TW202132558A - Ｔ細胞的製造方法 - Google Patents
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Abstract
本發明提供一種各自為IL-4非分泌且IFN-γ分泌型(Th1型)或IFN-γ非分泌且IL-4分泌型(Th2型)之CD4單陽性T細胞(CD4SP T細胞)的優良製造方法。本發明之Th1型或Th2型之CD4SP T細胞的製造方法包含將與IL-4之分泌相關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)誘導成CD4單陽性T細胞的步驟。
Description
本發明係關於製造分別與天然Th1細胞及Th2細胞相同之IL-4非分泌且IFN-γ分泌型(Th1型)及IFN-γ非分泌且IL-4分泌型(Th2型)之CD4單陽性T細胞的方法，例如，使用人工胸腺類器官(ATO)製造的方法，其中該ATO包含從iPS細胞分化誘導之造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)。又，本發明係關於控制造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)朝向Th1型及/或Th2型之CD4單陽性T細胞分化的方法。
嘗試使iPS細胞分化為細胞毒性T細胞，亦即CD8單陽性T細胞(在本說明書中記載為「CD8SP T細胞」)，並導入抗原特異性TCR(T細胞受體)或CAR(嵌合抗原受體)，以應用於腫瘤免疫療法的研究正盛行。此類腫瘤免疫療法著眼於細胞毒性T細胞之優良抗腫瘤活性而進行開發，然而從iPS細胞誘導生成輔助T細胞(helper T cell)，亦即CD4單陽性T細胞(在本說明書中記載為「CD4SP T細胞」)的技術並不存在，此亦為其隱含之背景。如果輔助T細胞能被誘導生成，則可同時增強細胞性免疫及體液性免疫兩者，得以應用於提高免疫細胞療法之效果。例如，已知在CAR-T療法中，除了投與導入CAR之CD8SP T細胞外，若同時投與CD4SP T細胞，則治療效果增強。又，若能分別特異地製
造或擴增為輔助T細胞之子集合(subset)的Th1細胞及Th2細胞，亦可用於腫瘤免疫療法以外之應用，例如調節被視為過敏疾病之病理背景的Th1/2平衡。再者，若能誘導成抑制性T細胞(Treg細胞)，被認為可藉由抑制細胞性免疫/體液性免疫來治療過敏‧自體免疫疾病。就一方面提高免疫細胞療法之效果，一方面擴大變異而言，從iPS細胞製作Th1細胞、Th2細胞、Treg細胞等甚為重要。
就CD8SP T細胞及/或CD4SP T細胞之製造方法而言，已知有如專利文獻1所記載的方法，其包含培養含有表現Notch配體之間質細胞及造血前驅細胞等的三次元細胞凝集體，亦即人工胸腺類器官(Artificial Thymic Organoid，ATO)之步驟。在專利文獻1之實施例中，就該方法之更具體實施型態而言，揭示使用從臍帶血等單離的(初代之)人類造血幹細胞‧前驅細胞(HSPC)製作ATO，從該ATO得到CD8SP T細胞、CD4SP T細胞、及CD4‧CD8雙陽性T細胞(在本說明書中記載為「CD4‧CD8DP T細胞」)，藉由將CD4SP T細胞以PMA/離子黴素(ionomycin)處理，分別得到極少數之只表現IFN-γ的細胞及只表現IL-4的細胞等內容(參見專利文獻1之圖4B、圖6B等)。
在非專利文獻1中，記載將從臍帶血、骨髓、周邊血等採集到的造血幹/前驅細胞(CD34+CD3-HSPC)與表現Notch配體之間質細胞(MS5-hDLL1細胞株)共培養，製作ATO，從該ATO產生CD4‧CD8DP T細胞之外，亦產生CD8SP T細胞及CD4SP T細胞等內容(參見圖1b、圖2b、圖3b、圖4a、圖4b、圖4f)。
在非專利文獻2中，記載將從人類iPS細胞分化誘導的胚性中胚葉前驅細胞(embryonic mesodermal progenitors，EMP)與表現Notch配體之間質細胞(MS5-hDLL1/4細胞株)共培養，製作胚性中胚葉類器官(embryonic mesodermal
organoids，EMO)，進一步向造血系統誘導，製作ATO，從該ATO產生CD4‧CD8DP T細胞之外，亦產生CD8SP(CD8 α β +)T細胞及少數之CD4SP(CD4+)T細胞(參見圖2C)，藉由將CD8SP T細胞以PMA/離子黴素(ionomycin)處理，得到表現IFN-γ及/或IL-2的細胞(參見圖3F)等內容。再者，亦記載在從纖維母細胞製作前述人類iPS細胞的情況，得到成熟初始T細胞之TCR為多種組庫(repertoire)，另一方面，在改變打算表現腫瘤相關抗原(NY-ESO-1肽)特異性TCR之iPS細胞的情況，得到表現此TCR的T細胞。
然而，上述3種文獻之任一者均未記載能有效率地製作IFN-γ分泌型(Th1型)CD4SP T細胞及IL-4分泌型(Th2型)CD4SP T細胞的方法，亦未記載控制造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)分化成Th1型及/或Th2型之CD4單陽性T細胞的方法。
在非專利文獻3中，記載與Th1分化(INF-γ基因表現)相關之轉錄因子及其信號傳達，以及與Th2分化(IL-4基因表現)相關之轉錄因子及其信號傳達。
[先前技術文獻]
[專利文獻]
[專利文獻1]WO2017/075389
[非專利文獻]
[非專利文獻1]Seet et al., Nature Methods vol.14 no.5, p521-530 (2017)
[非專利文獻2]Montel-Hagen et al., Cell Stem Cell. 2019 Mar;24(3):376-389
[非專利文獻3]Usui., Jpn.J.Clin.Immunol., 30(6), p419-427 (2007)
如上述，儘管期望從iPS細胞製作IFN-γ分泌型(Th1型)CD4SP T細胞及IL-4分泌型(Th2型)CD4SP T細胞，然使其實現之手段仍未達成。尤其，為了製作產生如上述之CD4SP T細胞用的ATO，不使用初代之造血幹/前驅細胞，而從患者採集細胞以製作iPS細胞或建立iPS細胞株，進一步對該等加以改變而使用從所得到之iPS細胞等分化誘導的造血幹細胞/前驅細胞，當考量在免疫細胞療法中之用途或生產效率時，有用性極高。
再者，非從ATO產生之T細胞，而從活體(周邊血)採集的初代T細胞藉由以PMA/離子黴素刺激，具有分泌IFN-γ或IL-4之任一者的特異性，因此若使用初代之T細胞，可得到Th1細胞或Th2細胞。相對地，在使用從iPS細胞誘導之造血前驅細胞(HPC)製作ATO的情況，將從該ATO生成之T細胞以PMA/離子黴素刺激時，在IFN-γ及IL-4之分泌方面不具充分的特異性，存在有無法選擇性地得到分泌任一者之Th1型及Th2型之CD4SP T細胞的問題。
本發明之課題為提供IL-4非分泌且IFN-γ分泌型(Th1型)或IFN-γ非分泌且IL-4分泌型(Th2型)之CD4單陽性T細胞(CD4SP T細胞)的優良製造方法。又，本發明之課題為提供控制分化成Th1型或Th2型之CD4單陽性T細胞的方法。
本發明人等培養與IL-4之分泌相關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的造血前驅細胞或造血幹細胞，例如，使用從IL4基因或TBX21基因經剔除之iPS細胞所得到的造血前驅細胞，藉以製作ATO並培養，發現分別有效率地產生Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞。
再者，在野生型iPS細胞之T細胞再分化中，由於見到IL-4之高度分泌及T-bet之高度表現，剔除編碼彼等之IL4基因及TBX21基因被認為可能使朝向成熟輔助T細胞之分化本身受到阻礙。然而，令人驚訝的見識是，即使剔除IL4基因及TBX21基因亦不引起此種阻礙，仍可製作Th1型及Th2型CD4SP T細胞。
亦即，本發明至少包含下述之事項。
[1]
一種製造Th1型或Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：
將與IL-4之分泌相關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)誘導成CD4單陽性T細胞的步驟。
[2]
如[1]記載之方法，其為製造Th1型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：
將(B1)與IL-4之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)誘導成CD4單陽性T細胞的步驟。
[3]
如[1]記載之方法，其為製造Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：
將(B2)與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)誘導成CD4單陽性T細胞的步驟。
[4]
如[1]記載之方法，其中，前述HSC及/或HPC為(b1)與IL-4之分泌相關之基因經剔除的HSC及/或HPC。
[5]
如[1]記載之方法，其中，前述HSC及/或HPC為(b2)與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除的HSC及/或HPC。
[6]
如[1]記載之方法，其為製造Th1型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：藉由培養人工胸腺類器官(ATO)，使IL-4非分泌且IFN-γ分泌型(Th1型)之CD4單陽性T細胞從該ATO產生的步驟，其中該人工胸腺類器官(ATO)包含：
