TW201936203A - 使用布勞特氏(blautia)菌株治療疾病之組合物及方法 - Google Patents
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Abstract
本發明提供與適用作治療劑之布勞特氏菌株A相關之方法及組合物。
Description
在某些態樣中，本文提供與個體(例如人類個體)中之疾病(例如癌症、自體免疫疾病、發炎疾病、代謝疾病)之治療及/或預防相關的方法及組合物(例如細菌組合物、醫藥組合物)，其包含投與包含布勞特氏(Blautia)菌株A及/或此類細菌之產物(例如細胞外囊泡(EV)及/或醫藥學上活性之生物質(PhAB))的細菌組合物。本發明亦提供製造及/或鑑別此類細菌及/或細菌產物之方法。在一些實施例中，本文提供包含此類細菌之生物反應器。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為包含與布勞特氏菌株A之核苷酸序列(例如基因組序列、16S序列、CRISPR序列)有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性(例如至少99.5 %序列一致性、至少99.6%序列一致性、至少99.7%序列一致性、至少99.8%序列一致性、至少99.9%序列一致性)的菌株。在一些實施例中，投與細菌組合物治療個體中之免疫病症。在一些實施例中，免疫病症為自體免疫疾病。在一些實施例中，免疫病症為發炎疾病。在一些實施例中，免疫病症為過敏。
在一些實施例中，本發明提供由本發明所提供之布勞特氏菌株A產生及/或由其生成及/或分離自其之細胞外囊泡(EV)。在一些實施例中，細菌組合物包含布勞特氏菌株A EV及完整布勞特氏菌株A細菌(例如活細菌、經殺滅細菌、經減毒細菌)兩者。在某些實施例中，本發明提供包含在不存在布勞特氏菌株A EV下的布勞特氏菌株A細菌之細菌組合物。在一些實施例中，醫藥組合物包含在不存在布勞特氏菌株A細菌下的布勞特氏菌株A EV。
在某些實施例中，本發明提供治療患有免疫病症(例如自體免疫疾病、發炎疾病、過敏)之個體的方法，其包含向該個體投與包含布勞特氏菌株A (例如經殺滅細菌、活細菌及/或經減毒細菌)之細菌組合物。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為包含與布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之相應核苷酸序列有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性(例如基因組序列一致性、16S序列一致性、CRISPR序列一致性) (例如至少99.5 %序列一致性、至少99.6%序列一致性、至少99.7%序列一致性、至少99.8%序列一致性、至少99.9%序列一致性)的菌株。在一些實施例中，細菌組合物中至少50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%之細菌為布勞特氏菌株A。在一些實施例中，細菌調配物中之所有或實質上所有細菌為布勞特氏菌株A。在一些實施例中，細菌調配物包含至少1 × 105
、5 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
或1 × 109
個菌落形成單位之布勞特氏菌株A。
在某些實施例中，本文提供治療患有代謝疾病之個體的方法，其包含向該個體投與本文所述之細菌組合物。在某些實施例中，本文提供治療患有癌症之個體的方法，其包含向該個體投與本文所述之細菌組合物。
在某些實施例中，本發明提供包含布勞特氏菌株A (例如經殺滅細菌、活細菌及/或經減毒細菌)及/或該等細菌之產物(例如細胞外囊泡(EV)及/或醫藥活性生物質(PhAB))的細菌組合物。在一些實施例中，細菌組合物中至少50%、60%、70%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%之細菌為布勞特氏菌株A。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為包含與布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之核苷酸序列有至少99%序列一致性(例如基因組序列一致性、16S序列一致性、CRISPR序列一致性)(例如至少99.5 %序列一致性、至少99.6%序列一致性、至少99.7%序列一致性、至少99.8%序列一致性、至少99.9%序列一致性)的菌株。在一些實施例中，細菌調配物中之所有或實質上所有細菌為布勞特氏菌株A。在一些實施例中，細菌調配物包含至少1 × 105
、5 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
或1 × 109
個菌落形成單位之布勞特氏菌株A。在一些實施例中，細菌組合物包含由布勞特氏菌株A製成的EV及/或PhAB (例如全細胞、細胞級分、來自醱酵之上清液、上清液級分及/或細胞外囊泡)。
在一些實施例中，細菌組合物係口服、靜脈內、瘤內或皮下投與。在一些實施例中，細菌組合物以2次或多於2次(例如3次或多於3次、4次或多於4次或5次或多於5次劑量)投與。在一些實施例中，對個體進行兩次或多於兩次劑量之投與相隔至少1小時、2小時、3小時、4小時、5小時、6小時、7小時、8小時、9小時、10小時、11小時、12小時、13小時、14小時、15小時、16小時、17小時、18小時、1天、2天、3天、4天、5天、6天、7天、8天、9天、10天、11天、12天、13天、14天、15天、16天、17天、18天、19天、20天或21天。在一些實施例中，投與作為生態共生物種之部分的第二細菌。
在某些實施例中，組合物包含特定比率之布勞特氏菌株A細菌與布勞特氏菌株A EV粒子。舉例而言，在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
、5 × 103
、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
、7 × 104
、8 × 104
、9 × 104
、1 × 105
、2 × 105
、3 × 105
、4 × 105
、5 × 105
、6 × 105
、7 × 105
、8 × 105
、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A EV粒子包含至少1個布勞特氏菌株A細菌。在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
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、7 × 105
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、1 × 106
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、3 × 106
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、5 × 106
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、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
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、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A EV粒子包含約1個布勞特氏菌株A細菌。在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
、5 × 103
、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
、7 × 104
、8 × 104
、9 × 104
、1 × 105
、2 × 105
、3 × 105
、4 × 105
、5 × 105
、6 × 105
、7 × 105
、8 × 105
、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
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、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A EV粒子包含不超過1個布勞特氏菌株A細菌。在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
、5 × 103
、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
、7 × 104
、8 × 104
、9 × 104
、1 × 105
、2 × 105
、3 × 105
、4 × 105
、5 × 105
、6 × 105
、7 × 105
、8 × 105
、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A細菌包含至少1個布勞特氏菌株A EV粒子。在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
、5 × 103
、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
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、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
、7 × 104
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、9 × 104
、1 × 105
、2 × 105
、3 × 105
、4 × 105
、5 × 105
、6 × 105
、7 × 105
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、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
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、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
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、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
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、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
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、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
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、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A細菌包含約1個布勞特氏菌株A EV粒子。在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
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、1 × 104
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、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
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、1 × 105
、2 × 105
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、5 × 105
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、1 × 106
、2 × 106
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、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
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、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
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、1 × 109
、2 × 109
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、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A細菌包含不超過1個布勞特氏菌株A EV粒子。
在某些實施例中，細菌組合物抑止遲發型過敏(DTH)中之免疫反應。在某些實施例中，細菌組合物誘導調節T細胞或消炎反應。在某些實施例中，細菌組合物抑制抗原特異性反應。在某些實施例中，細菌組合物治療過敏性接觸性皮炎。在某些實施例中，細菌組合物治療自體免疫心肌炎。在某些實施例中，細菌組合物治療第1型糖尿病。在某些實施例中，細菌組合物治療肉芽腫。在某些實施例中，細菌組合物治療周邊神經病。在某些實施例中，細菌組合物治療橋本氏甲狀腺炎(Hashimoto's thyroiditis)。在某些實施例中，細菌組合物治療多發性硬化。在某些實施例中，細菌組合物治療類風濕性關節炎。
在某些實施例中，細菌組合物治療結腸發炎。在某些實施例中，細菌組合物治療結腸炎。結腸炎可為急性及自限性或長期的。在某些實施例中，細菌組合物治療潰瘍性結腸炎。在某些實施例中，細菌組合物治療消化疾病。在某些實施例中，細菌組合物治療克羅恩氏病(Crohn's disease)。在某些實施例中，細菌組合物治療發炎性腸病(IBD)。在某些實施例中，細菌組合物治療顯微性結腸炎。在某些實施例中，細菌組合物治療膠原性結腸炎。在某些實施例中，細菌組合物治療轉流性結腸炎(diversion colitis)。在某些實施例中，細菌組合物治療化學性結腸炎。在某些實施例中，細菌組合物治療缺血性結腸炎。在某些實施例中，細菌組合物治療未定型結腸炎。在某些實施例中，細菌組合物治療非常型結腸炎。在一些實施例中，本方法進一步包含向個體投與額外治療劑(例如抗生素、免疫抑制劑、抗炎劑)。在一些實施例中，本方法進一步包含向個體投與第二治療性細菌。
在一些實施例中，個體為哺乳動物。在一些實施例中，個體為人類。在一些實施例中，個體為非人類哺乳動物(例如狗、貓、牛、馬、豬、驢、山羊、駱駝、小鼠、大鼠、天竺鼠、綿羊、駱馬、猴、大猩猩或黑猩猩)。
相關申請案
本申請案主張2017年11月14日申請的美國臨時專利申請案序列號62/585,782之優先權，其在此以全文引用之方式併入本文中。
綜述
綜述
在某些態樣中，本發明提供與治療及/或預防個體(例如人類個體)中之疾病(例如癌症、自體免疫疾病、發炎疾病、代謝疾病)相關的方法及組合物，其包含投與包含布勞特氏菌株A之細菌組合物；以及製造及/或鑑別此類細菌之方法。
在某些態樣中，本發明提供治療個體中之免疫病症(例如自體免疫疾病、發炎疾病、過敏)之方法，其包含向該個體投與包含布勞特氏菌株A之細菌組合物。
定義
定義
「投與」廣義上係指向個體投與組合物之途徑。投與途徑之實例包括口服、直腸投與、表面投與、吸入(經鼻)或注射。藉由注射之投與包括靜脈內(IV)、肌肉內(IM)、瘤內(IT)及皮下(SC)投與。本文所述之醫藥組合物可藉由任何有效途徑以任何形式來投與，該途徑包括(但不限於)：瘤內、口服、非經腸、經腸、靜脈內、腹膜內、表面、經皮(例如使用任何標準貼片)、皮內、經眼、經鼻(鼻內)、局部、非經口(諸如氣霧劑)、吸入、皮下、肌肉內、頰內、舌下、直腸(經直腸)、陰道、動脈內及鞘內，經黏膜(例如舌下、經舌、頰內(經頰)、尿道(經尿道)、陰道(例如經陰道及陰道周)、膀胱內、肺內、十二指腸內、胃內及支氣管內。在較佳實施例中，本文所述之醫藥組合物係經口、經直腸、瘤內、表面、膀胱內、藉由注射進入或鄰近於引流淋巴結、靜脈內、藉由吸入或氣霧劑或皮下投與。
如本文所用，術語「抗體」可指完整抗體及其抗原結合片段兩者。完整抗體為包括藉由二硫鍵互連之至少兩個重(H)鏈及兩條輕(L)鏈的糖蛋白。各重鏈包括重鏈可變區(本文中縮寫為VH
)及重鏈恆定區。各輕鏈包括輕鏈可變區(本文中縮寫為VL
)及輕鏈恆定區。VH
及VL
區可進一步細分成高變區，稱為互補決定區(CDR)，穿插有稱為構架區(FR)之較保守區。各VH
及VL
係由自胺基末端至羧基末端按以下順序排列之三個CDR及四個FR構成：FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鏈及輕鏈之可變區含有與抗原相互作用之結合域。術語「抗體」包括例如單株抗體、多株抗體、嵌合抗體、人類化抗體、人類抗體、多特異性抗體(例如雙特異性抗體)、單鏈抗體及抗原結合抗體片段。
如本文所用，術語抗體之「抗原結合片段」或「抗原結合部分」係指抗體之保留與抗原結合之能力的一或多個片段。涵蓋在術語抗體之「抗原結合片段」內之結合片段之實例包括Fab、Fab'、F(ab')2
、Fv、scFv、二硫鍵連接的Fv、Fd、雙功能抗體、單鏈抗體、NANOBODIES®、經分離CDRH3及保留完整抗體之可變區的至少一部分的其他抗體片段。此等抗體片段可使用習知重組及/或酶促技術來獲得，且可以與完整抗體相同的方式篩選抗原結合。
「細胞擴充」廣義上係指環境中的投與組合物之前實質上不存在於環境中且不存在於組合物本身中的細胞之流入或細胞之擴增。擴充環境之細胞包括免疫細胞、基質細胞、細菌細胞及真菌細胞。尤其受關注之環境為其中癌細胞駐留或定位之微環境。在一些情況下，微環境為腫瘤微環境或腫瘤引流淋巴結。在其他情況下，微環境為癌前組織位點或局部投與組合物之位點或距離投藥很長時間之後組合物將積聚之位點。
「演化支(clade)」係指系統樹之OTU或成員，其為在系統樹中的統計學上有效之節點的下游。演化支在系統樹中包含一組末端葉(terminal leaf)，其為獨特的單源演化單元且各末端葉共有一定程度的序列相似性。「操作分類單元」、「OTU」係指系統樹中之末端葉，且由核酸序列，例如整個基因組，或特異性基因序列及在物種層級上，與此核酸序列共有序列一致性之所有序列定義。在一些實施例中，特異性基因序列可為16S序列或16S序列之一部分。在其他實施例中，對兩個實體之整個基因組進行定序，且進行比較。在另一實施例中，可對選擇區域，諸如多位點序列標籤(MLST)、特異性基因或數組基因，進行基因比較。在16S實施例中，整個16S或16S之某一可變區中共有≥97%平均核苷酸一致性之OTU視為相同OTU (參見例如，Claesson M J, Wang Q, O'Sullivan O, Greene-Diniz R, Cole J R, Ros R P及O'Toole P W. 2010. 用於使用串聯可變16S rRNA基因區來解析高度複雜之微生物相組合物的兩種新一代定序技術之比較(Comparison of two next-generation sequencing technologies for resolving highly complex microbiota composition using tandem variable 16S rRNA gene regions).Nucleic Acids Res
38: e200. Konstantinidis K T, Ramette A及Tiedje J M. 2006. 基因組時代的細菌物種定義(The bacterial species definition in the genomic era).Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci
361: 1929-1940.)。在涉及完整基因組、MLST、特異性基因或數組基因之實施例中，共有≥95%平均核苷酸一致性之OTU視為相同OTU(參見例如，Achtman M及Wagner M. 2008. 微生物多樣性及微生物物種之遺傳性質(Microbial diversity and the genetic nature of microbial species).Nat . Rev . Microbiol .
6: 431-440. Konstantinidis K T, Ramette A及Tiedje J M. 2006. 基因組時代的細菌物種定義(The bacterial species definition in the genomic era).Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci
361: 1929-1940.)。OTU通常藉由比較生物體之間的序列來限定。一般而言，具有小於95%序列一致性之序列不視為形成相同OTU之一部分。OTU亦可藉由核苷酸標記或基因，尤其高度保守基因(例如「管家」基因)或其組合之任何組合來表徵。此類表徵採用例如WGS資料或整個基因組序列。
兩種或超過兩種單株微生物菌株之「組合」包括處於同一物質或產物或處於物理連接之產物中的物理共存的兩種單株微生物菌株，以及共顳投與或共定位的單株微生物菌株。
術語「降低」或「消耗」意謂，使得當相較於處理前狀態時，處理之後的差異(視情況而定)為以下的變化：至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、1/100、1/1000、1/10,000、1/100,000、1/1,000,000或不可偵測的。
術語「生態共生物種」為與經由活化互補宿主路徑誘導宿主協同作用以進行改良功效的兩種細菌相比，彼此交換代謝物及正向共調節的一組細菌。
術語「抗原決定基」意謂能夠特異性結合於抗體之蛋白質決定子。抗原決定基通常由諸如胺基酸或糖側鏈的分子之化學活性表面分組組成。某些抗原決定基可由特定胺基酸序列定義，抗體能夠結合於該等胺基酸。
如本文所用，「經工程改造之細菌」為已藉由人工干預由其天然狀態遺傳改變之任何細菌及任何此類細菌之後代。經工程改造之細菌包括例如靶向基因修飾之產物、隨機突變誘發篩選之產物及定向演化之產物。
術語「基因」廣義上用於指與生物功能相關之任何核酸。術語「基因」適用於特定的基因組序列以及由該基因組序列編碼的cDNA或mRNA。
兩個核酸分子之核酸序列之間的「一致性」，可使用已知電腦演算法(諸如「FASTA」程式)，使用例如如Pearson等人 (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:2444中之預設參數(其他程式包括GCG程式包(Devereux, J.等人, Nucleic Acids Research 12(I):387 (1984))、BLASTP、BLASTN、FASTA Atschul, S. F.等人, J Molec Biol 215:403 (1990)；Guide to Huge Computers, Mrtin J. Bishop編, Academic Press, San Diego, 1994, 及Carillo等人 (1988) SIAM J Applied Math 48:1073)，測定為一致性的百分比。舉例而言，可使用國家生物技術資訊資料庫中心(National Center for Biotechnology Information database)之BLAST功能來測定一致性。其他商業或公開可用的程式包括DNAStar 「MegAlign」程式(Madison, Wis.)及威斯康星大學(University of Wisconsin)遺傳學電腦小組(Genetics Computer Group；UWG)「Gap」程式(Madison Wis.)。
如本文所用，術語「免疫病症」係指由免疫系統之活性所引起的任何疾病、病症或疾病症狀，其包括自體免疫疾病、發炎疾病及過敏。免疫病症包括(但不限於)：自體免疫疾病(例如狼瘡、硬皮病、溶血性貧血、血管炎、第1型糖尿病、格雷氏病(Grave's disease)、類風濕性關節炎、多發性硬化、古巴士德氏症候群(Goodpasture's syndrome)、惡性貧血及/或肌病)、發炎疾病(例如尋常痤瘡、哮喘、乳糜瀉、慢性前列腺炎、絲球體腎炎、發炎性腸病、骨盆發炎疾病、再灌注損傷、類風濕性關節炎、類肉瘤病、移植排斥、血管炎及/或間質性膀胱炎)、及/或過敏(例如食物過敏、藥物過敏及/或環境過敏)。
術語「增加」意謂，使得當相較於處理前狀態時，處理之後的差異(視情況而定)呈以下變化：高至少10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、2倍、4倍、10倍、100倍、10^3倍、10^4倍、10^5倍、10^6倍及/或10^7倍。可增加之特性包括免疫細胞、細菌細胞、基質細胞、骨髓衍生之抑制細胞、纖維母細胞、代謝物及細胞介素。
「內部轉錄間隔子」或「ITS」為位於常用於鑑別真核物種，尤其真菌的常用前驅體轉錄物上的結構性核糖體RNA (rRNA)之間的一段非功能性RNA。形成核糖體核心的真菌之rRNA轉錄為信號基因，且由18S、5.8S及28S區以及分別處於18S與5.8S區之間及5.8S與28S區之間的ITS4及5組成。18S與5.8S及5.8S與28S區之間的此等兩個順反子間鏈段係藉由剪接來移除且如先前所述出於條形碼(barcoding)目的在物種之間含有顯著差異(Schoch等人 Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi. PNAS 109:6241-6246. 2012)。18S rDNA傳統上用於系統重構，然而ITS亦可提供此功能，因為其一般高度保守但含有具有足夠核苷酸多樣性以區分大多數真菌之屬及物種的高變區。
術語「經分離」或「富集」涵蓋已進行以下的微生物、細菌或其他實體或物質：(1)與至少一些其當最初生產(不論在自然界中還是在實驗環境中)時結合之組分分離，及/或(2)由人工產生、製備、純化及/或製造。經分離微生物可與其最初結合之其他組分之至少約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%或高於90%進行分離。在一些實施例中，經分離之微生物之純度超過約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或超過約99%。如本文所用，若物質實質上不含其他組分，則該物質為「純的」。術語「純化(purify/purifying/purified)」係指，微生物或其他物質已與至少一些其當最初產生或生成(例如不論在自然界中還是在實驗環境中)時或在其最初產生後之任何時間期間結合之組分分離。若微生物或若微生物或微生物群在產生時或其之後諸如與含有該微生物或微生物群之物質或環境分離，則該微生物或微生物群可視為經純化的，且經純化之微生物或微生物群可含有至多約10%、約20%、約30%、約40%、約50%、約60%、約70%、約80%、約90%或高於約90%的其他物質，且仍視為「經分離的」。在一些實施例中，經純化之微生物或微生物群之純度超過約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%或超過約99%。在本文所提供之微生物組合物之情況下，存在於組合物中之一或多種微生物類型可獨立地自含有微生物類型之物質或環境中所產生及/或所存在之一或多種其他微生物純化。微生物組合物及其微生物組分一般自殘餘環境產物純化。
如本文所用，「代謝物」係指用作任何細胞或微生物代謝反應中之底物或產生為來自任何細胞或微生物代謝反應的產物化合物、組合物、分子、離子、輔因子、催化劑或營養物質的任何及所有分子化合物、組合物、分子、離子、輔因子、催化劑或營養物質。
「微生物」係指任何天然或經工程改造之生物體，其表徵為細菌、真菌、微觀藻類、原蟲及與該生物體相關的發育階段或生命週期階段(例如營養期、孢子期(包括孢子形成、休眠及出芽)、潛伏期、生物膜期)。腸道微生物之實例包括：葛氏放線菌(Actinomyces graevenitzii
)、齲齒放線菌(Actinomyces odontolyticus
)、嗜黏蛋白阿克曼氏菌(Akkermansia muciniphila
)、糞擬桿菌(Bacteroides caccae
)、脆弱擬桿菌(Bacteroides fragilis
)、腐敗擬桿菌(Bacteroides putredinis
)、多形擬桿菌(Bacteroides thetaiotaomicron
)、瓦塔格擬桿菌(Bacteroides vultagus
)、青春雙叉桿菌(Bifidobacterium adolescentis
)、雙岐雙叉桿菌(Bifidobacterium bifidum
)、沃氏嗜膽菌(Bilophila wadsworthia
)、布勞特氏菌(Blautia
)、丁酸弧菌屬(Butyrivibrio
)、纖細曲桿菌(Campylobacter gracilis
)、梭菌叢III (Clostridia cluster III
)、梭菌叢IV、梭菌叢IX (胺基酸球菌群(Acidaminococcaceae group
))、梭菌叢XI、
梭菌叢XIII (消化鏈球菌群(Peptostreptococcus group
))、梭菌叢XIV、梭菌叢XV、產氣柯林斯菌(Collinsella aerofaciens
)、糞球菌(Coprococcus
)、桑斯棒狀桿菌(Corynebacterium sunsvallense
)、惰性脫硫弧菌(Desulfomonas pigra
)、產甲酸多爾氏菌(Dorea formicigenerans
)、長鏈多爾氏菌(Dorea longicatena
)、大腸桿菌(Escherichia coli
)、龐大真桿菌(Eubacterium hadrum
)、直腸真桿菌(Eubacterium rectale
)、普拉梭菌(Faecalibacteria prausnitzii
)、孿生球菌屬(Gemella
)、乳球菌屬(Lactococcus
)、毛螺菌屬(Lanchnospira
)、柔膜菌叢XVI (Mollicutes cluster XVI
)、柔膜菌叢XVIII、普雷沃菌屬(Prevotella
)、黏滑羅氏菌(Rothia mucilaginosa
)、伶俐瘤胃球菌(Ruminococcus callidus
)、活潑瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus
)、扭鏈瘤胃球菌(Ruminococcus torques
)及鏈球菌屬(Streptococcus
)。
「微生物群落」廣義上係指駐留在個體或患者之身體部位上或其中的微生物。微生物群落中之微生物可包括細菌、病毒、真核微生物體及/或病毒。微生物群落中之獨立微生物可為代謝活性的、休眠的、潛伏的或以孢子形式存在，可以浮游生物形式或以生物膜形式存在或可以可持續或暫時性方式存在於微生物群落中。微生物群落可為共生的或健康態之微生物群落或病態微生物群落。微生物群落對於個體或患者可為天然的，或微生物群落之組分可由於健康狀態(例如癌變前或癌狀態)或治療條件(例如抗生素治療，暴露於不同微生物)之變化而加以調節、引入或消耗。在一些態樣中，微生物群落出現在黏膜表面處。在一些態樣中，微生物群落為腸道微生物群落。在一些態樣中，微生物群落為腫瘤微生物群落。
組織或樣本之「微生物群落分佈」或「微生物群落標誌」係指微生物群落之細菌組成的至少部分特徵。在一些實施例中，微生物群落分佈指示是否有至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100或多於100種菌株存在或不存在於微生物群落中。
關於細菌之「經修飾」廣義上係指已經歷自其野生型形式進行之變化的細菌。細菌修飾之實例包括基因修飾、基因表現、表型修飾、調配、化學修飾及投配或濃縮。經改良之特性之實例描述於本說明書通篇中且包括例如減毒作用、營養缺陷性、導向或抗原性。表型修飾可包括例如細菌在修飾細菌之表型的培養基中之生長，所述生長增加或降低毒性。
如本文所用，若基因在經工程改造之細菌中在至少一些條件下以比其由相同物種之野生型細菌在相同條件下表現之水準要高的水準表現，則該基因在細菌中「過度表現」。類似地，若基因在經工程改造之細菌中在至少一些條件下以比其由相同物種之野生型細菌在相同條件下表現之水準要低的水準表現，則該基因在細菌中「表現不足」。
術語「聚核苷酸」及「核酸」可互換地使用。其指任何長度之核苷酸(去氧核糖核苷酸或核糖核苷酸)之聚合形式或其類似物。聚核苷酸可具有任何三維結構且可執行任何功能。以下為聚核苷酸之非限制性實例：基因或基因片段之編碼或非編碼區、自連接分析所定義之基因座(loci/locus)、外顯子、內含子、信使RNA (mRNA)、轉移RNA、核糖體RNA、核糖核酸酶、cDNA、重組聚核苷酸、分支聚核苷酸、質體、載體、經分離之任何序列DNA、經分離之任何序列RNA、核酸探針及引子。聚核苷酸可包含經修飾之核苷酸，諸如甲基化核苷酸及核苷酸類似物。若存在，可在聚合物組裝之前或之後賦予核苷酸結構之修飾。可諸如藉由與標記組分結合進一步修飾聚核苷酸。在本文中所提供之所有核酸序列中，U核苷酸可與T核苷酸互換。
「操作分類單元」及「OTU」係指系統樹中之末端葉，且由核酸序列，例如整個基因組，或特異性基因序列及在物種層級上，與此核酸序列共有序列一致性之所有序列定義。在一些實施例中，特異性基因序列可為16S序列或16S序列之一部分。在其他實施例中，對兩個實體之整個基因組進行定序，且進行比較。在另一實施例中，可對選擇區域，諸如多位點序列標籤(MLST)、特異性基因或數組基因，進行基因比較。對於16S，整個16S或16S之某一可變區中共有≥97%平均核苷酸一致性之OTU視為相同OTU。參見例如，Claesson MJ, Wang Q, O'Sullivan O, Greene-Diniz R, Cole JR, Ros RP及O'Toole PW. 2010. 用於使用串聯可變16S rRNA基因區來解析高度複雜之微生物相組合物的兩種新一代定序技術之比較. Nucleic Acids Res 38: e200. Konstantinidis KT, Ramette A及Tiedje JM. 2006. 基因組時代的細菌物種定義. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 361: 1929-1940。對於完整基因組、MLST、除16S以外之特異性基因或數組基因，共有≥95%平均核苷酸一致性之OTU視為相同OTU。參見例如，Achtman M及Wagner M. 2008. 微生物多樣性及微生物物種之遺傳性質. Nat. Rev. Microbiol. 6: 431-440. Konstantinidis KT, Ramette A及Tiedje JM. 2006. 基因組時代的細菌物種定義. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 361: 1929-1940。OTU通常藉由比較生物體之間的序列來限定。一般而言，具有小於95%序列一致性之序列不視為形成相同OTU之一部分。OTU亦可藉由核苷酸標記或基因，尤其高度保守基因(例如「管家」基因)或其組合之任何組合來表徵。本文提供對例如屬、物種及系統演化支進行分類分配的操作分類單元(OTU)。
如本文所用，「特異性結合」係指抗體與預定抗原結合之能力或多肽與其預定結合搭配物結合之能力。典型地，抗體或多肽以對應於約10- 7
M或小於10- 7
M之KD
的親和力與其預定抗原或結合搭配物特異性結合，且以比其與非特異性及不相關抗原/結合搭配物(例如BSA、酪蛋白)結合之親和力小至少10倍、至少100倍或至少1000倍之親和力(如由KD
表示)與預定抗原/結合搭配物結合。或者，特異性結合更廣泛地應用於雙組分系統，其中一種組分為蛋白質、脂質或碳水化合物或其組合，且以特異性方式與第二組分接合，該第二組分為蛋白質、脂質、碳水化合物或其組合。
術語「個體」或「患者」係指任何動物。描述為「有需要之」個體或患者係指需要治療疾病的個體或患者。哺乳動物(Mammal/mammalian animal)包括人類、實驗室動物(例如靈長類、大鼠、小鼠)、家畜(例如牛、綿羊、山羊、豬)及家養寵物(例如狗、貓、嚙齒動物)。舉例而言，個體可為非人類哺乳動物，包括(但不限於)狗、貓、牛、馬、豬、驢、山羊、駱駝、小鼠、大鼠、天竺鼠、綿羊、駱馬、猴、大猩猩或黑猩猩。個體或患者可為健康的，或可患有處於任何發展階段之免疫病症。
「菌株」係指具有基因特徵之細菌物種成員，該基因特徵使得該細菌物種成員可與相同細菌物種之緊密相關成員區別開。基因標誌可為不存在至少一個基因之全部或部分、不存在至少一個調節區(例如啟動子、終止子、核糖開關、核糖體結合位點)之全部或部分、不存在(「固化」)至少一種天然質體、存在至少一種重組基因、存在至少一種突變基因、存在至少一種外源基因(來源於另一物種之基因)、存在至少一個突變調節區(例如啟動子、終止子、核糖開關、核糖體結合位點)、存在至少一種非天然質體、存在至少一個抗生素抗性卡匣或其組合。可藉由PCR擴增，視情況接著對相關基因組區或整個基因組進行DNA定序，來鑑別不同菌株之間的基因標誌。在一個菌株(相較於相同物種之另一菌株)已獲得或失去抗生素抗性、或獲得或失去生物合成能力(諸如營養缺陷型菌株)之情況下，菌株可藉由分別使用抗生素或營養物質/代謝物進行選擇或反向選擇來區別開。
