用由RNAi產生之髮夾RNA (shRNA)使HUVEC中之內源性SCUBE2基因表現減量。染色質免疫沈澱 ( ChIP ). ChIP分析如在EZ-MAGNACHIP™ G套組使用說明書描述。簡言之，HUVEC (1 × 10⁷ 個細胞)藉由使用1%甲醛交聯，在500 μl溶胞緩衝液中溶解且超音波震盪處理成大約500 bp片段。ChIP使用抗HIF-1α或IgG之抗體。對照組DNA或免疫沈澱DNA取2 μl之DNA模板組成之50 μl反應體積中用引子(表1)擴增。PCR涉及使用Taq聚合酶35個循環：94℃持續30 sec，63.5℃持續30 sec，72℃持續40 sec，隨後72℃下持續5 min。在1.5%瓊脂糖凝膠上分離來自各PCR反應之10 µl樣品。螢光素酶報導基因分析 . 使用NUCLEOFECTOR™根據製造商之說明書，以4.5 µg SCUBE2啟動子螢光素酶報導基因質體(WT、M1、M2及M3)及內部對照(0.45 µg pRL-TK Renilla螢光素酶質體)短暫轉染HUVEC。再培養細胞2天，採集且製備，用於雙螢光素酶報導基因分析系統之報導基因分析。EC 增生分析 . 如所描述藉由溴化3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四唑鎓(MTT)分析來確定SCUBE2對EC增生之作用。簡言之，EC經胰蛋白酶處理且於100 µl培養基中含2000個細胞培養於96孔細胞培養盤上。次日，用VEGF (100 ng/ml)或對照培養基作用細胞4天，檢測細胞數目。EC 管腔生成分析 . 將EC (3 × 10³ 個細胞/孔)接種於具有VEGF(100 ng/ml)之15孔µ-Slide血管新生盤中之MATRIGEL™上。16小時之後，藉由計數在每孔之3個隨機區域中之血管來確定管腔化。VEGF 鹼性磷酸酶 ( AP ) 結合分析 . 基本上如文獻描述進行AP標記之VEGF蛋白質之生成及結合實驗。AP-VEGF藉由使用PCR藉由以下引子擴增VEGF cDNA之部分來構築：CCG CTC GAG GCA CCC ATG GCA GAA GGA (SEQ ID NO：67)及GCT CTA GAT TAT CAC CGC CTC GGC TTG TCA CA (SEQ ID NO：68)。隨後將498bp之擴增片段剪接於APtag-5之XhoI及XbaI限制位點中。AP-VEGF融合蛋白質及對照AP蛋白質是藉由短暫轉染至HEK-293T細胞中來生成。收集經轉染HEK-293T細胞之上清液、濃縮且儲存。將過度表現VEGFR2或連同SCUBE2一起過度表現之HEK-293T細胞及EC在上清液中於4℃下培育4 h，且以PBS洗滌3次。隨後細胞於冰上在溶胞緩衝液(25 mM Hepes，pH7.6、150 mM NaCl、5 mM EDTA、10 µg/ml抑肽酶、5 µg/ml亮抑酶肽、10%甘油及1% Triton X-100)中溶解5 min。細胞溶解物藉由在4℃下以10,000 xg離心20 min取上清液。AP活性使用磷酸對硝苯酯受質偵測。蛋白質相互作用 分析 . 使用活體外轉錄/轉譯方法生成Myc標記之VE-鈣黏素-FL、D1及D2蛋白質(Myc.VE-鈣黏素-FL、-D1、-D2)。使用麩胱甘肽-SEPHAROSE™珠粒自細菌溶解物之可溶部分結合重組GST標記之SCUBE2-CUB蛋白質(GST.SCUBE2-CUB)。FLAG標記之SCUBE2-FL、EGF、間隔區域、CR及CUB蛋白質(FLAG.SCUBE2-FL、-EGF、-間隔子、-CR、-CUB)藉由HEK-293T細胞過度表現生成。重組VEGF₁₆₅ 蛋白質購自R&D Systems。關於SCUBE2及VEGF₁₆₅ 相互作用分析，重組VEGF₁₆₅ 蛋白質與結合至抗FLAG M2抗體-瓊脂糖珠粒或對照珠粒之FLAG.SCUBE2-FL、EGF、間隔子、CR及CUB蛋白質在0.5 ml結合緩衝液[40 mM HEPES (pH 7.5)，100 mM KCl，0.1% NONIDET™ P-40及20 mM 2-巰基乙醇]中混合。在4℃下培育4 h之後，充分洗滌珠粒，且藉由免疫墨點法使用抗VEGF抗體來觀測相互作用的蛋白質。關於SCUBE2及VEGFR2相互作用分析，GST標記之SCUBE2-CUB蛋白質與Myc.VEGFR2-FL、-D1、-D2蛋白質在0.5 ml結合緩衝液中混合。在4℃下培育4 h之後，在輕微搖動下使蛋白質溶液與麩胱甘肽-SEPHAROSE™一起培育2 h。以結合緩衝液洗滌三次之後，藉由免疫墨點法使用抗Myc抗體來觀測沈澱之結合蛋白。共軛焦免疫螢光顯微分析 . 將內皮細胞固定於4%甲醛中，以2%胎牛血清作用1 h，且與雞抗SCUBE2及小鼠抗VEGFR2抗體一起培育1 h。以PBS洗滌3次且用ALEXA FLUOR® 488標記之抗小鼠IgG抗體及Alexa Fluor 594標記之抗雞IgY抗體染色1 h，隨後用PBS洗滌3次，且藉由使用具有DAPI之VECTASHIELD®封固劑封固。在室溫下在共軛焦顯微鏡下擷取螢光影像。RNA 提取、 cDNA 合成及 RT - PCR 藉由TRIZOL®方法由經培養細胞製備總RNA。取5μg RNA，使用SUPERSCRIPT™ II逆轉錄酶進行第一股cDNA合成。第一股cDNA反應物之十分之一作為模板用於各PCR。PCR產物以1%瓊脂糖凝膠上分析。引子列於表1中。免疫沈澱及西方墨點分析 Myc標記之VEGFR2表現構築體單獨及與編碼指定之FLAG標記之SCUBE2蛋白質的一系列表現質體組合轉染於HEK-293T細胞中。轉染之後兩天，用PBS洗滌細胞一次，於冰上在細胞溶解緩衝液(25 mM Hepes，pH7.6、150 mM NaCl、5 mM EDTA、10 µg/ml抑肽酶、5 µg/ml亮抑酶肽、10%甘油及1% TRITON® X-100)中作用5 min。細胞溶解物藉由在4℃下以10,000 xg離心20 min後取上清液。樣品與1 µg之指定抗體及20 µl之50% (v/v)蛋白A瓊脂糖在輕微搖動下一起培育2 h。在以緩衝液洗滌3次後，沈澱之錯合物藉由沸騰加熱溶解於樣品緩衝液，以SDS-PAGE分離，且轉移至PVDF膜，以含有0.1%明膠及0.05%TWEEN® 20之磷酸鹽緩衝鹽水(pH 7.5)反應且用指定抗體進行墨點分析。在2次洗滌之後，將墨點與過氧化酶結合之山羊抗小鼠IgG一起培育1 h。在洗滌膜之後，藉由使用VISGLOW™化學發光受質、HRP系統(Visual Protein)觀測。統計分析 . 資料呈現為平均值 ± SD且藉由雙尾成對t 檢定進行分析。P ＜ 0.05視為在統計上具有顯著差異。表1列舉用於RT-PCR (SEQ ID NO：69-82；85-86)；ChIP (SEQ ID NO：83-84)；Q-PCR (SEQ ID NO：87-94)；基因分型(SEQ ID NO：95-102)之引子序列及SEQ ID NO：。表1