(a)表現Notch配體之間質細胞，及
(b1)與IL-4之分泌相關之基因經剔除，而與IFN-γ之分泌相關之基因未經剔除的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)。
[6-1]
一種製造Th1型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：藉由培養人工胸腺類器官(ATO)，使IL-4非分泌且IFN-γ分泌型(Th1型)之CD4單陽性T細胞從該ATO產生的步驟，其中該人工胸腺類器官(ATO)包含：
(a)表現Notch配體之間質細胞，及
(b1)與IL-4之分泌相關之基因經剔除，而與IFN-γ之分泌相關之基因未經剔除的造血幹細胞(HSC)或造血前驅細胞(HPC)。
[6a]
如[6]或[6-1]記載之方法，其中與IL-4之分泌相關之基因為IL4基因。
[7]
如[1]記載之方法，其為製造Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：藉由培養人工胸腺類器官(ATO)培養，使IFN-γ非分泌且IL-4分泌型(Th2型)之CD4單陽性T細胞從該ATO產生的步驟，其中該人工胸腺類器官(ATO)包含：
(a)表現Notch配體之間質細胞，及
(b2)與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除，而與IL-4之分泌相關之基因未經剔除的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)。
[7-1]
一種製造Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：藉由培養人工胸腺類器官(ATO)，使IFN-γ非分泌且IL-4分泌型(Th2型)之CD4單陽性T細胞從該ATO產生的步驟，其中該人工胸腺類器官(ATO)包含：
(a)表現Notch配體之間質細胞，及
(b2)與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除，而與IL-4之分泌相關之基因未經剔除的造血幹細胞(HSC)或造血前驅細胞(HPC)。
[7a]
如[7]或[7-1]記載之方法，其中與IFN-γ之分泌相關之基因為TBX21基因。
[8]
如[1]記載之方法，其中前述造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)為從iPS細胞(iPSC)分化誘導的細胞。
[8-1]
如[6-1]或[7-1]記載之方法，其中前述(b1)或(b2)之造血幹細胞(HSC)或造血前驅細胞(HPC)為從iPS細胞(iPSC)分化誘導的細胞。
[9]
如[8]或[8-1]記載之方法，其中前述iPSC為源自T細胞的iPS細胞(T-iPSC)。
[10]
如[9]記載之方法，其中前述T細胞為CD4單陽性T細胞。
[11]
一種Th1型之CD4單陽性T細胞，其係依照[1]記載之方法而得到者。
[12]
一種Th2型之CD4單陽性T細胞，其係依照[1]記載之方法而得到者。
[13]
一種Th1型之CD4單陽性T細胞，其與IL-4之分泌相關的因子實質上係受損的。
[14]
一種Th2型之CD4單陽性T細胞，其與IFN-γ之分泌相關的因子實質上係受損的。
[15]
如[13]或[14]記載之CD4單陽性T細胞，其中前述Th1型之CD4單陽性T細胞或前述Th2型之CD4單陽性T細胞為從iPS細胞(iPSC)分化誘導的細胞。
[16]
如[15]記載之CD4單陽性T細胞，其中前述iPSC為源自T細胞的iPS細胞(T-iPSC)。
[17]
一種製造Th1型或Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含將與IL-4之分泌相關之基因或與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除的iPS細胞誘導成CD4單陽性T細胞的步驟。
[18]
一種造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)，其與IL-4之分泌相關的因子或與IFN-γ之分泌相關的因子實質上係受損的。
[18a]
如[18]記載之造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)，其與IL-4之分泌相關的因子實質上係受損的。
[18b]
如[18]記載之造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)，其與IFN-γ之分泌相關的因子實質上係受損的。
[19]
一種控制分化成Th1型或Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含使造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)中的與IL-4之分泌相關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的步驟。
[20]
一種醫藥組成物，其包含如[11]、[12]、[13]或[14]記載之CD4單陽性T細胞。
[21]
一種Th1型之CD4單陽性T細胞，其係依照[6-1]記載之方法而得到者。
[22]
一種Th2型之CD4單陽性T細胞，其係依照[7-1]記載之方法而得到者。
藉由本發明而能有效率地製造Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞，其對於利用輔助T細胞之免疫細胞療法的實用化或應用有很大的貢獻。
圖1展示與Th1及Th2之分化相關的信號傳達途徑以及本發明中藉由基因剔除等而實質上受損之對象蛋白質(T-bet及IL-4)。此圖將Usui T.(2007).Jpn.J.Clin.Immunol.,30(6),419-427之圖3進行部分改變。
圖2展示實施例1中的TBX21KO 654之定序結果(上圖)及IL4KO 656之定序結果(下圖)。
圖3展示在實施例2中，針對分別被確認為TBX21及IL4之同源變異體的iPS細胞株(IL4KO及TBX21KO iPS細胞株)，藉由擬胚體(Embryonic Body)法(EB法)分化成造血前驅細胞(HPC)時之培養條件(培養基成分、氧濃度)。
圖4展示在實施例2中，從ATO得到之細胞所表現的標記，該ATO係使用分別源自下列細胞株的HPC來製作：IL4基因剔除iPS細胞株(簡稱為IL4KO，以下相同)及TBX21基因剔除iPS細胞株(簡稱為TBX21KO，以下相同)，以及周邊血單核細胞(簡稱為PBMCs，以下相同，有時亦被稱為PBMC)及指定之基因未經剔除的野生型iPS細胞株(簡稱為野生(Wild)，以下相同，有時亦被稱為野生型(Wild-type))。在「IL4KO」及「TBX21KO」中，包含與「PBMCs」及「野
生」同樣顯示「CD4+CD8 β-」之表現模式(expression pattern)及「CD4+CD8 α-」之表現模式的細胞(各個顯示鄰近之框線內)，亦即CD4SP T細胞。
圖5展示在實施例2中，從ATO得到之CD4SP T細胞的趨化介素(chemokine)受體表現模式，其中該ATO係分別使用源自IL4KO、TBX21KO、PBMC及Wild-type的HPC來製作。
圖6展示在實施例3中，從ATO得到之CD4SP T細胞的細胞激素(cytokine)分泌模式，其中該ATO係分別使用源自IL4KO、TBX21KO、PBMC及野生型的HPC來製作。
圖7展示在實施例3中，各種細胞之IL-13產生。左圖：源自TKT3V1-7之野生型細胞的CD4SP T細胞(TKT-野生-CD4SPs)與初代之CD4SP T細胞(primary CD4SPs)的對比。右圖：源自TKT3V1-7之野生型細胞的CD4SP T細胞(TKT-野生-CD4SPs)與源自TKT3V1-7之IL4KO細胞之CD4SP T細胞(TKT IL4KO641/656-CD4SPs)的對比。縱軸：細胞數，橫軸：螢光強度。
[用於實施發明之型態]
在下述之說明中，將「(B1)與IL-4之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)」簡稱為「HSPC(B1)」，將「(B2)與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)」簡稱為「HSPC(B2)」，將「(a)表現Notch配體之間質細胞」簡稱為「間質細胞(a)」，將「(b1)與IL-4之分泌相關之基因經剔除，而與IFN-γ之分泌相關之基因未經剔除的造血幹細胞(HSC)或造血前驅細胞(HPC)」簡稱為「HSPC
(b1)」，將「(b2)與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除，而與IL-4之分泌相關之基因未經剔除的造血幹細胞(HSC)或造血前驅細胞(HPC)」簡稱為「HSPC(b2)」。HSPC(b1)及HSPC(b2)可分別為與IL-4之分泌相關之基因經剔除，而與IFN-γ之分泌相關之基因未經剔除的HSC及HPC，以及與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除，而與IL-4之分泌相關之基因未經剔除的HSC及HPC。又，將「造血幹細胞及/或造血前驅細胞」(造血幹細胞與造血前驅細胞之總稱)簡稱為「HSPC」。