如本文所用，術語「治療」個體之疾病或「治療」患有或疑似患有疾病之個體，係指對個體進行醫藥治療，例如，投與一或多種藥劑，以使得疾病之至少一個症狀減小或預防惡化。因此，在一個實施例中，「治療」尤其係指延遲進展、加速緩解、誘導緩解、加強緩解、加速恢復、增加替代治療法之功效或降低對替代性療法之耐藥性或其組合。
細菌
細菌
在某些態樣中，本發明提供使用細菌組合物之方法，該細菌組合物包含布勞特氏菌株A及/或此類細菌之產物(例如細胞外囊泡(EV)及/或醫藥學上活性之生物質(PhAB))。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為包含與布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之核苷酸序列(例如基因組序列、16S序列、CRISPR序列)有至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性(例如至少99.5 %序列一致性、至少99.6%序列一致性、至少99.7%序列一致性、至少99.8%序列一致性、至少99.9%序列一致性)的菌株。
根據國際承認的出於專利程序之目的之微生物體保藏的布達佩斯條約(Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms for the Purpose of Patent Procedure)條款，布勞特氏菌株A在2018年10月4日保藏於10801 University Boulevard, Manassas, Va. 20110-2209 USA之美國菌種保藏中心(American Type Culture Collection；ATCC)，且指定ATCC寄存編號為PTA-125346。
申請人表示，ATCC為提供持久性保藏且公眾(若專利得到授予)易於獲得的保藏所。在授予專利後將不可撤消地消除對於公眾獲取如此保藏之材料的所有限制。在專利申請案未決期間，由根據37 CFR 1.14及35 U.S.C. 122授權的專員確定的人才可獲得該材料。保藏材料將得到所有必要的小心維護，使其在最近一次提供保藏材料樣本的請求之後至少五年內、而且在任何情況下在保藏日之後至少三十(30)年內或專利有效期內(取二者之中較長的)保持存活且不受污染。由於保藏物狀況使得無法由保藏所提供樣本時，申請人承擔替換保藏物的責任。
在一些實施例中，本文所述之細菌經修飾以改良定殖及/或移植於哺乳動物胃腸道中(例如經改變之代謝，諸如改良之黏蛋白降解、增強之競爭特性、增加之運動性、增加之對腸道上皮細胞之黏附、經改變之趨化性)。在一些實施例中，本文所述之細菌經修飾以增強其免疫調節及/或治療效果(例如單獨或與另一治療劑組合)。在一些實施例中，本文所述之細菌經修飾以增強免疫活化(例如經由經改變的多醣、菌毛、繖毛、黏附素之產量)。在一些實施例中，本文所述之細菌經修飾以改良細菌製造(例如較高耐氧性、改良的凍融耐受性、較短生成時間)。
可根據此項技術中已知的方法來培養布勞特氏菌株A。舉例而言，布勞特氏菌株可使用例如以下中所揭示之方法在ATCC培養基2722、ATCC培養基1490或其他培養基中生長：Caballero等人, 2017. 「Cooperating Commensals Restore Colonization Resistance to Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium」Cell Host & Microbe
21:592-602，其以全文引用之方式併入本文中。
EV 之製造
EV 之製造
在某些態樣中，可使用此項技術中已知的任何方法製備本文所述之布勞特氏菌株A細菌EV。
在一些實施例中，無須EV純化步驟即可製備布勞特氏菌株A細菌EV。舉例而言，在一些實施例中，使用使布勞特氏菌株A EV保持完整之方法殺滅包含本文所述之EV的布勞特氏菌株A，且將所得細菌組分，包括EV，用於本文所述之方法及組合物中。在一些實施例中，使用抗生素(例如使用本文所述之抗生素)殺滅布勞特氏菌株A細菌。在一些實施例中，使用UV照射殺滅布勞特氏菌株A細菌。
在一些實施例中，自一或多種其他細菌組分純化本文所述之EV。用於自細菌純化EV之方法為此項技術中已知的。在一些實施例中，使用S. Bin Park等人 PLoS ONE. 6(3):e17629 (2011)或G. Norheim等人 PLoS ONE. 10(9): e0134353 (2015)中所述之方法由細菌培養物製備EV，該等文獻中之每一者以全文引用之方式併入本文中。在一些實施例中，將細菌培養至混濁度為高光學密度，且隨後加以離心以集結細菌(例如在4℃下，以10,000× g，持續30分鐘，在4℃下，以15,500× g，持續15分鐘)。在一些實施例中，隨後使培養上清液通過過濾器(例如0.22 µm過濾器)以排除掉完整細菌細胞。在一些實施例中，隨後對上清液進行切向流過濾，在此期間濃縮上清液，移除小於100 kDa之物種，且用PBS部分交換培養基。在一些實施例中，對過濾上清液進行離心以集結細菌EV(例如在4℃下，以100,000至150,000× g，持續1至3小時，在4℃下，以200,000 × g，持續1至3小時)。在一些實施例中，藉由再懸浮所得EV集結粒(例如於PBS中)，且將經再懸浮之EV施加至Optiprep (碘克沙醇(iodixanol))梯度或蔗糖梯度(例如30%至60%非連續梯度、0%至45%非連續梯度)，之後加以離心(例如在4℃下，以200,000× g，持續4至20小時)來進一步純化EV。可收集EV帶，用PBS稀釋且進行離心以集結EV (例如在4℃下，以150,000× g，持續3小時，在4℃下，以200,000× g，持續1小時)。可在使用之前將經純化之EV儲存在例如-80℃或-20℃下。在一些實施例中，藉由用DNA酶及/或蛋白酶K處理來進一步純化EV。
舉例而言，在一些實施例中，可在4℃下以11,000× g離心本文所揭示之布勞特氏菌株A細菌的培養物持續20至40分鐘以集結細菌。可使培養上清液通過0.22 µm過濾器以排除掉完整細菌細胞。可隨後使用可包括(但不限於)硫酸銨沈澱、超速離心或過濾之方法濃縮過濾上清液。舉例而言，對於硫酸銨沈澱，可將1.5至3 M硫酸銨緩慢添加至過濾上清液，同時在4℃下進行攪拌。可在4℃下培育沈澱物8至48小時，且隨後在4℃下以11,000× g離心持續20至40分鐘。所得集結粒含有布勞特氏菌株A細菌EV及其他碎片。使用超速離心，可在4℃下以100,000至200,000× g離心過濾上清液持續1至16小時。此離心之集結粒含有布勞特氏菌株A細菌EV及其他碎片，諸如大型蛋白質複合物。在一些實施例中，使用過濾技術，諸如經由使用Amicon Ultra自旋過濾器或藉由切向流過濾，可過濾上清液以保留分子量＞50或100 kDa之物種。
替代性地，例如藉由將生物反應器連接至交替切向流(ATF)系統(例如來自Repligen之XCell ATF)，可在生長期間或在生長期間之選定時間點由布勞特氏菌株A細菌培養物連續獲得EV。ATF系統會將完整細胞(＞0.22 μm)留滯在生物反應器中，且使較小組分(例如EV、游離蛋白)通過過濾器以供收集。舉例而言，系統可經配置以使得＜0.22 μm過濾物隨後通過100 kDa之第二過濾器，使得收集到0.22 μm與100 kDa之間的物種(諸如EV)，而小於100 kDa之物種則泵送回生物反應器中。替代性地，系統可經配置以使得在培養物生長期間生物反應器中之培養基得到補給及/或修飾。此方法所收集之EV可藉由如上文關於過濾上清液所述之超速離心或過濾得到進一步純化及/或濃縮。
由本文中提供之方法獲得的EV可藉由基於尺寸之管柱層析法、藉由親和性層析法、藉由離子交換層析法且藉由梯度超速離心，使用可包括(但不限於)使用蔗糖梯度或Optiprep梯度之方法來進一步純化。簡言之，若使用硫酸銨沈澱或超速離心來濃縮過濾上清液，則使用蔗糖梯度法，將集結粒再懸浮於60%蔗糖，30 mM Tris，pH 8.0中。若使用過濾來濃縮過濾上清液，則使用Amicon Ultra管柱將濃縮物緩衝液交換為60%蔗糖，30 mM Tris，pH 8.0。將樣本施加至35%至60%非連續蔗糖梯度且在4℃下以200,000× g離心持續3至24小時。簡言之，若使用硫酸銨沈澱或超速離心來濃縮過濾上清液，則使用Optiprep梯度法，將集結粒再懸浮於PBS中，且將3倍體積之60% Optiprep添加至樣本中。在一些實施例中，若使用過濾來濃縮過濾上清液，則使用60% Optiprep將濃縮物稀釋至最終濃度為35% Optiprep。將樣本施加至0%至45%非連續Optiprep梯度且在4℃下以200,000× g離心持續3至24小時，例如，在4℃下離心持續4至24小時。
在一些實施例中，為了證實EV製備物之無菌性及分離，將EV連續稀釋於用於常規培養所測試之細菌的洋菜培養基上，且使用常規條件進行培育。使非無菌製備物通過0.22 μm過濾器以排除掉完整細胞。為了進一步增加純度，經分離之EV可經DNA酶或蛋白酶K處理。
在一些實施例中，對於用於活體內注射之EV之製備，如先前所述處理經純化之EV (G. Norheim等人 PLoS ONE. 10(9): e0134353 (2015))。簡言之，在蔗糖梯度離心之後，將含有EV之帶再懸浮於含有3%蔗糖之溶液或熟習此項技術者已知的適用於活體內注射之其他溶液中至最終濃度為50 µg/mL。此溶液亦可含有佐劑，例如濃度為0至0.5% (重量體積比)之氫氧化鋁。在一些實施例中，對於用於活體內注射的EV之製備，將PBS中之EV無菌過濾至＜ 0.22 μm。
在某些實施例中，為了使樣本與進一步測試相容(例如，在TEM成像或活體外分析之前移除蔗糖)，使用過濾(例如，Amicon Ultra管柱)、透析或超速離心(200,000× g，≥ 3小時，4℃)及再懸浮將樣本緩衝液交換為PBS或30 mM Tris，pH 8.0。
在一些實施例中，EV製備物之無菌性可藉由將EV之一部分塗鋪於用於EV之生成中所用之細菌的標準培養的洋菜培養基上且使用標準條件培育來確認。
在一些實施例中，藉由層析及EV上之結合表面部分分離及富集所選EV。在其他實施例中，藉由螢光細胞分選藉由使用親和試劑、化學染料、重組蛋白之方法或熟習此項技術者已知的其他方法來分離及/或富集所選EV。
細菌組合物 / 醫藥組合物
在一些實施例中，藉由層析及EV上之結合表面部分分離及富集所選EV。在其他實施例中，藉由螢光細胞分選藉由使用親和試劑、化學染料、重組蛋白之方法或熟習此項技術者已知的其他方法來分離及/或富集所選EV。
細菌組合物 / 醫藥組合物
在某些態樣中，本文提供細菌組合物，其包含布勞特氏菌株A及/或此類細菌之產物(例如細胞外囊泡(EV)及/或醫藥學上活性之生物質(PhAB))。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)。在一些實施例中，布勞特氏菌株A為包含與布勞特氏菌株A之核苷酸序列具有以下序列一致性之菌株：至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%或至少99%序列一致性(例如至少99.5 %序列一致性、至少99.6%序列一致性、至少99.7%序列一致性、至少99.8%序列一致性、至少99.9%序列一致性)。在一些實施例中，細菌調配物包含本文所述之細菌及/或細菌之組合及醫藥學上可接受之載劑(例如醫藥組合物)。
在某些實施例中，細菌組合物中至少50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%之細菌為布勞特氏菌株A。在某些實施例中，細菌組合物中之實質上所有細菌為布勞特氏菌株A。在某些實施例中，細菌組合物包含至少1 × 103
個菌落形成單位(CFU)、1 × 104
個菌落形成單位(CFU)、1 × 105
個菌落形成單位(CFU)、5 × 105
個菌落形成單位(CFU)、1 × 106
個菌落形成單位(CFU)、2 × 106
個菌落形成單位(CFU)、3 × 106
個菌落形成單位(CFU)、4 × 106
個菌落形成單位(CFU)、5 × 106
個菌落形成單位(CFU)、6 × 106
個菌落形成單位(CFU)、7 × 106
個菌落形成單位(CFU)、8 × 106
個菌落形成單位(CFU)、9 × 106
個菌落形成單位(CFU)、1 × 107
個菌落形成單位(CFU)、2 × 107
個菌落形成單位(CFU)、3 × 107
個菌落形成單位(CFU)、4 × 107
個菌落形成單位(CFU)、5 × 107
個菌落形成單位(CFU)、6 × 107
個菌落形成單位(CFU)、7 × 107
個菌落形成單位(CFU)、8 × 107
個菌落形成單位(CFU)、9 × 107
個菌落形成單位(CFU)、1 × 108
個菌落形成單位(CFU)、2 × 108
個菌落形成單位(CFU)、3 × 108
個菌落形成單位(CFU)、4 × 108
個菌落形成單位(CFU)、5 × 108
個菌落形成單位(CFU)、6 × 108
個菌落形成單位(CFU)、7 × 108
個菌落形成單位(CFU)、8 × 108
個菌落形成單位(CFU)、9 × 108
個菌落形成單位(CFU)、1 × 109
個菌落形成單位(CFU)、5 × 109
個菌落形成單位(CFU)、1 × 1010
個菌落形成單位(CFU)、5 × 1010
個菌落形成單位(CFU)、1 × 1011
個菌落形成單位(CFU)、5 × 1011
個菌落形成單位(CFU)、1 × 1012
個菌落形成單位(CFU)、5 × 1012
個菌落形成單位(CFU)、1 × 1013
個菌落形成單位(CFU)之布勞特氏菌株A。
在一些實施例中，組合物中至少10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%之細菌係選自本文所述之細菌物種。組合物中10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%之細菌係選自本文所述之菌株。
在一些實施例中，本文中所述之組合物可僅包括本文所述之一種細菌物種，或可包括本文所述之兩種或多於兩種細菌物種。舉例而言，本文所述之1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20種物種，呈任何組合形式，可包括於本文提供之組合物中。
在一些實施例中，細菌組合物包含經殺滅細菌、活細菌及/或經減毒細菌。細菌可經巴氏殺菌、滅菌、高溫處理、噴霧烹煮及/或噴霧乾燥熱殺滅(熱處理可在50℃、65℃、85℃或多種其他溫度及/或變化時間量下進行)。亦可使用γ-照射(γ-irradiation/gamma irradiation)、暴露於UV光、福馬林滅活、及/或冷凍方法或其組合來殺滅或使細菌不活化。舉例而言，在投與之前，細菌可暴露於1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、35、40或50千格雷(kGy)之輻射。在一些實施例中，使用γ照射殺滅細菌(例如布勞特氏菌株A)。在一些實施例中，使用電子輻射(例如β輻射)或x射線照射殺滅或使細菌不活化。
細菌可生長至不同生長階段且以不同稀釋液及在生長階段期間之不同時間點測試功效。舉例而言，可在以固定相(包括早期或後期固定相)投與後或在指數階段期間之不同時間點測試細菌功效。除了藉由不同方法進行不活化之外，可使用不同比率之活細胞對不活化細胞或不同比率之處於不同生長階段的細胞來測試細菌功效。
在某些實施例中，本文提供包含本文中提供的布勞特氏菌株A EV及/或布勞特氏菌株A細菌之醫藥組合物(例如EV組合物)。在一些實施例中，EV組合物包含EV及/或本文所述之EV之組合及醫藥學上可接受之載劑。
在一些實施例中，醫藥組合物包含實質上或完全不含細菌之布勞特氏菌株A EV。在一些實施例中，醫藥組合物包含布勞特氏菌株A EV及完整布勞特氏菌株A細菌(例如活細菌、經殺滅細菌、經減毒細菌)兩者。在某些實施例中，醫藥組合物包含實質上或完全EV之布勞特氏菌株A細菌。
在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
、5 × 103
、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
、7 × 104
、8 × 104
、9 × 104
、1 × 105
、2 × 105
、3 × 105
、4 × 105
、5 × 105
、6 × 105
、7 × 105
、8 × 105
、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A EV粒子包含至少1個布勞特氏菌株A細菌。
在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
、5 × 103
、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
、7 × 104
、8 × 104
、9 × 104
、1 × 105
、2 × 105
、3 × 105
、4 × 105
、5 × 105
、6 × 105
、7 × 105
、8 × 105
、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A EV粒子包含約1個布勞特氏菌株A細菌。
在某些實施例中，醫藥組合物包含特定比率之布勞特氏菌株A細菌粒子與布勞特氏菌株A EV粒子。布勞特氏菌株A細菌粒子之數目可基於實際粒子數或(若細菌為活的)CFU數目。粒子數可藉由將一定數量的純化普布勞特氏菌株A EV與一定數量的純化布勞特氏菌株A細菌組合、藉由調整培養布勞特氏菌株A細菌之生長條件或藉由修飾布勞特氏菌株A細菌本身以產生較多或較少布勞特氏菌株A EV來確認。
在一些實施例中，為了對細菌樣本中所存在的布勞特氏菌株A EV及/或布勞特氏菌株A細菌之數目進行定量，可使用電子顯微法(例如超薄冷凍切片之EM)來目測囊泡及細菌且對其相對數目進行計數。替代性地，可使用奈米粒子追蹤分析(NTA)、庫爾特計數(Coulter counting)及動態光散射(DLS)或此等技術之組合的組合。NTA及庫爾特計數器對粒子進行計數且顯示其尺寸。DLS給出粒子之尺寸分佈但並未給出濃度。細菌直徑通常為1至2 μm。全範圍為0.2至20 μm。來自庫爾特計數及NTA之組合結果可顯示給定樣本中之細菌數。庫爾特計數顯示直徑為0.7至10 μm的粒子數。NTA顯示直徑為50至1400 nm的粒子數。對於大多數細菌樣本而言，單獨的庫爾特計數器可顯示樣本中之細菌數。EV直徑為20至250 nm。NTA將使得可對直徑為50至250 nm之粒子數進行計數。DLS顯示具有在1 nm至3 μm之大致範圍內的不同直徑的粒子之分佈。
在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
、5 × 103
、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
、7 × 104
、8 × 104
、9 × 104
、1 × 105
、2 × 105
、3 × 105
、4 × 105
、5 × 105
、6 × 105
、7 × 105
、8 × 105
、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A EV粒子包含不超過1個布勞特氏菌株A細菌。
在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
、5 × 103
、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
、7 × 104
、8 × 104
、9 × 104
、1 × 105
、2 × 105
、3 × 105
、4 × 105
、5 × 105
、6 × 105
、7 × 105
、8 × 105
、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A細菌包含至少1個布勞特氏菌株A EV粒子。
在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
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、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
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、4 × 104
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、7 × 104
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、9 × 104
、1 × 105
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、7 × 105
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、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
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、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A細菌包含約1個布勞特氏菌株A EV粒子。在一些實施例中，醫藥組合物每1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、3、3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、8、8.1、8.2、8.3、8.4、8.5、8.6、8.7、8.8、8.9、9、9.1、9.2、9.3、9.4、9.5、9.6、9.7、9.8、9.9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、100、150、200、250、300、350、400、450、500、550、600、650、700、750、800、850、900、950、1 × 103
、2 × 103
、3 × 103
、4 × 103
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、6 × 103
、7 × 103
、8 × 103
、9 × 103
、1 × 104
、2 × 104
、3 × 104
、4 × 104
、5 × 104
、6 × 104
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、9 × 104
、1 × 105
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、4 × 105
、5 × 105
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、7 × 105
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、9 × 105
、1 × 106
、2 × 106
、3 × 106
、4 × 106
、5 × 106
、6 × 106
、7 × 106
、8 × 106
、9 × 106
、1 × 107
、2 × 107
、3 × 107
、4 × 107
、5 × 107
、6 × 107
、7 × 107
、8 × 107
、9 × 107
、1 × 108
、2 × 108
、3 × 108
、4 × 108
、5 × 108
、6 × 108
、7 × 108
、8 × 108
、9 × 108
、1 × 109
、2 × 109
、3 × 109
、4 × 109
、5 × 109
、6 × 109
、7 × 109
、8 × 109
、9 × 109
、1 × 1010
、2 × 1010
、3 × 1010
、4 × 1010
、5 × 1010
、6 × 1010
、7 × 1010
、8 × 1010
、9 × 1010
、1 × 1011
、2 × 1011
、3 × 1011
、4 × 1011
、5 × 1011
、6 × 1011
、7 × 1011
、8 × 1011
、9 × 1011
及/或1 × 1012
個布勞特氏菌株A細菌包含不超過1個布勞特氏菌株A EV粒子。
在一些實施例中，醫藥組合物中至少1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%粒子為布勞特氏菌株A EV。
在一些實施例中，醫藥組合物中至少1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 粒子為布勞特氏菌株A細菌。
在一些實施例中，醫藥組合物中不超過1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%粒子為布勞特氏菌株A EV。
在一些實施例中，醫藥組合物中不超過1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 粒子為布勞特氏菌株A細菌。
在一些實施例中，醫藥組合物中約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%粒子為布勞特氏菌株A EV。
在一些實施例中，醫藥組合物中約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%粒子為布勞特氏菌株A細菌。
在一些實施例中，醫藥組合物中至少1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%蛋白質為布勞特氏菌株A EV蛋白質。
在一些實施例中，醫藥組合物中至少1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 蛋白質為布勞特氏菌株A細菌蛋白質。
在一些實施例中，醫藥組合物中不超過1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%蛋白質為布勞特氏菌株A EV蛋白質。
在一些實施例中，醫藥組合物中不超過1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%蛋白質為布勞特氏菌株A細菌蛋白質。
在一些實施例中，醫藥組合物中約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%蛋白質為布勞特氏菌株A EV蛋白質。
在一些實施例中，醫藥組合物中約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%蛋白質為布勞特氏菌株A細菌蛋白質。
在一些實施例中，醫藥組合物中至少1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99% 脂質為布勞特氏菌株A EV脂質。
在一些實施例中，醫藥組合物中至少1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%脂質為布勞特氏菌株A細菌脂質。
在一些實施例中，醫藥組合物中不超過1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%脂質為布勞特氏菌株A EV脂質。
在一些實施例中，醫藥組合物中不超過1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%脂質為布勞特氏菌株A細菌脂質。
在一些實施例中，醫藥組合物中約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%脂質為布勞特氏菌株A EV脂質。
在一些實施例中，醫藥組合物中約1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%脂質為布勞特氏菌株A細菌脂質。
在一些實施例中，醫藥組合物中之布勞特氏菌株A EV係自一或多種其他細菌組分純化。在一些實施例中，醫藥組合物進一步包含其他細菌組分。在一些實施例中，醫藥組合物包含細菌細胞。
如下文所詳述，本文所揭示之醫藥組合物可經專門調配以用於以固體或液體形式，包括適用於口服或直腸投與之彼等形式投與。
在一些實施例中，本文所述之組合物可為醫藥組合物、膳食補充品或食品(例如食物或飲料)。在一些實施例中，食品為動物飼料。
在某些實施例中，本文所述之用於口服之醫藥組合物包含使得能夠將細菌有效遞送至結腸之額外組分。在一些實施例中，可使用使得能夠將細菌遞送至結腸之醫藥製劑。此類調配物之實例包括pH敏感性組合物，諸如經緩衝之藥囊調配物或腸聚合物，當在腸聚合物穿過胃之後pH變成鹼性時，該等藥囊調配物或腸聚合物釋放其內含物。當pH敏感組合物用於調配醫藥製劑時，pH敏感組合物可為組合物分解之pH臨限值在約6.8與約7.5之間的聚合物。
適用於將細菌遞送至結腸之醫藥組合物之另一實施例為，藉由延遲釋放細菌大約3至5小時(其對應於小腸輸送時間)確保遞送至結腸的醫藥組合物。在一些實施例中，用於延遲釋放之醫藥組合物包括水凝膠殼。水凝膠為水合的，且在與胃腸道流體接觸後膨脹，結果為有效地釋放內含物(主要在結腸中釋放)。延遲釋放劑量單位包括含細菌組合物，其具有包覆或選擇性包覆細菌的材料。此類選擇性包衣材料之實例包括活體內可降解聚合物、可逐漸水解之聚合物、可逐漸溶於水之聚合物及/或酶可降解聚合物。用於有效延遲釋放之多種包衣材料為可獲得的，且包括例如：纖維素類聚合物，諸如羥丙基纖維素；丙烯酸聚合物及共聚物，諸如甲基丙烯酸聚合物及共聚物；及乙烯聚合物及共聚物，諸如聚乙烯吡咯啶酮。
使得能夠遞送至結腸之組合物之實例進一步包括：生物黏附組合物，其特異性黏附於結腸黏膜(例如美國專利第6,368,586號之說明書中所述之聚合物，其以引用之方式併入本文中)；及組合物，其中併入蛋白酶抑制劑以用於尤其在胃腸道中保護生物醫藥製劑歸因於蛋白酶之活性而分解。
使得能夠遞送至結腸之系統之實例為藉由壓力變化，以使得藉由利用由在胃之遠端部分處細菌醱酵中產生氣體引起之壓力變化而釋放內含物的方式，將組合物遞送至結腸之系統。此類系統不受特別限制，且其更特定實例為將內含物分散於栓劑基質中且用疏水性聚合物(例如乙基纖維素)包衣的膠囊。
能夠遞送至結腸之系統之另一實例為將組合物遞送該結腸之系統，該系統特異性地由結腸中存在之酶(例如碳水化合物羥化酶或碳水化合物還原酶)分解。此類系統不受特別限制，且其更具體實例包括使用食物組分(諸如非澱粉多醣、直鏈澱粉、三仙膠及偶氮聚合物)之系統。
在一些實施例中，以囊封、包覆腸溶包衣或粉劑形式提供含有布勞特氏菌株A之益生菌調配物，其中劑量範圍高達1011
cfu(例如高達1010
cfu)。在一些實施例中，在膠囊中，組合物包含5 × 1011
cfu之布勞特氏菌株A及10% (重量比)玉米澱粉。膠囊為包覆腸溶包衣的，以在pH5.5下在十二指腸釋放。在一些實施例中，膠囊為包覆腸溶包衣的，以在pH5.5下在十二指腸釋放。在一些實施例中，組合物包含經冷凍乾燥之布勞特氏菌株A之粉劑，其視為「安全性適格推定(Qualified Presumption of Safety)」(QPS)狀態。在一些實施例中，組合物在冷凍或冷藏溫度下為穩定的。
用於製造微生物組合物之方法可包括三個主要處理步驟。該等步驟為：生物體儲備、生物體製造及保藏。在某些實施例中，含有大量布勞特氏菌株A之樣本可藉由避免分離步驟來培養。
對於儲備，包括於微生物組合物中之菌株可：(1)直接與試樣分離或獲自備用儲備液，(2)視情況在支持生長以產生活生物質之營養物瓊脂或培養液上培養，及(3)生物質視情況保藏在長期儲存之多個等分試樣中。
在各實施例中，使用培養步驟，瓊脂或培養液可含有提供使得能夠進行生長之基本元素及特定因子的營養物質。實例應為由以下構成之培養基：20 g/L葡萄糖、10 g/L酵母提取物、10 g/L大豆蛋白腖、2 g/L檸檬酸、1.5 g/L磷酸二氫鈉、100 mg/L檸檬酸鐵銨、80 mg/L硫酸鎂、10 mg/L氯化血紅素、2 mg/L氯化鈣、1 mg/L甲萘醌。另一實例應為由以下構成之培養基：10 g/L牛肉提取物、10 g/L蛋白腖、5 g/L氯化鈉、5 g/L右旋糖、3 g/L酵母提取物、3 g/L乙酸鈉、1 g/L可溶澱粉及0.5 g/L L-半胱胺酸HCl，pH 6.8。各種微生物培養基及變體形式為此項技術中所熟知(例如R.M. Atlas,Handbook of Microbiological Media
(2010) CRC Press)。培養基可在開始時添加至培養物，可在培養期間添加，或可間歇地/連續流過培養物。細菌組合物中之菌株可作為微生物組合物之子集或作為構成微生物組合物之整個集合單獨培養。作為一實例，第一菌株可與第二菌株一起在混合連續培養中在低於任一細胞之最大生長速率之稀釋速率下培養，以防止培養物自培養中洗滌出。
將經培育之培養物在有利條件下培育持續足以生成生物質之時間。對於人類用途之微生物組合物，此通常在37℃溫度、pH及其他具有與正常人類生態棲位相似的值之參數下進行。環境可進行主動地控制、被動地控制(例如經由緩衝液)或允許偏移。舉例而言，對於厭氧性細菌組合物，可採用缺氧/還原環境。此可藉由向培養液中添加還原劑(諸如半胱胺酸)及/或去除氧來實現。作為一實例，細菌組合物之培養物可在37℃下、pH 7、在用1 g/L半胱胺酸-HCl預還原之以上培養基中生長。
當培養物已產生足夠生物質時，可將其保藏備用。可將生物體置放於化學環境中，該化學環境保護其免於冷凍(添加『冷凍保護劑』)中、乾燥(『凍乾保護劑』)及/或滲壓衝擊(『滲透保護劑』)、分配至多個(視情況相同)容器中以產生均一庫且隨後處理培養物以進行保藏。容器一般為不可滲透的，且具有確保與環境分離的封閉件。低溫保藏處理藉由在超低溫度(例如處於或低於-80℃)下冷凍液體來實現。乾燥保藏藉由蒸發(在噴霧乾燥或『冷卻乾燥』之情況下)或藉由昇華(例如對於冷凍乾燥、噴霧冷凍乾燥)而自培養物移除水。移除水改良在高於低溫條件之高溫下的長期微生物組合物儲存穩定性。若微生物組合物包含例如產孢子物種且引起產生孢子，則最終組合物可藉由額外手段(諸如密度梯度離心)來純化且使用上文所述之技術來保藏。微生物組合物儲備可藉由獨立地培養及保藏菌株，或藉由將菌株混合在一起來產生組合庫來進行。作為低溫保藏之一實例，微生物組合物培養物可藉由離心以使來自培養基之細胞集結來收集，對上清液進行傾析且用含有15%甘油之新製培養液置換。隨後，可將培養物等分至1 mL冷凍管中，密封且置放於-80℃下以長期保留存活力。在自冷凍儲存恢復後，此程序達成可接受的存活力。
微生物製造可使用類似於儲備之培養步驟來進行，包括上文所述之培養基組合物及培養條件。其可在較大操作規模下進行，尤其對於臨床研發或商業生產。在較大規模下，可在最終培養之前將微生物組合物進行數次轉種。在培養結束時，收集培養物，以使得能夠進一步調配成用於投與之劑型。此可涉及濃縮、移除非所需培養基組分及/或引入保存微生物組合物之化學介質，並且賦予該組合物是經由所選途徑投與方式所接受的。舉例而言，微生物組合物可培養至1010
CFU/mL之濃度，隨後藉由切向流微過濾濃縮20倍；用過的培養基可藉由透濾與由2%明膠、100 mM海藻糖及10 mM磷酸鈉緩衝液組成之保存培養基進行交換。隨後，可將懸浮液冷凍乾燥成粉末，且進行滴定。
在乾燥之後，粉末可經摻合達至適當效價，且與其他培養物及/或填充劑(諸如用於稠度及易於操作之微晶纖維素)混合；及調配成如本文所提供的細菌組合物。
在某些態樣中，提供用於投與個體之細菌組合物。在一些實施例中，將細菌組合物與額外活性及/或無活性物質組合，以便產生最終產物，該最終產物可呈單一劑量單位或呈多劑量格式。
在一些實施例中，組合物包含至少一種碳水化合物。「碳水化合物」係指糖或糖聚合物。術語「醣」、「多醣」、「碳水化合物」及「寡醣」可互換使用。大多數碳水化合物為具有多個羥基(分子之各碳原子上通常有一個)之醛或酮。碳水化合物一般具有分子式Cn
H2n
On
。碳水化合物可為單醣、雙醣、三醣、寡醣或多醣。大多數基礎碳水化合物為單醣，諸如葡萄糖、半乳糖、甘露糖、核糖、阿拉伯糖、木糖及果糖。雙醣為兩種經連接之單醣。例示性雙醣包括蔗糖、麥芽糖、纖維二糖及乳糖。通常，寡醣包括三個與六個之間的單醣單元(例如棉子糖、水蘇糖)，且多醣包括六個或多於六個單醣單元。例示性多醣包括澱粉、肝醣及纖維素。碳水化合物可含有經修飾之醣單元，諸如2'-去氧核糖，其中羥基經移除；2'-氟核糖，其中羥基用氟置換；或N-乙醯葡糖胺，一種葡萄糖之含氮形式(例如2'-氟核糖、去氧核糖及己醣)。碳水化合物可以多種不同形式存在，例如構象異構體、環狀形式、非環狀形式、立體異構體、互變異構體、端基異構體及異構體。
在一些實施例中，組合物包含至少一種脂質。如本文所用，「脂質」包括脂肪、油、三酸甘油酯、膽固醇、磷脂、呈任何形式之脂肪酸(包括游離脂肪酸)。脂肪、油及脂肪酸可為飽和、不飽和(順式或反式)或部分不飽和(順式或反式)的。在一些實施例中，脂質包含選自以下之至少一種脂肪酸：月桂酸(12:0)、肉豆蔻酸(14:0)、棕櫚酸(16:0)、棕櫚油酸(16:1)、十七烷酸(17:0)、十七碳烯酸(17:1)、硬脂酸(18:0)、油酸(18:1)、亞麻油酸(18:2)、次亞麻油酸(18:3)、十八碳四烯酸(18:4)、花生酸(20:0)、二十碳烯酸(20:1)、二十碳二烯酸(20:2)、二十碳四烯酸(20:4)、二十碳五烯酸(20:5) (EPA)、二十二烷酸(22:0)、二十二碳烯酸(22:1)、二十二碳五烯酸(22:5)、二十二碳六烯酸(22:6) (DHA)及二十四烷酸(24:0)。在一些實施例中，組合物包含至少一種經修飾脂質，例如已藉由蒸煮來修飾之脂質。
在一些實施例中，組合物包含至少一種補充礦物質或礦物質源。礦物質之實例包括(但不限於)：氯、鈉、鈣、鐵、鉻、銅、碘、鋅、鎂、錳、鉬、磷、鉀及硒。前述礦物質中之任一者之適合形式包括可溶礦物鹽、微溶礦物鹽、不溶性礦物鹽、螯合礦物質、礦物質錯合物、非反應性礦物質(諸如羰基礦物質)及還原礦物質以及其組合。