基因	正向(SEQ ID NO：)	反向(SEQ ID NO：)
SCUBE1	TGCGGCGGCGAGCTTGGTGAC (69)	TTTGGAGCGCAGCAGTTTGATGAA (70)
SCUBE2	TCTTGCCCAGGAAATACTACGACT (71)	TGGGCCAGGACATCAAACAGAG (72)
SCUBE3	TGGCCCAATGCAAGAATCGTCAGT (73)	TGGGCTAGCACCTCAAAGAAG (74)
GAPDH	GCCAAAAGGGTCATCATCTC (75)	ACCACCTGGTGCTCAGTGTA (76)
Scube1	CGGCGGCGAACTTGGTGACTACA (77)	TTGATAAAGGACCGGGGGAACAT (78)
Scube2	TGACTACCTGGTGATGCGGAAAAC (79)	CAGTGGCGTGTGGGAAGAGTCA (80)
Scube3	TGCTCCCCGGGCCACTACTAT (81)	AGCGCTGTTGGCCTCACTGGTCTT (82)
SCUBE2	GCACACGCACGCGCGCACACA (83)	GAAGGGTGCAGAGGGTGTGCT (84)
Gapdh	ATCATCCCTGCATCCACTGGTGCTG (85)	TGATGGCATTCAAGAGAGTAGGGAG(86)
SCUBE1	AACATCCCGGGGAACTACAG (87)	GCAGCCACCATTATTGTCCT (88)
SCUBE2	CAGGCAGAGTCCTGTGGAGT (89)	TAAAATGCAGCGTTCTCGTG (90)
SCUBE3	CCTGCTTGTCCTGCTGGT (91)	TCGATGTGGCAGTTGTCAGT (92)
GAPDH	TGAAGGTCGGAGTCAACGG (93)	AGAGTTAAAAGCAGCCCTGGTG (94)
Scube2-5 ' Flox	ATAGTCGACTGTTGTCCAGTATCTGTTGC (95)	ATAGCGGCCGCTACGACACCCTGGGATAAAG (96)
Scube2-3 ' Flox	GGCCATGTCCCTGAAGAAAACTA (97)	TTATGGGGCCAAGACACTCAAA (98)
Scube2- 空白	CTGGGGCCTCTGGGACACTATT (99)	GTTATGGGGCCAAGACACTCAAA (100)
Cre	TTACCGGTCGATGCAACGAGTGATG (101)	GTGAAACAGCATTGCTGTCACTT (102)