在下述之說明中，將「IL-4非分泌且IFN-γ分泌型(Th1型)之CD4單陽性T細胞」簡稱為「Th1型CD4SP T細胞」，將「IFN-γ非分泌且IL-4分泌型(Th2型)之CD4單陽性T細胞」簡稱為「Th2型CD4SP T細胞」。將藉由本發明之Th1型CD4SP T細胞之製造方法所得到的Th1型CD4SP T細胞簡稱為「本發明之Th1型CD4SP T細胞」，將藉由本發明之Th2型CD4SP T細胞之製造方法所得到的Th2型CD4SP T細胞簡稱為「本發明之Th2型CD4SP T細胞」。本發明之Th1型CD4SP T細胞及本發明之Th2型CD4SP T細胞可分別為與IL-4之分泌相關之因子實質上受損的Th1型之CD4單陽性T細胞，以及與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的Th2型之CD4單陽性T細胞，彼等之製造方法無特別限定。又，亦將「CD4單陽性T細胞」簡稱為「CD4SP細胞」。再者，實施例中的「CD4SP細胞」相當於CD4單陽性T細胞。
在本說明書中「造血幹細胞」(HSC)意指能分化成血球系細胞(白血球(嗜中性球、嗜酸性球、嗜鹼性球、淋巴球、單核球、巨噬細胞)、紅血球、血小板、肥胖細胞及樹狀細胞)的多能性幹細胞(multipotent stem cell)。又，在本說明書中「造血前驅細胞」(HPC)意指具有分化成血球系細胞之能力，但不具有幹細胞般之自我再生能力的細胞。人類之HSC及HPC主要存在於骨髓，然而於
周邊血、臍帶血中亦存在，可從各個部位回收。在本發明中，造血幹細胞可為從骨髓等活體組織、血液等單離的細胞，亦可為從ES細胞或iPS細胞製作的細胞。造血幹細胞(HSC)及造血前驅細胞(HPC)之任一者，就細胞標記而言，為CD34陽性且CD3陰性之細胞(CD34+CD3-細胞)。為造血幹細胞之某細胞，可藉由將其移植至動物且將著生者再度取出，移植至其他個體，若其保持著生，且具有自我再生能力，可確認該細胞為「幹細胞」而非「前驅細胞」。
在本說明書中「人工多能性幹細胞」(iPSC)意指藉由對哺乳動物體細胞或未分化幹細胞導入特定之因子(核初期化因子)，進行再程序化而得到的細胞。現今有著各式各樣的「人工多能性幹細胞」，除依照山中氏等人，藉由對小鼠纖維母細胞導入Oct3/4、Sox2、Klf4、c-Myc等4因子而建立的iPS細胞(Takahashi K,Yamanaka S.,Cell,(2006)126：663-676)之外，可使用將同樣之4因子導入人類纖維母細胞而建立的源自人類細胞之iPS細胞(Takahashi K,Yamanaka S.,et al.Cell,(2007)131：861-872.)；將上述4因子導入後，以Nanog之表現作為指標進行篩選而建立的Nanog-iPS細胞(Okita,K.,Ichisaka,T.,and Yamanaka,S.(2007).Nature 448,313-317.)；藉由不含c-Myc之方法所製作的iPS細胞(Nakagawa M,Yamanaka S.,et al.Nature Biotechnology,(2008)26,101-106)；藉由無病毒(virus free)法導入6因子而建立的iPS細胞(Okita K et al.Nat.Methods 2011 May；8(5)：409-12,Okita K et al.Stem Cells.31(3)：458-66)。又，亦可使用依照Thomson氏等人製作的藉由導入OCT3/4、SOX2、NANOG、LIN28等4因子而建立的人工多能性幹細胞(Yu J.,Thomson JA.et al.,Science(2007)318：1917-1920.)；依照Daley氏等人製作的人工多能性幹細胞(Park IH,Daley GQ.et al.,Nature(2007)451：141-146)；依照櫻田氏等人製作的人工多能性幹細胞(日本特
開第2008-307007號)等。此外，亦可使用公開之所有論文(例如，Shi Y.,Ding S.,et al.,Cell Stem Cell,(2008)Vol3,Issue 5,568-574；Kim JB.,Scholer HR.,et al.,Nature,(2008)454,646-650；Huangfu D.,Melton,DA.,et al.,Nature Biotechnology,(2008)26,No 7,795-797)，或者專利(例如，日本特開第2008-307007號、特開第2008-283972號、US2008-2336610、US2009-047263、WO2007-069666、WO2008-118220、WO2008-124133、WO2008-151058、WO2009-006930、WO2009-006997、WO2009-007852)記載的該領域中周知之人工多能性幹細胞之任一者。就人工多能性細胞株而言，可利用NIH、理研、京都大學等建立的各種iPS細胞株。例如，若為人類iPS細胞株，可列舉理研之HiPS-RIKEN-1A株、HiPS-RIKEN-2A株、HiPS-RIKEN-12A株、Nips-B2株、京都大學之253G1株、201B7株、409B2株、454E2株、606A1株、610B1株、648A1株等。再者，在本發明中，亦可利用如後述的源自T細胞之iPS細胞株。
在本說明書中「標記」，為「蛋白質標記」或「基因標記」，意指在指定之細胞型中，於細胞表面、細胞質內及/或核內等特異地表現的蛋白質或其基因。標記可有陽性選擇標記或陰性選擇標記。較佳之標記為細胞表面標記，尤其若為細胞表面陽性選擇標記，可實施生存細胞之濃縮、單離、及/或檢測。
蛋白質標記之檢測可利用：使用該蛋白質標記之特異性抗體的免疫學檢定，例如，ELISA、免疫染色、流式細胞術(flow cytometry)等進行。就蛋白質標記之特異性抗體而言，可使用結合於蛋白質標記中的特定胺基酸序列或與蛋白質標記結合之特定糖鏈等的抗體。又，可使用下述手法：以在細胞內表現，而於細胞表面(細胞膜上)不表現，或從細胞分泌之蛋白質標記(例如轉錄因子或
其次單元(subunit)、細胞激素等)作為對象，將細胞固定後，使用該蛋白質標記之特異性抗體，一方面於細胞內進行螢光染色，一方面使該蛋白質標記與報導(reporter)蛋白質一起表現。此手法較佳使用於未發現適當之細胞表面標記的情況。另一方面，基因標記之檢測可利用該領域中周知之核酸擴增方法及/或核酸檢測方法進行，例如，RT-PCR(包含定量PCR)、微陣列(microarray)、生物晶片及RNAseq等。
在本說明書中，標記等為「陽性」(positive)，意指標記等之蛋白質或基因的表現量(反映其之測定值、信號)超過藉由如上述之該領域中周知之手法可檢測的量或設定之基準值(或為其以上)。在本說明書中，標記等為「陰性」(negative)，意指標記等之蛋白質或基因的表現量未達藉由如上述之該領域中周知之手法全部或任一者可檢測之量或指定之基準值(或為其以下)。蛋白質或基因之表現的可檢測量或基準值可依所採用之手法或分析之目的而異。例如，若為標記之蛋白質之表現量(分泌量)，藉由螢光標識抗體將細胞染色之流式細胞術(具代表性者為螢光活化細胞分選：FACS)中的螢光信號，比基於非染色細胞之螢光信號所指定基準高(為其以上)時，可判定為「陽性」，低(為其以下)時，可判定為「陰性」。將表現為陽性者以「+」之記號表示，將表現為陰性者以「-」之記號表示(例如，「CD4+CD8-」與「CD4陽性CD8陰性」同義)。
「IFN-γ」意指「干擾素γ」(主要從受到抗原刺激之Th1產生，已知具有抗病毒能力增強、抗腫瘤作用、免疫反應調節等多種功能的蛋白質)。「IL-4」意指「介白素4」(已知除了可使受到抗原刺激之初始CD4+細胞分化成Th2細胞及增殖之外，具有使B細胞分化、產生抗體、控制M2巨噬細胞分化等多種功能的蛋白質)。「CXCR3」意指對在Th1細胞中選擇性地表現且對趨化介
素CXCL9(別名：干擾素γ誘導的單核球因子(monokine induced by interferon γ，MIG))及CXCL10(別名：干擾素γ誘導的蛋白質(interferon-inducible protein 10，IP-10))具特異性的共有受體。「CCR4」意指對在Th2細胞中選擇性地表現且對趨化介素CCL17(別名：胸腺和活化調節趨化介素(thymus and activation-regulated chemokine，TARC))及CCL22(別名：巨噬細胞源趨化介素(macrophage-derived chemokine，MDC))具特異性的共有受體。
在本發明中，「IL-4非分泌且IFN-γ分泌」意指例如藉由流式細胞術(FACS等)測定之細胞內所存在之蛋白質的表現中，IL-4為「陰性」且IFN-γ為「陽性」。「IFN-γ非分泌且IL-4分泌」意指例如藉由流式細胞術(FACS等)測定之細胞內所存在的蛋白質之表現中，IL-4為「陽性」且IFN-γ為「陰性」。
在本說明書中，只要無特別述及，蛋白質之「分泌」與「陽性」同義，蛋白質之「非分泌」與「陰性」同義。
在本說明書中，「間質細胞」意指在活體組織中，構成支撐實質細胞之結締組織的細胞，特別指可製作產生T細胞之ATO的間質細胞，具代表性者為包含於骨髓、胸腺等造血系統之組織的間質細胞。間質細胞可為小鼠骨髓細胞株MS-5、OP9、S17，可為人類間質細胞株HS-5、HS-27a等細胞株，亦可為從人類等採集的初代細胞，或從人類等之多能性幹細胞(iPS細胞等)分化誘導的細胞。
-製造方法-
本發明之Th1型之CD4單陽性T細胞(Th1型CD4SP T細胞)或Th2型之CD4單陽性T細胞(Th2型CD4SP T細胞)的製造方法，包含將與IL-4之分泌相
關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞及/或造血前驅細胞(HSPC)誘導成CD4單陽性T細胞(CD4S PT細胞)的步驟。具體而言，本發明之Th1型CD4SP T細胞的製造方法，包含將與IL-4之分泌相關之因子實質上受損(另一方面，與IFN-γ之分泌相關之因子實質上未受損)的HSPC(B1)誘導成CD4SP T細胞的步驟。本發明之Th2型CD4SP T細胞的製造方法，包含將與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損(另一方面，與IL-4之分泌相關之因子實質上未損傷)的HSPC(B2)誘導成CD4SP T細胞的步驟。