在一些實施例中，組合物包含至少一種補充維生素。該至少一種維生素可為脂溶性或水溶性維生素。適合維生素包括(但不限於)維生素C、維生素A、維生素E、維生素B12、維生素K、核黃素、菸酸、維生素D、維生素B6、葉酸、吡哆醇、硫胺素、泛酸及生物素。前述中之任一者之適合形式為維生素之鹽、維生素之衍生物、具有維生素之相同或類似活性之化合物及維生素之代謝物。
在一些實施例中，組合物包含賦形劑。適合賦形劑之非限制性實例包括緩衝劑、防腐劑、穩定劑、黏合劑、壓緊劑、潤滑劑、分散增強劑、崩解劑、調味劑、甜味劑及著色劑。
在一些實施例中，賦形劑為緩衝劑。適合緩衝劑之非限制性實例包括檸檬酸鈉、碳酸鎂、碳酸氫鎂、碳酸鈣及碳酸氫鈣。
在一些實施例中，賦形劑包含防腐劑。適合防腐劑之非限制性實例包括抗氧化劑，諸如α-生育酚及抗壞血酸酯；及抗微生物劑，諸如對羥基苯甲酸酯、氯丁醇及苯酚。
在一些實施例中，組合物包含黏合劑作為賦形劑。適合黏合劑之非限制性實例包括澱粉、預膠凝澱粉、明膠、聚乙烯吡咯啶酮、纖維素、甲基纖維素、羧甲基纖維素鈉、乙基纖維素、聚丙烯醯胺、聚乙烯噁唑烷酮(polyvinyloxoazolidone)、聚乙烯醇、C12
-C18
脂肪酸醇、聚乙二醇、多元醇、醣、寡醣及其組合。
在一些實施例中，組合物包含潤滑劑作為賦形劑。適合潤滑劑之非限制性實例包括硬脂酸鎂、硬脂酸鈣、硬脂酸鋅、氫化植物油、sterotex、聚氧乙烯單硬脂酸酯、滑石、聚乙二醇、苯甲酸鈉、月桂基硫酸鈉、月桂基硫酸鎂及輕質礦物油。
在一些實施例中，組合物包含分散增強劑作為賦形劑。適合分散劑之非限制性實例包括澱粉、褐藻酸、聚乙烯吡咯啶酮、瓜爾豆膠、高嶺土、膨潤土、純化木漿纖維素、羥基乙酸澱粉鈉、異非晶形矽酸鹽及微晶纖維素作為高HLB乳化劑界面活性劑。
在一些實施例中，組合物包含崩解劑作為賦形劑。在一些實施例中，崩解劑為非發泡崩解劑。適合非發泡崩解劑之非限制性實例包括澱粉，諸如玉米澱粉、馬鈴薯澱粉、預膠凝及其經改性澱粉；甜味劑；黏土，諸如膨潤土；微晶纖維素；海藻酸鹽；羥基乙酸澱粉鈉；膠，諸如瓊脂、瓜爾豆膠、刺槐豆膠、加拉亞膠(karaya)、果膠及黃蓍膠。在一些實施例中，崩解劑為發泡崩解劑。適合發泡崩解劑之非限制性實例包括碳酸氫鈉與檸檬酸的組合及碳酸氫鈉與酒石酸的組合。
在一些實施例中，細菌調配物包含包覆腸溶包衣或微囊包封。在某些實施例中，包覆腸溶包衣或微囊包封改良靶向胃腸道之所需區域。舉例而言，在某些實施例中，細菌組合物包含在與胃腸道之特定區域相關之pH下溶解的包覆腸溶包衣及/或微膠囊。在一些實施例中，包覆腸溶包衣及/或微膠囊在約5.5至6.2之pH下溶解，以在十二指腸中釋放；在約7.2至7.5之pH值下溶解，以在迴腸中釋放；及/或在約5.6至6.2之pH值下溶解，以在結腸中釋放。例示性包覆腸溶包衣及微膠囊描述於例如美國專利公開案第2016/0022592號中，該專利公開案以全文引用之方式併入本文中。
在一些實施例中，組合物為食品(例如食物或飲料)，諸如：健康食物或飲料；嬰兒食物或飲料；妊娠期婦女、運動員、老年人或其他指定群體之食物或飲料；功能性食物、飲料；指定健康用途之食物或飲料；膳食補充品；患者用食物或飲料或動物飼料。食品及飲料之具體實例包括：各種飲料，諸如果汁、提神飲料、茶飲料、飲用製劑、果凍飲料及功能性飲料；酒精性飲料，諸如啤酒；含碳水化合物食物，諸如稻米食品、麵條、麵包及意大利麵；膏狀品，諸如魚腸、香腸、海產食品之膏狀品；殺菌袋裝品，諸如咖喱、用濃厚澱粉調味醬調味的食物及中式湯；湯；乳製品，諸如牛奶、乳飲料、冰淇淋、乾酪及優格；醱酵品，諸如醱酵豆醬、優格、醱酵飲料及醃菜；豆製品；各種糖果產品，包括餅乾、甜餅及其類似物、糖果、口香糖、膠質糖、冷甜點(包括果凍)、焦糖奶油及冷凍甜點；速食食品，諸如速食湯及速食大豆湯；微波食品；及其類似物。此外，實例亦包括以粉末、顆粒、錠劑、膠囊、液體、膏體及果凍形式製備之健康食品及飲料。
在某些實施例中，本文所揭示之細菌結合益菌助生質向個體投與。益菌助生質為一般難以由宿主動物消化且選擇性地由細菌醱酵或代謝的碳水化合物。益菌助生質可為改變宿主中的微生物群落之組成或代謝的短鏈碳水化合物(例如寡醣)及/或簡單糖(例如單醣及二醣)及/或黏蛋白(高度糖基化之蛋白質)。短鏈碳水化合物亦被稱作寡醣，且通常含有2或3及至多8、9、10、15或多於15個糖部分。當將益菌助生質引入至宿主中時，益菌助生質影響宿主體內之細菌且並不直接影響宿主。在某些態樣中，益菌助生質組合物可選擇性地刺激宿主中有限數目之細菌中之一者的生長及/或活性。益菌助生質包括寡醣，諸如果寡醣(FOS) (包括菊糖)、半乳寡醣(GOS)、反式半乳寡醣、木寡醣(XOS)、殼寡醣(COS)、大豆寡醣(例如水蘇糖及棉子糖)、龍膽寡醣、異麥芽糖寡醣、甘露寡醣(mannooligosaccharide)、麥芽糖寡醣及甘露寡醣(mannanoligosaccharides)。寡醣不一定為單一組分，且可為含有不同寡聚度之寡醣的混合物，有時包括母體雙醣及單體糖。在許多常見食物，包括水果、蔬菜、牛奶及蜂蜜中，發現呈天然組分之各種類型的寡醣。寡醣之具體實例為乳酮糖、乳果糖、巴拉金糖(palatinose)、糖基蔗糖、瓜爾豆膠、阿拉伯膠、塔格糖(tagalose)、直鏈澱粉、支鏈澱粉、果膠、木聚糖及環糊精。益菌助生質亦可經純化或以化學或酶促方式合成。
PhAB 之製造
PhAB 之製造
在某些態樣中，本文所述之PhAB可使用此項技術中已知的任何方法製備。
在一些實施例中，本文所述之PhAB係藉由分級製備。細菌細胞及/或來自經培養之細菌細胞的上清液分級成不同藥理學活性生物質(PhAB)及/或由其衍生之產物。使用此項技術中已知的物質及方法分級細菌細胞及/或上清液(參見例如 Sandrini等人 Fractionation by ultracentrifugation of gram negative cytoplasmic and membrane proteins. 2014. Bio-Protocol. 4(21)；Scholler等人 Protoplast and cytoplasmic membrane preparations from Streptococcus sanguis and Streptococcus mutans. 1983. J Gen Micro. 129: 3271-3279；Thein等人 Efficient subfractionation of gram-negative bacteria for proteomics studies. 2010. Am Chem Society. 9: 6135-6147；Hobb等人 Evaluation of procedures for outer membrane isolation from Campylobacter jejuni. 2009. 155(Pt. 3): 979-988)。
此外，由本文中提供之方法獲得的PhAB可藉由基於尺寸之管柱層析法、藉由親和性層析法且藉由梯度超速離心，使用可包括(但不限於)使用蔗糖梯度或Optiprep梯度之方法來進一步純化。簡言之，若使用硫酸銨沈澱或超速離心來濃縮過濾上清液，則使用蔗糖梯度法，將集結粒再懸浮於60%蔗糖，30 mM Tris，pH 8.0中。若使用過濾來濃縮過濾上清液，則使用Amicon Ultra管柱將濃縮物緩衝液交換為60%蔗糖，30 mM Tris，pH 8.0。將樣本施加至35%至60%非連續蔗糖梯度且在4℃下以200,000× g離心持續3至24小時。簡言之，若使用硫酸銨沈澱或超速離心來濃縮過濾上清液，則使用Optiprep梯度法，將集結粒再懸浮於於PBS中之35% Optiprep中。在一些實施例中，若使用過濾來濃縮過濾上清液，則使用60% Optiprep將濃縮物稀釋至最終濃度為35% Optiprep。將樣本施加至35%至60%非連續蔗糖梯度且在4℃下以200,000× g離心持續3至24小時。
在一些實施例中，為了證實PhAB製備物之無菌性及分離，將PhAB連續稀釋於用於常規培養所測試之細菌的洋菜培養基上，且使用常規條件進行培育。使非無菌製備物通過0.22 μm過濾器以排除掉完整細胞。為了進一步增加純度，經分離之PhAB可經DNA酶或蛋白酶K處理。
在一些實施例中，對於用於活體內注射之PhAB之製備，如先前所述處理經純化之PhAB (G. Norheim等人PLoS ONE
. 10(9): e0134353 (2015))。簡言之，在蔗糖梯度離心之後，將含有PhAB之帶再懸浮於含有3%蔗糖之溶液或熟習此項技術者已知的適用於活體內注射之其他溶液中至最終濃度為50 µg/mL。此溶液亦可含有佐劑，例如濃度為0至0.5% (重量體積比)之氫氧化鋁。
在某些實施例中，為了使樣本與進一步測試相容(例如，在TEM成像或活體外分析之前移除蔗糖)，使用過濾(例如，Amicon Ultra管柱)、透析或超速離心(200,000× g，≥ 3小時，4℃)及再懸浮將樣本緩衝液交換為PBS或30 mM Tris，pH 8.0。
在一些實施例中，PhAB製備物之無菌性可藉由將PhAB之一部分塗鋪於用於PhAB之生成中所用之細菌的標準培養的洋菜培養基上且使用標準條件培育來確認。
在一些實施例中，藉由層析及PhAB上之結合表面部分分離及富集所選PhAB。在其他實施例中，藉由螢光細胞分選藉由使用親和試劑、化學染料、重組蛋白之方法或熟習此項技術者已知的其他方法來分離及/或富集所選PhAB。
投藥
投藥
在某些態樣中，本文提供一種將本文所述之細菌及/或細菌組合物遞送至個體之方法。在本文所提供之方法之一些實施例中，結合投與額外治療劑來投與細菌。在一些實施例中，細菌與額外治療劑共調配於醫藥組合物中。在一些實施例中，細菌與額外治療劑共投與。在一些實施例中，在投與細菌之前向個體投與額外治療劑(例如之前約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50或55分鐘、之前約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22或23小時或之前約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14天)。一些實施例中，在投與細菌之後向個體投與額外治療劑(例如之後約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50或55分鐘、之後約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22或23小時或之後約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14天)。在一些實施例中，使用相同遞送模式來遞送細菌及額外治療劑兩者。在一些實施例中，使用不同遞送模式來投與細菌及額外治療劑。舉例而言，在一些實施例中，口服投與細菌，而經由注射(例如靜脈內、肌肉內及/或瘤內注射)投與額外治療劑。
在某些實施例中，可結合任何其他習知抗免疫病症治療來投與本文所述之醫藥組合物、劑型及套組。此等治療可視需要及/或如所指示施加，且可在投與本文所述之醫藥組合物、劑型及套組之前、同時或之後進行。
給藥方案可為各種方法及量中之任一者，且可藉由熟習此項技術者根據已知臨床因素來測定。如醫學技術中所知，任一患者之劑量可視多種因素而定，其包括個體之物種、身材、身體表面積、年齡、性別、免疫能力及一般健康、待投與之特定微生物、投與持續時間及途徑、疾病之種類及階段(例如腫瘤大小)，及諸如同時投與之藥物的其他化合物。除以上因素以外，此類水準可受微生物之感染性及微生物之性質影響，該等感染性及性質如可由熟習此項技術者來測定。在本發明方法中，微生物之適當最小劑量水準可為微生物足以存活、生長及複製的水準。本文所述之治療方法可適用於治療免疫病症(例如自體免疫疾病、發炎疾病、過敏)。本文所述之醫藥組合物之劑量可根據劑型、投藥途徑、靶向疾病之程度或階段及其類似者來適當設定或調整。舉例而言，藥劑之一般有效劑量可介於每天每公斤體重0.01 mg與每天每公斤體重1000 mg之間、每天每公斤體重0.1 mg與每天每公斤體重1000 mg之間、每天每公斤體重0.5 mg與每天每公斤體重500 mg之間、每天每公斤體重1 mg與每天每公斤體重100 mg之間，或每天每公斤體重5 mg與每天每公斤體重50 mg之間。有效劑量可為每天每公斤體重0.01、0.05、0.1、0.5、1、2、3、5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、200、500或1000或大於1000 mg，但劑量不限於此。
在一些實施例中，向個體投與之劑量足以預防免疫病症、延遲其發作或減緩或終止其進展或預防免疫病症復發。熟習此項技術者應認識到，劑量將視各種因素而定，包括所採用之特定化合物之強度，以及個體之年齡、物種、病狀及體重。劑量之大小亦將藉由以下來測定：投與之途徑、時序及頻率，以及可伴隨特定化合物之投藥之任何不良副作用的存在、性質及程度，以及所需生理學作用。
適合劑量及給藥方案可藉由一般熟習此項技術者已知的習知範圍探求技術判定。一般而言，治療係以小於化合物之最佳劑量之較小劑量開始。其後，劑量以小增量增加，直至達至在該等情況下之最佳效應。有效劑量及治療方案可藉由常規及習知手段判定，開始例如在實驗動物中使用低劑量，且隨後增加劑量，同時監測效應，且同樣系統地改變給藥方案。常用動物研究以測定每公斤重量的生物活性劑之最大耐受劑量(MTD)。熟習此項技術者通常推知其他物種(包括人類)中之功效劑量，同時避免毒性。
根據上文，在治療性應用中，根據本發明使用之活性劑的劑量視以下而變化：活性劑；接受者患者的年齡、體重及臨床病狀；及投與療法的臨床醫生或醫師的經驗及判斷；以及影響所選劑量之其他因素。一般而言，劑量應足以引起減緩免疫病症之進展，且較佳消退免疫病症之進展。
獨立投與可包括任何數目之兩次或多於兩次投與(例如劑量)，包括兩次、三次、四次、五次或六次投與。熟習此項技術者可根據此項技術中已知的用於監測治療方法之方法及本文所提供之其他監測方法，容易地測定進行投與的次數或進行一或多次額外投與的客觀需要。在一些實施例中，劑量可相隔至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天，或1、2、3或4週。因此，本文所提供之方法包括向個體提供一或多次細菌投與之方法，其中投與次數可藉由監測個體來測定且基於監測結果，判定是否提供一或多次額外投與。關於是否提供一或多次額外投與之決定可基於各種監測結果，包括(但不限於)：腫瘤生長或腫瘤生長抑制之指示、出現新癌轉移或癌轉移抑制、個體之抗細菌抗體效價、個體之抗腫瘤抗體效價、個體之總體健康狀況及/或個體之體重。
各投與之間的時段可為各種時段中之任一者。各投與之間的時段可取決於各種因素中之任一者，包括如關於投與次數中所述之監測步驟、個體建立免疫反應之時段及/或個體自正常組織清除細菌之時段。在一個實例中，時段可取決於個體建立免疫反應之時段；舉例而言，時段可超過個體建立免疫反應之時段，諸如超過約一週、超過約十天、超過約兩週或超過約一個月；在另一實例中，時段可少於個體建立免疫反應之時段，諸如少於約一週、少於約十天、少於約兩週或少於約一個月。在另一實例中，時段可取決於個體自正常組織清除細菌之時段；舉例而言，時段可超過個體自正常組織清除細菌之時段，諸如超過約一天、超過約兩天、超過約三天、超過約五天或超過約一週。
在一些實施例中，結合本文所述之細菌遞送免疫病症治療劑會降低不良作用及/或改良免疫病症治療劑之功效。
本文所述之免疫病症治療劑之有效劑量為治療劑有效達成特定患者、組合物及投藥方式之所需治療反應，同時對於患者具有最小毒性的量。有效劑量水準可使用本文所述之方法來鑑別，且將視多種藥物動力學因素而定，該等因素包括：所投與之特定組合物的活性；投與途徑；投與時間；所採用之特定化合物之排泄速率；治療持續時間；與所採用之特定組合物組合使用的其他藥物、化合物及/或物質；所治療患者之年齡、性別、體重、病狀、一般健康狀況及先前病史；及醫學技術中熟知之類似因素。一般而言，免疫病症療法之有效劑量將為治療劑有效產生治療效果之最低劑量的量。此類有效劑量將一般視上文所述之因素而定。
免疫病症療法之毒性為個體在治療期間及之後經歷之不良作用的水準。與免疫病症療法毒性相關之不良事件包括(但不限於)：腹痛、酸消化不良、酸回流、過敏反應、禿髮、全身性過敏反應、貧血、焦慮、食慾不振、關節痛、乏力、運動失調、氮質血症、失去平衡、骨痛、出血、血凝塊、低血壓、血壓升高、呼吸困難、支氣管炎、淤血、白血球計數降低、紅血球計數降低、血小板計數降低、心臟毒性、膀胱炎、出血性膀胱炎、心律不整、心瓣膜疾病、心肌病、冠狀動脈疾病、白內障、中樞神經毒性、認知障礙、意識模糊、結膜炎、便秘、咳嗽、痙攣、膀胱炎、深層靜脈栓塞、脫水、抑鬱、腹瀉、眩暈、口乾、皮膚乾燥、消化不良、呼吸困難(dyspnea)、水腫、電解質不平衡、食道炎、疲乏、生育力喪失、發燒、胃腸積氣、面紅、胃逆流、胃食道逆流病、生殖器疼痛、粒細胞減少症、男子女乳症、青光眼、脫髮、手足症候群、頭痛、聽覺損失、心臟衰竭、心悸、胃灼熱、血腫、出血性膀胱炎、肝毒性、高澱粉酶血症、高鈣血症、高氯血症、高糖血症、高鉀血症、高脂血症、高鎂血症、高鈉血症、高磷酸鹽血症、色素過多、高三酸甘油酯血症、高尿酸血症、低白蛋白血症、低鈣血症、低氯血症、低血糖症、低鉀血症、低鎂血症、 低鈉血症、低磷酸鹽血症、陽萎、感染、注射部位反應、失眠、缺鐵、瘙癢、關節痛、腎衰竭、白細胞減少症、肝功能障礙、失憶、閉經、口瘡、黏膜炎、肌肉痛、肌痛、骨髓抑制、心肌炎、嗜中性白血球減少性發燒、噁心、腎毒性、嗜中性白血球減少症、流鼻血、麻木、耳毒性、疼痛、手足症候群(palmar-plantar erythrodysesthesia)、全部血球減少症、心包炎、周邊神經病、咽炎、畏光、光敏感、肺炎(pneumonia)、局部肺炎(pneumonitis)、蛋白尿、肺血栓、肺性纖維化、肺毒性、皮疹、心跳加快、直腸出血、坐立不安、鼻炎、癲癇、呼吸短促、鼻竇炎、血小板減少症、耳鳴、泌尿道感染、陰道出血、陰道乾燥、眩暈、水滯留(water retention)、無力、體重減輕、體重增加及口乾症(xerostomia)。一般而言，若經由療法達成之對於個體之益處勝過個體歸因於療法所經歷之不良事件，則毒性為可接受的。
在一些實施例中，投與細菌組合物治療免疫病症。
治療劑
治療劑
在某些態樣中，本文所提供之方法包括向個體投與單獨或與另一治療劑組合的本文所述之細菌及/或細菌組合物(例如含布勞特氏菌株A之細菌組合物)。在一些實施例中，可按任何次序向個體投與細菌組合物及其他療法。在一些實施例中，為結合投與細菌組合物及其他療法。
在一些實施例中，在投與額外治療劑之前(例如之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時或之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天)向個體投與細菌。在一些實施例中，在投與額外治療劑之後(例如之後至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時或之後至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天)向個體投與細菌。在一些實施例中，向個體同時或幾乎同時(例如投與在彼此一小時內進行)投與細菌及額外治療劑。在一些實施例中，在向個體投與細菌之前(例如之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時或之前至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天)向個體投與抗生素。在一些實施例中，在向個體投與細菌之後(例如之後至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23或24小時或之後至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30天)向個體投與抗生素。在一些實施例中，向個體同時或幾乎同時(例如投與在彼此一小時內進行)投與細菌及抗生素。
在某些實施例中，個體可進行手術。手術之類型包括(但不限於)預防性、診斷性或階段性、治癒性及姑息性手術。
在一些實施例中，額外治療劑為抗生素。舉例而言，若根據本文所提供之方法偵測到存在免疫病症相關細菌及/或免疫病症相關微生物群落分佈，則可投與抗生素以自個體消除免疫病症相關細菌。「抗生素」廣義上係指能夠抑制或預防細菌性感染之化合物。抗生素可以多種方式分類，包括其針對特異性感染之用途、其作用機制、其生物可用性或其靶微生物譜(例如革蘭氏陰性細菌對革蘭氏陽性細菌、好氧性細菌對厭氧性細菌等)，且此等抗生素可用於在宿主之特定區域(「生態棲位」)中殺滅特異性細菌(Leekha等人 2011. General Principles of Antimicrobial Therapy. Mayo Clin Proc. 86(2): 156-167)。在某些實施例中，抗生素可用於選擇性地靶向特定生態棲位之細菌。在一些實施例中，已知治療特定感染(包括免疫病症生態棲位)之抗生素可用於靶向免疫病症相關微生物，包括該生態棲位之免疫病症相關細菌。在其他實施例中，在細菌治療之後，投與抗生素。在一些實施例中，在細菌治療之後，投與抗生素以移除移植。
在一些態樣中，可基於抗生素之殺菌或抑菌特性來選擇抗生素。殺菌抗生素包括破壞細胞壁(例如β-內醯胺)、細胞膜(例如達托黴素(daptomycin))或細菌DNA (例如氟喹諾酮(fluoroquinolone))之作用機制。抑菌藥劑抑制細菌複製，且包括磺醯胺、四環素及巨環內酯，且藉由抑制蛋白質合成而起作用。此外，儘管一些藥物在某些生物體中可為殺菌的而在其他生物體中為抑菌的，但應知曉，靶生物體允許熟習此項技術者選擇具有適當特性之抗生素。在某些治療條件下，抑菌抗生素抑制殺菌抗生素之活性。因此，在某些實施例中，不將殺菌及抑菌抗生素組合。
抗生素包括(但不限於)：胺基糖苷、安莎黴素(ansamycin)、碳頭孢烯、碳青黴烯、頭胞菌素、醣肽、林可醯胺類、脂肽、巨環內酯、單環β-內醯胺類、硝基呋喃、唑烷酮、青黴素、多肽抗生素、喹諾酮、氟喹諾酮、磺醯胺、四環素及抗分支桿菌化合物及其組合。
胺基糖苷包括(但不限於)：阿米卡星(Amikacin)、慶大黴素(Gentamicin)、卡那黴素(Kanamycin)、新黴素、奈替黴素(Netilmicin)、托普黴素(Tobramycin)、巴龍黴素(Paromomycin)及觀黴素(Spectinomycin)。胺基糖苷對於例如革蘭氏陰性細菌，諸如大腸桿菌、克雷伯氏菌(Klebsiella)、綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa)及土拉文氏桿菌(Francisella tularensis)為有效的；且對於某些好氧性細菌有效但對於專性/兼性厭氧菌不太有效。咸信胺基糖苷與細菌30S或50S核糖體次單元結合，藉此抑制細菌蛋白合成。
安莎黴素包括(但不限於)：格爾德黴素(Geldanamycin)、除莠黴素(Herbimycin)、利福黴素(Rifamycin)及曲張鏈絲菌素(Streptovaricin)。咸信格爾德黴素及除莠黴素會抑制或改變熱休克蛋白90之功能。
碳頭孢烯包括(但不限於)氯碳頭孢。咸信碳頭孢烯會抑制細菌細胞壁合成。
碳青黴烯包括(但不限於)厄他培南(Ertapenem)、多尼培南(Doripenem)、亞胺培南(Imipenem)/西司他汀(Cilastatin)及美羅培南(Meropenem)。碳青黴烯作為廣效抗生素對於革蘭氏陽性細菌及革蘭氏陰性細菌兩者均具有殺菌性。咸信碳青黴烯會抑制細菌細胞壁合成。
頭胞菌素包括(但不限於)：頭孢羥胺苄(Cefadroxil)、頭孢唑林(Cefazolin)、頭孢噻吩(Cefalotin)、先鋒黴素(Cefalothin)、頭孢胺苄(Cefalexin)、頭孢克洛(Cefaclor)、頭孢孟多(Cefamandole)、頭孢西丁(Cefoxitin)、頭孢羅齊(Cefprozil)、頭孢呋辛(Cefuroxime)、頭孢克肟(Cefixime)、頭孢地尼(Cefdinir)、頭孢托侖(Cefditoren)、頭孢哌酮(Cefoperazone)、頭孢噻肟(Cefotaxime)、頭孢泊肟(Cefpodoxime)、頭孢他啶(Ceftazidime)、頭孢布坦(Ceftibuten)、頭孢唑肟(Ceftizoxime)、頭孢曲松(Ceftriaxone)、頭孢吡肟(Cefepime)、頭孢洛林酯(Ceftaroline fosamil)及頭孢吡普(Ceftobiprole)。所選頭胞菌素例如對於革蘭氏陰性細菌及對於革蘭氏陽性細菌(包括假單胞菌(Pseudomonas
))有效，某些頭胞菌素對於抗甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillin-resistantStaphylococcus aureus
；MRSA)有效。咸信頭胞菌素藉由干擾細菌細胞壁之肽聚糖層之合成而抑制細菌細胞壁合成。
醣肽包括(但不限於)替考拉寧(Teicoplanin)、萬古黴素(Vancomycin)及特拉萬星(Telavancin)。醣肽例如對於好氧性及厭氧性革蘭氏陽性細菌(包括MRSA及艱難梭菌(Clostridium difficile
))有效。咸信醣肽藉由干擾細菌細胞壁之肽聚糖層之合成而抑制細菌細胞壁合成。
林可醯胺類包括(但不限於)克林達黴素(Clindamycin)及林可黴素(Lincomycin)。林可醯胺類例如對於厭氧性細菌以及葡萄球菌及鏈球菌有效。咸信林可醯胺類與細菌50S核糖體次單元結合，藉此抑制細菌蛋白合成。
脂肽包括(但不限於)達托黴素(Daptomycin)。脂肽例如對於革蘭氏陽性細菌有效。咸信脂肽與細菌膜結合，且引起快速去極化。
大環內酯包括(但不限於)：阿奇黴素(Azithromycin)、克拉黴素(Clarithromycin)、地紅黴素(Dirithromycin)、紅黴素(Erythromycin)、羅紅黴素(Roxithromycin)、醋竹桃黴素(Troleandomycin)、泰利黴素(Telithromycin)及螺旋黴素(Spiramycin)。大環內酯例如對於鏈球菌及黴漿菌有效。咸信大環內酯與細菌50S核糖體次單元結合，從而抑制細菌蛋白合成。
單環β-內醯胺類包括(但不限於)安曲南(Aztreonam)。單環β-內醯胺類例如對於革蘭氏陰性細菌有效。咸信單環β-內醯胺類藉由干擾細菌細胞壁之肽聚糖層之合成而抑制細菌細胞壁合成。
硝基呋喃包括(但不限於)呋喃唑酮(Furazolidone)及呋喃妥因(Nitrofurantoin)。
唑烷酮包括(但不限於)利奈唑胺(Linezolid)、泊斯唑胺(Posizolid)、雷德唑胺(Radezolid)及特地佐利(Torezolid)。咸信唑烷酮為蛋白質合成抑制劑。
青黴素包括(但不限於)：阿莫西林(Amoxicillin)、安比西林(Ampicillin)、阿洛西林(Azlocillin)、卡本西林(Carbenicillin)、氯唑西林(Cloxacillin)、雙氯西林(Dicloxacillin)、氟氯西林(Flucloxacillin)、美洛西林(Mezlocillin)、二甲氧苯青黴素(Methicillin)、萘夫西林(Nafcillin)、苯唑西林(Oxacillin)、青黴素G、青黴素V、哌拉西林(Piperacillin)、替莫西林(Temocillin)及替卡西林(Ticarcillin)。青黴素例如對於革蘭氏陽性細菌、兼性厭氧菌(例如鏈球菌、疏螺旋體屬(Borrelia)及密螺旋體屬(Treponema))有效。咸信青黴素藉由干擾細菌細胞壁之肽聚糖層之合成而抑制細菌細胞壁合成。
青黴素組合包括(但不限於)：阿莫西林/棒酸鹽、安比西林/舒巴坦(sulbactam)、哌拉西林/他唑巴坦(tazobactam)及替卡西林/棒酸鹽。
多肽抗生素包括(但不限於)：桿菌肽(Bacitracin)、可利斯汀(Colistin)及多黏菌素(Polymyxin) B及E。多肽抗生素例如對於革蘭氏陰性細菌有效。咸信某些多肽抗生素抑制涉及細菌細胞壁之肽聚糖層之合成的焦磷酸異戊二烯酯，而其他多肽抗生素藉由位移細菌相對離子而使細菌外膜不穩定。
喹諾酮及氟喹諾酮包括(但不限於)：環丙沙星(Ciprofloxacin)、依諾沙星(Enoxacin)、加替沙星(Gatifloxacin)、吉米沙星(Gemifloxacin)、左氧氟沙星(Levofloxacin)、洛美沙星(Lomefloxacin)、莫西沙星(Moxifloxacin)、萘啶酸(Nalidixic acid)、諾氟沙星(Norfloxacin)、氧氟沙星(Ofloxacin)、曲伐沙星(Trovafloxacin)、格帕沙星(Grepafloxacin)、司帕沙星(Sparfloxacin)及替馬沙星(Temafloxacin)。喹諾酮/氟喹諾酮例如對於鏈球菌及奈瑟氏菌(Neisseria
)有效。咸信喹諾酮/氟喹諾酮抑制細菌DNA旋轉酶或拓樸異構酶IV，藉此抑制DNA複製及轉錄。
磺醯胺包括(但不限於)：磺胺米隆(Mafenide)、磺胺醋醯胺(Sulfacetamide)、磺胺嘧啶、磺胺嘧啶銀、磺胺二甲氧嗪、磺胺甲二唑、磺胺甲基異噁唑、胺苯磺胺、柳氮磺胺吡啶、磺胺異噁唑、甲氧苄啶-磺胺甲基異噁唑(增效磺胺甲基異噁唑)及磺醯胺基柯衣定(Sulfonamidochrysoidine)。咸信磺醯胺藉由競爭性抑制二氫葉酸合成酶而抑制葉酸合成，藉此抑制核酸合成。
四環素包括(但不限於)：地美環素(Demeclocycline)、多西環素(Doxycycline)、二甲胺四環素(Minocycline)、土黴素(Oxytetracycline)及四環素。四環素例如對於革蘭氏陰性細菌有效。咸信四環素與細菌30S核糖體次單元結合，藉此抑制細菌蛋白合成。
抗分支桿菌化合物包括(但不限於)：氯法齊明(Clofazimine)、二胺苯碸(Dapsone)、卷麯黴素(Capreomycin)、環絲胺酸、乙胺丁醇、乙硫異菸胺、異菸肼、吡嗪醯胺、立複黴素(Rifampicin)、利福布汀(Rifabutin)、利福噴丁(Rifapentine)及鏈黴素。
適合抗生素亦包括：阿斯凡納明(arsphenamine)、氯黴素(chloramphenicol)、磷黴素(fosfomycin)、梭鏈孢酸(fusidic acid)、甲硝噠唑(metronidazole)、莫匹羅星(mupirocin)、平板黴素(platensimycin)、奎奴普丁(quinupristin)/達福普汀(dalfopristin)、泰格環黴素(tigecycline)、磺甲硝咪唑(tinidazole)、甲氧苄啶阿莫西林(trimethoprim amoxicillin)/棒酸鹽、安比西林/舒巴坦、安福黴素(amphomycin)、瑞斯特黴素(ristocetin)、阿奇黴素(azithromycin)、桿菌肽、蟾蜍素II、嘉寶黴素(carbomycin)、殺菌肽Pl、克拉黴素(clarithromycin)、紅黴素、呋喃唑酮、梭鏈孢酸、褐酶酸鈉(Na fusidate)、短桿菌素(gramicidin)、亞胺培南(imipenem)、肽抗生素、交沙黴素(josamycin)、馬加寧(magainan) II、甲硝噠唑、硝基咪唑、蜜柑黴素(mikamycin)、誘變素B-Ny266、誘變素B-JHl 140、誘變素J-T8、乳酸鏈球菌素、乳酸鏈球菌素A、新生黴素、竹桃黴素、牡蠣菌素、哌拉西林/他唑巴坦、普那黴素(pristinamycin)、雷莫拉寧(ramoplanin)、蘭那雷辛(ranalexin)、無蛋白菌質(reuterin)、利福昔明(rifaximin)、薔薇黴素(rosamicin)、羅沙米星(rosaramicin)、觀黴素、螺旋黴素、抗金葡黴素(staphylomycin)、鏈黴殺陽素(streptogramin)、鏈黴殺陽素A、協同素(synergistin)、滔羅定(taurolidine)、替考拉寧(teicoplanin)、泰利黴素(telithromycin)、替卡西林/克拉維酸(clavulanic acid)、三乙醯竹桃黴素(triacetyloleandomycin)、泰黴素(tylosin)、短桿菌酪肽(tyrocidin)、短桿菌素(tyrothricin)、萬古黴素、維莫黴素(vemamycin)及維吉黴素(virginiamycin)。
在一些實施例中，額外治療劑為免疫抑制劑、DMARD、疼痛控制藥物、類固醇、非類固醇消炎藥(NSAID)或細胞介素拮抗劑及其組合。代表性劑包括(但不限於)：環孢素、類視黃素、皮質類固醇、丙酸衍生物、乙酸衍生物、烯醇酸衍生物、芬那酸衍生物、Cox-2抑制劑、盧米羅可(lumiracoxib)、布洛芬、水楊酸膽鹼鎂、非諾洛芬(fenoprofen)、雙水楊酸酯、二氟尼柳(difunisal)、托美丁(tolmetin)、酮洛芬(ketoprofen)、氟比洛芬(flurbiprofen)、奧沙普嗪(oxaprozin)、吲哚美辛(indomethacin)、舒林酸、依託度酸(etodolac)、酮咯酸、萘丁美酮(nabumetone)、萘普生(naproxen)、伐地昔布(valdecoxib)、依他昔布(etoricoxib)、MK0966；羅非昔布(rofecoxib)、乙醯胺苯酚、塞內昔布(Celecoxib)、雙氯芬酸、曲馬多(tramadol)、吡羅昔康(piroxicam)、美洛昔康(meloxicam)、替諾昔康(tenoxicam)、屈噁昔康(droxicam)、氯諾昔康(lornoxicam)、伊索昔康(isoxicam)、甲芬那酸、甲氯芬那酸、氟芬那酸、托芬那酸、伐地昔布(valdecoxib)、帕瑞昔布(parecoxib)、依託度酸、吲哚美辛、阿司匹林、布洛芬、非羅昔布(firocoxib)、甲胺喋呤(MTX)、抗瘧疾藥物(例如羥基氯奎及氯奎)、柳氮磺胺吡啶、來氟米特(Leflunomide)、硫唑嘌呤、環孢素、金鹽、二甲胺四環素、環磷醯胺、D-青黴胺、 二甲胺四環素、金諾芬(auranofin)、他克莫司(tacrolimus)、硫代苯酸金鈉(myocrisin)、氯芥苯丁酸、TNF α拮抗劑(例如TNF α拮抗劑或TNF α受體拮抗劑)，例如阿達木單抗(ADALIMUMAB) (Humira®)、依那西普(ETANERCEPT) (Enbrel®)、英利昔單抗(INFLIXIMAB) (Remicade®；TA-650)、聚乙二醇化賽妥珠單抗(CERTOLIZUMAB PEGOL) (Cimzia®；CDP870)、戈利木單抗(GOLIMUMAB) (Simpom®；CNTO 148)、阿那白滯素(ANAKINRA) (Kineret®)、利妥昔單抗(Rituxan®；MabThera®)、阿巴西普(ABATACEPT) (Orencia®)、托西利單抗(TOCILIZUMAB) (RoActemra/Actemra®)、整合素拮抗劑(TYSABRI® (那他珠單抗(natalizumab)))、IL-1拮抗劑(ACZ885 (Ilaris))、阿那白滯素(Kineret®)、CD4拮抗劑、IL-23拮抗劑、IL-20拮抗劑、IL-6拮抗劑、 BLyS拮抗劑(例如阿塞西普(Atacicept)、Benlysta®/LymphoStat-B® (貝利單抗(belimumab)))、p38抑制劑、CD20拮抗劑(奧克珠單抗(Ocrelizumab)、奧伐木單抗(Ofatumumab) (Arzerra®))、干擾素γ拮抗劑(芳妥珠單抗(Fontolizumab))、潑尼龍、強的松、地塞米松、皮質醇、皮質酮、氫皮質酮、甲基潑尼龍、倍他米松(betamethasone)、曲安西龍(triamcinolone)、倍氯米松(beclometasome)、氟氫可的松(fludrocortisone)、去氧皮質固酮、醛固酮、多西環素、萬古黴素、吡格列酮(pioglitazone)、SBI-087、SCIO-469、Cura-100、Oncoxin+Viusid、TwHF、甲氧沙林、維生素D-麥角鈣化醇、米那普侖(Milnacipran)、太平洋紫杉醇、羅格他酮(rosig tazone)、他克莫司(Tacrolimus) (Prograf®)、RADOOl、雷帕鳴(rapamune)、雷帕黴素(rapamycin)、福他替尼(fostamatinib)、芬太尼(Fentanyl)、XOMA 052、福他替尼二鈉、羅格列酮(rosightazone)、薑黃素(Longvida™)、羅素他汀(Rosuvastatin)、馬拉維若(Maraviroc)、雷米普利(ramipril)、米那普侖、考比前列酮(Cobiprostone)、索馬托品(somatropin)、tgAAC94基因療法載體、MK0359、GW856553、埃索美拉唑(esomeprazole)、依維莫司(everolimus)、曲妥珠單抗、JAKl及JAK2抑制劑、泛JAK抑制劑，例如四環吡啶酮6 (P6)、325、PF-956980、德諾單抗(denosumab)、IL-6拮抗劑、CD20拮抗劑、CTLA4拮抗劑、IL-8拮抗劑、IL-21拮抗劑、IL-22拮抗劑、整合素拮抗劑(Tysarbri® (那他珠單抗))、VGEF拮抗劑、CXCL拮抗劑、MMP拮抗劑、防禦素拮抗劑、IL-1拮抗劑(包括IL-1 β拮抗劑)及IL-23拮抗劑(例如受體誘餌、拮抗性抗體等)。
在一些實施例中，該藥劑為免疫抑制劑。免疫抑制劑之實例包括(但不限於)：皮質類固醇、美沙拉嗪(mesalazine)、美塞拉明(mesalamine)、柳氮磺胺吡啶、柳氮磺胺吡啶衍生物、免疫抑制藥物、環孢素A、巰基嘌呤、硫唑嘌呤、潑尼松、甲胺喋呤、抗組織胺、糖皮質激素、腎上腺素、茶鹼、色甘酸鈉、抗白三烯、用於鼻炎之抗膽鹼激導性藥物、TLR拮抗劑、炎性體抑制劑、抗膽鹼激導性解充血劑、肥大細胞穩定劑、單株抗IgE抗體、疫苗(例如用於其中過敏原之量逐漸增加的疫苗接種的疫苗)、細胞介素抑制劑(諸如抗IL-6抗體)、TNF抑制劑(諸如英利昔單抗、阿達木單抗、聚乙二醇化賽妥珠單抗、戈利木單抗或依那西普)及其組合。
在一些實施例中，免疫病症療法包含向個體投與治療性細菌及/或細菌治療組合，因此健康微生物群落可在該個體中復原。在一些實施例中，治療性細菌為非免疫病症相關細菌。在一些實施例中，治療性細菌為益生細菌。