^* SCUBE1 至 3 及GAPDH 係人類基因；Scube1 至 3 及Gapdh 係小鼠基因。結果 SCUBE2 表現於人類 EC 中 且調節 VEGF 誘導之 EC 增殖及管形成 吾等藉由免疫染色(圖1A)、流式細胞量測術(圖1B)及西方墨點分析(圖1C)首先確認SCUBE2蛋白質表現於HUVEC中。共軛焦免疫螢光染色及流式細胞分析揭示SCUBE2表現於EC細胞膜上(圖1A及1B)。另外，SCUBE2於增生性未匯合EC中表現量高於生長停滯之匯合EC (圖1C)。吾等隨後藉由SCUBE2在人類EC中之過度表現及基因表現減少來研究SCUBE2在調節VEGF反應中之潛在作用。以重組慢病毒在HUVEC中表現全長FLAG標記之SCUBE2或兩個獨立的標靶SCUBE2之短髮夾RNA (shRNA 1號及2號)，SCUBE2之過度表現及基因表現減少藉由RT-PCR或西方墨點分析驗證(圖1D及1G)。SCUBE2過度表現明顯增加(圖1E及1F)而SCUBE2基因表現減量(圖1H及1I)明顯減少VEGF誘發之EC生長及MATRIGEL™上之管腔生成網狀結構。總之，此等資料支持SCUBE2在HUVEC中具有調節VEGF誘發之增生及管腔生成之能力。HUVEC 中 SCUBE2 藉由 HIF - 1α 調節增加表現量 因為低氧誘發之藉由HIF-1α造成之VEGF表現增加對於產後的新血管生成至為關鍵，故而吾等隨後研究內皮細胞SCUBE2是否亦藉由類似機制增加其表現量。HUVEC暴露於低氧12 h之後，SCUBE2 (而非SCUBE1或SCUBE3)之表現在mRNA及蛋白質兩個層面皆顯著增加，其表現量與HIF-1α呈現正相關(圖2A及2B)。此外，ChIP分析及啟動子突變分析確認於低氧狀況下內源性HIF-1α可與SCUBE2啟動子之HIF結合區域(A/GCTGA)相互作用促使HUVEC中之SCUBE2表現增加(圖2C-2E)。產生 EC 專一性 Scube2 基因剔除 ( EC - KO ) 小鼠為進一步研究內皮細胞Scube2 對活體內VEGF反應之作用，吾等藉由使帶有Scube2 之條件性「Floxed」對偶基因[側接編碼9個EGF樣重複單元、間隔子區、3個富含半胱胺酸之結構模組及具有loxP 之CUB域的外顯子]之小鼠與在血管生成素受體(Tie2)啟動子控制下表現噬菌體重組酶Cre (其為泛內皮表現)的轉殖基因小鼠雜交，專一性剔除EC中之Scube2 。雄性Tie2 - Cre ；Scube2 ^+/- 與雌性Scube2^Flox ^/ ^Flox 小鼠交配以獲得Tie2 - Cre ；Scube2^Flox ^/+ (命名為「對照組」) 及Tie2 - Cre ；Scube2^Flox ^/- (命名為EC-KO)小鼠。為測定Scube2^Flox 對偶基因之內皮特異性重組效率，自對照組及EC-KO小鼠分離初代MLEC。流式細胞分析揭示此細胞群高度富含EC，此係因為大約95%之此等細胞皆表現CD31。另外，mRNA與蛋白質分析顯示Scube2 專一性的於小鼠內皮細胞中移除，而不影響EC-KO MLEC中之Scube1 及Scube3 表現量。同樣地，成年小鼠肺之免疫染色驗證EC-KO小鼠中完全去除內皮細胞(而非支氣管上皮細胞)Scube2 表現。因此，在成年EC-KO小鼠之內皮細胞中有效剔除Scube2 。對照組及EC-KO小鼠之繁殖結果符合孟德爾(Mendelian)定率，顯此發育中血管生成及血管新生並無異常。吾等在對照組及EC-KO小鼠之間未觀測到總體健康狀況及行為之明顯差異。EC-KO雌性能正常繁殖且幼崽正常，這表明再生性血管新生足以使得群落增殖。總之，此等資料表明內皮細胞Scube2 基因剔除不影響生理性血管新生。 Scube2 EC - KO 小鼠對 VEGF 及成體血管新生之反應減弱 為探究內皮細胞Scube2 在活體內VEGF刺激之血管新生中的潛在功能，吾等使用MATRIGEL™嵌入物分析，其中與VEGF(+)或生理食鹽水(-)混合之MATRIGEL™皮下投與至年齡及性別匹配的EC-KO及對照小鼠，7天後回收(圖3)。在肉眼檢查上，含有來自對照小鼠之VEGF之MATRIGEL™嵌入物係淡紅棕色的(圖3A)。然而，含有來自EC-KO小鼠之VEGF之嵌入物比對照組淡(圖3A)。同樣地，就EC-KO小鼠來說，含VEGF之MATRIGEL™塞中之總血紅素含量(一種無破損血管形成之量度，與新形成的毛細管網狀結構之量相關)降低約50% (圖3B)。為確保此血紅素差異是由減小的微血管分布密度所致，藉由用CD31抗體(內皮之標記物)免疫染色來量化嵌入物中之血管增生 (圖3C及3D)。與植入MATRIGEL™之對照小鼠相比，經植入EC-KO小鼠顯示血管生成減少，即使在含生理食鹽水之嵌入物中亦如此(圖3C)。此外，在EC-KO中含VEGF嵌入物之血管密度比對照小鼠低50% (圖3D)，且未見大血管(圖3C)，這表明VEGF誘導之成體血管新生反應受內皮細胞Scube2 調節。為進一步評估內皮細胞Scube2 之促血管新生作用，吾等使用第二種成體新血管生成動物模式(亦即，後肢局部缺血)：在對照組及EC-KO小鼠中結紮總股動脈，且分別藉由雷射都卜勒成像及CD31免疫染色隨時間點監測血液流動以及血管新生。雷射都卜勒分析揭示與未結紮對側肢體相比，手術後之對照組及EC-KO動物之結紮肢體中血液流動的減少程度類似(圖3E及3F)，表示在兩種品系中手術後局部缺血情況相同。在對照組小鼠中，血液流動在手術後21天復原至近乎基線水準。然而，在EC-KO動物中血液流動復原明顯減弱(圖3E及3F)。同樣地，腓腸肌(小腿)肌肉之組織學顯示在21天時EC-KO中經由結紮誘發之CD31陽性血管密度低於對照小鼠(圖3G及3H)。因此，在經由股動脈結紮誘發之局部缺血後，Scube2 於內皮細胞功能性血管新生上扮演不可或缺的角色。SCUBE2 在 HUVEC 中與 VEGFR2 相互作用且 增強 VEGF 與 VEGFR2 之結合由於SCUBE2可在活體外及活體內調節VEGF反應(圖1及3)且SCUBE蛋白質可作為訊號傳遞受體絲胺酸/蘇胺酸激酶或RTK之輔受體，因此吾等分析SCUBE2是否在HUVEC中與VEGFR2相互作用。共軛焦顯微鏡及共免疫沈澱實驗顯示在HUVEC中VEGF增強SCUBE2與VEGFR2之結合，在VEGF刺激之後10 min達到高峰值。在以SCUBE2及VEGFR2表現質體轉染之HEK-293T細胞中進一步詳細描述這個結果，顯示SCUBE2之CUB結構區域可與VEGFR2相互作用。另外，此SCUBE2-VEGFR2相互作用具有專一性，此係因為抗SCUBE2免疫沈澱並未降低其他RTK (諸如VEGFR1及EGFR)或另一種VEGFR2輔受體神經氈蛋白-1。最重要的是，除結合於VEGFR2以外，SCUBE2可經由其EGF-like重複結構區域直接與VEGF-A₁₆₅ 結合。吾等已進行額外共免疫沈澱實驗來驗證SCUBE1或SCUBE3是否亦可結合於VEGF或VEGFR2。不同於專一性結合於VEGF之SCUBE2，SCUBE1及SCUBE3無法與VEGF相互作用，表明SCUBE1或SCUBE3不能作為VEGF之輔受體(參見Lin等人「Endothelial SCUBE2 Interacts With VEGFR2 and Regulates VEGF-Induced Angiogenesis」Arterioscler Thromb Vasc Biol . 2017;37:144-155)。為評估SCUBE2實際上是否能夠增強VEGF與VEGFR2之結合，吾等首先生成鹼性磷酸酶(AP)-VEGF融合蛋白質。如與對照AP蛋白質相較，於HUVEC中AP-VEGF蛋白質有能力結合於內源性VEGFR2上。有趣的是，如與相對應對照HUVEC相較，SCUBE2過度表現會增加而SCUBE2基因表現減量或基因剔除會減少AP-VEGF結合。同樣地，史卡查(Scatchard)分析顯示在HEK-293T細胞中，在VEGFR2與SCUBE2共表現之情況下，VEGF與VEGFR2之結合親和力較僅VEGFR2之情況下的約增加3倍(K_d = 0.21 nM相對於0.58 nM)。總之，此等資料表明SCUBE2作為VEGFR2之輔受體且增強VEGF與VEGFR2之結合。SCUBE2 調整 HUVEC 中之 VEGFR2 磷酸化及下游訊號傳遞 吾等接著研究SCUBE2是否有助於HUVEC中之VEGF活化訊號傳遞。為此，吾等使用作為刺激劑之VEGF及SCUBE2 shRNA基因表現減量或SCUBE2過度表現來評估SCUBE2對VEGF誘導之訊號傳遞之功能。VEGF可誘發VEGFR2 Tyr1059磷酸化、p44/42 MAPK信號級聯及AKT活化。