「與IL-4之分泌相關之因子」意指與IL-4之分泌相關之基因，或該基因編碼的蛋白質。「與IL-4之分泌相關之基因」，用於製作HSPC(B1)時，實質上受損；用於製作HSPC(B2)時，實質上未受損。「與IL-4之分泌相關之基因」，典型而言雖為「IL4基因」，然而亦可為IL4基因以外的基因，只要該基因為藉由實質上受損而可抑制IL-4之分泌的基因，並為不妨礙Th1型CD4SP T細胞之製造，且不抑制IFN-γ之分泌的基因。更具體而言，可從編碼圖1右圖(Th2信號)中記載之蛋白質(即IL-4、IL-4R、Stat6、GATA3、mel-18、IL-5及IL-13(該蛋白質為複合體時，則指其至少一部分))的基因中，選擇「與IL-4之分泌相關之基因」。例如，已知作為Th2型CD4SP T細胞之主調節者(master regulator)的GATA3基因或IL4Ra(CD124)基因，若藉由實質上受損，可不妨礙向T細胞的分化而達成IL-4表現的抑制，則亦可使用作為「與IL-4之分泌相關之基因」。不針對如上述之「與IL-4之分泌相關之基因」，而是使該基因所編碼的蛋白質形成實質上受損，同樣亦可製作HSPC(B1)。
「與IFN-γ之分泌相關之因子」意指與IFN-γ之分泌相關之基因，或該基因所編碼的蛋白質。「與IFN-γ之分泌相關之基因」，用於製作HSPC
(B2)時，實質上受損；用於製作HSPC(B1)時，實質上未受損。「與IFN-γ之分泌相關之基因」，典型而言雖為編碼T-bet(參照圖1)的「TBX21基因」，然而亦可為TBX21基因以外的基因，只要該基因為藉由實質上受損而可抑制IFN-γ之分泌的基因，並為不妨礙Th2型CD4SP T細胞之製造，且不抑制IL-4之分泌的基因即可。更具體而言，可從編碼圖1左圖(Th1信號)中記載之蛋白質(即IL-12、IFN-γ、IL-12R β 2、IFN γ R、Stat4、T-bet、HLX(該蛋白質為複合體時，則指其至少一部分))的基因中，選擇「與IFN-γ之分泌相關之基因」。例如，IFN-γ基因或IL-12R β 2基因，其若實質上受損且不妨礙向T細胞的分化，則可使用作為「與IFN-γ之分泌相關之基因」。不針對如上述之「IFN-γ之分泌相關之基因」，而藉由使該基因所編碼的蛋白質實質上受損，亦可同樣地製作HSPC(B2)。
上述指定之因子「實質上受損」之造血幹細胞及/或造血前驅細胞(HSPC)，意指無法進行與該因子正常作用情況下同等之信號傳達的HSPC。例如意指(i)上述指定之基因被改變而不表現上述指定之蛋白質的HSPC、(ii)上述指定之(內因性)蛋白質在功能上受損的HSPC、(iii)上述指定之(內因性)蛋白質之表現降低的HSPC等，且意指可達到本發明之作用效果者，亦即於適當條件下培養時，可誘導成目標CD4SP T細胞者。就如(i)之HSPC而言，例如，可列舉將該基因剔除之HSPC、在該基因中至少一個鹼基經附加、插入、置換及/或刪除的HSPC等。就如(ii)之HSPC而言，例如，可列舉使顯性負(dominant negative)變異體(例如，STAT6中的STAT6ΔC(參見FEBS letters 579(2005)3953-3959))表現，藉此相對於內因性蛋白質展現優勢，使該內因性蛋白質之正常功能減弱的HSPC等。就如(iii)之HSPC而言，例如，包含針對上述指定之蛋白質之shRNA及/或
siRNA的HSPC等。已製成上述指定之因子「實質上受損」的HSPC，可藉由將該HSPC誘導成CD4SP T細胞，並從所得到之CD4SP T細胞中IL-4或IFN-γ的分泌而確認。又，在上述(iii)中「指定之蛋白質之表現降低」，意指HSPC中指定之蛋白質之表現量減少。在一實施態樣中，與處理(例如，對HSPC導入針對上述指定之(內因性)蛋白質的shRNA及/或siRNA)前之HSPC中的表現量相較，處理後之表現量至少降低約25%、40%、50%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%，或其以上(例如，96%、97%、98%或99%)。一般而言，周知有各式各樣用於製作某基因或蛋白質「實質上受損」之細胞的手段(用於處理之方法、條件、試藥、裝置等)。若為本技術領域人士，可從該等手段中選擇適當者，或依照適合本發明之設計，在可達到本發明之作用效果的條件下，製作無法進行與上述指定因子(基因或蛋白質)正常作用情況下同等之信號傳達的HSPC，亦即上述指定之因子「實質上受損之」的HSPC。
從上述之事項，本發明之一面向中，提供與IL-4之分泌相關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的HSPC(分別為與IL-4之分泌相關之因子實質上受損的HSPC，以及與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的HSPC)。又，本發明之另一面向中，提供一種控制向Th1型或Th2型之CD4單陽性T細胞分化的方法，其包含使造血幹細胞及/或造血前驅細胞(HSPC)中與IL-4之分泌相關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的步驟。
<剔除>
在本發明之較佳實施型態中，與IL-4之分泌相關之因子實質上受損的HSPC(B1)係與IL-4之分泌相關之基因經剔除的HSPC(b1)。在本發明之較佳實施型態
中，與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的HSPC(B2)為與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除的HSPC(b2)。
HSPC(b1)及HSPC(b2)可藉由在HSPC中，或在可被分化誘導成HSPC之原細胞中，分別將指定的基因剔除而製作。例如，在如前述從iPSC分化誘導成HSPC的情況，較佳為於iPSC之階段進行剔除處理。
剔除指定基因的手段無特別限定，可使用周知之各種手段。例如，CRISPR/Cas系統，為在本發明中用於將指定之基因剔除的較佳手段之一。若以基因組DNA上指定之基因座所含的鹼基序列作為標的，適當使用CRISPR/Cas系統，則反覆發生DNA之雙股斷裂(DSB)。其結果為在非同源性末端接合(NHEJ)或同源性重組修復(HR)之途徑中誘發修復錯誤，由於導入了鹼基之刪除或插入等變異，變成可藉由移框(frameshift)剔除指定基因。
就CRISPR/Cas系統而言，除為代表性的CRISPR/Cas9系統之外，周知有各種變異，在本發明中亦可使用各種系統。CRISPR/Cas系統包含複數個RNA誘導型核酸酶(Cas)參與的類別1(型I、型III、型IV)及單一Cas參與的類別2(型II、型V、型VI)。就較佳之CRISPR/Cas系統而言，例如，可列舉類別2型II之CRISPR/Cas9系統，或類別2型V之CRISPR-Cas12a/Cpf1。
在CRISPR/Cas系統中，雖使用嚮導RNA(gRNA)及RNA誘導型核酸酶，然而關於彼等，周知均有各種變異，在本發明中亦可使用各種實施型態者。
gRNA係藉由crRNA及tracrRNA構成。crRNA及tracrRNA可分別為其他RNA鏈，且形成複合體者，亦可為經由間隔基(spacer)連結的單一RNA鏈(單一嚮導RNA：sgRNA，或嵌合體RNA)。為了在HSPC中分別剔除指定之
基因，作為標的之鹼基序列(鄰接PAM序列的鹼基序列)，亦即對應於該鹼基序列的crRNA之鹼基序列，本技術領域人士當可適當的設計。gRNA能以RNA之型態，或包含藉由轉錄可生成該RNA之鹼基序列的DNA(表現質體等)之型態，導入細胞內。RNA之型態之gRNA，可為只由天然之核苷酸(腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶、尿嘧啶)構成者，亦可為包含天然之核苷酸及核苷酸類似物者。就核苷酸類似物而言，例如，可列舉糖部修飾核苷酸(2’-O-甲基核糖、2’-O-丙基核糖、2’-O-甲氧基乙氧基核糖、2’-O-甲氧基乙基核糖、2’-O-[2-(胍鎓)乙基]核糖、2’-O-氟核糖等)；架橋構造型人工核酸(BNA)(鎖人工核酸(LNA)、伸乙基架橋構造型人工核酸(ENA)等)；磷酸二酯鍵修飾核苷酸(磷酸二酯鍵轉變成硫代磷酸酯(phosphorothioate)鍵結之置換體、轉變成N3’-P5’胺基磷酸酯鍵結之置換體等)。在本發明之一實施型態中，gRNA之一部分(較佳為鹼基序列之3’及5’兩末端各至少一鹼基，更佳為各二鹼基或各三鹼基)可形成核苷酸類似物(較佳為糖部修飾核苷酸及磷酸二酯鍵修飾核苷酸，更具體而言，為2’-O-甲基核糖及磷酸二酯鍵轉變成硫代磷酸酯鍵結之置換體)。
RNA誘導型核酸酶可為兩個核酸酶結構域皆有活性的野生型核酸酶，亦可為其中之一有活性的變異型核酸酶(切口酶(nickase))。RNA誘導型核酸酶能以蛋白質之型態，或包含編碼該蛋白質之胺基酸序列之鹼基序列的核酸(如mRNA、或表現質體之DNA等)之型態，導入細胞內。
將CRISPR/Cas系統所用的指定RNA及RNA誘導型核酸酶導入細胞內(在本發明中，例如，HSPC內)的手段無特別限定。在本發明之一實施型態中，gRNA之RNA鏈及RNA誘導型核酸酶(Cas9等)之蛋白質可藉由電穿孔法(electroporation)導入細胞內。