在一些實施例中，額外治療劑為癌症治療劑。在一些實施例中，癌症治療劑為化學治療劑。此類化學治療劑之實例包括(但不限於)烷基化劑，諸如環磷醯胺；磺酸烷基酯，諸如白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)及哌泊舒凡(piposulfan)；氮丙啶，諸如苯唑多巴(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、米特多巴(meturedopa)及尤利多巴(uredopa)；乙烯亞胺及甲基三聚氰胺，包括六甲蜜胺、曲他胺(triethylenemelamine)、三伸乙基磷醯胺、三伸乙基硫代磷醯胺及三羥甲基三聚氰胺(trimethylolomelamine)；乙醯精寧(acetogenin) (尤其布拉他辛(bullatacin)及布拉他辛酮(bullatacinone))；喜樹鹼(包括合成類似物拓朴替康(topotecan))；苔蘚抑素(bryostatin)；海洋抑素(callystatin)；CC-1065 (包括其阿多來新(adozelesin)、卡折來新(carzelesin)及比折來新(bizelesin)合成類似物)；念珠藻環肽(cryptophycin)(尤其念珠藻環肽1及念珠藻環肽8)；海兔毒素(dolastatin)；倍癌黴素(duocarmycin) (包括合成類似物KW-2189及CB1-TM1)；艾榴素(eleutherobin)；水鬼蕉鹼(pancratistatin)；匍枝珊瑚醇(sarcodictyin)；海綿抑素(spongistatin)；氮芥，諸如氯芥苯丁酸(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷醯胺、雌氮芥(estramustine)、異環磷醯胺、二氯甲基二乙胺(mechlorethamine)、鹽酸氧二氯甲基二乙胺、美法侖(melphalan)、新恩比興(novembichin)、芬司特瑞(phenesterine)、潑尼氮芥(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)及尿嘧啶氮芥(uracil mustard)；亞硝基脲，諸如卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)及雷莫司汀(ranimnustine)；抗生素，諸如烯二炔抗生素(例如，卡奇黴素(calicheamicin)，尤其卡奇黴素γlI及卡奇黴素ωI1)；達內黴素(dynemicin)，包括達內黴素A；雙膦酸鹽，諸如氯屈膦酸鹽(clodronate)；埃斯培拉黴素(esperamicin)；以及新抑癌蛋白(neocarzinostatin)發色團及相關色蛋白烯二炔抗生素發色團、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放射菌素(actinomycin)、奧納黴素(authrarnycin)、偶氮絲胺酸、博萊黴素(bleomycin)、放線菌素C、卡拉比辛(carabicin)、洋紅黴素(carminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、色黴素(chromomycinis)、放線菌素D、道諾黴素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-側氧基-L-正白胺酸、小紅莓(doxorubicin) (包括嗎啉基-小紅莓、氰基嗎啉基-小紅莓、2-吡咯啉基-小紅莓及去氧小紅莓)、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、艾達黴素(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素(mitomycins) (諸如絲裂黴素C)、黴酚酸(mycophenolic acid)、諾拉黴素(nogalarnycin)、橄欖黴素(olivomycin)、培洛黴素(peplomycin)、潑非黴素(potfiromycin)、嘌呤黴素(puromycin)、奎那黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑黴素(streptonigrin)、鏈脲菌素(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯美司(ubenimex)、淨司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin)；抗代謝物，諸如甲胺喋呤(methotrexate)及5-氟尿嘧啶 (5-FU)；葉酸類似物，諸如迪諾特寧(denopterin)、甲胺喋呤、蝶羅呤(pteropterin)、曲美沙特(trimetrexate)；嘌呤類似物，諸如氟達拉濱(fludarabine)、6-巰基嘌呤、硫米嘌呤(thiamiprine)及硫鳥嘌呤；嘧啶類似物，諸如安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷、6-氮尿苷、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、二去氧尿苷、去氧氟尿苷、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷；雄激素，諸如卡魯睪酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、環硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)及睪內酯；抗腎上腺素，諸如胺格魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)及曲洛司坦(trilostane)；葉酸補充劑，諸如亞葉酸；醋葡醛內酯；醛磷醯胺糖苷；胺基乙醯丙酸；恩尿嘧啶(eniluracil)；安吖啶(amsacrine)；貝斯布西(bestrabucil)；比生群(bisantrene)；依達曲沙(edatraxate)；地磷醯胺(defofamine)；秋水仙胺(demecolcine)；地吖醌(diaziquone)；艾福米辛(elformithine)；依利醋銨(elliptinium acetate)；埃博黴素(epothilone)；依託格魯(etoglucid)；硝酸鎵；羥基脲；蘑菇多醣(lentinan)；氯尼達明(lonidainine)；類美登素，諸如美登素(maytansine)及安絲菌素(ansamitocins)；米托胍腙(mitoguazone)；米托蒽醌(mitoxantrone)；莫哌達醇(mopidanmol)；硝拉維林(nitraerine)；噴司他汀(pentostatin)；凡那明(phenamet)；吡柔比星(pirarubicin)；洛索蒽醌(losoxantrone)；鬼臼酸；2-乙基醯肼；丙卡巴肼(procarbazine)；PSK多醣複合物；雷佐生(razoxane)；根瘤菌素(rhizoxin)；西佐喃(sizofiran)；鍺螺胺(spirogermanium)；細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid)；三亞胺醌(triaziquone)；2,2',2''-三氯三乙胺；單端孢黴烯(trichothecene) (尤其T-2毒素、弗納庫林A (verracurin A)、桿孢菌素A (roridin A)及蛇形菌素(anguidine))；烏拉坦(urethan)；長春地辛(vindesine)；達卡巴嗪(dacarbazine)；甘露氮芥(mannomustine)；二溴甘露醇(mitobronitol)；二溴衛矛醇(mitolactol)；哌泊溴烷(pipobroman)；甲托辛(gacytosine)；阿拉伯糖苷(「Ara-C」)；環磷醯胺；噻替派；類紫杉醇，例如，太平洋紫杉醇及多西他賽(doxetaxel)；氯芥苯丁酸；吉西他濱(gemcitabine)；6-硫代鳥嘌呤；巰基嘌呤；甲胺喋呤；鉑配位錯合物，諸如順鉑(cisplatin)、奧沙利鉑(oxaliplatin)及卡鉑(carboplatin)；長春鹼；鉑；依託泊苷(etoposide) (VP-16)；異環磷醯胺；米托蒽醌(mitoxantrone)；長春新鹼；長春瑞濱(vinorelbine)；諾凡特龍(novantrone)；替尼泊苷(teniposide)；依達曲沙(edatrexate)；柔紅黴素(daunomycin)；胺基喋呤；希羅達(xeloda)；伊班膦酸鹽(ibandronate)；伊立替康(irinotecan) (例如CPT-11)；拓樸異構酶抑制劑RFS 2000；二氟甲基鳥胺酸(DMFO)；類視黃素，諸如視黃酸；卡培他濱(capecitabine)及以上任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。
在一些實施例中，癌症治療劑為癌症免疫療法藥劑。免疫療法係指使用個體免疫系統來治療癌症之治療，例如檢查點抑制劑、癌症疫苗、細胞介素、細胞療法、CAR-T細胞及樹突狀細胞療法。免疫療法之非限制性實例為檢查點抑制劑，包括納武單抗(Nivolumab) (BMS，抗PD-1)、派立珠單抗(Pembrolizumab) (Merck，抗PD-1)、伊匹單抗(Ipilimumab) (BMS，抗CTLA-4)、MEDI4736 (AstraZeneca，抗PD-L1)及MPDL3280A (Roche，抗PD-L1)。其他免疫療法可為腫瘤疫苗，諸如Gardail、Cervarix、BCG、sipulencel-T、Gp100:209-217、AGS-003、DCVax-L、Algenpantucel-L、Tergenpantucel-L、TG4010、ProstAtak、Prostvac-V/R-TRICOM、Rindopepimul、乙酸E75肽、IMA901、POL-103A、Belagenpumatucel-L、GSK1572932A、MDX-1279、GV1001及Tecemotide。免疫療法可經由注射(例如靜脈內、瘤內、皮下或至淋巴結中)投與，但亦可口服、表面或經由氣霧劑投與。免疫療法可包含佐劑，諸如細胞介素。
在一些實施例中，免疫療法藥劑為免疫檢查點抑制劑。免疫檢查點抑制廣義上係指抑制癌細胞可產生以預防或下調免疫反應的檢查點。免疫檢查點蛋白之實例包括(但不限於)：CTLA4、PD-1、PD-L1、PD-L2、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、KIR、LAG3、TIM-3或VISTA。免疫檢查點抑制劑可為與免疫檢查點蛋白結合且抑制免疫檢查點蛋白之抗體或其抗原結合片段。免疫檢查點抑制劑之實例包括(但不限於)：納武單抗、派立珠單抗、皮立珠單抗(pidilizumab)、AMP-224、AMP-514、STI-A1110、TSR-042、RG-7446、BMS-936559、MEDI-4736、MSB-0020718C、AUR-012及STI-A1010。
在一些實施例中，免疫療法藥劑為例如與癌症相關抗原結合之抗體或其抗原結合片段。癌症相關抗原之實例包括(但不限於)親脂素、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX (L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-連環蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、細胞週期素D1、細胞週期素-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH (hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、第二型穿膜絲胺酸蛋白酶、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸道羧基酯酶、K-ras、激肽釋放酶4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1 (亦稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、Lengsin、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺球蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、黑色素-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、肌凝蛋白I類、N-raw、NA88-A、neo-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、 pml-RARα融合蛋白、多形上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活素、SYT-SSX1或SYT-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、丙糖磷酸異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1、XAGE-1b/ GAGED2a。在一些實施例中，抗原為新抗原。
在一些實施例中，免疫療法藥劑為癌症疫苗及/或癌症疫苗之組分(例如抗原肽及/或蛋白質)。癌症疫苗可為蛋白質疫苗、核酸疫苗或其組合。舉例而言，在一些實施例中，癌症疫苗包含含有癌症相關抗原之抗原決定基的多肽。在一些實施例中，癌症疫苗包含編碼癌症相關抗原之抗原決定基的核酸(例如DNA或RNA，諸如mRNA)。在一些實施例中，核酸為載體(例如細菌載體、病毒載體)。細菌載體之實例包括(但不限於)：牛分支桿菌(Mycobacterium bovis；BCG)、鼠傷寒沙門桿菌亞種(Salmonella Typhimurium ssp.)、傷寒沙門氏菌亞種(Salmonella Typhi ssp.)、梭菌屬孢子(Clostridium sp. spore)、大腸桿菌(Escherichia coli) Nissle 1917、大腸桿菌K-12/LLO、單核球增多性李氏菌(Listeria monocytogenes)及弗氏志賀菌(Shigella flexneri)。病毒載體之實例包括(但不限於)：牛痘、腺病毒、RNA病毒及複製缺陷型鳥痘、複製缺陷型禽痘、複製缺陷型金絲雀痘、複製缺陷型MVA及複製缺陷型腺病毒。
在一些實施例中，癌症免疫療法包含投與用癌症特異性抗原激活之抗原呈遞細胞(APC)。在一些實施例中，APC為樹突狀細胞、巨噬細胞或B細胞。
癌症相關抗原之實例包括(但不限於)親脂素、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX (L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-連環蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、細胞週期素D1、細胞週期素-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH (hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/ Pmel17、GPNMB、HAUS3、第二型穿膜絲胺酸蛋白酶、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸道羧基酯酶、K-ras、激肽釋放酶4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1 (亦稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、Lengsin、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺球蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、黑色素-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、肌凝蛋白I類、N-raw、NA88-A、neo-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、pml-RARα融合蛋白、多形上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活素、SYT-SSX1或SYT-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、丙糖磷酸異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1、XAGE-1b/ GAGED2a。在一些實施例中，抗原為新抗原。
在一些實施例中，癌症免疫療法包含投與癌症特異性嵌合抗原受體(CAR)。在一些實施例中，將CAR投與在T細胞表面上。在一些實施例中，CAR與癌症相關抗原特異性結合。
在一些實施例中，癌症免疫療法包含向個體投與癌症特異性T細胞。在一些實施例中，T細胞為CD4+ T細胞。在一些實施例中，CD4+ T細胞為TH1 T細胞、TH2 T細胞或TH17 T細胞。在一些實施例中，T細胞表現對癌症相關抗原具有特異性的T細胞受體。
在一些實施例中，投與癌症疫苗與佐劑。佐劑之實例包括(但不限於)免疫調節蛋白、佐劑65、α-半乳糖苷基神經醯胺(α-GalCer)、磷酸鋁、氫氧化鋁、磷酸鈣、β-葡聚糖肽、CpG ODN DNA、GPI-0100、脂質A、脂多醣、Lipovant、Montanide、N-乙醯基-胞壁醯基-L-丙胺醯基-D-異麩醯胺酸、Pam3CSK4、quil A、霍亂毒素(CT)及來自腸毒性大腸桿菌之熱不穩定毒素(LT) (包括此等之衍生物(CTB、mmCT、CTA1-DD、LTB、LTK63、LTR72、dmLT))及海藻糖二黴菌酸酯。
在一些實施例中，免疫療法藥劑為向個體之免疫調節蛋白。在一些實施例中，免疫調節蛋白為細胞介素或趨化因子。免疫調節蛋白之實例包括(但不限於)：B淋巴細胞化學引誘劑(「BLC」)、C-C基元趨化因子11 (「伊紅趨素-1」)、嗜伊紅血球趨化性蛋白2 (「伊紅趨素-2」)、顆粒球群落刺激因子(「G-CSF」)、顆粒球巨噬細胞群落刺激因子(「GM-CSF」)、1-309、細胞間黏附分子1 (「ICAM-1」)、干擾素α (「IFN-α」)、干擾素β (「IFN-β」)、干擾素γ (「IFN-γ」)、介白素-1α (「IL-1α」)、介白素-1β (「IL-1β」)、介白素1受體拮抗劑(「IL-1 ra」)、介白素-2 (「IL-2」)、介白素-4 (「IL-4」)、介白素-5 (「IL-5」)、介白素-6 (「IL-6」)、介白素-6可溶性受體(「IL-6 sR」)、介白素-7 (「IL-7」)、介白素-8 (「IL-8」)、介白素-10 (「IL-10」)、介白素-11 (「IL-11」)、介白素-12之β次單元(「IL-12 p40」或「IL-12 p70」)、介白素-13 (「IL-13」)、介白素-15 (「IL-15」)、介白素-16 (「IL-16」)、介白素-17A-F (「IL-17A-F」)、介白素-18 (「IL-18」)、介白素-21 (「IL-21」)、介白素-22 (「IL-22」)、介白素-23 (「IL-23」)、介白素-33 (「IL-33」)、趨化因子(C-C基元)配位體2 (「MCP-1」)、巨噬細胞群落刺激因子(「M-CSF」)、由γ干擾素誘導之單核球激素(「MIG」)、趨化因子(C-C基元)配位體2 (「MIP-1α」)、趨化因子(C-C基元)配位體4 (「MIP-1β」)、巨噬細胞發炎蛋白-1-δ (「MIP-1δ」)、血小板衍生生長因子次單元B (「PDGF-BB」)、趨化因子(C-C基元)配位體5、調節活化正常T細胞表現及分泌(「RANTES」)、TIMP金屬肽酶抑制劑1 (「TIMP-1」)、TIMP金屬肽酶抑制劑2 (「TIMP-2」)、腫瘤壞死因子，淋巴毒素-α (「TNF α」)、腫瘤壞死因子，淋巴毒素-β (「TNF β」)、可溶性TNF受體1型(「sTNFRI」)、sTNFRIIAR、腦衍生神經營養因子(「BDNF」)、鹼性纖維母細胞生長因子(「bFGF」)、骨形態生成蛋白4 (「BMP-4」)、骨形態生成蛋白5 (「BMP-5」)、骨形態生成蛋白7 (「BMP-7」)、神經生長因子(「b-NGF」)、表皮生長因子(「EGF」)、表皮生長因子受體(「EGFR」)、內分泌腺衍生血管內皮生長因子(「EG-VEGF」)、纖維母細胞生長因子4 (「FGF-4」)、角質細胞生長因子(「FGF-7」)、生長分化因子15 (「GDF-15」)、膠細胞衍生神經營養因子(「GDNF」)、生長激素、肝素結合EGF樣生長因子(「HB-EGF」)、肝細胞生長因子(「HGF」)、胰島素樣生長因子結合蛋白1 (「IGFBP-1」)、胰島素樣生長因子結合蛋白2 (「IGFBP-2」)、胰島素樣生長因子結合蛋白3 (「IGFBP-3」)、胰島素樣生長因子結合蛋白4 (「IGFBP-4」)、胰島素樣生長因子結合蛋白6 (「IGFBP-6」)、胰島素樣生長因子1 (「IGF-1」)、胰島素、巨噬細胞群落刺激因子(「M-CSF R」)、神經生長因子受體(「NGF R」)、神經營養蛋白-3 (「NT-3」)、神經營養蛋白-4 (「NT-4」)、破骨細胞生成抑制因子(「骨保護素」)、血小板衍生生長因子受體(「PDGF-AA」)、磷脂醯肌醇-聚糖生物合成(「PIGF」)、含有Skp、Cullin、F盒之複合體(「SCF」)、幹細胞因子受體(「SCFR」)、轉型生長因子α (「TGFα」)、轉型生長因子β-1 (「TGF β 1」)、轉型生長因子β-3 (「TGF β 3」)、血管內皮生長因子(「VEGF」)、血管內皮生長因子受體2 (「VEGFR2」)、血管內皮生長因子受體3 (「VEGFR3」)、VEGF-D 6Ckine、酪胺酸-蛋白激酶受體UFO (「Axl」)、β細胞調節素(「BTC」)、黏膜相關上皮趨化因子(「CCL28」)、趨化因子(C-C基元)配位體27 (「CTACK」)、趨化因子(C-X-C基元)配位體16 (「CXCL16」)、C-X-C基元趨化因子5 (「ENA-78」)、趨化因子(C-C基元)配位體26 (「伊紅趨素-3」)、顆粒球趨化蛋白2 (「GCP-2」)、GRO、趨化因子 (C-C基元)配位體14 (「HCC-l」)、趨化因子(C-C基元)配位體16 (「HCC-4」)、介白素-9 (「IL-9」)、介白素-17F (「IL-17F」)、介白素-18-結合蛋白(「IL-18 BPa」)、介白素-28 A (「IL-28A」)、介白素29 (「IL-29」)、介白素31 (「IL-31」)、C-X-C基元趨化因子10 (「IP-10」)、趨化因子受體CXCR3 (「I-TAC」)、白血病抑制因子(「LIF」)、Light、趨化因子(C基元)配位體(「淋巴細胞趨化因子」)、 單核球化學引誘劑蛋白2 (「MCP-2」)、單核球化學引誘劑蛋白3 (「MCP-3」)、單核球化學引誘劑蛋白4 (「MCP-4」)、巨噬細胞衍生趨化因子(「MDC」)、巨噬細胞遷移抑制因子(「MIF」)、趨化因子(C-C基元)配位體20 (「MIP-3 α」)、C-C基序趨化因子19 (「MIP-3 β」)、趨化因子(C-C基元)配位體23 (「MPIF-1」)、巨噬細胞刺激蛋白α鏈(「MSPα」)、核小體裝配蛋白1樣4 (「NAP-2」)、分泌型磷蛋白1 (「骨橋蛋白」)、肺及活化調節細胞介素(「PARC」)、血小板因子4 (「PF4」)、基質細胞衍生因子-1α (「SDF-1 α」)、趨化因子(C-C基元)配位體17 (「TARC」)、胸腺表現趨化因子(「TECK」)、胸腺基質淋巴生成素(「TSLP 4- IBB」)、CD 166抗原(「ALCAM」)、分化叢集80 (「B7-1」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員17 (「BCMA」)、分化叢集14 (「CD14」)、分化叢集30 (「CD30」)、分化叢集40 (「CD40配位體」)、癌胚抗原相關細胞黏附分子1 (膽糖蛋白) (「CEACAM-1」)、死亡受體6 (「DR6」)、去氧胸苷激酶(「Dtk」)、1型膜糖蛋白(「內皮因子」)、受體酪胺酸-蛋白激酶erbB-3 (「ErbB3」)、內皮細胞-白細胞黏附分子1 (「E-選擇蛋白」)、細胞凋亡抗原1 (「Fas」)、Fms樣酪胺酸激酶3 (「Flt-3L」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員1 (「GITR」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員14 (「HVEM」)、細胞間黏附分子3 (「ICAM-3」)、IL-1 R4、IL-1 RI、 IL-10 Rβ、IL-17R、IL-2Rγ、IL-21R、溶酶體膜蛋白2 (「LIMPII」)、嗜中性白血球明膠酶相關脂質運載蛋白(「脂質運載蛋白-2」)、CD62L (「L-選擇素」)、淋巴內皮(「LYVE-1」)、MHC I類多肽相關序列A (「MICA」)、MHC I類多肽相關序列B (「MICB」)、NRGl-βl、β型血小板源生長因子受體(「PDGF Rβ」)、血小板內皮細胞黏附分子(「PECAM-1」)、RAGE、A型肝炎病毒細胞受體1 (「TIM-1」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員IOC (「TRAIL R3」)、Trappin蛋白轉麩醯胺酸酶結合域(「Trappin-2」)、尿激酶受體(「uPAR」)、血管細胞黏附蛋白1 (「VCAM-1」)、XEDARActivin A、Agouti相關蛋白(「AgRP」)、核糖核酸酶5 (「血管生成素」)、血管生成素1、血管生長抑素、Catheprin S、CD40、隱性家族蛋白IB (「Cripto-1」)、DAN、Dickkopf相關蛋白1 (「DKK-1」)、E-鈣黏素、上皮細胞黏附分子(「EpCAM」)、Fas配體(FasL或CD95L)、Fcg RIIB/C、FoUistatin、半乳糖凝集素-7、細胞間黏附分子2 (「ICAM-2」)、IL-13 Rl、IL-13R2、 IL-17B、IL-2 Ra、IL-2 Rb、IL-23、LAP、神經元細胞黏附分子(「NrCAM」)、纖維蛋白溶酶原活化因子抑制劑-1 (「PAI-1」)、血小板衍生生長因子受體(「PDGF-AB」)、抵抗素、基質細胞衍生因子1 (「SDF-1β」)、sgpl30、分泌性捲曲相關蛋白2 (「ShhN」)、唾液酸結合免疫球蛋白型凝集素(「Siglec-5」)、ST2、轉型生長因子-β 2 (「TGF β 2」)、Tie-2、血小板生成素(「TPO」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員10D (「TRAIL R4」)、骨髓細胞上表現之觸發受體1 (「TREM-1」)、血管內皮生長因子C (「VEGF-C」)、VEGFRlA脂聯素、脂肪酶(「AND」)、α-胎蛋白(「AFP」)、血管生成素樣4 (「ANGPTL4」)、β-2-微球蛋白(「B2M」)、基細胞黏附分子(「BCAM」)、碳水化合物抗原125 (「CA125」)、癌症抗原15-3 (「CA15-3」)、癌胚抗原(「CEA」)、cAMP受體蛋白(「CRP」)、人類表皮生長因子受體2 (「ErbB2」)、卵泡抑素、促卵泡激素(「FSH」)、趨化因子(C-X-C基元)配位體1 (「GRO α」)、人絨毛膜促性腺激素(「β HCG」)、胰島素樣生長因子1受體(「IGF-1 sR」)、IL-1 sRII、IL-3、IL-18 Rb、IL-21、瘦素、基質金屬蛋白酶-1 (「MMP-1」)、基質金屬蛋白酶-2 (「MMP-2」)、基質金屬蛋白酶-3 (「MMP-3」)、基質金屬蛋白酶-8 (「MMP-8」)、基質金屬蛋白酶-9 (「MMP-9)、基質金屬蛋白酶-10 (「MMP-10」)、基質金屬蛋白酶-13 (「MMP-13」)、神經細胞黏附分子(「NCAM-1」)、巢蛋白(「Nidogen-1」)、神經元特異性烯醇酶(「NSE」)、抑瘤素M (「OSM」)、降鈣素原、催乳素、前列腺特異性抗原(「PSA」)、唾液酸結合Ig樣凝集素9 (「Siglec-9」)、ADAM 17內肽酶(「TACE」)、甲狀球蛋白、金屬蛋白酶抑制劑4 (「TIMP-4」)、TSH2B4、解整合素及含金屬蛋白酶域之蛋白9 (「ADAM-9」)、血管生成素2、腫瘤壞死因子配位體超家族成員13/酸性富白胺酸細胞核磷蛋白32家族成員B (「APRIL」)、骨形態生成蛋白2 (「BMP-2」)、骨形態生成蛋白9 (「BMP-9」)、互補組分5a (「C5a」)、組織蛋白酶L、CD200、CD97、趨化素、腫瘤壞死因子受體超家族成員6B (「DcR3」)、脂肪酸結合蛋白2 (「FABP2」)、纖維母細胞活化蛋白α (「FAP」)、纖維母細胞生長因子19 (「FGF-19」)、半乳糖凝集素-3、肝細胞生長因子受體(「HGF R」)、IFN-γα/β R2、胰島素樣生長因子2 (「IGF-2」)、胰島素樣生長因子2受體(「IGF-2 R」)、 介白素-1受體6 (「IL-1R6」)、介白素24 (「IL-24」)、介白素33 (「IL-33」)、激肽釋放素14、天冬醯胺醯基內肽酶(「豆莢蛋白」)、經氧化低密度脂蛋白受體1 (「LOX-1」)、甘露糖結合凝集素(「MBL」)、腦啡肽酶(「NEP」)、易位相關(果蠅)之Notch同源物1 (「Notch-1」)、腎母細胞瘤過度表現(「NOV」)、骨活素、計劃性細胞死亡蛋白1 (「PD-1」)、N-乙醯胞壁醯-L-丙胺酸醯胺酶(「PGRP-5」)、絲胺酸蛋白酶抑因子A4、分泌性捲曲相關蛋白3 (「sFRP-3」)、凝血調節蛋白、鐸樣受體2 (「TLR2」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員10A (「TRAIL Rl」)、轉鐵蛋白(「TRF」)、WIF-lACE-2、白蛋白、AMICA、血管生成素4、B細胞活化因子(「BAFF」)、碳水化合物抗原19-9 (「CA19-9」)、CD 163、叢生蛋白(Clusterin)、CRT AM、趨化因子(C-X-C基元)配體14 (「CXCL14」)、胱抑素C、核心蛋白聚糖(「DCN」)、Dickkopf相關蛋白3 (「Dkk-3」)、δ樣蛋白1 (「DLL1」)、胎球蛋白A、肝素結合生長因子1 (「aFGF」)、葉酸受體α (「FOLR1」)、弗林蛋白酶(Furin)、GPCR相關分選蛋白1 (「GASP-1」)、GPCR相關分選蛋白2 (「GASP-2」)、顆粒球群落刺激因子受體(「GCSF R」)、絲胺酸蛋白酶第二型穿膜絲胺酸蛋白酶(「HAI-2」)、介白素-17B受體(「IL-17B R」)、介白素27 (「IL-27」)、淋巴球活化基因3 (「LAG-3」)、脂蛋白元A-V(「LDL R」)、胃蛋白酶原I、視黃醇結合蛋白4 (「RBP4」)、SOST、硫酸乙醯肝素蛋白聚糖(「多配體蛋白聚糖-1」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員13B (「TACI」)、組織因子路徑抑制劑(「TFPI」)、TSP-1、腫瘤壞死因子受體超家族成員10b (「TRAIL R2」)、TRANCE、肌鈣蛋白I、尿激酶纖維蛋白溶酶原活化物(「uPA」)、鈣黏素5、2型或VE鈣黏素(血管內皮) (亦稱為CD144 (「VE-鈣黏素」))、WNTl誘導性信號傳導路徑蛋白1 (「WISP-1」)及核因子κB之受體活化物(「RANK」)。
在一些實施例中，癌症治療劑為抗癌化合物。例示性抗癌化合物包括(但不限於)：阿侖單抗(Alemtuzumab) (Campath®)、亞利崔托寧(Alitretinoin) (Panretin®)、阿那曲唑(Anastrozole) (Arimidex®)、貝伐單抗(Bevacizumab) (Avastin®)、貝瑟羅汀(Bexarotene) (Targretin®)、硼替佐米(Bortezomib) (Velcade®)、伯舒替尼(Bosutinib) (Bosulif®)、貝倫妥單抗維多汀(Brentuximab vedotin) (Adcetris®)、卡博替尼(Cabozantinib) (Cometriq™)、卡非佐米(Carfilzomib) (Kyprolis™)、西妥昔單抗(Cetuximab) (Erbitux®)、克唑替尼(Crizotinib) (Xalkori®)、達沙替尼(Dasatinib) (Sprycel®)、地尼介白素迪夫托斯(Denileukin diftitox) (Ontak®)、鹽酸埃羅替尼(Erlotinib hydrochloride) (Tarceva®)、依維莫司(Everolimus) (Afinitor®)、依西美坦(Exemestane) (Aromasin®)、氟維司群(Fulvestrant) (Faslodex®)、吉非替尼(Gefitinib) (Iressa®)、替坦替伊莫單抗(Ibritumomab tiuxetan) (Zevalin®)、甲磺酸伊馬替尼(Imatinib mesylate) (Gleevec®)、伊匹單抗(Yervoy™)、二甲苯磺酸拉帕替尼(Lapatinib ditosylate) (Tykerb®)、來曲唑(Letrozole) (Femara®)、尼羅替尼(Nilotinib) (Tasigna®)、奧伐木單抗(Ofatumumab) (Arzerra®)、帕尼單抗(Panitumumab) (Vectibix®)、鹽酸帕唑帕尼(Pazopanib hydrochloride) (Votrient®)、帕妥珠單抗(Pertuzumab) (Perjeta™)、普拉曲沙(Pralatrexate) (Folotyn®)、瑞戈非尼(Regorafenib) (Stivarga®)、利妥昔單抗(Rituximab) (Rituxan®)、羅米地辛(Romidepsin) (Istodax®)、甲苯磺酸索拉非尼(Sorafenib tosylate) (Nexavar®)、蘋果酸舒尼替尼(Sunitinib malate) (Sutent®)、他莫昔芬(Tamoxifen) 、替西羅莫司(Temsirolimus) (Torisel®)、托瑞米芬(Toremifene) (Fareston®)、托西莫單抗(Tositumomab)及131I-托西莫單抗(Bexxar®)、曲妥珠單抗(Trastuzumab) (Herceptin®)、維甲酸(Tretinoin) (Vesanoid®)、凡德他尼(Vandetanib) (Caprelsa®)、維羅非尼(Vemurafenib) (Zelboraf®)、伏立諾他(Vorinostat) (Zolinza®)及Ziv-阿柏西普(Ziv-aflibercept) (Zaltrap®)。
調整調節基因表現之蛋白質之功能及其他細胞功能的例示性抗癌化合物(例如HDAC抑制劑、類視黃素受體配位體)為伏立諾他(Zolinza®)、貝瑟羅汀(Targretin®)及羅米地辛(Istodax®)、亞利崔托寧(Panretin®)及維甲酸(Vesanoid®)。
誘導細胞凋亡之例示性抗癌化合物(例如蛋白酶體抑制劑、抗葉酸劑)為硼替佐米(Velcade®)、卡非佐米(Kyprolis™)及普拉曲沙(Folotyn®)。
增加抗腫瘤免疫反應之例示性抗癌化合物(例如抗CD20、抗CD52；抗細胞毒性T淋巴球相關抗原-4)為利妥昔單抗(Rituxan®)、阿侖單抗(Campath®)、奧伐木單抗(Arzerra®)及伊匹單抗(Yervoy™)。
將毒性劑遞送至癌細胞之例示性抗癌化合物(例如抗CD20放射性核種融合物；IL-2白喉毒素融合物；抗CD30單甲基阿瑞他汀E (MMAE)融合物)為托西莫單抗及131I-托西莫單抗(Bexxar®)及替伊莫單抗(Zevalin®)、地尼介白素迪夫托斯(Ontak®)及貝倫妥單抗維多汀(Adcetris®)。
其他例示性抗癌化合物為小分子抑制劑及其結合物，例如兩面激酶(Janus kinase)、ALK、Bcl-2、PARP、PI3K、VEGF受體、Braf、MEK、CDK及HSP90。
例示性鉑基抗癌化合物包括例如順鉑、卡鉑、奧沙利鉑、賽特鉑、吡鉑、奈達鉑、特瑞鉑及利普鉑。適用於治療之其他金屬基藥物包括(但不限於)釕基化合物、二茂鐵衍生物、鈦基化合物及鎵基化合物。
在一些實施例中，癌症治療為包含放射性核種之放射性部分。例示性放射性核種包括(但不限於)Cr-51、Cs-131、Ce-134、Se-75、Ru-97、I-125、Eu-149、Os-189m、Sb-119、I-123、Ho-161、Sb-117、Ce-139、In-111、Rh-103m、Ga-67、Tl-201、Pd-103、Au-195、Hg-197、Sr-87m、Pt-191、P-33、Er-169、Ru-103、Yb-169、Au-199、Sn-121、Tm-167、Yb-175、In-113m、Sn-113、Lu-177、Rh-105、Sn-117m、Cu-67、Sc-47、Pt-195m、Ce-141、I-131、Tb-161、As-77、Pt-197、Sm-153、Gd-159、Tm-173、Pr-143、Au-198、Tm-170、Re-186、Ag-111、Pd-109、Ga-73、Dy-165、Pm-149、Sn-123、Sr-89、Ho-166、P-32、Re-188、Pr-142、Ir-194、In-114m/In-114及Y-90。