然而，SCUBE2 shRNA基因表現減量會減少(圖4A至B)而SCUBE2過度表現(圖4C至D)會增強VEGF誘導之VEGFR2磷酸化、p44/42 MAPK信號級聯及AKT活化。吾人之資料強烈指示作為VEGFR2輔受體，SCUBE2在HUVEC中有能力調節VEGF誘導之VEGFR2下游訊號傳遞。吾等已判定HUVEC中VEGF處理後SCUBE2之磷酸化狀況。在VEGF刺激之後，抗SCUBE2免疫沈澱物分別使用抗磷酸酪胺酸(p-Tyr)或抗磷絲胺酸/蘇胺酸(p-Ser/Thr)泛特異性抗體進行墨點分析。在以VEGF處理長達30 min後，SCUBE2似乎未磷酸化。然而，需要額外磷酸基蛋白質組分析來驗證SCUBE2是否在VEGF刺激之後磷酸化。 Scube2 調整初代鼠類肺 EC ( MLEC ) 中之 VEGF 訊號傳遞 與吾人之HUVEC中之基因表現減量實驗(圖1G-1I)類似，如與對照MLEC相比，在EC-KO MLEC中VEGF誘導之細胞增生及管腔生成明顯減弱(圖5A至B)。吾等進一步評估內皮細胞Scube2 基因缺失對VEGF誘導之訊號傳遞之作用。吾等以50 ng/ml VEGF刺激對照及EC-KO MLEC歷時0、10、20及30 min。與HUVEC中之SCUBE2 shRNA基因表現減量一致，EC-KO中藉由VEGFR2、p44/42 MAPK及AKT之磷酸化測定之VEGF訊號傳遞明顯低於對照MLEC (圖5C至D)。 Scube2 EC - KO 小鼠之主動脈環血管新生能力降低 吾等使用離體主動脈環分析進一步研究SCUBE2在血管新生中之功能，其中吾等比較源於對照組及EC-KO小鼠之主動脈環之血管新生能力。將自對照組及EC-KO小鼠分離之主動脈環以PBS或VEGF處理，且藉由量化生長之血管數目及量測新形成血管之總長度來測定各個別主動脈環之血管新生反應。第5天時，對VEGF (30 ng/ml)產生反應之管狀結構(出芽)數目及出芽之長度的定量結果顯示，與對照組主動脈環相較EC-KO中之兩個參數皆明顯降低(圖5E至5F)。因此，此等結果進一步確認活體外分析結果，證明SCUBE2於VEGFR2相關之血管新生中之重要性。EC - KO 小鼠中腫瘤生長降低 SCUBE2在腫瘤內皮細胞中高度表現。圖6顯示免疫組織化學染色之結果，說明乳房、肺、黑素瘤(A)及前列腺、肉瘤及膀胱癌瘤(B)中SCUBE2大量表現於EC(箭頭)。內皮細胞Scube2 於成體血管新生扮演重要角色 (圖3)，吾等隨後研究Scube2 之內皮細胞剔除 (EC-KO)對病理性腫瘤血管新生及腫瘤生長之影響。對照組及EC-KO小鼠皮下注射同基因型黑素瘤(B16F10)或路易斯肺癌瘤(LLC)細胞。EC-KO之腫瘤之生長與尺寸均低於對照小鼠(圖7A至D)。與剔除內皮細胞Scube2 之成體血管新生一致，EC-KO中之血管密度(藉由抗CD31染色所見)明顯低於對照組腫瘤(圖7E至H)，顯示內皮細胞Scube2 於促進腫瘤血管新生及生長中發揮重要功能。重要的是，非腫瘤成體皮膚中之血管密度和對照組與EC-KO動物並無差異(資料未示出)。 EC-KO小鼠中觀測到之血管新生缺陷暗示腫瘤細胞可能缺乏營養物質及氧且因而經歷細胞凋亡及壞死。與此概念相符，蘇木精(hematoxylin)及曙紅(eosin)染色揭示EC-KO腫瘤中壞死組織，但在對照組腫瘤中的壞死區域小得多(圖8A至B)。此外，如與對照組腫瘤相較，末端脫氧核苷酸轉移酶dUTP切口末端標記(TUNEL)分析及Ki-67免疫染色在EC-KO腫瘤中顯示細胞凋亡增加且腫瘤細胞增生明顯降低(圖8C-F)。此外，這些結果顯示內皮細胞Scube2 對於血管新生以維持腫瘤細胞存活為不可或缺的。圖9展示缺失內皮細胞Scube2 阻礙EC-KO小鼠中之腫瘤血管新生及腫瘤生長。顯示植入MLTC睾丸間質腫瘤後60天之代表性照片及在指定時間點量測之腫瘤生長速率(A及B)。EC-KO小鼠顯示腫瘤血管分布下降。腫瘤切片之CD31染色結果顯示EC-KO小鼠中EC及血管結構之數目減少(C)。在植入腫瘤細胞後60天腫瘤血管生成之量化圖(D)。EC - KO 小鼠中視網膜血管生長減少 圖10展示內皮細胞剔除Scube2 對視網膜血管分布之發育生長的作用。EC - KO 小鼠減輕由氧誘導之視網膜病變 圖11展示內皮細胞中剔除SCUBE2減少氧誘導之視網膜病變(OIR)。抗 SCUBE2 抗體 SCUBE2具有至少5個相異的結構區域(圖12A)：NH₂ 端訊號胜肽序列、9個重複之EGF-like重複區域(E)、間隔區域、3個富含半胱胺酸之結構模組 (CR)及一個COOH端之CUB區域。各區域之胺基酸為(1) SP：a.a. 1-37；(2) EGF-like重複區域：a.a. 49-442；(3) 間隔區域：a.a. 443-669；(4) CR：a.a. 70-803；及(5) CUB：a.a. 838-947。SCUBE2蛋白質(a.a. 38至a.a. 1028)能分泌至細胞胞外。生成SCUBE2抗體。圖12A顯示各SCUBE2 mAb之特異性標靶域。EGF-C3識別EGF-like重複區域4-6 (a.a. 175-323)，而SP-A1 (a.a. 441-659)、B1 (a.a. 441-659)及B2 (a.a. 441-659)結合SCUBE2之間隔區域。CR-5偵測SCUBE2之第1個富含半胱胺酸之結構模組(a.a. 668-725)。EGF-C3藉由以含有SCUBE2之EGF-like重複區域之重組蛋白免疫接種而獲得，且SP-A1、B1及B2藉由用含有SCUBE2之間隔區域之重組蛋白免疫接種而獲得。同樣地，CR-5藉由含有第1個富含半胱胺酸之重組蛋白免疫接種而獲得。此等抗體在活體外管腔生成分析中與內皮細胞一起培養顯示具抑制血管新生之特性 (圖12B)。表2至6顯示SCUBE2mAb之CDR序列。展示V_H 與V_L 域之互補決定區1至3 (CDR1至3)及構架區1至4 (FW1至4)。新生血管性眼部疾病之治療 在氧誘導之視網膜病變之小鼠模式中於玻璃體內注射SCUBE2抗體，觀察對視網膜新血管生成之影響。吾人之初步資料藉由活體外內皮細胞管腔生成分析顯示此等SCUBE2抗體可遏止血管新生。舉例而言，SP.B1能夠抑制經由VEGF刺激之內皮細胞增生及血管生成(圖13C至E)。抗 SCUBE2 ( SP . B1 ) 及抗 VEGF ( 貝伐單抗 ) 抗體 合併使用增加抑制肺、胰臟及結腸直腸癌生長之功效 由於吾人之結果表明膜相關之SCUBE2在腫瘤血管新生中發揮關鍵作用，因此吾等評估評估以mAb來抑制SCUBE2是否可做為用於治療實體腫瘤之潛在藥劑。產生對SCUBE2具有專一性之mAb (純系SP.B1)；該mAb未與SCUBE1或3交叉反應(圖13A至B)，這顯示此抗體具專一性。SCUBE2具有促血管新生活性，吾等首先評估HUVEC中此mAb對VEGF刺激之反應之活體外作用。培育SP.B1 mAb而非對照IgG能阻斷VEGF誘導之訊號傳遞，包括VEGFR2磷酸化及p44/42 MAPK/Akt活化(圖13F至I)。此mAb之功能活性是藉由抑制經由VEGF刺激之EC增生及血管生成的能力予以驗證(圖13C-E)。此外，吾等建立具有肺癌瘤LLC細胞之腫瘤模式，其不表現SCUBE2或VEGFR2。與SP.B1 mAb一起培養不影響癌細胞生長 (資料未示出)，因此SP.B1 mAb並不作用於腫瘤細胞，因此，任何減少的腫瘤生長均歸因於抗血管新生作用。由於SCUBE2作為VEGFR2之輔受體且貝伐單抗可抑制腫瘤血管新生，因此吾等亦研究用SP.B1及貝伐單抗(AVASTIN®)合併治療是否可對遏制肺腫瘤生長具有累加效應。當肺腫瘤達到50 mm³ 時開始治療性注射。如與小鼠或人類IgG治療相比，於SP.B1、貝伐單抗及合併治療(SP.B1 + 貝伐單抗)後LLC生長明顯受抑制(圖14A至C)。此外，與SP.B1 (29%)或貝伐單抗(40%)單獨治療相較，SP.B1 + 貝伐單抗對腫瘤生長具有更大抑制作用(56%) (圖14C)，因此這2種藥劑對於腫瘤血管新生可能針對不同路徑起作用。另外，免疫組織化學分析結果顯示SP.B1與貝伐單抗治療顯著減小血管密度(圖14D至E)。重要的是，分別與僅SP.B1及貝伐單抗治療相比，在SP.B1 + 貝伐單抗之情況下血管數目少了49%及31%。用SP.B1及貝伐單抗合併治療在臨床上具有標靶腫瘤血管新生之潛力。圖15展示合併抗SCUBE2 SP.B1及抗VEGF貝伐單抗(AVASTIN®)治療對胰管癌瘤生長及血管新生具有累加的抗腫瘤作用。圖16展示合併抗SCUBE2 SP.B1及抗VEGF貝伐單抗治療對結腸直腸腺癌生長及血管新生具有累加的抗腫瘤效果。表2