本發明中所用的各種細胞，亦即用於製作HSPC(B1)及(b1)、HSPC(B2)及(b2)、以及後述之HSPC(B1)等及HSPC(B2)等的iPS細胞、進一步用於製作該iPS細胞之細胞(T細胞等)，可各自為源自人類者，亦可為源自人類以外之動物，例如小鼠、大鼠、狗、豬、猴等之哺乳動物者，可依照藉由本發明得到之Th1型CD4SP T細胞或Th2型CD4SP T細胞的用途而選擇。例如，在假設Th1型CD4SP T細胞或Th2型CD4SP T細胞為投與至人類者的情況，上述之各種細胞以源自人類者為較佳。
用於製作HSPC(B1)、(B2)等之HSPC，亦即指定之因子實質上受損前的細胞，為以何種方式取得或製作者無特別限定。例如，可為從iPS細胞、ES細胞、其他具有分化成HSPC能力之細胞分化誘導而製作者，亦可為從臍帶血、骨髓、周邊血、其他活體採集的HSC或HPC。
<從iPSC向HSPC之分化誘導>
在本發明之較佳實施型態中，HSPC為從iPS細胞(iPSC)分化誘導的細胞。例如，使用從患者採集的細胞(較佳為T細胞，更佳為CD4SP T細胞)製作iPSC，該患者係預定將投與依照本發明之製造方法所得到的Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞，使用該iPSC製作之ATO可得到對患者而言為HLA型適合且不引起免疫排斥之Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞。又，亦可使用通用化(具有對多數患者不引起免疫排斥的特定HLA型，或HLA經剔除)的iPSC。
用於從iPSC向HSPC分化誘導之基本事項及具體實施型態為周知，無特別限定。以依據採用之分化誘導方法、培養日數等，適當調整、變更培養基組成、培養條件等，以提高向HSPC之分化誘導效率及細胞增加率為較佳。
在本發明之較佳實施型態中，從iPSC(較佳為後述之T-iPSC，以下相同)製作的HSPC可藉由無滋養層(feeder free)法製作。例如，以AE Grigoriadis et al.(2010).Blood,115(14)：2769-2776記載的在不使用滋養層(feeder)細胞下，使擬胚體(embryonic body)形成，進而產生HPC的「擬胚體法(EB法)」為較佳。
又，例如，如WO2011/096482、WO2013/176197記載，亦可將iPSC在滋養層細胞上培養，分化誘導成HSPC。從「容易誘導分化成中胚葉系統」的觀點而言，滋養層細胞以間質細胞為較佳。從「容易誘導分化成造血系統」的觀點而言，間質細胞以施行放射線照射等處理的OP9細胞、10T1/2細胞(C3H10T1/2細胞)等為較佳。
就用於無滋養層法(EB法等)之培養基而言，例如，可列舉StemFit(註冊商標，味之素股份有限公司)、StemPro(註冊商標，Thermo Fisher Scientific)。就用於將iPSC及滋養層細胞共培養之培養基而言，例如，可列舉X-VIVO培養基、伊斯可夫(Iscove)修飾杜白可(Dulbecco)培養基(IMDM培養基)、α-MEM、DMEM。然而，從含有HSPC等之袋狀構造物(sack)之形成效率高的觀點而言，以IMDM培養基為較佳。
培養基雖未必含有細胞激素，然而以含有細胞激素，進一步視需要含有血清(例如，胎牛血清(FBS))、胰島素、運鐵蛋白(transferrin)、亞硒酸鈉、L-麩醯胺酸(或GlutaMAX(Gibco))、α-單硫代甘油、抗壞血酸等為較佳。從將iPSC效率良好地向HSPC分化誘導的觀點而言，細胞激素以選自BMP、bFGF、VEGF、SCF、TPO及FLT3L所構成之群組中的至少一種細胞激素為較佳。在EB法中，例如，以將BMP4、bFGF及VEGF之三者之組合、bFGF、VEGF及SCF之三者之組合、或bFGF、VEGF、SCF、TPO及FLT3L之五者之組合，依據培
養日數變更使用為較佳。在iPSC與滋養層細胞之共培養法中，例如，以VEGF、SCF及TPO之三者之組合，或VEGF、SCF及FLT3L之三者之組合為更佳。
培養期間只要為可產生充分數量之HSPC(在iPSC與滋養層細胞之共培養法中，形成包含HSPC之袋狀構造物(sack))的期間即可，然而以例如從培養開始算起10至14日為較佳。培養環境無特別限定，較佳為約5%CO2、約37℃之條件。又，從提高HSPC之產生效率(袋狀構造物之形成效率)的觀點而言，以於低氧濃度(例如5至20%)之條件下培養為更佳。
藉由如上述之分化誘導而形成的袋狀構造物內，通常包含HSPC及其他細胞(血球細胞等)。袋狀構造物之內部所存在的細胞，可藉由物理之手段，例如經由已滅菌之篩狀器具(細胞過濾器(cell strainer)等)，從袋狀構造物分離而回收。由於HSPC係以表現CD34作為細胞表面標記之細胞，可藉由例如使用螢光標識之抗CD34抗體及細胞分選器(cell sorter)的流式細胞術，從經培養而得到之細胞團塊中單離。在本發明之一較佳實施型態中，HSPC為HPC。
<源自T細胞之iPSC的製作>
在本發明之較佳實施型態中，用於向HSPC分化誘導之iPSC為源自T細胞的iPSC(T-iPSC)。用於從T細胞製作iPSC之基本事項及具體實施型態為周知，例如，可參照WO2011/096482、WO2013/176197。再者，用於從T細胞以外製作iPSC之基本事項及具體實施型態亦為周知。
於用於製作iPSC之「T細胞」方面，可包含在表面表現T細胞受體(TCR：T cell receptor)，尤其是TCR之α鏈及β鏈(TCR α β)的細胞、其前驅細胞，亦即不表現TCR α β之原T細胞(pro-T cell)，或TCR β與前TCR α(pre-TCR α)會合而成的前T細胞(pre-T cell)等。又，於「T細胞」方面，可包含CD4
及CD8之表現同為陰性(negative)之T細胞(CD4‧CD8雙陰性T細胞)、CD4及CD8之表現同為陽性(positive)之T細胞(CD4‧CD8DP T細胞)、CD4之表現為陽性而CD8之表現為陰性的T細胞(CD4SP T細胞)、CD8之表現為陽性而CD4之表現為陰性的T細胞(CD8SP T細胞)。其中，表現為「陽性」或「陰性」之說明，如本說明書之其他處記載。在本發明中，尤其關於從ATO產生之「CD4SP T細胞」，用於判定CD4為「陽性」，CD8為「陰性」的「指定之基準」(閾值)，可參照天然輔助T細胞之CD4及CD8的表現量。
就用於製作iPSC之T細胞而言，例如，可使用從周邊血、淋巴節、骨髓、胸腺、脾臟、臍帶血、病變部組織等包含T細胞之組織等採集的T細胞。
在本發明之較佳實施型態中，用於製作iPSC之T細胞為CD4單陽性T細胞(CD4SP T細胞)。CD4SP T細胞可藉由例如使用螢光標識之抗CD4抗體及細胞分選器的流式細胞術，從組織等所含之細胞團塊中單離。在本發明中為了製作iPSC，可使用從CD4SP T細胞製作之iPS細胞株，例如TKT3V1-7株、b3a2株等。
所採集的T細胞具有抗原特異性，亦即具有由再構成之TCR基因所產生的抗原特異性TCR。從使用iPSC製作之ATO產生的本發明之Th1型或Th2型CD4SP T細胞可具有與用於製作該iPSC所用之T細胞所具有者相同或實質上相同的抗原特異性(抗原特異性TCR)。再者，具有期望之抗原特異性的T細胞，可藉由，例如，使用固定有期望抗原的親和性管柱等的精製處理，或使用結合有期望抗原之MHC(主要組織相容性複合體)之多聚物(例如，「MHC四聚體」、「Pro 5(註冊商標)MHC類別I五聚體」)等的精製處理，而從組織中單離。
在本發明之製造方法中，用於將與IL-4之分泌相關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的HSPC，亦即HSPC(B1)及(B2)，分別誘導成目標CD4SP T細胞，亦即Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞的手段(用於培養之方法、條件、裝置等)無特別限定。若為本技術領域人士，可藉由選擇適當之手段，或設計適合於本發明之培養條件(培養基、期間、溫度、周圍環境等)，培養上述HSPC，而誘導成上述CD4SP T細胞。例如，HSPC(B1)及(B2)可藉由以「ATO法」為基準進行培養，誘導成Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞。以下，就誘導方法(培養方法)之代表例而言，以指定基因經剔除之HSPC(b1)及(b2)作為對象的ATO法具體地記載於下文，然而本發明之製造方法中可使用的誘導方法(培養方法)不被其限定；又，亦可使用HSPC(b1)及(b2)以外之HSPC(B1)及(B2)。在依照ATO法以外之誘導方法(培養方法)實施本發明的情況，亦可在必要之範圍內(例如培養基相關方面)，參照關於ATO法所記載的以下之事項。
<ATO法>
在一較佳實施型態中，本發明之Th1型CD4SP T細胞之製造方法，包含
藉由培養包含下列(a)及(b1)的人工胸腺類器官(ATO)：
(a)表現Notch配體之間質細胞，及
(b1)與IL-4之分泌相關之基因經剔除，而與IFN-γ之分泌相關之基因未經剔除之造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)，
而使IL-4非分泌且IFN-γ分泌型(Th1型)之CD4SP T細胞從前述ATO產生的步驟。
在一較佳實施型態中，本發明之Th2型CD4SP T細胞之製造方法，包含藉由培養包含下列(a)及(b2)的人工胸腺類器官(ATO)：
(a)表現Notch配體之間質細胞，及
(b1)與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除，而與IL-4之分泌相關之基因未經剔除之造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)，
而使IFN-γ非分泌且IL-4分泌型(Th2型)之CD4SP T細胞從前述ATO產生的步驟。