在一些實施例中，癌症治療為抗生素。舉例而言，若根據本文所提供之方法偵測到癌症相關細菌之存在及/或癌症相關微生物群落分佈，則可投與抗生素以自個體消除癌症相關細菌。「抗生素」廣義上係指能夠抑制或預防細菌性感染之化合物。抗生素可以多種方式分類，包括其針對特異性感染之用途、其作用機制、其生物可用性或其靶微生物譜(例如革蘭氏陰性細菌對革蘭氏陽性細菌、好氧性細菌對厭氧性細菌等)，且此等抗生素可用於在宿主之特定區域(「生態棲位」)中殺滅特異性細菌(Leekha等人 2011. General Principles of Antimicrobial Therapy. Mayo Clin Proc. 86(2): 156-167)。在某些實施例中，抗生素可用於選擇性地靶向特定生態棲位之細菌。在一些實施例中，已知治療特定感染(包括癌症生態棲位)之抗生素可用於靶向癌症相關微生物，包括該生態棲位之癌症相關細菌。在其他實施例中，在細菌治療之後，投與抗生素。在一些實施例中，在細菌治療之後，投與抗生素以移除移植。免疫病症
在一些實施例中，本文所述之方法及組合物係關於治療或預防與病理性免疫反應相關之疾病或病症，諸如自體免疫疾病、過敏反應及/或發炎疾病。在一些實施例中，疾病或病症為發炎性腸病(例如克羅恩氏病或潰瘍性結腸炎)。在一些實施例中，本文所述之方法及組合物係關於治療或預防遲發型過敏、自體免疫心肌炎、肉芽腫、周邊神經病、橋本氏甲狀腺炎、結腸發炎、結腸炎、顯微性結腸炎、膠原性結腸炎、轉流性結腸炎、化學性結腸炎、缺血性結腸炎、未定型結腸炎、非常型結腸炎。
本文所述之方法可用於治療任何有需要之個體。如本文所用，「有需要之個體
」包括患有與病理性免疫反應相關之疾病或病症(例如發炎性腸病)的任何個體，以及具有增加的罹患此類疾病或病症之可能性的任何個體。
本文所述之組合物可用作例如用於預防或治療以下(部分或完全降低以下之不利影響)的醫藥組合物：自體免疫疾病，諸如慢性發炎性腸病、全身性紅斑狼瘡、牛皮癬、穆-韋二氏症候群(muckle-wells syndrome)、類風濕性關節炎、多發性硬化或橋本氏病(Hashimoto's disease)；過敏性疾病，諸如食物過敏、花粉症或哮喘；感染性疾病，諸如艱難梭菌感染；發炎疾病，諸如TNF介導之發炎疾病(例如，胃腸道之發炎疾病，諸如結腸袋炎(pouchitis)；心血管發炎性病狀，諸如動脈粥樣硬化；或發炎肺病，諸如慢性阻塞性肺病)；用作用於遏制器官移植或可能發生組織排斥之其他情況中的排斥的醫藥組合物；用於改善免疫功能之補充劑、食物或飲料；或用於遏制免疫細胞增殖或功能之試劑。
在一些實施例中，本文所提供之方法適用於治療發炎。在某些實施例中，身體之任何組織及器官之發炎，包括肌肉骨胳發炎、血管發炎、神經發炎、消化系統發炎、眼部發炎、生殖系統發炎及其他發炎，如下文所論述。
肌肉骨胳系統之免疫病症包括(但不限於)影響骨骼關節，包括手部、手腕、肘部、肩部、頜、脊椎、頸部、髖部、膝蓋、踝部及足部之關節之病狀，及影響連接肌肉與骨骼之組織，諸如肌腱的病狀。可用本文所述之方法及組合物治療的此類免疫病症之實例包括(但不限於)關節炎(包括例如骨關節炎、類風濕性關節炎、牛皮癬性關節炎、僵直性脊椎炎、急性及慢性感染性關節炎、與痛風及假性痛風相關之關節炎及幼年特發性關節炎)、肌腱炎、滑膜炎、腱鞘炎、滑囊炎、纖維組織炎(肌肉纖維疼痛)、上髁炎、肌炎及骨炎(包括例如佩吉特氏病(Paget's disease)、恥骨炎及囊性纖維性骨炎)。
眼部免疫病症係指影響眼部之任何結構，包括眼瞼之免疫病症。可用本文所述之方法及組合物治療的眼部免疫病症之實例包括(但不限於)瞼炎、眼瞼鬆弛、結膜炎、淚腺炎、角膜炎、乾燥性角膜結膜炎(乾眼)、鞏膜炎、倒睫及葡萄膜炎。
可用本文所述之方法及組合物治療的神經系統免疫病症之實例包括(但不限於)腦炎、格-巴二氏症候群(Guillain-Barre syndrome)、腦膜炎、神經肌僵直、發作性睡病、多發性硬化、脊髓炎及精神分裂症。可用本文所述之方法及組合物治療的血管結構或淋巴系統之發炎之實例包括(但不限於)關節硬化、關節炎、靜脈炎、血管炎及淋巴管炎。
可用本文所述之方法及組合物治療的神經系統免疫病症之實例包括(但不限於)腦炎、格-巴二氏症候群(Guillain-Barre syndrome)、腦膜炎、神經肌僵直、發作性睡病、多發性硬化、脊髓炎及精神分裂症。可用本文所述之方法及組合物治療的血管結構或淋巴系統之發炎之實例包括(但不限於)關節硬化、關節炎、靜脈炎、血管炎及淋巴管炎。
可用本文所述之方法及組合物治療的消化系統免疫病症之實例包括(但不限於)膽管炎、膽囊炎、腸炎、小腸結腸炎、胃炎、胃腸炎、發炎性腸病、迴腸炎及直腸炎。發炎性腸病包括例如一組相關病狀之某些此項技術中公認的形式。已知發炎性腸病之若干嚴重形式，其中克羅恩氏病(局部性腸病，例如非活性及活性形式)及潰瘍性結腸炎(例如非活性及活性形式)為此等病症中最常見的。此外，發炎性腸病涵蓋大腸急躁症、顯微性結腸炎、淋巴球性-漿細胞腸炎、腹腔病、膠原性結腸炎、淋巴球性結腸炎及嗜酸性小腸結腸炎。IBD之其他較不常見形式包括未定型結腸炎、偽膜性結腸炎(壞死性結腸炎)、缺血性發炎性腸病、白塞氏病(Behcet's disease)、類肉瘤病、硬皮病、IBD相關發育不良、發育不良相關腫塊或病變及原發性硬化性膽管炎。
可用本文所述之方法及組合物治療的生殖系統免疫病症之實例包括(但不限於)子宮頸炎、絨膜羊膜炎、子宮內膜炎、附睪炎、臍帶炎、卵巢炎、睪丸炎、輸卵管炎、輸卵管卵巢膿腫、尿道炎、陰道炎、外陰炎及外陰疼痛。
本文所述之方法及組合物可用於治療具有發炎組分之自體免疫病狀。此類病狀包括(但不限於)急性散播性一般禿頭症、白塞氏病、卻格司氏病(Chagas' disease)、慢性疲勞症候群、自主神經障礙、腦脊髓炎、僵直性脊椎炎、再生不全性貧血、化膿性汗腺炎、自體免疫肝炎、自體免疫卵巢炎、乳糜瀉、克羅恩氏病、第1型糖尿病、巨大細胞動脈炎、古巴士德氏症候群(goodpasture's syndrome)、格雷氏病(Grave's disease)、格-巴二氏症候群、橋本氏病、亨偌-絲奇恩賴紫瘢(Henoch-Schonlein purpura)、川崎氏病(Kawasaki's disease)、紅斑狼瘡、顯微性結腸炎、顯微性多動脈炎、混合性結締組織病、穆-韋二氏症候群(Muckle-Wells syndrome)、多發性硬化、重症肌無力、斜視眼陣攣肌陣攣症候群、視神經炎、奧德氏甲狀腺炎(ord's thyroiditis)、天疱瘡、結節性多動脈炎、多肌痛、類風濕性關節炎、萊特爾氏症候群(Reiter's syndrome)、休格連氏症候群(Sjogren's syndrome)、顳動脈炎、韋格納氏肉芽腫病(Wegener's granulomatosis)、溫式自體免疫溶血性貧血、間質性膀胱炎、萊姆病(Lyme disease)、硬斑病、牛皮癬、類肉瘤病、硬皮病、潰瘍性結腸炎及白斑病。
本文所述之方法及組合物可用於治療具有發炎組分之T細胞介導之過敏性疾病。此類病狀包括(但不限於)接觸性過敏、接觸性皮膚炎(包括由於野葛(poison ivy)所致)、蕁麻疹、皮膚過敏、呼吸道過敏(花粉熱、過敏性鼻炎、室內塵蟎過敏)及麩質敏感性腸病(乳糜瀉)。
可用本文所述之方法及組合物治療的其他免疫病症包括例如：闌尾炎、皮膚炎、皮肌炎、心內膜炎、纖維組織炎、齒齦炎、舌炎、肝炎、化膿性汗腺炎、虹膜炎、喉炎、乳房炎、心肌炎、腎炎、耳炎、胰臟炎、腮腺炎、心包炎、腹膜炎、咽炎、胸膜炎、局部肺炎、前列腺炎、腎盂腎炎及口炎、移植排斥(涉及器官，諸如腎臟、肝臟、心臟、肺、胰臟(例如胰島細胞)、骨髓、角膜、小腸、皮膚同種異體移植物、皮膚同種移植物及心瓣膜異種移植物；血清病及移植物抗宿主疾病)、急性胰臟炎、慢性胰臟炎、急性呼吸窘迫症候群、塞紮萊症候群(Sexary's syndrome)、先天性腎上腺增生、非化膿性甲狀腺炎、高鈣血症相關癌症、天疱瘡、大皰性疱疹樣皮膚炎、嚴重多形性紅斑、剝脫性皮膚炎、皮脂溢性皮膚炎、季節性或常年性過敏性鼻炎、支氣管哮喘、接觸性皮膚炎、異位性皮膚炎、藥物超敏反應、過敏性結膜炎、角膜炎、眼帶狀疱疹、虹膜炎及虹膜睫狀體炎、脈絡膜視網膜炎、視神經炎、症狀性類肉瘤病、暴發性或散播性肺結核化學療法、成人特發性血小板減少性紫瘢、成人繼發性血小板減少、後天性(自體免疫)溶血性貧血、成人白血病及淋巴瘤、兒童急性白血病、局部性腸炎、自體免疫血管炎、多發性硬化、慢性阻塞性肺病、實體器官移植排斥、敗血症。較佳治療包括移植排斥、類風濕性關節炎、牛皮癬性關節炎、多發性硬化、第1型糖尿病、哮喘、發炎性腸病、全身性紅斑狼瘡、牛皮癬、慢性阻塞性肺病及伴有感染性病狀(例如敗血症)之發炎的治療。
本文中所述之方法及組合物可用於治療代謝疾病、病症及症候群。此類病狀包括(但不限於)II型糖尿病、腦病、泰-薩克斯病(Tay-Sachs disease)、克拉培氏病(Krabbe disease)、半乳糖血症、苯酮尿症(PKU)及楓糖漿尿病。
本文所述之方法及組合物可用於治療神經退化性及神經疾病。此類病狀包括(但不限於)帕金森病、阿茲海默氏病、朊病毒病、亨廷頓氏病(Huntington's disease)、運動神經元疾病(MND)、脊髓小腦失調、脊髓性肌萎縮、肌張力障礙、特發性顱內高血壓、癲癇症、神經系統疾病、中樞神經系統疾病、運動障礙、多發性硬化、腦病、周邊神經病及術後認知功能障礙。
癌症
癌症
在一些實施例中，本文所述之方法及組合物係關於癌症之治療。在一些實施例中，可使用本文所述之方法治療任何癌症。可由本文所述之方法及組合物治療的癌症之實例包括(但不限於)來自以下之癌細胞：膀胱、血液、骨、骨髓、腦、乳房、結腸、食道、胃腸、齒齦、頭、腎臟、肝臟、肺、鼻咽、頸、卵巢、前列腺、皮膚、胃、睪丸、舌或子宮。此外，癌症可特定具有以下組織學類型、但其不限於此等：惡性贅瘤；癌瘤；未分化癌瘤；巨大及梭狀細胞癌；小細胞癌；乳頭狀癌；鱗狀細胞癌；淋巴上皮癌瘤；基底細胞癌；毛母質癌；移行細胞癌；乳頭狀移行細胞癌；腺癌；惡性胃泌素瘤；膽管上皮癌；肝細胞癌；組合之肝細胞癌及膽管上皮癌；小樑腺癌；腺樣囊性癌；腺瘤息肉中之腺癌；家族性息肉病大腸桿菌腺癌；實體癌瘤；惡性類癌瘤；細支氣管肺泡腺癌；乳頭狀腺癌；嫌色細胞癌；嗜酸性癌；嗜氧性腺癌；嗜鹼性球癌；透明細胞腺癌；粒狀細胞癌；濾泡性腺癌；乳頭狀及濾泡性腺癌；無包膜硬化性癌瘤；腎上腺皮質癌；子宮內膜樣癌；皮膚附屬器癌；頂泌腺癌；皮脂腺癌；耵聹腺癌；黏液表皮樣癌瘤；囊腺癌；乳頭狀囊腺癌；乳頭狀漿液性囊腺癌；黏液性囊腺癌；黏液性腺癌；戒環細胞癌；浸潤導管癌；髓性癌；小葉癌；發炎癌瘤；乳腺佩吉特氏病；腺泡細胞癌瘤；腺鱗癌瘤；含鱗狀化生腺癌；惡性胸腺瘤；惡性卵巢基質腫瘤；惡性泡膜細胞瘤；惡性粒層細胞腫瘤；及惡性母細胞瘤；塞特利氏細胞癌(sertoli cell carcinoma)；惡性雷迪格細胞腫瘤(leydig cell tumor)；惡性脂質細胞腫瘤；惡性副神經節瘤；惡性乳腺外副神經節瘤；嗜鉻細胞瘤；血管球肉瘤；惡性黑素瘤；無黑色素性黑素瘤；淺表擴散性黑素瘤；巨大色素痣內惡性黑素瘤；上皮狀細胞黑素瘤；惡性藍痣；肉瘤；纖維肉瘤；惡性纖維性組織細胞瘤；黏液肉瘤；脂肪肉瘤；平滑肌肉瘤；橫紋肌肉瘤；胚胎性橫紋肌肉瘤；肺泡橫紋肌肉瘤；基質肉瘤；惡性混合腫瘤；苗勒氏管混合腫瘤(mullerian mixed tumor)；腎母細胞瘤；肝胚細胞瘤；癌肉瘤；惡性間質瘤；惡性布倫納氏瘤(brenner tumor)；惡性葉狀腫瘤；滑膜肉瘤；惡性間皮瘤；無性細胞瘤；胚胎性瘤；惡性畸胎瘤；惡性甲狀腺腫樣卵巢瘤；絨膜癌；惡性中腎瘤；血管肉瘤；惡性血管內皮瘤；卡堡氏肉瘤；惡性血管外皮瘤；淋巴管肉瘤；骨肉瘤；皮質旁骨肉瘤；軟骨肉瘤；惡性軟骨母細胞瘤；間充質軟骨肉瘤；骨巨細胞瘤；尤文氏肉瘤；惡性牙源性腫瘤；成釉細胞牙肉瘤；惡性成釉細胞瘤；成釉細胞纖維肉瘤；惡性松果體瘤；脊索瘤；惡性神經膠質瘤；室管膜瘤；星形細胞瘤；原生質星形細胞瘤；肌原纖維性星形細胞瘤；星形母細胞瘤；神經膠母細胞瘤；少突神經膠質瘤；成少突神經膠質細胞瘤；原始神經外胚層；小腦肉瘤；成神經節細胞瘤；神經母細胞瘤；視網膜母細胞瘤；嗅覺神經性腫瘤；惡性腦膜瘤；神經纖維肉瘤；惡性神經鞘瘤；惡性粒狀細胞腫瘤；惡性淋巴瘤；霍奇金氏病；霍奇金氏淋巴瘤；類肉芽腫；小淋巴球性惡性淋巴瘤；彌漫性大細胞惡性淋巴瘤；濾泡性惡性淋巴瘤；蕈樣黴菌病；其他特定非霍奇金氏淋巴瘤；惡性組織細胞增多病；多發性骨髓瘤；肥大細胞肉瘤；免疫增殖性小腸疾病；白血病；淋巴白血病；漿細胞白血病；紅白血病；淋巴肉瘤細胞白血病；骨髓性白血病；嗜鹼性白血病；嗜酸性白血病；單核細胞性白血病；肥大細胞白血病；巨核母細胞白血病；骨髓肉瘤；漿細胞瘤、結腸直腸癌、直腸癌、及毛細胞白血病。
在一些實施例中，本文所提供之方法及組合物係關於白血病之治療。術語「白血病」廣義上意謂造血器官/系統之進行性惡性疾病，且一般特徵為血液及骨髓中之白血球及其前驅體之畸變增殖及發展。白血病疾病之非限制性實例包括：急性非淋巴球性白血病、慢性淋巴球性白血病、急性顆粒球性白血病、慢性顆粒球性白血病、急性前髓細胞性白血病、成人T細胞白血病、白血球缺乏性白血病、白血球性白血病、嗜鹼性白血病、母細胞性白血病、牛白血病、慢性骨髓細胞性白血病、皮膚白血病、胚胎性白血病、嗜酸性白血病、格羅斯白血病(Gross' leukemia)、里德爾細胞白血病(Rieder cell leukemia)、希林氏白血病(Schilling's leukemia)、幹細胞性白血病、亞白血性白血病、未分化細胞白血病、毛細胞白血病、血母細胞性白血病(hemoblastic leukemia)、成血細胞性白血病(hemocytoblastic leukemia)、組織細胞白血病、急性單核球性白血病、白血球減少性白血病、淋巴性白血病、淋巴母細胞白血病、淋巴球性白血病、淋巴生成白血病、淋巴細胞性白血病、淋巴肉瘤細胞白血病、肥大細胞白血病、巨核細胞白血病、小骨髓母細胞性白血病、單核球性白血病、骨髓母細胞性白血病、骨髓細胞性白血病、骨髓顆粒球性白血病、骨髓單核球性白血病、內格利白血病(Naegeli leukemia)、漿細胞白血病、漿球性白血病及前髓細胞性白血病。
在一些實施例中，本文所提供之方法及組合物係關於癌瘤之治療。術語「癌瘤」係指由上皮細胞構成之惡性生長，傾向於浸潤周圍組織及/或抵抗生理學及非生理學細胞死亡信號且引起癌轉移。癌瘤之非限制性例示性類型包括：腺泡癌、腺泡狀癌瘤、腺囊癌、腺樣囊性癌症、腺瘤癌、腎上腺皮質癌、肺泡癌、肺泡細胞癌、基底細胞癌、基底樣細胞癌、基底樣癌瘤、基底鱗狀細胞癌、細支氣管肺泡癌、細支氣管癌、支氣管癌、腦癌、膽管細胞癌、絨毛膜癌、膠樣癌、粉刺癌、子宮體癌、篩骨狀癌、鎧甲狀癌、皮狀癌、柱狀癌、柱狀細胞癌、導管癌、硬癌、胚胎性瘤、腦狀癌瘤、表皮樣癌、腺狀上皮癌、外生性癌、潰瘍性癌、纖維癌、膠體癌、膠狀癌、巨細胞癌、印戒細胞癌、單純癌、小細胞癌、馬鈴薯狀癌、球狀細胞癌、梭細胞癌、髓狀癌、鱗狀癌、鱗狀細胞癌、繩捆癌、毛細管擴張癌(carcinoma telangiectaticum)、血管擴張性癌(carcinoma telangiectodes)、移行細胞癌、塊狀癌、結節性癌、疣狀癌、絨毛狀癌、巨細胞癌、腺癌、粒層細胞癌、毛髮基質癌、血樣癌、肝細胞癌、何氏細胞癌(Hurthle cell carcinoma)、透明細胞癌、腎上腺樣癌、嬰兒胚胎性瘤、原位癌、表皮內癌瘤、上皮內癌瘤、侵蝕性潰瘍(Krompecher's carcinoma)、庫爾契茨基細胞癌(Kulchitzky-cell carcinoma)、大細胞癌、豆狀癌(lenticular carcinoma)、豆狀癌瘤(carcinoma lenticulare)、脂肪瘤樣癌、淋巴上皮癌、髓樣癌(carcinoma medullare)、髓性癌、黑色素癌、髓樣癌(carcinoma molle)、黏液性癌、黏液癌、黏液細胞癌、黏液表皮樣癌、黏膜癌、黏液癌瘤、黏液瘤樣癌、鼻咽癌、燕麥細胞癌、骨化性癌、骨樣癌、乳頭狀癌、門脈周性癌、原位癌(preinvasive carcinoma)、棘細胞癌、腦樣癌、腎臟之腎細胞癌、儲備細胞癌、肉瘤樣癌、施耐德癌(schneiderian carcinoma)、硬癌(scirrhous carcinoma)、梅克爾細胞癌(merkel cell carcinoma)、唾液腺癌及陰囊癌。
在一些實施例中，本文所提供之方法及組合物係關於肉瘤之治療。術語「肉瘤」一般係指由如胚胎結締組織之物質構成且一般由包埋於纖維狀異質或同質物質中的緊實細胞構成的腫瘤。肉瘤包括(但不限於)：軟骨肉瘤、纖維肉瘤、淋巴肉瘤、黑素肉瘤、黏液肉瘤、骨肉瘤、子宮內膜肉瘤、基質肉瘤、尤文氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、筋膜肉瘤、纖維母細胞肉瘤、巨細胞肉瘤、艾伯內西式肉瘤(Abemethy's sarcoma)、脂肉瘤、脂肪肉瘤、軟組織肺泡狀肉瘤、成釉細胞肉瘤、葡萄樣肉瘤、綠色瘤、絨膜癌、胚胎肉瘤、威耳姆士腫瘤(Wilms' tumor sarcoma)、顆粒球性肉瘤、霍奇金氏肉瘤(Hodgkin's sarcoma)、特發性多發性色素性出血性肉瘤、B細胞之免疫母細胞肉瘤、淋巴瘤、 T細胞之免疫母細胞肉瘤、詹恩遜氏肉瘤(Jensen's sarcoma)、卡堡氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、庫普弗細胞肉瘤(Kupffer cell sarcoma)、血管肉瘤、白血病性肉瘤、惡性間質瘤肉瘤、骨膜外肉瘤、網狀細胞肉瘤、勞斯肉瘤(Rous sarcoma)、漿液囊性肉瘤、滑膜肉瘤及毛細管擴張性肉瘤。
可使用本文所述之方法及組合物治療之額外例示性贅瘤包括：霍奇金氏疾病、非霍奇金氏淋巴瘤、多發性骨髓瘤、神經母細胞瘤、乳癌、卵巢癌、肺癌、橫紋肌肉瘤、原發性血小板增多症、原發性巨球蛋白血症、小細胞肺腫瘤、原發性腦瘤、胃癌、結腸癌、惡性胰島瘤、惡性類癌、癌前皮膚病變、睪丸癌、淋巴瘤、甲狀腺癌、神經母細胞瘤、食道癌、泌尿生殖道癌、惡性高鈣血症、子宮頸癌、子宮內膜癌、腎上腺皮質癌。
在一些實施例中，所治療癌症為黑素瘤。術語「黑素瘤」用於意謂由皮膚及其他器官之黑色素細胞系統產生之腫瘤。黑素瘤之非限制性實例為：哈帕二氏黑素瘤(Harding-Passey melanoma)、青少年黑素瘤、惡性雀斑樣痣黑素瘤、惡性黑素瘤、肢端雀斑黑素瘤、無黑色素性黑素瘤、良性青少年黑素瘤、克勞德曼黑素瘤(Cloudman's melanoma)、S91黑素瘤、結節性黑素瘤、陰囊黑素瘤及淺表擴散性黑素瘤。
可使用本文所述之方法及組合物治療的腫瘤之特定類別包括：淋巴增生病症、乳癌、卵巢癌、前列腺癌、子宮頸癌、子宮內膜癌、骨癌、肝癌、胃癌、結腸癌、胰臟癌、甲狀腺癌、頭頸癌、中樞神經系統癌、周邊神經系統癌、皮膚癌、腎癌以及所有以上之癌轉移。腫瘤之特定類型包括：肝細胞癌、肝瘤、肝母細胞瘤、橫紋肌肉瘤、食道癌、甲狀腺癌、神經節母細胞瘤、纖維肉瘤、黏液肉瘤、脂肪肉瘤、軟骨肉瘤、骨原性肉瘤、脊索瘤、血管肉瘤、內皮肉瘤、尤文氏腫瘤、平滑肌肉瘤、橫紋肌肉瘤、侵襲性乳腺管癌、乳頭狀腺癌、黑素瘤、肺鱗狀細胞癌、基底細胞癌、腺癌(高分化、中分化、低分化或未分化)、細支氣管肺泡癌、腎細胞癌、腎上腺樣瘤、腎上腺樣腺癌、膽管癌、絨膜癌、精細胞癌、胚胎性瘤、威耳姆士腫瘤、睪丸腫瘤、肺癌瘤(包括小細胞、非小細胞及大細胞肺癌瘤)、膀胱癌、神經膠質瘤、星形細胞瘤、神經管胚細胞瘤、顱咽管瘤、室管膜瘤、松果體瘤、視網膜母細胞瘤、神經母細胞瘤、結腸癌、直腸癌、造血性惡性病(包括所有類型之白血病及淋巴瘤，包括：急性骨髓性白血病、急性骨髓細胞性白血病、急性淋巴球性白血病、慢性骨髓性白血病、慢性淋巴球性白血病、肥大細胞白血病、多發性骨髓瘤、骨髓淋巴瘤、霍奇金氏淋巴瘤、非霍奇金氏淋巴瘤)。
在某些實施例中，所治療之癌症亦包括癌變前病變，例如光化性角化症(日光性角化症)、痣(發育異常痣)、光化性唇炎(農民唇(farmer's lip))、皮角(cutaneous horn)、巴雷斯特氏食道症(Barrett's esophagus)、萎縮性胃炎、先天性角化不良、缺鐵性吞咽困難、扁平苔癬、口腔黏膜下纖維化、光化性(日光性)彈性組織變性及頸椎發育不良。
在一些實施例中，所治療之癌症包括例如內胚層、外胚層或間葉細胞源之非癌性或良性腫瘤，包括(但不限於)膽管瘤、結腸息肉、腺瘤、乳頭瘤、囊腺瘤、肝細胞腺瘤、水囊狀胎塊、腎源性小管性腺瘤、鱗狀細胞乳頭瘤、胃息肉、血管瘤、骨瘤、軟骨瘤、脂肪瘤、纖維瘤、淋巴管瘤、平滑肌瘤、橫紋肌瘤、星形細胞瘤、斑痣、腦膜瘤及神經節細胞瘤。
實例
實例 1 ： 基於 KLH 之 遲發型超敏反應模型中的人類共生細菌之免疫調節
實例
實例 1 ： 基於 KLH 之 遲發型超敏反應模型中的人類共生細菌之免疫調節
遲發型過敏(DTH)為異位性皮膚炎(或過敏性接觸性皮膚炎)之動物模式，如Petersen等人綜述(In vivo pharmacological disease models for psoriasis and atopic dermatitis in drug discovery. Basic & Clinical Pharm & Toxicology. 2006. 99(2): 104-115；亦參見Irving C. Allen (編) Mouse Models of Innate Immunity: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, 2013. 第1031卷, DOI 10.1007/978-1-62703-481-4_13)。可在多種小鼠及大鼠菌株中使用不同半抗原或抗原，例如用佐劑乳化之抗原來誘導DTH。DTH的特徵在於致敏以及抗原特異性T細胞介導之反應，其引起紅斑、水腫及細胞浸潤，尤其抗原呈現細胞(APC)、嗜伊紅血球、活化CD4+ T細胞及細胞介素表現之Th2細胞之浸潤。
針對基於KLH之遲發型超敏反應模型製備測試調配物。遲發型過敏(DTH)模型提供活體內機制以研究細胞介導之免疫反應，及暴露於使小鼠致敏的特異性抗原之後的所引起之發炎。已使用DTH模型之若干變化形式且其為此項技術中所熟知(Irving C. Allen (編).Mouse Models of Innate Immunity: Methods and Protocols
, Methods in Molecular Biology. 第1031卷, DOI 10.1007/978-1-62703-481-4_13, Springer Science + Business Media, LLC 2013)。舉例而言，在免疫接種當天(第0天)新製備匙孔螺血氰蛋白(KLH)與完全弗氏佐劑(Complete Freund's Adjuvant；CFA)之乳液。為此目的，稱重8 mg KLH粉末且充分地再懸浮於16 mL生理鹽水中。藉由使用注射器及呂埃鎖定連接件(luer lock connector)將KLH/生理鹽水與等體積的CFA溶液混合(例如，10 mL KLH/生理鹽水+ 10 mL CFA溶液)來製備乳液。將KLH及CFA劇烈混合若干分鐘以形成白色乳液，以獲得最大穩定性。進行液滴測試以檢查是否獲得均勻乳液，繼續混合直至在水中保持可見完好液滴。
在第0天，用CFA中之KLH抗原藉由皮下免疫接種(4個部位，每個部位50 μL)對大約7週齡的C57Bl/6J雌性小鼠進行預致敏。
地塞米松，一種皮質類固醇，為已知的改善小鼠中之DTH反應的消炎劑且充當此模型中遏制發炎之陽性對照(Taube及Carlsten, Action of dexamethasone in the suppression of delayed-type hypersensitivity in reconstituted SCID mice. Inflamm Res. 2000. 49 (10): 548-52)。對於陽性對照組，藉由將6.8 mg地塞米松稀釋於400 μL 96%乙醇中來製備17 mg/mL地塞米松之儲備溶液。對於每日給藥，藉由在隔瓶中將儲備溶液以100×稀釋於無菌PBS中以獲得0.17 mg/mL之最終濃度來製備使用溶液以供腹膜內給藥。經地塞米松處理之小鼠腹膜內接受100 μL地塞米松(每公斤5 mL 0.17 mg/mL溶液)。冷凍蔗糖充當陰性對照(媒劑)。以呈1 × 10^10 CFU/ml的100 μl之細菌細胞每日口服投配布勞特氏菌株A。每日投配地塞米松(陽性對照)、媒劑(陰性對照)及布勞特氏菌株A。
在第8天，在右耳中用10 μg KLH之生理鹽水(呈10 μL之體積)溶液皮內(i.d.)攻擊小鼠，且在左耳中用對照攻擊小鼠。使用此項技術中已知的方法來量測發炎反應。在抗原攻擊之後48小時量測耳廓厚度(圖 1
)。如藉由耳部厚度所測定，與接受單獨媒劑之小鼠相比，布勞特氏菌株A在遏制發炎方面與地塞米松一樣有效。
可進一步使用不同時序及不同劑量來研究布勞特氏菌株A之功效。舉例而言，可在某一時間點，接近預致敏時間或接近DTH攻擊時間開始用含布勞特氏菌株A之細菌組合物進行處理。舉例而言，可與皮下注射(第0天)同時投與布勞特氏菌株A (每日每隻小鼠1 × 109
個CFU)，或可在皮內注射之前或之後投與其。以不同劑量且以限定時間間隔投與布勞特氏菌株A。舉例而言，用每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個細菌細胞之間的範圍的布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射液接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠可經由腹膜內(i.p.)注射、皮下(s.c.)注射、經鼻途徑投藥、經口管飼、表面投藥、皮內(i.d.)注射或其他投藥手段接受布勞特氏菌株A。一些小鼠可每日(例如，自第0天開始)接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。
舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射、皮內注射、表面投藥或經鼻途徑投藥。
一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用消炎劑(例如，抗CD154、TNF家族之成員之阻斷或其他處理)及/或合適對照(例如，媒劑或對照抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些經免疫接種之小鼠在不接受抗生素之情況下進行處理。
可藉由在CO2
/O2
麻醉下自眼血管叢進行放血，之後在第10天進行頸椎脫位術來處死研究動物。對於血清製備，在離心之前使血液樣本凝結。將血清轉移至乾淨試管中，各動物之血清轉移至單獨試管中。放血之後，將所有動物之雙耳(各耳於獨立小瓶中)、脾臟、腸系膜淋巴結(MLN)、整個小腸及結腸收集於冷凍小瓶中，速凍且儲存於＜ -70℃下。
可根據製造商之說明書使用解離酶來分離組織。使用此項技術中已知的技術，對細胞進行染色以藉由流動式細胞量測術進行分析。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。最後，對不同組織切片進行免疫組織化學以量測T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞及檢查點分子蛋白質表現。
實例 2 ： 測試物在調節 C57BL / 6 小鼠中之經 DSS 誘導之結腸炎方面的評估
實例 2 ： 測試物在調節 C57BL / 6 小鼠中之經 DSS 誘導之結腸炎方面的評估
葡聚糖硫酸鈉(DSS)誘導之結腸炎為已充分研究的結腸炎之動物模型，如Randhawa等人綜述(A review on chemical-induced inflammatory bowel disease models in rodents. Korean J Physiol Pharmacol. 2014. 18(4): 279-288；亦參見Chassaing等人 Dextran sulfate sodium (DSS)-induced colitis in mice. Curr Protoc Immunol. 2014年2月4日; 104: 單元15.25)。在此模型中，用DSS於飲用水中之溶液處理小鼠，引起腹瀉及體重減輕。
如此項技術中已知用DSS處理小鼠組以誘導結腸炎(Randhawa等人 2014; Chassaing等人 2014；亦參見Kim等人Investigating intestinal inflammation in DSS-induced model of IBD. J Vis Exp. 2012. 60: 3678)。舉例而言，藉由第0天至第5天暴露於經3% DSS處理之飲用水來誘導小鼠發生結腸炎。一個組未接受DSS且充當未經處理之對照。用蔗糖媒劑(陰性對照)、布勞特氏菌株A (每日每隻小鼠1 × 109
CFU)、布勞特氏菌株X (每日每隻小鼠1 × 109
CFU)或抗p40陽性對照(在第0天、第3天、第7天及第10天腹膜內投與)投配動物。每日對所有動物進行稱重。如藉由體重減輕之降低量所量測，布勞特氏菌株A 抗p40 (陽性對照)或布勞特氏菌株X更有效(圖 2
)。
在其他研究中，可在某一時間點，DSS投藥之第1天或其後某一時間開始用含布勞特氏菌株A之細菌組合物進行處理。舉例而言，可與開始DSS同時(第1天)投與布勞特氏菌株A，或可在第一次出現疾病體徵(例如，體重減輕或腹瀉)後或在嚴重結腸炎期期間投與布勞特氏菌株A。可針對重量、罹病率、存活期、腹瀉及/或血便之存在對小鼠進行每日觀測。
以不同劑量、不同時間間隔及/或不同給藥途徑投與布勞特氏菌株A。舉例而言，用每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個細菌細胞之間的劑量的布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠可經由腹膜內(i.p.)注射、皮下(s.c.)注射、經鼻途徑投藥、經口管飼或其他投藥手段接受布勞特氏菌株A。一些小鼠可每日(例如，自第1天開始)接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。
單獨或與完整細菌細胞組合，在伴隨或不伴隨加入其他消炎劑下測試含布勞特氏菌株A之細菌組合物在經DSS誘導之結腸炎的小鼠模型中之功效。
舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射或經鼻途徑投藥。
一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用額外消炎劑(例如，抗CD154、TNF家族之成員之阻斷或其他處理)及/或合適對照(例如，媒劑或對照抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些小鼠在預先不接受抗生素之情況下接受DSS。
在不同時間點，使用小型動物內窺鏡(德國Karl Storz Endoskipe)使小鼠在異氟醚麻醉下經歷視訊內窺鏡檢查。將記錄靜止影像及視訊以評估結腸炎程度及對處理之反應。將使用此項技術中已知的標準對結腸炎進行評分。將收集糞便物進行研究。
可使用此項技術中已知的方法移除胃腸道(GI)、淋巴結及/或其他組織以用於離體組織學、細胞介素及/或流動式細胞量測分析。舉例而言，收集組織且可根據製造商說明書使用解離酶分離組織。使用此項技術中已知的技術，對細胞進行染色以藉由流動式細胞量測術進行分析。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+胃腸道浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。最後，對不同組織切片進行免疫組織化學以量測T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞及檢查點分子蛋白質表現。
為了檢查疾病保護之影響及長久性，可用疾病觸發劑來再攻擊一些小鼠，而不是將其處死。再攻擊之後，將分析小鼠之結腸炎易感性、嚴重程度。
處死之後，可自所有動物收集結腸、小腸、脾臟及腸系膜淋巴結，且收集血液進行分析。
實例 3 ：小鼠實驗性自體免疫性腦脊髓炎 ( EAE ) 模型中之布勞特氏菌株 A
實例 3 ：小鼠實驗性自體免疫性腦脊髓炎 ( EAE ) 模型中之布勞特氏菌株 A
EAE為已充分研究的多發性硬化之動物模式，如Constantinescu等人綜述(Experimental autoimmune encephalomyelitis (EAE) as a model for multiple sclerosis (MS). Br J Pharmacol. 2011年10月; 164(4): 1079-1106)。可在多種小鼠及大鼠菌株中使用不同髓鞘相關肽，藉由活化引起腦炎之T細胞之授受性轉移或使用易患EAE之TCR轉殖基因小鼠來誘導EAE，如Mangalam等人(Two discreet subsets of CD8+ T cells modulate PLP91-110
induced experimental autoimmune encephalomyelitis in HLA-DR3 transgenic mice. J Autoimmun. 2012年6月; 38(4): 344-353)中所論述。
單獨或與完整細菌細胞組合，在伴隨或不伴隨加入其他消炎處理下測試含布勞特氏菌株A之細菌組合物在EAE之嚙齒動物模型中之功效。舉例而言，由Taconic (紐約州日耳曼敦)獲得雌性6至8週齡C57Bl/6小鼠。將在背部上的兩個部位處(上部及下部)向小鼠組投與兩個0.1 ml髓鞘少樹突神經膠細胞糖蛋白35-55 (MOG35-55；每個注射液100 μg；每隻小鼠200 μg (每隻小鼠總0.2 ml)，乳化於完全弗氏佐劑(CFA；每毫升乳液2至5 mg殺滅結核分支桿菌H37Ra)皮下(s.c.)注射液。在上述之後大約1至2小時，用於0.1 ml PBS中之200 ng百日咳毒素(PTx) (2 μg/ml)腹膜內(i.p.)注射小鼠。在第2天投與額外PTx之IP注射液。替代性地，將使用適量之替代髓鞘肽(例如，蛋白脂質蛋白(PLP))來誘導EAE。一些動物將充當未經處理之對照。將評定EAE嚴重程度且根據此項技術中已知的方法(Mangalam等人 2012)自第4天開始每日指配失能評分。
在某一時間點，接近免疫接種時間或EAE免疫接種之後開始用含布勞特氏菌株A之細菌組合物處理。舉例而言，可與免疫接種同時(第1天)投與含布勞特氏菌株A之細菌組合物，或可在第一次出現失能(例如，尾部疲軟)後或在嚴重EAE期間後投與含布勞特氏菌株A之細菌組合物。以不同劑量且以限定時間間隔投與含布勞特氏菌株A之細菌組合物。舉例而言，用有效劑量之布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。舉例而言，小鼠可接受在每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠可經由腹膜內(i.p.)注射、皮下(s.c.)注射、經鼻途徑投藥、經口管飼或其他投藥手段接受布勞特氏菌。一些小鼠可每日(例如，自第1天開始)接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。
舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射、皮下(s.c.)注射或經鼻途徑投藥。
一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用額外消炎劑或EAE治療劑(例如，抗CD154、TNF家族之成員之阻斷、維生素D或其他處理)及/或合適對照(例如，媒劑或對照抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些經免疫接種之小鼠在不接受抗生素之情況下進行處理。
在不同時間點，處死小鼠且可使用此項技術中已知的方法移除發炎部位(例如，腦及脊髓)、淋巴結或其他組織以用於離體組織學、細胞介素及/或流動式細胞量測分析。舉例而言，根據製造商之說明書使用解離酶來分離組織。使用此項技術中已知的技術，對細胞進行染色以藉由流動式細胞量測術進行分析。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+中樞神經系統(CNS)浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。最後，對不同組織切片進行免疫組織化學以量測T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞及檢查點分子蛋白質表現。
為了檢查疾病保護之影響及長久性，可用疾病觸發劑(例如，經活化之引起腦炎之T細胞或EAE誘導肽之再注射液)來再攻擊一些小鼠，而不是將其處死。再攻擊之後，將分析小鼠之疾病易感性及EAE嚴重程度。
實例 4 ： 小鼠膠原蛋白誘導之關節炎 ( CIA ) 模型中之布勞特氏菌株 A
實例 4 ： 小鼠膠原蛋白誘導之關節炎 ( CIA ) 模型中之布勞特氏菌株 A
膠原蛋白誘導之關節炎(CIA)為研究類風濕性關節炎(RA)常用之動物模型，如Caplazi等人(Mouse models of rheumatoid arthritis. Veterinary Pathology. 2015年9月1日. 52(5): 819-826)所述(亦參見Brand等人 Collagen-induced arthritis. Nature Protocols. 2007. 2: 1269-1275；Pietrosimone等人 Collagen-induced arthritis: a model for murine autoimmune arthritis. Bio Protoc. 2015年10月20日; 5(20): e1626)。
在CIA嚙齒動物模型之其他形式中，一種模型涉及用雞II型膠原蛋白對HLA-DQ8 Tg小鼠進行免疫接種，如Taneja等人所述(J. Immunology. 2007. 56: 69-78；亦參見Taneja等人 J. Immunology 2008. 181: 2869-2877；及Taneja等人 Arthritis Rheum., 2007. 56: 69-78)。雞CII之純化已由Taneja等人描述(Arthritis Rheum., 2007. 56: 69-78)。免疫接種之後針對CIA疾病發作及進展監測小鼠，且對疾病之嚴重程度進行評估及「分級」，如Wooley, J. Exp. Med. 1981. 154: 688-700所述。