mAb 純系：EGF -C3 (IgG2a )
V_H 域 (SEQ ID NO：1)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
EVKLVESGGGLVQPGGSRKLSCVAS (SEQ ID NO：9)	GFTISSFGMH (SEQ ID NO：3)	WVRQAPERGLEWVA (SEQ ID NO：10)	YISSGSNTIYYADTVKG (SEQ ID NO：4)
FW3	CDR3	FW4
RFTISRDNPKNTLFLQMTSLWSEDTAMYYCAR (SEQ ID NO：11)	SGTLDGWFTY (SEQ ID NO：5)	WGRGTLVTVST (SEQ ID NO：12)
V_L 域 (SEQ ID NO：2)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
DIVMTQPPLSLPVSLGDQASISC (SEQ ID NO：13)	RSSQSILHSNGNTYLE (SEQ ID NO：6)	WYLQKPGQSPKLLIY (SEQ ID NO：14)	KLFNRFS (SEQ ID NO：7)
FW3	CDR3	FW4
GVPDRFNGSGSGTDFTLKISRAEAEDLGVYYC (SEQ ID NO：15)	LQGSHVPPT (SEQ ID NO：8)	FGAGTKLEIK (SEQ ID NO：16

表3

mAb 純系：SP -A1 (IgG1 ) ； ( 與SP -B1 相同 )
V_H 域 (SEQ ID NO：17)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
EVQLQQSGPELVKPGASVKVSCKAS (SEQ ID NO：25)	GYAFTSYNMY (SEQ ID NO：19)	WVKQSHGKSLEWIG (SEQ ID NO：26)	YIDPYNGDTNNNQKFKG (SEQ ID NO：20)
FW3	CDR3	FW4
KATLTVDKSSSTAYMHLNSLTSEDSAVYYCAR (SEQ ID NO：27)	SYRYLAWFAY (SEQ ID NO：21)	WGQGTLVTVSA (SEQ ID NO：28)
V_L 域 (SEQ ID NO：18)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
DIVMTQSPLSLPVSLGDQASISC (SEQ ID NO：29)	RSSQSIVHSNGNTYLE (SEQ ID NO：22)	WYLQKPGQSPKLLIY (SEQ ID NO：30)	TVSNRFS (SEQ ID NO：23)
FW3	CDR3	FW4
GVPDRFSGSGSGTDFTLRISRVEAEDLGVYYC (SEQ ID NO：31)	FQGSHIPYT (SEQ ID NO：24)	FGGGTKLELK (SEQ ID NO：32)

表4

mAb 純系：SP -B1 (IgG1 )
V_H 域 (SEQ ID NO：17)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
EVQLQQSGPELVKPGASVKVSCKAS (SEQ ID NO：25)	GYAFTSYNMY (SEQ ID NO：19)	WVKQSHGKSLEWIG (SEQ ID NO：26)	YIDPYNGDTNNNQKFKG (SEQ ID NO：20)
FW3	CDR3	FW4
KATLTVDKSSSTAYMHLNSLTSEDSAVYYCAR (SEQ ID NO：27)	SYRYLAWFAY (SEQ ID NO：21)	WGQGTLVTVSA (SEQ ID NO：28)
V_L 域 (SEQ ID NO：18)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
DIVMTQSPLSLPVSLGDQASISC (SEQ ID NO：29)	RSSQSIVHSNGNTYLE (SEQ ID NO：22)	WYLQKPGQSPKLLIY (SEQ ID NO：30)	TVSNRFS (SEQ ID NO：23)
FW3	CDR3	FW4
GVPDRFSGSGSGTDFTLRISRVEAEDLGVYYC (SEQ ID NO：31)	FQGSHIPYT (SEQ ID NO：24)	FGGGTKLELK (SEQ ID NO：32)

表5

mAb 純系：SP -B2 (IgG1 )
V_H 域 (SEQ ID NO：33)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
EVQRVESGGGLVKPGGSLKLSCAAS (SEQ ID NO：41)	GFTFRNYAMS (SEQ ID NO：35)	WVRQTTEKKLEWVA (SEQ ID NO：42)	TINDVGSYTYFPASVKG (SEQ ID NO：36)
FW3	CDR3	FW4
RFTVSRDNTKNTLYLQMSSLRSEDTAMYYCVT (SEQ ID NO：43)	SSDTVPHHHALDY (SEQ ID NO：37)	WGQGSSVTVSS (SEQ ID NO：44)
V_L 域 (SEQ ID NO：34)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
DIVMTQPPASLAVSLGQRATVFC (SEQ ID NO：45)	RASQNVDSRGISFMH (SEQ ID NO：38)	WYQQKPGQPPKLLIY (SEQ ID NO：46)	AASNLES (SEQ ID NO：39)
FW3	CDR3	FW4
GIPARFRGSGSGTDFTLNIHPVEEEDVATYYC (SEQ ID NO：47)	QQSVEDLT (SEQ ID NO：40)	FGGGTKLELK (SEQ ID NO：48)

表6

mAb 純系：CR - 5 號 (IgG2b )
V_H 域 (SEQ ID NO：49)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
EVQRVESGGDLVKPGGTLKLSCAAS (SEQ ID NO：57)	GFTFRNYGMS (SEQ ID NO：51)	WVRQTPDKRLEWVA (SEQ ID NO：58)	TISSGGVYIYYPDSVKG (SEQ ID NO：52)
FW3	CDR3	FW4
RFTISRDNAKNTLFLQMSSLRSEDSAMYYC (SEQ ID NO：59)	ARDDYDGRGYFDY (SEQ ID NO：53)	WGQGTTLTVSS (SEQ ID NO：60)
V_L 域 (SEQ ID NO：50)
FW1	CDR1	FW2	CDR2
DIVMSQSPSSLAVSAGEKVTMSC (SEQ ID NO：61)	KSSQSLLNSRTRKNYLA (SEQ ID NO：54)	WYQQKPGQSPKLLIY (SEQ ID NO：62)	WASTRES (SEQ ID NO：55)
FW3	CDR3	FW4
GVPDRFTGSGSGTDFTLTISSVQAEDLAVYYC (SEQ ID NO：63)	KQSYNLPT (SEQ ID NO：56)	FGSGTKLDIK (SEQ ID NO：64)

總之，吾等展示SCUBE2 (而非SCUBE1或3) 在HUVEC中於低氧下受到HIF-1α調控增加其表現量。SCUBE2之此獨特的低氧誘導作用可在後肢局部缺血之後調節血液流動復原實驗中觀察到。因此，SCUBE2調節血管新生不受限於VEGF之作用。需要其他研究來釐清SCUBE2是否參與經由音蝟因子(sonic hedgehog)或VE鈣黏素傳訊介導之產後血管新生。在此，吾人之資料揭示SCUBE2作為新穎VEGFR2輔受體，其藉由調節VEGFR2相關之訊號傳遞來調節EC的VEGF誘發之管腔生成及細胞增生。SCUBE2可能在各種血管新生相關疾病(諸如動脈粥樣硬化、糖尿病性視網膜病及老年性黃斑變性)之發病機制中具有臨床重要性。除SCUBE2在正常器官EC中之表現以外，SCUBE2亦高度表現於大量類型之人類癌瘤及異種移植腫瘤之EC中(吾人之未公開的資料)。儘管需要其他研究來驗證內皮細胞SCUBE2是否涉及腫瘤血管新生，但由於SCUBE2 mAb具抗血管新生作用，故SCUBE2可應用於癌症療法之有潛力之目標分子。內皮細胞SCUBE2之藥理學阻斷為一種可應用於血管新生相關疾病之新穎治療策略。特徵為異常或過度血管新生或由其導致之疾病的實例列於表7中。表7