本發明之製造方法中的ATO法，除使用預先指定之因子實質上受損之HSPC(B1)或(B2)，較佳為指定之基因經預先剔除的HSPC(b1)或(b2)以外，製作ATO，並回收所產生之細胞的方式實施基本上與先前相同。ATO法之基本事項或具體實施型態為周知(例如參照專利文獻1：WO2017/075389)，本發明亦以其為基準，並改變必要之部分。就一例而言，在專利文獻1記載之方法中，雖初始係藉由插入(insert)，形成胚性中胚葉類器官(embryonic mesodermal organoid)，得到相當於HPC的細胞成分，然後製作ATO，但亦可改變其部分，藉由「擬胚體(Embryonic body)法(EB法)」(AE Grigoriadis et al.(2010).Blood,115(14)：2769-2776)，從iPSC分化誘導成HPC後，使用其製作ATO。在本發明中，製作ATO用的HSPC可被置換成特定基因經預先剔除的HSPC(b1)或(b2)。又，在本發明中，從ATO產生的細胞之中，應回收之細胞為Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞。
用於培養ATO(間質細胞(a)及HSPC(b1)、(b2))之培養基，基本上可從用於培養動物細胞之培養基中選擇，並將視需要添加的成分以適當濃度添加而使用。培養基及添加成分，可隨培養日數之經過而變更。
培養基可列舉例如，AIMV、X-VIVO-15、NeuroBasal、EGM2、TeSR、BME、BGJb、CMRL 1066、Glasgow MEM、改良MEM鋅Option、IMDM、199培養基、Eagle’s MEM、α MEM、DMEM、Ham、RPMI-1640及Fisher培養基。此等培養基可單獨使用任一種，亦可將兩種以上混合使用。就較佳之培養基之一例而言，可列舉RPMI-1640。
培養基可為含有血清之培養基或不含血清之培養基、或無異種來源(xeno-free)的培養基。從防止源自異種動物之構成要素所造成之汚染的觀點而言，血清亦可為與源自與所培養之細胞相同的動物者。不含血清之培養基，意指不具有未加工或未精製之血清的培養基，因此，可含有精製之具有源自血液之構成要素或源自動物組織之構成要素(成長因子等)的培養基。培養基可含有，亦可不含有血清之任何代替物。於血清之代替物方面，可包含白蛋白(富含脂質之白蛋白、牛白蛋白、重組白蛋白或人類化白蛋白等之白蛋白代用物、植物澱粉、葡萄聚糖、及蛋白質水解物等)、運鐵蛋白(或其他鐵輸送體)、脂肪酸、胰島素、膠原前驅物、微量元素、2-巰基乙醇、3'-硫代甘油(α-單硫代甘油、MTG)、或適當地含有彼等之同等物的材料。亦可使用剔除血清代替品(knockout serum replacement,KSR)、化學上規定之脂質濃縮型(chemically-defined lipid concentrated)(Gibco)、及GlutaMAX(Gibco)等市售材料。培養基亦可為適於細胞增殖的不含血清之培養基(SFM)。例如，培養基能包含B-27(註冊商標)補充劑、無異種來源(xeno-free)B-27(註冊商標)補充劑、NS21補充劑、GS21(商標)補充劑、或彼等之組合，其等係以對從3D細胞凝集體產生T細胞為有效之濃度存在。
培養基亦可包含選自生物素；醋酸DL α生育酚；DL α-生育酚；維生素A(乙酸酯)等之維生素；BSA(牛血清白蛋白)或人類白蛋白、不含脂肪酸
之部份V；催化酶；人類重組胰島素；人類運鐵蛋白；超氧化物歧化酶(superoxide dismutase)等之蛋白質；皮質固酮；D-半乳糖；乙醇胺HCl；麩胱甘肽(glutathione)(還原型)；L-肉鹼HCl；亞麻油酸；次亞麻油酸；黃體酮(progesterone)；腐胺(putrescine)2HCl；亞硒酸鈉；及T3(三碘-L-甲狀腺素)；PSG(青黴素、鏈黴素、及L-麩醯胺酸)構成之群組的一種或一種以上。培養基亦可包含從外部添加的抗壞血酸或其衍生物(例如抗壞血酸2-磷酸：PAA)。培養基亦可包含分別從外部添加的脂肪酸或脂質、胺基酸(非必須胺基酸等)、維生素、生長因子、細胞激素、抗生素、抗氧化物質、2-巰基乙醇、丙酮酸、緩衝劑、及無機鹽構成之群組的一種或二種以上。
培養基可包含從外部添加的細胞激素。就細胞激素而言，例如，可列舉FLT3配體(FLT3L)、介白素7(IL-7)、幹細胞因子(SCF)、血小板生成素(TPO)、IL-2、IL-3、IL-4、IL-6、IL-12、IL-15、IL-21、TNF-α、TGF-β、干擾素-γ、干擾素-λ、TSLP、胸腺五肽(thymopentin)、多效蛋白(pleiotrophin)、及中期因子(midkine)。此等細胞激素可單獨使用任一種，亦可將二種以上併用。
3D細胞凝集體可包含，亦可不包含外因性細胞外基質或支架(scaffold)。就外因性細胞外基質而言，例如，可列舉膠原、明膠、聚-L-離胺酸、聚-D-離胺酸、層黏連蛋白(laminain)、及纖連蛋白(fibronectin)、以及彼等之混合物、例如Matrigel(商標)、以及溶解細胞膜調製物等。
其他之ATO的培養條件，可適當地設定。培養溫度可為例如20℃至40℃，較佳為約37℃。CO2濃度可為例如2%至10%，較佳為2%至5%。氧濃度可為例如1%至20%，較佳為5%至20%。
ATO中之間質細胞(a)及HSPC(b1)或HSPC(b2)，能以任意之比率進行共培養。例如，間質細胞(a)：HSPC(b1)或HSPC(b2)可為100：1至1：100、90：1至1：90、80：1至1：80、70：1至1：70、60：1至1：60、50：1至1：50、40：1至1：40、30：1至1：30、20：1至1：20，較佳為20：1至1：4。在HSPC(b1)或HSPC(b2)係從源自T細胞之iPS細胞製作者的情況，上述比率以約1(例如MS5hDLL4)：4(例如HPC)為較佳；另一方面，在從源自非T細胞之iPS細胞製作者的情況，上述比率以約20(例如MS5hDLL4)：1(例如HPC)為較佳。
ATO之培養期間可為例如4週以上，較佳為5週以上，更佳為6週以上，進一步更佳為8週以上或9週以上。培養期間之上限無特別限定，而較佳可為16週以下，更佳為14週以下，進一步更佳為12週以下。具體而言，培養期間可為例如4至16週，較佳為5至16週，更佳為6至14週，進一步更佳為8至12週或9至12週。ATO之培養期間約4至9週，越長則所得到的細胞團塊中之CD4SP T細胞之比例有變高的傾向；另一方面，若超過一定期間，CD4SP T細胞之比例變得難以升高，進一步地，由於CCR7陽性細胞恐怕會減少(向效應子方向進行分化)，為得到期望之組成的細胞團塊，可依據細胞株或培養條件等，在如上述之範圍內，調整ATO之培養期間(例如設定於約9週)。
在本發明之製造方法中，從ATO產生的細胞中，除CD4SP T細胞之外，亦包含CD8SP T細胞、CD4‧CD8DN T細胞及CD4‧CD8DP T細胞。例如，可藉由使用螢光標識之抗CD4抗體及細胞分選器的流式細胞術(代表者為螢光活化細胞分選(cell sorting)：FACS)，從所產生的細胞之中將CD4SP T細胞單離並回收。再者，可藉由進行細胞內染色用之經各種螢光標識的抗IFN-γ抗
體及抗IL-4抗體以及流式細胞術，確認CD4SP T細胞中有Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞存在。在將Th2型CD4SP T細胞以活細胞回收的情況，可藉由例如流式細胞術，回收為CXCR3陰性、(與IL-4之分泌傾向一致的)CCR4陽性、且(為Th17細胞之標記的)CCR6陰性之細胞。
<間質細胞(a)>
間質細胞(a)可藉由對間質細胞導入Notch配體基因，使其表現而製作。間質細胞(a)與前述之HSPC等同樣可為源自人類者，亦可為源自人類以外之動物者。用於導入Notch配體基因之手段無特別限定，可採用例如病毒載體(逆轉錄病毒載體、慢病毒載體等)等周知之適當手段。例如，就Notch配體而言，將人類DLL1或人類DLL4進行轉導而建立MS-5小鼠間質細胞株(分別為MS5-hDLL1株及MS5-hDLL4株)，可使用此種細胞株作為本發明的間質細胞(a)。
在本說明書中所用的術語「Notch配體」，與記載ATO之製作方法等的專利文獻1：WO2017/075389(對應於日本特開第2018-533364號公報)中之術語同義，包含「標準之Notch配體」及「非標準之Notch配體」。就標準之Notch配體而言，例如，可列舉δ樣配體4(DLL4)、δ樣配體1(DLL1)、Jagged1(JAG1)、Jagged2(JAG2)、δ樣配體3(DLL3)、及X-δ2。就非標準之Notch配體而言，例如，可列舉接觸蛋白(contactin)-1、NOV/CCN3、接觸蛋白-6、骨膜蛋白(periostin)/OSF-2、DLK2/EGFL9、Pref-1/DLK1/FA1、DNER、凝血栓蛋白(thrombospondin)-2、MAGP-1/MFAP2、凝血栓蛋白-3、MAGP-2/MFAP5、凝血栓蛋白-4、及紡錘蛋白(netrin)-1。
-細胞-
本發明之Th1型CD4SP T細胞的第1實施型態，為藉由前述本發明之製造方法，亦即包含將與IL-4之分泌相關之因子實質上受損之造血幹細胞及/或造血前驅細胞(HSPC)誘導為CD4 SPT細胞之步驟的製造方法所得到的Th1型CD4SP T細胞。本發明之Th1型CD4SP T細胞的第2實施型態，為與IL-4之分泌相關之因子實質上受損的Th1型CD4SP T細胞。再者，本發明之Th1型CD4SP T細胞可相應於上述第1實施型態及第2實施型態兩者。本發明之Th1型CD4SP T細胞，如前述，以iPS細胞(iPSC)，例如從源自T細胞之iPS細胞(T-iPSC)分化誘導的細胞為較佳。