針對CIA誘導對小鼠進行免疫接種且分成不同處理組。單獨或與完整細菌細胞組合，在伴隨或不伴隨加入其他消炎處理下測試含布勞特氏菌株A之細菌組合物在CIA中之功效。
在接近用膠原蛋白免疫接種之時間或免疫接種後開始用含布勞特氏菌株A之細菌組合物處理。舉例而言，在一些組中，可與免疫接種同時(第1天)投與布勞特氏菌株A，或可在第一次出現疾病體徵後或在嚴重症狀出現後投與布勞特氏菌株A。以不同劑量且以限定時間間隔投與布勞特氏菌株A。
舉例而言，用每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個細菌細胞之間的劑量的布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠組可經由腹膜內(i.p.)注射、皮下(s.c.)注射、經鼻途徑投藥、經口管飼或其他投藥手段接受布勞特氏菌株A。一些小鼠可每日(例如，自第1天開始)接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。
舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射、皮下(s.c.)注射、皮內(i.d.)注射或經鼻途徑投藥。
一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用額外消炎劑或CIA治療劑(例如，抗CD154、TNF家族之成員之阻斷、維生素D或其他處理)及/或合適對照(例如，媒劑或對照抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些經免疫接種之小鼠在不接受抗生素之情況下進行處理。
在不同時間點，獲得血清樣本以使用標準ELISA評定抗雞及抗小鼠CII IgG抗體之水準(Batsalova等人 Comparative analysis of collagen type II-specific immune responses during development of collagen-induced arthritis in two B10 mouse strains. Arthritis Res Ther. 2012. 14(6): R237)。此外，處死一些小鼠且可使用此項技術中已知的方法移除發炎部位(例如滑膜)、淋巴結或其他組織以用於離體組織學、細胞介素及/或流動式細胞量測分析。將使用此項技術中已知的技術針對漿細胞浸潤及抗體之存在分析滑膜及滑液。此外，根據製造商之說明書使用解離酶來分離組織以檢查細胞浸潤物之概況。使用此項技術中已知的技術，對細胞進行染色以藉由流動式細胞量測術進行分析。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+滑膜浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。最後，對不同組織切片進行免疫組織化學以量測T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞及檢查點分子蛋白質表現。
為了檢查疾病保護之影響及長久性，可用疾病觸發劑(例如，經活化之具有CIA誘導肽之再注射液)來再攻擊一些小鼠，而不是將其處死。再攻擊之後，將分析小鼠之疾病易感性及CIA嚴重程度。
實例 5 ： 小鼠第 1 型糖尿病 ( T1D ) 模型中之布勞特氏菌株 A
實例 5 ： 小鼠第 1 型糖尿病 ( T1D ) 模型中之布勞特氏菌株 A
第1型糖尿病(T1D)為其中免疫系統靶向胰臟之胰島，由此破壞人體製造胰島素之能力的自體免疫疾病。
存在T1D之動物模型之不同模型，如Belle等人綜述(Mouse models for type 1 diabetes. Drug Discov Today Dis Models. 2009; 6(2): 41-45；亦參見Aileen JF King. The use of animal models in diabetes research. Br J Pharmacol. 2012年6月; 166(3): 877-894)。存在化學誘導之T1D、病原體誘導之T1D的模型以及其中小鼠自發罹患T1D之模型。
單獨或與完整細菌細胞組合，在伴隨或不伴隨加入其他消炎處理下測試含布勞特氏菌株A之細菌組合物在小鼠T1D模型中之功效。
取決於T1D誘導方法及/或罹患T1D是否為自發的，在某一時間點，接近誘導時間或誘導之後或自發出現之T1D出現之前(或出現後)開始用布勞特氏菌株A處理。以不同劑量且以限定時間間隔投與布勞特氏菌株A。舉例而言，用每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個細菌細胞之間的劑量的布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。其他小鼠可接受每隻小鼠25、50或100 mg之布勞特氏菌株A。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠可經由腹膜內(i.p.)注射、皮下(s.c.)注射、經鼻途徑投藥、經口管飼或其他投藥手段接受布勞特氏菌株A。一些小鼠可每日接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。
舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射或經鼻途徑投藥。
一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用額外處理及/或合適對照(例如，媒劑或對照抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些經免疫接種之小鼠在不接受抗生素之情況下進行處理。
實驗開始之前每兩週監測血糖一次。在其後不同時間點量測非空腹血糖。在不同時間點，處死小鼠且可使用此項技術中已知的方法移除部位胰臟、淋巴結或其他組織以用於離體組織學、細胞介素及/或流動式細胞量測分析。舉例而言，根據製造商之說明書使用解離酶來分離組織。使用此項技術中已知的技術，對細胞進行染色以藉由流動式細胞量測術進行分析。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化組織浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。最後，對不同組織切片進行免疫組織化學以量測T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞及檢查點分子蛋白質表現。亦可藉由ELISA評定抗體產生。
為了檢查疾病保護之影響及長久性，可用疾病觸發劑來再攻擊一些小鼠，而不是將其處死，或評定復發易感性。將分析再攻擊(或自發出現之復發)之後小鼠之糖尿病發病易感性及嚴重程度。
實例 6 ： 小鼠原發性硬化性膽管炎 ( PSC ) 模型中之布勞特氏菌株 A
實例 6 ： 小鼠原發性硬化性膽管炎 ( PSC ) 模型中之布勞特氏菌株 A
原發性硬化性膽管炎(PSC)為緩慢破壞膽管且導致末期肝硬化之慢性肝病。其與發炎性腸病(IBD)相關。
存在不同PSC動物模型，如Fickert等人綜述(Characterization of animal models for primary sclerosing cholangitis (PSC). J Hepatol. 2014年6月 60(6): 1290-1303；亦參見Pollheimer及Fickert. Animal models in primary biliary cirrhosis and primary sclerosing cholangitis. Clin Rev Allergy Immunol. 2015年6月 48(2-3): 207-17)。PSC模型中之疾病之誘導包括化學誘導(例如，3,5-二乙氧羰基-1,4-二氫可力丁(3,5-diethoxycarbonyl-1,4-dihydrocollidine；DDC)誘導之膽管炎)、病原體誘導(例如，小球隱胞子蟲)、實驗性膽道阻塞(例如，總膽管結紮(CBDL))及抗原驅動膽道損傷之基因轉殖小鼠模型(例如， Ova-Bil轉殖基因小鼠)。舉例而言，如Georgiev等人所述進行膽管結紮(Characterization of time-related changes after experimental bile duct ligation. Br J Surg. 2008. 95(5): 646-56)，或如Fickert等人所述，經DCC暴露誘導疾病(A new xenobiotic-induced mouse model of sclerosing cholangitis and biliary fibrosis. Am J Path. 第171(2)卷: 525-536)。
單獨或與完整細菌細胞組合，在伴隨或不伴隨加入某一其他治療劑下測試含布勞特氏菌株A之細菌組合物在小鼠PSC模型中之功效。
DCC 誘導之膽管炎
DCC 誘導之膽管炎
舉例而言，由Taconic或其他供應商獲得6至8週齡C57bl/6小鼠。向小鼠餵食經0.1% DCC補充之飲食持續不同持續時間。一些組將接受DCC補充食物持續1週，其他一些持續4週，其他一些持續8週。一些小鼠組可接受DCC補充飲食持續一定時長，且隨後使其恢復，其後接受正常飲食。可研究此等小鼠自疾病恢復之能力及/或其後續暴露於DCC後的復發之易感性。在某一時間點，接近DCC進給之時間或在初始暴露於DCC之後開始用布勞特氏菌株A處理。舉例而言，可在第1天投與布勞特氏菌株A或可有時在其後投與布勞特氏菌株A。以不同劑量且以限定時間間隔投與布勞特氏菌株A。舉例而言，用每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個細菌細胞之間的範圍的布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。其他小鼠可接受每隻小鼠25、50、100 mg之布勞特氏菌株A。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠可經由腹膜內注射、皮下(s.c.)注射、經鼻途徑投藥、經口管飼或其他投藥手段接受布勞特氏菌株A。一些小鼠可每日(例如，自第1天開始)接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射或經鼻途徑投藥。一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用額外藥劑及/或合適對照(例如，媒劑或抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些經免疫接種之小鼠在不接受抗生素之情況下進行處理。在不同時間點，針對ALT、AP、膽紅素及血清膽汁酸(BA)水準分析血清樣本。
在不同時間點，處死小鼠，記錄體重及肝臟重量，且可使用此項技術中已知的方法移除發炎部位(例如，肝臟、小腸及大腸、脾臟)、淋巴結或其他組織以用於離體組織形態學表徵、細胞介素及/或流動式細胞量測分析(參見Fickert等人 Characterization of animal models for primary sclerosing cholangitis (PSC)). J Hepatol. 2014. 60(6): 1290-1303)。舉例而言，針對ICAM-1、VCAM-1、MadCAM-1之表現對膽管進行染色。將一些組織染色以用於組織學檢查，而根據製造商說明書使用解離酶分離其他組織。使用此項技術中已知的技術，對細胞進行染色以藉由流動式細胞量測術進行分析。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)以及黏附分子表現(ICAM-1、VCAM-1、MadCAM-1)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+膽管浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。
肝臟組織製備用於例如使用天狼星紅(Sirius-red)染色，之後對纖維化區域定量來進行組織學分析。在處理結束時，收集血液以用於進行肝酶，例如AST或ALT之血漿分析，且測定膽紅素水準。可使用現有方案量測肝羥脯胺酸含量。可藉由qRT-PCR使用經驗證之引子來進行發炎及纖維化標記之肝基因表現分析。此等標記可包括(但不限於)MCP-1、α-SMA、Coll1a1及TIMP。可使用現有代謝體學方法在血漿、組織及糞便樣本中進行代謝物量測。最後，對肝臟切片進行免疫組織化學以量測嗜中性白血球、T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞或其他免疫細胞浸潤物。
為了檢查疾病保護之影響及長久性，可在稍後的時間用DCC來再攻擊一些小鼠，而不是將其處死。再攻擊之後，將分析小鼠之膽管炎易感性及膽管炎嚴重程度。
BDL 誘導之膽管炎
BDL 誘導之膽管炎
替代性地，測試含布勞特氏菌株A之細菌組合物在BDL誘導之膽管炎中之功效。舉例而言，由Taconic或其他供應商獲得6至8週齡C57Bl/6J小鼠。環境適應期之後，對小鼠進行外科手術以實施膽管結紮(BDL)。一些對照動物接受假手術。BDL手術在7至21天內引起肝臟損傷、發炎及纖維化。
在某一時間點，接近手術時間或手術之後某一時間開始用布勞特氏菌株A處理。以不同劑量且以限定時間間隔投與布勞特氏菌株A。舉例而言，用每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個細菌細胞之間的範圍的布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。其他小鼠可接受每隻小鼠25、50或100 mg之布勞特氏菌株A。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠可經由腹膜內注射、皮下(s.c.)注射、經鼻途徑投藥、經口管飼或其他投藥手段接受布勞特氏菌株A。一些小鼠每日(例如，自第1天開始)接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射或經鼻途徑投藥。一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用額外藥劑及/或合適對照(例如，媒劑或抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些經免疫接種之小鼠在不接受抗生素之情況下進行處理。在不同時間點，針對ALT、AP、膽紅素及血清膽汁酸(BA)水準分析血清樣本。
在不同時間點，處死小鼠，記錄體重及肝臟重量，且可使用此項技術中已知的方法移除發炎部位(例如，肝臟、小腸及大腸、脾臟)、淋巴結或其他組織以用於離體組織形態學表徵、細胞介素及/或流動式細胞量測分析(參見Fickert等人 Characterization of animal models for primary sclerosing cholangitis (PSC)). J Hepatol. 2014. 60(6): 1290-1303)。舉例而言，針對ICAM-1、VCAM-1、MadCAM-1之表現對膽管進行染色。將一些組織染色以用於組織學檢查，而根據製造商說明書使用解離酶分離其他組織。使用此項技術中已知的技術，對細胞進行染色以藉由流動式細胞量測術進行分析。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)以及黏附分子表現(ICAM-1、VCAM-1、MadCAM-1)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+膽管浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。
肝臟組織製備用於例如使用天狼星紅染色，之後對纖維化區域定量來進行組織學分析。在處理結束時，收集血液以用於進行肝酶，例如AST或ALT之血漿分析，且測定膽紅素水準。可使用現有方案量測肝羥脯胺酸含量。可藉由qRT-PCR使用經驗證之引子來進行發炎及纖維化標記之肝基因表現分析。此等標記可包括(但不限於)MCP-1、α-SMA、Coll1a1及TIMP。可使用現有代謝體學方法在血漿、組織及糞便樣本中進行代謝物量測。最後，對肝臟切片進行免疫組織化學以量測嗜中性白血球、T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞或其他免疫細胞浸潤物。
為了檢查疾病保護之影響及長久性，可針對恢復率分析小鼠，而不是將其處死。
實例 7 ： 小鼠非酒精性脂肪變性肝炎 ( NASH ) 模型中之布勞特氏菌株 A
實例 7 ： 小鼠非酒精性脂肪變性肝炎 ( NASH ) 模型中之布勞特氏菌株 A
非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)為非酒精性脂肪肝病(NAFLD)之嚴重形式，其中肝脂肪堆積(脂肪變性)及發炎引起肝臟損傷及肝細胞發生細胞死亡(氣脹)。
存在不同NASH動物模型，如Ibrahim等人綜述(Animal models of nonalcoholic steatohepatitis: Eat, Delete, and Inflame. Dig Dis Sci. 2016年5月. 61(5): 1325-1336；亦參見Lau等人 Animal models of non-alcoholic fatty liver disease: current perspectives and recent advances 2017年1月 241(1): 36-44)。
單獨或與完整細菌細胞組合，在伴隨或不伴隨加入另一治療劑下測試含布勞特氏菌株A之細菌組合物在小鼠NASH模型中之功效。舉例而言，為由Taconic (紐約州日耳曼敦)或其他供應商獲得的8至10週齡C57Bl/6J小鼠安排甲硫胺酸膽鹼缺乏(MCD)飲食持續4至8週時段，在此期間，將出現NASH特徵，包括脂肪變性、發炎、氣脹及纖維化。
在某一時間點，飲食開始時或飲食開始之後的某一時間點(例如之後一週)開始用布勞特氏菌株A處理。例如，可在與開始MCD飲食之同一天開始投與布勞特氏菌株A。以不同劑量且以限定時間間隔投與布勞特氏菌株A。舉例而言，用每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個細菌細胞之間的劑量的布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。其他小鼠可接受每隻小鼠25、50或100 mg之布勞特氏菌株A。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠可經由腹膜內(i.p.)注射、皮下(s.c.)注射、經鼻途徑投藥、經口管飼或其他投藥手段接受布勞特氏菌株A。一些小鼠可每日(例如，自第1天開始)接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。
舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射或經鼻途徑投藥。一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用額外NASH治療劑(例如FXR促效劑、PPAR促效劑、CCR2/5拮抗劑或其他處理)及/或合適對照處理。
在不同時間點及/或處理結束時，處死小鼠且使用此項技術中已知的方法移除肝臟、腸、血液、糞便或其他組織以用於離體組織學、生物化學、分子或細胞介素及/或流式細胞量測術分析。舉例而言，對肝臟組織稱重且製備用於組織學分析，其可包含用H&E、天狼星紅染色及測定NASH活動度評分(NAS)。在不同時間點，收集血液以使用標準品分析進行肝酶，例如AST或ALT之血漿分析。此外，可使用現有方案量測膽固醇之肝含量、三酸甘油酯或脂肪酸。可藉由QRT-PCR使用經驗證之引子進行發炎、纖維化、脂肪變性、ER應激或氧化應激標記之肝基因表現分析。此等標記可包括(但不限於) IL-6、MCP-1、α-SMA、Coll1a1、CHOP及NRF2。可使用現有生物化學及基於質譜分析之代謝體學方法在血漿、組織及糞便樣本中進行代謝物量測。亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+膽管浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。最後，對肝臟或腸切片進行免疫組織化學以量測嗜中性白血球、T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞或其他免疫細胞浸潤物。
為了檢查疾病保護之影響及長久性，可針對恢復率分析小鼠，而不是將其處死。
圖 3A
顯示布勞特氏菌及奧貝膽酸(OCA)對餵食MCD飲食之小鼠中的肝總膽固醇之影響。圖 3B
顯示布勞特氏菌及奧貝膽酸(OCA)對餵食MCD飲食之小鼠中的肝三酸甘油酯之影響。圖 3C
顯示布勞特氏菌及奧貝膽酸(OCA)對餵食MCD飲食之小鼠中的纖維化評分之影響。圖 3D
顯示布勞特氏菌在接受甲硫胺酸膽鹼缺乏(MCD)飲食，引發NASH症狀之小鼠中在降低NASH活動度評分(NAS)方面為有效的。
實例 8 ：小鼠牛皮癬模型中之布勞特氏菌株 A
實例 8 ：小鼠牛皮癬模型中之布勞特氏菌株 A
牛皮癬為T細胞介導之慢性發炎性皮膚病。所謂的「斑塊型」牛皮癬為牛皮癬之最常見形式且典型特徵為乾鱗屑(dry scale)、紅斑及由於免疫細胞浸潤至真皮及表皮中導致之皮膚增厚。若干動物模型已促進對此疾病之理解，如Gudjonsson等人綜述(Mouse models of psoriasis. J Invest Derm. 2007. 127: 1292-1308；亦參見van der Fits等人 Imiquimod-induced psoriasis-like skin inflammation in mice is mediated via the IL-23/IL-17 axis. J. Immunol. 2009年5月1日. 182(9): 5836-45)。
可在多種小鼠模型，包括使用轉殖基因、基因剔除或異種移植模型以及局部施用咪喹莫特(imiquimod；IMQ)、TLR7/8配位體之模型中誘導牛皮癬。
單獨或與完整細菌細胞組合，在伴隨或不伴隨加入其他消炎處理下測試含布勞特氏菌株A之細菌組合物在小鼠牛皮癬模型中之功效。舉例而言，由Taconic (紐約州日耳曼敦)或其他供應商獲得6至8週齡C57Bl/6或Balb/c小鼠。對小鼠背部及右耳進行刮毛。使小鼠組接受62.5 mg之局部日劑量之可在市面上購得的IMQ乳膏(5%) (Aldara；3M Pharmaceuticals)。將劑量施加至刮毛區持續5或6個連續日。每隔一定間隔，針對紅斑、脫屑及增厚以0至4之分值對小鼠進行評分，如van der Fits等人(2009)所述。使用Mitutoyo測微計監測小鼠耳部厚度。
在一些時間點，接近第一次施用IMQ之時間或其後某一時間開始用布勞特氏菌株A處理。舉例而言，可與皮下注射同時(第0天)投與布勞特氏菌株A，或可在施用之前或之後投與布勞特氏菌株A。以不同劑量且以限定時間間隔投與布勞特氏菌株A。舉例而言，用每隻小鼠1 × 104
與5 × 109
個細菌細胞之間的劑量的布勞特氏菌株A靜脈內注射一些小鼠。其他小鼠可接受每隻小鼠25、50或100 mg之布勞特氏菌株A。儘管一些小鼠將經由靜脈內注射液接受布勞特氏菌株A，但其他小鼠可經由腹膜內(i.p.)注射、經鼻途徑投與、經口管飼、表面投與、皮內(i.d.)注射、皮下(s.c.)注射或其他投藥手段接受布勞特氏菌株A。一些小鼠可每日(例如，自第0天開始)接受布勞特氏菌株A，而其他小鼠可以替代時間間隔(例如，隔日或每三天一次)接受布勞特氏菌株A。額外小鼠組可接受一定比率之細菌細胞與布勞特氏菌株A。細菌細胞可為活的、經殺滅的或經減毒的。細菌細胞可經新鮮(或冷凍)收集且投與，或其在投與之前可經照射或熱殺滅。
舉例而言，一些小鼠組在與布勞特氏菌株A投藥分開或與其共混的投藥中可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。如同布勞特氏菌株A一樣，細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射、皮內注射、皮下注射、表面投藥或經鼻途徑投藥。
一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用消炎劑(例如，抗CD154、TNF家族之成員之阻斷或其他處理)及/或合適對照(例如，媒劑或對照抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些經免疫接種之小鼠在不接受抗生素之情況下進行處理。
在不同時間點，自背部及耳部皮膚獲得樣本以用於使用此項技術中已知的方法進行冷凍切片染色分析。處死其他小鼠組且可使用此項技術中已知的方法移除淋巴結、脾臟、腸系膜淋巴結(MLN)、小腸、結腸及其他組織以用於組織學研究、離體組織學、細胞介素及/或流動式細胞量測分析。可根據製造商之說明書使用解離酶來分離一些組織。對冷凍切片樣本、組織樣本或離體獲得之細胞染色以用於使用此項技術中已知的技術進行流式細胞量測術。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+皮膚浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。最後，對不同組織切片進行免疫組織化學以量測T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞及檢查點分子蛋白質表現。
為了檢查牛皮癬保護之影響及長久性，可研究一些小鼠以評定恢復率或可用IMQ再攻擊該等小鼠，而不是將其處死。將針對牛皮癬易感性及反應之嚴重程度分析經再攻擊之小鼠組。
實例 9 ： 小鼠膠原蛋白誘導之關節炎 ( CIA ) 模型中 之 布勞特氏菌株 A
實例 9 ： 小鼠膠原蛋白誘導之關節炎 ( CIA ) 模型中 之 布勞特氏菌株 A
膠原蛋白誘導之關節炎(CIA)為研究類風濕性關節炎(RA)常用之動物模型，如Caplazi等人(Mouse models of rheumatoid arthritis. Veterinary Pathology. 2015年9月1日. 52(5): 819-826)所述(亦參見Brand等人 Collagen-induced arthritis. Nature Protocols. 2007. 2: 1269-1275；Pietrosimone等人 Collagen-induced arthritis: a model for murine autoimmune arthritis. Bio Protoc. 2015年10月20日; 5(20): e1626)。
在CIA嚙齒動物模型之其他形式中，一種模型涉及用雞II型膠原蛋白對HLA-DQ8 Tg小鼠進行免疫接種，如Taneja等人所述(J. Immunology. 2007. 56: 69-78；亦參見Taneja等人 J. Immunology 2008. 181: 2869-2877；及Taneja等人 Arthritis Rheum., 2007. 56: 69-78)。雞CII之純化已由Taneja等人描述(Arthritis Rheum., 2007. 56: 69-78)。免疫接種之後針對CIA疾病發作及進展監測小鼠，且對疾病之嚴重程度進行評估及「分級」，如Wooley, J. Exp. Med. 1981. 154: 688-700所述。
在第0天，在尾根部處給予所有小鼠0.05 mL乳化於完全弗氏佐劑(CFA)中的雞II型膠原蛋白之皮內/皮下(ID/SC)注射液(來源：Hooke Labs)。隨後在研究之第21天給予所有動物乳化於不完全弗氏佐劑(IFA)中之雞II型膠原蛋白之第二皮內/皮下注射液。LPS之腹膜內注射液不包括於此研究中。此範式引起自約第28天至第35天開始關節發炎。自第21天直至第56天研究結束針對關節炎一週三次對小鼠進行評估。該評估涉及按照0至4之等級對各爪部進行單獨地評分，其中0為正常且4等於嚴重腫脹，其引起關節僵硬，使得動物該肢體之重量無法增加。因此對於每日評估，各動物具有至多16之累計評分。藉由使用數位測徑規量測所有4個爪部的爪部厚度來評估爪部腫脹，一次係在第1天之基線處量測，且在第21天開始直至第56天研究結束每週量測一次。
在第0天研究開始之前對動物進行隨機分組。測試物給藥在第0天開始且至第56天由每日一次(QD)經由經口管飼投與的100 μl測試物或媒劑組成。每日經由經口管飼以每20 g 0.1mL之體積向治療組投與地塞米松(0.5 mg/kg)。若在此組中觀測到過度的體重減輕，則降低地塞米松之濃度持續較短時段直至恢復。針對關節炎一週三次評估小鼠直至研究結束。
最後的收集在第56天最後一次投配測試物之後2小時進行。處死後，經由心臟穿刺收集血液且製備血清且在運送至試驗委託者之前儲存於-80℃下。將兩個右爪(前爪及後爪)速凍，且將兩個左爪(前爪及後爪)儲存在10%中性緩衝福馬林中24小時，且隨後轉換為70%乙醇供儲存以用於組織學分析。速凍組織儲存在-80℃下。自各動物將脾臟及腹股溝淋巴結收集於填充有完全RPMI培養基且儲存於冰上之獨立試管中。
針對CIA誘導對小鼠進行免疫接種且分成不同處理組。單獨或與完整細菌細胞組合，在伴隨或不伴隨加入其他消炎治療下測試布勞特氏菌株A在CIA中之功效。
在接近用膠原蛋白免疫接種之時間或免疫接種後開始用布勞特氏菌株A處理。舉例而言，在一些組中，可與免疫接種同時(第1天)投與布勞特氏菌株A，或可在第一次出現疾病體徵後或在嚴重症狀出現後投與布勞特氏菌株A。以不同劑量且以限定時間間隔投與布勞特氏菌株A。
舉例而言，一些小鼠組可接受在1 × 104
與5 × 109
個之間的細菌細胞。細菌細胞投藥可因給藥途徑、劑量及排程而有所改變。此可包括經口管飼、靜脈內注射、腹膜內注射、皮下(s.c.)注射、皮內(i.d.)注射或經鼻途徑投藥。
一些小鼠組可在不同時間點且以有效劑量用額外消炎劑或CIA治療劑(例如，抗CD154、TNF家族之成員之阻斷、維生素D或其他處理)及/或合適對照(例如，媒劑或對照抗體)處理。
此外，在處理之前用抗生素處理一些小鼠。舉例而言，將萬古黴素(0.5 g/L)、安比西林(1.0 g/L)、慶大黴素(1.0 g/L)及兩性黴素B (0.2 g/L)添加至飲用水中，且在處理時或處理之前幾天停止抗生素處理。一些經免疫接種之小鼠在不接受抗生素之情況下進行處理。
在不同時間點，獲得血清樣本以使用標準ELISA評定抗雞及抗小鼠CII IgG抗體之水準(Batsalova等人 Comparative analysis of collagen type II-specific immune responses during development of collagen-induced arthritis in two B10 mouse strains. Arthritis Res Ther. 2012. 14(6): R237)。此外，處死一些小鼠且可使用此項技術中已知的方法移除發炎部位(例如滑膜)、淋巴結或其他組織以用於離體組織學、細胞介素及/或流動式細胞量測分析。使用此項技術中已知的技術針對漿細胞浸潤及抗體之存在分析滑膜及滑液。此外，根據製造商之說明書使用解離酶來分離組織以檢查細胞浸潤物之概況。使用此項技術中已知的技術，對細胞進行染色以藉由流動式細胞量測術進行分析。染色抗體可包括抗CD11c (樹突狀細胞)、抗CD80、抗CD86、抗CD40、抗MHCII、抗CD8a、抗CD4及抗CD103。可經分析之其他標記包括泛免疫細胞標記CD45、T細胞標記(CD3、CD4、CD8、CD25、Foxp3、T-bet、Gata3、Roryt、顆粒酶B、CD69、PD-1、CTLA-4)及巨噬細胞/骨髓標記(CD11b、MHCII、CD206、CD40、CSF1R、PD-L1、Gr-1、F4/80)。除了免疫表型分型之外，亦分析血清細胞介素，其包括(但不限於) TNFa、IL-17、IL-13、IL-12p70、IL12p40、IL-10、IL-6、IL-5、IL-4、IL-2、IL-1b、IFNy、GM-CSF、G-CSF、M-CSF、MIG、IP10、MIP1b、RANTES及MCP-1。可對由淋巴結或其他組織獲得的免疫細胞，及/或對離體獲得的純化CD45+滑膜浸潤免疫細胞進行細胞介素分析。最後，對不同組織切片進行免疫組織化學以量測T細胞、巨噬細胞、樹突狀細胞及檢查點分子蛋白質表現。
為了檢查疾病保護之影響及長久性，可用疾病觸發劑(例如，經活化之具有CIA誘導肽之再注射液)來再攻擊一些小鼠，而不是將其處死。再攻擊之後，分析小鼠之疾病易感性及CIA嚴重程度。
實例 10 ： 布勞特氏菌對小鼠非酒精性脂肪變性肝炎 ( NASH ) 模型中之 LGALS3 基因表現的影響
實例 10 ： 布勞特氏菌對小鼠非酒精性脂肪變性肝炎 ( NASH ) 模型中之 LGALS3 基因表現的影響
如實例7中詳述，在伴隨或不伴隨加入另一治療劑下測試布勞特氏細菌細胞在小鼠NASH模型中之功效。經由全轉錄組分析使用Applied Biosystems Clariom S微陣列(目錄號902930)，根據製造商說明書評定經處理之小鼠肝臟中之LGALS3基因表現。使用Qiagen's RNeasy Plus微型套組(目錄號74136)，根據製造商說明書自小鼠肝臟組織提取用於分析中之RNA。用Thermo之轉錄組分析控制台 (Transcriptome Analysis Console；TAC)軟體4.0版分析微陣列資料。SST-RMA標準化及信號強度值之log 2變換之後獲得基因表現量。藉由單向ANOVA，利用Sidak測試與媒劑組進行多重比較，使用GraphPad Prism 7軟體進行統計分析。
LGALS3編碼碳水化合物結合蛋白之半乳糖凝集素家族之成員。此蛋白質家族之成員對β-半乳糖苷具有親和力。過量脂肪酸氧化及伴隨形成晚期脂氧化終產物(advanced lipoxidation endproduct；ALE)的反應性羧基之產生藉由觸發發炎、肝細胞損傷及纖維化參與非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)。ALE-受體半乳糖凝集素-3之消蝕藉由減少受體介導之ALE清除及後續事件預防實驗性NASH(Iacobini C等人, J. Hepatol. 2011; 54(5):975-83)。半乳糖凝集素-3消蝕藉由降低肝ALE積聚來防止飲食誘導之NASH，同時減弱發炎、肝細胞損傷及纖維化。其亦減少脂質合成之上調及引起較少脂肪沈積、氧化應激及可能之胰島素抗性的氧化。半乳糖凝集素-3為參與肝臟攝取ALE之主要受體。
實例 11 ：小鼠肺癌模型
實例 11 ：小鼠肺癌模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試布勞特氏菌在小鼠肺癌模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，以不同劑量，以限定時間間隔投與布勞特氏菌。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之菌株(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
將1 × 106
個LLC1細胞或適當數目之來自另一肺癌細胞株之肺癌細胞注射至同基因型小鼠之後側腹中。以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析。其他小鼠可利用將腫瘤細胞注射至對側側腹中再攻擊，以測定免疫系統之記憶反應對於腫瘤生長的影響。
實例 12 ：小鼠乳癌模型
實例 12 ：小鼠乳癌模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試布勞特氏菌株在小鼠乳癌模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，以不同劑量，以限定時間間隔投與菌株。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之菌株(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
由ATCC獲得4T1小鼠乳癌細胞且將於50 μl PBS中之1 × 106
個細胞皮下注射於Balb/c雌性小鼠之一個或兩個後肢處(如Wang等人2003, Systemic dissemination of viral vectors during intratumoral injection. Molecular Cancer Therapeutics; 2(11)所述)。替代性地，由ATCC獲得EMT6小鼠乳癌細胞且在6至8週齡的Balb/c雌性小鼠之一個或兩個後肢處皮下注射處於50 μl PBS中之1 × 106
個細胞(如Guo等人 2014, Combinatorial Photothermal and Immuno Cancer Therapy Using Chitosan-Coated Hollow Copper Sulfide Nanoparticles. ASC Nano.; 8(6): 5670-5681所述)。另外，可使用其他可獲得的小鼠乳腺細胞株。
以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，以不同劑量，以限定時間間隔投與布勞特氏菌。舉例而言，將一些小鼠處死以使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析。其他小鼠可利用將腫瘤細胞注射至對側側腹中再攻擊，以測定免疫系統之記憶反應對於腫瘤生長的影響。
替代性地，4T1細胞可用於乳癌之正位鼠類模型中，如Tao等人所述(Taoet al.