器官	疾病
諸多器官	癌症(致癌基因活化；腫瘤抑制因子缺失)；傳染病(病原體表現血管新生基因，誘發血管新生程序或轉化EC)；自體免疫病症(肥大細胞及其他白血球之活化)
血管	血管畸形(Tie-e突變)；狄喬治症候群(DiGeorge syndrome)(低VEGF及神經氈蛋白-1表現)；HHT (內皮因子或ALK-1之突變)；海綿狀血管瘤(缺失Cx37及Cx40)；動脈粥樣硬化；移植動脈病。
脂肪組織	肥胖(經由脂肪膳食誘導之血管新生；經由血管新生抑制劑產生之重量損失)
皮膚	銀屑病、疣、過敏性皮炎、瘢痕瘤、化膿性肉芽腫、起泡疾病、AIDS患者中之卡波西肉瘤(Kaposi sarcoma)
眼	持續增生性玻璃體症候群(缺失Ang-2或VEGF164)；糖尿病性視網膜病；早產兒視網膜病；脈絡膜新生血管(TIMP-3突變)。
肺	原發性肺高血壓(生殖系BMPR-2突變；體細胞EC突變)；哮喘；鼻息肉
腸	發炎性腸道及牙周病、腹水、腹膜黏附
生殖系統	子宮內膜異位、子宮出血、卵巢囊腫、卵巢過度功能亢進
骨骼、關節	關節炎、滑膜炎、骨髓炎、骨贅形成

本發明之例示性實施例之前述描述僅出於說明及描述之目而呈現，且不意欲為窮舉的或將本發明限制於所揭示之精確形式。根據以上教示，許多修改及變化均係可能的。在本發明之描述中引用及論述一些參考文獻，其可包括專利、專利申請案及各種公開案。提供此類參考文獻之引用及/或論述僅闡明本發明之描述且不承認任何此類參考文獻係本文所述之本發明的「先前技術」。本說明書中引用及論述之所有參考文獻均以全文引用的方式併入本文中且其引用程度就如同已個別地將各參考文獻以引用的方式併入一般。