本發明之Th2型CD4SP T細胞的第1實施型態，為藉由前述本發明之製造方法，亦即包含將與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損之造血幹細胞及/或造血前驅細胞(HSPC)誘導成CD4 SPT細胞之步驟的製造方法所得到之Th2型CD4SP T細胞。本發明之Th2型CD4SP T細胞的第2實施型態，為與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的Th2型CD4SP T細胞。再者，本發明之Th2型CD4SP T細胞可相應於上述第1實施型態及第2實施型態兩者。本發明之Th2型CD4SP T細胞，如前述，以iPS細胞(iPSC)，例如從源自T細胞之iPS細胞(T-iPSC)分化誘導的細胞為較佳。
本發明之Th1型CD4SP T細胞的第1實施型態及第2實施型態，可與活體中存在的天然Th1型CD4SP T細胞(以下，簡稱為「天然之Th1細胞」)及藉由本發明以外之製造方法所得到的Th1型CD4SP T細胞區別。例如，在本發明之製造方法的較佳一實施型態中，雖將造血幹細胞及/或造血前驅細胞(HSPC)之IL-4之分泌相關之基因剔除，然而由於藉由其製造方法所得到的Th1型CD4SP T細胞，其IL-4之分泌相關之基因亦剔除，故可與天然之Th1細胞等
明顯地區別(在此情況，Th1型CD4SP T細胞相應於第1實施型態及第2實施型態兩者)。指定基因之剔除可依照通常方法，藉由調查基因組DNA之鹼基序列而確認。又，本發明之Th1型CD4SP T細胞之第2實施型態，由於與IL-4之分泌相關的因子實質上受損，可與不具有此種特徵的天然之Th1細胞等區別。藉由本發明之製造方法之其他實施型態所得到的Th1型CD4SP T細胞(第1實施型態)，亦可藉由依其製造方法之實施型態特徵(尤其，使HSPC之IL-4之分泌相關之因子實質上受損的手段)的痕跡等，與天然之Th1細胞等區別。同樣地，本發明之Th2型CD4SP T細胞之第1實施型態及第2實施型態，亦可與活體中存在的天然Th2型CD4SP T細胞(以下，亦簡稱為天然之Th2細胞)及藉由本發明以外之製造方法所得到的Th2型CD4SP T細胞區別。
再者，本發明之Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞，通常分別與天然之Th1細胞及Th2細胞相同，亦為表現CD45RA或CD45RO、CD3ε、TCRαβ等的細胞。若從趨化介素受體之表現觀之，本發明之Th1型CD4SP T細胞與天然之Th1細胞同樣地為CXCR3陽性且CCR4陰性，本發明之Th2型CD4SP T細胞與天然之Th2細胞同樣地為CXCR3陰性且CCR4陽性。又，本發明之Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞亦強烈表現CD5(為強陽性)，亦即亦成為成熟的Th1型CD4SP T細胞及成熟的Th2型CD4SP T細胞。
除上述之特徵以外，本發明之Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞有「包含代表中央記憶T細胞之表現型的CD28及CCR7的部分，具有高自體複製能力」的特點。
<用途>
本發明之Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞的用途無特別限定，然而例如可使用於腫瘤、感染症(例如，慢性感染症)、過敏性疾病、自體免疫疾病等之治療或預防。
因此，在本發明之一面向中，提供藉由本發明之製造方法所得到的Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞，以及含有此等細胞之醫藥組成物(細胞製劑)，其係用於上述疾病等之治療或預防。
又，在本發明之其他面向中，提供為了如上述之疾病等之治療或預防，而投與藉由本發明之製造方法所得到的Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞，或者含有此等之細胞醫藥組成物(細胞製劑)的方法(免疫細胞療法)。
上述之實施型態中的醫藥組成物(細胞製劑)(以下稱為「本發明之醫藥組成物(細胞製劑)」)，可含有Th1型CD4SP T細胞及Th2型CD4SP T細胞之任一者，亦能以任意比率混合而含有兩者。
本發明之醫藥組成物(細胞製劑)可依據投與途徑等，藉由周知之製劑學方法進行製劑化，例如，可調劑作為注射劑(靜脈注射劑、點滴注射劑等)、液劑、懸浮劑、乳劑等。在此種製劑化中，視需要可將藥理學上可容許之載劑(媒劑)或添加劑，具體而言為滅菌水、生理食鹽水、植物油、溶劑、基劑、乳化劑、懸浮劑、界面活性劑、安定劑、媒液、防腐劑、結合劑、稀釋劑、等張化劑、無痛化劑、增量劑、崩散劑、緩衝劑、被覆劑、潤滑劑、著色劑、溶解輔助劑等適當地組合而使用。再者，亦可依據治療或預防目的而一併含有Th1型CD4SP T細胞及/或Th2型CD4SP T細胞及其他有效成分(其他藥劑、細胞等，例如導入CAR之CD8SP T細胞)或免疫賦活化劑等。
本發明之醫藥組成物(細胞製劑)之投與方法無特別限定，較佳為非經口投與，例如，靜脈內、腹腔內、皮下或肌肉內投與，或對患部之局部投與，更佳為靜脈內投與或對患部之局部投與。本發明之醫藥組成物(細胞製劑)的投與量可依據對象之年齡、體重、症狀、健康狀態、劑型、投與方法等而適當地調節。
本發明之組成物之醫藥組成物(細胞製劑)的製品可附加以疾病等之治療或預防為要旨的表示。例如，可在製品之本體、容器、包裝等，或製品之說明書、附加文書、宣傳物、其他印刷物等上，記載以用於疾病等之治療或預防為要旨的資訊。
在本說明書及申請專利範圍中使用的情況，只要在語境上被認為無需限定，則單數形之術語包含複數形，複數形之術語包含單數形。因此，單數形之冠詞(例如，在英語之情況為「a」、「an」、「the」等)，只要無特別述及，可理解亦包含其複數形之概念。
[實施例]
[實施例1]iPS細胞(TBX21 KO細胞株、IL4 KO細胞株)之製造iPS細胞係使用由京都大學(CiRA)提供的TKT3V1-7株。將在AK03N培養基(味之素公司製)中繼代、維持，於孔內成為次融合(subconfluent)之未分化狀態之iPS細胞，使用TripLESelect(Thermo Fisher Scientific公司製)使其成為單細胞而回收。將回收之細胞以每一管(cuvette)含1.0×106個/100μL的方式再懸浮於Opti-MEM(Thermo Fisher Scientific公司製)中。
針對編碼轉錄因子T-bet之TBX21基因、編碼細胞激素IL-4之IL4基因，設計嚮導RNA，使用包含其識別序列的Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA(Integrated DNA Technologies公司製)及Alt-R CRISPR-Cas9 tracrRNA(同公司製)，
使嚮導RNA形成。使該嚮導RNA懸浮液與Alt-R S.p.Cas9 Nuclease 3NLS(同公司製)反應，形成RNP複合體。
以RNP複合體之最終濃度成為1.6μM的條件，將RNP複合體懸浮液與懸浮於Opti-MEM之1.0×106個之iPS細胞混合，對於本混合液，使用NEPA21電穿孔器(electroporator)(Nappagene公司製)進行電穿孔。
再者，進行電穿孔時，同時將Puro(嘌呤黴素抗性基因)質體進行電穿孔，藉由添加有嘌呤黴素的培養基中培養，進行Cas9蛋白導入細胞之間接性選擇。此係利用針對細胞的Cas9蛋白導入與質體導入之關聯。
將進行電穿孔之iPS細胞接種在經iMatrix-511(Matrixome公司製)被覆的10cm培養皿上，採集培養12日生成之群落，進行繼代。將此等源自各群落之細胞單株化並貯存，藉由定序確認目標基因之剔除及其變異形式。
定序(sequence)係藉由以嚮導RNA之目標序列夾在中間的方式設計引子，並針對PCR產物進行。將定序結果之實例示於圖2。即使藉由相同嚮導RNA之剔除(KO)處理，隨細胞株不同，產生的變異亦不同，已進行序列及形質確認之細胞株的一覽示於表1。再者，此等細胞株間，不論變異之形式，目標形質同等的表現於之後確認。
表1：所得到的KO株之列表
*1 IL4基因內之gRNA4的目標鹼基序列(序列編號1)5’-GTGTCCGTGGACAAAGTTGC-3’
*2 IL4基因內之gRNA5的目標鹼基序列(序列編號2)5’-CAAGTGCGATATCACCTTAC-3’
*3 TBX21基因內之gRNA2的目標鹼基序列(序列編號3)5’-GCGGTACCAGAGCGGCAAGT-3’
[實施例2]從iPS細胞(TBX21KO細胞株、IL4KO細胞株)至Th1細胞及Th2細胞之製造(iPSC→HPC/HPC→Th1細胞或Th2細胞)
將藉由定序而確認目標基因為TBX21或IL4之同源變異體的iPS細胞株藉由擬胚體(Embryonic Body)法(EB法)分化成造血前驅細胞(HPC)。EB法意指如AE Grigoriadis et al.(2010).Blood,115(14)：2769-2776所示，不使用滋養層細胞，使擬胚體(embryonic body)形成，產生造血前驅細胞的方法。在本實施例中，進行如圖3之改變。
於TKT3V1-7或其KO細胞株中，將對未分化細胞開始分化誘導之日當作day0，在day9用於ATO製作。將培養液中所含的EB塊使用40μm之細胞過濾器(Fisher Scientific公司製)除去，僅只回收浮游細胞。研判所回收之浮游細胞包含相當於造血前驅細胞的部分，在本實施例中，不將其分選，而以總體(bulk)作為ATO之材料。
人工胸腺類器官(Artificial Thymic Organoid)法為依照CS Seet et al.(2017).Nat Methods.14(5)：521-530所報導，使原本之初代造血幹細胞分化為α β型T細胞分化的類器官培養法。在其原本的方法中，將CD34陽性CD3陰性細胞藉由細胞分選器分選(sorting)後使用，研判亦可進行造血前驅細胞之分選。