2008. Imagable 4T1 model for the study of late stage breast cancer. 8: 288)。將小鼠處死以進行離體腫瘤分析。藉由流式細胞量測術及免疫組織化學來分析腫瘤。
實例 13 ：小鼠胰臟癌模型
實例 13 ：小鼠胰臟癌模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試布勞特氏菌株在小鼠胰臟癌模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受菌株之組。如實例9中所述，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受布勞特氏菌(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之菌株(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
將Panc02細胞維持在補充有10%胎牛血清及1%青黴素/鏈黴素之DMEM中，且在37℃、5% CO2
下培育。自Charles River公司或其他認證供應商獲得雌性8至10週齡C57Bl/6小鼠。將1 × 106
個Panc02細胞皮下注射至雌性C57Bl/6小鼠之右後側腹中。此方案係基於標準Panc02腫瘤模型(Maletzki等人 2008. Pancreatic cancer regression by intratumoral injection of live streptococcus pyogenes in a syngeneic mouse model. Gut. 57:483-491)。以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
替代性地，Panc02、6606PDA或Capan-1細胞株可用於胰臟癌之正位鼠類模型中，如Partecke等人(Partecke等人2011. A syngeneic orthotopic murine model of pancreatic adenocarcinoma in the C57/Bl6 mouse using the Panc02 and 6606PDA cell lines. Eur. Surg. Res. 47(2):98-107)或Chai等人 (Chai等人2013.Bioluminescent orthotopic model of pancreatic cancer progression. J. Vis. Exp. 76: 50395)所述。將小鼠處死以進行離體腫瘤分析。藉由流式細胞量測術及免疫組織化學來分析腫瘤。
實例 14 ：小鼠肝細胞癌模型
實例 14 ：小鼠肝細胞癌模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試布勞特氏菌株在小鼠肝細胞癌模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受菌株之組。如實例9中所述，以不同劑量，以限定時間間隔投與布勞特氏菌。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受布勞特氏菌(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之菌株(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
藉由皮下接種1 × 106
個Hepa129細胞(由NCI或其他來源獲得)、或適當數目之來自其他肝細胞癌細胞株之細胞，在小鼠中誘導肝細胞癌(如Gonzalez-Carmona等人 2008. CD40 ligand-expressing dendritic cells induce regression of hepatocellular carcinoma by activating innate and acquired immunity in vivo. Hepatology. 48(1):157-168所述)。將腫瘤細胞接種至一個或兩個側腹中。以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
實例 15 ：小鼠淋巴瘤模型
實例 15 ：小鼠淋巴瘤模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試布勞特氏菌株在小鼠淋巴瘤模型中之功效。舉例而言，將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，以不同劑量，以限定時間間隔投與菌株。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之菌株(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
一個淋巴瘤細胞株為A20淋巴瘤，但同基因型小鼠可使用其他淋巴瘤細胞株。由ATCC獲得A20淋巴瘤細胞，且將於50 μl PBS中之5 × 106
個細胞皮下注射於Balb/c雌性小鼠之一個或兩個後肢處(如Houot等人 2009. T-cell modulation combined with intratumoral CpG cures lymphoma in a mouse model without the need for chemotherapy. Blood. 113(15): 3546-3552)。以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
實例 16 ：小鼠前列腺癌模型
實例 16 ：小鼠前列腺癌模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試布勞特氏菌株在小鼠前列腺癌模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，以不同劑量，以限定時間間隔投與布勞特氏菌。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之布勞特氏菌(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
將小鼠前列腺癌細胞(1 × 105
個RM-1細胞或適當數目之來自另一前列腺癌細胞株之細胞)注射至同基因型小鼠中。以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
實例 17 ：小鼠漿細胞瘤模型
實例 17 ：小鼠漿細胞瘤模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試菌株在小鼠漿細胞瘤模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，以不同劑量，以限定時間間隔投與菌株。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之布勞特氏菌(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
礦物油誘導之漿細胞瘤模型
礦物油誘導之漿細胞瘤模型
為檢查布勞特氏菌在漿細胞瘤或多發性骨髓瘤模型中之功效，在0天與60天之間的不同時間點用500 μl 2,6,10,12-四甲基十五烷(「姥鮫烷油(pristane oil)」)腹膜內注射小鼠三次，如Potter等人 1983. Peritoneal plasmacytomagenesis in mice: comparison of different pristane dose regimens. J. Natl. Cancer Inst. 71(2):391-5所述(亦參加Lattanzio等人 1997. Defective Development of Pristane-Oil Induced Plasmacytomas in Interleukin-6-Deficient BALB/C Mice. Am. J. Pathology: 151(3):689696)。藉由腹脹之程度及腹水中之免疫細胞及顆粒來量測疾病之進展。藉由流式細胞量測術，來分析腹水流體之免疫細胞表型。
細胞株誘導之漿細胞瘤模型
細胞株誘導之漿細胞瘤模型
為檢查布勞特氏菌在漿細胞瘤或多發性骨髓瘤模型中之功效，將MOPC-104E細胞或J558漿細胞瘤細胞(TIB-6 ATCC) (5 × 106
個細胞)皮下注射於Balb/c小鼠之一或多個後側腹中，基於由Bhoopalam等人 1980. Effect of dextran-S (alpha, 1-3 dextran) on the growth of plasmacytomas MOPC-104E and J558. J. Immunol. 125(4):1454-8所述之模型(亦參見Wang等人 2015. IL-10 enhances CTL-mediated tumor rejection by inhibiting highly suppressive CD4+ T cells and promoting CTL persistence in a murine model of plasmacytoma. OncoImmunology. 4(7): e1014232-1-9)。將小鼠劃分成藉由經口管飼及在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑處理下接受布勞特氏菌之組。以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
實例 18 ：小鼠骨髓瘤之 SCID 小鼠模型
實例 18 ：小鼠骨髓瘤之 SCID 小鼠模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試布勞特氏菌在SCID小鼠骨髓瘤模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，以不同劑量，以限定時間間隔投與布勞特氏菌。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之範永氏球菌(Veillonalla) (在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
為了檢查使用人類血漿細胞白血病下的布勞特氏菌之功效，使用1 × 107
個人類骨髓瘤細胞株ARH77細胞(ARH77-ATCC CRL-1621，或適當數目之來自另一骨髓瘤細胞株(諸如KPMM2)之細胞)。將骨髓瘤細胞皮下注射於SCID小鼠之一個或兩個後側腹中(參見Caers等人 2004. Of mice and men: disease models of multiple myeloma. Drug Discovery Today: Disease Models. 1(4):373-380)。以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
實例 19 ：小鼠腎細胞癌模型
實例 19 ：小鼠腎細胞癌模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試菌株在小鼠腎細胞癌模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，可以不同劑量，以限定時間間隔投與布勞特氏菌。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之布勞特氏菌株(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
為檢查布勞特氏菌在小鼠腎細胞癌模型中之功效，將Renca細胞(ATCC CRL-2947)或其他腎細胞癌細胞(於0.1 ml PBS中之5 × 106
個細胞)皮下注射於7至8週齡同基因型Balb/c小鼠之一個或兩個側腹中。以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
實例 20 ：小鼠膀胱癌模型
實例 20 ：小鼠膀胱癌模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試菌株在小鼠膀胱癌模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，可以不同劑量，以限定時間間隔投與布勞特氏菌。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之菌株(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
在接種當天，收集MBT-2細胞(或其他膀胱癌細胞株)，且將其再懸浮於1:1 PBS/基質膠混合物中。將2 × 105
個MBT-2細胞懸浮於100 μl混合物中，且皮下注射於同基因型小鼠之一個或兩個後側腹中。以規則時間間隔，用測徑規來量測腫瘤。
如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
實例 21 ：小鼠結腸直腸癌模型
實例 21 ：小鼠結腸直腸癌模型
單獨或與其他癌症療法(包括檢查點抑制劑)組合，測試菌株在小鼠結腸直腸癌模型中之功效。將小鼠劃分成在伴隨或不伴隨檢查點抑制劑治療下接受布勞特氏菌株A及/或其他布勞特氏菌株之組。如實例9中所述，可以不同劑量，以限定時間間隔投與範永氏球菌。舉例而言，一些小鼠在腫瘤細胞注射後當天(第1天)接受菌株(p.o.)。一些小鼠接受七(7)次連續劑量之菌株(在第14天至第21天，每天一次劑量)。其他小鼠每天一次接受給藥，或替代性地，一些小鼠每隔一天接受給藥。替代性地，在限定時間點(例如，在第13天)或當腫瘤達至特定大小(例如，100 mm3
)時將小鼠隨機分入不同處理組且隨後開始相應治療。
由Taconic (紐約州日耳曼敦)獲得雌性6至8週齡Balb/c小鼠。將100,000個CT-26結腸直腸腫瘤細胞(ATCC CRL-2638)再懸浮於無菌PBS中，且在50%基質膠存在下接種。將CT-26腫瘤細胞皮下注射於各小鼠之一個後側腹中。在腫瘤細胞接種之後某一時間點以不同劑量且以限定時間間隔開始用布勞特氏菌株處理。舉例而言，一些小鼠接受在每劑量1 × 10^9與5 × 10^9之間的CFU (100 μl最終體積)。可能之給藥途徑包括經口管飼(p.o.)、靜脈內注射、瘤內注射(IT)或瘤周或腫瘤下或皮下注射。為評定布勞特氏菌治療之全身性抗腫瘤效應，可在用布勞特氏菌在第一側腹處進行IT、瘤周或腫瘤下處理之前，用腫瘤細胞在對側(未處理，第二)側腹對其他小鼠進行接種。
以規則時間間隔，用測徑規量測來自不同處理組的腫瘤。如實例9中所述，處死一些小鼠以供使用流式細胞量測術進行離體腫瘤分析，而對其他小鼠進行再攻擊以測定記憶反應對腫瘤生長之影響。
實例 22 ：製造條件
實例 22 ：製造條件
使用富集培養基來生長，且針對活體外及活體內用途製備細菌。舉例而言，培養基可含有糖、酵母提取物、植物類蛋白腖、緩衝劑、鹽、微量元素、界面活性劑、消泡劑及維生素。複合組分，諸如酵母提取物及蛋白腖之組合物可不限定或經部分限定(包括胺基酸、糖等之合適濃度)。微生物代謝可與資源，諸如碳及氮之利用率相關。可測試不同糖或其他碳源。可替代地，可如以下所示製備培養基且生長所選細菌：Saarela等人, J. Applied Microbiology
. 2005. 99: 1330-1339，所述文獻以引用之方式併入本文中。醱酵時間、低溫保護劑及細胞之中和之影響集中於冷凍-乾燥存活、儲存穩定性，且在不含牛奶類成分的情況下產生所選細菌之酸及膽汁暴露。
在大規模下，培養基為無菌的。可藉由超高溫(UHT)處理來滅菌。在極高溫下進行UHT處理持續較短時段。UHT範圍可為135℃至180℃。舉例而言，培養基可在135℃下滅菌10至30秒。
可在燒瓶中或在較小生物反應器中製備接種液，且監測生長。舉例而言，接種液大小可在總生物反應器體積之約0.5%與3%之間。視應用及材料之需求而定，生物反應器體積可為至少2 L、10 L、80 L、100 L、250 L、1000 L、2500 L、5000 L、10,000 L。
在接種之前，製備具有在所需pH、溫度及氧濃度下之培養基的生物反應器。培養基之初始pH可與方法設定點不同。pH應激在低細胞濃度下可能為不利的；初始pH可在pH 7.5與方法設定點之間。舉例而言，pH可設定在4.5與8.0之間。在醱酵期間，可經由使用氫氧化鈉、氫氧化鉀或氫氧化銨來控制pH。溫度可控制在25℃至45℃，例如在37℃下。藉由將培養液中之氧水準自約8 mg/L降低至0 mg/L，來產生厭氧條件。舉例而言，可使用氮氣或氣體混合物(N2
、CO2
及H2
)，以建立厭氧條件。或者，不使用氣體，且藉由細胞消耗來自培養基之殘餘氧氣來建立厭氧條件。視菌株及接種液大小而定，生物反應器醱酵時間可有所變化。舉例而言，醱酵時間可在約5小時至48小時之間變化。
使微生物自冷凍狀態恢復可能需要特殊考慮因素。生產培養基可在融化之後使細胞受激；可能需要特定融化培養基來不斷地自融化物質開始種子培養。出於增加種子體積或維持微生物生長狀態的目的的將種子物質轉移或傳遞至新製培養基之動力學可能會受微生物之當前狀態(指數生長、穩態生長、未應激、受應激)影響。
製造醱酵器之接種可影響生長動力學及細胞活性。生物反應器系統之初始狀態必須經最佳化以促進成功及恆定製造。種子培養物相對於總培養基之分率(例如，百分比)對生長動力學具有顯著影響。範圍可為醱酵器工作體積之1%至5%。培養基之初始pH可與方法設定點不同。pH應激在低細胞濃度下可能為不利的；初始pH可在pH 7.5與方法設定點之間。接種期間系統中之攪拌及氣流可與方法設定點不同。由兩種條件所致的物理及化學應激在低細胞濃度下可能為不利的。
方法條件及控制設定可能會影響微生物生長之動力學及細胞活性。方法條件之變化可能會改變膜組成、代謝物之產量、生長速率、細胞應激等。生長之最佳溫度範圍可隨菌株而變化。範圍可為20℃至40℃。細胞生長之最佳pH及後續活動之效能可隨菌株變化。範圍可為pH 5至pH 8。溶解於培養基中之氣體可由細胞使用以供代謝。可能需要在整個方法中調整O2
、CO2
及N2
之濃度。營養物質之可利用率可改變細胞生長。當可使用過量營養物質時，微生物可具有替代性動力學。
醱酵結束時及收集期間的微生物狀態可影響細胞存活及活性。可在收集之前即預處理微生物以針對參與分離及後續處理之物理及化學應激更好地製備其。溫度變化(通常降低至20℃至5℃)可降低細胞代謝、減緩生長(及/或死亡)及自醱酵器移除時之生理學變化。離心濃度之有效性可受培養pH影響。藉由提高pH 1至2個點可改良濃度之有效性但亦可能對細胞不利。可在收集之前即刻藉由增加培養基中之鹽及/或糖之濃度來使微生物受激。以此方式受激之細胞可較好地在後續期間經受住冷凍及凍乾。
分離方法及技術可影響微生物與培養基高效分離之程度。可使用離心技術移除固體。離心濃度之有效性可能受培養pH或絮凝劑之使用影響。藉由提高pH 1至2個點可改良濃度之有效性但亦可能對細胞不利。可在收集之前即刻藉由增加培養基中之鹽及/或糖之濃度來使微生物受激。以此方式受激之細胞可較好地在後續期間經受住冷凍及凍乾。另外，亦可經由過濾分離微生物。對於純化，若細胞需要過量的克數-分鐘數才能成功地離心，則過濾要優於離心技術。可在分離前後添加賦形劑。可添加賦形劑以用於低溫保護或用於在凍乾期間進行保護。賦形劑可包括(但不限於)蔗糖、海藻糖或乳糖，且替代性地，此等賦形劑可與緩衝劑及抗氧化劑混合。在凍乾之前，將數滴與賦形劑混合之細胞集結粒浸沒在液氮中。
可藉由連續離心來進行收集。可用各種賦形劑，將產物再懸浮至所需最終濃度。可添加賦形劑以用於低溫保護或用於在凍乾期間進行保護。賦形劑可包括(但不限於)蔗糖、海藻糖或乳糖，且替代性地，此等賦形劑可與緩衝劑及抗氧化劑混合。在凍乾之前，將數滴與賦形劑混合之細胞集結粒浸沒在液氮中。
物質(包括活細菌)之凍乾，以初級乾燥開始。在初級乾燥階段期間，移除冰。此處，產生真空，且向物質供應適量熱以使冰昇華。在二級乾燥階段期間，移除結合水分子之產物。此處，使溫度升高高於初級乾燥階段，以破壞水分子與產物物質之間已形成的任何物理-化學相互作用。亦可降低壓力，以進一步增強此階段期間之解吸附。在完成冷凍乾燥過程之後，腔室可用惰性氣體(諸如氮氣)填充。可在乾燥條件下，將產物密封在冷凍乾燥器內，從而防止暴露於大氣水及污染物。
參考文獻之併入
參考文獻之併入
本文提及之所有公開案及專利申請案均以全文引用之方式併入本文中，如同各個別公開案或專利申請案特定地且獨立地以引用之方式併入本文中一般。在有衝突的情況下，以本申請案(包括本文中之任何定義)為準。
等效方案
等效方案
熟習此項技術者將認識到或能夠僅使用常規實驗確定本文所述的本發明之具體實施例之許多等效方案。此類等效方案意欲由以下申請專利範圍涵蓋。
圖 1
顯示在基於KLH的遲發型超敏反應小鼠模型中，與媒劑(陰性對照)及消炎性地塞米松(Dexamethasone) (陽性對照)相比，口服投與之布勞特氏菌株A在降低抗原特異性耳部腫脹(耳部厚度)方面之功效。
圖 2
為顯示在12天時段內在急性DSS誘導之結腸炎模型中，與另一布勞特氏菌株(布勞特氏菌株X)、陽性對照(抗p40)及陰性對照(蔗糖媒劑)相比，針對布勞特氏菌株A之體重變化百分比。與抗p40抗體(陽性對照)相比，布勞特氏菌株A組顯示較少的體重變化。
圖 3A
顯示布勞特氏菌及奧貝膽酸(OCA)對餵食MCD飲食之小鼠中的肝總膽固醇之影響。
圖 3B
顯示布勞特氏菌及奧貝膽酸(OCA)對餵食MCD飲食之小鼠中的肝三酸甘油酯之影響。
圖 3C
顯示布勞特氏菌及奧貝膽酸(OCA)對餵食MCD飲食之小鼠中的纖維化評分之影響。
圖 3D
顯示布勞特氏菌在接受甲硫胺酸膽鹼缺乏(MCD)飲食，引發NASH症狀之小鼠中在降低NASH活動度評分(NAS)方面為有效的。
國外寄存
美國；American Type Culture Collection (ATCC)；2018/10/4；PTA-125346
國內寄存
食品工業發展研究所；108年2月19日；BCRC 910874
美國；American Type Culture Collection (ATCC)；2018/10/4；PTA-125346
國內寄存
食品工業發展研究所；108年2月19日；BCRC 910874
Claims (128)
- 一種治療個體中疾病之方法，其包含向該個體投與包含布勞特氏(Blautia )菌株A之細菌組合物。
- 如請求項1之方法，其中該布勞特氏菌株A為包含與布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之核苷酸序列有至少90%基因組、16S及/或CRISPR序列一致性的菌株。
- 如請求項1之方法，其中該布勞特氏菌株A為包含與該布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之核苷酸序列有至少99%基因組、16S及/或CRISPR序列一致性的菌株。
- 如請求項1之方法，其中該布勞特氏菌株A為該布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)。
- 如請求項1之方法，其中該細菌組合物包含經分離之布勞特氏菌株A細胞外囊泡(EV)。
- 如請求項5之方法，其中該細菌組合物包含布勞特氏菌株A細胞外囊泡(EV)及布勞特氏菌株A細菌。
- 如請求項6之方法，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及布勞特氏菌株A細菌粒子之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A EV：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項6之方法，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及細菌粒子之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A細菌：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項6之方法，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及布勞特氏菌株A細菌蛋白質之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A EV蛋白質：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項6之方法，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及布勞特氏菌株A細菌蛋白質之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A細菌蛋白質：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項6之方法，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及細菌脂質之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A EV脂質：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項6之方法，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及布勞特氏菌株A細菌脂質之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A細菌脂質：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項1之方法，其中該細菌組合物包含分離自EV之布勞特氏菌株A細菌。
- 如請求項1至13中任一項之方法，其中該疾病為免疫病症。
- 如請求項1至14中任一項之方法，其中該免疫病症係選自：過敏反應、發炎疾病、發炎性腸病、克羅恩氏病(Crohn's disease)、潰瘍性結腸炎、遲發型過敏、自體免疫心肌炎、肉芽腫、周邊神經病、橋本氏甲狀腺炎(Hashimoto's thyroiditis)、結腸發炎、結腸炎、顯微性結腸炎、膠原性結腸炎、轉流性結腸炎(diversion colitis)、化學性結腸炎、缺血性結腸炎、未定型結腸炎、非常型結腸炎、多發性硬化、橋本氏病、過敏性疾病、食物過敏、花粉症、哮喘、感染性疾病、艱難梭菌(Clostridium difficile)感染、發炎疾病、TNF介導之發炎疾病、胃腸道之發炎疾病、結腸袋炎(pouchitis)、心血管發炎性病狀、動脈粥樣硬化、發炎肺病、慢性阻塞性肺病、關節炎、骨關節炎、類風濕性關節炎、牛皮癬性關節炎、僵直性脊椎炎、急性及慢性感染性關節炎、與痛風及假性痛風相關之關節炎、幼年特發性關節炎、肌腱炎、滑膜炎、腱鞘炎、滑囊炎、纖維組織炎、肌肉纖維疼痛、上髁炎、肌炎及骨炎、佩吉特氏病(Paget's disease)、恥骨炎、囊性纖維性骨炎、眼部免疫病症、瞼炎、眼瞼鬆弛、結膜炎、淚腺炎、角膜炎、乾燥性角膜結膜炎(乾眼)、鞏膜炎、倒睫、葡萄膜炎、神經系統免疫病症、腦炎、格-巴二氏症候群(Guillain-Barre syndrome)、腦膜炎、神經肌僵直、發作性睡病、多發性硬化、脊髓炎、精神分裂症、血管結構或淋巴系統之發炎、關節硬化、關節炎、靜脈炎、血管炎、淋巴管炎、消化系統免疫病症、膽管炎、膽囊炎、腸炎、小腸結腸炎、胃炎、胃腸炎、迴腸炎、直腸炎、大腸急躁症、顯微性結腸炎、淋巴球性-漿細胞腸炎、腹腔病、膠原性結腸炎、淋巴球性結腸炎、嗜酸性小腸結腸炎、未定型結腸炎、偽膜性結腸炎(壞死性結腸炎)、缺血性發炎性腸病、白塞氏病(Behcet's disease)、類肉瘤病、硬皮病、IBD相關發育不良、發育不良相關聯腫塊或病變、原發性硬化性膽管炎、生殖系統免疫病症、子宮頸炎、絨膜羊膜炎、子宮內膜炎、附睪炎、臍帶炎、卵巢炎、睪丸炎、輸卵管炎、輸卵管卵巢膿腫、尿道炎、陰道炎、外陰炎、外陰疼痛、自體免疫病狀、急性散播性一般禿頭症、白塞氏病、卻格司氏病(Chagas' disease)、慢性疲勞症候群、自主神經障礙、腦脊髓炎、僵直性脊椎炎、再生不全性貧血、化膿性汗腺炎、自體免疫肝炎、自體免疫卵巢炎、乳糜瀉、第1型糖尿病、巨大細胞動脈炎、古巴士德氏症候群(goodpasture's syndrome)、格雷氏病(Grave's disease)、格-巴二氏症候群(Guillain-Barre syndrome)、亨偌-絲奇恩賴紫瘢(Henoch-Schonlein purpura)、川崎氏病(Kawasaki's disease)、紅斑狼瘡、顯微性結腸炎、顯微性多動脈炎、混合性結締組織病、穆-韋二氏症候群(Muckle-Wells syndrome)、多發性硬化、重症肌無力、斜視眼陣攣肌陣攣症候群、視神經炎、奧德氏甲狀腺炎(ord's thyroiditis)、天疱瘡、結節性多動脈炎、多肌痛、類風濕性關節炎、萊特爾氏症候群(Reiter's syndrome)、休格連氏症候群(Sjogren's syndrome)、顳動脈炎、韋格納氏肉芽腫病(Wegener's granulomatosis)、溫式自體免疫溶血性貧血、間質性膀胱炎、萊姆病(Lyme disease)、硬斑病、牛皮癬、類肉瘤病、硬皮病、潰瘍性結腸炎、白斑病、T細胞介導之過敏性疾病、接觸性過敏、接觸性皮膚炎、蕁麻疹、皮膚過敏、呼吸道過敏、花粉熱、過敏性鼻炎、室內塵蟎過敏、麩質敏感性腸病、乳糜瀉、闌尾炎、皮膚炎、皮肌炎、心內膜炎、纖維組織炎、齒齦炎、舌炎、肝炎、化膿性汗腺炎、虹膜炎、喉炎、乳房炎、心肌炎、腎炎、耳炎、胰臟炎、腮腺炎、心包炎、腹膜炎、咽炎、胸膜炎、局部肺炎、前列腺炎、腎盂腎炎、口炎、移植排斥、急性胰臟炎、慢性胰臟炎、急性呼吸窘迫症候群、塞紮萊症候群(Sexary's syndrome)、先天性腎上腺增生、非化膿性甲狀腺炎、高鈣血症相關癌症、天疱瘡、大皰性疱疹樣皮膚炎、嚴重多形性紅斑、剝脫性皮膚炎、皮脂溢性皮膚炎、季節性或常年性過敏性鼻炎、支氣管哮喘、接觸性皮膚炎、異位性皮膚炎、藥物超敏反應、過敏性結膜炎、角膜炎、眼帶狀疱疹、虹膜炎及虹膜睫狀體炎、脈絡膜視網膜炎、視神經炎、症狀性類肉瘤病、暴發性或散播性肺結核化學療法、成人特發性血小板減少性紫瘢、成人繼發性血小板減少、後天性(自體免疫)溶血性貧血、成人白血病及淋巴瘤、兒童急性白血病、局部性腸炎、自體免疫血管炎、多發性硬化、慢性阻塞性肺病、實體器官移植排斥、敗血症、類風濕性關節炎、牛皮癬性關節炎、多發性硬化、第1型糖尿病、哮喘、發炎性腸病、全身性紅斑狼瘡、牛皮癬、慢性阻塞性肺病、伴有感染性病狀之發炎及敗血症。
- 如請求項1至4中任一項之方法，其中該免疫病症為遲發型過敏、過敏性接觸性皮炎、自體免疫心肌炎、第1型糖尿病、肉芽腫、周邊神經病、橋本氏甲狀腺炎、多發性硬化、類風濕性關節炎、結腸發炎、結腸炎、潰瘍性結腸炎、顯微性結腸炎、膠原性結腸炎、轉流性結腸炎、化學性結腸炎、缺血性結腸炎、未定型結腸炎、非常型結腸炎、消化疾病、克羅恩氏病或發炎性腸病。
- 如請求項1至13中任一項之方法，其中該疾病為癌症。
- 如請求項17之方法，其中該癌症係選自由以下組成之群：惡性血液病、急性非淋巴球性白血病、慢性淋巴球性白血病、急性顆粒球性白血病、慢性顆粒球性白血病、急性前髓細胞性白血病、成人T細胞白血病、白血球缺乏性白血病、白血球性白血病、嗜鹼性白血病、母細胞性白血病、牛白血病、慢性骨髓細胞性白血病、皮膚白血病、胚胎性白血病、嗜酸性白血病、格羅斯白血病(Gross' leukemia)、里德爾細胞白血病(Rieder cell leukemia)、希林氏白血病(Schilling's leukemia)、幹細胞性白血病、亞白血性白血病、未分化細胞白血病、毛細胞白血病、血母細胞性白血病(hemoblastic leukemia)、成血細胞性白血病(hemocytoblastic leukemia)、組織細胞白血病、急性單核球性白血病、白血球減少性白血病、淋巴性白血病、淋巴母細胞白血病、淋巴球性白血病、淋巴生成白血病、淋巴細胞性白血病、淋巴肉瘤細胞白血病、肥大細胞白血病、巨核細胞白血病、小骨髓母細胞性白血病、單核球性白血病、骨髓母細胞性白血病、骨髓細胞性白血病、骨髓顆粒球性白血病、骨髓單核球性白血病、內格利白血病(Naegeli leukemia)、漿細胞白血病、漿球性白血病、前髓細胞性白血病、腺泡癌、腺泡狀癌瘤、腺囊癌、腺樣囊性癌症、腺瘤癌、腎上腺皮質癌、肺泡癌、肺泡細胞癌、基底細胞癌、基底樣細胞癌、基底樣癌瘤、基底鱗狀細胞癌、細支氣管肺泡癌、細支氣管癌、支氣管癌、腦癌、膽管細胞癌、絨毛膜癌、膠樣癌、粉刺癌、子宮體癌、篩骨狀癌、鎧甲狀癌、皮狀癌、柱狀癌、柱狀細胞癌、導管癌、硬癌、胚胎性瘤、腦狀癌瘤、表皮樣癌、腺狀上皮癌、外生性癌、潰瘍性癌、纖維癌、膠體癌、膠狀癌、巨細胞癌、印戒細胞癌、單純癌、小細胞癌、馬鈴薯狀癌、球狀細胞癌、梭細胞癌、髓狀癌、鱗狀癌、鱗狀細胞癌、繩捆癌、毛細管擴張癌(carcinoma telangiectaticum)、血管擴張性癌(carcinoma telangiectodes)、移行細胞癌、塊狀癌、結節性癌、疣狀癌、絨毛狀癌、巨細胞癌、腺癌、粒層細胞癌、毛髮基質癌、血樣癌、肝細胞癌、何氏細胞癌(Hurthle cell carcinoma)、透明細胞癌、腎上腺樣癌、嬰兒胚胎性瘤、原位癌、表皮內癌瘤、上皮內癌瘤、侵蝕性潰瘍(Krompecher's carcinoma)、庫爾契茨基細胞癌(Kulchitzky-cell carcinoma)、大細胞癌、豆狀癌(lenticular carcinoma)、豆狀癌瘤(carcinoma lenticulare)、脂肪瘤樣癌、淋巴上皮癌、髓樣癌(carcinoma medullare)、髓性癌、黑色素癌、髓樣癌(carcinoma molle)、黏液性癌、黏液癌、黏液細胞癌、黏液表皮樣癌、黏膜癌、黏液癌瘤、黏液瘤樣癌、鼻咽癌、燕麥細胞癌、骨化性癌、骨樣癌、乳頭狀癌、門脈周性癌、原位癌(preinvasive carcinoma)、棘細胞癌、腦樣癌、腎臟之腎細胞癌、儲備細胞癌、肉瘤樣癌、施耐德癌(schneiderian carcinoma)、硬癌(scirrhous carcinoma)、陰囊癌、 軟骨肉瘤、纖維肉瘤、淋巴肉瘤、黑素肉瘤、黏液肉瘤、骨肉瘤、子宮內膜肉瘤、基質肉瘤、尤文氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、筋膜肉瘤、纖維母細胞肉瘤、巨細胞肉瘤、艾伯內西式肉瘤(Abemethy's sarcoma)、脂肉瘤、脂肪肉瘤、軟組織肺泡狀肉瘤、成釉細胞肉瘤、葡萄樣肉瘤、綠色瘤、絨膜癌、胚胎肉瘤、威耳姆士腫瘤(Wilms' tumor sarcoma)、顆粒球性肉瘤、霍奇金氏肉瘤(Hodgkin's sarcoma)、特發性多發性色素性出血性肉瘤、B細胞之免疫母細胞肉瘤、淋巴瘤、T細胞之免疫母細胞肉瘤、詹恩遜氏肉瘤(Jensen's sarcoma)、卡堡氏肉瘤(Kaposi's sarcoma)、庫普弗細胞肉瘤(Kupffer cell sarcoma)、血管肉瘤、白血病性肉瘤、惡性間質瘤肉瘤、骨膜外肉瘤、網狀細胞肉瘤、勞斯肉瘤(Rous sarcoma)、漿液囊性肉瘤、滑膜肉瘤、毛細管擴張性肉瘤、霍奇金氏疾病、非霍奇金氏淋巴瘤、多發性骨髓瘤、神經母細胞瘤、乳癌、卵巢癌、肺癌、橫紋肌肉瘤、原發性血小板增多症、原發性巨球蛋白血症、小細胞肺腫瘤、原發性腦瘤、胃癌、結腸癌、惡性胰島瘤、惡性類癌、癌前皮膚病變、睪丸癌、淋巴瘤、甲狀腺癌、神經母細胞瘤、食道癌、泌尿生殖道癌、惡性高鈣血症、子宮頸癌、子宮內膜癌、腎上腺皮質癌、哈帕二氏黑素瘤(Harding-Passey melanoma)、青少年黑素瘤、惡性雀斑樣痣黑素瘤、惡性黑素瘤、肢端雀斑黑素瘤、無黑色素性黑素瘤、良性青少年黑素瘤、克勞德曼黑素瘤(Cloudman's melanoma)、S91黑素瘤、結節性黑素瘤、陰囊黑素瘤及淺表擴散性黑素瘤。
- 如前述請求項中任一項之方法，其中該細菌組合物係經口、經直腸、靜脈內、瘤內或皮下投與。
- 如請求項1至7中任一項之方法，其中該細菌組合物中至少50%之該等細菌為布勞特氏菌株A。
- 如請求項1至7中任一項之方法，其中該細菌組合物中至少90%之該等細菌為布勞特氏菌株A。
- 如請求項1至7中任一項之方法，其中該細菌組合物中實質上所有之該等細菌為布勞特氏菌株A。
- 如請求項1至10中任一項之方法，其中該細菌組合物包含至少1 × 106 個菌落形成單位(CFU)之布勞特氏菌株A。
- 如請求項11之方法，其中該細菌組合物包含至少1 × 107 CFU布勞特氏菌株A。
- 如請求項1之方法，其中該細菌組合物包含至少1 × 108 CFU之布勞特氏菌株A。
- 如請求項1至13中任一項之方法，其中該細菌組合物以兩次或多於兩次劑量投與。
- 如請求項14之方法，其中向該個體投與之該等兩次或多於兩次劑量相隔至少1天。
- 如請求項15之方法，其中該等兩次或多於兩次劑量之投與相隔至少1週。
- 如請求項1至16中任一項之方法，其中該細菌組合物包含活細菌。
- 如請求項1至16中任一項之方法，其中該細菌組合物包含經減毒細菌。
- 如請求項1至19中任一項之方法，其中該細菌組合物包含經殺滅細菌。
- 如請求項31之方法，其中該細菌組合物包含經照射細菌。
- 如請求項31之方法，其中該細菌組合物包含經γ照射之細菌。
- 如請求項1至33中任一項之方法，其中投與該細菌組合物治療該免疫病症。
- 如請求項1至34中任一項之方法，其中投與該細菌組合物誘導免疫反應。
- 如請求項1至35中任一項之方法，其中該方法進一步包含向該個體投與額外治療劑。
- 如請求項36之方法，其中該額外治療劑係選自由以下組成之群：免疫抑制劑、DMARD、疼痛控制藥物、類固醇、非類固醇消炎藥(NSAID)、細胞介素拮抗劑、環孢素、類視黃素、皮質類固醇、丙酸衍生物、乙酸衍生物、烯醇酸衍生物、芬那酸衍生物、Cox-2抑制劑、盧米羅可(lumiracoxib)、布洛芬、水楊酸膽鹼鎂、非諾洛芬(fenoprofen)、雙水楊酸酯、二氟尼柳(difunisal)、托美丁(tolmetin)、酮洛芬(ketoprofen)、氟比洛芬(flurbiprofen)、奧沙普嗪(oxaprozin)、吲哚美辛(indomethacin)、舒林酸、依託度酸(etodolac)、酮咯酸、萘丁美酮(nabumetone)、萘普生(naproxen)、伐地昔布(valdecoxib)、依他昔布(etoricoxib)、MK0966；羅非昔布(rofecoxib)、乙醯胺苯酚、塞內昔布(Celecoxib)、雙氯芬酸、曲馬多(tramadol)、吡羅昔康(piroxicam)、美洛昔康(meloxicam)、替諾昔康(tenoxicam)、屈噁昔康(droxicam)、氯諾昔康(lornoxicam)、伊索昔康(isoxicam)、甲芬那酸、甲氯芬那酸、氟芬那酸、托芬那酸、伐地昔布(valdecoxib)、帕瑞昔布(parecoxib)、依託度酸、吲哚美辛、阿司匹林、布洛芬、非羅昔布(firocoxib)、甲胺喋呤(MTX)、抗瘧疾藥物、羥基氯奎、氯奎、柳氮磺胺吡啶、來氟米特(Leflunomide)、硫唑嘌呤、環孢素、金鹽、二甲胺四環素、環磷醯胺、D-青黴胺、 二甲胺四環素、金諾芬(auranofin)、他克莫司(tacrolimus)、硫代苯酸金鈉(myocrisin)、氯芥苯丁酸、TNF α拮抗劑、TNF α拮抗劑、TNF α受體拮抗劑、阿達木單抗(ADALIMUMAB) (Humira®)、依那西普(ETANERCEPT) (Enbrel®)、英利昔單抗(INFLIXIMAB) (Remicade®；TA-650)、聚乙二醇化賽妥珠單抗(CERTOLIZUMAB PEGOL) (Cimzia®；CDP870)、戈利木單抗(GOLIMUMAB) (Simpom®；CNTO 148)、阿那白滯素(ANAKINRA) (Kineret®)、利妥昔單抗(Rituxan®；MabThera®)、阿巴西普(ABATACEPT) (Orencia®)、托西利單抗(TOCILIZUMAB) (RoActemra/Actemra®)、整合素拮抗劑、TYSABRI® (那他珠單抗(natalizumab))、IL-1拮抗劑、ACZ885 (Ilaris)、阿那白滯素(Kineret®)、CD4拮抗劑、IL-23拮抗劑、IL-20拮抗劑、IL-6拮抗劑、 BLyS拮抗劑、阿塞西普(Atacicept)、Benlysta®/LymphoStat-B® (貝利單抗(belimumab))、p38抑制劑、CD20拮抗劑、奧克珠單抗(Ocrelizumab)、奧伐木單抗(Ofatumumab) (Arzerra®)、干擾素γ拮抗劑、芳妥珠單抗(Fontolizumab)、潑尼龍、強的松、地塞米松、皮質醇、皮質酮、氫皮質酮、甲基潑尼龍、倍他米松(betamethasone)、曲安西龍(triamcinolone)、倍氯米松(beclometasome)、氟氫可的松(fludrocortisone)、去氧皮質固酮、醛固酮、多西環素、萬古黴素、吡格列酮(pioglitazone)、SBI-087、SCIO-469、Cura-100、Oncoxin+Viusid、TwHF、甲氧沙林、維生素D-麥角鈣化醇、米那普侖(Milnacipran)、太平洋紫杉醇、羅格他酮(rosig tazone)、他克莫司(Tacrolimus) (Prograf®)、RADOOl、雷帕鳴(rapamune)、雷帕黴素(rapamycin)、福他替尼(fostamatinib)、芬太尼(Fentanyl)、XOMA 052、福他替尼二鈉、羅格列酮(rosightazone)、薑黃素(Longvida™)、羅素他汀(Rosuvastatin)、馬拉維若(Maraviroc)、雷米普利(ramipril)、米那普侖、考比前列酮(Cobiprostone)、索馬托品(somatropin)、tgAAC94基因療法載體、MK0359、GW856553、埃索美拉唑(esomeprazole)、依維莫司(everolimus)、曲妥珠單抗、JAKl及JAK2抑制劑、泛JAK抑制劑，例如四環吡啶酮6 (P6)、325、PF-956980、德諾單抗(denosumab)、IL-6拮抗劑、CD20拮抗劑、CTLA4拮抗劑、IL-8拮抗劑、IL-21拮抗劑、IL-22拮抗劑、整合素拮抗劑(Tysarbri® (那他珠單抗))、VGEF拮抗劑、CXCL拮抗劑、MMP拮抗劑、防禦素拮抗劑、IL-1拮抗劑、IL-1 β拮抗劑)、IL-23拮抗劑、受體誘餌、拮抗性抗體、皮質類固醇、美沙拉嗪(mesalazine)、美塞拉明(mesalamine)、柳氮磺胺吡啶、柳氮磺胺吡啶衍生物、免疫抑制藥物、環孢素A、巰基嘌呤、硫唑嘌呤、潑尼松、甲胺喋呤、抗組織胺、糖皮質激素、腎上腺素、茶鹼、色甘酸鈉、抗白三烯、用於鼻炎之抗膽鹼激導性藥物、TLR拮抗劑、炎性體抑制劑、抗膽鹼激導性解充血劑、肥大細胞穩定劑、單株抗IgE抗體、疫苗、細胞介素抑制劑、抗IL-6抗體、TNF抑制劑、英利昔單抗、阿達木單抗、聚乙二醇化賽妥珠單抗、戈利木單抗及依那西普。
- 如請求項36之方法，其中該額外治療劑為抗生素。
- 如請求項38之方法，其中該抗生素係選自由以下組成之群：胺基糖苷、安莎黴素(ansamycin)、碳頭孢烯、碳青黴烯、頭胞菌素、醣肽、林可醯胺類、脂肽、巨環內酯、單環β-內醯胺類、硝基呋喃、唑烷酮、青黴素、多肽抗生素、喹諾酮、氟喹諾酮、磺醯胺、四環素、抗分支桿菌化合物及其組合。
- 如請求項36之方法，其中該額外治療劑為癌症治療劑。
- 如請求項40之方法，其中該癌症治療劑包含化學治療劑。