圖1展示SCUBE2表現於人類臍靜脈內皮細胞(human umbilical vein endothelial cells；HUVEC)之細胞表面，且調節血管內皮生長因子(VEGF)誘發之HUVEC增生及管腔生成。A 及B ，SCUBE2免疫螢光染色(呈綠色)及流式細胞儀量測結果。箭頭標示SCUBE2表現於EC膜上。細胞核以DAPI染色，呈藍色。C ，未匯合(增殖)及匯合(非增殖)HUVEC中SCUBE2蛋白質表現之西方墨點分析。D 至 F ，SCUBE2過度表現增強VEGF誘導之HUVEC增生及管腔生成。以FLAG標記之SCUBE2重組慢病毒將外源性SCUBE2表現於HUVEC(D)。SCUBE2過度表現對於VEGF誘發之HUVEC細胞生長之作用(E)。資料係來自3個獨立實驗之平均值 ± SD且相對於未受刺激之細胞增加之百分比。**，P ＜ 0.01。SCUBE2過度表現對VEGF誘發之管腔生成作用之活體外MATRIGEL™血管新生分析(F)。代表性影像標示於上方且藉由計數每一區域之管腔總數進行量化。資料係自3個獨立實驗計算之平均值 ± SD，**，P ＜ 0.01。G - I ，SCUBE2基因表現量減少會降低VEGF誘導之HUVEC增生及管腔生成。藉由兩個獨立之SCUBE2 shRNA慢病毒(SCUBE1-shRNA 1號及2號)降低SCUBE2於HUVEC之表現量(G)。螢光素酶shRNA慢病毒為負對照(對照shRNA)。SCUBE2基因表現降低對VEGF誘發之(H) HUVEC細胞生長及(I)管腔生成之影響。資料係來自3個獨立實驗之平均值 ± SD且表示相對於未受刺激之細胞增生的百分比。**，P ＜ 0.01。SCUBE2基因表現量降低對VEGF誘發之管腔生成作用之體外MATRIGEL™血管新生分析。代表性影像標示於上方且藉由計數每一區域之管腔之總數進行量化(I)。資料係自3個獨立實驗計算之平均值 ± SD，**，P ＜ 0.01。圖2展示HUVEC於低氧環境中藉由HIF-1α增加SCUBE2表現量增加。A 及B ，於低氧狀態下SCUBE2於HUVEC中表現量增加。HUVEC在常氧或低氧(1%)下培養12 hr。SCUBE2之mRNA及蛋白質表現量藉由定量RT-PCR (A)及西方墨點(B)分析進行驗證。資料係來自3個獨立實驗之平均值 ± SD。**，與常氧相比P ＜ 0.01。C ，含有野生(WT)或突變(M1、M2及M3) HIF-1α結合位點之SCUBE2啟動子報導基因構築體示意圖。SCUBE2 基因之啟動子之位置(-1500~+1)以橫線標示。HIF-1α結合位點以菱形標記，且突變位點以「×」標記。用於ChIP分析之引子及擴增區亦標記於圖中(上部圖)。D ，HIF-1α活化SCUBE2啟動子驅動之螢光素酶活性。短暫轉染SCUBE2 WT或突變啟動子構築體至HUVEC中其活性之量化圖。螢光素酶活性以Renilla螢光素酶活性(pRL-TK)標準化以控制轉染效率。E ，在低氧情況下HIF-1α直接結合於SCUBE2啟動子。HIF-1α蛋白質結合於HUVEC中SCUBE2 的啟動子藉由ChIP分析法鑑定，其中HIF-1α之特異性引子擴增238-bp片段。缺少細胞溶胞物(-)為負對照。資料為3個獨立實驗之平均值 ± SD。**，P ＜ 0.01。圖3展示Scube2 EC-KO小鼠中之成體血管新生之衰減。A至D，MATRIGEL™嵌入分析。在注射後7天自對照及EC-KO小鼠移出之含有生理食鹽水(-)或VEGF (+)之MATRIGEL™嵌入物的代表性圖片(A)。來自對照及EC-KO小鼠之補充生理食鹽水(-)及VEGF (+)之MATRIGEL™嵌入物之血紅素含量(B)。資料為平均值 ± SD (n = 5)。**，P ＜ 0.01。對照組及EC-KO小鼠移出之含有生理食鹽水(-)或VEGF (+)之MATRIGEL™嵌入物切片之抗CD31染色(C)。比例尺 = 40 μm。以IMAGEJ™定量CD31陽性判定MATRIGEL™嵌入物之血管形成量 (D)。資料為平均值 ± SD (n = 5)。**，P ＜ 0.01。E 至H ，後肢局部缺血誘導之新血管生成。在小鼠中右股動脈結紮前後之後肢血液流動之代表性雷射都卜勒(Doppler)影像(A)及量化值(B)。在對照及EC-KO小鼠中股動脈結紮之後21天的小腿血管之抗CD31免疫染色的代表性影像(C)及量化(D)。比例尺 = 100 µm。資料係平均值 ± SD (n = 6)。**，P ＜ 0.01，相比於對照。圖4展示SCUBE2調整HUVEC中之VEGFR2磷酸化及下游訊號傳遞。A 及B ，SCUBE2基因表現減少會降低HUVEC中之VEGF訊號傳遞。在HUVEC中對照及SCUBE2 shRNA基因表現減量之情況下，VEGFR2在Tyr1059處、p44/42促分裂原活化的蛋白激酶(MAPK)在Thr202/Tyr204處及AKT在Ser473處的VEGF誘導之磷酸化的HUVEC中VEGF傳訊之西方墨點分析(A)及量化(B)。資料由3個獨立實驗之平均值 ± SD。*，P ＜ 0.05；**，P ＜ 0.01，相比於對照。C 及D ，對組照及SCUBE2過度表現之EC中，VEGFR2 Tyr1059、p44/42 MAPK Thr202/Tyr204及AKT Ser473的VEGF誘發之磷酸化的EC中VEGF訊號傳遞之西方墨點分析(C)及量化值(D)。資料由3個獨立實驗之平均值 ± SD。*，P ＜ 0.05；**，P ＜ 0.01，相比於載體。圖5展示EC-KO小鼠肺EC (MLEC)中之VEGF反應及傳訊的衰減。A 及B ，EC-KO MLEC之VEGF誘發之管腔生成(A)及增生(B)。資料為3個獨立實驗之平均值 ± SD。**，P ＜ 0.01，相較於對照組。C 及D ，在對照組及EC-KO MLEC中，VEGF誘發VEGFR2 Tyr1059、p44/42 MAPK Thr202/Tyr204及AKT Ser473之磷酸化藉由西方墨點分析(C)及量化(D)。資料為3個獨立實驗之平均值 ± SD。*，P ＜ 0.05；**，P ＜ 0.01，相較於對照組。E ，顯微照片展示來自對照組及EC-KO小鼠之主動脈環嵌入膠原蛋白培養5天後之血管新生反應。比例尺 = 1 mm。F ，微血管出芽數目及長度之量化圖。藉由量化生長微血管之數目(左)及藉由量測由新生成之微血管佔據之總長度(右)測定各別主動脈環的血管新生反應。圖6展示SCUBE2在腫瘤內皮細胞(EC)中高度表現。小鼠(乳房、肺、黑素瘤)(A)及人類(前列腺、肉瘤、膀胱)(B)中SCUBE2於腫瘤EC大量表現(由紅色箭頭指示之棕色)之免疫組織化學染色結果圖。使用轉殖基因小鼠乳腺腫瘤病毒多瘤病毒中等T (mouse mammary tumor virus polyoma middle T；MMTV-PyMT)動物模式之自發性小鼠乳腺腫瘤。另外，兩個異種移植腫瘤是藉由皮下注射同基因型黑素瘤(B16F10)或路易斯肺癌瘤(Lewis lung carcinoma，LLC)細胞而產生。內皮細胞免疫染色於黑素瘤腫瘤中顯為紅色(而非棕色)，此係因為黑素瘤細胞之黑色素背景。人類正常及腫瘤組織購自商業的組織微陣列切片。圖7展示缺少內皮細胞Scube2 抑制EC-KO小鼠中之腫瘤血管新生及腫瘤生長。A 至 D ，對照組及EC-KO小鼠皮下注射B16F10黑素瘤細胞或路易斯肺癌瘤(LLC)腫瘤細胞。在植入後16天B16F10 (A)及LLC (B)腫瘤之代表性照片及在指定時間量測之腫瘤生長速率(C及D)。比例尺 = 10 mm。E 至 H ，EC-KO小鼠中腫瘤微血管分布。腫瘤切片之抗CD31染色顯示EC-KO小鼠中EC及血管結構之數目減少(E及F)。在植入腫瘤細胞之後16天腫瘤血管生成之量化圖(G及H)。比例尺 = 40 µm。資料係平均值 ± SD (n = 6)。**，P ＜ 0.01。圖8展示EC-KO腫瘤缺乏氧氣及營養物質且因此呈現細胞凋亡。來自對照或EC-KO小鼠之B16F10或LLC腫瘤切片之H&E染色(A)、TUNEL分析(C)及Ki-67染色(E)。腫瘤壞死(B)、腫瘤細胞凋亡(D)及增生(F)之量化圖。比例尺 = 100 µm。資料係平均值 ± SD (n = 6)。**，P ＜ 0.01。圖9展示缺失內皮細胞Scube2 阻礙EC-KO小鼠中之腫瘤血管新生及腫瘤生長。A 及B ，對照組及EC-KO小鼠皮下注射MLTC睾丸間質腫瘤細胞。在植入後60天MLTC睾丸間質腫瘤之代表性照片(A)及在指定時間量測之腫瘤生長速率(B)。比例尺 = 10 mm。C 及D ，腫瘤切片之CD31染色顯示EC-KO小鼠中EC及血管結構之數目減少(C)。在植入腫瘤細胞16天後腫瘤血管形成之量化圖(D)。比例尺 = 40 µm。資料為平均值 ± SD (n = 6)。**，P ＜ 0.01。圖10展示內皮細胞剔除Scube2 對視網膜血管發育之影響。A ，來自對照組及EC-KO幼鼠之P5視網膜泛內皮(pan-endothelial)標記物CD31染色結果。白色虛線為對照組血管新生(左)而橙色虛線為EC-KO血管新生(右)。B ，血管新生之高倍率放大圖(100×)。黃點標記絲狀偽足。C 及D ，藉由量測距視神經之徑向距離(C)及絲狀偽足之數目(D)(相對於對照之百分比)所得之視網膜血管新生量化圖。資料為平均值 ± SD (各組n = 5)。**，P ＜ 0.01。圖11展示內皮細胞中缺少SCUBE2減少氧誘導之視網膜病變(OIR)。A ，OIR動物模式之示意圖。新生小鼠在出生後第7天(P)至P12時暴露於75%氧氣，且在P12至P18時返回至室內空氣且於P18時觀察病理性新血管生成。B 及C ，在P18時分別自OIR或常氧對照小鼠視網膜分離總RNA(n = 3)，且隨後藉由Q-PCR或RT-PCR分析血管新生標記基因(B)或SCUBE基因家族(C)之mRNA表現量。D ，於暴露OIR模式後對照組或 EC - KO 小鼠之視網膜血管分布分析。p18時(自75%氧氣移除之後6天)之中心無血管區域或新生血管區域的大小分別以紅色或藍色標示。E 及F ，與經歷OIR模式之對照(n = 5)相比，EC - KO 小鼠(n = 5)中相對於整個視網膜大小之新生血管區域(E)或中心無血管區域(F)的大小(以%表現)明顯減少。**，P ＜ 0.01。圖12展示SCUBE2 mAb及抗血管新生效果。A ，SCUBE2 mAb及其標靶域。B ，藉由活體外管腔生成分析評估SCUBE2 mAb抑制血管新生能力。展示具有特異性及抗血管新生效應之抗SCUBE2 mAb之彙總。h，人類；m，小鼠；z，斑馬魚。圖13展示SCUBE2 mAb SP.B1抑制HUVEC中VEGF誘發之反應及訊號傳遞。A 及B ，SCUBE2 mAb SP.B1之特性。SP.B1 mAb藉由西方墨點分析及流式細胞分析技術能專一性識別表現於HEK-293T細胞中之人類及小鼠SCUBE2 (非1及3)蛋白質(A)，及HUVEC細胞表面上之SCUBE2(B)。C - I ， SP.B1 mAb阻斷VEGF誘發之細胞反應及VEGF誘導之VEGFR2磷酸化及MAPK/Akt活化。添加SP.B1而非對照IgG遏止VEGF誘發之HUVEC增生(C)及血管新生(D及E)且與劑量呈現正相關。在有SP.B1或對照組IgG之情形下，HUVEC中經由VEGF誘發之磷酸化及總VEGFR2、MAPK及Akt (F)，及量化圖(G-I)。資料為3個獨立實驗之平均值 ± SD (G-I)。**，P ＜ 0.01。圖14展示結合SP.B1mAb及VEGFmAb (AVASTIN®)對治療肺癌腫瘤生長及血管新生具有累加作用。A ，在注射LLC肺癌細胞後各處理組中隨時間點量測之平均腫瘤體積(n = 6)。箭頭標示抗體處理之時間點。B ，各處理之異種移植小鼠中之代表性LLC肺癌瘤。比例尺 = 1 cm。C ，切除腫瘤且稱量(n = 6/組)。(D及E)腫瘤之血管密度。D 及E ，以IMAGEJ™量化之肺癌腫瘤切片CD31免疫染色(D)及量化之腫瘤血管生成(E)。比例尺 = 40 µm。*，P ＜ 0.05；**，P ＜ 0.01。圖15展示結合SP.B1mAb及VEGF mAb (AVASTIN®)對治療胰管腫瘤生長及血管新生具有累加作用。A ，在注射PANC-1胰管腫瘤細胞後各處理組隨時間點量測之平均腫瘤體積(n = 6)。箭頭標示抗體處理之時間點。B ，各處理之異種移植小鼠中之代表性PANC-1胰臟腫瘤。比例尺 = 1 cm。C ，切除腫瘤且稱量(n = 6/組)。(D及E)腫瘤之血管密度。D 及E ，以IMAGEJ™量化之胰管腫瘤切片CD31免疫染色(D)及量化之腫瘤血管生成(E)。比例尺 = 40 µm。*，P ＜ 0.05；**，P ＜ 0.01。圖16展示結合SP.B1 mAb及VEGF mAb治療對結腸直腸腺癌生長及血管新生具有累加作用。A ，在注射LS 174T結腸癌細胞後各處理組隨時間點量測之平均腫瘤體積(n = 6)。箭頭標示抗體處理之時間點。B ，各處理之異種移植小鼠中之代表性LS 174T結腸直腸腺腫瘤。比例尺 = 1 cm。C ，切除腫瘤且稱量(n = 6/組)。(D及E)腫瘤之血管密度。D 及E ，以IMAGEJ™量化之結腸直腸腺腫瘤切片之CD31免疫染色(D)及量化之腫瘤血管生成(E)。比例尺 = 40 µm。*，P ＜ 0.05；**，P ＜ 0.01。