在本實施例中，將源自不分選而回收之總體iPS細胞的造血前驅細胞及MS5hDLL4細胞，以細胞數之比成為4：1的方式混合，將懸浮液之液滴裝載於插入式培養小杯(insert)(Merck(Millipore)公司製，MILLICELL INSERT 30MM ORGANOTYPIC PTFE 0.4UM 50/PK)中，使其浮游在每個插入式培養小杯(insert)之培養基中，開始進行ATO分化培養法。培養基係在RPMI-1640(Wako公司製)中，添加稀釋25倍之B-27TM補充劑(Supplement)(50X)、無血清(serum free)(Thermo Fisher Scientific公司製)、稀釋100倍之PSG(青黴素、鏈黴素、及L-麩醯胺酸)及同樣地稀釋100倍之GlutaMAX，再添加IL-7(最終濃度5ng/mL)、同時添加Flt3L(5ng/mL)及PAA(50μg/mL)而製作。再者，「MS5hDLL4細胞」係以慢病毒載體將hDLL4基因導入小鼠骨髓細胞株「MS-5」而製作的細胞。
在浮游於本培養基之插入式培養小杯(insert)上，將源自iPS細胞之HPC與MS5hDLL4之混合物培養9至12週，分化為CD4單陽性(SP)細胞及CD8單陽性(SP)細胞。由於先前未進行KO之源自iPSC的CD4SP或周邊血單核
球(圖4之「野生」及「PBMCs」)中可觀察到旺盛的IL-4分泌傾向，又可觀察到高度之T-bet表現，故假定藉由IL4KO或TBX21KO進行CD4SP、CD8SP分化、或T細胞分化有被阻礙的可能性，然而如圖4所示，能夠從任一個KO株得到向CD4SP之分化。
藉由初代輔助T細胞之解析，了解就趨化介素受體之表現模式而言，主導細胞性免疫之Th1細胞採取CXCR3陽性CCR4陰性；主導體液性免疫之Th2細胞採取CXCR3陰性CCR4陽性。假設於藉由使Th2之功能性細胞激素(即IL-4)之分泌消失的IL4KO中，細胞顯示Th1型之表現模式；而藉由編碼Th1之主調節子(master regulator)(主要為誘導分化的轉錄因子)T-bet的TBX21之KO，則顯示Th2型之表現模式。藉由使用抗CXCR3抗體(BD公司製，殖株(clone)：1C6/CXCR3)及抗CCR4抗體(BD公司製，殖株：1G1)之流式細胞儀的解析，對此進行驗證。其結果如圖5所示，從未施行KO處理之野生型所分化誘導的CD4SP，與PBMC中之初代CD4SP細胞同樣地，包含CXCR3陽性CCR4陰性細胞及CXCR3陰性CCR4陽性細胞兩者。與此相對地，從IL4KO細胞所分化誘導的CD4SP細胞，僅由CXCR3陽性CCR4陰性細胞構成，與Th1細胞之表現模式一致。又，從TBX21KO細胞分化誘導的CD4SP細胞，僅由CXCR3陰性細胞構成，其多數為CCR4陽性。此與Th2細胞之表現模式一致。
[實施例3]所得到之Th1細胞及Th2細胞之IL-4及IFN-γ分泌的確認
繼而，藉由使用抗IFN-γ抗體(BD公司製，殖株：B27)及抗IL-4抗體(Biolegend公司製，殖株：8D4-8)的細胞內染色流式細胞術之手法評價從IL4KO細胞分化誘導之CD4SP細胞及從TBX21KO細胞分化誘導之CD4SP細胞的細
胞激素產生能力。在莫能菌素(monensin)(2μM)之添加下，藉由PMA(40ng/mL)及離子黴素(4μg/mL)刺激3小時之結果，如圖6所示，顯示源自野生型之iPS細胞的CD4SP細胞中，55.2%產生IL-4，5.67%產生IFN-γ，26.6%顯示此兩者皆產生。與此相對地，從IL4KO細胞分化誘導的CD4SP細胞中，89.3%顯示僅分泌IFN-γ，此與Th1細胞之性質一致。又，源自TBX21KO細胞之CD4SP細胞中，35.7%顯示僅分泌IL-4，與Th2細胞之性質一致，另一方面，顯示只分泌IFN-γ的細胞僅0.34%，顯示兩者皆分泌的細胞為0%，顯示IFN-γ分泌之細胞幾乎消失。因此，確認藉由IL4KO可得到僅顯示IFN-γ分泌的Th1細胞，藉由TBX21KO可得到僅顯示IL-4分泌的Th2細胞。
關於源自IL4KO細胞之CD4SP細胞，可能只是見到因Th2細胞所產生的最終產物，即細胞激素IL-4的基因被KO而造成的IL-4產生消失。然而，如實施例2中所見，藉由IL4KO，趨化介素受體表現模式亦可改變成CXCR3陽性CCR4陰性之Th1細胞。再者，與IL-4一起產生，為Th2細胞之代表性功能細胞激素之IL-13之產生，係藉由使用抗IL-13抗體(Biolegend公司製，殖株：JES10-5A2)之細胞內染色流式細胞術的手法驗證。其結果如圖7所示，源自野生型之iPS細胞的CD4SP細胞中，與初代CD4SP細胞相比，含有高度產生IL-13的部分(fraction)，同時在源自複數種IL4KO細胞株之CD4SP細胞中，IL-13高度分泌之部分消失。藉由IL4KO，基因未被直接剔除的IL-13之分泌降低，可謂是IL4KO會妨礙Th2細胞之形質表現的證據之一。
<110> 國立大學法人京都大學(Kyoto University) 日商武田藥品工業股份有限公司(Takeda Pharmaceutical Company Limited)
<120> T細胞的製造方法(Method for Producing T cells)
<130> PT38-9050
<150> JP2019-199781
<151> 2019-11-01
<160> 3
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> IL4基因內之gRNA4的目標序列
<400> 1
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> IL4基因內之gRNA5的目標序列
<400> 2
<210> 3
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> TBX21基因內之gRNA2的目標序列
<400> 3
Claims (16)
- 一種製造Th1型或Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：將與IL-4之分泌相關之因子或與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(hPC)誘導成CD4單陽性T細胞的步驟。
- 如請求項1所述之方法，其為製造Th1型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：將(B1)與IL-4之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)誘導成CD4單陽性T細胞的步驟。
- 如請求項1所述之方法，其為製造Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：將(B2)與IFN-γ之分泌相關之因子實質上受損的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)誘導成CD4單陽性T細胞的步驟。
- 如請求項1所述之方法，其中，該HSC及/或HPC為(b1)與IL-4之分泌相關之基因經剔除的HSC及/或HPC。
- 如請求項1所述之方法，其中，該HSC及/或HPC為(b2)與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除的HSC及/或HPC。
- 如請求項1所述之方法，其為製造Th1型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：藉由培養人工胸腺類器官(ATO)，使IL-4非分泌且IFN-γ分泌型(Th1型)之CD4單陽性T細胞從該ATO產生的步驟，其中該人工胸腺類器官(ATO)包含：(a)表現Notch配體之間質細胞，及(b1)與IL-4之分泌相關之基因經剔除，而與IFN-γ之分泌相關之基因未經剔除的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)。
- 如請求項1所述之方法，其為製造Th2型之CD4單陽性T細胞的方法，其包含：藉由培養人工胸腺類器官(ATO)，使IFN-γ非分泌且IL-4分泌型(Th2型)之CD4單陽性T細胞從該ATO產生，其中該人工胸腺類器官(ATO)包含：(a)表現Notch配體之間質細胞，及(b2)與IFN-γ之分泌相關之基因經剔除，而與IL-4之分泌相關之基因未經剔除的造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)。
- 如請求項1所述之方法，其中，該造血幹細胞(HSC)及/或造血前驅細胞(HPC)為從iPS細胞(iPSC)分化誘導的細胞。
- 如請求項8所述之方法，其中，該iPSC為源自T細胞之iPS細胞(T-iPSC)。
- 如請求項9所述之方法，其中，該T細胞為CD4單陽性T細胞。
- 一種Th1型之CD4單陽性T細胞，其係藉由如請求項1所述之方法而得到者。
- 一種Th2型之CD4單陽性T細胞，其係藉由如請求項1所述之方法而得到者。
- 一種Th1型之CD4單陽性T細胞，其與IL-4之分泌相關的因子實質上係受損的。
- 一種Th2型之CD4單陽性T細胞，其與IFN-γ之分泌相關的因子實質上係受損的。
- 如請求項13或14所述之CD4單陽性T細胞，其中，該Th1型之CD4單陽性T細胞或該Th2型之CD4單陽性T細胞為從iPS細胞(iPSC)分化誘導的細胞。
- 如請求項15所述之CD4單陽性T細胞，其中，該iPSC為源自T細胞之iPS細胞(T-iPSC)。
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