- 如請求項41之方法，其中該化學治療劑係選自由以下組成之群：噻替派(thiotepa)、環磷醯胺、白消安(busulfan)、英丙舒凡(improsulfan)、哌泊舒凡(piposulfan)、苯唑多巴(benzodopa)、卡波醌(carboquone)、米特多巴(meturedopa)、尤利多巴(uredopa)、六甲蜜胺、曲他胺(triethylenemelamine)、三伸乙基磷醯胺、三伸乙基硫代磷醯胺、三羥甲基三聚氰胺(trimethylolomelamine)、布拉他辛(bullatacin)、布拉他辛酮(bullatacinone)、喜樹鹼、拓朴替康(topotecan)、苔蘚抑素(bryostatin)、海洋抑素(callystatin)、CC-1065、念珠藻環肽(cryptophycin) 1、念珠藻環肽8、海兔毒素(dolastatin)、倍癌黴素(duocarmycin)、艾榴素(eleutherobin)、水鬼蕉鹼(pancratistatin)、匍枝珊瑚醇(sarcodictyin)、海綿抑素(spongistatin)、氯芥苯丁酸(chlorambucil)、萘氮芥(chlornaphazine)、氯磷醯胺、雌氮芥(estramustine)、異環磷醯胺、二氯甲基二乙胺(mechlorethamine)、鹽酸氧二氯甲基二乙胺、美法侖(melphalan)、新恩比興(novembichin)、芬司特瑞(phenesterine)、潑尼氮芥(prednimustine)、曲磷胺(trofosfamide)、尿嘧啶氮芥(uracil mustard)、卡莫司汀(carmustine)、氯脲菌素(chlorozotocin)、福莫司汀(fotemustine)、洛莫司汀(lomustine)、尼莫司汀(nimustine)、雷莫司汀(ranimnustine)、卡奇黴素(calicheamicin)、達內黴素(dynemicin)、氯屈膦酸鹽(clodronate)、埃斯培拉黴素(esperamicin)、新抑癌蛋白(neocarzinostatin)發色團、阿克拉黴素(aclacinomysin)、放射菌素(actinomycin)、奧納黴素(authrarnycin)、偶氮絲胺酸、博萊黴素(bleomycin)、放線菌素C、卡拉比辛(carabicin)、洋紅黴素(carminomycin)、嗜癌菌素(carzinophilin)、色黴素(chromomycinis)、放線菌素D、道諾黴素(daunorubicin)、地托比星(detorubicin)、6-重氮-5-側氧基-L-正白胺酸、小紅莓(doxorubicin)、表柔比星(epirubicin)、依索比星(esorubicin)、艾達黴素(idarubicin)、麻西羅黴素(marcellomycin)、絲裂黴素(mitomycins)、絲裂黴素C、黴酚酸(mycophenolic acid)、諾拉黴素(nogalarnycin)、橄欖黴素(olivomycin)、培洛黴素(peplomycin)、潑非黴素(potfiromycin)、嘌呤黴素(puromycin)、奎那黴素(quelamycin)、羅多比星(rodorubicin)、鏈黑黴素(streptonigrin)、鏈脲菌素(streptozocin)、殺結核菌素(tubercidin)、烏苯美司(ubenimex)、淨司他丁(zinostatin)、佐柔比星(zorubicin)、甲胺喋呤(methotrexate)、5-氟尿嘧啶(5-FU)、迪諾特寧(denopterin)、甲胺喋呤(methotrexate)、蝶羅呤(pteropterin)、曲美沙特(trimetrexate)、氟達拉濱(fludarabine)、6-巰基嘌呤、硫米嘌呤(thiamiprine)、硫鳥嘌呤、安西他濱(ancitabine)、阿紮胞苷、6-氮尿苷、卡莫氟(carmofur)、阿糖胞苷(cytarabine)、二去氧尿苷、去氧氟尿苷、依諾他濱(enocitabine)、氟尿苷、卡魯睪酮(calusterone)、丙酸屈他雄酮(dromostanolone propionate)、環硫雄醇(epitiostanol)、美雄烷(mepitiostane)、睪內酯、胺格魯米特(aminoglutethimide)、米托坦(mitotane)、曲洛司坦(trilostane)、亞葉酸、醋葡醛內酯、醛磷醯胺糖苷、胺基乙醯丙酸、恩尿嘧啶(eniluracil)、安吖啶(amsacrine)、貝斯布西(bestrabucil)、比生群(bisantrene)、依達曲沙(edatraxate)、地磷醯胺(defofamine)、秋水仙胺(demecolcine)、地吖醌(diaziquone)、艾福米辛(elformithine)、依利醋銨(elliptinium acetate)、埃博黴素(epothilone)、依託格魯(etoglucid)、硝酸鎵、羥基脲、蘑菇多醣(lentinan)、氯尼達明(lonidainine)、美登素(maytansine)、安絲菌素(ansamitocins)、米托胍腙(mitoguazone)、米托蒽醌(mitoxantrone)、莫哌達醇(mopidanmol)、硝拉維林(nitraerine)、噴司他汀(pentostatin)、凡那明(phenamet)、吡柔比星(pirarubicin)、洛索蒽醌(losoxantrone)、鬼臼酸、2-乙基醯肼、丙卡巴肼(procarbazine)、PSK多醣複合物、雷佐生(razoxane)、根瘤菌素(rhizoxin)、西佐喃(sizofiran)、鍺螺胺(spirogermanium)、細交鏈孢菌酮酸(tenuazonic acid)、三亞胺醌(triaziquone)、2,2',2''-三氯三乙胺、單端孢黴烯(trichothecene)、T-2毒素、弗納庫林A (verracurin A)、桿孢菌素A (roridin A)、蛇形菌素(anguidine)、烏拉坦(urethan)、長春地辛(vindesine)、達卡巴嗪(dacarbazine)、甘露氮芥(mannomustine)、二溴甘露醇(mitobronitol)、二溴衛矛醇(mitolactol)、哌泊溴烷(pipobroman)、甲托辛(gacytosine)、阿拉伯糖苷、環磷醯胺、噻替派、太平洋紫杉醇、多西他賽(doxetaxel)、氯芥苯丁酸、吉西他濱(gemcitabine)、6-硫代鳥嘌呤、巰基嘌呤、甲胺喋呤、順鉑(cisplatin)、奧沙利鉑(oxaliplatin)、卡鉑(carboplatin)、長春鹼、鉑、依託泊苷(etoposide)、異環磷醯胺、米托蒽醌(mitoxantrone)、長春新鹼、長春瑞濱(vinorelbine)、諾凡特龍(novantrone)、替尼泊苷(teniposide)、依達曲沙(edatrexate)、柔紅黴素(daunomycin)、胺基喋呤、希羅達(xeloda)、伊班膦酸鹽(ibandronate)、伊立替康(irinotecan)、RFS 2000、二氟甲基鳥胺酸、視黃酸及卡培他濱(capecitabine)。
- 如請求項40至42中任一項之方法，其中該癌症治療劑包含癌症免疫療法藥劑。
- 如請求項43之方法，其中該癌症免疫療法藥劑包含免疫檢查點抑制劑。
- 如請求項44之方法，其中該免疫檢查點抑制劑為特異性結合至免疫檢查點蛋白之抗體或其抗原結合片段。
- 如請求項44之方法，其中該免疫檢查點蛋白係選自由以下組成之群：CTLA4、PD-1、PD-L1、PD-L2、A2AR、B7-H3、B7-H4、BTLA、KIR、LAG3、TIM-3或VISTA。
- 如請求項44之方法，其中該免疫檢查點抑制劑係選自由以下組成之群：納武單抗、派立珠單抗、皮立珠單抗(pidilizumab)、AMP-224、AMP-514、STI-A1110、TSR-042、RG-7446、BMS-936559、MEDI-4736、MSB-0020718C、AUR-012及STI-A1010。
- 如請求項43至47中任一項之方法，其中該癌症免疫療法藥劑包含癌症特異性抗體或其抗原結合片段。
- 如請求項48之方法，其中該癌症特異性抗體或其抗原結合片段特異性結合至癌症相關抗原。
- 如請求項49之方法，其中該癌症相關抗原係選自由以下組成之群：親脂素、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX (L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-連環蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、細胞週期素D1、細胞週期素-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH (hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、第二型穿膜絲胺酸蛋白酶、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸道羧基酯酶、K-ras、激肽釋放酶4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1 (亦稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、Lengsin、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺球蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、黑色素-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、肌凝蛋白I類、N-raw、NA88-A、neo-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、 pml-RARα融合蛋白、多形上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活素、SYT-SSX1或SYT-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、丙糖磷酸異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1及XAGE-1b/GAGED2a。
- 如請求項50之方法，其中該癌症相關抗原為新抗原。
- 如請求項43至51中任一項之方法，其中該癌症免疫療法藥劑包含癌症疫苗。
- 如請求項52之方法，其中該癌症疫苗包含多肽，該多肽包含癌症相關抗原之抗原決定基。
- 如請求項53之方法，其中該癌症相關抗原係選自由以下組成之群：親脂素、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX (L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-連環蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、細胞週期素D1、細胞週期素-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH (hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、第二型穿膜絲胺酸蛋白酶、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸道羧基酯酶、K-ras、激肽釋放酶4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1 (亦稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、Lengsin、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺球蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、黑色素-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、肌凝蛋白I類、N-raw、NA88-A、neo-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、 pml-RARα融合蛋白、多形上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活素、SYT-SSX1或SYT-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、丙糖磷酸異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1及XAGE-1b/GAGED2a。
- 如請求項53之方法，其中該癌症相關抗原為新抗原。
- 如請求項53至55中任一項之方法，其中該多肽為融合蛋白。
- 如請求項52之方法，其中該癌症疫苗包含編碼癌症相關抗原之抗原決定基之核酸。
- 如請求項57之方法，其中該癌症相關抗原係選自由以下組成之群：親脂素、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX (L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-連環蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、細胞週期素D1、細胞週期素-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH (hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、第二型穿膜絲胺酸蛋白酶、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸道羧基酯酶、K-ras、激肽釋放酶4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1 (亦稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、Lengsin、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺球蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、黑色素-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、肌凝蛋白I類、N-raw、NA88-A、neo-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、 pml-RARα融合蛋白、多形上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活素、SYT-SSX1或SYT-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、丙糖磷酸異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1及XAGE-1b/GAGED2a。
- 如請求項57之方法，其中該癌症相關抗原為新抗原。
- 如請求項57至59中任一項之方法，其中該核酸為DNA。
- 如請求項57至59中任一項之方法，其中該核酸為RNA。
- 如請求項61之方法，其中該RNA為mRNA。
- 如請求項60至62中任一項之方法，其中該核酸係在載體中。
- 如請求項63之方法，其中該載體為細菌載體。
- 如請求項64之方法，其中該細菌載體係選自由以下組成之群：牛分支桿菌(Mycobacterium bovis；BCG)、鼠傷寒沙門桿菌亞種(Salmonella Typhimurium ssp.)、傷寒沙門氏菌亞種(Salmonella Typhi ssp.)、梭菌屬孢子(Clostridium sp. spore)、大腸桿菌(Escherichia coli) Nissle 1917、大腸桿菌K-12/LLO、單核球增多性李氏菌(Listeria monocytogenes)及弗氏志賀菌(Shigella flexneri)。
- 如請求項63之方法，其中該載體為病毒載體。
- 如請求項66之方法，其中該病毒載體係選自由以下組成之群：牛痘、腺病毒、RNA病毒及複製缺陷型鳥痘、複製缺陷型禽痘、複製缺陷型金絲雀痘、複製缺陷型MVA及複製缺陷型腺病毒。
- 如請求項43至67中任一項之方法，其中該免疫療法藥劑包含經癌症特異性抗原預致敏之抗原呈現細胞(APC)。
- 如請求項68之方法，其中該APC為樹突狀細胞、巨噬細胞或B細胞。
- 如請求項68或69之方法，其中該癌症相關抗原係選自由以下組成之群：親脂素、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX (L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-連環蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、細胞週期素D1、細胞週期素-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH (hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、第二型穿膜絲胺酸蛋白酶、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸道羧基酯酶、K-ras、激肽釋放酶4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1 (亦稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、Lengsin、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺球蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、黑色素-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、肌凝蛋白I類、N-raw、NA88-A、neo-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、pml-RARα融合蛋白、多形上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活素、SYT-SSX1或SYT-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、丙糖磷酸異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1及XAGE-1b/GAGED2a。
- 如請求項68或69之方法，其中該癌症相關抗原為新抗原。
- 如請求項43至71中任一項之方法，其中該免疫療法藥劑包含癌症特異性嵌合抗原受體(CAR)。
- 如請求項72之方法，其中該CAR係投與在T細胞表面上。
- 如請求項72或73之方法，其中該CAR特異性結合至癌症相關抗原。
- 如請求項74之方法，其中該癌症相關抗原係選自由以下組成之群：親脂素、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX (L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-連環蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、細胞週期素D1、細胞週期素-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH (hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、第二型穿膜絲胺酸蛋白酶、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸道羧基酯酶、K-ras、激肽釋放酶4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1 (亦稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、Lengsin、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺球蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、黑色素-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、肌凝蛋白I類、N-raw、NA88-A、neo-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、 pml-RARα融合蛋白、多形上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活素、SYT-SSX1或SYT-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、丙糖磷酸異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1及XAGE-1b/GAGED2a。
- 如請求項73之方法，其中該癌症相關抗原為新抗原。
- 如請求項43至76中任一項之方法，其中該免疫療法藥劑包含癌症特異性T細胞。
- 如請求項77之方法，其中該T細胞為CD4+ T細胞。
- 如請求項78之方法，其中該CD4+ T細胞為TH 1 T細胞、TH 2 T細胞或TH 17 T細胞。
- 如請求項77至79中任一項之方法，其中該T細胞表現對癌症相關抗原具有特異性的T細胞受體。
- 如請求項80之方法，其中該癌症相關抗原係選自由以下組成之群：親脂素、AIM-2、ALDH1A1、α-輔肌動蛋白-4、α-胎蛋白(「AFP」)、ARTC1、B-RAF、BAGE-1、BCLX (L)、BCR-ABL融合蛋白b3a2、β-連環蛋白、BING-4、CA-125、CALCA、癌胚抗原(「CEA」)、CASP-5、CASP-8、CD274、CD45、Cdc27、CDK12、CDK4、CDKN2A、CEA、CLPP、COA-1、CPSF、CSNK1A1、CTAG1、CTAG2、細胞週期素D1、細胞週期素-A1、dek-can融合蛋白、DKK1、EFTUD2、延長因子2、ENAH (hMena)、Ep-CAM、EpCAM、EphA3、上皮腫瘤抗原(「ETA」)、ETV6-AML1融合蛋白、EZH2、FGF5、FLT3-ITD、FN1、G250/MN/CAIX、GAGE-1,2,8、GAGE-3,4,5,6,7、GAS7、磷脂醯肌醇蛋白聚糖-3、GnTV、gp100/Pmel17、GPNMB、HAUS3、第二型穿膜絲胺酸蛋白酶、HER-2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A11、HLA-A2、HLA-DOB、hsp70-2、IDO1、IGF2B3、IL13Rα2、腸道羧基酯酶、K-ras、激肽釋放酶4、KIF20A、KK-LC-1、KKLC1、KM-HN-1、KMHN1 (亦稱為CCDC110)、LAGE-1、LDLR-岩藻糖基轉移酶AS融合蛋白、Lengsin、M-CSF、MAGE-A1、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-C1、MAGE-C2、蘋果酸酶、乳腺球蛋白-A、MART2、MATN、MC1R、MCSP、mdm-2、ME1、黑色素-A/MART-1、Meloe、中期因子、MMP-2、MMP-7、MUC1、MUC5AC、黏蛋白、MUM-1、MUM-2、MUM-3、肌凝蛋白、肌凝蛋白I類、N-raw、NA88-A、neo-PAP、NFYC、NY-BR-1、NY-ESO-1/LAGE-2、OA1、OGT、OS-9、P多肽、p53、PAP、PAX5、PBF、 pml-RARα融合蛋白、多形上皮黏蛋白(「PEM」)、PPP1R3B、PRAME、PRDX5、PSA、PSMA、PTPRK、RAB38/NY-MEL-1、RAGE-1、RBAF600、RGS5、RhoC、RNF43、RU2AS、SAGE、分離蛋白1、SIRT2、SNRPD1、SOX10、Sp17、SPA17、SSX-2、SSX-4、STEAP1、存活素、SYT-SSX1或SYT-SSX2融合蛋白、TAG-1、TAG-2、端粒酶、TGF-βRII、TPBG、TRAG-3、丙糖磷酸異構酶、TRP-1/gp75、TRP-2、TRP2-INT2、酪胺酸酶、酪胺酸酶(「TYR」)、VEGF、WT1及XAGE-1b/GAGED2a。
- 如請求項43至81中任一項之方法，其中該免疫療法藥劑包含免疫活化蛋白。
- 如請求項82之方法，其中該免疫活化蛋白為細胞介素或趨化因子。
- 如請求項83之方法，其中該免疫活化蛋白係選自由以下組成之群：B淋巴細胞化學引誘劑(「BLC」)、C-C基元趨化因子11 (「伊紅趨素 -1」)、嗜伊紅血球趨化性蛋白2 (「伊紅趨素-2」)、顆粒球群落刺激因子(「G-CSF」)、顆粒球巨噬細胞群落刺激因子(「GM-CSF」)、1-309、 細胞間黏附分子1 (「ICAM-1」)、干擾素α (「IFN-α」)、干擾素β (「IFN-β」)、干擾素γ (「IFN-γ」)、介白素-1α (「IL-1α」)、介白素-1β (「IL-1β」)、介白素1受體拮抗劑(「IL-1 ra」)、介白素-2 (「IL-2」)、介白素-4 (「IL-4」)、介白素-5 (「IL-5」)、介白素-6 (「IL-6」)、介白素-6可溶性受體(「IL-6 sR」)、介白素-7 (「IL-7」)、介白素-8 (「IL-8」)、介白素-10 (「IL-10」)、介白素-11 (「IL-11」)、介白素-12之β次單元(「IL-12 p40」或「IL-12 p70」)、介白素-13 (「IL-13」)、介白素-15 (「IL-15」)、介白素-16 (「IL-16」)、介白素-17A-F (「IL-17A-F」)、介白素-18 (「IL-18」)、介白素-21 (「IL-21」)、介白素-22 (「IL-22」)、介白素-23 (「IL-23」)、介白素-33 (「IL-33」)、趨化因子(C-C基元)配位體2 (「MCP-1」)、巨噬細胞群落刺激因子(「M-CSF」)、由γ干擾素誘 導之單核球激素(「MIG」)、趨化因子(C-C基元)配位體2 (「MIP-1α」)、趨化因子(C-C基元)配位體4 (「MIP-1β」)、巨噬細胞發炎蛋白-1-δ (「MIP-1δ」)、血小板衍生生長因子次單元B (「PDGF-BB」)、趨化因子(C-C基元)配位體5、調節活化正常T細胞表現及分泌(「RANTES」)、TIMP金屬肽酶抑制劑1 (「TIMP-1」)、TIMP金屬肽酶抑制劑2 (「TIMP-2 」)、腫瘤壞死因子，淋巴毒素-α (「TNF α」)、腫瘤壞死因子，淋巴毒素-β (「TNF β」)、可溶性TNF受體1型(「sTNFRI」)、sTNFRIIAR、腦衍生神經營養因子(「BDNF」)、鹼性纖維母細胞生長因子(「bFGF」)、骨形態生成蛋白4 (「BMP-4」)、骨形態生成蛋白5 (「BMP-5」)、骨形態生成蛋白7 (「BMP-7」)、神經生長因子(「b-NGF」)、表皮生長因子(「EGF」)、表皮生長因子受體(「EGFR」)、內分泌腺衍生血管內皮生長因子(「EG-VEGF」)、纖維母細胞生長因子4 (「FGF-4」)、角質細胞生長因子(「FGF-7」)、生長分化因子15 (「GDF-15」)、膠細胞衍生神經營養因子(「GDNF」)、生長激素、肝素結合EGF樣生長因子(「HB-EGF」)、肝細胞生長因子(「HGF」)、胰島素樣生長因子結合蛋白1 (「IGFBP-1」)、胰島素樣生長因子結合蛋白2 (「IGFBP-2」)、胰島素樣生長因子結合蛋白3 (「IGFBP-3」)、胰島素樣生長因子結合蛋白4 (「IGFBP-4」)、胰島素樣生長因子結合蛋白6 (「IGFBP-6」)、胰島素樣生長因子1 (「IGF-1」)、胰島素、巨噬細胞群落刺激因子(「M-CSF R」)、神經生長因子受體(「NGF R」)、神經營養蛋白-3 (「NT-3」)、神經營養蛋白-4 (「NT-4」)、破骨細胞生成抑制因子(「骨保護素」)、血小板衍生生長因子受體(「PDGF-AA」)、磷脂醯肌醇-聚糖生物合成(「PIGF」)、含有Skp、Cullin、F盒之複合體(「SCF」)、幹細胞因子受體(「SCFR」)、轉型生長因子α (「TGFα」)、轉型生長因子β-1 (「TGF β 1」)、轉型生長因子β-3 (「TGF β 3」)、血管內皮生長因子(「VEGF」)、血管內皮生長因子受體2 (「VEGFR2」)、血管內皮生長因子受體3 (「VEGFR3」)、VEGF-D 6Ckine、酪胺酸-蛋白激酶受體UFO (「Axl」)、β細胞調節素(「BTC」)、黏膜相關上皮趨化因子(「CCL28」)、趨化因子(C-C基元)配位體27 (「CTACK」)、趨化因子(C-X-C基元)配位體16 (「CXCL16」)、C-X-C基元趨化因子5 (「ENA-78」)、趨化因子(C-C基元)配位體26 (「伊紅趨素-3」)、顆粒球趨化蛋白2 (「GCP-2」)、GRO、趨化因子(C-C基元)配位體14 (「HCC-l」)、趨化因子(C-C基元)配位體16 (「HCC-4」)、介白素-9 (「IL-9」)、介白素-17F (「IL-17F」)、介白素-18-結合蛋白(「IL-18 BPa」)、介白素-28 A (「IL-28A」)、介白素29 (「IL-29」)、介白素31 (「IL-31」)、C-X-C基元趨化因子10 (「IP-10」)、趨化因子受體CXCR3 (「I-TAC」)、白血病抑制因子(「LIF」)、Light、趨化因子(C基元)配位體(「淋巴細胞趨化因子」)、 單核球化學引誘劑蛋白2 (「MCP-2」)、單核球化學引誘劑蛋白3 (「MCP-3」)、單核球化學引誘劑蛋白4 (「MCP-4」)、巨噬細胞衍生趨化因子(「MDC」)、巨噬細胞遷移抑制因子(「MIF」)、趨化因子(C-C基元)配位體20 (「MIP-3 α」)、C-C基序趨化因子19 (「MIP-3 β」)、趨化因子(C-C基元)配位體23 (「MPIF-1」)、巨噬細胞刺激蛋白α鏈(「MSPα」)、核小體裝配蛋白1樣4 (「NAP-2」)、分泌型磷蛋白1 (「骨橋蛋白」)、肺及活化調節細胞介素(「PARC」)、血小板因子4 (「PF4」)、基質細胞衍生因子-1α (「SDF-1 α」)、趨化因子(C-C基元)配位體17 (「TARC」)、胸腺表現趨化因子(「TECK」)、胸腺基質淋巴生成素(「TSLP 4- IBB」)、CD 166抗原(「ALCAM」)、分化叢集80 (「B7-1」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員17 (「BCMA」)、分化叢集14 (「CD14」)、分化叢集30 (「CD30」)、分化叢集40 (「CD40配位體」)、癌胚抗原相關細胞黏附分子1 (膽糖蛋白) (「CEACAM-1」)、死亡受體6 (「DR6」)、去氧胸苷激酶(「Dtk」)、1型膜糖蛋白(「內皮因子」)、受體酪胺酸-蛋白激酶erbB-3(「ErbB3」)、內皮細胞-白細胞黏附分子1 (「E-選擇蛋白」)、細胞凋亡抗原1 (「Fas」)、Fms樣酪胺酸激酶3 (「Flt-3L」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員1 (「GITR」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員14 (「HVEM」)、細胞間黏附分子3 (「ICAM-3」)、IL-1 R4、IL-1 RI、IL-10 Rβ、IL-17R、IL-2Rγ、IL-21R、溶酶體膜蛋白2 (「LIMPII」)、嗜中性白血球明膠酶相關脂質運載蛋白(「脂質運載蛋白-2」)、CD62L (「L-選擇素」)、淋巴內皮(「LYVE-1」)、MHC I類多肽相關序列A (「MICA」)、MHC I類多肽相關序列B (「MICB」)、NRGl-βl、β型血小板源生長因子受體(「PDGF Rβ」)、血小板內皮細胞黏附分子(「PECAM-1」)、RAGE、A型肝炎病毒細胞受體1 (「TIM-1」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員IOC (「TRAIL R3」)、Trappin蛋白轉麩醯胺酸酶結合域(「Trappin-2」)、尿激酶受體(「uPAR」)、血管細胞黏附蛋白1 (「VCAM-1」)、XEDARActivin A、Agouti相關蛋白(「AgRP」)、核糖核酸酶5 (「血管生成素」)、血管生成素1、血管生長抑素、Catheprin S、CD40、隱性家族蛋白IB (「Cripto-1」)、DAN、Dickkopf相關蛋白1 (「DKK-1」)、E-鈣黏素、上皮細胞黏附分子(「EpCAM」)、Fas配體(FasL或CD95L)、Fcg RIIB/C、FoUistatin、半乳糖凝集素-7、細胞間黏附分子2 (「ICAM-2」)、IL-13 Rl、IL-13R2、 IL-17B、IL-2 Ra、IL-2 Rb、IL-23、LAP、神經元細胞黏附分子(「NrCAM」)、纖維蛋白溶酶原活化因子抑制劑-1 (「PAI-1」)、血小板衍生生長因子受體(「PDGF-AB」)、抵抗素、基質細胞衍生因子1 (「SDF-1β」)、sgpl30、分泌性捲曲相關蛋白2 (「ShhN」)、唾液酸結合免疫球蛋白型凝集素(「Siglec-5」)、ST2、轉型生長因子-β 2 (「TGF β 2」)、Tie-2、血小板生成素(「TPO」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員10D (「TRAIL R4」)、骨髓細胞上表現之觸發受體1 (「TREM-1」)、血管內皮生長因子C (「VEGF-C」)、VEGFRlA脂聯素、脂肪酶(「AND」)、α-胎蛋白(「AFP」)、血管生成素樣4 (「ANGPTL4」)、β-2-微球蛋白(「B2M」)、基細胞黏附分子(「BCAM」)、碳水化合物抗原125 (「CA125」)、癌症抗原15-3 (「CA15-3」)、癌胚抗原(「CEA」)、cAMP受體蛋白(「CRP」)、人類表皮生長因子受體2 (「ErbB2」)、卵泡抑素、促卵泡激素(「FSH」)、趨化因子(C-X-C基元)配位體1 (「GRO α」)、人絨毛膜促性腺激素(「β HCG」)、胰島素樣生長因子1受體(「IGF-1 sR」)、IL-1 sRII、IL-3、IL-18 Rb、IL-21、瘦素、基質金屬蛋白酶-1 (「MMP-1」)、基質金屬蛋白酶-2 (「MMP-2」)、基質金屬蛋白酶-3 (「MMP-3」)、基質金屬蛋白酶-8 (「MMP-8」)、基質金屬蛋白酶-9 (「MMP-9)、基質金屬蛋白酶-10 (「MMP-10」)、基質金屬蛋白酶 -13 (「MMP-13」)、神經細胞黏附分子(「NCAM-1」)、巢蛋白(「Nidogen-1」)、神經元特異性烯醇酶(「NSE」)、抑瘤素M (「OSM」)、降鈣素原、催乳素、前列腺特異性抗原(「PSA」)、唾液酸結合Ig樣凝集素9 (「Siglec-9」)、ADAM 17內肽酶(「TACE」)、甲狀球蛋白、金屬蛋白酶抑制劑4 (「TIMP-4」)、TSH2B4、解整合素及含金屬蛋白酶域之蛋白9 (「ADAM-9」)、血管生成素2、腫瘤壞死因子配位體超家族成員13/酸性富白胺酸細胞核磷蛋白32家族成員B (「APRIL」)、骨形態生成蛋白2 (「BMP-2」)、骨形態生成蛋白9 (「BMP-9」)、互補組分5a (「C5a」)、組織蛋白酶L、CD200、CD97、趨化素、腫瘤壞死因子受體超家族成員6B (「DcR3」)、脂肪酸結合蛋白2 (「FABP2」)、纖維母細胞活化蛋白α (「FAP」)、纖維母細胞生長因子19 (「FGF-19」)、半乳糖凝集素-3、肝細胞生長因子受體(「HGF R」)、IFN-γα/β R2、胰島素樣生長因子2 (「IGF-2」)、胰島素樣生長因子2受體(「IGF-2 R」)、 介白素-1受體6 (「IL-1R6」)、介白素24 (「IL-24」)、介白素33 (「IL-33」)、激肽釋放素14、天冬醯胺醯基內肽酶(「豆莢蛋白」)、經氧化低密度脂蛋白受體1 (「LOX-1」)、甘露糖結合凝集素(「MBL」)、腦啡肽酶(「NEP」)、易位相關(果蠅)之Notch同源物1 (「Notch-1」)、腎母細胞瘤過度表現(「NOV」)、骨活素、計劃性細胞死亡蛋白1 (「PD-1」)、N-乙醯胞壁醯-L-丙胺酸醯胺酶(「PGRP-5」)、絲胺酸蛋白酶抑因子A4、分泌性捲曲相關蛋白3 (「sFRP-3」)、凝血調節蛋白、鐸樣受體2 (「TLR2」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員10A (「TRAIL Rl」)、轉鐵蛋白(「TRF」)、WIF-lACE-2、白蛋白、AMICA、血管生成素4、B細胞活化因子(「BAFF」)、碳水化合物抗原19-9 (「CA19-9」)、CD 163、叢生蛋白(Clusterin)、CRT AM、趨化因子(C-X-C基元)配體14 (「CXCL14」)、胱抑素C、核心蛋白聚糖(「DCN」)、Dickkopf相關蛋白3 (「Dkk-3」)、δ樣蛋白1 (「DLL1」)、胎球蛋白A、肝素結合生長因子1 (「aFGF」)、葉酸受體α (「FOLR1」)、弗林蛋白酶(Furin)、GPCR相關分選蛋白1 (「GASP-1」)、GPCR相關分選蛋白2 (「GASP-2」)、顆粒球群落刺激因子受體(「GCSF R」)、絲胺酸蛋白酶第二型穿膜絲胺酸蛋白酶(「HAI-2」)、介白素-17B受體(「IL-17B R」)、介白素27 (「IL-27」)、淋巴球活化基因3 (「LAG-3」)、脂蛋白元A-V(「LDL R」)、胃蛋白酶原I、視黃醇結合蛋白4 (「RBP4」)、SOST、硫酸乙醯肝素蛋白聚糖(「多配體蛋白聚糖-1」)、腫瘤壞死因子受體超家族成員13B (「TACI」)、組織因子路徑抑制劑(「TFPI」)、TSP-1、腫瘤壞死因子受體超家族成員10b (「TRAIL R2」)、TRANCE、肌鈣蛋白I、尿激酶纖維蛋白溶酶原活化物(「uPA」)、鈣黏素5、2型或VE鈣黏素(血管內皮) (亦稱為CD144 (「VE-鈣黏素」))、WNTl誘導性信號傳導路徑蛋白1 (「WISP-1」)及核因子κB之受體活化物(「RANK」)。
- 如請求項43至84中任一項之方法，其中該免疫療法藥劑包含佐劑。
- 如請求項85之方法，其中該佐劑係選自由以下組成之群：免疫調節蛋白、佐劑65、α-半乳糖苷基神經醯胺(α-GalCer)、磷酸鋁、氫氧化鋁、磷酸鈣、β-葡聚糖肽、CpG DNA、GPI-0100、脂質A、脂多醣、Lipovant、Montanide、N-乙醯基-胞壁醯基-L-丙胺醯基-D-異麩醯胺酸、Pam3CSK4、quil A及海藻糖二黴菌酸酯。
- 如請求項40至86中任一項之方法，其中該癌症治療劑包含血管生成抑制劑。
- 如請求項87之方法，其中該血管生成抑制劑係選自由以下組成之群：貝伐單抗(Bevacizumab) (Avastin®)、Ziv-阿柏西普(Ziv-aflibercept) (Zaltrap®)、索拉非尼(Sorafenib) (Nexavar®)、舒尼替尼(Sunitinib) (Sutent®)、帕唑帕尼(Pazopanib) (Votrient® )、瑞戈非尼(Regorafenib) (Stivarga®)及卡博替尼(Cabozantinib) (Cometriq™)。
- 如請求項1至88中任一項之方法，其中該方法進一步包含向該個體投與第二治療性細菌。
- 如請求項1至88中任一項之方法，其中該方法進一步包含向該個體投與益菌助生質。
- 如請求項90之方法，其中該益菌助生質為果寡醣、半乳寡醣、反式半乳寡醣、木寡醣、殼寡醣、大豆寡醣、龍膽寡醣、異麥芽糖寡醣、甘露寡醣、麥芽糖寡醣、甘露寡醣、乳酮糖、乳果糖、巴拉金糖、糖基蔗糖、瓜爾豆膠、阿拉伯膠、塔格糖、直鏈澱粉、支鏈澱粉、果膠、木聚糖或環糊精。
- 如請求項1至91中任一項之方法，其中該個體為人類。
- 如請求項1至91中任一項之方法，其中該個體為非人類哺乳動物。
- 如請求項93之方法，其中該哺乳動物係選自由以下組成之群：狗、貓、牛、馬、豬、驢、山羊、駱駝、小鼠、大鼠、天竺鼠、綿羊、駱馬、猴、大猩猩或黑猩猩。
- 如請求項1至94中任一項之方法，其中第二細菌係作為生態共生物種之部分投與。
- 一種細菌組合物，其包含布勞特氏菌株A及醫藥學上可接受之載劑。
- 如請求項96之細菌組合物，其中該布勞特氏菌株A為包含與該布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之核苷酸序列有至少99%基因組、16S及/或CRISPR序列一致性的菌株。
- 如請求項96之細菌組合物，其中該布勞特氏菌株A為包含與該布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之核苷酸序列有至少99.9%基因組、16S及/或CRISPR序列一致性的菌株。
- 如請求項96之細菌組合物，其中該布勞特氏菌株A為該布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)。
- 如請求項96至99中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物經調配用於經口、經直腸、靜脈內、瘤內或皮下投與。
- 如請求項96至100中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物中至少50%之該等細菌為布勞特氏菌株A。
- 如請求項96至100中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物中至少90%之該等細菌為布勞特氏菌株A。
- 如請求項96至102中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物中實質上所有之該等細菌為布勞特氏菌株A。
- 如請求項96至103中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物包含至少1 × 106 個菌落形成單位(CFU)之布勞特氏菌株A。
- 如請求項104之細菌組合物，其中該細菌組合物包含至少1 × 107 CFU布勞特氏菌株A。
- 如請求項104之細菌組合物，其中該細菌組合物包含至少1 × 108 CFU布勞特氏菌株A。
- 如請求項96至105中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物包含活細菌。
- 如請求項96至107中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物包含經減毒細菌。
- 如請求項96至107中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物包含經滅活細菌。
- 如請求項96至109中任一項之細菌組合物，其中該細菌組合物包含經照射細菌。
- 如請求項110之細菌組合物，其中該細菌組合物包含經γ照射細菌。
- 一種細菌組合物，其包含經分離之布勞特氏菌株A細胞外囊泡(EV)。
- 一種細菌組合物，其包含布勞特氏菌株A細胞外囊泡(EV)及布勞特氏菌株A細菌。
- 如請求項113之細菌組合物，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及布勞特氏菌株A細菌粒子之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A EV：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項113之細菌組合物，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及細菌粒子之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A細菌：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項113之細菌組合物，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及免疫調節布勞特氏菌株A細菌蛋白質之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A EV蛋白質：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項113之細菌組合物，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及布勞特氏菌株A細菌蛋白質之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A細菌蛋白質：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項113之細菌組合物，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及細菌脂質之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A EV脂質：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 如請求項113之細菌組合物，其中醫藥組合物中總布勞特氏菌株A EV及布勞特氏菌株A細菌脂質之至少以下數量、約以下數量或不超過以下數量為布勞特氏菌株A細菌脂質：1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、21%、22%、23%、24%、25%、26%、27%、28%、29%、30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%或99%。
- 一種細菌組合物，其包含分離自EV之布勞特氏菌株A細菌。
- 如請求項33至45中任一項之方法，其中投與該細菌組合物治療該免疫病症。
- 如請求項33至46中任一項之方法，其中投與該細菌組合物誘導免疫反應。
- 如請求項33至46中任一項之方法，其中該布勞特氏菌株A經調配具有包覆腸溶包衣或微囊包封。
- 一種生物反應器，其包含布勞特氏菌株A細菌。
- 如請求項124之生物反應器，其中該布勞特氏菌株A為包含與該布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之核苷酸序列有至少90%基因組、16S及/或CRISPR序列一致性的菌株。
- 如請求項125之生物反應器，其中該布勞特氏菌株A為包含與該布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)之核苷酸序列有至少99%基因組、16S及/或CRISPR序列一致性的菌株。
- 如請求項125之生物反應器，其中該布勞特氏菌株A為該布勞特氏菌株A (ATCC保藏號PTA-125346)。
- 一種在生物反應器中生長細菌之方法，其包含 提供如請求項124至127中任一項之生物反應器；及 使該等細菌醱酵一段時間段。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201762585782P | 2017-11-14 | 2017-11-14 | |
| US62/585,782 | 2017-11-14 |
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