Claims

一種分離之抗SCUBE2抗體或其結合片段，其包含特異性結合於位於SCUBE2 (SEQ ID NO：66)內之標靶域之抗原結合區且呈現抑制VEGF誘導之血管新生的特性，其中該標靶域選自由以下組成之群：SCUBE2 (SEQ ID NO：66)之a.a.位置175至323範圍內之EGF-like區域4至6，或a.a.位置441至659範圍內之間隔區域，或a.a.位置668至725範圍內之第一富含半胱氨酸結構模組。
如請求項1之分離之SCUBE2抗體或其結合片段，其中該抑制VEGF誘導之血管新生的特性包含抑制腫瘤血管新生及VEGF刺激之內皮細胞增生及血管生成。
如請求項1之分離之抗SCUBE2抗體或其結合片段，其包含重鏈可變域(V_H )及輕鏈可變域(V_L )，其中： (a)該V_H 包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列，且該V_L 包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列；或 (b)該V_H 包含SEQ ID NO：1之胺基酸序列，且該V_L 包含SEQ ID NO：2之胺基酸序列；或 (c)該V_H 包含SEQ ID NO：33之胺基酸序列，且該V_L 包含SEQ ID NO：34之胺基酸序列；或 (d)該V_H 包含SEQ ID NO：49之胺基酸序列，且該V_L 包含SEQ ID NO：50之胺基酸序列。
如請求項1之分離之抗SCUBE2抗體或其結合片段，其中： (i)該V_H 包含有包含SEQ ID NO：19之胺基酸序列的互補決定區(CDR) 1、包含SEQ ID NO：20之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的CDR3；且該V_L 包含有包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：23之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的CDR3；或 (ii)該V_H 包含有包含SEQ ID NO：3之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：4之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：5之胺基酸序列的CDR3；且該V_L 包含有包含SEQ ID NO：6之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：7之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：8之胺基酸序列的CDR3；或 (iii)該V_H 包含有包含SEQ ID NO：35之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：36之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：37之胺基酸序列的CDR3；且該V_L 包含有包含SEQ ID NO：38之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：39之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：40之胺基酸序列的CDR3；或 (iv)該V_H 包含有包含SEQ ID NO：51之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：52之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：53之胺基酸序列的CDR3；且該V_L 包含有包含SEQ ID NO：54之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：55之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：56之胺基酸序列的CDR3。
如請求項1之分離之SCUBE2抗體或其結合片段，其係單株抗體。
如請求項1之分離之SCUBE2抗體或其結合片段，其係人類化的。
如請求項1之分離之SCUBE2抗體或其結合片段，其係選自由以下組成之群：Fv片段、片段抗原結合(Fab)片段、F(ab')₂ 片段、Fab'片段、Fd'片段及Fd片段及單鏈抗體可變片段(scFv)。
如請求項1之分離之SCUBE2抗體或結合片段，其囊封於脂質體內。
一種融合蛋白質，其包含如請求項1之分離之SCUBE2抗體或其結合片段。
一種醫藥組合物，其包含： (i)治療有效量之如請求項1至8中任一項之分離之SCUBE2抗體或其結合片段；及 (ii)治療有效量之特異性抗VEGF之抗VEGF抗體。
如請求項10之醫藥組合物，其中： (i)該SCUBE2抗體之V_H 包含SEQ ID NO：17之胺基酸序列，且該SCUBE2抗體之V_L 包含SEQ ID NO：18之胺基酸序列，或 (ii)該SCUBE2抗體之V_H 包含有包含SEQ ID NO：19之胺基酸序列的互補決定區(CDR) 1、包含SEQ ID NO：20之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：21之胺基酸序列的CDR3；且該SCUBE2抗體之V_L 包含有包含SEQ ID NO：22之胺基酸序列的CDR1、包含SEQ ID NO：23之胺基酸序列的CDR2及包含SEQ ID NO：24之胺基酸序列的CDR3。
如請求項11之醫藥組合物，其中該SCUBE2抗體係單株抗體、嵌合抗體或人類化抗體。
一種如請求項1至8中任一項之分離之SCUBE2抗體或其結合片段的用途，其係用於製造用於在有需要之個體中治療與VEGF誘導之血管新生相關之疾病的藥物。
如請求項13之用途，其中該與VEGF誘導之血管新生相關之疾病係選自由以下組成之群的至少一者：腫瘤、新生血管性眼部病症、持續增生性玻璃體症候群、糖尿病性視網膜病、早產兒視網膜病、脈絡膜新生血管、子宮內膜異位、子宮出血、卵巢囊腫及卵巢功能亢進。
如請求項13之用途，其與特異性抗VEGF之抗VEGF抗體之用途組合，用於製造用於在有需要之個體中治療與VEGF誘導之血管新生相關之疾病的藥物。